TW202417624A - 用於抑制Lp(a)表現的聚核酸分子、醫藥組合物及其用途 - Google Patents

用於抑制Lp(a)表現的聚核酸分子、醫藥組合物及其用途 Download PDF

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柯特 布拉德肖
安東尼 尼古拉斯
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美商靖因藥業(上海)有限公司
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Abstract

本發明揭示用於抑制脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的聚核酸分子、醫藥組合物及方法。

Description

用於抑制Lp(a)表現的聚核酸分子、醫藥組合物及其用途
對於RNA干擾(RNAi)作為一種選擇性降解mRNA之細胞機制的發現使得可以對細胞培養物中之細胞表型進行靶向操縱,且具有開發定向療法的潛力,(Behlke, 2006, Mol. Ther. 13, 644-670;Xie等人,2006, Drug Discov. Today 11, 67-73)。
脂蛋白(a) (Lp(a))係由LDL (低密度脂蛋白)脂質核心、脂蛋白元B (apo B)及獨特的脂蛋白元apo(a)組成的脂蛋白。Lp(a)被視為心血管疾病(CVD)最常見的獨立基因遺傳性致病風險因素之一。因此,需要開發有效的Lp(a)抑制劑。本文所描述之聚核酸分子、其結合物及方法滿足此需求且提供相關優勢。
在某些態樣中,本文揭示一種用於調節脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的聚核酸分子,其包含有義股及反義股,其中該反義股包含與選自SEQ ID NO: 1至154之核酸序列至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%一致的核酸序列。在一些情況下,該有義股包含與選自SEQ ID NO: 309至462之核酸序列至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%一致的核酸序列。在一些情況下,該反義股含有包含選自SEQ ID NO: 1至154之核酸序列的至少14、15、16、17、18、19、20、21或22個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列,其中。在一些情況下,該有義股含有包含選自SEQ ID NO: 309至462之核酸序列的至少14、15、16、17、18、19或20個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在一些情況下,該有義股包含SEQ ID NO: 309至462中之一者且該反義股包含選自SEQ ID NO: 1至154之核酸序列。
在一些情況下,該有義股包含至少兩個經修飾之連續核苷酸間鍵聯在5'端。在一些情況下,該反義股包含至少兩個經修飾之連續核苷酸間鍵聯在5'端及/或3'端。在一些情況下,經修飾之核苷酸間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯。在一些情況下,經修飾之核苷酸間鍵聯包含在立體化學上富集硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯。在一些情況下,經修飾之核苷酸間鍵聯為S P對掌性核苷酸間硫代磷酸酯鍵聯。在一些情況下,聚核酸包含複數個經修飾之核苷酸間鍵聯,且該複數個經修飾之核苷酸間鍵聯中之至少1、2、3或4個為在立體化學上富集硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯。在一些情況下,至少一個在立體化學上富集硫代磷酸酯置於兩個連續核苷之間,該兩個連續核苷為有義股或反義股之六個5'或3'端核苷中的兩個。在一些情況下,有義股包含5'- nnnnnnNfnNfnNfnnnnnnnnnn-3',其中反義股包含5'- nNfnnnnNfnnnnNfnNfnNfnnnnnnn-3',其中n代表2'-O-甲基修飾之核苷酸,且其中Nf代表2'-氟修飾之核苷酸。
在一些情況下,有義股或反義股之長度為約19至25個或約21至23個核苷酸。
在一些情況下,有義股包含與選自SEQ ID NO: 463至616之核酸序列至少80%、至少85%、至少90%、至少95%一致的核酸序列。在一些情況下,反義股包含與選自SEQ ID NO: 155至308之核酸序列具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%一致性的核酸序列。在一些情況下,有義股包含選自SEQ ID NO: 463至616之核酸序列的序列,且反義股包含選自SEQ ID NO: 155至308之核酸序列的序列。
在另一態樣中,本文提供用於調節脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的聚核酸分子,其中聚核酸分子包含: (a)包含UAGAUGACCAAGCUUGGCAGGUC (SEQ ID NO: 4)之核苷酸序列的反義股及包含CCUGCCAAGCUUGGUCAUCUA (SEQ ID NO: 312)之核苷酸序列的有義股;(b)包含UAUAGAUGACCAAGCUUGGCAGG (SEQ ID NO: 5)之核苷酸序列的反義股及包含UGCCAAGCUUGGUCAUCUAUA (SEQ ID NO:313)之核苷酸序列的有義股;(c)包含UCAUAGAUGACCAAGCUUGGCAG (SEQ ID NO: 6)之核苷酸序列的反義股及包含GCCAAGCUUGGUCAUCUAUGA (SEQ ID NO: 314)之核苷酸序列的有義股;(d)包含UCGACGGCAGUCCCUUCUGCGUC (SEQ ID NO: 11)之核苷酸序列的反義股及包含CGCAGAAGGGACUGCCGUCGA (SEQ ID NO: 319)之核苷酸序列的有義股;(e)包含UUCUAGGCUUGGAACCGGGGUAA (SEQ ID NO: 18)之核苷酸序列的反義股及包含ACCCCGGUUCCAAGCCUAGAA (SEQ ID NO: 326)之核苷酸序列的有義股;(f)包含UAGCCUCUAGGCUUGGAACCGGG (SEQ ID NO: 21)之核苷酸序列的反義股及包含CGGUUCCAAGCCUAGAGGCUA (SEQ ID NO: 329)之核苷酸序列的有義股;(g)包含UUUACCGUGGUAGCACUCCUGCA (SEQ ID NO: 44)之核苷酸序列的反義股及包含CAGGAGUGCUACCACGGUAAA (SEQ ID NO: 352)之核苷酸序列的有義股;(h)包含UUGUCCAUUACCGUGGUAGCACU (SEQ ID NO: 47)之核苷酸序列的反義股及包含UGCUACCACGGUAAUGGACAA (SEQ ID NO: 355)之核苷酸序列的有義股;(i)包含UCUCUGUCCAUUACCGUGGUAGC (SEQ ID NO: 49)之核苷酸序列的反義股及包含UACCACGGUAAUGGACAGAGA (SEQ ID NO: 357)之核苷酸序列的有義股;(j)包含UAUUGUGUCAGGUUGCAGUACUC (SEQ ID NO: 60)之核苷酸序列的反義股及包含GUACUGCAACCUGACACAAUA (SEQ ID NO: 368)之核苷酸序列的有義股;(k)包含UUGCGUCUGAGCAUUGUGUCAGG (SEQ ID NO: 64)之核苷酸序列的反義股及包含UGACACAAUGCUCAGACGCAA (SEQ ID NO: 372)之核苷酸序列的有義股;(l)包含UUAACUCUGUCCAUAAUGGUAGU (SEQ ID NO: 88)之核苷酸序列的反義股及包含UACCAUUAUGGACAGAGUUAA (SEQ ID NO: 396)之核苷酸序列的有義股;(m)包含UCCAAGCUUGGCAAGUUCUUCCU (SEQ ID NO: 89之核苷酸序列的反義股及包含GAAGAACUUGCCAAGCUUGGA (SEQ ID NO: 397)之核苷酸序列的有義股;(n)包含UAGAUGACCAAGCUUGGCAAGUU (SEQ ID NO: 90)之核苷酸序列的反義股及包含CUUGCCAAGCUUGGUCAUCUA (SEQ ID NO: 398)之核苷酸序列的有義股;或(o)包含UGGUCCGACUAUGCUGGUGUGGU (SEQ ID NO: 98)之核苷酸序列的反義股及包含CACACCAGCAUAGUCGGACCA (SEQ ID NO: 406)之核苷酸序列的有義股。
在另一態樣中,本文提供用於調節脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的聚核酸分子,其中聚核酸分子包含:(a)包含usAfsgaugAfccaaGfcUfuGfgcaggsusc (SEQ ID NO: 158)之核苷酸序列的反義股及包含cscsugccAfaGfcUfuggucaucua (SEQ ID NO: 466)之核苷酸序列的有義股;(b)包含usAfsuagaUfgaccAfaGfcUfuggcasgsg (SEQ ID NO: 159)之核苷酸序列的反義股及包含usgsccaaGfcUfuGfgucaucuaua (SEQ ID NO: 467)之核苷酸序列的有義股;(c)包含usCfsauagAfugacCfaAfgCfuuggcsasg (SEQ ID NO: 160)之核苷酸序列的反義股及包含gscscaagCfuUfgGfucaucuauga (SEQ ID NO: 468)之核苷酸序列的有義股;(d)包含usCfsgacgGfcaguCfcCfuUfcugcgsusc (SEQ ID NO: 165)之核苷酸序列的反義股及包含csgscagaAfgGfgAfcugccgucga (SEQ ID NO: 473)之核苷酸序列的有義股;(e)包含usUfscuagGfcuugGfaAfcCfggggusasa (SEQ ID NO: 172)之核苷酸序列的反義股及包含ascscccgGfuUfcCfaagccuagaa (SEQ ID NO: 480)之核苷酸序列的有義股;(f)包含usAfsgccuCfuaggCfuUfgGfaaccgsgsg (SEQ ID NO: 175)之核苷酸序列的反義股及包含csgsguucCfaAfgCfcuagaggcua (SEQ ID NO: 483)之核苷酸序列的有義股;(g)包含usUfsuaccGfugguAfgCfaCfuccugscsa (SEQ ID NO: 198)之核苷酸序列的反義股及包含csasggagUfgCfuAfccacgguaaa (SEQ ID NO: 506)之核苷酸序列的有義股;(h)包含usUfsguccAfuuacCfgUfgGfuagcascsu (SEQ ID NO: 201)之核苷酸序列的反義股及包含usgscuacCfaCfgGfuaauggacaa (SEQ ID NO: 509)之核苷酸序列的有義股;(i)包含usCfsucugUfccauUfaCfcGfugguasgsc (SEQ ID NO: 203)之核苷酸序列的反義股及包含usasccacGfgUfaAfuggacagaga (SEQ ID NO: 511)之核苷酸序列的有義股;(j)包含usAfsuuguGfucagGfuUfgCfaguacsusc (SEQ ID NO: 214)之核苷酸序列的反義股及包含gsusacugCfaAfcCfugacacaaua (SEQ ID NO: 522)之核苷酸序列的有義股;(k)包含usUfsgcguCfugagCfaUfuGfugucasgsg (SEQ ID NO: 218)之核苷酸序列的反義股及包含usgsacacAfaUfgCfucagacgcaa (SEQ ID NO: 526)之核苷酸序列的有義股;(l)包含usUfsaacuCfugucCfaUfaAfugguasgsu (SEQ ID NO: 242)之核苷酸序列的反義股及包含usasccauUfaUfgGfacagaguuaa (SEQ ID NO: 550)之核苷酸序列的有義股;(m)包含usCfscaagCfuuggCfaAfgUfucuucscsu (SEQ ID NO: 243)之核苷酸序列的反義股及包含gsasagaaCfuUfgCfcaagcuugga (SEQ ID NO: 551)之核苷酸序列的有義股;(n)包含usAfsgaugAfccaaGfcUfuGfgcaagsusu (SEQ ID NO: 244)之核苷酸序列的反義股及包含csusugccAfaGfcUfuggucaucua (SEQ ID NO: 552)之核苷酸序列的有義股;或(o)包含usGfsguccGfacuaUfgCfuGfgugugsgsu (SEQ ID NO: 252)之核苷酸序列的反義股及包含csascaccAfgCfaUfagucggacca (SEQ ID NO: 560)之核苷酸序列的有義股, 其中「A」係指腺苷-3'-磷酸;「a」係指2'-O-甲基腺苷-3'-磷酸;「Af」係指2'-氟腺苷-3'-磷酸;「C」係指胞苷-3'-磷酸;「c」係指2'-O-甲基胞苷-3'-磷酸;「Cf」係指2'-氟胞苷-3'-磷酸;「G」係指鳥苷-3'-磷酸;「g」係指2'-O-甲基鳥苷-3'-磷酸;「Gf」係指2'-氟鳥苷-3'-磷酸;「U」係指尿苷-3'-磷酸;「u」係指2'-O-甲基尿苷-3'-磷酸;「Uf」係指2'-氟尿苷-3'-磷酸;「T」係指5-甲基尿苷-3'-磷酸;「t」係指2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「Tf」係指2'-氟-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「s」係指3'-硫代磷酸酯。
在另一態樣中,本文提供一種用於調節脂蛋白(a)基因(Lp(a))表現的聚核酸分子結合物,其中該聚核酸分子結合物包含本文所描述之聚核酸分子及去唾液酸醣蛋白受體靶向部分。在一些情況下,去唾液酸醣蛋白受體靶向部分包含N-乙醯半乳胺糖(GalNAc)或半乳糖。在一些情況下,GalNAc包含變旋異構碳鍵結至三價、四價連接子、五價或六價連接子,其中該變旋異構碳為半胺縮醛基之一部分。
在一些情況下,聚核酸分子及去唾液酸醣蛋白受體靶向部分經由連接子偶合。在一些情況下,連接子為可裂解連接子。在一些情況下,連接子包含下式(IV), 其中Y1及Y2中之至少一者為該聚核酸分子中之核苷酸。在一些情況下,Y1為位於聚核酸分子之有義股之3'端上的最後一個核苷酸。
在一些情況下,連接子及去唾液酸醣蛋白受體靶向部分與位於聚核酸分子之有義股之3'端上的最後一個核苷酸顯示於式(V')、式(V'''')、式(V''''')或式(V'''''')中: ,其中式(V')中之Z為-H、-OH、-O-甲基、-F或-O-甲氧基乙基,且式(V')中之R為腺嘌呤、尿嘧啶、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶、無鹼基或其他; , 其中式(V'''')中之Z為對應於本文所描述之糖修飾中之一者的部分(例如-H、-OH、-O-甲基、-F或-O-甲氧基乙基),且式(V'''')中之R為腺嘌呤、尿嘧啶、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶、無鹼基或其他; , 其中式(V''''')中之Z為對應於本文所描述之糖修飾中之一者的部分(例如-H、-OH、-O-甲基、-F或-O-甲氧基乙基),且式(V''''')中之R為腺嘌呤、尿嘧啶、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶、無鹼基或其他;或 ,其中式(V'''''')中之Z為對應於本文所描述之糖修飾中之一者的部分(例如-H、-OH、-O-甲基、-F或-O-甲氧基乙基),且式(V'''''')中之R為腺嘌呤、尿嘧啶、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶、無鹼基或其他。
在一些情況下,連接子及去唾液酸醣蛋白受體靶向部分與位於聚核酸分子之有義股之3'端上的最後一個核苷酸顯示於式(V')中: (V'),其中式(V')中之Z為-H、-OH、-O-甲基、-F或-O-甲氧基乙基,且式(V')中之R為腺嘌呤、尿嘧啶、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶、無鹼基或其他。
在另一態樣中,本文提供一種醫藥組合物,其包含本文所描述之聚核酸分子、或本文所描述之聚核酸分子結合物,及醫藥學上可接受之賦形劑。在一些情況下,醫藥組合物經調配用於非經腸、經口、鼻內、經頰、經直腸、經皮、靜脈內、皮下或鞘內投與。
在另一態樣中,本文提供調節有需要個體之脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的方法,其包含:向該個體投與本文所描述之聚核酸分子、本文所描述之聚核酸分子結合物或本文所描述之醫藥組合物,由此調節有需要個體中之Lp(a)基因表現。
在另一態樣中,本文提供一種用於治療或預防心血管疾病或脂質病症之方法,其包含:向個體投與本文所描述之聚核酸分子、本文所描述之聚核酸分子結合物或本文所描述之醫藥組合物,由此調節有需要個體中之Lp(a)基因表現。在一些情況下,心血管疾病為冠狀動脈疾病、急性心肌梗塞、無症狀頸動脈粥樣硬化、中風、心房微顫、高膽固醇血症(hypercholesterolemia)或周邊動脈阻塞疾病。在一些情況下,脂質病症為高脂質血症(hyperlipidemia)或高膽固醇血症(hypercholesterolemia)。
在一些情況下,聚核酸分子係以足以使Lp(a)基因在該個體之細胞中之表現與對照相比降低或使該個體之血漿Lp(a)含量與對照相比降低至少約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%或90%的劑量投與。
交互參考
本申請案主張2022年8月11日申請之美國臨時申請案第63/371,167號及2023年3月3日申請之美國臨時申請案第63/449,914號之權益,其各以全文引用之方式併入本文中。 參考文獻併入
本說明書中所提及之所有出版物、專利及專利申請案均以引用的方式併入本文中,其引用的程度就如同特定且個別地指示各個別出版物、專利或專利申請案以引用的方式併入一般。就以引用的方式併入之公開案及專利或專利申請案與本說明書所含之揭示內容相抵觸而言,本說明書意欲替代及/或優先於任何此類相抵觸材料。
Lp(a)基因(LPA)位於染色體6q26-q27上,其係所有群體中Lp(a)濃度之主要基因座(F. Kronenberg等人,J Intern Med, 273 (1) (2013))。LPA基因為CVD之最大單基因風險因素之一(S. Tsimikas, J Am Coll Cardiol, 69 (6) (2017))。LPA基因在肝臟中高度表現,在肝臟移植之後觀測到Lp(a)急劇下降以及增加(A.A. Damluji等人,Journal of clinical lipidology, 10 (2) (2016))。
脂蛋白(a) (Lp(a))係由脂蛋白元(a) (apo(a)) 與脂蛋白元B (apo B)結合形成之低密度脂蛋白樣顆粒。apo(a)蛋白係經由二硫鍵共價連接於組裝之Lp(a)顆粒中的apo B。Lp(a)攜帶引起動脈粥樣硬化之膽固醇,且與致動脈粥樣硬化促發炎氧化磷脂結合作為人類血漿中氧化磷脂之優先載體,其促進發炎反應。
血漿Lp(a)含量主要由編碼apo (a)之LPA基因決定(S. Tsimikas, J Am Coll Cardiol, 69 (6) (2017))。Lp(a)含量在個體之間有所不同且與CVD風險成正比。Lp(a)血漿含量升高與動脈粥樣硬化及其表現的風險增加有關,其可包括高膽固醇血症(Seed等人,N. Engl. J. Med., 1990, 322, 1494-1499)、心肌梗塞(Sandkamp等人,Clin. Chem., 1990, 36, 20-23)及栓塞(Nowak-Gottl等人,Pediatrics, 1997, 99, E11)。因此,抑制LPA被視為治療CVD之潛在治療策略。
本文描述一種用於調節Lp(a)基因表現的聚核酸分子,其包含選自表1或表2之核酸序列。在一些情況下,該聚核酸分子係單股核酸分子。在一些情況下,聚核酸分子係包含有義股及反義股之雙股核酸分子。因此,本文提供與本文所描述之聚核酸分子雜交之人類Lp(a) mRNA的各種目標區域。本文所描述之聚核酸分子可為經修飾之聚核酸分子。舉例而言,經修飾之核酸分子可包含2'-氟修飾之核苷酸、2'-O-甲基修飾之核苷酸、或經修飾之核苷酸間鍵聯,諸如硫代磷酸酯鍵聯。在一些態樣中,本文提供與本文所描述之靶向部分結合之聚核酸。
本文亦描述一種調節個體中之Lp(a) mRNA或蛋白質表現的方法。本文進一步描述調節有需要個體中之LDL及/或膽固醇的方法。 定義
除非上下文另有明確指示,否則單數形式「一(a)」、「一(an)」及「該(the)」包括複數個參考物。舉例而言,術語「細胞(a cell)」包括一或多種細胞,包括其混合物。「A及/或B」在本文中用以包括以下所有替代形式:「A」、「B」、「A或B」及「A及B」。
當提供值的範圍時,應理解,除非上下文另有明確指示,否則在彼範圍之上限與下限之間的各個中間值(至下限之單位的十分之一)及在彼規定範圍內之任何其他規定值或中間值均涵蓋於本發明內。此等較小範圍之上限及下限可獨立地包括於較小範圍內且亦涵蓋於本發明內,在所規定範圍內受到任何特定排他性限制。在所規定範圍包括限值中之一或兩者的情況下,不包括彼等所包括限值中之任一者或兩者之範圍亦包括於本發明中。
本文在數值前存在術語「約(about)」之情況下呈現某些範圍。術語「約」在本文中用以提供其後之準確數值以及接近或近似該術語之後的數值之數值的文字支持。在確定數值是否接近或近似特定敍述之數值時,接近或近似未敍述之數值可為在呈現其之上下文中提供特定敍述之數值的實質性等效物的數值。
相對於本文中所鑑別之核酸序列的「序列一致性百分比(%)」或「一致性百分比(%)」被定義為在將任何保守性取代視為序列一致性之一部分的情況下進行序列比對之後,候選序列中之核酸與所比較核酸序列的一致百分比。
本文中所揭示之所有範圍亦涵蓋其任何及所有可能的子範圍及子範圍組合。任何列出的範圍均可被認為充分描述的且使得同一範圍能夠被分解為至少相同的兩份、三份、四份、五份、十份等。作為非限制性實例,本文所論述之各範圍可易分解為下部三分之一、中間三分之一及上部三分之一等。亦如熟習此項技術者將理解,所有語言,諸如「至多」、「至少」、「大於」、「小於」及其類似語言均包括所敍述之數目且係指可隨後如上文所論述分解為子範圍之範圍。最終,如熟習此項技術者將理解,範圍包括各個別成員。因此,例如,具有1至3個對象之群係指具有1、2或3個對象之群。類似地,具有1至5個對象之群係指具有1、2、3、4或5個對象之群,以此類推。
除非另有定義,否則本文所用之技術及科學術語具有與聚核酸分子、聚核酸分子結合物、醫藥組合物、方法及其他態樣所屬領域中一般熟習此項技術者通常所理解相同的含義。
如本文所用,術語「互補(complementary)」指示穩定且特異性結合之兩個核酸分子之間的足夠程度的互補性以避免非特異性結合。
如本文所用,術語「聚核酸(polynucleic acid)」及術語「聚核苷酸(polynucleotide)」可互換使用以指代核苷酸鏈。術語「核苷酸(nucleotide)」包括序列「G」、「C」、「A」、「T」及「U」,其各自一般代表含有鳥嘌呤、胞嘧啶、腺嘌呤、胸苷及尿嘧啶作為鹼基之核苷酸。在一些情況下,「核苷酸」可指經修飾之核苷酸(例如具有經修飾之糖部分、經修飾之鹼基、經修飾之核苷酸間鍵聯或其組合,包括但不限於2'-經修飾核苷酸、LNA、ENA、BNA、UNA、GNA等)。在一些情況下,「核苷酸」可指具有非典型鹼基的經修飾之核苷酸(例如,包括但不限於2-硫代尿苷、2-硫代胸苷、肌苷、2-胺基嘌呤、2,6-二胺基嘌呤、二氫尿苷、4-硫代尿苷、4-硫代胸苷、2-硫代胞苷)。
如本文所用,「個體(subject)」可為任何哺乳動物,包括人類及非人類靈長類動物。
「有需要個體(subject in need thereof)」係指患有Lp(a)相關病症或其症狀(包括但不限於CVD或脂質病症)之個體,或相對於總體人口發生Lp(a)相關病症或其症狀(包括但不限於CVD或脂質病症)之風險增加的個體。在一些情況下,有需要個體具有冠心病或動脈粥樣硬化或其症狀。在一些情況下,有需要個體具有高脂質血症或高膽固醇血症或其症狀。在一些情況下,有需要個體正被投與或已被投與不同於本文所揭示之聚核酸分子或結合物的藥物,用於治療或預防CVD或脂質病症。舉例而言,有需要個體正被投與阿托伐他汀(atorvastatin)或已被投與阿托伐他汀。
如本文所使用,術語「病狀(condition)」包括疾病、病症及易感性。在一些情況下,病狀為Lp(a)相關病症、動脈粥樣硬化血管疾病或其症狀。在一些情況下,病狀為高三酸甘油酯血症(hypertriglyceridemia)或其症狀。
如本文所使用,術語「動脈粥樣硬化」或「動脈粥樣硬化血管疾病」係指其中動脈內部由於斑塊堆積而變窄的疾病。在一些情況下,其可導致冠狀動脈疾病、中風、周邊動脈疾病或腎臟問題。
術語「心血管疾病(cardiovascular disease)」或「CVD」係指影響心臟或血管之所有類型的疾病,包括冠心病(動脈堵塞),其可導致心臟病發作、中風、先天性心臟缺損及周邊動脈疾病。CVD或其症狀可包括心肌梗塞、中風、心房微顫或鈣化性主動脈瓣狹窄。CVD或其症狀包括心跳停止或周邊動脈疾病。
術語「脂質病症(lipid disorder)」係指LDL、三酸甘油酯或兩者之含量升高的病症或病狀。舉例而言,脂質病症可為高脂質血症或高膽固醇血症。
如本文所用,術語「低密度脂蛋白(LDL)」係指由脂蛋白之外邊緣及膽固醇中心構成的顯微鏡下團塊(microscopic blob)。LDL可具有高度疏水性核心,其由稱為亞麻油酸酯之多不飽和脂肪酸及數百至數千酯化及未酯化膽固醇分子構成。LDL之核心亦可攜帶三酸甘油酯及其他脂肪,且可被磷脂殼及未酯化膽固醇包圍。
如本文所用,術語「治療(treat)」、「治療(treating)」或「治療(treatment)」任何疾病或病症係指在一個個例中改善疾病或病症(亦即,減緩或停滯或減少疾病或其至少一種臨床症狀之發展)。在另一個例中,「治療(treat)」、「治療(treating)」或「治療(treatment)」係指緩解或改善至少一種身體參數,包括患者可能無法辨別之身體參數。在又一個例中,「治療(treat)」、「治療(treating)」或「治療(treatment)」係指身體上(例如使可辨別症狀穩定)、生理學上(例如使身體參數穩定)或以兩種方式調節疾病或病症。
如本文所用,術語「預防(prevent)」、「預防(preventing)」及「預防(prevention)」係指未患有疾病或病狀但有發展該疾病或病狀之風險或易患上該疾病或病狀之個體的病狀病理學的發生率減少。預防可為完全的,例如個體中完全不存在病狀病理學。預防亦可為部分的,使得個體中之病狀病理學發生率低於在沒有本發明之情況下會發生的病狀病理學。
如本文所用,「投與(administering)」及其文法等效物可指向個體或患者提供本文所描述之醫藥組合物。可使用醫學領域中一般熟習此項技術者已知的習知方法向個體投與該組合物,視待治療之疾病類型或疾病部位而定。舉例而言,組合物可例如經口、非經腸、藉由吸入噴霧、局部、經直腸、經鼻、經頰、經陰道、經由植入式貯器或經由輸注投與。可採用一或多種此類途徑。
如本文所用,術語「醫藥組合物(pharmaceutical composition)」及其文法等效物可指包含治療有效量之活性醫藥成分以及一或多種醫藥學上可接受之賦形劑、載劑,及/或待向個體(例如有需要之人類)投與之治療劑的混合物或溶液。
如本文所用,「醫藥學上可接受(pharmaceutically acceptable)」及其文法等效物可指適用於製備醫藥組合物之材料的屬性,該醫藥組合物通常為安全、無毒的且既非生物學上亦非其他方面不合需要,且對於獸醫學以及人類醫藥用途而言係可接受的。「醫藥學上可接受」可指不會消除化合物之生物活性或特性且相對無毒之材料,諸如載劑或稀釋劑,亦即,可將該材料投與至個體而不會產生不合需要之生物效應,或不會以有害方式與含有該材料之醫藥組合物之任一種組分相互作用。
「醫藥學上可接受之賦形劑」係指可與藥劑一起向個體投與且當以足以遞送治療量之藥劑的劑量投與時不會破壞該藥劑之藥理學活性且無毒的賦形劑。
術語「治療劑(therapeutic agent)」可指當向個體投與時,具有治療、診斷及/或預防作用及/或引發所期望生物學及/或藥理學作用之任何藥劑。治療劑亦可稱為「活性物(actives)」或「活性劑(active agents)」。此類藥劑包括(但不限於)細胞毒素、放射性離子、化學治療劑、小分子藥物、蛋白質及核酸。
應瞭解,為清楚起見而描述於獨立實施例之上下文中的聚核酸分子及/或聚核酸分子結合物、包含該等聚核酸分子或該等聚核酸分子結合物之醫藥組合物、方法及其他態樣的某些特徵亦可以組合方式提供於單一實施例中。相反,為簡潔起見而描述於單一實施例之上下文中的聚核酸分子及/或聚核酸分子結合物、包含該等聚核酸分子或該等聚核酸分子結合物之醫藥組合物、方法及其他態樣的各種特徵亦可分別或以任何適合的子組合形式提供。實施例之所有組合具體地包涵於本發明中且在此類組合包涵可操作方法及/或組合物之程度上如同個別且明確地揭示每一個組合一般揭示於本文中。另外,描述此類變數之實施例中所列之所有子組合亦具體地包涵於本發明之聚核酸分子及/或聚核酸分子結合物、包含該等聚核酸分子或該等聚核酸分子結合物之醫藥組合物、方法及其他態樣中,且正如同每一個此類子組合個別且明確揭示於本文中一般揭示於本文中。 聚核酸分子 聚核酸分子之目標區域
本文描述一種用於調節Lp(a)基因表現的聚核酸分子。在一些情況下,該聚核酸分子係單股核酸分子。在一些情況下,該聚核酸分子係雙股核酸分子。
在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子與人類Lp(a) mRNA之某些區域雜交。在一些情況下,聚核酸分子包含有義股及反義股,且其中反義股與Lp(a) mRNA之特定區域雜交。如本文所用,術語「有義股」可與術語「隨從股(passenger strand)」互換使用,且術語「反義股」可與術語「引導股(guide strand)」互換使用。
在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子與人類Lp(a) mRNA之5' UTR區雜交。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子與人類Lp(a) mRNA之編碼區雜交。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子與人類Lp(a) mRNA之3' UTR區雜交。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子與人類Lp(a) mRNA之外顯子1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38或39之部分雜交。在一些態樣中,本文中所描述之聚核酸分子與人類Lp(a) mRNA (NCBI參考序列:NM_005577.4)之編碼區雜交。
在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子在人類Lp(a) mRNA (NCBI參考序列:NM_005577.4)上之結合位點的起始位置介於以下位置之間:190至210;250至270;360至390;400至450;460至520;530至550;1100至1200;2600至2700;2700至2800;2800至2900;3000至3300;3300至3600;3600至4000;4000至4200;4400至4700;4700至5000;5000至5200;或5500至6000。
本文所描述之聚核酸分子在人類Lp(a) mRNA (NCBI參考序列:NM_005577.4)上之結合位點的起始位置可在位置200至210、380至390、410至420、1100至1200、2700至2800、3200至3300、或3300至3400之間。
本文所描述之核酸分子在人類Lp(a) mRNA (NCBI參考序列:NM_005577.4)上之結合位點的起始位置可在以下位置之間:200至210、250至260、380至390、410至430、430至440、460至470、490至500、500至510、540至550、1150至1180、2650至2700、2700至2750、2760至2770、2850至2900、3200至3250、3250至3300、3300至3310、3700至3750、3750至3800、3950至4000、4800至4850、5100至5150、5500至5550、5850至5900、或2750至2800。 聚核酸分子之結構
本文描述一種用於調節Lp(a)基因表現的聚核酸分子。在一些情況下,該聚核酸分子係單股核酸分子,其中該單股核酸分子與Lp(a) mRNA之目標區域反向互補。
在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子不與Lp(a) mRNA之目標區域100%互補。因此,在一些情況下,本文所描述之聚核酸分子與Lp(a) mRNA之目標區域約95%互補。在一些情況下,本文所描述之聚核酸分子與Lp(a) mRNA之目標區域約90%互補。在一些情況下,本文所描述之聚核酸分子與Lp(a) mRNA之目標區域約85%互補。在一些情況下,本文所描述之聚核酸分子與Lp(a) mRNA之目標區域約80%互補。在一些情況下,本文所描述之聚核酸分子與Lp(a) mRNA之目標區域約75%互補。在一些情況下,本文所描述之聚核酸分子與Lp(a) mRNA之目標區域約70%互補。
在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子包含表1、表2或表5中之核酸序列。在一些情況下,本文所描述之聚核酸分子包含與表1、表2或表5中之序列至少80%、至少85%、至少90%或至少95%互補的核酸序列。在一些情況下,本文所描述之聚核酸分子包含與選自SEQ ID NO: 309至462之核酸序列至少80%、至少85%、至少90%或至少95%互補的核酸序列。在一些情況下,本文所描述之聚核酸分子包含與選自SEQ ID NO: 1至154之核酸序列至少80%、至少85%、至少90%或至少95%互補的核酸序列。
在一些情況下,本文所描述之聚核酸分子包含與表1、表2及表5中之序列(不包括突出物)至少80%、至少85%、至少90%或至少95%互補的核酸序列。在一些情況下,本文所描述之聚核酸分子包含與選自SEQ ID NO: 309至462之核酸序列(不包括突出物)至少80%、至少85%、至少90%或至少95%互補的核酸序列。在一些情況下,本文所描述之聚核酸分子包含與選自SEQ ID NO: 1至154之核酸序列(不包括突出物)至少80%、至少85%、至少90%或至少95%互補的核酸序列。
在其他態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含14個與表1、表2及表5中之序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含14個與SEQ ID NO: 309至462之核酸序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在又其他態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含15個與表1、表2及表5中之序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含15個與SEQ ID NO:309至462之核酸序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在又其他態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含16個與表1、表2及表5中之序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含16個與SEQ ID NO: 309至462之核酸序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在又其他態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含17個與表1、表2及表5中之序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含17個與SEQ ID NO:309至462之核酸序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在又其他態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含18個與表1、表2及表5中之序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含18個與SEQ ID NO:309至462之核酸序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在又其他態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含19個與表1、表2及表5中之序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含19個與SEQ ID NO:309至462之核酸序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在又其他態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含20個與表1、表2及表5中之序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含20個與SEQ ID NO:309至462之核酸序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在又其他態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含21個與表1、表2及表5中之序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含21個與SEQ ID NO:309至462之核酸序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在又其他態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含22個與表1、表2及表5中之序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含22個與SEQ ID NO:309至462之核酸序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。
在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含14個與SEQ ID NO: 1至154之核酸序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含15個與SEQ ID NO: 1至154之核酸序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含16個與SEQ ID NO: 1至154之核酸序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含17個與SEQ ID NO: 1至154之核酸序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含18個與SEQ ID NO: 1至154之核酸序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含19個與SEQ ID NO: 1至154之核酸序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含20個與SEQ ID NO: 1至154之核酸序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含21個與SEQ ID NO: 1至154之核酸序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含22個與SEQ ID NO: 1至154之核酸序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。
在又其他態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含14、15、16、17、18、19、20、21或22個與表1、表2及表5中之沒有突出物的序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含14、15、16、17、18、19、20、21或22個與SEQ ID NO: 309至462之沒有突出物的核酸序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含14、15、16、17、18、19、20、21或22個與SEQ ID NO: 1至154之沒有突出物的核酸序列互補之連續核苷酸且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。
在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子包含長度為至少10、11、12、13、14或15個核苷酸的股。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子包含長度為約15至40、16至30、17至30、18至30、18至27、18至25、18至23、19至23、20至23或21至23個核苷酸的股。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子包含長度為約15、16、17、18、19、20個核苷酸的股。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子包含長度為約21、22、23、24、25個核苷酸的股。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子包含長度為約26、27、28、29、30個核苷酸的股。
在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子包含長度為至少10、11、12、13、14或15個核苷酸之單股核酸。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子包含長度為約15至30、16至30、17至30、18至30、18至27、18至25、18至23、19至23、20至23或21至23個核苷酸之單股核酸。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子包含長度為約15、16、17、18、19、20個核苷酸之單股核酸。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子包含長度為約21、22、23、24、25個核苷酸之單股核酸。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子包含長度為約26、27、28、29、30個核苷酸之單股核酸。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子包含長度為約21個核苷酸之單股核酸。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子包含長度約23個核苷酸之單股核酸。
在一些情況下,聚核酸分子為包含有義股及反義股之雙股核酸分子,且其中反義股與Lp(a) mRNA之目標區域至少部分反向互補。
在一些態樣中,本文所描述之反義股不與Lp(a) mRNA之目標區域100%互補。因此,在一些情況下,本文所描述之反義股與Lp(a) mRNA之目標區域100%互補。在一些態樣中,本文所描述之反義股與Lp(a) mRNA之目標區域約95%互補。在一些態樣中,本文所描述之反義股與Lp(a) mRNA之目標區域約90%互補。在一些態樣中,本文所描述之反義股與Lp(a) mRNA之目標區域約85%互補。在一些態樣中,本文所描述之反義股與Lp(a) mRNA之目標區域約80%互補。在一些態樣中,本文所描述之反義股與Lp(a) mRNA之目標區域約75%互補。在一些態樣中,本文所描述之反義股與Lp(a) mRNA之目標區域約70%互補。
在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子包含表1或表2中之核酸序列。在其他態樣中,本文所描述之聚核酸分子包含與表1或表2中之序列至少80%、至少85%、至少90%或至少95%一致的核酸序列。在一些情況下,本文所描述之有義股包含與選自SEQ ID NO: 309至462之核酸序列至少80%、至少85%、至少90%或至少95%一致的核酸序列。在一些情況下,本文所描述之反義股包含與選自SEQ ID NO: 1至154之核酸序列至少80%、至少85%、至少90%或至少95%一致的核酸序列。在一些情況下,本文所描述之有義股包含與選自SEQ ID NO: 312至314、319、326、329、352、355、357、368、372、396至398及406之核酸序列至少80%、至少85%、至少90%、至少95%一致的核酸序列。在一些情況下,本文所描述之反義股包含與選自SEQ ID NO: 4至6、11、18、21、44、47、49、60、64、88至90及98之核酸序列至少80%、至少85%、至少90%、至少95%一致的核酸序列。
在又其他態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含表1或表2中之序列中之15個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在特定態樣中,本文所描述之有義股含有包含SEQ ID NO: 309至462之至少15個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在特定態樣中,本文所描述之反義股含有包含SEQ ID NO: 1至154之至少15個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在又其他態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含表1或表2中之序列中之至少16個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在特定態樣中,本文所描述之有義股含有包含SEQ ID NO: 309至462之至少16個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在特定態樣中,本文所描述之反義股含有包含SEQ ID NO: 1至154之至少16個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在又其他態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含表1或表2中之序列中之至少17個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在特定態樣中,本文所描述之有義股含有包含SEQ ID NO: 309至462之至少17個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在特定態樣中,本文所描述之反義股含有包含SEQ ID NO: 1至154之至少17個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在又其他態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含表1或表2中之序列中之至少18個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在特定態樣中,本文所描述之有義股含有包含SEQ ID NO: 309至462中之至少18個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在特定態樣中,本文所描述之反義股含有包含SEQ ID NO: 1至154中之至少18個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在又其他態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含表1或表2中之序列中之至少19個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在特定態樣中,本文所描述之有義股含有包含SEQ ID NO: 309至462中之至少19個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配之核酸序列。在特定態樣中,本文所描述之反義股含有包含SEQ ID NO: 1至154中之至少19個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在又其他態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含表1或表2中之序列中之至少20個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在特定態樣中,本文所描述之有義股含有包含SEQ ID NO: 309至462中之至少20個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在特定態樣中,本文所描述之反義股含有包含SEQ ID NO: 1至154中之至少20個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在又其他態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含表1或表2中之序列中之至少21個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在特定態樣中,本文所描述之有義股含有包含SEQ ID NO: 309至462中之至少21個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在特定態樣中,本文所描述之反義股含有包含SEQ ID NO: 1至154之至少21個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在又其他態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含表1或表2中之序列中之至少22個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在特定態樣中,本文所描述之反義股含有包含SEQ ID NO: 1至154中之至少22個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在特定態樣中,本文所描述之反義股含有包含SEQ ID NO: 1至154中之至少23個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在又其他態樣中,本文所描述之聚核酸分子含有包含表1或表2中之序列中之至少23個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。如本文所用,術語「連續序列」係指含有來自參考序列之多個連續核苷酸的序列。舉例而言,若參考序列為N 1N 2N 3N 4N 5N 6N 7,則連續序列可為N 1N 2N 3N 4或N 3N 4N 5N 6,但N 1N 3N 4N 5或N 3N 4N 7之序列不可為連續序列。
在一些態樣中,本文所描述之有義股含有包含SEQ ID NO: 312至314、319、326、329、352、355、357、368、372、396至398及406中之至少15個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之反義股含有包含SEQ ID NO: 4至6、11、18、21、44、47、49、60、64、88至90及98中之至少15個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之有義股含有包含SEQ ID NO: 312至314、319、326、329、352、355、357、368、372、396至398及406中之至少16個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之反義股含有包含SEQ ID NO: 4至6、11、18、21、44、47、49、60、64、88至90及98中之至少16個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之有義股含有包含SEQ ID NO: 312至314、319、326、329、352、355、357、368、372、396至398及406中之至少17個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之反義股含有包含SEQ ID NO: 4至6、11、18、21、44、47、49、60、64、88至90及98中之至少17個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之有義股含有包含SEQ ID NO: 312至314、319、326、329、352、355、357、368、372、396至398及406中之至少18個連續序列且具有不超過1、2或3個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之反義股含有包含SEQ ID NO: 4至6、11、18、21、44、47、49、60、64、88至90及98中之至少18個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之有義股含有包含SEQ ID NO: 312至314、319、326、329、352、355、357、368、372、396至398及406中之至少19個連續序列且具有不超過1、2或3個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之反義股含有包含SEQ ID NO: 4至6、11、18、21、44、47、49、60、64、88至90及98中之至少19個連續序列且具有不超過1、2或3個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之有義股含有包含SEQ ID NO: 312至314、319、326、329、352、355、357、368、372、396至398及406中之至少20個連續序列且具有不超過1、2或3個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之反義股含有包含SEQ ID NO: 4至6、11、18、21、44、47、49、60、64、88至90及98中之至少20個連續序列且具有不超過1、2或3個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之有義股含有包含SEQ ID NO: 312至314、319、326、329、352、355、357、368、372、396至398及406中之至少21個連續序列且具有不超過1、2或3個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之反義股含有包含SEQ ID NO: 4至6、11、18、21、44、47、49、60、64、88至90及98之至少21個連續序列且具有不超過1、2或3個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之反義股含有包含SEQ ID NO: 4至6、11、18、21、44、47、49、60、64、88至90及98中之至少22個連續序列且具有不超過1、2或3個錯配的核酸序列。在一些態樣中,本文所描述之反義股含有包含SEQ ID NO: 4至6、11、18、21、44、47、49、60、64、88至90及98中之至少23個連續序列且具有不超過1、2或3個錯配的核酸序列。
在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子包含長度為至少10、11、12、13、14或15個核苷酸之有義股及反義股。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子包含長度為約15至30、16至30、17至30、18至30、18至27、18至25、18至23、19至23、20至23或21至23個核苷酸之有義股及反義股。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子包含長度為約15、16、17、18、19、20個核苷酸的有義股及反義股。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子包含長度為約21、22、23、24、25個核苷酸的有義股及反義股。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子包含長度為約26、27、28、29、30個核苷酸的有義股及反義股。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子包含長度為19個核苷酸的有義股及長度為約21個核苷酸的反義股。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子包含長度為21個核苷酸的有義股及長度為約23個核苷酸的反義股。
在一些態樣中,本文所描述之有義股及反義股彼此反向互補且形成在反義股上具有3'突出端的雙螺旋體。在一些態樣中,本文所描述之有義股及反義股彼此反向互補且形成在反義股上具有5'突出端的雙螺旋體。在一些態樣中,本文所描述之有義股及反義股彼此反向互補且形成在有義股上具有3'突出端的雙螺旋體。在一些態樣中,本文所描述之有義股及反義股彼此反向互補且形成在有義股上具有5'突出端的雙螺旋體。 聚核酸分子之修飾
在一些態樣中,本文描述具有修飾之本文所描述的聚核酸分子。在一些態樣中,本文所描述之修飾出現於本文所描述之聚核酸分子之一或多種不同結構處(例如糖環、主鏈、鹼基上之修飾)。在一些態樣中,本文所描述之修飾包含本文所描述之聚核酸分子中一或多個核苷酸的取代。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子的不同百分比包含本文所描述之修飾。在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子的不同位置包含本文所描述之修飾。WO/2018/035380以全文引用的方式併入本文中。 修飾類型
在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子包含一或多種經糖修飾之核苷酸。在一些個例中,經糖修飾之核苷酸包括在核糖部分之2'羥基處之修飾。在一些個例中,經糖修飾之核苷酸包括用H、OR、R、鹵基、SH、SR、NH2、NHR、NR2或CN修飾,其中R為烷基部分。在一些態樣中,經糖修飾之核苷酸為2'-氟修飾之核苷酸。在一些態樣中,經糖修飾之核苷酸為2'-O-甲基修飾之核苷酸或2'-烷氧基修飾之核苷酸(例如2'-甲氧基修飾之核苷酸)。在一些個例中,2'羥基修飾包括2'-去氧、2'-去氧-2'-氟、2'-O-胺基丙基(2'-O-AP)、2'-O-二甲胺基乙基(2'-O-DMAOE)、2'-O-二甲胺基丙基(2'-O-DMAP)、2'-O-二甲基胺基乙氧基乙基(2'-O-DMAEOE)或2'-O-N-甲基乙醯胺基(2'-O-NMA)。在一些個例中,烷基部分包含雜取代。在一些個例中,雜環基之碳經氮、氧或硫取代。在一些個例中,雜環取代包括N-𠰌啉基(morpholino)、咪唑及N-吡咯啶基(pyrrolidino)。
在一些個例中,核糖部分之2'羥基包括鎖定或橋聯核糖修飾(例如LNA)、解鎖核糖修飾(例如UNA)或乙烯核酸(ENA)。
在一些態樣中,經糖修飾之核苷酸為2'-胺基修飾之核苷酸。在一些態樣中,經糖修飾之核苷酸為2'-疊氮基修飾之核苷酸。在一些態樣中,經糖修飾之核苷酸為2'-去氧修飾之核苷酸。在一些態樣中,經糖修飾之核苷酸為2'-O-甲氧基乙基(2'-MOE)。在一些態樣中,經糖修飾之核苷酸為鎖定核酸(LNA)。在一些態樣中,經糖修飾之核苷酸為乙烯橋聯核酸(ENA)。在一些態樣中,經糖修飾之核苷酸為(S)約束之乙基(cEt)。在一些態樣中,經糖修飾之核苷酸為三環DNA (tcDNA)。在一些態樣中,經糖修飾之核苷酸為2'-NH2核酸。
在一些態樣中,本文所描述之聚核苷酸分子包含一或多個經磷酸糖修飾之核苷酸。在一些態樣中,經修飾之磷酸糖為二胺基磷酸酯N-𠰌啉基(PMO)。在一些態樣中,經修飾之磷酸糖為胺基磷酸酯。在一些態樣中,經修飾之磷酸糖為硫代胺基磷酸酯。在一些態樣中,經修飾之磷酸糖為肽核酸(PNA)。
在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子包含一或多個經主鏈修飾之核苷酸。在一些態樣中,經修飾之主鏈為硫代磷酸酯。在一些態樣中,經修飾之主鏈為膦酸甲酯。在一些態樣中,經修飾之主鏈為胺基磷酸胍基丙酯。在一些態樣中,經修飾之主鏈為胺基磷酸甲磺醯酯(MsPA)鍵聯。在一些個例中,經修飾之主鏈包含以下中之一或多者:二硫代磷酸酯、膦酸甲酯、5'-膦酸伸烷酯、5'-膦酸甲酯、3'-膦酸伸烷酯、三氟化硼、3'-5'鍵聯或2'-5'鍵聯的硼烷磷酸酯及硒代磷酸酯(selenophosphates)、磷酸三酯、硫代烷基磷酸三酯、膦酸氫酯鍵聯、膦酸烷酯、硫代膦酸烷酯、硫代膦酸芳酯、硒代磷酸酯(phosphoroselenoates)及胺基磷酸酯。
在一些態樣中,經修飾之核苷酸包含經修飾之鳥嘌呤(例如,肌苷)或一或多個任何類型之非天然核酸。
在一些態樣中,經修飾之主鏈為硫代磷酸酯,且硫代磷酸酯為在立體化學上富集硫代磷酸酯。在某些態樣中,股含有至少一個在立體化學上富集硫代磷酸酯。在一些態樣中,股包含至少1、2、3個在立體化學上富集硫代磷酸酯。在一些態樣中,股僅包含1、2、3或4個在立體化學上富集硫代磷酸酯。在其他態樣中,至少一個(例如,一或兩個)在立體化學上富集硫代磷酸酯置於兩個連續核苷之間,該兩個連續核苷為股之六個5'端核苷中的兩個。在又其他態樣中,至少一個(例如,一或兩個)在立體化學上富集硫代磷酸酯置於兩個連續核苷之間,該兩個連續核苷為股之六個3'端核苷中的兩個。在又另外態樣中,一個在立體化學上富集硫代磷酸酯共價鍵結至距股內5'端的第一核苷及第二核苷。在一些態樣中,一個在立體化學上富集硫代磷酸酯共價鍵結至距股內5'端的第二十一核苷及第二十二核苷。在某些態樣中,一個在立體化學上富集硫代磷酸酯共價鍵結至距股內5'端的第二十二核苷及第二十三核苷。在特定態樣中,在立體化學上富集硫代磷酸酯具有 R P立體化學一致性。在某些態樣中,在立體化學上富集硫代磷酸酯具有 S P立體化學一致性。
在一些態樣中,本文所描述之聚核苷酸分子包含一或多個(例如,1至20、1至10、1至5個)立體化學富集(例如,核苷間)之硫代磷酸酯(例如,對於P立體異構源中心而言,具有至少10%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%或至少90% (例如至多約99%)的非鏡像異構物過量)。本文所描述之聚核苷酸分子包含一或多個(例如,1至20、1至10或1至5個;例如,核苷間)二硫代磷酸酯。二硫代磷酸酯在本文所描述之聚核苷酸分子中可為非P立體異構源的。硫代磷酸酯及二硫代磷酸酯可增強本文所描述之聚核苷酸分子對血清之外切核酸酶活性的穩定性。非P立體異構源二硫代磷酸酯可藉由減少可能的非鏡像異構物之數目簡化本文所描述之聚核苷酸分子的合成。通常,硫代磷酸酯或二硫代磷酸酯可連接本文所描述之聚核苷酸分子之六個3'端核苷及六個5'端核苷內的兩個鄰近核苷。在一些態樣中,在立體化學上富集硫代磷酸酯(例如 R P富集之硫代磷酸酯)可共價鍵結至距反義股之5'端的第一核苷(例如第一核苷之3'碳原子)及第二核苷(例如第二核苷之5'碳原子)。另外或可替代地,在立體化學上富集硫代磷酸酯(例如 S P富集之硫代磷酸酯)可共價鍵結至距反義股之5'端的第21核苷(例如,第21核苷之3'碳原子)及第22核苷(例如,第22核苷之5'碳原子)。此外,另外或可替代地,在立體化學上富集硫代磷酸酯(例如 S P富集之硫代磷酸酯或 R P富集之硫代磷酸酯)可共價鍵結至距反義股之5'端的第22核苷(例如,第22核苷之3'碳原子)及第23核苷(例如,第23核苷之5'碳原子)。
5' R P富集之硫代磷酸酯(例如,共價鍵結至距反義股中5'端的第一核苷(例如第一核苷之3'碳原子)及第二核苷(例如第二核苷之5'碳原子)的 R P富集之硫代磷酸酯)與3' S P富集之硫代磷酸酯(例如,共價鍵結至距5'端的第21核苷(例如第21核苷之3'碳原子)及第22核苷(例如第22核苷之5'碳原子)的 S P富集之硫代磷酸酯)的組合可產生優異功效及/或作用持續時間,例如藉由目標活性相對於缺乏5' R P富集之硫代磷酸酯與3' S P富集之硫代磷酸酯,或5' Rp富集之硫代磷酸酯與3' Sp及Rp富集之硫代磷酸酯之組合的參考引導股的降低來量測。在一些實施例中,在立體化學上富集硫代磷酸酯可包含R pR pS pS p(在引導股之位置1及2處之R pR p及在引導股之位置21及22處之S pS p)或R pR pS pR p(在引導股之位置1及2處之R pR p及在引導股之位置21及22處之S pR p)。在一些態樣中,本文所描述之聚核苷酸分子包含四個在立體化學上富集硫代磷酸酯:(1)共價鍵結至距反義股之5'端的第1核苷(例如第1核苷之3'碳原子)及第2核苷(例如第2核苷之5'碳原子)的Rp富集之硫代磷酸酯;(2)共價鍵結至距反義股之5'端的第2核苷(例如第2核苷之3'碳原子)及第3核苷(例如第3核苷之5'碳原子)的Rp富集之硫代磷酸酯;(3)共價鍵結至距反義股之5'端的第21核苷(例如第21核苷之3'碳原子)及第22核苷(例如第22核苷之5'碳原子)的Sp富集之硫代磷酸酯;及(4)共價鍵結至距反義股之5'端的第22核苷(例如第22核苷之3'碳原子)及第23核苷(例如第23核苷之5'碳原子)的Sp富集之硫代磷酸酯。在一些態樣中,本文所描述之聚核苷酸分子包含四個在立體化學上富集硫代磷酸酯:(1)共價鍵結至距反義股之5'端的第1核苷(例如第1核苷之3'碳原子)及第2核苷(例如第2核苷之5'碳原子)的Rp富集之硫代磷酸酯;(2)共價鍵結至距反義股之5'端的第2核苷(例如第2核苷之3'碳原子)及第3核苷(例如第3核苷之5'碳原子)的Rp富集之硫代磷酸酯;(3)共價鍵結至距反義股之5'端的第21核苷(例如第21核苷之3'碳原子)及第22核苷(例如第22核苷之5'碳原子)的Sp富集之硫代磷酸酯;及(4)共價鍵結至距反義股之5'端的第22核苷(例如第22核苷之3'碳原子)及第23核苷(例如第23核苷之5'碳原子)的Rp富集之硫代磷酸酯。
在一些態樣中,本文所描述之聚核苷酸分子包含一或多種嘌呤修飾。在一些態樣中,本文所描述之嘌呤修飾為2,6-二胺基嘌呤。在一些態樣中,本文所描述之嘌呤修飾為3-去氮-腺嘌呤。在一些態樣中,本文所描述之嘌呤修飾為7-去氮-鳥嘌呤。在一些態樣中,本文所描述之嘌呤修飾為8-疊氮基-腺嘌呤。
在一些態樣中,本文所描述之聚核苷酸分子包含一或多種嘧啶修飾。在一些態樣中,本文所描述之嘧啶修飾為2-硫基-胸苷。在一些態樣中,本文所描述之嘧啶修飾為5-甲醯胺-尿嘧啶。在一些態樣中,本文所描述之嘧啶修飾為5-甲基-胞嘧啶。在一些態樣中,本文所描述之嘧啶修飾為5-乙炔基尿嘧啶。
在一些情況下,本文所描述之聚核酸分子包含無鹼基取代。在考慮雜交聚核苷酸構築體用作siRNA之彼等情況下,需要降低類miRNA脫靶效應。在雜交聚核苷酸構築體中包括一或多個(例如一個或兩個)無鹼基取代可降低或甚至消除類miRNA脫靶效應,此係由於無鹼基取代缺乏能夠參與鹼基配對相互作用且緩解位阻的核鹼基。因此,本文所揭示之聚核苷酸分子可包括一或多個(例如一個或兩個)無鹼基取代。在一些態樣中,無鹼基取代位於距本文所描述之反義股之5'端的第5核苷酸處。在一些態樣中,無鹼基取代位於距本文所描述之反義股之5'端的第7核苷酸處。
當本文所揭示之聚核苷酸分子包括兩個或更多個無鹼基取代時,其結構可相同或不同。在某些態樣中,有義股含有一個無鹼基取代(例如反義股可不含無鹼基取代)。在其他態樣中,反義股含有一個無鹼基取代(例如有義股可不含無鹼基取代)。在又其他態樣中,反義股含有一個無鹼基取代,且有義股含有一個無鹼基取代。在其他態樣中,有義股包括核苷編號(x)與核苷編號(x+1)之間的無鹼基取代,其中x為2至7之整數。在又其他態樣中,反義股包括核苷編號(x)與核苷編號(x+1)之間的無鹼基取代,其中x為2至7之整數。
無鹼基取代可具有式(III): , 其中 L為糖類似物或經A、U、C、G之雜醯基取代,或為任何其他經取代核酸(例如鎖定或解鎖核酸、乙二醇核酸等); 各X 4獨立地為O或S; 各X 5獨立地為O、S、NH或鍵; 各R 9獨立地為H、視情況經取代之C 1-6烷基、視情況經取代之C 2-6烯基、視情況經取代之C 2-6炔基、視情況經取代之(C 1-9雜環基)-C 1-6烷基、視情況經取代之(C 6-10芳基)-C 1-6烷基、視情況經取代之(C 3-8環烷基)-C 1-6烷基、-LinkA(-T) p或結合部分; 各LinkA獨立地為多價連接子(例如,包括-C(O)-N(H)-); 各T獨立地為輔助部分; R 10為與股中之核苷(x)之3'碳原子的鍵; R 11為與股中之核苷(x+1)之5'氧原子的鍵; p為1至6之整數;且 t為1至6之整數。
在一些態樣中,本文所描述之無鹼基取代連接至本文所描述之聚核酸分子之反義股。在特定態樣中,無鹼基取代(例如式(III)之核苷酸間、無鹼基間隔子,其中t為1)可包括於本文所描述之反義股中(例如在引導股之種子區內)。在一些態樣中,無鹼基取代(例如式(III)之核苷酸間、無鹼基間隔子,其中t為1)可鍵結至距本文所描述之反義股之5'端的第二、第三、第四或第五核苷之3'碳原子。在某些態樣中,無鹼基取代(例如式(III)之核苷酸間、無鹼基間隔子,其中t為1)可鍵結至距本文所描述之反義股之5'端的第十三、第十四、第十五或第十六核苷之3'碳原子。在一些態樣中,無鹼基取代距本文所描述之反義股之5'端的第四、第五、第六、第七、第八及/或第九核苷。
本文所描述之聚核苷酸分子可含有包括種子區之股,該種子區包括含次黃嘌呤核鹼基之核苷(例如肌苷)。
在某些態樣中,含次黃嘌呤核鹼基之核苷為距股內5'端的第二核苷。在其他態樣中,含次黃嘌呤核鹼基之核苷為距股內5'端的第三核苷。在又其他態樣中,含次黃嘌呤核鹼基之核苷為距股內5'端的第四核苷。在又另外態樣中,含次黃嘌呤核鹼基之核苷為距股內5'端的第五核苷。在特定態樣中,含次黃嘌呤核鹼基之核苷為股中之第六核苷。在特定態樣中,含次黃嘌呤核鹼基之核苷為股中之第七核苷。
修飾之量及位置
在一些態樣中,本文所描述之聚核苷酸分子包含一或多種類型的如上文所描述之修飾。因此,在一些態樣中,本文所描述之聚核苷酸分子中的約10%核苷酸係用一或多種類型的如上文所描述之修飾進行修飾。在其他態樣中,本文所描述之聚核苷酸分子中的約20%核苷酸係用一或多種類型的如上文所描述之修飾進行修飾。在其他態樣中,本文所描述之聚核苷酸分子中的約30%核苷酸係用一或多種類型的如上文所描述之修飾進行修飾。在其他態樣中,本文所描述之聚核苷酸分子中的約40%核苷酸係用一或多種類型的如上文所描述之修飾進行修飾。在其他態樣中,本文所描述之聚核苷酸分子中的約50%核苷酸係用一或多種類型的如上文所描述之修飾進行修飾。在其他態樣中,本文所描述之聚核苷酸分子中的約60%核苷酸係用一或多種類型的如上文所描述之修飾進行修飾。在其他態樣中,本文所描述之聚核苷酸分子中的約70%核苷酸係用一或多種類型的如上文所描述之修飾進行修飾。在其他態樣中,本文所描述之聚核苷酸分子中的約80%核苷酸係用一或多種類型的如上文所描述之修飾進行修飾。在其他態樣中,本文所描述之聚核苷酸分子中的約90%核苷酸係用一或多種類型的如上文所描述之修飾進行修飾。在其他態樣中,本文所描述之聚核苷酸分子中的100%核苷酸係用一或多種類型的如上文所描述之修飾進行修飾。
在一些態樣中,本文所描述之一或多種類型之修飾發生於本文所描述之聚核苷酸分子內的種子區中。在一些態樣中,本文所描述之一或多種類型之修飾發生在本文所描述之聚核苷酸分子內的不同位置。在特定態樣中,本文所描述之一或多種類型之修飾發生於本文所描述之聚核苷酸分子的3'端。在特定態樣中,本文所描述之一或多種類型之修飾發生於本文所描述之聚核苷酸分子的5'端。在特定態樣中,本文所描述之一或多種類型之修飾以分散方式發生於本文所描述之聚核苷酸分子內。在特定態樣中,本文所描述之一或多種類型修飾以叢集形式發生於本文所描述之聚核苷酸分子內。 特定修飾模式
在一些態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股包含約三個2'-氟修飾之核苷酸及約十八個2'-O-甲基修飾之核苷酸,且其中反義股包含約五個2'-氟修飾之核苷酸及約十八個2'-O-甲基修飾之核苷酸。
在一些態樣中,本文描述經特定修飾模式修飾之聚核酸,其中有義股包含5'- nnnnnnNfnNfnNfnnnnnnnnnn-3',其中反義股包含5'- nNfnnnnNfnnnnNfnNfnNfnnnnnnn-3',其中n代表2'-O-甲基修飾之核苷酸,且其中Nf代表2'-氟修飾之核苷酸。在一些態樣中,有義股包含5'- NfnNfnNfnNfnNfNfNfnNfnNfnNfnNfnNf-3',其中反義股包含5'-nNfnNfnNfnNfnNfnnnNfnNfnNfnNfnnn-3',其中Nf代表2'-氟修飾之核苷酸,且其中n代表2'-O-甲基修飾之核苷酸。在一些態樣中,有義股包含5'-nnnnnnNfnNfNfNfnnnnnnnnnn -3',其中反義股包含5'-nNfnnnNfnNfNfnnnnNfnNfnnnnnnn -3',其中Nf代表2'-氟修飾之核苷酸,且其中n代表2'-O-甲基修飾之核苷酸。在一些態樣中,有義股包含5'-nnnnnnnnNfnNfnnnnnnnnnn -3',其中反義股包含5'-nNfnnnnnnnnnNfnNfnnnnnnnnn -3',其中Nf代表2'-氟修飾之核苷酸,且其中n代表2'-O-甲基修飾之核苷酸。在一些態樣中,有義股包含5'-nnnnnnNfnNfnNfnnnnnnnnnn -3',其中反義股包含5'-nNfnnnnnnnnnNfnNfnNfnnnnnnn -3',其中Nf代表2'-氟修飾之核苷酸,且其中n代表2'-O-甲基修飾之核苷酸。在一些個例中,各修飾模式在諸如以下位置包括一或多個硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯:在5'端上的第1核苷酸與第2核苷酸之間、在5'端上的第2核苷酸與第3核苷酸之間、在3'端的第1核苷酸與第2核苷酸之間,及/或在3'端上的第2與第3核苷酸之間。
在一些態樣中,反義股包含5'-nNfnnnNfnNfNfnnnnNfnNfnnnnnnn-3',其中Nf代表2'-氟修飾之核苷酸,且其中n代表2'-O-甲基修飾之核苷酸。在一些態樣中,反義股包含5'-nNfnnnNfnnnnnnnNfnNfnnnnnnn-3',其中Nf代表2'-氟修飾之核苷酸,且其中n代表2'-O-甲基修飾之核苷酸。在一些態樣中,反義股包含5'-nNfnnnnNfnnnnNfnNfnnnnnnnnn-3',其中Nf代表2'-氟修飾之核苷酸,且其中n代表2'-O-甲基修飾之核苷酸。在一些態樣中,反義股包含分別在位置2及14處之兩個2'-氟修飾之核苷酸或由其組成。在一些態樣中,反義股包含分別在位置2、12及14處之三個2'-氟修飾之核苷酸或由其組成。在一些態樣中,反義股包含分別在位置2、14及16處之三個2'-氟修飾之核苷酸或由其組成。在一些態樣中,反義股包含分別在位置2、12、14及16處之四個2'-氟修飾之核苷酸或由其組成。在一些態樣中,反義股包含在位置6、7、8或9處之2'-氟修飾之核苷酸。在一些態樣中,反義股包含位置4處之2'-氟修飾之核苷酸。在一些態樣中,反義股不含位置4處之2'-氟修飾之核苷酸。
在一些態樣中,有義股包含5'-nnnnnnNfnNfnNfnnnnnnnnnn-3',其中Nf代表2'-氟修飾之核苷酸,且其中n代表2'-O-甲基修飾之核苷酸。在一些態樣中,有義股包含5'- nnnnnnNfnNfNfNfnnnnnnnnnn-3',其中Nf代表2'-氟修飾之核苷酸,且其中n代表2'-O-甲基修飾之核苷酸。在一些態樣中,有義股包含5'-nnnnnnnnNfNfNfnnnnnnnnnn-3',其中Nf代表2'-氟修飾之核苷酸,且其中n代表2'-O-甲基修飾之核苷酸。在一些態樣中,有義股包含分別在位置9及11處之兩個2'-氟修飾之核苷酸或由其組成。在一些態樣中,有義股包含分別在位置7、9及11處之三個2'-氟修飾之核苷酸或由其組成。在一些態樣中,有義股包含分別在位置9、10及11處之三個2'-氟修飾之核苷酸或由其組成。在一些態樣中,有義股包含分別在位置7、9、10及11處之四個2'-氟修飾之核苷酸或由其組成。在一些態樣中,有義股包含在位置8、12或16處之2'-氟修飾之核苷酸。在一些態樣中,有義股不含位置8、12或16之2'-氟修飾之核苷酸
在一些態樣中,本文描述一種作為包含有義股及反義股之雙股核酸分子之聚核酸分子的特定修飾模式。在一些態樣中,反義股在距5'端之位置2包含2'-氟修飾之核苷酸。在一些態樣中,反義股在距5'端之位置14包含2'-氟修飾之核苷酸。在一些態樣中,反義股在距5'端之位置2及14包含2'-氟修飾之核苷酸。在一些態樣中,反義股在距5'端之位置12包含2'-氟修飾之核苷酸。在一些態樣中,反義股在距5'端之位置16包含2'-氟修飾之核苷酸。在其他態樣中,反義股在距5'端之位置6包含2'-氟修飾之核苷酸。在其他態樣中,反義股在距5'端之位置7包含2'-氟修飾之核苷酸。在其他態樣中,反義股在距5'端之位置8包含2'-氟修飾之核苷酸。在其他態樣中,反義股在距5'端之位置9包含2'-氟修飾之核苷酸。在其他態樣中,反義股在距5'端之位置4包含2'-氟修飾之核苷酸。
在一些態樣中,本文描述一種作為包含有義股及反義股之雙股核酸分子之聚核酸分子的特定修飾模式。在一些態樣中,有義股在距5'端之位置9包含2'-氟修飾之核苷酸。在一些態樣中,有義股在距5'端之位置11包含2'-氟修飾之核苷酸。在一些態樣中,有義股在距5'端之位置9及11包含2'-氟修飾之核苷酸。在一些態樣中,有義股在距5'端之位置7包含2'-氟修飾之核苷酸。在一些態樣中,有義股在距5'端之位置10包含2'-氟修飾之核苷酸。在一些態樣中,有義股在距5'端之位置9、11及7包含2'-氟修飾之核苷酸。有義股在距5'端之位置9及11及10包含2'-氟修飾之核苷酸。有義股在距5'端之位置9及7包含2'-氟修飾之核苷酸。有義股在距5'端之位置9及10包含2'-氟修飾之核苷酸。有義股在距5'端之位置9、11、7及10包含2'-氟修飾之核苷酸。在其他態樣中,有義股在距5'端之位置8包含2'-氟修飾之核苷酸。在其他態樣中,有義股在距5'端之位置12包含2'-氟修飾之核苷酸。在其他態樣中,有義股在距5'端之位置16包含2'-氟修飾之核苷酸。
在一些態樣中,聚核酸分子之有義股及反義股在以上兩個段落中所描述之位置處包含兩個或更多個2'-氟修飾之核苷酸的任何組合。
在一些態樣中,反義股包含5' - nNfnnnNfnNfNfnnnnNfnNfnnnnnnn-3'。在一些態樣中,反義股包含5' - nNfnnnNfnnnnnnnNfnNfnnnnnnn-3'。在一些態樣中,反義股包含5' - nNfnnnnNfnnnnNfnNfnnnnnnnnn-3'。在上文所描述之修飾模式中,「Nf」代表2'-氟修飾之核苷酸,且其中「n」代表2'-O-甲基修飾之核苷酸。
在一些態樣中,有義股包含5'- nnnnnnNfnNfnNfnnnnnnnnnn-3'。在一些態樣中,有義股包含5'- nnnnnnNfnNfNfNfnnnnnnnnnn-3'。在一些態樣中,有義股包含5'- nnnnnnnnNfNfNfnnnnnnnnnn-3'。在上文所描述之修飾模式中,「Nf」代表2'-氟修飾之核苷酸,且其中「n」代表2'-O-甲基修飾之核苷酸。
在一些態樣中,本文描述一種作為包含有義股及反義股之雙股核酸分子之聚核酸分子的特定修飾模式,其中該有義股包含約十二個2'-氟修飾之核苷酸及約九個2'-O-甲基修飾之核苷酸,且其中該反義股包含約九個2'-氟修飾之核苷酸及約十四個2'-O-甲基修飾之核苷酸。
在一些態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股經完全修飾且包含十二個2'-氟修飾之核苷酸、九個2'-O-甲基修飾之核苷酸,且其中反義股經完全修飾且包含九個2'-氟修飾之核苷酸及十四個2'-O-甲基修飾之核苷酸。
在一些態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股包含5'- NfnNfnNfnNfnNfNfNfnNfnNfnNfnNfnNf-3',其中反義股包含5'-nNfnNfnNfnNfnNfnnnNfnNfnNfnNfnnn-3',其中「Nf」表示2'-氟修飾之核苷酸,且其中「n」表示2'-O-甲基修飾之核苷酸。
在一些態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股包含5'- NfnNfnNfnNfnNfNfNfnNfnNfnNfnNfnNf -3',其中反義股包含5'- nNfnNfnNfnNfnNfnnnNfnNfnNfnNfnnn -3',其中有義股及/或反義股包含一或多個硫代磷酸酯鍵聯,其中「Nf」代表2'-氟修飾之核苷酸,且其中「n」代表2'-O-甲基修飾之核苷酸。在其他態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股包含5'- NfnNfnNfnNfnNfNfNfnNfnNfnNfnNfnNf -3',其中反義股包含5'- nNfnNfnNfnNfnNfnnnNfnNfnNfnNfnnn -3,其中有義股包含兩個硫代磷酸酯鍵聯,其中反義股包含四個硫代磷酸酯鍵聯,其中「Nf」代表2'-氟修飾之核苷酸,且其中「n」代表2'-O-甲基修飾之核苷酸。
在一些態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股及/或反義股經修飾為 8中之I型。 8. 核苷酸修飾模式
模式名稱 模式
有義股之I型 5'- NfsnsNfnNfnNfnNfNfNfnNfnNfnNfnNfnNf-3'
反義股之I型 5'-nsNfsnNfnNfnNfnNfnnnNfnNfnNfnNfnsnsn-3'
有義股之II型 5'- nsnsnnnnNfnNfNfNfnnnnnnnnnn -3'
反義股之II型 5'- nsNfsnnnNfnNfNfnnnnNfnNfnnnnnsnsn - 3'
有義股之III型 5'- nsnsnnnnnnNfnNfnnnnnnnnnn -3'
反義股之III型 5'- nsNfsnnnnnnnnnNfnNfnnnnnnnsnsn -3'
有義股之IV型 5'- nsnsnnnnNfnNfnNfnnnnnnnnnn -3'
反義股之IV型 5'- nsNfsnnnnnnnnnNfnNfnNfnnnnnsnsn -3'
有義股之V型 5'- nsnsnnnnNfnNfnNfnnnnnnnnnn -3'
反義股之V型 5'- nsNfsnnnnNfnnnnNfnNfnNfnnnnnsnsn -3'
有義股之VI型 5'- nnnnnnNfnNfnNfnnnnnnnnnn-invdN-invdN -3'
備註:「Nf」代表2'-氟修飾之核苷酸,「n」代表2'-O-甲基修飾之核苷酸,「s」代表3'-硫代磷酸酯,「invdN」代表反向去氧-核苷酸。
在一些態樣中,本文所提供之聚核苷酸分子含有包含SEQ ID NO: 309至462之核酸序列的有義股、包含SEQ ID NO: 1至154之核酸序列的反義股,且其中該有義股及/或反義股係以 8中所指定之I型修飾模式修飾。
在一些態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股包含約四個2'-氟修飾之核苷酸及約十七個2'-O-甲基修飾之核苷酸,且其中反義股包含約六個2'-氟修飾之核苷酸及約十七個2'-O-甲基修飾之核苷酸。
在一些態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股經完全修飾且包含四個2'-氟修飾之核苷酸、十七個2'-O-甲基修飾之核苷酸,且其中反義股經完全修飾且包含六個2'-氟修飾之核苷酸及十七個2'-O-甲基修飾之核苷酸。
在一些態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股包含5'- nnnnnnNfnNfNfNfnnnnnnnnnn -3',其中反義股包含5'- nNfnnnNfnNfNfnnnnNfnNfnnnnnnn - 3',其中「Nf」代表2'-氟修飾之核苷酸,且其中「n」代表2'-O-甲基修飾之核苷酸。
在一些態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股包含5'- nnnnnnNfnNfNfNfnnnnnnnnnn -3',其中反義股包含5'- nNfnnnNfnNfNfnnnnNfnNfnnnnnnn - 3',其中有義股及/或反義股包含一或多個硫代磷酸酯鍵聯,其中「Nf」代表2'-氟修飾之核苷酸,且其中「n」代表2'-O-甲基修飾之核苷酸。在其他態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股包含5'- nnnnnnNfnNfNfNfnnnnnnnnnn -3',其中反義股包含5'- nNfnnnNfnNfNfnnnnNfnNfnnnnnnn - 3',其中有義股包含兩個硫代磷酸酯鍵聯,其中反義股包含四個硫代磷酸酯鍵聯,其中「Nf」代表2'-氟修飾之核苷酸,且其中「n」代表2'-O-甲基修飾之核苷酸。
在一些態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股及/或反義股經修飾為 8中之II型。
在一些態樣中,本文所提供之聚核苷酸分子含有包含SEQ ID NO: 309至462之核酸序列的有義股及/或包含SEQ ID NO: 1至154之核酸序列的反義股,且其中有義股及/或反義股係以 8中所指定之II型修飾模式修飾。
在一些態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股包含約兩個2'-氟修飾之核苷酸及約十九個2'-O-甲基修飾之核苷酸,且其中反義股包含約三個2'-氟修飾之核苷酸及約二十個2'-O-甲基修飾之核苷酸。
在一些態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股經完全修飾且包含兩個2'-氟修飾之核苷酸及十九個2'-O-甲基修飾之核苷酸,且其中反義股經完全修飾且包含三個2'-氟修飾之核苷酸及二十個2'-O-甲基修飾之核苷酸。
在一些態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股包含5'- nnnnnnnnNfnNfnnnnnnnnnn -3',其中反義股包含5'- nNfnnnnnnnnnNfnNfnnnnnnnnn -3',其中「Nf」代表2'-氟修飾之核苷酸,且其中「n」代表2'-O-甲基修飾之核苷酸。
在一些態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股包含5'- nnnnnnnnNfnNfnnnnnnnnnn -3',其中反義股包含5'- nNfnnnnnnnnnNfnNfnnnnnnnnn -3',其中有義股及/或反義股包含一或多個硫代磷酸酯鍵聯,其中「Nf」代表2'-氟修飾之核苷酸,且其中「n」代表2'-O-甲基修飾之核苷酸。在其他態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股包含5'- nnnnnnnnNfnNfnnnnnnnnnn -3,其中反義股包含5'- nNfnnnnnnnnnNfnNfnnnnnnnnn -3',其中有義股包含兩個硫代磷酸酯鍵聯,其中反義股包含四個硫代磷酸酯鍵聯,其中「Nf」代表2'-氟修飾之核苷酸,且其中「n」代表2'-O-甲基修飾之核苷酸。
在一些態樣中,本文中描述特定修飾模式,其中有義股及/或反義股經修飾為 8中之III型。
在一些態樣中,本文所提供之聚核苷酸分子含有包含SEQ ID NO: 309至462之核酸序列的有義股及/或包含SEQ ID NO: 1至154之核酸序列的反義股,且其中該有義股及/或反義股係以 8中所指定之III型修飾模式修飾。
在一些態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股包含約三個2'-氟修飾之核苷酸及約十八個2'-O-甲基修飾之核苷酸,且其中反義股包含約四個2'-氟修飾之核苷酸及約十九個2'-O-甲基修飾之核苷酸。
在一些態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股經完全修飾且包含三個2'-氟修飾之核苷酸、十八個2'-O-甲基修飾之核苷酸,且其中反義股經完全修飾且包含四個2'-氟修飾之核苷酸、十九個2'-O-甲基修飾之核苷酸。
在一些態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股包含5'- nnnnnnNfnNfnNfnnnnnnnnnn -3',其中反義股包含5'- nNfnnnnnnnnnNfnNfnNfnnnnnnn -3',其中「Nf」代表2'-氟修飾之核苷酸,且其中「n」代表2'-O-甲基修飾之核苷酸。
在一些態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股包含5'- nnnnnnNfnNfnNfnnnnnnnnnn -3',其中反義股包含5'- nNfnnnnnnnnnNfnNfnNfnnnnnnn -3',其中有義股及/或反義股包含一或多個硫代磷酸酯鍵聯,其中「Nf」代表2'-氟修飾之核苷酸,且其中「n」代表2'-O-甲基修飾之核苷酸。在其他態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股包含5'- nnnnnnNfnNfnNfnnnnnnnnnn -3',其中反義股包含5'- nNfnnnnnnnnnNfnNfnNfnnnnnnn -3',其中有義股包含兩個硫代磷酸酯鍵聯,其中反義股包含四個硫代磷酸酯鍵聯,其中「Nf」代表2'-氟修飾之核苷酸,且其中「n」代表2'-O-甲基修飾之核苷酸。
在一些態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股及/或反義股經修飾為 8中之IV型。
在一些態樣中,本文所提供之聚核苷酸分子含有包含SEQ ID NO: 309至462之核酸序列的有義股及/或包含SEQ ID NO: 1至154之核酸序列的反義股,且其中有義股及/或反義股係以 8中所指定之IV修飾模式修飾。
在一些態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股包含約三個2'-氟修飾之核苷酸及約十八個2'-O-甲基修飾之核苷酸,且其中反義股包含約五個2'-氟修飾之核苷酸及約十八個2'-O-甲基修飾之核苷酸。
在一些態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股經完全修飾且包含三個2'-氟修飾之核苷酸及十八個2'-O-甲基修飾之核苷酸,且其中反義股經完全修飾且包含五個2'-氟修飾之核苷酸、十八個2'-O-甲基修飾之核苷酸。
在一些態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股包含5'- nnnnnnNfnNfnNfnnnnnnnnnn -3',其中反義股包含5'- nNfnnnnNfnnnnNfnNfnNfnnnnnnn -3',其中「Nf」代表2'-氟修飾之核苷酸,且其中「n」代表2'-O-甲基修飾之核苷酸。
在一些態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股包含5'- nnnnnnNfnNfnNfnnnnnnnnnn -3',其中反義股包含5'- nNfnnnnNfnnnnNfnNfnNfnnnnnnn -3',其中有及/或反義股包含一或多個硫代磷酸酯鍵聯,其中「Nf」代表2'-氟修飾之核苷酸,且其中「n」代表2'-O-甲基修飾之核苷酸。在其他態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股包含5'- nnnnnnNfnNfnNfnnnnnnnnnn -3',其中反義股包含5'- nNfnnnnNfnnnnNfnNfnNfnnnnnnn -3',其中有義股包含四個硫代磷酸酯鍵聯,其中反義股包含四個硫代磷酸酯鍵聯,其中「Nf」代表2'-氟修飾之核苷酸,且其中「n」代表2'-O-甲基修飾之核苷酸。
在一些態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股及/或反義股經修飾為 8中之V型。
在一些態樣中,本文所提供之聚核苷酸分子含有包含SEQ ID NO: 309至462之核酸序列的有義股及/或包含SEQ ID NO: 1至154之核酸序列的反義股,且其中有義股及/或反義股係以 8中所指定之V型修飾模式修飾。
在一些態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股包含約三個2'-氟修飾之核苷酸及約十八個2'-O-甲基修飾之核苷酸,在3'端上具有一或多個反向去氧核苷酸作為突出物。
在一些態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股經完全修飾且包含三個2'-氟修飾之核苷酸及十八個2'-O-甲基修飾之核苷酸,在3'端具有兩個反向去氧核苷酸作為突出物。
在一些態樣中,本文描述一種特定修飾模式,其中有義股包含5'- nnnnnnNfnNfnNfnnnnnnnnnn-invdN-invdN -3',其中「Nf」代表2'-氟修飾之核苷酸,且其中「n」代表2'-O-甲基修飾之核苷酸,且「invdN」代表反向去氧核苷酸。在一些個例中,invdN為反向去氧胸腺嘧啶。在一些態樣中,將與一或多個如式(IV''或IV''')中所示之靶向部分結合的連接子添加至5'端上的第一核酸。在一些態樣中,將與一或多個如式(V'')或(V''')中所示之GalNAc結合的連接子添加至5'端上的第一核酸。在一些態樣中,修飾模式包含一或多個硫代磷酸酯鍵聯。在一些態樣中,修飾模式顯示於式(VII)中。在一些態樣中,將此項技術中已知之5'端修飾應用於一或多個反向核苷酸。 (VII),其中R為對應於本文所描述之糖修飾的部分,在一些個例中,R為-O-甲基;其中R'為胸腺嘧啶、無鹼基或其他;其中A為-O或-S;且其中A'為-O或-S。
在一些態樣中,本文所提供之聚核苷酸分子含有包含SEQ ID NO: 309至462之核酸序列的有義股及/或包含SEQ ID NO: 1至154之核酸序列的反義股,且其中有義股及/或反義股係以 8中所指定之VI型修飾模式修飾。
在一些態樣中,本文所提供之聚核苷酸分子包含單股核酸,其包含選自SEQ ID NO: 1至154中之一者的核酸序列。在一些態樣中,本文所提供之聚核苷酸分子包含與選自SEQ ID NO: 309至462之核酸序列互補的單股核酸。
在一些態樣中,本文所提供之聚核苷酸分子含有包含選自SEQ ID NO: 309至462中之一者之核酸序列的有義股及包含選自SEQ ID NO: 1至154中之一者之核酸序列的反義股。在其他態樣中,本文所提供之聚核苷酸分子含有包含選自SEQ ID NO: 309至462中之一者之核酸序列的有義股、包含選自SEQ ID NO: 1至154中之一者之核酸序列的反義股,且其中有義股及/或反義股係以如本文所描述之修飾模式修飾。
在一些態樣中,本文所提供之聚核苷酸分子含有包含選自SEQ ID NO: 463至616中之一者之核酸序列的有義股及包含選自SEQ ID NO: 155至308之核酸序列的反義股。
本文中進一步提供一種用於調節脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的聚核酸分子,其中聚核酸分子含有包含usAfsgaugAfccaaGfcUfu Gfgcaggsusc (SEQ ID NO: 158) 之核苷酸序列的反義股及包含cscsugcc AfaGfcUfuggucaucua (SEQ ID NO: 466)之核苷酸序列的有義股,其中「A」係指腺苷-3'-磷酸;「a」係指2'-O-甲基腺苷-3'-磷酸;「Af」係指2'-氟腺苷-3'-磷酸;「C」係指胞苷-3'-磷酸;「c」係指2'-O-甲基胞苷-3'-磷酸;「Cf」係指2'-氟胞苷-3'-磷酸;「G」係指鳥苷-3'-磷酸;「g」係指2'-O-甲基鳥苷-3'-磷酸;「Gf」係指2'-氟鳥苷-3'-磷酸;「U」係指尿苷-3'-磷酸;「u」係指2'-O-甲基尿苷-3'-磷酸;「Uf」係指2'-氟尿苷-3'-磷酸;「T」係指5-甲基尿苷-3'-磷酸;「t」係指2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「Tf」係指2'-氟-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「s」係指3'-硫代磷酸酯。
本文進一步提供一種用於調節脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的聚核酸分子,其中聚核酸分子含有包含usAfsuagaUfgaccAfaGfcUfu ggcasgsg (SEQ ID NO: 159)之核苷酸序列的反義股及包含usgsccaaGfc UfuGfgucaucuaua (SEQ ID NO: 467)之核苷酸序列的有義股, 其中「A」係指腺苷-3'-磷酸;「a」係指2'-O-甲基腺苷-3'-磷酸;「Af」係指2'-氟腺苷-3'-磷酸;「C」係指胞苷-3'-磷酸;「c」係指2'-O-甲基胞苷-3'-磷酸;「Cf」係指2'-氟胞苷-3'-磷酸;「G」係指鳥苷-3'-磷酸;「g」係指2'-O-甲基鳥苷-3'-磷酸;「Gf」係指2'-氟鳥苷-3'-磷酸;「U」係指尿苷-3'-磷酸;「u」係指2'-O-甲基尿苷-3'-磷酸;「Uf」係指2'-氟尿苷-3'-磷酸;「T」係指5-甲基尿苷-3'-磷酸;「t」係指2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「Tf」係指2'-氟-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「s」係指3'-硫代磷酸酯。
本文進一步提供一種用於調節脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的聚核酸分子,其中聚核酸分子含有包含usCfsauagAfugacCfaAfgCfuuggcsasg (SEQ ID NO: 160)之核苷酸序列的反義股及包含gscscaagCfuUfgGfucaucuauga (SEQ ID NO: 468)之核苷酸序列的有義股,其中「A」係指腺苷-3'-磷酸;「a」係指2'-O-甲基腺苷-3'-磷酸;「Af」係指2'-氟腺苷-3'-磷酸;「C」係指胞苷-3'-磷酸;「c」係指2'-O-甲基胞苷-3'-磷酸;「Cf」係指2'-氟胞苷-3'-磷酸;「G」係指鳥苷-3'-磷酸;「g」係指2'-O-甲基鳥苷-3'-磷酸;「Gf」係指2'-氟鳥苷-3'-磷酸;「U」係指尿苷-3'-磷酸;「u」係指2'-O-甲基尿苷-3'-磷酸;「Uf」係指2'-氟尿苷-3'-磷酸;「T」係指5-甲基尿苷-3'-磷酸;「t」係指2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「Tf」係指2'-氟-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「s」係指3'-硫代磷酸酯。
本文進一步提供一種用於調節脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的聚核酸分子,其中聚核酸分子含有包含usCfsgacgGfcaguCfcCfuUfcugcgsusc (SEQ ID NO: 165)之核苷酸序列的反義股及包含csgscagaAfgGfgAfcugccgucga (SEQ ID NO: 473)之核苷酸序列的有義股, 其中「A」係指腺苷-3'-磷酸;「a」係指2'-O-甲基腺苷-3'-磷酸;「Af」係指2'-氟腺苷-3'-磷酸;「C」係指胞苷-3'-磷酸;「c」係指2'-O-甲基胞苷-3'-磷酸;「Cf」係指2'-氟胞苷-3'-磷酸;「G」係指鳥苷-3'-磷酸;「g」係指2'-O-甲基鳥苷-3'-磷酸;「Gf」係指2'-氟鳥苷-3'-磷酸;「U」係指尿苷-3'-磷酸;「u」係指2'-O-甲基尿苷-3'-磷酸;「Uf」係指2'-氟尿苷-3'-磷酸;「T」係指5-甲基尿苷-3'-磷酸;「t」係指2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「Tf」係指2'-氟-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「s」係指3'-硫代磷酸酯。
本文進一步提供一種用於調節脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的聚核酸分子,其中聚核酸分子含有包含usUfscuagGfcuugGfaAfcCfggggusasa (SEQ ID NO: 172)之核苷酸序列的反義股及包含ascscccgGfuUfcCfaagccuagaa (SEQ ID NO: 480)之核苷酸序列的有義股, 其中「A」係指腺苷-3'-磷酸;「a」係指2'-O-甲基腺苷-3'-磷酸;「Af」係指2'-氟腺苷-3'-磷酸;「C」係指胞苷-3'-磷酸;「c」係指2'-O-甲基胞苷-3'-磷酸;「Cf」係指2'-氟胞苷-3'-磷酸;「G」係指鳥苷-3'-磷酸;「g」係指2'-O-甲基鳥苷-3'-磷酸;「Gf」係指2'-氟鳥苷-3'-磷酸;「U」係指尿苷-3'-磷酸;「u」係指2'-O-甲基尿苷-3'-磷酸;「Uf」係指2'-氟尿苷-3'-磷酸;「T」係指5-甲基尿苷-3'-磷酸;「t」係指2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「Tf」係指2'-氟-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「s」係指3'-硫代磷酸酯。
本文進一步提供一種用於調節脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的聚核酸分子,其中聚核酸分子含有包含usAfsgccuCfuaggCfuUfgGfaaccgsgsg (SEQ ID NO: 175)之核苷酸序列的反義股及包含csgsguucCfaAfgCfcuagaggcua (SEQ ID NO: 483)之核苷酸序列的有義股,其中「A」係指腺苷-3'-磷酸;「a」係指2'-O-甲基腺苷-3'-磷酸;「Af」係指2'-氟腺苷-3'-磷酸;「C」係指胞苷-3'-磷酸;「c」係指2'-O-甲基胞苷-3'-磷酸;「Cf」係指2'-氟胞苷-3'-磷酸;「G」係指鳥苷-3'-磷酸;「g」係指2'-O-甲基鳥苷-3'-磷酸;「Gf」係指2'-氟鳥苷-3'-磷酸;「U」係指尿苷-3'-磷酸;「u」係指2'-O-甲基尿苷-3'-磷酸;「Uf」係指2'-氟尿苷-3'-磷酸;「T」係指5-甲基尿苷-3'-磷酸;「t」係指2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「Tf」係指2'-氟-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「s」係指3'-硫代磷酸酯。
本文進一步提供一種用於調節脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的聚核酸分子,其中聚核酸分子包含usUfsuaccGfugguAfgCfaCfuccugscsa (SEQ ID NO: 198)之核苷酸序列的反義股及包含csasggagUfgCfuAfccacgguaaa (SEQ ID NO: 506)之核苷酸序列的有義股, 其中「A」係指腺苷-3'-磷酸;「a」係指2'-O-甲基腺苷-3'-磷酸;「Af」係指2'-氟腺苷-3'-磷酸;「C」係指胞苷-3'-磷酸;「c」係指2'-O-甲基胞苷-3'-磷酸;「Cf」係指2'-氟胞苷-3'-磷酸;「G」係指鳥苷-3'-磷酸;「g」係指2'-O-甲基鳥苷-3'-磷酸;「Gf」係指2'-氟鳥苷-3'-磷酸;「U」係指尿苷-3'-磷酸;「u」係指2'-O-甲基尿苷-3'-磷酸;「Uf」係指2'-氟尿苷-3'-磷酸;「T」係指5-甲基尿苷-3'-磷酸;「t」係指2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「Tf」係指2'-氟-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「s」係指3'-硫代磷酸酯。
本文進一步提供一種用於調節脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的聚核酸分子,其中聚核酸分子含有包含usUfsguccAfuuacCfgUfgGfuagcascsu (SEQ ID NO: 201)之核苷酸序列的反義股及包含usgscuacCfaCfgGfuaauggacaa (SEQ ID NO: 509)之核苷酸序列的有義股,其中「A」係指腺苷-3'-磷酸;「a」係指2'-O-甲基腺苷-3'-磷酸;「Af」係指2'-氟腺苷-3'-磷酸;「C」係指胞苷-3'-磷酸;「c」係指2'-O-甲基胞苷-3'-磷酸;「Cf」係指2'-氟胞苷-3'-磷酸;「G」係指鳥苷-3'-磷酸;「g」係指2'-O-甲基鳥苷-3'-磷酸;「Gf」係指2'-氟鳥苷-3'-磷酸;「U」係指尿苷-3'-磷酸;「u」係指2'-O-甲基尿苷-3'-磷酸;「Uf」係指2'-氟尿苷-3'-磷酸;「T」係指5-甲基尿苷-3'-磷酸;「t」係指2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「Tf」係指2'-氟-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「s」係指3'-硫代磷酸酯。
本文進一步提供一種用於調節脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的聚核酸分子,其中聚核酸分子含有包含usCfsucugUfccauUfaCfcGfugguasgsc (SEQ ID NO: 203)之核苷酸序列的反義股及包含usasccacGfgUfaAfuggacagaga (SEQ ID NO: 511)之核苷酸序列的有義股,其中「A」係指腺苷-3'-磷酸;「a」係指2'-O-甲基腺苷-3'-磷酸;「Af」係指2'-氟腺苷-3'-磷酸;「C」係指胞苷-3'-磷酸;「c」係指2'-O-甲基胞苷-3'-磷酸;「Cf」係指2'-氟胞苷-3'-磷酸;「G」係指鳥苷-3'-磷酸;「g」係指2'-O-甲基鳥苷-3'-磷酸;「Gf」係指2'-氟鳥苷-3'-磷酸;「U」係指尿苷-3'-磷酸;「u」係指2'-O-甲基尿苷-3'-磷酸;「Uf」係指2'-氟尿苷-3'-磷酸;「T」係指5-甲基尿苷-3'-磷酸;「t」係指2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「Tf」係指2'-氟-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「s」係指3'-硫代磷酸酯。
本文進一步提供一種用於調節脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的聚核酸分子,其中聚核酸分子含有包含usAfsuuguGfucagGfuUfgCfaguacsusc (SEQ ID NO: 214)之核苷酸序列之反義股及包含gsusacugCfaAfcCfugacacaaua (SEQ ID NO: 522)之核苷酸序列的有義股, 其中「A」係指腺苷-3'-磷酸;「a」係指2'-O-甲基腺苷-3'-磷酸;「Af」係指2'-氟腺苷-3'-磷酸;「C」係指胞苷-3'-磷酸;「c」係指2'-O-甲基胞苷-3'-磷酸;「Cf」係指2'-氟胞苷-3'-磷酸;「G」係指鳥苷-3'-磷酸;「g」係指2'-O-甲基鳥苷-3'-磷酸;「Gf」係指2'-氟鳥苷-3'-磷酸;「U」係指尿苷-3'-磷酸;「u」係指2'-O-甲基尿苷-3'-磷酸;「Uf」係指2'-氟尿苷-3'-磷酸;「T」係指5-甲基尿苷-3'-磷酸;「t」係指2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「Tf」係指2'-氟-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「s」係指3'-硫代磷酸酯。
本文進一步提供一種用於調節脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的聚核酸分子,其中聚核酸分子含有包含usUfsgcguCfugagCfaUfuGfugucasgsg (SEQ ID NO: 218)之核苷酸序列的反義股及包含usgsacacAfaUfgCfucagacgcaa (SEQ ID NO: 526)之核苷酸序列的有義股,其中「A」係指腺苷-3'-磷酸;「a」係指2'-O-甲基腺苷-3'-磷酸;「Af」係指2'-氟腺苷-3'-磷酸;「C」係指胞苷-3'-磷酸;「c」係指2'-O-甲基胞苷-3'-磷酸;「Cf」係指2'-氟胞苷-3'-磷酸;「G」係指鳥苷-3'-磷酸;「g」係指2'-O-甲基鳥苷-3'-磷酸;「Gf」係指2'-氟鳥苷-3'-磷酸;「U」係指尿苷-3'-磷酸;「u」係指2'-O-甲基尿苷-3'-磷酸;「Uf」係指2'-氟尿苷-3'-磷酸;「T」係指5-甲基尿苷-3'-磷酸;「t」係指2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「Tf」係指2'-氟-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「s」係指3'-硫代磷酸酯。
本文進一步提供一種用於調節脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的聚核酸分子,其中聚核酸分子含有包含usUfsaacuCfugucCfaUfaAfugguasgsu (SEQ ID NO: 242)之核苷酸序列的反義股及包含usasccauUfaUfgGfacagaguuaa (SEQ ID NO: 550)之核苷酸序列的有義股,其中「A」係指腺苷-3'-磷酸;「a」係指2'-O-甲基腺苷-3'-磷酸;「Af」係指2'-氟腺苷-3'-磷酸;「C」係指胞苷-3'-磷酸;「c」係指2'-O-甲基胞苷-3'-磷酸;「Cf」係指2'-氟胞苷-3'-磷酸;「G」係指鳥苷-3'-磷酸;「g」係指2'-O-甲基鳥苷-3'-磷酸;「Gf」係指2'-氟鳥苷-3'-磷酸;「U」係指尿苷-3'-磷酸;「u」係指2'-O-甲基尿苷-3'-磷酸;「Uf」係指2'-氟尿苷-3'-磷酸;「T」係指5-甲基尿苷-3'-磷酸;「t」係指2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「Tf」係指2'-氟-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「s」係指3'-硫代磷酸酯。
本文進一步提供一種用於調節脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的聚核酸分子,其中聚核酸分子含有包含usCfscaagCfuuggCfaAfgUfucuucscsu (SEQ ID NO: 243)之核苷酸序列的反義股及包含gsasagaaCfuUfgCfcaagcuugga (SEQ ID NO: 551)之核苷酸序列的有義股,其中「A」係指腺苷-3'-磷酸;「a」係指2'-O-甲基腺苷-3'-磷酸;「Af」係指2'-氟腺苷-3'-磷酸;「C」係指胞苷-3'-磷酸;「c」係指2'-O-甲基胞苷-3'-磷酸;「Cf」係指2'-氟胞苷-3'-磷酸;「G」係指鳥苷-3'-磷酸;「g」係指2'-O-甲基鳥苷-3'-磷酸;「Gf」係指2'-氟鳥苷-3'-磷酸;「U」係指尿苷-3'-磷酸;「u」係指2'-O-甲基尿苷-3'-磷酸;「Uf」係指2'-氟尿苷-3'-磷酸;「T」係指5-甲基尿苷-3'-磷酸;「t」係指2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「Tf」係指2'-氟-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「s」係指3'-硫代磷酸酯。
本文進一步提供一種用於調節脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的聚核酸分子,其中聚核酸分子含有包含usAfsgaugAfccaaGfcUfuGfgcaagsusu (SEQ ID NO: 244之核苷酸序列的反義股及包含csusugccAfaGfcUfuggucaucua (SEQ ID NO: 552)之核苷酸序列的有義股, 其中「A」係指腺苷-3'-磷酸;「a」係指2'-O-甲基腺苷-3'-磷酸;「Af」係指2'-氟腺苷-3'-磷酸;「C」係指胞苷-3'-磷酸;「c」係指2'-O-甲基胞苷-3'-磷酸;「Cf」係指2'-氟胞苷-3'-磷酸;「G」係指鳥苷-3'-磷酸;「g」係指2'-O-甲基鳥苷-3'-磷酸;「Gf」係指2'-氟鳥苷-3'-磷酸;「U」係指尿苷-3'-磷酸;「u」係指2'-O-甲基尿苷-3'-磷酸;「Uf」係指2'-氟尿苷-3'-磷酸;「T」係指5-甲基尿苷-3'-磷酸;「t」係指2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「Tf」係指2'-氟-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「s」係指3'-硫代磷酸酯。
本文進一步提供一種用於調節脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的聚核酸分子,其中聚核酸分子含有包含usGfsguccGfacuaUfgCfuGfgu gugsgsu (SEQ ID NO: 252)之核苷酸序列的反義股及包含csascacc AfgCfaUfagucggacca (SEQ ID NO: 560)之核苷酸序列的有義股,其中「A」係指腺苷-3'-磷酸;「a」係指2'-O-甲基腺苷-3'-磷酸;「Af」係指2'-氟腺苷-3'-磷酸;「C」係指胞苷-3'-磷酸;「c」係指2'-O-甲基胞苷-3'-磷酸;「Cf」係指2'-氟胞苷-3'-磷酸;「G」係指鳥苷-3'-磷酸;「g」係指2'-O-甲基鳥苷-3'-磷酸;「Gf」係指2'-氟鳥苷-3'-磷酸;「U」係指尿苷-3'-磷酸;「u」係指2'-O-甲基尿苷-3'-磷酸;「Uf」係指2'-氟尿苷-3'-磷酸;「T」係指5-甲基尿苷-3'-磷酸;「t」係指2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「Tf」係指2'-氟-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「s」係指3'-硫代磷酸酯。
本文進一步提供一種用於調節脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的聚核酸分子,其中聚核酸分子含有包含usAfsgccuCfuaggCfuUfgGfaaccgsgsg (SEQ ID NO: 175)之核苷酸序列的反義股及包含csgsguucCfaAfgCfcuagaggcua (SEQ ID NO: 483)之核苷酸序列的有義股, 其中「A」係指腺苷-3'-磷酸;「a」係指2'-O-甲基腺苷-3'-磷酸;「Af」係指2'-氟腺苷-3'-磷酸;「C」係指胞苷-3'-磷酸;「c」係指2'-O-甲基胞苷-3'-磷酸;「Cf」係指2'-氟胞苷-3'-磷酸;「G」係指鳥苷-3'-磷酸;「g」係指2'-O-甲基鳥苷-3'-磷酸;「Gf」係指2'-氟鳥苷-3'-磷酸;「U」係指尿苷-3'-磷酸;「u」係指2'-O-甲基尿苷-3'-磷酸;「Uf」係指2'-氟尿苷-3'-磷酸;「T」係指5-甲基尿苷-3'-磷酸;「t」係指2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「Tf」係指2'-氟-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「s」係指3'-硫代磷酸酯。
本文進一步提供一種用於調節脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的聚核酸分子,其中聚核酸分子含有包含usAfsuuguGfucagGfuUfgCfaguacsusc (SEQ ID NO: 214)之核苷酸序列之反義股及包含gsusacugCfaAfcCfugacacaaua (SEQ ID NO: 522)之核苷酸序列的有義股,其中「A」係指腺苷-3'-磷酸;「a」係指2'-O-甲基腺苷-3'-磷酸;「Af」係指2'-氟腺苷-3'-磷酸;「C」係指胞苷-3'-磷酸;「c」係指2'-O-甲基胞苷-3'-磷酸;「Cf」係指2'-氟胞苷-3'-磷酸;「G」係指鳥苷-3'-磷酸;「g」係指2'-O-甲基鳥苷-3'-磷酸;「Gf」係指2'-氟鳥苷-3'-磷酸;「U」係指尿苷-3'-磷酸;「u」係指2'-O-甲基尿苷-3'-磷酸;「Uf」係指2'-氟尿苷-3'-磷酸;「T」係指5-甲基尿苷-3'-磷酸;「t」係指2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「Tf」係指2'-氟-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「s」係指3'-硫代磷酸酯。
1.
化合物 ID siRNA ID 未經修飾之反義序列(5'→3') SEQ ID NO. 經修飾之反義序列(5'→3') SEQ ID NO. siRNA ID 未經修飾之有義序列(5'→3') SEQ ID NO. 經修飾之有義序列(5'→3') SEQ ID NO. 人類轉錄物位置
SRS-000023 G-000023 UCCAAGCUUGGCAGGUCCUUCCU 1 usCfscaagCfuuggCfaGfgUfccuucscsu 155 P-000023 GAAGGACCUGCCAAGCUUGGA 309 gsasaggaCfcUfgCfcaagcuugga 463 198
SRS-000024 G-000024 UACCAAGCUUGGCAGGUCCUUCC 2 usAfsccaaGfcuugGfcAfgGfuccuuscsc 156 P-000024 AAGGACCUGCCAAGCUUGGUA 310 asasggacCfuGfcCfaagcuuggua 464 199
SRS-000025 G-000025 UAUGACCAAGCUUGGCAGGUCCU 3 usAfsugacCfaagcUfuGfgCfaggucscsu 157 P-000025 GACCUGCCAAGCUUGGUCAUA 311 gsasccugCfcAfaGfcuuggucaua 465 202
SRS-000026 G-000008 UAGAUGACCAAGCUUGGCAGGUC 4 usAfsgaugAfccaaGfcUfuGfgcaggsusc 158 P-000026 CCUGCCAAGCUUGGUCAUCUA 312 cscsugccAfaGfcUfuggucaucua 466 204
SRS-000027 G-000009 UAUAGAUGACCAAGCUUGGCAGG 5 usAfsuagaUfgaccAfaGfcUfuggcasgsg 159 P-000027 UGCCAAGCUUGGUCAUCUAUA 313 usgsccaaGfcUfuGfgucaucuaua 467 206
SRS-000028 G-000010 UCAUAGAUGACCAAGCUUGGCAG 6 usCfsauagAfugacCfaAfgCfuuggcsasg 160 P-000028 GCCAAGCUUGGUCAUCUAUGA 314 gscscaagCfuUfgGfucaucuauga 468 207
SRS-000029 G-000026 UAUCAAGCCAGCAUUUGGGUAGU 7 usAfsucaaGfccagCfaUfuUfggguasgsu 161 P-000029 UACCCAAAUGCUGGCUUGAUA 315 usascccaAfaUfgCfuggcuugaua 469 260
SRS-000030 G-000027 UGUCCCUUCUGCGUCUGAGCAUU 8 usGfsucccUfucugCfgUfcUfgagcasusu 162 P-000030 UGCUCAGACGCAGAAGGGACA 316 usgscucaGfaCfgCfagaagggaca 470 374
SRS-000031 G-000028 UCGGCAGUCCCUUCUGCGUCUGA 9 usCfsggcaGfucccUfuCfuGfcgucusgsa 163 P-000031 AGACGCAGAAGGGACUGCCGA 317 asgsacgcAfgAfaGfggacugccga 471 379
SRS-000032 G-000029 UGACGGCAGUCCCUUCUGCGUCU 10 usGfsacggCfagucCfcUfuCfugcguscsu 164 P-000032 ACGCAGAAGGGACUGCCGUCA 318 ascsgcagAfaGfgGfacugccguca 472 381
SRS-000033 G-000011 UCGACGGCAGUCCCUUCUGCGUC 11 usCfsgacgGfcaguCfcCfuUfcugcgsusc 165 P-000033 CGCAGAAGGGACUGCCGUCGA 319 csgscagaAfgGfgAfcugccgucga 473 382
SRS-000034 G-000030 UGCGACGGCAGUCCCUUCUGCGU 12 usGfscgacGfgcagUfcCfcUfucugcsgsu 166 P-000034 GCAGAAGGGACUGCCGUCGCA 320 gscsagaaGfgGfaCfugccgucgca 474 383
SRS-000035 G-000031 UGAACCGGGGUAACAGUCGGAGG 13 usGfsaaccGfggguAfaCfaGfucggasgsg 167 P-000035 UCCGACUGUUACCCCGGUUCA 321 uscscgacUfgUfuAfccccgguuca 475 406
SRS-000036 G-000032 UGGAACCGGGGUAACAGUCGGAG 14 usGfsgaacCfggggUfaAfcAfgucggsasg 168 P-000036 CCGACUGUUACCCCGGUUCCA 322 cscsgacuGfuUfaCfcccgguucca 476 407
SRS-000037 G-000033 UUGGAACCGGGGUAACAGUCGGA 15 usUfsggaaCfcgggGfuAfaCfagucgsgsa 169 P-000037 CGACUGUUACCCCGGUUCCAA 323 csgsacugUfuAfcCfccgguuccaa 477 408
SRS-000038 G-000034 UGCUUGGAACCGGGGUAACAGUC 16 usGfscuugGfaaccGfgGfgUfaacagsusc 170 P-000038 CUGUUACCCCGGUUCCAAGCA 324 csusguuaCfcCfcGfguuccaagca 478 411
SRS-000039 G-000035 UGGCUUGGAACCGGGGUAACAGU 17 usGfsgcuuGfgaacCfgGfgGfuaacasgsu 171 P-000039 UGUUACCCCGGUUCCAAGCCA 325 usgsuuacCfcCfgGfuuccaagcca 479 412
SRS-000040 G-000012 UUCUAGGCUUGGAACCGGGGUAA 18 usUfscuagGfcuugGfaAfcCfggggusasa 172 P-000040 ACCCCGGUUCCAAGCCUAGAA 326 ascscccgGfuUfcCfaagccuagaa 480 416
SRS-000041 G-000036 UCUCUAGGCUUGGAACCGGGGUA 19 usCfsucuaGfgcuuGfgAfaCfcggggsusa 173 P-000041 CCCCGGUUCCAAGCCUAGAGA 327 cscsccggUfuCfcAfagccuagaga 481 417
SRS-000042 G-000037 UGCCUCUAGGCUUGGAACCGGGG 20 usGfsccucUfaggcUfuGfgAfaccggsgsg 174 P-000042 CCGGUUCCAAGCCUAGAGGCA 328 cscsgguuCfcAfaGfccuagaggca 482 419
SRS-000043 G-000013 UAGCCUCUAGGCUUGGAACCGGG 21 usAfsgccuCfuaggCfuUfgGfaaccgsgsg 175 P-000043 CGGUUCCAAGCCUAGAGGCUA 329 csgsguucCfaAfgCfcuagaggcua 483 420
SRS-000044 G-000038 UGAGCCUCUAGGCUUGGAACCGG 22 usGfsagccUfcuagGfcUfuGfgaaccsgsg 176 P-000044 GGUUCCAAGCCUAGAGGCUCA 330 gsgsuuccAfaGfcCfuagaggcuca 484 421
SRS-000045 G-000039 UGAAGGAGCCUCUAGGCUUGGAA 23 usGfsaaggAfgccuCfuAfgGfcuuggsasa 177 P-000045 CCAAGCCUAGAGGCUCCUUCA 331 cscsaagcCfuAfgAfggcuccuuca 485 425
SRS-000046 G-000040 UCGGAAGGAGCCUCUAGGCUUGG 24 usCfsggaaGfgagcCfuCfuAfggcuusgsg 178 P-000046 AAGCCUAGAGGCUCCUUCCGA 332 asasgccuAfgAfgGfcuccuuccga 486 427
SRS-000047 G-000041 UGUUCGGAAGGAGCCUCUAGGCU 25 usGfsuucgGfaaggAfgCfcUfcuaggscsu 179 P-000047 CCUAGAGGCUCCUUCCGAACA 333 cscsuagaGfgCfuCfcuuccgaaca 487 430
SRS-000048 G-000042 UUGCUUGUUCGGAAGGAGCCUCU 26 usUfsgcuuGfuucgGfaAfgGfagccuscsu 180 P-000048 AGGCUCCUUCCGAACAAGCAA 334 asgsgcucCfuUfcCfgaacaagcaa 488 435
SRS-000049 G-000043 UGUGCUUGUUCGGAAGGAGCCUC 27 usGfsugcuUfguucGfgAfaGfgagccsusc 181 P-000049 GGCUCCUUCCGAACAAGCACA 335 gsgscuccUfuCfcGfaacaagcaca 489 436
SRS-000050 G-000044 UCGGUGCUUGUUCGGAAGGAGCC 28 usCfsggugCfuuguUfcGfgAfaggagscsc 182 P-000050 CUCCUUCCGAACAAGCACCGA 336 csusccuuCfcGfaAfcaagcaccga 490 438
SRS-000051 G-000045 UUCGGUGCUUGUUCGGAAGGAGC 29 usUfscgguGfcuugUfuCfgGfaaggasgsc 183 P-000051 UCCUUCCGAACAAGCACCGAA 337 uscscuucCfgAfaCfaagcaccgaa 491 439
SRS-000052 G-000046 UCAGUCGGUGCUUGUUCGGAAGG 30 usCfsagucGfgugcUfuGfuUfcggaasgsg 184 P-000052 UUCCGAACAAGCACCGACUGA 338 ususccgaAfcAfaGfcaccgacuga 492 442
SRS-000053 G-000047 UUGCUCAGUCGGUGCUUGUUCGG 31 usUfsgcucAfgucgGfuGfcUfuguucsgsg 185 P-000053 GAACAAGCACCGACUGAGCAA 339 gsasacaaGfcAfcCfgacugagcaa 493 446
SRS-000054 G-000048 UUAGCACUCCUGCACCCCAGGCC 32 usUfsagcaCfuccuGfcAfcCfccaggscsc 186 P-000054 CCUGGGGUGCAGGAGUGCUAA 340 cscsugggGfuGfcAfggagugcuaa 494 470
SRS-000055 G-000049 UGUAGCACUCCUGCACCCCAGGC 33 usGfsuagcAfcuccUfgCfaCfcccagsgsc 187 P-000055 CUGGGGUGCAGGAGUGCUACA 341 csusggggUfgCfaGfgagugcuaca 495 471
SRS-000056 G-000050 UGAUAACUCUGUCCAUUACCAUG 34 usGfsauaaCfucugUfcCfaUfuaccasusg 188 P-000056 UGGUAAUGGACAGAGUUAUCA 342 usgsguaaUfgGfaCfagaguuauca 496 493
SRS-000057 G-000051 UCGAUAACUCUGUCCAUUACCAU 35 usCfsgauaAfcucuGfuCfcAfuuaccsasu 189 P-000057 GGUAAUGGACAGAGUUAUCGA 343 gsgsuaauGfgAfcAfgaguuaucga 497 494
SRS-000058 G-000052 UUAUGUGCCUCGAUAACUCUGUC 36 usUfsauguGfccucGfaUfaAfcucugsusc 190 P-000058 CAGAGUUAUCGAGGCACAUAA 344 csasgaguUfaUfcGfaggcacauaa 498 503
SRS-000059 G-000053 UGUAUGUGCCUCGAUAACUCUGU 37 usGfsuaugUfgccuCfgAfuAfacucusgsu 191 P-000059 AGAGUUAUCGAGGCACAUACA 345 asgsaguuAfuCfgAfggcacauaca 499 504
SRS-000060 G-000054 UAGUAUGUGCCUCGAUAACUCUG 38 usAfsguauGfugccUfcGfaUfaacucsusg 192 P-000060 GAGUUAUCGAGGCACAUACUA 346 gsasguuaUfcGfaGfgcacauacua 500 505
SRS-000061 G-000055 UACAGUGGUGGAGUAUGUGCCUC 39 usAfscaguGfguggAfgUfaUfgugccsusc 193 P-000061 GGCACAUACUCCACCACUGUA 347 gsgscacaUfaCfuCfcaccacugua 501 515
SRS-000062 G-000056 UACCAAGCUUGGCAGGUUCUUCC 40 usAfsccaaGfcuugGfcAfgGfuucuuscsc 194 P-000062 AAGAACCUGCCAAGCUUGGUA 348 asasgaacCfuGfcCfaagcuuggua 502 541
SRS-000063 G-000057 UAUGACCAAGCUUGGCAGGUUCU 41 usAfsugacCfaagcUfuGfgCfagguuscsu 195 P-000063 AACCUGCCAAGCUUGGUCAUA 349 asasccugCfcAfaGfcuuggucaua 503 544
SRS-000064 G-000058 UAGAUGACCAAGCUUGGCAGGUU 42 usAfsgaugAfccaaGfcUfuGfgcaggsusu 196 P-000064 CCUGCCAAGCUUGGUCAUCUA 350 cscsugccAfaGfcUfuggucaucua 504 546
SRS-000065 G-000059 UUACCGUGGUAGCACUCCUGCAC 43 usUfsaccgUfgguaGfcAfcUfccugcsasc 197 P-000065 GCAGGAGUGCUACCACGGUAA 351 gscsaggaGfuGfcUfaccacgguaa 505 1162
SRS-000066 G-000014 UUUACCGUGGUAGCACUCCUGCA 44 usUfsuaccGfugguAfgCfaCfuccugscsa 198 P-000066 CAGGAGUGCUACCACGGUAAA 352 csasggagUfgCfuAfccacgguaaa 506 1163
SRS-000067 G-000060 UCAUUACCGUGGUAGCACUCCUG 45 usCfsauuaCfcgugGfuAfgCfacuccsusg 199 P-000067 GGAGUGCUACCACGGUAAUGA 353 gsgsagugCfuAfcCfacgguaauga 507 1165
SRS-000068 G-000061 UGUCCAUUACCGUGGUAGCACUC 46 usGfsuccaUfuaccGfuGfgUfagcacsusc 200 P-000068 GUGCUACCACGGUAAUGGACA 354 gsusgcuaCfcAfcGfguaauggaca 508 1168
SRS-000069 G-000015 UUGUCCAUUACCGUGGUAGCACU 47 usUfsguccAfuuacCfgUfgGfuagcascsu 201 P-000069 UGCUACCACGGUAAUGGACAA 355 usgscuacCfaCfgGfuaauggacaa 509 1169
SRS-000070 G-000062 UUCUGUCCAUUACCGUGGUAGCA 48 usUfscuguCfcauuAfcCfgUfgguagscsa 202 P-000070 CUACCACGGUAAUGGACAGAA 356 csusaccaCfgGfuAfauggacagaa 510 1171
SRS-000071 G-000016 UCUCUGUCCAUUACCGUGGUAGC 49 usCfsucugUfccauUfaCfcGfugguasgsc 203 P-000071 UACCACGGUAAUGGACAGAGA 357 usasccacGfgUfaAfuggacagaga 511 1172
SRS-000072 G-000063 UAACUCUGUCCAUUACCGUGGUA 50 usAfsacucUfguccAfuUfaCfcguggsusa 204 P-000072 CCACGGUAAUGGACAGAGUUA 358 cscsacggUfaAfuGfgacagaguua 512 1174
SRS-000073 G-000064 UGAUAACUCUGUCCAUUACCGUG 51 usGfsauaaCfucugUfcCfaUfuaccgsusg 205 P-000073 CGGUAAUGGACAGAGUUAUCA 359 csgsguaaUfgGfaCfagaguuauca 513 1177
SRS-000074 G-000065 UCGAUAACUCUGUCCAUUACCGU 52 usCfsgauaAfcucuGfuCfcAfuuaccsgsu 206 P-000074 GGUAAUGGACAGAGUUAUCGA 360 gsgsuaauGfgAfcAfgaguuaucga 514 1178
SRS-000075 G-000066 UACAGGAUCUGGAUUCCUGCAGU 53 usAfscaggAfucugGfaUfuCfcugcasgsu 207 P-000075 UGCAGGAAUCCAGAUCCUGUA 361 usgscaggAfaUfcCfagauccugua 515 2684
SRS-000076 G-000067 UAAUAAGGGGCUGCCACAGGAUC 54 usAfsauaaGfgggcUfgCfcAfcaggasusc 208 P-000076 UCCUGUGGCAGCCCCUUAUUA 362 uscscuguGfgCfaGfccccuuauua 516 2698
SRS-000077 G-000068 UAACAAUAAGGGGCUGCCACAGG 55 usAfsacaaUfaaggGfgCfuGfccacasgsg 209 P-000077 UGUGGCAGCCCCUUAUUGUUA 363 usgsuggcAfgCfcCfcuuauuguua 517 2701
SRS-000078 G-000069 UGUAUAACAAUAAGGGGCUGCCA 56 usGfsuauaAfcaauAfaGfgGfgcugcscsa 210 P-000078 GCAGCCCCUUAUUGUUAUACA 364 gscsagccCfcUfuAfuuguuauaca 518 2705
SRS-000079 G-000070 UCGUAUAACAAUAAGGGGCUGCC 57 usCfsguauAfacaaUfaAfgGfggcugscsc 211 P-000079 CAGCCCCUUAUUGUUAUACGA 365 csasgcccCfuUfaUfuguuauacga 519 2706
SRS-000080 G-000071 UUCGUAUAACAAUAAGGGGCUGC 58 usUfscguaUfaacaAfuAfaGfgggcusgsc 212 P-000080 AGCCCCUUAUUGUUAUACGAA 366 asgsccccUfuAfuUfguuauacgaa 520 2707
SRS-000081 G-000072 UUGUGUCAGGUUGCAGUACUCCC 59 usUfsguguCfagguUfgCfaGfuacucscsc 213 P-000081 GAGUACUGCAACCUGACACAA 367 gsasguacUfgCfaAfccugacacaa 521 2747
SRS-000082 G-000017 UAUUGUGUCAGGUUGCAGUACUC 60 usAfsuuguGfucagGfuUfgCfaguacsusc 214 P-000082 GUACUGCAACCUGACACAAUA 368 gsusacugCfaAfcCfugacacaaua 522 2749
SRS-000083 G-000073 UGCAUUGUGUCAGGUUGCAGUAC 61 usGfscauuGfugucAfgGfuUfgcagusasc 215 P-000083 ACUGCAACCUGACACAAUGCA 369 ascsugcaAfcCfuGfacacaaugca 523 2751
SRS-000084 G-000074 UGAGCAUUGUGUCAGGUUGCAGU 62 usGfsagcaUfugugUfcAfgGfuugcasgsu 216 P-000084 UGCAACCUGACACAAUGCUCA 370 usgscaacCfuGfaCfacaaugcuca 524 2753
SRS-000085 G-000075 UUGAGCAUUGUGUCAGGUUGCAG 63 usUfsgagcAfuuguGfuCfaGfguugcsasg 217 P-000085 GCAACCUGACACAAUGCUCAA 371 gscsaaccUfgAfcAfcaaugcucaa 525 2754
SRS-000086 G-000018 UUGCGUCUGAGCAUUGUGUCAGG 64 usUfsgcguCfugagCfaUfuGfugucasgsg 218 P-000086 UGACACAAUGCUCAGACGCAA 372 usgsacacAfaUfgCfucagacgcaa 526 2760
SRS-000087 G-000076 UUCUGCGUCUGAGCAUUGUGUCA 65 usUfscugcGfucugAfgCfaUfuguguscsa 219 P-000087 ACACAAUGCUCAGACGCAGAA 373 ascsacaaUfgCfuCfagacgcagaa 527 2762
SRS-000088 G-000077 UCUUCUGCGUCUGAGCAUUGUGU 66 usCfsuucuGfcgucUfgAfgCfauugusgsu 220 P-000088 ACAAUGCUCAGACGCAGAAGA 374 ascsaaugCfuCfaGfacgcagaaga 528 2764
SRS-000089 G-000078 UGAGCCUCUAGGCUUGGAAUCGG 67 usGfsagccUfcuagGfcUfuGfgaaucsgsg 221 P-000089 GAUUCCAAGCCUAGAGGCUCA 375 gsasuuccAfaGfcCfuagaggcuca 529 2815
SRS-000090 G-000079 UUUCAGAAGGAGCCUCUAGGCUU 68 usUfsucagAfaggaGfcCfuCfuaggcsusu 222 P-000090 GCCUAGAGGCUCCUUCUGAAA 376 gscscuagAfgGfcUfccuucugaaa 530 2823
SRS-000091 G-000080 UUUGCUCAGUUGGUGCUUGUUCA 69 usUfsugcuCfaguuGfgUfgCfuuguuscsa 223 P-000091 AACAAGCACCAACUGAGCAAA 377 asascaagCfaCfcAfacugagcaaa 531 2841
SRS-000092 G-000081 UCUUUGCUCAGUUGGUGCUUGUU 70 usCfsuuugCfucagUfuGfgUfgcuugsusu 224 P-000092 CAAGCACCAACUGAGCAAAGA 378 csasagcaCfcAfaCfugagcaaaga 532 2843
SRS-000093 G-000082 UGUGCCUUGAUAACUCUGUCCAU 71 usGfsugccUfugauAfaCfuCfuguccsasu 225 P-000093 GGACAGAGUUAUCAAGGCACA 379 gsgsacagAfgUfuAfucaaggcaca 533 2894
SRS-000094 G-000083 UGGAUCUGGAUUUCGGCAGUAGU 72 usGfsgaucUfggauUfuCfgGfcaguasgsu 226 P-000094 UACUGCCGAAAUCCAGAUCCA 380 usascugcCfgAfaAfuccagaucca 534 3023
SRS-000095 G-000084 UUAACACCAAGGGGCUGCCACAG 73 usUfsaacaCfcaagGfgGfcUfgccacsasg 227 P-000095 GUGGCAGCCCCUUGGUGUUAA 381 gsusggcaGfcCfcCfuugguguuaa 535 3044
SRS-000096 G-000085 UGUAUAACACCAAGGGGCUGCCA 74 usGfsuauaAfcaccAfaGfgGfgcugcscsa 228 P-000096 GCAGCCCCUUGGUGUUAUACA 382 gscsagccCfcUfuGfguguuauaca 536 3047
SRS-000097 G-000086 UUUGUAUAACACCAAGGGGCUGC 75 usUfsuguaUfaacaCfcAfaGfgggcusgsc 229 P-000097 AGCCCCUUGGUGUUAUACAAA 383 asgsccccUfuGfgUfguuauacaaa 537 3049
SRS-000098 G-000087 UGUUGUAUAACACCAAGGGGCUG 76 usGfsuuguAfuaacAfcCfaAfggggcsusg 230 P-000098 GCCCCUUGGUGUUAUACAACA 384 gscscccuUfgGfuGfuuauacaaca 538 3050
SRS-000099 G-000088 UUCGUGUCAGGUUGCAGUACUCC 77 usUfscgugUfcaggUfuGfcAfguacuscsc 231 P-000099 AGUACUGCAACCUGACACGAA 385 asgsuacuGfcAfaCfcugacacgaa 539 3090
SRS-000100 G-000089 UAGCAUCGUGUCAGGUUGCAGUA 78 usAfsgcauCfguguCfaGfgUfugcagsusa 232 P-000100 CUGCAACCUGACACGAUGCUA 386 csusgcaaCfcUfgAfcacgaugcua 540 3094
SRS-000101 G-000090 UGAGCAUCGUGUCAGGUUGCAGU 79 usGfsagcaUfcgugUfcAfgGfuugcasgsu 233 P-000101 UGCAACCUGACACGAUGCUCA 387 usgscaacCfuGfaCfacgaugcuca 541 3095
SRS-000102 G-000091 UUGAGCAUCGUGUCAGGUUGCAG 80 usUfsgagcAfucguGfuCfaGfguugcsasg 234 P-000102 GCAACCUGACACGAUGCUCAA 388 gscsaaccUfgAfcAfcgaugcucaa 542 3096
SRS-000103 G-000092 UUCUGAGCAUCGUGUCAGGUUGC 81 usUfscugaGfcaucGfuGfuCfagguusgsc 235 P-000103 AACCUGACACGAUGCUCAGAA 389 asasccugAfcAfcGfaugcucagaa 543 3098
SRS-000104 G-000093 UAAAGCCUCUAGGCUUGGAGCCA 82 usAfsaagcCfucuaGfgCfuUfggagcscsa 236 P-000104 GCUCCAAGCCUAGAGGCUUUA 390 gscsuccaAfgCfcUfagaggcuuua 544 3158
SRS-000105 G-000094 UCCAUAAUGGUAGUAGCAGUCCU 83 usCfscauaAfugguAfgUfaGfcagucscsu 237 P-000105 GACUGCUACUACCAUUAUGGA 391 gsascugcUfaCfuAfccauuaugga 545 3218
SRS-000106 G-000095 UUCCAUAAUGGUAGUAGCAGUCC 84 usUfsccauAfauggUfaGfuAfgcaguscsc 238 P-000106 ACUGCUACUACCAUUAUGGAA 392 ascsugcuAfcUfaCfcauuauggaa 546 3219
SRS-000107 G-000096 UGUCCAUAAUGGUAGUAGCAGUC 85 usGfsuccaUfaaugGfuAfgUfagcagsusc 239 P-000107 CUGCUACUACCAUUAUGGACA 393 csusgcuaCfuAfcCfauuauggaca 547 3220
SRS-000108 G-000097 UUCUGUCCAUAAUGGUAGUAGCA 86 usUfscuguCfcauaAfuGfgUfaguagscsa 240 P-000108 CUACUACCAUUAUGGACAGAA 394 csusacuaCfcAfuUfauggacagaa 548 3223
SRS-000109 G-000098 UAACUCUGUCCAUAAUGGUAGUA 87 usAfsacucUfguccAfuAfaUfgguagsusa 241 P-000109 CUACCAUUAUGGACAGAGUUA 395 csusaccaUfuAfuGfgacagaguua 549 3226
SRS-000110 G-000019 UUAACUCUGUCCAUAAUGGUAGU 88 usUfsaacuCfugucCfaUfaAfugguasgsu 242 P-000110 UACCAUUAUGGACAGAGUUAA 396 usasccauUfaUfgGfacagaguuaa 550 3227
SRS-000111 G-000020 UCCAAGCUUGGCAAGUUCUUCCU 89 usCfscaagCfuuggCfaAfgUfucuucscsu 243 P-000111 GAAGAACUUGCCAAGCUUGGA 397 gsasagaaCfuUfgCfcaagcuugga 551 3276
SRS-000112 G-000021 UAGAUGACCAAGCUUGGCAAGUU 90 usAfsgaugAfccaaGfcUfuGfgcaagsusu 244 P-000112 CUUGCCAAGCUUGGUCAUCUA 398 csusugccAfaGfcUfuggucaucua 552 3282
SRS-000113 G-000099 UAUAGAUGACCAAGCUUGGCAAG 91 usAfsuagaUfgaccAfaGfcUfuggcasasg 245 P-000113 UGCCAAGCUUGGUCAUCUAUA 399 usgsccaaGfcUfuGfgucaucuaua 553 3284
SRS-000114 G-000100 UCAUAGAUGACCAAGCUUGGCAA 92 usCfsauagAfugacCfaAfgCfuuggcsasa 246 P-000114 GCCAAGCUUGGUCAUCUAUGA 400 gscscaagCfuUfgGfucaucuauga 554 3285
SRS-000115 G-000101 UACUAUGCUGGUGUGGUGUCAUA 93 usAfscuauGfcuggUfgUfgGfugucasusa 247 P-000115 UGACACCACACCAGCAUAGUA 401 usgsacacCfaCfaCfcagcauagua 555 3303
SRS-000116 G-000102 UGACUAUGCUGGUGUGGUGUCAU 94 usGfsacuaUfgcugGfuGfuGfgugucsasu 248 P-000116 GACACCACACCAGCAUAGUCA 402 gsascaccAfcAfcCfagcauaguca 556 3304
SRS-000117 G-000103 UCGACUAUGCUGGUGUGGUGUCA 95 usCfsgacuAfugcuGfgUfgUfgguguscsa 249 P-000117 ACACCACACCAGCAUAGUCGA 403 ascsaccaCfaCfcAfgcauagucga 557 3305
SRS-000118 G-000104 UUCCGACUAUGCUGGUGUGGUGU 96 usUfsccgaCfuaugCfuGfgUfguggusgsu 250 P-000118 ACCACACCAGCAUAGUCGGAA 404 ascscacaCfcAfgCfauagucggaa 558 3307
SRS-000119 G-000105 UGUCCGACUAUGCUGGUGUGGUG 97 usGfsuccgAfcuauGfcUfgGfuguggsusg 251 P-000119 CCACACCAGCAUAGUCGGACA 405 cscsacacCfaGfcAfuagucggaca 559 3308
SRS-000120 G-000022 UGGUCCGACUAUGCUGGUGUGGU 98 usGfsguccGfacuaUfgCfuGfgugugsgsu 252 P-000120 CACACCAGCAUAGUCGGACCA 406 csascaccAfgCfaUfagucggacca 560 3309
SRS-000121 G-000106 UUUUCUGGGGUCCGACUAUGCUG 99 usUfsuucuGfggguCfcGfaCfuaugcsusg 253 P-000121 GCAUAGUCGGACCCCAGAAAA 407 gscsauagUfcGfgAfccccagaaaa 561 3316
SRS-000122 G-000107 UUUUUCUGGGGUCCGACUAUGCU 100 usUfsuuucUfggggUfcCfgAfcuaugscsu 254 P-000122 CAUAGUCGGACCCCAGAAAAA 408 csasuaguCfgGfaCfcccagaaaaa 562 3317
SRS-000123 G-000108 UUAGUUUUCUGGGGUCCGACUAU 101 usUfsaguuUfucugGfgGfuCfcgacusasu 255 P-000123 AGUCGGACCCCAGAAAACUAA 409 asgsucggAfcCfcCfagaaaacuaa 563 3320
SRS-000124 G-000109 UAUCCAUGGUGUAACACCAAGGG 102 usAfsuccaUfggugUfaAfcAfccaagsgsg 256 P-000124 CUUGGUGUUACACCAUGGAUA 410 csusugguGfuUfaCfaccauggaua 564 3396
SRS-000125 G-000110 UGAUCCAUGGUGUAACACCAAGG 103 usGfsauccAfugguGfuAfaCfaccaasgsg 257 P-000125 UUGGUGUUACACCAUGGAUCA 411 ususggugUfuAfcAfccauggauca 565 3397
SRS-000126 G-000111 UGGAUCCAUGGUGUAACACCAAG 104 usGfsgaucCfauggUfgUfaAfcaccasasg 258 P-000126 UGGUGUUACACCAUGGAUCCA 412 usgsguguUfaCfaCfcauggaucca 566 3398
SRS-000127 G-000112 UGGGAUCCAUGGUGUAACACCAA 105 usGfsggauCfcaugGfuGfuAfacaccsasa 259 P-000127 GGUGUUACACCAUGGAUCCCA 413 gsgsuguuAfcAfcCfauggauccca 567 3399
SRS-000128 G-000113 UUGACACUGGGAUCCAUGGUGUA 106 usUfsgacaCfugggAfuCfcAfuggugsusa 260 P-000128 CACCAUGGAUCCCAGUGUCAA 414 csasccauGfgAfuCfccagugucaa 568 3406
SRS-000129 G-000114 UCUGACACUGGGAUCCAUGGUGU 107 usCfsugacAfcuggGfaUfcCfauggusgsu 261 P-000129 ACCAUGGAUCCCAGUGUCAGA 415 ascscaugGfaUfcCfcagugucaga 569 3407
SRS-000130 G-000115 UGUUGCAAGGACACUUGAUUCUG 108 usGfsuugcAfaggaCfaCfuUfgauucsusg 262 P-000130 GAAUCAAGUGUCCUUGCAACA 416 gsasaucaAfgUfgUfccuugcaaca 570 3464
SRS-000131 G-000116 UCAUGGUAUAACACCAAGGACUA 109 usCfsauggUfauaaCfaCfcAfaggacsusa 263 P-000131 GUCCUUGGUGUUAUACCAUGA 417 gsusccuuGfgUfgUfuauaccauga 571 3735
SRS-000132 G-000117 UUCCAUGGUAUAACACCAAGGAC 110 usUfsccauGfguauAfaCfaCfcaaggsasc 264 P-000132 CCUUGGUGUUAUACCAUGGAA 418 cscsuuggUfgUfuAfuaccauggaa 572 3737
SRS-000133 G-000118 UAUCCAUGGUAUAACACCAAGGA 111 usAfsuccaUfgguaUfaAfcAfccaagsgsa 265 P-000133 CUUGGUGUUAUACCAUGGAUA 419 csusugguGfuUfaUfaccauggaua 573 3738
SRS-000134 G-000119 UGGGAUCCAUGGUAUAACACCAA 112 usGfsggauCfcaugGfuAfuAfacaccsasa 266 P-000134 GGUGUUAUACCAUGGAUCCCA 420 gsgsuguuAfuAfcCfauggauccca 574 3741
SRS-000135 G-000120 UGACAUUGUGUCAGGUUGCAGUA 113 usGfsacauUfguguCfaGfgUfugcagsusa 267 P-000135 CUGCAACCUGACACAAUGUCA 421 csusgcaaCfcUfgAfcacaauguca 575 3778
SRS-000136 G-000121 UGGACAUUGUGUCAGGUUGCAGU 114 usGfsgacaUfugugUfcAfgGfuugcasgsu 268 P-000136 UGCAACCUGACACAAUGUCCA 422 usgscaacCfuGfaCfacaaugucca 576 3779
SRS-000137 G-000122 UUGGACAUUGUGUCAGGUUGCAG 115 usUfsggacAfuuguGfuCfaGfguugcsasg 269 P-000137 GCAACCUGACACAAUGUCCAA 423 gscsaaccUfgAfcAfcaauguccaa 577 3780
SRS-000138 G-000123 UCACUGGACAUUGUGUCAGGUUG 116 usCfsacugGfacauUfgUfgUfcaggususg 270 P-000138 ACCUGACACAAUGUCCAGUGA 424 ascscugaCfaCfaAfuguccaguga 578 3783
SRS-000139 G-000124 UAUUCUGUCACUGGACAUUGUGU 117 usAfsuucuGfucacUfgGfaCfauugusgsu 271 P-000139 ACAAUGUCCAGUGACAGAAUA 425 ascsaaugUfcCfaGfugacagaaua 579 3790
SRS-000140 G-000125 UCACCAUUUGGGUAGUAUUCUGU 118 usCfsaccaUfuuggGfuAfgUfauucusgsu 272 P-000140 AGAAUACUACCCAAAUGGUGA 426 asgsaauaCfuAfcCfcaaaugguga 580 3991
SRS-000141 G-000126 UGUAUAACACCAAGGGCGAAUCU 119 usGfsuauaAfcaccAfaGfgGfcgaauscsu 273 P-000141 AUUCGCCCUUGGUGUUAUACA 427 asusucgcCfcUfuGfguguuauaca 581 4049
SRS-000142 G-000127 UCAUGGUAUAACACCAAGGGCGA 120 usCfsauggUfauaaCfaCfcAfagggcsgsa 274 P-000142 GCCCUUGGUGUUAUACCAUGA 428 gscsccuuGfgUfgUfuauaccauga 582 4053
SRS-000143 G-000128 UUCCAUGGUAUAACACCAAGGGC 121 usUfsccauGfguauAfaCfaCfcaaggsgsc 275 P-000143 CCUUGGUGUUAUACCAUGGAA 429 cscsuuggUfgUfuAfuaccauggaa 583 4055
SRS-000144 G-000129 UAUCCAUGGUAUAACACCAAGGG 122 usAfsuccaUfgguaUfaAfcAfccaagsgsg 276 P-000144 CUUGGUGUUAUACCAUGGAUA 430 csusugguGfuUfaUfaccauggaua 584 4056
SRS-000145 G-000130 UUGACACUGGGAUCCAUGGUAUA 123 usUfsgacaCfugggAfuCfcAfugguasusa 277 P-000145 UACCAUGGAUCCCAGUGUCAA 431 usasccauGfgAfuCfccagugucaa 585 4066
SRS-000146 G-000131 UCUGACACUGGGAUCCAUGGUAU 124 usCfsugacAfcuggGfaUfcCfauggusasu 278 P-000146 ACCAUGGAUCCCAGUGUCAGA 432 ascscaugGfaUfcCfcagugucaga 586 4067
SRS-000147 G-000132 UGGACCACCGUGGGAGUUGUGAG 125 usGfsgaccAfccguGfgGfaGfuugugsasg 279 P-000147 CACAACUCCCACGGUGGUCCA 433 csascaacUfcCfcAfcgguggucca 587 4138
SRS-000148 G-000133 UGGGACCACCGUGGGAGUUGUGA 126 usGfsggacCfaccgUfgGfgAfguugusgsa 280 P-000148 ACAACUCCCACGGUGGUCCCA 434 ascsaacuCfcCfaCfggugguccca 588 4139
SRS-000149 G-000134 UUGCUUGGAACUGGGACCACCGU 127 usUfsgcuuGfgaacUfgGfgAfccaccsgsu 281 P-000149 GGUGGUCCCAGUUCCAAGCAA 435 gsgsugguCfcCfaGfuuccaagcaa 589 4150
SRS-000150 G-000135 UAUUCUGUCACUGGACAUCGUGU 128 usAfsuucuGfucacUfgGfaCfaucgusgsu 282 P-000150 ACGAUGUCCAGUGACAGAAUA 436 ascsgaugUfcCfaGfugacagaaua 590 4450
SRS-000151 G-000136 UGAUGCCAGUGUGGUAUCAUAGA 129 usGfsaugcCfagugUfgGfuAfucauasgsa 283 P-000151 UAUGAUACCACACUGGCAUCA 437 usasugauAfcCfaCfacuggcauca 591 4645
SRS-000152 G-000137 UUGAUGCCAGUGUGGUAUCAUAG 130 usUfsgaugCfcaguGfuGfgUfaucausasg 284 P-000152 AUGAUACCACACUGGCAUCAA 438 asusgauaCfcAfcAfcuggcaucaa 592 4646
SRS-000153 G-000138 UGUGUAACACCAGGGUUGUUUCC 131 usGfsuguaAfcaccAfgGfgUfuguuuscsc 285 P-000153 AAACAACCCUGGUGUUACACA 439 asasacaaCfcCfuGfguguuacaca 593 4733
SRS-000154 G-000139 UAGGACACCUGAUUCUGUUUCUG 132 usAfsggacAfccugAfuUfcUfguuucsusg 286 P-000154 GAAACAGAAUCAGGUGUCCUA 440 gsasaacaGfaAfuCfagguguccua 594 4802
SRS-000155 G-000140 UUAGGACACCUGAUUCUGUUUCU 133 usUfsaggaCfaccuGfaUfuCfuguuuscsu 287 P-000155 AAACAGAAUCAGGUGUCCUAA 441 asasacagAfaUfcAfgguguccuaa 595 4803
SRS-000156 G-000141 UUCUAGGACACCUGAUUCUGUUU 134 usUfscuagGfacacCfuGfaUfucugususu 288 P-000156 ACAGAAUCAGGUGUCCUAGAA 442 ascsagaaUfcAfgGfuguccuagaa 596 4805
SRS-000157 G-000142 UCUCUAGGACACCUGAUUCUGUU 135 usCfsucuaGfgacaCfcUfgAfuucugsusu 289 P-000157 CAGAAUCAGGUGUCCUAGAGA 443 csasgaauCfaGfgUfguccuagaga 597 4806
SRS-000158 G-000143 UGUCUCUAGGACACCUGAUUCUG 136 usGfsucucUfaggaCfaCfcUfgauucsusg 290 P-000158 GAAUCAGGUGUCCUAGAGACA 444 gsasaucaGfgUfgUfccuagagaca 598 4808
SRS-000159 G-000144 UGGGAGUCUCUAGGACACCUGAU 137 usGfsggagUfcucuAfgGfaCfaccugsasu 291 P-000159 CAGGUGUCCUAGAGACUCCCA 445 csasggugUfcCfuAfgagacuccca 599 4812
SRS-000160 G-000145 UGGAACAACAGUGGGAGUCUCUA 138 usGfsgaacAfacagUfgGfgAfgucucsusa 292 P-000160 GAGACUCCCACUGUUGUUCCA 446 gsasgacuCfcCfaCfuguuguucca 600 4823
SRS-000161 G-000146 UGAAUGUGCCUCGAUAACUCUGG 139 usGfsaaugUfgccuCfgAfuAfacucusgsg 293 P-000161 AGAGUUAUCGAGGCACAUUCA 447 asgsaguuAfuCfgAfggcacauuca 601 4926
SRS-000162 G-000147 UUGGAUGACCAAGAUUGACAUGU 140 usUfsggauGfaccaAfgAfuUfgacausgsu 294 P-000162 AUGUCAAUCUUGGUCAUCCAA 448 asusgucaAfuCfuUfggucauccaa 602 4969
SRS-000163 G-000148 UAUGGAUGACCAAGAUUGACAUG 141 usAfsuggaUfgaccAfaGfaUfugacasusg 295 P-000163 UGUCAAUCUUGGUCAUCCAUA 449 usgsucaaUfcUfuGfgucauccaua 603 4970
SRS-000164 G-000149 UAAAACACCAAGGGCCUGUAUCG 142 usAfsaaacAfccaaGfgGfcCfuguauscsg 296 P-000164 AUACAGGCCCUUGGUGUUUUA 450 asusacagGfcCfcUfugguguuuua 604 5073
SRS-000165 G-000150 UGCAUCGCGUCAGGUUGCAGUAC 143 usGfscaucGfcgucAfgGfuUfgcagusasc 297 P-000165 ACUGCAACCUGACGCGAUGCA 451 ascsugcaAfcCfuGfacgcgaugca 605 5121
SRS-000166 G-000151 UAGCAUCGCGUCAGGUUGCAGUA 144 usAfsgcauCfgcguCfaGfgUfugcagsusa 298 P-000166 CUGCAACCUGACGCGAUGCUA 452 csusgcaaCfcUfgAfcgcgaugcua 606 5122
SRS-000167 G-000152 UGAGCAUCGCGUCAGGUUGCAGU 145 usGfsagcaUfcgcgUfcAfgGfuugcasgsu 299 P-000167 UGCAACCUGACGCGAUGCUCA 453 usgscaacCfuGfaCfgcgaugcuca 607 5123
SRS-000168 G-000153 UUGAGCAUCGCGUCAGGUUGCAG 146 usUfsgagcAfucgcGfuCfaGfguugcsasg 300 P-000168 GCAACCUGACGCGAUGCUCAA 454 gscsaaccUfgAfcGfcgaugcucaa 608 5124
SRS-000169 G-000154 UUCUGAGCAUCGCGUCAGGUUGC 147 usUfscugaGfcaucGfcGfuCfagguusgsc 301 P-000169 AACCUGACGCGAUGCUCAGAA 455 asasccugAfcGfcGfaugcucagaa 609 5126
SRS-000170 G-000155 UGUCUGAGCAUCGCGUCAGGUUG 148 usGfsucugAfgcauCfgCfgUfcaggususg 302 P-000170 ACCUGACGCGAUGCUCAGACA 456 ascscugaCfgCfgAfugcucagaca 610 5127
SRS-000171 G-000156 UUGUCUGAGCAUCGCGUCAGGUU 149 usUfsgucuGfagcaUfcGfcGfucaggsusu 303 P-000171 CCUGACGCGAUGCUCAGACAA 457 cscsugacGfcGfaUfgcucagacaa 611 5128
SRS-000172 G-000157 UGUGUCUGAGCAUCGCGUCAGGU 150 usGfsugucUfgagcAfuCfgCfgucagsgsu 304 P-000172 CUGACGCGAUGCUCAGACACA 458 csusgacgCfgAfuGfcucagacaca 612 5129
SRS-000173 G-000158 UUGUGUCUGAGCAUCGCGUCAGG 151 usUfsguguCfugagCfaUfcGfcgucasgsg 305 P-000173 UGACGCGAUGCUCAGACACAA 459 usgsacgcGfaUfgCfucagacacaa 613 5130
SRS-000174 G-000159 UUCUGUGUCUGAGCAUCGCGUCA 152 usUfscuguGfucugAfgCfaUfcgcguscsa 306 P-000174 ACGCGAUGCUCAGACACAGAA 460 ascsgcgaUfgCfuCfagacacagaa 614 5132
SRS-000175 G-000160 UUACAAUGCUUCCAGGACAUUUC 153 usUfsacaaUfgcuuCfcAfgGfacauususc 307 P-000175 AAUGUCCUGGAAGCAUUGUAA 461 asasugucCfuGfgAfagcauuguaa 615 5505
SRS-000176 G-000161 UCAGUGAUGUAACAUUCAGUCCU 154 usCfsagugAfuguaAfcAfuUfcagucscsu 308 P-000176 GACUGAAUGUUACAUCACUGA 462 gsascugaAfuGfuUfacaucacuga 616 5866
如本文所使用,「A」係指腺苷-3'-磷酸;「a」係指2'-O-甲基腺苷-3'-磷酸;「Af」係指2'-氟腺苷-3'-磷酸;「C」係指胞苷-3'-磷酸;「c」係指2'-O-甲基胞苷-3'-磷酸;「Cf」係指2'-氟胞苷-3'-磷酸;「G」係指鳥苷-3'-磷酸;「g」係指2'-O-甲基鳥苷-3'-磷酸;「Gf」係指2'-氟鳥苷-3'-磷酸;「U」係指尿苷-3'-磷酸;「u」係指2'-O-甲基尿苷-3'-磷酸;「Uf」係指2'-氟尿苷-3'-磷酸;「T」係指5-甲基尿苷-3'-磷酸;「t」係指2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「Tf」係指2'-氟-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「s」係指3'-硫代磷酸酯。「人類轉錄物位置」定義為人類轉錄物(NCBI參考序列編號:NM_005577.4)中之21聚體目標位點的5'位置。應注意,在一些個例中,有義股序列與有義股之3'端處的靶向部分(例如GalNAc或半乳糖(例如L96))偶合。   
結合 靶向部分
在某些態樣中,本文所描述之聚核苷酸分子與一或多個靶向部分偶合或結合以形成聚核苷酸靶向部分結合物分子。在一些個例中,靶向部分係選擇性地或較佳基於其將本文所描述之結合物分子靶向所需細胞群體、組織或器官的能力來選擇的。在一些個例中,靶向部分靶向細胞、組織或器官,該細胞、組織或器官表現靶向部分之對應結合搭配物(例如,對應受體或配位體)。舉例而言,藉由選擇含有N-乙醯基半乳胺糖(GalNAc)之靶向部分作為靶向部分可使本文所描述之聚核苷酸分子靶向表現去唾液酸醣蛋白(ASGP-R)的肝細胞。涵蓋此項技術中已知的用作靶向部分之任何適合GalNAc分子。例示性GalNAc分子包括三觸角GalNAc (例如,L96)。靶向部分之另一實例為半乳糖。靶向部分亦可為脂質、肽或小分子。
靶向細胞內之所需位點(例如內質網、高基氏體(Golgi apparatus)、細胞核或粒線體)之靶向部分(亦即,細胞內靶向部分)可包括於本文所揭示之雜交聚核苷酸構築體中。細胞內靶向部分之非限制性實例提供於WO 2015/069932及WO 2015/188197中;WO 2015/069932及WO 2015/188197中之細胞內靶向部分的揭示內容以引用的方式併入本文中。
因此,本文所描述之聚核苷酸分子可包括一或多種選自由以下組成之群的靶向部分:細胞內靶向部分、細胞外靶向部分及其組合。因此,在本文所描述之聚核苷酸分子中包括一或多個靶向部分(例如細胞外靶向部分,包括獨立地選自由以下組成之群的靶向部分:葉酸、甘露糖、N-乙醯半乳胺糖及前列腺特異性膜抗原)及一或多個細胞內靶向部分(例如靶向內質網、高基氏體、細胞核或粒線體之部分)可有助於將聚核苷酸遞送至特定細胞群體內之特定位點。在一些態樣中,靶向部分含有一或多個甘露糖碳水化合物。甘露糖靶向甘露糖受體,甘露糖受體為表現於肝竇細胞及抗原呈現細胞(例如巨噬細胞及樹突狀細胞)上之175 KDa膜相關受體。其為結合且內化甘露糖基化病原體及蛋白質的高效內吞/再循環受體(Lennartz等人J. Biol. Chem. 262:9942-9944, 1987;Taylor等人J. Biol. Chem. 265:12156-62, 1990)。
一些靶向部分描述於本文中。在一些態樣中,靶向部分含有或特異性結合於選自包括以下之群之蛋白質:胰島素、類胰島素生長因子受體1 (IGF1R)、IGF2R、類胰島素生長因子(IGF;例如,IGF 1或2)、間葉細胞上皮轉變因子受體(c-met;亦稱為肝細胞生長因子受體(HGFR))、肝細胞生長因子(HGF)、表皮生長因子受體(EGFR)、表皮生長因子(EGF)、調蛋白、纖維母細胞生長因子受體(FGFR)、血小板衍生生長因子受體(PDGFR)、血小板衍生生長因子(PDGF)、血管內皮生長因子受體(VEGFR)、血管內皮生長因子(VEGF)、腫瘤壞死因子受體(TNFR)、腫瘤壞死因子α (TNF-α)、TNF-β、葉酸受體(FOLR)、葉酸、運鐵蛋白、運鐵蛋白受體(TfR)、間皮素、Fc受體、c-kit受體、c-kit、整合素(例如,α4整合素或β-1整合素)、P-選擇蛋白、神經鞘胺醇-1-磷酸酯受體-1 (S1PR)、玻尿酸受體、白血球功能抗原-1 (LFA-1)、CD4、CD11、CD18、CD20、CD25、CD27、CD52、CD70、CD80、CD85、CD95 (Fas受體)、CD106 (血管細胞黏附分子1 (VCAM1))、CD166 (活化白血球細胞黏附分子(ALCAM))、CD178 (Fas配位體)、CD253 (TNF相關細胞凋亡誘導配位體(TRAIL))、ICOS配位體、CCR2、CXCR3、CCR5、CXCL12 (基質細胞衍生因子1 (SDF-1))、介白素1 (IL-1)、IL-1ra、IL-2、IL-3、IL-4、IL-6、IL-7、IL-8、CTLA-4、MART-1、gp100、MAGE-1、肝配蛋白(Eph)受體、黏膜地址素細胞黏附分子1 (MAdCAM-1)、癌胚抗原(CEA)、LewisY、MUC-1、上皮細胞黏附分子(EpCAM)、癌症抗原125 (CA125)、前列腺特異性膜抗原(PSMA)、TAG-72抗原及其片段。在其他態樣中,靶向部分含有紅血球白血病病毒致癌基因同源物(ErbB)受體(例如ErbB1受體;ErbB2受體;ErbB3受體;及ErbB4受體)。在一些態樣中,靶向部分含有一或多個(例如1至6個) N-乙醯半乳胺糖(GalNAc)。在一些態樣中,靶向部分含有一或多個(例如1至6個)半乳糖。在某些態樣中,靶向部分含有一或多個(例如1至6個)甘露糖。在其他態樣中,靶向部分含有葉酸配位體。葉酸配位體具有以下結構: 。 某些靶向部分可包括鈴蟾素(bombesin)、胃泌素、胃泌素釋放肽、腫瘤生長因子(TGF)(例如,TGF-α或TGF-β)或痘瘡病毒生長因子(VVGF)。非肽基靶向部分亦可用於靶向部分且可包括例如類固醇、碳水化合物、維生素及凝集素。一些靶向部分可包括多肽,諸如生長抑制素或生長抑制素類似物(例如,奧曲肽(octreotide)或蘭瑞肽(lanreotide))、鈴蟾素或抗體或其抗原結合片段。抗體可為任何公認類別或子類,例如IgG、IgA、IgM、IgD或IgE。典型地為屬於IgG類之彼等抗體。抗體可根據此項技術中已知之技術來源於任何物種。然而,通常,抗體來源於人類、鼠類或兔。另外,抗體可為多株或單株抗體,但通常為單株抗體。人類或嵌合(例如人源化)抗體可用於靶向部分。靶向部分可包括抗體之抗原結合片段。此類抗體片段可包括例如Fab'、F(ab')2、Fv或Fab片段、單域抗體、scFV或其他抗原結合片段。Fc片段亦可用於靶向部分中。此類抗體片段可例如藉由蛋白分解酶消化(例如藉由胃蛋白酶或番木瓜蛋白酶消化)、還原性烷基化或重組技術來製備。用於製備抗體片段之材料及方法為熟習此項技術者熟知。參見例如Parham, J. Immunology, 131:2895, 1983;Lamoyi等人,J. Immunological Methods, 56:235, 1983。
在本文所描述之聚核苷酸分子中用作靶向輔助部分的其他肽可選自KiSS肽及類似物、尿加壓素II肽及類似物、GnRH I及II肽及類似物、地普奧肽(depreotide)、伐普肽(vapreotide)、血管活性腸肽(VIP)、膽囊收縮素(CCK)、含RGD肽、黑色素細胞刺激激素(MSH)肽、神經調壓素、降鈣素、麩胱甘肽、YIGSR (白血球親合肽,例如,P483H,其含有血小板因子-4 (PF-4)之肝素結合區及富離胺酸序列)、心房利鈉肽(ANP)、β-類澱粉蛋白肽、δ-類鴉片拮抗劑(諸如ITIPP(psi))、磷脂結合蛋白-V、內皮素、白三烯B4 (LTB4)、趨化肽(例如,N-甲醯基-甲硫胺醯基-白胺醯基-苯丙胺酸-離胺酸(fMLFK)、GP IIb/IIIa受體拮抗劑(例如,DMP444)、人類嗜中性球彈性蛋白酶抑制劑(EPI-HNE-2及EPI-HNE-4)、纖維蛋白溶酶抑制劑、抗微生物肽、艾普提賽德(apticide) (P280及P274)、凝血酶致敏蛋白受體(包括類似物,諸如TP-1300)、扁頭腹蛇素(bitistatin)、垂體腺苷酸環化酶I型受體(PAC1)、纖維蛋白α鏈、衍生自噬菌體呈現庫之肽及其保守性取代。
一或多個(例如1至6個)靶向部分可經由-LinkA-連接至式(V'、V''、V'''、V''''、V'''''、V'''''')中之部分或X2。
在一些態樣中,靶向部分包括一或多個(例如,1至6個或1至3個)去唾液酸醣蛋白受體配位體(例如,GalNAc)。在一些態樣中,去唾液酸醣蛋白受體配位體(例如GalNAc)配位體經由變旋異構碳(例如其中變旋異構碳為縮醛或半胺縮醛中之碳原子)連接至-LinkA-。與其中去唾液酸醣蛋白受體配位體經由縮醛連接至連接子的雜交聚核苷酸構築體相比,經由半胺縮醛連接至連接子的去唾液酸醣蛋白受體配位體(例如,GalNAc)可產生在基因緘默方面具有優良功效的雜交聚核苷酸構築體。
在一些態樣中,連接子及三個去唾液酸醣蛋白受體靶向部分(其各自包含GalNAc)如式(V)中所示。在一些個例中,本文所描述之結合物僅包含一個去唾液酸醣蛋白受體靶向部分,因此結合物包含其中任何兩個靶向部分被移除的式(V)之結構。在一些個例中,本文所描述之結合物僅包含兩個去唾液酸醣蛋白受體靶向部分,因此本文所描述之結合物包含其中任一個靶向部分被移除的式(V)之結構。 (V), 其中Y1及Y2中之一者為核苷酸,或其中Y1及Y2兩者均為核苷酸,且Y1及Y2為來自本文所描述之聚核酸分子的連續或相鄰核苷酸。
在一些態樣中,本文所描述之連接子及靶向部分結合至有義股之3'端(例如,如式(V、V''''、V'''''、V'''''')中所示)。在一些態樣中,本文中所描述之連接子及靶向部分結合至有義股之5'端(例如如式(V'')或(V''')中所示)。在一些態樣中,本文所描述之連接子及靶向部分結合至反義股之3'端(例如,如式(V')、(V'''')、(V''''')、(V'''''')中所示)。在一些態樣中,本文所描述之連接子及靶向部分結合至反義股之5'端(例如如式(V'')或(V''')中所示)。 ,其中式(V')中之Z為對應於本文所描述之糖修飾中之一者的部分(例如-H、-OH、-O-甲基、-F或-O-甲氧基乙基),且式(V')中之R為腺嘌呤、尿嘧啶、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶、無鹼基或其他; 其中式(V'')中之Z為對應於本文所描述之糖修飾中之一者的部分(例如-H、-OH、-O-甲基、-F或-O-甲氧基乙基),且式(V'')中之R為腺嘌呤、尿嘧啶、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶、無鹼基或其他。 (V'''), 其中式(V''')中之Z為對應於本文所描述之糖修飾中之一者的部分(例如-H、-OH、-O-甲基、-F或-O-甲氧基乙基),且式(V''')中之R為腺嘌呤、尿嘧啶、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶、無鹼基或其他。 (V''''), 其中式(V'''')中之Z為對應於本文所描述之糖修飾中之一者的部分(例如-H、-OH、-O-甲基、-F或-O-甲氧基乙基),且式(V'''')中之R為腺嘌呤、尿嘧啶、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶、無鹼基或其他。 ,其中式(V''''')中之Z為對應於本文所描述之糖修飾中之一者的部分(例如-H、-OH、-O-甲基、-F或-O-甲氧基乙基),且式(V''''')中之R為腺嘌呤、尿嘧啶、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶、無鹼基或其他。 (V''''''), 其中式(V'''''')中之Z為對應於本文所描述之糖修飾中之一者的部分(例如-H、-OH、-O-甲基、-F或-O-甲氧基乙基),且式(V'''''')中之R為腺嘌呤、尿嘧啶、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶、無鹼基或其他。
在一些個例中,來自表1、表2或表5之隨從/有義股的3'端與X2-GalNAc (參見式(V)、(V')、(V'''')、(V''''')、(V''''''))結合。在一些個例中,來自表1、表2或表5之隨從/有義股的5'端與X2-GalNAc (參見式(V)、(V'')或(V"'))結合。在一些個例中,來自表1、表2或表5之隨從/有義股內的核酸(不在5'或3'端)與X2-GalNAc (參見式(V))結合。在一些個例中,來自表1、表2或表5之引導/反義股的3'端與X2-GalNAc (參見式(V)、(V')、(V'''')、(V''''')、(V''''''))結合。在一些個例中,來自表1、表2或表5之引導/反義股的5'端與X2-GalNAc (參見式(V)、(V'')或(V'''))結合。在一些個例中,來自表1、表2或表5之引導/反義股內的核酸(不在5'或3'端)與X2-GalNAc (參見式(V))結合。
在一些個例中,一或多個胞內體逃脫部分(例如1至6個或1至3個)可作為輔助部分連接至本文所揭示之聚核苷酸構築體或雜交聚核苷酸構築體。例示性胞內體逃脫部分包括化學治療劑(例如喹啉酮,諸如氯喹);促融脂質(例如二油醯基磷脂醯乙醇胺(DOPE));及聚合物,諸如聚乙烯亞胺(PEI);聚(β-胺基酯);多肽,諸如聚精胺酸(例如八精胺酸)及聚離胺酸(例如八離胺酸);質子海綿、病毒衣殼及肽轉導域,如本文所描述。例如,促融肽可衍生自:A型流感病毒之M2蛋白;流感病毒血球凝集素之肽類似物;C型流感病毒之HEF蛋白;絲狀病毒之跨膜醣蛋白;狂犬病病毒之跨膜醣蛋白;水泡性口炎病毒之跨膜醣蛋白(G);仙台病毒(Sendai virus)之融合蛋白;勝利基森林病毒(Semliki forest virus)之跨膜醣蛋白;人類呼吸道融合病毒(RSV)之融合蛋白;麻疹病毒之融合蛋白;新城雞瘟病毒(Newcastle disease virus)之融合蛋白;綿羊髓鞘脫落病毒(visna virus)之融合蛋白;鼠白血病病毒之融合蛋白;HTL病毒之融合蛋白;及猿猴免疫缺乏病毒(SIV)之融合蛋白。可用於促進胞內體逃脫之其他部分描述於Dominska等人, Journal of Cell Science, 123(8):1183-1189, 2010中。胞內體逃脫部分的特定實例(包括適合與本文所揭示之雜交聚核苷酸構築體結合之部分)提供於例如WO 2015/188197中;此等胞內體逃脫部分之揭示內容以引用的方式併入本文中。
如本文所描述,一或多個胞內體逃脫部分(例如1至6個或1至3個)可經由-LinkA-連接至式(V'、V''、V'''、V''''、V'''''或V'''''')中之部分或X2。
一或多個細胞穿透肽(CPP)(例如,1至6個或1至3個)可作為輔助部分連接至本文揭示之聚核苷酸構築體或雜交聚核苷酸構築體。如本文所揭示,CPP可經由二硫鍵生物可逆地鍵聯至雜交聚核苷酸。因此,在遞送至細胞後,CPP可在細胞內裂解,例如藉由細胞內酶(例如蛋白質二硫鍵異構酶、硫化還原蛋白或硫酯酶)裂解且藉此釋放聚核苷酸。
CPP為此項技術中已知的(例如,TAT或Arg8)(Snyder及Dowdy, 2005, Expert Opin. Drug Deliv. 2, 43-51)。CPP之特定實例(包括適合與本文所揭示之雜交聚核苷酸構築體結合的部分)提供於例如WO 2015/188197中;此等CPP之揭示內容以引用之方式併入本文中。
CPP係能夠促進生物運載物遞送至細胞的帶正電的肽。咸信,CPP之陽離子電荷對於其功能而言為必要的。此外,此等蛋白質之轉導似乎不受細胞類型影響,且此等蛋白質可在無明顯毒性之情況下有效地轉導幾乎所有培養細胞(Nagahara等人, Nat. Med. 4:1449-52, 1998)。除全長蛋白質以外,CPP亦已成功用於誘導DNA (Abu-Amer, 前述)、反義聚核苷酸(Astriab-Fisher等人, Pharm. Res, 19:744-54, 2002)、小分子(Polyakov等人, Bioconjug. Chem. 11:762-71, 2000)以及甚至40 nm無機鐵粒子(Dodd等人, J. Immunol. Methods 256:89-105, 2001; Wunderbaldinger等人, Bioconjug. Chem. 13:264-8, 2002; Lewin等人, Nat. Biotechnol. 18:410-4, 2000; Josephson等人, Bioconjug. Chem. 10:186-91, 1999)的細胞內吸收,表明在此過程中存在相當大的粒度靈活性。
在一種情況下,適用於如本文所描述之方法及組合物中之CPP包括特徵實質上為α螺旋形之肽。已發現,在CPP展現顯著α螺旋形時,轉染最佳化。在另一情況下,CPP包括含有鹼性胺基酸殘基的序列,該等鹼性胺基酸殘基實質上沿肽之至少一個面進行比對。本文所描述之CPP可為天然存在之肽或合成肽。
如本文所描述,一或多個細胞穿透肽(例如1至6或1至3個)可經由-LinkA-連接至式(I)中之部分或X2。
本文揭示之聚核苷酸構築體及雜交聚核苷酸構築體亦可包括共價連接之基於中性聚合物之輔助部分。中性聚合物包括聚(C1-6環氧烷),例如聚(乙二醇)及聚(丙二醇)及其共聚物,例如二嵌段及三嵌段共聚物。聚合物之其他實例包括酯化聚(丙烯酸)、酯化聚(麩胺酸)、酯化聚(天冬胺酸)、聚(乙烯醇)、聚(乙烯-共-乙烯醇)、聚(N-乙烯吡咯啶酮)、聚(乙基㗁唑啉)、聚(丙烯酸烷基酯)、聚(丙烯醯胺)、聚(N-烷基丙烯醯胺)、聚(N-丙烯基𠰌啉)、聚(乳酸)、聚(乙醇酸)、聚(二氧環己酮)、聚(己內酯)、苯乙烯-順丁烯二酸酐共聚物、聚(L-丙交酯-共-乙交酯)共聚物、二乙烯醚-順丁烯二酸酐共聚物、N-(2-羥丙基)甲基丙烯醯胺共聚物(HMPA)、聚胺基甲酸酯、N-異丙基丙烯醯胺聚合物及聚(N,N-二烷基丙烯醯胺)。例示性聚合物輔助部分可具有小於100、300、500、1000或5000 Da (例如大於100 Da)的分子量。其他聚合物為此項技術中已知。
如本文所描述,一或多個聚合物(例如1至6個或1至3個)可經由-LinkA-連接至式(V'、V''、V'''、V''''、V'''''、V'''''')中之部分或X2。 結合連接子
在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子包含鍵結至至少一個式(I)基團之有義股或反義股 或其鹽,或其立體異構物, 其中 各X 1獨立地為O或S; 各X 2獨立地為O、S、NH或鍵; 部分為視情況經取代之C 2-10烷烴-四基或基團-M 1-M 2-M 3,其中各M 1及各M 3獨立地為不存在或視情況經取代之C 1-6伸烷基,且M 2為視情況經取代之C 3-9雜環-四基、視情況經取代之C 6-10芳烴-四基,或視情況經取代之C 3-8環烷烴-四基; 各R 1及各R 2獨立地為H、視情況經取代之C 1-16烷基、視情況經取代之C 2-16雜烷基、結合部分或-LinkA(-T) p,其限制條件為至少一個R 1或至少一個R 2為結合部分或-LinkA(-T) p; 各R 3獨立地為H、視情況經取代之C 1-16烷基、視情況經取代之C 2-16雜烷基、視情況經取代之C 2-16烯基、視情況經取代之C 2-16炔基、視情況經取代之(C 1-9雜環基)-C 1-6烷基、視情況經取代之(C 6-10芳基)-C 1-6烷基、視情況經取代之(C 3-8環烷基)-C 1-6烷基、結合部分或-LinkA(–T) p; R 4為H、視情況經取代之C 1-6烷基、-LinkA(-T) p或-Sol; 各LinkA獨立地為多價連接子(例如包括-C(O)-N(H)-(例如至少一個多價連接子,包括鍵結至T的-C(O)-N(H)-)); 各T獨立地為輔助部分; Sol為撐體; m為1至6之整數; 各n獨立地為0或1; 各p獨立地為1至6之整數;且 q為0至3之整數。 至少一個式(I)之基團可鍵結至聚核苷酸之5'端、3'端、核苷間磷酸酯、核苷間硫代磷酸酯或核苷間二硫代磷酸酯。當至少一個式(I)之基團鍵結至核苷間磷酸酯、核苷間硫代磷酸酯或核苷間二硫代磷酸酯時,q為0。聚核苷酸構築體含有不超過一種Sol。
基團-LinkA-可包括0至3個多價單體(例如,視情況經取代之C 1-6烷烴-三基、視情況經取代之C 1-6烷烴-四基、或三價氮原子)及一或多個二價單體(例如,1至40個),其中各二價單體獨立地為視情況經取代之C 1-6伸烷基、視情況經取代之C 2-6伸烯基、視情況經取代之C 2-6伸炔基、視情況經取代之C 3-8伸環烷基、視情況經取代之C 3-8伸環烯基、視情況經取代之C 6-14伸芳基、具有1至4個選自N、O及S之雜原子的視情況經取代之C 1-9伸雜芳基、具有1至4個選自N、O及S之雜原子的視情況經取代之C 1-9伸雜環基、亞胺基、視情況經取代之N、O、或S(O)m,其中m為0、1或2。在一些態樣中,各單體獨立地為視情況經取代之C 1-6伸烷基、視情況經取代之C 3-8伸環烷基、視情況經取代之C 3-8伸環烯基、視情況經取代之C 6-14伸芳基、具有1至4個選自N、O及S之雜原子的視情況經取代之C 1-9伸雜芳基、具有1至4個選自N、O及S之雜原子的視情況經取代之C 1-9伸雜環基、亞胺基、視情況經取代之N、O、或S(O)m,其中m為0、1或2 (例如,m為2)。在某些態樣中,各單體獨立地為視情況經取代之C 1-6伸烷基、視情況經取代之C 3-8伸環烷基、視情況經取代之C 3-8伸環烯基、視情況經取代之C 6-14伸芳基、具有1至4個選自N、O及S之雜原子的視情況經取代之C 1-9伸雜芳基、具有1至4個選自N、O及S之雜原子的視情況經取代之C 1-9伸雜環基、視情況經取代之N、O、或S(O)m,其中m為0、1或2 (例如,m為2)。將輔助部分連接至結合部分或連接至其反應產物的非生物可逆連接子可包括2至500個(例如2至300或2至200個)此類單體。基團-LinkA-可包括聚(環氧烷)(例如,聚環氧乙烷、聚環氧丙烷、聚(1,3-環氧丙烷)、聚環氧丁烷、聚(四氫呋喃)及其二嵌段或三嵌段共聚物)。在一些態樣中,非生物可逆連接子包括聚環氧乙烷(例如分子量小於1 kDa之聚(環氧乙烷))。
式(I)中之基團-LinkA(-T)p可藉由以下部分中所描述之方法來製備。在一些個例中,-LinkA(-T)p具有式(II): –Q 1–Q 2([–Q 3–Q 4–Q 5] s–Q 6–T) p, (II) 其中 各s獨立地為0至20 (例如0至10)之整數,其中重複單元相同或不同; Q 1為結合連接子(例如,[-Q 3-Q 4-Q 5] s-Q C-,其中Q C為視情況經取代之C 2-12伸雜烷基(例如,含有-C(O)-N(H)-、-N(H)-C(O)-、-S(O) 2-N(H)-或-N(H)-S(O) 2-之伸雜烷基)、視情況經取代之C 1-12硫代伸雜環基(例如, )、視情況經取代之C 1-12伸雜環基(例如,1,2,3-三唑-1,4-二基或 )、環丁-3-烯-1,2-二酮-3,4-二基或吡啶-2-基腙); 若p為1,則Q 2為直鏈基團(例如,[-Q 3-Q 4-Q 5] s-),或若p為2至6之整數,則為分支鏈基團(例如,[-Q 3-Q 4-Q 5] s-Q 7([-Q 3-Q 4-Q 5] s-(Q 7) p1) p2,其中p1為0或1,p2為0、1、2或3); 各Q 3及各Q 6獨立地為不存在、-CO-、-NH-、-O-、-S-、-SO 2-、-OC(O)-、-COO-、-NHC(O)-、-C(O)NH-、-CH 2-、-CH 2NH-、-NHCH 2-、-CH 2O-或-OCH 2-; 各Q 4獨立地為不存在、視情況經取代之C 1-12伸烷基、視情況經取代之C 2-12伸烯基、視情況經取代之C 2-12伸炔基、視情況經取代之C 2-12伸雜烷基、視情況經取代之C 6-10伸芳基、視情況經取代之C 1-9伸雜芳基或視情況經取代之C 1-9伸雜環基; 各Q 5獨立地為不存在、-CO-、-NH-、-O-、-S-、-SO 2-、-CH 2-、-C(O)O-、-OC(O)-、-C(O)NH-、-NH-C(O)-、-NH-CH(R a)-C(O)-或-C(O)-CH(R a)-NH-; 各Q 7獨立地為視情況經取代之C 1-6烷烴-三基、視情況經取代之C 1-6烷烴-四基、視情況經取代之C 2-6雜烷烴-三基或視情況經取代之C 2-6雜烷烴-四基;且 各R a獨立地為H或胺基酸側鏈; 其限制條件為存在Q 3、Q 4及Q 5中之至少一者。
在一些態樣中,各Q 4獨立地為不存在、視情況經取代之C 1-12伸烷基、視情況經取代之C 2-12伸烯基、視情況經取代之C 2-12伸炔基、視情況經取代之C 2-12伸雜烷基或視情況經取代之C 1-9伸雜環基。在某些態樣中,s為1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20。
因此,在式(II)中,若各p1為0,則LinkA可包括單個分支點,或若至少一個p1為1,則包括多個分支點。
在式(II)中,Q 1可為-O-Q L-Q C-,其中Q L為視情況經取代之C 2-12伸雜烷基、視情況經取代之C 1-12伸烷基或-(視情況經取代之C 1-6伸烷基)-(視情況經取代之C 6-10伸芳基)-。在一些態樣中,Q L為視情況經取代之C 2-12伸雜烷基或視情況經取代之C 1-12伸烷基。在式(II)中,Q C可為:
在式(II)中,Q 2可為式[-Q 3-Q 4-Q 5] s-之直鏈基團,其中Q 3、Q 4及Q 5如針對式(II)所定義。替代地,Q 2可為分支鏈基團[-Q 3-Q 4-Q 5] s-Q 7([-Q 3-Q 4-Q 5] s-(Q 7) p1) p2,其中各Q 7獨立地為視情況經取代之C 1-6烷烴-三基、視情況經取代之C 1-6烷烴-四基、視情況經取代之C 2-6雜烷烴-三基或視情況經取代之C 2-6雜烷烴-四基; 其中 p1為0或1; p2為0、1、2或3; 其中, 當p1為0時,LinkA為三價或四價連接子,且 當p1為1時,LinkA為四價、五價或六價連接子。 在某些態樣中,p1為0。 在一些態樣中,Q 7為:
可用於製備式(I)中之基團-LinkA(-T)p之化合物描述於本文以及WO 2015/188197中。-LinkA之非限制性實例包括: 其中 R 18為連至部分之一鍵, 各R 19獨立地為連至輔助部分之一鍵, 各m5獨立地為1至20之整數, 各m6獨立地為1至10之整數, m7為1至6之整數,且 各X 6獨立地為O或S。 在式(II)中,當結合連接子具有式[-Q 3-Q 4-Q 5] s-Q C-時, -Q 2([-Q 3-Q 4-Q 5] s-Q 6-T) p可為: 其中 R 20為連至Q 1中之Q C之一鍵, 各R 19獨立地為連至一輔助部分之一鍵, 各m5獨立地為1至20之整數, 各m6獨立地為1至10之整數, m7為1至6之整數,且 各X 6獨立地為O或S。
在一些態樣中,本文所描述之連接子為可裂解的。在一些態樣中,本文中所描述之連接子為不可裂解的。
在一些態樣中,本文所描述之聚核酸分子包含鍵結至至少一個式(IV)基團的有義股或反義股, (IV), 其中Y1及Y2中之至少一者為該聚核酸分子中之核苷酸。
在一些個例中,Y1為聚核酸分子中之一個股之3'端上的最後一個核苷酸或5'端上的第一核苷酸。在一些個例中,Y1為聚核酸分子之有義股之3'端上的最後一個核苷酸或5'端上的第一核苷酸。在一些個例中,Y1為聚核酸分子之有義股之3'端上的最後一個核苷酸或5'端上的第一核苷酸,且Y2為3-羥基-丙氧基基團。在一些個例中,Y2為聚核酸分子中之一個股之5'端上的第一核苷酸或3'端上的最後一個核苷酸。在一些個例中,Y2為聚核酸分子之有義股之5'端上的第一核苷酸或3'端上的最後一個核苷酸。在一些個例中,Y2為聚核酸分子之有義股之5'端上的第一核苷酸或3'端上的最後一個核苷酸,且Y1為3-羥基-丙氧基基團。在其他個例中,Y1及Y2為聚核酸分子之一個股中的兩個連續核苷酸。
在一些態樣中,本文所描述之靶向部分與有義股(例如,式(IV')或(IV''''))之3'端結合。在一些態樣中,本文所描述之靶向部分與有義股(例如,式(IV'')或(IV'''))之5'端結合。在一些態樣中,本文所描述之靶向部分與反義股(例如,式(IV')或(IV''''))之3'端結合。在一些態樣中,本文所描述之靶向部分與反義股(例如,式(IV'')或(IV'''))之5'端結合。 其中式(IV')中之Z為對應於本文所描述之糖修飾中之一者的部分(例如-H、-OH、-O-甲基、-F或-O-甲氧基乙基),且式(IV')中之R為腺嘌呤、尿嘧啶、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶、無鹼基或其他。 , 其中式(IV'')中之Z為對應於本文所描述之糖修飾中之一者的部分(例如-H、-OH、-O-甲基、-F或-O-甲氧基乙基)且式(IV'')中之R為腺嘌呤、尿嘧啶、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶、無鹼基或其他。 , 其中式(IV''')中之Z為對應於本文所描述之糖修飾中之一者的部分(例如-H、-OH、-O-甲基、-F或-O-甲氧基乙基)且式(IV''')中之R為腺嘌呤、尿嘧啶、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶、無鹼基或其他。 , 其中式(IV'''')中之Z為對應於本文所描述之糖修飾中之一者的部分(例如-H、-OH、-O-甲基、-F或-O-甲氧基乙基)且式(IV'''')中之R為腺嘌呤、尿嘧啶、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶、無鹼基或其他。 醫藥組合物
本文所描述之聚核苷酸分子的遞送可藉由使用多種方法使細胞與聚核苷酸分子接觸來達成。在特定態樣中,本文所描述之聚核苷酸分子係用各種賦形劑、媒劑及載劑調配,如本文中其他地方更充分所描述。
本文所描述之醫藥組合物可經製備以將本文所揭示之雜交聚核苷酸構築體包括於適於使用載劑、賦形劑及媒劑投與個體之形式中。頻繁使用之賦形劑包括碳酸鎂、二氧化鈦、乳糖、甘露糖醇及其他糖、滑石、乳蛋白、明膠、澱粉、維生素、纖維素及其衍生物、動物油及植物油、聚乙二醇及溶劑,諸如無菌水、醇、甘油及多元醇。靜脈內媒劑包括流體及營養補充劑。防腐劑包括抗微生物劑、抗氧化劑、螯合劑及惰性氣體。其他醫藥學上可接受之媒劑包括水溶液、無毒賦形劑,包括鹽、防腐劑、緩衝劑及其類似物,如例如以下文獻中所描述:Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 第21版, Gennaro編, Lippencott Williams & Wilkins (2005)及The United States Pharmacopeia: The National Formulary (USP 36 NF31),出版於2013年。根據此項技術中之常規技術調節醫藥組合物之各種組分之pH及精確濃度。參見Goodman及Gilman的The Pharmacological Basis for Therapeutics。
本文所描述之醫藥組合物可局部或全身性投與。治療有效量將根據以下因素而變化:諸如個體之感染程度、個體之年齡、性別及體重。可調整劑量方案以提供最佳治療反應。舉例而言,可每天投與若干分次劑量,或可如治療情況之緊急程度所指示按比例減少劑量。
醫藥組合物可以適宜方式投與,諸如藉由注射(例如皮下、靜脈內、眶內及其類似方式)、經口投與、經眼施用、吸入、體表施用或直腸投與。視投與途徑而定,醫藥組合物可用保護醫藥組合物免受酶、酸及其他可能使醫藥組合物不活化之天然條件之影響的材料包覆。醫藥組合物亦可非經腸或腹膜內投與。亦可在甘油、液體聚乙二醇及其混合物中及在油中製備分散液。在一般儲存及使用條件下,此等製劑可含有用以防止微生物體生長之防腐劑。
適合於可注射使用之醫藥組合物包括無菌水溶液(其中可溶於水)或分散液及用於臨時製備無菌可注射溶液或分散液之無菌粉末。組合物通常將為無菌的且就存在易注射能力而言為流體。通常,組合物在製造及儲存條件下將為穩定的,且經保藏以防止諸如細菌及真菌之微生物的污染作用。媒劑可為含有例如水、乙醇、多元醇(例如甘油、丙二醇及液體聚乙二醇及其類似物)、其適合混合物以及植物油的溶劑或分散介質。可例如藉由使用包衣(諸如卵磷脂)、藉由維持就分散液而言的所需粒度及藉由使用界面活性劑來維持適當的流動性。微生物作用之預防可藉由各種抗菌劑及抗真菌劑達成,例如對羥基苯甲酸酯、氯丁醇、苯酚、抗壞血酸、硫柳汞及其類似物。在許多情況下,組合物中使用等張劑,例如糖、多元醇(諸如甘露糖醇、山梨糖醇)或氯化鈉。可注射組合物之延長吸收可藉由在組合物中包含延遲吸收劑(例如單硬脂酸鋁及明膠)來實現。
無菌可注射溶液可如下製備:將所需量之醫藥組合物視需要與上文列舉之一種成分或成分組合一起併入適當溶劑中,隨後過濾滅菌。一般而言,藉由將醫藥組合物併入含有鹼性分散介質及選自上列成分之所需其他成分的無菌媒劑中來製備分散液。
就容易投與及均一給藥而言,非經腸組合物調配成單位劑型特別有利。如本文所使用,單位劑型係指適合作為單一劑量用於待治療個體之實體不連續單元;含有預定量之醫藥組合物之各單元經計算以與所需醫藥媒劑結合而產生所需治療作用。單位劑型之規格與醫藥組合物之特徵及欲達成之特定治療效果相關。主要醫藥組合物以有效量與醫藥學上可接受之適合媒劑混配,以便以可接受的劑量單元進行方便且有效之投與。在含有補充活性成分之組合物之情況下,參考常見劑量及該等成分之投與方式決定劑量。
醫藥組合物可例如以載劑形式,例如以包覆腸溶包衣之單位劑型經口投與。醫藥組合物及其他成分亦可封閉於硬殼或軟殼明膠膠囊中或壓縮成錠劑。對於經口治療性投與,可將醫藥組合物與賦形劑合併且以可攝取之錠劑、糖衣錠、膠囊、丸劑、粉片及其類似形式使用。此類組合物及製劑應含有至少1重量%活性化合物。組合物及製劑之百分比當然可變化且可宜在單元之重量的約5%至約80%之間。錠劑、糖衣錠、丸劑、膠囊及類似者亦可含有以下物質:黏合劑,諸如黃蓍膠、阿拉伯膠、玉米澱粉或明膠;賦形劑,諸如磷酸二鈣;崩解劑,諸如玉米澱粉、馬鈴薯澱粉、褐藻酸及類似者;潤滑劑,諸如硬脂酸鎂;及甜味劑,諸如蔗糖、乳糖或糖精;或調味劑,諸如胡椒薄荷、冬青油或櫻桃調味劑。當單位劑型為膠囊時,其可含有除以上類型之物質以外之液體載劑。各種其他材料可以包衣形式存在或以其他方式改變劑量單元之物理形式。舉例而言,錠劑、丸劑或膠囊可塗有蟲膠、糖或兩者。糖漿或酏劑可含有藥劑、作為甜味劑之蔗糖、作為防腐劑之對羥基苯甲酸甲酯及對羥基苯甲酸丙酯、染料及調味劑,諸如櫻桃或橙味香料。用於製備任何單位劑型之任何物質應具有醫藥學上可接受之純度且在所用量下實質上無毒。此外,醫藥組合物可併入持續釋放製劑及調配物中。
本文所描述之醫藥組合物可包含一或多種促進本文所描述之聚核苷酸分子之生物可用性的滲透增強劑。WO 2000/67798,Muranishi, 1990, Crit. Rev. Ther. Drug Carrier Systems, 7, 1, Lee等人, 1991, Crit. Rev. Ther. Drug Carrier Systems, 8, 91以全文引用之方式併入本文中。在一些態樣中,滲透增強劑係腸道滲透增強劑。在一些態樣中,滲透增強劑為經皮滲透增強劑。在一些態樣中,滲透增強劑有助於穿過腦血障壁。在一些態樣中,滲透增強劑改良經口、經鼻、經頰、肺、陰道或角膜遞送模型之滲透性。在一些態樣中,滲透增強劑係脂肪酸或其衍生物。在一些態樣中,滲透增強劑係界面活性劑或其衍生物。在一些態樣中,滲透增強劑為膽汁鹽或其衍生物。在一些態樣中,滲透增強劑為螯合劑或其衍生物。在一些態樣中,滲透增強劑為非螯合非界面活性劑或其衍生物。在一些態樣中,滲透增強劑為酯或其衍生物。在一些態樣中,滲透增強劑為醚或其衍生物。在一些態樣中,滲透增強劑為二十碳四烯酸、十一酸、油酸、月桂酸、辛酸、癸酸、肉豆蔻酸、棕櫚酸、硬脂酸、亞麻油酸、次亞麻油酸、二癸酸酯、三癸酸酯、單烯醛、二月桂酸甘油酯、1-單癸酸甘油酯、1-十二烷基氮雜環庚-2-酮、醯基肉鹼、醯基膽鹼或單甘油脂、二甘油脂或其醫藥學上可接受之鹽。在一個特定態樣中,滲透增強劑為癸酸鈉(C10)。在一些態樣中,滲透增強劑為鵝去氧膽酸(CDCA)、熊去氧鵝去氧膽酸(UDCA)、膽酸、去氫膽酸、去氧膽酸、麩胺膽酸、甘胺膽酸、甘胺去氧膽酸、牛膽酸、牛去氧膽酸、牛磺酸-24,25-二氫-褐酶酸鈉或二醇二氫褐酶酸鈉。在一些態樣中,滲透增強劑為聚氧乙烯-9-十二烷基醚或聚氧乙烯-20-十六烷基醚。
對於本文所描述之聚核苷酸分子,適合的醫藥學上可接受之鹽包括(i)由陽離子(諸如鈉、鉀、銨、鎂、鈣)、多元胺(諸如精胺及亞精胺)等形成之鹽;(ii)由以下無機酸形成之酸加成鹽,該等無機酸例如鹽酸、氫溴酸、硫酸、磷酸及其類似者;及(iii)由有機酸形成之鹽,該等有機酸諸如(例如)乙酸、草酸、酒石酸、丁二酸、順丁烯二酸、反丁烯二酸、葡萄糖酸、檸檬酸、蘋果酸、抗壞血酸、苯甲酸、鞣酸、棕櫚酸、褐藻酸、聚麩胺酸、萘磺酸酸、甲磺酸、對甲苯磺酸、萘二磺酸、聚半乳糖醛酸及其類似者。
雖然本文所描述之雜交聚核苷酸構築體可能不需要使用賦形劑來遞送至目標細胞,但賦形劑之使用在一些態樣中可為有利的。因此,為遞送至目標細胞,本文所描述之雜交聚核苷酸分子可非共價結合賦形劑以形成複合物。賦形劑可用於在遞送之後改變生物分佈、增強吸收、提高雜交聚核苷酸構築體中之股的半衰期或穩定性(例如提高核酸酶抗性)及/或提高對特定細胞或組織類型之靶向。
例示性賦形劑包括縮合劑(例如能夠經由離子或靜電相互作用吸引或結合核酸之試劑);促融劑(例如能夠融合及/或經由細胞膜輸送之試劑);靶向特定細胞或組織類型之蛋白質(例如,促甲狀腺激素、促黑素、凝集素、醣蛋白、界面活性劑蛋白質A或任何其他蛋白質);脂質;脂多醣;脂質微胞或脂質體(例如由磷脂形成,諸如磷脂醯膽鹼、脂肪酸、糖脂、神經醯胺、甘油酯、膽固醇或其任何組合);奈米粒子(例如二氧化矽、脂質、碳水化合物或其他醫藥學上可接受之聚合物奈米粒子);由陽離子聚合物及陰離子試劑(例如CRO)形成之聚合複合體, 其中例示性陽離子聚合物包括多元胺(例如聚離胺酸、聚精胺酸、聚醯胺基胺及聚乙烯亞胺);膽固醇;樹枝狀聚合物(例如聚醯胺基胺(PAMAM)樹枝狀聚合物);血清蛋白(例如人類血清白蛋白(HSA)或低密度脂蛋白(LDL));碳水化合物(例如聚葡萄糖、聚三葡萄糖(pullulan)、幾丁質、聚葡萄胺糖、菊糖、環糊精或玻尿酸);脂質;合成聚合物(例如聚離胺酸(PLL)、聚乙烯亞胺、聚-L-天冬胺酸、聚-L-麩胺酸、苯乙烯-順丁烯二酸酐共聚物、聚(L-丙交酯-共-乙醇酸)共聚物、二乙烯醚-順丁烯二酸酐共聚物、N-(2-羥丙基)甲基丙烯醯胺共聚物(HMPA)、聚乙二醇(PEG)、聚乙烯醇(PVA)、聚胺基甲酸酯、聚(2-乙基丙烯酸)、N-異丙基丙烯醯胺聚合物、偽肽-多元胺、模擬肽多元胺,或多元胺);陽離子部分(例如,陽離子型脂質、陽離子卟啉(porphyrin)、多元胺之四級鹽或α螺旋肽);多價糖(例如,多價乳糖、多價半乳糖、N-乙醯基-半乳胺糖、N-乙醯基-葡糖胺、多價甘露糖或多價岩藻糖);維生素(例如,維生素A、維生素E、維生素K、維生素B、葉酸、維生素B12、核黃素、生物素或吡哆醛);輔因子;或破壞細胞骨架以增加吸收之藥物(例如,紫杉醇(taxol)、長春新鹼(vincristine)、長春鹼(vinblastine)、細胞遲緩素(cytochalasin)、諾考達唑(nocodazole)、傑普肯立德(japlakinolide)、紅海海綿素A (latrunculin A)、鬼筆環肽(phalloidin)、斯文霍立德A (swinholide A)、引達喏新(indanocine)或美瑟文(myoservin))。
如本文所描述之其他治療劑可與本文所描述之聚核苷酸分子組合包括於本文所描述之醫藥組合物中。 治療方法
在一些態樣中,本文描述一種調節個體中之Lp(a)基因表現的方法,其包含:向該個體投與本文所描述之聚核酸分子、本文所描述之聚核酸分子結合物,或本文所描述之醫藥組合物,由此調節該個體中之Lp(a)基因表現。
在一些態樣中,本文所描述之方法使個體中之Lp(a)基因表現(例如Lp(a) mRNA表現)與對照相比降低約或至少10%。如本文所用,術語「對照」係指未接受治療或接受安慰劑之個體或細胞。在一些態樣中,本文所描述之方法使個體中之Lp(a)基因表現與對照相比降低約或至少20%。在一些態樣中,本文所描述之方法使個體中之Lp(a)基因表現與對照相比降低約或至少30%。在一些態樣中,本文所描述之方法使個體中之Lp(a)基因表現與對照相比降低約或至少40%。在一些態樣中,本文所描述之方法使個體中之Lp(a)基因表現與對照相比降低約或至少50%。在一些態樣中,本文所描述之方法使個體中之Lp(a)基因表現與對照相比降低約或至少60%。在一些態樣中,本文所描述之方法使個體中之Lp(a)基因表現與對照相比降低約或至少70%。在一些態樣中,本文所描述之方法使個體中之Lp(a)基因表現與對照相比降低約或至少80%。在一些態樣中,本文所描述之方法使個體中之Lp(a)基因表現與對照相比降低約或至少90%。在一些態樣中,本文所描述之方法使個體中之Lp(a)基因表現與對照相比降低約100%。
在一些態樣中,本文所描述之方法達成約5 nM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約10 nM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約15 nM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約20 nM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約25 nM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約30 nM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約35 nM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約40 nM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約45 nM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約50 nM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約55 nM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約60 nM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約65 nM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約70 nM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約75 nM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約80 nM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約85 nM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約90 nM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約95 nM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約100 nM之IC50值。
在一些態樣中,本文所描述之方法達成約1 µM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約1.1 µM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約1.2 µM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約1.3 µM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約1.4 µM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約1.5 µM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約2 µM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約4 µM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約6 µM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約8 µM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約10 µM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約12 µM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約13 µM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約14 µM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約15 µM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約30 µM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約35 µM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約40 µM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約50 µM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約60 µM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約80 µM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約100 µM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約120 µM之IC50值。在一些態樣中,本文所描述之方法達成約160 µM之IC50值。
在一些態樣中,本文描述一種調節有需要個體中之血漿Lp(a)含量的方法,其包含向該個體投與本文所描述之聚核酸分子、本文所描述之聚核酸分子結合物、或本文所描述之醫藥組合物,其中本文所描述之聚核酸分子、本文所描述之聚核酸分子結合物或本文所描述之醫藥組合物降低個體中之血漿Lp(a)含量。
在一些態樣中,本文所描述之方法使個體中之血漿Lp(a)含量與對照(例如未經治療之個體或治療之前的個體)相比降低約或至少10%。在一些態樣中,本文所描述之方法使個體中之血漿Lp(a)含量與對照相比降低約或至少20%。在一些態樣中,本文所描述之方法使個體中之血漿Lp(a)含量與對照相比降低約或至少30%。在一些態樣中,本文所描述之方法使個體中之血漿Lp(a)含量與對照相比降低約或至少40%。在一些態樣中,本文所描述之方法使個體中之血漿Lp(a)含量與對照相比降低約或至少50%。在一些態樣中,本文所描述之方法使個體中之血漿Lp(a)含量與對照相比降低約或至少60%。在一些態樣中,本文所描述之方法使個體中之血漿Lp(a)含量與對照相比降低約或至少70%。在一些態樣中,本文所描述之方法使個體中之血漿Lp(a)含量與對照相比降低約或至少80%。在一些態樣中,本文所描述之方法使個體中之血漿Lp(a)含量與對照相比降低約或至少90%。在一些態樣中,本文所描述之方法使個體中之血漿Lp(a)含量與對照相比降低約100%。
在一些態樣中,本文描述一種用於治療或預防Lp(a)相關病症或其症狀、心血管疾病或脂質病症之方法,其包含向該個體投與如本文所揭示之聚核酸分子、如本文所揭示之聚核酸分子結合物或如本文所揭示之醫藥組合物。
在一些態樣中,Lp(a)相關病症或心血管疾病包括冠狀動脈疾病、急性心肌梗塞、無症狀頸動脈粥樣硬化、中風、心房微顫或周邊動脈阻塞疾病。在一些態樣中,心血管疾病或病症為高膽固醇血症。在一些態樣中,心血管疾病為心肌梗塞。在一些態樣中,心血管疾病為中風。在一些態樣中,心血管疾病為鈣化性主動脈瓣狹窄。在一些態樣中,心血管疾病為心跳停止。在一些態樣中,心血管疾病為周邊動脈疾病。在一些態樣中,脂質病症為高脂質血症或高膽固醇血症。 組合療法
在一些個例中,如本文所揭示之方法包含向個體(例如人類患者)投與如本文所揭示之聚核酸分子、如本文所揭示之聚核酸分子結合物或如本文所揭示之醫藥組合物,該個體在被投與如本文所揭示之聚核酸分子、如本文所揭示之聚核酸分子結合物或如本文所揭示之醫藥組合物時或前不久正接受用於治療Lp(a)相關病症或CVD之治療方案。舉例而言,先前已診斷患有動脈粥樣硬化之患者可已被開有處方,且在投與如本文所揭示之聚核酸分子、如本文所揭示之聚核酸分子結合物或如本文所揭示之醫藥組合物之前及/或同時採用另一種藥物之穩定治療方案。先前或並存的治療方案可包含例如(1)藉由抑制3-羥基-3-甲基戊二醯基(HMG)-輔酶A (CoA)還原酶誘導膽固醇合成之細胞耗乏的藥劑,諸如斯他汀(例如西立伐他汀、阿托伐他汀、辛伐他汀、匹伐他汀、瑞舒伐他汀、氟伐他汀、洛伐他汀、普伐他汀等);(2)抑制膽固醇吸收及或膽酸再吸收之藥劑;(3)提高脂蛋白代謝之藥劑(諸如菸鹼酸);及/或(4)在膽固醇消除中發揮作用之LXR轉錄因子的活化劑,諸如22-羥基膽固醇。 患者群體
本文所揭示之方法適用於降低表現出血漿Lp(a)含量升高的個體中之血漿Lp(a)含量。個體可為人類或非人類靈長類動物。在一些個例中,除表現出血清Lp(a)升高以外,個體在其他方面係健康的。舉例而言,個體在治療時可不表現出心血管、血栓性或其他疾病或病症之任何其他風險因素。然而,在其他個例中,基於被診斷患有由血漿Lp(a)升高引起或與血漿Lp(a)升高相關之疾病或病症或有發展該疾病或病症之風險來選擇個體。舉例而言,在投與如本文所揭示之聚核酸分子、如本文所揭示之聚核酸分子結合物或如本文所揭示之醫藥組合物之時或之前,個體可被診斷患有心血管疾病或病症或被鑑別為有發展心血管疾病或病症之風險,該心血管疾病或病症諸如冠狀動脈疾病、急性心肌梗塞、無症狀動脈粥樣硬化、中風、心房微顫、周邊動脈阻塞疾病等。在一些個例中,心血管疾病或病症為高膽固醇血症。舉例而言,若個體被診斷患有高膽固醇血症病狀或被鑑別為有發展高膽固醇血症病狀之風險,則可選擇個體以如本文所揭示之方法進行治療,該高膽固醇血症病狀諸如係異型接合家族性高膽固醇血症(heFH)、同型接合家族性高膽固醇血症(hoFH)),以及不同於家族性高膽固醇血症之高膽固醇血症發生率(nonFH)。個體可被診斷患有脂質疾病或病症(諸如(例如)高脂質血症及高膽固醇血症)或被鑑別為有發展該脂質疾病或病症之風險。
在一些個例中,在投與如本文所揭示之聚核酸分子、如本文所揭示之聚核酸分子結合物或如本文所揭示之醫藥組合物之時或之前,個體可被診斷患有血栓阻塞性疾病或病症(諸如(例如)肺栓塞、中央視網膜靜脈栓塞等)或鑑別為有發展該血栓阻塞性疾病或病症之風險。可基於被診斷患有上述疾病或病症中之兩者或更多者之組合或有發展上述疾病或病症中之兩者或更多者之組合的風險選擇患者。舉例而言,在投與本發明之醫藥組合物之時或之前,個體可被診斷患有冠狀動脈疾病及肺栓塞或被鑑別為有發展冠狀動脈疾病及肺栓塞之風險。其他診斷組合(例如動脈粥樣硬化及中央視網膜靜脈栓塞、heFH及中風等)亦包括於可藉由如本文所揭示之方法治療的患者群體之定義中。
在一些個例中,基於一或多個選自由以下組成之群的因素選擇待用如本文所揭示之方法治療之個體:年齡(例如,大於40、45、50、55、60、65、70、75或80歲)、種族、性別(男性或女性)、運動習慣(例如經常運動者、不運動者)、其他既往病史(例如II型糖尿病、高血壓等),以及目前的用藥狀態(例如,目前服用斯他汀(例如西立伐他汀(cerivastatin)、阿托伐他汀(atorvastatin)、辛伐他汀(simvastatin)、匹伐他汀(pitavastatin)、瑞舒伐他汀(rosuvastatin)、氟伐他汀(fluvastatin)、洛伐他汀(lovastatin)、普伐他汀(pravastatin)等)、β阻斷劑、菸鹼酸等)。本發明亦提供用於降低對習知斯他汀療法不耐受、無反應或反應不足之患者中的血漿Lp(a)含量的方法。在用如本文所揭示之方法治療之前,可基於此等因素中之一或多者(例如藉由問卷、診斷評估等)選擇/篩選潛在患者。 劑量
根據如本文所揭示之方法向個體投與的如本文所揭示之聚核酸分子、如本文所揭示之聚核酸分子結合物或如本文所揭示之醫藥組合物之量一般為治療有效量。如本文所用,術語「治療有效量」係指導致血漿Lp(a)可偵測到的降低的如本文所揭示之聚核酸分子、如本文所揭示之聚核酸分子結合物或如本文所揭示之醫藥組合物的劑量。舉例而言,如本文所揭示之聚核酸分子、如本文所揭示之聚核酸分子結合物或如本文所揭示之醫藥組合物的治療有效量包括(例如)如本文所揭示之聚核酸分子、如本文所揭示之聚核酸分子結合物或如本文所揭示之醫藥組合物在投與至個體時使血漿Lp(a)含量降低至少1%、2%、5%、10%、15%、20%、25%、30%、40%、50%或更多的量。在一些個例中,如本文所揭示之聚核酸分子的治療有效量可為在投與至個體時使Lp(a) mRNA含量降低至少1%、2%、5%、10%、15%、20%、25%、30%、40%、50%或更多的劑量。 方案
如本文所揭示之聚核酸分子、如本文所揭示之聚核酸分子結合物或如本文所揭示之醫藥組合物可在限定時程內向個體投與。本文所揭示之方法可包含向個體依序投與多次劑量之如本文所揭示之聚核酸分子、如本文所揭示之聚核酸分子結合物或如本文所揭示之醫藥組合物。如本文所用,「依序投與(sequentially administering)」意謂在不同時間點,例如在相隔預定間隔(例如數小時、數天、數週或數月)之不同天向個體投與各劑量之聚核酸分子、聚核酸分子結合物或醫藥組合物。本發明提供如下方法,其包含向患者依序投與單次初始劑量之聚核酸分子、聚核酸分子結合物或醫藥組合物,然後投與一或多次二級劑量之聚核酸分子、聚核酸分子結合物或醫藥組合物,且視情況接著投與一或多次三級劑量之聚核酸分子、聚核酸分子結合物或醫藥組合物。
術語「初始劑量」、「二級劑量」及「三級劑量」係指聚核酸分子、聚核酸分子結合物或醫藥組合物的投與時間順序。因此,「初始劑量」係在治療方案開始時投與之劑量(亦稱為「基線劑量」);「二級劑量」係在初始劑量之後投與之劑量;且「三級劑量」係在二級劑量之後投與之劑量。初始、二級及三級劑量均可含有相同量之聚核酸分子、聚核酸分子結合物或醫藥組合物,但一般將在投與頻率方面彼此不同。在一些個例中,初始、二級及/或三級劑量中所含之聚核酸分子、聚核酸分子結合物或醫藥組合物的量將在治療過程期間彼此不同(例如視需要上調或下調)。
在一些個例中,各二級及/或三級劑量係在前一劑量之後1至30天(例如1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30或更多天)投與。如本文所使用,片語「前一劑量(the immediately preceding dose)」意謂在多次投與的順序中,在無中間劑量的情況下按該順序投與下一個劑量之前向患者投與的聚核酸分子、聚核酸分子結合物或醫藥組合物的劑量。
如本文所揭示之方法可包含向患者投與任何數目的二級及/或三級劑量之聚核酸分子、聚核酸分子結合物或醫藥組合物。舉例而言,在一些個例中,僅向患者投與單次二級劑量。在其他個例中,向患者投與兩次或更多次(例如2、3、4、5、6、7、8次或更多次)二級劑量。在一些個例中,僅向患者投與單次三級劑量。在其他個例中,向患者投與兩次或更多次(例如2、3、4、5、6、7、8次或更多次)三級劑量。
在投與多次二級劑量的情況下,各二級劑量可以與其他二級劑量相同的頻率投與。舉例而言,各二級劑量可在前一劑量之後1至29天向患者投與。類似地,在投與多次三級劑量的情況下,各三級劑量可以與其他三級劑量相同的頻率投與。舉例而言,各三級劑量可在前一劑量之後1至60天向患者投與。替代地,向患者投與二級及/或三級劑量之頻率可在治療方案的過程中變化。投與頻率亦可在治療過程期間在臨床檢查之後由醫師視個別患者之需要來調整。 例示性實施例
實施例1. 一種用於調節脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的聚核酸分子,其包含與選自表1、表2或表5之核酸序列至少80%、至少85%、至少90%一致的核酸序列。
實施例2. 如實施例[0220]之聚核酸分子,其中該聚核酸分子包含選自表1、表2或表5之核酸序列。
實施例3. 如實施例1至2中任一例之聚核酸分子,其中該聚核酸分子為單股核酸分子。
實施例4. 如實施例3之聚核酸分子,其中該單股核酸分子包含至少14、15、16、17、18個與選自SEQ ID NO: 309至462之核酸序列互補且具有不超過1、2、3、4個錯配的連續核苷酸。
實施例5. 如實施例3之聚核酸分子,其中該單股核酸分子包含與選自SEQ ID NO: 1至154之核酸序列至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%一致。
實施例6.如實施例[0220]或2之聚核酸分子,其中該聚核酸分子為包含有義股及反義股之雙股核酸分子。
實施例7. 如實施例5之聚核酸分子,其中該有義股包含與選自SEQ ID NO: 309至462之核酸序列至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%一致的核酸序列。
實施例8. 如實施例5或實施例6之聚核酸分子,其中該反義股包含與選自SEQ ID NO: 1至154之核酸序列至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%一致的核酸序列。
實施例9. 如實施例5之聚核酸分子,其中該有義股含有包含至少14、15、16、17、18、19或20個選自SEQ ID NO: 309至462之核酸序列的連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。
實施例10. 如實施例[0225]之聚核酸分子,其中該反義股含有包含至少14、15、16、17、18、19、20、21或22個選自SEQ ID NO: 1至154之核酸序列的連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。
實施例11. 如實施例[0225]至[0229]中任一例之聚核酸分子,其中該有義股包含選自SEQ ID NO: 309至462之核酸序列且該反義股包含選自SEQ ID NO: 1至154之核酸序列。
實施例12. 如實施例[0220]至[0230]中任一例之聚核酸分子,其中該聚核酸分子包含(1)2'-氟修飾之核苷酸;(2)2'-O-甲基修飾之核苷酸;或(3)經修飾之核苷酸間鍵聯。
實施例13. 如實施例[0225]至12中任一例之聚核酸分子,其中該有義股包含至少兩個經修飾之連續核苷酸間鍵聯在5'端。
實施例14. 如實施例6至13中任一例之聚核酸分子,其中該反義股包含至少兩個經修飾之連續核苷酸間鍵聯在5'端及/或3'端。
實施例15. 如實施例6至14中任一例之聚核酸分子,其中該有義股包含5'- nnnnnnNfnNfnNfnnnnnnnnnn-3',其中該反義股包含5'- nNfnnnnNfnnnnNfnNfnNfnnnnnnn-3',其中n代表2'-O-甲基修飾之核苷酸,且其中Nf代表2'-氟修飾之核苷酸。
實施例16. 如實施例[0231]至[0234]中任一例之聚核酸分子,其中該經修飾之核苷酸間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯。
實施例17. 如實施例[0235]之聚核酸分子,其中該經修飾之核苷酸間鍵聯包含在立體化學上富集硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯。
實施例18. 如實施例[0231]至17中任一例之聚核酸分子,其中該經修飾之核苷酸間鍵聯為SP對掌性核苷酸間硫代磷酸酯鍵聯。
實施例19. 如實施例[0237]之聚核酸分子,其中該聚核酸包含複數個經修飾之核苷酸間鍵聯,且該複數個經修飾之核苷酸間鍵聯中之至少1、2、3或4個為在立體化學上富集硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯。
實施例20. 如實施例[0238]之聚核酸分子,其中該等在立體化學上富集硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯包含R-異構物及S-異構物兩者。
實施例21. 如實施例[0238]或[0239]之聚核酸分子,其中至少一個在立體化學上富集硫代磷酸酯置於兩個連續核苷之間,該兩個連續核苷為該有義股或該反義股之六個5'或3'端核苷中的兩個。
實施例22.如實施例[0225]至[0240]中任一例之聚核酸分子,其中該有義股或反義股之長度為19至25或21至23個核苷酸。
實施例23. 如實施例[0220]至[0224]之聚核酸分子,其中該聚核酸分子之長度為19至25或21至23個核苷酸。
實施例24. 如實施例1至23中任一例之聚核酸分子,其中該有義股包含與選自SEQ ID NO: 463至616之核酸序列至少80%、至少85%、至少90%、至少95%一致的核酸序列。
實施例25. 如實施例1至24中任一例之聚核酸分子,其中該反義股包含與選自SEQ ID NO: 155至308之核酸序列至少80%、至少85%、至少90%、至少95%一致的核酸序列。
實施例26. 如實施例1至25中任一例之聚核酸分子,其中該有義股包含選自SEQ ID NO: 463至616之核酸序列的序列,且該反義股包含選自SEQ ID NO: 155至308之核酸序列的序列。
實施例27. 一種用於調節脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的聚核酸分子,其中聚核酸分子包含: (a)包含UAGAUGACCAAGCUUGGCAGGUC (SEQ ID NO: 4)之核苷酸序列的反義股及包含CCUGCCAAGCUUGGUCAUCUA (SEQ ID NO: 312)之核苷酸序列的有義股; (b)包含UAUAGAUGACCAAGCUUGGCAGG (SEQ ID NO: 5)之核苷酸序列的反義股及包含UGCCAAGCUUGGUCAUCUAUA (SEQ ID NO:313)之核苷酸序列的有義股; (c)包含UCAUAGAUGACCAAGCUUGGCAG (SEQ ID NO: 6)之核苷酸序列的反義股及包含GCCAAGCUUGGUCAUCUAUGA (SEQ ID NO: 314)之核苷酸序列的有義股; (d)包含UCGACGGCAGUCCCUUCUGCGUC (SEQ ID NO: 11)之核苷酸序列的反義股及包含CGCAGAAGGGACUGCCGUCGA (SEQ ID NO: 319)之核苷酸序列的有義股; (e)包含UUCUAGGCUUGGAACCGGGGUAA (SEQ ID NO: 18)之核苷酸序列的反義股及包含ACCCCGGUUCCAAGCCUAGAA (SEQ ID NO: 326)之核苷酸序列的有義股; (f)包含UAGCCUCUAGGCUUGGAACCGGG (SEQ ID NO: 21)之核苷酸序列的反義股及包含CGGUUCCAAGCCUAGAGGCUA (SEQ ID NO: 329)之核苷酸序列的有義股; (g)包含UUUACCGUGGUAGCACUCCUGCA (SEQ ID NO: 44)之核苷酸序列的反義股及包含CAGGAGUGCUACCACGGUAAA (SEQ ID NO: 352)之核苷酸序列的有義股; (h)包含UUGUCCAUUACCGUGGUAGCACU (SEQ ID NO: 47)之核苷酸序列的反義股及包含UGCUACCACGGUAAUGGACAA (SEQ ID NO: 355)之核苷酸序列的有義股; (i)包含UCUCUGUCCAUUACCGUGGUAGC (SEQ ID NO: 49)之核苷酸序列的反義股及包含UACCACGGUAAUGGACAGAGA (SEQ ID NO: 357)之核苷酸序列的有義股; (j)包含UAUUGUGUCAGGUUGCAGUACUC (SEQ ID NO: 60)之核苷酸序列的反義股及包含GUACUGCAACCUGACACAAUA (SEQ ID NO: 368)之核苷酸序列的有義股; (k)包含UUGCGUCUGAGCAUUGUGUCAGG (SEQ ID NO: 64)之核苷酸序列的反義股及包含UGACACAAUGCUCAGACGCAA (SEQ ID NO: 372)之核苷酸序列的有義股; (l)包含UUAACUCUGUCCAUAAUGGUAGU (SEQ ID NO: 88)之核苷酸序列的反義股及包含UACCAUUAUGGACAGAGUUAA (SEQ ID NO: 396)之核苷酸序列的有義股; (m)包含UCCAAGCUUGGCAAGUUCUUCCU (SEQ ID NO: 89之核苷酸序列的反義股及包含GAAGAACUUGCCAAGCUUGGA (SEQ ID NO: 397)之核苷酸序列的有義股; (n)包含UAGAUGACCAAGCUUGGCAAGUU (SEQ ID NO: 90)之核苷酸序列的反義股及包含CUUGCCAAGCUUGGUCAUCUA (SEQ ID NO: 398)之核苷酸序列的有義股;或 (o)包含UGGUCCGACUAUGCUGGUGUGGU (SEQ ID NO: 98)之核苷酸序列的反義股及包含CACACCAGCAUAGUCGGACCA (SEQ ID NO: 406)之核苷酸序列的有義股。
實施例28. 一種用於調節脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的聚核酸分子,其中聚核酸分子包含: (a)包含usAfsgaugAfccaaGfcUfuGfgcaggsusc (SEQ ID NO: 158)之核苷酸序列的反義股及包含cscsugccAfaGfcUfuggucaucua (SEQ ID NO: 466)之核苷酸序列的有義股; (b)包含usAfsuagaUfgaccAfaGfcUfuggcasgsg (SEQ ID NO: 159)之核苷酸序列的反義股及包含usgsccaaGfcUfuGfgucaucuaua (SEQ ID NO: 467)之核苷酸序列的有義股; (c)包含usCfsauagAfugacCfaAfgCfuuggcsasg (SEQ ID NO: 160)之核苷酸序列的反義股及包含gscscaagCfuUfgGfucaucuauga (SEQ ID NO: 468)之核苷酸序列的有義股; (d)包含usCfsgacgGfcaguCfcCfuUfcugcgsusc (SEQ ID NO: 165)之核苷酸序列的反義股及包含csgscagaAfgGfgAfcugccgucga (SEQ ID NO: 473)之核苷酸序列的有義股; (e)包含usUfscuagGfcuugGfaAfcCfggggusasa (SEQ ID NO: 172)之核苷酸序列的反義股及包含ascscccgGfuUfcCfaagccuagaa (SEQ ID NO: 480)之核苷酸序列的有義股; (f)包含usAfsgccuCfuaggCfuUfgGfaaccgsgsg (SEQ ID NO: 175)之核苷酸序列的反義股及包含csgsguucCfaAfgCfcuagaggcua (SEQ ID NO: 483)之核苷酸序列的有義股; (g)包含usUfsuaccGfugguAfgCfaCfuccugscsa (SEQ ID NO: 198)之核苷酸序列的反義股及包含csasggagUfgCfuAfccacgguaaa (SEQ ID NO: 506)之核苷酸序列的有義股; (h)包含usUfsguccAfuuacCfgUfgGfuagcascsu (SEQ ID NO: 201)之核苷酸序列的反義股及包含usgscuacCfaCfgGfuaauggacaa (SEQ ID NO: 509)之核苷酸序列的有義股; (i)包含usCfsucugUfccauUfaCfcGfugguasgsc (SEQ ID NO: 203)之核苷酸序列的反義股及包含usasccacGfgUfaAfuggacagaga (SEQ ID NO: 511)之核苷酸序列的有義股; (j)包含usAfsuuguGfucagGfuUfgCfaguacsusc (SEQ ID NO: 214)之核苷酸序列的反義股及包含gsusacugCfaAfcCfugacacaaua (SEQ ID NO: 522)之核苷酸序列的有義股; (k)包含usUfsgcguCfugagCfaUfuGfugucasgsg (SEQ ID NO: 218)之核苷酸序列的反義股及包含usgsacacAfaUfgCfucagacgcaa (SEQ ID NO: 526)之核苷酸序列的有義股; (l)包含usUfsaacuCfugucCfaUfaAfugguasgsu (SEQ ID NO: 242)之核苷酸序列的反義股及包含usasccauUfaUfgGfacagaguuaa (SEQ ID NO: 550)之核苷酸序列的有義股; (m)包含usCfscaagCfuuggCfaAfgUfucuucscsu (SEQ ID NO: 243)之核苷酸序列的反義股及包含gsasagaaCfuUfgCfcaagcuugga (SEQ ID NO: 551)之核苷酸序列的有義股; (n)包含usAfsgaugAfccaaGfcUfuGfgcaagsusu (SEQ ID NO: 244)之核苷酸序列的反義股及包含csusugccAfaGfcUfuggucaucua (SEQ ID NO: 552)之核苷酸序列的有義股;或 (o)包含usGfsguccGfacuaUfgCfuGfgugugsgsu (SEQ ID NO: 252)之核苷酸序列的反義股及包含csascaccAfgCfaUfagucggacca (SEQ ID NO: 560)之核苷酸序列的有義股, 其中「A」係指腺苷-3'-磷酸;「a」係指2'-O-甲基腺苷-3'-磷酸;「Af」係指2'-氟腺苷-3'-磷酸;「C」係指胞苷-3'-磷酸;「c」係指2'-O-甲基胞苷-3'-磷酸;「Cf」係指2'-氟胞苷-3'-磷酸;「G」係指鳥苷-3'-磷酸;「g」係指2'-O-甲基鳥苷-3'-磷酸;「Gf」係指2'-氟鳥苷-3'-磷酸;「U」係指尿苷-3'-磷酸;「u」係指2'-O-甲基尿苷-3'-磷酸;「Uf」係指2'-氟尿苷-3'-磷酸;「T」係指5-甲基尿苷-3'-磷酸;「t」係指2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「Tf」係指2'-氟-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「s」係指3'-硫代磷酸酯。
實施例29. 一種用於調節脂蛋白(a)基因(Lp(a))表現的聚核酸分子結合物,其中該聚核酸分子結合物包含如實施例[0220]至23中任一例之聚核酸分子及去唾液酸醣蛋白受體靶向部分。
實施例30. 如實施例29之聚核酸分子結合物,其中該去唾液酸醣蛋白受體靶向部分包含N-乙醯半乳胺糖(GalNAc)或半乳糖。
實施例31. 如實施例29至30中任一例之聚核酸分子結合物,其中該聚核酸分子及該去唾液酸醣蛋白受體靶向部分經由連接子偶合。
實施例32. 如實施例31之聚核酸分子結合物,其中該連接子為可裂解連接子。
實施例33. 如實施例30至31中任一例之聚核酸分子結合物,其中該GalNAc包含變旋異構碳鍵結至三價、四價連接子、五價或六價連接子,其中該變旋異構碳為半胺縮醛基之一部分。
實施例34. 如實施例31至33中任一例之聚核酸分子結合物,其中該連接子包含下式(IV), ,其中Y1及Y2中之至少一者為該聚核酸分子中之核苷酸。
實施例35. 如實施例34之聚核酸分子結合物,其中該Y1為該聚核酸分子之有義股之3'端上的最後一個核苷酸。
實施例36. 如實施例31至35中任一例之聚核酸分子結合物,其中該連接子及該去唾液酸醣蛋白受體靶向部分與位於該聚核酸分子之有義股之3'端上的最後一個核苷酸顯示於式(V')、式(V'''')、式(V''''')或式(V'''''')中: ,其中式(V')中之Z為-H、-OH、-O-甲基、-F或-O-甲氧基乙基,且式(V')中之R為腺嘌呤、尿嘧啶、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶、無鹼基或其他; ,其中式(V'''')中之Z為對應於本文所描述之糖修飾中之一者的部分(例如-H、-OH、-O-甲基、-F或-O-甲氧基乙基),且式(V'''')中之R為腺嘌呤、尿嘧啶、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶、無鹼基或其他; ,其中式(V''''')中之Z為對應於本文所描述之糖修飾中之一者的部分(例如-H、-OH、-O-甲基、-F或-O-甲氧基乙基),且式(V''''')中之R為腺嘌呤、尿嘧啶、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶、無鹼基或其他;或 ,其中式(V'''''')中之Z為對應於本文所描述之糖修飾中之一者的部分(例如-H、-OH、-O-甲基、-F或-O-甲氧基乙基),且式(V'''''')中之R為腺嘌呤、尿嘧啶、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶、無鹼基或其他。
實施例37. 如實施例36之聚核酸分子結合物,其中該連接子及該去唾液酸醣蛋白受體靶向部分與位於該聚核酸分子之有義股之3'端上最後一個核苷酸顯示於式(V')中: (V'),其中式(V')中之Z為-H、-OH、-O-甲基、-F或-O-甲氧基乙基,且式(V')中之R為腺嘌呤、尿嘧啶、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶、無鹼基或其他。
實施例38. 一種醫藥組合物,其包含如實施例1至29中任一例之聚核酸分子或如實施例30至37中任一例之聚核酸分子結合物,及醫藥學上可接受之賦形劑。
實施例39. 如實施例38之醫藥組合物,其中該醫藥組合物經調配為奈米粒子調配物。
實施例40. 如實施例38或實施例39之醫藥組合物,其中該醫藥組合物經調配用於非經腸、經口、鼻內、經頰、經直腸、經皮、靜脈內、皮下或鞘內投與。
實施例41. 一種調節有需要個體中之脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的方法,其包含:
向該個體投與如實施例1至28中任一例之聚核酸分子、如實施例29至37中任一例之聚核酸分子結合物或如實施例38至40中任一例之醫藥組合物,由此調節有需要個體中之Lp(a)基因表現。
實施例42. 一種用於治療或預防心血管疾病或脂質病症之方法,其包含:
向該個體投與如實施例1至28中任一例之聚核酸分子、如實施例29至37中任一例之聚核酸分子結合物或如實施例38至40中任一例之醫藥組合物,由此調節有需要個體中之Lp(a)基因表現。
實施例43. 如實施例41或42之方法,其中該聚核酸分子係以足以使Lp(a)基因在該個體之細胞中之表現與對照相比降低至少約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%或90%的劑量投與。
實施例44. 如實施例41或42之方法,其中該聚核酸分子係以足以使該個體之血漿Lp(a)含量與對照相比降低至少約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%或90%的劑量投與。
實施例45. 如實施例41至44中任一例之方法,其中該聚核酸分子係以至少兩種劑量投與,該至少兩種劑量包含初始劑量及二級劑量。
實施例46. 如實施例45之方法,其中該二級劑量在投與該初始劑量之後1至30天投與。
實施例47.如實施例42至46中任一例之方法,其中該心血管疾病為冠狀動脈疾病、急性心肌梗塞、無症狀頸動脈粥樣硬化、中風、心房微顫或周邊動脈阻塞疾病。
實施例48. 如實施例42至46中任一例之方法,其中該脂質病症為高脂質血症(hyperlipidemia)或高膽固醇血症(hypercholesterolemia)。 實例
此等實例僅為了說明目的而提供且不限制本文所提供之申請專利範圍之範疇。 實例 1 - 靶向 Lp(a) siRNA 在初代人類肝細胞 (PHH) 中的活體外功效
將初代人類肝細胞解凍且以9×10 4個細胞/孔之密度塗鋪於經膠原蛋白塗佈之96孔盤上。在不存在轉染試劑的情況下用結合之siRNA處理肝細胞(自由吸收)。用濃度為10 µM或0.5 µM之siRNA處理細胞。未處理之PHH用作陰性對照。靶向不相關基因(Ahsa1)之siRNA亦用作陰性對照。細胞在37℃、5% CO 2下培育48h。在培育期結束時,溶解細胞,且藉由分支DNA (bDNA)分析法量測目標基因之相對表現,且使用標準方案針對管家基因標準化。
所測試之siRNA之有義股及反義股的修飾列於 1中。應注意,有義股序列中之各者在其3'端與GalNac-L96偶合。siRNA之活體外效力資料提供於 3中。
根據標準劑量反應曲線方案選擇四十八(48)個Lp(a) siRNA以符合劑量反應關係。所測試劑量包括10.0、3.33、1.11、0.37、0.12、0.04、0.01、0.005、0.002及0.001 µM siRNA。以至少大約85%來純化siRNA。
劑量反應曲線資料之概述提供於 4中。劑量反應曲線提供於 1A 至圖 1VV中。 實例 2 - 在非人類靈長類動物中測試 Lp(a) siRNA
在非人類靈長類動物研究中測試十五(15)個Lp(a) siRNA (在 2中表示為「SRS-000008」至「SRS-000022」)。對於各siRNA,隨從股/有義股之3'端經由X2與GalNAc結合(參見式(V'))。Lp(a) siRNA具有與食蟹獼猴LPA基因發生交叉反應之序列。向雄性食蟹獼猴(每個處理組n=4/siRNA)投與單次3 mg/kg皮下注射的Lp(a) siRNA構築體SRS-000008至SRS-000022。在第-1天(給藥前)及第3、7、10、14、21、28、35、42、49、56、63、70、77及84天收集血液樣本前使動物禁食隔夜。使用Lp(a) ELISA分析法(Abcam,目錄號ab212165)分析所有血清樣本中的Lp(a)循環蛋白量。 調配物製備
在給藥日在無菌條件下於在室溫進行siRNA製備。將siRNA用氯化鈉溶解,且旋轉或攪拌直至完全溶解。用0.22 µM無菌過濾器過濾溶液且將溶液收集於無菌容器中。將調配物儲存於2℃至8℃。將siRNA用適量的媒劑溶解,分別得到濃度為10mg/mL的給藥調配物。在給藥當天,將siRNA調配物儲存於2℃至8℃以供給藥。給藥程序在6小時內完成。 動物
該研究中使用食蟹獼猴。將動物圈養於不鏽鋼籠子中,每組5隻或更少,劑量水準相同,處於環境監測且通風良好的房間(習知級別),溫度保持在18℃至26℃,且相對濕度保持在40%至70%。螢光照明每天提供照明大約12小時。 實驗設計
為了獲得同性別中體重相當的小組,使用電腦產生之隨機化程序將所有猴子隨機分配各別處理組。在第-5天(第一次給藥前5天)獲得隨機分組所需之體重。隨機分組後,將猴子分配至處理組之一。
使用適當的一次性注射器及支撐針,透過在後肢及/或頸部及背部的皮膚上單點或多點皮下注射,向各組中之每隻猴子給予siRNA調配物。給藥前將注射部位周圍的毛髮剃除,且各注射點接受不超過2 mL。基於最近排期之體重計算劑量。
經由前肢或後肢皮下靜脈採集血液樣本以進行脂蛋白A(Lp(a))血清濃度偵測。在收集血液評估Lp(a)血清濃度之前使猴子禁食隔夜。
將全血樣本添加至經分離凝膠及凝結劑塗佈之離心管中,且暫時儲存且在室溫下轉移。將血液樣本在2小時內處理且在室溫下以1500 g離心10分鐘。離心後,將血清等分至2個新試管中且轉移至新標記之離心管中。所有樣本均在-20℃或以下儲存且避免反覆凍融。使用Watson LIMS 7.5系統來管理樣本。使用ELISA套組(目錄號:ab212165;製造商:Abcam)進行Lp(a)血清濃度分析。 資料分析使用ELISA分析法(Abcam,目錄號ab212165)自第-1天(給藥前)及第3、7、10、14、21、28、35、42、49、56、63、70、77及84天收集的血清樣本測定Lp(a)血清濃度。各個動物的結果係以循環Lp(a)蛋白相對於給藥前(第-1天)時間點的變化%表示。各處理組的平均%變化以及標準差呈現於 6中且繪製於 2中。 實例 3 - 在非人類靈長類動物中測試 Lp(a) siRNA
在實例2中所描述之類似研究中,在食蟹獼猴中測試四種Lp(a) siRNAs、SRS-000013、SRS-000016、SRS-000017及SRS-000018。對於各siRNA,隨從股/有義股之3'端經由X2與GalNAc結合(參見式(V'))。Lp(a) siRNA具有與食蟹獼猴LPA基因發生交叉反應之序列。向雄性食蟹猴(每個處理組n=4/siRNA)投與單次1 mg/kg皮下注射的每種Lp(a) siRNA。在第-1天(給藥前)及第3、7、10、14、21、28、35、42、49、56、63、70、77及85天收集血液樣本前使動物禁食隔夜。在第98、105、112、119、126、133及140天針對SRS-000016及SRS-000018處理組收集另外的血液樣本。使用Lp(a) ELISA分析法(Abcam,目錄號ab212165)分析所有血清樣本中的Lp(a)循環蛋白量。各個動物的結果係以循環Lp(a)蛋白相對於給藥前(第-1天)時間點的變化%表示。各處理組的平均%變化以及標準差呈現於 7中且繪製於 3中。
雖然本文中已經顯示及描述本發明之較佳態樣,熟習此項技術者將顯而易知此等態樣僅藉助於實例提供。熟習此項技術者現將在不背離本發明之情況下想到許多變化、改變及取代。應理解,本文中所描述之本發明態樣的各種替代方案可用於實施本發明。預期以下申請專利範圍限定本發明之範疇,且因此涵蓋此等申請專利範圍及其等效物之範疇內的方法及結構。 2
化合物 ID siRNA ID 未經修飾之反義序列(5'→3') SEQ ID NO 經修飾之反義序列(5'→3') SEQ ID NO siRNA ID 未經修飾之有義序列(5'→3') SEQ ID NO 經修飾之有義序列(5'→3') SEQ ID NO 人類轉錄物位置
SRS-000008 G-000008 UAGAUGACCAAGCUUGGCAGGUC 4 usAfsgaugAfccaaGfcUfuGfgcaggsusc 158 P-000008 CCUGCCAAGCUUGGUCAUCUA 312 cscsugccAfaGfcUfuggucaucua 466 204
SRS-000009 G-000009 UAUAGAUGACCAAGCUUGGCAGG 5 usAfsuagaUfgaccAfaGfcUfuggcasgsg 159 P-000009 UGCCAAGCUUGGUCAUCUAUA 313 usgsccaaGfcUfuGfgucaucuaua 467 206
SRS-000010 G-000010 UCAUAGAUGACCAAGCUUGGCAG 6 usCfsauagAfugacCfaAfgCfuuggcsasg 160 P-000010 GCCAAGCUUGGUCAUCUAUGA 314 gscscaagCfuUfgGfucaucuauga 468 207
SRS-000011 G-000011 UCGACGGCAGUCCCUUCUGCGUC 11 usCfsgacgGfcaguCfcCfuUfcugcgsusc 165 P-000011 CGCAGAAGGGACUGCCGUCGA 319 csgscagaAfgGfgAfcugccgucga 473 382
SRS-000012 G-000012 UUCUAGGCUUGGAACCGGGGUAA 18 usUfscuagGfcuugGfaAfcCfggggusasa 172 P-000012 ACCCCGGUUCCAAGCCUAGAA 326 ascscccgGfuUfcCfaagccuagaa 480 416
SRS-000013 G-000013 UAGCCUCUAGGCUUGGAACCGGG 21 usAfsgccuCfuaggCfuUfgGfaaccgsgsg 175 P-000013 CGGUUCCAAGCCUAGAGGCUA 329 csgsguucCfaAfgCfcuagaggcua 483 420
SRS-000014 G-000014 UUUACCGUGGUAGCACUCCUGCA 44 usUfsuaccGfugguAfgCfaCfuccugscsa 198 P-000014 CAGGAGUGCUACCACGGUAAA 352 csasggagUfgCfuAfccacgguaaa 506 1163
SRS-000015 G-000015 UUGUCCAUUACCGUGGUAGCACU 47 usUfsguccAfuuacCfgUfgGfuagcascsu 201 P-000015 UGCUACCACGGUAAUGGACAA 355 usgscuacCfaCfgGfuaauggacaa 509 1169
SRS-000016 G-000016 UCUCUGUCCAUUACCGUGGUAGC 49 usCfsucugUfccauUfaCfcGfugguasgsc 203 P-000016 UACCACGGUAAUGGACAGAGA 357 usasccacGfgUfaAfuggacagaga 511 1172
SRS-000017 G-000017 UAUUGUGUCAGGUUGCAGUACUC 60 usAfsuuguGfucagGfuUfgCfaguacsusc 214 P-000017 GUACUGCAACCUGACACAAUA 368 gsusacugCfaAfcCfugacacaaua 522 2749
SRS-000018 G-000018 UUGCGUCUGAGCAUUGUGUCAGG 64 usUfsgcguCfugagCfaUfuGfugucasgsg 218 P-000018 UGACACAAUGCUCAGACGCAA 372 usgsacacAfaUfgCfucagacgcaa 526 2760
SRS-000019 G-000019 UUAACUCUGUCCAUAAUGGUAGU 88 usUfsaacuCfugucCfaUfaAfugguasgsu 242 P-000019 UACCAUUAUGGACAGAGUUAA 396 usasccauUfaUfgGfacagaguuaa 550 3227
SRS-000020 G-000020 UCCAAGCUUGGCAAGUUCUUCCU 89 usCfscaagCfuuggCfaAfgUfucuucscsu 243 P-000020 GAAGAACUUGCCAAGCUUGGA 397 gsasagaaCfuUfgCfcaagcuugga 551 3276
SRS-000021 G-000021 UAGAUGACCAAGCUUGGCAAGUU 90 usAfsgaugAfccaaGfcUfuGfgcaagsusu 244 P-000021 CUUGCCAAGCUUGGUCAUCUA 398 csusugccAfaGfcUfuggucaucua 552 3282
SRS-000022 G-000022 UGGUCCGACUAUGCUGGUGUGGU 98 usGfsguccGfacuaUfgCfuGfgugugsgsu 252 P-000022 CACACCAGCAUAGUCGGACCA 406 csascaccAfgCfaUfagucggacca 560 3309
如本文所使用,「A」係指腺苷-3'-磷酸;「a」係指2'-O-甲基腺苷-3'-磷酸;「Af」係指2'-氟腺苷-3'-磷酸;「C」係指胞苷-3'-磷酸;「c」係指2'-O-甲基胞苷-3'-磷酸;「Cf」係指2'-氟胞苷-3'-磷酸;「G」係指鳥苷-3'-磷酸;「g」係指2'-O-甲基鳥苷-3'-磷酸;「Gf」係指2'-氟鳥苷-3'-磷酸;「U」係指尿苷-3'-磷酸;「u」係指2'-O-甲基尿苷-3'-磷酸;「Uf」係指2'-氟尿苷-3'-磷酸;「T」係指5-甲基尿苷-3'-磷酸;「t」係指2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「Tf」係指2'-氟-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「s」係指3'-硫代磷酸酯。「人類轉錄物位置」定義為人類轉錄物(NCBI參考序列編號:NM_005577.4)中之21聚體目標位點的5'位置。各經修飾之有義序列在其3'端經由連接子(例如式V'、V''''、V'''''或V'''''')與靶向部分(例如GalNAc或半乳糖)偶合。
3. 初代人類肝細胞 (PHH) 中之 siRNA 功效
化合物 ID 10 µM 0.5 µM 21 聚體有義股之位置
一式四份MV[ 目標mRNA 殘餘%] 一式四份SD 一式四份MV[ 目標mRNA 殘餘%] 一式四份SD
Untreated 118 8 94 10 n/a
SRS-000023 98 10 87 3 198
SRS-000024 85 11 79 4 199
SRS-000025 100 2 83 6 202
SRS-000026 73 6 63 5 204
SRS-000027 82 14 85 1 206
SRS-000028 66 11 68 4 207
SRS-000029 78 6 70 3 260
SRS-000030 97 9 83 6 374
SRS-000031 107 10 91 6 379
SRS-000032 100 9 80 10 381
未經處理 102 10 94 6 n/a
對照(Ahsa1) 96 15 86 6 n/a
SRS-000033 82 13 79 6 382
SRS-000034 96 17 79 3 383
SRS-000035 94 12 76 3 406
SRS-000036 92 6 92 11 407
SRS-000037 94 5 81 7 408
SRS-000038 93 2 82 6 411
SRS-000039 87 3 74 4 412
SRS-000040 73 11 75 1 416
SRS-000041 91 9 86 5 417
SRS-000042 93 8 85 2 419
untreated 96 3 90 5 n/a
untreated 100 9 102 2 n/a
SRS-000043 69 5 80 3 420
SRS-000044 81 6 89 3 421
SRS-000045 82 11 87 6 425
SRS-000046 86 9 97 7 427
SRS-000047 83 11 91 10 430
SRS-000048 95 14 99 6 435
SRS-000049 90 3 80 27 436
SRS-000050 70 31 97 4 438
SRS-000051 88 9 94 10 439
SRS-000052 85 5 94 8 442
未經處理 96 8 96 6 n/a
對照(Ahsa1) 105 1 117 5 n/a
SRS-000053 97 8 98 2 446
SRS-000054 67 4 89 1 470
SRS-000055 82 3 94 5 471
SRS-000056 77 6 87 3 493
SRS-000057 69 8 82 4 494
SRS-000058 63 7 73 3 503
SRS-000059 100 5 99 8 504
SRS-000060 100 6 103 8 505
SRS-000061 99 8 98 2 515
SRS-000062 86 4 89 3 541
未經處理 100 3 85 8 n/a
未經處理 89 7 102 3 n/a
SRS-000063 80 6 92 5 544
SRS-000064 63 10 69 4 546
SRS-000065 71 4 89 9 1162
SRS-000066 66 4 83 3 1163
SRS-000067 65 4 96 31 1165
SRS-000068 87 5 93 5 1168
SRS-000069 67 3 82 11 1169
SRS-000070 92 6 91 5 1171
SRS-000071 69 3 79 6 1172
SRS-000072 86 3 89 5 1174
未經處理 93 11 100 7 n/a
對照(Ahsa1) 94 7 118 14 n/a
SRS-000073 66 1 76 5 1177
SRS-000074 62 2 77 5 1178
SRS-000075 76 2 89 6 2684
SRS-000076 83 2 98 4 2698
SRS-000077 87 5 102 5 2701
SRS-000078 78 9 89 6 2705
SRS-000079 81 2 92 34 2706
SRS-000080 90 8 99 11 2707
SRS-000081 90 3 91 9 2747
SRS-000082 70 4 82 8 2749
未經處理 95 2 91 7 n/a
未經處理 101 7 109 11 n/a
SRS-000083 89 4 95 10 2751
SRS-000084 84 19 98 9 2753
SRS-000085 85 6 102 8 2754
SRS-000086 78 2 78 7 2760
SRS-000089 81 7 90 7 2815
SRS-000090 85 6 92 5 2823
SRS-000091 83 6 88 5 2841
SRS-000092 96 3 101 3 2843
SRS-000093 80 7 76 4 2894
SRS-000094 91 6 96 1 3023
未經處理 101 7 96 4 n/a
對照(Ahsa1) 108 5 94 7 n/a
SRS-000095 86 4 78 3 3044
SRS-000096 92 8 86 4 3047
SRS-000097 87 7 91 9 3049
SRS-000098 92 7 86 5 3050
SRS-000099 90 3 92 7 3090
SRS-000100 92 4 93 5 3094
SRS-000101 97 8 93 7 3095
SRS-000102 92 5 93 4 3096
SRS-000103 99 6 100 7 3098
SRS-000104 97 7 106 3 3158
未經處理 90 20 101 9 n/a
未經處理 97 10 144 64 n/a
SRS-000105 83 5 88 7 3218
SRS-000106 79 5 84 15 3219
SRS-000107 82 7 77 5 3220
SRS-000108 82 8 78 6 3223
SRS-000109 83 7 79 10 3226
SRS-000110 66 7 73 18 3227
SRS-000111 70 5 71 8 3276
SRS-000112 56 7 56 13 3282
SRS-000113 56 1 60 2 3284
SRS-000114 48 3 57 3 3285
未經處理 91 9 77 2 n/a
對照(Ahsa1) 108 5 95 1 n/a
SRS-000115 97 6 82 6 3303
SRS-000116 93 9 89 10 3304
SRS-000117 89 7 83 9 3305
SRS-000118 91 5 77 7 3307
SRS-000119 89 4 75 4 3308
SRS-000120 79 4 77 4 3309
SRS-000121 95 5 79 6 3316
SRS-000122 94 9 84 5 3317
SRS-000123 91 10 78 2 3320
SRS-000124 97 13 82 10 3396
未經處理 104 13 83 6 n/a
未經處理 99 6 99 3 n/a
SRS-000125 96 7 91 5 3397
SRS-000126 93 11 90 7 3398
SRS-000127 91 12 87 4 3399
SRS-000128 93 10 86 5 3406
SRS-000129 91 7 90 2 3407
SRS-000130 91 9 88 7 3464
SRS-000131 88 12 92 6 3735
SRS-000132 91 13 85 5 3737
SRS-000133 77 2 84 5 3738
SRS-000134 85 10 81 3 3741
未經處理 97 7 89 5 n/a
對照(Ahsa1) 108 4 105 5 n/a
SRS-000135 94 4 89 11 3778
SRS-000136 90 2 94 9 3779
SRS-000137 89 3 90 5 3780
SRS-000138 88 5 86 5 3783
SRS-000139 94 9 86 4 3790
SRS-000140 80 6 82 6 3991
SRS-000141 90 4 91 5 4049
SRS-000142 92 2 83 9 4053
SRS-000143 96 2 75 17 4055
SRS-000144 94 11 85 12 4056
未經處理 96 9 95 10 n/a
未經處理 101 3 94 3 n/a
SRS-000145 99 9 90 9 4066
SRS-000146 91 12 78 5 4067
SRS-000147 93 7 75 4 4138
SRS-000148 91 14 80 3 4139
SRS-000149 95 12 80 4 4150
SRS-000150 93 14 70 5 4450
SRS-000151 96 12 74 3 4645
SRS-000152 97 9 73 4 4646
SRS-000153 100 12 73 2 4733
SRS-000154 104 10 70 2 4802
未經處理 103 5 77 3 n/a
對照(Ahsa1) 97 6 110 17 n/a
SRS-000155 81 15 83 8 4803
SRS-000156 83 2 110 42 4805
SRS-000157 84 5 82 10 4806
SRS-000158 87 2 76 5 4808
SRS-000159 83 3 75 6 4812
SRS-000160 84 7 79 7 4823
SRS-000161 89 3 75 10 4926
SRS-000162 89 2 80 10 4969
SRS-000163 90 4 84 14 4970
SRS-000164 97 14 86 14 5073
未經處理 99 8 96 12 n/a
未經處理 121 18 102 7 n/a
SRS-000165 106 5 98 2 5121
SRS-000166 101 9 92 4 5122
SRS-000167 96 9 92 6 5123
SRS-000168 82 1 78 10 5124
SRS-000169 104 7 91 7 5126
SRS-000170 95 10 81 13 5127
SRS-000171 100 10 92 8 5128
SRS-000172 96 6 86 11 5129
SRS-000173 92 8 79 5 5130
SRS-000174 100 5 87 8 5132
未經處理 101 5 84 10 n/a
對照(Ahsa1) 92 14 117 11 n/a
SRS-000175 75 8 81 10 5505
SRS-000176 76 6 92 7 5866
SRS-000087 85 5 88 3 2762
SRS-000088 81 3 90 3 2764
未經處理 86 8 97 4 n/a
MV:平均值。SD:標準差。「21聚體有義股之位置」定義為人類轉錄物(NCBI參考序列編號:NM_005577.4)中之21聚體有義股目標位點的5'位置
4. 初代人類肝細胞中之劑量反應曲線
化合物 ID 轉錄物起始位點(21 聚體有義股之5' 位置) 劑量[µM] 一式四份MV [ 目標mRNA 殘餘%] 一式四份SD  
SRS-000026 204 模擬 99 8
10.0 40 8
3.33 44 4
1.11 56 3
0.37 63 9
0.12 65 3
0.04 68 7
0.01 75 3
0.005 73 2
0.002 79 4
0.001 86 4
對照(Ahsa1) 1.11 µM 95 2
   模擬 101 9
SRS-000027 206 10.0 51 4
3.33 54 4
1.11 59 7
0.37 70 7
0.12 79 6
0.04 88 4
0.01 93 9
0.005 92 3
0.002 95 13
0.001 102 10
   模擬 105 15
   模擬 97 5
SRS-000028 207 10.0 51 2
      3.33 55 4
      1.11 63 9
      0.37 58 5
      0.12 68 5
      0.04 94 3
      0.01 90 8
      0.005 83 5
      0.002 94 9
      0.001 93 4
對照(Ahsa1) 1.11 µM 99 6
   模擬 105 2
SRS-000029 260 10.0 59 7
3.33 60 4
1.11 75 11
0.37 70 4
0.12 75 2
0.04 82 4
0.01 86 6
0.005 82 5
0.002 88 3
0.001 87 4
   模擬 100 10
   模擬 98 11
SRS-000033 382 10.0 89 11
3.33 82 4
1.11 90 9
0.37 92 7
0.12 88 12
0.04 91 10
0.01 97 6
0.005 97 9
0.002 90 11
0.001 97 5
對照(Ahsa1) 1.11 µM 99 9
   模擬 102 3
SRS-000040 416 10.0 78 7
3.33 81 6
1.11 87 4
0.37 87 3
0.12 90 5
0.04 111 23
0.01 99 2
0.005 100 7
0.002 96 13
0.001 102 6
   模擬 101 6
   模擬 100 4
SRS-000043 420 10.0 75 6
3.33 74 2
1.11 76 3
0.37 83 5
0.12 78 4
0.04 87 9
0.01 89 5
0.005 88 5
0.002 94 7
0.001 92 3
對照(Ahsa1) 1.11 µM 102 5
   模擬 100 5
SRS-000044 421 10.0 73 4
3.33 74 2
1.11 84 5
0.37 83 7
0.12 79 4
0.04 82 7
0.01 81 3
0.005 88 8
0.002 93 4
0.001 93 3
   模擬 99 6
   模擬 89 8
SRS-000045 425 10.0 74 8
3.33 74 8
1.11 79 9
0.37 81 13
0.12 80 12
0.04 85 18
0.01 87 6
0.005 85 10
0.002 97 10
0.001 87 6
對照(Ahsa1) 1.11 µM 99 6
   模擬 106 19
SRS-000050 438 10.0 84 10
3.33 84 6
1.11 93 7
0.37 86 7
0.12 93 8
0.04 89 7
0.01 101 11
0.005 95 3
0.002 105 2
0.001 101 9
   模擬 107 8
   模擬 101 5
SRS-000054 470 10.0 61 4
3.33 64 6
1.11 73 4
0.37 78 5
0.12 80 4
0.04 88 5
0.01 90 7
0.005 88 4
0.002 95 10
0.001 90 8
對照(Ahsa1) 1.11 µM 102 11
   模擬 95 7
SRS-000056 493 10.0 57 3
3.33 60 2
1.11 73 7
0.37 76 6
0.12 78 7
0.04 85 4
0.01 94 10
0.005 92 8
0.002 98 8
0.001 99 13
   模擬 102 4
   模擬 102 7
SRS-000057 494 10.0 58 2
3.33 56 2
1.11 64 5
0.37 71 7
0.12 75 8
0.04 87 7
0.01 91 8
0.005 89 2
0.002 98 2
0.001 101 5
對照(Ahsa1) 1.11 µM 101 3
   模擬 98 4
SRS-000058 503 10.0 71 2
3.33 73 6
1.11 67 9
0.37 71 7
0.12 67 6
0.04 69 3
0.01 73 5
0.005 74 3
0.002 79 7
0.001 85 13
   模擬 98 10
   模擬 107 6
SRS-000064 546 10.0 46 2
3.33 50 2
1.11 58 3
0.37 63 4
0.12 69 5
0.04 72 2
0.01 77 2
0.005 74 4
0.002 82 2
0.001 90 2
對照(Ahsa1) 1.11 µM 92 6
   模擬 108 4
SRS-000065 1162 10.0 99 14
3.33 76 2
1.11 104 4
0.37 100 4
0.12 104 8
0.04 97 8
0.01 96 10
0.005 99 8
0.002 103 8
0.001 102 6
   模擬 93 6
   模擬 101 10
SRS-000066 1163 10.0 71 4
3.33 72 5
1.11 86 9
0.37 81 8
0.12 92 9
0.04 96 11
0.01 95 7
0.005 89 8
0.002 91 6
0.001 94 7
對照(Ahsa1) 1.11 µM 97 3
SRS-000067 1165 10.0 81 5
3.33 79 8
1.11 95 5
0.37 88 8
0.12 97 6
0.04 93 4
0.01 102 9
0.005 92 7
0.002 103 5
0.001 101 7
   模擬 98 4
   模擬 106 1
SRS-000069 1169 10.0 81 1
3.33 77 2
1.11 80 5
0.37 82 4
0.12 81 4
0.04 84 8
0.01 85 4
0.005 81 3
0.002 87 3
0.001 88 3
對照(Ahsa1) 1.11 µM 93 5
   模擬 102 6
SRS-000071 1172 10.0 87 9
3.33 85 3
1.11 92 9
0.37 87 4
0.12 92 5
0.04 93 6
0.01 85 4
0.005 93 5
0.002 87 7
0.001 93 4
   模擬 98 5
   模擬 99 12
SRS-000073 1177 10.0 55 5
3.33 58 3
1.11 71 4
0.37 75 3
0.12 76 3
0.04 80 5
0.01 80 6
0.005 84 7
0.002 96 6
0.001 100 9
對照(Ahsa1) 1.11 µM 100 8
   模擬 104 7
SRS-000074 1178 10.0 49 2
3.33 55 3
1.11 62 8
0.37 70 2
0.12 74 2
0.04 81 2
0.01 88 9
0.005 88 5
0.002 98 9
0.001 102 3
   模擬 97 3
   模擬 96 8
SRS-000075 2684 10.0 84 9
3.33 87 8
1.11 96 11
0.37 93 6
0.12 98 9
0.04 93 5
0.01 96 4
0.005 96 3
0.002 96 5
0.001 95 3
對照(Ahsa1) 1.11 µM 98 3
   模擬 111 2
SRS-000078 2705 10.0 88 1
3.33 89 8
1.11 96 4
0.37 92 4
0.12 107 11
0.04 107 16
0.01 86 4
0.005 91 11
0.002 94 3
0.001 96 3
   模擬 95 8
   模擬 88 6
SRS-000079 2706 10.0 58 1
3.33 57 2
1.11 59 5
0.37 64 3
0.12 64 3
0.04 73 7
0.01 67 6
0.005 68 3
0.002 75 4
0.001 80 5
對照(Ahsa1) 1.11 µM 88 13
   模擬 125 12
SRS-000082 2749 10.0 77 13
3.33 71 11
1.11 80 13
0.37 77 14
0.12 77 10
0.04 80 9
0.01 87 14
0.005 80 10
0.002 85 14
0.001 94 8
   模擬 100 14
   模擬 90 21
SRS-000086 2760 10.0 71 16
3.33 56 6
1.11 69 12
0.37 60 5
0.12 56 5
0.04 57 3
0.01 58 7
0.005 58 6
0.002 61 3
0.001 72 3
對照(Ahsa1) 1.11 µM 109 27
   模擬 99 4
SRS-000093 2894 10.0 61 4
3.33 57 5
1.11 60 9
0.37 67 2
0.12 75 2
0.04 73 5
0.01 75 9
0.005 77 3
0.002 84 4
0.001 81 9
   模擬 103 10
   模擬 98 4
SRS-000106 3219 10.0 87 9
3.33 90 19
1.11 102 11
0.37 87 7
0.12 83 9
0.04 84 9
0.01 92 12
0.005 79 13
0.002 82 7
0.001 85 6
對照(Ahsa1) 1.11 µM 100 9
   模擬 99 19
SRS-000107 3220 10.0 85 5
3.33 97 5
1.11 100 9
0.37 94 4
0.12 93 7
0.04 91 5
0.01 94 8
0.005 88 11
0.002 95 12
0.001 96 13
   模擬 103 6
   模擬 88 15
SRS-000108 3223 10.0 83 11
3.33 84 6
1.11 84 5
0.37 55 20
0.12 73 4
0.04 67 6
0.01 84 8
0.005 68 11
0.002 82 6
0.001 100 8
對照(Ahsa1) 1.11 µM 95 8
   模擬 109 2
SRS-000109 3226 10.0 94 7
3.33 86 17
1.11 83 14
0.37 92 16
0.12 80 9
0.04 80 11
0.01 81 15
0.005 74 17
0.002 84 6
0.001 91 6
   模擬 108 9
   模擬 92 8
SRS-000110 3227 10.0 66 4
3.33 62 3
1.11 67 1
0.37 58 11
0.12 68 3
0.04 79 6
0.01 84 9
0.005 82 11
0.002 88 7
0.001 94 4
對照(Ahsa1) 1.11 µM 101 4
   模擬 107 9
SRS-000111 3276 10.0 83 3
3.33 82 2
1.11 90 6
0.37 85 2
0.12 79 3
0.04 82 3
0.01 87 5
0.005 84 7
0.002 93 8
0.001 96 4
   模擬 100 8
   模擬 92 4
SRS-000112 3282 10.0 48 5
3.33 53 9
1.11 52 4
0.37 53 7
0.12 54 3
0.04 58 5
0.01 68 6
0.005 66 4
0.002 75 4
0.001 82 5
對照(Ahsa1) 1.11 µM 100 3
   模擬 91 5
SRS-000113 3284 10.0 55 6
3.33 63 4
1.11 84 7
0.37 79 1
0.12 76 3
0.04 81 2
0.01 87 4
0.005 85 6
0.002 88 7
0.001 93 4
   模擬 95 5
   模擬 93 6
SRS-000114 3285 10.0 41 2
3.33 42 2
1.11 47 5
0.37 60 3
0.12 67 5
0.04 74 2
0.01 85 6
0.005 75 6
0.002 88 5
0.001 92 8
對照(Ahsa1) 1.11 µM 99 6
   模擬 107 10
SRS-000120 3309 10.0 90 7
3.33 87 7
1.11 88 7
0.37 93 6
0.12 87 9
0.04 94 5
0.01 97 7
0.005 86 2
0.002 96 10
0.001 93 5
   模擬 77 52
   模擬 94 8
SRS-000133 3738 10.0 82 5
3.33 71 4
1.11 83 4
0.37 84 9
0.12 87 4
0.04 86 0
0.01 91 9
0.005 86 6
0.002 95 5
0.001 102 3
對照(Ahsa1) 1.11 µM 106 10
   模擬 103 5
SRS-000134 3741 10.0 97 2
3.33 95 6
1.11 103 8
0.37 98 7
0.12 102 5
0.04 100 8
0.01 105 11
0.005 103 12
0.002 104 17
0.001 111 6
   模擬 97 14
   模擬 103 4
SRS-000135 3778 10.0 90 9
3.33 87 10
1.11 91 7
0.37 106 23
0.12 93 5
0.04 89 4
0.01 85 24
0.005 91 5
0.002 97 6
0.001 95 6
對照(Ahsa1) 1.11 µM 94 4
   模擬 105 12
SRS-000140 3991 10.0 81 8
3.33 77 3
1.11 87 11
0.37 85 8
0.12 87 5
0.04 90 4
0.01 105 14
0.005 93 1
0.002 100 5
0.001 99 4
   模擬 98 3
   模擬 114 17
SRS-000155 4803 10.0 77 12
3.33 77 4
1.11 86 8
0.37 83 4
0.12 78 3
0.04 80 8
0.01 84 2
0.005 85 8
0.002 89 1
0.001 91 4
對照(Ahsa1) 1.11 µM 90 2
   模擬 104 6
SRS-000168 5124 10.0 65 3
3.33 63 4
1.11 82 17
0.37 74 5
0.12 72 8
0.04 74 8
0.01 86 8
0.005 83 3
0.002 88 9
0.001 90 4
   模擬 92 8
   模擬 97 4
SRS-000175 5505 10.0 85 6
3.33 88 7
1.11 85 11
0.37 82 7
0.12 81 10
0.04 87 14
0.01 91 7
0.005 88 8
0.002 89 7
0.001 92 4
對照(Ahsa1) 1.11 µM 102 4
   模擬 96 14
SRS-000176 5866 10.0 96 4
3.33 95 5
1.11 101 8
0.37 93 18
0.12 96 4
0.04 96 5
0.01 103 4
0.005 99 3
0.002 100 3
0.001 101 6
   模擬 106 9
   模擬 92 7
SRS-000087 2762 10.0 89 6
3.33 77 4
1.11 96 18
0.37 81 3
0.12 76 6
0.04 69 4
0.01 83 13
0.005 72 5
0.002 79 7
0.001 86 3
對照(Ahsa1) 1.11 µM 94 4
   模擬 108 15
SRS-000088 2764 10.0 94 8
3.33 86 13
1.11 99 8
0.37 95 7
0.12 95 17
0.04 99 14
0.01 105 7
0.005 97 12
0.002 99 15
0.001 97 10
   對照 106 6
MV:平均值。SD:標準差。「轉錄物起始位點」定義為人類轉錄物(NCBI參考序列編號:NM_005577.4)中之21聚體有義股目標位點的5'位置
5. 初代人類肝細胞中之最終劑量反應
化合物 ID siRNA ID 經修飾之反義序列(5'→3') SEQ ID NO. siRNA ID 經修飾之有義序列(5'→3') SEQ ID NO. IC50 (µM) IC80 (µM) NM_005577.4 中之轉錄起始位點 在最高劑量下之MV 最大KD SD 最大KD
SRS-000026 G-000008 usAfsgaugAfccaaGfcUfuGfgcaggsusc 158 P-000026 cscsugccAfaGfcUfuggucaucua 466 2.046722 127.9168 204 60.20508 7.820476
SRS-000027 G-000009 usAfsuagaUfgaccAfaGfcUfuggcasgsg 159 P-000027 usgsccaaGfcUfuGfgucaucuaua 467 12.28532 #N/A 206 48.55853 3.722845
SRS-000028 G-000010 usCfsauagAfugacCfaAfgCfuuggcsasg 160 P-000028 gscscaagCfuUfgGfucaucuauga 468 13.86981 #N/A 207 48.81948 2.262899
SRS-000029 G-000026 usAfsucaaGfccagCfaUfuUfggguasgsu 161 P-000029 usascccaAfaUfgCfuggcuugaua 469 49.46417 4399.698 260 41.22481 7.184138
SRS-000033 G-000011 usCfsgacgGfcaguCfcCfuUfcugcgsusc 165 P-000033 csgscagaAfgGfgAfcugccgucga 473 #N/A #N/A 382 10.80257 10.65991
SRS-000040 G-000012 usUfscuagGfcuugGfaAfcCfggggusasa 172 P-000040 ascscccgGfuUfcCfaagccuagaa 480 #N/A #N/A 416 22.43361 6.593784
SRS-000043 G-000013 usAfsgccuCfuaggCfuUfgGfaaccgsgsg 175 P-000043 csgsguucCfaAfgCfcuagaggcua 483 #N/A #N/A 420 25.05174 6.339611
SRS-000044 G-000038 usGfsagccUfcuagGfcUfuGfgaaccsgsg 176 P-000044 gsgsuuccAfaGfcCfuagaggcuca 484 #N/A #N/A 421 27.05507 3.55983
SRS-000045 G-000039 usGfsaaggAfgccuCfuAfgGfcuuggsasa 177 P-000045 cscsaagcCfuAfgAfggcuccuuca 485 #N/A #N/A 425 25.79898 7.67276
SRS-000050 G-000044 usCfsggugCfuuguUfcGfgAfaggagscsc 182 P-000050 csusccuuCfcGfaAfcaagcaccga 490 #N/A #N/A 438 16.28757 9.523407
SRS-000054 G-000048 usUfsagcaCfuccuGfcAfcCfccaggscsc 186 P-000054 cscsugggGfuGfcAfggagugcuaa 494 39.77935 1302.725 470 38.88559 3.700684
SRS-000056 G-000050 usGfsauaaCfucugUfcCfaUfuaccasusg 188 P-000056 usgsguaaUfgGfaCfagaguuauca 496 61.08738 #N/A 493 43.48794 2.714998
SRS-000057 G-000051 usCfsgauaAfcucuGfuCfcAfuuaccsasu 189 P-000057 gsgsuaauGfgAfcAfgaguuaucga 497 #N/A #N/A 494 41.58673 1.838853
SRS-000058 G-000052 usUfsauguGfccucGfaUfaAfcucugsusc 190 P-000058 csasgaguUfaUfcGfaggcacauaa 498 #N/A #N/A 503 28.61084 2.377041
SRS-000064 G-000058 usAfsgaugAfccaaGfcUfuGfgcaggsusu 196 P-000064 cscsugccAfaGfcUfuggucaucua 504 4.327232 961.917 546 54.44387 2.479078
SRS-000065 G-000059 usUfsaccgUfgguaGfcAfcUfccugcsasc 197 P-000065 gscsaggaGfuGfcUfaccacgguaa 505 #N/A #N/A 1162 1.002411 13.93118
SRS-000066 G-000014 usUfsuaccGfugguAfgCfaCfuccugscsa 198 P-000066 csasggagUfgCfuAfccacgguaaa 506 123.3882 1424.798 1163 29.36707 4.073732
SRS-000067 G-000060 usCfsauuaCfcgugGfuAfgCfacuccsusg 199 P-000067 gsgsagugCfuAfcCfacgguaauga 507 #N/A #N/A 1165 18.72208 5.49196
SRS-000069 G-000015 usUfsguccAfuuacCfgUfgGfuagcascsu 201 P-000069 usgscuacCfaCfgGfuaauggacaa 509 #N/A #N/A 1169 19.26548 1.456436
SRS-000071 G-000016 usCfsucugUfccauUfaCfcGfugguasgsc 203 P-000071 usasccacGfgUfaAfuggacagaga 511 #N/A #N/A 1172 13.3161 8.604597
SRS-000073 G-000064 usGfsauaaCfucugUfcCfaUfuaccgsusg 205 P-000073 csgsguaaUfgGfaCfagaguuauca 513 35.23821 #N/A 1177 45.02429 4.735237
SRS-000074 G-000065 usCfsgauaAfcucuGfuCfcAfuuaccsgsu 206 P-000074 gsgsuaauGfgAfcAfgaguuaucga 514 9.343352 #N/A 1178 51.44863 1.590263
SRS-000075 G-000066 usAfscaggAfucugGfaUfuCfcugcasgsu 207 P-000075 usgscaggAfaUfcCfagauccugua 515 4491.018 56880.83 2684 16.44153 9.013653
SRS-000078 G-000069 usGfsuauaAfcaauAfaGfgGfgcugcscsa 210 P-000078 gscsagccCfcUfuAfuuguuauaca 518 #N/A #N/A 2705 12.1747 1.347575
SRS-000079 G-000070 usCfsguauAfacaaUfaAfgGfggcugscsc 211 P-000079 csasgcccCfuUfaUfuguuauacga 519 #N/A #N/A 2706 41.82359 0.808165
SRS-000082 G-000017 usAfsuuguGfucagGfuUfgCfaguacsusc 214 P-000082 gsusacugCfaAfcCfugacacaaua 522 #N/A #N/A 2749 23.07176 13.12197
SRS-000086 G-000018 usUfsgcguCfugagCfaUfuGfugucasgsg 218 P-000086 usgsacacAfaUfgCfucagacgcaa 526 #N/A #N/A 2760 29.35791 15.60843
SRS-000087 G-000076 usUfscugcGfucugAfgCfaUfuguguscsa 219 P-000087 ascsacaaUfgCfuCfagacgcagaa 527 #N/A #N/A 2762 10.5034 6.168005
SRS-000088 G-000077 usCfsuucuGfcgucUfgAfgCfauugusgsu 220 P-000088 ascsaaugCfuCfaGfacgcagaaga 528 #N/A #N/A 2764 5.712127 7.947043
SRS-000093 G-000082 usGfsugccUfugauAfaCfuCfuguccsasu 225 P-000093 gsgsacagAfgUfuAfucaaggcaca 533 163.9122 #N/A 2894 39.04343 3.861572
SRS-000106 G-000095 usUfsccauAfauggUfaGfuAfgcaguscsc 238 P-000106 ascsugcuAfcUfaCfcauuauggaa 546 #N/A #N/A 3219 13.31607 9.205419
SRS-000107 G-000096 usGfsuccaUfaaugGfuAfgUfagcagsusc 239 P-000107 csusgcuaCfuAfcCfauuauggaca 547 #N/A #N/A 3220 14.80472 4.612617
SRS-000108 G-000097 usUfscuguCfcauaAfuGfgUfaguagscsa 240 P-000108 csusacuaCfcAfuUfauggacagaa 548 #N/A #N/A 3223 16.80029 11.10403
SRS-000109 G-000098 usAfsacucUfguccAfuAfaUfgguagsusa 241 P-000109 csusaccaUfuAfuGfgacagaguua 549 #N/A #N/A 3226 6.153194 7.498487
SRS-000110 G-000019 usUfsaacuCfugucCfaUfaAfugguasgsu 242 P-000110 usasccauUfaUfgGfacagaguuaa 550 #N/A #N/A 3227 33.61694 3.644445
SRS-000111 G-000020 usCfscaagCfuuggCfaAfgUfucuucscsu 243 P-000111 gsasagaaCfuUfgCfcaagcuugga 551 #N/A #N/A 3276 17.35972 2.580181
SRS-000112 G-000021 usAfsgaugAfccaaGfcUfuGfgcaagsusu 244 P-000112 csusugccAfaGfcUfuggucaucua 552 8.297705 #N/A 3282 51.59325 4.521415
SRS-000113 G-000099 usAfsuagaUfgaccAfaGfcUfuggcasasg 245 P-000113 usgsccaaGfcUfuGfgucaucuaua 553 33.84077 659.9335 3284 45.41711 6.175907
SRS-000114 G-000100 usCfsauagAfugacCfaAfgCfuuggcsasa 246 P-000114 gscscaagCfuUfgGfucaucuauga 554 1.349305 11004.53 3285 58.87523 2.300955
SRS-000120 G-000022 usGfsguccGfacuaUfgCfuGfgugugsgsu 252 P-000120 csascaccAfgCfaUfagucggacca 560 #N/A #N/A 3309 10.24371 7.209576
SRS-000133 G-000118 usAfsuccaUfgguaUfaAfcAfccaagsgsa 265 P-000133 csusugguGfuUfaUfaccauggaua 573 #N/A #N/A 3738 17.57087 5.286225
SRS-000134 G-000119 usGfsggauCfcaugGfuAfuAfacaccsasa 266 P-000134 gsgsuguuAfuAfcCfauggauccca 574 #N/A #N/A 3741 2.983854 2.420011
SRS-000135 G-000120 usGfsacauUfguguCfaGfgUfugcagsusa 267 P-000135 csusgcaaCfcUfgAfcacaauguca 575 #N/A #N/A 3778 9.608682 8.804995
SRS-000140 G-000125 usCfsaccaUfuuggGfuAfgUfauucusgsu 272 P-000140 asgsaauaCfuAfcCfcaaaugguga 580 #N/A #N/A 3991 19.11657 7.678151
SRS-000155 G-000140 usUfsaggaCfaccuGfaUfuCfuguuuscsu 287 P-000155 asasacagAfaUfcAfgguguccuaa 595 #N/A #N/A 4803 23.19757 11.52321
SRS-000168 G-000153 usUfsgagcAfucgcGfuCfaGfguugcsasg 300 P-000168 gscsaaccUfgAfcGfcgaugcucaa 608 #N/A #N/A 5124 34.5264 2.589133
SRS-000175 G-000160 usUfsacaaUfgcuuCfcAfgGfacauususc 307 P-000175 asasugucCfuGfgAfagcauuguaa 615 #N/A #N/A 5505 15.05201 6.295908
SRS-000176 G-000161 usCfsagugAfuguaAfcAfuUfcagucscsu 308 P-000176 gsascugaAfuGfuUfacaucacuga 616 #N/A #N/A 5866 3.802795 3.789188
如本文所使用,「A」係指腺苷-3'-磷酸;「a」係指2'-O-甲基腺苷-3'-磷酸;「Af」係指2'-氟腺苷-3'-磷酸;「C」係指胞苷-3'-磷酸;「c」係指2'-O-甲基胞苷-3'-磷酸;「Cf」係指2'-氟胞苷-3'-磷酸;「G」係指鳥苷-3'-磷酸;「g」係指2'-O-甲基鳥苷-3'-磷酸;「Gf」係指2'-氟鳥苷-3'-磷酸;「U」係指尿苷-3'-磷酸;「u」係指2'-O-甲基尿苷-3'-磷酸;「Uf」係指2'-氟尿苷-3'-磷酸;「T」係指5-甲基尿苷-3'-磷酸;「t」係指2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「Tf」係指2'-氟-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「s」係指3'-硫代磷酸酯。「NM_005577.4中之轉錄物起始位點」定義為人類轉錄物(NCBI參考序列編號:NM_005577.4)中之21聚體目標位點的5'位置。應注意,有義股序列在該有義股之3'端處與靶向部分(例如GalNAc或半乳糖)偶合。MV:平均值。SD:標準差。
6. 在單次 3 mg/kg 劑量之後食蟹獼猴循環 LP(a) 血清濃度的變化 %
獼猴血清脂蛋白A 濃度相對於基線之變化% ( 第-1 天) SRS ID SRS-000008 SRS-000009 SRS-000010 SRS-000011 SRS-000012 SRS-000013 SRS-000014 SRS-000015 SRS-000016 SRS-000017 SRS-000018 SRS-000019 SRS-000020 SRS-000021 SRS-000022
21 聚體有義股之位置 204 206 207 382 416 420 1163 1169 1172 2749 2760 3227 3276 3282 3309
研究日 -1 Avg 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
StDev 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3 Avg -12.9 -8.9 -1.7 -4.5 -11.9 -11.9 -5.3 8.8 0.2 -4.9 12.8 26.2 -0.1 7.3 22.3
StDev 10.8 8.6 20.6 15.0 16.0 12.6 60.4 9.8 20.8 22.8 31.6 26.6 11.6 17.1 16.8
7 Avg -49.7 -15.7 -40.0 -19.2 -24.8 -15.2 -18.7 -26.6 -27.7 -35.1 -17.0 25.0 -3.1 -30.7 25.9
StDev 5.3 7.9 10.3 18.0 10.7 14.7 46.4 12.5 16.3 15.5 15.2 20.3 22.1 15.2 13.6
10 Avg -67.5 -6.3 -63.9 -16.4 -31.6 -39.9 -22.5 -43.0 -45.9 -54.9 -51.9 -4.1 -30.8 -63.6 16.1
StDev 8.4 10.1 10.7 14.6 8.5 8.8 43.0 8.3 11.4 7.4 10.8 9.2 19.1 7.9 23.2
14 Avg -87.3 -31.8 -84.6 -35.8 -57.2 -63.2 -31.2 -68.1 -73.8 -74.6 -78.9 -22.7 -51.3 -84.7 1.8
StDev 4.4 5.3 4.5 4.4 6.1 7.1 48.1 4.8 3.1 7.6 15.0 19.5 13.7 4.1 18.2
21 Avg -98.9 -46.8 -98.7 -43.8 -71.0 -83.6 -47.5 -80.7 -87.6 -87.1 -90.1 -48.7 -65.7 -99.0 -16.6
StDev 2.2 9.9 2.7 10.3 7.3 3.1 37.1 5.1 1.2 3.8 7.2 10.8 12.8 2.0 14.2
28 Avg -100.0 -43.2 -100.0 -37.5 -77.4 -89.4 -47.0 -90.2 -92.6 -89.7 -94.9 -53.9 -80.3 -100.0 -22.5
StDev 0.0 14.8 0.0 16.5 5.2 3.5 44.4 7.0 2.4 3.9 4.3 17.0 13.3 0.0 15.4
35 Avg -100.0 -57.9 -100.0 -23.0 -76.5 -91.2 -55.0 -92.2 -95.2 -91.4 -96.5 -59.1 -83.4 -100.0 -17.0
StDev 0.0 17.9 0.0 11.8 6.4 3.1 35.3 5.6 1.3 3.1 3.1 11.1 11.2 0.0 20.9
42 Avg -100.0 -58.4 -100.0 -31.6 -82.1 -97.5 -64.8 -94.1 -96.7 -93.0 -97.5 -71.8 -86.3 -100.0 -23.4
StDev 0.0 14.9 0.0 7.6 7.2 3.0 16.2 4.2 2.2 3.9 3.1 20.0 9.7 0.0 11.2
49 Avg -100.0 -61.7 -100.0 -40.5 -83.9 -97.3 -65.5 -92.6 -98.5 -92.0 -97.4 -59.7 -81.8 -100.0 -24.0
StDev 0.0 27.7 0.0 7.2 8.0 3.2 15.9 5.1 2.0 3.8 3.2 6.2 12.8 0.0 11.1
56 Avg -100.0 -51.1 -100.0 -40.4 -81.4 -95.7 -60.4 -91.9 -98.1 -91.3 -98.5 -46.6 -86.9 -100.0 -26.7
StDev 0.0 13.9 0.0 5.5 9.7 3.2 16.3 5.8 2.3 3.7 1.9 16.7 9.9 0.0 11.1
63 Avg -100.0 -39.5 -100.0 -33.5 -81.4 -94.2 -57.0 -91.0 -98.3 -89.2 -96.5 -50.5 -85.7 -100.0 -25.0
StDev 0.0 19.4 0.0 18.1 8.9 4.3 20.0 6.7 2.3 5.4 3.5 12.9 10.3 0.0 9.1
70 Avg -100.0 -37.0 -100.0 -37.3 -81.3 -93.7 -58.4 -89.6 -97.6 -91.2 -95.3 -45.1 -82.3 -100.0 -9.9
StDev 0.0 21.8 0.0 8.1 11.6 5.9 18.9 7.8 1.7 4.0 4.2 14.4 14.8 0.0 17.8
77 Avg -100.0 -46.1 -100.0 -27.7 -78.0 -93.6 -55.6 -67.0 -96.5 -88.2 -94.2 -40.8 -81.9 -95.3 -6.8
StDev 0.0 38.8 0.0 6.2 14.3 4.5 13.0 42.5 2.6 5.0 5.3 12.1 13.9 9.4 31.3
84 Avg -100.0 -32.3 -100.0 -20.7 -77.6 -90.5 -52.0 -86.1 -96.0 -86.6 -93.8 -31.8 -78.0 -93.7 -13.9
StDev 0.0 24.0 0.0 14.5 13.4 7.6 14.4 10.8 1.2 5.0 4.6 13.1 17.6 12.5 24.9
7. 在單次 1 mg/kg 劑量之後食蟹獼猴循環 LP(a) 血清濃度的變化 %
獼猴血清脂蛋白A 濃度相對於基線之變化% ( 第-1 天)
SRS ID SRS-000013 SRS-000016 SRS-000017 SRS-000018
21 聚體有義股之位置 420 1172 2749 2760
研究日 Avg StDev Avg StDev Avg StDev Avg StDev
-1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3 8.5 2.7 0.5 13.0 7.6 6.7 -4.5 16.9
7 -11.5 9.9 -13.2 25.0 -22.8 5.4 -26.1 12.2
10 -28.2 8.3 -37.0 20.1 -41.0 6.4 -43.5 8.4
14 -46.2 4.9 -59.4 16.4 -58.3 4.3 -63.4 5.2
21 -65.3 26.5 -83.1 7.9 -85.6 3.2 -87.0 2.8
28 -81.8 5.7 -88.9 3.4 -87.0 5.2 -91.6 1.6
35 -79.9 2.6 -88.4 3.5 -83.5 7.3 -91.1 3.5
42 -76.6 6.3 -89.3 3.6 -84.1 6.3 -91.1 4.1
49 -75.8 10.0 -90.3 3.7 -84.3 5.5 -92.3 3.6
56 -67.9 15.9 -90.6 3.9 -80.2 7.4 -91.0 4.4
63 -70.9 13.6 -90.3 3.7 -78.0 6.8 -90.7 3.1
70 -63.9 18.9 -90.2 3.7 -69.1 8.6 -86.6 4.5
77 -62.6 18.8 -89.9 3.6 -71.1 6.2 -87.7 3.3
85 -62.2 12.7 -90.0 3.6 -67.1 8.2 -84.0 4.6
98 NA NA -88.0 3.9 NA NA -74.6 8.9
105 NA NA -88.5 4.4 NA NA -75.2 10.5
112 NA NA -86.6 4.7 NA NA -66.9 13.8
119 NA NA -84.1 6.1 NA NA -63.1 15.5
126 NA NA -80.3 9.2 NA NA -63.6 13.1
133 NA NA -79.8 10.2 NA NA -61.3 13.4
140 NA NA -79.9 10.7 NA NA -60.1 11.8
在隨附申請專利範圍中細緻闡述本發明之各種態樣。參考闡述其中利用本發明原理之說明性態樣的以下實施方式及下文附圖將更好地瞭解本發明之特徵及優勢。
1A 至圖 1VV顯示siRNA組合物對初代人類肝細胞(PHH)中之Lp(a)表現量的劑量反應。
2顯示食蟹獼猴中血清Lp(a)含量相對於基線(第-1天)的變化%。
3顯示食蟹獼猴中血清Lp(a)含量相對於基線(第-1天)的變化%。

Claims (34)

  1. 一種用於調節脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的聚核酸分子,其包含有義股及反義股,其中該反義股包含與選自SEQ ID NO: 1至154之核酸序列至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%一致的核酸序列。
  2. 如請求項1之聚核酸,其中該有義股包含與選自SEQ ID NO: 309至462之核酸序列至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%一致的核酸序列。
  3. 如請求項2之聚核酸分子,其中該反義股包含含有選自SEQ ID NO: 1至154之核酸序列之至少14、15、16、17、18、19、20、21或22個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。
  4. 如請求項1之聚核酸分子,其中該有義股包含含有選自SEQ ID NO: 309至462之核酸序列之至少14、15、16、17、18、19或20個連續序列且具有不超過1、2、3或4個錯配的核酸序列。
  5. 如請求項1之聚核酸分子,其中該有義股包含SEQ ID NO: 309至462中之一者且該反義股包含選自SEQ ID NO: 1至154之核酸序列。
  6. 如請求項5之聚核酸分子,其中該有義股包含至少兩個經修飾之連續核苷酸間鍵聯在5'端。
  7. 如請求項5之聚核酸分子,其中該反義股包含至少兩個經修飾之連續核苷酸間鍵聯在5'端及/或3'端。
  8. 如請求項6之聚核酸分子,其中該經修飾之核苷酸間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯。
  9. 如請求項8之聚核酸分子,其中該經修飾之核苷酸間鍵聯包含在立體化學上富集硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯。
  10. 如請求項8之聚核酸分子,其中該經修飾之核苷酸間鍵聯為S P對掌性核苷酸間硫代磷酸酯鍵聯。
  11. 如請求項10之聚核酸分子,其中該聚核酸包含複數個經修飾之核苷酸間鍵聯,且該複數個經修飾之核苷酸間鍵聯中之至少1、2、3或4個為在立體化學上富集硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯。
  12. 如請求項9之聚核酸分子,其中至少一個在立體化學上富集硫代磷酸酯置於兩個連續核苷之間,該兩個連續核苷為該有義股或該反義股之六個5'或3'端核苷中的兩個。
  13. 如請求項5之聚核酸分子,其中該有義股包含5'-nnnnnnNfnNfnNfnn nnnnnnnn-3',其中該反義股包含5'-nNfnnnnNfnnnnNfnNfnNfnnnnnnn-3',其中n代表2'-O-甲基修飾之核苷酸,且其中Nf代表2'-氟修飾之核苷酸。
  14. 如請求項5之聚核酸分子,其中該有義股或反義股之長度為約19至25個或約21至23個核苷酸。
  15. 如請求項5之聚核酸分子,其中該有義股包含與選自SEQ ID NO: 463至616之核酸序列至少80%、至少85%、至少90%、至少95%一致的核酸序列。
  16. 如請求項5之聚核酸分子,其中該反義股包含與選自SEQ ID NO: 155至308之核酸序列至少80%、至少85%、至少90%、至少95%一致的核酸序列。
  17. 如請求項5之聚核酸分子,其中該有義股包含選自SEQ ID NO: 463至616之核酸序列的序列,且該反義股包含選自SEQ ID NO: 155至308之核酸序列的序列。
  18. 一種用於調節脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的聚核酸分子,其中聚核酸分子包含: (a)包含UAGAUGACCAAGCUUGGCAGGUC (SEQ ID NO: 4)之核苷酸序列的反義股及包含CCUGCCAAGCUUGGUCAUCUA (SEQ ID NO: 312)之核苷酸序列的有義股; (b)包含UAUAGAUGACCAAGCUUGGCAGG (SEQ ID NO: 5)之核苷酸序列的反義股及包含UGCCAAGCUUGGUCAUCUAUA (SEQ ID NO:313)之核苷酸序列的有義股; (c)包含UCAUAGAUGACCAAGCUUGGCAG (SEQ ID NO: 6)之核苷酸序列的反義股及包含GCCAAGCUUGGUCAUCUAUGA (SEQ ID NO: 314)之核苷酸序列的有義股; (d)包含UCGACGGCAGUCCCUUCUGCGUC (SEQ ID NO: 11)之核苷酸序列的反義股及包含CGCAGAAGGGACUGCCGUCGA (SEQ ID NO: 319)之核苷酸序列的有義股; (e)包含UUCUAGGCUUGGAACCGGGGUAA (SEQ ID NO: 18)之核苷酸序列的反義股及包含ACCCCGGUUCCAAGCCUAGAA (SEQ ID NO: 326)之核苷酸序列的有義股; (f)包含UAGCCUCUAGGCUUGGAACCGGG (SEQ ID NO: 21)之核苷酸序列的反義股及包含CGGUUCCAAGCCUAGAGGCUA (SEQ ID NO: 329)之核苷酸序列的有義股; (g)包含UUUACCGUGGUAGCACUCCUGCA (SEQ ID NO: 44)之核苷酸序列的反義股及包含CAGGAGUGCUACCACGGUAAA (SEQ ID NO: 352)之核苷酸序列的有義股; (h)包含UUGUCCAUUACCGUGGUAGCACU (SEQ ID NO: 47)之核苷酸序列的反義股及包含UGCUACCACGGUAAUGGACAA (SEQ ID NO: 355)之核苷酸序列的有義股; (i)包含UCUCUGUCCAUUACCGUGGUAGC (SEQ ID NO: 49)之核苷酸序列的反義股及包含UACCACGGUAAUGGACAGAGA (SEQ ID NO: 357)之核苷酸序列的有義股; (j)包含UAUUGUGUCAGGUUGCAGUACUC (SEQ ID NO: 60)之核苷酸序列的反義股及包含GUACUGCAACCUGACACAAUA (SEQ ID NO: 368)之核苷酸序列的有義股; (k)包含UUGCGUCUGAGCAUUGUGUCAGG (SEQ ID NO: 64)之核苷酸序列的反義股及包含UGACACAAUGCUCAGACGCAA (SEQ ID NO: 372)之核苷酸序列的有義股; (l)包含UUAACUCUGUCCAUAAUGGUAGU (SEQ ID NO: 88)之核苷酸序列的反義股及包含UACCAUUAUGGACAGAGUUAA (SEQ ID NO: 396)之核苷酸序列的有義股; (m)包含UCCAAGCUUGGCAAGUUCUUCCU (SEQ ID NO: 89之核苷酸序列的反義股及包含GAAGAACUUGCCAAGCUUGGA (SEQ ID NO: 397)之核苷酸序列的有義股; (n)包含UAGAUGACCAAGCUUGGCAAGUU (SEQ ID NO: 90)之核苷酸序列的反義股及包含CUUGCCAAGCUUGGUCAUCUA (SEQ ID NO: 398)之核苷酸序列的有義股;或 (o)包含UGGUCCGACUAUGCUGGUGUGGU (SEQ ID NO: 98)之核苷酸序列的反義股及包含CACACCAGCAUAGUCGGACCA (SEQ ID NO: 406)之核苷酸序列的有義股。
  19. 一種用於調節脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現的聚核酸分子,其中聚核酸分子包含: (a)包含usAfsgaugAfccaaGfcUfuGfgcaggsusc (SEQ ID NO: 158)之核苷酸序列的反義股及包含cscsugccAfaGfcUfuggucaucua (SEQ ID NO: 466)之核苷酸序列的有義股; (b)包含usAfsuagaUfgaccAfaGfcUfuggcasgsg (SEQ ID NO: 159)之核苷酸序列的反義股及包含usgsccaaGfcUfuGfgucaucuaua (SEQ ID NO: 467)之核苷酸序列的有義股; (c)包含usCfsauagAfugacCfaAfgCfuuggcsasg (SEQ ID NO: 160)之核苷酸序列的反義股及包含gscscaagCfuUfgGfucaucuauga (SEQ ID NO: 468)之核苷酸序列的有義股; (d)包含usCfsgacgGfcaguCfcCfuUfcugcgsusc (SEQ ID NO: 165)之核苷酸序列的反義股及包含csgscagaAfgGfgAfcugccgucga (SEQ ID NO: 473)之核苷酸序列的有義股; (e)包含usUfscuagGfcuugGfaAfcCfggggusasa (SEQ ID NO: 172)之核苷酸序列的反義股及包含ascscccgGfuUfcCfaagccuagaa (SEQ ID NO: 480)之核苷酸序列的有義股; (f)包含usAfsgccuCfuaggCfuUfgGfaaccgsgsg (SEQ ID NO: 175)之核苷酸序列的反義股及包含csgsguucCfaAfgCfcuagaggcua (SEQ ID NO: 483)之核苷酸序列的有義股; (g)包含usUfsuaccGfugguAfgCfaCfuccugscsa (SEQ ID NO: 198)之核苷酸序列的反義股及包含csasggagUfgCfuAfccacgguaaa (SEQ ID NO: 506)之核苷酸序列的有義股; (h)包含usUfsguccAfuuacCfgUfgGfuagcascsu (SEQ ID NO: 201)之核苷酸序列的反義股及包含usgscuacCfaCfgGfuaauggacaa (SEQ ID NO: 509)之核苷酸序列的有義股; (i)包含usCfsucugUfccauUfaCfcGfugguasgsc (SEQ ID NO: 203)之核苷酸序列的反義股及包含usasccacGfgUfaAfuggacagaga (SEQ ID NO: 511)之核苷酸序列的有義股; (j)包含usAfsuuguGfucagGfuUfgCfaguacsusc (SEQ ID NO: 214)之核苷酸序列的反義股及包含gsusacugCfaAfcCfugacacaaua (SEQ ID NO: 522)之核苷酸序列的有義股; (k)包含usUfsgcguCfugagCfaUfuGfugucasgsg (SEQ ID NO: 218)之核苷酸序列的反義股及包含usgsacacAfaUfgCfucagacgcaa (SEQ ID NO: 526)之核苷酸序列的有義股; (l)包含usUfsaacuCfugucCfaUfaAfugguasgsu (SEQ ID NO: 242)之核苷酸序列的反義股及包含usasccauUfaUfgGfacagaguuaa (SEQ ID NO: 550)之核苷酸序列的有義股; (m)包含usCfscaagCfuuggCfaAfgUfucuucscsu (SEQ ID NO: 243)之核苷酸序列的反義股及包含gsasagaaCfuUfgCfcaagcuugga (SEQ ID NO: 551)之核苷酸序列的有義股; (n)包含usAfsgaugAfccaaGfcUfuGfgcaagsusu (SEQ ID NO: 244)之核苷酸序列的反義股及包含csusugccAfaGfcUfuggucaucua (SEQ ID NO: 552)之核苷酸序列的有義股;或 (o)包含usGfsguccGfacuaUfgCfuGfgugugsgsu (SEQ ID NO: 252)之核苷酸序列的反義股及包含csascaccAfgCfaUfagucggacca (SEQ ID NO: 560)之核苷酸序列的有義股, 其中「A」係指腺苷-3'-磷酸;「a」係指2'-O-甲基腺苷-3'-磷酸;「Af」係指2'-氟腺苷-3'-磷酸;「C」係指胞苷-3'-磷酸;「c」係指2'-O-甲基胞苷-3'-磷酸;「Cf」係指2'-氟胞苷-3'-磷酸;「G」係指鳥苷-3'-磷酸;「g」係指2'-O-甲基鳥苷-3'-磷酸;「Gf」係指2'-氟鳥苷-3'-磷酸;「U」係指尿苷-3'-磷酸;「u」係指2'-O-甲基尿苷-3'-磷酸;「Uf」係指2'-氟尿苷-3'-磷酸;「T」係指5-甲基尿苷-3'-磷酸;「t」係指2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「Tf」係指2'-氟-5-甲基尿苷-3'-磷酸;「s」係指3'-硫代磷酸酯。
  20. 一種用於調節脂蛋白(a)基因(Lp(a))表現的聚核酸分子結合物,其中該聚核酸分子結合物包含如請求項1至19中任一項之聚核酸分子及去唾液酸醣蛋白受體靶向部分。
  21. 如請求項20之聚核酸分子結合物,其中該去唾液酸醣蛋白受體靶向部分包含N-乙醯半乳胺糖(GalNAc)或半乳糖。
  22. 如請求項20之聚核酸分子結合物,其中該聚核酸分子及該去唾液酸醣蛋白受體靶向部分經由連接子偶合。
  23. 如請求項22之聚核酸分子結合物,其中該連接子為可裂解連接子。
  24. 如請求項21之聚核酸分子結合物,其中該GalNAc包含變旋異構碳鍵結至三價、四價連接子、五價或六價連接子,其中該變旋異構碳為半胺縮醛基之一部分。
  25. 如請求項22之聚核酸分子結合物,其中該連接子包含下式(IV), ,其中Y1及Y2中之至少一者為該聚核酸分子中之核苷酸。
  26. 如請求項25之聚核酸分子結合物,其中該Y1為位於該聚核酸分子之有義股之3'端上的最後一個核苷酸。
  27. 如請求項22之聚核酸分子結合物,其中該連接子及該去唾液酸醣蛋白受體靶向部分與位於該聚核酸分子之有義股之3'端上的最後一個核苷酸顯示於式(V')、式(V'''')、式(V''''')或式(V'''''')中: , 其中式(V')中之Z為-H、-OH、-O-甲基、-F或-O-甲氧基乙基,且式(V')中之R為腺嘌呤、尿嘧啶、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶、無鹼基或其他; , 其中式(V'''')中之Z為對應於本文所描述之糖修飾中之一者的部分(例如-H、-OH、-O-甲基、-F或-O-甲氧基乙基),且式(V'''')中之R為腺嘌呤、尿嘧啶、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶、無鹼基或其他; , 其中式(V''''')中之Z為對應於本文所描述之糖修飾中之一者的部分(例如-H、-OH、-O-甲基、-F或-O-甲氧基乙基),且式(V''''')中之R為腺嘌呤、尿嘧啶、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶、無鹼基或其他;或 ,其中式(V'''''')中之Z為對應於本文所描述之糖修飾中之一者的部分(例如-H、-OH、-O-甲基、-F或-O-甲氧基乙基),且式(V'''''')中之R為腺嘌呤、尿嘧啶、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶、無鹼基或其他。
  28. 如請求項27之聚核酸分子結合物,其中該連接子及該去唾液酸醣蛋白受體靶向部分與位於該聚核酸分子之有義股之3'端上最後一個核苷酸顯示於式(V')中: (V'),其中式(V')中之Z為-H、-OH、-O-甲基、-F或-O-甲氧基乙基,且式(V')中之R為腺嘌呤、尿嘧啶、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶、無鹼基或其他。
  29. 一種醫藥組合物,其包含如請求項[0220]至19中任一項之聚核酸分子及醫藥學上可接受之賦形劑。
  30. 如請求項29之醫藥組合物,其中該醫藥組合物經調配用於非經腸、經口、鼻內、經頰、經直腸、經皮、靜脈內、皮下或鞘內投與。
  31. 一種聚核酸分子之用途,其係用於製造用以調節有需要個體中之脂蛋白(a) (Lp(a))基因表現之藥劑,包含向該個體投與如請求項1至19中任一項之聚核酸分子,由此調節該有需要個體中之Lp(a)基因表現。
  32. 一種聚核酸分子之用途,其係用於製造用以治療或預防心血管疾病或脂質病症之藥劑,包含向該個體投與如請求項1至19中任一項之聚核酸分子,由此調節該有需要個體中之Lp(a)基因表現。
  33. 如請求項32之方法,其中該心血管疾病為冠狀動脈疾病、急性心肌梗塞、無症狀頸動脈粥樣硬化、中風、心房微顫、高膽固醇血症(hypercholesterolemia),或周邊動脈阻塞疾病。
  34. 如請求項32之方法,其中該脂質病症為高脂質血症或高膽固醇血症(hypercholesterolemia)。
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