CN103966321A - 一种区域选择性抗生物污染阵列芯片的制备方法 - Google Patents
一种区域选择性抗生物污染阵列芯片的制备方法 Download PDFInfo
- Publication number
- CN103966321A CN103966321A CN201410168551.9A CN201410168551A CN103966321A CN 103966321 A CN103966321 A CN 103966321A CN 201410168551 A CN201410168551 A CN 201410168551A CN 103966321 A CN103966321 A CN 103966321A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- chip
- array
- monomer
- biological
- biological contamination
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 238000011109 contamination Methods 0.000 title claims description 77
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 title claims description 23
- 239000000178 monomer Substances 0.000 claims abstract description 72
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 48
- -1 polydimethylsiloxane Polymers 0.000 claims abstract description 28
- 238000000018 DNA microarray Methods 0.000 claims abstract description 24
- 238000010559 graft polymerization reaction Methods 0.000 claims abstract description 23
- 239000011521 glass Substances 0.000 claims abstract description 14
- XUIMIQQOPSSXEZ-UHFFFAOYSA-N Silicon Chemical compound [Si] XUIMIQQOPSSXEZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 13
- 229910052710 silicon Inorganic materials 0.000 claims abstract description 13
- 239000010703 silicon Substances 0.000 claims abstract description 13
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 claims abstract description 11
- 239000004205 dimethyl polysiloxane Substances 0.000 claims abstract description 10
- 229920000435 poly(dimethylsiloxane) Polymers 0.000 claims abstract description 10
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 130
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 65
- 239000000243 solution Substances 0.000 claims description 63
- CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N Acetone Chemical compound CC(C)=O CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 55
- KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N Isopropanol Chemical compound CC(C)O KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 48
- UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N Benzene Chemical compound C1=CC=CC=C1 UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 33
- XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N Ethyl acetate Chemical compound CCOC(C)=O XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 30
- YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N Toluene Chemical compound CC1=CC=CC=C1 YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 27
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 19
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N Diethyl ether Chemical compound CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 18
- VLKZOEOYAKHREP-UHFFFAOYSA-N n-Hexane Chemical compound CCCCCC VLKZOEOYAKHREP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 18
- 239000002904 solvent Substances 0.000 claims description 17
- WYURNTSHIVDZCO-UHFFFAOYSA-N Tetrahydrofuran Chemical compound C1CCOC1 WYURNTSHIVDZCO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 16
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 16
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 16
- 238000005406 washing Methods 0.000 claims description 13
- 239000006087 Silane Coupling Agent Substances 0.000 claims description 12
- 230000035484 reaction time Effects 0.000 claims description 12
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 12
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 claims description 11
- 150000003141 primary amines Chemical group 0.000 claims description 10
- OWPUOLBODXJOKH-UHFFFAOYSA-N 2,3-dihydroxypropyl prop-2-enoate Chemical class OCC(O)COC(=O)C=C OWPUOLBODXJOKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 claims description 9
- RPQRDASANLAFCM-UHFFFAOYSA-N oxiran-2-ylmethyl prop-2-enoate Chemical group C=CC(=O)OCC1CO1 RPQRDASANLAFCM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- NIXOWILDQLNWCW-UHFFFAOYSA-N 2-Propenoic acid Natural products OC(=O)C=C NIXOWILDQLNWCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims description 8
- YLQBMQCUIZJEEH-UHFFFAOYSA-N tetrahydrofuran Natural products C=1C=COC=1 YLQBMQCUIZJEEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- XDTMQSROBMDMFD-UHFFFAOYSA-N Cyclohexane Chemical compound C1CCCCC1 XDTMQSROBMDMFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 6
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 claims description 6
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 6
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 6
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 6
- 239000002245 particle Substances 0.000 claims description 6
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 claims description 6
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 claims description 6
- 150000003335 secondary amines Chemical class 0.000 claims description 6
- 125000003700 epoxy group Chemical group 0.000 claims description 5
- 239000003208 petroleum Substances 0.000 claims description 5
- SMZOUWXMTYCWNB-UHFFFAOYSA-N 2-(2-methoxy-5-methylphenyl)ethanamine Chemical compound COC1=CC=C(C)C=C1CCN SMZOUWXMTYCWNB-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- FEWFXBUNENSNBQ-UHFFFAOYSA-N 2-hydroxyacrylic acid Chemical class OC(=C)C(O)=O FEWFXBUNENSNBQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- OMIGHNLMNHATMP-UHFFFAOYSA-N 2-hydroxyethyl prop-2-enoate Chemical class OCCOC(=O)C=C OMIGHNLMNHATMP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- SECXISVLQFMRJM-UHFFFAOYSA-N N-Methylpyrrolidone Chemical compound CN1CCCC1=O SECXISVLQFMRJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims description 4
- 239000007822 coupling agent Substances 0.000 claims description 4
- FZHAPNGMFPVSLP-UHFFFAOYSA-N silanamine Chemical compound [SiH3]N FZHAPNGMFPVSLP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- MJEMIOXXNCZZFK-UHFFFAOYSA-N ethylone Chemical compound CCNC(C)C(=O)C1=CC=C2OCOC2=C1 MJEMIOXXNCZZFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N N,N-Dimethylformamide Chemical compound CN(C)C=O ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 3
- 150000005215 alkyl ethers Chemical class 0.000 claims 1
- 239000000523 sample Substances 0.000 abstract description 13
- 238000001179 sorption measurement Methods 0.000 abstract description 8
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 abstract description 4
- 239000000463 material Substances 0.000 abstract description 2
- 238000003672 processing method Methods 0.000 abstract description 2
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 abstract 1
- 238000002444 silanisation Methods 0.000 abstract 1
- KWIUHFFTVRNATP-UHFFFAOYSA-N Betaine Natural products C[N+](C)(C)CC([O-])=O KWIUHFFTVRNATP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 19
- KWIUHFFTVRNATP-UHFFFAOYSA-O N,N,N-trimethylglycinium Chemical compound C[N+](C)(C)CC(O)=O KWIUHFFTVRNATP-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 19
- 229960003237 betaine Drugs 0.000 description 19
- 238000004528 spin coating Methods 0.000 description 12
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 11
- CLSIFQGHPQDTHQ-DTWKUNHWSA-N (2s,3r)-2-[(4-carboxyphenyl)methyl]-3-hydroxybutanedioic acid Chemical compound OC(=O)[C@H](O)[C@@H](C(O)=O)CC1=CC=C(C(O)=O)C=C1 CLSIFQGHPQDTHQ-DTWKUNHWSA-N 0.000 description 8
- 235000012431 wafers Nutrition 0.000 description 7
- ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N Formamide Chemical compound NC=O ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 229910021642 ultra pure water Inorganic materials 0.000 description 6
- 239000012498 ultrapure water Substances 0.000 description 6
- BXPPRGNMONDMBI-UHFFFAOYSA-N 1-ethoxy-2-[2-[2-[2-(2-hydroxyethoxy)ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanol;prop-2-enoic acid Chemical compound OC(=O)C=C.CCOC(O)COCCOCCOCCOCCO BXPPRGNMONDMBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 5
- 229920002818 (Hydroxyethyl)methacrylate Polymers 0.000 description 4
- 0 C*(C*N(C)C)S(C)(=O)=O Chemical compound C*(C*N(C)C)S(C)(=O)=O 0.000 description 4
- 241000252506 Characiformes Species 0.000 description 4
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 4
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 4
- 125000001495 ethyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 4
- VOZRXNHHFUQHIL-UHFFFAOYSA-N glycidyl methacrylate Chemical compound CC(=C)C(=O)OCC1CO1 VOZRXNHHFUQHIL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- OSNIIMCBVLBNGS-UHFFFAOYSA-N 1-(1,3-benzodioxol-5-yl)-2-(dimethylamino)propan-1-one Chemical compound CN(C)C(C)C(=O)C1=CC=C2OCOC2=C1 OSNIIMCBVLBNGS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- ZSZRUEAFVQITHH-UHFFFAOYSA-N 2-(2-methylprop-2-enoyloxy)ethyl 2-(trimethylazaniumyl)ethyl phosphate Chemical compound CC(=C)C(=O)OCCOP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C ZSZRUEAFVQITHH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- WOBHKFSMXKNTIM-UHFFFAOYSA-N Hydroxyethyl methacrylate Chemical compound CC(=C)C(=O)OCCO WOBHKFSMXKNTIM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 3
- 238000003491 array Methods 0.000 description 3
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 3
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 3
- 125000000118 dimethyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 3
- 230000005284 excitation Effects 0.000 description 3
- PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N gold Chemical compound [Au] PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000010931 gold Substances 0.000 description 3
- 229910052737 gold Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000002105 nanoparticle Substances 0.000 description 3
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 3
- QRIMLDXJAPZHJE-UHFFFAOYSA-N 2,3-dihydroxypropyl 2-methylprop-2-enoate Chemical compound CC(=C)C(=O)OCC(O)CO QRIMLDXJAPZHJE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CSWRCKVZMMKVDC-UHFFFAOYSA-N 3-[dimethyl-[2-(2-methylprop-2-enoyloxy)ethyl]azaniumyl]propanoate Chemical class CC(=C)C(=O)OCC[N+](C)(C)CCC([O-])=O CSWRCKVZMMKVDC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SJECZPVISLOESU-UHFFFAOYSA-N 3-trimethoxysilylpropan-1-amine Chemical compound CO[Si](OC)(OC)CCCN SJECZPVISLOESU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XDLMVUHYZWKMMD-UHFFFAOYSA-N 3-trimethoxysilylpropyl 2-methylprop-2-enoate Chemical compound CO[Si](OC)(OC)CCCOC(=O)C(C)=C XDLMVUHYZWKMMD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N Ethylene glycol Chemical compound OCCO LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- BAVYZALUXZFZLV-UHFFFAOYSA-O Methylammonium ion Chemical compound [NH3+]C BAVYZALUXZFZLV-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 2
- BLRPTPMANUNPDV-UHFFFAOYSA-N Silane Chemical compound [SiH4] BLRPTPMANUNPDV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 2
- 229910000077 silane Inorganic materials 0.000 description 2
- WYTZZXDRDKSJID-UHFFFAOYSA-N (3-aminopropyl)triethoxysilane Chemical compound CCO[Si](OCC)(OCC)CCCN WYTZZXDRDKSJID-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PSBDWGZCVUAZQS-UHFFFAOYSA-N (dimethylsulfonio)acetate Chemical compound C[S+](C)CC([O-])=O PSBDWGZCVUAZQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VILCJCGEZXAXTO-UHFFFAOYSA-N 2,2,2-tetramine Chemical compound NCCNCCNCCN VILCJCGEZXAXTO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SXGZJKUKBWWHRA-UHFFFAOYSA-N 2-(N-morpholiniumyl)ethanesulfonate Chemical compound [O-]S(=O)(=O)CC[NH+]1CCOCC1 SXGZJKUKBWWHRA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SEILKFZTLVMHRR-UHFFFAOYSA-N 2-phosphonooxyethyl 2-methylprop-2-enoate Chemical compound CC(=C)C(=O)OCCOP(O)(O)=O SEILKFZTLVMHRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FPQQSJJWHUJYPU-UHFFFAOYSA-N 3-(dimethylamino)propyliminomethylidene-ethylazanium;chloride Chemical compound Cl.CCN=C=NCCCN(C)C FPQQSJJWHUJYPU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NIXOWILDQLNWCW-UHFFFAOYSA-M Acrylate Chemical compound [O-]C(=O)C=C NIXOWILDQLNWCW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 102100023635 Alpha-fetoprotein Human genes 0.000 description 1
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O Ammonium Chemical compound [NH4+] QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- HAYQTUCTQTWZGI-UHFFFAOYSA-N C(C)O.C(CCCN)N Chemical compound C(C)O.C(CCCN)N HAYQTUCTQTWZGI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 1
- QUSNBJAOOMFDIB-UHFFFAOYSA-N Ethylamine Chemical class CCN QUSNBJAOOMFDIB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NQTADLQHYWFPDB-UHFFFAOYSA-N N-Hydroxysuccinimide Chemical compound ON1C(=O)CCC1=O NQTADLQHYWFPDB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 1
- PWKQWSBUJOHVID-UHFFFAOYSA-N OC.CO[SiH](OC)OC Chemical compound OC.CO[SiH](OC)OC PWKQWSBUJOHVID-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 108010026331 alpha-Fetoproteins Proteins 0.000 description 1
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 description 1
- 229910021538 borax Inorganic materials 0.000 description 1
- 229940098773 bovine serum albumin Drugs 0.000 description 1
- GHWVXCQZPNWFRO-UHFFFAOYSA-N butane-2,3-diamine Chemical compound CC(N)C(C)N GHWVXCQZPNWFRO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 1
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 1
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- OEYIOHPDSNJKLS-UHFFFAOYSA-N choline Chemical compound C[N+](C)(C)CCO OEYIOHPDSNJKLS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960001231 choline Drugs 0.000 description 1
- 238000003759 clinical diagnosis Methods 0.000 description 1
- 230000015271 coagulation Effects 0.000 description 1
- 238000005345 coagulation Methods 0.000 description 1
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 description 1
- 238000009792 diffusion process Methods 0.000 description 1
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 1
- GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N fluorescein Chemical compound O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N fluorescein-5-isothiocyanate Chemical compound O1C(=O)C2=CC(N=C=S)=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 1
- 238000007306 functionalization reaction Methods 0.000 description 1
- CGQIJXYITMTOBI-UHFFFAOYSA-N hex-5-enyl(trimethoxy)silane Chemical compound CO[Si](OC)(OC)CCCCC=C CGQIJXYITMTOBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WGCNASOHLSPBMP-UHFFFAOYSA-N hydroxyacetaldehyde Natural products OCC=O WGCNASOHLSPBMP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000002540 isothiocyanates Chemical class 0.000 description 1
- 239000007769 metal material Substances 0.000 description 1
- FQPSGWSUVKBHSU-UHFFFAOYSA-N methacrylamide Chemical compound CC(=C)C(N)=O FQPSGWSUVKBHSU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 1
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 1
- 238000011056 performance test Methods 0.000 description 1
- 239000002861 polymer material Substances 0.000 description 1
- 238000006116 polymerization reaction Methods 0.000 description 1
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 1
- 230000008569 process Effects 0.000 description 1
- 125000001436 propyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 238000004445 quantitative analysis Methods 0.000 description 1
- 230000004044 response Effects 0.000 description 1
- 239000004328 sodium tetraborate Substances 0.000 description 1
- 235000010339 sodium tetraborate Nutrition 0.000 description 1
- 238000004611 spectroscopical analysis Methods 0.000 description 1
- 239000011550 stock solution Substances 0.000 description 1
- 229940117986 sulfobetaine Drugs 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- QUNSENANWRESNO-UHFFFAOYSA-N toluene trimethoxysilane Chemical compound CO[SiH](OC)OC.Cc1ccccc1 QUNSENANWRESNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000012876 topography Methods 0.000 description 1
- BPSIOYPQMFLKFR-UHFFFAOYSA-N trimethoxy-[3-(oxiran-2-ylmethoxy)propyl]silane Chemical compound CO[Si](OC)(OC)CCCOCC1CO1 BPSIOYPQMFLKFR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000000870 ultraviolet spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6834—Enzymatic or biochemical coupling of nucleic acids to a solid phase
- C12Q1/6837—Enzymatic or biochemical coupling of nucleic acids to a solid phase using probe arrays or probe chips
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Immunology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Hematology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
Abstract
本发明公开了一种基于玻璃、硅片、聚二甲基硅氧烷基体的抗生物污染阵列芯片的加工方法。采用不同抗生物污染材料分别构建芯片阵列区域和非阵列区域,使整个芯片表面都具有抗生物污染的功能,阵列区域可与生物组分反应制得功能化的生物探针阵列。具体步骤包括:基体材料表面的硅烷化;一种抗生物污染单体的接枝聚合;另外一种抗生物污染并可功能化单体的接枝聚合;生物组分与阵列区域的偶联反应。采用该方法制得的阵列式生物芯片,生物分子非特异性吸附大大减弱、探针分子密度高、信号灵敏度高。
Description
技术领域
本发明涉及一种抗生物污染阵列芯片的制备方法,属于生物芯片技术领域。
背景技术
生物芯片技术的实质是在基片上构建有序点阵,并固定探针分子,使之与被测物质结合或反应,再通过检测分析获得被测物质的分子结构以及浓度等信息。该技术具有高通量、高信息量、微型化、自动化、快速响应等优点,可应用于临床诊断、环境监测、食品安全等领域。但迄今为止,生物芯片,尤其是蛋白质芯片并没有广泛应用于临床检验。其主要原因在于,临床样品,如血液、尿样等含有大量的生物大分子,在进行分析检测时,易于在芯片表面非特异性吸附,造成芯片的背景信号强,具有分子识别能力的阵列区域也易于发生吸附,导致分析的灵敏度、特异性和准确性较差,临床误诊率较高。现有的具有抗非特异性吸附功能的芯片多采用物理吸附的方法进行表面修饰。该方法虽然操作简单,但修饰后得到的表面不牢固,重现性较差。而采用化学法修饰的生物抗吸附芯片由于反应条件苛刻,操作难度大,不易大规模批量生产。
生物芯片的基体材料包括玻璃、硅片、金属材料以及一些高分子材料。其中,玻璃、硅片由于易于实现大规模微加工而应用广泛。现有的阵列加工方法,多借助于复杂的仪器设备,如机器手点样装置等,易于造成样品点扩散、阵列大小不易控制等问题。因此,采用光聚合的方法在常用的玻璃、硅片基质表面构建阵列区域大小可控的阵列可以解决上述问题。
针对上述技术问题,本发明提供了一种抗生物污染阵列芯片的制备方法。该方法以玻璃、硅片、聚二甲基硅氧烷作为基片,以共价键的形式在基片表面接枝抗生物污染功能的单体。该方法制备步骤简单,易于程序化。制得的阵列芯片表面包含两部分,分别为具有抗生物污染功能的非阵列区域和具有抗生物污染功能并可进行功能化的阵列区域。可功能化的阵列区域可通过进一步反应与蛋白质、核酸、氨基酸、多糖或具有伯胺或仲胺的粒子等生物组分偶联制得生物探针阵列。
该生物芯片的特点包括:无需点样设备,实现阵列区域和非阵列区域选择性功能化;生物分子非特异性吸附弱,探针分子密度高,背景噪音小,信号灵敏度高;尤其在复杂生物样品中的微量蛋白质定量分析,如癌症标志物的检测方面意义重大 。
发明内容
本发明提供了一种抗生物污染阵列芯片的制备方法。该方法工艺简单,对设备要求低,制得的阵列式生物芯片探针分子密度高、背景噪音小、信号灵敏度高。该芯片的特点在于表面具有抗生物污染的功能,可以有效减少生物组分的非特异性吸附,其中阵列部分可与蛋白质、核酸、氨基酸、多糖或具有伯胺或仲胺的粒子等生物组分偶联制得生物探针阵列,在微量生物分子检测领域具有应用前景。
本发明的目的是通过以下技术方法实现的:
方法1:
一种抗生物污染阵列芯片的制备方法1,包括以下步骤:
第一步,将清洗后的玻璃或硅片或聚二甲基硅氧烷芯片,置于含不饱和键的硅烷偶联剂溶液里浸泡一定时间后,取出、干燥;
第二步,将一种含有抗生物污染单体的溶液旋涂于芯片表面,紫外光透过掩膜照射在芯片表面,引发该单体与芯片表面的接枝聚合反应,光照部分形成抗生物污染的非阵列区域,未光照部分不发生反应;用50%甲醇水溶液清洗芯片,洗去未反应的单体;
第三步,将另外一种抗生物污染并且可功能化单体的溶液旋涂在整个芯片表面,紫外光照射下,第二步中未与抗生物污染单体反应的区域与该单体发生接枝聚合反应,形成抗生物污染并可功能化的阵列区域,洗净后得到全芯片抗生物污染、阵列区域可功能化的生物芯片;
第四步,将如蛋白质、基因等生物组分,通过偶联反应固定在阵列区域表面,制得具有抗生物污染表面的新型生物芯片。
本发明的上述方法1中,所述的含不饱和键的硅烷偶联剂的结构为以下三类中的任意一种或几种:
其中R为Me或Et,R’为H或者Me,n为1-10的整数。
本发明的上述方法1中,所述的含不饱和键的硅烷偶联剂与芯片的反应时间为5分钟-20小时,反应温度为25℃-80℃,浓度为0.1%-30%,溶剂包括:苯、甲苯、丙酮、乙醇、甲醇、异丙醇、四氢呋喃中的一种或几种。
本发明的上述方法1中,所述的抗生物污染单体包括以下列举的五类中的任意一种或几种:
(1)丙烯酸磺酸基甜菜碱类化合物
其中x为2-10的整数,y为2、3或4,R为H或者Me;
(2)丙烯酸磷酸基甜菜碱类化合物
其中x为2-18的整数,R为H或者Me;
(3)丙烯酸乙二醇酯类化合物
其中x为2-10的整数,R为H或者Me;
(4)丙烯酸羟基酯类化合物
其中x为1-10的整数,R为H或者Me;
(5)丙烯酸甘油酯类化合物
其中R为H或者Me。
本发明的上述方法1中,所述的抗生物污染单体与芯片表面的接枝反应,单体浓度为0.1%-50%,溶剂包括:丙酮、甲醇、乙醇、异丙醇、乙酸乙酯、己烷,石油醚、环己烷、苯及其衍生物、烷基醚类化合物中的一种或几种。
本发明的上述方法1中,所述的抗生物污染并可功能化单体指下列丙烯酸甜菜碱类化合物中的任意一种或几种:
其中x为2、3或4,y为1、2或3,R为H或者Me。
本发明的上述方法1中,所述的抗生物污染并可功能化单体与芯片表面的接枝反应,单体浓度为0.1%-50%,溶剂包括:N-甲基吡咯烷酮,二甲基甲酰胺、甲醇、乙醇、异丙醇、丙酮、乙酸乙酯、四氢呋喃、水中的一种或几种。
本发明的上述方法1中,所述的紫外光波长315-420nm,强度8-50mW/cm2,曝光时间0.5-10分钟。
本发明的上述方法1中,所述的阵列的生物组分包括蛋白质、核酸、氨基酸、多糖或具有伯胺或仲胺的粒子。偶联反应发生在pH=7-10的缓冲溶液中,反应的时间为5-300分钟。
一种抗生物污染阵列芯片的制备方法2,包括以下步骤:
第一步,将清洗后的玻璃或硅片或聚二甲基硅氧烷芯片,置于含氨基的硅烷偶联剂溶液里浸泡一定时间后,洗净、干燥;
第二步,将芯片浸入含有丙烯酸缩水甘油酯结构试剂的溶液中,在一定的条件下反应后,洗净、干燥;
第三步,将一种含有抗生物污染单体的溶液旋涂于芯片表面,紫外光透过掩膜照射在芯片表面,引发该单体与芯片表面的接枝聚合反应,光照部分形成抗生物污染的非阵列区域,未光照部分不发生反应;用50%的甲醇水溶液洗去未反应的单体;
第四步,将另外一种抗生物污染并且可功能化单体的溶液旋涂在整个芯片表面,紫外光照射下,第三步中未与抗生物污染单体反应的区域与该单体发生接枝聚合反应,形成抗生物污染并可功能化的阵列区域,洗净后得到全芯片抗生物污染、阵列区域可功能化的生物芯片;
第五步,将如蛋白质、基因等生物组分,通过偶联反应固定在阵列区域表面,制得具有抗生物污染表面的新型生物芯片。
本发明的上述方法2中,所述的氨基硅烷偶联剂的结构为:
其中R为Me或Et,n为1-10的整数。
本发明的上述方法2中,所述的氨基硅烷偶联剂与芯片的反应时间为5分钟-20小时,反应温度为25℃-80℃,浓度为0.1%-30%,溶剂包括:苯、甲苯、丙酮、乙醇、甲醇、异丙醇、四氢呋喃中的一种或几种。
本发明的上述方法2中,所述的与芯片表面反应的丙烯酸缩水甘油酯的结构为:
其中R为H或者Me,反应时间为10分钟-24小时,反应温度为20℃-100℃,浓度为0.1%-50%,溶剂包括:丙酮、甲醇、乙醇、异丙醇、乙酸乙酯、环己烷、苯及其衍生物、乙醚中的一种或几种。
本发明的上述方法2中,所述的抗生物污染单体包括以下列举的五类中的任意一种或几种:
(1)丙烯酸磺酸基甜菜碱类化合物
其中x为2-10的整数,y为2、3或4,R为H或者Me;
(2)丙烯酸磷酸基甜菜碱类化合物
其中x为2-18的整数,R为H或者Me;
(3)丙烯酸乙二醇酯类化合物
其中x为2-10的整数,R为H或者Me;
(4)丙烯酸羟基酯类化合物
其中x为1-10的整数,R为H或者Me;
(5)丙烯酸甘油酯类化合物
其中R为H或者Me。
本发明的上述方法2中,所述的抗生物污染单体与芯片表面的接枝反应,单体浓度为0.1%-50%,溶剂包括:丙酮、甲醇、乙醇、异丙醇、乙酸乙酯、己烷,石油醚、环己烷、苯及其衍生物、烷基醚类化合物中的一种或几种。
本发明的上述方法2中,所述的抗生物污染并可功能化单体指下列丙烯酸甜菜碱类化合物中的任意一种或几种或几种:
其中x为2、3或4,y为1、2或3,R为H或者Me。
本发明的上述方法2中,所述的抗生物污染并可功能化单体与芯片表面的接枝反应,单体浓度为0.1%-50%,溶剂包括:N-甲基吡咯烷酮,二甲基甲酰胺、甲醇、乙醇、异丙醇、丙酮、乙酸乙酯、四氢呋喃、水中的一种或几种。
本发明的上述方法2中,所述的紫外光波长315-420nm,强度8-50mW/cm2,曝光时间0.5-10分钟。
本发明的上述方法2中,所述的阵列的生物组分包括蛋白质、核酸、氨基酸、多糖或具有伯胺或仲胺的粒子。偶联反应发生在pH=7-10的缓冲溶液中,反应的时间为5-300分钟。
方法3:
一种抗生物污染阵列芯片的制备方法3,包括以下步骤:
第一步,将清洗后的玻璃或硅片或聚二甲基硅氧烷芯片,置于含环氧基团的硅烷偶联剂溶液里浸泡一定时间后,洗净、干燥;
第二步,将芯片浸入含有两个或两个以上伯胺基团试剂的溶液中,在一定的条件下反应后,洗净、干燥;
第三步,将芯片浸入含有丙烯酸缩水甘油酯结构试剂的溶液中,在一定的条件下反应后,洗净、干燥;
第四步,将一种含有抗生物污染单体的溶液旋涂于芯片表面,紫外光透过掩膜照射在芯片表面,引发该单体与芯片表面的接枝聚合反应,光照部分形成抗生物污染的非阵列区域,未光照部分不发生反应;用50%的甲醇水溶液洗去未反应的单体;
第五步,将另外一种抗生物污染并且可功能化单体的溶液旋涂在整个芯片表面,紫外光照射下,第四步中未与抗生物污染单体反应的区域与该单体发生接枝聚合反应,形成抗生物污染并可功能化的阵列区域,洗净后得到全芯片抗生物污染、阵列区域可功能化的生物芯片;
第六步,将如蛋白质、基因等的生物组分,通过偶联反应固定在阵列区域表面,制得具有抗生物污染表面的新型生物芯片。
本发明的上述方法3中,所述的含有环氧基团的硅烷偶联剂结构为:
其中R为Me或Et,n为1-10的整数。
本发明的上述方法3中,所述的含有环氧基团的硅烷偶联剂与芯片的反应时间为5分钟-20小时,反应温度为25℃-80℃,浓度为0.1%-30%,溶剂包括:苯、甲苯、丙酮、乙醇、甲醇、异丙醇、四氢呋喃中的一种或几种。
本发明的上述方法3中,所述的与芯片表面反应的伯胺基团试剂的结构为以下两类中的任意一种或几种:
其中n为1-10的整数,反应时间为10分钟-24小时,温度为20℃-100℃,浓度为0.1%-50%,溶剂包括:丙酮、甲醇、乙醇、异丙醇、乙醚中的一种或几种。
本发明的上述方法3中,所述的与芯片表面反应的丙烯酸缩水甘油酯的结构为:
其中R为H或者Me,反应时间为10分钟-24小时,温度为20℃-100℃,浓度为0.1%-50%,溶剂包括:丙酮、甲醇、乙醇、异丙醇、乙酸乙酯、环己烷、苯及其衍生物、乙醚中的一种或几种。
本发明的上述方法3中,所述的抗生物污染单体包括以下列举的五类中的任意一种或几种:
(1)丙烯酸磺酸基甜菜碱类化合物
其中x为2-10的整数,y为2、3或4,R为H或者Me;
(2)丙烯酸磷酸基甜菜碱类化合物
其中x为2-18的整数,R为H或者Me;
(3)丙烯酸乙二醇酯类化合物
其中x为2-10的整数,R为H或者Me;
(4)丙烯酸羟基酯类化合物
其中x为1-10的整数,R为H或者Me;
(5)丙烯酸甘油酯类化合物
其中R为H或者Me。
本发明的上述方法3中,所述的抗生物污染单体与芯片表面的接枝反应,单体浓度为0.1%-50%,溶剂包括:丙酮、甲醇、乙醇、异丙醇、乙酸乙酯、己烷,石油醚、环己烷、苯及其衍生物、烷基醚类化合物中的一种或几种。
本发明是上述方法3中,所述的抗生物污染并可功能化单体指下列丙烯酸甜菜碱类化合物中的任意一种或几种:
其中x为2、3或4,y为1、2或3,R为H或者Me。
本发明的上述方法3中,所述的抗生物污染并可功能化单体与芯片表面的接枝反应,单体浓度为0.1%-50%,溶剂包括:N-甲基吡咯烷酮,二甲基甲酰胺、甲醇、乙醇、异丙醇、丙酮、乙酸乙酯、四氢呋喃、水中的一种或几种。
本发明的上述方法3中,所述的紫外光波长315-420nm,强度8-50mW/cm2,曝光时间0.5-10分钟。
本发明的上述方法3中,所述的阵列的生物组分包括蛋白质、核酸、氨基酸、多糖或具有伯胺或仲胺的粒子,偶联反应发生在pH=7-10的缓冲溶液中,反应的时间为5-300分钟。
具体实施方式
实施例1:一种区域选择性抗生物污染阵列芯片的制备方法
将经过Piranha溶液(H2SO4/H2O2=4/1,v/v)清洗后的1cm×1cm硅片置于2%(v/v)的5-己烯基三甲氧基硅烷的甲醇溶液中,25℃反应30分钟,用甲醇洗净并干燥。5-己烯基三甲氧基硅烷的结构如下:
将40g/L的抗生物污染单体—3-[[2-( 甲基丙烯酰氧基)乙基](二甲基)-铵]-1-丙磺酸(SBMA)甜菜碱的甲醇溶液旋涂于芯片表面,旋涂速度为2000 rpm,时间为10秒。SBMA甜菜碱的结构为:
将芯片表面铺上带有阵列图案的掩膜,转移至20mW/cm2、365nm紫外光下,照射3分钟,引发SBMA甜菜碱与芯片表面的接枝聚合形成非阵列区域。用50%甲醇水溶液洗净后,将40g/L的抗生物污染并可功能化的单体——2-羧基-N,N-二甲基-N-(2’-甲基丙烯酰氧基乙基)乙铵盐(CBMA)的甜菜碱甲醇溶液旋涂在整个芯片表面,旋涂速度为2500rpm,时间为10秒。CBMA甜菜碱的结构为:
将芯片迅速转移至18mW/cm2、365nm紫外光下照射5分钟,上一步中未与SBMA甜菜碱反应的区域与CBMA发生接枝聚合反应,形成抗生物污染并可功能化的阵列区域。用超纯水洗净后得到全芯片抗生物污染、阵列区域可功能化的生物芯片。
实施例2:一种区域选择性抗生物污染阵列芯片的制备方法
将1cm×1cm聚二甲基硅氧烷基片置于5%(v/v)的3-(甲基丙烯酰氧)丙基三甲氧基硅烷的乙醇溶液中,25℃反应2小时,用50%的甲醇水溶液洗净并干燥。3-(甲基丙烯酰氧)丙基三甲氧基硅烷的结构为:
将30g/L抗生物污染单体—甲基丙烯酸甘油酯单体的甲醇/水(甲醇/水=1/1,v/v)溶液旋涂于芯片表面,旋涂速度为1500 rpm,时间为60秒。甲基丙烯酸甘油酯的结构为:
将芯片表面铺上带有阵列图案的掩膜,转移至20mW/cm2、365nm紫外光下,紫外光透过掩膜照射在芯片表面5分钟,引发甲基丙烯酸甘油酯与芯片表面的接枝聚合形成抗生物污染非阵列区域。芯片表面用50%的甲醇水溶液洗净后,将60g/L的抗生物污染并可功能化的单体—2-羧基-N,N-二甲基-N-(丙烯酰氨基丙基)甲铵盐甜菜碱的甲醇/水(甲醇/水=1/1,v/v)溶液旋涂在整个芯片表面,旋涂速度为1500 rpm,时间为20秒。2-羧基-N,N-二甲基-N-(丙烯酰氨基丙基)甲铵盐甜菜碱的结构为:
将芯片迅速转移至18mW/cm2、365nm紫外光下照射3分钟,上一步中未与甲基丙烯酰胺磺酸基甜菜碱反应的区域与2-羧基-N,N-二甲基-N-(丙烯酰氨基丙基)甲铵盐甜菜碱发生接枝聚合反应,形成抗生物污染并可功能化的阵列区域。用50%甲醇的水溶液洗净后得到全芯片抗生物污染、阵列区域可功能化的生物芯片。
实施例3:一种区域选择性抗生物污染阵列芯片的制备方法
将经过Piranha溶液(H2SO4/H2O2=4/1,v/v)清洗后的1cm×1cm玻璃片置于2%(v/v)的3-氨丙基三乙氧基硅烷的甲苯溶液中,70℃反应5小时,用甲苯洗净并在120℃真空干燥1小时。3-氨丙基三乙氧基硅烷的结构为:
将芯片浸入10%(v/v)的甲基丙烯酸缩水甘油酯的丙酮溶液中,25℃反应8小时,用丙酮洗净并干燥。甲基丙烯酸缩水甘油酯的结构为:
将4%(v/v)的抗生物污染单体—甲基丙烯酸羟乙酯的甲醇溶液旋涂于芯片表面,旋涂速度为2500 rpm,时间为10秒。甲基丙烯酸羟乙酯的结构为:
将芯片表面铺上带有阵列图案的掩膜,转移至15mW/cm2、365nm紫外光下,紫外光透过掩膜照射在芯片表面5分钟,引发甲基丙烯酸羟乙酯与芯片表面的接枝聚合形成非阵列区域。芯片表面用超纯水(50%甲醇水溶液)洗净后,将30g/L的抗生物污染并可功能化的单体—2-羧基-N,N-二甲基-N-(丙烯酰氨基丙基)甲铵盐甜菜碱的甲醇溶液旋涂在整个芯片表面,旋涂速度为3000 rpm,时间为10秒。将芯片迅速转移至18mW/cm2、365nm紫外光下照射3分钟,上一步中未与甲基丙烯酸羟乙酯反应的区域与2-羧基-N,N-二甲基-N-(丙烯酰氨基丙基)甲铵盐甜菜碱发生接枝聚合反应,形成抗生物污染并可功能化的阵列区域。用50%的甲醇水溶液洗净后得到全芯片抗生物污染、阵列区域可功能化的生物芯片。
实施例4:一种区域选择性抗生物污染阵列芯片的制备方法
将经过Piranha溶液(H2SO4/H2O2=4/1,v/v)清洗后的1cm×1cm玻璃片置于2%(v/v)的3-氨丙基三甲氧基硅烷的甲苯溶液,70℃反应5小时,用甲苯洗净后140℃真空干燥1小时。3-氨丙基三甲氧基硅烷的结构为:
将芯片浸入5%(v/v)的丙烯酸缩水甘油酯的异丙醇溶液中,55℃反应5小时,用异丙醇洗净并干燥。丙烯酸缩水甘油酯的结构为:
将40g/L的抗生物污染单体——丙烯酸乙氧基五缩乙二醇酯的乙醇/水(乙醇/水=1/1,v/v)溶液旋涂于芯片表面,旋涂速度为3000 rpm,时间为15秒。丙烯酸乙氧基五缩乙二醇酯的结构为:
将芯片表面铺上带有阵列图案的掩膜,转移至14mW/cm2、365nm紫外光下,紫外光透过掩膜照射在芯片表面2分钟,引发丙烯酸乙氧基五缩乙二醇酯与芯片表面的接枝聚合反应形成非阵列区域。芯片表面用超纯水(50%甲醇水溶液)洗净后将40g/L的抗生物污染并可功能化的单体—CBMA甜菜碱的乙醇/水(乙醇/水=1/1,v/v)溶液旋涂在整个芯片表面,旋涂速度为3000 rpm,时间为15秒。将芯片迅速转移至18mW/cm2、365nm紫外光下照射2分钟,上一步中未与丙烯酸乙氧基五缩乙二醇酯反应的区域与CBMA甜菜碱发生接枝聚合反应,形成抗生物污染并可功能化的阵列区域。用超纯水洗净后得到全芯片抗生物污染、阵列区域可功能化的生物芯片。
实施例5:一种区域选择性抗生物污染阵列芯片的制备方法
将经过Piranha溶液(H2SO4/H2O2=4/1,v/v)清洗后的1cm×1cm玻璃片置于2%(v/v)的3-缩水甘油醚氧基丙基三甲氧基硅烷甲苯溶液中,25℃反应12小时,用甲苯洗净后140℃干燥1小时。3-缩水甘油醚氧基丙基三甲氧基硅烷的结构为:
将芯片浸入10%(v/v)的三乙烯四胺的异丙醇溶液中,35℃反应2小时,用异丙醇洗净并干燥。三乙烯四胺的结构为:
将芯片浸入10%(v/v)的甲基丙烯酸缩水甘油酯的异丙醇溶液中,55℃反应5小时,用异丙醇洗净并干燥。将80g/L的抗生物污染单体—2-甲基丙烯酰氧基乙基磷酸胆碱甜菜碱的甲醇溶液旋涂于芯片表面,旋涂速度为3000 rpm,时间为10秒。2-甲基丙烯酰氧基乙基磷酸胆碱甜菜碱的结构为:
将芯片表面铺上带有阵列图案的掩膜,转移至10mW/cm2、365nm紫外光下,紫外光透过掩膜照射在芯片表面5分钟,引发2-甲基丙烯酰氧基乙基磷酸胆碱甜菜碱与芯片表面的接枝聚合反应形成非阵列区域。芯片表面用50%甲醇水溶液洗净后将40g/L的抗生物污染并可功能化的单体—CBMA甜菜碱的甲醇溶液旋涂在整个芯片表面,旋涂速度为2000rpm,时间为10秒。将芯片迅速转移至15mW/cm2、365nm紫外光下照射3分钟,上一步中未与2-甲基丙烯酰氧基乙基磷酸胆碱甜菜碱反应的区域与CBMA甜菜碱发生接枝聚合反应,形成抗生物污染并可功能化的阵列区域。用超纯水洗净后得到全芯片抗生物污染、阵列区域可功能化的生物芯片。
实施例6:一种区域选择性抗生物污染阵列芯片的制备方法
将1cm×1cm聚二甲基硅氧烷置于1% (v/v)的3-缩水甘油醚氧基丙基三甲氧基硅烷甲醇溶液中,25℃反应2小时,用甲醇洗净并干燥。再将芯片浸入10% (v/v) 1,4-二氨基丁烷的乙醇溶液中,35℃反应2小时,用乙醇洗净并干燥。二氨基丁烷的结构为:
将芯片浸入5% (v/v)的甲基丙烯酸缩水甘油酯的异丙醇溶液中,55℃反应5小时,用异丙醇洗净并干燥。将5% (v/v)的抗生物污染单体—丙烯酸甘油酯的乙醇溶液旋涂于芯片表面,旋涂速度为2500rpm,时间为10秒。丙烯酸甘油酯的结构为:
将芯片表面铺上带有阵列图案的掩膜,转移至14mW/cm2、365nm紫外光下,紫外光透过掩膜照射在芯片表面3分钟,引发丙烯酸甘油酯与芯片表面的接枝聚合反应形成非阵列区域。芯片表面用50%甲醇水溶液洗净后将40g/L的抗生物污染并可功能化的单体—CBMA甜菜碱的甲醇溶液旋涂在整个芯片表面,旋涂速度为2500rpm,时间为15秒。将芯片迅速转移至10mW/cm2、365nm紫外光下照射3分钟,上一步中未与丙烯酸甘油酯反应的区域与CBMA甜菜碱发生接枝聚合反应,形成抗生物污染并可功能化的阵列区域。用超纯水洗净后得到全芯片抗生物污染、阵列区域可功能化的生物芯片。
实施例7:一种区域选择性抗生物污染阵列芯片的应用
芯片的制备方法同实施例1。将制得的芯片置于新鲜配置的30 mM 1-(3-二甲氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺盐酸盐和15 mM N-羟基琥珀酰亚胺(溶于10 mM 2-(N-吗啉代)乙磺酸缓冲溶液)的混合液(pH=5)中活化芯片表面羧基基团,15分钟后用PBS缓冲溶液洗净芯片。
将洗净后的芯片分为三组,分别置于1000 μL 100 μg/mL的抗甲胎蛋白、1000μL 1×10-5 M/mL 5’-NH2-GGTTGGTGTGGTTGG-3’溶液、异硫氰酸荧光素标记的金纳米粒子(5 nm直径,浓度1×10-4%)的硼砂缓冲溶液(pH=9)中,恒温震荡箱中30℃反应,得到抗体阵列、DNA阵列、金纳米粒子阵列。
将金纳米粒子阵列芯片置于荧光显微镜488nm激发光下,可观察阵列区域处绿色荧光显示的阵列形貌;在抗体阵列表面滴加含有异硫氰酸荧光素标记的甲胎蛋白的血液,反应10分钟后,用PBS缓冲溶液冲洗芯片,置于荧光显微镜488nm激发光下,可观察阵列区域处绿色荧光显示的阵列形貌;将DNA阵列芯片表面滴加含有羧基四甲基罗丹明标记的凝血酵素的血液,反应10分钟后,用PBS缓冲溶液冲洗芯片,置于荧光显微镜543nm激发光下,可观察阵列区域处红色荧光显示的阵列形貌。分别将阵列形貌拍照,测量荧光强度。将芯片置于原子力显微镜下扫描,测量阵列的表面形貌。
实施例8:抗生物污染芯片的表征
紫外可见光度法标准曲线的制作:
配置1 mg/mL的牛血清白蛋白(全组分BSA)母液,用PBS溶液稀释至0.05 mg/mL、0.06mg/mL、0.07mg/mL、0.08mg/mL、0.09mg/mL、0.10 mg/mL、0.11mg/mL、0.12mg/mL、0.13mg/mL、0.14mg/mL、0.15 mg/mL。浓度为0 mg/mL 的溶液为校准归零液。将紫外可见分光光度计校准并归零,从低到高依次取不同浓度的溶液1 mL 于比色皿中,测定278 nm 处吸光度。结果重复3遍,取平均值。以蛋白浓度为横坐标、吸光度为纵坐标,绘制标准曲线并拟合,得到吸光度对应蛋白浓度关系为: A= 0.56×C-0.008,R2=0.9952。
不同抗生物污染单体接枝后抗生物污染性能测试:
芯片的制备方法同实施例1。取大小为2.5×2.5cm、分别接枝了3-[[2-( 甲基丙烯酰氧基)乙基](二甲基)-铵]-1-丙磺酸(样品1)、2-羧基-N,N-二甲基-N-(2’-甲基丙烯酰氧基乙基)乙铵盐(样品2)、丙烯酸乙氧基五缩乙二醇酯(样品3)、甲基丙烯酸羟乙酯(样品4)、丙烯酸甘油酯(样品5)的硅片,表面滴加200 μL 0.01 mg/mL 的BSA溶液,室温下静置1小时后,收集表面剩余溶液,浓缩至15 μL,经紫外可见光度法测得吸光度分别为A1= 0.060;A2= 0.059;A3= 0.051;A4= 0.049;A5=0.045;对应的BSA浓度为C1= 0.1214 mg/mL;C2= 0.1196 mg/mL;C3= 0.1054 mg/mL;C4= 0.1018 mg/mL;C5= 0.0946 mg/mL;经计算,表面接枝不同组分的芯片表面对BSA的吸附量分别为:3-[[2-( 甲基丙烯酰氧基)乙基](二甲基)-铵]-1-丙磺酸28.64 ng/cm2, 2-羧基-N,N-二甲基-N-(2’-甲基丙烯酰氧基乙基)乙铵盐32.96 ng/cm2, 丙烯酸乙氧基五缩乙二醇酯 67.04 ng/cm2, 甲基丙烯酸羟乙酯75.68 ng/cm2,丙烯酸甘油酯92.96 ng/cm2。
Claims (15)
1.一种抗生物污染阵列芯片的制备方法1,包括以下步骤:
第一步,将清洗后的玻璃或硅片或聚二甲基硅氧烷芯片置于含不饱和键的硅烷偶联剂溶液里浸泡一定时间后,取出、干燥;
第二步,将一种含有抗生物污染单体的溶液旋涂于芯片表面,紫外光透过掩膜照射在芯片表面,引发该单体与芯片表面的接枝聚合反应,光照部分形成抗生物污染的非阵列区域,未光照部分不发生反应;用50%甲醇水溶液清洗芯片,洗去未反应的单体;
第三步,将另外一种抗生物污染并且可功能化单体的溶液旋涂在整个芯片表面,紫外光照射下,第二步中未与抗生物污染单体反应的区域与该抗生物污染并且可功能化单体发生接枝聚合反应,形成抗生物污染并可功能化的阵列区域,洗净后得到全芯片抗生物污染、阵列区域可功能化的生物芯片;
第四步,将如蛋白质、基因等生物组分,通过偶联反应固定在阵列区域表面,制得具有抗生物污染表面的新型生物芯片。
2.一种抗生物污染阵列芯片的制备方法2,包括以下步骤:
第一步,将清洗后的玻璃或硅片或聚二甲基硅氧烷芯片,置于氨基硅烷偶联剂溶液里浸泡一定时间后,洗净、干燥;
第二步,将芯片浸入含有丙烯酸缩水甘油酯结构的试剂溶液中,在一定的条件下反应后,洗净、干燥;
第三步,将一种含有抗生物污染单体的溶液旋涂于芯片表面,紫外光透过掩膜照射在芯片表面,引发该单体与芯片表面的接枝聚合反应,光照部分形成抗生物污染的非阵列区域,未光照部分不发生反应;用50%甲醇水溶液清洗芯片,洗去未反应的单体;
第四步,将另外一种抗生物污染并且可功能化单体的溶液旋涂在整个芯片表面,紫外光照射下,第三步中未与抗生物污染单体反应的区域与该抗生物污染并且可功能化单体发生接枝聚合反应,形成抗生物污染并可功能化的阵列区域,洗净后得到全芯片抗生物污染、阵列区域可功能化的生物芯片;
第五步,将如蛋白质、基因等生物组分,通过偶联反应功能化在阵列区域表面,制得具有抗生物污染表面的新型生物芯片。
3. 一种抗生物污染阵列芯片的制备方法3,包括以下步骤:
第一步,将清洗后的玻璃或硅片或聚二甲基硅氧烷芯片,置于含环氧基团的硅烷偶联剂溶液里浸泡一定时间后,洗净、干燥;
第二步,将芯片浸入含有两个或两个以上伯胺基团试剂的溶液中,在一定的反应条件下反应后,洗净、干燥;
第三步,将芯片浸入含有丙烯酸缩水甘油酯结构试剂的溶液中,在一定的反应条件下反应后,洗净、干燥;
第四步,将一种含有抗生物污染单体的溶液旋涂于芯片表面,紫外光透过掩膜照射在芯片表面,引发该单体与芯片表面的接枝聚合反应,光照部分形成抗生物污染的非阵列区域,未光照部分不发生反应;用50%甲醇水溶液清洗芯片,洗去未反应的单体;
第五步,将另外一种抗生物污染并且可功能化单体的溶液旋涂在整个芯片表面,紫外光照射下,第四步中未与抗生物污染单体反应的区域与该抗生物污染并且可功能化单体发生接枝聚合反应,形成抗生物污染并可功能化的阵列区域,洗净后得到全芯片抗生物污染、阵列区域可功能化的生物芯片;
第六步,将如蛋白质、基因等生物组分,通过偶联反应功能化在阵列区域表面,制得具有抗生物污染表面的新型生物芯片。
4.如权利1所述的抗生物污染阵列芯片的制备方法1,其特征在于:含不饱和键的硅烷偶联剂的结构为以下三类中的任意一种或几种:
其中R为Me或Et,R’为H或Me,n为1-10的整数。
5.如权利2所述的区域选择性抗生物污染阵列芯片的制备方法2,其特征在于:氨基硅烷偶联剂的结构为:
其中R为Me或Et,n为1-10的整数。
6.如权利3所述的区域选择性抗生物污染阵列芯片的制备方法3,其特征在于:含环氧基团的硅烷偶联剂结构为:
其中R为Me或Et,n为1-10的整数。
7.如权利2或3所述的区域选择性抗生物污染阵列芯片的制备方法2或3,其特征在于:与芯片表面反应的丙烯酸缩水甘油酯的结构为:
其中R为H或Me,反应时间为10分钟-24小时,反应温度为20℃-100℃,浓度为0.1%-50%,溶剂包括:丙酮、甲醇、乙醇、异丙醇、乙酸乙酯、己烷,石油醚、环己烷、苯及其衍生物、烷基醚类中的一种或几种。
8.如权利3所述的区域选择性抗生物污染阵列芯片的制备方法3,其特征在于:与芯片表面反应的伯胺基团试剂的结构为以下两类中任意一种或几种:
其中n为1-10的整数,反应时间为10分钟-24小时,温度为20℃-100℃,浓度为0.1%-50%,溶剂包括:丙酮、甲醇、乙醇、异丙醇、乙醚中的一种或几种。
9.如权利1、2或3所述的任意一项区域选择性抗生物污染阵列芯片的制备方法,其特征在于:硅烷偶联剂与芯片的反应时间为5分钟-20小时,温度为25℃-80℃,浓度为0.1%-30%,溶剂包括:苯、甲苯、丙酮、乙醇、甲醇、异丙醇、四氢呋喃中的一种或几种。
10.如权利1、2或3所述的任意一项区域选择性抗生物污染阵列芯片的制备方法,其特征在于:抗生物污染单体包括下面列举的五类中的任意一种或几种:
(1)丙烯酸磺酸基甜菜碱类化合物
其中x为2-10的整数,y为2、3或4,R为H或者Me;
(2)丙烯酸磷酸基甜菜碱类化合物
其中x为2-18的整数,R为H或者Me;
(3)丙烯酸乙二醇酯类化合物
其中x为2-10的整数,R为H或者Me;
(4)丙烯酸羟基酯类化合物
其中x为1-10的整数,R为H或者Me;
(5)丙烯酸甘油酯类化合物
其中R为H或者Me。
11.如权利1、2或3所述的任意一项区域选择性抗生物污染阵列芯片的制备方法,其特征在于:抗生物污染性能单体与芯片表面的接枝反应,其单体浓度为0.1%-50%,溶剂包括丙酮、甲醇、乙醇、异丙醇、乙酸乙酯、己烷,石油醚、环己烷、苯及其衍生物、烷基醚类化合物中的一种或几种。
12.如权利1、2或3所述的任意一项区域选择性抗生物污染阵列芯片的制备方法,其特征在于:抗生物污染并可功能化单体指下列丙烯酸甜菜碱类化合物中的任意一种或几种:
其中x为2、3或4,y为1、2或3,R为H或者Me。
13.如权利1、2或3所述的任意一项抗生物污染阵列芯片的制备方法,其特征在于:抗生物污染并可功能化单体与芯片表面的接枝反应,单体浓度为0.1%-50%,溶剂包括:N-甲基吡咯烷酮,二甲基甲酰胺、甲醇、乙醇、异丙醇、丙酮、四氢呋喃、水中的一种或几种。
14.如权利1、2或3所述的任意一项抗生物污染阵列芯片的制备方法,其特征在于:紫外光波长315-420nm,强度5-50mW/cm2,曝光时间0.5-10分钟。
15.如权利1、2或3所述的任意一项抗生物污染阵列芯片的制备方法,其特征在于:阵列的生物组分包括蛋白质、核酸、氨基酸、多糖或具有伯胺或仲胺的粒子;偶联反应发生在pH=7-10的缓冲溶液中,反应的时间为5-300分钟。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201410168551.9A CN103966321A (zh) | 2014-04-24 | 2014-04-24 | 一种区域选择性抗生物污染阵列芯片的制备方法 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201410168551.9A CN103966321A (zh) | 2014-04-24 | 2014-04-24 | 一种区域选择性抗生物污染阵列芯片的制备方法 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN103966321A true CN103966321A (zh) | 2014-08-06 |
Family
ID=51236323
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201410168551.9A Pending CN103966321A (zh) | 2014-04-24 | 2014-04-24 | 一种区域选择性抗生物污染阵列芯片的制备方法 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN103966321A (zh) |
Cited By (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN108535482A (zh) * | 2018-04-11 | 2018-09-14 | 上海萨迦生物科技有限公司 | 一种用于肿瘤早期筛查和诊断的抗体芯片试剂盒 |
CN112063001A (zh) * | 2020-09-11 | 2020-12-11 | 徐州工程学院 | 一种类流体界面、构建方法及其抗污应用 |
CN114682309A (zh) * | 2020-12-29 | 2022-07-01 | 深圳华大生命科学研究院 | 芯片、制备芯片的方法及芯片的用途 |
US11834703B2 (en) | 2008-05-27 | 2023-12-05 | Agilent Technologies, Inc. | Hybridization compositions and methods |
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN103233274A (zh) * | 2013-05-06 | 2013-08-07 | 北京化工大学 | 一种聚合物基三维生物芯片的制备方法 |
-
2014
- 2014-04-24 CN CN201410168551.9A patent/CN103966321A/zh active Pending
Patent Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN103233274A (zh) * | 2013-05-06 | 2013-08-07 | 北京化工大学 | 一种聚合物基三维生物芯片的制备方法 |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
韩金祥等: "DNA微阵列基片的化学处理", 《中国生物工程杂志》 * |
Cited By (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US11834703B2 (en) | 2008-05-27 | 2023-12-05 | Agilent Technologies, Inc. | Hybridization compositions and methods |
US12209276B2 (en) | 2008-05-27 | 2025-01-28 | Agilent Technologies, Inc. | Hybridization compositions and methods |
CN108535482A (zh) * | 2018-04-11 | 2018-09-14 | 上海萨迦生物科技有限公司 | 一种用于肿瘤早期筛查和诊断的抗体芯片试剂盒 |
CN112063001A (zh) * | 2020-09-11 | 2020-12-11 | 徐州工程学院 | 一种类流体界面、构建方法及其抗污应用 |
CN112063001B (zh) * | 2020-09-11 | 2022-07-01 | 徐州工程学院 | 一种类流体界面、构建方法及其抗污应用 |
CN114682309A (zh) * | 2020-12-29 | 2022-07-01 | 深圳华大生命科学研究院 | 芯片、制备芯片的方法及芯片的用途 |
CN114682309B (zh) * | 2020-12-29 | 2024-04-09 | 深圳华大生命科学研究院 | 芯片、制备芯片的方法及芯片的用途 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US8497106B2 (en) | Immobilisation of biological molecules | |
CN102539733B (zh) | 一种可视化塑料基生物芯片及其制备方法和检测方法 | |
CN103147133B (zh) | 微阵列生物芯片的三维载体及其制备方法 | |
CN104316697A (zh) | 固定有抗原的免疫荧光载片的制备方法和由该方法制备的免疫荧光载片 | |
CN110308286B (zh) | 一种基于光热释放信号增强型甲状腺球蛋白电致化学发光免疫传感器 | |
CN103966321A (zh) | 一种区域选择性抗生物污染阵列芯片的制备方法 | |
Obiles et al. | Insights on the molecular characteristics of molecularly imprinted polymers as monitored by sum frequency generation spectroscopy | |
JP4866368B2 (ja) | 生化学的検体検出用の電気的に活性なコンビナトリアルケミカル(eacc)チップ | |
CN104761745A (zh) | 一种三维生物芯片基片制备方法 | |
CN103233274A (zh) | 一种聚合物基三维生物芯片的制备方法 | |
CN104194027A (zh) | 一种抗生物污染聚合物生物芯片的制备方法 | |
CN108503565B (zh) | 一种生物芯片基片,其制备方法及应用 | |
Dena et al. | Surface-imprinted polymers (SIPs): advanced materials for bio-recognition | |
WO2017167769A1 (en) | Microfluidics for analyte detection based on the light to heat conversion properties of metal nanoparticles | |
JP4630865B2 (ja) | 物質固定化剤、それを用いた物質固定化方法及びそれを用いた物質固定化基体 | |
WO2014110032A1 (en) | Nano-well based electrical immunoassays | |
TWI716717B (zh) | 用於基材表面修飾的化合物及基材表面的修飾方法 | |
JP2007525681A (ja) | 有機表面への生体分子の共有結合的固定化方法 | |
CN112300335A (zh) | 一种基于f-pda分子印迹传感器的制备方法及其应用 | |
US20060111517A1 (en) | Recognition layers made of hydrogel based on polyacrylamide for use in biosensor technology | |
JP5344438B2 (ja) | 物質固定用基板、物質固定化基板および分析方法 | |
CN112526120B (zh) | 一种基于spr技术检测沙丁胺醇的方法 | |
CN116794287A (zh) | 一种高抗垢性高准确率的粪便隐血传感器及其制备方法和应用 | |
CN103472220A (zh) | 多壁碳-聚苯胺-壳聚糖/纳米金胶复合修饰免疫传感器的制备 | |
CN104034895B (zh) | 高通量三维微流控芯片免疫测定装置及其制备方法 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
C06 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
C10 | Entry into substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
C02 | Deemed withdrawal of patent application after publication (patent law 2001) | ||
WD01 | Invention patent application deemed withdrawn after publication |
Application publication date: 20140806 |