具有杀狄斯瓦螨活性的几丁质酶、粘质沙雷氏菌及其应用
技术领域:
本发明属于生物技术领域,具体涉及具有杀狄斯瓦螨活性的几丁质酶ChiA、粘质沙雷氏菌,及其在杀狄斯瓦螨中的应用。
背景技术:
蜜蜂寄生螨一直是世界养蜂业最主要的危害之一,在全球范围危害,目前除澳大利亚、非洲部分地区尚未发现蜂螨外,其它洲的蜂群都受到蜂螨的危害。蜜蜂的外寄生螨狄斯瓦螨(俗称大蜂螨)(Varroa destructor Anderson&Trueman)吸食蜜蜂成蜂或幼虫的体液,造成蜜蜂体质下降,蜂群群势衰弱;此外,蜂螨还传播蜜蜂细菌和病毒病害。据报道,最近在美国等国出现的蜜蜂蜂群崩溃失调病(CCD)也与蜂螨的危害有关。每年我国养蜂业仅蜂螨造成的直接损失就达到几个亿人民币,而且因防治蜂螨使用药物造成蜂产品污染的间接损失更是不可估量。
目前主要用于防治蜜蜂螨害的方法有以下3种:(1)物理机械法:如蜂群的热处理;(2)化学防治法:如使用杀螨剂如有机酸和香精等;(3)生物技术防治法:包括蜜蜂饲养管理技术。但是目前使用最广泛的主要还是用药物来防治大蜂螨,其中使用最为普遍的是一种以拟除虫菊酯类农药-氟胺氰菊酯为主要原料的杀螨剂“螨扑”(Apistan)。不可否认,药物治螨起了一定的积极作用。但是,连续和大范围使用导致的污染和抗药性问题越来越严重。显然单靠药物治螨是不够的,还必须寻找其它途径来防治蜂螨。
一些生物防治技术已应用于防治蜂螨,如(1)割除雄蜂房法:自从西方蜜蜂身体上发现蜂螨,也发现蜜蜂对于蜂螨有清除行为,并可减轻蜂螨对蜂群所造成的危害。与此同时,养蜂工作者在实践中发现,割除雄蜂房也能降低蜂群中蜂螨的寄生密度,减弱蜂螨对蜂群所造成的危害。(2)使用抗螨除虫多功能巢础:利用蜂螨繁殖于封盖房,寄生于蜂体上这一生物学特性,直接把杀螨药物藏于蜂房中,阻断蜂螨幼虫在雄蜂房中正常羽化成成螨,从而达到杀灭蜂螨这一目的。(3)人工选育抗螨新品种:中华蜜蜂对于大蜂螨具有一定的抗性,蜂群内虽曾发现蜂螨,但未给蜂群造成危害。而且西方蜜蜂对于蜂螨也有一定的清理行为,养蜂工作者可以在蜂群中选择对蜂螨有较强清理行为的蜜蜂为种群,定向培育抗螨性强的蜂群,包括蜜蜂营养杂交(又称为蜜蜂无性杂交)。(4)利用病原真菌:绿僵菌(Metarhiziumanisopliae)和Hirsutella thompsonii对大蜂螨具有一定的防治效果。
但是,这些措施对蜂螨的控制效果并不令人满意,如割除雄蜂房法很难彻底消除螨害;由于长期以来自养自繁的养蜂模式导致的蜜蜂严重混杂退化和近亲繁殖衰退现象,培育抗螨品系的稳定性也不尽人意;病原真菌的应用仍受制于更有效品系的筛选、蜂巢温湿度、贮存方法和施用技术。因此,养蜂界仍在严重依赖业已产生抗性和引起残留的化学农药防治蜜蜂害螨。抗生素和化学农药的滥用,已经对我们的食品安全和国际贸易造成巨大的威胁。因此,养蜂业急需安全防治蜂螨的替代防治方法,热切期待环境友好的蜜蜂螨害防治新技术。
几丁质酶能够催化水解几丁质,产生几丁寡糖或几丁二糖。在自然界中很多微生物可以产生几丁质酶。几丁质酶具有广泛的生理功能,在生物防治方面得到了普遍应用;几丁质酶对杀虫剂具有增效作用,可加速害虫的致病过程;几丁质酶还可抑制病原真菌的生长。但是,到目前为止,未发现利用几丁质酶控制蜜蜂狄斯瓦螨的报道。
发明内容:
本发明的目的是提供了一种具有杀狄斯瓦螨活性的几丁质酶ChiA及其在杀狄斯瓦螨中的应用。
本发明的另外一个目的是提供了一种具有杀狄斯瓦螨活性的沙雷氏菌GEI Serratiamarcescens GEI菌株。
本发明通过以下技术方案实施的:
本发明所述的沙雷氏菌GEI Serratia marcescens GEI,是从广州市从化地区购买的中华蜜蜂工蜂肠道中分离得到的,经实验证实其对狄斯瓦螨具有强毒性,在细菌浓度108-109cfu/mL,沾染该菌的狄斯瓦螨,5天后死亡率为100%。该菌为光滑、湿润、隆起的中等大小的淡黄色菌落。其16SrRNA序列如SEQ ID NO.1所示,与登录号为gb|AY514432.1|的粘质沙雷氏菌的16SrRNA同源性为99%,将此菌株分类命名为:沙雷氏菌GEI Serratia marcescens GEI,于2009年5月6日保藏于中国典型培养物保藏中心(CCTCC,地址:中国武汉市武汉大学),保藏编号为CCTCC M 209097。
本发明从沙雷氏菌GEI的基因组DNA中克隆出一段基因碱基序列,应用原核表达载体pET-32a(+),在大肠杆菌中表达该基因,对该基因的编码蛋白进行纯化、复性、生物测定表明,该基因的编码蛋白对狄斯瓦螨具有比较强的毒性,该编码蛋白的酶活力为15.9U/mL的条件下,沾染该蛋白的狄斯瓦螨,5天后死亡率为40%。经过测序分析表明,该基因的开放读码框含有1692个碱基,序列如SEQ ID NO.2所示,BLAST分析表明该基因与登录号为AF454462.1的粘质沙雷氏菌几丁质酶基因chiA的相似性为96%,由此认为该基因属于几丁质酶chiA基因类别,是一个几丁质酶chiA基因类的新序列。
本发明所述的几丁质酶ChiA,由于具有杀狄斯瓦螨的活性,可以作为一种制剂使用,或者将该几丁质酶基因转入对环境无害的工程菌中,或者转入蜜蜂中,来防治蜜蜂的螨害。
本发明从蜜蜂工蜂中肠分离的沙雷氏菌GEI Serratia marcescens GEI对狄斯瓦螨具有强毒性,在细菌浓度108-109cfu/mL,沾染该菌的狄斯瓦螨,5天后死亡率为100%。从本发明分离的沙雷氏菌GEI Serratia marcescens GEI中克隆得到的新的几丁质酶chiA基因,该基因的编码蛋白几丁质酶ChiA对狄斯瓦螨具有较高的毒性,几丁质酶活力为15.9U/mL的条件下,沾染该蛋白的狄斯瓦螨,5天后死亡率为40%。本发明的实现为实现对环境友好的蜜蜂螨害防治新技术提供了途径,将本发明的酶作为制剂或者将该几丁质酶基因转入对环境无害的工程菌中,或者转入蜜蜂中,从而实现安全、无毒生物防治蜜蜂螨害。
本发明所述的沙雷氏菌GEI Serratia marcescens GEI,于2009年5月6日,保藏于中国典型培养物保藏中心(CCTCC,地址:中国武汉市武汉大学),其保藏编号为CCTCC M 209097。
图1:沙雷氏菌GEI对狄斯瓦螨的生物测定结果,A.沙雷氏菌GEI Serratia marcescensGEI;B.LB培养基。
图2:从沙雷氏菌株基因组中扩增得到chiA基因,1.chiA PCR产物;M.DL2000 DNAMarker。
图3:SDS-PAGE分析几丁质酶ChiA重组蛋白的诱导表达,1.未诱导的BL21(DE3)/pET-32a(+)重组菌;2.IPTG诱导的BL21(DE3)/pET-32a(+)重组菌;3.未诱导的BL21(DE3)/pET-32a(+)-chiA;4.IPTG诱导的BL21(DE3)/pET-32a(+)-chiA重组菌
图4:SDS-PAGE分析复性后的几丁质酶ChiA重组蛋白,1.IPTG诱导的BL21(DE3)/pET-32a(+)-chiA重组菌;2.IPTG诱导的BL21(DE3)/pET-32a(+)-chiA重组菌的包涵体蛋白的复性蛋白。
图5是不同浓度的NGA在A=550nm条件下的吸光度值的标准曲线。
图6是不同浓度的BSA在A=595nm条件下的吸光度值的标准曲线。
图7几丁质酶ChiA对狄斯瓦螨的生物测定结果,A.几丁质酶ChiA;B.蛋白溶解液;C.透析液。
具体实施例子:
在下面的实施例中进一步说明本发明,这并不限制本发明的范围。
实施例1
一、沙雷氏菌GEI Serratia marcescens GEI的分离和鉴定。
1.沙雷氏菌GEI Serratia marcescens GEI的分离
健康的中华蜜蜂,从广东省广州市从化区购买。
(1)从中蜂蜂群中取回健康成年工蜂。
(2)在超净工作台中将工蜂分别放入75%(v/v)的酒精中浸泡10s,再置于0.1%升汞液(w/v)中消毒2min。用灭菌水清洗工蜂,然后在无菌培养皿中进行解剖。
(3)用镊子夹住蜜蜂尾部的毒针,小心拖出中肠。
(4)将中肠放在灭菌研钵中研磨,将研磨液用灭菌水稀释至10-1-10-8,取10-6、10-7、10-83个稀释度。
(5)取各个稀释度的稀释液100μL分别涂布于LB培养基和PDA培养基上,各稀释度重复3次。
(6)将培养基置于28℃进行培养,约培养2-3天,挑取单菌落,进行纯化培养直到获得纯菌株并编号备下一步骤筛选具有杀螨作用的菌株中使用。
2.筛选具有杀螨作用的菌株
参照(Tsagou et al.,2004)的方法,并有所修改。
(1)从被大蜂螨感染的意蜂蜂群中取回巢脾,尽量从多个蜂箱中取。
(2)采集蜂螨的方法:用镊子打开蜂房,用毛笔或者小刷子从幼虫和蛹上收集大蜂螨。
(3)准备9cm的一次性培养皿,并在底部各铺一张灭好菌的滤纸,每个培养皿中放4只蜜蜂的白眼蛹作为大蜂螨的食物来源。
(4)把收集到的大蜂螨放入培养皿中,一个培养皿中放20头,收集到后的一个小时内进行测定。
(5)把从上个步骤中从中蜂工蜂中肠分离纯化得到的细菌菌株分别接种在含有10mL LB培养基的100mL的三角瓶中200r/min,28℃进行培养。
(6)培养使各个菌株的浓度为108-109cfu/mL(稀释平板计数法)。
(7)测定时采用浸泡的方法:用毛笔尖挑起蜂螨,并将蜂螨完全浸没在1mL菌液(装在1.5mL离心管中)中10s,处理完后将蜂螨再放回装有蜂蛹作为食物的培养皿中饲养。
(8)如果在处理的过程中发生蜂螨死亡的情况,则将该螨弃去不用。
(9)每个菌株的处理重复3次。
(10)对照组使用灭菌的LB液体培养基处理大蜂螨,重复3次。
(11)把培养皿保持在黑暗的培养箱(RQH-01人工气候箱)中,温度和湿度控制在32℃,80%RH。
(12)每天记录和观察大蜂螨的存活情况,使用毛笔尖刺激螨,如果螨对刺激没有反应,则认为螨已经死亡。
从中蜂肠道分离的细菌中筛选到1株对蜂螨具有很强毒性的菌株,如图1所示,其对狄斯瓦螨,5天后的致死率达到了100%。
3.高毒性菌株16SrRNA的鉴定和形态学特征。
将步骤2分离得到的对狄斯瓦螨具有很强毒性的菌株接种到4mL LB液体培养基中,常规振荡培养过夜(28℃,200r/min);培养物按3%接种量转接至含10mL培养基的100mL锥形瓶,培养至OD620≈2,应用TIANGEN细菌基因组提取试剂盒(北京TIANGEN公司)提取该菌株基因组DNA,以此基因组DNA为模板,PCR扩增该菌的16SrRNA。
(1)使用的引物
合成和使用的引物如下(Evans et al.,2006)。
引物 序列
eu27-for 5’-GAGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3’
eu1495-rev 5’-CTACGGCTACCTTGTTACGA-3’
(2)PCR扩增16SrRNA的片段
以筛选出的菌株基因组DNA为PCR反应的模板,以eu27-for,eu1495-rev为引物建立以下反应体系:
ddH2O 19.6μL
10×PCR buffer 2.5μL
dNTP Mix(10mmol/L) 0.5μL
eu27-for(20μmol/L) 0.5μL
eu1495-rev(20μmol/L) 0.5μL
DNA template 1μL
Easy-A high fidelity cloning enzyme 0.4μL
Total volume 25μL
充分混匀,按以下程序进行PCR扩增:94℃变性3min进入循环,94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸1min,30个循环后于72℃继续延伸10min。反应完成后,以1%琼脂糖凝胶电泳检测扩增结果。回收合适大小(1400bp左右)的目的带,将扩增的序列委托上海英俊生物技术有限公司测序,其序列如SEQ ID NO.1所示,测序结果在GenBank数据库中BLAST分析,发现该菌株的16SrRNA片段与登录号为gb|AY514432.1|的粘质沙雷氏菌的16SrRNA同源性为99%,初步推定该菌株是粘质沙雷氏菌,命名为沙雷氏菌GEI Serratiamarcescens GEI。该菌为光滑、湿润、隆起的中等大小的淡黄色菌落。由于该菌对狄斯瓦螨具有高毒性的功能特征,其含有的几丁质酶ChiA的编码基因与登录号为AF454462.1的粘质沙雷氏菌几丁质酶基因chiA的相似性为96%,以及一些形态学特征推测该菌为粘质沙雷氏菌 株的一个新品系,将此菌于2009年5月6日,保藏于中国典型培养物保藏中心(CCTCC,地址:中国武汉市武汉大学),保藏编号为CCTCC M 209097。
二、几丁质酶ChiA编码基因的克隆和测序。
1.沙雷氏菌GEI Serratia marcescens GEI的培养
从LB平板上挑取沙雷氏菌GEI Serratia marcescens GEI单菌落接种至4mL LB液体培养基中,常规振荡培养过夜(28℃,200r/min);培养物按3%接种量转接至含10mL培养基的100mL锥形瓶,培养至OD620≈2。
2.细菌基因组DNA的提取
应用常规试剂盒(TIANGEN细菌基因组提取试剂盒,北京TIANGEN公司)提取沙雷氏菌GEI基因组DNA。
3.引物的设计
根据国外已克隆的粘质沙雷氏菌的几丁质酶基因:chiA(登录号:Z36294.1)序列,以沙雷氏菌菌株GEI基因组DNA为模板,以Primer Premier 5.0和DNASTAR软件辅助,设计引物。
引物A:For:5′-ATGGATCCATGCGCAAATTTAATA-3′
Rev:5′-GCGGCCGCTTATTGAACGCCGGCGC-3’
注:划线标注的分别是限制性酶切位点EcoR I,Not I
4.PCR扩增几丁质酶chiA基因
以沙雷氏菌基因组为模板,用上述引物A,进行PCR扩增,PCR反应体系及循环设定如下:
ddH2O 18.7μL
10×PCRbuffer 2.5μL
dNTP Mix(10mmol/L) 0.5μL
Primer-for(20μmol/L) 1μL
Primer-rev(20μmol/L) 1μL
DNA模板 1μL
Easy-A high fidelity cloning enzyme 0.3μL
Total volume 25μL
充分混匀,按以下程序进行PCR扩增:94℃变性5min进入循环,94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸1min 30s,30个循环后于72℃继续延伸10min。反应完成后,以1%琼脂糖凝胶电泳检测扩增结果,如附图2所示,扩增得到了目的条带。
5.回收几丁质酶chiA的基因片段与克隆载体的体外连接。
将上一步骤扩增到的目的基因片段按照常规方法回收,然后与pMD18-T Vector连接,连接步骤如下。
(1)在微量离心管中配制下列DNA溶液,全量为5μL。
pMD18-T Vector 1μL
DNA回收片段 1μL
ddH2O 3μL
Total volume 25μL
(2)加入5μL(等量)的Ligation Mix。
(3)16℃反应30分钟。
注)①室温(25℃)也能正常进行连接反应,但反应效率稍微降低。
②5分钟也能正常进行连接反应,但反应效率稍微降低。
6.连接产物转化E.coli DH5α感受态细胞
(1)取出1管感受态细胞50μL,于冰上缓慢旋转融化;
(2)加入全部(10μL)待转化质粒(连接产物),轻轻旋转,将质粒与感受态细胞混合均匀,冰浴30min;
(3)42℃热休克45s,不要摇动离心管;
(4)立即将离心管转移到冰上,放置1min;
(5)加入450μL平衡到室温的无菌SOC培养基;
(6)于37℃,200r/min水平振荡1h;
(7)取25-100μL不同体积的菌液铺于预热的LB平板(含有常规浓度的Amp、IPTG、X-Gal)上,37℃倒置培养过夜。
7.几丁质酶ChiA基因阳性克隆鉴定和测序
在平板上对大肠杆菌转化子进行抗性筛选,挑取克隆,经应用引物A,进行PCR初步鉴定,其含有大小基本与目的片段几丁质酶chiA基因符合的大肠杆菌阳性转化子命名为转化子pMD18-T-chiA。将此转化子pMD18-T-chiA的菌液1mL,委托上海英俊生物技术有限公司测序,得到编码几丁质酶ChiA的核苷酸序列,该序列如SEQ ID No.2所示,大小为1692bp,推测蛋白为61.09kDa,BLAST分析表明该基因与登录号为AF454462.1的粘质沙雷氏菌几丁质酶基因chiA的相似性为96%,由此认为该基因属于几丁质酶ChiA基因类别,是一个几丁质酶ChiA基因类的新序列。
三、几丁质酶chiA基因的原核表达和表达蛋白的纯化、复性和酶活性测定。
1.几丁质酶基因在E.coli BL21(DE3)中的表达
(1)从重组的转化子pMD18-T-chiA中提取重组质粒pMD18-T-chiA。(应用TIANGEN质粒小提取试剂盒,北京TIANGEN公司,按照试剂盒上的操作步骤提取)。
(2)重组质粒pMD18-T-chiA的酶切。
pMD18-T-chiA建立如下酶切反应体系:
ddH2O 22μL
10×H Buffer 6μL
0.1%BSA 6μL
pMD 18-T-ChiA 20μL
EcoR I 3μL
Sac I 3μL
Total volume 60μL
(3)基因片段chiA与pET-32a(+)表达载体的连接。
胶回收酶切片段,将胶回收的目的基因片段与载体DNA以适当的比例建立连接反应,以达到最佳连接效果。T4DNA Ligase应最后加入,轻轻混匀反应体系,16℃连接过夜。反应体系如下:
10×T4 DNA Ligase Buffer 18.5μL
pET-32a(+) 0.5μL
基因片段chiA 5μL
T4DNA Ligase 1μL
Total volume 25μL
(4)连接产物常规转化E.coli BL21(DE3)。
(5)大肠杆菌转化子的阳性克隆鉴定。
对长出的转化子进行快速筛选,以引物A作为引物
ddH2O 18.7μL
10×PCR buffer 2.5μL
dNTP Mix(10mmol/L) 0.5μL
Primer-for(20μmol/L) 1μL
Primer-rev(20μmol/L) 1μL
菌液 1μL
Taq DNA Polymerase 0.3μL
Total volume 25μL
充分混匀,按以下程序进行PCR扩增:94℃变性3min进入循环,94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸1min,30个循环后于72℃继续延伸10min。反应完成后,以1%琼脂糖凝胶电泳检测扩增结果,在合适大小(1692bp)处出现特异性扩增条带的样品即为阳性克隆组合,保存阳性克隆并编号,命名为克隆子pET-32a(+)-chiA。
(6)IPTG诱导目的蛋白的大量表达。
取活化后的重组大肠杆菌克隆子pET-32a(+)-chiA的培养液,按体积比3%比例接种至新鲜LB(Carr)培养基中,继续培养至OD600为0.4-0.6,加入IPTG至终浓度为1mmol/L,37℃,200r/min诱导培养8h。
(7)表达产物的SDS-PAGE分析。
重组大肠杆菌克隆子pET-32a(+)-chiA的培养液,按3%比例接种至新鲜LB(Carr)培养基中,继续培养至OD600为0.4-0.6,加入IPTG至终浓度为1mmol/L,37℃,200r/min诱导培养8h。分别取0.2mL克隆子pET-32a(+)-chiA至1.5mL洁净离心管中,离心得菌体,加入50μL双蒸水与50μL 2×SDS-PAGE上样缓冲液等体积混合,沸水浴10min,进行SDS-PAGE电泳检测几丁质酶ChiA基因在大肠杆菌中的表达,对照为转入空载体pET-32a(+)的E.coliBL21(DE3)菌(未用IPTG诱导和用IPTG诱导),以及未用IPTG诱导的克隆子pET-32a(+)-chiA,由于载体pET-32a(+)其自带编码一个20.4kDa的蛋白标签,因此经过IPTG的诱导的克隆子pET-32a(+)-chiA的表达蛋白大概为81.5kDa,如图3所示,克隆子pET-32a(+)-chiA经IPTG诱导后成功表达了几丁质酶ChiA,而其他三个对照没有表达几丁质酶ChiA。
2、重组表达几丁质酶ChiA的纯化和复性
因为表达的重组蛋白几丁质酶ChiA在大肠杆菌中是以不溶性的包涵体形式存在,而包涵体往往是没有生物活性的,所以需要对表达的重组蛋白进行复性。Invitrogen公司的蛋白复性试剂盒(Protein Refording Kit)能够在弱酸性条件下溶解大肠杆菌中的包涵体重组蛋白,并在中性的环境中对溶解的蛋白透析两次:第一次利用加入还原剂的透析液促使蛋白二硫键的正确形成,第二次除去多余的还原剂。蛋白复性试剂盒已经成功的应用于细菌的碱性磷酸酶、β-半乳糖苷酶、绿色荧光蛋白和葡糖苷酸酶的重组蛋白,是一个成熟的蛋白复性试剂盒。本实施例使用的就是invitrogen公司的蛋白复性试剂盒(Protein Refording Kit),具体操作过程按照试剂盒的操作说明书操作,其操作步骤如下:
1、制备包涵体
①取上述含目的蛋白菌液,4℃,6500rpm离心15min,弃上清;
②将沉淀完全重悬于0.1倍菌液体积的1×IB洗涤液,反复混匀;
③在细胞裂解的过程中将重悬的溶液置于冰上以防止蛋白受热裂解,可选择超声波裂解或French Press法裂解细胞。
④细胞裂解后在混和液中迅速加入蛋白酶抑制剂,每40mL混和液加入5mL的含有EDTA的蛋白酶抑制剂Cocktail Set II或1mL的蛋白酶抑制剂Cocktail Set III;
⑤10000rpm离心10min收集包涵体;
⑥弃上清,将沉淀(内有包涵体)用0.1倍菌液体积的1×IB洗涤液完全重悬;
⑦重复步骤5收集沉淀;
⑧将上述沉淀再次用0.1倍菌液体积的1×IB洗涤液完全重悬,并将重悬液转移至重量已知的干净的离心管中;
⑨10000rpm离心10min收集包涵体,弃上清,并将离心管倒置在纸巾上以完全除去多余的液体;
⑩离心管称重,减去管中以得到包涵体的净重。一般来说,OD600为3时收集的菌液,并且不溶性蛋白在细胞中的含量为10-40%时,每毫升菌液中有1-4mg的包涵体。
1)蛋白的溶解和重新折叠
①根据包涵体的重量计算所需的溶解液量,溶解包涵体使其在溶解液中的浓度为10-20mg/ml,溶解液按如下配方在室温下配制:
10×IB Solubilization buffer 5mL
ddH2O 44.5mL
30%N-lauroylsarcosine 0.5mL
DTT 50μL
Total 50mL
②将配制的溶解液加入收集有包涵体的离心管中,轻微混和。大的片断用枪头反复打碎;
③室温静置15min;
④室温10000rpm离心10min离心,转移上清(内有溶解蛋白)于干净的离心管中(避免碎片)。
2)透析
①透析袋处理,过程如下:
a 把透析袋剪成适当长度(10-20cm)的小段;
b 在大体积的含有2%(W/V,质量体积百分比浓度)碳酸氢钠和1mmol/L EDTA(pH 8.0)的液体中将透析袋煮沸10min;
c 用蒸馏水彻底清洗透析袋;
d 放在1mmol/L EDTA(pH 8.0)中将其煮沸10min。冷却后,存放于4℃,必须确保透析袋始终浸没在溶液内。从此时起取用透析袋必须戴手套;
e 用前在透析袋内装满水然后排出,将之清洗干净;
②准备透析液(为样品的50倍,如样品量为15mL,则需透析液750mL,因透析两次故共需透析液1.5L),按以下配方配制:
50×IB dialysis Buffer 30mL
ddH2O 1.5L+
(1M DTT) 150μL
Total 1.5L
③4℃透析至少3h以上,换新的透析液继续透析3h以上;
④按上步骤制备透析液,但不加DTT;
⑤用不加DTT的透析液再透析一次。
3)氧化还原以促使二硫键的形成
为促使蛋白的二硫键的正确形成,可以在透析液中加入氧化剂和还原剂继续透析,经常用的氧化还原剂为氧化性谷胱甘肽和还原性谷胱甘肽,比较经济的方法是使用CuSO4或NaSeO3,但使用这种方法所形成的不正确的二硫键比前者高。因此本发明中使用氧化性谷胱甘肽和还原性谷胱甘肽。
①如上制备透析液,再加入氧化还原剂(其中所述的氧化还原剂含有还原性谷胱甘肽和氧化性谷胱甘肽,其浓度分别为1mM和0.2mM),于4℃保存;
②4℃透析蛋白过夜;
③如有必要,继续于室温或37℃透析蛋白以提高二硫键的形成率,最终得到复性蛋白。
另有一种替代的方法就是配制氧化性谷胱甘肽和还原性谷胱甘肽的浓缩液,并直接加到目标蛋白中,反应后透析再除去多余的氧化还原剂。复性完成后对复性蛋白进行SDS-PAGE分析,如图4所示,表明复性蛋白是较纯的几丁质酶ChiA。
3.酶活性的测定方法。
酶活力测定采用改良的还原糖法,其原理为可溶性壳聚糖酶解后释放出还原糖,还原糖与3,5-二硝基水杨酸(DNS)试剂反应变色,于分光光度计550nm处测定其光吸收值,以N-乙酰氨基葡萄糖(NAG)为标准糖,制作标准曲线。
酶活力(单位U)定义为:在37℃反应条件下,每分钟释放1μmol还原糖所需要的酶量为1个酶活力单位(U/mL)。
(1)NAG标准曲线的绘制
取7支25mL刻度的试管,按表加入各种试剂,振荡混匀,在沸水浴加热10min,随即放入盛有冷水的烧杯中冷却至室温,加20mL水稀释,混匀,在550nm波长下测OD值。以OD550值为纵坐标,NAG量(mg)为横坐标,绘制标准曲线,标准曲线如图5所示。
管号 |
0 |
1 |
2 |
3 |
4 |
5 |
6 |
NAG标准液(ml) |
0 |
0.2 |
0.4 |
0.6 |
0.8 |
1.0 |
1.2 |
蒸馏水(ml) |
2.0 |
1.8 |
1.6 |
1.4 |
1.2 |
1.0 |
0.8 |
DNS试剂(ml) |
3.0 |
3.0 |
3.0 |
3.0 |
3.0 |
3.0 |
3.0 |
相当NAG量(mg) |
0 |
0.2 |
0.4 |
0.6 |
0.8 |
1.0 |
1.2 |
(2)样品处理:测定取25mL试管中加入1mL胶体几丁质和1mL复性蛋白液,振荡混均后于37℃水浴中反应10min,立即进入沸水浴1min灭活,冷却至室温;加入3.0mLDNS试剂,振荡混匀,沸水浴加热10min,冷却至室温,于分光光度计550nm处测定光吸收值,对照NAG标准曲线计算出还原糖含量,折算成酶活力单位,重复三次,测试结果表明含有几丁质酶ChiA的蛋白复性液的酶活为15.9U/ml。
(3)各种试剂的制备:
酶活力测试的NAG标准液为1mg/mL,制备方法:称0.1g N-乙酰葡萄糖胺于适量水中溶解,转移至100mL容量瓶定容,即得1mg/mL标液。
酶活力测试的DNS试剂的制备方法:取3,5-二硝基水杨酸6.3g,加入2mol/L的NaOH溶液262mL加至500mL含185g酒石酸钾的热水中,再加入结晶酚和亚硫酸钠各5g,搅拌混匀加蒸馏水定容至1000mL。
酶活力测试的胶体几丁质的制备方法:在10℃下,将几丁质5g放入研钵中,加丙酮40mL研磨10min。边研磨边缓缓加入预冷浓HCl 200mL,充分研磨,使呈糊状,于4℃放置24h。用玻璃棉过滤,将滤液缓缓加入到盛有1000mL 50%乙醇(v/v)的烧杯中,边加边剧烈搅拌,然后静置,待胶体几丁质析出后去除清液,收集胶态几丁质。用蒸馏水冲洗胶态几丁质至pH 7,以蒸馏水定容至500mL,冷藏备用。
4.复性蛋白的浓度测定
本论文利用考马斯亮蓝法对蛋白的浓度进行测定,具体过程如下:
(1)在离心管中分别加入0.5mg/mL的BSA(牛血清白蛋白)5μL、10μL、15μL、20μL,以0.15mM/L的NaCl补足至200μL,以200μL的0.15mM/L的NaCl作为空白对照;
(2)每管加入2mL考马斯亮蓝G-250,振荡混匀,室温放置2min;
(3)用1cm光径的比色杯测BSA的A595,用A595对BSA标准蛋白的浓度作图并绘制标准曲线,其标准曲线如图6所示;
(4)取50μL的待测蛋白稀释为2mL并测定其A595,利用BSA的标准曲线确定待测蛋白的浓度。
利用考马斯亮蓝法测定蛋白质的浓度,并绘制BSA的标准曲线,如图6所示,计算几丁质酶ChiA复性蛋白浓度为:2.05μg/μL。
四、几丁质酶ChiA对蜜蜂狄斯瓦螨的毒杀作用测定。
1.几丁质酶ChiA对蜜蜂狄斯瓦螨的毒杀作用的生物测定。
2.生物测定的方法如下
参照(Tsagou et al.,2004)的方法,并有所修改。
(1)从被大蜂螨感染的意蜂蜂群中取回巢脾,尽量从多个蜂箱中取。
(2)采集蜂螨的方法:用镊子打开巢脾上的蜂房,用毛笔或者小刷子轻轻从幼虫和蛹上收集大蜂螨。
(3)准备9cm的一次性培养皿,并在底部各铺一张灭好菌的滤纸,每个培养皿中放4只工蜂的白眼蛹作为大蜂螨的食物来源。
(4)将收集到的大蜂螨放入培养皿中(一个培养皿中放20头),收集后的一个小时内进行测定。
(5)测定时采用浸泡的方法:用毛笔尖挑起蜂螨,并将蜂螨完全浸没在1mL几丁质酶ChiA复性蛋白溶液(15.9U/mL)(1.5mL离心管)中10s,处理完毕后将蜂螨放回装有蜂蛹作为食物的培养皿中饲养。
(6)如果在处理的过程中发生蜂螨死亡的情况,则将该螨弃去不用。每个处理重复3次。
(7)对照组使用蛋白溶解液,透析液处理大蜂螨,重复3次。
(8)培养皿置于黑暗的培养箱(RQH-01人工气候箱)中,温度和湿度控制在32℃,80%RH。
(9)每天记录和观察大蜂螨的存活情况。使用毛笔尖刺激螨,如果螨对刺激没有反应,则认为螨已经死亡。如果发现蜂蛹有死亡的情况要及时更换蜂蛹。
3.生物测定的结果如下
几丁质酶的活力测定数据显示,几丁质酶ChiA的酶活力为15.9U/mL,其对蜂螨的致死率为40%(如图7所示),由此可以说明几丁质酶ChiA对蜂螨具有毒性。
序列表
<110>广东省昆虫研究所
<120>具有杀狄斯瓦螨活性的几丁质酶、粘质沙雷氏菌及其应用
<160>2
<210>1
<211>1414
<212>DNA
<213>沙雷氏菌GEI(Serratia marcescens GEI)
<400>1
catgcaagtc gagcggtagc acaggggagc ttgctccctg ggtgacgagc ggcggacggg 60
tgagtaatgt ctgggaaact gcctgatgga gggggataac tactggaaac ggtagctaat 120
accgcataac gtcgcaagac caaagagggg gaccttcggg cctcttgcca tcagatgtgc 180
ccagatggga ttagctagta ggtggggtaa tggctcacct aggcgacgat ccctagctgg 240
tctgagagga tgaccagcca cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca 300
gcagtgggga atattgcaca atgggcgcaa gcctgatgca gccatgccgc gtgtgtgaag 360
aaggccttcg ggttgtaaag cactttcagc gaggaggaag gtggtgagct taatacgctc 420
atcaattgac gttactcgca gaagaagcac cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa 480
tacggagggt gcaagcgtta atcggaatta ctgggcgtaa agcgcacgca ggcggtttgt 540
taagtcagat gtgaaatccc cgggctcaac ctgggaactg catttgaaac tggcaagcta 600
gagtctcgta gaggggggta gaattccagg tgtagcggtg aaatgcgtag agatctggag 660
gaataccggt ggcgaaggcg gccccctgga cgaagactga cgctcaggtg cgaaagcgtg 720
gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgctgt aaacgatgtc gatttggagg 780
ttgtgccctt gaggcgtggc ttccggagct aacgcgttaa atcgaccgcc tggggagtac 840
ggccgcaagg ttaaaactca aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg 900
gtttaattcg atgcaacgcg aagaacctta cctactcttg acatccagag aactttccag 960
agatggattg gtgccttcgg gaactctgag acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt 1020
gttgtgaaat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttatccttt gttgccagcg 1080
gttcggccgg gaactcaaag gagactgcca gtgataaact ggaggaaggt ggggatgacg 1140
tcaagtcatc atggccctta cgagtagggc tacacacgtg ctacaatggc atatacaaag 1200
agaagcgacc tcgcgagagc aagcggacct cataaagtat gtcgtagtcc ggattggagt 1260
ctgcaactcg actccatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg tagatcagaa tgctacggtg 1320
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agtaggtagc ttaaccttcg ggagggcgct tacc 1414
<210>2
<211>1692
<212>DNA
<213>沙雷氏菌GEI(Serratia marcescens GEI)
<220>
<221>CDS
<222>(1)…(1692)
<400>2
atgcgcaaat ttaataaacc gctgttggcg ctgttgatcg gcagcacgct gtgttccgcg 60
gcgcaggccg ccgcgccggg caagccgacc atcgcctggg gtaacaccaa gttcgccatc 120
gtcgaagtcg atcaggcggc caccgcttat aataatctgg tgaaggtaaa aaatgccgcc 180
gacgtttcgg tctcctggaa tttatggaat ggcgacgcgg gcacgacggc caagatttta 240
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accgccagcg acgccaccga aattgtggtg gccgacaccg acggcagcca tttggcgccg 420
ttgaaagagc cgctgttgga aaagaataaa ccttataaac agaacttcgg caaagtggtc 480
ggttcttatt tcgtcgagtg gggcgtttac gggcgcaatt tcaccgtcga caagatcccg 540
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accggcaccg ccaccgggcc ggtcaaaggc acttgggaga acggcatcgt ggattatcgc 1440
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ggcgttcaat aa 1692