SAV1基因作为子宫肌瘤诊治标志物的用途
技术领域
本发明涉及生物技术领域,具体地涉及SAV1基因在子宫肌瘤的诊断、治疗中的用途。
背景技术
子宫肌瘤是妇科最常见的良性肿瘤,虽然大多数子宫肌瘤无明显症状,且很少恶变,不需或暂时不需治疗,但有症状的子宫肌瘤患者,或子宫肌瘤体积大的患者是应该治疗的,手术治疗是主要的治疗方法。因此,对这些患者术前应该诊断确切。因为子宫肌瘤与以下一些疾病,包括妊娠、子宫肥大症、子宫肉瘤、子宫慢性内翻、子宫畸形及盆腔炎性肿块容易混肴,因此,需要对上述疾病进行鉴别。现有技术中用于对上述疾病进行鉴别的方式多为仪器检查或者依照医生的经验,因此检测方法存在灵敏性和特异性的缺陷。因此,需要寻找一种能够诊断子宫肌瘤的特异性的标志物。
发明内容
为了克服现有技术的不足,本发明的目的在于提供一种可用于子宫肌瘤早期诊断的分子标志物。使用基因标志物来诊断子宫肌瘤具有及时性、特异性和灵敏性,从而使患者在疾病早期就能知晓疾病风险,针对风险高低,采取相应的预防和治疗措施。
为了实现上述目的,本发明采用如下技术方案:
本发明提供了检测SAV1基因表达的产品在制备诊断子宫肌瘤的工具中的应用。
进一步,所述检测SAV1基因表达的产品包括检测SAV1基因mRNA水平的产品、和/或检测SAV1蛋白水平的产品。
进一步,所述检测SAV1基因表达的产品包括:通过RT-PCR、实时定量PCR、免疫检测、原位杂交或芯片检测SAV1基因及其表达产物的表达水平以诊断子宫肌瘤的产品。
进一步,所述用RT-PCR诊断子宫肌瘤的产品至少包括一对特异扩增SAV1基因的引物;所述用实时定量PCR诊断子宫肌瘤的产品至少包括一对特异扩增SAV1基因的引物;所述用免疫检测诊断子宫肌瘤的产品包括:与SAV1蛋白特异性结合的抗体;所述用原位杂交诊断子宫肌瘤的产品包括:与SAV1基因的核酸序列杂交的探针;所述用芯片诊断子宫肌瘤的产品包括:蛋白芯片和基因芯片;其中,蛋白芯片包括与SAV1蛋白特异性结合的抗体,基因芯片包括与SAV1基因的核酸序列杂交的探针。
所述用实时定量PCR诊断子宫肌瘤的产品至少包括的一对特异扩增SAV1基因的引物如SEQIDNO.3和SEQIDNO.4所示。
所述检测SAV1基因表达的产品可以是检测SAV1基因表达的试剂、也可以是包含所述试剂的试剂盒、芯片、试纸等,也可以是使用所述试剂的高通量测序平台。
所述诊断子宫肌瘤的工具包括但不限于芯片、试剂盒、试纸、或高通量测序平台;高通量测序平台是一种特殊的诊断子宫肌瘤的工具,随着高通量测序技术的发展,对一个人的基因表达谱的构建将成为十分便捷的工作。通过对比疾病患者和正常人群的基因表达谱,容易分析出哪个基因的异常与疾病相关。因此,在高通量测序中获知SAV1基因的异常与子宫肌瘤相关也属于SAV1基因的用途,同样在本发明的保护范围之内。
本发明还提供了一种诊断子宫肌瘤的工具,所述工具包括检测SAV1基因表达的试剂;所述试剂包括检测SAV1基因mRNA的引物和/或探针、检测SAV1蛋白的抗体。
所述工具包括但不限于芯片、试剂盒、试纸、或高通量测序平台。
其中,所述芯片包括基因芯片、蛋白质芯片;所述基因芯片包括固相载体以及固定在固相载体的寡核苷酸探针,所述寡核苷酸探针包括用于检测SAV1基因转录水平的针对SAV1基因的寡核苷酸探针;所述蛋白质芯片包括固相载体以及固定在固相载体的SAV1蛋白的特异性抗体;所述基因芯片可用于检测包括SAV1基因在内的多个基因(例如,与子宫肌瘤相关的多个基因)的表达水平。所述蛋白质芯片可用于检测包括SAV1蛋白在内的多个蛋白质(例如与子宫肌瘤相关的多个蛋白质)的表达水平。通过将多个与子宫肌瘤的标志物同时检测,可大大提高子宫肌瘤诊断的准确率。
其中,所述试剂盒包括基因检测试剂盒和蛋白免疫检测试剂盒;所述基因检测试剂盒包括用于检测SAV1基因转录水平的试剂;所述蛋白免疫检测试剂盒包括SAV1蛋白的特异性抗体。进一步,所述试剂包括使用RT-PCR、实时定量PCR、免疫检测、原位杂交或芯片方法检测SAV1基因表达水平过程中所需的试剂。优选度,所述试剂包括针对SAV1基因的引物和/或探针。根据SAV1基因的核苷酸序列信息容易设计出可以用于检测SAV1基因表达水平的引物和探针。
所述试纸包括检测SAV1基因表达的试剂。
所述高通量测序平台包括检测SAV1基因表达的试剂。
与SAV1基因的核酸序列杂交的探针可以是DNA、RNA、DNA-RNA嵌合体、PNA或其它衍生物。所述探针的长度没有限制,只要完成特异性杂交、与目的核苷酸序列特异性结合,任何长度都可以。所述探针的长度可短至25、20、15、13或10个碱基长度。同样,所述探针的长度可长至60、80、100、150、300个碱基对或更长,甚至整个基因。由于不同的探针长度对杂交效率、信号特异性有不同的影响,所述探针的长度通常至少是14个碱基对,最长一般不超过30个碱基对,与目的核苷酸序列互补的长度以15-25个碱基对最佳。所述探针自身互补序列最好少于4个碱基对,以免影响杂交效率。
进一步,所述SAV1蛋白的特异性抗体包括单克隆抗体、多克隆抗体。所述SAV1蛋白的特异性抗体包括完整的抗体分子、抗体的任何片段或修饰(例如,,嵌合抗体、scFv、Fab、F(ab’)2、Fv等。只要所述片段能够保留与SAV1蛋白的结合能力即可。用于蛋白质水平的抗体的制备时本领域技术人员公知的,并且本发明可以使用任何方法来制备所述抗体。
在本发明的具体实施方案中,所述检测SAV1基因mRNA的引物包括SEQIDNO.3和SEQIDNO.4所示的引物对。
本发明还提供了SAV1基因和/或其表达产物的促进剂在制备治疗子宫肌瘤的药物中的应用。
所述促进剂包括促进SAV1基因表达的试剂和促进SAV1基因表达产物的试剂;所述促进SAV1基因表达的试剂包括促进基因转录的试剂、促进基因翻译的试剂、促进SAV1蛋白含量的试剂;所述促进SAV1基因表达产物的试剂包括促进SAV1基因表达产物稳定性的试剂、促进SAV1基因表达产物活性的试剂、促进SAV1基因表达产物功能的试剂。
具体地,所述促进SAV1基因表达的试剂包括:含有SAV1基因的试剂、携带SAV1基因的载体或宿主细胞所形成的试剂、含有SAV1蛋白质的试剂。
本发明的促进剂一方面可以用于补充内源性的SAV1蛋白的缺失或不足,通过提高SAV1蛋白的表达,从而治疗因SAV1蛋白缺乏导致的子宫肌瘤。另一方面可以用于促进SAV1蛋白的活性或者功能,从而治疗子宫肌瘤。
本发明所述携带基因的载体是本领域已知的各种载体,如市售的载体、包括质粒、粘粒、噬菌体、病毒等。
在本发明中,术语“宿主细胞”包括原核细胞和真核细胞。常用的原核宿主细胞的例子包括大肠杆菌、枯草杆菌等。常用的真核宿主细胞包括酵母细胞、昆虫细胞和哺乳动物细胞。较佳地,该宿主细胞是真核细胞,如CHO细胞、COS细胞等。
本发明还提供了一种用于治疗子宫肌瘤的药物组合物,所述药物组合物包括上面所述的SAV1基因和/或其表达产物的促进剂。
进一步,本发明的药物还包括药学上可接受的载体,载体,这类载体包括(但并不限于):稀释剂、赋形剂如水等、填充剂如淀粉、蔗糖等;粘合剂如纤维素衍生物、藻酸盐、明胶和聚乙烯吡咯烷酮;湿润剂如甘油;崩解剂如琼脂、碳酸钙和碳酸氢钠;吸收促进剂季铵化合物;表面活性剂如十六烷醇;吸附载体如高岭土和皂粘土;润滑剂如滑石粉、硬脂酸钙和镁、聚乙二醇等。
本发明的药物导入组织或者细胞的方式可以分为体外或者体内的方式。体外方式包括将含有SAV1基因的药物或者含有SAV1蛋白质的药物导入细胞中,再将细胞移植或回输到体内。体内方式包括直接将含有SAV1基因的药物或者含有SAV1蛋白质的药物注入体内组织中。
本发明的药物还可与其他治疗子宫肌瘤的药物联用,多种药物联合使用可以大大提到治疗的成功率。
在本发明的上下文中,“SAV1基因”包括SAV1基因以及SAV1基因的任何功能等同物的多核苷酸。SAV1基因包括与目前国际公共核酸序列数据库GeneBank中SAV1基因(NC_000014.9)DNA序列具有70%以上同源性,且编码相同功能蛋白质的DNA序列;
优选地,SAV1基因的编码序列包括以下任一一种DNA分子:
(1)序列表中SEQIDNO.1所示的DNA序列;
(2)在严格条件下与1)限定的DNA序列杂交且编码相同功能蛋白质的DNA序列;
(3)与(1)或(2)限定的DNA序列具有70%、优选地,90%以上同源性,且编码相同功能蛋白质的DNA分子。
在本发明的具体实施方案中,所述SAV1基因的编码序列是SEQIDNO.1所示的DNA序列。
在本发明的上下文中,SAV1基因表达产物包括SAV1蛋白以及SAV1蛋白的部分肽。所述SAV1蛋白的部分肽含有与子宫肌瘤相关的功能域。
“SAV1蛋白”包括SAV1蛋白以及SAV1蛋白的任何功能等同物。所述功能等同物包括SAV1蛋白保守性变异蛋白质、或其活性片段,或其活性衍生物,等位变异体、天然突变体、诱导突变体、在高或低的严紧条件下能与SAV1的DNA杂交的DNA所编码的蛋白质。
优选地,SAV1蛋白是具有下列氨基酸序列的蛋白质:
(1)由序列表中SEQIDNO.2所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
(2)将SEQIDNO.2所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且与SEQIDNO.2所示的氨基酸序列具有相同功能的由SEQIDNO.2所示的氨基酸序列衍生的蛋白质。取代、缺失或者添加的氨基酸的个数通常为1-50个,较佳地1-30个,更佳地1-20个,最佳地1-10个。
(3)与SEQIDNO.2所示的氨基酸序列具有至少80%同源性(又称为序列同一性),更优选地,与SEQIDNO.2所示的氨基酸序列至少约90%至95%的同源性,常为96%、97%、98%、99%同源性的氨基酸序列构成的多肽。
在本发明的具体实施方案中,所述SAV1蛋白是具有SEQIDNO.2所示的氨基酸序列的蛋白质。
通常,已知的是,一个蛋白质中一个或多个氨基酸的修饰不会影响蛋白质的功能。本领域技术人员会认可改变单个氨基酸或小百分比的氨基酸或对氨基酸序列的个别添加、缺失、插入、替换是保守修饰,其中蛋白质的改变产生具有相似功能的蛋白质。提供功能相似的氨基酸的保守替换表是本领域公知的。
通过添加一个氨基酸或多个氨基酸残基修饰的蛋白质的例子是SAV1蛋白的融合蛋白。对于与SAV1蛋白融合的肽或者蛋白质没有限制,只要所得的融合蛋白保留SAV1蛋白的生物学活性即可。
本发明的SAV1蛋白也包括对SEQIDNO.2所示的氨基酸序列的非保守修饰,只要经过修饰的蛋白质仍然能够保留SAV1蛋白的生物学活性即可。在此类修饰蛋白质中突变的氨基酸数目通常是10个或者更少,例如6个或者更少,例如3个或者更少。
在本发明的上下文中,“诊断子宫肌瘤”既包括判断受试者是否已经患有子宫肌瘤、也包括判断受试者是否存在患有子宫肌瘤的风险。
在本发明的上下文中,“治疗子宫肌瘤”从疾病的状态变化来分,可以包括疾病的缓解、疾病的完全治愈。
本发明的优点和有益效果:
本发明首次发现了SAV1基因表达与子宫肌瘤相关,通过检测受试者子宫组织中SAV1的表达,可以判断受试者是否患有子宫肌瘤、或者判断受试者是否存在患有子宫肌瘤的风险,从而指导临床医师给受试者提供预防方案或者治疗方案。
本发明发现了一种新的分子标记物-SAV1基因,相比传统的检测手段,基因诊断更及时、更特异、更灵敏,能够实现子宫肌瘤的早期诊断。
附图说明
图1显示利用QPCR检测SAV1基因在子宫组织中的表达情况;
图2显示利用Westernblot检测SAV1蛋白在子宫组织中的表达情况;
图3显示利用QPCR在转录水平上检测SAV1基因的过表达情况;
图4显示利用Westernblot检测SAV1蛋白的过表达情况;
图5显示利用MTT实验检测SAV1基因表达对子宫肌瘤细胞增殖的影响。
具体的实施方式
下面结合附图和实施例对本发明作进一步详细的说明。以下实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件,例如Sambrook等人,分子克隆:实验室手册(NewYork:ColdSpringHarborLaboratoryPress,1989)中所述的条件,或按照制造厂商所建议的条件。
实施例1正常肌层组织和子宫肌瘤组织中SAV1基因的表达差异
1、实验材料:
无菌取因子宫肌瘤行全子宫切除术者的子宫肌瘤组织和邻近的正常肌层组织,患者在术前3个月内未接受过激素治疗,术后均经病理确诊为子宫肌瘤,本实验材料取自40例子宫肌瘤患者,患者年龄在25-45岁间。
2、在转录水平上检测SAV1基因的差异表达
2.1组织RNA的提取(利用NorgenRNA提取试剂盒)
1)在较少RNase干扰的清洁区,使用含适量液氮的研钵称取离体组织样本约20mg,用杵棒研磨至粉末状;
2)将样本转移到一个不含RNA酶的2mL的离心管中;
3)加入300μLLysissolution,置于匀浆器内,充分研磨1-5min;
4)12000g,4℃,离心10min,转移上清至新的1.5mL的离心管中;
5)加入600μlRNase-FreeWater,用漩涡器混匀;
6)加入20μl蛋白酶K,在55℃温浴15min,不断涡旋混匀;
7)14000g,室温,离心1min,使细胞碎片沉淀于离心管底部,取上清转移到另外一个不含RNA酶1.5mL的离心管中;
8)加入450μl的95%乙醇,涡旋混匀;
RNA吸附:
9)取650μl含乙醇的裂解液加到离心柱中,14000g离心1min;
10)弃下层,重置收集管于柱上;
11)依照裂解液的容量,重复9)~10)步;
12)加入400μlWashsolution,14000g离心2min;
13)弃下层,将柱置于一新的收集管上;
DNase处理:
14)加入100μlEnzymeIncubationBuffer和15μlDNaseI,14000g离心1min;
15)将收集管中的溶液重新移入柱中;
16)室温放置15min;
RNA洗涤:
17)加入400μlWashsolution,14000g离心1min,弃下层,重置收集管于柱上;
18)加入400μlWashsolution,14000g离心2min,弃收集管;
RNA洗脱:
19)把柱子放入1.7mLElution管中;
20)加入30μlElutionBuffer;
21)200g离心2min,使溶液充分与柱结合,然后14000g离心1min。
2.2逆转录
利用TAKARA公司的逆转录试剂盒进行RNA的逆转录。
2.3QPCR
(1)引物设计
根据Genbank中SAV1基因和GAPDH基因的编码序列设计QPCR扩增引物,由上海生工生物工程技术服务有限公司合成。具体引物序列如下:
SAV1基因:
正向引物为5’-TGGTTCTTCTCAGTCATT-3’(SEQIDNO.3);
反向引物为5’-ATTCATAATATCTGTAGTCTTCAT-3’(SEQIDNO.4),
GAPDH基因:
正向引物为5’-TTTAACTCTGGTAAAGTGGATAT-3’(SEQIDNO.5);
反向引物为5’-GGTGGAATCATATTGGAACA-3’(SEQIDNO.6)。
(2)按照表1配制PCR反应体系:
其中,SYBRGreen聚合酶链式反应体系购自Invitrogen公司。
表1PCR反应体系
试剂 |
体积 |
正向引物 |
1μl |
反向引物 |
1μl |
SYBR Green聚合酶链式反应体系 |
12.5μl |
模板 |
2μl |
去离子水 |
补足25μl |
(3)PCR反应条件:95℃10min,(95℃15s,60℃40s)*45个循环。以SYBRGreen作为荧光标记物,在LightCycler荧光定量PCR仪上进行PCR反应,通过融解曲线分析和电泳确定目的条带,ΔΔCT法进行相对定量。
2.4统计学方法
实验都是按照重复3次来完成的,结果数据都是以平均值±标准差的方式来表示,采用SPSS13.0统计软件来进行统计分析的,不同组之间的差异采用t检验,认为当P<0.05时具有统计学意义。
2.5结果
结果如图1所示,与正常肌层组织相比,子宫肌瘤组织中SAV1基因的mRNA水平显著降低,差异具有统计学意义(P<0.05)。
3、在蛋白水平上检测SAV1基因的差异表达
3.1提取组织总蛋白
按照EpiQuik组织/细胞总蛋白提取试剂盒的说明书进行蛋白提取的操作。
3.2Westernblot检测
将提取的蛋白定量进行SDS-PAGE电泳,之后进行转膜、封闭、一抗孵育、二抗孵育、显色。
3.3统计学处理
将蛋白条带的灰度值使用ImageJ软件进行分析,以β-actin为内参,将目的白条带的灰度值进行归一化处理。结果数据都是以平均值±标准差的方式来表示,采用SPSS13.0统计软件来进行统计分析的,两者之间的差异采用t检验,认为当P<0.05时具有统计学意义。
3.4结果
结果如图2所示,与正常肌层组织相比,子宫肌瘤组织中SAV1蛋白含量降低,差异具有统计学意义(P<0.05)。
实施例2SAV1基因表达质粒构建
1、SAV1基因表达载体的构建
根据SAV1基因的编码序列(如SEQIDNO.1所示)设计扩增引物。从成人胎脑的cDNA文库(clontech公司,货号:638831)中扩增全长的SAV1基因的编码序列,将上述cDNA序列插入真核细胞表达载体pcDNA3.1中,连接获得的重组载体pcDNA3.1-SAV1用于后续实验。
2、子宫肌瘤细胞的培养与转染
手术切除子宫肌瘤后,立即在无菌条件下取每例子宫肌瘤组织1cm,置于10mL3%双抗(青、链霉素)的PBS中,密闭冰浴尽快送入细胞培养室。子宫肌瘤组织用3%双抗的PBS液漂洗,在含有DMEM培养液的平皿中修剪成1mm;大小的组织块。将剪碎的组织小块用弯头吸管送入培养瓶中,每小块间距2.0-3.0mm左右。组织块摆好后,将培养液吸出,轻轻将培养瓶翻转,让瓶底朝上,向瓶内注入含15%胎牛血清的DMEM培养液2mL,盖好瓶盖,将培养瓶倒置放在37℃、5%CO2培养箱内。4h后,将培养瓶慢慢翻转平放,静置培养。每2-3d换液1次。待细胞达80%融合时,用0.25%胰蛋白酶消化传代。
取第3-4代子宫肌瘤细胞按1×104/孔接种到24孔细胞培养板中,在37℃、5%CO2培养箱中细胞培养24h,转染按照脂质体转染试剂2000(购自于Invitrogen公司)的说明书转染,实验分为对照组(转染pcDNA3.1)和实验组(转染pcDNA3.1-SAV1),转染质粒的工作浓度是0.5μg/ml。
3、利用QPCR实验检测质粒转染的效果。
3.1提取细胞总RNA利用常规方法进行操作。
3.2逆转录
步骤同实施例1。
3.3QPCR
步骤同实施例1。
3.4统计学方法
实验都是按照重复3次来完成的,结果数据都是以平均值±标准差的方式来表示,采用SPSS13.0统计软件来进行统计分析的,两组之间的差异采用t检验,认为当P<0.05时具有统计学意义。
4、Western检测
具体步骤同实施例1。
5、结果
如图3所示,与转染pcDNA3.1空载体的细胞相比,转染pcDNA3.1-SAV1的细胞中SAV1的mRNA水平显著上调,差异具有统计学意义(P<0.05);如图4所示,与转染pcDNA3.1空载体的细胞相比,转染pcDNA3.1-SAV1的细胞中SAV1的蛋白水平显著上调,差异具有统计学意义(P<0.05)。
实施例3SAV1基因对子宫肌瘤细胞增殖的影响
采用MTT实验检测SAV1基因对子宫肌瘤细胞增殖能力影响。
1、步骤:各组细胞转染12h后胰酶消化,制成单细胞悬液,以每孔6000个细胞接种于96孔培养板中,每组分7个时间点,每个时间点设6个复孔。细胞贴壁后,进行第1次检测:每孔加入5g/L的MTT液20μl,继续培养4h后,吸去培养基,加入DMSO150μl,细心吹打,使紫蓝色沉淀充分溶解,用酶标仪在490nm波长测吸光度值(A值)。然后每12h检测1次,连续测72h,共7次。本实验重复3次。
2、统计学方法
实验都是按照重复3次来完成的,采用SPSS13.0统计软件来进行统计分析的,两组之间的差异采用t检验,认为当P<0.05时具有统计学意义。
3、结果
图5所示的结果显示:转染pcDNA3.1-SAV1组的细胞生长速度明显低于转染pcDNA3.1空载体组的细胞生长速度,差异具有统计学意义(P<0.05)上述结果表明SAV1表达能够抑制子宫肌瘤细胞的生长。
实施例4SAV1基因对子宫肌瘤细胞周期的影响
使用流式细胞仪检测细胞周期,在此过程中使用的PI单染试剂购自美国BD公司产品。
1、步骤:各组细胞转染48h后胰酶消化,制成单细胞悬液,PBS洗涤2次,70%的乙醇固定过夜。按操作说明加相应试剂,避光放置30min,流式细胞仪检测各组细胞周期。
2、统计学方法
实验都是按照重复3次来完成的,结果数据都是以平均值±标准差的方式来表示,采用SPSS13.0统计软件来进行统计分析的,两组之间的差异采用t检验,认为当P<0.05时具有统计学意义。
3、结果
如表2中显示的结果,与转染pcDNA3.1空载体组细胞相比,转染pcDNA3.1-SAV1组细胞处于G1期的细胞明显增多,处于S期的细胞明显减少。上述结果表明,SAV1基因表达能够抑制细胞周期。
表2细胞转染后细胞周期变化(百分比)
组别 |
G1期 |
G2期 |
S期 |
转染pcDNA3.1空载体组 |
28.54±1.08 |
15.07±0.47 |
56.39±0.42 |
转染pcDNA3.1-SAV1 |
58.47±1.75* |
14.97±1.57 |
26.56±1.18* |
注:与转染pcDNA3.1空载体组相比,*P<0.05。
上述实施例的说明只是用于理解本发明的方法及其核心思想。应当指出,对于本领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明原理的前提下,还可以对本发明进行若干改进和修饰,这些改进和修饰也将落入本发明权利要求的保护范围内。