WO2007142347A1 - 腫瘍マーカー及び癌疾病の罹患の識別方法 - Google Patents

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cancer
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Makoto Watanabe
Osamu Nishimura
Toshiya Matsubara
Ichiro Takemasa
Morito Monden
Katsuya Nagai
Nariaki Matsuura
Original Assignee
Shimadzu Corporation
Osaka University
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    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/57407Specifically defined cancers
    • G01N33/57419Specifically defined cancers of colon

Definitions

  • the present invention relates to clinical diagnosis 'check-up' follow-up and classification technology, and specifically, a tumor marker and method to identify morbidity of cancer. Disease) In particular, the present invention relates to a tumor marker for colorectal cancer and a method for identifying a disease of colorectal cancer.
  • Tumor markers for colorectal cancer are described in, for example, Anticancer Research, 2004, 24 (4), 2519-2530 (Non-patent Document 1).
  • typical tumor markers include carcinoembryonic antigen (CEA) and CA19-9.
  • Patent Document 1 includes HIA-C, MBC2, RAB22A, MGC15429, MHC class I as analysis results of cultured cells derived from lung cancer (xenogralttumors). Antigen is described as a cancer-related protein.
  • Patent Document 2 describes Tumor rejection antigen-1 as a single gene for uterine cancer.
  • Non-Patent Document 1 “Anticancer Research”, 2004, Vol. 24, No. 4, p. 2519-2530
  • Patent Document 1 US Patent Application Publication No. 2006/0019256
  • Patent Document 2 US Patent Application Publication No. 2003/0211498
  • tumor markers such as carcinoembryonic antigen (CEA) and CA19-9 are used in blood tests in colorectal cancer diagnosis.
  • CEA carcinoembryonic antigen
  • CA19-9 the concentration of these tumor markers is often at a normal level in the early cancer stage, and is often in the normal level range in the advanced cancer stage. From this point of view, there is a demand for the discovery of a novel tumor marker that is highly specific for the affected site and suitable for ffl diagnosis.
  • Patent Document 1 does not describe that the disclosed cancer-related protein is related to colorectal cancer.
  • Patent Document 2 does not describe that the disclosed uterine cancer marker gene is related to colorectal cancer.
  • An object of the present invention is to provide a tumor marker with high specificity to colorectal cancer. It is another object of the present invention to provide a method capable of identifying the morbidity of colorectal cancer. Summary of the Invention
  • the present inventors used a tissue and normal tissue in a colonic mucosa epithelium collected from a colorectal cancer patient as samples, and used the NBS method as a pro-ohm analysis method. Protein groups with differences were identified.
  • the N B S method is an excellent method for relative quantification of protein peptides using 2-nitrobenzenesulfenyl chloride. Proteomic angle using N B S method?
  • the ⁇ method is fundamentally different in separation mode and detection principle from the most general-purpose proteo depression angle 3 ⁇ 4ff method using two-dimensional electrophoresis. For this reason, according to the pro-ohm analysis method using the NBS method, it is considered possible to find one marker candidate protein different from the protein group reported as the renal cancer marker igffi so far.
  • the present invention includes the following inventions.
  • the following (1) and (2) relate to a tumor marker for colorectal cancer.
  • the following (1) relates to a tumor marker for colorectal cancer containing a protein whose expression level is higher than that in a normal level in cancer patients.
  • the level in a normal sample derived from a healthy individual the level in a normal sample that is not cancerous from a patient suffering from a cancer disease, and the like can be mentioned.
  • the following (5) and (6) relate to a method for identifying the incidence of colorectal cancer using the tumor marker for colorectal cancer described in (2) above.
  • the obtained measured value level is reduced from the normal level as one of the indicators that the subject individual is likely to have colorectal cancer.
  • the normal level of the protein may be the protein level in a non-cancerous sample serving as a control for a cancerous sample. For example, the level in a normal sample derived from a healthy individual, the level in a normal non-cancerous sample derived from a patient suffering from a cancer disease, and the like.
  • the method according to (6), wherein the sample is serum or urine, and the level of the protein is measured by a test based on biospecific affinity.
  • the present invention is also directed to a pharmaceutical composition for the treatment of colorectal cancer described in (7) and (8) below.
  • the treatment of colorectal cancer includes killing colorectal cancer cells and suppressing the growth of colorectal cancer cells. (7)
  • a pharmaceutical composition comprising at least one antibody that immunospecifically binds.
  • a pharmaceutical composition for promoting an immune response by supplying an immune stimulating amount to colon cancer cells comprising the tumor marker according to (1).
  • the pharmaceutical compositions (7) and (8) above can be identified as potential therapeutic agents used in the treatment of colorectal cancer.
  • the pharmaceutical compositions of the above (7) and (8) can be used as therapeutic agents used for the treatment of colorectal cancer.
  • the present invention it is possible to provide a tumor marker with high specificity to colorectal cancer. Further, according to the present invention, it is possible to provide a method capable of identifying the morbidity of colorectal cancer.
  • Figure 1 shows a protein (expression of 6 species) that is upregulated in colorectal cancer tissue according to the present invention.
  • the results of Western blotting analysis on floor samples are shown.
  • FIG. 2 shows immune tissues in clinical specimens (cancerous and non-cancerous parts of large intestine mucosal epithelial tissues of colon cancer patients) for proteins (six types 3 ⁇ 41) whose expression is promoted in colorectal cancer fibers in the present invention. Results of validation analysis by chemical staining are shown.
  • the present invention provides a tumor marker for colorectal cancer.
  • the protein provided as a tumor marker according to the present invention is extracted from a cancerous part or non-cancerous part of the colonic mucosal epithelial tissue collected from a colorectal cancer patient, and 2-nitrobenzenesulfide mouthlid ( They were identified by the pro-ohm analysis technique based on the NBS method (NBSC I) and the separation method using the H PLC.
  • NBS NBS-Nitro [ 13 C 6 ] benzenesulfuryl chloride
  • 2-Nitro [ 12 C 6 ] benzenesulfuryl chloride mix both NBS-modified protein samples with each other, perform appropriate treatments by those skilled in the art, such as trypsin digestion, and measure the difference in the amount of peptides using a mass spectrometer
  • the NBS method is described in Rapid Commun. Mass Spectrom., 2003, 17, 1642-1650 and International Publication No. 2 O 04/002950, Pamphlet.
  • Conventional two-dimensional electrophoresis methods have been difficult to separate and detect proteins having a basic isoelectric point and proteins having a large molecular weight of about 100 KDa.
  • the present invention 0
  • proteins can be isolated and purified by any protein purification technique selected by one skilled in the art. For example, techniques including chromatography such as ion exchange, affinity, and size exclusion column chromatography, centrifugation, solubility differences, and electrophoretic motion can be used.
  • proteins provided by the present invention as tumor markers, 6-phosphogluconolactonase, alphal acid glycoprotein ⁇ alpha-actinin 1, apurinic endonuclease, calumeniru chaperonin, Clathrin he avy chain 1, Clathrin light polypeptide A, c-myc binding protein ⁇ Complement factor H, Cysteine rich intestinal protein 1, F-box protein 40, Fibrinogen gamma, Fk506 Binding Protein Fkbp Mutant R42kH87V COMPLEX WITH Immunosuppressant Fk506, Guanine nucleotide binding protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1, Heat shock 70kD protein 9B, Heparan sulfate proteoglycan 2, HLA-C, hypothetical protein FLJ38 663, L-plastin polypeptide ⁇ MBC2, Migration inhibitory factor-related protein 14 variant E , Mitogen inducible gene, Proteasome subunit p58, RAB18
  • the protein is, for example, about 50 ⁇ 1 ⁇ 2 or more of the number of colorectal cancer patients and about 500/0 or more, preferably 100% or more larger in the cancerous part than in the non-cancerous part. Tend to show. Furthermore, among the above tanned proteins, Protein tyrosine phosphatase receptor type C, Prate in tyrosine phosphatase, receptor type, alpha, orosomucoid 2, Tumor rejection antigen 1, glycyl-tRNA synthetase ⁇ TLS proteiru Ribonuclease RNase A family 3, and heter ogeneous nuclear ribonucleoprotein H2 is specifically expressed in cancerous parts (or is below the detection limit in non-cancerous parts).
  • ADP-ribosylation factor-like 10C, aldehyde dehydragenase2, Alpha-actinin 4, Alpha-actinin 4, Annexin are proteins that are expressed less in normal colorectal cancer patients than normal levels.
  • the protein is, for example, About 50% or more of the number of intestinal cancer patients, the non-cancerous part tends to show an expression level of about 50% or more, preferably 100% or more larger than that in the cancerous part.
  • Collagen, type XIV, alpha 1 and Desmoglein 2 are specifically expressed in non-cancerous parts (or below the detection limit in cancerous parts).
  • the present invention also provides a method for identifying the onset of colorectal cancer by using at least one kind of protein selected from the above-mentioned protein / protein group as a tumor marker.
  • a sample derived from an individual who is a subject to be identified as suffering from colorectal cancer is prepared, and the level of at least one protein selected from the protein group is measured in the sample. The obtained measurement level is compared with the normal level.
  • Normal level Is a protein level in a sample serving as a control for a cancerous sample of at least one protein selected from the above tanno ⁇ group>.
  • the sample serving as a control for the cancerous sample is not particularly limited as long as it is not cancerous and is a sputum sample.
  • Examples include samples derived from healthy individuals and normal samples derived from patients suffering from cancer diseases.
  • a sample derived from an individual who is a subject to be identified as suffering from colorectal cancer is not particularly limited. Examples include cells and tissues, body fluids, and tissue extracts. Cells and tissues include tissue biopsy material and autopsy material, and also include tissue sections and tissue extracts. In particular, examples of the sample include cells, tissues, and tissue extracts of a colon-derived sample. Examples of samples derived from the large intestine include mucosal epithelium, lamina intestinal, mucosal lamina, submucosa, laminalitis and serosa. Body fluids include blood, urine, and body secretions.
  • Tissue extract refers to tissue homogenated or solubilized by methods known to those skilled in the art. Among these exemplified samples, serum and / or urine are preferably used as samples. Tumor marker measurements measured on samples containing individual cells, tissues, body fluids, and tissue extracts of the subject are preferably the same type of cells, tissues, body fluids, and tissue extracts. Is not cancerous and is compared to the level in the sample.
  • Tumor markers in tissues include, for example, cancer diagnosis and prognosis using tissue sections (for example, performed by immunohistochemical staining, mass imaging, etc.) and PET diagnosis (for example, radioactive probe for tumor markers) Or as a drug target for treatment (see the section “Pharmaceutical composition” below).
  • tumor markers in blood are objects that should be quantitatively measured in, for example, cancer diagnosis and prognosis.
  • Kanjimi Tanno ⁇ Chemical Group Power ⁇ 6-phosphogluconolactonase, Alphal acid glycoproteiru Alpha-actinin 1, Apurinic endonuclease, Calumeniru Chaperoning Clathrin heavy chain 1, Clathrin light polypeptide A, c-myc binding protein.
  • Complement factor H Cysteine rich intestinal protein 1, F-box protein 40, Fibrinogen gamma, Fk506 Binding Protein Fkb p Mutant R42kH87V COMPLEX WITH Immunosuppressant Fk506, Guanine nucleotid e binding protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1, Heat shock 70kD protein 9B, Heparan sulfate proteoglycan 2, HLA-C, hypothetical protein FLJ38663, L-plastin poly peptides MBC2, Migration inhibitory factor-related protein 14 variant E, Mitogen induci ble gene, Proteasome submit p58, RAB18,
  • the degree of increase in the measured value level should be such that the measured value level is 50% or more of the normal level, preferably 100% or more. It is good to make it cheap.
  • proteins Protein tyrosine phosphatase receptor type C, Prate in tyrosine phosphatase, receptor type, alpha, orosomucoid 2, Tumor rejection antigen 1, glycyl-tRNA synthetase ⁇ TLS protein Ribonuclease RNase A family 3, and heter ogeneous nuclear ribonucleoprotein H2I, colon cancer tissue
  • the individual who is likely to have colorectal cancer is likely to be one of the indicators ADP-ribosylation factor-like 10C, aldehyde dehydrogenase2, Alpha-actinin 4, Annexin A2 isoform 2, ATP synthase, H + transporting, mitochondrial FO complex, subunit d isoform a, ATP-
  • the individual who should be diagnosed with colorectal cancer can be one of the indicators that there is a possibility of having colorectal cancer.
  • the degree of reduction in the measured value level a normal level is measured levels of 5 00/0 or more, preferably when a guide device such that 1 0 0% or more.
  • Collagen, type XIV, alpha 1 and Desmoglein 2 are specific proteins in normal tissues (non-cancerous tissues), so if their absence is confirmed, colon cancer It can be one of the indicators that an individual who should be identified as having a high risk of developing colorectal cancer.
  • the level of the protein is preferably measured by a test based on biospecific affinity.
  • the test based on the biospecific affinity is a method well known to those skilled in the art, and is not particularly limited, but Imunoase is preferred.
  • Western Plot, Radionous Atsy, ELISA, Sandwich Immunossay, Immunoprecipitation, Precipitation Reaction, In-Gel Spreading Precipitation Reaction, Immunodiffusion Method, Aggregation Measurement, Complement Binding Assay Assay, Immunoradiation Included are assays including competitive and non-competitive assays, such as quantitation, fluorescent immunoassay, and protein A protein assay. In immunoassay, the presence of an antibody that binds to a tumor marker in an individual's sample is detected.
  • a sample is carried out by bringing a sample into contact with the antibody under conditions capable of forming an immune complex consisting of a tumor marker protein to be measured and an antibody of the protein in an Assy medium. More specific immunoassay protocols can be easily selected by those skilled in the art.
  • the protein level is measured by a test based on biospecific affinity as described above. It can be measured by other protein quantification methods. For example, the NBS method already described is a method with excellent quantification.
  • a sample prepared with a known level of the above protein or an appropriate sample such as a normal sample is used as a control sample to measure the difference in the amount of the protein present from the individual sample. It can be performed.
  • the tumor marker of the present invention may be measured alone or in combination with any other tumor marker. Accordingly, the method of the present invention may comprise measuring the level of another tumor marker as well as the level of the tumor marker of the present invention.
  • the tumor marker of the present invention is preferably used for the purpose of detection, diagnosis, monitoring, staging and prognosis determination of colorectal cancer. Preferably, it should be used to understand the dynamics of the tumor. O For example, when chemotherapy or radiation therapy is being performed on the tumor, it is used to determine how effective the treatment is. It should be done. In addition, when excision is performed on a tumor with no tumor marker value, it may be used for follow-up after surgery.
  • the present invention also provides a pharmaceutical composition for treating colorectal cancer by using a tumor marker containing a protein whose expression level is higher than a normal level in a colorectal cancer patient in the B-heavy tumor marker of the present invention.
  • a pharmaceutical composition comprising at least one antibody that specifically binds immunospecifically.
  • Antibodies include polyclonal antibodies, monoclonal antibodies, and anti-antigens prepared by molecular biological techniques. 7 061690
  • the antibody may be any substance that binds widely immunospecifically, and an antibody fragment or an antibody fusion protein may also be used. In any case, the antibody is prepared by a method well known to those skilled in the art.
  • Another form of the pharmaceutical composition is a pharmaceutical composition for promoting an immune response by supplying an immunostimulatory amount to cancer cells, comprising the tumor marker of the present invention. It is a thing.
  • the immunostimulatory amount refers to the amount of an antigen capable of eliciting a desired immune response for the treatment of cancer, and is determined by a method well known by those skilled in the art. According to this form, the cancer is treated using methods well known to those skilled in the art, which are known as all cancer vaccine therapies.
  • the pharmaceutical composition contains the antibody or tumor marker as an active ingredient, and may further contain a diluent, carrier, excipient, etc. acceptable as a pharmaceutical agent.
  • the pharmaceutical composition can be identified as a potential therapeutic agent used in the treatment of colorectal cancer. Alternatively, the pharmaceutical composition can be applied as a therapeutic agent used for the treatment of colorectal cancer.
  • Normal tissue ie, non-cancerous part of the colonic mucosa epithelial tissue
  • cancer tissue ie, cancerous part of the colonic mucosal epithelial tissue
  • buffer A 50 mM Tris-HCI (pH 8.0)
  • 100 mM NaCI 100 mM NaCI
  • 10 mM EDTA protease inhibitor
  • protease inhibitor aprotinin
  • solubilization buffer -B 9 M urea, 2 w / v% CHAPS, 10 mM EDTA, proteazeinhibitor solution (aprotinin, PMSF, leupepsin) aqueous solution)
  • solubilization buffer -B 9 M urea, 2 w / v% CHAPS, 10 mM EDTA, proteazeinhibitor solution (aprotinin, PMSF, leupepsin) aqueous solution)
  • the supernatant was obtained as an insoluble fraction.
  • the extracted proteins of these soluble and insoluble fractions were each treated with NBS reagent and analyzed for protein expression.
  • stable isotope labeling was performed according to the recommended protocol of 13 C NBS Stable Isotope Labeling Kit-N (Shimadzu Corporation).
  • the protein extracted from normal tissue was labeled with 12 CNBS (Light NBS), and the protein extracted from cancer tissue was labeled with 13 CNBS (Heavy NBS).
  • Each of the obtained labeled proteins was mixed, and desalted, reduced, alkylated, and trypsin digested according to the recommended protocol of the kit.
  • the labeled peptide was concentrated according to the protocol of the kit. Concentrated labeled peptides were subsequently separated by HPLC using a C18 column and applied to MS plates. The sample thus prepared was measured using a mass spectrometer Axim a-CFR plus (manufactured by Shimadzu Corporation), and a relative quantitative analysis of each protein was performed.
  • Protein fragments were identified by MS / MS analysis of peptide fragments that showed paired peaks using a tandem mass spectrometer Axima-QIT (manufactured by Shimadzu Corporation). By this method, the same analysis was finally performed on 24 clinical specimens. As a result of the analysis, in 50% or more of the total number of samples, proteins with increased or decreased protein expression in cancer fibers were identified. The degree of increase or decrease was based on the following amount. In other words, in the cancer part, for peptides whose abundance increased in the non-cancer part, the abundance in the cancer part is 50% or more larger than the abundance in the non-cancer part. (In other words, the abundance in the cancerous part is more than 150% of the abundance in the non-cancerous part).
  • the abundance in the noncancerous part is 50 «1 ⁇ 2 or more larger than the abundance in the cancerous part (abundance in the cancerous part But less than 66% of the abundance in non-cancerous areas).
  • the proteins shown in Table 1 to Table 8 below were identified.
  • “Meanj,” “SEMj,” and “SDJ are the relative ratios (%) measured in each clinical specimen (ie, the expression level of the protein in the non-cancerous part is 100%).
  • the average value, standard error, and standard deviation value of expression level (ratio) are shown in Tables 1 to 3.
  • Table 1 to Table 3 show that the protein expression level in the cancer area increases (Up- For example, proteins such as 6-phosphogluconolactonase (average expression level: approximately 2 ⁇ 16 times that of non-cancerous parts) whose expression level was increased in 16 out of 24 samples were identified.
  • Table 4 is a list of proteins that were specifically detected in the cancer area (All or None) .In Tables 1 to 4, “150% ⁇ J is the abundance in the cancer area”, non-cancerous. The number of specimens that was 150% or more of the abundance in the part.
  • Tables 5 to 7 are a list of proteins (Down-regulated proteins) in which the expression level of the protein in the cancerous part is decreased as compared with that in the non-cancerous part.
  • proteins such as Carbonic Anhydrase Form B (average expression level: 0.1 to 1 times that of non-cancerous parts) were identified in 15 out of 24 specimens.
  • Table 8 shows squirrels of proteins specifically detected in the non-cancerous part (All or None). “ ⁇ ⁇ 66%” in Tables 5 to 8 indicates the number of specimens whose abundance in the cancerous part was less than 660/6 of the abundance in the non-cancerous part.
  • Normal tissues ie, non-cancerous part of the colonic mucosal epithelial tissue
  • cancerous tissues ie, cancerous part of the colonic mucosal epithelial tissue
  • solubilized buffer eight 50 11 1>
  • protease inhibitor aprotinin, PMSF, leupepsin
  • solubilized buffer B 9M urea, 2% CHAPS, 10 mM EDTA.
  • Proteanase inhibitor (Abuguchi chinin, PSF, leupepsin) aqueous solution)
  • the supernatant was obtained as an insoluble fraction.
  • the soluble fractions are numbered patient 1-5, and each is used for analysis of ZYX, RAN, RGNU and AHCY, and the insoluble fraction is numbered patient 6-10. These were used for analysis of SGALS1 and VIM, respectively.
  • Each extract was separated by 12.5% acrylamide (15% acrylamide only for samples used for analysis of SGALS1) by SDS-PAGE gel, and then transferred to a nitrocellulose membrane.
  • For the transferred sample load the primary antibody against each protein (after 5 ⁇ and incubate at room temperature for 2 hours. After the reaction, wash the nitrocellulose membrane with PBS (Phosphate Buffered Saline) stopper, and then secondary antibody. (After adding the solution and reacting for 1 hour. After reacting with the antibody, each band was detected by adding the ECL coloring solution.
  • the antibodies used in this example are as follows.
  • FIG. 1 shows an electrophoretogram obtained by the above Western plotting.
  • N indicates a non-cancerous part and T indicates a cancerous part sample.
  • the protein that showed increased expression in the non-cancerous part from the cancer part in the quantification result by the NBS method that is, the protein that showed the expression suppression in the cancerous part from the non-cancerous part. It is easily estimated that such expression tendency is shown in the quantification results by Western blotting.
  • the paraffin section and the primary antibody were reacted at room temperature for 1 hour, washed with a PBS buffer, and further reacted with streb-avidin-biotin peroxidase complex.
  • a tissue slice and a coloring solution (3,3′-diaminobenzydyne tetrahydrochloride, 0.01% peroxidase peroxide, 0.05 aqueous squirrel solution ( ⁇ 7 ⁇ 6) were used. Tissue staining was performed by reacting for 3 minutes. The results are shown in Figure 2.
  • the NBS method quantification results showed an increase in expression in non-cancerous areas rather than cancerous areas Similarly, it is easily presumed that such an expression tendency is also shown in the analysis result by the immunohistochemical staining method for the protein, that is, the protein whose expression was suppressed in the cancer part from the non-cancer part.
  • the protein according to claim 1 is expressed more in large intestine cancer tissue than in non-cancer tissue, and the protein according to claim 3 is expressed in non-cancer tissue. It is less expressed in colorectal cancer tissue than it is. It is clear that these proteins can be used as tumor markers for colorectal cancer. When these proteins are used as tumor markers for colorectal cancer and a colorectal cancer disease is unknown in a sample whose colorectal cancer disease is unknown, the methods described in Examples 1 to 3 above can be used.

Abstract

本発明は、大腸癌の腫瘍マーカー及び大腸癌についての罹患を識別することができる方法を提供する。大腸癌組織から同定されたタンパク質を含む腫瘍マーカー。当該腫瘍マーカーを用いて大腸癌の罹患を識別する方法。当該方法においては、前記タンパク質の、大腸癌の罹患を識別すべき対象となる個人に由来する試料中におけるレベルを測定し、得られた測定値レベルと、前記タンパク質の正常レベルとを比較し、得られた測定値レベルが、前記正常レベルよりも増加又は減少していることを、前記対象となる個人が大腸癌に罹患している可能性が高いことの指標の1つとする。

Description

明 細 書 腫瘍マーカー及び癌疾病の罹患の識別方法
技術分野 本発明は、 臨床での診断'検診'経過観察、及び分類の技術に関し、 具体的には、 腫瘍マ 一力一及び癌疾病の罹患の識別方法 (Tumor Marker and Method to Identify Morbidity of Cancer Disease) に関する。 とりわけ、 本発明は、大腸癌の腫瘍マーカー及び大腸癌の罹 患の識別方法に闋する。
背景技術 大腸癌の診断 '検診■経過観察の手法の一つとして、血液検査が行われている。血液検査 においては、患者の血液中のある種のタンパク質 (腫瘍マーカー: tumor marker) の濃度 を計測することで、進行癌の存在を推定することができる。大腸癌の腫瘍マーカーについ ては、例えば、 Anticancer Research, 2004,24(4), 2519-2530 (非特許文献 1 ) などに記載 されている。現在、代表的な腫瘍マーカーとしては、癌胎児性抗原 (CEA) や CA19-9が 挙げられる。肝臓などへの転移があると、 これらの腫瘍マ一カーの濃度が 度に上昇する 。 また、 US2006/0019256 (COMPOSITIONS AND METHODS FOR TREATING AND DIAGNOSING CANCER) (特許文献 1 ) には、肺癌由来の培養細胞 (xenogralttumors)の解 析結果として、 HIA-C, MBC2、 RAB22A, MGC15429, MHC class I antigenが癌関連蛋白質 として記載されている。 さらに、 US2003/0211498 (TUMOR MARKERS IN OVARIAN CANCER) (特許文献 2) には、子宮癌マ一力一遺伝子として Tumor rejection antigen-1が 記載されている。 非特許文献 1 「ァンチキヤンサ一■リサーチ (Anticancer Research)」、 2004年 、 第 24巻、 第 4号、 p. 2519-2530
特許文献 1 米国特許出願公開第 2006/0019256号明細書
特許文献 2 米国特許出願公開第 2003/0211498号明細書
発明の開示
発明の目的
上述のように、癌胎児性抗原 (CEA) や CA19-9などの腫瘍マーカーが、 大腸癌の診断. 検診'経過観察における血液検査で用いられている。 しかしながら、早期癌の段階におい てはこれらの腫瘍マ一カーの濃度は正常レベルであることが多く、進行癌の段階において も正常レベルの範囲であることカ《少なくない。 このような観点から、罹患部位についての 特異性が高く且つ ffl診断に適した新規腫瘍マーカーの発見が求められている。 なお、 上記特許文献 1には、 開示された癌関連タンパク質が、大腸癌に関連しているこ とは記載されていなしゝ。 また、 上記特許文献 2には、 開示された子宮癌マ一カー遺伝子が 、 大腸癌に関連していることは記載されていない。 本発明は、 大腸癌に対してよリ特異性の高し、腫瘍マーカーを提供することを目的とする 。 また本発明は、 大腸癌につしゝての罹患を識別することができる方法を提供することを目 的とする。 発明の概要
本発明者らは、 大腸癌患者から採取した大腸粘膜上皮における病 織と正常組織とを 試料とし、 プロ亍オーム解析法として N B S法を用い、両紙織間で:? ¾量に一定量以上の 差が認められるタンパク質群を同定した。 N B S法は、 2—ニトロベンゼンスルフエニル クロリドを用いる、 タンパク質■ぺプチドの相対定量に優れた手法である。 N B S法を用 いるプロテオーム角? ^法は、 二次元電気泳動法を用いる最も汎用的なプロテオー厶角 ¾ff法 と、 分離様式及び検出原理が根本的に異なる。 このため、 N B S法を用しゝたプロ亍オーム 解析法によると、現在までに腎癌マーカー igffiとして報告されているタンパク質群とは異 なるマーカ一候補タンパク質を見出すことができると考えられる。
本発明は、 以下の発明を含む。 下記 (1 ) 及び (2) は、大腸癌の腫瘍マ一カーに関する。 下記 (1 ) は、癌患者体内で、 正常レベルに比べて発現量が多いタンパク質を含む大腸 癌の腫瘍マーカーに関する。
( 1 )
6-phosphogluconolactonase Alphal acid glyco protein, Alpha-actinin 1、 Apurinic en donuclease、 Calumenin, ChaperoninN Clathrin heavy chain 1、 Clathrin light polypeptid e A、 c-myc binding prateir Complement factor H、 Cysteine rich intestinal protein 1、 F-box protein 40、 Fibrinogen gamma、 Fk506 Binding Protein Fkbp Mutant R42kH87V COMPし EX WITH Immunosuppressant Fk506、 Guanine nucleotide binding protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1、 Heat shock 70kD protein 9B、 Heparan sulfate prat p pyyv., ht,i chdu ein lai Enolasmiretcululmenalrotn 1cimein 28 Enoloee hse- cnNmdra-- yypyy p,,,dase Co, Anhr Fo roabnl reca 1 Cates srmrdutsehinstenec 1 ci rihroteinn D
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( 5 )
ADP-ribosylation factor-like 10C、 aldehyde dehydrogenase2、 Alpha-actinin 4、 Annexi n A2 isoform 2、 ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial FO complex, subunit d i soform a、 ATP-binding cassette transporter family A member 12、 Calnexin、 Carbonic Anhydrase Form B、 Carbonyl reductase , 1、 Cathepsin S、 cysteine rich protein 1、 Dyn ein light chain 1、 Endoplasmic-reticulum-lumenal protein 28、 Enoyl coenzyme hydrase, short chain1、 Eukaryotic translation elongation factor 2、 Filamin B、 gelsolin isoform a 、 Glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase^ GTP-binding protein Rab3B、 H aptoglobiru Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A2、 Hydroxymethylglutaryl-CoA sy nthase, mitochondrial Isocitrate dehydrogenase 1、 Lymphocyte cytosolic protein 1、 Ma jor vault protein^ MGC15429 prateiru MHC class I antigen^ Myosin, heavy polypeptid e 14、 Myozenin 3、 NADH Ubiquinone oxidoreductase subunit B13、 Normal mucosa o f esophagus specific 1、 Olfactomedin 4、 phosphoenolpyruvate calboxykinase 2、 Phos phoglycerate mutase 1、 Proline arginine-rich end leucine-rich repeat protein precursor 、 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 2、 Protein P97、 Pyridoxin e 5-phosphate oxidase^ Raf kinase inhibitor protein % Ras associated protein Rab5B、 Retinoblastoma binding protein 4、 succinate dehydrogenase complex,subunit A„flavopr otein、 Thioredoxin domain containing 5、 TNRC15 protein; Collagen, type XIV, alpha 1、及び Desmoglein 2からなる群から選ばれるタンパク質を大腸癌の腫瘍マーカ一として 使用することによって、 大腸癌の罹患を識別する方法。 ( 6)
前記タンパク質の、 大腸癌の罹患を識別すべき対象となる個人に由来する試料中におけ るレベルを測定し、
得られた測定値レベルと、前記タン' ク質の正常レベルとを比較し、
得られた測定値レベルが、前記正常レベルよりも減少していることを、 前記対象となる 個人が大腸癌に罹患している可能性が高いことの指標の 1つとする、 ( 6 )に記載の大腸癌 の罹患を識別する方法。 前記タンパク質の正常レベルとは、癌性試料の対照となる非癌性試料における前記タン パク質レベルであればよい。例えば、健康な個人に由来する正常試料におけるレベルや、 癌疾病の罹患患者に由来する癌性でなしゝ正常試料におけるレベルなどが挙げられる。 前記試料が血清又は尿であリ、前記タン/ ク質のレベルは、 生体特異的親和性に基づく 検査によって測定される、 (6) に記載の大腸癌の罹患を識別する方法。 本発明はまた、下記 ( 7 ) 及び (8 ) に記載の大腸癌の処理のための薬剤組成物に向け られる。大腸癌の処理とは、 大腸癌細胞を死滅させること、 及び大腸癌細胞の成長を抑制 することを含む。 ( 7 )
大腸癌細胞に対して供給することによって、大腸癌細胞の死滅及び/又は大腸癌細胞成長 の抑制を促進する反応を誘発するための薬剤組成物であって、 (1 )に記載の腫瘍マーカー に免疫特異的に結合する少なくとも 1種の抗体を含む、薬剤組成物。 (8 )
免疫刺激量で、 大腸癌細胞に対して供給することによって、免疫応答を促進するための 薬剤組成物であって、 ( 1 ) に記載の腫瘍マーカーを含む、薬剤組成物。 上記 (7 ) 及び (8 ) の薬剤組成物は、 大腸癌の処理に用いられる潜在的な治療剤とし て特定されうる。或いは、 上記 (7 ) 及び (8 ) の薬剤組成物は、 大腸癌の処理に用いら れる治療剤として用いられうる。
本発明によると、 大腸癌に対してよリ特異性の高し、腫瘍マーカ一を提供することができ る。 また本発明によると、大腸癌についての罹患を識別することができる方法を提供する ことができる。
図面の簡単な説明
図 1は、本発明における大腸癌組織で発現が亢進するタンパク質 (6種蜀について、臨 床検体 (大腸癌患者の大腸粘 上皮組織の癌部及び非癌部) でのウェスタンブロッテイン グ解析結果を示す。
図 2は、本発明における大腸癌繊で発現が宂進するタンパク質 (6種 ¾1)について、臨 床検体 (大腸癌患者の大腸粘 fl莫上皮組織の癌部及び非癌部) での免疫組織化学染色による バリデ一ション解析結果を示す。
発明を実施するための形態 <腫瘍マーカー >
本発明は、 大腸癌の腫瘍マーカ一を提供する。
本発明におレゝて腫瘍マーカーとして提供するタンパク質は、大腸癌患者から採取された 大腸粘膜上皮組織の癌部、 非癌部よリ抽出し、 2—二トロベンゼンスルフエニルク口リド (NBSC I) を用いた同位 ί材票識法 (NBS法) と H PLCを用いた分離法とによるプ ロ亍オーム解析技術によって同定された。 NBS法は、 2種類の状態のタンパク質試料の うち一方を重しゝ試薬 (2—二トロ [13C6] ベンゼンスルフエニルクロリド) で修飾し、 他 方を軽い試薬 (2—二トロ [12C6] ベンゼンスルフエニルクロリド) で修飾し、 得られた N B S修飾タンパク質試料双方を互いに混合し、 トリプシン消化など当業者による適切な 処理を行い、 質量分析装置でぺプチド量の違いを測定することにより、 2種類の状態のタ ンパク質試料におけるタンパク質含有量の相対的な差を調べることができる方法である。
NBS法は、 Rapid Commun. Mass Spectrom., 2003, 17, 1642-1650及び国際公報第 2 O 04/002950号パンフレツ卜などに記載されている。 従来から汎用されてきた二次元電気泳動法では、塩基性の等電点を示すタンパク質及び 100 KD a前後の大きな分子量を持つタンパク質の分離と検出とに難があった。本発明 0
11 で用いた N B S法では、組織に含まれるタンパク質をトリプシン消化することによって得 られるぺプチド断片を直接的な解析対象とし、分離には H P L Cを用いるため、 分子量と 等電点とに関する制約はない。 このこと力ヽら、従来得られてきた知見と異なるものが得ら れる可能性がある。 これらのタンパク質は、 当業者によって選択されるあらゆるタンパク質精製技術によつ て単離及び精製することができる。例えば、 イオン交換、 ァフィ二ティ、及びサイズ排除 カラムクロマトグラフィーなどのクロマトグラフィー、遠心分離、 溶解度差、 及び電気泳 動などを含む技術を用いることができる。 本発明が腫瘍マーカ一として提供するタンパク質のうち、癌患者体内で、正常レベルに 比べて発現量力《多いタンパク質として、 6-phosphogluconolactonase、 Alphal acid glyco protein^ Alpha-actinin 1、 Apurinic endonuclease、 Calumeniru Chaperonin、 Clathrin he avy chain 1、 Clathrin light polypeptide A、 c-myc binding protein^ Complement factor H、 Cysteine rich intestinal protein 1、 F-box protein 40、 Fibrinogen gamma、 Fk506 Bi nding Protein Fkbp Mutant R42kH87V COMPLEX WITH Immunosuppressant Fk506、 Guanine nucleotide binding protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1、 Heat shock 70kD protein 9B、 Heparan sulfate proteoglycan 2、 HLA-C、 hypothetical protein FLJ38 663、 L-plastin polypeptide^ MBC2、 Migration inhibitory factor-related protein 14 variant E、 Mitogen inducible gene、 Proteasome subunit p58、 RAB18, member RAS oncogen e family、 RAB22A、 Radixiru RAN, member RAS oncogene family、 Rhodanese;thiosul fate sulfurtransferase、 Ribosomal protein し 13、 Ribosomal protein L27a、 Ribosomal pr otein L4、 Ribosomal protein S18、 Ribosomal protein S29、 Ribosome binding protein 1、 S adenosylhomocysteine hydrolase* Solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; adenine nucleotide translocator), member 5、 Solute carrier family 3(activator of dibasic and neutral amino acid transport), member 2、 Splicing factor 3B, subunit 3、 Splicing f actor, arginine/serine-rich 3 (SRp20) U5 snRNP-specific protein, 116 kD、 Ubiquitin iso peptidase T、 Vitronectin^ XTP3 transactivatied protein A、 Galectin 1、 Reticulocalbin 1 、 Vimentin、 ESP-2 (z xin); Protein tyrosine phosphatase receptor type C、 Protein t yrosine phosphatase, receptor type, alpha % orosomucoid 2、 Tumor rejection antigen 1 、 glycyl-tRNA synthetase: TLS proteir Ribonuclease RNase A family 3、 及び heterag eneous nuclear ribonucleoprotein H2を提供する。 上記タンパク質は、例えば、 大腸癌患者数の約 5 0 <½以上で、癌部において、 非癌部に おけるよリも約 5 00/0以上、 好ましくは 1 0 0 %以上大きし、発現量を示す傾向にある。 さらに、上記タンノ《ク質のうち、 Protein tyrosine phosphatase receptor type C、 Prate in tyrosine phosphatase, receptor type, alpha、 orosomucoid 2、 Tumor rejection antigen 1、 glycyl-tRNA synthetase^ TLS proteiru Ribonuclease RNase A family 3、 及び heter ogeneous nuclear ribonucleoprotein H2については、癌部において特異的に発現する (或 いは、 非癌部において検出限界以下である)。 本発明が腫瘍マーカーとして提供するタンパク質のうち、大腸癌患者体内で、 正常レべ ルに比べて発現量が少ないタンパク質として、 ADP-ribosylation factor-like 10C、 aldehyd e dehydragenase2、 Alpha-actinin 4、 Annexin A2 isoform 2、 ATP synthase, H+ transp orting, mitochondrial F0 complex, subunit d isoform a、 ATP-binding cassette transporte r family A member 12、 Calnexiru Carbonic Anhydrase Form B、 Carbonyl reductase 1 、 Cathepsin S、 cysteine rich protein 1、 Dynein light chain 1、 Endoplasmic-reticu!um-lu menal protein 28、 Enoyl coenzyme hydrase.short chainl、 Eukar otic translation elonga tion factor 2、 Filamin B、 gelsolin isoform a、 Glucosamine-fructose-6-phosphate aminot ransf erase GTP-binding protein Rab3B、 Haptoglobin、 Heterogeneous nuclear ribonucl eoprotein A2、 Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, mitochondrial, Isocitrate dehydroge nase 1、 Lymphocyte cytosolic protein 1、 ajor vault protein N MGC15429 protein MH C class I antigen s Myosin, heavy polypeptide 14、 Myozenin 3、 NADH Ubiquinone oxi doreductase subunit B13、 Normal mucosa of esophagus specific 1、 Olfadomedin 4、 p hosphoenolpyruvate calboxykinase 2、 Phosphoglycerate mutase 1、 Proline arginine-ric h end leucine-rich repeat protein precursor. Protein kinase C and casein kinase subst rate in neurons 2、 Protein P97、 Pyridoxine 5'-phosphate oxidase^ Raf kinase inhibitor protein^ Ras associated protein Rab5B、 Retinoblastoma binding protein 4、 succinate dehydrogenase complex, subunit A„flavoprotein、 Thioredoxin domain containing 5、 TNR C15 protein; Collagen, type XIV, alpha 1、 及び Desmoglein 2を提供する。 上記タンパク質は、例えば、 大腸癌患者数の約 5 0%以上で、 非癌部において、 癌部に おけるよりも約 5 0%以上、好ましくは 1 0 0%以上大きい発現量を示す傾向にある。 さらに、上記タンパク質のうち、 Collagen, type XIV, alpha 1、及び Desmoglein 2につ いては、 非癌部において特異的に発現する (或いは、癌部において検出限界以下である)
<大腸癌の罹患を識別する方法 >
本発明はまた、上記タン/ ク質群から選ばれる少なくとも 1種のタン/《ク質を腫瘍マ一 力一として使用することにより、 大腸癌の罹患を識別する方法を提供する。 本発明の方法においては、大腸癌の罹患を識別すべき対象となる個人に由来する試料を 用意し、 当該試料中において、 上記タンパク質群から選ばれる少なくとも 1種のタンパク 質のレベルを測定する。得られた測定値レベルは、 正常レベルと比較される。 正常レベル とは、上記タンノ《ク質群から選ばれる少なくとも 1種のタンパク質の、癌性試料の対照と なる試料における タンパク質レベルである。 ここで、癌性試料の対照となる試料は、 癌性でなしゝ試料であれば特に限定されない。例えば、健康な個人に由来する試料や、 癌疾 病の罹患患者に由来する正常試料などが挙げられる。 本発明において、 大腸癌の罹患を識別すべき対象となる個人に由来する試料としては、 特に限定されない。例えば、細胞や組織、体液、 及び組織抽出物などが挙げられる。細胞 や組織には、組織生検材料及び検死解剖材料などが含まれ、 それらの組織切片および組織 抽出物も含まれる。特に、試料としては、 大腸由来試料の細胞、組織、 及び組織抽出物が 挙げられる。大腸由来試料としては、粘膜上皮、 粘膜固有層、粘膜筋板、 粘膜下層、 固有 筋層、及び漿膜などが挙げられる。体液としては、血液、 尿、 及び体分泌物などが含まれ る。血液としては、 全血、血漿、 ifii5青などが含まれる。組織抽出物とは、 当業者に公知の 方法によってホモジネート又は可溶化された組織をいう。 これら例示された試料の中でも 、血清及び/又は尿を試料とすることが好ましい。 対象となる個人の細胞や組織、体液、 及び組織抽出物を含む試料におしゝて測定された腫 瘍マ一カーの測定値は、 好ましくは同種の細胞や組織、体液、及び組織抽出物を含む、 癌 性でなし、試料におけるレベルと比較される。 大腸癌の罹患の識別において、 腫瘍マーカーは、 以下の用途で用いられる。組織中の腫 瘍マーカーは、例えば、組織切片を用いた癌診断や予後診断 (例えば、 免疫組織化学染色 法、マスイメージングなどにより行う)、及び PET診断(例えば、腫瘍マーカーに対する放 射性プローブの使用により行う) におけるターゲットとして、 或いは、 治療における薬物 ターゲット (後述のく薬剤組成物〉の項目参照) となる。 また、血中の腫瘍マーカーは、 例えば、癌診断、 予後診断において定量的に測定されるべき対象となる。 上言己タンノ《ク質群力《、 6-phosphogluconolactonase、 Alphal acid glyco proteiru Alpha- actinin 1、 Apurinic endonuclease、 Calumeniru Chaperoning Clathrin heavy chain 1、 C lathrin light polypeptide A、 c-myc binding protein. Complement factor H、 Cysteine rich intestinal protein 1、 F-box protein 40、 Fibrinogen gamma、 Fk506 Binding Protein Fkb p Mutant R42kH87V COMPLEX WITH Immunosuppressant Fk506、 Guanine nucleotid e binding protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1、 Heat shock 70kD protein 9B、 Heparan sulfate proteoglycan 2、 HLA-C、 hypothetical protein FLJ38663、 L-plastin poly peptides MBC2、 Migration inhibitory factor-related protein 14 variant E、 Mitogen induci ble gene、 Proteasome submit p58、 RAB18, member RAS oncogene family、 RAB22A 、 Radixir RAN, member RAS oncogene family^ Rhodanese;thiosulfate sulfurtransfera se、 Ribosomal protein し 13、 Ribosomal protein L27a、 Ribosomal protein L4、 Ribosom al protein S18、 Ribosomal protein S29、 Ribosome binding protein 1、 S adenosylhomo cysteine hydrolaseN Solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; adenine nucleotide t ranslocator), member 5、 Solute carrier family 3(activator of dibasic and neutral amino acid transport), member 2、 Splicing factor 3B, subunit 3、 Splicing factor, arginine/serin e-rich 3 (SRp20)、 U5 snRNP-specific protein, 116 kD、 Ubiquitin isopeptidase T、 Vrtron ectir XTP3 transactivatied protein A、 Galectin 1、 Reticulocalbin 1、 imentiru ESP-2 (zyxin); Protein tyrosine phosphatase receptor type C、 Protein tyrosine phosphatase, receptor type, alpha、 orosomucoid 2、 Tumor rejection antigen 1、 glycyl-tRNA synthet ase、 TLS proteiru Ribonuclease RNase A family 3、 及び heterogeneous nuclear ribonu cleoprotein H2からなる群である場合、得られた測定値レベルが、正常レベルよりも上昇し ていることを、 大腸癌の罹患を識別すべき対象となる個人が、 大腸癌に罹患している可能 性が いことの指標の 1つとすることができる。 測定値レベルにおける上昇の度合いとし ては、 測定値レベルが、正常レベルの 5 0 %以上、 好ましくは 1 0 0 %以上となる程度を目 安にすると良い。 さらに、 上言己タンパク質のうち、 Protein tyrosine phosphatase receptor type C、 Prate in tyrosine phosphatase, receptor type, alpha、 orosomucoid 2、 Tumor rejection antigen 1、 glycyl-tRNA synthetase^ TLS protein Ribonuclease RNase A family 3、 及び heter ogeneous nuclear ribonucleoprotein H2Iこっし、て ίま、 大腸癌組織 ίこおし、て特異 0勺なタンノ"? ク質であるため、 その存在が確認されれば、 大腸癌の罹患を識別すべき対象となる個人が 、 大腸癌に罹患している可能性が高いことの指標の 1つとすることができる。 上記タンパク質群が、 ADP-ribosylation factor-like 10C、 aldehyde dehydrogenase2、 Al pha-actinin 4、 Annexin A2 isoform 2、 ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial FO complex, subunit d isoform a、 ATP-binding cassette transporter family A member 12 、 Calnexiris Carbonic Anhydrase Form B、 Carbonyl reductase 1、 Cathepsin S、 cystei ne rich protein 1、 Dynein light chain 1、 Endoplasmic-reticulum-lumenal protein 28、 En oyl coenzyme hydrase.short chain1、 Eukaryotic translation elongation factor 2、 Filamin B、 gelsolin isoform a、 Glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase^ GTP-bindi ng protein Rab3B、 Haptoglobin^ Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A2、 Hydrox ymethylglutaryl-CoA synthase, mitochondrials Isocitrate dehydrogenase 1、 Lymphocyte cytosolic protein 1、 Major vault proteiru MGC15429 protein^ MHC class I antigen、 My osin, heavy polypeptide 14、 Myozenin 3、 NADH Ubiquinone oxidoreductase subunit B 13、 Normal mucosa of esophagus specific 1、 Olfactomedin 4、 phosphoenolpyruvate c alboxykinase 2、 Phosphoglycerate mutase 1、 Proline arginine-rich end leucine-rich rep eat protein precursor^ Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 2、 Pr otein P97、 Pyridoxine 5-phosphate oxidase^ Raf kinase inhibitor proteiru Ras associat ed protein Rab5B、 Retinoblastoma binding protein 4、 succinate dehydrogenase compl ex.subunit A,,flavoprotein、 Thioredoxin domain containing 5、 TNRC15 protein; Colla gen, type XIV, alpha 1、及ぴ Desmoglein 2からなる群である場合、得られた測定値レべ ルが、 正常レベルよりも減少している場合、大腸癌の罹患を識別すべき対象となる個人が 、 大腸癌に罹患している可能性が^いことの指標の 1つとすることができる。 測定値レべ ルにおける減少の度合いとしては、 正常レベルが測定値レベルの 5 00/0以上、 好ましくは 1 0 0 %以上となる程度を目安にすると良い。 さらに、上記タンパク質のうち、 Collagen, type XIV, alpha 1、及び Desmoglein 2につ いては、 正常組織 (非癌組織) において特異的なタンパク質であるため、 その不在が確認、 されれば、大腸癌の罹患を識別すべき対象となる個人が、大腸癌に罹患している可能性が 高いことの指標の 1つとすることができる。 上記タンパク質のレベルは、 好ましくは、 生体特異的親和性に基づく検査によって測定 される。生体特異的親和性に基づく検査は当業者に良く知られた方法であり、特に限定さ れないが、 ィムノアツセィが好ましい。具体的には、 ウェスタンプロット、 ラジオィ厶ノ アツセィ、 E L I S A、サンドイッチィムノアツセィ、 免疫沈降法、 沈降反応、 ゲル内拡 散沈降反応、 免疫拡散法、凝集測定、補体結合分析検定、免疫放射定量法、 蛍光ィムノア ッセィ、 プロテイン Aィ厶ノアッセィなどの、競合及び非競合アツセィ系を含むィ厶ノア ッセィが含まれる。 ィムノアッセィにおいては、個体の試料中の腫瘍マーカーに結合する 抗体の存在を検出する。具体的には、 アツセィ培地中において、 測定すべき腫瘍マーカー タンパク質及び当該タンパク質の抗体からなる免疫複合体を形成しうる条件のもと、試料 を当該抗体に接触させることによって行われる。 より具体的なィムノアッセィプロトコル は、 当業者であれば容易に選択することができる。 上記タンパク質のレベルは、 上記のように、 生体特異的親和性に基づく検査によって測 定されること力《好ましいが、 その他のタンパク質定量法によって測定することもできる。 例えば、 既に述べた N B S法は、 定量性に優れた方法である。 この場合、上記タンパク質 を既知レベルで調製した試料や、 正常試料などの適当な試料を対照試料として、 対象とな る個人の試料との間における前記タンパク質の存在量の差を調べることによって、 測定を 行うことができる。 本発明の方法は、本発明の腫瘍マーカーを単独で測定してもよいし、 他のいかなる腫瘍 マーカーと組み合わせて測定してもよい。従って、本発明の方法は、 本発明の腫瘍マーカ —のレベルと同様に他の腫瘍マーカ一のレベルを測定することを含んでいてよい。 本発明の腫瘍マ一カーは、 大腸癌の検出、診断、 モニタリング、 ステージング及び予後 判定を目的として用いられるとよい。 好ましくは、腫瘍の動態の把握に用いられるとよい o例えば、腫瘍に対して化学療法や放射線療法が行われている場合、 その治療がどれくら いの効果を奏しているかを判断することに用いられるとよい。 また、 腫瘍マーカー値が い腫瘍に対して切除手術が行われた場合、術後の経過観察のために用いられるとよい。
<薬剤組成物 >
本発明はまた、本発明の B重瘍マーカーのうち、 大腸癌患者体内で、 正常レベルに比べて 発現量が多いタンパク質を含む腫瘍マーカ一を用いることによって大腸癌を処理するため の薬剤組成物に向けられる。 薬剤組成物の一形態は、 癌細胞に対して供給することによって、癌細胞の死滅及び/又は 癌細胞成長の抑制を促進する反応を誘発するための薬剤組成物であって、本発明の腫瘍マ 一力一に免疫特異的に結合する少なくとも 1種の抗体を含む、薬剤組成物である。 抗体は 、 ポリクローナル抗体、 モノクローナル抗体、 及び、 分子生物学的技術により調製した抗 7 061690
19 体を含む。 ここで抗体とは、広く免疫特異的に結合する物質であればよく、抗体フラグメ ントゃ抗体融合タンパク質も用いられてよい。 しゝずれの場合も、 抗体の調製は、 当業者に 良く知られた方法によつて行われる。 薬剤組成物の他の一形態は、免疫刺激量で、癌細胞に対して供給することによって、 免 疫応答を促進するための薬剤組成物であって、本発明の腫瘍マーカーを含む、 薬剤組成物 である。 ここで、 免疫刺激量とは、癌の処理のために所望する免疫反応を惹起することが 可能な抗原の量をいい、 当業者によって良く知られた方法で決定されるものである。 この 形態によると、 しゝゎゆる癌ワクチン療法として知られている、 当業者に良〈知られた方法 を用いて癌の処理が行われる。 上記薬剤組成物は、上記抗体或いは腫瘍マーカーを有効成分として含み、 薬剤として許 容される希釈剤、担体、賦形剤などをさらに含んでよい。 上記薬剤組成物は、 大腸癌の処 理に用いられる潜在的な治療剤として特定されうる。或いは、 上記薬剤組成物は、大腸癌 の処理に用いられる治療剤として適用されうる。
実施例
以下に実施例を示し、 本発明を具体的に説明するが、本発明は下記の実施例に制限され るものではない。
[実施例 1 : N B S法によるタンパク質発現解析]
大腸癌患者より正常組織 (すなわち大腸粘膜上皮組織の非癌部) および癌組織 (すなわ ち大腸粘膜上皮組織の癌部) を採取した。 それぞれの組織を可溶化バッファー A(50 mM Tris-HCI(pH8.0),100 mM NaCI, 10 mM EDTA, プロテアーゼインヒビター (ァプロチニン, PMSF, ロイペプシン)水溶液)中でホモジナイズし、 100000 XG (4°C, 1時間)で i¾S心した 後、 その上澄み液を可溶性画分として得た。 次に、遠心で得られた沈殿に可溶化バッファ -B(9Mゥレア、 2w/v% CHAPS、 10 mM EDTA、 プロテア一ゼインヒビタ一(ァプロチニ ン, PMSF, ロイペプシン)水溶液))中で再度ホモジナイズし、 100000 xG (4°C, 1時間)で超 遠心した後、 その上澄み液を不溶性画分として得た。 これら可溶性、 および不溶性画分の抽出蛋白質をそれぞれ NBS試薬によリ処理を行い、 蛋白質の発現解析を行った。 NBS試薬処理に関しては、 13C NBS Stable Isotope Labelin g Kit-N (島津製作所)の推奨プロ卜コルに従い、 安定同位体標識を行った。具体的には、 正 常組織から抽出された蛋白質を12 CNBS(Light NBS)でラベル化し、癌組織から抽出された 蛋白質を 13CNBS(Heavy NBS)でラベル化した。得られたそれぞれのラベル化蛋白質を混 合し、キッ卜の推奨プロ卜コルに従い、 脱塩■還元■アルキル化、 およびトリプシン消化 を行った。次に、 同キットのプロ卜コルに従い、 ラベル化ペプチドを濃縮した。 濃縮した ラベル化べプチドに関しては、引き続いて C18カラムを用いた〃 HPLCによる分離を行い 、 MSプレートに塗布した。 このようにして準備したサンプルに関して質量分析装置 Axim a-CFR plus (島津製作所製)を用いて測定し、 各蛋白質の相対定量解析を行った。 ペアピークを示したべプチド断片についてタンデム質量分析装置 Axima-QIT (島津製作 所製) によって MS/MS解析を行い、 タンパク質の同定を行った。 このような手法により、最終的に臨床検体 2 4症例に対して同様の解析を行った。解析 の結果、全検体数の 5 0 %以上の検体において、癌繊におけるタンパク質の発現量が増 加或いは減少しているタンパク質を同定した。増加或いは減少の度合いとしては、 次の量 を基準にした。すなわち、 癌部において、 非癌部におけるより存在量が増加したペプチド については、 癌部における存在量が、非癌部における存在量よりも 5 0%以上大きいもの (すなわち癌部における存在量が、非癌部における存在量の 1 5 0%以上のもの) を選出 した。 また、癌部において、 非癌部におけるより存在量が減少したペプチドについては、 非癌部における存在量が、癌部における存在量よりも 5 0«½以上大きいもの (癌部におけ る存在量が、非癌部における存在量の 6 6 %よリ少ないもの) を選出した。 その結果、下記表 1〜表 8に示すタンパク質を同定した。表中、 「Meanj、 「SEMj 、及 び「SDJ は、 それぞれ、各臨床検体において測定した相対比(%) (すなわち非癌部における 蛋白質の発現量を 100(%)とした時の癌部の発現量 (比))の平均値、標準誤差、及び標準偏差 値を示す。 表 1〜表 3は、 非癌部におけるよりも、癌部におけるタンパク質の発現量が増加するタ ンパク質(Up-regulated proteins)のリストである。例えば、 2 4検体中 1 6検体において 発現量が上昇した 6-phosphogluconolactonase (発現量平均値:非癌部に対して約 2 · 1 6倍) などのタンパク質を同定した。 表 4は、 癌部において特異的に検出された (All or None) タンパク質のリストである。表 1〜表 4における 「150%≤J は、癌部における存 在量が'、 非癌部における存在量の 1 5 0%以上であった検体数を示す。
表 1
N3
Figure imgf000024_0001
表 2
Figure imgf000025_0001
表 3
I>
Figure imgf000026_0001
表 4
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表 5〜表 7は、 非癌部におけるよりも、癌部におけるタンパク質の発現量が減少するタ ンパク質 (Down-regulated proteins) のリストである。例えば、 2 4検体中 1 5検体にお いて発現量力《減少する Carbonic Anhydrase Form B (発現量平均値:非癌部に対して 0. 1 1倍)などのタンパク質を同定した。表 8は、非癌部において特異的に検出された(All or None) タンパク質のリス卜である。表 5〜表 8における Γ<66%」 は、 癌部における存在 量が、非癌部における存在量の 6 60/6よリ少なかった検体数を示す。
表 5
Figure imgf000029_0001
表 6
00
Figure imgf000030_0001
表 7
CD
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表 8
Figure imgf000032_0001
GO O
下記実施例 2及び 3においては、上記 N B S法によって、非癌部におけるよリ癌部にお いて増加を示したタンパク質のうち、 ZYX (Zyxin)、 RAN (RAN, member RAS oncogene f ami I y )、 RCN1 (Ret i GU I oca I b i n)、 AHCY (S-adenosy I homocyste i ne hydro I ase)、 SGALS1 (Ga I ect i nl )、 及び VIM (Vimentin) の 6種のタンパク質について、 生体組織のウェスタンブロッティ ング解析と生体組織の免疫組織化学染色によるバリデーション解析とを行った。
[実施例 2:ゥエスタンブロッ亍ィング解析]
大腸癌患者 (5症例)より採取した正常組織 (すなわち大腸粘膜上皮組織の非癌部) およ び癌組織 (すなわち大腸粘膜上皮組織の癌部) を用意した。 それぞれの組織を可溶化バッ ファー八(50 11 1> | 3-1101 ( 118. 0),100 |^ 01, 10 mM EDTA, プロテアーゼインヒビター (ァ プロチニン, PMSF, ロイペプシン)水溶液)中でホモジナイズし、 100000 X G (4°C, 1時間) で超遠心した後、 その上澄み液を可溶性画分として得た。次に、遠心で得られた沈殿に可 溶化バッファー B (9Mゥレア、 2 % CHAPS, 10 mM EDTA. プロテア一ゼインヒビター (アブ口 チニン, P SF, ロイペプシン)水溶液))中で再度ホモジナイズし、 100000 x 6 (4°C, 1時間) で超遠心した後、 その上澄み液を不溶性画分として得た。
これら蛋白質抽出溶液のうち、 可溶性画分を pati ent 1〜5の番号を付し、 それぞれを ZYX、 RAN、 RGNU 及び AHCYの解析に用い、不溶性画分を pati ent 6~10の番号を付し、 そ れぞれ SGALS1及び VIMの解析に用いた。 各抽出液は、 12. 5 %ァクリルアミド (SGALS1の解析に用いるサンプルのみ 15 %ァクリ ルアミド) SDS-PAGEゲルにより分離し、 その後、 ニトロセルロース膜への転写を行った。 転写されたサンプルに対して、各蛋白質に対する一次抗体 (後 5©をロードし、 常温 2時間 インキュベーションした。反応後、ニトロセルロース膜を PBS (Phosphate Buffered Sal ine) ノ ッファーにより洗浄後、 二次抗体 (後 溶液を添加し、 1 時間反応させた。抗体と反応 した後、 ECL発色溶液を添加することによって各バンドを検出させた。 なお、本実施例で用いた抗体は以下の通リである。
—次抗体:
マウス抗ヒト ZYXポリクローナル抗体 (抗体希釈率 1/500)
マウス抗ヒト RANモノクローナル抗体 (抗体希釈率 1/2000)
マウス抗ヒト AHGYポリクローナル抗体 (抗体希釈率 1 /1000)
ゥサギ抗ヒト RCN1モノクローナル抗体 (抗体希釈率 1/1000)
ゥサギ抗ヒト SGAL1ポリクローナル抗体 (抗体希釈率 1/1000)
ゥサギ抗ヒ卜 VIMポリクロ一ナル抗体 (抗体希釈率 1/1000)
二次抗体:
西洋わさびペルォキシダーゼコンジユゲー卜-匕ッジ抗マウス IgG抗体 (抗体希釈率 1/400)
西洋わさびペルォキシダーゼコンジュゲート-口パ抗ゥサギ IgG抗体 (抗体希釈率 1/400) 図 1は、上記のウェスタンプロッティングによって得られた電気泳動図を示す。 図 1中 、 Nは非癌部由来識、 Tは癌部由来試料であることを示す。
図 1が示すように、 6種類の各蛋白質ともに、 5症例全ての癌部において発現が亢進して いることが確認された。 すなわち、上記実施例 1に示す N B S法による定量結果において 、 非癌部におけるよリ癌部において発現; it進を示したタンパク質は、 ゥ Iスタンプロッテ イングによる定量結果においても、実際にそのような発現亢進を示していた。 このように 、 N B S法による定量結果と、 ウェスタンブロッテイングによる定量結果とは、 良い相関 を示している。従って、 これらの分子が大腸癌に関連するタンパク質であることが確かに 確認された。
このことから、 N B S法による定量結果において癌部より非癌部において発現増加を示 したタンパク質、 すなわち非癌部より癌部において発現抑制を示したタンパク質も同樹こ 、 ウェスタンブロッテイングによる定量結果において、 そのような発現傾向が示されるこ とが容易に推定される。
[実施例 3 :免疫組織化学染色法による解析]
大腸癌患者 (10症例)より採取した、正常組織 (すなわち大腸粘膜上皮組織の非癌部) お よび癌組織 (すなわち大腸粘膜上皮組織の癌部) それぞれのパラフィン包埋切片 (4 μιη)を 用意した。抗体としては、上記ウェスタンブロッテイング解析に用いたものと同様のもの を用いた。
パラフィン切片と一次抗体とを一時間室温にて反応させ、 PBSバッファ一で洗浄後、 さ らにストレブ卜アビジン-ビォチンペルォキシダーゼコンプレックスと反応させた。 ¾的 に、組織切片と発色溶液(3, 3' -ジァミノベンザィダインテトラヒドロクロリド、 0. 01%過 酸化ペルォキシダ一ゼ、 0. 05 Μ卜リス水溶液 (ρΗ 7· 6) )とを 3分間反応させることにより、 組織染色を行った。 その結果を、 図 2に示す。
図 2において、 (Α)は、 ΖΥΧ、 (Β)は RA 、 (G)は RGN1、 (D)は AHCY、 (E)は SGALS1、及び (F) は VIMについての免疫組織化学染色結果を示し、 Tは癌部における染色結果、 Nは非癌部 における染色結果を示す。
図 2が示すように、 全症例において、 6種類の蛋白質の全てが、癌部における癌細胞 (も しくは、癌細胞を取リ巻く間質細胞)での蛋白質の発現が亢進していることを確認した。す なわち、上記実施例 1に示す N B S法による定量結果において、 非癌部におけるより癌部 において発現亢進を示したタンパク質は、免疫組織化学染色法による解析結果においても 、 実際にそのような発現亢進を示していた。 このように、 N B S法による定量結果と、 免 疫組織化学染色法による解析結果とは、 良い相関を示している。従って、 これらの分子が 大腸癌に関連するタンパク質であることが確かに確認された。
このことから、 N B S法による定量結果において癌部より非癌部において発現増加を示 したタンパク質、 すなわち非癌部より癌部において発現抑制を示したタンパク質も同様に 、 免疫組織化学染色法による解析結果において、 そのような発現傾向が示されることが容 易に推定される。
以上のことから、請求の範囲第 1項に記載のタンパク質は、 非癌組織におけるよリも大 腸癌組織においてより多く発現し、請求の範囲第 3項に記載のタンパク質は、 非癌組織に おけるよりも大腸癌組織におし、て少なく発現するものである。 そして、 これらのタンパク 質は、 大腸癌の腫瘍マーカ一として使用できることが明らかである。 これらのタンパク質 を大腸癌の腫瘍マーカーとし、 大腸癌の罹患が不明な検体について、大腸癌の罹患の識別 を行う際は、上記実施例 1 ~ 3に記載の手法を用いることができる。
上記実施例においては、本発明の範囲における具体的な形態について示したが、 本発明 は、 これらに限定されることなく他のいろいろな形態で実施することができる。 このため 、 上記実施例はあらゆる点で単なる例示に過ぎず、 P艮定的に解釈してはならない。 さらに 、請求の範囲の均等範囲に属する変更は、 すべて本発明の範囲内である。

Claims

請 求 の 範 囲
1 . 6-phosphogluconolactonase、 Alphal acid glyco protein Alpha-actinin 1、 Apurinic endonuclease、 Calumenin、 Chaperonir Clathrin heavy chain 1 Clathrin light polypeptide A、 c-myc binding protein^ Complement factor H、 Cysteine rich intestinal protein 1 F-box protein 40、 Fibrinogen gamma, Fk506 Binding Protein Fkbp Mutant R42kH87V COMPLEX WITH Immunosuppressant Fk506、 Guanine nucleotide binding protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1、 Heat shock 70kD protein 9B、 Heparan sulfate proteoglycan 2、 HLA-C、 hypothetical protein FLJ38663、 L-plastin polypeptide、 MBC2、 Migration inhibitory factor-related protein 14 variant E、 Mitogen inducible gene、 Proteasome subunit p58、 RAB18, member RAS oncogene family ^ RAB22A、 Radixiru RAN, member RAS oncogene family, Rhodanese;thiosulfate sulfurtransferase、 Ribosomal protein L13、 Ribosomal protein L27a、 Ribosomal protein L4、 Ribosomal protein S18、 Ribosomal protein S29、 Ribosome binding protein 1、 S adenosylhomocysteine hydrolase、 Solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; adenine nucleotide translocator), member 5、 Solute carrier family 3(activator of dibasic and neutral amino acid transport), member 2、 Splicing factor 3B, subunit 3、 Splicing factor, arginine/serine-rich 3 (SRp20)、U5 snRNP-specific protein, 116 kD、 Ubiquitin isopeptidase T、 Vitronectin、 XTP3 transactivatied protein A、 Galectin 1、 Reticulocalbin 1、 Vimentin、 ESP-2 (zyxin) ; Protein tyrosine phosphatase receptor type C、 Protein tyrosine phosphatase, receptor type, alpha、 orosomucoid 2、 Tumor rejection antigen 1、 glycyl-tRNA synthetase、 TLS protein、 Ribonuclease RNase A family 3、 及び heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2力、らなる群から選ばれる少なくとも 1種のタ ンパク質を含む、 大腸癌マーカー。
2. ADP-ribosylation factor-like 10C、 aldehyde dehydrogenase2、 Alpha-actinin 4 、 Annexin A2 isoform 2、 ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F0 complex, s ubunit d isoform a、 ATP-binding cassette transporter family A member 12、 Calnexir Carbonic Anhydrase Form B、 Carbonyl reductase 1、 Cathepsin S、 cysteine rich protei n 1、 Dynein light chain 1、 Endoplasmic-reticulum-lumenal protein 28、 Enoyl coenzyme hydrase'short chain"!、 Eukaryotic translation elongation factor 2、 Filamin B、 gelsolin i soform a、 Glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase、 GTP-binding protein R ab3B、 Haptoglobin^ Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A2、 Hydroxymethylglutar yl-CoA synthase, mitochondriak Isocitrate dehydrogenase 1、 Lymphocyte cytosolic prat ein 1、 Major vault protein N MGC 15429 protein s MHC class I antigen s Myosin, heavy polypeptide 14、 Myozenin 3、 NADH Ubiquinone oxidoreductase subunit B13、 Normal mucosa of esophagus specific 1、 Olfactomedin 4、 phosphoenolpyruvate calboxykinase 2、 Phosphoglycerate mutase 1、 Proline arginine-rich end leucine-rich repeat protein p recursor、 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 2、 Protein P97、 P yridoxine 5'-phosphate oxidase^ Raf kinase inhibitor protein^ Ras associated protein R ab5B、 Retinoblastoma binding protein 4、 succinate dehydrogenase complex.subunit A, ,flavoprotein Thioredoxin domain containing 5、 TNRC15 protein; Collagen, type XI V, alpha 1、 及び Desmoglein 2からなる群から選ばれるタンパク質を含む大腸癌マーカ一
3. 6-phosphogluconolactonase、 Alphal acid glyco proteir Alpha-actinin 1、 Ap urinic endonuclease、 Calumenin、 Chaperanir Clathrin heavy chain 1、 Clathrin light p olypeptide A、 c-myc binding proteiru Complement factor H、 Cysteine rich intestinal pr otein 1、 F-box protein 40、 Fibrinogen gamma、 Fk506 Binding Protein Fkbp Mutant R 42kH87V COMPLEX WITH Immunosuppressant Fk506、 Guanine nucleotide binding pr otein (G protein), beta polypeptide 2-like 1、 Heat shock 70kD protein 9B、 Heparan su yyyps, ADPュaao 2.os frlike Ioc aldehde dea_lationhdnse2 Alhaainro ein 4---
丑簦ί:5厂 π^一 λ
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,Biisl¾SSか ¾¾。か6 ttTsldM. gypu ¾tzeteeeoototeip Ribonuclease刀 A familh_Onousュ tonuclerejn r- jm gyyyでps,.a orosomucoid 2 Tumor reeotion mntien 1lcltRNA snthetase Tils alh- yypyy ppppでp,/to te 0 lroten toseosatase recetor 1otein trosinehoshatase reoerjrin hh r--u
y p ();,,,ec!etcuocabetSi 3 tasactivatiedrotein > Galin 1 Rillin 1 vimnin EP2zxn _rni-u
qppP)p p,p,,eccotein 116 k Ubiuitin isoetidase T vitronectin XTF 120 U5 snF?NPsitir 10-- pg (pg),,,,,cb 3B subunit 3 slicir- faclor arinine/seiineュ ch 3s ot memer 2 slicin farp_- yp( ),,a 3aclator of dibasc and neutral amino acid transebe 5 Solute carrier fmilivi- mmr
y ( y;.utaeail 25mitochondrial canier adenine nucleotide translocatordolase Sole crrir fmr
-yy p,,,toooarotein S29¾ibosomelDindinDroein 1 S adenoslhomcsteine h S18 Ribsml-_..
p - p p,,ot3 ribosomalrotein RiosomalDrotein L4 RiCTOSOmalrotein 5 omalrein 111--_
gy;,,, /S ocene famil Rhodanesethiosulfate sulfuiasferase Rluos RAN memluer RAnolrni
gy,,,bnt RAB18 memCTer RAS oncoene famil R22A Radnroteasome suuiABixi P- y pgg,tootorelatedroten≤ variattoeubeC2iation inhibir farin m Min indcile en B Mr_- gyyp _pypp p p,,S,otattcan 2 HLAC hheticalDrotein FLJ38663 Llstinoletide M Ifaeroeol_-—- 、 Annexin A2 isoform 2、 ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F0 complex, s ubunit d isoform a、 ATP-binding cassette transporter family A member 12、 Calnexin、 Carbonic Anhydrase Form B、 Carbonyl reductase 1、 Cathepsin S、 cysteine rich protei n 1、 Dynein light chain 1、 Endoplasmic-reticulum-Iumenal protein 28、 Enoyl coenzyme hydrase,short chain 1 s Eukaryotic translation elongation factor 2、 Filamin B、 gelsolin i soform a、 Glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase^ GTP-binding protein R ab3B、 Haptoglobin^ Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A2、 Hydroxymethylglutar yl-CoA synthase, mitochondriaU Isocitrate dehydrogenase 1、 Lymphocyte cytosolic prat ein 1、 Major vault protein^ MGC15429 protein^ MHC class I antigen、 Myosin, heavy polypeptide 14、 Myozenin 3、 NADH Ubiquinone oxidoreductase subunit B13、 Normal mucosa of esophagus specific 1、 Olfactomedin 4、 phosphoenolpyruvate calboxykinase 2、 Phosphoglycerate mutase 1、 Proline arginine-rich end leucine-rich repeat protein p recursor、 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 2、 Protein P97、 P yridoxine 5-phosphate oxidase^ Raf kinase inhibitor protein、 Ras associated protein R ab5B、 Retinoblastoma binding protein 4、 succinate dehydrogenase complex, subunit A, ,flavoprotein、 Thioredoxin domain containing 5、 TNRC15 protein; Collagen, type XI V, alpha 1、 及び Desmoglein 2からなる群から選ばれるタンパク質を大腸癌マーカーとし て使用することによって、大腸癌の罹患を識別する方法。 6. 前記タンパク質の、 大腸癌の罹患を識別すべき対象となる個人に由来する試料 中におけるレベルを測定し、
得られた測定値レベルと、前記タンパク質の正常レベルとを比較し、
得られた測定値レベルが、前記正常レベルよリも減少していることを、前記対象となる 個人が大腸癌に罹患している可能性が高いことの指標の 1つとする、 請求の範囲第 5項に 記載の大腸癌の罹患を識別する方法。
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EP07744982A EP2028492A4 (en) 2006-06-05 2007-06-05 TUMOR MARKERS AND METHOD FOR DETERMINING THE IMPACT OF ANY CANNULAR DISEASE

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Cited By (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2011148669A1 (ja) * 2010-05-25 2011-12-01 株式会社 島津製作所 大腸がんマーカービトロネクチン、及び採血試料中のビトロネクチン濃度の分析方法
WO2011148668A1 (ja) * 2010-05-25 2011-12-01 株式会社 島津製作所 大腸がんマーカーガレクチン、採血試料中のガレクチン濃度の分析方法及び大腸がんマーカーガレクチン検出キット
CN102504021A (zh) * 2011-05-03 2012-06-20 中国人民解放军军事医学科学院放射与辐射医学研究所 Fbxl15蛋白及其抑制剂以及它们的应用
EP2092085B1 (de) * 2006-11-02 2014-04-09 Signature Diagnostics AG Prognostische marker für die klassifizierung des dreijährigen progressionsfreien überlebens von patienten mit kolorektalem karzinom basierend auf expressionsprofilen von biologischen proben
EP3444358A1 (en) * 2009-02-20 2019-02-20 Onconome, Inc. Methods for diagnosis and prognosis of colorectal cancer

Families Citing this family (18)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE102006056784A1 (de) * 2006-12-01 2008-06-05 Meyer, Helmut E., Prof.Dr. Biomarker für die Diagnose von Pankreaskrebs
WO2013002433A1 (ko) * 2011-06-29 2013-01-03 배재대학교 산학협력단 혈액을 이용한 유방암 진단 방법
KR101058230B1 (ko) * 2009-03-16 2011-08-22 배재대학교 산학협력단 티오레독신 1을 유효성분으로 하는 유방암 진단용 마커, 및이를 이용한 유방암 진단 키트
US9382587B2 (en) 2009-03-16 2016-07-05 Paichai University Industry-Academic Cooperation Foundation Diagnosis of breast cancer based on expression level of thioredoxin-1
EP2239577A1 (en) * 2009-04-07 2010-10-13 Vereniging voor Christelijk Hoger Onderwijs, Wetenschappelijk Onderzoek en Patiëntenzorg Protein-based methods and compositions for the diagnosis of colorectal adenocarcinoma
MX2011011958A (es) 2009-05-11 2012-02-13 Berg Biosystems Llc Metodos para el tratamiento de trastornos metabolicos utilizando cambiadores epimetabólicos, moléculas intracelulares multidimensionales o influenciadores ambientales.
GB0922085D0 (en) 2009-12-17 2010-02-03 Cambridge Entpr Ltd Cancer diagnosis and treatment
JP2011206049A (ja) 2010-03-08 2011-10-20 Sumio Sugano 壊死マーカー及びその用途
EP2576610A4 (en) * 2010-06-01 2014-03-05 Miraculins Inc BIOMARKERS FOR THE DIAGNOSIS AND TREATMENT OF DARM CANCER
DE102011008050A1 (de) * 2011-01-07 2012-07-12 Universitätsklinikum Schleswig-Holstein Verfahren zur Diagnose der familiären adenomatösen Polyposis (FAP)
KR101933732B1 (ko) 2011-04-04 2018-12-28 버그 엘엘씨 중추 신경 시스템 종양들의 치료 방법
US9869673B2 (en) 2011-04-15 2018-01-16 The Children's Medical Center Corporation Diagnostic markers and therapeutic targets of kawasaki disease
JP5805518B2 (ja) 2011-12-21 2015-11-04 株式会社島津製作所 マルチプレックス大腸がんマーカーパネル
EP2983654A4 (en) 2013-04-08 2016-11-30 Berg Llc TREATMENT OF CANCER USING COENZYME POLYTHERAPIES Q10
SG10201907816RA (en) 2013-09-04 2019-09-27 Berg Llc Methods of treatment of cancer by continuous infusion of coenzyme q10
CN104407151B (zh) * 2014-11-19 2016-06-08 汕头大学医学院 Kindlin-2,Myosin-9和Annexin II三蛋白联合预测食管鳞癌患者预后试剂盒
CN105044360A (zh) * 2015-07-22 2015-11-11 浙江大学医学院附属邵逸夫医院 Rbp4作为结直肠癌血清标记物的应用及诊断试剂盒
CN113252806B (zh) * 2021-03-25 2023-08-29 嘉兴学院 S-腺苷同型半胱氨酸在制备用于诊断或治疗川崎病的产品中的用途

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20030211498A1 (en) 2000-04-03 2003-11-13 Morin Patrice J Tumor markers in ovarian cancer
WO2004002950A1 (ja) 2002-06-28 2004-01-08 Shimadzu Corporation スルフェニル化合物、ラベル化試薬、及びペプチドの解析方法
US20060019256A1 (en) 2003-06-09 2006-01-26 The Regents Of The University Of Michigan Compositions and methods for treating and diagnosing cancer

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP1546731A2 (en) * 2002-09-30 2005-06-29 Oncotherapy Science, Inc. Method for treating or preventing metastasis of colorectal cancers
WO2004066941A2 (en) * 2003-01-24 2004-08-12 Bayer Pharmaceuticals Corporation Expression profiles for colon cancer and methods of use

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20030211498A1 (en) 2000-04-03 2003-11-13 Morin Patrice J Tumor markers in ovarian cancer
WO2004002950A1 (ja) 2002-06-28 2004-01-08 Shimadzu Corporation スルフェニル化合物、ラベル化試薬、及びペプチドの解析方法
US20060019256A1 (en) 2003-06-09 2006-01-26 The Regents Of The University Of Michigan Compositions and methods for treating and diagnosing cancer

Non-Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
ANTICANCER RESEARCH, vol. 24, no. 4, 2004, pages 2519 - 2530
MAKIGUCHI Y.: "Daichogan Shuyo Marker ni yoru Shindan", SOGO RINSHO, vol. 46, no. 2, 1997, pages 277 - 281 + ABSTR. NO. P279, XP003019779 *
RAPID COMMUN. MASS SPECTROM., vol. 17, 2003, pages 1642 - 1650
See also references of EP2028492A4
YIN G. ET AL.: "Alcohol Dassuisokoso ADH2, ADH3 oyobi Acetaldehyde Dassuisokoso ALDH2 Idenshi Tagata to Daichogan", FUKUOKA DAICHOGAN KENKYU, NIHON GAN GAKKAI GAKUJUTSU SOKAI KIJI, vol. 64TH, 2005, pages 347 + ABSTR. NO. W-574, XP003019780 *

Cited By (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP2092085B1 (de) * 2006-11-02 2014-04-09 Signature Diagnostics AG Prognostische marker für die klassifizierung des dreijährigen progressionsfreien überlebens von patienten mit kolorektalem karzinom basierend auf expressionsprofilen von biologischen proben
EP3444358A1 (en) * 2009-02-20 2019-02-20 Onconome, Inc. Methods for diagnosis and prognosis of colorectal cancer
WO2011148669A1 (ja) * 2010-05-25 2011-12-01 株式会社 島津製作所 大腸がんマーカービトロネクチン、及び採血試料中のビトロネクチン濃度の分析方法
WO2011148668A1 (ja) * 2010-05-25 2011-12-01 株式会社 島津製作所 大腸がんマーカーガレクチン、採血試料中のガレクチン濃度の分析方法及び大腸がんマーカーガレクチン検出キット
JPWO2011148669A1 (ja) * 2010-05-25 2013-07-25 株式会社島津製作所 大腸がんマーカービトロネクチン、及び採血試料中のビトロネクチン濃度の分析方法
JP5904939B2 (ja) * 2010-05-25 2016-04-20 株式会社島津製作所 大腸がんマーカーガレクチン、採血試料中のガレクチン濃度の分析方法及び大腸がんマーカーガレクチン検出キット
CN102504021A (zh) * 2011-05-03 2012-06-20 中国人民解放军军事医学科学院放射与辐射医学研究所 Fbxl15蛋白及其抑制剂以及它们的应用
CN102504021B (zh) * 2011-05-03 2014-05-28 中国人民解放军军事医学科学院放射与辐射医学研究所 Fbxl15蛋白及其抑制剂以及它们的应用

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