CN102311472A - 2-氯-9-(2’-脱氧-2’-氟-β-D-阿拉伯呋喃糖基)-腺嘌呤的制备 - Google Patents

2-氯-9-(2’-脱氧-2’-氟-β-D-阿拉伯呋喃糖基)-腺嘌呤的制备 Download PDF

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Abstract

本发明涵盖氯法拉滨(又称为2-氯-9-(2′-脱氧-2′-氟-β-D-阿拉伯呋喃糖基)-腺嘌呤)的新合成法,其涉及1-O-乙酰基-2,3,5-三-O-苯甲酰基-呋喃核糖(又称为经保护糖)与双硅烷化2-氯腺嘌呤(又称为硅烷化核苷碱基)的直接偶联、选择性脱除单一苯甲酰基、磺酸酯形成(磺酰化)、氟化和最后脱除保护基(方案8)。

Description

2-氯-9-(2’-脱氧-2’-氟-β-D-阿拉伯呋喃糖基)-腺嘌呤的制备
技术领域
本发明涵盖氯法拉滨(又称为2-氯-9-(2′-脱氧-2′-氟-β-D-阿拉伯呋喃糖基)-腺嘌呤)的新合成法。 
背景技术
氯法拉滨(Clofarabine)是最初由艾尔斯肿瘤学公司(Ilex Oncology)开发的抗癌疗法 
Figure BSA00000187190200011
制剂(drug product)中的活性药物成分(active pharmaceutical ingredient,API;原料药)。 
Figure BSA00000187190200012
在2004年被FDA批准上市销售,用于治疗患有难治性或复发性急性淋巴细胞性白血病(lymphoblastic leukemia)的儿童。氯法拉滨是氟-脱氧阿拉伯糖核苷,它是腺苷的合成类似物。 
氯法拉滨的合成 
2-脱氯-氯法拉滨。怀特等人1曾报导,利用酸催化(对甲苯磺酸)1,3-二-O-乙酰基-5-O-苯甲基-2-脱氧-2-氟-D-阿拉伯呋喃糖苷(2)(由甲基2,3-脱水-α-D-呋喃核糖苷(3)制备2)与2,6-二氯嘌呤(4)(注意,其为游离嘌呤,即,其未经硅烷化或是脱质子化)稠合(偶联),通过短柱色谱法分离出30%产率的β-N9和29%α-N9,随后进行氨基化和还原反应,合成9-(2-脱氧-2-氟-β-D-阿拉伯呋喃糖基)-腺嘌呤(1),一种简单的氯法拉滨的2-脱氯类似物(方案1)。这一方法的重要但不利方面在于,形成α-与β-异构体的1∶1混合物(只需要β-异构体),而由此带来的后续影响是,需要柱色谱法来分离所述异构体。归因于大规模色谱分离的成本问题,使得所述方法不适用于大规模生产。另一个值得注意的方面在于,选择用苯甲基保护C5′-OH意味着不能使用所述方法合成氯法拉滨,因为苯甲基的氢解会导致同时去除腺嘌呤环上必不可少的C2-氯原子。也就是说,苯甲基与腺嘌呤环的氯原子不能相容。因此,不能使用原料2合成氯法拉滨。 
瓦特雷布等人3发明了一种合成方法,其不利用催化剂,而是利用2作为原料,在溶 
                                    
1怀特J.A.(Wright J.A.),泰勒N.F.(Taylor N.F.)和福克斯J.J.(Fox J.J.),有机化学杂志(J.Org.Chem.)1969,34(9),2632-2636。 
2安德森C.D.(Anderson C.D.),古德曼L.(Goodman L.)和贝克B.R.(Bake B.R.),美国化学学会杂志(J.Amer.Chem.Soc.)1958,80(19),5247-5252。 
3瓦特雷布K.A.(Watanable K.A.),楚C.K.(Chu C.K.)和福克斯J.J.(Fox J.J.),(斯隆-凯特林癌症 液条件下合成2′-脱氧-2′-氟-阿拉伯呋喃糖基嘌呤核苷,但使用此途径不能得到氯法拉滨。 
Figure BSA00000187190200021
方案1-怀特等人的1969法合成脱氯-氯法拉滨 
关键的糖原料。或许是试图解决此问题,瑞奇曼等人4利用较长的多步骤程序(方案2),合成了3-O-乙酰基-5-O-苯甲酰基-2-脱氧-2-氟-β-D-阿拉伯呋喃糖基溴化物(5a),此法利用苯甲酰基替换比较棘手的苯甲基。 
Figure BSA00000187190200022
方案2-瑞奇曼法合成1-溴-2-氟-阿拉伯呋喃糖5 
                                                                    
研究协会(Sloan-Kettering Institute for Cancer Research)),US4751221(1988)。 
4瑞奇曼U.(ReichmanU.),瓦特雷布K.A.(Watanabe K.A.)和福克斯J.J.(Fox J.J.)糖类研究(Carbohydr.Res.)1975,42,233-240。 
不久后,蒙特格美等人5成功地利用这一以不同方式保护的1-α-溴糖5a,通过在100℃下,在分子筛存在下于1,2-二氯乙烷中经16小时时期偶联游离2,6-二氯嘌呤(4),来合成经保护二氯嘌呤基核苷6(方案3)。尽管所需的6的β-异构体是主要产物,但也形成了其它核苷,包括6的α-异构体,再次表明预先氟化糖环会导致偶联步骤的本质效率较低。,利用柱色谱法纯化后获得纯的经保护核苷6,以中间体5a计,产率为32%,并且由此,以实际糖原料计,产率更低。作者等人还测试了1-O-乙酰基-脱溴类似物5b与4的偶联,但此法不能提供可接受产率的所需的6的β-异构体。 
Figure BSA00000187190200031
方案3-蒙特格美法合成二氯嘌呤基经保护核苷 
在蒙特格美利用1-α-溴糖5a作为原料来合成二氯嘌呤核苷6(如上述)的同时,霍维尔等人6则利用相近的类似物2-脱氧-2-氟-3,5-二-O-苯甲酰基-α-D-阿拉伯呋喃糖基溴化物(8)(方案4)。这两种化合物(即5a与8)的不同之处仅在于,酰基保护基位于C3-O位。霍维尔等人的溴糖8是以1-O-乙酰基-2,3,5-三-O-苯甲酰基-β-D-呋喃核糖(9;如下文可看到,与本发明的氯法拉滨合成法中所使用原料相同)为原料,使用重排、磺酰化、氟化和最终的溴化步骤这4个合成步骤制备,总产率为33-43%(如果再循环使用,则总产率为43%)。自此以后,所述溴糖8已成为已知的大部分氯法拉滨合成法中的关键原料,但是其也可以用于合成其它核苷,例如一系列(2′-氟-2′-脱氧-β-D-呋喃核糖 
                                   
5蒙特格美J.A.(Montgomery,J.A.),肖特南希A.T.(Shortnacy A.T.),卡森D.A.(Carson D.A.)和斯奎斯特J.A.(Secrist J.A.)药物化学杂志(J.Med.Chem.)1986,29,2389-2392。 
6霍维尔H.G.(Howell H.G.),布德福瑞P.R.(Brodfuehrer P.R.),布鲁迪捷S.P.(Brundidge S.P.),萨品诺C.J.(Sapino C.J.)有机化学杂志(J.Org.Chem.)1985,50,2597-2598;泰恩C.H.(Tann C.H.),布德福瑞P.R.(Brodfuehrer P.R.),布鲁迪捷S.P.(Brundidge S.P.),萨品诺C.J.(Sapino C.J.)和霍维尔H.G.(Howell H.G.)有机化学杂志(J.Org.Chem.)1985,50,3644-3647。 基)-尿嘧啶10a-d。7
Figure BSA00000187190200041
方案4-霍维尔法合成尿嘧啶基核苷 
蒙特格美首次合成氯法拉滨 
蒙特格美最先实际揭示合成氯法拉滨(7)的方法。8所述方法包含使用其已经揭示7的1-α-溴糖5a与2,6-二氯嘌呤(4)的无催化剂偶联,随后是氨基化和脱除保护基两个步骤(方案5)。4与5a在回流下于1,2-二氯乙烷中发生偶联反应,得到N9异构体混合物,在柱层析后,获得所需的中间物6的N9β-异构体,产率为32%。所需的6的N9β-异构体经历氨基化和脱除保护基,得到氯法拉滨(7)。氨基化本身提供单苯甲酰基化的氯法拉滨中间体(即,氨基化只是脱除C3′-OAc基团的保护基,并取代C6-C1基团),须通过添加LiOH进一步脱除保护基,得到7。由水进行三次再结晶,得到纯7,产率为42%。以5a计,氯法拉滨的总产率仅为13%,因此,以实际糖原料计,产率更低。 
不仅冗长的6和7的纯化不适于工业上大规模生产,而且原料糖5a6的合成也极为复杂。此外,5a的不稳定性也是大规模生产的不利因素,而且由于5a在偶联反应期间会部分分解,故所述反应须在极其干燥(即低含水量)的条件下执行。 
                                   
7泰恩C.H.(Tann C.H.),布德福瑞P.R.(Brodfuehrer P.R),布鲁迪捷S.P.(Brundidge S.P.),萨品诺C.J.(Sapino C.J.)和霍维尔H.G.(HowellH.G.)有机化学杂志(J.Org.Chem.)1985,50,3644-3647;霍维尔H.G.(Howell H.G.),布德福瑞P.R.(Brodfuehrer P.R.),布鲁迪捷S.P.(Brundidge S.P.),本尼基D.A.(Benigni D.A.)和萨品诺C.J.(Sapino C.J.)有机化学杂志(J.Org.Chem.)1988,53,85-88。 
8蒙特格美J.A.(Montgomery,J.A.),肖特南希-福勒A.T.(Shortnacy-Fowler,A.T.),克雷顿S.D.(Clayton,S.D.),瑞尔丹J.M.(Riordan,J.M.)和斯奎斯特III,J.A.(Secrist III,J.A.),药物化学杂志(J.Med.Chem.)1992,35,397-401;蒙特格美J.A.(Montgomery J.A.)和斯奎斯特III,J.A.(Secrist III,J.A.)(南方研究协会(Southern Research Institute)),WO9014352A1和US5034518。 
Figure BSA00000187190200051
方案5-蒙特格美首次合成氯法拉滨 
蒙特格美的改进方法 
最近,蒙特格美报导了一种改进方法,其涉及2-氯-6-经取代嘌呤(归因于N9氢的酸度相对较高)的钠盐17或其它盐(例如使用DBU形成)与现在优选的2-脱氧-2-氟-3,5-二-O-苯甲酰基-α-D-阿拉伯呋喃糖基溴化物(8)偶联,得到中间物11的异头混合物(方案6)。9此方法与其过去的程序之间的一个关键而明显的差异在于,使用了所述嘌呤的阴离子盐,其将会使所述嘌呤的亲核性更强。事实上,所述偶联反应可以在室温下而非100℃下进行。可以看出,中间物11是蒙特格美首次合成氯法拉滨时所使用的中间物的相近类似物。利用快速柱层析法将11的N9β-异构体与N9α-异构体分离,并由乙醇和氯仿结晶,产率为约70%。产物经少量的α-异构体污染。因此,很明显,利用此程序的重大突破在于,由于在偶联步骤中利用了SN2反应,而非SN1,导致形成产率高得多的β-异构体。因为利用氨很难去除苯甲酰基,所以改为在氨基化之前使用甲醇钠。此举导致位于C6的卤素经甲氧基取代,得到化合物12,产率为80%。利用氨进行氨基化,来置换甲氧基,得到氯法拉滨(7),产率为78%。由于在偶联步骤中使用了SN2法,以糖8计,偶联产率提高到47%,总产率达到18%。 
尽管优选卤素原子位于C6位,但其也主张烷氧基、叠氮基、氨基和经保护氨基处于此位置。因此,2-氯腺嘌呤(13)转化成其DBU盐衍生物,可与8偶联,但此举只在极小规模上得到论证,而且遵循制备型TLC分离出的14的N9β-异构体的产率低至28%。 
尽管进行了这些改进,但此方法的主要缺点,即中间物的异头混合物需要柱色谱来进行分离,仍保留下来。此外,所述专利的实例中未表明此程序适用于大规模制造氯法拉滨。 
                                   
9蒙特格美J.A.(Montgomery J.A.),福勒A.T.(FowlerA.T.),斯奎斯特III,J.A.(Secrist,III,J.A.),(南方研究协会(Southern Research Institute)),US6949640(2005)/US7470784(2008)。 
Figure BSA00000187190200061
方案6-蒙特格美的改进的氯法拉滨合成法 
艾尔斯产品公司(ILEX Products)/艾希斯蒂文斯公司(Ash Stevens)的优化法 
艾尔斯产品公司和艾希斯蒂文斯公司的化学家们使用2-氯-6-氨基嘌呤(又称为2-氯腺嘌呤;13)的钾盐11代替2,6-二氯嘌呤(4)的钠盐,在KOt-Bu和CaH2存在下于三元溶剂系统中与同一种溴糖8偶联,来优化上文所论述的蒙特格美程序。10选择13代替4意味着,不再需要蒙特格美法的氨基化步骤,节省了一个合成步骤。所述嘌呤钾盐的形成与偶联反应是在一个反应釜中进行(方案7)。溶剂混合物的选择会明显影响异头选择性和转化。添加剂CaH2通过去除溶剂中痕量的水,而具有有益作用。KBr和KCl对于异头选择性具有意外的有益影响,影响幅度与CaH2大致相当,表明在偶联反应中钾作为平衡离子的益处。优化后,通过偶联反应,获得中间物14,β-∶α-比率为15∶1,由乙酸丁酯-庚烷结晶以及利用甲醇再制浆,异构体比率升到80(β/α),产率为50%。脱除富含β-异构体的14的保护基,得到粗氯法拉滨,由甲醇结晶后,得到纯氯法拉滨,产率为64%。以糖8计,产率为32%,由此,以起始糖9计,总产率约为14%。显然,所述公司使用完善并且充分优化的SN2反应进行偶联,以及不使用柱层析法,是其方法的关键革新。 
就氯法拉滨的合成来说,此方法可视为技术现状(即,此方法是文献报导的最好的氯法拉滨合成法)。应注意,反应步骤的数量和总产率不是工艺成本效率的量度,因此艾尔斯产品公司/艾希斯蒂文斯公司方法的产率较低并不意味着与蒙特格美法相比较,此法具有较低成本效率。 
                                     
10鲍特W.E.(Bauta W.E.),斯奇梅尔B.E.(SchulmeierB.E.),普恩特J.F.(Puente J.F.),坎特瑞尔W.R.Jr(Cantrell W.R.,Jr),拉维特D.(Lovett D.),格贝尔J.(Goebel J.),安德森B.(Anderson B.),艾恩库D.(Ionescu D.)和郭R.(Guo R.).有机过程研究与开发(Org.Proc.Res.Dev.),2004,8,889-896;威廉姆E.B.(William E.B.),波尔柯B.D.(Burke B.D.),斯奇梅尔B.E.(Schulmeier B.E.),坎特瑞尔W.R.Jr(Cantrell W.R.,Jr),拉维特D.(Lovett D.),普恩特J.(Puente J.)(艾尔斯产品公司(ILEX Products,Inc.)),US6680382(2004)。 
方案7-艾尔斯产品公司和艾希斯蒂文斯公司的氯法拉滨合成法 
发明内容
本发明涵盖氯法拉滨(又称为2-氯-9-(2′-脱氧-2′-氟-β-D-阿拉伯呋喃糖基)-腺嘌呤)的新合成法,其涉及1-O-乙酰基-2,3,5-三-O-苯甲酰基-呋喃核糖(又称为经保护糖)与双硅烷化2-氯腺嘌呤(又称为硅烷化核苷碱基)的直接偶联、选择性脱除单一苯甲酰基、磺酸酯形成(磺酰化)、氟化和最后脱除保护基(方案8)。 
步骤1:经保护糖与核苷碱基的偶联步骤仅仅或相当多地得到所需β-N9异构体(CF-IM1)。这个维尔伯根糖基化反应(Vorbrüggen Glycosylation reaction)的高选择性是由起强立体指向性基团(strong stereodirecting group)作用的C2-OBz基团造成的结果。 
步骤2:此后,在乙酸-吡啶缓冲系统存在下,使用水合肼11或乙酸羟基铵(hydroxylaminium acetate)12,部分脱除苯甲酰基,得到2∶1比率的所需(desired)3,5-O-二苯甲酸酯(2-OH-CF-IM2)和不需要(unwanted)的区域异构体2,5-O-二苯甲酸酯(3-OH-CF-IM2),以及一些不合需要(undesired)的脱除双保护基的5-O-苯甲酸酯。 
步骤3:幸运的是,通过在热条件下,于溶剂中进行酰基转移,可将不合需要的2,5-O-二苯甲酸酯区域异构体异构化成所需的3,5-O-二苯甲酸酯。尽管此异构化程度取决于3,5-O-二苯甲酸酯与2,5-O-二苯甲酸酯之间的平衡常数,但小心地选择条件,可以使所需3,5-O-二苯甲酸酯相当多地处于固相中,而同时不合需要的异构体处于液相中。由此,溶液相平衡和新形成的3,5-O-二苯甲酸酯连续沉淀,推动总反应混合物(固相加溶液相) 
                                   
11石田Y.(Ishido Y.),中崎N.(Nakazaki N.)和坂入N.(Sakairi N.),英国化学会志:柏尔金汇刊I(J.C.SPerkinI),1979,2088-2098。 
12石田Y.(Ishido Y.),中崎N.(Nakazaki N.),冈崎K.(Okazaki K.)和坂入N.(Sakairi N.),英国化学会志:柏尔金汇刊I (J.C.S.Perkin I),1980,563-573。 
趋向3,5-O-二苯甲酸酯含量高于起始。在此异构化后,宜通过过滤分离出所需3,5-O-二苯甲酸酯异构体。 
步骤4:接着,使用磺酰化剂(即磺酸酐,Tf2O),磺酰化3,5-O-二苯甲酸酯(2-OH-CF-IM2)的C2′-OH。也可以推想其它类似离去基团,例如杂芳香族磺酸酯(例如咪唑磺酸酯)。 
步骤5:在引入(installation)有效的离去基团后,使用氟化试剂3HF.Et3N,在碱或碱盐(下文将予以揭示,优选碳酸胍)存在下,取代磺酸酯基。3HF.Et3N因不具有腐蚀性并且适用于大规模合成而成为优选的试剂。由于市面上供应的3HF.Et3N含有氯离子(可能呈HCl形式),而且由于在反应条件下,氯离子的亲核性比氟离子强,故会形成大量不合需要而且棘手的CF-IM4的氯化物类似物16。由于发现不可能(根据现有技术)从API本身中去除氯化物类似物16的脱除保护基形式,故需要首先限制其形成。此外,市面上供应的3HF.Et3N似乎通常/总是含有一些氯化物,而且甚至极少量也很难处理,所以进行彻底调查来确定如何降低其在反应中的影响。这最终导致发现,使用3HF.Et3N与碳酸胍(其在反应条件下,可能会释放出胍和CO2(g))的组合会产生较少但可接受的量的氯化物类似物16。作为预防措施,使经保护氯法拉滨CF-IM4结晶,以去除会另外影响最终API产物的质量的杂质。 
步骤6:脱除经保护氯法拉滨CF-IM4的保护基,得到纯度极高的氯法拉滨,无其它异构体被检测到。作为常规事件,其可进一步结晶以确保API满足其规格。 
本发明的关键方面: 
1)一种合成所述合成核苷的新颖方法。 
·已知的所有文献都是在糖环与核苷碱基稠合之前,在糖环中预先引入氟取代剂。相比之下,本发明的方法是在糖与核苷碱基稠合之后引入氟取代基。 
2)与现有技术的氯法拉滨合成法(除艾尔斯/艾希斯蒂文斯法(ILEX/Ash Stevensprocess)外)不同,本发明的方法完全避免了对色谱法的需求。 
·这是通过腺嘌呤环与糖单元稠合,而呋喃核糖C2-O基团仍存在于所述分子中(即,在氟取代之前)来实现。由于所述C2-O基团在酰化为酯形式(在此情况下为OBz酯)时,在偶联步骤中具有较强的立体指向性效应,故此举极为重要。 
·这意味着,在本发明的方法中不存在所有先前技术合成法中会产生的不需要的α-异构体。这不仅降低纯化步骤的负担,也提高了产率,使得工艺方法更加有效。当存在大量α-异构体时,现有技术采用色谱法将其去除。 
3)利用非均相热致异构化(heterogeneous thermal isomerisation),将不需要的区域异构体2,5-O-二苯甲酸酯(3-OH-CF-IM2)转化成所需的3,5-O-二苯甲酸酯(2-OH-CF-IM2),由此增加所需3,5-O-二苯甲酸酯的总产率,超过原始反应所产生的产率。 
·这可以视为一个再循环步骤。此举将使整个方法更为有效。 
4)通过特别使用碳酸胍添加剂,改变氟化条件,由此减少被保护的氯法拉滨CF-IM4的氯化物类似物的量。 
·此举通过减小后续纯化步骤的负担而具有较高的工艺效率。 
5)通过控制氯法拉滨前体CF-IM4的杂质概况(impurity profile),获得高质量氯法拉滨API。也就是说,CF-IM4是质量控制点。 
·由于当氯法拉滨被数种工艺杂质污染时,其本身质量似乎很难提高,故此举确保能获得符合规格(in-specification)等级的API。 
本发明提供一种制备具有式I的氯法拉滨的方法: 
Figure BSA00000187190200091
其包含: 
(a)利用硅烷化剂于有机溶剂中,或单纯利用纯硅烷化剂(即,硅烷化剂充当溶剂),硅烷化2-氯腺嘌呤(2-氯-6-氨基嘌呤),得到硅烷化产物II: 
Figure BSA00000187190200092
其中,R1是Si(R3)3,R2是氢或R1,R3是含有1到20个碳原子的烷基、烯基、炔基、芳基或杂芳基,x是0或1,同时y分别是2或1; 
(b)具有式III的经保护呋喃核糖: 
Figure BSA00000187190200101
其中R4是酰基(优选苯甲酰基或取代苯甲酰基),OR5是离去基团(例如R5是酰基,优选乙酰基的情形);与步骤(a)中制备的未经分离的硅烷化2-氯腺嘌呤II在路易斯酸(Lewis acid)或布朗斯特酸 (例如磺酸衍生物,包括三氟甲磺酸三甲基硅酯(trimethylsilyl triflate,TMSOTf)和三氟甲磺酸(triflic acid,TfOH))存在下偶联,水性处理(aqueous work-up)后,得到具有式IV的经保护2-氯腺苷: 
Figure BSA00000187190200103
其中R4如先前所定义; 
(c)利用亲核试剂(优选水合肼或乙酸羟基铵),在乙酸-吡啶缓冲系统中,部分脱除步骤(b)中制备的IV的保护基,水性处理(aqueous work-up)后,得到具有式V的化合物: 
和具有式VI的化合物的混合物: 
Figure BSA00000187190200112
所述混合物不经纯化直接进行下一步骤; 
(d)在高温(使用经典热能加热、红外光源或微波加热)下,于单一或混合溶剂系统中,将VI异构化成V,并且通过过滤分离出纯的或相当富集的V; 
(e)用磺酰化剂(优选三氟甲磺酸酐(Tf2O))磺酰化V,得到具有式VII的化合物: 
Figure BSA00000187190200113
其中OR6是含有1到12个碳原子的离去基团,例如磺酸酯或磺酰胺(例如SO2NHet,其中NHet是含氮芳香杂环),且R6优选为SO2CnF2n+1; 
(f)利用氟化剂(优选氟化氢三乙胺络合物),优选在碱或碱盐(例如三乙胺、吡啶、DBU、胍以及胍衍生物和碳酸胍,优选使用碳酸胍)存在下,氟化VII,得到具有式VIII的化合物: 
Figure BSA00000187190200121
(g)利用亲核碱脱除VIII的保护基,得到氯法拉滨I。 
(h)优选由水,或由水-醇混合物,结晶氯法拉滨。 
本发明的优点或特征
从氯法拉滨合成的现有技术可以看出一个重要问题,即,利用经保护的2-脱氧-2-氟-阿拉伯呋喃糖苷与腺嘌呤核苷碱基的偶联,有可能形成α-N9、α-N7和β-N7异构体杂质。α-N9异构体特别常见,而且难以去除,需要色谱法或结晶法。在本发明方法中,利用经保护D-呋喃核糖(CF-SM1(9))与双硅烷化2-氯腺嘌呤的偶联,选择性获得经保护的β-N92-氯腺苷CF-IM1,并且完全没有或含有相当少的α-N9和β-N7异构体。由于相邻基团参与C2-OBz基团,故不会形成可观量的α-N9异构体(方案8)。 
使用水合肼或乙酸羟基铵,区域选择性地脱除经保护2-氯腺苷CF-IM1的单一保护基,得到所需3,5-O-二苯甲酸酯(2-OH-CF-IM2)和不需要的区域异构体2,5-O-二苯甲酸酯(3-OH-CF-IM2),连同部分不合需要的脱除双保护基的5-O-苯甲酸酯的混合物。尽管如果直接分离此混合物,会产生较低产率的所需3,5-O-二苯甲酸酯,但我们发现,在MeOH中加热上文提到的混合物,通过C2′-O位与C3′-O位之间的酰基转移,而引起平衡驱动的异构化。由于所需的3,5-O-二苯甲酸酯实质上处于固相中,而同时不合需要的区域异构体2,5-O-二苯甲酸酯处于液相中,故溶液相平衡和新形成的3,5-O-二苯甲酸酯连续沉淀,推动总反应混合物(固相加溶液相)趋向3,5-O-二苯甲酸酯含量高于起始。尽管溶液相中的平衡常数看起来是2∶1的3,5-O-二苯甲酸酯∶2,5-O-二苯甲酸酯,但3,5-O-二苯甲酸酯因其沉淀而离开平衡。因此,总的说来,在热异构化后,仅仅通过简单的过滤,就可以获得可接受产率和良好质量的所需3,5-O-二苯甲酸酯 (2-OH-CF-IM2)。 
用Tf2O磺酰化2-OH-CF-IM2的C2′-OH,得到2′-O-三氟甲磺酰基-2-氯腺苷(2-Tf-CF-IM3)。需要此活性较高的离去基团使后续的氟化步骤有效地进行。尽管一些氟化物源(例如HF水溶液)腐蚀性极强,但基于HF的胺盐的氟化试剂(例如氟化氢三乙胺络合物3HF.Et3N和氟化氢吡啶络合物pyrdine.HF)看起来对玻璃无腐蚀性。重要的是,3HF.Et3N适用于大规模合成。由于市面上供应的3HF.Et3N含有氯离子(可能呈HCl形式),而且由于在反应条件下,氯离子的亲核性比氟离子强,故会形成大量不合需要而且有害的CF-IM4的氯化物类似物,即16(方案9)。此氯糖杂质16和其后续脱除保护基的产物15(2′-氯-氯法拉滨)证实难以通过纯化去除,尤其是15。然而,我们发现,当3HF.Et3N与碳酸胍添加剂一起使用时,可以将氯糖16的含量控制在低于0.10%的水平(通过HPLC测定),表明在脱除经保护氯法拉滨的保护基后,观察到API本身中氯糖15的含量低于0.10A%(通过HPLC测定)。经证实,这是至关重要的,因为在本发明的氯法拉滨结晶条件下,不可能(根据现有技术)降低2′-氯-氯法拉滨(即15)的含量,而事实上,其含量略有增加。 
本发明合成法的步骤数量与竞争性现有技术(CF-SM1(即9)计为原料)途径相同,而且由起始糖9起的总产率为约15%,包括再结晶以提供API级材料。单就总产率来说,本发明方法与现有技术的方法不相上下。 
Figure BSA00000187190200131
方案8-SPK的氯法拉滨合成法 
Figure BSA00000187190200141
方案9 
附图说明
无 
具体实施方式
本发明方法的实施例 
·制备2′,3′,5′-三-O-苯甲酰基-2-氯腺苷(CF-IM1) 
步骤1a-硅烷化: 
室温下,在氮气氛围下,将2-氯腺嘌呤(CF-SM1(9),50g,294.9mmol,1.0eq.)、MeCN(600mL,12P w.r.t.CF-SM1(9))和BSTFA(227.5g,883.8mmol,3.0eq.)加入配备机械搅拌和温度计的烧瓶中。搅拌混合物,并在回流下加热,直到混合物大致变澄清(约1小时)。 
步骤1b-维尔伯根糖基化: 
将TfOH(8.77g,58.5mmol,0.2eq.)和1-O-乙酰基-2,3,5-三-O-苯甲酰基-β-D-呋喃核糖(CF-SM2,142.5g,282.5mmol,0.95eq.)依次加到步骤1a制备的混合物中。随后,在回流下搅拌混合物1小时。将混合物冷却到20-35℃,并用MTBE(500mL)稀释,并且用饱和NaHCO3(750mL)洗涤0.5到1小时。在真空中,于40到50℃下 蒸发有机挥发物,得到CF-IM1:1H NMR(300MHz,CDCl3)δ7.9-8.1(m,6H,Ar),7.94(s,1H,H8),7.3-7.6(m,9H,Ar),6.45(d,J=2.7Hz 1H,H1′),6.15(m,2H,H2′,3′),5.30(s,2H,NH2,可变),4.90(dd,J4′,5a=3.2Hz,J5′a,5′b=12.0Hz,1H,H5′a),4.82(m,1H,H4′),4.72(dd,J4′,5a=4.1Hz,J5′a,5′b=12.0Hz,1H,H5′b);13C NMR(75MHz,CDCl3)δ166.30(1C),165.51(1C),165.43(1C),156.39(C6),154.74(C2),151.07(C4),139.05(C8),134.13(1C,Ar),134.05(1C,Ar),133.80(1C,Ar),130.17(2C,Ar),130.11(2C,Ar),129.91(2C,Ar),129.41(1C,Ar),128.95(3C,Ar),128.81(4C,Ar),128.46(1C,Ar),119.05(C5),86.45(C1′),81.26(C4′),74.57(C3′),71.73(C2′),63.98(C5′)。此粗产物直接用于下一步骤中。 
·制备2-氯-9-(3′,5′-二-O-苯甲酰基-β-D-呋喃核糖基)-腺嘌呤(2-OH-CF-IM2) 
步骤2-部分选择性脱除单一保护基: 
室温下,将步骤1b制备的CF-IM1加入配备机械搅拌和温度计的烧瓶中。随后,加入乙酸(277g,265mL)、吡啶(1109.6g,1132.7mL)和80%水合肼(73.8g,1.18mol,4eq.)。在氮气氛围下,将混合物加热到75到80℃,并持续加热,直到2-OH-CF-IM2的HPLC纯度在2小时时期内未显示增加(通常需要6到10小时)。 
将混合物冷却到35℃,并用甲基异丁基酮(3774.4g,3468mL)稀释,随后在低于35℃下,用2N H2SO4(3378mL)洗涤,以去除吡啶。用饱和NaHCO3(1734mL)洗涤有机相,直到分析得到有机相中的AcOH含量为不高0.5%。在真空中,于65℃下蒸发有机相至干。 
步骤3-异构化: 
将甲醇(356.4g,450mL)加入上文制备的残余物中,并在65℃下,搅拌不均匀混合物,直到分析母液中的3-OH-CF-IM2在2小时内未降低为止。将浆液冷却到20-25℃并过滤,并用甲醇(11.09g×2,140mL×2)洗涤滤饼,并且在真空中,于60℃下干燥4到6小时。将粗品2-OH-CF-IM2固体加入到配备机械搅拌器的烧瓶中。加入二甲亚砜(231g,210mL)以溶解固体,随后在20-25℃下,逐滴添加甲醇(831.6g,1050mL)。30分钟后,过滤浆液,并用甲醇(11.09g×2,140mL×2)洗涤滤饼,并且在真空中,于60℃下干燥4到6小时。获得2-OH-CF-IM2(67.9g,产率44%),HPLC纯度为94.7%。 1H NMR(300MHz,d6-DMSO)δ8.4(s,1H,H8),8.11(d,J=7.2Hz,2H),7.98(d,J=7.7Hz,2Hz,Ar),7.89(s,2H,NH2,可变换),7.69(m,2H,Ar),7.58(m,2H,Ar),7.52(m.2H,Ar),6.10(d,J=6.1Hz,1H,H1′),6.03(d,J=6.0Hz,1H,OH,可变换),5.70(dd,J=4.1Hz,5Hz,1H,H2′),5.13(dd,J=6.0,12.0Hz,1H,H3′),4.61-4.72(m,3H,H4′,5′)。 
Figure BSA00000187190200161
·制备2-氯-9-(3′,5′-二-O-苯甲酰基-2′-O-三氟甲基磺酰基-β-D-呋喃核糖基)-腺嘌呤(2-Tf-CF-IM3) 
步骤4-磺酰化: 
室温下,在氮气氛围下,将2-OH-CF-IM2(65g,HPLC测定纯度为94.7%,120.7mmol,1eq.)、二氯甲烷(650mL)和吡啶(65mL)加入配备机械搅拌器和温度计的烧瓶中。将浆液冷却到0到20℃。将Tf2O(85.1g,301.6mmol,2.5eq.)逐滴添加到混合物中,并将温度保持在0到20℃的范围内。混合物变澄清。当2-OH-CF-IM2的HPLC纯度为低于1%时,认为反应完成。室温下,用饱和NaHCO3(325mL)洗涤混合物以去除酸。室温下,用2N H2SO4(325mL)洗涤有机相以完全去除吡啶。使用分子筛干燥有机相,直到KF值为不高于1000ppm(0.1%)。在真空中,于40℃下蒸发有机相,直到剩余约290g残余物(包括约130mL DCM)。所述残余物直接用于下一步骤中。2-Tf-CF-IM3的纯度为95-99%,并且产率为95-99%。 
1H NMR(300MHz,CDCl3)δ8.11(dd,J=8.3,1.2Hz,2H,Ar),7.98(dd,J=8.3,1.2Hz,2H,Ar),7.87(s,1H,H8),7.70-7.60(m,1H,Ar),7.59-7.46(m,3H,Ar),7.41(t,J=7.7Hz,2H,Ar),6.34-6.23(m,2H,H1′,H3′),6.16(dd,J=5.3,3.2Hz,1H,H2′),6.07(bs,2H,NH2,可变换),4.86(dd,J=12.2,3.3Hz,1H,H5a′),4.81-4.74(m,1H,H4′),4.65(dd,J=12.2,4.2Hz,1H,H5b′)。 
·制备2-氯-9-(3′,5′-二-O-苯甲酰基-2′-脱氧-2′-氟-β-D-阿拉伯呋喃糖基)-腺嘌呤(CF-IM4) 
步骤5-氟化: 
室温下,将步骤4制备的残余物加入配备机械搅拌器和温度计的烧瓶中。加入EtOAc(697.5g,775mL)和碳酸胍(87g,482.9mmol)并将混合物加热到60℃。将3HF.Et3N(116.7g,723.9mmol)逐滴添加到混合物中(经0.5到1小时时期)。小心:放出气体(可能是CO2)。3HF.Et3N添加完成后,将混合物加热到回流(80℃),保持约10小时。当2-Tf-CF-IM3的HPLC纯度为低于3%时,认为反应完成。将反应混合物冷却到低于 35℃,并逐滴添加饱和碳酸氢钠(775mL)以中和酸。小心:放出气体。过滤混合物,以使相界清晰。用乙酸乙酯(232.5mL)萃取水相。在真空中,于40℃下蒸发合并的有机相,直到剩余约200g(包括约150mL EtOAc)残余物。将甲醇(450mL)加入混合物中,并加热到回流以实现溶解。如果固体未完全溶解,则再添加EtOAc,直到固体完全溶解。趁热过滤后,冷却溶液,直到固体沉淀,并在此温度下再保持2小时。将浆液冷却到20到25℃,保持2小时,并保持6小时。过滤浆液,并用MeOH(50mL)洗涤滤饼2次。在真空中,于60℃下干燥固体4到6小时,得到纯度为98%的CF-IM4,其中2-氯-9-(3′,5′-二-O-苯甲酰基-2′-脱氧-2′-氯-β-D-阿拉伯呋喃糖基)-腺嘌呤(Cl-CF-IM4)的纯度为不高于0.10%。由EtOAc-MeOH(1∶3,600mL)再结晶CF-IM4,以将2-氯-9-(2′,3′,5′-三-O-苯甲酰基-β-D-阿拉伯呋喃糖基)-腺嘌呤[(2’S)-Bz-CF-IM4]和2-氯-9-(2′-O-乙酰基-3′,5′-二-O-苯甲酰基-β-D-阿拉伯呋喃糖基)-腺嘌呤[(2’S)-Ac-CF-IM4]的总纯度进一步降低到NMT 0.15%。以2-OH-CF-IM2为原料,产率为44.4%。 
1H NMR(300MHz,CDCl3)δ8.0-8.1(m,5H,Ar),8.0(s,1H,H8),7.3-7.6(m,5H,Ar),6.61(t,J=2.85Hz,1H,H1′),6.54(d,J=2.4Hz,2H,NH2),,5.75(dd,J=2.1,17.1Hz,1H,H3′),5.37(dd,J=2.7Hz,49.8Hz,1H,H2′),4.81(d,J=4.2Hz,1H,H5′),4.57(m,1H,H4′)。 
Figure BSA00000187190200171
·制备2-氯-9-(2′-脱氧-2′-氟-β-D-阿拉伯呋喃糖基)腺嘌呤(氯法拉滨) 
步骤6-脱除保护基: 
将MeOH(75mL)和29%MeONa/MeOH溶液(0.11g,0.06eq.)加入100mL烧瓶中,并添加CF-IM4(5g,1.0eq.)。在30到40℃下搅拌混合物,并且其缓慢地变澄清。20到40分钟后,更多固体逐渐沉淀析出。反应在1到3小时内完成。加入乙酸(0.035g,0.06eq.)以中止反应。在真空中,于30到40℃下蒸发混合物,直到剩余约25g(包括约5P MeOH)浆液。将混合物冷却到0到20℃,保持2小时,随后过滤。用MeOH(5mL)洗涤滤饼2次,并且在真空中于60℃下干燥,得到2.6g白色固体状的氯法拉 滨,纯度为99.8A%,以CF-IM4为原料,产率为86.7%。 
1H NMR(300MHz,d6-DMSO)δ8.27(dd,1H,H8,J8,2′F=1.8Hz),6.33(dd,J1′,2′=4.8Hz,J1′,2′F=13.8Hz,1H,H1′),5.95(d,J3′,3′-OH=5.1Hz,1H,3′-OH),5.21(dt,J2′,3′=4.2Hz,J2′,2′F=52.8Hz,1H,H2′),5.08(t,J5′,5′-OH=5.7Hz,1H,5′-OH),4.42(dq,J3′,2′F=19.1Hz,1H,H3′),3.83(m,J3′,4′=5.1Hz,1H,H4′),3.65(m,J4′,5′b=6.0Hz,J5′a,5′b=11.7Hz,2H,H5′)。 
步骤7-再结晶
将粗氯法拉滨(2.6g)和水(104mL)加入烧瓶中。搅拌混合物并加热到80℃。将固体溶解于水中。在70到80℃下,趁热过滤溶液,以去除少量沉淀。缓慢冷却滤液以结晶,并在室温下搅拌过夜。过滤混合物,用MeOH洗涤并在真空中干燥,得到API级氯法拉滨(2.1g),产率为约80%。 

Claims (32)

1.一种制备具有式I的氯法拉滨的方法,
Figure FSA00000187190100011
其包含:
(a)单纯利用纯硅烷化剂,或利用硅烷化剂于有机溶剂中,硅烷化2-氯腺嘌呤(2-氯-6-氨基嘌呤),得到式II的硅烷化产物:
Figure FSA00000187190100012
其中,R1是Si(R3)3,R2是氢或R1,R3是含有1到20个碳原子的烷基、烯基、炔基、芳基或杂芳基,x是0或1,同时y分别是2或1;
(b)具有式III的被保护的呋喃核糖:
Figure FSA00000187190100013
其中R4分别是相同或不相同的取代酰基、芳酰基,OR5是离去基团,其中R5是酰基;与步骤(a)中制备的所述具有式II的硅烷化2-氯腺嘌呤在路易斯酸或非路易斯酸存在下偶联,得到具有式IV的被保护的2-氯腺苷:
Figure FSA00000187190100021
其中R4如先前所定义;
(c)利用亲核试剂,在溶剂中部分脱除步骤(b)中制备的所述式IV化合物的保护基,得到具有式V的化合物:
与具有式VI的化合物的混合物:
Figure FSA00000187190100023
(d)在高温下,在溶剂中将所述式VI化合物异构化成所述式V化合物,并分离出纯的或相当富集的V;
(e)衍生化所述式V化合物的C3′羟基,形成式VII化合物
Figure FSA00000187190100031
其中OR6是离去基团;
(f)利用氟化剂,在碱或碱盐存在下,氟化所述式VII化合物,得到具有式VIII的化合物:
(g)利用亲核碱脱除所述式VIII化合物的保护基,得到具有式I的氯法拉滨。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述硅烷化剂是N,O-双(三甲基硅基)三氟乙酰胺(BSTFA)或N,O-双(三甲基硅基)乙酰胺(BSA)。
3.根据权利要求1所述的方法,其中所述硅烷化步骤(a)是在乙腈溶剂中进行。
4.根据权利要求1所述的方法,其中步骤(a)的所述式II的硅烷化产物不经分离而直接用于接下来的偶联反应中。
5.根据权利要求1所述的方法,其中步骤(b)是在与步骤(a)中所用相同的有机溶剂中进行。
6.根据权利要求1所述的方法,其中步骤(b)中使用的所述路易斯酸是非金属路易斯酸。
7.根据权利要求6所述的方法,其中步骤(b)中使用的所述非金属路易斯酸是TfOH、TMSOTf、TMSI、TBSOTf、TsOH、MsOH、Ms2O。
8.根据权利要求1所述的方法,其中步骤(c)中的所述亲核试剂是氮碱。
9.根据权利要求8所述的方法,其中所述氮碱是水合肼或乙酸羟基铵。
10.根据权利要求1所述的方法,其中所述步骤(c)是在溶剂中进行,所述溶剂是吡啶与乙酸的混合物。
11.根据权利要求10所述的方法,其中步骤(c)的所述产物混合物中残余乙酸的含量是通过分析控制至0.5%以下。
12.根据权利要求1所述的方法,其中用于所述异构化步骤(d)的溶剂的特征在于:在高温下,所述式V化合物大大不溶解,而所述式VI化合物大大溶解。
13.根据权利要求12所述的方法,其中所述溶剂是醇溶剂。
14.根据权利要求12所述的方法,其中所述溶剂是甲醇。
15.根据权利要求12所述的方法,其中所述高温足以使式VI化合物异构化。
16.根据权利要求1所述的方法,其中步骤(e)的所述离去基团OR6是磺酸酯。
17.根据权利要求16所述的方法,其中所述磺酸酯是三氟甲磺酸酯。
18.根据权利要求1所述的方法,其中所述氟化剂是氟化物。
19.根据权利要求18所述的方法,其中所述氟化物呈HF形式,并且在碱、碱混合物或碱与碱盐的混合物存在下使用。
20.根据权利要求19所述的方法,其中所述碱是三乙胺(Et3N)、胍、胍衍生物、吡啶或1,8-二氮杂环十一烯(DBU)。
21.根据权利要求19所述的方法,其中所述碱盐是碳酸胍。
22.根据权利要求19所述的方法,其中所述氟化氢是在Et3N和胍存在下使用。
23.根据权利要求1所述的方法,其中所述氟化步骤是在酯溶剂中进行。
24.根据权利要求23所述的方法,其中所述酯溶剂是乙酸乙酯(EtOAc)。
25.根据权利要求1所述的方法,其中步骤(g)中使用的所述式VIII化合物通过HPLC测定,含有不高于0.10%式IX化合物:
Figure FSA00000187190100041
26.根据权利要求1所述的方法,其中步骤(g)中的所述亲核碱是烷基胺、氨或烷醇钠。
27.根据权利要求1所述的方法,其中所述烷醇钠是甲醇钠。
28.根据权利要求1所述的方法,其中步骤(g)的反应是在甲醇溶剂中进行。
29.根据权利要求1所述的方法,其中氯法拉滨进一步结晶。
30.一种制备式VIII化合物的方法,其包含利用氟化剂,在碱或碱盐存在下氟化式VII化合物
Figure FSA00000187190100051
得到具有式VIII的化合物:
Figure FSA00000187190100052
31.根据权利要求30所述的方法,其中所述式VIII化合物的纯度为至少99.8%。
32.根据权利要求30所述的方法,其中所述式VIII化合物含有少于约0.1%重量的任何个别杂质,所述杂质包含:
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