CN102234321B - 植物耐逆性相关蛋白GmNF-YB1及其编码基因和应用 - Google Patents

Abstract

本发明公开了一种植物耐逆性相关蛋白GmNF-YB1及其编码基因和应用。本发明提供的蛋白质，是如下(a)或(b)：(a)由序列表中序列1所示的氨基酸序列组成的蛋白质；(b)将序列1的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且与植物耐逆性相关的由序列1衍生的蛋白质。本发明的GmNF-YB1在干旱、乙烯和ABA的诱导下表达，编码的蛋白定位到细胞核上，并且可以特异的调控含有CCAAT-box顺式元件(核心序列：CCAAT)的基因的转录表达。本发明的GmNF-YB1可以提高植物的耐旱性，为人为控制抗逆和耐逆相关基因的表达提供了基础，将在培育抗逆性和耐逆性增强的植物育种中发挥重要的作用。

Description

植物耐逆性相关蛋白GmNF-YB1及其编码基因和应用

技术领域

本发明涉及一种植物耐逆性相关蛋白GmNF-YB1及其编码基因和应用。

背景技术

干旱、高盐及低温等逆境胁迫是影响植物生长、发育的障碍因子。因此，了解小麦对逆境条件的应答与信号传导机制，提高小麦品种的抗逆性，成为小麦遗传研究及小麦品种改良的重要任务之一。

在逆境胁迫下植物体内会产生一系列应答反应，伴随着许多生理生化及发育上的变化。明确植物对逆境的反应机制，将为抗逆基因工程研究和应用提供科学论据。目前，植物抗逆性研究已逐渐深入到细胞、分子水平，并与遗传学和遗传工程研究相结合，探索用生物技术来改进植物生长特性，其目的是提高植物对逆境的适应能力。

在干旱、高盐和低温等环境胁迫的逆境条件下，植物能够在分子、细胞和整体水平上做出相应的调整，以最大程度上减少环境所造成的伤害并得以生存。许多基因受胁迫诱导表达，这些基因的产物不仅能够直接参与植物的胁迫应答，而且能够调节其它相关基因的表达或参与信号传导途径，从而使植物避免或减少伤害，增强对胁迫环境的抗性。与胁迫相关的基因产物可以分为两大类：第一类基因编码的产物包括离子通道蛋白、水通道蛋白、渗透调节因子(蔗糖、脯氨酸和甜菜碱等)合成酶等直接参与植物胁迫应答的基因产物；第二类基因编码的产物包括参与胁迫相关的信号传递和基因表达调节的蛋白因子，如蛋白激酶、转录因子等。其中，转录因子在植物胁迫应答的基因表达调控中起着重要作用。

转录因子也称为反式作用因子，是能够与真核基因启动子区域中顺式作用元件发生特异性作用的DNA结合蛋白，通过它们之间以及与其它相关蛋白之间的相互作用，激活或抑制转录。转录因子的DNA结合区决定了它与顺式作用元件结合的特异性，而转录调控区决定了它对基因表达起激活或是抑制作用。此外，其自身活性还受到核定位及寡聚化等作用的影响。

目前已知在植物中与胁迫相关的转录因子主要有：具有AP2结构域的AP2(APETALA2)/EREBP(乙烯应答元件结合蛋白，ethylene responsive element bindingprotein)转录因子家族、含有碱性区域和亮氨酸拉链的bZIP(basic region/leucinezipper motif transcription factors)类转录因子、含有保守的WRKY氨基酸序列的WRKY转录因子家族、结合CCAAT-box的主要核转录因子的CBF(CCAAT binding factor)类转录因子、含有碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)和亮氨酸拉链的MYC家族和具有色氨酸簇(Trp cluster)的MYB家族。这些转录因子家族，除WRKY家族不参与植物的水胁迫反应外，其它四个家族均参与调节植物对干旱、高盐和低温等的逆境胁迫反应。其中，NF-Y转录因子在高等植物中广泛存在，近年来，在拟南芥、玉米、水稻均有报道，这表明NF-Y转录因子在高等植物中普遍存在并具有重要作用。

NF-Y(核转录因子，Nuclear Factor Y)是一种结合CCAAT-box的主要的核转录因子，特异的识别并结合许多真核生物组成型、诱导性和细胞周期依赖性基因的启动子或增强子中的保守序列CCAAT-box，并调控这些基因的转录水平的表达。NF-Y是由NF-YA、NF-YB和NF-YC三个不同亚基组成的三聚体。NF-YB和NF-YC的组蛋白折叠基序(HFM)相互作用使之形成二聚体，然后结合NF-YA形成异源三聚体的NF-Y复合物，从而结合CCAAT-box，调节其靶基因的转录。NF-YA至少有两个结构域用于蛋白质的结合：富含谷氨酰胺的结构域(Q-rich domain)和一个亚基相互作用的结构域(subunitinteraction domain)。NF-YB也有两个蛋白结合的结构域：组蛋白折叠基序(histone-fold motif)和TATA结合蛋白(TATA-binding protein)结合结构域(TBP-binding domain)。NF-YC有三个蛋白质的结合结构域：组蛋白折叠基序，TBP结合结构域以及富含谷氨酰胺的结构域。NF-YA和NF-YC的结构氨基酸序列与组蛋白折叠基序同源，NF-YB与H2B组蛋白折叠基序相关，而NF-YC于H2A组蛋白折叠基序相关，该基序由三个α螺旋和两个环组成，负责H2A/H2B二聚体的形成。

目前，在植物中关于NF-Y转录因子的功能的报道较少，都在干旱胁迫中起重要的作用(Nelson et al，2007)。Nelson等认为，与拟南芥AtNF-YB1转录因子同源的ZmNF-YB2，在缺水的条件下过表达ZmNF-YB2的转基因玉米可以明显增强抗旱性，由于ZmNF-YB2可以是多个与植物干旱有关参数发生改变，包括叶绿素含量、气口导度、叶片温度、减少萎蔫和维持光合作用，从而提高抗旱性(Nelson，Peter P.Repetti，TomR.Adams，Jingrui Wu，2007)。Wen-Xue Li，Youko Oono等的研究证实，AtNF-YA5的表达受到干旱和ABA处理的诱导。对其启动子GUS分析表明部分诱导反应发生在转录水平。NF-YA5有一个靶位点miR169，在干旱条件下，miR169表达受到抑制。NF-YA5在微管组织和保卫细胞有很高的表达，因此，利用一个关键性转录因子促进多个功能基因的表达，从而增强植物的抗逆性，已经成为植物抗逆基因工程的研究热点。

发明内容

本发明的目的是提供一种植物耐逆性相关蛋白GmNF-YB1及其编码基因和应用。

本发明提供的蛋白质，为一种结合CCAAT-box的核转录因子蛋白，名称为GmNF-YB1，来源于大豆属大豆(Glycine max L.)，是如下(a)或(b)：

(a)由序列表中序列1所示的氨基酸序列组成的蛋白质；

(b)将序列1的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且与植物耐逆性相关的由序列1衍生的蛋白质。

序列1的蛋白质由174个氨基酸残基组成，自氨基端第81-85位氨基酸残基序列为可能的核定位信号区，自氨基端第33-120位氨基酸残基序列为保守的NF-YB结构域。

为了使(a)中的GmNF-YB1便于纯化，可在由序列表中序列1所示的氨基酸序列组成的蛋白质的氨基末端或羧基末端连接上如表1所示的标签。

表1 标签的序列

标签	残基	序列
			Poly-Arg	5-6(通常为5个)	RRRRR
Poly-His	2-10(通常为6个)	HHHHHH
			FLAG	8	DYKDDDDK
Strep-tag II	8	WSHPQFEK
			c-myc	10	EQKLISEEDL

上述(b)中的GmNF-YB1可人工合成，也可先合成其编码基因，再进行生物表达得到。上述(b)中的GmNF-YB1的编码基因可通过将序列表中序列2所示的DNA序列中缺失一个或几个氨基酸残基的密码子，和/或进行一个或几个碱基对的错义突变，和/或在其5′端和/或3′端连上表1所示的标签的编码序列得到。

编码所述蛋白的基因也属于本发明的保护范围。

所述基因可为如下1)或2)或3)或4)或5)或6)的DNA分子：

1)序列表中序列2自5’端第157至681位核苷酸所示的DNA分子；

2)序列表中序列2自5’端第147至683位核苷酸所示的DNA分子；

3)序列表中序列2自5’端第146至683位核苷酸所示的DNA分子；

4)序列表中序列2所示的DNA分子；

5)在严格条件下与1)或2)或3)限定的DNA序列杂交且编码耐逆性相关蛋白的DNA分子；

6)与1)或2)或3)限定的DNA序列具有90％以上同源性，且编码耐逆性相关蛋白的DNA分子。

所述严格条件为在0.1×SSPE(或0.1×SSC)、0.1％SDS的溶液中，65℃条件下杂交并洗膜。

序列2中的cDNA序列由1032个核苷酸组成，开放阅读框架为自5′端第157-681位核苷酸。

含有所述基因的重组表达载体、表达盒、转基因细胞系或重组菌均属于本发明的保护范围。

可用现有的植物表达载体构建含有所述基因的重组表达载体。所述植物表达载体包括双元农杆菌载体和可用于植物微弹轰击的载体等。所述植物表达载体还可包含外源基因的3’端非翻译区域，即包含聚腺苷酸信号和任何其它参与mRNA加工或基因表达的DNA片段。所述聚腺苷酸信号可引导聚腺苷酸加入到mRNA前体的3’端，如农杆菌冠瘿瘤诱导(Ti)质粒基因(如胭脂合成酶Nos基因)、植物基因(如大豆贮存蛋白基因)3’端转录的非翻译区均具有类似功能。使用所述基因构建重组植物表达载体时，在其转录起始核苷酸前可加上任何一种增强型启动子或组成型启动子，如花椰菜花叶病毒(CAMV)35S启动子、玉米的泛素启动子(Ubiquitin)，它们可单独使用或与其它的植物启动子结合使用；此外，使用本发明的基因构建植物表达载体时，还可使用增强子，包括翻译增强子或转录增强子，这些增强子区域可以是ATG起始密码子或邻接区域起始密码子等，但必需与编码序列的阅读框相同，以保证整个序列的正确翻译。所述翻译控制信号和起始密码子的来源是广泛的，可以是天然的，也可以是合成的。翻译起始区域可以来自转录起始区域或结构基因。为了便于对转基因植物细胞或植物进行鉴定及筛选，可对所用植物表达载体进行加工，如加入可在植物中表达的编码可产生颜色变化的酶或发光化合物的基因(GUS基因、萤光素酶基因等)、具有抗性的抗生素标记物(庆大霉素标记物、卡那霉素标记物等)或是抗化学试剂标记基因(如抗除莠剂基因)等。从转基因植物的安全性考虑，可不加任何选择性标记基因，直接以逆境筛选转化植株。

所述重组表达载体具体可为YEP-GAP-GmNF-YB1或pBI121-GmNF-YB1。所述YEP-GAP-GmNF-YB1为将所述基因插入YEP-GAP的多克隆位点得到的重组质粒，优选为将序列表的序列2自5’端第147至683位核苷酸所示的DNA片段插入YEP-GAP的BamHI和XhoI酶切识别位点之间得到的重组质粒。所述pBI121-GmNF-YB1为将权利要求2所述基因插入pBI121的多克隆位点得到的重组质粒，优选为将序列表的序列2自5’端第146至683位核苷酸所示的DNA片段插入pBI121的Sma I和SacI酶切识别位点之间得到的重组质粒。

本发明还保护一种培育转基因植物的方法，是将所述基因导入目的植物中，得到耐逆性高于所述目的植物的转基因植物。所述基因具体可通过所述重组表达载体导入所述目的植物中。携带有所述基因的表达载体可通过使用Ti质粒、Ri质粒、植物病毒载体、直接DNA转化、显微注射、电导、农杆菌介导等常规生物学方法转化植物细胞或组织，并将转化的植物组织培育成植株。

所述目的植物既可以是单子叶植物也可以是双子叶植物，如拟南芥(如哥伦比亚生态型拟南芥)等。

所述耐逆性具体可为耐旱(抗旱)。

扩增所述基因或其任意片段的引物对也属于本发明的保护范围。

本发明还保护所述蛋白作为转录因子的应用。

本发明的GmNF-YB1在干旱、乙烯和ABA的诱导下表达，编码的蛋白定位到细胞核上，并且可以特异的调控含有CCAAT-box顺式元件(核心序列：CCAAT)的基因的转录表达，本发明的GmNF-YB1可以提高植物的耐旱性，为人为控制抗逆和耐逆相关基因的表达提供了基础，将在培育抗逆性和耐逆性增强的植物育种中发挥重要的作用。

附图说明

图1为GmNF-YB1与玉米ZmNF-YB2氨基酸序列的同源性比对结果。

图2为GmNF-YB1受胁迫诱导表达的荧光实时定量(Real-time)PCR图谱。

图3为GmNF-YB1在洋葱表皮细胞中的定位结果；A：GmNF-YB1定位于细胞核中；B：16318hGFP空载体对照。

图4为酵母单杂交系统证明转录因子体内结合特异性和激活特性的原理示意图。

图5为分子检测在转基因拟南芥中的目的基因；A：DNA水平检测目的基因；B：cDNA水平检测目的基因；M为Marker，col0为哥伦比亚生态型拟南芥，其余泳道分别为各个待鉴定植株，具有预期条带的为转基因植株。

图6为野生型和转基因拟南芥抗旱性比较；A：干旱处理前野生型植株；B：复水一周后的野生型植株；C：干旱处理前转基因植株；D：复水一周后的转基因植株。

具体实施方式

以下的实施例便于更好地理解本发明，但并不限定本发明。下述实施例中的实验方法，如无特殊说明，均为常规方法。下述实施例中所用的试验材料，如无特殊说明，均为自常规生化试剂商店购买得到的。下述实施例中的％，如无特殊说明，均为质量百分含量。以下实施例中的定量试验，均设置三次重复实验，结果取平均值。

实施例1、GmNF-YB1的克隆

一、mRNA的分离

将沙土中生长20天左右的大豆品种铁丰8号(购自中国农业科学院作物科学研究所)两叶期幼苗进行干旱处理5小时，用液氮速冻，-80℃保存备用。

采用Trizol法(TianGen)提取大豆叶片总RNA，第一链cDNA合成用反转录酶XL(AMV)。采用SMART法合成ds cDNA，PCR产物进行1.0％琼脂糖凝胶电泳检测。

二、GmNF-YB1基因全长序列的获得

通过5’RACE和3’RACE的方法获得大豆CCAAT-box的核转录因子B族基因全长序列。

将序列表的序列1所示的蛋白命名为GmNF-YB1蛋白，由174个氨基酸残基组成，具有保守的组蛋白折叠基序和TATA结合蛋白结合的结构域。GmNF-YB1的序列在Genabnk上进行比对，与玉米中的蛋白具有较高同源性(图1)，而在大豆中未发现同源蛋白，证明GmNF-YB1蛋白是一个新的蛋白。将GmNF-YB1蛋白的编码基因命名为GmNF-YB1基因，其开放阅读框架为自序列表的序列2的5′端第157位到681位核苷酸。

实施例2、实时荧光定量PCR分析GmNF-YB1的表达特性

一、胁迫处理

取室温生长20d左右的大豆铁丰8号幼苗进行以下处理：

(1)干旱处理(图2A)：将盆栽的大豆幼苗取出吸干根上的水分，置于干燥的滤纸上，干旱培养30分钟、1小时、2小时、5小时、12小时、24小时后取出材料，用液氮速冻，-80℃保存备用。

(2)盐渍处理(图2B)：将大豆幼苗置于200mM的由NaCl溶液中，光照培养30分钟、1小时、2小时、5小时、12小时、24小时后分别取出材料，用液氮速冻，-80℃保存备用。

(3)脱落酸处理(图2C)：将大豆幼苗置于100μM的脱落酸(ABA)溶液中，光照培养30分钟、1小时、2小时、5小时、12小时、24小时后分别取出并用液氮速冻，-80℃保存备用。

(4)低温处理(图2D)：将大豆幼苗置于4℃培养箱，光照培养30分钟、1小时、2小时、5小时、12小时、24小时后取出并用液氮速冻，-80℃保存备用。

(5)高温处理(图2E)：将大豆幼苗置于42℃下，光照培养30分钟、1小时、2小时、5小时、12小时、24小时后分别取出并用液氮速冻，-80℃保存备用。

(6)水杨酸处理(图2F)：将大豆幼苗置于50μM的水杨酸(SA)溶液中，光照培养30分钟、1小时、2小时、5小时、12小时、24小时后分别取出并用液氮速冻，-80℃保存备用。

(7)乙烯(EH)处理(图2G)：大豆幼苗置于50μM的GA溶液中，光照培养30分钟、1小时、2小时、5小时、12小时、24小时后分别取出并用液氮速冻，-80℃保存备用。

(8)茉莉酸甲酯(MeJA)处理(图2H)：将小麦幼苗置于50μM的MeJA溶液中，光照培养30分钟、1小时、2小时、5小时、12小时、24小时后分别取出材料，用液氮速冻后-80℃保存备用。

(9)对照的处理：直接取未经任何处理的大豆幼苗-80℃冻存作为对照(0小时)。

二、mRNA的分离

采用Trizol法(TianGen)提取大豆叶片总RNA。

三、反转录为cDNA

将纯化的mRNA反转录为cDNA。

四、实时荧光定量PCR

将cDNA稀释50倍后用作Q-RT-PCR的模板。用基因3′端非编码区的特异引物对对样品进行Q-RT-PCR扩增，分析基因对各种处理的应答情况，以actin做内参。Q-RT-PCR在ABI PRISM

7000实时荧光定量PCR仪上进行，一次平行试验设3次重复。利用Livak KJ和Schmittgen TD(2001)报道的方法，即2^-ΔΔCT计算相对表达量。

ΔΔC_T＝(C_T.Target-C_T.Actin)_Time x-(C_T.Target-C_T.Actin)_Time 0

Time x表示任意时间点，Time₀表示经actin校正后1倍量的目标基因表达。

结果见图2。

实施例3、GmNF-YB1亚细胞定位分析

1、材料准备：

在9cm培养皿上铺一薄层MS培养基，撕下后内表面朝上，平铺于MS培养基中心，直径在3cm范围内，25℃预培养4h。

2、金粉的处理：

取100mg直径为1.0μM的金粉放入1.5ml离心管中，加入1ml无水乙醇，充分振荡3min，以12000rpm离心1min，去上清，再加入1ml无菌水充分混匀后，以12000rpm离心，重复上述步骤3次。最后，将金粉悬浮于1ml超纯水中，-20℃保存备用。

3、制备微粒子弹：

3μg重组质粒(GmNF-YB1：16318hGFP)加入直径为1.0μM的金粉悬液6μl(50mg/ml)，0.1M亚精胺(spermidine)4μl，2.5M CaCl₂ 6μl，将金粉、DNA、亚精胺和氯化钙先分别振荡混匀，然后混合振荡混匀3min后，冰上静置15min。12000rpm离心10s(指转速达到12000rpm后10s)，弃上清。加入140μl无水乙醇，粗振荡后(打散金粉)12000rpm离心10s，收集金粉沉淀。20μl无水乙醇悬浮沉淀，点膜。

4、基因枪轰击受体材料：

①选用一定压力的可裂膜(本实验用1100psi)，与轰击膜一起，在70％的酒精中浸泡1～2h，取出晾干；

②金属挡板用酒精浸泡，在酒精灯上灭菌，基因枪的超净工作台紫外灭菌；

③取20μl上述制备好的金粉-质粒复合体，均匀涂布于轰击膜的中间位置上，不要涂于整个膜上，大小与载体固定圈上的孔径范围一致，晾干，然后固定在载体固定圈上；

④将上述载体固定圈安装到发射装置上；

⑤将可裂膜安装到气体加速管下端；

⑥将洋葱表皮培养皿放入真空室内，取下培养皿盖；

⑦抽真空指针到26In/Hg；

⑧放氦气于气体加速管，直到管中压力达到可裂膜所能承受的压力时，可裂膜破开；

⑨气体冲到轰击膜上，载体向下运动，被金属挡板挡住，而下面的金粉-质粒复合体却透过金属挡板的网孔射向靶细胞；

⑩将轰击好的洋葱表皮细胞放入25℃培养箱中，暗培养16～24h后在激光共聚焦显微镜下观察。

5、洋葱表皮细胞镜检：

将基因枪轰击、暗培养16-24h之后的洋葱表皮压片，然后在激光扫描共聚焦显微镜(Bio-Rad MicroRadiance)(Laser scanning confocal microscopy，LSMC)观察GFP(绿色荧光蛋白)荧光，并进行扫描照像。LSCM的工作参数为：Ex＝488nm，Em＝525±15nm，Power＝10％，Zoom7，中速扫描，Frame512×512。软件为TIME-COURSE和PHOTOSHOP5.0。见图3。

实施例4、GmNF-YB1的激活特性

用酵母单杂交系统证明转录因子的激活特性的主要原理如图4所示，将CCAAT顺式作用元件和突变体CCAAT顺式作用元件分别构建到pHISi-1载体和pLacZi载体的基本启动子Pmin(minimal promoter)上游，Pmin启动子下游连接报道基因(His3、LacZ和URA3)。当连接有编码转录因子的目的基因的表达载体YEP-GAP(不含激活功能)分别转化到连有CCAAT顺式作用元件和突变体CCAAT顺式作用元件的酵母细胞后，如果连有突变体CCAAT顺式作用元件的酵母细胞中的报道基因不能表达，而连有特定的CCAAT顺式作用元件的酵母细胞中的报道基因能够表达，说明该转录因子能与CCAAT顺式作用元件结合，且具有激活功能，激活了Pmin启动子，促使报道基因表达。从而证明了目的转录因子的体内结合特异性和激活功能。

YEP-GAP：中国农业科学院作物科学研究保证向公众提供；参考文献Liu Q，KasugaM，Sakuma Y，Abe H，Miura S，Yamaguchi-Shinozaki K，Shinozaki K.Two transcriptionfactors，DREB1 and DREB2，with an EREBP/AP2 DNA binding domain separate twocellular signal transduction pathways in drought-andlow-temperature-responsive gene expression，respectively，in Arabidopsis，Plant Cell 1998Aug；10(8)：1391-1406。

YPD液体培养基：细菌培养用酵母抽提物(Bacto-Yeast Extract)10g/L，细菌培养用胰化蛋白胨(Bacto-Peptone)20g/L，调节pH至5.8，121℃/15min灭菌，降至60℃以后加入40％的Glucose，使其终浓度为20g/L。

SD/His^-/Ura^-/Trp^-选择性培养基：不含氨基酸的酵母氮源(Yeast nitrogen base)6.7g/L，营养缺陷型混合物(drop-out media without His/Ura/Trp)100ml，琼脂粉(Bacteriological agar)20g/L，调节pH至5.8，121℃/15min灭菌，降至60℃后加入40％Glucose，使其终浓度为20g/L。

营养缺陷型混合物(Drop-out mix)：(10×)：L-Isoleucine(异亮氨酸)300mg/L，L-Valine(缬氨酸)1500mg/L，L-Adenine(腺嘌呤)200mg/L，L-Arginine(精氨酸)200mg/L，L-Histidine Hcl monohydrate(组氨酸)200mg/L，L-Leucine(亮氨酸)1000mg/L，L-Lysine Hcl(赖氨酸)300mg/L，L-Methionine(甲硫氨酸)200mg/L，L-Phenylalanine(苯丙氨酸)500mg/L，L-Threonine(苏氨酸)2000mg/L，L-Tyrosine(酪氨酸)300mg/L。

1×PEG/LiAc：50％ PEG3350 8ml，10×TE buffer 1ml，10×LiAc 1ml。

10×TE Buffer：100mM Tris-Hcl，10mM EDTA、pH＝7.5，121℃高压灭菌，室温保存。

1×TE/LiAc：10×TE buffer 1ml，10×LiAc 1ml，ddH₂O 8ml。

Z Buffer：Na₂HPO₄·7H₂O 16.1g/L，NaH₂PO₄·H₂O 5.5g/L，KCl 0.75g/L，MgSO₄·7H₂O0.246g/L，调节pH至7.0，121℃/15min灭菌，4℃保存。

X-gal储存液(X-gal Stock Solution)：用N，N-dimethyl-formamide(DMF)溶解X-gal，使其终浓度为20mg/ml，-20℃贮存。

含有X-gal的Z buffer缓冲液100ml(Z buffer with X-gal)，现用现配：Z buffer98ml，β-巯基乙醇(β-mercaptoethanol)0.27ml，X-gal储存液(X-gal stocksolution)1.67ml。

10×LiAc：100Mm Tris-Hcl，100mM EDTA，pH＝7.5。121℃高压灭菌、室温保存。

一、重组表达载体的构建

1、GmNF-YB1基因的获得

根据GmNF-YB1基因的序列设计引物GmNF-YB1和GmNF-YB1-XI，引物末端分别引入BamHI和XhoI酶切位点，以大豆品种铁丰8号(购自中国农业科学院作物科学研究所)的cDNA为模板，PCR扩增获得GmNF-YB1基因。

GmNF-YB1：5’-TTTGGATTCGGTTTGTGAGATGTCGGATGCAC-3’；

GmNF-YB1-XI：5’-GGTCTCGAGAACTATTCATGGCCTTGCATTGAAGG-3’。

PCR扩增产物进行1.2％琼脂糖凝胶电泳检测。

采用Agarose Gel DNA Purification Kit Ver.2.0(TaKaRa公司，Code No.：DV807A)回收纯化525bp左右的PCR产物。

2、重组表达载体的构建

①用限制性内切酶BamHI和XhoI酶切步骤1回收纯化的PCR产物，回收酶切产物；

②用限制性内切酶BamHI和XhoI酶切表达载体YEP-GAP，回收载体骨架；

③将步骤①的酶切产物和步骤②的载体骨架连接；

④将步骤③的连接产物电击转化JM109菌株(购自Clontech公司)，37℃过夜培养，挑取阳性克隆进行测序；测序结果表明，得到了重组质粒YEP-GAP-GmNF-YB1(在YEP-GAP的BamHI和XhoI酶切位点之间插入了序列表的序列2自5’端第147位-683位核苷酸所示的DNA片段)。

二、GmNF-YB1的体内结合特异性和激活特性的验证

1、酵母报道子的构建

(1)正常双重酵母报道子的构建

DNA片段A(含4个CCAAT元件；TTTAACCAATCAGAAA)：

5’-GAATTC-CCAAT-CCAAT-CCAAT-CCAAT-GTCGAC-3’(CCAAT的核心序列：CCAAT)。DNA片段A的核苷酸序列见序列表的序列3。

将DNA片段A构建到pHis-1载体(MATCHMAKER One-Hybrid System，Clontech公司)的Pmin_HIS3启动子上游，得到重组载体pHis-1-CCAAT，用Xho I和Nco I内切酶将pHis-1-CCAAT载体切成线状。

将DNA片段A构建到pLacZi载体(MATCHMAKER One-Hybrid System，Clontech公司)P_CYCI启动子上游，得到重组载体pLacZi-CCAAT，用Xho I和Nco I内切酶分别将pLacZi-CCAAT载体切成线状。

先将线状pHis-1-CCAAT载体转化到酵母细胞(YM4271株系，MATCHMAKEROne-Hybrid System，Clontech公司)内，获得能在SD/His^-培养基上正常生长的酵母转化子(Yeast transformant)。接着以这种酵母转化子为寄主细胞，继续转化含有4个重复CCAAT元件的pLacZi-CCAAT载体。这样在同时缺乏组氨酸和尿嘧啶的SD/His^-/Ura^-培养基上，选择获得含有pHis-1-CCAAT和pLacZi-CCAAT的正常双重酵母报道子。

(2)突变体双重酵母报道子的构建

DNA片段B(含4个mCCAAT元件)：5’-GAATTC-mCCAAT-mCCAAT-mCCAAT-mCCAAT-GTCGAC-3’(MDRE：将4个CCAAT元件的核心序列CCAAT突变成TTTTA)。DNA片段B的核苷酸序列见序列表的序列4。

用DNA片段B代替DNA片段A，方法同步骤(1)，得到突变体双重酵母报道子。

2、PEG/LiAc法转化酵母及结果分析

(1)接种酵母菌株(YM4271株系)到1ml YPD液体培养基中，剧烈震荡2分钟，分散团块后将悬浮液转至含有50ml YPD液体培养基的三角瓶中，30℃/250rpm摇过夜，测OD600＝1.7-1.8(计数约4×10⁷个/mL)；

(2)取30ml步骤(1)过夜培养物接到300ml新鲜的YPD培养基中，30℃/250rpm培养，约3小时(至OD600＝0.5±0.1)，室温1000g离心5min，收集菌体，弃上清，用1/2体积1×TE悬浮，1000g/5min离心；

(3)吸弃上清，用1.5ml新鲜配制的1×TE/LiAc溶液悬浮，振荡混匀备用；

(4)取出0.1ml酵母感受态进行转化，依次加下列溶液：0.1μg YEP-GAP-GmNF-YB1、0.1mg ssDNA(鲑鱼精DNA，Sigma)、0.6mlPEG/LiAc高速振荡1分钟，30℃/200rpm振荡培养30分钟；

(5)加入70ul DMSO(sigma#D8779)，轻轻倒置混匀，42℃热激30分钟，其间轻轻振荡，冰浴2分钟，室温1000g离心5min；

(6)吸弃上清，加入0.5ml 1×TE buffer悬浮细胞；

(7)用接种环蘸取悬浮液，分别在含有0、15mmol/L 3-AT的SD/His^-/Ura^-/Trp^-选择性培养基上画线培养。

(8)平板的一半培养正常双重酵母报道子，另一半培养突变体双重酵母报道子，以便做对照分析。

(9)颠倒放置于培养箱中，30℃培养3-4天。

(10)结果发现在0mmol/L 3-AT的SD/His^-/Ura^-/Trp^-的培养基平板上正常的酵母报道子和突变的酵母报道子都有生长，但突变的酵母报道子的直径明显小；而在15mmol/L3-AT的SD/His^-/Ura^-/Trp^-的培养基平板上正常的酵母报道子能正常生长，但突变的酵母报道子被抑止没有生长。

3、半乳糖苷酶活性检测

(1)从0mmol/L 3-AT的SD/His^-/Ura^-/Trp^-的培养基平板上分别挑取正常的酵母报道子和突变的酵母报道子菌落。转至YPD液体培养基中，于30℃振荡培养，待长至对数生长后期，取1.5ml菌液，3000rpm离心30s；

(2)弃上清，控干管中液体，将离心管置于液氮中速冻10min，取出使其自然融解，加50ul Z/X-gal溶液，30℃温育，结果发现正常的酵母报道子在6-8h内变蓝，而突变的酵母报道子在12h内没有变化，仍为白色。说明转录因子GmNF-YB1能与CCAAT顺式作用元件结合，且具有激活功能，激活了Pmin启动子，促使报道基因表达。从而证明了GmNF-YB1的体内结合特异性和激活功能。

实施例5、GmNF-YB1提高植物的抗旱性

一、重组表达载体的构建

1、GmNF-YB1基因的克隆

根据GmNF-YB1基因的序列设计引物对(GmNF-YB1-121F和GmNF-YB1-121R)，引物末端分别引入Sma I和SacI酶切识别位点，以铁丰8号大豆cDNA为模板PCR扩增GmNF-YB1基因。

GmNF-YB1-121F：5’-TCCCCCGGGGGTTTGTGAGATGTCGGATGCAC-3’；

GmNF-YB1-121R：5’-CGAGCTCAACTATTCATGGCCTTGCATTGAAGG-3’。

PCR扩增产物进行1.2％琼脂糖凝胶电泳，采用Agarose Gel DNA Purification KitVer.2.0(TaKaRa公司，Code No.：DV807A)回收纯化1.5Kb左右的条带。

2、重组表达载体的构建

①用限制性内切酶Sma I和SacI酶切步骤1回收纯化的PCR产物，回收酶切产物；

②用限制性内切酶Sma I和SacI酶切pBI121(Clontech公司购买)，回收载体骨架；

③将步骤①的酶切产物和步骤②的载体骨架连接；

④将步骤③的连接产物电击转化TOP10菌株(购自北京天根公司)，37℃过夜培养，挑取阳性克隆进行测序；测序结果表明，得到了重组质粒pBI121-GmNF-YB1(在pBI121的Sma I和SacI酶切位点之间插入了序列表的序列2自5’端第146-683位核苷酸所示的DNA片段)。

二、转基因植物的获得

1、用重组质粒pBI121-GmNF-YB1基因转化农杆菌C58(北京拜尔迪生物技术公司购买)，得到重组农杆菌。

2、将重组农杆菌接种于LB(含50mg/ml利福平，100mg/ml卡那霉素，50mg/ml庆大霉素)液体培养基中，28℃、3000rpm培养约30小时；

3、将步骤2的菌液转至LB(含50mg/ml利福平，100mg/ml卡那霉素，50mg/ml庆大霉素)中，28℃、300rpm培养约14小时(菌液OD600达到1.5-3.0)；

4、收集菌体，4℃、4000g离心10min，用含10％蔗糖MS液体培养基(含0.02％silwet)稀释至OD600约为0.8-1.0；

5、将拟南芥(哥伦比亚生态型Col-0，SALK公司购买)整株与花盆一起倒扣在盛有步骤4的菌液的容器中，使花浸泡50s左右，浸泡完毕后，取出花盆，侧放于托盘中，盖上黑色塑料布，24hr后揭开塑料布，直立放置花盆，进行正常的光照培养，收获T₁代种子，卡那霉素筛选(浓度为50μg/L卡那霉素)阳性植株。T₂代表示T₁代自交产生的种子及由它所长成的植株，T₃代表示T₂代自交产生的种子及由它所长成的植株。将T₃代植株进行在DNA和cDNA水平鉴定(DNA水平鉴定的引物对：F：5’-GGTTTGTGAGATGTCGGATGCAC-3’；R：5’-AACTATTCATGGCCTTGCATTGAAGG-3’；预期条带为544bp；cDNA水平鉴定的引物对：F：5’-GGTTTGTGAGATGTCGGATGCAC-3’；R：5’-AACTATTCATGGCCTTGCATTGAAGG-3’；预期条带为544bp)，部分样本的结果见图5。从阳性植株中筛选得到转基因植株(转GmNF-YB1基因植株)。

三、转空载体对照植物的获得

用质粒pBI121转化农杆菌，得到重组农杆菌，用重组农杆菌转化拟南芥，得到转空载体对照植株，方法同步骤二。

四、转基因植物的耐旱性鉴定

分别将T₃代转基因植株(Transgenic line)、T₃代转空载体对照植株和拟南芥Col-0(WT)(各60株)进行耐旱性鉴定。设置三次重复实验，结果取平均值。

将正常生长的萌发15天的幼苗不浇水，直至野生型植株枯萎(2周左右)，然后复水一周，观察表型、拍照并统计存活率。照片见图6。拟南芥Col-0的存活率为24％，90％转基因植株存活且能正常生长。转空载体对照植株的表型与拟南芥Col-0一致，存活率与拟南芥Col-0没有显著差异。

序列表

<110>中国农业科学院作物科学研究所

<120>植物耐逆性相关蛋白GmNF-YB1及其编码基因和应用

<130>CGGNARY102250

<160>4

<210>1

<211>174

<212>PRT

<213>大豆属大豆(Glycine max L.)

<400>1

Met Ser Asp Ala Pro Ala Ser Pro Ser His Glu Ser Gly Gly Glu Gln

1                   5                   10                  15

Ser Pro Arg Gly Ser Leu Ser Gly Ala Ala Arg Glu Gln Asp Arg Tyr

            20                  25                  30

Leu Pro Ile Ala Asn Ile Ser Arg Ile Met Lys Lys Ala Leu Pro Pro

        35                  40                  45

Asn Gly Lys Ile Ala Lys Asp Ala Lys Asp Thr Met Gln Glu Cys Val

    50                  55                  60

Ser Glu Phe Ile Ser Phe Ile Thr Ser Glu Ala Ser Glu Lys Cys Gln

65                  70                  75                  80

Lys Glu Lys Arg Lys Thr Ile Asn Gly Asp Asp Leu Leu Trp Ala Met

                85                  90                  95

Ala Thr Leu Gly Phe Glu Asp Tyr Ile Glu Pro Leu Lys Val Tyr Leu

            100                 105                 110

Ala Arg Tyr Arg Glu Ala Glu Gly Asp Thr Lys Gly Ser Ala Arg Ser

        115                 120                 125

Gly Asp Gly Ser Ala Arg Pro Asp Gln Val Gly Leu Ala Gly Gln Asn

    130                 135                 140

Ala Gln Leu Val His Gln Gly Ser Leu Asn Tyr Ile Gly Leu Gln Val

145                 150                 155                 160

Gln Pro Gln His Leu Val Met Pro Ser Met Gln Gly His Glu

                165                 170

<210>2

<211>1032

<212>DNA

<213>大豆属大豆(Glycine max L.)

<400>2

aagaatgtta agtaaaaata gtggagtatc ttctctgctt tctgtgttat tgtctggctt     60

ttggagccga tccaaccaat catcgctggc gccaaataca aaatctcatc ccttcccctt    120

tctcttactg actctctttg tcaccgggtt tgtgagatgt cggatgcacc ggcgagtccg    180

agtcacgaga gtggtggcga gcagagccct cgcggctcgt tgtccggcgc ggctagagag    240

caggaccggt accttcccat tgccaacatc agccgcatca tgaagaaggc tctgcctccc    300

aatggcaaga ttgcgaagga tgcaaaagac acaatgcaag aatgcgtttc tgaattcatc    360

agcttcatta ccagcgaggc gagtgagaaa tgccagaagg agaagagaaa gacaatcaat    420

ggagacgatt tactatgggc catggcaact ttagggtttg aagactacat tgagccgctt    480

aaggtgtacc tggctaggta cagagaggcg gagggtgaca ctaaaggatc tgctagaagt    540

ggtgatggat ctgctagacc agatcaagtt ggccttgcag gtcaaaatgc tcagcttgtt    600

catcagggtt cgctgaacta tattggtttg caggtgcaac cacaacatct ggttatgcct    660

tcaatgcaag gccatgaata gtttagatgc ttctacgcat cttatttatt tcccttgaat    720

gcttgtacgc atggaatggg tggaaacaat ggtttggtga tttaatattt aggttctcgt    780

ttagaaggca tcagtgtcag aattttgtta cggtactaag gtagattttt attaatacat    840

tatacatgtc atatttagct gcctgaccaa ctcaagggag agatgtgttt ggggttattg    900

catgtgattc gccatgtagc ttgtcatggt gagaagcact tgctttgagt gttttcttta    960

gattattata taatatataa tatttgcaga cactgcattt gttagtttat ttagtttagg   1020

ccatacagtt tg                                                       1032

<210>3

<211>76

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>

<400>3

gaattcttta accaatcaga aatttaacca atcagaaatt taaccaatca gaaatttaac     60

caatcagaaa gtcgac                                                     76

<210>4

<211>76

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>

<400>4

gaattcttta attttacaga aatttaattt tacagaaatt taattttaca gaaatttaat     60

tttacagaaa gtcgac                                                     76

Claims (9)

1.一种蛋白质，是由序列表中序列1所示的氨基酸序列组成的蛋白质。

2.编码权利要求1所述蛋白的基因。

3.根据权利要求2所述的基因，其特征在于：所述基因为如下1）或2）或3）或4）的DNA分子：

1）序列表中序列2自5’端第157至681位核苷酸所示的DNA分子；

2）序列表中序列2自5’端第147至683位核苷酸所示的DNA分子；

3）序列表中序列2自5’端第146至683位核苷酸所示的DNA分子；

4）序列表中序列2所示的DNA分子。

4.含有权利要求2或3所述基因的重组表达载体、表达盒或重组菌。

5.如权利要求4所述的重组表达载体，其特征在于：所述重组表达载体为YEP-GAP-GmNF-YB1或pBI121-GmNF-YB1；

所述YEP-GAP-GmNF-YB1为将权利要求2所述基因插入YEP-GAP的多克隆位点得到的重组质粒；

所述pBI121-GmNF-YB1为将权利要求2所述基因插入pBI121的多克隆位点得到的重组质粒。

6.一种培育转基因植物的方法，是将权利要求2或3所述基因导入目的植物中，得到耐逆性高于所述目的植物的转基因植物；

所述目的植物为拟南芥，所述耐逆性为耐旱。

7.如权利要求6所述的方法，其特征在于：权利要求2或3所述基因通过权利要求4或5所述重组表达载体导入所述目的植物。

8.如权利要求6或7所述的方法，其特征在于：所述拟南芥为哥伦比亚生态型拟南芥。

9.权利要求1所述蛋白作为转录因子的应用。

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