CN104561309B - 一种来自人辅助生殖囊胚植入前进行出生安全性预测的试剂盒 - Google Patents

一种来自人辅助生殖囊胚植入前进行出生安全性预测的试剂盒 Download PDF

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Abstract

本发明公开了一种在人辅助生殖囊胚植入前进行出生安全性预测的试剂盒。本发明所公开的在人辅助生殖囊胚植入前进行出生安全性预测的试剂盒，包括用于检测来自人辅助生殖囊胚的滋养外胚层的细胞中表5所示的97个基因的表达量的产品。如果辅助生殖囊胚的滋养外胚层的细胞中上述97个基因的表达量符合评判标准，那么该辅助生殖囊胚可以正常发育和孕妇可正常分娩。如果辅助生殖囊胚的滋养外胚层的细胞中上述97个基因的表达量不符合评判标准，那么该辅助生殖囊胚不正常发育，影响儿童健康和出现围产期合并症的可能性就随着不符合评判标准的基因数目增加而风险增加，进一步影响移植策略和决策，减少围产期合并症和患病儿童的可能性。

Description

一种来自人辅助生殖囊胚植入前进行出生安全性预测的试 剂盒
技术领域
本发明涉及一种来自人辅助生殖囊胚植入前进行出生安全性预测的试剂盒。
背景技术
辅助生殖技术(Assisted Reproductive Technology，ART)已经帮助超过85％的不孕夫妇成功妊娠，在过去的30年中，辅助生殖技术经过了卵巢刺激、体外受精-胚胎移植(IVF-ET)、卵细胞胞浆内单精子注射(ICSI)、种植前遗传学诊断(PGD)、未成熟卵体外培养(IVM)等一系列发展，为各种不孕症的治疗做出巨大的贡献。然而，由于辅助生殖技术是人类首个未经临床安全性评价即直接应用于临床治疗的技术，辅助生殖技术安全性一直广受关注。流行病学调查显示，在排除不孕疾病因素之后，即使采用单胎移植，辅助生殖技术仍然可能造成不良妊娠结局，包括：流产、早产、低出生体质量儿、先兆子痫等，辅助生殖围产期胎儿与孕妇发病率和死亡率高于自然妊娠。2005年Shevell等对1222例单纯促排卵治疗、554例IVF-ET妊娠以及34286例自然妊娠出生单胎的妊娠结局进行分析，发现当匹配年龄、种族、教育程度、BMI、吸烟史以及既往早产史之后，辅助生殖技术明显增加先兆子痫、前置胎盘、胎盘早剥等胎盘发育相关的妊娠合并症风险。2013年Pinborg提出辅助生殖中单胎移植的妊娠结局如何？并对单胎移植妊娠结局进行meta分析，发现即使排除多胎移植的影响，辅助生殖单胎移植的妊娠结局与自然妊娠单胎相比较仍然较差，包括早产、胎儿宫内发育迟缓、低体重儿、先兆子痫等发病率较高，可能与使用卵巢刺激药物和生殖细胞体外操作有关，而深入的病理生理机制不清楚。2013年Michele对欧洲辅助生殖妊娠结局数据进行分析，特别之处在于将单胎和多胎移植的妊娠结局分别独立进行分析，发现按照其定义的不良妊娠结局范围，单胎移植的不良妊娠结局发生率是32％，而不孕疾病因素虽然重要，但并不是这些不良结局的主要因素。
辅助生殖技术解决大量生殖系统问题，帮助不孕夫妇获得子代，给社会和家庭带来快乐。然而，相比较自然妊娠，流行病学和临床研究显示，排除不孕疾病因素影响，辅助生殖技术本身具有不确定的隐患，辅助生殖技术妊娠结局风险和出生婴儿健康(儿童期和成年期)风险增加，给社会经济和家庭带来巨大风险并长期负担。如何早期诊断和确认辅助生殖围产期结局和出生缺陷，就是非常紧迫的问题。早期诊断分为两个主要阶段，胚胎植入前和植入后。胚胎植入前是指体外受精后，在植入母体子宫之前阶段的遗传学诊断和安全性评价，目前对基因转录和表达的表观遗传学诊断空白。特别是对于比较复杂的辅助生殖操作，囊胚较长时间暴露在培养液、药物和复杂操作，对胚胎表观遗传学影响较大，更加需要对胚胎安全性和围产期结局进行评价。
辅助生殖技术是采用人工技术将精子和卵子在体外环境受精，然后移植到母体子宫继续妊娠。由于药物应用、体外操作和体外培养，使得受精卵发育过程受到影响，并最终影响到新生儿出生安全。目前对胚胎植入前的出生安全性评价研究，主要集中在遗传学诊断，包括染色体异常等，但是即使遗传基因正常的胚胎，由于受到外界环境的干扰，其遗传物质的表观遗传学也会发生变化，表现为某些基因转录、翻译和蛋白表达的时间和空间异常，这就使得辅助生殖孕妇的围产期安全性和新生儿安全性受到威胁，使得孕妇死亡率、新生儿疾病率和试管婴儿成年期疾病的风险增加。所以，一旦胚胎植入到试管婴儿母亲体内，胚胎就会连续发育，非常有必要在胚胎植入前就对辅助生殖技术对胚胎发育的不良影响进行评价。
发明内容
本发明所要解决的技术问题是如何在人辅助生殖囊胚植入前进行出生安全性诊断。
为解决上述技术问题，本发明提供了一种在人辅助生殖囊胚植入前进行出生安全性预测的试剂盒。
本发明所提供的在人辅助生殖囊胚植入前进行出生安全性预测的试剂盒，包括用于检测来自人辅助生殖囊胚的滋养外胚层的细胞中97个基因的表达量的产品；所述97个基因为表5的人下述A1)-A97)的基因：A1)ACE2基因；A2)MINA基因；A3)GPR126基因；A4)PCDH1基因；A5)ADAMTSL4基因；A6)CLDN10基因；A7)DAB2基因；A8)KRT80基因；A9)TFRC基因；A10)GRHL2基因；A11)COBLL1基因；A12)ICK基因；A13)NIPAL1基因；A14)EFHD1基因；A15)MED12L基因；A16)CD46基因；A17)ATF3基因；A18)MAPK14基因；A19)TLE3基因；A20)BIN2基因；A21)UBA6基因；A22)HSH2D基因；A23)USP53基因；A24)TLK1基因；A25)PTGES基因；A26)DIRC2基因；A27)ENPEP基因；A28)SORBS1基因；A29)ITCH基因；A30)SCYL2基因；A31)PLAC8基因；A32)USP15基因；A33)AFF4基因；A34)CD55基因；A35)ERO1L基因；A36)ERAP1基因；A37)HEATR5A基因；A38)GM2A基因；A39)MESDC2基因；A40)CCSER2基因；A41)GOLGA4基因；A42)CCDC186基因；A43)ASAH1基因；A44)FHL2基因；A45)GPD1L基因；A46)IFI30基因；A47)CTSL1基因；A48)CLN8基因；A49)ATP1B3基因；A50)DPPA3基因；A51)KRT18基因；A52)AZIN1基因；A53)CLTB基因；A54)SPPL2A基因；A55)GATA2基因；A56)CDYL基因；A57)ENTPD1基因；A58)AGFG1基因；A59)GATA3基因；A60)MYOF基因；A61)HEXB基因；A62)WWC1基因；A63)ATMIN基因；A64)NUS1基因；A65)IQGAP1基因；A66)TRIM33基因；A67)EZR基因；A68)IDH3A基因；A69)DCP2基因；A70)TTC28基因；A71)SPIN4基因；A72)ELMOD2基因；A73)KLF3基因；A74)ZNF415基因；A75)PRSS23基因；A76)OSBPL6基因；A77)FAT1基因；A78)LRIG3基因；A79)GALNT10基因；A80)ABCC4基因；A81)SLCO4C1基因；A82)CFL2基因；A83)SC5DL基因；A84)UGCG基因；A85)SPOPL基因；A86)BMPR1A基因；A87)ZNF277基因；A88)HMGCS1基因；A89)ACADSB基因；A90)UBXN2B基因；A91)CDCA2基因；A92)FOXN3基因；A93)ODC1基因；A94)KIN基因；A95)ACAT1基因；A96)KHDRBS3基因；A97)KPNA3基因。
上述试剂盒中，所述97个基因的表达量为采用Illumina HiSeq2000系统进行单细胞测序得到的基因表达量。
上述试剂盒中，所述辅助生殖囊胚具体可为体外人工受精第5天植入前的囊胚。
上述试剂盒中，所述试剂盒包括记载有以来自辅助生殖囊胚的滋养外胚层的细胞作为待测样品的载体。
上述试剂盒中，所述载体还记载有如下内容；如果来自辅助生殖囊胚的滋养外胚层的细胞的所述97个基因的表达量满足评判标准中的(B1)至(B97)，预示所述辅助生殖囊胚将正常发育；
所述评判标准如下：
(B1)所述ACE2基因的表达量为21.40±29.05；
(B2)所述MINA基因的表达量为4.19±4.48；
(B3)所述GPR126基因的表达量为2.48±6.99；
(B4)所述PCDH1基因的表达量为5.54±16.12；
(B5)所述ADAMTSL4基因的表达量为19.80±2.87；
(B6)所述CLDN10基因的表达量为2.28±231.29；
(B7)所述DAB2基因的表达量为2.96±80.98；
(B8)所述KRT80基因的表达量为6.48±0.31；
(B9)所述TFRC基因的表达量为14.50±70.17；
(B10)所述GRHL2基因的表达量为11.04±5.89；
(B11)所述COBLL1基因的表达量为63.50±6.00；
(B12)所述ICK基因的表达量为30.68±7.23；
(B13)所述NIPAL1基因的表达量为1.30±12.94；
(B14)所述EFHD1基因的表达量为527.79±62.57；
(B15)所述MED12L基因的表达量为282.54±2.18；
(B16)所述CD46基因的表达量为0.54±11.97；
(B17)所述ATF3基因的表达量为26.72±27.16；
(B18)所述MAPK14基因的表达量为132.05±18.00；
(B19)所述TLE3基因的表达量为6.76±7.34；
(B20)所述BIN2基因的表达量为6.43±21.99；
(B21)所述UBA6基因的表达量为9.36±4.00；
(B22)所述HSH2D基因的表达量为24.24±1.80；
(B23)所述USP53基因的表达量为16.16±5.09；
(B24)所述TLK1基因的表达量为123.24±5.47；
(B25)所述PTGES基因的表达量为2.87±198.95；
(B26)所述DIRC2基因的表达量为15.73±12.50；
(B27)所述ENPEP基因的表达量为26.22±21.58；
(B28)所述SORBS1基因的表达量为28.32±9.87；
(B29)所述ITCH基因的表达量为47.53±6.54；
(B30)所述SCYL2基因的表达量为11.65±11.75；
(B31)所述PLAC8基因的表达量为39.12±22.63；
(B32)所述USP15基因的表达量为5.14±12.02；
(B33)所述AFF4基因的表达量为2.05±3.36；
(B34)所述CD55基因的表达量为7.00±52.94；
(B35)所述ERO1L基因的表达量为6.47±11.62；
(B36)所述ERAP1基因的表达量为313.93±13.71；
(B37)所述HEATR5A基因的表达量为8.28±8.38；
(B38)所述GM2A基因的表达量为29.98±22.23；
(B39)所述MESDC2基因的表达量为38.44±19.38；
(B40)所述CCSER2基因的表达量为14.29±12.96；
(B41)所述GOLGA4基因的表达量为8.60±27.23；
(B42)所述CCDC186基因的表达量为13.80±4.58；
(B43)所述ASAH1基因的表达量为25.23±43.17；
(B44)所述FHL2基因的表达量为40.20±60.70；
(B45)所述GPD1L基因的表达量为18.90±12.48；
(B46)所述IFI30基因的表达量为12.60±56.02；
(B47)所述CTSL1基因的表达量为182.73±152,20；
(B48)所述CLN8基因的表达量为7.22±4.64；
(B49)所述ATP1B3基因的表达量为119.34±90.85；
(B50)所述DPPA3基因的表达量为8.05±759.91；
(B51)所述KRT18基因的表达量为17.44±3227.85；
(B52)所述AZIN1基因的表达量为22.55±16.98；
(B53)所述CLTB基因的表达量为19.64±35.87；
(B54)所述SPPL2A基因的表达量为13.05±24.54；
(B55)所述GATA2基因的表达量为38.76±56.38；
(B56)所述CDYL基因的表达量为17.33±18.77；
(B57)所述ENTPD1基因的表达量为61.05±3.89；
(B58)所述AGFG1基因的表达量为17.60±4.93；
(B59)所述GATA3基因的表达量为85.53±101.07；
(B60)所述MYOF基因的表达量为7.72±19.47；
(B61)所述HEXB基因的表达量为132.39±26.65；
(B62)所述WWC1基因的表达量为71.66±5.27；
(B63)所述ATMIN基因的表达量为13.35±26.88；
(B64)所述NUS1基因的表达量为78.30±16.92；
(B65)所述IQGAP1基因的表达量为17.70±15.08；
(B66)所述TRIM33基因的表达量为79.38±24.08；
(B67)所述EZR基因的表达量为337.73±69.72；
(B68)所述IDH3A基因的表达量为7.77±26.85；
(B69)所述DCP2基因的表达量为207.60±6.02；
(B70)所述TTC28基因的表达量为7.87±2.73；
(B71)所述SPIN4基因的表达量为2516.75±3.20；
(B72)所述ELMOD2基因的表达量为5551.51±5.26；
(B73)所述KLF3基因的表达量为47.31±12.02；
(B74)所述ZNF415基因的表达量为56.78±9.73；
(B75)所述PRSS23基因的表达量为25.77±45.05；
(B76)所述OSBPL6基因的表达量为26.32±26.05；
(B77)所述FAT1基因的表达量为501.65±1.47；
(B78)所述LRIG3基因的表达量为56.73±14.90；
(B79)所述GALNT10基因的表达量为25.96±14.22；
(B80)所述ABCC4基因的表达量为134.91±21.39；
(B81)所述SLCO4C1基因的表达量为36.28±7.31；
(B82)所述CFL2基因的表达量为11.37±16.60；
(B83)所述SC5DL基因的表达量为29.87±10.66；
(B84)所述UGCG基因的表达量为8.04±116.44；
(B85)所述SPOPL基因的表达量为236.39±7.16；
(B86)所述BMPR1A基因的表达量为144.77±12.49；
(B87)所述ZNF277基因的表达量为49.17±13.57；
(B88)所述HMGCS1基因的表达量为48.49±62.91；
(B89)所述ACADSB基因的表达量为8.36±9.14；
(B90)所述UBXN2B基因的表达量为117.25±5.36；
(B91)所述CDCA2基因的表达量为41.00±19.04；
(B92)所述FOXN3基因的表达量为46.17±18.02；
(B93)所述ODC1基因的表达量为56.54±255.04；
(B94)所述KIN基因的表达量为59.80±17.63；
(B95)所述ACAT1基因的表达量为283.74±20.61；
(B96)所述KHDRBS3基因的表达量为64.89±54.06；
(B97)所述KPNA3基因的表达量为12.05±54.82。
上述试剂盒中，所述用于检测来自人辅助生殖囊胚的滋养外胚层的细胞中97个基因的表达量的产品可为进行单细胞测序的产品，例如Illumina HiSeq2000系统。
上述用于检测来自人辅助生殖囊胚的滋养外胚层的细胞中97个基因的表达量的产品在制备上述在人辅助生殖囊胚植入前进行出生安全性预测的试剂盒中的应用也属于本发明的保护范围，所述97个基因为表5所述的97个基因。
上述用于检测来自人辅助生殖囊胚的滋养外胚层的细胞中97个基因的表达量的产品和上述载体在制备在辅助生殖囊胚植入前进行出生安全性预测的试剂盒中的应用也属于本发明的保护范围，所述97个基因为表5所述的97个基因。
上述试剂盒中，所述辅助生殖囊胚具体可为体外人工受精第5天植入前的囊胚。
本发明的主要贡献是，明确人辅助生殖技术对囊胚发育的影响，主要是发现97个基因的表达量差异。如果辅助生殖囊胚的滋养外胚层的细胞中上述97个基因的表达量符合所述评判标准，那么该辅助生殖囊胚可以正常发育和孕妇可正常分娩。如果辅助生殖囊胚的滋养外胚层的细胞中上述97个基因的表达量不符合所述评判标准，那么该辅助生殖囊胚不正常发育，影响儿童健康和出现围产期合并症的可能性就随着不符合评判标准的基因数目增加而风险增加，进一步影响移植策略和决策，减少围产期合并症和患病儿童的可能性。
附图说明
图1为研究组样本的照片。
图2为未来发育成胚胎的内细胞团照片。
图3为未来发育成胎盘的滋养外胚层照片。
具体实施方式
以下的实施例便于更好地理解本发明，但并不限定本发明。下述实施例中的实验方法，如无特殊说明，均为常规方法。下述实施例中所用的试验材料，如无特殊说明，均为自常规生化试剂商店购买得到的。以下实施例中的定量试验，均设置三次重复实验，结果取平均值。辅助生殖技术即体外人工受精-胚胎移植(IVF-ET)。用SPSS 17.0统计软件进行统计学处理,Student`s，t检验分析各实验数据，p<0.01为差异有统计学意义。单细胞测序采用Illumina HiSeq2000系统:上海仁科生物科技有限公司。Human Genome U133 Plus 2.0Array检测系统：博奥生物有限公司。
实施例、
研究时间为2010年至2014年。研究内容和标本收集得到北京大学伦理委员会的允许，囊胚的父亲和母亲均为知情同意的志愿者。研究组样本(共计3个研究样本，即3个囊胚)为临床收集的辅助生殖技术中受精第5天、植入前的囊胚。
研究组样本的照片见图1。取研究组样本，在高分辨率显微镜下采用机械方式进行分离，得到未来发育成胚胎的内细胞团(见图2)和未来发育成胎盘的滋养外胚层(见图3)，然后分别取单细胞由博奥生物有限公司采用Illumina HiSeq2000系统进行单细胞测序，获得该细胞的全基因组DNA中各个基因的表达量(即各个基因反转录产物mRNA丰度)。第一个囊胚研究样本：从滋养外胚层中取12个细胞。第二个囊胚研究样本：从内细胞团中取4个细胞，从滋养外胚层中取6个细胞。第三个囊胚研究样本：从内细胞团中取8个细胞。细胞1来自第一个囊胚研究样本的滋养外胚层。细胞2来自第一个囊胚研究样本的滋养外胚层。细胞3来自第一个囊胚研究样本的滋养外胚层。细胞4来自第一个囊胚研究样本的滋养外胚层。细胞5来自第一个囊胚研究样本的滋养外胚层。细胞6来自第二个囊胚研究样本的滋养外胚层。细胞7来自第二个囊胚研究样本的滋养外胚层。细胞8来自第二个囊胚研究样本的滋养外胚层。细胞9来自第二个囊胚研究样本的滋养外胚层。细胞10来自第一个囊胚研究样本的滋养外胚层。细胞11来自第一个囊胚研究样本的滋养外胚层。细胞12来自第一个囊胚研究样本的滋养外胚层。细胞13来自第一个囊胚研究样本的滋养外胚层。细胞14来自第一个囊胚研究样本的滋养外胚层。细胞15来自第一个囊胚研究样本的滋养外胚层。细胞16来自第一个囊胚研究样本的滋养外胚层。细胞17来自第二个囊胚研究样本的滋养外胚层。细胞18来自第二个囊胚研究样本的滋养外胚层。细胞19来自第三个囊胚研究样本的内细胞团。细胞20来自第三个囊胚研究样本的内细胞团。细胞21来自第三个囊胚研究样本的内细胞团。细胞22来自第三个囊胚研究样本的内细胞团。细胞23来自第三个囊胚研究样本的内细胞团。细胞24来自第三个囊胚研究样本的内细胞团。细胞25来自第三个囊胚研究样本的内细胞团。细胞26来自第二个囊胚研究样本的内细胞团。细胞27来自第二个囊胚研究样本的内细胞团。细胞28来自第二个囊胚研究样本的内细胞团。细胞29来自第二个囊胚研究样本的内细胞团。细胞30来自第三个囊胚研究样本的内细胞团。对于3个囊胚样本来说，共取了30个细胞。97个基因的相对表达量结果见表1、表2和表3。表1、表2和表3的结果表明：每个研究样本中，对于97个基因中的各个基因来说，来自滋养外胚层的各个细胞中基因的相对表达量基本一致，没有显著差异；每个研究样本中，对于97个基因中的各个基因来说，来自内细胞团的各个细胞中基因的相对表达量基本一致，没有显著差异。来自滋养外胚层的细胞中各个基因的平均相对表达量、来自内细胞团的细胞中各个基因的平均相对表达量以及两者的比值见表4。结果表明，对于97个基因中的各个基因来说，在来自滋养外胚层的细胞中的表达量均高于在来自内细胞团的细胞中的表达量。三个研究样本来自滋养外胚层的细胞中各个基因的平均相对表达量±标准差见表5。
表1各个细胞中97个基因的相对表达量-1
基因名称 细胞1 细胞2 细胞3 细胞4 细胞5 细胞6 细胞7 细胞8 细胞9 细胞10
ACE2 49.91 8.51 9.77 76.31 6.82 0.11 69.80 90.99 5.07 21.38
MINA 3.14 2.46 3.29 13.22 8.89 0.00 6.29 1.23 0.00 12.27
TTC28 1.97 3.38 2.17 11.69 0.00 2.36 0.00 0.38 0.00 4.86
GPR126 23.16 0.00 20.76 0.00 5.90 6.96 0.00 6.87 2.18 0.11
PCDH1 46.17 47.05 12.02 24.88 34.57 20.63 9.96 3.89 0.00 15.86
ADAMTSL4 0.51 3.71 0.00 4.75 3.79 0.00 0.00 0.78 4.24 4.35
SPIN4 5.87 0.71 8.66 2.87 6.99 0.27 0.50 10.13 2.91 0.00
ELMOD2 4.80 0.11 2.62 4.82 16.12 10.32 2.92 2.55 16.99 2.84
KLF3 9.92 20.47 53.67 6.97 4.87 1.01 11.83 3.46 3.95 12.16
ZNF415 8.79 27.28 26.12 11.54 0.00 0.00 0.40 10.54 21.70 1.55
PRSS23 81.56 138.98 51.62 61.47 140.66 43.57 12.21 13.34 1.98 80.53
OSBPL6 43.31 54.08 96.44 28.45 24.50 0.49 9.58 5.18 19.21 12.34
FAT1 0.76 0.00 0.21 0.48 0.51 0.00 0.93 3.82 3.04 0.12
CLDN10 702.58 356.88 585.52 199.28 668.90 467.12 493.19 511.04 621.21 221.68
DAB2 399.23 274.30 389.52 314.20 160.13 331.46 308.90 341.34 268.98 195.16
KRT80 1.46 0.40 0.64 1.09 0.67 0.56 0.32 0.58 0.22 0.21
LRIG3 6.69 17.10 19.16 16.35 10.85 44.51 32.80 30.02 32.60 15.39
TFRC 66.04 251.17 176.68 119.54 209.62 35.38 56.02 89.87 113.61 82.86
GRHL2 4.15 9.15 13.03 3.67 3.67 11.97 5.95 11.97 0.27 13.78
COBLL1 13.97 5.18 16.11 0.33 9.06 14.66 18.18 0.38 13.90 6.77
ICK 12.40 8.07 3.76 6.86 7.10 0.30 5.75 0.91 9.59 8.08
GALNT10 28.15 10.89 27.34 30.12 16.08 61.49 10.04 12.53 14.42 8.15
NIPAL1 33.87 27.15 21.36 40.70 11.52 0.14 22.24 8.54 1.23 28.40
EFHD1 141.96 167.71 230.49 30.01 10.06 94.11 134.40 105.93 22.48 91.68
MED12L 2.85 3.73 4.31 0.67 3.07 6.05 4.31 4.77 0.74 1.29
CD46 16.80 6.45 38.58 5.14 28.65 24.82 27.67 13.17 2.86 4.38
ATF3 20.88 14.15 36.53 80.73 43.19 23.59 0.00 0.43 0.00 23.65
ABCC4 42.56 13.63 66.56 6.18 13.95 74.23 30.78 43.41 48.14 30.75
MAPK14 57.29 37.11 30.30 36.02 28.75 44.71 24.18 35.96 36.02 55.72
TLE3 19.16 5.36 13.15 14.49 0.14 6.86 8.15 11.19 1.74 15.49
BIN2 40.44 42.06 48.54 68.88 8.69 51.51 13.04 77.20 19.53 63.51
UBA6 1.55 5.38 9.47 8.92 0.00 10.03 2.65 2.58 2.69 4.72
HSH2D 0.12 1.34 3.56 0.00 0.90 3.39 1.39 4.50 2.85 0.56
USP53 6.20 5.92 13.55 3.37 21.29 0.19 5.87 6.32 8.63 9.48
TLK1 4.60 10.21 2.63 3.46 2.24 3.86 3.80 3.30 18.38 21.69
PTGES 655.67 689.43 478.24 488.93 188.56 479.01 175.11 236.41 174.76 194.27
SLCO4C1 0.73 11.25 10.42 3.56 2.94 11.73 7.85 14.14 13.86 19.05
DIRC2 52.16 20.26 11.03 28.95 16.22 34.66 15.54 21.85 26.78 12.96
ENPEP 20.73 46.42 85.00 26.21 38.96 79.05 46.01 27.29 49.88 42.65
SORBS1 10.86 7.34 32.72 2.74 12.18 11.06 11.33 1.27 33.03 16.66
ITCH 7.33 23.09 11.53 5.84 7.55 0.13 9.94 19.22 8.60 14.36
SCYL2 22.13 0.93 1.40 11.80 20.95 29.79 0.55 4.22 37.02 8.96
CFL2 55.91 40.89 23.26 22.65 24.85 21.50 33.67 26.29 28.57 12.47
PLAC8 14.26 44.50 35.03 41.75 10.97 38.98 29.31 64.33 35.24 48.67
USP15 12.07 18.81 31.50 9.99 15.02 6.70 15.81 12.01 1.29 6.08
SC5DL 12.70 18.50 29.63 8.86 18.96 1.10 7.58 0.13 5.20 15.41
UGCG 313.86 346.37 244.85 292.63 296.08 210.98 131.59 59.25 24.49 144.80
AFF4 6.82 10.52 5.40 11.54 2.53 8.29 9.50 4.34 8.26 8.19
CD55 141.82 69.06 75.99 140.26 72.58 122.30 145.11 124.32 152.40 24.35
SPOPL 19.49 0.37 10.73 15.08 0.14 0.00 1.16 17.32 4.34 10.13
ERO1L 15.28 26.13 20.99 7.50 37.48 29.28 25.56 15.13 38.80 34.50
BMPR1A 17.10 19.58 48.34 18.67 43.50 16.12 33.78 4.39 23.19 9.00
ERAP1 21.88 14.75 7.54 33.58 11.71 38.42 11.15 19.26 34.51 8.75
HEATR5A 19.90 14.30 19.84 4.00 0.53 4.19 2.95 5.24 9.27 29.20
GM2A 65.49 29.50 20.37 30.07 9.46 48.56 60.62 57.12 40.97 11.43
ZNF277 36.38 13.71 9.48 4.88 41.55 12.62 6.22 35.78 33.66 12.41
MESDC2 75.10 72.85 67.05 37.13 50.04 41.94 58.30 73.06 44.70 101.31
CCSER2 24.70 15.87 20.65 33.80 48.96 4.33 12.18 23.64 3.42 9.86
GOLGA4 93.15 51.01 66.50 132.90 66.92 45.27 51.16 96.33 124.72 98.57
CCDC186 11.03 13.06 8.29 2.74 12.82 3.82 9.38 10.33 0.00 5.22
HMGCS1 132.52 162.29 117.27 256.73 156.02 181.34 83.88 140.55 52.61 268.95
ASAH1 63.22 96.91 106.95 62.57 75.99 92.29 23.15 74.98 136.17 25.69
ACADSB 28.68 11.46 8.08 5.18 11.50 11.73 23.68 23.24 3.23 1.29
FHL2 170.69 100.67 218.33 36.36 77.57 91.65 35.09 14.70 106.72 11.05
GPD1L 20.38 21.48 35.21 19.29 13.55 19.68 42.82 10.46 0.14 4.44
IFI30 29.86 97.37 102.35 28.03 10.45 208.12 62.62 156.24 24.79 5.62
CTSL1 198.21 402.65 351.15 201.75 424.81 209.80 368.63 235.47 356.68 154.34
CLN8 8.56 7.76 8.90 3.42 8.17 0.80 3.10 11.01 2.10 5.60
ATP1B3 278.38 327.07 274.93 82.73 106.27 105.80 153.01 176.52 224.59 132.19
UBXN2B 10.42 6.60 10.12 4.15 1.12 19.16 0.39 11.57 11.01 9.30
DPPA3 1501.20 2032.41 1493.98 2485.24 2569.09 2345.25 3826.89 3029.76 3010.59 2780.14
KRT18 7233.78 4830.27 5798.77 16308.98 6755.27 4574.82 3394.29 4176.96 3601.17 3651.28
AZIN1 39.70 56.54 22.28 17.20 49.00 25.57 63.36 58.76 49.01 36.42
CLTB 99.70 97.91 72.26 9.89 33.83 48.74 40.79 62.24 18.15 108.64
CDCA2 35.14 4.28 78.94 26.59 27.73 18.60 18.48 25.50 0.29 22.92
FOXN3 56.77 13.83 42.29 28.64 19.21 3.44 42.43 9.10 19.82 24.51
ODC1 851.93 672.55 801.54 189.47 1189.66 615.70 409.99 393.19 338.24 149.87
SPPL2A 54.94 14.01 59.81 37.85 61.53 77.74 70.33 10.17 71.26 28.59
KIN 11.19 43.03 14.98 3.81 29.60 51.88 13.59 0.56 27.53 41.63
GATA2 112.57 100.37 143.71 174.22 99.33 81.68 85.65 116.02 138.09 128.23
CDYL 40.20 41.34 84.06 24.89 39.35 21.59 44.52 29.19 23.35 17.98
ENTPD1 11.48 7.33 15.31 12.37 3.40 12.97 12.72 10.52 10.20 15.00
ACAT1 5.41 39.84 50.52 8.64 14.50 11.72 59.98 64.68 34.64 13.81
AGFG1 2.61 8.28 8.45 4.81 5.65 3.73 8.03 8.51 1.37 6.09
GATA3 353.68 299.85 232.58 197.89 175.83 148.60 260.77 254.60 196.15 384.51
KHDRBS3 168.89 159.87 140.32 136.06 73.63 118.20 147.15 132.41 142.76 116.99
MYOF 79.81 48.45 46.65 73.30 13.45 49.30 37.64 29.15 35.43 55.41
HEXB 35.88 81.42 23.50 16.03 29.36 84.17 14.61 64.11 19.00 39.58
WWC1 9.73 9.15 10.00 7.32 3.26 15.61 5.14 3.52 15.83 5.16
KPNA3 143.91 179.10 93.23 93.28 24.70 140.87 239.57 123.80 114.40 83.32
ATMIN 58.75 31.16 14.46 34.96 113.55 58.84 20.90 54.03 27.94 4.79
NUS1 16.84 42.82 37.14 54.11 34.07 13.99 36.47 59.98 33.94 63.09
IQGAP1 66.03 61.51 53.27 35.01 37.69 61.48 58.85 38.51 75.40 40.90
TRIM33 55.53 57.80 30.74 66.34 47.87 97.40 65.72 73.83 49.14 25.99
EZR 313.56 307.63 329.21 384.39 378.43 215.73 181.87 158.54 221.94 406.53
IDH3A 77.65 89.43 70.74 20.98 49.50 60.00 37.74 58.53 80.21 66.42
DCP2 17.22 8.51 23.02 7.62 5.47 2.56 11.94 11.07 9.18 18.16
表2各个细胞中97个基因的相对表达量-2
基因名称 细胞11 细胞12 细胞13 细胞14 细胞15 细胞16 细胞17 细胞18 细胞19 细胞20
ACE2 0.00 19.07 0.00 6.90 14.91 7.15 40.64 0.22 0.00 0.00
MINA 6.36 11.36 0.00 0.64 0.28 4.18 0.00 3.40 0.00 0.00
TTC28 1.74 3.40 1.78 3.65 3.16 3.86 0.00 1.75 0.00 0.00
GPR126 7.72 4.57 14.22 0.27 7.29 5.15 0.00 1.89 0.00 0.00
PCDH1 40.82 26.40 22.03 43.66 8.64 34.34 5.01 0.00 0.00 16.67
ADAMTSL4 1.55 1.98 9.37 0.84 0.00 0.11 8.23 0.49 0.00 0.00
SPIN4 0.61 2.06 3.50 4.29 6.88 2.67 0.25 0.00 1.73 0.00
ELMOD2 7.85 1.28 11.06 0.31 4.82 9.40 0.18 10.18 0.00 2.75
KLF3 18.50 9.91 12.67 13.09 26.50 13.54 24.45 14.34 11.00 0.00
ZNF415 19.42 0.14 5.29 16.24 0.00 11.12 0.20 20.15 0.00 0.00
PRSS23 132.16 81.55 20.99 56.00 40.68 133.03 50.28 43.13 5.32 6.56
OSBPL6 34.28 58.28 49.13 51.33 70.28 21.56 10.83 8.10 0.00 0.00
FAT1 2.64 3.74 0.88 0.00 2.79 2.00 3.79 0.10 0.00 0.00
CLDN10 322.08 1133.59 880.54 489.07 580.51 750.51 471.59 366.86 0.00 0.13
DAB2 345.91 414.42 221.40 145.02 332.79 200.14 309.34 232.84 52.40 0.63
KRT80 0.40 0.63 0.71 0.48 0.56 0.46 0.62 0.26 0.11 0.00
LRIG3 27.74 13.45 10.43 14.72 28.69 47.77 0.71 55.16 3.53 0.00
TFRC 244.33 123.08 31.19 202.47 156.25 220.73 101.07 120.40 18.12 1.27
GRHL2 21.95 4.30 3.92 0.00 10.91 9.27 0.23 2.36 0.00 0.00
COBLL1 0.80 3.67 7.77 0.24 7.36 5.78 4.39 0.00 0.00 0.00
ICK 9.56 7.55 10.11 2.78 7.29 6.23 33.30 15.86 1.19 0.00
GALNT10 32.30 29.70 33.50 11.83 50.20 18.00 22.50 22.52 11.92 0.00
NIPAL1 9.15 19.08 30.48 34.01 13.71 19.56 0.31 0.58 9.88 0.00
EFHD1 155.52 82.27 61.29 159.45 119.52 179.21 69.85 202.92 0.00 0.00
MED12L 1.35 0.38 1.18 0.00 7.61 2.54 0.20 4.14 0.00 0.00
CD46 2.28 2.13 12.86 25.43 34.67 26.42 20.57 7.24 0.63 0.59
ATF3 36.10 72.85 81.42 10.71 48.16 23.60 6.39 0.67 0.00 2.09
ABCC4 42.04 34.71 27.17 2.71 1.96 18.86 0.64 22.72 5.00 0.00
MAPK14 38.80 31.25 67.15 44.35 56.10 47.68 99.53 59.91 11.97 6.47
TLE3 5.81 21.46 7.86 13.78 11.79 6.14 30.29 13.39 7.50 0.00
BIN2 8.39 50.64 40.16 27.87 23.79 32.78 1.93 54.46 33.98 0.00
UBA6 2.71 0.89 10.76 0.00 1.48 3.09 0.37 11.83 0.00 0.98
HSH2D 5.64 1.65 5.33 0.52 1.89 0.91 0.00 2.17 0.00 0.94
USP53 0.99 7.49 9.01 2.64 4.94 3.62 0.68 9.96 0.00 0.22
TLK1 8.26 6.24 1.02 7.19 4.07 8.52 3.68 5.38 2.81 0.00
PTGES 467.15 624.00 358.03 358.57 289.22 226.17 52.22 47.63 0.13 0.36
SLCO4C1 23.82 19.97 8.48 0.39 1.77 11.20 0.15 1.45 0.00 4.63
DIRC2 47.98 36.97 18.05 48.53 31.19 28.83 33.09 38.15 3.65 9.28
ENPEP 38.09 39.09 12.16 79.40 26.31 21.11 23.60 22.29 0.00 0.13
SORBS1 20.54 20.97 23.00 23.01 23.85 16.08 0.48 6.21 2.20 0.00
ITCH 9.47 9.58 10.77 1.11 19.12 7.99 0.17 2.07 6.29 0.00
SCYL2 5.93 10.28 36.03 9.09 7.82 14.22 0.52 18.10 1.42 0.00
CFL2 41.85 24.60 4.82 16.30 68.37 28.38 6.59 7.90 13.95 0.00
PLAC8 68.66 54.13 82.73 65.82 23.75 79.94 49.29 5.59 4.54 1.00
USP15 7.12 9.60 16.24 8.91 20.51 11.17 10.47 54.93 4.90 1.58
SC5DL 12.35 15.20 26.10 40.36 18.17 12.28 2.26 2.43 1.55 4.17
UGCG 315.39 226.68 393.06 123.13 196.66 233.34 39.59 20.60 92.16 13.20
AFF4 8.40 5.55 5.07 7.24 0.17 6.39 0.55 11.90 2.03 0.12
CD55 70.69 114.77 152.96 99.19 109.45 94.92 275.90 133.58 7.13 0.71
SPOPL 2.05 3.26 17.49 19.83 0.86 7.73 10.49 6.86 9.69 0.00
ERO1L 12.97 6.01 14.79 21.36 25.30 14.36 0.41 1.00 4.85 3.17
BMPR1A 21.26 11.49 16.43 40.46 8.61 33.67 25.60 19.95 19.31 0.23
ERAP1 11.17 21.62 32.61 55.74 17.97 7.59 3.05 13.85 10.07 0.00
HEATR5A 16.98 13.31 19.46 20.39 0.86 15.72 21.74 14.37 11.42 3.22
GM2A 18.84 23.07 78.68 61.11 17.08 12.45 16.76 57.90 14.39 10.29
ZNF277 15.84 5.53 0.00 15.47 2.50 31.33 0.39 22.93 23.65 0.00
MESDC2 77.46 50.44 58.03 36.22 71.08 61.29 20.36 74.87 23.71 7.89
CCSER2 26.97 38.05 14.65 15.03 15.22 27.79 0.31 5.51 4.75 9.01
GOLGA4 66.22 129.84 85.28 63.45 109.93 85.24 67.41 92.22 1.67 6.22
CCDC186 8.82 14.22 13.13 11.39 4.59 2.99 0.14 7.49 7.39 0.00
HMGCS1 118.16 226.87 163.63 108.88 124.83 100.33 62.54 63.45 55.25 3.69
ASAH1 25.67 73.53 80.80 172.78 37.54 14.45 12.19 86.09 17.84 27.74
ACADSB 2.64 15.42 13.76 31.23 2.67 18.23 20.42 11.49 0.65 0.00
FHL2 23.13 78.30 11.40 184.59 97.10 40.17 79.29 63.03 14.89 0.16
GPD1L 6.69 11.03 8.22 44.78 25.04 18.47 8.82 14.49 0.39 0.00
IFI30 107.45 28.13 144.21 95.39 60.12 91.67 133.77 67.14 0.18 0.19
CTSL1 389.07 275.49 706.52 248.51 468.60 553.03 79.00 376.98 45.00 61.08
CLN8 5.96 8.43 2.38 14.03 7.24 6.53 19.91 10.48 0.00 2.52
ATP1B3 213.53 225.09 112.31 354.98 232.95 290.07 380.87 160.23 21.55 35.59
UBXN2B 11.27 8.95 0.00 18.77 6.70 6.89 5.57 5.15 12.48 0.00
DPPA3 2099.29 2222.16 2402.42 1432.91 1392.73 1527.41 2485.48 3899.38 986.42 319.55
KRT18 6639.14 9859.41 8183.99 4992.07 5182.94 2793.58 5291.90 2587.21 781.61 638.25
AZIN1 53.42 57.27 72.74 73.67 42.71 36.64 23.52 56.12 14.99 31.40
CLTB 32.81 33.04 79.62 5.03 89.23 53.79 129.08 40.24 33.92 13.39
CDCA2 48.24 47.88 26.91 44.05 21.72 30.96 3.92 11.05 15.49 0.83
FOXN3 31.83 41.37 71.09 11.44 6.93 29.35 16.51 19.28 9.80 7.69
ODC1 353.88 500.84 578.44 530.29 544.49 669.13 374.61 289.70 10.67 1.53
SPPL2A 16.14 51.74 37.64 52.87 70.50 43.15 63.83 104.16 7.72 28.99
KIN 43.45 11.84 27.21 0.00 50.10 49.46 15.44 27.97 14.98 0.46
GATA2 154.89 107.99 157.41 64.79 193.72 103.41 315.93 140.04 2.02 0.47
CDYL 16.55 43.05 28.00 3.44 67.50 47.25 39.12 38.04 22.34 0.14
ENTPD1 14.96 8.83 11.39 5.05 8.71 4.27 11.82 17.02 0.19 0.11
ACAT1 19.23 62.17 26.00 65.42 26.35 24.08 23.35 15.71 6.24 1.34
AGFG1 16.83 11.88 12.45 18.30 12.81 14.26 8.48 2.74 3.75 1.28
GATA3 525.82 236.94 128.77 192.34 316.79 179.81 149.49 164.46 59.68 14.80
KHDRBS3 205.34 193.57 317.56 116.46 175.07 130.74 86.74 111.19 0.24 8.29
MYOF 60.21 76.42 52.89 66.71 57.24 30.74 13.43 52.41 42.49 3.12
HEXB 56.19 6.30 56.70 78.35 87.40 64.30 26.88 61.99 7.49 23.22
WWC1 3.68 10.35 9.33 18.20 17.69 6.20 0.27 5.56 0.00 5.38
KPNA3 102.83 96.31 121.49 100.72 50.02 61.23 27.02 183.06 72.00 18.98
ATMIN 32.89 17.07 82.43 44.40 61.53 60.16 30.75 23.82 23.13 21.23
NUS1 35.32 44.93 74.16 71.67 36.06 35.72 50.16 60.95 11.95 37.57
IQGAP1 40.90 51.47 56.57 43.00 65.85 28.57 64.67 83.72 22.85 33.78
TRIM33 51.22 62.76 38.65 39.44 34.42 38.73 19.59 113.62 21.62 17.77
EZR 363.46 279.32 292.89 317.17 279.65 251.24 285.25 235.98 125.27 91.84
IDH3A 28.42 52.62 83.18 79.93 102.89 52.14 2.45 94.97 26.88 24.60
DCP2 12.31 8.83 6.43 10.99 20.40 8.26 2.35 18.93 7.09 4.63
表3各个细胞中97个基因的相对表达量-3
基因名称 细胞21 细胞22 细胞23 细胞24 细胞25 细胞26 细胞27 细胞28 细胞29 细胞30
ACE2 0.00 0.00 0.00 6.69 1.45 0.42 0.00 0.98 0.00 0.00
MINA 0.00 0.40 0.00 0.75 0.00 0.17 0.32 0.00 1.49 0.00
TTC28 0.00 0.00 0.00 1.11 0.00 0.26 0.00 0.00 0.92 0.00
GPR126 0.00 0.00 0.00 0.20 4.03 2.48 0.00 0.57 0.00 0.00
PCDH1 0.00 0.00 0.00 0.36 1.48 5.50 0.15 0.13 4.49 0.00
ADAMTSL4 0.00 2.09 0.00 0.24 0.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
SPIN4 0.00 0.00 0.24 0.44 2.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
ELMOD2 0.00 0.00 0.00 0.26 0.00 1.30 1.87 2.17 0.18 0.00
KLF3 0.00 0.59 1.06 0.00 0.00 2.84 8.73 0.24 0.77 0.00
ZNF415 0.21 16.67 0.00 0.00 0.18 0.41 0.00 0.66 0.00 0.00
PRSS23 0.00 0.00 0.00 7.60 1.13 23.38 9.78 0.33 5.08 61.42
OSBPL6 0.00 8.99 2.59 12.20 13.65 20.33 1.36 3.91 0.11 0.00
FAT1 0.00 1.19 0.00 1.11 0.00 0.64 0.00 0.12 0.00 0.00
CLDN10 5.44 29.53 47.79 87.25 0.39 984.52 1.17 16.28 3.59 0.13
DAB2 0.00 186.67 48.90 84.80 77.36 145.74 1.07 14.67 18.63 0.19
KRT80 0.00 0.00 0.15 0.16 0.11 0.38 0.23 0.21 0.00 0.00
LRIG3 0.00 0.89 0.34 13.27 2.11 18.78 0.32 17.39 0.00 0.00
TFRC 3.02 142.70 21.74 59.28 22.31 45.57 0.00 3.54 0.40 3.82
GRHL2 0.00 0.30 0.00 8.78 0.00 9.34 0.00 0.00 0.00 0.00
COBLL1 0.00 2.52 2.26 0.00 3.17 6.80 3.76 0.27 0.32 0.00
ICK 0.00 5.48 0.00 0.87 3.57 1.54 2.00 7.05 1.30 0.12
GALNT10 0.00 18.12 3.05 15.98 6.05 10.98 0.29 0.54 0.37 0.00
NIPAL1 0.00 4.14 1.79 14.76 7.30 0.68 2.66 9.06 0.00 0.00
EFHD1 0.00 10.66 70.12 25.72 0.00 96.87 2.42 17.42 75.42 25.64
MED12L 0.00 0.18 0.00 0.00 6.68 0.56 0.00 0.13 0.31 0.00
CD46 6.80 15.46 0.19 10.18 0.69 9.69 0.24 1.71 2.88 0.00
ATF3 9.43 6.99 7.86 0.00 0.00 32.25 23.00 1.80 1.74 2.63
ABCC4 0.26 44.58 0.14 14.75 1.82 17.46 0.14 4.44 0.12 0.00
MAPK14 1.95 6.31 10.83 16.46 54.19 18.15 1.85 1.31 13.27 0.00
TLE3 5.61 5.49 0.00 0.00 0.16 1.69 3.20 2.82 8.29 0.96
BIN2 6.50 11.05 50.74 12.64 1.31 0.00 0.00 1.17 0.00 0.00
UBA6 0.25 1.62 0.00 0.86 0.24 1.09 1.93 6.34 0.65 0.00
HSH2D 0.00 0.00 0.00 0.20 2.42 1.76 0.51 0.31 0.00 0.38
USP53 1.71 3.48 0.00 1.04 1.83 3.89 0.17 6.81 3.00 0.00
TLK1 1.37 2.02 0.60 4.40 1.08 1.40 4.31 0.76 3.27 0.00
PTGES 0.00 35.23 271.49 427.56 114.25 268.92 0.39 4.71 0.60 28.97
SLCO4C1 1.21 0.00 5.34 1.91 0.00 5.93 0.30 0.25 10.81 0.00
DIRC2 3.75 0.00 1.81 3.46 7.98 29.55 5.48 12.20 3.38 17.16
ENPEP 1.23 79.03 3.45 35.55 6.80 8.19 0.00 1.37 0.00 0.11
SORBS1 0.35 0.00 0.00 7.05 0.00 12.26 26.52 1.78 1.66 0.00
ITCH 0.24 6.08 0.21 0.00 0.39 7.95 6.17 0.98 2.98 1.25
SCYL2 0.21 15.71 0.35 0.15 4.34 3.57 16.06 1.20 2.40 2.15
CFL2 2.12 27.48 0.50 4.71 1.56 37.03 7.50 1.33 0.64 2.21
PLAC8 0.31 43.62 0.59 13.65 33.01 37.04 1.83 23.58 1.41 0.19
USP15 0.12 21.72 0.00 4.51 0.42 5.93 5.34 0.63 6.86 3.36
SC5DL 1.87 22.96 0.41 3.32 6.15 1.10 0.62 3.46 5.75 0.25
UGCG 4.66 0.19 9.20 104.27 1.02 91.29 105.82 251.26 83.79 3.52
AFF4 6.37 4.29 0.89 2.96 1.28 4.08 0.00 2.85 0.24 0.30
CD55 18.84 147.41 16.24 79.99 7.09 104.99 40.60 15.39 4.59 3.93
SPOPL 0.19 10.25 0.00 1.58 3.08 0.31 0.44 2.21 3.60 0.00
ERO1L 3.82 27.84 6.05 3.18 2.17 15.77 0.55 2.79 4.02 0.00
BMPR1A 8.76 3.22 0.86 12.31 2.90 8.00 1.00 0.66 20.27 12.11
ERAP1 4.70 15.68 14.76 5.03 17.01 3.54 2.02 6.98 0.30 0.00
HEATR5A 0.00 6.38 0.15 0.00 4.58 10.59 2.65 5.06 8.15 0.00
GM2A 8.82 23.55 23.46 17.05 15.05 34.09 0.49 1.18 0.62 0.28
ZNF277 0.00 6.86 0.75 0.00 10.56 18.24 0.82 0.58 7.54 0.00
MESDC2 3.49 37.90 38.44 18.04 2.19 60.97 13.12 6.11 22.94 12.05
CCSER2 4.86 14.56 7.83 5.82 5.33 12.11 0.88 4.24 5.30 5.15
GOLGA4 11.57 69.87 15.80 13.43 10.38 83.34 66.65 23.12 37.81 18.29
CCDC186 0.00 0.00 0.00 0.00 4.74 3.22 0.00 5.57 0.00 13.04
HMGCS1 3.68 83.35 52.40 42.75 142.73 75.76 4.95 148.64 11.81 0.14
ASAH1 0.70 65.54 0.24 100.92 43.99 32.22 0.23 6.74 3.16 14.48
ACADSB 5.82 14.76 0.23 0.81 12.19 5.18 14.85 0.38 5.94 0.00
FHL2 0.48 59.08 43.66 66.90 121.01 48.66 0.21 5.37 0.19 0.00
GPD1L 0.12 7.44 34.07 0.50 2.34 7.44 11.30 2.38 15.53 0.00
IFI30 0.22 113.77 130.03 0.00 0.73 67.73 1.95 1.31 44.90 4.03
CTSL1 84.15 242.29 329.66 225.10 74.82 134.23 57.85 72.12 58.12 162.40
CLN8 0.00 11.30 7.07 0.00 12.25 0.88 0.00 0.10 0.74 0.15
ATP1B3 112.68 155.30 53.02 205.41 104.35 104.67 40.06 99.05 52.15 24.14
UBXN2B 4.06 0.00 0.59 12.06 4.66 2.91 0.73 1.64 1.09 0.00
DPPA3 916.56 1191.45 1401.16 1321.62 1065.60 2020.13 364.84 651.69 1091.59 328.76
KRT18 417.49 1921.95 9099.93 6670.87 2567.87 5883.50 271.28 460.10 161.82 241.50
AZIN1 10.69 40.87 29.57 16.81 19.63 32.41 9.52 4.32 17.72 1.63
CLTB 2.64 49.17 38.87 5.61 0.13 30.38 6.37 13.51 1.03 95.55
CDCA2 3.45 20.21 0.00 10.95 7.72 15.54 25.41 20.72 16.26 0.00
FOXN3 7.95 4.14 1.21 6.12 6.55 14.77 27.64 5.53 45.42 0.00
ODC1 43.18 364.45 652.02 415.64 568.03 341.44 3.36 205.75 38.64 39.84
SPPL2A 0.47 71.31 3.22 16.27 13.34 56.06 0.70 47.39 18.56 0.00
KIN 16.60 15.96 0.25 0.43 20.54 13.62 3.90 0.93 22.67 22.48
GATA2 0.29 96.01 104.90 217.85 135.17 135.73 0.38 3.97 0.43 0.26
CDYL 1.03 21.63 4.42 12.62 32.02 12.22 19.25 20.81 41.78 0.16
ENTPD1 0.25 16.89 4.50 5.21 5.86 2.71 5.96 7.45 5.96 1.69
ACAT1 3.14 24.14 5.50 24.92 4.84 34.32 1.93 14.06 47.51 0.00
AGFG1 5.53 9.88 0.48 2.62 6.23 4.75 2.82 3.12 4.90 0.91
GATA3 0.31 196.10 203.85 325.60 296.80 129.05 13.49 78.97 1.12 0.38
KHDRBS3 32.36 72.26 91.10 82.70 248.90 173.54 37.32 12.80 2.87 57.71
MYOF 0.00 23.77 7.43 11.63 80.49 22.76 6.06 72.15 0.55 0.00
HEXB 1.29 79.03 5.20 48.94 30.92 31.91 15.82 0.82 12.56 3.91
WWC1 2.84 5.75 10.84 3.80 9.29 8.42 0.13 0.32 1.86 0.15
KPNA3 9.45 61.63 38.43 40.29 24.62 89.25 49.80 158.37 26.01 39.89
ATMIN 39.80 18.80 0.35 17.33 39.21 21.16 0.41 50.28 12.15 1.63
NUS1 5.88 38.72 1.79 18.29 19.42 20.85 46.54 16.02 33.78 4.77
IQGAP1 24.49 52.53 26.62 11.91 19.53 26.91 21.09 63.12 7.82 0.24
TRIM33 13.59 37.87 4.18 44.25 11.68 11.52 61.61 28.59 35.37 25.25
EZR 152.47 138.48 161.10 316.33 208.74 111.62 141.14 97.43 106.33 32.79
IDH3A 48.25 25.32 4.82 21.55 73.34 50.51 42.65 14.84 2.67 32.02
DCP2 8.21 4.88 0.40 0.69 4.85 10.60 13.67 2.32 9.94 0.14
表4
表5
注：表1-表5中的基因相对表达量为扣除背景信号的信号值。
将3个研究样本分别移植入三个辅助生殖妇女(即该囊胚的卵子供者)的子宫，在胚胎发育至孕7周±2天阶段内，在B超监视下穿刺吸取胎盘，得到各个胎盘样本(研究组胎盘样本)，分别命名为胎盘样本一、胎盘样本二和胎盘样本三。针对自然妊娠并自愿进行人工流产的妇女，在知情同意的情况下，在胚胎发育至孕7周±2天阶段内，在B超监视下穿刺吸取胎盘和胚胎，得到各个胎盘样本(对照组胎盘样本)，分别命名为胎盘样本四、胎盘样本五和胎盘样本六。研究组和对照组母亲的临床背景(临床背景指的是民族、年龄、初产妇/经产妇、流产史、孕前BMI；均无系统性疾病、妊娠期合并症、吸烟和酒精依赖；受教育程度均大于15年)是一对一、两两一致匹配对应的。取各个胎盘样本，提取总RNA，采用人类表达谱芯片Human Genome U133 Plus 2.0 Array测定各个胎盘样本中全基因组中各个基因的相对表达量。发现对于研究组胎盘样本和对照组胎盘样本来说，结果表明研究组胎盘样本的1千多个基因中各个基因的表达量均是对照组胎盘样本中同一种基因的表达量的两倍以上或二分之一倍以下。其中，在囊胚(辅助生殖技术中受精第5天、植入前的囊胚)中表达的基因有97个，研究组胎盘样本基因的平均相对表达量与对照组胎盘样本基因的平均相对表达量的比值见表6。对移植入3个研究样本的三个辅助生殖妇女进行持续追踪回访，三个妇女均正常分娩，对孩子持续追踪回访至1岁半，孩子各项指标均正常。
表6

Claims (7)

1.在人辅助生殖囊胚植入前进行出生安全性预测的试剂盒，包括用于检测来自人辅助生殖囊胚的滋养外胚层的细胞中97个基因的表达量的产品；所述97个基因为人的下述A1)-A97)的基因：A1)ACE2基因；A2)MINA基因；A3)GPR126基因；A4)PCDH1基因；A5)ADAMTSL4基因；A6)CLDN10基因；A7)DAB2基因；A8)KRT80基因；A9)TFRC基因；A10)GRHL2基因；A11)COBLL1基因；A12)ICK基因；A13)NIPAL1基因；A14)EFHD1基因；A15)MED12L基因；A16)CD46基因；A17)ATF3基因；A18)MAPK14基因；A19)TLE3基因；A20)BIN2基因；A21)UBA6基因；A22)HSH2D基因；A23)USP53基因；A24)TLK1基因；A25)PTGES基因；A26)DIRC2基因；A27)ENPEP基因；A28)SORBS1基因；A29)ITCH基因；A30)SCYL2基因；A31)PLAC8基因；A32)USP15基因；A33)AFF4基因；A34)CD55基因；A35)ERO1L基因；A36)ERAP1基因；A37)HEATR5A基因；A38)GM2A基因；A39)MESDC2基因；A40)CCSER2基因；A41)GOLGA4基因；A42)CCDC186基因；A43)ASAH1基因；A44)FHL2基因；A45)GPD1L基因；A46)IFI30基因；A47)CTSL1基因；A48)CLN8基因；A49)ATP1B3基因；A50)DPPA3基因；A51)KRT18基因；A52)AZIN1基因；A53)CLTB基因；A54)SPPL2A基因；A55)GATA2基因；A56)CDYL基因；A57)ENTPD1基因；A58)AGFG1基因；A59)GATA3基因；A60)MYOF基因；A61)HEXB基因；A62)WWC1基因；A63)ATMIN基因；A64)NUS1基因；A65)IQGAP1基因；A66)TRIM33基因；A67)EZR基因；A68)IDH3A基因；A69)DCP2基因；A70)TTC28基因；A71)SPIN4基因；A72)ELMOD2基因；A73)KLF3基因；A74)ZNF415基因；A75)PRSS23基因；A76)OSBPL6基因；A77)FAT1基因；A78)LRIG3基因；A79)GALNT10基因；A80)ABCC4基因；A81)SLCO4C1基因；A82)CFL2基因；A83)SC5DL基因；A84)UGCG基因；A85)SPOPL基因；A86)BMPR1A基因；A87)ZNF277基因；A88)HMGCS1基因；A89)ACADSB基因；A90)UBXN2B基因；A91)CDCA2基因；A92)FOXN3基因；A93)ODC1基因；A94)KIN基因；A95)ACAT1基因；A96)KHDRBS3基因；A97)KPNA3基因。
2.如权利要求1所述的试剂盒，其特征在于：所述试剂盒包括记载有如下内容的载体：以来自人辅助生殖囊胚的滋养外胚层的细胞作为待测样品，检测所述待测样品中所述97个基因表达量，根据所述待测样品中所述97个基因表达量对所述人辅助生殖囊胚植入前进行出生安全性预测。
3.如权利要求1或2所述的试剂盒，其特征在于：所述辅助生殖囊胚为体外人工受精第5天植入前的囊胚。
4.用于检测来自人辅助生殖囊胚的滋养外胚层的细胞中97个基因的表达量的产品在制备权利要求1或2或3所述试剂盒中的应用；所述97个基因为权利要求1所述的97个基因。
5.如权利要求4所述的应用，其特征在于：所述人辅助生殖囊胚为体外人工受精第5天植入前的囊胚。
6.用于检测来自辅助生殖囊胚的滋养外胚层的细胞中97个基因的表达量的产品和权利要求2所述的载体在制备权利要求1或2或3所述试剂盒中的应用；所述97个基因为权利要求1所述的97个基因。
7.如权利要求6所述的应用，其特征在于：所述辅助生殖囊胚为体外人工受精第5天植入人体前的囊胚。
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* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN107419029A (zh) * 2017-09-18 2017-12-01 北京积水潭医院 一种筛选优质囊胚的试剂盒
CN108913767A (zh) * 2018-07-20 2018-11-30 中南大学湘雅医院 一种帕金森病致病基因、试剂盒及应用
CN109251982B (zh) * 2018-08-14 2021-11-09 深圳市罗湖区人民医院 Adgrg6增强子的突变序列、检测方法、所用的特异性引物对和应用
CN109136172B (zh) * 2018-09-11 2022-02-11 苏州市立医院 提高囊胚率的小鼠精子体外培养试剂盒及其使用方法
CN110055328A (zh) * 2019-03-28 2019-07-26 昆明医科大学第一附属医院 一种基于代谢基因谱的肺腺癌诊断标志物

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102459635A (zh) * 2009-04-17 2012-05-16 国家医疗保健研究所 用于选择对于妊娠结果具有高潜能的感受态卵母细胞和感受态胚胎的方法
CN102770558A (zh) * 2009-11-05 2012-11-07 香港中文大学 由母本生物样品进行胎儿基因组的分析
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Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102459635A (zh) * 2009-04-17 2012-05-16 国家医疗保健研究所 用于选择对于妊娠结果具有高潜能的感受态卵母细胞和感受态胚胎的方法
CN102770558A (zh) * 2009-11-05 2012-11-07 香港中文大学 由母本生物样品进行胎儿基因组的分析
CN103740827A (zh) * 2014-01-13 2014-04-23 香港中文大学深圳研究院 胎儿dna芯片及其应用

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