CN101492676A - 用脑膜细胞生成诱导的多能性干细胞的方法及其用途 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及使用脑膜细胞诱导重编程为诱导的多能性干细胞(iPS)的方法,所述方法包括:用包含多能性干细胞因子的cDNA导入脑膜细胞;在适宜上述被导入的脑膜细胞生长的培养条件下培养该细胞。本发明还涉及脑膜细胞被诱导重编程为iPS的用途,特别是所述脑膜细胞在被导入了多能性干细胞因子的cDNA后而被诱导重编程为iPS的用途。
Description
一.发明背景
干细胞(stem cells)是人体及其各种组织细胞的初始来源,其最显著的生物学特征是既有自我更新和不断增殖的能力,又有多向分化的潜能。干细胞根据不同的来源分为成体干细胞(somaticstem cells)和胚胎干细胞(embryonic stem cells,ES细胞)。 成体干细胞包括骨髓间充质干细胞、胰腺干细胞、神经干细胞等成体组织中存在的。
1981年,ES细胞的分离和培养首先在小鼠中获得成功,是至今研究最广泛、最成熟的干细胞体系。随后,牛、羊等大动物的ES细胞分离和培养也相继获得成功。
hES细胞研究的应用前景主要是移植治疗,在组织工程学领域中以hES细胞作为种子细胞,可为临床上细胞、组织或器官的移植治疗提供大量的材料。通过控制hES细胞分化培养环境、转染能够促进ES细胞定向分化的关键分子基因等体外诱导分化策略,可获得特异性的组织细胞类型。这类细胞用于移植治疗,将给糖尿病、帕金森氏病、脊髓损伤、白血病、心肌损伤、肾衰竭、肝硬化等疾病的治疗带来新的希望。
一直以来,hES细胞研究面临着许多难题和争议,主要包括以下几个方面:(1)供体卵母细胞的来源困难,hES细胞建系效率低。此外,SCNT技术的不成熟必将需要进一步耗费更多的人类卵母细胞,故而其来源难以得到保证。(2)免疫排斥反应,除非采用SCNT技术,否则患者对hES细胞分化而来的各种细胞和组织仍然存在免疫排斥反应。(3)hES细胞具有成瘤性,移植到受体的体内后有发展为肿瘤的可能性,即使采用SCNT技术、给移植细胞设置自杀基因等应对措施,也不一定能够很好地解决这个问题(Reubinoff BE等人.Embryonic stem cell lines from human blastocysts:somatic differentiation in vitro。NatBiotechnol 2000;18:399-404;Richards M等人,Bongso A.Human feeders support prolongedundifferentiated growth of human inner cell masses and embryonic stem cells.Nat Biotechnol 2002;20:933-936;Burdon T等人,cell cycle
and pluripotency in embryonic stem cells.Trends Cell Biol 2002;12:432-438)。(4)体外保持hES风险(Nakagawa M,等人,N,Yamanaka S.Generation of induced pluripotentstem cells withoutMyc from mouse and human fibroblasts.Nat Biotechnol 2008;26:101-106)。同样,慢病毒转染技术可能也存在类似的风险。
为避开hES细胞和治疗性克隆研究的伦理学争论,需要找到一种替代途径,以便将人类的体细胞直接转化为多潜能干细胞,为患者提供“个性化”的自体干细胞。2003年,Gurdon研究小组发现,将已完全分化的小鼠胸腺细胞或成人外周血淋巴细胞的细胞核注入爪蟾卵母细胞后,哺乳动物细胞核的分化标志物丧失,而哺乳动物干细胞中最具特征性的标志物Oct4则呈高表达,提示哺乳动物细胞核可直接被两栖动物卵母细胞核泡所重构从而表达Oct4(Byrne JA等人,Nuclei of adult mammalian somatic cells aredirectly reprogrammed to oct-4 stem cell gene expression by amphibian oocytes.Curr Biol 2003;13:1206-1213)。
2006年,日本京都大学Yamanaka研究小组采用体外基因转染技术,从24个因子中筛选出Oct4、Sox2、c-Myc、Klf4等4个转录因子,通过逆转录病毒将上述4个转录因子导入胚胎小鼠成纤维细胞或成年小鼠尾部皮肤成纤维细胞,在小鼠ES细胞的培养条件下获得了Fbx15+的多潜能干细胞系,该细胞系在细胞形态、生长特性、表面标志物、形成畸胎瘤等方面与小鼠ES细胞非常相似,而在基因表达谱、DNA甲基化方式及形成嵌合体动物方面却不同于小鼠ES细胞,故将其命名为诱导的多能性干细胞(iPS细胞)(Takahashi K,Yamanaka S.Induction of pluripotent stem cells from mouse embryonic and adultfibroblast cultures by defined factors.Cell 2006;126:663-676)。
2007-07,Yamanaka研究小组进一步用Nanog代替Fbx15进行筛选,得到了Nanog+的iPS细胞系,该iPS细胞不仅在细胞形态、生长特性、标志物表达、移植到小鼠皮下可形成包含3个胚层组织细胞结构的畸胎瘤等方面与小鼠ES细胞非常相似,而且在DNA甲基化方式、基因表达谱、染色质状态、形成嵌合体动物等方面也与小鼠ES细胞几乎完全相似。此外,研究还发现重新激活原癌基因c-Myc是嵌合体动物出现肿瘤形成的原因;而转染的上述4个基因在iPS细胞中并没有表达,表明这些基因只在诱导过程中起作用,iPS细胞保持多潜能性状态的原因是内源性转录因子Nanog基因的表达(Okita K,Ichisaka T等人,germline-competent induced pluripotent stem cells.Nature 2007;448:313-317)。同时独立发表的另一篇来自美国科学家的研究论文同样证实了上述4个转录因子足以使小鼠成纤维细胞在体外诱导重构成为类似小鼠ES细胞的iPS细胞(Wernig M等人,In vitro reprogramming of fibroblasts intoa pluripotent ES cell-like state.Nature 2007;448:318-324)。
新近报道了小鼠肝细胞和胃上皮细胞同样也可被重构成为iPS细胞,遗传学细胞谱系示踪分析显示,iPS细胞源自谱系定型的体细胞的直接重构,而未发现逆转录病毒整合到特定的基因位点与细胞核重构相关(Aoi T等人,Generation of Pluripotent Stem Cells from Adult Mouse Liver and Stomach Cells.Science 2008)。
还有研究者利用相同的技术,将上述同样的4个转录因子导入到人类皮肤成纤维细胞中,也成功获得了iPS细胞。原代人类成纤维细胞样滑膜细胞和源自新生儿成纤维细胞的细胞系同样也可被重构成为iPS细胞。这类iPS细胞在细胞形态、增殖能力、表面抗原标志、基因表达谱、多潜能干细胞特异性基因的表观遗传学状态、端粒酶活性等方面与hES细胞相似,并且在体外培养时和在小鼠体内畸胎瘤形成中均可分化为3个胚层的不同细胞类型(Takahashi K等人,Induction of pluripotent stem cells from adult humanfibroblasts by defined factors.Cell 2007;131:861-872)。与此同时,威斯康辛大学Thomson研究小组也报道了成功诱导胎儿成纤维细胞转化为具有hES细胞基本特征的人类iPS细胞,所不同的是他们使用慢病毒作为载体,并在14个候选基因中选择了Oct4、Sox2、Nanog、Lin28等4个基因进行转导(YuJ等人,Induced pluripotent stem cell lines derived from human somatic cells.Science 2007;318:1917-1920)。
Park IH等人,Reprogramming of human somatic cells to pluripotency with defined factors.Nature 2008;451:141-146利用来自胎儿、新生儿及成人的皮肤或肺部的原代成纤维细胞,其中包括来自1名健康男性皮肤活检得到的成纤维细胞,采用Yamanaka研究小组的策略也获得了相同的结果。他们还发现Oct4和Sox2在诱导重构为iPS细胞过程中是必需的,正是这两个转录因子维持了人类iPS细胞的多潜能性,而Klf4和c-Myc的作用是改变染色质的结构,从而有利于Oct4和Sox2的结合,以提高诱导的效率。此外,这项研究的重要意义在于将取自皮肤活检的成纤维细胞诱导为iPS细胞。上述研究表明,从活检人类皮肤组织中提取体细胞后进行诱导以制备患者特异性的干细胞是可行的,因而有望克服细胞移植治疗中存在的免疫排斥反应。鉴于导入c-Myc基因可使嵌合体小鼠的肿瘤发生率高达20%,可能会阻碍其未来的临床应用(Okita K,Ichisaka T,Yamanaka S.Generation of germline-competent inducedpluripotent stem cells.Nature 2007;448:313-317)。因此,Yamanaka研究小组新近报道,小鼠和人类皮肤成纤维细胞转染c-Myc以外的其余3个基因,在调整培养条件后也可得到iPS细胞。去除c-Myc基因尽管可使未来临床应用的安全性显著提高,但形成iPS细胞的效率却明显降低。虽然嵌合体小鼠在100d内没有肿瘤发生,但逆转录病毒的再激活仍有导致肿瘤发生的潜在风险(NakagawaM,等人,Generationof induced pluripotent stem cells without Myc from mouse and human fibroblasts.Nat Biotechnol2008;26:101-106)。同样,慢病毒转染技术可能也存在类似的风险。
二.发明内容
尽管已经证明了病毒转导一系列外源因子可以使得小鼠和人的成纤维细胞(例如MEF和MSF)以及神经干细胞的后生和转录状态重置成多能胚胎干细胞(ES细胞)的状态(Takahashi K,Yamanaka S.Cell,2006;126:663-676;Wernig M,Meissner A,Foreman R,等人,Nature.2007;448:318-324;Yu J,VodyanikMA,Smuga-Otto K等人Science.2007;318:1917-1920),但是神经干细胞的培养条件要求极高,而MEF则是必须从胎鼠中获得,而且使用现有这些细胞诱导后产生的诱导的多能干细胞(induced pluripotentstem cell,iPS)产生嵌合小鼠的效率很低,产生的嵌合小鼠在一段时间后发生肿瘤的几率很大(Okita K,Ichisaka T,Yamanaka S.Generation of germline-competent induced pluripotent stem cells.Nature2007;448:313-317)。
在本发明中,令人惊讶的发现,尽管与已经发现的并且能够被诱导为多能干细胞的小鼠胚胎成纤维细胞(MEF)和皮肤成纤维细胞(MSF)明显不同,小鼠脑膜细胞仍能被产生iPS细胞系,并且这种细胞系在形成嵌合小鼠中是高度有效的。其效率远大于已经发现的可以被诱导为iPS的神经干细胞、MEF等。而且形成的嵌合小鼠在经过很长时间后,仍然存活良好,极大的降低了发生肿瘤的潜在风险。
在本发明的第一个方面中,本发明涉及将脑膜细胞诱导重编程为诱导的多能性干细胞的方法,所述方法包括:
(a)用包含多能性干细胞因子的cDNA导入脑膜细胞;
(b)在适宜上述被导入的脑膜细胞生长的培养条件下培养该细胞,以及任选地
(c)鉴定多能性干细胞克隆。
其中,所述多能性因子为对于干细胞多能性维持关键的因子,优选地,所述的多能性因子包括Oct4、Sox2(任选地,Sox1)、C-myc(任选地L-Myc或N-Myc),以及Klf4(任选地,Klf5或Klf2)。最优选地,所述多能性因子包括Oct4、Sox2、C-myc以及Klf4。上述多能性因子可以是任何来源的,优选为小鼠的多能性因子以及其变体,如Sox2,NCBI登录号为NM_011443.3(小鼠包含基因2的SRY-框)(SEQ ID NO:1);Oct4,NCBI登录号为NM_013633.2(小鼠POU结构域,5类,转录因子1(Pou5f1))(SEQ ID NO:2);Klf4,NCBI登录号为NM_010637.2(小鼠Kruppel-样因子4(肠(gut)))(SEQ ID NO:3);c-Myc,NCBI登录号为NM_010849.4(小鼠髓细胞瘤病癌基因(myelocytomatosis oncogene)(c-Myc))(SEQ ID NO:4);Soxl,NCBI登录号为NM_009233.3,(小鼠包含基因1的SRY-框)(SEQ ID NO:5);Klf2,NCBI登录号为NM_008452.2,(小鼠Kruppel-样因子2(肺))(SEQ ID NO:6);Klf5,NCBI登录号为NM_009769.4,(小鼠Kruppel-样因子5)(SEQ ID NO:7)。C-Myc还可以被换为其突变体L-myc(登录号为NM_008506.2,小鼠v-myc髓细胞瘤病病毒爱基因同源物1v,肺癌来源的(禽类)((Mycl1)))(SEQ ID NO:8);或者N-Myc(登录号为NM_008709.3,小鼠v-myc髓细胞瘤病病毒相关癌基因,神经母细胞瘤衍生的(禽类)(Mycn)(SEQ ID NO:10)。
在本发明的另一个方面中,本发明涉及脑膜细胞经诱导重编程产生的多能性干细胞的用途。特别是使用所述多能性干细胞来产生嵌合小鼠的用途。
在本发明的另外的方面中,本发明涉及脑膜细胞用于诱导重编程而产生多能性干细胞的用途。特别是通过将多能性干细胞因子的cDNA导入脑膜细胞后脑膜细胞被诱导重编程为多能性干细胞的用途。
在本发明的另一个方面中,本发明还涉及多能性干细胞因子cDNA通过被导入到脑膜细胞中来诱导脑膜细胞形成多能性干细胞的用途。
根据本发明所述,与现有技术公开的其它可以被诱导为iPS的细胞不同,脑膜细胞不仅可以诱导形成iPS,而且所产生的iPS产生嵌合小鼠的比例远大于现在已知的其它细胞;而且产生的这些嵌合小鼠存活状况良好,不会成瘤。这对于今后通过使用诱导的多能性细胞,而非直接从人体及动物体提取的胚胎干细胞,来利用组织再生医学治疗某些现有阶段难于治愈的疾病,尤其是与脑部相关的疾病,提供了更加有效且更加具有针对性的方案。
附图说明
图1.小鼠脑膜细胞(MENINGEAL)、小鼠胚胎成纤维细胞(MEF)、皮肤成纤维细胞(MSF)、3株小鼠脑膜来源的iPS(iPS-C5、C8和C12)以及小鼠胚胎干细胞系CGR8进行的全基因表达谱比较。
图1.A iPS-C5、C8和C12分别与小鼠脑膜细胞的全基因表达谱比较。
图1.B iPS-C5、C8和C12分别与多能性干细胞CGR8的全基因表达谱比较。
图1.C小鼠脑膜细胞与MEF的全基因表达谱比较。
图1.D小鼠脑膜细胞与MSF的全基因表达谱比较。
图2.CGR8与iPS、脑膜细胞与MEF基因表达异同的示意图。
图3.利用逆转录病毒载体从新生小鼠的脑膜产生iPS细胞的示意图。第12天的克隆与小鼠ES细胞在形态学上没有可见的区别。
图4.从3株随机挑选的iPS克隆(iPS-C5、C6和C12)衍生的细胞所形成的ES样克隆,其碱性磷酸酶(AP)染色为阳性。其与多能性干细胞CGR8形成的克隆没有可见的区别。
图5.半定量RT-PCR证实这3株iPS克隆表达关键的胚胎干细胞(ES)标志物;使用CGR8小鼠ES细胞作为阳性对照,使用未感染的脑膜细胞和MEF作为阴性对照。
图6.使用SEQ NO ID:10作为探针,3株iPS细胞基因组中Southern印迹的结果,图中显示的条带数目表示基因组中整合的Klf4基因的拷贝数。使用ES细胞系作为对照。
图7.共聚焦免疫荧光显微摄影显示在挑选的iPS细胞中Nanog、Rex1和SSEA1的均匀表达(homogeneous)。横线指示放大倍数。空白区域的方框内显示在低倍放大下的DAPI染色。
图8.使用酸式硫酸盐测序分析Oct4和Nanog启动子的甲基化状态。空白区域表示未甲基化,填充区域表示甲基化的CpG二核苷酸。
图9.iPS-C5和iPS-C6胚状体(EB)分化第4天的相差照片
图10.iPS-C5和iPS-C6胚状体(EB)分化第9天的半定量RT-PCR结果,使用分析3胚层的标志物。使用培养在添加LIF的ES培养基中的iPS细胞作为对照。
图11.显示了使用本发明方法获得的iPS构建的嵌合鼠,其中非嵌合小鼠为纯白色,用星号标记;嵌合小鼠由于注射的iPS细胞来源于黑色的ICR小鼠,呈现黑色与白色相间分布的体色。
具体实施方案
1.定义和技术
除非另外指明,本发明的实践将使用分子生物学、微生物学、细胞生物学、免疫学和重组DNA的传统技术,其属于本领域技术范围。参见例如,Sambrook,Fritsch和Maniatis,分子克隆实验指南,第3版(2002);CURRENT PROTOCOLS IN MOLECULAR BIOLOGY(F.M.Ausubel等人编著(1987));丛书METHODS INENZYMOLOGY(Academic Press,Inc.):PCR 2:A PRACTICAL APPROACH(M.J.MacPherson,B.D.Hames和G.R.Taylor编著,(1995)),Harlow和Lane编著,(1988)ANTIBODIES,A LABORATORY MANUAL and ANIMALCELL CULTURE(R.I.Freshney编著,(1987));W.French Anderson等人,HANDBOOK OF STEM CELLS,卷2。
本文中使用的一些术语具有下列定义的含义。
在说明书和权利要求书中使用的,单数型“一个”,和“这个”包括复数参考,除非上下文另有清楚的表述。例如,术语“(一个)细胞”包括复数的细胞,包括其混合物。
所有的数字标识,例如pH、温度、时间、浓度和分子量,包括范围,都是近似值,其以0.1的增量变动(+)或(-)。要了解,虽然不总是明确的叙述所有的数字标识之前都加上术语“约”。也要了解,虽然不总是明确的叙述,本文中描述的试剂仅仅是示例,其等价物是本领域已知的。
本文所述的“诱导的多能性干细胞(iPS细胞)”是这样的细胞,其在ES细胞培养条件下,与ES细胞在细胞形态、生长特性、表面标志物表达、移植到皮下可形成包含3个胚层组织细胞结构的畸胎瘤等方面与小鼠ES细胞非常相似,而且在DNA甲基化方式、基因表达谱、染色质状态、形成嵌合体动物等方面也与小鼠ES细胞几乎完全相似。
本文所述的脑膜细胞是来自哺乳动物的脑膜细胞,其来自神经脊(neural crest),并且可以被分化成几种细胞系,包括成骨细胞和神经元细胞,既可以是体内的又可以是体外的(Gagan JR,Tholpady SS,Ogle RC.Birth Defects Res C Embryo Today.2007;81:297-304.)。脑膜细胞由两层组成,软脑脊膜(内部l)和硬膜(外部),其包含脑并保护其不受伤害。
所述的脑膜细胞可以来源于任何动物(包括人),优选是哺乳动物,更优选是小鼠。各种动物来源的脑膜细胞可以从动物中容易地分离,例如从新生小鼠中分离;或者从人脑部手术后的脑部废弃物中分离得到;原代脑膜细胞还可以是商业可购得的,例如从美国Sciencell公司方便地购得(人脑膜细胞,货号1405,上海麦莎公司代理)。特别地,使用在中国典型培养物保藏中心(武汉市武昌珞珈山)于2008年8月21日提交保藏的小鼠原代脑膜细胞(保藏编号为CCTCC NO:C200838;分类命名:小鼠脑膜细胞GIBH001)。
本文所述的术语“诱导重编程”是指将体细胞去分化为多能性干细胞的过程。优选地,通过将维持干细胞多能性所需的多能性因子cDNA导入体细胞可以诱导体细胞去分化成为多能性干细胞(Takahashi K,Yamanaka S.Cell.2006;126:663-676;Wernig M,Meissner A,Foreman R,等人,Nature.2007;448:318-324;Yu J,Vodyanik MA,Smuga-Otto K等人Science.2007;318:1917-1920)。其中,优选地,所述的多能性因子包括Oct4、Sox2(任选地,Sox1)、C-myc(任选地L-Myc或N-Myc),以及Klf4(任选地,Klf5或Klf2)。最优选地,所述多能性因子为Oct4、Sox2、C-myc以及Klf4。具体地,所述多能性因子为Sox2,NCBI登录号为NM_011443.3(小鼠包含基因2的SRY-框)(SEQ ID NO:1);Oct4,NCBI登录号为NM_013633.2(小鼠POU结构域,5类,转录因子1(Pou5f1))(SEQ ID NO:2);Klf4,NCBI登录号为NM_010637.2(小鼠Kruppel-样因子4(肠(gut)))(SEQ ID NO:3);c-Myc,NCBI登录号为NM_010849.4(小鼠髓细胞瘤病癌基因(myelocytomatosis oncogene)(c-Myc))(SEQ ID NO:4);Sox1,NCBI登录号为NM_009233.3,(小鼠包含基因1的SRY-框)(SEQ ID NO:5);Klf2,NCBI登录号为NM_008452.2,(小鼠Kruppel-样因子2(肺))(SEQ ID NO:6);Klf5,NCBI登录号为NM_009769.4,(小鼠Kruppel-样因子5)(SEQ ID NO:7)。C-Myc还可以被换为其突变体L-myc(登录号为NM_008506.2,小鼠v-myc髓细胞瘤病病毒爱基因同源物1v,肺癌来源的(禽类)((Mycl1)))(SEQ ID NO:8);或者N-Myc(登录号为NM_008709.3,小鼠v-myc髓细胞瘤病病毒相关癌基因,神经母细胞瘤衍生的(禽类)(Mycn)(SEQ ID NO:10)。
将所述多能性因子cDNA导入体细胞的方法可以是本领域技术人员熟知的多种技术,包括病毒感染、脂质体转染、电穿孔、粒子轰击等各种将DNA转入细胞的方法。优选地,使用包含cDNA的病毒载体进行转染,所述病毒载体包括慢病毒载体、逆转录病毒载体等多种病毒载体。优选地逆转录病毒载体(例如pMX载体),如实施例中所述的。
本文所述的“适宜被导入多能性干细胞因子cDNA的脑膜细胞的生长条件”是本领域的常规干细胞培养条件,并且包括一些适宜各个具体细胞系,但是不影响细胞基本性质的修饰,培养方法以及培养条件参见W.French Anderson等人,HANDBOOK OF STEM CELLS,卷2。
本文所述的“嵌合小鼠”是通过本领域普通技术人员熟知的“嵌合鼠”技术实施的。是指将胚胎干细胞或通过本文技术获得的iPS注射入小鼠囊胚中,使得其与所注射入小鼠的囊胚中的胚胎细胞混合,共同在代孕母鼠中的子宫内生长发育,小鼠出生后全身上下的各个组织即由两种胚胎细胞共同混合组成,如马赛克拼图样,这样的小鼠被称为嵌合鼠(Evans M J,等人;The ability of EK cell to form chimerasafter selection of clones in G418 and some observation on the intergration of retroviral vectorproviral DNA into EK cells[M];Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology;1985年;Xian MW,Wu BY,Hu XL,Shang KG,Wu HL,1996.Construction of chimeric mice of ES cells bymicroinjection method.Hereditas(北京)18(1):7-10(中文))。使用iPS能否形成嵌合鼠是检验iPS是否与胚胎干细胞具有类似性质的最直接和最关键的证据。
实施例
下列实施例举例了发明人的标准实验室实践,用于示例本发明的模式,而不应将本发明理解为限定于这些实施例的范围。这些实施例。根据本文公开和本领域技术人员的普遍水平,技术人员将理解下列仅用于示例,可以在不超过本发明的范围内进行各种变动、修饰和改造。其中所涉及的技术,除非特别说明,均是本领域技术人员熟知的分子生物学、细胞生物学、生物化学等各个领域的常规技术。
实施例1.
细胞的制备和培养
分离新生C57BJ/L6小鼠的脑膜,用0.25%胰蛋白酶-EDTA()于37℃消化8-10分钟,然后用过火(fire-polished)移液器轻柔解离。将样品静置5分钟,沉淀组织碎片,将得到的细胞悬液以3.5×105个细胞/ml的密度接种在100-mm培养皿中,所述培养皿用聚-D-赖氨酸(100μg/ml)预包被处理。用高葡萄糖DMEM培养基(4.5g/L的葡萄糖,HyClone公司)培养所得到的细胞,培养基中包含10%胎牛血清(HyClone公司)、2mM丙酮酸钠(Gibco公司)、2mM L-谷氨酰胺(Gibco公司)、青霉素(100U/ml)和链霉素(100μg/ml)。
将胚胎干细胞(ES)和诱导的多能干细胞(induced pluripotent stem cells,iPS细胞)培养在用丝裂霉素(10μg/ml)处理的MEF(小鼠胚胎成纤维细胞)上,并且培养在高葡萄糖DMEM(HyClone公司)中,所述高葡萄糖DMEM包含15%FBS(Gibco),白血病抑制因子(LIF)、青霉素/链霉素、L-谷氨酰胺、β-巯基乙醇和非必需氨基酸(Gibco公司)。在纯化RNA或DNA之前,去除滋养层细胞,在0.2%明胶上传2代。
对于胚体的形成,通过胰蛋白酶消化收获iPS细胞,铺在非粘附的细菌培养皿上,并且在没有LIF的培养基中培养。
实施例2.
DNA微阵列
使用RNAeasy min试剂盒(Qiagen,Valencia,CA)根据制造商的说明从细胞分离总RNA。以3毫克总RNA为模板,使用T7-Oligo(dT)启动子(Affymetrix,Santa Clara,CA)和Superscript II聚合酶(Ivitrogen公司)合成cDNA。使用体外转录系统(使用RNA Transcript Labeling Kit(Affymetrix))合成附有生物素标记的cRNA(按Affymetrix RNA Transcript Labeling Kit说明书)。
将片段化的生物素-cRNA与小鼠GeneChip430.2(Affymetrix)杂交。使用GeneArray Scanner 7G(Affymetrix)扫描芯片,根据制造商说明,使用默认参数用Robust Multi-chip Average(RMA)方法处理数据(CEL文件形式),从中减去背景(以默认的内参探针为基准),并使用软件ArrayAssist 5.5.1(Stratagene Corp.and Strand Life Sciences Pvt Ltd.)进行归一化。
图1.A-C是使用上述方法对脑膜细胞(MENINGEAL)、小鼠胚胎成纤维细胞(MEF)、皮肤成纤维细胞(MSF)、3株小鼠脑膜来源的iPS(iPS-C5、C8和C12)以及小鼠胚胎干细胞系CGR8进行的全基因表达谱比较。
图1中每一个点均代表一种基因,X轴代表X轴所示细胞(如,图1.C的X轴对应MEF)中归一化的基因表达水平,Y轴代表Y轴所示细胞(如,图1.A的Y轴对应脑膜细胞)中归一化的基因表达水平。所有点相对于过X/Y轴交点的对角线越集中,说明两种细胞的基因表达谱相似度越高,也就提示两种细胞越相似。基于系统默认参数,图中红色的点代表在两种细胞中均存在高表达的基因;蓝色的点代表只在其中一种细胞中具有可检测的表达的基因。黄色的点代表在两种细胞中均无可检测的表达的基因。平行的线指示一种细胞中的基因表达相对于另一种细胞中的基因表达2、3、5和10倍的改变(高或低)。
以图1.C为例,箭头所示的点分别对应Sox2、Oct4和Nanog基因,其中,脑膜细胞中Sox2的表达量比MEF中的高10倍以上,而Oct4和Nanog在两种细胞中均没有可检测的表达。
从图1.A和B可见,3株诱导性多潜能干细胞(iPS-C6、C8和C12)与多能性干细胞系CGR8之间具有极高的相似度,而与原脑膜细胞具有较大的差异;另一方面,从图1.C和D可见,脑膜细胞与MEF、MSF的基因表达谱也显著不同。
图2的示意图具体显示了CGR8与iPS、脑膜细胞与MEF的基因表达异同。
由此可见,虽然以前认为脑膜细胞中大部分为成纤维细胞,但是经我们的基因芯片研究可以看出,其基因表达谱与成纤维细胞存在很大差异,在此不解释为对机制的任何限定,这种差异有可能是导致脑膜细胞来源的iPS与以前使用的MEF来源的iPS在后续细胞性质中差异的原因之一。
实施例3.
病毒载体感染脑膜细胞
根据实施例1所述的方法,在p6孔培养板中按每孔约4×104个细胞接种小鼠的脑膜细胞,在37℃、5%CO2的常规培养条件下培养过夜,用收集的病毒上清液感染培养的脑膜细胞。所述病毒上清液是通过用包含小鼠Oct4、Sox2、Klf4和c-Myc的cDNA的反转录病毒pMX载体(Addgene公司)按常规方法转染Plat-E细胞(Lipofectamine 2000,Invitrogen公司)获得的(参见Sambrook,Fritsch和Maniatis,分子克隆实验指南,第3版(2002))。与编码GFP的载体的对照孵育表明接近了100%的转染效率(数据未显示)。
实施例4.
感染细胞的继续培养和克隆筛选
在感染后第2天,将感染后的脑膜细胞的培养基,替换为实施例1中所述的ES细胞培养用培养基,在37℃、5%CO2的常规培养条件下培养6天,每天更换一次培养基,用0.25%胰蛋白酶-EDTA()于37℃消化为单细胞悬液,将消化后的细胞按每培养皿约20000个细胞的密度接种到100mm培养皿中,所述培养皿按实施例1中描述的方法,预先用滋养层细胞包被。接种后的细胞在37℃、5%CO2的常规培养条件下培养6天,显微镜检可见ES样克隆(如图3所示)。
移去100mm培养皿中的大部分培养基,使用移液器用10μL枪头吸取生长紧密,边缘光滑的单个克隆,用0.25%胰蛋白酶-EDTA()于37℃消化为单细胞悬液,将消化后的细胞接种到24孔板的单个孔中,每个孔接种一个ES样克隆,所述24孔板按实施例1中描述的方法,预先用滋养层细胞包被。接种后的细胞在37℃、5%CO2的常规培养条件下培养。
通过上述方法,在第6天,将105个细胞转移到10cm用小鼠成纤维细胞滋养层细胞包被的培养皿中(图3)。105个转导的脑膜的1000个集落与4因子一起孵育后12天,这与以前介绍的使用成纤维细胞的情况类似(Takahashi K,Yamanaka S.Cell.2006;126:663-676;Qin D,Li W,Zhang J,et al.Cell research.2007.)。这些具有典型的ES集落的致密形态,并且在第16天,证明了80%为AP染色阳性(数据未显示)。来自不同培养皿的12个集落被选出进行进一步表征。其中的10个能够在滋养层细胞上维持增殖。我们的方法的总体效率为大约0.8%,与以前报道的用4个因子(不选择)的成纤维细胞诱导(约0.5%-0.8%)类似(Qin D,Li W,Zhang J,等人Cell research.2007;Meissner A,Wernig M,Jaenisch R.Nat Biotech.2007;25(10):1177-81),略低于使用神经干细胞在相似的培养条件下进行的实验(3.6%,Kim JB,ZaehresH,Wu G,等人Nature.2008)。在这10个脑膜-iPS集落中,选择了3个,用AP染色这些集落也是阳性的(图4)。
实施例5
半定量RT-PCR鉴定iPS中干细胞标志物的表达
使用Trizol(Takara公司)试剂,按照制造商说明提取总RNA。用M-MLV(Takara公司)试剂盒进行逆转录,并使用rTaq试剂盒(Takara公司)对于实施例2中选出的3个集落进行PCR。用Takara公司的基因组DNA提取试剂盒,根据制造商的说明提取基因组DNA,并且用rTaq酶进行RT-PCR。所有上述PCR条件均使用常规PCR条件(参见分子克隆实验指南,第3版),按照制造商说明进行。
其中各标志物基因使用引物列表如表1所示。
表1,RT-PCR所用引物
SEQ ID NO: | 引物名称(前:因子名称)F:正向;R反向 | 引物序列 |
SEQ ID NO:11 | pMX-F | GACGGCATCGCAGCTTGGATACAC |
SEQ ID NO:12 | pMX-R | TTATCGTCGACCACTGTGCTG |
SEQ ID NO:13 | c-Myc-S1093 | CAGAGGAGGAACGAGCTGAAGCGC |
SEQ ID NO:14 | Sox2-S768 | GGTTACCTCTTCCTCCCACTCCAG |
SEQ ID NO:15 | Klf4-S1236 | GCGAACTCACACAGGCGAGAAACC |
SEQ ID NO:16 | Oct3/4-AS210 | TGCGGGCGGACATGGGGAATCC |
如图5所示,使用本申请的方法获得的iPS表达与多能性干细胞CGR8均表达相同的多能性因子,而这些因子在原始脑膜细胞中均没有可检测到的表达。
实施例6
Southern印迹
使用上述方法从小鼠iPS细胞系和R1 ES细胞中提取基因组DNA,取10μg基因组DNA用限制性酶消化过夜,根据制造商说明,酶切体系按常规方法配制,所述酶为EcoRI,BglII和NocI。
取10uL消化制备的基因组DNA片段样品,进行0.8%琼脂糖凝胶电泳。在碱变性后,将电泳分离的基因组DNA过夜转移到带阳性电荷的尼龙膜(Amersham公司)上,用紫外线辐射交联(条件)。然后,将上述尼龙膜在42℃,在DIG Easy Hyb缓冲液(Roche公司)中,与地高辛配基(DIG)-标记的DNA探针孵育过夜。洗涤(室温PBS洗涤15次)后,将碱性磷酸酶-缀合的抗-DIG抗体(1∶10,000,Roche公司)添加到膜上。在与CDP-star(Roche公司)一起孵育后,将膜暴露于X-射线膜。
图6显示了使用SEQ NO ID:10作为探针,在3株iPS细胞的基因组中的Southern印迹的结果,图中显示的条带数目表示基因组中整合的Klf4基因的拷贝数。这证明了转基因有多个拷贝整合。
实施例7
鉴定iPS基因组中病毒基因的插入
A.免疫荧光
室温下,将细胞在4%的多聚甲醛中固定30分钟后,用PBS洗涤,并且在室温下用含有5%FBS和0.1%的Triton-X100的PBS封闭20分钟。再用含有兔抗鼠Rex1、Nanog和鼠SSEA1单抗一抗(1∶50,Chemicon公司)的PBS(含有1%FBS)孵育1小时后,用PBS洗涤细胞。再与具有荧光素标记的合适二抗(Santa公司)孵育后,用PBS洗涤3次并且用80%的甘油封片。使用共聚焦显微镜(LEICA TCS AP2 AOBS)用于视觉观察。
图7中显示了三株iPS细胞所产生的ES样克隆的免疫荧光的结果,可见,多能性因子Nanog、SSEA1和Rex-1在三株iPS细胞中均有均匀的高表达。
B.亚硫酸氢盐基因组测序
根据制造商的说明,使用CpGenome修饰试剂盒(Chemicon公司)进行亚硫酸氢盐处理。处理过程中使用的Oct4和Nanog启动子的PCR引物见下表2。将上述PCR产物克隆到pMD18-T(Takara公司)载体中,随机选择克隆用于对每个基因测序,所述测序用M13正向和M13反向引物。启动子被封闭,基因不表达,证明了iPS中标志物的存在。
表2:PCR所用引物
SEQ IDNO: | 引物名称(前:因子名称)F:正向;R反向 | 引物序列 |
SEQ IDNO:17 | mOct4U | GGTTTTTAGAGGATGGGTTGAGTG |
SEQ IDNO:18 | mOct4L | CGGATCCCTAAAACCAAATATCCAACCATA |
SEQ IDNO:19 | mNanogU | AATGTTTATGGTGGATTTTGTAGGT |
SEQ IDNO:20 | mNanogL | CCCACACTCATATCAATATAATAAC |
图8中显示iPS克隆中内源性Oct4和Nanog启动子区域没有或只有极低程度的甲基化,而MEF和未接受注射的脑膜细胞中,上述基因组区域均呈现高度甲基化。也就是说,经过诱导重编程的iPS细胞中,内源性多能性干细胞因子的表达被激活了。
实施例8
iPS多能性的鉴定
A.EB分化和各胚层标志物的鉴定
为了证明脑膜iPS的多能型,将脑膜-iPS克隆培养在没有LIF的不粘着培养皿上以形成胚状体(图9)
将使用实施例3-4的方法制备,并经过实施例5-7的方法鉴定筛选出来的3株iPS细胞按常规方法用0.25%胰酶消化,转入无菌的细菌培养皿中,在不加LIF的常规ES培养基中悬浮培养。培养第4天,可见3株iPS细胞均形成了紧密、光滑的胚状体(EB)(参见图9)。
根据实施例5例举的方法,提取上述iPS-C5和iPS-C6及其形成的EB(第9天)的总RNA,并逆转录为cDNA进行多能性干细胞因子和各胚层分化标志物的RT-PCR鉴定,使用表3中列出的RT-PCR引物。
表3:RT-PCR鉴定标志物所用的引物
SEQ ID NO: | 引物名称(前:因子名称)F:正向;R反向 | 引物序列 |
SEQ ID NO:21 | Gata-6-F | GCAATGCATGCGGTCTAC |
SEQ ID NO:22 | Gata-6-R | CTCTTGGTAGCACCAGCTCA |
SEQ ID NO:23 | Fgf-5-F | AAAGTCAATGGCTCCCACGAA |
SEQ ID NO:24 | Fgf-5-R | CTTCAGTCTGTACTTCACTGG |
SEQ ID NO:25 | T-F | ATGCCAAAGAAAGAAACGAC |
SEQ ID NO:26 | T-R | AGAGGCTGTAGAACATGATT |
SEQ ID NO:27 | Is11-F | AGCAAGAACGACTTCGTGATG |
SEQ ID NO:28 | Is11-R | GACTGAGAGGGTCTCCAGCTC |
SEQ ID NO:29 | Bmp-2-F | GTTTGTGTTTGGCTTGACGC |
SEQ ID NO:30 | Bmp-2-R | AGACGTCCTCAGCGAATTTG |
SEQ ID NO:31 | GAPDH-F | CATCACCATCTTCCAGGAGC |
SEQ ID NO:32 | GAPDH-R | ATGCCAGTGAGCTTCCCGTC |
图10中显示RT-PCR的结果,可见使用本发明方法获得的iPS细胞具有分化为各胚层细胞的潜力。
B.构建嵌合鼠
注射用囊胚取自四周龄超排ICR母小鼠(黑色),与同品系公鼠合笼,见栓3.5d(当日见栓为0.5d)时从子宫和输卵管中收集胚胎,移入上覆石蜡油的M 16培养液滴内,于37℃5%CO2孵箱内培养。
注射前3h将嵌合用iPS细胞更换新鲜培养液,胰酶消化后制成单细胞悬液备用。将适量iPS细胞悬液和囊胚期胚胎移入M2注射液滴内,在显微注射系统下,用持卵针固定囊胚,用注射针吸取iPS细胞,从远离内细胞团的滋养层部位进针,每个囊胚注射细胞10-12个。注射后囊胚腔消失,置于培养液中于孵箱中培养1-3h,待囊胚腔恢复后,移入见栓2.5d的假孕母鼠子宫中进行培育。
图11显示了使用本发明方法获得的iPS构建的嵌合鼠,其中非嵌合小鼠为纯白色,嵌合小鼠由于注射的iPS细胞来源于黑色的ICR小鼠,故呈现黑色与白色相间分布的体色。
代孕母鼠产生的小鼠及其中嵌合鼠数统计如下表
表3.
其中,C57 iPS-C系列表示使用本发明的方法获得的三株iPS细胞系,ICR iPS-C系列表示使用传统方法从MEF获得的三株iPS细胞系,从嵌合鼠数/出生的小鼠数可以看出,使用本发明的脑膜-iPS产生嵌合鼠的比例远高于用现有技术所列的各种细胞产生的iPS。表明使用本发明的方法构建的iPS细胞系在产生嵌合鼠,也就是说在更彻底的诱导重编程方面具有突出的、预料不到的效果。
截止至本申请递交日,本发明所产生的嵌合小鼠无一只成瘤,已经成功存活了100多天,也表明使用脑膜-iPS得到的嵌合鼠的成瘤性远低于现有技术所产生的各种iPS。
序列表
<110>中国科学院广州生物医药与健康研究院
<120>用脑膜细胞生成诱导的多能性干细胞的方法及其用途
<160>32
<170>PatentIn版本3.3
<210>1
<211>2457
<212>DNA
<213>小鼠(Mus musculus)
<220>
<221>小鼠包含基因2的SRY-框(Sox2)
<222>(1)..(2457)
<400>1
ctattaactt gttcaaaaaa gtatcaggag ttgtcaaggc agagaagaga gtgtttgcaa 60
aaagggaaaa gtactttgct gcctctttaa gactagggct gggagaaaga agaggagaga 120
gaaagaaagg agagaagttt ggagcccgag gcttaagcct ttccaaaaac taatcacaac 180
aatcgcggcg gcccgaggag gagagcgcct gttttttcat cccaattgca cttcgcccgt 240
ctcgagctcc gcttcccccc aactattctc cgccagatct ccgcgcaggg ccgtgcacgc 300
cgaggccccc gcccgcggcc cctgcatccc ggcccccgag cgcggccccc acagtcccgg 360
ccgggccgag ggttggcggc cgccggcggg ccgcgcccgc ccagcgcccg catgtataac 420
atgatggaga cggagctgaa gccgccgggc ccgcagcaag cttcgggggg cggcggcgga 480
ggaggcaacg ccacggcggc ggcgaccggc ggcaaccaga agaacagccc ggaccgcgtc 540
aagaggccca tgaacgcctt catggtatgg tcccgggggc agcggcgtaa gatggcccag 600
gagaacccca agatgcacaa ctcggagatc agcaagcgcc tgggcgcgga gtggaaactt 660
ttgtccgaga ccgagaagcg gccgttcatc gacgaggcca agcggctgcg cgctctgcac 720
atgaaggagc acccggatta taaataccgg ccgcggcgga aaaccaagac gctcatgaag 780
aaggataagt acacgcttcc cggaggcttg ctggcccccg gcgggaacag catggcgagc 840
ggggttgggg tgggcgccgg cctgggtgcg ggcgtgaacc agcgcatgga cagctacgcg 900
cacatgaacg gctggagcaa cggcagctac agcatgatgc aggagcagct gggctacccg 960
cagcacccgg gcctcaacgc tcacggcgcg gcacagatgc aaccgatgca ccgctacgac 1020
gtcagcgccc tgcagtacaa ctccatgacc agctcgcaga cctacatgaa cggctcgccc 1080
acctacagca tgtcctactc gcagcagggc acccccggta tggcgctggg ctccatgggc 1140
tctgtggtca agtccgaggc cagctccagc ccccccgtgg ttacctcttc ctcccactcc 1200
agggcgccct gccaggccgg ggacctccgg gacatgatca gcatgtacct ccccggcgcc 1260
gaggtgccgg agcccgctgc gcccagtaga ctgcacatgg cccagcacta ccagagcggc 1320
ccggtgcccg gcacggccat taacggcaca ctgcccctgt cgcacatgtg agggctggac 1380
tgcgaactgg agaaggggag agattttcaa agagatacaa gggaattggg aggggtgcaa 1440
aaagaggaga gtaggaaaaa tctgataatg ctcaaaagga aaaaaaatct ccgcagcgaa 1500
acgacagctg cggaaaaaaa ccaccaatcc catccaaatt aacgcaaaaa ccgtgatgcc 1560
gactagaaaa cttttatgag agatcttggg acttcttttt gggggactat ttttgtacag 1620
agaaaacctg agggcggcgg ggagggcggg ggaatcggac catgtataga tctggaggaa 1680
aaaaactacg caaaactttt ttttaaagtt ctagtggtac gttaggcgct tcgcagggag 1740
ttcgcaaaag tctttaccag taatatttag agctagactc cgggcgatga aaaaaaagtt 1800
ttaatatttg caagcaactt ttgtacagta tttatcgaga taaacatggc aatcaaatgt 1860
ccattgttta taagctgaga atttgccaat atttttcgag gaaagggttc ttgctgggtt 1920
ttgattctgc agcttaaatt taggaccgtt acaaacaagg aaggagttta ttcggatttg 1980
aacattttag ttttaaaatt gtacaaaagg aaaacatgag agcaagtact ggcaagaccg 2040
ttttcgtggt cttgtttaag gcaaacgttc tagattgtac taaattttta acttactgtt 2100
aaaggcaaaa aaaaaatgtc catgcaggtt gatatcgttg gtaatttata atagcttttg 2160
ttcaatccta ccctttcatt ttgttcacat aaaaaatatg gaattactgt gtttgaaata 2220
ttttcttatg gtttgtaata tttctgtaaa ttgtgatatt ttaaggtttt tccccccttt 2280
tattttccgt agttgtattt taaaagattc ggctctgtta ttggaatcag gctgccgaga 2340
atccatgtat atatttgaac taataccatc cttataacag ctacattttc aacttaagtt 2400
tttactccat tatgcacagt ttgagataaa taaatttttg aaatatggac actgaaa 2457
<210>2
<211>1346
<212>DNA
<213>小鼠
<220>
<221>小鼠POU结构域,5类,转录因子1(Pou5f1)(Oct4)
<222>(1)..(1346)
<400>2
aaccgtccct aggtgagccg tctttccacc aggcccccgg ctcggggtgc ccaccttccc 60
catggctgga cacctggctt cagacttcgc cttctcaccc ccaccaggtg ggggtgatgg 120
gtcagcaggg ctggagccgg gctgggtgga tcctcgaacc tggctaagct tccaagggcc 180
tccaggtggg cctggaatcg gaccaggctc agaggtattg gggatctccc catgtccgcc 240
cgcatacgag ttctgcggag ggatggcata ctgtggacct caggttggac tgggcctagt 300
cccccaagtt ggcgtggaga ctttgcagcc tgagggccag gcaggagcac gagtggaaag 360
caactcagag ggaacctcct ctgagccctg tgccgaccgc cccaatgccg tgaagttgga 420
gaaggtggaa ccaactcccg aggagtccca ggacatgaaa gccctgcaga aggagctaga 480
acagtttgcc aagctgctga agcagaagag gatcaccttg gggtacaccc aggccgacgt 540
ggggctcacc ctgggcgttc tctttggaaa ggtgttcagc cagaccacca tctgtcgctt 600
cgaggccttg cagctcagcc ttaagaacat gtgtaagctg cggcccctgc tggagaagtg 660
ggtggaggaa gccgacaaca atgagaacct tcaggagata tgcaaatcgg agaccctggt 720
gcaggcccgg aagagaaagc gaactagcat tgagaaccgt gtgaggtgga gtctggagac 780
catgtttctg aagtgcccga agccctccct acagcagatc actcacatcg ccaatcagct 840
tgggctagag aaggatgtgg ttcgagtatg gttctgtaac cggcgccaga agggcaaaag 900
atcaagtatt gagtattccc aacgagaaga gtatgaggct acagggacac ctttcccagg 960
gggggctgta tcctttcctc tgcccccagg tccccacttt ggcaccccag gctatggaag 1020
cccccacttc accacactct actcagtccc ttttcctgag ggcgaggcct ttccctctgt 1080
tcccgtcact gctctgggct ctcccatgca ttcaaactga ggcaccagcc ctccctgggg 1140
atgctgtgag ccaaggcaag ggaggtagac aagagaacct ggagctttgg ggttaaattc 1200
ttttactgag gagggattaa aagcacaaca ggggtggggg gtgggatggg gaaagaagct 1260
cagtgatgct gttgatcagg agcctggcct gtctgtcact catcattttg ttcttaaata 1320
aagactggga cacacagtag atagct 1346
<210>3
<211>2905
<212>DNA
<213>小鼠
<220>
<221>小鼠Kruppel-样因子4(肠(gut))(Klf4)
<222>(1)..(2905)
<400>3
gccaagagag cgagcgcggc tccgggcgcg cggggagcag aggcggtggc gggcggcggg 60
ggcacccgga gccgccgagt gcccctcccc gcccctccag ccccccaccc aggaacccgc 120
ccgtgacccg cgcccatggc cgcgcgcacc cggtacagtc cccaggactc cgcaccccgc 180
gccaccgtcc agctcgcagt tccgcgccac cgcggccatt ctcacctggc ggcgccgccc 240
gccaccgccc ggaccacagc ccccgcgccg ccgacagcca cagtggccgc gacaacggtg 300
ggggacactg ctgagtccaa gagcgtgcag cctggccatc ggacctactt atctgccttg 360
ctgattgtct atttttataa gagtttacaa cttttctaag aatttttgta tacaaaggaa 420
ctttttttaa agacatcgcc ggtttatatt gaatccaaag aagaaggatc tcgggcaatc 480
tgggggtttt ggtttgaggt tttgtttcta aagtttttaa tcttcgttga ctttggggct 540
caggtacccc tctctcttct tcggactccg gaggaccttc tgggccccca cattaatgag 600
gcagccacct ggcgagtctg acatggctgt cagcgacgct ctgctcccgt ccttctccac 660
gttcgcgtcc ggcccggcgg gaagggagaa gacactgcgt ccagcaggtg ccccgactaa 720
ccgttggcgt gaggaactct ctcacatgaa gcgacttccc ccacttcccg gccgccccta 780
cgacctggcg gcgacggtgg ccacagacct ggagagtggc ggagctggtg cagcttgcag 840
cagtaacaac ccggccctcc tagcccggag ggagaccgag gagttcaacg acctcctgga 900
cctagacttt atcctttcca actcgctaac ccaccaggaa tcggtggccg ccaccgtgac 960
cacctcggcg tcagcttcat cctcgtcttc cccggcgagc agcggccctg ccagcgcgcc 1020
ctccacctgc agcttcagct atccgatccg ggccgggggt gacccgggcg tggctgccag 1080
aaacacaggt ggagggctcc tctacagccg agaatctgcg ccacctccca cggccccctt 1140
caacctgggg gacatcaatg acgtgagccc ctcgggcggc ttcgtggctg agctcctgcg 1200
gccggagttg gacccagtat acattccgcc acagcagcct cagccgccag gtggggggct 1260
gatgggcaag tttgtgctga aggcgtctct gaccacccct ggcagcgagt acagcagccc 1320
ttcggtcatc agtgttagca aaggaagccc agacggcagc caccccgtgg tagtggcgcc 1380
ctacagcggt ggcccgccgc gcatgtgccc caagattaag caagaggcgg tcccgtcctg 1440
cacggtcagc cggtccctag aggcccattt gagcgctgga ccccagctca gcaacggcca 1500
ccggcccaac acacacgact tccccctggg gcggcagctc cccaccagga ctacccctac 1560
actgagtccc gaggaactgc tgaacagcag ggactgtcac cctggcctgc ctcttccccc 1620
aggattccat ccccatccgg gggccaacta ccctcctttc ctgccagacc agatgcagtc 1680
acaagtcccc tctctccatt atcaagagct catgccaccg ggttcctgcc tgccagagga 1740
gcccaagcca aagaggggaa gaaggtcgtg gccccggaaa agaacagcca cccacacttg 1800
tgactatgca ggctgtggca aaacctatac caagagttct catctcaagg cacacctgcg 1860
aactcacaca ggcgagaaac cttaccactg tgactgggac ggctgtgggt ggaaattcgc 1920
ccgctccgat gaactgacca ggcactaccg caaacacaca gggcaccggc cctttcagtg 1980
ccagaagtgt gacagggcct tttccaggtc ggaccacctt gccttacaca tgaagaggca 2040
cttttaaatc ccacgtagtg gatgtgaccc acactgccag gagagagagt tcagtatttt 2100
tttttctaac ctttcacact gtcttcccac gaggggagga gcccagctgg caagcgctac 2160
aatcatggtc aagttcccag caagtcagct tgtgaatgga taatcaggag aaaggaagag 2220
tccaagagac aaaacagaaa tactaaaaac aaacaaacaa aaaaacaaac aaaaaaacca 2280
agaaaaaaaa atcacagaac agatggggtc tgatactgga tggatcttct atcattccaa 2340
taccaaatcc aacttgaaca tgcccggact tacaaaatgc caaggggtga ctggaagttt 2400
gtggatatca gggtatacac taaatcagtg agcttggggg gagggaagac caggattccc 2460
ttgaattgtg tttcgatgat gcaatacaca cgtaaagatc accttgtatg ctctttgcct 2520
tcttaaaaaa aaaaagccat tattgtgtcg gaggaagagg aagcgattca ggtacagaac 2580
atgttctaac agcctaaatg atggtgcttg gtgagttgtg gtcctaaagg taccaaacgg 2640
gggagccaaa gttctccaac tgctgcatac ttttgacaag gaaaatctag ttttgtcttc 2700
cgatctacat tgatgaccta agccaggtaa ataagcctgg tttatttctg taacattttt 2760
atgcagacag tctgttatgc actgtggttt cagatgtgca ataatttgta caatggttta 2820
ttcccaagta tgcctttaag cagaacaaat gtgtttttct atatagttcc ttgccttaat 2880
aaatatgtaa tataaattta accca 2905
<210>4
<211>2399
<212>DNA
<213>小鼠
<220>
<221>小鼠髓细胞瘤病癌基因(myelocytomatosis oncogene) (c-Myc)
<222>(1)..(2399)
<400>4
cccgcccacc cgccctttat attccggggg tctgcgcggc cgaggacccc tgggctgcgc 60
tgctctcagc tgccgggtcc gactcgcctc actcagctcc cctcctgcct cctgaagggc 120
agggcttcgc cgacgcttgg cgggaaaaag aagggagggg agggatcctg agtcgcagta 180
taaaagaagc ttttcgggcg tttttttctg actcgctgta gtaattccag cgagagacag 240
agggagtgag cggacggttg gaagagccgt gtgtgcagag ccgcgctccg gggcgaccta 300
agaaggcagc tctggagtga gaggggcttt gcctccgagc ctgccgccca ctctccccaa 360
ccctgcgact gacccaacat cagcggccgc aaccctcgcc gccgctggga aactttgccc 420
attgcagcgg gcagacactt ctcactggaa cttacaatct gcgagccagg acaggactcc 480
ccaggctccg gggagggaat ttttgtctat ttggggacag tgttctctgc ctctgcccgc 540
gatcagctct cctgaaaaga gctcctcgag ctgtttgaag gctggatttc ctttgggcgt 600
tggaaacccc gcagacagcc acgacgatgc ccctcaacgt gaacttcacc aacaggaact 660
atgacctcga ctacgactcc gtacagccct atttcatctg cgacgaggaa gagaatttct 720
atcaccagca acagcagagc gagctgcagc cgcccgcgcc cagtgaggat atctggaaga 780
aattcgagct gcttcccacc ccgcccctgt ccccgagccg ccgctccggg ctctgctctc 840
catcctatgt tgcggtcgct acgtccttct ccccaaggga agacgatgac ggcggcggtg 900
gcaacttctc caccgccgat cagctggaga tgatgaccga gttacttgga ggagacatgg 960
tgaaccagag cttcatctgc gatcctgacg acgagacctt catcaagaac atcatcatcc 1020
aggactgtat gtggagcggt ttctcagccg ctgccaagct ggtctcggag aagctggcct 1080
cctaccaggc tgcgcgcaaa gacagcacca gcctgagccc cgcccgcggg cacagcgtct 1140
gctccacctc cagcctgtac ctgcaggacc tcaccgccgc cgcgtccgag tgcattgacc 1200
cctcagtggt ctttccctac ccgctcaacg acagcagctc gcccaaatcc tgtacctcgt 1260
ccgattccac ggccttctct ccttcctcgg actcgctgct gtcctccgag tcctccccac 1320
gggccagccc tgagccccta gtgctgcatg aggagacacc gcccaccacc agcagcgact 1380
ctgaagaaga gcaagaagat gaggaagaaa ttgatgtggt gtctgtggag aagaggcaaa 1440
cccctgccaa gaggtcggag tcgggctcat ctccatcccg aggccacagc aaacctccgc 1500
acagcccact ggtcctcaag aggtgccacg tctccactca ccagcacaac tacgccgcac 1560
ccccctccac aaggaaggac tatccagctg ccaagagggc caagttggac agtggcaggg 1620
tcctgaagca gatcagcaac aaccgcaagt gctccagccc caggtcctca gacacggagg 1680
aaaacgacaa gaggcggaca cacaacgtct tggaacgtca gaggaggaac gagctgaagc 1740
gcagcttttt tgccctgcgt gaccagatcc ctgaattgga aaacaacgaa aaggccccca 1800
aggtagtgat cctcaaaaaa gccaccgcct acatcctgtc cattcaagca gacgagcaca 1860
agctcacctc tgaaaaggac ttattgagga aacgacgaga acagttgaaa cacaaactcg 1920
aacagcttcg aaactctggt gcataaactg acctaactcg aggaggagct ggaatctctc 1980
gtgagagtaa ggagaacggt tccttctgac agaactgatg cgctggaatt aaaatgcatg 2040
ctcaaagcct aacctcacaa ccttggctgg ggctttggga ctgtaagctt cagccataat 2100
tttaactgcc tcaaacttaa atagtataaa agaacttttt tttatgcttc ccatcttttt 2160
tctttttcct tttaacagat ttgtatttaa ttgttttttt aaaaaaatct taaaatctat 2220
ccaattttcc catgtaaata gggccttgaa atgtaaataa ctttaataaa acgtttataa 2280
cagttacaaa agattttaag acatgtacca taattttttt tatttaaaga cattttcatt 2340
tttaaagttg atttttttct attgttttta gaaaaaaata aaataattgg aaaaaatac 2399
<210>5
<211>4037
<212>DNA
<213>小鼠
<220>
<221>小鼠包含基因1的SRY-框(Sox1)
<222>(1)..(4037)
<400>5
gtcactcgcc agcgcgccat gcaaatcacc gccgccgccg gttcccattg gccgcggcgc 60
gctcatttaa tggcagcccg ggcccggcgt atggctgctg ggccccccgc gccaccggcc 120
ccgcgtgcgc ctccgctccg agcgcacggc ctcgggcagg cagcggacag cttgtcctgg 180
gcacagcggc acagctctct ggctctctgc tcgcgttggc actcccactg ctgtccctaa 240
ccccctccct ggctgcaccg cgatcgcccc ctccgaaccc ccctccgagt ccccctcagc 300
gcctggctcc ccccaggcac ctgggaccag cacatgccca gcgcacgcgg cgcaccgcct 360
tgctagaagt tgcggtccca gagttggaag ccgccaagga agccagcaca ggaacggaga 420
cttcgagccg acaagaggag gcagcgaacc ctgcgtcggg cccaggggca ccgcttcaga 480
cccagaaagt ggagcctcaa cttggccacg actgcacctg tttgcacagt tcagccctga 540
gtgaccggac ggcagcaatc aacctggcca tcggcctctt tggcaagtgg tttgtgcacc 600
gggagaaact ttccacctgc gagctggacc cgcgctaagt gcgtgtgctt ttgcctcttt 660
tttgttgttg ttgttgttgt ggcctccacc caaccccctt ctctccgcta ggcacccacc 720
gcacacacac cccccccccc agtctctctg ggctgatcct ctctccaccc acccaccccc 780
acccggccgt ctatgctcca ggccctctct ttgcggtacc ggtgaacccg ctagccgccc 840
agatgtacag catgatgatg gagaccgacc tgcactcgcc cggcggcgcc caggcgccca 900
cgaacctctc gggcccggcc ggggcgggcg ggggcggcgg tgggggcggg ggcggcggcg 960
gcggcggggg caccaaggcc aaccaggatc gggtcaagcg gcccatgaac gccttcatgg 1020
tgtggtcccg cggacagcgg cgcaagatgg cccaggaaaa ccccaagatg cacaactcgg 1080
agatcagcaa gcgcctcggg gccgagtgga aggtcatgtc cgaggccgag aagcggccgt 1140
tcatcgacga ggccaagaga ctgcgcgcgc tgcacatgaa ggaacacccg gattacaagt 1200
accggccgcg ccgcaagacc aagacgctgc tcaagaagga caagtactcg ctggccggcg 1260
ggctgctagc ggccggcgcg ggtggcggcg gcgcggccgt ggccatgggt gtgggcgtgg 1320
gcgtcggggc ggcggcggtg ggccagcgct tggagagccc aggcggcgcg gcgggaggag 1380
gctacgcgca tgtcaacggc tgggctaacg gcgcctaccc cggctcggtg gccgcggcgg 1440
ctgcggccgc ggccatgatg caggaggcac agctggccta cgggcagcac ccaggcgcgg 1500
gcggcgcgca cccgcacgca cacccggcgc acccgcaccc gcaccatccg cacgcgcatc 1560
ctcacaaccc gcagcccatg caccgctacg acatgggcgc gctgcagtac agccccatct 1620
ccaactctca gggctacatg agcgcgtcgc cttcgggcta cggcggcatc ccttacggcg 1680
ccgcggccgc cgccgccgcc gctgcgggcg gcgcgcacca gaactcggcg gtggcggcag 1740
cggcagccgc ggcagccgcg tcgtcggggg ccctgggcgc cctcggatct ctggtcaagt 1800
cggagccgag cggcagtccg ccggccccgg ctcactcacg ggcaccgtgt cccggggacc 1860
tgcgcgagat gatcagcatg tacctgcccg ccggcgaggg tggcgacccg gcggcggcag 1920
cggctgcggc ggcccaaagc cggctgcact cgctgccaca gcactaccag ggcgcgggcg 1980
cgggcgtcaa cggcacggtg cccctgacgc acatctagcg ccgcggggac gccggggaca 2040
ctgcggctta aggccggcgc cccggcgacg aagagcgagg cctgcgcccc agcctccaga 2100
gcccgacttt gtaccgaggt ccccgcgctc tcgataaaag gccgctctgg agagccgagc 2160
gccaggtgac atctgccccc atcaccttcc ccaggactcc gaggcgctga caccagactg 2220
gcctcttaga ctgaactttg gtgttttcat gagacctttt gtacagtatt tatcgtccgc 2280
agaggaggca cacagcgttt tctcggcttc ggaggacaaa agacaaaaac ccagcgaggc 2340
gatgccaact tttgtatgac tgccggctct gtaacttttt ccggggttta cttcccgcca 2400
gctcttctgc ctgaggccga gtgacggacc tcgagccctt ctcacttgtt ataaatctaa 2460
gtaaggcaga tccaaacatt tacaagtttt ttgtagttgt taccgctctt ttgggttggt 2520
tggttaattt ataccgcaat cccctctcag acggtggagt tatattctgg gttttgtaaa 2580
tctctgtatc cgagcatttc caattttttg ttttgttttg tattatttct tgtaaatgcg 2640
ttgtgacatt tttattttag gcgttgcgat acggggggaa gaggagtcgg atgttgtaca 2700
tagcctgcaa gtctttcatc taaaagcaaa aaacaaagag agataccccc aaaatgcatc 2760
aaatttgaat caatacattt aagagagaaa agcccgtttc cctgtgaaat cgaaacgtgc 2820
taattttata tgcatgtttt atgagttcaa aatacaatta gcaatctgtt ggaggagaaa 2880
ttatctgcag ggcccaagag taaggaaatc ccaccaagcg gagtgcagcg tttccgtgac 2940
tttattcggt ggggaaagag aaatcttaaa ctccatagat tattttgtag agttcaagtt 3000
gacacagaag ggaagtaatt acaaaatgct tcctaatggt ttagcgtttt aactgccatg 3060
gccctggctt attttttttt gcatttcttt cctgtggttc tgccttttgc atactgtagc 3120
agttttgagg cagctgggtc tcagaaggag gatgggttgt gctcagtggt gggacaaggc 3180
caaggatagg gacaacagcc accgccaaga cagcgtgcct ttgatttctc tgtaattgga 3240
attgtaagtg aaattatctt cctgtgcttc aaggaagcaa tcctgaccca gacctcacca 3300
ccacagagtc tctcacccag gtcttatccc atcccctccc gattcctctc tgggaaaatc 3360
caacataatt ctaccgattt tcttacacac acacacacac acacacacac acacactctc 3420
tcctgtgtga accgggatgc agattgccag ggaatgtaaa cacagaatgc tgtgtttatc 3480
attcctgacc agatcttgag gttgtttgat gctttaaata tttttaatta tattttttct 3540
aggtgtttat tggtatattg caggtccccc ccccctggaa tttaaagttc cctgtaaaac 3600
tttgtcttca agtaatctga cagcattaaa tattgcattt aaaagttata ctgtagcaaa 3660
tatgttttaa aattaatcat gacattagaa tgaaattcta tttttgaagg aaattttctt 3720
taagtccaga tggggaatga tactattttc agcatccttt cccctgattt tttcccaatt 3780
tcttttcttg gaatgaatat ggactagcca ttcaaaagtg gacttaatct agcaattcag 3840
taagaccaga gctcaaccta cattggagaa tatctttcag tataaatgct aatattacaa 3900
gtgacacgtg tgattttttt taaagtcatt taatgatttt gcttaaaccc ctcattcctt 3960
aaagtgattg caagagattc aagaatgacg cccactgctt tctgatgagg taataaaaga 4020
acacccctcc ctttttc 4037
<210>6
<211>1816
<212>DNA
<213>小鼠
<220>
<221>小鼠Kruppel-样因子2(肺)(Klf2)
<222>(1)..(1816)
<400>6
acacacagtc cctgccatgg cgctcagcga gcctatcttg ccgtcctttg ccactttcgc 60
cagcccgtgc gagcgcggcc tccaggagcg ctggccgcga aatgaacccg aggcgggcgg 120
cacggatgag gacctaaaca acgtgttgga cttcatcctc tccatgggat tggacggtct 180
gggcgccgaa aatcctcccg agcccccgcc gcagcccccg ccgcctgcct tctactaccc 240
ggagccgggt gctccgccgc cctacagcat ccccgcggcc agcctgggaa cagagctgct 300
gcgccccgac ctggacccgc ctcaggggcc ggctctgcac ggccgcttcc tcctcgcgcc 360
tcccgggcgg ctagtgaagg ccgagccccc cgaggtggac ggcggcggct acggctgcgc 420
tccgggcctg gcccacggac cgcgcgggct gaagctcgag ggcgccccag gagcgacagg 480
tgcatgcatg cggggtcccg ccggccgccc cccgccgccc ccggacacgc cgccgctcag 540
ccccgacggc cccctgcgca tcccggcgtc cggtccccgc aacccgttcc cgccgccctt 600
cggtcccggc cccagcttcg gcggtcccgg ccccgcgttg cactacgggc ctcccgcgcc 660
tggcgccttc ggtcttttcg aggacgcggc ggcagcggcg gcggcgctgg gcttggctcc 720
acctgccacg cgcggtctcc tcacgccgcc ctcgtccccg ctggagctgc tggaggccaa 780
gcccaaacgc ggccgccgct cctggccccg caagcgcgcc gccacacata cttgcagcta 840
caccaactgc ggcaagacct acaccaagag ctcgcaccta aaggcgcatc tgcgtacaca 900
cacaggtgag aagccttatc attgcaactg ggaaggatgc ggctggaagt tcgcgcgctc 960
tgacgagctt acccgccact accgaaagca cacaggtcac agaccctttc agtgccactt 1020
gtgcgaccgg gccttctcca ggtccgacca cctggccttg cacatgaagc gacacatgta 1080
gcctgggtcg actcggctag cccatgcgcg actgtggcag gttccacgcg cggggcacgg 1140
tccccttgca aacagactgc tatttattgg accttaggac agagccggac aagtgtggcc 1200
acaggaaaat gactctgcca ccagttctgg cccccacagt gactgaaggc cccaggaaag 1260
aagacaggag tctgtgaaga atgttttcaa aatggtgcaa taattgactt atttccctcg 1320
ggtccccact agaggatcga ggctagatgc cttgtgagaa atgcctttga gtttactgtc 1380
cccaacgttt ttataatatt gtatataaga ctatgaccga ttgtatttct ataagggaga 1440
cgatggcatc tctgccgcct gcttcgtttt tatacgactt ttttttaatt aaagttttgg 1500
atctttggag gaatcacggt agtggtgtgg ctggggatag ggtaggtcct gaggggacag 1560
ggagcagtca gtgcctgtgg ccaaggtcac cagctgcagc ccccagctgc caaggcctgt 1620
gggttcgcta taaatgtaaa catggtgttt taggattgag cacaggttat ttttaagtct 1680
gctactttga gccataattt gccccacccc caccccctgt atcccaagtg ggaaaagcct 1740
tggctccact gatgtggctg accattcctt tttttagaaa gaaaaataga aaagaaaatt 1800
aaaaaccttt tcctgg 1816
<210>7
<211>1728
<212>DNA
<213>小鼠
<220>
<221>小鼠Kruppel-样因子5(Klf5)
<222>(1)..(1728)
<400>7
cgcggggcag gtacgcgctc tcttaggttg ctggtggagc ttgggggtgg cgggagcggg 60
ttccggcgag agggtgagcg agcgctgggg cggggcggga gaaagtggct gcccgaggac 120
ctcggcggtg acgcgtggcc gagcccagga gccccgatct ccgtgcccgc cttcgtgagc 180
gtctggctgc cggcccaggg gtcccccgcc gcggcccccc gccgagtccg ccgtcccgtg 240
ccagcccgag cgaggtggga tcgcgatcgc tccgtgtccc gctcccgtaa tccccagacc 300
gtccatgccc acgcgggtgc tgaccatgag cgcccgcctg ggaccactgc cccagccgcc 360
ggccgcgcag gacgagcccg tgttcgcgca gctcaagccg gtgctgggcg ctgcgaaccc 420
ggcccgcgac gcggcgctct tctccggaga cgatctgaaa cacgcgcacc accacccgcc 480
tgcgccgccg ccagccgctg gcccgcgact gccctcggag gagctggtcc agacaagatg 540
tgaaatggag aagtatctga cccctcagct ccctccagtt ccgataattt cagagcataa 600
aaagtataga cgagacagtg cctcagtggt agaccagttc ttcactgaca ctgaaggcat 660
accttacagc atcaacatga acgtcttcct ccctgacatc actcacctga gaactggcct 720
ctacaaatcc cagagaccat gcgtaacaca gatcaagaca gaacctgtta ccattttcag 780
ccaccagagc gagtcgacgg cccctcctcc tcctccggcc cccacccagg ctctccccga 840
gttcactagt atcttcagct cccaccagac cacagcgcca ccacaggagg tgaacaatat 900
cttcatcaaa caagaacttc ctataccaga tcttcatctc tctgtccctt cccagcaggg 960
ccacctgtac cagctgttga atacaccgga tctagacatg cccagttcga caaaccagac 1020
ggcagtaatg gacaccctta atgtttctat ggcaggcctt aacccacacc cctctgctgt 1080
tccacagacg tcaatgaaac agttccaggg catgccccct tgcacgtaca ccatgccaag 1140
tcagtttctt ccacagcagg ccacctactt tcccccgtca ccaccaagct cagagcctgg 1200
aagtcccgat agacaagctg agatgctgca gaatctcacc ccacctccgt cctatgccgc 1260
tacaattgct tccaaactgg cgattcacaa cccaaattta cctgccactc tgccagttaa 1320
ttcgccaact ctcccacctg tcagatacaa cagaaggagt aacccggatc tggagaagcg 1380
acgtatccac ttctgcgatt ataatggttg cacaaaagtt tatacaaagt cgtctcactt 1440
aaaagctcac ctgaggactc atacgggcga gaagccctac aagtgcacct gggagggctg 1500
cgactggagg tttgcccggt cggatgagct gacccgccac tacaggaagc acacgggcgc 1560
caagccgttc cagtgcatgg tgtgccaacg cagcttctcc cgctccgacc acctcgcgct 1620
gcacatgaag cgccaccaga actgagcgag cgagcgctgc gcccacccgc ctgacgcctt 1680
gcagtccgct ctgccatcct ttaaaccgca gacctaactt cataaaaa 1728
<210>8
<211>3518
<212>DNA
<213>禽类
<220>
<221>小鼠v-myc髓细胞瘤病病毒爱基因同源物1v,
肺癌来源的(禽类)(L-Myc)
<222>(1)..(3518)
<400>8
cccgagccgg cggggagccg ctccgctcca ggtggcgggc ggcgggagcg aggtgaggct 60
gcgggtggcc cgggcagggg tccccagggg actggcgggc tgcaaggctg cagactgcct 120
tcgagacagc gcgcccccgc ccggccctgc tgtgcccccg gagctgagct ccgggcggtg 180
ctggcaaagt ttgctttgaa ctcgctcccc tcagcctggt cggcccgttg cgagctgccc 240
tgagcgagct gaccccaggc caggcttccc aggagcaggg accagggcgc gggctgcaag 300
ctggtgggcc tggggagaga ccagagcccc gcagccagct gcagcgaggg actcggagcc 360
gcctcttccc tcggcgggca ccgcagtcag ctcgtctccc ccttccctcc cgcagggagc 420
ggacatggac ttcgactcgt atcagcacta tttctacgac tatgactgcg gagaggattt 480
ctaccgctcc acggcgccca gcgaggacat ctggaagaaa ttcgagctgg tgccgtcgcc 540
ccccacgtcg ccgccctggg gctccggtcc cggcgccgtg gacccagcct ctgggattaa 600
tcccggggag ccgtggcctg gagggggtgc cggggacgag gcggaatctc ggggccattc 660
gaaagcctgg ggcaggaatt atgcttccat cattcgccgt gactgcatgt ggagcggctt 720
ctccgcccga gaacggctgg agagagtggt gagcgacagg ctggccccag gcgcgccccg 780
ggggaacccg cccaaagcgc ccgctacccc ggacggcact cctagtctgg aagccagtaa 840
cccggcgccc gccacccaat gtcagctggg cgagcccaag actcaggcct gctccgggtc 900
cgagagcccc agcgattctg aaggtgaaga gattgacgtg gtgaccgtgg agaagaggcg 960
atctctggac atccgaaagc cagtcaccat cacggtgcga gcagaccccc tggacccctg 1020
catgaagcac ttccatatct ctatccacca acagcagcat aactatgctg cccgttttcc 1080
tccagaaagt tgctctcaag agggggatcc tgagccaggt ccccaggaag aggctccgga 1140
gatagaagct cccaaggaga aagaggagga ggaagaggaa gaggaggaag aagagattgt 1200
gagcccccca cctgtcggaa gtgaggctcc ccagtcctgc caccccaaac ctgtcagttc 1260
tgacactgag gacgtgacca agaggaagaa ccataacttc ttggaacgaa aaaggaggaa 1320
tgacctccgc tcccggttcc tagccctgcg ggaccaggtt cccaccctgg ccagctgctc 1380
taaggccccc aaagtcgtga tcctcagcaa ggcgttagaa tacttgcagg ctttggtggg 1440
ggctgaaaag aaaatggcta cagagaaaag gcagctccgg tgtcggcaac agcaactgca 1500
aaagagaatc gcgtacctca gtggctacta accgaccaga acgcctgact tcttggtctc 1560
acagacacaa gcttattgtt taacctctct ctccctttta gtaatttgca cattttggtt 1620
acagcggggg gggcagtctg gacagtagat cccagaatgc attgcagccg gtgtgcgcac 1680
acaataaggg cttgcattct tggtaacctc gaaacccaat tctccctctt ccccgaccga 1740
ctcatgggaa tgctgtcctt ctctggcgcc tttggcttct cagcaggcag ctactgagga 1800
gatttggggt ctgcttagct cactagctcc tgacgaaagg ctgacagatg ctatgcaaca 1860
ggtggtggac gttgttgggg ctgcagccta cgtgaaatct cacactgtgc tggggcttca 1920
ggctaggaaa ggatgctgct ctcactgctg tctctgggga tgatctgagg acagctgggc 1980
ctggatactg tcccccaggc tccgttttcc aggaggcaag cgagctgtcc cgggcgaaga 2040
caagctcgca gacttgatca gcatggagca ttacctcacc gtcagacact ttacagtagc 2100
tgtggagtgg aaacctttaa gatagatttg gatggtaggc cacacccttc cctgcacgct 2160
caatgctatg actttgagaa agggcttggc ctctatgtag agtctttgtc tcagagttct 2220
ctgggccttc tcagagaggg acctttctat cctcacaagg gacctttttg tttcttcctg 2280
cctttgttat gcaatggcca ccacagcacc ctttcacacc gaccagaaat atttccccag 2340
gacataggga aatgggtcac agcccaggac ctggggaagc cttggcatcc ccactcatga 2400
ccaacggtcc ttgcccaggt tttctgcagg gctatttgag gcccagcttg gaaccttttc 2460
tcgaggcaga tagttacaag gtgcctctga aggacaagcc ctatcgcttc ctctttccca 2520
cctgcctctc tgtcagatct tgactctgtc tacaatctgc tggaacagtg caaacctgtc 2580
cttctcgagc aactttgctg gctctgcagc caccatcctg attctctgcc ggcctgagtc 2640
acatcctttc ccctggaatc tgggccttac agagagattc agaggggcac cgcttgcatt 2700
cacctgatgc ccccagaagg taaacttact tcctggtggg ttgtcagtgt acctctagga 2760
acgctactca gccaacaagg agagtttgct ccagctgtgt tctgcaactc cctgtggaat 2820
caaagtacag ccctctatcc tgggaaagtc accaagctag cagccgtcac gtgagcatct 2880
ttcaggagat cctaagcttt gcctgaaaga agagccagcc tttccagaac tctacccagg 2940
aaagcagatc tgttcctgct ggccctgggc ttggaagtag gggtacagtg tgggggacag 3000
acagtaagta acaacatgtg gctctcaaaa accagctacc acttccaaat tggctcccaa 3060
ctgtgatggc ctccaattac ttcctggcct caagtcctag aggaagcttc ggaagttgct 3120
gttgtacctg ttggggcagg acttctaggc accaagggac tcctggaact atcttgggag 3180
gacaagtggt gaacaggcta aagtctcatc tgaatggctt gtgttttata agctgctgcg 3240
gggttgtatg ctgtgggcgt cttttgtttt tgtttttgct ttttttttta atactgtatt 3300
tttgtatgct tttttgcaaa gtggtgttaa ctgtttttgt ataagaaaaa caaaaaacaa 3360
aaaccctcct gttgcaaggg tctggtttat tttgaaaggt gcatttacct gaaattttgt 3420
atttagttgt aatcattaat tgcttgattt taaactgttg ccttctggga catcttctaa 3480
taaaaagatt tctcaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaa 3518
<210>9
<211>2596
<212>DNA
<213>禽类
<220>
<221>小鼠v-myc髓细胞瘤病病毒相关癌基因,神经母细胞瘤衍生的(禽类)(N-Myc)
<222>(1)..(2596)
<400>9
agtgacagtc atctgtctgg acgcgctggg tggatgcggg gggctcctgg gaactgggtt 60
ggagccgaac gagcgctagc caggcgtaag cgcgcacaca ctgcagccgc cggaggacaa 120
ccccctcccg ccgccgctcc ctcagcccac ccggagaccc cagccccgag tcgcctccgg 180
atccccggca gtctgcggga gagttggagg ttggcgcgac tctgctgctc tccacgggaa 240
ggaagcactc ccccatatta aaaagagcgg agatattaaa agagaggcga acccatgccc 300
agctgcaccg cgtccaccat gccggggatg atctgcaaga acccagacct cgagtttgac 360
tcactgcagc cctgcttcta cccggacgaa gatgacttct acttcggcgg tcccgactcg 420
accccaccgg gggaggacat ctggaagaag tttgagctgc tgcccacgcc cccgttgtcg 480
cccagccgcg ccttcccaga gcacagcccg gagccttcga attgggctac ggagatgctg 540
ctgccggagg ccgacctgtg gggcaacccg gccgaggagg atgcgttcgg tctcgggggc 600
ctgggtggcc tcactcctaa tccggtcatc cttcaggact gcatgtggag cggcttctct 660
gcccgcgaga agctagagcg cgcagtgaac gaaaaactac agcacggcca cgggcccccg 720
ggcgtcagct cagcctgctc ggctcccgga gtgggtgcca gcagccccgg gggccgtgcc 780
cttggtgggt cgtcgagtgc tagccacacc ggggccaccc tgcctaccga cctctcccac 840
ccggctgccg aatgtgtgga ccccgccgtg gtcttcccct tcccggtgaa caagcgagag 900
tcggcgtcgg tgcccgctgc ccccactagc gccccggcga ccagcgctgc ggtcactagt 960
gtgtctgttc cagctactgc cccggtggct gctcctgctc gtgcaggcgg ccgtcctgcc 1020
agcagtgggg aggccaaggc cctcagcacc tccggagagg ataccttgag cgactcagat 1080
gatgaggatg acgaggagga agatgaagag gaggaaatcg atgtggtcac cgtagagaag 1140
agacgttcct cctctaacaa caaggcggta accactttca cgatcactgt gcgtcccaag 1200
acctccgctc tgggcctggg gcgagcacag cctggcgagc tgatcctcaa gcgctgtgtt 1260
cccatccatc agcagcacaa ctatgctgca ccctcaccct acgtggagag cgaggacgcg 1320
cccccgcaga aaaagatcaa gagcgaggct tctccacgcc ccctcaaaag tgttgttcca 1380
gcaaaagcga agagcctgag cccccgaaac tcagactcgg aggacagcga gcgccgccgc 1440
aaccacaaca tcctggagcg tcaacgccgg aacgacctgc gctccagctt cctgacgctc 1500
agggaccatg tgcctgagct ggtgaagaac gagaaggccg ccaaggtggt catcttgaaa 1560
aaggccaccg agtacgtgca cgccctacag gccaacgagc accagctcct gctggaaaag 1620
gagaaactgc aggcgaggca gcagcagttg ctaaagaaga tcgaacacgc tcggacttgc 1680
taaacgtttc ccacacggac agtcactgcc actttgcaca ttttgatttt tttttttttt 1740
taaacaaaca ttgtgttgac attaagaatg ttggtttact ttcaaattgg tcccctgtcg 1800
agtctggatc tgggtagggg gcaggacacg gggttctgcc atgaccttgg aaaaaaaact 1860
gacttatggg atgctgggtg gcttgttttc ctcctccata tcacctggtg acagccgtgg 1920
aagttcggga cactaaggag cttcaggagg ctgtgaagtc accttgttcc ggtccaagat 1980
tccaaacaga gtcattcctt ctttttacaa tggtgcttaa gttccagcaa atgccacaga 2040
agggggggtt gccatttgat gcccctggga acacttgtgt aaataccatt gatacacccg 2100
ccttttgtat acgtcctggg taatgagagg tggctcttgc ggccagtatt agactggaag 2160
ttcacaccta agtactgtaa gaatacctca atgtttgagg ggcatgtttt gtatacaaat 2220
atattgttaa tctgttatgt actgtactaa ttcctacacg gcctgtatac tttagtatga 2280
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atatatatat attccttttt ttcctagcct gtttcttcct tgtttactgt atttgttcat 2460
gtttggtgca tagaactggg taaaatggca aagttctgtg tttaatttct tcaaaatgta 2520
tatatttagt gctgcacctt agagcacttt gaaatacctc atgtttatga aaataaatag 2580
caattaaatg atgcaa 2596
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<212>DNA
<213>人造
<220>
<223>探针序列
<220>
<221>Klf4探针序列
<222>(1)..(1425)
<400>10
atggctgtca gcgacgctct gctcccgtcc ttctccacgt tcgcgtccgg cccggcggga 60
agggagaaga cactgcgtcc agcaggtgcc ccgactaacc gttggcgtga ggaactctct 120
cacatgaagc gacttccccc acttcccggc cgcccctacg acctggcggc gacggtggcc 180
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tcgtcttccc cggcgagcag cggccctgcc agcgcgccct ccacctgcag cttcagctat 420
ccgatccggg ccgggggtga cccgggcgtg gctgccagaa acacaggtgg agggctcctc 480
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gtgagcccct cgggcggctt cgtggctgag ctcctgcggc cggagttgga cccagtatac 600
attccgccac agcagcctca gccgccaggt ggggggctga tgggcaagtt tgtgctgaag 660
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ggaagcccag acggcagcca ccccgtggta gtggcgccct acagcggtgg cccgccgcgc 780
atgtgcccca agattaagca agaggcggtc ccgtcctgca cggtcagccg gtccctagag 840
gcccatttga gcgctggacc ccagctcagc aacggccacc ggcccaacac acacgacttc 900
cccctggggc ggcagctccc caccaggact acccctacac tgagtcccga ggaactgctg 960
aacagcaggg actgtcaccc tggcctgcct cttcccccag gattccatcc ccatccgggg 1020
gccaactacc ctcctttcct gccagaccag atgcagtcac aagtcccctc tctccattat 1080
caagagctca tgccaccggg ttcctgcctg ccagaggagc ccaagccaaa gaggggaaga 1140
aggtcgtggc cccggaaaag aacagccacc cacacttgtg actatgcagg ctgtggcaaa 1200
acctatacca agagttctca tctcaaggca cacctgcgaa ctcacacagg cgagaaacct 1260
taccactgtg actgggacgg ctgtgggtgg aaattcgccc gctccgatga actgaccagg 1320
cactaccgca aacacacagg gcaccggccc tttcagtgcc agaagtgtga cagggccttt 1380
tccaggtcgg accaccttgc cttacacatg aagaggcact tttaa 1425
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<212>DNA
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gacggcatcg cagcttggat acac 24
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<212>DNA
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<220>
<223>引物
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ttatcgtcga ccactgtgct g 21
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<212>DNA
<213>人造
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cagaggagga acgagctgaa gcgc 24
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<212>DNA
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<220>
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ggttacctct tcctcccact ccag 24
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<220>
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gcgaactcac acaggcgaga aacc 24
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<212>DNA
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tgcgggcgga catggggaat cc 22
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ggtttttaga ggatgggttg agtg 24
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<211>30
<212>DNA
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<220>
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cggatcccta aaaccaaata tccaaccata 30
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<212>DNA
<213>人造
<220>
<223>引物
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aatgtttatg gtggattttg taggt 25
<210>20
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<212>DNA
<213>人造
<220>
<223>引物
<400>20
cccacactca tatcaatata ataac 25
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<212>DNA
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gcaatgcatg cggtctac 18
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<212>DNA
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<220>
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ctcttggtag caccagctca 20
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<220>
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aaagtcaatg gctcccacga a 21
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<212>DNA
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<220>
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cttcagtctg tacttcactg g 21
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<212>DNA
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atgccaaaga aagaaacgac 20
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agaggctgta gaacatgatt 20
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<220>
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agcaagaacg acttcgtgat g 21
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catcaccatc ttccaggagc 20
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<212>DNA
<213>人造
<220>
<223>引物
<400>32
atgccagtga gcttcccgtc 20
Claims (28)
1.将脑膜细胞诱导重编程为诱导的多能性干细胞的方法,所述方法包括:
用包含多能性干细胞因子的cDNA导入脑膜细胞;
在适宜上述被导入的脑膜细胞生长的培养条件下培养该细胞。
2.如权利要求1的诱导重编程方法,所述方法还包括:
c)鉴定多能性干细胞克隆。
3.如权利要求1或2所述的诱导重编程方法,其中所述导入cDNA的方法为用包含所述cDNA的病毒载体感染脑膜细胞。
4.如权利要求1或2的诱导重编程方法,所述多能性干细胞因子包括Sox2、Oct4以及Klf4。
5.如权利要求4的诱导重编程方法,所述多能性干细胞因子还包括C-myc。
6.如权利要求4的诱导重编程方法,其中所述Sox2还可以是Sox1,Klf4还可以是Klf5或Klf2。
7.如权利要求5的诱导重编程方法,其中所述C-myc还可以是L-Myc或N-Myc。
8.如权利要求4-7中任一项所述的方法,其中所述Sox2为SEQ ID NO:1;Oct4为SEQ ID NO:2;Klf4为SEQ ID NO:3;c-Myc为SEQ ID NO:4;Sox1为SEQ ID NO:5;Klf2为SEQ ID NO:6;Klf5为SEQID NO:7;L-myc为SEQ ID NO:8;N-Myc为SEQ ID NO:10。
9.如权利要求1-8中任一项的诱导重编程方法,所述病毒载体为逆转录病毒载体。
10.如权利要求9的诱导重编程方法,所述逆转录病毒载体为pMX。
11.如权利要求1-10中任一项的诱导重编程方法,所述脑膜细胞来源于哺乳动物。
12.如权利要求11所述的诱导重编程方法,所述哺乳动物为小鼠。
13.如权利要求12所述的诱导重编程方法,所述脑膜细胞优选为保藏在中国典型培养物保藏中心的保藏编号为CCTCC NO:C200835的小鼠脑膜细胞。
14.通过权利要求12中方法产生的多能性干细胞用于产生嵌合小鼠的用途。
15.脑膜细胞用于经诱导重编程而产生多能性干细胞的用途。
16.如权利要求15中的脑膜细胞的用途,所述诱导脑膜细胞重编程的过程包括将包含多能性干细胞因子的cDNA导入脑膜细胞。
17.如权利要求16中的脑膜细胞的用途,其中所述多能性干细胞因子包括Sox2、Oct4以及Klf4。
18.如权利要求17中的脑膜细胞的用途,其中所述多能性干细胞因子还包括C-myc。
19.如权利要求17或18中的脑膜细胞的用途,其中所述Sox2还可以是Sox1,Klf4还可以是Klf5或Klf2。
20.如权利要求18中的脑膜细胞的用途,其中所述C-myc还可以是L-Myc或N-Myc。
21.如权利要求16-20中任一项的用途,其中所述导入为使用包含所述多能性因子cDNA的病毒载体感染脑膜细胞。
22.如权利要求15-21中任一项的脑膜细胞的用途,所述脑膜细胞来源于哺乳动物。
23.如权利要求22中脑膜细胞的用途,所述脑膜细胞来源于小鼠。
24.多能性干细胞因子用于诱导脑膜细胞重编程为多能性干细胞的用途。
25.如权利要求24所述的多能性干细胞因子的用途,其中所述诱导脑膜细胞重编程的过程包括将多能性干细胞因子的cDNA导入脑膜细胞。
26.如权利要求24所述的多能性干细胞因子的用途,其中所述导入为使用包含所述多能性因子cDNA的病毒载体感染脑膜细胞。
27.如权利要求24-26任一项所述的多能性干细胞因子的用途,所述多能性干细胞因子选自Sox2、Sox1、Oct4、C-myc、L-Myc、N-Myc、Klf5、klf2、Klf4和其组合。
28.如权利要求24-27中任一项所述的多能性干细胞因子的用途,其中所述脑膜细胞来源于小鼠。
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