WO1995030759A1 - Polypeptides biologiquement actifs inseres dans une albumine - Google Patents

Polypeptides biologiquement actifs inseres dans une albumine Download PDF

Info

Publication number
WO1995030759A1
WO1995030759A1 PCT/FR1995/000520 FR9500520W WO9530759A1 WO 1995030759 A1 WO1995030759 A1 WO 1995030759A1 FR 9500520 W FR9500520 W FR 9500520W WO 9530759 A1 WO9530759 A1 WO 9530759A1
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
polypeptide
albumin
sequence
active part
seq
Prior art date
Application number
PCT/FR1995/000520
Other languages
English (en)
Inventor
Jérôme BECQUART
Emmanuel Conseiller
Jean-Dominique Guitton
Florence Hardy
Patrice Yeh
Original Assignee
Rhone-Poulenc Rorer S.A.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Rhone-Poulenc Rorer S.A. filed Critical Rhone-Poulenc Rorer S.A.
Publication of WO1995030759A1 publication Critical patent/WO1995030759A1/fr

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/76—Albumins
    • C07K14/765—Serum albumin, e.g. HSA
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/80—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi
    • C12N15/81—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi for yeasts
    • C12N15/815—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi for yeasts for yeasts other than Saccharomyces
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2319/00—Fusion polypeptide

Definitions

  • the present invention relates to new biologically active polypeptides, their preparation and pharmaceutical compositions containing them.
  • polypeptides Although having one or more potential therapeutic activities, many polypeptides unfortunately cannot be exploited pharmaceutically. This can have different reasons, such as in particular their low stability in vivo, their complex or fragile structure, the difficulty of producing them on an industrially acceptable scale, etc. Similarly, certain polypeptides do not give the expected results in vivo due administration, packaging, pharmacokinetics, etc. problems
  • the object of the present invention is precisely to remedy these drawbacks. It aims in particular at the development of biologically active artificial proteins allowing optimal exploitation, therapeutically, of the biological properties of these polypeptides.
  • the present invention relates to a recombinant polypeptide comprising at least one active part derived from a polypeptide, natural or artificial, biologically active, genetically inserted in an albumin or one of its variants or derivatives.
  • albumin variant is meant according to the present invention any protein with high plasma half-life obtained by modification, using genetic engineering techniques, of a gene coding for a given isomorph of the human serum albumin, as well as any macromolecule with a high plasma half-life obtained by in vitro modification of the protein encoded by such genes.
  • Modification means any mutation, substitution, deletion, addition or modification of a genetic and / or chemical nature). Since albumin is very polymorphic, many natural variants have been identified and listed [Weitkamp LR et al., Ann. Hmm. Broom. 32 (1973) 219].
  • albumin derivatives are more particularly molecules comprising all or part of the albumin, fused where appropriate to at least one polypeptide sequence originating from a natural or artificial gene, itself endowed or not a biological activity.
  • albumin In the rest of the description, the different types of albumin explained above are commonly referred to as albumin.
  • the term active part is understood to mean a part having an activity which can either be direct (treatment of diseases, diagnosis, biological research, sensors, etc.), or indirect (for example usable in the prevention of diseases, in vaccine design, in medical imaging techniques etc.).
  • the active parts of biologically active polypeptides, inserted according to the invention, are preferably of therapeutic interest.
  • the polypeptides having a therapeutic activity can be of human origin or not.
  • Mention may be made, as representative of polypeptides of non-human origin, of peptides or their derivatives, having properties potentially useful in pathologies of the blood and interstitial compartments, such as hirudin, trigramine, antistatin, anticoagulant peptides. ticks (TAP), arietine, applagine etc ...
  • the polypeptide having a therapeutic activity is a polypeptide of human origin or a molecular variant.
  • it may be all or part of an enzyme, an enzyme inhibitor, an antigen, an antibody, a hormone, a receptor, a factor speaker in the control of coagulation, of an interferon, of a cytokine [the interleukins, but also their natural antagonist variants of their attachment to the receptor (s), cytokines of the SIS type (small induced secreted) and by example inflammatory proteins of macrophages (MIPs), etc.], of a growth and / or differentiation factor [and for example transforming growth factors (TGFs), differentiation factors of blood cells (erythropoietin, M-CSF, G-CSF, GM-CSF etc.), insulin and similar growth factors (IGFs), or cellular permeability factors (VPF VEGF), etc.], factor involved in the genesis / resorption of bone tissue (OIF and osteos
  • TGFs transforming growth factors
  • the active part of the polypeptides of the invention may consist of the entire biologically active polypeptide or of a structure derived therefrom or even correspond to an unnatural peptide sequence, isolated for example from random peptide libraries.
  • the term “derivative structure” means any polypeptide obtained by modification and retaining biological activity. Modification means any mutation, substitution, deletion, addition or modification of a genetic and / or chemical nature.
  • Such derivatives can be generated for different purposes, such as that in particular that of increasing the affinity of the molecule for its binding sites, that of improving its production levels, that of increasing its resistance to proteases, that of increasing its therapeutic efficacy or even of reducing its side effects , or to give it new biological properties.
  • the chimeric polypeptides of the invention have pharmacokinetic properties and a biological activity which can be used for the prevention or treatment of diseases.
  • polypeptides of the invention are those in which the active part has: • (a) the entire peptide structure or,
  • the molecules in which certain N- or O-glycosylation sites have been modified or deleted the molecules in which one or more residues have been substituted, or the molecules in which all cysteine residues have been substituted. Mention may also be made of molecules obtained from (a) by deletion of regions which play little or no part in the interaction with the binding sites under consideration, or which express an undesirable activity, and molecules comprising with respect to (a) additional residues, such as for example an N-terminal methionine and / or a secretion signal and / or a junction peptide.
  • the object of the present invention is particularly advantageous for active peptides too small to form a structural domain and / or not having good stability in vivo and / or good bioavailability.
  • the proposed insertion according to the invention makes it possible to associate them with one or more pre-existing domain (s) of albumin and thus to benefit from the bioavailability and the in vivo stability thereof.
  • the size of the active parts inserted into albumin varies between three to twenty five amino acid residues. However, sequences ranging from 1 residue to 100 residues can also be used.
  • the insertion of an active portion of peptide into the peptide sequence of albumin is carried out according to the invention so as to satisfy the following two conditions:
  • albumin It must be preserved at said active part, inserted within albumin, sufficient accessibility in order to keep it intact its biological activity. Furthermore, the structure of albumin must not undergo too great a destabilization which would of course be detrimental to the recombinant polypeptide called the chimera.
  • the insertion sites are preferably selected from albumin while respecting the previous requirements.
  • albumin is formed from the repetition of 3 domains each comprising two subdomains and it contains more than 67% of alpha helices. Each of the domains is superimposable on the others and is formed by 10 helices denoted by h1 to h10.
  • Subdomain A includes helices h1 to h6 and subdomain B, helices h7 to h10. Each subdomain is formed by a common motif: h1, h2, h3, h4 for domain A and h7, h8, h9 and MO for domain B.
  • the small additional helices h5 and h6 are linked by a disulfide bridge to the subdomain A.
  • Figure 1 shows schematically the structure of human albumin.
  • the insertion sites are preferably located in the regions of albumin presumed to form regions exposed on the surface of the molecule, these regions preferably being loops.
  • - region 5 which extends from residue 57 to 62 and which corresponds to a loop connecting the two helices h3 and h4 ;
  • An active part of biologically active peptide can be inserted in three different modes into the peptide sequence of albumin. - It can be a strict insertion consisting of a simple addition of the sequence of the peptide of interest in the original sequence of albumin which is preserved in its entirety.
  • the insertion may correspond to a substitution of a portion of the peptide sequence of albumin by the peptide sequence corresponding to the active part of the peptide of interest.
  • the active part of a biologically active peptide can be repeated several times in the chimera in the same place and / or in different regions of albumin.
  • different active parts either derived from the same peptide or from different peptides.
  • an active part of the peptides according to the invention can be inserted either strictly within albumin or surrounded by junction sequences.
  • junction sequences may in particular be peptide sequences rich in glycine residues and / or in serine residues and / or in threonine residues and / or any amino acid residue described as frequently encountered in the zones flexibility in proteins.
  • the recombinant polypeptides of the invention prove to be very particularly advantageous.
  • polypeptides of the invention can be expressed (and preferably secreted) by recombinant organisms, at levels allowing their industrial exploitation.
  • Another subject of the invention relates to a process for the preparation of the chimeric molecules described above. More specifically, this method consists in causing a eukaryotic or prokaryotic cellular host to express a nucleotide sequence coding for an active part of a desired polypeptide, then in collecting the produced polypeptide.
  • a eukaryotic or prokaryotic cellular host which can be used in the context of the present invention, mention may be made of animal cells, yeasts, or fungi.
  • yeasts mention may be made of yeasts of the genus Saccharomyce * ?, Kluweromvces. Pichia. Schwanniomvces. or Hansenula.
  • COS As regards animal cells, mention may be made of COS, CHO, CI27 cells, etc.
  • fungi capable of being used in the present invention there may be mentioned more particularly Aspergillus ssp. or Trichoderma ssp.
  • bacteria such as Escherichia coli. or belonging to the genera C-orvnebacterium. Bacillus. or StreptQmyceS-
  • nucleotide sequences which can be used in the context of the present invention can be prepared in different ways. Generally, they are obtained by assembling in the reading phase the sequences coding for each of the functional parts of the polypeptide. These can be isolated by techniques skilled in the art, and for example directly from cellular messenger RNAs (mRNAs), or by recloning from a complementary DNA library (cDNA), or still it can be totally synthetic nucleotide sequences. It is further understood that the nucleotide sequences can also be subsequently modified, for example by genetic engineering techniques, to obtain derivatives or variants of said sequences.
  • mRNAs messenger RNAs
  • cDNA complementary DNA library
  • this nucleotide sequence, coding for the active part of the polypeptide can be carried out directly or not, depending on the region chosen for insertion site, in the gene coding for albumin.
  • the selected region may, in fact, not contain an adequate restriction site for carrying out said insertion.
  • the creation of restriction sites, at the level of the region chosen for insertion site is preferably done by site-directed mutagenesis according to conventional techniques. However, it is also possible to insert the nucleotide sequence corresponding to "the active part of the biologically active polypeptide" directly by site-directed mutagenesis without the insertion revealing any particular restriction sites.
  • region 5 of the gene coding for albumin the presence of the PVull restriction site allows direct insertion of the nucleotide sequence. It therefore proves to be particularly useful as a site for cloning an active part of a polypeptide which it is desired to insert in the translational phase into the sequence of albumin at the level of the 57 th residue.
  • the ligation of the sequence coding for the active peptide with the restriction fragment, corresponding to the entire gene coding for albumin generates a nucleotide sequence comprising a hybrid gene coding for a chimeric protein of the SAH strict insertion type.
  • zone 419 to 430 the presence of 2 unique insertion sites, (Hincll and Arvll) makes it possible to insert and / or substitute the peptides of biological interest for the albumin sequence.
  • the insertion of said sequence is favored if one or more manipulable restriction sites are created therein.
  • the restriction sites to be created at the level of the sequence are chosen taking into account the nature of the already existing restriction sites. They must lead to selective insertion.
  • the use of two unique restriction sites makes it possible to construct genes coding for chimeras having the active peptide in insertion and / or in substitution.
  • the insertion of the peptide is done by replacing a bounded fragment of two unique restriction sites, in the complementary DNA of albumin, inserted by site-directed mutagenesis.
  • These two unique restriction sites could be, Mst I and Kpn I, in region 8 and Sst I and Xho I in region 13.
  • the creation of these restriction sites may or may not modify the polypeptide sequence of human albumin.
  • the subsequent cloning of the active peptide in the coding phase in this albumin gene may be exclusively the coding sequence of the peptide or may correspond to a combination of the coding sequence of the peptide and the coding sequence of the deleted fragment of albumin.
  • the present invention also relates to the protection of variants of nucleotide sequences coding for the corresponding albumin, that is to say integrating at least one unique non-natural restriction site, that is to say not present in the original sequence.
  • restriction sites can subsequently serve for the insertion of one or more active parts of biologically active polypeptide (s) into the mature protein.
  • the nucleotide sequence is part of an expression cassette comprising a region for initiating transcription (promoter region) allowing, in host cells, the expression of the nucleotide sequence placed under its control and coding for the polypeptides of the invention.
  • This region can come from promoter regions of genes strongly expressed in the host cell used, the expression being constitutive or regulable. In the case of yeasts, it may be the promoter of the phosphoglycerate kinase (PGK) gene.
  • PGK phosphoglycerate kinase
  • GPD glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase
  • bacteria it may be the promoter of the right or left genes of the bacteriophage lambda (P
  • the expression cassette can also comprise a transcription termination region functional in the envisaged host, positioned immediately downstream of the nucleotide sequence coding for a polypeptide of the invention.
  • the polypeptides of the invention result from the expression in a eukaryotic or prokaryotic host of a nucleotide sequence and from the secretion of the expression product of said sequence in the culture medium. It is in fact particularly advantageous to be able to obtain molecules by recombinant route directly in the culture medium.
  • the sequence The nucleotide coding for a polypeptide of the invention is preceded by a "leader" sequence (or signal sequence) directing the nascent polypeptide in the secretory pathways of the host used.
  • leader sequence can be the natural signal sequence of the biologically active polypeptide in the case where it is a naturally secreted protein, or that of the stabilizing structure, but it can also be any other functional "leader” sequence , or an artificial leader sequence. The choice of one or the other of these sequences is in particular guided by the host used. Examples of functional signal sequences include those of genes for sex pheromones or yeast "killer” toxins.
  • one or more markers making it possible to select the recombinant host can be added, such as for example the URA3 gene from the yeast S. cerevisiae. or genes conferring resistance to antibiotics such as geneticin (G418) or to any other toxic compound such as certain metal ions.
  • the assembly constituted by the expression cassette and by the selection marker can be introduced directly into the host cells considered, or be inserted beforehand into a functional self-replicating vector.
  • sequences homologous to regions present in the genome of the host cells are preferably added to this set; said sequences then being positioned on each side of the expression cassette and of the selection gene so as to increase the frequency of integration of the assembly into the host genome by targeting the integration of the sequences by homologous recombination.
  • a preferred replication system for yeasts of the genus Kluyveromyces is derived from the plasmid pKD1 initially isolated from K.drosophilarum: a preferred replication system for yeasts of the genus Saccharomyces is derived from the plasmid 2 ⁇ of S. cerevisiae.
  • this expression plasmid may contain all or part of said replication systems, or may combine elements derived from the plasmid pKD1 as well as from the plasmid 2 ⁇ .
  • the expression plasmids can be shuttle vectors between a bacterial host such as Escherichia coli and the chosen host cell.
  • restriction sites can correspond to the sequences such as 5'-GGCCNNNNNGGCC-3 '(SI) (SEQ ID No. 1) or 5'-GCGGCCGC-3' Q) (SEQ ID No. 2) in the since these sites are extremely rare and generally absent from an expression vector.
  • any method allowing the introduction of foreign DNA into a cell can be used. It may especially be transformation, electroporation, conjugation, or any other technique known to those skilled in the art.
  • yeast-type hosts the different Kluyveromyces strains used were transformed by treating whole cells in the presence of lithium acetate and polyethylene glycol, according to the technique described by Ito et al. [J. Bacteriol. 152 (1983) 163].
  • the transformation technique described by Durrens et al. [Curr. Genet. 18 (1990) 7] using ethylene glycol and dimethyl sulfoxide was also used. It is also possible to transform yeasts by electroporation, according to the method described by Karube et al. [FEBS Letters 122 (1985) 90].
  • An alternative protocol is also described in detail in the examples which follow.
  • the cells expressing said polypeptides are inoculated and the recovery of said polypeptides can be made, either during cell growth for the "continuous” methods, or at the end of growth for the "batch” cultures ( “batch”).
  • the polypeptides which are the subject of the present invention are then purified from the culture supernatant for their molecular, pharmacokinetic and biological characterization.
  • a preferred expression system for the polypeptides of the invention consists in the use of yeasts of the genus Kluyveromyces as host cell, transformed by certain vectors derived from the extrachromosomal replicon pKD1 initially isolated from K. marxianus var. drosophilarum. These yeasts, and in particular K. lactis and _ ⁇ _ fragilis, are generally capable of replicating said vectors in a stable manner and also have the advantage of being included in the list of GRAS organisms. ("G.enerally Becognized ⁇ s S_afe").
  • Preferred yeasts are preferably industrial strains of the genus Klu y veromyces capable of stable replication of said plasmids derived from the plasmid pKD1 and into which has been inserted a selection marker as well as an expression cassette allowing secretion at high levels polypeptides of the invention.
  • the present invention also relates to the nucleotide sequences coding for the chimeric polypeptides described above, as well as the recombinant, eukaryotic or prokaryotic cells, comprising such sequences.
  • the present invention also relates to the application, as medicament, of the polypeptides according to the present invention.
  • the subject of the invention is any pharmaceutical composition comprising one or more polypeptides or nucleotide sequences as described above.
  • These pharmaceutical compositions can be in the form of various formulations. They may in particular be nanoparticles on the surface of which are present polypeptides according to the invention. This type of formulation is more particularly used to carry out targeted targeting of the active principle.
  • the nucleotide sequences can be used in gene therapy.
  • Figure 1 Schematic representation of domain I of albumin with localization of insertion sites according to the invention. * indicates the location of the h2-h3 insertion site in domain III. The numbers 5, 8 and 13 identify the corresponding insertion zones.
  • Figure 2 Schematic representation of different modes of insertion of an active peptide into the structure of albumin.
  • Figure 3 Plasmid pYG105.
  • Figure 4 Modification of the albumin region 5 following the insertion of the sequence coding for IEGR as described in Example 8.1. The changes are shown in bold. The location of the modified or added restriction sites are indicated by a horizontal line and the cut-off position of the corresponding enzymes by a vertical line.
  • Figure 5 Cloning strategy for the insertion of IEGR in region 5 (example 8.1).
  • Figure 6 Cloning strategy for the insertion of an active peptide into region 13 of albumin.
  • the pBR322, pUC and phage plasmids of the M13 series are of commercial origin (Bethesda Research Laboratories).
  • the DNA fragments are separated according to their size by electrophoresis in agarose or acrylamide gels, extracted with phenol or with a phenol / chloroform mixture, precipitated with ethanol and then incubated in the presence of phage T4 DNA ligase (Biolabs) according to the supplier's recommendations.
  • Verification of the nucleotide sequences is carried out by the method developed by Sanger et al. [Proc. Natl. Acad. Sci. USA, ___ (1977) 5463-5467] using the kit distributed by Amersham.
  • Transformations of K. lactis with the DNA of the protein expression plasmids of the present invention are carried out by any technique known to those skilled in the art, an example of which is given in the text. Unless otherwise indicated, the bacterial strains used are E. coli
  • MC1060 lacJPOZYA, X74, gaJU, flajK, ⁇ t ⁇ A r
  • E. coli TG1 lac, ⁇ ro_A, B, ⁇ ji ⁇ E, îbi,
  • the yeast strains used belong to budding yeasts and more particularly to yeasts of the genus Kluyveromyces.
  • the K. lactis MW98-8C (a, ura ⁇ , ai ⁇ , lys, K + , pKD1 °) and K. lactis CBS 293.91 strains were particularly used; a sample of strain MW98-8C was deposited on the 16th
  • the yeast strains transformed by the expression plasmids coding for the proteins of the present invention are cultured in Erlenmeyer flasks or in pilot fermenters of 21 (SETRIC, France) at 28 ° C. in rich medium (YPD: 1% yeast extract, 2 % Bactopeptone, 2% glucose; or YPL: 1% yeast extract, 2% Bactopeptone, 2% lactose) with constant stirring.
  • YPD 1% yeast extract, 2 % Bactopeptone, 2% glucose
  • YPL 1% yeast extract, 2% Bactopeptone, 2% lactose
  • the Pvull site naturally located in the coding sequence is particularly useful as a cloning site for a biologically active peptide which it is desired to insert in the translational phase into SAH at the 58 ⁇ residue me.
  • the oligonucleotides synthesized are of the 5'-NN [3xN] pN-3 'type and its complementary strand.
  • Hindlll-Hindlll ⁇ Pvull restriction fragment corresponding to the entire gene coding for SAH, generates a Hindlll-Hjndjll restriction fragment comprising a hybrid gene coding for a chimeric protein of the SAH type strict insertion.
  • the peptide can be repeated several times in the chimera.
  • EXAMPLE 2 PROTOCOL FOR TOTAL OR PARTIAL INSERTION OF PEPTIDE USING TWO SINGLE AND NATURAL RESTRICTION SITES.
  • the use of two unique restriction sites makes it possible to construct genes coding for chimeras having the active peptide in strict insertion or in substitution or in partial insertion.
  • the existence of the unique Hincll and Ayril sites in the SAH coding sequence and in the vector makes it possible to generate a Hindlll-Hi ⁇ dlll ⁇ Hincll-Avrll fragment.
  • the elimination of the Hincll-Avrll nucleotide fragment corresponds to the deletion of the T (420) - N (429) peptide fragment.
  • the use of an appropriate complementary oligonucleotide makes it possible to clone a peptide in coding phase in the SAH gene.
  • This restriction fragment may be exclusively the coding sequence complementary to the peptide or may correspond to a combination of the coding sequence of the active peptide and the coding sequence of the T (420) - N (429) fragment of HSA.
  • the active peptide can be present several times in the chimera.
  • the chimeric proteins of the preceding examples can be expressed in yeasts from functional, regulatable or constitutive promoters, such as, for example, those present in the plasmids pYG105 (LAC4 promoter from Kluweromvces lacis), pYG106 (PQK promoter from Saccharomyces cerevisiae) .
  • pYG536 £ h-LQ5 promoter from S. cerevisiae
  • hybrid promoters such as those described in patent application EP 361 991.
  • the plasmids pYG105 and pYG106 are particularly useful here because they allow the expression of the genes encoded by the HindIII restriction fragments as described in the previous examples and clones in the Hindlll site and in the productive orientation (defined as the orientation which places the "prepro" region of albumin proximally to the transcription promoter), from functional promoters in K. lactis. controllable (pYG105) or constitutive (pYG106).
  • the plasmid pYG105 corresponds to the plasmid pKan707 described in patent application EP 361 991 in which the Hindlll restriction site unique and located in the geneticin resistance gene (G418) was destroyed by site-directed mutagenesis while retaining an unchanged protein ( oligodeoxynucleotide 5'-GAAATGCATAAGCTCTTGCCATTCTCACCG-3 '(SEQ ID No. 3)
  • the fragment ⁇ aJI- __a __ ⁇ encoding the mutated plasmid URA3 gene was then replaced by a restriction fragment £ all- ⁇ acj comprising a cassette of expression consisting of the LAC4 promoter from K.
  • lactis in the form of a Sall-Hindlll fragment
  • terminator of the PGK gene of S. cerevisiae in the form of a Hindlll-Sacl fragment
  • the plasmid pYG105 is mitotically very stable in Kluyveromyces yeasts. is represented in FIG. 3.
  • the plasmids pYG105 and pYG106 differ from each other only by the nature of the transcription promoter encoded by the Sall-HindIII fragment.
  • the transformation of yeasts belonging to the genus Kluyveromyces. and in particular the MW98-8C and CBS 293.91 strains of K. lactis. is carried out for example by the technique of treating whole cells with lithium acetate [Ito H. et al., J. Bacteriol. 152 (1983) 163-168], adapted as follows. The cells are grown at 28 ° C.
  • 0.1 ml aliquots of the resulting suspension of competent cells are incubated at 30 ° C for 1 hour in the presence of DNA and at a final concentration of 35% polyethylene glycol (PEG, 4ooo > Sigma). After a thermal shock of 5 minutes at 42 ° C, the cells are washed twice, resuspended in 0.2 ml of sterile water and incubated for 16 hours at 28 ° C in 2 ml of YPD medium to allow the phenotypic expression of the gene for resistance to G418 expressed under the control of the promoter P ⁇ -j (cf. EP 361 991); 200 ⁇ l of the cell suspension are then spread on selective YPD dishes (G418, 200 ⁇ g / ml). The dishes are incubated at 28 ° C and the transformants appear after 2 to 3 days of cell growth.
  • PEG polyethylene glycol
  • the recombinant clones are tested for their capacity to secrete the mature form of the chimeric proteins.
  • a few clones corresponding to the CBS 293.91 or MW98-8C strain transformed by the expression plasmids of the chimeras between the SAH and the biologically active part are incubated in YPD or YPL medium at 28 ° C.
  • the cell supernatants are recovered by centrifugation when the cells reach the stationary growth phase, optionally concentrated 10 times by precipitation for 30 minutes at -20 ° C in a final concentration of 60% ethanol, then tested after electrophoresis in SDS gel- PAGE 0, either directly by coloring the gel with 19
  • coomassie blue either after immunoblotting using primary antibodies directed against the biologically active part or a polyclonal rabbit serum directed against HSA.
  • the nitrocellulose filter is first incubated in the presence of specific primary antibodies, washed several times, incubated in the presence of goat antibodies directed against the primary antibodies, then incubated in the presence of an avidin complex.
  • -peroxidase using the "ABC kit” distributed by Vectastain (Biosys SA, Compiègne, France).
  • the immunological reaction is then revealed by the addition of 3,3-diamino benzidine tetrachlorydrate (Prolabo) in the presence of hydrogen peroxide, according to the manufacturer's recommendations.
  • the chimeras present in the culture supernatants corresponding to the transformed CBS 293.91 strain are first characterized using antibodies specific for the HSA part. It may be desirable to purify some of these chimeras.
  • the culture is then centrifuged (10000 g, 30 min), the supernatant is passed through a 0.22 mm filter (Millipore), then concentrated by ultrafiltration (Amicon) using a membrane whose discrimination threshold is located at 30 kDa .
  • the concentrate obtained is then dialyzed against a solution of Tris HCl (50 mM pH 8) and then purified on a column.
  • the concentrate corresponding to the culture supernatant of the transformed CBS 293.91 strain is purified by affinity chromatography on Blue-Trisacryl (IBF) and the samples are then dialyzed against water. Purification by molecular sieve can then be carried out.
  • a Superose 12 column (Pharmacia) is previously equilibrated in 20mM NaH2P ⁇ 4 100mM NaCl pH 7.0 buffer and the samples from affinity chromatography are loaded onto the column, collected and characterized. Purification by ion exchange chromatography can also be used.
  • the concentrate obtained after ultrafiltration is dialyzed against a solution of Tris HCl (50 mM pH 8), then deposited in 20 ml fractions on a column (5 ml) cation exchange (S Fast Flow, Pharmacia) balanced in the same stamp.
  • the column is then washed several times with the Tris HCl solution (50 mM pH 8) and the protein chimera is then eluted from the column by a gradient (0 to 1 M) of NaCl.
  • the fractions containing the chimeric protein are then combined and dialyzed against a 50 mM Tris HCl solution (pH 8) and then redeposited on a S Fast Flow column. After elution from the column, the fractions containing the protein are combined, dialyzed against water and lyophilized before characterization.
  • Peptide 11 has been described as an epitote of tryptophan synthase (Larvor et al. Mol. Immunol. (1991) 28, 523-531).
  • Peptide 11 has the following peptide sequence in the N to C terminal direction: HGRVGIYFGMK (SEQ ID No. 20).
  • the insertion strategy in the HincJI- ⁇ Yill zone consisted in making a ligation between a synthesized nucleotide fragment coding for peptide 11 and such that the reading frame for the coding sequence of HSA is respected and that the nature of the sequence coding of the SAH is that of origin.
  • oligonucleotides synthesized were the following: 5'-CCATGGTAGAGTAGGTATCTATTTCGGTATGAAA-3 '
  • Xho 1 were created by mutagenesis directed. The same type of directional cloning was performed. In the case of the total insertion of peptide 11 between residues A (191) and S (192), the following two oligonucleotides were synthesized: 5'- ACGGGATGAAGGGAAGGCCCATGGTAGAGTAGGTATCTATTTCGGTATGAAA-3 '(SEQ ID No. 8) and 5'-
  • the insertion requires the creation of the two restriction sites Sst I and Xho 1 beforehand.
  • the following two oligonucleotides have been synthesized: 5'-ACATGGTAGAGTAGGTATCTATTTCGGTATGAAA-3 '(SEQ ID N ° 10) and 5'-TCGATTTCATACCGAAATAGATACCTACTCTACCATGTAGCT-3 '(SEQ ID N ° 11).
  • residues R (186) to A (191) are deleted and substituted with peptide 11.
  • the two expression plasmids of these chimeras are 1671 and 1667 respectively.
  • Each of the plasmids, obtained in points 1, 2, 3 and 4 is used to transform a yeast strain according to the protocol described in example 4. the corresponding proteins are secreted and purified according to examples 5 and 6.
  • FIG. 4 The modifications that their insertion reveals on the nucleotide and peptide sequences of albumin are shown in FIG. 4.
  • the cloning strategy is shown diagrammatically in FIG. 5. This construction illustrates the case where junction sequences are introduced on both sides. other of the peptide of interest.
  • FIG. 6 describes a strategy for cloning a peptide in region 13.
  • the Sst I and Xho 1 restriction sites were created by site-directed mutagenesis.
  • region 13 total substitution and addition substitution of the simple IEGR sequence or framed with junction sequences were carried out respectively.
  • the oligonucleotides used are the following:
  • the oligonucleotides used are the following: 5'- ACCCTCGATCGAAGGTAGATCTCCA- 3 '(SEQ ID N ° 16) 5'- TCGATGGAGATCTACCTTCGATCGAGGGTAGCT-3' (SEQ ID N ° 17)
  • albumin is amputated from residue R (186) to residue A (191) and replaced by the sequence PSIEGRSP (SEQ ID No. 23) therefore leading to the addition of two residues.
  • the chimera is incubated in the presence of bovine factor Xa in an enzyme / substrate ratio of 1/10 and in a 50 mM Tris buffer, 100 mM NaCl, 1 mM CaCl 2, pH 8.0 for 3 hours at 37 ° C. At the end of this treatment, an analysis is carried out
  • DEPOSITOR (A) NAME: RHONE-POULENC RORER S.A.

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Abstract

La présente invention concerne des polypeptides recombinants biologiquement actifs essentiellement composés d'au moins une partie active dérivée d'un polypeptide, naturel ou artificiel, ayant une activité biologique, insérée dans une albumine ou un variant d'albumine, leur préparation et des compositions pharmaceutiques les contenant.

Description

Polypeptides biologiquement actifs insères dans une albumine
La présente invention concerne de nouveaux polypeptides biologiquement actifs, leur préparation et des compositions pharmaceutiques les contenant.
Quoique possédant une ou plusieurs activités thérapeutiques potentielles, de nombreux polypeptides ne peuvent, malheureusement, pas être exploités pharmaceutiquement. Ceci peut avoir différentes raisons, telles que notamment leur faible stabilité in vivo, leur structure complexe ou fragile, la difficulté de les produire à une échelle industriellement acceptable, etc.. De même, certains polypeptides ne donnent pas les résultats attendus in vivo en raison de problèmes d'administration, de conditionnement, de pharmacocinétique etc..
La présente invention a précisément pour objet de remédier à ces inconvénients. Elle vise notamment l'élaboration de protéines artificielles biologiquement actives permettant une exploitation optimale, sur le plan thérapeutique, des propriétés biologiques de ces polypeptides.
La Demanderesse a ainsi mis en évidence qu'il est possible d'insérer par voie génétique toute structure active, dérivée d'un polypeptide biologiquement actif, dans une autre structure proteique constituée d'albumine, sans en altérer lesdites propriétés biologiques. De manière inattendue, la sérum-albumine humaine permet de présenter efficacement la structure active à ses sites d'interaction et d'assurer une stabilité plasmatique élevée au polypeptide recombinant de l'invention.
Plus précisément, la présente invention concerne un polypeptide recombinant comportant au moins une partie active dérivée d'un polypeptide, naturel ou artificiel, biologiquement actif, génétiquement insérée dans une albumine ou un de ses variants ou dérivés.
Par variant de l'albumine, on entend désigner selon la présente invention toute protéine à haute demie-vie plasmatique obtenue par modification, à l'aide des techniques du génie génétique, d'un gène codant pour un isomorphe donné de la sérum-albumine humaine, ainsi que toute macromolécule à haute demie-vie plasmatique obtenue par modification in vitro de la protéine codée par de tels gènes. (Par modification, on doit entendre toute mutation, substitution, délétion, addition ou modification de nature génétique et/ou chimique). L'albumine étant très polymorphe, de nombreux variants naturels ont été identifiés et répertoriés [Weitkamp L.R. et al., Ann. Hum. Genêt. 32 (1973) 219].
En ce qui concerne les αerivés d'albumine, il s'agit plus particulièrement de molécules comportant tout ou partie de l'albumine, fusionnée le cas échéant à au moins une séquence polypeptidique provenant d'un gène naturel ou artificiel, elle même dotée ou non d'une activité biologique.
Dans la suite de la descnotion, les différents types d'albumines explicités ci- dessus sont communément désignés sous le terme albumine.
Au sens de la présente invention, il est entendu par partie active, une partie possédant une activité qui peut soit être directe (traitement des maladies, diagnostic, recherche biologique, capteurs...), ou indirecte (par exemple utilisable dans la prévention des maladies, dans la conception des vaccins, dans les techniques de l'imagerie médicale etc.).
Les parties actives de polypeptides biologiquement actifs, insérées selon l'invention, présentent de préférence un intérêt thérapeutique.
Les polypeptides possédant une activité thérapeutique peuvent être d'origine humaine ou non.
A titre représentatif des polypeptides d'origine non humaine, on peut citer des peptides ou leurs dérivés, possédant des propriétés potentiellement utiles dans les pathologies des compartiments sanguins et interstitiels, tels que l'hirudine, la trigramine, l'antistatine, les peptides anticoagulant des tiques (TAP), l'ariétine, l'applagine etc....
Selon un mode privilégié de l'invention, le polypeptide ayant une activité thérapeutique est un polypeptide d'origine humaine ou un variant moléculaire. Par exemple, il peut s'agir de tout ou partie, d'un enzyme, d'un inhibiteur d'enzyme, d'un antigène, d'un anticorps, d'une hormone, d'un récepteur, d'un facteur intervenant dans le contrôle de la coagulation, d'un interféron, d'une cytokine [les interleukines, mais aussi leurs variants antagonistes naturels de leur fixation au(x) récepteur(s), les cytokines de type SIS (small induced secreted) et par exemple les protéines inflammatoires des macrophages (les MIPs), etc.], d'un facteur de croissance et/ou de différenciation [et par exemple les facteurs de croissance transformants (les TGFs), les facteurs de différenciεtion des cellules sanguines (érythropoiétine, M-CSF, G-CSF, GM-CSF etc.), l'insuline et les facteurs de croissance qui lui ressemblent (les IGFs), ou encore les facteurs de perméabilité cellulaire (VPF VEGF), etc.], d'un facteur impliqué dans la génèso/résorption des tissus osseux (OIF et ostéospontine par exemple), d'un facteur impliqué dans la motilité ou la migration cellulaire [et par exemple le facteur de mobilité autocrine (AMF), le facteur de stimulation de la migration (MSF), ou encore facteur de dispersion (scatter factor/f acteur de croissance des hépatocytes)], d'un facteur bactéricide ou antifongique, d'un facteur chimiotactique [et par exemple le facteur plaquettaire 4 (PF4), ou encore les peptides chemoattractants des monocytes (MCP/ CAF) ou des neutrophiles (NCAF), etc.], d'un facteur cytostatique (et par exemple les protéines qui se fixent aux galactosides), d'une molécule adhésive plasmatique (et par exemple le facteur de von Willebrand, le fibrinogène etc..) ou interstitielle (laminine, ténascine, vitronectine, etc.) ou des matrices extracellulaires, ou encore toute séquence peptidique antagoniste ou agoniste d'interactions moléculaires et/ou intercellulaires impliquées dans les pathologies des compartiments circulatoires et interstitiels et par exemple la formation des thrombus artériels et veineux, les métastases cancéreuses, l'angiogénèse tumorale, le choc inflammatoire, les maladies autoimmunes, les pathologies osseuses et ostéo-articulaires etc.
Bien entendu, la partie active des polypeptides de l'invention peut être constituée par le polypeptide entier biologiquement actif ou par une structure dérivée de celui-ci ou encore correspondre à une séquence peptidique non naturelle, isolée par exemple à partir de banques peptidiques aléatoires. (Pour des raisons de simplification, ces différentes possibilités seront couvertes dans ce qui suit sous la désignation commune "partie active d'un peptide biologiquement actif".) Au sens de la présente invention, on entend par structure dérivée tout polypeptide obtenu par modification et conservant une activité biologique. Par modification, on doit entendre toute mutation, substitution, délétion, addition ou modification de nature génétique et/ou chimique. De tels dérivés peuvent être générés dans des buts différents, tels que notamment celui d'augmenter l'affinité de la molécule pour ses sites de fixation, celui d'améliorer ses niveaux de production, celui d'augmenter sa résistances aux protéases, celui d'augmenter son efficacité thérapeutique ou encore de réduire ses effets secondaires, ou celui de lui conférer de nouvelles propriétés biologiques. A titre d'exemple, les polypeptides chimères de l'invention possèdent des propriétés pharmacocinétiques et une activité biologique utilisable pour la prévention ou le traitement des maladies.
Des polypeptides de l'invention, particulièrement avantageux, sont ceux dans lesquels la partie active présente : • • (a) la structure peptidique entière ou,
(b) un fragment de (a) ou une structure dérivée de (a) par modification structurale (mutation, substitution addition et/ou délétion d'un ou plusieurs résidus) et possédant une activité thérapeutique.
Parmi les structures du type (b), on peut citer plus particulièrement les molécules dans lesquelles certains sites de N- ou O-glycosylation ont été modifiés ou supprimés, les molécules dans lesquelles un ou plusieurs résidus ont été substitués, ou les molécules dans lesquelles tous les résidus cystéine ont été substitués. On peut citer également des molécules obtenues à partir de (a) par délétion de régions n'intervenant pas ou peu dans l'interaction avec les sites de liaison considérés, ou exprimant une activité indésirable, et des molécules comportant par rapport à (a) des résidus supplémentaires, tels que par exemple une méthionine N-terminale et/ou un signal de sécrétion et/ou un peptide de jonction.
L'objet de la présente invention est particulièrement avantageux pour les peptides actifs trop petits pour former un domaine structural et/ou ne possédant pas une bonne stabilité in vivo et/ou une bonne biodisponibilité. L'insertion proposée selon l'invention, permet de les associer à un ou des domaine(s) pré-existant(s) de l'albumine et de bénéficier ainsi de la biodisponibilité et de la stabilité in vivo de celle- ci.
De manière générale, la taille des parties actives insérées dans l'albumine varie entre trois à vingt cinq résidus d'acides aminés. Toutefois, des séquences allant de 1 résidu à 100 résidus peuvent également être utilisées. L'insertion d'une partie active de peptide dans la séquence peptidique de l'albumine est réalisée selon l'invention de manière à satisfaire aux deux conditions suivantes:
Il doit être préservé à ladite partie active, insérée au sein de l'albumine, une accessibilité suffisante afin de lui conserver intacte son activité biologique. Par ailleurs, la structure de l'albumine ne doit pas non plus subir une déstabilisation trop importante qui serait bien entendu préjudiciable au polypeptide recombinant dit la chimère.
Les sites d'insertion sont préférentiellement sélectionnés au sein de l'albumine en respectant les précédents impératifs.
Selon la structure cristalline publiée par He et Carter (Nature 1992, 358, 209- 215) l'albumine est formée de la répétition de 3 domaines comprenant chacun deux sous-domaines et elle contient plus de 67% d'hélices alpha. Chacun des domaines est superposable aux autres et est formé de 10 hélices notées de h1 à h10. Le sous- domaine A comporte les hélices h1 à h6 et le sous-domaine B, les hélices h7 à h10. Chaque sous domaine est formé par un motif commun: h1 , h2, h3, h4 pour le domaine A et h7, h8, h9 et MO pour le domaine B. Les petites hélices h5 et h6 supplémentaires sont liées par un pont disulfure au sous domaine A. La figure 1 rend compte de manière schématique de la structure de l'albumine humaine. Les sites d'insertion sont de préférence localisés dans les régions de l'albumine présumées former des régions exposées à la surface de la molécule, ces régions étant préférentiellement des boucles.
A titre de sites d'insertion convenant tout particulièrement à l'invention, on peut mentionner trois régions du premier domaine : - la région 5 qui s'étend du résidu 57 à 62 et qui correspond à une boucle reliant les deux hélices h3 et h4 ;
- la région 8 comprenant les résidus 103 à 120 et correspondant à la zone inter sous- domaines.
- la région 13 comprise entre les résidus 178 et 200 et qui correspond à une hélice. Les hélices h2 et h3 du domaine III délimitent également, du résidu 419 au résidu 430, une autre région d'insertion envisageable selon l'invention.
Une partie active de peptide biologiquement actif peut être insérée selon trois modes différents dans la séquence peptidique de l'albumine. - Il peut s'agir d'une insertion stricte consistant en une simple addition de la séquence du peptide d'intérêt dans la séquence d'origine de l'albumine qui est conservée dans sa totalité.
- L'insertion peut correspondre à une substitution d'une portion de la séquence peptidique de l'albumine par la séquence peptidique correspondant à la partie active du peptide d'intérêt.
- Enfin, il peut s'agir d'une insertion combinant une addition d'une partie de la séquence peptidique active et une substitution d'une portion de la séquence peptidique de l'albumine par le reste de la partie active du peptide actif. La figure 2 rend compte d'une manière schématique de ces différents modes d'insertion.
Bien entendu, la partie active d'un peptide biologiquement actif peut être répétée plusieurs fois dans la chimère au même endroit et/ou dans des régions différentes de l'albumine. De même, il est également possible d'insérer selon l'invention des parties actives différentes, soit issues d'un même peptide ou de peptides différents.
Enfin, une partie active des peptides selon l'invention peut être insérée soit strictement au sein de l'albumine soit entourée de séquences de jonction.
En ce qui concerne ces séquences de jonction, il peut notamment s'agir de séquences peptidiques riches en résidus glycine et/ou en résidus serine et/ou en résidus thréonine et/ou tout résidu d'acide aminé décrit comme fréquemment rencontré dans les zones de flexibilité dans les protéines.
Les polypeptides recombinants de l'invention s'avèrent tout particulièrement avantageux.
Ils permettent de maintenir dans l'organisme une activité biologique donnée pendant un temps prolongé. Il s'avère ainsi possible de réduire les doses administrées et, dans certains cas, de potentialiser l'effet thérapeutique, par exemple en réduisant les effets secondaires consécutifs à une administration plus importante. Ils permettent avantageusement de générer et d'utiliser des structures dérivées de polypeptides biologiquement actifs très petites et donc très spécifiques d'un effet recherché. Ces polypeptides recombinants possèdent par ailleurs une répartition particulièrement avantageuse dans l'organisme, ce qui modifie leurs propriétés pharmacocinétiques et favorise le développement de leur activité biologique et leur utilisation. Ils présentent également l'avantage d'être faiblement ou non- immunogéniques pour l'organisme dans lequel ils sont utilisés. Finalement, les polypeptides de l'invention peuvent être exprimés (et préférentiellement sécrétés) par des organismes recombinants, à des niveaux permettant leur exploitation industrielle.
Un autre objet de l'invention concerne un procédé de préparation des molécules chimères décrites ci-avant. Plus précisément, ce procédé consiste à faire exprimer par un hôte cellulaire eucaryote ou procaryote une séquence nucléotidique codant pour une partie active d'un polypeptide désiré, puis à récolter le polypeptide produit. Parmi les hôtes eucaryotes utilisables dans le cadre de la présente invention, on peut citer les cellules animales, les levures, ou les champignons. En particulier, s'agissant de levures, on peut citer les levures du genre Saccharomyce*?, Kluweromvces. Pichia. Schwanniomvces. ou Hansenula. S'agissant de cellules animales, on peut citer les cellules COS, CHO, CI27, etc. Parmi les champignons susceptibles d'être utilisés dans la présente invention, on peut citer plus particulièrement Aspergillus ssp. ou Trichoderma ssp. Comme hôtes procaryotes, on préfère utiliser les bactéries telles que Escherichia coli. ou appartenant aux genres C-orvnebacterium. Bacillus. ou StreptQmyceS-
Les séquences nucléotidiques utilisables dans le cadre de la présente invention peuvent être préparées de différentes manières. Généralement, elles sont obtenues en assemblant en phase de lecture les séquences codant pour chacune des parties fonctionnelles du polypeptide. Celles-ci peuvent être isolées par les techniques de l'homme de l'art, et par exemple directement à partir des ARN messsagers (ARNm) cellulaires, ou par reclonage à partir d'une banque d'ADN complémentaire (ADNc), ou encore il peut s'agir de séquences nucléotidiques totalement synthétiques. Il est entendu de plus que les séquences nucléotidiques peuvent également être ultérieurement modifiées, par exemple par les techniques du génie génétique, pour obtenir des dérivés ou des variants desdites séquences.
L'insertion de cette séquence nucléotidique, codant pour la partie active du polypeptide, peut être réalisée directement ou non, selon la région choisie pour site d'insertion, dans le gène codant pour l'albumine.
La région sélectionnée peut, en effet, ne pas comporter de site de restriction adéquat à la réalisation de ladite insertion. Dans cette hypothèse, il peut s'avérer intéressant, préalablement à l'insertion, d'introduire un ou plusieurs sites de restriction uniques. La création de sites de restriction, au niveau de la région choisie pour site d'insertion, se fait de préférence par mutagénèse dirigée selon des techniques classiques. Toutefois on peut également insérer la séquence nucléotidique correspondant à "la partie active du polypeptide biologiquement actif" directement par mutagénèse dirigée sans que l'insertion ne fasse apparaître de sites de restriction particuliers.
Dans le cas particulier de la région 5 du gène codant pour l'albumine, la présence du site de restriction PVull autorise l'insertion directe de la séquence nucléotidique. Il se révèle donc particulièrement utile comme site de clonage d'une partie active d'un polypeptide que l'on souhaite insérer en phase traductionnelle dans la séquence de l'albumine au niveau du 57ème résidu.
Dans ce mode d'insertion, mettant à profit un site de restriction unique déjà existant dans la séquence d'origine de l'albumine, la ligature de la séquence codant pour le peptide actif avec le fragment de restriction, correspondant à la totalité du gène codant pour l'albumine, génère une séquence nucléotidique comportant un gène hybride codant pour une protéine chimère du type SAH insertion stricte.
Dans le cas particulier de la zone 419 à 430, la présence de 2 sites uniques d'insertion, (Hincll et Arvll) permet d'insérer et/ou substituer les peptides d'intérêt biologique à la séquence de l'albumine. En ce qui concerne plus particulièrement les régions 8 et 13, l'insertion de ladite séquence est favorisée si l'on y crée préalablement un ou des sites de restriction manipulables. Bien entendu, les sites de restriction à créer au niveau de la séquence sont choisis en tenant compte de la nature des sites de restriction déjà existants. Ils doivent conduire à une insertion sélective. Dans ce second mode de réalisation, l'emploi de deux sites de restriction uniques permet de construire des gènes codant pour des chimères ayant le peptide actif en insertion et/ou en substitution. L'insertion du peptide se fait par remplacement d'un fragment borné de deux sites de restriction uniques, dans l'ADN complémentaire de l'albumine, insérés par mutagénèse dirigée. Ces deux sites de restriction uniques pourront être, Mst I et Kpn I, dans la région 8 et Sst I et Xho I dans la région 13. La création de ces sites de restriction peut ou non modifier la séquence polypeptidique de l'albumine humaine. Le clonage subséquent du peptide actif en phase codante dans ce gène de l'albumine peut être exclusivement la séquence codante du peptide ou peut correspondre à un panachage de la séquence codante du peptide et de la séquence codante du fragment délété de l'albumine.
La présente invention vise également la protection des variants de séquences nucléotidiques codant pour l'albumine correspondante c'est à dire intégrant au moins un site de restriction unique non naturel c'est à dire non présent dans la séquence d'origine.
Avantageusement, la création de ces sites de restriction peut servir par la suite à l'insertion d'un ou plusieurs parties actives de polypeptide(s) biologiquement actif(s) dans la protéine mature.
Plus préférentiellement, dans le procédé de l'invention, la séquence nucléotidique fait partie d'une cassette d'expression comprenant une région d'initiation de la transcription (région promoteur) permettant, dans les cellules hôtes, l'expression de la séquence nucléotidique placée sous son contrôle et codant pour les polypeptides de l'invention. Cette région peut provenir de régions promoteurs de gènes fortement exprimés dans la cellule hôte utilisée, l'expression étant constitutive ou régulable. S'agissant de levures, il peut s'agir du promoteur du gène de la phosphoglycérate kinase (PGK). de la glycéraldéhyde-3-phosphate déshydrogénase (GPD). de la lactase (LΔΩ4), des énolases (E Ω), des alcools deshydrogénases (ADH). etc. S'agissant de bactéries, il peut s'agir du promoteur des gènes droit ou gauche du bactériophage lambda (P|_, PR), ou encore des promoteurs des gènes des opérons tryptophane (Ptrp) ou lactose (P|ac)- En outre, cette région de contrôle peut être modifiée, par exemple par mutagénèse in vitro, par introduction d'éléments additionnels de contrôle ou de séquences synthétiques, ou par des délétions ou des substitutions des éléments originels de contrôle. La cassette d'expression peut également comprendre une région de terminaison de la transcription fonctionnelle dans l'hôte envisagé, positionnée immédiatement en aval de la séquence nucléotidique codant pour un polypeptide de l'invention. Dans un mode préféré, les polypeptides de l'invention résultent de l'expression dans un hôte eucaryote ou procaryote d'une séquence nucléotidique et de la sécrétion du produit d'expression de ladite séquence dans le milieu de culture. Il est en effet particulièrement avantageux de pouvoir obtenir par voie recombinante des molécules directement dans le milieu de culture. Dans ce cas, la séquence nucléotidique codant pour un polypeptide de l'invention est précédée d'une séquence "leader" (ou séquence signal) dirigeant le polypeptide naissant dans les voies de sécrétion de l'hôte utilisé. Cette séquence "leader" peut être la séquence signal naturelle du polypeptide biologiquement actif dans le cas où celui-ci est une protéine naturellement sécrétée, ou celle de la structure stabilisatrice, mais il peut également s'agir de toute autre séquence "leader" fonctionnelle, ou d'une séquence "leader" artificielle. Le choix de l'une ou l'autre de ces séquences est notamment guidé par l'hôte utilisé. Des exemples de séquences signal fonctionnelles incluent celles des gènes des phéromones sexuelles ou des toxines "killer" de levures.
En plus de la cassette d'expression, un ou plusieurs marqueurs permettant de sélectionner l'hôte recombiné peuvent être additionnés, tels que par exemple le gène URA3 de la levure S. cerevisiae. ou des gènes conférant la résistance à des antibiotiques comme la généticine (G418) ou à tout autre composé toxique comme certains ions métalliques.
L'ensemble constitué par la cassette d'expression et par le marqueur de sélection peut être introduit directement dans les cellules hôtes considérées, soit inséré préalablement dans un vecteur autoréplicatif fonctionnel. Dans le premier cas, des séquences homologues à des régions présentes dans le génome des cellules hôtes sont préférentiellement additionnées à cet ensemble; lesdites séquences étant alors positionnées de chaque côté de la cassette d'expression et du gène de sélection de façon à augmenter la fréquence d'intégration de l'ensemble dans le génome de l'hôte en ciblant l'intégration des séquences par recombinaison homologue. Dans le cas où la cassette d'expression est insérée dans un système réplicatif, un système de réplication préféré pour les levures du genre Kluyveromyces est dérivé du plasmide pKD1 initialement isolé de K.drosophilarum: un système préféré de réplication pour les levures du genre Saccharomyces est dérivé du plasmide 2μ de S. cerevisiae. De plus, ce plasmide d'expression peut contenir tout ou partie desdits systèmes de réplication, ou peut combiner des éléments dérivés du plasmide pKD1 aussi bien que du plasmide 2μ. En outre, les plasmides d'expression peuvent être des vecteurs navettes entre un hôte bactérien tel que Escherichia coli et la cellule hôte choisie. Dans ce cas, une origine de réplication et un marqueur de sélection fonctionnant dans l'hôte bactérien sont requises. Il est également possible de positionner des sites de restriction entourant les séquences bactériennes et uniques sur le vecteur d'expression: ceci permet de supprimer ces séquences par coupure et religature in vitro du vecteur tronqué avant transformation des cellules hôtes, ce qui peut résulter en une augmentation du nombre de copies et en une stabilité accrue des plasmides d'expression dans lesdits hôtes. Par exemple, de tels sites de restriction peuvent correspondre aux séquences telles que 5'-GGCCNNNNNGGCC-3' (S I) (SEQ ID N°1) ou 5'-GCGGCCGC-3' Q ) (SEQ ID N°2) dans la mesure où ces sites sont extrêmement rares et généralement absents d'un vecteur d'expression.
Après construction de tels vecteurs ou cassette d'expression, ceux-ci sont introduits dans les cellules hôtes retenues selon les techniques classiques décrites dans la littérature. A cet égard, toute méthode permettant d'introduire un ADN étranger dans une cellule peut être utilisée. Il peut s'agir notamment de transformation, électroporation, conjugaison, ou toute autre technique connue de l'homme de l'art. A titre d'exemple pour les hôtes de type levure, les différentes souches de Kluyveromyces utilisées ont été transformées en traitant les cellules entières en présence d'acétate de lithium et de polyéthylène glycol, selon la technique décrite par Ito et al. [J. Bacteriol. 152 (1983) 163]. La technique de transformation décrite par Durrens et al. [Curr. Genêt.18 (1990) 7] utilisant l'éthylène glycol et le diméthylsulfoxyde a également été utilisée. Il est aussi possible de transformer les levures par électroporation, selon la méthode décrite par Karube et al. [FEBS Letters 122 (1985) 90]. Un protocole alternatif est également décrit en détail dans les exemples qui suivent.
Après sélection des cellules transformées, les cellules exprimant lesdits polypeptides sont inoculées et la récupération desdits polypeptides peut être faite, soit au cours de la croissance cellulaire pour les procédés "en continu", soit en fin de croissance pour les cultures "en lots" ("batch"). Les polypeptides qui font l'objet de la présente invention sont ensuite purifiés à partir du surnageant de culture en vue de leur caractérisation moléculaire, pharmacocinétique et biologique.
Un système d'expression préféré des polypeptides de l'invention consiste en l'utilisation des levures du genre Kluyveromyces comme cellule hôte, transformées par certains vecteurs dérivés du réplicon extrachromosomique pKD1 initialement isolé chez K. marxianus var. drosophilarum. Ces levures, et en particulier K. lactis et _<_ fragilis sont généralement capables de répliquer lesdits vecteurs de façon stable et possèdent en outre l'avantage d'être incluses dans la liste des organismes G.R.A.S. ("G.enerally Becognized Δs S_afe"). Des levures privilégiées sont préférentiellement des souches industrielles du genre Kluyveromyces capables de répliquer de façon stable lesdits plasmides dérivés du plasmide pKD1 et dans lesquels a été inséré un marqueur de sélection ainsi qu'une cassette d'expression permettant la sécrétion à des niveaux élevés des polypeptides de l'invention.
La présente invention concerne également les séquences nucléotidiques codant pour les polypeptides chimères décrits ci-avant, ainsi que les cellules recombinantes, eucaryotes ou procaryotes, comprenant de telles séquences.
La présente invention concerne aussi l'application à titre de médicament des polypeptides selon la présente rivention. Plus particulièrement, l'invention a pour objet toute composition pharmaceutique comprenant un ou plusieurs polypeptides ou séquences nucléotidiques tels que décrits ci-avant. Ces compositions pharmaceutiques peuvent se présenter sous forme de diverses formulations. Il peut notamment s'agir de nanoparticules à la surface desquelles sont présents des polypeptides selon l'invention. Ce type de formulation est plus particulièrement utilisé pour effectuer des ciblages dirigés en principe actif. Bien entedu, les séquences nucléotidiques peuvent être utilisées en thérapie génique.
La présente invention sera plus complètement décrite à l'aide des exemples qui suivent, qui doivent être considérés comme illustratifs et non limitatifs.
LISTE DES FIGURES
Les représentations des plasmides indiquées dans les Figures suivantes ne sont pas tracées à l'échelle et seuls les sites de restriction importants pour la compréhension des clonages réalisés ont été indiqués.
Figure 1 : Représentation schématique du domaine I de l'albumine avec localisation de sites d'insertion selon l'invention. * signale la localisation du site d'insertion h2-h3 dans le domaine III. Les chiffres 5, 8 et 13 identifient les zones d'insertion correspondantes.
Figure 2 : Représentation schématique de différents modes d'insertion d'un peptide actif dans la structure de l'albumine. Figure 3: Plasmide pYG105.
Figure 4: Modification de la région 5 de l'albumine suite à l'insertion de la séquence codant pour IEGR telle que décrite dans l'exemple 8.1. Les modifications figurent en caractères gras. L'emplacement des sites de restriction modifiés ou apportés sont indiqués par un trait horizontal et la position de coupure des enzymes correspondant par un trait vertical.
Figure 5: Stratégie de clonage pour l'insertion de IEGR dans la région 5 (exemple 8.1).
Figure 6: Stratégie de clonage pour l'insertion d'un peptide actif dans la région 13 de l'albumine.
EXEMPLES
TECHNIQUES GENERALES DE CLONAGE
Les méthodes classiquement utilisées en biologie moléculaire telles que les extractions préparatives d'ADN plasmidique, la centrifugation d'ADN plasmidique en gradient de chlorure de césium, l'électrophorèse sur gels d'agarose ou d'acrylamide, la purification de fragments d'ADN par électroélution, les extraction de protéines au phénol ou au phénol-chloroforme, la précipitation d'ADN en milieu salin par de l'éthanol ou de l'isopropanol, la transformation dans Escherichia coli etc ... sont bien connues de l'homme de métier et sont abondament décrites dans la littérature [Maniatis T. et al., "Molecular Cloning, a Laboratory Manual", Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, N.Y., 1982 ; Ausubel F.M. et al. (eds), "Current Protocols in Molecular Biology", John Wiley & Sons, New York, 1987]. Les enzymes de restriction ont été fournies par New England Biolabs
(Biolabs), Bethesda Research Laboratories (BRL) ou Amersham et sont utilisées selon les recommandations des fournisseurs.
Les plasmides de type pBR322, pUC et les phages de la série M13 sont d'origine commerciale (Bethesda Research Laboratories). Pour les ligatures, les fragments d'ADN sont séparés selon leur taille par électrophorèse en gels d'agarose ou d'acrylamide, extraits au phénol ou par un mélange phénol/chloroforme, précipités à l'éthanol puis incubés en présence de l'ADN ligase du phage T4 (Biolabs) selon les recommandations du fournisseur.
Le remplissage des extrémités 5' proéminentes est effectué par le fragment de
Klenow de l'ADN Polymérase I d'E. coli (Biolabs) selon les spécifications du fournisseur. La destruction des extrémités 3' proéminentes est effectuée en présence de l'ADN Polymérase du phage T4 (Biolabs) utilisée selon les recommandations du fabricant. La destruction des extrémités 5' proéminentes est effectuée par un traitement ménagé par la nucléase S1.
La mutagénèse dirigée in vitro par oligodéoxynucléotides synthétiques est effectuée selon la méthode développée par Taylor et al. [Nucleic Acids Res. ___\
(1985) 8749-8764] en utilisant le kit distribué par Amersham. Cette technique est notamment mise en oeuvre, dans le cadre de la présente invention, pour créer des sites de restriction uniques en vu d'une insertion subséquente.
L'amplification enzymatique de fragments d'ADN par la technique dite de PCR [Eolymérase-catalyzed £hain Réaction, Saiki R.K. et al., Science 22Ω (1985) 1350-
1354; Mullis K.B. et Faloona F.A., Meth. Enzym. 55 (1987) 335-350] est effectuée en utilisant un "DNA thermal cycler" (Perkin Elmer Cetus) selon les spécifications du fabricant.
La vérification des séquences nucléotidiques est effectuée par la méthode développée par Sanger et al. [Proc. Natl. Acad. Sci. USA, ___ (1977) 5463-5467] en utilisant le kit distribué par Amersham.
Les transformations de K. lactis avec l'ADN des plasmides d'expression des protéines de la présente invention sont effectuées par toute technique connue de l'homme de l'art, et dont un exemple est donné dans le texte. Sauf indication contraire, les souches bactériennes utilisées sont E. coli
MC1060 (lacJPOZYA, X74, gaJU, flajK, ≤tιAr), ou E. coli TG1 (lac, βro_A,B, ≤jiβE, îbi,
JtLSdDδ / F'HaD36, piQA+B+, ]acjq, lâΩZ, M15).
Les souches de levures utilisées appartiennent aux levures bourgeonnantes et plus particulièrement aux levures du genre Kluyveromyces. Les souche K. lactis MW98-8C (a, uraΔ, aiα, lys, K+, pKD1 °) et K. lactis CBS 293.91 ont été particulièrement utilisées; un échantillon de la souche MW98-8C a été déposé le 16
Septembre 1988 au Centraalbureau voor Schimmelkulturen (CBS) à Baarn (Pays
Bas) où il a été enregistré sous le numéro CBS 579.88. Une souche bactérienne (E. coli) transformée avec le plasmide pET-8c52K a été déposée le 17 Avril 1990 auprès de l'American Type Culture Collection sous le numéro ATCC 68306.
Les souches de levures transformées par les plasmides d'expression codant pour les protéines de la présente invention sont cultivées en erlenmeyers ou en fermenteurs pilotes de 21 (SETRIC, France) à 28°C en milieu riche (YPD: 1 % yeast extract, 2% Bactopeptone, 2% glucose; ou YPL: 1 % yeast extract, 2% Bactopeptone, 2% lactose) sous agitation constante.
EXEMPLE 1:
PROTOCOLE D'INSERTION STRICTE DE PEPTIDE EN UTILISANT UN SITE DE
RESTRICTION UNIQUE, PRESENT DANS LE GENE DE LA SAH.
De par son unicité dans le gène HSA et le vecteur associé, le site Pvull localisé naturellement dans la séquence codante, est particulièrement utile comme site de clonage d'un peptide biologiquement actif que l'on désire insérer en phase traductionnelle dans la SAH au niveau du 58'^me résidu. Dans un mode de réalisation particulier, il est utile d'employer des peptides de p résidus dont la séquence codante est [3xN]p. Dans ce cas, les oligonucléotides synthétisés sont du type 5'-NN [3xN]pN-3' et son brin complémentaire. La ligature de ce fragment avec le fragment de restriction Hindlll-Hindlll Δ Pvull, correspondant à la totalité du gène codant pour la SAH, génère un fragment de restriction Hindlll-Hjndjll comportant un gène hybride codant pour une protéine chimère du type SAH insertion stricte. Dans un autre mode de réalisation, le peptide peut être répété plusieurs fois dans la chimère.
EXEMPLE 2; PROTOCOLE D'INSERTION TOTALE OU PARTIELLE DE PEPTIDE EN UTILISANT DEUX SITES DE RESTRICTION UNIQUES ET NATURELS.
Dans un mode de réalisation particulier, l'utilisation de deux sites de restriction uniques permet de construire des gènes codant pour des chimères ayant le peptide actif en insertion stricte ou en substitution ou en insertion partielle. Par exemple, l'existence des sites uniques Hincll et Ayril dans la séquence codante de SAH et dans le vecteur permet de générer un fragment Hindlll-Hiηdlll Δ Hincll-Avrll. L'élimination du fragment nucléotidique Hincll-Avrll correspond à la délétion du fragment peptidique T(420) - N(429). L'utilisation d'un oligonucléotide complémentaire approprié permet de cloner un peptide en phase codante dans le gène de la SAH. Ce fragment de restriction peut être exclusivement la séquence codante complémentaire du peptide ou peut correspondre à un panachage de la séquence codante du peptide actif et de la séquence codante du fragment T(420) - N(429) de la SAH. Le peptide actif peut être présent plusieurs fois dans la chimère.
EXEMPLE 3
PLASMIDES D'EXPRESSION
Les protéines chimères des exemples précédents peuvent être exprimées dans les levures à partir de promoteurs fonctionnels, régulables ou constitutifs, tels que, par exemple, ceux présents dans les plasmides pYG105 (promoteur LAC4 de Kluweromvces lacis), pYG106 (promoteur PQK de Saccharomyces cerevisiae). pYG536 (promoteur £h-LQ5 de S .cerevisiae). ou des promoteur hybrides tels que ceux décrits dans la demande de brevet EP 361 991. Les plasmides pYG105 et pYG106 sont ici particulièrement utiles car ils permettent l'expression des gènes codés par les fragments de restriction Hindlll tel que décrits dans les exemples précédents et clones dans le site Hindlll et dans l'orientation productive (définie comme l'orientation qui place la région "prépro" de l'albumine de façon proximale par rapport au promoteur de transcription), à partir de promoteurs fonctionnels chez K.lactis. régulables (pYG105) ou constitutifs (pYG106). Le plasmide pYG105 correspond au plasmide pKan707 décrit dans la demande de brevet EP 361 991 dans lequel le site de restriction Hindlll unique et localisé dans le gène de résistance à la généticine (G418) a été détruit par mutagénèse dirigée tout en conservant une protéine inchangée (oligodeoxynucleotide 5'-GAAATGCATAAGCTCTTGCCATTCTCACCG-3' (SEQ ID N°3). Le fragment ≤aJI- __a__\ codant pour le gène URA3 du plasmide muté a été ensuite remplacé par un fragment de restriction £all-≤acj comportant une cassette d'expression constituée du promoteur LAC4 de K. lactis (sous la forme d'un fragment Sall-Hindlll) et du terminateur du gène PGK de S. cerevisiae (sous la forme d'un fragment Hindlll-Sacl). Le plasmide pYG105 est mitotiquement très stable chez les levures Kluyveromyces. Il est représenté en figure 3. Les plasmides pYG105 et pYG106 ne diffèrent entre eux que par la nature du promoteur de transcription encodé par le fragment Sall-Hindlll.
EXEMPLE 4 :
TRANSFORMATION DES LEVURES
La transformation des levures appartenant au genre Kluyveromyces. et en particulier les souches MW98-8C et CBS 293.91 de K. lactis. s'effectue par exemple par la technique de traitement des cellules entières par de l'acétate de lithium [Ito H. et al., J. Bacteriol. 152 (1983) 163-168], adaptée comme suit. La croissance des cellules se fait à 28°C dans 50 ml de milieu YPD, avec agitation et jusqu'à une densité optique à 600 nm (DOβOO) comprise entre 0,6 et 0,8; les cellules sont récoltées par centrifugation à faible vitesse, lavées dans une solution stérile de TE (10 mM Tris HCI pH 7,4; 1 mM EDTA), resuspendues dans 3-4 ml d'acétate lithium (0,1 M dans du TE) pour obtenir une densité cellulaire d'environ 2 x 108 cellules/ml, puis incubées à 30°C pendant 1 heure sous agitation modérée. Des aliquotes de 0,1 ml de la suspension résultante de cellules compétentes sont incubés à 30°C pendant 1 heure en présence d'ADN et à une concentration finale de 35% de polyéthylène glycol (PEG,4ooo> Sigma). Après un choc thermique de 5 minutes à 42°C, les cellules sont lavées 2 fois, resuspendues dans 0,2 ml d'eau stérile et incubées 16 heures à 28°C dans 2 ml de milieu YPD pour permettre l'expression phénotypique du gène de résistance au G418 exprimé sous contrôle du promoteur P^-j (cf. EP 361 991); 200 μl de la suspension cellulaire sont ensuite étalés sur boites YPD sélectives (G418, 200 μg/ml). Les boites sont mises à incuber à 28°C et les transformants apparaissent après 2 à 3 jours de croissance cellulaire.
EXEMPLE 5; SECRETION DES CHIMERES
Après sélection sur milieu riche supplémenté en G418 les clones recombinants sont testés pour leur capacité à sécréter la forme mature des protéines chimères. Quelques clones correspondant à la souche CBS 293.91 ou MW98-8C transformée par les plasmides d'expression des chimères entre la SAH et la partie biologiquement active sont mis à incuber en milieu YPD ou YPL à 28°C. Les surnageants cellulaires sont récupérés par centrifugation quand les cellules atteignent la phase stationnaire de croissance, éventuellement concentrés 10 fois par précipitation pendant 30 minutes à -20°C dans une concentration finale de 60% d'éthanol, puis testés après électrophorèse en gel SDS-PAGE 0, soit directement par coloration du gel par du 19
bleu de coomassie, soit après immunoblot en utilisant des anticorps primaires dirigés contre la partie biologiquement active ou un sérum polyclonal de lapin dirigé contre la SAH. Lors des expériences de détection immunologique, le filtre de nitrocellulose est d'abord incubé en présence des anticorps primaires spécifiques, lavé plusieurs fois, incubé en présence d'anticorps de chèvre dirigés contre les anticorps primaires, puis incubé en présence d'un complexe avidine-péroxydase en utilisant le "kit ABC" distribué par Vectastain (Biosys S.A., Compiègne, France). La réaction immunologique est ensuite révélée par addition de diamino-3,3' benzidine tetrachlorydrate (Prolabo) en présence d'eau oxygénée, selon les recommandations du fabricant.
EXEMPLE 6;
PURIFICATION DES CHIMERES
Les chimères présentes dans les surnageants de culture correspondant à la souche CBS 293.91 transformée, sont caractérisées dans un premier temps à l'aide d'anticorps spécifiques de la partie SAH. Il peut être souhaitable de purifier certaines de ces chimères. La culture est alors centrifugée (10000g, 30 min), le surnageant est passé à travers un filtre de 0,22 mm (Millipore), puis concentré par ultrafiltration (Amicon) en utilisant une membrane dont le seuil de discrimination se situe à 30 kDa. Le concentrât obtenu est alors dialyse contre une solution de Tris HCI (50 mM pH 8) puis purifié sur colonne. Par exemple, le concentrât correspondant au surnageant de culture de la souche CBS 293.91 transformée est purifié par chromatographie d'affinité sur Bleu-Trisacryl (IBF) et les échantillons sont ensuite dialyses contre de l'eau. Une purification par tamis moléculaire peut être ensuite réalisée. Dans ce cas, une colonne Superose 12 (Pharmacia) est préalablement équilibrée dans du tampon 20mM NaH2Pθ4 100mM NaCI pH 7.0 et les échantillons issus de la chromatographie d'affinité sont chargés sur la colonne, récoltés et caractérisés. Une purification par chromatographie d'échange d'ions peut également être utilisée. Dans certains cas, le concentrât obtenu après ultrafiltration est dialyse contre une solution de Tris HCI (50 mM pH 8), puis déposé par fractions de 20 ml sur une colonne (5 ml) échangeuse de cations (S Fast Flow, Pharmacia) équilibrée dans le même tampon. La colonne est alors lavée plusieurs fois par la solution de Tris HCI (50 mM pH 8) et la protéine chimère est alors éluée de la colonne par un gradient (0 à 1 M) de NaCI. Les fractions contenant la protéine chimère sont alors réunies et dialysées contre une solution de Tris HCI 50 mM (pH 8) puis redéposées sur colonne S Fast Flow. Après élution de la colonne, les fractions contenant la protéine sont réunies, dialysées contre de l'eau et lyophilisées avant caractérisation.
EXEMPLE 7;
INSERTION DU PEPTIDE 11 DANS LA SEQUENCE DE L'ALBUMINE
Le peptide 11 a été décrit en tant qu'épitote de la tryptophane synthase (Larvor et al. Mol. Immunol. (1991) 28, 523-531).
1. Insertion stricte dans une région ayant naturellement des sites de restriction uniques
Le peptide 11 a la séquence peptidique suivante dans le sens N a C terminal: HGRVGIYFGMK (SEQ ID N°20). La stratégie d'insertion dans la zone HincJI-ΔYill a consisté à faire une ligature entre un fragment nucléotidique synthétisé codant pour le peptide 11 et tel que le cadre de lecture pour la séquence codante de la SAH soit respecté et que la nature de la séquence codante de la SAH soit celle d'origine. Dans un premier temps nous avons donc synthétisé les deux oligonucléotides suivants : 5'- CCATGGTAGAGTAGGTATCTATTTCGGTATGAAAACTCCAACTCTTGTAGAGGTCT CGAGAAAT-3' (SEQ ID N°4) et 5'- CTAGATTTCTCGAGACCTCTACAAGATGTGGAGTTTTCATACCGAAATAGATACCT ACTCTACCATGG-3' (SEQ ID N°5). Ces deux oligonucléotides ont été hybrides puis ligaturés au fragment Hindlll-Hindlll Δ Hincll-Avrll. générant ainsi la totalité du gène de la SAH comportant l'insertion totale du peptide 11 entre S(419) et T(420), immé¬ diatement précédée de la région d'exportation" prépro" de la SAH. Ce fragment est clone dans l'orientation productive et dans le site Hindlll du plasmide pYG105. 2. Insertion par substitution et addition dans une région ayant naturellement des sites de restriction uniques
Dans un autre mode de réalisation, les oligonucléotides synthétisés ont été les suivants : 5'-CCATGGTAGAGTAGGTATCTATTTCGGTATGAAA-3'
(SEQ ID N°6) et 5'-CTAGTTTCΛTACCGAAATAGATACCTACTTCTTACCATGG-3' (SEQ ID N°7). Ces deux oligonucléotides sont hybrides puis ligaturés au fragment Hindlll-Hindlll Δ Hincll-Avrll. générant ainsi le gène d'une chimère amputé des résidus T(420) à N(429) et substitués par 'a séquence du peptide 11. Ce fragment est clone dans l'orientation productive et dans le site Hindlll du plasmide pYG105.
3. Insertion stricte dans une ήcjion ne possédant pas de sites de restriction uniques
Dans un autre mode de réelisation, deux sites de restriction uniques, Sst I et
Xho 1 , ont été crées par mutagér.èse dirigée. Le même type de clonage directionnel a été réalisé. Dans le cas de l'insertion totale du peptide 11 entre les résidus A(191) et S (192), les deux oligonucléotides suivants ont été synthétisés :5'- ACGGGATGAAGGGAAGGCCCATGGTAGAGTAGGTATCTATTTCGGTATGAAA-3' (SEQ ID N°8) et 5'-
TCGATTTCATTACCGAAATAGATACCTACTCTACCATGGGCCTTCCCTTCATCCCG TAGCT-3' (SEQ ID N°9). On prccède ensuite, selon le protocole déjà décrit aux points 1 ou 2 précédents, pour la réalisation du plasmide d'expression correspondant.
4. Insertion par substitution dans une région ne possédant pas de sites de restriction uniques
L'insertion nécessite au préalable la création des deux sites de restriction Sst I et Xho 1. Pour l'insertion partielle en soi, les deux oligonucléotides suivants ont été synthétisés : 5'-ACATGGTAGAGTAGGTATCTATTTCGGTATGAAA-3' (SEQ ID N°10) et 5'-TCGATTTCATACCGAAATAGATACCTACTCTACCATGTAGCT-3' (SEQ ID N°11). Dans ce dernier cas, les résidus R(186) à A(191) sont délétés et substitués par le peptide 11. Les deux plasmides d'expression de ces chimères sont respectivement 1671 et 1667. Chacun des plasmides, obtenus aux points 1 , 2, 3 et 4, est utilisé pour transformer une souche de levure selon le protocole décrit en exemple 4. les protéines correspondantes sont sécrétés et purifiées seon les exemples 5 et 6.
EXEMPLE g
INSERTION DE LA SEQUENCE PEPTIDIQUE IEGR, SUBSTRAT DU FACTEUR Xa
On procède à l'insertion du peptide contenant la séquence IEGR (SEQ ID N°21), cible du facteur protéasique Xa, qui coupe la prothrombine en thrombine dans la cascade de réactions intervenant dans la coagulation sanguine.
1. Insertion stricte dans la région 5 ayant un site Pvull unique
Pour effectuer cette insertion au site Pvu II du gène de l'albumine, il est dans un premier temps créer un vecteur réplicatif dépourvu du site Pvu II, dans lequel est ensuite inséré le gène codant pour la prépro albumine. Les deux oligonucléotides complémentaires suivants, codant pour la séquence IEGR, ont également été synthétisés: 5'-GATCCATAGAAGGTCGACTAG-3'(SEQ ID N°12) et 3'- CTAGGTATCTTCCAGCTGATC-5'(SEQ ID N°13). Ces deux oligonucléotides sont ensuite hybrides puis insérés au niveau du site Pvu II du gène de l'albumine. Les modifications que leur insertion fait apparaître sur les séquences nucléotidiques et peptidiques de l'albumine sont reportées sur la figure 4. La stratégie de clonage est schématisée en figure 5. Cette construction illustre le cas où des séquences de jonction sont introduites de part et d'autre du peptide d'intérêt.
2.lnsertion dans la région 13.
La figure 6 décrit une stratégie de clonage d'un peptide dans la région 13.
Dans ce qui suit, les sites de restriction Sst I et Xho 1 ont été créés par mutagénèse dirigée. Dans le cas de la région 13 on a procédé respectivement à une substitution totale et une substitution addition de la séquence IEGR simple ou encadrée de séquences de jonction. En ce qui concerne la substitution totale, les oligonucléotides utilisés sont les suivants:
5'- CAGAATCGAAGGTAGAGCC-3' (SEQ ID N°14) et 5'- TCGAGGCTCTACCTTCGATCGAGGGTAGCT- 3'(SEQ ID N°15) Au niveau proteique, la séquence (187)DEGK (SEQ ID N°22) est substituée par IEGR.
Dans le second cas, les oligonucléotides utilisés sont les suivants: 5'- ACCCTCGATCGAAGGTAGATCTCCA- 3'(SEQ ID N°16) 5'- TCGATGGAGATCTACCTTCGATCGAGGGTAGCT-3'(SEQ ID N°17)
Au niveau proteique, l'albumine est amputée du résidu R(186) au résidu A(191) et remplacée par la séquence PSIEGRSP (SEQ ID N°23) conduisant donc à une addition de deux résidus.
Les protéines correspondantes sont sécrétées et purifiées suivant les protocoles décrits dans les exemples précédents, le tableau I ci-après rend compte des caractéristiques de ces chimères.
Albumine Taux d'expression Rendement Pureté finale incorporant: uq/l purification
IEGR 150 15 98
PSIEGRPS 110 36 96
TABLEAU I
3 Activité bioloαioue de la chimère obtenue selon l'exemple 8.1
La chimère est incubée en présence de facteur Xa bovin dans un rapport enzyme/substrat de 1/10 et dans un tampon Tris 50mM, NaCI 100mM, CaCl2 1mM, pH 8.0 pendant 3 heures à 37°C. A l'issue de ce traitement, on réalise une analyse
SDS PAGE qui met en évidence le clivage de la chimère caractérisé par la génération d'un fragment d'albumine de masse de l'ordre de 60kD. LISTE DE SEQUENCES
(1) INFORMATION GENERALE:
(i) DEPOSANT: (A) NOM: RHONE-POULENC RORER S.A.
(B) RUE: 20, avenue Raymond ARON
(C) VILLE: ANTONY
(E) PAYS: FRANCE
(F) CODE POSTAL: 92165 (ii) TITRE DE L1 INVENTION :Nouveaux polypeptides biologiquement ac leur préparation et composition pharmaceutique les contenant.
(iii) NOMBRE DE SEQUENCES: 24
(iv) FORME LISIBLE PAR ORDINATEUR:
(A) TYPE DE SUPPORT: Tape (B) ORDINATEUR: IBM PC compatible
(C) SYSTEME D' EXPLOITATION: PC-DOS/MS-DOS
(D) LOGICIEL: Patentin Release #1.0, Version #1.25 (OEB)
(2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 1:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 13 paires de base
(B) TYPE: acide nucléique
(C) NOMBRE DE BRINS: simple
(D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc (iii) HYPOTHETIQUE: NON (iii) ANTI-SENS: NON (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 1:
GGCCNNNNNG GCC 13
(3) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 2:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 8 paires de base
(B) TYPE: acide nucléique (C ) NOMBRE DE BRINS: simple
(D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc (iii) HYPOTHETIQUE: NON (iii) ANTI-SENS: NON (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 2:
GCGGCCGC (4) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 3
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 30 paires de bases (B) TYPE: acide nucléique
(C) NOMBRE DE BRINS: simple
(D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc
(iii) HYPOTHETIQUE: NON (iii) ANTI-SENS: NON
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO:
GAAATGCATA AGCTCTTGCC ATTCTCACCG 30
(5) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 4:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 64 paires de bases
(B) TYPE: acide nucléique
(C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire
(ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc (iii) HYPOTHETIQUE: NON (iii) ANTI-SENS: NON (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID
CCATGGTAGA GTAGGTATCT ATTTCGGTAT GAAAACTCCA ACTCTTGTAG AGGTCTCGAG 60 AAAT 64
(6) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 5
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 68 paires de bases
(B) TYPE: acide nucléique
(C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire
(ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc (iii) HYPOTHETIQUE: NON (iii) ANTI-SENS: NON (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID N°5
CTAGATTTCT CGAGACCTCT ACAAGATGTG GAGTTTTCAT ACCGAAATAG ATACCTACTC 60 TACCATGG 68 (7) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 6:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 34 paires de bases
(B) TYPE: acide nucléique (C) NOMBRE DE BRINS: simple
(D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc (iii) HYPOTHETIQUE: NON (iii) ANTI-SENS: NON (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID Nc
CCATGGTAGA GTAGGTATCT ATTTCGGTAT GAAA 34
(8) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 7:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 40 paires de bases
(B) TYPE: acide nucléique
(C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire
(ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc (iii) HYPOTHETIQUE: NON (iii) ANTI-SENS: NON (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID N°7
CTAGTTTCAT ACCGAAATAG ATACCTACTT CTTACCATGG 40
(9) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 8: (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 52 paires de bases
(B) TYPE: acide nucléique
(C) NOMBRE DE BRINS: simple
(D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc
(iii) HYPOTHETIQUE: NON
(iii) ANTI-SENS: NON
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID Nc
ACGGGATGAA GGGAAGGCCC ATGGTAGAGT AGGTATCTAT TTCGGTATGA AA 52
(10) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 9:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 61 paires de bases
(B) TYPE: acide nucléique
(C) NOMBRE DE BRINS: simple
(D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc (iii) HYPOTHETIQUE: NON (iii) ANTI-SENS: NON (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID N 9
TCGATTTCAT TACCGAAATA GATACCTACT CTACCATGGG CCTTCCCTTC ATCCCGTAGC 60 T 61
(11) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 10:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 34 paires de bases (B) TYPE: acide nucléique
(C) NOMBRE DE BRINS: simple
(D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc
(iii) HYPOTHETIQUE: NON (iii) ANTI-SENS: NON
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID N°10
ACATGGTAGA GTAGGTATCT ATTTCGGTAT GAAA 34
(12) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 11: (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 42 paires de bases
(B) TYPE: acide nucléique
(C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire
(ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc (iii) HYPOTHETIQUE: NON (iii) ANTI-SENS: NON (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID N°ll
TCGATTTCAT ACCGAAATAG ATACCTACTC TACCATGTAG CT 42
(13) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 12: (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 21 paires de bases
(B) TYPE: acide nucléique
(C) NOMBRE DE BRINS: simple
(D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc (iii) HYPOTHETIQUE: NON (iii) ANTI-SENS: NON (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 12:
GATCCATAGA AGGTCGACTA G 21
(14) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 13:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 21 paires de bases
(B) TYPE: acide nucléique (C) NOMBRE DE BRINS: simple
(D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc
(iii) HYPOTHETIQUE: NON (iii) ANTI-SENS: NON
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID N°13
CTAGGTATCT TCCAGCTGAT C 21
(15) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 14:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 19 paires de bases
(B) TYPE: acide nucléique
(C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire
(ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc (iii) HYPOTHETIQUE: NON (iii) ANTI-SENS: NON (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID N°14
CAGAATCGAA GGTAGAGCC 19
(16) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 15:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 30 paires de bases
(B) TYPE: acide nucléique
(C) NOMBRE DE BRINS: simple
(D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc (iii) HYPOTHETIQUE: NON (iii) ANTI-SENS: NON (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID N°15
TCGAGGCTCT ACCTTCGATC GAGGGTAGCT 30
(17) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 16:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 24 paires de bases
(B) TYPE: acide nucléique (C) NOMBRE DE BRINS: simple
(D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc (iii) HYPOTHETIQUE: NON (iii) ANTI-SENS: NON (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID N°16
ACCCTCGATC GAAGGTAGAT CTCCA 24
(18) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 17: (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: 29
(A) LONGUEUR: 33 paires de bases
(B) TYPE: acide nucléique
(C) NOMBRE DE BRINS: simple
(D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc
(iii) HYPOTHETIQUE: NON
(iii) ANTI-SENS: NON
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID N°17
TCGATGGAGA TCTACCTTCG ATCGAGGGTA GCT 33
(19) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 18:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 31 paires de bases (B) TYPE: acide nucléique
(C) NOMBRE DE BRINS: simple
(D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc
(iii) HYPOTHETIQUE: NON (iii) ANTI-SENS: NON
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID N°18
GTCCCGGATG GAGCGCGTAC TTAGAGAGAA T 31
(20) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 19:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 39 paires de bases
(B) TYPE: acide nucléique
(C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire
(ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc (iii) HYPOTHETIQUE: NON (iii) ANTI-SENS: NON (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID N°19
TCGACAGGGC CTACCTCGCG CATGAATCTC TCTTAAGCT 39
(21) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 20:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 11 acides aminés
(B) TYPE: acide aminé (D) CONFIGURATION: linéaire
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 20
His Gly Arg Val Gly Ile Tyr Phe Gly Met Lys
5 10 (22) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 21:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 4 acides aminés
(B) TYPE: acide aminé
(D) CONFIGURATION: linéaire
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 21
Ile Glu Gly Arg
(23) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 22:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 4 acides aminés
(B) TYPE: acide aminé
(D) CONFIGURATION: linéaire (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 22
Asp Glu Gly Lys
(24) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 23: (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 8 acides aminés
(B) TYPE: acide aminé
(D) CONFIGURATION: linéaire
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 23
Pro Ser Ile Glu Gly Arg Ser Pro 5 (25) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 24:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 9 acides aminés
(B) TYPE: acide aminé
(D) CONFIGURATION: linéaire (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 24
Arg Met Glu Arg Val Leu Arg Glu Asn
5

Claims

REVENDICATIONS
1. Polypeptide recombinant comportant au moins une partie active dérivée d'un polypeptide, naturel ou synthétique, biologiquement actif, génétiquement insérée dans une albumine ou un de ses variants ou dérivés.
2. Polypeptide selon la revendication 1 caractérisé en ce que le polypeptide biologiquement actif possède une activité thérapeutique et est d'origine humaine.
3. Polypeptide selon la revendication 2 caractérisé en ce que le polypeptide ayant une activité thérapeutique est choisi parmi tout ou partie des enzymes, des inhibiteurs d'enzymes, des antigènes, des anticorps, des hormones, des récepteurs, des facteurs de la coagulation, des interférons, des cytokines, des facteurs de croissance et/ou de différenciation, des facteurs impliqués dans la génèse/résorption des tissus osseux, des facteurs chimiotactiques, des facteurs de motilité ou de migration cellulaire, des facteurs cytostatiques, des facteurs bactéricides ou antifongiques, ou des molécules adhésives plasmatiques, interstitielles ou des matrices extracellulaires.
4. Polypeptide selon l'une das revendications 1 à 3 caractérisé en ce que le polypeptide ayant une activité thérapeutique est choisi parmi toute séquence peptidique antagoniste ou agoniste d'interactions moléculaires et/ou cellulaires impliquées dans les pathologies des compartiments circulatoires et interstitiels.
5. Polypeptide selon l'une des revendications 1 à 4 caractérisé en ce que la partie active présente une structure choisie parmi :
(a) la structure peptidique entière ou,
(b) un fragment de (a) ou une structure dérivée de (a) par modification structurale (mutation, substitution, addition et/ou délétion d'un ou plusieurs résidus) et conservant une activité thérapeutique.
6. Polypeptide selon l'une des revendications 1 à 5 caractérisé en ce que la partie active est insérée strictement à l'intérieur de l'albumine ou entourée de séquence de jonctions.
7. Polypeptide selon l'une des revendications 1 à 6 caractérisé en ce que la partie active est insérée de préférence au niveau des régions de l'albumine présumées former des régions exposées à la surface de la molécule.
8. Polypeptide selon l'une des revendications 1 à 7 caractérisé en ce que la partie active est insérée au niveau de la région 5 s'etendant du résidu 57 à 62 de l'albumine.
9. Polypeptide selon l'une des revendications 1 à 7 caractérisé en ce que la partie active est insérée au niveau de la région 8 s'etendant du résidu 103 à 120 de l'albumine.
10. Polypeptide selon l'une des revendications 1 à 7 caractérisé en ce que la partie active est insérée au niveau de la région 13 s'etendant du résidu 178 à 200 de l'albumine.
11. Polypeptide selon l'une des revendications 1 à 7 caractérisé en ce que la partie active est insérée au niveau de la région du résidu 415 au résidu 425 délimitée par les hélices h2 et h3 du domaine III dans l'albumine.
12. Polypeptide selon l'une des revendications 1 à 12 caractérisé en ce que la partie active y est insérée sous forme unique ou multiple.
13. Polypeptide selon la revendication 12 caractérisé en ce que la partie active est répéter plusieurs fois au même endroit et/ou dans des régions différentes de l'albumine.
14. Polypeptide selon l'une des revendications 1 à 13 caractérisé en ce que les parties actives insérées sont de nature différente.
15. Variant d'une séquence nucléotidique codant pour l'albumine ou un de ses variants ou dérivés intégrant au moins un site de restriction unique non naturel.
16. Séquence nucléotidique codant pour un polypeptide selon l'une quelconque des revendications 1 à 14.
17. Séquence nucléotidique selon la revendication 16 caractérisée en ce qu'elle comprend une séquence "leader" permettant la sécrétion du polypeptide exprimé.
18. Cassette d'expression comprenant une séquence nucléotidique selon l'une des revendications 16 ou 17 sous le contrôle d'une région d'initiation de la transcription et éventuellement d'une région de terminaison de la transcription.
19. Plasmide autoréplicatif comportant une cassette d'expression selon la revendication 18.
20. Cellule recombinante eucaryote ou procaryote dans laquelle a été inséré une séquence nucléotidique selon l'une des revendications 16 ou 17 ou une cassette d'expression selon la revendication 18 ou un plasmide selon la revendication 19.
21. Cellule recombinante selon la revendication 20 caractérisée en ce qu'il s'agit d'une levure, d'une cellule animale, d'un champignon ou d'une bactérie.
22. Cellule recombinante selon la revendication 21 caractérisée en ce qu'il s'agit d'une levure.
23. Cellule recombinante selon la revendication 22 caractérisée en ce qu'il s'agit d'une levure du genre Saccharomyces ou Kluyveromyces.
24. Procédé de préparation d'un polypeptide tel que défini dans l'une des revendications 1 à 14 caractérisé en ce que l'on cultive une cellule recombinante selon l'une des revendications 20 à 23 dans des conditions d'expression, et on récupère le polypeptide produit.
25. Composition pharmaceutique comprenant un ou plusieurs polypeptides selon l'une quelconque des revendications 1 à 14.
26. Composition pharmaceutique comprenant une séquence nucléotidique selon l'une quelconque des revendications 16 à 17 utilisable en thérapie génique.
PCT/FR1995/000520 1994-05-06 1995-04-20 Polypeptides biologiquement actifs inseres dans une albumine WO1995030759A1 (fr)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FR94/05616 1994-05-06
FR9405616A FR2719593B1 (fr) 1994-05-06 1994-05-06 Nouveaux polypeptides biologiquement actifs, leur préparation et composition pharmaceutique les contenant.

Publications (1)

Publication Number Publication Date
WO1995030759A1 true WO1995030759A1 (fr) 1995-11-16

Family

ID=9462979

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/FR1995/000520 WO1995030759A1 (fr) 1994-05-06 1995-04-20 Polypeptides biologiquement actifs inseres dans une albumine

Country Status (2)

Country Link
FR (1) FR2719593B1 (fr)
WO (1) WO1995030759A1 (fr)

Cited By (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1997024445A1 (fr) * 1995-12-30 1997-07-10 Delta Biotechnology Limited Proteines de fusion recombinees d'hormone de croissance et d'albumine serique
WO2001005826A2 (fr) * 1999-07-19 2001-01-25 Gpc Biotech Inc. Polypeptides chimeres d'albumine serique et utilisations associees
WO2002070549A2 (fr) * 2001-01-18 2002-09-12 Gpc Biotech Inc. Polypeptides chimeriques d'albumine serique et utilisations de ces derniers
WO2004030686A1 (fr) * 2002-10-07 2004-04-15 Zav Yalov Vladimir Petrovich Peptides et proteines recombinantes imitant les interferons
US8012464B2 (en) 2001-12-21 2011-09-06 Human Genome Sciences, Inc. G-CSF-albumin fusion proteins
US8765915B2 (en) 2006-02-06 2014-07-01 Csl Behring Gmbh Modified coagulation factor VIIa with extended half-life
US9775888B2 (en) 2000-04-12 2017-10-03 Albumedix A/S Treatment with factor ix-albumin fusion protein

Families Citing this family (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
FR2686899B1 (fr) 1992-01-31 1995-09-01 Rhone Poulenc Rorer Sa Nouveaux polypeptides biologiquement actifs, leur preparation et compositions pharmaceutiques les contenant.
US6946134B1 (en) 2000-04-12 2005-09-20 Human Genome Sciences, Inc. Albumin fusion proteins
WO2004015113A2 (fr) * 2002-08-07 2004-02-19 Delta Biotechnology Ltd. Facteur neurotrophique ciliaire hybride avec l'albumine

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0399666A1 (fr) * 1989-04-29 1990-11-28 Delta Biotechnology Limited Protéines de fusion contenant des fragments N-terminaux de l'albumine de sérum humaine
WO1993015199A1 (fr) * 1992-01-31 1993-08-05 Rhone-Poulenc Rorer S.A. Nouveaux polypeptides biologiquement actifs, leur preparation et composition pharmaceutique les contenant
WO1993015211A1 (fr) * 1992-01-31 1993-08-05 Rhone-Poulenc Rorer S.A. Nouveaux polypeptides ayant une activite de stimulation des colonies de granulocytes, leur preparation et compositions pharmaceutiques les contenant
WO1993015200A1 (fr) * 1992-01-31 1993-08-05 Rhone-Poulenc Rorer S.A. Polypeptides antithrombotiques, antagonistes de la liaison du vwf aux plaquettes et/ou au sous-endothelium

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0399666A1 (fr) * 1989-04-29 1990-11-28 Delta Biotechnology Limited Protéines de fusion contenant des fragments N-terminaux de l'albumine de sérum humaine
WO1993015199A1 (fr) * 1992-01-31 1993-08-05 Rhone-Poulenc Rorer S.A. Nouveaux polypeptides biologiquement actifs, leur preparation et composition pharmaceutique les contenant
WO1993015211A1 (fr) * 1992-01-31 1993-08-05 Rhone-Poulenc Rorer S.A. Nouveaux polypeptides ayant une activite de stimulation des colonies de granulocytes, leur preparation et compositions pharmaceutiques les contenant
WO1993015200A1 (fr) * 1992-01-31 1993-08-05 Rhone-Poulenc Rorer S.A. Polypeptides antithrombotiques, antagonistes de la liaison du vwf aux plaquettes et/ou au sous-endothelium

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
J. VANDEKERCKHOVE ET AL.: "Enkephalins produced in transgenic plants using modified 2S seed storage proteins", BIOTECHNOLOGY, vol. 7, pages 929 - 932 *
JUBIER-MAURIN ET AL.: "Comparative study of the L1 family in the genus Mus : possible role of retroposition and convertion events in its concerted evolution", J. MOL. BIOL., vol. 184, no. 4, 20 August 1985 (1985-08-20), pages 547 - 564 *

Cited By (18)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US8642542B2 (en) 1995-12-30 2014-02-04 Novozymes Biopharma Dk A/S Recombinant fusion proteins to growth hormone and serum albumin
WO1997024445A1 (fr) * 1995-12-30 1997-07-10 Delta Biotechnology Limited Proteines de fusion recombinees d'hormone de croissance et d'albumine serique
EP1681304A3 (fr) * 1995-12-30 2006-11-22 Novozymes Delta Limited Protéines de fusion recombinées d'hormone de croissance et d'albumine sérique
CN100590133C (zh) * 1995-12-30 2010-02-17 诺维信生物制药英国有限公司 生长激素和血清白蛋白重组融合蛋白
WO2001005826A2 (fr) * 1999-07-19 2001-01-25 Gpc Biotech Inc. Polypeptides chimeres d'albumine serique et utilisations associees
WO2001005826A3 (fr) * 1999-07-19 2001-08-02 Gpc Biotech Inc Polypeptides chimeres d'albumine serique et utilisations associees
AU774555B2 (en) * 1999-07-19 2004-07-01 Gpc Biotech Inc. Chimeric polypeptides of serum albumin and uses related thereto
US10080785B2 (en) 2000-04-12 2018-09-25 Novozymes Biopharma Dk A/S Albumin fusion proteins
US9775888B2 (en) 2000-04-12 2017-10-03 Albumedix A/S Treatment with factor ix-albumin fusion protein
WO2002070549A3 (fr) * 2001-01-18 2003-07-03 Gpc Biotech Inc Polypeptides chimeriques d'albumine serique et utilisations de ces derniers
WO2002070549A2 (fr) * 2001-01-18 2002-09-12 Gpc Biotech Inc. Polypeptides chimeriques d'albumine serique et utilisations de ces derniers
US8211439B2 (en) 2001-12-21 2012-07-03 Human Genome Sciences, Inc. Albumin fusion proteins comprising insulin polypeptides
US8012464B2 (en) 2001-12-21 2011-09-06 Human Genome Sciences, Inc. G-CSF-albumin fusion proteins
US8993517B2 (en) 2001-12-21 2015-03-31 Human Genome Sciences, Inc. Albumin fusion proteins
US9221896B2 (en) 2001-12-21 2015-12-29 Human Genome Sciences, Inc. Albumin fusion proteins
US9296809B2 (en) 2001-12-21 2016-03-29 Human Genome Sciences, Inc. Albumin fusion proteins
WO2004030686A1 (fr) * 2002-10-07 2004-04-15 Zav Yalov Vladimir Petrovich Peptides et proteines recombinantes imitant les interferons
US8765915B2 (en) 2006-02-06 2014-07-01 Csl Behring Gmbh Modified coagulation factor VIIa with extended half-life

Also Published As

Publication number Publication date
FR2719593B1 (fr) 1996-05-31
FR2719593A1 (fr) 1995-11-10

Similar Documents

Publication Publication Date Title
EP0624195B1 (fr) Nouveaux polypeptides biologiquement actifs, leur preparation et composition pharmaceutique les contenant
WO1993015211A1 (fr) Nouveaux polypeptides ayant une activite de stimulation des colonies de granulocytes, leur preparation et compositions pharmaceutiques les contenant
FR2686901A1 (fr) Nouveaux polypeptides antithrombotiques, leur preparation et compositions pharmaceutiques les contenant.
EP0625202B1 (fr) Serum-albumine humaine, preparation et utilisation
EP0200655B1 (fr) Vecteurs d&#39;expression et de sécrétion de l&#39;hirudine par les levures transformées
JP2609367B2 (ja) プロセッシング部位に隣接する負に帯電したアミノ酸からなる酵母プロセッシングシステム
FR2650598A1 (fr) Derives de l&#39;albumine a fonction therapeutique
EP0236210B1 (fr) Procédé de préparation de la sérum albumine humaine mature
HUT51329A (en) Process for producing human serum albumin and other heterologous proteins from yeast by microbiological method
WO1995030759A1 (fr) Polypeptides biologiquement actifs inseres dans une albumine
EP2906593B1 (fr) Procede de preparation de proteine c1q recombinante
CA2077446A1 (fr) Procede de clonage et de production de polypeptides du domaine de liaison du facteur gpib humain de von willebrand, et methodes d&#39;utilisation
FR2680518A1 (fr) Promoteur de levure et son utilisation.
EP0652964B1 (fr) Promoteur du gene de la transaldolase de k. lactis et son utilisation
FR2635115A1 (fr) Procede de preparation de la serum albumine humaine a partir d&#39;une levure
WO1993015198A1 (fr) Polypeptides derives de l&#39;apolipoproteine aiv humaine, leur preparation et leur utilisation
JP3490444B2 (ja) 昆虫類の唾液からのトロンビン阻害剤
WO1994001569A1 (fr) Promoteur du gene de la pyruvate decarboxylase de k. lactis et son utilisation
EP0651811B1 (fr) Promoteur du gene de la proteine ribosomique rp28 de k. lactis et son utilisation
WO2022029389A1 (fr) Approche vaccinale basée sur des antigènes viraux triméricues
FR2701955A1 (fr) Facteur de croissance de la famille de l&#39;HARP, procédé d&#39;obtention et applications.
JPH0680697A (ja) ヒト好中球エラスターゼ阻害活性を有する天然型ポリペプチドおよびそれを含有する医薬製剤
EP0592574B1 (fr) Procede de production de proteines recombinantes et cellules hotes utilisees

Legal Events

Date Code Title Description
AK Designated states

Kind code of ref document: A1

Designated state(s): CA JP US

AL Designated countries for regional patents

Kind code of ref document: A1

Designated state(s): AT BE CH DE DK ES FR GB GR IE IT LU MC NL PT SE

DFPE Request for preliminary examination filed prior to expiration of 19th month from priority date (pct application filed before 20040101)
121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application
122 Ep: pct application non-entry in european phase
NENP Non-entry into the national phase

Ref country code: CA