WO2015011332A1 - Polinucleótido que contiene los genes gef y apoptina y su uso en terapia génica del cáncer de colon - Google Patents
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- C12N2750/10011—Circoviridae
- C12N2750/10022—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
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- C12N2750/10011—Circoviridae
- C12N2750/10033—Use of viral protein as therapeutic agent other than vaccine, e.g. apoptosis inducing or anti-inflammatory
Definitions
- the present invention is within the field of medicine and molecular biology, and refers to the use of gef and apoptin genes as antitumor gene therapy, and specifically for the treatment of colon cancer.
- Colorectal cancer is the third most common cancer in men and the second in women.
- the annual incidence of colon cancer is estimated at one million, and approximately 500,000 people die each year as a result of colon cancer worldwide (Ferlay et al., 2010. Int J Cancer 127: 2893-917). Recent advances in chemotherapy and radiotherapy have increased the average survival of patients.
- Gene therapy is presented as one of the most promising strategies for the development of a type of antitumor therapy that seeks the destruction of neoplastic cells, the cessation or decrease of their proliferation capacity or the correction of the cell defect that induces the alteration of the normal cell (Ortiz et al., 2012. Drug Discovery, 7 (3), 297-312).
- Apoptin a 121-amino acid protein encoded by an avian virus, does not resemble any other sequenced animal or viral protein (Noteborn et al., 1991. J Virol 1991; 65: 3131-3139). Apoptin induces apoptosis in young chicken thymocytes, as well as in transformed chicken cells under tissue culture conditions (Danen-van Oorschot e ⁇ al., 2003. J Biol Chem .; 278: 27729-27736; Leliveld e ⁇ al. , 2003a Nucleic Acids Res 2003a; 31: 4805-4813, Leliveld e ⁇ al., 2003b.
- the authors of the present invention have developed retroviral plasmids that incorporate the gef gene and the apoptin gene, providing a pharmaceutical composition and a combined preparation that can be used in antitumor therapy, and especially against colon cancer.
- a first aspect of the invention relates to an isolated RNA or DNA polynucleotide, hereafter referred to as a polynucleotide of the invention, capable of being translated into an amino acid sequence comprising a peptide having an identity of at least 95%. with the amino acid sequence of the GEF protein (SEQ ID NO: 1) and at least 95% with the amino acid sequence of the APOPTINE protein (SEQ ID NO: 2).
- RNA or DNA polynucleotide capable of translating into an amino acid sequence comprising a peptide that has an identity of at least 99% with the amino acid sequence of the GEF protein (SEQ ID NO: 1) and of at least 99% with the amino acid sequence of the APOPTINE protein (SEQ ID NO: 2).
- Another aspect of the invention relates to a genetic construction of DNA or RNA, hereinafter genetic construction of the invention, comprising at least one of the following types of sequences:
- Nucleotide sequence comprising at least one polynucleotide of the invention, for transcription in vitro or in vivo.
- nucleotide sequence corresponding to a gene expression system or vector comprising a polynucleotide of the invention, operably linked with at least one promoter that directs the transcription of said nucleotide sequence, and with other sequences necessary or appropriate for the transcription and its adequate regulation in time and place.
- composition of the invention comprising:
- component A of the invention, which are selected from:
- RNA or DNA polynucleotide capable of being translated into an amino acid sequence comprising a peptide having an identity of at least 95% with the amino acid sequence encoding the GEF protein (SEQ ID NO: 1),
- RNA or DNA polynucleotide capable of being translated into an amino acid sequence comprising a peptide having an identity of at least 99% with the amino acid sequence encoding the GEF protein (SEQ ID NO: 1).
- RNA A genetic construction of DNA or RNA, comprising at least one of the following types of sequences:
- nucleotide sequence comprising at least one polynucleotide according to (a) or (b), for transcription in vitro or in vivo,
- Nucleotide sequence corresponding to a gene expression system or vector comprising a polynucleotide according to (a) or (b), operably linked with at least one promoter that directs the transcription of said nucleotide sequence, and with others necessary or appropriate sequences for transcription and its appropriate regulation in time and place.
- component B hereafter component B of the invention, which is selected from:
- RNA or DNA polynucleotide capable of being translated into an amino acid sequence comprising a peptide having an identity of at least 95% with the amino acid sequence of the APOPTINE protein (SEQ ID NO: 2)
- SEQ ID NO: 2 A polynucleotide of isolated RNA or DNA capable of translating into an amino acid sequence comprising a peptide having an identity of at least 99% with the amino acid sequence encoding the APOPTINE protein (SEQ ID NO: 2).
- RNA A genetic construction of DNA or RNA, comprising at least one of the following types of sequences:
- nucleotide sequence comprising at least one polynucleotide according to (e) or (f), for transcription in vitro or in vivo.
- Nucleotide sequence corresponding to a gene expression system or vector comprising a polynucleotide according to (e) or (f), operably linked with at least one promoter that directs the transcription of said nucleotide sequence, and with others necessary or appropriate sequences for transcription and its appropriate regulation in time and place.
- the amino acid sequence encoding the APOPTINE protein (SEQ ID NO: 2).
- the composition is a pharmaceutical composition. More preferably the composition further comprises a pharmaceutically acceptable carrier. Even more preferably, it also comprises another active ingredient.
- Another aspect of the invention relates to a combined preparation, hereafter combined preparation of the invention, comprising a component A of the invention and a component B of the invention.
- the combined preparation further comprises another active ingredient.
- Another aspect of the invention relates to the use of a polynucleotide of the invention, of a genetic construct of the invention, of a composition of the invention, or of the combined preparation of the invention, in the manufacture of a medicament, or alternatively, to a polynucleotide of the invention, a genetic construct of the invention, a composition of the invention, or the combined preparation of the invention, for use as a medicament.
- Another aspect of the invention relates to the use of a polynucleotide of the invention, of a genetic construct of the invention, of a composition of the invention, or of the combined preparation of the invention, in the preparation of a medicament for the treatment of a disease that occurs with abnormal cell proliferation, or alternatively, a polynucleotide of the invention, a genetic construct of the invention, a composition of the invention, or the combined preparation of the invention, for the treatment of a disease that courses with proliferation abnormal cell.
- the disease that occurs with cell proliferation is cancer.
- the disease is colon cancer.
- Another aspect of the invention relates to the use of component A and component B of the invention, separately, combined or sequentially, in the manufacture of a medicament.
- Fig. 1 Determination of the effect of the expression of the gef and / or apoptin genes on cell proliferation.
- the cells (at a concentration of 25 x 10 3 cells per disk) were cultured for 10 days to determine their growth rate. The values they represent the mean ⁇ the standard deviation of the crops in quadruplicate.
- Fig. 2 Quantification of the induction of apoptosis in DLD-1 control cells and transformed by fluorescence-activated cell sorting analysis. The cells were stained with Annexin V and Pl to assess cell death by apoptosis after being treated with Dox for 2 and 6 days, as described in the Materials and Methods section. The data shown belong to 3 independent experiments.
- Fig. 3 FACScan analysis of the cell cycle.
- the different phases of the cell cycle of DLD-1, DLD1 / gef, DLD1 / apoptin, and DLD1 / gef-apoptin cells treated with Dox were analyzed for 2 and 6 days. The data shown belong to 3 independent experiments.
- Fig. 4 Analysis of mitochondrial membrane potential ( ⁇ ). Both transfected and non-transfected cells, treated with Dox for 2 and 6 days, were stained with JC-1. The red fluorescence represents the mitochondria that have the membrane intact, while the green fluorescence represents the mitochondria that have a low membrane depolarization.
- Fig. 5 Ultrastructural morphology of DLD-1, DLD1 / gef, DLD1 / apoptin, and DLD1 / gef-apoptin cells treated with Dox for 2 days to induce the expression of gef and / or apoptin.
- the typical morphology of the DLD-1 parental cells demonstrated a light cytoplasmic complexion.
- Images c, d and e DLD1 / gef cells that have granules and chromatin condensation, vesicle formation and pronounced protuberances in the mitochondria.
- Images f, g and h are examples of DLD-1, DLD1 / gef cells treated with Dox for 2 days to induce the expression of gef and / or apoptin.
- the authors of the present invention have developed a new gene therapy system based on the transfection of two suicide genes: 1.
- the prokaryotic gef gene which seems to act in a harmful way on cells through membrane modifications.
- the expression of the gef and apoptin genes alone or in combination induced by doxycycline in the DLD-1 line causes morphological alterations that indicate the entry of certain cell subpopulations into a process of programmed cell death or apoptosis.
- the most significant fact is that , as shown in Fig. 1 to Fig. 3, the combined expression of both genes induces a significant reduction in the proliferation rate compared to both parental lines and those expressing these genes separately, which is accompanied of a notable alteration of the proportion of cells in each phase of the cell cycle.
- the results demonstrate for the first time that the combined action of the gef and apoptin genes is much more cytotoxic and has more intense antitumor activity than the expression of these genes separately.
- the invention relates to the use of the gef and apoptin genes (either directly from their amino acid sequence, or by their application in gene therapy in polynucleotides and vectors that encode and express the gef and apoptin genes, that is, their amino acid sequence) in the preparation of a medicament for the treatment of proliferative diseases, preferably for the treatment of cancer, and even more preferably for the treatment of colon cancer.
- a first aspect of the invention relates to an isolated RNA or DNA polynucleotide, hereafter referred to as a polynucleotide of the invention, capable of being translated into an amino acid sequence comprising a peptide having an identity of at least 95%. with the amino acid sequence of the GEF protein (SEQ ID NO: 1) and another peptide having an identity of at least 95% with the amino acid sequence of the APOPTINE protein (SEQ ID NO: 2).
- RNA or DNA polynucleotide capable of translated into an amino acid sequence comprising a peptide that has an identity of at least 99% with the amino acid sequence of the GEF protein (SEQ ID NO: 1) and another peptide that has an identity of at least 99% with the sequence APOPTINE protein amino acid (SEQ ID NO: 2).
- the degree of identity / similarity of the proteins collected in the sequences SEQ ID NO: 1 and SEQ ID NO: 2 can be expected to be at least 80% or more, and more preferably at least 85%, a 90, 95% or 99%.
- sequence comparison methods are known in the state of the art, and include, but are not limited to, the BLASTP or BLASTN program, and FASTA (Altschul et al., J. Mol. Biol. 215: 403-410 ( 1999).
- homology refers to the similarity between two structures due to a common evolutionary ancestry, and more specifically, to the similarity between two or more nucleotide or amino acid sequences. Since two sequences are considered homologous if they have the same evolutionary origin, in general, it is assumed that higher values of similarity or identity of 95% would indicate homology. We can consider, therefore, that identity percentages of at least 95%, and preferably 99%, could maintain the function of the amino acid sequences contained in SEQ ID NO: 1 and SEQ ID NO: 2.
- identity refers to the proportion of identical nucleotides or amino acids between two nucleotide or amino acid sequences that are compared. Sequence comparison methods are known in the state of the art, and include, but are not limited to, the GAG program, including GAP (Devereux et al., Nucleic Acids Research 12: 287 (1984) Genetics Computer Group University of Wisconsin, Madison, (Wl); BLAST, BLASTP or BLASTN, and FASTA (Altschul et al., J. Mol. Biol. 215: 403-410 (1999).
- the GEF protein is also encoded by the UTI89_C0018 locus of E.Coli.
- amino acid sequence is found in SEQ ID NO: 1, (nucleotide sequence SEQ ID NO: 3 with GenBank access number (NCBI) GenBank (NCBI) AE005174.2). It also refers to any of its biologically active variants (currently 3 variants are known).
- the GEF protein is also defined by a nucleotide or polynucleotide sequence, which constitutes the coding sequence of the protein collected in SEQ ID NO: 1, and which would comprise various variants from:
- GenBank NCBI
- the APOPTINE protein also called Cux-1, ORF1, hypothetical protein or nucleocapside protein, is encoded by the CAVgp2 locus of chicken anemia virus.
- the APOPTIN protein is also defined by a nucleotide or polynucleotide sequence, which constitutes the sequence. encoder of the protein collected in SEQ ID NO: 2, and which would comprise various variants from:
- GenBank GenBank
- SEQ ID NO: 4 the sequence collected in GenBank (NCBI) M55918.1, between base pairs 486-851, collected in the sequence SEQ ID NO: 4.
- Another aspect of the invention relates to a genetic construction of DNA or RNA, hereinafter genetic construction of the invention, comprising at least one of the following types of sequences:
- nucleotide sequence comprising at least one polynucleotide of the invention, for transcription in vitro or in vivo.
- nucleotide sequence corresponding to a gene expression system or vector comprising a polynucleotide of the invention, operably linked with at least one promoter that directs the transcription of said nucleotide sequence, and with other sequences necessary or appropriate for the transcription and its adequate regulation in time and place.
- a “vector” is a replicon, or an integrative vector, to which another polynucleotide segment has been attached, to perform replication and / or expression of the bound segment.
- a “replicon” is any genetic element that behaves as an autonomous unit of polynucleotide replication within a cell; that is, able to replicate under its own control.
- An integrative vector is any genetic element that integrates and remains stable in the genome of a cell.
- Control sequence refers to polynucleotide sequences that are necessary to effect the expression of the sequences to which they are linked. The nature of such control sequences differs depending on the host organism; in prokaryotes, said control sequences generally include a promoter, a ribosomal binding site, and termination signals; in eukaryotes, generally, said control sequences include promoters, termination signals, enhancers and, sometimes, silencers.
- control sequences is intended to include, at a minimum, all components whose presence is necessary for expression, and may also include additional components whose presence is advantageous.
- promoter refers to a region of DNA upstream of the transcription start point, and in particular, which is capable of initiating transcription in a plant cell, be the origin of the promoter a plant or not.
- promoters include, but are not limited to, promoters obtained from plants, plant viruses, and bacteria that can express genes in plant cells, such as Agrobacterium or Rhizobium.
- promoters under development control include promoters that preferentially initiate transcription in certain tissues, such as leaves, roots, or seeds. Such Promoters are referred to herein as preferred of a type of tissue.
- tissue promoters that initiate transcription in a certain type of tissue, and are referred to as "specific tissue.”
- An “inducible” or “repressible” promoter is a promoter that is under the control of the environment. Examples of environmental conditions that may affect transcription are anaerobic conditions, or the presence of light.
- Specific tissue promoters, preferred tissue, cell type specific, or inducible promoters are types constitute the "non-constitutive" promoter class.
- a “constitutive” promoter is a promoter that is active in most environmental conditions.
- Operaationally linked refers to a juxtaposition in which the components thus described have a relationship that allows them to function in the intended way.
- a control sequence "operatively linked" to a sequence that is transcribed to the nucleotide sequence of the invention is linked such that the expression of the coding sequence is achieved under conditions compatible with the control sequences.
- a “coding sequence” or “coding sequence” is a polynucleotide sequence that is transcribed into mRNA and / or translated into a polypeptide when under the control of appropriate regulatory sequences. The limits of the coding sequence are determined by a translation start codon at the 5 'end and a translation end codon at the 3' end.
- a coding sequence may include, but is not limited to mRNA, cDNA, and recombinant polynucleotide sequences.
- polynucleotide and “nucleic acid” are used interchangeably herein, referring to polymeric forms of nucleotides of any length, both ribonucleotides (RNA or RNA) and deoxyribonucleotides (DNA or DNA).
- amino acid sequence refers to a polymeric form of amino acids of any length, which may or may not be chemical or biochemically modified.
- composition of the invention comprising:
- component A of the invention, which are selected from:
- RNA or DNA polynucleotide capable of being translated into an amino acid sequence comprising a peptide having an identity of at least 95% with the amino acid sequence encoding the GEF protein (SEQ ID NO: 1),
- RNA or DNA polynucleotide capable of being translated into an amino acid sequence comprising a peptide having an identity of at least 99% with the amino acid sequence encoding the GEF protein (SEQ ID NO: 1).
- RNA A genetic construction of DNA or RNA, comprising at least one of the following types of sequences:
- nucleotide sequence comprising at least one polynucleotide according to (a) or (b), for transcription in vitro or in vivo,
- nucleotide sequence corresponding to a gene expression system or vector comprising a polynucleotide according to (a) or (b), operably linked with at least one promoter that directs the transcription of said nucleotide sequence, and with others necessary or appropriate sequences for transcription and its appropriate regulation in time and place.
- component B of the invention which is selected from:
- RNA or DNA polynucleotide capable of being translated into an amino acid sequence comprising a peptide having an identity of at least 95% with the amino acid sequence of the APOPTINE protein (SEQ ID NO: 2)
- a polynucleotide of isolated RNA or DNA capable of translating into an amino acid sequence comprising a peptide having an identity of at least 99% with the amino acid sequence encoding the APOPTINE protein (SEQ ID NO: 2).
- RNA A genetic construction of DNA or RNA, comprising at least one of the following types of sequences:
- nucleotide sequence comprising at least one polynucleotide according to (e) or (f), for transcription in vitro or in vivo.
- nucleotide sequence corresponding to a gene expression system or vector comprising a polynucleotide according to (e) or (f), operably linked with at least one promoter that directs the transcription of said nucleotide sequence, and with others necessary or appropriate sequences for transcription and its appropriate regulation in time and place.
- the composition is a pharmaceutical composition. More preferably the composition further comprises a pharmaceutically acceptable carrier. Even more preferably, it also comprises another active ingredient.
- Another aspect of the invention relates to a combined preparation, hereafter combined preparation of the invention, comprising a component A of the invention and a component B of the invention.
- the combined preparation further comprises another active ingredient.
- Another aspect of the invention relates to the use of a polynucleotide of the invention, of a genetic construct of the invention, of a composition of the invention, or of the combined preparation of the invention, in the manufacture of a medicament, or alternatively, to a polynucleotide of the invention, a genetic construct of the invention, a composition of the invention, or the combined preparation of the invention, for use as a medicament.
- Another aspect of the invention relates to the use of a polynucleotide of the invention, of a genetic construct of the invention, of a composition of the invention, or of the combined preparation of the invention, in the preparation of a medicament for the treatment of a disease that occurs with abnormal cell proliferation, or alternatively, a polynucleotide of the invention, a genetic construct of the invention, a composition of the invention, or the combined preparation of the invention, for the treatment of a disease that courses with proliferation abnormal cell.
- the disease that occurs with cell proliferation is cancer.
- the disease is colon cancer.
- Abnormal proliferation means a proliferation that is independent of normal regulatory mechanisms, for example the interruption of cell proliferation caused by the intervention of apoptosis (programmed cell death)
- Another aspect of the invention relates to the use of component A and component B of the invention, separately, in combination or sequentially, in the manufacture of a medicament. More preferably, it refers to the use of component A and component B of the invention, separately, in combination or sequentially, in the preparation of a medicament for the treatment of cancer, and even more preferably, for the treatment of colon cancer.
- the term "medication”, as used herein, refers to any substance used for prevention, diagnosis, relief, treatment or cure of diseases in man and animals.
- the disease is a disease that occurs with cell proliferation, more preferably cancer, and even more preferably colon cancer.
- active substance means any component that potentially provides a pharmacological activity or other different effect on the diagnosis, cure, mitigation, treatment, or prevention of a disease, or that affects the structure or function of the body of man or other animals.
- the term includes those components that promote a chemical change in the preparation of the drug and are present therein in a modified form intended to provide the specific activity or effect.
- compositions of the present invention can be formulated for administration to an animal, and more preferably to a mammal, including man, in a variety of ways known in the state of the art.
- they can be, without being limited, in sterile aqueous solution or in biological fluids, such as serum.
- Aqueous solutions may be buffered or unbuffered and have additional active or inactive components. Additional components include salts to modulate ionic strength, preservatives including, but not limited to, antimicrobial agents, antioxidants, chelators, and the like.
- the compositions can be prepared for administration in solid form.
- compositions may be combined with various inert vehicles or excipients, including but not limited to; binders such as microcrystalline cellulose, gum tragacanth, or gelatin; excipients such as starch or lactose; dispersing agents such as alginic acid or corn starch; lubricants such as magnesium stearate, glidants such as colloidal silicon dioxide; sweetening agents such as sucrose or saccharin; or flavoring agents such as peppermint or methyl salicylate.
- binders such as microcrystalline cellulose, gum tragacanth, or gelatin
- excipients such as starch or lactose
- dispersing agents such as alginic acid or corn starch
- lubricants such as magnesium stearate, glidants such as colloidal silicon dioxide
- sweetening agents such as sucrose or saccharin
- flavoring agents such as peppermint or methyl salicylate.
- the DNA of interest can be introduced into the target cells by viral or non-viral methods, or by mixed methods.
- Viral methods include, for example, but not limited to, retroviruses, adenoviruses, adeno-associated viruses (AAVs), herpes viruses, or vectors known as "pseudotyped", in which the viral envelope of wild proteins has been replaced by peptides from other viruses, or by chimeric proteins, which consist of the parts of the viral protein necessary for incorporation into the virion, as well as the sequences that are supposed to interact with specific cellular protein receptors.
- retroviruses adenoviruses
- AAVs adeno-associated viruses
- herpes viruses or vectors known as "pseudotyped" in which the viral envelope of wild proteins has been replaced by peptides from other viruses, or by chimeric proteins, which consist of the parts of the viral protein necessary for incorporation into the virion, as well as the sequences that are supposed to interact with specific
- non-viral methods are the methods for introducing naked DNA, such as electroporation, sonication, or the use of biobalistics, nanoparticles, dendrimers, lipoplexes and pollexlexes, among others.
- Mixed methods include, for example, virosomes, which combine liposomes with an inactivated virus. These methods are illustrative and not limiting of the invention.
- a viral vector is used which is the RevTet-On expression system, and which contains the pRevTet-On and pRev-TRE vectors.
- compositions or preparations and / or their formulations can be administered to an animal, including a mammal and, therefore, to man, in a variety of ways, including, but not limited to, intraperitoneal, intravenous, intramuscular, subcutaneous, intracecal, intraventricular, oral, enteral, parenteral, intranasal or dermal.
- the dosage to obtain a therapeutically effective amount depends on a variety of factors, such as the age, weight, sex, tolerance, ... of the mammal.
- the term "therapeutically effective amount” refers to the amount of a polynucleotide, a genetic construct, a composition, or the combined preparation that produces the desired effect and, in general, will be determined , among other causes, due to the characteristics of said polynucleotide, of a genetic construction, of a composition, or of the combined preparation and the therapeutic effect to be achieved.
- the “adjuvants” and “pharmaceutically acceptable carriers” that can be used in said compositions are the vehicles known to those skilled in the art.
- the DLD-1 colorectal carcinoma cell line was obtained from the Immunology Service of the Hopital Virgen de las Nieves (Granada, Spain).
- the PT67 viral vector packaging cell line was purchased from Clontech, Palo Alto, Caifornia, USA.
- the DLD-1 and PT67 lines were grown at 37 ° C in a 5% C0 2 atmosphere with a DMEM (Dubelcco ' s modified Eagle Medium) (Sigma, St.
- DLD-1 derived from colon carcinoma was supplied by the Clinical Analysis Section of the Virgen de Las Nieves University Hospital in Granada.
- DLD-1 / gef expressing the gef gene obtained by infection of the DLD-1 line with a viral vector expressing the gef gene).
- DLD-1 / apop that expresses the apoptin gene obtained by infection of the DLD-1 line with a viral vector that expresses the apoptin gene).
- DLD-1 / gef-apop expressing the gef and apoptin genes obtained by infection of the DLD-1 line with vectors expressing the gefy apoptin genes).
- the RevTet-On system which includes the pRevTet-On and pRev-TRE vectors, and the RetroPack PT67 cell line, purchased from Clontech, Palo Alto, California, USA.
- the apoptin gene was grown by Dr. Mahvash Tavassoli, of the Rayne Institute, King's College, London, and the gef gene was ceded by Dr. J.L. Ramos, from the Zaid ⁇ n Experimental Station of the CSIC, Granada, Spain.
- the PCR product was digested by BamH I and Hind III and inserted into the pRev-TRE vector. This construction was used to transform E.Coli. The cells were placed in an LB culture medium with ampicillin. A positive clone (with pRevTRE-gef) was selected for transfection of DLD-1 cells after having verified by restriction enzymes and PCR that the sequence of the insert and its orientation are correct. The pRevTet-On vector and the pRevTRE-apoptin vector were cloned in the same way.
- DLD1, DLD1 / Tet-On-gef, DLD1 / Tet-On-apoptin, and DLD1 / Tet-On-gef-apoptin (25x10 3 ) cells were cultured in 6-well plates under the conditions described above. After 24h, the culture medium was renewed and 0.2 mg / mL of Dox (Sigma) was added to induce the expression of the genes Cells belonging to the control groups were not treated with Dox. The goal of treating DLD 1 cells with Dox is to verify that Dox has no effect on cell growth. The medium (with or without Dox) of all cells was renewed on alternative days until the end of the experiment. The experiment was performed in quadruplicate.
- the cells were stained with sulphordamine B (SRB) to perform a colorimetric assay using the Titertek Multiscan apparatus (Flow, Irvine, California) at 492 nm.
- SRB sulphordamine B
- the calibration line for the SRB assay was performed for each DLD 1 cell pass before each cell proliferation experiment.
- the Annexin V-FITC Apoptosis Detection Kit I kit (Pharmingen, San Diego, CA, USA) was used for the detection of apoptosis by flow cytometry.
- the cells (1 10 6 ) DLD1, DLD1 / Tet-On-gef, DLD1 / Tet-On-apoptin, and DLD1 / Tet-On-gef-apoptin were placed in 75-cm 2 culture bottles and all cultured the night. They were then incubated with Dox for 2 and 6 days.
- the 4 cell lines were detached with PBS-EDTA, washed twice with cold PBS (1.4 M NaCI, 27 mM KCI, 100 mM KH2P04 / K2HP04, pH 7.2) and centrifuged at 500g for 10 min.
- binding buffer solution (10 mM hepes, pH 7.1; 150 mM NaCI, 5 mM KCI, 1 mM MgCI2, 1.8 mM CaCI2), stained with annexin V (1 ⁇ of annexin V-FITC (25 ⁇ g / ml), 10 ⁇ binding buffer, 10 ⁇ propidium iodide (Pl) (50 ⁇ g / ml), 79 ⁇ H 2 0) and incubated in the dark for 15 min at room temperature. After that time, 500 ⁇ of the binding buffer solution was added and the cells (10,000 per sample) were immediately processed with flow cytometry (Becton Dickinson, San Jose, CA, USA).
- Dox-treated DLD1, DLD1 / Tet-On-gef, DLD1 / Tet-On-Apoptin and DLD1 / Tet-On-gef-Apoptin cells for 6 days were fixed with 2.5% glutaraldehyde in a buffer (pH 7.4 ) with 0.1 M sodium cacodylate for 1 h at room temperature.
- the pellet and monolayer were subsequently fixed with 1% osmium tetraoxide in a buffer with 0.1 M cacodylate for one hour at room temperature and subsequently, dehydrated in ethanol.
- the cells were detached from the vessel by treatment with propylene oxide and were embedded in Epon 812. After polymerization, the plastic was removed and ultrafine sections parallel and perpendicular to the surface of the culture flask were cut. The sections were stained with uranyl acetate lead lead and examined in a Hitachi H7000 transmission electron microscope.
- Monolayer cultured cells were peeled off, washed twice with a simple buffer (100 mg glucose; 100 ml PBS without Ca2 + or Mg2 +) and fixed with 70% cold ethanol (vol / vol) for one week. Next, the cells were centrifuged, washed once with a simple buffer and resuspended in a solution of Pl (50 ⁇ g / ml Pl, 0.5 mg / ml RNase in simple buffer, pH 7.4) for 30 min in the dark. The analysis with Fluorescence-activated cell sorter was carried out at 2 and 96h after induction. Data from 10,000 cells per sample were collected and analyzed with the FACScan flow cytometer Cellfit program (Becton Dickinson, San Jose, CA, USA).
- JC-1 The potential-sensitive dual-emission probe, 5 ', 6, 6'-tetra-chloro-1, 1', 3, 3'-tetraethyl-imidacarbocyanine iodide (JC-1) was used to measure the membrane mitochondrial potential ( ⁇ ).
- JC-1 is a fluorescent green monomer with low membrane potential, which forms fluorescent red aggregates promoted by a high membrane potential.
- the proportion of red / green fluorescence of JC-1 depends solely on the membrane potential and indicates depolarization thereof.
- the cells were washed twice with cold PBS, incubated with 2 mg / L of JC-1 at 37 ° C for 20 min and analyzed by flow cytometry (Becton Dickinson, San Jose, CA, USA) with excitation values and emission of 485 and 535 nm, respectively.
- DLD1 / Tet-On-apoptin cells treated with Dox growth inhibition of 50.41%, 71.4%, 64.7%, 43.46%, and 47.8% after 2, 4, 6, 8, and 10 days of incubation was observed , respectively (P ⁇ 0.001).
- DLD1 / Tet-On-gef-apoptin cells transduced with the gef and apoptin genes a 51.30% growth inhibition was observed after 2 days of Dox incubation with respect to the control cells.
- a growth inhibition of 64.1%, 45.45%, 51.9%, and 65.07% was observed after 4, 6, 8, and 10 days of incubation, respectively (P ⁇ 0.001).
- the DLD-1 cell culture contained 70.76% of cells in G1 / G0, 19.23% of S-phase cells and 10.01% of cells in G2 / M.
- DLD1 / Tet-On-gef-apoptin cells showed a gradual decrease of G1 phase cells and an accumulation of S phase and G2 / M cells.
- the increase in the number of cells in phase S (29.94%), and in phase G2 / M (27.01%) and the decrease in the population of cells in phase G1 (43.04% G1 / G0) were even more pronounced.
- DLD-1 cells transfected with a single gene and those transfected with both genes were observed under an optical microscope after induction with Dox, and more rounded cells and loss of adherence to the culture flask were observed. No morphological changes were seen in DLD-1 cells transfected with the empty vector with respect to the non-transfected ones (data not shown).
- DLD-1 cells transfected with the gef and / or apoptin genes were analyzed with a transmission electron microscope to deepen the study of the cytotoxicity of said genes. Through the analysis of ultrastructural images, the presence of dead cells by apoptosis was confirmed both in the cells transfected with the gef gene and in those transformed with the apoptin gene.
- control cells are large and rounded or polygonal, with well-defined borders and abundant granular cytoplasm, with nuclei of varying sizes;
- the cells have mitochondria with well-defined crests, endoplasmic reticulum, Golgi apparatus as well as free ribosomes or associated with the endoplasmic reticulum.
- the nucleus of the cells expressing the gef gene and / or the apoptin gene have the ultrastructural characteristics of apoptosis, including chromatin condensation, crescent shape, marginalization and vesicle formation, as seen in the images c , d, e, f, g, h, I, j and k of Figure 5.
- the membrane potential of the mitochondria was measured by the JC-1 probe in order to determine whether the apoptosis of DLD-1 cells induced by the gef and apoptin genes, alone or in combination, is carried out by the mitochondrial pathway
- the probe accumulates specifically in the mitochondria in amounts that vary according to the membrane potential. In the organelles with low membrane potential a small amount of JC-1 molecules accumulates, so they emit green fluorescence (485 excitation / 535 emission). At high concentrations (high membrane potential), the monomers of the probe form aggregates and emit a red fluorescence (535 excitation / 590 emission). Therefore, the loss of membrane potential translates into a change from red to green.
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Abstract
La invención consiste en un polinucleótido que incluye los genes gef y apoptina y su uso en terapia génica para tratar el cáncer de colon.
Description
POLINUCLEÓTIDO QUE CONTIENE LOS GENES GEF Y APOPTINA Y SU USO EN TERAPIA GÉNICA DEL CÁNCER DE COLON
La presente invención se encuentra dentro del campo de la medicina y la biología molecular, y se refiere al uso de los genes gef y apoptina como terapia génica antitumoral, y concretamente para el tratamiento del cáncer de colon.
ESTADO DE LA TÉCNICA ANTERIOR
El cáncer colorrectal es el tercer cáncer más común en hombres y el segundo en mujeres. La incidencia anual de cáncer de colon se estima en un millón, y aproximadamente 500.000 personas mueren cada año como consecuencia de un cáncer de colon en todo el mundo (Ferlay et al., 2010. Int J Cáncer 127:2893-917). Los recientes avances en la quimioterapia y la radioterapia han aumentado la supervivencia media de los pacientes.
La terapia génica, se presenta como una de las estrategias más prometedoras para el desarrollo de un tipo de terapia antitumoral que persigue la destrucción de las células neoplásicas, el cese o disminución de su capacidad de proliferación o la corrección del defecto celular que induce la alteración de la célula normal (Ortiz et al., 2012. Drug Discovery, 7(3), 297-312).
Se ha descrito que la utilización de "genes suicidas" (genes que inducen a la muerte celular) en terapia génica dirigida hacia tumores, induce a la muerte celular de las células tumorales (Vassaux et al., 2004. Expert Opin Biol T 7er4(4):519-30).
De entre estos genes suicidas, se ha descrito el efecto antitumoral del gen gef, con el fin de establecer una terapia combinada junto con agentes citotóxicos que potencien la acción de estos últimos (Ortiz et al., 2012. Biomedicine and Pharmacotherapy 66(7), 563-567). Se ha demostrado la utilidad de la transfección del gen gef en células humanas derivadas de cáncer de mama (MCF-7), mediante un vector de expresión simple con un promotor no específico inducido con dexametasona, lo que ha permitido demostrar la aparición de modificaciones ultraestructurales características de apoptosis (Boulaiz et al., 2003. Br J Cáncer. 7;89(1): 192-8.). Así mismo, nuestros resultados demuestran que en líneas celulares humanas derivadas de melanoma (MS-36), el gen gef es capaz de inducir modificaciones en el ciclo celular, que conducen a una disminución significativa de la capacidad de proliferación (Boulaiz et al., 2003. Cáncer Sci.; 94(6): 564-8.; Boulaiz et ai, 2008. Br J Dermatol. 159(2):370-8.).
De la misma forma, se ha descrito el papel del gen apoptina en la inducción de la muerte celular y su posible uso en la terapia génica antitumoral (Zhou eí al., 2012. Medical Oncology 29(4), 2985-2991). La apoptina, una proteína de 121 aminoácidos codificada por un virus aviar, no se asemeja a ninguna otra proteína animal o viral secuenciada (Noteborn et al., 1991. J Virol 1991 ; 65:3131-3139). La apoptina induce apoptosis en los timocitos de pollos jóvenes, así como en las células transformadas del pollo bajo condiciones de cultivo tisular (Danen-van Oorschot eí al., 2003. J Biol Chem.; 278:27729-27736; Leliveld eí al., 2003a. Nucleic Acids Res 2003a; 31 :4805-4813, Leliveld eí al., 2003b. J Biol Chem; 278: 9042-9051.; Natesan eí al., 2006. J Gen Virol 2006; 87:2933-2940.). Como las células transformadas del pollo, las líneas tumorales humanas y de roedores son sensibles a la apoptina (Noteborn, 1999a. Biogenic Amines 1999; 15:73-91. Noteborn, 1999b. Apoptosis 1999; 4:317-319.). De hecho, la inyección conjunta de células de carcinoma hepático y del gen de la apoptina en los tumores inducidos en ratones produjo una disminución de la masa tumoral debido fundamentalmente a apoptosis (Shen eí al., 2003. J Huazhong Univ Sci Technolog Med Sci 2003; 23: 105-107). La importante y trascendente singularidad de la apoptina es su propiedad de inducir apoptosis únicamente en células neoplásicas y no en células normales por lo que la convierte en un potencial agente anti-tumoral (Pietersen eí al., 1999; Gene Tfter 1999; 6:882-892. Maddika et al, 2006. Cáncer Biol Ther200Q; 5: 10-19). Sin embargo, el cáncer colorrectal avanzado o recurrente sigue siendo incurable por los tratamientos convencionales (Berrino et al., 2007. Lancet Oncol 8:773-883). Por lo tanto, es necesario explorar mejores opciones para el tratamiento del cáncer avanzado de colon. Se ha propuesto potenciar los efectos de los fármacos actuales y combinarlos con los posibles beneficios terapéuticos que podría aportar la terapia génica (Doloff et al., 2010. BMC Cáncer 2010; 10:487; Oh et al., 2010. Int J Mol Med 2010; 25(3):369-76; Kojima et al., 2010. J Surg Res 2009; 157(1): e63-70). La introducción de genes suicidas en células tumorales provocan un cierto grado de muerte celular de dichas células. Sin embargo, sería necesario encontrar una terapia génica en la que se introdujeran una combinación adecuada de genes para incrementar el efecto de la terapia, ya que el distinto mecanismo de acción de los mismos no conduce en general a resultados mejores que las terapias aisladas.
BREVE DESCRIPCIÓN DE LA INVENCIÓN
Los autores de la presente invención han desarrollado unos plásmidos retrovirales que incorporan el gen gef y el gen apoptina, proporcionando una composición farmacéutica y una preparación combinada que puede emplearse en la terapia antitumoral, y especialmente frente al cáncer de colon.
Así pues, un primer aspecto de la invención se refiere a un polinucleótido de ARN o ADN aislado, de ahora en adelante polinucleótido de la invención, capaz de traducirse a una secuencia aminoacídica que comprende un péptido que presenta una identidad de al menos un 95% con la secuencia aminoacídica de la proteína GEF (SEQ ID NO: 1) y de al menos un 95% con la secuencia aminoacídica de la proteína APOPTINA (SEQ ID NO: 2). Más preferiblemente se refiere a un polinucleótido de ARN o ADN aislado capaz de traducirse a una secuencia aminoacídica que comprende un péptido que presenta una identidad de al menos un 99% con la secuencia aminoacídica de la proteína GEF (SEQ ID NO: 1) y de al menos un 99% con la secuencia aminoacídica de la proteína APOPTINA (SEQ ID NO: 2).
Otro aspecto de la invención se refiere a una construcción genética de ADN o ARN, de ahora en adelante construcción genética de la invención, que comprende al menos uno de los siguientes tipos de secuencias:
a) Secuencia de nucleótidos, que comprende, al menos, un polinucleótido de la invención, para su transcripción in vitro o in vivo.
b) secuencia de nucleótidos, correspondiente a un sistema o vector de expresión génica que comprende un polinucleótido de la invención, operativamente enlazado con, al menos, un promotor que dirija la transcripción de dicha secuencia de nucleótidos, y con otras secuencias necesarias o apropiadas para la transcripción y su regulación adecuada en tiempo y lugar.
Otro aspecto de la invención se refiere a una composición, de ahora en adelante composición de la invención, que comprende:
I) un polinucleótido de la invención, y/o
II) al menos dos componentes, un componente A, de ahora en adelante componente A de la invención, que se seleccionan de entre:
a) Un polinucleótido de ARN o ADN aislado capaz de traducirse a una secuencia aminoacídica que comprende un péptido que presenta una identidad de al menos
un 95% con la secuencia aminoacídica que codifica para la proteína GEF (SEQ ID NO: 1),
b) Un polinucleótido de ARN o ADN aislado capaz de traducirse a una secuencia aminoacídica que comprende un péptido que presenta una identidad de al menos un 99% con la secuencia aminoacídica que codifica para la proteína GEF (SEQ ID NO: 1).
c) Una construcción genética de ADN o ARN, que comprende, al menos uno de los siguientes tipos de secuencias:
i) Secuencia de nucleótidos, que comprende, al menos, un polinucleótido según (a) o (b), para su transcripción in vitro o in vivo,
ii) Secuencia de nucleótidos, correspondiente a un sistema o vector de expresión génica que comprende un polinucleótido según (a) o (b), operativamente enlazado con, al menos, un promotor que dirija la transcripción de dicha secuencia de nucleótidos, y con otras secuencias necesarias o apropiadas para la transcripción y su regulación adecuada en tiempo y lugar.
d) La secuencia aminoacídica de la proteína GEF (SEQ ID NO: 1)
Y un componente B, de ahora en adelante componente B de la invención, que se selecciona de entre:
e) Un polinucleótido de ARN o ADN aislado capaz de traducirse a una secuencia aminoacídica que comprende un péptido que presenta una identidad de al menos un 95% con la secuencia aminoacídica de la proteína APOPTINA (SEQ ID NO: 2), f) Un polinucleótido de ARN o ADN aislado capaz de traducirse a una secuencia aminoacídica que comprende un péptido que presenta una identidad de al menos un 99% con la secuencia aminoacídica que codifica para la proteína APOPTINA (SEQ ID NO: 2).
g) Una construcción genética de ADN o ARN, que comprende, al menos uno de los siguientes tipos de secuencias:
i) Secuencia de nucleótidos, que comprende, al menos, un polinucleótido según (e) o (f), para su transcripción in vitro o in vivo.
ii) Secuencia de nucleótidos, correspondiente a un sistema o vector de expresión génica que comprende un polinucleótido según (e) o (f), operativamente enlazado con, al menos, un promotor que dirija la transcripción de dicha secuencia de nucleótidos, y con otras secuencias necesarias o apropiadas para la transcripción y su regulación adecuada en tiempo y lugar.
h) La secuencia aminoacídica que codifica para la proteína APOPTINA (SEQ ID NO: 2).
En una realización preferida de este aspecto de la invención, la composición es una composición farmacéutica. Más preferiblemente la composición además comprende un vehículo farmacéuticamente aceptable. Aún más preferiblemente, además comprende otro principio activo.
Otro aspecto de la invención se refiere a una preparación combinada, de ahora en adelante preparación combinada de la invención, que comprende un componente A de la invención y un componente B de la invención. En una realización preferida de este aspecto de la invención, la preparación combinada además comprende otro principio activo.
Otro aspecto de la invención se refiere al uso de un polinucleótido de la invención, de una construcción genética de la invención, de una composición de la invención, o de la preparación combinada de la invención, en la elaboración de un medicamento, o alternativamente, a un polinucleótido de la invención, una construcción genética de la invención, una composición de la invención, o la preparación combinada de la invención, para su uso como medicamento.
Otro aspecto de la invención se refiere al uso de un polinucleótido de la invención, de una construcción genética de la invención, de una composición de la invención, o de la preparación combinada de la invención, en la elaboración de un medicamento para el tratamiento de una enfermedad que cursa con proliferación celular anormal, o alternativamente, a un polinucleótido de la invención, una construcción genética de la invención, una composición de la invención, o la preparación combinada de la invención, para el tratamiento de una enfermedad que cursa con proliferación celular anormal. En una realización preferida de este aspecto de la invención la enfermedad que cursa con proliferación celular es el cáncer. En otra realización más preferida, la enfermedad es el cáncer de colon. Otro aspecto de la invención se refiere al uso del componente A y el componente B de la invención, por separado, combinado o secuencial, en la elaboración de un medicamento.
BREVE DESCRIPCIÓN DE LAS FIGURAS
Fig. 1. Determinación del efecto de la expresión de los genes gef y/o apoptina en la proliferación celular. Las células (a una concentración de 25 x 103 células por disco) se cultivaron durante 10 días para determinas su tasa de crecimiento. Los valores
representan la media ± la desviación estándar de los cultivos por cuadruplicado.
Fig. 2. Cuantificación de la inducción de apoptosis en células DLD-1 control y transformadas mediante fluorescence-activated cell sorting analysis. Las células fueron teñidas con Anexina V y Pl para evaluar la muerte celular por apoptosis después de ser tratados con Dox durante 2 y 6 días, como se describe en la sección Materiales y Métodos. Los datos que se muestran pertenecen a 3 experimentos independientes.
Fig. 3. FACScan analysis of the cell cycle. Se analizaron las diferentes fases del ciclo celular de las células DLD-1 , DLD1/gef, DLD1/apoptina, y DLD1/gef-apoptina tratadas con Dox durante 2 y 6 días. Los datos que se muestran pertenecen a 3 experimentos independientes.
Fig. 4. Análisis del potencial de membrana mitocondrial (ΔΨΓΠ). Tanto las células transfectadas como las no transfectadas, tratadas con Dox durante 2 y 6 días, fueron teñidas con JC-1. La fluorescencia roja representa las mitocondrias que tienen la membrana intacta, mientras que la fluorescencia verde representa las mitocondrias que tienen una baja despolarización de la membrana.
Fig. 5.. Morfología ultraestructural de las células DLD-1 , DLD1/gef, DLD1/apoptina, and DLD1/gef-apoptina tratadas con Dox durante 2 días para inducir la expresión de gef y/o apoptina. (Imágenes a y b). La morfología típica de las células parentales DLD-1 demostraron una complexión citoplasmática ligera. (Imágenes c,d y e). Células DLD1/gef que presentan gránulos y condensación de la cromatina, formación de vesículas y pronunciadas protuberancias en las mitocondrias. (Imágenes f, g y h). Célula DLD1/apoptina con membrana nuclear retorcida, retículo endoplasmático dilatado y sin estructura y formación de vesículas. (Imágenes i, j y k). Células DLD1/gef-apoptina con mitocondrias dilatadas y retículo endoplasmático y aparato de Golgi desorganizados. La masa de la cromatina compactada es muy densa y homogénea en textura. Se observaron tanto células necróticas como células apoptóticas con formación de vesículas.
DESCRIPCIÓN DE LA INVENCIÓN
Los autores de la presente invención han desarrollado un nuevo sistema de terapia génica basado en la transfección de dos genes suicidas:
1. El gen gef, procariótico, que parece actuar de forma lesiva sobre las células a través de modificaciones en la membrana.
2. La apoptina, un gen codificado por un virus aviar, que induce apoptosis en los timocitos de pollos jóvenes, así como en las células transformadas del pollo bajo condiciones de cultivo tisular. Utilizando como modelo experimental la línea DLD-1 derivada de carcinoma de colon humano, hemos conseguido transfectar satisfactoriamente estos genes mediante un vector de inducción controlable, lo que nos ha permitido analizar los efectos de su expresión sobre las características biológicas de las células tumorales.
La expresión de los genes gef y apoptina solos o combinados inducida mediante doxyciclina en la línea DLD-1 provoca alteraciones morfológicas que indican la entrada de determinadas subpoblaciones celulares en un proceso de muerte celular programada o apoptosis, Sin embargo, el hecho más significativo es que, tal como se muestra en las Fig.1 a la Fig.3 la expresión combinada de ambos genes induce una significativa reducción de la tasa de proliferación en comparación tanto con las líneas parentales como con las que expresan dichos genes por separado, que se acompaña de una notable alteración de la proporción de células en cada una de las fases del ciclo celular. Los resultados demuestran por primera vez que la acción combinada de los genes gef y apoptina es mucho más citotóxica y tiene actividad antitumoral más intensa de la que tiene la expresión de dichos genes por separado. Por lo tanto, la invención se refiere al uso de los genes gef y apoptina (bien directamente de su secuencia aminoacídica, o bien mediante su aplicación en terapia génica en polinucleótidos y vectores que codifiquen y expresen los genes gef y apoptina, esto es, su secuencia aminoacídica) en la elaboración de un medicamento para el tratamiento de enfermedades proliferatívas, preferiblemente para el tratamimento del cáncer, y aún más preferiblemente para el tratamiento del cáncer de colon.
Por tanto, un primer aspecto de la invención se refiere a un polinucleótido de ARN o ADN aislado, de ahora en adelante polinucleótido de la invención, capaz de traducirse a una secuencia aminoacídica que comprende un péptido que presenta una identidad de al menos un 95% con la secuencia aminoacídica de la proteína GEF (SEQ ID NO: 1) y otro pépido que presenta una identidad de al menos un 95% con la secuencia aminoacídica de la proteína APOPTINA (SEQ ID NO: 2). Más preferiblemente se refiere a un polinucleótido de ARN o ADN aislado capaz de
traducirse a una secuencia aminoacídica que comprende un péptido que presenta una identidad de al menos un 99% con la secuencia aminoacídica de la proteína GEF (SEQ ID NO: 1) y a otro péptido que presenta una identidad de al menos un 99% con la secuencia aminoacídica de la proteína APOPTINA (SEQ ID NO: 2). Puede esperarse que el grado de identidad/similaridad de las proteínas recogidas en las secuencias SEQ ID NO: 1 y SEQ ID NO: 2, sean de al menos de un 80% o mayor, y más preferiblemente de al menos un 85%, un 90, un 95% o un 99%. La correspondencia entre la(s) secuencia(s) aminoacídica(s) de la(s) secuencia(s) putativa(s) y las secuencias recogidas en SEQ ID NO: 1 y SEQ ID NO: 2, se puede determinar por métodos conocidos en la técnica. Los métodos de comparación de secuencias son conocidos en el estado de la técnica, e incluyen, aunque sin limitarse a ellos, el programa BLASTP o BLASTN, y FASTA (Altschul et al., J. Mol. Biol. 215: 403-410 (1999).
El término "homología", tal y como se utiliza en esta memoria, hace referencia a la semejanza entre dos estructuras debida a una ascendencia evolutiva común, y más concretamente, a la semejanza entre dos o más secuencias de nucleótidos o aminoácidos. Puesto que dos secuencias se consideran homologas si tienen el mismo origen evolutivo, en general, se asume que valores superiores de similitud o identidad del 95% indicarían homología. Podemos considerar, por tanto, que porcentajes de identidad de, al menos, un 95%, y preferiblemente un 99%, podrían mantener la función de las secuencias aminoacídicas recogidas en la SEQ ID NO: 1 y SEQ ID NO: 2.
El término "identidad", tal y como se utiliza en esta memoria, hace referencia a la proporción de nucleótidos o aminoácidos idénticos entre dos secuencias nucleotídicas o aminoacídicas que se comparan. Los métodos de comparación de secuencias son conocidos en el estado de la técnica, e incluyen, aunque sin limitarse a ellos, el programa GAG, incluyendo GAP (Devereux et al., Nucleic Acids Research 12: 287 (1984) Genetics Computer Group University of Wisconsin, Madison, (Wl); BLAST, BLASTP o BLASTN, y FASTA (Altschul et al., J. Mol. Biol. 215: 403-410 (1999).
La proteína GEF también está codificada por el locus UTI89_C0018 de E.Coli.
Su secuencia aminoacídica se encuentra en la SEQ ID NO: 1 , (de secuencia nucleotídica SEQ ID NO: 3 con número de acceso en el GenBank (NCBI) GenBank
(NCBI) AE005174.2). También se refiere a cualquiera de sus variantes biológicamente activas (actualmente se conocen 3 variantes).
En el contexto de la presente invención, la proteína GEF se define también por una secuencia de nucleótidos o polinucleótido, que constituye la secuencia codificante de la proteína recogida en la SEQ ID NO: 1 , y que comprendería diversas variantes procedentes de:
a) Moléculas de ácido nucleico que codifican un polipéptido que comprende la secuencia aminoacídica de la SEQ ID NO: 1 ,
b) Moléculas de ácido nucleico cuya cadena complementaria híbrida con la secuencia polinucleotídica de a),
c) Moléculas de ácido nucleico cuya secuencia difiere de a) y/o b) debido a la degeneración del código genético,
d) Moléculas de ácido nucleico que codifican un polipéptido que comprende la secuencia aminoacídica con una identidad de al menos un 80%, un 90%, un 95%, un 98% o un 99% con la SEQ ID NO: 1 , y en las que el polipéptido codificado por dichos ácidos nucleicos posee la actividad y las características estructurales de la proteína GEF. Entre las secuencias nucleotídicas que codifican para la proteína GEF se encuentra la secuencia recogida en el GenBank (NCBI) AE005174.2, recogida en la secuencia SEQ ID NO: 3.
SEQ ID NO: 1
MLNTCRVPLTDRKVKEKRAMKQHKVMIVALIVXCITAWAALVTRKDLCEVHIRTGQ
TEVAVFTAYESE
SEQ ID NO: 3
ttactcggattcgtaagccgtgaaaacagcaacctccgtctggccagttcggatgtgaacctcacagaggtcttttctc gttaccagcgccgccactacggcggtgatacasatgacgatcagggcgacaatcatcaccttatgctgcttcattgct ctcttctccttgaccttacggtcagtaagaggcactctacatgtgttcagcat
La proteína APOPTINA también llamada Cux-1 , ORF1 , hypothetical protein o proteína de la nucleocapsida, esta codificada por el locus CAVgp2 del virus de la anemia del pollo.
Su secuencia aminoacídica se encuentra en la SEQ ID NO: 2, con número de acceso en el GenBank (NCBI) NP_056774).
En el contexto de la presente invención, la proteína APOPTINA se define también por una secuencia de nucleótidos o polinucleótido, que constituye la secuencia
codificante de la proteína recogida en la SEQ ID NO: 2, y que comprendería diversas variantes procedentes de:
a) Moléculas de ácido nucleico que codifican un polipéptido que comprende la secuencia aminoacídica de la SEQ ID NO: 2,
b) Moléculas de ácido nucleico cuya cadena complementaria híbrida con la secuencia polinucleotídica de a),
c) Moléculas de ácido nucleico cuya secuencia difiere de a) y/o b) debido a la degeneración del código genético,
d) Moléculas de ácido nucleico que codifican un polipéptido que comprende la secuencia aminoacídica con una identidad de al menos un 80%, un 90%, un 95%, un 98% o un 99% con la SEQ ID NO: 2, y en las que el polipéptido codificado por dichos ácidos nucleicos posee la actividad y las características estructurales de la proteína APOPTINA. Entre las secuencias nucleotídicas que codifican para la proteína APOPTINA se encuentra la secuencia recogida en el GenBank (NCBI) M55918.1 , entre los pares de base 486-851 , recogida en la secuencia SEQ ID NO: 4.
SEQ ID NO: 2
MNALQEDTPPGPSTVFRPPTSSRPLETPHCREIRIGIAGITITLSLCGCANARAPTLR SATADNSESTGFKNVPDLRTDQPKPPSKKRSCDPSEYRVSELKESLITTTPSRPRT AKRRIRL SEQ ID NO: 4
ATGAACGCTCTCCAAGAAGATACTCCACCCGGACCATCAACGGTGTTCAGGCC
ACCAACAAGTTCACGGCCGTTGGAAACCCCTCACTGCAGAGAGATCCGGATTG
GTATCGCTGGAATTACAATCACTCTATCGCTGTGTGGCTGCGCGAATGCTCGC
GCTCCCACGCTAAGATCTGCAACTGCGGACAATTCAGAAAGCACTGGTTTCAA
GAATGTGCCGGACTTGAGGACCGATCAACCCAAGCCTCCCTCGAAGAAGCGAT
CCTGCGACCCCTCCGAGTACAGGGTAAGCGAGCTAAAAGAAAGCTTGATTACC
ACTACTCCCAGCCGACCCCGAACCGCAAAAAGGCGTATAAGACTGTAA
Otro aspecto de la invención se refiere a una construcción genética de ADN o ARN, de ahora en adelante construcción genética de la invención, que comprende al menos uno de los siguientes tipos de secuencias:
a) Secuencia de nucleótidos, que comprende, al menos, un polinucleótido de la invención, para su transcripción in vitro o in vivo.
b) secuencia de nucleótidos, correspondiente a un sistema o vector de expresión génica que comprende un polinucleótido de la invención, operativamente enlazado con, al menos, un promotor que dirija la transcripción de dicha secuencia de nucleótidos, y con otras secuencias necesarias o apropiadas para la transcripción y su regulación adecuada en tiempo y lugar.
Un gran número de estas construcciones, sistemas o vectores de expresión pueden ser obtenidos por métodos convencionales conocidos por los expertos en la materia y forman parte de la presente invención.
Un "vector" es un replicón, o un vector integrativo, al que se ha unido otro segmento polinucleótido, para realizar la replicación y/o expresión del segmento unido.
Un "replicón" es cualquier elemento genético que se comporta como una unidad autónoma de replicación polinucleotídica dentro de una célula; esto es, capaz de replicarse bajo su propio control.
Un vector integrativo es cualquier elemento genético que se integra y se mantiene estable en el genoma de una célula.
"Secuencia de control" se refiere a secuencias de polinucleótidos que son necesarias para efectuar la expresión de las secuencias a las que están ligadas. La naturaleza de dichas secuencias de control difiere dependiendo del organismo huésped; en procariotas, dichas secuencias de control generalmente incluyen un promotor, un sitio de unión ribosomal, y señales de terminación; en eucariotas, generalmente, dichas secuencias de control incluyen promotores, señales de terminación, intensificadores y, en ocasiones, silenciadores. Se pretende que el término "secuencias de control" incluya, como mínimo, todos los componentes cuya presencia es necesaria para la expresión, y también puede incluir componentes adicionales cuya presencia sea ventajosa.
Como se usa aquí, el término "promotor" hace referencia a una región del ADN aguas arriba del punto de inicio de la transcripción, y en el particular, que es capaz de iniciar la transcripción en una célula vegetal, sea el origen del promotor una planta o no. Ejemplos de promotores incluyen, pero no se limitan a, promotores obtenidos de plantas, virus de plantas, y bacterias que pueden expresar genes en células de plantas, como Agrobacterium o Rhizobium. Ejemplos de promotores bajo el control del desarrollo incluyen promotores que preferentemente inician la transcripción en ciertos tejidos, tales como hojas, raíces, o semillas. Tales
promotores se denominan en esta memoria como preferentes de un tipo de tejidos. Hay otros promotores que inician la transcripción en un determinado tipo de tejidos, y se denominan como "tejido específicos". Un promotor "inducible" o "reprimible" es un promotor que se encuentra bajo el control del medio ambiente. Ejemplos de condiciones ambientales que pueden afectar la transcripción son las condiciones anaeróbicas, o la presencia de luz. Los promotores de tejido específico, tejido preferido, específicos de un tipo celular, o promotores inducibles son tipos constituyen la clase de promotores "no constitutivos". Un promotor "constitutivo" es un promotor que está activo en la mayoría de las condiciones ambientales.
"Unidos de forma operativa" se refiere a una yuxtaposición en la que los componentes así descritos tienen una relación que les permite funcionar en la manera intencionada. Una secuencia de control "unida de forma operativa" a una secuencia que se transcribe a la secuencia nucleotídica de la invención, está ligada de tal manera que la expresión de la secuencia codificadora se consigue en condiciones compatibles con las secuencias de control.
Una "secuencia codificadora" o "secuencia codificante" es una secuencia de polinucleótidos que se transcribe a mRNA y/o se traduce a un polipéptido cuando está bajo control de secuencias reguladoras apropiadas. Los límites de la secuencia codificante se determinan mediante un codón de inicio de traducción en el extremo 5' y un codón de finalización de la traducción en el extremo 3'. Una secuencia codificante puede incluir, pero no se limita a mRNA, cDNA, y secuencias de polinucleótidos recombinantes.
Los términos "polinucleótido" y "ácido nucleico" se usan aquí de manera intercambiable, refiriéndose a formas poliméricas de nucleótidos de cualquier longitud, tanto ribonucleótidos (ARN ó RNA) como desoxiribonucleótidos (ADN ó DNA).
Los términos "secuencia aminoacídica", "péptido", "oligopéptido", "polipéptido" y "proteína" se usan aquí de manera intercambiable, y se refieren a una forma polimérica de aminoácidos de cualquier longitud, que pueden estar, o no, química o bioquímicamente modificados.
Otro aspecto de la invención se refiere a una composición, de ahora en adelante composición de la invención, que comprende:
I) un polinucleótido de la invención, y/o
II) al menos dos componentes, un componente A, de ahora en adelante componente A de la invención, que se seleccionan de entre:
a) un polinucleótido de ARN o ADN aislado capaz de traducirse a una secuencia aminoacídica que comprende un péptido que presenta una identidad de al menos un 95% con la secuencia aminoacídica que codifica para la proteína GEF (SEQ ID NO: 1),
b) Un polinucleótido de ARN o ADN aislado capaz de traducirse a una secuencia aminoacídica que comprende un péptido que presenta una identidad de al menos un 99% con la secuencia aminoacídica que codifica para la proteína GEF (SEQ ID NO: 1).
c) Una construcción genética de ADN o ARN, que comprende, al menos uno de los siguientes tipos de secuencias:
i) secuencia de nucleótidos, que comprende, al menos, un polinucleótido según (a) o (b), para su transcripción in vitro o in vivo,
ii) secuencia de nucleótidos, correspondiente a un sistema o vector de expresión génica que comprende un polinucleótido según (a) o (b), operativamente enlazado con, al menos, un promotor que dirija la transcripción de dicha secuencia de nucleótidos, y con otras secuencias necesarias o apropiadas para la transcripción y su regulación adecuada en tiempo y lugar.
d) la secuencia aminoacídica de la proteína GEF (SEQ ID NO: 1)
y un componente B, de ahora en adelante componente B de la invención, que se selecciona de entre:
e) un polinucleótido de ARN o ADN aislado capaz de traducirse a una secuencia aminoacídica que comprende un péptido que presenta una identidad de al menos un 95% con la secuencia aminoacídica de la proteína APOPTINA (SEQ ID NO: 2), f) Un polinucleótido de ARN o ADN aislado capaz de traducirse a una secuencia aminoacídica que comprende un péptido que presenta una identidad de al menos un 99% con la secuencia aminoacídica que codifica para la proteína APOPTINA (SEQ ID NO: 2).
g) Una construcción genética de ADN o ARN, que comprende, al menos uno de los siguientes tipos de secuencias:
i) secuencia de nucleótidos, que comprende, al menos, un polinucleótido según (e) o (f), para su transcripción in vitro o in vivo.
ii) secuencia de nucleótidos, correspondiente a un sistema o vector de expresión génica que comprende un polinucleótido según (e) o (f), operativamente enlazado con, al menos, un promotor que dirija la transcripción de dicha secuencia de nucleótidos, y con otras secuencias necesarias o apropiadas para la transcripción y su regulación adecuada en tiempo y lugar.
h) la secuencia aminoacídica que codifica para la proteína APOPTINA (SEQ ID NO: 2).
En una realización preferida de este aspecto de la invención, la composición es una composición farmacéutica. Más preferiblemente la composición además comprende un vehículo farmacéuticamente aceptable. Aún más preferiblemente, además comprende otro principio activo.
Otro aspecto de la invención se refiere a una preparación combinada, de ahora en adelante preparación combinada de la invención, que comprende un componente A de la invención y un componente B de la invención. En una realización preferida de este aspecto de la invención, la preparación combinada además comprende otro principio activo.
Otro aspecto de la invención se refiere al uso de un polinucleótido de la invención, de una construcción genética de la invención, de una composición de la invención, o de la preparación combinada de la invención, en la elaboración de un medicamento, o alternativamente, a un polinucleótido de la invención, una construcción genética de la invención, una composición de la invención, o la preparación combinada de la invención, para su uso como medicamento.
Otro aspecto de la invención se refiere al uso de un polinucleótido de la invención, de una construcción genética de la invención, de una composición de la invención, o de la preparación combinada de la invención, en la elaboración de un medicamento para el tratamiento de una enfermedad que cursa con proliferación celular anormal, o alternativamente, a un polinucleótido de la invención, una construcción genética de la invención, una composición de la invención, o la preparación combinada de la invención, para el tratamiento de una enfermedad que cursa con proliferación celular anormal. En una realización preferida de este aspecto de la invención la enfermedad que cursa con proliferación celular es el cáncer. En otra realización más preferida, la enfermedad es el cáncer de colon. Por proliferación anormal » se entiende una proliferación que es independiente de los mecanismos de regulación normales, por ejemplo la interrupción de la
proliferación celular causada por la intervención de la apoptosis (muerte celular programada)
Otro aspecto de la invención se refiere al uso del componente A y el componente B de la invención, por separado, combinado o secuencial, en la elaboración de un medicamento. Más preferiblemente, se refiere al uso del componente A y el componente B de la invención, por separado, combinado o secuencial, en la elaboración de un medicamento para el tratamiento del cáncer, y aún más preferiblemente, para el tratamiento del cáncer de colon.
El término "medicamento", tal y como se usa en esta memoria, hace referencia a cualquier sustancia usada para prevención, diagnóstico, alivio, tratamiento o curación de enfermedades en el hombre y los animales. En el contexto de la presente invención, la enfermedad es una enfermedad que cursan con proliferación celular, más preferiblemente el cáncer, y aún más preferiblemente el cáncer de colon.
Debe enfatizarse que el término "preparación combinada" o también denominada "yuxtaposición", en esta memoria, significa que los componentes de la preparación combinada no necesitan encontrarse presentes como unión, por ejemplo en una composición, para poder encontrarse disponibles para su aplicación separada o secuencial. De esta manera, la expresión "yuxtapuesta" implica que no resulta necesariamente una combinación verdadera, a la vista de la separación física de los componentes.
Como se emplea aquí, el término "principio activo", "substancia activa", "substancia farmacéuticamente activa", "ingrediente activo" o "ingrediente farmacéuticamente activo" significa cualquier componente que potencialmente proporcione una actividad farmacológica u otro efecto diferente en el diagnóstico, cura, mitigación, tratamiento, o prevención de una enfermedad, o que afecta a la estructura o función del cuerpo del hombre u otros animales. El término incluye aquellos componentes que promueven un cambio químico en la elaboración del fármaco y están presentes en el mismo de una forma modificada prevista que proporciona la actividad específica o el efecto.
Tanto las composiciones de la presente invención, así como la preparación combinada de la invención pueden formularse para su administración a un animal, y más preferiblemente a un mamífero, incluyendo al hombre, en una variedad de formas conocidas en el estado de la técnica. Así, pueden estar, sin limitarse, en
disolución acuosa estéril o en fluidos biológicos, tal como suero. Las disoluciones acuosas pueden estar tamponadas o no tamponadas y tienen componentes activos o inactivos adicionales. Los componentes adicionales incluyen sales para modular la fuerza iónica, conservantes incluyendo, pero sin limitarse a, agentes antimicrobianos, antioxidantes, quelantes, y similares. Alternativamente, las composiciones pueden prepararse para su administración en forma sólida. Las composiciones pueden combinarse con varios vehículos o excipientes inertes, incluyendo pero sin limitarse a; aglutinantes tales como celulosa microcristalina, goma tragacanto, o gelatina; excipientes tales como almidón o lactosa; agentes dispersantes tales como ácido algínico o almidón de maíz; lubricantes tales como estearato de magnesio, deslizantes tales como dióxido de silicio coloidal; agentes edulcorantes tales como sacarosa o sacarina; o agentes aromatizantes tales como menta o salicilato de metilo.
Se conocen numerosas formulaciones y vehículos para la terapia génica. Así, el ADN de interés puede introducirse en las células diana mediante métodos virales o no virales, o mediante métodos mixtos. Entre los métodos virales se encuentran, por ejemplo, pero sin limitarnos, retrovirus, adenovirus, virus adenoasociados (AAV), herpes virus, o vectores conocidos como "pseudotyped", en los cuales la cubierta vírica de proteínas silvestre ha sido remplazada por péptidos de otros virus, o por proteínas quiméricas, que constan de las partes de la proteína vírica necesarias para su incorporación en el virión, así como las secuencias que supuestamente a interaccionar con receptores específicos de proteínas celulares. Entre los métodos no virales se encuentran los métodos para introducir ADN desnudo, como la electroporación, la sonicación, o el uso de la biobalística, nanopartículas, dendrímeros, lipoplexes y poliplexes, entre otros. Entre los métodos mixtos se encuentran, por ejemplo, los virosomas, que combinan liposomas con un virus inactivado. Estos métodos son ilustrativos y no limitativos de la invención. En una realización preferida de este aspecto de la invención, se emplea un vector viral que es el sistema de expresión RevTet-On, y que contiene los vectores pRevTet-On y pRev-TRE.
Tales composiciones o preparaciones combinadas y/o sus formulaciones pueden administrarse a un animal, incluyendo un mamífero y, por tanto, al hombre, en una variedad de formas, incluyendo, pero sin limitarse a, intraperitoneal, intravenoso,
intramuscular, subcutáneo, intracecal, intraventricular, oral, enteral, parenteral, intranasal o dérmico.
La dosificación para obtener una cantidad terapéuticamente efectiva depende de una variedad de factores, como por ejemplo, la edad, peso, sexo, tolerancia,... del mamífero. En el sentido utilizado en esta descripción, la expresión "cantidad terapéuticamente efectiva" se refiere a la cantidad de un polinucleótido, de una construcción genética, de una composición, o de la preparación combinada que produzcan el efecto deseado y, en general, vendrá determinada, entre otras causas, por las características propias de dichos un polinucleótido, de una construcción genética, de una composición, o de la preparación combinada y el efecto terapéutico a conseguir. Los "adyuvantes" y "vehículos farmacéuticamente aceptables" que pueden ser utilizados en dichas composiciones son los vehículos conocidos por los técnicos en la materia.
A lo largo de la descripción y las reivindicaciones la palabra "comprende" y sus variantes no pretenden excluir otras características técnicas, aditivos, componentes o pasos. Para los expertos en la materia, otros objetos, ventajas y características de la invención se desprenderán en parte de la descripción y en parte de la práctica de la invención. Los siguientes ejemplos y dibujos se proporcionan a modo de ilustración, y no se pretende que sean limitativos de la presente invención.
EJEMPLOS DE LA INVENCIÓN
A continuación se ilustrará la invención mediante unos ensayos realizados por los inventores que pone de manifiesto el aumento del efecto antitumoral de la terapia génica en la que se combinan los genes gef y apoptina.
Material y métodos:
1. Cultivo celular
La línea celular DLD-1 de carcinoma colorectal fue obtenida del Servicio de Inmunología del Hopital Virgen de las Nieves (Granada, España). La línea celular empaquetadora de vectores virales PT67 fue comprada a Clontech, Palo Alto, Caifornia, EEUU. Las líneas DLD-1 y PT67 se cultivaron a 37 °C en una atmosfera al 5% de C02 con un medio de cultivo DMEM (Dubelcco's modified Eagle Medium)( Sigma, St. Louis, MO, EEUU) suplementado con un 10% de suero bovino fetal inactivado por calor (FBS) (Sigma), 2% de L-glutamina, 2.7% de bicarbonato sódico, 1 % de tampón Hepes, 40 mg/l de gentamicina y 500 mg/l de ampicilina.
Para el cultivo de las líneas DLD1/Tet-On-gef, DLD1/Tet-On-apoptina, and DLD1/Tet-On-gef-apoptina se utilizaron las mismas condiciones y el mismo medio suplementado con higromicina B (0.4 mg/mL, Sigma) y doxiciclina (Dox, 0.2 mg/mL). Este último se utiliza para inducir la expresión de los genes gefy apoptina. Los estudios se realizan por tanto en cuatro líneas celulares:
1. DLD-1 derivada de carcinoma de colon, fue suministrada por la Sección de Análisis Clínicos del Hospital Universitario Virgen de Las Nieves de Granada.
2. DLD-1/gef que expresa el gen gef (obtenida mediante infección de la línea DLD-1 con un vector viral que expresa el gen gef).
3. DLD-1 /apop que expresa el gen apoptina (obtenida mediante infección de la línea DLD-1 con un vector viral que expresa el gen apoptina).
4. DLD-1/gef-apop que expresa los genes gef y apoptina (obtenida mediante infección de la línea DLD-1 con vectores que expresan los genes gefy apoptina).
2. Construcción de los plásmidos retrovirales
Para la construcción de los vectores se usó el sistema RevTet-On que incluye los vectores pRevTet-On y pRev-TRE, y la línea celular RetroPack PT67, comprados a Clontech, Palo Alto, California, EEUU. El gen apoptina fue cecido por el Dr. Mahvash Tavassoli, del Instituto Rayne, King's College, London, y el gen gef fue cedido por el Dr. J.L. Ramos, de la Estación experimental del Zaidín del CSIC, Granada, España. El inserto completo de gef, flanqueado en sus extremos 3' y 5' por los sitios de restricción BamH I y Hind III respectivamente, fue amplificado mediante PCR. El producto de PCR fue digerido por BamH I y Hind III e insertado en el vector pRev-TRE. Esta construcción se usó para transformar E.Coli. Las células se pusieron en un medio de cultivo LB con ampicilina. Se seleccionó un clon positivo (con pRevTRE-gef) para la transfección de las células DLD-1 después de haber comprobado mediante enzimas de restricción y PCR que la secuencia del inserto y su orientación son conrrectas. El vector pRevTet-On y el vector pRevTRE- apoptina fueron clonados de la misma forma.
3. Estudio de la proliferación celular
Las células DLD1, DLD1/Tet-On-gef, DLD1/Tet-On-apoptina, and DLD1/Tet-On- gef-apoptina (25x103) fueron cultivadas en placas de 6 pocilios bajo las condiciones descritas anteriormente. Después de 24h, se renovó el medio de cultivo y se añadió 0.2 mg/mL de Dox (Sigma) para inducir la expresión de los
genes. Las células pertenecientes a los grupos control no fueron tratadas con Dox. El objetivo de tratar las células DLD 1 con Dox es verificar que Dox no tiene efectos en el crecimiento celular. El medio (con o sin Dox) de todas las células se renovó en días alternativos hasta el final del experimento. El experimento fue realizado por cuadriplicado. En los días 0, 2, 4, 6, 8, y 10 del tratamiento, las células fueron teñidas con sulforodamina B (SRB) para realizar un ensayo colorimétrico usando el aparato Titertek Multiscan (Flow, Irvine, California) a 492 nm. La recta de calibrado para el ensayo con SRB se realizó para cada pase de células DLD 1 antes de cada experimento de proliferación celular.
4. Detección de la apoptosis mediante tinción con anexina V-FITC y yoduro de propidio.
Se utilizó el kit Annexin V-FITC Apoptosis Detection Kit I (Pharmingen, San Diego, CA, EEUU) para la detección de apoptosis mediante citometría de flujo. Las células (1 106) DLD1 , DLD1/Tet-On-gef, DLD1/Tet-On-apoptina, and DLD1/Tet-On-gef- apoptina se colocaron en frascos de cultivo de 75-cm2 y se cultivaron toda la noche. Seguidamente se incubaron con Dox durante 2 y 6 días. Las 4 líneas celulares fueron despegadas con PBS-EDTA, lavadas dos veces con PBS frió (1.4 M NaCI, 27 mM KCI, 100 mM KH2P04/K2HP04, pH 7.2) y centrifugadas a 500g durante 10 min. A continuación fueron resuspendidas en 100 μΙ de la solución de binding buffer (10 mM hepes, pH 7.1 ; 150 mM NaCI, 5 mM KCI, 1 mM MgCI2, 1.8 mM CaCI2), teñidas con anexina V (1 μΙ de anexina V-FITC (25 μg/ml), 10 μΙ de binding buffer, 10 μΙ yoduro de propidio (Pl) (50 μg/ml), 79 μΙ H20) e incubadas en oscuridad durante 15 min a temperatura ambiente. Al cabo de ese tiempo, se les añadió 500 μΙ de la solución binding buffer y las células (10 000 por muestra) fueron inmediatamente procesadas con citometría de flujo (Becton Dickinson, San José, CA, EEUU).
5. Análisis ultraestructural
Las células DLD1 , DLD1/Tet-On-gef, DLD1/Tet-On-apoptina and DLD1/Tet-On-gef- apoptina tratadas con Dox durante 6 días fueron fijadas con glutaraldehido al 2,5% en un tampón (pH 7.4) con cacodilato de sodio 0.1 M durante 1 h a temperatura ambiente.
El pellet y la monocapa fueron fijadas posteriormente con tetraoxido de osmio al 1 % en un tampón con cacodilato 0.1 M durante una hora a temperatura ambiente y posteriormente, deshidratados en etanol. Las células fueron despegadas del recipiente mediante el tratamiento con oxido de propileno y fueron embebidas en Epon 812. Después de la polimerización, el plástico fue eliminado y se cortaron secciones ultrafinas paralelas y perpendiculares a la superficie del frasco de cultivo. Las secciones se tiñeron con citrato de acetato de uranilo y plomo y se examinaron en un microscopio electrónico de transmisión Hitachi H7000.
6. Análisis del ciclo celular
Las células cultivadas en monocapa fueron despegadas, lavadas dos veces con un tampón simple (100 mg glucose; 100 mi PBS sin Ca2+ or Mg2+) y fijadas con etanol frió al 70% (vol/vol) durante una semana. A continuación, las células fueron centrifugadas, lavadas una vez con un tampón simple y resuspendidas en una solución de Pl (50 μg/ml Pl, 0.5 mg/ml RNasa en tampón simple, pH 7.4) durante 30 min en oscuridad. El análisis con Fluorescence-activated cell sorter se llevó a cabo a las 2 y 96h después de la inducción. Los datos de 10 000 células por muestra fueron recogidos y analizados con el programa Cellfit de FACScan flow cytometer (Becton Dickinson, San José, CA, EEUU).
7. Medida del potencial de membrana mitocondrial (Δψιη)
Se usó la sonda dual-emission potential-sensitive , 5', 6, 6'-tetra-chloro-1 , 1 ', 3, 3'- tetraetil-imidacarbocianina iodida (JC-1) para medir el potencial mitocondrial de membrana (Δψηι). JC-1 es un monómero verde fluorescente a bajo potencial de membrana, que forma agregados rojo fluorescentes promovido por un elevado potencial de membrana.
La proporción de fluorescencia roja /verde de JC-1 depende únicamente del potencial de membrana e indica la despolarización de la misma. Las células fueron lavadas dos veces con PBS frío, incubadas con 2 mg/L de JC-1 a 37 °C durante 20 min y analizadas por citometria de flujo (Becton Dickinson, San José, CA, EEUU) con unos valores de excitación y emisión de 485 y 535 nm, respectivamente.
Resultados
1. Detección de la expresión de los genes gef y apoptina en las células transfectadas.
El chequeo en gel de agarosa al 2% de los productos de la PCR permitió observar la amplificación de un fragmento de 170 pb correspondiente al gen gef otro de 473pb correspondiente al gen de la apoptina, resultado de la presencia del ARNm de ambos genes, en las células transfectadas lo que demuestra una correcta expresión tras la inducción con dexametasona. La PCR fue negativa para las células transfectadas con el vector vacío y para las células no transfectadas. Para demostrar la integridad de las preparaciones de ARN, se realizó PCR utilizando primers específicos de -actina. En todos los casos el producto de esta amplificación fue detectado y fue de la misma intensidad, lo que indicó la no- degradación del ARN y que la PCR fue realizada a partir de las mismas cantidades de ARN.
2. Estudio del crecimiento celular
El efecto inducido por los genes suicidas se analizó mediante la medida de la proliferación celular con el ensayo MIT (Figura 1). En la curva que representa la tasa de inhibición del crecimiento celular no se aprecian diferencias significativas entre las células DLD-1 tratadas con Dox y las que no tratadas. Se observó una inhibición del crecimiento del 36.86% en las células DLD1/Tet-On-gef con respecto a las células control después de 2 días de incubación con Dox, y una inhibición del 50.19%, 29.53%, 31.44%, y 35.34% después de 4, 6, 8, y 10 días de incubación, respectivamente (P < 0.001). En las células DLD1/Tet-On-apoptina tratadas con Dox se observó una inhibición del crecimiento del 50.41 %, 71.4%, 64.7%, 43.46%, y 47.8% después de 2, 4, 6, 8, y 10 días de incubación, respectivamente (P < 0.001). En las células DLD1/Tet-On-gef-apoptina transducidas con los genes gef y apoptina, se observó una inhibición del crecimiento del 51.30% después de 2 días de incubación con Dox respecto a las células control. De la misma forma, se observó una inhibición del crecimiento del 64.1 %, 45.45%, 51.9%, y 65.07% después de 4, 6, 8, y 10 días de incubación, respectivamente (P < 0.001). Por tanto, hasta el día 6 de tratamiento con Dox, la inhibición de la proliferación en las células DLD1/Tet-On-gef-apoptina fue mayor que en las células que solo expresan el gen gef. Sin embargo, dicha inhibición fue muy similar en las células que solo expresan apoptina, sin diferencias estadísticas significativas. Sin embargo, a los 10 días de incubación, los genes gef y apoptina causan una inhibición de la proliferación del 35.9% y el 47.95%, mientras que la acción conjunta de ambos genes causa una inhibición del 65.13% (P < 0.001).
3. Análisis del efecto apoptótico
Para cuantificar el alcance de la apoptosis mediante citometría de flujo, se tiñeron las células simultáneamente con anexina V-FITC y IP nonvital dye para diferenciar: células viables (negativas para ambas tinciones), células en apoptosis temprana (positivo para anexina V-FITC y negativo para Pl), células en apoptosis tardía (positivas para anexina V-FITC y Pl) y células necróticas (positivas para Pl). En el cultivo control de DLD-1 , el 85% de las células era viables, el 2, 11 % estaban en apoptosis temprana, 2.76% estaban en apoptosis tardía o en las últimas etapas de la apoptosis, y un 10, 12% eran necróticas (P < 0.001), tal y como se observa en la figura 2. No se observaron diferencias entre las células DLD-1 tratadas con Dox y las no tratadas durante la primera semana. En el grupo DLD1/Tet-On-gef tratado con Dox durante 2 y 6 días, el 66.23% y 24.81 % de las células eran viables, el 14.19 % y el 4.59% fueron apoptóticas, el 0.92% y el 37.18% estaban en apoptosis tardía o en las últimas etapas de la apoptosis, y el 18.66% y el 33.41 % fueron necróticas, respectivamente. En el grupo DLD1/Tet-On-apoptina tratado con Dox durante 2 y 6 días, los porcentajes correspondientes son 35.7% y 23.35%, 6.8 % y 13.42%, 29.34% y 40.10%, y 28.16% y 23.36%, respectivamente (P < 0.001). Finalmente, en las células DLD1/Tet-On-gef-apoptina tratadas con Dox durante 2 y 6 días, los porcentajes correspondientes son 31.77% y 8.69%, 23.07% y 6.76%, 8.96% y 38.61 %, y 36.19% y 45.94%, respectivamente (P < 0.001).
4. Modulación del ciclo celular
El cultivo de células DLD-1 contenía un 70.76% de células en G1/G0, un 19.23% de células de fase S y un 10.01 % de células en G2/M. Sin embargo, después de 2 días de inducción con Dox, las células DLD1/Tet-On-gef-apoptina mostraron una disminución gradual de células en fase G1 y una acumulación de células en fase S y en fase G2/M. Después de 6 días de inducción, el incremento del número de células en fase S (29.94%), y en fase G2/M (27.01 %) y la disminución de la población de células en fase G1 (43.04% G1/G0) fueron aún más acentuadas.
After 6 days of induction, the increase in S-phase (29.94%), and G2/M-phase (27.01 %) cell populations and the decrease in Gi phase cells (43.04% Gi/G0 cells) were even more marked (Figura 3).
5. Cambios morfológicos
Se observó al microscopio óptico la morfología de las células DLD-1 transfectadas con un solo gen y las transfectadas con ambos genes después de la inducción con
Dox, y se apreciaron células más redondeadas y la pérdida de su adherencia al frasco de cultivo. No se apreciaron cambios morfológicos en las células DLD-1 transfectadas con el vector vacío con respecto a las no transfectadas (no se muestran los datos). Las células DLD-1 transfectadas con los genes gef y/o apoptina se analizaron con un microscopio electrónico de transmisión profundizar en el estudio de la citotoxicidad de dichos genes. Mediante el análisis de imágenes ultraestructurales, se confirmó la presencia de células muertas por apoptosis tanto en las células transfectadas con el gen gef como en las transformadas con el gen apoptina. Como se puede apreciar en las imágenes a y b de la figura 5, las células control son grandes y redondeadas o poligonales, con bordes bien definidos y abundante citoplasma granular, con núcleos de tamaños variables; las células tienen mitocondrias con crestas bien definidas, retículo endoplásmico, aparato de Golgi así como ribosomas libres o asociados al retículo endoplasmático. El núcleo de las células que expresa el gen gef y/o el gen apoptina presentan las características ultraestructurales de la apoptosis, incluyendo condensación de la cromatina, forma de media luna, marginación y formación de vesículas, tal y como se observa en las imágenes c, d, e, f, g, h, I, j y k de la figura 5. En las células transfectadas únicamente con el gen gef, se observaron grandes protuberancias en las mitocondrias en el día 2 del tratamiento con Dox. (Imágenes c, d y e de la figura 5). En las células transfectadas únicamente con el gen apoptina, se apreció la dilatación y destrucción del retículo endoplasmático (imágenes e, f y g de la figura 5). En las células transducidas con ambos genes, se observó la dilatación de la mitocondria y el RE y la destrucción de aparato de Golgi (imagen j de la figura 5), así como la presencia de células necróticas (imagen i de la figura 6).
6. Modulación del potencial de membrane mitochondrial.
Se midió el potencial de membrane de la mitochondria (Δψηι) mediante la sonda JC-1 con el objetivo de determinar si la apoptosis de las células DLD-1 inducida por los genes gef y apoptina, solos o combinados, se lleva a cabo por la vía mitocondrial. LA sonda se acumula específicamente en la mitocondria en cantidades que varían según el potencial de membrana. En las organelas con bajo potencial de membrana se acumula una pequeña cantidad de moléculas JC-1 , por lo que emiten fluorescencia verde (485 excitación/535 emisión). A altas concentraciones (alto potencial de membrana), los monómeros de la sonda forman
agregados y emiten una fluorescencia roja (535 excitación /590 emisión). Por tanto, la pérdida de potencial de membrana se traduce en un cambio de rojo a verde. Después de 2 y 6 días de tratamiento con Dox, las células transformadas con ambos genes suicidas mostraron una disminución del potencial de membrana mucho mayor que en el caso de las células que solo expresan gef o apoptina, o las control, tal y como se observa en la figura 4. Este resultado sugiere que la coexpresión de gef y apoptina induce la apoptosis mediante un mecanismo dependiente de la mitocondria.
En resumen, estos experimentos muestran que la expresión de los genes gef y apoptina, solos o combinados, inducida mediante doxyciclina en la línea DLD-1 provoca alteraciones morfológicas que indican la entrada de determinadas subpoblaciones celulares en un proceso de muerte celular programada o apoptosis. Sin embargo, el hecho más significativo es que la expresión combinada de ambos genes induce una significativa reducción de la tasa de proliferación en comparación tanto con las líneas parentales como con las que expresan dichos genes por separado, que se acompaña de una notable alteración de la proporción de células en cada una de las fases del ciclo celular.
Los resultados demuestran por primera vez que la acción combinada de los genes gef y apoptina es mucho más citotóxica y tiene actividad antitumoral más intensa de la que tiene la expresión de dichos genes por separado.
Claims
1. - Un polinucleótido de ARN o ADN aislado capaz de traducirse a una secuencia aminoacídica que comprende un péptido que presenta una identidad de al menos un 95% con la secuencia aminoacídica de la proteína GEF (SEQ ID NO: 1) y de al menos un 95% con la secuencia aminoacídica de la proteína APOPTINA (SEQ ID NO: 2).
2. - Un polinucleótido de ARN o ADN aislado capaz de traducirse a una secuencia aminoacídica que comprende un péptido que presenta una identidad de al menos un 99% con la secuencia aminoacídica de la proteína GEF (SEQ ID NO: 1) y de al menos un 99% con la secuencia aminoacídica de la proteína APOPTINA (SEQ ID NO: 2).
3. - Una construcción genética de ADN o ARN, que comprende, al menos uno de los siguientes tipos de secuencias:
a) Secuencia de nucleótidos, que comprende, al menos, un polinucleótido según cualquiera de las reivindicaciones 1-2, para su transcripción in vitro o in vivo.
b) secuencia de nucleótidos, correspondiente a un sistema o vector de expresión génica que comprende un polinucleótido según cualquiera de las reivindicaciones 1- 2, operativamente enlazado con, al menos, un promotor que dirija la transcripción de dicha secuencia de nucleótidos, y con otras secuencias necesarias o apropiadas para la transcripción y su regulación adecuada en tiempo y lugar.
4. - Una composición que comprende:
I) un polinucleótido según cualquiera de las reivindicaciones 1-2, y/o
II) al menos dos componentes, un componente A que se seleccionan de entre: a) un polinucleótido de ARN o ADN aislado capaz de traducirse a una secuencia aminoacídica que comprende un péptido que presenta una identidad de al menos un 95% con la secuencia aminoacídica que codifica para la proteína GEF (SEQ ID NO: 1),
b) Un polinucleótido de ARN o ADN aislado capaz de traducirse a una secuencia aminoacídica que comprende un péptido que presenta una identidad de al menos un 99% con la secuencia aminoacídica que codifica para la proteína GEF (SEQ ID NO: 1).
c) Una construcción genética de ADN o ARN, que comprende, al menos uno de los siguientes tipos de secuencias:
i) secuencia de nucleótidos, que comprende, al menos, un polinucleótido según (a) o (b), para su transcripción in vitro o in vivo.
ii) secuencia de nucleótidos, correspondiente a un sistema o vector de expresión génica que comprende un polinucleótido según (a) o (b), operativamente enlazado con, al menos, un promotor que dirija la transcripción de dicha secuencia de nucleótidos, y con otras secuencias necesarias o apropiadas para la transcripción y su regulación adecuada en tiempo y lugar.
d) la secuencia aminoacídica que codifica para la proteína GEF (SEQ ID NO: 1) y un componente B, que se selecciona de entre:
e) un polinucleótido de ARN o ADN aislado capaz de traducirse a una secuencia aminoacídica que comprende un péptido que presenta una identidad de al menos un 95% con la secuencia aminoacídica que codifica para la proteína APOPTINA (SEQ ID NO: 2),
f) Un polinucleótido de ARN o ADN aislado capaz de traducirse a una secuencia aminoacídica que comprende un péptido que presenta una identidad de al menos un 99% con la secuencia aminoacídica que codifica para la proteína APOPTINA (SEQ ID NO: 2).
g) Una construcción genética de ADN o ARN, que comprende, al menos uno de los siguientes tipos de secuencias:
i) secuencia de nucleótidos, que comprende, al menos, un polinucleótido según (e) o (f), para su transcripción in vitro o in vivo.
ii) secuencia de nucleótidos, correspondiente a un sistema o vector de expresión génica que comprende un polinucleótido según (e) o (f), operativamente enlazado con, al menos, un promotor que dirija la transcripción de dicha secuencia de nucleótidos, y con otras secuencias necesarias o apropiadas para la transcripción y su regulación adecuada en tiempo y lugar.
h) la secuencia aminoacídica que codifica para la proteína APOPTINA (SEQ ID NO: 2)
5. - La composición según la reivindicación 4, que es una composición farmacéutica.
6. - La composición según cualquiera de las reivindicaciones 4-5, que además comprende un vehículo farmacéuticamente aceptable.
7. - La composición según cualquiera de las reivindicaciones 4-6, que además comprende otro principio activo.
8. - Una preparación combinada que comprende un componente A y un componente B, según se define en la reivindicación 4.
9. - La preparación combinada según la reivindicación anterior, que además comprende un vehículo farmacéuticamente aceptable.
10. - La preparación combinada según cualquiera de las reivindicaciones 8-9, que además comprende otro principio activo.
1 1. - El uso de un polinucleótido según cualquiera de las reivindicaciones 1 -2, de una construcción genética según la reivindicación 3, de una composición según cualquiera de las reivindicaciones 4-7, o de la preparación combinada según cualquiera de las reivindicaciones 8-10, en la elaboración de un medicamento.
12. - El uso de un polinucleótido según cualquiera de las reivindicaciones 1 -2, de una construcción genética según la reivindicación 3, de una composición según cualquiera de las reivindicaciones 4-7, de la preparación combinada según cualquiera de las reivindicaciones 8-10, en la elaboración de un medicamento para el tratamiento de una enfermedad que cursa con proliferación celular anormal.
13. - El uso de un polinucleótido, de una construcción genética, de una composición, o de la preparación combinada según la reivindicación anterior, donde la enfermedad que cursa con proliferación celular es el cáncer.
14. - El uso de un polinucleótido, de una construcción genética, de una composición, o de la preparación combinada según la reivindicación anterior, donde la enfermedad que cursa con proliferación celular es el cáncer de colon.
15. - El uso de la preparación combinada según cualquiera de las reivindicaciones 1 1 -14 donde el componente A y el componente B de la invención se administran de manera simultánea, combinada o secuencial.
HOJA DE REEMPLAZO (REGLA 26)
Applications Claiming Priority (2)
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|---|---|---|---|
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| ESP201300753 | 2013-07-26 |
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|---|---|
| WO2015011332A1 true WO2015011332A1 (es) | 2015-01-29 |
Family
ID=52392781
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| PCT/ES2014/070606 Ceased WO2015011332A1 (es) | 2013-07-26 | 2014-07-25 | Polinucleótido que contiene los genes gef y apoptina y su uso en terapia génica del cáncer de colon |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| WO (1) | WO2015011332A1 (es) |
-
2014
- 2014-07-25 WO PCT/ES2014/070606 patent/WO2015011332A1/es not_active Ceased
Non-Patent Citations (4)
| Title |
|---|
| BOULAIZ, H. ET AL.: "A novel double-enhanced suicide gene therapy in a colon cancer cell line mediated by Gef and Apoptin''.", BIODRUGS., vol. 28, no. 1, February 2014 (2014-02-01), pages 63 - 74 * |
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| YAN, L. ET AL., CONSTRUCTION, EXPRESSION AND CHARACTERIZATION OF DUAL CANCER-SPECIFIC FUSION PROTEIN TARGETING CARCINOEMBRYONIC ANTIGEN IN INTESTINAL CARCINOMAS''., vol. 69, no. 1, January 2010 (2010-01-01), pages 120 - 125 * |
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