WO2019156305A1 - 다중 분석을 수행하기 위한 분주 매핑 장치 및 그 동작 방법 - Google Patents

다중 분석을 수행하기 위한 분주 매핑 장치 및 그 동작 방법 Download PDF

Info

Publication number
WO2019156305A1
WO2019156305A1 PCT/KR2018/011197 KR2018011197W WO2019156305A1 WO 2019156305 A1 WO2019156305 A1 WO 2019156305A1 KR 2018011197 W KR2018011197 W KR 2018011197W WO 2019156305 A1 WO2019156305 A1 WO 2019156305A1
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
primer
dispensing
sample
plate
primers
Prior art date
Application number
PCT/KR2018/011197
Other languages
English (en)
French (fr)
Inventor
김성식
정지현
김민진
김정민
강병규
Original Assignee
제노플랜코리아 주식회사
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by 제노플랜코리아 주식회사 filed Critical 제노플랜코리아 주식회사
Publication of WO2019156305A1 publication Critical patent/WO2019156305A1/ko

Links

Images

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6806—Preparing nucleic acids for analysis, e.g. for polymerase chain reaction [PCR] assay
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N35/00—Automatic analysis not limited to methods or materials provided for in any single one of groups G01N1/00 - G01N33/00; Handling materials therefor
    • G01N35/00584—Control arrangements for automatic analysers
    • G01N35/0092—Scheduling
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
    • B01L3/00—Containers or dishes for laboratory use, e.g. laboratory glassware; Droppers
    • B01L3/50—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes
    • B01L3/502—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures
    • B01L3/5025—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures for parallel transport of multiple samples
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813—Hybridisation assays
    • C12Q1/6834—Enzymatic or biochemical coupling of nucleic acids to a solid phase
    • C12Q1/6837—Enzymatic or biochemical coupling of nucleic acids to a solid phase using probe arrays or probe chips
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/686—Polymerase chain reaction [PCR]
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N35/00—Automatic analysis not limited to methods or materials provided for in any single one of groups G01N1/00 - G01N33/00; Handling materials therefor
    • G01N35/10—Devices for transferring samples or any liquids to, in, or from, the analysis apparatus, e.g. suction devices, injection devices
    • G01N35/1009—Characterised by arrangements for controlling the aspiration or dispense of liquids
    • G01N35/1011—Control of the position or alignment of the transfer device
    • G—PHYSICS
    • G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06F—ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING
    • G06F7/00—Methods or arrangements for processing data by operating upon the order or content of the data handled
    • G06F7/02—Comparing digital values
    • G06F7/023—Comparing digital values adaptive, e.g. self learning
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B25/00—ICT specially adapted for hybridisation; ICT specially adapted for gene or protein expression
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B30/00—ICT specially adapted for sequence analysis involving nucleotides or amino acids
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16C—COMPUTATIONAL CHEMISTRY; CHEMOINFORMATICS; COMPUTATIONAL MATERIALS SCIENCE
    • G16C20/00—Chemoinformatics, i.e. ICT specially adapted for the handling of physicochemical or structural data of chemical particles, elements, compounds or mixtures
    • G16C20/10—Analysis or design of chemical reactions, syntheses or processes
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00277—Apparatus
    • B01J2219/00279—Features relating to reactor vessels
    • B01J2219/00306—Reactor vessels in a multiple arrangement
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N35/00—Automatic analysis not limited to methods or materials provided for in any single one of groups G01N1/00 - G01N33/00; Handling materials therefor
    • G01N35/00584—Control arrangements for automatic analysers
    • G01N35/0092—Scheduling
    • G01N2035/0094—Scheduling optimisation; experiment design

Definitions

  • the present invention relates to a dispensing mapping device for performing multiple analysis, and an operation method thereof, and more particularly, to a dispensing mapping device and an operation method thereof capable of designing a dispensing sequence and combination optimized for analysis information in multiple analysis. .
  • PCR Polymerase chain reaction
  • PCR Polymerase Chain Reaction
  • the diagnosis through the nucleic acid amplification based on the above or the search for a specific gene has a limitation in that it searches for one template at a time. For example, even if the same symptom occurs in the same patient, the cause of the disease is often caused by several kinds of infectious pathogens. Therefore, the diagnosis of various pathogens is required separately. Amplifying them one at a time is a cumbersome and time consuming task. In addition, since the amount of nucleic acid that can be extracted from a limited sample in a general environment is finite, it is often impossible to repeat the diagnosis through nucleic acid amplification using a limited amount of nucleic acid.
  • such multiple assays are performed by sequentially dispensing a plurality of samples, primers, reagents, etc. into a reaction plate containing a plurality of wells using a dispensing apparatus having a plurality of nozzles.
  • a dispensing apparatus having a plurality of nozzles.
  • how effectively designing the dispensing order or combination for such samples, primers, etc. in multiplex analysis may be one of important factors in determining the overall analysis time.
  • the present invention is to solve the above problems, to provide a dispensing mapping device for performing a multi-analysis and a method of operating the same, which can design a dispensing order and combination of samples or primers optimized for analysis information in multiple analysis
  • a dispensing mapping device for performing a multi-analysis and a method of operating the same, which can design a dispensing order and combination of samples or primers optimized for analysis information in multiple analysis
  • a method of operating a frequency mapping device for performing multiple analysis includes receiving analysis information, the analysis information including information about at least one of a plurality of samples to be analyzed, a detection gene for each of the samples, and a primer corresponding to the detection gene; Partitioning the reaction plate into a plurality of zones; And arranging the sample and the primer sequentially on the partitioned region of the reaction plate.
  • the step of partitioning into the plurality of regions may be performed based on at least one of the maximum number of simultaneous dispensing, the spacing between the dispensing nozzles, and the spacing between the wells of the reaction plate.
  • At least one of the rows and columns of each partitioned region of the reaction plate may be equal to the maximum number of simultaneous dispensing.
  • the method may further include grouping at least one of the plurality of samples and the primers into at least one group based on the analysis information, and the arranging the plurality of samples and the primers may include: It is performed based on the grouping result, and the maximum number of samples and primers belonging to each of the groups may be equal to the maximum number of simultaneous dispensing.
  • the analysis information further includes information regarding the arrangement on the primer plate of the primer, and in the grouping, priority is sequentially given to the frequency of dispensing each of the primers and the arrangement order on the primer plate.
  • the primers can be grouped into at least one group.
  • the method further comprises the step of calculating the number of simultaneous dispensing for at least one of the samples and primers belonging to each of the groups, the step of arranging the sample and the primers, the samples belonging to each of the groups and At least one of the primers may be performed by sequentially arranging the partitioned regions of the reaction plate corresponding to the number of simultaneous dispensing.
  • the array may be preferentially performed on the sample and the primer belonging to the group having the highest number of simultaneous dispensing.
  • the method further comprises the step of calculating the number of simultaneous dispensing and the number of single dispensing for at least one of the samples and primers belonging to each of the groups, and the step of arranging the sample and the primers, Sequentially arranging at least one of the sample and the primer belonging to the partitioned region of the reaction plate corresponding to the number of simultaneous dispensing; And when the arrangement according to the number of simultaneous dispensing is completed, sequentially arranging at least one of the sample and the primer belonging to each of the groups to the remaining area of the reaction plate based on the number of single dispensing. have.
  • the assay information further comprises information regarding the arrangement on the sample plate of the sample and the arrangement on the primer plate of the primer, wherein the method comprises mixing the primers based on the grouping result ) Arranging on a plate; And mapping the sample array of the sample plate and the reaction plate, the primer plate, and the primer array of the mixing plate and the reaction plate to each other.
  • the mapping when the mapping is completed, at least one of the grouping result, the number of simultaneous dispensing and the number of single dispensing, the arrangement of the sample and the primer for the reaction plate, and the mapping result in response to the analysis information.
  • the method may further include storing one in a storage unit.
  • the criterion being dispensed It may include at least one of the time, the number of times of dispensing nozzle and the moving distance of the dispensing nozzle.
  • a computer readable recording medium having recorded thereon a program for performing the method.
  • a dispensing mapping device for performing multiple analysis.
  • the apparatus comprises: an input unit for receiving analysis information, the analysis information including information on at least one of a plurality of samples to be analyzed, a detection gene for each of the samples, and a primer corresponding to the detection gene; And dividing the reaction plate into a plurality of regions and arranging the sample and the primer sequentially on the partitioned region of the reaction plate.
  • the arrangement unit may divide the reaction plate into a plurality of regions based on at least one of the maximum possible number of simultaneous dispensing, the spacing between the dispensing nozzles, and the spacing between the wells of the reaction plate.
  • At least one of the rows and columns of each partitioned region of the reaction plate may be equal to the maximum number of simultaneous dispensing.
  • the apparatus may further include a cluster unit for grouping at least one of the plurality of samples and the primers into at least one group based on the analysis information, and the arrangement unit may include the plurality of samples based on the grouping result. And performing the arrangement of the primers, wherein the maximum number of samples and primers belonging to each of the groups may be equal to the maximum number of simultaneous dispensing.
  • the analysis information further includes information on the arrangement on the primer plate of the primer, the cluster portion, by sequentially giving priority to the number of times each of the primers and the arrangement order on the primer plate
  • the primers can be grouped into at least one group.
  • the calculation unit for calculating the number of simultaneous dispensing for at least one of the samples and primers belonging to each of the groups wherein the arrangement unit, at least one of the sample and the primers belonging to each of the group Corresponding number of simultaneous dispensing may be sequentially arranged in the partitioned region of the reaction plate.
  • the arrangement unit may preferentially perform an arrangement with respect to a sample and a primer belonging to a group having a large number of simultaneous dispensing.
  • the calculation unit for calculating at least one of the number of simultaneous dispensing and the number of single dispensing for at least one of the samples and primers belonging to each of the groups wherein the arrangement unit, among the samples and the primers belonging to each of the group At least one is sequentially arranged in a partitioned region of the reaction plate corresponding to the number of simultaneous dispensing, and when the arrangement according to the number of simultaneous dispensing is completed, at least one of the sample and the primer belonging to each of the groups Based on the number of dispensing, it may be arranged sequentially in the remaining area of the reaction plate.
  • the analytical information further comprises information relating to the arrangement on the sample plate of the sample and the arrangement on the primer plate of the primer, wherein the arrangement further comprises mixing the primers based on the grouping result.
  • the sample plate and the reaction plate of the sample array and the primer plate the mixing plate and the reaction plate of the reaction plate may further include a mapping unit for mapping (mapping).
  • the mapping when the mapping is completed, at least one of the grouping result, the number of simultaneous dispensing and the number of single dispensing, the arrangement of the sample and the primer for the reaction plate, and the mapping result in response to the analysis information. It may further include a storage unit for storing one.
  • a recommendation section for recommending an arrangement on the reaction plate of the sample and the primer suitable for the assay information according to a predetermined criterion, wherein the criterion is required to dispense. It may include at least one of the time, the number of times of dispensing nozzle and the moving distance of the dispensing nozzle.
  • the space of the reaction plate can be more efficiently used by partitioning the reaction plate into a plurality of regions and arranging samples and primers for dispensing in consideration of the number of simultaneous dispensing of the dispensing unit and the like.
  • the present invention by dividing the sample or primer into one or more groups capable of simultaneous dispensing in one unit, and by placing the sample or primer in the reaction plate in groups based on the number of simultaneous dispensing, etc., the number of dispensing nozzles according to the analysis performed, You can optimize your route, dispense time, and more.
  • the running cost of the analysis device can be reduced by optimizing the dispensing order and the combination necessary for the multiple analysis.
  • FIG. 1 shows a reaction plate according to one embodiment of the invention.
  • FIG. 2 shows a sample plate and a primer plate according to one embodiment of the invention.
  • FIG. 3 illustrates a dispensing mapping device according to an embodiment of the present invention.
  • FIG. 4 is a flowchart illustrating a method of operating a dispensing mapping device according to an embodiment of the present invention.
  • FIG. 5 is a flowchart illustrating a method of operating a dispensing mapping device according to an embodiment of the present invention.
  • 6 to 13 show an exemplary operation of the dispensing mapping device according to an embodiment of the present invention.
  • Figure 1 shows a reaction plate according to an embodiment of the present invention
  • Figure 2 (a) is a sample plate according to an embodiment of the present invention
  • Figure 2 (b) is an embodiment of the present invention
  • Each primer plate is shown.
  • the reaction plate is a mixture of primers, reagents (regent), etc. to each of a plurality of samples for multiple analysis by a predetermined reaction (for example, polymerase chain reaction (polymerase chain reaction, PCR) and the like), as shown in FIG. 1, may be implemented to include 384 wells (16 rows X 24 columns), each of which may be performed as described above.
  • the plurality of wells constituting the reaction plate are formed by combination of rows and columns, for example, A01, B01, C01... And so on.
  • the sample plate and the primer plate may each refer to a plate on which a plurality of samples including one or more genes to be detected and primers corresponding to the genes to be detected are arranged.
  • the sample may include, for example, blood, saliva, secretions, cells, and the like collected from a human, an animal, etc.
  • the primer is a base sequence complementary to a partial sequence of a gene to be detected as to initiate a PCR reaction. Can be configured.
  • the sample plate and primer plate can be configured to contain 96 wells (8 rows by 12 columns).
  • the sample plates include S1, S2.
  • 96 samples sequentially numbered may be sequentially arranged from the left column to the right column, and primers corresponding to 49 genes to be detected may be P1, P2... May be sequentially numbered and the like and arranged in the same manner.
  • the sample plate and the primer plate are the same as the reaction plate, by the combination of rows and columns, for example, A01, B01, C01... Of course, it can be coordinated with.
  • the configuration of the reaction plate, the sample plate and the primer plate is an example, and the configuration of the number, arrangement, and the like of each plate is variously changed based on the user's setting, etc., according to the embodiment to which the present invention is applied. Can be.
  • dispensing units may include a plurality of dispensing nozzles that are continuously disposed in one direction, and may be configured to convey samples or primers and the like in such a manner that the dispensing nozzles are aligned in the wells of each plate.
  • the optimal dispensing sequence suitable for multiple analysis of different samples and genes, and the like through a plate actually used by the user, a sample plate corresponding to the dispensing / analysis apparatus, a primer plate, a reaction plate, a virtual dispensing unit, and the like, It is possible to provide a design for the combination. A detailed manner related to this will be described below with reference to FIGS. 3 to 13.
  • FIG. 3 illustrates a dispensing mapping device according to an embodiment of the present invention.
  • the frequency division mapping apparatus 300 may include an input unit 310, a display unit 320, a storage unit 330, and a controller 340.
  • the input unit 310 may receive various data by the user of the frequency mapping apparatus 300.
  • the input unit 310 may receive analysis information for performing multiple analysis from a user.
  • the analysis information may include information about at least one of a plurality of samples to be analyzed, a detection gene for each sample and a primer corresponding to the detection gene, an arrangement on the sample plate of the sample, and an arrangement on the primer plate of the primer.
  • the data may further include, but is not limited to, information on the number of wells, the arrangement, and the like of the plates, the information on the reagents used in the reaction, the dispensing unit, and the like.
  • the input unit 310 may use various input devices applicable to the art, such as a key, a touch panel, and a touch screen.
  • the display unit 320 displays an image or data (for example, sample and / or primer array information, plate-to-plate array mapping information, etc.) for each plate on the screen, and divides the mapping device.
  • a user interface for input of a user required for the operation of 300 may be provided.
  • the display unit may be formed of a liquid crystal display (LCD), organic light emitting diodes (OLEDs), active matrix organic light emitting diodes (AMOLEDs), or the like.
  • the storage unit 330 may store various data accompanying the operation of the frequency dividing mapping apparatus 300.
  • the data may include analysis information for performing multiplex analysis, sequence information of samples and / or primers for each plate, array mapping information between plates, and the like, but is not limited thereto.
  • the storage unit 330 may be a hard disk drive (HDD), a read only memory (ROM), a random access memory (RAM), an electrically erasable and programmable read only memory (EEPROM), or a flash memory, as is known to those skilled in the art.
  • HDD hard disk drive
  • ROM read only memory
  • RAM random access memory
  • EEPROM electrically erasable and programmable read only memory
  • flash memory as is known to those skilled in the art.
  • Flash memory Compact Flash (CF) card
  • SD Secure Digital
  • SM Smart Media
  • MMC Multimedia card
  • Memory Stick It may be provided, may be provided in the dispensing mapping device 300, or may be provided in a separate device.
  • the controller 340 may control an overall operation of the frequency division mapping apparatus 300 and a signal flow between internal components thereof, and may perform a data processing function for processing data.
  • the controller 340 may include a cluster unit 341, a calculator 342, an array unit 343, a mapping unit 344, and a recommendation unit 345.
  • the cluster unit 341 may group at least one of the plurality of samples and primers into at least one group based on the analysis information.
  • the maximum number of samples and / or primers belonging to each group may be equal to the maximum number of simultaneous dispensing units of the dispensing unit.
  • grouping may be performed by sequentially arranging the samples or primers in a virtual plate based on the number of samples or primers dispensed, the order of arrangement on each plate, and the like.
  • the group divided by the cluster unit 341 may be simultaneously arranged (or divided) one or more times in a reaction plate or mixing plate as one dispensing unit.
  • the calculation unit 342 may calculate the number of simultaneous dispensing and / or the number of single dispensing for each group for the samples and / or primers grouped by the cluster unit 341.
  • the number of simultaneous dispensing may refer to the number of times that all the samples or primers belonging to the same group can be divided at the same time through the dispensing unit, etc.
  • the number of single dispensing refers to the number of dispensing samples or primers that are separately dispensed after the simultaneous dispensing. May be referred to.
  • the arrangement 343 may partition the reaction plate into a plurality of regions. For example, the arrangement 343 divides the reaction plate into a plurality of regions based on at least one of the maximum number of simultaneous dispensing units of the dispensing unit, the spacing between the dispensing nozzles, and the spacing between the plurality of wells constituting the reaction plate. can do. In this case, at least one of the rows and columns of the partitioned area may be equal to the maximum number of simultaneous dispensing units of the dispensing unit.
  • the arranging unit 343 may arrange the primers on the mixing plate based on the grouping result of the primers by the cluster unit 341, or simultaneously perform the sample and / or primer belonging to each group calculated by the calculating unit 342. Based on the number of dispenses and / or the number of single dispenses, a plurality of samples and primers can be arranged sequentially in the partitioned region of the reaction plate.
  • the mapping unit 344 may map the sample arrangement of the sample plate and the reaction plate, and the primer arrangement of the primer plate, the mixing plate, and the reaction plate. . This mapping can be done by interconnecting the coordinates of the wells in which the same sample and primer are arranged in each plate.
  • the mapping result may be provided to the user, and the user controls the actual dispensing or analyzing device based on the mapping result, thereby performing multiple analysis on the sample.
  • the recommender 345 may recommend an arrangement on the reaction plate of the sample and primer suitable for the analysis information in response to receiving the analysis information.
  • the recommendation unit 345 may be configured to search the storage unit 330 to search for an array of samples and primers suitable for analysis information, and provide the same to the user.
  • the user can be provided with a dispensing sequence and combination suitable for his analysis in a simple manner of selecting one of the recommended arrangements.
  • the frequency division mapping apparatus 300 may further include a communication unit.
  • the communication unit is provided for a direct connection with the outside or a connection through a network, and may be a wired and / or wireless communication unit.
  • the communication unit wires or wirelessly transmits data (for example, sample and primer arrangement information on the reaction plate) from the control unit 340, the storage unit 330, or wires data from the outside.
  • the wireless reception may be transmitted to the control unit 340 or stored in the storage unit 330.
  • the communication unit may be configured to receive and transmit the analysis information to the control unit 340 and the storage unit 330.
  • the communication unit may perform a function as the input unit 310 for receiving the analysis information.
  • the communication unit includes LAN, Wideband Code Division Multiple Access (WCDMA), Long Term Evolution (LTE), Wireless Broadband Internet (WiBro), Radio Frequency (RF) communications, Wireless LAN, Wireless Fidelity, It can communicate through NFC (Near Field Communication), Bluetooth, infrared communication, and the like.
  • WCDMA Wideband Code Division Multiple Access
  • LTE Long Term Evolution
  • WiBro Wireless Broadband Internet
  • RF Radio Frequency
  • Wireless LAN Wireless Fidelity
  • NFC Near Field Communication
  • Bluetooth infrared communication
  • FIGS. 6 to 13 illustrate exemplary operations of a dispensing mapping device according to an embodiment of the present invention.
  • the input unit 310 may receive analysis information from a user.
  • the analysis information may include information about at least one of a plurality of samples to be analyzed, a detection gene for each sample and a primer corresponding to the detection gene, an arrangement on the sample plate of the sample, and an arrangement on the primer plate of the primer.
  • Such analysis information may be directly received from the user through the input unit 310, or may be received from a user terminal connected via wired or wireless communication.
  • the analysis information may be input or provided in the form of listing primers corresponding to one or more genes to be detected for each of the plurality of samples, as shown in FIG. 6.
  • the detection gene and the primer corresponding to each sample may be the same or different at least a part.
  • the analysis information received in step S310 may be implemented to include information about the total number of samples and detection genes. That is, in this case, the user can be provided with a dispensing design suitable for multiple analysis of the sample only by inputting the total sample and the number of detection genes.
  • the arrangement unit 343 may partition the reaction plate into a plurality of regions.
  • the step S420 may be performed based on at least one of the maximum number of simultaneous dispensing units of the dispensing unit, the interval between the dispensing nozzles, and the interval between the plurality of wells constituting the reaction plate.
  • at least one of the rows and columns of the partitioned area may be equal to the maximum number of simultaneous dispensing units of the dispensing unit.
  • the maximum number of simultaneous dispensing units of a dispensing unit is eight
  • the reaction plate consists of 384 wells (16 rows x 24 columns)
  • the spacing between the dispensing nozzles is the spacing between the reaction plate wells.
  • the arrangement 343 may primary partition the reaction plate into four regions (8 rows X 12 columns) by alternately selecting the columns and rows of the wells, respectively.
  • the primary partitioned area is composed of eight rows with the same maximum number of possible divisions.
  • the arranging unit 343 divides the columns of the first partitioned region into eight regions based on the maximum number of simultaneous possible dispensing, and is divided into six regions (first to sixth regions) as shown in FIG. 7. Can be partitioned
  • information such as the maximum number of simultaneous dispensing of the dispensing unit which is the basis of performing the step S420, may be information received from the user together with the analysis information or stored as a default in the storage unit 330.
  • the cluster unit 341 may group at least one of the plurality of samples and the primers into at least one group based on the analysis information.
  • the maximum number of samples and / or primers belonging to each group may be equal to the maximum number of simultaneous dispensing units of the dispensing unit.
  • the cluster unit 341 may group a plurality of primers into one or more groups in a manner of sequentially giving priority to the number of divisions of the primers and the arrangement order on the primer plates and sequentially arranging them on the virtual plate. .
  • the primers included in the assay information may have different arrangement orders on the primer plate, and at least some primers may be different from the primers having different frequency of division. . That is, as shown in FIG. 6, since the two primers P9 and P28 are not applied to the sample 10, the two primers may have 9 divisions, unlike other primers having 10 divisions.
  • the cluster unit 341 preferentially distributes the primers having a fractional number of ten times to the maximum number of simultaneous dispensing units (for example, eight) of the dispensing unit.
  • Grouping of primers can be performed by arranging from the first row on the same imaginary plate and then placing the primers with a frequency of 9 divisions. At this time, among the primers having the same number of divisions, primers having a rapid arrangement order on the primer plate may be preferentially arranged on the virtual plate. Accordingly, the primers are to be grouped into four groups, as shown in FIG.
  • the group divided in step S430 is one dispensing unit, as described below, may be arranged (or divided) at least one time in the reaction plate or mixing plate (mixing plate).
  • the calculation unit 342 may calculate the number of simultaneous dispensing and the number of single dispensing for at least one of the samples and the primers belonging to each group.
  • primers grouped into four groups in FIG. 8A may have only 10 simultaneous fractions of primers belonging to the first to third groups from the left.
  • the primer belonging to the third group may have nine simultaneous dispensing times, and may have one single dispensing number for each of the two primers P26 and P27.
  • the arranging unit 343 may sequentially arrange the plurality of samples and primers on the reaction plate partitioned into a plurality of regions based on the number of simultaneous dispensing and / or the number of single dispensing calculated in operation S440.
  • the arranging unit 343 may sequentially arrange at least one of the sample and the primer belonging to each group in the partitioned region of the reaction plate corresponding to the number of simultaneous dispensing. At this time, the arrangement may be performed preferentially on samples and / or primers belonging to a group having a higher number of simultaneous dispensing.
  • the step S450 may be performed by arranging at least one of the sample and the primer belonging to each of the groups sequentially in the remaining region of the reaction plate based on the number of single dispensing. Can be.
  • the arrangement unit 343 may be configured such that the array units 343 may be configured from the first row of the first region of the reaction plate in response to the number of simultaneous dispensing of the primers P1 to P8 belonging to the first group.
  • the primers P26, P27, P9, and P28 belonging to the fourth group were then arranged in response to the number of simultaneous dispensing.
  • the arrangement based on the number of simultaneous dispensing can be performed by arranging nine times. Further, when the arrangement based on the number of simultaneous dispensing is completed, the arrangement unit 343 then arranges the second primer P26, P27 of the fourth group having a single dispensing frequency in the remaining region of the fifth region, thereby causing the reaction plate. The arrangement of the plurality of primers for can be completed.
  • the arrangement of the plurality of samples relative to the reaction plate may be performed corresponding to the arrangement of the primers. That is, for example, when the arrangement 343 completes the arrangement based on the number of simultaneous and single dispensing for the group in the primer, the arrangement for the sample is as shown in FIG. 10. It may be implemented to be performed corresponding to the arrangement.
  • the result of the arrangement of the sample and the primer for the reaction plate is output to the user through the display unit 320, or may be displayed to the user by being transmitted to the user terminal connected by wired, wireless communication.
  • the arrangement unit 343 may arrange the primers on the mixing plate based on the grouping result of operation S430.
  • the mixing plate is for mixing various reagents (e.g., master mix, etc.) prior to dispensing the primer into the reaction plate, and in the same manner as the sample plate and the primer plate, 96 wells (8 rows by 12 columns) It may be configured to include.
  • the arrangement of the primer on the mixing plate may be the same as the primer arrangement on the imaginary plate used for grouping in step S430, or only the starting position is horizontally shifted differently.
  • the mapping unit 344 may map the sample array of the sample plate and the reaction plate, and the primer array of the primer plate, the mixing plate, and the reaction plate. This mapping can be done by interconnecting the coordinates of the wells in which the same sample and primer are arranged in each plate.
  • FIGS. 12 and 13 illustrate the arrangement of the primers of the primer plate, the reaction plate and the mixing plate shown in FIGS. 2B, 9 and 11 may be mapped to each other as shown in FIGS. 12 and 13.
  • FIG. 12 illustrates the mapping result between the primer plate and the mixing plate
  • FIG. 13 may illustrate the mapping result between the mixing plate and the reaction plate.
  • the operation method 400 when the step S470 is completed, the grouping result, the number of simultaneous and single dispenses calculated for the sample and / or primer group in response to the analysis information, the sample and primer for the reaction plate
  • the method may further include storing at least one of the arrangement and the final mapping result in the storage unit 330.
  • the stored mapping result can be provided or transmitted to the user.
  • the operation method 400 when performing the multiple analysis based on the mapping result, calculating at least one of the expected dispensing time, the number of dispensing nozzles, and the moving distance of the dispensing nozzles; It may further include. Such information may be stored in the storage unit 330 together with the mapping result.
  • the method 400 of operation further includes receiving a user's request for editing and modifying the arrangement on the reaction plate and / or the arrangement on the mixing plate based on the grouping of the sample or primer. can do. Through this, the user can modify the grouping of the sample or primer, the arrangement of the sample and the primer by reflecting his or her preference, the actual experimental situation, and the like.
  • FIG. 5 is a flowchart illustrating a method of operating a dispensing mapping device according to an embodiment of the present invention.
  • the dispensing mapping device 300 may automatically recommend at least one arrangement of a sample and a primer.
  • steps S510, S520, S540, and S550 of the operation method 500 of FIG. 5 are the same as steps S410, S420, S460, and S470 of the operation method 400 of FIG. And detailed description thereof will be omitted.
  • the recommendation unit 345 may recommend an arrangement on the reaction plate of the sample and primer suitable for the analysis information in response to receiving the analysis information. That is, when the analysis information is received from the user, the recommendation unit 345 may search the storage unit 330 to search for an array of samples and primers suitable for the analysis information, and provide the same to the user.
  • step S530 may be performed based on a predetermined criterion including at least one of a dispensing time, a number of dispensing nozzles, and a moving distance of the dispensing nozzles.
  • the user may select at least one of the time required for dispensing, the number of dispensing of the dispensing nozzle, and the moving distance of the dispensing nozzle as a recommendation criterion
  • the recommendation unit 345 may include a sample input by the user and a detection gene of each sample or One or more arrays corresponding to the information of the primer may be detected, and an array matching the criteria selected by the user among the detected arrays may be recommended to the user.
  • various embodiments described herein may be implemented by hardware, middleware, microcode, software, and / or combinations thereof.
  • various embodiments may include one or more application specific semiconductors (ASICs), digital signal processors (DSPs), digital signal processing devices (DSPDs), programmable logic devices (PLDs), field programmable gate arrays (FPGAs). ), Processors, controllers, microcontrollers, microprocessors, other electronic units designed to perform the functions presented herein, or a combination thereof.
  • ASICs application specific semiconductors
  • DSPs digital signal processors
  • DSPDs digital signal processing devices
  • PLDs programmable logic devices
  • FPGAs field programmable gate arrays
  • Processors controllers, microcontrollers, microprocessors, other electronic units designed to perform the functions presented herein, or a combination thereof.
  • various embodiments may be embedded in or encoded on a computer-readable medium containing instructions. Instructions embedded in or encoded on a computer-readable medium may cause a programmable processor or other processor to perform a method, for example, when the instructions are executed.
  • Computer-readable media includes computer storage media. The storage medium may be any available medium that can be accessed by a computer.
  • such computer-readable media may include RAM, ROM, EEPROM, CD-ROM, or other optical disk storage media, magnetic disk storage media or other magnetic storage devices, or instructions or computer-accessible instructions or desired program code. It may include any other medium that can be used to store in the form of data structures.
  • Such hardware, software, firmware, etc. may be implemented within the same device or within separate devices to support the various operations and functions described herein.
  • the components, units, modules, components, etc., described herein as "parts" may be implemented separately or separately as discrete but interoperable logic devices.
  • the depiction of different features for modules, units, etc. is intended to highlight different functional embodiments and does not necessarily mean that they must be realized by individual hardware or software components. Rather, functionality associated with one or more modules or units may be performed by separate hardware or software components or integrated into common or separate hardware or software components.

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Theoretical Computer Science (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
  • Evolutionary Biology (AREA)
  • Medical Informatics (AREA)
  • Pure & Applied Mathematics (AREA)
  • Clinical Laboratory Science (AREA)
  • Computational Mathematics (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Mathematical Analysis (AREA)
  • Mathematical Optimization (AREA)
  • Computing Systems (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
  • Automatic Analysis And Handling Materials Therefor (AREA)

Abstract

본 발명의 일 실시예에 따라 다중 분석을 수행하기 위한 분주 매핑 장치 및 그 동작 방법이 제공된다. 상기 방법은, 분석 정보를 수신하는 단계 - 상기 분석 정보는 분석 대상인 복수의 샘플, 상기 샘플 각각에 대한 검출 유전자 및 상기 검출 유전자에 대응하는 프라이머 중 적어도 하나에 관한 정보를 포함함 -; 반응 플레이트를 복수의 영역으로 구획하는 단계; 및 상기 반응 플레이트의 구획된 영역 상에 순차적으로 상기 샘플 및 상기 프라이머를 배열하는 단계를 포함할 수 있다.

Description

다중 분석을 수행하기 위한 분주 매핑 장치 및 그 동작 방법
본 발명은 다중 분석을 수행하기 위한 분주 매핑 장치 및 그 동작 방법에 관한 것으로서, 구체적으로 다중 분석에 있어서 분석 정보에 최적화된 분주 순서 및 조합을 설계할 수 있는 분주 매핑 장치 및 그 동작 방법에 관한 것이다.
중합효소 연쇄 반응, 즉 PCR(Polymerase Chain Reaction)은 핵산을 포함하는 샘플 용액을 반복적으로 가열 및 냉각하여 핵산의 특정 염기 서열을 갖는 부위를 연쇄적으로 복제하여 그 특정 염기 서열 부위를 갖는 핵산을 기하급수적으로 증폭하는 기술로써, 생명과학, 유전공학 및 의료 분야 등에서 분석 및 진단 목적으로 널리 사용되고 있다.
한편, 위와 같은 핵산 증폭에 기초한 통한 진단이나 특정 유전자의 검색 기법은 한번에 하나의 주형을 검색한다는 점에서 한계를 가진다. 예를 들어, 같은 환자에게 같은 증상이 발생할지라도 발병의 원인이 여러 종류의 감염성 병원체에 의한 경우가 많아서 다양한 병원체의 진단이 개별적으로 필요하게 되는데, 여러 개의 주형을 증폭해야 하는 이러한 상황에서 각각의 주형을 한번에 하나씩 증폭하는 것은 번거롭고 시간을 많이 소비하는 작업이다. 또한, 일반적인 환경에서 제한된 시료에서 추출할 수 있는 핵산의 양은 유한하므로, 제한된 양의 핵산을 이용하여 핵산 증폭을 통한 반복적인 진단이 불가능할 경우가 자주 발생할 수 있다.
이러한 문제점을 해결하기 위하여, 1 이상의 시료로부터 동시에 많은 주형의 핵산을 분석하기 위한 다중 분석 방법이 도입된 바 있다.
통상적으로 이러한 다중 분석은 복수 개의 노즐을 가지는 분주 장치를 이용하여, 복수의 시료, 프라이머(primer), 시약 등을 복수의 웰을 포함하는 반응 플레이트(reaction plate)로 순차적으로 분주하는 방식으로 분석이 수행되는데, 시료 또는 검출하고자 하는 핵산이 다수일수록 이러한 분주의 수행에 소요되는 증대될 수밖에 없다. 따라서, 다중 분석에 있어서 이러한 시료, 프라이머 등에 대한 분주 순서 또는 조합을 얼마나 효과적으로 디자인 하느냐는 전체적인 분석 시간을 결정하는 중요한 요인 중 하나라 할 수 있다.
이로 인해, 시료 또는 검출 핵산의 개수 등에 따라 최적의 분주 순서 및 조합을 디자인하는 기술에 대한 요구가 증대하고 있으나, 현재까지, 이와 관련하여 실제 구현된 기술은 거의 전무한 실정이다.
본 발명은 상기 문제점을 해결하기 위한 것으로서, 다중 분석에 있어서 분석 정보에 최적화된 샘플 또는 프라이머 등의 분주 순서 및 조합을 설계할 수 있는 다중 분석을 수행하기 위한 분주 매핑 장치 및 그 동작 방법을 제공하는 것을 목적으로 한다.
본 발명의 기술적 과제들은 이상에서 언급한 기술적 과제들로 제한되지 않으며, 언급되지 않은 또 다른 기술적 과제들은 아래의 기재들로부터 당업자에게 명확하게 이해될 수 있을 것이다.
본 발명의 일 실시예에 따라 다중 분석을 수행하기 위한 분주 매핑 장치의 동작 방법이 제공된다. 상기 방법은, 분석 정보를 수신하는 단계 - 상기 분석 정보는 분석 대상인 복수의 샘플, 상기 샘플 각각에 대한 검출 유전자 및 상기 검출 유전자에 대응하는 프라이머 중 적어도 하나에 관한 정보를 포함함 - ; 반응 플레이트를 복수의 영역으로 구획하는 단계; 및 상기 반응 플레이트의 구획된 영역 상에 순차적으로 상기 샘플 및 상기 프라이머를 배열하는 단계를 포함할 수 있다.
바람직하게는, 상기 복수의 영역으로 구획하는 단계는, 최대 동시 분주 가능 개수, 분주 노즐 사이의 간격 및 상기 반응 플레이트의 웰(well) 사이의 간격 중 적어도 하나에 기초하여 수행될 수 있다.
또한, 바람직하게는, 상기 반응 플레이트의 구획된 각 영역의 행 및 열 중 적어도 하나는 상기 최대 동시 분주 가능 개수와 동일할 수 있다.
또한, 바람직하게는, 상기 분석 정보를 기초로 상기 복수의 샘플 및 상기 프라이머 중 적어도 하나를 적어도 하나의 그룹으로 그룹핑하는 단계를 더 포함하고, 상기 복수의 샘플 및 상기 프라이머를 배열하는 단계는, 상기 그룹핑 결과에 기초하여 수행되며, 상기 그룹 각각에 속하는 최대 샘플 및 프라이머 수는 최대 동시 분주 가능 개수와 동일할 수 있다.
또한, 바람직하게는, 상기 분석 정보는 상기 프라이머의 프라이머 플레이트 상의 배열에 관한 정보를 더 포함하고, 상기 그룹핑하는 단계에서는, 상기 프라이머 각각의 분주 횟수 및 상기 프라이머 플레이트 상의 배열 순서에 순차적으로 우선 순위를 부여하여 상기 프라이머를 적어도 하나의 그룹으로 그룹핑할 수 있다.
또한, 바람직하게는, 상기 그룹 각각에 속하는 샘플 및 프라이머 중 적어도 하나에 대하여 동시 분주 횟수를 산출하는 단계를 더 포함하고, 상기 샘플 및 상기 프라이머를 배열하는 단계는, 상기 그룹 각각에 속하는 상기 샘플 및 상기 프라이머 중 적어도 하나를 상기 동시 분주 횟수에 대응하여 상기 반응 플레이트의 구획된 영역에 순차적으로 배열함으로써 수행될 수 있다.
또한, 바람직하게는, 상기 샘플 및 상기 프라이머를 배열하는 단계에서는, 상기 동시 분주 횟수가 많은 그룹에 속하는 샘플 및 프라이머 대하여 우선적으로 배열을 수행할 수 있다.
또한, 바람직하게는, 상기 그룹 각각에 속한 샘플 및 프라이머 중 적어도 하나에 대하여 동시 분주 횟수 및 단일 분주 횟수를 산출하는 단계를 더 포함하고, 상기 샘플 및 상기 프라이머를 배열하는 단계는, 상기 그룹 각각에 속하는 상기 샘플 및 상기 프라이머 중 적어도 하나를 상기 동시 분주 횟수에 대응하여 상기 반응 플레이트의 구획된 영역에 순차적으로 배열하는 단계; 및 상기 동시 분주 횟수에 따른 배열이 완료되면, 상기 그룹 각각에 속하는 상기 샘플 및 상기 프라이머 중 적어도 하나를 상기 단일 분주 횟수에 기초하여, 상기 반응 플레이트의 나머지 영역에 순차적으로 배열하는 단계를 포함할 수 있다.
또한, 바람직하게는, 상기 분석 정보는 상기 샘플의 샘플 플레이트 상의 배열 및 상기 프라이머의 프라이머 플레이트 상의 배열에 관한 정보를 더 포함하고, 상기 방법은, 상기 그룹핑 결과에 기초하여, 상기 프라이머를 믹싱(mixing) 플레이트에 배열하는 단계; 및 상기 샘플 플레이트와 상기 반응 플레이트의 샘플 배열 및 상기 프라이머 플레이트, 상기 믹싱 플레이트와 상기 반응 플레이트의 프라이머 배열을 상호 매핑(mapping)하는 단계를 더 포함할 수 있다.
또한, 바람직하게는, 상기 매핑이 완료되면, 상기 분석 정보에 대응하여 상기 그룹핑 결과, 상기 동시 분주 횟수와 상기 단일 분주 횟수, 상기 반응 플레이트에 대한 상기 샘플과 상기 프라이머의 배열 및 상기 매핑 결과 중 적어도 하나를 저장부에 저장하는 단계를 더 포함할 수 있다.
또한, 바람직하게는, 상기 분석 정보의 수신에 응답하여, 소정의 기준에 따라 상기 분석 정보에 적합한 상기 샘플 및 상기 프라이머의 상기 반응 플레이트 상의 배열을 추천하는 단계를 더 포함하고, 상기 기준은 분주 소요 시간, 분주 노즐의 교체 횟수 및 상기 분주 노즐의 이동 거리 중 적어도 하나를 포함할 수 있다.
본 발명의 일 실시예에 따라 상기 방법을 수행하기 위한 프로그램이 기록된 컴퓨터 판독 가능한 기록매체가 제공된다.
본 발명의 일 실시예에 따라 다중 분석을 수행하기 위한 분주 매핑 장치가 제공된다. 상기 장치는, 분석 정보를 수신하는 입력부 - 상기 분석 정보는 분석 대상인 복수의 샘플, 상기 샘플 각각에 대한 검출 유전자 및 상기 검출 유전자에 대응하는 프라이머 중 적어도 하나에 관한 정보를 포함함 - ; 및 반응 플레이트를 복수의 영역으로 구획하고, 상기 반응 플레이트의 구획된 영역 상에 순차적으로 상기 샘플 및 상기 프라이머를 배열하는 배열부를 포함할 수 있다.
바람직하게는, 상기 배열부는, 최대 동시 분주 가능 개수, 분주 노즐 사이의 간격 및 상기 반응 플레이트의 웰(well) 사이의 간격 중 적어도 하나에 기초하여 상기 반응 플레이트를 복수의 영역으로 구획할 수 있다.
또한, 바람직하게는, 상기 반응 플레이트의 구획된 각 영역의 행 및 열 중 적어도 하나는 상기 최대 동시 분주 가능 개수와 동일할 수 있다.
또한, 바람직하게는, 상기 분석 정보를 기초로 상기 복수의 샘플 및 상기 프라이머 중 적어도 하나를 적어도 하나의 그룹으로 그룹핑하는 클러스터부를 더 포함하고, 상기 배열부는, 상기 그룹핑 결과에 기초하여 상기 복수의 샘플 및 상기 프라이머의 배열을 수행하며, 상기 그룹 각각에 속하는 최대 샘플 및 프라이머 수는 최대 동시 분주 가능 개수와 동일할 수 있다.
또한, 바람직하게는, 상기 분석 정보는 상기 프라이머의 프라이머 플레이트 상의 배열에 관한 정보를 더 포함하고, 상기 클러스터부는, 상기 프라이머 각각의 분주 횟수 및 상기 프라이머 플레이트 상의 배열 순서에 순차적으로 우선 순위를 부여하여 상기 프라이머를 적어도 하나의 그룹으로 그룹핑할 수 있다.
또한, 바람직하게는, 상기 그룹 각각에 속하는 샘플 및 프라이머 중 적어도 하나에 대하여 동시 분주 횟수를 산출하는 산출부를 더 포함하고, 상기 배열부는, 상기 그룹 각각에 속하는 상기 샘플 및 상기 프라이머 중 적어도 하나를 상기 동시 분주 횟수에 대응하여 상기 반응 플레이트의 구획된 영역에 순차적으로 배열할 수 있다.
또한, 바람직하게는, 상기 배열부는, 상기 동시 분주 횟수가 많은 그룹에 속하는 샘플 및 프라이머 대하여 우선적으로 배열을 수행할 수 있다.
또한, 바람직하게는, 상기 그룹 각각에 속한 샘플 및 프라이머 중 적어도 하나에 대하여 동시 분주 횟수 및 단일 분주 횟수를 산출하는 산출부를 더 포함하고, 상기 배열부는, 상기 그룹 각각에 속하는 상기 샘플 및 상기 프라이머 중 적어도 하나를 상기 동시 분주 횟수에 대응하여 상기 반응 플레이트의 구획된 영역에 순차적으로 배열하고, 상기 동시 분주 횟수에 따른 배열이 완료되면, 상기 그룹 각각에 속하는 상기 샘플 및 상기 프라이머 중 적어도 하나를 상기 단일 분주 횟수에 기초하여, 상기 반응 플레이트의 나머지 영역에 순차적으로 배열할 수 있다.
또한, 바람직하게는, 상기 분석 정보는 상기 샘플의 샘플 플레이트 상의 배열 및 상기 프라이머의 프라이머 플레이트 상의 배열에 관한 정보를 더 포함하고, 상기 장치는, 상기 배열부가 상기 그룹핑 결과에 기초하여 상기 프라이머를 믹싱(mixing) 플레이트에 배열하면, 상기 샘플 플레이트와 상기 반응 플레이트의 샘플 배열 및 상기 프라이머 플레이트, 상기 믹싱 플레이트와 상기 반응 플레이트의 프라이머 배열을 상호 매핑(mapping)하는 매핑부를 더 포함할 수 있다.
또한, 바람직하게는, 상기 매핑이 완료되면, 상기 분석 정보에 대응하여 상기 그룹핑 결과, 상기 동시 분주 횟수와 상기 단일 분주 횟수, 상기 반응 플레이트에 대한 상기 샘플과 상기 프라이머의 배열 및 상기 매핑 결과 중 적어도 하나를 저장하는 저장부를 더 포함할 수 있다.
또한, 바람직하게는, 상기 분석 정보의 수신에 응답하여, 소정의 기준에 따라 상기 분석 정보에 적합한 상기 샘플 및 상기 프라이머의 상기 반응 플레이트 상의 배열을 추천하는 추천부를 더 포함하고, 상기 기준은 분주 소요 시간, 분주 노즐의 교체 횟수 및 상기 분주 노즐의 이동 거리 중 적어도 하나를 포함할 수 있다.
본 발명에 따르면, 상이한 개수의 샘플 및 검출 유전자를 가지는 다중 분석에 대해 각각 최적화된 분주 순서 및 조합에 대한 설계를 용이하게 수행할 수 있다.
또한, 본 발명에 따르면, 분주 유닛의 동시 분주 가능 횟수 등을 고려하여 반응 플레이트를 복수의 영역으로 구획하고 분주를 위한 샘플 및 프라이머의 배열을 수행함으로써, 반응 플레이트의 공간을 보다 효율적으로 이용할 수 있다.
또한, 본 발명에 따르면, 샘플 또는 프라이머를 하나의 단위로 동시 분주 가능한 1 이상의 그룹으로 분류하고, 동시 분주 횟수 등에 기초하여 그룹 단위로 반응 플레이트에 배치함으로써, 분석 수행에 따른 분주 노즐의 교환 횟수, 이동 경로, 분주 시간 등을 최적화할 수 있다.
또한, 본 발명에 따르면, 다중 분석에 필요한 분주 순서 및 조합을 최적화함으로써, 분석 장치의 러닝 코스트(running cost)를 절감할 수 있다.
또한, 본 발명에 따르면, 반응 플레이트에 대한 샘플 및 프라이머의 배열, 플레이트 간의 매핑 결과를 저장하여 데이터베이스화함으로써, 사용자에게 보다 신속하게 분석 정보에 적합한 분주 설계 기능을 제공할 수 있다.
본 발명의 상세한 설명에서 인용되는 도면을 보다 충분히 이해하기 위하여 각 도면의 간단한 설명이 제공된다.
도 1은 본 발명의 일 실시예에 따른 반응 플레이트를 도시한다.
도 2는 본 발명의 일 실시예에 따른 샘플 플레이트 및 프라이머 플레이트를 도시한다.
도 3은 본 발명의 일 실시예에 따른 분주 매핑 장치를 도시한다.
도 4는 본 발명의 일 실시예에 따른 분주 매핑 장치의 동작 방법을 도시한다.
도 5는 본 발명의 일 실시예에 따른 분주 매핑 장치의 동작 방법을 도시한다.
도 6 내지 도 13은 본 발명의 일 실시예에 따른 분주 매핑 장치의 예시적인 동작을 도시한다.
이하, 본 발명에 따른 실시예들은 첨부된 도면들을 참조하여 설명한다. 각 도면의 구성요소들에 참조부호를 부가함에 있어서, 동일한 구성요소들에 대해서는 비록 다른 도면상에 표시되더라도 가능한 한 동일한 부호를 가지도록 하고 있음에 유의해야 한다. 또한, 본 발명의 실시예를 설명함에 있어, 관련된 공지 구성 또는 기능에 대한 구체적인 설명이 본 발명의 실시예에 대한 이해를 방해한다고 판단되는 경우에는 그 상세한 설명은 생략한다. 또한, 이하에서 본 발명의 실시예들을 설명할 것이나, 본 발명의 기술적 사상은 이에 한정되거나 제한되지 않고 당업자에 의해 변형되어 다양하게 실시될 수 있다.
명세서 전체에서, 어떤 부분이 다른 부분과 "연결"되어 있다고 할 때, 이는 "직접적으로 연결"되어 있는 경우뿐 아니라, 그 중간에 다른 소자를 사이에 두고 "간접적으로 연결"되어 있는 경우도 포함한다. 명세서 전체에서, 어떤 부분이 어떤 구성요소를 "포함"한다고 할 때, 이는 특별히 반대되는 기재가 없는 한 다른 구성요소를 제외하는 것이 아니라 다른 구성요소를 더 포함할 수 있는 것을 의미한다. 또한, 본 발명의 실시예의 구성 요소를 설명하는 데 있어서, 제 1, 제 2, A, B, (a), (b) 등의 용어를 사용할 수 있다. 이러한 용어는 그 구성 요소를 다른 구성 요소와 구별하기 위한 것일 뿐, 그 용어에 의해 해당 구성 요소의 본질이나 차례 또는 순서 등이 한정되지 않는다.
도 1은 본 발명의 일 실시예에 따른 반응 플레이트를 도시하며, 도 2의 (a)는 본 발명의 일 실시예에 따른 샘플 플레이트를, 도 2의 (b)는 본 발명의 일 실시예에 따른 프라이머 플레이트를 각각 도시한다.
본 발명에서, 반응 플레이트(reaction plate)는 다중 분석을 위해 복수의 샘플 각각에 프라이머(primer), 시약(regent) 등을 혼합하여 소정의 반응(예를 들어, 중합효소 연쇄반응(polymerase chain reaction, PCR) 등)이 수행되는 플레이트로서, 도 1에서 도시되는 바와 같이, 상기 반응이 각각 수행될 수 있는 384개(16행X24열)의 웰(well)을 포함하도록 구현될 수 있다. 이때, 반응 플레이트를 구성하는 복수의 웰은, 도 1에서 도시되는 바와 같이, 행과 열의 조합에 의해, 예를 들어, A01, B01, C01… 등으로 좌표화될 수 있다.
샘플 플레이트(sample plate)와 프라이머 플레이트(primer plate)은 각각, 검출 대상이 되는 1 이상의 유전자를 포함하는 복수의 샘플과 이러한 검출 대상 유전자에 대응하는 프라이머가 배치되는 플레이트를 지칭할 수 있다. 여기서 샘플은, 예를 들어, 사람, 동물 등으로부터 채취된 혈액, 타액, 분비물, 세포 등을 포함할 수 있으며, 프라이머는 PCR 반응을 개시하기 위한 것으로서 검출 대상 유전자의 일부 서열에 상보적인 염기 서열로 구성될 수 있다.
샘플 플레이트와 프라이머 플레이트는 96개(8행X12열)의 웰을 포함하도록 구성될 수 있다. 예를 들어, 도 2에서 도시되는 바와 같이, 샘플 플레이트에는 S1, S2… 등으로 순차적으로 넘버링되는 96개의 샘플이 좌측 열에서 우측 열 방향으로 순차적으로 배치될 수 있으며, 프라이머 플레이트에는 49개의 검출 대상 유전자에 대응하는 프라이머가 P1, P2… 등으로 순차적으로 넘버링되어 동일한 방식으로 배치될 수 있다. 더하여, 샘플 플레이트와 프라이머 플레이트이 웰 역시, 반응 플레이트와 동일하게, 행과 열의 조합에 의해, 예를 들어, A01, B01, C01… 등으로 좌표화될 수 있음은 물론이다.
다만, 이러한 반응 플레이트, 샘플 플레이트 및 프라이머 플레이트의 구성은 예시적인 것으로서, 플레이트 각각의 웰의 개수, 배치 등의 구성은, 본 발명이 적용되는 실시예에 따라, 사용자의 설정 등에 기초하여 다양하게 변경될 수 있다.
한편, 도시되어 있지는 않지만, 샘플 플레이트와 반응 플레이트 사이, 및/또는 프라이머 플레이트와 반응 플레이트 사이의 샘플 및/또는 프라이머의 이송은 분주 유닛(dispensing unit)을 통해 수행될 수 있다. 이러한 분주 유닛은 일 방향으로 연속 배치되는 복수의 분주 노즐을 포함할 수 있으며, 이러한 분주 노즐이 각각의 플레이트의 웰에 정렬되는 방식으로 샘플 또는 프라이머 등을 이송하도록 구성될 수 있다.
본 발명에 따르면, 사용자가 실제 이용하는 플레이트, 분주/분석 장치에 대응하는 샘플 플레이트, 프라이머 플레이트, 반응 플레이트, 가상의 분주 유닛 등을 통하여, 상이의 샘플 및 유전자의 다중 분석에 적합한 최적의 분주 순서 및 조합에 대한 설계(design)를 제공할 수 있다. 이에 관한 구체적인 방식은 이하에서 도 3 내지 도 13을 참조하여 상술하기로 한다.
도 3은 본 발명의 일 실시예에 따른 분주 매핑 장치를 도시한다.
도 3을 참조하면, 분주 매핑 장치(300)는 입력부(310), 표시부(320), 저장부(330) 및 제어부(340)를 포함할 수 있다.
입력부(310)는 분주 매핑 장치(300)의 사용자에 의해 다양한 데이터가 수신될 수 있다. 특히, 본 발명에 따른 분주 매핑 장치(300)에 있어서, 입력부(310)는 사용자로부터 다중 분석을 수행하기 위한 분석 정보를 수신할 수 있다. 여기서 분석 정보는 분석 대상인 복수의 샘플, 샘플 각각에 대한 검출 유전자 및 검출 유전자에 대응하는 프라이머, 샘플의 샘플 플레이트 상의 배열, 프라이머의 프라이머 플레이트 상의 배열 중 적어도 하나에 관한 정보를 포함할 수 있다. 더하여, 상기 데이터에는 각각 플레이트의 웰 개수, 배치 등에 관한 정보, 반응에 사용되는 시약, 분주 유닛 등에 관한 정보를 더 포함할 수 있으나, 이에 한정되지 않는다. 입력부(310)는 키(key), 터치 패널, 터치 스크린 등 당해 기술 분야에서 적용 가능한 다양한 입력 장치가 이용될 수 있다.
표시부(320)는 제어부(340)로부터 제공되는 이미지 또는 데이터(예를 들어, 각각의 플레이트에 대한 샘플 및/또는 프라이머의 배열 정보, 플레이트 간 배열 매핑 정보 등)를 화면에 표시하고, 분주 매핑 장치(300)의 동작을 위해 요구되는 사용자의 입력을 위한 사용자 인터페이스를 제공할 수 있다. 표시부는 액정표시장치(LCD, Liquid Crystal Display), 유기 발광 다이오드(OLED, Organic Light Emitting Diodes), 능동형 유기 발광 다이오드(AMOLED, Active Matrix Organic Light Emitting Diodes) 등으로 형성될 수 있다.
저장부(330)에는 분주 매핑 장치(300)의 동작에 수반되는 다양한 데이터가 저장될 수 있다. 상기 데이터에는 다중 분석을 수행하기 위한 분석 정보, 각각의 플레이트에 대한 샘플 및/또는 프라이머의 배열 정보, 플레이트 간 배열 매핑 정보 등 등이 포함될 수 있으나, 이에 한정되지 않는다. 저장부(330)는, 통상의 기술자에게 알려진 바와 같이, HDD(Hard Disk Drive), ROM(Read Only Memory), RAM(Random Access Memory), EEPROM(Electrically Erasable and Programmable Read Only Memory), 플래시 메모리(flash memory), CF(Compact Flash) 카드, SD(Secure Digital) 카드, SM(Smart Media) 카드, MMC(Multimedia) 카드 또는 메모리 스틱(Memory Stick) 등 정보의 입출력이 가능한 다양한 형태의 저장 장치로 구현될 수 있으며, 분주 매핑 장치(300) 내부에 구비되거나, 별도의 장치에 구비될 수 있다.
제어부(340)는 분주 매핑 장치(300)의 전반적인 동작 및 그 내부 구성들 간의 신호 흐름을 제어하고, 데이터를 처리하는 데이터 처리 기능을 수행할 수 있다. 이를 위해 제어부(340)는, 클러스터부(341), 산출부(342), 배열부(343), 매핑부(344) 및 추천부(345)를 포함할 수 있다.
클러스터부(341)는 분석 정보를 기초로 복수의 샘플 및 프라이머 중 적어도 하나를 적어도 하나의 그룹으로 그룹핑할 수 있다. 이때, 그룹 각각에 속하는 최대 샘플 및/또는 프라이머 수는 분주 유닛의 최대 동시 분주 가능 개수와 동일할 수 있다. 예를 들어, 이러한 그룹핑은 샘플 또는 프라이머의 분주 횟수, 각각의 플레이트 상의 배열 순서 등에 기초하여 샘플 또는 프라이머를 가상의 플레이트에 순차적으로 배열하는 방식으로 수행될 수 있다. 클러스터부(341)에 의해 분할된 그룹은 하나의 분주 단위로서 반응 플레이트 또는 믹싱 플레이트(mixing plate)에 1회 이상 동시 배열(또는 분주)될 수 있다.
산출부(342)는 클러스터부(341)에 의해 그룹핑된 샘플 및/또는 프라이머에 대하여 각각의 그룹 별로 동시 분주 횟수 및/또는 단일 분주 횟수를 산출할 수 있다. 여기서, 동시 분주 횟수는 동일 그룹에 속하는 샘플 또는 프라이머 전체가 분주 유닛을 통해 동시에 반응 플레이트 등에 분주 가능한 횟수를 지칭할 수 있으며, 단일 분주 횟수는 동시 분주 이후 단독으로 분주되는 샘플 또는 프라이머의 분주 횟수를 지칭할 수 있다.
배열부(343)는 반응 플레이트를 복수의 영역으로 구획할 수 있다. 예를 들어, 배열부(343)는 분주 유닛의 최대 동시 분주 가능 개수, 분주 노즐 사이의 간격 및 반응 플레이트를 구성하는 복수의 웰 사이의 간격 중 적어도 하나에 기초하여 반응 플레이트를 복수의 영역으로 구획할 수 있다. 이때, 구획된 영역의 행과 열 중 적어도 하나는 분주 유닛의 최대 동시 분주 가능 개수와 동일할 수 있다.
또한, 배열부(343)는 클러스터부(341)에 의한 프라이머의 그룹핑 결과에 기초하여 프라이머를 믹싱 플레이트에 배치하거나, 산출부(342)에 의해 산출된 각 그룹에 속하는 샘플 및/또는 프라이머의 동시 분주 횟수 및/또는 단일 분주 횟수에 기초하여, 복수의 샘플 및 프라이머를 반응 플레이트의 구획된 영역에 순차적으로 배열할 수 있다.
매핑부(344)는 반응 플레이트에 대한 샘플과 프라이머의 배열이 완료되면, 샘플 플레이트와 반응 플레이트의 샘플 배열, 및, 프라이머 플레이트, 믹싱 플레이트와 반응 플레이트의 프라이머 배열을 상호 매핑(mapping)할 수 있다. 이러한 매핑은 각 플레이트에서 동일 샘플 및 프라이머가 배열되는 웰의 좌표를 상호 연결하는 방식으로 수행될 수 있다. 이러한 매핑 결과는 사용자에게 제공될 수 있으며, 사용자는 이러한 매핑 결과를 기초로 실제 분주 또는 분석 장치를 제어함으로써, 샘플에 대한 다중 분석을 수행하게 된다.
추천부(345)는 분석 정보 수신에 응답하여, 분석 정보에 적합한 샘플 및 프라이머의 반응 플레이트 상의 배열을 추천할 수 있다. 구체적으로, 추천부(345)는 저장부(330)를 검색하여 분석 정보에 적합한 샘플 및 프라이머의 배열을 검색하고, 이를 사용자에게 제공하도록 구성될 수 있다. 이 경우, 사용자는 추천된 배열 중 하나를 선택하는 간이한 방식만으로 자신의 분석에 적합하는 분주 순서 및 조합을 제공받을 수 있게 된다.
도 3에 도시되어 있지는 않지만, 분주 매핑 장치(300)는 통신부를 더 포함할 수 있다. 통신부는 외부와의 직접 연결 또는 네트워크를 통한 연결을 위해 제공되는 것으로서, 유선 및/또는 무선 통신부일 수 있다. 구체적으로, 통신부는 제어부(340), 저장부(330) 등으로부터의 데이터(예를 들어, 반응 플레이트에 대한 샘플 및 프라이머의 배열 정보 등)를 유선 또는 무선으로 전송하거나, 외부로부터 데이터)를 유선 또는 무선 수신하여 제어부(340)로 전달하거나 저장부(330)에 저장할 수 있다. 특히, 통신부는 분석 정보를 수신하여 제어부(340) 및 저장부(330)에 전달하도록 구성될 수 있으며, 이 경우, 통신부는 분석 정보를 수신하는 입력부(310)로서의 기능을 수행할 수 있다. 통신부는 랜(LAN), WCDMA(Wideband Code Division Multiple Access), LTE(Long Term Evolution), WiBro(Wireless Broadband Internet), RF(Radio Frequency)통신, 무선랜(Wireless LAN), 와이파이(Wireless Fidelity), NFC(Near Field Communication), 블루투스, 적외선 통신 등을 통해 통신할 수 있다. 다만, 이는 예시적인 것으로서, 본 발명이 적용되는 실시예에 따라 당해 기술분야에서 적용 가능한 다양한 유, 무선 통신 기술이 이용될 수 있다.
*도 4는 본 발명의 일 실시예에 따른 분주 매핑 장치의 동작 방법을 도시하며, 도 6 내지 도 13은 본 발명의 일 실시예에 따른 분주 매핑 장치의 예시적인 동작을 도시한다.
S410 단계에서, 입력부(310)는 사용자로부터 분석 정보를 수신할 수 있다. 여기서 분석 정보는 분석 대상인 복수의 샘플, 샘플 각각에 대한 검출 유전자 및 검출 유전자에 대응하는 프라이머, 샘플의 샘플 플레이트 상의 배열, 프라이머의 프라이머 플레이트 상의 배열 중 적어도 하나에 관한 정보를 포함할 수 있다. 이러한 분석 정보는, 입력부(310)를 통해 사용자로부터 직접 데이터를 입력받거나, 유, 무선 통신으로 연결된 사용자 단말로부터 수신될 수 있다.
예를 들어, 분석 정보는, 도 6에서 도시되는 바와 같이, 복수의 샘플 각각에 대하여 검출하고자 하는 1 이상의 유전자에 대응하는 프라이머를 나열하는 형태로 입력 또는 제공될 수 있다. 이때, 샘플 각각에 대응하는 검출 유전자 및 프라이머는 동일하거나, 적어도 일부가 상이할 수 있다.
또한, 실시예에 따라, 전체 샘플에 대해 동일한 유전자를 검출하도록 하도록 구성되는 경우에는, S310 단계에서 수신되는 분석 정보는 샘플 및 검출 유전자의 총 개수에 관한 정보를 포함하도록 구현될 수 있다. 즉, 이 경우, 사용자는 전체 샘플 및 검출 유전자 개수를 입력하는 것만으로 해당 샘플의 다중 분석에 적합한 분주 설계를 제공받을 수 있게 된다.
S420 단계에서, 배열부(343)는 반응 플레이트를 복수의 영역으로 구획할 수 있다. S420 단계는, 분주 유닛의 최대 동시 분주 가능 개수, 분주 노즐 사이의 간격 및 반응 플레이트를 구성하는 복수의 웰 사이의 간격 중 적어도 하나에 기초하여 수행될 수 있다. 이때, 구획된 영역의 행과 열 중 적어도 하나는 분주 유닛의 최대 동시 분주 가능 개수와 동일할 수 있다.
예를 들어, 도 7을 참조하면, 분주 유닛의 최대 동시 가능 분주 개수가 8개이고, 반응 플레이트가 384개(16행X24열)의 웰로 구성되며, 분주 노즐 사이의 간격이 반응 플레이트 웰 사이의 간격의 2배에 대응하는 경우, 배열부(343)는 웰의 열과 행을 각각 교번하여 선택하는 방식으로 반응 플레이트를 4개의 영역(8행X12열)으로 1차 구획할 수 있다. 이때, 1차 구획된 영역은 행이 최대 동시 가능 분주 개수와 동일한 8개로 구성되게 된다. 이어서, 배열부(343)는 1차 구획된 영역의 열을 다시 최대 동시 가능 분주 개수를 기초로 8개씩 분할하여, 도 7에 도시되는 바와 같이, 6개의 영역(제 1 내지 제 6 영역)으로 구획할 수 있다.
한편, S420 단계 수행의 기초가 되는 분주 유닛의 최대 동시 분주 가능 개수 등의 정보는, 분석 정보와 함께 사용자로부터 수신되거나, 저장부(330)에 디폴트(default)로 저장된 정보일 수 있다.
S430 단계에서, 클러스터부(341)는 분석 정보를 기초로 복수의 샘플 및 프라이머 중 적어도 하나를 적어도 하나의 그룹으로 그룹핑할 수 있다. 상술한 바와 같이, 그룹 각각에 속하는 최대 샘플 및/또는 프라이머 수는 분주 유닛의 최대 동시 분주 가능 개수와 동일할 수 있다.
일 실시예에서, 클러스터부(341)는 프라이머 각각의 분주 횟수 및 프라이머 플레이트 상의 배열 순서에 순차적으로 우선 순위를 부여하여 가상의 플레이트에 배열하는 방식으로 복수의 프라이머를 1 이상의 그룹으로 그룹핑할 수 있다.
예를 들어, 도 2의 (b) 및 도 6을 참조하면, 분석 정보에 포함된 프라이머는 프라이머 플레이트 상에서 각각 상이한 배열 순서를 가지며, 또한, 적어도 일부 프라이머는 분주 횟수가 다른 프라이머와 상이할 수 있다. 즉, 도 6과 같이, 2개의 프라이머(P9, P28)가 10번 샘플에 적용되지 않기 때문에, 상기 2개의 프라이머는 분주 횟수가 10회인 다른 프라이머와 달리, 9회의 분주 횟수를 가질 수 있다.
이 경우, 클러스터부(341)는, 도 8의 (a)에 도시되는 바와 같이, 분수 횟수가 10회인 프라이머를 우선적으로 행이 분주 유닛의 최대 동시 분주 가능 개수(예를 들어, 8개)와 동일한 가상의 플레이트에 1열부터 배열하고, 이어서, 분주 횟수가 9회인 프라이머를 배치하는 방식으로 프라이머에 대한 그룹핑을 수행할 수 있다. 이때, 동일한 분주 횟수를 가지는 프라이머 간에는 프라이머 플레이트 상의 배열 순서가 빠른 프라이머가 우선적으로 가상의 플레이트에 배열될 수 있다. 이에 따라, 프라이머는, 도 8의 (a)와 같이, 4개의 그룹으로 그룹핑되게 된다.
한편, S430 단계에 분할된 그룹은 하나의 분주 단위로서, 이하 상술되는 바와 같이, 반응 플레이트 또는 믹싱 플레이트(mixing plate)에 1회 이상 동시 배열(또는 분주)될 수 있다.
S440 단계에서, 산출부(342)는 그룹 각각에 속한 샘플 및 프라이머 중 적어도 하나에 대하여 동시 분주 횟수 및 단일 분주 횟수를 산출할 수 있다.
예를 들어, 도 8의 (b)를 참조하면, 도 8의 (a)에서 4개의 그룹으로 그룹핑된 프라이머는 좌측부터 제 1 내지 제 3 그룹에 속하는 프라이머는 10회의 동시 분수 횟수만을 가질 수 있다. 반면, 제 3 그룹에 속하는 프라이머는 9회의 동시 분주 횟수 가지고, 2개의 프라이머(P26, P27)에 대하여 각각 1회의 단일 분주 횟수를 가질 수 있다.
S450 단계에서, 배열부(343)는 S440 단계를 통해 산출된 동시 분주 횟수 및/또는 단일 분주 횟수에 기초하여 복수의 샘플 및 프라이머를 복수의 영역으로 구획된 반응 플레이트에 순차적으로 배열할 수 있다.
구체적으로, 배열부(343)는 그룹 각각에 속하는 샘플 및 프라이머 중 적어도 하나를 동시 분주 횟수에 대응하여 반응 플레이트의 구획된 영역에 순차적으로 배열할 수 있다. 이때, 배열은 동시 분주 횟수가 더 많은 그룹에 속하는 샘플 및/또는 프라이머에 대하여 우선적으로 수행될 수 있다. 또한, 이어서, 동시 분주 횟수에 따른 배열이 완료되면, 그룹 각각에 속하는 샘플 및 상기 프라이머 중 적어도 하나를 단일 분주 횟수에 기초하여, 반응 플레이트의 나머지 영역에 순차적으로 배열하는 방식으로 S450 단계를 수행할 수 있다.
즉, 예를 들어, 도 8 및 도 9를 참조하면, 배열부(343)는 제 1 그룹에 속하는 프라이머(P1 내지 P8)를 동시 분주 횟수에 대응하여 반응 플레이트의 제 1 영역의 1 행부터 제 2 영역의 2행까지 10회 배열하고, 이어서, 동일한 방식으로 제 2 그룹에 속하는 프라이머(P10 내지 P17) 및 제 3 그룹에 속하는 프라이머(P18 내지 P25)를 반응 플레이트의 제 2 영역의 3행부터 제 4 영역의 6행까지 10회씩 배열한 다음, 이어서, 제 4 그룹에 속하는 프라이머(P26, P27, P9, P28)을 동시 분주 횟수에 대응하여 반응 플레이트의 제 4 영역의 나머지 영역과 제 5 영역에 9회 배열하는 방식으로, 동시 분주 횟수에 기초한 배열을 수행할 수 있다. 또한, 동시 분주 횟수에 기초한 배열이 완료되면, 이어서, 배열부(343)는 단일 분주 횟수를 가진 제 4 그룹의 2개 프라이머(P26, P27)를 제 5 영역의 나머지 영역에 배열함으로써, 반응 플레이트에 대한 복수의 프라이머의 배열을 완료할 수 있다.
일 실시예에서, 반응 플레이트에 대한 복수의 샘플의 배열은 프라이머의 배열에 대응하여 수행될 수 있다. 즉, 예를 들어, 배열부(343)는 프라이머에 그룹에 대한 동시 분주 횟수 및 단일 분주 횟수에 기초한 배열을 완료하면, 샘플에 대한 배열은, 도 10에서 도시되는 바와 같이, 반응 플레이트 상의 프라이머의 배열에 대응하여 수행되도록 구현될 수 있다.
한편, 본 발명에서, 반응 플레이트에 대한 샘플 및 프라이머의 배열 결과는, 표시부(320)를 통해 사용자에게 출력되거나, 유, 무선 통신으로 연결된 사용자 단말로 전송됨으로써, 사용자에게 표시될 수 있다.
S460 단계에서, 배열부(343)은 S430 단계의 그룹핑 결과에 기초하여 프라이머를 믹싱 플레이트에 배열할 수 있다. 여기서 믹싱 플레이트는 프라이머를 반응 플레이트에 분주하기에 앞서, 각종 시약(예를 들어, master mix 등)을 혼합하기 위한 것으로서, 샘플 플레이트 및 프라이머 플레이트와 동일하게, 96개(8행X12열)의 웰을 포함하도록 구성될 수 있다.
이때, 믹싱 플레이트 상의 프라이머의 배열은, 도 11에서 도시되는 바와 같이, S430 단계에서 그룹핑을 위해 사용되는 가상의 플레이트 상의 프라이머 배열과 동일하거나, 개시 위치만 상이하게 수평 이동된 형태일 수 있다.
S470 단계에서, 매핑부(344)는 샘플 플레이트와 반응 플레이트의 샘플 배열, 및, 프라이머 플레이트, 믹싱 플레이트와 반응 플레이트의 프라이머 배열을 상호 매핑(mapping)할 수 있다. 이러한 매핑은 각 플레이트에서 동일 샘플 및 프라이머가 배열되는 웰의 좌표를 상호 연결하는 방식으로 수행될 수 있다.
예를 들어, 도 2의 (b), 도 9 및 도 11에 도시되는, 프라이머 플레이트, 반응 플레이트 및 믹싱 플레이트의 프라이머의 배열은 도 12 및 도 13과 같이 상호 매핑될 수 있다. 여기서, 도 12는 프라이머 플레이트와 믹싱 플레이트 사이의 매핑 결과를 도시하고, 도 13은 믹싱 플레이트와 반응 플레이트 사이의 매핑 결과를 도시할 수 있다.
일 실시예에서, 동작 방법(400)은 S470 단계가 완료되면, 분석 정보에 대응하여 그룹핑 결과, 샘플 및/또는 프라이머 그룹에 대하여 산출된 동시 분주 횟수와 단일 분주 횟수, 반응 플레이트에 대한 샘플과 프라이머의 배열 및 최종 매핑 결과 중 적어도 하나를 저장부(330)에 저장하는 단계를 더 포함할 수 있다. 특히, 저장된 매핑 결과는 사용자에게 제공 또는 전송될 수 있다.
또한, 일 실시예에서, 동작 방법(400)은, 매핑 결과에 기초하여 다중 분석을 수행하는 경우, 예상되는 분주 소요 시간, 분주 노즐의 교체 횟수 및 분주 노즐의 이동 거리 중 적어도 하나를 산출하는 단계를 더 포함할 수 있다. 이러한 정보는 매핑 결과 등과 함께 저장부(330)에 저장될 수 있다.
또한, 일 실시예에서, 동작 방법(400)은, 사용자의 편집 요청을 수신하고, 이에 기초하여, 샘플 또는 프라이머의 그룹핑, 반응 플레이트 상의 배열 및/또는 믹싱 플레이트 상의 배열을 수정하는 단계를 더 포함할 수 있다. 이를 통해, 사용자는 자신의 선호도, 실제 실험 상황 등을 반영하여 샘플 또는 프라이머의 그룹핑, 샘플 및 프라이머의 배열을 수정할 수 있게 된다.
도 5는 본 발명의 일 실시예에 따른 분주 매핑 장치의 동작 방법을 도시한다.
도 5를 참조하면, 분주 매핑 장치(300)는 샘플 및 프라이머 중 적어도 하나의 배열을 자동 추천할 수 있다. 여기서, 도 5의 동작 방법(500)의 S510, S520, S540 및 S550 단계는 도 4의 동작 방법(400)의 S410, S420, S460 및 S470 단계와 동일하므로 중복되는 부분은 도 4의 설명을 참조하고 이하 자세한 설명은 생략한다.
S530 단계에서, 추천부(345)는 분석 정보 수신에 응답하여, 분석 정보에 적합한 샘플 및 프라이머의 반응 플레이트 상의 배열을 추천할 수 있다. 즉, 사용자로부터 분석 정보가 수신되면, 추천부(345)는 저장부(330)를 검색하여 분석 정보에 적합한 샘플 및 프라이머의 배열을 검색하고, 이를 사용자에게 제공할 수 있다.
일 실시예에서, S530 단계는 분주 소요 시간, 분주 노즐의 교체 횟수 및 분주 노즐의 이동 거리 중 적어도 하나를 포함하는 소정의 기준에 기초하여 수행될 수 있다. 예를 들어, 사용자는 분주 소요 시간, 분주 노즐의 교체 횟수 및 분주 노즐의 이동 거리 중 적어도 하나를 추천 기준으로 선택할 수 있으며, 추천부(345)는 사용자가 입력한 샘플 및 샘플 각각의 검출 유전자 또는 프라이머의 정보에 대응하는 1 이상의 배열을 검출하고, 검출된 배열 중에서 사용자가 선택한 기준에 부합하는 배열을 사용자에게 추천할 수 있다.
한편, 본 명세서에 기재된 다양한 실시예들은 하드웨어, 미들웨어, 마이크로코드, 소프트웨어 및/또는 이들의 조합에 의해 구현될 수 있다. 예를 들어, 다양한 실시예들은 하나 이상의 주문형 반도체(ASIC)들, 디지털 신호 프로세서(DSP)들, 디지털 신호 프로세싱 디바이스(DSPD)들, 프로그램어블 논리 디바이스(PLD)들, 필드 프로그램어블 게이트 어레이(FPGA)들, 프로세서들, 컨트롤러들, 마이크로컨트롤러들, 마이크로프로세서들, 여기서 제시되는 기능들을 수행하도록 설계되는 다른 전자 유닛들 또는 이들의 조합 내에서 구현될 수 있다.
또한, 예를 들어, 다양한 실시예들은 명령들을 포함하는 컴퓨터-판독가능한 매체에 수록되거나 인코딩될 수 있다. 컴퓨터-판독가능한 매체에 수록 또는 인코딩된 명령들은 프로그램 가능한 프로세서 또는 다른 프로세서로 하여금 예컨대,　명령들이 실행될 때 방법을 수행하게끔 할 수 있다. 컴퓨터-판독가능한 매체는 컴퓨터 저장 매체를 포함한다. 저장 매체는 컴퓨터에 의해 액세스될 수 있는 임의의 가용 매체일 수도 있다.　예를 들어,　이러한 컴퓨터-판독가능한 매체는 RAM, ROM, EEPROM, CD-ROM　또는 기타 광학 디스크 저장 매체, 자기 디스크 저장 매체 또는 기타 자기 저장 디바이스,　또는 원하는 프로그램 코드를 컴퓨터에 의해 액세스가능한 명령들 또는 데이터 구조들의 형태로 저장하는데 이용될 수 있는 임의의 다른 매체를 포함할 수 있다.
이러한 하드웨어, 소프트웨어, 펌웨어 등은 본 명세서에 기술된 다양한 동작들 및 기능들을 지원하도록 동일한 디바이스 내에서 또는 개별 디바이스들 내에서 구현될 수 있다. 추가적으로, 본 발명에서 "~부"로 기재된 구성요소들, 유닛들, 모듈들, 컴포넌트들 등은 함께 또는 개별적이지만 상호 운용가능한 로직 디바이스들로서 개별적으로 구현될 수 있다. 모듈들, 유닛들 등에 대한 서로 다른 특징들의 묘사는 서로 다른 기능적 실시예들을 강조하기 위해 의도된 것이며, 이들이 개별 하드웨어 또는 소프트웨어 컴포넌트들에 의해 실현되어야만 함을 필수적으로 의미하지 않는다. 오히려, 하나 이상의 모듈들 또는 유닛들과 관련된 기능은 개별 하드웨어 또는 소프트웨어 컴포넌트들에 의해 수행되거나 또는 공통의 또는 개별의 하드웨어 또는 소프트웨어 컴포넌트들 내에 통합될 수 있다.
특정한 순서로 동작들이 도면에 도시되어 있지만, 이러한 동작들이 원하는 결과를 달성하기 위해 도시된 특정한 순서, 또는 순차적인 순서로 수행되거나, 또는 모든 도시된 동작이 수행되어야 할 필요가 있는 것으로 이해되지 말아야 한다. 임의의 환경에서는, 멀티태스킹 및 병렬 프로세싱이 유리할 수 있다. 더욱이, 상술한 실시예에서 다양한 구성요소들의 구분은 모든 실시예에서 이러한 구분을 필요로 하는 것으로 이해되어서는 안되며, 기술된 구성요소들이 일반적으로 단일 소프트웨어 제품으로 함께 통합되거나 다수의 소프트웨어 제품으로 패키징될 수 있다는 것이 이해되어야 한다.
이상에서와 같이 도면과 명세서에서 최적 실시예가 개시되었다. 여기서 특정한 용어들이 사용되었으나, 이는 단지 본 발명을 설명하기 위한 목적에서 사용된 것이지 의미한정이나 특허청구범위에 기재된 본 발명의 범위를 제한하기 위하여 사용된 것은 아니다. 그러므로 본 기술 분야의 통상의 지식을 가진 자라면 이로부터 다양한 변형 및 균등한 타 실시예가 가능하다는 점을 이해할 것이다. 따라서 본 발명의 진정한 기술적 보호범위는 첨부된 특허청구범위의 기술적 사상에 의해 정해져야 할 것이다.

Claims (23)

  1. 다중 분석을 수행하기 위한 분주 매핑 장치의 동작 방법으로서,
    분석 정보를 수신하는 단계 - 상기 분석 정보는 분석 대상인 복수의 샘플, 상기 샘플 각각에 대한 검출 유전자 및 상기 검출 유전자에 대응하는 프라이머 중 적어도 하나에 관한 정보를 포함함 - ;
    반응 플레이트를 복수의 영역으로 구획하는 단계; 및
    상기 반응 플레이트의 구획된 영역 상에 순차적으로 상기 샘플 및 상기 프라이머를 배열하는 단계를 포함하는, 방법.
  2. 제 1 항에 있어서,
    상기 복수의 영역으로 구획하는 단계는,
    최대 동시 분주 가능 개수, 분주 노즐 사이의 간격 및 상기 반응 플레이트의 웰(well) 사이의 간격 중 적어도 하나에 기초하여 수행되는, 방법.
  3. 제 2 항에 있어서,
    상기 반응 플레이트의 구획된 각 영역의 행 및 열 중 적어도 하나는 상기 최대 동시 분주 가능 개수와 동일한, 방법.
  4. 제 1 항에 있어서,
    상기 분석 정보를 기초로 상기 복수의 샘플 및 상기 프라이머 중 적어도 하나를 적어도 하나의 그룹으로 그룹핑하는 단계를 더 포함하고,
    상기 복수의 샘플 및 상기 프라이머를 배열하는 단계는, 상기 그룹핑 결과에 기초하여 수행되며,
    상기 그룹 각각에 속하는 최대 샘플 및 프라이머 수는 최대 동시 분주 가능 개수와 동일한, 방법.
  5. 제 4 항에 있어서,
    상기 분석 정보는 상기 프라이머의 프라이머 플레이트 상의 배열에 관한 정보를 더 포함하고,
    상기 그룹핑하는 단계에서는, 상기 프라이머 각각의 분주 횟수 및 상기 프라이머 플레이트 상의 배열 순서에 순차적으로 우선 순위를 부여하여 상기 프라이머를 적어도 하나의 그룹으로 그룹핑하는, 방법.
  6. 제 4 항에 있어서,
    상기 그룹 각각에 속하는 샘플 및 프라이머 중 적어도 하나에 대하여 동시 분주 횟수를 산출하는 단계를 더 포함하고,
    상기 샘플 및 상기 프라이머를 배열하는 단계는, 상기 그룹 각각에 속하는 상기 샘플 및 상기 프라이머 중 적어도 하나를 상기 동시 분주 횟수에 대응하여 상기 반응 플레이트의 구획된 영역에 순차적으로 배열함으로써 수행되는, 방법.
  7. 제 6 항에 있어서,
    상기 샘플 및 상기 프라이머를 배열하는 단계에서는,
    상기 동시 분주 횟수가 많은 그룹에 속하는 샘플 및 프라이머 대하여 우선적으로 배열을 수행하는, 방법.
  8. 제 4 항에 있어서,
    상기 그룹 각각에 속한 샘플 및 프라이머 중 적어도 하나에 대하여 동시 분주 횟수 및 단일 분주 횟수를 산출하는 단계를 더 포함하고,
    상기 샘플 및 상기 프라이머를 배열하는 단계는,
    상기 그룹 각각에 속하는 상기 샘플 및 상기 프라이머 중 적어도 하나를 상기 동시 분주 횟수에 대응하여 상기 반응 플레이트의 구획된 영역에 순차적으로 배열하는 단계; 및
    상기 동시 분주 횟수에 따른 배열이 완료되면, 상기 그룹 각각에 속하는 상기 샘플 및 상기 프라이머 중 적어도 하나를 상기 단일 분주 횟수에 기초하여, 상기 반응 플레이트의 나머지 영역에 순차적으로 배열하는 단계를 포함하는, 방법.
  9. 제 4 항에 있어서,
    상기 분석 정보는 상기 샘플의 샘플 플레이트 상의 배열 및 상기 프라이머의 프라이머 플레이트 상의 배열에 관한 정보를 더 포함하고,
    상기 방법은,
    상기 그룹핑 결과에 기초하여, 상기 프라이머를 믹싱(mixing) 플레이트에 배열하는 단계; 및
    상기 샘플 플레이트와 상기 반응 플레이트의 샘플 배열 및 상기 프라이머 플레이트, 상기 믹싱 플레이트와 상기 반응 플레이트의 프라이머 배열을 상호 매핑(mapping)하는 단계를 더 포함하는, 방법.
  10. 제 9 항에 있어서,
    상기 매핑이 완료되면, 상기 분석 정보에 대응하여 상기 그룹핑 결과, 상기 동시 분주 횟수와 상기 단일 분주 횟수, 상기 반응 플레이트에 대한 상기 샘플과 상기 프라이머의 배열 및 상기 매핑 결과 중 적어도 하나를 저장부에 저장하는 단계를 더 포함하는, 방법.
  11. 제 1 항에 있어서,
    상기 분석 정보의 수신에 응답하여, 소정의 기준에 따라 상기 분석 정보에 적합한 상기 샘플 및 상기 프라이머의 상기 반응 플레이트 상의 배열을 추천하는 단계를 더 포함하고,
    상기 기준은 분주 소요 시간, 분주 노즐의 교체 횟수 및 상기 분주 노즐의 이동 거리 중 적어도 하나를 포함하는, 방법.
  12. 제 1 항 내지 제 11 항 중 어느 한 항에 따른 방법을 수행하기 위한 프로그램이 기록되는, 컴퓨터 판독 가능한 기록 매체.
  13. 다중 분석을 수행하기 위한 분주 매핑 장치로서,
    분석 정보를 수신하는 입력부 - 상기 분석 정보는 분석 대상인 복수의 샘플, 상기 샘플 각각에 대한 검출 유전자 및 상기 검출 유전자에 대응하는 프라이머 중 적어도 하나에 관한 정보를 포함함 - ; 및
    반응 플레이트를 복수의 영역으로 구획하고, 상기 반응 플레이트의 구획된 영역 상에 순차적으로 상기 샘플 및 상기 프라이머를 배열하는 배열부를 포함하는, 장치.
  14. 제 13 항에 있어서,
    상기 배열부는, 최대 동시 분주 가능 개수, 분주 노즐 사이의 간격 및 상기 반응 플레이트의 웰(well) 사이의 간격 중 적어도 하나에 기초하여 상기 반응 플레이트를 복수의 영역으로 구획하는, 장치.
  15. 제 14 항에 있어서,
    상기 반응 플레이트의 구획된 각 영역의 행 및 열 중 적어도 하나는 상기 최대 동시 분주 가능 개수와 동일한, 장치.
  16. 제 13 항에 있어서,
    상기 분석 정보를 기초로 상기 복수의 샘플 및 상기 프라이머 중 적어도 하나를 적어도 하나의 그룹으로 그룹핑하는 클러스터부를 더 포함하고,
    상기 배열부는, 상기 그룹핑 결과에 기초하여 상기 복수의 샘플 및 상기 프라이머의 배열을 수행하며,
    상기 그룹 각각에 속하는 최대 샘플 및 프라이머 수는 최대 동시 분주 가능 개수와 동일한, 장치.
  17. 제 16 항에 있어서,
    상기 분석 정보는 상기 프라이머의 프라이머 플레이트 상의 배열에 관한 정보를 더 포함하고,
    상기 클러스터부는, 상기 프라이머 각각의 분주 횟수 및 상기 프라이머 플레이트 상의 배열 순서에 순차적으로 우선 순위를 부여하여 상기 프라이머를 적어도 하나의 그룹으로 그룹핑하는, 장치.
  18. 제 16 항에 있어서,
    상기 그룹 각각에 속하는 샘플 및 프라이머 중 적어도 하나에 대하여 동시 분주 횟수를 산출하는 산출부를 더 포함하고,
    상기 배열부는, 상기 그룹 각각에 속하는 상기 샘플 및 상기 프라이머 중 적어도 하나를 상기 동시 분주 횟수에 대응하여 상기 반응 플레이트의 구획된 영역에 순차적으로 배열하는, 장치.
  19. 제 18 항에 있어서,
    상기 배열부는, 상기 동시 분주 횟수가 많은 그룹에 속하는 샘플 및 프라이머 대하여 우선적으로 배열을 수행하는, 장치.
  20. 제 16 항에 있어서,
    상기 그룹 각각에 속한 샘플 및 프라이머 중 적어도 하나에 대하여 동시 분주 횟수 및 단일 분주 횟수를 산출하는 산출부를 더 포함하고,
    상기 배열부는, 상기 그룹 각각에 속하는 상기 샘플 및 상기 프라이머 중 적어도 하나를 상기 동시 분주 횟수에 대응하여 상기 반응 플레이트의 구획된 영역에 순차적으로 배열하고,
    상기 동시 분주 횟수에 따른 배열이 완료되면, 상기 그룹 각각에 속하는 상기 샘플 및 상기 프라이머 중 적어도 하나를 상기 단일 분주 횟수에 기초하여, 상기 반응 플레이트의 나머지 영역에 순차적으로 배열하는, 장치.
  21. 제 16 항에 있어서,
    상기 분석 정보는 상기 샘플의 샘플 플레이트 상의 배열 및 상기 프라이머의 프라이머 플레이트 상의 배열에 관한 정보를 더 포함하고,
    상기 장치는,
    상기 배열부가 상기 그룹핑 결과에 기초하여 상기 프라이머를 믹싱(mixing) 플레이트에 배열하면, 상기 샘플 플레이트와 상기 반응 플레이트의 샘플 배열 및 상기 프라이머 플레이트, 상기 믹싱 플레이트와 상기 반응 플레이트의 프라이머 배열을 상호 매핑(mapping)하는 매핑부를 더 포함하는, 장치.
  22. 제 21 항에 있어서,
    상기 매핑이 완료되면, 상기 분석 정보에 대응하여 상기 그룹핑 결과, 상기 동시 분주 횟수와 상기 단일 분주 횟수, 상기 반응 플레이트에 대한 상기 샘플과 상기 프라이머의 배열 및 상기 매핑 결과 중 적어도 하나를 저장하는 저장부를 더 포함하는, 장치..
  23. 제 13 항에 있어서,
    상기 분석 정보의 수신에 응답하여, 소정의 기준에 따라 상기 분석 정보에 적합한 상기 샘플 및 상기 프라이머의 상기 반응 플레이트 상의 배열을 추천하는 추천부를 더 포함하고,
    상기 기준은 분주 소요 시간, 분주 노즐의 교체 횟수 및 상기 분주 노즐의 이동 거리 중 적어도 하나를 포함하는, 장치.
PCT/KR2018/011197 2018-02-09 2018-09-20 다중 분석을 수행하기 위한 분주 매핑 장치 및 그 동작 방법 WO2019156305A1 (ko)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
KR10-2018-0016555 2018-02-09
KR1020180016555A KR102066119B1 (ko) 2018-02-09 2018-02-09 다중 분석을 수행하기 위한 분주 매핑 장치 및 그 동작 방법

Publications (1)

Publication Number Publication Date
WO2019156305A1 true WO2019156305A1 (ko) 2019-08-15

Family

ID=67540374

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/KR2018/011197 WO2019156305A1 (ko) 2018-02-09 2018-09-20 다중 분석을 수행하기 위한 분주 매핑 장치 및 그 동작 방법

Country Status (3)

Country Link
US (1) US20190249225A1 (ko)
KR (1) KR102066119B1 (ko)
WO (1) WO2019156305A1 (ko)

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US11625446B2 (en) * 2021-05-03 2023-04-11 Oracle International Corporation Composing human-readable explanations for user navigational recommendations

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2002162401A (ja) * 2000-11-27 2002-06-07 Hitachi Ltd 自動分析装置
JP2002181818A (ja) * 2000-12-15 2002-06-26 Otsuka Pharmaceut Factory Inc 複数異分子種蛋白ｍＲＮＡの同時測定方法およびそれに用いるキット収容体
JP2003107097A (ja) * 1996-12-31 2003-04-09 Genometrix Inc 多重化分子分析装置および方法
JP2010025587A (ja) * 2008-07-15 2010-02-04 Olympus Corp 自動分析装置、検体分注方法および検体分注装置の特別洗浄方法
JP5231186B2 (ja) * 2008-08-08 2013-07-10 ベックマン コールター， インコーポレイテッド 検体分注方法および分析装置

Family Cites Families (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6902703B2 (en) * 1999-05-03 2005-06-07 Ljl Biosystems, Inc. Integrated sample-processing system
US20080261220A1 (en) * 2000-11-30 2008-10-23 Third Wave Technologies, Inc. Nucleic Acid Detection Assays
US20070092403A1 (en) * 2005-10-21 2007-04-26 Alan Wirbisky Compact apparatus, compositions and methods for purifying nucleic acids
JP2009534688A (ja) * 2006-04-24 2009-09-24 プロテダイン・コーポレーション 自律的に作動するツールを備えているロボットシステム
JP2009030987A (ja) * 2007-07-24 2009-02-12 Canon Inc 液体試料分注装置、生化学反応装置
US9101930B2 (en) * 2012-02-13 2015-08-11 Neumodx Molecular, Inc. Microfluidic cartridge for processing and detecting nucleic acids

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2003107097A (ja) * 1996-12-31 2003-04-09 Genometrix Inc 多重化分子分析装置および方法
JP2002162401A (ja) * 2000-11-27 2002-06-07 Hitachi Ltd 自動分析装置
JP2002181818A (ja) * 2000-12-15 2002-06-26 Otsuka Pharmaceut Factory Inc 複数異分子種蛋白ｍＲＮＡの同時測定方法およびそれに用いるキット収容体
JP2010025587A (ja) * 2008-07-15 2010-02-04 Olympus Corp 自動分析装置、検体分注方法および検体分注装置の特別洗浄方法
JP5231186B2 (ja) * 2008-08-08 2013-07-10 ベックマン コールター， インコーポレイテッド 検体分注方法および分析装置

Also Published As

Publication number Publication date
KR102066119B1 (ko) 2020-02-17
US20190249225A1 (en) 2019-08-15
KR20190096750A (ko) 2019-08-20

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CA2921645C (en) Methods and systems for aligning sequences
KR102446941B1 (ko) 서열 변이체 검출 방법 및 시스템
WO2013081333A1 (ko) 염기 서열 정렬 장치 및 그 방법
Kehoe et al. DNA microarrays for studies of higher plants and other photosynthetic organisms
Hung et al. Analysis of microarray and RNA-seq expression profiling data
Tanigawa et al. WhichTF is functionally important in your open chromatin data?
WO2012039567A2 (en) Terminal device for downloading and installing an application and method thereof
WO2019156305A1 (ko) 다중 분석을 수행하기 위한 분주 매핑 장치 및 그 동작 방법
Wentker et al. An interactive macrophage signal transduction map facilitates comparative analyses of high-throughput data
Renkonen et al. Network analysis of single nucleotide polymorphisms in asthma
WO2022245062A1 (ko) 인공 지능 기반의 유전체 분석 및 의약 물질 개발 방법 및 시스템
WO2021132920A1 (ko) 유전자 검사를 위한 맞춤형 유전자칩 및 이의 제작 방법
Dainese et al. A parallelized, automated platform enabling individual or sequential ChIP of histone marks and transcription factors
Pouladi et al. Biomechanisms of comorbidity: Reviewing integrative analyses of multi-omics datasets and electronic health records
Zuo et al. Why do long zinc finger proteins have short motifs
WO2016193846A2 (en) Degenerate primer sets
Liedtke et al. Correlated expression analysis of genes implicated in schizophrenia: identification of putative disease-related pathways
WO2014119914A1 (ko) 유전자 서열 기반 개인 마커에 관한 정보를 제공하는 방법 및 이를 이용한 장치
Lee et al. An algorithm of discovering signatures from DNA databases on a computer cluster
Wang et al. Use of Bastion for the Identification of Secreted Substrates
Nalbandian et al. Resolving breakpoints of chromosomal rearrangements at the nucleotide level using Sanger sequencing
Soucy et al. Molecular Genetic Testing Approaches for Retinitis Pigmentosa
WO2023191493A1 (ko) 유전자지문 정보를 이용한 아바타의 고유식별자 생성 시스템 및 방법
WO2005093631A1 (ja) 特異的塩基配列探索方法
Ayati et al. What Do We Learn from Network-Based Analysis of Genome-Wide Association Data?

Legal Events

Date Code Title Description
121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application

Ref document number: 18905253

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A1

NENP Non-entry into the national phase

Ref country code: DE

122 Ep: pct application non-entry in european phase

Ref document number: 18905253

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A1