CN105399721B - 新化合物及其制备方法和在制备抗菌抗肿瘤药物中的应用 - Google Patents

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Abstract

本发明公开了链霉菌、新化合物及其制备方法和在制备抗菌抗肿瘤药物中的应用。该链霉菌Streptomyces sp.SCSIO 10428能够产生三种napyradiomycins类新抗生素化合物4‑dehyd ro‑4a‑dechloronapyradiomycin A1(1)、3‑dechloro‑3‑bromonapyradiomycin A1(2)和3‑chloro‑6,8‑dihydroxy‑8‑α‑lapachone(3)。这类化合物具有较强的拮抗革兰氏阳性细菌作用,能够用于制备抗革兰氏阳性细菌药物;同时能够用于制备抗肿瘤药物。因此本发明为制备具有抗菌和抗肿瘤活性的napyradiomycins类新抗生素化合物4‑dehydro‑4a‑dechloronapyradiomycin A1(1),3‑dechloro‑3‑bromonapyradiomycin A1(2)和3‑chloro‑6,8‑dihydroxy‑8‑α‑lapachone(3)提供了一种新的方法,为开发高效、低毒的抗菌抗肿瘤药物提供了理想的侯选化合物。

Description

新化合物及其制备方法和在制备抗菌抗肿瘤药物中的应用
本分案申请是专利申请号为:201310180810.5,发明名称为:链霉菌、新化合物及其制备方法和在制备抗菌抗肿瘤药物中的应用,申请日为:2013年05月15日的专利申请的分案申请。
技术领域:
本发明属于工业微生物领域,具体涉及一株能够产生多个napyradiomycins类新抗生素化合物的海洋来源链霉菌Streptomyces sp.SCSIO 10428,以及利用该菌生产的napyradiomycins类新化合物及其制备方法和在制备抗菌抗肿瘤药物中的应用。
背景技术:
近年来,发现新型海洋放线菌资源,并从中筛选新型的活性次生代谢产物成为国际上海洋微生物研究的重要方向。从海洋放线菌中寻找结构新颖、高效、低毒的代谢产物逐渐成为药物寻找的新源泉。
发明内容:
本发明的第一个目的是提供一株海洋来源的链霉菌Streptomyces sp.SCSIO10428,该菌于2013年5月6日保藏于中国典型培养物保藏中心(CCTCC),地址:中国武汉市武汉大学,其保藏编号为:CCTCC NO.M 2013186。
本发明的海洋来源的链霉菌Streptomyces sp.SCSIO 10428是从广西北海斜阳岛海域的海底沉积物中分离获得的。常规方法提取其16S rRNA,其16S rRNA序列如SEQ IDNO.1所示,将16S rRNA进行BLAST比对,并进行系统发育树分析,系统发育树如图1所示。由此该菌株被鉴定为链霉菌Streptomyces sp.SCSIO 10428,该菌于2013年5月6日保藏于中国典型培养物保藏中心(CCTCC),地址:中国武汉市武汉大学,其保藏编号为:CCTCC NO.M2013186。
本发明发现海洋来源的链霉菌Streptomyces sp.SCSIO 10428能够产生多种napyradiomycins类新抗生素化合物,包括4-去氢-4a-去氯纳皮拉霉素A1(1),3-dechloro-3-bromonapyradiomycin A1(2)和3-氯-6,8-二羟基-8-α-拉帕醌(3)。
本发明的第二个目的是提供三种新的具有抗菌和细胞毒活性的napyradiomycins类抗生素4-去氢-4a-去氯纳皮拉霉素A1(1),3-dechloro-3-bromonapyradiomycin A1(2)和3-氯-6,8-二羟基-8-α-拉帕醌(3),其结构如式(I)所示:
当R1=Cl,R2=H,R3=No H,R4=geranyl时为4-去氢-4a-去氯纳皮拉霉素A1,当R1=Br,R2=H2,R3=Cl,R4=geranyl时为3-dechloro-3-bromonapyradiomycin A1,当R1=Cl,R2=H2,R3=No H,R4=No H时为3-氯-6,8-二羟基-8-α-拉帕醌。
本发明的第三个目的是提供一种4-去氢-4a-去氯纳皮拉霉素A1(1),3-dechloro-3-bromonapyradiomycin A1(2)和3-氯-6,8-二羟基-8-α-拉帕醌(3)的制备方法。
本发明的4-去氢-4a-去氯纳皮拉霉素A1(1),3-dechloro-3-bromonapyradiomycin A1(2)和3-氯-6,8-二羟基-8-α-拉帕醌(3)是从链霉菌Streptomyces sp.SCSIO 10428的发酵培养物中制备分离得到的。
本发明优选通过以下方法从链霉菌Streptomyces sp.SCSIO 10428的发酵培养物中制备得到4-去氢-4a-去氯纳皮拉霉素A1(1),3-dechloro-3-bromonapyradiomycin A1(2)和3-氯-6,8-二羟基-8-α-拉帕醌(3),具体步骤如下:
(a)制备链霉菌Streptomyces sp.SCSIO 10428的发酵培养物;
(b)将发酵培养物的发酵液和菌丝体分离,发酵液用乙酸乙酯萃取,合并乙酸乙酯萃取液,浓缩后得到浸膏A;菌丝体先用乙醇浸提,合并浸提液,回收乙醇后剩余水混合液用乙酸乙酯萃取,乙酸乙酯萃取液浓缩后得到浸膏B,将浸膏A和浸膏B合并,得到粗提物;
(c)粗提物经硅胶柱层析,异辛烷/乙酸乙酯v/v,30/1,16/1,8/1,4/1,2/1,1/1,0/1;氯仿/甲醇v/v,1/1,0/1,梯度洗脱,收集异辛烷/乙酸乙酯体积比8/1洗脱的馏分Fr.3,收集异辛烷/乙酸乙酯体积比4/1洗脱的馏分Fr.4,收集异辛烷/乙酸乙酯体积比2/1洗脱的馏分Fr.5;
(d)将馏分Fr.3进行反相中压液相层析,乙腈/水系统梯度洗脱,40/60,65/35,80/20,82/18,84/16,86/14,93/17,96/14,100/0,v/v,依次得到9个馏分Fr.3A~Fr.3I,将馏分Fr.3I进行正相硅胶中压液相层析,正己烷/乙酸乙酯系统梯度洗脱,98/2,96/4,90/10,v/v,依次得到3个馏分Fr.3I1~Fr.3I3,将馏分Fr.3I2进行凝胶柱层析,洗脱系统为氯仿/甲醇体积比=1/1,然后对其第2个馏分Fr.3I22进行纯化后得到化合物2(3-dechloro-3-bromonapyradiomycin A1);
(e)将馏分Fr.5合并到馏分Fr.4中,将合并得到的馏分Fr.4进行反相中压液相层析,乙腈/水系统梯度洗脱,45/55,50/50,60/40,64/36,66/34,68/32,70/30,75/25,80/20,85/15,90/10,95/5,100/0,v/v,依次得到13个馏分Fr.4A~Fr.4M,将馏分Fr.4I合并到馏分Fr.3G中,然后将合并后的Fr.3G进行反相中压液相层析,乙腈/水系统梯度洗脱,60/40,70/30,70/30,75/25,80/20,85/15,85/15,85/15,90/0,v/v,依次得到9个馏分Fr.3G1~Fr.3G9,其中第2个馏分Fr.3G2即为单体化合物3(3-氯-6,8-二羟基-8-α-拉帕醌);将馏分Fr.3G7经纯化后得到化合物1(4-去氢-4a-去氯纳皮拉霉素A1)。
所述的(a)步骤的制备链霉菌SCSIO 10428的发酵培养物优选通过以下方法制备:将活化的链霉菌Streptomyces sp.SCSIO 10428接入种子培养基中,28℃,200rpm,培养72h制得种子液,将种子液以体积百分比6%的接种量接入到发酵培养基中,28℃,200rpm,振荡培养7d,而制得发酵培养物,所述的种子培养基和发酵培养基的配方为,按质量分数100%计,包括可溶性淀粉1%,细菌学蛋白胨0.2%,酵母提取物0.4%,CaCO3 0.1%,KBr0.01%,Fe2(SO4)3·4H2O 0.004%,海盐3%,余量为水,pH 7.0。按上述组份和含量混合均匀,然后121℃,灭菌30min。
本发明通过实验发现化合物4-去氢-4a-去氯纳皮拉霉素A1(1),3-dechloro-3-bromonapyradiomycin A1(2)和3-氯-6,8-二羟基-8-α-拉帕醌(3)对金黄色葡萄球菌(S.aureus ATCC 29213),枯草芽孢杆菌(B.Subtilis SCSIO BS01)和苏云金芽孢杆菌(B.thuringensis SCSIO BT01)等革兰氏阳性菌具有较强的抑制作用(化合物3对金黄色葡萄球菌S.aureus ATCC 29213除外)。其中,尤其是化合物2对这三种革兰氏阳性菌的MIC分别低至0.5,1和1μg mL-1,比阳性对照所用的抗生素ampicillin具有更强的抑菌活性。同时,结果显示化合物1-3对革兰氏阴性菌的大肠杆菌(Escherichia coli ATCC 25922)没有抑制作用。由此可见化合物4-去氢-4a-去氯纳皮拉霉素A1(1),3-dechloro-3-bromonapyradiomycin A1(2)和3-氯-6,8-二羟基-8-α-拉帕醌(3)具有较好抑制革兰氏阳性细菌活性,有望研发成为抗菌新药。
因此本发明的第四个目的是提供4-去氢-4a-去氯纳皮拉霉素A1(1),3-dechloro-3-bromonapyradiomycin A1(2)或3-氯-6,8-二羟基-8-α-拉帕醌(3)在制备抗革兰氏阳性细菌药物中的应用。
进一步优选4-去氢-4a-去氯纳皮拉霉素A1(1)或3-dechloro-3-bromonapyradiomycin A1(2)在抗金黄色葡萄球菌,枯草芽孢杆菌或苏云金芽孢杆菌药物中的应用。3-氯-6,8-二羟基-8-α-拉帕醌(3)在抗枯草芽孢杆菌或苏云金芽孢杆菌药物中的应用。
本发明通过实验发现,化合物4-去氢-4a-去氯纳皮拉霉素A1(1),3-dechloro-3-bromona pyradiomycin A1(2)对人乳腺癌细胞MCF7、人神经胶质瘤细胞SF268、人非小细胞肺癌细胞NCI-H460和人肝癌肿瘤细胞HepG2都具有中等细胞毒活性(IC50值介于10~20μM);化合物3-氯-6,8-二羟基-8-α-拉帕醌(3)对人神经胶质瘤细胞SF268具有中等细胞毒活性(IC50值约为24μM)。说明化合物4-去氢-4a-去氯纳皮拉霉素A1(1),3-dechloro-3-bromonapyra diomycin A1(2)和3-氯-6,8-二羟基-8-α-拉帕醌(3)均具有细胞毒活性,可望开发成为抗肿瘤新药。
因此,本发明的第五个目的是提供4-去氢-4a-去氯纳皮拉霉素A1(1),3-dechloro-3-bro monapyradiomycin A1(2)或3-氯-6,8-二羟基-8-α-拉帕醌(3)在制备抗肿瘤药物中的应用。
优选,化合物4-去氢-4a-去氯纳皮拉霉素A1(1)或3-dechloro-3-bromonapyradiomycin A1(2)在制备治疗人乳腺癌、人神经胶质瘤、人非小细胞肺癌或人肝癌药物中的应用。
优选,化合物3-氯-6,8-二羟基-8-α-拉帕醌(3)在制备治疗人神经胶质瘤药物中的应用。
综上可知,本发明的链霉菌Streptomyces sp.SCSIO 10428能够产生具有抗菌活性的napyradiomycins类新抗生素化合物4-去氢-4a-去氯纳皮拉霉素A1(1),3-dechloro-3-bromonapyradiomycin A1(2)和3-氯-6,8-二羟基-8-α-拉帕醌(3),这类化合物具有较强的拮抗革兰氏阳性细菌作用,能够用于制备抗革兰氏阳性细菌药物;同时,化合物1和2对人乳腺癌细胞MCF7、人神经胶质瘤细胞SF268、人非小细胞肺癌细胞NCI-H460和人肝癌肿瘤细胞HepG2都具有中等细胞毒活性,化合物3对人神经胶质瘤细胞SF268具有中等细胞毒活性,因此能够用于制备抗肿瘤药物。因此本发明为制备具有抗菌和抗肿瘤活性的napyradiomycins类新抗生素化合物4-去氢-4a-去氯纳皮拉霉素A1(1),3-dechloro-3-bromonapyradiomycin A1(2)和3-氯-6,8-二羟基-8-α-拉帕醌(3)的生产制备提供了一种新的方法,为开发高效、低毒的抗菌抗肿瘤药物提供了理想的侯选化合物。
本发明的链霉菌Streptomyces sp.SCSIO 10428于2013年5月6日保藏于中国典型培养物保藏中心(CCTCC),地址:中国武汉市武汉大学,其保藏编号为:CCTCC NO.M2013186。
附图说明:
图1是链霉菌Streptomyces sp.SCSIO 10428基于16S rDNA构建的系统发育树;
图2是化合物1-3的关键1H-1H COSY和HMBC相关核磁谱图。
具体实施方式:
以下实施例是对本发明的进一步说明,而不是对本发明的限制。
实施例1:链霉菌Streptomyces sp.SCSIO 10428的分离和鉴定
本发明的海洋来源的链霉菌Streptomyces sp.SCSIO 10428是从广西北海斜阳岛海域的海底沉积物中分离获得的。常规方法提取其16S rRNA,其16S rRNA序列如SEQ IDNO.1所示,将16S rRNA进行BLAST比对,并进行系统发育树分析,系统发育树如图1所示。由此该菌株被鉴定为链霉菌Streptomyces sp.SCSIO 10428,该菌于2013年5月6日保藏于中国典型培养物保藏中心(CCTCC),地址:中国武汉市武汉大学,其保藏编号为:CCTCC NO.M2013186。
实施例2:活性代谢产物的分离和制备
1、种子培养基(发酵培养基):按总质量分数100%计,包括可溶性淀粉1%,细菌学蛋白胨0.2%,酵母提取物0.4%,CaCO3 0.1%,KBr 0.01%,Fe2(SO4)3·4H2O 0.004%,海盐3%,余量为水,pH 7.0。按上述组份和含量混合均匀,然后121℃,灭菌30min。
2、发酵
2.1、种子培养:将活化的链霉菌Streptomyces sp.SCSIO 10428接入每瓶含有50mL种子培养基的250mL的锥形培养瓶中,28℃,200rpm,培养72h制得种子液。
2.2、发酵培养:将种子液以6%的接种量(体积百分比)接入到20L发酵培养基中,28℃,200rpm,振荡培养7d,而制得发酵培养物。
3、萃取:发酵培养物经离心(3500r·min-1,10min)将发酵液和菌丝体分离,发酵液用乙酸乙酯萃取4次,合并乙酸乙酯萃取液,减压蒸馏浓缩后得到浸膏A(8.5g);菌丝体先用乙醇在室温下浸提3次,合并浸提液,减压回收乙醇后剩余水混合液用乙酸乙酯萃取,乙酸乙酯萃取液减压蒸馏浓缩后得到浸膏B(7.5g),将浸膏A和浸膏B合并,得到粗提物(16.0g)。
4、活性化合物的提取分离和鉴定
将浸膏A和浸膏B合并的粗提物(16.0g)用35g硅胶(100~200目)进行拌样,经硅胶柱梯度洗脱(异辛烷/乙酸乙酯,30/1,16/1,8/1,4/1,2/1,1/1,0/1;氯仿/甲醇,1/1,0/1,v/v,每个梯度洗脱400mL),依次得到9个馏分(Fr.1~Fr.9)。将馏分Fr.3(3g,异辛烷/乙酸乙酯体积比8/1洗脱的馏分)进行C18反相中压液相层析(柱型35x 3cm,乙腈/水系统梯度洗脱,40/60,65/35,80/20,82/18,84/16,86/14,93/17,96/14,100/0,v/v,每个梯度洗脱600mL),依次得到9个馏分(Fr.3A~Fr.3I)。将馏分Fr.3I(367mg,乙腈/水体积比100/0洗脱的馏分)进行正相硅胶中压液相层析(预制硅胶柱40~60μm,6nm,12g,正己烷/乙酸乙酯系统梯度洗脱,98/2,96/4,90/10,v/v),依次得到3个馏分(Fr.3I1~Fr.3I3)。将馏分Fr.3I2(258mg,正己烷/乙酸乙酯体积比96/4洗脱的馏分)进行凝胶柱层析(Sephadex LH-20),洗脱系统为氯仿/甲醇体积比=1/1,然后对其第2个馏分Fr.3I22(107mg)进行半制备高效液相层析(Angilent Chemstation,反相柱Phenomenex,Luna 5μPhenyl-Hexyl,250x10mm,5μm,10nm;溶剂A相,超纯水;溶剂B相,乙腈;80%B相恒梯度洗脱,3.0mL min-1),得到化合物2(8.3mg,保留时间为26.8min)。将馏分Fr.5(异辛烷/乙酸乙酯体积比2/1洗脱的馏分)合并到馏分Fr.4(异辛烷/乙酸乙酯体积比4/1洗脱的馏分),将合并得到的馏分Fr.4(3.7g)进行C18反相中压液相层析(柱型35x 3cm,乙腈/水系统梯度洗脱,45/55,50/50,60/40,64/36,66/34,68/32,70/30,75/25,80/20,85/15,90/10,95/5,100/0,v/v,每个梯度洗脱600mL),依次得到13个馏分(Fr.4A~Fr.4M)。将馏分Fr.4I(472.0mg,乙腈/水体积比80/20洗脱的馏分)合并到馏分Fr.3G(1.7g,乙腈/水体积比93/17洗脱的馏分),然后将合并后的Fr.3G进行C18反相中压液相层析(柱型35x 3cm,乙腈/水系统梯度洗脱,60/40,70/30,70/30,75/25,80/20,85/15,85/15,85/15,90/0,v/v,每个梯度洗脱720mL),依次得到9个馏分(Fr.3G1~Fr.3G9),其中第2个馏分(Fr.3G2,乙腈/水体积比70/30洗脱的馏分)即为单体化合物3(13.0mg)。将得到的馏分Fr.3G7(568.0mg,乙腈/水体积比85/15洗脱的馏分)取一部分(200.0mg)进行半制备高效液相层析(Hitachi Model D-2000Elite station,反相柱Phenomenex,Gemini 5μC18,250x 10mm,5μm,11nm;溶剂A相,超纯水;溶剂B相,乙腈;90%B相恒梯度洗脱,3.0mL min-1),得到化合物1(8.0mg,保留时间为29.5min)。
结构鉴定:
化合物1:淡黄色油状,其核磁数据归属如表1所示;(c 0.30,MeOH);UV(MeOH)λmax(logε):202(4.61),257(4.39),312(4.09),362(4.15)nm;IRνmax 3294,2920,1701,1616,1373,1261,1145,802cm-1;高分辨质谱HRESIMS m/z C25H29ClO5(实测值[M+Na]+467.1595,计算值为467.1596),不饱和度为9。化合物1的红外光谱IR在波长3294cm–1处有宽带吸收,表明分子中含有多个羟基官能团,在波长1701cm–1处有吸收,表明分子中含有共轭的羰基官能团。紫外吸收光谱UV在257,312和362nm处分别有最大吸收波长,表明该化合物中含有芳环等官能团。氢谱中存在以下信号:1个活泼羟基(δH 12.57),3个芳环次甲基质子(δH 7.19,6.92和6.71),两个烯烃质子(δH 5.02和4.98),一个连接氯原子的的次甲基质子(δH 4.39),三个亚甲基质子(δH 2.48,2.00和1.94),以及5个脂肪链甲基质子(δH 1.68,1.58,1.53,1.44和1.09)。碳谱中存在以下信号:2个羰基碳(δC 195.4和188.6),2个酚羟基碳(δC 165.5和164.0),10个sp2杂化的次甲基碳或者季碳(化学位移值在δC 141.7与108.4之间),一个连氧季碳(δC83.3),一个连氯季碳(δC 59.6),以及其他8个sp3杂化的亚甲基或甲基碳(化学位移值低于δC40),化合物1的氢谱碳谱特征显示其与napyradiomycins类抗生素化合物极其相似。仔细比较化合物1的波谱数据与已知化合物napyradiomycin A1[Shiomi,K.;Nakamura,H.;Iinuma,H.;Naganawa,H.;Isshiki,K.;Takeuchi,T.;Umezawa,H.,Structures of new antibiotics napyradiomycins.J.Antibiot.1986,39,494-501.],发现二者基本相同,除了以下差别:化合物1在分子式中少了一分子的HCl,同时多了一个不饱和度。在核磁波谱中,化合物1在C-4位与C-4a之间多了一个双键存在:在氢谱中,化合物1在H-4位多出了一个烯氢质子(δH 6.92),同时缺失了一组亚甲基质子(δH 2.48和2.41);在碳谱中,化合物1在C-4位和C-4a位分别多出一个烯碳(δC 136.9,CH和137.1,C),而缺失了一个亚甲基碳(C-4位,δC 42.9,CH2)和一个季碳(C-4a位,δC 79.2,C)。进一步,这个结构片段的差别也可以从以下的HMBC(图2)得到确证:从H-4到C-4a/C-5/C-10a/C-2以及从H-3到C-4的相关。通过这些波谱数据,化合物1的平面结构得以确定如式(II)中的1所示,命名为4-dedydro-4a-dechloronapyradiomycin A1。对于化合物1的立体构型,虽然没有实验数据进行直接证明,但是我们推测其绝对构型可能为(3R,10aR),这主要基于以下两点证据:(i),迄今为止已经报道过的napyradiomycins类抗生素化合物,其绝对构型都是(3R,10aR);(ii),从该类化合物的生物合成途径来看,化合物1是由napyradiomycin A1脱去一分子的HCl得到,因此C-3位仍然保留了相同的绝对构型。
合物2:淡黄色油状,其核磁数据归属如表1所示;(c 0.30,MeOH);UV(MeOH)λmax(logε):202(4.62),253(4.35),297(4.19),364(4.06)nm;IRνmax 3348,2939,1701,1612,1450,1369,1253,1072,1018,732cm-1;高分辨质谱HRESIMS m/z C25H31ClBrO5(实测值[M+H]+525.1047,计算值为525.1038),不饱和度为8。比较化合物2的波谱数据与已知化合物napyradiomycin A1[Shiomi,K.;Nakamura,H.;Iinuma,H.;Naganawa,H.;Isshiki,K.;Takeuchi,T.;Umezawa,H.,Structures of new antibioticsnapyradiomycins.J.Antibiot.1986,39,494-501.],发现二者基本相同,只有C-3位卤素取代基的差异:对于napyradiomycin A1,δC 59.0,δH 4.43,dd,J=4.5和11.5Hz(Cl取代);而对于化合物2,δC 51.0,δH 4.55,dd,J=7.5和8.5Hz(Br取代)。因此,化合物2被推导为3-dechloro-3-bromonapyradiomycin A1,结构如式(II)中的2所示。进一步,HMBC从H-3到C2/C-4/C4a的相关信号也进一步确证了该推断(图2)。化合物2绝对构型的确定是比较化合物2与napyradiomycin A1的旋光数据(化合物2,c 0.30,MeOH;napyradiomycinA1,c 0.50,EtOH)。由于化合物2的旋光值与napyradiomycin A1的一样为正值,因此其绝对构型也应该与napyradiomycin A1相同,即为(3R,4aR,10aR)。
化合物3:橙色针状,其核磁数据归属如表1所示;(c 0.14,CHCl3);UV(MeOH)λmax(logε):217(4.42),263(4.19),305(3.95),450(3.42)nm;IRνmax 3348,2939,1674,1608,1280,1095,1022,887,779cm-1;高分辨质谱HRESIMS m/z C15H14ClO5(实测值[M+H]+309.0532,计算值为309.0524),不饱和度为7。紫外吸收光谱UV在263,305和450nm处分别有最大吸收波长,表明该化合物中含有萘醌类发色团。比较化合物3的波谱数据与已知化合物(R)-3-chloro-6-hydroxy-8-methoxy-α-lapachone[Motohashi,K.;Sue,M.;Furihata,K.;Ito,S.;Seto,H.,Terpenoids produced by actinomycetes:napyradiomycins from Streptomyces antimycoticus NT17.J.Nat.Prod.2008,71,595-601.],发现化合物3仅缺少了C-8位甲氧基(δC56.0,δH 3.87)信号,于是推测化合物3为3-chloro-6,8-dihydroxy-α-lapachone,其结构具体如式(II)中的3所示。同理,化合物3的结构也是通过二维核磁相关谱(HMBC和COSY等)予以确证(图2)。化合物3的绝对构型被确定为3R,同样是比较3与(R)-3-chloro-6-hydroxy-8-methoxy-α-lapachone的旋光数据(3,c 0.14,CHCl3);(R)-3-chloro-6-hydroxy-8-methoxy-α-lapachone,c 0.12,CHCl3)。
式(Ⅱ)中的1为4-去氢-4a-去氯纳皮拉霉素A1;2为3-dechloro-3-bromonapyradiomy cin A1;3为3-氯-6,8-二羟基-8-α-拉帕醌。
表1:化合物1-3的核磁数据归属(1H-NMR数据于500MHz测定,13C-NMR数据于125MHz测定,样品溶于CDCl3检测;括号中为偶合常数(Hz))。
实施例3:化合物1-3的抗菌活性测定
测定了化合物4-去氢-4a-去氯纳皮拉霉素A1(1),3-dechloro-3-bromonapyradiomycin A1(2)和3-氯-6,8-二羟基-8-α-拉帕醌(3)对大肠杆菌(Escherichia coli ATCC 25922),金黄色葡萄球菌(S.aureus ATCC 29213),枯草芽孢杆菌(B.Subtilis SCSIO BS01)和苏云金芽孢杆菌(B.thuringensis SCSIO BT01)的抑制活性(MIC),实验方法参考文献(Kumar,S.;Kannabiran,K.,Antifungal activity ofStreptomyces VITSVK5spp.against drug resistant A spergillus clinical isolatesfrom pulmonary tuberculosis patients.J.Mycol.Med.2010,20,101-107.),结果如表2所示:
表2:化合物1-3的抗菌活性
由表2表明,化合物1-3对金黄色葡萄球菌(S.aureus ATCC 29213),枯草芽孢杆菌(B.Subtilis SCSIO BS01)和苏云金芽孢杆菌(B.thuringensis SCSIO BT01)等革兰氏阳性菌具有较强的抑制作用(化合物3对金黄色葡萄球菌S.aureus ATCC 29213除外)。其中,尤其是化合物2对这三种革兰氏阳性菌的MIC分别低至0.5,1和1μg mL-1,比阳性对照所用的抗生素ampicillin具有更强的抑菌活性。同时,结果显示化合物1-3对革兰氏阴性菌的大肠杆菌(Escherichia coli ATCC 25922)没有抑制作用。综合数据表明,4-去氢-4a-去氯纳皮拉霉素A1(1),3-dechloro-3-bromonapyradiomycin A1(2)和3-氯-6,8-二羟基-8-α-拉帕醌(3)能够被用于制备拮抗革兰氏阳性菌的药物。
实施例4:化合物1-3的细胞毒活性测定
测定了化合物4-去氢-4a-去氯纳皮拉霉素A1(1),3-dechloro-3-bromonapyradiomycin A1(2)和3-氯-6,8-二羟基-8-α-拉帕醌(3)对人乳腺癌细胞MCF7、人神经胶质瘤细胞SF268、人非小细胞肺癌细胞NCI-H460和人肝癌肿瘤细胞HepG2的抑制活性(IC50),实验方法参考文献(Skehan,P.;Storeng,R.;Scudiero,D.;Monks,A.;McMahon,J.;Vistica,D.;Warren,J.T.;Bokesch,H.;Kenney,S.;Boyd,M.R.,New colorimetriccytotoxicity assay for anticanc er drug screening.J.Natl.Cancer Inst.1990,82,1107-1112.),结果如表3所示:
表3:化合物1-3的细胞毒活性
由表3表明,化合物1和2对人乳腺癌细胞MCF7、人神经胶质瘤细胞SF268、人非小细胞肺癌细胞NCI-H460和人肝癌肿瘤细胞HepG2都具有中等细胞毒活性(IC50值介于10~20μM);化合物3对人乳腺癌细胞MCF7、人非小细胞肺癌细胞NCI-H460和人肝癌肿瘤细胞HepG2都没有细胞毒活性(IC50值大于40μM),但是却对人神经胶质瘤细胞SF268具有中等细胞毒活性(IC50值约为24μM)。综合数据表明,4-去氢-4a-去氯纳皮拉霉素A1(1),3-dechloro-3-bromonapyradiomycin A1(2)和3-氯-6,8-二羟基-8-α-拉帕醌(3)能够被用于制备抗肿瘤的药物。

Claims (1)

1.链霉菌(Streptomyces sp).SCSIO 10428CCTCC NO.M 2013186在制备化合物4-去氢-4a-去氯纳皮拉霉素A1中的应用;
式(Ⅱ)中的1为4-去氢-4a-去氯纳皮拉霉素A1。
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Citations (1)

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Non-Patent Citations (4)

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Title
Napyradiomycins A and B1: non-steroidal estrogen-receptor antagonists produced by a Streptomyces;Hori Yasuhiro 等;《Journal of Antibiotics》;19931231;第46卷(第12期);第1890-1893页 *
Novel antibiotics. Napyradiomycins. Production, isolation,physicochemical properties and biological activity;Shiomi Kazuro 等;《Journal of Antibiotics》;19860430;第39卷(第4期);第487-493页 *
Structures of new antibiotics.Napyradiomycins;Shiomi Kazuro 等;《Journal of Antibiotics》;19860430;第39卷(第4期);第494-501页 *
Tabebuia avellanedae naphthoquinones: activity against methicillin-resistant staphylococcal strains, cytotoxic activity and in vivo dermal irritability analysis;Pereira Eliezer Menezes等;《Annals of Clinical Microbiology and Antimicrobials》;20060322;第5卷(第5期);第1-7页 *

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