WO2009077173A3 - Bibliothèques de produits chimiques codés par adn - Google Patents
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Abstract
L'invention concerne un procédé de préparation d'une bibliothèque de produits chimiques codés par ADN comprenant des éléments qui comprennent une fraction chimique, une fraction de liaison et une fraction d'ADN. Ce procédé comprend pour chaque élément les étapes consistant à : (I) coupler un synthon initial à un oligomère simple brin codant initial par l'intermédiaire d'une fraction de liaison pour former un conjugué initial, l'oligomère simple brin codant initial comprenant une première région amorce, une région codante initiale et une première région d'hybridation; (II) éventuellement coupler un synthon intermédiaire et un oligomère simple brin codant intermédiaire audit conjugué initial pour former un conjugué intermédiaire, le couplage ayant lieu dans n'importe quel ordre et : (a) le synthon intermédiaire étant couplé au résidu du synthon initial; et (b) l'oligomère simple brin codant intermédiaire comprenant une région codante intermédiaire et une seconde région d'hybridation et étant couplé par : (i) hybridation d'un oligomère simple brin complémentaire qui comprend un modificateur chimique, une première région d'hybridation complémentaire, une région codante intermédiaire complémentaire et une seconde région d'hybridation complémentaire par interaction entre la première région d'hybridation et la première région d'hybridation complémentaire; (ii) traitement du conjugué formé avec une ADN polymérase pour allonger l'oligomère simple brin codant initial pour qu'il soit complémentaire à la région codante intermédiaire complémentaire et la seconde région d'hybridation complémentaire; (iii) retrait de l'oligomère simple brin complémentaire par dénaturation de l'ADN et capture de l'oligomère simple brin complémentaire par l'intermédiaire du modificateur chimique; (III) coupler un synthon final et un oligomère simple brin codant final au conjugué initial ou intermédiaire selon ce qui est approprié pour former un conjugué final, le couplage ayant lieu dans n'importe quel ordre et : (a) le synthon final étant couplé au résidu du synthon initial, ou pouvant de plus ou sinon être couplé au résidu du synthon intermédiaire (s'il est présent); et (b) l'oligomère simple brin codant final comprenant une région codante finale et une seconde région amorce et étant couplé par : (i) hybridation d'un oligomère simple brin complémentaire qui comprend une première ou seconde région d'hybridation complémentaire selon ce qui est approprié, une région codante finale complémentaire et une seconde région amorce complémentaire, par interaction entre la première ou seconde région d'hybridation et la première ou seconde région d'hybridation complémentaire, selon ce qui est approprié; (ii) traitement du conjugué formé avec une ADN polymérase pour allonger l'oligomère simple brin codant initial pour qu'il soit complémentaire à la région codante finale complémentaire et la seconde région amorce complémentaire et pour allonger le brin codant complémentaire pour qu'il soit complémentaire à l'oligomère simple brin codant initial.
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