TWI731268B - 可增強抗腫瘤與抗病毒ｔ細胞存活與其功能性之方法與組合物 - Google Patents
可增強抗腫瘤與抗病毒ｔ細胞存活與其功能性之方法與組合物 Download PDFInfo
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Abstract
本發明係關於一種藉由誘使細胞內高度表現Akt分子以增強該等細胞之存活與功能性而達到抗腫瘤或抗病毒免疫活性的方法。Akt訊息傳遞路徑可防止免疫檢查點的表現，而使具抗原特異性的細胞毒殺型T淋巴細胞可免於在免疫抑制性微環境中耗竭。本發明亦揭示，Akt基因具有可應用於治療慢性病毒感染疾病或惡性腫瘤的T細胞輸入療法用以進行T細胞工程的潛在利用性。
Description
本發明係關於一種使用高表達Akt之免疫細胞的免疫細胞療法。更特別地，本發明之高表達Akt之免疫細胞可用於治療在免疫抑制性微環境中的病毒感染和惡性腫瘤。
免疫細胞療法(Adoptive cell therapy,ACT)是一種臨床上可實施且具高臨床價值的療法，係透過基因工程技術強化免疫細胞，使免疫細胞具有新抗原特異性、增強其功能性或是增加其存活能力，並強化免疫細胞對病毒或是腫瘤的免疫反應，以治療對病毒或腫瘤的免疫反應有受損或甚至失去作用的慢性病毒感染或是惡性腫瘤患者。
在慢性病毒感染或是惡性腫瘤患者體中，通常都能偵測到單株T細胞反應，但大部分具抗原特異性的T細胞在活化後，很快就進入耗竭或細胞凋亡階段，尤其是具有病毒或腫瘤特異性的細胞毒殺型T淋巴細胞(Cytotoxicity T lymphocytes,CTLs)經常因持續性的T細胞受體(T-cell receptor；TCR)訊號與缺少合適的共刺激而進入耗竭。T細胞耗竭有以下表徵，T細胞會逐漸失去增殖能力、缺乏細胞激素、細胞毒殺功能受損、細胞表面高度表現多種免疫檢查點、細胞凋亡速度上升。
免疫檢查點(Immune checkpoints)，像是PD-1、CTLA-4等，為一種在收到TCR訊號後其表現量會上升，以調節T細胞活化程度的分子，通常在耗竭的T細胞上都會高度表現此類分子，許多相關文獻也都指出，因免疫檢查點而產生的訊息傳遞路徑會導致T細胞在活化及分化過程中出現代謝失衡。
免疫檢查點相關之訊息傳遞路徑，除了已知PD-1可活化PP2A路徑、CTLA-4可活化SHP2路徑，而抑制T細胞因TCR訊息傳遞路徑所誘發的Akt活化之外，其餘的相關機制目前都仍不明確。
Akt已經被證實對T細胞的生長、增殖及存活有很重大的影響，像是可以透過Foxo、mTOR、Wnt/β-catenin等訊息傳遞路徑調控T細胞的分化。在淋巴細胞性腦膜炎病毒(Lymphocytic choriomeningitis virus,LCMV)慢性感染過程中，細胞毒殺型T淋巴細胞(cytotoxic T lymphocytes,CTLs)中的Akt與mTOR訊息傳遞路徑的活化皆受損，導致細胞毒殺型T淋巴細胞因PD-1訊息傳遞路徑的活化而呈現耗竭。
因此，本發明係提供一種於抗病毒或抗腫瘤之CTLs中增強Akt/mTOR訊息傳遞路徑，藉以使CTLs免於T細胞耗竭之方法，此方法具有可進一步應用於重組TCR技術或嵌合型抗原受體(CAR)技術，以增強經基因重組之T細胞的存活與功能性，用於治療患有惡性腫瘤或慢性病毒感染等疾病患者之潛力。
本發明係提供一種透過使Akt分子於細胞毒殺型T淋巴細胞內過度表現，以增強抗腫瘤或抗病毒T細胞存活與其功能性的方法。已發現此過度表現Akt之CTLs在遇到肝臟中的抗原時，能保有高度的增殖能力與功能性，表示
Akt分子可幫助CTLs克服其處在抑制性微環境時產生的T細胞耗竭。本發明更進一步揭示，Akt分子的表現可促進抗病毒及抗腫瘤CTLs反應，例如增殖、細胞激素的製造及細胞毒殺等，並且能使CTLs對抗因骨髓來源抑制細胞(myeloid derived suppressor cells,MDSCs)所誘導的增殖停滯。除此之外，具活性Akt分子的持續性表現能促使T細胞在耐受性肝臟或腫瘤微環境中確保存活並毒殺受病毒感染的或腫瘤細胞。本發明亦揭示具活性Akt分子只有在與T細胞受體(TCR)訊息傳遞路徑共同作用下，才會啟動細胞毒殺型T淋巴細胞的大量增殖反應，故施用活化Akt於T細胞基因改造工程並不具有致癌化的風險。
在本發明之一實施例中，係顯示帶有豆蔻酸化之Akt分子(myr-Akt)能夠錨定於細胞膜上並被磷酸化。將分別表現Akt1與Akt2之細胞毒殺型T淋巴細胞輸入小鼠後，此兩種細胞於肝臟與脾臟快速大量擴增，顯示Akt的過度表現與細胞毒殺型T淋巴細胞於肝臟內的生存，或與細胞毒殺型T淋巴細胞對於抗原刺激產生的二級增殖反應有關。
T細胞耗竭的特徵在於其表面高度表現多種免疫檢查點，因此阻斷免疫檢查點能有效挽救CTLs免於T細胞耗竭，並進一步增強其對抗腫瘤的反應。於另一實施例中，本發明揭示Akt分子之訊號傳遞能防止免疫檢查點之表現，特別是防止在具B型肝炎病毒特異性CTLs上之免疫檢查點LAG-3與TIGIT的表現。
在本發明之部份實施例中，係揭露經基因工程而具有Akt1/2的細胞毒殺型T淋巴細胞，在兩種不同實驗模型中皆可有效清除肝內病毒感染，並且在痊癒後的個體中能持續存在並提供具保護性之記憶免疫力。
於本發明之部份實施例中，係揭露經基因工程而具有Akt2的細胞毒殺型T淋巴細胞能夠在一透過致癌基因所引起之肝細胞癌的老鼠模型(HCC
mouse model)中有效根除既有的肝細胞癌。因此Akt1與Akt2基因可應用於治療肝臟慢性病毒感染及惡性腫瘤之T細胞輸入療法中做為對T細胞進行基因工程之標的，因為透過Akt訊息傳遞路徑能夠逆轉細胞毒殺型T淋巴細胞在免疫抑制微環境中的T耗竭。
圖1，包含圖1A-1O，係顯示具B型肝炎病毒特異性(HBV-specific)之細胞毒殺型T淋巴細胞經由免疫輸入療法輸至HBV帶原小鼠後所產生之T細胞耗竭。圖1A為經帶有B型肝炎病毒之重組腺病毒(AdHBV)感染後之小鼠接受免疫治療，輸入2x105 HBc93-100特異性細胞毒殺型T淋巴細胞後其血清中B型肝炎e抗原(HBeAg)的動力圖；圖1B為HBV帶原小鼠於接受CD45.1+細胞毒殺型T淋巴細胞輸入治療後，於特定時間的肝臟與脾臟的流式細胞儀分析圈選圖；圖1C則為其定量圖。給予CD45.2+之AdHBV小鼠輸入5x105體外活化的HBc93-100CD8+T細胞進行免疫治療，在輸入後第3、7、11天：(1)輸入之T細胞上免疫檢查點的表現量分別為下：圖1D、1H、1L為PD-1表現量之直方圖；圖1E、1I、1M為TIM-3表現量之直方圖；圖1F、1J、1N為LAG-3表現量之直方圖，上述圖中灰色直方為對照組；(2)針對內源性CD8+T細胞與輸入之CD45.1+CD8+T細胞上的免疫檢查點進行染色，平均螢光強度(mean fluorescence intensity,MFI)結果如下：圖1G為3天後、圖1K為7天後、圖1O為11天後。**係表示P<0.01、***係表示P<0.001(unpaired Students’s t-test)。
圖2，包含圖2A-2F，係顯示不同的老鼠Akt同功異形體對肝內的細胞毒殺型T淋巴細胞擴張的調控影響。圖2A係為用來基因工程T細胞之反轉錄病毒載體MSCV之構築概要，其含有5’與3’端之長末端重覆序列(long terminal
repeats,LTR)、P2A連接胜肽序列(2A)(SEQ ID NO：10)、CD90.1基因、土撥鼠肝炎病毒之後轉錄調控因子(woodchuck hepatitis virus posttranscriptional regulatory element，WPRE)。於pMSCV-mAkt1/Akt2/Akt3-2A-CD90.1質體中，在其2A序列之上游另含有src豆蔻酸化序列(myr)(SEQ ID NO：8)與小鼠的AKT1(SEQ ID NO：2)、AKT2(SEQ ID NO：4)、AKT3(SEQ ID NO：6)其中一序列；圖2B係為體外活化之CD45.1+OT-I T細胞經分別帶有2A-CD90.1、mAkt1-2A-CD90.1、mAkt2-2A-CD90.1、mAkt3-2A-CD90.1序列與對照組之反轉錄病毒轉型後兩天之轉型效率圖，係透過流式細胞儀分析其細胞表面的CD90.1表現量做為其效率判定；圖2C係為西方墨點法之結果圖，用以檢測對照組與轉型Akt1、Akt2、Akt3之CD8+T細胞的phospho-Akt、total Akt、β-actin、phospho-S6的表現量；圖2D係為小鼠經輸入細胞毒殺型T淋巴細胞後，於其肝臟與脾臟所表現同源性抗體之定量圖，小鼠於細胞輸入前一天，經高壓注射法(HDI)注射一由白蛋白啟動子控制之質體，此質體編碼卵白蛋白(Ovalbumin，OVA)與螢光素酶(luciferase)基因，一天後輸入1x105之OT-I轉型細胞毒殺型T淋巴細胞，輸入後之第7天，分離肝臟淋巴細胞與脾臟細胞，並使用流式細胞儀分析輸入的細胞毒殺型T淋巴細胞之所佔比例與數目；圖2E、2F分別為小鼠經輸入細胞毒殺型T淋巴細胞後於其肝臟與脾臟所表現被輸入的細胞毒殺型T淋巴細胞之累積數量圖，小鼠於細胞輸入前一天，經高壓注射法注射一由白蛋白啟動子控制之質體，此質體帶有卵白蛋白與螢光素酶基因，一天後免疫輸入1x105之OT-I轉型細胞毒殺型T淋巴細胞，免疫輸入後分別於第3、7、15天，肝臟淋巴細胞與脾細胞被分離出來，並使用流式細胞儀分析被輸入的細胞毒殺型T淋巴細胞之所佔比例與數目，*係表示P<0.05、**係表示P<0.01、***係表示P<0.001(unpaired Student’s t-test)。
圖3，包含圖3A、3B，顯示轉型Akt2 OT-I細胞毒殺型T淋巴細胞增殖的情形。圖3A為小鼠肝臟之生物發光動力圖，小鼠於細胞輸入前一天經高壓注射法注射一由白蛋白啟動子控制之質體，此質體帶有卵白蛋白，或注射一控制組載體，一天後分別給予控制組與實驗組2A-luc OT-I細胞毒殺型T淋巴細胞與mAkt2-2A-luc OT-I細胞毒殺型T淋巴細胞；該些CTLs會表現luciferase，因此其增殖可以生物冷光偵測。圖3B為分別於免疫輸入後第1、4、8、10、12、15、18、25天監測並記錄其生物發光的結果。
圖4，包含圖4A-4T，係顯示經基因工程後帶有活化Akt1之HBc93-100特異性之細胞毒殺型T淋巴細胞，在肝臟內避免產生T細胞耗竭現象。圖4A-4C分別為PD-1、TIGIT、LAG-3在Akt1-CD90.1或CD90.1(圖中之ctrl)反轉錄病毒轉型兩天後CTLs上表現量之直方圖，圖中灰色直方區塊為同種型之陰性對照組，空白直方區塊則為各特定之實驗組；圖4D係為圖4A-4C染色結果之平均螢光強度條狀圖。4E-4G分別為Akt1-CD90.1或CD90.1(圖中之ctrl)CTLs經過24小時使用抗CD3/CD28磁珠再刺激後其PD-1、TIGIT、LAG-3表現量之直方圖，圖中灰色直方區塊為同種型之陰性對照組，空白直方區塊則為各特定之實驗組；圖4H係為圖4E-4G染色結果之平均螢光強度條狀圖；圖4I-4T係為進行細胞輸入小鼠後的免疫檢查點之表現量，各免疫檢查點的表現係同時以直方圖與平均螢光強度條狀圖表示，首先，給予經帶有B型肝炎病毒之重組腺病毒(AdHBV)感染後之小鼠進行5x105 Akt1-CD90.1或CD90.1(ctrl)細胞毒殺型T淋巴細胞治療，分別於輸入後第6、19天，分離出肝臟淋巴細胞與脾臟細胞，並使用流式細胞儀分析輸入之細胞毒殺型T淋巴細胞上所表現的免疫檢查點，係圈選CD8+CD45.1+為被輸入的細胞毒殺型T淋巴細胞，圖4I、4J為輸入後第6天之PD-1表現之定量結果，圖4M、4N為同時之TIM-3表現定量結果，圖4Q、4R為同時之
LAG3表現定量結果，而圖4K、4L為輸入後第19天之PD-1表現之定量結果，圖40、4P為同時之TIM-3表現定量結果，圖4S、4T為同時之LAG3表現定量結果。圖中灰色直方區塊為同模式之對照組，空白直方區塊則為各特定之實驗組，於平均螢光強度條狀圖中，N值皆為3，*係表示P<0.05、**係表示P<0.01、***係表示P<0.001(unpaired Student’s t-test)。
圖5，包含圖5A-5H，係顯示於動物體外實驗中，Akt訊息傳遞對免疫檢查點表現的影響。圖5A-5C係分別為PD-1、TIGIT、LAG-3三種免疫檢查點在經CD90.1(ctrl)、Akt1-CD90.1、Akt2-CD90.1反轉錄病毒轉型兩天後CTLs上的表現量，圖中灰色直方區塊為同模式之對照組，空白直方區塊則為各特定之實驗組；圖5D則為上述3種免疫檢查點之平均螢光強度定量條狀圖；圖5E-5G係分別為PD-1、TIGIT、LAG-3三種免疫檢查點在經抗CD3/CD28磁珠再刺激1天之轉型CD90.1(ctrl)、Akt2-CD90.1細胞毒殺型T淋巴細胞上的表現量，圖中灰色直方區塊為同模式之對照組，空白直方區塊則為各特定之實驗組；圖5H為上述3種免疫檢查點之平均螢光強度定量條狀圖，*係表示P<0.05、**係表示P<0.01、***係表示P<0.001(unpaired Student’s t-test)。
圖6，包含圖6A-6F，係顯示於持續感染HBV的小鼠實驗模型中，2x105 HBc93-100特異性細胞毒殺型T淋巴細胞能避免T細胞耗竭。給予CD45.2+之AdHBV小鼠輸入2x106之轉型Akt2-CD90.1或CD90.1(ctrl)細胞毒殺型T淋巴細胞，並於輸入後第19天從小鼠體內分離出肝臟淋巴細胞與脾細胞，使用流式細胞儀分析其免疫檢查點之表現，圖6A、6C、6E分別為PD-1、TIM-3、TIGIT在輸入後第19天於輸入之細胞毒殺型T淋巴細胞上的表現量，圖中灰色直方區塊為同模式之對照組，空白直方區塊則為各特定之實驗組；圖6B、6D、6F分別為其染
色結果之平均螢光強度條狀圖，N值皆為3，*係表示P<0.05、**係表示P<0.01、***係表示P<0.001(unpaired Student’s t-test)。
圖7，包含圖7A-7O，係顯示經基因工程後表現活化Akt1之HBc93-100特異性細胞毒殺型T淋巴細胞於持續感染HBV的小鼠實驗模型中能產生針對HBV之免疫能力。CD45.2+之小鼠經AdHBV感染2.5個月後輸入5x105 Akt1-CD90.1或CD90.1(ctrl)細胞毒殺型T淋巴細胞，並於輸入後第6天與第19天從小鼠體內分離出肝臟淋巴細胞與脾臟細胞，並使用流式細胞儀分析被輸入的CD45.1+細胞毒殺型T淋巴細胞之所佔比例與數目，圖7A為所圈選用於分析之細胞群；圖7B、7C分別為輸入後第6天與第19天於肝臟與脾臟中被輸入的細胞毒殺型T淋巴細胞數目的定量圖；圖7D為小鼠血清中B型肝炎e抗原(HBeAg)的動力圖；圖7E為小鼠血清中ALT的動力圖；圖7F為圖7B中實驗小鼠之肝臟組織切片蘇木精-伊紅染色(H&E染色)之染色結果圖；圖7G-7J則分別為圖7B中實驗小鼠之肝臟組織切片進行B型肝炎core抗原(HBcAg)、cleaved caspase 3、Gr-1、CD45.1免疫化學染色之染色結果圖；圖7K為圖7C中實驗小鼠之肝臟組織切片H&E染色之染色結果圖；圖7L-7O則分別為圖7C中實驗小鼠之肝臟組織切片進行HBcAg、cleaved caspase 3、Gr-1、CD45.1免疫化學染色之染色結果圖，於此實施例中N值為3-4，*係表示P<0.05、**係表示P<0.01、***係表示P<0.001(unpaired Student’s t-test)，比例尺為100或40μm。
圖8，包含圖8A-8D，係顯示經基因工程後表現活化Akt2之HBc93-100特異性細胞毒殺型T淋巴細胞於持續感染HBV的小鼠實驗模型中能產生針對HBV之免疫能力。CD45.2+小鼠經AdHBV感染後，接受2x106轉型Akt2-CD90.1或CD90.1(ctrl)HBc93-100特異性細胞毒殺型T淋巴細胞，於輸入後第19天從小鼠體內分離出肝臟淋巴細胞與脾細胞，並使用流式細胞儀分析被輸入
的CD8+CD45.1+細胞毒殺型T淋巴細胞之所佔比例與數目。圖8A為所圈選用於分析之細胞群，CD8+CD45.1+細胞被圈選並判讀為被輸入之細胞；圖8B為輸入後第19天於肝臟與脾臟中被輸入的細胞毒殺型T淋巴細胞的定量圖；圖8C為小鼠血清中ALT的動力圖；圖8D為小鼠血清中HBeAg的動力圖，*係表示P<0.05、**係表示P<0.01、***係表示P<0.001(unpaired Student’s t-test)。
圖9，包含圖9A-9D，係顯示HBV帶原之小鼠接受免疫治療後，被輸入之HBV特異性細胞毒殺型T淋巴細胞的細胞激素表現量。CD45.2+之小鼠經AdHBV感染後輸入5x105轉型Akt1-CD90.1或CD90.1(ctrl)HBc93-100特異性細胞毒殺型T淋巴細胞，並於輸入後第19天從小鼠體內分離出肝臟淋巴細胞與脾臟細胞，使用HBc93-100胜肽再刺激6小時，接著進行細胞表面標記與細胞內之細胞激素的螢光染色，並使用流式細胞儀分析具分泌細胞激素功能的細胞毒殺型T淋巴細胞的所佔比例。圖9A為被輸入之HBV特異性細胞毒殺型T淋巴細胞其細胞內之細胞激素INF-γ、TNF-α表現量的Zebra plots圖；圖9B為分泌INF-γ之細胞毒殺型T淋巴細胞(SP)所佔比例與同時分泌INF-γ、TNF-α之細胞毒殺型T淋巴細胞(DP)所佔比例的條狀圖。CD45.2+之小鼠經AdHBV感染後輸入5x105轉型Akt2-CD90.1或CD90.1(ctrl)HBc93-100特異性細胞毒殺型T淋巴細胞，並於輸入後第19天從小鼠體內分離出肝臟淋巴細胞與脾細胞，使用HBc93-100胜肽再刺激6小時，接著進行細胞表面標記與細胞內之細胞激素的螢光染色，並使用流式細胞儀分析具分泌細胞激素功能的細胞毒殺型T淋巴細胞的所佔比例，CD8+CD45.1+細胞被圈選並判讀為被輸入之細胞；圖9C為被輸入之HBV特異性細胞毒殺型T淋巴細胞其細胞內之細胞激素INF-γ、TNF-α表現量的Zebra plots圖；圖9D為分泌INF-γ之細胞毒殺型T淋巴細胞(SP)所佔比例與同時分泌INF-γ、TNF-α之細胞毒殺
型T淋巴細胞(DP)所佔比例的條狀圖，*係表示P<0.05、**係表示P<0.01、***係表示P<0.001(unpaired Student’s t-test)。
圖10，包含圖10A-10J，係顯示Akt訊息傳遞可促進細胞毒殺型T淋巴細胞在肝臟中的抗原清除能力以及自我更新維持細胞數目衡定。小鼠於細胞輸入一天前，經高壓注射法(HDI)注射一由白蛋白啟動子控制之質體，此質體帶有卵白蛋白與螢光素酶基因(OVA-Luc)，一天後接受細胞治療，輸入1x105之OT-I轉型細胞毒殺型T淋巴細胞，細胞輸入後之第3、7、14天，分別從小鼠體內分離出肝臟淋巴細胞與脾臟細胞，並使用流式細胞儀進行被輸入的細胞毒殺型T淋巴細胞之所佔比例與數目的分析，圖10A為具生物發光表現的小鼠，等同於表現卵白蛋白的小鼠於特定時間點的所佔比例圖，圖10B、10C分別為於肝臟內有表現卵白蛋白之小鼠的肝臟與脾臟中累積被輸入的細胞毒殺型T淋巴細胞之動力圖，圖10D為帶有OVA-Luc之小鼠分別接受輸入1x105 2A-CD90.1(ctrl)或Akt1-2A-CD90.1之OT-I轉型細胞毒殺型T淋巴細胞後其血清內ALT值之動力圖。於細胞輸入後之第7、30、63天，從小鼠體內分離出肝臟淋巴細胞與脾臟細胞，並使用流式細胞儀進行被輸入的細胞毒殺型T淋巴細胞之所佔比例與數目的分析，圖10E、10F分別為其肝臟與脾臟中累積被輸入的細胞毒殺型T淋巴細胞之動力圖，圖10G則為其肝臟切片H&E染色的染色結果圖。帶有OVA-Luc之小鼠於細胞輸入後第6天與第62天，透過腹腔注射給予1mg的BrdU，於細胞輸入後之第7、63天，從小鼠體內分離出肝臟淋巴細胞與脾臟細胞，並使用流式細胞儀進行表現BrdU的被輸入之細胞毒殺型T淋巴細胞所佔比例的分析，圖H為帶有OVA-Luc之小鼠於細胞輸入後第7天與第63天帶有BrdU染色之Akt1之OT-I細胞毒殺型T淋巴細胞的代表直方圖，圖I則為帶有BrdU的Akt1 OT-I細胞毒殺型T淋巴細胞所佔之比例量圖，圖J為OVA-Luc小鼠接受輸入2A-CD90.1(ctrl)或
Akt1-2A-CD90.1之OT-I轉型細胞毒殺型T淋巴細胞後，分別於細胞輸入後第7、32、63天採集肝臟組織，並針對其肝臟內細胞的Ki-67表現量進行免疫化學染色分析的切片染色圖，比例尺為100或40μm，*係表示P<0.05、**係表示P<0.01、***係表示P<0.001(unpaired Student’s t-test)。
圖11，圖11A係顯示C57BL/6小鼠經不同病毒劑量之重組腺病毒感染後，於小鼠體內生物發光之影像圖，此重組腺病毒帶有一表現卵白蛋白與螢光素酶(OVA-Luc)之基因片段，且此一基因由白蛋白啟動子控制；圖11B為透過定量活體螢光冷光影像系統以定量、監測小鼠體內螢光表現，並繪製成一根據時間點所做之總螢光表現圖。
圖12，包含圖12A-12G，係顯示經基因工程後表現活化Akt1之CD8+T細胞的記憶反應。圖12A，為檢測轉型Akt的細胞毒殺型T淋巴細胞的記憶反應實驗設計圖，圖12B為小鼠經帶有一由白蛋白啟動子控制的卵白蛋白與螢光素酶基因之腺病毒(Ad-Albp-OL)感染，並於特定時間點給予免疫輸入1x105對照組T細胞與轉型Akt1的OT-I T細胞後，其血清中ALT表現之動力圖。如實驗設計圖，小鼠接受Ad-Albp-OL感染，於12天後接受輸入2A-CD90.1(ctrl)或Akt1-CD90.1 OT-I轉型細胞毒殺型T淋巴細胞，並於細胞輸入後第6天透過高壓注射法給予一由白蛋白啟動子控制之質體，此質體帶有卵白蛋白與螢光素酶基因(pENTRY-Albp-OL)，圖12C為小鼠體內生物發光於不同時間點之動力圖，圖12D為注射質體後第7天，分離出肝臟淋巴細胞與脾臟細胞，使用流式細胞儀分析被輸入之細胞毒殺型T淋巴細胞的所佔比例，圖12E為肝臟組織切片進行H&E染色後之切片染色圖，圖12F為肝臟組織切片進行CD8免疫化學染色後之切片染色圖，圖12G為肝臟切片進行Gr-1免疫化學染色後之切片染色圖，比例尺為100或
40μm，*係表示P<0.05、**係表示P<0.01、***係表示P<0.001(unpaired Student’s t-test)。
圖13，包含13A-13F，係顯示經基因工程後表現Akt的CD8+T細胞的記憶反應。小鼠經Ad-Albp-OL感染後接受細胞輸入2A-CD90.1(ctrl)、Akt1 OT-I或Akt2 OT-I轉型細胞毒殺型淋巴細胞，於細胞輸入後第7天，分離出肝臟淋巴細胞與脾臟細胞，使用流式細胞儀分析細胞數目，圖13A-13D分別為被輸入之細胞毒殺型T淋巴細胞、CD11b+ NK1.1-骨髓細胞、NK1.1+ CD3-自然殺手細胞、NK1.1+ CD3+自然殺手T細胞的數量定量圖。另於2A-CD90.1(ctrl)或Akt2 OT-I轉型細胞毒殺型T淋巴細胞細胞輸入後第64天，藉高壓注射法給予pENTRY-Albp-OL，圖13E為小鼠於細胞輸入後於不同時間點所測得血清中之ALT值，圖13F為小鼠體內生物發光於不同時間點之動力圖，*係表示P<0.05、**係表示P<0.01、***係表示P<0.001(unpaired Student’s t-test)。
圖14，包含圖14A-14C，係顯示肝細胞癌的腫瘤微環境對經基因工程後表現Akt2的細胞毒殺型T淋巴細胞的影響。小鼠藉高壓注射法給予致癌基因，像是Akt、N-RasV12，以誘發肝細胞癌，在誘發後第31天給予2x106 2A-CD90.1(ctrl)或Akt2 OT-I轉型細胞毒殺型T淋巴細胞，並在細胞治療後的第10天採集肝臟與腫瘤組織，圖14A-14C分別為CD8、F4/80、cleaved caspase 3的免疫化學染色切片圖，T標記為腫瘤組織，L標記為肝臟組織。
圖15，包含圖15A-15D，係顯示經基因工程後表現Akt的細胞毒殺型T淋巴細胞其抗癌能力。小鼠藉高壓注射法給予致癌基因，像是Akt、N-RasV12，以誘發肝細胞癌，肝細胞癌的生長係透過定量活體螢光冷光影像系統監測，之後分別注射給予2x105CD90.1(ctrl)、Akt1、Akt2的轉型HBc93-100特異性細胞毒殺型T淋巴細胞，圖15A為小鼠在接受輸入不同T細胞前與接受後其生
物發光定量圖，圖15B-15D分別為具有肝細胞癌之小鼠接受免疫輸入ctrl、Akt1、Akt2的轉型HBc93-100特異性細胞毒殺型T淋巴細胞後，第19天所採集之肝臟與腫瘤組織樣本照片，*係表示P<0.05、**係表示P<0.01、***係表示P<0.001(unpaired Student’s t-test)。
圖16，包含圖16A-16L，係顯示藉由Akt分子的過度表現，改善嵌合型抗原受體T細胞的腫瘤特異性增殖、細胞激素的生產、細胞毒殺。圖16A係為用來基因工程T細胞之反轉錄病毒載體MSCV之構築概要，其含有5’與3’端之長末端重覆序列(long terminal repeats,LTR)、P2A連接胜肽序列(2A)、土撥鼠肝炎病毒之後轉錄調控因子(WPRE)。於pMSCV-mAkt1/Akt2-2A-CAR質體中，在2A序列後有嵌合型抗原受體(CAR)之開放閱讀框，例如抗B型肝炎之嵌合型抗原受體(S-CAR)、抗癌胚抗原之嵌合型抗原受體(anti-CEA CAR)，於2A序列上游另含有src豆蔻酸化序列(myr)與小鼠的AKT1、AKT2基因其中一序列；於另一pMSCV-hAkt1/hAkt2-2A-CAR質體中，係將原先的小鼠AKT1、AKT2基因替換為人類AKT1、AKT2基因。使用分別帶有mAkt1/mAkt2-2A-CD90.1、抗癌胚抗原之嵌合型抗原受體(anti-CEA CAR)或mAkt1/Akt2-2A-anti-CEA CAR之開放閱讀框的反轉錄病毒轉型入於體外被活化的小鼠CD3+T細胞，並與人類大腸直腸癌細胞株LS174T細胞共培養，後續使用EdU併入DNA的方法來檢測與監控當T細胞與腫瘤細胞在共培養的情況下，第22小時到第28小時間T細胞DNA合成情形，圖16B為表現Akt1(mAkt1)、抗癌胚抗原之嵌合型抗原受體(antiCEA)或Akt1-2A-anti-CEA CAR(mAkt1-antiCEA)的CD4+或CD8+T細胞的增殖直方圖，圖16C、16E與16D、16F分別為兩組於共培養的上清液中經ELISA所測得之IFN-γ與IL-2的濃度，圖16G、16I與16H、16J分別為帶有mAkt1或mAkt2的轉型T細胞在與LS174Tv細胞共培養一天後其細胞內IFN-γ與Granzyme B的染色表現數據
圖；圖K係顯示轉型2A-CD90.1或mAkt1-2A-CD90.1之OT-I細胞毒殺型T淋巴細胞於不同比例濃度的骨髓來源抑制細胞(myeloid derived suppressor cells,MDSCs)環境中經由抗CD3/CD28磁珠再刺激後其增殖能力折線圖，該MDSCs係取自患有EL4腫瘤之小鼠；圖L係顯示轉型2A-CD90.1或mAkt2-2A-CD90.1之HBc93-100特異性細胞毒殺型T淋巴細胞於不同比例濃度的MDSCs環境中經由抗CD3/CD28磁珠再刺激後其增殖能力折線圖，該MDSCs係取自患有肝細胞癌腫瘤之小鼠，*係表示P<0.05、**係表示P<0.01、***係表示P<0.001(unpaired Student’s t-test)。
除非另外定義，否則本說明書所使用之技術名詞與科學名詞皆為本發明領域中具通常知識者一般所熟知之定義。
於本說明書中，“OT-I細胞”係指一種具卵白蛋白特異性的轉基因CD8+T細胞，此轉基因T細胞其受體經設計後可辨識卵白蛋白上257-264胺基酸表位，而被應用於T細胞正選擇過程中胺基酸功能、CD8+T細胞對抗抗原的反應等相關研究。
於本說明書中，“帶有B型肝炎病毒之重組腺病毒(AdHBV)”係指一帶有B型肝炎病毒基因組的線病毒，可透過小鼠尾靜脈經高壓注射此病毒進而建立一B型肝炎病毒感染之小鼠動物模型。
於本說明書中，“B型肝炎core抗原(HBcAg)”係指一種B型肝炎病毒所表現之抗原蛋白質，可見於B型肝炎病毒的核心表面上及受B型肝炎病毒感染細胞內。
於本說明書中，“B型肝炎e抗原(HBeAg)”係指一種B型肝炎病毒所表現之抗原蛋白質，可於經由AdHBV感染而建立的B型肝炎病毒感染之小鼠動物模型的血清中偵測到。
本發明中所用之DNA或RNA分子皆透過質體增幅、體外轉錄或體外合成來增幅放大，並透過電穿孔、脂質體或其他化學載體轉染至該標的細胞。
本發明所使用之用於基因編輯之標的細胞，為來自多種物種之T細胞、自然殺手細胞、造血幹細胞、胚胎幹細胞或分化多能性幹細胞，並可藉由病毒感染、DNA或RNA轉型而進行基因編輯。
本發明所使用之重組病毒載體或跳躍子載體，為反轉錄病毒、慢病毒、腺病毒、一腺相關病毒或其他用於轉導或併入轉殖基因的相關病毒與各式跳躍子系統。
於一實施例中，係利用細胞免疫療法將體外活化之具有B型肝炎病毒特異性的CD8+T細胞輸入至B型肝炎病毒帶原小鼠，並觀察其血清中B型肝炎病毒抗原的改變，以檢測具病毒特異性的細胞毒殺型T淋巴細胞於肝臟時，肝臟中的微環境如何影響其二級增殖反應，並發現大部分的帶原小鼠皆無法於42天內消除B型肝炎病毒的感染，且於帶原小鼠的肝臟與脾臟中也觀察到所輸入的T細胞之數量變化與其細胞表面所表現的T細胞耗竭分子，例如PD-1、TIM-3、LAG-3等分子，於細胞數量方面，B型肝炎病毒特異性T細胞數量於肝臟中有上升，於脾臟中則無此現象；而T細胞表面的耗竭分子，相較於內源性之CD8+T細胞，B型肝炎病毒特異性T細胞不管在肝臟或是脾臟，其表面上的PD-1、LAG-3皆有較高的表現量，然而比較脾臟與肝臟內的B型肝炎病毒特異性T細胞兩者間的差異，可發現肝臟內的B型肝炎病毒特異性T細胞其PD-1、TIM-3、LAG-3表
現量皆高於脾臟內B型肝炎病毒特異性T細胞，從上述結果可發現肝臟微環境中所存在的B型肝炎病毒抗原可導致B型肝炎病毒特異性T細胞耗竭。
免疫檢查點如PD-1可活化PP2A路經、CTLA-4可活化SHP-1/2路徑，而抑制T細胞因TCR訊息傳遞路徑所誘發的Akt磷酸化/活化，因此本發明進一步檢驗Akt訊息傳遞路徑之於CD8+T細胞處於肝臟內時的分化與擴增能力的關係。於本發明一實施例中，分別轉型小鼠的AKT1、AKT2、AKT3基因至小鼠T細胞，該AKT基因序列上游含有src豆蔻酸化序列，以確保其錨定細胞膜與持續性活化Akt分子的能力，並將該轉型後之T細胞輸入小鼠體內，後續使用西方點墨法檢測，其結果顯示只有輸入之經基因編輯T細胞有表現豆蔻酸化序列之Akt，對照組T細胞並無此表現，且分別表現此三種Akt蛋白的細胞毒殺型T淋巴細胞，皆可於其Akt蛋白之Ser473上發現磷酸化，而只有在表現Akt1或Akt2的T細胞上有觀察到Akt上Thr308的磷酸化現象。
為檢測過度表現Akt蛋白與細胞毒殺型T淋巴細胞在肝臟中的生存與面對抗原刺激所產生二級增殖反應之間的關係，在本發明一實施例中，係經由高壓注射將一帶有卵白蛋白基因與螢光素酶基因的質體注射到小鼠體內，而使小鼠肝臟可以偵測到卵白蛋白與螢光素酶的表現。之後給予細胞治療，輸入具表現Akt1或Akt2的轉型細胞毒殺型T淋巴細胞，於細胞治療7天後，發現該基因編輯過之T細胞大量累積在肝臟與脾臟內，以肝臟為例，相較於控制組T細胞，Akt1細胞毒殺型T淋巴細胞的數量約為其25萬倍，Akt2細胞毒殺型T淋巴細胞的數量則約為其95萬倍
在本發明一實施例中，係將體外活化且經轉型Akt1或Akt2之HBc93-100細胞毒殺型T淋巴細胞與控制組細胞毒殺型T淋巴細胞分別輸入經AdHBV感染的小鼠體內，以檢測Akt訊息傳遞路徑對於具B型肝炎病毒特異性的
細胞毒殺型T淋巴細胞上所表現之免疫檢查點的影響，於細胞治療後第6天與第19天進行T細胞表面免疫檢查點的表現量分析，發現於免疫治療後第19天，相較之下，轉型Akt1或Akt2之細胞毒殺型T淋巴細胞上的PD-1、TIM-3、LAG-3表現量顯著性的低於控制組細胞毒殺型T淋巴細胞。
在本發明一實施例中，係將控制組與轉型Akt1之HBc93-100細胞毒殺型T淋巴細胞輸入B型肝炎病毒帶原小鼠，以檢測經轉型Akt之細胞毒殺型T淋巴細胞是否能克服肝臟中所產生的抑制機制並改善B型肝炎病毒感染，於輸入第14天後，發現只有轉型Akt1的細胞毒殺型T淋巴細胞具有改善B型肝炎病毒感染的情況，且轉型Akt1的細胞毒殺型T淋巴細胞大部分皆分布於肝臟而非脾臟，在清除完抗原後，才分布至脾臟；另外，相較於控制組，在接受輸入轉型Akt1的細胞毒殺型T淋巴細胞的小鼠肝臟內發現較多的cleaved caspase 3陽性的細胞凋亡肝細胞、較少的B型肝炎core抗原陽性肝細胞，但在清除完抗原後，單核細胞數量減少，且於其肝臟內皆偵測不到B型肝炎core抗原陽性肝細胞與cleaved caspase 3陽性的細胞凋亡肝細胞的存在；反之，於控制組中，細胞毒殺型T淋巴細胞並無法改善B型肝炎病毒感染，且也無法引起發炎反應。
在本發明另一實施例中，係將轉型Akt2之具腫瘤特異性之CD8+細胞毒殺型T淋巴細胞輸入至患有肝細胞癌之小鼠，以檢測經轉型Akt2之細胞毒殺型T淋巴細胞毒殺肝癌細胞的能力，於細胞輸入10天後，此轉型T細胞會分布於腫瘤組織與肝臟中，並改變腫瘤組織中微環境以活化或吸引周圍F4/80+巨噬細胞至腫瘤組織，除此之外，cleaved caspase 3陽性的腫瘤細胞也表現於腫瘤組織中，且於小鼠血清中可偵測到ALT濃度上升，以上結果可揭示Akt2的活化能使細胞毒殺型T淋巴細胞具有更強的功能性，並毒殺肝臟中之腫瘤細胞，其可能是
透過細胞毒殺型T淋巴細胞本身的細胞毒殺能力或是分泌細胞激素以活化巨噬細胞的抗癌功能。
在本發明一實施例中，係將人類或小鼠的Akt1或Akt2基因與抗-癌胚抗原之嵌合型抗原受體(anti-CEA CAR)基因序列編輯至質體中，轉型至細胞毒殺型T淋巴細胞後，與人類大腸直腸癌細胞株LS174T共培養，以檢測Akt分子作用於癌症免疫細胞療法之可行性，轉型帶有anti-CEA CAR的CD4+或CD8+T細胞皆可被LS174T刺激活化、增殖，另外，除了表現anti-CEA CAR外，額外表現Akt1的T細胞還能促進CD4+或CD8+T細胞的增殖能力，且相較於只表現anti-CEA CAR的T細胞其培養基，於表現Akt1或Akt2基因與anti-CEA CAR的T細胞其培養基中，可偵測到更高濃度的IL-2與IFN-γ。透過細胞內染色，CD8+T細胞內IFN-γ與Granzyme B的表現量皆上升，也證實當T細胞高度表現活化Akt1或Akt2時，能促進其分泌細胞激素與增強其細胞毒殺能力。
本發明可藉由下列實施例來進一步闡明，實施例僅用來進一步說明而非限制本發明之應用與範圍，另外，於小鼠動物模型中所使用之mAkt同功異形體，僅用以闡述本發明，也非限制本發明之應用與範圍。
實施例一、細胞毒殺型T淋巴細胞於肝臟內之T細胞耗竭現象
對經由帶有B型肝炎病毒之重組腺病毒(AdHBV)感染的C57BL/6小鼠進行細胞治療，輸入由體外活化的CD45.1+HBC93-100特異性CD8+T細胞，並在後續42天內觀察小鼠血清中B型肝炎e抗原的改變(如圖1A所示)。
使用流式細胞儀分析在細胞治療後3到14天，肝臟與脾臟內被輸入的HBC93-100特異性CD8+T細胞數目統計(圖1B、1C)，如圖1C，可見被輸入之具B型肝炎病毒特異性細胞毒殺型T淋巴細胞在肝臟的數量，從第3天到第14天，其數目有顯著性的增加。
在輸入細胞後第3與第7天，檢測在肝臟與脾臟的被輸入之具B型肝炎病毒特異性細胞毒殺型T淋巴細胞其耗竭分子的表現量，以內生性CD8+T細胞做為控制組，相較之下，不論是在肝臟或是脾臟，被輸入之T細胞其PD-1、LAG-3表現量皆較高，而TIM-3表現量也有稍許提升(圖1D至1K)。
於輸入後第14天，相較於控制組，肝臟中被輸入之T細胞其TIM3表現量達到一較高值，而脾臟中則無此現象(參照圖1E、1G、1I、1K、1M、1O)；除此之外，脾臟中被輸入之T細胞其PD-1、LAG-3表現量皆低於肝臟中被輸入之T細胞(圖1D至1O)。
實施例二、於細胞毒殺型T淋巴細胞中持續表現活化Akt同功異形體
係使用小鼠幹細胞反轉錄病毒(murine stem cell retroviral，MSCV)系統做為運送外來基因至T細胞之載體，因此系統於轉型造血幹細胞系統具有較高效率，於本實施例中，是製造一pMSCV-CD90.1質體，係用p2A連接胜肽序列取代潮黴素抗性基因，與CD90.1開放閱讀框(open reading frame，ORF)所組成，並於CD90.1基因的3端非轉譯區加入土撥鼠肝炎病毒之後轉錄調控因子(woodchuck hepatitis virus posttranscriptional regulatory element，WPRE)，以增強轉基因的表現。將此帶有WPRE序列的CD90.1基因係由pLKO_TRC024質體(RNAi core lab，台北，台灣)進行擴增，並使用小鼠4T1乳癌細胞的互補DNA進行聚合酶鏈式反應，以複製小鼠AKT1(SEQ ID NO：1)、AKT2(SEQ ID NO：3)、AKT3(SEQ ID NO：5)基因，並在所用引子，也就是AKT基因上游端，加入src豆蔻酸化序列，以確保其能標靶於細胞膜上，並持續性地活化Akt分子，此帶有豆蔻酸化序列的同種型AKT基因係透過此一質體中p2A連接胜肽序列與CD90.1基因連接，而最終製造得到pMSCV-mAkt1-CD90.1、pMSCV-mAkt2-CD90.1、
pMSCV-mAkt3-CD90.1三種質體，主要的表現匣(expression cassette)係由MSCV的5端、3端的長末端重複序列(long terminal repeats，LTRs)位於其兩側。於本實施例中共使用四種質體進行重組反轉錄病毒，分別為攜帶小鼠AKT1、AKT2、AKT3及或只帶有CD90.1基因(控制組)等四種重組病毒(見圖2A)。
先於體外藉由抗CD3/CD28磁珠激活CD8+OT-I T細胞，轉型帶有上述質體的重組反轉錄病毒，接著使用抗CD90.1抗體進行其表面抗原染色，並使用流式細胞儀進行分析，以評估轉基因之表現。結果顯示，約75%至95%的CD8+T細胞可被攜帶CD90.1、AKT1-CD90.1或AKT2-CD90.1基因的反轉錄病毒轉導(呈現CD90.1陽性)，而僅有約23%的CD8+T細胞被攜帶AKT3-CD90.1基因的反轉錄病毒轉導(其CD90.1表現量較低)，如圖2B所示。
先前文獻指出，三種Akt同功異形體具有不同的表現情形，Akt1(SEQ ID NO：1)、Akt2(SEQ ID NO：3)表現於幾乎所有組織上，然而Akt3(SEQ ID NO：5)主要表現於腦與睪丸上，也因此可解釋為何Akt3在CD8+T細胞中的表現量低。另外，透過西方墨點法，可檢驗得知經轉型Akt的細胞毒殺型T淋巴細胞上才有表現外源性的豆蔻酸化Akt分子，且此三種轉型的Akt同功異形體皆可在其Ser473上出現Akt磷酸化，但只有Akt1、Akt2分子的Thr308出現Akt磷酸化現像(如圖2C所示)。
實施例三、Akt訊號傳遞路徑可促進肝臟內細胞毒殺型T淋巴細胞的抗原依賴增殖反應
係由高壓注射(hydrodynamic injection，HDI)將一由白蛋白啟動子控制之質體注射至小鼠體內，此質體編碼卵白蛋白(Ovalbumin，OVA)與螢光素酶(luciferase)基因(pENTRY-Albp-OL)，後續對小鼠分別輸入三種Akt同功異形體
的轉型細胞毒殺型T淋巴細胞，或控制組(CD90.1)以進行免疫治療。結果顯示，表現Akt1、Akt2的轉型細胞毒殺型T淋巴細胞迅速於肝臟與脾臟中增殖。
細胞治療時，分別輸入約10萬個經體外活化的轉型細胞毒殺型T淋巴細胞，於小鼠體內經肝臟中抗原活化後，表現Akt1、Akt2的轉型細胞毒殺型T淋巴細胞迅速增殖，在肝臟與脾臟內共計平均約有2300萬個表現Akt1的轉型細胞毒殺型T淋巴細胞，與1億1300萬個表現Akt2的轉型細胞毒殺型T淋巴細胞(如圖2D所示)，而大部分經輸入的控制組(CD90.1)轉型細胞毒殺型T淋巴細胞於輸入後就消失了，可能是因其缺少共刺激活化、生長訊號或因肝臟內的抑制性微環境所致。
透過時間動力學實驗，進一步驗證表現Akt1、Akt2的兩種轉型細胞毒殺型T淋巴細胞迅速擴張與增殖的現象(參照圖2E、2F)，可見表現Akt2的轉型細胞毒殺型T淋巴細胞，不論於肝臟或脾臟內增殖的效果皆較表現Akt1與控制組的轉型細胞毒殺型T淋巴細胞更好，除此之外，亦可見表現Akt1的轉型細胞毒殺型T淋巴細胞較偏好存在於肝臟中(如圖2D至2F)。
因此，另建築一表現Akt與螢光素酶的質體，以監測經Akt轉型細胞毒殺型T淋巴細胞的分布與增殖情形。分別將只轉型螢光素酶基因的細胞毒殺型T淋巴細胞(Luc-CTLs)，以及轉型Akt2、螢光素酶基因的細胞毒殺型T淋巴細胞(Akt2-Luc-CTLs)輸入至其肝臟內有或無表現卵白蛋白的小鼠。觀察結果顯示，只有具T細胞受體(TCR)訊息傳遞依賴性Akt2-Luc-CTL累積在具抗原表現的小鼠肝臟中，而不存在其他器官或其肝臟中無抗原表現的小鼠中(如圖3所示)，此結果顯示只有當轉型細胞毒殺型T淋巴細胞受到TCR訊息傳遞活化後，活化Akt的訊息傳遞才能助長CTLs大量增生，而且Akt-CTLs在抗原清除後會進行T-
細胞縮減，不會過度增殖造成免疫風暴。而控制組CTLs無法對應肝臟中的抗原刺激而增殖(如圖3)。
實施例四、Akt訊息傳遞路徑可抑制細胞毒殺型T淋巴細胞上免疫檢查點分子的表現
首先，於體外轉型Akt並活化的HBc93-100特異性CD8+T細胞，在活化後第3天進行其細胞表面免疫檢查點分子的表現分析，持續活化Akt1或Akt2訊息傳遞的細胞毒殺型T淋巴細胞並無法改變其表面PD-1、TIGIT的表現(如圖4A、4B、4D、5A、5B、5D)，然而，卻可以顯著性的減少其表面LAG-3的表現量(如圖4C、4D、5C、5D)。
此等CTL於抗-CD3/抗-CD28磁珠活化後第3天，已回復到具有低量或無免疫檢查點分子(如PD-1及TIGIT，除LAG-3之外)表現的靜息狀態。而施予抗-CD3/抗-CD28磁珠再刺激後，測量此等免疫檢查點分子於CTLs細胞表面上的表現量於轉型對照組、Akt1或Akt2的細胞毒殺型T淋巴細胞其表面立刻能偵測到PD-1的表現(如圖4E、4H、5E、5H)，而且於轉型Akt1的細胞毒殺型T淋巴細胞上，其表現量還較對照組稍高(如圖4E、4H)；於轉型Akt2的細胞毒殺型T淋巴細胞上，其表現量較對照組稍低(如圖5E、5H)，然而，相較於對照組，轉型Akt1或Akt2的細胞毒殺型T淋巴細胞其表面LAG-3、TIGIT的表現量低於對照組(如圖4F至4H、5F-5H)。
為進一步檢測Akt訊息傳遞路徑對免疫檢查點的調節作用是否能於肝臟中的抑制性微環境中作用，係將轉型對照組、Akt1的細胞毒殺型T淋巴細胞輸入至由帶有B型肝炎病毒之重組腺病毒(AdHBV)感染所建立的肝炎模式小鼠，並於輸入後第6、第19天進行其表面免疫檢查點的分析，於輸入後第6天時，
兩種轉型細胞毒殺型T淋巴細胞表面皆具高表現量的PD-1，但到了第19天後，於轉型Akt1的細胞毒殺型T淋巴細胞表面其PD-1表現量反而下降(如圖4M-4P)。
於暴露至HBV後第6天，肝臟內Akt1-CTLs可表現高量的TIM-3表現，而脾臟內CTLs及肝臟內對照組CTLs，於此時間點其TIM-3表現量相對較低，表示於轉型Akt1的細胞毒殺型T淋巴細胞中，較易因TCR的訊息傳遞而活化(如圖4M、4N)。然而，於第6後第19天期間，於肝臟內轉型Akt1的細胞毒殺型T淋巴細胞之TIM-3表現量下降，而肝臟內對照組CTLs之TIM-3表現量反而大幅度的上升，但是在脾臟內CTLs則無此現象(如圖4M-P所示)。
另外，在免疫治療後第6天、第19天，肝臟內對照組經轉型的細胞毒殺型T淋巴細胞其表面皆具高表現量的LAG-3，而相比之下，轉型Akt1的細胞毒殺型T淋巴細胞其表面皆呈現較低表現量的LAG-3(如圖4R至4T)。
本實施例內容揭示Akt訊息傳遞路徑對PD-1表現量的影響不大，但能於TCR訊息傳遞早期就正向活化TIM-3的表現量，並且進一步證實Akt訊息傳遞路徑能在有B型肝炎病毒感染的情況下，減少細胞毒殺型T淋巴細胞表面表現LAG-3、TIGIT等分子。
於經抗CD3/CD28磁珠再活化24小時後，由活體外及活體內數據顯示相較於對照組CTLs，轉型Akt1的細胞毒殺型T淋巴細胞其表面不論是PD-1或TIM-3的表現量皆較高，此強烈暗示轉型Akt1的細胞毒殺型T淋巴細胞對TCR的訊息傳遞的反應較強，並且具有負向調控LAG-3、TIGIT表現量的作用。關於轉型Akt1的細胞毒殺型T淋巴細胞較早表現TIM-3這方面，可能係因其具有對抗B型肝炎病毒感染的功能性；而到了較晚期，轉型Akt1的細胞毒殺型T淋巴細胞其表面免疫檢查點表現量下降，則可能是因較強的功能性而使能較有效的去除
肝臟內B型肝炎病毒抗原，此時轉型Akt1的細胞毒殺型T淋巴細胞所受的抗原刺激遞減。
實施例五、細胞毒殺型T淋巴細胞的Akt訊息傳遞路徑可增強其功能性與毒殺受B型肝炎病毒感染細胞的能力
B型肝炎病毒帶原小鼠接受細胞治療後，分別測量其肝臟與脾臟內輸入的對照組或轉型Akt1的HBc93-100特異性細胞毒殺型T淋巴細胞的細胞數量，系顯示不論是在輸入後第6天或第19天，皆是肝臟內經轉型Akt1的細胞毒殺型T淋巴細胞數量遠多於對照組(如圖7A至7C)。
B型肝炎病毒帶原小鼠接受細胞治療後，於輸入後14天內，經轉型Akt1的細胞毒殺型T淋巴細胞可有效的改善持續性的B型肝炎病毒感染(如圖7D)，透過檢測細胞治療後第3天到第7天內小鼠體內血清中ALT值的變化，亦顯示轉型Akt1的細胞毒殺型T淋巴細胞比對照組的細胞毒殺型T淋巴細胞有更好的細胞毒殺功能(如圖7E)；另外，於細胞輸入後第6天，轉型Akt1的細胞毒殺型T淋巴細胞主要分布於肝臟而非脾臟，並且當抗原清除完畢後，更是消失於脾臟(如圖7B、7C)，且透過H&E染色，於小鼠的肝臟可見大量的單核細胞浸潤(如圖7F)。
使用免疫化學染色進行經細胞治療6天後B型肝炎病毒帶原小鼠肝臟切片染色，係針對肝細胞與免疫細胞上所表現的B型肝炎core抗原與cleaved caspase 3，結果顯示，相較於接受對照組細胞毒殺型T淋巴細胞，接受輸入轉型Akt1的細胞毒殺型T淋巴細胞的小鼠其表現B型肝炎core抗原的肝細胞數目較少，但表現cleaved caspase 3的肝細胞數目卻較多，且周圍都有單核細胞聚集，表示轉型Akt1的細胞毒殺型T淋巴細胞具有毒殺被B型肝炎病毒感染的肝細胞的功能(如圖7G、7H)；另外，於輸入轉型Akt1的細胞毒殺型T淋巴細胞的小鼠的肝
臟中，也檢測到較多的Gr-1+骨髓細胞與被輸入的細胞毒殺型T淋巴細胞(如圖7I、7J)。
於輸入轉型Akt1的細胞毒殺型T淋巴細胞的小鼠，當抗原被清除完畢後，肝臟的組織學切片免疫化學染色結果與正常肝臟無異，單核細胞數目減少，也偵測不到表現B型肝炎core抗原與表現cleaved caspase 3的的肝細胞，同樣的，Gr-1+骨髓細胞數目也減少，且仍能檢測到被輸入的細胞毒殺型T淋巴細胞，然而，於輸入對照組細胞毒殺型T淋巴細胞的小鼠免疫化學染色切片結果中，顯示此細胞毒殺型T淋巴細胞並無法毒殺、清除B型肝炎病毒，也無法產生發炎反應(如圖7F至7O)。
同樣的，轉型Akt2的細胞毒殺型T淋巴細胞於小鼠體內遇到抗原時，也能於抗原存在的位置快速增殖(如圖8A、8B)、避免T細胞進入耗竭狀態(如圖6)、具有有效的細胞毒殺功能(如圖8C)、並且比對照組的細胞毒殺型T淋巴細胞有更佳的清除B型肝炎病毒感染的能力(如圖8D)。轉型Akt1或Akt2的細胞毒殺型T淋巴細胞於小鼠體內受到B型肝炎病毒抗原刺激時，相較於對照組的細胞毒殺型T淋巴細胞，更能夠分泌IFN-γ與TNF-α(如圖9A至9D)。
實施例六、Akt1只促進T細胞受器(TCR)依賴性的增殖並可增強細胞毒殺型T淋巴細胞的自我更新維持細胞數目衡定
於此實施例中係使用生物發光來檢測、定量轉型後的細胞毒殺型T淋巴細胞其清除小鼠肝臟內抗原的能力，係顯示轉型Akt1的OT-I細胞毒殺型T淋巴細胞具有更佳的清除肝臟中卵白蛋白的能力(如圖10A)，於輸入至小鼠後7天內，就可清除肝臟中抗原，並其細胞在肝臟的增殖數目同時也達到最高(如圖10B、10C)，另外輸入轉型Akt1的OT-I細胞毒殺型T淋巴細胞小鼠，其血清中ALT
值也有所上升，係顯示該轉型Akt1的OT-I細胞毒殺型T淋巴細胞具有毒殺表現卵白蛋白肝細胞的細胞毒殺作用(如圖10D)。
長期監控肝臟內與脾臟內被輸入的轉型Akt1的OT-I細胞毒殺型T淋巴細胞數量與該被輸入小鼠其血清中ALT值，結果顯示於細胞毒殺型T淋巴細胞輸入後第63天，抗原被清除完畢後，小鼠血清中的ALT值便開始降回正常值，該細胞毒殺型T淋巴細胞數目也減少了約5000倍(如圖10D至圖10F)，另外，在輸入後第7天時，仍能於被輸入轉型Akt1的OT-I細胞毒殺型T淋巴細胞小鼠其肝竇中觀察到許多單核細胞，該現象也於輸入後第32天開始消失(如圖10G)。
除此之外，於本實施例中亦分別分析被輸入的轉型Akt1的細胞毒殺型T淋巴細胞與內源性之CD8+T細胞於免疫治療後第7天與第63天的細胞增殖能力，係顯示在缺乏抗原的情況下，轉型Akt1的細胞毒殺型T淋巴細胞仍保有一定程度的DNA合成，以持續性的自我更新，也因此於抗原清除完畢後，該細胞數目仍能維持(如圖10H、10I)，另外，如圖10J所示，於輸入後第7天時，小鼠肝竇中的轉型Akt1的細胞毒殺型T淋巴細胞皆表現Ki-67，表示其正在旺盛的增殖，但在輸入後第32天與第63天時，就已幾乎偵測不到此現象了(如圖10J)。
實施例七、Akt訊息傳遞路徑可促進T細胞的記憶機制
設計一經帶有一由白蛋白啟動子控制的卵白蛋白與螢光素酶基因之腺病毒(Ad-Albp-OL)感染的小鼠實驗模型，其肝臟會持續性的表現卵白蛋白與螢光素酶，給予2x108與4x108IU濃度的Ad-Albp-OL腺病毒，可使小鼠肝臟持續穩定的表現螢光素酶長達兩個月(如圖11)，於此實施例中，係給予4x108IU濃度的Ad-Albp-OL腺病毒感染小鼠，後續分別給予對照組細胞毒殺型T淋巴細胞、轉型Akt1或Akt2細胞毒殺型T淋巴細胞。
於輸入後第7天，在該輸入轉型Akt1或Akt2細胞毒殺型T淋巴細胞的Ad-Albp-OL腺病毒感染小鼠的肝臟與脾臟中，相較於輸入對照組細胞毒殺型T淋巴細胞，轉型Akt1或Akt2細胞毒殺型T淋巴細胞數目比對照組細胞毒殺型T淋巴細胞數目多(如圖13A)，轉型Akt1或Akt2細胞毒殺型T淋巴細胞所引起的發炎反應可進一步促進先天免疫細胞的反應，像是CD11b+骨髓細胞、自然殺手細胞皆可於輸入轉型Akt1或Akt2細胞毒殺型T淋巴細胞的小鼠肝臟中被偵測到，而輸入對照組細胞毒殺型T淋巴細胞的小鼠則無此現象(如圖13B至13D)；於輸入後第7天或第14天，輸入轉型Akt1-OT-I細胞毒殺型T淋巴細胞的小鼠血清中ALT值上升，且從第七天就顯示具有清除病毒的能力，相較之下，輸入對照組細胞毒殺型T淋巴細胞並無此現象(如圖12B、12C)；於第一次細胞輸入60天後，高壓注射一pENTRY-Albp-OL或pENTRY載體至輸入對照組細胞毒殺型T淋巴細胞的小鼠與輸入轉型Akt1-OT-I細胞毒殺型T淋巴細胞的小鼠，以檢測小鼠免疫系統是否已產生抗原特異性的T細胞記憶，結果係顯示第二次受到抗原刺激時，兩組小鼠血清中ALT值皆上升，但相較於第一次免疫反應，其數值較低(如圖12B)，且於輸入轉型Akt1-OT-I細胞毒殺型T淋巴細胞的小鼠體內，當再次受到抗原刺激時，可於3天內迅速清除抗原，於輸入轉型Akt2-OT-I細胞毒殺型T淋巴細胞的小鼠體內也顯示相同結果(如圖13E、13F)，然而於輸入對照組細胞毒殺型T淋巴細胞的小鼠體內則無法迅速清除抗原(如圖12C)，顯示其T細胞記憶有缺損。
如圖12D，係顯示當輸入轉型Akt1細胞毒殺型T淋巴細胞的小鼠再次受到抗原刺激後的第7天，小鼠肝臟內具抗原特異性的T細胞已開始增殖，且從組織學切片檢驗，不論是輸入對照組細胞毒殺型T淋巴細胞的小鼠或是輸入轉型Akt1細胞毒殺型T淋巴細胞的小鼠，其肝臟經抗原再刺激後皆未出現明顯的發炎反應(如圖12E)，然而於輸入轉型Akt1細胞毒殺型T淋巴細胞的小鼠的肝竇中
仍能偵測到CD8+T細胞與Gr-1+骨髓細胞(如圖12F、12G)。本實施例揭示轉型Akt細胞毒殺型T淋巴細胞不僅具有較強的功能性，還可更有效率的產生T細胞記憶機制，以清除再次感染的同一抗原。
實施例八、細胞毒殺型T淋巴細胞的Akt訊息傳遞路徑可增強其細胞毒殺功能與毒殺腫瘤細胞功能
係透過給予患有肝細胞癌之實驗小鼠細胞治療，輸入具有腫瘤抗原特異性之轉型Akt2的CD8+細胞毒殺型T淋巴細胞，以檢測轉型Akt的細胞毒殺型T淋巴細胞毒殺腫瘤細胞的能力，小鼠肝臟切片的免疫化學染色結果如圖14，可見腫瘤處有大量轉型Akt2的細胞毒殺型T淋巴細胞(如圖14A)，另外在腫瘤周圍的微環境也被改變，吸引了大量F4/80+的巨噬細胞出現於腫瘤處(如圖14B)。
且相較於給予對照組細胞毒殺型T淋巴細胞治療的小鼠，於輸入轉型Akt2的細胞毒殺型T淋巴細胞的小鼠可見大量表現cleaved caspase 3的腫瘤細胞(如圖14C)；除此之外，於小鼠血清中ALT數值的變化也有所不同，輸入轉型Akt2的細胞毒殺型T淋巴細胞3天後的小鼠體內可檢測到ALT值的上升，而對照組小鼠則無此現象(ALT值分別為118.1 U/L與22.8 U/L)，且於輸入轉型Akt2的細胞毒殺型T淋巴細胞10天後的小鼠體內，也仍能檢測到ALT值持續性的上升(590.5 U/L)。
另外，給予患有肝細胞癌的實驗小鼠細胞治療，分別輸入具HBc93-100特異性的對照組、轉型Akt1、轉型Akt2的細胞毒殺型T淋巴細胞，其腫瘤變化結果係如圖15，透過定量活體螢光冷光影像系統定量，可見給予轉型Akt2的細胞毒殺型T淋巴細胞治療的小鼠其腫瘤生長受抑制(如圖15A)，透過肉眼觀察，亦可看見肝臟上病灶變小或消失(如圖15B至15D)。
因此可得知Akt2訊息傳遞路徑的活化，可有效的增強細胞毒殺型T淋巴細胞毒殺肝腫瘤細胞的能力。
實施例九、轉型Akt之嵌合型抗原受體(chimeric antigen receptor，CAR)T細胞毒殺腫瘤細胞的能力
為了進一步探索Akt分子在癌症免疫療法中的潛在應用性，遂構築帶有人類或小鼠Akt1或Akt2基因的質體，與編碼抗癌胚抗原(CEA)嵌合型抗原受體(CAR)之開放讀框(如圖16A)。本實施例所用的抗癌胚抗原之嵌合型抗原受體係為Hombach等人(Hombach,A.et al.J Immunol. 167(11),6123-31,2001)所揭示之構築。使用分別帶有小鼠AKT1基因、抗癌胚抗原之嵌合型抗原受體開放讀框，或同時包含兩基因的重組反轉錄病毒，轉型活化中的小鼠CD3+T細胞，並監測其增殖能力、細胞激素分泌與細胞毒殺。
轉型的細胞毒殺型T淋巴細胞與表現癌胚抗原的大腸直腸癌細胞細胞株LS174T細胞共培養，並透過胸苷類似物EdU併入DNA的方法來監測其增殖情形，結果如圖16B，係顯示轉型抗癌胚抗原的CD4+或CD8+T細胞都會對LS174T細胞的刺激產生反應而增殖，而Akt訊息傳遞路徑能更一步增強其增殖能力。
皆與LS174T細胞共培養時，相較於只表現抗癌胚抗原之嵌合型抗原受體的轉型T細胞，同時表現抗癌胚抗原之嵌合型抗原受體與Akt1或Akt2分子的轉型T細胞的培養基中可偵測到較高濃度的IL-2、IFN-r(如圖16C至16F)，透過細胞內免疫螢光染色(如圖16G至16J)，亦顯示轉型Akt1或Akt2的CD8+T細胞與LS174T細胞共培養時，表現Akt1或Akt2可增強細胞毒殺型T淋巴細胞的細胞激素分泌與其細胞毒殺能力。
另外，轉型Akt1或Akt2的細胞毒殺型T淋巴細胞具有抵抗因骨髓來源抑制細胞(myeloid derived suppressor cells,MDSCs)而造成的增值停滯(如圖16K、16L)，也進一步揭示了運用轉型Akt基因至T細胞運用於免疫細胞療法的可行性(如轉型至CAR T細胞)。
綜合以上實施例，本發明係提供一種藉由誘使抗腫瘤與抗病毒T細胞內過度表現Akt分子以增強細胞存活與功能的方法，轉型Akt的細胞毒殺型T淋巴細胞在遇到肝臟中抗原時，展現較高的增殖能力與較佳的功能性，顯示當T細胞處於抑制性微環境時，Akt分子可協助T細胞避免其進入耗竭狀態。本發明更進一步揭示，Akt分子有利於提升抗腫瘤與抗病毒細胞毒殺型T淋巴細胞的增殖能力、細胞激素分泌與其細胞毒殺，並使T細胞得以抵抗因骨髓來源抑制細胞而造成的增殖停滯；而且持續性的表現Akt分子，能使處於具耐受性的肝臟或腫瘤微環境中的T細胞繼續存活，以及維持其毒殺細胞的能力；並且只有在與T細胞受體的訊息傳遞路徑的共同作用下，才會引起大幅的增殖現象，並不具癌化的風險，因此本發明進而提出一種可用以治療慢性病毒感染或惡性腫瘤的的組成物及其使用方法。
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Claims (17)
- 一種用於減少免疫耐受性的組成物，係包含一可過度表現Akt分子的經轉型細胞，該經轉型細胞包含編碼下列之多核苷酸序列：a.一Akt分子或同功異形體；及b.一將該Akt分子或其同功異形體帶至該經轉型細胞之細胞膜的胜肽序列；其中該轉型細胞為一免疫細胞，該Akt分子或同功異形體係選自Akt1、Akt2、Akt3或其任意組合。
- 如請求項1所述之組成物，其中該胜肽序列為一如SEQ ID NO：7序列所示之豆蔻酸化-目標靶定序列(myristoylation-targeting sequence)。
- 如請求項1所述之組成物，其中該多核苷酸序列進一步包含一編碼嵌合型抗原受體或一重組T細胞受體之片段。
- 如請求項3所述之組成物，其中該多核苷酸序列進一步包含一編碼用以連接該Akt分子或同功異形體與該嵌合型抗原受體或該重組T細胞受體之連接胜肽的片段。
- 如請求項4所述之組成物，其中該連接胜肽序列為一如SEQ ID NO：9序列所示之2A胜肽序列。
- 一種如請求項1所述之組成物用於製備治療病毒感染性疾病藥物之用途，其中該轉型細胞亦可為一造血幹細胞、一胚胎幹細胞、一分化多能性幹細胞，或上述細胞所衍生之免疫細胞。
- 如請求項6所述之用途，其中該病毒感染性疾病為肝炎。
- 一種如請求項1所述之組成物用於製備治療癌症藥物之用途，其中該轉型細胞亦可為一造血幹細胞、一胚胎幹細胞、一分化多能性幹細胞或上述細胞所衍生之免疫細胞。
- 如請求項8所述之用途，其中該癌症為肝癌。
- 如請求項9所述之用途，其中該肝癌係包含肝細胞癌、膽管癌、肝臟血管肉瘤及肝臟惡性類上皮血管內皮癌。
- 一種如請求項3所述之組成物用於製備治療癌症藥物之用途，其中該轉型細胞亦可為一造血幹細胞、一胚胎幹細胞、一分化多能性幹細胞或上述細胞所衍生之免疫細胞。
- 一種用以製備如請求項1所述之組成物之方法，包含：將一重組病毒或跳躍子載體轉型至一標的細胞，及增殖該標的細胞。
- 如請求項12所述之方法，其中該重組病毒或跳躍子載體為一反轉錄病毒、一慢病毒、一腺病毒、一腺相關病毒或其他用於轉導或併入轉殖基因的相關病毒與各式跳躍子系統。
- 如請求項12所述之方法，其中該重組病毒或跳躍子載體係透過質體增幅、體外轉錄或體外合成來增幅放大，並透過電穿孔、脂質體或其他化學載體轉染至該標的細胞。
- 如請求項12所述之方法，其中該標的細胞為一T細胞、一自然殺手細胞、一造血幹細胞、一胚胎幹細胞、一分化多能性幹細胞或上述幹細胞所衍生之免疫細胞。
- 如請求項12所述之方法，其中該標的細胞係透過病毒轉導及DNA或RNA轉染做進一步修飾。
- 如請求項12所述之方法，其中該增殖該標的細胞之步驟係包含使用可溶性、與平板結合(plate-bound)的抗-CD3與抗-CD28抗體，或使用抗-CD3與抗-CD28磁珠刺激該標的細胞，並加入細胞激素以增進該標的細胞之生長。
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