WO2024035137A1 - 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체 및 이의 용도 - Google Patents

바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체 및 이의 용도 Download PDF

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WO2024035137A1
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seq
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bacillus subtilis
treatment
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김다연
전은재
김계영
강선미
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주식회사 메디스팬
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    • A61K2039/55511—Organic adjuvants
    • A61K2039/55516—Proteins; Peptides

Definitions

  • the present invention relates to Bacillus subtilis flagellin variants and their uses, and more specifically, to improved storage stability and reduced immunogenicity compared to wild-type Bacillus subtilis -derived flagellin. It relates to flagellin variants and uses thereof.
  • Flagella is an important component that determines bacterial motility and is largely composed of a hook, basal body, and filament. It is also known that flagella have the function of determining the swimming or swarming motility of bacteria, the tacticity of bacteria, forming a biofilm, and determining the attachment ability of pathogenic microorganisms.
  • the structural unit protein that makes up the filament of the flagellum is called flagellin, and flagellin is regularly assembled to form a filament. Hayashi et al.
  • TLR5 expressed in mammals recognizes flagellin from Gram-negative and Gram-positive bacteria and activates NF- ⁇ B (Hayashi F, Smith KD, Ozinsky A, Hawn TR, Yi EC, Goodlett DR, Eng JK , Akira S, Underhill DM, Aderem A: Nature 410:1099-1103, 2001).
  • Flagellin is a structural protein that assembles into the whip-like filaments of bacterial flagella, which extend from the cell surface and function to enable bacteria to move. Flagellin acts as a virulence factor for pathogenic bacteria and promotes their entry and invasion into host cells. Flagellin is found exclusively in bacteria and is one of the most abundant proteins in flagellated bacteria, making flagellin a major target of host immune surveillance. Upon bacterial invasion, flagellin is detected by Toll-like receptor 5 (TLR5) and NAIP5/NLRC4 in the host and activates innate immunity contributing to immediate elimination of the pathogen in the host.
  • TLR5 Toll-like receptor 5
  • NAIP5/NLRC4 activates innate immunity contributing to immediate elimination of the pathogen in the host.
  • TLR5 is an innate immune receptor located on the cell surface and consists of an extracellular leucine-rich repeat (LRR) domain, a transmembrane domain, and an intracellular domain. TLR5 recognizes flagellin as a pathogen-associated molecular pattern using its extracellular domain and activates the MyD88-dependent signaling pathway and NF- ⁇ B-mediated inflammatory cytokine production.
  • LRR leucine-rich repeat
  • Flagellin has been of interest as a target for the development of vaccine carrier proteins or vaccine adjuvants because it serves as the first line of defense against flagellated-pathogenic bacteria. Fusion proteins of antigen and flagellin have proven effective as experimental vaccines against a variety of infectious diseases, including West Nile fever, malaria, plague, and tuberculosis, and TLR5 activation by flagellin also protects hematopoietic cells and gastrointestinal tissue from radiation. It has been reported to affect the survival and growth of cancer cells. In addition, flagellin has been reported to have therapeutic effects in diseases such as liver disease, metabolic syndrome, and colitis.
  • immune responses to biological therapeutics can be widely elicited against both non-human and human-derived proteins. These reactions weaken the clinical effect, limit efficacy, and sometimes cause pathological disease or even death of the patient.
  • This type of immune response is often triggered by an antibody response.
  • a patient's antibody response depends on the presence of B-cell epitopes and T-cell epitopes.
  • B-cell receptor in the body recognizes and binds to an administered foreign protein
  • the foreign protein is internalized by the B-cell through receptor-mediated endocytosis and undergoes a proteolytic process.
  • the obtained peptide is then presented by MHC class II molecules.
  • T helper cell recognizes a T cell epitope, the T helper cell stimulates the corresponding B cell to proliferate and differentiate into a plasma cell that produces antibodies.
  • the present inventor continued research to develop a variant of Bacillus subtilis flagellin that maintains its physiological activity, but has reduced immunogenicity in the body, lowers the risk of side effects, and has improved storage stability. As a result, the present invention was completed. .
  • the object of the present invention is to include an amino acid sequence having at least 50% identity with the wild-type Bacillus subtilis flagellin of SEQ ID NO: 1, and reduced immunogenicity compared to the wild-type Bacillus subtilis flagellin. To provide a Bacillus subtilis flagellin variant.
  • Another object of the present invention is to provide a polynucleotide containing a base sequence encoding the Bacillus subtilis flagellin variant, a vector containing the polynucleotide, and a host cell transformed with the vector.
  • Another object of the present invention is to prevent or treat damage caused by radiation exposure comprising the Bacillus subtilis flagellin variant as an active ingredient; For preventing or treating reperfusion injury; For preventing or treating inflammatory bowel disease; For preventing or treating autoimmune diseases; For preventing or treating viral infections; For preventing or treating metabolic diseases; For preventing or treating aging; For enhancing immune function; For the prevention or treatment of cancer; For preventing or treating liver disease; Alternatively, a pharmaceutical composition for preventing or treating colitis is provided.
  • another object of the present invention is to prevent or treat damage caused by radiation exposure consisting of the Bacillus subtilis flagellin variant; For preventing or treating reperfusion injury; For preventing or treating inflammatory bowel disease; For preventing or treating autoimmune diseases; For preventing or treating viral infections; For preventing or treating metabolic diseases; For preventing or treating aging; For enhancing immune function; For the prevention or treatment of cancer; For preventing or treating liver disease; Alternatively, a pharmaceutical composition for preventing or treating colitis is provided.
  • another object of the present invention is to prevent or treat damage caused by radiation exposure, which is essentially composed of the Bacillus subtilis flagellin variant; For preventing or treating reperfusion injury; For preventing or treating inflammatory bowel disease; For preventing or treating autoimmune diseases; For preventing or treating viral infections; For preventing or treating metabolic diseases; For preventing or treating aging; For enhancing immune function; For the prevention or treatment of cancer; For preventing or treating liver disease; Alternatively, a pharmaceutical composition for preventing or treating colitis is provided.
  • Another object of the present invention is to provide a vaccine adjuvant containing the Bacillus subtilis flagellin variant as an active ingredient.
  • Another object of the present invention is to treat damage caused by radiation exposure; For the treatment of reperfusion injury; For the treatment of inflammatory bowel disease; For treatment of autoimmune diseases; For treatment of viral infections; For the treatment of metabolic diseases; For aging treatment; For enhancing immune function; For cancer treatment; For the treatment of liver disease; Alternatively, it provides a use of the Bacillus subtilis flagellin variant of any one of claims 1 to 13 for producing a pharmaceutical composition for treating colitis.
  • Another object of the present invention is to treat radiation exposure comprising administering an effective amount of a pharmaceutical composition containing the Bacillus subtilis flagellin variant of any one of claims 1 to 13 as an active ingredient to an individual in need thereof.
  • the present invention includes an amino acid sequence having at least 50% identity with the wild-type Bacillus subtilis flagellin of SEQ ID NO: 1, and the wild-type Bacillus subtilis flagellin.
  • a Bacillus subtilis flagellin variant with reduced immunogenicity compared to gelin is provided.
  • the present invention provides a polynucleotide containing a base sequence encoding the Bacillus subtilis flagellin variant, a vector containing the polynucleotide, and a host transformed with the vector. Provide cells.
  • the present invention provides a method for preventing or treating damage caused by radiation exposure, comprising the Bacillus subtilis flagellin variant as an active ingredient; For preventing or treating reperfusion injury; For preventing or treating inflammatory bowel disease; For preventing or treating autoimmune diseases; For preventing or treating viral infections; For preventing or treating metabolic diseases; For preventing or treating aging; For enhancing immune function; For the prevention or treatment of cancer; For preventing or treating liver disease; Alternatively, a pharmaceutical composition for preventing or treating colitis is provided.
  • the present invention provides a method for preventing or treating damage caused by radiation exposure consisting of the Bacillus subtilis flagellin variant; For preventing or treating reperfusion injury; For preventing or treating inflammatory bowel disease; For preventing or treating autoimmune diseases; For preventing or treating viral infections; For preventing or treating metabolic diseases; For preventing or treating aging; For enhancing immune function; For the prevention or treatment of cancer; For preventing or treating liver disease; Alternatively, a pharmaceutical composition for preventing or treating colitis is provided.
  • the present invention provides a method for preventing or treating damage caused by radiation exposure, which consists essentially of the Bacillus subtilis flagellin variant; For preventing or treating reperfusion injury; For preventing or treating inflammatory bowel disease; For preventing or treating autoimmune diseases; For preventing or treating viral infections; For preventing or treating metabolic diseases; For preventing or treating aging; For enhancing immune function; For the prevention or treatment of cancer; For preventing or treating liver disease; Alternatively, a pharmaceutical composition for preventing or treating colitis is provided.
  • the present invention provides a vaccine adjuvant containing the Bacillus subtilis flagellin variant as an active ingredient.
  • the present invention is for treating damage caused by radiation exposure; For the treatment of reperfusion injury; For the treatment of inflammatory bowel disease; For treatment of autoimmune diseases; For treatment of viral infections; For the treatment of metabolic diseases; For aging treatment; For enhancing immune function; For cancer treatment; For the treatment of liver disease; Alternatively, it provides a use of the Bacillus subtilis flagellin variant of any one of claims 1 to 13 for producing a pharmaceutical composition for treating colitis.
  • the present invention is to administer an effective amount of a pharmaceutical composition containing the Bacillus subtilis flagellin variant of any one of claims 1 to 13 as an active ingredient to an individual in need thereof.
  • Treatment of damage caused by radiation exposure including; Treatment of reperfusion injury; Treatment of inflammatory bowel disease; Treatment of autoimmune diseases; Treatment of viral infections; treatment of metabolic diseases; aging treatment; Enhances immune function; cancer treatment; Treatment of liver disease; Alternatively, a method of treating colitis is provided.
  • the single letter (triple letter) of amino acids refers to the following amino acids according to standard abbreviation conventions in the field of biochemistry: A (Ala): alanine; C(Cys): Cysteine; D(Asp): Aspartic acid; E(Glu): glutamic acid; F(Phe): Phenylalanine; G(Gly): glycine; H(His): histidine; I(IIe): Isoleucine; K(Lys): Lysine; L(Leu): leucine; M(Met): methionine; N(Asn): Asparagine; O(Ply): pyrrolysine; P(Pro): Proline; Q(Gln): Glutamine; R(Arg): arginine; S(Ser): Serine; T(Thr): threonine; U(Sec): selenocysteine, V(Val):
  • amino acid letter (amino acid position) (amino acid letter)
  • amino acid letter means that the preceding amino acid is replaced with the subsequent amino acid at the corresponding amino acid position in the wild-type protein.
  • R57H indicates that arginine, corresponding to the 57th amino acid of the wild-type protein, is replaced with histidine.
  • the present invention provides a Bacillus subtilis flagellin comprising an amino acid sequence having at least 50% identity with the wild-type Bacillus subtilis flagellin of SEQ ID NO: 1, and having reduced immunogenicity compared to the wild-type Bacillus subtilis flagellin.
  • sflagellin variants Provided are sflagellin variants.
  • the flagellin can induce an immune response in the infected host when flagellated bacteria are infected. More specifically, Toll-like receptor 5 (TLR5; Toll like receptor 5), which exists on the surface of the human cell membrane, interacts with the flagellin to induce intracellular signal transmission, through which the expression of the transcription factor NF-kB This increase not only induces the activation of innate immune signals, but also regulates acquired immune responses.
  • TLR5 Toll-like receptor 5
  • NF-kB transcription factor NF-kB
  • SEQ ID NO: 1 is wild-type flagellin derived from B. subtilis (Bsflagellin).
  • the Bsflagellin variant is 50% or more, 55% or more, 60% or more, 65% or more, 70% or more, 75% or more, 80% or more, 85% or more of the wild-type Bsflagellin of SEQ ID NO: 1, It may include an amino acid sequence having at least 90%, at least 91%, at least 92%, at least 93%, at least 94%, at least 95%, at least 96%, at least 97%, at least 98%, or at least 99%.
  • the amino acid sequence having the sequence identity is one in which any change has occurred in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and may include one or more substitutions, deletions, additions, and/or insertions.
  • Such variants may be naturally occurring or may be modified or modified using any of a number of techniques well known in the art, for example, to modify or modify one or more of the above peptide sequences of the invention and to those described herein. It can be produced synthetically by evaluating its biological activity.
  • the amino acid sequence having more than 50% sequence identity with SEQ ID NO: 1 includes conservative substitutions.
  • a 'conservative substitution' is a substitution in which an amino acid is replaced with another amino acid having similar characteristics, so that a person skilled in the art can predict that the secondary structure and hydropathic nature (hydropathic nature) of the peptide are substantially unchanged. .
  • amino acid groups show conservation changes: (1) ala, pro, gly, glu, asp, gln, asn, ser, thr; (2) cys, ser, tyr, thr; (3) val, ile, leu, met, ala, phe; (4) lys, arg, his; and (5) phe, tyr, trp, his.
  • the modification may be performed within the wild-type Bsflagellin structure according to SEQ ID NO: 1, and functional molecules encoding protein variants or derivatives with desired (desirable) characteristics may be obtained.
  • a person skilled in the art may change one or more codons based on protein codon information known in the art. You can.
  • amino acids can be substituted for other amino acids within a protein or peptide structure without significant loss of interactive binding capacity with the structure, such as a receptor, the antigen-binding site of an antibody, or a binding site on a substrate molecule.
  • the interactive capabilities and properties of proteins, as well as the biological and functional activities of proteins, are generally defined, and specific amino acid sequence substitutions can be made in (in) the protein or peptide sequence and, of course, in (in) the underlying DNA coding sequence. This can be achieved, and nevertheless, proteins having the same or similar characteristics can be obtained.
  • hydropathic amino acid index may also be taken into consideration.
  • the importance of the hydropathic amino acid index in conferring interactive biological functions on proteins is generally understood in the art (Kyte and Doolittle, 1982, incorporated herein by reference).
  • the relative hydropathic nature of amino acids contributes to the secondary structure of the resulting protein, which in turn dictates the protein's interactions with other molecules, such as enzymes, substrates, receptors, DNA, antibodies, antigens, etc. It was known.
  • Each amino acid is assigned a hydropathic index based on its hydrophobicity and charge properties (Kyte and Doolittle, 1982). These values are: isoleucine (+4.5); Valine (+4.2); leucine (+3.8); phenylalanine (+2.8); Cysteine/Cystine (+2.5); Methionine (+1.9); Alanine (+1.8); Glycine (-0.4); Threonine (-0.7); Serine (-0.8); tryptophan (-0.9); Tyrosine (-1.3); Proline (-1.6); histidine (-3.2); Glutamic acid (-3.5); glutamine (-3.5); Aspartic acid (-3.5); Asparagine (-3.5); Rizin (-3.9); and arginine (-4.5).
  • a specific amino acid can be substituted by another amino acid with a similar susceptibility index or score, and obtain a protein with similar biological activity (i.e., still obtain a biologically functionally equivalent protein).
  • amino acids with a water reduction index within ⁇ 2 are preferred for substitution
  • substitution of amino acids with a water reduction index within ⁇ 1 are particularly preferred
  • substitution of amino acids with a water reduction index within ⁇ 0.5 are even more particularly preferred.
  • hydrophilicity As described in U.S. Patent No. 4,554,101, the following hydrophilicity values are assigned to amino acid residues: arginine (+3.0); Lysine (+3.0); Aspartic acid (+3.0 ⁇ 1); Glutamic acid (+3.0 ⁇ 1); Serine (+0.3); Asparagine (+0.2); Glutamine (+0.2); Glycine (0); Threonine (-0.4); Proline (-0.5 ⁇ 1); Alanine (-0.5); histidine (-0.5); Cysteine (-1.0); Methionine (-1.3); Valine (-1.5); leucine (-1.8); Isoleucine (-1.8); Tyrosine (-2.3); Phenylalanine (-2.5); Tryptophan (-3.4).
  • amino acids can be substituted for other amino acids with similar hydrophilicity values, and a biologically equivalent protein can be obtained.
  • substitution of an amino acid whose hydrophilicity value is within ⁇ 2 is preferable
  • substitution of an amino acid whose hydrophilicity value is within ⁇ 1 is particularly preferable
  • substitution of an amino acid whose hydrophilicity value is within ⁇ 0.5 is even more preferable. Particularly desirable.
  • amino acid substitutions can be based on the relative similarity of amino acid side-chain substituents, such as their hydrophobicity, hydrophilicity, charge, size, etc. can do.
  • Exemplary substitutions taking into account the various features of the foregoing are well known to those skilled in the art and include: arginine and lysine; glutamic acid and aspartic acid; serine and threonine; glutamine and asparagine; Valine, leucine and isoleucine.
  • Amino acid substitutions may also be made based on similarity in polarity, charge, solubility, hydrophobicity, hydrophilicity and/or amphipathic properties of the residues.
  • negatively charged amino acids include aspartic acid and glutamic acid
  • Positively charged amino acids include lysine and arginine
  • amino acids having an uncharged polar head group with similar hydrophilicity values include leucine, isoleucine, and valine; glycine and alanine; asparagine and glutamine; Examples include serine, threonine, phenylalanine, and tyrosine.
  • a protein having more than 50% sequence identity with Bsflagellin according to SEQ ID NO: 1 may include non-conservative changes in amino acids. In addition, for example, it can be changed by deletion or addition of amino acids that have minimal effect on the secondary structure and hydropathic properties of Bsflagellin according to SEQ ID NO: 1.
  • Comparison between two sequences is typically performed by comparing sequences on a comparison window to identify and compare local regions of sequence similarity.
  • “comparison window” refers to a segment of at least about 20 consecutive positions, typically 30 to 75, 40 to 50 consecutive positions, wherein the sequence consists of two sequences After this optimal alignment, it can be compared to a reference sequence of the same number of consecutive positions.
  • Optimal alignment of sequences for comparison can be performed, for example, using the Megalign program in the Lasergene suite of bioinformatics software (DNASTAR, Inc., Madison, Wis.) using default parameters.
  • This program includes several alignment schemes described in the following references: Dayhoff, M. O. (1978) A model of evolutionary change in proteins-Matrices for detecting distant relationships. In Dayhoff, M. O. (ed.) Atlas of Protein Sequence and Structure, National Biomedical Research Foundation, Washington D.C. Vol. 5, Suppl. 3, pp. 345-358; Hein J. (1990) Unified Approach to Alignment and Phylogenes pp. 626-645 Methods in Enzymology vol.
  • optimal alignment of sequences for comparison may be performed by the partial identity algorithm of Smith and Waterman (1981) Add.APL.Math 2:482, or by the partial identity algorithm of Needleman and Wunsch (1970) J.Mol.Biol.48:443. This can be done by an identity sorting algorithm, by the similarity search method of Pearson and Lipman (1988) Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:2444, or by computerized implementation of these algorithms (GAP, BESTFIT, BLAST, FASTA). , and TFASTA in the Wisconsin Genetics Software Package, Genetics Computer Group (GCG), 575 Science Dr., Madison, Wis.), or may be performed by inspection.
  • BLAST and BLAST2.0 can be used to determine percent sequence identity for polynucleotides and polypeptides of the invention, for example, with the parameters described herein.
  • Software for performing BLAST analysis is publicly available through the National Center for Biotechnology Information.
  • a scoring matrix can be used to calculate a cumulative score.
  • the elongation of word hits in each direction stops when: the cumulative alignment score has been reduced by the quantity ) When the number becomes 0 (zero) or less due to alignment accumulation of residues; or when the end of a sequence is reached.
  • the BLAST algorithm parameters W, T, and X determine the sensitivity and speed of alignment.
  • the 'percentage sequence identity' is determined by comparing two best aligned sequences over a comparison window of at least 20 positions, wherein the portion of the polypeptide sequence in the comparison window is a reference sequence (which is an additional or no deletion) may contain additions or deletions (i.e., gaps) of up to 20 percent, typically 5 to 15 percent, or 10 to 12 percent.
  • the percentage determines the number of positions where the same amino acid residue exists in both sequences to obtain the number of matching positions, dividing the number of matching positions by the total number of positions in the reference sequence (i.e., window size), and , and this result is multiplied by 100 to calculate the percent sequence identity.
  • percent (%) sequence identity means that after aligning the sequences and introducing gaps, if necessary, without considering any conservative substitutions as part of the sequence identity to achieve maximum percent sequence identity; It is defined as the percentage of amino acid residues in a candidate sequence that are identical to amino acid residues in the reference protein. Alignment for the purpose of determining percent amino acid identity can be performed by a variety of methods within the skill of the art, for example, using publicly available computer software programs, see, for example, Current Protocols in Molecular Biology (Ausubel et al. , eds., 1987), and BLAST, BLAST-2, ALIGN or Megalign (DNASTAR) software.
  • the percent amino acid sequence identity of a given amino acid sequence A with or for a given amino acid sequence B is calculated as follows: 100 times the fraction X/Y; where It will be understood that if the length of amino acid sequence A is not the same as the length of amino acid sequence B, the percent amino acid sequence identity of A to B will not be the same as the percent amino acid sequence identity of B to A.
  • a chemoselective ligation technique may be used to prepare a protein having more than 50% sequence identity with Bsflagellin according to SEQ ID NO: 1, for example, a polymer in a site-specific and controlled manner. This can be done by attaching a (polymer).
  • These techniques typically rely on the incorporation of a chemoselective anchor into the protein backbone, either by chemical or recombinant means, and subsequent modification to a polymer carrying a complementary linker.
  • the assembly process and the covalent structure of the obtained protein-polymer conjugate are controlled, thereby enabling rational optimization of drug properties such as efficacy and pharmacokinetic properties. This improves their pharmacokinetic properties, for example by allowing selective attachment of PEG.
  • the Bsflagellin variant is at least 4%, 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 40%, or 45% compared to wild-type Bsflagellin.
  • Immunogenicity may be reduced by more than 50%, more than 55%, more than 60%, more than 65%, more than 70%, more than 75%, more than 80%, more than 85%, or more than 90%.
  • immunogenicity means that a specific substance that induces an immune response in the body of an animal such as a human induces a humoral and/or cell-mediated immune response. Such immunogenicity can disable the therapeutic effect and cause side effects.
  • the immunogenicity may mean B-cell activation due to the presence of a B-cell epitope recognized by B-cells or antibodies secreted by B-cells.
  • the Bsflagellin mutant may be characterized by improved productivity compared to wild-type Bsflagellin.
  • the productivity may refer to protein productivity in host cells transformed with a vector according to a conventional recombinant protein production method.
  • the Bsflagellin variant may be characterized as having increased productivity by more than 50%, 100%, 150%, or 200% compared to wild-type Bsflagellin.
  • the Bsflagellin variant may be characterized by an increased protein residual rate after storage at 37°C for 2 weeks compared to wild-type Bsflagellin.
  • the Bsflagellin has a protein residual rate of at least 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, or 80% after storage at 37°C for 2 weeks compared to wild-type Bsflagellin.
  • the Bsflagellin variant showing more than 50% sequence identity with the flagellin according to SEQ ID NO: 1 is 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95% or 100% of wild-type Bsfalgellin.
  • the Bsflagellin variant according to the present invention exhibits equivalent or improved TLR5 activation ability and NF-kB signaling activity compared to the wild-type Bsflagellin according to SEQ ID NO: 1, while also exhibiting additional advantages, such as low immunogenicity, improved productivity, It is characterized by being able to provide structural stability, pharmacokinetic advantages, low toxicity in the body, and storage stability.
  • the Bsflagellin variant may be characterized as comprising one or more mutations among the following (1) to (8) in the wild-type Bsflagellin sequence of SEQ ID NO: 1:
  • amino acid substitution at at least one position selected from the group consisting of L34, S49, M52, L59, A85, I86, Q103, Q104, L118, G151, G155, D176, G191, D200, E231, D236 and R275;
  • HVR hyper variable region
  • the amino acid substitution in (1) is L34C, S49C, M52C, L59C, A85K, A85N, I86N, Q103A, Q104A, L118R, G151A, G155A, D176A, G191C, D200A, E231C, D236C and R275Q. It may be characterized as being at least one selected from the group consisting of.
  • the deletion of one or more amino acids in (3) ND1 is deletion at positions 43 to 44, deletion at positions 43 to 50, deletion at positions 100 and 144 in the wild type Bacillus subtilis flagellin sequence of SEQ ID NO: 1. It may be characterized as one or more deletions selected from the group consisting of deletion number 146.
  • the deletion of one or more amino acids in the (4) ND0 to ND1 interface region is deletion 33 to 34, deletion 33 to 41, and deletion 33 to 33 in the wild-type Bacillus subtilis flagellin sequence of SEQ ID NO: 1. It can be characterized as being any one deletion selected from the group consisting of deletion number 42.
  • the deletion of one or more amino acids in the (5) HVR is deletion 179 to 180, deletion 164 to 179, deletion 164 to 180 in the wild-type Bacillus subtilis flagellin sequence of SEQ ID NO: 1, and It can be characterized as being any one deletion selected from the group consisting of deletions 152 to 180.
  • the deletion of one or more amino acids in CD1 may be characterized as one or more deletions selected from the group consisting of deletions 181 to 183, deletions 181 to 187, and deletions 230 to 235. there is.
  • the deletion of one or more amino acids in CD0 (7) is deletion 266 to 275, deletion 270 to 275, deletion 239 to 253, deletion 243 to 253, deletion 243 to 260, and deletion 239. It may be characterized as one or more deletions selected from the group consisting of deletions ⁇ 275.
  • the variant may include the mutations of (2), (3), and (6) above, and may or may not include the mutation of (1) above.
  • the mutant is a deletion of the amino terminal 0 domain (ND0, amino acids 1 to 32) in wild-type Bsflagellin of SEQ ID NO: 1; and deletions of T100, D144, G145, F146, A181, A182 and T183; Contains or does not contain an amino acid substitution at at least one position selected from the group consisting of L34, S49, M52, L59, A85, I86, Q103, Q104, L118, G151, G155, D176, G191, D200, E231, D236 and R275 It can be characterized as not.
  • the mutant is a deletion of the amino terminal 0 domain (ND0, amino acids 1 to 32) in wild-type Bsflagellin of SEQ ID NO: 1; and deletions of T100, D144, G145, F146, A181, A182 and T183; Contains or does not contain at least one amino acid substitution selected from the group consisting of L34C, S49C, M52C, L59C, A85K, A85N, I86N, Q103A, Q104A, L118R, G151A, G155A, D176A, G191C, D200A, E231C, D236C and R275Q It can be characterized as not.
  • the variant includes the mutations (2), (3), (5) and (6) above in wild-type Bsflagellin of SEQ ID NO: 1, and includes the mutation of (1) above, or It may be characterized as not being included.
  • the mutant is a deletion of the amino terminal 0 domain (ND0, amino acids 1 to 32) in wild-type Bsflagellin of SEQ ID NO: 1; and deletions of T100, D144, G145, F146, D179, F180, A181, A182 and T183; Contains or does not contain an amino acid substitution at at least one position selected from the group consisting of L34, S49, M52, L59, A85, I86, Q103, Q104, L118, G151, G155, D176, G191, D200, E231, D236 and R275 It can be characterized as not.
  • the mutant is a deletion of the amino terminal 0 domain (ND0, amino acids 1 to 32) in wild-type Bsflagellin of SEQ ID NO: 1; and deletions of T100, D144, G145, F146, D179, F180, A181, A182 and T183; Contains or does not contain at least one amino acid substitution selected from the group consisting of L34C, S49C, M52C, L59C, A85K, A85N, I86N, Q103A, Q104A, L118R, G151A, G155A, D176A, G191C, D200A, E231C, D236C and R275Q It can be characterized as not.
  • Bacillus subtilis flagellin variant may be selected from the following variants:
  • the flagellin variant may be characterized as having NF-kB signaling activity.
  • the flagellin variant may include a tag.
  • the tag is attached to the N-terminus of the flagellin variant.
  • the tag is attached to the C-terminus of the flagellin variant.
  • the flagellin variant may contain a signal (or leader) sequence at the N-terminus of the protein, which directs transport of the protein either simultaneously with or after translation.
  • the flagellin variants may also be combined with linker sequences or other sequences (e.g., polyHis) to facilitate the synthesis, purification, or identification of proteins (e.g., polyHis), or to enhance the binding of proteins to solid supports. ) can be.
  • the flagellin variant of the present invention may include a pharmaceutically acceptable salt form.
  • the pharmaceutically acceptable salts include, for example, hydrochloride, sulfate, phosphate, acetate, citrate, tartrate, succinate, lactate, maleate, fumarate, oxalate, methanesulfonate, or p-toluenesulfonate. It may be mentioned, but it is not limited to this.
  • the flagellin variant of the present invention is full-length modified by phosphorylation, sulfation, acrylation, glycosylation, methylation, farnesylation, etc. It may be flagellin or a fragment thereof.
  • the flagellin variant may be in the form of a fusion protein containing another polypeptide.
  • the flagellin variant may be a fusion protein containing one or more antigens.
  • antigens include S. pneumoniae PspA1 antigen, S. pneumoniae PspA2 antigen, S. pneumoniae PspA3 antigen, S. pneumoniae PspA4 antigen, S. pneumoniae PspA5 antigen and/or S. pneumoniae PspA6 antigen.
  • the flagellin variant may be in the form of a fusion protein to which one or more immunomodulatory substances are bound.
  • the immune modulating substance may be included without limitation as long as it is known in the art to increase the immune response, and non-limiting examples include interferon- ⁇ , interferon- ⁇ , interferon- ⁇ , interferon- ⁇ , interferon- ⁇ , Interleukin-1 ⁇ , interleukin-1 ⁇ , interleukin-2, interleukin-3, interleukin-4, interleukin-5, interleukin-6, interleukin-7, interleukin-8, interleukin-9, interleukin-10, interleukin-11, interleukin- 12, interleukin-13, interleukin-14, interleukin-18, B cell growth factor, CD40 ligand, TNF- ⁇ , TNF- ⁇ , CCL25, CCL28 or active fragments thereof.
  • the present invention also provides a polynucleotide containing a base sequence encoding the Bacillus subtilis flagellin variant.
  • the combination of bases constituting the polynucleotide is not particularly limited as long as it can encode the polypeptide of the present invention.
  • the polynucleotide may be provided as a single- or double-stranded nucleic acid molecule, including all DNA, cDNA, and RNA sequences.
  • the present invention also provides a vector containing the above polynucleotide.
  • Vectors of the present invention include, but are not limited to, plasmid vectors, cosmid vectors, bacteriophage vectors, viral vectors, etc.
  • the vector of the present invention may be a conventional cloning vector or an expression vector, and the expression vector includes expression control sequences such as a promoter, operator, start codon, stop codon, polyadenylation signal, and enhancer (promoting gene), as well as expression vectors for membrane targeting or secretion. It contains a signal sequence or leader sequence and can be manufactured in various ways depending on the purpose.
  • the polynucleotide sequence according to the present invention may be operably linked to an expression control sequence, and the operably linked gene sequence and the expression control sequence may be an expression control sequence that includes a selection marker and a replication origin.
  • “Operably linked” means linked in a way that allows gene expression when an appropriate molecule is attached to the expression control sequence, whereby one nucleic acid fragment is linked to another nucleic acid fragment to alter its function or expression. refers to being influenced by other nucleic acid fragments.
  • “Expression control sequence” means a DNA sequence that regulates the expression of an operably linked polynucleotide sequence in a particular host cell. Such regulatory sequences include a promoter to effect transcription, optional operator sequences to regulate transcription, sequences encoding suitable mRNA ribosome binding sites, and sequences that regulate termination of transcription and translation.
  • the vector also includes a selection marker for selecting host cells containing the vector, and, if the vector is replicable, an origin of replication.
  • the present invention also provides host cells transformed with the vector.
  • Transformation with the vector can be performed by transformation techniques known to those skilled in the art.
  • microprojectile bombardment electroporation, calcium phosphate (CaPO4) precipitation, calcium chloride (CaCl2) precipitation, PEG-mediated fusion, and microinjection.
  • CaPO4 calcium phosphate
  • CaCl2 calcium chloride
  • PEG-mediated fusion PEG-mediated fusion
  • microinjection PEG-mediated fusion
  • liposome-mediated method can be used.
  • 'host cell' can be used interchangeably with 'transformant', etc., and can be introduced into cells by any means (e.g. electric shock method, calcium phosphatase precipitation method, microinjection method, transformation method, viral infection, etc.). refers to a prokaryotic or eukaryotic cell containing heterologous DNA.
  • the host cell includes all types of single-celled organisms commonly used in the cloning field, such as prokaryotic microorganisms such as various bacteria (e.g., Clostridia genus, Escherichia coli, etc.), lower eukaryotic microorganisms such as yeast, and insect cells, Cells derived from higher eukaryotes, including plant cells and mammals, can be used as host cells, but are not limited thereto. Since protein expression levels and modifications vary depending on the host cell, a person skilled in the art can select and use the host cell most suitable for the purpose.
  • prokaryotic microorganisms such as various bacteria (e.g., Clostridia genus, Escherichia coli, etc.)
  • lower eukaryotic microorganisms such as yeast
  • insect cells Cells derived from higher eukaryotes, including plant cells and mammals, can be used as host cells, but are not limited thereto. Since protein expression levels and modifications vary depending on the host
  • the present invention also provides a pharmaceutical composition containing the Bacillus subtilis flagellin variant as an active ingredient.
  • the flagellin variant and the fusion protein may exhibit the ability to activate the TLR5 pathway.
  • the fusion protein of the present invention can exhibit a preventive, ameliorating or therapeutic effect on diseases, syndromes, etc. that are known to be preventable, ameliorating or treating through activation of the TLR5 pathway.
  • TLR5 pathway Diseases and syndromes known to be preventable, ameliorated, or treatable through activation of the TLR5 pathway include damage caused by radiation exposure; reperfusion injury; inflammatory bowel disease; autoimmune disease; viral infection; Aging; Decreased immune function; Or it could be cancer.
  • the pharmaceutical composition of the present invention is used for preventing or treating damage caused by radiation exposure; For preventing or treating reperfusion injury; For preventing or treating inflammatory bowel disease; For preventing or treating autoimmune diseases; For preventing or treating viral infections; For preventing or treating metabolic diseases; For preventing or treating aging; For enhancing immune function; For the prevention or treatment of cancer; For preventing or treating liver disease; Alternatively, it may be characterized as a pharmaceutical composition for preventing or treating colitis.
  • the flagellin variant of the present invention can be understood to exert a preventive, ameliorating or therapeutic effect even on diseases that will be discovered in the future to be preventable, ameliorating or treating through activation of the TLR5 pathway, and therefore, the pharmaceutical composition of the present invention
  • the scope of diseases targeted for treatment is not particularly limited.
  • Activation of the TLR5 pathway and its relevance to the treatment of damage caused by radiation exposure Activation of the TLR5 pathway and its relation to the treatment of tissue damage caused by reperfusion, Activation of the TLR5 pathway and its relation to the treatment of inflammatory bowel disease, Activation of the TLR5 pathway and autoimmunity Relevance to disease treatment, connection between activation of the TLR5 pathway and treatment of viral infections, connection between activation of the TLR5 pathway and diseases caused by aging, connection between activation of the TLR5 pathway and immune enhancement, activation of the TLR5 pathway and immune enhancement
  • the relationship between activation of the TLR5 pathway and cancer treatment can be referred to known literature.
  • the damage caused by radiation exposure may be gastrointestinal syndrome or hematopoietic syndrome caused by radiation exposure.
  • the disease caused by aging may be hair loss due to aging, cataract, hernia, colitis, osteoporosis, or osteomalacia.
  • the cancer includes breast cancer, lung cancer, colon cancer, kidney cancer, liver cancer, ovarian cancer, prostate cancer, testicular cancer, urogenital cancer, lymphatic cancer, rectal cancer, pancreatic cancer, esophageal cancer, stomach cancer, cervical cancer, thyroid cancer, skin cancer, leukemia, Acute lymphoblastic leukemia, acute lymphoblastic leukemia, B-cell lymphoma, T-cell lymphoma, Hodgkin's lymphoma, non-Hodgkin's lymphoma, hairy cell lymphoma, histiocytic lymphoma and Burkitt's lymphoma, acute and chronic myeloid leukemia, myelodysplastic syndrome, myeloid It may be leukemia, promyelocytic leukemia, astrocytoma, neuroblastoma, glioma, schwannoma, fibrosarcoma, rhabdomyosarcoma, osteosarcoma,
  • the liver disease may be selected from the group consisting of non-alcoholic fatty liver disease, non-alcoholic steatohepatitis, alcoholic fatty liver disease, hepatitis, liver fibrosis, liver cirrhosis, liver failure, and liver cancer.
  • the metabolic disease may be selected from the group consisting of diabetes, metabolic syndrome, insulin resistance, hyperlipidemia, and hypertension.
  • the colitis may be inflammatory bowel disease or irritable colitis, and the inflammatory bowel disease may be ulcerative colitis or Crohn's disease.
  • the pharmaceutical composition of the present invention can be formulated in various ways depending on the route of administration by methods known in the art along with pharmaceutically acceptable carriers other than the flagellin variants.
  • “Pharmaceutically acceptable” refers to a non-toxic substance that is physiologically acceptable and does not inhibit the action of the active ingredient when administered to humans and does not usually cause gastrointestinal upset, allergic reactions such as dizziness, or similar reactions.
  • the carrier includes all types of solvents, dispersion media, oil-in-water or water-in-oil emulsions, aqueous compositions, liposomes, microbeads and microsomes.
  • the route of administration may be oral or parenteral.
  • Parenteral administration methods include, but are not limited to, intravenous, intramuscular, intraarterial, intramedullary, intrathecal, intracardiac, transdermal, subcutaneous, intraperitoneal, intranasal, enteral, topical, sublingual, or rectal administration. You can.
  • the pharmaceutical composition of the present invention When the pharmaceutical composition of the present invention is administered orally, the pharmaceutical composition of the present invention can be formulated into powder, granules, tablets, pills, sugar-coated tablets, capsules, liquid, or gel according to methods known in the art along with a suitable carrier for oral administration. , can be formulated in the form of syrup, suspension, wafer, etc.
  • suitable carriers include sugars including lactose, dextrose, sucrose, sorbitol, mannitol, xylitol, erythritol and maltitol, starches including corn starch, wheat starch, rice starch and potato starch, cellulose, Fillers such as cellulose, including methyl cellulose, sodium carboxymethylcellulose, and hydroxypropylmethylcellulose, gelatin, polyvinylpyrrolidone, etc. may be included. Additionally, in some cases, cross-linked polyvinylpyrrolidone, agar, alginic acid, or sodium alginate may be added as a disintegrant. Furthermore, the pharmaceutical composition may further include anti-coagulants, lubricants, wetting agents, fragrances, emulsifiers, and preservatives.
  • the pharmaceutical composition of the present invention can be formulated with a suitable parenteral carrier in the form of injections, transdermal administration, and nasal inhalation according to methods known in the art.
  • a suitable parenteral carrier in the form of injections, transdermal administration, and nasal inhalation according to methods known in the art.
  • suitable carriers include, but are not limited to, solvents or dispersion media including water, ethanol, polyols (e.g., glycerol, propylene glycol, and liquid polyethylene glycol, etc.), mixtures thereof, and/or vegetable oils. You can.
  • suitable carriers include Hanks' solution, Ringer's solution, phosphate buffered saline (PBS) containing triethanol amine, or isotonic solutions such as sterile water for injection, 10% ethanol, 40% propylene glycol, and 5% dextrose. etc. can be used.
  • PBS phosphate buffered saline
  • isotonic solutions such as sterile water for injection, 10% ethanol, 40% propylene glycol, and 5% dextrose. etc. can be used.
  • it may additionally contain various antibacterial and antifungal agents such as parabens, chlorobutanol, phenol, sorbic acid, thimerosal, etc.
  • the injection may additionally contain an isotonic agent such as sugar or sodium chloride.
  • transdermal administration means administering a pharmaceutical composition topically to the skin so that an effective amount of the active ingredient contained in the pharmaceutical composition is delivered into the skin.
  • the pharmaceutical composition of the present invention can be prepared in an injectable formulation and administered by lightly pricking the skin with a 30-gauge thin injection needle or applying it directly to the skin.
  • the flagellin variants are administered in the form of an aerosol spray from a pressurized pack or nebulizer using, for example, dichlorofluoromethane, trichlorofluoromethane, dichlorotetrafluoroethane, carbon dioxide or another suitable gas. It can be delivered conveniently.
  • the dosage unit can be determined by providing a valve that delivers a metered amount.
  • gelatin capsules and cartridges for use in inhalers or insufflators can be formulated to contain a powder mixture of the compound and a suitable powder base such as lactose or starch.
  • the pharmaceutical composition according to the present invention may contain one or more buffers (e.g. saline or PBS), carbohydrates (e.g. glucose, mannose, sucrose or dextran), antioxidants, bacteriostatic agents, chelating agents. (e.g. EDTA or glutathione), adjuvants (e.g. aluminum hydroxide), suspending agents, thickening agents and/or preservatives.
  • buffers e.g. saline or PBS
  • carbohydrates e.g. glucose, mannose, sucrose or dextran
  • antioxidants e.g. glucose, mannose, sucrose or dextran
  • bacteriostatic agents e.g. EDTA or glutathione
  • adjuvants e.g. aluminum hydroxide
  • suspending agents e.g. aluminum hydroxide
  • compositions of the present invention can be formulated using methods known in the art to provide rapid, sustained or delayed release of the active ingredient after administration to a mammal.
  • composition of the present invention can be administered in combination with known substances that are effective in preventing or treating the diseases listed above.
  • the present invention also provides a vaccine adjuvant containing the Bacillus subtilis flagellin variant as an active ingredient.
  • One of the most important requirements for a vaccine adjuvant is to have immunomodulatory functions such as controlling the expression of co-stimulatory molecules on the surface of antigen-presenting cells and controlling cytokine secretion by inducing antigen-specific T cells.
  • TLR5 PRRs such as TLR5 are distributed on the cell surface or in the cytoplasm of host cells, and induce an ‘innate immune response’ by stimulation of various PAMPs and further regulate the ‘acquired immune response’. do. Therefore, TLR5 agonists can be suitable targets for the development of various 'immunomodulators', especially 'vaccine adjuvants'.
  • the fusion protein of the present invention capable of activating the TLR5 pathway activates the TLR5 pathway to enhance the innate immune response and acquired immune response, thereby significantly improving the host's immune function against co-administered antigens.
  • the vaccine adjuvant of the present invention may be prepared by a conventional method well known in the art, and may optionally further include various additives that can be used in vaccine production in the art.
  • the invention also provides a method for treating damage caused by radiation exposure; For the treatment of reperfusion injury; For the treatment of inflammatory bowel disease; For treatment of autoimmune diseases; For treatment of viral infections; For the treatment of metabolic diseases; For aging treatment; For enhancing immune function; For cancer treatment; For the treatment of liver disease; Alternatively, it provides a use of the Bacillus subtilis flagellin variant of any one of claims 1 to 13 for producing a pharmaceutical composition for treating colitis.
  • the present invention also provides for damage caused by radiation exposure, comprising administering an effective amount of a pharmaceutical composition containing the Bacillus subtilis flagellin variant of any one of claims 1 to 13 as an active ingredient to an individual in need thereof.
  • therapy comprising administering an effective amount of a pharmaceutical composition containing the Bacillus subtilis flagellin variant of any one of claims 1 to 13 as an active ingredient to an individual in need thereof.
  • therapy comprising administering an effective amount of a pharmaceutical composition containing the Bacillus subtilis flagellin variant of any one of claims 1 to 13 as an active ingredient to an individual in need thereof.
  • therapy Treatment of reperfusion injury; Treatment of inflammatory bowel disease; Treatment of autoimmune diseases; Treatment of viral infections; treatment of metabolic diseases; aging treatment; Enhances immune function; cancer treatment; Treatment of liver disease;
  • a method of treating colitis is provided.
  • the 'effective amount' of the present invention refers to an amount that exhibits the effect of improving, treating, detecting, diagnosing cancer or cancer, or suppressing or reducing the disease when administered to an individual, and the 'individual' refers to an animal, preferably a mammal. It may be an animal, especially an animal including humans, and may also be a cell, tissue, organ, etc. derived from an animal. The subject may be a patient in need of the effect.
  • the 'treatment' of the present invention comprehensively refers to improving symptoms due to cancer or the disease, which may include curing, substantially preventing, or improving the condition of the disease, and can prevent the disease from occurring. This includes, but is not limited to, relieving, curing, or preventing one or most of the symptoms that arise.
  • the term “comprising” is used in the same sense as “including” or “characterized by,” and specifically refers to the composition or method according to the present invention. It does not exclude additional components or method steps that have not been used. Additionally, the term “consisting of” means excluding additional elements, steps, or ingredients that are not separately stated.
  • the term “essentially consisting of” means that, in the scope of a composition or method, it may include substances or steps that do not substantially affect its basic characteristics in addition to the described substances or steps.
  • Bacillus subtilis flagellin variant provided by the present invention not only has reduced immunogenicity in the body compared to the wild type, but also has improved storage stability, so as to develop a treatment and/or vaccine for diseases that can be prevented, improved, or treated by TLR5 activation. It can be very useful in the development of supplements.
  • FIGS 1a to 1c are structural schematics of wild-type Bsflagellin and Bsflagellin mutant proteins prepared in examples of the present invention.
  • Figure 2 shows the results of evaluating the signal intensity of NF-kB after administering BM-03, a Bsflagellin mutant, and wild-type Bsflagellin to NF-kB reporter mice.
  • sequence information was inserted into the BepiPred 2.0 program, and values above cutoff 0.6 were analyzed as immunogenicity-inducing regions.
  • Bsflagellin WT (SEQ ID NO: 1)
  • BM01 Deletion: M1 ⁇ S32 BM02 Deletion: T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183 BM03 Deletion: M1-S32, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183 BM04 Deletion: M1-S32, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183, D179, F180 BM05
  • M1 ⁇ G34 T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183 BM06 Deletion: M1-D41, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183 BM07 Deletion: M1-A44, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183 BM08 Deletion: M1-E50, T100, D144, G
  • FIG. 1 A schematic diagram of the protein structure of each Bsflagellin mutant and wild-type Bsflagellin is shown in Figure 1.
  • a plasmid containing the sequences shown in Table 2 below was constructed, and each protein was produced using it. Cloning was performed in the following order.
  • Purified protein is obtained by performing washing (50mM/100mM/250mM/500mM Imidazole) and Elution (Elution buffer; 20mM Sodium phosphate, pH7.6, 150mM NaCl, 1M Imidazole) using different Imidazole concentrations.
  • Protein is loaded using a sample pump and after equilibration, fractionation is performed using a salt gradient (A; 20mM Sodium phosphate, pH7.6, 10mM NaCl, B; 20mM Sodium phosphate, pH7.6, 1M NaCl).
  • A 20mM Sodium phosphate, pH7.6, 10mM NaCl
  • B 20mM Sodium phosphate, pH7.6, 1M NaCl
  • Relative productivity was comparatively analyzed based on the amount of protein that could be obtained per 1L when purifying wild-type Bacillus flagellin and presented in a table.
  • Luciferin D-Luciferin Salt lot # 122799 PerkinElmer 150mg/kg is injected intraperitoneally by ip method and Isoflurane (Ifranaek Hana Pharmaceutical) 2% Respiratory anesthesia was performed at ⁇ 2.5% (O 2 ).
  • mice were maintained at 1.5% to 1.8% (O 2 ) anesthesia using the IVIS TM imaging system (Perkin Elmer), and fluorescence detection images were obtained up to the neck of the mouse.
  • Bacillus subtilis flagellin variant provided by the present invention not only has reduced immunogenicity in the body compared to the wild type, but also has improved storage stability, so as to develop a treatment and/or vaccine for diseases that can be prevented, improved, or treated by TLR5 activation. It can be very useful in the development of supplements and has high industrial applicability.

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Abstract

본 발명은 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis) 플라젤린 변이체 및 이의 용도에 관한 것으로, 보다 상세하게는 야생형의 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis) 유래 플라젤린과 비교해 보관 안정성이 향상되고 면역원성이 감소된 플라젤린 변이체 및 이의 용도에 관한 것이다.

Description

바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체 및 이의 용도
본 출원은 2022년 8월 10일에 출원된 대한민국 특허출원 제 10-2022-0100229호를 우선권으로 주장하고, 상기 명세서 전체는 본 출원의 참고문헌이다.
본 발명은 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis) 플라젤린 변이체 및 이의 용도에 관한 것으로, 보다 상세하게는 야생형의 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis) 유래 플라젤린과 비교해 보관 안정성이 향상되고 면역원성이 감소된 플라젤린 변이체 및 이의 용도에 관한 것이다.
편모(flagella)는 세균의 운동성을 결정하는 중요한 구성요소이며 크게 후크(hook), 기저체(basal body) 및 필라멘트(filament)로 구성되어 있다. 편모는 세균의 유영(swimming) 혹은 유주운동(swarming motility), 세균의 주성(taxis)을 결정하고, 바이오필름(biofilm)을 형성하여, 병원성 미생물의 부착능을 결정하는 기능이 있다고도 알려져 있다. 편모의 필라멘트를 구성하는 구성 단위 단백질을 플라젤린(flagellin)이라 하며, 플라젤린이 규칙적으로 조합되어(assembling) 필라멘트를 형성한다. Hayashi 등은 포유류가 발현하는 TLR5가 그람 음성 및 그람 양성 세균의 플라젤린을 인지하여 NF-κB를 활성화시킨다고 보고하였다(Hayashi F, Smith KD, Ozinsky A, Hawn TR, Yi EC, Goodlett DR, Eng JK, Akira S, Underhill DM, Aderem A: Nature 410:1099-1103, 2001).
플라젤린은 박테리아 편모의 채찍 줄기 모양의 필라멘트로 조립되는 구조 단백질로, 세포 표면에서 연장되어 박테리아가 움직일 수 있도록 기능한다. 플라젤린은 병원성 세균의 병원성 박테리아가 독성 인자로 작용하여 숙주 세포 내로 침투하고 침입하는 것을 촉진한다. 플라젤린은 박테리아에서 독점적으로 발견되며 편모성 박테리아(flagellated bacteria)에서 가장 풍부한 단백질 중 하나이기 때문에 플라젤린은 숙주 면역 감시의 주요 대상이 된다. 박테리아의 침입시, 플라젤린은 숙주에서 Toll-like receptor 5 (TLR5)와 NAIP5/NLRC4에 의해 검출되고 숙주에서 병원균의 즉각적인 제거에 기여하는 선천성 면역을 활성화시킨다.
TLR5는 세포 표면에 위치한 선천성 면역 수용체이며, 세포 외 leucine-rich repeat(LRR) 도메인, 막 횡단 도메인 및 세포 내 도메인으로 구성된다. TLR5는 플라젤린을 세포 외 도메인을 사용하는 병원체 관련 분자 패턴으로 인식하고 MyD88-의존성 신호전달 경로 및 NF-κB 매개 염증성 사이토카인 생성을 활성화시킨다.
플라젤린은 편모성-병원성 박테리아에 대한 첫 번째 방어선 역할을 하기 때문에 백신 담체 단백질 또는 백신 보조제 개발의 대상으로서 관심이 되어왔다. 항원과 플라젤린의 융합 단백질은 웨스트 나일 발열, 말라리아, 전염병 및 결핵을 비롯한 다양한 전염성 질병에 대한 실험용 백신으로 효과적임이 입증되었고, 플라젤린에 의한 TLR5 활성화는 또한 조혈 세포와 방사선으로 인한 위장 조직을 보호하고 암 세포의 생존과 성장에 영향을 미치는 것으로 보고된 바 있다. 이 외에도, 플라젤린은 간 질환, 대사증후군, 대장염 등의 질환에서도 치료 효과를 나타내는 것으로 보고된 바 있다.
한편, 생물학적 치료제에 대한 면역반응은 비인간 및 인간 유래 단백질 모두에 대해 널리 유발될 수 있다. 이러한 반응은 임상 효과를 약화시키고, 효력을 제한시키기도 하며, 때때로 병적 질환을 유발하거나 심지어 환자의 사망을 일으키기도 한다. 이와 같은 면역반응은 항체 반응에 의해 유발되는 경우가 많다. 환자의 항체 반응은 B-세포 에피토프와 T-세포 에피토프의 존재에 의존한다. 체내 B-세포 리셉터가 투여된 외래 단백질을 인식하고 결합할 경우, 외래 단백질은 리셉터 매개 엔도사이토시스(endocytosis)에 의해 B-세포에 내면화(internalize)되어 단백질 가수분해 과정을 겪게 된다. 이어서 얻어진 펩티드는 MHC 클래스 II 분자에 의해 제공된다. T 헬퍼 세포가 T 세포 에피토프를 인식하면 T 헬퍼 세포는 상응하는 B 세포를 자극하여 증식하고 항체를 생산하는 플라스마 세포로 분화한다.
외래 딘백질의 면역원성으로 인한 체내 유용성의 감소를 해결하기 위해 종래 여러가지 탈면역화(de-immunization) 기술이 제공된 바 있으나, 플라젤린의 면역원성을 감소 또는 제거하기 위한 기술은 아직까지 보고된 바 없다.
이에, 본 발명자는 바실러스 서브틸리스 플라젤린의 생리활성은 유지하면서도, 체내 면역원성이 감소되어 부작용 위험이 적고 보관 안정성이 향상된 변이체를 개발하기 위해 연구를 거듭하였고, 그 결과 본 발명을 완성하게 되었다.
따라서, 본 발명의 목적은 서열번호 1의 야생형 바실러스 서브틸리스 플라젤린(Bacillus subtilis flagellin)과 적어도 50% 이상의 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하고, 상기 야생형 바실러스 서브틸리스 플라젤린 대비 면역원성이 감소된 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체를 제공하는 것이다.
본 발명의 다른 목적은 상기 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis) 플라젤린 변이체를 암호화하는 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 상기 폴리뉴클레오티드를 포함하는 벡터 및 상기 벡터로 형질전환된 숙주세포를 제공하는 것이다.
본 발명의 다른 목적은 상기 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis) 플라젤린 변이체를 유효성분으로 포함하는 방사선 노출에 의한 손상 예방 또는 치료용; 재관류 손상 예방 또는 치료용; 염증성 장 질환 예방 또는 치료용; 자가면역질환 예방 또는 치료용; 바이러스 감염 예방 또는 치료용; 대사 질환 예방 또는 치료용; 노화 예방 또는 치료용; 면역기능 증강용; 암 예방 또는 치료용; 간 질환 예방 또는 치료용; 또는 대장염 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공하는 것이다.
또한, 본 발명의 다른 목적은 상기 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis) 플라젤린 변이체로 이루어진 방사선 노출에 의한 손상 예방 또는 치료용; 재관류 손상 예방 또는 치료용; 염증성 장 질환 예방 또는 치료용; 자가면역질환 예방 또는 치료용; 바이러스 감염 예방 또는 치료용; 대사 질환 예방 또는 치료용; 노화 예방 또는 치료용; 면역기능 증강용; 암 예방 또는 치료용; 간 질환 예방 또는 치료용; 또는 대장염 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공하는 것이다.
또한, 본 발명의 다른 목적은 상기 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis) 플라젤린 변이체로 필수적으로 이루어진 방사선 노출에 의한 손상 예방 또는 치료용; 재관류 손상 예방 또는 치료용; 염증성 장 질환 예방 또는 치료용; 자가면역질환 예방 또는 치료용; 바이러스 감염 예방 또는 치료용; 대사 질환 예방 또는 치료용; 노화 예방 또는 치료용; 면역기능 증강용; 암 예방 또는 치료용; 간 질환 예방 또는 치료용; 또는 대장염 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공하는 것이다.
본 발명의 다른 목적은 상기 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis) 플라젤린 변이체를 유효성분으로 포함하는 백신 보조제를 제공하는 것이다.
본 발명의 다른 목적은 방사선 노출에 의한 손상 치료용; 재관류 손상 치료용; 염증성 장 질환 치료용; 자가면역질환 치료용; 바이러스 감염 치료용; 대사 질환 치료용; 노화 치료용; 면역기능 증강용; 암 치료용; 간 질환 치료용; 또는 대장염 치료용 약학적 조성물을 제조하기 위한 제1항 내지 제13항 중 어느 한 항의 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체의 용도를 제공하는 것이다.
본 발명의 다른 목적은 제1항 내지 제13항 중 어느 한 항의 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체를 유효성분으로 포함하는 약학적 조성물의 유효량을 이를 필요로 하는 개체에 투여하는 것을 포함하는 방사선 노출에 의한 손상 치료; 재관류 손상 치료; 염증성 장 질환 치료; 자가면역질환 치료; 바이러스 감염 치료; 대사 질환 치료; 노화 치료; 면역기능 증강; 암 치료; 간 질환 치료; 또는 대장염 치료 방법을 제공하는 것이다.
전술한 본 발명의 목적을 달성하기 위하여 본 발명은 서열번호 1의 야생형 바실러스 서브틸리스 플라젤린(Bacillus subtilis flagellin)과 적어도 50% 이상의 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하고, 상기 야생형 바실러스 서브틸리스 플라젤린 대비 면역원성이 감소된 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체를 제공한다.
본 발명의 다른 목적을 달성하기 위하여 본 발명은 상기 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis) 플라젤린 변이체를 암호화하는 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 상기 폴리뉴클레오티드를 포함하는 벡터 및 상기 벡터로 형질전환된 숙주세포를 제공한다.
본 발명의 다른 목적을 달성하기 위하여 본 발명은 상기 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis) 플라젤린 변이체를 유효성분으로 포함하는 방사선 노출에 의한 손상 예방 또는 치료용; 재관류 손상 예방 또는 치료용; 염증성 장 질환 예방 또는 치료용; 자가면역질환 예방 또는 치료용; 바이러스 감염 예방 또는 치료용; 대사 질환 예방 또는 치료용; 노화 예방 또는 치료용; 면역기능 증강용; 암 예방 또는 치료용; 간 질환 예방 또는 치료용; 또는 대장염 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공한다.
또한, 본 발명의 다른 목적을 달성하기 위하여 본 발명은 상기 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis) 플라젤린 변이체로 이루어진 방사선 노출에 의한 손상 예방 또는 치료용; 재관류 손상 예방 또는 치료용; 염증성 장 질환 예방 또는 치료용; 자가면역질환 예방 또는 치료용; 바이러스 감염 예방 또는 치료용; 대사 질환 예방 또는 치료용; 노화 예방 또는 치료용; 면역기능 증강용; 암 예방 또는 치료용; 간 질환 예방 또는 치료용; 또는 대장염 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공한다.
또한, 본 발명의 다른 목적을 달성하기 위하여 본 발명은 상기 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis) 플라젤린 변이체로 필수적으로 이루어진 방사선 노출에 의한 손상 예방 또는 치료용; 재관류 손상 예방 또는 치료용; 염증성 장 질환 예방 또는 치료용; 자가면역질환 예방 또는 치료용; 바이러스 감염 예방 또는 치료용; 대사 질환 예방 또는 치료용; 노화 예방 또는 치료용; 면역기능 증강용; 암 예방 또는 치료용; 간 질환 예방 또는 치료용; 또는 대장염 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공한다.
본 발명의 다른 목적을 달성하기 위하여 본 발명은 상기 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis) 플라젤린 변이체를 유효성분으로 포함하는 백신 보조제를 제공한다.
본 발명의 다른 목적을 달성하기 위하여 본 발명은 방사선 노출에 의한 손상 치료용; 재관류 손상 치료용; 염증성 장 질환 치료용; 자가면역질환 치료용; 바이러스 감염 치료용; 대사 질환 치료용; 노화 치료용; 면역기능 증강용; 암 치료용; 간 질환 치료용; 또는 대장염 치료용 약학적 조성물을 제조하기 위한 제1항 내지 제13항 중 어느 한 항의 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체의 용도를 제공한다.
본 발명의 다른 목적을 달성하기 위하여 본 발명은 제1항 내지 제13항 중 어느 한 항의 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체를 유효성분으로 포함하는 약학적 조성물의 유효량을 이를 필요로 하는 개체에 투여하는 것을 포함하는 방사선 노출에 의한 손상 치료; 재관류 손상 치료; 염증성 장 질환 치료; 자가면역질환 치료; 바이러스 감염 치료; 대사 질환 치료; 노화 치료; 면역기능 증강; 암 치료; 간 질환 치료; 또는 대장염 치료 방법을 제공한다.
본 명세서에 사용된 아미노산의 일문자(삼문자)는 생화학 분야에서의 표준 약어 규정에 따라 다음의 아미노산을 의미한다: A(Ala): 알라닌; C(Cys): 시스테인; D(Asp): 아스파르트산; E(Glu): 글루탐산; F(Phe): 페닐알라닌; G(Gly): 글라이신; H(His): 히스티딘; I(IIe): 이소류신; K(Lys): 라이신; L(Leu): 류신; M(Met): 메티오닌; N(Asn): 아스파라진; O(Ply): 피롤라이신; P(Pro): 프롤린; Q(Gln): 글루타민; R(Arg): 아르지닌; S(Ser): 세린; T(Thr): 쓰레오닌; U(Sec):셀레노시스테인, V(Val): 발린; W(Trp): 트립토판; Y(Tyr): 타이로신.
본 명세서에 표기되는 "(아미노산일문자)(아미노산위치)(아미노산일문자)"는 야생형 단백질의 해당 아미노산 위치에서 선행 표기된 아미노산이 후행 표기된 아미노산으로 치환된다는 것을 의미한다. 예를 들면, R57H는 야생형 단백질의 57번째 아미노산에 해당하는 아르기닌이 히스티딘으로 치환된다는 것을 가리킨다.
이하, 본 발명에 대해 상세히 설명한다.
본 발명은 서열번호 1의 야생형 바실러스 서브틸리스 플라젤린(Bacillus subtilis flagellin)과 적어도 50% 이상의 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하고, 상기 야생형 바실러스 서브틸리스 플라젤린 대비 면역원성이 감소된 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체를 제공한다.
본 발명에서 상기 플라젤린은 편모성 세균이 감염된 경우에 감염된 숙주 내에서 면역 반응을 유도할 수 있다. 보다 구체적으로 인체의 세포막 표면에 존재하는 톨-유사수용체 5(TLR5; Toll like receptor 5)는 상기 플라젤린과 상호작용을 통하여 세포 내 신호 전달을 유발하고, 이를 통하여 전사인자인 NF-kB의 발현이 증가되어 선천성 면역신호 활성화를 유도할 뿐만 아니라, 획득 면역 반응을 조절할 수 있다.
본 발명에서 상기 서열번호 1은 B.subtilis 유래의 야생형 플라젤린이다(Bsflagellin).
[서열번호 1]
MRINHNIAALNTLNRLGSNNGAAQKNMEKLSSGLRINRAGDDAAGLAISEKMRGQIRGLEMASKNSQDGISLIQTAEGALTETHAILQRMRELTVQAGNTGTQQAEDLGAIKDEMDALIEEIDGISNRTEFNGKKLLDGTNSTDGFTFQIGANAGQQLNVKIDSMSSTALGVNALDVTDFAATAFDDQLKSIDTAINTVSTQRAKLGAVQNRLEHTINNLGASGENLTAAESRIRDVDMAKEMSEFTKNNILSQASQAMLAQANQQPQNVLQLLR
본 발명의 일 양태에서, 상기 Bsflagellin 변이체는 서열번호 1의 야생형 Bsflagellin과 50% 이상, 55% 이상, 60% 이상, 65% 이상, 70% 이상, 75% 이상, 80% 이상, 85% 이상, 90% 이상, 91% 이상, 92% 이상, 93% 이상, 94% 이상, 95% 이상, 96% 이상, 97% 이상, 98% 이상 또는 99% 이상의 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함할 수 있다.
상기 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열은, 상기 서열번호 1의 아미노산 서열에 임의의 변경이 발생한 것으로서, 하나 이상의 치환, 결실, 부가 및/또는 삽입을 포함할 수 있다. 이러한 변이체는 자연적으로 발생되는 것일 수 있고, 또는 본 기술분야에 잘 알려진 임의의 다수의 기술을 이용하여, 예를 들어 본 발명의 상기 펩타이드 서열 중의 하나 이상을 수정 또는 변형하고 본 명세서에 기재된 이들의 생물학적 활성을 평가하는 것에 의해 합성적으로 생성될 수 있다.
본 발명의 일 실시양태로서, 상기 서열번호 1과 50% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열은 보존적 치환을 포함한다. '보존적 치환'이란, 어느 아미노산이 유사한 특성을 가지는 다른 아미노산으로 치환되어 당업자라면 그 펩타이드의 2차 구조 및 감수성질(hydropathic nature, 소수성 또는 친수성 성질)이 실질적으로 비변화되었다고 예측할 수 있는 치환이다. 일반적으로 하기 아미노산 군이 보존성 변화를 나타낸다: (1) ala, pro, gly, glu, asp, gln, asn, ser, thr; (2) cys, ser, tyr, thr; (3) val, ile, leu, met, ala, phe; (4) lys, arg, his; 및 (5) phe, tyr, trp, his.
상기 변형(modification)은 서열번호 1에 따른 야생형 Bsflagellin 구조 내에 수행되는 것일 수 있고, 원하는(바람직한) 특징을 가지고 있는 단백질 변이체 또는 파생물(derivatives)을 암호화하는 기능적 분자를 수득할 수 있다. 서열번호 1에 따른 Bsflagellin과 등가(equivalent)의 또는 향상된(improved) 변이체를 제작하기 위해 펩타이드의 아미노산 서열을 변경하고자 하는 경우, 당업자는 당업계에 알려진 단백질 코돈 정보에 기초하여 하나 이상의 코돈을 변화시킬 수 있다.
예를 들어, 수용체, 항체의 항원-결합 부위 또는 기질 분자상의 결합 부위와 같은 구조를 가지는 상호작용적인 결합능력의 상당한 손실 없이, 특정 아미노산은 단백질 또는 펩타이드 구조 내에서 다른 아미노산으로 치환될 수 있다. 왜냐하면 이것은 일반적으로 정의된 단백질의 생물학적 기능적 활성으로서 단백질의 상호작용적인 능력 및 성질 때문이며, 특정 아미노산 서열 치환이 단백질 또는 펩타이드 서열 중(안)에서 이루어질 수 있고, 또한 물론 근본적인 DNA 코딩 서열 중(안)에서 이루어질 수 있고, 그럼에도 불구하고 동일 또는 유사의 특성을 가지는 단백질을 수득할 수 있다.
따라서 원하는 유용성 또는 활성의 상당한 손실 없이, 서열번호 1에 따른 Bsflagellin을 암호화하는 DNA 서열에서 다양한 변화가 이루어지는 것이 고려된다. 이러한 변형에는, 아미노산의 감수(hydropathic, 소수성 또는 친수성 성질) 지수 또한 고려될 수 있다. 단백질에 상호작용적인 생물학적 기능을 부여하는 감수 아미노산 지수(hydropathic amino acid index)의 중요성은 본 기술분야에서 일반적으로 이해된다(Kyte 및 Doolittle, 1982, 참조에 의해 본 명세서에 원용된다). 예를 들어, 아미노산의 상대적인 감수(hydropathic) 성질은 얻어진 단백질의 2차 구조에 기여하고 이것이 결국 다른 분자, 예를 들면 효소, 기질, 수용체, DNA, 항체, 항원 등과 상기 단백질의 상호작용을 규정하는 것이 알려졌다. 각 아미노산은 그 소수성 및 전하 특성에 기반하여 감수 지수(hydropathic index) 가 지정된다(Kyte 및 Doolittle, 1982). 이들 값은 아래와 같다: 이소류신(+4.5); 발린(+4.2); 류신(+3.8); 페닐알라닌(+2.8); 시스테인/시스틴(+2.5); 메티오닌(+1.9); 알라닌(+1.8); 글리신(-0.4); 트레오닌(-0.7); 세린(-0.8); 트립토판(-0.9); 티로신(-1.3); 프롤린(-1.6); 히스티딘(-3.2); 글루타민산(-3.5); 글루타민(-3.5); 아스파르트산(-3.5); 아스파라긴(-3.5); 리진(-3.9); 및 아르기닌(-4.5).
특정 아미노산은 이와 유사한 감수 지수 또는 점수(score)를 가지는 다른 아미노산에 의해 치환될 수 있고, 그리고 유사한 생물학적 활성을 가지는 단백질을 수득할 수 있게 한다(즉, 여전히 생물학적 기능적으로 등가의 단백질을 수득한다)는 것은 당업계에 공지이다. 이러한 변경에 있어서, 감수 지수가 ±2 이내인 아미노산이 치환에 바람직하고, 감수지수가 ±1 이내인 아미노산의 치환이 특히 바람직하고, 감수지수가 ±0.5 이내인 아미노산의 치환이 더욱 특히 바람직하다.
동일한 아미노산의 치환이 친수성(hydrophilicity)에 기반하여 유효하게 수행될 수 있다는 것도 또한 본 기술분야에서 이해되어 있다. 미국 특허 제4,554,101호에 기술된 것과 같이, 이하의 친수성값(hydrophilicity values)이 아미노산 잔기에 지정되어있다: 아르기닌(+3.0); 리신(+3.0); 아스파르트산(+3.0±1); 글루타민산(+3.0±1); 세린(+0.3); 아스파라긴(+0.2); 글루타민(+0.2); 글리신(0); 트레오닌(-0.4); 프롤린(-0.5±1); 알라닌(-0.5); 히스티딘(-0.5); 시스테인(-1.0); 메티오닌(-1.3); 발린(-1.5); 류신(-1.8); 이소류신(-1.8); 티로신(-2.3); 페닐알라닌(-2.5); 트립토판(-3.4). 아미노산이 유사한 친수성 값을 가지는 다른 아미노산으로 치환될 수 있고, 그리고 생물학적으로 등가의 단백질을 수득할수 있다는 것이 이해된다. 이러한 변경에 있어서 그 친수성값이 ±2 이내인 아미노산의 치환이 바람직하고, 그 친수성값이 ±1 이내인 아미노산의 치환이 특히 바람직하고, 그리고 그 친수성값이 ±0.5 이내인 아미노산의 치환이 보다 더 특히 바람직하다.
위에서 개요를 서술한 바와 같이, 아미노산 치환은 아미노산 곁사슬(side-chain) 치환기의 상대적인 유사성에 기반할 수 있으며, 예를 들어 이들(곁사슬 치환기의 상대적 유사성)의 소수성, 친수성, 전하, 크기, 등에 기반할 수 있다. 전술의 다양한 특징을 고려하는 예시적인 치환들은 당업자에게 주지이며, 하기를 포함한다: 아르기닌 및 리신; 글루타민산 및 아스파르트산; 세린 및 트레오닌; 글루타민 및 아스파라긴; 발린, 류신 및 이소류신.
아미노산 치환은 또한 잔기의 극성, 전하, 용해성, 소수성, 친수성 및/또는 양친매성 특성의 유사성에 기반하여 수행되는 것일 수 있다. 예를 들어, 음으로 하전된(negatively charged) 아미노산으로서는 아스파르트산 및 글루타민산을 포함하며; 양으로 하전된(positively charged) 아미노산으로서는 리신 및 아르기닌을 포함하고; 그리고 유사한 친수성값을 가지는 비하전성 극성 헤드기를 가지는 아미노산으로서는 류신, 이소류신 및 발린; 글리신 및 알라닌; 아스파라긴 및 글루타민; 세린, 트레오닌, 페닐알라닌 및 티로신을 들 수 있다.
또한 상기 서열번호 1에 따른 Bsflagellin과 50% 이상의 서열 동일성을 갖는 단백질은 아미노산의 비보존적 변경을 포함할 수 있다. 또한, 예를 들어 상기 서열번호 1에 따른 Bsflagellin의 2차 구조 및 감수(hydropathic) 특성에 대해서 가지는 영향이 최소인 아미노산의 결실 또는 부가에 의해 변경될 수 있다.
단백질의 아미노산 서열이 비교될 경우, 후술하는 바와 같이 두 시퀀스가 최대의 일치(maximum correspondence)로 정렬될 때 만일 두 서열에서 아미노산의 서열이 동일한 경우에, 상기 두 서열은 "동일"하다고 한다. 두 개 서열간 비교는, 대표적으로는 비교 윈도우(comparison window)상에서 배열을 비교하여 서열 유사성의 국소적 영역을 동정 및 비교함으로써 수행된다. 본 명세서 중에서 사용되는 “비교 윈도우”란, 적어도 약 20개의 연속적인 위치, 통상적으로 30 내지 75, 40 내지 50개의 연속하는 위치의 부분(segment)을 의미하는 것으로서, 상기 부분에서 서열은 두 개 서열이 최적으로 정렬된 후에 같은 수의 연속되는 위치의 참조 서열(reference sequence)과 비교될 수 있다.
비교를 위한 서열의 최적 정렬은, 예를 들어 bioinformatics software(DNASTAR, Inc., Madison, Wis.)의 Lasergene suite에서 Megalign program을 이용하여, 기본 매개변수(default parameter)를 이용하여 수행될 수 있다. 이 프로그램은 이하의 참고 문헌에 기재된 몇 개의 정렬 양식(alignment scheme)을 포함하고 있다: Dayhoff, M. O. (1978) A model of evolutionary change in proteins-Matrices for detecting distant relationships. In Dayhoff, M. O. (ed.) Atlas of Protein Sequence and Structure, National Biomedical Research Foundation, Washington D.C. Vol. 5, Suppl. 3, pp. 345-358; Hein J. (1990) Unified Approach to Alignment and Phylogenes pp. 626-645 Methods in Enzymology vol. 183, Academic Press, Inc., San Diego, Calif.; Higgins, D. G. and Sharp, P. M. (1989) CABIOS 5:151-153; Myers, E. W. and Muller W. (1988) CABIOS 4:11-17; Robinson, E. D. (1971) Comb. Theor 11:105; Santou, N. Nes, M. (1987) Mol. Biol. Evol. 4:406-425; Sneath, P. H. A. and Sokal, R. R. (1973) Numerical Taxonomy-the Principles and Practice of Numerical Taxonomy, Freeman Press, San Francisco, Calif.; Wilbur, W. J. and Lipman, D. J. (1983) Proc. Nat'l Acad., Sci. USA 80:726-730.
혹은, 비교를 위한 서열의 최적 정렬은, Smith 및 Waterman(1981) Add.APL.Math 2:482의 부분적 동일성 알고리즘에 의해 수행되거나, Needleman 및 Wunsch(1970) J.Mol.Biol.48:443의 동일성 정렬 알고리즘에 의해 수행되거나, Pearson 및 Lipman(1988) Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:2444의 유사성 검색 방법에 의해 수행되거나, 이들 알고리즘의 컴퓨터화한 실행(GAP, BESTFIT, BLAST, FASTA, and TFASTA in the Wisconsin Genetics Software Package, Genetics Computer Group (GCG), 575 Science Dr., Madison, Wis.)에 의하여 수행되거나, 또는 검사에 의해 수행될 수 있다.
서열 동일성 및 서열 유사성 백분율(percent)을 결정하기 위한 적절한 알고리즘의 예는 BLAST 및 BLAST2.0 알고리즘일 수 있으며, 이들은 각각 Altschul et al. (1977) Nucl. Acids Res.25:3389~3402 및 Altschul et al. (1990) J.Mol.Biol.215:403~410에 기재되어있다. BLAST 및 BLAST2.0은 본 발명의 폴리뉴클레오티드 및 폴리펩타이드에 대한 서열 동일성 백분율을 결정하기 위해 사용될수 있으며, 예를 들어 본 명세서에 기재된 파라미터와 함께 이용될 수 있다. BLAST 분석을 수행하기 위한 소프트웨어는 National Center for Biotechnology Information를 통해 공개적으로 이용 가능하다. 아미노산 서열에 대해서, 채점표(scoring matrix)가 누적 점수(score)를 계산하기 위해 이용될 수 있다.
각 방향에서 글자 일치(word hit)의 신장은 하기의 경우에 정지한다: 누적 정렬 점수(score)가 그 최대 도달값으로부터 quantity X에 의해 줄어들었을 경우, 누적 점수가 하나 이상의 음의 점수(negative scoring) 잔기의 정렬 누적으로 인해 0(zero) 이하가 되었을 경우; 또는 어느 서열의 말단에 도달했을 경우. 상기 BLAST 알고리즘 파라미터 W, T 및 X는 정렬의 감도(sensitivity) 및 속도를 결정한다.
하나의 예시적인 접근에 있어서, '서열 동일성 백분율(percentage)'은 적어도 20개 위치의 비교 윈도우 상에서 2개의 최적 정렬 서열을 비교함으로서 결정되고, 여기서 비교 윈도우 중의 폴리펩타이드 서열 부분은 참조 서열(이것은 부가 또는 결실을 포함하지 않는다)과 비교하여 20 퍼센트 이하, 통상적으로는 5~15 퍼센트, 또는 10~12 퍼센트의 부가 또는 결실(즉, 갭)을 포함할 수 있다. 상기 백분율은 양(both) 서열에서 동일한 아미노산 잔기가 존재하는 위치의 수를 결정해 일치하는 위치의 수를 얻고, 상기 일치하는 위치의 수를 참조 서열의 위치 총수(즉, 윈도우 사이즈)로 나누어주고, 그리고 이 결과에 100을 곱해 서열 동일성 백분율이 산출된다.
본 발명에서 사용되는 용어 “퍼센트(%) 서열 동일성”은 서열을 정렬하고 갭을 도입한 후, 필요하다면 최대 퍼센트 서열 동일성을 달성하기 위해 임의의 보존적 치환을 서열 동일성의 일부로서 고려하지 않고, 기준 단백질 내 아미노산 잔기와 동일한 후보 서열 내 아미노산 잔기의 백분율로서 정의한다. 퍼센트 아미노산 동일성을 결정하기 위한 목적의 정렬은 예를 들어 공개적으로 입수할 수 있는 컴퓨터 소프트웨어 프로그램을 사용하여 당업계의 기술 범위 내에 있는 다양한 방법, 예를 들어 참고문헌[Current Protocols in Molecular Biology (Ausubel 외, eds., 1987)]에 기재된 방법, 및 블라스트(BLAST), 블라스트-2, 얼라인(ALIGN) 또는 메갈라인(Megalign)(DNASTAR) 소프트웨어를 사용하여 달성할 수 있다. 당업자는 비교되는 서열의 전체 길이에 대해 최대 정렬을 달성하는데 필요한 임의의 알고리즘을 포함하여, 정렬 측정을 위한 적절한 파라미터를 결정할 수 있다. 본 명세서에서의 목적을 위해, 주어진 아미노산 서열 B와 또는 주어진 아미노산 서열 B에 대한 주어진 아미노산 서열 A의 퍼센트(%) 아미노산 서열 동일성은 다음과 같이 계산된다: 분율(fraction) X/Y의 100 배, 여기서 X는 A와 B의 프로그램 정렬에서 서열 정렬 프로그램에 의해 동일하게 일치하는 아미노산 잔기 점수의 수이며, Y는 B에서 아미노산 잔기의 총 수이다. 아미노산 서열 A의 길이가 아미노산 서열 B의 길이와 동일하지 않은 경우, A 대 B의 퍼센트(%) 아미노산 서열 동일성은 B 대 A의 퍼센트(%) 아미노산 서열 동일성과 같지 않음을 이해할 것이다.
특정 양태에서, 서열번호 1에 따른 Bsflagellin과 50% 이상의 서열 동일성을 갖는 단백질을 제조하기 위하여 화학선택적 결찰(chemoselective ligation)기술이 이용될 수 있으며, 예를 들어 부위 특이적인 방식 및 제어된 방식으로 중합체(polymer)를 부착하는 것에 의할 수 있다. 이러한 기술은 대표적으로 화학적 수단 또는 재조합 수단 중 하나에 의해 단백질 골격 내로 화학선택적인 앵커(chemoselective anchor)가 결합하는 것과, 상보적인 링커를 운반하는 중합체로 후속적 변경하는 것에 의존한다. 결과적으로, 조립 공정 및 얻어진 단백질-중합체 결합체(protein-polymer conjugate)의 공유결합 구조는 제어되며, 그것에 따라 유효성 및 약물 동태학적 특성 등과 같은 약물 특성의 합리적 최적화가 가능하게 된다. 예컨대 PEG의 선택적인 부착을 허용함으로써 이들의 약동학적 특성을 개선한다.
본 발명의 일 양태에서, 상기 Bsflagellin 변이체는 야생형 Bsflagellin과 대비 적어도 4% 이상, 5% 이상, 10% 이상, 15% 이상, 20% 이상, 25% 이상, 30% 이상, 40% 이상, 45% 이상, 50% 이상, 55% 이상, 60% 이상, 65% 이상, 70% 이상, 75% 이상, 80% 이상, 85% 이상 또는 90% 이상 면역원성이 감소된 것일 수 있다.
본 발명의 일 양태에서, 상기 “면역원성”은 인간과 같은 동물의 체내에서 면역 반응을 유발하는 특정 물질이 체액성 및/또는 세포 매개 면역 반응을 유도하는 것을 의미한다. 이와 같은 면역원성은 치료 효과를 비활성화하고 부작용을 유발할 수 있다. 본 발명의 바람직한 일 양태에서, 상기 면역원성은 B-세포 또는 B-세포가 분비하는 항체에 의해서 인식되는 B-세포 에피토프(epitope)의 존재에 따른 B-세포 활성화를 의미하는 것일 수 있다.
본 발명의 다른 일 양태에서, 상기 Bsflagellin 변이체는 야생형 Bsflagellin 대비 생산성이 향상된 것을 특징으로 할 수 있다. 본 발명의 일 양태에서, 상기 생산성은 통상적인 재조합 단백질 제조방법에 따라 벡터로 형질전환된 숙주세포에서의 단백질 생산성을 의미하는 것일 수 있다. 바람직하게는, 동일 조건 하에서 상기 Bsflagellin 변이체는 야생형 Bsflagellin 대비 생산성이 50%, 100%, 150%, 또는 200% 이상 항상된 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명의 다른 일 양태에서, 상기 Bsflagellin 변이체는 야생형 Bsflagellin 대비 37℃에서 2주간 보관 후 단백질의 잔존율이 증가된 것을 특징으로 할 수 있다. 바람직하게는, 상기 Bsflagellin은 야생형 Bsflagellin 대비 37℃에서 2주간 보관 후 단백질의 잔존율이 적어도 50% 이상, 55% 이상, 60% 이상, 65% 이상, 70% 이상, 75% 이상, 80% 이상, 85% 이상, 90% 이상, 95% 이상 또는 100% 이상 증가된 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명의 일 양태에서, 상기 서열번호 1에 따른 플라젤린과 50% 이상의 서열 동일성을 나타내는 Bsflagellin 변이체는 야생형 Bsfalgellin의 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95% 또는 100% 수준으로 TLR5 경로를 활성화시킬 수 있으며, 또는 야생형 Bsflagellin 또는 Bsflagellin 단편과 동일하거나 또는 본질적으로 동일한 정도로 TLR5 경로를 활성화시키거나, 또는 야행성 Bsflagellin 또는 Bsflagellin 단편과 비교하여 더 높게 TLR5 경로를 활성화시킬 수 있다.
본 발명에 따른 상기 Bsflagellin 변이체는 서열번호 1에 따른 야생형의 Bsflagellin과 비교하여 동등 또는 향상된 TLR5 활성화능 및 NF-kB 신호전달 활성을 나타내면서 동시에 부가적인 이점, 예를 들어, 낮은 면역원성, 향상된 생산성, 구조 안정성, 약물동태학적 이점, 낮은 체내 독성, 저장 안정성 등을 제공할 수 있는 것을 특징으로 한다.
본 발명의 일 양태에서, 상기 Bsflagellin 변이체는 서열번호 1의 야생형 Bsflagellin 서열에서 아래 (1) 내지 (8) 중 하나 이상의 변이를 포함하는 것을 특징으로 할 수 있다:
(1) L34, S49, M52, L59, A85, I86, Q103, Q104, L118, G151, G155, D176, G191, D200, E231, D236 및 R275로 이루어진 군에서 선택된 적어도 하나의 위치에서 아미노산 치환;
(2) 아미노 말단 0 도메인(ND0, 1~32번 아미노산)의 결손;
(3) 아미노 말단 1 도메인(ND1, 43~146번 아미노산) 내 하나 이상의 아미노산의 결손;
(4) ND0 ~ ND1 인터페이스 영역(33~42번 아미노산) 내 하나 이상의 아미노산의 결손;
(5) 초가변영역(hyper variable region, HVR, 147~180번 아미노산) 내 하나 이상의 아미노산의 결손;
(6) 카르복시 말단 1 도메인(CD1, 181~235번 아미노산) 내 하나 이상의 아미노산의 결손;
(7) 카르복시 말단 0 도메인(CD0, 239~275번 아미노산) 내 하나 이상의 아미노산의 결손; 및
(8) CD1 ~ CD0 인터페이스 영역(236~238번 아미노산)의 결손.
본 발명의 일 양태에서, 상기 (1)의 아미노산 치환은 L34C, S49C, M52C, L59C, A85K, A85N, I86N, Q103A, Q104A, L118R, G151A, G155A, D176A, G191C, D200A, E231C, D236C 및 R275Q로 이루어진 군에서 선택된 적어도 하나인 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명의 일 양태에서, 상기 (3) ND1 내 하나 이상의 아미노산의 결손은 서열번호 1의 야생형 바실러스 서브틸리스 플라젤린 서열에서 43~44번 결손, 43~50번 결손, 100번 결손 및 144~146번 결손으로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 결손인 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명의 일 양태에서, 상기 (4) ND0 ~ ND1 인터페이스 영역 내 하나 이상의 아미노산의 결손은 서열번호 1의 야생형 바실러스 서브틸리스 플라젤린 서열에서 33~34번 결손, 33~41번 결손 및 33~42번 결손으로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나의 결손인 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명의 일 양태에서, 상기 (5) HVR 내 하나 이상의 아미노산의 결손은 서열번호 1의 야생형 바실러스 서브틸리스 플라젤린 서열에서 179~180번 결손, 164~179번 결손, 164~180번 결손 및 152~180번 결손으로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나의 결손인 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명의 일 양태에서, (6) CD1 내 하나 이상의 아미노산의 결손은 181~183번 결손, 181~187번 결손 및 230~235번 결손으로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 결손인 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명의 일 양태에서, 상기 (7) CD0 내 하나 이상의 아미노산의 결손은 266~275번 결손, 270~275번 결손, 239~253번 결손, 243~253번 결손, 243~260번 결손 및 239~275번 결손으로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 결손인 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명의 바람직한 일 양태에서, 상기 변이체는 상기 (2), (3) 및 (6)의 변이를 포함하고, 및 상기 (1)의 변이를 포함하거나 또는 포함하지 않는 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명의 바람직한 일 양태에서, 상기 변이체는 서열번호 1의 야생형 Bsflagellin에서 아미노 말단 0 도메인(ND0, 1~32번 아미노산)의 결손; 및 T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183의 결손을 포함하고; L34, S49, M52, L59, A85, I86, Q103, Q104, L118, G151, G155, D176, G191, D200, E231, D236 및 R275로 이루어진 군에서 선택된 적어도 하나의 위치에서 아미노산 치환을 포함하거나 포함하지 않는 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명의 바람직한 일 양태에서, 상기 변이체는 서열번호 1의 야생형 Bsflagellin에서 아미노 말단 0 도메인(ND0, 1~32번 아미노산)의 결손; 및 T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183의 결손을 포함하고; L34C, S49C, M52C, L59C, A85K, A85N, I86N, Q103A, Q104A, L118R, G151A, G155A, D176A, G191C, D200A, E231C, D236C 및 R275Q로 이루어진 군에서 선택된 적어도 하나의 아미노산 치환을 포함하거나 포함하지 않는 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명의 다른 일 양태에서, 상기 변이체는 서열번호 1의 야생형 Bsflagellin에서 상기 (2), (3), (5) 및 (6)의 변이를 포함하고, 상기 (1)의 변이를 포함하거나 또는 포함하지 않는 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명의 바람직한 일 양태에서, 상기 변이체는 서열번호 1의 야생형 Bsflagellin에서 아미노 말단 0 도메인(ND0, 1~32번 아미노산)의 결손; 및 T100, D144, G145, F146, D179, F180, A181, A182 및 T183의 결손을 포함하고; L34, S49, M52, L59, A85, I86, Q103, Q104, L118, G151, G155, D176, G191, D200, E231, D236 및 R275로 이루어진 군에서 선택된 적어도 하나의 위치에서 아미노산 치환을 포함하거나 포함하지 않는 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명의 바람직한 일 양태에서, 상기 변이체는 서열번호 1의 야생형 Bsflagellin에서 아미노 말단 0 도메인(ND0, 1~32번 아미노산)의 결손; 및 T100, D144, G145, F146, D179, F180, A181, A182 및 T183의 결손을 포함하고; L34C, S49C, M52C, L59C, A85K, A85N, I86N, Q103A, Q104A, L118R, G151A, G155A, D176A, G191C, D200A, E231C, D236C 및 R275Q로 이루어진 군에서 선택된 적어도 하나의 아미노산 치환을 포함하거나 포함하지 않는 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명의 일 양태에서 상기 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체는 다음의 변이체들로부터 선택되는 것을 특징으로 할 수 있다:
상기 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체는 다음의 변이체들로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체:
서열번호 1에서 A85K, A85N, I86N, L118R 또는 R275Q;
서열번호 1에서 1~32번 결손;
서열번호 1에서 T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183, D179 및 F180 결손;
서열번호 1에서 1~34번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
서열번호 1에서 1~41번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
서열번호 1에서 1~44번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
서열번호 1에서 1~50번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
서열번호 1에서 1~32번, 164~179번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
서열번호 1에서 1~32번, 152~187번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
서열번호 1에서 1~32번, 270~275번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
서열번호 1에서 1~32번, 266~275번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
서열번호 1에서 1~32번, 236~275번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
서열번호 1에서 1~32번, 230~275번 T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
서열번호 1에서 1~50번, 236~275번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
서열번호 1에서 1~32번, 243~253번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
서열번호 1에서 1~32번, 239~253번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
서열번호 1에서 1~32번, 243~260번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
서열번호 1에서 1~32번, 236~253번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
서열번호 1에서 서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, L34C 및 D236C;
서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, S49C 및 E231C;
서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, M26C 및 E198C;
서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, L33C 및 G191C;
서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, Q103A 및 Q104A;
서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, 및 G151A;
서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, 및 1555A;
서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, 및 D176A;
서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, 및 D200A;
서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, Q103A, Q104A 및 G155A;
서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, Q103A, Q104A 및 D176A;
서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, Q103A, Q104A 및 D200A;
서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, Q103A, Q104A, G151A 및 D176A;
서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, Q103A, Q104A, G151A 및 D200A;
서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, 및 A85N;
서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, 및 R275Q
서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, A85N 및 R275Q;
서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183, D179 및 F180 결손, 및 A85N;
서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183, D179 및 F180 결손, 및 R275Q; 및
서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183, D179 및 F180 결손, A85N 및 R275Q.
본 발명의 일 양태에서, 상기 플라젤린 변이체는 NF-kB 신호전달 활성을 보유하는 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명의 일 양태에서, 상기 플라젤린 변이체는 태그를 포함할 수 있다. 또 다른 양태에서, 상기 태그는 플라젤린 변이체의 N-말단에 부착된다. 또 다른 또 다른 양태에서, 상기 태그는 플라젤린 변이체의 C-말단에 부착된다.
상기 플라젤린 변이체는 단백질의 N-말단에 시그널(또는 리더) 서열을 포함할 수 있고, 이 서열은 번역과 동시에 또는 번역 후에 그 단백질의 이송을 지시한다. 상기 플라젤린 변이체는, 또한 단백질의 합성, 정제 또는 동정을 용이하게 하기 위해(예를 들면 폴리His), 또는 단백질의 고체 지지체에 대한 결합을 증강하기 위해, 링커 서열 또는 다른 서열과 결합(컨쥬게이트)될 수 있다.
본 발명의 상기 플라젤린 변이체에는 약학적으로 허용가능한 염의 형태가 포함이 될 수 있다. 상기 약학적으로 허용가능한 염은 예를 들어, 염산염, 황산염, 인산염, 초산염, 구연산염, 주석산염, 숙신산염, 젖산염, 말레산염, 푸마르산염, 옥살산염, 메탄술폰산염, 또는 파라톨루엔술폰산염 등을 들 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
경우에 따라서, 본 발명의 상기 플라젤린 변이체는 인산화(phosphorylation), 황화(sulfation), 아크릴화(acrylation), 당화(glycosylation), 메틸화(methylation), 파네실화(farnesylation) 등으로 수식(modification)된 전장 플라젤린 또는 이의 단편일 수도 있다.
본 발명에서, 상기 플라젤린 변이체는 다른 폴리펩타이드를 포함하는 융합 단백질의 형태일 수 있다. 예를 들어, 상기 플라젤린 변이체는 하나 이상의 항원을 포함하는 융합 단백질일 수 있다. 상기 항원의 비제한적인 예시로는 S. pneumoniae PspA1 항원, S. pneumoniae PspA2 항원, S. pneumoniae PspA3 항원, S. pneumoniae PspA4 항원, S. pneumoniae PspA5 항원 및/또는 S. pneumoniae PspA6 항원을 들 수 있다. 또는, 예를 들어, 상기 플라젤린 변이체는 하나 이상의 면역 조절성 물질이 결합된 융합 단백질의 형태일 수 있다. 상기 면역 조절성 물질은 당업계에서 면역반응을 증가시키는 것으로 알려진 것이라면 제한없이 포함될 수 있으며, 이의 비제한적인 예시로는 인터페론-α, 인터페론-β, 인터페론-γ, 인터페론-ω, 인터페론-τ, 인터류킨-1α, 인터류킨-1β, 인터류킨-2, 인터류킨-3, 인터류킨-4, 인터류킨-5, 인터류킨-6, 인터류킨-7, 인터류킨-8, 인터류킨-9, 인터류킨-10, 인터류킨-11, 인터류킨-12, 인터류킨-13, 인터류킨-14, 인터류킨-18, B세포 성장 인자, CD40 리간드, TNF- α, TNF- β, CCL25, CCL28 또는 이의 활성 단편 등을 들 수 있다.
본 발명은 또한 상기 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis) 플라젤린 변이체를 암호화하는 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드를 제공한다.
상기 폴리뉴클레오티드는 본 발명의 폴리펩타이드를 암호화할 수 있는 한 폴리뉴클레오티드를 구성하는 염기 조합이 특별히 제한되지 않는다. 상기 폴리뉴클레오티드는 DNA, cDNA 및 RNA 서열을 모두 포함하여 단쇄 또는 이중쇄의 형태의 핵산분자로서 제공될 수 있다.
본 발명은 또한 상기 폴리뉴클레오티드를 포함하는 벡터를 제공한다.
본 발명의 벡터는 플라스미드 벡터, 코즈미드 벡터, 박테리오파아지 벡터 및 바이러스 벡터 등을 포함하나 이에 제한되지 않는다. 본 발명의 벡터는 통상의 클로닝 벡터 또는 발현벡터일 수 있으며, 발현벡터는 프로모터, 오퍼레이터, 개시코돈, 종결코돈, 폴리아데닐화 시그널 및 인핸서(촉진유전자) 같은 발현 조절 서열 외에도 막 표적화 또는 분비를 위한 시그널 서열 또는 리더 서열을 포함하며 목적에 따라 다양하게 제조될 수 있다. 본 발명에 따른 상기 폴리뉴클레오티드 서열은 발현 조절 서열에 작동 가능하게 연결될 수 있으며, 상기 작동 가능하게 연결된 유전자 서열과 발현 조절 서열은 선택 마커 및 복제 개시점(replication origin)을 같이 포함하고 있는 하나의 발현 벡터 내에 포함될 수 있다. "작동 가능하게 연결(operably linked)"된다는 것은 적절한 분자가 발현 조절 서열에 결합될 때 유전자 발현을 가능하게 하는 방식으로 연결되는 것으로, 하나의 핵산 단편이 다른 핵산 단편과 결합되어 그의 기능 또는 발현이 다른 핵산 단편에 의해 영향을 받는 것을 말한다. "발현 조절 서열(expression control sequence)"이란 특정한 숙주 세포에서 작동 가능하게 연결된 폴리뉴클레오티드 서열의 발현을 조절하는 DNA 서열을 의미한다. 그러한 조절 서열은 전사를 실시하기 위한 프로모터, 전사를 조절하기 위한 임의의 오퍼레이터 서열, 적합한 mRNA 리보좀 결합 부위를 코딩하는 서열 및 전사 및 해독의 종결을 조절하는 서열을 포함한다. 또한 상기 벡터는 벡터를 함유하는 숙주 세포를 선택하기 위한 선택 마커를 포함하고, 복제 가능한 벡터인 경우 복제기원을 포함한다.
본 발명은 또한 상기 벡터로 형질전환된 숙주세포를 제공한다.
상기 벡터로 형질전환하는 것은 당업자에게 공지된 형질전환기술에 의해 수행될 수 있다. 바람직하게는 미세사출법(microprojectile bombardment), 전기충격유전자전달법(electroporation), 인산 칼슘(CaPO4) 침전, 염화칼슘(CaCl2) 침전, PEG-매개 융합법(PEG-mediated fusion), 미세주입법(microinjection) 및 리포좀 매개법(liposome-mediated method)을 이용할 수 있다.
상기 용어 '숙주세포'는 '형질전환체' 등과 호환성 있게 사용될 수 있으며, 임의의 수단(예: 전기충격법, 칼슘 포스파타제 침전법, 미세주입법, 형질전환법, 바이러스 감염 등)에 의해 세포 내로 도입된 이종성 DNA를 포함하는 원핵 또는 진핵 세포를 의미한다.
본 발명에서 상기 숙주세포는 클로닝 분야에서 통상적으로 사용되는 모든 종류의 단세포 유기체, 예컨대 각종 박테리아 (예컨대, Clostridia속, 대장균, 등) 등의 원핵세포 미생물, 효모 등의 하등 진핵세포 미생물과 곤충 세포, 식물 세포, 포유동물 등을 포함하는 고등 진핵생물 유래의 세포를 숙주세포로 사용할 수 있으며, 이에 제한되지 않는다. 숙주세포에 따라서 단백질의 발현량과 수식 등이 다르게 나타나므로, 당업자가 목적하는 바에 가장 적합한 숙주세포를 선택하여 사용할 수 있다.
본 발명은 또한 상기 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis) 플라젤린 변이체를 유효성분으로 포함하는 약학적 조성물을 제공한다.
본 발명의 일실시예에 따르면, 상기 플라젤린 변이체 및 상기 융합 단백질은 TLR5 경로의 활성화능을 나타낼 수 있다.
따라서, 본 발명의 상기 융합 단백질은 TLR5 경로의 활성화를 통해 예방, 개선 또는 치료가 가능한 것으로 공지된 질환, 증후군 등에 대하여 예방, 개선 또는 치료효과를 나타낼 수 있다.
TLR5 경로의 활성화를 통해 예방, 개선 또는 치료가 가능한 것으로 공지된 질환, 증후군은 방사선 노출에 의한 손상; 재관류 손상; 염증성 장 질환; 자가면역질환; 바이러스 감염; 노화; 면역기능 감퇴; 또는 암일 수 있다.
따라서, 본 발명의 상기 약학적 조성물은 방사선 노출에 의한 손상 예방 또는 치료용; 재관류 손상 예방 또는 치료용; 염증성 장 질환 예방 또는 치료용; 자가면역질환 예방 또는 치료용; 바이러스 감염 예방 또는 치료용; 대사 질환 예방 또는 치료용; 노화 예방 또는 치료용; 면역기능 증강용; 암 예방 또는 치료용; 간 질환 예방 또는 치료용; 또는 대장염 예방 또는 치료용 약학적 조성물인 것을 특징으로 할 수 있다.
특히, 본 발명의 상기 플라젤린 변이체는 TLR5 경로 활성화를 통해 예방, 개선 또는 치료가 가능한 것으로 향후 밝혀질 질환에 대해서도 예방, 개선 또는 치료 효과를 발휘할 것으로 이해될 수 있으므로, 본 발명의 상기 약학적 조성물의 치료 대상 질환은 그 범위가 특별히 제한되는 것은 아니다.
TLR5 경로의 활성화와 방사선 노출에 의한 손상 치료와의 관련성, TLR5 경로의 활성화와 재관류로 인한 조직 손상 치료와의 관련성, TLR5 경로의 활성화와 염증성 장 질환 치료와의 관련성, TLR5 경로의 활성화와 자가면역질환 치료와의 관련성, TLR5 경로의 활성화와 바이러스 감염 치료와의 관련성, TLR5 경로의 활성화와 노화로 인한 질환과의 관련성, TLR5 경로의 활성화와 면역 증진과의 관련성, TLR5 경로의 활성화와 면역 증진과의 관련성, TLR5 경로의 활성화와 암 치료와의 관련성은 공지된 문헌을 참고할 수 있다.
본 발명에서 상기 방사선 노출에 의한 손상은 방사선 노출에 의한 위장 증후군 또는 조혈 증후군일 수 있다.
본 발명에서 상기 노화에 의한 질환은 노화에 의한 탈모, 백내장, 탈장, 대장염, 골다공증 또는 골연화증일 수 있다.
본 발명에서 상기 암은 유방암, 폐암, 결장암, 신장 암, 간암, 난소 암, 전립선 암, 고환암, 비뇨 생식관 암, 림프계 암, 직장암, 췌장암, 식도암, 위암, 자궁 경부암, 갑상선암, 피부암, 백혈병, 급성 림프구성 백혈병, 급성 림프아구성 백혈병, B 세포 림프종, T 세포 림프종, 호지킨 림프종, 비호지킨 림프종, 모발세포 림프종, 조직구 림프종 및 버킷 림프종, 급성 및 만성 골수성 백혈병, 골수형성이상증후군, 골수성 백혈병, 전골수구백혈병, 성상세포종, 신경아세포종, 신경 교종, 신경초종, 섬유육종, 횡문근육종, 골육종, 색소성 건피증, 각질극 세포종, 정상피종, 갑상선 여포암, 기형암종, 또는 위장관의 암일 수 있다.
본 발명에서 상기 간 질환은 비알코올성 지방간, 비알코올성 지방간염, 알코올성 지방간, 간염, 간 섬유화, 간 경변, 간 부전 및 간암으로 이루어진 군에서 선택될 수 있다.
본 발명에서 상기 대사 질환은 당뇨, 대사증후군, 인슐린 저항성, 고지혈증 및 고혈압으로 이루어진 군에서 선택될 수 있다.
본 발명에서 상기 대장염은 염증성 대장 질환 또는 과민성 대장염일 수 있고, 상기 염증성 대장 질환은 궤양성 대장염 또는 크론병(Chron's disease)일 수 있다.
본 발명의 약학적 조성물은 상기 플라젤린 변이체 외에 약학적으로 허용되는 담체와 함께 당업계에 공지된 방법으로 투여경로에 따라 다양하게 제형화될 수 있다. “약학적으로 허용되는”이란 생리학적으로 허용되고 인간에게 투여될 때, 활성성분의 작용을 저해하지 않으며 통상적으로 위장 장애, 현기증과 같은 알레르기 반응 또는 이와 유사한 반응을 일으키지 않는 비독성의 물질을 말한다. 상기 담체로는 모든 종류의 용매, 분산매질, 수중유 또는 유중수 에멀젼, 수성 조성물, 리포좀, 마이크로비드 및 마이크로좀이 포함된다.
투여 경로로는 경구적 또는 비경구적으로 투여될 수 있다. 비경구적인 투여방법으로는 이에 한정되지는 않으나 정맥내, 근육내, 동맥내, 골수내, 경막내, 심장내, 경피, 피하, 복강내, 비강내, 장관, 국소, 설하 또는 직장내 투여일 수 있다.
본 발명의 약학적 조성물을 경구 투여하는 경우 본 발명의 약학적 조성물은 적합한 경구 투여용 담체와 함께 당업계에 공지된 방법에 따라 분말, 과립, 정제, 환제, 당의정제, 캡슐제, 액제, 겔제, 시럽제, 현탁액, 웨이퍼 등의 형태로 제형화될 수 있다. 적합한 담체의 예로는 락토즈, 덱스트로즈, 수크로즈, 솔비톨, 만니톨, 자일리톨, 에리스리톨 및 말티톨 등을 포함하는 당류와 옥수수 전분, 밀 전분, 쌀 전분 및 감자 전분 등을 포함하는 전분류, 셀룰로즈, 메틸 셀룰로즈, 나트륨 카르복시메틸셀룰로오즈 및 하이드록시프로필메틸셀룰로즈 등을 포함하는 셀룰로즈류, 젤라틴, 폴리비닐피롤리돈 등과 같은 충전제가 포함될 수 있다. 또한, 경우에 따라 가교결합 폴리비닐피롤리돈, 한천, 알긴산 또는 나트륨 알기네이트 등을 붕해제로 첨가할 수 있다. 나아가, 상기 약학적 조성물은 항응집제, 윤활제, 습윤제, 향료, 유화제 및 방부제 등을 추가로 포함할 수 있다.
또한, 비경구적으로 투여하는 경우 본 발명의 약학적 조성물은 적합한 비경구용 담체와 함께 주사제, 경피 투여제 및 비강 흡입제의 형태로 당 업계에 공지된 방법에 따라 제형화될 수 있다. 상기 주사제의 경우에는 반드시 멸균되어야 하며 박테리아 및 진균과 같은 미생물의 오염으로부터 보호되어야 한다. 주사제의 경우 적합한 담체의 예로는 이에 한정되지는 않으나, 물, 에탄올, 폴리올(예를 들어, 글리세롤, 프로필렌 글리콜 및 액체 폴리에틸렌 글리콜 등), 이들의 혼합물 및/또는 식물유를 포함하는 용매 또는 분산매질일 수 있다. 보다 바람직하게는, 적합한 담체로는 행크스 용액, 링거 용액, 트리에탄올 아민이 함유된 PBS(phosphate buffered saline) 또는 주사용 멸균수, 10% 에탄올, 40% 프로필렌 글리콜 및 5% 덱스트로즈와 같은 등장 용액 등을 사용할 수 있다. 상기 주사제를 미생물 오염으로부터 보호하기 위해서는 파라벤, 클로로부탄올, 페놀, 소르빈산, 티메로살 등과 같은 다양한 항균제 및 항진균제를 추가로 포함할 수 있다. 또한, 상기 주사제는 대부분의 경우 당 또는 나트륨 클로라이드와 같은 등장화제를 추가로 포함할 수 있다.
경피 투여제의 경우 연고제, 크림제, 로션제, 겔제, 외용액제, 파스타제, 리니멘트제, 에어롤제 등의 형태가 포함된다. 상기에서 “경피 투여”는 약학적 조성물을 국소적으로 피부에 투여하여 약학적 조성물에 함유된 유효한 양의 활성성분이 피부 내로 전달되는 것을 의미한다. 예컨대, 본 발명의 약학적 조성물을 주사형 제형으로 제조하여 이를 30 게이지의 가는 주사 바늘로 피부를 가볍게 단자(prick)하거나 피부에 직접적으로 도포하는 방법으로 투여될 수 있다. 이들 제형은 제약 화학에 일반적으로 공지된 처방서인 문헌(Remington's Pharmaceutical Science, 15th Edition, 1975, Mack Publishing Company, Easton, Pennsylvania)에 기술되어 있다.
흡입 투여제의 경우, 상기 플라젤린 변이체는 예를 들면, 디클로로플루오로메탄, 트리클로로플루오로메탄, 디클로로테트라플루오로에탄, 이산화탄소 또는 다른 적합한 기체를 사용하여, 가압 팩 또는 연무기로부터 에어로졸 스프레이 형태로 편리하게 전달할 수 있다. 가압 에어로졸의 경우, 투약 단위는 계량된 양을 전달하는 밸브를 제공하여 결정할 수 있다. 예를 들면, 흡입기 또는 취입기에 사용되는 젤라틴 캡슐 및 카트리지는 화합물 및 락토오즈 또는 전분과 같은 적합한 분말 기제의 분말 혼합물을 함유하도록 제형화할 수 있다.
그 밖의 약학적으로 허용되는 담체로는 공지된 문헌에 기재되어 있는 것을 참고로 할 수 있다.
또한, 본 발명에 따른 약학적 조성물은 하나 이상의 완충제(예를 들어, 식염수 또는 PBS), 카보하이트레이트(예를 들어, 글루코스, 만노즈, 슈크로즈 또는 덱스트란), 항산화제, 정균제, 킬레이트화제(예를 들어, EDTA 또는 글루타치온), 아쥬반트(예를 들어, 알루미늄 하이드록사이드), 현탁제, 농후제 및/또는 보존제를 추가로 포함할 수 있다.
또한, 본 발명의 약학적 조성물은 포유동물에 투여된 후 활성 성분의 신속, 지속 또는 지연된 방출을 제공할 수 있도록 당업계에 공지된 방법을 사용하여 제형화될 수 있다.
또한, 본 발명의 약학적 조성물은 상기 나열한 각 질환들의 예방 또는 치료하는 효과가 있는 공지의 물질과 병용하여 투여할 수 있다.
본 발명은 또한 상기 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis) 플라젤린 변이체를 유효성분으로 포함하는 백신 보조제를 제공한다.
백신보조제(adjuvant)의 가장 중요한 요건 중의 하나가 항원제공세포 표면의 공동자극 분자 발현 조절과 항원 특이적 T 세포의 유도로 인한 사이토카인 분비조절과 같은 면역조절기능을 가지고 있는 것이다.
그런데, TLR5와 같은 PRR은 숙주세포의 세포 표면 혹은 세포질 내에 분포하며, 다양한 PAMP의 자극에 의해 '선천성 면역 반응(innate immune response)'을 유도하고 나아가 '획득 면역 반응(adaptive immune response)'을 조절한다. 따라서, TLR5 작동제(agonist)들은 다양한 '면역 조절제', 특히 '백신 보조제' 개발에 적합한 표적이 될 수 있다.
따라서, TLR5 경로 활성화능이 있는 본 발명의 융합 단백질은 TLR5 경로를 활성화하여 선천성 면역 반응 및 획득 면역 반응을 증강시킴으로써, 함께 투여된 항원에 대한 숙주의 면역능이 월등히 향상될 수 있다.
본 발명이 상기 백신 보조제는 당업계에 잘 알려진 통상적인 방법으로 제조될 수 있고, 당업계에서 백신 제조 시 사용할 수 있는 여러 첨가물들을 임의로 더 포함할 수도 있다.
본 발명은 또한 방사선 노출에 의한 손상 치료용; 재관류 손상 치료용; 염증성 장 질환 치료용; 자가면역질환 치료용; 바이러스 감염 치료용; 대사 질환 치료용; 노화 치료용; 면역기능 증강용; 암 치료용; 간 질환 치료용; 또는 대장염 치료용 약학적 조성물을 제조하기 위한 제1항 내지 제13항 중 어느 한 항의 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체의 용도를 제공한다.
본 발명은 또한 제1항 내지 제13항 중 어느 한 항의 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체를 유효성분으로 포함하는 약학적 조성물의 유효량을 이를 필요로 하는 개체에 투여하는 것을 포함하는 방사선 노출에 의한 손상 치료; 재관류 손상 치료; 염증성 장 질환 치료; 자가면역질환 치료; 바이러스 감염 치료; 대사 질환 치료; 노화 치료; 면역기능 증강; 암 치료; 간 질환 치료; 또는 대장염 치료 방법을 제공한다.
본 발명의 상기 '유효량'이란 개체에게 투여하였을 때, 암 또는 암의 개선, 치료, 검출, 진단 또는 상기 질환의 억제 또는 감소 효과를 나타내는 양을 말하며, 상기 '개체'란 동물, 바람직하게는 포유동물, 특히 인간을 포함하는 동물일 수 있으며, 동물에서 유래한 세포, 조직, 기관 등일 수도 있다. 상기 개체는 상기 효과가 필요한 환자(patient) 일 수 있다.
본 발명의 상기 '치료'는 암 또는 상기 질환으로 인한 증상을 개선시키는 것을 포괄적으로 지칭하고, 이는 상기 질환을 치유하거나, 실질적으로 예방하거나, 또는 상태를 개선시키는 것을 포함할 수 있으며, 상기 질환으로부터 비롯된 한 가지 증상 또는 대부분의 증상을 완화시키거나, 치유하거나 예방하는 것을 포함하나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 명세서에서 용어 “을 포함하는(comprising)”이란 “함유하는(including)” 또는 “특징으로 하는(characterized by)”과 동일한 의미로 사용되며, 본 발명에 따른 조성물 또는 방법에 있어서, 구체적으로 언급되지 않은 추가적인 구성 성분 또는 방법의 단계 등을 배제하지 않는다. 또한 용어 “로 이루어지는(consisting of)”이란 별도로 기재되지 않은 추가적인 요소, 단계 또는 성분 등을 제외하는 것을 의미한다. 용어 “필수적으로 이루어지는(essentially consisting of)”이란 조성물 또는 방법의 범위에 있어서, 기재된 물질 또는 단계와 더불어 이의 기본적인 특성에 실질적으로 영향을 미치지 않는 물질 또는 단계 등을 포함할 수 있는 것을 의미한다.
본 발명이 제공하는 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체는 야생형과 비교하여 체내 면역원성이 감소되었을 뿐 아니라, 저장 안정성이 향상되어 TLR5 활성화에 의해 예방, 개선 또는 치료할 수 있는 질환의 치료제 개발 및/또는 백신 보조제 개발에 매우 유용하게 활용이 될 수 있다.
도 1a 내지 1c는 야생형 Bsflagellin과 본 발명의 실시예에서 제조한 Bsflagellin 변이체 단백질의 구조 모식도를 나타낸 도면이다.
도 2는 Bsflagellin 변이체인 BM-03과 야생형 Bsflagellin을 NF-kB reporter mouse에 투여한 후 NF-kB의 signal intensity를 평가한 결과이다.
이하, 본 발명을 하기 실시예에 의해 상세히 설명한다. 단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하기 위한 것일 뿐, 본 발명이 이들에 의해 제한되는 것은 아니다.
실험방법
1. 컴퓨터를 이용한 면역원성 예측 및 변이체 디자인
(1) 타겟 단백질의 서열정보를 기반으로 B-cell에 의한 면역반응을 일으킬 수 있는 지역을 예측하였다.
(2) 대표적으로 BepiPred 2.0 program에 서열정보를 대입하고 cut off 0.6 이상의 수치를 면역원성 유발 지역으로 분석하였다.
(3) Cut off를 초과하는 지역의 면적을 수학적으로 계산한 후 야생형 바실러스 플라젤린의 면역원성 값을 기준으로 상대적인 면역원성을 예측하였다.
이에 따라, 서열번호 1의 야생형 Bsflagellin에서 아래 표 1에 나타낸 변이를 포함하는 변이체를 디자인하였다:
이름 Mutation 위치(서열번호 1 기준)
Bsflagellin WT (서열번호 1)
BM01 결손: M1~S32
BM02 결손: T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183
BM03 결손: M1~S32, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183
BM04 결손: M1~S32, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183, D179, F180
BM05 결손: M1~G34, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183
BM06 결손: M1~D41, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183
BM07 결손: M1~A44, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183
BM08 결손: M1~E50, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183
BM09 결손: 1M~32S, S164~D179, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183
BM10 결손: 1M~32S, A152~D187, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183
BM11 결손: M1~S32, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183, V270~R275
BM12 결손: M1~S32, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183, Q266~R275
BM13 결손: M1~S32, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183, D236~R275
BM14 결손: M1~S32, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183, A230~R275
BM15 결손: M1~E50, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183, D236~R275
BM16 결손: M1~S32, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183 M243~S253
BM17 결손: M1~S32, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183, M239~S253
BM18 결손: M1~S32, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183, M243~L260
BM19 결손: M1~S32, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183, D236~S253
BS01 BM03의 결손 부분 + L34C, D236C
BS02 BM03의 결손 부분 + S49C, E231C
BS03 BM03의 결손 부분 + M26C, E198C
BS04 BM03의 결손 부분 + L33C, G191C
BD01 BM03의 결손 부분 + Q103A, Q104A
BD02 BM03의 결손 부분 + G151A
BD03 BM03의 결손 부분 + G155A
BD04 BM03의 결손 부분 + D176A
BD05 BM03의 결손 부분 + D200A
BD06 BM03의 결손 부분 + Q103A, Q104A, G155A
BD07 BM03의 결손 부분 + Q103A, Q104A, D176A
BD08 BM03의 결손 부분 + Q103A, Q104A, D200A
BD09 BM03의 결손 부분 + Q103A, Q104A, G151A, D176A
BD10 BM03의 결손 부분 + Q103A, Q104A, G151A, D200A
BA01 A85K
BA02 A85N
BA03 I86N
BA04 L118R
BE01 R275Q
BC01 BM03의 결손 부분 + A85N
BC02 BM03의 결손 부분 + R275Q
BC03 BM03, A85N, R275Q
BC04 BM04의 결손 부분 + A85N
BC05 BM04의 결손 부분 + R275Q
BC06 BM04의 결손 부분 + A85N, R275Q
상기 각 Bsflagellin 변이체와 야생형 Bsflagellin의 단백질 구조 모식도를 도 1에 나타내었다.
2. Gene cloning
하기 표 2에 기재한 서열을 포함하는 플라스미드를 제작하였고, 이를 이용하여 각각의 단백질을 제작하였다. 아래와 같은 순서에 따라 cloning을 진행하였다.
PCR
(1) Macrogen사에 문의하여 제작한 ORF를 맞춘 프라이머를 사용하여 야생형 바실러스 플라젤린을 Template DNA로 Site directed mutagenesis by PCR을 실시하였다.
(2) Primer 서열 및 합성하고자 하는 서열에 알맞게 PCR조건을 설정하여 PCR을 실시하였다.
PCR product preparation을 실시한 후 PCR fragment DNA에 6X Dyne loading star dye 2㎕를 첨가하고, 겔 전기영동을 통해 PCR 결과물의 크기와 band의 유무를 확인하였다.
Restriction
(1) PCR 생성물에 TaKaRa Dpn1(1235A)을 1㎕ 넣고 37°C에서 30분간 incubation을 실시한다. 30분 후 PCR prep을 실시한다.
Ligation
(1) 획득한 DNA와 vector를 섞은 mixture와 Takara DNA Ligase Kit Ver. 2.1 (6022)의 Sol1를 1:1로 총 10ul 용액을 만들어 준 후 25°C에서 30분간 incubation한다.
Transformation
(1) DH5α (RH617) 및 BL21 (DE3) (CP110) competent cell 50㎕를 15분간 녹여준 후 Ligation이 끝난 plasmid를 넣어준 후 20분간 얼음에서 incubation한다.
(2) 42℃ Heating block에서 50초 동안 열 충격을 준 후 얼음에서 5분간 incubation 시킨다.
(3) (2)의 cell에 LB 50㎕를 넣어준 후 37℃에서 30분간 incubation하여 균을 키워준다.
(4) Kanamycin(+) LB Agar plate에 (3)의 cell을 넣고 spreading한 후 18시간동안 37℃에서 incubation 한다.
(5) (4)의 plate에서 single colony를 선택하여 16시간동안 키운 후 plasmid prep을 실시한다.
(6) Prep으로 확보한 plasmid를 sequencing을 의뢰하여(Macrogen) cloning이 완료되었음을 확인하였다.
상기 표 2의 프라이머를 이용하여 제작된 단백질 및 DNA 서열을 하기 표 2에 나타냈다.
명칭 분류 서열
BM01 아미노산 서열
(서열번호 2) 		SGLRINRAGDDAAGLAISEKMRGQIRGLEMASKNSQDGISLIQTAEGALTETHAILQRMRELTVQAGNTGTQQAEDLGAIKDEMDALIEEIDGISNRTEFNGKKLLDGTNSTDGFTFQIGANAGQQLNVKIDSMSSTALGVNALDVTDFAATAFDDQLKSIDTAINTVSTQRAKLGAVQNRLEHTINNLGASGENLTAAESRIRDVDMAKEMSEFTKNNILSQASQAMLAQANQQPQNVLQLLR
BM02 아미노산 서열
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3. 단백질 발현
Culture & Cell Harvest
(1) Bsflagellin 변이체 종균 10㎕를 Kanamycin 50uM이 포함된 LB배지 10㎖에 접종한다.
(2) 37°C shaking incubator에서 170rpm으로 overnight 배양한다.
(3) Kanamycin 50uM을 포함하는 1.2L 배지에 (2)의 배양액을 9ml 넣어준다.
(4) 37°C에서 OD(600nm) 0.5~0.7의 absorbance값까지 키우고 IPTG를 final conc. 0.5mM 넣어준다.
(5) 17°C로 온도를 낮춰주고 18시간동안 단백질 발현을 유도한다.
(6) 배양이 끝나면 Centrifuge를 이용하여 8000rpm으로 7분간 pellet만을 수거한다.
4. 단백질 정제
Cell Lysis & sonication
(1) 배양 후 획득한 pellet 5g에 60ml의 cell suspension buffer (20mM Sodium phosphate, pH7.6, 150mM NaCl)를 넣고 pipette aid를 이용하여 cell을 잘 풀어준다.
(2) (1)cell을 Amp: 52%, Pulser: 2sec/1sec, Time: 23min(on time)으로 Sonication한다.
(3) Sonication이 완료된 sample은 10000rpm으로 30분간 pellet down을 실시하여 상층액을 회수한다.
IMAC (His affinity chromatography)
(1) 5ml Ni-NTA agarose resin (Qiagen, 30210)을 Econo-column(Bio-Rad, 7374252)을 washing하고 lysis된 단백질 상층액과 상온에서 2시간동안 shaking incubation을 실시한다.
(2) Imidazole 농도 차이를 이용한 washing (50mM/100mM/250mM/500mM Imidazole)과 Elution(Elution buffer; 20mM Sodium phosphate, pH7.6, 150mM NaCl, 1M Imidazole)을 진행하여 정제된 단백질을 획득한다.
(3) 각각 fraction sample을 SDS-PAGE로 target protein의 위치 및 purity를 확인한다.
(4) Target 단백질을 20mM Sodium phosphate, pH7.6, 150mM NaCl buffer로 교환한다 (10K Centricon tube사용).
His-tag cleavage & LPS removal
(1) 정제된 시료에 2㎕ Thrombin(BPS bio, 80111)을 넣어주고 37°C에서 1시간 동안 shaking incubation을 실시한다.
(2) Incubation후 Triton X-114를 1%(V/V)만큼 넣고 vortexer로 충분히 섞어주고 얼음에 박아서 10분간 incubation한다.
(3) 10분이 지나면 37°C heating block으로 옮겨주고 block에서 10분간 incubation한다.
(4) (3)의 sample을 15000rpm, 37°C, 10min 동안Centrifuge하여 Triton X 114 및 LPS를 pellet down시킨다.
(5) (2)~(4)의 과정을 2회 반복하고 최종적으로 만들어진 sample을 10배 volume의 20mM Sodium phosphate, pH7.6, 10mM NaCl buffer에 넣어서 희석시킨다.
IEX (Anion exchange chromatography)
(1) CIP후 잘 보관된 Hi-trapTm QHP 5ml column(17115301)을 Akta PURE 150 장비 연결하고 equalization buffer (20mM Sodium phosphate, pH7.6, 10mM NaCl )를 5CV이상 충분히 흘려준다.
(2) 단백질을 sample pump를 이용하여 loading 하고 equilibration 후 Salt gradient (A; 20mM Sodium phosphate, pH7.6, 10mM NaCl, B; 20mM Sodium phosphate, pH7.6, 1M NaCl) 로 Fractionation을 실시한다.
(3) 각각 fraction을 SDS-PAGE를 이용하여 sample이 있는 fraction만을 선택한다.
(4) Target sample이 있는 fraction만을 분리하고 해당 fraction만을 1X PBS pH7.4 buffer로 buffer change를 실시한다. (Dialysis tube: SnakeSkinT Dialysis Tubing, 10K MWCO, Pierce, 68100), 4°C, overnight
(5) 획득한 단백질을 nano-drop기기를 이용하여 농도를 측정한 후 획득한 단백질의 총량을 측정한 후 배양액 1L당 수득한 단백질의 양을 기록한다.
6. 단백질 생산성 분석
(1) 변이체에 따라 배양액 1L 당 획득되는 단백질의 양을 기록한다.
(2) 야생형 바실러스 플라젤린 정제시 1L 당 획득할 수 있는 단백질 양을 기준으로 상대적인 생산성을 비교 분석하여 표로 나타내었다.
7. 단백질 안정성 비교실험
(1) 단백질을 5 ㎍씩 동일한게 분주 후 37℃에서 0주, 1주, 2주 동안 incubation 한다.
(2) 각각의 일수별로 incubation한 시료는 SDS-PAGE로 단백질 패턴의 변화를 비교한다.
(3) Image J 프로그램을 이용하여 major band의 intensity 변화를 그래프화 한다.
(4) 초기 대비 Main peak area 대비 0주, 1주, 2주 후 Main peak의 잔량을 측정하여 안정성을 비교하였다.
8. NF-kB reporter mouse를 이용한 생체 내 이미징 (IVIS)
(1)물질 및 PBS를 NF-kB reporter mouse (B6.129-Gt(ROSA)26Sortm1(NF-kBp-Luciferase-dTomato)HLee 마우스에 5ug/mouse로 Subcutaneous s.c.방법으로 2주 1회로 총 6주 3회 피하에 주입하였다.
(2)물질 주입 3시간 후 형광 검출 10분-15분 이전에 Luciferin (D-Luciferin Salt lot# 122799 PerkinElmer) 150mg/kg로 intraperitoneally i.p. 방법으로 복강 내로 주입 하고 Isoflurane (아이프란액 하나제약) 2% ~ 2.5%(O2)로 호흡 마취를 진행하였다.
(3)마취 한 마우스를 IVISTM imaging system (Perkin Elmer)을 이용하여 1.5 % ~ 1.8% (O2) 마취를 유지하며 마우스의 목 부분까지 형광 검출 영상을 얻었다.
실험결과
1. 면역원성 평가
각 재조합 단백질의 면역원성 평가 결과를 아래 표 3에 나타내었다.
이름 면역원성 (WT Bsflagellin 대비%)
Bsflagellin(WT) 100
BM01 82.11
BM02 95.25
BM03 81.75
BM04 139.98
BM05 69.91
BM06 109.24
BM07 94.12
BM08 34.22
BM09 163.24
BM10 43.04
BM11 25.81
BM12 79.38
BM13 87.28
BM14 113.50
BM15 127.81
BM16 125.26
BM17 60.02
BM18 55.97
BM19 42.97
BS01 86.64
BS02 47.22
BS03 60.37
BS04 60.33
BD01 38.61
BD02 42.71
BD03 29.98
BD04 17.10
BA01 105.18
BA02 123.87
BA03 127.83
BA04 126.61
BE01 65.03
BC01 42.76
BC02 82.40
BC03 25.64
BC04 170.62
BC05 167.12
BC06 211.41
상기 제조된 각 변이체 Bsflagellin과 Bsflagellin WT의 TLR5 아고니스트 활성을 종래 보고된 방법에 따라 평가해 본 결과, 상기 변이체 Bsflagellin들은 Bsflagellin WT과 동등한 수준의 활성을 나타내는 것으로 확인되었다.
그 다음으로, Bsflagellin WT과 변이체인 BM03을 다회투여 (3차 투여) 후 NF-kB reporter mouse 내 NF-kB의 signal intensity 변화를 통해 Bsflagellin (WT) 대비 BM03의 TLR5 특이적 NF-kB 활성과 함께 중화항체 생성을 확인하고자 하였다.이에 대한 결과를 도 2에 나타내었다.
도 2에 나타낸 바와 같이, Bsflagellin WT 과 비교하였을 때 변이체인 BM03의 TLR5 특이적 NF-kB 활성이 더 높게 유지되는 것으로 확인되었다. 이를 통해, BM03이 Bsflagellin WT 대비 중화항체 형성이 낮고, 결과적으로 더 높은 TLR5 특이적 NF-kB activation 활성을 나타낸다는 것을 알 수 있었다.
2. 안정성 평가
상기 면역원성 평가 결과에서 우수한 효과를 나타낸 일부 단백질을 선택하여 안정성 평가를 수행하고, 그 결과를 아래 표 4에 나타내었다.
이름 37°C 2주 보관 후 안정성
(실험 시작 시점 대비 단백질 잔존량%)
Bsflagellin(WT) 46.7
BM03 82.2
BM08 100
BM11 100
BM12 100
BM13 99
BM14 99.3
3. 생산성 평가
상기 면역원성 평가 결과에서 우수한 효과를 나타낸 일부 단백질을 선택하여 생산성 평가를 수행하고, 그 결과를 아래 표 5에 나타내었다.
이름 생산성 (WT Bsflagellin 대비%)
BM03 250
BM06 100
BM08 336
BM10 104
BM11 273.87
BM12 470
BM13 408
BM14 290
BM15 420
BM16 400
BM18 120
BS02 201.25
본 발명이 제공하는 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체는 야생형과 비교하여 체내 면역원성이 감소되었을 뿐 아니라, 저장 안정성이 향상되어 TLR5 활성화에 의해 예방, 개선 또는 치료할 수 있는 질환의 치료제 개발 및/또는 백신 보조제 개발에 매우 유용하게 활용이 될 수 있어 산업상 이용가능성이 높다.

Claims (19)

  1. 서열번호 1의 야생형 바실러스 서브틸리스 플라젤린(Bacillus subtilis flagellin)과 적어도 50% 이상의 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하고, 상기 야생형 바실러스 서브틸리스 플라젤린 대비 면역원성이 감소된 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체.
  2. 제1항에 있어서, 상기 야생형 바실러스 서브틸리스 플라젤린 대비 37℃에서 2주간 보관 후 단백질의 잔존율이 증가된 것을 특징으로 하는 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체.
  3. 제1항에 있어서, 서열번호 1의 야생형 바실러스 서브틸리스 플라젤린 서열에서 아래 (1) 내지 (8) 중 하나 이상의 변이를 포함하는 것을 특징으로 하는 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체:
    (1) L34, S49, M52, L59, A85, I86, Q103, Q104, L118, G151, G155, D176, G191, D200, E231, D236 및 R275로 이루어진 군에서 선택된 적어도 하나의 위치에서 아미노산 치환;
    (2) 아미노 말단 0 도메인(ND0, 1~32번 아미노산)의 결손;
    (3) 아미노 말단 1 도메인(ND1, 43~146번 아미노산) 내 하나 이상의 아미노산의 결손;
    (4) ND0 ~ ND1 인터페이스 영역(33~42번 아미노산) 내 하나 이상의 아미노산의 결손;
    (5) 초가변영역(hyper variable region, HVR, 147~180번 아미노산) 내 하나 이상의 아미노산의 결손;
    (6) 카르복시 말단 1 도메인(CD1, 181~235번 아미노산) 내 하나 이상의 아미노산의 결손;
    (7) 카르복시 말단 0 도메인(CD0, 239~275번 아미노산) 내 하나 이상의 아미노산의 결손; 및
    (8) CD1 ~ CD0 인터페이스 영역(236~238번 아미노산)의 결손.
  4. 제4항에 있어서, 상기 (1)의 아미노산 치환은 L34C, S49C, M52C, L59C, A85K, A85N, I86N, Q103A, Q104A, L118R, G151A, G155A, D176A, G191C, D200A, E231C, D236C 및 R275Q로 이루어진 군에서 선택된 적어도 하나인 것을 특징으로 하는 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체.
  5. 제4항에 있어서, 상기 (3) ND1 내 하나 이상의 아미노산의 결손은 서열번호 1의 야생형 바실러스 서브틸리스 플라젤린 서열에서 43~44번 결손, 43~50번 결손, 100번 결손 및 144~146번 결손으로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 결손인 것을 특징으로 하는 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체.
  6. 제3항에 있어서, 상기 (4) ND0 ~ ND1 인터페이스 영역 내 하나 이상의 아미노산의 결손은 서열번호 1의 야생형 바실러스 서브틸리스 플라젤린 서열에서 33~34번 결손, 33~41번 결손 및 33~42번 결손으로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나의 결손인 것을 특징으로 하는 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체.
  7. 제3항에 있어서, 상기 (5) HVR 내 하나 이상의 아미노산의 결손은 서열번호 1의 야생형 바실러스 서브틸리스 플라젤린 서열에서 179~180번 결손, 164~179번 결손, 164~180번 결손 및 152~180번 결손으로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나의 결손인 것을 특징으로 하는 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체.
  8. 제3항에 있어서, 상기 (6) CD1 내 하나 이상의 아미노산의 결손은 181~183번 결손, 181~187번 결손 및 230~235번 결손으로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 결손인 것을 특징으로 하는 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체.
  9. 제3항에 있어서, 상기 (7) CD0 내 하나 이상의 아미노산의 결손은 266~275번 결손, 270~275번 결손, 239~253번 결손, 243~253번 결손, 243~260번 결손 및 239~275번 결손으로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 결손인 것을 특징으로 하는 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체.
  10. 제3항에 있어서, 상기 변이체는 상기 (2), (3) 및 (6)의 변이를 포함하고, 및 상기 (1)의 변이를 포함하거나 또는 포함하지 않는 것을 특징으로 하는 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체.
  11. 제3항에 있어서, 상기 변이체는 상기 (2), (3), (5) 및 (6)의 변이를 포함하고, 상기 (1)의 변이를 포함하거나 또는 포함하지 않는 것을 특징으로 하는 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체.
  12. 제1항에 있어서, 상기 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체는 다음의 변이체들로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체:
    서열번호 1에서 A85K, A85N, I86N, L118R 또는 R275Q;
    서열번호 1에서 1~32번 결손;
    서열번호 1에서 T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
    서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
    서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183, D179 및 F180 결손;
    서열번호 1에서 1~34번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
    서열번호 1에서 1~41번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
    서열번호 1에서 1~44번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
    서열번호 1에서 1~50번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
    서열번호 1에서 1~32번, 164~179번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
    서열번호 1에서 1~32번, 152~187번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
    서열번호 1에서 1~32번, 270~275번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
    서열번호 1에서 1~32번, 266~275번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
    서열번호 1에서 1~32번, 236~275번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
    서열번호 1에서 1~32번, 230~275번 T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
    서열번호 1에서 1~50번, 236~275번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
    서열번호 1에서 1~32번, 243~253번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
    서열번호 1에서 1~32번, 239~253번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
    서열번호 1에서 1~32번, 243~260번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
    서열번호 1에서 1~32번, 236~253번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손;
    서열번호 1에서 서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, L34C 및 D236C;
    서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, S49C 및 E231C;
    서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, M26C 및 E198C;
    서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, L33C 및 G191C;
    서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, Q103A 및 Q104A;
    서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, 및 G151A;
    서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, 및 1555A;
    서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, 및 D176A;
    서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, 및 D200A;
    서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, Q103A, Q104A 및 G155A;
    서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, Q103A, Q104A 및 D176A;
    서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, Q103A, Q104A 및 D200A;
    서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, Q103A, Q104A, G151A 및 D176A;
    서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, Q103A, Q104A, G151A 및 D200A;
    서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, 및 A85N;
    서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, 및 R275Q
    서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182 및 T183 결손, A85N 및 R275Q;
    서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183, D179 및 F180 결손, 및 A85N;
    서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183, D179 및 F180 결손, 및 R275Q; 및
    서열번호 1에서 1~32번, T100, D144, G145, F146, A181, A182, T183, D179 및 F180 결손, A85N 및 R275Q.
  13. 제1항에 있어서, 상기 플라젤린 변이체는 NF-kB 신호전달 활성을 보유하는 것을 특징으로 하는, 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체.
  14. 제1항 내지 제13항 중 어느 한 항의 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체를 암호화하는 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드.
  15. 제14항의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 벡터.
  16. 제1항 내지 제13항 중 어느 한 항의 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체를 유효성분으로 포함하는 방사선 노출에 의한 손상 예방 또는 치료용; 재관류 손상 예방 또는 치료용; 염증성 장 질환 예방 또는 치료용; 자가면역질환 예방 또는 치료용; 바이러스 감염 예방 또는 치료용; 대사 질환 예방 또는 치료용; 노화 예방 또는 치료용; 면역기능 증강용; 암 예방 또는 치료용; 간 질환 예방 또는 치료용; 또는 대장염 예방 또는 치료용 약학적 조성물.
  17. 제1항 내지 제13항 중 어느 한 항의 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체를 유효성분으로 포함하는 백신 보조제.
  18. 방사선 노출에 의한 손상 치료용; 재관류 손상 치료용; 염증성 장 질환 치료용; 자가면역질환 치료용; 바이러스 감염 치료용; 대사 질환 치료용; 노화 치료용; 면역기능 증강용; 암 치료용; 간 질환 치료용; 또는 대장염 치료용 약학적 조성물을 제조하기 위한 제1항 내지 제13항 중 어느 한 항의 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체의 용도.
  19. 제1항 내지 제13항 중 어느 한 항의 바실러스 서브틸리스 플라젤린 변이체를 유효성분으로 포함하는 약학적 조성물의 유효량을 이를 필요로 하는 개체에 투여하는 것을 포함하는 방사선 노출에 의한 손상 치료; 재관류 손상 치료; 염증성 장 질환 치료; 자가면역질환 치료; 바이러스 감염 치료; 대사 질환 치료; 노화 치료; 면역기능 증강; 암 치료; 간 질환 치료; 또는 대장염 치료 방법.
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