CN103698303B - 一种表面等离子体共振(spr)传感芯片及其制备方法和应用 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及一种表面等离子体共振(SPR)传感芯片及其制备方法和应用,属于医学检测领域。所述SPR传感芯片的结构为,先在基质玻璃片表面依次镀上铬膜和金膜,在所镀的金膜表面修饰生物素‑miRNA探针;所述修饰生物素‑miRNA探针用三(2‑羧乙基)膦(TCEP)还原巯基,用6‑巯基1‑己醇(MCH)封堵。本发明的有益技术效果为,本发明公开了一种表面等离子体共振(SPR)传感芯片,此芯片可用于直接检测低分子量、超低浓度分子;并且公开了此SPR传感芯片的制备方法,此方法制备成本低、测试效果稳定;并公开了此传感芯片的应用,此芯片的使用方法简单、不需要特殊设备、并且测试原料可再生并且重复使用,而且测试效果良好。
Description
技术领域
本发明属于医学检测领域,尤其涉及一种microRNA (miRNA)的检测方法,具体是基于表面等离子体共振(SPR)以及金纳米棒信号放大的超灵敏和无标记快速microRNA(miRNA)检测方法,属于医学检测领域。
技术背景
MicroRNAs (miRNAs)是一类在进化上高度保守的非编码小分子单链RNA, 在基因转录后调控中发挥至关重要的作用,广泛存在于动植物体内,越来越多的证据表明,miRNAs参与很多重要的生理和病理过程, 例如发育、器官形成、调亡、细胞增殖、肿瘤发生等。因此,miRNAs分析检测就成了我们进一步研究其生物功能,疾病诊断和治疗以及相关基因药物开发的关键技术。
贵金属纳米材料由于其独特的光物理及化学性质、良好的生物相容性、低毒性,在miRNA分析中扮演者重要的角色并且被广泛应用于各种生物传感器。
SPR技术是一种基于芯片表面折射率或质量变化的光学检测技术,具有灵敏、快速、免标记等优点,可实时在线跟踪固液界面上的反应,在蛋白质和核酸等生物分子检测方面具有广阔的应用前景。但是传统的SPR检测方法难以直接检测低分子量、超低浓度的分子。miRNAs序列短、缺乏共同的特征、含量少、在细胞中表达丰度低,因此直接利用传统的SPR技术很难检测。大部分SPR传感器都是基于球形金纳米颗粒的,有关金纳米棒(GNRs)的研究较少。
发明内容
本发明解决的技术问题为,传统的SPR方法难以直接检测低分子量、超低浓度分子,本发明公开一种表面等离子体共振(SPR)传感芯片及其制备方法和应用,目的在于提供一种低成本、速度快的测试方法,及一种可再生并且重复使用、效果好的SPR传感芯片。
为实现上述目的本发明采取如下的技术方案。
本发明涉及一种表面等离子体共振(SPR)传感芯片,所述SPR传感芯片的结构为,先在基质玻璃片表面依次镀上铬膜和金膜,在所镀的金膜表面修饰生物素-miRNA探针。
所述SPR传感芯片的优选技术方案为,所述修饰生物素-miRNA探针用三(2-羧乙基)膦(TCEP)还原巯基,用6-巯基1-己醇(MCH)封堵。
本发明还涉及上述传感芯片的制备方法,首先在基质玻璃片上制备厚度为1~3nm的铬膜,在其上制备厚度为40~60 nm的金膜;然后在金膜上固定探针,将包含三(2-羧乙基)膦(TCEP)的磷酸缓冲液(PBS)的生物素-miRNA探针滴到金膜上,过夜;固定探针后,用PBS溶液洗去未结合的探针,将得到的金膜用6-巯基1-己醇(MCH)封堵后冲洗,得到SPR传感芯片。
所述传感芯片制备方法的优选技术方案为,所述金膜上固定探针的方法为,将25μL 0.1 μM的生物素-miRNA探针滴到金膜上,其中包含0.1 M, pH 7.4磷酸缓冲液(PBS),在PBS中含有2 μM三(2-羧乙基)膦(TCEP)。
所述传感芯片制备方法的优选技术方案为,固定探针经过清洗后,用1.45×10−6M的6-巯基1-己醇(MCH)封堵。
本发明还涉及上述传感芯片的应用,所述SPR传感芯片与金纳米棒(GNRs)-链霉亲和素用于检测miRNA、DNA、蛋白质、抗原的含量。
所述传感芯片应用的优选技术方案为,所述miRNA含量的检测,是将SPR传感芯片置于SPR检测通道上、将不同浓度的目标miRNA注射到流动分析池,miRNA与生物素-miRNA探针杂交形成双链使生物素暴露出来,记录其对应的SPR信号响应。然后在低浓度miRNA时,注入GNRs-链霉亲和素,记录其对应的SPR信号响应,根据标准曲线,确定miRNA的浓度。
所述传感芯片应用的优选技术方案为,在低浓度miRNA时所用的缓冲液为10 mMPBS (pH=7.4)。
所述传感芯片应用的优选技术方案为,所述检测结束后,向SPR检测通道中分别注射2 mM的NaOH和2 mM的HCl,用于洗脱结合的GNRs-链霉亲和miRNA,即可测试下一个样品。
所述传感芯片应用的优选技术方案为,所述方法可测量的miRNA低浓度为0.1~100 pM。
所述传感芯片应用的优选技术方案为,所述金纳米棒、(GNRs)-链霉亲和素的制备步骤为:
(1) GNRs合成:将19.5 mL十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)溶液(0.1 M,30 ℃溶解)和0.5 mL四氯金酸水合物(HAuCl4·3H2O)溶液(0.01 M)混合好后,加入1.2 mL配置好的硼氢化钠溶液(0.01 M),快速搅拌混合2分钟,然后在25℃-27℃下熟化5-10分钟,即得种子溶液;将19 mL CTAB溶液和0.16 mL硝酸银溶液 (0.01 M,现配现用)在25℃-27℃下混合10分钟,将1 mLHAuCl4·3H2O溶液加入其中,约5-10分钟后加入抗坏血酸溶液(0.1 M),手摇混匀,即得生长溶液。最后将0.032 mL种子溶液加入生长溶液中,搅动1分钟左右,放入25℃-27℃水浴中生长,不要任何搅拌静置17个小时,生长后将金纳米棒在13000 rpm下离心12分钟,重复三次除去多余的CTAB,最后将金纳米棒分散在等浓度的CTAB里;
(2) GNRs-链霉亲和素制备:用1-乙基-(3-二甲基氨基丙基)碳酰二亚胺盐酸盐(EDC)来活化硫辛酸(TA)的羧基,然后与链霉亲和素的胺基结合,将GNRs与链霉亲和素进行端部结合的步骤是:首先将3 mL再分散的GNRs溶液逐滴加入6 mL稀释的链霉亲和素(2×10-8M)溶液中,轻摇4小时;反应后,将结合的金棒在12000 rpm下离心10分钟,重复三次,每次离心都用含0.1%聚乙二醇(PEG)的CTAB (0.005 M ,pH 3.8)溶液进行悬浮,最后将修饰的GNRs重新分散在300 μL含0.1%PEG 的CTAB (0.005 M ,pH 3.8)溶液中,4℃下保存,制得GNRs-链霉亲和素。
本发明中,所述GNRs-链霉亲和素用于信号放大。
所述的MCH溶液为MCH原液用纯乙醇稀释配制而成的。
所述的磷酸缓冲液(PBS),是将储备溶液Na2HPO4 (0.2 M)与NaH2PO4(0.2 M)以大约81/19的比例混合,使其pH值为7.4,然后加入0.9%的NaCl配置成的。
上述方法中链霉亲和素的活化方法为将6mL TA (0.0026 M, 乙醇配置)与8mL 链霉亲和素(2×10-7M)混合,然后逐滴加入1.5 mL EDC并慢慢倒转混合,在室温下反应4小时。反应后,将其在PBS溶液(0.01 M, pH7.4)中4℃下透析三天,每天更换三次透析液。
所述的CTAB (0.005 M ,pH 3.8)是用1M HCl来调节pH值。
所述的链霉亲和素分子量约为60 kDa。
所述的加入的GNRs-链霉亲和素用10 mM PBS (pH=7.4)进行稀释。
所述的GNRs-链霉亲和素与生物素-miRNA探针有强的相互亲和作用。
上述方法的优点还在于,完成一个样品测试后,向SPR检测通道中分别注射2 mMNaOH和2 mM HCl洗脱结合的GNRs-链霉亲和素和miRNA后,即可测试下一个样品。
所述的不同浓度的目标miRNA浓度分别位于0.1~100 nM和低浓度0.1~100 pM范围内。
上述方法中检测miRNA的流速为8 μL/min,检测GNRs-链霉亲和素的流速为12 μL/min。
本发明还可用于特异性检测,在生物素-miRNA探针修饰的表面分别注射20 nM目标miRNA序列、单碱基错配序列和三碱基错配序列,记录其对应的SPR信号。
本发明的有益技术效果为,本发明公开了一种表面等离子体共振(SPR)传感芯片,此芯片可用于直接检测低分子量、超低浓度分子;并且公开了此SPR传感芯片的制备方法,此方法制备成本低、测试效果稳定;并公开了此传感芯片的应用,此芯片的使用方法简单、不需要特殊设备、并且测试原料可再生并且重复使用,而且测试效果良好。
附图说明
图1为miRNA基于SPR检测方法的示意图;
图2为未与链霉亲和素结合的GNRs透射电子显微镜照片及粒径分布图;
图3为与链霉亲和素结合的GNRs透射电子显微镜照片及粒径分布图;
图4为GNRs(红色曲线)和GNRs-链霉亲和素(黑色曲线)的紫外吸收光谱;
图5为GNRs,GNRs-链霉亲和素和链霉亲和素样品的红外吸收光谱;
图6为经1.45×10-6M MCH封堵1小时后,先后注入2 nM目标片段(a)和2×10-9 MGNRs-链霉亲和素(b)后的SPR响应图;插图:两种情况下a与b的SPR响应柱状图,PBS为缓冲液;
图7为SPR响应与不同目标片段浓度(0.1 nM, 1 nM, 2 nM, 10 nM, 50 nM,100nM)对数的柱状图;插图:SPR响应值与目标浓度对数的线性图;
图8为在不同浓度miRNA (0.1 pM, 5 pM, 10 pM, 50 pM, 100 pM )存在下加入固定浓度的GNRs-链霉亲和素的SPR响应图,直线代表没加入GNRs-链霉亲和素前的基线;插图:SPR响应值与目标浓度对数的线性图;
图9为在金膜表面分别组装0.1 μM生物素-miRNA探针后注射20 nM不同目标片段(完全互补链,单碱基错配链,三碱基错配链)的SPR响应图;插图:三种情况下的SPR柱状图。
具体实施方式
实施例1
1.在载玻片上喷镀厚度为为40~60 nm金膜的方法为:
(1)将BK7载玻片在80℃水虎鱼(H2O2与浓H2SO4体积比为1:3的混合液)中清洗30分钟,待冷却到室温后,载玻片用去离子水冲洗干净,N2吹干;
(2)将清洗干净后的载玻片置于真空镀膜机中镀膜:
a)先镀一层2 nm厚的铬膜;
b)在铬膜上继续镀一层50 nm厚的金膜。
2. 芯片的制备:
(1)将干净的金膜用100%的乙醇冲洗然后再用去离子水洗净,最后用N2气吹干备用。
(2)配制0.1 μM的生物素-miRNA探针溶液,其中包含2 μM TCEP的PBS溶液(0.1 M,pH 7.4)。
(3)将25 μL生物素-miRNA探针溶液滴到准备好的金膜上,在4℃下过夜。
(4)固定探针后,用少量PBS溶液洗去未结合的探针并用N2气吹干,将得到的金膜用1.45×10−6M的MCH封堵1个小时,最后去离子水冲洗,N2气吹干以备SPR检测。
3. SPR仪器校准步骤:
(1)装上修饰好的金膜后,将注射阀搬到Load模式,模式选择阀搬到Serial模式,装上含去离子水的注射器进行校准。
(2)调整流速为50 μL/min,向样品环中注入 150 μL 1%的乙醇,将阀搬到inject模式,使其SPR响应为60.0 mDeg,重复几次。
4. miRNA传感器性能检测实验步骤为:
(1)校准后,将注射器缓冲液换为PBS (0.1 M, pH 7.4 ),调整流速为8 μL/min,待基线平稳后,分别注入150 μL 0.1、1、2、10、50、100 nM的目标片段溶液(PBS, 0.1M),调整反应时间为10分钟,同时记录SPR响应信号。
(2)测完一个浓度片段后向SPR检测通道中注射2 mM盐酸溶液2分钟,将(1)中结合到芯片上的目标片段洗脱,为检测下一个样品做准备。
(3)实验准备和仪器校准步骤与上面相同,调整流速为8 μL/min,然后用缓冲液PBS (10 mM, pH7.4)跑基线,待基线稳定后,分别注入0.1、5、10、50、100 pM的目标片段,调整反应时间为10分钟,记录SPR响应信号,接着缓冲液冲洗5分钟,待基线平稳后流动注射等浓度的GNRs-链霉亲和素溶液(2×10-9M),反应时间为5分钟,缓冲液冲洗,记录SPR响应信号。
a)(3)中检测miRNA时所用的缓冲液为10 mM PBS (pH=7.4)。
b)用10 mM的PBS (pH=7.4)将制备好的GNRs-链霉亲和素(2×10-8M)稀释10倍。
(4)测完一个浓度片段后向SPR检测通道中先后注射2 mM氢氧化钠溶液和盐酸溶液各2分钟,将(3)中结合到芯片上的GNRs-链霉亲和素和目标片段洗脱,为检测下一个样品做准备。
(5)从图7和图8中可以看出,在0.1~100 nM和0.1~100 pM的范围内,miRNA浓度与SPR的信号成线性关系。
5. miRNA传感器选择性检测步骤为:
在生物素-miRNA探针修饰的表面分别注射20 nM目标miRNA序列、单碱基错配序列和三碱基错配序列,步骤与上述相同,分别记录其对应的SPR响应信号。
图1:生物素-miRNA探针首先修饰到金膜上形成发卡结构,当与其互补的目标片段存在时,两者杂交形成双链使生物素暴露出来,产生一个SPR信号,接着GNRs-链霉亲和素与生物素识别并结合到DNA*RNA复合物上,加强了传感器对miRNA的响应,从而导致了SPR信号增强。
如图2所示:GNRs的平均长度为42.1±1.2 nm,宽为14.3±0.9 nm,根据粒径分布图可知它的纵横比为3.5,约占全部粒子的36%。
从图3可以看出修饰了链霉亲和素后,GNRs边缘与图2相比更模糊,说明链霉亲和素对金棒的形貌有一定影响。从粒径分布图可以看出GNRs的纵横比有所增加。
从图4可以看出GNRs在修饰了链霉亲和素后纵向吸收峰蓝移了大约18 nm,表明了纵向吸收峰比横向吸收峰敏感,说明了GNRs表面附近折射率发生了变化并且GNRs没有发生聚集现象。
从图5可以看出,链霉亲和素-金棒和链霉亲和素在1638 cm−1左右时有一个明显的特征峰,即C=C、C=N键的振动峰,而GNRs没有,表明链霉亲和素已成功修饰在GNRs上。
从图6可以看出加入GNRs-链霉亲和素后,由于生物素与亲和素的强相互作用,SPR响应大大增加,当注射的GNRs-链霉亲和素完全流出流动分析池后,GNRs-链霉亲和素从金膜表面洗脱下来,信号开始下降(~3567s),可能是由于金膜在长时间冲洗下遭到破坏,因而导致了SPR信号的不断下降,从小图两种情况的比较可以看出,加入GNRs-链霉亲和素后的SPR信号变化b比不加时a增加了16倍。
由图7可以看出在GNRs-链霉亲和素不存在时,可以观察到目标片段浓度大于0.1nM的SPR响应,随着目标片段浓度的增加对应的SPR响应逐渐上升,在0.1~100 nM之间表现出很好的线性关系。
从图8可以看出加入GNRs-链霉亲和素后检测浓度达到了0.1 pM,并且在低浓度目标片段0.1~100pM间有线性关系。
从图9可以看出,单碱基错配序列(红色)的SPR响应是完全互补序列(黑色)SPR响应值的63%,而完全互补序列的SPR响应值是三碱基错配序列(绿色)SPR响应值的2.96倍。
实施例2
1.金膜的制备:
(1)将BK7载玻片在80℃水虎鱼(H2O2与浓H2SO4体积比为1:3的混合液)中清洗30分钟,待冷却到室温后,载玻片用去离子水冲洗干净,N2吹干;
(2)将清洗干净后的载玻片置于真空镀膜机中镀膜:
a)先镀一层2 nm厚的铬膜;
b)在铬膜上继续镀一层50 nm厚的金膜。
2. 芯片的制备:同实施例1。
3、GNRs-链霉亲和素的制备
用1-乙基-(3-二甲基氨基丙基)碳酰二亚胺盐酸盐(EDC)来活化硫辛酸(TA)的羧基,然后与链霉亲和素的胺基结合,将GNRs与链霉亲和素进行端部结合的步骤是:首先将3mL再分散的GNRs溶液逐滴加入6 mL稀释的链霉亲和素(2×10-8M)溶液中,轻摇4小时;反应后,将结合的金棒在12000 rpm下离心10分钟,重复三次,每次离心都用含0.1%聚乙二醇(PEG)的CTAB (0.005 M ,pH 3.8)溶液进行悬浮,最后将修饰的GNRs重新分散在300 μL含0.1%PEG 的CTAB (0.005 M ,pH 3.8)溶液中,4℃下保存,制得GNRs-链霉亲和素。
4、测试步骤
(1)将制备好的生物素-miRNA探针芯片置于分析池上,参照实施例1进行校准;
(2)分别注入150 μL 0.1、1、2、10、50、100 nM的目标片段溶液(PBS, 0.1M),调整反应时间为10分钟,同时记录SPR响应信号;
(3)测完一个浓度片段后向SPR检测通道中注射2 mM盐酸溶液2分钟,将(2)中结合到芯片上的目标片段洗脱,为检测下一个样品做准备。
(4)分别注入0.1、5、10、50、100 pM的目标片段,调整反应时间为10分钟,记录SPR响应信号,接着缓冲液冲洗5分钟,待基线平稳后分别注射等浓度的GNRs-链霉亲和素溶液(2×10-9M),反应时间为5分钟,缓冲液冲洗,记录SPR响应信号。
a)(4)中检测miRNA时所用的缓冲液为10 mM PBS (pH=7.4)。
b)用10 mM的PBS (pH=7.4)将制备好的GNRs-链霉亲和素(2×10-8M)稀释10倍。
(5)测完一个浓度片段后向SPR检测通道中先后注射2 mM氢氧化钠溶液和盐酸溶液各2分钟,将(4)中结合到芯片上的GNRs-链霉亲和素和目标片段洗脱,为检测下一个样品做准备。
实施例3
利用实施例1得到的miRNA传感器进行特异性检测的步骤为:
(1)在生物素-miRNA探针修饰的表面分别注射20 nM目标miRNA序列、单碱基错配序列和三碱基错配序列,步骤与实施例2中的4相同,分别记录其对应的SPR响应信号。
(2)传感器的再生步骤参照实施例2。
Claims (9)
1.一种表面等离子体共振(SPR)传感芯片,其特征在于,所述SPR传感芯片的结构为,先在基质玻璃片表面依次镀上铬膜和金膜,在所镀的金膜表面修饰生物素-miRNA探针,所述修饰生物素-miRNA探针用三(2-羧乙基)膦(TCEP)还原巯基,用6-巯基1-己醇(MCH)封堵。
2.如权利要求1所述传感芯片的制备方法,其特征在于,首先在基质玻璃片上制备厚度为1~3nm的铬膜,在其上制备厚度为40~60nm的金膜;然后在金膜上固定探针,将包含三(2-羧乙基)膦(TCEP)的磷酸缓冲液(PBS)的生物素-miRNA探针滴到金膜上,过夜;固定探针后,用PBS溶液洗去未结合的探针,将得到的金膜用6-巯基1-己醇(MCH)封堵后冲洗,得到SPR传感芯片。
3.根据权利要求2所述传感芯片的制备方法,其特征在于,所述金膜上固定探针的方法为,将25μL 0.1μM的生物素-miRNA探针滴到金膜上,其中包含0.1M,pH 7.4磷酸缓冲液(PBS),在PBS中含有2μM三(2-羧乙基)膦(TCEP)。
4.根据权利要求2所述传感芯片的制备方法,其特征在于,固定探针经过清洗后,用1.45×10-6M的6-巯基1-己醇(MCH)封堵。
5.如权利要求1所述传感芯片的应用,其特征在于,所述SPR传感芯片与金纳米棒(GNRs)-链霉亲和素用于检测miRNA、DNA、蛋白质、抗原的含量。
6.根据权利要求5所述传感芯片的应用,其特征在于,所述miRNA含量的检测,是将SPR传感芯片置于SPR检测通道上、将不同浓度的目标miRNA注射到流动分析池,miRNA与生物素-miRNA探针杂交形成双链使生物素暴露出来,记录其对应的SPR信号响应;然后在低浓度miRNA时,注入GNRs-链霉亲和素,记录其对应的SPR信号响应,根据标准曲线,确定miRNA的浓度;低浓度miRNA时所用的缓冲液是PH值为7.4的10mM PBS。
7.根据权利要求6所述传感芯片的应用,其特征在于,所述检测结束后,向SPR检测通道中分别注射2mM的NaOH和2mM的HCl,用于洗脱结合的GNRs-链霉亲和miRNA,即可测试下一个样品。
8.根据权利要求5所述传感芯片的应用,其特征在于,所述方法可测量的miRNA低浓度为0.1~100pM。
9.根据权利要求5所述传感芯片的应用,其特征在于,所述金纳米棒、(GNRs)-链霉亲和素的制备步骤为:
(1)GNRs合成:将19.5mL、0.1M,30℃溶解十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)溶液和0.5mL、0.01M四氯金酸水合物(HAuCl4·3H2O)溶液混合好后,加入1.2mL、0.01M配置好的硼氢化钠溶液,快速搅拌混合2分钟,然后在25℃-27℃下熟化5-10分钟,即得种子溶液;将19mL CTAB溶液和0.16mL、0.01M现配现用硝酸银溶液在25℃-27℃下混合10分钟,将1mLHAuCl4·3H2O溶液加入其中,约5-10分钟后加入0.1M的抗坏血酸溶液,手摇混匀,即得生长溶液;最后将0.032mL种子溶液加入生长溶液中,搅动1分钟左右,放入25℃-27℃水浴中生长,不要任何搅拌静置17个小时,生长后将金纳米棒在13000rpm下离心12分钟,重复三次除去多余的CTAB,最后将金纳米棒分散在等浓度的CTAB里;
(2)GNRs-链霉亲和素制备:用1‐乙基‐(3‐二甲基氨基丙基)碳酰二亚胺盐酸盐(EDC)来活化硫辛酸(TA)的羧基,然后与链霉亲和素的胺基结合,将GNRs与链霉亲和素进行端部结合的步骤是:首先将3mL再分散的GNRs溶液逐滴加入6mL、2×10-8M稀释的链霉亲和素溶液中,轻摇4小时;反应后,将结合的金棒在12000rpm下离心10分钟,重复三次,每次离心都用含0.1%、0.005M、PH为3.8聚乙二醇(PEG)的CTAB溶液进行悬浮,最后将修饰的GNRs重新分散在300μL、0.005M、PH为3.8含0.1%PEG的CTAB溶液中,4℃下保存,制得GNRs-链霉亲和素。
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