CN101287988A - 用于流感诊断和治疗的方法和组合物 - Google Patents

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Abstract

本发明提供用于检测样品中流感病毒的存在和量的方法和组合物，包括高危流感A株。本发明还提供检测对象是否感染流感病毒以及检测流感病毒类型和株的方法。该方法包括将对象的样本与PDZ多肽(PDZ)和/或PDZ配体(PL)接触，并检测PDZ和PL之间是否发生结合相互作用。还提供鉴定抗病毒剂的分析，以及利用组合物改变流感感染细胞中PDZ与PL结合的方法。

Description

用于流感诊断和治疗的方法和组合物
相关申请
本申请要求美国临时申请60/696,221(2005年7月1日提交)、美国临时申请60/726,377(2005年10月13日提交)、60/765,292(2006年2月2日提交)和60/792,274(2006年4月14日提交)的优先权，上述各申请均在此完整引入作为参考。
发明背景
流行性病毒感染造成世界范围内严重的丧失生命并引起人类疾病，范围从普通感冒到危及生命的流感、西尼罗河病毒(West Nile)和HIV感染。及时的检测、诊断和治疗是在流行性、广泛流行性和动物流行性背景中限制疾病传播的关键。快速筛查和诊断方法对减少患者患病和群体风险是特别有用。同样地，快速抑制病毒组装和增殖的治疗剂特别适用于治疗方案。
最近，流感A已经显示成为对人群潜在的严重风险。禽类株已经交叉到人类，越来越多的证据表明人和人之间的传播很快就可能发生1。禽流感株对人群影响的实例是最近出现的超强毒禽流感株H5N1(鸟流感)，其中大约50％的感染个体(42人)死亡，在中国、印度尼西亚和越南由于屠宰上百万家禽导致食物短缺。跟踪流行的可能性，世界卫生组织在2005年7月考虑将全球威胁水平提高到4或者5(共6个级别)。一位舆论领袖(opinion leader)最近在媒体上表示，对禽流感的“检测、监督、预防和治疗”...(是)...“与时间的竞赛”1。因为很少从人类分离出禽类株，并且人类中的死亡率很高，看来在全世界人群中实际上不存在免疫力。因此，存在世界范围大流行的可能。对比来说，在1918年全球流感流行造成大约2-4千万人死亡。今天随着人口密度的增加，可能会有更高的死亡率。
在病毒安全参考实验室中，例如满足防护级别4(ContainmentGroup 4)病原体的要求，用于流感A感染的检测和确认的病毒学试验方法是耗时耗力并且高风险的，即，包括在含胚鸡蛋中的病毒分离4-7天；从死亡或者濒死胚胎中收集尿囊液；在红细胞凝集和红细胞凝集抑制试验、免疫扩散试验中检测上述液体；和，利用专门制备的单一特异性抗血清，在过夜免疫扩散分析中通过红细胞凝集素和神经氨酸苷酶，对液体中的病毒进行最终分型。现有的分型包括鉴定16个不同的可能的病毒红细胞凝集素蛋白的每一种与9个不同的可能的病毒神经氨酸苷酶蛋白的组合。令人遗憾的是，因为只有很少的流感A致病株在当时危及经济和健康，这种耗时的工作很多可能是不需要的和浪费的。
现有的流感抗原的快速免疫诊断检测，像“Binax NOW FIuA andFluBTM”(Binax，Inc.，Porltand，ME)，″Directigen Flu A+BTM″(BectonDickinson，Franklin Lakes，NJ)，″Flu OIATM″(Biostar Inc.，Boulder，CO)，″Quick VueTM″(Quidel，Sand Diego，CA)，″Influ AB QuickTM″(DenkaSieken Co.，Ltd.，Japan)和″Xpect Flu A & B″(Remel Inc.，Lenexa，KS)，据报道能够检测流感A或者区别流感A和B，但重要地是，不能区别不同的流感A亚型或者流感A的致病和非致病株。该检测形式的复杂性可能要求专业训练。此外，通常需要大量的病毒颗粒以获得阳性试验结果，这限制了它们在病毒排放水平最高时的短暂窗口期的使用。分析敏感度也是可变的，在某些分析中产生高达20％假阴性试验结果，成为当前的重要关注36(例如，参见“WHO recommendations on the useof rapid testing for influenza diagnosis(WHO推荐使用流感诊断的快速检测)”，2005年7月)。最近引入基于逆转录PCR的诊断(RT-PCR)用于确认流感A病毒，使检测能力产生重要进步36，但是费力，且需要高度受训的人员，使得当场(on-site)和野外检测(field-testing)困难。因为反转录酶的相对低效，有效检测病毒RNA可能需要大量病毒(例如，104病毒颗粒)和多至20个引物。尽管存在这些显著的障碍，但在美国、加拿大和香港的12个不同的参与检测实验室之间，最近记载了参考实验室中高水平熟练的RT-PCR流感A检测36。利用RT-PCR和HA引物，Lee等人37描述了H5和H7亚型病毒间的定量鉴别。Munch等人38报告了利用NP引物，在RT-PCR中，相似的可能差异特异性。令人遗憾的是，RT-PCR不易于适合流行背景中对象的高通量筛查，或者在农业或者医护点(point-of-care)背景中的现场使用。
此外，新流感株的复杂性、多样性和快速出现使高风险株的诊断困难，因此快速反应在现在几乎是不可能的。对流行病学家来说，高突变率和基因重配造成的多样性，使得难以预期新品系在何处出现和及时做出反应引入新的PCR诊断引物。因而，(目前)流感的多样性表明了多重PCR方法的必要性。
禽流感病毒(H5N1)被认为是通过水生野禽中流感病毒的突变和部分重配进化的2，3。“患病”鸟类中的高致病性疾病可以不同，从疾病的明显病征很少的突然死亡到伴有呼吸症状、过度流泪、窦炎、头部水肿、无羽表皮的发绀和腹泻的更具特征的疾病，即，OIE在其健康指导中采用的“患病”的诊断病征(Manual of Diagnostic Tests and Vaccinesfor Terrestrial Animals(陆生动物诊断分析和疫苗手册)，第五版，2004，World Organization for Animal Health(世界动物卫生组织))。在被感染的鸟类中，流感A病毒仅在2-3天内就排放4，5。考虑到人类中的高死亡率，快速检测对隔离感染的禽类和人类对象和保护人群是必要的。在本领域，禽流感(bird flu)的人类病例历史上发生于东南亚地区，那里缺乏复杂的诊断分析设备、病毒安全参考BL4实验室和方法的顺畅通路。因此，在个体患者水平评估群体风险现在是非常成问题的。在其他目标中，本发明提供这些问题的解决方案。
支持农业和公众健康所需的快速诊断分析，被证明是挑战性的一即，对于抗病毒宿主应答(抗体)的血清学检测或者样本中病毒蛋白(抗原)的鉴定。流感A亚型的检测也是复杂的，因为：(i)流行病学的范围和公众健康的需要，即，对于环境样本中和感染家畜，(例如猪流感)，家禽(例如禽流感(avian flu))和人类(例如禽流感(birdflu))中病毒检测的潜在需要；和，(ii)可能检验的样品范围广，可能包括血清，鼻咽、咽喉含漱、鼻或者喉部的样本(人类)；和，泄殖腔、粪便和气管的样本(鸟类)。因为高危病毒倾向于快速传播，速度极为重要。高亲合力的特异性结合试剂无疑是关键和必需的。在其他目标中，本发明解决这些关键需求。
通过红细胞凝集-抑制(HI)的经典流感血清试验(用于抗体)相对简单，但在农业实践中这些试验对于免疫或者自然感染后检测禽抗体是相对不敏感的，因为血清抗体在感染后倾向于快速下降。在最优条件下，例如Xu等人39最近描述了一种胶乳凝集试验，即，利用完全热灭活的疫苗病毒和来自免疫鸟类的血清。据报道后一HI-试验具有88％的灵敏度(12％假阴性)和98％的特异性，在这种情况下，对这种危险病毒病原体的农业或者公共卫生检测来说假阴性率太高。同样地，利用中国禽类场所的样品，最近Jin等人4描述了重组流感NP抗原在ELISA分析中的可能应用。这些研究者注意到病毒排放从第2天开始，但抗病毒抗体的滴度在2周时最高。遗憾的是，在检测被感染的动物之前后者的“滞后”在当前世界范围的危机中是无法接受的。展示进一步可能的复杂因素，后者研究中的数据显示低剂量的病毒只产生非常低滴度的抗体，即，说明隐性感染可能检测不到。
流感即流感B常规诊断方法中的现有局限性在Steininger等人41发表的数据中有记录。在后来的研究中，使用不同的试验方法检测标准A型流感储存病毒制品；和，有下列发现：即，基于酶的快速分析比常规病毒分离法检测的灵敏度低大约1000倍；而常规病毒分离法又比RT-PCR的灵敏度低大约1000倍。尽管后者有灵敏度的总量限制，但ELISA仍然正确鉴别出62％的阳性样本和88％取自小于5岁的流感B患者的样本。作为差样本对分析性能影响的实例，对商业可用的流感试验分析其在检测实验性感染的志愿者的鼻咽样本中病毒抗原的灵敏度。报道的结果表明，分析灵敏度对于Directigen流感分析43(BectonDickinson)来说大约是60％；和，对流感光学免疫测定(FLU OIA；ThermoBioStar/Biota)44来说在48-100％范围内。重要的是，(不管后来的分析的明显局限性)，Sharma等人45报道了A型流感病毒感染的快速确认：(i)减少不相关的实验室试验，例如尿分析和白细胞检验，以及，(ii)抗生素在发烧婴儿和幼儿中的不恰当使用。因此，在临床实践中灵敏度相对较差的筛查分析仍然是有用的，因为该分析正确鉴别出那些需要额外随诊的患者。显而易见，为了非参考实验室的使用，需要对用户友善性、速度、分辨性和绝对定量灵敏度进行改进，即，即使用于常规流感检测。同样地，常规流感检测对于提示如何获得所需分析性能的方法没有特别的帮助，所述检测性能是检测患者样本中高危流感A株所需要的。
H5N1和H7禽流感A病毒呈现的毒力因子和H9N2流感病毒动物流行病的传播和它们与哺乳动物宿主因子的相互作用已经被综述5。在流感恶性禽类株编码的蛋白中，NS1(非结构蛋白-1)早期在感染细胞中表达，但与HA和NA不同，它与病毒粒子无关，只表达为胞内蛋白。NS1由基因组片段8编码，是增强病毒mRNA翻译的病毒调节因子；干扰宿主细胞mRNA的成熟和转运6；结合宿主mRNA的poly(A)尾；改变宿主细胞基因表达的内在小干扰RNA(siRNA)控制7；预防抗病毒蛋白激酶R的ds-RNA诱导；抑制干扰素α/β(IFN-α/β)的抗病毒作用的诱导8和拮抗其抗病毒作用9，10；和，通过巨噬细胞11和树突状细胞12刺激促炎性细胞因子的产生。INF-α/β在先天性和获得性免疫应答以及发病机理中的作用已经被综述13。
感染细胞中NS1蛋白的分布表明优选核定位，即，在细胞质、核糖体和多聚核糖体部分22-24的量较少。高毒力禽H5N1株的NS1蛋白在体外显著抑制人细胞的干扰素应答25。一些机理研究表明，NS1中羧基末端缺失可能减弱野生型A/Swine/Texas/4199-2/98(TX/98)病毒26以及马流感病毒27的体内毒力。有趣地是，缺失NS1基因的流感A似乎在干扰素-缺陷型细胞系中复制得最好28，向作者提示INF-α/β的NS1抑制可能是高效病毒增殖必需的。此外，据报道高毒力H5N1-NS1基因重重配到毒力较低的H1N1-A株中降低了杂交病毒的肺清除率，并还引起炎性细胞因子的水平升高29。Tumpey等人40报道了检测抗NS1抗体可能可用于区别已接种的和已感染的家禽，即，因为NS1只在感染细胞中表达，而不在灭活的梯度纯化疫苗病毒中表达。令人遗憾的是，后来基于抗体的血清试验方法遇到上面和HI试验相同的普遍问题：即，低灵敏度和不能在病毒排放和感染潜在传播前检测到病毒。
利用H7N3株，Cattoli等人42报告评估了对来自实验和自然感染火鸡的气管样本中病毒检测的计时、特异性和敏感性，即，抗原-捕获ELISA，RT-PCR和实时RT-PCR，(即，后两个试验针对M基因)。在后来相对受控的实验室条件下，早在感染后3-5天就可以特异性和高灵敏度良好地检测病毒。他们总结出只要有足够的检测灵敏度，理论上应该可能在感染第3-5天检测到至少这种特定的禽类病毒和或许其他更高毒力的禽类株。
因此，在医学领域仍然明显需要能够检测具体致病病毒株的改进的、廉价的、快速的、精确的和有鉴别力的方法，所述致病病毒最经常涉及引起医学上重大的疾病。还特别需要简单的分析方法，其能够在不发达国家、市场、诊所、医生和兽医办公室、学校和食品加工厂由相对未受过训练的人员常规使用。考虑到新流感A变异体的传播在世界范围内造成的威胁，临床领域需要新的和改进的抗病毒药剂。本发明满足了这些需求。
发明简述
在一方面，本发明通过检测患者样本中是否存在A型流感病毒的NS1蛋白，存在表明患者感染了A型流感病毒，从而提供鉴定患者是否感染A型流感病毒的方法。检测步骤能包括将患者样本与特异结合A型流感病毒蛋白NS1的试剂接触；并检测该试剂和NS1蛋白的特异结合，特异结合表明A型流感病毒的存在。备选或者此外，该检测可以包括检测编码NS1蛋白的PDZ配体模体(PL)的mRNA的存在，并由mRNA的存在推断出NS1蛋白的存在。优选的PL具有以下模体：S/T-X-V/I/L，其中S是丝氨酸，T是苏氨酸，V是缬氨酸，I是异亮氨酸，L是亮氨酸和X是任意氨基酸。优选，该试剂是至少一种PDZ多肽。或者，该试剂可以是至少一种抗体。对于泛-特异(pan-specific)性抗体，抗体可以是对NS1蛋白的保守区域特异。优选，接触步骤包括将患者样本与特异结合A型流感病毒蛋白NS1不同表位的第一和第二试剂接触，第一试剂固定在支持物上，检测步骤检测其中第一和第二试剂与NS1蛋白特异结合的夹心，表明病毒的存在。第一和第二试剂可以是第一和第二抗体，但优选第一试剂是一种或者多种PDZ多肽，第二试剂是一种或者多种抗体。第一试剂可以是一种或者多种PDZ多肽和一种或者多种抗体的混合物。抗体可以是对A型流感病毒NS1的全部亚型特异的抗体。
一种或者多种PDZ多肽可以是下列的一种或者多种：外膜，PSD95(PDZ # 2)，PSD95(PDZ #1，2，3)，DLG1(PDZ #1)，DLG1(PDZ #1，2)，DLG1(PDZ #2)，DLG2(PDZ #1)，DLG2(PDZ #2)，Magi3(PDZ #1)，PTN3(PDZ #1)，MAST2(PDZ #1)，NeDLG(PDZ #1，2)，Shank1 d1，Shank2 d1，Shank3 d1，Syntrophinl α，Syntrophin γ1，Magi1(PDZ #1)，Magi1(PDZ #4)，Tip1；PTPL1(PDZ#1)，Mint3(PDZ #1)，Lym Mystique(PDZ #1)，DLG2(PDZ #3)，MUPP1(PDZ#8)，NeDLG(PDZ #1)，DLG5(PDZ #1)，PSD95(PDZ #1)，NumBP(PDZ #3)，LIMK1(PDZ #1)，KIAA0313，DLG1(PDZ #2)，Syntenin(PDZ #2)，Pick1，MAST2，PTN3(PDZ #1)，NOS1(PDZ#1，2，3)，MINT1(PDZ #2)，ZO-1(PDZ #2)，NSP和RIM212。
患者样本可以是下列的任意一种：血液，组织，鼻分泌物，肺渗出液，泄殖腔样本，粪便样本，喉拭子和唾液。优选，患者是人，鸟类，猪，马，或者哺乳动物。PDZ多肽优选包括PL结合区(80-100氨基酸区)，例如PSD95 d2的PL结合区于SEQ ID NO：1提供。为了进行亚型特异测定，PDZ多肽优选的是PSD95 d1，PSD95 d2，PSD95 d3，INADL8d1，Magild1，DLG1d2，DLG1d3，NeDLG1d1，或者NeDLG1d2。
在另一方面，本发明提供了通过鉴定亚型特异性流感A型病毒蛋白NS1 PDZ配体模体(PL)区的存在，对A型流感感染进行诊断和分型的方法。优选PL具有以下模体：S/T-X-V/I/L，其中S是丝氨酸，T是苏氨酸，V是缬氨酸，I是异亮氨酸，L是亮氨酸和X是任意氨基酸。
在一方面，本发明提供检测待测样本中包含PL区的A型流感病毒蛋白的存在和量的方法，该方法通过在适于结合的条件下，将等份的待测样本与至少一种PDZ肽和至少一种PDZ配体(PL)检测试剂混合；和测定PDZ肽和PL检测试剂之间的结合，结合的降低表明待测样本中A型流感病毒蛋白的存在。优选，A型流感病毒蛋白是NP，HA，M1或者NS1。优选，PL检测试剂包括来自A型流感病毒蛋白C末端的PL模体，所述蛋白选自：NP，HA，M1和NS1。优选PL模体是：S/T-X-V/I/L，其中S是丝氨酸，T是苏氨酸，V是缬氨酸，I是异亮氨酸，L是亮氨酸和X是任意氨基酸。
在另一方面，本发明提供鉴定患者是否感染A型流感病毒的方法，该方法通过检测患者的鼻分泌物、痰样本或者喉拭子中是否存在A型流感病毒的NS1蛋白，存在表明患者感染A型流感病毒。
在一方面，本发明提供在待测样本中检测包含PL区的A型流感病毒蛋白的存在和量的方法，该方法通过混合等份的待测样本和至少一种PDZ肽；和检测PDZ肽和PL A型流感病毒蛋白之间的结合，结合表明待测样本中A型流感病毒蛋白的存在。
在另一方面，本发明通过检测患者是否感染流感A，提供检测患者是否感染流感A致病株的方法，如果患者被感染，检测患者样本中具有PL模体的非结构蛋白的存在，存在表明患者感染了A型流感病毒的致病株。
在一方面，本发明提供鉴定患者样本中A型流感病毒特异性亚型存在的方法，该方法通过将患者样本与至少一种PDZ多肽或者至少一种捕获抗体接触，所述PDZ多肽或捕获抗体与对流感病毒A亚型特异的NS1蛋白的PL模体特异结合；并检测PDZ多肽或者捕获抗体是否与样本中的PL模体特异结合，特异结合表明该亚型的存在。优选，该接触步骤包括将患者样本与大量PDZ多肽接触，所述PDZ多肽特异结合多个NS1蛋白中的多个PL模体，所述NS1蛋白对流感病毒A的多个亚型特异；并且检测包括确定哪种PDZ多肽特异结合其PL模体，与一种或者多种PDZ多肽的结合从而表明亚型的存在。优选，捕获抗体识别NS1的羧基末端。优选，捕获抗体或者PDZ多肽识别一种或者多种PDZ配体模体(PLs)：ESEV(SEQ ID NO：2)，ESEI(SEQ ID NO：3)，ESKV(SEQ ID NO：4)，TSEV(SEQ ID NO：5)，GSEV(SEQ ID NO：6)，RSEV(SEQ ID NO：7)，RSKV(SEQ ID NO：8)，GSEI(SEQ ID NO：9)，GSKV(SEQ ID NO：10)，NICI(SEQ ID NO：11)，TICI(SEQ ID NO：12)，RICI(SEQ ID NO：13)，DMAL(SEQ ID NO：14)，DMTL(SEQ ID NO：15)，DIAL(SEQ ID NO：16)，DLDY(SEQ ID NO：17)，SICL(SEQ ID NO：18)，SEV，SEI，SKV，和SKI。优选，PDZ多肽至少是下列的一种：外膜，PSD95(PDZ # 2)，PSD95(PDZ #1，2，3)，DLG1(PDZ #1)，DLG1(PDZ #1，2)，DLG1(PDZ #2)，DLG2(PDZ #1)，DLG2(PDZ #2)，Magi3(PDZ #1)，PTN3(PDZ #1)，MAST2(PDZ #1)，NeDLG(PDZ #1，2)，Shank1 d1，Shank2 d1，Shank3 d1，Syntrophinl α，Syntrophin γ1，Magi1(PDZ #1)，Magi1(PDZ #4)，Tip1；PTPL1(PDZ #1)，Mint3(PDZ #1)，Lym Mystique(PDZ #1)，DLG2(PDZ #3)，MUPP1(PDZ #8)，NeDLG(PDZ #1)，DLG5(PDZ #1)，PSD95(PDZ #1)，NumBP(PDZ #3)，LIMK1(PDZ #1)，KIAA0313，DLG1(PDZ #2)，Syntenin(PDZ #2)，Pick1，MAST2，PTN3(PDZ#1)，NOS1(PDZ #1，2，3)，MINT1(PDZ #2)，ZO-1(PDZ#2)，NSP和RIM2。患者样本可以是鼻分泌物，痰样本，喉拭子，泄殖腔样本，粪便样本，肺渗出液，或者唾液。如果该方法用于鉴定亚型，则该亚型优选禽流感A并且PL是PL模体ESEV/I/A(SEQ ID NO：19)。或者，亚型是H3N2和PL是PL模体RSKV(SEQ ID NO：8)。或者，PL是PL模体ESKV(SEQ ID NO：4)。或者，亚型是H1N1和PL是PL模体RSEV(SEQ ID NO：7)。该方法还能够包括将样本与检测抗体接触。优选，检测抗体包括信号发生化合物，并且不抑制PL与PDZ的结合或者捕获抗体与NS1的结合。
PDZ多肽或者抗体可以固定在固相支持物上。如果固相支持物是毛细管流动分析装置，接触步骤包括将小棒浸在患者样本中。优选，毛细管流动测定是免疫测定法。优选，固相支持物是侧向流测定。
在一方面，本发明提供用于患者样本中流感A病毒的鉴定和分亚型的试剂盒，所述试剂盒包括与固定在固相支持物上的流感A病毒NS1特异结合的试剂。优选，该试剂是抗体，PDZ多肽，寡核苷酸适配体，或者混合物。
在另一方面，本发明提供用于患者样本中流感A病毒鉴定和/或分亚型的试剂盒，包括与流感A病毒编码蛋白特异结合的试剂；和与NS1蛋白特异结合的试剂。优选，特异结合NS1蛋白的试剂与蛋白上的PL区结合。优选，该试剂是抗体，PDZ多肽，寡聚核苷酸适配体，或者混合物。优选，流感A病毒编码蛋白是NS1。
在一方面，本发明提供用于患者样本中流感A病毒鉴定和/或分亚型的试剂盒，包括与NS1在非PL模体处特异结合的试剂和与NS1在PL模体处特异结合的试剂。
在一方面，本发明提供具有大量PDZ多肽的试剂盒，所述PDZ多肽对多个流感A病毒的多个NS1蛋白的多个PL模体特异。
在一方面，本发明提供鉴定能够特异结合流感病毒PDZ配体(PL)的PDZ多肽的方法，通过将流感病毒非结构蛋白PL与具有PDZ结构域的候选多肽在适于结合的条件下接触；检测PL与候选多肽的特异结合；并确认PL结合到PDZ结合位点。
在一方面，本发明提供分离的抗体，该抗体与A型流感病毒NS1蛋白中的羧基末端模体特异结合。优选，具有PL模体的羧基末端模体是ESEV(SEQ ID NO：2)，ESEI(SEQ ID NO：3)，ESKV(SEQ ID NO：4)，TSEV(SEQ ID NO：5)，GSEV(SEQ ID NO：6)，RSEV(SEQ ID NO：7)，RSKV(SEQ ID NO：8)，GSEI(SEQ ID NO：9)，GSKV(SEQ ID NO：10)，NICI(SEQ ID NO：11)，TICI(SEQ ID NO：12)，RICI(SEQ ID NO：13)，DMAL(SEQ ID NO：14)，DMTL(SEQ ID NO：15)，DIAL(SEQ ID NO：16)，DLDY(SEQ ID NO：17)，SICL(SEQ ID NO：18)，SEV，SEI，SKV，或者SKI。优选，抗体是单克隆抗体或者抗体片段。优选；PL模体是ESEV/I/A(SEQ ID NO：19)。
在一方面，本发明提供对感染A型流感病毒或者具有感染风险的患者进行治疗或者预防的方法，该方法通过对患者使用有效方案的药剂来实现，所述药剂抑制病毒的NS1蛋白与细胞的PDZ蛋白的相互作用，从而作用于感染的治疗或者预防。优选，该药剂是与A型流感病毒NS1蛋白的PL模体特异结合的抗体。优选，药剂是反义寡核苷酸，小分子，siRNA或者锌指蛋白，并且该药剂抑制流感A NS1蛋白或者PDZ蛋白的表达。优选，NS1的PL模体是ESEV(SEQ ID NO：2)，ESEI(SEQ ID NO：3)，ESKV(SEQ ID NO：4)，TSEV(SEQ ID NO：5)，GSEV(SEQ ID NO：6)，RSEV(SEQ ID NO：7)，RSKV(SEQ ID NO：8)，GSEI(SEQ ID NO：9)，GSKV(SEQ ID NO：10)，NICI(SEQ ID NO.11)，TICI(SEQ ID NO：12)，RICI(SEQ ID NO：13)，DMAL(SEQ ID NO：14)，DMTL(SEQ ID NO：15)，DIAL(SEQ ID NO：16)，DLDY(SEQ ID NO：17)，SICL(SEQ ID NO：18)，SEV，SEI，SKV，或者SKI。优选，药剂是PDZ多肽并且它包括至少与PL SEQ ID NO：1相互作用的结合区。优选，PDZ多肽下面的至少一种：外膜，PSD95(PDZ #2)，PSD95(PDZ #1，2，3)，DLG1(PDZ #1)，DLG1(PDZ #1，2)，DLG1(PDZ #2)，DLG2(PDZ #1)，DLG2(PDZ #2)，Magi3(PDZ #1)，PTN3(PDZ#1)，MAST2(PDZ#1)，NeDLG(PDZ #1，2)，Shank1 d1，Shank2 d1，Shank3 d1，Syntrophinl α，Syntrophin γ1，Magi1(PDZ#1)，Magi1(PDZ#4)，Tip1；PTPL1(PDZ#1)，Mint3(PDZ#1)，Lym Mystique(PDZ#1)，DLG2(PDZ#3)，MUPP1(PDZ #8)，NeDLG(PDZ #1)，DLG5(PDZ #1)，PSD95(PDZ #1)，NumBP(PDZ #3)，LIMK1(PDZ #1)，KIAAO313，DLG1(PDZ#2)，Syntenin(PDZ#2)，Pick1，MAST2，PTN3(PDZ#1)，NOS1(PDZ#1，2，3)，MINT1(PDZ#2)，ZO-1(PDZ#2)，NSP和RIM2。
在另一方面，本发明提供筛选抗病毒剂的方法，该方法通过在待测化合物存在或者缺失的条件下，将PDZ多肽和流感病毒PDZ配体(PL)接触；和将待测化合物存在条件下较之缺失条件下的PDZ/PL结合量作比较，优选抗病毒剂减少PDZ/PL结合，并还可能包括在体内或者胞内检测试剂以鉴定其是否干扰干扰素的产生。
在一方面，本发明提供非天然的PDZ配体(PL)肽诊断试剂，其具有选自流感A蛋白C端氨基酸序列内的氨基酸线性阵列，因此PL能够结合哺乳动物PDZ多肽。优选，PL具有以下模体：S/T-X-V/I/L，其中S是丝氨酸，T是苏氨酸，V是缬氨酸，I是异亮氨酸，L是亮氨酸和X是任意氨基酸。优选，流感A NS1蛋白阵列包括以下至少一种：ESEV(SEQ ID NO：2)，ESEI(SEQ ID NO：3)，ESKV(SEQ ID NO：4)，TSEV(SEQ ID NO：5)，GSEV(SEQ ID NO：6)，RSEV(SEQ ID NO：7)，RSKV(SEQ ID NO：8)，GSEI(SEQ ID NO：9)，GSKV(SEQ ID NO：10)，NICI(SEQ ID NO：11)，TICI(SEQ ID NO：12)，RICI(SEQ ID NO：13)，DMAL(SEQ ID NO：14)，DMTL(SEQ ID NO：15)，DIAL(SEQ ID NO：16)，DLDY(SEQ ID NO：17)，SICL(SEQ ID NO：18)，SEV，SEI，SKV或者SKI。还能包括诊断试剂，例如阳性对照，阴性对照，分析标准品，分析校准品(calibrator)，竞争性分析配体，标记的肽检测剂或者固相捕获剂。还能包括合成肽，重组多肽，基本上纯化的天然PL多肽，基本上纯化的天然PL多肽的片段，模拟PL的肽，寡核苷酸适配体PL或者多肽适配体PL。优选，PL肽来自流感A NS1蛋白。
在一方面，本发明提供一种非天然的PDZ多肽诊断试剂，用于检测生物样本中的流感A PL，所述生物样本包含能够结合流感A NS1蛋白的非天然PDZ多肽，优选的PDZ结构域蛋白诊断试剂选自阳性对照、阴性对照、分析标准品、分析校准品、竞争性配体、标记的蛋白检测结合伴侣和捕获剂的诊断试剂，优选外膜，PSD95(PDZ # 2)，PSD95(PDZ #1，2，3)，DLG1(PDZ #1)，DLG1(PDZ #1，2)，DLG1(PDZ #2)，DLG2(PDZ #1)，DLG2(PDZ #2)，Magi3(PDZ #1)，PTN3(PDZ #1)，MAST2(PDZ #1)，NeDLG(PDZ #1，2)，Shank1 d1，Shank2 d1，Shank3 d1，Syntrophinl α，Syntrophin γ 1，Magi1(PDZ#1)，Magi1(PDZ#4)，Tip1；PTPL1(PDZ#1)，Mint3(PDZ#1)，Lym Mystique(PDZ#1)，DLG2(PDZ#3)，MUPP1(PDZ #8)，NeDLG(PDZ #1)，DLG5(PDZ #1)，PSD95(PDZ#1)，NumBP(PDZ #3)，LIMK1(PDZ #1)，KIAA0313，DLG1(PDZ #2)，Syntenin(PDZ #2)，Pick1，MAST2，PTN3(PDZ#1)，NOS1(PDZ #1，2，3)，MINT1(PDZ #2)，ZO-1(PDZ#2)，NSP或者RIM2。
在另一方面，本发明提供用于检测待测样本中流感A蛋白的信号发生结合剂，所述待测样本包含非天然PL或者非天然PDZ，其中PL或者PDZ均是与信号发生化合物共价连接的肽或者多肽。
在一方面，本发明提供鉴定患者是否感染致病流感A的方法，该方法通过检测患者样本中是否存在A型流感病毒的NS2蛋白，该蛋白在70位具有丝氨酸，其存在表明患者感染流感A的致病株。优选的检测步骤是将患者样本与特异结合具有丝氨酸70的序列的试剂接触。优选试剂是抗体或者核酸。
在一方面，提供鉴定患者是否感染致病A型禽流感病毒的方法，该方法包括，将患者样本与PSD-95 PDZ蛋白接触；和检测PSD-95 PDZ蛋白与样本之间的特异结合，特异结合表明A型流感病毒的存在，该存在表明患者感染致病A型禽流感病毒。优选，致病A型流感病毒是H5N1。优选，PSD-95 PDZ蛋白是PSD-95的结构域2。优选，流感NS1蛋白PL具有以下模体：ESKV，ESEI(SEQ ID NO：3)，或者ESEV(SEQID NO：2)。在一方面，接触步骤包括将患者样本与PSD-95 PDZ蛋白和抗体接触，所述抗体与A型流感病毒蛋白NS1的不同抗原表位而不是PSD-95 PDZ蛋白特异结合，PSD-95固定在支持物上，检测步骤检测NS1蛋白与抗体的特异结合。在另一方面，该方法包括将患者样本与第二PDZ蛋白接触的另外步骤，INADL d8作为对照并检测特异结合，第一PDZ-95蛋白相对于第二PDZ蛋白特异结合更高表明患者感染了致病A型禽流感病毒。
附图简述
图1是显示禽类、人类和其他哺乳动物中NS1 PL序列ESEV(SEQID NO：2)出现的时程图。
图2是显示禽类、人类和其他哺乳动物中NS1 PL序列EPEV(SEQID NO：27)出现的时程图。
图3是显示禽类、人类和其他哺乳动物中NS1 PL序列RSKV(SEQID NO：8)出现的时程图。
图4显示对检验6个人流感A阳性样本的鼻分泌物的结果。
图5显示感染A/PR/8/34的MDCK细胞中的NS1表达。
图6显示细胞中PDZ与NS1的相互作用。
图7显示细胞中INADL d8与H3N2 NS1的相互作用。
图8显示利用PDZ捕获剂和单克隆抗体检测剂AU-4B2，用于NS1诊断的侧向流形式。
图9显示利用单克隆抗体捕获剂和单克隆抗体检测剂AU-4B2的侧向流形式。
图10a-k是11个示范性侧向流流感检测形式。
定义
除非另外定义，所有此处使用的技术和科学术语与本发明所属领域的普通技术人员通常所理解含义相同的。下列文献给技术人员提供了本发明使用的许多术语的一般定义：Singleton等人，DICTIONARYOF MICROBIOLOGY AND MOLECULAR BIOLOGY(微生物和分子生物)(第二版，1994)；THE CAMBRIDGE DICTIONARY OF SCIENCEAND TECHNOLOGY(剑桥科技词典)(Walker编著，1988)；和Hale &Marham，THE HARPER COLLINS DICTIONARY OF BIOLOGY(HARPER COLLINS生物词典)(1991)。尽管与此处描述的方法相似或者等同的任何方法和材料都可用于本发明的实践或者检测，但现在描述优选的方法和材料。按照逻辑(而不是字母)顺序提供定义以帮助读者实现本发明，即，如下：也就是，
“试剂”包括任何物质，分子，元素，化合物，实体，或者其组合，包括但不限于，例如，蛋白，多肽，小的有机分子，多糖-肽嵌合分子，核苷酸-肽嵌合分子等。试剂的典型实例包括非天然状态的天然产物，合成肽化合物，化合物，以及两种或更多种天然或者非天然化合物。除非另作说明，术语“试剂”，“物质”，和“化合物”可以互换使用。
“禽流感A”是指A亚型流感，其感染禽类对象并在禽类对象之间传染。禽流感血凝素(hemmagglutinin)亚型的典型实例包括H5，H6，H7，H9和H10，典型菌株包括H5N1，H6N2，H7N3，H7N7，H9N2，H10N4和H10N5。
“禽类对象”是指适合进行检测或者治疗的对象，包括所有种类的鸟类，包括野生鸟类(例如野禽)和家养种类(例如家禽)。优选，要检测或者治疗的禽类对象选自鸡、火鸡、鸭、鹅、鹌鹑、鸵鸟、鸸鹋和外来鸟类例如鹦鹉、美冠鹦鹉和鸡尾鹦鹉。更优选，要检测的禽类对象是鸡，火鸡，鹅或者鹌鹑。
“非天然”用来指在自然界不存在的组合物。非天然组合物的典型实例包括基本上纯化的组合物，以及，那些包含着在自然界的相同化学形式中不会出现的化合物的组合物，例如，化学和基因修饰蛋白、核酸等。
此处使用的“调节”是指例如通过激动结合活性的上调(即，活化或者刺激)，和例如通过拮抗结合活性的下调(即抑制或者遏制)二者。此处使用的术语“PDZ配体结合调节剂”是指能够改变包含PDZ结构域的多肽与PDZ配体(即，“PL”)结合的试剂。调节剂包括，但不限于，活化剂例如激动剂和抑制剂例如拮抗剂二者。抑制剂可能引起部分或者完全的结合抑制。
当用于区别不同的流感病毒株情况下，“流感A的致病株”是指根据OIE世界动物卫生组织、世界卫生组织或者它们指定的代表提出的指南的“须通报禽流感”(NAI)病毒，例如，在OIE“Manual of DiagnosticTests and Vaccines for Terrestrial Animals，5th edition，(陆生动物诊断分析和疫苗手册，第五版)  2004(www.oie.int)中提出的指南。此外，该致病株在毒力或者H5或者H7病毒的典型试验中具有“高致病性”，所述H5或者H7病毒具有流感A血凝素(HA)前体蛋白HA0切割位点的氨基酸序列，所述氨基酸序列与在毒性病毒中观察到的任何HA0切割位点氨基酸序列相似，即，如OIE或者代表性的相似国家或者国际组织或者行业协会所规定。流感A毒性H5和H7株中HA0切割位点氨基酸序列的典型实例包括病毒前体血凝素蛋白切割位点处的多个碱性氨基酸(精氨酸或者赖氨酸)，例如，其中H7病毒的低毒株具有-PEIPKGR*GLF-(SEQ ID NO：20)或者-PENPKGR*GLF-(SEQ IDNO：21)，高致病株具有-PEIPKKKKR*GLF-(SEQ ID NO：22)，-PETPKRKRKR*GLSF-(SEQ ID NO：23)，-PEIPKICREKR*GLF-(SEQID NO：24)或者-PETPKRRRR*GLF-(SEQ ID NO：25)。现在典型的毒力试验包括用感染性病毒接种4-8周龄鸡，其中如果病毒株在10天内造成大于75％的死亡率，则该病毒株被认为是高致病性的；和/或，静脉内致病性指数(IVPI)大于1.2的任意病毒，其中静脉内接种的鸟类在10天期间每24小时检查；正常，记分为“0”；患病为“1”；严重患病为“ 2”；死亡为“3”；和，计算平均分作为IVPI。后来的高致病性病毒株被OIE称为“高致病性NAI病毒”(HPNIA)。现有的NAI典型实例包括流感A的H5和H7株。现在HPNIA的典型实例包括H5N1。
“流感A的低致病株”表示须通报的禽流感A，即，NAI分离物(上文)，但其对鸡不具有致病性并且不具有HA0切割位点氨基酸序列，所述序列与在毒性病毒中观察到的任何HA0切割位点氨基酸序列相似，即，该病毒株被OIE称为“低致病性禽流感(LPAI)”。
“PDZ结构域”是指与脑突触蛋白PSD-95、果蝇(Drosophila)分隔连接蛋白Discs-Large(DLG)和/或上皮细胞紧密连接蛋白ZO1(ZO1)具有大约90个连续氨基酸同源的氨基酸序列；优选大约80-90个；更优选，大约70-80个，更优选大约50-70个氨基酸。PDZ结构域的典型实例在本领域还已知有Discs-Large同源性重复(“DHRs”)和“GLGF”重复(SEQ ID NO：26)。在各种膜相关蛋白中发现了PDZ结构域的实例，包括鸟苷酸化激酶同系物的MAGUK家族的成员，几种蛋白磷酸酯酶和激酶，神经元一氧化氮合成酶(neuronal nitric oxide synthase)，肿瘤抑制蛋白，和几种抗肌萎缩蛋白相关蛋白，总称为syntrophins。该PDZ结构域包括天然和非天然的氨基酸序列。PDZ结构域的典型实例包括PDZ蛋白的多态变异体，以及，包含两个不同PDZ蛋白等部分的嵌合PDZ结构域。优选，该PDZ结构域包含与下列公开的氨基酸序列基本相似的氨基酸序列：美国专利申请号10/485,788(2004年2月3日提交)，国际专利申请PCT/US03/285/28508(2003年9月9日提交)，国际专利申请PCT/USO1/44138(2001年11月9日提交)，在此完整引入作为参考。典型的非天然PDZ结构域包括那些氨基酸序列的对应遗传密码已经突变的PDZ结构域，例如，用于产生改变(增强或者减弱)与PL结合或者与PL结合特异性的氨基酸改变。任选PDZ结构域或者其变异体与来自脑突触蛋白PSD-95、果蝇分隔连接蛋白Discs-Large(DLG)和/或上皮细胞紧密连接蛋白ZO1(ZO1)和动物同系物中至少一种的PDZ结构域具有至少50、60、70、80或者90％的序列一致性。任选天然PDZ结构域的变异体与天然PDZ结构域具有至少90％的序列一致性。PDZ结构域的序列一致性由PDZ结构域内的至少70个氨基酸确定，优选80个氨基酸，和更优选80-90或者80-100个氨基酸。当类似物和人序列进行最大限度比对时，类似物的氨基酸指定为天然人序列中相应氨基酸的相同编号。类似物通常与天然存在的肽在一个、两个或者几个位置存在不同，经常借助于保守置换。术语“等位基因变异体”用于指相同种类中不同个体基因之间的变异和该基因编码的蛋白中相应的变异。PSD-95 d2的示范性PDZ结构域如SEQ ID NO：1所示。
“PDZ蛋白”，与“包含PDZ结构域的多肽”和“PDZ多肽”可以互换使用，是指具有PDZ结构域(上文)的天然存在或者非天然存在的蛋白。以前(上文)已经公开了PDZ蛋白的典型实例，包括CASK，MPP1，DLG1，DLG2，PSD95，NeDLG，TIP-33，TIP-43，LDP，LIM，LIMK1，LIMK2，MPP2，AF6，GORASP1，INADL，KIAA0316，KIAA1284，MAGI1，MAST2，MINT1，NSP，NOS1，PAR3，PAR3L，PAR6β，PICK1，Shank 1，Shank 2，Shank 3，SITAC-18，TIP1，和ZO-1。用于筛查分析的该非天然PDZ结构域多肽可以包含例如比天然PDZ结构域小的PDZ结构域。例如非天然PDZ结构域可任选包含“GLGF”模体，即，具有GLGF氨基酸序列(SEQ ID NO：26)的模体，其通常位于PDZ结构域附近，例如通常在N端大约10-20个氨基酸内。PDZ结合活性通常需要GLGF模体(SEQ ID NO：26)和紧挨着GLGF模体(SEQ ID NO：26)N端的3个氨基酸。同样地，非天然PDZ结构域可以构建为PDZ结构域C-末端缺失β-折叠，即，通常可以从天然PDZ结构域删除这一区域而不影响PL的结合。提供了一些示范性的PDZ蛋白，括号内是GI或者检索号(accession numbers)：PSMD9(9184389)，af6(430993)，AIPC(12751451)，ALP(2773059)，APXL-1(13651263)，MAGI2(2947231)，CARDI1(1282772)，CARDI4(13129123)，CASK(3087815)，CNK1(3930780)，CBP(3192908)，Densin 180(16755892)，DLG1(475816)，DLG2(12736552)，DLG5(3650451)，DLG6剪接变异体(splice var)1(14647140)，DLG6剪接变异体2(AB053303)，DVL1(2291005)，DVL2(2291007)，DVL3(6806886)，ELFIN 1(2957144)，ENIGMA(561636)，ERBIN(8923908)，EZRIN结合蛋白50(3220018)，FLJ00011(10440342)，FLJ1 1215(11436365)，FLJ12428(BC012040)，FLJ12615(10434209)，FLJ20075  Semcap2(7019938)，FLJ21687(10437836)，FLJ31349(AK055911)，FLJ32798(AK057360)，GoRASP1(NM031899)，GoRASP2(13994253)，GRIP1(4539083)，GTP酶活化酶(2389008)，鸟嘌呤交换因子(6650765)，HEMBA 1000505(10436367)，HEMBA 1003117(7022001)，HSPC227(7106843)，HTRA3(AY040094)，HTRA4(AL576444)，INADL(2370148)，KIAA0147 Vartul(1469875)，KIAA0303 MAST4(2224546)，KIAA0313(7657260)，KIAA0316(6683123)，KIAA0340(2224620)，KIAA0380(2224700)，KIAA0382(7662087)，KIAA0440(2662160)，KIAA0545(14762850)，KIAA0559(3043641)，KIAA0561 MAST3(3043645)，KIAA0613(3327039)，KIAA0751 RIM2(12734165)，KIAA0807 MAST2(3882334)，KIAA0858(4240204)，KIAA0902(4240292)，KIAA0967(4589577)，KIAA0973 SEMCAP3(5889526)，KIAA1202(6330421)，KIAA1222(6330610)，KIAA1284(6331369)，KIAA1389(7243158)，KIAA1415(7243210)，KIAA1526(5817166)，KIAA1620(10047316)，KIAA1 634 MAGI3(10047344)，KIAA1719(1267982)，LIM Mystique(12734250)，LIM(3108092)，LIMK1(4587498)，LIMK2(1805593)，LIM-RIL(1085021)，LU-1(U52111)，MAGI1(3370997)，MGC5395(BC012477)，MINT1(2625024)，MINT3(3169808)，MPP1(189785)，MPP2(939884)，MPP3(1022812)，MUPP1(2104784)，NeDLG(10853920)，Neurabin II(AJ401189)，NOS1(642525)，新PDZ基因(7228177)，新丝氨酸蛋白酶(1621243)，Numb结合蛋白(AK056823)，外膜蛋白(7023825)，p55T(12733367)，PAR3(8037914)，PAR3-样(AF428250)，PAR6(2613011)，PAR6β(13537116)，PAR6γ(13537118)，PDZ-73(5031978)，PDZK1(2944188)，PICK1(4678411)，PIST(98394330)，prIL16(1478492)，PSAP(6409315)，PSD95(3318652)，PTN-3(179912)，PTN-4(190747)，PTPL1(515030)，RGS12(3290015)，RGS3(18644735)，Rho-GAP10(NM020824)，Rhophilin-样(14279408)，丝氨酸蛋白酶(2738914)，Shank 2(6049185)，Shank 3(AC000036)，Sliroom(18652858)，与GRASP65相似(14286261)，与Numb px2的配体相似(BC036755)，与PTP同系物相似(21595065)，SIP1(2047327)，SITAC-18(8886071)，SNPCIIA(20809633)，Shank 1(7025450)，Syntenin(2795862)，Syntrophin 1 α(1145727)，Syntrophin β 2(476700)，Syntrophin γ 1(9507162)，Syntrophin γ 2(9507164)，TAX2-样蛋白(3253116)，TIAM 1(4507500)，TIAM 2(6912703)，TIP 1(2613001)，TIP2(2613003)，TIP33(2613007)，TIP43(2613011)，X-11 β(3005559)，ZO-1(292937)，ZO-2(12734763)，ZO-3(10092690)。
“ PDZ配体”，缩写为“PL”，表示一种天然存在的蛋白，该蛋白具有与PDZ结构域结合并与其形成分子间相互作用复合物的氨基酸序列。之前在现有的美国和国际专利申请(上文)中已经披露了PL的典型实例。流感A PL的其他实例在下面实施例部分中提供。
“PDZ试剂”用来指一种化合物，其与那些不包括PDZ试剂的对照相比，在检测分析中干扰至少20％的PDZ配体多肽和包含PDZ结构域多肽之间发生的结合相互作用，例如，至少30％，至少40％，至少50％，至少60％，至少70％，至少80％，至少90％，至少95％，直到大约99％或者100％。尽管不希望受限于任何具体的作用机理，但该PDZ剂可能起干扰作用，例如通过结合到否则将与流感NS1配体结合的PDZ结构域；或者，它可以直接结合NS1配体以阻止其结合PDZ蛋白。通常，后来的PDZ试剂是那些在特定分析中表现出IC50在大约1mM或者更低范围内的PDZ试剂。显示更低IC50的化合物，例如，通常其IC50为大约100μM，10μM，1μM，100nM，10nM，1nM甚或更低。后来的PDZ试剂可用于治疗和预防药物组合物，给药以减轻、治疗或者预防由流感A病毒感染引起的一种或者多种疾病的症状。“PL调节剂”在用于PDZ试剂(上文)背景时，是指结合流感A NS1蛋白并调节其与PDZ结构域结合的化合物。
“PDZ调节剂”在用于PDZ试剂(上文)背景时，是指结合PDZ结构域并调节流感NS1蛋白在对象PDZ结构域位点结合的化合物。
该PDZ调节剂和PL调节剂可以分别是设计成结合PDZ结构域或者PL的肽、模拟肽或者小分子模拟物。下面的实施例部分非常详细地描述了检测PDZ调节剂是否结合PDZ结构域的分析法。同样地，还阐明了用于检测PL调节剂是否结合PDZ结构域的分析法，例如，重组PDZ结构域融合蛋白与重组NS1融合蛋白结合。
“PDZ介导的病症”是指流感A感染对象中的一种或者多种症状，由流感A病毒蛋白PL在宿主细胞PDZ结构域的结合引起。后来的症状起因于病毒感染，包括，但不限于发烧，咳嗽，喉咙痛，肌肉疼痛，结膜炎，呼吸问题，气道中过度粘液产生，对继发性细菌感染的易感性增加，肺炎，神经感染等。
“患病”用在此处是指禽类对象时，包括的体征和症状可以从几乎没有明显病征的猝死到具有呼吸征象、过度流泪、窦炎、头部水肿、无羽表皮发绀和腹泻的更具特征的疾病。OIE在它们的卫生指南“Manual of Diagnostic Tests and Vaccines for Terrestrial Animals，第五版，世界动物卫生组织”中披露了“患病”的典型诊断体征、样本和检验。
此处使用的“类似物”是指结构上类似感兴趣的天然PDZ或者PL分子的分子，但其已经被修饰，例如，通过取代或者化学修饰一种或者多种所选的氨基酸取代基。与起始分子比较，类似物可能显示相同、相似或者改进的功用。合成和筛选类似物以鉴定具有改进特征的已知化合物的变异体在医药领域是公知的，例如，增强结合亲合力，改变与目标结合的选择性，减少与非目标分子的结合，改进体外和体内稳定性，和改进药理学性质。
“接触”具有其正常含义，是指结合两种或更多种试剂从而使成分合并，例如，待测样本中的PL与PDZ合并。接触可以在体外发生，例如，PDZ蛋白与细胞裂解产物在试管或者其他容器中合并，或者，原位，例如，借助于细胞的天然生物合成活性，天然宿主细胞PDZ蛋白和天然病毒PL在流感感染的细胞中合并。或者，通过例如将PDZ结构域编码序列转染到流感A感染细胞中，而合并重组PDZ与病毒PL。
“多聚体”用于指一种或者多种类型重复单元的连续阵列，而不管来源。多聚体可以在生物系统中发现，特别包括多肽和多核苷酸，以及，包含氨基酸、核苷酸或者其类似物的化合物。术语“多核苷酸”是指任意长度核苷酸或者其类似物的多聚体，包括长度范围从10-100个核苷酸的寡核苷酸和长度大于100个核苷酸的多核苷酸。术语“多肽”是指具有任意长度的氨基酸连续排列的多聚体，优选连续排列中从大约12个到大约50个氨基酸范围；和，最优选的大于大约50个氨基酸。
“多肽”和“蛋白”互换使用，包括氨基酸(其中天然肽键骨架被替换为非天然合成骨架)和多肽(其中一种或者多种天然氨基酸被替换为一种或者多种非天然存在或者合成的模拟氨基酸)的聚合连续阵列。
“融合蛋白”是指由来源于两种或更多种天然蛋白的氨基酸序列组成的多肽，其表达为单个重组蛋白，即，在其天然状态不连接的两种或更多种氨基酸序列在重组蛋白中连接在一起，例如利用它们各自的氨基和羧基末端通过肽键，从而形成单一连续的氨基酸序列。融合蛋白可以是两个、三个或者甚至四个或者更多个不同的天然或者非天然蛋白的组合。典型融合蛋白包括那些具有两个或者更多个异源的，即，无关的，氨基酸序列；那些兼具异源和同源的，即，相关的，序列。融合蛋白还由下列氨基酸序列组成：有或者没有N端甲硫氨酸残基的氨基酸序列，那些标签用于抗原的抗原表位鉴定的氨基酸序列，以及，那些具有信号发生化合物作为融合伴侣的氨基酸序列，例如，具有荧光伴侣的融合蛋白；酶伴侣例如β-半乳糖苷酶；化学发光伴侣例如荧光素酶；等。
“捕获试剂”，当用于诊断分析试剂或者方法的背景时，是指在结合相互作用和适用于诊断分析形式的时间段内，能够结合流感病毒分析物的试剂，所述相互作用具有足够的强度(例如测定为结合亲合力)和特异性，该特异性允许从不同病毒分析物的混合物中浓缩病毒分析物；所述适用于诊断分析形式的时间段，即，通常大约5分钟到大约90分钟；优选大约5分钟到大约60分钟；和，最优选的大约5分钟到大约30分钟。根据本发明的可选实施方式，该捕获试剂包含PDZ结构域或者PL。典型的捕获试剂在下面实施例部分说明。捕获试剂通常“特异结合”一种或者多种病毒分析物，例如，包含PL的蛋白，而排斥其他分析物，例如，不包含PL的蛋白。优选，该捕获试剂结合该病毒分析物的解离常数(KD)小于大约10-6M，优选，小于大约10-7M；和，最优选的，小于大约10-8M。
“特异结合”，当用于该天然和非天然PDZ结构域与PL试剂之间的结合相互作用时，用于指捕获或者检测试剂优先结合特定病毒分析物的能力，所述特定病毒分析物存在于不同病毒分析物的混合物中。在某些实施方式中，该特异结合相互作用能够辩别具有或者缺失PL的蛋白，即，在一些实施方式中鉴别能力大于大约10到约100倍；和，优选大于约1000到约10,000倍。
术语“基本上一致”是指当最优比对时，例如利用缺省缺口权重(default gap weight)通过程序GAP或者BESTFIT，两个肽序列共有至少65％的序列一致性，优选至少80％或者90％的序列一致性，更优选至少95％的序列一致性或者更高(例如，99％的序列一致性或者更高)。优选，不同的残基位置区别在于保守氨基酸取代。
“结合干扰”用于涉及PDZ结构域与PL的第一结合相互作用，从而在诊断分析形式中形成复合物；其中，随后在必要的第二结合相互作用中检测该复合物，即，当第一结合相互作用抑制第二结合相互作用导致信号发生化合物产生的信号强度减弱时，产生干扰。本发明方法中该组合物发生的信号受到的结合干扰小于15％；优选，小于10％；和，最优选小于大约5％。
“捕获剂/分析物复合物”是由捕获试剂，例如PDZ结构域融合蛋白，和分析物，例如含有PL的流感病毒蛋白，特异结合产生的复合物。在“适于特异结合的条件下”，捕获试剂和分析物特异结合，即，一个与另一个，其中这种物理化学条件可以便利地根据例如盐浓度、pH、去污剂浓度、蛋白浓度、温度和时间表示。该条件适合于例如在溶液中使得结合发生；或者可选地，结合成员中的一种被固定到固相上。这种合适的典型条件在诊断领域是公知的，例如参见，Harlow和Lane，“ Antibodies：A Laboratory Manual”，Cold Spring Harbor Laboratory，ColdSpring Harbor，N.Y.(1989)。合适的条件优选导致结合相互作用的解离常数(KD)小于大约10-6M；优选，小于大约10-7M；和，最优选小于大约10-8M。
“表面结合捕获试剂”与“固相捕获试剂”互换使用，用来指固定在固体基质表面的PDZ结构域或者PL捕获剂，所述固体基质例如，片层，珠子，或者其他结构，例如在下面更详细说明的带孔板等。在某些实施方式中，此处使用的捕获剂的集合存在于相同支持物的表面上，例如，以其中表面上的特定位置对应于存在的特定表面结合捕获剂的阵列形式。
“分离的”或者“纯化的”通常指物质(化合物，多核苷酸，蛋白，多肽，多肽组合物)的分离，使得该物质在其存在的样本中占有显著的百分比(例如，大于2％，大于5％，大于10％，大于20％，大于50％，或者更高，通常直到大约90％-100％)。在某些实施方式中，基本上纯化的成份包括样本的至少50％，80％-85％，或者90-95％。用于纯化感兴趣的多核苷酸和多肽的技术在本领域是公知的，包括，例如，离子交换层析，亲合层析和密度沉降。通常，当相对于样本的其他成份，一种物质在该样本中存在的量是在自然界未发现的，则该物质被纯化。
“评价”，当用于该试验的背景时，是指评估试验结果和/或进行试验测定，以确定流感A病毒分析物是否存在于待测样本中。典型的评估包括“确定(determining)”，“测定(measuring)”，“评估(cvaluating)”和“分析(assaying)”，它们可以互换使用，包括定量和/或定性测定。评价可以是相对的或者绝对的。“评价结合”包括检测结合相互作用的量或者程度，以及，检测是否发生特定结合相互作用，即，结合是否存在。
“治疗”，是指将本发明的化合物对需要其的对象给药，目的是达到所需的药理和/或生理作用，例如，预防或者减轻一种或者多种疾病的症状(上文)。该治疗可以采用预防方式给药，即，预防一种或者多种疾病症状的发展；和/或，治疗以缓解或者消除疾病的症状。需要其治疗的对象包括人类和家养动物。
此处使用的“受试者”，是指人类和家养动物，例如哺乳动物，鱼，鸟，爬行动物，两栖动物等等。
“信号发生化合物”，缩写为“SGC”，是指可以连接到PL或者PDZ的分子(例如利用下面披露的化学连接方法)，并且能够在本公开的分析法中反应形成可检测的化学或者物理实体(即，反应产物)。反应产物的典型实例包括沉淀物、荧光信号、具有颜色的化合物，等等。典型SGC包括例如，生物发光化合物(例如，荧光素酶)，荧光团(例如，如下文)，生物发光和化学发光化合物，放射性同位素(例如，131I，125I，14C，3H，35S，32p，等等)，酶(例如，如下文)，结合蛋白(例如，生物素，抗生物素蛋白，链霉亲和素等等)，磁性颗粒，化学反应性化合物(例如，着色染剂)，标记的寡核苷酸；分子探针(例如，CY3，Research Organics，Inc.)，等等。典型的荧光团包括异硫氰酸荧光素，琥珀酰荧光素，若丹明B，丽丝胺(lissamine)，9，10-二苯基蒽，二萘嵌苯，红荧烯，芘和其荧光衍生物例如异氰酸酯，异硫氰酸酯，酰氯或者磺酰氯，伞形酮，镧系元素例如铕(Eu)的稀土螯合物，等等。可用于信号发生结合物的典型SGC包括下列中的酶：1类IUB，尤其是1.1.1和1.6(例如，乙醇脱氢酶，甘油脱氢酶，乳酸脱氢酶，苹果酸脱氢酶，葡萄糖-6-磷酸脱氢酶，甘油醛-3-磷酸胶氢酶等等)；1.11.1类IUB(例如，过氧化氢酶，过氧化物酶，氨基酸氧化酶，半乳糖氧化酶，葡萄糖氧化酶，抗坏血酸氧化酶，心肌黄酶，尿素酶等等)；2类IUB，尤其是2.7和2.7.1(例如，己糖激酶等等)；3类IUB，尤其是3.2.1和3.1.3(例如，α淀粉酶，纤维素酶，β-半乳糖透明质酸酶(galacturonidase)，淀粉葡萄糖苷酶，β-葡糖醛酸酶，碱性磷酸酶，酸性磷酸酶等等)；4类IUB(例如，裂解酶)；5类IUB，尤其是5.3和5.4(例如，磷酸葡糖异构酶，磷酸丙糖酶异构酶(trios phosphataseisomerase)，磷酸葡糖变位酶等等)。信号发生化合物还包括其产物可以通过荧光和化学发光波长检测的SGC，例如，荧光素酶，荧光发射金属例如152Eu，或者镧系的其他；化合物例如鲁米诺，异鲁米诺，吖啶鎓盐，等等；生物发光化合物例如荧光素；荧光蛋白；等等。荧光蛋白包括，但不限于下列：即，(i)绿色荧光蛋白(GFP)，即，包括但不限于，GFP的“人源化”形式，其中天然存在的核苷酸序列的密码子被改变成更密切匹配人密码子偏差；(ii)源于维多利亚多管水母(Aequoria victoria)的GFP和其衍生物，例如，“人源化”衍生物例如增强的GFP，它是商品化提供的，例如，来自Clontech，Inc.；(iii)来自其他种类例如海肾(Renilla reniformis)，Renilla mulleri，或者Ptilosarcus guernyi的GFP，如WO99/49019和Peelle等人(2001)J.Protein Chem.20：507-519所描述；(iv)“人源化”重组GFP(hrGFP)(Stratagene)；和，(v)来自珊瑚虫(Anthozoan)种类的其他荧光和有色蛋白，例如Matz等人(1999)Nature Biotechnol 17：969-973所描述那些；等等。该信号发生化合物可以偶联到PL或者PDZ结构域多肽。可以通过金属螯合基团例如EDTA实现某些SGC与蛋白的连接。该SGC都具有允许检测和/或定量待测样本中流感PL分析物的共同特性。利用目视法可以检测该SGC；优选，适于自动化的方法例如分光光度法，荧光法，化学发光法，电纳米方法(electrical nanometric method)包括例如，电导、阻抗、电阻等等的变化和磁场方法。
此处使用的“固相”是指可以静电、疏水或者共价连接一种或者多种反应物的表面。典型的固相包括例如：尼龙6；尼龙66；聚苯乙烯；胶乳珠；磁性珠；玻璃珠；聚乙烯；聚丙烯；聚丁烯；丁二烯-苯乙烯共聚物；硅橡胶；聚酯；聚酰胺；纤维素和衍生物；丙烯酸酯；甲基丙烯酸酯；聚乙烯；氯乙烯；聚氯乙烯；聚氟乙烯；聚苯乙烯共聚物；硅凝胶；硅片玻璃；琼脂糖；右旋糖苷；脂质体；不溶蛋白金属；和，硝化纤维素。典型的固相包括形成为珠子、管、条带、圆盘、滤纸、板等等的那些。滤器可用于捕获分析物例如作为滤液，或者通过截留起作用，或者通过将PL或者PDZ共价结合到滤器上起作用(例如，参见下面的实施例部分)。根据本发明的某些实施方式，配给用户的固相捕获试剂可以由包被“捕获试剂”(下文)的固相(上文)组成，并进行包装(例如，在氮气气氛下)以保存和/或最大化捕获试剂与生物样本中流感PL分析物的结合。
“捕获试剂”是指能够结合流感PL的固定PDZ多肽(或者肽)。该捕获试剂可以由PDZ溶液；或者修饰以促进其与固相结合的PDZ；或者已经固定在固相表面上的PDZ组成，所述固定在固相表面上的PDZ例如，通过静电力、范德华力、疏水力、共价化学键等等(如下面进一步披露)将PDZ连接到固相(上文)来固定。PDZ捕获试剂的典型实例在下面的实施例部分公开，包括活动的固相PDZ捕获试剂，例如固定在活动的胶乳珠上的PDZ，例如在胶乳珠浸染棒(dipstick)分析中。
“检测试剂”是指一种结合物，包含连接到PL或者PDZ多肽或者肽的SGC；或者，连接到能够特异结合PL或者PDZ的抗体的SGC。该检测试剂的典型实例包括一种或者多种PL或者PDZ与一种或者多种SGC化合物的复合物，即，高分子复合物。有关检测试剂包括活动的固相检测试剂，例如胶乳珠浸染棒分析中活动的胶乳珠。
“生物样本”是指从活的(或者死的)生物体，例如，哺乳动物、鱼、鸟、爬行动物、有袋类动物等等获得的样本。生物样本包括组织液，组织切片，空气或者水中带有的生物材料，并例如通过过滤、离心等等从中收集，例如，用于评价生物恐怖威胁等等。备选的生物样本可以取自胎儿或者卵，卵黄和羊水。典型生物液体包括，例如尿液，血液，血浆，血清，脑脊液，精液，肺灌洗液，粪便，痰，粘液，含水生物材料等等。或者，生物样本包括鼻咽或者口咽拭子，鼻灌洗液，来自气管、肺、肺泡、肠、脾、肾、大脑、肝和心脏的组织，痰，粘液，含水生物材料，泄殖腔拭子，痰，鼻和口腔粘液，等等。典型的生物样本还包括食品，例如，肉、加工食品、家禽、猪等等的样本。生物样本还包括污染的溶液(例如，食品加工溶液等等)，来自门诊场所、医院、诊所、食品加工场所(例如，饭店，屠宰场，冷藏库，超级市场包装等等)的拭样。生物样本还可以包括原位组织和体液(即，不是收集用于检验的样本)，例如，该方法可用于检测眼睛中病毒感染的存在或者严重性，例如，利用滴眼剂，将测试条(test strips)直接用于结膜；或者，通过例如将指示剂胶囊置于检验对象的口或者鼻咽，检测肺感染的存在或者程度。或者，拭子或者测试条可以置于口中。生物样本可以来源于对象的任意组织，器官或者细胞群。在一些实施方式中，从对象获得刮片、活组织切片或者灌洗液。生物样本可以包括体液例如血液，尿液，痰液，和口腔液体；和样本例如鼻洗涤液、拭子或者抽吸物，气管抽吸物，下疳拭子，和大便样本。适于目标个体病原体检测的生物样本的收集方法是本领域技术人员已知的，例如鼻咽样本例如鼻拭子、洗涤液或者抽吸物，或者，在涉及呼吸系统疾病的高危流感A病毒情况下的气管抽吸物，口腔拭子等等。因此，本发明的实施方式提供可用于检测各种不同类型的生物样本中流感A污染或者感染的存在或者量的方法。任选，生物样本可以悬浮在包含抗生素例如青霉素、链霉素、庆大霉素和制霉菌素的等渗溶液中。
此处使用的“配体”是指能够结合PDZ结合位点的PL化合物。配体的典型实例包括包含PL的复合病毒颗粒(上文)，该颗粒发现于各种不同的流感A株中。该配体能够填满PDZ结构域结合位点处的三维空间，使得静电斥力被最小化，静电引力被最大化，疏水性和氢键键合力被最大化。配体以特异和可饱和的方式结合PDZ多肽，并且结合亲合力可以根据本领域技术人员已知的配体结合检测法测定，例如下面所公开的。
“特异性”，当用于本发明实施方式的分析背景时，是指根据本发明步骤进行的该分析，能够从一组生物样本(例如，100个样本的组)中正确鉴定出样本的“指示”百分比。该样本组全部包含一种或者多种胞壁质分析物(例如，细菌或者真菌污染的阳性对照样本)。优选该“指示”特异性大于85％，(例如，分析法能够指示100个样本中大于85个包含一种或者多种胞壁质分析物)，并最优选，该分析法的指示特异性大于90％。任选，该分析法能够鉴别“真正的非流感A病例”，即，从生物样本组(例如，100个样本的组)中检测出阴性样本的“指示”百分比。优选，本发明的该步骤能够正确鉴定出“真正的非禽流感A病例”；和最优选，本发明的该步骤能够正确鉴定出“真正的低致病性禽流感A病例”。在不同的实施方式中，样本的阴性对照组或者不包含流感A PL分析物；或者，包含非禽流感A PL分析物；或者，包含非致病的流感PL。优选该特异性大于85％，(例如，分析法能够指出100个样本中超过85个)，和最优选，该检测法的特异性大于90％。
“特异性”，当用于本发明实施方式的背景时，是指根据本发明步骤进行的该分析法能够从一组包含阳性对照(上文)和阴性对照(即，缺失PL分析物)的样本组中鉴定出“指示”百分比的包含流感PL分析物的那些样本。优选该“指示”的灵敏度大于85％和最优选大于90％。任选，该分析法能够从一组样本中以包含流感PL分析物的那些样本的“ 指示”百分比鉴定出“真正的流感A病例”。优选，本发明的该步骤能够正确的鉴定出“真正的禽流感A病例”；和，最优选，本发明的该步骤能够正确的鉴定出“真正的致病性禽流感A病例”。在不同的实施方式中，样本的阳性对照组包含流感A PL分析物；或者，包含禽流感APL分析物；或者，包含高致病性的流感A PL。优选该“指示”灵敏度大于大约70％和更优选大于大约80％。甚至更优选，灵敏度大于大约85％和最优选大于对照灵敏度的大约90％。或者，该灵敏度可以参照鉴定相同蛋白的PCR反应的灵敏度测定。
就特异性和灵敏度而言，任选可以运用下列定义：
“阳性预测值”，缩写为PPV，是指在本方法中检测为阳性并且是真正禽流感A病例的样本的百分比。优选，本方法的PPV大于约65％，和最优选的大于约80％。
“阴性预测值”，缩写为NPV，是指检测为阴性并且是真正阴性流感A病例的样本的百分比。优选，本方法的NPV大于约85％，和最优选大于约90％。
当涉及生物样本时，“真正阳性流感A”是指两个或者更多个独立试验确认的包含流感A病毒颗粒的样本，所述试验例如，在含胚鸡卵中分离和培养，在商业化免疫测定法、免疫扩散、红细胞凝集和/或红细胞凝集抑制试验中鉴定病毒抗原来鉴别HA和/或NA亚型，在呼吸器官标本的细胞中病毒RNA的RT-PCR检测或者流感A抗原的免疫荧光检测。
当涉及生物样本时，“真正阳性禽流感A”是指两个或者更多个独立试验确认的包含禽流感A病毒颗粒的样本，所述试验例如，在含胚鸡卵中分离和培养，在商业化免疫分析试验、免疫扩散、红细胞凝集和/或红细胞凝集抑制试验中鉴定病毒抗原来鉴别HA和/或NA亚型，在呼吸器官标本的细胞中病毒RNA的RT-PCR检测或者禽流感A抗原的免疫荧光检测。
当涉及生物样本时，“真正阳性高致病性禽流感A”是指如上文定义并由两个或者更多个独立试验确认的包含高致病性禽流感A病毒颗粒的样本，所述试验例如，在含胚鸡卵中分离和培养，在商业化免疫分析试验、免疫扩散、红细胞凝集和/或红细胞凝集抑制试验中鉴定病毒抗原来鉴别HA和/或NA亚型，在呼吸器官标本的细胞中病毒RNA的RT-PCR检测或者禽流感A抗原的免疫荧光检测。
当涉及生物样本时，“阴性禽流感A”是指两个或者更多个独立试验确认的不包含禽流感A病毒颗粒的样本，所述试验例如，在含胚鸡卵中分离和培养，在商业化免疫分析试验、免疫扩散、红细胞凝集和/或红细胞凝集抑制试验中鉴定病毒抗原来鉴别HA和/或NA亚型，呼吸器官标本的细胞中病毒RNA的RT-PCR检测或者流感A抗原的免疫荧光检测。
当涉及生物样本时，“真正阴性禽禽流感A”是指两个或者更多个独立试验确认的不包含禽流感A病毒颗粒的样本，所述试验例如，在含胚小鸡卵中分离和培养，在商业化免疫分析试验、免疫扩散、红细胞凝集和/或红细胞凝集抑制试验中鉴定病毒抗原鉴别HA和/或NA亚型，呼吸器官标本的细胞中病毒RNA的RT-PCR检测或者流感A抗原的免疫荧光检测。在这种情况下，生物样本可能包含除了禽流感A病毒颗粒以外的流感A病毒颗粒，即，如上文定义。
当涉及生物样本时，“真正阴性高致病性禽流感A”是指如上定义并且由两个或者更多个独立试验确认的不包含高致病性禽流感A病毒颗粒的样本，所述试验例如，在含胚小鸡卵中分离和培养，在商业化免疫分析试验、免疫扩散、红细胞凝集和/或红细胞凝集抑制试验中鉴定病毒抗原来鉴别HA和/或NA亚型，呼吸器官标本的细胞中病毒RNA的RT-PCR检测或者流感A抗原的免疫荧光检测。但是该样本可能包含上文定义的流感A病毒颗粒或者较低致病性的禽流感A病毒颗粒。
当用于本发明实施方式的试验法情况下时，“背景”是指试验结果中的不确定性，(有时表示为假阳性或者假阴性结果的百分比或者通过测定试验结果的置信度)，是由试验中存在可能干扰分析的正确运行的物质时产生的。可能起干扰作用的物质，即，干扰物质、混淆(confounding)物质等的典型实例包括内源性PDZ结合多肽，信号发生化合物的抑制剂或者底物，例如，酶抑制剂，自由基反应性化合物，内源性过氧化物等等。
此处使用的“基本上纯化的”是指包含非天然状态的天然PDZ或者PL多肽或者肽的制剂，例如其纯度高于自然界中的水平。典型的比天然样本中记载的更高水平的纯度包括PDZ和PL多肽和其片段，相对于存在于天然来源材料中的水平，它们被富集大于约10倍到约25倍，优选的大于约26倍到约50倍，和最优选大于约100倍。该制剂还优选包含小于约10％的杂质，和最优选小于约5％的可检测杂质，例如通过SDS-PAGE或者反相HPLC。
先前已经确定并在NCBI的Genbank数据库中电子储存的核酸和蛋白序列在此通过Genbank检索号(GI)引入作为参考。在那些Genbank项目中披露的序列集合为了一切目的在此完整引入作为参考。申请人明确保留以后修改说明书以具体列举一种或者多种这些序列、或者其任意标明部分的权利。
此处涉及的各种生化和分子生物学方法都是本领域公知的，并且描述于，例如，Sambrook等人，Molecular Cloning：A Laboratory Manual，Cold Spring Harbor Press，N.Y.第二(1989)和第三(2000)版，和CurrentProtocols in Molecular Biology，(Ausubel，F.M.等人编著)John Wiley &Sons，Inc.，New York(1987-1999)。
核酸可以是DNA或者RNA，和单链或者双链。寡核苷酸可以是天然存在或者合成的，但通常通过合成方法制备。优选的本发明的核酸包括DNA片段，或者它们的互补序列(complement)，包括如表12所示的包含Ser70的NS2序列中的任意一个。该片段通常在5和100个连续碱基之间，并且范围经常在5，10，12，15，20，或者25个核苷酸到10，15，30，25，20，50或者100个核苷酸之间。5-10，5-20，10-20，12-30，15-30，10-50，20-50或者20-100个碱基之间的核酸是常见的。多态性位点可以存在于片段内的任意位置。该片段可以来自于表12所示的NS2的任意等位基因形式。为了在表中简便起见，符号T用于代表DNA中的胸腺嘧啶和RNA中的尿嘧啶。因此，在RNA寡核苷酸中，符号T应解释为表示尿嘧啶残基。
杂交探针能够以碱基特异方式结合核酸的互补链。这种探针包括核酸，肽核酸，如Nielsen等人于Science 254，1497-1500(1991)的描述。
术语引物是指一种单链寡核苷酸，它能够在合适条件(即，存在4种不同的核苷三磷酸和聚合剂，例如，DNA或者RNA聚合酶或者逆转录酶)、合适缓冲液和合适温度下，作为模板指导的DNA合成起始点。引物的适合长度取决于引物的打算用途，但范围通常在15到40个核苷酸之间。短的引物分子通常需要较冷的温度以便与模板形成足够稳定的杂交复合物。引物无须反映模板的精确序列，但必须足够互补以便与模板杂交。术语引物位点是指与引物杂交的靶DNA区域。术语引物对是指包括5′上游引物和3′下游引物的引物组，5′上游引物与待扩增的DNA序列的5′端杂交，3′下游引物与待扩增的序列的3′端互补序列杂交。
多态性是指病毒种群中两种或更多遗传确定的可变序列或者等位基因的存在。第一个鉴定的等位基因形式被随意命名为参照形式，而其他等位基因形式被命名为可变或者变体等位基因。在这种情况下，多态性包括70位，其中甘氨酸被替换为丝氨酸。
单核苷酸多态性发生在被单核苷酸占据的多态性位点，这是等位基因序列之间的变异位点。该位点通常在等位基因高度保守序列(例如，种群成员中变化小于1/100或者1/1000的序列)的前后。
单核苷酸多态性通常由于多态性位点处一个核苷酸取代另一个而产生。转换(transition)是一种嘌呤被另一种嘌呤或者一种嘧啶被另一种嘧啶替换。颠换(transversion)是一种嘌呤被一种嘧啶替换，或者反之亦然。单核苷酸多态性还可以源于相对于参照等位基因的核苷酸的缺失或者核苷酸的插入。
一组多态性是指至少2个，和有时5个，或者更多的如表12或者13和/或表3a-e所示的多态性。
杂交通常在严谨条件下进行，该条件允许寡核苷酸和靶DNA之间的特异结合，靶DNA包含如表12或者13和/或表3a-e所示的多态性位点中的一种。严谨条件定义为任意合适的缓冲液浓度和温度以及任意去除寡核苷酸非特异性结合的洗涤条件，所述缓冲液浓度和温度允许寡核苷酸能够与高度同源的序列特异杂交，该序列跨越至少一个如表12或者13所示的多态性位点。例如，5×SSPE(750mM NaCl，50mM磷酸钠，5mM EDTA，pH 7.4)和温度25-30℃的条件适于等位基因特异探针的杂交。
通常洗涤条件的范围从室温到60℃。
术语引物是指一种单链寡核苷酸，它能够在合适条件(即，存在4种不同的核苷三磷酸和聚合试剂，例如，DNA或者RNA聚合酶或者逆转录酶)、合适缓冲液和合适温度下，作为模板指导的DNA合成起始点。引物的适合长度取决于引物的打算用途，但范围通常在15到30个核苷酸之间，尽管也可以使用更短或者更长的引物。短的引物分子通常需要较冷的温度以便与模板形成足够稳定的杂交复合物。引物无须反映模板的精确序列，但必须足够互补以便与模板杂交。术语“引物位点”是指与引物杂交的靶DNA区域。术语“引物对”是指包括5′上游引物和3′下游引物的引物组，5′上游引物与待扩增的DNA序列的5′端杂交，3′下游引物与待扩增DNA序列的3′端互补序列杂交。
为将氨基酸取代分类为保守或者非保守，氨基酸分组如下：组I(疏水性侧链)：正亮氨酸，甲硫氨酸，丙氨酸，缬氨酸，亮氨酸，异亮氨酸；组II(中性亲水性侧链)：半胱氨酸，丝氨酸，苏氨酸；组III(酸性侧链)：天冬氨酸，谷氨酸；组IV(碱性侧链)：天门冬酰胺，谷氨酰胺，组氨酸，赖氨酸，精氨酸；组V(影响链取向的残基)：甘氨酸，脯氨酸；和组VI(芳香族侧链)：色氨酸，酪氨酸，苯丙氨酸。保守取代包括同类氨基酸之间的取代。非保守取代是由这些类型中一种的成员交换另一成员构成。
此处叙述的方法可以按照所叙述事件的任意次序进行，即，达到这样的顺序逻辑上可行的程度。此外，当提供范围数值时，应当清楚，在所述范围上下限之间的每个居间值，以及落在该范围内的任意其他提及的或者居间的值都包括在本发明内。同时，预期所述的本发明改变的任何任选特征可以阐明并独立提出权利要求，或者与此处描述的任意一个或者多个特征结合。
指示单个物品包括存在有多个相同物品的可能性。更具体地，如此处和所属权利要求中使用的，单数形式“一个”、“所述(said)”和“该(the)”包括复数指示，除非上下文明显另有规定。还应注意，可以起草权利要求以排除任何任选元素。因而，对于权利要求元素的叙述相关的排它术语如“唯一”“只有”等的使用，或者“负性”限制的使用，本声明意在作为前提基础。
发明详述
本发明的前提部分基于注意到流感NS1蛋白具有PL区，该PL区与哺乳动物PDZ蛋白相互作用，并且不同的PL模体与不同的PDZ蛋白特异性相互作用。本发明的前提还部分地基于以下结果：在身体分泌物例如鼻分泌物中能够发现可检测水平的NS1 PL蛋白。流感A夺取正常宿主细胞的功能，并引起导致致病性的变化。已发现某些致病性流感株具有非结构NS1蛋白，该蛋白含有结合哺乳动物PDZ蛋白的配体模体。作为急性毒力因子，NS1蛋白可能干扰或者转变宿主细胞高分子蛋白复合物的PDZ蛋白组装。因为PDZ蛋白还通常参与分子伴侣、内吞和分泌过程，此处公开的证据有力支持以下观点：毒性流感株破坏基于细胞PDZ的调节机制。本发明提供新的诊断组合物和方法，以及，治疗性抗病毒靶位和候选化合物。
本结果显示特异PDZ蛋白与流感NS1的结合具有高亲合力和特异性。PDZ蛋白与毒性而不是非毒性流感A株中的C端三-和四-肽NS1模体结合。为了说明该方法，利用重组PDZ蛋白和交叉反应的抗NS1单克隆抗体，构建嵌合分析以区别致病性和非致病性流感A株(又称为毒性的和非毒性的)。该分析方法包括将对象的待测样本与包含PDZ结构域的多肽接触，并检测样本中的致病性流感A NS1 PDZ配体是否结合PDZ配体多肽。包含PDZ的多肽和病毒PDZ配体之间的结合表明NS1来自于流感A的毒性株。当对患者样本进行试验时，该结果表明对象感染了流感A病毒的致病株。该分析特别适合于鉴定H5和/或H7致病株。更优选该分析鉴定至少一种致病株，包括H5N1、H7N2、H7N7、H10N7，并最优选该分析鉴定H5N1株。更优选，该分析鉴定禽类株的致病株，例如当前造成禽流感的H5N1，其具有NS1 PL模体ESEV(SEQ ID NO：2)。
不同的流感A株编码具有不同PDZ配体(PL)的蛋白。因此不同的流感A株可以根据它们的PL进行区分。因此，本发明还提供通过与特异NS1 PL类型的关系，确定流感病毒亚型的方法。还提供检测人类对象是否感染禽流感病毒H5N1株的方法。还提供鉴定抗病毒剂的分析法。因为该方法检测只在感染细胞内部产生的病毒NS1抗原，所以该方法可用于筛查，以检测当前被感染的对象。该方法是特别有利的，因为与其他方法不同，它可以区别已免疫和被感染的对象。被感染的对象具有病毒NS1抗原，而已免疫的则没有。最优选，该方法能够区别禽流感A病毒的不同亚型，以鉴定(即，具有阳性分析结果)一种或者多种高致病性禽流感A株，如果它们存在于生物样本中。优选，该分析方法包括例如，在商业化屠宰场、农场或者养殖场监控禽类对象感染高致病性禽流感A株例如H5N1或者H7的步骤，。在其他实施方式中，本发明通过鉴定被感染的动物并除去和/或销毁和/或治疗它们以预防传染其他对象，而提供预防在大量对象中流行的流感A病毒传播的方法。优选，该方法包括区分感染了高致病性流感A株，例如禽类亚型如H5N1，与那些感染了较低致病性株的禽类和人类对象。
此外本发明提供检测对象是否感染流感病毒；和/或，受试者是否感染高危流感A病毒的禽类株的方法。该方法包括将来自对象的待测样本与特异识别NS1 PL的PDZ结构域多肽、抗体和/或适配体和/或其他试剂接触，并检测待测样本中的分析物与PDZ结构域多肽、抗体和/或适配体之间是否发生结合相互作用。评价和检测该结合相互作用可用于确定待测样本包含流感病毒PL；从而确认受试者被感染。该方法还可以在流感A病毒株之间进行区分，例如评价对象是否感染高危禽流感病毒株(致病性)例如H5N1，或者，感染较低危的H1N1株(无致病性)。还提供在鉴定药物抗病毒化合物，例如药物开发中有用的筛选分析法。因此，本发明发现了在各种诊断和治疗应用中的用途。
I.流感病毒
流感病毒属于正粘病毒科(Orthomyxoviridae)，并基于它们核蛋白(NP)和基质蛋白(M1)的抗原差异分为A、B和C组。进一步分型到株通常基于对存在于两个毒粒糖蛋白中的抗原类型，即，红细胞凝集素(HA；H)和神经氨酸苷酶(NA；N)进行评价。HA和NP是毒性因子，介导病毒粒子与宿主细胞表面的连接。M1蛋白被认为在病毒组装和出芽中起作用，而NP在RNA复制和转录中起作用。除这些毒粒蛋白之外，两个其他非结构(即非毒粒)蛋白在病毒感染细胞中表达，它们被称为非结构蛋白1和2(NS1；NS2)。非结构病毒蛋白NS1具有多重功能，包括调节剪接和核输出细胞mRNAs和刺激翻译，以及抵抗宿主干扰素能力。在流感病毒中已经鉴定和测序了NS1蛋白，该序列可以在NCBI数据库中查到。其他流感病毒中的NS1蛋白，是指与在已知流感亚型中鉴定为NS1的蛋白之一具有最大序列相似性的蛋白，使用的序列例如，genbank检索号，CY003340，CY003324，DQ266101，等等。
全部禽流感病毒分类为A型。已经从人，猪，马和海洋哺乳动物以及家养和野生鸟类中分离出A型病毒。禽流感病毒是发生人流感大流行的关键因素，因为1957年的亚洲流行性感冒和1968年的香港流感都是由据认为是禽类来源的病毒引起。近年来，H5N1和H7N7亚型的纯种禽流感病毒已经在香港和荷兰直接造成致命的人类疾病(Horimoto，T.和Kawaoka，Y.(2001)Clin.Microbiol.Rev.14：129-149；Guan，Y.等人(2004)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 101：8156-8161)。
II.PL区
下面的实施例显示，流感病毒病原体包含具有PDZ配体的模体的病毒蛋白，所述PDZ配体结合PDZ蛋白。具有PL模体的病毒蛋白，包括红细胞凝集素(HA)，核蛋白(NP)，基质1(M1)和非结构蛋白1(NS1)蛋白。但是，II型PL模体(全部，单除了NS1蛋白)显示与PDZ蛋白较弱的结合。通常在蛋白最后3或者4个C末端氨基酸处发现PL模体。在大多数流感NS1蛋白中发现的可鉴别模体是S/T-X-V/I/L，其中S是丝氨酸，T是苏氨酸，V是缬氨酸，I是异亮氨酸，L是亮氨酸，X是任意氨基酸。各特异性模体的频率在实施例1和表3a-e中显示。尽管EPEV(SEQ ID NO：27)和KMAD(SEQ ID NO：28)不对应于典型的PL模体，但它们在一定程度上结合PDZ，并且也能用于鉴定。表3a-e和图1-3的结果显示了通过H和N抗原鉴别的亚型和相应NS1 PL模体之间的非随机关系。特异NS1 PL模体此处被称为NS1PL类。
III.PDZ蛋白
最近已经显示PDZ结构域是细胞质膜蛋白复合物的主要组织者。最初鉴定PDZ结构域为突触后密度蛋白PSD95/SAP90、果蝇肿瘤抑制物dig-A和紧密连接蛋白ZO-1内的保守序列元件。尽管最初被称为GLGF(SEQ ID NO：26)或者DHR模体，但现在它们已知为代表前3个包含PDZ的蛋白(PDZ：PSD95/DLG/ZO-1)的缩写。现在这些80-90个氨基酸的序列已在超过75种蛋白中得到了很好的鉴定，并在单个蛋白内特征性地多拷贝表达。PDZ结构域被国家生物技术信息中心(theNational Center for Biotechnology Information)(www.ncbi.gov)识别为家族，例如在Pfam中。还发现它们存在于不同生物体的整个系统发育中，如多细胞动物、植物和细菌。这种广泛的物种分布好象是只有这种结构域特有的，但或许PDZ结构域最区别性特征在于观察到绝大多数包含它们的蛋白与胞质膜相关。尽管在许多不同结构中发现了PDZ结构域，但各PDZ蛋白通常局限于特定的亚细胞结构域，例如突触；细胞-细胞接触；或者顶端、底部或者侧部的细胞表面。这引出一种推测，即PDZ结构域进化早，在组织胞质膜结构域中发挥主要作用。PDZ结构域最普遍的功能可能是将它们的配体定位到合适的胞质膜结构域。在极化上皮细胞中，PDZ蛋白清楚地定位在不同的顶端、底部-侧部和结合的膜结构域，并且在大部分情况下，与它们的跨膜和细胞溶质结合伴侣共定位。显然PDZ蛋白还具有一个基本作用，在特定亚细胞结构域内空间簇聚集和锚定跨膜蛋白。
PDZ结构域包含约80-90个残基，它们折叠成具有5-6个β链和两个α螺旋的β-夹心结构。肽配体结合在由β链(bB)、α螺旋和结合肽的羰基的环组成的疏水性裂缝(cleft)中。肽以反平行模式与bB链结合，C末端残基占据疏水性袋。PDZ杂二聚体形成线性的头尾(head-to-tail)排列，参与伴侣蛋白之一上内部构件(internal)的识别。PDZ结构域蛋白在本领域是已知的，通过蛋白测序和鉴定PDZ结构域的存在，新的蛋白能够被鉴定为具有PDZ结构域。2004年8月2日提交的美国专利申请10/485,788详细解释了PDZ蛋白，并给出了大量实例。或者，怀疑是PDZ蛋白的蛋白可以检测与各种PL蛋白或者NS1 PL类的结合。
IV.PDZ/PL相互作用
来自流感的包含PL模体的NS1蛋白与实施例中所示的PDZ蛋白结合。实施例2显示了用于鉴定结合的方法。2004年8月2日提交的美国专利申请10/485,788和2003年11月14日提交的10/714,537详细描述了检测PDZ结构域多肽和候选PDZ配体多肽之间结合的两个互补分析(A和G分析)。在两个不同分析的每一种中，检测具有对应于预期结合一种或者多种PDZ结构域的蛋白的C末端的序列的肽(即候选PL肽)，和PDZ结构域多肽(通常是包含PDZ结构域的融合蛋白)之间的结合。
A.检测PDZ结构域多肽和NMDA受体PL蛋白之间相互作用的 分析
建立了两个称为“A”和“G”的互补分析来检测PDZ结构域多肽和候选PDZ配体之间的结合。在两个不同分析的每一种中，检测具有对应于预期结合一种或者多种PDZ结构域的蛋白C末端的序列的肽(即候选PL肽)和PDZ结构域多肽(通常是包含PDZ结构域的融合蛋白)之间的结合。在“A”分析中，固定候选PL肽并检测可溶PDZ结构域多肽与固定肽的结合(“A”分析的命名是因以下事实：在一个实施方式中用抗生物素蛋白表面(avidin)固定肽)。在“G”分析中，固定PDZ结构域多肽，并检测可溶PL肽的结合(“G”分析的命名是因为用GST-结合表面固定PDZ结构域多肽)。下面描述示范性的分析。
I.“A分析”利用固定PL肽检测PDZ配体结合。
分析包括下列步骤：
(1)将生物素化的候选PL肽固定在抗生物素蛋白包被的表面上。然后测定PDZ结构域融合蛋白与该表面的结合。
(2)抗生物素蛋白与表面，例如蛋白结合表面结合。任选，通过每孔添加100μL溶于不含钙和镁的磷酸盐缓冲盐水pH 7.4(“PBS”，GibcoBRL)的20μg/mL的抗生物素蛋白(Pierce)，在4℃12小时，将抗生物素蛋白结合到聚苯乙烯96孔板(例如，Nunc Polysorb(cat#_475094))。然后通过每孔添加200μLPBS，在4℃ 2小时，对板进行处理以阻断非特异性的相互作用，所述PBS每100mL含有2g无蛋白酶牛血清白蛋白(“PBS/BSA”)。然后对板的每孔重复添加每孔200μLPBS，用PBS洗板3次，然后将板的内含物倒入废液器中，在干燥表面上轻叩板。
(3)通过每孔添加50μL溶于PBS/BSA的0.4μM肽，在4℃30分钟，将生物素化的PL肽(或者候选PL肽)固定在板的孔表面上。通常，各个不同的肽添加到至少8个不同的孔，因此能够做出多重测量(例如，双份重复，并且还利用不同的GST/PDZ结构域融合蛋白和单独的GST阴性对照)，并且还准备其他的阴性对照孔，其中没有肽被固定。在PL肽固定到表面上后，用PBS洗板3次。
(4)通过每孔添加50μL包含溶于PBS/BSA的5μg/mL GST/PDZ结构域融合蛋白的溶液，在4℃ 2小时，使得GST/PDZ结构域融合蛋白与表面反应。作为阴性对照，添加单独的GST(即不是融合蛋白)到指定孔，通常每个固定肽至少2个孔(即双份重复测量)。反应2小时后，用PBS洗板3次以去除未结合的融合蛋白。
(5)可以利用本领域已知的各种方法和检测器检测GST/PDZ结构域融合蛋白与抗生物素蛋白-生物素化肽表面的结合。在一个实施方式中，板中每孔添加50μL溶于PBS/BSA的抗GST抗体(例如2.5μg/mL多克隆山羊抗GST抗体，Pierce)，使其在4℃反应20分钟。用PBS洗板3次，添加第二种可检测的标记抗体。在一个实施方式中，板中每孔添加50μL 2.5μg/mL辣根过氧化酶(HRP)偶联的多克隆兔抗山羊免疫球蛋白抗体，使其在4℃反应20分钟。用包含0.2％Tween 20的50mM Tris pH 8.0洗板5次，通过每孔添加100μL HRP底物溶液(TMB，Dako)，在室温(RT)20分钟显色。通过每孔添加100μL 1M硫酸终止HRP和其底物的反应，在450nm读出板上各孔的光密度(O.D.)。
(6)通过对来自PL肽和PDZ结构域多肽组合的孔中信号与背景信号进行比较，检测PL肽和PDZ结构域多肽的特异结合。背景信号是阴性对照中发现的信号。典型的特异或者选择性反应至少两倍于背景信号，更典型的超过5倍于背景信号，和最典型的是10倍于或者更多倍于背景信号。此外，统计上有显著意义的反应包括多次测量的信号和背景相差至少两个标准误差的反应，更典型的是4个标准误差，和最典型的是6个或者更多个标准误差。相应地，比较信号的重复测定与背景的重复测定的统计检验(例如T-检验)将得出p值＜0.05，更典型的是p值＜0.01，和最典型的是p值＜0.001或者更低。如所述，在“A”分析的实施方式中，来自GST/PDZ结构域融合蛋白与未接触(即未被覆盖)PL肽的抗生物素蛋白表面相结合的信号是一个合适的阴性对照(有时称为“B”)。来自单独GST多肽(即不是融合蛋白)与已经接触(即被覆盖)PL肽的包被抗生物素蛋白的表面相结合的信号是第二种合适的阴性对照(有时称为“B2”)。因为所有的检测都进行多次(即至少两次)，用几次检测的算术平均值(或者，相当于，平均)确定结合，用平均值的标准误差确定结合检测中的概率误差。N次检测的平均值的标准误差等于下列的平方根：各检测值和平均值之间差值的平方和，除以(N)和(N-1)的乘积。因此，在一个实施方式中，通过将特定PL-PDZ组合的平均信号(″平均S″)和信号的标准误差(“SE”)与平均值B1和/或平均值B2进行比较，确定PDZ蛋白与板结合PL肽的特异结合。
II.“G分析”一利用固定PDZ结构域融合多肽的PDZ配体结合检 测
在一方面，本发明提供一种检测法，其中GST/PDZ融合蛋白被固定在表面上(“G”分析)。然后测量标记PL肽(例如图3a-e中所列那些中的一种)与该表面的结合。在一个优选的实施方式中，该分析法按下列步骤进行：
(1)将PDZ结构域多肽结合到表面，例如蛋白结合表面。在一个优选的实施方式中，包含一个或多个PDZ结构域的GST/PDZ融合蛋白与聚苯乙烯96孔板结合。能够通过任意不同的标准方法将GST/PDZ融合蛋白结合到板上，尽管需要小心操作使融合蛋白结合到板的步骤不改变PDZ结构域的配体结合性质。在一个实施方式中，GST/PDZ融合蛋白通过包被在96孔板上的抗GST抗体来结合。当按下列操作时可以实现与板的充分结合：
a.聚苯乙烯96孔板(例如，Nunc Polysorb)中每孔添加100μL溶于PBS的5μg/mL山羊抗GST多克隆抗体(Pierce)，在4℃12小时。
b.每孔添加200μL PBS/BSA，在4℃2小时，对板进行封闭。
c.用PBS洗板3次。
d.板上每孔添加50μL溶于PBS/BSA的5μg/mL GST/PDZ融合蛋白或者作为阴性对照的单独GST多肽(即不是融合蛋白)，在4℃2小时。
e.再用PBS洗板3次。
(2)通过每孔添加50μL溶于PBS/BSA的20μM生物素化的肽溶液，使生物素化的PL肽与表面在4℃反应10分钟，然后再在25℃孵育20分钟。用冰冷的PBS洗板3次。
(3)可以利用本领域技术人员已知的各种方法和检测器检测生物素化的肽与GST/PDZ融合蛋白表面的结合。在一个示范性步骤中，每孔添加100μL溶于BSA/PBS的0.5μg/mL链霉亲和素-辣根过氧化物酶(HRP)结合物，在4℃反应20分钟。然后用包含0.2％Tween 20的50mM Tris pH8.0洗板5次，通过每孔添加100μL HRP底物溶液(TMB，Dako)在室温(RT)20分钟显色。通过每孔添加100μL 1M硫酸终止HRP和其底物的反应，在450nm处读出板上各孔的光密度(O.D.)。
(4)通过对来自PL肽和PDZ结构域多肽组合的孔中的信号与背景信号进行比较，确定PL肽和PDZ结构域多肽的特异结合。背景信号是阴性对照中发现的信号。典型的特异性或者选择性反应至少两倍于背景信号，更典型的超过5倍于背景信号，和最典型的是10倍于或者更多倍于背景信号。此外，统计上有显著意义的反应包括多次测量得到信号和背景相差至少两个标准误差的反应，更典型的是4个标准误差，和最典型的是6个或者更多个标准误差。相应地，比较信号的重复测定与背景的重复测定的统计检验(例如T-检验)将得出p值＜0.05，更典型的是p值＜0.01，和最典型的是p值＜0.001或者更低。如所述，在“G”分析的实施方式中，来自给定PL肽与固定的(表面结合的)单独GST多肽结合的信号是合适的阴性对照(有时称为“B1”)。因为所有的测定都进行多次(即至少两次)，用几次检测的算术平均值(或者，相当于，平均)确定结合，并用平均值的标准误差确定结合测定中的概率误差。N次检测平均值的标准误差等于下列的平方根：各检测值和平均值之间差值的平方和，除以(N)和(N-1)的乘积。因此，在一个实施方式中，通过将特定PL-PDZ组合的平均信号(“平均S”)和信号的标准误差(“SE”)与平均值B1进行比较，确定PDZ蛋白与板结合肽的特异结合。
i)“G′分析”和“G″分析”
上文描述的“G分析”特定条件的两种特定改变尤其有用。改变的分析法使用更少量的标记PL肽，并且相对上文描述的特定分析条件，对PDZ配体结合的检测的生化要求略有不同。
为了方便起见，本章节描述的分析条件称为“G′分析”和“G″分析”，而在前面章节中描述的G分析特定条件称为“G0分析”。“G′分析”与“G0分析”相同，除了步骤(2)中肽浓度是10μM而不是20μM。这导致检测亲合力较低和/或离解速率较快的相互作用时灵敏度略低。相应地，它稍微增加了以下情况的确定性，即被检测的相互作用具有足够的亲合力和半衰期，从而具有生物学重要性并且是有用的治疗目标。
“G″分析”与“G0分析”相同，除了步骤(2)中肽浓度是1μM而不是20μM，并且在25℃孵育60分钟(而不是，例如，4℃ 10分钟然后是25℃20分钟)。这导致对亲合力低、离解速率快、和/或亲合力在25℃比在4℃更低的相互作用的灵敏度较低。如果(我们发现通常对PDZ配体结合来说是成立的)反应熵是负的(即产物的熵小于反应物的熵)，则相互作用在25℃的亲合力比在4℃时低。相反，在“G″分析”和“ G0分析”中，对结合和离解速率慢的相互作用，PDZ-PL结合信号可能是相似的，因为PDZ-PL复合物将在“G″分析”的较长孵育期间积聚。因此“G″分析”和“G0分析”结果的比较可用于估算不同PDZ-PL相互作用的相对熵、焓和动力学。(熵和焓通过等式ΔG＝RT 1n(Kd)＝ΔH-TΔS与结合亲合力建立联系，其中ΔG、H和S分别是反应自由能、焓和熵，T是凯氏度数的温度，R是气体常数，Kd是平衡解离常数)。特别是，只能在“ G0分析”中检测到或者在“G0分析”中检测更强的相互作用通常在25℃具有快速的离解速率(t1/2＜10分钟)和负反应熵，而在“G″分析”中检测的同样强的相互作用通常在25℃具有较慢的离解速率(t1/2＞10分钟)。PDZ-PL相互作用的热力学和动力学的大致估算(可通过上文概述的“G0分析”相对“G″分析”结果的比较实现)可用于设计相互作用的有效抑制剂。例如，基于从给定PDZ结构域缓慢解离(通过与“ G0分析”相似的“G″分析”中的结合证明)的PL化学结构的小分子抑制剂可能自身解离缓慢，因此具有高亲合力。
采用这样的方式，“G分析”步骤(2)温度和持续时间的改变可用于了解PDZ配体结合反应的动力学和热力学，并了解该反应抑制剂的设计。
本发明的可检测标记物可以是任意可检测的化合物或者组合物，它们可以直接或者间接与分子结合(例如上面描述)。该标记物能够是本身可检测(例如，放射性同位素标记或者荧光标记)或者，对酶标记物来说，可以催化底物化合物或者组合物可检测的的化学变化。优选的标记物是酶标记物，它催化非放射性显色试剂的变色。
有时，标记物间接与抗体结合。技术人员知道用于间接结合的不同技术。例如，抗体可以与生物素结合，上述任意类型的标记物可以与抗生物素蛋白结合，或者反之亦然(同样参见上面的“A”和“G”分析)。生物素选择性结合到抗生物素蛋白，因此，标记物可以用这种间接方式与抗体结合。参见，Ausubel，上文，对涉及生物素-抗生物素蛋白结合和相似分析的技术的综述。或者，为实现标记物与抗体的间接结合，抗体与小半抗原(例如地高辛)结合，上述不同类型标记物中的一种与抗-半抗原抗体(例如抗-地高辛抗体)结合。因此，可以实现标记物与抗体的间接结合。
分析变化可以包括不同的洗涤步骤。“洗涤”表示将固相暴露于水溶液(通常是缓冲液或者细胞培养基)，以这种方法使未结合的材料(例如，未粘附细胞，未粘附捕获剂，未结合配体，受体，受体构建物，细胞裂解产物或者HRP抗体)从中去除。为减少背景噪声，方便的是在洗涤液中包括去污剂(例如，Triton X)。通常，洗涤后从分析板的孔中倒出水性洗涤液。利用自动化洗涤设备可以方便地实现洗涤。有时，可能需要几个洗涤步骤(例如，在大约1到10个洗涤步骤之间)。
PDZ-PL检测分析中还可以使用不同的缓冲液。例如，不同的阻断缓冲液可用于降低分析背景。术语“阻断缓冲液”是指包含至少一种阻断化合物的水性pH缓冲溶液，其能够结合没有被包含PL或者PDZ的蛋白包被的基质的暴露表面。阻断化合物通常是蛋白例如牛血清白蛋白(BSA)，明胶，酪蛋白或者奶粉，并且不与分析中的任何试剂交叉反应。阻断缓冲液的pH通常在大约7到7.5之间，合适的缓冲剂包括磷酸盐和TRIS。
在检测PDZ-PL相互作用中，可以使用不同的酶-底物组合。酶-底物组合的实例包括，例如：
(i)辣根过氧化物酶(HRPO)与过氧化氢酶作为底物，其中过氧化氢酶氧化染料前体(例如邻苯二胺[OPD]或者3，3′，5，5′-四甲基联苯胺盐酸盐[TMB])(如上所述)。
(ii)碱性磷酸酶(AP)与对-硝基苯磷酸作为生色底物。
(iii)β-D-半乳糖苷酶(βD-Gal)与生色底物(例如对-硝基苯-β-D-半乳糖苷酶)或者荧光底物4-甲基伞型酮-β-D-半乳糖苷酶。已有大量的其他酶-底物组合。对于这些组合的总体概述，可参见美国专利4,275,149和4,318,980，这两篇均在此引入作为参考。
下页的表1和2，列出包含PDZ结构域的蛋白(“PDZ蛋白”)和PDZ配体(“PL”)，此处已经鉴定出它们彼此结合。每个PL蛋白具有结合至少一种PDZ蛋白的亲合力。表1的第2栏列出PL蛋白来源的流感A蛋白(例如，红细胞凝集素(HA)，核蛋白(NP)，基质(M1)和非结构蛋白1(NS1))；第3栏列出PL模体氨基酸序列；第4栏提供与PL结合的PDZ结构域蛋白的GenBank识别号(GI号)(该数据库项目在此引入作为参考，包括其中描述的任意注释)。
表1-PDZ-PL的相互作用*
  病原体   蛋白   C端  PDZ伴侣
  流感A   NS1   ESEV(SEQID NO：2)  外膜；PSD95(PDZ # 2)；PSD95(PDZ #1，2，3)；DLG1(PDZ#1)；DLG1(PDZ  #1，2)；DLG1(PDZ  #2)；DLG2(PDZ#1)；DLG2(PDZ #2)；Magi3(PDZ #1)；PTN3(PDZ#1)；MAST2(PDZ#1)；NeDLG(PDZ #1，2)；Shank1d1；Shank2 d1；Shank3 d1；Syntrophinlα；Syntrophin γ1；Magi1(PDZ#1)；Magi1(PDZ #4)；Tip1；PTPL1(PDZ #1)；Mint3(PDZ #1)；Lym Mystique(PDZ#1)；DLG2(PDZ #3)；MUPP1(PDZ #8)；NeDLG(PDZ #1)；DLG5(PDZ #1)；PSD95(PDZ #1)；NumBP(PDZ #3)；LIMK1(PDZ#1)；KIAA0313；DLG1(PDZ #2)；Syntenin(PDZ #2)；Pick1
  NS1   EPEV(SEQID NO：27)  PSD95(PDZ # 2)PSD95(PDZ #1，2，3)
  NS1  ESEI(SEQ IDNO：3) 外膜；PSD95(PDZ #2)；PSD95(PDZ #1，2，3)；NeDLG(PDZ #1，2)；DLG2(PDZ #2)；MAST2；PTN3(PDZ#1)
  NS1  ESKV(SEQID NO：4) PSD95(PDZ #2)；PSD95(PDZ #1，2，3)；MAST2；Magi3(PDZ #1)；NeDLG(PDZ #1，2)；NumBP(PDZ #4)
*实验证实的相互作用。
表2-PDZ-PL相互作用
 流感A   HA   8486126   RICI(SEQ ID NO：13)，NICI(SEQ  ID NO：11)，TICI(SEQ ID NO：12)  NOS1(PDZ#1，2，3)；MINT1(PDZ#2)；ZO-1(PDZ #2)；NSP；RIM2
  NS1   8486133   ESEV(SEQ ID NO：2)，RSEV(SEQ ID NO：7)，RSKV(SEQ ID NO：8)  NeDLG(PDZ#1，2)；LIM-RIL；Vartul(PDZ#1，2)；MAGI2；DLG2(PDZ#1，2)；MAST2；DLG1(PDZ#1，2)；PSD95(PDZ# 1，2，3)；MAGI1；TIP1；MAGI 3；外膜蛋白；MAST2；Syntrophin γ1；MUPP1(PDZ#13)；PTPL1(PDZ#2)；Syntrophin 1 α；ERBIN；KIAA1526；AIPC；LIM mystique；TIP43；TIP2
 流感B   HA   8486153   SICL(SEQ ID NO：18)  NOS1(PDZ #1，2，3)；MINT1(PDZ#2)；ZO-1(PDZ #2)；NSP；RIM2；新型丝氨酸蛋白酶；PICK1
  NA   8486155   DMAL(SEQ IDNO：14)，DMTL(SEQIDNO：15)，DIAL(SEQIDNO：16)  ZO-1(PDZ#2)；RIM2；新型丝氨酸蛋白酶；MINT1
  M1   8486158   RKYL(SEQ IDNO：29)，KKYL(SEQIDNO：30)  ZO-1(PDZ #2)RIM2 d1
  核蛋白   8486160   DLDY(SEQ IDNO：17)  ZO-1(PDZ#2)RIM2 d1；syntenin
PDZ蛋白可以产生为融合蛋白，只要它们包含活性PDZ结构域。例如，已经产生了PDZ结构域克隆入载体(PGEX-3X载体)用于产生GST-PDZ融合蛋白(Pharmacia)，并在现有的美国和国际专利申请中有教导，例如，美国专利申请10/485,788(2004年2月3日提交)，国际专利申请PCT/US03/285/28508(2003年9月9日提交)，国际专利申请PCT/US01/44138(2001年11月9日提交)，在此完整引入作为参考。
V.筛选PDZ蛋白
筛选方法可以包括利用已知的用于序列分析和/或结构域分析的任意计算机程序，使用序列分析鉴定PDZ结构域。一旦鉴定出PDZ蛋白，可以筛选其与流感PL蛋白相互作用的能力。
PDZ蛋白或者PDZ结构域多肽是包含PDZ结构域的任何蛋白。任意包含PDZ结构域的蛋白，无论是天然、重组、嵌合或者片段，都可筛选其结合流感PL结构域的能力。美国专利申请10/485,788(2004年2月3日提交)，国际专利申请PCT/US03/285/28508(2003年9月9日提交)，国际专利申请PCT/US01/44138(2001年11月9日提交)给出了PDZ结构域的鉴定方法，在此完整引入作为参考。
VI.筛选其他PL结合剂
适于在诊断分析中使用的PL结合剂包括特异结合一种或者多种PL模体的任意试剂。利用在筛选抗病毒剂方法中公开的相同方法能够鉴定这样的试剂。例如，利用包含PL模体的蛋白能够鉴定该试剂。利用任意类型的文库，例如包括表达文库和小分子文库，能够鉴定待测化合物。用于筛选治疗剂或者治疗先导物的待测化合物的优选来源是噬菌体展示文库。参见，例如，Devlin，WO91/18980；Key，B.K.，等人编著，Phage Display of Peptides and Proteins，A Laboratory Manual，Academic Press，San Diego，CA，1996。噬菌体展示是一种强大的技术，使人能够从包含108-109个不同序列的文库中，使用噬菌体遗传学选择和扩增具有所需特征的肽或者蛋白。可以将文库设计为氨基酸序列在所需位置的选择性上色(variegation)，使得文库对所需特征偏好。设计文库使肽表达为与噬菌体表面呈现的蛋白融合。挑选具有所需特征的噬菌体展示肽，能够再生长进行扩增。因为肽是通过噬菌体的增殖扩增的，可以方便地测序所选噬菌体的DNA，从而促进所选肽的快速分析。
通过筛选特异结合PDZ结构域蛋白和/或NS1 PL的噬菌体，能够挑选出编码肽抑制剂的噬菌体。产生与蛋白融合的文库，例如表达在噬菌体表面的基因II。文库可以由不同长度的、线性的或者通过包含两个Cys氨基酸进行限制的肽组成，与噬菌体蛋白融合或者还可以融合到其他作为支架的蛋白。还可以设计文库偏好此处公开的PL区或者偏好从初始文库筛选的结合噬菌体得到的肽序列，所述初始文库提供其他的分析抑制剂化合物。
VII.用于诊断和治疗用途的抗体
本发明的NS1，NS1 PL，PDZ和PDZ PL结合结构域多肽可用于产生在诊断和治疗中使用的抗体。抗体可以是多克隆抗体、不同的单克隆抗体或者具有不同表位特异性的集合单克隆抗体。采用依据抗体类型的标准方法，单克隆抗体由包含抗原的蛋白片段制备(参见，例如，Kohler，等人，Nature，256：495，(1975)；和Harlow & Lane，Antibodies，ALaboratory Manual(C.S.H.P.，NY，1988)Queen等人，Proc.Natl.Acad.Sci USA 86：10029-10033(1989)和WO 90/07861；Dower等人，WO91/17271和McCafferty等人，WO 92/01047(每项在此引入作为参考用于所有的目的)。噬菌体展示技术还可以用于诱变抗体的CDR区，所述抗体先前显示具有与本发明肽的亲合力。一些抗体与存在于NS1或者PDZ蛋白的一种形式而不是其他形式中的抗原表位结合。例如，一些抗体与NS1 C端PL位点内的抗原表位结合。那些结合特异性NS1 PL模体的抗体可被分为NS1 PL类-特异抗体。此外，一些抗体与PDZ蛋白的PDZ结构域内的抗原表位结合。一些抗体与例如表1中所示的PDZ多肽特异结合，而不与其他结合。可以纯化抗体，例如，通过与支持物结合和从其洗脱，所述支持物上结合有激发抗体的多肽或者肽。
术语“抗体”或者“免疫球蛋白”用于包括完整的抗体和其结合片段。通常，片段与作为片段来源的完整抗体竞争与抗原片段的特异结合，所述抗原片段包括分开的重链，轻链Fab，Fab′F(ab′)2，Fabc和Fv。通过重组DNA技术或者通过酶或者化学分离完整的免疫球蛋白来产生片段。术语“抗体”还包括一种或者多种免疫球蛋白链，该免疫球蛋白链与其他蛋白化学结合，或者与其他蛋白表达为融合蛋白。术语“抗体”还包括双特异性(bispecific)抗体。双特异性或者双功能抗体是一种人工杂交抗体，具有两个不同的重/轻链对和两个不同的结合位点。可以通过各种方法包括杂交瘤融合或者Fab′片段连接产生双特异性抗体。参见，例如，Songsivilai & Lachmann，Clin.Exp.Immunol.79：315-321(1990)；Kostelny等人，J.Immunol.148，1547-1553(1992)。
抗体可以用作流感A感染和其亚型，尤其是禽流感A感染的预测和诊断的试剂(例如，在预包装的试剂盒中)。可以用各种方法预测和诊断流感A感染。
A.泛反应性(Pan-reactive)抗体
泛反应性或者泛特异性(pan-specific)抗体是单克隆或者多克隆抗体，它们与任意和所有的流感A病毒NS1蛋白结合，或者，与超过3种流感NS1蛋白结合，或者更优选的超过5种。优选，泛反应性或者泛特异性抗体识别至少下列3种流感A株：H5N1，H3N2和H1N1。泛反应性抗体可用于鉴定流感A病毒的存在但不能鉴定它是何种亚型。因此，泛反应性单克隆抗体可以特异识别NS1蛋白的保守区，或者可以识别两种或更多种NS1蛋白或者特异NS1PL类的PL区。优选的NS1蛋白的保守区例如可以在RNA结合结构域中发现，在国家生物技术信息中心(the National Center for Biotechnology Information)的网址上显示为NCBI IVNS1ABP。然而，已经显示的PL区在病毒亚型之间是不同的，有可能鉴定出结合NS1区超过一种PL的单克隆抗体。
但是，泛反应性抗体的其他实施方式包括多克隆抗体和/或单克隆抗体的混合物，其作为一个整体来看能够鉴定全部或者很多流感A病毒。这些抗体能够识别NS1蛋白的保守或者非保守区。如果抗体识别NS1 PL区，抗体混合物优选识别还包含PL区的NS1：ESEV(SEQ IDNO：2)，ESEI(SFQ ID NO：3)，ESKV(SEQ ID NO：4)，TSEV(SEQ IDNO：5)，GSEV(SEQ ID NO：6)，RSEV(SEQ ID NO：7)，RSKV(SEQ IDNO：8)，GSEI(SEQ ID NO：9)，GSKV(SEQ ID NO：10)，NICI(SEQ IDNO：11)，TICI(SEQ ID NO：12)，RICI(SEQ ID NO：13)，DMAL(SEQ IDNO：14)，DMTL(SEQ ID NO：15)，DIAL(SEQ ID NO：16)，DLDY(SEQID NO：17)，SICL(SEQ ID NO：18)，SEV，SEI，SKV和SKI。如果使用超过一种抗体和/或PDZ蛋白，PDZ蛋白优选是至少一种选自表1或者2的蛋白，并且抗体优选模拟至少一种PDZ蛋白。
B.PDZ蛋白的单克隆抗体替代品(surrogates)
如上面和实施例中所示，存在多种识别并结合NS1蛋白上PL模体的PDZ蛋白。识别相同模体的抗体也可以用作这些PDZ蛋白的替代品。优选，PDZ蛋白是下列的一种：外膜蛋白，PSD95(PDZ #2)；PSD95(PDZ #1，2，3)；DLG1(PDZ #1)；DLG1(PDZ #1，2)；DLG1(PDZ #2)；DLG2(PDZ #1)；DLG2(PDZ #2)；Magi3(PDZ #1)；PTN3(PDZ #1)；MAST2(PDZ #1)；NeDLG(PDZ #1，2)；Shank1 d1；Shank2 d1；Shank3 d1；Syntrophinl α；Syntrophin γ1；Magi1(PDZ#1)；Magi1(PDZ#4)；Tip1；PTPL1(PDZ#1)；Mint3(PDZ#1)；Lym Mystique(PDZ#1)；DLG2(PDZ#3)；MUPP1(PDZ #8)；NeDLG(PDZ #1)；DLG5(PDZ #1)；PSD95(PDZ#1)；NumBP(PDZ #3)；LIMK1(PDZ #1)；KIAA0313；DLG1(PDZ #2)；Syntenin(PDZ #2)；Pick1或者类似物或者片段。更优选，抗体模拟特异识别PL ESEV(SEQ ID NO：2)的任意PDZ蛋白。识别特异NS1 PL模体的抗体替代品可命名为NS1 PL类别-特异的。
C.抗体和其他结合剂的混合物
抗体和PDZ蛋白(和/或适配体)的混合物可用于任何分析。PDZ蛋白和抗体可以用于NS1不同亚型的鉴定，流感A病毒的鉴定，鉴别出与较低致病形式比较的致病形式。在一些分析中，混合抗体和PDZ蛋白，共同施用于一个样本。在其他分析中，抗体和PDZ蛋白是分离的，以便结合不同的样本以鉴定两个不同的亚型或者对亚型的鉴定进行确认。
VIII.适配体
适配体是在体外从大量随机序列种群选择的RNA或者DNA分子，通过形成结合袋(binding pockets)识别特异的配体。变构核糖酶是RNA酶，其活性通过效应子分子与适配体结构域的结合而调节，所述适配体结构域位于活性位点外。这些RNA作为精确的分子开关，受特异效应子存在或者缺失的控制。适配体能够结合核酸，蛋白，甚至完整的生物体。适配体不同于抗体，然而它们模拟抗体在各种诊断形式中的性质。因此，适配体可以用于替代抗体和/或PDZ蛋白，或者与抗体和/或PDZ蛋白联用，鉴定一般和特异NS1 PL区的存在。
IX.NS2序列和致病性的相关性
流感A的非结构蛋白NS1和NS2都是由相同基因利用不同的剪接产生的。发生的剪接类型导致NS1和NS2蛋白羧基末端的差异。就NS1来说，这导致羧基末端特殊的PL，而NS2在C端没有PL。因为NS1中PL区的特异序列能与致病性有关，对NS2蛋白的变化分析任意类型的相关性。分析致病株中由剪接产生的NS2序列，与那些不具有致病性比较进行分析。表12和13在蛋白水平和核苷酸水平对序列进行了分析。这些表显示70位的甘氨酸到丝氨酸的取代与病毒的致病性和/或毒性高度相关，特别是关于1918年大流行的H1N1株。利用H5N1株描述了示范性的NS2序列，如国家生物技术信息中心(www.ncbi.gov)所述，例如AF 144307，并且当序列最大限度地比对时，并且对相应的其他NS2蛋白进行氨基酸和编码氨基酸密码子的编号。因为这种相关性，鉴定出一种方法，该方法利用NS2在Ser70处的多态性作为单独的试验来分析一种给定的流感A株是否是致病性的。该方法还可用于鉴定特异流感株。或者，NS2多态性可以和此处公开的NS1试验联用，鉴定致病性或者确认以不同方法鉴定的致病性。
筛选NS2蛋白中Ser70序列变化的方法包括鉴定蛋白水平或者核苷酸水平变化的方法。
1.基于蛋白的诊断试验
本发明提供基于蛋白的诊断试验，以鉴定包括Ser70的NS2蛋白的存在，用于鉴定流感A病毒、流感A病毒株和致病性的流感A病毒株。利用NS2中Ser70多态性序列的诊断试验可以使用与NS1分析中相同的形式(参见章节VIII和其他相关的章节)。该试验鉴定位置70处丝氨酸的存在，如果丝氨酸存在，鉴定流感株为致病性的。如果丝氨酸不存在，则鉴定流感株为非致病性的。
识别NS2蛋白中丝氨酸70变化的单克隆或者多克隆抗体可用于鉴定一种流感株为流感A，能够鉴定特异流感A株，并且能够鉴定一种病毒是否是致病性的。可以产生NS2抗体以识别丝氨酸70的存在，并可用于鉴定致病性的株。例如，能够利用表12或者13中提供的肽产生抗体，所述抗体针对70位具有丝氨酸的NS2区。然后筛选丝氨酸70抗体以确定它们是否与70位具有甘氨酸或者其他氨基酸的肽发生交叉反应。或者，可以产生针对各病毒株识别包括丝氨酸70的特异序列的抗体，产生株-特异抗体(还可参见为NS1抗体提供的章节VIII)。在一些试验中，抗体用于鉴定一种病毒株为致病性的。在一些试验中，NS2抗体可代替NS1抗体。在一些试验中，NS2抗体与NS1抗体在任何使用NS1蛋白的试验中联用。NS2抗体可用于鉴定特异性流感A病毒，鉴定一种病毒为流感A病毒，或者鉴定一种病毒是致病性的。
或者，其他结合剂可用于替代抗体，例如通过噬菌体展示文库技术选择的肽。
2.核酸诊断试验
本发明还提供基于核酸的诊断试验，以鉴定编码包括Ser70的蛋白的NS2核酸的存在。这些试验可以用于鉴定流感A病毒，流感A病毒株，和致病性的流感A病毒株。该诊断试验使用一种序列，该序列包括在各种形式的NS2中编码Ser70的密码子。例如，该诊断试验可以使用与编码Ser70序列互补的探针或者引物。优选，使用编码表12中鉴定的肽的序列。如果丝氨酸70被鉴定为存在，则鉴定流感病毒为致病性的。
检测NS2中多态性的方法。能够通过几种方法确定样本中碱基的同一性，所述碱基占据NS2核酸的包括表12所示Ser-70的序列，所述方法依次进行描述。
A.单碱基延伸方法
例如，US 5,846,710，US 6,004,744，US 5,888,819和US 5,856,092描述了单碱基延伸方法。简单来说，该方法通过与靶序列互补的引物杂交起作用，使得引物的3′端立即紧邻但不跨越靶序列的潜在变异位点。也就是说，该引物包括靶多核苷酸互补序列的子序列，所述子序列终止在紧邻多态性位点5′端的碱基。杂交在一种或者多种标记核苷酸存在的条件下进行，所述标记核苷酸与可能占据潜在变异位点的碱基互补。例如，对于编码NS2Ser70多态性的序列，可以使用一种或者多种标记的核苷酸引物。针对各多态性的引物能够包括不同的标记以区分多态性。优选，引物重叠或者部分编码剪接位点。这表示剪接位点或者多态性区域的一些部分包含在引物中，优选Ser70位点。在一些方法中，尤其是使用多重差异标记的核苷酸的方法中，核苷酸是双脱氧核苷酸。如果存在与占据靶序列中变异位点的碱基互补的核苷酸，则在允许引物延伸的条件下进行杂交。延伸合并标记的核苷酸，从而产生标记的延伸引物。如果使用多重差异标记的核苷酸并且目标是杂合体，则可以获得多重差异标记的延伸引物。检测延伸的引物，提供指示哪些碱基占据目标多核苷酸中的变异位点。
B.等位基因-特异性探针
例如Saiki等人(Nature 324，163-166(1986)；Dattagupta，EP235,726，Saiki，WO 89/11548描述了用于分析多态性的探针的设计和使用。利用该公开的内容，可以将探针设计为识别包括Ser70多态性的特定序列，所述特定序列与一种类型病毒或者病毒株的靶DNA片段杂交，而不与其他类型病毒或者病毒株的相应片段杂交，这是由于两种病毒中各自片段中存在的不同多态性形式造成的。杂交条件应该足够严谨，使Ser70区的等位基因之间的杂交强度存在显著差异，优选基本二元的反应(binary response)，其中探针只与一种等位基因杂交。一些探针设计为与靶DNA的片段杂交，使得Ser70的多态性位点对准探针的中心位置(例如，15mer中的第7位；16mer中的第8或者9位)。这种探针设计实现了来自不同病毒和/或株的编码NS2蛋白的不同核酸之间杂交的良好区分。
这些探针经常成对使用，对子中的一个成员表现出与靶序列的一种参照形式完全匹配，而另一成员表现出与变异体形式或者不同的参照形式完全匹配。然后可以将几对探针固定在相同的支持物上，用于相同靶序列内多重多态性的同时分析。还可以通过与核酸阵列杂交鉴别多态性，WO95/11995描述了其中的一些实例(在此完整引入作为参考用于所有目的)。
C.等位基因特异的扩增方法
等位基因-特异性引物与靶DNA中重叠多态性的位点杂交，并且引物只扩增与引物表现出完全互补的等位基因形成。参见Gibbs，Nucleic Acid Res.17，2427-2448(1989)。这种引物与在远端位点杂交的第二引物联用。扩增起始于两个引物，产生可检测的产物，提示存在特异的等位基因形式。通常用第二对引物作为对照，其中一个在多态性位点显示单个碱基错配，另一个显示与远端位点的完全互补。单碱基错配阻止扩增，没有形成可检测的产物。在一些方法中，错配包括在与多态性相关的寡核苷酸的3′-端位置，因为这个位置对于从引物延长是最不稳定的。参见，例如，WO 93/22456。在这种情况下，可以将等位基因特异引物设计为与NS2的剪接位点重叠，包括Ser70位置。
D.直接测序
本发明NS2多态性序列的直接分析可以利用双脱氧链终止法或者Maxam-Gilbert方法实现(参见Sambrook等人，Molecular Cloning，ALaboratory Manual(第二版，CSHP，New York 1989)；Zyskind等人，Recombinant DNA Laboratory Manual，(Acad.Press，1988))。)
E.变性梯度凝胶电泳
利用聚合酶链式反应产生的扩增产物可以利用变性梯度凝胶电泳进行分析。根据DNA在溶液中序列依赖性的不同熔解性质和电泳迁移，可以鉴定NS2Ser70多态性的不同等位基因。Erlich编著，PCRTechnology，Principles and Applications for DNA Amplification，(W.H.Freeman and Co，New York，1992)，Chapter 7。
F.单链构象多态性分析
靶序列的等位基因可以利用单链构象多态性分析进行区分，所述单链构象多态性分析通过单链PCR产物电泳迁移的变化鉴定碱基差异，如Orita等人描述，Proc.Nat.Acad.Sci.86，2766-2770(1989)。如上所述能够产生扩增的PCR产物，加热或者变性，形成单链扩增产物。单链核酸可以重新折叠或形成部分取决于碱基序列的二级结构。单链扩增产物不同的电泳迁移率可能与靶序列等位基因之间的碱基序列差异相关。
3.NS2治疗剂-此处公开的筛针对NS1和PDZ蛋白的抗病毒治疗剂和筛选抗病毒治疗剂的方法同样可以用于鉴定NS2的结合伴侣，鉴定阻断NS2和结合伴侣之间相互作用的治疗剂，和治疗毒性流感A感染的患者。(参见章节XI药物组合物)。鉴定针对NS2的治疗剂的靶标包括，在包含Ser70的重叠区阻断结合伴侣和NS2相互作用的试剂，阻断NS2PL(内部位点)和PDZ结合伴侣之间相互作用的试剂，和磷酸化Ser70的丝氨酸激酶，导致抑制相互作用。
X.诊断试验
本发明的实施方式提供诊断捕获剂和检测剂，它们可用于在各种不同类型的生物样本中鉴定流感A病毒和其产物的检测法。可用于检测流感病毒的代表性试验形式包括酶联固相吸附试验，放射性标记结合试验，PDZ-和PL-结合试验，时间分辨PDZ和PL荧光试验，以及，夹心和酶-级联试验形式。示例性的方法，可以从免疫测定领域用于该试验的方法修改，包括均相和多相试验形式；竞争性和非竞争性试验形式；酶连接固相试验形式，荧光试验形式，时间分辨荧光试验形式，生物发光试验形式，级联酶试验等等。
在本发明的某些实施方式中，一种或者多种PDZ蛋白被用作捕获剂从生物样本分离一种或者多种PL分析物。在其它可选的实施方式中，一种或者多种PDZ蛋白与一种或者多种信号发生化合物结合，用作鉴定生物样本中一种或者多种PL分析物的存在或者量的检测剂。在其他实施方式中，PL蛋白和PL肽与信号发生化合物(PL-SGC)结合，用于竞争性配体抑制试验，即，其中病毒PL的存在与一种或者多种PL-SGC竞争与PDZ的结合。优选，PDZ蛋白是下列至少一种：外膜蛋白，PSD95(PDZ # 2)；PSD95(PDZ #1，2，3)；DLG1(PDZ #1)；DLG1(PDZ #1，2)；DLG1(PDZ #2)；DLG2(PDZ #1)；DLG2(PDZ #2)；Magi3(PDZ #1)；PTN3(PDZ #1)；MAST2(PDZ #1)；NeDLG(PDZ #1，2)；Shank1 d1；Shank2 d1；Shank3 d1；Syntrophinl α；Syntrophin γ1；Magi1(PDZ #1)；Magi1(PDZ #4)；Tip1；PTPL1(PDZ #1)；Mint3(PDZ #1)；LymMystique(PDZ #1)；DLG2(PDZ#3)；MUPP1(PDZ #8)；NeDLG(PDZ#1)；DLG5(PDZ #1)；PSD95(PDZ #1)；NumBP(PDZ #3)；LIMK1(PDZ#1)；KIAA0313；DLG1(PDZ #2)；Syntenin(PDZ #2)；Pick1或者类似物或者片段。对那些常规鉴定流感A的试验，可以使用PDZ蛋白和抗体的混合物。对于这些试验，PDZ蛋白可能包括将上述一种蛋白与识别其他病原体特异的或者流感A特异的PL模体的其他蛋白混合。
本发明提供检测样本中病原体PL蛋白的方法，并发现其在诊断对象病毒感染中的用途。在许多实施方式中，从受试者处获得生物样本，检测样本中病原体PL蛋白的存在。样本中可检测量的病原体PL蛋白的存在表明个体感染了特定病毒。在其他实施方式中，检测生物样本中病原体PL蛋白的水平，与样本中的对照量进行比较。样本中病原体PL蛋白的相对量指示病原体感染的严重性。
该方法通常包括对流感A PL蛋白特异的两种结合伴侣，其中一个是如上所述的PDZ结构域多肽。通常，该方法包括a)利用结合伴侣之一从样本分离病原体PL，和b)用另一种结合伴侣检测病原体PL蛋白。
对亚型特异性试验或者NS1 PL类别特异性试验，待鉴定的PL优选是下面一种：ESEV(SEQ ID NO：2)，ESEI(SEQ ID NO：3)，ESKV(SEQID NO：4)，TSEV(SEQ ID NO：5)，GSEV(SEQ ID NO：6)，RSEV(SEQ IDNO：7)，RSKV(SEQ ID NO：8)，GSEI(SEQ ID NO：9)，GSKV(SEQ IDNO：10)，NICI(SEQ ID NO：11)，TICI(SEQ ID NO：12)，RICI(SEQ IDNO：13)，DMAL(SEQ ID NO：14)，DMTL(SEQ ID NO：15)，DIAL(SEQID NO：16)，DLDY(SEQ ID NO：17)，SICL(SEQ ID NO：18)，SEV，SEI，SKV和SKI。对亚型特异性试验，使用的PDZ蛋白优选是下面的至少一种：PSD95(PDZ # 2)；PSD95(PDZ #1，2，3)；DLG1(PDZ#1)；DLG1(PDZ #1，2)；DLG1(PDZ #2)；DLG2(PDZ #1)；DLG2(PDZ #2)；Magi3(PDZ #1)；PTN3(PDZ #1)；MAST2(PDZ #1)；NeDLG(PDZ #1，2)；Shank1 d1；Shank2 d1；Shank3 d1；Syntrophinl α；Syntrophin γ1；Magi1(PDZ #1)；Magi1(PDZ #4)；Tip1；PTPL1(PDZ #1)；Mint3(PDZ #1)；LymMystique(PDZ #1)；DLG2(PDZ #3)；MUPP1(PDZ #8)；NeDLG(PDZ#1)；DLG5(PDZ #1)；PSD95(PDZ #1)；NumBP(PDZ#3)；LIMK1(PDZ#1)；KIAA0313；DLG1(PDZ #2)；Syntenin(PDZ #2)；Pick1或者类似物或者片段。NS1 PL可以高度预测病毒的H和A抗原和亚型。
对病原体特异性试验，待鉴定的NS1 PL优选是下面的至少一种：ESEV(SEQ ID NO：2)，ESEI(SEQ ID NO：3)，ESKV(SEQ ID NO：4)，TSEV(SEQ ID NO：5)，GSEV(SEQ ID NO：6)，RSEV(SEQ ID NO：7)，RSKV(SEQ ID NO：8)，GSEI(SEQ ID NO：9)，GSKV(SEQ ID NO：10)，NICI(SEQ ID NO：11)，TICI(SEQ ID NO：12)，RICI(SEQ ID NO：13)，DMAL(SEQ ID NO：14)，DMTL(SEQ ID NO：15)，DIAL(SEQ IDNO：16)，DLDY(SEQ ID NO：17)，SICL(SEQ ID NO：18)，SEV，SEI，SKV和SKI。对病原体特异性试验，使用的PDZ蛋白优选是选自表1或者2中的至少一种或者类似物或者片段。
对流感A特异性试验，待鉴定的NS1PL优选是下面的至少一种：ESEV(SEQ ID NO：2)，ESEI(SEQ ID NO：3)，ESKV(SEQ ID NO：4)，TSEV(SEQ ID NO：5)，GSEV(SEQ ID NO：6)，RSEV(SEQ ID NO：7)，RSKV(SEQ ID NO：8)，GSEI(SEQ ID NO：9)，GSKV(SEQ ID NO：10)，NICI(SEQ ID NO：11)，TICI(SEQ ID NO：12)，RICI(SEQ ID NO：13)，DMAL(SEQ ID NO：14)，DMTL(SEQ ID NO：15)，DIAL(SEQ ID NO：16)，DLDY(SEQ ID NO：17)，SICL(SEQ ID NO：18)，SEV，SEI，SKV和SKI。对病原体特异性试验，使用的PDZ蛋白优选是选自表1或者2中的至少一种或者类似物或者片段。
A.ELISA夹心多相分析形式
如下面实施例部分所述，利用该PDZ捕获和单克隆抗NS1，构建检测生物样本中高危流感A株的夹心分析形式。当前分析的灵敏度范围在1-1,000ng/ml之间：即，对商业用于检测生物样本中流感A病毒类型或者量具有足够的灵敏度，注意下列告诫：即，
a)免疫测定法能够区别流感A H5N1，H1N1和H3N2株的NS1蛋白；
b)不同分析形式的交叉反应模式不同，并还取决于待检测的特定流感A株，以及，包含细胞裂解产物的生物样本中的绝对灵敏度；和，
c)在诊断设备领域中确定不同分析形式的检测限现在是相对常规的。
尽管可以确定可能用于本方法的各种竞争性和非竞争性分析形式，但现在优选是夹心分析形式，因为已经证明这些分析具有性能特征和各种良好建立的(well established)信号放大策略。在当前优选的夹心免疫测定实施方式中，使用特异的高亲合力非天然PDZ蛋白捕获生物样本中的天然病毒NS1抗原；用抗NS1小鼠单克隆抗体检测结合的NS1抗原；和，利用信号发生化合物检测结合的抗NS1抗体的存在，例如用偶联酶的第二抗体(例如，偶联辣根过氧化物酶的抗体；HRP)或者生物素化的第二抗体和链霉亲和素-酶偶联物(例如，HRP)。
通常，本发明的方法包括以下步骤：(i)利用第一结合剂即捕获剂，从复杂生物样本中分离(separating)(即，分离(isolating))天然病毒PL蛋白分析物；和，(ii)利用第二结合剂即检测剂，检测分离的PL分析物。分离和检测步骤可以利用结合伴侣实现，所述结合伴侣对PL分析物具有不同水平的特异性，例如，如果捕获剂是高特异性的，则可以要求检测剂是较低特异性的，反之亦然。在某些实施方式中，捕获剂优选是PDZ结构域多肽。更优选，捕获剂是表1和/或表2所列的一种。在其他实施方式中，第一结合伴侣是抗病原体PL蛋白抗体或者抗体的混合物，条件是在这些实施方式中检测剂的至少一种组分是PDZ多肽，例如，与捕获/分离的PL分析物结合并且然后利用偶联信号发生化合物的抗PDZ抗体检测复合物中PL分析物的存在的PDZ蛋白检测剂。在某些当前优选的实施方式中，直接的或者通过连接子，将PDZ捕获剂结合在固相上。例如，在一个非限制性实施例中，PDZ结构域多肽结合磁珠。在后面的实施例中，当接触生物样本时，固定在磁珠上的PDZ捕获剂能够与样本中的流感病毒PL蛋白有效形成PDZ-PL相互作用复合物。然后，施加磁场，从样本分离包含结合的流感病毒PL的相互作用复合物。在另一个非限制性实施例中，将PDZ结构域多肽捕获剂固定在微量滴定板的表面上；将包含流感PL的生物样本与固定的捕获剂接触，导致PL与板表面的结合；用缓冲液洗板，从板上去除非PL病毒分析物；和，因此，固定的PL分析物从生物样本分离。各种分离(separation)/分离(isolation)方法都是已知的，例如，利用磁场、洗涤等等。采用的特定方法取决于特定的分析形式。例如，可以通过许多不同的方法进行分离，包括但不限于洗涤；磁性方法；离心；过滤；层析法，包括分子筛、离子交换和亲合层析；在电场中分离；毛细管作用例如在侧向流测试条中；免测沉淀法；和，下面公开的类似方法。
在某些实施方式中，通过将等份的生物样本接触测试条的一端，然后让蛋白在测试条上迁移，例如通过毛细管作用例如侧向流，从生物样本中的其他病毒和细胞蛋白分离流感PL蛋白。该方法不同于先前的免疫测定法，因为在存在一种或者多种PDZ多肽试剂，抗体，和/或适配体的测定法中，例如，作为捕获和/或检测剂，这给予该测定法特异鉴定高危流感A病毒株的存在或者量的能力。该方法不同于先前的免疫测定法，在于以下事实：它们鉴定存在于患者样本中的病毒蛋白，而不是抗体。用于侧向流分离、检测和定量的方法和装置是本领域已知的，例如，美国专利号6,942,981，5,569,608；6,297,020；和6,403,383，在此完整引入作为参考。在一个非限制性实施例中，测试条包括用于上样的近端区域(上样区)和包含PDZ多肽捕获剂和缓冲试剂和添加剂的远端试验区，所述缓冲试剂和添加剂适于迁移生物样本中PDZ多肽和任意流感PL蛋白之间的结合相互作用。在其他实施方式中，测试条包括两个试验区域，该区域包含不同的PDZ结构域多肽，即，每个能够特异地与不同的流感PL蛋白分析物相互作用。
根据上面公开的方法，从生物样本中的其他蛋白分离流感PL蛋白分析物，即，采用这种方法使样本中的分析物适合于检测和/或定量。，利用PDZ多肽、偶联信号发生化合物的PDZ多肽、抗体、适配体等等，本发明的实施方式提供检测分离的流感PL蛋白的新方法。根据其他实施方式，利用对病原体PL蛋白特异的抗体，例如偶联信号发生化合物的抗体，检测与PDZ捕获剂、抗体和/或适配体结合的流感PL分析物。当然，各种检测方法是诊断领域已知的，并且本(非限制性)公开的目的不是为了阐明所有可选的公知方法。而是，本公开是为了满足阐明实施本发明最佳方式的要求，并作为可选方法的综合参考指导。
在某些实施方式中，在均相分析形式中，即，无需分离步骤，用偶联了SGC(信号发生化合物)的PDZ结构域检测样本中病原体PL蛋白分析物的存在。在该分析中，PL与PDZ结构域的结合诱导SGC产生信号的变化，例如，荧光各向异性的变化。
在其他实施方式中，多相固相检测模型(上文公开)可用于检测生物样本中的流感PL分析物。如上文背景部分所述，PDZ蛋白与包含PL的细胞蛋白结合。同样地，在感染细胞中，包含PL的流感病毒蛋白与宿主细胞的PDZ蛋白结合。尽管通常预期这些相互作用将在诊断分析形式中竞争结合，但在此还提供以下指导，即出乎意料地，这些后来天然相互作用的亲合力和质量平衡是非常弱的，或者在去污剂提取的细胞裂解产物中是被充分破坏的，或在该诊断分析形式中流感PL分析物是可检测的。因此，在存在的去污剂例如Tween-20或者TritonX100小于约0.5％的条件下；优选，小于约0.2％；和，最优选，于大约0.1％的条件下，可以制备和测定裂解产物。
在某些实施方式中，样本中病毒PL蛋白的水平可以被定量和/或与对照进行比较。合适的阴性对照样本例如从已知是健康的个体获得，例如，已知没有流感病毒感染的个体。特异性对照可以从已知患有流感B感染的个体，或者感染较低毒性流感株，例如，H1N1、H3N2等等的个体收集。对照样品可以来自与待测对象有遗传关系的个体，但还可以来自遗传无关的个体。合适的阴性对照样本还可能是来自个体在感染早期的收集的样本，即，时间点比取得待测样本的时间点早。本发明的实施方式还包括非感染性阳性对照，即，具有高危流感A病毒PL的氨基酸序列的重组蛋白。
初始Western印迹，(参见下面的实施例部分)，显示生物样本中NS1水平足以允许在各种不同的可行免疫分析形式中检测这些抗原。但是，应证明特定生物样本中的NS1水平对于在特定免疫分析形式中检测是有限的，然后，作为另一种选择性的实施方式，通过体外感染细胞来扩增生物样本中的活病毒，即，病毒扩增样本中的NS1蛋白应该在大约6小时到大约12小时内可以检测到。在其它的选择性实施方式中，用于提高生物样本和病毒扩增样本中NS1抗原收率的方法包括利用蛋白酶抑制剂和蛋白酶体抑制剂，例如MG132。
B.试剂的制备
PL肽，PDZ结构域多肽，和适配体可以通过本领域已知的合成(即，利用设备)或者利用重组方法制备。例如，用于重组蛋白表达的方法和条件是本领域公知的，例如，参见Sambrook，上文，和Ausubel，上文。Winnacker“From Genes to Clones，VCH Publishers，N.Y.，N.Y.，1987”；和Ausubel，上文，综合讨论了利用哺乳动物组织细胞培养表达多肽的用途。
2003年7月29日提交的美国专利申请序列号10/630,590和公布为US20040018487和美国专利序列号6,942,981中也公开了结合分析的细节。
基于细胞的分析通常包括利用重组表达系统，共同产生(即，在相同细胞内产生，不管它们产生的时间)该PDZ结构域多肽和流感PL。用于在真核细胞中产生该多肽的合适细胞公开在下面的实施例部分。有可能适于表达该PDZ结构域多肽和流感PL的细胞类型包括下列：例如，猴肾细胞(COS细胞)，SV40转化的猴肾CVI细胞(COS-7，ATCCCRL 165 1)；人胚肾细胞(HEK-293，Graham等人，J.Gen Virol.36：59(1977))；HEK-293T细胞；幼仓鼠肾细胞(BHK，ATCC CCL 10)；中国仓鼠卵巢细胞(CHO，Urlaub和Chasin，Proc.Natl.Acad.Sci.(USA)77：4216，(1980)；小鼠塞尔托利细胞(TM4，Mather，Biol.Reprod.23：243-251(1980))；猴肾细胞(CVI ATCC CCL 70)；非洲绿猴肾细胞(VERO-76，ATCC CRL-1587)；人宫颈癌细胞(HELA，ATCC CCL 2)；犬肾细胞(MDCK，ATCC CCL 34)；布法罗大鼠肝细胞(BRL 3A，ATCCCRL 1442)；人肺细胞(W138，ATCC CCL 75)；人肝细胞(hep G2，HB8065)；小鼠乳腺瘤(MMT 060562，ATCC CCL 51)；TRI细胞(Mather等人，Annals N.Y.Acad.Sci 383：44-68(1982))；NIH/3T3细胞(ATCCCRL-1658)；和小鼠L细胞(ATCC CCL-I)。其他的细胞系将是显而易见的。各种各样的细胞可得自美国典型微生物菌种保藏中心(merieanType Culture Collection)，10801 University Boulevard，Manassas，Va.20110-2209。
C.样本制备
可以使用包含可检测浓度的流感蛋白并优选NS1的任意样本。可使用样本的实例是，例如，肺渗出液，细胞提取物(呼吸器官，鼻内上皮层)，血液，粘液，和鼻拭子。此处显示，在猪和人的鼻拭子中能够发现非常高浓度的NS1。这是令人惊奇的，因为NS1被认为是一种胞内蛋白。因此，优选的用于NS1鉴定的样本是鼻分泌物。
实施例中显示了PL蛋白与PDZ蛋白和/或抗体的结合，该结合在高达0.05％SDS的存在下发生，包括0.03％和0.01％。因此，当鼻或者其他身体分泌物不可能容易地用于侧向流形式时，它可以用SDS处理。优选，添加的SDS的量直到最终浓度为0.01％，更优选为0.03％，甚至更优选为0.05％。可以使用其他不干扰PDZ蛋白、抗体或者适体或者其他试剂与PL蛋白结合的去污剂和类似物。可以使用不干扰蛋白/蛋白相互作用的其他样品处理方法，包括用缓冲液或者水稀释。
D.单独或者联用常规流感A试验
该试验鉴定样本中流感A的存在。因此，该试验可以使用利用抗体或者适配体等鉴定NS1保守区域存在的方法。优选，单一单克隆抗体或者单一适配体鉴定全部NS1的变异体。当利用识别NS1蛋白保守区域的抗体时，这是非常可能的。或者，可以使用超过一种抗体和/或适配体和/或PDZ蛋白或者其他结合剂来鉴定全部流感A亚型。该方法还可以根据NS1蛋白的存在，使用抗体和PDZ蛋白的混合物来鉴定全部流感A。常规流感A试验可以与更特异的试验联用来分型病毒，这些试验可以顺序或者同时进行。如果在该试验中使用，还可以参见上面用于优选的PL区和PDZ蛋白的泛特异抗体的说明。
E.致病性流感A试验
该试验鉴定具有NS1蛋白PL模体的全部形式的病毒。此处确定了流感A的非致病株具有缺失禽类PL模体的NS1蛋白。因此，特异性鉴定致病性流感A病毒存在的方法可以鉴定包含禽类PL区的NS1的存在。一种或者多种PDZ蛋白和/或抗体可用于鉴定所有的各种PL区。例如，如果只使用PDZ蛋白，至少需要两种PDZ蛋白来鉴定所有的NS1 PL蛋白。或者，使用能够识别包含PL区的NS1蛋白的单个抗体。优选，待鉴定的NS1的PL区是下列至少一种：ESEV(SEQ ID NO：2)，ESEI(SEQ ID NO：3)，ESKV(SEQ ID NO：4)，TSEV(SEQ ID NO：5)，GSEV(SEQ ID NO：6)，RSEV(SEQ ID NO：7)，RSKV(SEQ ID NO：8)，GSEI(SEQ ID NO：9)，GSKV(SEQ ID NO：10)，NICI(SEQ ID NO：11)，TICI(SEQ ID NO：12)，RICI(SEQ ID NO：13)，DMAL(SEQ ID NO：14)，DMTL(SEQ ID NO：15)，DIAL(SEQ ID NO：16)，DLDY(SEQ ID NO：17)，SICL(SEQ ID NO：18)，SEV，SEI，SKV和SKI。优选，待鉴定的PL区是包含禽类PL区的。优选，一种或者多种PDZ蛋白选自表1或者2中的至少一种或者类似物或者活性片段。
F.致病性A型禽流感病毒试验
H5N1禽流感的NS1蛋白具有结合多样化PDZ结构域的C端序列，所述PDZ结构域不能结合典型人流感例如H3N2的NS1。77％的禽流感H5N1分离物的NS1蛋白末端是ESEV(SEQ ID NO：2)，此外，ESEV(SEQ ID NO：2)、ESKV(SEQ ID NO：4)和ESEI(SEQ ID NO：3)后两个最常见的C端NS1序列，占禽流感分离物的另外17％，也与PSD-95以高亲合力结合(即：分别为45nM和200nM)。H3N2 NS1的末端是RSKV(SEQ ID NO：8)，该序列与PSD-95结合的亲合力即使有的话也非常低。因此PSD-95可以用作禽流感的检测剂，并从其他株例如H3N2区别禽流感。
尽管可以使用PSD-95的任意部分，只要其具有PDZ结构域，但PSD-95结构域-1、-2和-3具有不同的结合特异性和亲合力。作为鉴定的一部分，其中PDZ蛋白与禽流感H5N1 PLs的亲合力最高(参见实施例2和表4a-e)，发现PSD-95结构域2PDZ结合的亲合力最高。因此，分析中使用的PSD-95PDZ蛋白只需要包括蛋白的一种PDZ结构域，和优选包括至少来自结构域2的PDZ或者足以进行特异结合的其片段。PSD-95PDZ蛋白与样本接触。如果该样本包含致病性流感病毒A，PSD-95PDZ与致病性流感病毒NS1蛋白的PL特异结合。
可以使用例如图8和11和实施例6所叙述的侧向流形式，利用PDZ捕获然后是单克隆抗体检测，检测禽类NS1 PL蛋白。或者，侧向流形式可以使用单克隆抗体捕获和PDZ检测。利用一种或者多种重组PDZ蛋白作为捕获剂，沿着膜在特定位置沉积在膜上，可以产生侧向流(参见实施例6)。侧向流结果的分析可以定性或者定量的。优选，使用来自鼻分泌物的患者样本。可以预先处理样本，使其更容易在侧向流形式使用的膜上流动。患者样本最初可以与偶联信号分子的泛反应性抗NS1单克隆抗体接触。用于检测的单克隆抗体优选不与所使用PDZ蛋白相同的抗原表位结合，而是，代之以结合全部NS1蛋白共有的分离抗原表位。如果样本中的NS1蛋白结合捕获剂(沉积在膜上的PDZ蛋白)，PDZ蛋白在膜上沉积的位点出现条带。利用这种侧向流形式可以检测对禽流感株特异的C端NS1模体。这些包括ESEV(SEQID NO：2)，ESEI(SEQ ID NO：3)和ESKV(SEQ ID NO：4)。在一些情况下，可以使用EPEV(SEQ ID NO：27)。或者可以使用其他捕获剂，包括只与NS1蛋白的一种PL模体特异结合的抗体。
为了定性或者定量分析和为了质量控制，可以包括下列对照的任意一种或者全部。对照带由山羊抗小鼠抗体(GAM)组成。鉴通过将结合全部形式NS1蛋白的抗体沉积在膜上，来定是否存在任何流感A的泳道。可包括阴性对照，其包括具有除了PDZ结构域以外全部结构域的PSD-95蛋白。其他对照可以包括用于定量信号的对照，例如已知与膜上捕获剂结合较弱、中等、较强或者根本不结合的纯化形式的PL蛋白，优选的捕获剂是PDZ蛋白或者对一种或者多种PL特异的抗体。
可以包括用于定量信号的对照，以便分析结合强度来区别与PSD-95结合较弱或者中等的PL。例如，实施例6指出利用下列符号定量结合强度：(-)是指没有结合，(+)是指较弱的结合，(++)是指中等的结合和(+++)是指较强的结合。与特定PDZ蛋白结合的强度可用于区别具有NS1的H1N1，所述NS1末端是与PSD-95以中等亲合力结合的RSEV。用于强结合的阳性对照可以是来自H5N1的纯化NS1，用于较弱结合的对照可以是来自H3N2的纯化NS1，用于中等结合的对照可以是来自H1N1的纯化NS1。
或者，可以使用其他PDZ蛋白进一步区分结合PSD-95的株。例如，如实施例6所示，H5N1和H1N1都结合PSD-95。所以，使用INADLD8鉴定病毒株是否是H1N1或者H5N1，因为只有H1N1结合。与INADLD8的结合可以使得不容置疑地鉴定PL作为H5N1与PSD-95结合。在表4a-e和实施例2中可以发现结合H1N1但不结合H5N1的其他PDZ蛋白。
G.特定NS1 PL试验
该试验通过特定NS1 PL鉴定NS1 PL类的特定类型。它还可以通过特定NS 1PL类来鉴定亚型。虽然通常HA和NP抗原的类型与NS1 PL区相关，但情况不总是这样。有可能，例如，由于重配或者病毒能经受的其他遗传过程，来自例如H1N1病毒的NS1 PL区可能转移到H2N1病毒中。但是，不受特定理论限制，NS1 PL区的存在可能对患者样本中病毒的致病性更具有提示作用。这可能是因为NS1在感染中所起的生物学作用。优选的试验鉴定人的PL ESEV(SEQ ID NO：2)。优选的试验鉴定禽流感A NS1 PL，该PLs具有模体ESEV(SEQ ID NO：2)，ESEI(SEQ ID NO：3)，和ESKV(SEQ ID NO：4)。这鉴定病毒的高致病性株，并可以采取合适测定来治疗和隔离疾病。其他优选的试验包括，例如，能够使人特异鉴定NS1PL亚型的阵列。这类阵列还可以包括流感A的常规试验。这类试验还可以包括确定HA和NP蛋白类型的试验。优选，待鉴定的PL是下列的一种：ESEV(SEQ ID NO：2)，ESEI(SEQ ID NO：3)，ESKV(SEQ ID NO：4)，TSEV(SEQ ID NO：5)，GSEV(SEQ ID NO：6)，RSEV(SEQ ID NO：7)，RSKV(SEQ ID NO：8)，GSEI(SEQ ID NO：9)，GSKV(SEQ ID NO：10)，NICI(SEQ ID NO：11)，TICI(SEQ ID NO：12)，RICI(SEQ ID NO：13)，DMAL(SEQ ID NO：14)，DMTL(SEQ ID NO：15)，DIAL(SEQ ID NO：16)，DLDY(SEQ ID NO：17)，SICL(SEQ ID NO：18)，SEV，SEI，SKV和SKI.更优选，待鉴定的NS1PL是ESEV(SEQ IDNO：2)。优选，所使用的至少一种PDZ蛋白选自表1或者2中的至少一种、片段或者类似物。更优选，至少一种PDZ蛋白是下列的至少一种：外膜蛋白，PSD95(PDZ # 2)；PSD95(PDZ #1，2，3)；DLG1(PDZ #1)；DLG1(PDZ #1，2)；DLG1(PDZ #2)；DLG2(PDZ #1)；DLG2(PDZ #2)；Magi3(PDZ #1)；PTN3(PDZ #1)；MAST2(PDZ #1)；NeDLG(PDZ #1，2)；Shank1 d1；Shank2 d1；Shank3 d1；Syntrophinl α；Syntrophin γ1；Magi1(PDZ #1)；Magi1(PDZ #4)；Tip1；PTPL1(PDZ#1)；Mint3(PDZ #1)；LymMystique(PDZ#1)；DLG2(PDZ#3)；MUPP1(PDZ#8)；NeDLG(PDZ#1)；DLG5(PDZ#1)；PSD95(PDZ#1)；NumBP(PDZ#3)；LIMK1(PDZ#1)；KIAA0313；DLG1(PDZ#2)；Syntenin(PDZ#2)；Pick1或者类似物或者片段和/或模拟任何PDZ蛋白的抗体(或者适配体)。
H.血清抗体的试验
可以在任何形式的诊断方法中使用鉴定血清抗体存在的试验，所述抗体结合特定的NS1 PL模体和/或在70位具有丝氨酸的NS2蛋白。可以在侧向流或者其他形式中使用特定的包括重叠区的NS1PL肽作为捕获剂，所述重叠区包含Ser70。
I.流行环境中分析的用途
分析灵敏度和特异性可以该变，以实现生物样本中流感A NS1检测的不同绝对水平，例如，通过在竞争性分析形式中降低竞争性配体的水平，改变夹心分析中捕获和检测剂的量等等。因此，本试验方法包括各种具有不同性能属性的分析，以满足不同用途中的不同要求，如下面实施例部分所述。例如，在禽类流行环境中，通常记录到最高的PPV和阳性试验结果更可能是真实的，即，最低的NPV和假阴性结果倾向于更可能。此外在监控禽类对象中流感A的流行性时，将全部样本提供给参考实验室用于检验是目前的惯例。通过在本筛选分析中鉴定真正阳性的样本，例如，在野外或者护理点，本试验分析发现了减少最终必须提交给参考实验室用于检验的样本数目的用途，即，在流行期间当试验负担高时具有特别的价值。因为目前都是实行宰杀所有动物，而不管它们是否被感染，相对高的假阳性率是可以接受的，但是它还必须还具有相对低的假阴性率。在某些实施方式中，本发明提供具有不同特异性、灵敏度、PPV和NPV的试验试剂盒，在流行期间使用，此处称为“流行性试验方法”。优选适合当前需要，本流行性试验方法具有以下分析性能：即，特异性大于约65％；灵敏度大于约90％；PPV大于约85％；NPV大于约65％；假阳性值小于大约25％和假阴性率小于约5％。
相反，在禽类对象流感A发病率低的时候，通常记录到最低的PPV，假阳性试验结果更有可能，和最高的NPV，阴性试验结果倾向于更有可能和真实。在这些低发病率的时候，筛查目标可以是快速鉴定可能被感染的动物并隔离它们，直到例如在参考实验室中完成验证试验。因此，在某些实施方式中，本发明提供具有增强的灵敏度和NPV的试验方法，在低流感A发病率的时候使用，这时监控是根本的，即，此处称为“监控试验方法”。优选，该监控试验方法具有以下分析性能：即，特异性大于约65％；灵敏度大于约90％；PPV大于约85％；NPV大于约65％；假阳性率小于约20％和假阴性率小于约5％。当该监控试验方法用于筛查超过100个成员的禽群时，作为一个整体的禽群的PPV显著高于任何特定分析中得到的预测值。因此，当在监控试验方法中得到阳性试验结果时，利用上文的流行性试验分析法重复检测禽群成员可能证明是有益的。
在人类而不是禽类中，试验目的当然是不同的。流感A感染的及时证据可能具有重要的病例管理意义，例如，尽早提示在儿童或者老年对象中施用抗病毒剂。通常对人的诊断产物要求高度的特异性和灵敏度，例如，大于90％的特异性和，和大于90％PPV的灵敏度。但是，在所定义的流行环境中，例如，游船感染，那里PPV高；假阳性的可能性低，假阴性的可能性高；和，当提交样本进行验证试验时，可能需要较低的特异性例如65％，以便进一步降低假阴性试验结果的数目例如该值小于大约5％。
J.诊断和治疗试剂盒
提供实施本方法的试剂盒。该试剂盒不同于免疫分析试剂盒，至少存在下列一种或者多种成分：(i)PDZ结构域多肽和(ii)打印的说明书，用于指导利用PDZ结构域多肽来鉴定生物样本中高危流感A禽类病毒株的分析。该试剂盒允许鉴定患者样本中的病毒蛋白而不是抗体，使其对被感染的个体更特异。该试剂盒任选包含一种或者多种试剂、缓冲液或者添加剂组合物或者上文公开的试剂；和，在某些实施方式中，该试剂盒还可以包含对流感A病毒PL，优选NS1特异的抗体。在其他实施方式中，该试剂盒还可以包括一种装置，例如设备或者系统，用于从生物样本的其他潜在干扰物质中去除流感病毒PL。如果需要，该试剂盒还可以包括，一种或者多种对进行分析有用的不同组分：例如，一种或者多种分析容器；一种或者多种对照或者校准试剂；一种或者多种在其上进行分析的固相表面；或者，一种或者多种缓冲液、添加剂或者检测剂或者抗体；一种或者多种打印说明书，例如包装插入物和/或容器标签，标明用于进行分析的各组分的量，以及，用于评价分析结果的指导。该试剂盒能包含用于进行各种不同类型分析形式的组分，包括例如测试条，夹心ELISA，Western印迹分析，胶乳凝集等等。该试剂盒内的参照、对照和校准物可以包含，例如，一种或者多种天然和非天然的流感PL蛋白，重组PL多肽，合成PL肽，PDZ结构域多肽，PDZ结构域肽和/或用于评价本方法的性能和准确度的合适比色和酶标准品。
用于实施本方法的说明书通常记录在合适的记录介质上，并包括在试剂盒中，例如，作为包装插入物。例如，说明书可以打印在基质例如纸或者塑料上。在其他实施方式中，说明书可以数字记录在电子计算机可读的存储介质上，例如CD-ROM，磁盘等等。在其他实施方式中，用户能够从远程数字源，例如在因特网网点，以可下载的文档文件形式获得用于进行本方法的说明书。
任选，该试剂盒可以包括用于进行流感A常规试验以及特异试验的试剂。例如侧向流试验可以包括鉴定普通流感A病毒存在的道和鉴定病毒是否是禽流感A的道。常规试验可以是鉴定流感A病毒存在的任何试验，包括针对NS1存在的试验。可以包括的其他类型的普通流感A可以鉴定任何流感A蛋白。或者根据患者血液中抗体的存在可以鉴定流感A的存在。最后，通常可以使用PCR试验鉴定流感A的存在。
K.阵列
在其他实施方式中，本发明提供PDZ，抗体，和/或适配体阵列，所述阵列由固定在固相上可识别选定位置的不同PDZ多肽、抗体和/或适配体或者类似的结合剂组成。阵列中每个固定的PDZ多肽、抗体和/或适配体对PL配体都对PL配体具有明确的结合亲合力和特异性，即，包括已鉴定的与流感病毒蛋白中PL的结合相互作用。阵列的区分活性由下列因素确定：(i)各自不同PDZ多肽、抗体和/或适配体的结合亲合力；(II)各自不同PDZ多肽、抗体和/或适配体对PL的结合特异性；和，(iii)分析条件，例如，离子强度，时间，pH等等。PDZ结构域是高度特异的，例如，MAST205中的PDZ结构域能够区别包含TDV和SDV的C端PL序列。同样地，相同PDZ蛋白内，不同的各自结构域可能具有不同的结合特异性和亲合力，即，PSD-95结构域-1、-2和-3具有不同的结合特异性和亲合力。申请人已经在先前的美国专利申请中克隆、表达和公开了超过255个不同的人PDZ结构域的序列，所述PDZ结构域包括了人类基因组中超过90％的全部PDZ结构域。对PDZ结构域融合蛋白与不同的PL肽的相互作用作图，构成选择本流感阵列特定成员的基础。出乎意料地，阵列的选择性基于以下发现：(i)不同流感A株中有区别的不同NS1 PL氨基酸序列模体，如下面实施例部分所述；和，联合(ii)不同流感病毒蛋白中不同的PL序列模体，即，HA，NP，MA1，NS1等等。
本发明的实施方式提供区别待测样本中流感A病毒或者流感B的不同株的方法，根据是流感病毒蛋白中PL的组成结合性质，例如，HA，NP，MA1，NS1等等，其中流感A和B的不同株和/或亚型在阵列中产生独特的结合模式。该方法包括以下步骤：(a)在阵列不同预定位置接触等份待测样本；(b)在阵列的特定位置检测结合的存在或者缺失；(c)根据阵列中的结合模式确定(i)待测样本中存在流感PL和(ii)阵列中PL结合的模式构成流感A或者B病毒特定毒株的区别标记。根据阵列可区别的流感A病毒的代表性实例包括例如H1N1，H2N2，H2N3，H2N5，H3N2，H3N8，H4N6，H5N1，H6N1，H6N2，H7N2，H7N3和H7N7。优选，该阵列至少部分基于和NS1 PL的结合。更优选，PDZ、抗体和/或适配体阵列特异地鉴定至少一种NS1 PL的存在，包括：ESEV(SEQ ID NO：2)，ESEI(SEQ ID NO：3)，ESKV(SEQ ID NO：4)，TSEV(SEQ ID NO：5)，GSEV(SEQ ID NO：6)，RSEV(SEQ ID NO：7)，RSKV(SEQ ID NO：8)，GSEI(SEQ ID NO：9)，GSKV(SEQ ID NO：10)，NICI(SEQ ID NO：11)，TICI(SEQ ID NO：12)，RICI(SEQ ID NO：13)，DMAL(SEQ ID NO：14)，DMTL(SEQ ID NO：15)，DIAL(SEQ IDNO：16)，DLDY(SEQ ID NO：17)，SICL(SEQ ID NO：18)，SEV，SEI，SKV和SKI。更优选，NS1 PL是ESEV(SEQ ID NO：2)。优选，PDZ蛋白是选自表1或者2中的至少一种、片段或者类似物。更优选，阵列包括至少一种PDZ蛋白，抗体或者模拟表1和2中所列任意PDZ蛋白的适体，类似物和活性片段。更优选的，阵列包括PDZ蛋白，抗体模拟物和/或适配体，包括外膜蛋白，PSD95(PDZ # 2)；PSD95(PDZ #1，2，3)；DLG1(PDZ #1)；DLG1(PDZ #1，2)；DLG1(PDZ #2)；DLG2(PDZ#1)；DLG2(PDZ #2)；Magi3(PDZ #1)；PTN3(PDZ #1)；MAST2(PDZ #1)；NeDLG(PDZ #1，2)；Shank1 d1；Shank2 d1；Shank3 d1；Syntrophinl α；Syntrophin γ1；Magi1(PDZ #1)；Magi1(PDZ #4)；Tip1；PTPL1(PDZ #1)；Mint3(PDZ #1)；Lym Mystique(PDZ #1)；DLG2(PDZ #3)；MUPP1(PDZ#8)；NeDLG(PDZ #1)；DLG5(PDZ #1)；PSD95(PDZ#1)；NumBP(PDZ#3)；LIMK1(PDZ #1)；KIAA0313；DLG1(PDZ#2)；Syntenin(PDZ #2)；Pick1或者类似物或者片段和/或模拟任何PDZ蛋白的抗体(或者适配体)。
L.侧向流设计
类似于家庭妊娠试验，侧向流装置通过将液体施加于测试条起作用，所述测试条已经经过特异生物制剂处理。通过携带液体样本，用相应生物制剂标记的荧光体流过测试条，当它们进入特异区时能被捕获。测试条上发现的荧光体信号的量与靶分析物的量成比例。
采用一些方法将怀疑含有流感A的样本添加到侧向流装置中，令样本通过扩散移动，线或者有色的区带表明流感A的存在。侧向流通常包括固相支持物(例如硝酸纤维素膜)，其包含3个特定区域：样本添加区，包含一种或者多种固定的PDZ蛋白和抗体的捕获区，和包含一个或者多个区带的读出区，各区带包含一种或者多种标记物。侧向流还可以包括阳性和阴性对照。因此，例如侧向流装置在某些实施方式中将按照如下进行：通过将等份生物样本接触测试条的一端，然后让蛋白在测试条上迁移，例如通过毛细管作用例如侧流，从生物样本中的其他病毒和细胞蛋白分离流感PL蛋白。包括一种或者多种PL结合剂例如PDZ多肽试剂、抗体和/或适配体作为捕获和/或检测剂。用于侧向流分离、检测和定量的方法和装置是本领域已知的，例如，美国专利号5,569,608；6,297,020；和6,403,383，在此完整引入作为参考。在一个非限制性实施例中，测试条包括用于上样的近端区域(上样区)和包含PDZ多肽捕获剂和缓冲试剂和添加剂的远端试验区，所述缓冲试剂和添加剂适于建立迁移的生物样本中PDZ多肽和任何流感PL蛋白之间的结合相互作用。在其他实施方式中，测试条包括两个试验区域，该区域包含不同的PDZ结构域多肽，即，每个能够特异地与不同的流感PL蛋白分析物相互作用。
XI.药物组合物
上述筛查过程可以鉴定一种或者多种类型的化合物，所述化合物可以掺入药物组合物。这些化合物包括试剂，所述试剂是至少一种NS1蛋白或者至少一种PDZ蛋白的转录、翻译和翻译后处理的抑制剂。该试剂还可能抑制或者阻断NS1和PDZ蛋白或者其混合物的结合。这些化合物还包括试剂，所述试剂是一种或者多种NS1蛋白、一种或者多种PDZ蛋白或者NS1和PDZ蛋白之间相互作用的抑制剂，并且所述试剂具有固有的呼吸和/或消化或者上皮细胞-特异活性或者成像活性。该化合物还包括偶联物，其中药剂或者成像组分与抑制剂连接，所述抑制剂是NS1、PDZ蛋白或者NS1蛋白和PDZ蛋白之间相互作用的抑制剂。还提供偶联物，所述偶联物包括具有药物活性的试剂和相对单独试剂对PDZ蛋白具有降低的底物能力的偶联基团，是为了减少该试剂转运入未感染细胞，在那里试剂将产生不需要的副作用。优选，该化合物或者试剂抑制或者阻断至少一种下列PL与PDZ蛋白的结合：ESEV(SEQ ID NO：2)，ESEI(SEQ ID NO：3)，ESKV(SEQ ID NO：4)，TSEV(SEQ ID NO：5)，GSEV(SEQ ID NO：6)，RSEV(SEQ ID NO：7)，RSKV(SEQ ID NO：8)，GSEI(SEQ ID NO：9)，GSKV(SEQ ID NO：10)，NICI(SEQ ID NO：11)，TICI(SEQ ID NO：12)，RICI(SEQ ID NO：13)，DMAL(SEQ ID NO：14)，DMTL(SEQ ID NO：15)，DIAL(SEQ ID NO：16)，DLDY(SEQ ID NO：17)，SICL(SEQ ID NO：18)，SEV，SEI，SKV和SKI。更优选，被阻断或者抑制的NS1 PL是ESEV。优选，该化合物或者试剂抑制与至少一种来自表1或者2的PDZ蛋白的结合。更优选，被抑制的PDZ蛋白或者相互作用是是下列至少一种：PSD95(PDZ # 2)；PSD95(PDZ #1，2，3)；DLG1(PDZ #1)；DLG1(PDZ #1，2)；DLG1(PDZ#2)；DLG2(PDZ #1)；DLG2(PDZ #2)；Magi3(PDZ #1)；PTN3(PDZ #1)；MAST2(PDZ #1)；NeDLG(PDZ #1，2)；Shank1 d1；Shank2 d1；Shank3 d1；Syntrophinl α；Syntrophin γ1；Magi1(PDZ #1)；Magi1(PDZ #4)；Tip1；PTPL1(PDZ #1)；Mint3(PDZ#1)；Lym Mystique(PDZ#1)；DLG2(PDZ#3)；MUPP1(PDZ#8)；NeDLG(PDZ #1)；DLG5(PDZ #1)；PSD95(PDZ#1)；NumBP(PDZ #3)；LIMK1(PDZ #1)；KIAA0313；DLG1(PDZ #2)；Syntenin(PDZ#2)；Pick1或者类似物或者片段和/或模拟任何PDZ蛋白的抗体(或适配体)。
一种或者多种上述实体可以与药物可接受的、无毒的载体或者稀释剂组合，所述载体或者稀释剂定义为通常用来配制用于动物或者人类给药的药物组合物的介质。选择稀释剂以便不影响组合的生物活性。这类稀释剂的实例是蒸馏水，缓冲水，生理盐水，磷酸盐缓冲液(PBS)，Ringer氏溶液，右旋糖溶液和Hank氏溶液。此外，药物组合物或者制剂还可以包括其他载体，佐剂，或者无毒的非治疗性非免疫性稳定剂、赋形剂等等。组合物还可以包括其他物质以接近生理条件，例如pH调节和缓冲剂，毒性调节剂，湿润剂，去污剂等等(参见，例如，Remington′sPharmaceutical Sciences，Mace Publishing Company PublishingCompany，Philadelphia，PA，第17版(1985)；用于药物投放方法的简要综述可以参见，Langer，Science 249：1527-1533(1990)；这些参考文件中的每一篇均在此完整引入作为参考)。
用于口服给药的药物组合物可以是例如下列形式，片剂，丸剂，粉剂，锭剂，袋剂，囊剂(catchet)，酏剂，悬浮液，乳剂，溶液，或者糖浆剂。合适赋形剂的一些实例包括乳糖，右旋糖，蔗糖，山梨糖醇，甘露醇，淀粉，阿拉伯树胶，磷酸钙，藻酸盐，黄芪胶，明胶，硅酸钙，微晶纤维素，聚乙烯吡咯烷酮，纤维素，无菌水，糖浆，和甲基纤维素。还可以包括防腐剂例如甲基-和羟丙基苯甲酸盐(propylhydroxy-benzoates)；甜味剂；和调味剂。根据剂型，在对患者给药后组合物可以提供快速的、持续的或者延迟的活性成分释放。聚合材料可以用于口服缓释投放(参见″Medical Applications ofControlled Release，″Langer和Wise(编著)，CRC Pres.，Boca Raton，Florida(1974)；″Controlled Drug Bioavailability，″Drug Product Designand Performance，Smolen和Ball(编著)，Wiley，New York(1984)；Ranger和Peppas，1983，J Macromol.Sci.Rev.Macromol Chem.23：61；还可参见Levy等人，1985，Science 228：190；During等人，1989，Ann.Neurol.25：351；Howard等人，1989，J.Neurosurg.71：105)。通过将偶联物包裹在胶囊内或者缓慢溶解的多聚体内，能够实现缓释。优选的多聚体包括羧甲基纤维素钠，羟丙纤维素，羟丙基甲基纤维素和羟乙基纤维素(最优选，羟丙基甲基纤维素)。其他优选的纤维素醚已经被描述(Alderman，Int.J.Pharm.Tech. & Prod.Mfr.，1984，5(3)1-9)。本领域已经描述了影响药物释放的因素(Bamba等人，Int.J.Pharm.，1979，2，307)。为了通过吸入给药，根据此处公开的内容应用的化合物采用气溶胶喷雾制剂形式可以方便地投放，所述制剂来自增压包装或者喷雾器，借助于合适的喷射剂，例如，二氯二氟甲烷，三氯氟甲烷，二氯四氟乙烷，二氧化碳或者其他合适的气体，或者来自无喷射剂的干粉吸入器。就增压气雾剂而言，剂量单位可以通过设置投放计量的阀来确定。例如在吸入器或者吹入器中使用的明胶的胶囊和药筒，可以制成包含化合物和合适的粉末基质例如乳糖或者淀粉的粉末混合物。
根据几个良好确立的方案的任意一个，容易确定药物组合物的有效剂量和给药方式(给药的量和频度)。例如，通常利用动物研究(例如，小鼠，大鼠)确定生物活性试剂的每千克重量的最大耐受剂量。通常，至少一种被测的动物种类是哺乳动物。来自动物研究的结果可以推断确定在其他种类中使用的剂量，例如人类。
可以向患者施用化合物用于预防性和/或治疗性处理。治疗量是指无论以任何方式，足以治疗疾病状态或者症状，或者其它预防、阻止、延缓、或者逆转疾病或者任何其他不良症状进程的量。在预防性应用中，向易感特定疾病或者感染或者处于该风险下的患者施用化合物。因此，“预防有效的”量是足以预防、阻止或者延缓疾病状态或者其症状的量。在任一种情况下，组合物中包含的化合物的准确量取决于患者的健康和体重情况。
确定药物组合物的合适剂量，例如，通常利用动物研究(例如，小鼠，大鼠)确定生物活性试剂的每千克重量的最大耐受剂量。通常，至少一种被测的动物种类是哺乳动物。来自动物研究的结果可以推断确定在其他种类中使用的剂量，例如人类。
药物组合物的组分优选是高纯度的，并且基本上不含潜在有害的污染物(例如至少国家食品(NF)级的，通常至少分析级的，和更常见至少药物级的)。
为了给定化合物必须在使用前合成的程度，所得产物通常基本上不含任何潜在的毒剂，尤其是任何内毒素，内毒素可能在合成或者净化步骤期间存在。通常在GMP条件下制备组合物。用于肠胃外给药的组合物通常是无菌的和基本上等渗的。
A.抗病毒剂
适合本发明使用的药物组合物包括其中包含有效剂量活性剂的组合物。抗病毒剂包括NS1、PDZ和/或NS1/PDZ相互作用的抑制剂，所述抑制剂优选显示出对NS1或者PDZmRNA或者蛋白水平的至少30，50，75，95，或者99％的抑制。利用特异结合蛋白的抗体然后检测抗体和蛋白之间形成的复合物，可以通过建立免疫分析定量蛋白的表达。可以通过例如，点印迹分析，原位杂交，RT-PCR，定量逆转录PCR(即，称为“TaqMan”方法)，Northern印迹和核酸探针阵列方法，定量mRNA水平。优选，用于鉴定抑制剂的NS1 PL是下列一种：ESEV(SEQ IDNO：2)，ESEI(SEQ ID NO：3)，ESKV(SEQ ID NO：4)，TSEV(SEQ IDNO：5)，GSEV(SEQ ID NO：6)，RSEV(SEQ ID NO：7)，RSKV(SEQ IDNO：8)，GSEI(SEQ ID NO：9)，GSKV(SEQ ID NO：10)，NICI(SEQ IDNO：11)，TICI(SEQ ID NO：12)，RICI(SEQ ID NO：13)，DMAL(SEQ IDNO：14)，DMTL(SEQ ID NO：15)，DIAL(SEQ ID NO：16)，DLDY(SEQID NO：17)，SICL(SEQ ID NO：18)，SEV，SEI，SKV和SKI。更优选，用于鉴定抑制剂的NS1 PL是ESEV(SEQ ID NO：2)。优选，用于鉴定抑制剂的PDZ蛋白是选自表1或者2中的至少一种、片段或者类似物。更优选，用于鉴定抑制剂的PDZ蛋白是下列至少一种：外膜蛋白，PSD95(PDZ #2)；PSD95(PDZ #1，2，3)；DLG1(PDZ #1)；DLG1(PDZ#1，2)；DLG1(PDZ #2)；DLG2(PDZ #1)；DLG2(PDZ #2)；Magi3(PDZ#1)；PTN3(PDZ #1)；MAST2(PDZ #1)；NeDLG(PDZ #1，2)；Shank1 d1；Shank2 d1；Shank3 d1；Syntrophinlα；Syntrophin γ1；Magi1(PDZ #1)；Magi1(PDZ #4)；Tip1；PTPL1(PDZ #1)；Mint3(PDZ #1)；Lym Mystique(PDZ #1)；DLG2(PDZ #3)；MUPP1(PDZ #8)；NeDLG(PDZ #1)；DLG5(PDZ #1)；PSD95(PDZ #1)；NumBP(PDZ #3)；LIMK1(PDZ #1)；KIAA0313；DLG1(PDZ #2)；Syntenin(PDZ #2)；Pick1或者类似物或者片段和/或模拟任意PDZ蛋白的抗体(或者适配体)。
抗病毒剂可以包括经鉴定与PDZ蛋白结合的PL肽治疗剂，所述PDZ蛋白与流感NS1或者其他PL蛋白相互作用。抗病毒剂包括基于PL模体或者PDZ结构域的肽。用于抑制流感病毒PL和与PL结合的PDZ结构域相互作用的一些示范性肽显示于表11(SEQ IDNOS：89-987)。其他有用的肽是SEQ ID NOS：2，48，53，996和997，如实施例所述。本发明的治疗剂包括肽本身，包括从C端开始的至少5、10、15或者20个连续残基的其截短型，和所有这些肽的保守取代变异体和模拟物，任选将它们掺入药物组合物中。保守取代，如果有的话，优选发生于所述肽的C端3-4个氨基酸外。阻断致病性流感PL与PDZ结合的肽可用于治疗致病性流感。优选，表11所示的肽，其截短型、保守取代的变异体或者模拟物与转运蛋白肽(蛋白转导结构域)在肽序列的N端连接。可以使用数个转运蛋白肽序列，包括Tat和触足蛋白(antennapedia)(参见实施例7)。抗病毒治疗剂还包括抑制病毒PL和PDZ之间相互作用的小分子，以及Cox2抑制剂(如此处表8中鉴定的)。已经在此处的表9和10中鉴定了一些小分子抑制剂。
B.筛选抗病毒剂的方法
此处公开了筛选与NS1 PL蛋白和/或PDZ蛋白结合的试剂的方法。最初筛选的是与NS1 PL或者PDZ蛋白的PDZ结构域结合的试剂。然后检测它们抑制PDZ/PL相互作用的能力。在下面的“B.抗病毒剂分析”中也提供了这些方法。可以在体外利用天然或者合成的PL蛋白进行结合分析。或者，包含天然或者合成的PDZ结构域的蛋白可用于鉴定能够结合特定PDZ蛋白的试剂。
此处公开的筛选抗病毒剂的方法鉴定阻断或者抑制病毒PL和任何与其有相互作用的PDZ蛋白之间相互作用的试剂。筛选抑制剂和编码其的DNA的抑制NS1和/或PDZ表达的能力。进行初筛，选择能够抑制或者终止PDZ/PL相互作用的试剂亚组。这样的分析可以在体外进行，利用分离的PDZ蛋白和PL蛋白或者其能够彼此结合的片段。这样的筛选鉴定的试剂然后能够进行功能分析。还可以在表达PL蛋白的细胞中筛选试剂，所述细胞或者天然表达PDZ蛋白，或者经转化表达PDZ蛋白。
除了以上公开和说明的诊断试验外，实施方式提供鉴定能够调节一种或者多种结合相互作用的候选抗病毒剂的分析法，所述结合相互作用发生在流感A感染的细胞中流感病毒PL和宿主细胞PDZ多肽之间。该方法包括在抗病毒剂存在下，检测对照PL例如合成PL肽，与PDZ结构域多肽例如重组PDZ融合蛋白的结合。候选抗病毒剂调节对照PL和PDZ结构域多肽之间的结合。申请人之前在美国和国际专利申请中，例如在此完整引入作为参考的美国专利号5,569,608；6,297,020；和6,403,383中，已经公开了测定对照PL和PDZ结构域多肽之间结合相互作用的分析。
特别有用的筛选分析使用既表达一种或者多种流感NS1 PL又表达一种或者多种PDZ结构域蛋白的细胞。这类细胞能够通过用编码蛋白的多核苷酸共转染细胞重组产生，或者能够通过用第二种蛋白转染天然包含蛋白之一的细胞产生。在一个特定实施方式中，这类细胞在多孔培养皿中生长，与不同浓度的待测化合物接触预定的时间段，所述时间段能够根据经验确定。分析全细胞裂解产物、培养基或者细胞膜对PL/PDZ相互作用的抑制。与对照相比显著抑制活性的待测化合物被认为是治疗剂候选物。
分离的PDZ结构域蛋白或者其PL结合片段，可以在任何的各种药物筛选技术中用于筛选治疗化合物。或者，能够使用包含PL模体的分离NS1 PL蛋白或者片段。用于这类试验的蛋白可以是膜结合的，在溶液中游离的，固着在固相支持物上，带在细胞表面的，或者位于细胞内的。可以测定PDZ结构域或者NS1 PL和待测试剂之间结合复合物的形成。更具体地，如果相互作用比无待测化合物存在时测量的相互作用显著更低，则待测化合物被认为是PDZ/PL相互作用的抑制剂。在该背景下，术语“显著更低”是指在待测化合物存在下，PDZ/PL相互作用与无待测化合物存在条件下测量的相互作用相比时显著更低，在分析法的置信限内。
还可以筛选肽或者其他化合物的随机文库适合作为PDZ/PL结合的抑制剂，或者单纯结合PDZ结构域蛋白或者NS1 PL蛋白。许多类型的化合物都可以产生组合文库，其可以采用逐步方式合成。这类化合物包括多肽，β-转角模拟物，多糖，磷脂，激素，前列腺素，类固醇，芳香族化合物，杂环化合物，苯二氮平，低聚N-取代甘氨酸和低聚氨基甲酸酯(oligocarbamates)。通过编码合成文库(ESL)方法可以构建化合物的大组合文库，所述方法描述于Affymax，WO 95/12608，Affymax，WO 93/06121，Columbia University，WO 94/08051，Pharmacopeia，WO 95/35503和Scripps，WO 95/30642(各在此引入作为参考用于所有目的)。
用于筛选治疗剂或者治疗先导物的待测化合物的优选来源是噬菌体展示文库。参见，例如，Devlin，WO91/18980；Key，B.K.，等人编著，Phage Display of Peptides and Proteins，A Laboratory Manual，AcademicPress，San Diego，CA，1996。噬菌体展示是一种强大的技术，能够令人从包含108-109个不同序列的文库中，使用噬菌体遗传学选择和扩增具有所需特征的肽或者蛋白。可以设计文库，用于氨基酸序列在所需位置的选择性上色(variegation)，允许文库对所需特征的偏好。设计文库使肽表达为与噬菌体表面展示的蛋白融合。挑选具有所需特征的噬菌体展示肽，并能再生长进行扩增。因为肽是通过噬菌体的增殖扩增的，可以方便的测序所选噬菌体的DNA，从而促进所选肽的快速分析。
通过选择特异结合PDZ结构域蛋白和/或NS1 PL的噬菌体，能够挑选出编码肽抑制剂的噬菌体。产生融合到蛋白的文库，例如表达在噬菌体表面上的基因II。文库可以由不同长度的、线性的或者通过包含两个Cys氨基酸进行限制的的肽组成，与噬菌体蛋白融合，或者还能够融合到其他作为支架的蛋白。还能够设计文库偏好此处公开的PL区或者偏好从初始文库选择的结合噬菌体得到的肽序列，所述初始文库提供其他的待测抑制剂化合物。
C.抗病毒剂的类型
下面阐明的任意试剂可以用作药物以及那些在筛选方法中鉴定者。抑制剂可以从任意类型的文库鉴定，包括RNA表达文库，噬菌体表达文库，小分子文库，肽文库。还可以利用核酸和/或多肽的已知序列产生抑制剂。化合物还包括几类已知调控基因表达的分子，例如锌指蛋白，核糖酶，siRNAs和反义RNAs。
(a)siRNA抑制剂
siRNAs是相对较短的、至少部分双链的RNA分子，其用于抑制互补mRNA转录体的表达。尽管实现本发明不需要理解机理，但是认为siRNAs通过诱导互补mRNA转录体的降解起作用。设计和使用siRNAs的原理通常描述于WO 99/32619，Elbashir，EMBO J.20，6877-6888(2001)和Nykanen等人，Cell 107，309-321(2001)；WO01/29058。
本发明的siRNAs由至少部分互补的RNA的两条链形成，每条链优选长度为10-30，15-25，或者17-23或者19-21个核苷酸。所述链可以在全长彼此完全互补，或者在另外双链分子的一端或者两端具有单链3′-突出端。单链突出端，如果存在，通常是1-6个碱基，优选1或者2个碱基。选择siRNA的反义链与NS1或者PDZ转录体的片段基本上互补(例如，至少80，90，95％和优选的100％)。任何错配的碱基优选存在于siRNA链的末端或者在末端附近。末端错配的碱基能够是脱氧核糖核苷酸。siRNA的有义链显示与NS1或者PDZ转录体片段的互补体相似的关系。特别合适的siRNAs具有两条链，每条具有19个碱基的完全互补性，并且在有义链的3′端具有两个不配对的碱基，在反义链的3′端具有一个不配对的碱基。
如果就这样施用siRNA，因为编码siRNA的DNA的形式不同，则siRNA的链可以包含一种或者多种核苷酸类似物。核苷酸类似物位于那些抑制剂活性基本上不受影响的位置，例如在5′-端和/或3′端区域，尤其是单链突出区。优选核苷酸类似物是糖-或者骨架-修饰的核糖核苷酸。核酸碱基-修饰的核糖核苷酸，即核糖核苷酸，包含非天然存在的核酸碱基而不是天然存在的核酸碱基，例如5-位修饰的尿苷或者胞苷，例如5-(2-氨基)丙基尿苷，5-溴尿苷；8位修饰的腺苷和鸟苷，例如8-溴鸟苷；去氮核苷酸，例如7-去氮-腺苷；O-和N-烷基化核苷酸，例如N6-甲基腺苷也是合适的。在优选的糖修饰核糖核苷酸中，2′OH-基团被选自H，OR，R，卤素，SH，SR，NH2，NHR，NR2或者CN的基团取代，其中R是C1-C6烷基，烯基或者炔基，卤素是F，C1，Br或者I。在优选的骨架-修饰的核糖核苷酸中，与相邻核糖核苷酸连接的磷酸酯基团被修饰的基团例如硫代磷酸酯基团取代。在siRNA 5′羟化残基上的磷酸基中引入其他优选的修饰。通过用ATP和T4激酶处理siRNA，可以引入这样的基团。还可以修饰天然RNA的磷酸二酯键，以包括至少一种氮或者硫杂原子。可以使RNA结构中的修饰适合于特定的基因抑制，同时避免一些生物体中由dsRNA引起的常见恐慌反应。同样地，可以修饰碱基以阻断腺苷脱氨酶的活性。
NS1或者PDZ转录体内的许多片段是设计siRNAs的合适目标。当NS1 PL的选定片段用于选择性靶定亚型时，该片段优选显示与转录体的其他NS1 PL区缺少完全的序列同一性。优选，NS1或者PDZ蛋白的选定片段显示出与NS1 PL的相应片段(如果有的话)至少1、2、3、4或者更多个核苷酸差异。可以从NS1或者PDZ的编码区、5′UTR和3′UTR选择靶位点，在一些情况下，NS1的PL位点是优选的。优选的靶位点是称为NS1 PL的siRNA(参见实施例)。该位点在C端，并对流感A病毒亚型特异。其他优选的位点包括PDZ蛋白的PL结合位点。
通过在一对启动子之间插入编码siRNA的DNA片段，能够重组合成siRNA，所述启动子定向驱动插入片段从反方向的转录。这类启动子的转录产生两个互补RNA链，该互补RNA链随后能退火形成所需的dsRNA。用于这类系统的示范性质粒包括质粒(PCR 4.0 TOPO)(由Invitrogen提供)。另一个实例是载体pGEM-T(Promega，Madison，WI)，其中反向定向的启动子是T7和SP6；还可以使用T3启动子。或者，编码siRNA链的DNA片段被插入到单启动子的下游。在该系统中，共转录siRNA的有义和反义链，产生自身互补的单RNA链，从而能够形成dsRNA。编码siRNAs的载体可以在体外或者细胞培养物中转录，或者可以导入转基因动物或者患者用于原位表达。合适的载体描述如下。用于重组表达的启动子和任选的其他调控序列的选择可以决定表达的组织特异性。例如，PDGF，朊病毒，神经烯醇酶，或者thy-1启动子适合于在中枢神经系统表达。
还能够通过有机化学合成和体外退火，合成siRNAs的链。如果是化学合成或者通过体外酶促合成，RNA在导入细胞前可以纯化。例如，通过用溶剂或者树脂沉淀、电泳、层析、或者其组合来提取，可以从混合物中纯化RNA。RNA可以被干燥用于储存，或者溶于水溶液。溶液可包含促进退火和/或双链稳定的缓冲液或者盐。通过各种方法，能够将siRNAs以RNA或者编码RNA的DNA形式导入细胞或者生物体，如下面所述。
(b)反义多核苷酸
通过结合并干扰有义mRNA的翻译，干扰转录，干扰RNA前体的加工或者定位，抑制mRNA的转录或者通过一些其它机理起作用，反义多核苷酸能够造成抑制。反义分子通过何种特定机理减少表达不是最关键的。
通常反义多核苷酸包括至少7至10到通常20或者更多个核苷酸的单链反义序列，所述序列与来自基因mRNA的序列特异杂交。一些反义多核苷酸来自长度约10到大约50个的核苷酸，或者长度大约14到大约35个的核苷酸。一些反义多核苷酸是小于大约100个核苷酸或者小于大约200个核苷酸的多核苷酸。通常，如果需要，反义多核苷酸应该足够长以形成稳定的双链，但是还需足够短以便体内给药，这取决于给药方式。与靶序列特异杂交所需的多核苷酸最小长度取决于几个因素，尤其是，例如G/C含量，错配碱基(如果有的话)的位置，与靶多核苷酸群相比该序列的独特程度，和多核苷酸的化学性质(例如，甲基膦酸酯骨架，肽核酸，硫代磷酸酯)。
为确保特异杂交，反义序列至少与编码它们的靶mRNA或者基因的片段基本上互补。一些反义序列与它们的目标靶序列完全互补。但是反义多核苷酸还能包括，核苷酸取代，添加，缺失，转换，转座，或者修饰，或者其他核酸序列或者非核酸部分，只要将与对应于RNA或者其基因的有关靶的序列特异结合保留作为该多核苷酸的功能性质。用于抑制NS1或者PDZ蛋白表达的反义多核苷酸被设计成显示出与特定NS1或者PDZ基因或者转录体的完全的或者相当程度的序列一致性，和与不同PDZ基因的不完全的和较低程度的序列一致性。
一些反义序列与mRNA相对易接近的序列(例如，相对缺少二级结构)互补。这可以通过分析预测的RNA二级结构来确定，利用例如MFOLD程序(Genetics Computer Group，Madison WI)和本领域已知的体外或者体内检验。用于鉴定有效反义组合物的另一个有用的方法利用寡聚核苷酸的组合阵列(参见，例如，Milner等，1997，NatureBiotechnology 15：537)。
可以利用任何合适的生产核酸的方法制备反义核酸(DNA，RNA，修饰的，类似物，等等)，例如此处公开的化学合成和重组方法。反义RNA可以就这样投放或者以编码反义RNA的DNA形式投放。编码反义RNA的DNA可以作为载体的成分或者非复制形式投放，例如下面所述。
(c)锌指蛋白
锌指蛋白还可以用于抑制NS1或者PDZ蛋白或者核酸或者特定NS1亚型的表达。锌指蛋白可以工程化或者选择结合靶基因内的任意需要的靶位点。在一些方法中，靶位点在启动子或者增强子内。在其他方法中，靶位点在结构基因内。在一些方法中，锌指蛋白与翻译阻遏剂连接，例如来自人类KOX-1蛋白的KRAB抑制结构域(Thiesen等人，New Biologist 2，363-374(1990)；Margolin等人，Proc.Natl.Acad.ScL USA 91，4509-4513(1994)；Pengue等人，Nucl.Acids Res.22：2908-2914(1994)；Witzgall等人，Proc.Natl Acad.Sci USA 91，4514-4518(1994)。WO 00/00388描述了选择适合被锌指蛋白靶定的靶位点的方法，和设计锌指蛋白结合选定的靶位点的方法。EP.95908614.1描述了利用噬菌体展示选择与靶结合的锌指蛋白的方法。用于设计锌指蛋白的靶位点通常是大约9-19个核苷酸。为了抑制NS1或者PDZ蛋白或者多核苷酸，在NS1或者PDZ蛋白或者多核苷酸内选择靶位点，所述位点显示与上面讨论的不同PDZ基因或者转录体是不完全的或者缺乏显著的序列一致性。WO 00/00409描述了利用锌指蛋白调控内源基因的方法。锌指蛋白可以作为蛋白或者以编码锌指的核酸形式给药。在后一种情况下，核酸可以利用载体或者如下所述的不可复制形式投放。
(d)核糖酶
核糖酶是充当酶的RNA分子，并且能够被工程化在特定位点切割其他RNA分子。该过程中核糖酶自身不消耗，并且能够催化作用于切割mRNA靶分子的多个拷贝。Haseloff & Gerlach，(1988)Nature334：585-591和Uhlenbeck，(1987)Nature 328：596-603和US 5,496,698描述了设计反向切割靶RNA的核糖酶的一般规则。
核糖酶通常包括两个侧翼片段和侧翼片段之间的催化区，所述侧翼片段显示与转录体(靶亚位点)上的两个位点互补并与其结合。侧翼片段通常长5-9个核苷酸，最佳长6-8个核苷酸。核糖酶催化区的长度通常是大约22个核苷酸。mRNA靶在靶亚位点之间包含一致的(consensus)切割位点，具有通式NUN，优选GUC(Kashani-Sabet和Scanlon，(1995)Cancer Gene Therapy 2：213-223；Perriman，等人，(1992)Gene(Amst.)113：157-163；Ruffher，等人，(1990)Biochemistry 29：10695-10702)；Birikh，等人，(1997)Eur.J.Biochem.245：1-16；Perrealt，等人，(1991)Biochemistry 30：4020-4025)。
通过选择靶亚位点，并从而选择与该亚位点互补的核糖酶侧翼片段，可以控制核糖酶的特异性。对于NS1或者PDZ蛋白的抑制剂，优先选择靶亚位点，使在其他PDZ蛋白中不存在准确的相应亚位点，并优选没有具有显著序列一致性的相应亚位点。核糖酶可以作为RNA分子，或者以编码核糖酶的DNA作为可复制载体组分的形式，或者采用如下所述的不可复制的形式，进行投放。
(e).抗体
化合物包括抗体，完整的和其结合片段二者都是，例如Fabs，Fvs，它们与本发明基因编码的蛋白特异结合。通常抗体是单克隆抗体，尽管多克隆抗体也能重组表达(参见，例如，US6,555,310)。能够表达的抗体实例包括小鼠抗体，嵌合抗体，人源化抗体，镶嵌(veneered)抗体和人类抗体。嵌合抗体是轻和重链基因已经构建的抗体，通常通过遗传工程对属于不同种类的免疫球蛋白基因片段进行构建(参见，例如，Boyce等人，Annals of Oncology 14：520-535(2003))。例如，小鼠单克隆抗体基因的可变(V)片段可以与人的恒定(C)片段连接。典型的嵌合抗体因此是一种杂合蛋白，由小鼠抗体的V或者抗原结合结构域和人抗体的C或者效应器结构域组成。人源化抗体具有基本上来自人抗体的可变区骨架残基(称为受体抗体)和基本上来自小鼠抗体的互补决定区，(称为供体免疫球蛋白)。参见Queen等人，Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86：10029-10033(1989)和WO 90/07861，US 5,693,762，US 5,693,761，US 5,585,089，US 5,530,101和Winter，US 5,225,539。恒定区(constant region)，如果存在，也基本上或者全部来自人免疫球蛋白。特别是，通过常规杂交瘤方法，噬菌体展示(参见，例如，Dower等人，WO 91/17271和McCafferty等人，WO 92/01047)，利用具有人免疫系统的转基因小鼠(Lonberg等人，WO93/12227(1993))，可以获得抗体。编码免疫球蛋白链的核酸可以从产生抗体的杂交瘤或者细胞系获得，或者基于已出版文献中的免疫球蛋白核酸或者氨基酸序列。
(f).模拟化合物
在特定实施方式中，本筛选法化合物中鉴定的该候选抗病毒化合物是所述PDZ结构域多肽或者PL的模拟肽，即，与所述PDZ结构域或者PL具有基本上相同的结构和/或功能特点的合成化合物。所述模拟物可以完全由氨基酸的合成、非天然类似物组成，或者，是部分天然肽氨基酸和部分氨基酸非天然类似物的嵌合分子。模拟物还包括任意量的天然氨基酸保守取代，只要这类取代也是基本上不改变模拟物的结构和/或抑制或者结合活性。至于是保守变异体的本发明多肽，常规实验法确定模拟物是否在本发明的范围内，即，其结构和/或功能基本上不改变。因此，如果模拟组合物能够抑制所述多肽之间的结合，则该模拟组合物在本发明的范围内。
模拟物可以包含非天然结构组分的任意组合，它们通常来自3个结构组：a)除了天然酰胺键(“肽键”)连接外的残基连接组；b)代替天然存在的氨基酸残基的非天然的残基；或者c)诱导二级结构模拟的残基，即，诱导或者稳定二级结构，例如，β转角，γ转角，β折叠，α螺旋构象，等等。
当多肽残基的全部或者一些通过除了天然肽键外的化学方法连接时，多肽可以表征为模拟物。个体模拟肽残基可以通过肽键、其他化学键或者偶联方法连接，例如，戊二醛，N-羟基琥珀酰亚胺酯，双官能马来酰亚胺，N，N＝-二环己基碳二亚胺(DCC)或者N，N＝-二异丙基碳二亚胺(DIC)。可以替代常规酰胺键(“肽键”)连接的连接基团包括，例如，酮亚甲基(例如，对于-C(＝O)-NH-的-C(＝O)-CH2-)，氨基亚甲基(CH2-NH)，乙烯，烯烃(CH＝CH)，醚(CH2-O)，硫醚(CH2-S)，四唑(CN4-)，噻唑，逆酰胺(retroamide)，硫代酰胺，或者酯(参见，例如，Spatola(1983)Chemistry and Biochemistry of Amino Acids，Peptides and Proteins，Vol.7，pp 267-357，A Peptide BackboneModifications，Marcell Dekker，NY)。
通过包含全部或者一些非天然残基取代天然存在的氨基酸残基，多肽也可以表征为模拟物。在科学和专利文献中详尽描述了非天然残基；下面描述了可用作天然氨基酸残基模拟物的一些示范性非天然组合物和指导方针。
芳香族胺基酸的模拟物能够通过用以下物质取代而产生，例如，D-或者L-萘基丙氨酸(naphylalanine)；D-或者L-苯基甘氨酸；D-或者L-2噻吩丙氨酸；D-或者L-1，2，3，或者4-芘基丙氨酸(pyreneylalanine)；D-或者L-3噻吩丙氨酸；D-或者L-(2-吡啶基)-丙氨酸；D-或者L-(3-吡啶基)-丙氨酸；D-或者L-(2-吡嗪基)-丙氨酸；D-或者L-(4-异丙基)-苯基甘氨酸；D-(三氟甲基)-苯基甘氨酸；D-(三氟甲基)-苯基丙氨酸；D-对-氟苯丙氨酸；D-或者L-对-二苯基苯丙氨酸；K-或者L-对-甲氧基二苯基苯丙氨酸；D-或者L-2-吲哚(烷基)丙氨酸；和，D-或者L-烷基丙氨酸(alkylainines)，其中烷基可以是取代的或者未取代的甲基，乙基，丙基，己基，丁基，戊基，异丙基，异丁基，sec-isotyl，异戊基，或者非酸性氨基酸。非天然氨基酸的芳环包括，例如，噻唑基，苯硫基，吡唑基，苯并咪唑基，萘基，呋喃基，吡咯基，和吡啶基芳环。
通过用下列物质取代，例如，非羰酸盐氨基酸同时维持负电荷；(膦酰基)丙氨酸；硫酸苏氨酸，能够产生酸性氨基酸的模拟物。羧基侧基(例如，天冬氨酰或者谷氨酰基)还可以通过与碳二亚胺(R-N-C-N-R＝)反应进行选择性修饰，所述碳二亚胺例如，L-环己基-3(2-吗啉基-(4-乙基)碳二亚胺或者L-乙基-3(4-氮鎓-4，4-二甲基苯基(dimetholpentyl))碳二亚胺。通过与铵离子反应，天冬氨酰或者谷氨酰还可以转变为天冬酰胺酰和谷氨酰胺酰残基。
通过用下列物质取代，例如，(除赖氨酸和精氨酸外)氨基酸鸟氨酸，瓜氨酸，或者(胍基)-乙酸，或者(胍基)烷基乙酸，其中烷基按上面所定义，可以产生碱性氨基酸的模拟物。腈衍生物(例如，包含CN-部分取代COOH)可以被天门冬酰胺或者谷氨酰胺取代。天冬酰胺酰和谷氨酰胺酰残基可以脱氨基，成为相应的天冬氨酰或者谷氨酰残基。
通过精氨酰与下列物质反应，例如，一种或者多种常规试剂，包括，例如，苯基乙二醛，2，3-丁二酮，1，2-环己二酮，或者水合茚三酮，优选在碱性条件下反应，能够产生精氨酸残基模拟物。
通过酪氨酰与例如芳香族重氮化合物或者四硝基甲烷反应，能够产生酪氨酸残基模拟物。N-乙酰基咪唑(acetylimidizol)和四硝基甲烷可分别用于生成O-乙酰酪氨酰类和3-硝基衍生物。
通过半胱氨酰残基与下列物质反应，例如，α-卤代乙酸酯例如2-氯乙酸或者氯乙酰胺和相应的胺，得到羧甲基或者羧酰胺甲基衍生物，可以产生半胱氨酸残基模拟物。通过半胱氨酰残基与下列物质反应，例如，溴-三氟丙酮，α-溴-β-(5-咪唑酰基丙酸；磷酸氯乙酰，N-烷基马来酰亚胺，3-硝基-2-吡啶二硫化物；甲基2-吡啶二硫化物；对氯汞苯甲酸；2-氯汞基-4硝基苯酚；或者，氯-7-硝基苯并-氧-1，3-二唑，也能够产生半胱氨酸残基模拟物。
通过赖氨酰与例如琥珀酸或者其他羧酸酐反应，能产生赖氨酸模拟物(和可以改变氨基末端残基)。通过与亚氨酯反应，例如甲基皮考林亚氨酯(picolinimidate)，磷酸吡哆醛，吡哆醛，氯代硼氢化物，三硝基苯磺酸，O-甲基异脲，2，4-戊二酮，以及与乙醛酸的转酰胺基酶催化反应，也可以产生赖氨酸和其他包含α-氨基的残基模拟物。
通过与例如甲硫氨酸亚砜反应，可以产生甲硫氨酸的模拟物。脯氨酸的模拟物包括，例如，哌啶酸，噻唑烷羧酸，3-或者4-羟基脯氨酸，脱氢脯氨酸，3-或者4-甲基脯氨酸，或者3，3，-二甲基脯氨酸。通过组氨酰与例如二乙基焦碳酸酯或者对溴苯酰甲基溴反应，可以产生组氨酸残基模拟物。
其他模拟物包括，例如，通过以下作用产生的那些：脯氨酸和赖氨酸的羟化作用；丝氨酰或者苏氨酰残基的羟基磷酸化作用；赖氨酸，精氨酸和组氨酸的α-氨基甲基化；N端胺的乙酰化；主链酰胺残基的甲基化或者用N-甲基氨基酸取代；或者C端羧基的酰胺化。
所述多肽的氨基酸还可以用相反手性的氨基酸(或者模拟肽残基)取代。因此，以L-构型天然存在的任意氨基酸(还可以称为R或者S，取决于化学实体的结构)可以用相同化学结构类型的氨基酸或者模拟肽取代，但它们具有相反的手性，通常称为D-氨基酸，但此外还可以称为R-或者S-形。
本发明的模拟物还可以包括组合物，该组合物包含结构模拟残基，尤其是诱导或者模拟二级结构的残基，例如β转角，β折叠，α螺旋结构，γ转角，等等。例如，在肽内用D-氨基酸；N-α-甲基氨基酸；C-α-甲基氨基酸；或者脱氢氨基酸取代天然氨基酸残基，可以诱导或者稳定β转角，γ转角，β折叠或者α螺旋构象。β转角模拟结构已得以描述，例如，Nagai(1985)Tet.Lett.26：647-650；Feigl(1986)J.Amer.Chem.Soc.108：181-182；Kahn(1988)J.Amer.Chem.Soc.110：1638-1639；Kemp(1988)Tet.Lett.29：5057-5060；Kahn(1988)J.Molec.Recognition1：75-79。β折叠模拟结构已得以描述，例如，Smith(1992)J.Amer.Chem.Soc.114：10672-10674。例如，Beusen(1995)Biopolymers 36：181-200，描述了顺式酰胺替代物，1，5-二取代四唑，诱导VI型β转角。Banerjee(1996)Biopolymers 39：769-777，描述了掺入非手性ω-氨基酸残基以产生聚亚甲基单位作为酰胺键的取代。通过例如强场1H NMR或者2DNMR光谱，可以分析多肽的二级结构，参见，例如，Higgins(1997)J.Pept.Res.50：421-435。还可以参见，Hruby(1997)Biopolymers43：219-266，Balaji等人，美国专利号5,612,895。
D.改进抗病毒剂
为改进抗病毒剂在所选细胞中的接受和导入，存在许多已知的方法。例如，蛋白的PEG化可使它们更能抵抗免疫系统。或者，可以在蛋白和载体中添加胞内信号或者部分使它们更易进入所选细胞。可以添加使蛋白或者载体易被感染细胞特异摄取的部分，在这种情况下是对呼吸细胞表达的受体特异的配体。该部分可以对流感受体或者细胞类型特异的受体具有特异性。
该治疗化合物还可以进一步修饰，以便该化合物更容易溶解或者促进其进入细胞。例如，化合物可以在任意位置PEG化，或者化合物可以偶联到膜易位(translocating)肽例如tat、触足蛋白或者信号序列膜易位肽，如U.Langel所述，″Cell Penetrating Peptides″，CRC Press，Boca Rotan，2002，即，在此完全引入作为参考。
本领域已经描述了许多肽序列，它们能够促进与这些序列连接的肽通过胞质膜进入细胞(Derossi等人，1998，Trends in Cell Biol.8：84)。为了本发明的目的，这类肽统称为“跨膜转运蛋白肽”，这与“细胞穿透肽”互换使用。后者细胞穿透肽的实例包括，但不限于下列肽：即，源自HIV的tat(Vives等人，1997，J.Biol.Chem.272：16010；Nagahara等人，1998，Nat.Med.4：1449)，来自果蝇(Drosophila)的触足蛋白(Derossi等人，1994，J.Biol.Chem.261：10444)，来自单纯疱疹病毒的VP22(Elliot和D′Hare，1997，Cell 88：223-233)，抗DNA抗体的互补决定区(CDR)2和3(Avrameas等人，1998，Proc.Natl Acad.Sci U.S.A.，95：5601-5606)，70KDa热休克蛋白(Fujihara，1999，EMBOJ.18：411-419)和转运蛋白(transportan)(Pooga等人，1998，FASEB J.12：67-77)。在某些实施方式中，可以使用截短的HIV tat肽。
E.干扰素产生
干扰素α和β(IFN-α/β)在抗病毒抵抗的固有细胞机制中起着重要作用，例如，抑制病毒序列的转录和翻译。IFN-α/β受体信号复合物的组装需要给受体复合物募集因子，包括转录因子，例如NF-κB，STAT和INF-诱导的转录因子-3；和蛋白激酶。据认为RACK1可以作为支架蛋白，给复合物募集和/或结合PKC和STAT；可能结合网蛋白，即，半桥粒(hemidesmasome)组织者(organizer)。最近来自其他实验室的数据表明腮腺炎和麻疹病毒可能破坏INF-α/β信号复合物，即，据报道腮腺炎V-蛋白结合RACK1，并诱导STAT从受体复合物解离；和，在麻疹病毒感染细胞中，据报道病毒C和/或V蛋白通过结合和“冻结”INF-α/β受体复合物，来抑制信号激酶的磷酸化作用。
干扰素-α/β信号抑制促-细胞凋亡应答，通过STAT和NFκB14的核转移提高细胞存活率14。干扰素受体信号触发PKC-δ15的活化，其又能下调半胱天冬酶316，以及，通过STAT17和，在气道中，通过NFκB18，19，下调促炎症信号。据报道PKC-δ活化还抑制TNFα诱导的凋亡20，21。在这方面，IFN-α/β信号的禽流感NS1抑制看来会促进细胞死亡和决定疾病的严重程度。因此，用于药物研发的候选药剂和新的分子靶标是干扰和/或阻断NS1对IFN-α/β信号作用的那些。这些试剂在感染流感A的对象中促进改善一种或者多种症状的所需治疗效果。
流感A的高危(也参见致病性)禽类株在人类中造成爆发性感染，即，快速越过粘膜肺组织传播进入循环和CNS。不受特定理论束缚，很有可能某些后来的效应源自受非结构流感A病毒蛋白介导INB-α/β信号的抑制。此外，很有可能病毒蛋白例如NS1和NS2抑制胞内PDZ结构域-PL的相互作用，而这种相互作用对于有效的INB-α/β信号信号和诱导细胞抗病毒抵抗机理是必需的。
此处鉴定了INF-α/β受体-1中可能的PDZ-配体(PL)序列(检索号16166194)，C端序列“QDFV”(SEQ ID NO：31)，即，可能的1-型PL序列。相似的，INF-α/β-受体-1信号复合物的其他潜在成员还包括下列推断的C端PL序列模体：即，MAP-1A(检索号2119250)包含″KSRV″(SEQ ID NO：32)；MAP-1B(检索号14165456/5174525)包含″KIEL″(SEQ ID NO：33)；MAP-1A/1B轻链-3(检索号12383056/18551443)包含C端″KLSV″(SEQ ID NO：34)；网蛋白-1(检索号4505877)包含C端PL序列模体″SAVA″(SEQ ID NO：35)；PKC-δ(检索号509050)包含″KVLL″(SEQ ID NO：36)；INF-可诱导蛋白激酶(检索号13637584和4506103-elf2 α)包含C端序列模体″RHTC″(SEQID NO：37)；干扰素α应答转录因子-3(检索号5174475)具有C端模体″LSLV″(SEQ ID NO：38)；和，干扰素调节因子-2(检索号20141499/4504723)包含″VKSC″(SEQ ID NO：39)。
因此，很有可能PDZ结构域-PL相互作用在病毒发病机理中起着重要作用，并从而成为开发药物化合物的靶标。
能够抑制NS1与IFN-α/β受体复合物的胞内PDZ结构域相互作用的药物化合物包括PL肽，和其模拟物，NS1 PL/IFN-α/β相互作用的肽抑制剂，NS1表达的抑制剂，细胞可渗透的非天然PDZ结构域多肽，和其模拟物，和能够抑制NS1 PL与人特异PDZ结构域结合的小分子抑制剂，所述PDZ结构域参与IFN-α/β反应。
F.5.4治疗方法
此处公开的药物组合物用于流感A疾病预防或治疗方法。
从上面公开的内容可知，本发明具有多种应用。例如，NS1蛋白、PDZ蛋白或者NS1和PDZ蛋白之间相互作用的抑制剂，可用于鉴定与转运蛋白相互作用并且能够进入感染细胞的试剂或者偶联物。NS1蛋白、PDZ蛋白或者NS1和PDZ蛋白之间相互作用的抑制剂还能通过鉴别结合感染细胞的偶联部分并将偶联部分与试剂连接，用于增强试剂结合感染细胞的能力。
在预防应用中，给对流感A感染易感、或者处于患流感A感染发展风险的对象施用一定量的药物组合物或者药物，所述的量足够预防、减弱或者阻止流感A感染的发展。在治疗应用中，给被怀疑患有、或者已经患有流感的患者施用一定量的组合物或者药物，所述的量足够逆转、阻止或者至少部分阻止，流感A感染的症状。在预防和治疗方案中，作为NS1、PDZ和/或NS1-PDZ相互作用抑制剂形式的本发明活性剂，通常分几次剂量给药，直到实现充分的应答。但是，在预防和治疗方式中，活性剂还可以单次剂量给药，直到实现充分的应答。通常，对治疗进行监控，并可以给予重复剂量。此外，对于那些治疗流感A感染治疗或者流感A感染发展的患者，治疗方式可以使用相似的剂量；给药途径和给药频率。
根据治疗的疾病、哺乳动物种类和特定给药方式，可以与载体组合产生单一剂型的NS1蛋白、PDZ蛋白和/或NS1/PDZ相互作用和其他活性剂的抑制剂的量是不同的。对于任意特定患者，“有效剂量”，“药理可接受剂量”或者“药理可接受量”可能取决于各种因素，包括使用的特定化合物的活性，接受治疗的患者的物种，年龄，体重，健康状况、性别和饮食；给药时间和途径；代谢或者排泄速度；同时或者先前给药的其他药物；疾病的类型和严重度；副作用的严重程度，患者是否是动物或者人类，等等。通常患者是人类，但还可以治疗非人类的哺乳动物，包括转基因哺乳动物。可以施用有效剂量的全长活性剂或者其活性片段。
对于用于本发明方法的NS1蛋白、PDZ蛋白和/或NS1/PDZ相互作用的任意抑制剂和其他活性剂，用于人类的有效量最初可以从非人类动物模型估算。临床医生利用本领域已知的参数可以确定有效量。通常，开始的给药剂量稍微低于最佳有效量。此后小量增加给药量直到达到有效剂量。(参见The Merck Manual of Diagnosis and Therapy，第16半，§22，1992，Berkow，Merck Research Laboratories，Rahway，NewJersey，在此引入作为参考)。
剂量需要逐步增高以最优化安全性和效果。可以通过实验动物的标准药学步骤检测此处描述的化合物的毒性和治疗效果，例如通过测定LD50(导致50％试验群体死亡的剂量)和ED50(在50％试验群体中治疗有效的剂量)。有毒和治疗效果之间的剂量比例是治疗指数，可以表达为LD50和ED50之间的比例。优选显示高治疗指数的化合物。从这些非人类动物研究获得的数据可用于配制对于人用无毒的剂量范围。这类化合物的剂量优选处于循环浓度范围内，该范围包括几乎没有或者没有毒性的ED50。个人医生根据患者情况可以选择正确的剂型、给药途径和剂量。(参见，例如，Fingl等人(1975)In：ThePharmacological Basis of Therapeutics，Chapter 1，在此引入作为参考)。
G.给药方法
NS1蛋白、PDZ蛋白和/或NS1/PDZ相互作用的抑制剂和其他活性剂可以被单独投放或者施用于哺乳动物，例如，人类患者或者对象，以药物可接受的盐或者其可水解前体的形式，或者以药物组合物形式，其中有效剂量的化合物与合适的载体或者赋形剂混合。有效方案是指药物或者药物组合以足够的量和频率并且通过合适途径给药，以便至少可检测地预防、延缓、抑制或者逆转流感A感染至少一种症状的发展。“有效剂量”，“药理可接受剂量”，“药理可接受量”是指当以合适的方式给药时，存在足够量的NS1蛋白或者表达、PDZ蛋白或者表达和/或NS1/PDZ蛋白相互作用的抑制剂、活性剂或者NS1、PDZ蛋白和/或NS1/PDZ蛋白相互作用的抑制剂与其他活性剂联合，以获得所需要的结果，例如，预防、延缓、抑制或者逆转流感A感染的症状或者流感A感染的进展。
用于本发明方法的的流感A的NS1、一种或者多种PDZ蛋白和/或NS1/PDZ蛋白相互作用的抑制剂和其他活性剂可以作为药物组合物给药，所述药物组合物包括NS1、PDZ蛋白和/或NS1/PDZ蛋白相互作用的抑制剂或者活性剂，和各种其他药学可接受的组分。药物组合物可以是以下形式：固体(例如粉剂，颗粒，糖衣丸，片剂或者丸剂)，半固体(例如凝胶剂，浆剂，或者膏剂)，液体，或者气体(例如气雾剂或者吸入剂)。
本发明使用的合适剂型可以参考Remington′s PharmaceuticalSciences(Mack Publishing Company 1985)Philadelphia，PA，第17版)和Langer，Science(1990)249：1527-1533，在此引入作为参考。此处描述的药物组合物可以采用常规方式制备，即，混合，溶解，粒化，制备糖衣丸，磨粉，乳化，包囊，捕获或者冻干步骤。
NS1/PDZ蛋白和/或NS1/PDZ蛋白相互作用的抑制剂和其他活性剂可以与常见的赋形剂、稀释剂或者载体一起配制，压成片剂，或者配制成酏剂或者方便口服给药的溶液。NS1、PDZ蛋白和/或NS1/PDZ蛋白相互作用的抑制剂和其他活性剂还可以配制缓释剂型等等。
可以多种方式实现化合物的给药，包括口服，含服，直肠，胃肠外，腹膜内，经皮，透皮，气管内，静脉内，和肌内给药。该化合物可以在长效或者缓释的剂型中，局部而不是全身方式给药。此外，化合物可以在脂质体中给药。此外，化合物可以通过基因治疗方式给药。
为了口腔给药，组合物可以采用按常规方式配制的片剂或者锭剂的形式。
为了吸入给药，本发明应用的化合物以气溶胶喷物制剂形式可以方便地投放，所述制剂来自增压包装、喷雾器(nebulizer)或者注射喷雾器(syringe sprayer)，借助于合适的喷射剂，例如，二氯二氟甲烷，三氯氟甲烷，二氯四氟乙烷，二氧化碳或者其他合适的气体，或者来自无喷射剂的干粉吸入器。就增压气雾剂而言，剂量单位可以通过设置投放计定量的阀来确定。例如在吸入器或者吹入器中使用的明胶的胶囊和药筒，可以制成包含化合物和合适的粉末基质例如乳糖或者淀粉的粉末混合物。
化合物可以配制成通过注射进行肠胃外给药，例如，通过弹丸注射(bolus injection)或者连续输注。用于注射的剂型可以存在于单位剂型，例如，在安瓿中或者多剂量容器中，含有添加的防腐剂。组合物可以采用以下形式：油基或水性介质中的悬浮液、溶液、或者乳液，并且可以包含配制剂(formulator agents)例如悬浮、稳定和/或分散剂。组合物配制成无菌、基本等渗的和完全符合美国食品和药物管理局(theU.S.Food and Drug Administration)的所有药品生产质量管理规范(Good Manufacturing Practice，GMP)。
NS1、PDZ蛋白和/或NS1/PDZ蛋白相互作用的抑制剂和其他活性剂还可以配制为直肠组合物，例如栓剂或者保留灌肠剂，例如，包含常用栓剂基质例如可可脂，碳蜡，聚乙二醇或者其他甘油酯，所有这些在体温下溶化，而在室温下凝固。
除以上描述的剂型外，化合物还可以配制为长效制剂(depotpreparation)。这类长效剂型可以通过植入(例如，皮下或者肌内)或者通过肌肉注射给药。因此，例如，化合物可以用合适的聚合或者疏水性材料(例如，作为可接受的油中的乳剂)或者离子交换树脂配制，或者作为微溶的衍生物，例如，微溶的盐。(参见，例如，Urquhart等人，(1984)，Ann Rev.Pharmacol.Toxicol.24：199；Lewis，ed.，1981，Controlled Release of Pesticides and Pharmaceuticals，Plenum Press，NewYork，N.Y.，美国专利号3,773,919，和3,270,960，在此引入作为参考)。
或者，可以使用用于疏水性药物化合物的其他运送系统。脂质体和乳剂是疏水性的药物运送介质或者载体的公知实例。在一些方法中，可以使用循环时间长，即，隐形脂质体。Woodle等人的美国专利号5,013,556一般性地描述了这类脂质体，其教示在此引入作为参考。本发明的化合物还可以通过控释工具和/或运送装置给药，所述工具和装置描述于美国专利号3,845,770；3,916,899；3,536,809；3,598,123；和4,008,719；其公开内容在此引入作为参考。
为了通过基因治疗给药，目标遗传物质(例如，DNA或者RNA)被转移到宿主中以治疗或者预防流感A感染。在本发明中，目标遗传物质编码NS1、PDZ和/或NS1/PDZ相互作用的抑制剂、活性剂或者其片段。根据本发明的一个方面，遗传物质应该是有疗效的。许多这类蛋白、载体、DNA本身是已知的。(参见Culver，K.W.，″Gene Therapy″，1994，p.xii，Mary Ann Liebert，Inc.，Publishers，New York，N.Y.，在此完整引入作为参考)。只为了示例的目的，载体可以选自莫洛尼小鼠白血病病毒载体，带有组织特异启动子的腺病毒载体，单纯性疱疹载体，牛痘的载体，人工染色体，受体介导的基因运送，和上述载体的混合物。基因治疗载体是由不同的实验室商品化供应的，例如Chiron，Inc.，Emeryville，Calif.；Genetic Therapy，Inc.，Gaithersburg，Md.；Genzyme，Cambridge，Mass.；Somtax，Alameda，Calif；Targeted Genetics，Seattle，Wash.；Viagene和Vical，San Diego，Calif。
腺病毒是遗传物质的有希望的基因治疗载体，所述遗传物质编码NS1、PDZ和/或NS1/PDZ相互作用的抑制剂、活性剂或者其片段。可以操纵腺病毒使其编码和表达所需基因产物(例如，NS1、PDZ和/或NS1/PDZ相互作用的抑制剂或者其片段)，并且同时其在正常裂解病毒生活周期中的复制能力被灭活。无需将病毒DNA整合入宿主细胞染色体就可以实现腺病毒表达，从而缓解了关于插入突变发生的担心。此外，腺病毒作为活的伤寒疫苗已经使用很多年，具有优异的安全特征(Schwartz，A.R.等人(1974)Am.Rev.Respir.Dis.109：233-238)。最后，在许多例子中已经证明了腺病毒介导的基因转移，包括α-1-抗胰蛋白酶和CFTR转移到棉鼠的肺中(Rosenfeld，M.A.等人(1991)Science 252：431-434；Rosenfeld等人，(1992)Cell 68：143-155)。此外，试图确认腺病毒为人类癌症致病剂的广泛研究一律是阴性的(Green，M.等人(1979)PNAS USA 76：6606)。
药物组合物还能包括合适的固体或者胶体相载体或者赋形剂。这类载体或者赋形剂的实例包括但不限于碳酸钙，磷酸钙，各种糖，淀粉，纤维素衍生物，明胶，和多聚体例如聚乙二醇。
实施例
实施例1：流感A NS1蛋白具有PDZ结构域配体(PL)模体
NCBI流感资源数据库的检查显示，NS1蛋白序列具有符合结合PDZ结构域能力的特征。这类序列被命名为PDZ结构域配体或者PL。经鉴定这些流感NS1蛋白的PL模体是S/T-X-V/I/L，其中S是丝氨酸，T是苏氨酸，V是缬氨酸，I是异亮氨酸，L是亮氨酸，X是任意氨基酸。NCBI数据库747个全长人NS1序列中，572个具有该模体。NCBI数据库345个全长鸡NS1序列中，237个具有该模体。该数据概述于表3a-3e，和图1-3。该数据提供了特定NS1 PL模体在不同的动物和人类中出现的统计表述。统计分析可用于分析各种动物中发现了何种PL模体，它们如何在物种之间穿梭，以及在一些情况下，通常发现何种PL具有特定H或者N蛋白。
人PL分成5个序列组(参见表3a)：RSKI(SEQ ID NO：40)，ESEV(SEQ ID NO：2)，KSEV(SEQ ID NO：41)，RSEV(SEQ ID NO：7)，和RSKV(SEQ ID NO：8)。亚型和特定PL模体间存在着强相关性；RSKI(SEQ ID NO：40)和H3N2(93％)，ESEV(SEQ ID NO：2)和H5N1(100％)，KSEV(SEQ ID NO：41)和H1N1(100％，尽管数量少)，RSEV(SEQ IDNO：7)和H3N2(98％)，以及RSKV(SEQ ID NO：8)和H3N2(95％)。
鸡PL分成5个序列组(参见表3b)：ESEI(SEQ ID NO：3)，ESEV(SEQ ID NO：2)，GSEV(SEQ ID NO：6)，ESKV(SEQ ID NO：4)和GSKV(SEQ ID NO：10)。亚型或亚型组与特定PL模体间存在着强相关性；ESEI(SEQ ID NO：3)和H7N2(90％)，ESEV(SEQ ID NO：2)和H5N1(64％)，ESKV(SEQ ID NO：4)和H5N2(84％)以及GSKV(SEQ ID NO：10)和H5N2(100％-但数量稍小)。如果汇总需通报的禽流感或者H5和H7，ESEI(SEQ ID NO：3)与NAI 100％相关，ESEV(SEQ ID NO：2)与NAI 83％相关。
鸭PL分成3个序列组(参见表3c)。猪PL分成7个序列组(参见表3d)。马PL分成1个序列组(参见表3e)。
NS1PL序列与HN分亚型的非随机组合表明了通过NS1 PL分型鉴定HN亚型的方法。PDZ结合模式可用于区分不同的PL序列，并作为流感分亚型的基础。
表3a-e
表3a：人NS1 PL 572 PL/747分离物
Figure A20068003203401161
表3b：鸡NS1 PL 237 PL/345分离物
表3c：鸭NS1 PL 72 PL/110分离物
Figure A20068003203401171
表3d：猪NS1 PL 31 PL/109分离物
Figure A20068003203401172
表3e：马NS1 PL 3PL/21分离物
Figure A20068003203401181
检查3个代表性的PL序列基团，ESEV(SEQ ID NO：2)、EPEV(SEQ ID NO：27)和RSKV(SEQ ID NO：8)，揭示了PL可能的起源。ESEV(SEQ ID NO：2)首先出现在禽类分离物中，直到2003年才进入人类和哺乳动物宿主(参见图1)。EPEV(SEQ ID NO：27)首先出现在马分离物中，在1997年进入人类、禽类和其他哺乳动物宿主(参见图2)。RSKV(SEQ ID NO：8)首先出现在人类分离物中，直到1997年才进入其他物种，具体是猪(参见图3)。这类分析对评价流行性感冒的物种起源可以是非常重要的。
上述分析证明了一种检测流感病毒NS1多肽存在的新方法，它利用了对流感A特异和特定亚型特异的PL模体。特定PL的鉴定是鉴定样本存在何种流感病毒株的方法。
实施例2：PDZ分析
本实施例描述PDZ蛋白与不同流感A PL模体的结合。利用改良ELISA评定PDZ蛋白。简单来说，产生GST-PDZ融合，其包含PDZ蛋白的完整PDZ结构域。此外，合成对应于不同流感A株NS1蛋白的C端20个氨基酸的生物素化的肽，并利用HPLC纯化。这些实体之间的结合通过“G”分析检测，这是一种比色分析，利用抗生物素蛋白-HRP结合生物素和过氧化物酶底物。来自特定流感株的NS1蛋白的序列如SEQ ID NOS：42-47所显示。
检测NS1PL(或者就H5N1A来说是C末端)与人PDZ蛋白的结合，利用(i)选择模拟流感A H5N1、H1N1和H3N2株中某些NS1PL(或者C末端)序列的生物素化的合成20-mer肽；和，(ii)重组系统中合成基因编码的重组NS1蛋白，即，表达系统中合成NS1 DNA并与编码MBP免疫化学标签的序列融合(麦芽糖结合蛋白；NEB；根据厂商的说明书产生)。
在人类基因组中所有不同PDZ结构域的几乎全套(255)组成的阵列形式中检测基质graphPeptides和蛋白。每个PDZ结构域多肽都可以在商品化的谷胱甘肽S-转移酶标签的表达系统中表达为重组GST-PDZ多肽。利用链霉亲和素-HRP和TMB底物，检测生物素化的PL肽与PDZ结构域多肽的特异结合。同样地，利用生物素化的抗MBP、链霉亲和素-HRP和TMB底物，可显示NS1-MBP融合蛋白与PDZ结构域多肽的特异结合。分析结合的相对强度，显示每个PL的强和弱结合剂。当用于捕获或者鉴定PL蛋白时，优选结合更强的PDZ蛋白。但是对于利用PDZ蛋白与不同PL蛋白差异结合的试验，弱结合PDZ蛋白仍然可能是有用的。结果如下：检测来自A/Taiwan/1996Ac.#AAC14269株的MBP.NS1 H1N1(RSEV)PL(SEQ ID NO：42)与多种PDZ蛋白的结合。发现下列PDZ蛋白结合强：Rho-Gap 10，Syntrophin 1α，外膜，Magi2 d3，Magi1 d4，Tip43 d1，Magi1 d1，Tip 1，PSD95 d1，2，3，PTPL1 d2，PSD95 d2，INADL d8，DLG1 d1，2，Vartul d2，PSD95 d1，Magi1 3 d1，DLG1 d2.Mast2 d1，NeDLG d1，2，SNPC 11a，DLG2d2。发现下列PDZ蛋白结合弱：Magi3 d2，PTN3 d1，DLG2 d1.在利用直接结合夹心分析的滴定研究中，发现PSD95 d1，2，3结合的EC50为1.29μg/ml，外膜蛋白结合的EC50为1.25μg/ml.。其他测定结果显示于4a。
表4a：滴定EC50：MBP.NS1 H1N1(RSEV-SEQ ID NO：7)
Figure A20068003203401191
检测来自A/New York/31/2004 Ac.# AAX56415株的MBP.NS1H3N2(RSKV)PL(SEQ ID NO：43)与多种PDZ蛋白的结合。发现下列PDZ蛋白结合强：外膜，PSD95 d1，2，3，INADL d8，DLG1 d1，2，Grip 1d4，Shank 1，GoRaspl d1，Sim GoRasp65，Syntenin d2，NeDLG d3，FLJ12615，KIAA0967，PTN3 d1，DLG2 d1，NeDLG1，d1，2，DLG2 d2，mastl d1，Kiaal719d4，Kiaal415 d1，和Pick1 FL。发现下列结合弱：Shank 2，NumbBP d3，psd95 d1，2，3，和Mast2d1。在利用直接结合夹心分析的滴定研究中，发现PSD95 d1，2，3结合的EC50为25.3μg/ml，发现INADL结合的EC50为0.869μg/ml。其它测定结果显示于表4b。
表4b：滴定EC50：MBP.NS1 H3N2(RSKV-SEQ ID NO：8)
Figure A20068003203401201
检测来自A/Hong Kong/97/1998 Ac.#AAK49317株的MBP.NS1H5N1A(EPEV)PL(SEQ ID NO：44)与多种PDZ蛋白的结合。发现下列PDZ蛋白结合强：ALP，PSD95 d1，和PICK FL。发现下列结合弱：INADL d8，NeDLG d1，2，和KIAA1719 d4。在利用直接结合夹心分析的滴定研究中，发现外膜蛋白结合的EC50为12.55μg/ml，发现PSD95d1，2，3结合的EC50为15.76μg/ml。其它测定结果显示于表4c。
表4c：滴定EC50：MBP.NS1 H5N1 A(EPEV-SEQ ID NO：27)
Figure A20068003203401202
检测来自A/Viet nam/1194/2004 Ac.#AAT73394株的MBP.NS1H5N1B(ESEV)PL(SEQ ID NO：45)与不同PDZ蛋白的结合。发现下列DZ蛋白结合强：DLG1 d1，2，LIM mystique d1，DLG2d3，Vartul d2，PSD95 d1，Magi3 d1，DLG1 d2，PTN-3 d1，DLG2 d1，NeDLG1 d1，2，Magi2 d5，DLG2 d2，和PSD95 d3 CS Bound，Magi2 d1，DLG1 d1，RhoGap10，外膜，Magi1 d4，Tip 43，Tip1 d1，PSD95 d1，2，3，Tip33 d1，PSD95 d2。发现下列结合弱：SIP1 d2，Lim RiL，mint3d2，ALP1，PSD95 d3，SEMCAP 3 d1，LIMK 1，Kiaa0613，Syntrophin γ1，Magi2 d6，Mast2d1，Magi1 d5，INADL d3，Magi3d2，syntrophin 1α，magi2 d3，par3L d2，Magi1 d1，Kiaal719 d5，Vartul d1，和PTPL1 d1。在利用直接结合夹心分析的滴定研究中，发现PSD95d1，2，3结合的EC50为0.29μg/ml，发现外膜蛋白结合的EC50为0.18μg/ml。其它测量结果显示于表4d(ND表示未进行)。
表4d：滴定EC50：MBP.NS1 H5N1B(ESEV-SEQ ID NO：2)
Figure A20068003203401211
检测来自A/duck/ST/4003/2003 Ac.#AAF02349/6048830株的肽1958H5N1A(EPEV)PL(SEQ ID NO：46)与不同PDZ蛋白的结合。发现下列DZ蛋白结合弱：MAST2d1，PSD95 d1，2，3，和PSD95 d2。在利用直接结合夹心分析的滴定研究中，发现PSD95d2结合的EC50为3.8μg/ml，发现PSD95 d1，2，3结合的EC50为4.1μg/ml。其它测定结果显示于表4e。
表4e滴定EC50：1958 H5N1A肽(EPEV-SEQ ID NO：27)
Figure A20068003203401221
检测来自A/chicken/Hong Kong/915/1997 Ac.#AAT73457/50296374株的肽1959H5N1B(ESEV)PL(SEQ ID NO：47)与不同PDZ蛋白的结合。
符合碰撞分类(hit classification)特定标准的PDZ汇总于基质碰撞列表(Matrix Hits List)的表4a-e，显示相互作用的相对强度。为了按碰撞(hit)分类，NS1-PDZ相互作用的OD必须大于平均背景的两倍，并且它必须在至少两个样本中符合碰撞。分类为“弱”的碰撞具有小于0.5的OD，分类为“强”的碰撞具有大于0.5的OD。
利用如上所述的用于基质分析的相同检测系统进行肽和融合蛋白滴定。基质碰撞列表用于确定何种PDZ与NS1滴定来测定相互作用的强度。上面显示了每种检测的特定PL的滴定结果。列出了滴定NS1-PDZ相互作用计算出的EC50s。下面提供使用的特定分析和方法。
A.肽纯化
代表不同流感A NS1蛋白C端20个氨基酸的肽，通过标准FMOC化学方法合成，如果不用作未标记的竞争性试剂，则将其生物素化。利用大小为10*25mm，5um的Vydac 218TP Cl 8反相柱，通过反相高效液相色谱法(HPLC)纯化肽。大约40mg的肽溶于2.0mL 49.9％乙腈和0.1％三氟乙酸(TFA)的水溶液中。然后通过25微米注射过滤器(Millipore)将该溶液注入HPLC设备。用于获得好的分离的缓冲液是(A)含有0.1％TFA的蒸馏水和(B)含有乙腈的0.1％TFA。分离是基于肽的性质发生的。总体上疏水性的肽比亲水性的肽更晚洗脱。收集包含“纯”肽的级份，利用质谱仪(MS)核查。纯化的肽进行冻干以保持稳定和以后使用。
B.鉴定肽和融合蛋白试剂和材料之间相互作用的“G”分析：
·Nunc Polysorp 96孔酶标板(Nunc cat#62409-005)
(Maxisorp板显示有较高的背景信号)
·PBS pH 7.4(Gibco BRL cat#1 6777-148)或者(AVC磷酸盐缓冲盐水，8g NaCl，0.29g KCl，1.44g Na2HPO4，0.24g KH2PO4，加H2O到1L和pH 7.4；0.2μm过滤
·2％BSA/PBS(10g牛血清白蛋白，级份V(ICN Biomedicalscat#IC15142983)溶于500ml PBS
·山羊抗-GST mAb储存液5mg/ml，4℃保存，(AmershamPharmacia cat#27-4577-01)，PBS1∶1000稀释，终浓度5μg/ml
·HRP-链霉亲和素，2.5mg/2ml储存液4℃保存(Zymedcat#43-4323)，2％BSA1∶2000稀释，终浓度0.5μg/ml
·洗涤缓冲液，0.2％Tween 20溶于50mM Tris pH 8.0
·即用TMB(Dako cat#S 1600)
·1M H2SO4
·12w多道移液器，
·50ml试剂库，
·15ml聚丙烯锥形管
方案
1)用100μl 5μg/ml山羊抗GST包被板，在4℃ O/N
2)倒出包被抗体，轻拍干
3)封闭-每孔添加200μl 2％BSA，4℃ 2小时
4)在2％BSA中准备蛋白
(每排或者每两列2ml)
5)用冷的PBS洗涤3次(在整个实验中必须是冷的)(洗涤最后在孔中残留PBS直到立即添加下一步)
6)在冰上每孔添加50μl蛋白(4℃ 1-2小时)
7)在2％BSA中准备肽(2ml/排或者/列)
8)用冷的PBS洗涤3次
9)在冰上每孔添加50μl肽(开始时间/结束时间)
a.在添加最后一次肽后在冰上放置恰好10分钟
b.在室温放置恰好20分钟
10)准备12ml/板的HRP-链霉亲和素(在2％BSA中1∶2000稀释)
11)用冷的PBS洗涤3次
12)在冰上每孔添加100μl HRP-链霉亲和素，4℃ 20分钟
13)打开读板器，准备文件
14)洗涤5次，避免起泡
15)用手套，每孔添加100μl TMB底物。
a.在室温下暗处孵育
b.定期检查板(5，10&20分钟)
c.如果需要，在650nm(蓝色)读取早期读数
d.在20分钟时，用100μl 1M H2SO4终止反应
e.在450nm(黄色)读取最终读数
实施例3：NS1蛋白在人临床样本中的表达
检查人鼻分泌物中流感A NS1的存在和量。收集人鼻抽吸物，-80℃保存于M4病毒转移培养基(Remel，Inc，Lenexa，KS)中。解冻保存的材料，在10％SDS-PAGE上电泳。用NS1，3H3和1A10的单克隆抗体(Arbor Vita Corporation，s Sunnyvale，Ca)进行Western印迹分析。6个样本的结果显示于图4。该结果显示NS1在鼻分泌物中大量存在。
为了研究感染流感A病毒的细胞产生和分泌NS1的时间线，MDCK细胞在0.1的MOI下被人流感A/PR/8感染。收集上清液以及细胞，在1％Triton X-100中裂解，利用对NS1泛反应性的单克隆抗体3H3进行SDS-PAGE和Western分析。感染后24小时内在感染细胞中检测到NS1，48小时内在感染细胞的上清中检测到NS1(参见图5)。这表明基于NS1的诊断也许能在48小时内和可能24小时内检测流感A造成的感染。
实施例4：细胞中NS1与PDZ的相互作用
为验证细胞中NS1与PDZ蛋白的相互作用，进行一系列PDZ牵出(pull-down)实验。用包含HA-NS1-H5N1B的质粒或者用HA-NS1-H3N2转染293HEK细胞。按照此处所述制备裂解产物。制备谷胱甘肽-琼脂糖凝胶-PDZ珠(10ugDLG1d1，2，10ug NeDLGd1，2，和10ug PSD95d1，2，3)，用于牵出(pulldown)来自转染的293ET细胞的150ug裂解产物，如图6和7所示。在4℃过夜孵育并用HNTG缓冲液多次洗涤后，用牵出物制备膜。该膜用F63-3G1上清(1∶5)探测。全部3个检测的PDZs成功地从表达HA-H5N1B的细胞中牵出NS1(参见图6)。
类似地，制备谷胱甘肽-琼脂糖凝胶-PDZ珠(40ug INADLd8)，用于牵出转染H3N2的293ET细胞的150ug裂解产物。在4℃过夜孵育和用PBS多次洗涤后，准备Western印迹，用a-HA(1∶500)(Roche)检测。INADL d8成功地从细胞裂解产物中牵出HA-H3N2NS1(图7)。
结论是如基质(MATRIX)分析所确定，NS1 PL在细胞内是有功能的，它可以与PDZ结构域相互作用。
实施例5：NS1的单克隆抗体
制备与NS1蛋白亚型、NS1 PL类特异结合和具有泛特异性的单克隆抗体。产生NS1单克隆抗体的策略如下，结果显示于表5、6和7：
1.制备用于表5汇总的亚型的NS1的GST和MBP融合蛋白。克隆载体获自Pharmacia(GST)或者New England Biolabs(MBP)。通过DNA 2.0(Menlo Park，Ca)利用重叠寡核苷酸合成NS1编码区。
2.用MBP-NS1融合蛋白免疫小鼠，剂量范围是每剂量10-100ug，开始在CFA中，然后是在IFA和PBS中。
3.根据Kohler和Milstein所述(Nature 1975)，在用相应GST-NS1融合蛋白最后一次加强免疫后3天，收集脾细胞和淋巴细胞，并与FOX-NY骨髓瘤细胞融合。
4.首先在ELISA(参见表5-7的直接ELISA)中用MBP-NS1筛选杂交瘤。克隆阳性孔，用一组MBP和GST NS1再筛选，并将其分为泛反应性的或者亚型活性的
5.利用Western印迹进一步筛选，证实符合NS1的靶蛋白的分子量。
6.利用S2分析形式(参见实施例4)进行另外的筛选，用于与PDZ捕获的相容性(参见表5-7的S2 ELISA)。
7.用细胞裂解产物形式的真核表达NS1重复步骤5和6。
8.检查抗体对实施例6所述侧向流形式的相容性。
9.最后，检查抗体检测临床样本中NS1的能力。
该工作流程对获得识别人临床样本的抗体是关键的。
表5
Figure A20068003203401271
表5(续)
表6
Figure A20068003203401291
表7
Figure A20068003203401292
实施例6：侧向流
图8，9和11提供用于NS1检测的侧向流形式的实施例。图8提供一种侧向流，利用PDZ捕获继之以单克隆抗体检测。对所有情况，利用提条器(striper)将重组PDZ结构域蛋白或者抗体沉积在RF120Millipore膜上。对图8，PDZ蛋白PSD95D1-3，和INADL D8沉积浓度为0.5mg/ml。还沉积对照条带，其由山羊抗小鼠抗体(GAM)组成，浓度也为0.5mg/ml。NS1蛋白与100ul体积溶于TBS-T缓冲液的金交联单克隆的抗NS1例如4B2结合。使用的NS1蛋白来自H1N1，H3N2，H5N197，H5N1，而对照道(control lane)不包含NS1。在所有情况下，稀释人鼻抽吸物并保存于盐水或者M4，按指示。样本与如下所述量的金交联抗体直接混合。
将PDZ条膜插入NS1/抗NS1蛋白溶液，流动起始于毛细管作用和导湿垫。根据PDZ反应性模式对NS1进行分型H1N1与PSD95和INADL d8均结合；H3N2只结合INADL d8；H5N1只结合PSD95。利用与PDZ的反应性和用金交联的泛反应性抗NS1单克隆抗体，根据NS1侧向流的结果进行流感A分型。
在图9中，13种不同的单克隆抗体沉积在侧向流装置中。这13种使用的抗体是F64-1 AO，F64-3H3，F64-6G12，F64-7A8，F64-7D1，F68-1D10，F68-4B2，F68-4H9，F68-6A12，F68-6B7，F68-6D6，F68-7B10。向包含H1N1流感病毒的样本中添加亚型特异的金交联泛NS1抗体。将样本加入侧向流装置，结果显示于图9。该结果显示，泛特异抗体可以用于鉴定何种抗体与H1N1结合最好的试验和测定。利用下列符号定量结合强度：(-)是指没有结合，(+)是指弱结合，(+++)是指强结合和(++)是指中等结合。
在膜上沉积泛特异抗体，产生鉴定患者样本中致病性流感A的侧向流试验。患者样本与金标记抗体的混合物混合，所述抗体识别全部NS1 PL。样本加入侧向流测试条，如果存在流感A的致病株，条上将形成一条线。
利用下列方案和材料进行条测试检验：使用的材料包括：之前用山羊抗小鼠/PSD95 d1，2，3/INADL d8涂条的测试条；TBST/2％BSA/0.25％Tween 20缓冲液；NS1蛋白MBP-H1N1、MBP-H3N2、MBP-H5N1 A、和MBP-H5N1B″旧″(Jon′s)快速金交联F68-4B2抗体的储存液；和Maxisorp ELISA板。按如下步骤进行：
1.)NS1蛋白储存液在TBST/2％BSA/0.25％Tween 20中稀释到100ng/uL(利用不少于5uL蛋白进行稀释)
2.)通过向10uL TBST/2％BSA/0.25％Tween 20中添加10uL蛋白，将100ng/uL稀释液被稀释到50ng/uL
3.)制备溶于TBST/2％BSA/0.25％Tween 20缓冲液的金交联抗体储存液。每100uL缓冲液中添加4uL抗体，准备足够6个100uL反应(这提供了额外的死体积)使用的缓冲液。
4.)ELISA板各孔中添加98uL抗体/缓冲液混合物
5.)向含有缓冲液的孔中添加2uL NS1稀释液(每孔一种NS1)
6.)一个孔中只有抗体和缓冲液作为阴性“无NS1”对照
7.)轻敲ELISA板若干次以混合孔的内含物
8.)在孔中加入预涂条(pre-striped)的测试条，在进展期间观察。在大约15分钟后(当全部液体已经被吸收，但条还未干燥时)，从孔中取出条，扫描进计算机。
图10a和10b中提供的试验按如下方式制备：GST-PSD95 d1，2，3蛋白以3mg/mL涂条在膜上用于禽类试验，或者可以使用两种单克隆抗体的混合物(1.1mg/mL F64-3H3和0.075mg/mL F68-4H9用于泛流感A试验)。1mg/mL多克隆山羊抗小鼠抗体的第二条线用于试验捕获线。下面阐明试验步骤。
1.制备具有样本膜和接收垫(sink pad)的卡片。
2.用PDZ蛋白和/或抗体对膜涂条(参见上面对浓缩的说明)
3.膜在56度干燥过夜，然后将卡片切成4.26mm宽的条。
4.将玻璃纤维样本垫与条的底部连接，将完整的条放置于盒内用于测试。
5.解冻待测样本，添加80μl样本到20μl缓冲液中。上下抽吸若干次进行混合。
6.在样本/缓冲溶液中掺加8μl金交联(Au-)检测体混合物。该检测体混合物是4μl Au-F68-4B2和4μl Au-F68-3D5。上下抽吸若干次进行混合。
7.在盒的样本孔中添加100μl制备的样本。
8.在样本添加后15分钟读取盒上的试验和对照线。对于任何读数可信的试验结果，对照线都是清晰可见的。流感A阳性样本标注为(+)。流感A阴性样本标注为(-)。上箭头(top arrow)指向对照，下箭头(bottom arrow)指向测试。在两种情况下，顶部线是对照线(山羊抗小鼠mAb)，下面第二条线是测试线(用于泛流感A试验的F64-3H3和F68-4H9mAbs的混合物以及用于禽类试验的PSD95 d1，2，3)。对禽类试验检测2ng H5N1蛋白。底部环状斑点是样本孔。在图10a中，两个试验都是阳性的。
图10c显示用图10a和10b所示形式检测的20个人样本中的3个。所述样本显示各种结果，例如，样本1对流感A是阳性的，但对禽流感A是阴性的，样本14对两者都是阴性的。图10d显示对H1N1，H3N2，和H5N1重组蛋白相同的试验。泛FluA试验对这三个都是阳性的。禽流感试验只对H5N1是阳性的。在图10e中，金交联PDZ用作检测体，而单个或者多个mAb用于捕获。图10e具有以含有F68-4B2 mAb捕获剂的Au-PSD95 d1，2，3形式添加的液体金(liquid gold)。1.7ng NS1 H5N1蛋白检测阳性。这是禽流感特异性试验。
在图10f中，使用干金(dried gold)方法。卡片的制备与液体金方案相同，除了在进行任何涂条前样本垫被固定到卡片上。当捕获剂被涂下条后，在卡片底部的样本垫上喷射金交联检测体混合物(其这时还包含偶联稀释剂)。卡片被干燥，切割，并像液体试验一样放入盒中。当制备人样本时，在100μl人样本在盒中进行反应时，它们只用缓冲溶液处理(不添加其他的金交联检测体混合物)。流感A阳性样本标注为(+)，流感A阴性样本标注为(-)。这些盒的设计和读数与液体金盒一样。在图10f中，样本7和9对流感A和禽流感都是阳性的，样本12对流感A和禽流感都是阴性的。
实施例7：PDZ/PDZ配体相互作用的抑制剂
在该实施例中，选择化合物分析其作为PDZ/PDZ配体相互作用的抑制剂。对于挑选的PDZ/PL对，筛选了下列23种药物(1-17号是COX抑制剂)。1.氟尼酸，2.布洛芬，3.奈普生钠，4.双氯芬酸钠盐，5.乙酰水杨酸，6.水杨酸，7.氟吡洛芬，8.舒林酸硫醚，9.舒林酸，10.依托度酸，11.吲哚美辛，12.酮咯酸氨丁三醇盐，13.酮基布洛芬，14.甲芬那酸，15.卡洛芬，16.巴氯芬，17.菲诺洛芬，18.甲磺酰苯扎托品，19.盐酸阿米替林，20.色甘酸钠，21.盐酸去甲丙咪嗪，22.盐酸氯丙咪嗪，和23.盐酸去甲替林。在下面的说明中，A部分提供利用COX抑制剂进行的实验，B部分提供利用小分子抑制剂进行的实验，C部分提供利用肽抑制剂进行的实验。表8提供A-C部分中用于鉴定抑制剂的PDZ/PL相互作用。使用的PL序列是SEQ IDNOS：54-59。结果显示于表1-13。
表8：用于药物筛选的PDZ/PL相互作用
Figure A20068003203401341
A.根据以下两个标准选择COX抑制剂：1.存在好在PDZ的零位发生相互作用的羰酸基团，和2.可以位于PDZ零位的羰酸基团附近的疏水性或者芳香族基团。疏水性或者芳香族基团不是绝对必需的，但是优选的。
浓度为250uM药物浓度的COX分子在基质/阵列竞争性分析形式中接受筛选，即，该分析中在前面描述的小分子竞争物存在或者缺失的条件下，测定配体与融合蛋白中固相PDZ结构域的对接(docking)。结果如下。舒林酸硫醚抑制Magi1 d1/AVC1857。菲诺洛芬抑制PSD95d1/AVC1912相互作用。分析中没有任何药物显著抑制PSD95d2/AVCAA345相互作用。菲诺洛芬抑制PSD95 d2/AVCAA348相互作用。菲诺洛芬抑制PSD95 d3/AVC1916相互作用。菲诺洛芬抑制SHANK1/AVC1965相互作用。舒林酸硫醚抑制TIP1/AVCAA56相互作用。其他药物在该分析中未显示显著的抑制。两个主要小分子碰撞是舒林酸硫醚和苯氧苯丙酸。
结果表明COX抑制剂可以用作PDZ/PDZ配体相互作用的抑制剂，这些抑制剂的衍生物可能是基于PDZ的靶标的有效治疗剂，那些被测的舒林酸硫醚和菲诺洛芬显示出最强的抑制作用。
B.根据分子模型预测PDZ/PDZ配体相互作用的小分子抑制剂。利用Accelrys software(Accelrys，San Diego，CA)的in silico筛选构建模型，和用4种不同PDZ结构域模拟物对接(dock)650,000分子文库(ChemDiv，San Diego，CA；Blanca Pharmaceuticals，Mountain View，CA)。该分子模型基于发现的化合物具有通过静电、氢键键合和疏水性相互作用与PDZ相互作用的能力。
从in silico筛选得到的最佳碰撞用于在基质/阵列竞争性分析形式中接受筛选，即，该分析中在别处描述的小分子竞争物存在或者缺失的条件下，测定配体与融合蛋白中固相PDZ结构域的对接(docking)。表9列出了筛选的抑制PDZ/PDZ配体相互作用的小分子。可以参考本领域技术人员任何已知的小分子公共数据库，获得待测小分子抑制剂的化学结构和化学式。小分子抑制剂的其他实施例可见于美国临时申请ARBV：002USP1，标题为“Small Molecule Inhibitors of PDZInteractions”，________提交，在此完整引入作为参考。用于筛选的小分子浓度是～250uM。这些筛选的结果显示于表10。
表9 250uM小分子浓度下，药物筛选中用于碰撞的碰撞相对强度
Figure A20068003203401361
表10
Figure A20068003203401371
参考总结结果的表10和11，根据分析的OD(450)读数，小分子被认为是碰撞弱、中或者强：弱碰撞：OD相对于对照降低＞40％，中碰撞：OD相对于对照降低～40-60％，强碰撞：OD降低＞40％。
在该后来分析中最好的碰撞然后进行滴定结合研究，即，在相同竞争性分析中滴定小分子进行估算，IC50值和结果总结于表10。
根据in silico筛选，鉴定出PDZ/PL相互作用的不同小分子抑制剂。这些分子可用于阻断治疗值的PDZ/PL相互作用，包括流感ANS1/PDZ相互作用。
C.鉴定和检测肽治疗抑制剂(参见表11)。每个包含PL(H5N1，H3N2和H1N1)的流感A NS1蛋白类型具有与若干种PDZs相互作用的潜力。这些PDZ的每一个本身可能就是抗有关流感A株的潜在治疗靶标，这样的话，用肽阻断PDZ可能具有治疗功用。为了鉴定潜在的治疗肽，搜索AVC专利数据库寻找每个PDZ的PDZ配体。AVC数据库包含PL/PDZ相互作用，这是基于经先前描述的专利ELISA试验(G分析)鉴定的。用于鉴定有希望的PL的标准基于下列3个标准：1)OD(450nm)＞＝0.5，2)测定的相对标准偏差＜0.25，3)肽浓度＝＜20微摩尔。
根据PDZ/PL结合相互作用、结构和结合数据的数据库，鉴定C端序列最可能与根据PSD95 d2结构和结合数据的PSD95 d2结构(SEQID NO：1，例如)结合。因此，禽流感A(H5N1)优选的肽治疗抑制剂基于结合PSD95 d2的肽和，与符合共有序列：E/D/N/Q-S/T-D/E/Q/N-V/L(SEQ ID NO：48)的PSD95 d2结合的最佳和优选的肽序列。
利用这些共有序列，以下是用作结合PSD95d2结构域的肽抑制剂优选C端序列的实例：
1)ESDV(SEQ ID NO：49)
2)ESEV(SEQ ID NO：2)
3)ETDV(SEQ ID NO：50)
4)ETEV(SEQ ID NO：51)
5)DTDV(SEQ ID NO：52)
6)DTEV(SEQ ID NO：53)
7)DSDV(SEQ ID NO：996)
8)DSEV(SEQ ID NO：997)
针对各PDZ的潜在PDZ配体治疗肽汇总于表11。表11在第一列显示PL肽标识符(AVC ID)，第二列显示PL肽名称(源自作为其来源的蛋白)，第三列显示肽序列，最后一列显示序列识别号。表的每个部分包含一个题头，表明PLs将结合的PDZ蛋白。表11所示的肽或者其保留C端PL的截短型是适于治疗流感的试剂。阻断致病性流感PL与PDZ结合的PL肽治疗剂可用于治疗致病性流感。例如，通过将转运蛋白肽(蛋白转导结构域)连接到该肽序列的N端，这些肽(SEQ IDNOS：89-987)中每个肽的C端序列(长3到20个氨基酸)可以转变成治疗剂。具有C端保守的3个氨基酸的至少长5个氨基酸的这些肽的亚片段被用作表11所列各PDZ的病毒PL/PDZ相互作用的治疗抑制剂，优选，至少6个氨基酸长，7个氨基酸长，8个氨基酸长，9个氨基酸长，和10个氨基酸长。优选至少C端4个氨基酸是保守的，更优选，C端5个氨基酸是保守的，C端6个氨基酸，或者C端7个氨基酸。肽治疗剂还包括包含肽模拟物中氨基酸保守取代的肽。但是，优选保守取代位于除了最后3或者4个氨基酸以外的区域中。使用若干种转运蛋白肽序列，包括Tat和触足蛋白。利用实施例2描述的A或者G PDZ分析，鉴定那些抑制PDZ/PL相互作用的肽，对所述肽进行进一步分析。对那些被证明具有抑制作用的肽在体外和流感动物模型中进行进一步研究。
实施例8：与毒性相关的NS2模体
在前面部分，NS1 PL模体，ESEV(SEQ ID no：2)，与禽亚型H5N1中所见的高度毒性/致死表型有关。因为NS1的PL部分与NS2重叠，分析了禽PL保守性对重叠区中NS2序列的影响。NS1和NS2对重叠区使用不同的读码框，这对可以使用的密码子的选择构成了限制。所述分析确认，该区域的序列变化改变了NS1而不是NS2的蛋白序列(参见表12和13一在表12中STYPE是指病毒的亚型)。具体地，在H5N1中，PL序列ESEV(SEQ ID NO：2)，EPEV(SEQ ID NO：27)和ESKV(SEQID NO：4)不改变NS2的蛋白序列，在NS2的70位保持丝氨酸(S或者Ser)。相反，良性亚型例如H3N2包含导致70位为甘氨酸的核苷酸序列。这种情况的唯一例外是导致1918年致命大流行病的1918株H1N1，其表达PL，KSEV(SEQ ID NO：41)，这导致与H5N1株一样的70位丝氨酸。表12所示的NS1 PL序列是ESEV(SEQ ID NO：2)，EPEV(SEQID NO：27)，ESKV(SEQ ID NO：4)，RSKV(SEQ ID NO：8)，KSEV(SEQID NO：41)，和RSEV(SEQ ID NO：7)，在表中鉴别NS1 C端编码区域的SEQ ID NO与NS2区域的SEQ ID NO相同s(参见表12和13)。因此，流感A病毒NS2蛋白中70位的丝氨酸与病毒的毒性相关。因而，70位丝氨酸可以用作高毒性的标记物，而NS2中70位甘氨酸可以用作更良性的临床病程的标记物。下文中NS270位的变化被用作诊断标记物和治疗靶标。丝氨酸取代允许该序列被磷酸化，可能被激酶调控。
表12/S70与高毒性临床病程相关
Figure A20068003203401401
用作诊断标记物
从表现流感A症状的患者中提取粘液样本。该样本经过处理使其更具流动性以便用于侧向流形式。利用实施例6中提出的方案产生侧向流形式，除了用一种核酸鉴定捕获剂来捕获样本中存在的任何包含70位丝氨酸的NS2，所述核酸与包括重叠区并包含来自表12的NS2蛋白中的丝氨酸70的序列互补。所述捕获剂包括与所有已知的毒性流感A株互补的核酸。阳性结果表明患者应该接受针对流感A病毒高毒性形式的治疗。
表13/S70与高毒性临床病程相关
基于单克隆抗体的试验是相似的，除了一系列特异识别包括来自表12丝氨酸70的重叠区的抗体被用作捕获剂。
用于治疗剂设计使用阻断NS2和靶标之间相互作用的治疗剂。具体地，治疗剂阻断NS2蛋白在70位丝氨酸处的结合。给已经感染流感A的患者或者在感染前施用肽或者小分子治疗剂，给药量足以阻断NS2和其靶标之间的相互作用。通过吸入给药，继续治疗直到患者症状消失和/或患者不再有感染疾病的危险。
本说明书引用的全部出版物和专利在此引入作为参考，就如各个独立出版物或者专利是具体和单独地表明引入作为参考。通过GID或者检索号引用的Genbank记录，尤其是任何多肽序列、多核苷酸序列或者其注释在此引入作为参考。任何出版物的引用是因为其公开在提交日期前，不应被认为是承认因为先前的发明，本发明不享有居先于这类出版物的权利。
尽管本发已经明参考其特定实施例进行了描述，但本领域技术人员应当了解，可以做出各种改变和等同替换，而不脱离本发明的真实精神和范围。此外，可以做出许多改进以使特定情况、材料、物质的组成、方法、工序或者步骤适应本发明的目标、精神和范围。所有这类改进认为是在此处所附权利要求的范围内。本说明书中提及的全部出版物和专利申请在此相同程度引入作为参考，就如各个独立出版物或者专利申请是具体和单独地指出用来引入作为参考。
表11：结合DLG2 d1的PL序列
Figure A20068003203401431
表11续：结合GORASP d1的PL序列
  AVC ID   肽   序列   SeqID.No.
  1927   X＝L-苯基甘氨酸
  1754   核衣壳，SARS   DFSRQLQNSMSGASADSTQA   89
  1820   TRPM7   KKKKQPGNSTKESESTNSVRLML   90
  1750   M蛋白，SARS   NYKLNTDHAGSNDNIALLVQ   91
  AA70.1   HPV E6#18   SGGNRARQERLQRRRETQV   92
  1795   Tat-A2A肾上腺素能受体   YGRKKRRQRRRARGDRKRIV   93
  1791   Tat-MUC1 Ile-2   YGRKKRRQRRRAVAATSINL   94
  1940   Tat-CLCA-3(鼠)   YGRKKRRQRRREMQVTLGLH   95
  1775   Tat-N-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRGASADSTQA   96
1947 Tat-hCLCA1 YGRKKRRQRRRIGELQLSIA 97
  1922   X＝L-α-氨基丁酸   YGRKKRRQRRRKLSSIESDX   98
  1777   Tat-M-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRNDNIALLVQ   99
  1789   Tat-ERC1b   YGRKKRRQRRRQDEEEGIWA   100
  1776   Tat-E-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRSEGVPDLLV   101
  1752   E蛋白，SARS   YVYSRVKNLNSSEGVPDLLV   102
表11续：结合GRIP1 d4的PL序列
表11续：结合INADL d8的PL序列
表11续：结合INADL d8的PL序列(续)
Figure A20068003203401471
表11续：结合KIAA1284 d1的PL序列
Figure A20068003203401481
表11续：结合KIAA1284 d1的PL序列
  AVC ID   肽   序列   Seq.IDNo.
  AA05.1   CD4(修饰的)   LSEKKTSQSPHRFQKTASPI   182
  AA227   密蛋白2   PGQPPKVKSEFNSYSLTGYV   183
  AA140   KIAA 1481   PIPAGGCTFSGIFPTLTSPL   184
  AA244   α-2B肾上腺素能受体   QDFRRAFRRILARPWTQTAW   185
  AA240   多巴胺转运蛋白   RELVDRGEVRQFTLRHWLKV   186
  AA23.3   Fas配体   SSKSKSSEESQTFFGLYKL   187
  AA228   柄蛋白2   SSPDSSYQGKGFVMSRAMYV   188
  AA200L   HER2受体   TFKGTPTAENPEYLGLDVPV   189
  AA33   KV1.3   TTNNNPNSAVNIKKIFTDV   190
  AA114   GLUR7(代谢型谷氨酸受体)   VDPNSPAAKKKYVSYNNLVI   191
  AA77   HPV-E6 #63   VHKVRNKFKAKCSLCRLYII   192
  1940   Tat-CLCA-3(鼠)   YGRKKRRQRRREMQVTLGLH   193
  1775   Tat-N-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRGASADSTQA   194
  1947   Tat-hCLCA1   YGRKKRRQRRRIGELQLSIA   195
  AA348   TATNMDA2B9   YGRKKRRQRRRKLSSIESDV   196
  1922   X＝L-α-氨基丁酸   YGRKKRRQRRRKLSSIESDX   197
  1777   Tat-M-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRNDNIALLVQ   198
  1776   Tat-E-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRSEGVPDLLV   199
表11续：结合KIAA1415 d1的PL序列(续)
  AVC ID   肽   序列   Seq.IDNo.
  AA245   α-2C肾上腺素能受体   DFRPSFKHILFRRARRGFRQ   200
  AA222   密蛋白18   DGGARTEDEVQSYPSKHDYV   201
  AA248   生长激素抑制素受体4   EALQPEPGRKRIPLTRTTT F   202
  1761   FGF受体3 IIIc同工型1   FHSKTAGANTTDKELEVLSL   203
  AA220   密蛋白10   GGEDFKTTNPSKQFDKNAYV   204
  AA258   去甲肾上腺素转运蛋白   HHLVAQRDIRQFQLQHWLAI   205
  AA70   HPV-E6 #18   HSCCNRARQERLQRRRETQV   206
  AA182L   肝配蛋白B2   ILNSIQVMRAQMNQIQSVEV   207
  AA226   密蛋白7   KAGYRAPRSYPKSNSSKEYV   208
  AA327   PAR-2   KHSRKSSSYSSSSTTVKTSY   209
  1820   TRPM7   KKQPGNSTKESESTNSVRLML   210
  AA250   5-羟色胺受体3a   LAVLAYSITLVMLWSIWQYA   211
  AA225   密蛋白9   LGYSIPSRSGASGLDKRDYV   212
  AA34.2   NMDA   LNSCSNRRVYKKMPSIESDV   213
  AA227   密蛋白2   PGQPPKVKSEFNSYSLTGYV   214
  AA140   KIAA 1481   PIPAGGCTFSGIFPTLTSPL   215
  AA244   α-2B肾上腺素能受体   QDFRRAFRRILARPWTQTAW   216
  AA240   多巴胺转运蛋白   RELVDRGEVRQFTLRHWLKV   217
  AA23.3   Fas配体   SSKSKSSEESQTFFGLYKL   218
  AA228   柄蛋白2   SSPDSSYQGKGFVMSRAMYV   219
  AA124   CXCR3   SSSRRDSSWSETSEASYSGL   220
  1759   EGFR   TAENAEYLRVAPQSSEFIGA   221
  AA33   KV1.3   TTNNNPNSAVNIKKIFTDV   222
  AA114   GLUR7(代谢型谷氨酸盐R)   VDPNSPAAKKKYVSYNNLVI   223
  AA77   HPV-E6 #63   VHKVRNKFKAKCSLCRLYII   224
  1775   Tat-N-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRGASADSTQA   225
  1777   Tat-M-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRNDNIALLVQ   226
  1776   Tat-E-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRSEGVPDLLV   227
表11续：结合KIAA1719 d4的PL序列
  AVC ID   肽   序列   Seq.IDNo.
  AA222   密蛋白18   DGGARTEDEVQSYPSKHDYV   228
  1761   FGF受体3IIIc同工型1   FHSKTAGANTTDKELEVLSL   229
  AA243   α-2A肾上腺素受体   HDFRRAFKKILARGDRKRIV   230
  AA258   去甲肾上腺素转运蛋白   HHLVAQRDIRQFQLQHWLAI   231
  AA70   HPV-E6 #18   HSCCNRARQERLQRRRETQV   232
  AA226   密蛋白7   KAGYRAPRSYPKSNSSKEYV   233
  AA327   PAR-2   KHSRKSSSYSSSSTTVKTSY   234
  1820   TRPM7   KKKKQPGNSTKESESTNSVRLML   235
  AA250   5-羟色胺受体3a   LAVLAYSITLVMLWSIWQYA   236
  AA300   TRAF2   NSYVRDDAIFIKAIVDLTGL   237
  AA227   密蛋白2   PGQPPKVKSEFNSYSLTGYV   238
  AA244   α-2B肾上腺素受体   QDFRRAFRRILARPWTQTAW   239
  AA328   GPR5   SPASIPHSPGAFAYEGASFY   240
  AA23.3   Fas配体   SSKSKSSEESQTFFGLYKL   241
  AA124   CXCR3   SSSRRDSSWSETSEASYSGL   242
  AA77   HPV-E6 #63   VHKVRNKFKAKCSLCRLYII   243
  1940   Tat-CLCA-3(鼠)   YGRKKRRQRRREMQVTLGLH   244
  1777   Tat-M-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRNDNIALLVQ   245
  1912   生物素-Tat-NMDAR2 special1   YGRKKRRQRRRRISSIETDV   246
  1917   1917   YGRKKRRQRRRRISSLETQV   247
  1776   Tat-E-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRSEGVPDLLV   248
表11续：结合Lim Mystique d1的PL序列
  AVC ID   肽   序列   Seq.IDNo.
  AA72.1   HPVE633(修饰的)   AAGGRSARGGRLQGRRETAL   249
  AA115   早老蛋白-1   ATDYLVQPFMDQLAFHQFYI   250
  AA245   α-2C肾上腺素能受体   DFRPSFKHILFRRARRGFRQ   251
  AA178L   PDZ-结合激酶(PBK)   EDPKDRPSAAHIVEALETDV   252
  AA218   CSPG4(硫酸软骨素蛋白多糖4)   ELLQFCRTPNPALKNGQYWV   253
  1761   FGF受体3IIIc同工型1   FHSKTAGANTTDKELEVLSL   254
  AA346   NMDA R2B   FNGSSNGHVYEKLSSIESDV   255
  AA80.1   HPV E6#35(无半胱氨酸)   GRWTGRAMSAWKPTRRETEV   256
  AA243   α-2A肾上腺素能受体   HDFRRAFKKILARGDRKRIV   257
  AA258   去甲肾上腺素转运蛋白   HHLVAQRDIRQFQLQHWLAI   258
  AA70   HPV-E6 #18   HSCCNRARQERLQRRRETQV   259
  AA182L   肝配蛋白B2   ILNSIQVMRAQMNQIQSVEV   260
  AA327   PAR-2   KHSRKSSSYSSSSTTVKTSY   261
  1820   TRPM7   KKKKQPGNSTKESESTNSVRLML   262
  AA40   DOCK2   LASKSAEEGKQIPDSLSTDL   263
  AA250   5-羟色胺受体3a   LAVLAYSITLVMLWSIWQYA   264
  AA311   β-1联蛋白   LMDGLPPGDSNQLAWFDTDL   265
  AA34.2   NMDA   LNSCSNRRVYKKMPSIESDV   266
  AA345   NMDA R2A   LNSSSNRRVYKKMPSIESDV   267
  AA140   KIAA 1481   PIPAGGCTFSGIFPTLTSPL   268
  AA217   联蛋白-δ2   PYSELNYETSHYPASPDSWV   269
  AA244   α-2B肾上腺素能受体   QDFRRAFRRILARPWTQTAW   270
  AA56   IAX   QISPGGLEPPSEKHFRETEV   271
  AA240   多巴胺转运蛋白   RELVDRGEVRQFTLRHWLKV   272
  AA328   GPR5   SPASIPHSPGAFAYEGASFY   273
  AA23.3   Fas配体   SSKSKSSEESQTFFGLYKL   274
  AA124   CXCR3   SSSRRDSSWSETSEASYSGL   275
表11续：结合Lim Mystique d1的PL序列(续)
  AVC ID   肽   序列   Seq.IDNo.
  AA223   密蛋白1   SYPTPRPYPKPAPSSGKDYV   276
  AA200L   HER2受体   TFKGTPTAENPEYLGLDVPV   277
  AA180   NMDA谷氨酸受体2C(无半胱氨酸)   TQGFPGPATWRRISSLESEV   278
  AA114   GLUR7(代谢型谷氨酸盐受体)   VDPNSPAAKKKYVSYNNLVI   279
  AA125   紧密连合蛋白3(ZO-3)   VHDAESSDEDGYDWGPATDL   280
  AA77   HPV-E6#63   VHKVRNKFKAKCSLCRLYII   281
  AA123   a-辅肌动蛋白2   VPGALDYAAFSSALYGESDL   282
  1784   Tat-MUC1(Ala变体)   YGRKKRRQRRRAVAAASANL   283
  1763   Tat-MUC1   YGRKKRRQRRRAVAATSANL   284
  1791   Tat-MUC1 Ile-2   YGRKKRRQRRRAVAATSINL   285
  1764   Tat-HER2   YGRKKRRQRRREYLGLDVPV   286
  AA348   TATNMDA2B9   YGRKKRRQRRRKLSSIESDV   287
  1777   Tat-M-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRNDNIALLVQ   288
表11续：结合MAGI1 d1的PL序列
表11续：结合MAGI1 d1的PL序列(续)
  1861   HPV E6#45(Cys-＞Ser)   NTSSDQARQERLRRRRETQV   321
  AA227   密蛋白2   PGQPPKVKSEFNSYSLTGYV   322
  AA140   KIAA 1481   PIPAGGCTFSGIFPTLTSPL   323
  AA244   α-2B肾上腺素能受体   QDFRRAFRRILARPWTQTAW   324
  AA56   TAX   QISPGGLEPPSEKHFRETEV   325
  AA252   毒蕈碱性乙酰胆碱受体M4   QQYQQRQSVIFHKRAPEQAL   326
  AA240   多巴胺转运蛋白   RELVDRGEVRQFTLRHWLKV   327
  AA207L   Nedasin(S-型)   RNIEEVYVGGKQVVPFSSSV   328
  AA74.1   HPV E6 52(修饰的)   SEGGRPTRGPRLQGRRVTQV   32g
  AA095   GluR5-2(大鼠)   SFTSILTCHQRRTQRKETVA   330
  AA70.1   HPV E6#18   SGGNRARQERLQRRRETQV   331
  AA253   Clasp-3   SLIGPVQKEYQRELGKLSSP   332
  AA214L   ErbB-4受体   SLKPGTVLPPPPYRHRNTVV   333
  AA06   CD6   SPQPDSTDNDDYDDISAA   334
  AA23.3   Fas配体   SSKSKSSEESQTFFGLYKL   335
  AA228   柄蛋白2   SSPDSSYQGKGFVMSRAMYV   336
  AA124   CXCR3   SSSRRDSSWSETSEASYSGL   337
  AA223   密蛋白1   SYPTPRPYPKPAPSSGKDYV   338
  AA36   神经配蛋白   TFAAGFNSTGLPHSTTRV   339
  AA69.1   HPV E6#16(修饰的)   TGRGMSGGRSSRTRRETQL   340
  AA66.1   HPV E6#66(无半胱氨酸)   TGSALQAWRHTSRQATESTV   341
  AA180   NMDA谷氨酸受体2C(无半胱氨酸   TQGFPGPATWRRISSLESEV   342
  AA22   DNAM-1   TREDIYVNYPTFSRRPKTRV   343
  AA33   KV1.3   TTNNNPNSAVNIKKIFTDV   344
  AA114   GLUR7(代谢型谷氨酸盐R)   VDPNSPAAKKKYVSYNNLVI   345
  AA82   AdenoE4 typ9   VGTLLLERVIFPSVKIATLV   346
  AA77   HPV-E6 #63   VHKVRNKFKAKCSLCRLYII   347
  1862   HPV E6 #82   WTGQSANSRKPPRQRSETQV   348
  AA353   bTAT-TAX   YGRKKRRQRRREKHFRETEV   349
  1775   Tat-N-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRGASADSTQA   350
  AA348   TATNMDA2B9   YGRKKRRQRRRKLSSIESDV   351
  1777   Tat-M-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRNDNIALLVQ   352
  1912   生物素-Tat-NMDAR2 special1   YGRKKRRQRRRRISSIETDV   353
  AA25   FceRlb   YSATYSELEDPGEMsPPIDLI   354
表11续：结合MAGI2 d5的PL序列(续)
  AVC ID   肽   序列   SeqIDNo.
  AA72.1   HPV E6 33(修饰的)   AAGGRSARGGRLQGRRETAL   355
  AA115   presenilin-1   ATDYLVQPFMDQLAFHQFYI   356
  AA75.1   HPV E6 58(修饰的)   AVGGRPARGGRLQGRRQTQV   357
  AA30   LPAP   AWDDSARAAGGQGLHVTAL   358
  AA245   α-2C肾上腺素受体   DFRPSFKHILFRRARRGFRQ   359
  AA222   密蛋白18   DGGARTEDEVQSYPSKHDYV   360
  AA59   PTEN   DSDPENEPFDEDQHTQITKV   361
  AA218   CSPG4(硫酸软骨素蛋白多糖4)   ELLQFCRTPNPALKNGQYWV   362
  AA210L   APC-结肠腺瘤性息肉蛋白   ESSGTQSPKRHSGSYLVTSV   363
  1761   成纤维细胞生长因子受体3IIIc同工型1   FHSKTAGANTTDKELEVLSL   364
  AA346   NMDA R2B   FNGSSNGHVYEKLSSIESDV   365
  AA220   密蛋白10   GGEDFKTTNPSKQFDKNAYV   366
  AA80.1   HPV E6#35(无半胱氨酸)   GRWTGRAMSAWKPTRRETEV   367
  AA243   α-2A肾上腺素受体   HDFRRAFKKILARGDRKRIV   368
  AA258   去甲肾上腺素转运蛋白   HHLVAQRDIRQFQLQHWLAI   369
  AA70   HPV-E6 #18   HSCCNRARQERLQRRRETQV   370
  AA182L   柄蛋白B2   ILNSIQVMRAQMNQIQSVEV   371
  AA226   密蛋白7   KAGYRAPRSYPKSNSSKEYV   372
  AA327   PAR-2   KHSRKSSSYSSSSTTVKTSY   373
  1820   TRPM7   KQPGNSTKESESTNSVRLML   374
  AA229   密蛋白5   KYSAPRRPTATGDYDKKNYV   375
  AA40   DOCK2   LASKSAEEGKQIPDSLSTDL   376
  AA250   5-羟色胺受体3a   LAVLAYSITLVMLWSIWQYA   377
  AA225   密蛋白9   LGYSIPSRSGASGLDKRDYV   378
  AA311   β-1联蛋白   LMDGLPPGDSNQLAWFDTDL   379
表11续：结合MAGI2 d5的PL序列(续)
  AVC ID   肽   序列   Seq.IDNo.
  AA34.2   NMDA   LNSCSNRRVYKKMPSIESDV   380
  AA345   NMDA R2A   LNSSSNRRVYKKMPSIESDV   381
  AA227   密蛋白2   PGQPPKVKSEFNSYSLTGYV   382
  AA140   KIAA 1481   PIPAGGCTFSGIFPTLTSPL   383
  AA217   联蛋白-δ2   PYSELNYETSHYPASPDSWV   384
  AA07   CD34   QATSRNGHSARQHVVADTEL   385
  AA244   α-2B肾上腺素能受体   QDFRRAFRRILARPWTQTAW   386
  AA56   TAX   QISPGGLEPPSEKHFRETEV   387
  AA240   多巴胺转运蛋白   RELVDRGEVRQFTLRHWLKV   388
  AA207L   Nedasin(S-型)   RNIEEVYVGGKQVVPFSSSV   389
  AA328   GPR5   SPASIPHSPGAFAYEGASFY   390
  AA23.3   Fas配体   SSKSKSSEESQTFFGLYKL   391
  AA228   柄蛋白2   SSPDSSYQGKGFVMSRAMYV   392
  AA124   CXCR3   SSSRRDSSWSETSEASYSGL   393
  AA66.1   HPV E6J66(无半胱氨酸)   TGSALQAWRHTSRQATESTV   394
  AA180   NMDA谷氨酸受体2C(无半胱氨酸   TQGFPGPATWRRISSLESEV   395
  AA33   KV1.3   TTNNNPNSAVNIKKIFTDV   396
  AA114   GLUR7(代谢型谷氨酸受体)   VDPNSPAAKKKYVSYNNLVI   397
  AA82   AdenoE4 typ9   VGTLLLERVIFPSVKIATLV   398
  AA125   紧密连合蛋白3(ZO-3)   VHDAESSDEDGYDWGPATDL   399
  AA77   HPV-E6 #63   VHKVRNKFKAKCSLCRLYII   400
  AA123   a-辅肌动蛋白2   VPGALDYAAFSSALYGESDL   401
  1763   Tat-MUC1   YGRKKRRQRRRAVAATSANL   402
  1764   Tat-HER2   YGRKKRRQRRREYLGLDVPV   403
  1775   Tat-N-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRGASADSTQA   404
  AA348   TATNMDA2B9   YGRKKRRQRRRKLSSIESDV   405
  1777   Tat-M-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRNDNIALLVQ   406
  1776   Tat-E-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRSEGVPDLLV   407
表11续：结合MAGI3 d1的PL序列
  AVC ID   肽   序列   Seq.IDNo.
  AA72.1   HPV E6 33(修饰的)   AAGGRSARGGRLQGRRETAL   408
  AA121   CD68   ALVLIAFCIIRRRPSAYQAL   409
  AA29.3   IL-8RA   ARHRVTSYTSSSVNVSSNL   410
  AA115   早老蛋白-1   ATDYLVQPFMDQLAFHQFY   411
  AA75.1   HPV E6 58(修饰的)   AVGGRPARGGRLQGRRQTQV   412
  AA245   α-2C肾上腺素能受体   DFRPSFKHILFRRARRGFRQ   413
  AA218   CSPG4(硫酸软骨素蛋白多糖4)   ELLQFCRTPNPALKNGQYWV   414
  AA19   CD148   ENLAPVTTFGKTNGYIA   415
  AA210L   APC-结肠腺瘤性息肉蛋白   ESSGTQSPKRHSGSYLVTSV   416
  AA346   NMDA R2B   FNGSSNGHVYEKLSSIESDV   417
  AA347   NMDA R2D   GGDLGTRRGSAHFSSLESEV   418
  AA220   claudin 10   GGEDFKTTNPSKQFDKNAYV   419
  AA108.1   GLUR2(谷氨酸受体2-修饰的)   GGGGGSGGGGGSGIESVK   420
  AA36.3   神经配蛋白(连接子14aa)   GGGGGSGGGGSGGGHSTTRV   421
  AA36.2   神经配蛋白(连接子12aa)   GGGGGSGGGGSGLPHSTTRV   422
  AA22.2   DNAM-1(连接子12aa)   GGGGGSGGGGSGSRRPKTRV   423
  1859   HPV E6 #33(Cys-＞Ser)   GRWAGRSAASWRSRRRETAL   424
  AA80.1   HPV E6 #35(无半胱氨酸)   GRWTGRAMSAWKPTRRETEV   425
  AA80   HPV-E6 #35   GRWTGRCMSCWKPTRRETEV   426
  1858   HPV E6 #58(mod Cys-＞Ser)   GRWTGRSAVSWRPRRRQTQV   427
  1857   HPV E6 #35(mod Cys-＞Ser)   GRWTGRSMSSWKPTRRETEV   428
  AA67.1   HPV E6 #57(cysteine-free)   HAMNAAPRAMENAPALRTSH   429
  AA258   去甲肾上腺素转运蛋白   HHLVAQRDIRQFQLQHWLAI   430
  AA02.1   Clasp-2   ISGTPTSTMVHGMTSSSSVV   431
  AA26   半乳凝素3   ISKLGISGDIDLTSASYTMI   432
  AA226   密蛋白7   KAGYRAPRSYPKSNSSKEYV   433
  AA327   PAR-2   KHSRKSSSYSSSSTTVKTSY   434
  1820   TRPM7   KKKKQPGNSTKESESTNSVRLML   435
  AA40   DOCK2   LASKSAEEGKQIPDSLSTDL   436
  AA250   5-羟色胺受体3a   LAVLAYSITLVMLWSIWQYA   437
  AA106   Kir2.1(内向整流型K+通道)   LHNQASVPLEPRPLRRESEI   438
  AA34.2   NMDA   LNSCSNRRVYKKMPSIESDV   439
表11续：结合MAGI3 d1的PL序列(续)
  AVC ID   肽   序列   Seq.ID No.
  AA345   NMDA R2A   LNSSSNRRVYKKMPSIESDV   440
  AA05.2   CD4(修饰的)C-＞S   LSEKKTSQSPHRFQKTSSP   441
  1860   HPV E6 #52(Cys-＞Ser)   GRWTGRSSESWRPRPVTQV   442
  1861   HPV E6 #45(Cys-＞Ser)   NTSSDQARQERLRRRRETQV   443
  AA227   密蛋白2   PGQPPKVKSEFNSYSLTGYV   444
  AA140   KIAA 1481   PIPAGGCTFSGIFPTLTSPL   445
  AA217   联蛋白-δ2   PYSELNYETSHYPASPDSWV   446
  AA244   α-2B肾上腺素能受体   QDFRRAFRRILARPWTQTAW   447
  AA56   TAX   QISPGGLEPPSEKHFRETEV   448
  AA240   多巴胺转运蛋白   RELVDRGEVRQFTLRHWLKV   449
  AA207L   Nedasin(S-型)   RNIEEVYVGGKQVVPFSSSV   450
  AA095   GluR5-2(大鼠)   SFTSILTCHQRRTQRKETVA   451
  AA70.1   HPV E6 #18   SGGNRARQERLQRRRETQV   452
  AA253   Clasp-3   SLIGPVQKEYQRELGKLSSP   453
  AA214L   ErbB-4受体   SLKPGTVLPPPPYRHRNTVV   454
  AA06   CD6   SPQPDSTDNDDYDDISAA   455
  AA23.3   Fas配体   SSKSKSSEESQTFFGLYKL   456
  AA228   柄蛋白2   SPDSSYQGKGFVMSRAMYV   457
  AA117   早老蛋白-2   STDNLVRPFMDTLASHQLYI   458
  AA223   密蛋白1   SYPTPRPYPKPAPSSGKDYV   459
  AA36   神经配蛋白   TFAAGFNSTGLPHSTTRV   460
  AA200L   HER2受体   TFKGTPTAENPEYLGLDVPV   461
  AA69.1   HPV E6#16(修饰的)   TGRGMSGGRSSRTRRETQL   462
  AA66.1   HPV E6#66(无半胱氨酸)   GSALQAWRHTSRQATESTV   463
  AA180   NMDA谷氨酸受体2C(无半胱氨酸   TQGFPGPATWRRISSLESEV   464
  AA22   DNAM-1   TREDIYVNYPTFSRRPKTRV   465
  AA33   KV1.3   TTNNNPNSAVNIKKIFTDV   466
  AA114   GLUR7(代谢型谷氨酸受体)   VDPNSPAAKKKYVSYNNLVI   467
  AA82   AdenoE4 typ9   VGTLLLERVIFPSVKIATLV   468
  AA77   HPV-E6 #63   VHKVRNKFKAKCSLCRLYII   469
  1862   HPV E6 #82   VTGQSANSRKPPRQRSETQV   470
  AA348   TATNMDA2B9   YGRKKRRQRRRKLSSIESDV   471
  1777   Tat-M-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRNDNIALLVQ   472
  AA25   FceRlb   YSATYSELEDPGEMSPPIDL   473
表11续：结合MAGI3 d2的PL序列
  AVC ID   肽   序列   Seq.IDNo.
  AA115   早老蛋白-1   ATDYLVQPFMDQLAFHQFYI   474
  AA75.1   HPV E6 58(修饰的)   AVGGRPARGGRLQGRRQTQV   475
  AA245   α-2C肾上腺素受体   DFRPSFKHILFRRARRGFRQ   476
  AA59   PTEN   DSDPENEPFDEDQHTQITKV   477
  AA233L   5-羟色胺受体5HT-2B   DTLLLTENEGDKTEEQVSYV   478
  AA178L   PDZ-结合激酶(PBK)   EDPKDRPSAAHIVEALETDV   479
  AA210L   APC-结肠腺瘤性息肉蛋白   ESSGTQSPKRHSGSYLVTSV   480
  AA36.3   神经配蛋白(连接子14aa)   GGGGGSGGGGSGGGHSTTRV   481
  AA36.2   神经配蛋白(连接子12aa)   GGGGGSGGGGSGLPHSTTRV   482
  AA80.1   HPV E6#35(无半胱氨酸)   GRWTGRAMSAWKPTRRETEV   483
  AA80   HPV-E6 #35   GRWTGRCMSCWKPTRRETEV   484
  AA243   α-2A肾上腺素受体   HDFRRAFKKILARGDRKRIV   485
  AA258   去甲肾上腺素转运蛋白   HHLVAQRDIRQFQLQHWLAI   486
  AA216   NMDA R2C   HPTDITGLPNLSDPSVSTVV   487
  AA182L   肝配蛋白B2   ILNSIQVMRAQMNQIQSVEV   488
  AA02.1   ClaSp-2   ISGTPTSTMVHGMTSSSSVV   489
  AA152L   ActRIIA   IVTVVTMVTNVDFPPKESSL   490
  AA226   密蛋白7   KAGYRAPRSYPKSNSSKEYV   491
  AA327   PAR-2   KHSRKSSSYSSSSTTVKTSY   492
  1820   TRPM7   KQPGNSTKESESTNSVRLML   493
  AA40   DOCK2   LASKSAEEGKQIPDSLSTDL   494
  AA250   5-羟色胺受体3a   LAVLAYSITLVMLWSIWQYA   495
  AA34.2   NMDA   LNSCSNRRVYKKMPSIESDV   496
  AA227   密蛋白2   PGQPPKVKSEFNSYSLTGYV   497
表11：结合MAGI3 d2的PL序列(续)
  密蛋白2   PGQPPKVKSEFNSYSLTGYV   497
  KIAA 1481   PIPAGGCTFSGIFPTLTSPL   498
  RA-GEF(ras/rap1A-assoc.-GEF)   PYQSQGFSTEEDEDEQVSAV   499
  α-2B肾上腺素能受体   QDFRRAFRRILARPWTQTAW   500
  TAX   QISPGGLEPPSEKHFRETEV   501
  多巴胺转运蛋白   RELVDRGEVRQFTLRHWLKV   502
  BAI-1(脑特异性血管生成抑制剂1)   RSGATIPLVGQDIIDLQTEV   503
  GluR5-2(大鼠)   SFTSILTCHQRRTQRKETVA   504
  ErbB-4受体   SLKPGTVLPPPPYRHRNTVV   505
  CD6   SPQPDSTDNDDYDDISAA   506
  Fas配体   SSKSKSSEESQTFFGLYKL   507
  CXCR3   SSSRRDSSWSETSEASYSGL   508
  密蛋白1   SYPTPRPYPKPAPSSGKDYV   509
  神经配蛋白   TFAAGFNSTGLPHSTTRV   510
HPV E6#35(无半胱氨酸) TGSALQAWRHTSRQATESTV 511
  NMDA谷氨酸受体2C(无半胱氨酸)   TQGFPGPATWRRISSLESEV   512
  DNAM-1   TREDIYVNYPTFSRRPKTRV   513
  KV1.3   TTNNNPNSAVNIKKIFTDV   514
  GLUR7(代谢型谷氨酸受体)   VDPNSPAAKKKYVSYNNLVI   515
  AdenoE4 typ9   VGTLLLERVIFPSVKIATLV   516
  HPV-E6 #63   VHKVRNKFKAKCSLCRLYII   517
  1854   YGRKKRRQRRRARGRRETWV   518
  TATNMDA2B9   YGRKKRRQRRRKLSSIESDV   519
  Tat-M-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRNDNIALLVQ   520
  Tat-E-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRSEGVPDLLV   521
表11续：结合NeDLG d1的PL序列
  AVC ID   肽   序列   Seq.IDNo.
  AA72.1   HPV E6 33(修饰的)   AAGGRSARGGRLQGRRETAL   522
  AA206L   CITRON蛋白   AGAVRTPLSQVNKVWDQSSV   523
  AA29.3   IL-8RA   ARHRVTSYTSSSVNVSSNL   524
  AA75.1   HPV E6 58(修饰的)   AVGGRPARGGRLQGRRQTQV   525
  AA245   α-2C肾上腺素受体   DFRPSFKHILFRRARRGFRQ   526
  AA28.1   CDW125(修饰的)   EVIGYIEKPGVETLEDSVF   527
  AA220   密蛋白10   GGEDFKTTNPSKQFDKNAYV   528
  AA80.1   HPV E6#35(无半胱氨酸)   GRWTGRAMSAWKPTRRETEV   529
  AA80   HPV-E6 #35   GRWTGRCMSCWKPTRRETEV   530
  AA258   去甲肾上腺素转运蛋白   HHLVAQRDIRQFQLQHWLAI   531
  AA70   HPV-E6 #18   HSCCNRARQERLQRRRETQV   532
  AA226   密蛋白7   KAGYRAPRSYPKSNSSKEYV   533
  AA327   PAR-2   KHSRKSSSYSSSSTTVKTSY   534
  1820   TRPM7   KKKKQPGNSTKESESTNSVRLML   535
  AA229   密蛋白5   KYSAPRRPTATGDYDKKNYV   536
  AA250   5-羟色胺受体3a   LAVLAYSITLVMLWSIWQYA   537
  AA311   β-1联蛋白   LMDGLPPGDSNQLAWFDTDL   538
  AA34.2   NMDA   LNSCSNRRVYKKMPSIESDV   539
  AA227   密蛋白2   PGQPPKVKSEFNSYSLTGYV   540
  AA140   KIAA 1481   PIPAGGCTFSGIFPTLTSPL   541
  AA217   联蛋白-δ2   PYSELNYETSHYPASPDSWV   542
  AA244   α-2B肾上腺素受体   QDFRRAFRRILARPWTQTAW   543
  AA240   多巴胺转运蛋白   RELVDRGEVRQFTLRHWLKV   544
  AA240   多巴胺转运蛋白   RELVDRGEVRQFTLRHWLKV   545
  AA253   Clasp-3   SLIGPVQKEYQRELGKLSSP   546
  AA23.3   Fas配体   SSKSKSSEESQTFFGLYKL   547
  AA228   柄蛋白2   SSPDSSYQGKGFVMSRAMYV   548
  1759   EGFR   TAENAEYLRVAPQSSEFIGA   549
  AA66.1   HPV E6#66(无半胱氨酸)   TGSALQAWRHTSRQATESTV   550
  AA180   NMDA谷氨酸受体2C(无半胱氨酸)   TQGFPGPATWRRISSLESEV   551
  AA33   KV1.3   TTNNNPNSAVNIKKIFTDV   552
  AA114   GLUR7(代谢型谷氨酸受体)   VDPNSPAAKKKYVSYNNLVI   553
  AA251   v-AKT1   VDSERRPHFPQFSYSASGTA   554
  AA82   AdenoE4 trp9   VGTLLLERVIFPSVKIATLV   555
  AA77   HPV-E6 #63   VHKVRNKFKAKCSLCRLYII   556
  1777   Tat-M-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRNDNIALLVQ   557
表11续：结合NeDLG d2的PL序列
  AVC ID   肽   序列   Seq.IDNo.
  AA72.1   HPV E6 33(修饰的)   AAGGRSARGGRLQGRRETAL   558
  AA206L   CITRON蛋白   AGAVRTPLSQVNKVWDQSSV   559
  AA115   早老蛋白-1   ATDYLVQPFMDQLAFHQFYI   560
  AA75.1   HPV E6 58(修饰的)   AVGGRPARGGRLQGRRQTQV   561
  AA245   α-2C肾上腺素受体   DFRPSFKHILFRRARRGFRQ   562
  AA178L   PDZ-结合激酶(PBK)   EDPKDRPSAAHIVEALETDV   563
  AA218   CSPG4(硫酸软骨素蛋白多糖4)   ELLQFCRTPNPALKNGQYWV   564
  AA210L   APC-结肠腺瘤性息肉蛋白   ESSGTQSPKRHSGSYLVTSV   565
  AA346   NMDA R2B   FNGSSNGHVYEKLSSIESDV   566
  AA347   NMDA R2D   GGDLGTRRGSAHFSSLESEV   567
  AA80.1   HPV E6#_35(无半胱氨酸)   GRWTGRAMSAWKPTRRETEV   568
  AA80   HPV-E6 #35   GRWTGRCMSCWKPTRRETEV   569
  AA258   去甲肾上腺素转运蛋白   HHLVAQRDIRQFQLQHWLAI   570
  AA70   HPV-E6#18   HSCCNRARQERLQRRRETQV   571
  AA182L   肝配蛋白B2   ILNSIQVMRAQMNQIQSVEV   572
  AA226   密蛋白7   KAGYRAPRSYPKSNSSKEYV   573
  AA327   PAR-2   KHSRKSSSYSSSSTTVKTSY   574
  1820   TRPM7   KKKKQPGNSTKESESTNSVRLML   575
  AA229   密蛋白5   KYSAPRRPTATGDYDKKNYV   576
  AA250   5-羟色胺受体3a   LAVLAYSITLVMLWSIWQYA   577
  AA225   密蛋白9   LGYSIPSRSGASGLDKRDYV   578
  AA311   β-1联蛋白   LMDGLPPGDSNQLAWFDTDL   579
  AA34.2   NMDA   LNSCSNRRVYKKMPSIESDV   580
  AA345   NMDA R2A   LNSSSNRRVYKKMPSIESDV   581
  AA227   密蛋白2   PGQPPKVKSEFNSYSLTGYV   582
表11续：结合NeDLG d2的PL序列
  AVC ID   肽   序列   Seq.IDNo.
  AA140   KIAA 1481   PIPAGGCTFSGIFPTLTSPL   583
  AA217   联蛋白-δ2   PYSELNYETSHYPASPDSWV   584
  AA244   α-2B肾上腺素受体   QDFRRAFRRILARPWTQTAW   585
  AA56   TAX   QISPGGLEPPSEKHFRETEV   586
  AA240   多巴胺转运蛋白   RELVDRGEVRQFTLRHWLKV   587
  AA240   多巴胺转运蛋白   RELVDRGEVRQFTLRHWLKV   588
  AA207L   Nedasin(S-型)   RNIEEVYVGGKQVVPFSSSV   589
  AA095   GluR5-2(大鼠)   SFTSILTCHQRRTQRKETVA   590
  AA214L   ErbB-4受体   SLKPGTVLPPPPYRHRNTVV   591
  AA06   CD6   SPQPDSTDNDDYDDISAA   592
  AA23.3   Fas配体   SSKSKSSEESQTFFGLYKL   593
  AA228   柄蛋白2   SSPDSSYQGKGFVMSRAMYV   594
  1759   EGFR   TAENAEYLRVAPQSSEFIGA   595
  AA200L   HER2受体   TFKGTPTAENPEYLGLDVPV   596
  AA66.1   HPV E6#66(无半胱氨酸)   TGSALQAWRHTSRQATESTV   597
  AA180   NMDA谷氨酸受体2C(无半胱氨酸)   TQGFPGPATWRRISSLESEV   598
  AA22   DNAM-1   TREDIYVNYPTFSRRPKTRV   599
  AA33   KV1.3   TTNNNPNSAVNIKKIFTDV   600
  AA114   GLUR7(代谢型谷氨酸受体)   VDPNSPAAKKKYVSYNNLVI   601
  AA82   AdenoE4 typ9   VGTLLLERVIFPSVKIATLV   602
  AA77   HPV-E6 #63   VHKVRNKFKAKCSLCRLYII   603
  AA348   TATNMDA2B9   YGRKKRRQRRRKLSSIESDV   604
  1777   Tat-M-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRNDNIALLVQ   605
  1776   Tat-E-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRSEGVPDLLV   606
  AA25   FceRlb   YSATYSELEDPGEMSPPIDL   607
表11续：结合外膜蛋白的PL序列
Figure A20068003203401651
表11续：结合外膜蛋白的PL序列
  AVC ID   肽   序列   Seq.IDNo.
  AA07   CD34   ATSRNGHSARQHVVADTEL   635
  AA244   α-2B肾上腺素能受体   DFRRAFRRILARPWTQTAW   636
  AA56   TAX   ISPGGLEPPSEKHFRETEV   637
  AA112   GluR δ-2   PTPTLGLNLGNDPDRGTSI   638
  AA240   多巴胺转运蛋白   ELVDRGEVRQFTLRHWLKV   639
  AA240   多巴胺转运蛋白   ELVDRGEVRQFTLRHWLKV   640
  AA207L   Nedasin(S-型)   NIEEVYVGGKQVVPFSSSV   641
  AA181   BAI-1(脑特异性血管生成抑制剂1)   SGATIPLVGQDIIDLQTEV   642
  AA095   GluR5-2(大鼠)   FTSILTCHQRRTQRKETVA   643
  AA70.1   HPV E6 #18   SGGNRARQERLQRRRETQV   644
  AA06   CD6   SPQPDSTDNDDYDDISAA   645
  AA23.3   Fas配体   SSKSKSSEESQTFFGLYKL   646
  AA228   柄蛋白2   SPDSSYQGKGFVMSRAMYV   647
  AA223   密蛋白1   YPTPRPYPKPAPSSGKDYV   648
  AA36   神经配蛋白   TFAAGFNSTGLPHSTTRV   649
  AA200L   HER2受体   FKGTPTAENPEYLGLDVPV   650
  AA69.1   HPV E6#16(修饰的)   TGRGMSGGRSSRTRRETQL   651
  AA66.1   HPV E6#66(无半胱氨酸)   GSALQAWRHTSRQATESTV   652
  AA180   NMDA谷氨酸受体2C(无半胱氨酸)   QGFPGPATWRRISSLESEV   653
  AA22   DNAM-1   REDIYVNYPTFSRRPKTRV   654
  AA33   KV1.3   TTNNNPNSAVNIKKIFTDV   655
  AA114   GLUR7(代谢型谷氨酸受体)   DPNSPAAKKKYVSYNNLVI   656
  AA82   AdenoE4 typ9   GTLLLERVIFPSVKIATLV   657
  AA125   紧密连合蛋白3(ZO-3)   HDAESSDEDGYDWGPATDL   658
  AA77   HPV-E6 #63   HKVRNKFKAKCSLCRLYII   659
  AA123   a-辅肌动蛋白2   PGALDYAAFSSALYGESDL   660
  AA348   TATNMDA2B9   GRKKRRQRRRKLSSIESDV   661
  1777   Tat-M-蛋白-SARS   GRKKRRQRRRNDNIALLVQ   662
  1776   Tat-E-蛋白-SARS   GRKKRRQRRRSEGVPDLLV   663
表11续：结合Pick1 d1的PL序列
  AVC ID   肽   序列   Seq.IDNo.
  1927   X＝L-苯基甘氨酸   YGRKKRRQRRRKLSSIESDX   664
  AA121   CD68   ALVLIAFCIIRRRPSAYQAL   665
  AA115   早老蛋白-1   ATDYLVQPFMDQLAFHQFYI   666
  AA245   α-2C肾上腺素能受体   DFRPSFKHILFRRARRGFRQ   667
  AA222   密蛋白18   DGGARTEDEVQSYPSKHDYV   668
  AA218   CSPG4(硫酸软骨素蛋白多糖4)   ELLQFCRTPNPALKNGQYWV   669
  1761   FGF受体3 IIIc同工型1   FHSKTAGANTTDKELEVLSL   670
  AA80.1   HPV E6#35(无半胱氨酸)   GRWTGRAMSAWKPTRRETEV   671
  AA243   α-2A肾上腺素能受体   HDFRRAFKKILARGDRKRIV   672
  AA258   去甲肾上腺素转运蛋白   HHLVAQRDIRQFQLQHWLAI   673
  AA70   HPV-E6 #18   HSCCNRARQERLQRRRETQV   674
  AA182L   肝配蛋白B2   ILNSIQVMRAQMNQIQSVEV   675
  AA226   密蛋白7   KAGYRAPRSYPKSNSSKEYV   676
  AA327   PAR-2   KHSRKSSSYSSSSTTVKTSY   677
  AA118   MINT-1   KTMPAAMYRLLTAQEQPVYI   678
  AA229   密蛋白5   KYSAPRRPTATGDYDKKNYV   679
  AA250   5-羟色胺受体3a   LAVLAYSITLVMLWSIWQYA   680
  AA05.2   CD4(修饰的)C-＞S   LSEKKTSQSPHRFQKTSSPI   681
  AA227   密蛋白2   PGQPPKVKSEFNSYSLTGYV   682
  AA140   KIAA 1481   PIPAGGCTFSGIFPTLTSPL   683
  AA217   联蛋白-δ2   PYSELNYETSHYPASPDSWV   684
  AA244   α-2B肾上腺素能受体   QDFRRAFRRILARPWTQTAW   685
  AA240   多巴胺转运蛋白   RELVDRGEVRQFTLRHWLKV   686
  AA06   CD6   SPQPDSTDNDDYDDISAA   687
  AA23.3   Fas配体   SSKSKSSEESQTFFGLYKL   688
  AA228   柄蛋白2   SSPDSSYQGKGFVMSRAMYV   689
  AA223   密蛋白1   SYPTPRPYPKPAPSSGKDYV   690
  AA33   KV1.3   TTNNNPNSAVNIKKIFTDV   691
  AA114   GLUR7(代谢型谷氨酸盐R)   VDPNSPAAKKKYVSYNNLVI   692
  AA77   HPV-E6 #63   VHKVRNKFKAKCSLCRLYII   693
  1940   Tat-CLCA-3(鼠)   YGRKKRRQRRREMQVTLGLH   694
  1764   Tat-HER2   YGRKKRRQRRREYLGLDVPV   695
  1947   Tat-hCLCA1   YGRKKRRQRRRIGELQLSIA   696
  1922   X＝L-α-氨基丁酸   YGRKKRRQRRRKLSSIESDX   697
表11续：结合PSD95 d1的PL序列
  AVC ID   肽   序列   Seq.IDNo.
  AA72.1   HPV E6 33(修饰的)   AAGGRSARGGRLQGRRETAL   698
  AA75.1   HPV E6 58(修饰的)   AVGGRPARGGRLQGRRQTQV   699
  AA245   α-2C肾上腺素受体   DFRPSFKHILFRRARRGFRQ   700
  AA222   密蛋白18   DGGARTEDEVQSYPSKHDYV   701
  AA218   CSPG4(硫酸软骨素蛋白多糖   ELLQFCRTPNPALKNGQYWV   702
  AA346   NMDA R2B   FNGSSNGHVYEKLSSIESDV   703
  AA347   NMDA R2D   GGDLGTRRGSAHFSSLESEV   704
  AA220   密蛋白10   GGEDFKTTNPSKQFDKNAYV   705
  1859   HPV E6#33(Cys-＞Ser)   GRWAGRSAASWRSRRRETAL   706
  AA80.1   HPV E6#35(无半胱氨酸)   GRWTGRAMSAWKPTRRETEV   707
  AA258   去甲肾上腺素转运蛋白   HHLVAQRDIRQFQLQHWLAI   708
  AA226   密蛋白7   KAGYRAPRSYPKSNSSKEYV   709
  AA327   PAR-2   KHSRKSSSYSSSSTTVKTSY   710
  1820   TRPM7   KKKKQPGNSTKESESTNSVRLML   711
  AA229   密蛋白5   KYSAPRRPTATGDYDKKNYV   712
  AA250   5-羟色胺受体3a   LAVLAYSITLVMLWSIWQYA   713
  AA225   密蛋白9   LGYSIPSRSGASGLDKRDYV   714
  AA34.2   NMDA   LNSCSNRRVYKKMPSIESDV   715
  AA345   NMDA R2A   LNSSSNRRVYKKMPSIESDV   716
  AA227   密蛋白2   PGQPPKVKSEFNSYSLTGYV   717
  AA140   KIAA 1481   PIPAGGCTFSGIFPTLTSPL   718
  AA217   联蛋白-δ2   PYSELNYETSHYPASPDSWV   719
  AA244   a-2B肾上腺素受体   QDFRRAFRRILARPWTQTAW   720
  AA56   TAX   QISPGGLEPPSEKHFRETEV   721
  AA240   多巴胺转运蛋白   RELVDRGEVRQFTLRHWLKV   722
  AA207L   Nedasin(S-型)   RNIEEVYVGGKQVVPFSSSV   723
  AA095   GluR5-2(大鼠)   SFTSILTCHQRRTQRKETVA   724
  AA23.3   Fas配体   SSKSKSSEESQTFFGLYKL   725
  AA228   柄蛋白2   SSPDSSYQGKGFVMSRAMYV   726
  AA223   密蛋白1   SYPTPRPYPKPAPSSGKDYV   727
  AA66.1   HPV E6#66(无半胱氨酸)   TGSALQAWRHTSRQATESTV   728
表11续：结合PSD95 d1的PL序列
Figure A20068003203401691
表11续：结合PSD95 d1，2的PL序列
  AVC ID   肽   序列   Seq.IDNo.
  AA72.1   HPV E6 33(修饰的)   AAGGRSARGGRLQGRRETAL   762
  AA29.3   IL-8RA   ARHRVTSYTSSSVNVSSNL   763
  AA75.1   HPV E6 58(修饰的)   AVGGRPARGGRLQGRRQTQV   764
  AA245   α-2C肾上腺素能受体   DFRPSFKHILFRRARRGFRQ   765
  AA178L   PDZ-结合激酶(PBK)   EDPKDRPSAAHIVEALETDV   766
  AA218   CSPG4(硫酸软骨素蛋白多糖4)   ELLQFCRTPNPALKNGQYWV   767
  AA210L   APC-结肠腺瘤性息肉蛋白   ESSGTQSPKRHSGSYLVTSV   768
  AA346   NMDA R2B   FNGSSNGHVYEKLSSIESDV   769
  AA347   NMDA R2D   GGDLGTRRGSAHFSSLESEV   770
  AA220   密蛋白10   GGEDFKTTNPSKQFDKNAYV   771
  AA108.1   GLUR2(谷氨酸受体2-修饰的)   GGGGGSGGGGGSGIESVKI   772
  1859   HPV E6#33(Cys-＞Ser)   GRWAGRSAASWRSRRRETAL   773
  AA80.1   HPV E6#35(无半胱氨酸)   GRWTGRAMSAWKPTRRETEV   774
  1858   HPV E6 #58(mod Cys-＞Ser)   GRWTGRSAVSWRPRRRQTQV   775
  AA258   去甲肾上腺素转运蛋白   HHLVAQRDIRQFQLQHWLAI   776
  AA216   NMDA R2C   HPTDITGLPNLSDPSVSTVV   777
  AA70   HPV-E6 #18   HSCCNRARQERLQRRRETQV   778
  AA182L   肝配蛋白B2   ILNSIQVMRAQMNQIQSVEV   779
  AA02.1   Clasp-2   ISGTPTSTMVHGMTSSSSVV   780
  AA226   密蛋白7   KAGYRAPRSYPKSNSSKEYV   781
  AA13P   磷酸化CD95   KDITSDSENSNFRNEIQSLV   782
  AA13   CD95   KDITSDSENSNFRNEIQSLV   783
  AA327   PAR-2   KHSRKSSSYSSSSTTVKTSY   784
1820 TRPM7 KKKQPGNSTKESESTNSVRLML 785
  AA250   5-羟色胺受体3a   LAVLAYSITLVMLWSIWQYA   786
  AA106   Kir2.1(内向整流型K+通道)   LHNQASVPLEPRPLRRESEI   787
  AA34.2   NMDA   LNSCSNRRVYKKMPSIESDV   788
  AA345   NMDA R2A   LNSSSNRRVYKKMPSIESDV   789
  1860   HPV E6#52(Cys-＞Ser)   MGRWTGRSSESWRPRPVTQV   790
  1861   HPV E6#45(Cys-＞Ser)   NTSSDQARQERLRRRRETQV   791
表11续：结合PSD95 d1，2的PL序列(续)
  AA217   联蛋白-δ2   PYSELNYETSHYPASPDSWV   793
  AA244   α-2B肾上腺素能受体   QDFRRAFRRILARPWTQTAW   794
  AA56   TAX   QISPGGLEPPSEKHFRETEV   795
  AA240   多巴胺转运蛋白   RELVDRGEVRQFTLRHWLKV   796
  AA207L   Nedasin(S-型)   RNIEEVYVGGKQVVPFSSSV   797
  AA181   BAI-1(脑特异性血管生成抑制剂1)   RSGATIPLVGQDIIDLQTEV   798
  AA095   GluR5-2(大鼠)   SFTSILTCHQRRTQRKETVA   799
  AA253   Clasp-3   SLIGPVQKEYQRELGKLSSP   800
  AA214L   ErbB-4受体   SLKPGTVLPPPPYRHRNTVV   801
  AA23.3   Fas配体   SSKSKSSEESQTFFGLYKL   802
  AA223   密蛋白1   SYPTPRPYPKPAPSSGKDYV   803
  AA36   神经配蛋白   TFAAGFNSTGLPHSTTRV   804
  AA200L   HER2受体   TFKGTPTAENPEYLGLDVPV   805
  AA69.1   HPV E6#16(修饰的)   TGRGMSGGRSSRTRRETQL   806
  AA66.1   HPV E6#66(无半胱氨酸)   TGSALQAWRHTSRQATESTV   807
  AA180   NMDA谷氨酸受体2C(无半胱氨酸   TQGFPGPATWRRISSLESEV   808
  AA22   DNAM-1   TREDIYVNYPTFSRRPKTRV   809
  AA33   KV1.3   TTNNNPNSAVNIKKIFTDV   810
  AA114   GLUR7(代谢型谷氨酸受体)   VDPNSPAAKKKYVSYNNLVI   811
  AA82   AdenoE4 typ9   VGTLLLERVIFPSVKIATLV   812
  AA77   HPV-E6 #63   VHKVRNKFKAKCSLCRLYII   813
  1862   HPV E6 #82   WTGQSANSRKPPRQRSETQV   814
  1775   Tat-N-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRGASADSTQA   815
  AA348   TATNMDA2B9   YGRKKRRQRRRKLSSIESDV   816
  1967   Tat-H1N1   YGRKKRRQRRRMAGTIRSEV   817
  1961   H5N1 AAT73368/50296240   YGRKKRRQRRRMARTIESEI   818
  1959   H5N1 AAT73457/50296374   YGRKKRRQRRRMARTIESEV   819
  1958   H5N1 AAF02349/6048830   YGRKKRRQRRRMERTIEPEV   820
  1777   Tat-M-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRNDNIALLVQ   821
表11续：结合PSD95 d2的PL序列
  AVC ID   肽   序列   Seq.IDNo.
  AA72.1   HPVE633(修饰的)   AAGGRSARGGRLQGRRETAL   822
  AA75.1   HPVE658(修饰的)   AVGGRPARGGRLQGRRQTQV   823
  AA346   NMDA R2B   FNGSSNGHVYEKLSSIESDV   824
  AA347   NMDA R2D   GGDLGTRRGSAHFSSLESEV   825
  1859   HPV E6#33(Cys-＞Ser)   GRWAGRSAASWRSRRRETAL   826
  AA80.1   HPVE6#35(无半胱氨酸)   GRWTGRAMSAWKPTRRETEV   827
  1858   HPV E6#58(mod Cys-＞Ser)   GRWTGRSAVSWRPRRRQTQV   828
  AA13   CD95   KDITSDSENSNFRNEIQSLV   829
  AA327   PAR-2   KHSRKSSSYSSSSTTVKTSY   830
  1820   TRPM7   KKKQPGNSTKESESTNSVRLML   831
  AA34.2   NMDA   LNSCSNRRVYKKMPSIESDV   832
  AA345   NMDA R2A   LNSSSNRRVYKKMPSIESDV   833
  1861   HPV E6#45(Cys-＞Ser)   NTSSDQARQERLRRRRETQV   834
  AA56   TAX   QISPGGLEPPSEKHFRETEV   835
  AA240   多巴胺转运蛋白   RELVDRGEVRQFTLRHWLKV   836
  AA181   BAI-1(脑特异性血管生成抑制剂1)   RSGATIPLVGQDIIDLQTEV   837
  AA06   CD6   SPQPDSTDNDDYDDISAA   838
  AA124   CXCR3   SSSRRDSSWSETSEASYSGL   839
  AA69.1   HPV E6#16(修饰的)   TGRGMSGGRSSRTRRETQL   840
  AA180   NMDA谷氨酸受体2C(无半胱氨酸   TQGFPGPATWRRISSLESEV   841
  AA33   KV1.3   TTNNNPNSAVNIKKIFTDV   842
  AA77   HPV-E6#63   VHKVRNKFKAKCSLCRLYII   843
  1915   生物素-Tat-NMDA-优化的   YGRKKRRQRRRALKS IETEV   844
  1854   1854   YGRKKRRQRRRARGRRETWV   845
  1767   Tat-FGFR3IIIc同工型1   YGRKKRRQRRRDKELEVLSL   846
  AA356   bTAT-TAXAA   YGRKKRRQRRREKHFREAEA   847
  AA353   bTAT-TAX   YGRKKRRQRRREKHFRETEV   848
  1764   Tat-HER2   YGRKKRRQRRREYLGLDVPV   849
  1853   1853   YGRKKRRQRRRGMTSSSSVV   850
  1914   生物素-Tat-NMDAR2_短   YGRKKRRQRRRIETEV   851
表11续：结合PSD95d2的PL序列(续)
  AVC ID   肽   序列   Seq.IDNo
  1930   1930   YGRKKRRQRRRKLSSIESDL   852
  AA348   TATNMDA2B9   YGRKKRRQRRRKLSSIESDV   853
  AA351   TAT-NR2B9   YGRKKRRQRRRKLSSIESDV   854
  1923   X＝2-氨基-4，4，4-三氟丁酸   YGRKKRRQRRRKLSSIESDX   855
  1924   X＝L-叔丁基-甘氨酸   YGRKKRRQRRRKLSSIESDX   856
  1926   X＝3-氟-DL-缬氨酸   YGRKKRRQRRRKLSSIESDX   857
  1929   X＝4，4，4-三氟-DL-缬氨酸   YGRKKRRQRRRKLSSIESDX   858
  1944   X＝正缬氨酸NMDAR2B类似物   YGRKKRRQRRRKLSSIESDX   859
  1954   X＝炔丙基甘氨酸P0 NMDAR2B   YGRKKRRQRRRKLSSIESDX   860
  1963   X＝4-氨基-PheTat-NMDAR2B变体   YGRKKRRQRRRKLSSIESXV   861
  1953   NMDAR2B P-1 Y   YGRKKRRQRRRKLSSIESYV   862
  1939   Tat-NMDAR2B S-＞T P-2   YGRKKRRQRRRKLSSIETDV   863
  1945   X＝正缬氨酸，S-＞T P-2NMDAR2B类似物   YGRKKRRQRRRKLSSIETDX   864
  1946   X＝L-2NH4-3ureidoproacidP-2TatNMD   YGRKKRRQRRRKLSSIEXDV   865
  1931   1931   YGRKKRRQRRRKLSSIEYDV   866
  1961   H5N 1AAT73368/50296240   YGRKKRRQRRRMARTIESEI   867
  1959   H5N1 AAT73457/50296374   YGRKKRRQRRRMARTIESEV   868
  1958   H5N1 AAF02349/6048830   YGRKKRRQRRRMERTIEPEV   869
  1777   Tat-M-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRNDNIALLVQ   870
  1855   1855   YGRKKRRQRRRQDERVETRV   871
  1918   TAT-SLO2   YGRKKRRQRRRQDSREETQL   872
  1912   生物素-Tat-NMDAR2special1   YGRKKRRQRRRRISSIETDV   873
  1913   生物素-Tat-NMDAR2special2   YGRKKRRQRRRRISSIQTDV   874
  1797   Tat-NMDA 2C9   YGRKKRRQRRRRISSLESEV   875
  1911   Biotin-Tat-NMDAR2C S-＞T mut   YGRKKRRQRRRRISSLETEV   876
  1917   1917   YGRKKRRQRRRRISSLETQV   877
  1938   Tat-HPV33E6(无半胱氨酸)   YGRKKRRQRRRRSRRRETAL   878
  1916   生物素-Tat-CRIPT   YGRKKRRQRRRTKNYKQTSV   879
表11续：结合PTN-3的PL序列
  AVC ID   肽   序列   Seq.IDNo.
  1820   TRPM7   KKKQPGNSTKESESTNSVRLML   880
  AA311   β-1联蛋白   LMDGLPPGDSNQLAWFDTDL   881
  1763   Tat-MUC1   YGRKKRRQRRRAVAATSANL   882
  1764   Tat-HER2   YGRKKRRQRRREYLGLDVPV   883
  1775   Tat-N-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRGASADSTQA   884
  1777   Tat-M-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRNDNIALLVQ   885
  1776   Tat-E-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRSEGVPDLLV   886
表11续：结合SHANK1的PL序列
Figure A20068003203401741
表11续：结合SHANK1的PL序列
  AVC ID   肽   序列   Seq.IDNo.
  AA311   β-1联蛋白   LMDGLPPGDSNQLAWFDTDL   912
  AA113   SSTR2(生长抑素受体2)   LNETTETQRTLLNGDLQTSI   913
  AA34.2   NMDA   LNSCSNRRVYKKMPSIESDV   914
  AA329   VIPS_人   LQFHRGSRAQSFLQTETSVI   915
  AA227   密蛋白2   PGQPPKVKSEFNSYSLTGYV   916
  AA140   KIAA 1481   PIPAGGCTFSGIFPTLTSPL   917
  AA147   Na+/Pi协同转运蛋白2   PPATPSPRLALPAHHNATRL   918
  AA45   BLR-1   PSWRRSSLSESENATSLTTF   919
  AA217   联蛋白-δ2   PYSELNYETSHYPASPDSWV   920
  AA244   α-2B肾上腺素能受体   QDFRRAFRRILARPWTQTAW   921
  AA240   多巴胺转运蛋白   RELVDRGEVRQFTLRHWLKV   922
  1895   TAMRA-粘性类别1(Val0)   RRASTSRETWV   923
  AA181   BAI-1(脑特异性血管生成抑制剂1)   RSGATIPLVGQDIIDLQTEV   924
  AA23.3   Fas配体   SSKSKSSEESQTFFGLYKL   925
  AA228   柄蛋白2   SSPDSSYQGKGFVMSRAMYV   926
  AA124   CXCR3   SSSRRDSSWSETSEASYSGL   927
  AA36   神经配蛋白   TFAAGFNSTGLPHSTTRV   928
  AA69.1   HPV E6 #16(修饰的)   TGRGMSGGRSSRTRRETQL   929
  AA22   DNAM-1   TREDIYVNYPTFSRRPKTRV   930
  AA114   GLUR7(代谢型谷氨酸盐R)   VDPNSPAAKKKYVSYNNLVI   931
  AA77   HPV-E6 #63   VHKVRNKFKAKCSLCRLYII   932
  AA123   a-辅肌动蛋白2   VPGALDYAAFSSALYGESDL   933
  1767   Tat-FGFR3 IIIc同工型1   YGRKKRRQRRRDKELEVLSL   934
  1956   Tat-COX-2   YGRKKRRQRRRLLKERSTEL   935
  1777   Tat-M-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRNDNIALLVQ   936
  1950   Tat-TIAM 1   YGRKKRRQRRRPSRKLNTEI   937
  1965   Tat-hGKAP   YGRKKRRQRRRYIPEAQTRL   938
表11续：结合TIP43 d1的PL序列
  AVC ID   肽   序列   Seq.IDNo.
  AA72.1   HPV E6 33(修饰的)   AAGGRSARGGRLQGRRETAL   939
  1761   FGF受体3IIIc同工型1   FHSKTAGANTTDKELEVLSL   940
  AA346   NMDA R2B   FNGSSNGHVYEKLSSIESDV   941
  AA347   NMDA R2D   GGDLGTRRGSAHFSSLESEV   942
  AA80.1   HPV E6#35(无半胱氨酸)   GRWTGRAMSAWKPTRRETEV   943
  AA327   PAR-2   KHSRKSSSYSSSSTTVKTSY   944
  1820   TRPM7   KKKQPGNSTKESESTNSVRLML   945
  AA40   DOCK2   LASKSAEEGKQIPDSLSTDL   946
  AA345   NMDA R2A   LNSSSNRRVYKKMPSIESDV   947
  AA181   BAI-1(脑特异性血管生成抑制剂1)   RSGATIPLVGQDIIDLQTEV   948
  AA095   GluR5-2(大鼠)   SFTSILTCHQRRTQRKETVA   949
  AA124   CXCR3   SSSRRDSSWSETSEASYSGL   950
  AA180   NMDA谷氨酸受体2C(无半胱氨酸   TQGFPGPATWRRISSLESEV   951
  AA33   KV1.3   TTNNNPNSAVNIKKIFTDV   952
  AA77   HPV-E6 #63   VHKVRNKFKAKCSLCRLYII   953
  1764   Tat-HER2   YGRKKRRQRRREYLGLDVPV   954
  1775   Tat-N-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRGASADSTQA   955
  AA348   TATNMDA2B9   YGRKKRRQRRRKLSSIESDV   956
  1777   Tat-M-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRNDNIALLVQ   957
表11续：结合Vartul d2的PL序列
  AVC ID   肽   序列   Seq.ID No.
  AA72.1   HPVE633(修饰的)   AAGGRSARGGRLQGRRETAL   958
  AA206L   CITRON蛋白   AGAVRTPLSQVNKVWDQSSV   959
  AA29.3   IL-8RA   ARHRVTSYTSSSVNVSSNL   960
  AA115   早老蛋白-1   ATDYLVQPFMDQLAFHQFY   961
  AA245   α-2C肾上腺素能受体   DFRPSFKHILFRRARRGFRQ   962
  AA218   CSPG4(硫酸软骨素蛋白多糖4)   ELLQFCRTPNPALKNGQYWV   963
  AA210L   APC-结肠腺瘤性息肉蛋白   ESSGTQSPKRHSGSYLVTSV   964
  AA80.1   HPV E6#35(无半胱氨酸)   GRWTGRAMSAWKPTRRETEV   965
  AA258   去甲肾上腺素转运蛋白   HHLVAQRDIRQFQLQHWLA   966
  AA327   PAR-2   KHSRKSSSYSSSSTTVKTSY   967
  1820   TRPM7   KKKQPGNSTKESESTNSVRLML   968
  AA250   5-羟色胺受体3a   LAVLAYSITLVMLWSIWQYA   969
  AA34.2   NMDA   LNSCSNRRVYKKMPSIESDV   970
  AA140   KIAA 1481   PIPAGGCTFSGIFPTLTSPL   971
  AA190L   肝配蛋白B1   PVYIVQEMPPQSPANIYYKV   972
  AA217   联蛋白-δ2   PYSELNYETSHYPASPDSVVV   973
  AA244   α-2B肾上腺素能受体   QDFRRAFRRILARPWTQTAW   974
  AA56   TAX   QISPGGLEPPSEKHFRETEV   975
  AA240   多巴胺转运蛋白   RELVDRGEVRQFTLRHWLKV   976
  AA253   Clasp-3   SLIGPVQKEYQRELGKLSSP   977
  AA23.3   Fas配体   SSKSKSSEESQTFFGLYKL   978
  AA223   密蛋白1   SYPTPRPYPKPAPSSGKDYV   979
  AA180   NMDA谷氨酸受体2C(无半胱氨酸)   TQGFPGPATWRRISSLESEV   980
  AA33   KV1.3   TTNNNPNSAVNIKKIFTDV   981
  AA114   GLUR7(代谢型谷氨酸盐R)   VDPNSPAAKKKYVSYNNLV   982
  AA77   HPV-E6 #63   VHKVRNKFKAKCSLCRLY   983
  1775   Tat-N-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRGASADSTQA   984
  AA348   TATNMDA2B9   YGRKKRRQRRRKLSSIESDV   985
  1777   Tat-M-蛋白-SARS   YGRKKRRQRRRNDNIALLVQ   986
  AA25   FceRlb   YSATYSELEDPGEMSPPIDL   987
引文：
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序列表
<110>阿波维塔公司(Arbor Vita Corporation)
<120>用于流感诊断和治疗的方法和组合物
      (METHODS AND COMPOSITIONS FOR DIAGNOSIS AND TREATMENT OF VIRAL
     INFECTIONS)
<130>SCT076129-47
<140>WO 00/000,000
<141>2006-06-30
<150>US 60/696,221
<151>2005-07-01
<150>US 60/726,377
<151>2005-10-13
<150>US 60/765,292
<151>2006-02-02
<150>US 60/792,274
<151>2006-04-14
<160>997
<170>PatentIn version 3.3
<210>1
<211>104
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PDZ domain PSD95 d2
<400>1
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1             5               10                15
Ile Lys Gly Pro Lys Gly Leu Gly Phe Ser Ile Ala Gly Gly Val Gly
          20               25               30
Asn Gln His Ile Pro Gly Asp Asn Ser Ile Tyr Val Thr Lys Ile Ile
       35               40               45
Glu Gly Gly Ala Ala His Lys Asp Gly Arg Leu Gln Ile Gly Asp Lys
   50                55               60
Ile Leu Ala Val Asn Ser Val Gly Leu Glu Asp Val Met His Glu Asp
65               70               75               80
Ala Val Ala Ala Leu Lys Asn Thr Tyr Asp Val Val Tyr Leu Lys Val
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Ala Lys Pro Ser Asn Ala Tyr Leu
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<211>4
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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1
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<211>4
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PDZ Ligand Motif
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1
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<211>4
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PDZ Ligand Motif
<400>4
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<211>4
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<211>4
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<212>PRT
<213>Artificial
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<212>PRT
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<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PDZ Ligand Motif
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<212>PRT
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<220>
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<212>PRT
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<212>PRT
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<212>PRT
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<212>PRT
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<220>
<223>PDZ Ligand Motif
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Ser Ile Cys Leu
1
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<211>4
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PDZ Ligand Motif
<220>
<221>MISC_FEATURE
<222>(4)..(4)
<223>X may be V，Ior A
<400>19
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1
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<213>Artificial
<220>
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<213>Artificial
<220>
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1             5                10
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<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>HAO cleavage site sequence
<400>22
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1             5                10
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<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>23
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1             5               10
<210>24
<211>13
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>HAO cleavage site sequence
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1             5               10
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<213>Artificial
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<211>4
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PDZ domain motif
<400>26
Gly Leu Gly Phe
1
<210>27
<211>4
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL motif
<400>27
Glu Pro Glu Val
1
<210>28
<211>4
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL motif
<400>28
Lys Met Ala Asp
1
<210>29
<211>4
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PDZ ligand motif
<400>29
Arg Lys Tyr Leu
1
<210>30
<211>4
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PDZ ligand motif
<400>30
Lys Lys Tyr Leu
1
<210>31
<211>4
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>Putative C-terminal PL motif
<400>31
Gln Asp Phe Val
1
<210>32
<211>4
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>Putative C-terminal  PL motif
<400>32
Lys Ser Arg Val
1
<210>33
<211>4
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>Putative C-terminal PL motif
<400>33
Lys Ile Glu Leu
1
<210>34
<211>4
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>Putative C-terminal PL motif
<400>34
Lys Leu Ser Val
1
<210>35
<211>4
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>Putative C-terminal PL motif
<400>35
Ser Ala Val Ala
1
<210>36
<211>4
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>Putative C-terminal PL motif
<400>36
Lys Val Leu Leu
1
<210>37
<211>4
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>Putative C-terminal PL motif
<400>37
Arg His Thr Cys
1
<210>38
<211>4
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>Putative C-terminal PL motif
<400>38
Leu Ser Leu Val
1
<210>39
<211>4
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>Putative C-terminal PL motif
<400>39
Val Lys Ser Cys
1
<210>40
<211>4
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>Human PL sequence motif
<400>40
Arg Ser Lys Ile
1
<210>41
<211>4
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>Human PL sequence motif
<400>41
Lys Ser Glu Val
1
<210>42
<211>230
<212>PRT
<213>Influenza virus
<400>42
Met Asp Ser Asn Thr Leu Ser Ser Phe Gln Val Asp Cys Phe Leu Trp
1             5               10                15
His Val Arg Lys Gln Val Ala Asp Gln Glu Leu Gly Asp Ala Pro Phe
          20               25               30
Leu Asp Arg Leu Arg Arg Asp Gln Lys Ser Leu Lys Gly Arg Gly Ser
       35               40               45
Thr Leu Gly Leu Asn Ile Glu Thr Ala Thr Cys Val Gly Lys Gln Ile
   50               55                60
Val Glu Arg Ile Leu Lys Glu Glu Ser Asp Glu Ala Phe Lys Met Thr
65               70               75               80
Met Ala Ser Ala Leu Ala Ser Arg Tyr Leu Thr Asp Met Thr Ile Glu
              85              90                95
Glu Met Ser Arg Asp Trp Phe Ile Val Met Pro Lys Gln Lys Val Ala
          100              105               110
Gly Pro Leu Cys Val Arg Met Asp Gln Ala Ile Thr Asp Lys Asn Ile
       115              120              125
Ile Leu Lys Ala Asn Phe Ser Val Ile Phe Asn Arg Leu Glu Thr Leu
   130               135              140
Thr Leu Leu Arg Ala Phe Thr Glu Glu Gly Ala Ile Val Gly Glu Ile
145              150               155              160
Ser Pro Leu Pro Ser Leu Pro Gly His Thr Asn Glu Asp Val Lys Asn
             165               170              175
Ala Ile Gly Ile Leu Ile Gly Gly Leu Glu Trp Asn Asp Asn Thr Val
          180              185               190
Arg Val Ser Glu Ala Leu Gln Arg Phe Ala Trp Arg Ser Ser Asn Glu
       195              200              205
Asn Gly Arg Pro Pro Leu Thr Pro Thr Gln Lys Arg Lys Met Ala Gly
   210               215              220
Thr Ile Arg Ser Glu Val
225              230
<210>43
<211>230
<212>PRT
<213>Influenza virus
<400>43
Met Asp Ser Asn Thr Val Ser Ser Phe Gln Val Asp Cys Phe Leu Trp
1             5               10                15
His Ile Arg Lys Gln Val Val Asp Gln Glu Leu Ser Asp Ala Pro Phe
          20               25               30
Leu Asp Arg Leu Arg Arg Asp Gln Arg Ser Leu Arg Gly Arg Gly Asn
       35               40               45
Thr Leu Gly Leu Asp Ile Lys Ala Ala Thr His Val Gly Lys Gln Ile
   50               55                60
Val Glu Lys Ile Leu Lys Gly Glu Ser Asp Glu Ala Leu Lys Met Thr
65               70               75               80
Met Ala Ser Thr Pro Ala Ser Arg Tyr Ile Thr Asp Met Thr Ile Glu
              85              90                95
Glu Leu Ser Arg Asn Trp Phe Met Leu Met Pro Lys Gln Lys Met Glu
          100              105               110
Gly Pro Leu Cys Ile Arg Met Asp Gln Ala Ile Met Glu Lys Asn Ile
       115              120              125
Met Leu Lys Ala Asn Phe Ser Val Ile Phe Asp Arg Leu Glu Asn Ile
   130               135              140
Val Leu Leu Arg Ala Phe Thr Glu Glu Gly AlaIle Val Gly GluIle
145              150               155             160
Ser Pro Leu Pro Ser Phe Pro Gly His Thr Ile Glu Asp Val Lys Asn
             165               170              175
Ala Ile Gly Val Leu Ile Gly Gly Leu Glu Trp Asn Asp Asn Thr Val
          180              185               190
Arg Val Ser Lys Asn Leu Gln Arg Phe Ala Trp Arg Ser Ser Asn Glu
       195              200              205
Asn Gly Gly Pro Pro Leu Thr Pro Lys Gln Lys Arg Lys Met Ala Arg
   210               215              220
Thr Ala Arg Ser Lys Val
225              230
<210>44
<211>230
<212>PRT
<213>Influenza virus
<400>44
Met Asp Ser Asn Thr Val Ser Ser Phe Gln Val Asp Cys Phe Leu Trp
1             5               10                15
Arg Val Arg Lys Arg Phe Ala Asp Gln Glu Leu Gly Asp Ala Pro Phe
          20               25               30
Leu Asp Arg Leu Arg Arg Asp Gln Lys Ser Leu Arg Gly Arg Gly Ser
       35               40               45
Thr Leu Gly Leu Asp Ile Arg Thr Ala Thr Arg Glu Gly Lys His Ile
   50               55                60
Val Glu Arg Ile Leu Glu Glu Glu Ser Asp Glu Ala Leu Lys Met Thr
65               70               75               80
Ile Ala Ser Val Pro Ala Pro Arg Tyr Leu Thr Glu Met Thr Leu Glu
              85              90                95
Glu Met Ser Arg Asp Trp Leu Met Leu Ile Pro Lys Gln Lys Val Thr
          100              105               110
Gly Ser Leu Cys Ile Arg Met Asp Gln Ala Ile Met Asp Lys Asp Ile
       115              120              125
Ile Leu Lys Ala Asn Phe Ser Val Ile Phe Asn Arg Leu Glu Ala Leu
   130               135              140
Ile Leu Leu Arg Ala Phe Thr Asp Glu Gly AlaIle Val Gly Glu Ile
145              150               155             160
Ser Pro Leu Pro Ser Leu Pro Gly His Thr Glu Glu Asp Val Lys Asn
             165               170              175
Ala Ile Gly Val Leu Ile Gly Gly Leu Glu Trp Asn Asp Asn Thr Val
          180              185               190
Arg Val Ser Glu Thr Leu Gln Arg Phe Thr Trp Arg Ser Ser Asp Glu
       195              200              205
Asn Gly Arg Ser Pro Leu Pro Pro Lys Gln Lys Arg Lys Met Glu Arg
   210               215              220
Thr Ile Glu Pro Glu Val
225              230
<210>45
<211>225
<212>PRT
<213>Influenza virus
<400>45
Met Asp Ser Asn Thr Val Ser Ser Phe Gln Val Asp Cys Phe Leu Trp
1             5               10                15
His Val Arg Lys Arg Phe Ala Asp Gln Glu Leu Gly Asp Ala Pro Phe
          20               25               30
Leu Asp Arg Leu Arg Arg Asp Gln Lys Ser Leu Arg Gly Arg Gly Asn
       35               40               45
Thr Leu Gly Leu Asp Ile Glu Thr Ala Thr Arg Ala Gly Lys Gln Ile
   50               55                60
Val Glu Arg Ile Leu Glu Glu Glu Ser Asp Lys Ala Leu Lys Met Pro
65               70               75               80
Ala Ser Arg Tyr Leu Thr Asp Met Thr Leu Glu Glu Met Ser Arg Asp
              85              90                95
Trp Phe Met Leu Met Pro Lys Gln Lys Val Ala Gly Ser Leu Cys Ile
          100              105               110
Lys Met Asp Gln Ala Ile Met Asp Lys Thr Ile Ile Leu Lys Ala Asn
       115              120              125
Phe Ser Val Ile Phe Asp Arg Leu Glu Thr Leu Ile Leu Leu Arg Ala
   130               135              140
Phe Thr Glu Glu Gly Ala Ile Val Gly Glu Ile Ser Pro Leu Pro Ser
145              150              155               160
Leu Pro Gly His Thr Gly Glu Asp Val Lys Asn Ala Ile Gly Val Leu
             165               170              175
Ile Gly Gly Leu Glu Trp Asn Asp Asn Thr Val Arg Val Thr Glu Thr
          180              185               190
Ile Gln Arg Phe Ala Trp Arg Asn Ser Asp Glu Asp Gly Arg Leu Pro
       195              200              205
Leu Pro Pro Asn Gln Lys Arg Lys Met Ala Arg Thr Ile Glu Ser Glu
   210               215              220
Val
225
<210>46
<211>20
<212>PRT
<213>Influenza virus
<400>46
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Met Glu Arg Thr Ile
1             5               10                15
Glu Pro Glu Val
          20
<210>47
<211>20
<212>PRT
<213>Influenza virus
<400>47
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Met Ala Arg Thr Ile
1             5               10                15
Glu Ser Glu Val
          20
<210>48
<211>4
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PSD95 binding peptide motif
<220>
<221>MISC_FEATURE
<222>(1)..(1)
<223>X is E or D or N or Q
<220>
<221>MISC_FEATURE
<222>(2)..(2)
<223>X is S or T
<220>
<221>MISC_FEATURE
<222>(3)..(3)
<223>X is D or E or Q or N
<220>
<221>MISC_FEATURE
<222>(4)..(4)
<223>X is V or L
<400>48
Xaa Xaa Xaa Xaa
1
<210>49
<211>4
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>Preferred C-terminal  sequence
<400>49
Glu Ser Asp Val
<210>50
<211>4
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>Preferred C-terminal sequence
<400>50
Glu Thr Asp Val
1
<210>51
<211>4
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>Preferred C-terminal  sequence
<400>51
Glu Thr Glu Val
1
<210>52
<211>4
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>Preferred C-terminal sequence
<400>52
Asp Thr Asp Val
1
<210>53
<211>4
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>Preferred C-terminal sequence
<400>53
Asp Thr Glu Val
1
<210>54
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence
<400>54
Gly Arg Trp Thr Gly Arg Ser Met Ser Ser Trp Lys Pro Thr Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
         20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence
<400>55
Gln Ile Ser Pro Gly Gly Leu Glu Pro Pro Ser Glu Lys His Phe Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
<210>56
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence
<400>56
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Tyr Ile Pro Glu Ala
1             5               10                15
Gln Thr Arg Leu
          20
<210>57
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence
<400>57
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Arg Ile Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Thr Asp Val
          20
<210>58
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence
<400>58
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
<210>59
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence
<400>59
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Thr Lys Asn Tyr Lys
1             5               10                15
Gln Thr Ser Val
          20
<210>60
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding DLG2 d1
<400>60
Ala Ala Gly Gly Arg Ser Ala Arg Gly Gly Arg Leu Gln Gly Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Ala Leu
          20
<210>61
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding DLG2 d1
<400>61
Ala Gly Ala Val Arg Thr Pro Leu Ser Gln Val Asn Lys Val Trp Asp
1             5               10                15
Gln Ser Ser Val
          20
<210>62
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding DLG2 d1
<400>62
Ala Val Gly Gly Arg Pro Ala Arg Gly Gly Arg Leu Gln Gly Arg Arg
1             5               10                15
Gln Thr Gln Val
          20
<210>63
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding DLG2 d1
<400>63
Asp Phe Arg Pro Ser Phe Lys His Ile Leu Phe Arg Arg Ala Arg Arg
1             5               10                15
Gly Phe Arg Gln
          20
<210>64
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding DLG2 d1
<400>64
Asp Thr Leu Leu Leu Thr Glu Asn Glu Gly Asp Lys Thr Glu Glu Gln
1             5               10                15
Val Ser Tyr Val
          20
<210>65
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding DLG2 d1
<400>65
Gly Arg Trp Thr Gly Arg Ala Met Ser Ala Trp Lys Pro Thr Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
<210>66
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding DLG2 d1
<400>66
His His Leu Val Ala Gln Arg Asp Ile Arg Gln Phe Gln Leu Gln His
1             5               10                15
Trp Leu Ala Ile
          20
<210>67
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding DLG2 d1
<400>67
Lys His Ser Arg Lys Ser Ser Ser Tyr Ser Ser Ser Ser Thr Thr Val
1             5               10                15
Lys Thr Ser Tyr
          20
<210>68
<211>23
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding DLG2 d1
<400>68
Lys Lys Lys Lys Gln Pro Gly Asn Ser Thr Lys Glu Ser Glu Ser Thr
1             5               10                15
Asn Ser Val Arg Leu Met Leu
          20
<210>69
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding DLG2 d1
<400>69
Leu Ala Val Leu Ala Tyr Ser Ile Thr Leu Val Met Leu Trp Ser Ile
1             5               10                15
Trp Gln Tyr Ala
          20
<210>70
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding DLG2 d1
<400>70
Leu Asn Ser Cys Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
<210>71
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding DLG2 d1
<400>71
Leu Asn Ser Ser Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
<210>72
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding DLG2 d1
<400>72
Pro Ile Pro Ala Gly Gly Cys Thr Phe Ser Gly Ile Phe Pro Thr Leu
1             5               10                15
Thr Ser Pro Leu
          20
<210>73
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding DLG2 d1
<400>73
ProTyr Ser Glu Leu Asn Tyr Glu Thr Ser His Tyr Pro Ala Ser Pro
1            5               10                15
Asp Ser Trp Val
20
<210>74
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding DLG2 d1
<400>74
Gln Asp Phe Arg Arg Ala Phe Arg Arg Ile Leu Ala Arg Pro Trp Thr
1             5               10                15
Gln Thr Ala Trp
          20
<210>75
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>75
Gln Ile Ser Pro Gly Gly Leu Glu Pro Pro Ser Glu Lys His Phe Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
<210>76
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>76
Arg Glu Leu Val Asp Arg Gly Glu Val Arg Gln Phe Thr Leu Arg His
1             5               10                15
Trp Leu Lys Val
          20
<210>77
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>77
Ser Phe Thr Ser Ile Leu Thr Cys His Gln Arg Arg Thr Gln Arg Lys
1             5               10                15
Glu Thr Val Ala
          20
<210>78
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>78
Ser Leu Lys Pro Gly Thr Val Leu Pro Pro Pro Pro Tyr Arg His Arg
1             5               10                15
Asn Thr Val Val
          20
<210>79
<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>79
Ser Ser Lys Ser Lys Ser Ser Glu Glu Ser Gln Thr Phe Phe Gly Leu
1             5               10                15
Tyr Lys Leu
<210>80
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>80
Ser Tyr Pro Thr Pro Arg Pro Tyr Pro Lys Pro Ala Pro Ser Ser Gly
1             5               10                15
Lys Asp Tyr Val
          20
<210>81
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>81
Thr Gly Ser Ala Leu Gln Ala Trp Arg His Thr Ser Arg Gln Ala Thr
1             5               10                15
Glu Ser Thr Val
          20
<210>82
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>82
Thr Gln Gly Phe Pro Gly Pro Ala Thr Trp Arg Arg Ile Ser Ser Leu
1             5               10                15
Glu Ser Glu Val
          20
<210>83
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>83
Val Gly Thr Leu Leu Leu Glu Arg Val Ile Phe Pro Ser Val Lys Ile
1             5               10                15
Ala Thr Leu Val
          20
<210>84
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>84
Val His Lys Val Arg Asn Lys Phe Lys Ala Lys Cys Ser Leu Cys Arg
1             5               10                15
Leu Tyr Ile Ile
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>85
 Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Gly Ala Ser Ala Asp
1              5               10                15
Ser Thr Gln Ala
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>86
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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<400>87
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Asn Asp Asn Ile Ala
1             5               10                15
Leu Leu Val Gln
          20
<210>88
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding DLG2 d1
<400>88
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Ser Glu Gly Val Pro
1             5               10                15
Asp Leu Leu Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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Asp Phe Ser Arg Gln Leu Gln Asn Ser Met Ser Gly Ala Ser Ala Asp
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Ser Thr Gln Ala
          20
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<212>PRT
<213>Artificial
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<400>90
Lys Lys Lys Lys Gln Pro Gly Asn Ser Thr Lys Glu Ser Glu Ser Thr
1             5               10                15
Asn Ser Val Arg Leu Met Leu
          20
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<213>Artificial
<220>
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<400>91
Asn Tyr Lys Leu Asn Thr Asp His Ala Gly Ser Asn Asp Asn Ile Ala
1             5               10                15
Leu Leu Val Gln
20
<210>92
<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>92
Ser Gly Gly Asn Arg Ala Arg Gln Glu Arg Leu Gln Arg Arg Arg Glu
1             5               10                15
Thr Gln Val
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>93
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Ala Arg Gly Asp Arg
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Lys Arg Ile Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>94
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Ala Val Ala Ala Thr
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Ser Ile Asn Leu
          20
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<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>95
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Glu Met Gln Val Thr
1             5               10                15
Leu Gly Leu His
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>96
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Gly Ala Ser Ala Asp
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Ser Thr Gln Ala
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>97
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Ile Gly Glu Leu Gln
1             5               10                15
Leu Ser Ile Ala
          20
<210>98
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<220>
<221>misc_feature
<222>(20)..(20)
<223>Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400>98
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Xaa
          20
<210>99
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>99
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Asn Asp Asn Ile Ala
1             5               10                15
Leu Leu Val Gln
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding GORASP d1
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Gln Asp Glu Glu Glu
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Gly Ile Trp Ala
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>101
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Ser Glu Gly Val Pro
1             5               10                15
Asp Leu Leu Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding GORASP d1
<400>102
Tyr Val Tyr Ser Arg Val Lys Asn Leu Asn Ser Ser Glu Gly Val Pro
1             5               10                15
Asp Leu Leu Val
          20
<210>103
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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Ala Val Gly Gly Arg Pro Ala Arg Gly Gly Arg Leu Gln Gly Arg Arg
1             5               10                15
Gln Thr Gln Val
          20
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<211>20
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<213>Artificial
<220>
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Asp Phe Arg Pro Ser Phe Lys His Ile Leu Phe Arg Arg Ala Arg Arg
1             5               10                15
Gly Phe Arg Gln
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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His His Leu Val Ala Gln Arg Asp Ile Arg Gln Phe Gln Leu Gln His
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Trp Leu Ala Ile
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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His Ser Cys Cys Asn Arg Ala Arg Gln Glu Arg Leu Gln Arg Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Gln Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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Lys His Ser Arg Lys Ser Ser Ser Tyr Ser Ser Ser Ser Thr Thr Val
1             5               10                15
Lys Thr Ser Tyr
          20
<210>108
<211>23
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding GRIP1 d4
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Lys Lys Lys Lys Gln Pro Gly Asn Ser Thr Lys Glu Ser Glu Ser Thr
1             5               10                15
Asn Ser Val Arg Leu Met Leu
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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Lys Tyr Ser Ala Pro Arg Arg Pro Thr Ala Thr Gly Asp Tyr Asp Lys
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Lys Asn Tyr Val
          20
<210>110
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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Leu Ala Val Leu Ala Tyr Ser Ile Thr Leu Val Met Leu Trp Ser Ile
1             5               10                15
Trp Gln Tyr Ala
          20
<210>111
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>111
Gln Asp Phe Arg Arg Ala Phe Arg Arg Ile Leu Ala Arg Pro Trp Thr
1             5               10                15
Gln Thr Ala Trp
          20
<210>112
<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding GRIP1 d4
<400>112
Ser Ser Lys Ser Lys Ser Ser Glu Glu Ser Gln Thr Phe Phe Gly Leu
1             5               10                15
Tyr Lys Leu
<210>113
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding GRIP1 d4
<400>113
Ser Ser Pro Asp Ser Ser Tyr Gln Gly Lys Gly Phe Val Met Ser Arg
1             5               10                15
Ala Met Tyr Val
          20
<210>114
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>114
Val Asp Pro Asn Ser Pro Ala Ala Lys Lys Lys Tyr Val Ser Tyr Asn
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Asn Leu Val Ile
          20
<210>115
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>115
Val His Lys Val Arg Asn Lys Phe Lys Ala Lys Cys Ser Leu Cys Arg
1             5               10                15
Leu Tyr Ile Ile
          20
<210>116
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding GRIP1 d4
<400>116
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Gly Ala Ser Ala Asp
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Ser Thr Gln Ala
          20
<210>117
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding GRIP1 d4
<400>117
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Asn Asp Asn Ile Ala
1             5               10                15
Leu Leu Val Gln
          20
<210>118
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding GRIP1 d4
<400>118
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Ser Glu Gly Val Pro
1             5               10                15
Asp Leu Leu Val
          20
<210>119
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>119
Ala Gly Ala Val Arg Thr Pro Leu Ser Gln Val Asn Lys Val Trp Asp
1             5               10                15
Gln Ser Ser Val
          20
<210>120
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>120
Ala Leu Val Leu Ile Ala Phe Cys Ile Ile Arg Arg Arg Pro Ser Ala
1             5               10                15
Tyr Gln Ala Leu
          20
<210>121
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>121
Ala Thr Asp Tyr Leu Val Gln Pro Phe Met Asp Gln Leu Ala Phe His
1             5               10                15
Gln Phe Tyr Ile
          20
<210>122
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>122
Ala Val Gly Gly Arg Pro Ala Arg Gly Gly Arg Leu Gln Gly Arg Arg
1             5               10                15
Gln Thr Gln Val
          20
<210>123
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>123
Asp Phe Arg Pro Ser Phe Lys His Ile Leu Phe Arg Arg Ala Arg Arg
1             5               10                15
Gly Phe Arg Gln
          20
<210>124
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>124
Asp Ser Asp Pro Glu Asn Glu Pro Phe Asp Glu Asp Gln His Thr Gln
1             5               10                15
Ile Thr Lys Val
          20
<210>125
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>125
Asp Thr Leu Leu Leu Thr Glu Asn Glu Gly Asp Lys Thr Glu Glu Gln
1             5               10                15
Val Ser Tyr Val
          20
<210>126
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>126
Glu Leu Leu Gln Phe Cys Arg Thr Pro Asn Pro Ala Leu Lys Asn Gly
1             5               10                15
Gln Tyr Trp Val
          20
<210>127
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>127
Glu Ser Ser Gly Thr Gln Ser Pro Lys Arg His Ser Gly Ser Tyr Leu
1             5               10                15
Val Thr Ser Val
          20
<210>128
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>128
Gly Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Leu Pro His Ser
1             5               10                15
Thr Thr Arg Val
          20
<210>129
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>129
Gly Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Ser Arg Arg Pro
1             5               10                15
Lys Thr Arg Val
          20
<210>130
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>130
Gly Arg Trp Thr Gly Arg Ala Met Ser Ala Trp Lys Pro Thr Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
<210>131
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>131
His His Leu Val Ala Gln Arg Asp Ile Arg Gln Phe Gln Leu Gln His
1             5               10                15
Trp Leu Ala Ile
          20
<210>132
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>132
His Ser Cys Cys Asn Arg Ala Arg Gln Glu Arg Leu Gln Arg Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Gln Val
          20
<210>133
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>133
Ile Asn Ser Val Gly Ser Thr Ala Ser Ser Ser Gln Pro Leu Leu Val
1             5               10                15
His Asp Asp Val
          20
<210>134
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>134
Lys Ala Gly Tyr Arg Ala Pro Arg Ser Tyr Pro Lys Ser Asn Ser Ser
1             5               10                15
Lys Glu Tyr Val
          20
<210>135
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>135
Lys His Ser Arg Lys Ser Ser Ser Tyr Ser Ser Ser Ser Thr Thr Val
1             5               10                15
Lys Thr Ser Tyr
          20
<210>136
<211>23
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>136
Lys Lys Lys Lys Gln Pro Gly Asn Ser Thr Lys Glu Ser Glu Ser Thr
1             5               10                15
Asn Ser Val Arg Leu Met Leu
          20
<210>137
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>137
Lys Thr Met Pro Ala Ala Met Tyr Arg Leu Leu Thr Ala Gln Glu Gln
1             5               10                15
Pro Val Tyr Ile
          20
<210>138
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>138
Leu Ala Val Leu Ala Tyr Ser Ile Thr Leu Val Met Leu Trp Ser Ile
1             5               10                15
Trp Gln Tyr Ala
          20
<210>139
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>139
Leu Gly Tyr Ser Ile Pro Ser Arg Ser Gly Ala Ser Gly Leu Asp Lys
1             5               10                15
Arg Asp Tyr Val
          20
<210>140
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>140
Leu Asn Ser Cys Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
<210>141
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>141
Leu Asn Ser Ser Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
<210>142
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>142
Pro Ile Pro Ala Gly Gly Cys Thr Phe Ser Gly Ile Phe Pro Thr Leu
1             5               10                15
Thr Ser Pro Leu
          20
<210>143
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>143
Pro Tyr Ser Glu Leu Asn Tyr Glu Thr Ser His Tyr Pro Ala Ser Pro
1             5               10                15
Asp Ser Trp Val
          20
<210>144
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>144
Gln Asp Phe Arg Arg Ala Phe Arg Arg Ile Leu Ala Arg Pro Trp Thr
1             5               10                15
Gln Thr Ala Trp
          20
<210>145
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>145
Arg Glu Leu Val Asp Arg Gly Glu Val Arg Gln Phe Thr Leu Arg His
1             5               10                15
Trp Leu Lys Val
          20
<210>146
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>146
Arg Asn Ile Glu Glu Val Tyr Val Gly Gly Lys Gln Val Val Pro Phe
1             5               10                15
Ser Ser Ser Val
          20
<210>147
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>147
Ser Phe Thr Ser Ile Leu Thr Cys His Gln Arg Arg Thr Gln Arg Lys
1             5               10                15
Glu Thr Val Ala
          20
<210>148
<211>18
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>148
Ser Pro Gln Pro Asp Ser Thr Asp Asn Asp Asp Tyr Asp Asp Ile Ser
1             5               10                15
Ala Ala
<210>149
<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>149
Ser Ser Lys Ser Lys Ser Ser Glu Glu Ser Gln Thr Phe Phe Gly Leu
1             5               10                15
Tyr Lys Leu
<210>150
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>150
Ser Ser Pro Asp Ser Ser Tyr Gln Gly Lys Gly Phe Val Met Ser Arg
1             5               10                15
Ala Met Tyr Val
          20
<210>151
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>151
Ser Tyr Pro Thr Pro Arg Pro Tyr Pro Lys Pro Ala Pro Ser Ser Gly
1             5               10                15
Lys Asp Tyr Val
          20
<210>152
<211>18
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>152
Thr Phe Ala Ala Gly Phe Asn Ser Thr Gly Leu Pro His Ser Thr Thr
1             5               10                15
Arg Val
<210>153
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>153
Thr Phe Lys Gly Thr Pro Thr Ala Glu Asn Pro Glu Tyr Leu Gly Leu
1             5               10                15
Asp Val Pro Val
          20
<210>154
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>154
Thr Gly Ser Ala Leu Gln Ala Trp Arg His Thr Ser Arg Gln Ala Thr
1             5               10                15
Glu Ser Thr Val
          20
<210>155
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>155
Thr Gln Gly Phe Pro Gly Pro Ala Thr Trp Arg Arg Ile Ser Ser Leu
1             5               10                15
Glu Ser Glu Val
          20
<210>156
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>156
Thr Arg Glu Asp Ile Tyr Val Asn Tyr Pro Thr Phe Ser Arg Arg Pro
1             5               10                15
Lys Thr Arg Val
          20
<210>157
<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>157
Thr Thr Asn Asn Asn Pro Asn Ser Ala Val Asn Ile Lys Lys Ile Phe
1             5               10                15
Thr Asp Val
<210>158
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>158
Val Asp Pro Asn Ser Pro Ala Ala Lys Lys Lys Tyr Val Ser Tyr Asn
1             5               10                15
Asn Leu Val Ile
          20
<210>159
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>159
Val Gly Thr Leu Leu Leu Glu Arg Val Ile Phe Pro Ser Val Lys Ile
1             5               10                15
Ala Thr Leu Val
          20
<210>160
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>160
Val His Lys Val Arg Asn Lys Phe Lys Ala Lys Cys Ser Leu Cys Arg
1             5               10                15
Leu Tyr Ile Ile
          20
<210>161
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>161
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Gly Ala Ser Ala Asp
1             5               10                15
Ser Thr Gln Ala
          20
<210>162
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>162
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
<210>163
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>163
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Met Ala Arg Thr Ala
1             5               10                15
Arg Ser Lys Val
          20
<210>164
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding INADL d8
<400>164
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Asn Asp Asn Ile Ala
1             5               10                15
Leu Leu Val Gln
          20
<210>165
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1284 d1
<220>
<221>misc_feature
<222>(20)..(20)
<223>Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400>165
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Xaa
          20
<210>166
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1284 d1
<400>166
Ala Val Gly Gly Arg Pro Ala Arg Gly Gly Arg Leu Gln Gly Arg Arg
1             5               10                15
Gln Thr Gln Val
          20
<210>167
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1284 d1
<400>167
Asp Phe Arg Pro Ser Phe Lys His Ile Leu Phe Arg Arg Ala Arg Arg
1             5               10                15
Gly Phe Arg Gln
          20
<210>168
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1284 d1
<400>168
Asp Gly Gly Ala Arg Thr Glu Asp Glu Val Gln Ser Tyr Pro Ser Lys
1             5               10                15
His Asp Tyr Val
          20
<210>169
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1284 d1
<400>169
Phe His Ser Lys Thr Ala Gly Ala Asn Thr Thr Asp Lys Glu Leu Glu
1             5               10                15
Val Leu Ser Leu
          20
<210>170
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1284 d1
<400>170
Gly Gly Glu Asp Phe Lys Thr Thr Asn Pro Ser Lys Gln Phe Asp Lys
1             5               10                15
Asn Ala Tyr Val
          20
<210>171
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1284 d1
<400>171
Gly Arg Trp Thr Gly Arg Ala Met Ser Ala Trp Lys Pro Thr Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
<210>172
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1284 d1
<400>172
His Asp Phe Arg Arg Ala Phe Lys Lys Ile Leu Ala Arg Gly Asp Arg
1             5               10                15
Lys Arg Ile Val
          20
<210>173
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1284 d1
<400>173
His His Leu Val Ala Gln Arg Asp Ile Arg Gln Phe Gln Leu Gln His
1             5               10                15
Trp Leu Ala Ile
          20
<210>174
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1284 d1
<400>174
His Ser Cys Cys Asn Arg Ala Arg Gln Glu Arg Leu Gln Arg Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Gln Val
          20
<210>175
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1284 d1
<400>175
Ile Leu Asn Ser Ile Gln Val Met Arg Ala Gln Met Asn Gln Ile Gln
1             5               10                15
Ser Val Glu Val
          20
<210>176
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1284 d1
<400>176
Lys Ala Gly Tyr Arg Ala Pro Arg Ser Tyr Pro Lys Ser Asn Ser Ser
1             5               10                15
Lys Glu Tyr Val
          20
<210>177
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1284 d1
<400>177
Lys His Ser Arg Lys Ser Ser Ser Tyr Ser Ser Ser Ser Thr Thr Val
1             5               10                15
Lys Thr Ser Tyr
          20
<210>178
<211>23
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1284 d1
<400>178
Lys Lys Lys Lys Gln Pro Gly Asn Ser Thr Lys Glu Ser Glu Ser Thr
1             5               10                15
Asn Ser Val Arg Leu Met Leu
          20
<210>179
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1284 d1
<400>179
Leu Ala Val Leu Ala Tyr Ser Ile Thr Leu Val Met Leu Trp Ser Ile
1             5               10                15
Trp Gln Tyr Ala
          20
<210>180
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1284 d1
<400>180
Leu Gly Tyr Ser Ile Pro Ser Arg Ser Gly Ala Ser Gly Leu Asp Lys
1             5               10                15
Arg Asp Tyr Val
          20
<210>181
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1284 d1
<400>181
Leu Asn Ser Cys Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
<210>182
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1284 d1
<400>182
Leu Ser Glu Lys Lys Thr Ser Gln Ser Pro His Arg Phe Gln Lys Thr
1             5               10                15
Ala Ser Pro Ile
          20
<210>183
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1284 d1
<400>183
Pro Gly Gln Pro Pro Lys Val Lys Ser Glu Phe Asn Ser Tyr Ser Leu
1            5               10                15
Thr Gly Tyr Val
          20
<210>184
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1284 d1
<400>184
Pro Ile Pro Ala Gly Gly Cys Thr Phe Ser Gly Ile Phe Pro Thr Leu
1             5               10                15
Thr Ser Pro Leu
          20
<210>185
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1284 d1
<400>185
Gln Asp Phe Arg Arg Ala Phe Arg Arg Ile Leu Ala Arg Pro Trp Thr
1             5               10                15
Gln Thr Ala Trp
          20
<210>186
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1284 d1
<400>186
Arg Glu Leu Val Asp Arg Gly Glu Val Arg Gln Phe Thr Leu Arg His
1             5               10                15
Trp Leu Lys Val
          20
<210>187
<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1284 d1
<400>187
Ser Ser Lys Ser Lys Ser Ser Glu Glu Ser Gln Thr Phe Phe Gly Leu
1             5               10                15
Tyr Lys Leu
<210>188
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1284 d1
<400>188
Ser Ser Pro Asp Ser Ser Tyr Gln Gly Lys Gly Phe Val Met Ser Arg
1             5               10                15
Ala Met Tyr Val
          20
<210>189
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>189
Thr Phe Lys Gly Thr Pro Thr Ala Glu Asn Pro Glu Tyr Leu Gly Leu
1             5               10                15
Asp Val Pro Val
          20
<210>190
<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>190
Thr Thr Asn Asn Asn Pro Asn Ser Ala Val Asn Ile Lys Lys Ile Phe
1             5               10                15
Thr Asp Val
<210>191
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>191
Val Asp Pro Asn Ser Pro Ala Ala Lys Lys Lys Tyr Val Ser Tyr Asn
1             5               10                15
Asn Leu Val Ile
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>192
Val His Lys Val Arg Asn Lys Phe Lys Ala Lys Cys Ser Leu Cys Arg
1             5               10                15
Leu Tyr Ile Ile
          20
<210>193
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>193
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Glu Met Gln Val Thr
1             5               10                15
Leu Gly Leu His
          20
<210>194
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>194
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Gly Ala Ser Ala Asp
1             5               10                15
Ser Thr Gln Ala
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Ile Gly Glu Leu Gln
1             5               10                15
Leu Ser Ile Ala
          20
<210>196
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>196
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
<210>197
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<220>
<221>misc_feature
<222>(20)..(20)
<223>Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400>197
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Xaa
          20
<210>198
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>198
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Asn Asp Asn Ile Ala
1             5               10                15
Leu Leu Val Gln
          20
<210>199
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>199
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Ser Glu Gly Val Pro
1             5               10                15
Asp Leu Leu Val
          20
<210>200
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>200
Asp Phe Arg Pro Ser Phe Lys His Ile Leu Phe Arg Arg Ala Arg Arg
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Gly Phe Arg Gln
          20
<210>201
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>201
Asp Gly Gly Ala Arg Thr Glu Asp Glu Val Gln Ser Tyr Pro Ser Lys
1             5               10                15
His Asp Tyr Val
          20
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<213>Artificial
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Glu Ala Leu Gln Pro Glu Pro Gly Arg Lys Arg Ile Pro Leu Thr Arg
1             5               10                15
Thr Thr Thr Phe
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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<400>203
Phe His Ser Lys Thr Ala Gly Ala Asn Thr Thr Asp Lys Glu Leu Glu
1             5               10                15
Val Leu Ser Leu
          20
<210>204
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>204
Gly Gly Glu Asp Phe Lys Thr Thr Asn Pro Ser Lys Gln Phe Asp Lys
1             5               10                15
Asn Ala Tyr Val
          20
<210>205
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>205
His His Leu Val Ala Gln Arg Asp Ile Arg Gln Phe Gln Leu Gln His
1             5               10                15
Trp Leu Ala Ile
          20
<210>206
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>206
His Ser Cys Cys Asn Arg Ala Arg Gln Glu Arg Leu Gln Arg Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Gln Val
          20
<210>207
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>207
Ile Leu Asn Ser Ile Gln Val Met Arg Ala Gln Met Asn Gln Ile Gln
1             5               10                15
Ser Val Glu Val
          20
<210>208
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>208
Lys Ala Gly Tyr Arg Ala Pro Arg Ser Tyr Pro Lys Ser Asn Ser Ser
1             5               10                15
Lys Glu Tyr Val
          20
<210>209
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>209
Lys His Ser Arg Lys Ser Ser Ser Tyr Ser Ser Ser Ser Thr Thr Val
1             5               10                15
Lys Thr Ser Tyr
          20
<210>210
<211>23
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>210
Lys Lys Lys Lys Gln Pro Gly Asn Ser Thr Lys Glu Ser Glu Ser Thr
1             5               10                15
Asn Ser Val Arg Leu Met Leu
          20
<210>211
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>211
Leu Ala Val Leu Ala Tyr Ser Ile Thr Leu Val Met Leu Trp Ser Ile
1             5               10                15
Trp Gln Tyr Ala
          20
<210>212
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Leu Gly Tyr Ser Ile Pro Ser Arg Ser Gly Ala Ser Gly Leu Asp Lys
1             5               10                15
Arg Asp Tyr Val
          20
<210>213
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Leu Asn Ser Cys Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
<210>214
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>214
Pro Gly Gln Pro Pro Lys Val Lys Ser Glu Phe Asn Ser Tyr Ser Leu
1             5               10                15
Thr Gly Tyr Val
          20
<210>215
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>215
Pro Ile Pro Ala Gly Gly Cys Thr Phe Ser Gly Ile Phe Pro Thr Leu
1             5               10                15
Thr Ser Pro Leu
          20
<210>216
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>216
Gln Asp Phe Arg Arg Ala Phe Arg Arg Ile Leu Ala Arg Pro Trp Thr
1             5               10                15
Gln Thr Ala Trp
          20
<210>217
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>217
Arg Glu Leu Val Asp Arg Gly Glu Val Arg Gln Phe Thr Leu Arg His
1             5               10                15
Trp Leu Lys Val
          20
<210>218
<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>218
Ser Ser Lys Ser Lys Ser Ser Glu Glu Ser Gln Thr Phe Phe Gly Leu
1             5               10                15
Tyr Lys Leu
<210>219
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>219
Ser Ser Pro Asp Ser Ser Tyr Gln Gly Lys Gly Phe Val Met  Ser Arg
1             5               10                15
Ala Met Tyr Val
          20
<210>220
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>220
Ser Ser Ser Arg Arg Asp Ser Ser Trp Ser Glu Thr Ser Glu Ala Ser
1             5               10                15
Tyr Ser Gly Leu
          20
<210>221
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>221
Thr Ala Glu Asn Ala Glu Tyr Leu Arg Val Ala Pro Gln Ser Ser Glu
1             5               10                15
Phe Ile Gly Ala
          20
<210>222
<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>222
Thr Thr Asn Asn Asn Pro Asn Ser Ala Val Asn Ile Lys Lys Ile Phe
1             5               10                15
Thr Asp Val
<210>223
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1415 d1
<400>223
Val Asp Pro Asn Ser Pro Ala Ala Lys Lys Lys Tyr Val Ser Tyr Asn
1             5               10                15
Asn Leu Val Ile
          20
<210>224
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>224
Val His Lys Val Arg Asn Lys Phe Lys Ala Lys Cys Ser Leu Cys Arg
1             5               10                15
Leu Tyr Ile Ile
          20
<210>225
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1415 d1
<400>225
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Gly Ala Ser Ala Asp
1             5               10                15
Ser Thr Gln Ala
          20
<210>226
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1415 d1
<400>226
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Asn Asp Asn Ile Ala
1             5               10                15
Leu Leu Val Gln
          20
<210>227
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1415 d1
<400>227
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Ser Glu Gly Val Pro
1             5               10                15
Asp Leu Leu Val
          20
<210>228
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>228
Asp Gly Gly Ala Arg Thr Glu Asp Glu Val Gln Ser Tyr Pro Ser Lys
1             5               10                15
His Asp Tyr Val
          20
<210>229
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1719 d4
<400>229
Phe His Ser Lys Thr Ala Gly Ala Asn Thr Thr Asp Lys Glu Leu Glu
1             5               10                15
Val Leu Ser Leu
          20
<210>230
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1719 d4
<400>230
His Asp Phe Arg Arg Ala Phe Lys Lys Ile Leu Ala Arg Gly Asp Arg
1             5               10                15
Lys Arg Ile Val
          20
<210>231
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1719 d4
<400>231
His His Leu Val Ala Gln Arg Asp Ile Arg Gln Phe Gln Leu Gln His
1             5               10                15
Trp Leu Ala Ile
          20
<210>232
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1719 d4
<400>232
His Ser Cys Cys Asn Arg Ala Arg Gln Glu Arg Leu Gln Arg Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Gln Val
          20
<210>233
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1719 d4
<400>233
Lys Ala Gly Tyr Arg Ala Pro Arg Ser Tyr Pro Lys Ser Asn Ser Ser
1             5               10                15
Lys Glu Tyr Val
          20
<210>234
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1719 d4
<400>234
Lys His Ser Arg Lys Ser Ser Ser Tyr Ser Ser Ser Ser Thr Thr Val
1             5               10                15
Lys Thr Ser Tyr
          20
<210>235
<211>23
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1719 d4
<400>235
Lys Lys Lys Lys Gln Pro Gly Asn Ser Thr Lys Glu Ser Glu Ser Thr
1             5               10                15
Asn Ser Val Arg Leu Met Leu
          20
<210>236
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1719 d4
<400>236
Leu Ala Val Leu Ala Tyr Ser Ile Thr Leu Val Met Leu Trp Ser Ile
1             5               10                15
Trp Gln Tyr Ala
          20
<210>237
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<223>PL sequence binding KIAA1719 d4
<400>237
Asn Ser Tyr Val Arg Asp Asp Ala Ile Phe Ile Lys Ala Ile Val Asp
1             5               10                15
Leu Thr Gly Leu
          20
<210>238
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>238
Pro Gly Gln Pro Pro Lys Val Lys Ser Glu Phe Asn Ser Tyr Ser Leu
1             5               10                15
Thr Gly Tyr Val
          20
<210>239
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<223>PL sequence binding KIAA1719 d4
<400>239
Gln Asp Phe Arg Arg Ala Phe Arg Arg Ile Leu Ala Arg Pro Trp Thr
1             5               10                15
Gln Thr Ala Trp
          20
<210>240
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1719 d4
<400>240
Ser Pro Ala Ser Ile Pro His Ser Pro Gly Ala Phe Ala Tyr Glu Gly
1             5               10                15
Ala Ser Phe Tyr
          20
<210>241
<211>19
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<213>Artificial
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<400>241
Ser Ser Lys Ser Lys Ser Ser Glu Glu Ser Gln Thr Phe Phe Gly Leu
1             5               10                15
Tyr Lys Leu
<210>242
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1719 d4
<400>242
Ser Ser Ser Arg Arg Asp Ser Ser Trp Ser Glu Thr Ser Glu Ala Ser
1             5               10                15
Tyr Ser Gly Leu
          20
<210>243
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1719 d4
<400>243
Val His Lys Val Arg Asn Lys Phe Lys Ala Lys Cys Ser Leu Cys Arg
1             5               10                15
Leu Tyr Ile Ile
          20
<210>244
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>244
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Glu Met Gln Val Thr
1             5               10                15
Leu Gly Leu His
          20
<210>245
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1719 d4
<400>245
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Asn Asp Asn Ile Ala
1             5               10                15
Leu Leu Val Gln
          20
<210>246
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1719 d4
<400>246
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Arg Ile Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Thr Asp Val
          20
<210>247
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1719 d4
<400>247
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Arg Ile Ser Ser Leu
1             5               10                15
Glu Thr Gln Val
          20
<210>248
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding KIAA1719 d4
<400>248
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Ser Glu Gly Val Pro
1             5               10                15
Asp Leu Leu Val
          20
<210>249
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>249
Ala Ala Gly Gly Arg Ser Ala Arg Gly Gly Arg Leu Gln Gly Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Ala Leu
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>250
Ala Thr Asp Tyr Leu Val Gln Pro Phe Met Asp Gln Leu Ala Phe His
1             5               10                15
Gln Phe Tyr Ile
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>251
Asp Phe Arg Pro Ser Phe Lys His Ile Leu Phe Arg Arg Ala Arg Arg
1             5               10                15
Gly Phe Arg Gln
          20
<210>252
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>252
Glu Asp Pro Lys Asp Arg Pro Ser Ala Ala His Ile Val Glu Ala Leu
1             5               10                15
Glu Thr Asp Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>253
Glu Leu Leu Gln Phe Cys Arg Thr Pro Asn Pro Ala Leu Lys Asn Gly
1             5               10                15
Gln Tyr Trp Val
          20
<210>254
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
<400>254
Phe His Ser Lys Thr Ala Gly Ala Asn Thr Thr Asp Lys Glu Leu Glu
1             5               10                15
Val Leu Ser Leu
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
<400>255
Phe Asn Gly Ser Ser Asn Gly His Val Tyr Glu Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>256
Gly Arg Trp Thr Gly Arg Ala Met Ser Ala Trp Lys Pro Thr Arg Arg
1             5               101                5
Glu Thr Glu Val
          20
<210>257
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
<400>257
His Asp Phe Arg Arg Ala Phe Lys Lys Ile Leu Ala Arg Gly Asp Arg
1             5               10                15
Lys Arg Ile Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>258
His His Leu Val Ala Gln Arg Asp Ile Arg Gln Phe Gln Leu Gln His
1             5               10                15
Trp Leu Ala Ile
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
<400>259
His Ser Cys Cys Asn Arg Ala Arg Gln Glu Arg Leu Gln Arg Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Gln Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>260
Ile Leu Asn Ser Ile Gln Val Met Arg Ala Gln Met Asn Gln Ile Gln
1             5               10                15
Ser Val Glu Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
<400>261
Lys His Ser Arg Lys Ser Ser Ser Tyr Ser Ser Ser Ser Thr Thr Val
1             5               10                15
Lys Thr Ser Tyr
          20
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<211>23
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
<400>262
Lys Lys Lys Lys Gln Pro Gly Asn Ser Thr Lys Glu Ser Glu Ser Thr
1             5               10                15
Asn Ser Val Arg Leu Met Leu
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
<400>263
Leu Ala Ser Lys Ser Ala Glu Glu Gly Lys Gln Ile Pro Asp Ser Leu
1             5               10                15
Ser Thr Asp Leu
          20
<210>264
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
<400>264
Leu Ala Val Leu Ala Tyr Ser Ile Thr Leu Val Met Leu Trp Ser Ile
1             5               10                15
Trp Gln Tyr Ala
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
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Leu Met Asp Gly Leu Pro Pro Gly Asp Ser Asn Gln Leu Ala Trp Phe
1             5               10                15
Asp Thr Asp Leu
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
<400>266
Leu Asn Ser Cys Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
<400>267
Leu Asn Ser Ser Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
<400>268
Pro Ile Pro Ala Gly Gly Cys Thr Phe Ser Gly Ile Phe Pro Thr Leu
1             5               10                15
Thr Ser Pro Leu
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
<400>269
Pro Tyr Ser Glu Leu Asn Tyr Glu Thr Ser His Tyr Pro Ala Ser Pro
1            5               10                15
Asp Ser Trp Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
<400>270
Gln Asp Phe Arg Arg Ala Phe Arg Arg Ile Leu Ala Arg Pro Trp Thr
1             5               10                15
Gln Thr Ala Trp
          20
<210>271
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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Gln Ile Ser Pro Gly Gly Leu Glu Pro Pro Ser Glu Lys His Phe Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
<210>272
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
<400>272
Arg Glu Leu Val Asp Arg Gly Glu Val Arg Gln Phe Thr Leu Arg His
1             5               10                15
Trp Leu Lys Val
          20
<210>273
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
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Ser Pro Ala Ser Ile Pro His Ser Pro Gly Ala Phe Ala Tyr Glu Gly
1             5               10                15
Ala Ser Phe Tyr
          20
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<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
<400>274
Ser Ser Lys Ser Lys Ser Ser Glu Glu Ser Gln Thr Phe Phe Gly Leu
1             5               10                15
Tyr Lys Leu
<210>275
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
<400>275
Ser Ser Ser Arg Arg Asp Ser Ser Trp Ser Glu Thr Ser Glu Ala Ser
1             5               10                15
Tyr Ser Gly Leu
          20
<210>276
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
<400>276
Ser Tyr Pro Thr Pro Arg Pro Tyr Pro Lys Pro Ala Pro Ser Ser Gly
1             5               10                15
Lys Asp Tyr Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
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Thr Phe Lys Gly Thr Pro Thr Ala Glu Asn Pro Glu Tyr Leu Gly Leu
1             5               10                15
Asp Val Pro Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
<400>278
Thr Gln Gly Phe Pro Gly Pro Ala Thr Trp Arg Arg Ile Ser Ser Leu
1             5               10                15
Glu Ser Glu Val
          20
<210>279
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
<400>279
Val Asp Pro Asn Ser Pro Ala Ala Lys Lys Lys Tyr Val Ser Tyr Asn
1             5               10                15
Asn Leu Val Ile
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
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Val His Asp Ala Glu Ser Ser Asp Glu Asp Gly Tyr Asp Trp Gly Pro
1             5               10                15
Ala Thr Asp Leu
          20
<210>281
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
<400>281
Val His Lys Val Arg Asn Lys Phe Lys Ala Lys Cys Ser Leu Cys Arg
1             5               10                15
Leu Tyr Ile Ile
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
<400>282
Val Pro Gly Ala Leu Asp Tyr Ala Ala Phe Ser Ser Ala Leu Tyr Gly
1             5               10                15
Glu Ser Asp Leu
          20
<210>283
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
<400>283
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Ala Val Ala Ala Ala
1             5               10                15
Ser Ala Asn Leu
          20
<210>284
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
<400>284
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Ala Val Ala Ala Thr
1             5               10                15
Ser Ala Asn Leu
          20
<210>285
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
<400>285
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Ala Val Ala Ala Thr
1             5               10                15
Ser Ile Asn Leu
          20
<210>286
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
<400>286
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Glu Tyr Leu Gly Leu
1             5               10                15
Asp Val Pro Val
          20
<210>287
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
<400>287
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
<210>288
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Lim Mystique d1
<400>288
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Asn Asp Asn Ile Ala
1             5               10                15
Leu Leu Val Gln
          20
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<213>Artificial
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Ala Ala Gly Gly Arg Ser Ala Arg Gly Gly Arg Leu Gln Gly Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Ala Leu
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<223>PL sequence binding MAGI1 d1
<400>290
Ala Leu Val Leu Ile Ala Phe Cys Ile Ile Arg Arg Arg Pro Ser Ala
1             5               10                15
Tyr Gln Ala Leu
          20
<210>291
<211>19
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<213>Artificial
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<223>PL sequence binding MAGI1 d1
<400>291
Ala Arg His Arg Val Thr Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Val Asn Val Ser
1             5               10                15
Ser Asn Leu
<210>292
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI1 d1
<400>292
Ala Thr Asp Tyr Leu Val Gln Pro Phe Met Asp Gln Leu Ala Phe His
1             5               10                15
Gln Phe Tyr Ile
          20
<210>293
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<223>PL sequence binding MAGI1 d1
<400>293
Ala Val Gly Gly Arg Pro Ala Arg Gly Gly Arg Leu Gln Gly Arg Arg
1             5               10                15
Gln Thr Gln Val
          20
<210>294
<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI1 d1
<400>294
Ala Trp Asp Asp Ser Ala Arg Ala Ala Gly Gly Gln Gly Leu His Val
1             5               10                15
Thr Ala Leu
<210>295
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI1 d1
<400>295
Asp Phe Arg Pro Ser Phe Lys His Ile Leu Phe Arg Arg Ala Arg Arg
1             5               10                15
Gly Phe Arg Gln
          20
<210>296
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI1 d1
<400>296
Glu Leu Leu Gln Phe Cys Arg Thr Pro Asn Pro Ala Leu Lys Asn Gly
1             5               10                15
Gln Tyr Trp Val
          20
<210>297
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI1 d1
<400>297
Glu Ser Ser Gly Thr Gln Ser Pro Lys Arg His Ser Gly Ser Tyr Leu
1             5               10                15
Val Thr Ser Val
          20
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Phe Asn Gly Ser Ser Asn Gly His Val Tyr Glu Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
<210>299
<211>19
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<213>Artificial
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Gly Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Gly Ser Gly Ile Glu Ser
1             5               10                15
Val Lys Ile
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Gly Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly His Ser
1             5               10                15
Thr Thr Arg Val
          20
<210>301
<211>20
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<213>Artificial
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<400>301
Gly Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Leu Pro His Ser
1             5               10                15
Thr Thr Arg Val
          20
<210>302
<211>20
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<213>Artificial
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<400>302
Gly Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Ser Arg Arg Pro
1             5               10                15
Lys Thr Arg Val
          20
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<400>303
Gly Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Thr Phe Ser Arg Arg Pro
1             5               10                15
Lys Thr Arg Val
          20
<210>304
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>304
Gly Arg Trp Ala Gly Arg Ser Ala Ala Ser Trp Arg Ser Arg Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Ala Leu
          20
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Gly Arg Trp Thr Gly Arg Ala Met Ser Ala Trp Lys Pro Thr Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
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<211>20
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Gly Arg Trp Thr Gly Arg Ser Ala Val Ser Trp Arg Pro Arg Arg Arg
1             5               10                15
Gln Thr Gln Val
          20
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<211>20
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Gly Arg Trp Thr Gly Arg Ser Met Ser Ser Trp Lys Pro Thr Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
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<211>20
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His His Leu Val Ala Gln Arg Asp Ile Arg Gln Phe Gln Leu Gln His
1             5               10                15
Trp Leu Ala Ile
          20
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His Ser Cys Cys Asn Arg Ala Arg Gln Glu Arg Leu Gln Arg Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Gln Val
          20
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<211>20
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Ile Ser Gly Thr Pro Thr Ser Thr Met Val His Gly Met Thr Ser Ser
1             5               10                15
Ser Ser Val Val
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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Lys Ala Gly Tyr Arg Ala Pro Arg Ser Tyr Pro Lys Ser Asn Ser Ser
1             5               10                15
Lys Glu Tyr Val
          20
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<211>19
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<213>Artificial
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Lys Asp Ser Arg Pro Ser Phe Val Gly Ser Ser Ser Gly His Thr Ser
1             5               10                15
Thr Thr Leu
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Lys His Ser Arg Lys Ser Ser Ser Tyr Ser Ser Ser Ser Thr Thr Val
1             5               10                15
Lys Thr Ser Tyr
          20
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<213>Artificial
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Lys Lys Lys Lys Gln Pro Gly Asn Ser Thr Lys Glu Ser Glu Ser Thr
1             5               10                15
Asn Ser Val Arg Leu Met Leu
          20
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Leu Ala Val Leu Ala Tyr Ser Ile Thr Leu Val Met Leu Trp Ser Ile
1             5               10                15
Trp Gln Tyr Ala
          20
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<211>20
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Leu His Asn Gln Ala Ser Val Pro Leu Glu Pro Arg Pro Leu Arg Arg
1             5               10                15
Glu Ser Glu Ile
         20
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<213>Artificial
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Leu Asn Glu Thr Thr Glu Thr Gln Arg Thr Leu Leu Asn Gly Asp Leu
1             5               10                15
Gln Thr Ser Ile
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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Leu Asn Ser Cys Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
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<213>Artificial
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Leu Asn Ser Ser Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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Met Gly Arg Trp Thr Gly Arg Ser Ser Glu Ser Trp Arg Pro Arg Pro
1             5               10                15
Val Thr Gln Val
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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Asn Thr Ser Ser Asp Gln Ala Arg Gln Glu Arg Leu Arg Arg Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Gln Val
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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Pro Gly Gln Pro Pro Lys Val Lys Ser Glu Phe Asn Ser Tyr Ser Leu
1             5               10                15
Thr Gly Tyr Val
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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Pro Ile Pro Ala Gly Gly Cys Thr Phe Ser Gly Ile Phe Pro Thr Leu
1             5               10                15
Thr Ser Pro Leu
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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Gln Asp Phe Arg Arg Ala Phe Arg Arg Ile Leu Ala Arg Pro Trp Thr
1             5               10                15
Gln Thr Ala Trp
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Gln Ile Ser Pro Gly Gly Leu Glu Pro Pro Ser Glu Lys His Phe Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
<210>326
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI1 d1
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Gln Gln Tyr Gln Gln Arg Gln Ser Val Ile Phe His Lys Arg Ala Pro
1             5               10                15
Glu Gln Ala Leu
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Arg Glu Leu Val Asp Arg Gly Glu Val Arg Gln Phe Thr Leu Arg His
1             5               10                15
Trp Leu Lys Val
          20
<210>328
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Arg Asn Ile Glu Glu Val Tyr Val Gly Gly Lys Gln Val Val Pro Phe
1             5               10                15
Ser Ser Ser Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>329
Ser Glu Gly Gly Arg Pro Thr Arg Gly Pro Arg Leu Gln Gly Arg Arg
1             5               10                15
Val Thr Gln Val
          20
<210>330
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Ser Phe Thr Ser Ile Leu Thr Cys His Gln Arg Arg Thr Gln Arg Lys
1             5               10                15
Glu Thr Val Ala
          20
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<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
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Ser Gly Gly Asn Arg Ala Arg Gln Glu Arg Leu Gln Arg Arg Arg Glu
1             5               10                15
Thr Gln Val
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Ser Leu Ile Gly Pro Val Gln Lys Glu Tyr Gln Arg Glu Leu Gly Lys
1             5              10                15
Leu Ser Ser Pro
          20
<210>333
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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Ser Leu Lys Pro Gly Thr Val Leu Pro Pro Pro Pro Tyr Arg His Arg
1             5               10                15
Asn Thr Val Val
          20
<210>334
<211>18
<212>PRT
<213>Artificial
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Ser Pro Gln Pro Asp Ser Thr Asp Asn Asp Asp Tyr Asp Asp Ile Ser
1             5               10                15
Ala Ala
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<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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Ser Ser Lys Ser Lys Ser Ser Glu Glu Ser Gln Thr Phe Phe Gly Leu
1             5              10                15
Tyr Lys Leu
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Ser Ser Pro Asp Ser Ser Tyr Gln Gly Lys Gly Phe Val Met Ser Arg
1             5               10                15
Ala Met Tyr Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Ser Ser Ser Arg Arg Asp Ser Ser Trp Ser Glu Thr Ser Glu Ala Ser
1             5               10                15
Tyr Ser Gly Leu
          20
<210>338
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Ser Tyr Pro Thr Pro Arg Pro Tyr Pro Lys Pro Ala Pro Ser Ser Gly
1             5               10                15
Lys Asp Tyr Val
          20
<210>339
<211>18
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI1 d1
<400>339
Thr Phe Ala Ala Gly Phe Asn Ser Thr Gly Leu Pro His Ser Thr Thr
1             5               10                15
Arg Val
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<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI1 d1
<400>340
Thr Gly Arg Gly Met Ser Gly Gly Arg Ser Ser Arg Thr Arg Arg Glu
1             5               10                15
Thr Gln Leu
<210>341
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI1 d1
<400>341
Thr Gly Ser Ala Leu Gln Ala Trp Arg His Thr Ser Arg Gln Ala Thr
1             5               10                15
Glu Ser Thr Val
          20
<210>342
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI1 d1
<400>342
Thr Gln Gly Phe Pro Gly Pro Ala Thr Trp Arg Arg Ile Ser Ser Leu
1             5               10                15
Glu Ser Glu Val
          20
<210>343
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI1 d1
<400>343
Thr Arg Glu Asp Ile Tyr Val Asn Tyr Pro Thr Phe Ser Arg Arg Pro
1             5               10                15
Lys Thr Arg Val
          20
<210>344
<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI1 d1
<400>344
Thr Thr Asn Asn Asn Pro Asn Ser Ala Val Asn Ile Lys Lys Ile Phe
1             5               10                15
Thr Asp Val
<210>345
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI1 d1
<400>345
Val Asp Pro Asn Ser Pro Ala Ala Lys Lys Lys Tyr Val  Ser Tyr Asn
1             5               10                15
Asn Leu Val Ile
          20
<210>346
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI1 d1
<400>346
Val Gly Thr Leu Leu Leu Glu Arg Val Ile Phe Pro Ser Val Lys Ile
1             5               10                15
Ala Thr Leu Val
          20
<210>347
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>347
Val His Lys Val Arg Asn Lys Phe Lys Ala Lys Cys Ser Leu Cys Arg
1             5               10                15
Leu Tyr Ile Ile
          20
<210>348
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI1 d1
<400>348
Trp Thr Gly Gln Ser Ala Asn Ser Arg Lys Pro Pro Arg Gln Arg Ser
1             5               10                15
Glu Thr Gln Val
          20
<210>349
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI1 d1
<400>349
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Glu Lys His Phe Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
<210>350
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI1 d1
<400>350
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Gly Ala Ser Ala Asp
1             5               10                15
Ser Thr Gln Ala
          20
<210>351
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>351
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
<210>352
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI1 d1
<400>352
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Asn Asp Asn Ile Ala
1             5               10                15
Leu Leu Val Gln
          20
<210>353
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI1 d1
<400>353
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Arg Ile Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Thr Asp Val
          20
<210>354
<211>20
 <212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI1 d1
<400>354
Tyr Ser Ala Thr Tyr Ser Glu Leu Glu Asp Pro Gly Glu Met Ser Pro
1             5               10                15
Pro Ile Asp Leu
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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Ala Ala Gly Gly Arg Ser Ala Arg Gly Gly Arg Leu Gln Gly Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Ala Leu
          20
<210>356
<211>20
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<213>Artificial
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Ala Thr Asp Tyr Leu Val Gln Pro Phe Met Asp Gln Leu Ala Phe His
1             5               10                15
Gln Phe Tyr Ile
          20
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<213>Artificial
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Ala Val Gly Gly Arg Pro Ala Arg Gly Gly Arg Leu Gln Gly Arg Arg
1             5               10                15
Gln Thr Gln Val
          20
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Ala Trp Asp Asp Ser Ala Arg Ala Ala Gly Gly Gln Gly Leu His Val
1             5               10                15
Thr Ala Leu
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<213>Artificial
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Asp Phe Arg Pro Ser Phe Lys His Ile Leu Phe Arg Arg Ala Arg Arg
1             5               10                15
Gly Phe Arg Gln
          20
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<213>Artificial
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Asp Gly Gly Ala Arg Thr Glu Asp Glu Val Gln Ser Tyr Pro Ser Lys
1             5               10                15
His Asp Tyr Val
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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Asp Ser Asp Pro Glu Asn Glu Pro Phe Asp Glu Asp Gln His Thr Gln
1             5               10                15
Ile Thr Lys Val
          20
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<211>20
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Glu Leu Leu Gln Phe Cys Arg Thr Pro Asn Pro Ala Leu Lys Asn Gly
1             5               10                15
Gln Tyr Trp Val
          20
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<213>Artificial
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Glu Ser Ser Gly Thr Gln Ser Pro Lys Arg His Ser Gly Ser Tyr Leu
1             5               10                15
Val Thr Ser Val
          20
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Phe His Ser Lys Thr Ala Gly Ala Asn Thr Thr Asp Lys Glu Leu Glu
1             5               10                15
Val Leu Ser Leu
          20
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<213>Artificial
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Phe Asn Gly Ser Ser Asn Gly His Val Tyr Glu Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
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<213>Artificial
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Gly Gly Glu Asp Phe Lys Thr Thr Asn Pro Ser Lys Gln Phe Asp Lys
1             5               10                15
Asn Ala Tyr Val
          20
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Gly Arg Trp Thr Gly Arg Ala Met Ser Ala Trp Lys Pro Thr Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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His Asp Phe Arg Arg Ala Phe Lys Lys Ile Leu Ala Arg Gly Asp Arg
1             5               10                15
Lys Arg Ile Val
          20
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His His Leu Val Ala Gln Arg Asp Ile Arg Gln Phe Gln Leu Gln His
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Trp Leu Ala Ile
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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His Ser Cys Cys Asn Arg Ala Arg Gln Glu Arg Leu Gln Arg Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Gln Val
          20
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<213>Artificial
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Ile Leu Asn Ser Ile Gln Val Met Arg Ala Gln Met Asn Gln Ile Gln
1             5               10                15
Ser Val Glu Val
          20
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<213>Artificial
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Lys Ala Gly Tyr Arg Ala Pro Arg Ser Tyr Pro Lys Ser Asn Ser Ser
1             5               10                15
Lys Glu Tyr Val
          20
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<212>PRT
<213>Artificial
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Lys His Ser Arg Lys Ser Ser Ser Tyr Ser Ser Ser Ser Thr Thr Val
1             5               10                15
Lys Thr Ser Tyr
        20
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<213>Artificial
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Lys Lys Lys Lys Gln Pro Gly Asn Ser Thr Lys Glu Ser Glu Ser Thr
1             5               10                15
Asn Ser Val Arg Leu Met Leu
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Lys Tyr Ser Ala Pro Arg Arg Pro Thr Ala Thr Gly Asp Tyr Asp Lys
1             5               10                15
Lys Asn Tyr Val
          20
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<213>Artificial
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Leu Ala Ser Lys Ser Ala Glu Glu Gly Lys Gln Ile Pro Asp Ser Leu
1             5               10                15
Ser Thr Asp Leu
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>377
Leu Ala Val Leu Ala Tyr Ser Ile Thr Leu Val Met Leu Trp Ser Ile
1             5               10                15
Trp Gln Tyr Ala
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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Leu Gly Tyr Ser Ile Pro Ser Arg Ser Gly Ala Ser Gly Leu Asp Lys
1             5               10                15
Arg Asp Tyr Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Leu Met Asp Gly Leu Pro Pro Gly Asp Ser Asn Gln Leu Ala Trp Phe
1             5               10                15
Asp Thr Asp Leu
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Leu Asn Ser Cys Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI2 d5
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Leu Asn Ser Ser Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
<210>382
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Pro Gly Gln Pro Pro Lys Val Lys Ser Glu Phe Asn Ser Tyr Ser Leu
1             5               10                15
Thr Gly Tyr Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Pro Ile Pro Ala Gly Gly Cys Thr Phe Ser Gly Ile Phe Pro Thr Leu
1             5               10                15
Thr Ser Pro Leu
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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ProTyr Ser Glu Leu Asn Tyr Glu Thr Ser His Tyr Pro Ala Ser Pro
1            5               10                15
Asp Ser Trp Val
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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<400>385
Gln Ala Thr Ser Arg Asn Gly His Ser Ala Arg Gln His Val Val Ala
1             5               10                15
Asp Thr Glu Leu
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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Gln Asp Phe Arg Arg Ala Phe Arg Arg Ile Leu Ala Arg Pro Trp Thr
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Gln Thr Ala Trp
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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Gln Ile Ser Pro Gly Gly Leu Glu Pro Pro Ser Glu Lys His Phe Arg
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Glu Thr Glu Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Arg Glu Leu Val Asp Arg Gly Glu Val Arg Gln Phe Thr Leu Arg His
1             5               10                15
Trp Leu Lys Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Arg Asn Ile Glu Glu Val Tyr Val Gly Gly Lys Gln Val Val Pro Phe
1             5               10                15
Ser Ser Ser Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Ser Pro Ala Ser Ile Pro His Ser Pro Gly Ala Phe Ala Tyr Glu Gly
1             5               10                15
Ala Ser Phe Tyr
          20
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<212>PRT
<213>Artificial
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Ser Ser Lys Ser Lys Ser Ser Glu Glu Ser Gln Thr Phe Phe Gly Leu
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Tyr Lys Leu
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Ser Ser Pro Asp Ser Ser Tyr Gln Gly Lys Gly Phe Val Met Ser Arg
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Ala Met Tyr Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Ser Ser Ser Arg Arg Asp Ser Ser Trp Ser Glu Thr Ser Glu Ala Ser
1             5               10                15
Tyr Ser Gly Leu
          20
<210>394
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Thr Gly Ser Ala Leu Gln Ala Trp Arg His Thr Ser Arg Gln Ala Thr
1             5               10                15
Glu Ser Thr Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Thr Gln Gly Phe Pro Gly Pro Ala Thr Trp Arg Arg Ile Ser Ser Leu
1             5               10                15
Glu Ser Glu Val
          20
<210>396
<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
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Thr Thr Asn Asn Asn Pro Asn Ser Ala Val Asn Ile Lys Lys Ile Phe
1             5               10                15
Thr Asp Val
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Val Asp Pro Asn Ser Pro Ala Ala Lys Lys Lys Tyr Val Ser Tyr Asn
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Asn Leu Val Ile
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Val Gly Thr Leu Leu Leu Glu Arg Val Ile Phe Pro Ser Val Lys Ile
1             5               10                15
Ala Thr Leu Val
          20
<210>399
<211>20
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<213>Artificial
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<400>399
Val His Asp Ala Glu Ser Ser Asp Glu Asp Gly Tyr Asp Trp Gly Pro
1             5               10                15
Ala Thr Asp Leu
          20
<210>400
<211>20
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<213>Artificial
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<400>400
Val His Lys Val Arg Asn Lys Phe Lys Ala Lys Cys Ser Leu Cys Arg
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Leu Tyr Ile Ile
          20
<210>401
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI2 d5
<400>401
Val Pro Gly Ala Leu Asp Tyr Ala Ala Phe Ser Ser Ala Leu Tyr Gly
1             5               10                15
Glu Ser Asp Leu
          20
<210>402
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI2 d5
<400>402
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Ala Val Ala Ala Thr
1             5               10                15
Ser Ala Asn Leu
          20
<210>403
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI2 d5
<400>403
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Glu Tyr Leu Gly Leu
1             5               10                15
Asp Val Pro Val
          20
<210>404
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>404
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Gly Ala Ser Ala Asp
1             5               10                15
Ser Thr Gln Ala
          20
<210>405
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI2 d5
<400>405
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
<210>406
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<223>PL sequence binding MAGI2 d5
<400>406
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Asn Asp Asn Ile Ala
1             5               10                15
Leu Leu Val Gln
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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<400>407
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Ser Glu Gly Val Pro
1             5               10                15
Asp Leu Leu Val
          20
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Ala Ala Gly Gly Arg Ser Ala Arg Gly Gly Arg Leu Gln Gly Arg Arg
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Glu Thr Ala Leu
          20
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<213>Artificial
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Ala Leu Val Leu Ile Ala Phe Cys Ile Ile Arg Arg Arg Pro Ser Ala
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Tyr Gln Ala Leu
          20
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<400>410
Ala Arg His Arg Val Thr Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Val Asn Val Ser
1             5               10                15
Ser Asn Leu
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<213>Artificial
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Ala Thr Asp Tyr Leu Val Gln Pro Phe Met Asp Gln Leu Ala Phe His
1             5               10                15
Gln Phe Tyr Ile
          20
<210>412
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>412
Ala Val Gly Gly Arg Pro Ala Arg Gly Gly Arg Leu Gln Gly Arg Arg
1             5               10                15
Gln Thr Gln Val
          20
<210>413
<211>20
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<213>Artificial
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Asp Phe Arg Pro Ser Phe Lys His Ile Leu Phe Arg Arg Ala Arg Arg
1             5               10                15
Gly Phe Arg Gln
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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Glu Leu Leu Gln Phe Cys Arg Thr Pro Asn Pro Ala Leu Lys Asn Gly
1             5               10                15
Gln Tyr Trp Val
          20
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<211>17
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<213>Artificial
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Glu Asn Leu Ala Pro Val Thr Thr Phe Gly Lys Thr Asn Gly Tyr Ile
1             5               10                15
Ala
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<211>20
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<213>Artificial
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Glu Ser Ser Gly Thr Gln Ser Pro Lys Arg His Ser Gly Ser Tyr Leu
1             5               10                15
Val Thr Ser Val
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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Phe Asn Gly Ser Ser Asn Gly His Val Tyr Glu Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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Gly Gly Asp Leu Gly Thr Arg Arg Gly Ser Ala His Phe Ser Ser Leu
1             5               10                15
Glu Ser Glu Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Gly Gly Glu Asp Phe Lys Thr Thr Asn Pro Ser Lys Gln Phe Asp Lys
1             5               10                15
Asn Ala Tyr Val
          20
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<211>19
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<213>Artificial
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Gly Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Gly Ser Gly Ile Glu Ser
1             5               10                15
Val Lys Ile
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Gly Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly His Ser
1             5               10                15
Thr Thr Arg Val
          20
<210>422
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>422
Gly Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Leu Pro His Ser
1             5               10                15
Thr Thr Arg Val
          20
<210>423
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Gly Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Ser Arg Arg Pro
1             5               10                15
Lys Thr Arg Val
          20
<210>424
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Gly Arg Trp Ala Gly Arg Ser Ala Ala Ser Trp Arg Ser Arg Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Ala Leu
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Gly Arg Trp Thr Gly Arg Ala Met Ser Ala Trp Lys Pro Thr Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
<210>426
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Gly Arg Trp Thr Gly Arg Cys Met Ser Cys Trp Lys Pro Thr Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Gly Arg Trp Thr Gly Arg Ser Ala Val Ser Trp Arg Pro Arg Arg Arg
1             5               10                15
Gln Thr Gln Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Gly Arg Trp Thr Gly Arg Ser Met Ser Ser Trp Lys Pro Thr Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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His Ala Met Asn Ala Ala Pro Arg Ala Met Glu Asn Ala Pro Ala Leu
1             5               10                15
Arg Thr Ser His
          20
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<213>Artificial
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His His Leu Val Ala Gln Arg Asp Ile Arg Gln Phe Gln Leu Gln His
1             5               10                15
Trp Leu Ala Ile
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Ile Ser Gly Thr Pro Thr Ser Thr Met Val His Gly Met Thr Ser Ser
1             5               10                15
Ser Ser Val Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Ile Ser Lys Leu Gly Ile Ser Gly Asp Ile Asp Leu Thr Ser Ala Ser
1             5               10                15
Tyr Thr Met Ile
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Lys Ala Gly Tyr Arg Ala Pro Arg Ser Tyr Pro Lys Ser Asn Ser Ser
1             5               10                15
Lys Glu Tyr Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Lys His Ser Arg Lys Ser Ser Ser Tyr Ser Ser Ser Ser Thr Thr Val
1             5               10                15
Lys Thr Ser Tyr
          20
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<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d1
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Lys Lys Lys Lys Gln Pro Gly Asn Ser Thr Lys Glu Ser Glu Ser Thr
1             5               10                15
Asn Ser Val Arg Leu Met Leu
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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Leu Ala Ser Lys Ser Ala Glu Glu Gly Lys Gln Ile Pro Asp Ser Leu
1             5               10                15
Ser Thr Asp Leu
          20
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<212>PRT
<213>Artificial
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Leu Ala Val Leu Ala Tyr Ser Ile Thr Leu Val Met Leu Trp Ser Ile
1             5               10                15
Trp Gln Tyr Ala
          20
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<212>PRT
<213>Artificial
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Leu His Asn Gln Ala Ser Val Pro Leu Glu Pro Arg Pro Leu Arg Arg
1             5               10                15
Glu Ser Glu Ile
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Leu Asn Ser Cys Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Leu Asn Ser Ser Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<223>PL sequence binding MAGI3 d1
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Leu Ser Glu Lys Lys Thr Ser Gln Ser Pro His Arg Phe Gln Lys Thr
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Ser Ser Pro Ile
          20
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<213>Artificial
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Met Gly Arg Trp Thr Gly Arg Ser Ser Glu Ser Trp Arg Pro Arg Pro
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Val Thr Gln Val
          20
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<213>Artificial
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Asn Thr Ser Ser Asp Gln Ala Arg Gln Glu Arg Leu Arg Arg Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Gln Val
          20
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<213>Artificial
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<223>PL sequence binding MAGI3 d1
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Pro Gly Gln Pro Pro Lys Val Lys Ser Glu Phe Asn Ser Tyr Ser Leu
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Thr Gly Tyr Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Pro Ile Pro Ala Gly Gly Cys Thr Phe Ser Gly Ile Phe Pro Thr Leu
1            5                10                15
Thr Ser Pro Leu
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<223>PL sequence binding MAGI3 d1
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Pro Tyr Ser Glu Leu Asn Tyr Glu Thr Ser His Tyr Pro Ala Ser Pro
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Asp Ser Trp Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Gln Asp Phe Arg Arg Ala Phe Arg Arg Ile Leu Ala Arg Pro Trp Thr
1             5               10                15
Gln Thr Ala Trp
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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GlnIle Ser Pro Gly Gly Leu Glu Pro Pro Ser Glu Lys His Phe Arg
1            5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
<210>449
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d1
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Arg Glu Leu Val Asp Arg Gly Glu Val Arg Gln Phe Thr Leu Arg His
1             5               10                15
Trp Leu Lys Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<223>PL sequence binding MAGI3 d1
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Arg Asn Ile Glu Glu Val Tyr Val Gly Gly Lys Gln Val Val Pro Phe
1             5               10                15
Ser Ser Ser Val
          20
<210>451
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d1
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Ser Phe Thr Ser Ile Leu Thr Cys His Gln Arg Arg Thr Gln Arg Lys
1             5               10                15
Glu Thr Val Ala
          20
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<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
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<223>PL sequence binding MAGI3 d1
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Ser Gly Gly Asn Arg Ala Arg Gln Glu Arg Leu Gln Arg Arg Arg Glu
1             5               10                15
Thr Gln Val
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d1
<400>453
Ser Leu Ile Gly Pro Val Gln Lys Glu Tyr Gln Arg Glu Leu Gly Lys
1             5               10                15
Leu Ser Ser Pro
          20
<210>454
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d1
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Ser Leu Lys Pro Gly Thr Val Leu Pro Pro Pro Pro Tyr Arg His Arg
1             5               10                15
Asn Thr Val Val
          20
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<211>18
<212>PRT
<213>Artificial
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<223>PL sequence binding MAGI3 d1
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Ser Pro Gln Pro Asp Ser Thr Asp Asn Asp Asp Tyr Asp Asp Ile Ser
1             5               10                15
Ala Ala
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<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
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Ser Ser Lys Ser Lys Ser Ser Glu Glu Ser Gln Thr Phe Phe Gly Leu
1             5               10                15
Tyr Lys Leu
<210>457
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d1
<400>457
Ser Ser Pro Asp Ser Ser Tyr Gln Gly Lys Gly Phe Val Met Ser Arg
1             5               10                15
Ala Met Tyr Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d1
<400>458
Ser Thr Asp Asn Leu Val Arg Pro Phe Met Asp Thr Leu Ala Ser His
1             5               10                15
Gln Leu Tyr Ile
          20
<210>459
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<223>PL sequence binding MAGI3 d1
<400>459
Ser Tyr Pro Thr Pro Arg Pro Tyr Pro Lys Pro Ala Pro Ser Ser Gly
1             5               10                15
Lys Asp Tyr Val
          20
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<211>18
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<213>Artificial
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<223>PL sequence binding MAGI3 d1
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Thr Phe Ala Ala Gly Phe Asn Ser Thr Gly Leu Pro His Ser Thr Thr
1             5               10                15
Arg Val
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<211>20
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<213>Artificial
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Thr Phe Lys Gly Thr Pro Thr Ala Glu Asn Pro Glu Tyr Leu Gly Leu
1             5               10                15
Asp Val Pro Val
          20
<210>462
<211>19
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<213>Artificial
<220>
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<400>462
Thr Gly Arg Gly Met Ser Gly Gly Arg Ser Ser Arg Thr Arg Arg Glu
1             5               10                15
Thr Gln Leu
<210>463
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d1
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Thr Gly Ser Ala Leu Gln Ala Trp Arg His Thr Ser Arg Gln Ala Thr
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Glu Ser Thr Val
          20
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<213>Artificial
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Thr Gln Gly Phe Pro Gly Pro Ala Thr Trp Arg Arg Ile Ser Ser Leu
1             5                10                15
Glu Ser Glu Val
          20
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<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d1
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Thr Arg Glu Asp Ile Tyr Val Asn Tyr Pro Thr Phe Ser Arg Arg Pro
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Lys Thr Arg Val
          20
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<213>Artificial
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Thr Thr Asn Asn Asn Pro Asn Ser Ala Val Asn Ile Lys Lys Ile Phe
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Thr Asp Val
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<213>Artificial
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Val Asp Pro Asn Ser Pro Ala Ala Lys Lys Lys Tyr Val Ser Tyr Asn
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<213>Artificial
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<223>PL sequence binding MAGI3 d1
<400>468
Val Gly Thr Leu Leu Leu Glu Arg Val Ile Phe Pro Ser Val Lys Ile
1             5               10                15
Ala Thr Leu Val
          20
<210>469
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d1
<400>469
Val His Lys Val Arg Asn Lys Phe Lys Ala Lys Cys Ser Leu Cys Arg
1             5               10                15
Leu Tyr Ile Ile
          20
<210>470
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d1
<400>470
Trp Thr Gly Gln Ser Ala Asn Ser Arg Lys Pro Pro Arg Gln Arg Ser
1             5               10                15
Glu Thr Gln Val
          20
<210>471
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d1
<400>471
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
<210>472
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d1
<400>472
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Asn Asp Asn Ile Ala
1             5               10                15
Leu Leu Val Gln
          20
<210>473
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d1
<400>473
Tyr Ser Ala Thr Tyr Ser Glu Leu Glu Asp Pro Gly Glu Met Ser Pro
1             5               10                15
Pro Ile Asp Leu
          20
<210>474
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>474
Ala Thr Asp Tyr Leu Val Gln Pro Phe Met Asp Gln Leu Ala Phe His
1             5               10                15
Gln Phe Tyr Ile
          20
<210>475
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>475
Ala Val Gly Gly Arg Pro Ala Arg Gly Gly Arg Leu Gln Gly Arg Arg
1             5               10                15
Gln Thr Gln Val
          20
<210>476
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>476
Asp Phe Arg Pro Ser Phe Lys His Ile Leu Phe Arg Arg Ala Arg Arg
1             5               10                15
Gly Phe Arg Gln
          20
<210>477
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>477
Asp Ser Asp Pro Glu Asn Glu Pro Phe Asp Glu Asp Gln His Thr Gln
1             5               10                15
Ile Thr Lys Val
          20
<210>478
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>478
Asp Thr Leu Leu Leu Thr Glu Asn Glu Gly Asp Lys Thr Glu Glu Gln
1             5               10                15
Val Ser Tyr Val
          20
<210>479
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>479
Glu Asp Pro Lys Asp Arg Pro Ser Ala Ala His Ile Val Glu Ala Leu
1             5               10                15
Glu Thr Asp Val
          20
<210>480
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>480
Glu Ser Ser Gly Thr Gln Ser Pro Lys Arg His Ser Gly Ser Tyr Leu
1             5               10                15
Val Thr Ser Val
          20
<210>481
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>481
Gly Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly His Ser
1             5               10                15
Thr Thr Arg Val
          20
<210>482
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>482
Gly Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Leu Pro His Ser
1             5               10                15
Thr Thr Arg Val
          20
<210>483
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>483
Gly Arg Trp Thr Gly Arg Ala Met Ser Ala Trp Lys Pro Thr Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
<210>484
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>484
Gly Arg Trp Thr Gly Arg Cys Met Ser Cys Trp Lys Pro Thr Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
<210>485
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>485
His Asp Phe Arg Arg Ala Phe Lys Lys Ile Leu Ala Arg Gly Asp Arg
1             5               10                15
Lys Arg Ile Val
          20
<210>486
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>486
His His Leu Val Ala Gln Arg Asp Ile Arg Gln Phe Gln Leu Gln His
1             5               10                15
Trp Leu Ala Ile
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>487
His Pro Thr Asp Ile Thr Gly Leu Pro Asn Leu Ser Asp Pro Ser Val
1             5               10                15
Ser Thr Val Val
          20
<210>488
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>488
Ile Leu Asn Ser Ile Gln Val Met Arg Ala Gln Met Asn Gln Ile Gln
1             5               10                15
Ser Val Glu Val
          20
<210>489
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>489
Ile Ser Gly Thr Pro Thr Ser Thr Met Val His Gly Met Thr Ser Ser
1             5               10                15
Ser Ser Val Val
          20
<210>490
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>490
Ile Val Thr Val Val Thr Met Val Thr Asn Val Asp Phe Pro Pro Lys
1             5               10                15
Glu Ser Ser Leu
          20
<210>491
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>491
Lys Ala Gly Tyr Arg Ala Pro Arg Ser Tyr Pro Lys Ser Asn Ser Ser
1             5               10                15
Lys Glu Tyr Val
          20
<210>492
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>492
Lys His Ser Arg Lys Ser Ser Ser Tyr Ser Ser Ser Ser Thr Thr Val
1             5               10                15
Lys Thr Ser Tyr
          20
<210>493
<211>23
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>493
Lys Lys Lys Lys Gln Pro Gly Asn Ser Thr Lys Glu Ser Glu Ser Thr
1             5               10                15
Asn Ser Val Arg Leu Met Leu
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>494
Leu Ala Ser Lys Ser Ala Glu Glu Gly Lys Gln Ile Pro Asp Ser Leu
1             5               10                15
Ser Thr Asp Leu
          20
<210>495
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>495
Leu Ala Val Leu Ala Tyr Ser Ile Thr Leu Val Met Leu Trp Ser Ile
1             5               10                15
Trp Gln Tyr Ala
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>496
Leu Asn Ser Cys Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
<210>497
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>497
Pro Gly Gln Pro Pro Lys Val Lys Ser Glu Phe Asn Ser Tyr Ser Leu
1             5               10                15
Thr Gly Tyr Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>498
Pro Ile Pro Ala Gly Gly Cys Thr Phe Ser Gly Ile Phe Pro Thr Leu
1             5               10                15
Thr Ser Pro Leu
          20
<210>499
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>499
Pro Tyr Gln Ser Gln Gly Phe Ser Thr Glu Glu Asp Glu Asp Glu Gln
1             5               10                15
Val Ser Ala Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>500
Gln Asp Phe Arg Arg Ala Phe Arg Arg Ile Leu Ala Arg Pro Trp Thr
1             5               10                15
Gln Thr Ala Trp
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>501
Gln Ile Ser Pro Gly Gly Leu Glu Pro Pro Ser Glu Lys His Phe Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
<210>502
<211>20
<212>PRT
<213>Artifieial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>502
Arg Glu Leu Val Asp Arg Gly Glu Val Arg Gln Phe Thr Leu Arg His
1             5               10                15
Trp Leu Lys Val
          20
<210>503
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>503
Arg Ser Gly Ala Thr Ile Pro Leu Val Gly Gln Asp Ile Ile Asp Leu
1             5               10                15
Gln Thr Glu Val
          20
<210>504
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>504
Ser Phe Thr Ser Ile Leu Thr Cys His Gln Arg Arg Thr Gln Arg Lys
1             5               10                15
Glu Thr Val Ala
          20
<210>505
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>505
Ser Leu Lys Pro Gly Thr Val Leu Pro Pro Pro Pro Tyr Arg His Arg
1             5               10                15
Asn Thr Val Val
          20
<210>506
<211>18
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>506
Ser Pro Gln Pro Asp Ser Thr Asp Asn Asp Asp Tyr Asp Asp Ile Ser
1             5               10                15
Ala Ala
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<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>507
Ser Ser Lys Ser Lys Ser Ser Glu Glu Ser Gln Thr Phe Phe Gly Leu
1             5               10                15
Tyr Lys Leu
<210>508
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>508
Ser Ser Ser Arg Arg Asp Ser Ser Trp Ser Glu Thr Ser Glu Ala Ser
1             5               10                15
Tyr Ser Gly Leu
         20
<210>509
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>509
Ser Tyr Pro Thr Pro Arg Pro Tyr Pro Lys Pro Ala Pro Ser Ser Gly
1             5               10                15
Lys Asp Tyr Val
20
<210>510
<211>18
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>510
Thr Phe Ala Ala Gly Phe Asn Ser Thr Gly Leu Pro His Ser Thr Thr
1             5               10                15
Arg Val
<210>511
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>511
Thr Gly Ser Ala Leu Gln Ala Trp Arg His Thr Ser Arg Gln Ala Thr
1             5               10                15
Glu Ser Thr Val
          20
<210>512
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>512
Thr Gln Gly Phe Pro Gly Pro Ala Thr Trp Arg Arg Ile Ser Ser Leu
1             5               10                15
Glu Ser Glu Val
          20
<210>513
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>513
Thr Arg Glu Asp Ile Tyr Val Asn Tyr Pro Thr Phe Ser Arg Arg Pro
1             5               10                15
Lys Thr Arg Val
          20
<210>514
<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>514
Thr Thr Asn Asn Asn Pro Asn Ser Ala Val Asn Ile Lys Lys Ile Phe
1             5               10                15
Thr Asp Val
<210>515
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>515
Val Asp Pro Asn Ser Pro Ala Ala Lys Lys Lys Tyr Val Ser Tyr Asn
1             5               10                15
Asn Leu Val Ile
          20
<210>516
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>516
Val Gly Thr Leu Leu Leu Glu Arg Val Ile Phe Pro Ser Val Lys Ile
1             5               10                15
Ala Thr Leu Val
          20
<210>517
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>517
Val His Lys Val Arg Asn Lys Phe Lys Ala Lys Cys Ser Leu Cys Arg
1             5               10                15
Leu Tyr Ile Ile
          20
<210>518
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>518
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Ala Arg Gly Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Trp Val
          20
<210>519
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>519
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
<210>520
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>520
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Asn Asp Asn Ile Ala
1             5               10                15
Leu Leu Val Gln
          20
<210>521
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding MAGI3 d2
<400>521
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Ser Glu Gly Val Pro
1             5               10                15
Asp Leu Leu Val
          20
<210>522
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d1
<400>522
Ala Ala Gly Gly Arg Ser Ala Arg Gly Gly Arg Leu Gln Gly Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Ala Leu
          20
<210>523
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d1
<400>523
Ala Gly Ala Val Arg Thr Pro Leu Ser Gln Val Asn Lys Val Trp Asp
1             5               10                15
Gln Ser Ser Val
          20
<210>524
<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d1
<400>524
Ala Arg His Arg Val Thr Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Val Asn Val Ser
1             5               10                15
Ser Asn Leu
<210>525
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d1
<400>525
Ala Val Gly Gly Arg Pro Ala Arg Gly Gly Arg Leu Gln Gly Arg Arg
1             5               10                15
Gln Thr Gln Val
          20
<210>526
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d1
<400>526
Asp Phe Arg Pro Ser Phe Lys His Ile Leu Phe Arg Arg Ala Arg Arg
1             5               10                15
Gly Phe Arg Gln
          20
<210>527
<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>527
Glu Val Ile Gly Tyr Ile Glu Lys Pro Gly Val Glu Thr Leu Glu Asp
1             5               10                15
Ser Val Phe
<210>528
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>528
Gly Gly Glu Asp Phe Lys Thr Thr Asn Pro Ser Lys Gln Phe Asp Lys
1             5               10                15
Asn Ala Tyr Val
          20
<210>529
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>529
Gly Arg Trp Thr Gly Arg Ala Met Ser Ala Trp Lys Pro Thr Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
<210>530
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d1
<400>530
Gly Arg Trp Thr Gly Arg Cys Met Ser Cys Trp Lys Pro Thr Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
<210>531
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d1
<400>531
His His Leu Val Ala Gln Arg Asp Ile Arg Gln Phe Gln Leu Gln His
1             5               10                15
Trp Leu Ala Ile
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>532
His Ser Cys Cys Asn Arg Ala Arg Gln Glu Arg Leu Gln Arg Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Gln Val
          20
<210>533
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>533
Lys Ala Gly Tyr Arg Ala Pro Arg Ser Tyr Pro Lys Ser Asn Ser Ser
1             5               10                15
Lys Glu Tyr Val
          20
<210>534
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>534
Lys His Ser Arg Lys Ser Ser Ser Tyr Ser Ser Ser Ser Thr Thr Val
1             5               10                15
Lys Thr Ser Tyr
          20
<210>535
<211>23
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>535
Lys Lys Lys Lys Gln Pro Gly Asn Ser Thr Lys Glu Ser Glu Ser Thr
1             5               10                15
Asn Ser Val Arg Leu Met Leu
          20
<210>536
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>536
Lys Tyr Ser Ala Pro Arg Arg Pro Thr Ala Thr Gly Asp Tyr Asp Lys
1             5               10                15
Lys Asn Tyr Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>537
Leu Ala Val Leu Ala Tyr Ser Ile Thr Leu Val Met Leu Trp Ser Ile
1             5                10                15
Trp Gln Tyr Ala
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>538
Leu Met Asp Gly Leu Pro Pro Gly Asp Ser Asn Gln Leu Ala Trp Phe
1             5               10                15
Asp Thr Asp Leu
          20
<210>539
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d1
<400>539
Leu Asn Ser Cys Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>540
ProGly Gln Pro Pro Lys Val Lys Ser Glu Phe Asn Ser Tyr Ser Leu
1            5               10                15
Thr Gly Tyr Val
          20
<210>541
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>541
Pro Ile Pro Ala Gly Gly Cys Thr Phe Ser Gly Ile Phe Pro Thr Leu
1             5               10                15
Thr Ser Pro Leu
          20
<210>542
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d1
<400>542
Pro Tyr Ser Glu Leu Asn Tyr Glu Thr Ser His Tyr Pro Ala Ser Pro
1             5               10                15
Asp Ser Trp Val
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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Gln Asp Phe Arg Arg Ala Phe Arg Arg Ile Leu Ala Arg Pro Trp Thr
1             5               10                15
Gln Thr Ala Trp
          20
<210>544
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d1
<400>544
Arg Glu Leu Val Asp Arg Gly Glu Val Arg Gln Phe Thr Leu Arg His
1             5               10                15
Trp Leu Lys Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d1
<400>545
Arg Glu Leu Val Asp Arg Gly Glu Val Arg Gln Phe Thr Leu Arg His
1             5               10                15
Trp Leu Lys Val
          20
<210>546
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d1
<400>546
Ser Leu Ile Gly Pro Val Gln Lys Glu Tyr Gln Arg Glu Leu Gly Lys
1             5               10                15
Leu Ser Ser Pro
          20
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<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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Ser Ser Lys Ser Lys Ser Ser Glu Glu Ser Gln Thr Phe Phe Gly Leu
1             5               10                15
Tyr Lys Leu
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d1
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Ser Ser Pro Asp Ser Ser Tyr Gln Gly Lys Gly Phe Val Met Ser Arg
1             5               10                15
Ala Met Tyr Val
          20
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<212>PRT
<213>Artificial
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Thr Ala Glu Asn Ala Glu Tyr Leu Arg Val Ala Pro Gln Ser Ser Glu
1             5               10                15
Phe Ile Gly Ala
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Thr Gly Ser Ala Leu Gln Ala Trp Arg His Thr Ser Arg Gln Ala Thr
1             5               10                15
Glu Ser Thr Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>551
Thr Gln Gly Phe Pro Gly Pro Ala Thr Trp Arg Arg Ile Ser Ser Leu
1             5               10                15
Glu Ser Glu Val
          20
<210>552
<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d1
<400>552
Thr Thr Asn Asn Asn Pro Asn Ser Ala Val Asn Ile Lys Lys Ile Phe
1             5               10                15
Thr Asp Val
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d1
<400>553
Val Asp Pro Asn Ser Pro Ala Ala Lys Lys Lys Tyr Val Ser Tyr Asn
1             5               10                15
Asn Leu Val Ile
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Val Asp Ser Glu Arg Arg Pro His Phe Pro Gln Phe Ser Tyr Ser Ala
1             5               10                15
Ser Gly Thr Ala
          20
<210>555
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d1
<400>555
Val Gly Thr Leu Leu Leu Glu Arg Val Ile Phe Pro Ser Val Lys Ile
1             5               10                15
Ala Thr Leu Val
          20
<210>556
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>556
Val His Lys Val Arg Asn Lys Phe Lys Ala Lys Cys Ser Leu Cys Arg
1             5               10                15
Leu Tyr Ile Ile
          20
<210>557
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d1
<400>557
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Asn Asp Asn Ile Ala
1             5               10                15
Leu Leu Val Gln
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>558
Ala Ala Gly Gly Arg Ser Ala Arg Gly Gly Arg Leu Gln Gly Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Ala Leu
          20
<210>559
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>559
Ala Gly Ala Val Arg Thr Pro Leu Ser Gln Val Asn Lys Val Trp Asp
1             5               10                15
Gln Ser Ser Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>560
Ala Thr Asp Tyr Leu Val Gln Pro Phe Met Asp Gln Leu Ala Phe His
1             5               10                15
Gln Phe Tyr Ile
          20
<210>561
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<223>PL sequence binding NeDLG d2
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Ala Val Gly Gly Arg Pro Ala Arg Gly Gly Arg Leu Gln Gly Arg Arg
1             5               10                15
Gln Thr Gln Val
          20
<210>562
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>562
Asp Phe Arg Pro Ser Phe Lys His Ile Leu Phe Arg Arg Ala Arg Arg
1             5               10                15
Gly Phe Arg Gln
          20
<210>563
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>563
Glu Asp Pro Lys Asp Arg Pro Ser Ala Ala His Ile Val Glu Ala Leu
1             5               10                15
Glu Thr Asp Val
          20
<210>564
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>564
Glu Leu Leu Gln Phe Cys Arg Thr Pro Asn Pro Ala Leu Lys Asn Gly
1             5               10                15
Gln Tyr Trp Val
          20
<210>565
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>565
Glu Ser Ser Gly Thr Gln Ser Pro Lys Arg His Ser Gly Ser Tyr Leu
1             5               10                15
Val Thr Ser Val
          20
<210>566
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>566
Phe Asn Gly Ser Ser Asn Gly His Val Tyr Glu Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
<210>567
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>567
Gly Gly Asp Leu Gly Thr Arg Arg Gly Ser Ala His Phe Ser Ser Leu
1             5               10                15
Glu Ser Glu Val
          20
<210>568
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>568
Gly Arg Trp Thr Gly Arg Ala Met Ser Ala Trp Lys Pro Thr Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
<210>569
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>569
Gly Arg Trp Thr Gly Arg Cys Met Ser Cys Trp Lys Pro Thr Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
<210>570
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>570
His His Leu Val Ala Gln Arg Asp Ile Arg Gln Phe Gln Leu Gln His
1             5               10                15
Trp Leu Ala Ile
          20
<210>571
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>571
His Ser Cys Cys Asn Arg Ala Arg Gln Glu Arg Leu Gln Arg Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Gln Val
          20
<210>572
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>572
Ile Leu Asn Ser Ile Gln Val Met Arg Ala Gln Met Asn Gln Ile Gln
1             5               10                15
Ser Val Glu Val
          20
<210>573
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>573
Lys Ala Gly Tyr Arg Ala Pro Arg Ser Tyr Pro Lys Ser Asn Ser Ser
1             5               10                15
Lys Glu Tyr Val
          20
<210>574
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>574
Lys His Ser Arg Lys Ser Ser Ser Tyr Ser Ser Ser Ser Thr Thr Val
1             5               10                15
Lys Thr Ser Tyr
          20
<210>575
<211>23
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>575
Lys Lys Lys Lys Gln Pro Gly Asn Ser Thr Lys Glu Ser Glu Ser Thr
1             5               10                15
Asn Ser Val Arg Leu Met Leu
          20
<210>576
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>576
Lys Tyr Ser Ala Pro Arg Arg Pro Thr Ala Thr Gly Asp Tyr Asp Lys
1             5               10                15
Lys Asn Tyr Val
          20
<210>577
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>577
Leu Ala Val Leu Ala Tyr Ser Ile Thr Leu Val Met Leu Trp Ser Ile
1             5               10                15
Trp Gln Tyr Ala
          20
<210>578
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>578
Leu Gly Tyr Ser Ile Pro Ser Arg Ser Gly Ala Ser Gly Leu Asp Lys
1             5               10                15
Arg Asp Tyr Val
          20
<210>579
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>579
Leu Met Asp Gly Leu Pro Pro Gly Asp Ser Asn Gln Leu Ala Trp Phe
1             5               10                15
Asp Thr Asp Leu
          20
<210>580
<211>20
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<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>580
Leu Asn Ser Cys Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
<210>581
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>581
Leu Asn Ser Ser Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
<210>582
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<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>582
Pro Gly Gln Pro Pro Lys Val Lys Ser Glu Phe Asn Ser Tyr Ser Leu
1             5               10                15
Thr Gly Tyr Val
          20
<210>583
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>583
Pro Ile Pro Ala Gly Gly Cys Thr Phe Ser Gly Ile Phe Pro Thr Leu
1             5               10                15
Thr Ser Pro Leu
          20
<210>584
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>584
Pro Tyr Ser Glu Leu Asn Tyr Glu Thr Ser His Tyr Pro Ala Ser Pro
1             5               10                15
Asp Ser Trp Val
          20
<210>585
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>585
Gln Asp Phe Arg Arg Ala Phe Arg Arg Ile Leu Ala Arg Pro Trp Thr
1             5               10                15
Gln Thr Ala Trp
          20
<210>586
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>586
Gln Ile Ser Pro Gly Gly Leu Glu Pro Pro Ser Glu Lys His Phe Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
<210>587
<211>20
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<213>Artificial
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<400>587
Arg Glu Leu Val Asp Arg Gly Glu Val Arg Gln Phe Thr Leu Arg His
1             5               10                15
Trp Leu Lys Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>588
Arg Glu Leu Val Asp Arg Gly Glu Val Arg Gln Phe Thr Leu Arg His
1             5               10                15
Trp Leu Lys Val
          20
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<211>20
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<213>Artificial
<220>
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<400>589
Arg Asn Ile Glu Glu Val Tyr Val Gly Gly Lys Gln Val Val Pro Phe
1             5               10                15
Ser Ser Ser Val
          20
<210>590
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>590
Ser Phe Thr Ser Ile Leu Thr Cys His Gln Arg Arg Thr Gln Arg Lys
1             5               10                15
Glu Thr Val Ala
          20
<210>591
<211>20
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<213>Artificial
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<400>591
Ser Leu Lys Pro Gly Thr Val Leu Pro Pro Pro Pro Tyr Arg His Arg
1             5               10                15
Asn Thr Val Val
          20
<210>592
<211>18
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<213>Artificial
<220>
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<400>592
Ser Pro Gln Pro Asp Ser Thr Asp Asn Asp Asp Tyr Asp Asp Ile Ser
1             5               10                15
Ala Ala
<210>593
<211>19
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<213>Artificial
<220>
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<400>593
Ser Ser Lys Ser Lys Ser Ser Glu Glu Ser Gln Thr Phe Phe Gly Leu
1             5               10                15
Tyr Lys Leu
<210>594
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>594
Ser Ser Pro Asp Ser Ser Tyr Gln Gly Lys Gly Phe Val Met Ser Arg
1             5               10                15
Ala Met Tyr Val
          20
<210>595
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>595
Thr Ala Glu Asn Ala Glu Tyr Leu Arg Val Ala Pro Gln Ser Ser Glu
1             5               10                15
Phe Ile Gly Ala
          20
<210>596
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>596
Thr Phe Lys Gly Thr Pro Thr Ala Glu Asn Pro Glu Tyr Leu Gly Leu
1             5               10                15
Asp Val Pro Val
          20
<210>597
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>597
Thr Gly Ser Ala Leu Gln Ala Trp Arg His Thr Ser Arg Gln Ala Thr
1             5               10                15
Glu Ser Thr Val
          20
<210>598
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>598
Thr Gln Gly Phe Pro Gly Pro Ala Thr Trp Arg Arg Ile Ser Ser Leu
1             5               10                15
Glu Ser Glu Val
          20
<210>599
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>599
Thr Arg Glu Asp Ile Tyr Val Asn Tyr Pro Thr Phe Ser Arg Arg Pro
1             5               10                15
Lys Thr Arg Val
          20
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<211>19
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<213>Artificial
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<400>600
Thr Thr Asn Asn Asn Pro Asn Ser Ala Val Asn Ile Lys Lys Ile Phe
1             5               10                15
Thr Asp Val
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>601
Val Asp Pro Asn Ser Pro Ala Ala Lys Lys Lys Tyr Val Ser Tyr Asn
1             5               10                15
Asn Leu Val Ile
          20
<210>602
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>602
Val Gly Thr Leu Leu Leu Glu Arg Val Ile Phe Pro Ser Val Lys Ile
1             5               10                15
Ala Thr Leu Val
          20
<210>603
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>603
Val His Lys Val Arg Asn Lys Phe Lys Ala Lys Cys Ser Leu Cys Arg
1             5               10                15
Leu Tyr Ile Ile
          20
<210>604
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>604
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
<210>605
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>605
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Asn Asp Asn Ile Ala
1             5               10                15
Leu Leu Val Gln
          20
<210>606
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>606
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Ser Glu Gly Val Pro
1             5               10                15
Asp Leu Leu Val
          20
<210>607
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding NeDLG d2
<400>607
Tyr Ser Ala Thr Tyr Ser Glu Leu Glu Asp Pro Gly Glu Met Ser Pro
1             5               10                15
Pro Ile Asp Leu
          20
<210>608
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>608
Ala Ala Gly Gly Arg Ser Ala Arg Gly Gly Arg Leu Gln Gly Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Ala Leu
          20
<210>609
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>609
Ala Gly Ala Val Arg Thr Pro Leu Ser Gln Val Asn Lys Val Trp Asp
1             5               10                15
Gln Ser Ser Val
          20
<210>610
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>610
Ala Val Gly Gly Arg Pro Ala Arg Gly Gly Arg Leu Gln Gly Arg Arg
1             5               10                15
Gln Thr Gln Val
          20
<210>611
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>611
Asp Phe Arg Pro Ser Phe Lys His Ile Leu Phe Arg Arg Ala Arg Arg
1             5               10                15
Gly Phe Arg Gln
          20
<210>612
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>612
Asp Gly Gly Ala Arg Thr Glu Asp Glu Val Gln Ser Tyr Pro Ser Lys
1             5               10                15
His Asp Tyr Val
          20
<210>613
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>613
Glu Leu Leu Gln Phe Cys Arg Thr Pro Asn Pro Ala Leu Lys Asn Gly
1             5               10                15
Gln Tyr Trp Val
          20
<210>614
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>614
Glu Ser Ser Gly Thr Gln Ser Pro Lys Arg His Ser Gly Ser Tyr Leu
1             5               10                15
Val Thr Ser Val
          20
<210>615
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>615
Phe Asn Gly Ser Ser Asn Gly His Val Tyr Glu Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
<210>616
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>616
Gly Gly Asp Leu Gly Thr Arg Arg Gly Ser Ala His Phe Ser Ser Leu
1             5               10                15
Glu Ser Glu Val
          20
<210>617
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>617
Gly Gly Glu Asp Phe Lys Thr Thr Asn Pro Ser Lys Gln Phe Asp Lys
1             5               10                15
Asn Ala Tyr Val
          20
<210>618
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>618
Gly Arg Trp Thr Gly Arg Ala Met Ser Ala Trp Lys Pro Thr Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
<210>619
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>619
His His Leu Val Ala Gln Arg Asp Ile Arg Gln Phe Gln Leu Gln His
1             5               10                15
Trp Leu Ala Ile
          20
<210>620
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>620
His Ser Cys Cys Asn Arg Ala Arg Gln Glu Arg Leu Gln Arg Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Gln Val
          20
<210>621
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>621
Ile Ser Gly Thr Pro Thr Ser Thr Met Val His Gly Met Thr Ser Ser
1             5               10                15
Ser Ser Val Val
          20
<210>622
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>622
Lys Ala Gly Tyr Arg Ala Pro Arg Ser Tyr Pro Lys Ser Asn Ser Ser
1             5               10                15
Lys Glu Tyr Val
          20
<210>623
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>623
Lys Glu Asn Asp Tyr Glu Ser Ile Ser Asp Leu Gln Gln Gly Arg Asp
1             5               10                15
Ile Thr Arg Leu
          20
<210>624
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>624
Lys His Ser Arg Lys Ser Ser Ser Tyr Ser Ser Ser Ser Thr Thr Val
1             5               10                15
Lys Thr Ser Tyr
          20
<210>625
<211>23
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>625
Lys Lys Lys Lys Gln Pro Gly Asn Ser Thr Lys Glu Ser Glu Ser Thr
1             5               10                15
Asn Ser Val Arg Leu Met Leu
          20
<210>626
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>626
Lys Tyr Ser Ala Pro Arg Arg Pro Thr Ala Thr Gly Asp Tyr Asp Lys
1             5               10                15
Lys Asn Tyr Val
          20
<210>627
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>627
Leu Ala Val Leu Ala Tyr Ser Ile Thr Leu Val Met Leu Trp Ser Ile
1             5               10                15
Trp Gln Tyr Ala
          20
<210>628
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>628
Leu Gly Tyr Ser Ile Pro Ser Arg Ser Gly Ala Ser Gly Leu Asp Lys
1             5               10                15
Arg Asp Tyr Val
          20
<210>629
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>629
Leu His Asn Gln Ala Ser Val Pro Leu Glu Pro Arg Pro Leu Arg Arg
1             5               10                15
Glu Ser Glu Ile
          20
<210>630
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>630
Leu Asn Ser Cys Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
<210>631
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>631
Leu Asn Ser Ser Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
<210>632
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>632
Pro Gly Gln Pro Pro Lys Val Lys Ser Glu Phe Asn Ser Tyr Ser Leu
1             5               10                15
Thr Gly Tyr Val
          20
<210>633
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>633
Pro Ile Pro Ala Gly Gly Cys Thr Phe Ser Gly Ile Phe Pro Thr Leu
1             5               10                15
Thr Ser Pro Leu
          20
<210>634
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>634
Pro Tyr Ser Glu Leu Asn Tyr Glu Thr Ser His Tyr Pro Ala Ser Pro
1             5               10                15
Asp Ser Trp Val
          20
<210>635
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>635
Gln Ala Thr Ser Arg Asn Gly His Ser Ala Arg Gln His Val Val Ala
1             5               10                15
Asp Thr Glu Leu
          20
<210>636
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>636
Gln Asp Phe Arg Arg Ala Phe Arg Arg Ile Leu Ala Arg Pro Trp Thr
1             5               10                15
Gln Thr Ala Trp
          20
<210>637
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>637
Gln Ile Ser Pro Gly Gly Leu Glu Pro Pro Ser Glu Lys His Phe Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
<210>638
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>638
Gln Pro Thr Pro Thr Leu Gly Leu Asn Leu Gly Asn Asp Pro Asp Arg
1             5               10                15
Gly Thr Ser Ile
          20
<210>639
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>639
Arg Glu Leu Val Asp Arg Gly Glu Val Arg Gln Phe Thr Leu Arg His
1             5               10                15
Trp Leu Lys Val
          20
<210>640
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>640
Arg Glu Leu Val Asp Arg Gly Glu Val Arg Gln Phe Thr Leu Arg His
1             5               10                15
Trp Leu Lys Val
          20
<210>641
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>641
Arg Asn Ile Glu Glu Val Tyr Val Gly Gly Lys Gln Val Val Pro Phe
1             5               10                15
Ser Ser Ser Val
          20
<210>642
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>642
Arg Ser Gly Ala Thr Ile Pro Leu Val Gly Gln Asp Ile Ile Asp Leu
1             5               10                15
Gln Thr Glu Val
          20
<210>643
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>643
Ser Phe Thr Ser Ile Leu Thr Cys His Gln Arg Arg Thr Gln Arg Lys
1             5               10                15
Glu Thr Val Ala
          20
<210>644
<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>644
Ser Gly Gly Asn Arg Ala Arg Gln Glu Arg Leu Gln Arg Arg Arg Glu
1             5               10                15
Thr Gln Val
<210>645
<211>18
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>645
Ser Pro Gln Pro Asp Ser Thr Asp Asn Asp Asp Tyr Asp Asp Ile Ser
1             5               10                15
Ala Ala
<210>646
<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>646
Ser Ser Lys Ser Lys Ser Ser Glu Glu Ser Gln Thr Phe Phe Gly Leu
1             5               10                15
Tyr Lys Leu
<210>647
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>647
Ser Ser Pro Asp Ser Ser Tyr Gln Gly Lys Gly Phe Val Met Ser Arg
1             5               10                15
Ala Met Tyr Val
          20
<210>648
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>648
Ser Tyr Pro Thr Pro Arg Pro Tyr Pro Lys Pro Ala Pro Ser Ser Gly
1             5               10                15
Lys Asp Tyr Val
          20
<210>649
<211>18
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>649
Thr Phe Ala Ala Gly Phe Asn Ser Thr Gly Leu Pro His Ser Thr Thr
1             5               10                15
Arg Val
<210>650
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>650
Thr Phe Lys Gly Thr Pro Thr Ala Glu Asn Pro Glu Tyr Leu Gly Leu
1             5               10                15
Asp Val Pro Val
          20
<210>651
<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>651
Thr Gly Arg Gly Met Ser Gly Gly Arg Ser Ser Arg Thr Arg Arg Glu
1             5               10                15
Thr Gln Leu
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>652
Thr Gly Ser Ala Leu Gln Ala Trp Arg His Thr Ser Arg Gln Ala Thr
1             5               10                15
Glu Ser Thr Val
          20
<210>653
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>653
Thr Gln Gly Phe Pro Gly Pro Ala Thr Trp Arg Arg Ile Ser Ser Leu
1             5               10                15
Glu Ser Glu Val
          20
<210>654
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>654
Thr Arg Glu Asp Ile Tyr Val Asn Tyr Pro Thr Phe Ser Arg Arg Pro
1             5               10                15
Lys Thr Arg Val
          20
<210>655
<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>655
Thr Thr Asn Asn Asn Pro Asn Ser Ala Val Asn Ile Lys Lys Ile Phe
1             5               10                15
Thr Asp Val
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>656
Val Asp Pro Asn Ser Pro Ala Ala Lys Lys Lys Tyr Val Ser Tyr Asn
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Asn Leu Val Ile
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>657
Val Gly Thr Leu Leu Leu Glu Arg Val Ile Phe Pro Ser Val Lys Ile
1             5               10                15
Ala Thr Leu Val
          20
<210>658
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>658
Val His Asp Ala Glu Ser Ser Asp Glu Asp Gly Tyr Asp Trp Gly Pro
1             5               10                15
Ala Thr Asp Leu
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>659
Val His Lys Val Arg Asn Lys Phe Lys Ala Lys Cys Ser Leu Cys Arg
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Leu Tyr Ile Ile
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>660
Val Pro Gly Ala Leu Asp Tyr Ala Ala Phe Ser Ser Ala Leu Tyr Gly
1             5               10                15
Glu Ser Asp Leu
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>661
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>662
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Asn Asp Asn Ile Ala
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Leu Leu Val Gln
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding Outer Membrane Protein
<400>663
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Ser Glu Gly Val Pro
1             5               10                15
Asp Leu Leu Val
          20
<210>664
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<220>
<221>misc_feature
<222>(20)..(20)
<223>Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400>664
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Xaa
          20
<210>665
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PICK1 d1
<400>665
Ala Leu Val Leu Ile Ala Phe Cys Ile Ile Arg Arg Arg Pro Ser Ala
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Tyr Gln Ala Leu
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<223>PL sequence binding PICK1 d1
<400>666
Ala Thr Asp Tyr Leu Val Gln Pro Phe Met Asp Gln Leu Ala Phe His
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Gln Phe Tyr Ile
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Asp Phe Arg Pro Ser Phe Lys His Ile Leu Phe Arg Arg Ala Arg Arg
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Gly Phe Arg Gln
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PICK1 d1
<400>668
Asp Gly Gly Ala Arg Thr Glu Asp Glu Val Gln Ser Tyr Pro Ser Lys
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His Asp Tyr Val
          20
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<212>PRT
<213>Artificial
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Glu Leu Leu Gln Phe Cys Arg Thr Pro Asn Pro Ala Leu Lys Asn Gly
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Gln Tyr Trp Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Phe His Ser Lys Thr Ala Gly Ala Asn Thr Thr Asp Lys Glu Leu Glu
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Val Leu Ser Leu
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PICK1 d1
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Gly Arg Trp Thr Gly Arg Ala Met Ser Ala Trp Lys Pro Thr Arg Arg
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Glu Thr Glu Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PICK1 d1
<400>672
His Asp Phe Arg Arg Ala Phe Lys Lys Ile Leu Ala Arg Gly Asp Arg
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Lys Arg Ile Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PICK1 d1
<400>673
His His Leu Val Ala Gln Arg Asp Ile Arg Gln Phe Gln Leu Gln His
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Trp Leu Ala Ile
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PICK1 d1
<400>674
His Ser Cys Cys Asn Arg Ala Arg Gln Glu Arg Leu Gln Arg Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Gln Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PICK1 d1
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Ile Leu Asn Ser Ile Gln Val Met Arg Ala Gln Met Asn Gln Ile Gln
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Ser Val Glu Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PICK1 d1
<400>676
Lys Ala Gly Tyr Arg Ala Pro Arg Ser Tyr Pro Lys Ser Asn Ser Ser
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Lys Glu Tyr Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PICK1 d1
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Lys His Ser Arg Lys Ser Ser Ser Tyr Ser Ser Ser Ser Thr Thr Val
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Lys Thr Ser Tyr
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PICK1 d1
<400>678
Lys Thr Met Pro Ala Ala Met Tyr Arg Leu Leu Thr Ala Gln Glu Gln
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Pro Val Tyr Ile
          20
<210>679
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>679
Lys Tyr Ser Ala Pro Arg Arg Pro Thr Ala Thr Gly Asp Tyr Asp Lys
1             5               10                15
Lys Asn Tyr Val
          20
<210>680
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PICK1 d1
<400>680
Leu Ala Val Leu Ala Tyr Ser Ile Thr Leu Val Met Leu Trp Ser Ile
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Trp Gln Tyr Ala
          20
<210>681
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PICK1 d1
<400>681
Leu Ser Glu Lys Lys Thr Ser Gln Ser Pro His Arg Phe Gln Lys Thr
1             5               10                15
Ser Ser Pro Ile
          20
<210>682
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PICK1 d1
<400>682
Pro Gly Gln Pro Pro Lys Val Lys Ser Glu Phe Asn Ser Tyr Ser Leu
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Thr Gly Tyr Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PICK1 d1
<400>683
Pro Ile Pro Ala Gly Gly Cys Thr Phe Ser Gly Ile Phe Pro Thr Leu
1             5               10                15
Thr Ser Pro Leu
          20
<210>684
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>684
Pro Tyr Ser Glu Leu Asn Tyr Glu Thr Ser His Tyr Pro Ala Ser Pro
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Asp Ser Trp Val
          20
<210>685
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PICK1 d1
<400>685
Gln Asp Phe Arg Arg Ala Phe Arg Arg Ile Leu Ala Arg Pro Trp Thr
1             5               10                15
Gln Thr Ala Trp
          20
<210>686
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PICK1 d1
<400>686
Arg Glu Leu Val Asp Arg Gly Glu Val Arg Gln Phe Thr Leu Arg His
1             5               10                15
Trp Leu Lys Val
          20
<210>687
<211>18
<212>PRT
<213>Artificial
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<223>PL sequence binding PICK1 d1
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Ser Pro Gln Pro Asp Ser Thr Asp Asn Asp Asp Tyr Asp Asp Ile Ser
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Ala Ala
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<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PICK1 d1
<400>688
Ser Ser Lys Ser Lys Ser Ser Glu Glu Ser Gln Thr Phe Phe Gly Leu
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Tyr Lys Leu
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PICK1 d1
<400>689
Ser Ser Pro Asp Ser Ser Tyr Gln Gly Lys Gly Phe Val Met Ser Arg
1             5               10                15
Ala Met Tyr Val
          20
<210>690
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Ser Tyr Pro Thr Pro Arg Pro Tyr Pro Lys Pro Ala Pro Ser Ser Gly
1             5               10                15
Lys Asp Tyr Val
          20
<210>691
<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PICK1 d1
<400>691
Thr Thr Asn Asn Asn Pro Asn Ser Ala Val Asn Ile Lys Lys Ile Phe
1             5               10                15
Thr Asp Val
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PICK1 d1
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Val Asp Pro Asn Ser Pro Ala Ala Lys Lys Lys Tyr Val Ser Tyr Asn
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Asn Leu Val Ile
          20
<210>693
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PICK1 d1
<400>693
Val His Lys Val Arg Asn Lys Phe Lys Ala Lys Cys Ser Leu Cys Arg
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Leu Tyr Ile Ile
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<223>PL sequence binding PICK1 d1
<400>694
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Glu Met Gln Val Thr
1             5               10                15
Leu Gly Leu His
          20
<210>695
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PICK1 d1
<400>695
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Glu Tyr Leu Gly Leu
1             5               10                15
Asp Val Pro Val
          20
<210>696
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<400>696
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Ile Gly Glu Leu Gln
1             5               10                15
Leu Ser Ile Ala
          20
<210>697
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<220>
<221>misc_feature
<222>(20)..(20)
<223>Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400>697
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Xaa
          20
<210>698
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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Ala Ala Gly Gly Arg Ser Ala Arg Gly Gly Arg Leu Gln Gly Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Ala Leu
          20
<210>699
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>699
Ala Val Gly Gly Arg Pro Ala Arg Gly Gly Arg Leu Gln Gly Arg Arg
1             5               10                15
Gln Thr Gln Val
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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Asp Phe Arg Pro Ser Phe Lys His Ile Leu Phe Arg Arg Ala Arg Arg
1             5               10                15
Gly Phe Arg Gln
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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<400>701
Asp Gly Gly Ala Arg Thr Glu Asp Glu Val Gln Ser Tyr Pro Ser Lys
1             5               10                15
His Asp Tyr Val
          20
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Glu Leu Leu Gln Phe Cys Arg Thr Pro Asn Pro Ala Leu Lys Asn Gly
1             5               10                15
Gln Tyr Trp Val
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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<400>703
Phe Asn Gly Ser Ser Asn Gly His Val Tyr Glu Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>704
Gly Gly Asp Leu Gly Thr Arg Arg Gly Ser Ala His Phe Ser Ser Leu
1             5               10                15
Glu Ser Glu Val
          20
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<213>Artificial
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<400>705
Gly Gly Glu Asp Phe Lys Thr Thr Asn Pro Ser Lys Gln Phe Asp Lys
1             5               10                15
Asn Ala Tyr Val
          20
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<213>Artificial
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Gly Arg Trp Ala Gly Arg Ser Ala Ala Ser Trp Arg Ser Arg Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Ala Leu
          20
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<213>Artificial
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<400>707
Gly Arg Trp Thr Gly Arg Ala Met Ser Ala Trp Lys Pro Thr Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
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<213>Artificial
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<400>708
His His Leu Val Ala Gln Arg Asp Ile Arg Gln Phe Gln Leu Gln His
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Trp Leu Ala Ile
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>709
Lys Ala Gly Tyr Arg Ala Pro Arg Ser Tyr Pro Lys Ser Asn Ser Ser
1             5               10                15
Lys Glu Tyr Val
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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Lys His Ser Arg Lys Ser Ser Ser Tyr Ser Ser Ser Ser Thr Thr Val
1             5               10                15
Lys Thr Ser Tyr
          20
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<213>Artificial
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<400>711
Lys Lys Lys Lys Gln Pro Gly Asn Ser Thr Lys Glu Ser Glu Ser Thr
1             5               10                15
Asn Ser Val Arg Leu Met Leu
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Lys Tyr Ser Ala Pro Arg Arg Pro Thr Ala Thr Gly Asp Tyr Asp Lys
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Lys Asn Tyr Val
          20
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<212>PRT
<213>Artificial
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Leu Ala Val Leu Ala Tyr Ser Ile Thr Leu Val Met Leu Trp Ser Ile
1             5               10                15
Trp Gln Tyr Ala
          20
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<213>Artificial
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Leu Gly Tyr Ser Ile Pro Ser Arg Ser Gly Ala Ser Gly Leu Asp Lys
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Arg Asp Tyr Val
          20
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<213>Artificial
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Leu Asn Ser Cys Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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Leu Asn Ser Ser Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
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Pro Gly Gln Pro Pro Lys Val Lys Ser Glu Phe Asn Ser Tyr Ser Leu
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Thr Gly Tyr Val
          20
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<213>Artificial
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Pro Ile Pro Ala Gly Gly Cys Thr Phe Ser Gly Ile Phe Pro Thr Leu
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Thr Ser Pro Leu
          20
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<212>PRT
<213>Artificial
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Pro Tyr Ser Glu Leu Asn Tyr Glu Thr Ser His Tyr Pro Ala Ser Pro
1             5               10                15
Asp Ser Trp Val
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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Gln Asp Phe Arg Arg Ala Phe Arg Arg Ile Leu Ala Arg Pro Trp Thr
1             5               10                15
Gln Thr Ala Trp
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Gln Ile Ser Pro Gly Gly Leu Glu Pro Pro Ser Glu Lys His Phe Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>722
Arg Glu Leu Val Asp Arg Gly Glu Val Arg Gln Phe Thr Leu Arg His
1             5               10                15
Trp Leu Lys Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>723
Arg Asn Ile Glu Glu Val Tyr Val Gly Gly Lys Gln Val Val Pro Phe
1             5               10                15
Ser Ser Ser Val
          20
<210>724
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Ser Phe Thr Ser Ile Leu Thr Cys His Gln Arg Arg Thr Gln Arg Lys
1             5               10                15
Glu Thr Val Ala
          20
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<211>19
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<213>Artificial
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Ser Ser Lys Ser Lys Ser Ser Glu Glu Ser Gln Thr Phe Phe Gly Leu
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Tyr Lys Leu
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Ser Ser Pro Asp Ser Ser Tyr Gln Gly Lys Gly Phe Val Met Ser Arg
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Ala Met Tyr Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Ser Tyr Pro Thr Pro Arg Pro Tyr Pro Lys Pro Ala Pro Ser Ser Gly
1             5               10                15
Lys Asp Tyr Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Thr Gly Ser Ala Leu Gln Ala Trp Arg His Thr Ser Arg Gln Ala Thr
1             5               10                15
Glu Ser Thr Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>729
Thr Gln Gly Phe Pro Gly Pro Ala Thr Trp Arg Arg Ile Ser Ser Leu
1             5               10                15
Glu Ser Glu Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Thr Arg Glu Asp Ile Tyr Val Asn Tyr Pro Thr Phe Ser Arg Arg Pro
1             5               10                15
Lys Thr Arg Val
          20
<210>731
<211>19
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PSD95 d1
<400>731
Thr Thr Asn Asn Asn Pro Asn Ser Ala Val Asn Ile Lys Lys Ile Phe
1             5               10                15
Thr Asp Val
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Val Asp Pro Asn Ser Pro Ala Ala Lys Lys Lys Tyr Val Ser Tyr Asn
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Asn Leu Val Ile
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>733
Val Gly Thr Leu Leu Leu Glu Arg Val Ile Phe Pro Ser Val Lys Ile
1             5               10                15
Ala Thr Leu Val
          20
<210>734
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PSD95 d1
<400>734
Val His Lys Val Arg Asn Lys Phe Lys Ala Lys Cys Ser Leu Cys Arg
1             5               10                15
Leu Tyr Ile Ile
          20
<210>735
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PSD95 d1
<400>735
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Ala Leu Lys Ser Ile
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
<210>736
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PSD95 d1
<400>736
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Ala Arg Gly Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Trp Val
          20
<210>737
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PSD95 d1
<400>737
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Glu Lys His Phe Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
<210>738
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>738
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Gly Ala Ser Ala Asp
1             5               10                15
Ser Thr Gln Ala
          20
<210>739
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PSD95 d1
<400>739
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Gly Met Thr Ser Ser
1             5               10                15
Ser Ser Val Val
          20
<210>740
<211>16
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>740
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Ile Glu Thr Glu Val
1             5               10                15
<210>741
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PSD95 d1
<400>741
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
<210>742
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PSD95 d1
<400>742
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
<210>743
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PSD95 d1
<220>
<221>misc_feature
<222>(20)..(20)
<223>Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400>743
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Xaa
          20
<210>744
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PSD95 d1
<220>
<221>misc_feature
<222>(20)..(20)
<223>Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400>744
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Xaa
          20
<210>745
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PSD95 d1
<220>
<221>misc_feature
<222>(20)..(20)
<223>Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400>745
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Xaa
          20
<210>746
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PSD95 d1
<220>
<221>misc_feature
<222>(19)..(19)
<223>Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400>746
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Xaa Val
          20
<210>747
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PSD95 d1
<400>747
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Tyr Val
          20
<210>748
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PSD95 d1
<400>748
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Thr Asp Val
          20
<210>749
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PSD95 d1
<220>
<221>misc_feature
<222>(20)..(20)
<223>Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400>749
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Thr Asp Xaa
          20
<210>750
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PSD95 d1
<400>750
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Tyr Asp Val
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Asn Asp Asn Ile Ala
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Leu Leu Val Gln
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Gln Asp Glu Arg Val
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Glu Thr Arg Val
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Gln Asp Ser Arg Glu
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Glu Thr Gln Leu
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Arg Ile Ser Ser Ile
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Glu Thr Asp Val
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Arg Ile Ser Ser Ile
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Gln Thr Asp Val
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Arg Ile Ser Ser Leu
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Glu Ser Glu Val
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Arg Ile Ser Ser Leu
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Arg Ile Ser Ser Leu
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Glu Thr Gln Val
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Arg Ser Arg Arg Arg
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Glu Thr Ala Leu
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Thr Lys Asn Tyr Lys
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Gln Thr Ser Val
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Tyr Ser Ala Thr Tyr Ser Glu Leu Glu Asp Pro Gly Glu Met Ser Pro
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Pro Ile Asp Leu
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Ala Ala Gly Gly Arg Ser Ala Arg Gly Gly Arg Leu Gln Gly Arg Arg
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Glu Thr Ala Leu
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Ala Arg His Arg Val Thr Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Val Asn Val Ser
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Ser Asn Leu
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Ala Val Gly Gly Arg Pro Ala Arg Gly Gly Arg Leu Gln Gly Arg Arg
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Gln Thr Gln Val
          20
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Asp Phe Arg Pro Ser Phe Lys His Ile Leu Phe Arg Arg Ala Arg Arg
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Gly Phe Arg Gln
          20
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Glu Asp Pro Lys Asp Arg Pro Ser Ala Ala His Ile Val Glu Ala Leu
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Glu Leu Leu Gln Phe Cys Arg Thr Pro Asn Pro Ala Leu Lys Asn Gly
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Glu Ser Ser Gly Thr Gln Ser Pro Lys Arg His Ser Gly Ser Tyr Leu
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Val Thr Ser Val
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Phe Asn Gly Ser Ser Asn Gly His Val Tyr Glu Lys Leu Ser Ser Ile
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Glu Ser Asp Val
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Gly Gly Asp Leu Gly Thr Arg Arg Gly Ser Ala His Phe Ser Ser Leu
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Glu Ser Glu Val
          20
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Gly Gly Glu Asp Phe Lys Thr Thr Asn Pro Ser Lys Gln Phe Asp Lys
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Asn Ala Tyr Val
          20
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Gly Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Gly Ser Gly Ile Glu Ser
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Val Lys Ile
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Gly Arg Trp Ala Gly Arg Ser Ala Ala Ser Trp Arg Ser Arg Arg Arg
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Glu Thr Ala Leu
          20
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Gly Arg Trp Thr Gly Arg Ala Met Ser Ala Trp Lys Pro Thr Arg Arg
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Glu Thr Glu Val
          20
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Gly Arg Trp Thr Gly Arg Ser Ala Val Ser Trp Arg Pro Arg Arg Arg
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Gln Thr Gln Val
          20
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His His Leu Val Ala Gln Arg Asp Ile Arg Gln Phe Gln Leu Gln His
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Trp Leu Ala Ile
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His Pro Thr Asp Ile Thr Gly Leu Pro Asn Leu Ser Asp Pro Ser Val
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His Ser Cys Cys Asn Arg Ala Arg Gln Glu Arg Leu Gln Arg Arg Arg
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Ile Leu Asn Ser Ile Gln Val Met Arg Ala Gln Met Asn Gln Ile Gln
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Ser Val Glu Val
          20
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Ile Ser Gly Thr Pro Thr Ser Thr Met Val His Gly Met Thr Ser Ser
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Ser Ser Val Val
          20
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Lys Ala Gly Tyr Arg Ala Pro Arg Ser Tyr Pro Lys Ser Asn Ser Ser
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Lys Glu Tyr Val
          20
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Lys Asp Ile Thr Ser Asp Ser Glu Asn Ser Asn Phe Arg Asn Glu Ile
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Gln Ser Leu Val
          20
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Lys Asp Ile Thr Ser Asp Ser Glu Asn Ser Asn Phe Arg Asn Glu Ile
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Gln Ser Leu Val
          20
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Lys His Ser Arg Lys Ser Ser Ser Tyr Ser Ser Ser Ser Thr Thr Val
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Lys Thr Ser Tyr
          20
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Lys Lys Lys Lys Gln Pro Gly Asn Ser Thr Lys Glu Ser Glu Ser Thr
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Asn Ser Val Arg Leu Met Leu
          20
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Leu Ala Val Leu Ala Tyr Ser Ile Thr Leu Val Met Leu Trp Ser Ile
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Trp Gln Tyr Ala
          20
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Leu His Asn Gln Ala Ser Val Pro Leu Glu Pro Arg Pro Leu Arg Arg
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Glu Ser Glu Ile
          20
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Leu Asn Ser Cys Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
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Leu Asn Ser Ser Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
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Met Gly Arg Trp Thr Gly Arg Ser Ser Glu Ser Trp Arg Pro Arg Pro
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Val Thr Gln Val
          20
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Asn Thr Ser Ser Asp Gln Ala Arg Gln Glu Arg Leu Arg Arg Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Gln Val
          20
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Pro Ile Pro Ala Gly Gly Cys Thr Phe Ser Gly Ile Phe Pro Thr Leu
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Thr Ser Pro Leu
          20
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Pro Tyr Ser Glu Leu Asn Tyr Glu Thr Ser His Tyr Pro Ala Ser Pro
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Asp Ser Trp Val
          20
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Gln Asp Phe Arg Arg Ala Phe Arg Arg Ile Leu Ala Arg Pro Trp Thr
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Gln Thr Ala Trp
          20
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Gln Ile Ser Pro Gly Gly Leu Glu Pro Pro Ser Glu Lys His Phe Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
<210>796
<211>20
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<213>Artificial
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Arg Glu Leu Val Asp Arg Gly Glu Val Arg Gln Phe Thr Leu Arg His
1             5               10                15
Trp Leu Lys Val
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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<400>797
Arg Asn Ile Glu Glu Val Tyr Val Gly Gly Lys Gln Val Val Pro Phe
1             5               10                15
Ser Ser Ser Val
          20
<210>798
<211>20
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<400>798
Arg Ser Gly Ala Thr Ile Pro Leu Val Gly Gln Asp Ile Ile Asp Leu
1             5               10                15
Gln Thr Glu Val
          20
<210>799
<211>20
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<213>Artificial
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<400>799
Ser Phe Thr Ser Ile Leu Thr Cys His Gln Arg Arg Thr Gln Arg Lys
1             5               10                15
Glu Thr Val Ala
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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<400>800
Ser Leu Ile Gly Pro Val Gln Lys Glu Tyr Gln Arg Glu Leu Gly Lys
1             5               10                15
Leu Ser Ser Pro
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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Ser Leu Lys Pro Gly Thr Val Leu Pro Pro Pro Pro Tyr Arg His Arg
1             5               10                15
Asn Thr Val Val
          20
<210>802
<211>20
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<213>Artificial
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Ser Leu Lys Pro Gly Thr Val Leu Pro Pro Pro Pro Tyr Arg His Arg
1             5               10                15
Asn Thr Val Val
          20
<210>803
<211>20
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<213>Artificial
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Ser Tyr Pro Thr Pro Arg Pro Tyr Pro Lys Pro Ala Pro Ser Ser Gly
1             5               10                15
Lys Asp Tyr Val
          20
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Thr Phe Ala Ala Gly Phe Asn Ser Thr Gly Leu Pro His Ser Thr Thr
1             5               10                15
Arg Val
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<211>20
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<213>Artificial
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<400>805
Thr Phe Lys Gly Thr Pro Thr Ala Glu Asn Pro Glu Tyr Leu Gly Leu
1             5               10                15
Asp Val Pro Val
          20
<210>806
<211>19
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Thr Gly Arg Gly Met Ser Gly Gly Arg Ser Ser Arg Thr Arg Arg Glu
1             5               10                15
Thr Gln Leu
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Glu Ser Thr Val
          20
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Thr Gln Gly Phe Pro Gly Pro Ala Thr Trp Arg Arg Ile Ser Ser Leu
1             5               10                15
Glu Ser Glu Val
          20
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Thr Arg Glu Asp Ile Tyr Val Asn Tyr Pro Thr Phe Ser Arg Arg Pro
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Lys Thr Arg Val
          20
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Thr Thr Asn Asn Asn Pro Asn Ser Ala Val Asn Ile Lys Lys Ile Phe
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Thr Asp Val
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Val Asp Pro Asn Ser Pro Ala Ala Lys Lys Lys Tyr Val Ser Tyr Asn
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Asn Leu Val Ile
          20
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Val Gly Thr Leu Leu Leu Glu Arg Val Ile Phe Pro Ser Val Lys Ile
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Ala Thr Leu Val
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Val His Lys Val Arg Asn Lys Phe Lys Ala Lys Cys Ser Leu Cys Arg
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Leu Tyr Ile Ile
          20
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Trp Thr Gly Gln Ser Ala Asn Ser Arg Lys Pro Pro Arg Gln Arg Ser
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          20
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
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Glu Ser Asp Val
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Met Ala Gly Thr Ile
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Arg Ser Glu Val
          20
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Met Ala Arg Thr Ile
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Glu Ser Glu Ile
          20
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Met Ala Arg Thr Ile
1             5               10                15
Glu Ser Glu Val
          20
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Met Glu Arg Thr Ile
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Glu Pro Glu Val
          20
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Asn Asp Asn Ile Ala
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Ala Ala Gly Gly Arg Ser Ala Arg Gly Gly Arg Leu Gln Gly Arg Arg
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Glu Thr Ala Leu
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Ala Val Gly Gly Arg Pro Ala Arg Gly Gly Arg Leu Gln Gly Arg Arg
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Phe Asn Gly Ser Ser Asn Gly His Val Tyr Glu Lys Leu Ser Ser Ile
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Glu Ser Asp Val
          20
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Gly Gly Asp Leu Gly Thr Arg Arg Gly Ser Ala His Phe Ser Ser Leu
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Glu Ser Glu Val
          20
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Gly Arg Trp Ala Gly Arg Ser Ala Ala Ser Trp Arg Ser Arg Arg Arg
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Glu Thr Ala Leu
          20
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Gly Arg Trp Thr Gly Arg Ala Met Ser Ala Trp Lys Pro Thr Arg Arg
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Glu Thr Glu Val
          20
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Gly Arg Trp Thr Gly Arg Ser Ala Val Ser Trp Arg Pro Arg Arg Arg
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Gln Thr Gln Val
          20
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Lys Asp Ile Thr Ser Asp Ser Glu Asn Ser Asn Phe Arg Asn Glu Ile
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Gln Ser Leu Val
          20
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<213>Artificial
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Lys His Ser Arg Lys Ser Ser Ser Tyr Ser Ser Ser Ser Thr Thr Val
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Lys Thr Ser Tyr
          20
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Lys Lys Lys Lys Gln Pro Gly Asn Ser Thr Lys Glu Ser Glu Ser Thr
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Asn Ser Val Arg Leu Met Leu
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<213>Artificial
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Leu Asn Ser Cys Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
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Glu Ser Asp Val
          20
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<213>Artificial
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Leu Asn Ser Ser Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
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Glu Ser Asp Val
          20
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Asn Thr Ser Ser Asp Gln Ala Arg Gln Glu Arg Leu Arg Arg Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Gln Val
          20
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Gln Ile Ser Pro Gly Gly Leu Glu Pro Pro Ser Glu Lys His Phe Arg
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Glu Thr Glu Val
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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Arg Glu Leu Val Asp Arg Gly Glu Val Arg Gln Phe Thr Leu Arg His
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Trp Leu Lys Val
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<213>Artificial
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Arg Ser Gly Ala Thr Ile Pro Leu Val Gly Gln Asp Ile Ile Asp Leu
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Gln Thr Glu Val
          20
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<213>Artificial
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Ser Pro Gln Pro Asp Ser Thr Asp Asn Asp Asp Tyr Asp Asp Ile Ser
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Ala Ala
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Ser Ser Ser Arg Arg Asp Ser Ser Trp Ser Glu Thr Ser Glu Ala Ser
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Tyr Ser Gly Leu
          20
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<213>Artificial
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Thr Gly Arg Gly Met Ser Gly Gly Arg Ser Ser Arg Thr Arg Arg Glu
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Thr Gln Leu
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<213>Artificial
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Thr Gln Gly Phe Pro Gly Pro Ala Thr Trp Arg Arg Ile Ser Ser Leu
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Glu Ser Glu Val
          20
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<211>19
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<213>Artificial
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Thr Thr Asn Asn Asn Pro Asn Ser Ala Val Asn Ile Lys Lys Ile Phe
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Thr Asp Val
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<213>Artificial
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Val His Lys Val Arg Asn Lys Phe Lys Ala Lys Cys Ser Leu Cys Arg
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Leu Tyr Ile Ile
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Ala Leu Lys Ser Ile
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Glu Thr Glu Val
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Ala Arg Gly Arg Arg
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Glu Thr Trp Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Asp Lys Glu Leu Glu
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Val Leu Ser Leu
          20
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<213>Artificial
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Glu Lys His Phe Arg
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Glu Ala Glu Ala
          20
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Glu Lys His Phe Arg
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Glu Thr Glu Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Glu Tyr Leu Gly Leu
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Asp Val Pro Val
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Gly Met Thr Ser Ser
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Ser Ser Val Val
          20
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Ile Glu Thr Glu Val
1             5               10                15
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>852
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Leu
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding PSD95 d2
<400>853
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
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Glu Ser Asp Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>854
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
Glu Ser Asp Val
          20
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<213>Artificial
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<222>(20)..(20)
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
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Glu Ser Asp Xaa
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<223>Xaa can be any naturally occurring amino acid
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
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Glu Ser Asp Xaa
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Glu Ser Asp Xaa
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<222>(20)..(20)
<223>Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<213>Artificial
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<221>misc_feature
<222>(19)..(19)
<223>Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400>861
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
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Glu Ser Xaa Val
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
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Glu Ser Tyr Val
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
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Glu Thr Asp Val
          20
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<221>misc_feature
<222>(20)..(20)
<223>Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400>864
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
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<221>misc_feature
<222>(18)..(18)
<223>Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400>865
Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
1             5               10                15
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Glu Ser Glu Val
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          20
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          20
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Glu Ser Glu Val
          20
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          20
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          20
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<213>Artificial
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Ser Glu Gly Val Pro
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          20
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          20
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Asn Ala Tyr Val
          20
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Gly Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly His Ser
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Thr Thr Arg Val
          20
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Gly Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Leu Pro His Ser
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Thr Thr Arg Val
          20
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Gly Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Ser Arg Arg Pro
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Lys Thr Arg Val
          20
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His His Leu Val Ala Gln Arg Asp Ile Arg Gln Phe Gln Leu Gln His
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Trp Leu Ala Ile
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His Ser Cys Cys Asn Arg Ala Arg Gln Glu Arg Leu Gln Arg Arg Arg
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Glu Thr Gln Val
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Lys Ala Gly Tyr Arg Ala Pro Arg Ser Tyr Pro Lys Ser Asn Ser Ser
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Lys Glu Tyr Val
          20
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Lys Asp Ser Arg Pro Ser Phe Val Gly Ser Ser Ser Gly His Thr Ser
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Thr Thr Leu
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Lys Glu Asn Asp Tyr Glu Ser Ile Ser Asp Leu Gln Gln Gly Arg Asp
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Ile Thr Arg Leu
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Lys His Ser Arg Lys Ser Ser Ser Tyr Ser Ser Ser Ser Thr Thr Val
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Lys Thr Ser Tyr
          20
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Lys Lys Lys Lys Gln Pro Gly Asn Ser Thr Lys Glu Ser Glu Ser Thr
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Asn Ser Val Arg Leu Met Leu
          20
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Lys Pro Gln Ile Ala Ala Leu Lys Glu Glu Thr Glu Glu Glu Val Gln
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Asp Thr Arg Leu
          20
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Lys Tyr Ser Ala Pro Arg Arg Pro Thr Ala Thr Gly Asp Tyr Asp Lys
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Lys Asn Tyr Val
          20
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Leu Ala Ser Lys Ser Ala Glu Glu Gly Lys Gln Ile Pro Asp Ser Leu
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Ser Thr Asp Leu
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Leu Ala Val Leu Ala Tyr Ser Ile Thr Leu Val Met Leu Trp Ser Ile
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Trp Gln Tyr Ala
          20
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Leu Gly Tyr Ser Ile Pro Ser Arg Ser Gly Ala Ser Gly Leu Asp Lys
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Arg Asp Tyr Val
          20
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Leu Met Asp Gly Leu Pro Pro Gly Asp Ser Asn Gln Leu Ala Trp Phe
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Asp Thr Asp Leu
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          20
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Leu Asn Ser Cys Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
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Pro Ile Pro Ala Gly Gly Cys Thr Phe Ser Gly Ile Phe Pro Thr Leu
1             5               10                15
Thr Ser Pro Leu
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>918
Pro Pro Ala Thr Pro Ser Pro Arg Leu Ala Leu Pro Ala His His Asn
1             5               10                15
Ala Thr Arg Leu
          20
<210>919
<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>919
Pro Ser Trp Arg Arg Ser Ser Leu Ser Glu Ser Glu Asn Ala Thr Ser
1             5               10                15
Leu Thr Thr Phe
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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Pro Tyr Ser Glu Leu Asn Tyr Glu Thr Ser His Tyr Pro Ala Ser Pro
1             5               10                15
Asp Ser Trp Val
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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<400>921
Gln Asp Phe Arg Arg Ala Phe Arg Arg Ile Leu Ala Arg Pro Trp Thr
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Gln Thr Ala Trp
          20
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<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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<400>922
Arg Glu Leu Val Asp Arg Gly Glu Val Arg Gln Phe Thr Leu Arg His
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Trp Leu Lys Val
          20
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<213>Artificial
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Arg Arg Ala Ser Thr Ser Arg Glu Thr Trp Val
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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Arg Ser Gly Ala Thr Ile Pro Leu Val Gly Gln Asp Ile Ile Asp Leu
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Gln Thr Glu Val
          20
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<211>19
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<213>Artificial
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<400>925
Ser Ser Lys Ser Lys Ser Ser Glu Glu Ser Gln Thr Phe Phe Gly Leu
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Tyr Lys Leu
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<213>Artificial
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Ser Ser Pro Asp Ser Ser Tyr Gln Gly Lys Gly Phe Val Met Ser Arg
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Ala Met Tyr Val
          20
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<213>Artificial
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Ser Ser Ser Arg Arg Asp Ser Ser Trp Ser Glu Thr Ser Glu Ala Ser
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Tyr Ser Gly Leu
          20
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<213>Artificial
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<400>928
Thr Phe Ala Ala Gly Phe Asn Ser Thr Gly Leu Pro His Ser Thr Thr
1             5               10                15
Arg Val
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<211>19
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<213>Artificial
<220>
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<400>929
Thr Gly Arg Gly Met Ser Gly Gly Arg Ser Ser Arg Thr Arg Arg Glu
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Thr Gln Leu
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<213>Artificial
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Thr Arg Glu Asp Ile Tyr Val Asn Tyr Pro Thr Phe Ser Arg Arg Pro
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Lys Thr Arg Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Val Asp Pro Asn Ser Pro Ala Ala Lys Lys Lys Tyr Val Ser Tyr Asn
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Asn Leu Val Ile
          20
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<212>PRT
<213>Artificial
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Val His Lys Val Arg Asn Lys Phe Lys Ala Lys Cys Ser Leu Cys Arg
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Leu Tyr Ile Ile
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<400>933
Val Pro Gly Ala Leu Asp Tyr Ala Ala Phe Ser Ser Ala Leu Tyr Gly
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Glu Ser Asp Leu
          20
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<213>Artificial
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Asp Lys Glu Leu Glu
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Val Leu Ser Leu
          20
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<213>Artificial
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Leu Leu Lys Glu Arg
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Ser Thr Glu Leu
          20
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<213>Artificial
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Asn Asp Asn Ile Ala
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Leu Leu Val Gln
          20
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<212>PRT
<213>Artificial
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Pro Ser Arg Lys Leu
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Asn Thr Glu Ile
          20
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<212>PRT
<213>Artificial
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Tyr Ile Pro Glu Ala
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Gln Thr Arg Leu
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Ala Ala Gly Gly Arg Ser Ala Arg Gly Gly Arg Leu Gln Gly Arg Arg
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          20
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<213>Artificial
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Phe His Ser Lys Thr Ala Gly Ala Asn Thr Thr Asp Lys Glu Leu Glu
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Val Leu Ser Leu
          20
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<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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Phe Asn Gly Ser Ser Asn Gly His Val Tyr Glu Lys Leu Ser Ser Ile
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Glu Ser Asp Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
<223>PL sequence binding TIP43 d1
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Gly Gly Asp Leu Gly Thr Arg Arg Gly Ser Ala His Phe Ser Ser Leu
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Glu Ser Glu Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
<220>
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Gly Arg Trp Thr Gly Arg Ala Met Ser Ala Trp Lys Pro Thr Arg Arg
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Glu Thr Glu Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<223>PL sequence binding TIP43 d1
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Lys His Ser Arg Lys Ser Ser Ser Tyr Ser Ser Ser Ser Thr Thr Val
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Lys Thr Ser Tyr
          20
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<213>Artificial
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Lys Lys Lys Lys Gln Pro Gly Asn Ser Thr Lys Glu Ser Glu Ser Thr
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<213>Artificial
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Leu Ala Ser Lys Ser Ala Glu Glu Gly Lys Gln Ile Pro Asp Ser Leu
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Ser Thr Asp Leu
          20
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<213>Artificial
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Leu Asn Ser Ser Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
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Glu Ser Asp Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Arg Ser Gly Ala Thr Ile Pro Leu Val Gly Gln Asp Ile Ile Asp Leu
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Gln Thr Glu Val
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Ser Phe Thr Ser Ile Leu Thr Cys His Gln Arg Arg Thr Gln Arg Lys
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Ser Ser Ser Arg Arg Asp Ser Ser Trp Ser Glu Thr Ser Glu Ala Ser
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Tyr Ser Gly Leu
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<213>Artificial
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Glu Ser Glu Val
          20
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<213>Artificial
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Thr Thr Asn Asn Asn Pro Asn Ser Ala Val Asn Ile Lys Lys Ile Phe
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Thr Asp Val
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<213>Artificial
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Leu Tyr Ile Ile
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<213>Artificial
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Glu Tyr Leu Gly Leu
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Asp Val Pro Val
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<213>Artificial
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Gly Ala Ser Ala Asp
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Ser Thr Gln Ala
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Lys Leu Ser Ser Ile
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Glu Ser Asp Val
          20
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<213>Artificial
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<223>PL sequence binding TIP43 d1
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Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Asn Asp Asn Ile Ala
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Leu Leu Val Gln
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Ala Ala Gly Gly Arg Ser Ala Arg Gly Gly Arg Leu Gln Gly Arg Arg
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          20
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<213>Artificial
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Ala Gly Ala Val Arg Thr Pro Leu Ser Gln Val Asn Lys Val Trp Asp
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Gln Ser Ser Val
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<213>Artificial
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Ala Arg His Arg Val Thr Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Val Asn Val Ser
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Ser Asn Leu
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<223>PL sequence binding Vartul d2
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Ala Thr Asp Tyr Leu Val Gln Pro Phe Met Asp Gln Leu Ala Phe His
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Gln Phe Tyr Ile
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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Asp Phe Arg Pro Ser Phe Lys His Ile Leu Phe Arg Arg Ala Arg Arg
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Gly Phe Arg Gln
          20
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<212>PRT
<213>Artificial
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<223>PL sequence binding Vartul d2
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Glu Leu Leu Gln Phe Cys Arg Thr Pro Asn Pro Ala Leu Lys Asn Gly
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Gln Tyr Trp Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<223>PL sequence binding Vartul d2
<400>964
Glu Ser Ser Gly Thr Gln Ser Pro Lys Arg His Ser Gly Ser Tyr Leu
1             5               10                15
Val Thr Ser Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<223>PL sequence binding Vartul d2
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Gly Arg Trp Thr Gly Arg Ala Met Ser Ala Trp Lys Pro Thr Arg Arg
1             5               10                15
Glu Thr Glu Val
          20
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<211>20
<212>PRT
<213>Artificial
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<223>PL sequence binding Vartul d2
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His His Leu Val Ala Gln Arg Asp Ile Arg Gln Phe Gln Leu Gln His
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Trp Leu Ala Ile
          20
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<213>Artificial
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<223>PL sequence binding Vartul d2
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Lys His Ser Arg Lys Ser Ser Ser Tyr Ser Ser Ser Ser Thr Thr Val
1             5               10                15
Lys Thr Ser Tyr
          20
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<213>Artificial
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<223>PL sequence binding Vartul d2
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Lys Lys Lys Lys Gln Pro Gly Asn Ser Thr Lys Glu Ser Glu Ser Thr
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Asn Ser Val Arg Leu Met Leu
          20
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<213>Artificial
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<223>PL sequence binding Vartul d2
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Leu Ala Val Leu Ala Tyr Ser Ile Thr Leu Val Met Leu Trp Ser Ile
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Trp Gln Tyr Ala
          20
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<211>20
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<213>Artificial
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<223>PL sequence binding Vartul d2
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Leu Asn Ser Cys Ser Asn Arg Arg Val Tyr Lys Lys Met Pro Ser Ile
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Glu Ser Asp Val
          20
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<213>Artificial
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<223>PL sequence binding Vartul d2
<400>971
Pro Ile Pro Ala Gly Gly Cys Thr Phe Ser Gly Ile Phe Pro Thr Leu
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Thr Ser Pro Leu
          20
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<213>Artificial
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<223>PL sequence binding Vartul d2
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Pro Val Tyr Ile Val Gln Glu Met Pro Pro Gln Ser Pro Ala Asn Ile
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Tyr Tyr Lys Val
          20
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<213>Artificial
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<223>PL sequence binding Vartul d2
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Pro Tyr Ser Glu Leu Asn Tyr Glu Thr Ser His Tyr Pro Ala Ser Pro
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          20
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<213>Artificial
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<223>PL sequence binding Vartul d2
<400>974
Gln Asp Phe Arg Arg Ala Phe Arg Arg Ile Leu Ala Arg Pro Trp Thr
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Gln Thr Ala Trp
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Leu Tyr Ile Ile
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          20
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Glu Ser Asp Val
          20
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Leu Leu Val Gln
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Pro Ile Asp Leu
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1

Claims (94)

1.一种鉴定患者是否感染A型流感病毒的方法，包括：
确定患者样本中是否存在A型流感病毒的NS1蛋白，存在表明患者感染A型流感病毒。
2.如权利要求1所述的方法，其中确定包括：
将患者样本与特异结合A型流感病毒蛋白NS1的试剂接触；和
检测该试剂和NS1蛋白之间的特异结合，特异结合表明A型流感病毒的存在。
3.如权利要求1所述的方法，其中确定包括确定编码NS1蛋白PDZ配体模体(PL)的mRNA的存在，并由mRNA的存在推断出NS1蛋白的存在。
4.如权利要求1所述的方法，其中NS1蛋白PL具有模体S/T-X-V/I/L，其中S是丝氨酸，T是苏氨酸，V是缬氨酸，I是异亮氨酸，L是亮氨酸，和X是任意氨基酸。
5.如权利要求2所述的方法，其中试剂是至少一种PDZ多肽。
6.如权利要求2所述的方法，其中试剂是至少一种抗体。
7.如权利要求6所述的方法，其中抗体对NS1蛋白的保守区特异。
8.如权利要求2所述的方法，其中接触步骤包括，将患者样本与特异结合A型流感病毒蛋白NS1不同表位的第一和第二试剂接触，第一试剂固定在支持物上，并且检测步骤检测其中第一和第二试剂与NS1蛋白特异结合的夹心，以表明病毒的存在。
9.如权利要求8所述的方法，其中第一和第二试剂是第一和第二抗体。
10.如权利要求8所述的方法，其中第一试剂是一种或者多种PDZ多肽，和第二试剂是一种或者多种抗体。
11.如权利要求8所述的方法，其中第一试剂是一种或者多种PDZ多肽和一种或者多种抗体的混合物。
12.如权利要求6所述的方法，其中所述抗体是对A型流感病毒NS1的所有亚型特异的抗体。
13.如权利要求5所述的方法，其中至少一种PDZ多肽选自：外膜，PSD95(PDZ#2)，PSD95(PDZ#1，2，3)，DLG1(PDZ#1)，DLG1(PDZ#1，2)，DLG1(PDZ#2)，DLG2(PDZ#1)，DLG2(PDZ#2)，Magi3(PDZ#1)，PTN3(PDZ#1)，MAST2(PDZ#1)，NeDLG(PDZ#1，2)，Shank1 d1，Shank2 d1，Shank3 d1，Syntrophin1α，Syntrophin γ1，Magi1(PDZ#1)，Magi1(PDZ#4)，Tip1；PTPL1(PDZ#1)，Mint3(PDZ#1)，Lym Mystique(PDZ#1)，DLG2(PDZ#3)，MUPP1(PDZ#8)，NeDLG(PDZ#1)，DLG5(PDZ#1)，PSD95(PDZ#1)，NumBP(PDZ#3)，LIMK1(PDZ#1)，KIAA0313，DLG1(PDZ#2)，Syntenin(PDZ#2)，Pick1，MAST2，PTN3(PDZ#1)，NOS1(PDZ#1，2，3)，MINT1(PDZ#2)，ZO-1(PDZ#2)，NSP和RIM212。
14.如权利要求1所述的方法，其中所述患者样本选自：血液，组织，鼻分泌物，肺渗出液，泄殖腔样本，粪便样本，喉拭子和唾液。
15.如权利要求1所述的方法，其中所述患者选自：人，鸟，猪，马，和哺乳动物。
16.如权利要求5所述的方法，其中所述PDZ多肽是包括PSD95d2的PL结合区SEQ ID NO：1(80-100氨基酸区域)的蛋白。
17.如权利要求5所述的方法，其中所述PDZ多肽是选自下列的蛋白：PSD95 d1，PSD95 d2，PSD95 d3，INADL8d1，Magi1 d1，DLG1d2，DLG1d3，NeDLG1d1，和NeDLG1d2。
18.一种用于A型流感感染诊断和分型的方法，包括鉴定亚型特异性A型流感病毒蛋白NS1 PDZ配体模体(PL)区的存在。
19.如权利要求18所述的方法，其中PL区具有模体：S/T-X-V/I/L，其中S是丝氨酸，T是苏氨酸，V是缬氨酸，I是异亮氨酸，L是亮氨酸，和X是任意氨基酸。
20.一种检测待测样本中包含PL区的A型流感病毒蛋白的存在和量的方法，包括：
在适于结合的条件下，将等份待测样本和至少一种PDZ肽和至少一种PDZ配体(PL)检测剂混合；和
测定PDZ肽和PL检测剂之间的结合，其中结合降低表明待测样本中存在A型流感病毒蛋白。
21.如权利要求20所述的方法，其中A型流感病毒蛋白选自：NP，HA，M1和NS1。
22.如权利要求20所述的方法，其中PL检测剂包括来自A型流感病毒蛋白C末端的PL模体，所述A型流感病毒蛋白选自：NP，HA，M1和NS1。
23.如权利要求22所述的方法，其中PL模体是：S/T-X-V/I/L，其中S是丝氨酸，T是苏氨酸，V是缬氨酸，I是异亮氨酸，L是亮氨酸，和X是任意氨基酸。
24.一种鉴定患者是否感染A型流感病毒的方法，包括：
确定患者的鼻分泌物、痰样本或者喉拭子中是否存在A型流感病毒的NS 1蛋白，存在表明患者感染A型流感病毒。
25.一种检测待测样本中包含PL区的A型流感病毒蛋白的存在和量的方法，包括：
将等份待测样本和至少一种PDZ肽混合；和
测定PDZ肽和PL A型流感病毒蛋白之间的结合，其中结合表明待测样本中存在A型流感病毒蛋白。
26.一种确定患者是否感染流感A致病株的方法，包括
确定患者是否感染流感A，
如果患者被感染；和
确定患者样本中带有PL模体的非结构蛋白的存在，存在表明患者感染A型流感病毒的致病株。
27.一种鉴定患者样本中A型流感病毒的特异性亚型存在的方法，包括：
将患者样本与至少一种PDZ多肽或者至少一种捕获抗体接触，所述捕获抗体与对流感病毒A亚型特异的NS1蛋白的PL模体特异结合；和
检测PDZ多肽或者捕获抗体是否与样本中的PL模体特异结合，特异结合表明亚型的存在。
28.如权利要求27所述的方法，其中接触步骤包括将患者样本与多个PDZ多肽接触，所述PDZ多肽特异结合多个NS1蛋白中的多个PL模体，所述PL模体对流感病毒A的多个亚型特异；并且检测包括确定哪种PDZ多肽特异结合其PL模体，与一种或者多种PDZ多肽结合从而表明亚型的存在。
29.如权利要求27所述的方法，其中所述捕获抗体识别NS1的羧基末端。
30.如权利要求27所述的方法，其中所述捕获抗体或者PDZ多肽识别选自下列的一种或者多种PDZ配体模体(PL)：ESEV(SEQ IDNO：2)，ESEI(SEQ ID NO：3)，ESKV(SEQ ID NO：4)，TSEV(SEQ IDNO：5)，GSEV(SEQ ID NO：6)，RSEV(SEQ ID NO：7)，RSKV(SEQ IDNO：8)，GSEI(SEQ ID NO：9)，GSKV(SEQ ID NO：10)，NICI(SEQ IDNO：11)，TICI(SEQ ID NO：12)，RICI(SEQ ID NO：13)，DMAL(SEQ IDNO：14)，DMTL(SEQ ID NO：15)，DIAL(SEQ ID NO：16)，DLDY(SEQID NO：17)，SICL(SEQ ID NO：18)，SEV，SEI，SKV和SKI。
31.如权利要求27所述的方法，其中所述PDZ多肽选自：外膜，PSD95(PDZ#2)，PSD95(PDZ#1，2，3)，DLG1(PDZ#1)，DLG1(PDZ#1，2)，DLG1(PDZ#2)，DLG2(PDZ#1)，DLG2(PDZ#2)，Magi3(PDZ#1)，PTN3(PDZ#1)，MAST2(PDZ#1)，NeDLG(PDZ#1，2)，Shank1 d1，Shank2 d1，Shank3 d1，Syntrophin1α，Syntrophinγ1，Magi1(PDZ#1)，Magi1(PDZ#4)，Tip1；PTPL1(PDZ#1)，Mint3(PDZ#1)，Lym Mystique(PDZ#1)，DLG2(PDZ#3)，MUPP1(PDZ#8)，NeDLG(PDZ#1)，DLG5(PDZ#1)，PSD95(PDZ#1)，NumBP(PDZ#3)，LIMK1(PDZ#1)，KIAA0313，DLG1(PDZ#2)，Syntenin(PDZ#2)，Pick1，MAST2，PTN3(PDZ#1)，NOS1(PDZ#1，2，3)，MINT1(PDZ#2)，ZO-1(PDZ#2)，NSP和RIM2。
32.如权利要求27所述的方法，其中所述患者样本选自：鼻分泌物，痰样本，喉拭子，泄殖腔样本，粪便样本，肺渗出液和唾液。
33.如权利要求27所述的方法，其中所述亚型是禽流感A，所述PL是PL模体ESEV/I/A(SEQ ID NO：19)。
34.如权利要求27所述的方法，其中所述亚型是H3N2，PL是PL模体RSKV。
35.如权利要求27所述的方法，其中所述PL是PL模体ESKV(SEQ ID NO：4)。
36.如权利要求24所述的方法，其中所述亚型是H1N1，PL是PL模体RSEV。
37.如权利要求27所述的方法，还包括将样本与检测抗体接触。
38.如权利要求37所述的方法，其中所述检测抗体包括信号发生化合物。
39.如权利要求37所述的方法，其中所述检测抗体不抑制PL与PDZ的结合或者捕获抗体与NS1的结合。
40.如权利要求27所述的方法，其中所述PDZ多肽或者所述抗体固定在固体支持物上。
41.如权利要求40所述的方法，其中所述固体支持物是毛细管流动分析装置，所述接触步骤包括将小棒浸在所述患者样本中。
42.如权利要求41所述的方法，其中毛细管流动分析是免疫分析。
43. 如权利要求40所述的方法，其中固体支持物是侧向流分析。
44.一种用于患者样本中流感A病毒的鉴定和分型的试剂盒，包括，
与流感A病毒NS1特异结合的试剂，其中所述试剂固定在固体支持物上。
45.如权利要求44所述的试剂盒，其中所述试剂是抗体，PDZ多肽，寡核苷酸适配体，或者其混合物。
46.一种用于患者样本中流感A病毒鉴定和/或分型的试剂盒，包括
与流感A的病毒编码蛋白特异结合的试剂；和
与NS1蛋白特异结合的试剂。
47.如权利要求46所述的试剂盒，其中特异结合NS1蛋白的试剂与蛋白上的PL区结合。
48.如权利要求46所述的试剂盒，其中所述试剂是抗体，PDZ多肽，寡核苷酸适配体，或者其混合物。
49.如权利要求46所述的试剂盒，其中所述流感A的病毒编码蛋白是NS1。
50.一种用于患者样本中流感A病毒鉴定和/或分型的试剂盒，包括
与NS1在PL模体以外处特异结合的试剂；和
与NS1在PL模体处特异结合的试剂。
51.一种包括多个PDZ多肽的试剂盒，所述PDZ多肽对多个流感A病毒的多个NS1蛋白中的多个PL模体特异。
52.一种鉴定能够特异结合流感病毒PDZ配体(PL)的PDZ多肽的方法，包括：
将流感病毒非结构蛋白PL与具有PDZ结构域的候选多肽在适于结合的条件下接触；和
检测PL与候选多肽的特异结合；和确认PL与PDZ结合位点结合。
53.一种分离的抗体，所述抗体与A型流感病毒NS1蛋白的羧基末端模体特异结合。
54.如权利要求53所述的分离的抗体，其中所述羧基末端模体包括选自下列的PL模体：ESEV(SEQ ID NO：2)，ESEI(SEQ ID NO：3)，ESKV(SEQ ID NO：4)，TSEV(SEQ ID NO：5)，GSEV(SEQ ID NO：6)，RSEV(SEQ ID NO：7)，RSKV(SEQ ID NO：8)，GSEI(SEQ ID NO：9)，GSKV(SEQ ID NO：10)，NICI(SEQ ID NO：11)，TICI(SEQ ID NO：12)，RICI(SEQ ID NO：13)，DMAL(SEQ ID NO：14)，DMTL(SEQ ID NO：15)，DIAL(SEQ ID NO：16)，DLDY(SEQ ID NO：17)，SICL(SEQ ID NO：18)，SEV，SEI，SKV和SKI。
55.如权利要求53所述的抗体，其中所述抗体是单克隆抗体或者抗体片段。
56.如权利要求53所述的抗体，其中所述PL模体是ESEV/I/A(SEQ ID NO：19)。
57.一种用于患有A型流感病毒感染或者处于A型流感病毒感染风险下的患者的治疗或者预防的方法，包括：
对患者给药试剂的有效方案，所述试剂抑制病毒NS1蛋白与细胞PDZ蛋白的相互作用，从而实现治疗或者预防感染。
58.如权利要求57所述的方法，其中所述试剂是特异结合A型流感病毒NS1蛋白PL模体的抗体。
59.如权利要求57所述的方法，其中试剂选自：反义寡核苷酸，小分子，siRNA和锌指蛋白，其中所述试剂抑制流感A NS1蛋白或者PDZ蛋白的表达。
60.如权利要求58所述的方法，其中NS1的PL模体选自：ESEV(SEQ ID NO：2)，ESEI(SEQ ID NO：3)，ESKV(SEQ ID NO：4)，TSEV(SEQ ID NO：5)，GSEV(SEQ ID NO：6)，RSEV(SEQ ID NO：7)，RSKV(SEQ ID NO：8)，GSEI(SEQ ID NO：9)，GSKV(SEQ ID NO：10)，NICI(SEQ ID NO：11)，TICI(SEQ ID NO：12)，RICI(SEQ ID NO：13)，DMAL(SEQ ID NO：14)，DMTL(SEQ ID NO：15)，DIAL(SEQ ID NO：16)，DLDY(SEQ ID NO：17)，SICL(SEQ ID NO：18)，SEV，SEI，SKV和SKI。
61.如权利要求58所述的方法，其中试剂是PDZ多肽。
62.如权利要求61所述的方法，其中PDZ多肽至少包括与PL相互作用的结合区，SEQ ID NO：1。
63.如权利要求61所述的方法，其中所述PDZ多肽选自：外膜，PSD95(PDZ#2)，PSD95(PDZ#1，2，3)，DLG1(PDZ#1)，DLG1(PDZ#1，2)，DLG1(PDZ#2)，DLG2(PDZ#1)，DLG2(PDZ#2)，Magi3(PDZ#1)，PTN3(PDZ#1)，MAST2(PDZ#1)，NeDLG(PDZ#1，2)，Shank1 d1，Shank2 d1，Shank3 d1，Syntrophin1α，Syntrophinγ1，Magi1(PDZ#1)，Magi1(PDZ#4)，Tip1；PTPL1(PDZ#1)，Mint3(PDZ#1)，Lym Mystique(PDZ#1)，DLG2(PDZ#3)，MUPP1(PDZ#8)，NeDLG(PDZ#1)，DLG5(PDZ#1)，PSD95(PDZ#1)，NumBP(PDZ#3)，LIMK1(PDZ#1)，KIAA0313，DLG1(PDZ#2)，Syntenin(PDZ#2)，Pick1，MAST2，PTN3(PDZ#1)，NOS1(PDZ#1，2，3)，MINT1(PDZ#2)，ZO-1(PDZ#2)，NSP和RIM2。
64.一种筛选抗病毒剂的方法，包括：
在待测化合物存在或者缺失的条件下，将PDZ多肽和流感病毒PDZ配体(PL)接触；和
将待测化合物存在时PDZ/PL结合的量与待测化合物缺失时相比较，其中所述抗病毒剂减少PDZ/PL结合。
65.如权利要求64所述的方法，还包括在体内或者胞内检测所述试剂以鉴定其是否干扰干扰素产生。
66.一种非天然的PDZ配体(PL)肽诊断剂，包括选自流感A蛋白C端氨基酸序列以内的氨基酸线性阵列，其中所述PL能够结合哺乳动物PDZ多肽。
67.如权利要求66所述的非天然PDZ配体(PL)肽试剂，其中PL具有模体：S/T-X-V/I/L，其中S是丝氨酸，T是苏氨酸，V是缬氨酸，I是异亮氨酸，L是亮氨酸，和X是任意氨基酸。
68.如权利要求66所述的非天然PL肽诊断剂，其中流感A NS1蛋白的氨基酸线性阵列选自：ESEV(SEQ ID NO：2)，ESEI(SEQ IDNO：3)，ESKV(SEQ ID NO：4)，TSEV(SEQ ID NO：5)，GSEV(SEQ IDNO：6)，RSEV(SEQ ID NO：7)，RSKV(SEQ ID NO：8)，GSEI(SEQ IDNO：9)，GSKV(SEQ ID NO：10)，NICI(SEQ ID NO：11)，TICI(SEQ IDNO：12)，RICI(SEQ ID NO：13)，DMAL(SEQ ID NO：14)，DMTL(SEQ IDNO：15)，DIAL(SEQ ID NO：16)，DLDY(SEQ ID NO：17)，SICL(SEQ IDNO：18)，SEV，SEI，SKV和SKI。
69.如权利要求66所述的非天然PL肽诊断剂，还包括选自下列的诊断剂：阳性对照，阴性对照，分析标准品，分析校准品，竞争性分析配体，标记的肽检测剂或者固相捕获剂。
70.如权利要求66所述的非天然PL肽诊断剂，还包括合成肽，重组多肽，基本上纯化的天然PL多肽，基本上纯化的天然PL多肽的片段，模拟PL的肽，寡核苷酸适配体PL和多肽适配体PL。
71.如权利要求70所述的非天然PL肽，其中所述PL肽来自流感A NS1蛋白。
72.一种用于检测生物样本中流感A PL的非天然PDZ多肽诊断剂，包括能够结合流感A NS1蛋白的非天然PDZ多肽，其中PDZ结构域蛋白诊断剂选自阳性对照、阴性对照、分析标准品、分析校准品、竞争性配体、标记的蛋白检测结合伴侣和捕获剂的诊断剂。
73.如权利要求72所述的非天然PDZ多肽诊断剂，选自：外膜，PSD95(PDZ#2)，PSD95(PDZ#1，2，3)，DLG1(PDZ#1)，DLG1(PDZ#1，2)，DLG1(PDZ#2)，DLG2(PDZ#1)，DLG2(PDZ#2)，Magi3(PDZ#1)，PTN3(PDZ#1)，MAST2(PDZ#1)，NeDLG(PDZ#1，2)，Shank1 d1，Shank2 d1，Shank3 d1，Syntrophin1α，Syntrophinγ1，Magi1(PDZ#1)，Magi1(PDZ#4)，Tip1；PTPL1(PDZ#1)，Mint3(PDZ#1)，Lym Mystique(PDZ#1)，DLG2(PDZ#3)，MUPP1(PDZ#8)，NeDLG(PDZ#1)，DLG5(PDZ#1)，PSD95(PDZ#1)，NumBP(PDZ#3)，LIMK1(PDZ#1)，KIAA0313，DLGZ(PDZ#2)，Syntenin(PDZ#2)，Pick1，MAST2，PTN3(PDZ#1)，NOS1(PDZ#1，2，3)，MINT1(PDZ#2)，ZO-1(PDZ#2)，NSP和RIM2。
74.一种用于检测待测样本中流感A蛋白的信号发生结合剂，包括非天然PL或者非天然PDZ，其中PL或者PDZ任一种包括与信号发生化合物共价连接的肽或者多肽。
75.一种鉴定患者是否感染致病流感A的方法，包括：
确定患者样本中是否存在A型流感病毒的NS2蛋白，所述蛋白包括第70位的丝氨酸，该蛋白的存在表明患者感染流感A的致病株。
76.如权利要求75所述的方法，其中确定包括：
将患者样本与特异结合NS2蛋白的试剂接触，所述NS2蛋白中第70位被丝氨酸所占据。
77.如权利要求76所述的方法，其中试剂是抗体。
78.如权利要求75所述的方法，其中确定包括确定编码NS2蛋白的核酸密码子70中的一个或者多个核苷酸的一致性。
79.如权利要求78所述的方法，其中确定包括将核酸与探针或者引物接触，所述探针或者引物与包括或者靠近一个或者多个核苷酸的核酸序列杂交。
80.一种鉴定患者是否感染致病性A型禽流感病毒的方法，包括：
将患者样本与PSD-95PDZ蛋白接触；和
检测PSD-95PDZ蛋白与样本之间的特异结合，特异结合表明存在A型流感病毒，存在表明患者感染致病性A型禽流感病毒。
81.如权利要求80所述的方法，其中致病性A型流感病毒是H5N1。
82.如权利要求80所述的方法，其中PSD-95PDZ蛋白是PSD-95的结构域2。
83.如权利要求80所述的方法，其中流感NS1蛋白PL具有以下模体：ESKV(SEQ ID NO：4)，ESEI(SEQ ID NO：3)，或者ESEV(SEQ IDNO：2)。
84.如权利要求80所述的方法，其中接触步骤包括将患者样本与PSD-95PDZ蛋白和抗体接触，所述抗体与A型流感病毒蛋白NS1的不同表位而不是PSD-95PDZ蛋白特异结合，PSD-95固定在支持物上，检测步骤检测与抗体特异结合的NS1蛋白。
85.如权利要求80所述的方法，还包括将患者样本与作为对照的第二种PDZ蛋白INADL d8接触，并确定特异结合，第一种PDZ-95蛋白相对于第二种PDZ蛋白的特异性结合更高表明患者感染致病性A型禽流感病毒。
86.NS-1蛋白在取自患者的样本中检测流感A的用途。
87.如权利要求1所述的用途，其中样本是鼻分泌物。
88.与流感A致病株的PL模体结合的抗体在鉴定流感A中的用途。
89.PDZ多肽在检测流感A致病株中的用途。
86.NS-1蛋白在取自患者的样本中检测流感A的用途。
87.如权利要求1所述的用途，其中样本是鼻分泌物。
88.与流感A致病株的PL模体结合的抗体在鉴定流感A中的用途。
89.PDZ多肽在检测流感A致病株中的用途。
90.来自流感A致病株的NS-1蛋白和结合NS-1的PDZ蛋白在筛选具有用于治疗流感A致病株活性的化合物中的用途。
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