CN101586167A - 原发性肝细胞癌诊断试剂、试剂盒及防治药物 - Google Patents

原发性肝细胞癌诊断试剂、试剂盒及防治药物 Download PDF

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Abstract

本发明属于肿瘤诊断及防治领域,具体涉及一种原发性肝细胞癌诊断试剂、试剂盒及防治药物。本发明为早期诊断及防治原发性肝细胞癌提供了一种新的诊断试剂和药物,还为筛选防治原发性肝细胞癌的药物提供了一种新方法。本发明原发性肝细胞癌诊断试剂含有可检测人磷酸甘油酸变位酶1基因的转录水平或翻译水平的试剂。本发明诊断试剂可以用于早期诊断原发性肝细胞癌,具有好的应用前景。本发明防治原发性肝细胞癌的药物如:能表达人磷酸甘油酸变位酶1的shRNA分子的表达载体等能改变人磷酸甘油酸变位酶1基因的转录水平或翻译水平的药物。

Description

原发性肝细胞癌诊断试剂、试剂盒及防治药物
技术领域
本发明属于肿瘤诊断及防治领域,具体涉及一种原发性肝细胞癌诊断试剂、试剂盒及防治药物。
背景技术
原发性肝细胞癌是我国最常见的恶性肿瘤之一,在消化系统恶性肿瘤中位居第三位,仅次于胃癌和食管癌。我国每年大约有30万人死于原发性肝细胞癌,占世界肝癌死亡人数的50%。值得注意的是,世界各地原发性肝细胞癌发病率均有上升趋势。原发性肝细胞癌的主要临床表现为肝区的胀痛或钝痛,晚期会出现黄疸,临床诊断主要依靠临床表现和血清甲胎蛋白的浓度,但具有典型临床表现的病例往往已经到晚期,且根据血清甲胎蛋白浓度难以鉴别良恶性肝病,给原发性肝细胞癌的早期诊断和治疗带来很大的难度。
肝细胞癌早期一般采用手术切除治疗,中晚期大多采取多种方法联合治疗,主要有化学治疗、放射治疗和肝移植。由于原发性肝细胞癌对放疗和化疗不敏感,而肝移植又受限于供体肝短缺,造成肝癌病人的5年生存率很低。因此,探索新的治疗原发性肝细胞癌的方法势在必行,而肝细胞癌的基因治疗正成为目前的探索热点。
在成年哺乳动物中,磷酸甘油酸变位酶以二聚体形式存在,其亚单位有B和M两种,分别由不同的基因编码,分子量都为30kD。磷酸甘油酸变位酶有三种同工酶,BB型、MM型和MB型。BB型同工酶(即通常所说的PGAM1)存在于成人脑、肝脏和肾脏中,为脑型同工酶;MM型同工酶(即通常所说的PGAM2)存在于骨骼肌和心肌中,为肌肉型同工酶;MB型同工酶仅存在于心肌。磷酸甘油酸变位酶1(PGAM1)是糖酵解过程中的关键酶,在2,3-二磷酸甘油酸帮助下,催化3-磷酸甘油酸转化为2-磷酸甘油酸。到目前为止,未见有通过检测人磷酸甘油酸变位酶1基因表达水平来实现早期诊断原发性肝细胞癌的诊断试剂及试剂盒的相关报道,也未见有通过降低其表达水平达到防治原发性肝细胞癌的目的的相关报道。
本领域目前需要提供新的原发性肝细胞癌的诊断尤其是早期诊断的检测产品以及防治药物。
发明内容
本发明所要解决的技术问题是目前原发性肝细胞癌难以诊断尤其是难以早期诊断和防治
本发明解决技术问题的技术方案是针对上述不足,提供一种可以早期诊断原发性肝细胞癌疾病的诊断试剂。
其中,上述的可检测人磷酸甘油酸变位酶1基因的转录水平的试剂包括能特异扩增人磷酸甘油酸变位酶1基因的mRNA的PCR引物。
进一步的,上述能特异扩增人磷酸甘油酸变位酶1基因的mRNA的PCR引物为如下引物对:
正义链:SEQ ID NO.1 5’-GCACCCACTCCCTTCATACAAT-3’;
反义链:SEQ ID NO.2 5’-ACGCAGGTTACATTCGTCTTCC-3’。
其中,上述可检测人磷酸甘油酸变位酶1基因的翻译水平的试剂也可以包括人磷酸甘油酸变位酶1的多克隆抗体或单克隆抗体。使用时,这些多克隆抗体或单克隆抗体上最好耦联有标记物,所述的标记物可为同位素标记物或荧光标记物。
本发明同时提供了能检测人磷酸甘油酸变位酶1基因表达水平的试剂在制备原发性肝细胞癌检测试剂盒或生物芯片中的用途。
本发明还提供了一种可以早期诊断原发性肝细胞癌的诊断试剂盒或生物芯片。该原发性肝细胞癌诊断试剂盒或生物芯片含有上述的诊断试剂。
本发明还提供了能降低人磷酸甘油酸变位酶1基因的表达水平的药物在制备防治原发性肝细胞癌的药物组合物中的用途。
本发明的第二个目的是提供一种用于治疗原发性肝细胞癌的药物,该药物能降低人磷酸甘油酸变位酶1基因的转录水平或翻译水平。
进一步的,上述能降低人磷酸甘油酸变位酶1基因的转录水平或翻译水平的药物可以是化学药、中药、化学药物组合物、中药组合物或生物制品中至少一种。
进一步的,上述的生物制品是针对人磷酸甘油酸变位酶1的shRNA分子(发夹状RNA分子)或能表达人磷酸甘油酸变位酶1的shRNA分子的载体。
其中,上述的人磷酸甘油酸变位酶1的shRNA分子具有SEQ ID NO.7所述的核苷酸序列:
5’-GGUGAAGAUCUGGAGGCGCUUCAAGAGAGCGCCUCCAGAUCUUCACC-3’。
其中,能表达上述shRNA分子的载体包括下述核苷酸序列:
SEQ ID NO.5所示的正义链:
5’-CACCGGTGAAGATCTGGAGGCGCTTCAAGAGAGCGCCTCCAGATCTTCACCTTTTTTG-3’;
SEQ ID NO.6所示的反义链:
5’-GATCCAAAAAAGGTGAAGATCTGGAGGCGCTCTCTTGAAGCGCCTCCAGATCTTCACC-3’。
本发明的第三个目的是提供一种筛选治疗原发性肝细胞癌的药物的方法,该方法包括以下步骤:
a、建立原发性肝细胞癌的细胞模型或动物模型的模型组,并设立正常对照组;
b、用待筛选药物按剂量梯度作用于模型组,然后检测其中人磷酸甘油酸变位酶1基因的转录水平或翻译水平;
c、将检测结果与正常对照组进行比较,能使模型组中人磷酸甘油酸变位酶1基因的转录水平或翻译水平显著趋近正常对照组的待筛选药物即被筛中。
本发明各技术方案的建立是主要基于对原发性肝细胞癌发生发展相关蛋白的开创性研究,采用SILAC技术同位素标记人肝癌细胞株HepG2,然后与人正常肝细胞株L02按照蛋白量1∶1混合,接着SDS-PAGE电泳分离总蛋白,切取蛋白条带,胶内酶解,再通过质谱分析鉴定出原发性肝细胞癌相关蛋白候选分子。共筛选出63个差异蛋白,其中51个在癌组织中上调,12个下调。对鉴定出的差异蛋白进行了功能分析和归类,并首次确定人磷酸甘油酸变位酶1为原发性肝细胞癌相关蛋白候选分子。
本发明还进一步应用免疫组织化学技术研究人磷酸甘油酸变位酶1在原发性肝细胞癌中的表达,功能研究提示与原发性肝细胞癌密切相关的人磷酸甘油酸变位酶1能应用于临床诊断、预后判断及药物开发中。
正是在上述大量的开创性研究的基础上,发明了将上述人磷酸甘油酸变位酶1基因的转录水平或翻译水平作为检测目标的原发性肝细胞癌诊断试剂及试剂盒;同时也发明了以上述人磷酸甘油酸变位酶1基因的转录水平或翻译水平作为靶标的筛选治疗原发性肝细胞癌药物的方法;还发明了能通过降低人磷酸甘油酸变位酶1基因的表达水平防治原发性肝细胞癌的药物,比如人磷酸甘油酸变位酶1的shRNA分子和能表达人磷酸甘油酸变位酶1的shRNA分子的质粒。
本发明有益效果在于:本发明原发性肝细胞癌诊断试剂可以在早期有效诊断原发性肝细胞癌疾病,大大提高了患者的生存率;本发明原发性肝细胞癌诊断试剂只需要少量肝组织即可进行有效诊断;本发明原发性肝细胞癌诊断试剂能反映患者的肝细胞癌的分化情况,有利于医生选择适合的药物及方法对患者进行针对性治疗。本发明防治原发性肝细胞癌疾病的药物,尤其是人磷酸甘油酸变位酶1的shRNA分子、能表达人磷酸甘油酸变位酶1的shRNA分子的载体等药物可以有效防治原发性肝细胞癌,为临床原发性肝细胞癌疾病用药提供了一种新的选择。本发明筛选防治原发性肝细胞癌疾病的药物的方法,为寻找防治原发性肝细胞癌疾病的药物提供了一种新的途径,具有广阔的应用前景。
附图说明
图1是构建的shRNA质粒结构图。
图2是裸鼠肿瘤体积测量结果图,纵坐标为肿瘤体积,横坐标为治疗天数。
图3是人磷酸甘油酸变位酶1干扰效率图。
图4是免疫组化分析结果图,是Ki-67在肿瘤组织中的表达结果,纵坐标为Ki-67表达阳性细胞百分率。
图5是TUNEL检测结果图,纵坐标为TUNEL表达阳性细胞百分率;
图6为TUNEL检测的结果图片。
具体实施方式
下面结合附图通过具体实施方式对本发明做进一步的描述,并不因此将本发明仅限制在所述的实施例范围之中。
实施例一人磷酸甘油酸变位酶1与原发性肝细胞癌发生发展关系的初步确定
1.细胞来源及培养条件
人肝癌细胞株HepG2购买自ATCC(美国标准菌种收藏所,American Type CultureCollection),而人正常肝细胞株L02购买自中国细胞培养中心(China Cell CultureCenter)。
HepG2在DMEM培养,其中,在DMEM中补加10%胎牛血清、107U/L青霉素和10mg/L链霉素,而L02在RPMI 1640培养。培养条件均为37℃,5%CO2浓度。
2.试剂来源
细胞培养稳定同位素标记技术(SILAC)相关试剂:胎牛血清购自Hyclone公司;
SDS-PAGE相关试剂:DC蛋白测定试剂盒购自Bio-Rad公司;考马斯亮蓝R-250购自Merck公司;
酶解及质谱分析相关试剂:胰蛋白酶Trypsin Gold购自Promega公司;乙腈(ACN),三氟乙酸(TFA),碳酸氢胺,甲酸均为色谱纯级,购自Sigma公司;基质α-氰基-4-羟基肉桂酸(CHCA)购自Sigma公司。
3.方法
3.1细胞培养稳定同位素标记技术(SILAC)
HepG2培养于含有稳定同位素标记的L-赖氨酸(13C6 15N4)的SILAC培养基。SILAC培养基即以不含L-赖氨酸的DMEM为基础,补加10%胎牛血清、107U/L青霉素、10mg/L链霉素和100mg/L稳定同位素标记的L-赖氨酸(13C6 15N4)(纯度:98%)形成的培养基。当标记的L-赖氨酸完全掺入到蛋白质中时,收集细胞,生理盐水洗涤3次,-80℃保存。
L02培养于常规的RPMI 1640,也收集细胞,生理盐水洗涤3次,-80℃保存。
3.2 SDS-PAGE电泳
分别向HepG2和L02加入适当体积的RIPA裂解液裂解细胞,涡旋混匀4~15min,冰浴下超声数次,使裂解液清亮,14000rpm,4℃,15min,取上清。DC蛋白测定试剂盒测定蛋白浓度后,HepG2和L02按照蛋白量1∶1的比例混合。
制备浓度分别为12%和5%的SDS-PAGE分离胶和浓缩胶(表1)。然后在样品中加入1/4体积5×SDS上样缓冲液,100℃,5min,接着13000rpm,5min,取上清。每孔蛋白上样量为60μg,并加上未染蛋白Marker。电泳时起始电压80V,待溴酚蓝进入分离胶后,调整为120V,至溴酚蓝到达距离底部边缘1cm时停止电泳。取出凝胶,考马斯亮蓝R-250染色。
表1  5%浓缩胶与12%分离胶配制方法
5%浓缩胶 体积(ml) 12%分离胶   体积(ml)
  水   2.1   水   1.6
  30%丙烯酰胺溶液   0.5   30%丙烯酰胺溶液   2
  1.5mol/L Tris(pH 6.8)   0.38   1.5 M Tris(pH 8.8)   1.3
  10%SDS   0.03   10%SDS   0.05
  10%过硫酸氨   0.03   10%过硫酸氨   0.05
  TEMED   0.003   TEMED   0.002
  Total   3   Total   5
3.3胶内酶解
(1)双蒸水洗胶2-3次,以除去残留的乙醇和乙酸;
(2)用刀片将蛋白条带切成1mm3大小的胶粒,盛于0.6ml EP管中;
(3)脱色:加入100ul 100mM NH4HCO3/50%ACN,37℃摇床脱色45分钟,去上清,重复2次,直到胶粒完全脱色;
(4)脱水:加100ul ACN,10分钟后吸出ACN,真空干燥胶粒;
(5)酶解:每管加12.5ng/ul的胰酶10-20ul,4℃放置1小时,然后吸去多余胰酶,加入15ul的40mM NH4HCO3/10%ACN覆盖胶粒,37℃酶解过夜;
(6)提肽:将酶液转移到新EP管中,胶粒中加入50-80ul 50%ACN/5%TFA,20℃,功率70%,超声15min,然后短暂离心,合并上清;再加入20-50ul 50%ACN/5%TFA,重复1次,合并上清;
(7)干燥:提肽液室温真空干燥成5ul。
3.4 LC-MS/MS进行蛋白鉴定和定量
胰蛋白酶消化得到的多个肽段通过液相色谱(LC)而得到分离。分离肽段进入一级质谱,离子源将分子转化成离子,均带上2个正电荷,然后经过电磁场分离,获得肽段的质荷比(m/z)谱,即肽质量指纹谱。从一级质谱产生的肽段中选择丰度在前十位的母离子,进入二级质谱,经惰性气体碰撞后肽段沿肽链断裂,由所得到的各肽段质量数差值推定肽段序列。
4.结果及分析
质谱数据解谱使用ProteinLynx 2.2.5软件,从原始的MS/MS谱中产生PKL格式的数据文件,在Mascot检索系统(http://www.matrixscience.com)内以Swiss-Prot为数据库进行检索。每次检索时,根据输入的PKL数据,数据库将根据其与库内储存数据进行匹配,得到若干候选蛋白分子,并根据MOWSE得分多少排序,并产生一个及格线。最高分超过及格线者认为检索结果有意义,未达及格线则认为检索无结果。得分高低表示匹配性高低,即可能性的大小。理想的检索结果应为第一候选蛋白得分较高,其他候选蛋白得分较低(低于及格线),二者分数相差较大,并且该蛋白肽段匹配数目较多,氨基酸序列覆盖率较高,则该检索结果可靠性较高。
检索出全部候选蛋白之后,使用MassLynx V4.0软件计算在HepG2与L02中表达差异在2倍以上的蛋白。
根据上述方法,鉴定出63个差异蛋白,其中,在癌细胞中上调51个,下调12个。这63个差异蛋白的生物功能分布情况如下:代谢34.9%,信号转导12.7%,结构成分7.9%,其他44.5%。
对癌相关蛋白进行后续验证的候选分子的选择,按以下标准:
〔1〕在人肝癌细胞株HepG2与人正常肝细胞株L02之间差异显著,MassLynx V4.0分析软件计算表达差异应在2倍以上;
〔2〕在人肝癌细胞株HepG2与人正常肝细胞株L02中,分别表达恒定,且表达量较高;
〔3〕差异重复性好,重复至少应在4次以上;
〔4〕质谱检测信号强,信噪比高;
〔5〕信息学检索,MOWSE得分较高,可靠性理想;
〔6〕功能检索提示该蛋白应具有较重要生理功能,且目前在癌症研究领域文献报道较少,与原发性肝细胞癌的基础研究与临床实践尚无确切联系。则该蛋白与原发性肝细胞癌的相关性具有一定临床意义。
根据以上标准,在63个鉴定出的差异蛋白中,确定人磷酸甘油酸变位酶1(PGAM1)作为癌相关蛋白候选分子。该蛋白在肝癌细胞与正常肝细胞中表达恒定,差异明显,二者表达差异为6倍;质谱鉴定结果理想,匹配肽段8个,氨基酸序列覆盖率38%,MOWSE得分172;该蛋白序列含氨基酸254个,序列覆盖率为38%,匹配4个肽段,分别为第66-83、163-176、181-191、196-251位氨基酸。
实施例二人磷酸甘油酸变位酶1为原发性肝细胞癌发生发展相关蛋白的验证
采用RT-PCR和Western Blot方法对人磷酸甘油酸变位酶1在原发性肝细胞癌与正常肝组织间的表达差异在转录水平和翻译水平进行验证。
1.原发性肝细胞癌及正常肝组织标本来源
本实施例选用的54例原发性肝细胞癌组织标本于2007年4月~6月采集自四川大学华西医院肝胆外科接受手术治疗的原发性肝细胞癌患者。患者年龄分布在34~66岁之间,平均年龄为44.8±8.5岁,所有患者术前未经化疗、放疗,术后病理诊断明确,临床资料齐备。21例正常肝组织标本于同期采集自该院接受手术治疗的肝囊肿或肝内胆管结石患者,患者年龄分布在39~57岁,平均年龄为45.4±5.7岁。所有患者临床资料齐备。54例癌组织标本均为原发性肝细胞癌,其中高分化11例,中分化28例,低分化15例;手术病理分期为I期14例,II期21例,III期9例,IV期10例。肝细胞癌分期参照UICC(国际抗癌联合会)2002年第六版的标准,病理组织学分级参照Edmondson Steiner分级标准。
组织标本切下后,PBS液反复清洗,去除血污及坏死组织,滤纸吸干,切为0.5cm直径大小组织块,以冻存管分装,标记,迅速保存于液氮备用。
2.试剂来源
RT-PCR相关试剂:Trizol Reagent购自Invitrogen公司;Oligo(dT)、MgCl2、dNTPmix、RNase Inhibitor、AMV-Optimized Taq、AMV RTase XL等购自TaKaRa公司。
Western Blot相关试剂:羊抗人磷酸甘油酸变位酶1单克隆抗体购自Abcam公司;小鼠抗人β-actin单克隆抗体购自Santa Cruz公司;辣根过氧化物酶(HRP)标记兔抗羊IgG与羊抗小鼠IgG(二抗)购自北京中衫金桥生物技术有限公司;蛋白质预染Marker购自MBI公司;PVDF膜购自Amersham Biosciences公司;Tween-20购自北京中衫金桥生物技术有限公司。
3.转录水平人磷酸甘油酸变位酶1的表达差异验证
3.1 RT-PCR引物序列设计与合成
设计RT-PCR引物,并送英骏(Invitrogen)生物技术有限公司合成,具体见表2(其中,GAPDH为看家基因,其作为内参,确保上样量一致)。
表2 RT-PCR引物序列及产物片段大小
Figure A20091030448300111
3.2组织总RNA提取(Trizol法)
从液氮中取出25mg组织样品,迅速于液氮下充分研磨至粉末,置于0.5ml Trizol试剂中,反复吹打以裂解组织细胞,室温下静置5分钟。加入0.1ml氯仿,剧烈振荡,室温下静置2分钟,4℃,12000g离心15分钟。取上层水相,加入0.25ml异丙醇,室温静置10分钟,4℃,12000g离心10分钟。弃上清,加入0.5ml 75%乙醇进行洗涤,涡旋混合,4℃,7500g离心5分钟。弃上清,自然干燥,以RNase-free水溶解RNA。
取少量进行1%琼脂糖电泳鉴定,紫外分光光度计检测浓度、纯度,分装后-80℃保存备用。RNA纯度根据A260nm/A280nm比值判定,比值小于1.6提示有蛋白杂质,1.6-1.8提示含有DNA,在1.8-2.0之间提示RNA纯度较高,无降解、无杂质。
本实施例中提取的RNA的A260nm/A280nm比值为1.93,因此,其纯度较高,无降解、无杂质。
3.3 cDNA第一链的合成
取本实施例3.2提取的总RNA 2μl(1.5μg/μl),经RNase-free DNase消化除去可能存在的痕量DNA后,与1μl Oligo(dT)(0.5μg/μl)混合,加RNase-free水定容至12μl,混匀后65℃水浴5分钟使二级结构变性,立即置冰浴冷却。然后按以下反应体系(表3)45℃逆转录30分钟,95℃5分钟灭活AMV-RTase XL,立即置冰浴冷却。-20℃保存合成的cDNA。
表3 RNA逆转录反应体系
  试剂   体积
  Oligo(dT)   1μl
  10 mM dNTP mix   1μl
  RNase Inhibitor(40U/μl)   0.5μl
  AMV RTase XL(5U/μl)   0.5μl
  5×First Strand Buffer   4μl
  DTT(0.1M)   2μl
  RNA模板   2μl
  RNase-free Water   9μl
  Total   20μl
3.4PCR反应
取上述合成的cDNA 5μl为模板进行PCR扩增。反应体系50μl,如表4;反应条件如表5。
表4PCR反应体系
  试剂   体积
  10×PCR Buffer   5μl
  MgCl2(25mM)   4μl
  AMV-Optimized Taq   1μl
  上游引物(20μM)   1μl
  下游引物(20μM)   1μl
  cDNA   5μl
  dNTP mix(2.5mM)   4μl
  RNase-free Water   29μl
  Total   50μl
表5 PCR反应条件
Figure A20091030448300131
注:退火温度①为人磷酸甘油酸变位酶1;②为GAPDH
3.5图像及结果分析
PCR反应结束后,取部分产物进行1%琼脂糖电泳,紫外光下扫描成像。使用QuantityOne 4.6分析软件对图像进行分析,以扩增产物条带的光密度值(Density),相对于GAPDH反映该基因在RNA水平的表达。如表6所示,54例原发性肝细胞癌组织人磷酸甘油酸变位酶1表达强度平均为113.4±29.7;对应的21例正常肝组织表达强度为24.2±3.6,在癌组织中该基因mRNA表达为正常组织中的4.68倍,有显著性差异(t检验,P<0.01)。结果显示,相对于正常组织,人磷酸甘油酸变位酶1的mRNA在癌组织中为高表达,证明了人磷酸甘油酸变位酶1为原发性肝细胞癌发生发展相关蛋白。
表6 RT-PCR检测人磷酸甘油酸变位酶1mRNA表达
  基因   原发性肝细胞癌   正常肝   T/N   P值*
  人磷酸甘油酸变位酶1 113.4±29.7 24.2±3.6 4.68 P<0.01
注:表达强度以光密度值表示;T:原发性肝细胞癌;N:正常肝;*t检验
4.翻译水平人磷酸甘油酸变位酶1的表达差异验证
4.1组织总蛋白样品制备
从液氮中取出25mg组织样品,迅速于液氮下充分研磨至粉末,置于400ul ModifiedRIPA组织裂解缓冲液,涡旋混匀。冰浴下超声数次,使裂解液清亮,然后14000rpm,4℃,15min,取上清,标记,置-80℃保存,备用。
4.2 SDS-PAGE电泳
制备浓度分别为12%和5%的SDS-PAGE分离胶和浓缩胶(表1)。以提取的组织总蛋白为样品,以结构蛋白β-actin作为内参,上样前用DC蛋白测定试剂盒对样品进行蛋白浓度测定,以确保上样量的一致性。然后在样品中加入1/4体积5×SDS上样缓冲液,100℃,5min,接着13000rpm,5-10min,取上清。每孔蛋白上样量为30μg,并加上预染蛋白Marker。电泳时起始电压80V,待溴酚蓝进入分离胶后,调整为120V,至溴酚蓝到达距离底部边缘1cm时停止电泳,取出凝胶,切角作记号。
4.3转膜
依据胶的大小剪取滤纸6片和PVDF膜1张,将膜浸泡纯甲醇3-5秒,接着将膜、滤纸和凝胶置于转移缓冲液中平衡10min。然后按顺序装配转移三明治:负极->海绵->3层滤纸->胶->膜->3层滤纸->海绵->正极。将三明治置于转移槽内,冰浴下100V,转膜1h。结束后取出杂交膜,切角作记号。
4.4免疫杂交与显色
TBS室温洗膜5min后,置于25ml封闭缓冲液中4℃孵育过夜。分别加入1∶1000稀释的羊抗人磷酸甘油酸变位酶1抗体和1∶500稀释的小鼠抗人β-actin抗体,37℃孵育2h。TBST漂洗3次后,分别加入1∶10000稀释的HRP标记兔抗羊IgG和羊抗小鼠IgG,37℃孵育2h,TBST漂洗3次,再用TBS漂洗1次。
化学发光法检测:将试剂盒中两种溶液按1∶1比例混合,均匀涂抹于膜正面,5min后,曝光,冲洗。
4.5图像及结果分析
将胶片扫描成像后,使用Quantity One 4.6分析软件对图像进行分析,以显色条带的光密度值(Density),相对于β-actin反映该蛋白的表达情况。统计结果显示:与正常肝组织相比,66.7%的原发性肝细胞癌的人磷酸甘油酸变位酶1为高表达。具体结果如表7所示,54例原发性肝细胞癌组织人磷酸甘油酸变位酶1表达强度平均为93.6±3.8;对应的21例正常肝组织表达强度为21.7±3.1,在癌组织中该蛋白表达为正常组织中的4.3倍,有显著性差异(t检验,P<0.01)。此结果与RT-PCR结果所示的差异趋势一致,在翻译水平上证明了人磷酸甘油酸变位酶1为原发性肝细胞癌发生发展相关蛋白。
表7 Western Blot检测人磷酸甘油酸变位酶1蛋白表达
  蛋白分子   原发性肝细胞癌   正常肝   T/N   P值*
  人磷酸甘油酸变位酶1 93.6±3.8 21.7±3.1 4.3 P<0.01
注:表达强度以光密度值表示;T:原发性肝细胞癌;N:正常肝;*t检验
实施例三免疫组化分析人磷酸甘油酸变位酶1在原发性肝细胞癌与正常肝组织上的表达
1.组织样品来源
石蜡标本来自四川大学华西医院肝胆外科。54例原发性肝细胞癌组织标本和21例正常肝组织标本相关情况已在实施例二叙述。
2.试剂来源
EnVision+辣根过氧化物酶(HRP)免疫组化染色系统购自德国汉堡的Dako CytomationGmbH公司,其中包括过氧化物酶封闭液(Peroxidase Block)、辣根过氧化物酶标记多聚物结合羊抗兔IgG(Labelled Polymer-HRP ANTI RABBIT)、底物缓冲液(Substrate Buffer)、DAB染色液(DAB+Chromogen)。山羊抗人磷酸甘油酸变位酶1抗体购自Abcam公司。
3.方法
3.1组织处理
取新鲜组织厚度不超过5mm,10%中性福尔马林固定24小时以上,冲水12-24小时后,梯度酒精(75%->85%->95%->100%)脱水,再二甲苯处理,石蜡浸泡,最后石蜡包埋。
3.2组织切片
石蜡组织块做3-4μm连续切片5张,裱于APES预处理的载玻片上,65℃烤片2小时,置4℃长期保存。每例标本均取一张切片进行常规HE染色。
3.3免疫组化染色
(1)60℃烤片2小时,二甲苯脱蜡两次,每次10分钟;
(2)梯度酒精水化:100%->95%->85%->75%,每次2分钟,蒸馏水洗涤两次,每次5分钟;
(3)抗原修复:柠檬酸钠缓冲液淹没切片,高压锅内煮沸,上汽3分钟后缓慢冷却,然后PBS洗涤两次,每次5分钟;
(4)3%过氧化氢室温避光封闭10分钟,然后PBS洗涤2次,每次5分钟;
(5)正常血清封闭:滴加正常兔血清,37℃,20分钟;
(6)孵育一抗:滴加1∶150稀释的山羊抗人磷酸甘油酸变位酶1抗体,置湿盒中4℃孵育过夜,然后PBS漂洗15分钟;
(7)孵育二抗:滴加辣根过氧化物酶标记的兔抗山羊的抗体,置湿盒中37℃孵育40分钟。PBS洗涤2次,每次5分钟;
(8)DAB显色:滴加新配置DAB显色液,镜下控制显色(5-10分钟),适时终止,然后自来水充分冲洗;
(9)苏木素复染:室温,30秒,自来水冲洗返蓝15分钟;
(10)梯度酒精脱水:85%,2分钟->95%,2分钟->100%,2次,5分钟,然后二甲苯透明,两次,每次5分钟,最后中性树胶封片。
每批实验均设立阴性对照,以PBS代替一抗为阴性对照。
4.图像分析与结果判定
人磷酸甘油酸变位酶1免疫组化阳性染色主要表现为显微镜下细胞浆内出现棕黄色颗粒沉着。使用ECLIPSE E600图像采集系统采集图像,采用半定量综合积分法进行结果判定。
半定量综合积分法:按细胞显色有无及深浅计分:0分为无色,1分为浅黄色,2分为棕黄色,3分为棕褐色;按显色细胞所占比例计分:0分<5%,1分5-25%,2分26-50%,3分51-75%,4分>76%。两者乘积即为该切片积分,0分为阴性(-),1-3分为弱阳性(+),4-7分为阳性(++),8-12分为强阳性(+++)。所有切片均为盲法判定。
从图像分析结果可以看出,人磷酸甘油酸变位酶1在正常肝组织表达较弱,在原发性肝细胞癌组织中则表达较强,且主要为胞浆表达。根据半定量综合积分法,该蛋白在正常肝组织表达阴性(-)为19%(4/21),弱阳性(+)为81%(17/21),阳性(++)和强阳性(+++)均为0例;在原发性肝细胞癌组织表达阴性(-)为0例,弱阳性表达为33%(18/54),阳性为26%(14/54),强阳性为41%(22/54)(表8),二者表达有显著性差异(P<0.01)。正常肝组织积分总分为48,平均分2.29±1.02;原发性肝细胞癌组织为428,平均分7.93±2.58,二者表达有显著性差异(P<0.01)。此结果显示该蛋白在原发性肝细胞癌组织中表达显著高于正常肝组织,与实施例二的结果一致。
表8人磷酸甘油酸变位酶1在正常肝与原发性肝细胞癌癌组织中的表达
  例数   -   +   ++   +++a   总分   平均分a
  N   21   19%(4/21)   81%(17/21)   0   0   48   2.29±1.02
  T   54   0   33%(18/54)   26%(14/54)   41%(22/54)   428   7.93±2.58
注:T:原发性肝细胞癌;N:正常肝;at检验,P<0.01。
5.人磷酸甘油酸变位酶1与肝细胞癌病理组织学分级关系的分析
54例原发性肝细胞癌标本中,参照Edmondson Steiner分级标准,高分化11例,中分化28例,低分化15例。根据半定量综合积分法,该蛋白在高分化肝细胞癌组织表达阴性为0,弱阳性为73%(8/11),阳性为18%(2/11),强阳性为9%(1/11),积分总分为63,平均分5.73±2.46;中分化肝细胞癌组织表达阴性为0,弱阳性为36%(10/28),阳性为39%(11/28)、强阳性为25%(7/28),积分总分为217,平均分7.75±2.68;低分化肝细胞癌组织表达阴性和弱阳性均为0,阳性为7%(1/15)、强阳性为93%(14/15),积分总分为148,平均分9.87±3.17(表9)。
表9人磷酸甘油酸变位酶1与肝细胞癌病理组织学分级关系
  分级   例数   -   +   ++   +++a   总分   平均分b
  高分化   11   0   73%(8/11)   18%(2/11)   9%(1/11)   63   5.73±2.46
  中分化   28   0   36%(10/28)   39%(11/28)   25%(7/28)   217   7.75±2.68
  低分化   15   0   0   7%(1/15)   93%(14/15)   148   9.87±3.17
注:a列联表x2检验,P<0.01;b单向方差分析,P<0.05;LSD-t检验,P<0.01(高与中;高与低;中与低);0分为(-),1-3分为(+),4-7分为(++),8-12分为(+++)。
统计分析显示随组织分化程度降低,该蛋白的表达有升高趋势,故认为人磷酸甘油酸变位酶1的表达与病理组织学分级具有关联性(列联表x2检验,P<0.01)。积分统计也显示高分化组与中分化组,高分化组与低分化组,中分化组与低分化组表达均有显著差异(LSD-t检验,P<0.01)。
实施例四本发明原发性肝细胞癌诊断试剂、诊断试剂盒及生物芯片的制备及检测效果
在实施例一和实施例二创造性地确定了人磷酸甘油酸变位酶1与原发性肝细胞癌的关系后,将耦联有标记物的人磷酸甘油酸变位酶1蛋白的多克隆抗体或单克隆抗体或者能特异扩增人磷酸甘油酸变位酶1基因的mRNA的PCR引物作为主要原料即可制得到本发明原发性肝细胞癌诊断试剂、诊断试剂盒及生物芯片。
用实施例二的引物对(SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2所示序列)和RT-PCR所需的其他常规试剂体系制得本发明原发性肝细胞癌诊断试剂盒。使用该试剂盒并用实施例二的方法检测受试人的肝组织细胞中人磷酸甘油酸变位酶1基因的转录水平,如果受试人的肝组织细胞中的人磷酸甘油酸变位酶1基因的转录水平比正常水平明显偏高,则病受试人很可能已患有原发性肝细胞癌疾病;通过比较免疫组化染色强度(与表9中数据比较),即可初步判断患者原发性肝细胞癌分化阶段,即高、中、低分化。
实施例五本发明防治原发性肝细胞癌的药物的制备及筛选
本实施例以特异性针对人磷酸甘油酸变位酶1的shRNA的表达质粒作为待制备和筛选的防治原发性肝细胞癌的药物。
短发夹shRNA的表达质粒构建
根据人磷酸甘油酸变位酶1(PGAM1基因序列见SEQ ID NO.8,编码区为39-803bp,其编码的氨基酸序列见SEQ ID NO.9)的cDNA序列,设计特异性针对PGAM1序列370-389bp的短发夹shRNA序列,如下所示:
正义链(SEQ ID NO.5):
5’-
Figure A20091030448300181
GTGAAGATCTGGAGGCGCTTCAAGAGAGCGCCTCCAGATCTTCACCTTTTTT-3’
反义链(SEQ ID NO.6):
3’-CACTTCTAGACCTCCGCGAAGTTCTCTCGCGGAGGTCTAGAAGTGGAAAAAA
Figure A20091030448300184
-5’
序列结构:
Figure A20091030448300185
+正义链+发夹环+反义链+终止信号+
Figure A20091030448300186
以TTCAAGAGA为发夹环,TTTTTT为转录终止信号。无序序列GTT CTC CGA ACG TGT CACGT为阴性对照(NC)。
含卡那霉素耐药基因的pGPU6/GFP/Neo质粒通过Bbs I和BamH I双酶切线性化,在T4 DNA连接酶的催化下,与退火形成的寡核苷酸双链连接。连接产物转化感受态细胞DH5α,并挑选阳性克隆,按标准方法扩增质粒载体,并分别用BamH I和Pst I酶切鉴定。阳性重组载体能被BamH I切开,而不能被Pst I切开。收集酶切鉴定正确的重组质粒进行测序,结果表明构建成功,获得了PGAM1-shRNA表达载体(质粒结构如图1所示;上海吉玛制药技术有限公司提供)。构建的该表达载体所表达的人磷酸甘油酸变位酶1的shRNA分子具有SEQ ID NO.7所述的核苷酸序列:
5’-GGUGAAGAUCUGGAGGCGCUUCAAGAGAGCGCCUCCAGAUCUUCACC-3’。
2.动物模型建立、药物筛选与药效确认
每只健康雌性BALB/C裸鼠(由四川大学华西医院生物治疗国家重点实验室提供,裸鼠年龄:6-8周;未生育;重量:18-20克)右肋下注射含有2×106HepG2细胞的100μl PBS悬液。几天后,当瘤体直径达到0.6cm左右时,裸鼠随机分为4组,每组5只。
未处理组(PBS):PBS 100μl;
脂质体组(Lipo):脂质体Lipofectamine 2000 12.5μg/100μl PBS;
阴性对照组(NC):无序载体5μg/100μl PBS;
PGAM1-shRNA组(PGAM-shRNA):PGAM1-shRNA载体5μg/100μl PBS。
质粒与脂质体比例为1∶2.5。以上处理均为尾静脉注射,每2天一次。第10次注射后2天处死裸鼠。治疗的副作用,如体重,食欲和行为等也同时记录。
2.1肿瘤体积测量与组织学分析
肿瘤体积在接种后每2天测量一次直至裸鼠被处死,按以下公式计算:0.52×最长径×最短径2。剥离的肿瘤以中性福尔马林固定,石蜡包埋,并切片进行HE染色,在显微镜下观察进行组织学检测。
结果:当对裸鼠进行了10次注射后处死裸鼠,瘤体被剥离称重。虽然各组肿瘤初始体积相同,但经过治疗后,各组肿瘤体积生长产生了明显差异,如图2所示。虽然PGAM shRNA没有实现对肿瘤的完全抑制,但是与其他各组相比,其肿瘤生长得到了显著抑制。PBS组,脂质体组和阴性对照组,平均体积分别为505.65±40.14,405.58±40.23,350.2315±34.16mm3。而PGAM1-shRNA处理组体积仅为212.71±24.28mm3,较其他各组减少40-58%(P<0.05)。对肿瘤进行免疫组化分析也证实,在PGAM1-shRNA组PGAM1的表达显著下降,与各对照组相比,处理组PGAM1表达下降75%以上(P<0.01),如图3所示。
2.2免疫组化分析
为检测细胞的增殖,进行了Ki-67的免疫组化分析。试验分组及处理同前,抗体采用羊抗人Ki-67抗体。结果分析方法:在5个随机视野中,计算核阳性细胞的百分比。为检测细胞的凋亡,还进行了TUNEL实验,试验分组及处理同前,TUNEL试验采用常规方法。
结果:如图4所示,PBS组,脂质体组和阴性对照组中Ki-67表达阳性细胞百分率分别为85.7±7.6,84.2±6.7,80.1±6.4;而sPGAM1-shRNA处理组则为27.5±6.4(P<0.01)。表明PGAM1-shRNA处理引起显著的细胞增殖抑制。
在TUNEL检测中(计数结果见图5,染色照片见图6),PBS组,脂质体组和阴性对照组中TUNEL阳性细胞百分率分别为4.6±1.9,7.1±3.4,11.4±5.8。而PGAM1-shRNA处理组则为52.2±8.7(P<0.01),显著高于其他各组。此外,在PBS组,脂质体组和阴性对照组之间,细胞凋亡未发现明显差异,提示脂质体与阴性对照载体对肿瘤生长无显著影响。说明本发明PGAM1-shRNA能够显著地引发肿瘤细胞调亡。
为判断以上处理是否有潜在的毒副作用,治疗期间观察了裸鼠可能的毒性反应,在体重,食欲和行为等方面,均未发现显著异常。对裸鼠肝,肾,心脏,肺等器官的石蜡切片进行组织学观察,也未见病理学改变。这些结果显示通过shRNA抑制PGAM1表达,可显著抑制体内肿瘤细胞增殖与促进细胞凋亡,并导致肿瘤生长抑制,没有明显毒副作用,即本发明能表达人磷酸甘油酸变位酶1的shRNA分子的载体可以有效治疗原发性肝细胞癌疾病。而本发明筛选防治原发性肝细胞癌药物的方法也是能有效筛选防治原发性肝细胞癌疾病的药物。
SEQUENCE LISTING
<110>四川大学
<120>原发性肝细胞癌诊断试剂、试剂盒及防治药物
<130>A090221k
<160>9
<170>PatentIn version 3.4
<210>1
<211>22
<212>DNA
<213>artificial
<220>
<223>artificial
<400>1
gcacccactc ccttcataca at                                         22
<210>2
<211>22
<212>DNA
<213>artificial
<220>
<223>artificial
<400>2
acgcaggtta cattcgtctt cc                                         22
<210>3
<211>20
<212>DNA
<213>artificial
<220>
<223>artificial
<400>3
accacagtcc atgccatcac                                            20
<210>4
<211>20
<212>DNA
<213>artificial
<220>
<223>artificial
<400>4
tccaccaccc tgttgctgta                                            20
<210>5
<211>58
<212>DNA
<213>artificial
<220>
<223>artificial
<400>5
caccggtgaa gatctggagg cgcttcaaga gagcgcctcc agatcttcac cttttttg  58
<210>6
<211>58
<212>DNA
<213>artificial
<220>
<223>artificial
<400>6
gatccaaaaa aggtgaagat ctggaggcgc tctcttgaag cgcctccaga tcttcacc  58
<210>7
<211>47
<212>RNA
<213>artificial
<220>
<223>artificial
<400>7
ggugaagauc uggaggcgcu ucaagagagc gccuccagau cuucacc              47
<210>8
<211>1762
<212>DNA
<213>Homo sapiens
<220>
<221>CDS
<222>(39)..(803)
<400>8
gctaatccca gtcggtgccg catccccagc ccgccgcc atg gcc gcc tac aaa ctg   56
                                  Met Ala Ala Tyr Lys Leu
                                          1               5
gtg ctg atc cgg cac ggc gag agc gca tgg aac ctg gag aac cgc ttc    104
Val Leu Ile Arg His Gly Glu Ser Ala Trp Asn Leu Glu Asn Arg Phe
            10                  15                  20
agc ggc tgg tac gac gcc gac ctg agc ccg gcg ggc cac gag gag gcg    152
Ser Gly Trp Tyr Asp Ala Asp Leu Ser Pro Ala Gly His Glu Glu Ala
        25                  30                  35
aag cgc ggc ggg cag gcg cta cga gat gct ggc tat gag ttt gac atc    200
Lys Arg Gly Gly Gln Ala Leu Arg Asp Ala Gly Tyr Glu Phe Asp Ile
    40                  45                  50
tgc ttc acc tca gtg cag aag aga gcg atc cgg acc ctc tgg aca gtg    248
Cys Phe Thr Ser Val Gln Lys Arg Ala Ile Arg Thr Leu Trp Thr Val
55                  60                  65                  70
cta gat gcc att gat cag atg tgg ctg cca gtg gtg agg act tgg cgc    296
Leu Asp Ala Ile Asp Gln Met Trp Leu Pro Val Val Arg Thr Trp Arg
                75                  80                  85
ctc aat gag cgg cac tat ggg ggt cta acc ggt ctc aat aaa gca gaa    344
Leu Asn Glu Arg His Tyr Gly Gly Leu Thr Gly Leu Asn Lys Ala Glu
            90                  95                 100
act gct gca aag cat ggt gag gcc cag gtg aag atc tgg agg cgc tcc    392
Thr Ala Ala Lys His Gly Glu Ala Gln Val Lys Ile Trp Arg Arg Ser
        105                 110                 115
tat gat gtc cca cca cct ccg atg gag ccc gac cat cct ttc tac agc    440
Tyr Asp Val Pro Pro Pro Pro Met Glu Pro Asp His Pro Phe Tyr Ser
    120                 125                 130
aac atc agt aag gat cgc agg tat gca gac ctc aca gaa gat cag cta    488
Asn Ile Ser Lys Asp Arg Arg Tyr Ala Asp Leu Thr Glu Asp Gln Leu
135                 140                 145                 150
ccc tcc tgt gag agt ctg aag gat act att gcc aga gct ctg ccc ttc    536
Pro Ser Cys Glu Ser Leu Lys Asp Thr Ile Ala Arg Ala Leu Pro Phe
                155                 160                 165
tgg aat gaa gaa ata gtt ccc cag atc aag gag ggg aaa cgt gta ctg    584
Trp Asn Glu Glu Ile Val Pro Gln Ile Lys Glu Gly Lys Arg Val Leu
            170                 175                 180
att gca gcc cat ggc aac agc ctc cgg ggc att gtc aag cat ctg gag    632
Ile Ala Ala His Gly Asn Ser Leu Arg Gly Ile Val Lys His Leu Glu
        185                 190                 195
ggt ctc tct gaa gag gct atc atg gag ctg aac ctg ccg act ggt att    680
Gly Leu Ser Glu Glu Ala Ile Met Glu Leu Asn Leu Pro Thr Gly Ile
    200                 205                 210
ccc att gtc tat gaa ttg gac aag aac ttg aag cct atc aag ccc atg    728
Pro Ile Val Tyr Glu Leu Asp Lys Asn Leu Lys Pro Ile Lys Pro Met
215                 220                 225                 230
cag ttt ctg ggg gat gaa gag acg gtg cgc aaa gcc atg gaa gct gtg    776
Gln Phe Leu Gly Asp Glu Glu Thr Val Arg Lys Ala Met Glu Ala Val
                235                 240                 245
gct gcc cag ggc aag gcc aag aag tga aggccggcgg ggaggatact          823
Ala Ala Gln Gly Lys Ala Lys Lys
            250
gtccccagga gcaccctccc tgcccgtctt gtccctctgc ccctcccacc tgcacatgtc  883
acactgacca catctgtaga catcttgagt tgtagctgca gacggggacc agtggctccc  943
attttcattt tagccatttt gtcgcctgca cccactccct tcatacaatc tagtcagaat 1003
agcagttcta gagcacaggt tctcagtcta agctatggaa aagctcccct tatccaacag 1063
agtttaaaag tagtgacttg ggtttttgcg agtgctttgt ttactaagga ctttggggag 1123
gaaccatgct aagccatgac cagtgaggag aagcaacaga gcctgtctgt ccccatgagc 1183
ggagtctgtc ctctgctctt ctgcagtcag gtcactgcct actgcctggg ggctctagtc 1243
attccagtgg aagacgaatg taacctgcgt ggtgatgtga caactgtttc ctccctgacc 1303
ccagaggatc tggctctagg ttgggatcaa tcctgaattt cgttatgtgt taatttactt 1363
ttattaaaaa agtatagtat atataataca aaacaataac ccttctgggg tttcttgtgg 1423
cggttgaaat agtcccacat gtggtcatca gaaaataagc cattcctcat accaatatag 1483
gatcagctcc ttgacctctg aggggcagga gtgcttcctg gtgtgtgtat tagaatccct 1543
tcctgccttg tttcatggca gtgaaatgcc tcttggtcct gtccaagtgt atctttcact 1603
gatttctgaa tcatgttcta gttgcttgac cctgccacat gggtccagtg ttcatctgag 1663
cataactgta ctaaatcctt tttccatatc agtataataa aggagtgatg tgcaataaaa 1723
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaa                        1762
<210>9
<211>254
<212>PRT
<213>Homo sapiens
<400>9
Met Ala Ala Tyr Lys Leu Val Leu Ile Arg His Gly Glu Ser Ala Trp
1               5                   10                  15
Asn Leu Glu Asn Arg Phe Ser Gly Trp Tyr Asp Ala Asp Leu Ser Pro
            20                  25                  30
Ala Gly His Glu Glu Ala Lys Arg Gly Gly Gln Ala Leu Arg Asp Ala
        35                  40                  45
Gly Tyr Glu Phe Asp Ile Cys Phe Thr Ser Val Gln Lys Arg Ala Ile
    50                  55                  60
Arg Thr Leu Trp Thr Val Leu Asp Ala Ile Asp Gln Met Trp Leu Pro
65                  70                  75                  80
Val Val Arg Thr Trp Arg Leu Asn Glu Arg His Tyr Gly Gly Leu Thr
                85                  90                  95
Gly Leu Asn Lys Ala Glu Thr Ala Ala Lys His Gly Glu Ala Gln Val
            100                 105                 110
Lys Ile Trp Arg Arg Ser Tyr Asp Val Pro Pro Pro Pro Met Glu Pro
        115                 120                 125
Asp His Pro Phe Tyr Ser Asn Ile Ser Lys Asp Arg Arg Tyr Ala Asp
    130                 135                 140
Leu Thr Glu Asp Gln Leu Pro Ser Cys Glu Ser Leu Lys Asp Thr Ile
145                 150                 155                 160
Ala Arg Ala Leu Pro Phe Trp Asn Glu Glu Ile Val Pro Gln Ile Lys
                165                 170                 175
Glu Gly Lys Arg Val Leu Ile Ala Ala His Gly Asn Ser Leu Arg Gly
            180                 185                 190
Ile Val Lys His Leu Glu Gly Leu Ser Glu Glu Ala Ile Met Glu Leu
        195                 200                 205
Asn Leu Pro Thr Gly Ile Pro Ile Val Tyr Glu Leu Asp Lys Asn Leu
    210                 215                 220
Lys Pro Ile Lys Pro Met Gln Phe Leu Gly Asp Glu Glu Thr Val Arg
225                 230                 235                 240
Lys Ala Met Glu Ala Val Ala Ala Gln Gly Lys Ala Lys Lys
                245                 250

Claims (10)

1.原发性肝细胞癌诊断试剂,含有检测人磷酸甘油酸变位酶1基因表达水平的试剂。
2.根据权利要求2所述的原发性肝细胞癌诊断试剂,其特征在于:所述检测人磷酸甘油酸变位酶1基因的表达水平的试剂包括能特异扩增人磷酸甘油酸变位酶1基因的mRNA的PCR引物对:
正义链SEQ ID NO.1:5’-GCACCCACTCCCTTCATACAAT-3’,
反义链SEQ ID NO.2:5’-ACGCAGGTTACATTCGTCTTCC-3’;
或者包括人磷酸甘油酸变位酶1的多克隆抗体或单克隆抗体。
3.原发性肝细胞癌检测试剂盒或生物芯片,含有权利要求1或2所述的原发性肝细胞癌诊断试剂。
4.能检测人磷酸甘油酸变位酶1基因表达水平的试剂在制备原发性肝细胞癌检测试剂盒或生物芯片中的用途。
5.能降低人磷酸甘油酸变位酶1基因的表达水平的药物在制备防治原发性肝细胞癌的药物组合物中的用途。
6.防治原发性肝细胞癌的药物组合物,其特征在于:能降低人磷酸甘油酸变位酶1基因的转录水平或翻译水平。
7.根据权利要求7所述的防治原发性肝细胞癌的药物组合物,其特征在于:所述防治原发性肝细胞癌的药物组合物为人磷酸甘油酸变位酶1的shRNA分子或能表达该人磷酸甘油酸变位酶1的shRNA分子的表达载体添加药学上可接受的辅助性成分制备而成。
8.根据权利要求8所述的防治原发性肝细胞癌的药物组合物,其特征在于:所述的人磷酸甘油酸变位酶1的shRNA分子具有SEQ ID NO.7所述的核苷酸序列:
5’-GGUGAAGAUCUGGAGGCGCUUCAAGAGAGCGCCUCCAGAUCUUCACC-3’。
9.根据权利要求8所述的防治原发性肝细胞癌的药物,其特征在于:所述的能表达人磷酸甘油酸变位酶1的shRNA分子的表达载体包括下述核苷酸序列:
SEQ ID NO.5所示的正义链:
5’-CACCGGTGAAGATCTGGAGGCGCTTCAAGAGAGCGCCTCCAGATCTTCACCTTTTTTG-3’;
以及,SEQ ID NO.6所示的反义链:
5’-GATCCAAAAAAGGTGAAGATCTGGAGGCGCTCTCTTGAAGCGCCTCCAGATCTTCACC-3’。
10.一种筛选防治原发性肝细胞癌的药物的方法,其特征在于包括以下步骤:
a、建立原发性肝细胞癌的细胞模型或动物模型的模型组,并设立正常对照组;
b、用待筛选药物按剂量梯度作用于模型组,然后检测其中人磷酸甘油酸变位酶1基因的转录水平或翻译水平;
c、将检测结果与正常对照组进行比较,能使模型组中人磷酸甘油酸变位酶1基因的转录水平或翻译水平显著趋近正常对照组的待筛选药物即被筛中。
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