WO2006097631A1 - Procede et dispositif permettant d’isoler des microorganismes - Google Patents

Procede et dispositif permettant d’isoler des microorganismes Download PDF

Info

Publication number
WO2006097631A1
WO2006097631A1 PCT/FR2006/000578 FR2006000578W WO2006097631A1 WO 2006097631 A1 WO2006097631 A1 WO 2006097631A1 FR 2006000578 W FR2006000578 W FR 2006000578W WO 2006097631 A1 WO2006097631 A1 WO 2006097631A1
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
particles
microorganisms
medium
magnetic
microorganism
Prior art date
Application number
PCT/FR2006/000578
Other languages
English (en)
Inventor
Nicolas Bara
Thierry Bernardi
Original Assignee
Biofilm Control
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Biofilm Control filed Critical Biofilm Control
Priority to EP06743578A priority Critical patent/EP1859281A1/fr
Priority to BRPI0609830-4A priority patent/BRPI0609830A2/pt
Priority to CA002601366A priority patent/CA2601366A1/fr
Priority to US11/886,082 priority patent/US20080213856A1/en
Priority to AU2006224472A priority patent/AU2006224472A1/en
Priority to MX2007011380A priority patent/MX2007011380A/es
Publication of WO2006097631A1 publication Critical patent/WO2006097631A1/fr
Priority to NO20075157A priority patent/NO20075157L/no

Links

Classifications

    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/569—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for microorganisms, e.g. protozoa, bacteria, viruses
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/02—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms
    • C12Q1/24—Methods of sampling, or inoculating or spreading a sample; Methods of physically isolating an intact microorganisms
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/543—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with an insoluble carrier for immobilising immunochemicals
    • G01N33/54313—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with an insoluble carrier for immobilising immunochemicals the carrier being characterised by its particulate form
    • G01N33/54326—Magnetic particles
    • G01N33/54333—Modification of conditions of immunological binding reaction, e.g. use of more than one type of particle, use of chemical agents to improve binding, choice of incubation time or application of magnetic field during binding reaction

Definitions

  • the present invention relates to the isolation of microorganisms.
  • biofilms Many microorganisms develop by synthesizing a biofilm. In addition to bacteria, fungi, algae and protozoa are also organized in biofilms.
  • Biofilms are therefore ubiquitous in many areas for which they pose health risks and sometimes cause relatively significant damage.
  • Conditioning of the surface The organic or mineral molecules present in the liquid phase will adsorb on the surface, to form a "conditioning film”.
  • Adhesion or reversible adhesion The microorganisms present approach the surfaces by gravimetry, brownian movements or by chemotaxis if they possess flagella. During this first fixing step, involving only purely physical phenomena and weak physicochemical interactions, the microorganisms can still be easily unhooked.
  • - Adhesion This slower stage involves interactions of higher energy as well as microbial metabolism and cellular appendages of the microorganism (flagella, pilis, .7) • Adhesion is an active and specific phenomenon.
  • the first colonizers will attach irreversibly to the surface thanks to the synthesis of exopolysaccharides (EPS). This process is relatively slow and depends on environmental factors and microorganisms.
  • EPS exopolysaccharides
  • the maturation of the biofilm (development and colonization of the surface): After adhering to a surface, the bacteria multiply and regroup to form microcolonies surrounded by polymers. This matrix of polymers (or glycocalyx) will act as a "cement” and strengthen the association of bacteria with each other and with the surface to finally form a biofilm and reach a state of equilibrium.
  • the biofilm generally develops into a three-dimensional structure that constitutes a place of confinement. This microenvironment will be the site of many physiological and molecular changes with respect to the planktonic growth pattern.
  • the biofilm thus formed will occupy all the surface that is offered to him if the conditions allow it.
  • the maturation of the biofilm is correlated with the production of EPS even if certain species of microorganisms that do not synthesize or few polymers can also adhere and form biofilms on surfaces.
  • Biofilms are structures in perpetual dynamic equilibrium that evolve according to the support, the microorganisms and the environment. This evolution can be reflected by cell or aggregate detachments.
  • the adhesion and fixation property of the microorganisms is used to allow the isolation thereof.
  • the principle of the invention is to add in a crude sample, more or less liquid, a medium which we want to study the contamination by a microorganism, particles, particularly beads, magnetic or magnetizable, to leave the beads in contact with the medium for a time sufficient for the adhesion of microorganisms to the surface of the particles, to isolate said particles from the medium by any appropriate means, particularly with the aid of a magnet and to spread said particles on a solid culture medium suitable for culturing said microorganisms entrapped with the particles.
  • the subject of the invention is a process for isolating at least one microorganism from a medium containing them, comprising the following steps:
  • the method may comprise a preliminary step of pre-culturing the sampling of said medium containing the microorganism that is to be isolated.
  • the sample is brought to a temperature compatible with the viability of the microorganisms.
  • living microorganisms exist under extreme conditions in terms of temperature, partial pressure of gas (oxygen, nitrogen, carbon dioxide, etc.), salinity, pH (acid, basic) under oxido-reduction conditions and / or under aerobic or anaerobic conditions. From then on, the skilled person will adapt the culture temperature to the requirements of the organism that he cultivates.
  • culturing temperatures may be from 20 to 50 degrees Celsius, preferably from 30 to 40 degrees Celsius.
  • This preculture step which aims to enrich the culture medium with microorganisms can be carried out for a very variable time depending on the microorganisms, which can be between 20 minutes and 7 to 10 days, preferably between 1 and 48 hours, possibly with stirring.
  • the method may comprise an additional step interposed between steps c) and d) of the process according to the invention, consisting of the optional immersion of the beads obtained in step c ) in an advantageously aqueous rinsing solution for removing the previous medium and for removing non-adherent microorganisms (present in the ball imbibition liquid).
  • This step makes it possible to select the most adherent microorganisms whose adhesion is the most irreversible.
  • This step can also be the occasion of rapid or prolonged treatments for testing the adhesion properties of microorganisms (preventive or curative treatments in the rinsing solution).
  • the skilled person can easily determine the amount of beads that he introduced into the environment.
  • step b) the incubation of step b) continues for a time that can be between a few seconds and a few hours, preferably between 15 seconds and 45 minutes depending on the microorganisms.
  • the microorganisms could adhere to the particles (beads).
  • the separation of the particles and the medium in step c) can be carried out according to any method known to those skilled in the art.
  • these particles could be removed by centrifugation and elimination of the culture medium, or alternatively, and preferably according to the invention, by using a system generating a magnetic or electrical field capable of attracting particles, particularly a magnet.
  • the particles are removed by means of a magnet, which is advantageously immersed in the sample.
  • the system generating a magnetic or electrical field capable of attracting particles, particularly a magnet may be protected by any system, particularly a removable cover or cover, made of any material, for example plastic , which does not interfere with magnetic or electric waves. Even more advantageously, said hood is disposable after use. We could then reuse this magnet.
  • the method may comprise an additional step of washing the system generating a magnetic or electric field in order to eliminate the non-adherent microorganisms present in the wetting liquid, or the weakly adherent microorganisms.
  • said system is immersed in a wash solution which may, for example, be sterile culture medium.
  • a wash solution which may, for example, be sterile culture medium.
  • the spreading of said particles on a support compatible with the development of the microorganisms can be carried out by depositing said particles on the surface of a microorganism culture device, for example a Petri dish containing a suitable culture medium. to the development of microorganisms.
  • a microorganism culture device for example a Petri dish containing a suitable culture medium.
  • the deposit can be made by removing the magnet from the plastic cover while bringing the plastic cover closer to the surface of the microorganism culture device.
  • the beads can be deposited using another magnet placed under the surface of the culture device.
  • any system known to those skilled in the art such as for example a manual spreader, may be used.
  • a rotating magnet placed under the surface of the microorganism culture device is used.
  • the dispersion of the beads can also be obtained by a liquid vortex generated by the rotation of the microorganism culture device.
  • the culture device is placed in an incubator for a time sufficient for the development of microorganisms on the surface of the device.
  • a person skilled in the art will adapt the incubation time and the temperature to the microorganism that he wishes to isolate. This time can be between a few hours and several days, preferably between 4 hours and 48 hours.
  • the incubation temperature may be between 30 and 40 degrees Celsius.
  • Figure 1 represents a comparison of traditional methods of sampling microorganisms (A) and the method according to the invention (B);
  • Figure 2 shows the steps of sampling and rinsing particles
  • Figure 3 shows the deposition of particles on the surface of a Petri dish
  • Figure 4 shows the dispersion of the particles on the surface of the petri dish using a rotating magnet.

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
  • Immobilizing And Processing Of Enzymes And Microorganisms (AREA)
  • Coating Of Shaped Articles Made Of Macromolecular Substances (AREA)

Abstract

L'invention a pour objet une nouvelle méthode d'isolement de microorganisme basée sur la capacité desdits microorganisme à adhérer à la surface de particules.

Description

PROCEDE ET DISPOSITIF PERMETTANT D1ISOLER
DES MICROORGANISMES
La présente invention se rapporte à l ' isolement des microorganismes .
Nombre de microorganismes se développent en synthétisant un biofilm. Outre les bactéries, les champignons, les algues, les protozoaires s'organisent également en biofilms .
Les biofilms sont donc omniprésents dans de nombreux domaines pour lesquels ils présentent des risques sanitaires et causent parfois des dommages relativement importants .
Lorsqu'un biofilm se développe, il y a d'abord adhésion des bactéries sur un support puis colonisation de ce support. Les bactéries en se multipliant forment rapidement un film constitué par des strates de corps cellulaires sécrétant une gangue d'exopolysaccharide qui les protège des agressions du milieu environnant (COSTERTON et al., Science, vol.284 ( 5418 ), p : 1318-22, 1999). La cinétique de formation d'un biofilm peut être subdivisée en 5 étapes (figure 1):
Conditionnement de la surface : Les molécules organiques ou minérales présentes dans la phase liquide vont s'adsorber sur la surface, pour y former un « film conditionnant » .
- L' adhérence ou adhésion réversible : Les microorganismes présents se rapprochent des surfaces par gravimétrie, mouvements browniens ou par chimiotactisme s'ils possèdent des flagelles. Au cours de cette première étape de fixation, faisant intervenir uniquement des phénomènes purement physiques et des interactions physicochimiques faibles, les microorganismes peuvent encore être facilement décrochés. - L'adhésion : Cette étape plus lente fait intervenir des interactions de plus forte énergie ainsi que le métabolisme microbien et les appendices cellulaires du microorganisme (flagelles, pilis ,....)• L'adhésion est un phénomène actif et spécifique. Les premiers colonisateurs vont s'attacher de manière irréversible à la surface grâce notamment à la synthèse d'exopolysaccharides (EPS). Ce processus est relativement lent et dépend des facteurs environnementaux et des microorganismes en présence.
- La maturation du biofilm (développement et colonisation de la surface) : Après avoir adhéré à une surface, les bactéries se multiplient et se regroupent pour former des microcolonies entourées de polymères. Cette matrice de polymères (ou glycocalyx) va agir comme un « ciment » et renforcer l'association des bactéries entre- elles et avec la surface pour finalement former un biofilm et atteindre un état d'équilibre. Le biofilm se développe généralement en une structure tridimensionnelle qui constitue un lieu de confinement. Ce micro-environnement va être le siège de nombreuses modifications physiologiques et moléculaires par rapport au mode de croissance planctonique . Le biofilm ainsi formé va occuper toute la surface qui lui est offerte si les conditions le lui permettent. Généralement la maturation du biofilm est corrélée à la production d'EPS même si certaines espèces de microorganismes ne synthétisant pas ou peu de polymères peuvent également adhérer et former des biofilms sur des surfaces.
- Décrochement ; Les biofilms sont des structures en perpétuel équilibre dynamique qui évoluent en fonction du support, des microorganismes et de l'environnement. Cette évolution peut se traduire par des décrochements de cellules ou d'agrégats.
Selon la présente invention, la propriété d'adhésion et de fixation des microorganismes est utilisée pour permettre l'isolement de ceux-ci. Le principe de l'invention consiste à ajouter dans un prélèvement brut, plus ou moins liquide, d'un milieu dont on veut étudier la contamination par un microorganisme, des particules, particulièrement des billes, magnétiques ou magnétisables, à laisser les billes en contact avec le milieu pendant un temps suffisant à l'adhésion des microorganismes à la surface des particules, à isoler lesdites particules du milieu par tout moyen approprié, particulièrement à l'aide d'un aimant et à étaler lesdites particule sur un milieu de culture solide adéquat afin de réaliser une culture desdits microorganismes piégés avec les particules.
Ainsi l'invention à pour objet un procédé d'isolement d'au moins un microorganisme à partir d'un milieu les contenant, comprenant les étapes suivantes :
a) introduction dans un prélèvement dudit milieu d'une quantité donnée de particules magnétiques ou magnétisables
b) incubation des particules et du milieu pendant un temps suffisant à l ' adhésion des microorganismes à la surface desdites particules ;
c) séparation desdites particules du milieu
d) étalement desdites particules sur un support compatible avec le développement des microorganismes ;
e) incubation desdites particules sur un support pendant un temps suffisant au développement de colonies correspondant au microorganisme isolé.
Selon un mode de réalisation particulier de l'invention, le procédé peut comprendre une étape préalable de pré-culture du prélèvement dudit milieu contenant le microorganisme que l'on veut isoler. Pour cela on porte ledit prélèvement à une température compatible avec la viabilité des microorganismes. On sait parfaitement que, outre les organismes vivants à des températures classiques (20 à 50 degrés Celsius), il existe des microorganismes vivants dans des conditions extrêmes en températures, en pression partielle de gaz (Oxygène, Azote, gaz carbonique, ...) , en salinité, en pH (acide, basique), en conditions d'oxydo-réductions et/ou en conditions aérobies ou anaérobies. Dès Lors, l'Homme du Métier adaptera la température de culture aux exigences de l'organisme qu'il cultive. De la manière la plus courante, les températures de culture peuvent être comprises entre 20 et 50 degrés Celsius, de préférence entre 30 et 40 degrés Celsius. Cette étape de préculture qui a pour objectif d'enrichir le milieu de culture en microorganismes peut s ' effectuer pendant un temps très variable en fonction des microorganismes, qui peut-être compris entre 20 minutes et 7 à 10 jours, de préférence entre 1 et 48 heures, éventuellement sous agitation.
Selon encore un autre mode de réalisation particulier de l'invention, le procédé peut comprendre une étape supplémentaire intercalée entre les étapes c) et d) du procédé selon l'invention, consistant en l'immersion facultative des billes obtenues à l'étape c) dans une solution de rinçage avantageusement aqueuse permettant d'éliminer le précédent milieu et permettant d'éliminer les microorganismes non adhérents (présents dans le liquide d'imbibition des billes). Cette étape permet de sélectionner les microorganismes les plus adhérents et dont l'adhésion est la plus irréversible. Cette étape peut aussi être l'occasion de traitements rapides ou prolongés pour tester les propriétés d'adhésion des microorganismes (traitements préventifs ou curatifs dans la solution de rinçage).
L'Homme du Métier sait déterminer sans difficulté la quantité de billes qu'il introduit dans le milieu.
Selon l'invention, l'incubation de l'étape b) se poursuit pendant un temps qui peut être compris entre quelques secondes et quelques heures, de préférence entre 15 secondes et 45 minutes en fonction des microorganismes.
Après ce temps d'incubation, les microorganismes ont pu adhérer sur les particules (billes).
Selon l'invention, la séparation des particules et du milieu à l'étape c) peut être réalisée selon toute méthode connue de l'Homme du Métier. Par exemple, on pourrait prélever ces particules par centrifugation et élimination du milieu de culture, ou encore, et préférentiellement selon l'invention, en utilisant un système générant un champ magnétique ou électrique capable d'attirer les particules, particulièrement un aimant. Selon cette forme de réalisation particulièrement préférée, les particules sont prélevées à l'aide d'un aimant, lequel est avantageusement plongé dans le prélèvement.
Selon un mode de réalisation avantageux, le système générant un champ magnétique ou électrique capable d'attirer les particules, particulièrement un aimant, peut être protégé par tout système, particulièrement un revêtement amovible ou un capot, réalisé en tout matériau, par exemple du plastique, qui n'interfère pas avec les ondes magnétiques ou électriques. Encore plus avantageusement, ledit capot est jetable après utilisation. On pourrait alors réutiliser cet aimant.
Selon encore un mode de réalisation particulier de l'invention, le procédé peut comporter une étape supplémentaire de lavage du système générant un champ magnétique ou électrique afin d'éliminer les microorganismes non adhérents présents dans le liquide de mouillage, ou les microorganismes faiblement adhérents . Au cours de cette étape supplémentaire, on plonge ledit système dans une solution de lavage qui peut, par exemple, être du milieu de culture stérile. L'Homme du Métier comprend que cette étape en principe ne dure pas plus de quelques secondes, tout au plus quelques minutes, le temps nécessaires à l'élimination des microorganismes non-adhérents à la surface du système.
Selon l'invention, l'étalement desdites particules sur un support compatible avec le développement des microorganismes peut être réalisé par dépôt desdites particules à la surface d'un dispositif de culture de microorganisme, par exemple une boîte de Pétri contenant un milieu de culture adéquat au développement des microorganismes .
Selon un mode de réalisation particulier, le dépôt peut-être réalisé en retirant l'aimant du capot plastique tout en rapprochant le capot plastique de la surface du dispositif de culture de microorganismes.
Selon un autre mode de réalisation de l'invention, les billes peuvent être déposées en utilisant un autre aimant placé sous la surface du dispositif de culture.
Pour étaler et disperser les billes, on peut utiliser tout système connu de l'Homme du Métier, comme par exemple un étaleur manuel. Selon un mode de réalisation particulier, on utilise un aimant rotatif placé sous la surface du dispositif de culture de microorganismes.
La dispersion des billes peut être obtenue aussi par un vortex liquide généré par la rotation dispositif de culture de microorganisme.
Une fois les particules (billes) dispersées, le dispositif de culture est placé dans un incubateur pendant un temps suffisant au développement des microorganismes à la surface du dispositif. Ici, l'Homme du métier adaptera le temps d'incubation et la température au microorganisme qu'il désire isoler. Ce temps peut être compris entre quelques heures et plusieurs jours, de préférence entre 4 heures et 48 heures. La température d'incubation peut être comprise entre 30 et 40 degrés Celsius. D ' autres avantages de l ' invention apparaîtront dans les figures annexées dans lesquelles :
• la figure 1 représente une comparaison des méthodes traditionnelles de prélèvement des microorganismes (A) et la méthode selon l'invention (B) ;
• la figure 2 représente les étapes de prélèvement et de rinçage des particules ;
• la figure 3 représente le dépôt des particules à la surface d'une boîte de Pétri ;
• la figure 4 représente la dispersion des particules à la surface de la boîte de Pétri à l'aide d'un aimant rotatif .

Claims

REVENDICATIONS
1. Un procédé d'isolement d'au moins un microorganisme à partir d'un milieu les contenant, comprenant les étapes suivantes :
a) introduction dans un prélèvement dudit milieu d'une quantité donnée de particules magnétiques ou magnétisables ;
b) incubation des particules et du milieu pendant un temps suffisant au développement et à l'adhésion des microorganismes à la surface desdites particules ;
c ) séparation desdites particules du milieu ;
d) étalement desdites particules sur un support compatible avec le développement des microorganismes ;
e) incubation desdites particules sur un support pendant un temps suffisant au développement de colonies correspondant au microorganisme isolé.
2. Le procédé selon la revendication 1, caractérisé en ce qu'il comprend en outre une étape préalable de pré-culture du prélèvement dudit milieu contenant le microorganisme que l'on veut isoler, éventuellement sous agitation.
3. Le procédé selon la revendication 2, caractérisé en ce que l'on porte ledit prélèvement à une température compatible avec la viabilité des microorganismes, particulièrement à une température comprise entre 20 et 50 degrés Celsius, de préférence entre 30 et 40 degrés Celsius.
4. Le procédé selon la revendication 2, caractérisé en ce que l'étape de pré-culture à une durée comprise entre 20 minutes et 10 jours, de préférence entre 1 heure et 48 heures.
5. Le procédé selon l ' une quelconque des revendications 1 à
4, caractérisé en ce qu'il comprend en outre une étape supplémentaire entre les étapes c) et d) , consistant en l'immersion facultative des billes obtenues à l'étape c) dans une solution de rinçage avantageusement aqueuse.
6. Le procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à
5, caractérisé en ce que l'incubation de l'étape b) se poursuit pendant un temps qui peut être compris entre quelques secondes et quelques heures, de préférence entre 15 secondes et 45 minutes en fonction des microorganismes.
7. Le procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à
6, caractérisé en ce que la séparation des particules et du milieu à l'étape c) est réalisée par centrifugation et élimination du milieu de culture, ou encore en utilisant un système générant un champ magnétique ou électrique capable d'attirer les particules.
8. Le procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à
6, caractérisé en ce que la séparation des particules et du milieu à l'étape c) est réalisée à l'aide d'un aimant.
9. Le procédé selon la revendication 8, caractérisé en ce que l'aimant est plongé dans le prélèvement.
10. Le procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à
7, caractérisé en ce que le système générant un champ magnétique ou électrique capable d'attirer les particules, est protégé, particulièrement par un revêtement amovible, ou un capot.
11. Le procédé selon la revendication 10, caractérisé en ce que ledit revêtement amovible ou capot est jetable.
12. Le procédé selon l'une quelconque des revendications 7 à 10, caractérisé en ce qu'il comporte une étape supplémentaire de lavage du système générant un champ magnétique ou électrique.
PCT/FR2006/000578 2005-03-15 2006-03-15 Procede et dispositif permettant d’isoler des microorganismes WO2006097631A1 (fr)

Priority Applications (7)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP06743578A EP1859281A1 (fr) 2005-03-15 2006-03-15 Procede et dispositif permettant d'isoler des microorganismes
BRPI0609830-4A BRPI0609830A2 (pt) 2005-03-15 2006-03-15 processo de isolamento de pelo menos um microorganismo
CA002601366A CA2601366A1 (fr) 2005-03-15 2006-03-15 Procede et dispositif permettant d'isoler des microorganismes
US11/886,082 US20080213856A1 (en) 2005-03-15 2006-03-15 Method and Device for Isolating Micro-Organisms
AU2006224472A AU2006224472A1 (en) 2005-03-15 2006-03-15 Method and device for isolating micro-organisms
MX2007011380A MX2007011380A (es) 2005-03-15 2006-03-15 Metodo y dispositivo que permite aislar microorganismos.
NO20075157A NO20075157L (no) 2005-03-15 2007-10-10 Fremgangsmate og innretning for a isolere mikroorganismer

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FR0502553 2005-03-15
FR0502553A FR2883296B1 (fr) 2005-03-15 2005-03-15 Procede et dispositif permettant d'isoler les microorganismes

Publications (1)

Publication Number Publication Date
WO2006097631A1 true WO2006097631A1 (fr) 2006-09-21

Family

ID=35276220

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/FR2006/000578 WO2006097631A1 (fr) 2005-03-15 2006-03-15 Procede et dispositif permettant d’isoler des microorganismes

Country Status (11)

Country Link
US (1) US20080213856A1 (fr)
EP (1) EP1859281A1 (fr)
CN (1) CN101156070A (fr)
AU (1) AU2006224472A1 (fr)
BR (1) BRPI0609830A2 (fr)
CA (1) CA2601366A1 (fr)
FR (1) FR2883296B1 (fr)
MX (1) MX2007011380A (fr)
NO (1) NO20075157L (fr)
RU (1) RU2007137792A (fr)
WO (1) WO2006097631A1 (fr)

Families Citing this family (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
FR2866707A1 (fr) * 2004-02-23 2005-08-26 Thierry Bernardi Procede et dispositif permettant de detecter la formation et le developpement de biofilms dans un milieu de culture
FR2962221A1 (fr) * 2010-07-02 2012-01-06 Biofilm Control Procede de detection d'interactions moleculaires
EP2646564A4 (fr) * 2010-12-03 2014-05-07 Blood Cell Storage Inc Procédés d'isolement de microorganismes
FR3056929B1 (fr) * 2016-09-30 2021-01-22 Univ Claude Bernard Lyon Dispositif de nettoyage d’au moins un biofilm et procede de nettoyage dudit au moins un biofilm

Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5491068A (en) * 1991-02-14 1996-02-13 Vicam, L.P. Assay method for detecting the presence of bacteria
WO2000001462A1 (fr) * 1998-07-01 2000-01-13 The Board Of Governors For Higher Education, State Of Rhode Island And Providence Plantations Dispositif continu a paroi rotative avec gradient de champ magnetique hybride pour perfectionnement des separations par affinite magnetique colloidale
EP1118676A2 (fr) * 2000-01-21 2001-07-25 Chemagen AG Méthode pour l'isolation des cellules
WO2004003231A2 (fr) * 2002-07-01 2004-01-08 Sinvent As Fixation d'une substance cible
US20040224359A1 (en) * 2002-04-12 2004-11-11 Madonna Angelo J. Method for detecting low concentrations of a target bacterium that uses phages to infect target bacterial cells
US20050019827A1 (en) * 2001-10-09 2005-01-27 Sabine Diller Method for unspecific enrichment of bacterial cells

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2004111264A1 (fr) * 2003-06-13 2004-12-23 University Technologies International Inc. Essai de biofilm bacterien utilisant des billes magnetiques
FR2866707A1 (fr) * 2004-02-23 2005-08-26 Thierry Bernardi Procede et dispositif permettant de detecter la formation et le developpement de biofilms dans un milieu de culture

Patent Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5491068A (en) * 1991-02-14 1996-02-13 Vicam, L.P. Assay method for detecting the presence of bacteria
WO2000001462A1 (fr) * 1998-07-01 2000-01-13 The Board Of Governors For Higher Education, State Of Rhode Island And Providence Plantations Dispositif continu a paroi rotative avec gradient de champ magnetique hybride pour perfectionnement des separations par affinite magnetique colloidale
EP1118676A2 (fr) * 2000-01-21 2001-07-25 Chemagen AG Méthode pour l'isolation des cellules
US20050019827A1 (en) * 2001-10-09 2005-01-27 Sabine Diller Method for unspecific enrichment of bacterial cells
US20040224359A1 (en) * 2002-04-12 2004-11-11 Madonna Angelo J. Method for detecting low concentrations of a target bacterium that uses phages to infect target bacterial cells
WO2004003231A2 (fr) * 2002-07-01 2004-01-08 Sinvent As Fixation d'une substance cible

Non-Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
MITCHELL B A ET AL: "Use of immunomagnetic capture on beads to recover Listeria from environmental samples", JOURNAL OF FOOD PROTECTION, vol. 57, no. 8, August 1994 (1994-08-01), pages 743 - 745, XP009059144, ISSN: 0362-028X *
SAFARIK, I. ET AL.: "The application of magnetic separations in applied microbiology; equipment and procedures, applications in immuno-magnetic separation, and detection procedures, and use in waste-water treatment, immobilization, etc", JOURNAL OF APPLIED BACTERIOLOGY, OXFORD, GB, vol. 78, no. 6, 1995, pages 575 - 585, XP002096125 *
See also references of EP1859281A1 *
ZBOROWSKI M ET AL: "Quantitative separation of bacteria in saline solution using lanthanide Er(III) and a magnetic field.", JOURNAL OF GENERAL MICROBIOLOGY, vol. 138, no. 1, January 1992 (1992-01-01), pages 63 - 68, XP001247249, ISSN: 0022-1287 *

Also Published As

Publication number Publication date
FR2883296A1 (fr) 2006-09-22
MX2007011380A (es) 2008-03-18
CN101156070A (zh) 2008-04-02
FR2883296B1 (fr) 2007-05-18
BRPI0609830A2 (pt) 2010-04-27
NO20075157L (no) 2007-10-10
AU2006224472A1 (en) 2006-09-21
EP1859281A1 (fr) 2007-11-28
CA2601366A1 (fr) 2006-09-21
RU2007137792A (ru) 2009-04-20
US20080213856A1 (en) 2008-09-04

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Salama et al. Characterization, structure, and function of extracellular polymeric substances (EPS) of microbial biofilm in biological wastewater treatment systems: a review
McLandsborough et al. Biofilms: at the interface between biophysics and microbiology
Khan et al. Experimental and theoretical examination of surface energy and adhesion of nitrifying and heterotrophic bacteria using self-assembled monolayers
Xue et al. Impact of chlorine disinfection on redistribution of cell clusters from biofilms
Aldred et al. The effects of a serine protease, Alcalase®, on the adhesives of barnacle cyprids (Balanus amphitrite)
Pires et al. Online monitoring of biofilm growth and activity using a combined multi-channel impedimetric and amperometric sensor
Srinandan et al. Nutrients determine the spatial architecture of Paracoccus sp. biofilm
Dzionek et al. Fluorescein diacetate hydrolysis using the whole biofilm as a sensitive tool to evaluate the physiological state of immobilized bacterial cells
Fletcher Bacterial biofilms and biofouling
EP1859281A1 (fr) Procede et dispositif permettant d'isoler des microorganismes
US20120178137A1 (en) Cell-mediated silica sol-gel encapsulation of living cells and tissues
Liu et al. Bioluminescent nanopaper for rapid screening of toxic substances
Villalobos et al. A BOD monitoring disposable reactor with alginate-entrapped bacteria
Wadhawan et al. A new method to determine initial viability of entrapped cells using fluorescent nucleic acid staining
Nagano et al. Cold-adapted yeasts in deep-sea environments
Ebrahimi et al. A microbial biosensor for hydrogen sulfide monitoring based on potentiometry
Wagner et al. Initial phases of microbial biofilm formation on opaque, innovative anti‐adhesive surfaces using a modular microfluidic system
Sun et al. Monitoring early stages of bacterial adhesion at silica surfaces through image analysis
Vázquez-Nion et al. Response surface optimization of a method for extracting extracellular polymeric substances (EPS) from subaerial biofilms on rocky substrata
Aiyer et al. An improvised microtiter dish biofilm assay for non-invasive biofilm detection on microbial fuel cell anodes and studying biofilm growth conditions
Prieur et al. Piezophilic prokaryotes
Zhang et al. Surface thiolation of silicon for antifouling application
Roy et al. Methods of sample preparation and assay of bacterial biofilms with special reference to their significance in agriculture and extreme environments
Albayrak et al. A novel glutamine biosensor based on zinc oxide nanorod and glutaminase enzyme from Hypocria jecorina
Moldoveanu Environmental factors influences on bacterial biofilms formation.

Legal Events

Date Code Title Description
121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application
WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 2006743578

Country of ref document: EP

WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 2601366

Country of ref document: CA

WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: MX/a/2007/011380

Country of ref document: MX

Ref document number: 200680008409.1

Country of ref document: CN

NENP Non-entry into the national phase

Ref country code: DE

WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 561689

Country of ref document: NZ

WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 1497/MUMNP/2007

Country of ref document: IN

WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 2006224472

Country of ref document: AU

WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 2007137792

Country of ref document: RU

ENP Entry into the national phase

Ref document number: 2006224472

Country of ref document: AU

Date of ref document: 20060315

Kind code of ref document: A

WWP Wipo information: published in national office

Ref document number: 2006224472

Country of ref document: AU

WWP Wipo information: published in national office

Ref document number: 2006743578

Country of ref document: EP

WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 11886082

Country of ref document: US

ENP Entry into the national phase

Ref document number: PI0609830

Country of ref document: BR

Kind code of ref document: A2