CN102939301A - 作为抗菌剂使用的肽化合物 - Google Patents

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CN102939301A CN2011800220133A CN201180022013A CN102939301A CN 102939301 A CN102939301 A CN 102939301A CN 2011800220133 A CN2011800220133 A CN 2011800220133A CN 201180022013 A CN201180022013 A CN 201180022013A CN 102939301 A CN102939301 A CN 102939301A
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Abstract

已经发现式(I)化合物用于细菌感染的治疗,其中:R0是(C8-C11)-支链烷基、CH3-(CH2)m-、CH3-O-(CH2CH2O)2CH2-、或者苯基-(CH2)x-;m=6-10;x=1-3;R1,R3,R4,R7,和R8是独立地选自式GF-(CH2)n-;以及n=1-4;和GF=-NH2或者-NH-C(=NH)-NH2;R2是-CH(CH3)(OH)、-CH(CH3)2、-CH2NH2或者-CH2OH;R5和R6是独立地选自H、-(C1-C4)-直链或者支链烷基、-(CH2)-R10、-CH2-CH2-S-CH3和-CH-(CH3)-OH;R9是CONH2、-CH(CH3)(OH)或者CONHR11;R10是苯基、3-吲哚基、4-咪唑基、4-羟基苯基,α或者β-萘基或者2-,3-或者4-吡啶基;R11是特定的肽序列;u是CH2或者S;v是NH或者S;w是CH2或者CO;以及当R9是CONH2时,(a)R5或者R6是-CH(CH3)(OH),或者(b)R5和R6是H;或者(c)连接到R9的碳原子构型是S或者(d)连接到R5的碳原子构型是R;和当R9是–CH(CH3)OH时,R8是GF(CH2)n其中n是3和GF是-NH-C(=NH)-NH2,和R7是GF(CH2)n其中n是2和GF是NH2

Description

作为抗菌剂使用的肽化合物
技术领域
本发明涉及一种抗革兰氏阳性细菌和一些革兰氏阴性细菌的新的化合物、其制备方法、包含其的药物组合物及其作为抗菌剂的用途。
背景技术
引起疾病的微生物已经对抗生素药物疗法产生了耐药性,这是一个越来越严重的公共健康问题。引起该问题的部分原因在于某些细菌及其他传染性的微生物可显著地产生对抗生素的耐药性。另一个引起该问题的原因是在人用药和兽药及农业中滥用抗生素。由耐多种药物的细菌引起的流行传染增加,已成为了全球性的问题,包括耐2,6-二甲氧基苯青霉素的金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、耐万古霉素的肠球菌,和某些革兰氏阴性细菌如绿脓假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)、鲍曼不动杆菌(Acinetobacter baumanii)和肺炎克雷伯氏菌(Klebsiellapneumoniae)。这种传染是极难控制的,并常引起疾病和死亡。典型地,传统抗生素与一个或多个特异性的靶蛋白或靶受体相互作用,且遗传抗药性出现的速率取决于许多因素,如蛋白或者靶受体的数量。
耐传统抗生素的菌株的不断的出现,使得针对靶向为细菌细胞膜的新型药物的开发力度加大,如抗生物肽(AMP’s)。AMPs是一类新型治疗剂,细菌可能无法产生对这种治疗剂的遗传抗性,因为它们主要作用于细胞膜的脂质成分。在这些化合物中,临床上已证明抗生素多粘菌素B(PxB)具有新的疗效,且开始被认为是抗耐多药细菌类抗生素的代表。
多粘菌素(特别地多粘菌素B)是1947年发现的一类抗生素,其具有抗革兰氏阴性细菌的显著活性。多粘菌素B是一种从多粘芽孢杆菌(Bacillus polymyxa)中分离的脂肽抗生素。它的基本结构由聚阳离子肽环和具有脂肪酸尾部的三肽侧链组成。由于抗生素开发途径穷尽和由耐多药的(MDR)革兰氏阴性细菌引起的全球性医院感染的流行增加,近年来,多粘菌素B再次出现在医疗实践中,且其用途持续增加。多粘菌素B及多粘菌素族的其他成员是治疗由耐多药细菌引起的传染的最后的方法,且有时是唯一可用的有效的抗生素。此外,多粘菌素的耐药性很少见,且基本上是适应性的反应,因此耐药性是可逆的。多粘菌素B还能够通过高-亲合力地结合到脂质A部分来抑制细菌脂多糖(LPS)的生物学活性,可用于治疗LPS诱导的脓毒性休克。令人遗憾地,多粘菌素B没有抗革兰氏阳性菌和厌氧菌的活性。此外,因为显示出了一些肾毒性和神经毒性,多粘菌素用途受限。
因此,仍然需要找到新型有效的抗菌剂,该抗菌剂不仅具有抗革兰氏阴性细菌的活性,而且还具有抗革兰氏阳性细菌的活性。
发明简述
发明人已经发现一些具有抗菌活性的肽化合物在细菌细胞膜的脂类组分水平上起作用,且其具有抗革兰氏阳性细菌和革兰氏阴性细菌的活性。这些化合物基于天然的多粘菌素的结构。然而,不同于多粘菌素,这些化合物不仅具有抗革兰氏阴性细菌的活性,而且在微摩尔的范围内,其具有抗革兰氏阳性细菌的活性。由于可应答由两种类型的细菌引起的感染,所以该发现是有利的。因此,本发明的一个方面在于提供式(I)的化合物,
其中R0是基团,其选自由(C8-C11)-支链烷基、CH3-(CH2)m-、CH3-O-(CH2CH2O)2CH2-和
Figure BDA00002337136700032
所组成的组;
m是6-10的整数;x是1-3的整数;R1、R3、R4、R7和R8独立地选自具有以下通式的基团:GF-(CH2)n-;其中n是1-4的整数;GF是基团,其选自由-NH2和-NH-C(=NH)-NH2所组成的组;R2是基团,其选自由-CH(CH3)(OH),-CH(CH3)2,-CH2NH2和-CH2OH所组成的组;
R5和R6是基团,其独立地选自由H、直链或者支链(C1-C4)烷基、-(CH2)-R10、-CH2-CH2-S-CH3和-CH(CH3)(OH)所组成的组;
R9选自由CONH2、-CH(CH3)(OH)和CONHR11所组成的组;
R10是基团,其选自由苯基、3-吲哚基、4-咪唑基、4-羟基苯基、α-萘基或β-萘基和2-、3-或4-吡啶基所组成的组;
R11是肽序列,其选自由Ala-Leu-Arg、Ala-Leu-Arg-Ala-Leu-Arg、Gly-Arg-Val-Glu-Val-Leu-Tyr-Arg-Gly-Ser-Trp、Lys-Val-Leu、Lys-Val-Leu-Lys-Val-Leu、Leu-Met-Trp-Trp-Met-Leu、Orn-Orn-Orn、Gln-Arg-Gly-Arg-Ala-Glu-Glu-Val-Tyr-Tyr-Ser-Gly-Thr和Glu-(γ-亚精胺)-Arg-Gly-Arg-Ala-Glu-Glu-Val-Tyr-Tyr-Ser-Gly-Thr;和Glu(Arg-Gly-Arg-Ala-Glu-Glu-Val-Tyr-Tyr-Ser-Gly-Thr)-γ-亚精胺所组成的组;
u是CH2或者S;v是NH或者S;w是CH2或者CO;附带条件是,当R9是CONH2时,应用以下情况之一:下列情形之一将适用:(a)R5或者R6是-CH(CH3)(OH);或者(b)R5和R6是H;或者(c)连接到R9的碳原子的构型是S;或者(d)连接到R5的碳原子的构型是是R;和当R9是–CH(CH3)OH(苏氨酸的侧链)时,R8是GF(CH2)n其中n是3和GF是-NH-C(=NH)-NH2,和R7是GF(CH2)n其中n是2和GF是NH2
在一个优选的实施例中,式(I)化合物是上述这些化合物,其中R2是–CH(CH3)(OH)。
在另一个优选的实施例中,(I)化合物是那些具有式(Ia)结构的化合物,其中u是CH2,v是NH,w是CO,R9是-CH(CH3)(OH)并且连接到R9的碳原子的构型是S。
Figure BDA00002337136700041
在另一个更优选的实施例中,式(Ia)是
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(4-10)[Dab-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-Thr],(Ia1)。
术语环(4-10)意指通过酰胺键,苏氨酸10位的末端羧基连接到Dab的4位的侧链,形成大环。
D-氨基酸的构型用D表示。当没有提及构型时,可以理解为氨基酸的构型是L。
在另一个优选的实施例中,式(I)化合物是那些具有式(Ib)结构的化合物,其中u是S,v是S和w是CH2
在另一个优选的实施例中,式(Ib)化合物是那些化合物,其中R9是CONHR11和R11是肽序列,其选自由Ala-Leu-Arg、Ala-Leu-Arg-Ala-Leu-Arg、Gly-Arg-Val-Glu-Val-Leu-Tyr-Arg-Gly-Ser-Trp、Lys-Val-Leu、Lys-Val-Leu-Lys-Val-Leu、Leu-Met-Trp-Trp-Met-Leu、Orn-Orn-Orn、Gln-Arg-Gly-Arg-Ala-Glu-Glu-Val-Tyr-Tyr-Ser-Gly-Thr、Glu(γ-亚精胺)-Arg-Gly-Arg-Ala-Glu-Glu-Val-Tyr-Tyr-Ser-Gly-Thr、Glu(Arg-Gly-Arg-Ala-Glu-Glu-Val-Tyr-Tyr-Ser-Gly-Thr)-γ-亚精胺所组成的组;
在另一个更优选的实施例中,式(Ib)化合物是选自下列物质的化合物:
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-Cys]-Ala-Leu-Arg,(Ib1);
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-Cys]-Ala-Leu-Arg-Ala-Leu-Arg,(Ib2);
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-Cys]-Gly-Arg-Val-Glu-Val-Leu-Tyr-Arg-Gly-Ser-Trp],(Ib3);
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-Cys]-Lys-Val-Leu,(Ib4);
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-Phe-Leu-Arg-Dab-Cys]-Lys-Val-Leu-Lys-Val-Leu,(Ib5);
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-Cys]-Leu-Met-Trp-Trp-Met-Leu,(Ib6);
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-Cys]-Orn-Orn-Orn,(Ib7);
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Dab-Arg-Cys]-Gln-Arg-Gly-Arg-Ala-Glu-Glu-Val-Tyr-Tyr-Ser-Gly-Thr,(Ib8);和
壬酰基-Arg-Thr-Dab-ciclo(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Dab-Arg-Cys]-Glu-(γ-亚精胺)-Arg-Gly-Arg-Ala-Glu-Glu-Val-Tyr-Tyr-Ser-Gly-Thr,(Ib9)。
术语“环(S-S)”意指通过两个半胱氨酸之间的二硫键形成的大环。在另一个优选的实施例中,式(Ib)化合物是选自下列:
壬酰基-Arg-Thr-Arg-环(S-S)[Cys-Dab-Phe-Leu-Arg-Dab-Cys],(Ib10);
壬酰基-Arg-Thr-Arg-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-DCys],(Ib11);
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-Phe-Leu-Arg-Dab-Cys],(Ib12);和
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-DCys],(Ib13)。
特别地,具有在10位包含D-半胱氨酸的肽可获得良好的结果。在另一个更优选的实施例中,式(Ib)化合物是选自下列:
壬酰基-Arg-Thr-Arg-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-DCys],(Ib11);
和壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-DCys],(Ib13)。
在另一个更优选的实施例中,式(Ib)化合物是壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-DCys],(Ib13)。
在另一个优选的实施例中,式(Ib)化合物是那些化合物,其中R6是–(CH)(CH3)(OH)。
在另一个优选的实施例中,式(Ib)化合物是选自下列:
壬酰基-Arg-Thr-Arg-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Thr-Arg-Dab-Cys],(Ib14);
壬酰基-Arg-Thr-Arg-环(S-S)[Cys-Dab-Phe-Thr-Arg-Dab-Cys],(Ib15);
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Thr-Arg-Dab-Cys],(Ib16);
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-Phe-Thr-Arg-Dab-Cys],(Ib17);
壬酰基-Arg-Thr-Arg-环(S-S)[Cys-Dab-Trp-Thr-Arg-Dab-Cys],(Ib18);
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-Trp-Thr-Arg-Dab-Cys],(Ib19);
壬酰基-Arg-Thr-Arg-环(S-S)[Cys-Dab-DLeu-Thr-Arg-Dab-Cys],(Ib20);
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DLeu-Thr-Arg-Dab-Cys],(Ib21);
癸酰基-Arg-Thr-Arg-环(S-S)[Cys-Dab-DTrp-Thr-Dab-Dab-Cys],(Ib22);
癸酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DLeu-Thr-Arg-Dab-Cys],(Ib23);
癸酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-Trp-Thr-Arg-Dab-Cys],(Ib24);和
十二酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-Phe-Thr-Arg-Dab-Cys],(Ib25)。
在另一个优选的实施例中,式(Ib)化合物是那些化合物,其中R5或者R6是氢。
在另一个优选的实施例中,式(Ib)化合物是选自下列:
壬酰基-Arg-Thr-Arg-环(S-S)[Cys-Dab-Gly-Gly-Arg-Dab-Cys],(Ib26);
壬酰基-Arg-Thr-Arg-环(S-S)[Cys-Dab-Gly-Leu-Arg-Dab-Cys],(Ib27);
壬酰基-Arg-Thr-Arg-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Gly-Arg-Dab-Cys],(Ib28);
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Gly-Arg-Dab-Cys],(Ib29);和
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-Gly-Leu-Arg-Dab-Cys],(Ib30)。
在另一个优选的实施例中,式(Ib)化合物是选自下列:
辛酰基-Arg-Thr-Arg-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-Cys],(Ib31);
(S)-6-甲基庚酰基-Arg-Thr-Arg-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-Cys],(Ib32);
(S)-6-甲基辛酰基-Arg-Thr-Arg-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-Cys],(Ib33);
辛酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-Cys],(Ib34);
(S)-6-甲基庚酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-Cys],(Ib35);和
(S)-6-甲基辛酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-Cys],(Ib36)。
更优选的式(I)化合物是选自下列:
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(4-10)[Dab-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-Thr],(Ia1);
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-Cys]-Gly-Arg-Val-Glu-Val-Leu-Tyr-Arg-Gly-Ser-Trp],(Ib3);
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-Cys]-Leu-Met-Trp-Trp-Met-Leu,(Ib6);和
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-DCys],(Ib13)。
本发明的化合物可以通过固相Fmoc/tBu合成法来制备。每种氨基酸的合成由下列步骤组成:(i)用N,N-二甲基甲酰胺(DMF)冲洗树脂几次;ii)用20%哌啶/DMF处理;iii)用DMF冲洗若干次;iv)Fmoc-保护性氨基酸和2-(1H-苯并三氮唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基脲阳离子六氟磷酸/二异丙基乙胺(HBTU/DIEA)在DMF中酰化;v)用DMF冲洗若干次并用二氯甲烷(CH2Cl2)冲洗若干次;和vi)DMF冲洗若干次。
通过之前的方法获得的肽可以通过预备的HPLC纯化。通过该方法可以达到的最终纯度大于90%,但优选地大于95%。
本发明的化合物易于根据所述的化学合成方法来制备,而商用多粘菌素是通过发酵方法获得的。
本发明的另一个方面是式(I)化合物,用作抗革兰氏阳性细菌的抗菌剂,与医学相关的革兰氏阳性细菌中,其中如杆菌、李斯特菌、葡萄球菌、微球菌、链球菌、肠球菌、梭状芽孢杆菌、支原体和放线菌是众所周知的。
在一个优选的实施例中,革兰氏阳性细菌选自草分枝杆菌(Micobacterium phlei)、金色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)和藤黄微球菌(Micrococcus luteus)。在一个特别的实施例中,革兰氏阳性细菌选自草分枝杆菌ATCC41423、金色葡萄球菌ATCC 6538和藤黄微球菌ATCC 9341。
本发明的一个方面可以解释为如上定义的化合物在制备用于治疗包括人类的哺乳动物中革兰氏阳性细菌引起的细菌感染的药物中的用途。
本发明也涉及一种包括人类的哺乳动物的治疗和/或预防方法,所述包括人类的哺乳动物已罹患或者感染由革兰氏阳性细菌引起的细菌传染,特别地涉及上述的传染之一,所述方法包括对所述患者施用治疗有效量的本发明的化合物及药学上可接受的赋形剂或者载体。
如上定义的式(I)化合物用作抗革兰氏阴性细菌的抗菌剂也是本发明一部分。医药相关的革兰氏阴性细菌包括大肠杆菌(Escherichia coli)、沙门氏菌(Salmonella)、肠杆菌科(Enterobacteriaceae)、假单胞菌属(Pseudomonas)、莫拉克氏菌属(Moraxella)、螺杆菌属(Helicobacter)、军团杆菌属(Legionella)、流感嗜血杆菌(Hemophilus influenzae)、肺炎克雷伯氏菌(Klebsiella pneumoniae)、奇异变形杆菌(Proteus mirabilis)、阴沟肠杆菌(Enterobactercloacae)、粘质沙雷菌(Serratia marcescens)和鲍氏不动杆菌(Acinetobacter baumannii)。
在一个优选的实施例中,革兰氏阴性细菌选自鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella typhimurium)、绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa)、大肠杆菌和不动杆菌(Acinetobacter sp.)。在一个特别的实施例中,革兰氏阴性细菌选自鼠伤寒沙门氏菌14028、绿脓杆菌9027、大肠杆菌8739和不动杆菌属ATCC 5798。本发明的这一方面还可以解释为是如上定义的式(I)化合物在制备用于治疗包括人类的哺乳动物中的革兰氏阴性细菌所引起的细菌感染的药物中的用途。
本发明还涉及一种包括人类的哺乳动物的治疗和/或预防方法,所述动物已罹患或者感染由革兰氏阴性细菌所引起的细菌传染,特别地涉及上述传染之一,所述方法包括对所述患者施用治疗有效量的本发明的式(I)化合物和药学上可接受的赋形剂或者载体。
本发明的化合物可以以与其他已知的抗菌剂相同的方式使用。本发明的化合物可以单独使用或者与其它的合适的生物活性化合物组合。在一个特别的实施例中,式(I)化合物用于治疗革兰氏阴性细菌或者革兰氏阳性细菌传染引起的菌血症和/或败血病,单独给药或者与常规的抗生素组合。在一个优选的实施例中,本发明的式(I)化合物局部使用或者口服使用,在外科手术前除去消化道的污染。
如上所述的这些化合物是有益的,因为这些化合物具有广谱的抗菌活性,因此可假定它们作用于膜水平,面对抗生素耐用性,它们比其它的作用于特异的受体或者酶的抗生素更有效。
本发明的再一个方面涉及一种药物组合物,其包含治疗有效量的式(I)的化合物,与适量的药物赋形剂或者载体。
药物组合物可以通过复合发明式(I)的化合物与药学上可接受的固体或者液体的赋形剂或者载体,而后依据标准的制药规范来制备。
本发明的药物组合物可以以标准的方式给药,用于治疗需要得到治疗的疾病病症,例如通过口服给药、胃肠外给药、吸入给药、直肠给药、经皮给药或者局部给药。在诊断为细菌感染的患者(如人类及其他动物)中,用于治疗疾病或抗细菌感染时,所述化合物及其药物组合物,优选地将以一种剂量给药,以在进行治疗的患者中,获得和维持有效的抗菌治疗所需的浓度,即活性成分的量或者血液水平。通常这种有效抗菌治疗所需的活性成分的剂量在大约0.1到大约100mg/Kg的范围,更优选地大约3.0到大约50mg/Kg体重/每天。可以理解的是,根据患者的需求、所需治疗的细菌感染的严重性和特别地所使用的化合物,剂量可以不同。
在说明书和权利要求书中,术语“包括”和该词的变化,没有意指除外其它的技术特征、添加剂、组分、或者步骤。查阅说明书后,本发明的另外的目的,优点和特征对于本领域技术人员来说将是显而易见的,或者可以通过本发明的实施而了解到。用图解法提供下列实施例和附图,且实施例和附图不用于限制本发明。此外,本发明涵盖本文指明的特别的和优选的实施例所有可能的组合。
具体实施方式
缩写:Boc,叔丁氧羰基;Dab:2,4-二氨基丁酸;DIEA,N,N-二异丙基乙胺;Dde,N-[1-(4,4-二甲基-2,6-二氧代环己基-1–亚基)乙基];DIPCDI,N,N’-二异丙基碳化二亚胺;DMF,N,N-二甲基甲酰胺;ES,电喷射;Fmoc,9-芴基甲氧羰基;HATU,2-(7-氮杂-1H-苯并三唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基脲阳离子六氟磷酸;HBTU,2-(1H-苯并三氮唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基脲阳离子六氟磷酸;HOBt,1-羟苯并三唑;HPLC,高效液相色谱;MALDI-TOF,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱;MS,质谱;MIC,最低抑菌浓度;MW,分子量;Pbf,2,2,4,6,7-戊甲基二氢苯并呋喃-5-磺酰基;TFA,三氟乙酸;Trt,三苯甲基。
基本方法
为了制备实施例的化合物,使用固相Fmoc/tBu合成的通用方案
每个合成循环的Fmoc/tBu合成方案由下列步骤组成:(i)用DMF冲洗树脂(5x30s);(ii)用20%哌啶/DMF处理(1x1min+2x10min,清除Fmoc);(iii)用DMF冲洗(5x30s);(iv)在最低量的DMF中用Fmoc-带保护基的氨基酸(3倍过量)与活化试剂HBTU/DIEA(分别3和6倍过量)酰化;(v)用DMF(5x30s)和CH2Cl2(5x30s)冲洗;(vi)Kaiser检验(用肽-树脂样品);(vii)DMF冲洗(5x30s)。
在反应容器中,通过用TFA/茴香硫醚/1,2-乙二硫醇/三异丙基硅烷/水(70:10:10:1:3.5;3h)处理来进行肽的基本裂解和全部脱保护。滤去TFA溶液。再用0.5mL的TFA混合物冲洗树脂两次,并合并冲洗液。将获得的裂解液加入到冷乙醚(TFA混合物与乙醚的比例为1:20)以析出肽。另外用乙醚(3倍)冲洗粗肽,轻轻倒出乙醚,固体在空气中干燥。
然后肽粗产物溶于10%DMSO水溶液到1mM或者稍微更低的浓度来形成分子内二硫键。在开放系统中搅拌所述溶液12-36小时。通过空气氧化反应进行环化,并通过HPLC和MS监测。
通过预备的HPLC进行纯化。在实施例中,具有原装Varian Load &lock C18色谱柱(250x2.5mm,10μm)的Varian Pro-star 200准备系统用水-乙腈-0.1%TFA梯度混合物洗脱,并使用UV在220nm检测。
通过用PerSeptive Biosystems,Voyager-DE的MALDI-TOF质谱来鉴别区分肽。
通过使用Merck或者Kromasil C18反相色谱柱(4x250mm,5μm直径和孔径
Figure BDA00002337136700131
分析HPLC来评价纯化出来的肽的均一性。以1ml·min-1的流速用H2O-0.1%TFA和MeCN-0.1%TFA的混合物进行洗脱,并在220nm UV检测。
实施例1:制备壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg- Dab-Cys]-Gly-Arg-Val-Glu-Val-Leu-Tyr-Arg-Gly-Ser-Trp](Ib 3 ),(式(Ib) 化合物,其中R 0 =CH 3 (CH 2 ) 7 -,R 1 =-CH 2 CH 2 CH 2 NHC(=NH)-NH 2 (精氨 酸侧链),R 2 =-CH(CH 3 )OH,(苏氨酸侧链),R 3 =CH2CH2NH2(Dab侧 链),R 4 =-CH 2 CH 2 NH 2 (Dab侧链),R 5 =-CH 2 Ph(DPhe侧链),R 6 =- CH 2 CH(CH 3 ) 2 (亮氨酸侧链),R 7 =-CH 2 CH 2 CH 2 NHC(=NH)-NH 2 (精氨酸 侧链)和R 8 =-CH 2 CH 2 NH 2 (Dab侧链),R 9 =Gly-Arg-Val-Glu-Val-Leu- Tyr-Arg-Gly-Ser-Trp。
保护性氨基酸:Fmoc-Cys(Trt)-OH、Fmoc-Dab(Boc)-OH、FmocArg(Pbf)-OH、Fmoc-Leu-OH,Fmoc-DPhe-OH、Fmoc-Thr(tBu)-OH、Fmoc-Gly-OH、Fmoc-Val-OH、Fmoc-Glu(tBu)-OH、Fmoc-Tyr(tBu)-OH、Fmoc-Ser(tBu)-OH、Fmoc-Trp(Boc)-OH。
在具有的聚乙烯盘的聚丙烯注射器中,按照标准Fmoc/tBu方法进行人工肽合成。使用Fmoc-Rink树脂(600mg,0.282mmol,f=0.47mmol/g树脂)。按照如上所述Fmoc/tBu固相合成方案添加氨基酸序列。装配完整序列后,在最低量的DMF中,壬酸(134μl,0.846mmol,3倍过量)与HBTU/DIEA(分别3和6倍过量)结合。反应完成后,用DMF(5x30s)和CH2Cl2(5x30s)冲洗树脂。
在裂解和形成二硫键之后,粗肽的重量是300mg(产率90%)。通过HPLC纯化后产生了30mg纯化的肽(产率10%)。
纯化后的肽的表征:均一性(通过HPLC图谱的面积积分)>95%;ESI:m/z 528.95([M+5H+]5+),660.90([M+4H+]4+),440.95([M+6H+]6+),881.00([M+3H+]3+)。MW:结果值2639.75(预期值2639.39)。
实施例2:制备壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg- Dab-Cys]-Leu-Met-Trp-Trp-Met-Leu(Ib 6 ),式(Ib)化合物,其中R 0 = CH 3 (CH 2 ) 7 -,R 1 =-CH 2 CH 2 CH 2 NHC(=NH)-NH 2 (精氨酸侧链),R 2 =- CH(CH 3 )OH,(苏氨酸侧链),R 3 =-CH 2 CH 2 NH 2 (Dab侧链),R 4 =- CH 2 CH 2 NH 2 (Dab侧链),R 5 =-CH 2 Ph(DPhe侧链),R 6 =-CH 2 CH(CH 3 ) 2 (亮氨酸侧链),R 7 =-CH 2 CH 2 CH 2 NHC(=NH)-NH 2 (精氨酸侧链)和R 8 =- CH 2 CH 2 NH 2 (Dab侧链),R 9 =Leu-Met-Trp-Trp-Met-Leu。
保护性氨基酸:Fmoc-Cys(Trt)-OH、Fmoc-Dab(Boc)-OH、Fmoc-Arg(Pbf)-OH、Fmoc-Leu-OH、Fmoc-DPhe-OH、Fmoc-Thr(tBu)-OH、Fmoc-Met-OH、Fmoc-Trp(Boc)-OH。
按照实施例1所述,Fmoc-Rink树脂上按照标准的Fmoc/tBu方法进行人工肽的合成。
纯化肽的表征:均一性(通过HPLC图谱的面积积分)>95%;ESI:m/z 550.15([M+4H+]4+),440.15([M+5H+]5+),733.35.00([M+3H+]3+)。MW:结果值2196.6(预期值2197.04)。
实施例3:制备壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg- Dab-DCys],((Ib 13 ),式(Ib)化合物,其中R 0 =CH 3 (CH 2 ) 7 -,R 1 =- CH 2 CH 2 CH 2 NHC(=NH)-NH 2 (精氨酸侧链),R 2 =-CH(CH 3 )OH,(苏氨酸 侧链),R 3 =CH 2 CH 2 NH 2 (Dab侧链),R 4 =-CH 2 CH 2 NH 2 (Dab侧链),R 5 =- CH 2 Ph(DPhe侧链),R 6 =-CH 2 CH(CH 3 ) 2 (亮氨酸侧链),R 7 =- CH 2 CH 2 CH 2 NHC(=NH)-NH 2 (精氨酸侧链)和R 8 =-CH 2 CH 2 NH 2 (Dab侧链), R 9 =CONHR 11 和R 11 =H。
保护性氨基酸:Fmoc-Cys(Trt)-OH、Fmoc-Dab(Boc)-OH、Fmoc-Arg(Pbf)-OH、Fmoc-Leu-OH、Fmoc-DPhe-OH、Fmoc-Thr(tBu)-OH、Fmoc-DCys(Trt)-OH。
按照实施例1所述,在Fmoc-Rink树脂上的按照标准的Fmoc/tBu方法进行人工肽的合成。
纯化肽的表征:均一性(通过HPLC图谱的面积积分)>95%;MALDI-TOF:m/z 1336.68([M+H]+,100%),1359.49([M+Na]+,17%)。
实施例4:制备壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Thr-Arg- Dab-Cys]((Ib 16 ),式(Ib)化合物,其中R 0 =CH 3 (CH 2 ) 7 -,R 1 =- CH 2 CH 2 CH 2 NHC(=NH)-NH 2 (精氨酸侧链),R 2 =-CH(CH 3 )OH,(苏氨酸 侧链),R 3 =-CH 2 CH 2 NH 2 (Dab侧链),R 4 =-CH 2 CH 2 NH 2 (Dab侧链),R 5 = -CH 2 Ph(DPhe侧链),R 6 =-CH(CH 3 )(OH),(苏氨酸侧链),R 7 =- CH 2 CH 2 CH 2 NHC(=NH)-NH 2 (精氨酸侧链)和R 8 =-CH 2 CH 2 NH 2 (Dab侧 链),R 9 =CONHR 11 ,R 11 =H。
保护性氨基酸:Fmoc-Cys(Trt)-OH、Fmoc-Dab(Boc)-OH、Fmoc-Arg(Pbf)-OH、Fmoc-DPhe-OH、Fmoc-Thr(tBu)-OH,
按照实施例1所述,在Fmoc-Rink树脂上按照标准的Fmoc/tBu方法进行人工肽的合成。
纯化肽的表征:均一性(通过HPLC图谱的面积积分)>95%;MALDI-TOF:m/z 1324.24([M+H]+,100%),1347.45([M+Na]+,16%)。
实施例5:制备壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Gly-Arg- Dab-Cys]((Ib 29 ),式(Ib)化合物,其中R 0 =CH 3 (CH 2 ) 7 -,R 1 =- CH 2 CH 2 CH 2 NHC(=NH)-NH 2 (精氨酸侧链),R 2 =-CH(CH 3 )OH,(苏氨酸 侧链),R 3 =-CH 2 CH 2 NH 2 (Dab侧链),R 4 =-CH 2 CH 2 NH 2 (Dab侧链),R 5 =-CH 2 Ph(DPhe侧链),R 6 =-H,(甘氨酸侧链),R 7 =- CH 2 CH 2 CH 2 NHC(=NH)-NH 2 (精氨酸侧链)和R 8 =-CH 2 CH 2 NH 2 (Dab侧 链),R 9 =CONHR 11 ,yR 11 =H。
保护性氨基酸:Fmoc-Cys(Trt)-OH、Fmoc-Dab(Boc)-OH、Fmoc-Arg(Pbf)-OH、Fmoc-DPhe-OH、Fmoc-Thr(tBu)-OH、Fmoc-Gly-OH。
按照实施例1所述,在Fmoc-Rink树脂上按照标准的Fmoc/tBu方法进行人工肽的合成。
纯化肽的表征:均一性(通过HPLC图谱的面积积分)>95%;MALDI-TOF:m/z 1280.59([M+H]+,100%),1284.45([M+Na]+,18%)。
实施例6:制备壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(4-10)[Dab-Dab-DPhe-Leu- Arg-Dab-Thr]((Ia 1 ),式(Ia)化合物,其中R 0 =CH 3 (CH 2 ) 7 -,R 1 =- CH 2 CH 2 CH 2 NHC(=NH)-NH 2 (精氨酸侧链),R 2 =-CH(CH 3 )OH,(苏氨酸 侧链),R 3 =-CH 2 CH 2 NH 2 (Dab侧链),R 4 =-CH 2 CH 2 NH 2 (Dab侧链),R 5 =-CH 2 Ph(DPhe侧链),R 6 =-CH 2 CH(CH 3 ) 2 (亮氨酸侧链),R 7 =- CH 2 CH 2 CH 2 NHC(=NH)-NH 2 (精氨酸侧链)和R 8 =-CH 2 CH 2 NH 2 (Dab侧链 Dab)。
保护性氨基酸:Fmoc-Arg(Pbf)-OH、Fmoc-Dab(Boc)-OH、Fmoc-Dab(Dde)-OH、Fmoc-DPhe-OH、Fmoc-Leu-OH、Fmoc-Thr(tBu)-OH。
在具有聚乙烯盘的聚丙烯注射器中,按照标准Fmoc/tBu方法进行人工肽合成。使用Clorotrytil氯化树脂(800mg,0.48mmol,f=0.6mmol/g树脂)。按照如上所述Fmoc/tBu固相合成方案添加氨基酸序列。引入桥接的Dab4作为Fmoc-Dab(Dde)-OH。一旦整个序列装配完成,在最低量的DMF中,壬酸(228μl,1.44mmol,3倍过量)与HBTU/DIEA(分别3和6倍过量)结合。反应完成后,用DMF(5x30s)和CH2Cl2(5x30s)冲洗树脂。
用肼(1%在DMF中)处理保护性的肽树脂来除去Dde保护基团。然后用温和的TFA(1%在CH2Cl2)处理从树脂上解离肽,因此保留其余的侧链保护基(tBu型和Pbf基团)。在DMF:CHCl3=1:1溶液(肽浓度0.3m)与HATU:HOBt:DIEA (1.1:1.1:2.2当量)中在室温下进行在Dab4和C-末端Thr10之间的环化,反应48h。在最终的TFA裂解来去除其余的侧链保护基团之前,在硅石色谱柱中纯化粗的具有保护的环状肽。
粗肽的重量是130mg(产率21%)。通过HPLC纯化产生11mg(产率8.5%)纯化后的肽。
纯化后的肽的表征:均一性(通过HPLC图谱的面积积分)>91.8%;MALDI-TOF:m/z 1316.89([M+H]+,100%),1297.98([M+H-H2O]+,68%)1339.65([M+Na]+,19%)。
实施例7:制备壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-Phe-Leu-Arg- Dab-Cys](Ib 12 );式(Ib)化合物,其中R 0 =CH 3 (CH 2 ) 7 -,R 1 =- CH 2 CH 2 CH 2 NHC(=NH)-NH 2 (精氨酸侧链),R 2 =-CH(CH 3 )OH,(苏氨酸 侧链),R 3 =-CH 2 CH 2 NH 2 (Dab侧链),R 4 =-CH 2 CH 2 NH 2 (Dab侧链),R 5 = -CH 2 Ph(苯丙氨酸侧链),R 6 =-CH 2 CH(CH 3 ) 2 (亮氨酸侧链),R 7 =- CH 2 CH 2 CH 2 NHC(=NH)-NH 2 (精氨酸侧链),R 8 =-CH 2 CH 2 NH 2 (Dab侧 链),R 9 =CONHR 11 ,yR 11 =H。
保护性氨基酸:Fmoc-Cys(Trt)-OH、Fmoc-Dab(Boc)-OH、Fmoc-Arg(Pbf)-OH、Fmoc-Leu-OH、Fmoc-Phe-OH、Fmoc-Thr(tBu)-OH、Fmoc-Cys(Trt)-OH。
按照实施例1所述,在Fmoc-Rink树脂上按照标准的Fmoc/tBu方法进行人工肽的合成。
纯化后的肽的表征:均一性(通过HPLC图谱的面积积分)>95%;MALDI-TOF:m/z 1336.30([M+H]+,100%),1358.40([M+Na]+,15%)。
实施例8:制备壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-Gly-Leu-Arg- Dab-Cys],(Ib 30 ),式(Ib)化合物,其中R 0 =CH 3 (CH 2 ) 7 -,R 1 =- CH 2 CH 2 CH 2 NHC(=NH)-NH 2 (精氨酸侧链),R 2 =-CH(CH 3 )OH,(苏氨酸 侧链),R 3 =-CH 2 CH 2 NH 2 (Dab侧链),R 4 =-CH 2 CH 2 NH 2 (Dab侧链),R 5 =H(甘氨酸侧链),R 6 =-CH 2 CH(CH 3 ) 2 (亮氨酸侧链),R 7 =- CH 2 CH 2 CH 2 NHC(=NH)-NH 2 (精氨酸侧链),R 8 =-CH 2 CH 2 NH 2 (Dab侧链), R 9 =CONHR 11 ,yR 11 =H。
保护性氨基酸:Fmoc-Cys(Trt)-OH、Fmoc-Dab(Boc)-OH、Fmoc-Arg(Pbf)-OH、Fmoc-Gly-OH、Fmoc-Leu-OH、Fmoc-Thr(tBu)-OH、Fmoc-Cys(Trt)-OH
根据实施例1所述,在Fmoc-Rink树脂上按照标准的Fmoc/tBu方法进行人工肽的合成。
纯化后的肽的表征:均一性(通过HPLC图谱的面积积分)>95%;MALDI-TOF:m/z 1246.03([M+H]+,100%)。
实施例9:制备壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DLeu-Thr-Arg- Dab-Cys],(Ib 21 ),式(Ib)化合物,其中R 0 =CH 3 (CH 2 ) 7 -,R 1 =- CH 2 CH 2 CH 2 NHC(=NH)-NH 2 (精氨酸侧链),R 2 =-CH(CH 3 )OH,(苏氨酸 侧链),R 3 =-CH 2 CH 2 NH 2 (Dab侧链),R 4 =-CH 2 CH 2 NH 2 (Dab侧链),R 5 =CH 2 CH(CH 3 ) 2 (DLeu侧链),R 6 =-CH(CH 3 )OH,(苏氨酸侧链),R 7 =-CH 2 CH 2 CH 2 NHC(=NH)-NH 2 (精氨酸侧链),R 8 =-CH 2 CH 2 NH 2 (Dab侧 链),R 9 =CONHR 11 ,yR 11 =H。
保护性氨基酸:Fmoc-Cys(Trt)-OH,Fmoc-Dab(Boc)-OH、Fmoc-Arg(Pbf)-OH、Fmoc-DLeu-OH、Fmoc-Thr(tBu)-OH、Fmoc-Cys(Trt)-OH
按照实施例1所述,在Fmoc-Rink树脂上按照标准的Fmoc/tBu方法进行人工肽的合成。
纯化后的肽的表征:均一性(通过HPLC图谱的面积积分)>95%;MALDI-TOF:m/z 1291.70([M+H]+,100%),1312.76([M+Na]+,16%)。
实施例10:抗菌试验
在无菌的96孔板上测定(Corning Costar 3598微量滴定板)脂肽的抗菌活性。最终容积为200μL的样品的制备如下:将在培养基(MH,Muller Hinton Broth,Difco,USA)中包含浓度为105菌落-形成单位/ml的细菌等份悬液(μL),调节至pH7.4,添加到包含从1mg/mL肽储备液制备的100μl的水溶液中,该溶液在MH肉汤中进行连续2倍稀释,并调节至pH7.4(Jorgensen和Turnide,2003)。
在37℃培养24-48小时后,用吸光度酶标仪ELx 800(Bio-tekInstruments)测量在492nm的吸光度,从而测定细菌的抑制作用。抗菌活性表示为MIC,培养24-48小时后,观察在哪种浓度没有生长。
在Tryptycase大豆肉汤培养基上(Pronadisa,Barcelona)培养微生物,并在37℃培养直到观察到细菌生长为止。然后在胰蛋白胨大豆琼脂(Pronadisa,Barcelona)上划线培养,并在37℃培养直到菌落形成为止。将微生物保藏在cryobilles(EAS实验室,France)中,温度为-20℃。
用于抗菌活性试验的细菌株从美国菌种保藏中心(ATCC,罗克维尔市,马里兰州,美国)获得:
大肠杆菌ATCC 8739
绿脓杆菌ATCC 9027
鼠伤寒沙门氏菌ATCC 14028
不动杆菌ATCC 5798
金黄色葡萄球菌ATCC 6538
草分支杆菌ATCC 41423
藤黄微球菌ATCC 9341结果显示在表1表2中。
表1:革兰氏阳性抗菌活性(MIC,单位μg/ml)
表2:革兰氏阴性抗菌活性(MIC,单位μg/ml)
对照(多粘菌素B):(S)-6-甲基辛酰基-Dab-Thr-Dab-环(4-10)[Dab-Dab-DPhe-Leu-Dab-Dab-Thr].
本发明的化合物的分子量比PxB高。该事实意味着以微摩尔单位代替mg/ml表示的活性,本发明的化合物也比PxB高。
因此,上述活性结果将在下面以微摩尔单位表示,以更好的比较研究结果。
表3:革兰氏阳性抗菌活性(MIC,以微摩尔单位)
Figure BDA00002337136700212
表格4:革兰氏阴性抗菌活性(MIC,以微摩尔为单位)
Figure BDA00002337136700221
此外,值得提及的是,已经用具有治疗活性的模型获得了最佳结果。因此,不动杆菌ATCC 5798是不动杆菌属的代表,不动杆菌属是在医院传染中问题最多的细菌之一。金黄色葡萄球菌是与抗生素耐药性有关的最重要的细菌之一,结核分枝杆菌是肺结核致病因子(结核杆菌)的非病原代表。
这些结果表明新型化合物(I)对革兰氏阳性细菌和革兰氏阴性细菌都显示了在微摩尔水平的活性(天然的多粘菌素对革兰氏阴性细菌的MIC稍高,但天然的多粘菌素没有显示抗革兰氏阳性细菌的活性)。因此,由于市售的抗生素(天然的多粘菌素和达托霉素(daptomicin))仅相对一种类型的细菌(分别是革兰氏阴性或者革兰氏阳性)具有活性,所以新化合物抗菌谱更广。

Claims (15)

1.一种式(I)的化合物,
Figure FDA00002337136600011
其中:
R0是基团,其选自由(C8-C11)-支链烷基、CH3-(CH2)m-、CH3-O-(CH2CH2O)2CH2-,和
Figure FDA00002337136600012
所组成的组;
m是6~10的整数;
x是1~3的整数;
R1、R3、R4、R7和R8是独立地选自具有下列式的基团:
GF-(CH2)n-;
其中n是1~4的整数;GF是基团,其选自由-NH2和-NH-C(=NH)-NH2所组成的组;
R2是基团,其选自由-CH(CH3)(OH)、-CH(CH3)2、-CH2NH2和-CH2OH所组成的组;
R5和R6是基团,其独立地选自由H、-(C1-C4)-直链或者支链烷基、-(CH2)-R10、-CH2-CH2-S-CH3和-CH(CH3)(OH)所组成的组;
R9是选自由CONH2、-CH(CH3)(OH)和CONHR11所组成的组中;
R10是基团,其选自由苯基、3-吲哚基、4-咪唑基、4-羟基苯基、α或者β-萘基和2-、3-或者4-吡啶基所组成的组;
R11是肽序列,其选自由Ala-Leu-Arg、Ala-Leu-Arg-Ala-Leu-Arg、Gly-Arg-Val-Glu-Val-Leu-Tyr-Arg-Gly-Ser-Trp、Lys-Val-Leu、Lys-Val-Leu-Lys-Val-Leu、Leu-Met-Trp-Trp-Met-Leu、Orn-Orn-Orn、Gln-Arg-Gly-Arg-Ala-Glu-Glu-Val-Tyr-Tyr-Ser-Gly-Thr,和Glu-(γ-亚精胺)-Arg-Gly-Arg-Ala-Glu-Glu-Val-Tyr-Tyr-Ser-Gly-Thr;和Glu(Arg-Gly-Arg-Ala-Glu-Glu-Val-Tyr-Tyr-Ser-Gly-Thr)-γ-亚精胺所组成的组;
u是CH2或者S;
v是NH或者S;
w是CH2或者CO;
附带条件是,当R9是CONH2时,
(a)R5或者R6是-CH(CH3)(OH),或者
(b)R5和R6是H;或者
(c)连接到R9的碳原子的构型是S,或者
(d)连接到R5的碳原子的构型是是R;
和当R9是-CH(CH3)OH时,R8是GF(CH2)n,其中n是3且GF是-NH-C(=NH)-NH2,和R7是GF(CH2)n,其中n是2且GF是NH2
2.根据权利要求1所述的化合物,其中u是CH2,v是NH,Z是CO,R9是-CH(CH3)(OH),连接到R9的碳原子的构型是S,且具有式(Ia)的结构。
Figure FDA00002337136600031
3.根据权利要求2所述的化合物,其是壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(4-10)[Dab-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-Thr]。
4.根据权利要求2所述的化合物,其中u是S,v是S,w是CH2
具有式(Ib)的结构
Figure FDA00002337136600032
5.根据权利要求4所述的化合物,其中R11是肽序列,其选自由Ala-Leu-Arg、Ala-Leu-Arg-Ala-Leu-Arg、Gly-Arg-Val-Glu-Val-Leu-Tyr-Arg-Gly-Ser-Trp、Lys-Val-Leu、Lys-Val-Leu-Lys-Val-Leu、Leu-Met-Trp-Trp-Met-Leu、Orn-Orn-Orn、Gln-Arg-Gly-Arg-Ala-Glu-Glu-Val-Tyr-Tyr-Ser-Gly-Thr、Glu(γ-亚精胺)-Arg-Gly-Arg-Ala-Glu-Glu-Val-Tyr-Tyr-Ser-Gly-Thr,和Glu(Arg-Gly-Arg-Ala-Glu-Glu-Val-Tyr-Tyr-Ser-Gly-Thr)-γ-亚精胺所组成的组。
6.根据权利要求5所述的化合物,其是选自下列:
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-Cys]-Ala-Leu-Arg;
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-Cys]-Ala-Leu-Arg-Ala-Leu-Arg;
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-Cys]-Gly-Arg-Val-Glu-Val-Leu-Tyr-Arg-Gly-Ser-Trp];
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-Cys]-Lys-Val-Leu;
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-Phe-Leu-Arg-Dab-Cys]-Lys-Val-Leu-Lys-Val-Leu;
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-Cys]-Leu-Met-Trp-Trp-Met-Leu;
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-Cys]-Orn-Orn-Orn;
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Dab-Arg-Cys]-Gln-Arg-Gly-Arg-Ala-Glu-Glu-Val-Tyr-Tyr-Ser-Gly-Thr;和
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Dab-Arg-Cys]-Glu-(γ-亚精胺)-Arg-Gly-Arg-Ala-Glu-Glu-Val-Tyr-Tyr-Ser-Gly-Thr。
7.根据权利要求4所述的化合物,其是选自下列:
壬酰基-Arg-Thr-Arg-环(S-S)[Cys-Dab-Phe-Leu-Arg-Dab-Cys];
壬酰基-Arg-Thr-Arg-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-DCys];
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-Phe-Leu-Arg-Dab-Cys];和
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-DCys]。
8.根据权利要求7所述的化合物,其是选自下列:
壬酰基-Arg-Thr-Arg-环(S-S)[Cys-Dab-Phe-Leu-Arg-Dab-Cys];和
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-Phe-Leu-Arg-Dab-Cys]。
9.根据权利要求4所述的化合物,其是选自下列:
壬酰基-Arg-Thr-Arg-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Thr-Arg-Dab-Cys];
壬酰基-Arg-Thr-Arg-环(S-S)[Cys-Dab-Phe-Thr-Arg-Dab-Cys];
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Thr-Arg-Dab-Cys];
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-Phe-Thr-Arg-Dab-Cys];
壬酰基-Arg-Thr-Arg-环(S-S)[Cys-Dab-Trp-Thr-Arg-Dab-Cys];
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-Trp-Thr-Arg-Dab-Cys];
壬酰基-Arg-Thr-Arg-环(S-S)[Cys-Dab-DLeu-Thr-Arg-Dab-Cys];
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DLeu-Thr-Arg-Dab-Cys];
癸酰基-Arg-Thr-Arg-环(S-S)[Cys-Dab-DTrp-Thr-Dab-Dab-Cys];
癸酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DLeu-Thr-Arg-Dab-Cys];
癸酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-Trp-Thr-Arg-Dab-Cys];和
十二酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-Phe-Thr-Arg-Dab-Cys]。
10.根据权利要求1所述的化合物,其是选自下列:
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(4-10)[Dab-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-Thr];
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-Cys]-Gly-Arg-Val-Glu-Val-Leu-Tyr-Arg-Gly-Ser-Trp];
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-Cys]-Leu-Met-Trp-Trp-Met-Leu;和
壬酰基-Arg-Thr-Dab-环(S-S)[Cys-Dab-DPhe-Leu-Arg-Dab-DCys]。
11.如在权利要求1-10中任一项所定义的化合物用于制备治疗包括人类的哺乳动物中由革兰氏阳性细菌引发的细菌感染的药物中的用途。
12.根据权利要求11所述的用途,其中革兰氏阳性细菌是选自由结核分枝杆菌、金黄色葡萄球菌和藤黄微球菌所组成的组。
13.如在权利要求1-10中任一项所定义的化合物用于制备治疗包括人类的哺乳动物中由革兰氏阴性细菌引发的细菌感染的药物中的用途。
14.根据权利要求13所述的用途,其中革兰氏阴性细菌选自由鼠伤寒沙门氏菌、绿脓杆菌、大肠杆菌和不动杆菌所组成的组。
15.一种药物组合物,其包含治疗有效量的如在权利要求1-10中所定义的化合物连同药学上可接受的赋形剂或者载体。
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Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN109414477A (zh) * 2016-05-13 2019-03-01 我希望增效剂公司 Spr741人类药代动力学和有效剂量

Families Citing this family (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ES2506715B1 (es) * 2013-04-12 2015-07-22 Universitat De Barcelona Compuestos peptídicos útiles como agentes antibióticos
EP3173421A1 (en) 2015-11-30 2017-05-31 Universitat de Barcelona Peptidic compounds useful as antibacterial agents
US11279733B2 (en) 2017-11-02 2022-03-22 The University Of Queensland Peptide antibiotics
EP3636659A1 (en) 2018-10-08 2020-04-15 Universitat de Barcelona Polymyxin-based compounds useful as antibacterial agents

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN1425025A (zh) * 1999-12-15 2003-06-18 卡比斯特制药公司 作为抗菌剂的新颖的脂肽
CN1616484A (zh) * 2004-09-27 2005-05-18 沈阳药科大学 一种新的环肽类抗肿瘤抗病毒抗菌活性化合物
CN1839150A (zh) * 2003-07-17 2006-09-27 麦根克斯有限公司 脂肽抗菌衍生物组合物及其应用方法
CN101189253A (zh) * 2004-11-12 2008-05-28 丘比斯特药物股份有限公司 抗感染脂肽类
CN101602792A (zh) * 2009-04-14 2009-12-16 华东师范大学 一种新型抗菌脂肽及其制备和应用

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6951652B2 (en) * 1998-07-29 2005-10-04 Biosynth S.R.L. Vaccine for prevention of gram-negative bacterial infections and endotoxin related diseases
US20060004185A1 (en) * 2004-07-01 2006-01-05 Leese Richard A Peptide antibiotics and peptide intermediates for their prepartion

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN1425025A (zh) * 1999-12-15 2003-06-18 卡比斯特制药公司 作为抗菌剂的新颖的脂肽
CN1839150A (zh) * 2003-07-17 2006-09-27 麦根克斯有限公司 脂肽抗菌衍生物组合物及其应用方法
CN1616484A (zh) * 2004-09-27 2005-05-18 沈阳药科大学 一种新的环肽类抗肿瘤抗病毒抗菌活性化合物
CN101189253A (zh) * 2004-11-12 2008-05-28 丘比斯特药物股份有限公司 抗感染脂肽类
CN101602792A (zh) * 2009-04-14 2009-12-16 华东师范大学 一种新型抗菌脂肽及其制备和应用

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN109414477A (zh) * 2016-05-13 2019-03-01 我希望增效剂公司 Spr741人类药代动力学和有效剂量

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