CN105647918A - 抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法 - Google Patents
抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法 Download PDFInfo
- Publication number
- CN105647918A CN105647918A CN201610097651.6A CN201610097651A CN105647918A CN 105647918 A CN105647918 A CN 105647918A CN 201610097651 A CN201610097651 A CN 201610097651A CN 105647918 A CN105647918 A CN 105647918A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- primer
- hepatitis
- antigen
- pbk
- nbd
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K1/00—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
- C07K1/14—Extraction; Separation; Purification
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/08—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from viruses
- C07K16/081—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from viruses from DNA viruses
- C07K16/082—Hepadnaviridae, e.g. hepatitis B virus
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/08—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from viruses
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/65—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression using markers
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Virology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
本发明公开了一种抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法,通过基因工程手段,将合成的甲烷马氏甲烷八叠球菌(Methanosarcina?mazei)物种的氨酰-tRNA合成酶(mPylRS)的基因与质粒pBK重组,获得mPylRS-pBK;以mPylRS-pBK为模板,构建突变库lib-mPylRS-pBK;将lib-mPylRS-pBK电击转化、筛选;筛选重组NBDKRS-pBK质粒;将抗HBeAg抗体的DNA与pBAD重组,获得anti-HBeAg-4tag-pBAD;分别将质粒anti-HBeAg-4tag-pBAD和NBDKRS-pBK转化到感受态中,获得了制备抗乙肝e抗原红色荧光抗体的生物表达系统。本发明实现了抗乙肝e抗原红色荧光抗体的制备,提高了检测的灵敏度。
Description
技术领域
本发明涉及生物技术领域,尤其涉及一种抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法。
背景技术
乙型病毒性肝炎的简称是乙型肝炎,它是由乙肝病毒感染引起的传染性疾病,也是肝硬化和肝癌的主要病因。我国是乙型肝炎的高发地区,感染人数超过9300万,乙肝防控的难度依然严峻。
乙肝e抗原的定量是医生判断病情和指导治疗的重要依据。受技术所限,乙肝e抗原的检测一直处于手工定性或者半定量状态。最近,国外的公司有通过化学显色的方法来定量乙肝e抗原,然而化学显色方法灵敏度低,检测不到血液中低丰度的乙肝e抗原,会给乙肝e抗原的检测带来误判。荧光发光检测的方法灵敏度高,可以检测到样本中单个拷贝的靶标。目前绿色荧光标记抗体比较单一,而抗体的种类有很多,发展红色荧光标记的乙肝e抗原,在同一个检测中检测多个抗原,提高检测效率。
基于此,有必要设计一种抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法,用来提高乙肝e抗原检测的灵敏度,实现乙肝e抗原的精确定量检测,辅助加强对乙型肝炎的发病的监控力度。
发明内容
本发明的目的在于提供一种抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法,旨在提高乙肝e抗原的检测灵敏度、性质稳定性和特异性,适用于乙肝e抗原的精确定量检测。
为实现上述目的,本发明提供一种抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法,所述抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法包括如下步骤:
S1:获得甲烷马氏甲烷八叠球菌mPylRS突变库lib-mPylRS-pBK;
S2:获得NBD-赖氨酸;
S3:筛选获得NBDKRS-pBK质粒,该NBDKRS-pBK质粒包括能够特异识别NBD-赖氨酸的吡咯赖氨酸氨酰-tRNA合成酶突变体NBDKRS的基因序列;
S4:合成抗乙肝e抗原抗体的DNA序列,将所述抗乙肝e抗原抗体的DNA序列与质粒pBAD重组,获得大肠杆菌表达质粒anti-HBeAg-4tag-pBAD;
S5:将步骤S3中的NBDKRS-pBK质粒和步骤S4中的anti-HBeAg-4tag-pBAD质粒按照第一预设比例混合,经过电击转化,导入到大肠杆菌Top10中,经抗性筛选,获得菌株A;
S6:将步骤S5获得的菌株A接种培养,在培养基中添加特定的物质,对菌株A进行培养、离心、超声破碎以及柱纯化得到抗乙肝e抗原红色荧光抗体。
优选地,所述第一预设比例为1:1。
优选地,所述步骤S1包括如下步骤:
S101:人工合成甲烷马氏甲烷八叠球菌mPylRS的DNA序列;
S102:将上述合成的甲烷马氏甲烷八叠球菌mPylRS的DNA序列连接到pBK质粒上,获得重组质粒mPylRS-pBK;
S103:设计定点突变引物,所述定点突变引物包括引物f-L309NNK、引物r-L309NNK、引物f-L305NNK、引物r-L305NNK、引物f-N346F348NNK、引物r-N346F348NNK、引物f-Y384NNK和引物r-Y384NNK;
S104:以所述重组质粒mPylRS-pBK为模板,以所述引物f-L309NNK和引物r-L309NNK为引物,通过聚合酶链式反应,获得突变库1;
S105:以所述突变库1为模板,以所述引物f-L305NNK和引物r-L305NNK为引物,通过聚合酶链式反应,获得突变库2;
S106:以所述突变库2为模板,以所述引物f-N346F348NNK和引物r-N346F348NNK为引物,通过聚合酶链式反应,获得突变库3;
S107:以所述突变库3为模板,以所述引物f-Y384NNK和引物r-Y384NNK为引物,通过聚合酶链式反应,获得突变库4;
S108:所述突变库1、突变库2、突变库3和突变库4按照第二预设比例混合,获得用于NBD-赖氨酸筛选用的甲烷马氏甲烷八叠球菌mPylRS突变库lib-mPylRS-pBK。
优选地,所述第二预设比例为1:1:32:1。
优选地,所述NBDKRS的突变位点为L305A,L309G,N346C,F348A。
优选地,所述步骤S2包括如下步骤:
S201:取预设量的4-氯-7-硝基苯-2-氧-1,3-二唑(NBD-Cl),及赖氨酸溶于乙酸乙酯和水的混合液中,并加热到30℃,滴加预设量的表面活性剂十六烷基三甲基溴化胺,反应2小时,得到NBD-赖氨酸A;
S202:取第三预设量的上述NBD-赖氨酸A;经液相色谱分离,滤膜过滤除菌,得到NBD-赖氨酸母液C。
优选地,所述NBD-赖氨酸母液C的浓度设定为100mM。
优选地,所述特定的物质为由NBD-赖氨酸母液C、卡那霉素、四环素和L-阿拉伯糖组成的混合物。
优选地,所述步骤S6包括如下步骤:
S601:将步骤S5获得的菌株A接种于LB液体培养基中,并置于37℃摇床中培养12小时,获得扩增用的菌种母液B;
S602:将所述菌种母液B按照1:100的体积比,接种于体积为1L的LB液体培养基中,37℃摇床培养2小时,获得培养液C;
S603:在所述培养液C中,添加NBD-赖氨酸母液C,卡那霉素,四环素,L-阿拉伯糖10mL培养7小时,获得培养液D;
S604:取所述培养液D,分别置于离心管中离心,获得大肠杆菌沉淀组1;
S605:将所述大肠杆菌沉淀组1加入无菌水,漩涡震荡重悬,获得大肠杆菌沉淀组2;
S606:将所述大肠杆菌沉淀组2分别置于-80℃的冰箱,30min后取出,室温下融化;
S607:将S606中融化的大肠杆菌沉淀组2中,加超声缓冲液;置于超声破碎仪上进行破碎,离心,获得大肠杆菌沉淀组2相应的上清液组1;
S608:将所述上清液组1经镍离子亲和柱,分离纯化,获得抗乙肝e抗原的红色荧光抗体。
优选地,所述超声破碎仪的功率为25瓦,工作时间为5秒,间歇时间为10秒,工作环境为4℃NBD-赖氨酸ANBD-赖氨酸A。
本发明提供的抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法通过合成甲烷马氏甲烷八叠球菌(Methanosarcinamazei)物种的吡咯赖氨酸氨酰-tRNA合成酶(mPylRS)的DNA序列,并将所述DNA序列连接到pBK质粒上获得mPylRS-pBK;通过“一步饱和突变”的方法,构建mPylRS酶活力中心的突变库lib-mPylRS-pBK;将lib-mPylRS-pBK电击转化至包含有筛选质粒pREP的筛选Top10感受态中,制备筛选用大肠杆菌;合成NBD-赖氨酸;筛选重组了特异识别NBD-赖氨酸的氨酰-tRNA合成酶突变体NBDKRS的NBDKRS-pBK质粒;通过基因工程手段,将抗HBeAg抗体anti-HBeAg的DNA序列与质粒pBAD重组,获得anti-HBeAg-4tag-pBAD;通过转化的方法,将anti-HBeAg-4tag-pBAD质粒和NBDKRS-pBK质粒转化Top10感受态中,获得了制备抗乙肝e抗原红色荧光抗体的表达系统,从而实现了抗乙肝e抗原红色荧光抗体的制备。本发明抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法提高了乙肝e抗原检测的灵敏度。
附图说明
图1为本发明抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法的流程示意图;
图2为本发明抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法的步骤S1的流程示意图;
图3为本发明抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法的步骤S2的流程示意图;
图4为本发明NBD-赖氨酸的结构示意图;
图5为本发明抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法的步骤S6的流程示意图。
具体实施方式
下面结合具体实施例对本发明做进一步的详细说明,以下实施例是对本发明的解释,本发明并不局限于以下实施例。
如图1所示,图1为本发明抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法的流程示意图。本发明提供的抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法包括如下步骤:
S1:获得甲烷马氏甲烷八叠球菌mPylRS突变库lib-mPylRS-pBK;
S2:获得NBD-赖氨酸;
S3:筛选获得NBDKRS-pBK质粒,该NBDKRS-pBK质粒包括能够特异识别NBD-赖氨酸的吡咯赖氨酸氨酰-tRNA合成酶突变体NBDKRS的基因序列;
S4:合成抗乙肝e抗原抗体的DNA序列,将所述抗乙肝e抗原抗体的DNA序列与质粒pBAD重组,获得大肠杆菌表达质粒anti-HBeAg-4tag-pBAD;
S5:将步骤S3中的NBDKRS-pBK质粒和步骤S4中的anti-HBeAg-4tag-pBAD质粒按照第一预设比例混合,经过电击转化,导入到大肠杆菌Top10中,经抗性筛选,获得菌株A;
S6:将步骤S5获得的菌株A接种培养,在培养基中添加特定的物质,对菌株A进行培养、离心、超声破碎以及柱纯化得到抗乙肝e抗原红色荧光抗体。
在本实施例中,乙肝e抗原的英文缩写为HbeAg,是乙肝病毒内核的一种主要结构蛋白。甲烷马氏甲烷八叠球菌(Methanosarcinamazei)表示一种产甲烷厌氧菌;mPylRS(pyrrolysineaminoacyl-tRNAsynthetase)中文为吡咯赖氨酸氨酰-tRNA合成酶。核苷酸序列表1为特异识别NBD-赖氨酸的吡咯赖氨酸氨酰-tRNA合成酶NBDKRS的基因序列;氨基酸序列表为特异识别NBD-赖氨酸的吡咯赖氨酸氨酰-tRNA合成酶NBDKRS的氨基酸序列;核苷酸序列表2为抗乙肝e抗原抗体的突变基因序列。
在实施例中,野生型产甲烷厌氧菌的mPylRS(吡咯赖氨酸氨酰-tRNA合成酶)只识别吡咯赖氨酸(第22种基因编码的天然氨基酸),并催化吡咯赖氨酸和对应的tRNA发生转运反应,从而把吡咯赖氨酸连接到对应tRNA上,延伸因子EF-Tu携带上述产物至核糖体,参与蛋白质合成。tRNA又称转运RNA(transferribonucleicacidtRNA),是具有携带并转运氨基酸功能的一类小分子核糖核酸。但是野生型的产甲烷厌氧菌的mPylRS(吡咯赖氨酸氨酰-tRNA合成酶)并不识别NBD-赖氨酸,因此并不能确定哪一种mPylRS突变体能够识别NBD-赖氨酸,所以要做突变-建库-筛选(定向进化),最终筛选到能够特异识别NBD-赖氨酸的mPylRS突变体,即命名为NBDKRS。
如图2所示,图2为本发明抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法的步骤S1的流程示意图。在本实施例中,步骤S1为获得甲烷马氏甲烷八叠球菌(Methanosarcinamazei)mPylRS突变库;在实现步骤S1的过程中,又可分8个步骤来实现,分别是步骤S101、S102、S103、S104、S105、S106、S107和S108。具体的步骤如下:
S101:人工合成甲烷马氏甲烷八叠球菌mPylRS的DNA序列;
S102:将上述合成的甲烷马氏甲烷八叠球菌mPylRS的DNA序列连接到pBK质粒上,获得重组质粒mPylRS-pBK;
S103:设计定点突变引物,所述定点突变引物包括引物f-L309NNK、引物r-L309NNK、引物f-L305NNK、引物r-L305NNK、引物f-N346F348NNK、引物r-N346F348NNK、引物f-Y384NNK和引物r-Y384NNK;
S104:以所述重组质粒mPylRS-pBK为模板,以所述引物f-L309NNK和引物r-L309NNK为引物,通过聚合酶链式反应,获得突变库1;
S105:以所述突变库1为模板,以所述引物f-L305NNK和引物r-L305NNK为引物,通过聚合酶链式反应,获得突变库2;
S106:以所述突变库2为模板,以所述引物f-N346F348NNK和引物r-N346F348NNK为引物,通过聚合酶链式反应,获得突变库3;
S107:以所述突变库3为模板,以所述引物f-Y384NNK和引物r-Y384NNK为引物,通过聚合酶链式反应,获得突变库4;
S108:所述突变库1、突变库2、突变库3和突变库4按照第二预设比例混合,获得用于NBD-赖氨酸筛选用的甲烷马氏甲烷八叠球菌mPylRS突变库lib-mPylRS-pBK。
在步骤S101中首先人工合成甲烷马氏甲烷八叠球菌(Methanosarcinamazei)mPylRS的DNA序列,然后通过步骤S102将甲烷马氏甲烷八叠球菌(Methanosarcinamazei)mPylRS的DNA连接到pBK质粒上,既可以通过传统酶切链接,也可以采用分步PCR方法,利用饱和突变的方法,设计引物,把单个氨基酸的密码子突变为NNK(N代表A,T,C,G四种密码子,K代表T,G两种密码子)NNK组合把一个氨基酸的密码子突变为4*4*2=32种,对应20种氨基酸。达到“无中生有”的目的,最终获得重组质粒A。此外,pBK质粒比较小,有利于下游的大容量库的构建。当上述合成的甲烷马氏甲烷八叠球菌(Methanosarcinamazei)mPylRS的编码DNA连接到pBK质粒中,是通过分步聚合酶链式反应(PCR)方法时,实现步骤如下:在特定50μLPCR扩增体系和特定方法下实现突变库的构建。50μLPCR扩增体系包括:无菌水40μL、10倍浓度的缓冲液5μL,质粒DNA模板1μL,PCR扩增引物正负链各1μL,10mMdNTPs1μL,高保真酶1μL。以下各步骤PCR反应体系均按照该体系进行。以上所述的反应体系,在PCR扩增仪上进行扩增,PCR反应扩增的方法为:94℃,4分钟,预变性;94℃,1分钟,变性;58℃,30秒,退火;72℃,3分钟,延伸;重复变性-退火-延伸步骤26个循环后,72℃保温5分钟,然后降温到16度,完成反应。以下各步骤突变库,均按照此方法进行。每一步骤的PCR扩增后,需要经过电击感受态大肠杆菌进行转化,并在大肠杆菌中进行扩增,经过质粒提取步骤得到可用于下一步PCR扩增反应的质粒。以上所述的可用于电击的感受态的制备采用标准步骤进行。
在本实施例中,设计定点突变引物的原理为先把野生型的pylrs连接到pBK上,然后设计引物(在特定位点有突变),PCR后,得到本底pylrs-pBK和突变pylrs-pBK,由于本底的pylrs-pBK从DH5a中提取,腺嘌呤核苷上会甲基化,用特异识别甲基化腺嘌呤核苷的DpnI酶切即可去除本底。得到的线性质粒片段(含有突变)转化到感受态细胞中,得到环化的质粒。提取环化的质粒,以此为模版,再利用另一对突变引物进行突变,同样用DpnI处理,得到突变库2,再次重复,得到突变库3,得到突变库4。把单个氨基酸的密码子突变为NNK(N代表A,T,C,G四种密码子,K代表T,G两种密码子。)NNK组合把一个氨基酸的密码子突变为4*4*2=32种,对应20种氨基酸。根据蛋白质晶体结构,可以获得结合底物的酶活中心,该中心由多个氨基酸组成,经过InsightII分子模拟计算,分子模拟软件InsightII对mPylRS酶活力中心进行测算,可以预测底物分子周围的氨基酸,这些氨基酸是进化mPylRS的重要依据。在步骤S103中,通过定点突变原理设计4对不同的引物,如表1所示,表1为采用本发明较佳实施例的引物的序列。该4对引物分别是引物f-L309NNK、引物r-L309NNK、引物f-L305NNK、引物r-L305NNK、引物f-N346F348NNK、引物r-N346F348NNK、引物f-Y384NNK和引物r-Y384NNK。在步骤S104中,利用步骤S103中的引物f-L309NNK、引物r-L309NNK,通过PCR(聚合酶链式反应),可获得突变库1;同理,利用步骤S103中的引物f-L305NNK和引物r-L305NNK、引物f-N346F348NNK和引物r-N346F348NNK、引物f-Y384NNK和引物r-Y384NNK,分别通过PCR(聚合酶链式反应),可分别获得突变库2、突变库3、突变库4。将得到的突变库1、突变库2、突变库3和突变库4按照1:1:32:1的比例混合,最终可获得用于NBD-赖氨酸筛选用的甲烷马氏甲烷八叠球菌(Methanosarcinamazei)mPylRS突变库lib-mPylRS-pBK。详细步骤如下:在以上所述反应体系中加入上述引物f-L309NNK和引物r-L309NNK,进行PCR扩增,得PCR产物1;PCR产物1,经过电击转化到感受态大肠杆菌中扩增,经质粒提取,得到突变库1;以上述突变库1为模板,在反应体系中加入上述引物f-L305NNK和引物r-L305NNK,经PCR扩增和上述突变库1相同的步骤处理,得到突变库2;以上述突变库2为模板,经过引物f-N346F348NNK和引物r-N346F348NNK扩增,得到PCR产物3,PCR产物3经过上述突变库1相同的制备方法,得到突变库3,突变库3经过引物Y349NNK-f和引物Y349NNK-r引物扩增、转化、质粒提取步骤得到突变库4;把以上所述突变库1-4按照第二预设比例为1:1:32:1混合,得到最终用于NBD-赖氨酸筛选用的甲烷马氏甲烷八叠球菌(Methanosarcinamazei)mPylRS突变库(lib-mPylRS-pBK)。
表1本发明较佳实施例的引物序列
如图3所示,图3为本发明抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法的步骤S2的流程示意图。
步骤S2包括如下步骤:
S201:取预设量的4-氯-7-硝基苯-2-氧-1,3-二唑(NBD-Cl)和赖氨酸,溶于乙酸乙酯和水中,并加热到30℃,滴加预设量的十六烷基三甲基溴化胺,反应2小时,即可得到NBD-赖氨酸A;
S202:取第三预设量的上述NBD-赖氨酸A;经液相色谱分离,滤膜过滤除菌,得到NBD-赖氨酸母液C。
在步骤S2中,主要涉及NBD-赖氨酸的合成;如图4所示,图4为本发明NBD-赖氨酸的结构示意图。其合成步骤如下:在步骤S201中,首先取4-氯-7-硝基苯-2-氧-1,3-二唑(NBD-Cl)5g,溶于水中,并加热到30℃,慢慢向4-氯-7-硝基苯-2-氧-1,3-二唑(NBD-Cl)溶液中滴加溶于水的赖氨酸2.4克,搅拌混匀2分钟,得到预反应混合液,慢慢向预反应混合液中滴加十六烷基三甲基溴化胺100毫升,得到NBD-赖氨酸A。NBD-赖氨酸A溶于100毫升水中,经液相色谱分离,得到NBD-赖氨酸3克以供筛选。在本实施例中,NBD-赖氨酸经过0.22微米滤膜过滤除菌。
在步骤S3中,主要筛选特异识别NBD-赖氨酸的吡咯赖氨酸氨酰-tRNA合成酶NBDKRS突变体:在步骤S2中合成的非天然氨基酸NBD-赖氨酸,溶解到水中,经过0.22微米滤膜过滤除菌,得到终浓度为100mM的NBD-赖氨酸母液。进行筛选之前,构建筛选pREP质粒,pREP质粒上携带氯霉素抗性基因,该氯霉素抗性基因上含有一个TAG,用TAG取代编码蛋氨酸的密码子ATG,如果没有氨基酸插入的情况下,该氯霉素基因无法表达,当有氯霉素存在的情况下,大肠杆菌无法生存;只有当特定的甲烷马氏甲烷八叠球菌(Methanosarcinamazei)mPylRS的单个突变体特意识别NBDK,并插入到氯霉素基因上的TAG位点时,氯霉素才可得到表达,共包含pREP和NBDKRS-pBK质粒的目的菌株才能生存,获得具有氯霉素抗性的阳性克隆,该克隆中包含的NBDKRS-pBK质粒和步骤S4中的pBAD质粒共转化,即可实现连接到pBAD质粒上的anti-HBeAg-4tag基因编码的蛋白质HBeAg的表达以及特定位点的标记。
所述NBDKRS的筛选步骤如下:首先转化lib-mPylRS-pBK至包含pREP质粒的Top10大肠杆菌感受态中,Top10大肠杆菌感受态细胞可用于DNA的化学转化。经37℃,1小时孵育后,涂布在正筛选培养板上。正筛选把目的克隆呈现出来,对应的负筛选则是把非目的克隆剔除。正筛选培养板的配制方法如下:100毫升LB培养基中加入0.15g琼脂粉,高压灭菌处理,并降温到60℃;在其中加入1毫升以上所述的浓度为100mM的NBD-赖氨酸母液,100μL80mg/mL的氯霉素液体,浓度为12.5mg/mL的四环素100μL,浓度为50mg/mL的卡那霉素100μL,混匀过后,倒入无菌培养板中,冷却后备用。经过37℃下,48小时的培养,挑选在正筛选板子上存活的单克隆细菌进行培养12小时,得到的单克隆细菌分别印在两种培养基上1和培养基2上。培养基1的配方为:100毫升LB培养基中加入0.015g琼脂粉,高压灭菌处理,并降温到60℃;在其中加入1毫升以上所述的浓度为100mM的NBD-赖氨酸母液,100μL80mg/mL的氯霉素液体,浓度为12.5mg/mL的四环素100μL,浓度为50mg/mL的卡那霉素100μL,混匀过后,倒入无菌培养板中,冷却后备用。培养基2的配方为:100毫升LB培养基中加入0.15g琼脂粉,高压灭菌处理,并降温到60℃;在其中加入100μL80mg/mL的氯霉素液体,浓度为50mg/mL的四环素100μL,浓度为50mg/mL的卡那霉素100μL,混匀过后,倒入无菌培养板中,冷却后备用。印在培养基1和2上的细菌在37℃下培养48小时,能够在培养基1上生存同时不能在培养基2上生存的单克隆即为含有NBDKRS的菌株。该菌株特异识别NBD-赖氨酸。NBDKRS的突变位点为L305A,L309G,N346C,F348A4个突变位点。
在本实施例中,NBD-赖氨酸是目的底物,因此在筛选的时候添加到筛选平板上。配制母液是生化研究的常规或者常识。假设100毫升液体中含有若干成分,把他们直接混合,体积会增大,只有配成母液,才能保证浓度的情况下,不影响体积。参考PCR中的10倍buffer,就是母液。转化成功的菌株能够在氯霉素抗性平板上活下来。pREP质粒的作用就是让识别氨基酸的酶活下来。pylT基因编码携带NBD-赖氨酸进入核糖体翻译的tRNA;通过NBDKRS的突变位点为L305A,L309G,N346C,F348A的设计及筛选最终可以得到只识别NBD-赖氨酸,提高了特异性。
在步骤S4中设计抗乙肝e抗原抗体的突变DNA序列,获得该突变体,将所述抗乙肝e抗原抗体的突变DNA与质粒pBAD重组,获得表达质粒anti-HBeAg-4tag-pBAD,对于表达质粒anti-HBeAg-4tag-pBAD来说,能够将抗HBeAg(乙肝e抗体)的基因的第4个密码子突变为TAG。质粒pBAD也来自于Invitrogen公司,质粒pBAD为表达质粒中的一种,用于目的基因的表达。具体过程可表述为:设计抗乙肝e抗原抗体的突变DNA序列(见序列表中的序列3)也可以通过基因公司合该突变体,并把其克隆到质粒pBAD,该pBAD质粒的多克隆位点选择在EcoRI和NotI酶切位点之间进行酶切连接,达到基因重组的目的,最终得到大肠杆菌表达质粒anti-HBeAg-4tag-pBAD。
在步骤S5中分别将步骤S4中构建的NBDKRS-pBK质粒线性化;将步骤S5中构建的anti-HBeAg-4tag-pBAD质粒按照第一预设比例混合,该第一预设比例为1:1;经过电击转化,导入到大肠杆菌Top10感受态中,获得菌株A。Top10感受态来自于Invitrogen公司,Top10为原核表达中的常用的感受态菌株,为大肠杆菌的一种。电击转化,电压为1.8千伏,电击时间为3.8秒。
参照图5,图5为本发明抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法的步骤S6的流程示意图。
步骤S6包括如下步骤:
S601:将步骤S5获得的菌株A接种于LB液体培养基中,并置于37℃摇床中培养12小时,获得扩增用的菌种母液B;
S602:将所述菌种母液B按照1:100的体积比,接种于体积为1L的LB液体培养基中,37℃摇床培养2小时,获得培养液C;
S603:在所述培养液C中,添加NBD-赖氨酸母液C,卡那霉素,四环素,L-阿拉伯糖10mL37℃,200转速,培养7小时,获得培养液D;
S604:取所述培养液D,分别置于离心管中离心,获得大肠杆菌沉淀组1;
S605:将所述大肠杆菌沉淀组1加入无菌水,漩涡震荡重悬,获得大肠杆菌沉淀组2;
S606:将所述大肠杆菌沉淀组2分别置于-80℃的冰箱,30min后取出,室温下融化;
S607:将S606中融化的大肠杆菌沉淀组2中,加超声缓冲液;置于超声破碎仪上进行破碎,离心,获得大肠杆菌沉淀组2相应的上清液组1;
S608:将所述上清液组1经镍离子亲和柱,分离纯化,获得抗乙肝e抗原的红色荧光抗体。
在本实施例中,L-阿拉伯糖是一种作用温和的诱导剂,不被细菌代谢而十分稳定,因此被实验室广泛应用。继续添加NBD-赖氨酸母液1mL,于30℃,200rpm下继续培养7小时得到大肠杆菌菌体,经5000rpm,30min离心,超声破碎,镍柱纯化步骤得到抗乙肝e抗原荧光抗体。在步骤S603中,卡那霉素、四环素起到抗性筛选的作用;超声破碎仪的功率为25瓦,工作时间为5秒,间歇时间为10秒,工作环境为4℃。
为检测上述得到的抗乙肝e抗原荧光抗体的识别乙肝e抗原的效率和特异性,我们采取以下实例对本发明进行解释,本发明并不局限于以下实施例。实例1:
利用低浓度的乙肝e抗原作为样品,测试本发明制备的荧光抗体的灵敏度,具体步骤如下。
S120:取乙肝e抗原,用磷酸缓冲液(PBS)对乙肝e抗原进行稀释,配制成浓度为0ng/mL、0.2ng/mL、0.5ng/mL、1ng/mL、1.5ng/mL、2ng/mL、2.5ng/mL、10ng/mL、15ng/mL、20ng/mL10个梯度的乙肝e抗原液备用。
S130:将所述抗乙肝e抗原荧光抗体10μL、磷酸缓冲液90μL,分别加入到酶标板的11个孔中,在第11个孔中加入没有荧光标记的乙肝e抗原荧光抗体10μL、磷酸缓冲液90μL,分别命名为1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11室温孵育12h。
S140:将所述S130中的酶标板中的液体吸弃,重新加入100μL磷酸缓冲液至酶标板中,将所述酶标板置于摇床上,每分钟30rpm,室温清洗5分钟。
S150:重复步骤S140两次,并吸弃酶标板中1-11板孔中的磷酸缓冲液。
S160:在所述酶标板板孔1中加入100μL磷酸缓冲液,在板孔1-11中分别加入10μL浓度为0ng/mL、0.2ng/mL、0.5ng/mL、1ng/mL、1.5ng/mL、2ng/mL、2.5ng/mL、10ng/mL、15ng/mL、20ng/mL10个梯度的乙肝e抗原液,其中板孔1为阳性对照,板孔11为阴性对照,板孔2-10为样本组。
S170:在板孔1-11中分别加入90μL磷酸缓冲液。把酶标板置于摇床上,按照每分钟30rpm的rpm速室温孵育2h。
S180:将S170所述酶标板1-11板孔中的液体吸弃,并在酶标板的1-11板孔中加入100μLPBS,按照每分钟30rpm,室温清洗5分钟。
S190:重复S180两次。
S200:将所述清洗后的酶标板置于酶标仪上进行检测,550nm激光激发,采集595nm下的荧光,结果如表2所示。
表2本发明制备的荧光抗体的荧光强度值
板孔编号 | 荧光强度(a.u) | 抗原终浓度(ng/mL) |
1 | 10000 | 0 |
2 | 8000 | 0.02 |
3 | 6100 | 0.04 |
4 | 4375 | 0.06 |
5 | 2114 | 0.13 |
6 | 1005 | 0.2 |
7 | 823 | 0.31 |
8 | 432 | 0.89 |
9 | 331 | 1.34 |
10 | 100.9 | 2.0 |
11 | 0.21 | 0.02 |
从表2的测试结果发现:对于阴性对照组11(即未标记的抗乙肝e抗原抗体)荧光强度为0.21a.u;对于阳性对照组1(荧光标记的抗乙肝e抗原抗体)没有与其对应的乙肝e抗原识别,荧光强度最大为10000,当不同浓度的乙肝e抗原和荧光标记的抗乙肝e抗原抗体结合时,荧光信号不同,且随着乙肝e抗原的浓度逐渐增大,荧光信号逐渐减弱;此外,通过该测试还能够得出该荧光抗体可以检测到0.02ng/L级的抗原的结论。
本发明提供的抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法通过合成甲烷马氏甲烷八叠球菌(Methanosarcinamazei)物种的吡咯赖氨酸氨酰-tRNA合成酶(mPylRS)的DNA序列,并将所述DNA序列连接到pBK质粒上获得NBDKRS-pBK;通过设计抗乙肝e抗原抗体的突变DNA序列,获得该突变体,将所述抗乙肝e抗原抗体的突变DNA与质粒pBAD重组,获得大肠杆菌表达质粒anti-HBeAg-4tag-pBAD;通过将质粒NBDKRS-pBK、anti-HBeAg-4tag-pBAD按照一定的比例混合,电击转化,导入到大肠杆菌Top10中,进行抗性筛选,获得了制备抗乙肝e抗原荧光抗体的生物表达系统,该系统介导NBD-赖氨酸在抗乙肝e抗原抗体的氨基酸序列的4位点插入,从而实现了抗乙肝e抗原荧光抗体的制备;大幅度提高乙肝e抗原检测的灵敏度,实现乙肝e抗原的精确定量检测,辅助加强了对乙肝病情的监控力度。
以上仅为本发明的优选实施例,并非因此限制本发明的专利范围,凡是利用本发明说明书及附图内容所作的等效结构或等效流程变换,或直接或间接运用在其他相关的技术领域,均同理包括在本发明的专利保护范围内。
Claims (10)
1.一种抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法,其特征在于,所述抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法包括如下步骤:
S1:获得甲烷马氏甲烷八叠球菌mPylRS突变库lib-mPylRS-pBK;
S2:获得NBD-赖氨酸;
S3:筛选获得NBDKRS-pBK质粒,该NBDKRS-pBK质粒包括能够特异识别NBD-赖氨酸的吡咯赖氨酸氨酰-tRNA合成酶突变体NBDKRS的基因序列;
S4:合成抗乙肝e抗原抗体的DNA序列,将所述抗乙肝e抗原抗体的DNA序列与质粒pBAD重组,获得大肠杆菌表达质粒anti-HBeAg-4tag-pBAD;
S5:将步骤S3中的NBDKRS-pBK质粒和步骤S4中的anti-HBeAg-4tag-pBAD质粒按照第一预设比例混合,经过电击转化,导入到大肠杆菌Top10中,经抗性筛选,获得菌株A;
S6:将步骤S5获得的菌株A接种培养,在培养基中添加特定的物质,对菌株A进行培养、离心、超声破碎以及柱纯化得到抗乙肝e抗原红色荧光抗体。
2.如权利要求1所述的抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法,其特征在于,所述第一预设比例为1:1。
3.如权利要求1所述的抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法,其特征在于,所述步骤S1包括如下步骤:
S101:人工合成甲烷马氏甲烷八叠球菌mPylRS的DNA序列;
S102:将上述合成的甲烷马氏甲烷八叠球菌mPylRS的DNA序列连接到pBK质粒上,获得重组质粒mPylRS-pBK;
S103:设计定点突变引物,所述定点突变引物包括引物f-L309NNK、引物r-L309NNK、引物f-L305NNK、引物r-L305NNK、引物f-N346F348NNK、引物r-N346F348NNK、引物f-Y384NNK和引物r-Y384NNK;
S104:以所述重组质粒mPylRS-pBK为模板,以所述引物f-L309NNK和引物r-L309NNK为引物,通过聚合酶链式反应,获得突变库1;
S105:以所述突变库1为模板,以所述引物f-L305NNK和引物r-L305NNK为引物,通过聚合酶链式反应,获得突变库2;
S106:以所述突变库2为模板,以所述引物f-N346F348NNK和引物r-N346F348NNK为引物,通过聚合酶链式反应,获得突变库3;
S107:以所述突变库3为模板,以所述引物f-Y384NNK和引物r-Y384NNK为引物,通过聚合酶链式反应,获得突变库4;
S108:所述突变库1、突变库2、突变库3和突变库4按照第二预设比例混合,获得用于NBD-赖氨酸筛选用的甲烷马氏甲烷八叠球菌mPylRS突变库lib-mPylRS-pBK。
4.如权利要求3所述的抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法,其特征在于,所述第二预设比例为1:1:32:1。
5.如权利要求1所述的NBDKRS,其特征在于,所述NBDKRS的突变位点为L305A,L309G,N346C,F348A。
6.如权利要求1所述的抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法,其特征在于,所述步骤S2包括如下步骤:
S201:取预设量的4-氯-7-硝基苯-2-氧-1,3-二唑(NBD-Cl),及赖氨酸溶于乙酸乙酯和水的混合液中,并加热到30℃,滴加预设量的表面活性剂十六烷基三甲基溴化胺,反应2小时,得到NBD-赖氨酸A;
S202:取第三预设量的上述NBD-赖氨酸A;经液相色谱分离,滤膜过滤除菌,得到NBD-赖氨酸母液C。
7.如权利要求6所述的抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法,其特征在于,所述NBD-赖氨酸母液C的浓度设定为100mM。
8.如权利要求6所述的抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法,其特征在于,所述特定的物质为由NBD-赖氨酸母液C、卡那霉素、四环素和L-阿拉伯糖组成的混合物。
9.如权利要求8所述的抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法,其特征在于,所述步骤S6包括如下步骤:
S601:将步骤S5获得的菌株A接种于LB液体培养基中,并置于37℃摇床中培养12小时,获得扩增用的菌种母液B;
S602:将所述菌种母液B按照1:100的体积比,接种于体积为1L的LB液体培养基中,37℃摇床培养2小时,获得培养液C;
S603:在所述培养液C中,添加NBD-赖氨酸母液C,卡那霉素,四环素,L-阿拉伯糖10mL培养7小时,获得培养液D;
S604:取所述培养液D,分别置于离心管中离心,获得大肠杆菌沉淀组1;
S605:将所述大肠杆菌沉淀组1加入无菌水,漩涡震荡重悬,获得大肠杆菌沉淀组2;
S606:将所述大肠杆菌沉淀组2分别置于-80℃的冰箱,30min后取出,室温下融化;
S607:将S606中融化的大肠杆菌沉淀组2中,加超声缓冲液;置于超声破碎仪上进行破碎,离心,获得大肠杆菌沉淀组2相应的上清液组1;
S608:将所述上清液组1经镍离子亲和柱,分离纯化,获得抗乙肝e抗原的红色荧光抗体。
10.如权利要求9所述的抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法,其特征在于,所述超声破碎仪的功率为25瓦,工作时间为5秒,间歇时间为10秒,工作环境为4℃。
Priority Applications (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201610097651.6A CN105647918A (zh) | 2016-02-20 | 2016-02-20 | 抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法 |
PCT/CN2016/080500 WO2017140031A1 (zh) | 2016-02-20 | 2016-04-28 | 抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201610097651.6A CN105647918A (zh) | 2016-02-20 | 2016-02-20 | 抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN105647918A true CN105647918A (zh) | 2016-06-08 |
Family
ID=56489795
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201610097651.6A Pending CN105647918A (zh) | 2016-02-20 | 2016-02-20 | 抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法 |
Country Status (2)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN105647918A (zh) |
WO (1) | WO2017140031A1 (zh) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN105713917A (zh) * | 2016-02-20 | 2016-06-29 | 深圳市圣必智科技开发有限公司 | 基于绿色荧光蛋白发光结构域标记的抗乙肝表面抗原抗体的制备方法 |
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN103917872A (zh) * | 2011-11-02 | 2014-07-09 | 优志旺电机株式会社 | 使用含荧光标记抗体可变区域的多肽复合体的荧光免疫测定方法 |
Family Cites Families (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR101285904B1 (ko) * | 2005-08-18 | 2013-07-15 | 암브룩스, 인코포레이티드 | tRNA 조성물 및 이의 용도 |
CN102062778A (zh) * | 2009-11-17 | 2011-05-18 | 上海荣盛生物药业有限公司 | 体外检测抗体的组合物 |
BR112015006368B1 (pt) * | 2012-09-24 | 2022-02-08 | Medimmune Limited | Processo para produção de linha celular eucariótica estável |
CN104450746A (zh) * | 2014-08-30 | 2015-03-25 | 武汉佰福泰制药有限公司 | 一种向蛋白质定点引入非天然氨基酸的方法 |
-
2016
- 2016-02-20 CN CN201610097651.6A patent/CN105647918A/zh active Pending
- 2016-04-28 WO PCT/CN2016/080500 patent/WO2017140031A1/zh active Application Filing
Patent Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN103917872A (zh) * | 2011-11-02 | 2014-07-09 | 优志旺电机株式会社 | 使用含荧光标记抗体可变区域的多肽复合体的荧光免疫测定方法 |
Non-Patent Citations (3)
Title |
---|
LI-TAO GUO,ET AL: "Polyspecific pyrrolysyl-tRNA synthetases from directed evolution", 《PROC NATL ACAD SCI U S A》 * |
NCBI: "pyrrolysine--tRNA(Pyl) ligase [Methanosarcina mazei]NCBI Reference Sequence: WP_011033391.1", 《NCBI》 * |
王天元: "利用基因编码的非天然氨基酸研究甲酸化及甲酰化赖氨酸翻译后修饰", 《中国博士学位论文全文数据库》 * |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN105713917A (zh) * | 2016-02-20 | 2016-06-29 | 深圳市圣必智科技开发有限公司 | 基于绿色荧光蛋白发光结构域标记的抗乙肝表面抗原抗体的制备方法 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
WO2017140031A1 (zh) | 2017-08-24 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Nagel et al. | Glossary for chemists of terms used in biotechnology (IUPAC Recommendations 1992) | |
CN107502608A (zh) | 用于敲除人ALDH2基因的sgRNA、ALDH2基因缺失细胞株的构建方法及应用 | |
CN103509729B (zh) | 一种生产辅酶q10工程菌的构建方法、工程菌及其应用 | |
TWI461541B (zh) | 檢測動物或植物病原之引子組、方法及套組 | |
CN105531382A (zh) | 基于噬菌体的细菌检测法 | |
CN107022568A (zh) | 哺乳动物细胞中高效多点插入非天然氨基酸的系统 | |
Takeshita et al. | Tripartite symbiosis of an anaerobic scuticociliate with two hydrogenosome-associated endosymbionts, a Holospora-related alphaproteobacterium and a methanogenic archaeon | |
CN103626852B (zh) | 一种AraC突变体蛋白及其应用 | |
Filloux et al. | Metagenomics approaches based on virion-associated nucleic acids (VANA): an innovative tool for assessing without a priori viral diversity of plants | |
CN103898162B (zh) | 一种检测环境中多环芳烃化学物的质粒及应用 | |
CN104911152B (zh) | 一株重组传染性造血器官坏死病毒rIHNV HLJ‑09株及其构建方法和应用 | |
CN107759674A (zh) | 一种牛支原体免疫相关性蛋白、含有该蛋白的检测试剂盒及其在牛支原体抗体检测中的用途 | |
Pilchová et al. | Development and validation of a loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay for rapid detection of Glaesserella (Haemophilus) parasuis | |
CN105647918A (zh) | 抗乙肝e抗原的红色荧光抗体的制备方法 | |
Rosen et al. | Optimization of VSV‐ΔG‐spike production process with the Ambr15 system for a SARS‐COV‐2 vaccine | |
Voss et al. | Effect of ammonium chloride on plasmid DNA production in high cell density batch culture for biopharmaceutical use | |
Nickles et al. | Comprehensive guide to extracting and expressing fungal secondary metabolites with Aspergillus fumigatus as a case study | |
Liu et al. | Constructing an Antibiotic-Free Protein Expression System for Ovalbumin Biosynthesis in Probiotic Escherichia coli Nissle 1917 | |
Kamusoko et al. | Purification and Amplification of DNA from cellulolytic Bacteria: Application for Biogas production from crop residues | |
CN105524167A (zh) | 抗乙肝e抗原的绿色荧光抗体的制备方法 | |
CN105566440A (zh) | 基于nbdk的定点荧光标记方法 | |
CN114214338A (zh) | 猪源piv5全长感染性克隆及其制备方法和应用 | |
Kumar et al. | Isolation, Screening and Identification of Potential Thermo Stable Bacterial Enzyme Producers in Sangameshwar, Tural Hot Spring. | |
Pourmasoumi et al. | Screening megasynthetase mutants at high throughput using droplet microfluidics | |
CN116676275B (zh) | A基因型嵌合腮腺炎病毒株和制备方法及用途 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
C06 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
WD01 | Invention patent application deemed withdrawn after publication |
Application publication date: 20160608 |
|
WD01 | Invention patent application deemed withdrawn after publication |