WO2022196747A1 - 心不全およびその併発疾患の治療法、治療剤および診断法。 - Google Patents

心不全およびその併発疾患の治療法、治療剤および診断法。 Download PDF

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WO2022196747A1
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heart failure
hematopoietic stem
tgf
mice
stem cells
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克仁 藤生
幸輝 中山
一成 小室
一郎 眞鍋
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国立大学法人東京大学
国立大学法人千葉大学
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    • C07K14/475—Growth factors; Growth regulators
    • C07K14/495—Transforming growth factor [TGF]

Definitions

  • the present invention relates to therapeutic methods, therapeutic agents and diagnostic methods for heart failure and its concurrent diseases.
  • Heart failure is one of the increasing diseases in today's aging society.
  • Conventional treatment for heart failure cases is mainly oral treatment, but after hospitalization for heart failure, about 30% of patients are re-hospitalized in half a year even if they are discharged.
  • heart failure is characterized by repeated recurrences of heart failure once it occurs, and when re-hospitalized, the condition of the heart is worse than the previous hospitalization, and repeated recurrences eventually lead to death.
  • Non-Patent Document 2 Non-Patent Document 2
  • the present invention aims to provide a therapeutic method, a therapeutic agent, and an auxiliary method for diagnosing heart failure and concurrent diseases.
  • the inventors focused on hematopoietic stem cells, which are the origin of macrophages, and conducted intensive research. revealed an important role.
  • the inventors have found that transplantation of bone marrow collected from heart failure model mice to mice that do not develop heart failure induces cardiac dysfunction and cardiac fibrosis. They also found that similar bone marrow transplantation aggravated kidney damage and inhibited skeletal muscle regeneration.
  • TGF- ⁇ 1 active transforming growth factor ⁇ 1
  • the inventors found that monocytes and macrophages that divide and differentiate from hematopoietic stem cells undergoing epigenetic changes due to reduced TGF- ⁇ 1 signaling fail to differentiate into cardioprotective mature macrophages, resulting in cardiac function. was found to decrease. Based on these findings, the inventors administered TGF- ⁇ 1 to heart failure model mice, and found that the proliferation of hematopoietic stem cells with such epigenetic changes could be suppressed. These results suggest that administration of hematopoietic stem cells unaffected by heart failure and administration of activated TGF- ⁇ 1 are effective in treating heart failure, especially recurrent heart failure and comorbidities. In addition, we found that epigenetic changes in hematopoietic stem cells that have experienced heart failure can be used as an index to diagnose heart failure cases that are at risk of becoming severe, such as recurrent heart failure.
  • the present invention is the following (1) to (13).
  • a therapeutic drug or therapeutic composition for heart failure and/or concurrent diseases of heart failure comprising active TGF- ⁇ 1 or full-length TGF- ⁇ 1 as an active ingredient.
  • a therapeutic drug or therapeutic composition for heart failure and/or a concurrent disease of heart failure the therapeutic drug or therapeutic composition comprising hematopoietic stem cells unaffected by heart failure as an active ingredient.
  • a therapeutic drug or therapeutic composition for heart failure and/or a concurrent disease of heart failure comprising as an active ingredient tyrosine hydroxylase (TH) or an activity-promoting factor thereof. thing.
  • the therapeutic drug or therapeutic composition according to any one of (1) to (3) above, wherein the heart failure to be treated is incipient heart failure.
  • the therapeutic drug or therapeutic composition according to any one of (1) to (3) above, wherein the heart failure to be treated is recurrent heart failure.
  • the therapeutic agent or therapeutic composition according to any one of (1) to (6) above, wherein the concurrent disease is renal failure and/or skeletal muscle regeneration failure.
  • a growth inhibitor for hematopoietic stem cells affected by heart failure characterized by containing active TGF- ⁇ 1 or full-length TGF- ⁇ 1.
  • An auxiliary method for determining the possibility of aggravation of heart failure wherein the presence or absence of epigenetic changes in hematopoietic stem cells derived from a subject is used as an index.
  • a method of screening for a candidate substance for the treatment of heart failure and/or concurrent diseases caused by heart failure comprising administering a candidate substance to a heart failure model animal and measuring the amount of TH in sympathetic neurons of the heart failure model animal.
  • the screening method comprising: (12) The above (11), which comprises extracting an organ containing sympathetic nerves from the heart failure model animal, making the organ transparent, and measuring the amount of TH in the nerve cells of the sympathetic nerves that innervate the organ.
  • the method described in . (13) The method according to (12) above, wherein the amount of TH is quantified using an anti-TH antibody.
  • the sign "-" indicates a numerical range including the values on the left and right of it.
  • the therapeutic agent according to the present invention can effectively treat heart failure (initial heart failure and recurrent heart failure) and accompanying comorbidities.
  • auxiliary diagnostic method of the present invention it is possible to provide data for determining the possibility of aggravation of heart failure and the possibility of developing concurrent diseases.
  • b Competitive HSC transplantation procedure in which HSCs (hematopoietic stem cells) are transplanted from control mice and mice 4 weeks after TAC.
  • Flow cytometric analysis was performed 8 weeks after transplantation into recipients.
  • d Gene set enrichment analysis (GSEA) results to compare transcriptomes of Ly-6C lo macrophages derived from control or heart failure-experienced bone marrow cells.
  • the gene set consists of differentially expressed genes in each RNA-seq data between circulating monocytes and cardiac macrophages. Left: genes whose expression is elevated in monocytes, right: genes whose expression is elevated in cardiac macrophages. The components of both gene sets are shown in Figures 11 and 12, respectively.
  • NES normalized enrichment score.
  • PCA Principal component analysis
  • Neutro neutrophils
  • mac macrophages.
  • a A procedure for following the differentiation of hematopoietic stem cells into tissue macrophages using DNA barcodes.
  • Hematopoietic stem cells (derived from CD45.1 mice) transfected with a barcode sequence (1 ⁇ 10 6 bp) by lentivirus were transplanted into recipient mice (CD45.2 mice), and the barcode sequences and The barcode sequences in tissue macrophages were sequenced.
  • b Hierarchical clustering of readout barcodes from steady-state mice.
  • c Between each cell lineage shown in the figure (T and B cells, neutrophils, monocytes, kidney Ly-6C hi /Ly-6C lo macrophages, cardiac Ly-6C lo macrophages (CCR2 hi , CCR2 lo )) Pearson's correlation coefficient of barcode repertoire is shown. Analysis was performed on 3 individual recipient mice.
  • T T cells
  • B B cells
  • N neutrophils
  • M monocytes.
  • a Principal component analysis results of ATAC-seq of hematopoietic stem cells selected from control mice and mice 4 weeks after TAC.
  • b Motif analysis of regions showing weaker peaks in post-TAC HSCs than in control HSCs.
  • c Shows the top-ranked Gene Ontology for genes closest to the peak region decreased in HSCs after TAC.
  • UMAP Uniform Manifold Approximation and Projection
  • ns no significant difference, one-way ANOVA.
  • g Shows the experimental procedure for h. Mice were treated with vehicle or LY36947 and two weeks later their bone marrow was transplanted into recipient mice. TAC treatment was performed 6 weeks after transplantation.
  • i Diagrams explaining epigenetic changes in hematopoietic stem cells induced by heart failure and their effects on recurrence and coexisting diseases.
  • Fig. 1b shows the results of flow cytometric analysis of Cd11b + Cd64 + Ly6clo cardiac macrophages from recipient mice shown in Fig. 1b.
  • Hematopoietic stem cells from control and 4-week post-TAC mice were simultaneously transplanted into recipient mice.
  • n 6.
  • Phenotypic analysis of cardiac macrophages in recipient mice that underwent bone marrow transplantation from control mice or mice undergoing heart failure. Bone marrow transplantation was performed according to the procedure shown in FIG. 1b. n 12.
  • c Representative flow cytometry analysis method for control mice shown in Fig. 1b.
  • n 4-6, respectively. *P ⁇ 0.05, one-way ANOVA. Leukocyte analysis in hematopoietic stem cells treated with TGF- ⁇ 1 receptor inhibitors. As in FIG. 4g, donor bone marrow treated with vehicle or a TGF- ⁇ 1 receptor inhibitor (LY364947) was transplanted into the recipient. White blood cell counts and percentages of various cell lineages in donor mice (a) and recipient mice (b) after bone marrow transplantation are shown. Inhibition of TGF- ⁇ 1 signaling in hematopoietic stem cells affects tissue macrophage reconstitution. Shows the reconstitution rate of each cell lineage 6 weeks after bone marrow transplantation. Donor Cd45.1 mice were pretreated with vehicle or LY364947 for 2 weeks (right panel).
  • BMC bone marrow cell. Gene set up-regulated in monocytes used in the GSEA of Fig. 1d. Gene set up-regulated in cardiac macrophages used in the GSEA of Fig. 1d. Confirmation that full-length TGF- ⁇ 1 becomes active TGF- ⁇ 1 in the bone marrow. After daily intraperitoneal administration of recombinant human full-length TGF- ⁇ 1, the amount of active TGF- ⁇ 1 in the bone marrow was measured one week later.
  • TGF- ⁇ 1 TGF- ⁇ 1 or PBS (control) was administered daily immediately after TAC, and the percentage of EdU (5-ethynyl-2'-deoxyuridine) positive cells (EdU + HSC) after 7 days (1 week) was investigated. show. *P ⁇ 0.05, one-way ANOVA followed by Tukey test. Measurement of Tyrosine Hydroxylase (TH) levels in sympathetic neurons (bone marrow) of TAC-treated mice.
  • EdU + HSC EdU + HSC
  • Sympathetic neurons in the bone marrow cavity of heart failure model mice (TAC-treated mice) or control mice were immunostained with an anti-TH antibody, and the length (total length) of the stained nerve fibers was measured. Control is the result using TAC-untreated mice.
  • A shows the results of immunostaining of cleared femur with anti-TH antibody
  • Fig. 2 shows the results of real-time PCR quantification of Th gene (tyrosine hydroxylase gene) expression levels in sympathetic ganglia of heart failure model mice (TAC-treated mice) or control mice.
  • TAC-treated mice Sympathetic neurons innervating the kidneys of heart failure model mice (TAC-treated mice) or control mice were immunostained with an anti-TH antibody, and the area of the stained region was measured. Control is the result using TAC-untreated mice.
  • A is the result of clearing the kidney and immunostaining the sympathetic neurons innervating the kidney with an anti-TH antibody
  • B is the result of quantifying the area of the region stained with the anti-TH antibody. Measurements were performed on samples 4 weeks after TAC treatment.
  • N 3, *P ⁇ 0.05, analyzed by Student T test.
  • Fig. 2 shows the results of real-time PCR quantification of Th gene (tyrosine hydroxylase gene) expression levels in sympathetic ganglia (supplying sympathetic nerves to the kidney) of heart failure model mice (TAC-treated mice) or control mice. Measurements were performed 4 days after TAC treatment.
  • N 6, *P ⁇ 0.05, analyzed by Student T test.
  • a first embodiment is a therapeutic agent or composition for treating heart failure and/or concurrent diseases of heart failure, comprising active TGF- ⁇ 1 or full-length TGF- ⁇ 1 as an active ingredient. It is a thing.
  • heart failure refers to pathological conditions caused by various heart diseases such as myocardial infarction, valvular heart disease, and myocarditis. In general, when heart failure occurs, the pumping function of the heart does not work normally, and blood circulation throughout the body becomes stagnant.
  • Heart failure in this embodiment includes not only initial heart failure (initial heart failure) but also recurrent heart failure (recurrent heart failure).
  • Concomitant diseases or conditions of heart failure include, for example, renal failure, decreased muscle mass (e.g., skeletal muscle regeneration failure, skeletal muscle hypofunction (frailty), etc.), emaciation, etc. things) can be mentioned.
  • TGF- ⁇ is a transforming growth factor (Transforming Growth Factor- ⁇ : TGF- ⁇ ), and in mammals, there are three isoforms (TGF- ⁇ 1, - ⁇ 2 and - ⁇ 3). exists. TGF- ⁇ was initially identified as a factor that promotes fibroblast transformation, but subsequent studies have reported that it is involved in the suppression of cell proliferation, the induction of cell differentiation, and the induction of apoptosis. ing.
  • TGF- ⁇ is firstly a complex of a prepeptide portion called LAP (Latency associated protein) and active TGF- ⁇ (full-length TGF- ⁇ ) (approximately 100 kD polypeptide dimer) (latent TGF- ⁇ ), and upon some stimulation, active TGF- ⁇ (a dimer of approximately 25 kD polypeptide) is released from the latent TGF- ⁇ complex.
  • LAP Local associated protein
  • active TGF- ⁇ full-length TGF- ⁇
  • active TGF- ⁇ a dimer of approximately 25 kD polypeptide
  • This active TGF- ⁇ can bind to TGF- ⁇ receptors and induce various physiological activities.
  • Active TGF- ⁇ 1 is a dimer of the C-terminal 112-amino acid portion of full-length TGF- ⁇ 1 and has activity. Active TGF- ⁇ 1 binds to two types of serine/threonine kinase TGF- ⁇ receptors and transduces intracellular signals through Smad phosphorylation. TGF- ⁇ 1 is one of the important cytokines that maintain the homeostasis of the body, and its abnormalities are important factors involved in the progression of various diseases and life maintenance. The amino acid sequences of human full-length TGF- ⁇ 1 and active TGF- ⁇ 1 are shown in SEQ ID NO: 4 and SEQ ID NO: 5, respectively.
  • the therapeutic agents and therapeutic compositions of this embodiment may contain not only active TGF- ⁇ 1, but also full-length TGF- ⁇ 1. Although active TGF- ⁇ 1 ultimately functions, it has been confirmed that full-length TGF ⁇ 1 becomes active TGF- ⁇ 1 in the body and exerts its effects (see Examples).
  • "full-length TGF- ⁇ 1" and “active TGF- ⁇ 1” also include proteins substantially identical to "full-length TGF- ⁇ 1" and “active TGF- ⁇ 1", respectively. Specifically, the proteins substantially identical to "full-length TGF- ⁇ 1" and “active TGF- ⁇ 1" are human-derived "full-length TGF- ⁇ 1" and "active TGF- ⁇ 1", respectively.
  • a protein comprising an amino acid sequence having 80% or more sequence identity with the amino acid sequences shown in SEQ ID NO: 4 and SEQ ID NO: 5, and having the same activity as the protein consisting of SEQ ID NO: 4 and SEQ ID NO: 5, respectively, or , hematopoietic stem cells that have undergone heart failure, or hematopoietic stem cells that have undergone epigenetic changes (see the description in the sixth embodiment) due to decreased TGF- ⁇ 1 signals.
  • amino acid sequence having sequence identity of 80% or more may be any percentage as long as it is an amino acid sequence having sequence identity of 80% or more, for example, 90% or more, 91% More preferred are amino acid sequences having a sequence identity of 92% or greater, 93% or greater, 94% or greater, 95% or greater, 96% or greater, 97% or greater, 98% or greater, or 99% or greater.
  • full-length TGF- ⁇ 1" and “active TGF- ⁇ 1" in the present embodiment also include “full-length TGF- ⁇ 1" and "active TGF- ⁇ 1" derived from animals other than humans.
  • the inventors found that when bone marrow (including hematopoietic stem cells) derived from mice that had experienced heart failure was transplanted into mice that had not developed heart failure (healthy mice), heart failure such as cardiac dysfunction and cardiac fibrosis occurred. and exacerbated renal damage and inhibited skeletal muscle regeneration. Furthermore, the present inventors found that in the niche of hematopoietic stem cells derived from mice that have experienced heart failure, active TGF- ⁇ 1 is significantly reduced, and as a result, epigenetic changes are induced in hematopoietic stem cells, resulting in heart failure. In some hematopoietic stem cells derived from mice, the chromatin regions bound by downstream molecules in TGF- ⁇ 1 signaling are markedly closed.
  • the inventors found that monocytes and macrophages that reached the heart after division and differentiation from hematopoietic stem cells with reduced TGF- ⁇ 1 signaling and epigenetic changes differentiated into cardioprotective mature macrophages.
  • Single-cell sequencing and RNA velocity analysis revealed that the inability to do so deteriorates cardiac function. This suggests that active TGF- ⁇ 1 is effective in improving heart failure, recurrent heart failure, and concomitant heart failure.
  • a second embodiment is a therapeutic agent or composition for treating heart failure and/or concurrent diseases of heart failure, which comprises hematopoietic stem cells unaffected by heart failure as an active ingredient.
  • hematopoietic stem cells not affected by heart failure refer to hematopoietic stem cells derived from healthy subjects who have never developed heart failure.
  • transcription factors that function downstream of TGF- ⁇ 1 signals such as specific chromatin regions, such as Smad transcription factors, GATA3, GATA5, ERG, RUNX2, and KLF9, have been identified.
  • Hematopoietic stem cells characterized in that the binding chromatin region is not closed can also be mentioned, and particularly preferably TGF- ⁇ 1 signal Hematopoietic stem cells whose chromatin regions bound by Smad transcription factors, which are downstream molecules of , are not closed.
  • the “hematopoietic stem cells” of the present embodiment are preferably CD34-positive and CD45-weakly positive cells in the case of humans, for example.
  • the "hematopoietic stem cells not affected by heart failure" of the present embodiment include cells derived from living organisms, cells obtained by proliferating cells derived from living organisms, or those induced from pluripotent stem cells (ES cells, iPS cells, etc.). may be
  • a third embodiment is an agent for suppressing proliferation of hematopoietic stem cells affected by heart failure, characterized by containing active TGF- ⁇ 1 or full-length TGF- ⁇ 1.
  • the term "heart failure-affected hematopoietic stem cells” refers to hematopoietic stem cells that proliferate in patients who have experienced heart failure. , characterized by the closure of specific chromatin regions, e.g., Smad transcription factors, GATA3, GATA5, ERG, RUNX2, KLF9, and other transcription factors that function downstream of TGF- ⁇ 1 signaling. Stem cells.
  • the present inventors have found that the proliferation of hematopoietic stem cells with such epigenetic changes induces a decrease in cardiac function.
  • Active TGF- ⁇ 1 or full-length TGF- ⁇ 1 suppresses the proliferation of hematopoietic stem cells affected by heart failure, ie, hematopoietic stem cells with the epigenetic changes described above (see Examples). Therefore, agents containing active TGF- ⁇ 1 or full-length TGF- ⁇ 1 are effective in preventing and treating the onset of heart failure and the onset of heart failure complications by suppressing the proliferation of hematopoietic stem cells affected by heart failure. It is considered to demonstrate
  • a fourth embodiment is a therapeutic agent or therapeutic composition for heart failure and/or concurrent diseases of heart failure, comprising Tyrosine Hydroxylase (TH) (EC 1.14.16.2) or a TH activity promoter as an active ingredient.
  • the therapeutic agent or composition comprising as
  • TH in this embodiment also includes a protein substantially identical to TH (refer to the description regarding TGF- ⁇ 1 for "substantially identical").
  • the inventors cleared the bone marrow and kidney of a heart failure model mouse, and immunostained sympathetic neurons in the bone marrow cavity and TH in the sympathetic nerve cells in the kidney with antibodies. We found that the amount of TH in the sympathetic nerves of mice was clearly decreased.
  • TH is an enzyme that produces norepinephrine, and norepinephrine is known to activate Schwann cells and promote the release of active TGF- ⁇ 1 from Schwann cells (Yamazaki et al., Cell. 2011). Nov 23;147(5):1146-58.). Therefore, a decrease in TH activity in the sympathetic nerves reduces the release of activated TGF- ⁇ 1 from Schwann cells, resulting in increased proliferation of hematopoietic stem cells that cause epigenetic changes, leading to the onset of heart failure or heart failure.
  • the present inventors have clarified that the decrease in TH activity in the sympathetic nerves of heart failure model mice is caused by decreased transcription of the Th gene that encodes TH (see FIGS. 17 and 19). ).
  • factors that promote TH or TH activity within the sympathetic nerves of heart failure patients are thought to be effective in treating heart failure and heart failure comorbidities. .
  • the therapeutic agent according to the embodiment of the present invention may be administered as an active ingredient (e.g., active TGF- ⁇ 1, full-length TGF- ⁇ 1, hematopoietic stem cells that have not undergone heart failure, TH or a factor promoting TH activity) itself.
  • active TGF- ⁇ 1, full-length TGF- ⁇ 1, hematopoietic stem cells that have not undergone heart failure, TH or a factor promoting TH activity itself.
  • the therapeutic drug (therapeutic drug and therapeutic composition) of the present invention may contain known ingredients that are recognized to have a therapeutic effect on heart failure or concurrent diseases of heart failure.
  • the dosage form of the therapeutic drug according to the embodiment of the present invention is not particularly limited, but liquid preparations such as injections and infusions can be mentioned. Liquid preparations may be dissolved or suspended in water or other suitable solvents at the time of use. When a liquid preparation is used as an injection or a drip, it is prepared by dissolving the active ingredient in water, but if necessary, it may be dissolved in physiological saline or glucose solution, and a buffer or A preservative may be added.
  • a person skilled in the art can determine the type of pharmaceutical additive used in the production of the therapeutic agent according to the embodiment of the present invention, the ratio of the pharmaceutical additive to the active ingredient, or the method of producing the therapeutic agent depending on the form. It can be selected as appropriate.
  • Inorganic or organic substances, or solid or liquid substances can be used as pharmaceutical additives, and can generally be blended between 1% and 90% by weight based on the weight of the active ingredient.
  • examples of pharmaceutical additives include lactose, glucose, mannitol, dextrin, cyclodextrin, starch, sucrose, magnesium aluminometasilicate, synthetic aluminum silicate, sodium carboxymethylcellulose, hydroxypropyl starch, and calcium carboxymethylcellulose.
  • ion exchange resin methylcellulose, gelatin, gum arabic, hydroxypropylcellulose, hydroxypropylmethylcellulose, polyvinylpyrrolidone, polyvinyl alcohol, light anhydrous silicic acid, magnesium stearate, talc, tragacanth, bentonite, veegum, titanium oxide, sorbitan fatty acid ester, Sodium lauryl sulfate, glycerin, fatty acid glycerin ester, refined lanolin, glycerogelatin, polysorbate, macrogol, vegetable oil, wax, liquid paraffin, white petrolatum, fluorocarbon, nonionic surfactant, propylene glycol, water and the like.
  • the active ingredient is mixed with pH adjusters such as hydrochloric acid, sodium hydroxide, lactose, lactic acid, sodium, sodium monohydrogen phosphate, sodium dihydrogen phosphate, sodium chloride, glucose, etc. Dissolve in distilled water for injection together with an isotonizing agent, filter aseptically and fill into an ampoule, or add mannitol, dextrin, cyclodextrin, gelatin, etc. and lyophilize in vacuum to prepare an injection that dissolves before use. good.
  • lecithin, polysorbate 80, polyoxyethylene hydrogenated castor oil, etc. may be added to the active ingredient and emulsified in water to form an emulsion for injection.
  • the dosage, administration frequency and administration method of the therapeutic agent etc. according to the embodiment of the present invention are not particularly limited, and the purpose of prevention and / or treatment of aggravation / progression of the disease to be treated, the type of disease, the weight and age of the patient It can be appropriately selected by a doctor's judgment according to such conditions.
  • the therapeutic agents, etc. are prepared using carriers that can prevent immediate elimination from the body as sustained release formulations such as implanted tablets and microencapsulated delivery systems.
  • sustained release formulations such as implanted tablets and microencapsulated delivery systems.
  • Biodegradable, biocompatible polymers can be used as such carriers, such as ethylene vinyl acetate, polyanhydrides, polyglycolic acid, collagen, polyorthoesters, and polylactic acid. Such materials can be readily prepared by those skilled in the art.
  • Liposomal suspensions can also be used as pharmaceutically acceptable carriers.
  • Liposomes are prepared through filters of suitable pore size to a suitable size for use as a lipid composition containing, but not limited to, phosphatidylcholine, cholesterol and PEG-derived phosphatidylethanol (PEG-PE), followed by reverse-phase evaporation. can be refined by PEG-PE
  • the therapeutic agent or the like according to the embodiment of the present invention may be provided in the form of a kit together with instructions such as an administration method.
  • the medicines contained in the kit can effectively maintain the activity of constituents such as the therapeutic agent for a long period of time, and the containers are manufactured from materials that do not adsorb to the inside of the container and that do not alter the constituents. supplied.
  • a sealed glass ampoule may contain a buffer or the like sealed in the presence of a neutral, non-reactive gas such as nitrogen gas.
  • the kit may also be accompanied by instructions for use. Instructions for use of the kit may be printed on paper or the like, or stored in an electromagnetically readable medium such as a CD-ROM or DVD-ROM and supplied to the user.
  • a fifth embodiment is a method of treating heart failure and/or heart failure co-morbidity, comprising administering to a patient a therapeutic agent or the like according to an embodiment of the present invention.
  • treatment means preventing or alleviating the progression and deterioration of pathological conditions caused in mammals with heart failure (including recurrent heart failure) and concomitant diseases of heart failure (e.g., renal failure, skeletal muscle regeneration failure, etc.).
  • the "mammal" to be treated means any animal classified as mammals, including, but not limited to, humans and pet animals such as dogs, cats, rabbits, ferrets, mice, and hamsters. , cattle, pigs, sheep, horses and other livestock animals.
  • a particularly preferred "mammal” is a human.
  • the sixth embodiment is an auxiliary method for determining the possibility of aggravation of heart failure, wherein the presence or absence of epigenetic changes in hematopoietic stem cells derived from a subject is used as an index.
  • "Epigenetic change” in this embodiment refers to a change in the chromatin structure in the cell nucleus, particularly a change that opens or closes the chromatin structure of the chromosomal DNA region to which the transcription factor binds.
  • the opening of the chromatin structure of the chromosomal DNA region means that protein factors such as transcription factors can approach and bind to the DNA region. A state in which protein factors such as transcription factors cannot bind.
  • the "epigenetic change” in the present embodiment means that the distribution state of the closed structure and the open structure in the chromatin structure of the hematopoietic stem cells derived from the subject is different from that of the hematopoietic stem cells derived from healthy subjects (i.e., those who have not experienced heart failure). It is to have a significantly different distribution state compared to the distribution state of hematopoietic stem cells).
  • “epigenetic changes” include, but are not limited to, chromatin regions that bind transcription factors that function downstream of TGF- ⁇ 1 signals, such as Smad3, GATA3, GATA5, ERG, RUNX2, and KLF9.
  • the chromatin region to which Smad3, a downstream molecule of TGF- ⁇ 1 signaling, binds is closed (closed). More specifically, in this embodiment, for example, when the chromatin region of subject-derived hematopoietic stem cells to which Smad3 binds is significantly closed compared to the chromatin of healthy subject-derived hematopoietic stem cells, the It is an ancillary method to determine if a subject's heart failure is likely to become severe.
  • Methods for selectively detecting whether the chromatin structure is closed or open include the ATAC (Assay for Transposase-Accessible Chromatin)-seq method and the scATACseq (single cell ATAC-seq) method.
  • a seventh embodiment is a method of screening for a candidate therapeutic drug for heart failure and/or concurrent diseases caused by heart failure, comprising administering a candidate substance to a heart failure model animal, and treating TH in sympathetic neurons of the heart failure model animal.
  • the screening method comprising measuring the amount of The present inventors cleared the bone marrow and kidney of a heart failure model mouse, constructed a staining system to measure the amount of tyrosine hydroxylase (TH) present in the cells of the sympathetic nerves that innervate these organs, and quantified it. succeeded in.
  • TH tyrosine hydroxylase
  • TH is produced in the cell bodies within sympathetic neurons, transported within axons and distributed within nerve fibers. Therefore, when the length of a nerve fiber stained by TH immunostaining is visualized to be short, it means that the amount of TH in that nerve cell is reduced.
  • the present inventors have found that in kidney-cleared heart failure model mice, the area in the kidney stained with anti-TH antibody is reduced compared to control mice. It was confirmed that the amount of TH in the cells was decreased. From the above results, when the amount of TH in sympathetic nerve cells is increased by administering a therapeutic agent candidate substance for heart failure to a heart failure model animal, the candidate substance can exert an effect as a therapeutic agent for heart failure. can be determined.
  • the amount of TH in sympathetic neurons can be measured by a method known in the art.
  • a bone or other organ containing sympathetic nerves in the bone marrow cavity may be collected from a model animal, and the amount of TH in the sympathetic nerve cells may be measured. More specifically, when bone is used, the bone marrow is cleared, the sympathetic nerve cells in the bone marrow cavity are immunostained with an anti-TH antibody, and the length of the stained sympathetic nerve fiber is used as an index of the amount of TH. may be measured as Also, when using other organs, the organ is made transparent, the sympathetic neurons that control the organ are immunostained with an anti-TH antibody, and the area (area) of the stained organ is examined for the sympathetic neurons. It may be measured as an indicator of the amount of TH.
  • a heart failure model animal can be produced by, for example, transverse aortic constriction (TAC).
  • TAC transverse aortic constriction
  • the term "animal” used herein includes, but is not limited to, mice, rats, rabbits, dogs, cats, pigs, and the like.
  • examples of bones containing sympathetic nerves in the medullary cavity include the femur, tibia, fibula, ilium, spine, sternum, and skull. Examples include kidney, skeletal muscle, adipose tissue, lung, thyroid, bone, pancreas, liver, intestinal tract, and adrenal gland.
  • Method 1-1 Mice C57BL/6J mice were purchased from CLEA Japan. Congenic strain C57BL/6J mice (CD45.1 mice) for the CD45 locus were purchased from Sankyo Lab Service (Tsukuba, Japan). All mice were housed in independent cages in a pathogen-free environment at the animal breeding facility of the University of Tokyo. Mice were allowed ad libitum access to standard mouse chow and water. All experiments were approved by the Animal Experiment Ethics Committee of the University of Tokyo School of Medicine and were conducted in strict compliance with the University of Tokyo Animal Experiment Guidelines.
  • Bone marrow cells are harvested from tibia, femur, pelvis and vertebrae in MACS buffer (PBS supplemented with 0.5% bovine serum albumin, 2 mM EDTA) by crushing the bone using a pestle and mortar. did. Cells were passed through a 25G needle several times and treated with a 70 ⁇ m cell strainer (Greiner). After removing red blood cells from the samples using PharmLyse solution (BD: Becton, Dickinson and Company), cells were washed with MACS buffer and treated with a 40 ⁇ m cell strainer.
  • MACS buffer PBS supplemented with 0.5% bovine serum albumin, 2 mM EDTA
  • Mouse CD117 ⁇ beads (Miltenyi) were added to the cells and incubated for 15 minutes at 4°C. After cells were washed and treated with a 40 ⁇ m cell strainer, samples were separated using autoMACS (Miltenyi). Cells separated by positive selection were washed with FACS buffer (PBS with 5% FBS) and mixed with antibodies for use in flow cytometry. CD45 + Lin ⁇ Sca1 + cKit + cells were sorted as LSK cells and CD45 + Lin ⁇ Sca1 + cKit + CD34 ⁇ Flt3 ⁇ CD150 + CD48 ⁇ cells were sorted as hematopoietic stem cells.
  • LSK cells For competitive engraftment of LSK cells, separately isolated LSK cells (10 5 ) from CD45.1 and CD45.2 mice were mixed with Lin + rescue cells (10 5 ) from each mouse type. Five-week-old female recipient mice (CD45.1/CD45.2) were irradiated whole body with 9 Gy and the cell suspension was injected intravenously.
  • the excised two ventricles were minced mechanically with curved scissors. Tissue prepared from one heart was then treated with 1 ml of 450 U/ml collagenase I (Sigma-Aldrich), 60 U/ml hyraluronidase (Sigma-Aldrich) and 60 U/ml DNase-I (Sigma-Aldrich). DMEM at 37°C for 45 minutes. Cells in suspension were vortexed for 20 seconds, treated with a 40 ⁇ m cell strainer, and washed with 12 ml of cold HBSS (containing 0.2% FBS and 0.2% BSA). Cells were then centrifuged at 400 g for 5 minutes, washed with PBS and resuspended in FACS buffer.
  • DMEM at 37°C for 45 minutes.
  • Cells in suspension were vortexed for 20 seconds, treated with a 40 ⁇ m cell strainer, and washed with 12 ml of cold HBSS (containing 0.2% FBS and 0.2% BSA
  • the kidney tissue was processed using the gentleMACS dissociator (Miltenyi) according to the attached instruction manual. After the excised kidney was minced mechanically with curved scissors, the tissue prepared from the kidney was immersed in 2.35 ml DMEM containing 100 ⁇ l Enzyme D, 50 ⁇ l Enzyme R and 12.5 ⁇ l Enzyme A (Miltenyi). Tissues were then incubated in gentleMACS with the settings of protocol 37C_multi_B_01. Cells isolated from digested kidney were treated with a 70 ⁇ m cell strainer, then washed with PBS and resuspended in FACS buffer.
  • gentleMACS dissociator Miltenyi
  • Skeletal muscle was processed according to previous reports (Guardiola et al., J Vis Exp, doi:10.3791/54515 2017: Motohas et al., J Vis Exp, doi:10.3791/50846 2014).
  • the tibialis anterior muscle was exposed and the fascia removed with scissors.
  • the tibialis anterior tendon ends were cut and the tip was pulled out towards the knee before cutting near the mid-abdomen.
  • the distal half was used for pathological analysis.
  • the harvested proximal half was mechanically minced with curved scissors and incubated for 40 minutes at 37°C in DMEM supplemented with 0.2% collagenase type 2 (Worthington) and 0.01% DNase-I (Sigma-Aldrich). did.
  • DMEM collagenase type 2
  • DNase-I Sigma-Aldrich
  • Peripheral blood was collected in a tube coated with K3-EDTA (Greiner) by retro-orbital blood sampling. To calculate cell numbers, CountBright Absolute Counting beads (Thermo Fisher) were added to the samples. After removing red blood cells from samples with BD PharmLyse solution (BD), cell suspensions were used for flow cytometric analysis or sorting.
  • K3-EDTA Gibco-EDTA
  • CountBright Absolute Counting beads Thermo Fisher
  • mice were given 10 ⁇ g/g body weight of 5-ethynyl-2′-deoxyuridine (EdU) intraperitoneally 4 hours before anesthesia. A suspension of bone marrow cells was prepared as previously described.
  • EdU 5-ethynyl-2′-deoxyuridine
  • CD117 + was isolated using MACS, cell suspensions were analyzed for CD45.2-V500, Sca1-PE, cKit-APC/Cy7, CD34-FITC, CD135-BV421, CD150-V786 and lineage markers (CD4, CD8, CD11b, Ly6g, B220, CD127, Ter119)-PerCP/Cy5.5, stained for 90 minutes at 4°C, and washed with 3 ml of FACS buffer. Cells were labeled using the Click-iT Plus EdU Alexa Fluor 647 Flow Cytometry Assay Kit (Thermo Fisher) according to the manufacturer's instructions. The percentage of APC-positive cells among CD45.2 + Lin ⁇ Sca1 + cKit + CD34 ⁇ Flt3 ⁇ CD150 + hematopoietic stem cells was calculated using FACS Aria III.
  • TAC Transverse aortic constriction
  • mice were similarly anesthetized and underwent surgical procedures without coarctation of the aorta.
  • UUO Unilateral ureteral obstruction
  • mice were anesthetized by intraperitoneal injection of a mixture of xylazine and ketamine, and 50 ⁇ l of 20 ⁇ M cardiotoxin solution or vehicle was injected into the right tibialis anterior muscle of the mice. Muscle extracts for pathological analysis were immersed in freezing compounds (part 2 for optimal temperature compound, part 1 for 30% sucrose in deionized water) and flash frozen in liquid nitrogen.
  • Barcode plasmid library construction 52 base random SW repeat barcode oligo DNA pool (S for G/C; W for A/T) (5' -TAACTTACGGAGTCGCTCTACG SWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSW CAGGACCTAAAGAATCCCATCC -3' (SEQ ID NO: 1); forward and reverse primers is underlined) was chemically synthesized and amplified by PCR using the following amplification conditions.
  • PCR amplification conditions 98°C, 30 seconds, 98°C, 10 seconds for 10 cycles, 98°C, 10 seconds, 72°C, 10 seconds, then 62°C, 72°C, 1 minute, 98°C, 10 seconds for 20 cycles, 72°C, 1 minute, and Final extension at 72°C for 5 minutes PCR amplification products were cloned into the lentiviral backbone vector, pBC001 v3 (Addgene; https://benchling.com/s/seq-cWGPBaROWGixteFedTqA).
  • pBC001 v3 has a barcode cloning site in the 3'UTR after the CMV promoter and EGFP.
  • the PCR amplified product and backbone plasmid were digested with XbaI (NEB) at 37°C for 60 minutes and with BamHI (NEB) at 37°C overnight, and then purified on a column.
  • XbaI XbaI
  • BamHI NEB
  • 1,500 fmol insert and 150 fmol backbone were ligated with T4 DNA ligase (Nippon Gene) at 16°C for 18 hours.
  • Ligation products were purified for bacterial transformation.
  • 500 ng of DNA was transformed into 200 ⁇ L of chemically competent cells (NEB) using the high efficiency transformation protocol provided with the kit. After 60 minutes of growth in SOC medium, bacterial cells were plated on 10 LB plates containing 100 ⁇ g/mL ampicillin.
  • Hematopoietic stem cells isolated from CD45.1 mice were cultured ex vivo according to a previous report (Wilkinson et al., Nature 571, 117-121, doi:10.1038/s41586-019-1244-x 2019). Sorted cells were resuspended in HSC medium (HemEX-Type9A; Cell Science & Technology) containing 10 ng/ml SCF (Biolegend), 100 ng/ml TPO (Biolegend) and penicillin-streptomycin (Gibco), and the fibronectin-coated 24 100-1,000 cells were plated per well in flat-bottom well plates (Corning).
  • HSC medium HemEX-Type9A; Cell Science & Technology
  • cultured hematopoietic stem cells were infected with barcode lentivirus pBC008 in HSC medium containing 5 ng/ml polybrene.
  • infected hematopoietic stem cells were detected with Accutase (Thermo Fisher) and stained with CD45.1-APC, Sca1-PE, cKit-APC/Cy7 and Lin - PerCP/Cy5.5.
  • GFP + Lin ⁇ Sca1 + cKit + cells were sorted using FACS Aria IIIa and mixed with CD45.2 + Lin ⁇ cKit + Sca1 ⁇ cells as rescue cells.
  • mice Five-week-old recipient CD45.2 mice were whole-body irradiated with 9 Gy and intraperitoneally injected with 2 ⁇ 10 4 GFP + LSK cells and 10 5 rescue cells per mouse. After 2 months, recipient mice were euthanized, peripheral blood, heart and kidney were collected and treated as previously described. After that, FACS-sorted cells were lysed in Buffer RLT plus (QIAGEN), and genomic DNA was extracted using AllPrep DNA/RNA Mini Kit (QIAGEN). The barcode sequence incorporated into the genomic DNA was PCR amplified with NEBNext Ultra II Q5 Master Mix (NEB) using the primer pairs shown below.
  • NEB NEBNext Ultra II Q5 Master Mix
  • Amplification conditions are as follows. 98°C, 30 seconds, 98°C, 10 seconds for 18 cycles, 60°C, 10 seconds, 72°C, 30 seconds, and 72°C, 5 minutes
  • the cloned sequence by PCR was amplified for 9-11 cycles using NEBNext Multiplex Oligos (NEB) to create a library for sequencing.
  • NEB NEBNext Multiplex Oligos
  • the prepared library was outsourced to Genewiz and subjected to paired-end sequencing using an Illumina sequencer. Both barcode sequences of the pair-end sequences were compared and only full-length barcode sequences with perfect matches were collected. Barcode sequences with 4 bases or less of mismatches were assembled into one barcode sequence.
  • the total number of barcodes for each cell type ranged from 6,808,221 to 15,745,444. Barcode counts were normalized to give a total count of 10,000,000 for each cell type.
  • To cluster barcode counts barcodes with a normalized barcode count of 10 or greater were hierarchically clustered for at least one sample (Fig. 3b). Pearson correlation coefficients were calculated between cell types.
  • mice were given 10 ⁇ g/g body weight of 5-ethynyl-2′-deoxyuridine (Edu) intraperitoneally 4 hours before anesthesia.
  • a suspension of bone marrow cells was prepared as described above.
  • the cell suspension was analyzed with CD45.2-V500, Sca1-PE, cKit-APC/Cy7, CD34-FITC, CD135-BV421, CD150-V786 and lineage markers (CD4, Stained with CD8, CD11b, Ly6g, B220, CD127, Ter119)-PerCP/Cy5.5 for 90 min at 4° C.
  • RNA Sequencing RNA sequencing was performed according to a previous report (Nakayama et al., Proc Natl Acad Sci USA 117, 14365-14375, doi:10.1073/pnas.2005924117 2020).
  • Total RNA was purified from cells using RNeasy (Qiagen) and from tissues using RNeasy plus micro RNA Purification kit (Qiagen) according to the attached instructions.
  • RNeasy Qiagen
  • RNeasy plus micro RNA Purification kit Qiagen
  • cell lysates were passed through gDNA Eliminator spin columns to remove contaminating genomic DNA. Poly-A mRNA was extracted from total RNA using Oligo-dT from the NEBNext Poly(A) RNA Magnetic Isolation Module (NEB).
  • RNA-seq libraries were prepared according to the attached protocol. Libraries were subjected to single-end or paired-end sequencing using a HiSeq 1500 sequencer (Illumina). Reads were aligned to the mm10 mouse genome using STAR (Dobin et al., Bioinformatics 29, 15-21, doi:10.1093/bioinformatics/bts635 2013). Aligned read files were analyzed by HOMER (Heinz et al., Mol Cell 38, 576-589 2010). Expression analysis of RNA-seq data was performed using HOMER.
  • ATAC-seq Assay for transposase-accessible chromatin with sequencing
  • the protocol previously reported (Corces et al., Nat Methods 14, 959-962, doi:10.1038/nmeth.4396 2017) was followed.
  • 5,000 sorted CD45.2 + Lin - Sca1 + cKit + CD34 - Flt3 - CD150 + cells were suspended in 400 ⁇ l of resuspension buffer (10 mM Tris-HCl pH 7.4, 10 mM NaCl, and 3 mM MgCl 2 ).
  • the fragmented DNA was used for amplification, library construction and sequencing according to Illumina's guidelines. The quality of sequencing data was checked using FastQC. Filtered reads were mapped against the mm10 mouse genome using HOMER. HOMER was used for peak detection. Peaks overlapping blacklisted regions (Dunham et al., Nature 489, 57-74, doi:10.1038/nature11247 2012) or simple repeat regions were removed. The peaks detected in the 6 samples were merged and the tags normalized within a 200 bp range around the peak were counted for PCA in Figure 4a.
  • edgeR Robot et al., Bioinformatics 26, 139-140, doi:10.1093/bioinformatics/btp616 2009
  • edgeR was used to count counts within a 200bp range around the peak as controls. Comparisons were made between TAC samples.
  • HOMER identified motifs enriched in peaks with significantly lower counts (FDR ⁇ 0.1) in TAC samples than controls.
  • the percentage of counts mapped to the mitochondrial genome was greater than 5%. Cells with high UMI counts ( ⁇ 5,500) were also excluded to avoid possible duplication. Cells from the remaining 1,497 control mice and cells from 1,715 post-TAC mice were used for subsequent analysis. Control and TAC cell databases were aggregated with 2,000 highly variable genes (Stuart et al., Cell 177, 1888-1902 2019) using Seurat v3's standard integration procedure. The expression matrix was subjected to dimensionality reduction using principal component analysis of the corrected integrated gene matrix. Clusters were identified by a graph-based approach using the Louvain modularity optimization algorithm. tSNE (t-distributed stochastic neighbor embedding) was used for dimensionality reduction and visualization of the dataset.
  • tSNE t-distributed stochastic neighbor embedding
  • stray myeloid (Cd34 ⁇ Spi1 hi Itgam + ) cells were previously removed prior to the clustering shown in FIG. 4d.
  • mitochondrial and ribosomal genes were removed and log-normalized data for HSC clusters (clusters 1, 2, 3, 4 and 8) were obtained from Seurat Analysis was performed using MAST (Finak et al., Genome Biol 16, 015-0844 2015) with the FindMarkers function.
  • GSEA was performed using a rank file created according to a previous report (http://genomespot.blogspot.com/2015/01/how-to-generate-rank-file-from-gene.html).
  • the MAGIC algorithm was used to display gene expression as a violin plot.
  • hematopoietic stem cell populations signature HSCs
  • MPPs multipotent progenitors
  • TGF- ⁇ 1-administered heart failure model mice mice subjected to aortic coarctation (TAC)) 2.6
  • PBS phosphate-buffered saline
  • TGF- ⁇ 1 administered to mice was performed by intraperitoneal injection at 40 ng/g per mouse body weight. Dosing was performed on day 1 (day 1) and day 5 (day 5) after TAC.
  • TAC 1W a solution containing no recombinant human TGF- ⁇ 1 was administered (TAC 1W in FIG. 14).
  • tyrosine hydroxylase TH
  • Mice were transcardially perfused with PBS and then perfused and fixed with 4% Paraformaldehyde (PFA).
  • PFA Paraformaldehyde
  • a femur or kidney was removed. After extraction of the femur, the skeletal muscle was removed with scissors. Femurs or kidneys were then infiltrated with 4% PFA and fixed overnight. The femur or kidney was then infiltrated with CUBIC-L (T3740, TCI) at 37°C for 6 days.
  • CUBIC-B T3780, TCI
  • Femurs or kidneys were then placed back into CUBIC-L and allowed to infiltrate for 3 days.
  • a longitudinal incision line was made in the center of the femur to allow penetration of the antibody.
  • the above-treated femurs or kidneys were blocked with 5% goat serum (ab7481, Abcam) and permeated with primary antibodies at 37°C for 5 days.
  • the primary antibodies for the femur were 500-fold diluted anti-tyrosine hydroxylase rabbit monoclonal antibody (ab152, Abcam), 250-fold diluted anti-active TGF- ⁇ 1 mouse monoclonal antibody (MAB2401, R&D), 1,000-fold diluted anti -GFAP chicken polyclonal antibody (ab4674, Abcam) was used to prepare an antibody cocktail in PBS containing 0.5% Triton-X and 0.1% sodium azide.
  • a 500-fold diluted anti-tyrosine hydroxylase rabbit monoclonal antibody (ab152, Abcam) was used to prepare an antibody solution in PBS containing 0.5% Triton-X and 0.1% sodium azide. After reacting with the primary antibody, the femur or kidney was washed with PBS and permeated with the secondary antibody at 37°C for 5 days.
  • Secondary antibodies for femur were 100-fold diluted anti-chicken IgY Alexa Fluor Plus 488 (A32931, Thermo Fisher), 100-fold diluted anti-rabbit IgG Alexa Fluor Plus 555 (A32732, Thermo Fisher), 100-fold diluted anti -mouse IgG Alexa Fluor 633 (A21050, Thermo Fisher) was used to make antibody cocktails in 0.5% Triton-X, 0.1% sodium azide in PBS.
  • an antibody solution was prepared in PBS containing 0.5% Triton-X and 0.1% sodium azide using 100-fold diluted anti-rabbit IgG Alexa Fluor Plus 555 (A32732, Thermo Fisher) and used.
  • the refractive index of the sample was adjusted with CUBIC-R+ (T3741, TCI).
  • MVPLAPO 0.63x/NA 0.15 objective lens
  • MVX-ZB10 1.6x zoom body
  • Th gene expression level in sympathetic ganglia Regarding femoral sympathetic ganglia TAC was performed on 8-week-old mice using a 26G needle. 6) Under anesthesia and untreated 8-week-old mice, both left and right sympathetic ganglia that innervate the femur were removed and infiltrated with RNA later. Expression levels were quantified. In addition, for the sympathetic ganglion of the sympathetic nerve innervating the kidney, TAC was performed on 8-week-old mice using a 26G needle. The left and right sympathetic ganglia that innervate the kidney were removed from the mice under anesthesia and infiltrated with RNA later, and then Th gene expression and ribosomal RNA (18s) expression levels were quantified by real-time PCR.
  • HSCs hematopoietic stem cells
  • mice Collected post-TAC HSCs and control HSCs were transplanted into wild-type mice, respectively, and left ventricular ejection fraction and cardiac fibrosis area were evaluated 4 and 6 months later.
  • Mice engrafted with post-TAC HSCs showed signs of cardiac dysfunction with fibrosis 4 months after bone marrow transplantation when compared to mice engrafted with control HSCs, and such symptoms were more pronounced 6 months after bone marrow transplantation. became more pronounced (Fig. 1a).
  • control HSCs from CD45.1 mice
  • post-TAC HSCs from CD45.2
  • mosaic bone marrow consisting of control HSCs and post-TAC HSCs was established.
  • recipient mice CD45.1/45.2 with cytoplasm
  • Fig. 1c the organization of blood cells in the recipient mice was examined.
  • RNA-seq The transcriptomes of post-TAC HSC-derived Ly-6C lo macrophages and control HSC-derived Ly-6C lo macrophages sorted separately from recipient mice were compared (RNA-seq).
  • Fig. 1d in Ly-6C lo macrophages derived from post-TAC HSCs, genes whose expression is upregulated in cardiac macrophages are less expressed, confirming that the differentiation process from monocytes to cardiac macrophages is impaired. (Fig. 1d).
  • mice After transplantation of bone marrow from control or post-TAC mice, recipient mice were administered cardiotoxin to injure skeletal muscle.
  • the damaged myofibrils of mice transplanted with bone marrow of post-TAC mice were found to regenerate to a lesser extent than mice transplanted with bone marrow of control mice (FIGS. 2d and e).
  • HSCs are heterogeneous (heterogeneous), there were clear differences in their repertoire between B/T cells and myeloid lineage cells. Neutrophil and monocyte repertoires were very similar (Fig. 3b, Fig. 7). Ly-6C hi renal macrophages appeared to be monocyte-derived, whereas cardiac and renal Ly-6C lo macrophages appeared to be less associated with the peripheral blood myeloid lineage (Fig. 3b). , c and FIG. 7). The above results suggest that monocytes derived from hematopoietic stem cells that have changed to favor the myeloid lineage tend not to differentiate into tissue-mature macrophages.
  • GATA3 is well known as a transcription factor that is essential for the polarization of Ly- 6Clo macrophages and the differentiation of helper T cells and innate lymphoid cells, suggesting that TAC-mediated activation of hematopoietic stem cells. Epigenetic changes dictate macrophage differentiation, suggesting a shift toward differentiation toward the myeloid lineage (Fig. 4c).
  • scRNA-seq single-cell RNA sequencing
  • CD34 - FLAT - LSK Long - Sca1 + c-Kit + Cd45 + : adult hematopoietic stem cells
  • Fig. 4d All cells comprising control HSCs and post-TAC HSCs were divided into 11 subpopulations
  • GSEA Gene Set Enrichment Analysis
  • scRNA-seq was performed on clusters 4, 5, and 7 with high hematopoietic stem cell signature (landmark) scores, and the SMAD2/3 pathway was inactive in HSC after TAC.
  • TGF- ⁇ signaling induces the progression of heart failure.
  • Donor mice were treated with a TFG- ⁇ 1 receptor inhibitor (LY364947) or vehicle, followed by TAC treatment 6 weeks after transplantation of LY364947-treated hematopoietic stem cells into recipient mice (Fig. 4g).
  • TFG- ⁇ 1 receptor inhibitor LY364947
  • vehicle a TFG- ⁇ 1 receptor inhibitor
  • TAC treatment 6 weeks after transplantation of LY364947-treated hematopoietic stem cells into recipient mice
  • Fig. 9b shows that the myeloid shift induced by inhibition of TGF- ⁇ 1 receptors in donor mouse hematopoietic stem cells (Fig. 9a) was also maintained in recipient mouse hematopoietic stem cells (Fig. 9b).
  • TGF- ⁇ 1 suppresses the proliferation of hematopoietic stem cells that have undergone epigenetic changes, it is thought that the decline in cardiac function can also be suppressed. Therefore, we administered full-length human TGF- ⁇ 1 immediately after TAC to C57BL6J mice, and investigated whether the proliferation of hematopoietic stem cells (hematopoietic stem cells with epigenetic changes) was suppressed.
  • TGF- ⁇ 1 becomes active TGF- ⁇ 1 in the body.
  • Recombinant TGF- ⁇ 1 full length
  • PBS phosphatidylcholine
  • Activated TGF- ⁇ 1 in the bone marrow was measured by the ELISA method described in 1-13 above.
  • TAC the amount of activated TGF- ⁇ 1 decreased, but systemic administration of full-length TGF- ⁇ 1 increased the amount of activated TGF- ⁇ 1 in the bone marrow to levels similar to those in controls. recovered.
  • tyrosine hydroxylase TH
  • femurs collected from mice were cleared, and the amount of tyrosine hydroxylase (TH) present in sympathetic neurons inside was quantified by immunostaining with an anti-TH antibody.
  • staining of active TGF- ⁇ 1 with an anti-activated TGF- ⁇ 1 antibody and staining of Schwann cells with an anti-GFAP (Glial fibrillary acidic protein) antibody at the same time has been known to detect TH-positive nerve fibers. It was confirmed that Schwann cells were present in the cells, and active TGF- ⁇ 1 was present in the Schwann cells.
  • Th gene expression level in sympathetic ganglia after heart failure Based on the above results, the expression level of the tyrosine hydroxylase gene ( Th gene) in sympathetic nerve cells after heart failure was examined. Sympathetic ganglia (left and right) that supply sympathetic nerves to the femur were isolated from heart failure model mice treated with TAC, and Th gene expression was measured by real-time PCR. As a result, it was found that the expression level of the Th gene was significantly decreased 3 days and 7 days after TAC treatment (Fig. 17). Moreover, in the sympathetic ganglia innervating the kidney of the TAC-treated mouse model of heart failure, a decrease in Th gene expression level was confirmed 4 weeks after AC (FIG. 19). These results suggest that the decrease in TH levels in sympathetic neurons after heart failure is due to the decrease in Th gene expression levels in sympathetic ganglia.
  • the present invention provides effective therapeutic agents for heart failure and its concurrent diseases.
  • the present invention also provides a complementary method for diagnosing potentially severe heart failure, such as recurrent heart failure. Therefore, the present invention is expected to be used in the pharmaceutical and medical fields.

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Abstract

本発明は、心不全および併発疾患の治療方法、治療剤および診断方法（診断の補助的方法）の提供を目的とする。具体的には、本発明は、心不全および心不全の併発疾患の治療薬または治療用組成物であって、活性型TGF-β1または全長TGF-β1を含有する、前記治療薬または治療用組成物、または、心不全および心不全の併発疾患の治療薬または治療用組成物であって、心不全の影響を受けていない造血幹細胞を有効成分として含む、前記治療薬または治療用組成物である。さらに、本発明は、心不全の重症化の可能性を判断するための補助的方法であって、被験者由来の造血幹細胞におけるエピジェネティックな変化の有無を指標とする、前記補助的方法である。

Description

心不全およびその併発疾患の治療法、治療剤および診断法。
　本発明は、心不全およびその併発疾患の治療法、治療剤および診断法に関する。
　心不全は、現在の高齢化社会において、増加している疾患の1つである。従来の心不全症例の治療法は、内服治療が中心であるが、心不全で入院後、軽快退院しても半年で30％程度の再入院が生じる。さらに、心不全は一度心不全を生じると再発を繰り返すという特徴を持っており、再入院した際には、心臓の状態が前回入院より悪化しており、再発の繰り返しにより、最終的に死に至る。
　また、心不全の再発によって、腎不全、骨格筋再生不全（フレイル）などの併発疾患を発症し、このような病態も心不全の生命予後を悪化させる要因となっている。しかしながら、心不全の再発や併発疾患のメカニズムには不明な点が多く、有効な治療法や治療剤の開発が当該分野における重要な課題となっている。
　従来、心臓の機能は心筋細胞の働きによってのみ規定されているのではないかと考えられていたが、心臓内に1%程度存在する心臓マクロファージによっても強く規定されていることが報告された（非特許文献１）。また、ある種の心臓マクロファージは、自ら分泌するIL-10を介して、拡張機能障害の進行を促進することが報告されている（非特許文献２）。以上のように、心不全など心臓の機能障害には、心臓マクロファージが重要な役割を果たしていることが明らかになってきたが、心不全の再発および併発疾患の発症と、心臓マクロファージとの関連性については、不明な点が多い。
Fujiuら, Nat Med 24, 1234-1245, doi:10.1038/s41591-018-0059-x, 2017. Hulsmansら, J. Exp. Med. 215, 423-440, https://doi.org/10.1084/Jem.20171274, 2018.
　上記事情に鑑み、本発明は、心不全および併発疾患の治療方法、治療剤および診断方法の補助的方法の提供を目的とする。
　発明者らは、心臓機能が心臓マクロファージによって規定されているということに鑑み、マクロファージの起源である造血幹細胞に着目し、鋭意研究を行った結果、心不全の再発および共存疾患の発症における造血幹細胞の重要な役割を明らかにした。
　発明者らは、心不全モデルマウスから採取した骨髄を、心不全を発症していないマウスに移植したところ、心機能障害および心臓線維化が引き起こされることを明らかにした。また、同様の骨髄移植により、腎臓の損傷が悪化し、骨格筋の再生が阻害されること見出した。さらに、発明者らは、心不全を経験したマウス由来の造血幹細胞ニッチにおいて、活性型トランスフォーミング増殖因子β1（transforming growth factor β1：TGF-β1）が、著しく減少していること、その結果、造血幹細胞のエピジェネティック変化が惹起されること、網羅的エピジェネティック解析により、心不全を経験したマウス由来の造血幹細胞の一部の細胞では、TGF-β1のシグナル伝達における下流分子が結合するクロマチン領域が顕著に閉じていることを明らかにした。
　さらに、発明者らは、TGF-β1のシグナル低下によってエピジェネティック変化が生じた造血幹細胞から分裂および分化した、単球およびマクロファージは、心臓保護的な成熟したマクロファージに分化出来ず、その結果心機能が低下することを見出した。発明者らは、当該知見を踏まえて心不全モデルマウスにTGF-β1を投与したところ、当該エピジェネティック変化が生じた造血幹細胞の増殖を抑制できることを見出した。
　以上の結果から、心不全の影響を受けていない造血幹細胞の投与、活性型TGF-β1の投与が、心不全、特に再発した心不全および併発疾患の治療に有効であることが示唆された。また、心不全を経験した造血幹細胞のエピジェネティックな変化を指標にして、心不全の中でも、再発心不全などのように重症化のリスクのある症例の診断が可能であることを見出した。
　すなわち、本発明は以下の（１）～（１３）である。
（１）心不全および／または心不全の併発疾患の治療薬または治療用組成物であって、活性型TGF-β1または全長TGF-β1を有効成分として含む、前記治療薬または治療用組成物。
（２）心不全および／または心不全の併発疾患の治療薬または治療用組成物であって、心不全の影響を受けていない造血幹細胞を有効成分として含む、前記治療薬または治療用組成物。
（３）前記心不全の影響をうけていない造血幹細胞において、TGF-β1シグナルの下流の分子が結合する遺伝子領域のクロマチンが閉鎖していないことを特徴とする、上記（２）に記載の治療薬または治療用組成物。
（４）心不全および／または心不全の併発疾患の治療薬または治療用組成物であって、チロシンヒドロキシラーゼ（Tyrosine Hydroxylase；TH）またはその活性促進因子を有効成分として含む、前記治療薬または治療用組成物。
（５）治療対象である心不全が初発の心不全である、上記（１）から（３）までのいずれかに記載の治療薬または治療用組成物。
（６）治療対象である心不全が再発した心不全である、上記（１）から（３）までのいずれかに記載の治療薬または治療用組成物。
（７）前記併発疾患が、腎不全および／または骨格筋再生不全であることを特徴とする、上記（１）から（６）までのいずれかに記載の治療薬または治療用組成物。
（８）活性型TGF-β1または全長TGF-β1を含有することを特徴とする、心不全の影響を受けた造血幹細胞の増殖抑制剤。
（９）心不全の重症化の可能性を判断するための補助的方法であって、被験者由来の造血幹細胞におけるエピジェネティックな変化の有無を指標とする、前記補助的方法。
（１０）前記エピジェネティックな変化が、TGF-β1シグナルの下流の分子が結合する遺伝子領域のクロマチンの閉鎖である、（９）に記載の補助的方法。
 （１１）心不全および／または心不全による併発疾患の治療薬候補となる物質のスクリーニング方法であって、心不全モデル動物に候補物質を投与し、当該心不全モデル動物の交感神経細胞内のTHの量を測定することを含む、前記スクリーニング方法。
（１２）前記心不全モデル動物から、交感神経を含む臓器を採取し、当該臓器を透明化し、当該臓器を支配する交感神経の神経細胞内のTHの量を測定することを含む、上記（１１）に記載の方法。
（１３）前記THの量を抗TH抗体で定量することを特徴とする、上記（１２）に記載の方法。
　なお、本明細書において「～」の符号は、その左右の値を含む数値範囲を示す。
　本発明にかかる治療剤は、心不全（初発の心不全および再発心不全）およびこれに伴う併発疾患を効果的に治療することが可能である。
　さらに本発明にかかる診断の補助的方法によれば、心不全の重症化の可能性の判断および併発疾患の発症の可能性の判断のためのデータ等を提供することができる。
心不全を経験したマウス由来の骨髄移植によって生じる、心臓機能への影響を検討した結果。ａ：コントロールまたはTAC（大動脈縮窄術）後マウスから、若いマウスへの骨髄移植を行った。移植後、レシピエントマウスに対し、心エコーによる左室駆出率の評価および免疫組織学的な解析による線維化領域の評価を行った。各グループ n=6。*P<0.05、**P<0.01、two-tailed unpaired Student’s t-test。control：コントロール、pTAC：TAC処置後、BMT：骨髄移植（他の図においても同じ）。ｂ：コントロールマウスとTAC後4週目のマウスからHSC（造血幹細胞）を移植する、競合的HSC移植の手順を示す。レシピエントへの移植から8週間後にフローサイトメトリー解析を行った。ｃ：レシピエントマウスの末梢血のCd45+細胞（左）と心臓マクロファージ（右）をフローサイトメトリーで解析した結果を示す。 n=6。 *P<0.05、one-way ANOVA。ｄ：コントロールの骨髄細胞または心不全を経験した骨髄細胞に由来する、Ly-6Cloマクロファージのトランスクリプトームを比較するための Gene set enrichment analysis（GSEA）の結果。遺伝子セットは、循環血液中の単球と心臓マクロファージ間で、各RNAシークエンスデータにおいて発現差のある遺伝子からなる。左：単球で発現が上昇している遺伝子、右：心臓マクロファージで発現が上昇している遺伝子。両遺伝子セットの構成要素は、図１１および図１２に、各々示す。NES：normalized enrichment score。ｅ：コントロールマウスおよびTAC後のマウス由来の造血幹細胞のRNAシークエンスデータの主成分分析（Principal component analysis ：PCA）結果を示す。 心不全を経験したマウス由来の骨髄移植が心臓以外の器官の機能に与える影響を検討した結果。ａ：コントロールマウスまたはTAC後マウスの骨髄を移植したレシピエントマウスを片側尿管結紮（unilateral ureteral obstruction：UUO）処置し、7日後の腎臓に関する、腎臓尿細管傷害スコア（左）と線維化面積を示す。n=6。*P<0.05、two-tailed unpaired Student’s t-test。ｂ：コントロールマウスまたはTAC後マウスの骨髄を移植したレシピエントマウスをUUO処置し、3日後の腎臓内におけるドナー由来マクロファージの数をカウントした結果を示す。n=6。*P<0.05、two-tailed unpaired Student’s t-test。ｃ：図１ｂに示す競合的移植（コントロールマウスとTAC後マウスの骨髄を同時に移植すること）後のレシピエントマウスにおける、TAC後マウスの骨髄およびコントロールマウスの骨髄に由来する、血液中Cd45+細胞、心臓マクロファージおよび腎臓マクロファージの量を比較した結果を示す。データはTAC後マウスの骨髄に由来する細胞の割合を示している。n=6. *P<0.05, ns not significant, one-way ANOVA。Neutro：好中球、mac：マクロファージ。ｄ：カルディオトキシン投与後28日における、前脛骨筋の中心核筋原繊維（centrally nucleated myofiber：CSA）の平均断面積を示す。n=4～5。*P<0.05、two-tailed unpaired Student’s t-test。ｅ：カルディオトキシン投与後28日における、再生した筋原繊維の中心核筋原繊維の断面積の分布を示す。n=4～5。*P<0.05、two-tailed unpaired Student’s t-test。 組織マクロファージとなる細胞の運命を決定付ける要因の検討。ａ： DNAバーコードを使用して、造血幹細胞が組織マクロファージへ分化する過程を追跡するための手順を示す。レンチウイルスによりバーコード配列（1×106bp）を導入した造血幹細胞（CD45.1マウス由来）を、レシピエントマウス（CD45.2マウス）に移植し、血中単球内のバーコード配列および組織マクロファージ内のバーコード配列をシークエンスした。ｂ：定常状態のマウス由来の読み出されたバーコードの階層クラスタリングを示す。ｃ：図に示した各細胞系列（TおよびB細胞、好中球、単球、腎臓Ly-6Chi／Ly-6Cloマクロファージ、心臓Ly-6Cloマクロファージ（CCR2hi 、CCR2lo））間のバーコードレパトアのPearsonの相関係数を示す。3個体のレシピエントマウスについて解析を行った。T：T細胞、B：B細胞、N：好中球、M：単球。 TGF-βシグナルの阻害による造血幹細胞のエピジェネティック変化。ａ：コントロールマウスとTACから4週間後のマウスから選別した造血幹細胞のATAC-seqの主成分分析結果を示す。ｂ：コントロールHSCよりもTAC後HSCにおいて、弱いピークを示す領域のモチーフ分析の結果を示す。ｃ：TAC後のHSCで減少したピーク領域に最も近い遺伝子について、上位にランキングされた遺伝子オントロジーを示す。ｄ：コントロールマウスのHSCおよびTACから4週間後のHSC間の単一細胞RNAシークエンス混合データのUMAP（Uniform Manifold Approximation and Projection）を示す。全てのプロットを11のクラスターに分類した。ｅ：コントロールHSCとTAC後HSCのトランスクリプトームを比較した遺伝子オントロジー解析の結果を示す。左図：各クラスターにおけるTGF-βシグナル濃縮のバイオリンプロット。各バイオリンプロットにおいて、オレンジ（左側）がコントロールHSC、グリーン（右側）がTAC後HSC。右図：コントロールHSCとTAC後HSC間のSMAD2/3核内パスウェイのGSEA解析結果を示す。ｆ：コントロールの骨髄およびTACから1、2、3および4週間後の骨髄の抽出液中に存在する活性型TGF-β1濃度をELISAで測定した結果を示す。タンパク質濃度は総タンパク質の量に対して標準化した。n=6～8。*P<0.05、ns：有意差無し、one-way ANOVA。ｇ：ｈの実験手順を示す。マウスをビークルまたはLY36947で処理し、2週間後にその骨髄をレシピエントマウスに移植した。移植から6週間後にTAC処理を行った。ｈ：ビークルまたはLY36947で処理した骨髄を移植したレシピエントマウスの左室駆出率をTACから2週間後に測定した結果を示す。n=6。**P<0.01、two-tailed unpaired Student’s t-test。ｉ：心不全によって誘導される造血幹細胞のエピジェネティック変化と再発および共存疾患に及ぼす影響について説明した図である。 コントロールマウスまたは心不全を経験したマウスの造血幹細胞から誘導された心臓マクロファージの表現型の解析。図１ｂに示すレシピエントマウス由来のCd11b+Cd64+Ly6clo心臓マクロファージのフローサイトメトリー解析の結果を示す。コントロールマウスおよびTAC後4週間のマウス由来の造血幹細胞を同時にレシピエントマウスに移植した。n=6。ns：有意差無し、*P<0.05、two-way ANOVA。 コントロールマウスまたは心不全を経験したマウスから骨髄移植を行ったレシピエントマウスの心臓マクロファージの表現型の解析。図１ｂに示す手順で骨髄移植を行った。n=12。その後、TACを行わなかったコントロールマウスおよびTACから4週間後のマウス、各々のマウスについて行ったフローサイトメトリー解析を示す（各々n=6、n=6）。ａ：レシピエントマウスの末梢血中の血液細胞（上）と心臓マクロファージ（下）に関するフローサイトメトリー解析結果を示す。 n=6。 *P<0.05、one-way ANOVA。mono：単球、mac：マクロファージ。ｂ：図５のLy6clo心臓マクロファージについてのフローサイトメトリー解析結果を示す。各々n=6。 *P<0.05、**P<0.01, two-tailed unpaired Student’s t-test。ｃ：図１ｂに示されるコントロールマウスに関する代表的なフローサイトメトリー解析方法。 組織マクロファージとなる細胞の運命を決定付ける要因の検討。図に示した各細胞系列（TおよびB細胞、好中球、単球、腎臓Ly-6Chi／Ly-6Cloマクロファージ、心臓Ly-6Cloマクロファージ（CCR2hi 、CCR2lo））間のバーコードレパトアのPearsonの相関係数を示す。3個体のレシピエントマウスについて解析を行った。図３ｃのレシピエントマウスとは別のマウスを用いた解析結果である。 心不全を経験した造血幹細胞の増殖能についての検討。TACから1週間後、2週間後および4週間後において、EdU（5-ethynyl-2’-deoxyuridine）陽性細胞の割合を調べた結果を示す。各々n=4～6。*P<0.05 、one-way ANOVA。 TGF-β1受容体阻害剤で処理した造血幹細胞における白血球の分析。図４ｇと同様に、ビークルまたはTGF-β1受容体阻害剤（LY364947）で処理したドナーの骨髄をレシピエントに移植した。骨髄移植後のドナーマウス（ａ）およびレシピエントマウス（ｂ）における、白血球数と各種細胞系列の割合を示す。 造血幹細胞内のTGF-β1シグナル伝達の阻害による、組織マクロファージの再構成への影響。骨髄移植から6週間後における、各細胞系列の再構成割合を示す。ドナーCd45.1マウスをビークルまたはLY364947で2週間前処理した（右図）。ビークルまたはLY364947で前処理したマウスの骨髄細胞を処理していないCd45.2骨髄細胞と混合し、レシピエントマウスに移植した。n=6。*P<0.05、two-tailed unpaired Student’s t-test。BMC：骨髄細胞（bone marrow cell）。 図１ｄのGSEAで使用した、単球で発現が上昇している遺伝子セット。 図１ｄのGSEAで使用した、心臓マクロファージで発現が上昇している遺伝子セット。 全長TGF-β1が骨髄内で活性型TGF-β1となることの確認。組換体ヒト全長TGF-β1を連日、腹腔内投与した後、1週間後に骨髄内の活性型TGF-β1の量を測定した。 心不全を経験した造血幹細胞の増殖能に対するTGF-β1の影響の検討。TAC直後にTGF-β1またはPBS（コントロール）を毎日投与し、7日後（1週間後）において、EdU（5-ethynyl-2’-deoxyuridine）陽性細胞（EdU+ HSC）の割合を調べた結果を示す。*P<0.05 、one-way ANOVA後にTukey testを行った。 TAC処理マウスの交感神経細胞（骨髄）内のチロシンヒドロキシラーゼ（Tyrosine Hydroxylase：TH）量の測定。心不全モデルマウス（TAC処理マウス）またはコントロールマウスの骨髄腔内の交感神経細胞を抗TH抗体で免疫染色を行い、染色された神経線維の長さ（総長）を測定した。ControlはTAC未処理のマウスを用いた結果である。Ａは透明化した大腿骨を抗TH抗体で免疫染色した結果で、Ｂは抗TH抗体で染色された交感神経線維の長さの合計値を示す。TAC処理後1週間および4週間のサンプルについて測定を行った。N=6、*P<0.05、one-way ANOVAおよびTukey-Kramerで解析した。 大腿骨内の交感神経およびシュワン細胞の免疫染色。心不全モデルマウス（TAC処理マウス）またはコントロールマウスの大腿骨の透明化したサンプルを、抗GFAP（Glial fibrillary acidic protein）抗体、抗TH抗体または抗活性型TGF-β1抗体で免疫染色した結果を示す（右図）。TAC処理後1週間および4週間のサンプルについて観察を行った。N=6、*P<0.05、one-way ANOVAおよびTukey-Kramerで解析した。 TAC処理マウスの交感神経節（大腿骨）におけるTh遺伝子の発現量の測定。心不全モデルマウス（TAC処理マウス）またはコントロールマウスの交感神経節におけるTh遺伝子（チロシンヒドロキシラーゼ遺伝子）の発現量をリアルタイムPCRで定量した結果を示す。TAC処理後3日および5日に測定を行った。N=6、*P<0.05、one-way ANOVAおよびTukey-Kramerで解析した。 TAC処理マウスの交感神経細胞（腎臓）内のチロシンヒドロキシラーゼ（Tyrosine Hydroxylase：TH）量の測定。心不全モデルマウス（TAC処理マウス）またはコントロールマウスの腎臓を支配する交感神経細胞を抗TH抗体で免疫染色を行い、染色された領域の面積を測定した。ControlはTAC未処理のマウスを用いた結果である。Ａは、腎臓を透明化し、腎臓を支配する交感神経細胞を抗TH抗体で免疫染色した結果で、Ｂは、抗TH抗体で染色された領域の面積を定量した結果である。TAC処理後4週間のサンプルについて測定を行った。N=3、*P<0.05、Student T testで解析した。 TAC処理マウスの交感神経節（腎臓）におけるTh遺伝子の発現量の測定。心不全モデルマウス（TAC処理マウス）またはコントロールマウスの交感神経節（腎臓へ交感神経を供給する）におけるTh遺伝子（チロシンヒドロキシラーゼ遺伝子）の発現量をリアルタイムPCRで定量した結果を示す。TAC処理後4日に測定を行った。N=6、*P<0.05、Student T testで解析した。
　第１の実施形態は、心不全および／または心不全の併発疾患の治療薬または治療用組成物であって、活性型TGF-β1または全長TGF-β1を有効成分として含む、前記治療薬または治療用組成物である。
　本実施形態において、「心不全」とは、心筋梗塞や心臓弁膜症、心筋炎などの心臓の種々の疾患が原因となって引き起こされる病態のことである。一般に、心不全になると、心臓のポンプ機能が正常に働かなくなり、全身の血液の循環が滞ってしまう。本実施形態における心不全には、初発の心不全（初発時の心不全）の他、再発した心不全（再発性の心不全）も含まれる。また、心不全の併発疾患または病態としては、例えば、腎不全、筋肉量の低下（例えば、骨格筋再生不全、骨格筋機能低下（フレイル）など）、るい痩など（特に、交感神経障害が惹起するもの）を挙げることができる。
　本実施形態において、「TGF-β」とはトランスフォーミング増殖因子（Transforming Growth Factor-β：TGF-β）のことで、哺乳動物では、3つのアイソフォーム（TGF-β1、-β2および-β3）が存在している。TGF-βは、当初線維芽細胞の形質転換を促進する因子として同定されたが、その後の研究により、細胞増殖の抑制、細胞の分化誘導、アポトーシスの誘導などに関与していることが報告されている。TGF-βは、まず、LAP（Latency associated protein）と称されるプレペプチド部分と活性型TGF-βとの複合体（全長TGF-β）（約100 kDポリペプチドの2量体）（潜在型TGF-β）として産生され、何らかの刺激により、潜在型TGF-β複合体から活性型TGF-β（約25 kDポリペプチドの2量体）が放出される。この活性型TGF-βは、TGF-β受容体と結合することが可能で、様々な生理活性を誘導する。
　活性型TGF-β1は、全長TGF-β1のC末端側の112個のアミノ酸からなる部分がダイマーを作って活性を持ったものである。活性型TGF-β1は2種類のセリン／スレオニンキナーゼ型のTGF-β受容体に結合し、Smadのリン酸化を介して、細胞内にシグナルを伝達する。TGF-β1は生体の恒常性を維持する重要なサイトカインの一つで、その異常が様々な病気の進展、生命維持に関与する重要な因子である。ヒトの全長TGF-β1および活性型TGF-β1のアミノ酸配列を、各々、配列番号４および配列番号５に示す。
　本実施形態の治療薬および治療用組成物は、活性型TGF-β1のみならず、全長TGF-β1を含んでもよい。最終的に機能するのは活性型TGF-β1であるが、全長TGFβ1は体内において、活性型TGF-β1となって効果を発揮することが確認されている（実施例を参照のこと）。
　本実施形態において、「全長TGF-β1」および「活性型TGF-β1」には、各々、「全長TGF-β1」および「活性型TGF-β1」と実質的に同一のタンパク質も含まれる。「全長TGF-β1」および「活性型TGF-β1」と実質的に同一のタンパク質とは、具体的には、ヒト由来の「全長TGF-β1」および「活性型TGF-β1」の場合、各々、配列番号４および配列番号５に示すアミノ酸配列と80％以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ、各々、配列番号４および配列番号５からなるタンパク質と同一の活性を有するタンパク質、または、心不全を経験した造血幹細胞もしくはTGF-β1のシグナルの減少によってエピジェネティック変化（第６の実施形態における記載を参照のこと）が生じた造血幹細胞の増殖を抑制する活性を有するタンパク質のことである。ここで、「80％以上の配列同一性を有するアミノ酸配列」は、80％以上の配列同一性を有するアミノ酸配列であれば、何％であってもよいが、たとえば、90％以上、91％以上、92％以上、93％以上、94％以上、95％以上、96％以上、97％以上、98％以上または99％以上の配列同一性を有するアミノ酸配列がより好ましい。
　さらに、本実施形態における「全長TGF-β1」および「活性型TGF-β1」には、ヒト以外の動物由来の「全長TGF-β1」および「活性型TGF-β1」も含まれる。
　発明者らは、上述の通り、心不全を経験したマウス由来の骨髄（造血幹細胞を含む）を、心不全を発症していないマウス（健常マウス）に移植したところ、心機能障害および心臓線維化など心不全の症状が引き起こされること、腎臓の損傷が悪化し、骨格筋の再生が阻害されることを見出した。さらに、本発明者らは、心不全を経験したマウス由来の造血幹細胞ニッチにおいて、活性型TGF-β1が、著しく減少していること、その結果、造血幹細胞のエピジェネティック変化が惹起され、心不全を経験したマウス由来の造血幹細胞の一部の細胞では、TGF-β1のシグナル伝達における下流分子が結合するクロマチン領域が顕著に閉じていることを明らかにした。さらにまた、発明者らは、TGF-β1のシグナルが低下しエピジェネティックな変化が生じた造血幹細胞から分裂、分化して心臓に達した単球およびマクロファージは、心臓保護的な成熟したマクロファージに分化出来ないことが心機能を低下させていることを１細胞シーケンスとRNA velocity解析で明らかにした。このことから、活性型TGF-β1が、心不全または再発心不全、および心不全の併発疾患の改善に有効であることが示唆された。
　第２の実施形態は、心不全および／または心不全の併発疾患の治療薬または治療用組成物であって、心不全の影響を受けていない造血幹細胞を有効成分として含む、前記治療薬または治療用組成物である。
　ここで「心不全の影響を受けていない造血幹細胞」とは、心不全を発症した経験のない健常者由来の造血幹細胞のことである。また、「心不全の影響を受けていない造血幹細胞」として、特定のクロマチン領域、例えば、Smad転写因子群、GATA3、GATA5、ERG、RUNX2、KLF9などのTGF-β1シグナルの下流で機能する転写因子が結合するクロマチン領域が閉じていない（すなわち、当該クロマチン領域が開いており転写因子が結合し得る状態にあること）との特徴を有する造血幹細胞を挙げることもでき、特に好ましくは、TGF-β1シグナルの下流分子であるSmad転写因子群が結合するクロマチン領域が閉じていない造血幹細胞である。また、本実施形態の「造血幹細胞」は、例えば、ヒトの場合は、CD34陽性およびCD45弱陽性である細胞が好ましい。
　本実施形態の「心不全の影響を受けていない造血幹細胞」としては、生体由来の細胞、生体由来の細胞を増殖させた細胞、または多能性幹細胞（ES細胞、iPS細胞など）から誘導したものであってもよい。
　第３の実施形態は、活性型TGF-β1または全長TGF-β1を含有することを特徴とする、心不全の影響を受けた造血幹細胞の増殖抑制剤である。
　本実施形態において、「心不全の影響を受けた造血幹細胞」とは、心不全を発症した経験のある患者において増殖する造血幹細胞のことで、上述の「エピジェネティックな変化」が生じた造血幹細胞、すなわち、特定のクロマチン領域、例えば、Smad転写因子群、GATA3、GATA5、ERG、RUNX2、KLF9などのTGF-β1シグナルの下流で機能する転写因子が結合するクロマチン領域が閉じていることを特徴とする造血幹細胞のことである。このようなエピジェネティックな変化が生じた造血幹細胞が増殖すると、心機能の低下が惹起されることが、本発明者らによって見出されている。活性型TGF-β1または全長TGF-β1は、心不全の影響を受けた造血幹細胞、すなわち、上記エピジェネティックな変化が生じた造血幹細胞の増殖を抑制する（実施例を参照のこと）。従って、活性型TGF-β1または全長TGF-β1を含有する剤は、心不全の影響を受けた造血幹細胞の増殖を抑制することで、心不全の発症および心不全の併発疾患の発症の予防および治療に効果を発揮すると考えられる。
　第４の実施形態は、心不全および／または心不全の併発疾患の治療薬または治療用組成物であって、チロシンヒドロキシラーゼ（Tyrosine Hydroxylase；TH）（EC 1.14.16.2）またはTH活性促進因子を有効成分として含む、前記治療薬または治療用組成物である。ここで、本実施形態におけるTHには、THと実質的に同一のタンパク質も含まれる（「実質的に同一」についてはTGF-β1に関する記載を参照のこと）。
　発明者らは、心不全モデルマウスの骨髄および腎臓を透明化し、骨髄腔内の交感神経細胞および腎臓内の交感神経細胞内のTHを抗体で免疫染色したところ、コントロールマウスと比較して、心不全モデルマウスの交感神経内におけるTHの量が明らかに減少していることを明らかにした。THはノルエピネフリン（norepinephrine）の産生を行う酵素であり、ノルエピネフリンは、シュワン細胞を活性化して、シュワン細胞からの活性型TGF－β1の放出を促すことが知られている（Yamazakiら、Cell. 2011 Nov 23;147(5):1146-58.）。従って、交感神経内におけるTH活性の低下が、活性型TGF-β1のシュワン細胞からの放出量を減少させ、その結果、エピジェネティック変化を引き起こした造血幹細胞の増殖が増加し、心不全の発症あるいは心不全の再発につながると考えられる。また、本発明者らは、心不全モデルマウスの交感神経内のTH活性の低下は、THをコードするTh遺伝子の転写の低下が原因であることを明らかにしている（図１７および図１９を参照のこと）。
　以上のことから、THまたは心不全患者の交感神経内のTH活性を促進する因子（特に、Th遺伝子の転写を活性化する因子）は、心不全および心不全の併発疾患の治療に有効であると考えられる。
　本発明の実施形態にかかる治療薬は、有効成分（例えば、活性型TGF-β1、全長TGF-β1、心不全を経験していない造血幹細胞、THまたはTH活性促進因子）自体を投与してもよいが、一般的には、有効成分である１または複数の物質の他、１または２以上の製剤用添加物を含む治療組成物の形態で投与することが望ましい。また、本発明の治療薬等（治療薬および治療用組成物）には、心不全または心不全の併発疾患に対して治療効果が認められている既知の成分が配合されていてもよい。
　本発明の実施形態にかかる治療薬等の剤形としては、特に限定はしないが、注射剤、点滴剤などの液体製剤が挙げられる。液体製剤にあっては、用時、水または他の適当な溶媒に溶解または懸濁するものであってもよい。液体製剤を注射剤または点滴剤として使用する場合には、有効成分を水に溶解させて調製されるが、必要に応じて生理食塩水あるいはブドウ糖溶液に溶解させてもよく、また、緩衝剤や保存剤を添加してもよい。
　本発明の実施形態にかかる治療薬等の製造に用いられる製剤用添加物の種類、有効成分に対する製剤用添加物の割合、あるいは、治療薬等の製造方法は、その形態に応じて当業者が適宜選択することが可能である。製剤用添加物としては無機または有機物質、あるいは、固体または液体の物質を用いることができ、一般的には、有効成分重量に対して1重量％から90重量％の間で配合することができる。具体的には、製剤用添加物の例として乳糖、ブドウ糖、マンニット、デキストリン、シクロデキストリン、デンプン、蔗糖、メタケイ酸アルミン酸マグネシウム、合成ケイ酸アルミニウム、カルボキシメチルセルロースナトリウム、ヒドロキシプロピルデンプン、カルボキシメチルセルロースカルシウム、イオン交換樹脂、メチルセルロース、ゼラチン、アラビアゴム、ヒドロキシプロピルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、ポリビニルピロリドン、ポリビニルアルコール、軽質無水ケイ酸、ステアリン酸マグネシウム、タルク、トラガント、ベントナイト、ビーガム、酸化チタン、ソルビタン脂肪酸エステル、ラウリル硫酸ナトリウム、グリセリン、脂肪酸グリセリンエステル、精製ラノリン、グリセロゼラチン、ポリソルベート、マクロゴール、植物油、ロウ、流動パラフィン、白色ワセリン、フルオロカーボン、非イオン性界面活性剤、プロピレングルコール、水等が挙げられる。
　注射剤を製造するには、有効成分を必要に応じて塩酸、水酸化ナトリウム、乳糖、乳酸、ナトリウム、リン酸一水素ナトリウム、リン酸二水素ナトリウムなどのpH調整剤、塩化ナトリウム、ブドウ糖などの等張化剤と共に注射用蒸留水に溶解し、無菌濾過してアンプルに充填するか、さらにマンニトール、デキストリン、シクロデキストリン、ゼラチンなどを加えて真空凍結乾燥し、用時溶解型の注射剤としてもよい。また、有効成分にレチシン、ポリソルベート８０、ポリオキシエチレン硬化ヒマシ油などを加えて水中で乳化せしめ注射剤用乳剤とすることもできる。
　本発明の実施形態にかかる治療薬等の投与量および投与回数および投与方法は特に限定されず、治療対象疾患の悪化・進展の防止および／または治療の目的、疾患の種類、患者の体重や年齢などの条件に応じて、医師の判断により適宜選択することが可能である。
　一般的には、注射剤として用いる場合には、成人に対して一日量0.001～1000mg（有効成分重量）を連続投与または間欠投与することが望ましい。
　本発明の実施形態にかかる治療薬等は、埋込錠およびマイクロカプセルに封入された送達システムなどの徐放性製剤として、体内から即時に除去されることを防ぎ得る担体を用いて調製してもよい。そのような担体として、エチレンビニル酢酸塩、ポリ酸無水物、ポリグリコール酸、コラーゲン、ポリオルトエステルおよびポリ乳酸などの生物分解性、生物適合性ポリマーを用いることができる。このような材料は、当業者によって容易に調製することができる。また、リポソームの懸濁液も薬学上許容される担体として使用することができる。リポソームは、限定はしないが、ホスファチジルコリン、コレステロールおよびPEG誘導ホスファチジルエタノール（PEG-PE）を含む脂質組成物として、使用に適するサイズになるように、適当なポアサイズのフィルターを通して調製され、逆相蒸発法によって精製することができる。
　本発明の実施形態にかかる治療薬等は、投与方法等の説明書と共にキットの形態で提供してもよい。キット中に含まれる薬剤は、当該治療薬等の構成成分の活性を長期間有効に持続し、容器内側に吸着することなく、また、構成成分を変質することのない材質で製造された容器により供給される。例えば、封着されたガラスアンプルは、窒素ガスのような中性で不反応性を示すガスの存在下で封入されたバッファーなどを含んでもよい。
　また、キットには使用説明書が添付されてもよい。当該キットの使用説明は、紙などに印刷されたものであっても、CD-ROM、DVD-ROMなどの電磁的に読み取り可能な媒体に保存されて使用者に供給されてもよい。
　第５の実施形態は、本発明の実施形態にかかる治療薬等を患者に投与することを含む、心不全および／または心不全の併発疾患の治療方法である。
　ここで「治療」とは、心不全（再発心不全を含む）、心不全の併発疾患（例えば、腎不全、骨格筋再生不全など）を発症したほ乳動物において引き起こされる病態の進行および悪化を阻止または緩和することを意味する。治療の対象となる「ほ乳動物」は、ほ乳類に分類される任意の動物を意味し、特に限定はしないが、例えば、ヒトの他、イヌ、ネコ、ウサギ、フェレット、マウス、ハムスターなどのペット動物、ウシ、ブタ、ヒツジ、ウマなどの家畜動物などのことである。特に好ましい「ほ乳動物」は、ヒトである。
　第６の実施形態は、心不全の重症化の可能性を判断するための補助的方法であって、被験者由来の造血幹細胞におけるエピジェネティックな変化の有無を指標とする、前記補助的方法である。
　本実施形態における「エピジェネティックな変化」とは、細胞核内のクロマチン構造の変化を指し、特に、転写因子が結合する染色体DNA領域のクロマチン構造が開くまたは閉じる変化のことである。染色体DNA領域のクロマチン構造が開くとは、当該DNA領域に転写因子などのタンパク因子が接近し結合可能な状態になることで、染色体DNA領域のクロマチン構造が閉じるとは、逆に当該DNA領域に転写因子などのタンパク因子が結合できなくなる状態のことである。
　本実施形態における「エピジェネティックな変化」は、被験対象由来の造血幹細胞のクロマチン構造において、閉じた構造と開いた構造の分布状態が、健常者由来の造血幹細胞（すなわち、心不全を経験していない造血幹細胞）の分布状態と比較して、有意に異なる分布状態になることである。ここで、「エピジェネティックな変化」として、例えば、TGF-β1シグナルの下流で機能する転写因子、特に限定はしないが、Smad3、GATA3、GATA5、ERG、RUNX2、KLF9などが結合するクロマチン領域が閉鎖している（閉じている）ことが挙げられ、特に、TGF-β1シグナルの下流分子であるSmad3が結合するクロマチン領域が閉鎖している（閉じている）ことが挙げられる。
　より具体的には、本実施形態は、例えば、被験者由来の造血幹細胞のSmad3が結合するクロマチン領域が、健常者由来の造血幹細胞のクロマチンと比較して、有意に閉鎖しているときに、当該被験者の心不全は重症化する可能性がある判断するための補助的な方法である。
　クロマチン構造が閉じているのか、または開いているのかを選択的に検出する方法として、ATAC（Assay for Transposase-Accessible Chromatin）-seq法、scATACseq （single cell ATAC-seq）法などが挙げられる。
　第７の実施形態は、心不全および／または心不全による併発疾患の治療薬候補となる物質のスクリーニング方法であって、心不全モデル動物に候補物質を投与し、当該心不全モデル動物の交感神経細胞内のTHの量を測定することを含む、前記スクリーニング方法である。
　本発明者らは、心不全モデルマウスの骨髄および腎臓を透明化し、これらの臓器を支配する交感神経の細胞内に存在するTyrosine Hydroxylase（TH）の量を測定する染色システムを構築し、その定量化に成功した。その結果、骨髄を透明化した心不全モデルマウスでは、コントロールマウスと比較して、抗TH抗体で染色される神経線維の長さが短く可視化されている、すなわち、交感神経細胞内のTHの量が減少していることを見出した。THは、交感神経細胞内の細胞体で産生され、軸索内を運搬されて神経線維内へと分布する。そのため、THの免疫染色で染色される神経線維の長さが短く可視化されるということは、その神経細胞内のTHの量が減少していることを意味する。
　また、本発明者らは、腎臓を透明化した心不全モデルマウスでは、コントロールマウスと比較して、抗TH抗体で染色される腎臓内の領域が減少している、すなわち、腎臓を支配する交感神経の細胞内のTHの量が減少していることを確認した。
　以上の結果から、心不全モデル動物に心不全の治療薬の候補物質を投与することにより、交感神経細胞内のTHの量が増大した場合、当該候補物質は心不全の治療薬としての効果を発揮し得ると判断することができる。
　交感神経細胞内のTHの量の測定は、当該技術分野において公知の方法により測定することができる。例えば、モデル動物から、骨髄腔内に交感神経を含む骨またはその他の臓器を採取し、当該交感神経細胞内のTHの量を測定してもよい。より具体的には、骨を用いる場合には、骨髄を透明化し、当該骨髄腔内の交感神経細胞を抗TH抗体で免疫染色し、染色された交感神経線維の長さをTHの量の指標として測定してもよい。また、他の臓器を用いる場合にも、当該臓器を透明化して、当該臓器を支配する交感神経細胞を抗TH抗体で免疫染色し、染色された臓器の領域（面積）を交感神経細胞内のTHの量の指標として測定してもよい。骨やその他の臓器の透明化は、例えば、CUBIC法またはCUBIC法の変法などに基づいて行う実施することができる。
　本実施形態において、心不全モデル動物は、例えば、大動脈縮窄術（Transverse aortic constriction：TAC）などにより作製することができる。ここで「動物」としては、特に限定はしないが、例えば、マウス、ラット、ウサギ、イヌ、ネコ、ブタなどが挙げられる。
　なお、特に限定はしないが、骨髄腔内に交感神経を含む骨としては、例えば、大腿骨、脛骨、腓骨、腸骨、背骨、胸骨、頭蓋骨などを挙げることができ、その他の臓器としては、例えば、腎臓、骨格筋、脂肪組織、肺、甲状腺、骨、膵臓、肝臓、腸管、副腎などを挙げることができる。
　本明細書が英語に翻訳されて、単数形の「a」、「an」、および「the」の単語が含まれる場合、文脈から明らかにそうでないことが示されていない限り、単数のみならず複数のものも含むものとする。
　以下に実施例を示してさらに本発明の説明を行うが、本実施例は、あくまでも本発明の実施形態の例示にすぎず、本発明の範囲を限定するものではない。
１．方法
１－１．マウス
　C57BL/6Jマウスは日本クレアから購入した。CD45遺伝子座に関するコンジェニック系C57BL/6Jマウス（CD45.1マウス）は三協ラボサービス（つくば、日本）から購入した。全てのマウスは、東京大学の動物飼育施設にて、病原体フリーの環境で独立したケージ内で飼育した。マウスには標準的なマウス餌および水を自由摂取させた。全ての実験は、東京大学医学部動物実験倫理委員会の承認を得て、東京大学動物実験ガイドラインを厳密に遵守して行った。
１－２．造血幹細胞の単離
　骨髄細胞は、MACSバッファー（0.5% ウシ血清アルブミン、2mM EDTAを添加したPBS）中で、乳棒および乳鉢を使用して骨を粉砕し、頸骨、大腿骨、骨盤および脊椎骨から採取した。細胞は、25Gニードルに数回通し、70μmのセルストレイナー（Greiner）で処理した。PharmLyse溶液（BD：Becton、Dickinson and Company）を使用してサンプルから赤血球を除去した後、細胞をMACSバッファーで洗浄し、40μmのセルストレイナーで処理した。マウスCD117μビーズ（Miltenyi）を細胞に添加し、4℃で15分間インキュベートした。細胞を洗浄し、40μmのセルストレイナーで処理した後、サンプルはautoMACS（Miltenyi）を用いて分離した。ポジティブ選択により分離した細胞をFACSバッファー（5% FBSを添加したPBS）で洗浄し、フローサイトメトリーで使用する抗体と混合した。CD45+ Lin- Sca1+ cKit+細胞をLSK細胞として選別し、CD45+ Lin- Sca1+ cKit+CD34-Flt3-CD150+CD48-細胞を造血幹細胞として選別した。
１－３．骨髄細胞の移植
　骨髄細胞の移植は以下のように行った。骨髄細胞は骨を粉砕し、PBSで洗浄することにより抽出した。得られた細胞は、PBSで2回洗浄し、PBSに再懸濁した。5週齢の雌のレシピエントマウスに9Gyの放射線を体全体に照射し、マウス1個体あたり106細胞を静脈内に注入した。
　造血幹細胞またはLSK細胞の競合的移植は、前述のようにして分離した細胞で行った。造血幹細胞の混合物（細胞数は各図に示す）をCD45.1/CD45.2 マウスから分離した105個のCD34+ Lin- Sca1+ cKit+細胞に加えた。LSK細胞の競合的移植については、CD45.1マウスおよびCD45.2マウスから別々に分離したLSK細胞（105個）を、各マウス型由来の Lin+ レスキュー細胞（105個）と混合した。5週齢の雌のレシピエントマウス（CD45.1/CD45.2）に9Gyの放射線を体全体に照射し、細胞懸濁液を静脈内に注入した。
１－４．組織ホモジナイゼーション
　心臓組織のホモジナイゼーションは既報に従って行った（Fujiuら, Nat. Med. 23, 611-622, 2017：Aronoffら, J Vis Exp, doi:10.3791/58114 2018）。キシラジン（10 mg/kg）とケタミン（100 ng/kg）の混合物をマウスの腹腔内に投与して麻酔を行った。その後、心臓を露出させ10 mlのPBSを左心室から灌流した。その後、心臓全体を摘出し、房室間溝のちょうど心室側で切断をして左右の心房と房室弁を除去した。切除した2心室を弯曲鋏で機械的に細かく刻んだ。その後、1つの心臓から調製した組織は、450 U/mlコラゲナーゼI（Sigma-Aldrich）、60 U/ml ヒラルロニダーゼ（Sigma-Aldrich）および60 U/ml DNase-I（Sigma-Aldrich）を含む1 mlのDMEM中で37℃にて45分間インキュベートした。懸濁液中の細胞を20秒間ボルテックスし、40μmのセルストレイナーで処理し、12 mlの冷やしたHBSS（0.2% FBSと0.2%BSAを含む）で洗浄した。その後、細胞を400 gで5分間遠心し、PBSで洗浄した後、FACSバッファーに再懸濁した。
　腎臓組織は、gentleMACS dissociator（Miltenyi）を用いて、添付の使用説明書に従って処理を行った。摘出した腎臓を、弯曲鋏で機械的に細かく刻んだ後、腎臓から調製した組織を100μlのEnzyme D、50μlのEnzyme Rおよび12.5μlのEnzyme A（Miltenyi）を含む2.35 mlのDMEMに浸漬した。その後、プロトコール37C_multi_B_01の設定で、gentleMACS中で組織をインキュベートした。消化した腎臓から分離した細胞を70μmのセルストレイナーで処理した後、PBSで洗浄し、FACSバッファーに再懸濁した。
　骨格筋は、既報に従って処理を行った（Guardiolaら, J Vis Exp, doi:10.3791/54515 2017：Motohasら, J Vis Exp, doi:10.3791/50846 2014）。前脛骨筋を露出させ、はさみで筋膜を除去した。前脛骨筋腱末端を切断し、先端を膝の方に引出した後、腹の中央付近で切断した。末端側半分は病理解析のために使用した。採取した近位側半分を、弯曲鋏で機械的に細かく刻み、0.2 % コラゲナーゼタイプ2（Worthington）および0.01 % DNase-I（Sigma-Aldrich）を添加したDMEM中で、37℃にて40分間インキュベートした。ホモジナイズした混合物にDMEMを添加した後、細胞懸濁物を70μmセルストレイナーで処理し、DMEMで洗浄した後、FACSバッファーに再懸濁した。
　末梢血は、後眼窩採血によりK3-EDTA（Greiner）でコートしたチューブ中に回収した。細胞数を算出するために、CountBright Absolute Counting beads（Thermo Fisher）をサンプルに添加した。BD PharmLyse solution（BD）でサンプルから赤血球を除去した後、細胞懸濁物をフローサイトメトリー解析またはソーティングに用いた。
１－５．フローサイトメトリー
　ACSバッファー中の細胞懸濁物を、FcR blocking reagent（Biolegend）と4℃で5分間インキュベートし、その後、蛍光色素を結合した抗体とインキュベートした。造血幹細胞を分離するために、サンプルを、CD45.1-APCもしくはCD45.2-APC、Sca1-PE、cKit-APC/Cy7、CD34-FITC、CD135-BV421、CD48-PE/Cy7、CD150-V786および系統マーカー（CD4、CD8、CD11b、Ly6g、B220、CD127、Ter119）-PerCP/Cy5.5と4℃で90分間インキュベートした。
　腎臓マクロファージおよび骨格筋マクロファージを分離するために、サンプルをCD45.1-FITC、CD45.2-APC、CD11b-BV421、F4/80-PE、Ly6g-PE/Cy7およびLy6c-APC/Cy7で、4℃、30分間染色した。染色後、細胞懸濁物をFACSバッファーで2回洗浄した後、ヨウ化プロピジウムを添加したFACSバッファーに再懸濁し、FACS Aria IIIa instrument（BD）を使用したフローサイトメトリー解析およびセルソーティングに供した。結果は、FlowJo（BD）を用いて解析した。
１－６．造血幹細胞の増殖解析
　増殖する細胞を標識するために、麻酔の4時間前に、マウスの腹腔内に体重1gあたり10μgの5-エチニル-2’-デオキシウリジン（EdU）を投与した。骨髄細胞の懸濁物は前述の方法で調製した。CD117+を、MACSを用いて分離した後、細胞懸濁物をCD45.2-V500、Sca1-PE、cKit-APC/Cy7、CD34-FITC、CD135-BV421、CD150-V786および系統マーカー（CD4、CD8、CD11b、Ly6g、B220、CD127、Ter119）-PerCP/Cy5.5で、4℃、90分間染色し、3 mlのFACSバッファーで洗浄した。Click-iT Plus EdU Alexa Fluor 647 Flow Cytometry Assay Kit（Thermo Fisher）を使用し、添付の使用説明書に従って細胞を、標識した。CD45.2+Lin-Sca1+cKit+CD34-Flt3-CD150+ 造血幹細胞中のAPCポジティブ細胞の割合は、FACS Aria IIIを用いて算定した。
１－７．大動脈縮窄術（Transverse aortic constriction：TAC）
　TACは既報に従って行った（Fujiuら, Nat. Med. 23, 611-622, 2017）。8週齢の雄のマウスにキシラジン（10 mg/kg）とケタミン（100 ng/kg）の混合物を腹腔内に投与して麻酔を行った。その後、齧歯類用従量式人工呼吸器を使用し、呼吸量0.4 mlの室内空気、呼吸数100呼吸/minで、挿管および換気した。胸骨の基部を切断して心臓を露出させた。大動脈は、26Gニードルを大動脈に沿わせた状態で、7-0ナイロン縫合糸を用いて、腕頭動脈と左総頚動脈の間を締め付け、その後、同ニードルを抜去した。偽手術マウスは、同様の麻酔を施し、大動脈縮窄は行わずに外科的処置を行った。
１－８．片側尿管結紮（Unilateral ureteral obstruction：UUO） 
　UUOは既報に従って行った（Fujiuら, J Clin Invest 121, 3425-3441　2011）。骨髄移植から8週間後、マウスにキシラジンとケタミンの混合物を腹腔内に投与して麻酔を行い、左背部に切り込みを入れた。露出された尿管を尿管腎盂移行部で結紮した。
１－９．骨格筋再生モデル
　カルディオトキシンは既報に従って投与した（Guardiolaら, J Vis Exp, doi:10.3791/54515 2017：Ahrensら, J Vis Exp, doi:10.3791/60194 2019）。骨髄移植から8週間後、マウスにキシラジンとケタミンの混合物を腹腔内に注射して麻酔をかけ、50μlの20μM カルディオトキシン溶液またはビークルをマウスの右前脛骨筋に注射した。病理学的解析のための筋肉抽出物は凍結化合物（2の部分は至適切削温度化合物、1の部分は30%スクロース脱イオン水溶液）中に浸漬し、液体窒素中で瞬間凍結した。
１－１０．バーコードプラスミドライブラリの構築
　52塩基のランダムSWリピートバーコードオリゴDNAプール（SはG/C; WはA/T）（5’-TAACTTACGGAGTCGCTCTACGSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWSWCAGGACCTAAAGAATCCCATCC-3’（配列番号１）；フォワードおよびリバースプライマの設定箇所を下線で示す）は、化学合成し、下記の増幅条件を用いてPCRで増幅した。
PCR増幅条件
98℃、30秒、
98℃、10秒を10サイクル、
98℃、10秒、
72℃、10 秒、その後62℃、
72℃、1分、
98℃、10秒を20サイクル、
72℃、1分、および
72℃、5分で最終伸長
　PCR増幅産物はレンチウイルスバックボーンベクター、pBC001 v3（Addgene；https://benchling.com/s/seq-cWGPBaROWGixteFedTqA）にクローニングした。pBC001 v3はCMVプロモーターおよびEGFPの後の3’UTR中にバーコードクローニング部位を有している。PCR増幅産物およびバックボーンプラスミドをXbaI（NEB）で37℃、60分間、BamHI（NEB）で37℃一晩消化した後、カラムで精製した。バーコードライブラリのクローニングについては、1,500 fmolのインサートと150 fmolのバックボーンを、T4 DNAリガーゼ（日本ジーン）で、16℃、18時間ライゲーションした。ライゲーション産物はバクテリアの形質転換のために精製した。キットに添付の高効率形質転換プロトコールを使用して、500 ngのDNAで、200μLのケミカルコンピテントセル（NEB）を形質転換した。SOC培地で60分間増殖させた後、バクテリア細胞を100μg/mLのアンピシリンを含む10 LBプレートにプレーティングした。37℃で一晩インキュベートした後、全ての菌叢を500 mLフラスコに回収し、100μg/mLのアンピシリンを含むLB液体培地中で数時間増殖させた。700倍に希釈した別々の形質転換サンプル（2組）から、バーコード全体の複雑度を～7.0×105と評価した。 プールしたプラスミドDNAはMidi-prep（NucleoBond Extra Midi kit）を用いて精製した。ランダムクローンを単離した後、遺伝子型PCRにより、24テストレンチウイルスプラスミドクローンのうち、23クローンがバーコードインサートを含んでいることを確認した。
１－１１．造血幹細胞のバーコード化
　既報（Wilkinsonら, Nature 571, 117-121, doi:10.1038/s41586-019-1244-x  2019）に従い、CD45.1マウスから分離した造血幹細胞をエクスビボで培養した。選別した細胞を、10 ng/ml SCF（Biolegend）、100 ng/ml TPO（Biolegend）およびpenicillin-streptomycin（Gibco）を含むHSC培地（HemEX-Type9A；Cell Science＆Technology）に再懸濁し、フィブロネクチンコートの24ウェル平底プレート（Corning）に、1ウェルあたり100-1,000細胞をプレーティングした。プレーティングから5日目、培養した造血幹細胞にバーコードレンチウイルスpBC008を、5 ng/mlポリブレンを含むHSC培地中で感染させた。感染から4日目、感染した造血幹細胞を、Accutase（Thermo Fisher）を用いて検出し、CD45.1-APC、Sca1-PE、cKit-APC/Cy7およびLin-PerCP/Cy5.5で染色した。GFP+Lin-Sca1+cKit+細胞をFACS Aria IIIaを用いて選別し、レスキュー細胞としてのCD45.2+ Lin-cKit+Sca1-細胞と混合した。5週齢のレシピエントCD45.2マウスの全身に9 Gyの放射線を照射し、1マウスあたり2×104個のGFP+LSK細胞と105個のレスキュー細胞を腹腔内に投与した。2ヶ月後、レシピエントマウスを安楽死させ、末梢血、心臓および腎臓を採取し、前述の通り処置を行った。その後、FACSで選別した細胞をBuffer RLT plus（QIAGEN）中に溶解させ、ゲノムDNAをAllPrep DNA/RNA Mini Kit （QIAGEN）を用いて抽出した。ゲノムDNAに取り込まれたバーコード配列は、NEBNext Ultra II Q5 Master Mix（NEB）により、以下に示すプライマーペアを使用してPCR増幅を行った。
プライマーペア
5’-TCT TTC CCT ACA CGA CGC TCT TCC GAT CTT AAC TTA CGG AGT CGC TCT ACG-3’（配列番号２）
5’-GTG ACT GGA GTT CAG ACG TGT GCT CTT CCG ATC TGG ATG GGA TTC TTT AGG TCC TG-3’（配列番号３）
増幅条件は以下の通りである。
98℃、30秒、
98℃、10秒を18サイクル、
60℃、10秒、
72℃、30秒、および
72℃、5分
　PCRによる複製配列をNEBNext Multiplex Oligos（NEB）を用いて、配列決定のためのライブラリを作製するために9-11サイクル増幅させた。作製したライブラリは、Genewiz社に委託して、Illuminaシークエンサーにより、paired-endシークエンシングを行った。Pair-end配列の両方のバーコード配列を比較し、完全一致した全長バーコード配列のみを集めた。ミスマッチが4ベース以下のバーコード配列を1つのバーコード配列にアセンブリーした。各細胞タイプのバーコードの総数は、6,808221から15,745,444の範囲にあった。バーコードカウントは、各細胞タイプの総カウントが10,000,000となるように標準化した。バーコードカウントをクラスター化するために、少なくとも1つのサンプルに対して、標準化したバーコードカウントが10以上のバーコードを階層クラスター化した（図３ｂ）。Pearsonの相関係数を細胞タイプ間で計算した。
１－１２．増殖造血幹細胞の解析
　増殖細胞を標識するために、麻酔をかける4時間前に、マウスの腹腔内に体重1gあたり10μgの5-エチニル-2’-デオキシウリジン（Edu）を投与した。骨髄細胞の懸濁液を上述の通り調製した。MCSを用いてCD117+細胞を分離した後、細胞懸濁液をCD45.2-V500、Sca1-PE、cKit-APC/Cy7、CD34-FITC、CD135-BV421、CD150-V786および系統マーカー（CD4、CD8、CD11b、Ly6g、B220、CD127、Ter119)-PerCP/Cy5.5で、4℃で90分間染色し、3 mlのFACSバッファーで洗浄した。サンプルは、Click-iT Plus EdU Alexa Fluor 647 Flow Cytometry Assay Kit（Thermo Fisher）を用いて、添付の使用説明書に従って標識した。CD45.2+Lin-Sca1+cKit+CD34-Flt3-CD150+造血幹細胞中の APCポジティブ細胞のパーセンテージをFACS Aria IIIで測定した。
１－１３．ELISA法
　骨髄細胞は既報に従い処理した（Frodermannら, Nat. Med. 25, 1761-1771, doi:10.1038/s41591-019-0633-x 2019）。大腿骨の一方の骨幹端を除去し、切断面を下にして、4℃、2分間、6,000gで骨を遠心し、骨髄を抽出した。抽出物を、1大腿骨あたり200μlの溶解バッファー（1% NP-40または1% Triton X-100、50 mM Tris pH 7.4、150 mM NaCl、2 mM N-ethylmaleimide (NEM)、1 mM EDTAおよびprotease inhibitor cocktail (Roche)）中で溶解させた。溶け残った破片を4℃、10分、15,000 rpmで遠心して除去した。タンパク質溶解物を3つに分けた。各画分の一部を、タンパク質濃度の測定に使用した。次いで、活性型TFG-β1の濃度をLegend MAX free active TGF-β1 ELISA kit（Biolegend）を使用し、添付の使用説明書に従い測定した。2組のサンプルを希釈せずに使用した。
１－１４．RNAシークエンシング
　RNAシークエンシングは既報に従って行った（Nakayamaら, Proc Natl Acad Sci USA 117, 14365-14375, doi:10.1073/pnas.2005924117 2020）。細胞からはRNeasy（Qiagen）を使用し、組織からはRNeasy plus micro RNA Purification kit（Qiagen）を使用して、添付の使用説明書に従って総RNAを精製した。RNAシークエンシングの前に、混入したゲノムDNAを除去するために、細胞溶解物をgDNA Eliminatorスピンカラムに通した。Poly-A mRNAは、NEBNext Poly(A) RNA Magnetic Isolation Module（NEB）のOligo-dTを用いて、総RNAから抽出した。その後、NEBNext Ultra II RNA Library Prep Kit for Illumina（NEB）を使用して、添付のプロトコールに従ってRNA-seqライブラリを調製した。ライブラリは、HiSeq 1500 sequencer（Illumina）を使用して、single-end配列決定またはpaired-end配列決定を行った。リードはSTAR（Dobinら, Bioinformatics 29, 15-21, doi:10.1093/bioinformatics/bts635 2013）を使用してmm10マウスのゲノムに対してアライメントした。アライメントしたリードファイルは、HOMER（Heinzら, Mol Cell 38, 576-589 2010）で解析した。RNA-seqデータの発現解析は、HOMERを用いて行った。Gene set enrichment analysisは、DESeq2（Loveら, Genome Biol. 15, 550, doi:10.1186/s13059-014-0550-8 2014：Moothaら, Nat. Genet. 34, 267-273 2003）を使用して解析された発現データから、既報（http://genomespot.blogspot.com/2015/01/how-to-generate-rank-file-from-gene.html）に従い作成されたランクファイルを用いて、GSEA（Subramanianら, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 15545-15550, doi:10.1073/pnas.0506580102 2005）を使用して行った。
１－１５．ATAC-seq（Assay for transposase-accessible chromatin with sequencing）
　既報（Corcesら, Nat Methods 14, 959-962, doi:10.1038/nmeth.4396 2017）のプロトコールに従った。選別された5,000個のCD45.2+Lin-Sca1+cKit+CD34-Flt3-CD150+細胞を、400μlの再懸濁バッファー（10 mM Tris-HCl pH 7.4, 10 mM NaCl, and 3 mM MgCl2）で洗浄し、0.1% NP40、0.1% Tween-20および0.01% digitoninを添加した 50μlの再懸濁バッファー中で3分間氷上にて溶解させた。0.1% Twee-20を添加した1 mlの再懸濁バッファーで核を洗浄した後、50μlのtransposition mix（16.5μl PBS、5μl 水、25 μl 2× TD Buffer、2.5μl Tn5 enzyme（Illumina）、0.5μl 1% digitoninおよび0.5μl 10% Tween-20）を細胞ペレットに添加した。その後、サンプルを37℃、30分間インキュベートした。反応物は、MinElute reaction Cleanup Kit（Qiagen）で処理し、12μlのEBバッファーで溶出した。ライブラリ調製物のリマインダーは従来のATACプロトコール（Buenrostroら, Nat Methods 10, 1213-1218, doi:10.1038/nmeth.2688 (2013))を用いて行った。
　断片化したDNAは、Illumina社のガイドラインに従い、増幅、ライブラリの構築およびシークエンスのために使用した。シークエンスデータの質を、FastQCを使用してチェックした。フィルターをかけたリードは、HOMERを使用して、mm10マウスゲノムに対してマッピングした。ピークの検出には、HOMERを使用した。ブラックリスト領域（Dunhamら, Nature 489, 57-74, doi:10.1038/nature11247 2012）またはシンプルリピート領域とオーバーラップしたピークは除去した。6サンプルで検出されたピークをマージして、ピーク周辺の200bp範囲内に標準化したタグを図４ａのPCAのためにカウントした。ATACピークに濃縮されたモチーフの同定のために、edgeR（Robinsonら, Bioinformatics 26, 139-140, doi:10.1093/bioinformatics/btp616 2009）を使用して、ピーク周辺の200bp範囲内のカウントをコントロールとTACサンプル間で比較した。TACサンプルにおいてコントロールよりも、顕著に低いカウント（FDR<0.1）のピークに濃縮されたモチーフをHOMERで同定した。
１－１６．単一細胞のトランスクリプトーム解析
　コントロールマウスまたはTAC後4週間のマウスから、CD34-FLT3-LSK細胞の単一細胞懸濁液を調製した後、懸濁液をChromium single cell 3' reagent version 3.1で処理し、10x Genomics platformで解析した。シークエンスデータは、Cell Rangerで処理し、mm10ゲノム上にマッピングした。マッピングしたデータは、Seurat version 3を主に用いてフィルターリングと解析を行った（van Dijkら, Cell 174, 716-729.e727, doi:10.1016/j.cell.2018.05.061 2018）。細胞が700 UMI（unique molecular identifiers）より低い発現状態の場合にフィルターをかけた。ミトコンドリアゲノムにマップされたカウントの割合は、5%以上であった。重複の可能性を回避するために、高いUMIカウント（≧5,500）の細胞も除外した。残りの1,497コントロールマウス由来の細胞および1,715 TAC後マウスの細胞を次の解析に使用した。コントロールおよびTAC細胞のデータベースはSeurat v3’s standard integration procedureを使用し、2,000 highly variable gene（Stuartら, Cell 177, 1888-1902 2019）によりアグリゲートした。発現マトリックスは、corrected integrated gene matrixの主成分分析を用いて、次元削減を行った。クラスターは、Louvain modularity optimization algorithmを使用して、グラフベースアプローチにより同定した。データセットの次元削減および可視化には、tSNE（t-distributed stochastic neighbor embedding）を用いた。図４ｄに示すクラスタリングを行う前に、小数の紛れ込んだミエロイド（Cd34-Spi1hiItgam+）細胞（65細胞）を予め除去した。コントロール細胞とTAC細胞間において発現差のある遺伝子の解析については、ミトコンドリアおよびリボソーム遺伝子を除去し、HSCクラスター（クラスター1、2、3、4および8）の対数で正規化したデータは、SeuratのFindMarkers機能により、MAST（Finakら, Genome Biol 16, 015-0844 2015）を使用して解析した。GSEAは既報（http://genomespot.blogspot.com/2015/01/how-to-generate-rank-file-from-gene.html）に従って作成したランクファイルを用いて行った。バイオリンプロットとして遺伝子発現を表示するために、MAGICアルゴリズムを用いた。
　より造血幹細胞を特徴づける遺伝子を発現している造血幹細胞集団（signature HSC）および多能性前駆細胞（multipotent progenitor：MPP）を同定するために、public data baseから入手可能な造血幹細胞およびMPP1-4細胞のバルクRNA-seqデータ（ArrayExpress, E-MTAB-2262）を使用した（Cabezas-Wallscheidら, Cell Stem Cell 15, 507-522 2014）。ダウンロードしたfastqデータを、STARを使用してmm10にマッピングし、遺伝子発現を、HOMERを用いて解析した。造血幹細胞とMPP1-4細胞間で発現が異なる遺伝子を、DESeqを用いて同定した（Loveら, Genome Biol 15, 014-0550 2014）。MPP1-4細胞よりも造血幹細胞において、4倍高く発現している遺伝子（FDR<0.01）を、造血幹細胞シグネチャーセット（225遺伝子）として使用した。造血幹細胞よりもMPP1-4細胞において、高いレベルで発現している遺伝子（FDR<0.01）を、MPPシグネチャーセット（289遺伝子）として使用した。遺伝子セットの発現レベルを可視化するために、既報に従ってMAGIC-imputedデータを使用して遺伝子セットスコアを計算した。コントロール細胞とTAC細胞のクラスターの比率を比較するために、Rを用いてFisher’s exact testを行い、p値は、1×109回の繰り返しで、Monte Carlo simulationにより計算した。
１－１７．TGF-β1を投与した心不全モデルマウス（大動脈縮窄術（TAC）を施したマウス）由来の造血幹細胞の増殖の評価
　50μgの組換体ヒトTGF-β1（全長）（PeproTech）を10mM クエン酸（pH 2.6）に溶解し、0.1% ウシ血清アルブミンを含むリン酸緩衝食塩水（phosphate-buffered saline；PBS）で希釈し、最終濃度を10μg/mLにした。マウスへのTGF-β1の投与はマウスの体重あたり、40 ng/gを腹腔内投与によって行った。投与は、TAC後1日目（day1）および5日目（day5）に行った。対照として、組換体ヒトTGF-β1を含まない溶液を投与した（図１４中、TAC 1W）。最初の投与から7日後（1週間後）に、骨髄内の造血幹細胞の増殖を前述のEdUを用いて、％EdUとして評価を行った。統計処理は、one-way ANOVA解析後、post-doc testとして、Tukey testで各群比較を行い、P<0.05の値を有意とした。
１－１８．交感神経細胞内のチロシンヒドロキシラーゼ（tyrosine hydroxylase；TH）の定量
　骨および腎臓の透明化は、CUBIC法 (Clear, Unobstructed Brain/Body Imaging Cocktails and Computational analysis) （例えば、Susakiら, Cell 157, 726-739 2014；Tainakaら, Cell  159, 911-924 2014）に修正を加えた方法で行った。
　マウスを経心臓的にPBSで還流し、次いで4% パラホルムアルデヒド（Paraformaldehyde；PFA）で還流し固定した。大腿骨または腎臓を摘出した。大腿骨については、摘出後、骨格筋をハサミで取り除いた。その後、大腿骨または腎臓を４％PFAに浸透し一晩固定した。次に、 大腿骨または腎臓をCUBIC-L（T3740、TCI）に、 37℃、6 日間浸透させた。PBSで洗浄後、大腿骨または腎臓をCUBIC-B（T3780、TCI）に6日間浸透させた。その後、 大腿骨または腎臓をCUBIC-Lに戻して、3日間浸透させた。大腿骨については、大腿骨の中心に長軸方向に切開線を作製し、抗体の浸透を可能にした。
　上記処理を行った大腿骨または腎臓を、5% goat serum（ab7481、Abcam） でブロッキングを行い、一次抗体に5 日間37 ℃で浸透させた。一次抗体は、大腿骨については、500倍希釈のanti-tyrosine hydroxylase rabbit monoclonal antibody（ab152、Abcam）、 250倍希釈のanti-active TGF-β1 mouse monoclonal antibody（MAB2401、R&D）、1,000倍希釈の anti-GFAP chicken polyclonal antibody（ab4674、Abcam）を用いて、0.5% Triton-X、0.1% sodium azideを含んだPBS内で抗体カクテルを作製し、使用した。腎臓については、500倍希釈のanti-tyrosine hydroxylase rabbit monoclonal antibody（ab152、Abcam）を用いて、0.5% Triton-X、0.1% sodium azideを含んだPBS内で抗体溶液を作製し、使用した。一次抗体を反応させた後、大腿骨または腎臓をPBSで洗浄を行った後、37℃で5日間、二次抗体に浸透させた。二次抗体は、大腿骨については、100倍希釈anti-chicken IgY Alexa Fluor Plus 488（A32931、Thermo Fisher）、100倍希釈anti-rabbit IgG Alexa Fluor Plus 555（A32732、Thermo Fisher）、100倍希釈anti-mouse IgG Alexa Fluor 633（A21050、Thermo Fisher）を用いて、0.5% Triton-X、0.1% sodium azide 含有PBS内で抗体カクテルを作製し、使用した。腎臓については、100倍希釈anti-rabbit IgG Alexa Fluor Plus 555（A32732、Thermo Fisher）を用いて、0.5% Triton-X、0.1% sodium azideを含んだPBS内で抗体溶液を作製し、使用した。サンプルの屈折率は、CUBIC-R+（T3741、TCI）で調整した。
　3D画像は、Light-sheet fluorescence microscope（RapidScope（登録商標））を使用して取得した。
　具体的には、染色した大腿骨または腎臓を、oil（屈折率、nD=1.522）のゲルに固定し、スキャンした。レンズは、0.63x/NA 0.15 対物レンズ（MVPLAPO、Olympus）と1.6x zoom body（MVX-ZB10、Olympus）を使用し、3D画像は、voxel resolution of 6.5 x 6.5 x 6.5 μmで取得した。フィルターは、以下のように設定した：Alexa Fluor 488、Ex:488 nm、50 mW and Em: 536/40 nm bandpass; for Alexa Fluor 555, Ex: 532 nm, 25 mW and Em: 593/40 nm bandpass：Alexa Fluor 633、Ex: 640 nm、10 mW and Em: 692/40 nm bandpass。
　3D画像は、Imaris software（Oxford instruments）で構築した。大腿骨については、TH陽性交感神経線維は、ImarisのFilament Tracer moduleを用いて、 ≧10μmの神経線維を半自動検出で検出した。神経線維の長さは同ソフトウェアで自動的に算出した。腎臓については、腎臓全体を2Dに投射した画像を用いて、TH陽性の領域の面積を、Imaris software（Oxford instruments）で定量化した。
１－１９．交感神経節におけるTh遺伝子発現量の測定
　大腿骨の交感神経節については、8週のマウスに対して、26Gの針を用いてTACを行い、TAC処理3日後、7日後の個体（それぞれn=6）および無処理の8週マウスを麻酔下にて、大腿骨を支配する交感神経節を左右ともに取り出し、RNA laterに浸透させた後、リアルタイムPCRでTh遺伝子の発現量とリボソームRNA（18s）発現量を定量した。
　また、腎臓を支配する交感神経の交感神経節については、8週のマウスに対して、26Gの針を用いてTACを行い、TAC処理4週後の個体（n=6）および無処理の12週マウスを麻酔下に腎臓を支配する交感神経節を左右ともに取り出し、RNA laterに浸透させた後、リアルタイムPCRでTh遺伝子発現とリボソームRNA（18s）発現量を定量した。
１－２０．統計処理
　サンプルサイズはパワー計算を基礎としなかった。解析から除いた動物はいなかった。動物実験を行った調査者は、実験中の配置および結果の評価について伏せられていたが、外科的処置中の遺伝子型またはマウスに偽手術を行うのか、またはTAC術を行うかについては、伏せられていなかった。マウスはランダムに各種実験に使用された。
　図１ｃ、図２ａ、図２ｂ、図２ｄ、図４ｈ、図６ａ、図９を除いて、データは、中間値、第１および第３の四分位数および最小値と最大値を示した箱ひげ図で示した。図２ａ、図２ｂ、図２ｄ、図４ｈ、図９においては、バー±S.D.を使用した。パーセンテージに関数積み上げグラフは、図１ｃ、図６ａで使用した。図２ｃにおいては、同じマウスから取得したデータ点を黒線でつなげた。頻度分布を表す棒グラフは、図２ｅおよび図１０で使用した。
　等分散性は、F-testを用いて2グループを比較し、複数のグループ間の比較には、Bartlett's testを用いた。2グループ間の比較は、Student's t-testを用いて行った。3以上のグループ間の差は、one-way ANOVA後にTukey-Kramer post-hoc testを行って解析した。P<0.05の値を有意とした。エラーバーは、特に注記しない限り標準偏差を示す。統計分析は、GraphPad Prism 8 software（GraphPad Software）、RおよびPandasとNumPyを用いたPythonを使用して行った。グラフは、GraphPad Prism、Microsoft Excel、Seuratとggplotを用いたR、およびmatplotlibとseabornを用いたPythonを使用して作成した。
２．結果
２－１．心不全を経験したマウス由来の造血幹細胞の心臓機能に及ぼす影響
　心不全を経験したマウス由来の造血幹細胞（hematopoietic stem cell：HSC）が、心臓の機能に何らかの影響を与えるかどうかについて検討を行った。大動脈狭窄術（transverse aortic constriction：TAC、以下「TAC」 と記載する。）により、マウスの心臓に負荷を課すことで心不全を誘導した。TACにより誘導した心不全モデルマウス由来の造血幹細胞（以下「TAC後HSC」と記載する。）とコントロールマウス由来の造血幹細胞（以下「コントロールHSC」と記載する。）を採集した。採集したTAC後HSCおよびコントロールHSCを、各々、野生型マウスに移植し、4ヶ月および6ヶ月後に左室駆出率と心臓の線維化領域の評価を行った。TAC後HSCを移植したマウスは、コントロールHSCを移植したマウスと比較すると、骨髄移植から4ヶ月後に、線維化を伴う心機能不全の兆候を示し、このような症状は、骨髄移植から6ヶ月後には、より顕著になった（図１ａ）。
　上記結果に示されるような、心不全を経験した造血幹細胞の性質の変化が、心臓マクロファージの表現型に影響を与えるかどうかについて次に検討した。TAC後HSCの分化傾向を調べるために、コントロールHSC（CD45.1マウス由来）とTAC後HSC（CD45.2由来）をレシピエントマウスに移植し、コントロールHSCとTAC後HSCからなるモザイク状の骨髄を有するレシピエントマウス（CD45.1/45.2）を作製した後（図１ｂ）、レシピエントマウスにおける血液細胞の構成について調べた（図１ｃ）。末梢血のフローサイトメトリー解析結果から、コントロールHSCに比べて、TAC後HSCからより多くの単球と好中球誘導されていた。この結果から、子孫細胞のミエロイド系へのシフトが起こっていることが示唆された（図１ｃ（左図））。末梢血ではTAC後HSC由来の単球の割合が多かったが、TAC後HSCから誘導される心臓Ly-6Cloマクロファージの誘導量は、定常状態のマウスおよび骨髄移植後にTACを行ったレシピエントマウスのいずれにおいても、コントロールHSCから誘導される量よりも少なかった（図１ｃ、図５および図６ａ）。レシピエントマウスから別々に選別されたTAC後HSC由来のLy-6CloマクロファージおよびコントロールHSC由来Ly-6Cloマクロファージのトランスクリプトームを比較した（RNA-seq）。図１ｄに示すように、TAC後HSC由来のLy-6Cloマクロファージでは、心臓マクロファージにおいて発現が上昇する遺伝子の発現が少なく、単球から心臓マクロファージへの分化過程に障害があることが確認された（図１ｄ）。
　心不全を経験することによって生じる造血幹細胞の変化について検討するために、コントロールマウスとTAC後のマウス由来の造血幹細胞のトランスクリプトームを比較した（図１ｅ）。造血幹細胞のRNAシークエンスデータの主成分分析（principal component analysis：PCA）を行ったところ、TAC後HSCとコントロールHSCではそのトランスクリプトームが著しく異なることが明らかになった。
２－２．心不全を経験したマウス由来の造血幹細胞の心臓以外の器官の機能に及ぼす影響
　次に、心不全を経験した造血幹細胞が、心臓以外の器官、例えば、腎臓や骨格筋に対して、悪影響を及ぼすかどうかについて調べた。TAC後HSCが外部からのストレスに対する腎臓の脆弱性を誘導するかどうかを明らかにするために、コントロールマウスおよびTAC後マウスの骨髄を移植したレシピエントマウスに、片側尿管結紮（Unilateral ureteral obstruction: UUO）を施した。TAC後マウスの骨髄を移植したレシピエントマウスは、コントロールマウスの骨髄を移植したレシピエントマウスに比べて、著しい尿細管傷害（図２ａ左）および間質性線維症の症状（図２ａ右）を呈していた。UUOの初期段階では、コントロールマウスの骨髄を移植したマウスの腎臓に比べて、TAC後の骨髄を移植したマウスの腎臓において、より多くのLy-6Chi炎症促進性マクロファージが認められた（図２ｂ上）。次に、TAC後マウス由来骨髄とコントロールマウス由来骨髄からなるモザイク状の骨髄を持つマウスの腎臓マクロファージについて検討を行った。TAC後マウスの骨髄に由来する細胞群は、心臓マクロファージの場合と同様に、Ly-6Chiマクロファージに比べてLy-6Cloマクロファージが相対的に少なかった（図２ｃ）。
　さらに、心不全を経験した骨髄の移植が骨格筋に与える影響について検討した。コントロールまたはTAC後マウス由来の骨髄を移植した後、レシピエントマウスにカルディオトキシン（cardiotoxin）を投与して骨格筋に傷害を与えた。コントロールマウスの骨髄を移植したマウスに比べて、TAC後マウスの骨髄を移植したマウスの傷害を受けた筋原繊維は、再生の程度が低いことが明らかになった（図２ｄおよびｅ）。以上の結果から、心不全によって性質が変わった造血幹細胞は、多臓器不全を引き起こし、共存疾患の発症を誘導することが示唆された。
２－３．組織マクロファージとなる細胞の運命の決定要因の検討
　上記結果は、組織マクロファージの表現型は、造血幹細胞の時点である程度決められていること、心臓のストレスによって性質が変化した造血幹細胞が、成熟した常駐マクロファージに分化すると考えられる。この仮説を検証するため、造血幹細胞の分化を追跡するために、造血幹細胞をバーコード化した（図３ａ）。DNAコードで標識したHSCsの移植後、我々は、血中白血球、心臓マクロファージおよび腎臓マクロファージの各細胞画分のバーコードのレパトアを比較した。HSCsは不均一（異種性）であることから、B細胞／T細胞とミエロイド系細胞の間でそのレパトアに明らかな相違が認められた。好中球および単球のレパトアは、非常に類似していた（図３ｂ、図７）。Ly-6Chi 腎臓マクロファージは単球に由来しているようであったが、心臓および腎臓のLy-6Cloマクロファージは、末梢血の骨髄細胞系列との関連性は低いようであった（図３ｂ、ｃおよび図７）。以上の結果は、ミエロイド系偏重へ変化した造血幹細胞由来の単球は、組織成熟マクロファージへ分化しない傾向であることを示唆している。
２－４．心不全を経験した造血幹細胞の性質変化の詳細についての検討。
　次に、心不全後に、造血幹細胞の性質がどのような過程を経て変化するのか検討を行った。まず、TAC後HSCの増殖能について調べたところ、TAC後4週間の間、増殖する造血幹細胞数が継続的に上昇することが分かった（図８）。次に、このような造血幹細胞の増殖増加が、造血幹細胞にエピジェネティックな影響を与えるかどうかを明らかにするために、TAC後HSCとコントロールHSCのTransposase- Accessible Chromatin Sequencing（ATAC-seq）アッセイを行った。主成分分析（principal component analysis：PCA）の結果、コントロールHSCのATAC-seqデータはさまざまな位置に局在しているのに対し、TAC後HSCのATAC-seqデータは均一で、特定の位置に収束しているようであった（図４ａ）。コントロールHSCとTAC後HSC間で、明らかに異なるシグナルを持つピーク領域に注目すると、TAC後HSCでは、オープンクロマチン領域（開いたクロマチン領域）が減少しており、例えば、GATA3モチーフおよびSMAD3モチーフに富む、いくつかのクロマチン領域が、TAC処理後のHSCではクローズしている（閉じている）ことが分かった（図４ｂ）。GATA3は、Ly-6Cloマクロファージの極性化およびヘルパーT細胞と自然リンパ球（innate lymphoid cell）の分化のために欠かせない転写因子としてよく知られており、このことは、TACによる造血幹細胞のエピジェネティックな変化がマクロファージの分化を決定し、ミエロイド系への分化にシフトすることを示唆している（図４ｃ）。
　次に、コントロールHSCとTAC後HSCを比較するために、CD34-FLAT-LSK（Lin- Sca1+c-Kit+Cd45+：成体型造血幹細胞）細胞の単一細胞RNAシークエンス（scRNA-seq）を行った。コントロールHSCおよびTAC後HSCを構成する全細胞を、11のサブ集団に分けた（図４ｄ）。11のクラスター中、造血幹細胞シグネチャー（目印）のスコアが高いクラスター4、5および7について、scRNA-seq のGSEA（Gene Set Enrichment Analysis）を行ったところ、SMAD2/3パスウェイがTAC後HSCでは不活性化されていることが示された（図４ｄ）。この結果は、TGF-βシグナル伝達のダウンレギュレーションが生じていることを示唆している。さらに、活性型TGF-β1の濃度が著しく低下していることが、ELISA分析によって確認された（図４ｆ）。TGF-βシグナルパスウェイは、造血幹細胞の冬眠に重要な役割を果たしている（Yamazakiら, Blooc 113, 1250-1256, 2009）ことを考え合わせると、上記結果は、心不全の発症を導く心臓ストレスが、骨髄におけるTGF-βシグナル伝達を減少させて、造血幹細胞の冬眠の維持を阻害することを示唆している。
　次に、TGF-βシグナル伝達の阻害が心不全の進行を誘導するかどうか検討した。ドナーマウスをTFG-β1受容体阻害剤（LY364947）またはビークルで処置した後、LY364947で処理された造血幹細胞をレシピエントマウスに移植した後6週間後に、TAC処置を行った（図４ｇ）。レシピエントマウスにおいて、造血幹細胞におけるTGF-β1シグナル伝達を阻害すると、血液中のB細胞数が減少した（図９ｂ）。この結果から、ドナーマウスの造血幹細胞におけるTGF-β1受容体の阻害によって引き起こされたミエロイド系シフト（図９ａ）は、レシピエントマウスの造血幹細胞においても維持されることが示唆された（図９ｂ）。
　また、LY364947で処理した造血幹細胞を移植すると、レシピエントマウスにおいて、圧負荷に対する心臓の適応度が低下し、収縮不全に陥った（図４ｈ）。そこで、TGF-β1シグナルが阻害された造血幹細胞が、心不全を誘導するメカニズムを調べるために、LY364947またはビークルで処理した造血幹細胞の再構成比率を比較した。LY364947処理した造血幹細胞の心臓Ly-6Cloマクロファージの構成割合は、ビークル処理した造血幹細胞よりも低かった（図１０）。
　上記結果は、心不全による心臓ストレスが骨髄中のTGF-β1のシグナルを減少させ、造血幹細胞の性質を変化させることを示唆している（図４ｉ）。性質が変化した造血幹細胞に由来する単球は、心臓を保護する役割を担うLy-6Cloマクロファージに分化しなくなり、その結果、心不全の進行および再発、さらには、腎不全や骨格筋再生不全などの併発疾患を惹起すると考えられる。
２－５．心不全によってエピジェネティック変化が生じた造血幹細胞の増殖に対するTGF-β1の影響の検討。
　TAC後に骨髄内の活性型TGF-β1の濃度が低下し、造血幹細胞のエピジェネティック変化が生じ（図４）、造血幹細胞が増殖状態になる（図８）。エピジェネティック変化が生じた造血幹細胞から分化して、心臓に供給された単球は心臓保護的な心臓マクロファージに十分に分化できない（図１ｃおよび図６ａ）ため、エピジェネティック変化が生じた造血幹細胞の増殖能が高まると、さらなる心機能の低下を惹起することが予想される。従って、活性型TGF-β1の投与により、エピジェネティック変化が生じた造血幹細胞の増殖が抑制されれば、心機能の低下をも抑制できると考えられる。
　そこで、C57BL6Jマウスに対して、TAC直後からヒトTGF-β1全長を投与し、造血幹細胞（エピジェネティック変化が生じた造血幹細胞）の増殖が抑制されるかどうかを検討した。
　まず、全長TGF-β1が体内で活性型TGF-β1となることを確認した。組換体TGF-β1（全長）をPBSに溶解し、40μg/kg 体重の量を、TAC直後から腹腔内投与し、その後、一日一回同様に投与を行った。コントロールとしては同量のPBSを腹腔内投与した。骨髄内の活性型TGF-β1を上記１－１３に記載したELISA法で測定した。TAC後一週間で、低下する活性化TGF-β1の量が、全長TGF-β1を全身投与することによって、骨髄内で活性型TGF-β1の量が増加し、コントロールと同程度の量にまで回復した。このことは、投与した全長TGF-β1が体内で活性型TGF-β1になり、骨髄内の活性型TGF-β1が増加したことを意味する（図１３）。
　次に、C57BL6Jマウスに対して、TAC後1日および5日にヒト全長TGF-β1を投与し、造血幹細胞（エピジェネティック変化が生じた造血幹細胞）の増殖が抑制されるかどうかを検討した。その結果、TACによって増加する造血幹細胞数の増加が（EdU陽性細胞数の割合）が、全長TGF-β1投与群において完全に抑制されることが確認された（図１４）。
２－６．心不全後に生じる交感神経の変化の解析
　正常状態の骨髄内では、交感神経細胞から放出されるノルエピネフリンによって活性化されるシュワン細胞が活性型TGFβ1を放出し、放出されたTGF-β1が、骨髄腔内の造血幹細胞に作用し、造血幹細胞の幹細胞としての性質を維持していることが知られている。また、これまで、心不全時の骨髄内の交感神経活性は活性化されるものと考えられてきた。しかし、その詳細は不明であった。そこで、心不全モデルマウス（TAC処理マウス）を用いて、上記の現象について検証を行った。
　具体的には、マウスから採取した大腿骨を透明化し、その内部の交感神経細胞内に存在するチロシンヒドロキシラーゼ（Tyrosine Hydroxylase：TH）の存在量を抗TH抗体による免疫染色により定量した。同時に活性型TGF-β1を抗活性型TGF-β1抗体で染色し、同時に抗GFAP（Glial fibrillary acidic protein）抗体でシュワン細胞を染色すると、従来から知られているようにTH陽性の神経線維の周りにシュワン細胞が存在し、そのシュワン細胞に活性型TGF-β1が存在していることを確認し得た。一方でTAC処理マウスでは、抗TH抗体で染色される交感神経線維の長さ（抗TH抗体で染色される神経線維の全ての長さの総和）がコントロールマウスと比較して、短くなっていることが明らかとなった（図１５ＡおよびＢ）。そこで、神経線維自体が短くなっているのかどうかについて確認した。透明化した大腿骨のサンプルを、シュワン細胞のマーカーであるGFAPに対する抗体とTHに対する抗体で染色したところ、抗TH抗体では、図１５Ａと同様に神経線維が短くなっているような染色像が得られたのに対し、抗GFAP抗体では、コントロールと同様の染色像が得られた。つまり、シュワン細胞のワーラー変性が生じていなかったことから、THの発現を失った神経線維が存在しており、シュワン細胞は神経線維の周囲に存在していると判断できる。このことは、TAC処理後も交感神経線維自体はそのまま存在しており（デナベーションされていない）、交感神経細胞内のTHの量が顕著に減少しているということが明らかになった（交感神経の神経障害を意味する）（図１６Ｂ）。併せて、抗活性型TGF-β1抗体で免疫染色すると、抗TH抗体による染色像と同様に低下していた。
　以上の結果から、心不全時に骨髄内において、交感神経細胞内のTH量が低下し、その結果、シュワン細胞からの活性型TGF-β1の放出量が低下することが示唆された（図１６Ａ）。これまでは、この機構が心不全によって骨髄内交感神経が破綻を来たし、造血幹細胞の増殖、エピジェネティック変化が惹起され、心不全が再発しやすくなると考えられていた。
　上記大腿骨を用いた実験に加え、腎臓を用いて同様の実験を行った。その結果、心不全モデルマウスの腎臓を支配する交感神経細胞内のTH量も、同様に低下していることが確認された（図１８）。
２－７．心不全後の交感神経節におけるTh遺伝子発現量の測定
　上記結果を踏まえて、心不全後の交感神経細胞内におけるチロシンヒドロキシラーゼ遺伝子（Th遺伝子）の発現量を調べた。
　TAC処理した心不全モデルマウスにおいて、大腿骨へ交感神経を供給する交感神経節（左右）を摘出し、Th遺伝子の発現をリアルタイムPCRで測定した。その結果、TAC処理後3日、7日において、Th遺伝子の発現量が有意に低下することが分かった（図１７）。また、TAC処理した心不全モデルマウスの腎臓を支配する交感神経節についても、AC4週後にTh遺伝子の発現量の低下が確認された（図１９）。
　以上の結果から、心不全後の交感神経細胞内のTH量の低下は、交感神経節におけるTh遺伝子の発現量の低下によるものであることが示唆された。
　本発明は、心不全およびその併発疾患の有効な治療薬等を提供する。また、本発明は、再発した心不全のように重症化の可能性のある心不全の診断を行うための補助的な方法を提供する。従って、本発明は、医薬および医療分野にいての利用が期待される。

Claims (13)

  1. 　心不全および／または心不全の併発疾患の治療薬または治療用組成物であって、活性型TGF-β1または全長TGF-β1を有効成分として含む、前記治療薬または治療用組成物。
  2. 　心不全および／または心不全の併発疾患の治療薬または治療用組成物であって、心不全の影響を受けていない造血幹細胞を有効成分として含む、前記治療薬または治療用組成物。
  3. 　前記心不全の影響をうけていない造血幹細胞において、TGF-β1シグナルの下流の分子が結合する遺伝子領域のクロマチンが閉鎖していないことを特徴とする、請求項２に記載の治療薬または治療用組成物。
  4. 　心不全および／または心不全の併発疾患の治療薬または治療用組成物であって、チロシンヒドロキシラーゼ（Tyrosine Hydroxylase；TH）またはその活性促進因子を有効成分として含む、前記治療薬または治療用組成物。
  5. 　治療対象である心不全が初発の心不全である、請求項１から請求項４までのいずれか１項に記載の治療薬または治療用組成物。
  6. 　治療対象である心不全が再発した心不全である、請求項１から請求項４までのいずれか１項に記載の治療薬または治療用組成物。
  7. 　前記併発疾患が、腎不全および／または骨格筋再生不全であることを特徴とする、請求項１から請求項６までのいずれか１項に記載の治療薬または治療用組成物。
  8. 　活性型TGF-β1または全長TGF-β1を含有することを特徴とする、心不全の影響を受けた造血幹細胞の増殖抑制剤。
  9. 　心不全の重症化の可能性を判断するための補助的方法であって、
    被験者由来の造血幹細胞におけるエピジェネティックな変化の有無を指標とする、前記補助的方法。
  10. 　前記エピジェネティックな変化が、TGF-β1シグナルの下流の分子が結合する遺伝子領域のクロマチンの閉鎖である、請求項９に記載の補助的方法。
  11. 　心不全および／または心不全による併発疾患の治療薬候補となる物質のスクリーニング方法であって、心不全モデル動物に候補物質を投与し、当該心不全モデル動物の交感神経細胞内のTHの量を測定することを含む、前記スクリーニング方法。
  12. 　前記心不全モデル動物から、交感神経を含む臓器を採取し、当該臓器を透明化し、当該臓器を支配する交感神経の神経細胞内のTHの量を測定することを含む、請求項１１に記載の方法。
  13. 　前記THの量を抗TH抗体で定量することを特徴とする、請求項１２に記載の方法。
     
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