BR112017021318A2 - método implementado por computador, e mídia legível por computador - Google Patents

método implementado por computador, e mídia legível por computador

Info

Publication number
BR112017021318A2
BR112017021318A2 BR112017021318-4A BR112017021318A BR112017021318A2 BR 112017021318 A2 BR112017021318 A2 BR 112017021318A2 BR 112017021318 A BR112017021318 A BR 112017021318A BR 112017021318 A2 BR112017021318 A2 BR 112017021318A2
Authority
BR
Brazil
Prior art keywords
computer
readings
present
sample
classified
Prior art date
Application number
BR112017021318-4A
Other languages
English (en)
Inventor
Lin Henry
Kamalakaran Sitharthan
Original Assignee
Koninklijke Philips N.V.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Koninklijke Philips N.V. filed Critical Koninklijke Philips N.V.
Publication of BR112017021318A2 publication Critical patent/BR112017021318A2/pt

Links

Classifications

    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B30/00—ICT specially adapted for sequence analysis involving nucleotides or amino acids
    • G16B30/10—Sequence alignment; Homology search
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B20/00—ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
    • G16B20/20—Allele or variant detection, e.g. single nucleotide polymorphism [SNP] detection
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B20/00—ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B50/00—ICT programming tools or database systems specially adapted for bioinformatics
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A90/00—Technologies having an indirect contribution to adaptation to climate change
    • Y02A90/10—Information and communication technologies [ICT] supporting adaptation to climate change, e.g. for weather forecasting or climate simulation

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Evolutionary Biology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Theoretical Computer Science (AREA)
  • Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
  • Medical Informatics (AREA)
  • Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Bioethics (AREA)
  • Databases & Information Systems (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Information Retrieval, Db Structures And Fs Structures Therefor (AREA)
  • Management, Administration, Business Operations System, And Electronic Commerce (AREA)
  • Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)

Abstract

a presente invenção refere-se a métodos e a aparelho para identificar e quantificar os micro-organismos presentes em uma amostra. as leituras de sequência são classificadas com o uso de métodos existentes, mas os resultados de classificação são corrigidos para considerar o número de leituras as quais se espera que sejam falsamente classificadas como determinadas através de simulação. com as estatísticas sobre o número esperado de leituras com erro de classificação, um método linear dos mínimos quadrados (não negativo ou diferente) ou outra técnica relacionada pode ser usada para ajustar o número de leituras que são classificadas em várias unidades taxonômicas (por exemplo, espécies) e para determinar valores mais precisos para as quantidades daquelas unidades taxonômicas realmente presentes na amostra, eliminando micro-organismos nas unidades taxonômicas falsamente determinadas como presentes na amostra.
BR112017021318-4A 2015-04-09 2016-04-08 método implementado por computador, e mídia legível por computador BR112017021318A2 (pt)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201562145026P 2015-04-09 2015-04-09
US62/145,026 2015-04-09
PCT/EP2016/057799 WO2016162504A1 (en) 2015-04-09 2016-04-08 Method and apparatus for estimating the quantity of microorganisms within a taxonomic unit in a sample

Publications (1)

Publication Number Publication Date
BR112017021318A2 true BR112017021318A2 (pt) 2018-06-26

Family

ID=55701971

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
BR112017021318-4A BR112017021318A2 (pt) 2015-04-09 2016-04-08 método implementado por computador, e mídia legível por computador

Country Status (10)

Country Link
US (1) US10998083B2 (pt)
EP (1) EP3281136B1 (pt)
JP (1) JP7023711B2 (pt)
CN (1) CN107533587B (pt)
AU (2) AU2016245213A1 (pt)
BR (1) BR112017021318A2 (pt)
CA (1) CA2981913A1 (pt)
MX (1) MX2017012758A (pt)
RU (1) RU2751241C2 (pt)
WO (1) WO2016162504A1 (pt)

Families Citing this family (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CA3054487A1 (en) * 2017-03-01 2018-09-07 Bluedot Llc Systems and methods for metagenomic analysis
CN110277139B (zh) * 2019-06-18 2023-03-21 江苏省产品质量监督检验研究院 一种基于互联网的微生物限度检查系统及方法
CN113284560B (zh) * 2021-04-28 2022-05-17 广州微远基因科技有限公司 病原检测背景微生物判断方法及应用
CN114334004B (zh) * 2021-12-04 2024-03-15 江苏先声医学诊断有限公司 一种病原微生物快速比对鉴定方法及其应用
CN115841847B (zh) * 2022-12-12 2023-05-12 哈尔滨因极科技有限公司 一种微生物信息测定及提取系统和方法

Family Cites Families (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6780602B2 (en) * 2001-11-01 2004-08-24 Microbiosystems, Limited Partnership Taxonomic identification of pathogenic microorganisms and their toxic proteins
CA2730197A1 (en) * 2008-07-10 2010-01-14 Tacount Exact Ltd. Method, kit and system for culturable cell count
US20110295902A1 (en) * 2010-05-26 2011-12-01 Tata Consultancy Service Limited Taxonomic classification of metagenomic sequences
KR101347509B1 (ko) * 2011-06-20 2014-01-06 가톨릭대학교 산학협력단 섬망 고위험군 예측모형 시스템 및 그 예측모형 방법, 및 그것을 이용한 섬망 고위험군 예측 시스템
EP2734955A1 (en) * 2011-07-19 2014-05-28 Ovizio Imaging Systems NV/SA A method and system for detecting and/or classifying cancerous cells in a cell sample
EP2964785B8 (en) * 2013-03-04 2020-10-21 Fry Laboratories LLC Method and kit for characterizing microorganisms
CN104252627A (zh) * 2013-06-28 2014-12-31 广州华多网络科技有限公司 Svm分类器训练样本获取方法、训练方法及其系统
CN103627800B (zh) * 2013-11-14 2015-02-25 浙江天科高新技术发展有限公司 环境微生物快速检测方法

Also Published As

Publication number Publication date
RU2017138867A3 (pt) 2020-06-26
RU2751241C2 (ru) 2021-07-12
MX2017012758A (es) 2018-01-30
CN107533587B (zh) 2021-10-08
US20180129777A1 (en) 2018-05-10
AU2021212155A1 (en) 2021-08-26
JP2018518725A (ja) 2018-07-12
AU2021212155B2 (en) 2023-06-29
CA2981913A1 (en) 2016-10-13
AU2016245213A1 (en) 2017-11-23
RU2017138867A (ru) 2019-05-13
WO2016162504A1 (en) 2016-10-13
JP7023711B2 (ja) 2022-02-22
US10998083B2 (en) 2021-05-04
CN107533587A (zh) 2018-01-02
EP3281136B1 (en) 2024-06-05
EP3281136A1 (en) 2018-02-14

Similar Documents

Publication Publication Date Title
BR112017021318A2 (pt) método implementado por computador, e mídia legível por computador
BR112018002848A2 (pt) método, aparelho, mídia de armazenamento não transitório, programa de computador, kit para medir níveis de expressão de seis ou mais genes-alvo da via de sinalização celular
DK3583214T5 (da) Fremgangsmåder og sammensætninger til identificering eller kvantificering af mål i en biologisk prøve
BR112017017025A2 (pt) métodos e composições para analizar componentes celulares
EA201991105A1 (ru) Методы оценки риска с использованием общей и специфической неклеточной днк
BR112018008051A2 (pt) vacinas de ácido nucleico para vírus de varicella zoster (vzv)
BR112017008082A2 (pt) composições e métodos para detectar um vírus de rna
BR112017007965A2 (pt) método implantado por computador para inferir a atividade de uma via de sinalização celular de tgf-b em um indivíduo; aparelho para inferir a atividade de uma via de sinalização celular de tgf-b em um indivíduo; meio de armazenamento não transitório; programa de computador; kits para medir níveis de expressão de três ou mais genes-alvo da via de sinalização celular de tgf-b em uma amostra de um indivíduo; inferir a atividade de uma via de sinalização celular de tgf-b em um indivíduo; inferir a atividade de uma via de sinalização celular de tgf-b em um indivíduo; e uso do kit
BR112018002040A2 (pt) controle de uma nuvem de dispositivo
BR112018069557A2 (pt) spike-ins de ácido nucléico sintético
BR112018071543A2 (pt) execução do teste de suscetibilidade antimicrobiana e sistemas e métodos relacionados
CN106460028B (zh) 细胞的分化状态的评价方法
BR112016019836A2 (pt) método para analisar uma amostra de um sujeito, dispositivo de diagnóstico para utilização no diagnóstico da endometriose, kit, uso de um biomarcador, e, método para aumentar uma resposta de anticorpos em um sujeito
CO2020003882A2 (es) Anticuerpo multiespecifico
BR112017019260A2 (pt) métodos, sistemas e aparelhos para classificação e processamento de analitos
MY192493A (en) Urinalysis device and dry reagent for quantitative urinalysis
BR112016005064A2 (pt) método para avaliar os efeitos de uma composição compreendendo microrganismos em microbiota intestinal
BR112014018729A8 (pt) Método e aparelho para testar materiais de circulação perdidos para formações subterrâneas
BR112018006843A2 (pt) sistema de fluxo e métodos para contagem digital
BR112016021929A2 (pt) Método, dispositivo e conjunto para a avaliação da qualidade de uma amostra de produto, conjunto de dados, meio de armazenamento de dados, uso dos rotuladores e método para o fornecimento de uma coleção de produtos
BR112018073178A2 (pt) método, matriz e uso dos mesmos
BR112014031182A2 (pt) método para testar uma formação, sistema para testar a pressão de uma formação e meio de armazenamento legível por computador
BR112018016984A2 (pt) método computadorizado para execução em um sistema de computador e produto de programa de computador
BR112017008201A2 (pt) unidade de teste de gás, e, métodos para alaviar a adequabilidade e para determinar a possibilidade de um substrato.
BR112018015155A2 (pt) métodos para determinação da presença ou ausência de um micro-organismo em uma amostra, para testar rapidamente uma matriz alimentar e um micro-organismo alvo, e, composição.

Legal Events

Date Code Title Description
B06U Preliminary requirement: requests with searches performed by other patent offices: procedure suspended [chapter 6.21 patent gazette]
B11B Dismissal acc. art. 36, par 1 of ipl - no reply within 90 days to fullfil the necessary requirements
B350 Update of information on the portal [chapter 15.35 patent gazette]