TWI780098B - 用於進行自動流體測定體積試劑遞送和自動測試之系統和方法 - Google Patents

用於進行自動流體測定體積試劑遞送和自動測試之系統和方法 Download PDF

Info

Publication number
TWI780098B
TWI780098B TW106145537A TW106145537A TWI780098B TW I780098 B TWI780098 B TW I780098B TW 106145537 A TW106145537 A TW 106145537A TW 106145537 A TW106145537 A TW 106145537A TW I780098 B TWI780098 B TW I780098B
Authority
TW
Taiwan
Prior art keywords
reagent
fluid
flow path
pump
flow
Prior art date
Application number
TW106145537A
Other languages
English (en)
Other versions
TW201830020A (zh
Inventor
布萊德 凱恩特 德斯
凱文 凱配
Original Assignee
美商伊路米納有限公司
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by 美商伊路米納有限公司 filed Critical 美商伊路米納有限公司
Publication of TW201830020A publication Critical patent/TW201830020A/zh
Application granted granted Critical
Publication of TWI780098B publication Critical patent/TWI780098B/zh

Links

Images

Classifications

    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N35/00—Automatic analysis not limited to methods or materials provided for in any single one of groups G01N1/00 - G01N33/00; Handling materials therefor
    • G01N35/10—Devices for transferring samples or any liquids to, in, or from, the analysis apparatus, e.g. suction devices, injection devices
    • G01N35/1009—Characterised by arrangements for controlling the aspiration or dispense of liquids
    • G01N35/1016—Control of the volume dispensed or introduced
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
    • B01L3/00—Containers or dishes for laboratory use, e.g. laboratory glassware; Droppers
    • B01L3/02—Burettes; Pipettes
    • B01L3/0289—Apparatus for withdrawing or distributing predetermined quantities of fluid
    • B01L3/0293—Apparatus for withdrawing or distributing predetermined quantities of fluid for liquids
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
    • B01L3/00—Containers or dishes for laboratory use, e.g. laboratory glassware; Droppers
    • B01L3/50—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes
    • B01L3/502—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures
    • B01L3/5027—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip
    • B01L3/502715—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip characterised by interfacing components, e.g. fluidic, electrical, optical or mechanical interfaces
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
    • B01L3/00—Containers or dishes for laboratory use, e.g. laboratory glassware; Droppers
    • B01L3/50—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes
    • B01L3/502—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures
    • B01L3/5027—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip
    • B01L3/50273—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip characterised by the means or forces applied to move the fluids
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
    • B01L3/00—Containers or dishes for laboratory use, e.g. laboratory glassware; Droppers
    • B01L3/50—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes
    • B01L3/502—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures
    • B01L3/5027—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip
    • B01L3/502738—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip characterised by integrated valves
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N35/00—Automatic analysis not limited to methods or materials provided for in any single one of groups G01N1/00 - G01N33/00; Handling materials therefor
    • G01N35/10—Devices for transferring samples or any liquids to, in, or from, the analysis apparatus, e.g. suction devices, injection devices
    • G01N35/1002—Reagent dispensers
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N35/00—Automatic analysis not limited to methods or materials provided for in any single one of groups G01N1/00 - G01N33/00; Handling materials therefor
    • G01N35/10—Devices for transferring samples or any liquids to, in, or from, the analysis apparatus, e.g. suction devices, injection devices
    • G01N35/1009—Characterised by arrangements for controlling the aspiration or dispense of liquids
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N35/00—Automatic analysis not limited to methods or materials provided for in any single one of groups G01N1/00 - G01N33/00; Handling materials therefor
    • G01N35/10—Devices for transferring samples or any liquids to, in, or from, the analysis apparatus, e.g. suction devices, injection devices
    • G01N35/1095—Devices for transferring samples or any liquids to, in, or from, the analysis apparatus, e.g. suction devices, injection devices for supplying the samples to flow-through analysers
    • G01N35/1097—Devices for transferring samples or any liquids to, in, or from, the analysis apparatus, e.g. suction devices, injection devices for supplying the samples to flow-through analysers characterised by the valves
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
    • B01L2200/00—Solutions for specific problems relating to chemical or physical laboratory apparatus
    • B01L2200/02—Adapting objects or devices to another
    • B01L2200/026—Fluid interfacing between devices or objects, e.g. connectors, inlet details
    • B01L2200/027—Fluid interfacing between devices or objects, e.g. connectors, inlet details for microfluidic devices
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
    • B01L2200/00—Solutions for specific problems relating to chemical or physical laboratory apparatus
    • B01L2200/14—Process control and prevention of errors
    • B01L2200/143—Quality control, feedback systems
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
    • B01L2200/00—Solutions for specific problems relating to chemical or physical laboratory apparatus
    • B01L2200/16—Reagents, handling or storing thereof
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
    • B01L2300/00—Additional constructional details
    • B01L2300/02—Identification, exchange or storage of information
    • B01L2300/024—Storing results with means integrated into the container
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
    • B01L2300/00—Additional constructional details
    • B01L2300/08—Geometry, shape and general structure
    • B01L2300/0861—Configuration of multiple channels and/or chambers in a single devices
    • B01L2300/0877—Flow chambers
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
    • B01L2400/00—Moving or stopping fluids
    • B01L2400/04—Moving fluids with specific forces or mechanical means
    • B01L2400/0475—Moving fluids with specific forces or mechanical means specific mechanical means and fluid pressure
    • B01L2400/0478—Moving fluids with specific forces or mechanical means specific mechanical means and fluid pressure pistons
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
    • B01L2400/00—Moving or stopping fluids
    • B01L2400/06—Valves, specific forms thereof
    • B01L2400/0622—Valves, specific forms thereof distribution valves, valves having multiple inlets and/or outlets, e.g. metering valves, multi-way valves
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N35/00—Automatic analysis not limited to methods or materials provided for in any single one of groups G01N1/00 - G01N33/00; Handling materials therefor
    • G01N35/10—Devices for transferring samples or any liquids to, in, or from, the analysis apparatus, e.g. suction devices, injection devices
    • G01N35/1009—Characterised by arrangements for controlling the aspiration or dispense of liquids
    • G01N2035/1025—Fluid level sensing

Abstract

一種系統包括試劑選擇閥，其在控制上從多個試劑流動路徑中選擇試劑流動路徑，以及泵，其被耦合到試劑流動路徑以根據規定測試協議而通過試劑流動路徑吸取液體。系統包括排放流動路徑，其逐出所吸取液體，以及流量計，其測量由泵所排出的液體並且輸出代表所測流動的數據。系統還包括處理器以存取數據並且確定由泵所排出的液體的體積。

Description

用於進行自動流體測定體積試劑遞送和自動測試之系統和方法
本申請案涉及自動測定體積試劑遞送測試。
相關申請案之交互參照
本申請案主張享有：根據35 U.S.C.§119(e)於2017年3月24日所提申的英國(GB)專利申請案第1704772.1號的優先權，其主張於2017年1月5日所提申的美國專利申請案第62/442,736號的優先權的權益；以及根據35 U.S.C.§119(e)於2017年1月5日所提申的美國專利申請案第62/442,736號的優先權，兩者的整體內容以引用方式併入本文中。
背景技術器械已經開發並且繼續發展用於對感興趣的分子，特別是DNA，RNA和其他生物樣品進行測序。在測序操作之前，製備感興趣的分子樣品以形成文庫或模板，其將與試劑混合併最終引入流動池中，其中單個分子將附著在位點並被擴增以增強可檢測性。然後，測序操作包括重複一系列步驟以在位點處結合分子，標記結合組分，在位點處對組分成像，並處理所得圖像數據。
在這樣的測序系統中，流體系統(或子系統)在諸如編程計算機 的控制系統和適當的接口的控制下提供物質流(例如，試劑)。
在本說明書中描述的主題的一個或多個實施方式的細節在附圖和以下描述中闡述。從描述，附圖和權利要求中，其他特徵，方面和優點將變得顯而易見。
在一些實施方式中，提供一種系統，其包括試劑選擇閥，其在控制上從多個試劑流動路徑中選擇試劑流動路徑；泵，其流體地被耦合到試劑流動路徑，以根據規定測試協議而通過所選擇試劑流動路徑吸取流體，並且接著通過被流體地耦合於泵的排放流動路徑排放所吸取流體；流量計，其測量在自泵排放所吸取流體期間由於泵中的任何液體通過排放流動路徑的排出而引起的液體流速，並且產生表示所測量的液體流速的數據；以及控制電路，其在操作上被耦合到試劑選擇閥，泵和流量計，控制電路具有一個或多個處理器及儲存機器可執行指令的記憶體，機器可執行指令在由一個或多個處理器執行時控制一個或多個處理器存取所述數據，並且確定從數據中確定由泵所排出的液體的體積。
在系統的一些實施方式中，泵可包括注射器泵。
在系統的一些實施方式中，流量計可與排放流動路徑流體地共線。
在系統的一些實施方式中，記憶體可用以儲存或可儲存另外機器可執行指令，其在由一個或多個處理器執行時進一步控制一個或多個處理器以使一個或多個處理器使用數據來確定穩態流速，其開始在泵送周期開始之後的預定時間量並且結束在泵送周期結束之前的預定時間量。
在系統的一些實施方式中，記憶體可用以儲存或可儲存另外機器 可執行指令，其在由一個或多個處理器執行時進一步控制一個或多個處理器以使一個或多個處理器整合所測量的液體流速，來獲得由泵所排出的液體的總體積。
在系統的一些實施方式中，記憶體可用以儲存或可儲存另外機器可執行指令，其在由一個或多個處理器執行時進一步控制一個或多個處理器以使一個或多個處理器對所測量的液體流速進行低通濾波。
在系統的一些實施方式中，記憶體可用以儲存或可儲存另外機器可執行指令，其在由一個或多個處理器執行時進一步控制一個或多個處理器以控制試劑選擇閥和泵的操作來執行多個試劑排出測試，其中對於每個試劑排出測試控制一個或多個處理器以：a)使試劑選擇閥選擇試劑流動路徑中的不同一個作為所選擇試劑流動路徑，b)使泵抽吸預定量的流體，同時被流體地連接於所選擇試劑流動路徑通，c)使泵通過排放流動路徑將來自(b)的流體逐出，以及d)自流量計獲得關於任何液體流過排出流動路徑的所測量液體流速作為(c)的結果的數據。
在系統的一些實施方式中，記憶體可用以儲存或可儲存另外機器可執行指令，其在由一個或多個處理器執行時進一步控制一個或多個處理器以針對每個排出測試而響應於在(d)中所獲得的數據來確定是否存在故障狀況，其指示在(c)中流過排放流動路徑的液體的總量超出(b)的流體預定量的第一預定閾值量，並且當確定對於試劑排出測試中的一個或多個存在故障狀況時向用戶提供通知。
在系統的一些實施方式中，泵可吸取和排出的流體介在大約2000微升和大約4000微升。
在系統的一些實施方式中，泵可以介在大約每分鐘1000微升和大約每分鐘10000微升之間的流體流速來吸取和排出流體。
在一些實施方式中，可提供一種系統，其包括流動池，在基因測序操作期間將來自多個試劑收容器的試劑通過流動池予以泵送；試劑選擇閥，其在控制上以從多個試劑收容器中選擇所選擇試劑；共用線路選擇閥，其被流體地連接於試劑選擇閥並且在控制上選擇性地將所選擇試劑引導至流動池或通過旁通線路；排出流動路徑；流量計，其被流體地耦合到排放流動路徑以測量流過排放流動路徑的液體並且產生表示所測量液體流動的數據；泵，其被流體地插置於i)排放流動路徑和ii)流動池及旁通線路之間，泵吸取所選擇試劑通過由試劑選擇閥和共用線路選擇閥的位置所定義的流動路徑，並且將所選擇試劑通過排放流動路徑予以逐出；以及控制電路，其在操作上被耦合到試劑選擇閥，共用線路選擇閥，泵和流量計，控制電路具有一個或多個處理器和儲存機器可執行指令的記憶體，機器可執行指令在由一個或多個處理器執行時控制一個或多個處理器存取數據並且確定由泵逐出的液體的體積。
在系統的一些實施方式中，記憶體可用以儲存或可儲存另外機器可執行指令，其在由一個或多個處理器執行時進一步控制一個或多個處理器以使試劑選擇閥和共用線路選擇閥定義所欲流動路徑。
在系統的一些實施方式中，記憶體可用以儲存或可儲存另外機器可執行指令，其在由一個或多個處理器執行時進一步控制一個或多個處理器以實行多個試劑排出測試，其中對於每個試劑排出測試，一個或多個處理器被控制為：a)使試劑選擇閥選擇不同試劑，並且使共用線路選擇閥在流通池或旁通線路之間進行選擇以定義選定流動路徑，b)使泵通過所選擇流動路徑抽吸預定量的流體，c)使泵將來自(b)的流體通過排出流動路徑予以逐出，以及d)從流量計獲得關於由於(c)所產生的流過排放流動路徑的任何液體試劑的所測量液體流速。
在系統的一些實施方式中，記憶體可用以儲存或可儲存另外機器 可執行指令，其在由一個或多個處理器執行時進一步控制一個或多個處理器以針對每個排出測試而響應於在(d)中所獲得的數據來確定是否存在故障狀況，其指示在(c)中流過排放流動路徑的液體的總體積超出(b)的流體預定量的第一預定閾值量，並且當確定對於試劑排出測試中的一個或多個存在故障狀況時向用戶提供通知。
在系統的一些實施方式中，記憶體可用以儲存或可儲存另外機器可執行指令，其在由一個或多個處理器執行時進一步控制一個或多個處理器整合來自(d)的所測量液體流速，以獲得在(c)中由泵所逐出的流體的總體積。
在一些實施方式中，可提供一種方法，其包括實施用於實行一個或多個試劑排出測試的儲存測試協議，其中每個試劑排出測試包括：a)從多個試劑流動路徑中選擇試劑流動路徑，b)根據儲存測試協議啟動泵以通過所選擇試劑流動路徑吸取預定量的流體，c)從泵中通過排出流動路徑排出吸取流體，d)測量在(c)期間通過排放流動路徑所排放的任何液體的流速並且產生表示流速的數據，以及e)處理數據以確定所選擇試劑流動路徑的品質。
在方法的一些實施方式中，可針對不同的試劑流動路徑重複(a)至(e)。
在方法的一些實施方式中，(e)還可包括：f)在(e)期間，使用數據確定在(c)期間流過排放流動路徑的液體的總體積，g)由於在(c)期間通過排放路徑的液體流的總體積超出的流體預定量的第一閾值量而確定(a)的所選擇試劑流動路徑具有缺陷，以及h)響應於(g)產生關於故障的通知。
在方法的一些實方式中，(e)可包括對數據進行低通濾波。
在方法的一些實施方式中，(f)可包括對數據進行積分以獲得在(c)期間流過排出流動路徑的液體的總體積。
在本申請案說明書中所述主題的一個或多個實施方式的細節被 闡述在後附圖式和下述說明中。根據下述說明，後附圖式和申請專利範圍，其它特徵，觀點和優點將變得顯而易見。注意到下述圖式的相對尺寸未必按比例繪製。
10:定序系統
12:儀器
14:樣品來源
16:樣品
18:樣品/庫製備系統
20:流動池/陣列
22:可移動平台
24:方向
26:光學檢測系統
28:光
30:試劑
32:閥控元件
34:流動路徑
36:流出物流動路徑
38:泵
40:附加閥控元件
42:處置器皿/收容器
44:控制/監督系統
46:控制系統
48:數據採集和分析系統
50:記憶體電路
52:介面
54:外部網路或系統
56A、56B:通道
58:(第一)共用線路
60:(第二)共用線路
62:旁通線路
64:收容器/試劑
66:試劑選擇閥(RSV)
68:共用線路選擇閥(CLSV)
70:注射器
72:致動器
74A、74B、74C:壓力感測器
76:試劑選擇閥(URSV)
78:第一用過試劑收容器
80:流速計
82:第二用過試劑收容器
84:閥介面介面
86:泵介面
88:輸入/輸出電路
90:流控控制協議
92:平台控制協議
94:光學控制協議
96:圖像採集和處理協議
98:其它協議/例程
100:處理器
101:操作員介面
104:遞送測試控制邏輯
106:抽吸序列/過程
108:遞送序列/過程
110:數據處理/分析序列/過程
150:截斷分析
152:原始流速數據圖表
154:垂直軸線
156:水平軸線
158:時間步進
160:原始跡線
162:濾波流速數據圖表
164:跡線
166:尖峰
168:平均分析圖表
170:平均值跡線
174:濾波流速數據圖表
176:垂直軸線
178:水平軸線
180:時間步進
182:完整跡線
184:上升跡線
186:下降跡線
188:穩態跡線
190:截切流速數據圖表
192:積分數據圖表
194:垂直軸線
196:體積跡線
198、208、212:條形圖
200:垂直軸線
202:水平軸線
204:正常/預期流速數據
206、216:異常
210:值
214:正常/預期流量數據
當參考後附圖式來閱讀以下〔實施方式〕時，本申請案的此些和其它特徵，觀點和優點將變得更好理解，其中在所有後附圖式中，相同文字表示相同元件，其中：圖1是其中可採用所主張技術的示例性定序系統的圖解概觀；圖2是圖1的定序系統的示例性流體系統的圖解概觀；圖3是圖1的定序系統的示例性處理和控制系統的圖解概觀；圖4是例示用於在圖1的定序系統上所實行的自動測定體積試劑遞送測試的遞送測試控制邏輯的實例的流程圖；圖5是例示後隨有對所測量流速數據進行移動平均濾波分析的數據截斷分析的實例的例圖；圖6是例示對經濾波流速數據進行積分分析來確定流量的實例的例圖；以及圖7是例示出包括針對每個測試流動路徑所呈現的測量流速，標準偏差和計算流量的自動測定體積試劑遞送測試的結果實例的例圖。
圖1例示經配置為處理分子樣品的定序系統10的實施方式，分子樣品可被定序以確定其成分，成分順序以及大體上樣品結構。系統包括用以接收並且處理生物樣品的儀器12。樣品來源14提供樣品16，其在很多情況下將包 括組織樣品。樣品來源可包括例如個體或受試者，諸如人類、動物、微生物、植物或其它施體(包括環境樣品)，或者是包括關注有機分子的任何其它受試者，其之序列是待定的。系統可與取得自生物體的樣品以外的樣品一起使用，包括合成分子。在許多情況下，分子將包括DNA、RNA或具有鹼基對的其它分子，其之序列可定義具有最終關注特定功能的基因和變體。
將樣品16引入樣品/庫(library)製備系統18中。系統可分離，斷開，和以其它方式準備樣品以用於分析。所生成庫包括利於定序操作的關注分子的長度有。接著將所生成庫提供給其中進行定序操作的儀器12。事實上，有時候可被稱作為模板的庫在自動或半自動過程中與試劑組合，並且接著在進行定序之前先行被引入流動池。
在圖1所例示的實施方式中，儀器包括用以接收樣品庫的流動池或陣列20。流動池包括用以允許定序化學發生的一個或多個流體通道，其包括庫的分子的附著連接，以及在定序操作期間可被檢測的位置或位點處的增幅。例如，流動池/陣列20可包括被固定在位置或位點處的一個或多個表面上的定序模板。“流動池”可包括圖案化陣列，諸如微陣列，奈米陣列等。實際上，此些位置或位點可在支撐件的一個或多個表面上以規則且重複模式、複雜非重複模式、或隨機安排進行佈置。為使定序化學發生，流動池還允許引入用於反應，沖洗等的物質，例如包括各種試劑，緩衝液和其它反應介質。此些物質流過流動池並且可在個別位點處與關注分子接觸。
在儀器12中，流動池20被安裝在可移動平台22上，其在此實施方式中可如元件符號24所指示的一個或多個方向上移動。流動池20可例如被設置成可移除且可替換卡匣的形式，其可與系統的可移動平台22或其它構件上的埠口介接，以便允許試劑和其它流體被來回遞送於流動池20。平台與在定序期間可將輻射或光28引導至流動池的光學檢測系統26相關聯。光學檢測系統可採用 各種方法(例如螢光顯微鏡方法)來檢測被設置在流動池的位點處的分析物。作為非限制性實例，光學檢測系統26可採用共焦線路掃描以產生漸進像素化圖像數據，其可被分析以定位流動池中的各別位點並且確定最近被附著或結合到每個站點的核苷酸的類型。還可採用其它合適的成像技術，諸如其中著樣品掃描一個或多個輻射點的技術或採用“步進和射擊”成像方法的技術。光學檢測系統26和平台22可協作以維持流動池和檢測系統處於靜態關係，同時獲得區域圖像，或者是如所指出的，流動池可以任何合適模式予以掃描(例如點掃描，線掃描，“步進和射擊”掃描)。
儘管許多不同的技術可被用於成像，或者是更一般地被用於檢測位點處的分子，但是目前設想到的實施方式可在引起螢光標籤激發的波長處利用共焦光學成像。憑藉其吸收光譜被激發的標籤憑藉其發射光譜返回螢光信號。光學檢測系統26被配置為捕獲如此信號，以在允許分析信號發射位點的解析度下處理像素化圖像數據，並且處理及儲存所生成圖像數據(或從其導出的數據)。
在定序操作中，循環操作或過程以其中促進反應的自動或半自動方式予以實施，例如使用單一核苷酸或使用寡核苷酸，接著進行沖洗，成像和去阻隔以製備後續循環。在從樣品庫中提取所有有用資訊之前，被製備為用於定序並且被固定在流動池上的樣品庫可經歷多次如此循環。光學檢測系統可通過使用電子檢測電路(例如照相機或成像電子電路或晶片)以在定序操作的每個循環期間從對流動池(及其位點)的掃描中生成圖像數據。接著可分析所生成圖像數據以在圖像數據中定位各別位點，並且例如通過參考在特定位置處被檢測到的光的特定顏色或波長(特定螢光標籤的特徵發射光譜)來分析和表徵在位點處所存在的分子，如在此位置處的圖像數據中的一群或一組像素所指示。例如在DNA或RNA定序應用中，四種常見核苷酸可由可區別的螢光發射光 譜(光的波長或波長范圍)來表示。每個發射光譜接著可被賦予對應於此核苷酸的值。基於此分析並且追踪為每個位點所確定的循環值，可為每個位點確定個別核苷酸及其順序。接著可進一步處理此些序列以組合段包括基因，染色體等的較長片段。如在本說明書中所使用，術語“自動”和“半自動”意謂一旦操作被啟動或一旦包括操作的過程被啟動，則通過使用少許或無人互動進行編程或配置的系統來執行此些操作。
在所例示實施方式中，試劑30通過閥控元件(valving)32被吸入或抽吸到流動池中。閥控元件可從儲有試劑的收容器或器皿中存取試劑，諸如通過移液管或吸管(圖1中未示出))。閥控元件32可允許基於所執行的規定定序操作來選擇試劑。閥門可進一步接收命令以用於引導試劑通過流動路徑34進入流動池。出口或流出物流動路徑36引導來自流動池的用過試劑。在所例示實施方式中，泵作用於將試劑移動通過系統。泵38還可作用於其它有用功能，諸如測量通過系統10的試劑或其它流體，抽吸空氣或其它流體等。泵38下游的附加閥控元件40允許將用過試劑適當地引導至處置器皿或收容器42。
儀器還包括一定程度的電路，其有助於命令各種系統組件的操作，通過來自感測器的反饋來監測它們的操作，收集圖像數據，並且至少部分地處理圖像數據。在圖1所例示實施方式中，控制/監督系統44包括控制系統46和數據採集和分析系統48。前述系統兩者將包括一個或多個處理器(例如數位處理電路，諸如微處理器、多核處理器、FPGA或任何其它合適的處理電路)，以及可儲存機器可執行指令以用於例如控制一個或更多電腦、處理器或其它類似邏輯裝置來提供某些功能的相關聯記憶體電路50(例如固態記憶體裝置，動態記憶體裝置，板上及/或板外記憶體裝置等)。專用或通用電腦可至少部分組成控制系統和數據採集和分析系統。控制系統可包括例如電路(例如經過編程)用以處理用於流控(fluidics)，光學，平台控制和儀器的任何其它有用功能的命 令。數據採集和分析系統48與光學檢測系統介接以命令光學檢測系統或平台或前述兩者的移動，用於循環檢測的光的發射，返回信號的接收和處理等。儀器還可包括如元件符號52所示的各種介面，諸如操作員介面，其允許對儀器進行控制和監測，加載樣品，啟動自動或半自動定序操作，生成報告等。最後，在圖1的實施方式中，外部網路或系統54可被耦合到儀器並且與其配合，以例如用於分析，控制，監測，維修和其它操作。
可被注意到的是儘管在圖1中例示單一流動池和流控路徑以及單一光學檢測系統。然而在一些儀器中可容納多於一個的流動池和流控路徑。例如在目前設想到的實施方式中，提供兩種如此配置以增強定序和吞吐量。實際上，可提供任何數量的流動池和路徑。這些可使用相同或不同的試劑收容器，處置收容器，控制系統，圖像分析系統等。在有提供的情況下，多個流控系統可經個別控制或以協作方式予以控制。要被理解到的是術語“流體地連接”在本文中可用於敘述兩個或多個構件之間的連接，其使此些構件彼此流體地連通，如此與“電性連接”的方式相同，其可用於敘述在兩個或多個構件之間的電性連接。例如，可使用術語“流體地插置”來敘述構件的特定順序。例如，如果將構件B流體地插置在構件A和C之間，則從構件A流動到構件C的流體在到達構件C之前將流過構件B。
圖2例示圖1的定序系統的示例性流體系統。在所例示實施方式中，流動池20包括一系列路徑或通道56A和56B，其可被成對分組以用於在定序操作期間接收流體物質(例如試劑，緩衝液，反應介質)。通道56A被耦合到共用線路58(第一共用線路)，而通道56B被耦合到第二共用線路60。還提供旁通線路62以允許流體繞過流動池而不進入流動池20。如上述，一系列器皿或收容器64允許儲存可在定序操作期間使用的試劑和其它流體。試劑選擇閥66(RSV)被機械地耦合到馬達或致動器(未示出)，以允許選擇要被引入流動池的試劑中 的一個或多個。接著所選擇試劑前進到共用線路選擇閥(CLSV)68，其類似地包括馬達(未示出)。共用線路選擇閥68可被命令以選擇共用線路58和60中的一個或多個、或兩個共用線路，以使試劑64以受控方式流動到通道56A及/或56B，或者是旁通線路62以使試劑中的一個或多個流過旁通線路。可被注意到的是可通過旁通線路來實現其它有用操作，例如將所有試劑(和液體)灌注到試劑選擇閥(和共用線路選擇閥)而不吸入空氣通過流通池的功能，獨立於流動池實行試劑通道和吸管的沖洗(例如，自動或半自動沖洗)的功能，以及在系統上實行診斷功能(例如壓力和體積遞送測試)的功能。
用過試劑通過被耦合在流動池和泵38之間的線路離開流動池。在所例示實施方式中，泵38包括具有一對注射器70的注射器泵，此對注射器70由致動器72控制和移動以抽吸試劑和其它流體，並且在測試，驗證和定序循環的不同操作期間射出或逐出試劑和流體。泵組件可包括各種其它部件和部件，包括閥控元件，儀表，致動器等(未示出)。在所例示實施方式中，壓力感測器74A和74B感測在泵的入口線路上的壓力，而設置壓力感測器74C以感測由注射器泵所輸出的壓力。
被系統使用的流體從泵輸入用過試劑選擇閥(URSV)76。此閥允許選擇用於用過試劑和其它流體的多個流動路徑中之一個。在所例示實施方式中，第一流動路徑通向第一用過試劑收容器78，而第二流動路徑通過流量計80通向第二用過試劑收容器82。取決於所使用的試劑，將試劑或某些試劑收集分開器皿中以用於處置可以是有利的，並且用過試劑選擇閥76允許如此控制。
應該要注意的是在泵組件內的閥控元件可允許各種流體(包括試劑，溶劑，清潔劑，空氣等)被泵抽吸並且通過一個或多個共用線路，旁通線路和流動池予以注入或循環。此外，如上述，在目前設想的實施方式中，圖2中所示流控系統的兩個並行實施方式可在共用控制下予以設置。每個流控系統可 以是單一定序儀器的一部分，並且可並行地執行包括對不同流動池和樣品庫的定序操作的功能。
流控系統在控制系統46的命令下操作，控制系統46實施用於測試，驗證，定序等的規定協議。規定協議將被事先建立，並且包括一系列活動事件或操作，諸如抽吸試劑、抽吸空氣、抽吸其它流體、排出此些試劑，空氣和流體等。此協議將允許如此流控操作與儀器的其它操作的協作，諸如在流動池中發生的反應、流動池及其位點的成像等。在所例示實施方式中，控制系統46採用一個或多個閥介面84，以提供用於閥的命令信號，以及泵介面86，以命令泵致動器的操作。各種輸入/輸出電路88也可以被設置以用於接收反饋並且處理此反饋，其諸如來自壓力感測器74A-C和流量計80。
圖3例示控制/監督系統44的某些功能構件的實例。如所例示，記憶體電路50儲存在測試，調試，故障排除，維修和定序操作期間所執行的規定例程。許多如此協議和例程可被實施並且被儲存在記憶體電路中，並且如此協議和例程可不時地被更新或變更。如圖3所例示，如此協議和例程可包括流控控制協議90，以用於控制各種閥，泵和任何其它流控致動器，以及用於接收和處理來自流控感測器(例如閥)和流動和壓力感測器的反饋。平台控制協議92允許根據需要(例如在成像期間)移動流動池。光學控制協議94允許向成像構件發出命令以照亮流動池的部分並且接收返回信號以進行處理。圖像採集和處理協議96允許對圖像數據進行至少部分處理，以提取用於定序的有用數據。如元件符號98所示的其它協議和例程可被提供在相同或不同的記憶體電路中。實際上，記憶體電路可被提供為一個或多個記憶體裝置，例如揮發性和非揮發性記憶體。此記憶體可在儀器內，並且有時可在板外。
一個或多個處理器100存取儲存協議並且在儀器上予以實施。如上述，處理電路可以是專用電腦、通用電腦或任何合適硬體，韌體和軟體平台 的一部分。處理器和儀器的操作可由人類操作員通過操作員介面101來命令。操作員介面可允許測試，調試，故障排除和維修，以及用於報告儀器中可出現的任何問題。操作員介面也可允許啟動和監視定序操作。
如上所述，為使定序能夠發生，基於所實行的規定定序操作引入試劑用於反應。在製造，調試或使用期間實行診斷測試以檢查流體系統是否存在洩漏或堵塞可能是理想的，以避免不正確試劑量被遞送。為試劑遞送的準確確定而避免手動操作，提供如下述的自動測定體積(volumetric)試劑遞送測試。
圖4是例示用於可在定序系統10上實行的自動測定體積試劑遞送測試的遞送測試控制邏輯104的實例的流程圖。遞送測試控制邏輯104的一個或多個事件可由控制/監督系統44(例如控制系統46及數據採集和分析系統48)予以執行。在所例示實施方式中，遞送測試控制邏輯104可包括用以實行抽吸序列(包括112至122)的過程106，用以實行遞送序列(包括124至130)的過程108，以及用以實行數據處理/分析序列(包括132到144)。遞送測試控制邏輯104還可包括用於退出遞送測試控制邏輯104的邏輯146，以及用於重複遞送測試控制邏輯104以測試另一關注流動路徑(試劑)的過程148。
在啟動遞送測試控制邏輯104時，控制系統46可在方塊112中驗證定序系統10的各種“歸位(home)”狀態。例如，定序系統10可能已經處於空閒狀態，使得在啟動遞送測試控制邏輯104時，控制系統46可首先驗證各種閥是否歸位(例如RSV 66，CLSV 68，URSV 76)以及泵是否歸位(例如泵38)等。如在本文中所使用的術語歸位意謂將可調構件返回預設或“歸位”位置的過程，例如返回特定操作限制或預定設定的過程。在114處，控制系統46可將URSV 76移動到第一位置以將排出流動路徑(其可在泵38下游)與收容器82流體地連接。在某些實施方式中，控制系統46可將URSV 76移動到與第一位置不同的第二位置以將排出流動路徑與收容器78流體地連接。在116處，控制系統46可將CLSV 68移動到對應於相應流動路徑的位置或埠口。例如，流動路徑可包括與第一共用線路58流體地連接的一個或多個路途或通道56A、或與第二共用線路60流體地連接的路途或通道56B，流動路徑還可包括旁通線路62。CLSV 68的不同位置或埠口可分別對應於上述流動路徑之一個，因此通過將CLSV 68移動到特定位置，可選擇相應流動路徑。
在118處，控制系統46可致動一個或多個閥，其可以是一個或多個泵38的一部分，如此一個或多個泵通過流動池20或通過旁通線路62與相應試劑流動路徑流體地連接。例如，控制系統46可使閥門將泵38的輸出/輸入流體地耦合至泵38的第一埠口，其與連接至流動池20的試劑流動路徑流體地連接，或者是控制系統46可使閥門將泵38的輸出/輸入流體耦合至泵38的第二埠口，該第二埠口與連接至旁通線路62的試劑流動路徑流體連接。在120處，控制系統46可使RSV 66移動以允許從多個不同試劑中抽吸特定試劑。例如，RSV 66可移動到不同位置或埠口，其中每個位置或埠口對應於相應試劑。可理解到的是過程114至120可以或未必(及/或以與上述相同順序)被執行。在某些實施方式中，過程114至120可彼此並行或同時被執行。
在122處，控制系統46控制泵38以經由穿過RSV 66和CLSV 68的流動路徑，從試劑來源或其它來源抽吸一定體積的試劑或其它液體或流體。一旦完成過程112至120，關注流動路徑將被建立，從而選擇相應關注試劑，並且控制系統46可開始通過協議抽吸體積，例如抽吸如由特定協議(諸如測試協議或分析協議)所確定的所選擇關注試劑的指定體積。這樣結束抽吸序列(106)。接下來，遞送測試控制邏輯104可前進至遞送序列108(包括過程124至130)。在124處，控制系統46可使作為泵38的一部分的閥致動至分配配置，使得當泵38被致動以將所抽吸試劑逐出泵38，所分配流體流動至指定埠口。例如，泵38的閥的閥位置可被改變為在泵38處進行“分配”，以使流體被分配到URSV 76而不是 到流通池20或旁通線路62。換言之，在遞送序列(108)期間，泵38從抽吸序列(106)吸取的內容被分配到URSV 76。可控制URSV 76以便將所分配流體繞送通過排出流動路徑，其通過流量計80到用過試劑收容器82。
在126處，控制系統46經由流量計80開始數據(例如流速數據)記錄。可連續地或以任何合適的時間間隔記錄數據。可理解到的是數據記錄間隔可與流量計80的流動響應時間一樣短(例如大約20毫秒)。在過程128中，控制系統46使泵38開始分配流體體積，並且所分配流體流入收容器82。在130處，控制系統46停止記錄數據(例如流速數據)。在某些實施方式中，數據記錄可發生直到泵38的注射器70完成分配動作為止，即在泵38的整個分配循環期間。在某些實施方式中，當流速達到穩定狀態或處於根據測試協議的任何其它合適時間時，可發生數據記錄的終止。
一旦針對給定試劑/流動路徑收集數據，可用一個或多個方式分析測定體積流速數據以執行各種診斷檢查。例如，在一些實施方式中，可分析流速數據以便在給定量的液體(試劑)被抽吸之後確定從泵38分配多少液體-如果被分配的總量少(或多)於被抽吸的總量，則可確定錯誤條件。例如，測試協議可包括驅動泵38以經由選定的流動路徑抽吸2000μL的特定試劑，並且接著致動泵38以將所有抽吸的液體通過流量計80完全地分配。如果流量計80收集指示只有1500μL流過流量計80的數據，則如此可指示某一類型的系統錯誤，例如在流動路徑中的洩漏有500μL的液體試劑損失、不足量的試劑在試劑收容器中(如此可能發生，如果試劑收容器有受損)、或泵38的不正確致動(如此可能發生，例如如果泵致動被錯誤校準-注射器泵通常可被致動以基於感測器來分配精確量的液體，感測器測量在此泵中的注射器柱塞在致動期間經歷多少行進；如果感測器被錯誤校準，則柱塞可能行進太少並且抽吸入比期望的少的液體-以類似方式，注射器泵也可在相反意義上被錯誤校準，例如它可能抽吸比期望 多的液體，流量計在這種情況下可測量比協議規定應當被抽吸還多的液體體積)。應該被理解到的是涉及注射泵的測定體積流動測試可在泵處於歸位位置(如前述)時開始和結束，例如注射器柱塞處於最底部位置而使得不再有流體可從注射器被逐出。
應該要理解到的是對於如在本文中所用語句“抽吸預定量的液體”或雷同語句的參考意謂在獲得預定量的液體的抽吸。在理想狀態下，所獲得的液體量將等於所抽吸液體的體積。但是，如果洩漏或某一其它因素減少通過此抽吸入所實際獲得的液體量，則通過此抽吸所獲得的實際液體量將小於所需液體量。應該理解到的是為更加清楚，對於抽吸液體量的參考在本文中被被替換成為術語“抽吸和流體量”。例如，如果2000微升的流體從其中只含有1500微升的液體的收容器中抽吸，則最終2000微升的所抽吸流體可包括1500微升的流體和500微升的空氣。
可經測試的系統性能的另一觀點是檢查測定體積流速。例如根據測試協議，泵38可以一個或多個指定分配速率運行。流量計80可被用於監測在分配操作期間流體從泵38被泵出的的測定體積流速，並且可確認泵38以與協議的指定測定體積流速對準的速率分配液體。如前述，此測定體積流速測量/確定可與總測定體積流速確定同時進行。
作為診斷測試的一部分，可測試用於分析儀器的多個或全部流動路徑的試劑。例如，如此也可包括測試通向每個試劑收容器的每個流動路徑。儘管通向各種試劑的流動路徑的較大部分可共同分享，例如沿著旁通線路62或通過流動池20的通道A及/或B的部分，但是用於每個試劑的流動路徑可在RSV 66下游偏離。測試每個如此流動路徑可允許識別可存在於RSV 66下游的區域中的潛在洩漏，例如如果與RSV 66流體地連接並且被用於抽吸液體離開試劑收容器的吸管被損壞，例如破裂或以其它方式受損，或者是已經變得鬆脫(吸管例如 可被設置為在末端具有螺紋配件的管，其中可被旋入將流體從吸管繞送至RSV 66的較大歧管中)，並且使得流體可從吸管尖端除外的位置流入吸管，則如此可允許空氣通如此入口點被抽吸到流動路徑中，由此減少所抽吸的液體量。
在一些實施方式中，可使用試劑中在實際分析期間所使用的部分來實行如此測定體積流速和體積測試。在其它實施方式中，試劑可用價格較低或另外以其它問題較少的液體(例如蒸餾水)替換(例如視所需，可選擇或修改此些液體以模擬試劑的各種流體性質，例如黏度)。流量及/或流速測試可以變化間隔和變化頻率進行。在一些實施方式中，例如，當分析儀器首次被打開並且加載有試劑時，可實行一個或兩個類型的測試。在一些另外實施方式中，當試劑卡匣或來源被移除並且用新試劑卡匣或來源替換時，可執行一個或兩個類型的測試。在一些附加或替代實施方式中，可周期性地實行一個或兩個類型的測試，例如根據常規時間表或響應於正被實執行的預定數量的分析週期等等因素。
返回圖4，在完成遞送序列108後，數據採集和分析系統48可前進至數據處理/分析序列110(包括過程132至144)，在此期間，根據上述討論可對來自測定體積流量計的數據實行一個或多個類型的數據處理。例如在132處，數據採集和分析系統48可以可選地對在遞送序列108期間所收集的數據實行數據截斷。數據截斷可包括將“上部”和“下部”截斷濾波器應用於所收集的流速數據，如將在圖5中所討論。在134處，數據採集和分析系統48可對濾波的流速數據(來自132)實行另一濾波。例如可將“移動平均濾波器”應用於流速數據，如將在圖5中所討論。在136處，數據採集和分析系統48可對濾波流速數據進行積分以計算對於給定流動的總流量。例如，可在濾波流速數據上執行梯形積分以計算總流量，如將參照圖6所討論。
在138處，數據採集和分析系統48可以可選地基於濾波數據(在 134處)來計算平均流速及/或流速的標準偏差；如果沒有正執行泵速測試，則可予以忽略。數據採集和分析系統48還可基於在過程136中所分析的數據來計算流量，如上述並且將參照圖7所進一步討論。在140處，數據採集和分析系統48可確定所測試的流動路徑(試劑)的合格/不合格狀態。例如，合格/不合格確定可基於在所計算的總流量與預定流量之間的比較，如將在圖7中所討論。預定流量可以是特定試劑值(取決於特定基因定序協議)，或者是可基於泵38的泵送容量(例如泵送體積)。例如，如果特定試劑在分析協議期間被使用2000μL的量，則預定量可以是2000μL以模擬在實行分析協議期間所使用的量。在另一實例中，如果注射泵具有1500μL的最大排出，則預定量可以是1500μL，即使在分析協議(需要多次注射器抽吸循環)期間使用超過此量亦如此。如果所計算的總流量大於或小於預定流量並且差值大於預定閾值或容限，則可認為定序系統10未能對所選擇流動路徑(試劑)進行合格的測定體積試劑遞送測試，並且遞送測試控制邏輯104可前進到方塊142以記錄測試結果。如果所計算的平均流量等於預定流量或落在預定流量的預定閾值或容限內，則可認為定序系統10能對所選擇流動路徑(試劑)進行合格的測定體積試劑遞送測試，並且遞送測試控制邏輯104可前進到144以記錄測試結果。可被理解到的是閾值或容限可以是預定流量的0.01%、0.1%、1%、5%或10%，或者可以是任何合適值，其取決於所選擇試劑，基因定序協議，泵38的固有準確度，流量計80的固有測量準確度等因素。
在過程142和144中所記錄的數據及/或結果可被儲存在記憶體電路50中，及/或可通過介面52(根據請求或協議)被提供給授權用戶。可理解到的是知道測定體積試劑遞送測試的合格/不合格結果可幫助驗證儀器12的準確度並且進行校正。此外，在過程142和過程144中所記錄的數據及/或結果還可有助於在一個或多個流動路徑對於測定體積試劑遞送測試為不合格的情況下對問題 進行故障排除。
在146處，遞送測試控制邏輯104已經完成針對所選擇關注流動路徑(試劑)的測定體積流動遞送測試，並且控制系統46可基於在148處的測試協議前進至下一個關注流動路徑(試劑)。例如，控制系統46可返回到120以將RSV設置為協議中所指定的下一個位置或埠口，並且可針對另一關注試劑實行過程(122至146)。如果僅實行流速測試以例如確定泵38是否被正確地實行，則或許不需要測試所有的試劑流動路徑，因為泵的分配動作可使用相同的流動路徑到流量計80而無論選擇哪個試劑的。但是，如果正執行測定體積遞送測試，則可測試每個試劑流動路徑。如此，遞送測試控制邏輯104可繼續進行直到測試每個關注流動路徑(試劑)為止。另或者，控制系統46可在完成流動路徑(試劑)測試或在收到用戶的指令時結束測定體積流動量遞送測試並且退出遞送測試控制邏輯104。
圖5是例示如圖4的132和134處所述的數據截斷分析和數據過濾(移動平均)分析的實例的例圖。此例圖包括原始流速數據圖表152，濾波流速數據圖表162和平均分析圖表168，其中具有垂直軸線154表示以每分鐘多少微升(μL/min)計的流速以及水平軸線156表示以秒(sec)為單位的時間。在原始流速數據圖表152中，當原始流速數據由流量計80收集時，原始跡線160以時間步進158為單位進行繪製。可理解到的是時間步進158可以是任何合適的時間間隔(例如0.5、1、2、3、4、5或10秒)，並且未必小於流量計80的響應時間(例如20毫秒)。可以有一個或者多個尖峰166，其可以是對測量準確度具有可忽略影響但明顯偏離原始跡線160的規範或趨勢的雜訊。儘管如此，在某些情況下從先前分析中移除一個或多個尖峰166以改善準確性可以是所期望的。
根據原始跡線160，可基於指定上部和下部截斷極限來移除(與一個或多個尖峰相對應的)值。在一個實例中，如果值在指定截斷止極限之外， 則此值可被替換為先前值(例如在先前時間步進中的值)以產生如在濾波流速數據圖表162中所示的跡線164(例如濾波跡線)。在某些實施方式中，下部截斷值可以是大約0μL/min，並且上部截斷值可以是大約5000μL/min。另或者，取決於測試協議，下部和上部極限可以是特定試劑的任何合適值。應當要注意的是在完成如上述的截斷分析150時，與跡線160相比，跡線164可更加清楚(例如具有減少的數據雜訊)。在一個方面，“經移除值”也可以是有用於提供關於流體特性的資訊。例如，經移除或截斷的點數量(例如一個或多個尖峰)可與流體系統中的氣泡數量成比例。因此，尖峰的數量可以相加，並且流體系統中的微泡總數可基於針對給定樣本所觀察的尖峰數量來估計。如果需要，可將以此方式所獲取的估計微泡數量與預定微泡閾值量進行比較，並且產生警報或通知以提醒用戶存在經常產生不希望的微泡或存在如果估計微泡數量超過此門檻。
在截斷分析150之後，可實行平均(移動平均)分析168，其中使用指定的移動平均濾波器將數據濾波處理應用於跡線164，以產生如平均分析圖表168所示的平均值跡線170(例如濾波跡線)。可理解到的是移動平均濾波器(或低通濾波器)是通常用於使任何取樣數據/信號陣列平滑的濾波器。在某些實施方式中，用於移動平均分析的窗口大小在0.1秒時間步進處可以是50個數據點(例如50個流速數據點被平均以產生平均流速值)。另或者，可使用任何其它合適的窗口大小。另或者，可使用任何其它合適的平均分析，例如基於頻率的傅立葉變換，例如使用傅里葉變換將數據轉換到頻域，從頻域數據集中移除較高階諧波和頻率，並且接著將調整後的頻域數據集轉換回時域以產生不包括較高頻雜訊的濾波數據集。
圖6是例示如圖4的136處所述的積分分析的實例的例圖。此例圖包括濾波流速數據圖表174和截切流速數據圖表190，其中具有垂直軸線176表示以μL/min計的流速以及水平軸線178表示以秒為單位的時間的。在濾波流速數 據圖表174中，以時間步進180為函數來繪製多個完整跡線182，其中多個完整跡線182中的每一個表示針對相應流動路徑(試劑)所獲得的濾波流速數據(例如由過程132和134進行濾波)。應該要注意的是多個完整跡線182中的每一個都包括其中流速隨時間快速上升的上升跡線184，其中流速隨時間快速下降的下降跡線186，以及其中在上升跡線184和下降跡線186之間流速保持相對恆定的穩態跡線188。上升跡線184和下降跡線186可歸因於流體慣性(例如引起測定體積流速隨時間變化所需的流體中的壓力差)和流體容量，以及在對泵38發出命令之後的流動開始(例如數個到幾十毫秒的量級)。
在某些實施方式中，從先前數據處理/分析中移除上升跡線184和下降跡線186中的流速數據以提高準確度可能是所期望的，例如在流速測量而不是總測定體積流量測量期間。例如，數據採集和分析系統48可具有預定的“開始延遲”時間(例如大致跨越上升跡線184)及/或預定的“長度”時間(例如大致跨越穩態跡線188)，使得來自上升跡線184和下降跡線186的流速數據可被移除、截切或忽略，並且僅有在流量計80達到穩態之後所測量的流速數據保留下來用於進一步分析，導致截切流速數據圖表190。應該要注意到的是可基於在穩態跡線188中的流速數據來計算平均流速和相應標準偏差。
接下來，數據採集和分析系統48可在相應時段上對上升跡線184，穩態跡線188和下降跡線186進行積分，以確定如積分數據圖表192中所示的總流量。雖然任何合適的數值積分方法可用於積分過程(例如在136處)，但在所例示實施方式中，在穩態跡線188上執行梯形積分以產生積分數據圖表192。積分數據圖表192具有表示以μL為單位的在測定體積試劑遞送測試期間所遞送的流量的垂直軸線194，並且具有表示以秒為單位的時間的水平軸線178。以時間步進180為函數繪製多個體積跡線196，其中多個體積跡線196中的每一個代表針對相應流動路徑(試劑)所獲得的總體積流量數據。如在多個體積跡線 196所示，每個流動路徑(試劑)的流量在飽和到一個值之前隨時間繼續增加，此值表示被用於確定如在圖1的過程140中所討論的測定體積試劑遞送測試的結果是否合格/不合格的積分流量。
圖7是例示具有針對每個測試流動路徑所呈現的測量流速，標準偏差和計算流量的測定體積試劑遞送測試的結果的實例的例圖。此例圖包括條形圖198，條形圖208和條形圖212，每個具有與在上述遞送測試控制邏輯104之後所測試的多個流動路徑(試劑)相對應的多個值。在條形圖198和208中，垂直軸線200表示以μL/min為單位的平均流速(例如基於在業已達到穩態遞送之後所測量的流速加以計算)，並且水平軸線202表示經測試的流動路徑(試劑)。在條形圖198的所例示實施方式中，平均流速數據包括多個正常/預期流速數據204以及些許異常206。例如根據測試協議，平均流速對於一些流動路徑(在條形圖198右側上標記為VB2的四個流動路徑)可以是大約4000μL/min，而對於其它流動路徑可以是大約2000μL/min。對於應當具有大約2000μL/min的流速的流動路徑來說，大約1500μL/min和大約500μL/min的值在正常範圍之外，例如2000μL/min的±10%，並且因此認為異常206。應該要注意到的是測試協議可至少部分地基於流量計80的感測準確度來建立，例如可選擇流速以使得流速保持在流量計具有可接受準確度的水平處。例如，推薦流速可以是大約1000μL/min。在另一實例中，推薦流速可低於大約40000μL/min的理論流速，並且低於大約10000μL/min的實際流速。在目前上下文中，術語“大約”意欲表示所指示值或許不精確，並且實際值可以不實質性地變更所涉及操作的方式從所指示值變化。例如，如在本文中所使用的術語“大約”意欲傳達落在所指示值的特定容限(例如±10%、±5%或±1%)內的適當值，如本領域技術人員可理解。
可對應於每個平均流速(例如204和206)計算標準偏差值，並將予以顯示為條形圖208中的值210。在某些實施方式中，如圖4的過程140中所討 論的合格/不合格確定也可基於上述標準偏差值。
最後在條形圖212中，垂直軸線200表示以μL為單位的平均流量，並且水平軸線202表示所測試流動路徑(試劑)。在條形圖212中，對流量數據進行積分包括多個正常/預期流量數據214(對應於正常/預期流量數據204--在此實例中，數據表示在一分鐘間隔內所流動的總體積)以及些許異常216(由異常206導致)。例如，根據測試協議(其可涉及對於每個試劑/流動路徑持續1分鐘的測定體積流動)，對於一些流動路徑來說，積分流量可以是大約4000μL，而對於其它流動路徑可以是大約2000μL。對於應具有大約2000μL的流量的流動路徑來說，大約1500μL和大約500μL的值可被認為在可接受範圍之外(例如在此些值與期望值之間的差值大於預定閾值)，並且因此被視為異常216。基於自動測定體積遞送測試(例如如果測定體積遞送測試指示一個或多個試劑流動在可接受容限之外)的結果(例如圖7)，可實行診斷序列或測試以檢查儀器12是否存在可導致在定序期間遞送不正確試劑量的洩漏或堵塞。
可理解到的是預期積分流量可至少部分取決於泵38的容量。基於上述流體系統，預計積分流量等於由泵38所排出的流體體積。對於具有兩對注射器70(例如每個具有大約1000μL的容量)的泵38來說，由泵38所排出的流體體積在大約2000μL和大約4000μL之間(例如，如果僅一對注射器70進行分配則約2000μL，如果兩對注射器70進行分配則大約4000μL)。在一些實施方式中，可使用大於或小於大約1000μL(例如大約1250μL、大約500μL、大約250μL)的注射器70，並且預期積分流量將相應地發生改變。
在本申請案說明書和申請專利範圍中使用(如果有的話)例如(a)、(b)、(c)或類似符號的順序指示符應該被理解為不傳達任何特定順序或排序，其除非在明確指出如此順序或排序的範圍內。例如，如果存在標示有(i)，(ii)和(iii)的三個步驟，則應該被理解為除非以其它方式另有說明，否則這 些步驟可以任何順序來實行(或者甚至是同時，如果不會相衝突)。例如，如果步驟(ii)涉及處理在步驟(i)中所創建的元素，則步驟(ii)可被視為發生在步驟(i)之後的某個時點處。類似地，如果步驟(i)涉及處理在步驟(ii)中所創建的元素，則相反意義是要被理解到。
還應該理解到的是使用“以”(例如“閥以在兩個流動路徑之間切換”)可用例如“被配置為”的語言來替換，例如“閥被配置在兩個流動路徑之間切換“等。
當參考量或類似可量化性質使用時，除非以其它方式另有說明，否則諸如“大約”，“近似”，“大致上”，“標稱”等術語應該被理解為包括在所指定值的±10%內的值。
除了本申請案說明書中所列出的申請專利範圍，下述額外實施方式應該被理解到落在為在本申請案說明書的範圍內：實施方式1：一種系統，其包括：試劑選擇閥，其在控制上從多個試劑流動路徑中選擇試劑流動路徑；泵，其被耦合到試劑流動路徑以根據規定測試協議而通過試劑流動路徑吸取液體；排出流動路徑，其逐出所吸取液體；流量計，其測量由泵所排出的液體並且產生代表所測量流動的數據；以及處理器，其存取數據並且確定由泵所排出的液體的體積或質量。
實施方式2：實施方式1的系統，其中泵包括注射泵。
實施方式3：實施方式1的系統，其中流量計被耦合在排出流動路徑中。
實施方式4：實施方式1的系統，其中流量計在測試協議期間測量在多個時間步進處的流速。
實施方式5：實施方式4的系統，其中處理器對所測量流速進行積分以獲得由泵所排出的液體的總體積或質量。
實施方式6：實施方式1的系統，其中處理器將所測量流速實行低通濾波。
實施方式7：實施方式1的系統，其包括用以控制試劑選擇閥和泵的操作的控制電路，並且通過選擇不同的試劑流動路徑而自動地接續執行另一排出測試。
實施方式8：實施方式7的系統，其中控制電路向用戶提供排出測試的結果的輸出。
實施方式9：實施方式1的系統，其中由泵所排出的流體體積介在大約2000微升和大約4000微升之間。
實施方式10：實施方式1的系統，其中由泵所排出的流體的流速介在大約每分鐘1000微升和大約每分鐘10000微升之間。
實施方式11：一種系統，其包括：流動池，在基因定序操作期間通過流動池泵送多個試劑；試劑選擇閥，其在控制上從被佈置在相應試劑收容器中的多個試劑中選擇試劑；以及共用線路選擇閥，其在控制上選擇將試劑從試劑選擇閥引導通過流動池或通過旁通線路；泵，其被耦合在流通池和旁通線路下游，以根據規定測試協議通過由試劑選擇閥和共用線路選擇閥的位置所定義的流動路徑來吸取液體；排出流動路徑，其逐出所吸取液體；流量計，其被耦合到流動路徑中的至少一個以測量由泵所排出的液體並且產生表示所測量的流動的數據；以及處理器，其存取數據並且確定由泵所排出的液體的體積或質量。
實施方式12：實施方式11的系統，其包括用以控制試劑選擇閥和共用線路選擇閥的操作的控制電路，以定義所欲試劑流動路徑。
實施方式13：實施方式12的系統，其中控制電路通過選擇不同的試劑流動路徑來接續執行另一排出測試。
實施方式14：實施方式11的系統，其中流量計在測試協議期間測量在多個時間步進處的流速。
實施方式15：實施方式14的系統，其中處理器對所測量流速進行積分以獲得由泵所排出的液體的總體積或質量。
實施方式16：一種方法，其包括：實施儲存測試協議，其包括：從多個試劑流動路徑中選擇所欲試劑流動路徑；根據儲存測試協議啟動泵以通過所選擇試劑流動路徑吸取液體；通過排出流動路徑排出所吸取液體；測量液體的流速並且產生表示流速的數據；以及處理數據以確定流動路徑中的至少一個的品質。
實施方式17：實施方式16的方法，包括針對不同的試劑流動路徑重複儲存測試協議，並且處理結果數據以分別確定每個試劑流動路徑的品質。
實施方式18：實施方式16的方法，其中在多個接續時間步進處測量流速。
實施方式19：實施方式18的方法，其中處理數據包括在多個時間步進中的多於一個時間步進上對數據進行低通濾波。
實施方式20：實施方式18的方法，其中處理數據包括在多個時間步進上對所測量流速進行整合，以獲得在儲存測試協議期間被排出的液體體積。
應該要理解到的是前述概念的所有組合(前提是如此概念不會相互不一致)被認為是本申請案說明書的發明主題的一部分。更具體來說，出現在本申請案說明書結尾處的所主張保護主題的所有組合被設想是本申請案說明書的發明主題的一部分。還應該被理解到的是在本文中也可出現在通過引用方式所併入的任何記載中的明確採用術語應該被賦予與在本文中所記載特定概念最一致的含義。
10:定序系統
12:儀器
14:樣品來源
16:樣品
18:樣品/庫製備系統
20:流動池/陣列
22:可移動平台
24:方向
26:光學檢測系統
28:光
30:試劑
32:閥控元件
34:流動路徑
36:流出物流動路徑
38:泵
40:附加閥控元件
42:處置器皿/收容器
44:控制/監督系統
46:控制系統
48:數據採集和分析系統
50:記憶體電路
52:介面
54:外部網路或系統

Claims (15)

  1. 一種流體系統，其包括：試劑選擇閥，其在控制上從多個試劑流動路徑中選擇試劑流動路徑；泵，其流體地被耦合到所述試劑流動路徑，以根據規定測試協議而通過所選擇的所述試劑流動路徑來吸取流體，並且接著經由與泵流體地耦合的排出流動路徑排出所吸取流體；流量計，其測量在從所述泵排出所述吸取流體期間在所述泵中的任何流體通過所述排出流動路徑的排出而引起的流體流速，並且產生表示所測量的所述流體流速的數據；以及控制電路，其在操作上被耦合到所述試劑選擇閥，所述泵和所述流量計，所述控制電路具有一個或多個處理器和儲存機器可執行指令的記憶體，所述機器可執行指令在由所述一個或多個處理器執行時控制所述一個或多個處理器存取所述數據並且根據所述數據來確定由所述泵所排出的流體的體積，其中所述記憶體儲存進一步的機器可執行指令，其在由所述一個或多個處理器執行時進一步控制所述一個或多個處理器以控制所述試劑選擇閥和所述泵的操作，來實行多個試劑排出測試，其中對於每個試劑排出測試，所述一個或多個處理器經過控制以：a)使所述試劑選擇閥選擇所述試劑流動路徑中的不同試劑流動路徑作為選擇試劑流動路徑，b)使所述泵抽吸預定量的流體，同時與所述選擇試劑流動路徑流體地連接，c)使所述泵通過排放流動路徑將來自(b)的所述流體逐出，d)從所述流量計獲得關於任何流體流過所述排出流動路徑的所測量的所述流體流速作為(c)的結果的數據， e)針對每個排出測試而響應於(d)中所獲得的所述數據來確定是否存在故障狀況，其中指示在(c)中流過所述排放流動路徑的流體總量超出(b)的所述預定量的流體的第一預定閾值量，並且f)當確定針對所述試劑排出測試中的一個或多個存在故障狀況時向用戶提供通知。
  2. 根據請求項1所述的流體系統，其中所述泵包括注射器泵。
  3. 根據請求項1所述的流體系統，其中所述流量計與所述排放流動路徑流體地共線。
  4. 根據請求項1所述的流體系統，其中所述記憶體儲存進一步的機器可執行指令，其在由所述一個或多個處理器執行時進一步控制所述一個或多個處理器使用數據來確定穩態流速，其開始於泵送循環開始之後的預定時間量並且結束於所述泵送循環結束之前的預定時間量流速。
  5. 根據請求項4所述的流體系統，其中所述記憶體儲存進一步的機器可執行指令，其在由所述一個或多個處理器執行時進一步控制所述一個或多個處理器以使所述一個或多個處理器對所測量的所述流體流速進行積分，來獲得由所述泵所排出的所述流體的總體積。
  6. 根據請求項1所述的流體系統，其中所述記憶體儲存進一步的機器可執行指令，其在由所述一個或多個處理器執行時進一步控制所述一個或多個處理器以使所述一個或多個處理器對所測量的所述流體流速實行低通濾波。
  7. 根據請求項1所述的流體系統，其中所述泵抽吸並且排出介在大約2000微升和大約4000微升之間的流體。
  8. 根據請求項1所述的流體系統，其中所述泵以介在大約每分鐘1000微升和大約每分鐘10000微升之間的流體流速來抽吸和排出所述流體。
  9. 一種流體系統，其包括： 流動池，在基因定序操作期間通過所述流動池以泵送來自多個試劑收容器的試劑；試劑選擇閥，其在控制上從所述多個試劑收容器中選擇所選擇試劑；共用線路選擇閥，其與所述試劑選擇閥流體地連接，並且在控制上選擇性地將所述所選擇試劑引導至所述流動池或通過旁通線路；排出流動路徑；流量計，其被流體地耦合到所述排放流動路徑以測量通過所述排放流動路徑所流動的流體，並且產生表示所測量流體流動的數據；泵，其被流體地插置於i)所述排放流動路徑以及ii)所述流動池和所述旁通線路之間，所述泵通過由所述試劑選擇閥和所述共用線路選擇閥的位置所定義的流動路徑來吸取所述所選擇試劑，並且通過所述排放流動路徑逐出所述所選擇試劑；以及控制電路，其在操作上被耦合到所述試劑選擇閥，所述共用線路選擇閥，所述泵和所述流量計，所述控制電路具有一個或多個處理器和儲存機器可執行指令的記憶體，所述機器可執行指令在由所述一個或多個處理器執行時控制所述一個或多個處理器存取所述數據，並且確定由所述泵所逐出的所述流體的體積，其中所述記憶體儲存進一步的機器可執行指令，其在由所述一個或多個處理器執行時進一步控制所述一個或多個處理器執行多個試劑排出測試，其中對於每個試劑排出測試，所述一個或多個處理器經過控制以：a)使所述試劑選擇閥選擇不同試劑，並且使所述共用線路選擇閥在所述流通池或所述旁通線路之間選擇以定義選擇流動路徑，b)使所述泵通過所述選擇流動路徑來抽吸預定量的流體，c)使所述泵將來自(b)的所述流體通過所述排出流動路徑予以逐出， d)從所述流量計獲得關於自(c)產生流過所述排出流動路徑的任何流體試劑的所述所測量流體流速的數據，e)針對每個排出測試而響應於(d)中所獲得的所述數據來確定是否存在故障狀況，其中指示在(c)中通過所述排放流動路徑所流動的總流量超出(b)的所述預定量的流體的第一預定閾值量，並且f)當確定針對所述試劑排出測試中的一個或多個存在故障狀況時向用戶提供通知。
  10. 根據請求項9所述的流體系統，其中所述記憶體儲存進一步的機器可執行指令，其在由所述一個或多個處理器執行時進一步控制所述一個或多個處理器使所述試劑選擇閥和所述共用線路選擇閥定義所欲流動路徑。
  11. 根據請求項9所述的流體系統，其中所述記憶體儲存進一步的機器可執行指令，其在由所述一個或多個處理器執行時進一步控制所述一個或多個處理器對來自(d)的所述所測量流體流速進行積分，以獲得在(c)中由所述泵所逐出的所述流體的總體積。
  12. 一種流體系統之自動測試之方法，其包括：執行儲存測試協議以執行一個或多個試劑排出測試，其中每個試劑排出測試包括：a)從多個試劑流動路徑中選擇試劑流動路徑；b)啟動泵以根據所述儲存測試協議通過所選擇的所述試劑流動路徑吸取預定量的流體；c)從所述泵出將所吸取的流體排出並且通過排出流動路徑；d)測量在(c)期間通過所述排放流動路徑所排放的任何流體的流速，並且產生代表所述流速的數據；以及e)處理所述數據以確定所選擇的所述試劑流動路徑的品質，其中(e)還包 括：f)在(e)期間，使用所述數據以在(c)期間確定通過所述排放流動路徑所流動的所述流體的總體積；g)由於在(c)期間流過所述排放路徑的所述流體的所述總體積超出所述預定量的流體的第一閾值量，而確定(a)的所選擇的所述試劑流動路徑具有故障；和h)響應於(g)以產生關於所述故障的通知。
  13. 根據請求項12所述的方法，其中針對不同的試劑流動路徑重複(a)至(e)。
  14. 根據請求項12所述的方法，其中(e)包括對所述數據進行低通濾波。
  15. 根據請求項12所述的方法，其中(f)包括對所述數據進行積分以獲得在(c)期間通過所述排放流動路徑所流動的所述流體的所述總體積。
TW106145537A 2017-01-05 2017-12-25 用於進行自動流體測定體積試劑遞送和自動測試之系統和方法 TWI780098B (zh)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201762442736P 2017-01-05 2017-01-05
US62/442,736 2017-01-05
GB1704772.1 2017-03-24
GBGB1704772.1A GB201704772D0 (en) 2017-01-05 2017-03-24 Automated volumetric reagent delivery testing
??1704772.1 2017-03-24

Publications (2)

Publication Number Publication Date
TW201830020A TW201830020A (zh) 2018-08-16
TWI780098B true TWI780098B (zh) 2022-10-11

Family

ID=58687954

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
TW106145537A TWI780098B (zh) 2017-01-05 2017-12-25 用於進行自動流體測定體積試劑遞送和自動測試之系統和方法

Country Status (6)

Country Link
US (2) US10989728B2 (zh)
EP (1) EP3566058A4 (zh)
CN (1) CN110226090A (zh)
GB (1) GB201704772D0 (zh)
TW (1) TWI780098B (zh)
WO (1) WO2018128845A1 (zh)

Families Citing this family (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2017039503A1 (en) * 2015-09-02 2017-03-09 Telefonaktiebolaget Lm Ericsson (Publ) First and second radio network nodes and methods performed therein
GB201704772D0 (en) 2017-01-05 2017-05-10 Illumina Inc Automated volumetric reagent delivery testing
EP3775932A4 (en) * 2018-04-07 2021-12-29 Lumacyte LLC Fluidic autosampler and incubator
JP6971411B2 (ja) * 2018-09-25 2021-11-24 株式会社日立ハイテク 自動分析装置
CA3142971A1 (en) * 2019-12-30 2021-07-08 Illumina, Inc. Systems for monitoring fluidics in reagent cartridges and related methods
IL294294A (en) * 2019-12-30 2022-08-01 Illumina Inc flow cell assemblies and associated reagent selector valves

Citations (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5354440A (en) * 1988-11-29 1994-10-11 Isco, Inc. Capillary electrophoresis technique
US20100111768A1 (en) * 2006-03-31 2010-05-06 Solexa, Inc. Systems and devices for sequence by synthesis analysis
US20130260372A1 (en) * 2012-04-03 2013-10-03 Illumina, Inc. Integrated optoelectronic read head and fluidic cartridge useful for nucleic acid sequencing
US20140177378A1 (en) * 2012-12-21 2014-06-26 Intermolecular, Inc. High Dilution Ratio by Successively Preparing and Diluting Chemicals
US20150346149A1 (en) * 2009-12-01 2015-12-03 Oxford Nanopore Technologies Limited Biochemical analysis instrument
US20160047805A1 (en) * 2010-01-13 2016-02-18 Flir Systems, Inc. In situ-dilution method and system for measuring molecular and chemical interactions
CN105572399A (zh) * 2010-06-30 2016-05-11 安派科生物医学科技有限公司 疾病检测仪

Family Cites Families (16)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPH0612511Y2 (ja) 1985-04-29 1994-03-30 株式会社堀場製作所 フロースルー式液体分析装置
JP2731895B2 (ja) * 1995-04-04 1998-03-25 麻生セメント株式会社 輸液ポンプの点検装置
US5691486A (en) * 1996-07-30 1997-11-25 Bayer Corporation Apparatus and methods for selecting a variable number of test sample aliquots to mix with respective reagents
GB0028647D0 (en) * 2000-11-24 2001-01-10 Nextgen Sciences Ltd Apparatus for chemical assays
US7096750B2 (en) 2004-04-06 2006-08-29 Universal Analyzers, Inc. Sequencing and averaging multiple sample system
US7704457B2 (en) * 2005-11-18 2010-04-27 Patton Charles J Automatic, field portable analyzer using discrete sample aliquots
US8076154B2 (en) * 2007-06-05 2011-12-13 Ecolab Usa Inc. Method of calibration for nonlinear optical sensor
US8545773B2 (en) 2007-07-25 2013-10-01 The Board Of Trustees Of The University Of Arkansas Versatile multichannel capillary biosensor system
US8173080B2 (en) 2008-02-14 2012-05-08 Illumina, Inc. Flow cells and manifolds having an electroosmotic pump
WO2009105711A1 (en) * 2008-02-21 2009-08-27 Decision Biomarkers, Inc. Assays based on liquid flow over arrays
US8673627B2 (en) 2009-05-29 2014-03-18 Life Technologies Corporation Apparatus and methods for performing electrochemical reactions
US8951781B2 (en) 2011-01-10 2015-02-10 Illumina, Inc. Systems, methods, and apparatuses to image a sample for biological or chemical analysis
GB2490673B (en) * 2011-05-09 2018-08-29 Agilent Technologies Inc Pump reducing a fluid flow by a determined amount
JP6625519B2 (ja) 2013-03-15 2019-12-25 イナノベイト， インコーポレイテッド アッセイシステムおよびカートリッジデバイス
US9970437B2 (en) 2014-11-25 2018-05-15 Genia Technologies, Inc. Two-way pump selectable valve and bypass waste channel
GB201704772D0 (en) 2017-01-05 2017-05-10 Illumina Inc Automated volumetric reagent delivery testing

Patent Citations (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5354440A (en) * 1988-11-29 1994-10-11 Isco, Inc. Capillary electrophoresis technique
US20100111768A1 (en) * 2006-03-31 2010-05-06 Solexa, Inc. Systems and devices for sequence by synthesis analysis
US20150346149A1 (en) * 2009-12-01 2015-12-03 Oxford Nanopore Technologies Limited Biochemical analysis instrument
US20160047805A1 (en) * 2010-01-13 2016-02-18 Flir Systems, Inc. In situ-dilution method and system for measuring molecular and chemical interactions
CN105572399A (zh) * 2010-06-30 2016-05-11 安派科生物医学科技有限公司 疾病检测仪
US20130260372A1 (en) * 2012-04-03 2013-10-03 Illumina, Inc. Integrated optoelectronic read head and fluidic cartridge useful for nucleic acid sequencing
US20140177378A1 (en) * 2012-12-21 2014-06-26 Intermolecular, Inc. High Dilution Ratio by Successively Preparing and Diluting Chemicals

Also Published As

Publication number Publication date
US20210208177A1 (en) 2021-07-08
EP3566058A1 (en) 2019-11-13
US11841376B2 (en) 2023-12-12
CN110226090A (zh) 2019-09-10
US10989728B2 (en) 2021-04-27
EP3566058A4 (en) 2020-08-19
US20180188278A1 (en) 2018-07-05
TW201830020A (zh) 2018-08-16
GB201704772D0 (en) 2017-05-10
WO2018128845A1 (en) 2018-07-12

Similar Documents

Publication Publication Date Title
TWI780098B (zh) 用於進行自動流體測定體積試劑遞送和自動測試之系統和方法
US7876935B2 (en) Sample processing apparatus with a vision system
US9857388B2 (en) Automatic analyzer
KR20190093590A (ko) 유동 셀 액체 탈기 시스템 및 방법
EP2233931A1 (en) Cleaning apparatus, and automatic analysis apparatus
US11002629B2 (en) Pressure and leak testing methods
JP2013044530A (ja) 分注装置
TWI766924B (zh) 用於選擇性流出物收集的系統和方法
US20210060554A1 (en) Method and Apparatus for Measuring a Temperature of a Fluid for Use with a Microfluidic Analysis Apparatus, and Microfluidic Analysis Apparatus Comprising an Apparatus

Legal Events

Date Code Title Description
GD4A Issue of patent certificate for granted invention patent