WO2023247607A1 - Fatp2 in t-zellen als zielmolekül zur behandlung von juveniler idiopathischer arthritis in kindern - Google Patents

Fatp2 in t-zellen als zielmolekül zur behandlung von juveniler idiopathischer arthritis in kindern Download PDF

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WO2023247607A1
WO2023247607A1 PCT/EP2023/066764 EP2023066764W WO2023247607A1 WO 2023247607 A1 WO2023247607 A1 WO 2023247607A1 EP 2023066764 W EP2023066764 W EP 2023066764W WO 2023247607 A1 WO2023247607 A1 WO 2023247607A1
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WO
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fatp2
protein
antibody
active ingredient
cells
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PCT/EP2023/066764
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Klaus Tenbrock
Kim Ohl
Bas Vastert
Jorg VAN LOOSDREGT
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Rheinisch-Westfälische Technische Hochschule (Rwth) Aachen
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    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2500/00Screening for compounds of potential therapeutic value
    • G01N2500/10Screening for compounds of potential therapeutic value involving cells

Definitions

  • the present invention relates to the role of the FATP2 protein (Fatty Acid Transport Protein 2) in T cells in the development of autoimmune diseases, in particular rheumatism, rheumatoid arthritis, juvenile idiopathic arthritis, chronic inflammatory bowel diseases such as ulcerative colitis and Crohn's disease, multiple sclerosis , and other autoimmune diseases with T-cell involvement.
  • the present invention particularly relates to methods for identifying compounds that bind to FATP2 protein and to the use of FATP2 protein to screen and identify FATP2-interacting and FATP2-inhibiting compounds.
  • the present invention further relates to pharmaceutical compositions for use in the treatment of autoimmune diseases, in particular pharmaceutical compositions comprising active ingredients that bind to and/or inhibit the FATP2 protein.
  • autoimmune diseases affect approximately 5 to 8% of the population worldwide. They are associated with high morbidity and premature mortality; After cardiovascular and tumor diseases, they represent the third most common group of diseases.
  • systemic autoimmune diseases include rheumatic joint inflammation; they concern as juvenile Idiopathic arthritis (JIA) affects around 20,000 children and rheumatoid arthritis affects around 1.5 million adults in Germany. Both diseases are autoimmune diseases of unknown origin that cause intermittent chronic inflammation of the joints.
  • JIA juvenile Idiopathic arthritis
  • T cells In addition to the cells of the innate immune system such as neutrophils and monocytes, which trigger the inflammatory processes, cells of the adaptive immune system such as T cells also determine the chronic inflammatory reactions in the joints.
  • T cells T cells play a role. These are mainly found in tissue and are not always amenable to immunosuppression.
  • T cells regulatory T cells
  • the metabolism of T cells in patients with (childhood) rheumatism differs significantly from that of healthy individuals; There is a fundamental dysregulation of fatty acid metabolism in patients with childhood rheumatism, especially in the inflamed joint. This particularly affects the memory T cells, which make up up to 95% of the T cells in the inflamed joint.
  • T cells The functions of memory T cells are determined by metabolic conditions, which can also be accompanied by a reprogramming of their functions (so-called “metabolic reprogramming”). For the necessary energy metabolism, T cells essentially use the three energy resources glucose, glutamine and fatty acids. The transport proteins for neither glutamine nor fatty acids have yet been clearly identified and defined. The metabolic properties of memory T cells differ significantly from the properties of naive and effector T cells (Geltink et al. 2018). Resting na ⁇ ve T cells utilize oxidative metabolism to efficiently produce energy; they absorb glucose at a very low rate to provide the energy necessary to maintain their operational metabolic functions.
  • Na ⁇ ve T cells use pyruvate from glucose breakdown to generate ATP via oxidative phosphorylation or fatty acid oxidation.
  • Activated T cells have to proliferate and therefore switch to an anabolic growth program so that they can carry out their effector functions.
  • the predominant metabolic state of activated T cells is aerobic glycolysis, which is characterized by the fact that pyruvate from glucose breakdown is converted into lactate, even though there is sufficient oxygen for one complete glucose oxidation is available (Geltink et al. 2018). This process, known as the “Warburg effect” from previous studies in tumor biology, is a common feature of actively proliferating cells. After effector cells have completed their tasks, they either die or transform into memory T cells.
  • Memory T cells form the “immunological memory” of the immune system in that they respond to a repeated encounter with the antigen with a stronger immune reaction (“secondary immune response”).
  • second immune response The signal transduction and metabolic pathways that regulate the generation of memory T cells are therefore of great interest.
  • Mitochondrial fatty acid oxidation is necessary for the development of CD8+ memory T cells and is dependent on tumor necrosis factor (TNF) receptor-associated factor-6 (TRAF6) (Pearce et al. 2009).
  • TNF tumor necrosis factor
  • TRF6 tumor necrosis factor-6
  • Fatty acid oxidation generates acetyl coenzyme A (CoA), which can be further metabolized in the citric acid cycle, as well as FADEL and NADH+H + , which can be used directly to generate adenosine triphosphate (ATP) via the electron transport chain.
  • Free fatty acids are energy-rich molecules, and fatty acid oxidation may represent a preferred energy source for memory T cells (“Tmem”) because they rely on metabolic pathways dependent on oxidative phosphorylation. Additionally, greater mitochondrial content confers a bioenergetic advantage to memory T cells by enhancing the rapid immune response in response to re-infection.
  • CD8-positive memory T cells In contrast to effector T cells, which are particularly dependent on glycolysis, CD8-positive memory T cells therefore have a higher respiratory reserve capacity and rely primarily on fatty acid oxidation.
  • tissue-resident CD8-positive memory T cells genes encoding fatty acid-binding proteins (FABP4 and FABP5) are among the most highly upregulated genes, as is the gene encoding CD36, a so-called “lipid-scavenger cell -surface receptor” (Pan et al. 2017).
  • the data on CD4-positive T cells with regard to their fatty acid metabolism are still sparse.
  • ACC1 a rapid! enzyme of fatty acid biosynthesis
  • an object underlying the present invention was to provide methods and means for identifying active ingredients, compounds and compositions, and their use in the treatment of autoimmune diseases.
  • the present application discloses the identification of a new molecular target molecule (“targets”) for the therapy of autoimmune diseases.
  • targets a new molecular target molecule
  • the fatty acid transport protein 2 FATP2, Fatty Acid Transport Protein 2
  • SLC27A2 SLC27A2 gene
  • fatty acid transport protein-2 (FATP2) has so far been detected in the liver, small intestine, kidney, pancreas, and placenta (Falcon et al. 2010; Perez et al. 2020; Khan et al. 2020).
  • the protein is encoded by Solute Carrier Family 27 Member 2"(SLC27A2')-G&n and has two main functions, long chain activation Fatty acids as a “very long-chain acyl-coenzyme A (CoA)” synthetase (ACSVL), and the transport of coenzyme A-activated long-chain fatty acids as a fatty acid transport protein (Falcon et al. 2010; Khan et al. 2020; Melton et al. 2013).
  • the transport molecule FATP2 was developed by Falcon et al. (2010) has been linked to the development of non-alcoholic fatty liver disease in mice. Other studies suggest that the molecule may be partially responsible for the pathogenesis of diabetic kidney disease (Khan et al. 2020). It was further shown that upregulation of the expression of the SLC27A2 gene or the FATP2 protein in differentiated thyroid carcinomas can be associated with increased proliferation and migration of tumor cells (Feng et al. 2021), and that the FATP2 protein in Tumors may be involved in the reprogramming of neutrophils (Veglia et al. 2019).
  • W02020/172510 discloses methods for tumor therapy by inhibiting, blocking or downregulating FATP2 in MDSCs (Myeloid-derived Suppressor Celis, myeloid suppressor cells), a heterogeneous population of immature and pathologically activated myeloid cells found in tumor patients accumulate in large quantities, suppress the activity and proliferation of T cells and natural killer (NK) cells, and promote the growth of tumors through this immunosuppressive effect.
  • MDSCs Myeloid-derived Suppressor Celis, myeloid suppressor cells
  • NK natural killer
  • the present application discloses the SLC27A2 gene or the FATP2 protein for the first time as a target molecule and thus a new therapeutic approach for the development of therapeutics for the treatment of patients with autoimmune diseases.
  • T cell function offers for the first time the possibility of specifically influencing this T cell function and reprogramming it by changing metabolism.
  • T cells have been the receptor/transporter of free fatty acids, which, along with glucose, are an essential source of energy, especially in inflamed tissue represent, not known.
  • the fatty acid transport protein identified as FATP2 is upregulated 10-fold in T cells in inflamed joints of patients, for example with childhood rheumatism, compared to the blood of the same patients and healthy controls. It has also been shown that in memory T cells that are made to proliferate, FATP2 expression is upregulated 30-fold, and at the same time the cells' fatty acid uptake increases massively.
  • the present invention provides methods and means for identifying drugs, compounds and compositions for use in the treatment of autoimmune diseases, in particular for identifying highly effective drugs, compounds and compositions for use in the treatment of rheumatism, rheumatoid arthritis, juvenile idiopathic arthritis, chronic Inflammatory bowel diseases including ulcerative colitis and Crohn's disease, multiple sclerosis, and other autoimmune diseases with T-cell involvement.
  • a further object of the present invention was to provide a method for identifying an active ingredient that binds to and/or inhibits the FATP2 protein or a fragment thereof.
  • a further object of the present invention is to provide pharmaceutical compositions containing these agents and methods for preparing such pharmaceutical compositions based on the findings described above.
  • FIG. 1 shows that T cells present in the synovial fluid of juvenile idiopathic arthritis (JIA) patients have increased fatty acid uptake that is associated with increased expression of FATP2/SLC27A2.
  • the fatty acid receptor FATP2 is mainly expressed in CD4+ memory cells.
  • Fig. 1A Uptake of free fatty acids into CD4+ T cells from the blood or synovium of JIA patients. The measurement was carried out after incubating the cells for 15 minutes with BodipyeTMFL C 12 (2 pM) and subsequent flow cytometric analysis. The mean fluorescence intensity (MFI) is shown minus the respective FMO control (AMFI). Data show mean expression in 4 patients ⁇ standard error, **p ⁇ 0.01.
  • Fig. 1B FATP2 protein expression in CD4+ T cells from the peripheral blood (PB) or the synovium (SF) of JIA patients (flow cytometry analysis). A representative image is shown.
  • Fig. 1 C Expression of SLC27A2 RNA in CD4 + T cells of the synovium of JIA patients compared to the blood of the same patients.
  • Fig. ID Protein expression of FATP2 in CD4+ T cell subtypes (effector memory T cells (Tem), tissue resident memory T cells (T m ) and naive T cells (Tnaive)) from the blood or synovium of JIA patients (flow cytometric analysis).
  • the mean fluorescence intensity (MFI) is shown minus the respective FMO control (AMFI).
  • Data show mean expression in 5 patients ⁇ standard error, ***p ⁇ 0.001. ****p ⁇ 0.0001.
  • Fig. IE mRNA expression of FATP2 compared to other metabolic proteins in CD4+ memory T cells after 48 hours and 72 hours of stimulation with anti-CD3 and anti-CD28 antibodies and in unstimulated CD4+ memory T cells.
  • the CD4+ memory T cells were isolated from the blood of healthy controls using magnetic cell separation. Data show the mean expression of 4 experiments with different donors ⁇ standard error, **p ⁇ 0.01, ***p ⁇ 0.001.
  • Figure 2 shows that the FATP2 inhibitor Lipofermata inhibits fatty acid uptake in CD4+ T cells and inhibits IFN- ⁇ expression and proliferation without inducing apoptosis.
  • Fig. 2A Uptake of free fatty acids in CD4+ T cells after addition of Lipofermata in increasing concentrations (0, 2, 5, 7.5 and 10 pM).
  • the cells were stimulated with anti-CD3 and anti-CD28 antibodies for 48 hours.
  • the measurement was carried out after incubating the cells for 15 minutes with BodipyeTM FL C12 (2 pM) and subsequent flow cytometric analysis.
  • the mean fluorescence intensity (MFI) is shown minus the respective FMO control (AMFI). Data show mean expression measured in 3 experiments ⁇ standard error.
  • Fig. 2B Exemplary histogram of fatty acid uptake in CD4+ T cells without the addition of Lipofermata (right) and after the addition of Lipofermata (left).
  • Fig. 2C Percentage number of IFN- ⁇ positive CD4 + T cells after addition of Lipofermata in increasing concentrations (0, 2, 5, 7.5 and 10 pM). The cells were kept for 48 hours stimulated with anti-CD3 and anti-CD28 antibodies. The determination of IFN- ⁇ positive cells was carried out after 5 hours of restimulation with PMA and ionomycin in the presence of GolgiPlugTM using flow cytometry. Data show mean expression measured in 5-6 experiments ⁇ standard error, *p ⁇ 0.01.
  • Fig. 2D Exemplary dot diagram of IFN- ⁇ expression without addition of Lipofermata (left, control) and after addition of Lipofermata (right).
  • Fig. 2E Percentage of proliferated CD4 + T cells after addition of Lipofermata in increasing concentrations (0, 2, 5, 7.5 and 10 pM). For this purpose, the cells were stained with “cell proliferation dye eFlourTM” and stimulated with anti-CD3 and anti-CD28 antibodies for 48 hours. Proliferated cells were determined using flow cytometry. Data show mean expression measured in 5 experiments ⁇ standard error, *p ⁇ 0.01.
  • Fig. 2F Exemplary dot diagram of cell proliferation without addition of Lipofermata (left, control) and after addition of Lipofermata (right).
  • Fig. 2G Exemplary dot diagram of dead cells with Lipofermata treatment (right) and without (left, control). For this purpose, the cells were stimulated for 72 hours with anti-CD3 and anti-CD28 antibodies and stained with propidium iodide (PI) for flow cytometry to see live/dead differentiation.
  • PI propidium iodide
  • the present invention relates to a method for inhibiting or reducing fatty acid uptake into a T cell, the activation and/or the proliferation of a T cell, the method comprising at least one step selected from the group consisting of
  • T cells refers to cells including T precursor cells, T lymphocytes, cytotoxic (possibly CD8-positive) T cells, (possibly CD4-positive) T “helpers” cells (Th cells), Th 1 cells, Th2 cells, Th3 cells, Th9 cells, Thl7 cells, Th22 cells, Tfh cells, memory T cells, regulatory T cells (Treg) , suppressor T cells (Tsup), “natural killer” T cells (NKT cells), naive T cells, activated T cells, mucosa-associated invariant T cells, alpha-beta T cells, gamma -Delta T-cells, thymocytes, double-positive (CD4/CD8-positive) thymocytes, primary T-cells, mature immunocompetent T-cells, autoreactive T-cells, peripheral T-cells, synovial T-cells, and T- Cell lines.
  • the said inhibition or reduction of the 6ZC 742 gene expression can, for example, be a 6ZC 742 gene “knock-down”, a “knock-out”, a conditional “gene knock-out”, a gene change or mutation in the sense of an insertion, Deletion and/or substitution, a gene modification using a gene editing system, RNA interference, siRNA and/or antisense RNA.
  • the term “gene editing system” or “gene editing systems” refers to molecular biology techniques for targeted modification of DNA, for example the SLC27A2 gene.
  • the classic gene editing systems include, for example, zinc finger nucleases (ZFNs), transcription activator-like effector nucleases (T ALENs), the CRISPR/Cas method, the CRISPR/Cpfl system and so-called meganucleases.
  • ZFNs zinc finger nucleases
  • T ALENs transcription activator-like effector nucleases
  • CRISPR/Cas method the CRISPR/Cpfl system and so-called meganucleases.
  • the specific recognition of DNA occurs in zinc finger muclease, TALEN and meganuclease by a specific protein part, while in CRISPR systems it is mediated by a specific RNA (Zhu and Zhu, 2022).
  • Zinc finger nucleases are artificially produced restriction enzymes. They contain a zinc finger domain that binds to DNA and a nuclease domain that cuts the DNA. The zinc finger domain can be engineered to recognize a specific DNA sequence.
  • TALENs are fusion proteins composed of a Z4Z-£ ⁇ ector DNA-binding domain and an endonuclease domain.
  • the sequence-specific binding occurs through the DNA-binding domain introduced during protein design, after which a sequence-specific cut is carried out by the endonuclease.
  • the CRISPR/Cas method ⁇ Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeals". Genes are inserted, removed or switched off using the CRISPR/Cas system, as well as nucleotides in a gene are changed.
  • the DNA-cutting Q/.s enzyme binds a specific RNA sequence. This RNA sequence is followed by another RNA -Sequence that can bind to a DNA with a complementary sequence via base pairing.
  • the RNA serves as a bridge between Cas and the DNA to be cut.
  • the complexation of Cas, the RNA and the DNA creates the DNA-cutting /.s enzyme brought into the spatial proximity of the bound DNA, whereupon the enzyme cuts the (indirectly bound) DNA.
  • DNA is inserted into the interface, another DNA is added, which has overlapping sequences at both ends for one of the two ends of the interface having.
  • the DNA to be inserted is connected to the ends of the interface through the cell's own DNA repair (Nidhi et al. 2021).
  • the endonucleases mentioned are used to introduce targeted changes in the genome of individual cells or complex organisms.
  • the enzymes cut double-stranded DNA at a predetermined target sequence, creating double-strand breaks.
  • the double strand breaks in turn activate DNA repair processes in the cell, such as “Non-homologous end-joining” (NHEJ) or homologous repair, which is also known as “homology directed repair” (HDR).
  • NHEJ Non-homologous end-joining
  • HDR can be used to specifically insert defined mutations or entire DNA sections into the genome.
  • Genome editing can be used to specifically destroy a gene (gene “knockout”), to introduce a gene at a specific location in the genome (gene “knockin”), or to introduce a point mutation in a gene.
  • base editing is a new precise method of genome editing, which consists of changing individual bases in the DNA sequence).
  • a mutated form of the Cas9 nuclease which can no longer cut DNA, is coupled with a deaminase in the form of a fusion protein.
  • This fusion protein is able to specifically create a desired DNA sequence using an sgRNA (“single-guide” RNA). recognize and change a base through deamination.
  • sgRNA single-guide” RNA
  • Cas9 can be coupled with an adenosine deaminase so that the adenosine is converted to inosine, which is replaced with guanosine after DNA repair and replication.
  • the base pair AT is converted into GC (Zhu and Zhu, 2022).
  • RNA interference is a natural mechanism in eukaryotic cells that serves to specifically switch off genes in the cell nucleus. It allows so-called “gene silencing”. RNA interference is based on an interaction of short pieces of RNA with the mRNA involving several enzyme complexes. As a result of the activity of these enzyme complexes, the mRNA is split into several fragments, destroying the encoded information and preventing translation into a protein.
  • RNA small interfering RNA
  • Antisense RNA is a single-stranded RNA that is complementary to a protein-coding mRNA. Almost all antisense RNAs have secondary structures such as “stem-loops” and sometimes also more complex tertiary structures such as “pseudoknots” between these secondary structures. These structural elements determine the rate of degradation by intracellular ribonucleases as well as the rate at which the antisense RNA pairs with the complementary mRNA. Mating stops the translation of the gene.
  • Said inhibition or reduction of FATP2 (fatty acid transport protein 2) protein activity may include the use of an agent that binds to the FATP2 protein and/or inhibits or reduces its activity.
  • said T cell is a synovial T cell, particularly preferably a synovial memory T cell.
  • the FATP2 protein can be a mammalian, non-primate, primate and in particular a human FATP2 protein or a fragment thereof.
  • the present invention relates to a method for identifying an active ingredient that binds to the FATP2 protein of a T cell, or a fragment thereof, and/or the activity of the FATP2 protein of a T cell, or a fragment of it, inhibited or reduced.
  • the procedure includes at least the following steps:
  • the active ingredient to be screened and identified according to the present invention is a FATP2 inhibitor or FATP2 antagonist, an agent that inhibits or reduces the activity of the FATP2 protein, or a fragment thereof.
  • the active ingredient according to the present invention can be selected from the group consisting of a low molecular weight compound, a peptide, in particular a natural or synthetic peptide or peptide derivative, and a biologic or biological active ingredient.
  • the term "low molecular weight compound”, “small molecule”("smol") or “chemical drug” refers to an organic compound of low molecular weight ( ⁇ 10,000 daltons, especially ⁇ 1,000 daltons), often of size on the order of 1 nm. Many drugs are small molecules. Such small molecules can regulate a biological process. Small molecules may be able to inhibit a specific function of a protein. In the field of pharmacology, the term “small molecule” refers specifically to molecules that bind to specific biological macromolecules and act as an effector by altering the activity or function of a target. For example, acetylsalicylic acid (ASA) is considered a low molecular weight compound that measures 180 Daltons and 21 atoms. Such low molecular weight compounds often have little ability to trigger an immune response and remain relatively stable over time.
  • ASA acetylsalicylic acid
  • the low molecular weight compound according to the present invention may contain, for example, alkyl, alkenyl, alkynyl, alkoxy, aryl, alkylene, arylene, amino, halogen, carboxylate derivative, cycloalkyl, among other chemical backbones, substituents, groups or residues. , carbonyl derivative, heterocycloalkyl, heteroaryl, heteroarylene, sulfonate, sulfate, phosphonate, phosphate, phosphine, phosphine oxide groups.
  • biological is preferably an antibody, or an antigen-binding fragment thereof, or an antigen-binding derivative thereof, or an antibody-like molecule or protein, or an aptamer, or a nucleic acid.
  • the active ingredient is a member of a “library” of connections.
  • the “library” (mixture) of compounds can e.g. B. include low molecular weight compounds, natural or synthetic peptides or peptide derivatives, or biologics or biological active ingredients or biological compounds.
  • (combinatorial) compound library or “library of compounds” refers to collections of chemical compounds, small molecules, natural or synthetic peptides or peptide derivatives, or macromolecules such as proteins or other biologics each containing a large number of related chemical, peptide or biological species of molecules that can be used together in particular screening assays or identification steps.
  • compound libraries molecular libraries of low-molecular chemical compounds
  • high-throughput Screening of the compounds for interaction with the target molecule
  • These methods also include so-called “focus libraries”, highly annotated and pre-selected chemical molecule libraries (Wassermann et al. 2014), DNA-encoded libraries of chemical compounds (Martin et al. 2020), and chemoinformatics-based virtual molecule libraries (Saldivar -Gonzalez et al. 2020).
  • phage display technologies to identify suitable “small molecule” active ingredients has been described, for example, by Takakusagi et al., 2020.
  • Numerous other peptide and antibody “display” technologies such as “Bacterial Display”, “Yeast Surface Display” and “Mammalian Surface Display” as well as “Ribosome Display” are described in Valldorf et al.,
  • the biologic is an antibody, an antigen-binding one Fragment thereof, an antigen-binding derivative thereof, an antibody-like molecule or protein, an aptamer, or a nucleic acid.
  • the FATP2 protein is bound to a solid phase or is in solution.
  • the present invention relates to the use of a nucleic acid encoding the FATP2 protein or a fragment thereof, or the use of the FATP2 protein or a fragment thereof, in a method of identification an active ingredient that binds to the FATP2 protein or a fragment thereof and/or inhibits or reduces the activity of the FATP2 protein or a fragment thereof.
  • a nucleic acid which encodes the FATP2 protein or a fragment thereof is cloned into a suitable expression vector, e.g. a suitable expression plasmid, as described (Green and Sambrook 2012).
  • the recombinant expression protein is introduced by transfection into a cell suitable for the expression of the FATP2 protein or a fragment thereof, the cell is propagated in cell culture with a suitable cell culture medium, and the expressed protein is purified from the cells and/or the cell culture medium.
  • transfection refers to any method of intentionally introducing a foreign nucleic acid into a eukaryotic cell.
  • Various types of nucleic acids can be used for transfection into eukaryotic cells, in particular deoxyribonucleic acid (DNA), ribonucleic acid (RNA), as well as small, non-coding RNAs such as siRNA, shRNA, and miRNA.
  • DNA deoxyribonucleic acid
  • RNA ribonucleic acid
  • small, non-coding RNAs such as siRNA, shRNA, and miRNA.
  • transfection With regard to transfection, a distinction is made between stable and transient transfection.
  • stable transfection long-term expression of the transgene is achieved by integrating the nucleic acid introduced into the cell into the cellular genome, while transient transfection, in which the expression of the transgene only occurs temporarily, does not require integration of the nucleic acid into the cellular genome ( Fus-Kujawa et al. 2021).
  • the selection of the optimal transfection method depends on various factors, in particular the type and origin of the target or production cell as well as the type of nucleic acid introduced.
  • Physical, chemical and viral vector-based transfection methods can be used to introduce foreign (modified homologous and/or heterologous) nucleic acid encoding the desired transgene(s) into eukaryotic cells.
  • Physical transfection methods include, for example, electroporation, sonoporation, magnetofection, microinjection and biolistic methods.
  • Chemical transfection methods include the calcium phosphate method, the use of dendrimers, cationic polymers such as diethylaminoethyl dextran (DEAE-dextran), nanoparticles, non-liposomal nanoparticles, and liposomal transfection.
  • Transfection using viral vectors involves genetic factors in particular modified retroviruses and lentiviruses, adenoviruses, and adeno-associated viruses (AAV) are used (Fus-Kujawa et al. 2021).
  • the present invention relates to an active ingredient obtained by said method for identifying an active ingredient that binds to the FATP2 protein of a T cell or a fragment thereof and/or the activity of the FATP2 protein of a T cell, or a fragment thereof, inhibited or reduced, or obtained by one of the above-described embodiments of said method.
  • the present invention relates to an active ingredient that binds to the FATP2 protein or a fragment thereof in a T cell, and/or inhibits or reduces the activity of the FATP2 protein, or a fragment thereof, and/or the degradation of the FATP2 protein promotes.
  • the present invention relates to an active ingredient which inhibits or reduces the expression of the SLC27A2 gene in a T cell, preferably where the T cell is a synovial T cell.
  • the present invention relates to an active ingredient, wherein the active ingredient is a low molecular weight compound (smol), a peptide or peptide derivative, or a biologic, preferably wherein the biologic is an antibody or an antigen-binding fragment thereof, or an antigen -binding derivative thereof, or an antibody-like protein, or an aptamer or a nucleic acid.
  • the active ingredient is a low molecular weight compound (smol), a peptide or peptide derivative, or a biologic, preferably wherein the biologic is an antibody or an antigen-binding fragment thereof, or an antigen -binding derivative thereof, or an antibody-like protein, or an aptamer or a nucleic acid.
  • the active ingredient binds specifically to the FATP2 protein or a fragment thereof with a high or particularly high affinity and/or avidity. In a preferred embodiment, the active ingredient, when bound to FATP2, reduces or inhibits FATP2 activity.
  • the term "specifically bind" as used herein means that the active ingredient has a dissociation constant KD with respect to its binding to the FATP2 protein molecule or an epitope thereof of at most about 100 pM.
  • the KD is about 100 pM or lower, about 50 pM or lower, about 30 pM or lower, about 20 pM or lower, about 10 pM or lower, about 5 pM or lower, about 1 pM or lower, about 900 nM or lower, about 800 nM or lower, about 700 nM or lower, about 600 nM or lower, about 500 nM or lower, about 400 nM or lower, about 300 nM or lower, about 200 nM or lower, about 100 nM or lower, about 90 nM or lower, about 80 nM or lower, about 70 nM or lower, about 60 nM or lower, about 50 nM or lower, about 40 nM or lower, about 30 nM or lower, about 20 nM or lower,
  • the present invention relates to an antibody, or an antigen-binding fragment or antigen-binding derivative thereof, or an antibody-like protein, which specifically binds to the FATP2 protein, preferably to the FATP2 protein in a T cell .
  • the present invention relates to said antibody, or antigen-binding fragment or antigen-binding derivative thereof, or antibody-like protein, wherein the antibody, or antigen-binding fragment or derivative thereof, or antibody-like protein inhibits FATP2 activity , i.e. acts as an inhibitor or antagonist of FATP2.
  • antibody refers to a protein consisting of one or more polypeptide chains encoded by immunoglobulin genes or fragments of immunoglobulin genes or cDNAs derived therefrom. These immunoglobulin genes include the constant region light chain kappa, lambda and heavy chain alpha, delta, epsilon, gamma and mu genes, as well as any of the many different variable region genes.
  • the basic structural unit of immunoglobulin is usually a tetramer, which consists of two identical pairs of polypeptide chains, the light chains (L, with a molecular weight of about 25 kDa) and the heavy chains (H, with a molecular weight of about 50-70 kDa).
  • Each heavy chain consists of a heavy chain variable region (abbreviated as VH or VH) and a heavy chain constant region (abbreviated as CH or CH).
  • the heavy chain constant region consists of three domains, namely CHI, CH2 and CH3.
  • Each light chain contains a light chain variable region (abbreviated as VL or VL) and a light chain constant region (abbreviated as CL or CL).
  • VH and VL regions can be further subdivided into regions of hypervariability, also referred to as complementarity determining regions (CDR), interspersed with regions that are more conserved, referred to as framework regions (FR).
  • CDR complementarity determining regions
  • FR framework regions
  • Each VH and VL region consists of three CDRs and four FRs, arranged from amino terminus to carboxy terminus in the order FR1, CDRI, FR2, CDR2, FR3, CDR3, FR4.
  • the variable regions of the heavy and light chains form a binding domain that interacts with an antigen.
  • the CDRs are most important for binding the antibody or the antigen-binding part of it.
  • the FRs can be replaced with other sequences as long as the three-dimensional structure required for antigen binding is preserved.
  • antigen-binding portion of the (monoclonal) antibody refers to one or more fragments of an antibody that retain the ability to specifically bind to the antigen in its native form.
  • antigen-binding portions of the antibody include a Fab fragment, a monovalent fragment consisting of the VL, VH, CL and CHI domains, an F(ab')2 fragment, a bivalent fragment containing two Fab fragments connected by a disulfide bridge at the hinge region, an Fd fragment consisting of the VH and CHI domains, an Fv fragment consisting of the VL and VH domains of a single arm of an antibody, and a dAb fragment consisting of a VH domain and an isolated complementarity determining region (CDR).
  • CDR complementarity determining region
  • the antibody, antibody fragment or antibody derivative thereof according to the present invention may be a monoclonal antibody.
  • the antibody can be of the IgA, IgD, IgE, IgG or IgM isotype.
  • the term "monoclonal antibody (mAb)" refers to an antibody composition having a homogeneous antibody population, ie, a homogeneous population consisting of a whole immunoglobulin or a fragment or derivative thereof.
  • Such an antibody is particularly preferably selected from the group consisting of IgG, IgD, IgE, IgA and/or IgM, or a fragment or derivative thereof.
  • fragment refers to fragments of such an antibody that retain their target binding capacities, e.g. a CDR (complementarity determining region), a hypervariable region, a variable domain (Fv), an IgG heavy chain (consisting of VH -, CHI, hinge, CH2 and CH3 regions), an IgG light chain (consisting of VL and CL regions) and/or a Fab and/or F(ab)2.
  • CDR complementarity determining region
  • Fv variable domain
  • IgG heavy chain consististing of VH -, CHI, hinge, CH2 and CH3 regions
  • IgG light chain consististing of VL and CL regions
  • derivative refers to protein constructs that are structurally different from, but still have some structural relationship to, the common antibody concept, e.g. B. scFv, Fab and/or F(ab)2, as well as bi-, tri- or higher-specific antibody constructs. All of these elements are explained below.
  • antibody derivatives known to those skilled in the art are diabodies, camelid antibodies, domain antibodies, two-chain bivalent homodimers consisting of scFvs, IgAs (two IgG structures linked by a J chain and a secretory component), shark Antibodies, antibodies consisting of New World primate scaffold plus non-New World primate CDR, dimerized constructs comprising CH3+VL+VH, other scaffold protein formats comprising CDRs, and antibody conjugates.
  • antibody-like protein refers to a protein that has been engineered (e.g., through mutagenesis of Ig loops) to specifically bind to a target molecule.
  • an antibody-like protein comprises at least one variable peptide loop bound to a protein backbone at both ends. This double structural constraint increases the binding affinity of the antibody-like protein to a level comparable to that of an antibody.
  • the length of the variable peptide loop typically consists of 10 to 20 amino acids.
  • the scaffold protein can be any protein with good solubility properties.
  • the scaffolding protein is a small globular protein.
  • Antibody-like proteins include, without limitation, affibodies, anticalins and designed ankyrin proteins and affilin proteins.
  • Antibody-like proteins can be derived from large libraries of mutants, e.g. B. by panning from large phage display libraries, and can be isolated in analogy to regular antibodies. Antibody-like binding proteins can also be obtained by combinatorial mutagenesis of surface-exposed residues in globular proteins. Antibody-like proteins have been described, for example, in Binz et al. (2005) and Hosse et al. (2006).
  • Fab refers to an IgG fragment comprising the antigen binding region, the fragment being composed of a constant and a variable domain of each of the heavy and light chains of the antibody.
  • F(ab)2 refers to an IgG fragment consisting of two Fab fragments linked together by disulfide bonds.
  • scFv refers to a single chain variable fragment that is a fusion of the variable regions of the heavy and light chains of immunoglobulins linked together by a short linker, usually serine (S) and/or glycine. (G) includes residues. This chimeric molecule retains the specificity of the original immunoglobulin despite the removal of the constant regions and the introduction of a linker peptide.
  • Modified antibody formats include bi- or tri-specific antibody constructs, antibody-based fusion proteins, immunoconjugates and the like.
  • IgG, scFv, Fab and/or F(ab)2 are antibody formats well known to those skilled in the art. Detailed explanations and techniques can be found in relevant textbooks.
  • the antibody or the antigen-binding fragment thereof or the antigen-binding derivative thereof is a murine, a chimeric, a humanized or a human antibody or an antigen-binding fragment or an antigen-binding derivative thereof.
  • Mouse-derived monoclonal antibodies mAbs
  • mAbs can cause undesirable immunological side effects because they contain a protein from another species that can induce an immune response.
  • antibody humanization and maturation methods have been developed to generate antibody molecules with minimal immunogenicity when used in humans, while ideally maintaining the specificity and affinity of the non-human parental antibody. With these methods z. B. the framework regions of a mouse mAb are replaced by corresponding human framework regions (so-called CDR grafting).
  • W0200907861 discloses the generation of humanized forms of mouse antibodies by linking the CDR regions of non-human antibodies to human constant regions using recombinant DNA technology.
  • US6548640 describes CDR transplantation techniques, and US5859205 describes the production of humanized antibodies.
  • humanized antibody refers to an antibody, a fragment or a derivative thereof, in which at least a portion of the constant regions and/or the framework regions and optionally a portion of the CDR regions of the antibody are derived from human immunoglobulin sequences or is adapted to this.
  • the present invention relates to an active ingredient as described above, or an antibody, an antigen-binding fragment or an antigen-binding derivative thereof, or an antibody-like protein as described above, for use in the treatment of an autoimmune disease.
  • the autoimmune disease is preferably rheumatism, rheumatoid arthritis, juvenile idiopathic arthritis, chronic inflammatory bowel diseases including ulcerative colitis and Crohn's disease, multiple sclerosis, and other autoimmune diseases with T-cell involvement.
  • the present invention relates to a pharmaceutical composition
  • a pharmaceutical composition comprising the active ingredient as described above, or the antibody, the antigen-binding fragment or antigen-binding derivative thereof, or an antibody-like protein as described above, and one or more pharmaceutically acceptable excipients Use in the treatment of an autoimmune disease, preferably wherein said autoimmune disease is selected from the group consisting of rheumatism, rheumatoid arthritis, juvenile idiopathic arthritis, chronic inflammatory bowel diseases including ulcerative colitis and Crohn's disease, multiple sclerosis, and other autoimmune diseases with T-cell involvement.
  • the said pharmaceutically acceptable excipient(s) is/are selected from the group consisting of pharmaceutically acceptable buffers, surfactants, diluents, carriers, excipients, fillers, binders, lubricants, Lubricants, disinfectants, adsorbents and/or preservatives.
  • the said pharmaceutical composition can be administered in the form of powder, tablets, pills, capsules or beads.
  • the pharmaceutical formulation may be ready for administration, while in lyophilized form the formulation must be converted into a liquid form before administration, e.g. B. by adding water for injections containing a preservative such as. E.g., but not limited to, benzyl alcohol, antioxidants such as vitamin A, vitamin E, vitamin C, retinyl palmitate and selenium, the amino acids cysteine and methionine, citric acid and sodium citrate, synthetic preservatives such as the parabens methylparaben and propylparaben may or may not contain.
  • a preservative such as. E.g., but not limited to, benzyl alcohol, antioxidants such as vitamin A, vitamin E, vitamin C, retinyl palmitate and selenium, the amino acids cysteine and methionine, citric acid and sodium citrate, synthetic preservatives such as the parabens methylparab
  • the pharmaceutical formulation may further contain one or more stabilizers, e.g. B. can be an amino acid, a sugar polyol, a disaccharide and / or a polysaccharide.
  • the pharmaceutical formulation may further contain one or more surfactants, one or more isotonizing agents and/or one or more metal ion chelators and/or one or more preservatives.
  • the pharmaceutical formulation as described herein may be suitable for at least oral, parenteral, intravenous, intramuscular or subcutaneous administration.
  • the active ingredient or antibody according to the present invention can be provided in a sustained release formulation which allows the sustained release of the active ingredient over a certain period of time.
  • primary packaging such as. B. a prefilled syringe or pen, a vial or an infusion bag, comprising said pharmaceutical formulation according to this aspect of the invention.
  • the prefilled syringe or pen may contain the formulation either in freeze-dried form (which must then be dissolved, for example with water for injections, before administration) or in aqueous form.
  • the syringe or pen is often a single-use, disposable device and can have a volume of between 0.1 and 20 ml. However, the syringe or pen can also be a reusable syringe or a multi-dose pen.
  • the present invention relates to the use of an active ingredient that binds to the FATP2 protein in a method for treating an autoimmune disease, preferably wherein said autoimmune disease is selected from the group consisting of rheumatism, rheumatoid arthritis, juvenile idiopathic arthritis, chronic inflammatory bowel diseases including Ulcerative colitis and Crohn's disease, multiple sclerosis, and other autoimmune diseases with T-cell involvement.
  • said active ingredient when bound to FATP2, inhibits FATP2 activity.
  • the present invention further relates to the use of an active ingredient that binds to the FATP2 protein for the production of a medicament for treating an autoimmune disease, the autoimmune disease preferably being selected from the group consisting of rheumatism, rheumatoid arthritis, juvenile idiopathic arthritis, chronic inflammatory bowel disease including ulcerative colitis and Crohn's disease, multiple sclerosis, and other autoimmune diseases with T-cell involvement.
  • the active ingredient when bound to FATP2, inhibits F ATP2 activity.
  • the present invention further relates to a method for treating or preventing an autoimmune disease, the method comprising administering an active ingredient that binds to and/or inhibits the FATP2 protein in a therapeutically effective dose or amount to a human or animal subject.
  • an active ingredient that binds to and/or inhibits the FATP2 protein in a therapeutically effective dose or amount to a human or animal subject.
  • the term "effective dose” or “effective amount” means a dose or amount of the active ingredient necessary, in terms of dosages and periods of administration, to achieve the desired therapeutic result in a patient. Effective amounts may vary depending on factors such as the disease state, the patient's age, gender and/or weight, the pharmaceutical formulation, the subtype of disease being treated, and the like, but may nevertheless be routinely determined by one skilled in the art.
  • the present invention relates to a method for producing an active ingredient according to the method for identifying said active ingredient that binds to the FATP2 protein or a fragment thereof and/or the activity of the FATP2 protein or a fragment thereof, inhibits or reduces, as described above, further comprising the purification of said active ingredient.
  • the present invention further relates to a method for producing a pharmaceutical composition, comprising
  • the present invention relates to a composition comprising a combination of
  • the active ingredient that binds to the FATP2 protein or a fragment thereof in a T cell and/or inhibits or reduces the activity of the FATP2 protein or a fragment thereof in a T cell, as above described, or the antibody or antigen-binding fragment or antigen-binding derivative thereof or the antibody-like protein as described above, or the pharmaceutical composition comprising the active ingredient as described above, or the antibody, the antigen-binding fragment or antigen-binding derivative thereof, or an antibody-like protein as described above, and one or more pharmaceutically acceptable excipients, and
  • the present invention relates to a therapeutic kit comprising:
  • Example 1 Increased fatty acid uptake by T cells in the synovial fluid of JIA patients using the transport protein FATP2
  • the inventors were able to show that T cells found in the synovial fluid of juvenile idiopathic arthritis (JIA) patients promote increased uptake of fatty acids.
  • JIA juvenile idiopathic arthritis
  • ZI have acids that are associated with increased expression of FATP24S7T '27/42.
  • the fatty acid receptor FATP2 is mainly expressed in CD4+ memory cells (Fig. 1).
  • Example 1A Uptake of free fatty acids in CD4-positive T cells from the blood or synovium of JIA patients
  • Fig. 1 A The uptake of free fatty acids into CD4+ T cells from the blood or synovium of juvenile idiopathic arthritis (JIA) patients was determined (Fig. 1 A). The measurement was carried out after incubating the cells for 15 minutes with BodipyeTMFL C12 (2 pM) and subsequent flow cytometric analysis. The mean fluorescence intensity (MFI) is shown minus the respective FMO control (AMFI). Data show mean expression in four patients ⁇ standard error, **p ⁇ 0.01.
  • T cells in the synovial fluid depend on fatty acids in order to proliferate (Hradilkova et al. 2019).
  • Andreas Radbruch's working group suggested that this dependency is dependent on the transcription factor TWIST1, which is predominantly expressed in PDl-positive T cells.
  • TWIST 1 was not found to be upregulated in normal CD4-positive effector cells in the synovial fluid, and expression in synovial fluid regulatory T cells (Tregs) was undetectable (RNAseq single-cell data, Bas Vastert, UMC Utrecht, personal communication).
  • CD36 is usually upregulated in Treg cells in hypoxic environments (such as wise in tumors) with increased glycolysis and lactate concentration (around 5 mmol/liter, which is approximately the concentration present in the synovial fluid of JIA patients), where it is critical for the suppression of CD8-positive T cells .
  • the inventors surprisingly found a specific upregulation of fatty acid transporter 2 (FATP2, also called SLC27A2) in CD4-positive T effector cells in the synovial fluid and even more so in CD4-positive Treg cells in the synovial fluid compared to the peripheral blood healthy children, healthy adults and children with JIA (Fig. 2), which may be responsible for the effect that the inventors observed on fatty acid transport.
  • FATP2 also called SLC27A2
  • Example 1B FATP2 protein expression in CD4-positive T cells from the blood or synovium of JIA patients
  • FATP2 protein expression in CD4+ T cells from the peripheral blood (PB) or synovium (SF) of JIA patients was determined by flow cytometric analysis (Fig. 1 B). A representative image is shown.
  • the expression of 5ZC2742 RNA was determined in CD4 + T cells of the synovium of JIA patients compared to the blood of the same patients (Fig. 1 C).
  • FATP2 protein expression was measured in CD4+ T cell subtypes (effector memory T cells (T em ), tissue resident memory T cells (T m ) and naive T cells (Tnaive)) from the blood or synovium of JIA patients determined using flow cytometric analysis (Fig. 1 D).
  • the mean fluorescence intensity (MFI) is shown minus the respective FMO control (AMFI).
  • Data show mean expression in five patients ⁇ standard error, ***p ⁇ 0.001. ****p ⁇ 0.0001.
  • Example IC SLC2 Z42 mRNA expression in stimulated and unstimulated CD4-positive memory T cells from the blood of healthy controls
  • the mRNA expression of 5ZC 742/FATP2 compared to other metabolic proteins in CD4+ memory T cells after 48 h and 72 h of stimulation with anti-CD3 and anti-CD28 antibodies as well as in unstimulated CD4+ memory T cells - Cells were determined (Fig. 1 E).
  • the CD4+ memory T cells were isolated from the blood of healthy control subjects using magnetic cell separation. Data show the mean expression of four experiments with different donors ⁇ standard error, **p ⁇ 0.01, ***p ⁇ 0.001.
  • SLC27A21F ATP2 is highly upregulated in stimulated memory T cells compared to other metabolic proteins.
  • SLC27A2/F ATP2 mRNA expression was dramatically higher in MACS-isolated human na ⁇ ve CD4+ and CD45R0 CD4+ memory T cells from peripheral blood of healthy donors after stimulation than without stimulation. The data suggest a specific role for this transport protein in the activation of memory T cells.
  • Example 2 Blockade of fatty acid uptake in memory T cells reduces IFN ⁇ production and proliferation of the cells
  • FATP2 FATP2 inhibitors
  • Lipofermata Adeshakin et al. 2021
  • Grassofermata Grassofermata
  • the inventors were able to show that the FATP2 inhibitor Lipofermata inhibits fatty acid uptake in CD4+ T cells and inhibits fFN-y expression and proliferation of T cells without inducing apoptosis (Fig. 2). With the help of Lipofermata, the function of FATP2 in T cells could be clearly confirmed.
  • Lipofermata (5-Bromo-5'-phenyl-spiro[3H-indole-3,2'(3'H)-[l,3,4]thiadiazole]-2(lH)-one) the fatty acid absorption in the Memory T cells are effectively blocked and the proliferation and production of inflammatory mediators are inhibited.
  • This absorption route is therefore of central importance for the metabolism of T cells, which play an essential role in the pathogenesis of childhood rheumatism and other autoimmune diseases.
  • a targeted blockade of this signaling pathway opens up the use of a completely new mechanism of action in the therapy of autoimmune diseases.
  • Fig. 2 B shows an exemplary histogram of fatty acid uptake in CD4+ T cells without the addition of Lipofermata (right) and after the addition of Lipofermata (left).
  • IFN- ⁇ -positive CD4 + T cells were examined after addition of Lipofermata at increasing concentrations of 0, 2, 5, 7.5, and 10 pM (Fig. 2 C).
  • the cells were stimulated with anti-CD3 and anti-CD28 antibodies for 48 hours.
  • the determination of IFN- ⁇ -positive cells was carried out after 5 hours of restimulation with PMA and ionomycin in the presence of GolgiPlugTM using flow cytometry. Data show mean expression measured in 5-6 experiments ⁇ standard error, *p ⁇ 0.01.
  • Figure 2 D shows an exemplary dot diagram of IFN- ⁇ expression without addition of Lipofermata (left) and after addition of Lipofermata (right).
  • the percentage of proliferated CD4 + T cells was determined after addition of Lipofermata in increasing concentrations of 0, 2, 5, 7.5 and 10 pM (Fig. 2 E).
  • the cells were stained with “Cell proliferation dye eFlourTM” and stimulated with anti-CD3 and anti-CD28 antibodies for 48 hours. Proliferated cells were determined using flow cytometry. Data show mean expression measured in five experiments ⁇ standard error, *p ⁇ 0.01.
  • Fig. 2 F shows an exemplary dot diagram of cell proliferation without addition of Lipofermata (left) and after addition of Lipofermata (right).
  • Figure 2 G shows an exemplary dot plot of the dead cells with Lipofermata treatment (right) and without (left).
  • the cells were stimulated for 72 hours with anti-CD3 and anti-CD28 antibodies and stained with propidium iodide (PI) for flow cytometry to see live/dead differentiation.
  • PI propidium iodide
  • the present data show a dramatically increased uptake of free fatty acids in T cells in the synovial fluid of JIA patients, which could be related to the specific upregulation of SLC 27A2 -encoded FATP2, and which resulted in a change in metabolism and thus function of these cells. It should be noted that virtually all effector T cells in the synovium represent the memory phenotype.
  • SLC 27A2 -encoded FATP2 could be blocked by a specific inhibitor (Lipofermata, Veglia et al. 2019).
  • a specific inhibitor Lipofermata, Veglia et al. 2019
  • CD4+ T cells were isolated from the blood of healthy donors and stimulated with anti-CD3 and anti-CD28 antibodies in the presence or absence of lipofermata. It was shown that Lipofermata practically completely blocked T cell proliferation and reduced IFN- ⁇ production in a concentration-dependent manner without inducing apoptosis.
  • Example 3 Screening for active ingredients that bind to and/or inhibit the transport protein FATP2
  • Screening experiments enable the identification and validation of small molecule therapeutic compounds, peptides and/or biologics that bind to and/or inhibit the activity of the FATP2 protein.
  • DNA-encrypted substance libraries are generated and screened as described (Kunig et al. 2018). Furthermore, phage display technologies (Takakusagi et al. 2020), cell surface display or ribosome display technologies (Valldorf et al. 2022) and/or combinatorial peptide libraries (Bozovicar and Bratkovic 2019) are used.
  • recombinant FATP2 protein or fragments thereof which can carry a tag for marking, identification or purification, e.g. a His tag or a FLAG tag, are expressed in bacterial expression systems such as E. coli, or in insect cells or mammalian cells.
  • the purified FATP2 protein is incubated with substances from the substance library and isolated by immunoprecipitation.
  • the compounds bound to the FATP2 protein are identified, for example, by Sanger sequencing of the DNA barcodes.
  • the identified agents and compounds are then tested for their properties in appropriate bioassays Effects on the function of FATP2, its fatty acid transport activity, as well as the IFN- ⁇ production and the proliferation of memory T cells were tested.
  • Experimental mouse zzz-vzvo models are also used for this purpose.
  • a zzz-vz7ro fluorochrome reporter system based on human cells is being established, for example the expression of eGFP -FATP2 fusion protein or a luciferase-based reporter system is used to screen compound libraries in 384- to 1,536-well assays to identify compounds that reduce eGFP fluorescence or luciferase levels as readout.
  • the expression of these human FATP2 fusion reporter constructs in the cells mentioned can e.g. B. by transfection and selection via resistance gene cassettes or by viral transduction. Human cell lines such as 293 T cells are used for these assays.
  • cytotoxicity assays are performed to exclude compounds that have an effect on reporter fluorescence or activity due to nonspecific toxicity or triggering of apoptosis.
  • Bozovicar K. and Bratkovic T. 2019. Evolving a peptide: Library platforms and diversification strategies. Int. J. Mol. Be. Vol. 21 No. 215; doi: 10.3390/ijms21010215.
  • FATP2 is a hepatic fatty acid transporter and peroxisomal very long-chain acyl-CoA synthetase. Am J Physiol Endocrinol Metab Vol. 299, p. E384-E393.
  • FATP2 fatty acid transport protein 2
  • SEQ ID NO. 3 amino acid sequence of human FATP2:

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Abstract

Die vorliegende Erfindung betrifft die Rolle des FATP2-Proteins (Fatty Acid Transport Protein 2) in T-Zellen bei der Entwicklung von Autoimmunerkrankungen, insbesondere von Rheuma, Rheumatoider Arthritis, juveniler idiopathischer Arthritis, chronischen entzündlichen Darmerkrankungen wie Colitis ulcerosa, und weiteren Autoimmunerkrankungen mit T-zellulärer Beteiligung. Die vorliegende Erfindung betrifft insbesondere Verfahren zur Identifizierung von Verbindungen, die an das FATP2-Protein binden, und auf die Verwendung von FATP2-Protein zum Screening und zur Identifizierung von FATP2-interagierenden und FATP2-inhibierenden Verbindungen. Die vorliegende Erfindung betrifft ferner pharmazeutische Zusammensetzungen zur Verwendung bei der Behandlung von Autoimmunerkrankungen, insbesondere pharmazeutische Zusammensetzungen, die Wirkstoffe umfassen, die an das FATP2-Protein binden und/oder dieses hemmen.

Description

FATP2 IN T-ZELLEN ALS ZIELMOLEKÜL ZUR BEHANDLUNG VON JUVENILER IDIOPATHISCHER ARTHRITIS IN KINDERN
Technischer Bereich der Erfindung
Die vorliegende Erfindung betrifft die Rolle des FATP2-Proteins (Fatty Acid Transport Protein 2) in T-Zellen bei der Entwicklung von Autoimmunerkrankungen, insbesondere von Rheuma, Rheumatoider Arthritis, juveniler idiopathischer Arthritis, chronischen entzündlichen Darmerkrankungen wie Colitis ulcerosa und Morbus Crohn, Multiple Sklerose, und weiteren Autoimmunerkrankungen mit T-zellulärer Beteiligung. Die vorliegende Erfindung betrifft insbesondere Verfahren zur Identifizierung von Verbindungen, die an das FATP2- Protein binden, und auf die Verwendung von FATP2-Protein zum Screening und zur Identifizierung von FATP2-interagierenden und FATP2-inhibierenden Verbindungen. Die vorliegende Erfindung betrifft ferner pharmazeutische Zusammensetzungen zur Verwendung bei der Behandlung von Autoimmunerkrankungen, insbesondere pharmazeutische Zusammensetzungen, die Wirkstoffe umfassen, die an das FATP2-Protein binden und/oder dieses hemmen.
Hintergrund und Stand der Technik
Autoimmunerkrankungen betreffen etwa 5 bis 8% der Bevölkerung weltweit. Sie sind mit einer hohen Morbidität und vorzeitiger Mortalität verbunden; nach den Herz-Kreislauf- und Tumorerkrankungen stellen sie die dritthäufigste Gruppe von Erkrankung dar. Bei Autoimmunkrankheiten greift das Immunsystem gesundes, körpereigenes Gewebe an, weil nicht mehr zwischen „fremd“ und „selbst“ unterschieden werden kann. Zu den systemischen Autoimmunkrankheiten zählen rheumatische Gelenkentzündungen; sie betreffen als juvenile idiopathische Arthritis (JIA) etwa 20.000 Kinder und als Rheumatoide Arthritis etwa 1,5 Millionen Erwachsene in Deutschland. Beide Erkrankungen sind Autoimmunerkrankungen unbekannten Ursprungs, die eine intermittierende chronische Entzündung der Gelenke verursacht. Neben den Zellen des angeborenen Immunsystems wie Neutrophile und Monocyten, die die Entzündungsvorgänge auslösen, bestimmen auch Zellen des adaptiven Immunsystems wie T-Zellen die chronischen Entzündungsreaktionen in den Gelenken.
Trotz inzwischen zunehmender therapeutischer Optionen sind Autoimmunerkrankungen bislang nicht heilbar. Bei einer Vielzahl von Autoimmunerkrankungen konnte die wesentliche Beteiligung von T-Zellen nachgewiesen werden, wie z.B. bei rheumatoider Arthritis, juveniler idiopathischer Arthritis, Colitis ulcerosa und Multipler Sklerose. Dabei spielen insbesondere sog. „Memory“-T-Zellen (Gedächtnis-T-Zellen) eine Rolle. Diese finden sich hauptsächlich gewebeständig und sind einer Immunsuppression nicht immer zugänglich.
Ihr inflammatorisches Potential kann innerhalb der entzündeten Gelenke nicht von regulatorischen T-Zellen (Treg-Zellen) kontrolliert werden. Nahezu alle T-Zellen innerhalb der Gelenke von Patienten mit juveniler idiopathischer Arthritis zeigen den Phänotyp von Memory-T-Zellen.
Der Metabolismus von T-Zellen von Patienten mit (kindlichem) Rheuma unterscheidet sich signifikant von dem Gesunder; es findet sich eine fundamentale Dysregulation des Fettsäuremetabolismus bei Patienten mit kindlichem Rheuma, insbesondere im entzündeten Gelenk. Dies betrifft vor allem die Gedächtnis-T-Zellen, die bis zu 95% der T-Zellen im entzündeten Gelenk ausmachen.
Die Funktionen von Gedächtnis-T-Zellen sind durch metabolische Gegebenheiten determiniert, die auch mit einer Umprogrammierung ihrer Funktionen einhergehen können (sog. „metabolic reprogramming“). Für den notwendigen Energiestoffwechsel nutzen T-Zellen im Wesentlichen die drei Energieressourcen Glukose, Glutamin und Fettsäuren. Weder für Glutamin noch für Fettsäuren sind die Transportproteine bisher eindeutig identifiziert und definiert. Die metabolischen Eigenschaften von Gedächtnis-T-Zellen unterscheiden sich deutlich von den Eigenschaften von naiven und Effektor-T-Zellen (Geltink et al. 2018). Ruhende naive T- Zellen bedienen sich eines oxidativen Metabolismus, um effizient Energie zu produzieren; sie nehmen mit sehr geringer Rate Glukose auf, um die notwendige Energie für die Aufrechterhaltung ihrer betrieblichen Stoffwechselfunktionen bereitzustellen. Naive T-Zellen verwenden Pyruvat aus dem Glukose-Abbau zur ATP-Gewinnung mittels oxidativer Phosphorylierung oder Fettsäure-Oxidation. Aktivierte T-Zellen dagegen müssen proliferieren und schalten deshalb auf ein Programm zum anabolischen Wachstum um, damit sie ihre Effektor- Funktionen ausüben können. Der vorherrschende Stoffwechsel-Zustand von aktivierten T- Zellen (sowohl CD4- als auch CD8-positiven T-Zellen) ist die aerobe Glykolyse, die daduch gekennzeichnet ist, dass Pyruvat aus dem Glukose-Abbau zu Laktat umgesetzt wird, obwohl ausreichend Sauerstoff für eine vollständige Glukose-Oxidation zur Verfügung steht (Geltink et al. 2018). Dieser Prozess, der als „Warburg-Effekt“ aus früheren Studien in der Tumorbiologie bekannt ist, ist ein gemeinsames Merkmal von aktiv proliferierenden Zellen. Nachdem Effektor-Zellen ihre Aufgaben erfüllt haben, gehen sie entweder zugrunde oder verwandeln sich in Gedächtnis-T-Zellen.
Gedächtnis-T-Zellen bilden das „immunologische Gedächtnis“ des Immunsystems insofern, als sie auf eine wiederholte Begegnung mit dem Antigen mit einer stärkeren Immunreaktion („sekundäre Immunantwort“) reagieren. Die Signaltransduktions- und Stoffwechselwege, die die Bildung von Gedächtnis-T-Zellen regulieren, sind daher von großem Interesse. Die mitochondriale Fettsäure-Oxidation ist notwendig für die Entwicklung von CD8-positiven Gedächtnis-T-Zellen und abhängig vom Tumor-Nekrosefaktor-(TNF-)Rezeptor-assoziierten Faktor-6 (TRAF6) (Pearce et al. 2009). Die Fettsäure-Oxidation generiert Acetyl -Coenzym A (CoA), welches im Zitronensäure-Zyklus weiter metabolisiert werden kann, sowie FADEL und NADH+H+, die direkt verwendet werden können, um über die Elektronentransportkette Adenosintriphosphat (ATP) zu erzeugen. Freie Fettsäuren sind energiereiche Moleküle, und die Fettsäure-Oxidation könnte eine bevorzugte Energiequelle für Gedächtnis-T-Zellen („Tmem“) darstellen, da sie auf von oxidativer Phosphorylierung abhängige Stoffwechselwege angewiesen sind. Außerdem verleiht ein größerer Gehalt an Mitochondrien GedächtnisT-Zellen einen bioenergetischen Vorteil, indem er die schnelle Immunreaktion in Antwort auf eine Re-Infektion verstärkt. Im Gegensatz zu Effektor-T-Zellen, die insbesondere auf Glykolyse angewiesen sind, besitzen CD8-positive Gedächtnis-T-Zellen deshalb eine höhere respiratorische Reserve-Kapazität und verlassen sich vorwiegend auf die Fettsäure-Oxidation. In gewebeständigen CD8-positiven Gedächtnis-T-Zellen zählen Gene, die Fettsäure-bindende Proteine (FABP4 und FABP5) codieren, zu den am stärksten hochregulierten Genen, genauso wie das Gen, das für CD36 codiert, einen sog. „Lipid-scavenger cell-surface receptor“ (Pan et al. 2017). Die Daten zu CD4-positiven T-Zellen hinsichtlich ihres Fettsäure-Metabolismus sind demgegenüber noch spärlich. Es konnte aber gezeigt werden, dass die genetische Deletion von ACC1, einem geschwind! gkeits-begrenzenden Enzym der Fettsäure-Biosynthese, die Bildung von CD4-positiven Gedächtnis-T-Zellen steigert, und dass die Inhibition der ACCl-Funktion die Bildung von Gedächtnis-T-Zellen während einer Parasiten-Infektion in Mäusen erhöht (Endo et al. 2019).
Über den Aufnahmemechanismus von Fettsäuren in T-Zellen und die Identität von Transportmolekülen für Fettsäuren in T-Zellen war im Stand der Technik bisher nichts bekannt. Die therapeutischen Möglichkeiten bei Autoimmunerkrankungen sind bisher begrenzt, eine Heilung nicht möglich. Insbesondere ist keine Therapieoption, die den Metabolismus von Immunzellen zum Ziel hat, verfügbar.
Somit bestand eine der vorliegenden Erfindung zugrunde liegende Aufgabe in der Bereitstellung von Verfahren und Mitteln zur Identifizierung von Wirkstoffen, Verbindungen und Zusammensetzungen, sowie ihrer Verwendung bei der Behandlung von Autoimmunerkrankungen.
In der vorliegenden Anmeldung wird die Identifizierung eines neuen molekularen Zielmoleküls („Targets“) für die Therapie von Autoimmunerkrankungen offenbart. Im Rahmen der vorliegenden Erfindung wurde das Fettsäure-Transportprotein-2 (FATP2, Fatty Acid Transport Protein 2), codiert vom SLC27A2-Gen, als Fettsäure-Transporter in T-Zellen identifiziert, und erstmals nachgewiesen, dass dessen Blockade die Funktion der T-Zellen hinsichtlich ihrer Produktion von Zytokinen, der Aktivierung ihrer Effektorfunktionen und hinsichtlich ihrer Proliferation beeinflussen.
Eine Expression des Fettsäure-Transportproteins-2 (FATP2) wurde bisher nachgewiesen in Leber, Dünndarm, Niere, Pankreas, und Plazenta (Falcon et al. 2010; Perez et al. 2020; Khan et al. 2020). Das Protein wird codiert vom Solute Carrier Family 27 Member 2" (SLC27A2')-G&n und hat im Wesentlichen zwei Funktionen, die Aktivierung langkettiger Fettsäuren als eine „Very Long-Chain Acyl-Coenzyme A (CoA)“- Synthetase (ACSVL), und den Transport Coenzym A-aktivierter langkettiger Fettsäuren als Fettsäure-Transportprotein (Falcon et al. 2010; Khan et al. 2020; Melton et al. 2013).
Das Transportmolekül FATP2 wurde von Falcon et al. (2010) mit der Entwicklung von nicht-alkoholischer Fettleber bei Mäusen in Verbindung gebracht. Andere Studien deuten darauf hin, dass das Molekül für die Pathogenese von diabetischen Nierenerkrankungen mitverantwortlich sein könnte (Khan et al. 2020). Weiter wurde gezeigt, dass eine Hochregulierung der Expression des SLC27A2-Gens bzw. des FATP2-Proteins in differenzierten Schilddrüsen-Karzinomen mit einer erhöhten Proliferation und Migration von Tumorzellen assoziiert sein kann (Feng et al. 2021), und dass das FATP2-Protein in Tumoren an einer Re- Programmierung von Neutrophilen beteiligt sein kann (Veglia et al. 2019). W02020/172510 (Wistar Institute) offenbart Verfahren zur Tumortherapie durch eine Hemmung, Blockade oder Runterregulation von FATP2 in MDSCs (Myeloid-derived Suppressor Celis, myeloide Suppressor-Zellen), einer heterogenen Population von unreifen und pathologisch aktivierten myeloiden Zellen, die sich bei Tumorpatienten in großen Mengen ansammeln, die Aktivität und Proliferation von T-Zellen und Natural Killer (NK)-Zellen unterdrücken, und durch diese immunsuppressive Wirkung das Wachstum der Tumoren begünstigen.
Die vorliegende Anmeldung offenbart das SLC27A2-Gen bzw. das FATP2-Protein erstmals als Zielmolekül und damit neuen therapeutischen Ansatz für die Entwicklung von Therapeutika zur Behandlung von Patienten mit Autoimmunerkrankungen.
Zusammenfassung der Erfindung
Die Erfinder haben erstmals und überraschend mit dem vom SLC27A2-Gen-codierten FATP2 einen Fettsäure-Transporter in T-Zellen, insbesondere in Gedächtnis-T-Zellen identifiziert, dessen Blockade die Funktionen dieser T-Zellen (Proliferation, Produktion von Zytokinen) wesentlich beeinflusst. Dieser fundamentale Schritt für das Verständnis der T-Zellfunktion bietet erstmals die Möglichkeit, diese T-Zellfunktion gezielt zu beeinflussen und durch eine Veränderung des Metabolismus neu zu programmieren.
Bislang war für T-Zellen der aufnehmende Rezeptor/Transporter von freien Fettsäuren, die neben Glukose eine wesentliche Energiequelle insbesondere im entzündeten Gewebe darstellen, nicht bekannt. Das als FATP2 identifizierte Fettsäuretransportprotein ist in T- Zellen in entzündeten Gelenken von Patienten, beispielsweise mit kindlichem Rheuma, 10- fach hochreguliert im Vergleich zum Blut derselben Patienten und gesunden Kontrollen. Zudem konnte nachgewiesen werden, dass in Gedächtnis-T-Zellen, welche zur Proliferation gebracht werden, die FATP2-Expression 30-fach hochreguliert wird, und gleichzeitig die Fettsäureaufnahme der Zellen massiv steigt.
Die vorliegende Erfindung stellt Verfahren und Mittel zur Identifizierung von Wirkstoffen, Verbindungen und Zusammensetzungen zur Verwendung bei der Behandlung von Autoimmunerkrankungen bereit, insbesondere zur Identifizierung von hochwirksamen Wirkstoffen, Verbindungen und Zusammensetzungen zur Verwendung bei der Behandlung von Rheuma, Rheumatoider Arthritis, juveniler idiopathischer Arthritis, chronischen entzündlichen Darmerkrankungen einschließlich Colitis ulcerosa und Morbus Crohn, Multiple Sklerose, und anderen Autoimmunerkrankungen mit T-zellulärer Beteiligung.
In Anbetracht des Standes der Technik war es eine Aufgabe der vorliegenden Erfindung, ein Verfahren zur Hemmung oder Verringerung der Fettsäureaufnahme in eine T-Zelle, der Aktivierung und/oder der Proliferation einer T-Zelle bereitzustellen.
Eine weitere Aufgabe der vorliegenden Erfindung bestand darin, ein Verfahren zur Identifizierung eines Wirkstoffs bereitzustellen, der an das FATP2-Protein oder ein Fragment davon bindet und/oder dieses hemmt.
Es war eine weitere Aufgabe der vorliegenden Erfindung, ein Verfahren zur Verwendung einer Nukleinsäure, die für das FATP2-Protein, oder ein Fragment davon, codiert, oder das FATP2-Protein selbst, oder ein Fragment davon, für die Identifizierung eines Wirkstoffs, der an FATP2, oder ein Fragment davon, bindet, bereitzustellen.
Es war eine weitere Aufgabe der vorliegenden Erfindung, Wirkstoffe zur Verwendung bei der Behandlung einer Autoimmunerkrankung bereitzustellen, insbesondere zur Verwendung bei der Behandlung von Rheuma, Rheumatoider Arthritis, juveniler idiopathischer Arthritis, chronischen entzündlichen Darmerkrankungen einschließlich Colitis ulcerosa und Morbus Crohn, Multipler Sklerose, und anderen Autoimmunerkrankungen mit T-zellulärer Beteiligung, basierend auf den oben beschriebenen Erkenntnissen. Eine weitere Aufgabe der vorliegenden Erfindung ist die Bereitstellung von pharmazeutischen Zusammensetzungen, die diese Mittel enthalten, und von Verfahren zur Herstellung solcher pharmazeutischen Zusammensetzungen, basierend auf den oben beschriebenen Erkenntnissen.
Die beschriebenen und weitere technischen Aufgaben werden durch die Vorrichtungen bzw. Verfahren gemäß den unabhängigen Ansprüchen der aktuellen Erfindung gelöst. Die abhängigen Ansprüche beschreiben bevorzugte Ausführungsformen. Wertebereiche, die durch numerische Werte begrenzt sind, sollen stets die besagten Grenzwerte beinhalten.
Die Erfindung und allgemeine vorteilhafte Ausgestaltungen werden im Folgenden näher erläutert.
Beschreibung der Zeichnungen
Fig. 1 zeigt, dass T-Zellen, die in der Synovialflüssigkeit von juvenilen idiopathischen Arthritis (JIA)-Patienten vorkommen, eine verstärkte Aufnahme von Fettsäuren haben, die mit einer vermehrten Expression von FATP2/SLC27A2 einhergeht. Der Fettsäurerezeptor FATP2 ist dabei vor allem in CD4+ Gedächtniszellen exprimiert.
Fig. 1A: Aufnahme von freien Fettsäuren in CD4+ T-Zellen aus dem Blut oder dem Synovium von JIA Patienten. Die Messung erfolgte nach 15-minütiger Inkubation der Zellen mit Bodipye™FL C 12 (2 pM) und nachfolgender durchflusszytometri scher Analyse. Die Mittlere Fluoreszenzintensität (MFI) ist abzüglich der jeweiligen FMO Kontrolle dargestellt (AMFI). Die Daten zeigen die mittlere Expression in 4 Patienten ± Standardfehler, **p < 0.01.
Fig. 1B: FATP2 -Proteinexpression in CD4+ T-Zellen aus dem Peripherblut (PB) oder dem Synovium (SF) von JIA Patienten (durchflusszytometri sehe Analyse). Es ist ein repräsentatives Bild gezeigt. Fig. 1 C: Expression von SLC27A2 RNA in CD4+ T-Zellen der Synovialis von JIA Patienten im Vergleich zum Blut derselben Patienten.
Fig. ID: Proteinexpression von FATP2 in CD4+ T-Zellsubtypen (Effektor-Gedächtnis-T- Zellen (Tem), Gewebeständige Gedächtnis-T-Zellen (Tm) und naive T-Zellen (Tnaive)) aus dem Blut oder dem Synovium von JIA Patienten (durchflusszytometrische Analyse). Die Mittlere Fluoreszenzintensität (MFI) ist abzüglich der jeweiligen FMO Kontrolle dargestellt (AMFI). Die Daten zeigen die mittlere Expression in 5 Patienten ± Standardfehler, ***p < 0 001. ****p < 0.0001.
Fig. IE: mRNA Expression von FATP2 im Vergleich zu anderen Stoffwechselproteinen in CD4+ Gedächtnis-T-Zellen nach 48 stündiger und 72 stündiger Stimulation mit anti-CD3 und anti-CD28 Antikörpern und in nicht stimulierten CD4+ Gedächtnis-T-Zellen. Die CD4+ Gedächtnis-T-Zellen wurden mittels magnetischer Zellseparation aus dem Blut gesunder Kontrollen isoliert. Die Daten zeigen die mittlere Expression von 4 Experimenten mit unterschiedlichen Spendern ± Standardfehler, **p < 0.01, ***p < 0.001.
Fig. 2 zeigt, dass der FATP2-Inhibitor Lipofermata die Fettsäureaufnahme in CD4+ T-Zellen inhibiert, und die IFN-y Expression und Proliferation hemmt, ohne Apoptose zu induzieren.
Fig. 2A: Aufnahme von freien Fettsäuren in CD4+ T-Zellen nach Zugabe von Lipofermata in steigenden Konzentrationen (0, 2, 5, 7,5 und 10 pM). Dazu wurden die Zellen für 48 Stunden mit anti-CD3 und anti-CD28 Antikörpern stimuliert. Die Messung erfolgte nach 15-minütiger Inkubation der Zellen mit Bodipye™ FL C12 (2 pM) und nachfolgender durchfluss- zytometri scher Analyse. Die Mittlere Fluoreszenzintensität (MFI) ist abzüglich der jeweiligen FMO Kontrolle dargestellt (AMFI). Die Daten zeigen die mittlere Expression gemessen in 3 Experimenten ± Standardfehler.
Fig. 2B: Exemplarisches Histogramm der Fettsäureaufnahme in CD4+ T-Zellen ohne Zugabe von Lipofermata (rechts) und nach Lipofermata Zugabe (links).
Fig. 2C Prozentuale Anzahl IFN-y positiver CD4+ T-Zellen nach Zugabe von Lipofermata in steigender Konzentration (0, 2, 5, 7,5 und 10 pM). Dazu wurden die Zellen für 48 Stunden mit anti-CD3 und anti-CD28 Antikörpern stimuliert. Die Bestimmung IFN-y positiver Zellen erfolgte nach 5-stündiger Restimulation mit PMA und lonomycin in Anwesenheit von GolgiPlug™ mittels Durchflusszytometrie. Die Daten zeigen die mittlere Expression gemessen in 5-6 Experimenten ± Standardfehler, *p < 0.01.
Fig. 2D: Exemplarisches Punktdiagramm der IFN-y Expression ohne Zugabe von Lipofermata (links, Kontrolle) und nach Lipofermata Zugabe (rechts).
Fig. 2E: Prozentualer Anteil proliferierter CD4+ T-Zellen nach Zugabe von Lipofermata in steigender Konzentration (0, 2, 5, 7,5 und 10 pM). Dazu wurden die Zellen mit “cell proliferation dye eFlour™” gefärbt und für 48 Stunden mit anti-CD3 und anti-CD28 Antikörpern stimuliert. Die Bestimmung proliferierter Zellen erfolgte mittels Durchflusszytometrie. Die Daten zeigen die mittlere Expression gemessen in 5 Experimenten ± Standardfehler, *p < 0.01.
Fig. 2F: Exemplarisches Punktdiagramm der Zellproliferation ohne Zugabe von Lipofermata (links, Kontrolle) und nach Lipofermata Zugabe (rechts).
Fig. 2G: Exemplarisches Punktdiagramm der toten Zellen mit Lipofermata Behandlung (rechts) und ohne (links, Kontrolle). Die Zellen wurden dazu für 72 Stunden mit anti-CD3 und anti-CD28 Antikörpern stimuliert und zur durchflusszytometri sehen Lebend/Tot- Unterscheidung mit Propidiumiodid (PI) angefärbt.
Ausführliche Beschreibung der Erfindung
Bevor die Erfindung im Detail beschrieben wird, wird darauf hingewiesen, dass diese Erfindung nicht begrenzt ist auf bestimmte Bestandteile der beschriebenen Vorrichtungen oder beschriebenen Schritte der Verfahren, da diese Verfahren bzw. Vorrichtungen variieren können. Es wird auch darauf hingewiesen, dass die verwendete Terminologie hierfür nur zum Zweck für bestimmte beschriebene Ausführungsformen benutzt wird, und nicht absichtlich begrenzt ist. Es soll angemerkt werden, dass in der Beschreibung und in den anhängenden Ansprüchen die einfache Form wie „ein/eine“ oder „der/die/das“ einen singulären und/oder pluralen Gegenstand beinhaltet, sofern der Kontext nicht eindeutig etwas anderes vorschreibt. Für den Fall, dass ein Parameterbereich angegeben wurde, zählen die begrenzenden Zahlenwerte als Grenzwerte zum offenbarten bzw. beanspruchten Zahlenbereich dazu.
Es ist ferner zu beachten, dass die hier offenbarten Ausführungsformen nicht als einzelne Ausführungsformen zu verstehen sind, die sich nicht aufeinander beziehen würden. Merkmale, die im Zusammenhang mit einer Ausführungsform diskutiert werden, sollen auch im Zusammenhang mit anderen hier gezeigten Ausführungsformen als offenbart gelten. Wenn in einem Fall ein bestimmtes Merkmal nicht mit einer Ausführungsform, sondern mit einer anderen offenbart wird, wird der Fachmann verstehen, dass dies nicht unbedingt bedeutet, dass dieses Merkmal nicht mit der anderen Ausführungsform offenbart werden soll. Der Fachmann wird verstehen, dass es dem Prinzip dieser Anmeldung entspricht, das betreffende Merkmal auch für die andere Ausführungsform zu offenbaren, dass dies aber aus Gründen der Klarheit und um die Spezifikation in einem überschaubaren Umfang zu halten, nicht getan wurde.
Ferner wird der Inhalt der hierin genannten Dokumente des Standes der Technik durch Bezugnahme einbezogen. Dies gilt insbesondere für Dokumente des Standes der Technik, die Standard- oder Routineverfahren offenbaren. In diesem Fall hat die Einbeziehung durch Bezugnahme vor allem den Zweck, eine ausreichende Offenbarung zu ermöglichen und langwierige Wiederholungen zu vermeiden.
Gemäß einem ersten Aspekt betrifft die vorliegende Erfindung ein Verfahren zur Hemmung oder Verringerung der Fettsäureaufnahme in eine T-Zelle, der Aktivierung und/oder der Proliferation einer T-Zelle, wobei das Verfahren mindestens einen Schritt umfasst, ausgewählt aus der Gruppe bestehend aus
(i) Hemmen oder Reduzieren der SLC27A2-Gen expression der T-Zelle,
(ii) Hemmen oder Reduzieren der Aktivität des Fettsäure-Transportproteins-2 (FATP2), und/oder
(iii) Fördern des Abbaus des FATP2-Proteins. Wie hierin verwendet, bezieht sich der Begriff „T-Zellen“ auf Zellen umfassend T-Vorläufer- Zellen, T-Lymphozyten, cytotoxische (ggfs. CD8-positive) T-Zellen, (ggfs. CD4-positive) T- „Helfer“ -Zellen (Th-Zellen), Th 1 -Zellen, Th2-Zellen, Th3 -Zellen, Th9-Zellen, Thl7-Zellen, Th22-Zellen, Tfh-Zellen, Gedächtnis-T-Zellen, regulatorische T-Zellen (Treg), Suppressor- T-Zellen (Tsup), „Natural Killer“ T-Zellen (NKT-Zellen), naive T-Zellen, aktivierte T- Zellen, mucosa-assoziierte invariante T-Zellen, Alpha-Beta-T-Zellen, Gamma-Delta-T- Zellen, Thymocyten, doppelt-positive (CD4/CD8-positive) Thymocyten, primäre T-Zellen, reife immunkompetente T-Zellen, autoreaktive T-Zellen, periphere T-Zellen, synoviale T- Zellen, und T-Zell-Linien.
Die besagte Hemmung oder Reduzierung der 6ZC 742-Genexpression kann beispielsweise einen 6ZC 742-Gen-„Knock-down“, einen „Knock-out“, einen konditionalen „Gen-Knock- out“, eine Genveränderung oder Mutation im Sinne einer Insertion, Deletion und/oder Substitution, eine Genveränderung mittels eines Gen-Editierungs-Systems, eine RNA- Interferenz, siRNA und/oder Antisense-RNA umfassen.
Wie hierin verwendet, bezieht sich der Begriff „Gene Editing System” oder „Gen- Editierungs-Systeme“ auf molekularbiologische Techniken zur zielgerichteten Veränderung von DNA, beispielsweise am SLC27A2-Gen. Zu den klassischen Gen-Editierungs-Systemen gehören beispielsweise Zink-Finger-Nucleasen (ZFNs), Transkriptions-Aktivator-ähnliche Effektor-Nucleasen (T ALENs), die CRISPR/Cas-Methode, das CRISPR/Cpfl -System und sog. Meganukleasen. Die spezifische Erkennung der DNA erfolgt bei der Zinkfingemuklease, der TALEN und der Meganuclease durch einen bestimmten Proteinteil, während sie bei den CRISPR-Systemen durch eine spezifische RNA vermittelt wird (Zhu and Zhu, 2022).
Zink-Finger-Nucleasen (ZFNs) sind künstlich hergestellte Restriktionsenzyme. Sie enthalten eine Zinkfingerdomäne, die an DNA bindet, und eine Nukleasedomäne, welche die DNA schneidet. Die Zinkfingerdomäne kann so konstruiert werden, dass sie eine bestimmte DNA- Sequenz erkennt.
TALENs sind Fusionsproteine aus einer Z4Z-£^ector-DNA-bindenden Domäne und einer Endonukleasedomäne. Durch die im Zuge eines Proteindesigns eingeführte DNA-bindende Domäne erfolgt die sequenzspezifische Bindung, danach wird von der Endonuklease ein sequenzspezifischer Schnitt ausgeführt. Die CRISPR/Cas-Methode ^Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeals"., gruppierte kurze palindromische Wiederholungen mit regelmäßigen Abständen und CRJSPR- associated, CRISPR-assoziiertes Protein) ist ein molekularbiologisches Verfahren, um DNA gezielt zu schneiden und zu verändern. Es können sowohl Gene mit dem CRISPR/Cas- System eingefügt, entfernt oder ausgeschaltet werden, als auch Nukleotide in einem Gen geändert werden. Das DNA-schneidende Q/.s-Enzym bindet eine bestimmte RNA-Sequenz. Auf diese RNA-Sequenz folgt eine weitere RNA-Sequenz, die per Basenpaarung an eine DNA mit komplementärer Sequenz binden kann. Die RNA dient hierbei als Brücke zwischen Cas und der zu schneidenden DNA. Durch die Komplexierung von Cas, der RNA und der DNA wird das DNA-schneidende /.s-Enzym in die räumliche Nähe der gebundenen DNA gebracht, woraufhin das Enzym die (indirekt gebundene) DNA schneidet. Im Falle einer Einfügung von DNA in die Schnittstelle wird eine weitere DNA hinzugegeben, die an ihren beiden Enden jeweils überlappende Sequenzen für eines der beiden Enden der Schnittstelle aufweist. Die einzufügende DNA wird durch die zelleigene DNA-Reparatur mit den Enden der Schnittstelle verbunden (Nidhi et al. 2021).
Die genannten Endonukleasen werden zum Einführen zielgerichteter Veränderungen im Genom von einzelnen Zellen oder komplexen Organismen eingesetzt. Die Enzyme schneiden doppel strängige DNA an einer vorbestimmten Ziel sequenz, wodurch Doppel Strangbrüche entstehen. Die Doppel Strangbrüche wiederum aktivieren DNA-Reparatur-Prozesse in der Zelle, wie das “Non-homologous end-joining" (NHEJ) oder die Homologe Reparatur, die auch als “homology directed repair" (HDR) bezeichnet wird. Während mittels NHEJ Gene gezielt inaktiviert werden, kann die HDR zum gezielten Einfügen definierter Mutationen oder ganzer DNA- Ab schnitte ins Genom herangezogen werden. Die Genom-Editierung kann zum gezielten Zerstören eines Gens (Gen-“Knockout”), zum Einführen eines Gens an einer spezifischen Stelle im Genom (Gen-“Knockin”), oder zur Einführung einer Punktmutation in einem Gen verwendet werden.
Die sog. „Basen-Editierung” (Base Editing) ist eine neue präzise Methode der Genom- Editierung, die darin besteht, einzelne Basen in der DNA-Sequenz zu verändern). Hierbei wird eine mutierte Form der Cas9-Nuklease, die die DNA nicht mehr schneiden kann, mit einer Deaminase in Form eines Fusionsproteins gekoppelt. Dieses Fusionsprotein ist in der Lage, mit einer sgRNA (“single-guide” RNA) eine gewünschte DNA-Sequenz spezifisch zu erkennen und durch Desaminierung eine Base zu verändern. Im Falle der Fusion mit Cytidin- Deaminase wird das Cytidin in Uracil umgewandelt, das durch DNA-Reparatur und Replikation mit Thymidin ersetzt wird. Dadurch wird das Basenpaar C-G zu T-A mutiert. Alternativ kann Cas9 mit einer Adenosin-Deaminase gekoppelt werden, so dass das Adenosin in Inosin umgewandelt wird, das nach DNA-Reparatur und Replikation mit Guanosin ersetzt wird. In diesem Fall wird das Basenpaar A-T in G-C umgewandelt (Zhu and Zhu, 2022).
Die RNA-Interferenz (RNAi, RNA-Silencing) ist ein natürlicher Mechanismus in eukaryont- ischen Zellen, welcher der zielgerichteten Abschaltung von Genen im Zellkern dient. Sie erlaubt ein sog. “Gene Silencing”. Die RNA-Interferenz beruht auf einer Wechselwirkung kurzer RNA-Stücke mit der mRNA unter Beteiligung mehrerer Enzymkomplexe. Als Folge der Aktivität dieser Enzymkomplexe wird die mRNA in mehrere Bruchstücke gespalten, die codierte Information damit zerstört und die Translation in ein Protein verhindert.
Bei der sog. “small interfering RNA” (siRNA) handelt es sich um kurze RNA-Fragmente, welche im Organismus zum selektiven Abbau der komplementären mRNA führen. Damit verhindern sie gezielt die Genexpression und die Bildung von Proteinen.
Antisense-RNA ist eine einzelsträngige RNA, die komplementär zu einer proteincodierenden mRNA ist. Fast alle Antisense-RNAs weisen Sekundärstrukturen wie “stem-loops” und teilweise auch komplexere Tertiär Strukturen, wie “Pseudoknoten” zwischen eben diesen Sekundärstrukutren auf. Diese Strukturelemente bestimmen die Abbaurate durch intrazelluläre Ribonukleasen sowie die Rate, mit welcher sich die Antisense-RNA mit der komplementären mRNA paart. Die Paarung unterbindet die Translation des Gens.
Die besagte Hemmung oder Reduzierung der FATP2 (Fettsäure-Transportprotein-2)-Protein- Aktivität kann die Verwendung eines Wirkstoffs umfassen, der an das FATP2-Protein bindet und/oder seine Aktivität hemmt oder reduziert.
Vorzugsweise ist die besagte T-Zelle eine synoviale T-Zelle, besonders bevorzugt eine synoviale Gedächtnis-T-Zelle. Bei dem FATP2-Protein kann es sich um ein Säugetier-, Nicht-Primaten-, Primaten- und insbesondere um ein humanes FATP2-Protein oder ein Fragment davon handeln.
Gemäß einem zweiten Aspekt betrifft die vorliegende Erfindung ein Verfahren zur Identifizierung eines Wirkstoffs, der an das FATP2-Protein einer T-Zelle, oder ein Fragment davon, bindet, und/oder die Aktivität des FATP2-Proteins einer T-Zelle, oder eines Fragments davon, hemmt oder reduziert.
Das Verfahren umfasst mindestens die folgenden Schritte:
(i) Bereitstellen des FATP2-Proteins oder eines Fragments davon,
(ii) Zugabe von mindestens einem Wirkstoff, der auf Bindung an das FATP2-Protein oder ein Fragment davon untersucht werden soll, und
(iii) Identifizierung des mindestens einen Wirkstoffs, der an das FATP2-Protein oder ein Fragment davon gebunden hat.
Vorzugsweise ist der zu screenende und zu identifizierende Wirkstoff gemäß der vorliegenden Erfindung ein FATP2-Inhibitor oder FATP2- Antagonist, ein die Aktivität des FATP2-Proteins, oder eines Fragments davon, hemmendes oder reduzierendes Agens.
Der Wirkstoff gemäß der vorliegenden Erfindung kann aus der Gruppe bestehend aus einer niedermolekularen Verbindung, einem Peptid, insbesondere einem natürlichen oder synthetischen Peptid oder Peptid-Derivat, und einem Biologikum oder biologischen Wirkstoff ausgewählt werden.
Im Kontext der vorliegenden Erfindung bezieht sich der Begriff "niedermolekulare Verbindung", "kleines Molekül" ("smol") oder "chemisches Arzneimittel" auf eine organische Verbindung mit niedrigem Molekulargewicht (<10.000 Dalton, insbesondere < 1.000 Dalton), oft mit einer Größe in der Größenordnung von 1 nm. Viele Medikamente sind kleine Moleküle. Solche kleinen Moleküle können einen biologischen Prozess regulieren. Kleine Moleküle können in der Lage sein, eine spezifische Funktion eines Proteins zu hemmen. Im Bereich der Pharmakologie bezieht sich der Begriff "kleines Molekül" insbesondere auf Moleküle, die an spezifische biologische Makromoleküle binden und als Effektor wirken, indem sie die Aktivität oder Funktion eines Ziels verändern. Zum Beispiel gilt Acetylsalicylsäure (ASS) als niedermolekulare Verbindung, die 180 Dalton misst und aus 21 Atomen besteht. Solche niedermolekularen Verbindungen haben oft nur eine geringe Fähigkeit, eine Immunreaktion auszulösen und bleiben über die Zeit relativ stabil.
Die niedermolekulare Verbindung gemäß der vorliegenden Erfindung kann neben anderen chemischen Rückgraten, Substituenten, Gruppen oder Resten beispielsweise Alkyl-, Alkenyl, Alkinyl-, Alkoxy-, Aryl-, Alkylen-, Arylen-, Amino-, Halogen-, Carboxylatderivat-, Cycloalkyl-, Carbonylderivat-, Heterocycloalkyl-, Heteroaryl-, Heteroarylen-, Sulfonat-, Sulfat-, Phosphonat-, Phosphat-, Phosphin-, Phosphinoxidgruppen umfassen.
Das "Biologikum", "biologische Arzneimittel", "biologische Therapeutikum", "Biopharmazeutikum" oder der "biologische Wirkstoff' gemäß der vorliegenden Erfindung ist vorzugsweise ein Antikörper, oder ein antigen-bindendes Fragment davon, oder ein antigen-bindendes Derivat davon, oder ein antikörperähnliches Molekül oder Protein, oder ein Aptamer, oder eine Nukleinsäure.
In einer bevorzugten Ausführungsform des Verfahrens zur Identifizierung eines Wirkstoffs, der an das FATP2-Protein oder ein Fragment davon bindet, und/oder die Aktivität des FATP2-Proteins, oder eines Fragments davon, hemmt oder reduziert, ist der Wirkstoff Mitglied einer „Bibliothek“ von Verbindungen.
Die "Bibliothek" (Mischung) von Verbindungen kann z. B. niedermolekulare Verbindungen, natürliche oder synthetische Peptide oder Peptid-Derivate, bzw. Biologika oder biologische Wirkstoffe oder biologische Verbindungen umfassen.
Im Kontext der vorliegenden Erfindung bezieht sich der Begriff "(kombinatorische) Verbindungsbibliothek" oder "Bibliothek von Verbindungen" auf Sammlungen von jeweils chemischen Verbindungen, kleinen Molekülen, natürlichen oder synthetischen Peptiden oder Peptid-Derivaten, bzw. Makromolekülen wie Proteinen oder anderen Biologika, in denen jeweils eine große Anzahl verwandter chemischer, pepti discher bzw. biologischer Spezies von Molekülen enthalten sind, die zusammen in bestimmten Screening-Assays oder Identifizierungsschritten verwendet werden können.
Verfahren zur Herstellung von Molekülbibliotheken niedermolekularer chemischer Verbindungen („Compound Libraries“) und zur Hochdurchsatz-Prüfung („High-Throughput- Screening“) der Verbindungen auf Wechselwirkung mit dem Target-Molekül sind im Stand der Technik beschrieben (zum Beispiel, Volochnyuk et al. 2019). Diese Verfahren umfassen auch sog. „Fokus-Libraries“, hochgradig annotierte und vor-selektierte chemische Molekülbibliotheken (Wassermann et al. 2014), DNA-codierte Bibliotheken chemischer Verbindungen (Martin et al. 2020), und chemoinformatik-basierte virtuelle Molekülbibliotheken (Saldivar-Gonzalez et al. 2020). Die Verwendung sog. „Phage Display“-Technologien zur Identifizierung von geeigneten „Small-Molecule“ -Wirkstoff en wurde beispielsweise beschrieben von Takakusagi et al., 2020. Zahlreiche andere Peptid- und Anti-körper- „Display“-Technologien wie „Bacterial Display“, „Yeast Surface Display“ und „Mammalian Surface Display“ sowie „Ribosome Display“ sind beschrieben in Valldorf et al.,
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Verfahren zur Herstellung von Molekülbibliotheken, deren Immobilisierung und deren Hochdurchsatz-Prüfung („High-Throughput-Screening“) von biologischen Molekülen, beispielsweise von Peptiden, Peptid-Derivaten, Proteinen, Antikörpern, antigen-bindenden Antikörper-Fragmenten, antigen-bindenden Antikörper-Derivaten, oder antikörper-ähnlichen Molekülen, sind im Stand der Technik ebenfalls beschrieben (für Peptid-Bibliotheken beispielsweise in Bozovicar und Bratkovic 2019; Schwaar et al. 2019; für Antikörper-Bibliotheken in Lin und Lerner 2021).
In einer bevorzugten Ausführungsform des Verfahrens zur Identifizierung eines Wirkstoffs, der an das FATP2-Protein oder ein Fragment davon bindet, und/oder die Aktivität des FATP2-Proteins oder eines Fragments davon hemmt oder reduziert, ist das Biologikum ein Antikörper, ein antigen-bindendes Fragment davon, ein antigen-bindendes Derivat davon, ein antikörperähnliches Molekül oder Protein, ein Aptamer, oder eine Nukleinsäure.
In einer bevorzugten Ausführungsform des Verfahrens zur Identifizierung eines Wirkstoffs, der an das FATP2-Protein oder ein Fragment davon bindet, und/oder die Aktivität des FATP2-Proteins oder eines Fragments davon hemmt oder reduziert, ist das FATP2-Protein an eine feste Phase gebunden oder liegt in Lösung vor.
Gemäß einem dritten Aspekt betrifft die vorliegende Erfindung die Verwendung einer Nukleinsäure, die das FATP2-Protein oder ein Fragment davon kodiert, oder die Verwendung des FATP2-Proteins oder eines Fragments davon, in einem Verfahren zur Identifizierung eines Wirkstoffs, der an das FATP2-Protein oder ein Fragment davon bindet, und/oder die Aktivität des FATP2-Proteins oder eines Fragments davon hemmt oder reduziert.
Zur Expression des FATP2-Proteins oder eines Fragments davon wird eine Nukleinsäure, die das FATP2-Protein oder ein Fragment davon kodiert, in einen geeigneten Expressionsvektor, z.B. ein geeignetes Expressionsplasmid, kloniert wie beschrieben (Green und Sambrook 2012). Das rekombinante Expressionsprotein wird durch Transfektion in eine für die Expression des FATP2-Proteins oder eines Fragments davon geeignete Zelle eingeschleust, die Zelle in Zellkultur mit einem geeigneten Zellkulturmedium propagiert, und das exprimierte Protein aus den Zellen und/oder dem Zellkulturmedium gereinigt.
Wie hierin verwendet, bezieht sich der Begriff „Transfektion“ auf jegliches Verfahren zum absichtlichen Einbringen einer fremden Nukleinsäure in eine eukaryontische Zelle. Für eine Transfektion in eukaryontische Zellen können verschiedene Arten von Nukleinsäuren verwendet werden, insbesondere Desoxyribonukleinsäure (DNA), Ribonukleinsäure (RNA), sowie kleine, nicht codierende RNAs wie siRNA, shRNA, und miRNA.
Hinsichtlich der Transfektion werden stabile und transiente Transfektion unterschieden. Bei der stabilen Transfektion wird durch Integration der in die Zelle eingeführten Nukleinsäure in das zelluläre Genom eine Langzeit-Expression des Transgens erreicht, während die transiente Transfektion, bei der die Expression des Transgens nur vorübergehend erfolgt, keine Integration der Nukleinsäure in das zelluläre Genom erfordert (Fus-Kujawa et al. 2021).
Die Auswahl der optimalen Transfektionsmethode hängt von verschiedenen Faktoren ab, insbesondere dem Typ und Ursprung der Ziel- bzw. Produktionszelle sowie der Art der eingeführten Nukleinsäure. Für die Einführung von fremder (modifizierter homologer und/ oder heterologer) Nukleinsäure, die das/die gewünschte(n) Transgen(e) codiert, in eukaryontische Zellen können physikalische, chemische und virale vector-basierte Transfektions- methoden verwendet werden. Physikalische Transfektionsverfahren umfassen z.B. Elektro- poration, Sonoporation, Magnetofektion, Microinjektion und biolistische Verfahren. Zu den chemischen Transfektionsverfahren zählen die Calciumphosphat-Methode, die Verwendung von Dendrimeren, kationischen Polymeren wie Diethylaminoethyl-dextran (DEAE-dextran), Nanopartikeln, nicht-liposomalen Nanopartikeln, und liposomaler Transfektion. Bei der Transfektion mittels viraler Vektoren (sog. „Transduktion“) kommen insbesondere genetisch modifizierte Retro- und Lentiviren, Adenoviren, und adeno-assoziierte Viren (AAV) zum Einsatz (Fus-Kujawa et al. 2021).
Gemäß einem vierten Aspekt betrifft die vorliegende Erfindung einen Wirkstoff, erhalten durch besagtes Verfahren zur Identifizierung eines Wirkstoffs, der an das FATP2-Protein einer T-Zelle oder ein Fragment davon bindet, und/oder die Aktivität des FATP2-Proteins einer T-Zelle, oder eines Fragments davon, hemmt oder reduziert, bzw. erhalten durch eine der oben beschriebenen Ausführungsformen des besagten Verfahrens.
Weiterhin betrifft die vorliegende Erfindung einen Wirkstoff, der an das FATP2-Protein oder ein Fragment davon in einer T-Zelle bindet, und/oder die Aktivität des FATP2-Proteins, oder eines Fragments davon, hemmt oder reduziert, und/oder den Abbau des FATP2-Proteins fördert.
Weiterhin betrifft die vorliegende Erfindung einen Wirkstoff, der die Expression des SLC27A2-Gens in einer T-Zelle hemmt oder reduziert, vorzugsweise wobei die T-Zelle eine synoviale T-Zelle ist.
In einer bevorzugten Ausführungsform betrifft die vorliegende Erfindung einen Wirkstoff, wobei der Wirkstoff eine niedermolekulare Verbindung (smol), ein Peptid oder Peptid- Derivat, oder ein Biologikum ist, vorzugsweise wobei das Biologikum ein Antikörper oder ein antigen-bindendes Fragment davon, oder ein antigen-bindendes Derivat davon, oder ein antikörperähnliches Protein, oder ein Aptamer oder eine Nukleinsäure ist.
In einer bevorzugten Ausführungsform bindet der Wirkstoff spezifisch mit einer hohen oder besonders hohen Affinität und/oder Avidität an das FATP2-Protein oder ein Fragment davon. In einer bevorzugten Ausführungsform reduziert oder hemmt der Wirkstoff, wenn er an FATP2 gebunden ist, die FATP2- Aktivität.
Der Begriff "spezifisch binden", wie hier verwendet, bedeutet, dass der Wirkstoff eine Dissoziationskonstante KD bezüglich seiner Bindung an das FATP2-Proteinmolekül oder ein Epitop davon von höchstens etwa 100 pM aufweist. In einer Ausführungsform ist die KD etwa 100 pM oder niedriger, etwa 50 pM oder niedriger, etwa 30 pM oder niedriger, etwa 20 pM oder niedriger, etwa 10 pM oder niedriger, etwa 5 pM oder niedriger, etwa 1 pM oder niedriger, etwa 900 nM oder niedriger, etwa 800 nM oder niedriger, etwa 700 nM oder niedriger, etwa 600 nM oder niedriger, etwa 500 nM oder niedriger, etwa 400 nM oder niedriger, etwa 300 nM oder niedriger, etwa 200 nM oder niedriger, etwa 100 nM oder niedriger, etwa 90 nM oder niedriger, etwa 80 nM oder niedriger, etwa 70 nM oder niedriger, etwa 60 nM oder niedriger, etwa 50 nM oder niedriger, etwa 40 nM oder niedriger, etwa 30 nM oder niedriger, etwa 20 nM oder niedriger, oder etwa 10 nM oder niedriger, etwa 1 nM oder niedriger, etwa 900 pM oder niedriger, etwa 800 pM oder niedriger, etwa 700 pM oder niedriger, etwa 600 pM oder niedriger, etwa 500 pM oder niedriger, etwa 400 pM oder niedriger, etwa 300 pM oder niedriger, etwa 200 pM oder niedriger, etwa 100 pM oder niedriger, etwa 90 pM oder niedriger, etwa 80 pM oder niedriger, etwa 70 pM oder niedriger, etwa 60 pM oder niedriger, etwa 50 pM oder niedriger, etwa 40 pM oder niedriger, etwa 30 pM oder niedriger, etwa 20 pM oder niedriger oder etwa 10 pM oder niedriger oder etwa 1 pM oder niedriger.
Gemäß einem fünften Aspekt betrifft die vorliegende Erfindung einen Antikörper, oder ein antigen-bindendes Fragment oder antigen-bindendes Derivat davon, oder ein antikörperähnliches Protein, das spezifisch an das FATP2-Protein, vorzugsweise an das FATP2-Protein in einer T-Zelle, bindet.
In einer bevorzugten Ausführungsform betrifft die vorliegende Erfindung besagten Antikörper, oder antigen -bindendes Fragment oder antigen-bindendes Derivat davon, oder antikörperähnliches Protein, wobei der Antikörper, oder das antigen-bindende Fragment oder Derivat davon, oder das antikörperähnliche Protein die FATP2- Aktivität inhibiert, d.h. als Inhibitor oder Antagonist von FATP2 wirkt.
Wie hierin verwendet, bezieht sich der Begriff "Antikörper" auf ein Protein, das aus einer oder mehreren Polypeptidketten besteht, die von Immunglobulin-Genen oder Fragmenten von Immunglobulin-Genen oder von diesen abgeleiteten cDNAs kodiert werden. Zu diesen Immunglobulin-Genen gehören die Gene der leichten Kette kappa, lambda und der schweren Kette alpha, delta, epsilon, gamma und mu der konstanten Region sowie jedes der vielen verschiedenen Gene der variablen Region.
Die grundlegende Struktureinheit des Immunglobulins (Antikörpers) ist normalerweise ein Tetramer, das aus zwei identischen Paaren von Polypeptidketten besteht, den leichten Ketten (L, mit einem Molekulargewicht von etwa 25 kDa) und den schweren Ketten (H, mit einem Molekulargewicht von etwa 50-70 kDa). Jede schwere Kette besteht aus einer variablen Region der schweren Kette (abgekürzt als VH oder VH) und einer konstanten Region der schweren Kette (abgekürzt als CH oder CH). Die konstante Region der schweren Kette besteht aus drei Domänen, nämlich CHI, CH2 und CH3. Jede leichte Kette enthält eine variable Region der leichten Kette (abgekürzt als VL oder VL) und eine konstante Region der leichten Kette (abgekürzt als CL oder CL). Die VH- und VL-Regionen können weiter unterteilt werden in Regionen mit Hypervariabilität, die auch als komplementaritätsbestimmende Regionen (CDR) bezeichnet werden, durchsetzt mit Regionen, die eher konserviert sind und als Framework-Regionen (FR) bezeichnet werden. Jede VH- und VL-Region besteht aus drei CDRs und vier FRs, die vom Aminoterminus zum Carboxyterminus in der Reihenfolge FR1, CDRI, FR2, CDR2, FR3, CDR3, FR4 angeordnet sind. Die variablen Regionen der schweren und leichten Ketten bilden eine Bindungsdomäne, die mit einem Antigen interagiert.
Die CDRs sind am wichtigsten für die Bindung des Antikörpers bzw. des antigenbindenden Teils davon. Die FRs können durch andere Sequenzen ersetzt werden, sofern die dreidimensionale Struktur, die für die Bindung des Antigens erforderlich ist, erhalten bleibt.
Der Begriff "antigenbindender Teil" des (monoklonalen) Antikörpers bezieht sich auf ein oder mehrere Fragmente eines Antikörpers, die die Fähigkeit zur spezifischen Bindung an das Antigen in seiner nativen Form beibehalten. Beispiele für antigenbindende Teile des Antikörpers umfassen ein Fab-Fragment, ein monovalentes Fragment, das aus den VL-, VH-, CL- und CHI -Domänen besteht, ein F(ab')2-Fragment, ein bivalentes Fragment, das zwei Fab-Fragmente umfasst, die durch eine Disulfidbrücke an der Schamierregion verbunden sind, ein Fd-Fragment, bestehend aus der VH- und CHI -Domäne, ein Fv-Fragment, bestehend aus den VL- und VH-Domänen eines einzelnen Arms eines Antikörpers, und ein dAb-Fragment, das aus einer VH-Domäne und einer isolierten komplementaritätsbestimmenden Region (CDR) besteht.
Der Antikörper, das Antikörperfragment oder das Antikörperderivat davon gemäß der vorliegenden Erfindung kann ein monoklonaler Antikörper sein. Der Antikörper kann vom Isotyp IgA, IgD, IgE, IgG oder IgM sein. Wie hierin verwendet, bezieht sich der Begriff "monoklonaler Antikörper (mAb)" auf eine Antikörperzusammensetzung mit einer homogenen Antikörperpopulation, d.h. einer homogenen Population, die aus einem ganzen Immunglobulin oder einem Fragment oder Derivat davon besteht. Besonders bevorzugt ist ein solcher Antikörper ausgewählt aus der Gruppe bestehend aus IgG, IgD, IgE, IgA und/oder IgM, oder ein Fragment oder Derivat davon.
Wie hierin verwendet, bezieht sich der Begriff "Fragment" auf Fragmente eines solchen Antikörpers, die ihre Zielbindungskapazitäten beibehalten, z.B. eine CDR (komplementaritätsbestimmende Region), eine hypervariable Region, eine variable Domäne (Fv), eine schwere IgG-Kette (bestehend aus VH-, CHI-, Scharnier-, CH2- und CH3 -Regionen), eine leichte IgG-Kette (bestehend aus VL- und CL-Regionen) und/oder eine Fab und/oder F(ab)2.
Wie hier verwendet, bezieht sich der Begriff "Derivat" auf Proteinkonstrukte, die sich strukturell von dem gängigen Antikörperkonzept unterscheiden, aber dennoch eine gewisse strukturelle Verwandtschaft zu diesem aufweisen, z. B. scFv, Fab und/oder F(ab)2, sowie auf bi-, tri- oder höher-spezifische Antikörperkonstrukte. Alle diese Elemente werden im Folgenden erläutert.
Weitere dem Fachmann bekannte Antikörperderivate sind Diabodies, Camelid-Antikörper, Domain-Antikörper, bivalente Homodimere mit zwei Ketten, die aus scFvs bestehen, IgAs (zwei IgG- Strukturen, die durch eine J-Kette und eine sekretorische Komponente verbunden sind), Hai-Antikörper, Antikörper, die aus Neuwelt-Primaten-Gerüst plus Nicht-Neuwelt- Primaten-CDR bestehen, dimerisierte Konstrukte, die CH3+VL+VH umfassen, andere Gerüstproteinformate, die CDRs umfassen, und Antikörperkonjugate.
Wie hier verwendet, bezieht sich der Begriff "antikörperähnliches Protein" auf ein Protein, das (z. B. durch Mutagenese von Ig-Schleifen) so verändert wurde, dass es spezifisch an ein Zielmolekül bindet. Typischerweise umfasst ein solches antikörperähnliches Protein mindestens eine variable Peptidschleife, die an beiden Enden an ein Proteingerüst gebunden ist. Diese doppelte strukturelle Einschränkung erhöht die Bindungsaffinität des antikörperähnlichen Proteins auf ein Niveau, das mit dem eines Antikörpers vergleichbar ist. Die Länge der variablen Peptidschleife besteht typischerweise aus 10 bis 20 Aminosäuren. Das Gerüstprotein kann jedes Protein mit guten Löslichkeitseigenschaften sein. Vorzugsweise ist das Gerüstprotein ein kleines globuläres Protein. Antikörperähnliche Proteine umfassen ohne Einschränkung Affibodies, Anticaline und designte Ankyrin-Proteine und Affilin-Proteine. Antikörperähnliche Proteine können aus großen Bibliotheken von Mutanten abgeleitet werden, z. B. durch Panning aus großen Phage-Display -Bibliotheken, und können in Analogie zu regulären Antikörpern isoliert werden. Auch können antikörperähnliche Bindungsproteine durch kombinatorische Mutagenese von oberflächenexponierten Resten in globulären Proteinen erhalten werden. Antikörperähnliche Proteine wurden beschrieben beispielsweise in Binz et al. (2005) und Hosse et al. (2006).
Wie hier verwendet, bezieht sich der Begriff "Fab" auf ein IgG-Fragment, das die Antigenbindungsregion umfasst, wobei das Fragment aus einer konstanten und einer variablen Domäne jeweils der schweren und leichten Kette des Antikörpers zusammengesetzt ist.
Wie hier verwendet, bezieht sich der Begriff "F(ab)2" auf ein IgG-Fragment, das aus zwei Fab-Fragmenten besteht, die durch Disulfidbindungen miteinander verbunden sind.
Der hier verwendete Begriff "scFv" bezieht sich auf ein variables Einzelkettenfragment, das eine Fusion der variablen Regionen der schweren und leichten Ketten von Immunglobulinen ist, die durch einen kurzen Linker miteinander verbunden sind, der üblicherweise Serin- (S) und/oder Glycin- (G) Reste umfasst. Dieses chimäre Molekül behält die Spezifität des ursprünglichen Immunglobulins bei, trotz der Entfernung der konstanten Regionen und der Einführung eines Linker-Peptids.
Modifizierte Antikörperformate sind z.B. bi- oder tri spezifische Antikörperkonstrukte, antikörperbasierte Fusionsproteine, Immunkonjugate und ähnliches.
IgG, scFv, Fab und/oder F(ab)2 sind Antikörperformate, die dem Fachmann gut bekannt sind. Detailierte Ausführungen und Techniken sind in entsprechenden Lehrbüchern zu finden.
Gemäß bevorzugten Ausführungsformen der vorliegenden Erfindung ist der Antikörper oder das antigenbindende Fragment davon oder das antigenbindende Derivat davon ein muriner, ein chimärer, ein humanisierter oder ein humaner Antikörper bzw. ein antigenbindendes Fragment oder ein antigenbindendes Derivat davon. Monoklonale Antikörper (mAb), die von der Maus stammen, können unerwünschte immunologische Nebenwirkungen verursachen, da sie ein Protein einer anderen Spezies enthalten, das eine Immunantwort induzieren kann. Um dieses Problem zu überwinden, wurden Methoden zur Humanisierung und Reifung von Antikörpern entwickelt, um Antikörpermoleküle mit minimaler Immunogenität bei Anwendung am Menschen zu erzeugen, während die Spezifität und Affinität des nicht-humanen parentalen Antikörpers im Idealfall erhalten bleibt. Bei diesen Methoden werden z. B. die Gerüstregionen eines Maus- mAbs durch entsprechende humane Gerüstregionen ersetzt (sog. CDR-Grafting). W0200907861 offenbart die Erzeugung humanisierter Formen von Maus-Antikörpern durch Verknüpfung der CDR-Regionen nicht-humaner Antikörper mit humanen konstanten Regionen mittels rekombinanter DNA-Technologie. US6548640 beschreibt CDR- Transplantationstechniken, und US5859205 beschreibt die Herstellung humanisierter Antikörper.
Wie hierin verwendet, bezieht sich der Begriff "humanisierter Antikörper" auf einen Antikörper, ein Fragment oder ein Derivat davon, bei dem mindestens ein Teil der konstanten Regionen und/oder der Gerüstregionen und optional ein Teil der CDR-Regionen des Antikörpers von humanen Immunglobulinsequenzen abgeleitet oder an diese angepasst ist.
Gemäß einem sechsten Aspekt betrifft die vorliegende Erfindung einen Wirkstoff wie oben beschrieben oder einen Antikörper, ein antigen-bindendes Fragment oder ein antigenbindendes Derivat davon, oder ein antikörperähnliches Protein, wie oben beschrieben, zur Verwendung bei der Behandlung einer Autoimmunerkrankung.
Dabei handelt es sich bei der Autoimmunerkrankung vorzugsweise um Rheuma, Rheumatoide Arthritis, juvenile idiopathische Arthritis, chronische entzündliche Darmerkrankungen einschließlich Colitis ulcerosa und Morbus Crohn, Multiple Sklerose, und anderen Autoimmunerkrankungen mit T-zellulärer Beteiligung.
Weiterhin betrifft die vorliegende Erfindung eine pharmazeutische Zusammensetzung, umfassend den Wirkstoff wie oben beschrieben, oder den Antikörper, das antigen-bindende Fragment oder antigen-bindende Derivat davon, oder ein antikörperähnliches Protein, wie oben beschrieben, und einen oder mehrere pharmazeutisch verträgliche Hilfsstoffe, zur Verwendung bei der Behandlung einer Autoimmunerkrankung, vorzugsweise wobei besagte Autoimmunerkrankung ausgewählt ist aus der Gruppe bestehend aus Rheuma, Rheumatoider Arthritis, juveniler idiopathischer Arthritis, chronischen entzündlichen Darmerkrankungen einschließlich Colitis ulcerosa und Morbus Crohn, Multiple Sklerose, und anderen Autoimmunerkrankungen mit T-zellulärer Beteiligung.
Bei einer bevorzugten Ausführungsform der vorliegenden Erfindung ist/sind der/die besagte(n) pharmazeutisch verträgliche(n) Hilfsstoff(e) ausgewählt aus der Gruppe bestehend aus pharmazeutisch verträglichen Puffern, Tensiden, Verdünnungsmitteln, Trägem, Hilfsstoffen, Füllstoffen, Bindemittel, Schmiermitteln, Gleitmitteln, Desinfektionsmitteln, Adsorptionsmitteln und/oder Konservierungsmitteln.
Die besagte pharmazeutische Zusammensetzung kann in Form von Pulver, Tabletten, Pillen, Kapseln oder Perlen verabreicht werden. In wässriger Form kann die pharmazeutische Formulierung zur Verabreichung bereit sein, während die Formulierung in lyophilisierter Form vor der Verabreichung in eine flüssige Form überführt werden muss, z. B. durch Zugabe von Wasser für Injektionszwecke, das ein Konservierungsmittel wie z. B., aber nicht beschränkt auf, Benzylalkohol, Antioxidantien wie Vitamin A, Vitamin E, Vitamin C, Retinylpalmitat und Selen, die Aminosäuren Cystein und Methionin, Zitronensäure und Natriumcitrat, synthetische Konservierungsmittel wie die Parabene Methylparaben und Propylparaben enthalten kann oder nicht.
Die pharmazeutische Formulierung kann ferner einen oder mehrere Stabilisatoren enthalten, die z. B. eine Aminosäure, ein Zuckerpolyol, ein Disaccharid und/oder ein Polysaccharid sein können. Die pharmazeutische Formulierung kann weiterhin ein oder mehrere Tenside, ein oder mehrere Isotonisierungsmittel und/oder einen oder mehrere Metallionenchelatoren und/oder ein oder mehrere Konservierungsmittel enthalten.
Die pharmazeutische Formulierung, wie hierin beschrieben, kann zumindest für eine orale, parenterale, intravenöse, intramuskuläre oder subkutane Verabreichung geeignet sein. Alternativ kann der Wirkstoff oder Antikörper gemäß der vorliegenden Erfindung in einer Depotformulierung bereitgestellt werden, die die verzögerte Freisetzung des Wirkstoffs über einen bestimmten Zeitraum ermöglicht. Weiterhin wird eine Primärverpackung, wie z. B. eine vorgefüllte Spritze oder ein vorgefüllter Pen, ein Fläschchen oder ein Infusionsbeutel, bereitgestellt, die die besagte pharmazeutische Formulierung gemäß diesem Aspekt der Erfindung umfasst.
Die vorgefüllte Spritze oder der Pen kann die Formulierung entweder in gefriergetrockneter Form (die dann vor der Verabreichung z. B. mit Wasser für Injektionszwecke aufgelöst werden muss) oder in wässriger Form enthalten. Die Spritze oder der Pen ist häufig ein Einwegartikel zum einmaligen Gebrauch und kann ein Volumen zwischen 0,1 und 20 ml haben. Die Spritze oder der Pen kann jedoch auch eine Mehrwegspritze oder ein Mehrdosen- Pen sein.
Weiterhin betrifft die vorliegende Erfindung die Verwendung eines Wirkstoffs, der an das FATP2-Protein bindet, in einem Verfahren zur Behandlung einer Autoimmunerkrankung, vorzugsweise wobei besagte Autoimmunerkrankung ausgewählt ist aus der Gruppe bestehend aus Rheuma, Rheumatoider Arthritis, juveniler idiopathischer Arthritis, chronischen entzündlichen Darmerkrankungen einschließlich Colitis ulcerosa und Morbus Crohn, Multiple Sklerose, und anderen Autoimmunerkrankungen mit T-zellulärer Beteiligung. Vorzugsweise hemmt der Wirkstoff, wenn er an FATP2 gebunden ist, die FATP2-Aktivität.
Weiterhin betrifft die vorliegende Erfindung die Verwendung eines Wirkstoffs, der an das FATP2-Protein bindet, zur Herstellung eines Arzneimittels zur Behandlung einer Autoimmunerkrankung, wobei die Autoimmunerkrankung vorzugsweise ausgewählt ist aus der Gruppe bestehend aus Rheuma, Rheumatoider Arthritis, juveniler idiopathischer Arthritis, chronischen entzündlichen Darmerkrankungen einschließlich Colitis ulcerosa und Morbus Crohn, Multiple Sklerose, und anderen Autoimmunerkrankungen mit T-zellulärer Beteiligung. Vorzugsweise hemmt der Wirkstoff, wenn er an FATP2 gebunden ist, die F ATP2- Aktivität.
Weiterhin betrifft die vorliegende Erfindung ein Verfahren zur Behandlung oder Vorbeugung einer Autoimmunerkrankung, wobei das Verfahren die Verabreichung eines Wirkstoffs, der an das FATP2-Protein bindet und/oder dieses hemmt, in einer therapeutisch wirksamen Dosis oder Menge an ein menschliches oder tierisches Subjekt umfasst. Wie hierin verwendet, bedeutet der Begriff "wirksame Dosis" oder "wirksame Menge" eine Dosis oder eine Menge des Wirkstoffs, die bezüglich der Dosierungen und Verabreichungs- Zeiträume notwendig ist, um bei einem Patienten das erwünschte therapeutische Ergebnis zu erzielen. Wirksame Mengen können in Abhängigkeit von Faktoren wie dem Krankheitszustand, dem Alter, dem Geschlecht und/oder dem Gewicht des Patienten, der pharmazeutischen Formulierung, der Unterart der zu behandelnden Krankheit und dergleichen variieren, können aber dennoch von einem Fachmann routinemäßig bestimmt werden.
Gemäß einem siebten Aspekt betrifft die vorliegende Erfindung ein Verfahren zur Herstellung eines Wirkstoffs gemäß dem Verfahren zur Identifizierung des besagten Wirkstoffs, der an das FATP2-Protein oder ein Fragment davon bindet, und/oder die Aktivität des FATP2-Proteins, oder eines Fragments davon, hemmt oder reduziert, wie oben beschrieben, ferner umfassend die Aufreinigung des besagten Wirkstoffs.
Weiterhin betrifft die vorliegende Erfindung ein Verfahren zur Herstellung einer pharmazeutischen Zusammensetzung, umfassend
(i) das Verfahren zur Identifizierung des besagten Wirkstoffs, der an das FATP2-Protein oder ein Fragment davon bindet, und/oder die Aktivität des FATP2-Proteins, oder eines Fragments davon, hemmt oder reduziert, wie oben beschrieben, und ferner
(ii) das Mischen des identifizierten Wirkstoffs mit einem pharmazeutisch akzeptablen Träger.
Gemäß einem achten Aspekt betrifft die vorliegende Erfindung eine Zusammensetzung, umfassend eine Kombination aus
(i) dem Wirkstoff, der an das FATP2-Protein oder ein Fragment davon in einer T-Zelle bindet, und/oder die Aktivität des FATP2-Proteins, oder eines Fragments davon, in einer T- Zelle, hemmt oder reduziert, wie oben beschrieben, oder dem Antikörper oder antigenbindenden Fragment oder antigen-bindenden Derivat davon oder dem antikörperähnlichen Protein wie oben beschrieben, oder der pharmazeutischen Zusammensetzung, umfassend den Wirkstoff wie oben beschrieben, oder den Antikörper, das antigen-bindende Fragment oder antigen-bindende Derivat davon, oder ein antikörperähnliches Protein, wie oben beschrieben, und einen oder mehrere pharmazeutisch verträgliche Hilfsstoffe, und
(ii) einer oder mehreren weiteren therapeutisch aktiven Verbindungen. Gemäß einem neunten Aspekt betrifft die vorliegende Erfindung ein therapeutisches Kit, umfassend:
(i) die pharmazeutische Zusammensetzung wie oben beschrieben,
(ii) eine Vorrichtung zur Verabreichung der besagten Zusammensetzung, und
(iii) optional eine Gebrauchsanweisung.
Beispiele
Die vorliegende Erfindung wird durch die im Folgenden gezeigten und diskutierten Beispiele und Zeichnungen genauer erläutert. Dabei ist zu beachten, dass die Beispiele und Zeichnungen nur beschreibenden Charakter haben und nicht dazu gedacht sind, die Erfindung in irgendeiner Form einzuschränken.
Die Erfindung ist nicht auf die offengelegten Ausführungsformen beschränkt. Andere Variationen der offengelegten Ausführungsformen können von Fachleuten bei der Ausführung der beanspruchten Erfindung aus einem Studium der Zeichnungen, der Offenbarung und der beigefügten Ansprüche verstanden und ausgeführt werden. In den Ansprüchen schließt das Wort "umfassend" andere Elemente oder Schritte nicht aus, und der unbestimmte Artikel "ein" oder "eine" schließt eine Mehrzahl nicht aus. Die bloße Tatsache, dass bestimmte Maßnahmen in voneinander verschiedenen abhängigen Ansprüchen rezitiert werden, bedeutet nicht, dass eine Kombination dieser Maßnahmen nicht vorteilhaft eingesetzt werden kann. Etwaige Bezugszeichen in den Ansprüchen sind nicht als Einschränkung des Anwendungsbereichs zu verstehen.
Alle hier offengelegten Aminosäuresequenzen sind vom N-Terminus zum C-Terminus dargestellt; alle hier offengelegten Nukleinsäuresequenzen sind 5'->3' dargestellt.
Beispiel 1: Erhöhte Fettsäureaufnahme von T-Zellen in der Synovialflüssigkeit von JIA- Patienten mittels des Transportproteins FATP2
Die Erfinder konnten zeigen, dass T-Zellen, die in der Synovialflüssigkeit von juvenilen idiopathischen Arthritis (JIA)-Patienten vorkommen, eine verstärkte Aufnahme von Fett-
ZI säuren aufweisen, die mit einer vermehrten Expression von FATP24S7T ’27/42 einhergeht. Der Fettsäurerezeptor FATP2 ist dabei vor allem in CD4+ Gedächtniszellen exprimiert (Fig. 1).
Beispiel 1A: Aufnahme von freien Fettsäuren in CD4-positiven T-Zellen aus dem Blut bzw. dem Synovium von JIA-Patienten
Die Aufnahme von freien Fettsäuren in CD4+ T-Zellen aus dem Blut oder dem Synovium von juvenilen idiopathischen Arthritis (JIA)-Patienten wurde bestimmt (Fig. 1 A). Die Messung erfolgte nach 15-minütiger Inkubation der Zellen mit Bodipye™FL C12 (2 pM) und nachfolgender durchflusszytometri scher Analyse. Die Mittlere Fluoreszenzintensität (MFI) ist abzüglich der jeweiligen FMO Kontrolle dargestellt (AMFI). Die Daten zeigen die mittlere Expression in vier Patienten ± Standardfehler, **p < 0.01.
Die Daten zeigen, dass die Aufnahme von freien Fettsäuren durch CD4-positive T-Zellen in der Synovialflüssigkeit von JIA-Patienten im Vergleich zum peripheren Blut drastisch erhöht ist. Die Daten legen auch nahe, dass die Fettsäureoxidation eine wichtige Rolle bei Gedächtnis-T-Zellen spielt, damit sie ihre Funktionen ausüben können.
Dies bestätigt eine frühere Publikation der Arbeitsgruppe von Andreas Radbruch, in der gezeigt wird, dass T-Zellen in der Synovialflüssigkeit, um proliferieren zu können, von Fettsäuren abhängen (Hradilkova et al. 2019). Allerdings wurde von der Arbeitsgruppe von Andreas Radbruch vorgeschlagen, dass diese Abhängigkeit von dem Transkriptionsfaktor TWIST1 abhängig sei, der vorwiegend in PDl-positiven T-Zellen exprimiert wird. Allerdings konnte nicht festgestellt werden, dass TWIST 1 in normalen CD4-positiven Effektor-Zellen in der Synovialflüssigkeit hochreguliert ist, und die Expression in regulatorischen T-Zellen (Tregs) der Synovialflüssigkeit war nicht nachweisbar (RNAseq- Einzelzell-Daten, Bas Vastert, UMC Utrecht, persönliche Mitteilung). Außerdem ist die Expression von CD36, einem anderen Rezeptor für die Aufnahme von Lipiden, in regulatorischen T-Zellen (Tregs) der Synovialflüssigkeit sowie T-Zellen der Synovialflüssigkeit (Daten nicht gezeigt) im Vergleich zu peripherem Blut drastisch reduziert, was im Gegensatz steht zu publizierten Daten für murine CD8-positive ruhende T-Gedächtniszellen (Pan, Tian et al., 2017, Survival of tissue-resident memory T cells requires exogenous lipid uptake and metabolism, Nature Vol. 543, p. 252-256). Dies ist außerdem interessant, weil CD36 gewöhnlich in Treg-Zellen hochreguliert ist in hypoxischer Umgebung (wie beispiels- weise in Tumoren) mit erhöhter Glykolyse und Laktat-Konzentration (um die 5 mmol/liter, was ungefähr der Konzentration entspricht, die in der Synovialflüssigkeit von JIA-Patienten vorliegt), wo es für die Suppression von CD8-positiven T-Zellen kritisch ist.
Stattdessen fanden die Erfinder überraschenderweise eine spezifische Hochregulation des Fettsäure-Transporters 2 (FATP2, auch SLC27A2 genannt) in CD4-positiven T-Effektor- zellen in der Synovialflüssigkeit und noch mehr in CD4-positiven Treg-Zellen der Synovialflüssigkeit im Vergleich zum peripheren Blut von gesunden Kindern, gesunden Erwachsenen und Kindern mit JIA (Fig. 2), was für den Effekt, den die Erfinder bezüglich des Fettsäure-Transports beobachtet haben, verantwortlich sein dürfte.
Beispiel 1B: FATP2-Proteinexpression in CD4-positiven T-Zellen aus dem Blut bzw. dem Synovium von JIA-Patienten
Die FATP2-Proteinexpression in CD4+ T-Zellen aus dem Peripherblut (PB) bzw. dem Synovium (SF) von JIA-Patienten wurde mittels durchflusszytometrischer Analyse bestimmt (Fig. 1 B). Es ist ein repräsentatives Bild gezeigt. Außerdem wurde die Expression von 5ZC2742-RNA in CD4+ T-Zellen der Synovialis von JIA Patienten im Vergleich zum Blut derselben Patienten bestimmt (Fig. 1 C).
Weiterhin wurde die Proteinexpression von FATP2 in CD4+ T-Zellsubtypen (Effektor- Gedächtnis-T-Zellen (Tem), gewebeständige Gedächtnis-T-Zellen (Tm) und naive T-Zellen (Tnaive)) aus dem Blut bzw. Synovium von JIA-Patienten mittels durchflusszytometrischer Analyse bestimmt (Fig. 1 D). Die Mittlere Fluoreszenzintensität (MFI) ist abzüglich der jeweiligen FMO Kontrolle dargestellt (AMFI). Die Daten zeigen die mittlere Expression in fünf Patienten ± Standardfehler, ***p < 0.001. ****p < 0.0001.
Beispiel IC: SLC2 Z42-mRNA-Expression in stimulierten und nicht-stimulierten CD4- positiven Gedächtnis-T-Zellen aus dem Blut gesunder Kontrollen
Die mRNA-Expression von 5ZC 742/FATP2 im Vergleich zu anderen Stoffwechselproteinen in CD4+ Gedächtnis-T-Zellen nach 48-stündiger und 72-stündiger Stimulation mit Anti-CD3- und Anti-CD28-Antikörpern sowie in nicht-stimulierten CD4+ Gedächtnis-T- Zellen wurde bestimmt (Fig. 1 E). Die CD4+ Gedächtnis-T-Zellen wurden mittels magnetischer Zell-Separation aus dem Blut gesunder Kontroll-Personen isoliert. Die Daten zeigen die mittlere Expression von vier Experimenten mit unterschiedlichen Spendern ± Standardfehler, **p < 0.01, ***p < 0.001.
Die Daten belegen, dass SLC27A21F ATP2 in stimulierten Gedächtnis-T-Zellen im Vergleich zu anderen Stoffwechselproteinen sehr stark hochreguliert wird. Die mRNA-Expression von SLC27A2/F ATP2 war drastisch höher in MACS-isolierten, humanen naiven CD4+ und CD45R0 CD4+ Gedächtnis-T-Zellen aus dem peripheren Blut gesunder Spender nach Stimulation als ohne Stimulation. Die Daten lassen auf eine spezifische Rolle dieses Transport-Proteins an der Aktivierung der Gedächtnis-T-Zellen schließen.
Beispiel 2: Blockade der Fettsäureaufnahme in Gedächtnis-T-Zellen vermindert IFNy- Produktion und Proliferation der Zellen
Einige niedermolekulare Antagonisten von FATP2 wurden bereits beschrieben, welche die Fettsäureaufnahme in Zellen hemmen, beispielsweise Lipofermata (Adeshakin et al. 2021) und Grassofermata (Saini et al. 2015). Die Erfinder konnten zeigen, dass der FATP2- Inhibitor Lipofermata die Fettsäureaufnahme in CD4+ T-Zellen inhibiert sowie die fFN-y- Expression und Proliferation der T-Zellen hemmt, ohne Apoptose zu induzieren (Fig. 2). Mit Hilfe von Lipofermata konnte also die Funktion von FATP2 in T-Zellen eindeutig bestätigt werden.
Mittels Lipofermata (5-Bromo-5'-phenyl-spiro[3H-indole-3,2'(3'H)-[l,3,4]thiadiazol]-2(lH)- one) kann die Fettsäureaufnahme in den Gedächtnis-T-Zellen effektiv blockiert und die Proliferation und die Produktion von Entzündungsmediatoren gehemmt werden. Damit ist dieser Aufnahmeweg von zentraler Bedeutung für den Metabolismus von T-Zellen, welche in der Pathogenese des kindlichen Rheuma, aber auch anderer Autoimmunerkrankungen eine wesentliche Rolle spielen. Eine gezielte Blockade dieses Signalweges eröffnet die Ausnutzung eines komplett neuen Wirkmechanismus' in der Therapie von Autoimmunerkrankungen.
Die Aufnahme von freien Fettsäuren in CD4+ T-Zellen nach Zugabe von Lipofermata in steigenden Konzentrationen von 0, 2, 5, 7,5 und 10 pM wurde untersucht (Fig. 2 A). Dazu wurden die Zellen für 48 Stunden mit Anti-CD3- und Anti-CD28-Antikörpem stimuliert. Die Messung erfolgte nach 15-minütiger Inkubation der Zellen mit Bodipye™FL C12 (2 pM) und nachfolgender durchflusszytometri scher Analyse. Die Mittlere Fluoreszenzintensität (MFI) ist abzüglich der jeweiligen FMO Kontrolle dargestellt (AMFI). Die Daten zeigen die mittlere Expression gemessen in drei Experimenten ± Standardfehler.
Fig. 2 B zeigt ein exemplarisches Histogramm der Fettsäureaufnahme in CD4+ T-Zellen ohne Zugabe von Lipofermata (rechts) und nach Lipofermata Zugabe (links).
Außerdem wurde die prozentuale Anzahl IFN-y-positiver CD4+ T-Zellen nach Zugabe von Lipofermata in steigenden Konzentrationen von 0, 2, 5, 7,5 und 10 pM untersucht (Fig. 2 C). Dazu wurden die Zellen für 48 Stunden mit Anti-CD3- und Anti-CD28-Antikörpem stimuliert. Die Bestimmung IFN-y-positiver Zellen erfolgte nach 5-stündiger Restimulation mit PMA und lonomycin in Anwesenheit von GolgiPlug™ mittels Durchflusszytometrie. Die Daten zeigen die mittlere Expression gemessen in 5-6 Experimenten ± Standardfehler, *p < 0.01.
Fig. 2 D zeigt ein exemplarisches Punktdiagramm der IFN-y-Expression ohne Zugabe von Lipofermata (links) und nach Lipofermata Zugabe (rechts).
Weiterhin wurde der prozentuale Anteil proliferierter CD4+ T-Zellen nach Zugabe von Lipofermata in steigenden Konzentrationen von 0, 2, 5, 7,5 und 10 pM bestimmt (Fig. 2 E). Dazu wurden die Zellen mit “Cell proliferation dye eFlour™” gefärbt und für 48 Stunden mit Anti-CD3- und Anti-CD28-Antikörpem stimuliert. Die Bestimmung proliferierter Zellen erfolgte mittels Durchflusszytometrie. Die Daten zeigen die mittlere Expression gemessen in fünf Experimenten ± Standardfehler, *p < 0.01.
Fig. 2 F zeigt ein exemplarisches Punktdiagramm der Zellproliferation ohne Zugabe von Lipofermata (links) und nach Lipofermata Zugabe (rechts).
Fig. 2 G zeigt ein exemplarisches Punktdiagramm der toten Zellen mit Lipofermata- Behandlung (rechts) und ohne (links). Die Zellen wurden dazu für 72 Stunden mit Anti-CD3- und Anti-CD28-Antikörpern stimuliert und zur durchflusszytometri sehen Lebend/Tot- Unterscheidung mit Propidiumiodid (PI) angefärbt. Zusammenfassend zeigen die vorliegenden Daten eine drastisch erhöhte Aufnahme von freien Fettsäuren in T-Zellen in der Synovialflüssigkeit von JIA-Patienten, die zur spezifischen Hochregulation von SLC 27A2 -codiertem FATP2 in Beziehung gesetzt werden konnte, und die eine Änderung im Metabolismus und somit der Funktion dieser Zellen anzeigt. Dabei ist zu berücksichtigen, dass praktisch alle Effektor-T-Zellen im Synovium den Gedächtnis-Phänotyp repräsentieren. Die gesteigerte Expression von SLC 27A2 -codiertem FATP2 konnte durch einen spezifischen Inhibitor (Lipofermata, Veglia et al. 2019) blockiert werden. Um den Effekt dieses Inhibitors auf T-Zellen zu testen, wurden CD4+ T-Zellen aus dem Blut gesunder Spender isoliert und in Gegenwart oder Abwesenheit von Lipofermata mit Anti-CD3- und Anti-CD28-Antikörpern stimuliert. Dabei zeigte sich, dass Lipofermata die T-Zell-Proliferation praktisch komplett blockierte, und die IFN-y-Produktion konzentrationsabhängig reduzierte, ohne Apoptose zu induzieren.
Beispiel 3: Screening auf Wirkstoffe., die an das Transportprotein FATP2 binden und/oder sie hemmen
Screening-Experimente ermöglichen die Identifizierung und Validierung von niedermolekularen therapeutischen Verbindungen, Peptiden und/oder Biologika, die an das FATP2- Protein binden und/oder dessen Aktivität hemmen.
Es werden DNA-verschlüsselte Substanzbibliotheken generiert und gescreent, wie beschrieben (Kunig et al. 2018). Weiterhin werden Phage Display-Technologien (Takakusagi et al. 2020), Zelloberflächen-Display oder Ribosom-Display-Technologien (Valldorf et al. 2022) und/oder kombinatorische Peptid-Bibliotheken (Bozovicar und Bratkovic 2019) verwendet. Dazu werden rekombinantes FATP2-Protein oder Fragmente davon, die einen Tag zur Markierung, Identifizierung oder Reinigung tragen können, z.B. einen His-Tag oder einen FLAG-tag, in bakteriellen Expressionssystemen wie E. coli, oder in Insektenzellen oder Säugetierzellen exprimiert.
Das gereinigte FATP2-Protein wird mit Substanzen aus der Substanzbibliothek inkubiert und durch Immunpräzipitation isoliert. Die an das FATP2-Protein gebundenen Verbindungen werden z.B. durch Sanger- Sequenzierung der DNA-Barcodes identifiziert. Die identifizierten Agentien und Verbindungen werden anschliessend in entsprechenden Bioassays auf ihre Wirkung auf die Funktion von FATP2, dessen Fettsäure-Transportaktivität, sowie die IFN-y- Produktion und die Proliferation von Gedächtnis-T-Zellen getestet. Zu diesem Zweck werden auch experimentelle Maus-zzz-vzvo-Modelle eingesetzt.
Für die Identifizierung und Validierung von niedermolekularen therapeutischen Verbindungen, Peptiden und/oder Biologika, die eine Wirkung auf die FATP2- Aktivität oder seine Expression ausüben, wird ein zzz-vz7ro-Fluorochrom-Reportersystem auf Basis humaner Zellen etabliert, wobei beispielsweise die Expression des eGFP-FATP2-Fusionsproteins oder ein Luciferase-basiertes Reportersystem verwendet wird, um Substanzbibliotheken in Assays mit 384 bis 1.536 Vertiefungen auf die Identifizierung von Verbindungen zu screenen, die die eGFP -Fluoreszenz oder den Luciferase-Spiegel als Readout reduzieren. Die Expression dieser humanen FATP2-Fusionsreporterkonstrukte in den genannten Zellen kann z. B. durch Transfektion und Selektion über Resistenzgenkassetten oder durch virale Transduktion erfolgen. Für diese Assays werden humane Zelllinien wie z.B. 293 T-Zellen eingesetzt. Parallel zu diesem Screening werden Zytotoxizitätsassays durchgeführt, um Verbindungen auszuschliesen, die einen Effekt auf die Reporterfluoreszenz oder -aktivitat aufgrund von unspezifischer Toxizität oder Auslösung von Apoptose ausüben.
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Figure imgf000038_0001
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Sequenzen:
Humanes FATP2, Nukleotid- bzw. Aminosäuresequenzen
(SLC27A2, Solute Carrier Family 27 Member 2, Homo sapiens, human;
NCBI Entrez Gene Nr. 11001)
SEQ ID Nr. 1, Nukleotid-Sequenz-Eintrag enthaltend die humane FATP2-Sequenz: aatacgacta cacctgctcc ggagcccgcg gcggtacctg cagcggagga getetgtett 60 ccccttcatc tcacgcgagc ccggcgtccc gccgcgtgcg ccccggcgca gcccgccagt 120 ccgcccggag cccgcccagt cgccgcgctg cacgcccggg gtgaaccctc tgccctcgct 180 gggacagagg gccccgcagc egteatgett tccgccatct acacagtcct ggcgggactg 240 ctgttcctgc cgctcctggt gaacctctgc tgcccatact tcttccagga cataggctac 300 ttcttgaagg tggccgccgt gggccggagg gtgcgcagct acgggcagcg gcggccggcg 360 cgcaccatcc tgcgggcgtt cctggagaaa gcgcgccaga cgccacacaa gccttttctg 420 ctcttccgcg acgagactct cacctacgcg caggtggacc ggcgcagcaa tcaagtggcc 480 cgggcgctgc acgaccacct cggcctgcgc cagggagact gcgtggcgct ccttatgggt 540 aacgagccgg cctacgtgtg gctgtggctg gggctggtga agctgggctg tgccatggcg 600 tgcctcaatt acaacatccg cgcgaagtcc ctgctgcact gcttccagtg ctgcggggcg 660 aaggtgctgc tggtgtcgcc agaactacaa gcagctgtcg aagagatact gccaagcctt 720 aaaaaagatg atgtgtccat ctattatgtg agcagaactt ctaacacaga tgggattgac 780 tctttcctgg acaaagtgga tgaagtatca actgaaccta tcccagagtc atggaggtct 840 gaagtcactt tttccactcc tgccttatac atttatactt ctggaaccac aggtcttcca 900 aaagcagcca tgatcactca tcagcgcata tggtatggaa ctggcctcac ttttgtaagc 960 ggattgaagg cagatgatgt catctatatc actctgccct tttaccacag tgctgcacta 1020 ctgattggca ttcacggatg tattgtggct ggtgctactc ttgccttgcg gactaaattt 1080 tcagccagcc agttttggga tgactgcaga aaatacaacg tcactgtcat tcagtatatc 1140 ggtgaactgc ttcggtattt atgcaactca ccacagaaac caaatgaccg tgatcataaa 1200 gtgagactgg cactgggaaa tggcttacga ggagatgtgt ggagacaatt tgtcaagaga 1260 tttggggaca tatgcatcta tgagttctat gctgccactg aaggcaatat tggatttatg 1320 aattatgcga gaaaagttgg tgctgttgga agagtaaact acctacagaa aaaaatcata 1380 acttatgacc tgattaaata tgatgtggag aaagatgaac ctgtccgtga tgaaaatgga 1440 tattgcgtca gagttcccaa aggtgaagtt ggacttctgg tttgcaaaat cacacaactt 1500 acaccattta atggctatgc tggagcaaag gctcagacag agaagaaaaa actgagagat 1560 gtctttaaga aaggagacct ctatttcaac agtggagatc tcttaatggt tgaccatgaa 1620 aatttcatct atttccacga cagagttgga gatacattcc ggtggaaagg ggaaaatgtg 1680 gccaccactg aagttgctga tacagttgga ctggttgatt ttgtccaaga agtaaatgtt 1740 tatggagtgc atgtgccaga tcatgagggt cgcattggca tggcctccat caaaatgaaa 1800 gaaaaccatg aatttgatgg aaagaaactc tttcagcaca ttgctgatta cctacctagt 1860 tatgcaaggc cccggtttct aagaatacag gacaccattg agatcactgg aacttttaaa 1920 caccgcaaaa tgaccctggt ggaggagggc tttaaccctg ctgtcatcaa agatgccttg 1980 tatttcttgg atgacacagc aaaaatgtat gtgcctatga ctgaggacat ctataatgcc 2040 ataagtgcta aaaccctgaa actctgaata ttcccaggag gataactcaa catttccaga 2100 aagaaactga atggacagcc acttgatata atccaacttt aatttgattg aagattgtga 2160 ggaaattttg taggaaattt gcatacccgt aaagggagac ttttttaaat aacagttgag 2220 tctttgcaag taaaaagatt tagagattat tatttttcag tgtgcaccta ctgtttgtat 2280 ttgcaaactg agcttgttgg agggaaggca ttatttttta aaatacttag taaattaaat 2340 gaac 2344
SEQ ID Nr. 2, codierende Nukleotid-Sequenz des humanen FATP2 (Nukl. 205 - 2067 von SEQ ID Nr. 1): atgctttccg ccatctacac agtcctggcg ggactgctgt tcctgccgct cctggtgaac 60 ctctgctgcc catacttctt ccaggacata ggctacttct tgaaggtggc cgccgtgggc 120 cggagggtgc gcagctacgg gcagcggcgg ccggcgcgca ccatcctgcg ggcgttcctg 180 gagaaagcgc gccagacgcc acacaagcct tttctgctct tccgcgacga gactctcacc 240 tacgcgcagg tggaccggcg cagcaatcaa gtggcccggg cgctgcacga ccacctcggc 300 ctgcgccagg gagactgcgt ggcgctcctt atgggtaacg agccggccta cgtgtggctg 360 tggctggggc tggtgaagct gggctgtgcc atggcgtgcc tcaattacaa catccgcgcg 420 aagtccctgc tgcactgctt ccagtgctgc ggggcgaagg tgctgctggt gtcgccagaa 480 ctacaagcag ctgtcgaaga gatactgcca agccttaaaa aagatgatgt gtccatctat 540 tatgtgagca gaacttctaa cacagatggg attgactctt tcctggacaa agtggatgaa 600 gtatcaactg aacctatccc agagtcatgg aggtctgaag tcactttttc cactcctgcc 660 ttatacattt atacttctgg aaccacaggt cttccaaaag cagccatgat cactcatcag 720 cgcatatggt atggaactgg cctcactttt gtaagcggat tgaaggcaga tgatgtcatc 780 tatatcactc tgccctttta ccacagtgct gcactactga ttggcattca cggatgtatt 840 gtggctggtg ctactcttgc cttgcggact aaattttcag ccagccagtt ttgggatgac 900 tgcagaaaat acaacgtcac tgtcattcag tatatcggtg aactgcttcg gtatttatgc 960 aactcaccac agaaaccaaa tgaccgtgat cataaagtga gactggcact gggaaatggc 1020 ttacgaggag atgtgtggag acaatttgtc aagagatttg gggacatatg catctatgag 1080 ttctatgctg ccactgaagg caatattgga tttatgaatt atgcgagaaa agttggtgct 1140 gttggaagag taaactacct acagaaaaaa atcataactt atgacctgat taaatatgat 1200 gtggagaaag atgaacctgt ccgtgatgaa aatggatatt gcgtcagagt tcccaaaggt 1260 gaagttggac ttctggtttg caaaatcaca caacttacac catttaatgg ctatgctgga 1320 gcaaaggctc agacagagaa gaaaaaactg agagatgtct ttaagaaagg agacctctat 1380 ttcaacagtg gagatctctt aatggttgac catgaaaatt tcatctattt ccacgacaga 1440 gttggagata cattccggtg gaaaggggaa aatgtggcca ccactgaagt tgctgataca 1500 gttggactgg ttgattttgt ccaagaagta aatgtttatg gagtgcatgt gccagatcat 1560 gagggtcgca ttggcatggc ctccatcaaa atgaaagaaa accatgaatt tgatggaaag 1620 aaactctttc agcacattgc tgattaccta cctagttatg caaggccccg gtttctaaga 1680 atacaggaca ccattgagat cactggaact tttaaacacc gcaaaatgac cctggtggag 1740 gagggcttta accctgctgt catcaaagat gccttgtatt tcttggatga cacagcaaaa 1800 atgtatgtgc ctatgactga ggacatctat aatgccataa gtgctaaaac cctgaaactc 1860 tga 1863
SEQ ID Nr. 3, Aminosäure-Sequenz von humanem FATP2:
Met Leu Ser Ala Ile Tyr Thr Val Leu Ala Gly Leu Leu Phe Leu Pro
Figure imgf000040_0001
Leu Leu Val Asn Leu Cys Cys Pro Tyr Phe Phe Gin Asp Ile Gly Tyr
Figure imgf000040_0002
Phe Leu Lys Val Ala Ala Val Gly Arg Arg Val Arg Ser Tyr Gly Gin 35 40 45
Arg Arg Pro Ala Arg Thr Ile Leu Arg Ala Phe Leu Glu Lys Ala Arg 50 55 60
Gin Thr Pro His Lys Pro Phe Leu Leu Phe Arg Asp Glu Thr Leu Thr 65 70 75 80
Tyr Ala Gin Val Asp Arg Arg Ser Asn Gin Val Ala Arg Ala Leu His
85 90 95
Asp His Leu Gly Leu Arg Gin Gly Asp Cys Val Ala Leu Leu Met Gly
100 105 110
Asn Glu Pro Ala Tyr Val Trp Leu Trp Leu Gly Leu Val Lys Leu Gly 115 120 125
Cys Ala Met Ala Cys Leu Asn Tyr Asn Ile Arg Ala Lys Ser Leu Leu
130 135 140
His Cys Phe Gin Cys Cys Gly Ala Lys Val Leu Leu Val Ser Pro Glu 145 150 155 160
Leu Gin Ala Ala Val Glu Glu Ile Leu Pro Ser Leu Lys Lys Asp Asp
165 170 175
Val Ser Ile Tyr Tyr Val Ser Arg Thr Ser Asn Thr Asp Gly Ile Asp 180 185 190
Ser Phe Leu Asp Lys Val Asp Glu Val Ser Thr Glu Pro Ile Pro Glu
195 200 205
Ser Trp Arg Ser Glu Val Thr Phe Ser Thr Pro Ala Leu Tyr Ile Tyr 210 215 220
Thr Ser Gly Thr Thr Gly Leu Pro Lys Ala Ala Met Ile Thr His Gin 225 230 235 240
Arg Ile Trp Tyr Gly Thr Gly Leu Thr Phe Val Ser Gly Leu Lys Ala
245 250 255
Asp Asp Val Ile Tyr Ile Thr Leu Pro Phe Tyr His Ser Ala Ala Leu 260 265 270
Leu Ile Gly Ile His Gly Cys Ile Val Ala Gly Ala Thr Leu Ala Leu
275 280 285
Arg Thr Lys Phe Ser Ala Ser Gin Phe Trp Asp Asp Cys Arg Lys Tyr 290 295 300
Asn Val Thr Val Ile Gin Tyr Ile Gly Glu Leu Leu Arg Tyr Leu Cys 305 310 315 320
Asn Ser Pro Gin Lys Pro Asn Asp Arg Asp His Lys Val Arg Leu Ala
325 330 335 Leu Gly Asn Gly Leu Arg Gly Asp Val Trp Arg Gin Phe Val Lys Arg
340 345 350
Phe Gly Asp Ile Cys Ile Tyr Glu Phe Tyr Ala Ala Thr Glu Gly Asn
355 360 365
Ile Gly Phe Met Asn Tyr Ala Arg Lys Val Gly Ala Val Gly Arg Val
370 375 380
Asn Tyr Leu Gin Lys Lys Ile Ile Thr Tyr Asp Leu Ile Lys Tyr Asp 385 390 395 400 Val Glu Lys Asp Glu Pro Val Arg Asp Glu Asn Gly Tyr Cys Val Arg
405 410 415
Val Pro Lys Gly Glu Val Gly Leu Leu Val Cys Lys Ile Thr Gin Leu
420 425 430
Thr Pro Phe Asn Gly Tyr Ala Gly Ala Lys Ala Gin Thr Glu Lys Lys
435 440 445
Lys Leu Arg Asp Val Phe Lys Lys Gly Asp Leu Tyr Phe Asn Ser Gly
450 455 460
Asp Leu Leu Met Val Asp His Glu Asn Phe Ile Tyr Phe His Asp Arg 465 470 475 480 Val Gly Asp Thr Phe Arg Trp Lys Gly Glu Asn Val Ala Thr Thr Glu
485 490 495
Val Ala Asp Thr Val Gly Leu Val Asp Phe Val Gin Glu Val Asn Val
500 505 510
Tyr Gly Val His Val Pro Asp His Glu Gly Arg Ile Gly Met Ala Ser
515 520 525
Ile Lys Met Lys Glu Asn His Glu Phe Asp Gly Lys Lys Leu Phe Gin
530 535 540
His Ile Ala Asp Tyr Leu Pro Ser Tyr Ala Arg Pro Arg Phe Leu Arg 545 550 555 560 Ile Gin Asp Thr Ile Glu Ile Thr Gly Thr Phe Lys His Arg Lys Met
565 570 575
Thr Leu Val Glu Glu Gly Phe Asn Pro Ala Val Ile Lys Asp Ala Leu
580 585 590
Tyr Phe Leu Asp Asp Thr Ala Lys Met Tyr Val Pro Met Thr Glu Asp
595 600 605
Ile Tyr Asn Ala Ile Ser Ala Lys Thr Leu Lys Leu
610 615 620

Claims

Patentansprüche:
1. Verfahren zur Hemmung oder Verringerung der Fettsäureaufnahme in eine T-Zelle, der Aktivierung und/oder der Proliferation einer T-Zelle, wobei das Verfahren mindestens einen Schritt umfasst, ausgewählt aus der Gruppe bestehend aus
(i) Hemmen oder Reduzieren der SLC27A2-Gen expression der T-Zelle,
(ii) Hemmen oder Reduzieren der Aktivität des Fettsäure-Transportproteins-2 (FATP2), und/oder
(iii) Fördern des Abbaus des FATP2-Proteins.
2. Verfahren nach Anspruch 1, wobei die Hemmung oder Reduzierung der SLC27A2- Genexpression einen 5ZC2742-Gen-Knock-down, Knock-out, konditionalen Gen- Knockout, eine Genveränderung im Sinne einer Insertion, Deletion und/oder Substitution, eine Genveränderung mittels eines Gen-Editierungs-Systems, eine RNA- Interferenz, siRNA und/oder Antisense-RNA umfasst.
3. Verfahren nach Anspruch 1, wobei die Hemmung oder Reduzierung der FATP2- Aktivität die Verwendung eines Wirkstoffs umfasst, der an das FATP2-Protein bindet.
4. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 3, wobei besagte T-Zelle eine synoviale T- Zelle ist.
5. Verfahren zur Identifizierung eines Wirkstoffs, der an das FATP2-Protein einer T- Zelle, oder ein Fragment davon, bindet, und/oder die Aktivität des FATP2-Proteins einer T-Zelle, oder eines Fragments davon, hemmt oder reduziert.
6. Verfahren nach Anspruch 5, umfassend mindestens die folgenden Schritte:
(i) Bereitstellen des FATP2-Proteins oder eines Fragments davon,
(ii) Zugabe von mindestens einem Wirkstoff, der auf Bindung an das FATP2-Protein oder ein Fragment davon untersucht werden soll, und
(iii) Identifizierung des mindestens einen Wirkstoffs, der an das FATP2-Protein oder ein Fragment davon gebunden hat. Verfahren nach einem der Ansprüche 5 und 6, wobei der Wirkstoff ein FATP2- Inhibitor ist. Verfahren nach einem der Ansprüche 5 bis 7, wobei der Wirkstoff Mitglied einer Bibliothek von Verbindungen ist. Verfahren nach einem der Ansprüche 5 bis 8, wobei der Wirkstoff ausgewählt ist aus der Gruppe bestehend aus einer niedermolekularen Verbindung, einem Peptid und einem Biologikum. Verfahren nach Anspruch 9, wobei das Biologikum ein Antikörper, ein antigenbindendes Fragment davon, ein antigenbindendes Derivat davon, ein antikörperähnliches Molekül oder ein Aptamer ist. Verfahren nach einem der Ansprüche 5 bis 10, wobei das FATP2-Protein an eine feste Phase gebunden ist oder in Lösung vorliegt. Verwendung einer Nukleinsäure, die das FATP2-Protein oder ein Fragment davon kodiert, oder des FATP2-Proteins oder eines Fragments davon, in einem Verfahren zur Identifizierung eines Wirkstoffs, der an das FATP2-Protein oder ein Fragment davon bindet, nach einem der Ansprüche 5 bis 11. Wirkstoff, erhalten durch das Verfahren nach einem der Ansprüche 5 bis 11. Wirkstoff, der die Expression des SLC27A2-Gens in einer T-Zelle hemmt oder reduziert, vorzugsweise wobei die T-Zelle eine synoviale T-Zelle ist. Wirkstoff, der an das FATP2-Protein oder ein Fragment davon in einer T-Zelle bindet, und/oder die Aktivität des FATP2-Proteins, oder eines Fragments davon, hemmt oder reduziert, und/oder den Abbau des FATP2-Proteins fördert. Wirkstoff nach einem der Ansprüche 13 bis 15, wobei der Wirkstoff eine niedermolekulare Verbindung („small molecule“, „smol“), ein Peptid oder ein Biologikum ist, vorzugsweise wobei das Biologikum ein Antikörper oder ein Fragment davon, ein Derivat davon, ein antikörperähnliches Protein, oder ein Aptamer ist. Antikörper, oder antigen-bindendes Fragment oder antigen-bindendes Derivat davon, oder antikörperähnliches Protein, das spezifisch an das FATP2-Protein in einer T- Zelle bindet. Antikörper, oder antigen-bindendes Fragment oder antigen-bindendes Derivat davon, oder antikörperähnliches Protein, nach Anspruch 17, wobei der Antikörper, oder das antigenbindende Fragment oder Derivat davon, oder das antikörperähnliche Protein, die FATP2- Aktivität inhibiert. Wirkstoff nach einem der Ansprüche 13 bis 16 oder Antikörper, antigen-bindendes Fragment oder antigen-bindendes Derivat davon, oder antikörperähnliches Protein, nach einem der Ansprüche 17 und 18, zur Verwendung bei der Behandlung einer Autoimmunerkrankung. Wirkstoff oder Antikörper, antigen-bindendes Fragment oder antigen-bindendes Derivat davon, oder antikörperähnliches Protein, zur Verwendung nach Anspruch 19, wobei besagte Autoimmunerkrankung ausgewählt ist aus der Gruppe bestehend aus Rheuma, Rheumatoider Arthritis, juveniler idiopathischer Arthritis, chronischen entzündlichen Darmerkrankungen einschließlich Colitis ulcerosa und Morbus Crohn, Multiple Sklerose, und anderen Autoimmunerkrankungen mit T-zellulärer Beteiligung. Verwendung eines Wirkstoffs, der an das FATP2-Protein bindet, in einem Verfahren zur Behandlung einer Autoimmunerkrankung, wobei besagte Autoimmunerkrankung vorzugsweise ausgewählt ist aus der Gruppe bestehend aus Rheuma, Rheumatoider Arthritis, juveniler idiopathischer Arthritis, chronischen entzündlichen Darmerkrankungen einschließlich Colitis ulcerosa und Morbus Crohn, Multiple Sklerose, und anderen Autoimmunerkrankungen mit T-zellulärer Beteiligung. Verwendung eines Wirkstoffs, der an das FATP2-Protein bindet, zur Herstellung eines Arzneimittels zur Behandlung einer Autoimmunerkrankung, wobei besagte Autoimmunerkrankung vorzugsweise ausgewählt ist aus der Gruppe bestehend aus Rheuma, Rheumatoider Arthritis, juveniler idiopathischer Arthritis, chronischen entzündlichen Darmerkrankungen einschließlich Colitis ulcerosa und Morbus Crohn, Multiple Sklerose, und anderen Autoimmunerkrankungen mit T-zellulärer Beteiligung. Verwendung eines Wirkstoffs nach einem der Ansprüche 21 und 22, wobei der Wirkstoff, wenn er an FATP2 gebunden ist, die FATP2- Aktivität hemmt. Verfahren zur Behandlung oder Vorbeugung einer Autoimmunerkrankung, wobei das Verfahren die Verabreichung eines Wirkstoffs, der an das FATP2-Protein bindet und/oder dieses hemmt, in einer therapeutisch wirksamen Dosis an ein menschliches oder tierisches Subjekt umfasst. Verfahren zur Herstellung eines Wirkstoffs gemäß eines Verfahrens nach einem der Ansprüche 5 bis 11, ferner umfassend die Aufreinigung des Wirkstoffs. Pharmazeutische Zusammensetzung, umfassend den Wirkstoff nach einem der Ansprüche 13 bis 16 oder den Antikörper, das antigen-bindende Fragment oder antigen-bindende Derivat davon, oder ein antikörperähnliches Protein, nach einem der Ansprüche 17 und 18, und einen oder mehrere pharmazeutisch verträgliche Hilfsstoffe, zur Verwendung bei der Behandlung einer Autoimmunerkrankung, vorzugsweise wobei besagte Autoimmunerkrankung ausgewählt ist aus der Gruppe bestehend aus Rheuma, Rheumatoider Arthritis, juveniler idiopathischer Arthritis, chronischen entzündlichen Darmerkrankungen einschließlich Colitis ulcerosa und Morbus Crohn, Multiple Sklerose, und anderen Autoimmunerkrankungen mit T- zellulärer Beteiligung. Pharmazeutische Zusammensetzung nach Anspruch 26, wobei die Hilfsstoffe ausgewählt sind aus der Gruppe bestehend aus pharmazeutisch verträglichen Puffern, Tensiden, Verdünnungsmitteln, Trägern, Hilfsstoffen, Füllstoffen, Bindemittel, Schmiermitteln, Gleitmitteln, Desinfektionsmitteln, Adsorptionsmitteln und/oder Konservierungsmitteln. Verfahren zur Herstellung einer pharmazeutischen Zusammensetzung, umfassend
(i) das Verfahren nach einem der Ansprüche 5 bis 11, und ferner
(ii) das Mischen des identifizierten Wirkstoffs mit einem pharmazeutisch akzeptablen Träger. Zusammensetzung, umfassend eine Kombination aus
(i) dem Wirkstoff, der an das FATP2-Protein in einer T-Zelle bindet, nach einem der Ansprüche 13 bis 16, dem Antikörper oder antigen-bindenden Fragment oder antigenbindenden Derivat davon oder dem antikörperähnlichen Protein nach einem der Ansprüche 17 und 18, oder der pharmazeutischen Zusammensetzung nach einem der Ansprüche 26 und 27, und
(ii) einer oder mehreren weiteren therapeutisch aktiven Verbindungen. Therapeutisches Kit, umfassend:
(i) die pharmazeutische Zusammensetzung nach einem der Ansprüche 26, 27 oder 29,
(ii) eine Vorrichtung zur Verabreichung der Zusammensetzung, und
(iii) optional eine Gebrauchsanweisung.
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