具体实施方式
通过以下详细说明结合附图可以进一步理解本发明的特点和优点。所提供的实施例仅是对本发明方法的说明,而不以任何方式限制本发明揭示的其余内容。下列实施例中未注明的具体实验条件和方法,通常按照常规条件如:J.萨姆布鲁克等主编,科学出版社,1992,分子克隆实验指南(第三版);D.L.斯佩克特等,科学出版社,2001,细胞实验指南等书中所述的条件,或按照制造厂商所建议的条件。
【实施例1】Glu重组防龋蛋白疫苗的构建
1、引物的设计合成
从NCBI:BLAST中的变形链球菌UA159(Streptococcus mutans UA159)基因组序列中水不溶性葡萄糖基转移酶葡萄糖结合区Glu基因片段编码序列(Sequence ID:AE014133.2),设计合成一对特异性引物,引物由上海生工生物工程技术有限公司合成;引物的序列和编号如下:
GLU基因PCR扩增引物
上游引物
5′-CGC GGATCC ATGGGCTATCAAGCCAAAG-3′
下游引物
5′-CCG CTCGAG AATCCGAACTCGTTCTCCAG-3′
(扩增产物5′端含有BamHI位点,3′端含有XholI位点)
2、变形链球菌UA159全基因组DNA的提取
培养变形链球菌UA159(美国模式培养物集存库ATCC购买)(使用BHI液体培养基),37℃,220rpm置于摇床震荡过夜。取4ml菌液集菌,10000rpm离心1分钟,弃上清。加入500μlTE洗涤,震荡重悬,14000rpm离心3分钟,弃上清。加入300μl组织细胞裂解液,超声5秒钟。加入10μl溶菌酶、10μl蛋白酶K、2μl变溶菌素后37℃温育1小时,每隔15分钟上下颠倒混匀5-10次。65℃温育1小时,每隔15分钟涡旋震荡混匀5-10次后放置至室温。加入2.5μl胰蛋白酶37℃温育30分钟。加入400μl MPC裂解液,充分混匀,14000rpm离心10分钟,转移上清至无菌离心管。加入600μl酚/氯仿/异戊醇(24:25:1),混匀,14000rpm离心10分钟,转移上清至无菌离心管。加入250μl氯仿,混匀,14000rpm离心10分钟,转移上清至无菌离心管。加入350μl异丙醇,混匀,放置沉淀2小时,4℃14000rpm离心10分钟,弃上清。70%乙醇洗涤沉淀,4℃14000rpm离心10分钟,弃上清。真空干燥DNA沉淀后加入50μlTE,室温2小时充分溶解DNA。检测DNA浓度和纯度,-20℃保存。
3.PCR(聚合酶链反应)扩增目的片段
1)建立PCR反应体系
用移液器将上述组分混匀,在PCR热循环仪上进行以下反应:98℃变性5min,98℃10Sec,59℃20Sec,72℃1min,进行33个循环,72℃10min。
使用5μl PCR扩增产物进行2%琼脂糖凝胶电泳,以2kdDNA ladder为分子量参照标准,凝胶成像系统扫描,分析结果(图1)。
2)PCR产物回收纯化
PCR产物使用OMEGA Cycle-Pure Kit纯化试剂盒(货号D64922-01)纯化,具体步骤如下:
a PCR产物加入4-5倍体积缓冲液CP,震荡混匀。
b加入离心柱离心(室温,10000g,离心1分钟)。
c加入DNA wash buffer 700μl(室温,10000g,离心1分钟)。
d重复上一步。
e空管离心(室温,13000g,离心2分钟)
f加入无菌水20-30μl,静置1-2分钟。
g离心收集(室温,13000g,离心1分钟)
h测回收产物的浓度和纯度。
3)酶切初步鉴定(图2)
PCR纯化进行初步酶切鉴定,酶切条件如下:
备注:37℃恒温酶切3-5小时。对酶切产物进行0.8%琼脂糖凝胶电泳
4、构建原核表达载体
1)载体pET28a质粒提取
将pET28a甘油菌(卡那霉素抗性)的LB固体培养基中,37℃培养12-16小时,挑单菌落接种于含相应抗生素(卡那霉素抗性)的5-10ml LB液体培养基中,37℃摇床震荡过夜培养(12小时),按照OMEGA试剂盒说明提取质粒。
2)构建原核表达载体
a)pET28a载体双酶切(所加质粒量根据质粒浓度调整):
双酶切反应体系如下:
反应条件:37℃,3-5小时
b)载体与插入片段切胶回收
对双酶切产物进行0.8%琼脂糖凝胶电泳,对照2kd DNA ladder进行切胶回收,具体步骤按照OMEGA(D2500-01)使用方法,具体操作如下:
1)紫外灯下切下含目的条带的琼脂凝胶。
2)承重,以1mg=1μl计算胶体积,加入等体积Buffer XP2,混匀后60℃加热至胶完全溶解(大约10分钟)。
3)转移液体至离心柱,室温10000g离心1分钟,弃离心液。
4)加入300μl Buffer XP2,室温10000g,离心1分钟,弃离心液。
5)加入700μl Buffer SPW,室温10000g,离心1分钟,弃离心液。
6)重复上一步骤。
7)室温空管离心13000g离心2分钟。
8)加入Elution Buffer 30-40μl,静置2分钟。
9)室温13000g离心1分钟,收集离心液,测OD。
c)载体与目的片段连接
反应体系如下:
备注:16℃过夜连接(12-16小时),载体和插入片段摩尔比建议为1:1-1:3得到的克隆质粒命名为pET28a-Glu。
d)化学转化
取连接产物5μl加入50μl E.coli DH5α(天根生化科技有限公司),轻轻混匀,冰浴30分钟,42℃90秒,再次冰浴150秒,加入500μl预热的LB液体培养基,37℃(150rpm)摇床培养45分钟,取200μl涂布到含卡那霉素的LB固体培养基(100μg/μl),37℃培养过夜(12-16小时)。
e)鉴定阳性克隆
挑取单克隆,37℃卡那霉素阳性LB液体培养基(100μg/ml)摇菌培养增殖12小时,集菌,使用OMEGA试剂盒提取质粒,选择BamH和XholI进行酶切鉴定。
5、目的蛋白诱导表达
1)诱导融合蛋白表达
a)挑取含有目的蛋白的重组子的单克隆,转入10ml卡那霉素阳性的LB液体培养基,37℃过夜震荡培养。
b)取200μl菌液接种至10ml新鲜配制的卡那霉素阳性的LB液体培养基中,37℃摇床震荡过夜。
c)A600OD值为0.5-0.6时,加入IPTG终浓度为1.0mmol/L,继续37℃培养4小时。
d)取诱导组菌液和未诱导菌液各1ml,4℃10000rpm离心1分钟,弃上清,-20℃保存。
e)诱导组和未诱导组各自加入100μl PBS,混匀,超声破菌(超声10次,功率为200W,时间3秒钟,超声间隔时间3秒钟),4℃14000rpm离心10分钟。分离上清和沉淀,在沉淀中加入100μl PBS,混匀。
f)取上清和沉淀各20μl,加入20μl 2X上样缓冲液,100℃煮沸5分钟。
g)分别取处理后样品10μl-20μl进行SDS-PAGE电泳。
2)诱导条件优化
根据前期实验发现在常规条件下很难得到可溶性的重组蛋白,为提高重组蛋白的产量和增大其溶解性,分别对诱导温度、IPTG浓度和诱导时间等条件进行了优化。
①最适温度优化(图3)
a)挑取含有目的蛋白的重组子的单克隆,转入10ml卡那霉素阳性的LB液体培养基,37℃培养震荡过夜。
b)取200μl菌液接种至3管10ml新鲜配制的卡那霉素阳性的LB液体培养基中,37℃摇床震荡过夜。
c)待A600OD值为0.5-0.6时,取未诱导菌液1ml,加入IPTG终浓度为0.2mmol/L,分别按15℃、30℃、37℃继续培养,于诱导后7小时从各管中取诱导菌液1ml。
d)将诱导组菌液和未诱导菌液,4℃10000rpm离心1分钟,弃上清,-20℃保存。
e)诱导组和未诱导组各自加入100ul PBS,混匀,超声破菌(超声10次,功率为200W,时间3秒钟,超声间隔时间3秒钟),4℃14000rpm离心10分钟。分离上清和沉淀,在沉淀中加入100μl PBS,混匀。
f)取上清和沉淀各20μl,加入20μl 2X上样缓冲液,100℃煮沸5分钟。
g)取处理后样品10μl-20μl进行SDS-PAGE电泳,其余-20℃保存。
结果显示SDS-PAGE电泳在不同温度下用1mM IPTG诱导的含pET28a-Glu的大肠杆菌在约35KD处有一条明显的蛋白带。在低温条件下(15℃时),目的蛋白占细菌总蛋白的比例较正常诱导条件下高。
②最适IPTG浓度优化(图4)
a)挑取含有目的蛋白的重组子的单克隆,转入10ml卡那霉素阳性的LB液体培养基,37℃培养震荡过夜。
b)取200μl菌液接种至3管10ml新鲜配制的卡那霉素阳性的LB液体培养基中,37℃摇床震荡过夜。
c)待A600OD值约为0.5-0.6时,取未诱导菌液1ml,分别加入IPTG终浓度为0.1mmol/L、0.3mmol/L,15℃继续培养,于诱导后7小时、20小时从各管中取诱导菌液1ml。
d)将诱导组菌液和未诱导菌液,4℃10000rpm离心1分钟,弃上清,-20℃保存。
e)诱导组和未诱导组各自加入100μl PBS,混匀,超声破菌(超声10次,功率为200W,时间3秒钟,超声间隔时间3秒钟),4℃14000rpm离心10分钟。分离上清和沉淀,在沉淀中加入100μl PBS,混匀。
f)取上清和沉淀各20μl,加入20μl 2X上样缓冲液,100℃煮沸5分钟。
g)取处理后样品10μl-20μl进行SDS-PAGE电泳,其余-20℃保存。
结果表明0.3mM IPTG诱导的样品上清中以可溶性存在的蛋白表达量最大,蛋白带最浓。0.3mM为最适合的诱导浓度。
3)金属螯合亲和层析获得预期分子量的重组蛋白的过程(图5)
①从-80℃冰箱里取出冻存的阳性克隆,在含有50μg/ml卡娜霉素的固体LB平板上划线;挑取单菌落接种于5ml液体LB培养基(含50μg/ml卡娜霉素)中,160rpm,37℃培养过夜;
②按照1:100的比例转接到500ml LB培养基(含50μg/ml卡娜霉素),160rpm,37℃培养至OD600达到0.4-0.6,菌液经冰浴冷却10分钟,再加入终浓度0.1-0.2mM的IPTG,120rpm,16℃诱导10-16h。
③收菌:4℃,8000rpm离心5分钟收集诱导后的菌体,去上清,用binding buffer洗涤一次,根据菌体的量,选择适量的bingding buffer重悬菌体。
④破碎:冰浴环境下,超声破碎条件为37%功率,破3s、停5s,30min。
⑤收集蛋白粗液:10000rpm,30min,4℃离心破碎液,收集上清,并经0.45μm过滤器过滤,冰浴备用。
⑥上样和纯化:使用1ml HisTrap FF镍柱以及AKTA purifier 10仪器进行纯化。SDS-PAGE电泳,分析目的蛋白的纯度(图6);
⑦透析。冰浴搅拌透析换液,除去咪唑;
⑧蛋白分装冻存于-80℃备用。
【实施例2】Glu重组蛋白鼻腔免疫小鼠的新型蛋白疫苗免疫效能的检测
为了评价防龋蛋白疫苗,本发明采用BALB/c小鼠为动物模型。
1、动物免疫
1)免疫策略:分组以新型重组防龋蛋白疫苗Glu,重组蛋白PAc(阳性对照),PBS(空白对照),PCIA-P DNA疫苗免疫接种小鼠。
2)免疫途径和方法:经鼻腔滴注,在未麻醉情况下间断缓慢、交替滴注于小鼠两侧鼻腔。
3)分组:取6-8周龄健康雌性BALB/c小鼠48只,每组12只随机分成4组(每组中6只于第8周处死取脾脏,进行脾细胞上清细胞因子的检测),分组如下:
a)PBS对照组(第0周和第2周均鼻腔接种PBS)
b)rPAc(第0周和第2周均鼻腔接种Glu)(50μg/只)
c)重组蛋白Glu(第0周和第2周均鼻腔接种GLU)(50μg/只)
d)PCIA-P DNA疫苗(第0周和第2周均鼻腔接种GLU)(50μg/只)
2、动物血清和唾液样本的收集
1)分别于免疫接种前(第0周)和初次免疫后第2、4、6、8、10、12、16、20周采集小鼠的血清和唾液样本。
2)血清采集方法:眶后静脉丛取血法,从眼外眦进针穿刺入眶后静脉丛,收集血液约100-200μl,置于室温待血液凝固后4℃静置过夜,次日4℃、4000rpm离心10分钟,小心吸取上层血清,-20℃保存备用。
3)唾液样本采集方法:腹腔注射0.2%的毛果芸香碱(0.7mg/100g体重),用微量加样器吸取唾液,收集约250μl,4℃,4000rpm离心10分钟,收集上清并分装,-20℃保存备用。
3、ELISA检测唾液及血清中特异性抗体的水平
1)包被抗原:10μg/ml的PAc或GLU重组蛋白溶于0.05M碳酸盐缓冲液中,将10ug/ml(W/V)抗原溶液加入96孔聚苯乙烯微量酶标板(Corning公司产品,下同),每孔100μl,4℃冰箱过夜。
2)次日弃包被液,每孔加入200ulPBS-T(PBS含0.1%Tween-20,pH 7.5,下同)洗涤5次,每次3min。
3)封闭:每孔加入200μl封闭液(含2%BSA的PBST),37℃湿盒中封闭90min;
4)弃封闭液,每孔加入200μl PBST洗涤5次后,每次3min。
5)加待检样本:将待测血清1:50,唾液1:1用PBS稀释,混匀,每孔加入100μl,每个样本均设置复孔,37℃孵育120min。
6)弃去孔内样本溶液,每孔加入200μl PBST洗涤5次,每次3min。
7)二抗孵育::用含3%BSA的PBST稀释辣根过氧化物酶标记羊抗小鼠IgG(H+L),辣根过氧化物酶标记羊抗小鼠IgG1,辣根过氧化物酶标记羊抗小鼠IgG2a(终浓度均为1:10000),辣根过氧化物酶标记羊抗小鼠IgA(终浓度均为1:1000),每孔加入100μl,置于37℃湿盒内孵育120min。
8)弃去孔内溶液,每孔加入200μl PBST洗涤5次后,每次3min。
9)底物反应:向酶标板各孔中加入显色底溶液(含0.045%H2O2,0.4mg/ml o-phenylenediamine dihydrochloride(OPD)的磷酸-柠檬酸盐缓冲液),每孔100μl,37℃避光显色25min。
10)终止反应:每孔加入2M H2SO450μl终止反应即刻测量波长为490nm处样本OD值,并保存读数结果。
11)标准曲线设置:
①包被抗体采用未标记羊抗小鼠IgG或者IgA抗体,溶于0.1M碳酸盐缓冲液中,每孔加入100μl,4℃冰箱过夜。
②加入待测样本操作时,设置标准曲线孔内加入用PBST缓冲液倍比稀释的标准小鼠血清,每孔加样100μl,每个样本一式两份,37℃湿盒内孵育120min。
③其他操作步骤及所用试剂均与检测样本相同,每96孔板均设置标准曲线,并与待测样本的检测同时进行。
ELISA实验根据标准曲线计算样本中的特异性抗体或细胞因子的含量,取复孔平均值,使用SPSS13.0进行统计学分析并绘制结果图,P<0.05或P<0.01为统计差异显著性检验水平。
结果表明,Glu蛋白疫苗免疫小鼠后能明显提高特异性抗体的产生水平。(图7)
4、小鼠脾细胞培养上清细胞因子水平的检测(图8)
1)小鼠脾细胞培养上清的制备
①末次免疫后6周,脱颈处死小鼠,75%乙醇中浸泡3分钟,取出小鼠放置于一次性无菌培养皿(10cm),无菌操作下剖开腹部小心取出脾脏并去除脂肪和外膜;
②用3ml的注射器芯在尼龙网上挤压研磨脾脏,研磨过程中保证脾脏组织和尼龙网浸于预冷的RPMI-1640培养基中浸润;研磨完全后,使细胞悬液从尼龙网漏下,收集于50ml离心管中,并用RPMI-1640培养基洗涤尼龙网和研磨平皿,洗涤的细胞悬液也收集到离心管中;
③4℃,1200rpm离心8分钟,弃上清;
④沉淀中加入1ml红细胞裂解液重悬细胞,室温静置1分钟;
⑤加入预冷的RPMI-1640培养基至总体积10ml,静置1分钟使组织团块沉降;转移细胞悬液至新的15ml离心管中,沉降于50ml管底的团块不转移;
⑥4℃,1200rpm离心8分钟,弃上清;
⑦5ml的R10培养基重悬细胞沉淀;
⑧细胞计数并根据计数结果调整至细胞浓度为5×106/ml,加入12孔板中,每孔500μl,每个样本均设置复孔,37℃,5%CO2培养箱静置过夜;
⑨每孔加入500μl含Glu或PAc重组蛋白的R10培养基(rPAc终浓度为20μg/ml);
⑩37℃,5%CO2培养箱培养48小时,收集细胞,2000rpm离心10分钟,吸取细胞培养上清并分装,-20℃保存备用;
2)脾细胞培养上清细胞因子IFN-γ、IL-4的检测(图8):
①提前20分钟将检测小鼠IFN-γ、IL-4的ELISA试剂盒内板条从4℃冰箱取出,放置至室温;
②未稀释的细胞培养上清加入孔内(100ug/孔),同时加入梯度稀释的不同浓度的标准品(浓度分别为1000、500、250、125、62.5、31.25、15.6、0pg/ml),同样每孔100μl,空白孔加入100μl标本通用稀释液。每个样本设三个复孔。用封板胶将孔板封住后,置37℃孵育90分钟;
③每孔加入300μl洗涤液,洗板5次,每次约30秒,甩尽洗涤液,并在吸水纸上拍干;
④每孔加入100μl生物素化抗体工作液,空白孔加入生物素化抗体稀释液,再用封板胶纸封住板孔,置37℃孵育60分钟;
⑤每孔加入300μl洗涤液,再洗板5次,每次约30秒,甩尽洗涤液,并在吸水纸上拍干;
⑥每孔加入100μl酶结合物工作液,空白孔加入酶结合物稀释液,再用封板胶纸封住板孔,置37℃避光孵育30分钟;
⑦再按上述洗涤方法洗板5次;
⑧每孔加100μl显色底物(TMB),37℃避光孵育15分钟,并预热酶标仪,设置好检测程序;
⑨每孔加100μl终止液并于3分钟内即可测量OD450值,保存读数结果以备统计学分析。
在各实验组中脾细胞分泌的IFN-γ和IL-4的水平和阴性对照组比较虽未有显著的统计学差异,但从趋势上看,DNA疫苗免疫组,所分泌的IFN-γ相对较低而IL-4水平相对较高,提示该组免疫方式可能诱导Th2型免疫反应。而当使用GLU或rPAc蛋白疫苗免疫后,出现了IFN-γ的分泌在此基础上相对升高而IL-4水平相对降低的现象,可推测,GLU蛋白疫苗在此免疫过程中介导了Th1型为主的免疫应答。由此可见,新型的防龋蛋白疫苗GLU可有效的诱导Th1型免疫反应,增强防龋疫苗的免疫效能。