CN101045930A - 依尼奥小单孢菌西索霉素生物合成基因簇 - Google Patents

Abstract

本发明从西索米星产生菌依尼奥小单孢菌Ts388高产菌株中克隆到西索米星生物合成基因簇，该基因簇总长约37739p，包括多个orf和2个rRNA(rRNA1和rRNA2)；分子量：(37.739/1.575)*10⁶≈23.96*10⁶，该DNA序列涉及到西索米星生物合成的相关酶。本发明的基因可用于研究西索霉素生物合成的机制，基因的功能，基因的组织和基因的调控等；对这些基因进行改良，有可能得到高产的优良菌种；利用这些基因进行重新组织，或利用这些基因与其它基因进行重组，有可能构建出新的生理活性物质或新药物，最终获得新化合物，产生巨大的经济效益和社会效益。

Description

依尼奥小单孢菌西索霉素生物合成基因簇

技术领域

本发明属于抗生素合成领域，具体涉及一种依尼奥小单孢菌西索霉素生物合成基因簇。

背景技术

微生物是生物制药的重要源泉，放线菌位居首位。用依尼奥小单孢菌生产西索霉素已有报道，但是产量较低。抗生素产生菌的生物合成基因几乎总是与其抗性基因相连锁，从研究抗性基因入手有望从根本上提高小单孢菌生物合成抗生素的能力；借助抗性基因，可以方便地克隆相关抗生素生物合成基因簇。我国在小单孢菌基因克隆方面的研究少见报道，并且国内外未见报道西索霉素生物合成基因簇。

发明内容

本发明的目的是针对上述问题，提供一种依尼奥小单孢菌西索霉素生物合成基因簇，该基因簇揭示了生物合成西索霉素的相关DNA序列，对应的开放性阅读框，基因排列顺序和可能的基因功能。

本发明的依尼奥小单孢菌西索霉素生物合成基因簇，其碱基序列如序列表中SEQ ID NO.1所示。其基因簇的分子量：(37.739/1.575)*10⁶≈23.96*10⁶；几何结构：DNA如附图所示。

本发明的显著优点为：本发明首次从依尼奥小单孢菌Ts388中克隆到西索霉素生物合成基因，这些基因可用于研究西索霉素的生物合成机制，基因的功能，基因的组织和生物合成的基因调控等；对这些基因进行改良，有可能得到高产的优良菌种，用于工业化生产，产生丰厚的利润；利用这些基因进行重新组织，或利用这些基因与其它基因进行重组，有可能构建出新的生理活性物质或新药物，最终获得新化合物，产生巨大的经济效益和社会效益。

附图说明

附图为西索霉素生物合成基因簇的相关DNA序列图。

具体实施方式

该西索霉素生物合成基因簇的来源为依尼奥小单孢菌Ts388。

该西索霉素生物合成基因簇总长约37739p，包括多个orf和2个rRNA(rRNA1和rRNA2)。该西索霉素生物合成基因簇的DNA序列涉及到西索米星的生物合成的相关酶。估计有28个左右orf，其中sisT，sisU，sisV，srmO，sisW，sisX，sisY，sisZ，srmA，sisA，sisB，sisC，sisD，sisE，sisF，sisL，SCD2，SCD3已经确定。

该西索霉素生物合成基因簇的制备步骤为：

1材料和方法

1.1材料

(1)菌种与质粒伊纽小单孢菌(M.inyoensis)Ts388由本研究室保存；E.coli BL21(DE3)、E.coliDH5α和质粒pUC18均由上海来益生物药物研发中心提供。表达载体pET-30a购自Novagen公司。

(2)培养基LB培养基，根据需要添加氨苄青霉素(终浓度100μg/mL)；用于伊纽小单孢菌TS388生长的培养基见以下文献。使用的抗生素及浓度为氨苄青霉素100μg/mL，卡那霉素50μg/mL。其它常用化学药品及试剂购自上海生物工程公司和华美公司。

(3)主要试剂所有的工具酶购自TaKaRa公司；氨苄青霉素(Amp)为华美生物工程公司产品；琼脂糖为Pharmacia产品；PCR引物由上海生物工程公司合成；DNA序列由TaKaRa公司测定。

1.2基因的克隆及其测序

伊纽小单孢菌TS388染色体DNA的提取见以下文献；质粒DNA采用碱裂解法提取，DNA酶切、连接等均按产品说明书进行；采用CaCl2方法制备感受态细胞，在含有抗生素的选择性培养基上筛选阳性转化子。DNA采用试剂盒回收(购自TaKaRa公司)。

从GenBank中选择与伊纽小单孢菌亲缘关系比较接近的、产庆大霉素的棘孢小单孢菌(M.echinospora)庆大霉素生物合成基因簇(AY524043)作为引物设计的参考模板，设计引物。PCR循环条件为：94℃预变性5min；94℃变性1min，59℃复性1min，72℃延伸2min，循环30次；最后72℃保温10min。PCR产物经琼脂糖凝胶电泳回收，经相应的限制性酶切割，开与受同样酶双酶切的pUC18载体进行连接，然后转化大肠杆菌DH5α感受态细胞，构建含扩增片段的亚克隆子，经蓝白斑筛选，得到了阳性克隆子，送TaKaRa公司测序，所得序列应用vector NTI 9.1和Blast软件进行序列比对和结构预测。

本发明的西索霉素生物合成基因簇的制备工艺、步骤、条件、收集、纯化步骤和鉴定方法已经公开发表于以下文献中：

[1]洪文荣，许向前，朱春宝，陈代杰，朱宝泉。依纽小单胞菌2-脱氧蟹肌醇合成酶基因的克隆与表达。复旦学报，2006，45(3)：.283-287。

[2]洪文荣，朱春宝，陈代杰，朱宝泉。紫苏霉素抗性基因srml的克隆及其特性研究复旦学报，2005，44(4)：549-554。

[3]洪文荣，陈代杰，朱宝泉。依尼奥小单孢菌抗性基因sisR的克隆研究，生物工程学报，2005，21(1)，149～153。

本发明的西索霉素生物合成基因簇的DNA序列由TaKaRa公司检测，应用vector NTI 9.1和Blast软件进行序列比对和结构功能预测。

基因功能预测：

经DNA序列及其蛋白质序列比对分析，与已知同类功能基因的同源性达90％以上，则初步推测其功能相似。以srmA抗性基因的功能预测为例，阐述如下【sis-srmA为来自伊纽小单孢菌(Micromonosporainyoensis)Ts388的srmA基因；gen-grmA为来自产庆大霉素的棘孢小单孢菌(Micromonospora echinospora)的grmA基因】：

srmA与grmA的DNA比对结果：

                  1                                                         60

gen-grmA-orf   (1)ATGACGACATCTGCGCCTGAGGACCGTATCGACCAGGTCGAGCAGGCCATCACCAAGAGC

sis-srmA-orf   (1)ATGACGACATCTACGGGCGACGACCGTATCGACCAGATTCAGCAGGCCATCACCAAGAGC

   Consensus   (1)ATGACGACATCT CG  GA GACCGTATCGACCAG T   AGCAGGCCATCACCAAGAGC

                  61                                                       120

gen-grmA-orf  (61)CGGCGCTACCAGACGGTGGCCCCGGCCACCGTGCGGCGCCTGGCCCGGGCTGCCCTCGTC

sis-srmA-orf  (61)CGGCGCTACCAGACGGTGGCCCCGGCCACCGTGCGTCGCCTGGCCCGGGCCGCCCTGGTC

   Consensus  (61)CGGCGCTACCAGACGGTGGCCCCGGCCACCGTGCG CGCCTGGCCCGGGC GCCCT GTC

                  121                                                      180

gen-grmA-orf (121)GCCGCGCGGGGCGACGTGCCGGACGCGGTGAAGCGCACCAAGCGCGGGCTGCATGAGATC

sis-srmA-orf (121)GCCTCGCGGGGGGACGTGCCGGACGCGGTGAAGCGCACGAAGCGCGGGCTGCACGAGATC

   Consensus (121)GCC CGCGGGG GACGTGCCGGACGCGGTGAAGCGCAC AAGCGCGGGCTGCA GAGATC

                  181                                                      240

gen-grmA-orf (181)TACGGGGCCTTCCTGCCGCCCAGCCCGCCCAACTACGCAGCGTTGCTGCGGCAGCTCGAC

sis-srmA-orf (181)TACGGCGCCTTTCTGCCGCCCAGTGCGCCTAACTACACAGCGTTGCTGCGGCACCTCGAC

   Consensus (181)TACGG GCCTT CTGCCGCCCAG CGCC AACTAC  CAGCGTTGCTGCGGCA CTCGAC

                  241                                                      300

gen-grmA-orf (241)TCCGCTGTGGACGCCGGTGACGACGAGGCGGTCCGGGCGGCTCTGCGCCGCGCGATGTCA

sis-srmA-orf (241)GCCGCAGTGGAGGCCGGTGACGACGAGGCGGTCCGTTCGTCCCTGTCTCGCGCGATGTCG

   Consensus (241) CCGC GTGGA GCCGGTGACGACGAGGCGGTCCG CG  C CTG   CGCGCGATGTC

                  301                                                      360

gen-grmA-orf (301)GTGCATGTGTCCACTCGTGAGCGATTGCCGCACCTGGCGGAGTTCTACCAGGAGATCTTC

sis-srmA-orf (301)GTGCACATGTCCACCCGAGAGCGGCTGCCGCACCTCGACGAGTTCTACCGGGAGATCTTC

   Consensus (301)GTGCA  TGTCCAC CG GAGCG  TGCCGCACCT G  GAGTTCTACC GGAGATCTTC

                  361                                                      420

gen-grmA-orf (361)CGTCACGTGCCCCAGCCCAACACGCTGCGTGACCTCGCCTGTGGCCTCAATCCGCTGGCC

sis-srmA-orf (361)CGTCACGTGCCACGGCCGAACACGTTGCGTGACCTGGCGTGTGGCCTCAACCCGCTGGCC

   Consensus (361)CGTCACGTGCC C GCC AACACG TGCGTGACCT GC TGTGGCCTCAA CCGCTGGCC

                  421                                                      480

gen-grmA-orf  (421)GCTCCCTGGATGGGCCTGTCGGACCAGACCGTCTACGTCGCCTCCGACATCGACGCCCGG

sis-srmA-orf  (421)GTGCCCTGGATGGGCCTGTCCGACGAGACCGTCTACGTCGCCTCCGACATCGACGCCCGC

   Consensus  (421)G  CCCTGGATGGGCCTGTC GAC AGACCGTCTACGTCGCCTCCGACATCGACGCCCG

                   481                                                      540

gen-grmA-orf  (481)CTGATCGGCTTCGTGGACGCCGCCCTGACGAGGCTGGGCGTCGCGCACCGTACGAGCGTG

sis-srmA-orf  (481)CTGATGGACTTCGTGGGCGCTGCCCTGACGAGGCTGGGGGTGGCGTACCGTACGAGCGTG

   Consensus  (481)CTGAT G CTTCGTGG CGC GCCCTGACGAGGCTGGG GT GCG ACCGTACGAGCGTG

                   541                                                      600

gen-grmA-orf  (541)GTCGACCTCCTCGAGGACCGCCTTGACGAGCCGACCGACGTCACGCTATTGCTGAAGACG

sis-srmA-orf  (541)GTCGACCTCCTTGAGGCCCGCCTTGACGAGCCGGCCGACGTCACGCTATTGCTGAAGACG

   Consensus  (541)GTCGACCTCCT GAGG CCGCCTTGACGAGCCG CCGACGTCACGCTATTGCTGAAGACG

                   601                                                      660

gen-grmA-orf  (601)CTGCCCTGTCTGGAGACTCAGCGACGAGGCTCCGGCTGGGAAGTGATTGACATTGTCAAC

sis-srmA-orf  (601)CTCCCCTGTCTGGAGACTCAGCAACGAGGCTCCGGCTGGGAAGTGATTGACATTGTCAAC

   Consensus  (601)CT CCCTGTCTGGAGACTCAGC ACGAGGCTCCGGCTGGGAAGTGATTGACATTGTCAAC

                   661                                                      720

gen-grmA-orf  (661)TCGCCGATTATCGTGGTAACCTTCCCGACCAAGTCTCTCGGTCAGCGATCGAAGGGGATG

sis-srmA-orf  (661)TCGCCGATTATCGTGGTAACCTTCCCGACCAAGTCTCTCGGTCAGCGATCGAAGGGGATG

   Consensus  (661)TCGCCGATTATCGTGGTAACCTTCCCGACCAAGTCTCTCGGTCAGCGATCGAAGGGGATG

                   721                                                      780

gen-grmA-orf  (721)TTTCAGAACTATTCACAAAGTTTTGAGTCCCAGGCCAGAGAACGGTCGTGCCGAATTCAG

sis-srmA-orf  (721)TTTCAGAACTATTCACAGAGTTTTGAGTCCCAGGCTAGCGAACGATCGTGCCGCATTCAG

   Consensus  (721)TTTCAGAACTATTCACA AGTTTTGAGTCCCAGGC AG GAACG TCGTGCCG ATTCAG

                   781                                       825

gen-grmA-orf  (781)CGACTGGAGATCGGCAACGAGCTGATTTACGTCATTCAGAAATAG

sis-srmA-orf  (781)CGACTGGAGATCGGCAACGAGCTGATTTACGTTATTCACAAATAG

   Consensus  (781)CGACTGGAGATCGGCAACGAGCTGATTTACGT ATTCA AAATAG

orf的DNA同源性达91.0％；

ArmA与GrmA的aa比对结果：

                  1                                                         60

gen-grmA-aa    (1)MTTSAPEDRIDQVEQAITKSRRYQTVAPATVRRLARAALVAARGDVPDAVKRTKRGLHEI

sis-srmA-aa    (1)MTTSTGDDRIDQIQQAITKSRRYQTVAPATVRRLARAALVASRGDVPDAVKRTKRGLHEI

   Consensus   (1)MTTS DDRIDQI  QAITKSRRYQTVAPATVRRLARAALVAARGDVPDAVKRTKRGLHEI

                  61                                                       120

gen-grmA-aa   (61)YGAFLPPSPPNYAALLRQLDSAVDAGDDEAVRAALRRAMSVHVSTRERLPHLAEFYQEIF

sis-srmA-aa   (61)YGAFLPPSAPNYTALLRHLDAAVEAGDDEAVRSSLSRAMSVHMSTRERLPHLDEFYREIF

   Consensus  (61)YGAFLPPS PNY ALLR LDAAVDAGDDEAVRAAL RAMSVHMSTRERLPHL EFY EIF

                  121                                                      180

gen-grmA-aa  (121)RHVPQPNTLRDLACGLNPLAAPWMGLSDQTVYVASDIDARLIGFVDAALTRLGVAHRTSV

sis-srmA-aa  (121)RHVPRPNTLRDLACGLNPLAVPWMGLSDETVYVASDIDARLMDFVGAALTRLGVAYRTSV

   Consensus (121)RHVP PNTLRDLACGLNPLA PWMGLSD TVYVASDIDARLI FV AALTRLGVAHRTSV

                  181                                                      240

gen-grmA-aa  (181)VDLLEDRLDEPTDVTLLLKTLPCLETQRRGSGWEVIDIVNSPIIVVTFPTKSLGQRSKGM

sis-srmA-aa  (181)VDLLEARLDEPADVTLLLKTLPCLETQQRGSGWEVIDIVNSPIIVVTFPTKSLGQRSKGM

   Consensus (181)VDLLE RLDEP DVTLLLKTLPCLETQ RGSGWEVIDIVNSPIIVVTFPTKSLGQRSKGM

                   241                             275

gen-grmA-aa   (241)FQNYSQSFESQARERSCRIQRLEIGNELIYVIQK-

sis-srmA-aa   (241)FQNYSQSFESQASERSCRIQRLEIGNELIYVIHK-

   Consensus  (241)FQNYSQSFESQA ERSCRIQRLEIGNELIYVI K

同源性达92.7％。

经DNA序列和蛋白质序列比对，其同源性达90％以上。推断其功能与grmA相似，以下功能检测证明了这一推测的可行性。

功能检测(srmA对西索霉素的抗性能力)：

从伊纽小单孢菌(Micromonospora inyoensis)Ts388扩增到包含紫苏霉素抗性基因srmA的DNA序列(844bp)，并将其克隆到pUC19/18载体上。srmA基因是依靠它自身的启动子激活(ATG上游19bp序列)，在E.coli DH5α中表达，并不受LacZ启动子的控制。其开放性阅读框长822bp，编码含274aa的多肽链。预测的SrmA蛋白序列与GrmA(来自棘孢小单孢菌)的同源性依次为92.7％，其DNA序列的同源性为91.0％。srmA与grmA抗性基因具有相同的核糖体结合位点GGAGG。

srm A基因抗性范围和抗性能力。对紫苏霉素类及其它一些具代表性的抗生素的抗性测验，如四环类抗生素的金霉素(Chlortetracycline)，喹诺酮类的环丙沙星(Ciprofloxacin)以及亚胺青霉烯(Imipenem)等。抗性检测结果见表1。

表1srm A基因的抗性范围和抗性能力

Antibiotics	MIC	Antibiotics	MIC	Antibiotics	MIC	Antibiotics	MIC
								SisomicinImipenem	＞1000＜5	GentamycinKanamycin	＞1100＞2000	ApramycinTobramycin	＜10＞800	ChlortetracyclineCiprofloxacin	＜6＜10

表1的抗性检测结果表明，srm A基因仅对紫苏霉素类抗生素的抗性负责，功能检测结果与推测相一致。

核苷酸序列表

<110>福州大学

<120>依尼奥小单孢菌西索霉素生物合成基因簇

<160>1

<210>1

<211>37739

<212>DNA

<213>依尼奥小单孢菌(Micromonospora inyoensis)Ts388

<220>

<223>该西索霉素生物合成基因簇总长37739p，包括多个orf和2个rRNA(rRNA1和rRNA2)。

<400>1

actcggatgc ttcacccccg gcacgacgct cccctaccca tccacacacc tgcaccagac  60

atcaaggcct ggcgaagtaa aaatgtgaat gccacagctt cggcggtgtg cttgagcccc  120

gctacattgt cggcgcggaa ccacttgacc agtgagctat tacgcactct ttaaagggtg  180

gctgcttcta agccaacctc ctggttgtct atgcgacccc acatcctttt ccacttagca  240

cacgcttagg ggccttagct ggtgatctgg gctgtttccc tctcgactac gaagcttatc  300

ccccgcagtc tcactgccgc gctctcactt accggcattc ggagtttggc tgatttcggt  360

aagcttgtgg gccccctaga ccatccagtg ctctacctcc ggcaagaaac acgcgacgct  420

gcacctaaat gcatttcggg gagaaccagc tatcacggag tttgattggc ctttcacccc  480

taaccacagg tcatccccca acttttcaac gttggtgggt tcggccctcc acgcggtctt  540

acccgcgctt cagcctgccc atggctagat cactccgctt cgggtctaga gcatgcgact  600

aaaaacgccc tattcagact cgctttcgct acggctcccc cacacgggtt aacctcgcca  660

catgccacta actcgcaggc tcattcttca aaaggcacgc cgtcaccccg caaggctccg  720

acggattgta ggcgaacggt ttcaggtact atttcactcc cctcccgggg tacttttcac  780

cattccctca cggtacttgt ccgctatcgg tcaccaggaa gtatttaggc ttaccaggtg  840

gtcctggcag attcacggca gatttcagga gtccgccgct actcgggaac acccacagaa  900

ggtcagcaac tttcacctac cggactctca ccgcctacgg tcagcctttc cagactgttc  960

ggctagccac tgactttata actcctcgaa cacgtgtcag catgttcagc agggtcccac  1020

aaccccgacc acgcaacccc tgacaggtat cacacgcagc cggtttagcc tcaatccgct  1080

ttcgctcgcc actactcacg gaatcactat ttgttttctc ttcctacggg tactgagatg  1140

tttcacttcc ccgcgttccc cccatacacc ctatgtgttc aggtgcaggt gacatcacat  1200

gactgatgcc aggtttcccc attcggacac cctgggatca cagcttggtt gacagctccc  1260

ccaggcctat cgcggcctcc cacgtccttc atcggctcct ggtgccaagg catccaccgt  1320

tcgcccttga caacttgacc acaaagatgc tcgcgtccac tgtgcaattc tcaaccaacg  1380

accaacccac aacccaccac atcccacacc taaacccaca cggatccggt ttgcgagacc  1440

aggtcatgcc tggcagtaat cacctagaag aaccaaccac cacgggttgt tccttcagga  1500

cccaacaggg tgccatccgc ccctccccag ccgcaccaca acccccgttc caccaccccc  1560

gaagagatgc gtactagaag attccggccg ttgccaggga aaaactcacc agtgtctccg  1620

ccatcgagca ccccgacccg acattcgcag gtcgcgggct ccttaccacc cttcggtgga  1680

aggtgctcct tagaaaggag gtgatccagc cgcaccttcc ggtacggcta ccttgttacg  1740

acttcgtccc aatcgccagc cccaccttcg acggctccct ccacaagggt tgggccaccg  1800

gcttcgggtg ttgccgactt tcgtgacgtg acgggcggtg tgtacaaggc ccgggaacgt  1860

attcaccgca gcgttgctga tctgcgatta ctagcgactc cgacttcacg gggtcgagtt  1920

gcagaccccg atccgaactg agaccggctt tttgggattc gctccacctc acggtatcgc  1980

agcccattgt accggccatt gtagcatgcg tgaagccctg gacataaggg gcatgatgac  2040

ttgacgtcat ccccaccttc ctccgagttg accccggcag tcttcgatga gtccccgcca  2100

tagcgcgctg gcaacatcga acgagggttg cgctcgttgc gggacttaac ccaacatctc  2160

acgacacgag ctgacgacag ccatgcacca cctgtgaccg cccccgaagg acccgacatc  2220

tctgccggtt ttgcggccat gtcaaaccca ggtaaggttc ttcgcgttgc atcgaattaa  2280

tccgcatgct ccgccgcttg tgcgggcccc cgtcaattcc tttgagtttt agccttgcgg  2340

ccgtactccc caggcggggc gcttaatgcg ttagctgcgg cacagagaac cggagaggct  2400

ccccacacct agcgcccaac gtttacagcg tggactacca gggtatctaa tcctgttcgc  2460

tccccacgct ttcgctcctc ggcgtcagta tcggcccaga gacccgcctt cgccaccggt  2520

gttcctcctg atatctgcgc atttcaccgc tacaccagga attccagtct cccctaccga  2580

actctagcct gcccgtatcg actgcaggcc cgcagttgag ctgcgggttt tcacagtcga  2640

cgcgacaagc cgcctacgag ctctttacgc ccaataaatc cggacaacgc tcgcgcccta  2700

cgtcttaccg cggctgctgg cacgtagttg gccggcgctt cttctgcagg taccgtcact  2760

tacgcttcgt ccctgctgaa agaggtttac aacccgaagg ccgtcatccc tcacgcggcg  2820

tcgctgcatc aggcttccgc ccattgtgca atattcccca ctgctgcctc ccgtaggagt  2880

ctgggccgtg tctcagtccc agtgtggccg gtcgccctct caggccggct acccgtcgtc  2940

gccttggtag gccatcaccc caccaacaag ctgataggcc gcgagcccat cccaggccga  3000

aaaactttcc accaacgatc atgcgatcga cggtcctatt cggtattagc cccggtttcc  3060

cggggttatc ccaaagccta ggacaggttg ctcacgtgtt actcacccgt tcgccgctcg  3120

agtaccccga agggcctttc cgctcgactt gcatgtgtta agcacgccgc cagcgttcgt  3180

cctgagccag gatcaaactc tccaacaaaa acttgttgaa caatcgtccc ggcaacaaaa  3240

gtgttgccaa aggaatccca accaaccaga cacaccgaag catgcccagc cagtccgggg  3330

tataaatcat aattggcact ggcttatcaa gcaccctgtt gagttctcaa agaaaaacca  3360

cacaccatcc ggaaccctca ccaggcgcca tccggggcaa tccgttccca ctcccgccgc  3420

tctcgcgccg ggcacttcta ctacgttacc tcaccgtttc cgccgtgtca aaccgtgtgt  3480

cccggtctgt cgtgcttggt acggtttggc tccgctgacc gcaggcagcg gcgaaccgct  3540

gcgctttgct catcggattc ggcaggccgg ccgctgcggt ctcccgctcg ctcgcccggt  3600

gccctgccgg tcgtgaacct tacccggccg gttccgcccc gccaaatcga cccctcggtc  3660

gatccggtgg agcaccaccc ggatcccgat gccggaggag tgaacccctc ctgcctcgta  3720

ccgcccggct tcggactccc aggtgctttg ccctgtttcg tccgttccgc gctggcagag  3780

agaaagttac gcgtccgagg gtttgaacgt caaatcgggg gggtagcggc ccgcgtcaca  3840

tcgtcgatgt ctggctatac cgcctggtca gaccggctgc gggcacgccg ctgggcgagc  3900

acgccccgga cacccagcac gccgaccgcc gtaccgatgg tcagggacgc ggcgatcagc  3960

agcgcgtgga tccagagaaa gccggtaccg ccaccctcgc cgaccgtccc ggtcgaccag  4020

gacctcgggt cgttccagat cgcgaccgcg aacctcggcc agatcgccca ggtccagccc  4080

ccgacaccga caaggaagag cgcccagcca cgtgacagca ccatggccgc cgagtatgcc  4140

agcgccgtgg acgcgtcgac cctgttcagg gcatcgcgcc tcggccggcg gggttaccgt  4200

ggacccgtgg tccggacgag caacctcccg gcggcgggcg tcgagctgag cgacgacctg  4260

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ccagcgggtt gaggccacac gccaggtcac gcaacgtgtt cggccgtggc acgtgacgga  13260

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gctgggtcac ctcgacgacc gggccgtcgc actgcaccgg gagctgctga cccgggcggg  16200

cgcgatggtg accatccccg aggaggtcga ccttgacgag gtgatgcacc ggttgcggtt  16260

cgacaacaag cgcggctacc tcagcgaccc ggccgagagc agcgcgatgg tcctcctcgg  16320

tggactgggc cagccactgt ggcaggacgg ccgtccactg gtctccgtcc cgatggccct  16380

ggtcggcgag gtcatcaacg agatcgcctg cccggagatg ccgaacttcg agctggtggc  16440

agcggctcag ggcgagcggg tgccggacac ggtgggtgct gccgatggtt gagcgtctgg  16500

gtgtcgccgt cgtcgggggc gggttcatgg gtggcgtgca cgccgaggtc ctcaccgccg  16560

atccccgggt ggatctgcgc tgggtggtgg accgcgacga gcgcgtcggc acggaactcg  16620

ccacccgctt cggcgcacgt gccaccgcga ccctcgacga ggcgctggct gacgacgcgg  16680

tccgcctcgt ggtggtggcc actccggccg ccacccacga accgatcgcg gcgcgggtga  16740

tcgccgcagg ccggcacgtc ctggtggaga agccgctcgt gctctccacc gggcacgccc  16800

ggcagttggc cgccgcagcc cgcgaacgcg gggtgacgct cgcgcacggt ggcaacttcg  16860

tctacgcgcc gaagttcgtc cgggcccgcg aactggctgc ggaccgggac gcgctgggca  16920

ccgtccactc cgtccgggtg gcgttccgga cgtccggccc ggacaccgac tggttccggt  16980

cgaaggcgac cgccggtggc ggtgccctca ccgacctcgg ctggcacgcc gtggagctgt  17040

gccgctggat gctcggcaag ccggccatcc ggtccgtcgc cgcctgcacc cgccagctca  17100

gcgccgcggg ggacgtcgag gaccagggcg tcgtcctgat cgagttcgcc gacggcgcga  17160

tcggtcagtg cgacgtctcc tgggtctgcc ccggtggtga acagctcacg gtcgaggtga  17220

tcggcacgga gggtctggtc accgccgacc tctggcaggg catgggcgtc gaggtgtaca  17280

ccaacaccaa gttcggcgcg gtgtgggagc ccaaccaggg gtggctgcgt cctgagtggg  17340

agtggatccg caacagcgga tacgtgcacc aggaccgtca ggtcgtggac gcggtgctcg  17400

agggccggcc gatggagcac accccggacg acgcagtcgc gatcgtcgag gcgctcgagg  17460

cggcctaccg cagcgcggcg gacggacgga aagtggagac gaatgcctga caaccgtgcc  17520

ccccggggcg tcctctcgat gacaccgttc ttcctctacg ccgaccacca gaagctgtgg  17580

aagccacggt tcgacccgat gggcggcatg cacgtgttgg gccacgcgat cgtgacggag  17640

atgggccggc ggggcttccc gcaacgggtc ctcaccatgg ccccacccgg cgtcccgaag  17700

gacctccaga tcgcgccgaa cgtcaccgtg cacgcccggc gcctgccggt gttgccgatc  17760

ccgtccaagc tggagggtta cttcggcctg gtcggggcgt gggcgaaggc cagcctgctc  17820

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gacggatccg gctcggcccc ggcgtacgcg tacgccgcgg cgcaggtcct cgacgtgccg  17940

atcgtgtcgc acatctactc atgccggtca ctcacccagc gcccgaccac ggtgttcgag  18000

cgggtggccg acccggtggc caagtcggcg gagaagtacg tcatccagca ctccggtgcg  18060

gtgctgaccc tcagcgacaa ggtccgcgag cgcatccggg acgagctgca cgtgccggac  18120

gaccgggtgc accggttggc acacctggtc accgacaact tcgtcgggca cgacacgccg  18180

gagcgccggg aggaactgcg gcagcggttc gggctgaccg acgacaagcc gaccgtcctc  18240

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attgccaagc ggcgggactg ccggttcctg atcgccggtg acggaccgca gcgcggtgac  18360

atcgaggcgc tggcgcggca gctcggcgtc gccgacaagc tggtcatcac cggcttcctg  18420

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tacgaggagc tgggcgtcgt cgtgctcgag tacatgatga tgaagcgccc ggtcgtggcg  18540

cacgacgtca gcggcgtaca caagctagtc gagcacatga agaccggcgt gctggtgccg  18600

cccttcgacc ctccgaagct cgccgacgcc atcgagatgg ttctcgacga tccggacctg  18660

gcccgtcgcc tggcggacgc cgccgagccg attcctcagc gggagtactc gctggcctcg  18720

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ggacctgaac gcggacttca acgagtacct gctcaaccgg gtcgagctcg agcaggtaca  18960

gggcccggag aacagccacg agttcaccca gcccttcatc aagcagttct tcctgaacca  19020

catcaccggc aactacttcg ccgagacgaa cttcgagcag tgggaactgc agcagcagtg  19080

ccaggtggct ccggagagcc tctccatctg ggacccgccg ttcccgttct cgtactgtga  19140

gttcctgtcg atcctgcggg acgagccgga acgcgtcgcg aagctggtcc gggacccgga  19200

cgcgaacatc taccacgcct tctaccacga gaaggtcgcc ggccaggccg ccgagctggg  19260

catgatgggc ttctcgatca tggggtacaa ccaggtcatc cccgcgctga ccctgggcta  19320

cctgatgaag caggagaacc cggacctcta catctgctgg ggcgggccct gggtgacctc  19380

cttcgcggac atgctcatcc cgcgtctgga ggcctgcccg gagctgggcg acctgatcga  19440

tgcgctggtc gtccgggagg gcgaggagcc gctgctgaag atggccgagg cgttgtcccg  19500

cggcgagcgt ccggtgggca tccccggcgg ttgcaagccg atgtcggagc agagcgtgct  19560

cgacaccaag ccggtcgtcc gcaagctgct gctggagatg tcgaagcccc gggaaaacgt  19620

cccgaacacc cactggcgga ccgaggacgg cacctacgag cgcagcggtg acatctcctg  19680

ggtcgccgac atgaaccaga tcccgacccc ggactacagc gacttcgacc tgtcgctgta  19740

caccacgttc cgggagggtc agggcagcct ggtgctccag ggctcgcggt cctgctacta  19800

catgaagtgc tccttctgca acgcgatcac caacttcgcg ccgtggagct accgggagcg  19860

cagcaccgag aacatcgaga aggacatcga caccttcctg gagctgtacc cgggcgtcgt  19920

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cttcatcgag aagaagcgcc cggagctgtt ctgggaggtg gacgtccggt tcgagggcaa  20040

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ccaccggctg ctccaggaca gccgggaact gggctacaag ccgttcctga tgaccatcgt  20220

cggcctgccc accgaggagc ggaacgaggc cgaggagctt tacgagttcc tcagcgagta  20280

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tggtgcatcg acccggtgaa ggtcgaggag gcgatcaccg accggaccag ggcgatcatg  21180

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gtgtggatcc accactccct gctgtcggtg gagccggagg acgtacagga catgctggat  21960

gcggtggtca aggtccggga caatctgggg gcgctgaaga agagcctatg atcggatcat  22020

ggctctgacg aagctcggtc gggcggacac cccgcccgac cgatccctcg aaacattccc  22080

gatcggcgac agctcgcagg agatcaccat cgactgccgg gagttcacct gccgctgccc  22140

catcaccggg cagccggact gggcgaccat ccggatcgaa taccgtcccg gcgaccgggg  22200

agtggagacc aagagtctca agctctacct ggagaccttc cgggacgagg ggatcttcca  22260

cgagcacctg gcgacgaaga tgcgtgacga cctggtggcg gccctcgaac cggtcttcct  22320

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cagtcccttg ccgagtacga cgacgtcagc cggcacaccc aacccgtgca cgcccttcgg  23160

ccccgcccgg aacccggtgt acacctcatc caacatgaac ggcacgtcat accgcgcaca  23220

caacgccgac atccggcggt agtgatcgag gtcgaagtac aggacctcgg gcgagacgat  23280

gacgccggcg acctgctcac cgaacgcctc cagcatcttc gccagggcct tctcgttgta  23340

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ctcgtgccag ccgtggtagc cggacgacag gaccaactcc cgacccgtcg ccgctcgcgc  23460

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gtgcccacca cgccattcac gtctcccggg gtcggacgcg gccgcccggg tcagctcaga  23880

gaaattcgtc cagcagttgg atgtaggtca gcttgtgctg gtcgacggtg atgccgtacc  23940

gccggaggaa gtgctcggcg tgcggcggac cgtagcccca gacgtcgtcc tggccgatgt  24000

tgtacagcgc cagggcgagg tccatccacc ggtccgacac cccggcccgg tcgacgtcga  24060

ggatgccggc cagggtcagc gtctccggat cgaccagcac gttgtcgagg cagaagtcac  24120

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gctgctgagc cgtccagccc tcgtgcgagg ggtccacgtc gtcgaggtcg agcgcgccca  24240

gcgccatcga ggagctggcc tggtggatca ggtcggccag ccgacgctcg aacgggcact  24300

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cgccggacga acgctcgccc aggcactccc acgggtcgtc cttgtcgccc cagccagcca  24660

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tcctccgcga agtccagctt ccgctcctcc gtcaactcac cacccgacgt cggcgcgatg  24900

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tcgaacatca gggccgggcc acccacccag ttcggaatcc cctcaccggt gaggatctcc  25140

cgcataccgt ccgccagccg acggcccatc gcctccgcgt gctcgtacac acccggcgtg  25200

tccagcacat ccaacaccgc catcgccgcc gccatcggcg gcacctcccg cgtgtacgtc  25260

ccctggatcc ccgacacgtc atacgcatcg atgatgtccc gacgacccat caccgccgcc  25320

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ccagcatata gcactgtaac tatgcgcgga atggccgaaa cagctactga cgtttagtga  26280

ttttactttc cgtaacgcga cgggagcagg gcggagtatc cgccggtcaa tccattgccg  26340

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gcggctgacc gctgtacagc gcgatggccg cagcgatcat gtcaccggcg aagcggcaga  26940

actggtcggc gccggccccc ttgtcggcgt ccgcgacgtg ctgcatcacg cagacgcaac  27000

ccagcgggtg ccccagtgcc agcagtccgt cggcggactc ccggatcgcc cgcacggtgg  27060

ccggcagttc ctccgggctc tccgggtcga gctgcgccat gctgtgctcg accagacgtg  27120

cgccggcctc cgccgccgag accggcccct gctcgcggcg ctccgccccc tcaaggacgt  27180

acttcggcca cagcgccatg gcgagggtcc ccacccaggc cgtgtagagc tcgtccgcgg  27240

ccaggacacc gttggcgaag gcgaagttga actggtcgaa cagggcgggg tcggtcagcg  27300

ggtcgacgat gccccgggtc agacaggtct ggtagtccgg ggagccgtag atcgggtaga  27360

acgggttggt ccagaactcg accccggcca gcaccaggtt gaccgcgtcc tgcacgatcg  27420

cgtcgaggct ctggtcgggc agcccgacga tgatcgcggc gctcgccgtc agcccgaact  27480

tctcgaacag ggcgaccccg gcggagacct tgtccagcga ggtgaacccc ttgcgcatct  27540

tgcgcagccg ggccgcgtcg gtggtctcca gcccgaggaa gaggtcgtcg aagccggccg  27600

agaccatgct ctccaccagg tcctcggtga gcttcacgac ggtcatcccg ttcggcaggc  27660

tgagccggac gtcgagctta cggcggacga tctcctggca gatggcgtgc acccgctcga  27720

tgtcgaaggt gaagttgtcg tcctccacca ggaagcggcg caccccgtgc acgttgacgt  27780

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ggtcggcgac gaagggcgca cggggacgga tgtgcggcgt gccgggcgtg gcgcactcgc  28020

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cgaacgcgtc cagcagcgcg accgtggtca cctcggcctc accgagcatc accgcgtcga  28140

cctcgggcac ctcgagcacg tgcgggaagg cgacggtgcc gtgctgaccg ccaacgatca  28200

ccttcgcgtt cggcaggacg cgcttcgcca tccgggccag ctcgtaggcg ctctcgtagt  28260

agggggtgaa catgcaggag atgccgacga cgtccgcctc gctggcggcg agggcagcct  28320

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acacgatcgg cacgtcgagg acctgcgccg cggcgtacgc gtacgccggg gccgagccgg  28500

atccgtcgca gtgcgcgtgc acgatcccga tctcccgctt gagttgctcc ttgttacgca  28560

ccacgtagag caggctggcc ttcgcccacg ccccgaccag gccgaagtaa ccctccagct  28620

tggacgggat cggcaacacc ggcaggcgcc gggcgtgcac ggtgacgttc ggcgcgatct  28680

ggaggtcctt cgggacgccg ggtggggcca tggtgaggac ccgttgcggg aagccccgcc  28740

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cggccctcga gcaccgcgtc cacgacctga cggtcctggt gcacgtatcc gctgttgcgg  29040

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gagatctggg tgagccagat catcccgagc gtggtgagca gcgcgccgat cccggccacg  32160

acgctcggac cgagcttggg taccagctgt ccgctcagga tcgcggcgac caggaccagg  32220

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ccctcgcgtt cacgctcggt atcggcgcgg ccgcgctgct ctacgaccgg cacgacgtgg  35520

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tcggagccct ctccctggcc gccgccgcgc tggacgacgt gatggcctgg accctgctgg  35700

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gggccttcgc cttcggtctg gtgatgcccc gggagccacg ggcgttgctc gccgagtccc  36000

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tggtgctgat ggccctcctc accacggcca tggcggtgcc gctgctgccc aaggggctgc  36360

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cggtgtgtcg cgtgccgcag ggccacgccc tgacccgggc gtacgcctga acgctgagta  36600

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tctccgtccc gatggccctg gtcggcgagg tcatcaacga gatcgcctga tggagatcc   37739

Claims (1)

1.一种依尼奥小单孢菌西索霉素生物合成基因簇，其特征在于：其碱基序列如序列表中SEQID NO.1所示。

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