WO2022096564A1 - Procédé de fabrication d'une puce d'analyse et puce d'analyse - Google Patents

Procédé de fabrication d'une puce d'analyse et puce d'analyse Download PDF

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WO2022096564A1
WO2022096564A1 PCT/EP2021/080623 EP2021080623W WO2022096564A1 WO 2022096564 A1 WO2022096564 A1 WO 2022096564A1 EP 2021080623 W EP2021080623 W EP 2021080623W WO 2022096564 A1 WO2022096564 A1 WO 2022096564A1
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analysis
pellet
matrix
chip
biological sample
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PCT/EP2021/080623
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Pascal PFLIMLIN
Bernard LUDWIG
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Preciphos
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    • B01L9/52Supports specially adapted for flat sample carriers, e.g. for plates, slides, chips

Definitions

  • the present invention relates to the field of biological analyses, in particular biochemical analyses.
  • the invention relates to a process for manufacturing filter chips, which can optionally be functionalized to carry out biological analyses.
  • protein microarrays In the field of biological analyses, it is known to use protein chips (“protein microarrays”) to study the biochemical activity of proteins.
  • a library of antibodies or protein fragments (“probes”) – or even whole proteins – is placed on a matrix such as a glass slide. In this case, one and the same sample is tested on all the probes deposited on the matrix.
  • Document WO2014/053237 is an example in which a miniaturized device allows analysis of several biological samples simultaneously (“multiplex” analysis). Each sample can also be exposed to several different probes successively. In other words, the device allows an analysis of the “3D analysis” type.
  • the device described by this document comprises a plurality of channels, into each of which a sample in the liquid phase can be injected independently of the other channels.
  • Each channel can be formed from several tubular portions. Between two successive portions is inserted an approximately cylindrical analysis zone formed in an appropriate matrix.
  • the analysis zones can in particular be formed in a flat nitrocellulose matrix, the entire surface of which, except for the analysis zones, is rendered hydrophobic by an impregnation of wax.
  • the analysis zones can simply consist of untreated nitrocellulose, so that they constitute zones of filtration, or alternatively of nitrocellulose functionalized for example by means of a probe molecule.
  • the impregnation operation with wax makes it possible to delimit the analysis zones, but also to limit the lateral diffusion inside the matrix (that is to say outside a given analysis zone towards the other neighboring analysis zones) of the molecules of interest (probe molecules or molecules of a sample).
  • a solid ink printing process is implemented, so as to deposit a layer of wax on the matrix in the areas that must be rendered. hydrophobic.
  • the matrix is heated to a temperature higher than the melting point of the wax used, then cooled, so that the wax diffuses laterally and in depth, in the thickness of the matrix. , so as to limit its subsequent undesirable distribution to the analysis areas.
  • the filling of the holes can be obtained by laminating a sheet of adsorbent material on the previously drilled base plate.
  • the sheet of analysis material is stressed anisotropically due to the tensile force exerted in the direction of rolling.
  • the properties of the adsorbent material after insertion into the holes are therefore anisotropic. It is even possible that the thickness of the adsorbent material varies within the same hole.
  • the lamination does not break the continuity of the sheet of adsorbent material.
  • the adsorbent material therefore forms a continuous surface between two channels under or on the plate, as can be observed in FIG. 2b of document US2004/0115707.
  • the molecules of interest therefore risk diffusing from one channel 3 to another due to this continuity.
  • the adsorbent material can be dissolved in a solvent.
  • the solution obtained is then injected into the holes and the solvent evaporated.
  • This liquid phase injection technique also does not allow precise control of the isotropy of the properties of the test zone, in particular because the air flow allowing the evaporation of the solvent is necessarily directional.
  • the bond between the adsorbent material, once solidified, and the base plate is not ensured with certainty.
  • the quality of this bond depends in particular on the chemical compositions of the adsorbent material and of the base plate.
  • the connection between a given analysis zone and the plate can therefore prove to be fragile. In the event of forced circulation of liquid, by means of a relative vacuum, these analysis zones could come off and be carried away by the circulating liquid. It is therefore not possible to carry out an analysis with forced circulation of liquid through the analysis zones obtained by this embodiment.
  • the invention therefore aims to propose a method for manufacturing a chip for analyzing a biological sample making it possible to finely control this chemical composition and this physical structure.
  • the invention aims to provide a method for manufacturing a low-cost analysis chip, not requiring a heat, chemical or irradiation treatment step for the formation of the test sites in the matrix (except during a possible biochemical functionalization of these sites after or before the formation of the sites) and making it possible to carry out a quantitative analysis of high precision and sensitivity and/or an analysis of a biological sample or a simple filtration of a liquid biological sample.
  • the invention relates to a method for manufacturing a chip for analyzing a biological sample comprising:
  • At least one pellet is provided, cut from a sheet of solid and porous analysis material, the pellet having a lower surface and an upper surface,
  • one proceeds to the insertion of at least one pellet in at least one through hole of the matrix by translation of at least one pellet in the direction normal to the lower and upper surfaces of the matrix;
  • a mechanical assembly is carried out at a temperature below the melting temperatures of the support and analysis materials, during which a pressing force in the direction normal to the lower and upper surfaces of the matrix is exerted on at least a portion of the matrix which adjoins the at least one pellet inserted into the matrix and/or on at least one of the lower and upper surfaces of the at least one pellet inserted into the matrix.
  • an analysis chip comprising at least one pellet of analysis material inserted into a hole passing through a support material.
  • the assembly between the pellet and the support material is not obtained by a chemical process, nor by melting one of the materials so that the physical and chemical properties of the support and analysis materials before assembly are not or at least are very little altered after assembly, including near the interface between these two materials.
  • Assembly is obtained only mechanically and by the exercise of a pressing force normal to the upper and lower surfaces of the die, so that the deformation of the materials is uniform in a plane normal to the direction of the pressing force.
  • the method therefore makes it possible, unlike methods implementing a rolling step, not to introduce anisotropy into the support material and/or the analysis material in a direction normal to the direction of the pressing force.
  • Such an anisotropy would, for example, lead in the case of immunological tests using fluorescent reagents to inhomogeneous fluorescence on the surface of an analysis tablet, which would make the quantitative analysis of the fluorescence signal imprecise.
  • the means necessary to implement are only mechanical, therefore not very polluting in that they do not include solvent and they are simple to implement. According to various aspects, it is possible to provide one and/or the other of the characteristics below taken alone or in combination.
  • the pressing force is exerted on a portion of the matrix which adjoins the at least one pellet inserted into the matrix. Thanks to this arrangement, this portion of the matrix can be folded over and/or below the pellet so that the pellet can be at least partially crimped by the matrix.
  • the assembly of the pellet to the matrix in the analysis chip will present a good mechanical resistance and will not be affected by the flow of a liquid sample to be analyzed in the direction normal to the surfaces. top and bottom of the matrix, or even by a relative vacuum applied on the side of one of these surfaces in order to accelerate the flow of the liquid sample.
  • the pressing force is exerted on at least one of the lower and upper surfaces of the at least one pellet inserted into the matrix.
  • the pellet at least partially crimps the matrix so that the assembly of the pellet to the matrix will present a certain mechanical resistance and it will not be affected by the flow of a liquid sample to be analyzed in the direction normal to the upper and lower surfaces of the matrix, or even by a relative vacuum applied on the side of one of these surfaces in order to accelerate the flow of the liquid sample.
  • the support material is hydrophobic and the analysis material is hydrophilic or vice versa.
  • the analysis material is hydrophilic or vice versa.
  • the support material is hydrophilic
  • the analysis material is hydrophobic and it is then possible to deposit a sample to be tested in the organic phase on the tablet without it diffusing towards the support material.
  • the at least one pellet in the method of manufacturing a chip for analyzing a biological sample, for inserting the at least one pellet into the at least one through hole, the at least one pellet is translated into the at least one through-hole by means of a punch, the at least one pellet having been cut out from the sheet of analysis material before its insertion by means of this same punch and the at least one through hole having been formed beforehand in the matrix by means of this same punch. Thanks to this arrangement, a single tool is necessary to prepare an analysis chip, namely a punch having one or more punches of sizes and shapes adapted to the shapes of the desired wells.
  • the at least one pellet is functionalized.
  • a biochemical functionalization by means of an antibody or an antigen which is adsorbed on the pellet.
  • the chip for analyzing a biological sample obtained by the method makes it possible to implement an analysis test implementing the reagent used for the functionalization, for example an immunological test.
  • the analysis chip can therefore be adapted to the analysis needs thanks to this functionalization step.
  • the analysis chips can for example be produced in series before the functionalization step and each functionalized at will at the time of the analysis.
  • the analysis material is functionalized before inserting the at least one pellet into the matrix. Thanks to this arrangement, the functionalization can be done on the whole of a sheet of analysis material before the cutting of the pellet. This saves time when the analysis chips are prepared in series.
  • the control of the functionalization, and in particular of a quantity of analysis reagent deposited on each pellet is also better, which ultimately allows better precision and better reproducibility of the tests carried out with a given series of analysis chips. .
  • the insertion of the at least one pellet into the matrix is repeated at least once, using for each new insertion a functionalized analysis material different from that used for the previous insertion and a punch corresponding to at least one through hole of the matrix different from that used for the previous insertion.
  • the mechanical assembly of at least one pad with the matrix results in a crimping of at least one pad on at least least a portion of its lower and upper surfaces by the matrix.
  • the pellet cannot be pushed, under normal conditions of use, outside the die at least on one side of this die.
  • the assembly of the matrix and the pellet therefore resists a relative vacuum or the pressure exerted on one side of the pellet by the sample to be tested when it is deposited.
  • the at least one pellet in the method of manufacturing an analysis chip for a biological sample, before the insertion of the at least one pellet into the matrix, the at least one pellet is brought to a temperature lower than that of the matrix. Thanks to this arrangement, the analysis material shrinks before its insertion, which facilitates its insertion into the through hole by reducing the contact forces and it expands after insertion, so that after insertion, the contact between the pellet and the matrix is secured and allows the tablet to be held in place in the matrix.
  • the invention also relates to a chip for analyzing a biological sample comprising:
  • the analysis chip d a biological sample being characterized in that the at least one pellet is crimped on at least one of its upper and lower surfaces by the matrix.
  • Such an analysis chip has the advantage of not containing any residue of solvent or melting or soldering zone which could alter the precision of a test carried out with this chip. Crimping makes it possible both to preserve the native physico-chemical properties of the support material and of the analysis material. It also makes it possible to carry out a test with flow of a sample along the axis of the through hole from one side of the pellet to the other, since the assembly between the pellet and the matrix has good mechanical resistance.
  • the support material comprises at least one component chosen from a metal, a plastic material and cellulose and in that the analysis material of which the at least one pellet includes at least one component selected from nitrocellulose, cellulose, and an organic polymer.
  • Such materials are inexpensive and have the necessary qualities of biochemical inertness and adsorption to implement analyzes such as biochemical tests.
  • the assembly of the at least one pellet and of the matrix withstands at least a relative vacuum equal to 0.100 bar.
  • the invention also relates to a device for analyzing a biological sample comprising at least two chips for analyzing a biological sample according to one of the preceding embodiments superposed and in which the at least one pellet of one of the at least two chips is configured to perform a filtration function and is superimposed with the at least one functionalized pad of another chip of the at least two chips.
  • the invention further relates to a diagnostic kit comprising at least one analysis chip for a biological sample according to one of the preceding embodiments and at least one analysis reagent.
  • One or more analysis reagents in particular a buffer, a solvent, an antigen, an antibody, can thus be supplied in order to carry out a test, such as an immunological test, which is standardized.
  • the invention also relates to the use of a chip for analyzing a biological sample according to one of the preceding embodiments for diagnostic purposes or for an immunological test.
  • the invention finally relates to a device for manufacturing a chip for analyzing a biological sample according to one of the preceding embodiments, the manufacturing device comprising:
  • an insertion system suitable for inserting the at least one pellet into the at least one through-hole of the die by translation of the pellet in the direction normal to the lower and upper surfaces of the die;
  • a mechanical assembly system at a temperature below the melting temperatures of the support and analysis materials, adapted to exert a pressing force in the direction normal to the lower and upper surfaces of the matrix on at least a portion of the matrix which adjoins the at least one pellet inserted into the matrix and/or onto at least one of the lower and upper surfaces of the at least one pellet inserted into the matrix.
  • Such a manufacturing device is simple to implement and introduces only minimal and isotropic deformation of the support and/or analysis material in any plane parallel to the lower and upper surfaces of the matrix. It therefore makes it possible to form analysis chips at low cost and while preserving the native physico-chemical properties of the support and analysis materials.
  • Figure 1 shows one embodiment of a scan chip support array.
  • Figure 2 shows a support strip in which three basic parts each allowing to form a support matrix have just been cut.
  • FIG. 3al represents a support die portion at the beginning of the drilling of a through hole, seen in section along a plane containing the axis of this hole, according to a particular embodiment.
  • FIG. 3a2 represents a support die portion in which a through hole is being drilled, seen in section along a plane containing the axis of this hole, according to a particular embodiment.
  • FIG. 3b represents a portion of support matrix, after drilling a through hole and at the start of a step of inserting a pellet of analysis material, seen in section along a plane containing the axis of this hole , according to a particular embodiment.
  • FIG. 3c represents a portion of support matrix during insertion of a pellet of analysis material, seen in section along a plane containing the axis of this hole, according to a particular embodiment.
  • FIG. 3d represents a portion of support matrix at the end of a step of inserting a pellet of analysis material, seen in section along a plane containing the axis of this hole, according to a particular embodiment .
  • Figure 4a shows a sectional view of the same support die portion as in Figure 3d at the start of the assembly step in a particular embodiment.
  • Figure 4b shows a sectional view of the same support die portion as in Figure 3d during the assembly step in a particular embodiment.
  • Figure 4c shows a sectional view of the same portion of support matrix as in Figure 3d at the end of the assembly step in a particular embodiment.
  • Figure 5 shows a top view of one embodiment of a scan chip.
  • Figure 6 shows a multiplexed analysis device comprising two analysis chips.
  • FIG. 7 represents a top view of an embodiment of an analysis chip support matrix, in which the through holes have different shapes.
  • FIG. 8a presents a photograph obtained with a binocular magnifying glass (Zeiss, Stemi SV8 model) of an analysis chip of a biological sample 1 cut out along a plane orthogonal to the upper and lower faces of the chip and containing a diameter of the circular section of a cylindrical through-hole.
  • a binocular magnifying glass Zeiss, Stemi SV8 model
  • FIG. 8b reproduces a photograph of an analysis chip obtained with a method of the prior art implementing a Xerox® Solid Ink printer, the diameter of the analysis pellets being of the order of 500 micrometers.
  • Figure 8c presents a photograph of the analysis chip of Figure 8b obtained with a binocular loupe (Zeiss, model Stemi SV8, magnification x64).
  • FIG. 8d presents a photograph of the analysis chip of FIG. 8a obtained with a binocular loupe (Zeiss, Stemi SV8 model, magnification x64) obtained by the method according to the invention, in which the analysis material is nitrocellulose, the backing material of the black paper coated with wax, the diameter of the analysis pellets being equal to 500 micrometers.
  • a binocular loupe Zeiss, Stemi SV8 model, magnification x64
  • FIG. 9 presents a photograph of an analysis chip obtained with a binocular loupe (Zeiss, Stemi SV8 model, magnification x64) obtained by the method according to the invention, in which the analysis material is nitrocellulose, and the support material is brass, the diameter of the analysis pellets being equal to 500 micrometers.
  • the invention relates to a method of manufacturing an analysis chip for a biological sample 1 intended to be implemented in isolation or in an analysis device 7.
  • the analysis device 7 - or the analysis chip of a biological sample 1 alone - allows for example to carry out analyzes of biological fluids such as blood or a liquid fraction of blood (plasma, serum), urine, saliva, etc.
  • the liquid analyzed can also be a reaction medium comprising bio-molecules such as antibodies or proteins.
  • the analysis chips for a biological sample 1 can thus be used to detect and quantify complex biomolecules in biological media: blood, plasma, serum, organs or organ extracts, reaction medium in which complex biomolecules are produced ( antibodies, proteins).
  • the biological analysis can be an immunological test such as an ELISA (“Enzyme-Linked ImmunoSorbent Assay”) test.
  • the analysis chips of a biological sample 1 can still be implemented in the field of the food industry for the search for pathogenic agents, for example during health checks.
  • the method for manufacturing an analysis chip for a biological sample 1 according to the invention comprises:
  • support material formed in a solid material, called "support material”, having a lower surface and an upper surface and in which has been formed at least one hole 11 passing through it between its lower and upper surfaces;
  • the analysis chip for a biological sample 1 obtained at the end of the method comprises:
  • At least one pad 3 cut from a sheet of solid and porous analysis material and inserted into the at least one through hole 11, the at least one pad 3 being crimped on at least one of its upper and lower surfaces by matrix 10.
  • the analysis chip for a biological sample 1 which can be observed in a particular embodiment in FIG. 5, therefore comprises a support matrix 10 formed in a solid material of thickness el in which one or more holes through 11 were formed.
  • a particular embodiment of the support die 10 is represented in FIG. 1.
  • Another particular embodiment of the support die 10 is represented in FIG. 7.
  • the support die 10 is formed by cutting a base part 21, of suitable shape for the analysis device in which it is intended to be used or else for its use in isolation.
  • the base part 21 is for example a rectangular or square parallelepiped cut from a support strip 2 of a solid material, called in the following “support material”, having a lower surface and a flat upper surface parallel to each other.
  • a base part 21 cut from the support strip 2 to form a support matrix 10 can be a parallelepiped and have a width L1 of between 5 mm (5 millimeters) and 50 mm and a length L2 of between 5 mm and 50 mm.
  • the support matrix 10 is formed in an analysis material of constant thickness el between the lower surface and the upper surface, these surfaces being in this case flat and parallel to each other.
  • the thickness el of the support strip 2 is then constant and identical to that of the cut piece 21. It is preferably less, for example by at least a factor of ten, than the other dimensions (length L1 and width L2) of the cut piece 21.
  • the support strip 2 can for example have a width L3 either identical to or slightly greater than the width L1 of the support matrix 10, or for example greater than twice the width LL
  • the width L3 of the support strip 2 is thus for example between 5 mm and 50 mm.
  • the length L4 of the support strip 2 can be greater, or even much greater, than the length L2 of the part 21.
  • the length L4 for example, greater than 1 m or even 10 m.
  • a base part 21 can for example be carried out by means of a punch into which the support strip 2 is inserted.
  • the cutting of the base parts 21 can be automated, the support strip 2 being translated by an adequate distance between two successive cuts of a base part 21.
  • the thickness el of the support strip 2 (and of a base part 21 cut from this support strip 2) can be less than 1 mm, less than 0.15 mm, or even less between 0.1 mm.
  • the thickness el of the support strip can be equal to 0.06 mm.
  • the support strip 2 has a width of 20 mm and a length of 25 m for example.
  • the width and length can be changed according to the type of analysis chips 1 to be manufactured.
  • the thickness of the support strip 2 can be equal to 0.12 mm, i.e. the current thickness of the filtering membranes (generally made of nitrocellulose) formed in the analysis material, but it could also be of the order of 0, 10mm.
  • a base part 21 is a square filtering membrane with sides of 20 mm.
  • the support strip 2 can in particular be made of metal, for example steel, copper or brass.
  • the support strip 2 can, in an alternative embodiment, be made of plastic.
  • the plastic material can be polyethylene, polyvinyl chloride, polystyrene, polymethyl methacrylate, polypropylene or any other plastic material commonly used in the field of biochemical analyses. It may have undergone a surface treatment or be UV resistant.
  • the support material may also contain vegetable fibres, for example cellulose. It may in particular be paper.
  • the support material is strong but not necessarily rigid.
  • the support strip 2 can thus have a certain flexibility, provided that the support strip 2 or a support matrix 10 formed from this support strip 2 can be manipulated and moved for the preparation of the analysis chips 1, in particular without tearing , including in the case where the preparation of the support matrix 10 is automated.
  • Rex Copy A4 photocopier paper distributed by Mondi® with a weight of 80 g/m 2 , available on the priority date of the present patent application, is suitable for the invention.
  • the material is sufficiently rigid for the upper and lower surfaces to be effectively flat when the lower surface is, at least locally, simply placed on a flat support.
  • the support material is rigid enough to allow the cutting of one or more base parts 21 by means of a cookie cutter.
  • a base piece 21 of support material at least one through hole 11 is formed through the material in its thickness, that is to say along the direction normal to the lower and upper surfaces of the piece 21.
  • a through hole 11 is formed by means of a punch 42, as shown in Figures 3a1 (at the start of drilling), 3a2 (during drilling), and 3b (just before drilling). injection step that follows the drilling step, described later).
  • the punch 42 is translated along the direction of the axis of the future through-hole 11, so as to pierce the support die 10.
  • a dedicated cutting guide 4 can be placed under the support strip 2 The stroke of the punch 42 through the cutting guide 4 is adjusted so as to allow the ejection of a pellet 10b from the support strip 2, as can be seen in Figures 3a1 and 3a2.
  • the punch can then be moved in the opposite direction so as to release the support die 10 then comprising one or more through holes 11.
  • the through holes 11 are formed on the locations corresponding to the future base parts 21 in the support strip 2 before one or more base parts 21 are cut out.
  • the through holes 11 are formed in a base part 21 already cut out.
  • the through holes 11 are formed at the same time as the part 21 is cut, for example by means of a cookie cutter of suitable shape.
  • the shape of the through holes 11 can be chosen according to the needs of the analysis.
  • the surface delimiting the interior of a through-hole 11 is a cylinder whose generatrix is parallel to the direction normal to the lower and upper surfaces of the part 21, direction which will be referred to below as the "axis of the hole”. 11”.
  • the through holes 11 are cylinders of revolution.
  • one of the through-holes 11 can be analyzed as formed by two through-sub-parts of circular section 11a and 11b, connected by a channel 11e.
  • the characteristic dimensions of a through hole 11 in a direction of the upper or lower surface of the work 21 in which the through hole 11 is formed may be less than 1 mm.
  • a support matrix 10 can comprise 9, 12, 24, 48 or 96 holes (or wells) 11 having the shape of cylinders of revolution with a diameter d1 of the order of 300 to 800 ⁇ m (micrometers), two successive through holes 11 being spaced apart by a distance d2 of the order of 100 to 250 ⁇ m.
  • a cutout or a reference mark 12 is formed on the support matrix 10 so as to be able to identify its orientation, in particular during an analysis which will be carried out later.
  • This arrangement makes it possible to differentiate the through holes 11 from each other when the support matrix 10 has elements of symmetry.
  • a support matrix 10 is therefore provided, formed in a support material of constant thickness el between a lower surface and an upper surface in which have been formed one or more holes 11 passing through it in its thickness.
  • a sheet 6 of constant thickness, denoted e2, of a second porous solid material called “analysis material” is provided, having an upper surface and a lower surface.
  • the analysis material is intended to receive on one of its lower and upper surfaces a liquid sample to be analyzed or filtered, which must then be able to flow towards the other of these surfaces, either spontaneously by simple diffusion, or due to forced circulation of the liquid.
  • the analysis material can therefore be a porous material such as paper, in particular filter paper, that is to say paper with a high alpha-cellulose content (in particular more than 90%, 95%, or even 98% of alpha-cellulose).
  • the analysis material can still be nitrocellulose.
  • Nitrocellulose has a good affinity for small proteins, peptides or nucleic acids. It is therefore particularly well suited for biological analyses. These examples should not, however, be considered as limiting.
  • the material for analysis can be chosen in particular according to its resistance to humidity, its filtration rate, its breaking strength, its rate of capillary rise or its resistance to the passage of air.
  • the analysis material is preferably hydrophilic, so that the liquid to be analyzed wets the surface of the analysis material.
  • the support material can be hydrophobic.
  • a material is hydrophobic if the water does not wet the material, i.e. if the angle between a drop of water and the surface of the material on which the drop is deposited is strictly greater than 90°. Otherwise, the analytical material is hydrophilic.
  • the assay material can be hydrophobic and the support material hydrophilic.
  • the analysis material can be an isotropic or anisotropic filter membrane.
  • it may be an organic filter membrane, that is to say a membrane comprising an organic polymer such as cellulose acetate, a polysulfone or a polyamide.
  • the thickness e2 of the analysis material can be close to the thickness el of the support material.
  • the thickness e2 can be greater than, equal to or less than the thickness el.
  • the thickness e2 of the analysis material may thus be of the order of a few hundreds, or even a few tens of micrometers, for example 50 ⁇ m to 150 ⁇ m.
  • a portion of the analysis material, called pellet 3 is inserted into at least one through hole 11 of the support matrix 10, so that the pellet 3 closes this hole 11.
  • a pad 3 is therefore complementary to a hole 11 in which it must be inserted over at least part of the thickness of the support material.
  • the surface delimiting the interior of a through hole 11 is a cylinder whose generatrix is parallel to the direction normal to the lower and upper surfaces of the part 21, a pellet 3 which can be inserted therein is a cylinder whose generatrix is parallel, after insertion, to the axis of the through hole 11 whose base has the same shape as the base of the through hole 11.
  • pad should therefore not be interpreted in a limiting manner in terms of shape. It was chosen in relation to the easiest embodiment to implement, that is to say the one for which the through hole 11 and the pad 3 are cylinders of revolution.
  • the pellet 3 inserting into the through hole 11 formed of two sub-parts 1 la, 11b and a channel 1 the will have the complementary shape adapted to fill the sub -parties l ia, 11b and 1 the, while the pellet 3 fitting into the cylindrical through-hole 11 will be cylindrical.
  • the height of the pad 3 can in all cases be equal to the height of the hole 11 (as seen in the sectional view along a plane containing the axis of the through hole 11 shown in Figure 4c) or different from this (see FIG. 9 which shows an analysis chip 1 according to the invention, the support material of which is brass coated with Le Parfait® food paraffin (reference 365 EMB 44 026, packaging 250g) and the material for nitrocellulose analysis (Reference: Amersham Protran® Premium pores 0.45pm NitroCellulose, GE Healthcare Life Science Nitrocellulose Bloting Membrane Nucleic acid and Protein application Catalog No 10600008).
  • the interlocking carried out in the insertion step is obtained solely by translation of the patch 3 along the axis of the through hole 11.
  • the backing die 10 may remain in place under the punch 42 after hole 11 has been drilled.
  • a sheet 6 of analysis material is then placed above the pierced support matrix 10, as shown in FIG. 3b and the punch 42 is again moved along the axis of the hole at a distance least slightly lower than that which made it possible to drill hole 11.
  • the punch 42 cuts out the pellet 3 to be inserted and drives it along its path inside the through hole 11, but without it coming out completely from the through hole 11 on the side of the lower surface. of the support die 10 and so that it is positioned above at least part of the overhang 10a.
  • the pellet 3 is therefore well fitted, at least over part of its height, in the through-hole 11.
  • the choice of the stroke of the punch makes it possible to position the disc 3 at a chosen height in the through hole 11 concerned, for example so that the lower base of the disc 3 is in the same plane as the surface. bottom of the support matrix 10 or at least the lowest points of the overhang 10a, as shown in Figure 3c.
  • pellets 3 cut out in advance for example by means of a cookie cutter or any other precision cutting tool and to insert them into the through hole 11 which corresponds to them by a vertical translational movement.
  • This tool may in particular be made of steel so that its rigidity and its resistance over time are guaranteed. The dimensions of this tool will be adapted to the types of analysis chips 1 to be produced.
  • 25 through-holes 11 of 500 micrometers in diameter are formed spaced 200 micrometers apart, contained in a 6mm x 6mm square placed in the center of a base piece 21 in the shape of a square of support material (20 x 20mm ).
  • the punch tool will therefore have 25 punches with a diameter of 500 micrometers.
  • the punches used for all the through-holes 11 or for part of these through-holes 11 may have different diameters.
  • the diameter (or a characteristic dimension in the case where the section of the through hole 11 is not circular) of the punch may thus be less than 1000 micrometers, less than 900 micrometers, less than 800 micrometers, less than 700 micrometers, less than 600 micrometers, less than 500 micrometers, less than 400 micrometers, less than 300 micrometers, less than 200 micrometers, less than 150 micrometers, less than 100 micrometers .
  • the “punches as well as two counter-pieces” assembly can be fixed under a press, between the jaws 5a and 5b of this press.
  • the support strip 2 unrolls automatically in the lower part of the first counterpart and adjusted in the middle of this “punches; first counterpart; second against part” in order to make wells (through holes 11) automatically by simple movement from top to bottom in the intended place.
  • the strip of analysis material is introduced above the second counterpart, once the punch has returned to the "high” position.
  • a second stamping (this time of the analysis material, forming the filter membrane) is then carried out, allowing the cutting of pellets 3 of this analysis material, for example a filter membrane.
  • the downward stroke of the punches of the punch can then, for example, be adjusted for this second stamping in such a way that in the low position, the punch stops at the start of the support strip 2 already pierced. In this way the punches will push the pellets 3 of analysis material, for example nitrocellulose, freshly cut and insert them into the through-holes 11 so as to fill, at least partially, these through-holes 11 of the matrix (or membrane ) support.
  • analysis material for example nitrocellulose
  • the strip can advance under a second press which has the function of crimping the pellets of analysis material, for example of nitrocellulose, in the support strip 2, or at least in the support matrix 10, by a shock (pressure) which can be exerted on the entire surface of the membrane in order to properly block the pellets in the support strip, as described below.
  • a shock pressure
  • the strength of this pressure or (shock) can be determined by testing.
  • the insertion is done if possible only by translation of the pellet 3 along the axis of the through hole 11 concerned, so as to keep the properties of the material unchanged. analysis during this step.
  • the method according to the invention has the advantage of not implementing any step which could introduce an anisotropy of the properties of this material and thus degrade the precision and sensitivity of the analysis, as discussed above for a step of rolling.
  • the support matrix 10 comprises at least two pads 3 inserted in at least two different through holes 11, these pads 3 are not connected by a portion of analytical material. Consequently, if the analysis material is chosen to be sufficiently different from that of the support material, it is unlikely that the molecules which are adsorbed on a given patch 3 risk migrating towards a neighboring patch 3.
  • the liquid to be analyzed wets the patch 3, by choosing a support material of hydrophobicity different from that of the analysis material, it is possible to limit, or even avoid, the lateral diffusion of the liquid to be analyzed. from a pad 3 to the support material - and possibly to another pad 3.
  • the sample to be analyzed is an aqueous solution
  • a hydrophilic analysis material and a hydrophobic support material can be chosen.
  • hydrophilic support material and pellets 3 of hydrophobic analysis material in the case where the sample to be analyzed is an organic phase immiscible with water.
  • This step of injection only by a translational movement along the axis of the hole 11 makes it possible, while respecting the physico-chemical properties of the support and analysis materials, to obtain at the end of the complete process an analysis chip of a biological sample 1 allowing qualitative analyzes of high sensitivity.
  • the support die 10 has at least two through-holes 11 and a first pad 3 is inserted into one of the through-holes 11 before another pad 3 is inserted into another through-hole 11.
  • This embodiment makes it possible to insert into two different through-holes 11 two pads 3 formed in different analysis materials.
  • a patch 3 la on which a first antigen has been adsorbed can be inserted into a first through-hole 11 of a support matrix 10 and another patch 31b on which a second antigen has been adsorbed can be inserted into a second through-hole 11 of the support matrix 10.
  • a cut-out or reference mark 12 optionally formed on the support matrix 10 can make it possible to identify the positions of the various test sites.
  • This quantification limit is easier to control in the case of a sheet than in the case of a single pellet 3 in which the edge effects will play an important role.
  • the probe molecules may in particular be those described in patent EP3591024B1 (inventors Wong Ka-Leung, Goetz Joan et al.) filed on 07/05/2018, namely ultra-bright luminescent lanthanide nanoparticles comprising terbium. Quantification limits of the order of a few atoms per microliter of liquid to be tested are thus achieved.
  • the analysis material is not functionalized and is kept in its native structure at the level of the pellets 3.
  • a so-called “filtering” pellet 32 is formed, the only function of which is a function of filtration.
  • one or more pads 3 can be calibration pads 33 of the analysis chip of a biological sample 1.
  • a pellet 3 is cooled just before injection to a temperature slightly lower than that of the support matrix 10 into which it is to be inserted. In this way, insertion is facilitated but simultaneously with insertion, the patch 3 heats up and therefore expands, preferably enough to ensure that it is held in place at the end of the injection step.
  • a pellet 3 is fitted into a through-hole 11, so that it is above at least a fraction of the overhang 10a, as represented in FIG. 3d.
  • the biological sample analysis chip 1 If the biological sample analysis chip 1 is at rest, the pad(s) 3 remain in place in the through-hole(s) 11. The biological sample analysis chip 1 could therefore possibly be used as it is .
  • pellets 3 remain in place, for example due to the flow of a sample liquid, forced or under the effect of gravity.
  • a fourth step, called assembly, is therefore implemented in such a way as to secure the assembly of the pad(s) 3 with the support die 10.
  • a pressing force of direction Tax of the through hole 11 is exerted on the analysis chip by means of two jaws 5a, 5b of a clamping system placed below and above the bases of the pad 3 and at least a fraction of the support matrix 10 which adjoins it.
  • fraction of the support matrix 10 which adjoins a pad 3 is meant the fraction of support matrix which is in the immediate vicinity of this pad 3 and delimits the through-hole 11 in which it is inserted.
  • the fraction of the support matrix 10 which adjoins a pad 3 can include all or part of an overhang 10a.
  • the fraction of support matrix 10 which adjoins a cylindrical pellet 3 with axis the axis of a through hole 11 and with section S can be at least that which is located in the cylindrical volume with axis Tax of the through hole 11 and of section S', S' being obtained by a dilation with a ratio greater than 1 and centered on the intersection of Tax of the through hole and of the section S.
  • a pellet 3 is cylindrical by diameter equal to 100 micrometers, it will be possible to exert a pressing force on the support matrix portion located in the cylinder with the same axis as the pellet 3 once inserted and with a diameter at least equal to 101 micrometers, at least equal to 102 micrometers, at the at least equal to 103 micrometers, at least equal to 104 micrometers, at least equal to 104 micrometers, at least equal to 110 micrometers, at least equal to 120 micrometers, at least equal to 130 micrometers, at least equal to 140 micrometers, 150 micrometers.
  • the pressing force is exerted by means of the clamping system on the whole of the upper surface and/or of the lower surface of the support die 10.
  • the pressing force can then be exerted by means of the clamping system, the jaws 5a, 5b of which, when they come together, grip at least a portion of the support die 10 which adjoins a patch 3 so that the support die portion 10 crimps the upper surface and/or the lower surface of the patch 3.
  • the pressing force may not include a component in a direction normal to the axis of a through hole 11.
  • the direction of the pressing force is then collinear with the axis of the through hole 11 , so that no non-native anisotropic is introduced into the support and analysis materials in a direction that is not collinear with the axis of the through-hole 11.
  • the pressing force can then be exerted by means of the clamping system, the jaws 5a, 5b of which, when they approach, grip at least a portion of the lower surface and/or the upper surface of a pellet 3 which would protrude of the support matrix 10, so that the upper surface and/or the lower surface of the pellet 3 folds over the matrix 10 and crimps it.
  • the mechanical assembly step can therefore result in crimping of at least one pad 3 on at least one of its lower and upper surfaces by the die 10.
  • this document considers the wording of the preceding sentence covers the two possible scenarios: crimping of die 10 by pad 3 or crimping of pad 3 by die 10, the technical effect being the same in both cases, namely an assembly of at least one pad 3 to the matrix 10 resisting a stress exerted along the axis of the through hole 11.
  • the pad 3 is crimped over the entire circumference of its lower base by the support matrix.
  • the patch 3 is crimped over the entire circumference of its upper base by the support die.
  • Disc 3 can be crimped simultaneously over the entire circumference of its lower base and over the entire circumference of its upper base.
  • the pad 3 is assembled more solidly to the support matrix 10 after this assembly step than before and is more resistant to tearing due to a force exerted from the upper face towards the lower face of this pad.
  • the fact of exerting only a mechanical action, the latter being moreover exerted in the direction of the axis of a through-hole 11 and possibly distributed uniformly on the bases of a patch 3 makes it possible to maintain the uniformity and the isotropy of the physico-chemical properties of the material for analysis in the planes normal to the axis of the through-hole 11 concerned.
  • the pressure exerted during this assembly step can be chosen according to the mechanical resistance of the assembly necessary for the analyses.
  • the upstream and downstream faces are understood here relative to the direction and direction of fluid flow.
  • an analysis tablet 3 “remains in place” if, at the end of the analysis, this analysis tablet still completely closes the through-hole 11 in which it was inserted.
  • a shift of the patch 3 in the direction of the axis of the through hole due to the pressure difference between its upstream and downstream faces can occur without calling into question the quality of the analysis carried out by means of the analysis chip of a biological sample 1.
  • the upper face of a pellet 3 can, in a particular embodiment, simply be subjected to atmospheric pressure and the lower face placed under depression.
  • an analysis device comprising a chip for analyzing a biological sample 1 can be implemented with forced circulation of fluid, which makes it possible to control the contact time of the sample to be tested with a pellet 3 and therefore the reproducibility of the analysis.
  • This arrangement also makes it possible to reduce the duration of the analyses.
  • the forced circulation of the sample to be tested avoids, or at least accelerates, the washing steps generally necessary to eliminate the fraction of the test sample which has not reacted as well as the molecules which have adsorbed in such a way non-specific on the membrane.
  • a conventional ELISA test requires a much longer time, usually 12 to 24 hours.
  • the mechanical assembly is carried out in the solid phase, and at a temperature below the melting temperatures of the support and analysis materials. This assembly therefore does not implement a process of the welding type, for example, which could denature the materials or modify their physical structure.
  • the assembly method according to the invention there is no possibility of migration of the support material or of a solvent towards the analysis material and vice versa, so that the analysis material retains from the properties its native properties, that is to say its properties before assembly with the support material.
  • the interface between the support material and the analysis material is clean, as can be seen in Figure 8a on which is presented a photograph of a section of an analysis chip of a biological sample 1 in a plane containing the axis of a cylindrical through-hole 11 and a diameter of its section.
  • the support material is the black paper distributed by the company Mondi®, with a weight of 80 g/m 2 , available on the priority date of the present patent application.
  • the assay material is nitrocellulose (Reference: Amersham Protran® Premium pores 0.45pm NitroCellulose, GE Healthcare Life Science Nitrocellulose Blotting Membrane Nucleic acid and Protein application Catalog No 10600008).
  • the diameter of the through holes is 500 micrometers.
  • the photographs in Figures 8a, 8c and 8d were obtained with a binocular magnifying glass (Zeiss, model STEMI SV8, magnification x64). It is further noted that in FIGS. 8d and 9 that at the magnification of the binocular loupe, the analysis material and the support material do not diffuse towards each other. Finally, it is observed in FIGS. 8a, 8d and 9 that the process for preparing the analysis chip makes it possible to obtain wells whose edges are clean and this with dimensions of the order of ten or hundred of micrometers.
  • Figures 8b and 8c show a photograph of an analysis chip obtained with a printing process using a solid ink printer whose wells have a diameter of 500 micrometers. It is observed in this photograph that the ink used to form the wells diffuses towards the analysis material, so that the section of a well is not really circular, which affects the precision of the analysis as well as to its reproducibility, the contours of two different wells never being strictly the same.
  • the white spots present (other than the pellets 3) in the support material of FIG. 8c correspond to areas in which the ink forming the pellets has diffused.
  • the material The medium has therefore lost its native properties due to the printing and the quantity of ink forming a given pellet is therefore not known.
  • the reproducibility and precision of an analysis on a pellet is therefore difficult to control with this method of the prior art.
  • figure 8d whose magnification is substantially equal to that of figure 8c, that the grain of the support material is observed but no diffusion of the analysis material towards the support material. The same is true in the case of Figure 9.
  • the method according to the invention therefore makes it possible to obtain finer control of the analysis pellets 3 than the methods of the prior art.
  • the bio-functionalization of an analysis chip of a biological sample 1 consists in particular in attaching a capture molecule (for example an antibody to detect an antigen) targeting the complex biomolecule to be detected and quantified in the biological liquid to be analyzed.
  • a capture molecule for example an antibody to detect an antigen
  • a roll of analysis chips 1, in which the pellets 3 are already in place can be placed on a "spotting" machine.
  • the roll is unrolled to scroll the strips of analysis chips 1 on a filter plate connected to a vacuum pump.
  • the injection head of the spotting machine deposits, for example, in 2 or 3 injections, a volume of the order of 10 pL of a solution containing the captured molecule, for example, at a concentration of 10 to 30 pg/mL.
  • the suction vacuum can be chosen to allow a slow filtration over a time of approximately 20 seconds of the 10 pL of solution. All of the pellets 3 of each analysis chip of a biological sample I can thus be processed in the same way.
  • a second application can then be carried out under the same conditions but with a solution of BSA (Bovine Serum Albumin), for example at a concentration of around 100 pg/mL.
  • BSA Bovine Serum Albumin
  • This solution makes it possible to saturate the polar sites of the analysis chip of a filtering biological sample 1 to avoid non-specific bonds between the biomolecule which will be detected and the analysis surface, for example of nitrocellulose, of the chip of analysis of a biological sample 1.
  • the analysis chips 1 can be separated from each other with a cutting tool so as to obtain analysis chips all isolated of the same dimensions.
  • An analysis chip of a biological sample 1 obtained by the method according to the invention can be stored for several months at room temperature, preferably in a dry atmosphere (for example under airtight and watertight protection) .
  • analysis chips 1 can be stored at 20°C +/- 5°C for at least 1 month, at least 2 months, at least 3 months, at least 4 months, at least 5 months, at least 6 months, at least 7 months, at least 8 months, at least 9 months, at least 10 months, at least 11 months, at least 12 months without altering their analytical properties.
  • a reference test on a reference biological sample will statistically give the same concentration of the analyte sought (same mean and same standard deviation) on a batch of analysis chips of a biological sample 1 just after manufacture and after storage at 20°C +/- 5°C under airtight and watertight protection (e.g. blister pack) for at least 1 month, at least 2 months, at least 3 months, at least 4 months, at at least 5 months, at least 6 months, at least 7 months, at least 8 months, at least 9 months, at least 10 months, at least 11 months, at least 12 months.
  • airtight and watertight protection e.g. blister pack
  • injection and assembly make it possible to control the properties of the support material independently of the properties of the analysis material and vice versa, unlike the methods of the prior art.
  • the support material is formed from a metal plate
  • this metal plate can be rendered hydrophobic beforehand.
  • a surface treatment such as a coating with a natural or synthetic wax, can be implemented.
  • such a treatment limits the analytical qualities of the chip, since the wax can migrate in an uncontrolled manner from the support material to the analysis material, for example on occasion a step of heating or chemical treatment or rolling.
  • the wax (or any other chemical compound used for the surface treatment) can then interfere with the analysis.
  • fluorescence quenching phenomena are observed, which reduce the sensitivity of the analysis when fluorescent probe molecules are used.
  • the assembly step does not lead to such uncontrolled diffusion or migration of the wax. Certain embodiments even make it possible to avoid a diffusion or an uncontrolled migration of chemical species from the analysis pellets 3 or towards these pellets 3.
  • the method according to the invention therefore makes it possible to obtain an analysis chip of a biological sample 1 whose test zones (in other words the analysis pellets 3) are formed with better precision than with the methods of the prior art.
  • one of the materials among the support and analysis materials can be hydrophilic, it will be possible in a particular embodiment to work under controlled hygrometry conditions for one or more stages of the process, so as to keep a precise control over the geometry and the volume of the support matrix 10 and/or the pellets 3 of an analysis chip for a biological sample 1.
  • An analysis chip for a biological sample 1 obtained by the method according to the invention can be implemented in isolation.
  • a sample to be analyzed can be deposited on one or more of the pads 3 of the chip.
  • several samples to be analyzed can each be deposited on one or more pellets 3 different from those used for the other samples, simultaneously or successively.
  • the chip for analyzing a biological sample 1 can, to do this, be placed horizontally, so that a given liquid sample to be analyzed flows from the upper face of the patch 3 on which it has been deposited towards the underside of this same pad 3, either under the effect of gravity or under the effect of a pressure gradient, a relative vacuum being applied on the side of the underside of the pad 3.
  • the analysis device 7 consists of a stack of solid support plates 72, for example made of polymethyl methacrylate (PMMA) or another plastic material, in which are formed microchannels 71 and between which are interposed analysis chips 1.
  • PMMA polymethyl methacrylate
  • the microchannels are aligned with each other and the analysis sites (that is to say the pads 3) of the analysis chips 1 are inserted between two microchannels of two consecutive support plates 72. It is also possible to superimpose several analysis chips 1 between two consecutive support plates 72. In this case, if different samples to be analyzed are tested in the different channels, it is possible to perform a 3D multiplexed analysis.
  • an analysis device 7 comprising four pillars on which the analysis chip of a biological sample 1 is fixed by its four corners. These two examples are non-limiting.
  • the detection of an analyte of interest can be done by an immunological analysis of the ELISA type: once the complex of capture molecule / biomolecule of interest has formed on the analysis sites (or equivalent wells) of the analysis chip of a biological sample 1, a revealing antibody is added which specifically binds to the capture molecule/biomolecule complex. The fluorescence or the color which appears in each well is measured using a device such as a photomultiplier or a CMOS type camera, coupled with a computer program which carries out the calculations.
  • the invention therefore also relates to an analysis device 7 comprising at least one analysis chip for a biological sample 1.
  • the analysis device 7 can contain several analysis chips 1, in particular superimposed, as described below. above.
  • the invention further relates to a diagnostic kit comprising at least one chip for analyzing a biological sample 1.
  • the diagnostic kit can also comprise a support for the chip for analyzing a biological sample 1 and/or at least one analysis reagent.
  • the analysis reagent may in particular contain one or more antibodies or one or more antigens with a view to implementing an immunological test.
  • the analysis reagent can also be a developer.
  • immunological test is understood to mean a test implementing at least one antigen to detect antibodies directed against a pathogenic agent in a sample or at least one antibody to detect an antigen of a pathogen in a sample.
  • the analysis reagent can also be a buffer, for example a saline phosphate buffer (PBS) or another solution, for example a solution of bovine serum albumin (BSA).
  • PBS saline phosphate buffer
  • BSA bovine serum albumin
  • the invention relates to the use of a chip for analyzing a biological sample 1 for diagnostic purposes or for carrying out an immunological test.
  • serological research tests at the quantification of antibodies of the immunoglobulin G or M type can be implemented after functionalizations of the analysis chip of a biological sample 1 by means of the appropriate antigen .
  • the biological sample analysis chip 1 can also be functionalized to search for and quantify heat shock proteins such as the proteins of the HSP60 family by means of a specific antibody, for example fluorescent.
  • apolipoprotein ApoAl or even mediators of inflammation such as C-reactive protein (CRP) or the pancreatic stabilizing protein PSP (“pancreatic stone protein”) can be sought by the implementation of an enzymoimmunological method on the analysis chip of a biological sample 1.
  • CRP C-reactive protein
  • PSP pancreatic stabilizing protein
  • the invention finally relates to a device for manufacturing a chip for analyzing a biological sample 1 according to any one of the embodiments comprising:
  • an insertion system suitable for inserting at least one pellet 3 into at least one through hole 11 of the matrix 10 by translation of the pellet 3 in the direction normal to the upper and lower surfaces of die 10
  • a mechanical assembly system at a temperature below the melting temperatures of the support and analysis materials, adapted to exert a pressing force in the direction normal to the lower and upper surfaces of the matrix 10 on at least a portion of the matrix 10 which adjoins the at least one pellet 3 inserted into the matrix 10 and/or on at least one of said lower and upper surfaces of the at least one pellet 3 inserted into the matrix 10.
  • the device for manufacturing an analysis chip for a biological sample 1 can in particular comprise one or more punches, each comprising one or more punches which may or may not be identical and whose stroke is adjustable, and one or more counter-pieces .
  • the device for manufacturing an analysis chip of a biological sample 1 can be fully automated.

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  • Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)

Abstract

Un procédé de fabrication d'une puce d'analyse d'un échantillon biologique (1) comprend la fourniture d'une matrice (10) formée dans un matériau support solide dans lequel a été formé au moins un trou (11) traversant et d'au moins une pastille (3), découpée dans une feuille (6) de matériau d'analyse solide et poreux; l'insertion d'au moins une pastille (3) dans l'au moins un trou traversant (11) de la matrice (10) par translation de la pastille (3) suivant la direction normale aux surfaces inférieure et supérieure de la matrice (10); l'assemblage mécanique à une température inférieure aux températures de fusion des matériaux support et d'analyse au moyen d'une force pressante normale à la surface supérieure de la matrice.

Description

Procédé de fabrication d’une puce d’analyse et puce d’analyse
DOMAINE DE L’INVENTION
La présente invention se rapporte au domaine des analyses biologiques, notamment des analyses biochimiques.
Plus précisément, l’invention se rapporte à un procédé de fabrication de puces filtrantes, pouvant éventuellement être fonctionnalisées pour réaliser des analyses biologiques.
ARRIÈRE-PLAN TECHNOLOGIQUE
Dans le domaine des analyses biologiques, il est connu d’utiliser des puces à protéines (« protein microarrays ») pour étudier l’activité biochimique des protéines. Dans de telles puces, une bibliothèque d’anticorps ou de fragments protéiques (« sondes ») - voire de protéines entières - est disposée sur une matrice telle qu’une lame en verre. Dans ce cas, un seul et même échantillon est testé sur l’ensemble des sondes déposées sur la matrice.
Des dispositifs d’analyses biologiques permettant l’analyse en parallèle de plusieurs échantillons ont aussi été développés.
Le document WO2014/053237 est un exemple dans lequel un dispositif miniaturisé permet une analyse de plusieurs échantillons biologiques simultanément (analyse « en multiplex »). Chaque échantillon peut de plus être exposé à plusieurs sondes différentes successivement. Autrement dit, le dispositif permet une analyse de type « analyse 3D ».
Le dispositif décrit par ce document comprend une pluralité de canaux, dans chacun desquels peut être injecté un échantillon en phase liquide indépendamment des autres canaux.
Chaque canal peut être formé de plusieurs portions tubulaires. Entre deux portions successives est insérée une zone d’analyse approximativement cylindrique formée dans une matrice appropriée.
Les zones d’analyse peuvent notamment être formées dans une matrice plane en nitrocellulose dont toute la surface sauf les zones d’analyse est rendue hydrophobe par une imprégnation de cire.
Les zones d’analyse peuvent être simplement constituées de nitrocellulose non traitée, de sorte qu’elles constituent des zones de fdtration, ou bien de nitrocellulose fonctionnalisée par exemple au moyen d’une molécule sonde.
L’opération d’imprégnation avec de la cire permet de délimiter les zones d’analyse, mais aussi de limiter la diffusion latérale à l’intérieur de la matrice (c’est-à-dire hors d’une zone d’analyse donnée vers les autres zones d’analyse voisines) des molécules d’intérêt (molécules sondes ou molécules d’un échantillon).
Pour cette opération d’imprégnation, un procédé d’impression à encre solide est mis en œuvre, de façon à déposer sur la matrice une couche de cire dans les zones qui doivent être rendues hydrophobes. A l’issue de l’impression, la matrice est chauffée à une température supérieure à la température de fusion de la cire utilisée, puis refroidie, de façon à ce que la cire diffuse latéralement et en profondeur, dans l’épaisseur de la matrice, de manière à limiter sa diffusion ultérieure indésirable vers les zones d’analyse.
Cependant, un tel procédé ne permet pas de contrôler finement le volume d’une zone d’analyse donnée ni la forme de la surface qui délimite ce volume, comme le montrent les figures présentées dans ce document. En particulier, la circonférence de la surface supérieure d’un site de test varie d’un site à l’autre et n’est en général pas circulaire, de sorte que, dans la direction de l’écoulement, la section de la zone d’analyse n’est pas précisément identique à la section intérieure du canal dans laquelle la zone d’analyse doit être insérée.
En conséquence, la précision d’un tel dispositif est limitée du fait du procédé de fabrication utilisé pour former les zones d’analyse, et de manière concomitante, la limite de quantification reste trop élevée pour certaines analyses biologiques dans lesquelles les concentrations mises en jeu (ou leurs variations) sont particulièrement faibles.
Le document US2004/0115707 divulgue quant à lui une unité d’analyse biochimique comprenant une plaque de base présentant une pluralité de trous remplis d’un matériau poreux et adsorbant de manière à former une pluralité de zones d’analyse.
Le remplissage des trous peut être obtenu par laminage d’une feuille de matériau adsorbant sur la plaque de base préalablement percée.
Lors du laminage, la feuille de matériau d’analyse est sollicitée de manière anisotrope du fait de l’effort de traction exercé dans la direction du laminage. Les propriétés du matériau adsorbant après insertion dans les trous sont donc anisotropes. Il est même possible que l’épaisseur du matériau adsorbant varie au sein d’un même trou.
Par ailleurs, le laminage ne rompt pas la continuité de la feuille de matériau adsorbant. Le matériau adsorbant forme donc une surface continue entre deux canaux sous ou sur la plaque, comme cela peut-être observé sur la figure 2b du document US2004/0115707. Les molécules d’intérêt (de l’échantillon ou sondes) risquent donc de diffuser d’un canal 3 à l’autre du fait de cette continuité.
La précision et la sensibilité d’une analyse quantitative effectuée avec une telle plaque sont donc limitées.
Dans un autre mode de réalisation décrit par US2004/0115707, le matériau adsorbant peut être dissous dans un solvant. La solution obtenue est ensuite injectée dans les trous et le solvant évaporé. Cette technique d’injection en phase liquide ne permet pas non plus un contrôle précis de l’isotropie des propriétés de la zone de test, notamment parce que le flux d’air permettant l’évaporation du solvant est nécessairement directionnel.
Par ailleurs, il peut rester des traces de solvant dans le matériau adsorbant, qui risquent d’interagir avec les molécules sondes ou à analyser. En outre, l’utilisation de solvants, notamment des solvants organiques dans le cas de la nitrocellulose, rend le procédé polluant.
Enfin, la liaison entre le matériau adsorbant, une fois solidifié, et la plaque de base n’est pas assurée de manière certaine. La qualité de cette liaison dépend notamment des compositions chimiques du matériau adsorbant et de la plaque de base. La liaison entre une zone d’analyse donnée et la plaque peut donc s’avérer fragile. En cas de circulation forcée de liquide, au moyen d’un vide relatif, ces zones d’analyse risqueraient de se détacher et d’être entraînée par le liquide circulant. Il n’est donc pas possible de pratiquer une analyse avec circulation forcée de liquide à travers les zones d’analyse obtenues par ce mode de réalisation.
D’autres procédés, mettant en œuvre différents produits chimiques ou une étape de chauffage ou une étape d’irradiation par exemple sont aussi décrits dans le document W001/19502A2, après une première étape de laminage.
Outre les inconvénients du laminage précédemment exposés, tous ces modes de réalisation présentent l’inconvénient d’entraîner des modifications physico-chimiques de la membrane filtrante qui altèrent ses propriétés essentielles pour l’analyse et donc la sensibilité et la précision de l’analyse.
Dans la mesure où la composition chimique et la structure physique de la membrane sur laquelle est mise en œuvre l’analyse influent sur les performances de la méthode d’analyse, et notamment sur la limite de quantification de cette méthode, l’invention vise donc à proposer un procédé de fabrication d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique permettant de contrôler finement cette composition chimique et cette structure physique.
En particulier, l’invention vise à proposer un procédé de fabrication d’une puce d’analyses à faible coût, ne nécessitant pas d’étape de traitement thermique, chimique ou d’irradiation pour la formation des sites de test dans la matrice (mis-à-part lors d’une éventuelle fonctionnalisation biochimique de ces sites postérieure ou antérieure à la formation des sites) et permettant de réaliser une analyse quantitative de précision et de sensibilité élevées et/ou une analyse d’un échantillon biologique ou une simple filtration d’un échantillon biologique liquide.
RÉSUMÉ DE L’INVENTION
Ainsi, l’invention se rapporte à un procédé de fabrication d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique comprenant :
- on fournit une matrice formée dans un matériau support solide, présentant une surface inférieure et une surface supérieure et dans laquelle a été formé au moins un trou la traversant entre lesdites surfaces inférieure et supérieure;
- on fournit au moins une pastille, découpée dans une feuille de matériau d’analyse solide et poreux, la pastille présentant une surface inférieure et une surface supérieure,
- on procède à l’insertion d’au moins une pastille dans au moins un trou traversant de la matrice par translation de l’an moins une pastille suivant la direction normale aux surfaces inférieure et supérieure de la matrice ;
- on réalise un assemblage mécanique à une température inférieure aux températures de fusion des matériaux support et d’analyse, au cours de laquelle une force pressante de direction normale aux surfaces inférieure et supérieure de la matrice est exercée sur au moins une portion de la matrice qui jouxte l’au moins une pastille insérée dans la matrice et /ou sur au moins une des surfaces inférieure et supérieure de l’au moins une pastille insérée dans la matrice.
Grâce à ces dispositions, on obtient une puce d’analyse comprenant au moins une pastille de matériau d’analyse insérée dans un trou traversant un matériau support. L’assemblage entre la pastille et le matériau support n’est pas obtenu par un procédé chimique, ni par fusion d’un des matériaux de sorte que les propriétés physiques et chimiques des matériaux support et d’analyse avant l’assemblage ne sont pas ou tout au moins sont très peu altérées après l’assemblage, y compris à proximité de l’interface entre ces deux matériaux. L’assemblage est obtenu uniquement mécaniquement et par l’exercice d’une force pressante normale aux surfaces supérieure et inférieure de la matrice, de sorte que la déformation des matériaux est uniforme dans un plan normal à la direction de la force pressante. Le procédé permet donc, à la différence des procédés mettant en œuvre une étape de laminage, de ne pas introduire d’anisotropie dans le matériau support et ou le matériau d’analyse dans une direction normale à la direction de la force pressante. Une telle anisotropic conduirait par exemple dans le cas de tests immunologiques mettant en œuvre des réactifs fluorescent à une fluorescence inhomogène à la surface d’une pastille d’analyse, ce qui rendrait l’analyse quantitative du signal de fluorescence imprécise.
Grâce à l’ensemble de ces dispositions, la sensibilité et la reproductibilité d’une puce d’analyse obtenue par le procédé suivant l’invention sont donc améliorées par rapport à des puces obtenues suivant les procédés de l’art antérieur.
Par ailleurs, les moyens nécessaires pour mettre en œuvre sont uniquement mécaniques, donc peu polluants en ce qu’ils ne comprennent pas de solvant et ils sont simples à mettre en œuvre. Selon différents aspects, il est possible de prévoir l’une et/ou l’autre des caractéristiques ci- dessous prises seules ou en combinaison.
Selon un mode de réalisation, dans le procédé de fabrication d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique, la force pressante est exercée sur une portion de la matrice qui jouxte l’au moins une pastille insérée dans la matrice. Grâce à cette disposition, cette portion de la matrice peut être repliée au-dessus et/ou en-dessous de la pastille de sorte que la pastille peut être au moins partiellement sertie par la matrice. Ainsi, l’assemblage de la pastille à la matrice dans la puce d’analyse présentera une bonne résistance mécanique et ne sera pas affecté par l’écoulement d’un échantillon liquide à analyser dans la direction normale aux surfaces supérieure et inférieure de la matrice, voire par un vide relatif appliqué du côté de l’une de ces surfaces dans le but d’accélérer l’écoulement de l’échantillon liquide.
Selon un mode de réalisation du procédé de fabrication d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique, la force pressante est exercée sur au moins une des surfaces inférieure et supérieure de l’au moins une pastille insérée dans la matrice. Grâce à cette disposition, la pastille sertit au moins partiellement la matrice de sorte que l’assemblage de la pastille à la matrice présentera une certaine résistance mécanique et il ne sera pas affecté par l’écoulement d’un échantillon liquide à analyser dans la direction normale aux surfaces supérieure et inférieure de la matrice, voire par un vide relatif appliqué du côté de l’une de ces surfaces dans le but d’accélérer l’écoulement de l’échantillon liquide.
Selon un mode de réalisation particulier, dans le procédé de fabrication d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique, le matériau support est hydrophobe et le matériau d’analyse est hydrophile ou inversement. De cette manière, il est par exemple possible de déposer sur la pastille un échantillon à tester en phase aqueuse sans qu’il ne diffuse vers le matériau support si celui -ci est hydrophobe. Inversement si le matériau support est hydrophile, le matériau d’analyse est hydrophobe et il est alors possible de déposer sur la pastille un échantillon à tester en phase organique sans qu’il ne diffuse vers le matériau support.
Selon un mode de réalisation particulier, dans le procédé de fabrication d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique, pour l’insertion de l’au moins une pastille dans l’au moins un trou traversant, l’au moins une pastille est translatée dans l’au moins un trou traversant au moyen d’un emporte-pièce, l’au moins une pastille ayant été découpée dans la feuille de matériau d’analyse avant son insertion au moyen de ce même emporte-pièce et l’au moins un trou traversant ayant été formé au préalable dans la matrice au moyen de ce même emporte-pièce. Grâce à cette disposition, un seul outil est nécessaire pour préparer une puce d’analyse, à savoir un emporte-pièce présentant un ou plusieurs poinçons de tailles et de formes adaptées aux formes des puits souhaités. Un tel outil est simple à concevoir et à mettre en œuvre et permet éventuellement une automatisation du procédé, ce qui permet d’obtenir de manière reproductible, rapide et à faible coût des puces d’analyse de précision élevée et contrôlée. Selon un mode de réalisation particulier, dans le procédé de fabrication d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique, à l’issue de l’assemblage mécanique, on procède à la fonctionnalisation de l’au moins une pastille. On peut par exemple envisager une fonctionnalisation biochimique, au moyen d’un anticorps ou d’un antigène qui s’adsorbe sur la pastille.
De cette manière, la puce d’analyse d’un échantillon biologique obtenue par le procédé permet de mettre en œuvre un test d’analyse mettant en œuvre le réactif utilisé pour la fonctionnalisation, par exemple un test immunologique. La puce d’analyse peut donc être adaptée aux besoins d’analyse grâce à cette étape de fonctionnalisation. Les puces d’analyses peuvent par exemple être produites en série avant l’étape de fonctionnalisation et fonctionnalisées chacune à volonté au moment de l’analyse. Selon un mode de réalisation particulier, dans le procédé de fabrication d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique, on procède à la fonctionnalisation du matériau d’analyse avant l’insertion de l’au moins une pastille dans la matrice. Grâce à cette disposition, la fonctionnalisation peut se faire sur l’ensemble d’une feuille de matériau d’analyse avant le découpage de la pastille. Cela permet un gain de temps lorsque les puces d’analyse sont préparées en série. Le contrôle de la fonctionnalisation, et notamment d’une quantité de réactif d’analyse déposé sur chaque pastille, est aussi meilleur, ce qui permet au final une meilleure précision et une meilleure reproductibilité des tests effectués avec une série donnée de puces d’analyse.
Selon un mode de réalisation particulier, dans le procédé de fabrication d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique, on réitère l’insertion de l’au moins une pastille dans la matrice au moins une fois en utilisant pour chaque nouvelle insertion un matériau d’analyse fonctionnalisé différent de celui utilisé pour l’insertion précédente et un emporte-pièce correspondant à au moins un trou traversant de la matrice différent celui utilisé pour l’insertion précédente.
Grâce à cette disposition, il est possible de former plusieurs pastilles d’analyse fonctionnalisées différemment sur une même puce d’analyse. Il est alors possible de réaliser plusieurs tests différents simultanément sur la même puce, sur le même échantillon ou sur plusieurs échantillons différents. Le procédé reste simple à mettre en œuvre puisqu’il ne nécessite que des emporte-pièces différents ou équivalemment un seul emporte-pièce muni de plusieurs poinçons positionnés à des endroits différents et qui peuvent être activés séparément ou par groupes. Selon un mode de réalisation particulier, dans le procédé de fabrication d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique, l’assemblage mécanique d’au moins une pastille avec la matrice résulte en un sertissage d’au moins une pastille sur au moins une portion de ses surfaces inférieure et supérieure par la matrice.
Grâce à cette disposition, la pastille ne peut pas être poussée, dans les conditions normales d’utilisation, à l’extérieur de la matrice au moins d’un côté de cette matrice. L’assemblage de la matrice et de la pastille résiste donc à un vide relatif ou à la pression exercée sur un côté de la pastille par l’échantillon à tester lorsqu’il est déposé.
Selon un mode de réalisation particulier, dans le procédé de fabrication d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique, avant l’insertion de l’au moins une pastille dans la matrice, l’au moins une pastille est portée à une température inférieure à celle de la matrice. Grâce à cette disposition, le matériau d’analyse se rétracte avant son insertion, ce qui facilite son insertion dans le trou traversant en réduisant les forces de contact et il se dilate après insertion, de sorte qu’après insertion, le contact entre la pastille et la matrice est assuré et permet le maintien en place de la pastille dans la matrice. L’invention concerne aussi une puce d’analyse d’un échantillon biologique comprenant :
- une matrice formée dans un matériau support solide, présentant une surface inférieure et une surface supérieure et dans laquelle a été formé au moins un trou la traversant entre lesdites surfaces inférieure et supérieure;
- au moins une pastille, découpée dans une feuille de matériau d’analyse solide et poreux et insérée dans l’au moins un trou traversant, l’au moins une pastille présentant une surface inférieure et une surface supérieure, la puce d’analyse d’un échantillon biologique étant caractérisée en ce que l’au moins une pastille est sertie sur au moins une de ses surfaces supérieure et inférieure par la matrice.
Une telle puce d’analyse présente l’avantage de ne pas contenir de résidu de solvant ou de zone de fusion ou de brasure qui pourraient altérer la précision d’un test réalisé avec cette puce. Le sertissage permet à la fois de conserver les propriétés physico-chimiques natives du matériau support et du matériau d’analyse. Il permet aussi de réaliser un test avec écoulement d’un échantillon suivant l’axe du trou traversant d’un côté à l’autre de la pastille, puisque l’assemblage entre la pastille et la matrice présente une bonne résistance mécanique.
Selon un mode de réalisation de la puce d’analyse d’un échantillon biologique, le matériau support comprend au moins un composant choisi parmi un métal, un matériau plastique et la cellulose et en ce que le matériau d’analyse dont est formée l’au moins une pastille comprend au moins un composant choisi parmi la nitrocellulose, la cellulose, et un polymère organique.
De tels matériaux sont peu coûteux et présentent les qualités nécessaires d’inertie biochimique et d’adsorption pour mettre en œuvre des analyses telles que des tests biochimiques.
Selon un mode de réalisation de la puce d’analyse d’un échantillon biologique, l’assemblage de l’au moins une pastille et de la matrice résiste au moins à un vide relatif égal à 0, 100 bar.
Grâce à cette disposition, il est possible de mettre en œuvre une analyse sur un échantillon s’écoulant de manière forcée à travers la pastille sans que la pastille ne se sépare de la matrice du fait des surpressions qui s’exercent localement.
L’invention porte encore sur un dispositif d’analyse d’un échantillon biologique comprenant au moins deux puces d’analyse d’un échantillon biologique suivant l’un des modes de réalisation précédents superposées et dans lequel l’au moins une pastille d’une des au moins deux puces est configurée pour assurer une fonction de filtration et est superposée avec l’au moins une pastille fonctionnalisée d’uneautre puce des au moins deux puces.
Il est ainsi possible d’empiler plusieurs puces d’analyse pour obtenir un dispositif d’analyse en trois dimensions, l’analyse réalisée variant d’un site d’analyse à l’autre dans la direction de l’empilement et/ou au sein d’une puce d’analyse donnée et de réaliser une première étape de filtration avant l’analyse, notamment pour séparer le sérum des globules rouges en vue d’une analyse d’un prélèvement sanguin. Dans ce dernier cas, le dispostif permet d’éviter une étape de centrifugation. L’invention porte en outre sur un kit de diagnostic comprenant au moins une puce d’analyse d’un échantillon biologique suivant l’un des modes de réalisation précédents et au moins un réactif d’analyse. Un ou plusieurs réactifs d’analyse, notamment un tampon, un solvant, un antigène, un anticorps, peuvent ainsi être fournis afin de réaliser un test, tel qu’un test immunologique, standardisé.
L’invention concerne aussi l’utilisation d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique selon l’un des modes de réalisation précédents à des fins de diagnostic ou pour un test immunologique.
L’invention concerne enfin un dispositif de fabrication d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique suivant l’un des modes de réalisation précédents, le dispositif de fabrication comprenant :
- un système d’insertion adapté pour insérer l’au moins une pastille dans l’au moins un trou traversant de la matrice par translation de la pastille suivant la direction normale aux surfaces inférieure et supérieure de la matrice ;
- un système d’assemblage mécanique à une température inférieure aux températures de fusion des matériaux support et d’analyse, adapté pour exercer une force pressante de direction normale aux surfaces inférieure et supérieure de la matrice sur au moins une portion de la matrice qui jouxte l’au moins une pastille insérée dans la matrice et/ou sur au moins une des surfaces inférieure et supérieure de l’au moins une pastilles insérée dans la matrice.
Un tel dispositif de fabrication est simple à mettre en œuvre et n’introduit qu’une déformation du matériau support et/ou d’analyse tout au plus minime et isotrope dans tout plan parallèle aux surfaces inférieure et supérieure de la matrice. Il permet donc de former des puces d’analyse à faible coût et en préservant les propriétés physico-chimiques natives des matériaux support et d’analyse.
BRÈVE DESCRIPTION DES DESSINS
Des modes de réalisation de l’invention seront décrits ci-dessous par référence aux dessins, décrits brièvement ci-dessous :
La figure 1 représente un mode de réalisation d’une matrice support de puce d’analyse.
La figure 2 représente une bande support dans laquelle trois pièces de base permettant de former chacune une matrice support viennent d’être découpées.
La figure 3al représente une portion de matrice support au début du perçage d’un trou traversant, vue en coupe suivant un plan contenant l’axe de ce trou, suivant un mode de réalisation particulier.
La figure 3a2 représente une portion de matrice support dans laquelle un trou traversant est en cours de perçage, vue en coupe suivant un plan contenant l’axe de ce trou, suivant un mode de réalisation particulier. La figure 3b représente une portion de matrice support, après perçage d’un trou traversant et au début d’une étape d’insertion d’une pastille de matériau d’analyse, vue en coupe suivant un plan contenant l’axe de ce trou, suivant un mode de réalisation particulier.
La figure 3c représente une portion de matrice support en cours d’insertion d’une pastille de matériau d’analyse, vue en coupe suivant un plan contenant l’axe de ce trou, suivant un mode de réalisation particulier.
La figure 3d représente une portion de matrice support à l’issue d’une étape d’insertion d’une pastille de matériau d’analyse, vue en coupe suivant un plan contenant l’axe de ce trou, suivant un mode de réalisation particulier.
La figure 4a représente une vue en coupe de la même portion de matrice support que sur la figure 3d au début de l’étape d’assemblage dans un mode de réalisation particulier.
La figure 4b représente une vue en coupe de la même portion de matrice support que sur la figure 3d au cours de l’étape d’assemblage dans un mode de réalisation particulier.
La figure 4c représente une vue en coupe de la même portion de matrice support que sur la figure 3d à l’issue de l’étape d’assemblage dans un mode de réalisation particulier.
La figure 5 représente une vue de dessus d’un mode de réalisation d’une puce d’analyse.
La figure 6 représente un dispositif d’analyse multiplexé comprenant deux puces d’analyse.
Sur les dessins, des références identiques désignent des objets identiques ou similaires.
La figure 7 représente en vue de dessus un mode de réalisation d’une matrice support de puce d’analyse, dans laquelle les trous traversants ont des formes différentes.
La figure 8a présente une photographie obtenue avec une loupe binoculaire (Zeiss, modèle Stemi SV8) d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 découpée suivant un plan orthogonal aux faces supérieure et inférieure de la puce et contenant un diamètre de la section circulaire d’un trou traversant cylindrique.
La figure 8b reproduit une photographie d’une puce d’analyse obtenue avec un procédé de l’art antérieur mettant en œuvre une imprimante Xerox® Solid Ink, le diamètre des pastilles d’analyse étant de l’ordre de 500 micromètres.
La figure 8c présente une photographie de la puce d’analyse de la figure 8b obtenue avec une loupe binoculaire (Zeiss, modèle Stemi SV8, grossissement x64).
La figure 8d présente une photographie de la puce d’analyse de la figure 8a obtenue avec une loupe binoculaire (Zeiss, modèle Stemi SV8, grossissement x64) obtenue par le procédé suivant l’invention, dans laquelle le matériau d’analyse est de la nitrocellulose, le matériau support du papier noir enduit de cire, le diamètre des pastilles d’analyse étant égal à 500 micromètres.
La figure 9 présente une photographie d’une puce d’analyse obtenue avec une loupe binoculaire (Zeiss, modèle Stemi SV8, grossissement x64) obtenue par le procédé suivant l’invention, dans laquelle le matériau d’analyse est de la nitrocellulose, et le matériau support est du laiton, le diamètre des pastilles d’analyse étant égal à 500 micromètres. DESCRIPTION DÉTAILLÉE
L’invention concerne un procédé de fabrication d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 destinée à être mise en œuvre isolément ou dans un dispositif d’analyses 7. Le dispositif d’analyses 7 - ou la puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 à elle seule - permet par exemple de réaliser des analyses de liquides biologiques tels que le sang ou une fraction liquide du sang (plasma, sérum), l’urine, la salive, etc.
Le liquide analysé peut aussi être un milieu réactionnel comprenant des bio-molécules telles que des anticorps ou des protéines.
La notion d’analyse d’un échantillon biologique doit donc être comprise au sens large c’est-à- dire qu’il s’agit d’une analyse impliquant au moins une biomolécule parmi le ou les réactifs et/ou le ou les analytes.
Les puces d’analyse d’un échantillon biologique 1 peuvent ainsi être utilisées pour détecter et quantifier des biomolécules complexes dans des milieux biologiques : sang, plasma, sérum, organes ou extrait d’organes, milieu réactionnel dans lequel sont produits des biomolécules complexes (anticorps, protéines).
Notamment, l’anayse biologique peut être un test immunologique tel qu’un test ELISA(« Enzyme-Linked ImmunoSorbent Assay »).
Les puces d’analyse d’un échantillon biologique 1 peuvent encore être mises en œuvre dans le domaine de l’agro-alimentaire pour la recherche d’agents pathogènes, par exemple à l’occasion de contrôles sanitaires.
Le procédé de fabrication d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 suivant l’invention comprend :
- la fourniture d’une matrice support 10 formée dans un matériau solide, appelé « matériau support », présentant une surface inférieure et une surface supérieure et dans lequel a été formé au moins un trou 11 le traversant entre ses surfaces inférieure et supérieure;
- la fourniture d’au moins une pastille 3 découpée dans une feuille d’un second matériau solide poreux, appelé « matériau d’analyse », l’au moins une pastille 3 présentant une surface inférieure et une surface supérieure ;
- l’insertion de l’au moins une pastille 3 dans l’au moins un trou traversant 11 de la matrice support 10 par translation de l’au moins une pastille 3 suivant la direction normale aux surfaces inférieure et supérieure de la matrice 10 ;
- un assemblage mécanique à froid, à une température inférieure aux températures de fusion des matériaux support et d’analyse, au cours de laquelle une force pressante de direction normale aux surfaces inférieure et supérieure de la matrice 10 est exercée sur au moins une portion de la matrice 10 qui jouxte l’au moins une pastille 3 insérée dans la matrice 10 et /ou sur au moins une desdites surfaces inférieure et supérieure de l’au moins une pastilles 3 insérée dans la matrice 10. La puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 obtenue à l’issue du procédé comprend :
- une matrice 10 formée dans un matériau support solide, dans lequel a été formé au moins un trou 11 le traversant;
- au moins une pastille 3, découpée dans une feuille de matériau d’analyse solide et poreux et insérée dans l’au moinsun trou traversant 11, l’au moins une pastille 3 étant sertie sur au moins une de ses surfaces supérieure et inférieure par la matrice 10.
La puce d’analyse d’un échantillon biologique 1, que l’on peut observer dans un mode de réalisation particulier sur la figure 5, comporte donc une matrice support 10 formée dans un matériau solide d’épaisseur el dans lequel un ou plusieurs trous traversants 11 ont été formés. Un mode de réalisation particulier de la matrice support 10 est représenté sur la figure 1. Un autre mode de réalisation particulier de la matrice support 10 est représenté sur la figure 7. Comme représenté sur la figure 2, la matrice support 10 est formée par découpe d’une pièce de base 21, de forme adéquate pour le dispositif d’analyse dans lequel elle est destinée à être utilisée ou bien pour son utilisation de manière isolée. La pièce de base 21 est par exemple un parallélépipède rectangle ou carré découpée dans une bande support 2 d’un matériau solide, appelé dans la suite « matériau support », présentant une surface inférieure et une surface supérieure plane parallèles entre elles.
Une pièce de base 21 découpée dans la bande support 2 pour former une matrice support 10 peut être un parallélépipède et avoir une largeur L1 comprise entre 5 mm (5 millimètres) et 50 mm et une longueur L2 comprise entre 5 mm et 50 mm.
Dans un mode de réalisation particulier, la matrice support 10 est formée dans un matériau d’analyse d’épaisseur constante el entre la surface inférieure et la surface supérieure, ces surfaces étant dans ce cas planes et parallèles entre elles.
L’épaisseur el de la bande support 2 est alors constante et identique à celle de la pièce découpée 21. Elle est de préférence inférieure, par exemple d’au moins un facteur dix, aux autres dimensions (longueur L1 et largeur L2) de la pièce découpée 21.
La bande support 2 peut par exemple avoir une largeur L3 soit identique, soit légèrement supérieure à la largeur L1 de la matrice support 10, soit par exemple supérieure au double de la largeur LL
Dans ce dernier cas, il est possible de découper plusieurs pièces de base 21 dans la largeur de la bande support 2.
La largeur L3 de la bande support 2 est ainsi par exemple comprise entre 5 mm et 50 mm.
La longueur L4 de la bande support 2 peut être supérieure, voire très supérieure, à la longueur L2 de la pièce 21. La longueur L4 par exemple supérieure à 1 m voire à 10m.
De cette manière, il est possible de découper successivement plusieurs pièces de base 21 dans la bande support 2. La découpe d’une pièce de base 21 peut par exemple être réalisée au moyen d’un emporte-pièce dans lequel on insère la bande support 2.
Si la bande support 2 est assez longue, la découpe des pièces de base 21 peut être automatisée, la bande support 2 étant translatée d’une distance adéquate entre deux découpes successives d’une pièce de base 21.
L’épaisseur el de la bande support 2 (et d’une pièce de base 21 découpée dans cette bande support 2) peut être inférieure à 1 mm, inférieure à 0,15 mm, ou encore inférieure entre 0,1 mm. Par exemple, l’épaisseur el de la bande support peut être égale à 0,06 mm.
Dans un mode de réalisation particulier, la bande support 2 a une largeur de 20 mm et une longueur de 25 m par exemple. La largeur et la longueur peuvent être changées en fonction du type de puces d’analyse 1 à fabriquer. L’épaisseur de la bande support 2 peut être égale à 0,12 mm soit l’épaisseur actuelle des membranes filtrantes (en général en nitrocellulose) formées dans le matériau d’analyse, mais elle pourrait aussi être de l’ordre de 0,10 mm.
Dans un mode de réalisation particulier, une pièce de base 21 est une membrane filtrante carrée de 20mm de côté.
La bande support 2 peut notamment être en métal, par exemple en acier, en cuivre ou en laiton. La bande support 2 peut, dans un mode de réalisation alternatif, être en plastique. A titre d’exemple non limitatif, le matériau plastique peut être le polyéthylène, le polychlorure de vinyle, le polystyrène, le polyméthacrylate de méthyle, le polypropylène ou tout autre matériau plastique couramment utilisé dans le domaine des analyses biochimiques. Il peut avoir subi un traitement de surface ou être résistant aux UV.
Le matériau support peut encore contenir des fibres végétales, à titre d’exemple de la cellulose. Il peut notamment s’agir de papier.
Le matériau support est solide mais pas nécessairement rigide. La bande support 2 peut ainsi présenter une certaine souplesse, à condition que la bande support 2 ou une matrice support 10 formée à partir de cette bande support 2 puisse être manipulée et déplacée pour la préparation des puces d’analyse 1, notamment sans se déchirer, y compris dans le cas où la préparation de la matrice support 10 est automatisée. A titre d’exemple, le papier pour photocopieur Rex Copy A4 distribué par la société Mondi®, de grammage 80g/m2, disponible à la date de priorité de la présente demande de brevet, convient pour l’invention.
Dans le cas où la bande support 2 est souple, le matériau est suffisamment rigide pour que les surfaces supérieure et inférieure soient effectivement planes lorsque la surface inférieure est, au moins localement, simplement posée sur un support plan.
Dans un mode de réalisation, le matériau support est assez rigide pour permettre le découpage d’une ou plusieurs pièces de base 21 au moyen d’un emporte-pièce. Dans une pièce de base 21 de matériau support, on forme au moins un trou traversant 11 traversant le matériau dans son épaisseur, c’est-à-dire suivant la direction normale aux surfaces inférieure et supérieure de la pièce 21.
Dans un mode de réalisation particulier, un trou traversant 11 est formé au moyen d’un emporte-pièce 42, comme représenté sur les figures 3al (au début du perçage), 3a2 (en cours de perçage), et 3b (juste avant l’étape d’injection qui suit l’étape de perçage, décrite plus loin). Dans ce mode de réalisation, l’emporte-pièce 42 est translaté suivant la direction de l’axe du futur trou traversant 11, de manière à percer la matrice support 10. Un guide de coupe 4 dédié peut être placé sous la bande support 2. La course de l’emporte-pièce 42 à travers le guide de coupe 4 est réglée de manière à permettre l’éjection d’une pastille 10b issue de la bande support 2, comme on peut le visualiser sur les figures 3al et 3a2.
L’emporte-pièce peut alors être déplacé en sens inverse de manière à libérer la matrice support 10 comprenant alors un ou plusieurs trous traversants 11.
Dans un mode de réalisation particulier, les trous traversants 11 sont formés sur les emplacements correspondants aux futures pièces de base 21 dans la bande support 2 avant qu’une ou plusieurs pièces de base 21 ne soient découpées.
Dans un autre mode de réalisation, les trous traversants 11 sont formés dans une pièce de base 21 déjà découpée.
En variante, les trous traversants 11 sont formés en même temps que la pièce 21 est découpée, par exemple au moyen d’un emporte-pièce de forme adaptée.
La forme des trous traversants 11 peut être choisie en fonction des besoins de l’analyse. Par exemple, la surface délimitant l’intérieur d’un trou traversant 11 est un cylindre dont la génératrice est parallèle à la direction normale aux surfaces inférieure et supérieure de la pièce 21, direction que l’on appellera dans la suite « axe du trou 11 ».
Par exemple, les trous traversants 11 sont des cylindres de révolution.
Dans le mode de réalisation représenté sur la figure 7, l’un des trous traversants 11 peut s’analyser comme formé de deux sous-parties traversantes de section circulaire 1 la et 11b, reliés par un canal 1 le. Une fois les pastilles de matériau d’analyse insérées comme décrit dans la suite, il sera ainsi possible de déposer l’échantillon à analyser dans le puits correspondant au premier « sous-trou » et de laisser l’échantillon diffuser de la sous-partie 1 la vers la sous-partie 11b. Dans ce cas, il est possible d’utiliser la puce d’analyse pour effectuer un test de type par flux latéral(« lateral flow »).
Les dimensions caractéristiques d’un trou traversant 11 dans une direction de la surface supérieure ou inférieure de la pièce 21 dans laquelle le trou traversant 11 est formé peuvent être inférieures à 1 mm.
Par exemple, une matrice support 10 peut comprendre 9, 12, 24, 48 ou 96 trous (ou puits) 11 ayant la forme de cylindres de révolution de diamètre dl de l’ordre de 300 à 800 pm (micromètres), deux trous traversants 11 successifs étant espacés d’une distance d2 de l’ordre de 100 à 250 pm.
Optionnellement, une découpe ou une marque repère 12 est formée sur la matrice support 10 de manière à pouvoir repérer son orientation, notamment lors d’une analyse qui sera réalisée ultérieurement. Cette disposition permet de différencier les trous traversants 11 les uns des autres lorsque la matrice support 10 présente des éléments de symétrie.
A l’issue de l’étape de perçage d’un trou traversant 11, les faces inférieures et supérieures du matériau support ne sont plus strictement planes à proximité des bases inférieure et supérieure du trou traversant 11 mais il se forme un débord 10a de matériau support sur tout le pourtour d’un trou traversant 11 du côté de la face inférieure du matériau support, du fait de la résistance qu’oppose le matériau support à son découpage. Ce débord 10a, que l’on peut observer sur la figure 3a2, sera mis à profit lors de l’étape d’assemblage ultérieure.
Dans la première étape du procédé suivant l’invention, on fournit donc une matrice support 10 formée dans un matériau support d’épaisseur constante el entre une surface inférieure et une surface supérieure dans lequel ont été formés un ou plusieurs trous 11 le traversant dans son épaisseur.
Dans une deuxième étape, on fournit une feuille 6 d’épaisseur constante, notée e2, d’un second matériau solide poreux dit « matériau d’analyse », présentant une surface supérieure et une surface inférieure.
Le matériau d’analyse est destiné à recevoir sur l’une de ses surfaces inférieure et supérieure un échantillon liquide à analyser ou à filtrer, qui doit pouvoir ensuite s’écouler vers l’autre de ces surfaces, soit spontanément par simple diffusion, soit du fait d’une circulation forcée du liquide. Le matériau d’analyse peut donc être un matériau poreux tel que du papier, notamment du papier-filtre c’est -à-dire du papier à haute teneur en alpha-cellulose (notamment plus de 90%, 95%, voire 98% d’alpha-cellulose) .
Le matériau d’analyse peut encore être de la nitrocellulose.
La nitrocellulose présente une bonne affinité pour les petites protéines, les peptides ou les acides nucléiques. Elle est donc de ce fait particulièrement bien adaptée pour des analyses biologiques. Ces exemples ne doivent toutefois pas être considérés comme limitatifs.
Le matériau d’analyse peut être choisi notamment en fonction de sa résistance à l’humidité, sa vitesse de filtration, sa force de rupture, sa vitesse d’ascension capillaire ou encore sa résistance au passage de l’air.
Dans le cas où le liquide à analyser contient majoritairement de l’eau, le matériau d’analyse est de préférence hydrophile, de façon à ce que le liquide à analyser mouille la surface du matériau d’analyse. Dans ce cas, le matériau support peut être hydrophobe.
Dans toute la suite, on considérera qu’un matériau est hydrophobe si l’eau ne mouille pas le matériau, c’est-à-dire si l’angle entre une goutte d’eau et la surface du matériau sur laquelle la goute est déposée est strictement supérieur à 90°. Dans le cas contraire, le matériau d’analyse est hydrophile.
En variante, le matériau d’analyse peut être hydrophobe et le matériau support hydrophile.
Le matériau d’analyse peut être une membrane filtrante isotrope ou anisotrope. En particulier, il peut s’agir d’une membrane filtrante organique, c’est-à-dire une membrane comprenant un polymère organique tel que l’acétate de cellulose, une polysulfone ou une polyamide.
L’épaisseur e2 du matériau d’analyse peut être proche de l’épaisseur el du matériau support. L’épaisseur e2 peut être supérieure, égale ou inférieure à l’épaisseur el.
Dans le cas où le matériau support est de la nitrocellulose, l’épaisseur e2 du matériau d’analyse pourra ainsi être de l’ordre de quelques centaines, voire quelques dizaines de micromètres, par exemple 50 pm à 150 pm.
Dans une troisième étape, dite d’injection, on insère une portion du matériau d’analyse, dite pastille 3, dans au moins un trou traversant 11 de la matrice support 10, de manière à ce que la pastille 3 obture ce trou 11.
Une pastille 3 est donc complémentaire d’un trou 11 dans lequel elle doit être insérée sur au moins une partie de l’épaisseur du matériau support. En d’autres termes, si la surface délimitant l’intérieur d’un trou traversant 11 est un cylindre dont la génératrice est parallèle à la direction normale aux surfaces inférieure et supérieure de la pièce 21, une pastille 3 qui pourra y être insérée est un cylindre dont la génératrice est parallèle, après insertion, à l’axe du trou traversant 11 dont la base à la même forme que la base du trou traversant 11.
Le terme « pastille » ne doit donc pas être interprété de manière limitative en termes de forme. Il a été choisi par rapport au mode de réalisation le plus facile à metre en œuvre, c’est-à-dire celui pour lequel le trou traversant 11 et la pastille 3 sont des cylindres de révolution.
Ainsi, dans le mode de réalisation représenté sur la figure 7, la pastille 3 s’insérant dans le trou traversant 11 formé de deux sous-parties 1 la, 11b et d’un canal 1 le aura la forme complémentaire adaptée pour remplir les sous-parties l ia, 11b et 1 le, tandis que la pastille 3 s’insérant dans le trou traversant 11 cylindrique sera cylindrique.
La hauteur de la pastille 3 peut dans tous les cas être égale à la hauteur du trou 11 (ainsi qu’on l’observe sur la vue en coupe suivant un plan contenant l’axe du trou traversant 11 présentée à la figure 4c) ou différente de celle-ci (voir la figure 9 qui présente une puce d’analyse 1 suivant l’invention dont le matériau support est du laiton enduit avec la paraffine alimentaire Le Parfait® (référence 365 EMB 44 026, conditionnement 250g) et le matériau d’analyse de la nitrocellulose (Référence: Amersham Protran® Premium pores 0.45pm NitroCellulose, GE Healtcare Life Science Nitrocellulose Bloting Membrane Nucleic acid and Protein application Catalogue No 10600008).
L’emboîtement réalisé à l’étape d’insertion est obtenu uniquement par translation de la pastille 3 suivant l’axe du trou traversant 11. Par exemple, si le trou traversant 11 a été formé dans la matériau support au moyen d’un emporte-pièce, la matrice supportlO peut rester en place sous l’emporte-pièce 42 après le perçage du trou 11.
Une feuille 6 de matériau d’analyse est alors placée au-dessus de la matrice support 10 percée, comme cela est représenté sur la figure 3b et l’emporte-pièce 42 est à nouveau déplacé suivant l’axe du trou suivant une distance au moins légèrement inférieure à celle qui a permis de percer le trou 11.
De cette manière, l’emporte-pièce 42 découpe la pastille 3 à insérer et l’entraîne dans sa course à l’intérieur du trou traversant 11, mais sans qu’elle ne ressorte totalement du trou traversant 11 du côté de la surface inférieure de la matrice support 10 et de manière à ce qu’elle soit positionnée au-dessus d’au moins une partie du débord 10a.
A l’issue de cette étape d’insertion, la pastille 3 est donc bien emboîtée, au moins sur une partie de sa hauteur, dans le trou traversant 11.
Le choix de la course de l’emporte-pièce permet de positionner la pastille 3 à une hauteur choisie dans le trou traversant 11 concerné, par exemple de manière à ce que la base inférieure de la pastille 3 soit dans le même plan que la surface inférieure de la matrice support 10 ou au moins des points les plus bas du débord 10a, comme représenté sur la figure 3c.
Il est aussi possible d’utiliser un emporte-pièce dédié à l’étape d’insertion, par exemple dans un mode de réalisation dans lequel la production des matrices est automatisée et réalisée très en amont de l’étape d’insertion.
Il est encore possible de fournir une ou plusieurs pastilles 3 découpées à l’avance, par exemple au moyen d’un emporte-pièce ou de tout autre outil de découpe de précision et de les insérer dans le trou traversant 11 qui leur correspond par un mouvement de translation verticale.
Le mode de réalisation dans lequel la découpe et l’insertion sont réalisées consécutivement avec le même emporte-pièce présente l’avantage de la simplicité du positionnement des pastilles et de la rapidité de la réalisation de cette étape.
Dans ce dernier cas, il s’agit de réaliser un outil emporte-pièces et deux contre pièces correspondantes afin de pouvoir perforer convenablement la bande support 2 et ainsi réaliser les puits (ou encore « spot », ou encore trous traversants 11) dans la bande support 2 dans un premier temps. Cet outil pourra notamment être en acier afin que sa rigidité et sa tenue dans le temps soient garanties. Les dimensions de cet outil seront adaptées aux types de puces d’analyse 1 à réaliser.
Dans un mode de réalisation particulier, on forme 25 trous traversants 11 de 500 micromètres de diamètre espacés de 200 micromètres, contenus dans un carré de 6mm x 6mm placé au centre d’une pièce de base 21 en forme de carré de matériau support (20x20mm).
L’outil emporte-pièce aura donc 25 poinçons d’un diamètre de 500 micromètres. Pour d’autres configurations de la puce d’analyse d’un échantillon biologique 1, les poinçons utilisés pour tous les trous traversants 11 ou pour une partie de ces trous traversants 11 pourront avoir des diamètres différents . Le diamètre (ou une dimension caractéristique dans le cas où la section du trou traversant 11 n’est pas circulaire) de l’emporte-pièce pourra ainsi être inférieur à 1000 micromètres, inférieur à 900 micromètres, inférieur à 800 micromètres, inférieur à 700 micromètres, inférieur à 600 micromètres, inférieur à 500 micromètres, inférieur à 400 micromètres, inférieur à 300 micromètres, inférieur à 200 micromètres, inférieur à 150 micromètres, inférieur à 100 micromètres .
L’ensemble « emporte-pièces ainsi que deux contre pièces » peut être fixé sous une presse, entre les mâchoires 5a et 5b de cette presse. La bande support 2 vient se dérouler d’une manière automatique dans la partie basse de la première contre pièce et ajustée au milieu de cet « emporte-pièces ; première contre pièce ; deuxième contre pièce » afin de réaliser des puits (trous traversants 11) automatiquement par simple mouvement de haut en bas à la place prévue. Dès que ce premier emboutissage est terminé, la bande de matériau d’analyse est introduite au- dessus de la deuxième contre pièce, une fois l’emporte pièce revenu en position « haute » . Un deuxième emboutissage (cette fois-ci du matériau d’analyse, formant la membrane filtrante) est alors effectué, permettant les découpes de pastilles 3 de ce matériau d’analyse, par exemple une membrane filtrante.
La course de descente des poinçons de l’emporte-pièce peut alors par exemple être réglée pour ce deuxième emboutissage de telle manière à ce qu’en position basse, le poinçon s’arrête au début de la bande support 2déjà percée. De cette manière les poinçons vont pousser les pastilles 3 de matériau d’analyse, par exemple de nitrocellulose, fraîchement découpées et les insérer dans les trous traversants 11 de manière à remplir, au moins partiellement, ces trous traversants 11 de la matrice ( ou membrane) support.
Ceci étant fait, la bande peut avancer sous une deuxième presse qui a pour fonction de sertir les pastilles de matériau d’analyse, par exemple de nitrocellulose, dans la bande support 2, ou tout au moins dans la matrice support 10, par un choc (pression) qui pourra s’exercer sur toute la surface de la membrane afin de bien bloquer les pastilles dans la bande support, comme décrit plus loin. La force de cette pression ou (choc) peut être déterminée par des tests.
Quel que soit le mode de réalisation choisi pour l’étape d’injection, l’insertion se fait si possible uniquement par translation de la pastille 3 suivant l’axe du trou traversant 11 concerné, de manière à maintenir inchangées les propriétés du matériau d’analyse au cours de cette étape. En particulier, le procédé suivant l’invention présente l’avantage de ne mettre en œuvre aucune étape qui pourrait introduire une anisotropic des propriétés de ce matériau et dégrader ainsi la précision et la sensibilité de l’analyse, comme discuté précédemment pour une étape de laminage.
Par ailleurs, dans le cas où la matrice support 10 comporte au moins deux pastilles 3 insérées dans au moins deux trous traversants 11 différents, ces pastilles 3 ne sont pas reliées par une portion de matériau d’analyse. En conséquence, si le matériau d’analyse est choisi suffisamment différent de celui du matériau support, il est peu probable que les molécules qui s’adsorbent sur une pastille 3 donnée risquent de migrer vers une pastille 3 voisine.
De la même façon, si le liquide à analyser mouille la pastille 3, en choisissant un matériau support d’hydrophobicité différente de celle du matériau d’analyse, il est possible de limiter, voire d’éviter, la diffusion latérale du liquide à analyser à partir d’une pastille 3 vers le matériau support - et éventuellement vers une autre pastille 3.
Ainsi, si l’échantillon à analyser est une solution aqueuse, on pourra choisir un matériau d’analyse hydrophile et un matériau support hydrophobe.
On pourra aussi envisager un matériau support hydrophile et des pastilles 3 de matériau d’analyse hydrophobes dans le cas où l’échantillon à analyser est une phase organique non miscible avec l’eau.
Cette étape d’injection uniquement par un mouvement de translation suivant l’axe du trou 11 permet, en respectant les propriétés physico-chimiques des matériaux support et d’analyse, d’obtenir à l’issue du procédé complet une puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 permettant des analyses qualitatives de sensibilité élevée.
Dans un mode de réalisation particulier, la matrice support 10 présente au moins deux trous traversants 11 et une première pastille 3 est insérée dans l’un des trous traversants 11 avant qu’une autre pastille 3 ne soit insérée dans un autre trou traversant 11.
Dans ce cas, au moins deux emporte-pièce s différents sont mis enjeu consécutivement.
Ce mode de réalisation permet d’insérer dans deux trous traversants 11 différents deux pastilles 3 formées dans des matériaux d’analyse différents.
Par exemple, on peut préparer au moins deux feuilles de matériau d’analyse au départ identiques mais ayant chacun subi une étape de bio-fonctionnalisation différente, notamment par adsorption de deux antigènes différents.
Une pastille 3 la sur laquelle un premier antigène a été adsorbé pourra être insérée dans un premier trou traversant 11 d’une matrice support 10 et une autre pastille 31b sur laquelle un deuxième antigène a été adsorbé pourra être insérée dans un deuxième trou traversant 11 de la matrice support 10.
Dans ce cas, une découpe ou marque repère 12 optionnellement formée sur la matrice support 10 pourra permettre de repérer les positions des différents sites de test.
Dans le cas où la gestion de la bio-fonctionnalisation se fait à l’échelle de la feuille de matériau d’analyse, plutôt que pastille 3 par pastille 3 sur une puce donnée et/ou sur des puces successives, il est possible de produire en série avec un rendement élevé des puces d’analyse identiques et présentant des qualités analytiques identiques, permettant de travailler dans des conditions de répétabilité, voire de reproductibilité satisfaisantes. La limite de quantification, c’est-à-dire la plus petite concentration ou teneur de l’analyte pouvant être quantifiée, avec une incertitude acceptable, dans les conditions expérimentales décrites de la méthode, peut être considérée constante pour une série de puces d’analyse produites de manière automatisée à partir des mêmes feuilles de matériau d’analyse.
Cette limite de quantification est plus facile à contrôler dans le cas d’une feuille que dans le cas d’une pastille unique 3 dans lesquels les effets de bord vont jouer un rôle important.
Il est en outre possible d’orienter les molécules sondes utilisées pour la fonctionnalisation de manière à ce que les sites sur lesquels les molécules à tester peuvent se fixer soient orientés suivant l’axe du trou. Cette disposition permet d’accroître encore la sensibilité (ou la limite de quantification) de l’analyse. Les molécules sondes peuvent notamment être celles décrites dans le brevet EP3591024B1 (inventeurs Wong Ka-Leung, Goetz Joan et al.) déposé le 05/07/2018, à savoir des nanoparticules de lanthanide luminescentes ultrabrillantes comprenant du terbium. On parvient ainsi à des limites de quantification de l’ordre de quelques atomoles par microlitre de liquide à tester.
Dans un mode de réalisation particulier, le matériau d’analyse n’est pas fonctionnalisé et est conservé dans sa structure native au niveau des pastilles 3. De cette manière, on forme une pastille 32 dite « filtrante » dont la seule fonction est une fonction de filtration.
Si l’on superpose une puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 comprenant des pastilles filtrantes 32 et une puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 comprenant des pastilles fonctionnalisées 31 (31a, 31b, etc.) afin que chaque pastille filtrante 32 soit placée au-dessus d’une pastille fonctionnalisée 31, de manière à ce que tout le fluide qui traverse une pastille filtrante 32 parvienne sur la pastille fonctionnalisée 31 correspondante, il est ainsi possible d’analyser un prélèvement sanguin sans centrifugation préalable, les globules rouges étant retenus par la puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 filtrante tandis que le sérum ou le plasma traverse cette puce pour être ensuite analysée par la puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 fonctionnalisée.
Cette disposition permet donc un gain de temps et de matériel important pour de telles analyses. Dans un mode de réalisation particulier, une ou plusieurs pastilles 3 peuvent être des pastilles de calibration 33 de la puce d’analyse d’un échantillon biologique 1.
Dans un mode de réalisation particulier de l’étape d’injection, une pastille 3 est refroidie juste avant l’injection à une température légèrement inférieure à celle de la matrice support 10 dans laquelle elle doit être insérée. De cette façon, l’insertion est facilitée mais simultanément à l’insertion, la pastille 3 se réchauffe donc se dilate, de préférence suffisamment pour assurer son maintien en place à l’issue de l’étape d’injection.
Ce mode de réalisation est avantageux lorsque le matériau support présente une rigidité particulière, comme c’est le cas pour certains matériaux plastiques. A Tissue de l’étape d’injection, une pastille 3 est emboîtée dans un trou traversant 11, de manière à ce qu’elle soit au-dessus d’au moins une fraction du débord 10a, comme représenté sur la figure 3d.
Si la puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 est au repos, la ou les pastilles 3 restent en place dans le ou les trous traversants 11. La puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 pourrait donc éventuellement être utilisée telle quelle.
Toutefois dans la mesure ou aucun traitement chimique ou thermique n’est mis en œuvre à l’étape d’injection, il n’est pas certain que les pastilles 3 restent en place, par exemple du fait de l’écoulement d’un échantillon à liquide, forcé ou sous l’effet de la gravité.
Une quatrième étape, dite d’assemblage, est donc mise en œuvre de manière à sécuriser l’assemblage de la ou des pastilles 3 avec la matrice support 10.
Pour ce faire, une force pressante de direction Taxe du trou traversant 11 est exercée sur la puce d’analyse au moyen de deux mâchoires 5a, 5b d’un système de serrage placées en-dessous et au-dessus des bases de la pastille 3 et d’au moins une fraction de la matrice support 10 qui la jouxte.
Par fraction de la matrice support 10 qui jouxte une pastille 3, on entend la fraction de matrice support qui se trouve à proximité immédiate de cette pastille 3 et délimite le trou traversant 11 dans lequel elle est insérée. Notamment, la fraction de la matrice support 10 qui jouxte une pastille 3 peut inclure tout ou partie d’un débord 10a.
Dans un mode de réalisation particulier, la fraction de matrice support 10 qui jouxte une pastille cylindrique 3 d’axe l’axe d’un trou traversant 11 et de section S peut être au moins celle qui se trouve dans le volume cylindrique d’axe Taxe du trou traversant 11 et de section S’, S’ étant obtenue par une homothétie de rapport supérieur à 1 et de centre l’intersection de Taxe du trou traversant et de la section S. Par exemple, si une pastille 3 est cylindrique de diamètre égal 100 micromètres, on pourra exercer une force pressante sur la portion de matrice support se trouvant dans le cylindre de même axe que la pastille 3 une fois insérée et de diamètre au moins égal à 101 micromètres, au moins égal à 102 micromètres, au moins égal à 103 micromètres, au moins égal à 104 micromètres, au moins égal à 104 micromètres, au moins égal à 110 micromètres, au moins égal à 120 micromètres, au moins égal à 130 micromètres, au moins égal à 140micromètres, 150 micromètres.
Si plusieurs pastilles 3 sont insérées dans la matrice support 10, on applique le même raisonnement à chacune des pastilles 3.
Dans un mode de réalisation particulier, la force pressant est exercée au moyen du système de serrage sur l’ensemble de la surface supérieure et/ou de la surface inférieure de la matrice support 10.
La force pressante peut alors être exercée au moyen du système de serrage dont les mâchoires 5a, 5b lorsqu’elles se rapprochent viennent enserrer au moins une portion de la matrice support 10 qui jouxte une pastille 3 de manière à ce que la portion de matrice support 10 sertisse la surface supérieure et/ou la surface inférieure de la pastille 3.
Dans ce mode de réalisation, on comprend que la force pressante peut ne pas comprendre de composante dans une direction normale à l’axe d’un trou traversant 11. La direction de la force pressante est alors colinéaire à l’axe du trou traversant 11, de sorte qu’aucune anisotropic non native n’est introduite dans les matériaux support et d’analyse dans une direction non colinéaire à l’axe du trou traversant 11. Cette disposition permet notamment de contrôler avec précision la limite de quantification de la puce d’analyse.
En variante, la force pressante peut alors être exercée au moyen du système de serrage dont les mâchoires 5a, 5b lorsqu’elles se rapprochent viennent enserrer au moins une portion de la surface inférieure et ou de la surface supérieur d’une pastille 3 qui dépasserait de la matrice support 10, de manière à ce que la surface supérieure et/ou la surface inférieure de la pastille 3 se replie sur la matrice 10 et la sertisse.
L’étape d’assemblage mécanique peut donc résulter en un sertissage d’au moins une pastille 3 sur au moins une de ses surfaces inférieure et supérieure par la matrice 10. Pour simplifier, on considère dans ce document, la formulation de la phrase précédente couvre les deux cas de figures possibles : sertissage de la matrice 10 par la pastille 3 ou sertissage de la pastille 3 par la matrice 10, l’effet technique étant dans les deux cas le même à savoir un assemblage d’au moins une pastille 3 à la matrice 10 résistante à une contrainte exercée suivant l’axe du trou traversant 11.
Si une pastille 3 est initialement de hauteur e2 inférieure à la hauteur e 1 du trou traversant 11, dans l’hypothèse où la base inférieure de la pastille 3 était placée plus haut qu’au moins une fraction du débord 10 a, la force pressante qui s’exerce suivant l’axe du trou permet de réaliser un sertissage comme représenté sur les figure 4a (au début de l’étape d’assemblage), 4b (en cours d’assemblage) et 4c (à l’issue de l’étape d’assemblage) : les épaisseurs e’ 1 du matériau support et e’2 de la pastille 3 à l’issue l’étape d’assemblage sont inférieures à leurs épaisseurs el et e2 avant cette étape, et le débord 10a a été replié sur tout le pourtour de la pastille 3 de sorte que le matériau support forme une collerette au-dessus et en dessous de la pastille 3. Dans un mode de réalisation particulier, la pastille 3 est sertie sur tout le pourtour de sa base inférieure par la matrice support. Dans un mode de réalisation particulier, la pastille 3 est sertie sur tout le pourtour de sa base supérieure par la matrice support. La pastille 3 peut être simultanément sertie sur tout le pourtour de sa base inférieure et sur tout le pourtour de sa base supérieure.
En conséquence, la pastille 3 est assemblée plus solidement à la matrice support 10 après cette étape d’assemblage qu’avant et résiste davantage à l’arrachement du fait d’une force exercée de la face supérieure vers la face inférieure de cette pastille. Lors de l’étape d’assemblage, le fait de n’exercer qu’une action mécanique, celle-ci étant de plus exercée dans la direction de l’axe d’un trou traversant 11 et possiblement répartie uniformément sur les bases d’une pastille 3, permet de maintenir l’uniformité et l’isotropie des propriétés physico-chimiques du matériau d’analyse dans les plans normaux à l’axe du trou traversant 11 concerné.
La pression exercée lors de cette étape d’assemblage peut être choisie en fonction de la résistance mécanique de l’assemblage nécessaire pour les analyses.
Par exemple, il est possible d’obtenir une puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 dont les pastilles 3 restent en place lorsqu’un fluide les traverse de manière forcée au moyen d’une différence de pression entre la face amont et la face aval de la pastille inférieure à 100 mbar
(millibar) ; inférieure à 200 mbar ; inférieure à 300 mbar ; inférieure à 400 mbar ; inférieure à
500 mbar ; inférieure à 600 mbar ; inférieure à 650 mbar ; inférieure à 700 mbar ; inférieure à
750 mbar ; inférieure à 800 mbar ; inférieure à 850 mbar ; inférieure à 900 mbar ; inférieure à
950 mbar ; inférieure à 1.00 bar.
Les faces amont et aval sont ici comprises relativement au sens et à la direction d’écoulement du fluide.
On considère qu’une pastille d’analyse 3 « reste en place » si à l’issue de l’analyse, cette pastille d’analyse obture toujours totalement le trou traversant 11 dans lequel elle a été insérée. En particulier, un décalage de la pastille 3 dans la direction de l’axe du trou traversant du fait de la différence de pression entre ses faces amont et aval peut intervenir sans pour autant remettre en cause la qualité de l’analyse pratiquée au moyen de la puce d’analyse d’un échantillon biologique 1.
Si la pastille d’analyse 3 « reste en place » lorsqu’une différence de pression existe entre ses faces amont et aval, on dira alors que la puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 « résiste » au vide relatif correspondant.
La face supérieure d’une pastille 3 peut, dans un mode de réalisation particulier, être simplement soumise à la pression atmosphérique et la face inférieure placée en dépression. De cette manière, un dispositif d’analyse comprenant une puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 peut être mis en oeuvre avec circulation forcée de fluide, ce qui permet de contrôler le temps de contact de l’échantillon à tester avec une pastille3 et donc la reproductibilité de l’analyse.
Cette disposition permet aussi de réduire les durées des analyses.
Notamment, la circulation forcée de l’échantillon à tester évite, ou au moins accélère, les étapes de lavage en général nécessaires pour éliminer la fraction de l’échantillon test qui n’a pas réagi ainsi que les molécules qui se sont adsorbées de manière non spécifique sur la membrane. Par exemple, il est possible d’effectuer un test sanguin sur une durée de 30 minutes entre le dépôt de l’échantillon (non centrifugé) et le résultat de l’analyse. Un test ELISA conventionnel nécessite un temps beaucoup plus long, en général de 12 à 24 heures.
L’assemblage mécanique est réalisé en phase solide, et à une température inférieure aux températures de fusion des matériaux support et d’analyse. Cet assemblage ne met donc pas en œuvre de procédé de type soudure par exemple, qui pourraient dénaturer les matériaux ou modifier leur structure physique.
Grâce au procédé d’assemblage suivant l’invention, il n’y a pas de possibilité de migration du matériau support ou d’un solvant vers le matériau d’analyse et réciproquement, de sorte que le matériau d’analyse conserve à l’issue des propriétés ses propriétés natives, c’est-à-dire ses propriétés avant l’assemblage au matériau support. De plus, l’interface entre le matériau support et le matériau d’analyse est franche, comme on peut le constater sur la figure 8a sur laquelle est présentée une photographie d’une coupe d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 dans un plan contenant l’axe d’un trou traversant 11 cylindrique et un diamètre de sa section. Dans ce cas, ainsi que dans le cas de la figure 8d, le matériau support est le papier noir distribué par la société Mondi®, de grammage 80g/m2, disponible à la date de priorité de la présente demande de brevet. Il a été imprégné de paraffine alimentaire Le Parfait® (référence 365 EMB 44 026, conditionnement 250g) de sorte qu’une matrice support percée de 9 trous pèse 55mg avant imprégnation et 77 mg après imprégnation. Le matériau d’analyse est de la nitrocellulose (Référence: Amersham Protran® Premium pores 0.45pm NitroCellulose, GE Healtcare Life Science Nitrocellulose Blotting Membrane Nucleic acid and Protein application Catalogue No 10600008).
Le diamètre des trous traversants est 500 micromètres. Les photographies des figures 8a, 8c et 8d ont été obtenues avec une loupe binoculaire (Zeiss, modèle STEMI SV8, grossissement x64). On constate de plus que sur les figures 8d et 9 qu’au grossissement de la loupe binoculaire, le matériau d’analyse et le matériau support ne diffusent pas l’un vers l’autre. On observe enfin sur les figure 8a, 8d et 9 que le procédé de préparation de la puce d’analyse permet d’obtenir des puits dont les bords sont francs et ce à des dimensions de l’ordre de la dizaine ou de la centaine de micromètres.
La situation est différente dans le cas des figure 8b et 8c, qui présentent une photographie d’une puce d’analyse obtenue avec un procédé d’impression au moyen d’une imprimante à encre solide dont les puits ont un diamètre de 500 micromètres. On observe sur cette photographie que l’encre permettant de former les puits diffuse vers le matériau d’analyse, de sorte que la section d’un puits n’est pas vraiment circulaire, ce qui nuit à la précision de l’analyse ainsi qu’à sa reproductibilité, les contours de deux puits différents n’étant jamais strictement les mêmes.
Les taches blanches présentes (autres que les pastilles 3) dans le matériau support de la figure 8c correspondent à des zones dans lesquelles l’encre formant les pastilles a diffusé. Le matériau support a done perdu ses propriétés natives du fait de l’impression et la quantité d’encre formant une pastille donnée n’est en conséquence pas connue. La reproductibilité et la précision d’une analyse sur une pastille est donc difficile à maîtriser avec ce procédé de l’art antérieur.
On notera sur la figure 8d, dont le grossissement est sensiblement égal à celui de la figure 8c que l’on observe le grain du matériau support mais pas de diffusion du matériau d’analyse vers le matériau support. Il en va de même dans le cas de la figure 9.
Le procédé suivant l’invention permet donc bien d’obtenir un contrôle plus fin des pastilles 3 d’analyse que les procédés de l’art antérieur.
A l’issue de l’étape d’assemblage, il est possible de réaliser une étape de fonctionnalisation d’une ou plusieurs pastilles 3. A titre d’exemple, on peut déposer avec une pipette ou une micropipette, éventuellement de manière automatisée, un volume choisi d’une solution de molécules sonde sur une ou plusieurs pastilles 3.
La bio-fonctionnalisation d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 consiste notamment à fixer une molécule de capture (par exemple un anticorps pour détecter un antigène) ciblant la biomolécule complexe à détecter et quantifier dans le liquide biologique à analyser.
Dans un mode de réalisation particulier, un rouleau de puces d’analyse 1, dans lesquelles les pastilles 3 sont déjà en place, peut être mis en place sur une machine de « spotting ». Le rouleau est déroulé pour faire défiler les barrettes de puces d’analyse 1 sur un plateau filtrant relié à une pompe à vide. La tête d’injection de la machine de dépôt (« spotting») dépose par exemple en 2ou 3 injections un volume de l’ordre de 10 pL d’une solution contenant la molécule capture, par exemple, à une concentration de 10 à 30 pg/mL.
Le vide d’aspiration peut être choisi pour permettre une filtration lente sur un temps d’environ 20 secondes des 10 pL de solution. La totalité des pastilles 3 de chaque puce d’analyse d’un échantillon biologique Ipeut ainsi être traitée de la même façon.
Une deuxième application peut ensuite être réalisée dans les mêmes conditions mais avec une solution de BSA (Bovine Sérum Albumine), par exemple à une concentration de l’ordre de 100 pg/mL. Cette solution permet de saturer les sites polaires de la puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 filtrante pour éviter des liaisons non spécifiques entre la biomolécule qui sera détectée et la surface d’analyse, par exemple de nitrocellulose, de la puce d’analyse d’un échantillon biologique 1.
Après incubation du rouleau de puces d’analyse 1, par exemple à 37 degrés Celsius pendant 30 minutes, les puces d’analyse 1 peuvent être séparées les unes des autres avec un outil de découpe de manière à obtenir des puces d’analyse isolées toutes de mêmes dimensions.
A l’issue de l’étape d’assemblage, et éventuellement après fonctionnalisation, il est donc possible, si cela n’a pas déjà été réalisé antérieurement, de découper les pièces de base 12 pour détacher la ou les puces d’analyse 1 de la bande support 2. Une puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 obtenues par le procédé suivant l’invention peut être conservée plusieurs mois à température ambiante, de préférence dans une atmosphère sèche (par exemple sous protection étanche à l’air et à l’eau). Notamment, des puces d’analyse 1 peuvent être conservées à 20°C +/- 5°C pendant au moins 1 mois, au moins 2 mois, au moins 3 mois, au moins 4 mois, au moins 5 mois, au moins 6 mois, au moins 7 mois, au moins 8 mois, au moins 9 mois, au moins 10 mois, au moins 11 mois, au moins 12 mois sans altération de leurs propriétés analytiques. Notamment, un test de référence sur un échantillon biologique de référence donnera statistiquement la même concentration de l’analyte recherchée (même moyenne et même écart type) sur un lot de puces d’analyse d’un échantillon biologique 1 juste après fabrication et après conservation à 20°C +/- 5°C sous protection étanche à l’air et à l’eau (par exemple sous blister) pendant au moins 1 mois, au moins 2 mois, au moins 3 mois, au moins 4 mois, au moins 5 mois, au moins 6 mois, au moins 7 mois, au moins 8 mois, au moins 9 mois, au moins 10 mois, au moins 11 mois, au moins 12 mois.
Les deux dernières étapes (injection et assemblage) permettent de contrôler les propriétés du matériau support indépendamment des propriétés du matériau d’analyse et réciproquement, à la différence des procédés de l’art antérieur.
Typiquement, si le matériau support est formé à partir d’une plaque de métal, cette plaque de métal peut être au préalable rendue hydrophobe. Par exemple un traitement de surface, telle qu’une enduction avec une cire naturelle ou de synthèse, peut être mis en œuvre.
Dans les procédés connus, un tel traitement limite les qualités analytiques de la puce, puisque la cire peut migrer de manière incontrôlée du matériau support vers le matériau d’analyse, par exemple à l’occasion une étape de chauffage ou de traitement chimique ou de laminage. La cire (ou tout autre composé chimique utilisé pour le traitement de surface) peut alors interférer avec l’analyse. On observe entre autres des phénomènes de quenching de fluorescence, qui réduisent la sensibilité de l’analyse lorsque des molécules sondes fluorescentes sont mises en œuvre. Dans l’invention, l’étape d’assemblage n’entraîne pas une telle diffusion ou migration incontrôlée de la cire. Certains modes de réalisation permettent même d’éviter une diffusion ou une migration incontrôlée d’espèces chimiques à partir des pastilles d’analyse 3 ou vers ces pastilles 3. Le procédé suivant l’invention permet donc d’obtenir une puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 dont les zones de tests (autrement dit les pastilles d’analyse 3) sont formées avec une meilleure précision qu’avec les procédés de l’art antérieur.
Cette analyse est aussi valable pour le cas où les pastilles 3 sont fonctionnalisées avant l’étape d’injection.
On voit donc l’intérêt de l’étape d’injection selon l’invention, qui permet de limiter les interférences entre les matériaux support et d’analyse qui la constituent, et ainsi d’obtenir une puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 de limite de quantification basse. De plus, aucun solvant ni traitement thermique n’intervient dans les étapes d’injection et d’assemblage des zones tests avec la matrice support. Ces étapes peuvent être réalisées au moyen d’outils simples. Le procédé est donc peu coûteux, rapide, et peu polluant.
Dans la mesure où l’un des matériaux parmi les matériaux support et d’analyse peut être hydrophile, on pourra dans un mode de réalisation particulier travailler dans des conditions d’hygrométrie contrôlée pour une ou plusieurs étapes du procédé, de manière à garder un contrôle précis sur la géométrie et le volume de la matrice support 10 et/ou des pastilles 3 d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique 1.
Une puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 obtenue par le procédé suivant l’invention peut être mise en œuvre isolément. Dans ce cas, un échantillon à analyser peut être déposé sur une ou plusieurs des pastilles 3 de la puce. Ou encore plusieurs échantillons à analyser peuvent être déposés chacun sur une ou plusieurs pastilles 3 différentes de celles utilisées pour les autres échantillons, simultanément ou successivement.
La puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 peut, pour ce faire, être placée horizontalement, de sorte qu’un échantillon liquide à analyser donné s’écoule de la face supérieure de la pastille 3 sur laquelle il a été déposé vers la face inférieure de cette même pastille 3, soit sous l’effet de la gravité, soit sous l’effet d’un gradient de pression, un vide relatif étant appliqué du côté de la face inférieure de la pastille 3.
Plusieurs puces d’analyses 1, notamment fonctionnalisées de manière différente les unes des autres, peuvent être superposées dans comme décrit dans la demande W02014/053,237A1, de manière à ce que soient formés différents canaux, chaque canal contenant une seule pastille 3 ou plusieurs pastilles 3, chacune de ces dernières appartenant à une puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 différente.
Un tel dispositif d’analyse multiplexée en trois dimensions est schématiquement représenté sur la figure 6. Le dispositif d’analyse 7 consiste en un empilement de plaques support 72 solides, par exemple en Polymethacrylate de méthyle (PMMA) ou autre matériau plastique, dans lesquelles sont formés des microcanaux 71 et entre lesquelles sont intercalées des puces d’analyse 1.
Les microcanaux sont alignés les uns avec les autres et les sites d’analyse (c’est-à-dire les pastilles 3) des puces d’analyse 1 viennent s’insérer entre deux microcanaux de deux plaques support 72 consécutives. Il est aussi possible de superposer plusieurs puces d’analyses 1 entre deux plaques support 72 consécutives. Dans ce cas, si différents échantillons à analyser sont testés dans les différents canaux, il est possible d’effectuer une analyse multiplexée 3D.
Plus simplement, il est possible de prévoir un dispositif d’analyse 7 comprenant quatre piliers sur lesquels est fixée la puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 par ses quatre coins. Ces deux exemples sont non limitatifs. La détection d’un analyte d’intérêt peut se faire par une analyse immunologique de type ELISA : une fois le complexe molécule de capture / biomolécule d’intérêt formé sur les sites d’analyse (ou équivalemment puits) de la puce d’analyse d’un échantillon biologique 1, un anticorps de révélation est ajouté qui se lie spécifiquement au complexe molécule de capture / biomolécule. La fluorescence ou la couleur qui apparaît dans chaque puits est mesurée à l’aide d’un dispositif tel qu’un photomultiplicateur ou d’une caméra type CMOS, couplé à un programme informatique qui réalise les calculs.
L’invention porte donc aussi sur un dispositif d’analyse 7 comprenant au moins une puce d’analyse d’un échantillon biologique 1. Le dispositif d’analyse 7 peut contenir plusieurs puces d’analyses 1, notamment superposées, comme décrit ci-dessus.
L’invention porte en outre sur un kit de diagnostic comprenant au moins une puce d’analyse d’un échantillon biologique 1. Le kit de diagnostic peut aussi comprendre un support pour la puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 et/ou au moins un réactif d’analyse. Le réactif d’analyse peut notamment contenir un ou plusieurs anticorps ou un ou plusieurs antigènes en vue de mettre en œuvre un test immunologique. Le réactif d’analyse peut aussi être un révélateur.
Dans le cas de la présente demande, on entend par test immunologique (« immunoassay ») un test mettant en œuvre au moins un antigène pour détecter des anticorps dirigés contre un agent pathogène dans un prélèvement ou au moins un anticorps pour détecter un antigène d'un agent pathogène dans un prélèvement.
Le réactif d’analyse peut aussi être un tampon, par exemple un tampon phosphate salé (PBS) ou encore un autre solution, par exemple un solution d’albumine de sérum bovin (BSA).
L’invention concerne l’utilisation d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 à des fins de diagnostic ou pour réaliser un test immunologique. Notamment, des test sérologiques de recherche at la quantification d’anticorps de type immunoglobulines G ou M (IgG ou IgM) peuvent être mis en œuvre après fonctionnalisations de la puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 au moyen de l’antigène adéquat. La puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 peut aussi être fonctionnalisée pour rechercher et quantifier les protéines de choc thermique telles que les protéines de la famille HSP60 au moyen d’un anticorps spécifique, par exemple fluorescent. L’apolipoprotéine ApoAl ou encore des médiateurs de l’inflammation tels que la protéine C-réactive (CRP) ou la protéine stabilisatrice du pancréas PSP (« pancreatic stone protein ») peuvent être recherchés par la mise en œuvre d’une méthode enzymoimmunologique sur la puce d’analyse d’un échantillon biologique 1.
L’invention porte enfin sur un dispositif de fabrication d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 suivant l’un quelconque des modes de réalisation comprenant :
- un système d’insertion adapté pour insérer au moins une pastille 3 dans au moins un trou traversant 11 de la matrice 10 par translation de la pastille 3 suivant la direction normale aux surfaces inférieure et supérieure de la matrice 10
- un système d’assemblage mécanique à une température inférieure aux températures de fusion des matériaux support et d’analyse, adapté pour exercer une force pressante de direction normale aux surfaces inférieure et supérieure de la matrice 10 sur au moins une portion de la matrice 10 qui jouxte l’au moins une pastille 3 insérée dans la matrice 10 et /ou sur au moins une desdites surfaces inférieure et supérieure de l’au moins une pastille 3 insérée dans la matrice 10.
Le dispositif de fabrication d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 peut notamment comprendre un ou plusieurs emporte-pièce, comprenant chacun un ou plusieurs poinçons identiques ou non et dont la course est réglable, et une ou plusieurs contre-pièce.
Le dispositif de fabrication d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique 1 peut être entièrement automatisé.
LISTE DES SIGNES DE RÉFÉRENCE
I : puce d’analyse
10 : matrice support
10a : débord de matériau support
I I : trou traversant la matrice support 10
1 la, 11b : sous-partie d’un trou traversant 11
1 le : canal reliant deux sous-parties 1 la et 11b
12 : découpe / marque repère
2 : bande support
21 : pièce de base
3 : pastille de matériau d’analyse
31 a, b, c : pastille 3 fonctionnalisée
32 : pastille filtrante
33 : pastille de calibration
4 : guide de coupe
42 : poinçon d’un emporte-pièce
5a, 5b : mâchoires d’une presse
6 : feuille de matériau d’analyse
7 : dispositif d’analyse multiplexé
71 : microcanal
72 : plaque support

Claims

29 REVENDICATIONS
[Revendication 1] Procédé de fabrication d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique (1) comprenant :
- on fournit une matrice (10) formée dans un matériau support solide, présentant une surface inférieure et une surface supérieure et dans laquelle a été formé au moins un trou (11) la traversant entre lesdites surfaces inférieure et supérieure;
- on fournit au moins une pastille (3), découpée dans une feuille (6) de matériau d’analyse solide et poreux, ladite pastille présentant une surface inférieure et une surface supérieure,
- on procède à l’insertion de l’au moins une pastille (3) dans l’au moins un trou traversant (11) de la matrice (10) par translation de l’au moins une pastille (3) suivant la direction normale aux surfaces inférieure et supérieure de la matrice (10) ;
- on réalise un assemblage mécanique à une température inférieure aux températures de fusion des matériaux support et d’analyse, au cours de laquelle une force pressante de direction normale aux surfaces inférieure et supérieure de la matrice (10) est exercée sur au moins une portion de la matrice (10) qui jouxte Tau moins une pastille (3) insérée dans la matrice (10) et /ou sur au moins une des surfaces inférieure et supérieure de Tau moins une pastille (3) insérée dans la matrice (10).
[Revendication 2] Procédé de fabrication d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique (1) selon la revendication 1 caractérisé en ce que ladite force pressante est exercée sur une portion de la matrice (10) qui jouxte Tau moins une pastille (3) insérée dans la matrice (10).
[Revendication 3] Procédé de fabrication d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique (1) selon la revendication 1 ou la revendication 2 caractérisé en ce que ladite force pressante est exercée sur au moins une des surfaces inférieure et supérieure de l’au moins une pastille (3) insérée dans la matrice (10).
[Revendication 4] Procédé de fabrication d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique (1) selon Tune quelconque des revendications 1 à 3 caractérisé en ce que le matériau support est hydrophobe et le matériau d’analyse est hydrophile ou inversement.
[Revendication 5] Procédé de fabrication d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique (1) selon Tune quelconque des revendications 1 à 4 caractérisé en ce que, pour l’insertion de Tau moins une pastille (3) dans Tau moins un trou traversant (11), Tau moins une pastille (3) est translatée dans Tau moins un trou traversant (11) au moyen d’un emporte-pièce, en ce que Tau moins une pastille (3) a été découpée dans la feuille (6) de matériau d’analyse avant son insertion au moyen de ce même emporte-pièce et en ce que Tau moins un trou 30 traversant (11) a été formé au préalable dans la matrice (10) au moyen de ce même emporte- pièce.
[Revendication 6] Procédé de fabrication d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique (1) selon l’une quelconque des revendications 1 à 5 caractérisé en ce qu’à l’issue de l’assemblage mécanique, on procède à la fonctionnalisation de l’au moins une pastille (3).
[Revendication 7] Procédé de fabrication d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique (1) selon l’une quelconque des revendications 1 à 6 caractérisé en ce qu’on procède à la fonctionnalisation du matériau d’analyse avant l’insertion de l’au moins une pastille (3) dans la matrice (10).
[Revendication 8] Procédé de fabrication d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique (1) selon l’une quelconque des revendications 1 à 7 caractérisé en ce que ledit assemblage mécanique de l’au moins une pastille (3) avec la matrice (10) résulte en un sertissage de l’au moins une pastille (3) sur au moins une portion de ses surfaces inférieure et supérieure par la matrice (10).
[Revendication 9] Procédé de fabrication d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique (1) selon l’une quelconque des revendications 1 à 8 caractérisé en ce qu’avant l’insertion de l’au moins une pastille (3) dans la matrice (10), l’au moins une pastille (3) est portée à une température inférieure à celle de la matrice (10).
[Revendication 10] Procédé de fabrication d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique (1) selon les revendications 5 et 7 caractérisé en ce qu’on réitère l’insertion d’au moins une pastille (3) dans la matrice (10) au moins une fois en utilisant pour chaque nouvelle insertion un matériau d’analyse fonctionnalisé différent de celui utilisé pour l’insertion précédente et un emporte-pièce correspondant à au moins un trou traversant (11) de la matrice (10) différent de celui utilisé pour l’insertion précédente.
[Revendication 11] Puce d’analyse d’un échantillon biologique (1) comprenant :
- une matrice (10) formée dans un matériau support solide, présentant une surface inférieure et une surface supérieure et dans laquelle a été formé au moins un trou (11) la traversant entre lesdites surfaces inférieure et supérieure;
- au moins une pastille (3), découpée dans une feuille de matériau d’analyse solide et poreux et insérée dans l’au moins un trou traversant (11), l’au moins une pastille (3) présentant une surface inférieure et une surface supérieure, et caractérisée en ce que l’au moins une pastille (3) est sertie sur au moins une de ses surfaces supérieure et inférieure par la matrice (10).
[Revendication 12] Puce d’analyse d’un échantillon biologique (1) selon la revendication 11 dans laquelle le matériau support comprend au moins un composant choisi parmi un métal, un matériau plastique et la cellulose ou une combinaison de ceux-ci et en ce que le matériau d’analyse dont est formée l’au moins une pastille (3) comprend au moins un composant choisi parmi la nitrocellulose, la cellulose et un polymère organique.
[Revendication 13] Puce d’analyse d’un échantillon biologique (1) selon l’une quelconque des revendications 11 à 12 dans laquelle l’assemblage de l’au moins une pastille (3) et de la matrice (10) résiste au moins à un vide relatif égal à 0,100 bar.
[Revendication 14] Dispositif d’analyse comprenant au moins deux puces d’analyse d’un échantillon biologique (1) selon l’une des revendications 11 à 13 superposées et dans lequel l’au moins une pastille (3) d’une des au moins deux puces est configurée pour assurer une fonction de filtration et est superposée avec l’au moins une pastille (3) fonctionnalisée d’une autre puce des au moins deux puces.
[Revendication 15] Kit de diagnostic comprenant au moins une puce d’analyse d’un échantillon biologique (1) selon l’une des revendications 11 à 13 et au moins un réactif d’analyse.
[Revendication 16] Utilisation d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique (1) selon l’une quelconque des revendications 11 à 13 à des fins de diagnostic ou dans un test immunologique.
[Revendication 17] Dispositif de fabrication d’une puce d’analyse d’un échantillon biologique (1) selon l’une quelconque des revendications 10 à 13, ledit dispositif de fabrication comprenant :
- un système d’insertion adapté pour insérer l’au moins une pastille (3) dans l’au moins un trou traversant (11) de la matrice (10) par translation de la pastille (3) suivant la direction normale aux surfaces inférieure et supérieure de la matrice (10) ;
- un système d’assemblage mécanique à une température inférieure aux températures de fusion des matériaux support et d’analyse, adapté pour exercer une force pressante de direction normale aux surfaces inférieure et supérieure de la matrice (10) sur au moins une portion de la matrice (10) qui jouxte l’au moins une pastille (3) insérée dans la matrice (10) et/ou sur au moins une desdites surfaces inférieure et supérieure de l’au moins une pastille (3) insérée dans la matrice (10).
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