CN102939915A - 一种杂交石斑鱼的种质鉴定方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种杂交石斑鱼的种质鉴定方法，基本步骤如下：对待测样本进行形态学参数测定，包括传统可量性状：全长、体长、头长、尾柄长、吻长、眼径、眼间距，以及框架测量数据：D1-4、D5-8；对上述获取的参数进行初步处理，获得以下特征参数值：下颌骨最后端与头背部末端之间直线距离/体长、臀鳍起点与背鳍末端之间直线距离/体长、全长/体长、头长/吻长、体长/尾柄长、头长/眼径、头长/眼间距；将以上参数值处理后代入相应判别函数模型，根据最大Y值判断该样本所属类别。本发明方法简便易行并准确有效。
Description
技术领域
本发明涉及一种种质鉴定方法，具体涉及一种杂交石斑鱼的种质鉴定方法。
背景技术
石斑鱼属于鲈形目酯科石斑鱼亚科，全世界已命名的有约100多种，我国约40多种。石斑鱼个体大、营养丰富、肉质鲜美，具有很高的经济价值，是我国沿海地区重要的养殖鱼类之一。但石斑鱼具有生长缓慢、成熟期晚、存在性逆转等特点，加上近年来面临的过度捕捞，导致自然鱼类资源数量急剧减少。但近年的人工繁殖石斑鱼后代存在个体变小、抗病力减弱等种质退化现象。杂交为解决该问题提供了一个新的研究方向。由于杂交涉及不同类型的亲本遗传物质的重新组合，后代可能会出现具有经济价值的新品种，因而在鱼类繁育方面应用比较广泛。随着养殖产业的蓬勃发展，杂交种的推广以及同时面临杂交种可能逃逸的环境生态压力的加大，对杂交种的鉴定和鉴别显得尤为重要。
目前的鱼类种质鉴定方法主要有两大类，形态学方法、生化与分子遗传学方法，各有其优缺点。分子遗传学方法能从根本上去揭示其遗传物质特征，进行物种鉴定和亲缘关系分析。但操作技术较复杂，对仪器设备要求高，整个过程较耗时。比如应用RAPD技术分析，容易出现非特异性扩增；AFLP技术在鱼类种质检测中多用于mtDNA多态性研究，而mtDNA具有一定的遗传局限性；而微卫星技术需要大量筛选分子标记。相对而言，形态学方法更为直观、简便易行。对操作人员要求低，推广起来比较容易。
发明内容
本发明的目的是提供一种简便易行并准确有效的杂交石斑鱼种质鉴定方法。
为解决上述技术问题，本发明通过以下的技术方案来实现，一种杂交石斑鱼的种质鉴定方法，包括步骤：
（1）获取待测样本石斑鱼形态学参数，其中包括传统可量性状参数：全长、体长、头长、尾柄长、吻长、眼径、眼间距；以及框架测量参数：下颌骨最后端与头背部末端的之间直线距离D1-4、臀鳍起点与背鳍末端之间直线距离D5-8；
（2）对上述获取的参数进行初步处理，获得以下特征参数值：下颌骨最后端与头背部末端之间直线距离/体长、臀鳍起点与背鳍末端之间直线距离/体长、全长/体长、头长/吻长、体长/尾柄长、头长/眼径、头长/眼间距；
（3）将以上获得的下颌骨最后端与头背部末端之间直线距离/体长、臀鳍起点与背鳍末端之间直线距离/体长、全长/体长、头长/吻长、体长/尾柄长、头长/眼径、头长/眼间距七个数据依次用X1~X7代替，并分别代入下列判定模型：
Y1=-1183+3099X1+2184X2+604.432X3+37.99X4+17.807X5-10.972X6+10.687X7；
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Y3=-1103+3094X1+1895X2+572.099X3+34.5X4+17.904X5-3.031X6+11.634X7；
（4）根据所得最大的Y值来判别该样本所属类别，其中Y1代表鞍
带石斑鱼、Y2代表棕点石斑鱼、Y3代表虎龙斑。
本发明上述步骤（1）中，对所述的传统可量性状参数和框架测量参数通过传统测量法或纸板测量法获取。
本发明所述纸板测量法，用针在纸板上比照鱼体的框架结构点依次扎孔。
本发明待测样本石斑鱼在测量前用冰浴处理5分钟，以麻醉和舒展鱼体。
本发明与现有技术相比，本发明采用基于传统可量性状和框架数据的综合判别，只需要测定9项形态指标，以获得7个形态学参数代入判别模型进行判别即可；更加快速、经济、简便；而且准确有效。
附图说明
图1为石斑鱼框架数据测量图。
具体实施方式
以下结合实施例来进一步解释本发明，但实施例并不对本发明做任何形式的限定。
获取数据前，待测鱼体均冰浴处理5分钟，以起到麻醉和鱼体舒展的作用，以获得更真实的数据。待测鱼经天平称量后进行形态学参数的测定，具体包括传统可量性状测定和框架测量参数测定。传统可量性状有全长、体长、体高、体宽、头长、吻长、眼径、眼间距、尾柄长、尾柄高、肛前体长、眼后头长,共12项参数；本发明只需获取全长、体长、头长、尾柄长、吻长、眼径、眼间距7项参数。
框架测量所取定位点参照附图1，数据为两个坐标点之间的直线距离长度,可精确到0.1cm。选取10个坐标点，其中坐标点1为下颌骨最后端；坐标点2为吻前端；坐标点3为腹鳍起点；坐标点4为头背部末端；坐标点5为臀鳍起点；坐标点6为背鳍起点；坐标点7为臀鳍末端；坐标点8为背鳍末端；坐标点9为尾鳍腹部起点；坐标点10为尾鳍背部起点。各坐标点之间的距离为21个框架数据，例如，D1-2为坐标点1和坐标点2之间的直线距离。本发明只需获取下颌骨最后端与头背部末端的之间直线距离D1-4、臀鳍起点与背鳍末端之间直线距离D5-8。
上述传统可量数据和框架数据的采集可根据实际需要选用以下其中一种方法进行操作：
（1）传统测量法：选用直尺或卷尺等测量工具进行逐一测量。
（2）纸板测量法：把试验鱼放置在硬纸板或质量较好的白纸上，人工选取标志点（参照附图1），用大头针在纸上扎孔作为标记，事后再测量纸板上两点间的距离，得到所需数据。
两者相比，第一种操作较简便，第二种操作时间较短，对鱼体的损伤相对较小。但相比较的样本组间同一类数据只能采取同一种测量方法，以减少误差，提高结果准确度。
对上述获取的参数进行初步处理，获得以下特征参数值：下颌骨最后端与头背部末端之间直线距离/体长、臀鳍起点与背鳍末端之间直线距离/体长、全长/体长、头长/吻长、体长/尾柄长、头长/眼径、头长/眼间距；
将以上获得的下颌骨最后端与头背部末端之间直线距离D1-4/体长、臀鳍起点与背鳍末端之间直线距离D5-8/体长、全长/体长、头长/吻长、体长/尾柄长、头长/眼径、头长/眼间距七个数据依次用X1~X7代替，并分别代入下列判定模型：
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根据所得最大的Y值来判别该样本所属类别，其中Y1代表鞍带石斑鱼、Y2代表棕点石斑鱼、Y3代表虎龙斑。
用已知的鱼种对上述方法进行验证实验如下，待测杂交石斑鱼均取自广东省大亚湾水产实验中心，鞍带石斑鱼、棕点石斑鱼、虎龙斑各30尾。体重，体长（范围）如下表:
表1观测样本的数量和规格
对观测样本进行9个形态学参数的测定，分别测定：全长、体长、头长、尾柄长、吻长、眼径、眼间距、D1-4、D5-8，数据经初步处理，获得7个特征参数：D1-4/体长、D5-8/体长、全长/体长、头长/吻长、体长/尾柄长、头长/眼径、头长/眼间距，并代入判别公式计算Y值。具体数据见表2。
表2观测样本参数值及判别Y值
根据以上判别结果，除了鞍带石斑鱼17号样本的判别有误外，其余所有样本均判别正确，经验证结果分析，可计算判别正确率，如表3所示。
表3本发明方法结果准确率
综上，通过观测样本验证的结果表明本发明方法具备较大实际应用价值，综合判别正确率可达98.9%。
以上实施例对本发明不同的实施过程进行了详细的阐述，但是本发明的实施方式并不仅限于此。本技术领域的普通技术人员依据本发明中公开的内容，采用等效的替换或修改，均可实现本发明的目的。
Claims (4)
1.一种杂交石斑鱼的种质鉴定方法，其特征在于，包括步骤：
（1）获取待测样本石斑鱼形态学参数，其中包括传统可量性状参数：全长、体长、头长、尾柄长、吻长、眼径、眼间距；以及框架测量参数：下颌骨最后端与头背部末端的之间直线距离、臀鳍起点与背鳍末端之间直线距离；
（2）对上述获取的参数进行初步处理，获得以下特征参数值：下颌骨最后端与头背部末端之间直线距离/体长、臀鳍起点与背鳍末端之间直线距离/体长、全长/体长、头长/吻长、体长/尾柄长、头长/眼径、头长/眼间距；
（3）将以上步骤2获得的七个数据依次用X1~X7代替，并分别代入下列判定模型：
Y1=-1183+3099X1+2184X2+604.432X3+37.99X4+17.807X5-10.972X6+10.687X7；
Y2=-1245+3413X1+1967X2+584.208X3+37.597X4+19.98X5-6.528X6+16.487X7；
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（4）根据所得最大的Y值来判别该样本所属类别，其中Y1代表鞍带石斑鱼、Y2代表棕点石斑鱼、Y3代表虎龙斑。
2.根据权利要求1所述杂交石斑鱼的种质鉴定方法，其特征在于步骤（1）中，对所述的传统可量性状参数和框架测量参数通过传统测量法或纸板测量法获取。
3.根据权利要求2所述杂交石斑鱼的种质鉴定方法，其特征是所述纸板测量法，用针在纸板上比照鱼体的框架结构点依次扎孔。
4.根据权利要求1或2或3所述杂交石斑鱼的种质鉴定方法，其特征在于待测样本石斑鱼在测量前用冰浴处理5分钟。
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Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| C06 | Publication | ||
| PB01 | Publication | ||
| C10 | Entry into substantive examination | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
| C14 | Grant of patent or utility model | ||
| GR01 | Patent grant | ||
| ASS | Succession or assignment of patent right |
Owner name: GUANGZHOU ZHONGSHAN UNIVERSITY TECHNOLOGY PARK MAN Free format text: FORMER OWNER: ZHONGSHAN UNIVERSITY Effective date: 20140918 |
|
| C41 | Transfer of patent application or patent right or utility model | ||
| TR01 | Transfer of patent right |
Effective date of registration: 20140918 Address after: 510275, A, block 1501, Zhongda Science Park, No. 135 West Haizhuqu District Road, Guangzhou, Guangdong, Xingang Patentee after: Guangzhou Zhongshan University Science Park Management Co., Ltd. Address before: 510275 Xingang West Road, Guangdong, Guangzhou, No. 135, No. Patentee before: Sun Yat-sen University |
|
| ASS | Succession or assignment of patent right |
Owner name: GUANGDONG DAHUANONG ANIMAL HEALTH PRODUCTS CO., LT Free format text: FORMER OWNER: GUANGZHOU ZHONGSHAN UNIVERSITY TECHNOLOGY PARK MANAGEMENT CO., LTD. Effective date: 20150226 |
|
| C41 | Transfer of patent application or patent right or utility model | ||
| COR | Change of bibliographic data |
Free format text: CORRECT: ADDRESS; FROM: 510275 GUANGZHOU, GUANGDONG PROVINCE TO: 519080 ZHUHAI, GUANGDONG PROVINCE |
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| TR01 | Transfer of patent right |
Effective date of registration: 20150226 Address after: Tangjiawan town Xiangzhou District Zhuhai city Guangdong province 519080 Tang Qi Lu No. 437 building on the third floor of mountain chicken Patentee after: SUN YAT-SEN UNIVERSITY Address before: 510275, A, block 1501, Zhongda Science Park, No. 135 West Haizhuqu District Road, Guangzhou, Guangdong, Xingang Patentee before: Guangzhou Zhongshan University Science Park Management Co., Ltd. |
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| PE01 | Entry into force of the registration of the contract for pledge of patent right |
Denomination of invention: A germplasm identification method of hybrid grouper Effective date of registration: 20210928 Granted publication date: 20140416 Pledgee: CITIC Bank Haikou branch Pledgor: GUANGDONG DALINYANG MARINE BIOLOGICAL Co.,Ltd. Registration number: Y2021980010248 |
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| PE01 | Entry into force of the registration of the contract for pledge of patent right |