WO2024028949A1 - 電気泳動装置 - Google Patents
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Definitions
- the present invention relates to an electrophoresis device.
- a multi-focus capillary electrophoresis device uniform signal intensity is detected from all capillaries by irradiating a capillary array consisting of multiple capillaries arranged in a row with laser light from both ends.
- a capillary array consisting of multiple capillaries arranged in a row with laser light from both ends.
- Patent Document 1 describes an electrophoresis device that suppresses reflected return light and transmitted return light.
- a polarizer and a half-wave plate are used to suppress transmitted return light while making the laser light irradiated to the capillary array from both ends perpendicular to the capillary axis.
- the technology is disclosed.
- FIG. 12 (Example 7) of Patent Document 1 discloses a technique of irradiating laser light at an angle deviated from perpendicular to the capillary axis in order to suppress reflected return light.
- An object of the present invention is to provide an electrophoresis device that has a high degree of freedom in selecting a laser device while suppressing deterioration of analysis performance.
- the present invention provides an electrophoresis device that irradiates laser light from both ends of a capillary array in which a plurality of capillaries are arranged and detects light from the plurality of capillaries.
- An optical isolator was provided on the optical path from the light source to the capillary array.
- reflected return light can be suppressed without the need to irradiate the laser while being tilted with respect to the capillary axis, so it is possible to provide an electrophoresis device with high analytical performance. Furthermore, since transmitted return light and reflected return light can be reliably suppressed, the degree of freedom in selecting a laser device is increased.
- FIG. 1 is a schematic diagram of an electrophoresis device of this embodiment.
- FIG. 3 is a diagram showing how DNA bands separated by electrophoresis move within a capillary. A graph showing an example of a change in emission spectrum.
- FIG. 3 is a diagram schematically showing the path of laser light in the optical irradiation system of the electrophoresis device according to Example 1.
- FIG. 3 is a diagram showing how laser light enters a polarization-dependent optical isolator in the forward direction.
- FIG. 3 is a diagram showing how returning light enters a polarization-dependent optical isolator in the opposite direction.
- FIG. 3 is a diagram showing how DNA bands separated by electrophoresis move within a capillary. A graph showing an example of a change in emission spectrum.
- FIG. 3 is a diagram schematically showing the path of laser light in the optical
- FIG. 3 is a diagram showing the linear polarization state of a laser beam that irradiates a capillary array from below after entering a polarization-dependent optical isolator, and of the transmitted return light.
- FIG. 3 is a diagram showing the polarization state of laser light that irradiates the capillary array from above after entering the polarization-dependent optical isolator and the transmitted return light.
- FIG. 3 is a diagram showing an optical path followed by a laser beam that enters a polarization-independent optical isolator from the forward direction, and a polarization direction at each position viewed from the beam traveling direction.
- FIG. 3 is a diagram showing an optical path followed by return light entering a polarization-independent optical isolator from the opposite direction, and a polarization direction at each position viewed from the beam traveling direction.
- FIG. 3 is a diagram showing the linear polarization state of laser light that irradiates the capillary array from below after entering the polarization-independent optical isolator and the transmitted return light.
- FIG. 3 is a diagram showing the linear polarization state of laser light that irradiates the capillary array from above after entering the polarization-independent optical isolator and the transmitted return light.
- FIG. 1 is a schematic diagram of the electrophoresis apparatus of this embodiment.
- the electrophoresis apparatus 101 includes a capillary array 117 composed of one or more capillaries 102, a constant temperature bath 118 that keeps the capillaries 102 at a constant temperature, and a high-voltage power supply 104 that applies voltage to the capillaries 102. , a pump mechanism 103 for injecting polymer into the capillary 102, and a transport mechanism 125.
- the transport mechanism 125 is a mechanism for transporting the buffer container 121, the cleaning container 122, the waste liquid container 123, and the sample container 124 to the capillary cathode end 127.
- the capillary array 117 is formed between a load header 129 provided at one end, a capillary head 112 provided at the other end, and the load header 129 and the capillary head 112, and detects a sample electrophoresing within the capillary 102.
- a detection unit 116 is provided.
- the capillary array 117 is composed of, for example, 24 capillaries 102, and when changing the measurement method, the capillary array 117 is replaced with one having a different capillary length. Further, even if the capillary 102 is damaged or deteriorates in quality, it is replaced with a new capillary array 117.
- the capillary 102 is formed of a glass tube with an inner diameter of 50 ⁇ m and an outer diameter of 320 ⁇ m, and its surface is coated with polyimide to improve strength. However, in the detection part 116 of the capillary 102 that is irradiated with laser light, the polyimide coating is removed so that the light emitted from inside is likely to leak to the outside.
- the inside of the capillary 102 is filled with a separation medium by a pump mechanism 103 to provide a migration difference during electrophoresis.
- a polymer which is a highly viscous solution, is used as the separation medium.
- the capillary cathode ends 127 are each fixed through a metal hollow electrode 126, and the tip of the capillary 102 protrudes from the hollow electrode 126 by about 0.5 mm. Further, the hollow electrodes 126 provided in each capillary 102 are all attached to the load header 129 as one unit. Furthermore, all the hollow electrodes 126 are electrically connected to the high voltage power supply 104 mounted on the main body of the apparatus, and operate as cathode electrodes when a voltage is applied such as during electrophoresis or sample introduction.
- the capillary end opposite to the capillary cathode end 127 is bundled and bonded together by the capillary head 112.
- the capillary head 112 is connected to the block 107 in a pressure-tight and airtight manner. Then, the new polymer is filled into the capillary 102 by the pump mechanism 103. Polymer refilling in the capillary 102 is performed after each measurement to improve the performance of the measurements.
- the optical system includes a light irradiation mechanism 114 that irradiates the detection unit 116, an array holder 105 that holds the detection unit 116, a spectrometer 132 that separates the light emitted from the detection unit 116 into each wavelength, and detects the separated light. and a two-dimensional detector 115.
- the light irradiation mechanism 114 irradiates the detection unit 116, the light emitted from the detection unit 116 is spectrally separated by the spectrometer 132, and then the two-dimensional detector 115 Detect with.
- the constant temperature bath 118 is covered with a heat insulating material, and the inside thereof is controlled to a constant temperature by a heating/cooling mechanism 120. Further, the fan 119 circulates and stirs the air in the thermostatic chamber 118 to keep the temperature of the capillary array 117 uniform and constant.
- the pump mechanism 103 includes a plunger pump 106, a block 107, a check valve 108, an electric valve 113, a polymer container 109, and an anode buffer container 110.
- Block 107 is provided with a flow path that communicates plunger pump 106, polymer container 109, anode buffer container 110, and capillary array 117.
- a check valve 108 is provided in the flow path between the plunger pump 106 and the polymer container 109 to prevent backflow of the polymer.
- An electric valve 113 is provided in the flow path between the block 107 and the anode buffer container 110.
- the electric valve 113 When filling the chamber 128 of the plunger pump 106 and the capillary array 117 with polymer, the electric valve 113 is closed to prevent the buffer solution from flowing in from the anode buffer container 110. When performing electrophoresis, the electric valve 113 is opened and the anode electrode 111 and the capillary cathode end 127 are energized.
- the transport mechanism 125 includes three electric motors and a linear actuator (not shown), and is movable in three axes: vertical, horizontal, and depth directions. Furthermore, one or more containers can be placed on the moving stage 130 of the transport mechanism 125. Furthermore, the moving stage 130 is equipped with an electric grip 131, which can grip and release each container. Therefore, the buffer container 121, the cleaning container 122, the waste liquid container 123, and the sample container 124 can be transported to the load header 129 as necessary. Note that unnecessary containers are stored in a predetermined storage space within the device.
- FIG. 2 is a diagram showing how DNA bands separated by electrophoresis move within a capillary.
- the detection unit 116 of the capillary 102 is irradiated with a focused laser beam, and this laser beam has an irradiation area 702 with a predetermined width. Therefore, the signal obtained by the two-dimensional detector 115 changes from the time the DNA band 701 enters the laser beam irradiation area 702 to the time it exits the laser beam irradiation area 702. Further, since the migration direction is equal to the wavelength dispersion direction, the DNA band 701 moves in the wavelength dispersion direction while passing through the laser beam irradiation region 702. Therefore, the emission spectrum 703 of the signal obtained by the two-dimensional detector 115 apparently changes as shown in FIG.
- FIG. 3 is a graph showing an example of changes in the emission spectrum.
- the spectral shift as shown in FIG. 3 provides the same effect as the wavelength of the emission spectrum 703 changing over time while the DNA band 701 passes through the laser beam irradiation region 702.
- electrophoresis multiple fluorescent dyes are used, and each fluorescent dye is associated with four types of bases. Therefore, when the emission spectrum 703 apparently changes, it becomes impossible to make the observed emission spectrum 703 completely correspond to each fluorescent dye or each base (matrix conversion). That is, when performing matrix conversion into each component of the emission spectrum 703, a pseudo signal that is a residual component that cannot be converted is generated. False signals cause a decline in the discrimination ability of fluorescent dyes and misdiagnosis. When the laser beam irradiation area 702 becomes wider, the false signal due to the spectral shift becomes larger.
- the light irradiation mechanism 114 in this embodiment includes a laser unit 201 that is a light source that oscillates a laser beam 202, a beam splitter 205 that splits the laser beam 202 into two, and a reflection mirror 203 that changes the path of the laser beam 202. It has a condensing lens 206 that condenses the laser beam 202.
- a polarization dependent optical isolator 204 is inserted on the optical path between the laser unit 201 and the beam splitter 205.
- each laser beam 202 split by the beam splitter 205 is guided below the capillary array by the reflecting mirror 203, and the other is guided above the capillary array by the reflecting mirror 203. Furthermore, each laser beam 202 enters from the upper end or lower end of the capillary array after being focused by a condensing lens 206, and the fluorescence emitted from the detection unit 116 of each capillary 102 is detected by a two-dimensional detector 115. be done.
- a capillary array is composed of 24 capillaries 102, and each capillary 102 is fixed in line with the reference base 207 in the detection unit 116.
- a virtual plane formed by the central axis (capillary axis) of each capillary on the reference base 207 is called a capillary arrangement plane, and a virtual straight line perpendicular to each capillary axis on the capillary arrangement plane is called an optical axis 208. call.
- the capillary array is composed of 24 capillaries 102, but the number of capillaries 102 is not limited to 24.
- FIG. 5A is a diagram showing how laser light enters the polarization-dependent optical isolator in the forward direction
- FIG. 5B is a diagram showing how returning light enters the polarization-dependent optical isolator in the reverse direction.
- the polarization-dependent optical isolator 204 includes a first polarizer 302a, a second polarizer 302b, and a Faraday rotator 301 located between the first polarizer 302a and the second polarizer 302b. be done.
- the second polarizer 302b is installed with its transmission axis tilted by 45 degrees with respect to the first polarizer 302a.
- the Faraday rotator 301 rotates the polarization direction 303 by a constant angle regardless of the incident direction or the polarization direction.
- a Faraday rotator 301 that rotates the polarization direction by 45 degrees is used.
- the rotation direction of the polarization direction 303 rotated by the Faraday rotator 301 for incident light in the forward direction is opposite to the rotation direction of the polarization direction 303 rotated by the Faraday rotator 301 for incident light in the reverse direction. direction.
- the laser beam when the laser beam enters the polarization-dependent optical isolator 204 from the forward direction, the laser beam passes through the first polarizer 302a, and then the polarization direction is rotated by 45 degrees by the Faraday rotator 301. and enters the second polarizer 302b. Since the second polarizer 302b has a transmission axis tilted at 45 degrees, the laser beam passes through the second polarizer 302b.
- the returned light when the returned light enters the polarization-dependent optical isolator 204 from the opposite direction, the returned light passes through the second polarizer 302b and then passes through the Faraday rotator 301 in the forward direction.
- the polarization direction is rotated by 45 degrees in the opposite direction, and the light is incident on the first polarizer 302a. Since the polarization direction of the returned light at this time is perpendicular to the transmission axis of the first polarizer 302a, the returned light is blocked by the first polarizer 302a.
- FIG. 6 is a conceptual diagram showing transmitted return light and reflected return light when a capillary array is irradiated with laser light.
- the incident light on the capillary array is shown slightly tilted from the direction perpendicular to the capillary axis for convenience.
- the laser beam 202 When the laser beam 202 is incident on the capillary array, reflection of the laser beam 202 occurs at the interface between the air and the outer wall of the capillary, and at the interface between the inner wall of the capillary and the gel. In particular, at the former interface, since the refractive index is large, the reflected light intensity becomes large. Since there are two interfaces between the air and the capillary outer wall for each capillary, in a capillary array consisting of 24 capillaries, reflections at the interface between the air and the capillary outer wall occur a total of 48 times. When the reflected return light 401 from the capillary array reaches the laser unit 201, which is a light source, laser oscillation by the laser unit 201 becomes unstable.
- the transmitted light that passes through the capillary array and is emitted from the side opposite to the incident side is the transmitted return light 402.
- This transmitted return light 402 is attenuated by the reflected light compared to the incident light.
- laser oscillation by the laser unit 201 becomes unstable.
- FIG. 7A is a diagram showing the linear polarization state of the laser light that irradiates the capillary array from below after entering the polarization-dependent optical isolator and the transmitted return light.
- the xy plane in FIG. 7A is a plane perpendicular to the traveling direction of the laser beam, and shows the linear polarization state at each position (the same applies to FIGS. 7B, 9A, and 9B). Further, in FIG. 7A, illustration of the mirror is omitted, and the beam splitter position is shown as point A.
- the laser light emitted from the laser unit 201 enters the polarization-dependent optical isolator 204 in a linearly polarized state in the x-axis direction.
- the laser light incident on the polarization-dependent optical isolator 204 is incident in the forward direction, and therefore passes through with the linearly polarized light rotated by 45 degrees, as shown in FIG. 5A.
- the laser light that has passed straight through the beam splitter (point A) enters the capillary array 117 from below with its polarization angle of 45°.
- the transmitted return light that has passed through the capillary array 117 continues to follow the other laser path and then enters the polarization-dependent optical isolator 204 again, but since it is incident in the opposite direction, the first The light is blocked by the polarizer 302a.
- the reflected return light is not shown in FIG. 7A, since it enters the polarization-dependent optical isolator 204 at the same polarization angle while following the path of the incident light, it is blocked in the same way as the transmitted return light.
- FIG. 7B is a diagram showing the polarization state of the laser light that irradiates the capillary array from above after entering the polarization-dependent optical isolator and the transmitted return light.
- the laser beam emitted from the laser unit 201 enters the polarization-dependent optical isolator 204 in a linearly polarized state in the x-axis direction, and the polarization-dependent optical isolator 204 enters the polarization-dependent optical isolator 204 in a state in which the linearly polarized light is rotated by 45 degrees. pass through.
- the laser beam reflected by the beam splitter (point A) enters the capillary array 117 from above with its polarization angle of 45°.
- the transmitted return light that has passed through the capillary array 117 follows the other laser path and then enters the polarization-dependent optical isolator 204 again, but is blocked by the first polarizer 302a as in the case of FIG. 7A.
- the reflected return light is not shown in FIG. 7B, since it enters the optical isolator at the same polarization angle while following the path of the incident light, it is blocked in the same way as the transmitted return light.
- the polarization-dependent optical isolator of this embodiment plays the role of reliably blocking returned light even if the state of linearly polarized light is disrupted by irradiation of the capillary array with laser light. Therefore, it is also possible to use a laser unit with low resistance to returned light, increasing the degree of freedom in selecting a laser device. Furthermore, since the optical axes of the laser beams that are irradiated onto the capillary array from both ends are coaxial and perpendicular to the capillary axis, the irradiation area of the laser beams is narrowed, and pseudo signals due to spectral shifts can be reduced. As a result, the sample separation performance of the electrophoresis device is improved.
- the optical irradiation system of the electrophoresis device according to Example 2 will be explained using FIGS. 8A to 9B.
- the light irradiation mechanism 114 in this embodiment has a polarization-independent optical isolator 801 as an optical isolator, unlike in the first embodiment.
- the polarization-independent optical isolator 801 includes a first birefringent crystal 803a, a second birefringent crystal 803b, and a first birefringent crystal 803a and a second birefringent crystal. It is composed of a Faraday rotator 301 located between the crystals 803b, a half-wave plate 802 located between the first birefringent crystal 803a and the second birefringent crystal 803b, and a pinhole plate 804.
- the same Faraday rotator 301 as in Example 1 is used, but in this example, a half-wave plate 802 is also used.
- the half-wave plate 802 also rotates the polarization direction by 45 degrees.
- the direction of rotation of the polarization direction 303 rotated by the half-wave plate 802 for incident light in the forward direction and the direction of rotation of the polarization direction 303 rotated by the half-wave plate 802 for incident light in the reverse direction are Faraday rotations.
- the orientation is the same.
- FIG. 8A is a diagram showing the optical path followed by a laser beam that enters the polarization-independent optical isolator from the forward direction and the polarization direction at each position viewed from the beam traveling direction.
- the laser beam 202 traveling in the forward direction passes through the pinhole of the pinhole plate 804 and enters the first birefringent crystal 803a.
- the first birefringent crystal 803a separates the laser beam 202 into an ordinary ray 806 and an extraordinary ray 807 whose polarization directions differ by 90 degrees due to the difference in refractive index in each axis direction.
- Each light beam is rotated by 45 degrees by the Faraday rotator 301, and then further rotated by 45 degrees in the same direction by the half-wave plate 802, so that the polarization direction is rotated by a total of 90 degrees, and then by the second birefringent crystal 803b. be recombined.
- FIG. 8B is a diagram showing the optical path followed by the return light that enters the polarization-independent optical isolator from the opposite direction, and the polarization direction at each position viewed from the beam traveling direction.
- the returned light 808 traveling in the opposite direction enters the second birefringent crystal 803b, it is separated into an ordinary ray 806 and an extraordinary ray 807.
- Each light beam is rotated by 45 degrees by the half-wave plate 802, and then rotated by 45 degrees in the opposite direction by the Faraday rotator 301, so that the light beam enters the first birefringent crystal 803a while the polarization direction remains in its original state. do.
- each light beam in the first birefringent crystal 803a is the same as after passing through the second birefringent crystal 803b, each light beam remains separated without being recombined and remains in the first birefringent crystal 803a. , and is blocked by a pinhole plate 804.
- FIG. 9A is a diagram showing the linear polarization state of the laser light that irradiates the capillary array from below after entering the polarization-independent optical isolator and the transmitted return light. Since the laser light that has entered the polarization-independent optical isolator 801 is incident in the forward direction, it passes through the polarization-independent optical isolator 801, as shown in FIG. 8A. The laser light that has passed straight through the beam splitter (point A) enters the capillary array 117 from below.
- the transmitted return light that has passed through the capillary array 117 continues to follow the other laser path and then enters the polarization-independent optical isolator 801 again, but since it is incident in the opposite direction, it is not connected to the pinhole as shown in FIG. 8B.
- the light is blocked by a plate 804. Note that although the reflected return light is not shown in FIG. 9A, after following the path of the incident light, it enters the polarization-independent optical isolator 801 again, and is blocked similarly to the transmitted return light.
- FIG. 9B is a diagram showing the linear polarization state of the laser light that irradiates the capillary array from above after entering the polarization-independent optical isolator and the transmitted return light.
- the laser light incident on the polarization-independent optical isolator 801 passes through the polarization-independent optical isolator 801.
- the laser beam reflected by the beam splitter (point A) enters the capillary array 117 from above.
- the transmitted return light that has passed through the capillary array 117 continues to follow the other laser path and then enters the polarization-independent optical isolator 801 again, but is blocked by the pinhole plate 804 .
- the reflected return light is not shown in FIG. 9B, after following the path of the incident light, it enters the polarization-independent optical isolator 801 again, and is blocked similarly to the transmitted return light.
- the polarizer blocks light other than a specific polarization angle, so the effect of suppressing the returned light is high.
- dependent optical isolators as well, a certain degree of effect of suppressing the return light can be expected. That is, according to this embodiment as well, it becomes possible to use a laser unit with low resistance to returned light, and the degree of freedom in selecting a laser device increases. Furthermore, since the laser beam irradiation area is narrow and false signals due to spectral shifts can be reduced, the sample separation performance of the electrophoresis device is also improved.
- the present invention is not limited to the embodiments described above, and various modifications are possible.
- the number of optical isolators is set to one by providing an optical isolator on the optical path from the light source to the beam splitter. It is also possible to have a configuration in which
- Electrophoresis apparatus 102... Capillary, 103... Pump mechanism, 104... High voltage power supply, 105... Array holder, 106... Plunger pump, 107... Block, 108... Check valve, 109... Polymer container, 110... Anode buffer Container, 111...Anode electrode, 112...Capillary head, 113...Electric valve, 114...Light irradiation mechanism, 115...Two-dimensional detector, 116...Detection unit, 117...Capillary array, 118...Thermostat, 119...Fan, 120 ... heating and cooling mechanism, 121 ... buffer container, 122 ... cleaning container, 123 ...
- waste liquid container 124 ... sample container, 125 ... transport mechanism, 126 ... hollow electrode, 127 ... capillary cathode end, 128 ... chamber, 129 ... load header, 130...Moving stage, 131...Grip, 201...Laser unit, 202...Laser light, 203...Reflection mirror, 204...Polarization dependent optical isolator, 205...Beam splitter, 206...Condenser lens, 207...Reference base, 208... Optical axis, 301... Faraday rotator, 302a... first polarizer, 302b... second polarizer, 303... polarization direction, 401... reflected return light, 402... transmitted return light, 701...
- DNA band 702... irradiation Region, 703... Emission spectrum, 801... Polarization independent optical isolator, 802... Half-wave plate, 803a... First birefringent crystal, 803b... Second birefringent crystal, 804... Pinhole plate, 806... Ordinary ray , 807...Abnormal ray, 808...Return light
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Abstract
本発明の目的は、分析性能の劣化を抑制しつつ、レーザ装置の選定自由度が高い電気泳動装置を提供することにある。そのために、本発明は、複数のキャピラリを並べたキャピラリアレイの両端からレーザ光を照射し、複数のキャピラリからの光を検出する電気泳動装置であって、前記レーザ光の光源から前記キャピラリアレイまでの光路上に、光アイソレータを設けた。これにより、キャピラリ軸に対して傾いた状態でレーザを照射させなくても、反射戻り光が抑制できるため、分析性能の高い電気泳動装置が提供可能となる。また、透過戻り光と反射戻り光を確実に抑制できるため、レーザ装置の選定自由度が高くなる。
Description
本発明は、電気泳動装置に関する。
マルチフォーカス方式のキャピラリ電気泳動装置では、1列に並べられた複数キャピラリからなるキャピラリアレイにレーザ光を両端から照射することで、全キャピラリから均一な信号強度を検出する。このようなマルチフォーカス方式の場合、キャピラリからの反射戻り光および透過戻り光が光源であるレーザユニットに戻る可能性があり、結果として、レーザ発振が不安定化し、分析性能に悪影響を及ぼすこともある。
特許文献1には、反射戻り光や透過戻り光を抑制する電気泳動装置が記載されている。例えば、特許文献1の図11(実施例6)では、キャピラリアレイへ両端から照射されるレーザ光をキャピラリ軸と垂直にしつつ、透過戻り光を抑制するために、偏光子および半波長板を用いる技術を開示している。また、特許文献1の図12(実施例7)では、反射戻り光を抑制するために、キャピラリ軸に対して垂直からずれた角度でレーザ光を照射する技術を開示している。
特許文献1の図11の技術では、キャピラリアレイ通過時にレーザ光の偏光状態が崩れた場合、半波長板を通過した後の光にも偏光角度のばらつきが生じ、一部の成分は偏光子を通過するため、透過戻り光についても、完全に遮光することは困難である。さらに、同技術では、反射戻り光を抑制することが困難であるため、戻り光への耐性の強いレーザユニットを用いる必要があり、レーザ装置の選定の自由度が低い。また、特許文献1の図12の技術では、キャピラリ軸に対して傾いた状態でレーザが照射されるので、レーザ光の照射領域が広くなり、スペクトルシフトによる疑似信号が発生する可能性がある。疑似信号が発生すると、電気泳動装置のサンプル分離性能が劣化する。
本発明の目的は、分析性能の劣化を抑制しつつ、レーザ装置の選定自由度が高い電気泳動装置を提供することにある。
前述の課題を解決するために、本発明は、複数のキャピラリを並べたキャピラリアレイの両端からレーザ光を照射し、複数のキャピラリからの光を検出する電気泳動装置であって、前記レーザ光の光源から前記キャピラリアレイまでの光路上に、光アイソレータを設けた。
本発明によれば、キャピラリ軸に対して傾いた状態でレーザを照射させなくても、反射戻り光が抑制できるため、分析性能の高い電気泳動装置が提供可能となる。また、透過戻り光と反射戻り光を確実に抑制できるため、レーザ装置の選定自由度が高くなる。
本発明の実施形態に係る電気泳動装置の構成について、図1を用いて説明する。図1は、本実施形態の電気泳動装置の概略図である。図1に示すように、電気泳動装置101は、1本以上のキャピラリ102により構成されるキャピラリアレイ117と、キャピラリ102を恒温に保つ恒温槽118と、キャピラリ102に電圧を印加する高圧電源104と、キャピラリ102内にポリマーを注入するポンプ機構103と、搬送機構125と、を備える。なお、搬送機構125は、バッファ容器121、洗浄容器122、廃液容器123およびサンプル容器124を、キャピラリ陰極端127に搬送するため機構である。
キャピラリアレイ117は、一端に設けられたロードヘッダ129と、他端に設けられたキャピラリヘッド112と、ロードヘッダ129とキャピラリヘッド112との間に形成されてキャピラリ102内を電気泳動するサンプルを検出する検出部116と、を有する。また、キャピラリアレイ117は、例えば24本のキャピラリ102で構成され、測定手法を変更する場合、異なるキャピラリ長さを有するもの交換される。また、キャピラリ102に破損や品質の劣化が見られた場合にも、新品のキャピラリアレイ117に交換される。
キャピラリ102は、内径50μm、外径320μmのガラス管で形成され、強度を向上させるために表面がポリイミドでコーティングされている。ただし、キャピラリ102のうち、レーザ光が照射される検出部116は、内部の発光が外部に漏れやすいように、ポリイミド被膜が除去されている。キャピラリ102の内部は、電気泳動時に泳動差を与えるための分離媒体が、ポンプ機構103によって充填される。本実施形態では、分離媒体として、高粘性溶液であるポリマーが用いられる。
キャピラリ陰極端127は、それぞれ金属製の中空電極126を通して固定されており、キャピラリ102先端が中空電極126から0.5mm程度突き出た状態になっている。また、キャピラリ102毎に装備された中空電極126は、すべてが一体となってロードヘッダ129に装着される。さらに、すべての中空電極126は、装置本体に搭載されている高圧電源104と導通しており、電気泳動やサンプル導入など電圧が印加される際に陰極電極として動作する。
キャピラリ陰極端127と反対側のキャピラリ端部は、キャピラリヘッド112により1つに束ねられて接着されている。キャピラリヘッド112は、ブロック107に耐圧気密で接続される。そして、ポンプ機構103により、キャピラリ102内に新規ポリマーが充填される。キャピラリ102中のポリマー詰め替えは、測定の性能を向上させるために測定ごとに実施される。
光学系は、検出部116を照射する光照射機構114と、検出部116を保持するアレイホルダ105と、検出部116内の発光を各波長に分光する分光器132と、分光された光を検出する2次元検出器115と、で構成される。電気泳動により分離されたキャピラリ102中のサンプルを検出するときは、光照射機構114で検出部116を照射し、検出部116からの発光を分光器132で分光した上で、2次元検出器115で検出する。
恒温槽118は、断熱材で覆われており、加熱冷却機構120によって、その内部が一定の温度に制御される。また、ファン119が、恒温槽118内の空気を循環および攪拌させ、キャピラリアレイ117の温度を均一かつ一定に保つ。
ポンプ機構103は、プランジャーポンプ106と、ブロック107と、逆止弁108と、電動バルブ113と、ポリマー容器109と、陽極バッファ容器110と、で構成される。ブロック107には、プランジャーポンプ106、ポリマー容器109、陽極バッファ容器110およびキャピラリアレイ117を連通させる流路が設けられる。プランジャーポンプ106とポリマー容器109の間の流路には、ポリマーの逆流を防ぐ逆止弁108が設けられる。ブロック107と陽極バッファ容器110の間の流路には、電動バルブ113が設けられる。プランジャーポンプ106のチャンバー128およびキャピラリアレイ117へのポリマー充填の際は、電動バルブ113が閉じることで、陽極バッファ容器110からバッファ液が流入するのを防ぐ。電気泳動を実施する際は、電動バルブ113が開き、陽極電極111とキャピラリ陰極端127が通電される。
搬送機構125は、図示しない3つの電動モータとリニアアクチュエータを備えており、上下、左右および奥行き方向の3軸に移動可能である。また、搬送機構125の移動ステージ130には、1つ以上の容器を載せることができる。さらに、移動ステージ130には、電動のグリップ131が備えられており、各容器を掴むことや放すことができる。このため、バッファ容器121、洗浄容器122、廃液容器123およびサンプル容器124を、必要に応じて、ロードヘッダ129まで搬送できる。なお、不必要な容器は、装置内の所定収容所に保管されている。
ここで、スペクトルシフトによる疑似信号の概要について説明する。図2は、電気泳動によって分離されたDNAバンドがキャピラリ内を移動する状態を示す図である。キャピラリ102の検出部116には、集光されたレーザ光が照射されるが、このレーザ光は、所定の幅の照射領域702を有する。従って、DNAバンド701がレーザ光の照射領域702に入ってから出るまでの間、2次元検出器115によって得られる信号は、変化する。また、泳動方向は波長分散方向に等しいため、DNAバンド701は、レーザ光の照射領域702を通過する間、波長分散方向に移動する。したがって、2次元検出器115によって得られる信号の発光スペクトル703は、見かけ上、図3に示すように変化する。
図3は、発光スペクトルの変化の例を示すグラフである。図3のようなスペクトルシフトは、DNAバンド701がレーザ光の照射領域702を通過する間に、発光スペクトル703の波長が経時変化するのと同様の効果を与える。電気泳動法では、複数の蛍光色素を使用し、それぞれの蛍光色素が4種類の塩基に対応付けられている。従って、発光スペクトル703が見かけ上変化すると、観測された発光スペクトル703を各蛍光色素あるいは各塩基に完全に対応させる(マトリックス変換する)ことが不可能になる。すなわち、発光スペクトル703の各成分にマトリックス変換するとき、変換不可能な残渣成分である疑似信号が生じる。疑似信号は、蛍光色素の識別能力の低下や誤診断の原因となる。レーザ光の照射領域702が広くなると、スペクトルシフトによる疑似信号が大きくなる。
図4は、実施例1に係る電気泳動装置の光学照射系における、レーザ光の経路を模式的に示した図である。本実施例における光照射機構114は、レーザ光202を発振する光源であるレーザユニット201と、レーザ光202を2つに分岐するビームスプリッタ205と、レーザ光202の経路を変える反射ミラー203と、レーザ光202を集光する集光レンズ206と、を有する。レーザユニット201からビームスプリッタ205までの間の光路上には、偏光依存型光アイソレータ204が挿入されている。ビームスプリッタ205で分岐されたレーザ光202のうち、一方は、反射ミラー203によってキャピラリアレイの下方側に導かれ、他方は、反射ミラー203によってキャピラリアレイの上方側に導かれる。さらに、各レーザ光202は、集光レンズ206で集光された後に、キャピラリアレイの上端または下端から入射し、各キャピラリ102の検出部116から発せられる蛍光が、2次元検出器115にて検出される。
なお、図4ではキャピラリ102が5本のみ示されているが、本実施例では、24本のキャピラリ102でキャピラリアレイが構成され、各キャピラリ102が検出部116において基準ベース207に並べて固定されている。本明細書では、基準ベース207上の各キャピラリの中心軸(キャピラリ軸)が形成する仮想平面をキャピラリ配列平面と呼び、キャピラリ配列平面にあって各キャピラリ軸に垂直な仮想直線を光軸208と呼ぶ。なお、本実施例では24本のキャピラリ102でキャピラリアレイを構成しているが、キャピラリ102の本数は24本に限定されない。
図5Aおよび図5Bを用いて、偏光依存型光アイソレータ204の遮光原理を示す。図5Aは、偏光依存型光アイソレータにレーザ光が順方向に入射する様子を示す図であり、図5Bは、偏光依存型光アイソレータに戻り光が逆方向に入射する様子を示す図である。偏光依存型光アイソレータ204は、第1の偏光子302aと、第2の偏光子302bと、第1の偏光子302aと第2の偏光子302bの間に位置するファラデー回転子301と、で構成される。ここで、第2の偏光子302bは、第1の偏光子302aに対して透過軸が45°傾いた状態で設置される。また、ファラデー回転子301は、入射方向や偏光方向に関わらず、偏光方向303を一定角度回転させる。本実施例では、偏光方向を45°回転させるファラデー回転子301が用いられる。ただし、順方向の入射光に対してファラデー回転子301が回転させる偏光方向303の回転方向と、逆方向の入射光に対してファラデー回転子301が回転させる偏光方向303の回転方向と、は反対向きとなる。
図5Aに示すように、レーザ光が偏光依存型光アイソレータ204に順方向から入射する場合、レーザ光は、第1の偏光子302aを透過した後、ファラデー回転子301で偏光方向が45°回転し、第2の偏光子302bに入射する。第2の偏光子302bは、透過軸が45°傾いているので、レーザ光は第2の偏光子302bを通過する。
一方、図5Bに示すように、戻り光が偏光依存型光アイソレータ204に逆方向から入射する場合、戻り光は、第2の偏光子302bを透過した後、ファラデー回転子301で順方向の場合と逆方向に偏光方向が45°回転し、第1の偏光子302aに入射する。このときの戻り光の偏光方向は、第1の偏光子302aの透過軸と垂直となるため、戻り光が第1の偏光子302aによって遮光される。
ここで、反射戻り光と透過戻り光の概略について、図6を用いて説明する。図6は、キャピラリアレイにレーザ光を照射したときの透過戻り光と反射戻り光を示す概念図である。図6では、キャピラリアレイからの透過光と反射光を判り易くするため、キャピラリアレイへの入射光を、便宜上、キャピラリ軸に対して垂直な方向から若干傾けて示している。
キャピラリアレイにレーザ光202が入射すると、空気とキャピラリ外壁の界面、キャピラリ内壁とゲルの界面、においてレーザ光202の反射がそれぞれ発生する。特に、前者の界面においては、屈折率が大きいために、反射光強度が大きくなる。空気とキャピラリ外壁の界面は、1本のキャピラリについて2つ存在するので、24本からなるキャピラリアレイでは、空気とキャピラリ外壁の界面における反射は合計48回発生する。このキャピラリアレイからの反射戻り光401が光源であるレーザユニット201に届くと、レーザユニット201によるレーザ発振が不安定になる。
また、キャピラリアレイを透過し、入射側とは反対側から放出される透過光が、透過戻り光402である。この透過戻り光402は、入射光に比べて、反射光の分だけ、減衰している。この透過戻り光402がレーザユニット201に届くと、レーザユニット201によるレーザ発振が不安定になる。
図7Aは、偏光依存型光アイソレータに入射後キャピラリアレイに対して下方から照射するレーザ光と、その透過戻り光の直線偏光状態を示す図である。図7Aのxy平面は、レーザ光の進行方向に対して垂直な平面であり、各位置における直線偏光状態を示している(図7B、図9Aおよび図9Bも同様)。また、図7Aでは、ミラーの図示は省略し、ビームスプリッタ位置をA点として示している。レーザユニット201を出射したレーザ光は、x軸方向の直線偏光状態で偏光依存型光アイソレータ204に入射する。偏光依存型光アイソレータ204に入射したレーザ光は、順方向の入射となるため、図5Aに示すように、直線偏光が45°回転した状態で通過する。ビームスプリッタ(A点)を直進したレーザ光は、偏光角度45°のままキャピラリアレイ117に下方から入射する。キャピラリアレイ117を通過した透過戻り光は、そのまま他方のレーザ経路を辿った後に再び偏光依存型光アイソレータ204に入射するが、逆方向の入射となるため、図5Bに示すように、第1の偏光子302aによって遮光される。なお、反射戻り光は、図7Aに示していないが、入射光の経路を辿りながら同じ偏光角度で偏光依存型光アイソレータ204に入射するため、透過戻り光と同様に遮光される。
図7Bは、偏光依存型光アイソレータに入射後キャピラリアレイに対して上方から照射するレーザ光と、その透過戻り光の偏光状態を示す図である。図7Aの場合と同様、レーザユニット201を出射したレーザ光は、x軸方向の直線偏光状態で偏光依存型光アイソレータ204に入射し、直線偏光が45°回転した状態で偏光依存型光アイソレータ204を通過する。ビームスプリッタ(A点)で反射されたレーザ光は、偏光角度45°のままキャピラリアレイ117に上方から入射する。キャピラリアレイ117を通過した透過戻り光は、他方のレーザ経路を辿った後に再び偏光依存型光アイソレータ204に入射するが、図7Aの場合と同様、第1の偏光子302aによって遮光される。なお、反射戻り光は、図7Bに示していないが、入射光の経路を辿りながら同じ偏光角度で光アイソレータに入射するため、透過戻り光と同様に遮光される。
本実施例では、キャピラリアレイへの照射時にレーザ光の偏光状態が崩れ、戻り光の偏光角度にばらつきが生じた場合でも、図5Bに示すように、偏光角度45°の直線偏光のみが第2の偏光子302bを通過して、ファラデー回転子301に入射することになる。また、ファラデー回転子301では、戻り光の偏光方向が順方向の場合と逆方向に回転されるので、戻り光が第1の偏光子302aにより遮光される。すなわち、本実施例の偏光依存型光アイソレータは、キャピラリアレイへのレーザ光の照射によって直線偏光の状態が崩れたとしても、戻り光を確実に遮光する役割を果たしている。したがって、戻り光への耐性の低いレーザユニットを用いることも可能となり、レーザ装置の選択自由度が高まる。また、キャピラリアレイへ両端から照射されるレーザ光の光軸が、同軸であり、かつ、キャピラリ軸に垂直であるため、レーザ光の照射領域が狭くなり、スペクトルシフトによる擬似信号が低減できる。その結果、電気泳動装置のサンプル分離性能が向上する。
実施例2に係る電気泳動装置の光学照射系について、図8A~図9Bを用いて説明する。本実施例における光照射機構114は、光アイソレータとして、実施例1と異なり、偏光無依存型光アイソレータ801を有する。
偏光無依存型光アイソレータ801は、図8Aおよび図8Bに示すように、第1の複屈折結晶803aと、第2の複屈折結晶803bと、第1の複屈折結晶803aと第2の複屈折結晶803bの間に位置するファラデー回転子301と、第1の複屈折結晶803aと第2の複屈折結晶803bの間に位置する半波長板802と、ピンホール板804と、で構成される。
ここで、ファラデー回転子301は、実施例1と同様のものが用いられるが、本実施例では、半波長板802も用いられる。半波長板802も、ファラデー回転子301と同様に、偏光方向を45°回転させる。しかし、順方向の入射光に対して半波長板802が回転させる偏光方向の回転方向と、逆方向の入射光に対して半波長板802が回転させる偏光方向303の回転方向とは、ファラデー回転子301の場合と異なり、同じ向きとなる。
図8Aは、偏光無依存型光アイソレータに順方向から入射するレーザ光が辿る光路と、ビーム進行方向から見た各位置における偏光方向と、を示す図である。順方向に進むレーザ光202は、ピンホール板804のピンホールを通過し、第1の複屈折結晶803aに入射する。第1の複屈折結晶803aは、各軸方向の屈折率差により、偏光方向が90°異なる常光線806と異常光線807にレーザ光202を分離する。本実施例では、常光線806の偏光が図8Aの面と垂直方向になるものとする。各光線は、ファラデー回転子301によって45°回転された後、半波長板802によって同方向に45°さらに回転されることで、偏光方向が合計90°回転され、第2の複屈折結晶803bによって再結合される。
図8Bは、偏光無依存型光アイソレータに逆方向から入射する戻り光が辿る光路と、ビーム進行方向から見た各位置における偏光方向と、を示す図である。逆方向に進む戻り光808は、第2の複屈折結晶803bに入射すると、常光線806と異常光線807に分離される。各光線は、半波長板802によって45°回転された後、ファラデー回転子301によって逆方向に45°回転されることで、偏光方向が元の状態のまま、第1の複屈折結晶803aに入射する。しかし、第1の複屈折結晶803aにおける各光線の偏光方向は、第2の複屈折結晶803b通過後と同じであるため、各光線は再結合せずに分離したまま第1の複屈折結晶803aを通過し、ピンホール板804によって遮光される。
図9Aは、偏光無依存型光アイソレータに入射後キャピラリアレイに対して下方から照射するレーザ光と、その透過戻り光の直線偏光状態を示す図である。偏光無依存型光アイソレータ801に入射したレーザ光は、順方向の入射となるため、図8Aに示すように、偏光無依存型光アイソレータ801を通過する。ビームスプリッタ(A点)を直進したレーザ光は、キャピラリアレイ117に下方から入射する。キャピラリアレイ117を通過した透過戻り光は、そのまま他方のレーザ経路を辿った後に再び偏光無依存型光アイソレータ801に入射するが、逆方向の入射となるため、図8Bに示すように、ピンホール板804によって遮光される。なお、反射戻り光は、図9Aに示していないが、入射光の経路を辿った後に再び偏光無依存型光アイソレータ801に入射し、透過戻り光と同様に遮光される。
図9Bは、偏光無依存型光アイソレータに入射後キャピラリアレイに対して上方から照射するレーザ光と、その透過戻り光の直線偏光状態を示す図である。図9Aの場合と同様、偏光無依存型光アイソレータ801に入射したレーザ光は、偏光無依存型光アイソレータ801を通過する。その後、ビームスプリッタ(A点)で反射したレーザ光は、キャピラリアレイ117に上方から入射する。キャピラリアレイ117を通過した透過戻り光は、そのまま他方のレーザ経路を辿った後に再び偏光無依存型光アイソレータ801に入射するが、ピンホール板804によって遮光される。なお、反射戻り光は、図9Bに示していないが、入射光の経路を辿った後に再び偏光無依存型光アイソレータ801に入射し、透過戻り光と同様に遮光される。
実施例1の偏光依存型光アイソレータの場合、戻り光がばらついていても偏光子によって特定の偏光角度以外の光が遮光されるため、戻り光の抑制効果は高いが、本実施例の偏光無依存型光アイソレータの場合も、戻り光の抑制効果は一定程度期待できる。すなわち、本実施例によっても、戻り光への耐性の低いレーザユニットを用いることが可能となり、レーザ装置の選択自由度が高まる。また、レーザ光の照射領域が狭く、スペクトルシフトによる擬似信号が低減できるため、電気泳動装置のサンプル分離性能も向上する。
本発明は、前述した各実施例に限定されるものではなく、様々な変形が可能である。例えば、前述の各実施例では、光源からビームスプリッタまでの光路上に光アイソレータを設けることで、光アイソレータの個数を1つとしているが、ビームスプリッタで分岐された後の光路上にそれぞれ光アイソレータを設ける構成であっても良い。
101…電気泳動装置、102…キャピラリ、103…ポンプ機構、104…高圧電源、105…アレイホルダ、106…プランジャーポンプ、107…ブロック、108…逆止弁、109…ポリマー容器、110…陽極バッファ容器、111…陽極電極、112…キャピラリヘッド、113…電動バルブ、114…光照射機構、115…2次元検出器、116…検出部、117…キャピラリアレイ、118…恒温槽、119…ファン、120…加熱冷却機構、121…バッファ容器、122…洗浄容器、123…廃液容器、124…サンプル容器、125…搬送機構、126…中空電極、127…キャピラリ陰極端、128…チャンバー、129…ロードヘッダ、130…移動ステージ、131…グリップ、201…レーザユニット、202…レーザ光、203…反射ミラー、204…偏光依存型光アイソレータ、205…ビームスプリッタ、206…集光レンズ、207…基準ベース、208…光軸、301…ファラデー回転子、302a…第1の偏光子、302b…第2の偏光子、303…偏光方向、401…反射戻り光、402…透過戻り光、701…DNAバンド、702…照射領域、703…発光スペクトル、801…偏光無依存型光アイソレータ、802…半波長板、803a…第1の複屈折結晶、803b…第2の複屈折結晶、804…ピンホール板、806…常光線、807…異常光線、808…戻り光
Claims (5)
- 複数のキャピラリを並べたキャピラリアレイの両端からレーザ光を照射し、複数のキャピラリからの光を検出する電気泳動装置であって、
前記レーザ光の光源から前記キャピラリアレイまでの光路上に、光アイソレータが設けられたことを特徴とする電気泳動装置。 - 請求項1に記載の電気泳動装置において、
前記キャピラリアレイへ両端から照射される前記レーザ光の光軸が、同軸であり、キャピラリ軸に垂直かつキャピラリアレイの配列平面に平行あることを特徴とする電気泳動装置。 - 請求項1に記載の電気泳動装置において、
前記光源から発振された前記レーザ光を2つに分岐するビームスプリッタと、
分岐された前記レーザ光を前記キャピラリアレイの一方側および他方側へ導くミラーと、を有し、
前記光源から前記ビームスプリッタまでの光路上に、前記光アイソレータが設けられたことを特徴とする電気泳動装置。 - 請求項1に記載の電気泳動装置において、
前記光アイソレータは、第1の偏光子と、第2の偏光子と、前記第1の偏光子と前記第2の偏光子の間に位置するファラデー回転子と、を有する偏光依存型光アイソレータであることを特徴とする電気泳動装置。 - 請求項1に記載の電気泳動装置において、
前記光アイソレータは、第1の複屈折結晶と、第2の複屈折結晶と、前記第1の複屈折結晶と前記第2の複屈折結晶の間に位置するファラデー回転子と、前記第1の複屈折結晶と前記第2の複屈折結晶の間に位置する半波長板と、を有する偏向無依存型光アイソレータであることを特徴とする電気泳動装置。
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---|---|---|---|---|
JP2004144479A (ja) * | 2001-09-28 | 2004-05-20 | Hitachi Ltd | マルチキャピラリアレイ電気泳動装置 |
JP2005030830A (ja) * | 2003-07-09 | 2005-02-03 | Nippon Sheet Glass Co Ltd | 蛍光分析用光合分波器、蛍光分析用光学モジュール、蛍光分析装置、蛍光・光熱変換分光分析装置、及び蛍光分析用チップ |
JP2006133726A (ja) * | 2004-10-06 | 2006-05-25 | Kanagawa Acad Of Sci & Technol | 酸化物材料、光磁気デバイス、ファラデー回転係数制御方法、磁気抵抗効果素子、磁気メモリ素子、残留磁化制御方法及び保持力制御方法 |
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2022
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Patent Citations (3)
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