CN103160521A - arylomycins A生物合成基因簇 - Google Patents

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CN103160521A CN2011104222017A CN201110422201A CN103160521A CN 103160521 A CN103160521 A CN 103160521A CN 2011104222017 A CN2011104222017 A CN 2011104222017A CN 201110422201 A CN201110422201 A CN 201110422201A CN 103160521 A CN103160521 A CN 103160521A
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靳旭
饶敏
魏维
戈梅
朱丽
陈玲玲
万明玉
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Abstract

本发明公开了由Streptomyces parvus CGMCC No.4027菌株产生的具有抗菌活性的抗生素--arylomycins A的生物合成基因簇。整个基因簇共包含8个基因:3个NRPS基因(aryA、aryB、aryD);1个后修饰基因(aryC);3个前体合成基因(aryF、aryG、aryH)以及1个MbtH基因(aryE)。通过对上述生物合成基因的遗传操作可阻断arylomycin A2和arylomycinA4的合成。本发明所提供的基因也可以用来寻找和发现可用于医药、工业或农业的化合物或基因、蛋白。

Description

arylomycins A生物合成基因簇
技术领域
本发明属于微生物基因工程领域,具体地说,是关于抗生素arylomycins A的生物合成基因簇。 
背景技术
随着致病菌耐药性问题的日益严峻,临床上对新抗生素的需求也显得更为迫切。为了应对这一局面,人们一方面对已有抗生素进行改造,另一方面也加快了新型抗生素筛选的步伐。Alexandra 
Figure BDA0000120625320000011
等在2002年从Streptomyces sp.Tü6075分离得到了两组脂肽类化合物arylomycins,包括arylomycins A和arylomycins B(Schimana,Gebhardt et al.2002)。它们都属于六肽化合物,含有相同肽链(D-Me-Ser-D-Ala-Gly-L-Me-Hpg-L-Ala-L-Tyr),不同的是,arylomycins B中的Tyr含有-NO2取代基。最近,我们从Streptomyces parvus CGMCC No.4027的发酵液中分离到了arylomycin A2和arylomycin A4,结构如图1所示。 
2004年,Mark Paetzel等获得了arylomycin A2与Escherichia coli I型信号肽酶结合复合物 
Figure BDA0000120625320000012
分辨率的晶体结构,研究发现arylomycin A2的C端可与信号肽酶催化活性中心的Ser和Lys残基侧链形成氢键,同时arylomycin A2形成β-折叠结构模拟信号肽酶底物的结合(Paetzel,Goodall et al.2004)。I型信号肽酶(SPase I,EC 3.4.21.89)是一种广泛存在于真细菌细胞膜中的丝氨酸蛋白酶,负责将前蛋白N-端的信号肽切除,对细菌的生存和生长至关重要。SPase I被抑制后,会造成分泌蛋白在细胞膜上的大量积累并最终导致细菌死亡(Dalbey and Wickner 1985)。一直以来,病原菌蛋白酶抑制剂被认为药物发展的一个方向,但是对人体的毒害性降低了这些抑制剂最终成药的可能性。区别于经典的Ser/His/Asp催化机制,SPase I利用独特的Ser/Lys催化二元体机制,这就意味着SPase I抑制剂有着更高的特异性,对真核细胞有着更低的毒性。同时,由于催化活性中心位于细胞膜外侧,I型信号肽酶被认为是一种很有潜力的抗生素筛选靶标。虽然已经得到了arylomycin A2与Escherichia coli SPase I结合复合物的晶体结构,但在最初生物活性研究中,arylomycins只对Streptococcuspneumonia、Staphylococcus epidermidis及土壤微 生物Rhodococcus opacus、Brevibacillus brevis有抗菌活性,而对大多的病原菌如Staphylococcus aureus、Escherichia coli和Pseudomonas aeruginosa没有活性,这大大限制了其成为药物的可能性。但2010年有研究发现,Staphylococcus aureus、Escherichia coli和Pseudomonas aeruginosa之所以对arylomycins表现出耐药性,是由于这些病原菌的SPase I催化活性中心的Ser突变为Pro从而导致两者的亲和力降低。通过对自然界中厚壁菌门、放线菌们、变形菌门、拟杆菌门及疣微菌门衣原体属中SPase I相应位置Pro突变的分布研究表明,很多自然界中的细菌不存在Pro突变而对arylomycins表现为敏感,如革兰氏阳性边病原菌Streptococcus pneumoniae、Streptococcus pyogenes、S.haemolyticus 及革兰氏阴性病原菌Chlamydia trachomatis等(Smith,Roberts et al.2010)。因此arylomycins作为广谱性抗生素有着广阔的应用前景。 
除了加工与生存及生长相关蛋白,I型信号肽酶与其它生命活动如细菌耐药性、细菌毒素的分泌等,也有着密切关系。例如,一些病原菌由于能分泌β-内酰胺酶而对β-内酰胺类抗生素产生耐药性,而研究表明arylomycins类似物lipoglycopeptides能抑制S.aureus β-内酰胺酶的分泌(Kulanthaivel,Kreuzman et al.2004)。因此除了直接作为抗生素使用,arylomycins还能够调节细菌毒性或者使得病原菌变得对其它抗生素敏感,这将大大扩大arylomycins应用范围(Roberts,Smith et al.2007)。 
迄今为止,还没有arylomycins生物合成基因簇相关研究的报道。 
发明内容
本发明的目的是提供由Streptomyces parvus CGMCC No.4027菌株产生的具有抗菌活性的抗生素--arylomycins A的生物合成基因簇。 
根据本发明,抗生素arylomycins A的生物合成基因簇包含8个基因: 
aryA编码非核糖体肽合成酶NRPS; 
aryB编码非核糖体肽合成酶NRPS; 
aryC编码P450酶; 
aryD编码非核糖体肽合成酶NRPS; 
aryE编码MbtH家族蛋白; 
aryF编码羟基扁桃酸合酶Hmas; 
aryG编码羟基扁桃酸氧化酶Hmo; 
aryH编码羟基苯甘氨酸氨基转移酶HpgT。 
根据本发明,所述基因aryA位于SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列的第3739-5493个碱基处,长度为1755个碱基对,编码584个氨基酸。 
根据本发明,所述基因aryB位于SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列的第5481-15938个碱基处,长度为10458个碱基对,编码3485个氨基酸。 
根据本发明,所述基因aryC位于SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列的第16567-17736个碱基处,长度为1170个碱基对,编码389个氨基酸。 
根据本发明,所述基因aryD位于SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列的第17795-30688个碱基处,长度为12894个碱基对,编码4297个氨基酸。 
根据本发明,所述基因aryE位于SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列的第30714-30935个碱基处,长度为222个碱基对,编码73个氨基酸。 
根据本发明,所述基因aryF位于SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列的第30983-32047个碱基处,长度为1065个碱基对,编码354个氨基酸。 
根据本发明,所述基因aryG位于SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列的第32044-33159个碱基处,长度为1116个碱基对,编码371个氨基酸。 
根据本发明,所述基因aryH位于SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列的第33152-34501个碱基处,长度为1350个碱基对,编码449个氨基酸。 
根据本发明,所述基因簇的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。 
本发明所提供的包含arylomycins A生物合成相关的所有基因和蛋白信息可以帮助人们理解arylomycins类天然产物的生物合成机制,为进一步遗传改造提供了材料和知识。本发明所提供的基因也可以用来寻找和发现可用于医药、工业或农业的化合物或基因、蛋白。 
附图说明
图1为arylomycin A2及arylomycin A4的化学结构示意图。 
图2为本发明的arylomycins A生物合成基因簇结构示意图。 
图3为原始菌株及各突变株发酵液HPLC分析结果图。其中,I为原始菌株,II为orf-1敲除突变株,III为orf1敲除突变株,IV为orf2敲除突变株,V为aryA敲除突变株,VI为aryB敲除突变株,VII为aryC敲除突变株,VIII为aryD敲除突变株。 
图4为arylomycins A中非天然氨基酸HPG的生物合成途径示意图。 
图5为原始菌株、突变株及HPG补料后各菌株发酵液HPLC分析结果图。其中, I为原始菌株,II为aryF敲除突变株,III为aryG敲除突变株,IV为aryH敲除突变株,V为aryF敲除突变株HPG补料,VI为aryG敲除突变株HPG补料,VII为aryH敲除突变株HPG补料。 
图6为arylomycin A2和arylomycin A4的生物合成过程示意图。 
具体实施方式
以下通过具体实施例对本发明作进一步说明。应理解,以下实施例仅用于说明本发明,而不用于限定本发明的范围。 
本发明所用的菌种为Streptomycesparvus,于2010年07月20日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心(CGMCC),保藏地址为北京市朝阳区北辰西路1号院3号,保藏号CGMCC No.4027。 
本发明中所涉及的分子生物学操作参照Practical Streptomyces Genetics(Norwich:John Innes Foundation,2000)和《分子克隆:实验室手册》(New York:Cold Spring Harbor Laboratory,2001)等进行。 
实施例1、arylomycins生物合成基因簇的克隆 
1.1、Streptomyces parvus CGMCC No.4027总DNA提取 
将新鲜S.parvus CGMCC No.4027斜面孢子接种到3ml TSB培养基中,28℃,220rpm振荡培养30h。取2ml至2ml离心管中,12000rpm离心10min,用无菌水洗涤一次,菌丝体重悬于250μl SET,并加入溶菌酶至终浓度4mg/ml,37℃水浴40~60min。加入50μl 10%SDS和2.5μl 10mg/ml蛋白酶K,于55℃水浴2h,期间不断震荡。然后加入200μl 5mol/LNaCl和500μl氯仿,混匀,室温放置30min,12000rpm离心15min。取上清,加入1ml异丙醇,12000rpm离心5min,沉淀用70%乙醇洗涤一次并抽干,加入100μl TE缓冲溶液于-20℃保存。 
1.2、arylomycins生物合成基因簇的克隆 
微生物代谢具有多样性,随着越来越多次级代谢产物生物合成基因簇的获得,发现不同的微生物的基因组中也会含有相同化合物的合成基因簇。如A21978C产生菌Streptomyces roseosporus NRRL 15998虽然没有报道其能够产生核苷肽类抗生素,但在其基因组中发现了类似负责Pacidamycin生物合成的基因簇(Zhang,Ostash et al.2010)。 
已知Streptomycesparvus CGMCC No.4027也能够产生A21978C系列物质,另外还发现其可以产生arylomycins类代谢产物。在对已经公开的A21978C产生菌Streptomyces roseosporus NRRL15998的基因组进行分析的过程中,发现基因 SSGG_05586-SSGG_05590编码非核糖体肽合成酶(NRPS),其中模块组成、异构化(E)结构域及甲基化(M)结构域与arylomycins结构中肽链组成对应,因此其可能与arylomycins基因簇类似。根据SSGG_05586-SSGG_05590上下游序列,利用Vector NTI软件设计引物,以1.1中制备的S.parvus CGMCC No.4027染色体为模板逐段PCR。 
PCR反应体系(50μl)包括PrimerSTAR HS DNA聚合酶(2.5U/μl)0.5μl、2×GC缓冲液25μl、dNTP(浓度各为2.5mM)4μl、引物(20mM)各0.5μl、Streptomyces parvus CGMCC No.4027总DNA 1μl、dH2O 18.5μl。反应条件为:94℃预变性3min;94℃变性1min,58~68℃复性30s,72℃延伸2.5min,共30个循环;最后72℃延伸10min。 
低熔点胶回收预期大小DNA片段,与pMD18-T simple Vector连接,转化E.coli DH5α,涂布于含有100μg/ml氨苄青霉素的LB平板上,37℃培养。挑取单菌落过夜培养,抽提质粒,根据大小将可能含有预期大小DNA片段的质粒测序。 
引物序列及PCR产物大小如表1所示。最终将所得16个片段拼接起来,所得序列总长为39503bp,GC含量为71.9%。核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。 
表1、引物序列及PCR产物大小 
Figure BDA0000120625320000051
Figure BDA0000120625320000061
实施例2、arylomycins生物合成基因簇功能分析 
通过生物信息学分析,所得序列共包含17个开放阅读框,如图2所示。包含3个功能未知基因(orf-1、orf-2、orf-3),3个NRPS基因(aryA、aryB、aryD),1个后修饰基因(aryC),3个前体合成基因(aryF、aryG、aryH),1个MbtH基因(aryE),2个ABC转运相关基因(orf1、orf2),3个与细菌外被膜形成相关基因(orf3、orf4、orf5),详细分析结果如表2所示。 
表2、arylomycins生物合成基因簇生物信息学分析 
Figure BDA0000120625320000062
Figure BDA0000120625320000071
实施例3、arylomycins A生物合成基因簇边界确定 
3.1、S.parvus CGMCC No.4027遗传转移系统的建立 
将含有待接合转移质粒的E.coli ET1256737℃过夜培养,取200μl菌液至装有20ml LB培养基的250ml三角瓶中,37℃培养3~4h至OD600达到0.5左右。然后将菌液转移至50ml离心管中4000rpm离心5min收集菌体,并用等体积的新鲜LB洗涤两次,然后重悬于2ml LB中,作为大肠杆菌供体细胞。取-70℃保存的S.parvus CGMCC No.4027孢子悬液一管8000rpm离心2min,去上清,用1ml的2×YT培养基洗涤两次,重悬于500μl 2×YT培养基中,50℃水浴10min。待冷却后加入500μl大肠杆菌供体细胞,混匀,涂布于含有10mM MgCl2的MS平板上,28℃培养16~20h。在平板表面覆盖1ml无菌水(含0.5mg/ml萘啶酮酸和1mg/ml安普霉素),用涂布棒涂匀并吹干,28℃培养3~4天。挑取接合子进行筛选验证。 
3.2、基因orf-1缺失突变株的构建 
设计引物orf-1_u-F(5’-aagcttgacacgttgcccggcaagag-3’)、orf-1_u-R(5’-ctgcagaccccgtcggcaacttcgtc-3’),和引物orf-1_d-F(5’-ctgcagcgaagctcaaggaatccgac-3’)、orf-1_d-R(5’-gaattcagctgacgcagacgctgac-3’)分别PCR扩增orf-1的上、下游片段orf-1_u、orf-1_d。PCR产物回收后分别与pMD18-T载体连接,转化E.coli DH5α提取质粒并测序验证。然后pMD18-T-orf-1_u质粒经HindIII和Pst I酶切,回收orf-1_u片段;pMD18-T-orf-1_d质粒用Pst I和EcoR I酶切,回收orf-1_d片段;orf-1_u、orf-1_d与经过HindIII和EcoR I酶切的pKC1139连接得到重组质粒pKC1139-orf-1_u-orf-1_d。重组质粒转化E.coli ET12567后按3.1中所述接合转移方法导入S.parvus CGMCC No.4027。 
挑取接合子至含50μg/ml安普霉素的MS平板37℃培养2~3天。然后挑取单菌落接种于液体TSB培养基,28℃培养三代。菌液适当稀释后涂布于MS平板,挑选对安普霉素敏感的单菌落,利用引物orf-1-F(5’-ccttccgcgagatcttcgatcttc-3’)、orf-1-R(5’-gattccttgagcttcgccgcag-3’)进行PCR验证。 
3.3、基因orf1和orf2缺失突变株构建 
基因orf1和orf2缺失突变株的构建方法与3.2中orf-1缺失突变株的构建方法相同,只是所用引物不同,具体情况如表3所示。 
表3、基因orf1和orf2缺失突变株构建和验证引物 
3.4、S.parvus CGMCC No.4027及相关突变株液体发酵及HPLC分析 
3.4.1、液体发酵 
将S.parvus CGMCC No.4027及相关突变株的新鲜斜面孢子(高氏一号斜面培养基)接种于种子培养基(葡萄糖1%,糊精4%,黄豆饼粉2%,磷酸二氢钾0.02%,氯化钠0.25%,pH 7.3~7.5),28℃,220rpm振荡培养44h。然后以8%接种量转入液体发酵培养基(黄豆饼粉2.2%,糊精3.6%,葡萄糖0.8%,磷酸二氢钾0.02%,pH 7.3~7.5),28℃,220rpm振荡培养5天。 
3.4.2、发酵液处理 
取800μl 3.4.1中获得的发酵液,然后加入等体积的无水甲醇,混匀,4℃放置30min,12000rpm离心15min。取上清进行HPLC分析。 
3.4.3、HPLC分析 
对3.4.2中获得的发酵液进行HPLC分析,具体条件如下: 
流动相:A相:乙腈-缓冲液(10∶90) 
B相:乙腈-缓冲液(45∶55) 
缓冲液:0.5%(NH4)H2PO4
分析用柱:Hypersil C18,4.6×250mm,5μm 
柱温:30℃ 
检测波长:223nm 
流速:1.5mL/min 
梯度条件如表所示: 
  时间(min)   0   15   17
  A%   25   0   0
  B%   75   100   100
3.5、arylomycins A生物合成基因簇边界确定 
根据基因编码的蛋白功能分析,arylomycins A生物合成基因簇左侧边界研究集中在aryA基因上游,orf-1、orf-2、orf-3编码3个未知功能蛋白,和原始菌株相比(图3I),对orf-1基因的敲除不影响arylomycins合成(图3II),表明其与arylomycins生物合成无关。arylomycins的生物合成基因簇右侧边界研究集中在aryH下游,orf1、orf2分别编码ABC转运ATP结合蛋白、ABC转运透性酶,orf1、orf2敲除后,影响到其它化合物的合成,其中orf1突变株很多化合物不能合成(图3III),而orf2突变株很多化合物的产量降低(图3IV),同时突变株的色素产量提高,产孢能力减弱。因此orf1、orf2两个基因并非仅仅与arylomycins相关,排除在基因簇之外。orf3、orf4、orf5三个基因分别编码分泌蛋白、聚γ谷氨酸合成蛋白PgsC、荚膜合成蛋白CapB,它们与细菌外被膜的形成有关,而与arylomycins合成无关。因此,最终将arylomycins A生物合成基因簇确定为aryA-aryH,共8个开放阅读框。 
实施例4、arylomycins A生物合成基因簇中功能基因的鉴定 
arylomycins A生物合成基因簇包含aryA-aryH共8个基因,其中3个NRPS基因(aryA、aryB、aryD)分别编码非核糖体肽合酶NRPS,负责arylomycins中非核糖体合成六肽(D-Me-Ser-D-Ala-Gly-L-Me-Hpg-L-Ala-L-Tyr)的合成;3个前体合成基因(aryF、aryG、aryH)分别编码羟基扁桃酸合酶Hmas、羟基扁桃酸氧化酶Hmo、羟基苯甘氨酸氨基转移酶HpgT,负责非天然氨基酸对羟基苯甘氨酸(HPG)的合成;1个后修饰基因(aryC)编码P450酶,负责甲基HPG与Tyr酪氨酸之间联芳键的合成。 
另外,基因簇中还有1个编码MbtH家族蛋白基因(aryE),MbtH家族蛋白通常与NRPS连锁,具有反式互补特性,其中一个MbtH敲除后会被基因组其它位置编码的 相应蛋白互补。Felnagle E.A等研究表明MbtH蛋白可能影响氨基酸的活化,是NRPS的构成部分(Felnagle,Barkei et al.2010)。为了确定除了aryE以外的aryA-aryD和aryF-aryG确实负责arylomycins A的生物合成,按照3.2中所述的方法构建基因aryA、aryB、aryC、aryD、aryF、aryG、aryH缺失突变株,引物如表4所示。 
表4、基因aryA-aryD和aryF-aryH缺失突变株构建和验证引物 
Figure BDA0000120625320000101
按照3.4中所述的方法检测野生菌株和各缺失突变株的发酵产物,发现当aryA(图3V)、aryB(图3VI)、aryC(图3VII)、aryD(图3VIII)、aryF(图5II)、aryG(图5III)、aryH(图5IV)基因阻断后影响到菌株arylomycin A2和arylomycin A4的产生,进一步证明得到的基因簇为arylomycins A生物合成基因簇。 
实施例5、Arylomycins A中非天然氨基酸HPG的生物合成 
在arylomycins A生物合成基因簇中,aryF、aryG、aryH分别编码羟基扁桃酸合酶(Hmas)、羟基扁桃酸氧化酶(Hmo)、羟基苯甘氨酸氨基转移酶(HpgT)。arylomycin中HPG的生物合成途径如图4所示。4-羟基丙酮酸在Hmas的作用下氧化脱羧产生4-羟基扁桃酸,4-羟基扁桃酸被Hmo氧化生成4羟基苯乙醛酸,然后通过HpgT转氨作用生成对羟基苯甘氨酸。 
aryF、aryG、aryH基因敲除后,菌株不能产生arylomycin A2和arylomycin A4。当在发酵液中外源添加HPG时,aryF(图5V)、aryG(图5VI)、aryH(图5VII)基因突变菌株恢复产生arylomycin A2和arylomycin A4,进一步证明了aryF、aryG、aryH编码蛋白AryF、AryG、AryH负责非天然氨基酸HPG的生物合成。 
实施例6、arylomycins A骨架合成及后修饰反应 
在arylomycins A生物合成基因簇中有三个基因(ayrA、aryB、aryD)负责编码arylomycins骨架组装相关的非核糖体肽合成酶NRPS(AryA、AryB、AryD),NRPS由多模块组成,模块的特异性结构域具有特定的活性。AryA含有1个结构域(C);AryB含有两个模块M1(C-A-M-T-E)和M2(C-A-T-E),共9个结构域;AryD含有4个模块M3*(A-T)、M4(C-A-M-T)、M5(C-A-T)和M6(C-A-T-Te),共13个结构域;其中AryA编码的C结构域与M3*(A-T)相互作用够成一个完整的模块M3(C-A-T)。模块M1-M6中的A结构域分别负责Ser、Ala、Gly、Hpg、Ala、Tyr的腺苷酰化激活和装载,模块M1和M4中的M结构域负责Ser和Hpg的N-甲基化修饰,模块M1和M2中的E结构域分别负责Ser、Ala的异构化。M1为起始模块,其中的C结构域将活化的脂肪酸链与第一个氨基酸D-Me-Ser通过酰胺键连接。然后,延伸模块通过各自的C结构域与上游的酰基发生缩合组装成arylomycin A骨架,最终通过模块M6中的Te结构域将其从NRPS上分离下来。游离线性脂肽中的HPG和Tyr进一步在AryD的催化作用下形成联芳键产生完整的arylomycins化合物。整个过程如图6所示。 
Figure IDA0000120625380000011
Figure IDA0000120625380000021
Figure IDA0000120625380000031
Figure IDA0000120625380000041
Figure IDA0000120625380000061
Figure IDA0000120625380000081
Figure IDA0000120625380000091
Figure IDA0000120625380000101
Figure IDA0000120625380000111
Figure IDA0000120625380000121
Figure IDA0000120625380000131
Figure IDA0000120625380000141
Figure IDA0000120625380000151
Figure IDA0000120625380000161
Figure IDA0000120625380000191
Figure IDA0000120625380000201
Figure IDA0000120625380000211
Figure IDA0000120625380000221
Figure IDA0000120625380000241
Figure IDA0000120625380000251
Figure IDA0000120625380000261
Figure IDA0000120625380000271
Figure IDA0000120625380000301

Claims (10)

1.抗生素arylomycins A的生物合成基因簇,其特征在于,所述基因簇包含8个基因:
aryA编码非核糖体肽合成酶NRPS;
aryB编码非核糖体肽合成酶NRPS;
aryC编码P450酶;
aryD编码非核糖体肽合成酶NRPS;
aryE编码MbtH家族蛋白;
aryF编码羟基扁桃酸合酶Hmas;
aryG编码羟基扁桃酸氧化酶Hmo;
aryH编码羟基苯甘氨酸氨基转移酶HpgT。
2.如权利要求1所述的基因簇,其特征在于,所述基因aryA位于SEQ IDNO:1所示的核苷酸序列的第3739-5493个碱基处,长度为1755个碱基对,编码584个氨基酸。
3.如权利要求1所述的基因簇,其特征在于,所述基因aryB位于SEQ IDNO:1所示的核苷酸序列的第5481-15938个碱基处,长度为10458个碱基对,编码3485个氨基酸。
4.如权利要求1所述的基因簇,其特征在于,所述基因aryC位于SEQ IDNO:1所示的核苷酸序列的第16567-17736个碱基处,长度为1170个碱基对,编码389个氨基酸。
5.如权利要求1所述的基因簇,其特征在于,所述基因aryD位于SEQ IDNO:1所示的核苷酸序列的第17795-30688个碱基处,长度为12894个碱基对,编码4297个氨基酸。
6.如权利要求1所述的基因簇,其特征在于,所述基因aryE位于SEQ IDNO:1所示的核苷酸序列的第30714-30935个碱基处,长度为222个碱基对,编码73个氨基酸。
7.如权利要求1所述的基因簇,其特征在于,所述基因aryF位于SEQ IDNO:1所示的核苷酸序列的第30983-32047个碱基处,长度为1065个碱基对,编码354个氨基酸。
8.如权利要求1所述的基因簇,其特征在于,所述基因aryG位于SEQ IDNO:1所示的核苷酸序列的第32044-33159个碱基处,长度为1116个碱基对,编码371个氨基酸。
9.如权利要求1所述的基因簇,其特征在于,所述基因aryH位于SEQ IDNO:1所示的核苷酸序列的第33152-34501个碱基处,长度为1350个碱基对,编码449个氨基酸。
10.如权利要求1所述的基因簇,其特征在于,所述基因簇的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。
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