TW202346327A - 編碼具有降低免疫原性的因子ｖｉｉｉ多肽之核酸 - Google Patents

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Abstract

本揭示文本提供了密碼子優化的因子VIII序列、包含密碼子優化的因子VIII序列的載體和宿主細胞、由密碼子優化的因子VIII序列編碼的多肽以及產生此類多肽的方法。

Description

編碼具有降低免疫原性的因子VIII多肽之核酸
本揭示文本提供了密碼子優化的因子VIII序列、包含密碼子優化的因子VIII序列的載體和宿主細胞、由密碼子優化的因子VIII序列編碼的多肽以及產生此類多肽的方法。
向患者提供低成本重組FVIII蛋白的主要障礙是商業生產的高成本。FVIII蛋白在異源表現系統中表現較差，比類似大小的蛋白質低二至三個數量級。（Lynch等人, Hum. Gene. Ther.; 4:259-72 (1993)）。FVIII的較差表現部分是由於FVIII編碼序列中抑制FVIII表現的順式作用元件的存在，所述順式作用元件如轉錄沈默子元件（Hoeben等人, Blood85:2447-2454 (1995)）、基質附著樣序列（MAR）（Fallux等人, Mol. Cell. Biol.16:4264-4272 (1996)）和轉錄延伸抑制元件（Koeberl等人, Hum. Gene. Ther.; 6:469-479 (1995)）。因此，本領域對在異源系統中高效表現的FVIII序列存在需要。
揭示編碼具有FVIII活性的多肽的密碼子優化的核酸分子。
在某些態樣，本文揭示一種分離的核酸分子，所述分離的核酸分子包含與SEQ ID NO:11具有至少85%序列同一性的核苷酸序列，其中所述核苷酸序列編碼具有因子VIII活性的多肽。在一些實施例中，所述核苷酸序列與SEQ ID NO: 11具有至少90%序列同一性。在一些實施例中，所述核苷酸序列與SEQ ID NO: 11具有至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%序列同一性。本文還揭示一種分離的核酸分子，所述分離的核酸分子包含SEQ ID NO: 11的核苷酸序列，其中所述核苷酸序列編碼具有因子VIII活性的多肽。
本文還揭示分離的核酸分子，所述分離的核酸分子包含與SEQ ID NO: 11的核苷酸58-4815具有至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的核苷酸序列。在一些實施例中，如請求項1-5中任一項所述的分離的核酸分子，其中所述核苷酸序列包含SEQ ID NO: 11的核苷酸58-4815。
在某些態樣，本文揭示一種分離的核酸分子，所述分離的核酸分子包含與SEQ ID NO:14具有至少85%序列同一性的核苷酸序列，其中所述核苷酸序列編碼具有因子VIII活性的多肽。在一些實施例中，所述核苷酸序列與SEQ ID NO: 14具有至少90%序列同一性。在一些實施例中，所述核苷酸序列與SEQ ID NO: 14具有至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%序列同一性。本文還公開了一種分離的核酸分子，所述分離的核酸分子包含SEQ ID NO: 14的核苷酸序列，其中所述核苷酸序列編碼具有因子VIII活性的多肽。
在另一個態樣，本文揭示一種分離的核酸分子，所述分離的核酸分子包含表現因子VIII多肽的基因盒，其中所述基因盒包含與SEQ ID NO: 16具有至少85%序列同一性的核苷酸序列。在一些實施例中，所述基因盒包含與SEQ ID NO: 16具有至少90%序列同一性的核苷酸序列。在一些實施例中，所述基因盒包含與SEQ ID NO: 16具有至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的核苷酸序列。本文還公開了一種分離的核酸分子，所述分離的核酸分子包含表現因子VIII多肽的基因盒，其中所述基因盒包含SEQ ID NO: 16的核苷酸序列。
在另一個態樣，本文揭示一種分離的核酸分子，所述分離的核酸分子包含表現因子VIII多肽的基因盒，所述基因盒包含：編碼FVIII蛋白的核苷酸序列，所述核苷酸序列包含與SEQ ID NO: 11或SEQ ID NO: 14具有至少85%序列同一性的核酸序列；控制所述核苷酸序列的轉錄的啟動子；和轉錄終止序列。
在一些實施例中，所述啟動子是肝臟特異性啟動子。在一些實施例中，所述啟動子是小鼠甲狀腺素轉運蛋白(transthyretin)（mTTR）啟動子。在一些實施例中，所述啟動子是mTTR482啟動子。在一些實施例中，所述啟動子包含SEQ ID NO: 9的核苷酸序列。
在一些實施例中，所述分離的核酸分子還包含增強子元件。在一些實施例中，所述增強子元件是mTTR增強子元件。在一些實施例中，所述mTTR增強子元件包含SEQ ID NO: 8的核苷酸序列。
在一些實施例中，所述分離的核酸分子還包含合成增強子序列。在一些實施例中，所述合成增強子序列包含SEQ ID NO: 7的核苷酸序列。
在一些實施例中，所述核酸分子還包含多嘌呤區（polypurine tract）（PPT）。在一些實施例中，所述PPT序列包含SEQ ID NO: 6的核苷酸序列。
在一些實施例中，所述核酸分子還包含人CMV啟動子區序列。在一些實施例中，所述CMV啟動子區序列包含SEQ ID NO: 1的核苷酸序列。
在一些實施例中，所述核酸分子還包含5’長末端重複（LTR）序列。在一些實施例中，所述核酸分子還包含3’ LTR序列。
在一些實施例中，所述核酸分子還包含莖環4序列。在一些實施例中，所述莖環4序列包含SEQ ID NO: 4的核苷酸序列。
在一些實施例中，所述核酸分子還包含SL123的引子結合位點。在一些實施例中，所述SL123的引子結合位點包含SEQ ID NO: 3的核苷酸序列。
在一些實施例中，所述核酸分子還包含RU5區的引子結合位點。在一些實施例中，所述RU5區序列包含SEQ ID NO: 2的核苷酸序列。
在另一個態樣，本文揭示一種分離的核酸分子，所述分離的核酸分子包含表現因子VIII多肽的基因盒，其中所述基因盒從5’至3’包含：5’長末端重複（LTR）序列；包含SEQ ID NO: 9的核苷酸序列的肝臟特異性的經修飾的小鼠甲狀腺素轉運蛋白（mTTR）啟動子；包含與SEQ ID NO: 11或SEQ ID NO: 14具有至少85%序列同一性的核酸序列的編碼FVIII蛋白的核苷酸序列；和3’ LTR序列。
在另一個態樣，本文揭示一種載體，所述載體包含本文揭示的核酸分子。
在另一個態樣，本文揭示一種宿主細胞，所述宿主細胞包含本文公開的核酸分子。本文還揭示了由所述宿主細胞產生的多肽。
在另一個態樣，本文揭示一種產生具有FVIII活性的多肽的方法，所述方法包括：將本文揭示的宿主細胞在產生具有FVIII活性的多肽的條件下培養，以及回收所述具有FVIII活性的多肽。
在另一個態樣，本文揭示一種醫藥組合物，所述醫藥組合物包含如本文所揭示的核酸分子。在一些實施例中，所述醫藥組合物包含含有本文揭示的核酸分子的載體。在一些實施例中，所述醫藥組合物還包含醫藥上可接受的賦形劑。
在另一個態樣，本文揭示一種套組，所述套組包含本文揭示的核酸分子和用於向有需要的個體投予所述核酸分子的說明書。
在另一個態樣，本文揭示一種增加個體中的具有FVIII活性的多肽的表現的方法，所述方法包括投予包含與SEQ ID NO: 11、SEQ ID NO: 14或SEQ ID NO: 16具有至少80%序列同一性的核苷酸序列的核酸分子。
在另一個態樣，本文揭示一種治療個體的出血障礙的方法，所述方法包括投予包含與SEQ ID NO: 11、SEQ ID NO: 14或SEQ ID NO: 16具有至少85%序列同一性的核苷酸序列的核酸分子。在一些實施例中，所述治療個體的出血障礙的方法包括投予本文揭示的醫藥組合物。在一些實施例中，所述出血障礙是A型血友病。
對電子提交的序列表的引用
將以xml檔電子提交的序列表（名稱：732716_SA9-486TW；大小：56,424位元組；創建日期：2022年9月27日）的內容藉由引用以其整體併入本文。
本揭示文本涉及編碼具有因子VIII（FVIII）活性的多肽的密碼子優化的核酸分子、包含優化的核酸分子的載體和宿主細胞、由優化的核酸分子編碼的多肽、和產生此類多肽的方法。本揭示文本還涉及治療出血障礙（如血友病）的方法，所述方法包括向所述個體投予優化的FVIII核酸序列、包含優化的核酸序列的載體或由此編碼的多肽。
本揭示文本藉由提供優化的FVIII序列滿足了本領域中的重要需求，所述優化的FVIII序列顯示出在宿主細胞中的表現增加、在產生重組FVIII的方法中的改善的FVIII蛋白產率、以及在用於基因治療方法時潛在地導致更大的治療功效。在某些實施例中，本揭示文本描述了一種分離的核酸分子，所述分離的核酸分子包含與SEQ ID NO: 11的核苷酸序列具有序列同源性的核苷酸序列。在某些實施例中，本揭示文本描述了一種分離的核酸分子，所述分離的核酸分子包含與SEQ ID NO: 14的核苷酸序列具有序列同源性的核苷酸序列。在某些實施例中，本揭示文本描述了一種分離的核酸分子，所述分離的核酸分子包含與SEQ ID NO: 16的核苷酸序列具有序列同源性的核苷酸序列。
為了提供對說明書和申請專利範圍的清晰理解，下文提供了以下定義。 定義
應注意，術語“一個/一種（a）”或“一個/一種（an）”實體是指一個/一種或多個/多種所述實體：例如，“一個核苷酸序列”應理解為代表一個或多個核苷酸序列。因此，術語“一個/一種（a）”（或“一個/一種（an）”）、“一個/一種或多個/多種”和“至少一個/一種”在本文中可互換使用。
術語“約”在本文中用於意指大約、大致、大約地或在…左右。當術語“約”與數值範圍結合使用時，它藉由擴展所述數值的上下邊界來修改該範圍。通常，術語“約”在本文中用於向上或向下（較高或較低）以10%的差異修飾高於和低於所述值的數值。
出於本揭示文本的目的的術語“分離的”指定已經從其原始的環境（它天然存在的環境）中移出的生物材料（細胞、多肽、多核苷酸或其片段、變體或衍生物）。例如，在植物或動物中以天然狀態存在的多核苷酸是未分離的，然而與它天然存在的鄰近核酸分離的相同的多核苷酸被認為是“分離的”。不要求具體純化水平。為了本揭示文本的目的，重組產生的多肽和宿主細胞中表現的蛋白質被視為是分離的，已經藉由任何適當的技術分離、分級或部分或基本上純化的天然或重組多肽亦是如此。
“核酸”、“核酸分子”、“寡核苷酸”和“多核苷酸”可互換使用，並且是指呈單鏈形式或雙鏈螺旋的核糖核苷（腺苷、鳥苷、尿苷或胞苷；“RNA分子”）或去氧核糖核苷（去氧腺苷、去氧鳥苷、去氧胸苷或去氧胞苷；“DNA分子”）的磷酸酯聚合形式或其任何磷酸酯類似物，如硫代磷酸酯和硫代酸酯。雙鏈DNA-DNA、DNA-RNA和RNA-RNA螺旋是可能的。術語核酸分子、特別是DNA或RNA分子僅僅是指分子的一級和二級結構，並且不將其限制為任何特定三級形式。因此，這個術語包括尤其在線性或環狀DNA分子（例如，限制性片段）、質體、超螺旋化DNA和染色體中發現的雙鏈DNA。在討論特定雙鏈DNA分子的結構時，在本文中可以根據常規習慣描述序列，僅沿DNA的非轉錄鏈（即，具有與mRNA同源的序列的鏈）以5’至3’方向給出序列。“重組DNA分子”是已經經歷分子生物學操縱的DNA分子。DNA包括但不限於cDNA、基因組DNA、質體DNA、合成DNA和半合成DNA。本揭示文本的“核酸組合物”包含如本文所述的一種或多種核酸。
如本文所用，“編碼區”或“編碼序列”是多核苷酸中由可轉譯成胺基酸的密碼子組成的部分。雖然“終止密碼子”（TAG、TGA或TAA）通常不轉譯成胺基酸，但是可以認為其是編碼區的一部分，但是任何側接序列（例如啟動子、核糖體結合位點、轉錄終止子、內含子等）不是編碼區的一部分。編碼區的邊界通常由5’末端的起始密碼子（編碼所得多肽的胺基末端）和3’末端的轉譯終止密碼子（編碼所得多肽的羧基末端）來決定。兩個或更多個編碼區可以存在於單一多核苷酸構建體中（例如，在單一載體上），或者存在於單獨的多核苷酸構建體中（例如，在單獨的（不同的）載體上）。然後，結果就是單一載體可以僅含有單個編碼區，或者包含兩個或更多個編碼區。
哺乳動物細胞分泌的某些蛋白質與分泌信號肽相關，一旦生長中的蛋白質鏈跨越糙面內質網的輸出已經起始所述分泌信號肽便從成熟蛋白質被切割下來。本領域普通技術人員知道，信號肽通常融合至多肽的N末端，並且從完整或“全長”多肽被切割下來以產生多肽的分泌或“成熟”形式。在某些實施例中，天然信號肽或該序列的保留指導多肽分泌的能力的功能衍生物與所述多肽可操作地締合。可替代地，可以使用異源哺乳動物信號肽（例如，人組織纖溶酶原啟動物（TPA）或小鼠ß-葡糖醛酸糖苷酶信號肽）或其功能衍生物。
術語“下游”是指核苷酸序列位於參考核苷酸序列的3’。在某些實施例中，下游核苷酸序列涉及轉錄起始點之後的序列。例如，基因的轉譯起始密碼子位於轉錄起始位點的下游。
術語“上游”是指核苷酸序列位於參考核苷酸序列的5’。在某些實施例中，上游核苷酸序列是指位於編碼區或轉錄起點的5’側的序列。例如，大多數啟動子位於轉錄起始位點的上游。
如本文所用，術語“基因盒(genetic cassette)”、“表現盒”和“基因表現盒”可互換使用，並且意指能夠指導特定多核苷酸序列在適當的宿主細胞中表現的DNA序列，其包含與感興趣多核苷酸序列可操作地連接的啟動子。基因盒可以涵蓋位於編碼區上游（5’非編碼序列）、內部或下游（3’非編碼序列），且影響相關編碼區的轉錄、RNA加工、穩定性或轉譯的核苷酸序列。如果意圖在真核細胞中表現編碼區，則多聚腺苷酸化信號和轉錄終止序列通常將位於編碼序列的3’。在一些實施例中，基因盒包含編碼基因產物的多核苷酸。在一些實施例中，基因盒包含編碼miRNA的多核苷酸。在一些實施例中，基因盒包含異源多核苷酸序列。編碼產物（例如，miRNA或基因產物（例如，多肽，如治療性蛋白質））的多核苷酸可以包括與一個或多個編碼區可操作地締合的啟動子和/或其他表現（例如，轉錄或轉譯）控制序列。在可操作締合中，以將基因產物的表現置於一個或多個調控區的影響或控制下的方式將基因產物（例如，多肽）的編碼區與所述一個或多個調控區締合。例如，如果啟動子功能的誘導引起編碼由編碼區所編碼的基因產物的mRNA的轉錄，並且如果啟動子與編碼區之間的連接的性質不干擾啟動子指導基因產物表現的能力或者不干擾DNA模板被轉錄的能力，則編碼區和啟動子“可操作地締合”。除了啟動子以外的其他表現控制序列（例如，增強子、操縱子、阻遏物和轉錄終止信號）也可以與編碼區可操作地締合以指導基因產物表現。
“表現控制序列”是指提供編碼序列在宿主細胞中的表現的調控核苷酸序列，如啟動子、增強子、終止子等。表現控制序列通常涵蓋有助於與其可操作地連接的編碼核酸的有效轉錄和轉譯的任何調控核苷酸序列。表現控制序列的非限制性例子包括啟動子、增強子、轉譯前導序列、內含子、聚腺苷酸化識別序列、RNA加工位點、效應子結合位點或莖環結構。多種表現控制序列是本領域技術人員已知的。這些包括而不限於在脊椎動物細胞中起作用的表現控制序列，如但不限於來自巨細胞病毒的啟動子和增強子片段（即時早期啟動子，與內含子A結合）、猿猴病毒40（早期啟動子）和反轉錄病毒（如勞氏肉瘤病毒）。其他表現控制序列包括衍生自脊椎動物基因的那些，如肌動蛋白、熱休克蛋白、牛生長激素和兔β珠蛋白，以及能夠控制真核細胞中基因表現的其他序列。另外的合適的表現控制序列包括組織特異性啟動子和增強子以及淋巴因子誘導型啟動子（例如可由干擾素或白細胞介素誘導的啟動子）。其他表現控制序列包括內含子序列、轉錄後調控元件和聚腺苷酸化信號。在本揭示文本的其他地方討論了另外的示例性表現控制序列。
類似地，多種轉譯控制元件是本領域普通技術人員已知的。這些轉譯控制元件包括但不限於核糖體結合位點、轉譯起始和終止密碼子以及衍生自小核糖核酸病毒的元件（特別是內部核糖體進入位點，或IRES）。
如本文所用的術語“表現”是指多核苷酸產生基因產物（例如，RNA或多肽）的過程。它包括而不限於將多核苷酸轉錄成信使RNA（mRNA）、轉移RNA（tRNA）、小髮夾RNA（shRNA）、小干擾RNA（siRNA）或任何其他RNA產物以及將mRNA轉譯為多肽。表現產生“基因產物”。如本文所用，基因產物可以是核酸，例如藉由基因轉錄產生的信使RNA，或者是從轉錄物轉譯的多肽。本文描述的基因產物還包括經過轉錄後修飾（例如聚腺苷酸化或剪接）的核酸，或經過轉譯後修飾（例如甲基化、糖基化、脂質的添加、與其他蛋白質亞基締合或蛋白水解切割）的多肽。如本文所用，術語“產量”是指藉由基因表現產生的多肽的量。
“載體”是指用於將核酸選殖和/或轉移至宿主細胞中的任何載具。載體可以是複製子，另一核酸區段可以與其連接以實現所連接區段的複製。“複製子”是指在體內起自主複製單元的作用（即，能夠在其自身控制下複製）的任何遺傳元件（例如，質體、噬菌體、粘粒、染色體、病毒）。術語“載體”包括用於體外、離體或體內將核酸引入細胞的病毒載體和非病毒載具。很多載體是本領域已知和使用的，包括例如質體、經修飾的真核病毒或經修飾的細菌病毒。將多核苷酸插入合適的載體中可以藉由將適當多核苷酸片段連接至具有互補粘性末端的所選載體中來完成。
可以對載體進行工程化以編碼可選標記或報導子，其提供對已經併入載體的細胞的選擇或鑑定。選擇性標記或報導子的表現允許鑑定和/或選擇併入並表現含於載體上的其他編碼區的宿主細胞。本領域中已知並使用的可選標記基因的例子包括：提供針對胺苄青黴素、鏈黴素、健他黴素、康黴素、潮黴素、雙丙胺磷除草劑、磺醯胺等的抗性的基因；和用作表型標記的基因，即花色苷調控基因、異戊烷基轉移酶基因等。本領域中已知並使用的報導子的例子包括：螢光素酶（Luc）、綠色螢光蛋白（GFP）、氯黴素乙醯轉移酶（CAT）、β-半乳糖苷酶（LacZ）、β-葡糖醛酸糖苷酶（Gus）等。還可以將可選標記視為報導子。
術語“可選標記”是指能夠基於標記基因的效應（即，對抗生素的抗性、對除草劑的抗性、比色標記、酶、螢光標記等）加以選擇的鑑定因子（通常是抗生素或化學抗性基因），其中所述效應用於跟蹤所關注核酸的遺傳和/或鑑定已經遺傳所關注核酸的細胞或生物體。本領域中已知並使用的可選標記基因的例子包括：提供針對胺苄青黴素、鏈黴素、健他黴素、康黴素、潮黴素、雙丙胺磷除草劑、磺醯胺等的抗性的基因；和用作表型標記的基因，即花色苷調控基因、異戊烷基轉移酶基因等。
術語“報導基因”是指編碼能夠基於報導基因的效應加以鑑定的鑑定因子的核酸，其中所述效應用於跟蹤所關注核酸的遺傳性、鑑定已經遺傳所關注核酸的細胞或生物體和/或測量基因表現誘導或轉錄。本領域中已知並使用的報導基因的例子包括：螢光素酶（Luc）、綠色螢光蛋白（GFP）、氯黴素乙醯轉移酶（CAT）、β-半乳糖苷酶（LacZ）、β-葡糖醛酸糖苷酶（Gus）等。也可以將可選標記基因視為報導基因。
“啟動子”與“啟動子序列”可互換使用並且是指能夠控制編碼序列或功能RNA的表現的DNA序列。通常，編碼序列位於啟動子序列的3'。啟動子可以整體衍生自天然基因，或由衍生自見於自然界的不同啟動子的不同元件組成，或甚至包含合成DNA片段。本領域技術人員應理解，不同的啟動子可指導基因在不同組織或細胞類型中，或在不同發育階段，或回應不同環境或生理條件而表現。使基因在大多數細胞類型中在大多數時間表現的啟動子一般被稱為“組成型啟動子”。使基因在特定細胞類型中表現的啟動子一般被稱為“細胞特異性啟動子”或“組織特異性啟動子”。使基因在發育或細胞分化的特定階段表現的啟動子一般被稱為“發育特異性啟動子”或“細胞分化特異性啟動子”。在用誘導啟動子的試劑、生物分子、化學品、配體、光等暴露或處理細胞後被誘導並且使基因表現的啟動子一般被稱為“誘導型啟動子”或“可調型啟動子”。進一步認識到，由於在大多數情況下，尚未完全界定調節序列的確切邊界，所以不同長度的DNA片段可具有相同啟動子活性。在本揭示文本的其他地方討論了另外的示例性啟動子。
啟動子序列通常在其3’末端以轉錄起始位點為界，並向上游（5’方向）延伸以包括以高於背景的可檢測水平起始轉錄所必需的最小數目的鹼基或元件。在啟動子序列內將發現轉錄起始位點（例如藉由用核酸酶S1標示（mapping）方便地界定）以及負責RNA聚合酶的結合的蛋白質結合結構域（共有序列）。
術語“質體”是指通常攜帶並非細胞的中心代謝的一部分的基因，並且通常呈環狀雙鏈DNA分子的形式的染色體外元件。此類元件可以是衍生自任何來源的單鏈或雙鏈DNA或RNA的線性、環狀或超螺旋化的自主複製序列、基因組整合序列、噬菌體或核苷酸序列，其中多個核苷酸序列已經接合或重組至獨特構建中，所述構建能夠將用於所選基因產物的啟動子片段和DNA序列以及適當的3'非轉譯序列引入細胞中。
可以使用的真核病毒載體包括但不限於腺病毒載體、反轉錄病毒載體、腺相關病毒載體、痘病毒（例如，痘苗病毒載體）、桿狀病毒載體或皰疹病毒載體。非病毒載體包括質體、脂質體、帶電脂質（細胞轉染素）、DNA-蛋白質複合物和生物聚合物。
“選殖載體”是指“複製子”，其是單位長度的連續複製的核酸並且其包含複製起點，如質體、噬菌體或粘粒，另一核酸區段可以與所述複製子連接以實現所連接區段的複製。某些選殖載體能夠在一種細胞類型（例如，細菌）中複製，並在另一細胞類型（例如，真核細胞）中表現。選殖載體通常包含一個或多個可以用於選擇包含載體的細胞的序列和/或一個或多個用於插入感興趣核酸序列的多選殖位點。
術語“表現載體”是指設計用於在插入宿主細胞內後能夠表現插入的核酸序列的載具。如上所述，插入的核酸序列以與調節區處於可操作締合放置。
藉由本領域熟知的方法將載體引入宿主細胞中，所述方法是例如轉染、電穿孔、顯微注射、轉導、細胞融合、DEAE葡聚糖、磷酸鈣沈澱、脂轉染（溶酶體融合）、使用基因槍或DNA載體轉運蛋白。
如本文所用，“培養（culture）”、“培養（to culture）”和“培養（culturing）”意指在允許細胞生長或分裂的體外條件下培育細胞或使細胞維持存活狀態。如本文所用，“培養的細胞”是指體外繁殖的細胞。
如本文所用，術語“多肽”旨在涵蓋單數“多肽”以及複數“多肽”，並且是指由藉由醯胺鍵（也稱為肽鍵）線性連接的單體（胺基酸）構成的分子。術語“多肽”是指兩個或更多個胺基酸的任何一條或多條鏈，並且不涉及產物的具體長度。因此，肽、二肽、三肽、寡肽、“蛋白質”、“胺基酸鏈”或用於指兩個或更多個胺基酸的一條或多條鏈的任何其他術語包括於“多肽”的定義內，並且術語“多肽”可以代替這些術語中的任一個術語或與其互換使用。術語“多肽”還意圖指多肽的表現後修飾的產物，所述修飾包括但不限於糖基化、乙醯化、磷酸化、醯胺化、藉由已知的保護/阻斷基團衍生、蛋白質水解切割或藉由非天然存在的胺基酸修飾。多肽可以從天然生物來源衍生或藉由重組技術產生，但不一定是從指定的核酸序列轉譯。其能以任何方式產生，包括藉由化學合成產生。
術語“胺基酸”包括丙胺酸（Ala或A）；精胺酸（Arg或R）；天門冬醯胺酸（Asn或N）；天門冬胺酸（Asp或D）；半胱胺酸（Cys或C）；麩醯胺酸（Gln或Q）；麩胺酸（Glu或E）；甘胺酸（Gly或G）；組胺酸（His或H）；異白胺酸（Ile或I）；白胺酸（Leu或L）；離胺酸（Lys或K）；甲硫胺酸（Met或M）；苯丙胺酸（Phe或F）；脯胺酸（Pro或P）；絲胺酸（Ser或S）；蘇胺酸（Thr或T）；色胺酸（Trp或W）；酪胺酸（Tyr或Y）；和擷胺酸（Val或V）。非傳統胺基酸也在本揭示文本的範圍內，並且包括正白胺酸、鳥胺酸、正擷胺酸、高絲胺酸和其他胺基酸殘基類似物，如Ellman等人 Meth. Enzym. 202:301-336 (1991)中所述的那些。為了產生此類非天然存在的胺基酸殘基，可以使用Noren等人 Science 244:182 (1989) 和Ellman等人, 同上的程序。簡單來說，這些程序涉及用非天然存在的胺基酸殘基化學啟動抑制劑tRNA，之後進行RNA的體外轉錄和轉譯。引入非傳統胺基酸也可以使用本領域中已知的肽化學來實現。如本文所用，術語“極性胺基酸”包括具有零個淨電荷，但是在其側鏈的不同部分具有非零部分電荷的胺基酸（例如，M、F、W、S、Y、N、Q、C）。這些胺基酸可以參與疏水相互作用和靜電相互作用。如本文所用，術語“帶電胺基酸”包括在其側鏈上具有非零淨電荷的胺基酸（例如，R、K、H、E、D）。這些胺基酸可以參與疏水相互作用和靜電相互作用。
本揭示文本中還包括多肽的片段或變體及其任何組合。術語“片段”或“變體”在涉及本揭示文本的多肽結合結構域或結合分子時包括保留參考多肽的至少一些特性（例如，對FcRn結合結構域或Fc變體的FcRn結合親和力、對FVIII變體的凝結活性或對VWF片段的FVIII結合活性）的任何多肽。除了本文其他地方討論的特異性抗體片段之外，多肽的片段還包括蛋白水解片段以及缺失片段，但不包括天然存在的全長多肽（或成熟多肽）。本揭示文本的多肽結合結構域或結合分子的變體包括如上所述的片段，以及由於胺基酸取代、缺失或插入而具有改變的胺基酸序列的多肽。變體可以是天然存在的或非天然存在的。非天然存在的變體可以使用本領域中已知的誘變技術來產生。變體多肽可包含保守性或非保守性胺基酸取代、缺失或添加。
“保守胺基酸取代”是用具有類似側鏈的胺基酸殘基替代胺基酸殘基的取代。本領域已經定義了具有相似側鏈的胺基酸殘基家族，包括鹼性側鏈（例如離胺酸、精胺酸、組胺酸）、酸性側鏈（例如天門冬胺酸、麩胺酸）、不帶電荷的極性側鏈（例如甘胺酸、天門冬醯胺酸、麩醯胺酸、絲胺酸、蘇胺酸、酪胺酸、半胱胺酸）、非極性的側鏈（例如丙胺酸、擷胺酸、白胺酸、異白胺酸、脯胺酸、苯丙胺酸、甲硫胺酸、色胺酸）、β-分支側鏈（例如蘇胺酸、擷胺酸、異白胺酸）、以及芳香族側鏈（例如酪胺酸、苯丙胺酸、色胺酸、組胺酸）。因此，如果多肽中的胺基酸被來自相同側鏈家族的另一種胺基酸替代，則將取代視為保守的。在另一個實施例中，一串胺基酸可以用結構相似、側鏈家族成員的順序和/或組成不同的串保守地替換。
如本領域中已知的術語“同一性百分比”是兩個或更多個多肽序列或者兩個或更多個多核苷酸序列之間的關係，如藉由比較序列所確定。在本領域中，根據具體情況，“同一性”也意指多肽或多核苷酸序列之間的序列關聯性程度，如藉由此類序列的串之間的匹配所確定。“同一性”可以藉由已知的方法容易地計算，所述方法包括但不限於描述於以文獻中的那些： Computational Molecular Biology(Lesk, A. M.編輯) Oxford University Press, New York (1988)； Biocomputing: Informatics and Genome Projects(Smith, D. W.編輯) Academic Press, New York (1993)； Computer Analysis of Sequence Data, 第 I部分 (Griffin, A. M.和Griffin, H. G.編輯) Humana Press, New Jersey (1994)； Sequence Analysis in Molecular Biology(von Heinje, G.編輯) Academic Press (1987)；和 Sequence Analysis Primer(Gribskov, M.和Devereux, J.編輯) Stockton Press, New York (1991)。確定同一性的優選方法設計為給出所測試序列之間的最佳匹配。確定同一性的方法被編纂於可公開獲得的電腦程式中。序列比對和同一性百分比計算可以使用序列分析軟體來進行，所述序列分析軟體是例如LASERGENE生物資訊學計算套件的Megalign程式（DNASTAR Inc.，Madison, WI）、GCG程式套件（Wisconsin Package 9.0版，Genetics Computer Group（GCG），Madison, WI）、BLASTP、BLASTN、BLASTX（Altschul等人, J. Mol. Biol. 215:403 (1990)）和DNASTAR（DNASTAR, Inc. 1228 S. Park St. Madison, WI 53715 USA）。在本申請案的上下文中將理解，如果使用序列分析軟體進行分析，除非另外指定，否則分析結果將基於所參考程式的“預設值”。如本文所用的“預設值”將意指在首次初始化時最初用軟體載入的任一組值或參數。出於確定本揭示文本的優化的BDD FVIII序列與參考序列之間的同一性百分比的目的，僅使用參考序列中對應於本揭示文本的優化的BDD FVIII序列中的核苷酸的核苷酸來計算同一性百分比。例如，在比較含有B結構域的全長FVIII核苷酸序列與本揭示文本的優化的B結構域缺失（BDD）FVIII核苷酸序列時，將使用包括A1、A2、A3、C1和C2結構域的比對部分來計算同一性百分比。全長FVIII序列的編碼B結構域的部分（其將在比對中產生大的“空位”）中的核苷酸將不會被計為錯配。另外，在確定本揭示文本的優化的BDD FVIII序列或其指定部分（例如，SEQ ID NO: 16的核苷酸2183-4474和4924-7006）與參考序列之間的同一性百分比時，將藉由比對、用匹配核苷酸數除以如本文所述的優化的BDD-FVIII序列或其指定部分的完整序列中的核苷酸總數來計算同一性百分比。
如本文所用，術語“插入位點”是指FVIII多肽或其片段、變體或衍生物中的如下位置，其緊鄰可以插入異源部分的位置的上游。“插入位點”被指定為一個編號，所述編號對應於成熟天然FVIII（SEQ ID NO: 18）中插入位點對應的胺基酸的編號，其緊鄰插入位置的N末端。例如，片語“a3在對應於SEQ ID NO: 24的胺基酸1656的插入位點包含異源部分”指示，異源部分位於對應於SEQ ID NO: 24的胺基酸1656和胺基酸1657的兩個胺基酸之間。
如本文所用，短語“緊鄰胺基酸的下游”是指與胺基酸的末端羧基緊緊相鄰的位置。類似地，短語“緊鄰胺基酸上游”是指緊鄰胺基酸的末端胺基的位置。
如本文所用，術語“插入（inserted）”、“插入（is inserted）”、“插入（inserted into）”或語法上相關的術語是指重組FVIII多肽中相對於天然成熟人FVIII（SEQ ID NO: 18）中的類似位置而言的異源部分的位置。
如本文所用，術語“半衰期”是指體內具體多肽的生物半衰期。半衰期可以表示為投予個體的量的一半被從動物的循環和/或其他組織中清除所需的時間。在將給定多肽的清除曲線構建為時間的函數時，所述曲線通常是雙相的，具有快速的α相和較長的β相。α相通常代表所投予的Fc多肽在血管內與血管外空間之間的平衡，並且部分取決於多肽的大小。β相通常代表多肽在血管內空間中的分解代謝。在一些實施例中，FVIII和包含FVIII的嵌合蛋白是單相的，並且因此不具有α相，而是只具有單一β相。因此，在某些實施例中，如本文所用，術語半衰期是指多肽在β相中的半衰期。
如本文所用的術語“連接”是指第一胺基酸序列或核苷酸序列分別與第二胺基酸序列或核苷酸序列共價或非共價接合。第一胺基酸或核苷酸序列可以與第二胺基酸或核苷酸序列直接接合或並置，或者可替代地，插入序列可以將第一序列共價接合至第二序列。術語“連接”不僅意指第一胺基酸序列與第二胺基酸序列在C末端或N末端融合，還包括將完整的第一胺基酸序列（或第二胺基酸序列）插入第二胺基酸序列（或分別地，第一胺基酸序列）中的任兩個胺基酸中。在一個實施例中，第一胺基酸序列可以藉由肽鍵或連接子連接至第二胺基酸序列。第一核苷酸序列可以藉由磷酸二酯鍵或連接子連接至第二核苷酸序列。連接子可以是肽或多肽（對於多肽鏈）或者核苷酸或核苷酸鏈（對於核苷酸鏈）或者任何化學部分（對於多肽和多核苷酸鏈二者）。術語“連接”還藉由連字號（-）指示。
如本文所用，術語“與……締合”是指在第一胺基酸鏈與第二胺基酸鏈之間形成的共價或非共價鍵。在一個實施例中，術語“與……締合”是指共價、非肽鍵或非共價鍵。這種締合可以用冒號表示，即（:）。在另一個實施例中，它指除肽鍵外的共價鍵。例如，胺基酸半胱胺酸包含硫醇基，其可與第二個半胱胺酸殘基上的硫醇基形成二硫鍵或二硫橋。在大多數天然存在的IgG分子中，CH1區域和CL區域藉由二硫鍵締合，並且這兩條重鏈藉由在對應於使用Kabat編號系統的239和242的位置（位置226或229，EU編號系統）處的兩個二硫鍵締合。共價鍵的例子包括但不限於肽鍵、金屬鍵、氫鍵、二硫鍵、σ鍵、π鍵、δ鍵、糖苷鍵、抓氫鍵、彎曲鍵、偶極鍵、回饋π鍵、雙鍵、三鍵、四鍵、五鍵、六鍵、共軛、超共軛、芳香、哈普托數或反鍵。非共價鍵的非限制性例子包括離子鍵（例如陽離子-π鍵或鹽鍵）、金屬鍵、氫鍵（例如二氫鍵、分子氫配合物、低勢壘氫鍵或對稱氫鍵）、范德華力、倫敦分散力、機械鍵、鹵鍵、親金作用、嵌入、堆積、熵力或化學極性。
如本文所用，“止血”意指停止或減慢出血（bleeding）或出血症（hemorrhage）；或者停止或減慢血液流經血管或身體部分。
如本文所用，“止血障礙”意指遺傳上的遺傳性或獲得性病症，特徵在於由於形成纖維蛋白凝塊的能力受損或無能，傾向於自發地或由於創傷而出血。此類障礙的例子包括血友病。三種主要形式是A型血友病（因子VIII缺乏）、B型血友病（因子IX缺乏或“克雷司馬斯病”）和C型血友病（因子XI缺乏，輕度出血傾向）。其他止血障礙包括例如血管性血友病、因子XI缺乏（PTA缺乏）、因子XII缺乏、纖維蛋白原、凝血酶原、因子V、因子VII、因子X或因子XIII的缺乏或結構異常、GPIb缺陷或缺乏的巨血小板綜合症。GPIb（VWF的受體）可能有缺陷並導致缺少初級凝塊形成（初級止血）和增加的出血傾向、以及Glanzman和Naegeli的血小板無力症（Glanzmann血小板無力症）。在肝功能衰竭（急性和慢性形式）中，肝臟的凝結因子產生不足；這可能增加出血風險。
可以預防性地使用本揭示文本的分離的核酸分子、分離的多肽或包含分離核酸分子的載體。如本文所用，術語“預防性治療”是指在出血發作之前投予分子。在一個實施例中，需要通用止血劑的個體正在進行或即將進行手術。本揭示文本的多核苷酸、多肽或載體可以作為預防藥在手術之前或之後投予。本揭示文本的多核苷酸、多肽或載體可以在手術期間或之後投予以控制急性出血發作。手術可包括但不限於肝移植、肝切除、牙科手術或幹細胞移植。
本揭示文本的分離的核酸分子、分離的多肽或載體也用於按需治療。術語“按需(on-demand)治療”是指響應出血發作的症狀或者在可能引起出血的活動之前投予分離的核酸分子、分離的多肽或載體。在一個態樣，可以在出血開始時（如在損傷後）或在預期要出血時（如在手術前），將按需治療給予個體。在另一個態樣，可以在增加出血風險的活動（如接觸運動）之前給予按需治療。
如本文所用，術語“急性出血”是指無論任何潛在原因的出血發作。例如，個體可能患有創傷、尿毒癥、遺傳性出血障礙（例如，因子VII缺乏）、血小板障礙或由於產生針對凝血因子的抗體而產生的抗性。
如本文所用的“治療（treat）”、“治療（treatment）”、“治療（treating）”是指例如疾病或病症嚴重程度的降低；病程持續時間的縮短；與疾病或病症有關的一種或多種症狀的改善；為患有疾病或病症的個體提供有益的效果而不一定治癒所述疾病或病症或與疾病或病症相關的一種或多種症狀的預防。在一個實施例中，術語“治療（treating）”或“治療（treatment）”意指藉由投予本揭示文本的分離的核酸分子、分離的多肽或載體，將個體中的FVIII谷值水平維持在至少約1 IU/dL、2 IU/dL、3 IU/dL、4 IU/dL、5 IU/dL、6 IU/dL、7 IU/dL、8 IU/dL、9 IU/dL、10 IU/dL、11 IU/dL、12 IU/dL、13 IU/dL、14 IU/dL、15 IU/dL、16 IU/dL、17 IU/dL、18 IU/dL、19 IU/dL或20 IU/dL。在另一個實施例中，治療（treating或treatment）意指將FVIII谷值水平維持在約1 IU/dL與約20 IU/dL之間、約2 IU/dL與約20 IU/dL之間、約3 IU/dL與約20 IU/dL之間、約4 IU/dL與約20 IU/dL之間、約5 IU/dL與約20 IU/dL之間、約6 IU/dL與約20 IU/dL之間、約7 IU/dL與約20 IU/dL之間、約8 IU/dL與約20 IU/dL之間、約9 IU/dL與約20 IU/dL之間、或約10 IU/dL與約20 IU/dL之間。疾病或病症的治療（treatment或treating）還可以包括將個體的FVIII活性維持在相當於非血友病個體中FVIII活性的至少約1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%或20%的水平。治療所需的最低谷水平可以藉由一種或多種已知方法來測量，並且可以針對每個個人加以調節（增加或減小）。
如本文所用，“投予”意指經由醫藥上可接受的途徑將醫藥上可接受的本揭示文本的編碼因子VIII的核酸分子、因子VIII多肽或包含編碼因子VIII的核酸分子的載體投予至個體。投予途徑可以是靜脈內的，例如靜脈內注射和靜脈內輸注。另外的投予途徑包括例如皮下、神經內、眼內、鞘內、肌內、口服、經鼻和經肺投予。核酸分子、多肽和載體可以作為包含至少一種賦形劑的醫藥組合物的一部分來投予。
如本文所用，片語“有需要的個體”包括將受益於本揭示文本的核酸分子、多肽或載體的投予例如以改善止血的個體（如哺乳動物個體）。在一個實施例中，個體包括但不限於患有血友病的個體。在另一個實施例中，個體包括但不限於已經發展出FVIII抑制劑並且因此需要繞路療法的個體。個體可以是成年人或未成年人（例如，小於12歲）。
如本文所用，術語“凝血因子”是指天然存在的或重組產生的分子或其類似物，其預防個體的出血發作或縮短出血發作的持續時間。換句話說，其意指具有促凝血活性（即，負責將纖維蛋白原轉化為不溶性纖維蛋白的網狀物，從而引起血液凝結或凝血）的分子。“可啟動的凝血因子”是呈無活性形式（例如，呈其酶原形式）的凝血因子，其能夠被轉化為活性形式。
如本文所用，“凝血活性”意指參與生化反應級聯的能力，所述級聯以形成纖維蛋白凝塊告終和/或降低出血症或出血發作的嚴重程度、持續時間或頻率。
如本文所用，術語“異源的”或“外源的”是指此類分子通常在給定背景下（例如，在細胞中或在多肽中）未發現。例如，可以將外源或異源分子引入細胞中並且僅在例如藉由轉染或其他形式的遺傳工程化操縱細胞之後存在，或者異源胺基酸序列可以存在於其天然不存在的蛋白質中。
如本文所用，術語“異源核苷酸序列”是指不與給定多核苷酸序列一起天然存在的核苷酸序列。在一個實施例中，異源核苷酸序列編碼能夠延長FVIII的半衰期的多肽。在另一個實施例中，異源核苷酸序列編碼增加FVIII的流體力學半徑的多肽。在其他實施例中，異源核苷酸序列編碼改善FVIII的一種或多種藥代動力學特性但不顯著影響其生物學活性或功能（例如，其促凝血活性）的多肽。在一些實施例中，FVIII藉由連接子與異源核苷酸序列編碼的多肽連接或相連。
“參考核苷酸序列”在本文中用作與本揭示文本的核苷酸序列的比較時，是與本揭示文本的核苷酸序列基本上相同的多核苷酸序列，但是對應於FVIII序列的部分未經優化。
如本文所用，關於核苷酸序列的術語“優化”是指編碼多肽的多核苷酸序列，其中所述多核苷酸序列已經突變以增強所述多核苷酸序列的特性。在一些實施例中，進行優化以增加轉錄水平、增加轉譯水平、增加穩態mRNA水平、增加或減少調控蛋白（如通用轉錄因子）的結合、增加或減少剪接或增加多核苷酸序列產生的多肽的產量。可以對多核苷酸序列進行以使其優化的變化的例子包括密碼子優化、G/C含量優化、去除重複序列、去除富含AT的元件、去除隱蔽剪接位點、去除阻遏轉錄或轉譯的順式作用元件、添加或去除多聚T或多聚A序列、在轉錄起始位點周圍添加增強轉錄的序列（如Kozak共有序列）、去除可以形成莖環結構的序列、去除去穩定序列、去除CpG基序及其兩個或更多個組合。 多核苷酸序列
本揭示文本的某些態樣涉及一種核酸分子，所述核酸分子包含基因盒（例如，編碼治療性蛋白質和/或miRNA）。在一些實施例中，基因盒編碼治療性蛋白質。在一些實施例中，治療性蛋白質包含凝血因子。在一些實施例中，基因盒編碼miRNA。在一些實施例中，核酸分子還包含至少一個非編碼區。在某些實施例中，所述至少一個非編碼區包含啟動子序列、內含子、表現控制序列或其任何組合。
在一些實施例中，基因盒包含編碼FVIII多肽的核苷酸序列，其中核苷酸序列經密碼子優化。在一些實施例中，基因盒包含由mTTR啟動子驅動、編碼密碼子優化的FVIII的核苷酸序列。在一些實施例中，基因盒包含國際申請號PCT/US2017/015879中揭露的核苷酸序列，將所述申請藉由引用以其整體併入。在一些實施例中，基因盒是如PCT/US2017/015879中所述的“hFVIIIco6XTEN”基因盒。在一些實施例中，參考核苷酸序列對應於如揭露於PCT/US2017/015879中的hFVIIIco6XTEN序列。
在一些實施例中，基因盒包含密碼子優化的cDNA，所述cDNA編碼B結構域缺失（BDD）的密碼子優化的人因子VIII分子。在一些實施例中，所述基因盒包含與SEQ ID NO: 14具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的核苷酸序列。在一些實施例中，所述基因盒包含編碼coBDDFVIII6-3aa多肽的核苷酸序列。
在一些實施例中，所述基因盒還包含編碼XTEN多肽的核苷酸序列。在一些實施例中，所述基因盒包含密碼子優化的cDNA，所述密碼子優化的cDNA編碼與144個胺基酸的XTEN多肽融合的B結構域缺失（BDD）的密碼子優化的人因子VIII（BDDcoFVIII）。在一些實施例中，所述基因盒包含如SEQ ID NO: 11所示的核苷酸序列。在一些實施例中，所述基因盒包含與SEQ ID NO: 11具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的核苷酸序列。在一些實施例中，所述基因盒包含編碼coBDDFVIII6-XTEN-3aa多肽的核苷酸序列。
在一些實施例中，所述基因盒包含如SEQ ID NO: 16所示的核苷酸序列。在一些實施例中，所述基因盒包含與SEQ ID NO: 16具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的核苷酸序列。
在一些實施例中，本揭示文本涉及編碼具有FVIII活性的多肽的密碼子優化的核酸分子。在一些實施例中，多核苷酸編碼全長FVIII多肽。在其他實施例中，所述核酸分子編碼B結構域缺失的（BDD）FVIII多肽，其中缺失FVIII的B結構域的全部或一部分。在一個特定的實施例中，所述核酸分子編碼包含與SEQ ID NO: 12具有至少約80%、至少約85%、至少約86%、至少約87%、至少約88%、至少約89%、至少約90%、至少約95%、至少約96%、至少約97%、至少約98%或至少約99%序列同一性的胺基酸序列的多肽或其片段。
在一些實施例中，本揭示文本的核酸分子編碼包含信號肽的FVIII多肽或其片段。在其他實施例中，所述核酸分子編碼缺乏信號肽的FVIII多肽。在一些實施例中，所述信號肽包含SEQ ID NO: 13的胺基酸序列。
在一個實施例中，基因盒是單鏈核酸。在另一個實施例中，基因盒是雙鏈核酸。在另一個實施例中，基因盒是封閉端雙鏈核酸（ceDNA）。
除非另外指定，否則如本文所用的“具有FVIII活性的多肽”意指具有正常凝結作用的功能性FVIII多肽。術語具有FVIII活性的多肽包括保留凝結途徑中全長野生型因子VIII的功能的其功能性片段、變體、類似物或衍生物。“具有FVIII活性的多肽”可與FVIII蛋白、FVIII多肽或FVIII互換使用。FVIII功能的例子包括但不限於啟動凝結的能力、作為因子IX的輔因子作用的能力或在Ca 2+和磷脂存在下與因子IX形成因子Ⅹ酶（tenase）複合物的能力，所述複合物然後將因子X轉化為啟動形式Xa。在一個實施例中，具有FVIII活性的多肽包含兩條多肽鏈，具有FVIII重鏈的第一鏈和具有FVIII輕鏈的第二鏈。在另一個實施例中，具有FVIII活性的多肽是單鏈FVIII。單鏈FVIII可以含有在對應於成熟人FVIII序列（SEQ ID NO: 19）的胺基酸殘基1645和/或1648處的一個或多個突變或取代。參見國際申請號PCT/US2012/045784，將其藉由引用以其整體併入本文。FVIII蛋白可以是人、豬、犬、大鼠或鼠FVIII蛋白。另外，來自人和其他物種的FVIII之間的比較已經鑑定出可能為功能所需的保守殘基。參見例如，Cameron等人 (1998) Thromb. Haemost. 79:317-22；和美國專利號6,251,632。
多種測試可用於評估多肽的FVIII活性：啟動部分促凝血酶原激酶時間（aPTT）測試、生色測定、ROTEM ®測定、凝血酶原時間（PT）測試（也用於確定INR）、纖維蛋白原測試（通常藉由克勞斯法進行）、血小板計數、血小板功能測試（通常藉由PFA-100進行）、TCT、出血時間、混合測試（如果將患者的血漿與正常血漿混合，是否矯正異常）、凝結因子測定、抗磷脂抗體、D-二聚體、遺傳測試（例如，因子V Leiden、凝血酶原突變G20210A）、稀釋魯塞爾蝰蛇毒時間（dRVVT）、雜項血小板功能測試、凝血彈性描記法（TEG或Sonoclot）、凝血彈性測量法（TEM ®，例如ROTEM ®）或優球蛋白溶解時間（ELT）。
aPTT測試是測量“固有”（也稱為接觸啟動途徑）和常見凝結途徑二者的功效的性能指示物。這個測試一般用於測量市售重組凝血因子（例如，FVIII或FIX）的凝血活性。其與測量外在途徑的凝血酶原時間（PT）結合使用。
ROTEM ®分析提供關於止血的整體動力學的資訊：凝血時間、凝塊形成、凝塊穩定性和溶解。凝血彈性測量法中的不同參數依賴於血漿凝結系統的活性、血小板功能、纖維蛋白溶解或影響這些相互作用的許多因素。這個分析可以提供次級止血的全面見解。
如本文所用，FVIII的“B結構域”與本領域中已知的B結構域相同，所述B結構域是藉由全長人FVIII（SEQ ID NO: 20）的內部胺基酸序列同一性和凝血酶的蛋白質水解切割位點（例如，殘基Ser741-Arg1648）來定義。其他人FVIII結構域是藉由以下胺基酸殘基來定義：A1，殘基Ala1-Arg372；A2，殘基Ser373-Arg740；A3，殘基Ser1690-Ile2032；C1，殘基Arg2033-Asn2172；C2，殘基Ser2173-Tyr2332。A3-C1-C2序列包括殘基Ser1690-Tyr2332。其餘序列（殘基Glu1649-Arg1689）通常被稱為FVIII輕鏈啟動肽。豬、小鼠和犬FVIII的所有結構域（包括B結構域）的邊界的位置也是本領域中已知的。BDD FVIII的例子是REFACTO®重組BDD FVIII（Wyeth Pharmaceuticals, Inc.）。 “B結構域缺失的FVIII”可以具有揭露於以下文獻中的完整或部分缺失：美國專利號6,316,226、6,346,513、7,041,635、5,789,203、6,060,447、5,595,886、6,228,620、5,972,885、6,048,720、5,543,502、5,610,278、5,171,844、5,112,950、4,868,112和6,458,563，將其中每一個均藉由引用以其整體併入本文。B結構域缺失的FVIII的其他例子揭露於Hoeben R.C.等人 (1990) J. Biol. Chem.265 (13): 7318-7323；Meulien等人 (1988), Protein Eng.2(4): 301-6；Toole等人 (1986) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83, 5939-5942；Eaton等人 (1986) Biochemistry 25:8343-8347；Sarver等人 (1987) DNA 6:553-564；歐洲專利號295597；和國際公開號WO 91/09122、WO 88/00831和WO 87/04187，將其中的每一個均藉由引用以其整體併入本文。可以在任何FVIII序列中產生前述每一種缺失。 密碼子優化
在一個實施例中，本揭示文本提供了一種分離的核酸分子，所述分離的核酸分子包含編碼具有FVIII活性的多肽的核苷酸序列，其中已經將所述核酸序列進行密碼子優化。在一些實施例中，將編碼具有FVIII活性的多肽的序列針對人表現進行密碼子優化。在其他實施例中，將編碼具有FVIII活性的多肽的序列針對鼠表現進行密碼子優化。
術語“密碼子優化的”，因為它是指用於轉化各種宿主的基因或核酸分子的編碼區，是指在不改變由DNA編碼的多肽的情況下，反映宿主生物體的典型密碼子使用的基因或核酸分子編碼區中的密碼子的改變。這種優化包括將至少一個或多於一個或相當數量的密碼子用一個或多個更常用於該生物體的基因中的密碼子替代。
包含編碼任何多肽鏈的胺基酸的密碼子的核苷酸序列中的偏差允許基因編碼序列中的變化。因為每個密碼子由三個核苷酸組成，並且包含DNA的核苷酸局限於四種特定的鹼基，因此存在64種可能的核苷酸組合，其中的61種編碼胺基酸（剩餘的三種密碼子編碼結束轉譯的信號）。作為結果，許多胺基酸由多於一種密碼子指定。例如，胺基酸丙胺酸和脯胺酸由四種三聯體編碼，絲胺酸和精胺酸由六種三聯體編碼，而色胺酸和甲硫胺酸僅由一種三聯體編碼。這種簡併性允許DNA鹼基組成在很大的範圍內變化而不會改變由DNA編碼的蛋白質的胺基酸序列。
許多生物體展現出在增長的肽鏈中使用特定的密碼子來編碼特定的胺基酸的插入的偏差。密碼子偏好性或密碼子偏差、生物體之間密碼子使用的差異性是由遺傳密碼的簡併性所提供的，並且在許多生物體中都是詳細記錄的。密碼子偏差通常與信使RNA（mRNA）的轉譯效率相關，其轉而又被認為尤其取決於被轉譯的密碼子的特性和特定轉移RNA（tRNA）分子的可用性。細胞中選定的tRNA的優勢通常是肽合成中最常使用的密碼子的反映。因此，基於密碼子優化，可以針對在給定生物體中的最佳基因表現來定制基因。
鑒於可用於多種動物、植物和微生物物種的大量的基因序列，已經計算了密碼子使用的相對頻率。密碼子使用表可以例如在“Codon Usage Database”獲得，在www.kazusa.or.jp/codon/（2012年6月18日訪問）獲得。參見Nakamura, Y.等人 Nucl. Acids Res. 28:292 (2000)。
以優化的頻率隨機分配密碼子以編碼給定的多肽序列可以藉由計算每種胺基酸的密碼子頻率，然後將密碼子隨機分配到所述多肽序列來手動完成。另外，各種演算法和電腦軟體程式可以用於計算最佳序列。
密碼子優化還可以包括將潛在的免疫原性序列從由核苷酸序列編碼的蛋白質序列中去除。在一些實施例中，經由電腦模擬（in silico）方法可以用於鑑定蛋白質或核苷酸序列中潛在的免疫原性序列。這些方法的非限制性例子包括人白細胞抗原（HLA）等位基因（例如，DR、DP、DQ）的鑑定以及給定蛋白質序列中的主要組織相容性複合物II類（MHCII）結合位點的鑑定。在一些實施例中，公共資料庫（如免疫表位資料庫和分析資源（IEDB）（http://www.iedb.org/））可以用於鑑定潛在的免疫原性序列（參見例如，Zhang Q等人 Nucleic Acids Res (2008) 36:W513-8；Kim Y等人 Nucleic Acids Res (2012) 40:W525-30；Dhanda等人 Nucleic Acids Res (2019) 47: W502-W506）。在一些實施例中，NetMHCIIpan 3.0方法可以用於鑑定潛在的免疫原性序列，如描述於Lamberth K等人 Sci Transl Med. 2017;9(372):eaag1286中。在一些實施例中，缺失了編碼潛在的免疫原性序列的核苷酸序列。 異源核苷酸序列
在一些實施例中，本揭示文本的分離的核酸分子還包含異源核苷酸序列。在一些實施例中，本揭示文本的分離的核酸分子還包含至少一種異源核苷酸序列。所述異源核苷酸序列可以與本揭示文本的優化的BDD-FVIII核苷酸序列在5'端、在3'端處連接，或插入到所述優化的BDD-FVIII核苷酸序列的中間。因此，在一些實施例中，由異源核苷酸序列編碼的異源胺基酸序列與由核苷酸序列編碼的FVIII胺基酸序列的N末端或C末端連接，或者插入到所述FVIII胺基酸序列的兩個胺基酸之間。在一些實施例中，所述異源胺基酸序列可以在一個或多個插入位點處插入到兩個胺基酸之間。在一些實施例中，所述異源胺基酸序列可以在以下文獻中揭露的任何位點處插入由本揭示文本的核酸分子編碼的FVIII多肽內：國際公開號WO 2013/123457 A1、WO 2015/106052 A1或美國公開號2015/0158929 A1，將其中的每一個均藉由引用以其整體併入本文。
在一些實施例中，將由異源核苷酸序列編碼的異源胺基酸序列插入B結構域或其片段內。在一些實施例中，將異源胺基酸序列插入FVIII內，緊接對應於野生型成熟人FVIII（SEQ ID NO: 19）的胺基酸745的胺基酸的下游。在一個特定實施例中，所述FVIII包含對應於野生型成熟人FVIII（SEQ ID NO: 19）的胺基酸746-1637的缺失，並且將由異源核苷酸序列編碼的異源胺基酸序列緊接對應於野生型成熟人FVIII（SEQ ID NO: 19）的胺基酸745的下游插入。本文引用的FVIII的插入位點指示對應於野生型成熟人FVIII（SEQ ID NO: 19）的胺基酸位置的胺基酸位置。
在一些實施例中，異源部分是具有非結構化或結構化特徵的肽或多肽，所述特徵與併入本揭示文本的蛋白質中時體內半衰期的延長相關。非限制性例子包括白蛋白、白蛋白片段、免疫球蛋白的Fc片段、人絨毛膜促性腺激素的β亞基的C末端肽（CTP）、HAP序列、XTEN序列、轉鐵蛋白或其片段、PAS多肽、聚甘胺酸連接子、聚絲胺酸連接子、白蛋白結合部分或者這些多肽的任何片段、衍生物、變體或組合。
在某些實施例中，異源部分改善了FVIII蛋白的一種或多種藥代動力學特性但不顯著影響其生物學活性或功能。在一些實施例中，異源部分增加了本揭示文本的FVIII蛋白的體內和/或體外半衰期。FVIII蛋白的體內半衰期可以藉由本領域技術人員已知的任何方法來確定，所述方法例如活性測定（生色測定或一步式凝血aPTT測定）、ELISA、ROTEM TM等。
在其他實施例中，異源部分增加了本揭示文本的FVIII蛋白或其片段（例如，在FVIII蛋白的蛋白質水解切割後包含異源部分的片段）的穩定性。如本文所用，術語“穩定性”是指本領域公認的回應環境條件（例如，升高或降低的溫度）維持FVIII蛋白的一種或多種物理特性的量度。在某些態樣，物理特性可以是維持FVIII蛋白的共價結構（例如，不存在蛋白質水解切割、不期望的氧化或脫醯胺作用）。在其他態樣，物理特性還可以是處於正確折疊狀態的FVIII蛋白的存在（例如，不存在可溶性或不溶性聚集體或沈澱物）。在一個態樣，FVIII蛋白的穩定性是藉由測定FVIII蛋白的生物物理特性來測量，所述生物物理特性例如熱穩定性、pH解折疊譜、糖基化的穩定去除、溶解度、生化功能（例如，結合至蛋白質、受體或配體的能力）等和/或其組合。在另一個態樣，生化功能是藉由相互作用的結合親和性來證實。在一個態樣，蛋白質穩定性的量度是熱穩定性，即對熱激發的抗性。穩定性可以使用本領域中已知的方法來測量，如HPLC（高效液相層析）、SEC（尺寸排阻層析）、DLS（動態光散射）等。測量熱穩定性的方法包括但不限於差式掃描量熱法（DSC）、差式掃描螢光測定法（DSF）、圓二色性（CD）和熱激發測定。
在一些實施例中，異源部分包括一個或多個XTEN序列、其片段、變體或衍生物。如本文所用，“XTEN序列”是指延伸長度的多肽，其具有非天然存在的基本上不重複的序列，所述序列主要由小親水胺基酸構成，並且所述序列在生理條件下具有較低程度的或不具有二級或三級結構。作為異源部分，XTEN可以用作半衰期延長部分。另外，XTEN可以提供所需特性，包括但不限於增強的藥代動力學參數和溶解度特徵。可以藉由引入XTEN序列賦予的其他有利特性包括增強的構形柔性、增強的水溶性、高度的蛋白酶抗性、低免疫原性、與哺乳動物受體的低結合或增加的流體動力學（或Stokes）半徑。
XTEN可以有不同的長度用於插入或連接至FVIII。在一些實施例中，用於本揭示文本的XTEN序列是具有大於約20、30、40、50、60、70、80、90、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000、1200、1400、1600、1800或2000個胺基酸殘基的肽或多肽。在某些實施例中，XTEN是具有大於約20至約3000個胺基酸殘基、大於30至約2500個殘基、大於40至約2000個殘基、大於50至約1500個殘基、大於60至約1000個殘基、大於70至約900個殘基、大於80至約800個殘基、大於90至約700個殘基、大於100至約600個殘基、大於110至約500個殘基、或大於120個至大約400個殘基的肽或多肽。在一個具體實施例中，所述XTEN包含長度長於42個胺基酸且短於144個胺基酸的胺基酸序列。
本揭示文本的XTEN序列可包含一個或多個具有5至14個（例如9至14個）胺基酸殘基的序列基序或與所述序列基序至少80%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%相同的胺基酸序列，其中所述基序包含、基本上由或由選自甘胺酸（G）、丙胺酸（A）、絲胺酸（S）、蘇胺酸（T）、麩胺酸（E）和脯胺酸（P）的4-6種類型的胺基酸（例如5種胺基酸）組成。參見US 2010-0239554 A1。
可以用作本揭示文本的嵌合蛋白中的異源部分的XTEN序列的例子揭露於例如以下文獻中：美國專利公開號2010/0239554 A1、2010/0323956 A1、2011/0046060 A1、2011/0046061 A1、2011/0077199 A1或2011/0172146 A1，或者國際專利公開號WO 2010091122 A1、WO 2010144502 A2、WO 2010144508 A1、WO 2011028228 A1、WO 2011028229 A1或WO 2011028344 A2，將其中的每一個均藉由引用以其整體併入本文。
所述一個或多個XTEN序列可以在由核苷酸序列編碼的胺基酸序列的C末端或N末端處插入，或者在由核苷酸序列編碼的胺基酸序列中的兩個胺基酸之間插入。例如，所述XTEN可以在一個或多個插入位點的兩個胺基酸之間插入。允許XTEN插入的FVIII內的位點的例子可以發現於例如國際公開號WO 2013/123457 A1或美國公開號2015/0158929 A1中，將其藉由引用以其整體併入本文。
在某些實施例中，異源部分是肽連接子。
如本文所用，術語“肽連接子”或“連接子部分”是指連接多肽鏈的線性胺基酸序列中的兩個結構域的肽或多肽序列（例如，合成肽或多肽序列）。
在一些實施例中，編碼肽連接子的異源核苷酸序列可以在本揭示文本的優化的FVIII多核苷酸序列與編碼例如上文所述的異源部分之一（如白蛋白）的異源核苷酸序列之間插入。肽連接子可以向嵌合多肽分子提供柔性。連接子通常不被切割，但是可能需要這種切割。在一個實施例中，在加工期間不去除這些連接子。
可以存在於本揭示文本的嵌合蛋白中的一種類型的連接子是蛋白酶可切割的連接子，其包含切割位點（即，蛋白酶切割位點底物，例如因子XIa、Xa或凝血酶切割位點）並且可以在切割位點的N末端或C末端或兩側上包括其他連接子。這些可切割連接子在併入本揭示文本的構建體中時產生具有異源切割位點的嵌合分子。
在一個實施例中，由本揭示文本的核酸分子編碼的FVIII多肽包含兩個或更多個Fc結構域或部分，所述兩個或更多個Fc結構域或部分經由cscFc連接子連接以形成包含於單條多肽鏈中的Fc區。cscFc連接子側接有至少一個細胞內加工位點，即由細胞內酶切割的位點。多肽在所述至少一個細胞內加工位點的切割產生包含至少兩條多肽鏈的多肽。
其他肽連接子可以任選地用於本揭示文本的構建體中，例如以將FVIII蛋白連接至Fc區。可以結合本揭示文本使用的一些示例性連接子包括例如更詳細地描述於下文中的包含GlySer胺基酸的多肽。
在一個實施例中，肽連接子是合成的，即非天然存在的。在一個實施例中，肽連接子包括包含如下胺基酸序列的肽（或多肽）（其可以是或可以不是天然存在的），所述胺基酸序列將第一線性胺基酸序列與在自然界中並非與其天然地連接或遺傳融合的第二線性胺基酸序列連接或遺傳融合。例如，在一個實施例中，肽連接子可以包含非天然存在的多肽，其是天然存在的多肽的修飾形式（例如，包含突變，如添加、取代或缺失）。在另一個實施例中，肽連接子可以包含非天然存在的胺基酸。在另一個實施例中，肽連接子可以包含存在於在自然界中不存在的線性序列中的天然存在的胺基酸。在仍另一個實施例中，肽連接子可以包含天然存在的多肽序列。
在另一個實施例中，肽連接子包含gly-ser連接子或由所述gly-ser連接子組成。如本文所用，術語“gly-ser連接子”是指由甘胺酸和絲胺酸殘基組成的肽。在某些實施例中，所述gly-ser連接子可以插入肽連接子的兩個其他序列之間。在其他實施例中，gly-ser連接子連接於肽連接子的另一序列的一個或兩個末端。在又其他實施例中，兩個或更多個gly-ser連接子串聯併入肽連接子中。在一個實施例中，本揭示文本的肽連接子包含上鉸鏈區的至少一部分（例如，衍生自IgG1、IgG2、IgG3或IgG4分子）、中鉸鏈區的至少一部分（例如，衍生自IgG1、IgG2、IgG3或IgG4分子）和一系列gly/ser胺基酸殘基。
本揭示文本的肽連接子的長度為至少一個胺基酸並且可以具有變化的長度。在一個實施例中，本揭示文本的肽連接子的長度為約1至約50個胺基酸。如在此上下文中所用，術語“約”指示+/-兩個胺基酸殘基。由於連接子長度必須是正整數，長度為約1至約50個胺基酸的長度意指長度為1-3至48-52個胺基酸的長度。在另一個實施例中，本揭示文本的肽連接子的長度為約10至約20個胺基酸。在另一個實施例中，本揭示文本的肽連接子的長度為約15至約50個胺基酸。在另一個實施例中，本揭示文本的肽連接子的長度為約20至約45個胺基酸。在另一個實施例中，本揭示文本的肽連接子的長度為約15至約35或約20至約30個胺基酸。在另一個實施例中，本揭示文本的肽連接子的長度為約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、40、50、60、70、80、90、100、500、1000或2000個胺基酸。在一個實施例中，本揭示文本的肽連接子的長度為20或30個胺基酸。
在一些實施例中，肽連接子可以包含至少2、至少3、至少4、至少5、至少10、至少20、至少30、至少40、至少50、至少60、至少70、至少80、至少90或至少100個胺基酸。在其他實施例中，肽連接子可以包含至少200、至少300、至少400、至少500、至少600、至少700、至少800、至少900或至少1,000個胺基酸。在一些實施例中，肽連接子可以包含至少約10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、150、200、300、400、500、600、700、800、900、1000、1100、1200、1300、1400、1500、1600、1700、1800、1900或2000個胺基酸。肽連接子可以包含1-5個胺基酸、1-10個胺基酸、1-20個胺基酸、10-50個胺基酸、50-100個胺基酸、100-200個胺基酸、200-300個胺基酸、300-400個胺基酸、400-500個胺基酸、500-600個胺基酸、600-700個胺基酸、700-800個胺基酸、800-900個胺基酸或900-1000個胺基酸。
可以使用本領域中已知的技術將肽連接子引入多肽序列中。可以藉由DNA序列分析來確認修飾。可以使用質體DNA轉化宿主細胞用於穩定產生所產生的多肽。 表現控制序列
在一些實施例中，本揭示文本的核酸分子或載體還包含至少一個表現控制序列。例如，本揭示文本的分離的核酸分子可以與至少一個表現控制序列可操作地連接。所述表現控制序列可以是例如啟動子序列或啟動子-增強子組合。
組成型哺乳動物啟動子包括但不限於以下基因的啟動子：次黃嘌呤磷酸核糖轉移酶（HPRT）、腺苷脫胺酶、丙酮酸激酶、β-肌動蛋白啟動子和其他組成型啟動子。在真核細胞中組成型起作用的示例性病毒啟動子包括例如來自巨細胞病毒（CMV）、猿猴病毒（例如，SV40）、乳頭瘤病毒、腺病毒、人免疫缺陷病毒（HIV）、勞斯肉瘤病毒、巨細胞病毒、莫洛尼白血病病毒的長末端重複序列（LTR）和其他反轉錄病毒的啟動子，以及單純皰疹病毒的胸苷激酶啟動子。其他組成型啟動子是本領域普通技術人員已知的。可用作本揭示文本的基因表現序列的啟動子還包括誘導型啟動子。誘導型啟動子是在誘導劑存在下表現。例如，在某些金屬離子存在下誘導金屬硫蛋白啟動子以促進轉錄和轉譯。其他誘導型啟動子是本領域普通技術人員已知的。
在一個實施例中，本揭示文本包括在組織特異性啟動子和/或增強子控制下的轉基因表現。在另一個實施例中，啟動子或其他表現控制序列選擇性地增強轉基因在肝細胞中的表現。在某些實施例中，啟動子或其他表現控制序列選擇性地增強轉基因在肝細胞、竇狀細胞和/或內皮細胞中的表現。在一個特定實施例中，啟動子或其他表現控制序列選擇性地增強轉基因在內皮細胞中的表現。在某些實施例中，啟動子或其他表現控制序列選擇性地增強轉基因在以下中的表現：肌肉細胞、中樞神經系統、眼睛、肝臟、心臟或其任何組合。肝臟特異性啟動子的例子包括但不限於小鼠甲狀腺素轉運蛋白啟動子（mTTR）、天然人因子VIII啟動子、人α-1-抗胰蛋白酶啟動子（hAAT）、人白蛋白最小啟動子和小鼠白蛋白啟動子。在一些實施例中，本文公開的核酸分子包含mTTR啟動子。mTTR啟動子描述於Costa等人 (1986) Mol. Cell. Biol. 6:4697中。FVIII啟動子描述於Figueiredo和Brownlee, 1995, J. Biol. Chem. 270:11828-11838中。在一些實施例中，啟動子選自肝臟特異性啟動子（例如，α1-抗胰蛋白酶（AAT））、肌肉特異性啟動子（例如，肌肉肌酸激酶（MCK）、肌球蛋白重鏈α（αMHC）、肌紅蛋白（MB）和結蛋白（DES））、合成啟動子（例如，SPc5-12、2R5Sc5-12、dMCK和tMCK）或其任何組合。
在一些實施例中，轉基因表現靶向肝臟。在某些實施例中，轉基因表現靶向肝細胞。在其他實施例中，轉基因表現靶向內皮細胞。在一個特定實施例中，轉基因表現靶向天然表現內源FVIII的任何組織。在一些實施例中，轉基因表現靶向中樞神經系統。在某些實施例中，轉基因表現靶向神經元。在一些實施例中，轉基因表現靶向傳入神經元。在一些實施例中，轉基因表現靶向傳出神經元。在一些實施例中，轉基因表現靶向中間神經元。在一些實施例中，轉基因表現靶向神經膠質細胞。在一些實施例中，轉基因表現靶向星形膠質細胞。在一些實施例中，轉基因表現靶向少突膠質細胞。在一些實施例中，轉基因表現靶向小神經膠質細胞。在一些實施例中，轉基因表現靶向室管膜細胞。在一些實施例中，轉基因表現靶向許旺細胞。在一些實施例中，轉基因表現靶向衛星細胞。在一些實施例中，轉基因表現靶向肌肉組織。在一些實施例中，轉基因表現靶向平滑肌。在一些實施例中，轉基因表現靶向心肌。在一些實施例中，轉基因表現靶向骨骼肌。在一些實施例中，轉基因表現靶向眼睛。在一些實施例中，轉基因表現靶向感光細胞。在一些實施例中，轉基因表現靶向視網膜神經節細胞。
可以用於本文揭示的核酸分子的其他啟動子包括小鼠甲狀腺素轉運蛋白啟動子（mTTR）、天然人因子VIII啟動子、人α-1-抗胰蛋白酶啟動子（hAAT）、人白蛋白最小啟動子、小鼠白蛋白啟動子、三重四脯胺酸（TTP；也稱為ZFP36）啟動子、CASI啟動子、CAG啟動子、巨細胞病毒（CMV）啟動子、α1-抗胰蛋白酶（AAT）啟動子、肌肉肌酸激酶（MCK）啟動子、肌球蛋白重鏈α（αMHC）啟動子、肌紅蛋白（MB）啟動子、結蛋白（DES）啟動子、SPc5-12啟動子、2R5Sc5-12啟動子、dMCK啟動子和tMCK啟動子、磷酸甘油酸激酶（PGK）啟動子或其任何組合。
在一些實施例中，本文揭示的核酸分子包含甲狀腺素轉運蛋白（TTR）啟動子。在一些實施例中，所述啟動子是小鼠甲狀腺素轉運蛋白（mTTR）啟動子。mTTR啟動子的非限制性例子包括如揭露於美國公開號US2019/0048362中的mTTR202啟動子、mTTR202opt啟動子和mTTR482啟動子，將所述專利藉由引用以其整體併入本文。在一些實施例中，所述啟動子是肝臟特異性的經修飾的小鼠甲狀腺素轉運蛋白（mTTR）啟動子。在一些實施例中，所述啟動子是肝臟特異性的經修飾的小鼠甲狀腺素轉運蛋白（mTTR）啟動子mTTR482。mTTR482啟動子的例子描述於Kyostio-Moore等人 (2016) Mol Ther Methods Clin Dev. 3:16006和Nambiar B.等人 (2017) Hum Gene Ther Methods, 28(1):23-28中。在一些實施例中，所述啟動子是包含SEQ ID NO: 9的核酸序列的肝臟特異性的經修飾的小鼠甲狀腺素轉運蛋白（mTTR）啟動子。
可以使用一種或多種增強子元件進一步增強表現水平以實現治療功效。一種或多種增強子可以單獨提供，或與一種或多種啟動子元件一起提供。通常，表現控制序列包含多個增強子元件和組織特異性啟動子。在一個實施例中，增強子包含一個或多個複本的α-1-微球蛋白/雙庫尼茨抑制劑（bikunin）增強子（Rouet等人 (1992) J. Biol. Chem. 267:20765-20773；Rouet等人 (1995), Nucleic Acids Res. 23:395-404；Rouet等人 (1998) Biochem. J. 334:577-584；Ill等人 (1997) Blood Coagulation Fibrinolysis 8:S23-S30）。在一些實施例中，增強子衍生自肝臟特異性轉錄因子結合位點（如EBP、DBP、HNF1、HNF3、HNF4、HNF6和Enh1），所述肝臟特異性轉錄因子結合位點包含HNF1、（有義）-HNF3、（有義）-HNF4、（反義）-HNF1、（反義）-HNF6、（有義）-EBP、（反義）-HNF4（反義）。在一些實施例中，增強子是包含SEQ ID NO: 8的核酸序列的mTTR482增強子。
在一些實施例中，增強子包含一個或兩個經修飾的凝血酶原增強子（pPrT2）、一個或兩個α1-微雙庫尼茨抑制劑增強子（A1MB2）、經修飾的小鼠白蛋白增強子（mEalb）、乙型肝炎病毒增強子II（HE11）或CRM8增強子。在一些實施例中，增強子是合成增強子。在一些實施例中，增強子是包含SEQ ID NO: 7的核酸序列的合成增強子。
在一些實施例中，本文揭示的核酸分子包含內含子或內含子序列。在一些實施例中，內含子序列是天然存在的內含子序列。在一些實施例中，內含子序列是合成序列。在一些實施例中，內含子序列衍生自天然存在的內含子序列。在一些實施例中，內含子序列是雜合的合成內含子或嵌合內含子。在一些實施例中，內含子序列是嵌合內含子，所述嵌合內含子由雞β-肌動蛋白/兔β-珠蛋白內含子組成並且已經修飾以消除現有五個ATG序列，從而減少假轉譯起始。在某些實施例中，內含子序列包含SV40小T內含子。
在一些實施例中，本文公開的核酸分子包含一個或多個DNA核靶向序列（DTS）。DTS促進含有此類序列的DNA分子易位至核中。在某些實施例中，DTS包含SV40增強子序列。在某些實施例中，DTS包含c-Myc增強子序列。在一些實施例中，核酸分子包含位於第一ITR與第二ITR之間的DTS。在一些實施例中，核酸分子包含位於第一ITR的3’和轉基因（例如FVIII蛋白）的5’的DTS。在一些實施例中，核酸分子包含位於轉基因的3’和所述核酸分子上的第二ITR的5’的DTS。
在一些實施例中，本文揭示的核酸分子包含toll樣受體9（TLR9）抑制序列。示例性TLR9抑制序列描述於例如Trieu等人 (2006) Crit Rev Immunol. 26(6):527-44；Ashman等人 Int’l Immunology 23(3): 203-14中。 載體系統
本揭示文本的一些實施例涉及包含一種或多種編碼本文所述的具有FVIII活性的多肽的密碼子優化的核酸分子的載體、包含所述載體的宿主細胞、和使用所述載體治療出血障礙的方法。本揭示文本藉由提供包含優化的FVIII序列的載體滿足了本領域中的重要需求，所述優化的FVIII序列顯示出在個體中的表現增加以及在用於基因治療方法時潛在地導致更大的治療功效。
用於本揭示文本的合適的載體包括表現載體、病毒載體和質體載體。在一個實施例中，所述載體是病毒載體。
如本文所用，表現載體是指任何核酸構建體，其含有用於插入的編碼序列的轉錄和轉譯的必需元件，或者在RNA病毒載體的情況下，當引入時合適的宿主細胞時用於複製和轉譯的必需元件。表現載體可包括質體、噬菌粒、病毒及其衍生物。
本揭示文本的表現載體將包括編碼本文所述的BDD FVIII蛋白的優化的多核苷酸。在一個實施例中，所述BDD FVIII蛋白的優化的編碼序列與表現控制序列可操作地連接。如本文所用，當兩個核酸序列以這種方式共價連接以允許每個組分核酸序列保留其功能性時，它們是可操作地連接的。當編碼序列和基因表現控制序列以這種方式共價連接以便將編碼序列的表現或轉錄和/或轉譯置於基因表現控制序列的影響或控制之下時，它們被稱為可操作連接的。如果5'基因表現序列中啟動子的誘導導致編碼序列的轉錄，並且如果兩個DNA序列之間的連接的性質沒有 (1) 導致移碼突變的引入，(2) 干擾啟動子區指導編碼序列轉錄的能力，或 (3) 干擾相應RNA轉錄物被轉譯成蛋白質的能力，則這兩個DNA序列被稱為可操作連接的。因此，如果基因表現序列能夠影響編碼核酸序列的轉錄使得所得轉錄物被轉譯成所需的蛋白質或多肽，則所述基因表現序列將與該編碼核酸序列可操作地連接。
病毒載體包括但不限於來自以下病毒的核酸序列：反轉錄病毒（如莫洛尼鼠白血病病毒、哈威鼠肉瘤病毒、鼠乳腺瘤病毒和勞斯氏肉瘤病毒）；慢病毒；腺病毒；腺相關病毒；SV40型病毒；多瘤病毒；愛潑斯坦-巴爾病毒；乳頭瘤病毒；皰疹病毒；痘苗病毒；脊髓灰質炎病毒；和RNA病毒（如反轉錄病毒）。人們可以便利地採用本領域熟知的其他載體。某些病毒載體是基於非細胞病變的真核病毒，其中非必需基因已經被目的基因替代。在一個實施例中，病毒是腺相關病毒，雙鏈DNA病毒。腺相關病毒可以被工程化為複製缺陷型並且能夠感染大範圍的細胞類型和物種。
根據本揭示文本，可以使用衍生自幾乎任何血清型的一種或多種不同的AAV載體序列。特定的AAV載體序列的選擇將由諸如目的趨向性、所需的載體產量等已知參數指導。通常，AAV血清型具有在胺基酸和核酸水平上具有顯著同源性的基因組序列、提供了一組相關的遺傳功能、產生相關的病毒體、並且相似地複製和組裝。關於不同AAV血清型的基因組序列和基因組相似性的綜述參見例如，GenBank登錄號U89790；GenBank登錄號J01901；GenBank登錄號AF043303；GenBank登錄號AF085716；Chlorini等人 (1997) J. Vir. 71: 6823-33；Srivastava等人 (1983) J. Vir. 45:555-64；Chlorini等人 (1999) J. Vir. 73:1309-1319；Rutledge等人 (1998), J. Vir. 72:309-319；或Wu等人 (2000) J. Vir. 74: 8635-47。AAV血清型1、2、3、4和5是在本揭示文本的背景下用於所述用途的AAV核苷酸序列的說明性來源。AAV6、AAV7、AAV8或AAV9或藉由例如衣殼改組技術和AAV衣殼文庫獲得的或者從新設計、開發或進化的ITR中獲得的最近開發的AVV樣顆粒也適合於某些公開申請。參見Dalkara等人 (2013), Sci. Transl. Med. 5(189): 189ra76；Kotterman MA (2014) Nat. Rev. Genet. 15(7):455。
其他載體包括質體載體。質體載體在本領域中已經被廣泛描述，並且是本領域技術人員熟知的。參見例如，Sambrook等人, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 第二版, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989。在最近的幾年裡，質體載體已經被發現對於在體內向細胞遞送基因是特別有利的，因為它們不能在宿主基因組內複製並且不能整合到宿主基因組中。然而，這些質體（具有與宿主細胞相容的啟動子）可以表現來自質體內可操作編碼的基因的肽。可以從商業供應商獲得的一些常用的質體包括pBR322、pUC18、pUC19、各種pcDNA質體、pRC/CMV、各種pCMV質體、pSV40和pBlueScript。特定質體的另外的例子包括pcDNA3.1，目錄號V79020；pcDNA3.1/hygro，目錄號V87020；pcDNA4/myc-His，目錄號V86320；和pBudCE4.1，目錄號V53220，所有均來自Invitrogen（加利福尼亞州卡爾斯巴德）。其他質體是本領域普通技術人員熟知的。另外，可以使用標準分子生物技術去除和/或添加DNA的特定片段來定制設計質體。
在某些實施例中，有用的是在載體內包括一個或多個miRNA靶序列，所述miRNA靶序列例如與優化的FVIII轉基因可操作地連接。載體中包括的多於一個複本的miRNA靶序列可以增加系統的有效性。例如，表現多於一種轉基因的載體可以具有在多於一個可以相同或不同的miRNA靶序列控制下的轉基因。miRNA靶序列可以是串聯的，但是也包括其他排列。含有miRNA靶序列的轉基因基因盒也能以反義定向插入載體內。miRNA靶序列的例子描述於以下文獻中：WO 2007/000668、WO 2004/094642、WO 2010/055413或WO 2010/125471，所述文獻藉由引用以其整體併入本文。然而，在某些其他實施例中，載體將不包括任何miRNA靶序列。是否要包括miRNA靶序列（以及數量）的選擇將依據已知參數（如計畫的組織標靶、所需的表現水平等）來指導。 慢病毒載體
慢病毒包括牛慢病毒群、馬慢病毒群、貓慢病毒群、綿羊山羊慢病毒群和靈長類慢病毒群的成員。用於基因療法的慢病毒載體的發展綜述於以下文獻中：Klimatcheva等人 (1999) Frontiers in Bioscience 4:481-496。適用於基因療法的慢病毒載體的設計和使用描述於例如美國專利號6,207,455和6,615,782中。慢病毒的例子包括但不限於HIV-1、HIV-2、HIV-1/HIV-2假型、HIV-1/SIV、FIV、山羊關節炎腦炎病毒（CAEV）、馬傳染性貧血病毒和牛免疫缺陷病毒。
在一些實施例中，本揭示文本的慢病毒載體是“第三代”慢病毒載體。如本文所用，術語“第三代”慢病毒載體是指具有第二代載體系統的特徵的慢病毒包裝系統，並且其進一步缺乏功能性tat基因，例如tat基因已從其缺失或失活的慢病毒包裝系統。通常，編碼rev的基因在單獨的表現構建體上提供。參見例如，Dull等人 (1998) J. Virol. 72: 8463-8471。如本文所用，“第二代”慢病毒載體系統是指缺乏功能性附屬基因的慢病毒包裝系統，如附屬基因vif、vpr、vpu和nef已經從其缺失或失活的慢病毒包裝系統。參見例如，Zufferey等人 (1997) Nat. Biotechnol. 15:871-875。如本文所用，“包裝系統”是指一組病毒構建體，其包含編碼參與包裝重組病毒的病毒蛋白的基因。通常，包裝系統的構建體將最終被摻入包裝細胞中。
在一些實施例中，本揭示文本的第三代慢病毒載體是自失活慢病毒載體。在一些實施例中，慢病毒載體是VSV.G假型慢病毒載體。在一些實施例中，慢病毒載體包含用於轉基因表現的肝細胞特異性啟動子。在一些實施例中，肝細胞特異性啟動子是增強的甲狀腺素轉運蛋白啟動子。在一些實施例中，慢病毒載體包含miR-142的一個或多個靶序列以降低針對轉基因產物的免疫反應。在一些實施例中，將miR-142的一個或多個靶序列摻入本揭示文本的慢病毒載體中允許所需的轉基因表現譜。例如，摻入miR-142的一個或多個靶序列可以在血管內和血管外造血譜系中抑制轉基因表現，而在非造血細胞中維持轉基因表現。在用本揭示文本的慢病毒載體系統處理的腫瘤易發小鼠中未檢測到癌發生。參見Brown等人 (2007) Blood 110:4144-52；Brown等人 (2006) Nat. Ned. 12:585-91；和Cantore等人 (2015) Sci. Transl. Med. 7(277):277ra28。
本揭示文本的慢病毒載體包括編碼本文所述的BDD FVIII蛋白的密碼子優化的多核苷酸。在一個實施例中，所述BDD FVIII蛋白的優化的編碼序列與表現控制序列可操作地連接。如本文所用，當兩個核酸序列以這種方式共價連接以允許每個組分核酸序列保留其功能性時，它們是可操作地連接的。當編碼序列和基因表現控制序列以這種方式共價連接以便將編碼序列的表現或轉錄和/或轉譯置於基因表現控制序列的影響或控制之下時，它們被稱為可操作連接的。如果5'基因表現序列中啟動子的誘導導致編碼序列的轉錄，並且如果兩個DNA序列之間的連接的性質沒有 (1) 導致移碼突變的引入，(2) 干擾啟動子區指導編碼序列轉錄的能力，或 (3) 干擾相應RNA轉錄物被轉譯成蛋白質的能力，則這兩個DNA序列被稱為可操作連接的。因此，如果基因表現序列能夠影響編碼核酸序列的轉錄使得所得轉錄物被轉譯成所需的蛋白質或多肽，則所述基因表現序列將與該編碼核酸序列可操作地連接。
本文揭示的示例性慢病毒載體實施例的示意圖呈現如圖1。關於示例性慢病毒載體實施例的產生的另外的資訊可以發現於實例2中。用於基因療法的反轉錄病毒載體設計的進一步討論提供於Poletti和Mavilio, Viruses. 2021(13):1526中。
在某些實施例中，慢病毒載體是能夠感染非分裂細胞的重組慢病毒的載體。在某些實施例中，慢病毒載體是能夠感染肝細胞（例如，肝細胞）的重組慢病毒的載體。慢病毒基因組和原病毒DNA通常具有在反轉錄病毒中發現的三個基因：gag、pol和env，它們兩側是兩個長末端重複（LTR）序列。gag基因編碼內部結構（基質、衣殼和核衣殼）蛋白；pol基因編碼RNA引導的DNA聚合酶（反轉錄酶）、蛋白酶和整合酶；並且env基因編碼病毒包膜糖蛋白。5'和3' LTR用於促進病毒體RNA的轉錄和多腺苷酸化。LTR含有病毒複製所需的所有其他順式作用序列。慢病毒具有另外的基因，包括vif、vpr、tat、rev、vpu、nef和vpx（在HIV-l、HIV-2和/或SIV中）。
與5' LTR相鄰的是基因組反轉錄所需的序列（tRNA引子結合位點）和將病毒RNA有效衣殼化至顆粒中所需的序列（Psi位點）。如果所述序列對於病毒基因組中缺失衣殼化（或將反轉錄病毒RNA包裝到傳染性病毒體中）是必需的，則順式缺陷就會阻止基因組RNA的衣殼化。
在一些實施例中，慢病毒載體包含莖環123（SL123）的引子結合位點（PBS）。在一些實施例中，PBS包含SEQ ID NO: 3的核苷酸序列。在一些實施例中，慢病毒載體包含Psi莖環4（SL4）序列。在一些實施例中，慢病毒載體包含SEQ ID NO: 4的核苷酸序列。Psi和相關序列的進一步討論可以發現於Kim等人 PLoS ONE 2012.7(11): e50148中。
然而，所得突變體仍然能夠指導所有病毒體蛋白的合成。本揭示文本提供了一種產生能夠感染非分裂細胞的重組慢病毒的方法，所述方法包括將合適的宿主細胞用攜帶包裝功能（即gag、pol和env以及rev和tat）的兩種或更多種載體轉染。如將被下文所公開的，缺乏功能性tat基因的載體對於某些應用是所希望的。因此，例如，第一載體可以提供編碼病毒gag和病毒pol的核酸，並且另一種載體可以提供編碼病毒env的核酸以產生包裝細胞。將提供異源基因的載體（本文中標識為轉移載體）引入該包裝細胞中，產生釋放攜帶目的外來基因的感染性病毒顆粒的生產細胞。
根據上文指示的載體和外來基因的配置，第二載體可以提供編碼病毒包膜（env）基因的核酸。env基因可以源自幾乎任何合適的病毒，包括反轉錄病毒。在一些實施例中，env蛋白是允許轉導人和其他物種的細胞的雙向性包膜蛋白。
反轉錄病毒來源的env基因的例子包括但不限於：莫洛尼鼠白血病病毒（MoMuLV或MMLV）、哈威鼠肉瘤病毒（HaMuSV或HSV）、鼠乳腺腫瘤病毒（MuMTV或MMTV）、長臂猿白血病病毒（GaLV或GALV）、人免疫缺陷病毒（HIV）和勞斯肉瘤病毒（RSV）。也可以使用其他env基因，如水皰性口炎病毒（VSV）蛋白G（VSV G）、肝炎病毒的env基因和流感病毒的env基因。在一些實施例中，病毒env核酸序列與本文其他地方所述的調控序列可操作地相關。
在某些實施例中，慢病毒載體缺失了HIV致病基因env、vif、vpr、vpu和nef，而沒有損害所述載體轉導非分裂細胞的能力。在一些實施例中，慢病毒載體包含3' LTR的U3區的缺失。所述U3區的缺失可以是完全缺失的或部分缺失的。
在一些實施例中，可以將本揭示文本的包含本文所述的FVIII核苷酸序列的慢病毒載體轉染到具有以下的細胞中：(a) 包含gag、pol、或gag和pol基因的第一核苷酸序列，和 (b) 包含異源env基因的第二核苷酸序列；其中所述慢病毒載體缺乏功能性tat基因。在其他實施例中，將所述細胞用包含rev基因的第四核苷酸序列進一步轉染。在某些實施例中，慢病毒載體缺乏選自vif、vpr、vpu、vpx和nef或其組合的功能性基因。
在某些實施例中，本揭示文本的慢病毒載體包含編碼gag蛋白、Rev回應元件、中心多嘌呤區（cPPT）或其任何組合的一個或多個核苷酸序列。
在一些實施例中，慢病毒載體在其表面上表現一種或多種多肽，它們改善慢病毒載體或所編碼FVIII多肽的靶向和/或活性。所述一種或多種多肽可以由慢病毒載體編碼，或者可以在慢病毒載體從宿主細胞出芽期間摻入。在慢病毒產生期間，病毒顆粒從產生宿主細胞出芽。在出芽過程期間，病毒顆粒具有源自宿主細胞的脂質膜的脂質包衣。因此，病毒顆粒的脂質包衣可以包括先前存在於宿主細胞表面上的膜結合多肽。
在一些實施例中，慢病毒載體在其表面上表現一種或多種多肽，它們在投予至人個體後抑制針對慢病毒載體的免疫反應。在一些實施例中，慢病毒載體的表面包含一種或多種CD47分子。CD47是一種“自我標記”蛋白，其在人細胞上普遍表現。CD47的表面表現藉由CD47與巨噬細胞表現的SIRPα的相互作用抑制巨噬細胞誘導的對內源性細胞的吞噬作用。表現高水平CD47的細胞不太可能在體內被人巨噬細胞靶向和破壞。
在一些實施例中，慢病毒載體在其表面上包含高濃度的CD47多肽分子。在一些實施例中，慢病毒載體是在具有CD47的高表現水平的細胞株中產生。在某些實施例中，慢病毒載體是在CD47高細胞中產生，其中所述細胞在細胞膜上具有CD47的高表現。在特定實施例中，慢病毒載體是在CD47高HEK 293T細胞中產生，其中所述HEK 293T在細胞膜上具有CD47的高表現。在一些實施例中，HEK 293T細胞被修飾以具有相對於未修飾的HEK 293T細胞增加的CD47表現。在某些實施例中，CD47是人CD47。
在一些實施例中，慢病毒載體具有很少或沒有主要組織相容性複合物I類（MHC-I）的表面表現。表面表現的MHC-I展示來自細胞內的“非自身”蛋白的肽片段，如指示感染的蛋白質片段，從而促進針對細胞的免疫反應。在一些實施例中，慢病毒載體是在MHC-I 低細胞中產生，其中所述細胞在細胞膜上具有降低的MHC-I的表現。在一些實施例中，慢病毒載體是在MHC-I-（或“MHC-I 無”、“MHC-1 陰性”或“MHC-陰性”）細胞中產生，其中所述細胞缺少MHC-I的表現。
在特定實施例中，慢病毒載體包含脂質包衣，所述脂質包衣包含高濃度的CD47多肽並且缺少MHC-I多肽。在某些實施例中，慢病毒載體是在CD47高/MHC-I 低細胞株（例如，CD47高/MHC-I 低HEK 293T細胞株）中產生。在一些實施例中，慢病毒載體是在CD47高/無MHC-I細胞株（例如，CD47高/MHC-I 無HEK 293T細胞株）中產生。
慢病毒載體的例子揭露於美國專利號9,050,269和國際公開號WO 9931251、W0 9712622、W0 9817815、W0 9817816和WO 9818934中，所述專利藉由引用以其整體併入本文。 反向末端重複（ ITR ）序列
在一些實施例中，本文揭示的核酸序列包含反向末端重複（ITR）序列。如本文所用，“反向末端重複”（或“ITR”）是指位於單鏈核酸序列的5'端或3'端的核酸子序列，其包含一組核苷酸（初始序列），之後下游是其反向補體，即迴文序列。初始序列與反向補體之間的插入核苷酸序列可以具有任何長度，包括零。在一個實施例中，可用於本揭示文本的ITR包含一個或多個“迴文序列”。ITR可以具有任何數目的功能。在一些實施例中，本文所述的ITR形成髮夾結構。在一些實施例中，ITR形成T形髮夾結構。在一些實施例中，ITR形成非T形髮夾結構，例如U形髮夾結構。在一些實施例中，ITR促進核酸分子在細胞的細胞核中的長期存活。在一些實施例中，ITR促進核酸分子在細胞的細胞核中的永久存活（例如，持續細胞的整個壽命）。在一些實施例中，ITR促進核酸分子在細胞的細胞核中的穩定性。在一些實施例中，ITR促進核酸分子在細胞的細胞核中的保留。在一些實施例中，ITR促進核酸分子在細胞的細胞核中的持久性。在一些實施例中，ITR抑制或防止核酸分子在細胞的細胞核中的降解。
因此，如本文所用的“ITR”可以折疊回於自身並形成雙鏈區段。例如，在折疊形成雙螺旋時，序列GATCXXXXGATC包含GATC的初始序列及其補體（3'CTAG5'）。在一些實施例中，ITR包含初始序列與反向補體之間的連續迴文序列（例如，GATCGATC）。在一些實施例中，ITR包含初始序列與反向補體之間的中斷的迴文序列（例如，GATCXXXXGATC）。在一些實施例中，連續或中斷的迴文序列的互補部分彼此相互作用以形成“髮夾環”結構。如本文所用，在單鏈核苷酸分子上的至少兩個互補序列鹼基配對形成雙鏈部分時，產生“髮夾環”結構。在一些實施例中，僅ITR的一部分形成髮夾環。在其他實施例中，整個ITR形成髮夾環。
在本揭示文本中，至少一個ITR是非腺病毒相關病毒（非AAV）的ITR。在某些實施例中，ITR是病毒科細小病毒科（ Parvoviridae）的非AAV成員的ITR。在一些實施例中，ITR是依賴病毒屬（ Dependovirus）或紅病毒屬（ Erythrovirus）的非AAV成員的ITR。
在一些實施例中，本文所述的核酸分子中的ITR可以是轉錄啟動的ITR。轉錄啟動的ITR可以包含已經藉由包括至少一個轉錄活性元件而被轉錄啟動的野生型ITR的全部或一部分。多種類型的轉錄活性元件適用於這個背景。在一些實施例中，轉錄活性元件是組成型轉錄活性元件。組成型轉錄活性元件提供持續水平的基因轉錄，並且在需要持續表現轉基因時是優選的。在其他實施例中，轉錄活性元件是誘導型轉錄活性元件。誘導型轉錄活性元件通常在誘導物（或誘導條件）不存在下展現低活性，並且在誘導物存在下（或切換至誘導條件）上調。當僅在某些時間或在某些位置需要表現時或當需要使用誘導劑逐步增加表現水平時，誘導型轉錄活性元件可能是優選的。轉錄活性元件也可以具有組織特異性；也就是說，其僅在某些組織或細胞類型中展現活性。
能以多種方式將轉錄活性元件併入ITR中。在一些實施例中，將轉錄活性元件併入ITR的任何部分的5′或ITR的任何部分的3′。在其他實施例中，轉錄啟動的ITR的轉錄活性元件位於兩個ITR序列之間。如果轉錄活性元件包含兩個或更多個必須被間隔開的元件，則那些元件可以與ITR的部分交替。在一些實施例中，ITR的髮夾結構缺失並用轉錄元件的反向重複來替代。這後一種排列將產生類比結構中的缺失部分的髮夾。多個串聯轉錄活性元件也可以存在於轉錄啟動的ITR中，並且這些元件可以相鄰或間隔開。另外，可以將蛋白質結合位點（例如，Rep結合位點）引入轉錄啟動的ITR的轉錄活性元件中。轉錄活性元件可以包含使得能夠藉由RNA聚合酶受控轉錄DNA以形成RNA的任何序列，並且可以包含例如如下文所定義的轉錄活性元件。
轉錄啟動的ITR向具有相對受限的核苷酸序列長度的核酸分子提供轉錄啟動和ITR功能二者，這有效地使可以攜帶並從核酸分子表現的轉基因的長度最大化。將轉錄活性元件併入ITR中能以多種方式來完成。對ITR序列和轉錄活性元件的序列需求的比較可以提供對編碼ITR內的元件的方式的瞭解。例如，可以藉由在複製轉錄活性元件的功能元件的ITR序列中引入特定變化將轉錄活性添加至ITR。本領域中存在多種技術可有效添加、缺失和/或改變特定位點的具體核苷酸序列（參見例如，Deng和Nickoloff (1992) Anal. Biochem. 200:81-88）。產生轉錄啟動的ITR的另一方式涉及在ITR中的所需位置引入限制位點。另外，可以使用本領域中已知的方法將多個轉錄啟動元件併入轉錄啟動的ITR中。
藉由說明，可以藉由包括一個或多個諸如以下等轉錄活性元件來產生轉錄啟動的ITR：TATA盒、GC盒、CCAAT盒、Sp1位點、Inr區、CRE（cAMP調控元件）位點、ATF-1/CRE位點、APBβ盒、APBα盒、CArG盒、CCAC盒或如本領域中已知參與轉錄的任何其他元件。 宿主細胞
本揭示文本還提供了包含本揭示文本的核酸分子或載體的宿主細胞。如本文所用，術語“轉化”應在廣義上使用，是指將DNA引入受體宿主細胞中，這改變了基因型並因此導致受體細胞的變化。
“宿主細胞”是指已經用使用重組DNA技術構建並且編碼至少一種異源基因的載體轉化的細胞。本揭示文本的宿主細胞優選地具有哺乳動物來源；最優選地具有人或小鼠來源。相信本領域技術人員有能力優先地確定最適合於其目的的特定宿主細胞株。示例性宿主細胞株包括但不限於CHO、DG44和DUXB11（中國倉鼠卵巢系，DHFR-）、HELA（人宮頸癌）、CVI（猴腎系）、COS（具有SV40 T抗原的CVI的衍生物）、R1610（中國倉鼠成纖維細胞）、BALBC/3T3（小鼠成纖維細胞）、HAK（倉鼠腎系）、SP2/O（小鼠骨髓瘤）、P3x63-Ag3.653（小鼠骨髓瘤）、BFA-1c1BPT（牛內皮細胞）、RAJI（人淋巴細胞）、PER.C6 ®、NS0、CAP、BHK21和HEK 293（人腎）。在一個特定實施例中，所述宿主細胞選自CHO細胞、HEK293細胞、BHK21細胞、PER.C6 ®細胞、NS0細胞和CAP細胞。宿主細胞株通常可以從商業服務、美國組織培養物保藏中心（American Tissue Culture Collection）或從揭示文獻獲得。
將本揭示文本的分離的核酸分子或載體引入宿主細胞中可以藉由本領域技術人員熟知的多種技術來完成。這些技術包括但不限於轉染（包括電泳和電穿孔）、原生質體融合、磷酸鈣沈澱、與包膜DNA的細胞融合、顯微注射和完整病毒感染。參見Ridgway, A. A. G. " Mammalian Expression Vectors" 第24.2章, 第470-472頁 Vectors, Rodriguez和Denhardt編輯 (Butterworths, Boston, Mass. 1988)。可以將質體經由電穿孔引入宿主中。使轉化的細胞在適於產生輕鏈和重鏈的條件下生長，並且測定重鏈和/或輕鏈蛋白質合成。示例性測定技術包括酶聯免疫吸附測定（ELISA）、放射免疫測定（RIA）、或螢光啟動細胞分選儀分析（FACS）、免疫組織化學等。
使包含本揭示文本的分離的核酸分子或載體的宿主細胞在適當生長培養基中生長。如本文所用，術語“適當生長培養基”是指含有細胞生長所需的營養物的培養基。細胞生長所需的營養素可以包括碳源、氮源、必需胺基酸、維生素、礦物質和生長因子。任選地，所述培養基可含有一個或多個選擇因子。任選地，所述培養基可含有小牛血清或胎牛血清（FCS）。在一個實施例中，所述培養基基本上不含IgG。所述生長培養基通常藉由例如藥物選擇或必需營養素缺乏來選擇含有DNA構建體的細胞，所述必需營養素由DNA構建體上的選擇性標記補充或與DNA構建體共轉染。所培養的哺乳動物細胞通常在市售的含血清或無血清培養基（例如，MEM、DMEM、DMEM/F12）中生長。在一個實施例中，培養基是CDoptiCHO（Invitrogen，加利福尼亞州卡爾斯巴德）。在另一個實施例中，培養基是CD17（Invitrogen，加利福尼亞州卡爾斯巴德）。適合用於所用具體細胞株的培養基的選擇在本領域普通技術人員的水平內。
在一些實施例中，適用於本發明的宿主細胞是昆蟲來源的。在一些實施例中，合適的昆蟲宿主細胞包括例如從草地貪夜蛾（ Spodoptera frugiperda）（Sf）分離的細胞株或從粉紋夜蛾（richoplusia ni）（Tni）分離的細胞株。本領域技術人員將能夠容易地確定任何Sf或Tni細胞株的適用性。示例性昆蟲宿主細胞包括而不限於Sf9細胞、Sf21細胞和High Five™細胞。示例性昆蟲宿主細胞還包括而不限於不受外來病毒污染的任何Sf或Tni細胞株，例如Sf-彈狀病毒（rhadovirus）陰性（Sf-RVN）和Tn-野田村病毒（nodavirus）陰性（Tn-NVN）細胞。其他合適的宿主昆蟲細胞是本領域技術人員已知的。在一個特定實施例中，昆蟲宿主細胞是Sf9細胞。
本揭示文本的多個態樣提供了選殖本文所述的核酸分子的方法，其包括將能夠形成複雜二級結構的核酸分子插入適宜載體中，和將所得載體引入適宜細菌宿主菌株中。如本領域中已知，核酸的複雜二級結構（例如，長迴文區）可能不穩定並且難以在細菌宿主菌株中選殖。例如，本揭示文本的包含第一ITR和第二ITR（例如，非AAV細小病毒ITR，例如，HBoV1 ITR）的核酸分子可能難以使用常規方法來選殖。長DNA迴文序列抑制DNA複製並且在大腸桿菌（ E. coli）、芽孢桿菌屬（ Bacillus）、鏈球菌屬（ Steptococcus）、鏈黴菌屬（ Streptomyces）、釀酒酵母（ S. cerevisiae） 、小鼠和人的基因組中不穩定。這些效應是由於藉由鏈內鹼基配對形成髮夾或十字形結構所致。在大腸桿菌中，在SbcC或SbcD突變體中可以顯著克服對DNA複製的抑制。SbcD是核酸酶亞基，並且SbcC是SbcCD複合物的ATP酶亞基。大腸桿菌SbcCD複合物是負責防止長迴文序列複製的外切核酸酶複合物。SbcCD複合物是具有ATP依賴性雙鏈DNA外切核酸酶活性和ATP非依賴性單鏈DNA內切核酸酶活性的核複合物。SbcCD可以識別DNA迴文序列並且藉由攻擊所產生的髮夾結構來瓦解複製叉。
在某些實施例中，適宜細菌宿主菌株不能拆分十字形DNA結構。在某些實施例中，適宜細菌宿主菌株包含SbcCD複合物中的破壞。在一些實施例中，SbcCD複合物中的破壞包含SbcC基因和/或SbcD基因中的基因破壞。在某些實施例中，SbcCD複合物中的破壞包含SbcC基因中的基因破壞。包含SbcC基因中的基因破壞的各種細菌宿主菌株是本領域中已知的。例如但不限於，細菌宿主菌株PMC103包含基因型 sbcC 、 recD 、 mcrA 、 ΔmcrBCF；細菌宿主菌株PMC107包含基因型 recBC 、 recJ 、 sbcBC 、 mcrA 、 ΔmcrBCF；並且細菌宿主菌株SURE包含基因型 recB 、 recJ 、 sbcC 、 mcrA 、 ΔmcrBCF 、 umuC 、 uvrC。因此，在一些實施例中，選殖本文所述的核酸分子的方法包括將能夠形成複雜二級結構的核酸分子插入適宜載體中，和將所得載體引入宿主菌株PMC103、PMC107或SURE中。在某些實施例中，選殖本文所述的核酸分子的方法包括將能夠形成複雜二級結構的核酸分子插入適宜載體中，和將所得載體引入宿主菌株PMC103中。
適宜載體是本領域中已知的並且描述於本文中的其他地方。在某些實施例中，用於本揭示文本的選殖方法中的適宜載體是低複本載體。在某些實施例中，用於本揭示文本的選殖方法中的適宜載體是pBR322。 多肽的產生
本揭示文本還提供了由本揭示文本的核酸分子編碼的多肽。在其他實施例中，本揭示文本的多肽由包含本揭示文本的分離的核酸分子的載體編碼。在又其他實施例中，本揭示文本的多肽由包含本揭示文本的分離的核酸分子的宿主細胞產生。
多種方法可用於從本揭示文本的優化的核酸分子重組產生FVIII蛋白。所需序列的多核苷酸可以藉由從頭固相DNA合成或藉由較早製備的多核苷酸的PCR誘變產生。寡核苷酸介導的誘變是一種用於在核苷酸序列中製備取代、插入、缺失或改變（例如，改變的密碼子）的方法。例如，藉由使編碼所需突變的寡核苷酸與單鏈DNA模板雜交來改變起始DNA。雜交後，DNA聚合酶用於合成模板的整個第二互補鏈，所述模板摻入了寡核苷酸引子。在一個實施例中，基因工程化（例如，基於引子的PCR誘變）足以摻入如本文所定義的改變，以產生本揭示文本的多核苷酸。
對於重組蛋白的產生，將本揭示文本的編碼FVIII蛋白的優化的多核苷酸序列插入適當的表現載具中，所述表現載具即為含有所插入編碼序列的轉錄和轉譯必需元件的載體，或在RNA病毒載體的情況下為含有複製和轉譯必需元件的載體。
將本揭示文本的多核苷酸序列以正確的閱讀框插入載體中。然後將表現載體轉染到將表現多肽的合適的靶細胞中。本領域已知的轉染技術包括但不限於磷酸鈣沈澱（Wigler等人 1978, Cell14 : 725）和電穿孔（Neumann等人 1982, EMBO, J.1 : 841）。多種宿主表現載體系統可以用於在真核細胞中表現本文所述的FVIII蛋白。在一個實施例中，真核細胞是動物細胞，包括哺乳動物細胞（例如，HEK293細胞、PER.C6 ®、CHO、BHK、Cos、HeLa細胞）。本揭示文本的多核苷酸序列還可以編碼允許FVIII蛋白分泌的信號序列。本領域技術人員將理解，FVIII蛋白被轉譯的同時，信號序列被細胞切割以形成成熟蛋白。各種信號序列是本領域已知的，例如，天然因子Vll信號序列、天然因子IX信號序列和小鼠IgK輕鏈信號序列。可替代地，在不包括信號序列的情況下可以藉由裂解細胞來恢復FVIII蛋白。
本揭示文本的FVIII蛋白可以在轉基因動物（如齧齒類動物、山羊、綿羊、豬或牛）中合成。術語“轉基因動物”是指已經將外來基因併入基因組中的非人動物。因為這個基因是在種系組織中存在，其從親代傳遞給後代。將外源基因引入單細胞胚胎中（Brinster等人 1985, Proc. Natl. Acad.Sci. USA 82:4438）。產生轉基因動物的方法是本領域已知的，包括產生免疫球蛋白分子的轉基因學（Wagner等人 1981, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 78: 6376；McKnight等人 1983, Cell 34 : 335；Brinster等人 1983, Nature 306: 332；Ritchie等人 1984, Nature 312: 517；Baldassarre等人 2003, Theriogenology 59 : 831；Robl等人 2003, Theriogenology 59: 107；Malassagne等人 2003, Xenotransplantation 10 (3): 267）。
表現載體可以編碼允許易於純化或鑑定重組產生的蛋白質的標籤。例子包括但不限於，載體pUR278（Ruther等人 1983, EMBO J. 2: 1791），在所述載體中本文所述的FVIII蛋白的編碼序列可以被連接到在框內具有lac Z編碼區的載體中，從而產生雜合蛋白；pGEX載體可以用於表現具有谷胱甘肽S-轉移酶（GST）標籤的蛋白質。這些蛋白質通常是可溶的並且可以藉由吸附到谷胱甘肽瓊脂糖珠，然後在游離谷胱甘肽的存在下洗脫，容易地從細胞中純化出來。載體包括切割位點（例如，PreCission蛋白酶（Pharmacia，新澤西州皮派克）），為了易於在純化後去除標籤。
出於本揭示文本的目的，可以使用許多表現載體系統。這些表現載體通常可在宿主生物體中作為附加體或作為宿主染色體DNA的組成部分進行複製。表現載體可包括表現控制序列，包括但不限於啟動子（例如天然締合或異源啟動子）、增強子、信號序列、剪接信號、增強子元件和轉錄終止序列。優選地，所述表現控制序列是能夠轉化或轉染真核宿主細胞的載體中的真核啟動子系統。表現載體還可以利用衍生自動物病毒的DNA元件，如牛乳頭瘤病毒、多瘤病毒、腺病毒、痘苗病毒、桿狀病毒、反轉錄病毒（RSV、MMTV或MOMLV）、巨細胞病毒（CMV）或SV40病毒。其他涉及具有內部核糖體結合位點的多順反子系統的使用。
一般來說，表現載體含有選擇標記（例如胺苄青黴素抗性、潮黴素抗性、四環素抗性或新黴素抗性）以允許檢測用所需DNA序列轉化的那些細胞（參見例如，Itakura等人, 美國專利4,704,362）。可以藉由引入一種或多種標記來選擇已將DNA整合至其染色體中的細胞，所述一種或多種標記允許選擇經轉染的宿主細胞。所述標記可以提供對營養缺陷型宿主的原營養、殺生物劑抗性（例如抗生素）或對重金屬如銅的抗性。可選擇標誌基因可以直接與待表現的DNA序列連接，或者藉由共轉化引入同一細胞中。
可用於表現優化的FVIII序列的載體的例子是NEOSPLA（美國專利號6,159,730）。此載體含有巨細胞病毒啟動子/增強子、小鼠β珠蛋白主要啟動子、SV40複製起點、牛生長激素聚腺苷酸化序列、新黴素磷酸轉移酶外顯子1和外顯子2、二氫葉酸還原酶基因和前導序列。已發現此載體在摻入可變區和恒定區基因、細胞中轉染、隨後在含有G418的培養基中選擇和甲胺蝶呤擴增後，會導致非常高水平的抗體表現。載體系統還在美國專利號5,736,137和5,658,570中教導，將其中的每一個均藉由引用以其整體併入本文。此系統提供高表現水平，例如，＞ 30 pg/細胞/天。其他示例性載體系統揭露於例如美國專利號6,413,777中。
在其他實施例中，可以使用多順反子構建體表現本揭示文本的多肽。在這些表現系統中，可以從單個多順反子構建體產生多個目的基因產物，如多聚體結合蛋白的多個多肽。這些系統有利地使用內部核糖體進入位點（IRES）以在真核宿主細胞中提供相對較高水平的多肽。相容的IRES序列揭露於美國專利號6,193,980中，將其也併入本文。
更一般地，一旦製備了編碼多肽的載體或DNA序列，就可以將表現載體引入合適的宿主細胞中。也就是說，所述宿主細胞可被轉化。如上所述，可以藉由本領域技術人員熟知的各種技術來實現將質體引入宿主細胞中。轉化的細胞在適於產生FVIII多肽的條件下生長，並且進行FVIII多肽合成測定。示例性測定技術包括酶聯免疫吸附測定（ELISA）、放射免疫測定（RIA）或螢光啟動細胞分選儀分析（FACS）、免疫組織化學等。
在描述用於從重組宿主分離多肽的過程時，術語“細胞”和“細胞培養物”可互換使用以表示多肽來源，除非另有明確說明。換言之，從“細胞”中回收多肽可以意指從離心沈澱的全細胞，或從含有培養基和懸浮細胞二者的細胞培養物中回收。
用於蛋白質表現的宿主細胞株優選是哺乳動物來源的；最優選是人或小鼠來源的，因為本揭示文本的分離的核酸已經針對在人細胞中表現進行了優化。上文已經描述了示例性宿主細胞株。在產生具有FVIII活性的多肽的方法的一個實施例中，宿主細胞是HEK293細胞。在產生具有FVIII活性的多肽的方法的另一個實施例中，宿主細胞是CHO細胞。
編碼本揭示文本的多肽的基因也可以在非哺乳動物細胞中表現，如細菌或酵母或植物細胞。在這一方面，應當理解，也可以轉化多種單細胞非哺乳動物微生物如細菌；即那些能夠在培養或發酵中生長的那些微生物。易於轉化的細菌包括以下的成員：腸桿菌科，如大腸桿菌（Escherichia coli）或沙門氏菌屬（Salmonella）的菌株；芽孢桿菌科，如枯草芽孢桿菌（Bacillus subtilis）；肺炎球菌屬（Pneumococcus）；鏈球菌屬（Streptococcus）和流感嗜血桿菌（Haemophilus influenzae）。還應理解，當在細菌中表現時，多肽典型情況下會成為內含體的一部分。必須分離、純化多肽，然後將其組裝成功能性分子。
可替代地，可以將本揭示文本的優化的核苷酸序列摻入轉基因中以引入轉基因動物的基因組中並且隨後在轉基因動物的乳汁中表現（參見例如，Deboer等人, US 5,741,957；Rosen, US 5,304,489；和Meade等人, US 5,849,992）。合適的轉基因包括與來自乳腺特異性基因的啟動子和增強子可操作連接的多肽的編碼序列（如酪蛋白或β乳球蛋白）。
體外生產允許按比例放大以給出大量的所需多肽。在組織培養條件下用於哺乳動物細胞培養的技術是本領域已知的並且包括同質懸浮培養（例如在氣升式反應器或連續攪拌反應器中），或在瓊脂糖上微珠或陶瓷盒上的固定化或包埋的細胞培養（例如在中空纖維、微膠囊中）。如果必要和/或需要，可以藉由常規層析方法純化多肽溶液，例如凝膠過濾，離子交換層析，DEAE-纖維素層析或（免疫）親和層析，例如，在合成鉸鏈區多肽的優選生物合成後或在本文所述的HIC層析步驟之前或之後。親和標籤序列（例如His(6)標籤）可以任選地附接或包括在多肽序列內以促進下游純化。
一旦表現，就可以根據本領域的標準程序純化FVIII蛋白，所述標準程序包括硫酸銨沈澱、親和柱層析、HPLC純化、凝膠電泳等（通常參見Scopes, Protein Purification (Springer-Verlag, N.Y., (1982)）。至少約90%至95%同質性的基本上純的蛋白質優選用於藥物用途，其中98%至99%或更高的同質性是最優選的。 醫藥組合物
含有本揭示文本的分離的核酸分子、核酸分子編碼的具有FVIII活性的多肽、載體或宿主細胞的組合物可以含有合適的醫藥上可接受的載劑。例如，所述組合物可以含有有助於將活性化合物加工成設計用於遞送至作用位點的製劑的賦形劑和/或助劑。
醫藥組合物可以被配製用於藉由推注注射的腸胃外投予（即靜脈內、皮下或肌內）。注射用配製品能以單位劑型存在，例如在添加有防腐劑的安瓿中或多劑量容器中。組合物可以採取諸如於油性或水性媒劑中的懸浮液、溶液或乳液等形式，並且含有諸如懸浮劑、穩定劑和/或分散劑等配製劑。可替代地，活性成分可以呈粉末形式，用於用適宜媒劑（例如，無熱原水）來構造。
適合於腸胃外投予的配製品還包括呈水溶性形式（例如，水溶性鹽）的活性化合物的水溶液。另外，可以投予作為適當油性注射懸浮液的活性化合物的懸浮液。適宜親脂溶劑或媒劑包括脂肪油（例如，芝麻油）或合成脂肪酸酯（例如，油酸乙酯或甘油三酯）。水性注射懸浮液可以含有增加懸浮液粘度的物質，包括例如羧甲基纖維素鈉、山梨醇和葡聚糖。任選地，懸浮液還可以含有穩定劑。脂質體還可以用於包封本揭示文本的分子，用於遞送至細胞或間質空間中。示例性醫藥上可接受的載劑是生理上相容的溶劑、分散介質、包衣、抗細菌劑和抗真菌劑、等滲劑和吸收延遲劑、水、鹽水、磷酸鹽緩衝鹽水、右旋糖、甘油、乙醇等。在一些實施例中，組合物包含等滲劑，例如糖、多元醇（如甘露醇、山梨醇）或氯化鈉。在其他實施例中，組合物包含增強活性成分的貯存期限或有效性的醫藥上可接受的物質（如潤濕劑）或少量輔助物質（如潤濕劑或乳化劑、防腐劑或緩衝液）。
本揭示文本的組合物可以呈多種形式，包括例如液體（例如，可注射和可輸注的溶液）、分散液、懸浮液、半固體和固體劑型。優選形式取決於投予方式和治療應用。
組合物可以配製為溶液、微乳液、分散液、脂質體或其他適合於高藥物濃度的有序結構。無菌可注射溶液可以藉由以下方式製備：將活性成分以所需量併入視需要具有上文所列舉成分中的一種或組合的適當溶劑中，之後過濾滅菌。通常，分散液是藉由以下方式來製備：將活性成分併入無菌媒劑中，所述媒劑含有基礎分散介質和來自上文所列舉的那些成分的所需其他成分。在用於製備無菌可注射溶液的無菌粉末的情況下，優選製備方法是真空乾燥和冷凍乾燥，這些方法從預先無菌過濾的溶液產生活性成分和任何其他所需成分的粉末。可以例如藉由以下方式維持溶液的適當流動性：藉由使用諸如卵磷脂等包衣，在分散液的情況下藉由維持所需細微性，以及藉由使用表面活性劑。可注射組合物的延長吸收可以藉由以下方式來實現：在組合物中包括延遲吸收的藥劑，例如單硬脂酸鹽和明膠。
活性成分可以用受控釋放配製品或裝置來配製。此類配製品和裝置的例子包括植入物、經皮貼劑和微囊化遞送系統。可以使用生物可降解的生物相容性聚合物，例如乙烯乙酸乙烯酯、聚酐、聚乙醇酸、膠原蛋白、聚原酸酯和聚乳酸。製備此類配製品和裝置的方法是本領域已知的。參見例如，Sustained and Controlled Release Drug Delivery Systems, J. R. Robinson編輯, Marcel Dekker, Inc., New York, 1978。
可注射長效配製品可以藉由以下方式來製備：形成藥物於生物可降解聚合物（如聚丙交酯-聚乙交酯）中的微囊化基質。根據藥物與聚合物的比率以及所採用聚合物的性質，可以控制藥物釋放速率。其他示例性生物可降解聚合物是聚原酸酯和聚酐。可注射長效配製品還可以藉由將藥物捕集於脂質體或微乳液中來製備。
可以將補充性活性化合物併入組合物中。在一個實施例中，用另一凝血因子或其變體、片段、類似物或其衍生物配製本揭示文本的嵌合蛋白。例如，凝血因子包括但不限於因子V、因子VII、因子VIII、因子IX、因子X、因子XI、因子XII、因子XIII、凝血酶原、纖維蛋白原、血管性血友病因子或重組可溶性組織因子（rsTF）或前述任一種的啟動形式。凝血因子或止血劑還可以包括抗纖維蛋白溶藥，例如ε-胺基己酸、胺甲環酸。
可以調節劑量方案以提供最佳所需反應。例如，可以投予單次推注，可以隨時間投予若干次分開劑量，或者可以如治療情況的緊迫性所示的成比例地減少或增加劑量。有利的是以劑量單位形式配製腸胃外組合物，以便於投予和劑量均勻。參見例如，Remington's Pharmaceutical Sciences (Mack Pub. Co., Easton, Pa. 1980)。
除了活性化合物以外，液體劑型還可以含有惰性成分，如水、乙醇、碳酸乙酯、乙酸乙酯、苯甲醇、苯甲酸苄酯、丙二醇、1,3-丁二醇、二甲基甲醯胺、油、甘油、四氫糠醇、聚乙二醇和山梨聚糖的脂肪酸酯。
合適的藥物載劑的非限制性例子也描述於E. W. Martin的Remington's Pharmaceutical Sciences中。賦形劑的一些例子包括澱粉、葡萄糖、乳糖、蔗糖、明膠、麥芽、水稻、麵粉、白堊、矽膠、硬脂酸鈉、單硬脂酸甘油酯、滑石、氯化鈉、脫脂乳粉、甘油、丙烯、二醇、水、乙醇等。組合物還可以含有pH緩衝試劑以及潤濕劑或乳化劑。
對於口服投予，醫藥組合物可以採取藉由常規手段製備的片劑或膠囊的形式。還可以將組合物製備為液體，例如糖漿或懸浮液。液體可以包括懸浮劑（例如，山梨醇糖漿、纖維素衍生物或氫化食用脂肪）、乳化劑（卵磷脂或阿拉伯膠）、非水性媒劑（例如，扁桃仁油、油性酯、乙醇或分餾植物油）和防腐劑（例如，對羥基苯甲酸甲酯或對羥基苯甲酸丙酯或山梨酸）。製劑還可以包括矯味劑、著色劑和甜味劑。可替代地，組合物可以作為乾產品存在，用於用水或另一種適宜媒劑來構造。
對於經頰投予，組合物可以採取根據常規方案的片劑或錠劑的形式。
對於藉由吸入投予，根據本揭示文本使用的化合物便捷地以含有或不含賦形劑的霧化氣溶膠的形式或以氣溶膠噴霧劑的形式從任選地具有推進劑的加壓包或霧化器遞送，所述推進劑是例如二氯二氟甲烷、三氯氟甲烷、二氯四氟甲烷、二氧化碳或其他合適的氣體。在加壓氣霧劑的情況下，劑量單位可以藉由提供遞送計量量的閥來確定。例如用於吸入器或吹入器中的明膠的膠囊和藥筒可以配製含有化合物與諸如乳糖或澱粉等適宜粉末基質的粉末混合物。
醫藥組合物還可以被配製用於作為例如含有常規栓劑基質（如可哥脂或其他甘油酯）的栓劑或保留灌腸劑經直腸投予。
在一個實施例中，醫藥組合物包含具有因子VIII活性的多肽、編碼具有因子VIII活性的多肽的優化的核酸分子、包含所述核酸分子的載體或包含所述載體的宿主細胞以及醫藥上可接受的載劑。在一些實施例中，組合物是藉由選自以下的途徑來投予：局部投予、眼內投予、腸胃外投予、鞘內投予、硬膜下投予和口服投予。腸胃外投予可以是靜脈內或皮下投予。 治療方法
在一些態樣，本揭示文本涉及治療有需要的個體的疾病或病症的方法，所述方法包括投予本文所揭示的核酸分子、載體、多肽或醫藥組合物。
在一些實施例中，本揭示文本涉及用於增加個體中的具有FVIII活性的多肽的表現的方法。在一些實施例中，所述方法包括投予包含與SEQ ID NO: 11、SEQ ID NO: 14或SEQ ID NO: 16具有至少80%序列同一性的核苷酸序列的核酸分子。
在一些實施例中，本揭示文本涉及治療出血障礙的方法。在一些實施例中，本揭示文本涉及治療A型血友病的方法。
分離的核酸分子、載體或多肽可以靜脈內、皮下、肌內或經由任何粘膜表面投予，例如口服、舌下、經頰、舌下、經鼻、經直腸、經陰道或經由肺途徑。分離的核酸分子、載體或多肽還可以神經內、眼內和鞘內投予。可以將凝血因子蛋白植入生物聚合物固相支援體內或與所述固相支援體連接，從而允許將嵌合蛋白緩慢釋放至所需位點。
在一個實施例中，分離的核酸分子、載體或多肽的投予途徑是腸胃外的。如本文所用的術語腸胃外包括靜脈內、動脈內、腹膜內、肌內、皮下、直腸或陰道投予。在一些實施例中，分離的核酸分子、載體或多肽是靜脈內投予的。雖然所有這些投予形式明顯被認為是在本揭示文本的範圍內，但投予形式將是用於注射，特別是用於靜脈內或動脈內注射或滴注的溶液。
用於治療病症的本揭示文本的組合物的有效劑量根據許多不同因素而變化，所述因素包括投予手段、靶位點、患者的生理狀態、患者是人還是動物、所投予的其他藥物以及治療是預防性的還是治療性的。通常，患者是人，但是也可以治療非人哺乳動物，包括轉基因哺乳動物。治療劑量可以使用本領域技術人員已知的常規方法逐步增加，以優化安全性和功效。
本揭示文本的核酸分子、載體或多肽可以任選地與在需要治療（例如，預防性或治療性）的障礙或病症的治療中有效的其他藥劑組合投予。
如本文所用，與輔助療法結合或組合的本揭示文本的分離的核酸分子、載體或多肽的投予意指依序、同時、同延、並行、伴隨或同期投予或應用所述療法和所公開的多肽。本領域技術人員將瞭解，組合治療方案中各種組分的投予或應用可以定時以增強治療的總體有效性。基於所選輔助療法和本說明書的傳授內容，技術人員（例如，醫師）在不進行過度實驗的情況下便能夠容易地辨別有效的組合治療方案。
應進一步瞭解，本揭示文本的分離的核酸分子、載體或多肽可以與一種或多種藥劑結合或組合使用（例如，以提供組合治療方案）。本揭示文本的多肽或多核苷酸可以組合的示例性藥劑包括代表用於所治療的特定障礙的當前護理標準的藥劑。此類藥劑的性質可以是化學的或生物的。術語“生物劑（biologic）”或“生物劑（biologic agent）”是指預期用作治療劑的從活的生物體和/或其產物製備的任何醫藥活性劑。
要與本揭示文本的多核苷酸或多肽組合使用的藥劑的量可以隨個體變化，或者可以根據本領域的知識來投予。參見例如，Bruce A Chabner等人, Antineoplastic Agents,Goodman & Gilman's The Pharmacological Basis of Therapeutics 1233-1287（Joel G. Hardman等人編輯, 第9版 1996）。在另一個實施例中，投予符合護理標準的量的這種藥劑。
在一個實施例中，本文還揭示了一種套組，所述套組包含本文揭示的核酸分子以及向有需要的個體投予所述核酸分子的說明書。在另一個實施例中，本文揭示一種用於產生本文所提供的核酸分子的桿狀病毒系統。核酸分子是在昆蟲細胞中產生的。在另一個實施例中，提供了一種針對表現構建體的納米顆粒遞送系統。表現構建體包含本文揭示的核酸分子。 基因療法
體細胞基因療法已經被探索為對出血障礙，並且特別是A型血友病的可能的治療方法。基因療法是對血友病的特別有吸引力的治療方法，因為它有藉由單次投予編碼FVIII的載體後持續內源性產生FVIII來治癒疾病的潛力。A型血友病非常適合於基因替代方法，因為其臨床表現可完全歸因於缺少以微小量（200 ng/ml）在血漿中循環的單一基因產物（FVIII）。
由於慢病毒載體的大容量和經由整合維持轉基因表現的能力，它們作為基因遞送載具得到重視。已經在許多離體細胞療法臨床專案中評價了慢病毒載體具有有前途的功效和安全性特徵。
本揭示文本藉由提供包含密碼子優化的FVIII序列的慢病毒載體滿足了本領域中的重要需求，所述優化的FVIII序列顯示出在個體中的表現增加以及在用於基因治療方法時潛在地導致更大的治療功效。本揭示文本的實施例涉及包含一個或多個編碼本文所述的具有FVIII活性的多肽的密碼子優化的核酸分子的慢病毒載體、包含所述慢病毒載體的宿主細胞（例如，肝細胞）以及使用所公開的慢病毒載體的方法（例如，使用本文揭示的慢病毒載體治療出血障礙）。
總體上，本文公開的治療方法涉及投予包含核酸分子的慢病毒載體，所述核酸分子包含至少一個編碼FVIII凝血因子的密碼子優化的核酸序列，其中所述編碼FVIII凝血因子的核酸序列與合適的表現控制序列可操作地連接，所述表現控制序列在一些實施例中被摻入到慢病毒載體（例如，複製缺陷型慢病毒病毒載體）中。
本揭示文本提供了治療有需要的個體的出血障礙（例如，A型血友病）的方法，所述方法包括向所述個體投予至少一劑5 x 10 10或更少的轉導單位/kg（TU/kg）（或者10 9或更少的TU/kg、或者10 8或更少的TU/kg）的慢病毒載體，所述慢病毒載體包含含有編碼具有FVIII活性的多肽的核苷酸序列的分離的核酸分子。在一些實施例中，所述核苷酸序列與SEQ ID NO: 11具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%序列同一性。在一些實施例中，所述核苷酸序列與SEQ ID NO: 14具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%序列同一性。
在一些實施例中，將慢病毒載體以單一劑量或多個劑量投予。在一些實施例中，將慢病毒載體劑量一次性投予或分成多個亞劑量，例如，兩個亞劑量、三個亞劑量、四個亞劑量、五個亞劑量、六個亞劑量或多於六個亞劑量投予。在一些實施例中，投予多於一個慢病毒載體。
在一些實施例中，將慢病毒載體的劑量重複投予至少兩次、至少三次、至少四次、至少五次、至少六次、至少七次、至少八次、至少九次或至少十次。在一些實施例中，將慢病毒載體經由靜脈內注射投予。
在一些實施例中，個體是兒童個體，而在其他態樣，個體是成人個體。
在一些實施例中，慢病毒載體包含至少一個組織特異性啟動子，即，將在特定組織或細胞類型中調節具有FVIII活性的多肽的表現的啟動子。在一些實施例中，慢病毒載體中的組織特異性啟動子選擇性地增強具有FVIII活性的多肽在靶活細胞中的表現。在一些實施例中，選擇性地增強具有FVIII活性的多肽在靶活細胞中的表現的組織特異性啟動子包含mTTR啟動子。在一些實施例中，靶活細胞是肝細胞。
由於慢病毒載體可以轉導所有肝細胞類型，轉基因（例如，FVIII）在不同細胞類型中的表現可以藉由在慢病毒載體中使用不同的啟動子來控制。因此，慢病毒載體可以包含特異性啟動子，所述啟動子將控制FVIII轉基因在不同的組織或細胞類型（如不同的肝組織或細胞類型）中的表現。因此，在一些實施例中，慢病毒載體可以包含內皮特異性啟動子，所述啟動子將控制FVIII轉基因在肝內皮組織中的表現；或肝細胞特異性啟動子，所述啟動子將控制FVIII轉基因在肝細胞中的表現；或二者。
在一些實施例中，慢病毒載體包含一種或多種組織特異性啟動子，所述啟動子控制FVIII轉基因在除肝以外的組織中的表現。在一些實施例中，將分離的核酸分子穩定整合到靶細胞或靶組織的基因組中，例如肝細胞的基因組中或肝內皮細胞的基因組中。
在一些實施例中，在本揭示文本的慢病毒載體中編碼具有FVIII活性的多肽的核苷酸序列包含coBDDFVIII-3aa（SEQ ID NO:14）、由其組成或基本上由其組成。
在其他實施例中，在本揭示文本的慢病毒載體中編碼具有FVIII活性的多肽的核苷酸序列包含coBDDFVIII6-XTEN-3aa（SEQ ID NO:11）、由其組成或基本上由其組成。
在其他實施例中，在本揭示文本的慢病毒載體中編碼具有FVIII活性的多肽的核苷酸序列包含SEQ ID NO:16、由其組成或基本上由其組成。
本文揭示的慢病毒載體可以在哺乳動物（例如，人患者）體內以低劑量（例如，10 10TU/kg或更低、10 9TU/kg或更低、或10 8TU/kg或更低）使用，使用基因治療方法對於選自以下的出血疾病或障礙的治療將是治療上有益的：出血凝結障礙、關節積血、肌肉出血、口腔出血、出血症、出血至肌肉中、口腔出血症、創傷、頭部創傷、胃腸出血、顱內出血、腹內出血、胸腔內出血、骨折、中樞神經系統出血、咽後間隙出血、腹膜後間隙出血和髂腰肌鞘出血。在一個實施例中，出血疾病或障礙是血友病。在另一個實施例中，出血疾病或障礙是A型血友病。
在一些實施例中，將靶細胞（例如，肝細胞）在體外用低劑量（例如，10 10TU/kg或更低、10 9TU/kg或更低、或10 8TU/kg或更低）的本文公開的慢病毒載體處理，然後投予至患者。在某些實施例中，將靶細胞（例如，肝細胞）在體外用約3.0 x 10 9TU/kg的本文公開的慢病毒載體處理，然後投予至患者。在又另一個實施例中，將來自患者的細胞（例如，肝細胞）用低劑量（例如，10 10TU/kg或更低、10 9TU/kg或更低、或10 8TU/kg或更低）的本文公開的慢病毒載體離體處理，然後投予至患者。
在一些實施例中，相對於生理正常循環FVIII水平，投予本文公開的慢病毒載體（例如，以10 10TU/kg或更低、10 9TU/kg或更低、或10 8TU/kg或更低投予）後的血漿FVIII活性增加至少約100%、至少約110%、至少約120%、至少約130%、至少約140%、至少約150%、至少約160%、至少約170%、至少約180%、至少約190%、至少約200%、至少約210%、至少約220%、至少約230%、至少約240%、至少約250%、至少約260%、至少約270%、至少約280%、至少約290%或至少約300%。
本揭示文本還提供了治療、預防、改善有需要的個體的止血障礙（例如，出血障礙，如A型血友病）的方法，所述方法包括向所述個體投予治療有效量的慢病毒載體，所述慢病毒載體包含含有編碼具有FVIII活性的多肽的核苷酸序列的分離的核酸分子，其中將所述慢病毒載體以5x10 10或更少TU/kg、10 9或更少TU/kg、或10 8或更少TU/kg的至少一個劑量投予。
藉由本揭示文本的慢病毒載體的治療/改善和預防可以是繞路療法。接受繞路療法的個體可能已經產生針對凝血因子（例如，FVIII）的抑制劑，或者正在產生凝血因子抑制劑。
本揭示文本的慢病毒載體藉由促進纖維蛋白凝塊的形成治療或預防止血障礙。由本揭示文本的核酸分子編碼的具有FVIII活性的多肽可以啟動凝結級聯的成員。凝血因子可以是外在途徑、固有途徑或二者的參與者。
本揭示文本的慢病毒載體可以用於治療已知可用FVIII治療的止血障礙。可以使用本揭示文本的方法治療的止血障礙包括但不限於A型血友病、B型血友病、血管性血友病、因子XI缺乏（PTA缺乏）、因子XII缺乏、以及纖維蛋白原、凝血酶原、因子V、因子VII、因子X或因子XIII的缺乏或結構異常、關節積血、肌肉出血、口腔出血、出血症、出血至肌肉中、口腔出血症、創傷、頭部創傷、胃腸出血、顱內出血、腹內出血、胸腔內出血、骨折、中樞神經系統出血、咽後間隙出血、腹膜後間隙出血和髂腰肌鞘出血。
用於向個體投予的組合物包括包含核酸分子的慢病毒載體，所述核酸分子包含本揭示文本的編碼FVIII凝血因子（用於基因療法應用）以及FVIII多肽分子的優化的核苷酸序列。在一些實施例中，用於投予的組合物是在體內、在體外或離體與本揭示文本的慢病毒載體接觸的細胞。
在一些實施例中，止血障礙是遺傳性障礙。在一個實施例中，個體患有A型血友病。在其他實施例中，止血障礙是缺乏FVIII的結果。在其他實施例中，止血障礙可能是缺陷性FVIII凝血因子的結果。
在另一個實施例中，止血障礙可以是獲得性障礙。獲得性障礙可能源自潛在的繼發性疾病或病症。無關病症可以是（作為例子但不限制）癌症、自身免疫疾病或妊娠。獲得性障礙可能源自衰老或源自治療潛在繼發性障礙的藥物療法（例如，癌症化學療法）。
本揭示文本還涉及治療未患止血障礙或導致獲得止血障礙的繼發性疾病或病症的個體的方法。本揭示文本因此涉及治療需要通用止血劑的個體的方法，所述方法包括投予治療有效量的本揭示文本的慢病毒載體。例如，在一個實施例中，需要通用止血劑的個體正在進行或即將進行手術。本揭示文本的慢病毒載體可以在手術之前或之後作為預防劑投予。
本揭示文本的慢病毒載體可以在手術期間或之後投予以控制急性出血事件。手術可以包括但不限於肝移植、肝切除或幹細胞移植。
在另一個實施例中，本揭示文本的慢病毒載體可以用於治療患有急性出血發作但未患止血障礙的個體。急性出血發作可能源自嚴重創傷（例如，手術）、車禍、傷口、槍擊撕裂（laceration gun shot）或導致不受控制的出血的任何其他創傷性事件。
慢病毒載體可以用於預防性治療患有止血障礙的個體。慢病毒載體也可以用於治療患有止血障礙的個體的急性出血發作。
在另一個實施例中，本文公開的慢病毒載體的投予和/或隨後FVIII蛋白轉基因的表現不誘導個體的免疫反應。在一些實施例中，免疫反應包含產生針對FVIII的抗體。在一些實施例中，免疫反應包含細胞因子分泌。在一些實施例中，免疫反應包含啟動B細胞、T細胞或B細胞和T細胞二者。在一些實施例中，免疫反應是抑制性免疫反應，其中相對於未產生免疫反應的個體的FVIII的活性，個體的免疫反應降低FVIII蛋白的活性。在某些實施例中，藉由投予本揭示文本的慢病毒載體表現FVIII蛋白預防針對FVIII蛋白或從分離的核酸分子或慢病毒載體表現的FVIII蛋白的抑制性免疫反應。
在一些實施例中，將本揭示文本的慢病毒載體與至少一種促進止血的其他藥劑組合投予。促進止血的所述其他藥劑是具有已證實的凝血活性的治療劑。作為例子但不限制，止血劑可以包括因子V、因子VII、因子IX、因子X、因子XI、因子XII、因子XIII、凝血酶原或纖維蛋白原或前述任一種的啟動形式。凝血因子或止血劑還可以包括抗纖維蛋白溶解藥，例如ε-胺基己酸、胺甲環酸。
在本揭示文本的一個實施例中，組合物（例如，慢病毒載體）是在將FVIII投予至個體時以可啟動的形式存在的組合物。這種可啟動的分子可以在投予至個體後在體內在凝血位點處被啟動。
本揭示文本的慢病毒載體可以靜脈內、皮下、肌內或藉由任何粘膜表面投予，例如，口服、舌下、經頰、舌下、經鼻、直腸、陰道或經由肺途徑。可以將慢病毒載體植入生物聚合物固體支援物內或連接至生物聚合物固體支援物，從而允許將載體緩慢釋放到所需的位點。
在一個實施例中，慢病毒載體的投予途徑是腸胃外。如本文所用的術語腸胃外包括靜脈內、動脈內、腹膜內、肌內、皮下、直腸或陰道投予。腸胃外投予的靜脈內形式是優選的。雖然所有這些投予形式明顯被認為是在本揭示文本的範圍內，但投予形式將是用於注射，特別是用於靜脈內或動脈內注射或滴注的溶液。通常，適於注射的醫藥組合物可以包含緩衝液（例如乙酸鹽、磷酸鹽或檸檬酸鹽緩衝液）、表面活性劑（例如聚山梨醇酯）、任選地穩定劑（例如人白蛋白）等。然而，在與本文的傳授內容相容的其他方法中，可以將慢病毒載體直接遞送至不良細胞群的位點，從而增加患病組織對治療劑的暴露。
用於腸胃外投予的製劑包括無菌水溶液或非水溶液、懸浮液和乳液。非水性溶劑的例子是丙二醇、聚乙二醇、植物油（如橄欖油）以及可注射的有機酯（如油酸乙酯）。水性載劑包括水、醇/水溶液、乳液或懸浮液，包括鹽水和緩衝介質。在本揭示文本中，醫藥上可接受的載劑包括但不限於0.01-0.1 M且優選地0.05 M磷酸鹽緩衝液或0.8%鹽水。其他常見的腸胃外媒劑包括磷酸鈉溶液、林格氏右旋糖、右旋糖和氯化鈉、乳酸林格氏液或不揮發油。靜脈內媒劑包括流體和營養補充劑、電解質補充劑（如基於林格氏右旋糖的那些）等。也可以存在防腐劑和其他添加劑，如例如抗微生物劑、抗氧化劑、螯合劑和惰性氣體等。
更具體地，適於注射使用的醫藥組合物包括無菌的水性溶液（在水溶性的情況下）或分散液、以及用於臨時製備無菌可注射溶液或分散液的無菌粉末。在此類情況下，組合物必須是無菌的並且應當是易於注射的程度的流體。其應在製造和儲存條件下穩定，並且將優選地抵抗微生物（如細菌和真菌）的污染作用而保存。載劑可以是溶劑或分散介質，所述溶劑或分散介質含有例如水、乙醇、多元醇（例如，甘油、丙二醇和液體聚乙二醇等）及其合適的混合物。可以例如藉由使用包衣如卵磷脂、在分散體的情況下藉由維持所需細微性以及藉由使用表面活性劑來維持適當的流動性。
防止微生物的作用可以藉由各種抗細菌劑以及抗真菌劑（例如，對羥基苯甲酸酯、氯丁醇、苯酚、抗壞血酸、硫柳汞等）來實現。在許多情況下，將優選地在組合物中包括等滲劑，例如糖、多元醇（如甘露醇、山梨醇）或氯化鈉。藉由在組合物中包括延遲吸收的藥劑（例如，單硬脂酸鋁和明膠），可以實現可注射組合物的延長吸收。
在任何情況下，無菌可注射溶液可以藉由以下方式製備：將活性化合物（例如，多肽自身或與其他活性劑組合）以所需量摻入視需要具有上文所列舉成分中的一種或組合的適當溶劑中，之後過濾滅菌。通常，藉由將活性化合物併入無菌媒劑中來製備分散體，所述無菌媒劑含有基礎分散介質和來自以上列舉的那些的所需其他成分。在用於製備無菌可注射溶液的無菌粉末的情況下，優選製備方法是真空乾燥和冷凍乾燥，所述真空乾燥和冷凍乾燥從其先前無菌過濾的溶液產生活性成分加上任何另外的所需成分的粉末。將用於注射的製劑加工，填充至容器（如安瓿、袋子、瓶子、注射器或小瓶）中，並且根據本領域已知的方法在無菌條件下密封。此外，製劑可以以套組的形式包裝和出售。此類製品將優選地具有標籤或包裝說明書，所述標籤或包裝說明書表明相關組合物可用於治療患有或易患凝血障礙的個體。
醫藥組合物還可以被配製用於作為例如含有常規栓劑基質（如可哥脂或其他甘油酯）的栓劑或保留灌腸劑經直腸投予。
用於治療病症的本揭示文本的組合物的有效劑量根據許多不同因素而變化，所述因素包括投予手段、靶位點、患者的生理狀態、患者是人還是動物、所投予的其他藥物以及治療是預防性的還是治療性的。通常，患者是人，但是也可以治療非人哺乳動物，包括轉基因哺乳動物。治療劑量可以使用本領域技術人員已知的常規方法逐步增加，以優化安全性和功效。
慢病毒載體可以作為單一劑量或作為多個劑量來投予，其中多個劑量可以連續投予或以指定時間間隔投予。可以採用體外測定來確定用於投予的最佳劑量範圍和/或時間表。測量凝血因子活性的體外測定是本領域已知的。另外，有效劑量可以根據從動物模型（例如，血友病犬）獲得的劑量-反應曲線來推知（Mount等人 2002, Blood 99 (8): 2670）。
在上述範圍中間的劑量也意圖在本揭示文本的範圍內。可以每天、隔日、每週或根據按經驗分析確定的任何其他時間表向個體投予此類劑量。示例性治療使得需要在例如至少六個月的延長時期中以多個劑量投予。
可以多次投予本揭示文本的慢病毒載體。單一劑量之間的間隔可以是每天、每週、每個月或每年。如藉由測量修飾的多肽或抗原在患者體內的血液水平所指示，間隔也可以是不規律的。本揭示文本的慢病毒載體的劑量和頻率根據由轉基因編碼的FVIII多肽在患者體內的半衰期而變化。
本揭示文本的慢病毒載體的投予的劑量和頻率可以根據治療是預防性還是治療性而變化。在預防性應用中，將含有本揭示文本的慢病毒載體的組合物投予至尚未處於疾病狀態的患者，以增強所述患者的抵抗力或最小化疾病的影響。這種劑量被定義為“預防有效劑量”。在很長一段時間內以相對較不頻繁的間隔投予相對較低的劑量。一些患者在其餘生中繼續接受治療。
本揭示文本的慢病毒載體可以任選地與在需要治療（例如，預防性或治療性）的障礙或病症的治療中有效的其他藥劑組合投予。
如本文所用，與輔助療法結合或組合的本揭示文本的慢病毒載體的投予意指依序、同時、同延、並行、伴隨或同期投予或應用所述療法和所公開的多肽。本領域技術人員將瞭解，組合治療方案中各種組分的投予或應用可以定時以增強治療的總體有效性。基於所選輔助療法和本說明書的傳授內容，技術人員（例如，醫師）在不進行過度實驗的情況下便能夠容易地辨別有效的組合治療方案。
應進一步瞭解，本揭示文本的慢病毒載體可以與一種或多種藥劑結合或組合使用（例如，以提供組合治療方案）。可以與本揭示文本的慢病毒載體組合的示例性藥劑包括代表用於所治療的特定障礙的當前護理標準的藥劑。此類藥劑的性質可以是化學的或生物的。術語“生物劑（biologic）”或“生物劑（biologic agent）”是指預期用作治療劑的從活的生物體和/或其產物製備的任何醫藥活性劑。
要與本揭示文本的慢病毒載體組合使用的藥劑的量可以隨個體變化，或者可以根據本領域的知識來投予。參見例如，Chabner等人, Pharmacological Basis of Therapeutics 1233-1287 (Joel G. Hardman等人編輯, 第9版 1996)。在另一個實施例中，投予符合護理標準的量的這種藥劑。
在某些實施例中，將本揭示文本的慢病毒載體與免疫抑制劑、抗過敏劑或抗炎劑結合投予。這些藥劑通常是指起到抑制或遮罩本文所治療的個體的免疫系統的作用的物質。這些藥劑包括抑制細胞因子產生、下調或抑制自身抗原表現或遮罩MHC抗原的物質。此類藥劑的例子包括2-胺基-6-芳基-5-取代的嘧啶；硫唑嘌呤；環磷醯胺；溴麥角環肽；達那唑；胺苯碸；戊二醛；MHC抗原和MHC片段的抗獨特型抗體；環孢菌素A；類固醇，如糖皮質激素，例如，潑尼松、甲潑尼龍和地塞米松；細胞因子或細胞因子受體拮抗劑，包括抗干擾素-γ、-β或-α抗體、抗腫瘤壞死因子-α抗體、抗腫瘤壞死因子-β抗體、抗白介素-2抗體和抗IL-2受體抗體；抗LFA-1抗體，包括抗CD11a和抗CD18抗體；抗L3T4抗體；異源抗淋巴細胞球蛋白；全T抗體；含有LFA-3結合結構域的可溶性肽；鏈激酶；TGF-β；鏈道酶；FK506；RS-61443；去氧精胍菌素和雷帕黴素。在某些實施例中，藥劑是抗組胺藥。如本文所用的“抗組胺藥”是拮抗組胺的生理作用的藥劑。抗組胺藥的例子是氯苯那敏、苯海拉明、普魯米近、色甘酸鈉、阿司咪唑、馬來酸阿紮他定、馬來酸溴苯那敏、馬來酸卡比沙明、鹽酸西替利嗪、富馬酸氯馬斯汀、鹽酸賽庚啶、馬來酸右溴苯那敏、馬來酸右氯苯那敏、茶苯海明、鹽酸苯海拉明、琥珀酸多西拉敏、鹽酸非索非那定、鹽酸特非那定、鹽酸羥嗪、氯雷他定、鹽酸美克洛嗪、檸檬酸曲吡那敏、鹽酸曲吡那敏和鹽酸曲普利啶。
可以將免疫抑制劑、抗過敏劑或抗炎劑摻入慢病毒載體投予方案中。例如，免疫抑制劑或抗炎劑的投予可以在投予所公開的慢病毒載體之前開始，並且可以在此後以一個或多個劑量繼續。在某些實施例中，將免疫抑制劑或抗炎劑作為慢病毒載體的預先用藥來投予。
如前所述，本揭示文本的慢病毒載體可以以醫藥有效量投予，以用於凝血障礙的體內治療。在這一態樣，應當理解，本揭示文本的慢病毒載體可以被配製成促進投予且促進活性劑的穩定性。優選地，根據本揭示文本的醫藥組合物包含醫藥上可接受的、無毒的、無菌的載劑，如生理鹽水、無毒緩衝液、防腐劑等。當然，本揭示文本的醫藥組合物可以以單一劑量或多個劑量投予，以提供醫藥有效量的多肽。
多種測試可用於評估凝結系統的功能：啟動部分促凝血酶原激酶時間（aPTT）測試、生色測定、ROTEM®測定、凝血酶原時間（PT）測試（也用於確定INR）、纖維蛋白原測試（通常藉由克勞斯法進行）、血小板計數、血小板功能測試（通常藉由PFA-100進行）、TCT、出血時間、混合測試（如果將患者的血漿與正常血漿混合，是否矯正異常）、凝結因子測定、抗磷脂抗體、D-二聚體、遺傳測試（例如，因子V Leiden、凝血酶原突變G20210A）、稀釋魯塞爾蝰蛇毒時間（dRVVT）、雜項血小板功能測試、凝血彈性描記法（TEG或Sonoclot）、凝血彈性測量法（TEM®，例如ROTEM®）或優球蛋白溶解時間（ELT）。
aPTT測試是測量“固有”（也稱為接觸啟動途徑）和常見凝結途徑二者的功效的性能指示物。這個測試一般用於測量市售重組凝血因子（例如，FVIII或FIX）的凝血活性。其與測量外在途徑的凝血酶原時間（PT）結合使用。
ROTEM®分析提供關於止血的整體動力學的資訊：凝血時間、凝塊形成、凝塊穩定性和溶解。凝血彈性測量法中的不同參數依賴於血漿凝結系統的活性、血小板功能、纖維蛋白溶解或影響這些相互作用的許多因素。這個分析可以提供次級止血的全面見解。
本文所述的所有各個態樣、實施例和選擇都能以任何和所有變化組合。
本說明書中所提到的所有出版物、專利和專利申請都藉由引用併入本文，併入程度如同指示每個單獨出版物、專利或專利申請明確且單獨地藉由引用併入一般。
已經一般性地描述了本揭示文本，藉由參考本文所提供的實例可以獲得進一步的理解。這些實例僅用於說明的目的，而不具有限制性。 實例 實例 1 ：優化的 coBDDFVIII6-XTEN-3aa 轉基因的產生
假設可以藉由針對靶向宿主對編碼序列進行密碼子優化來提高轉基因表現水平。在先前的研究中已經使用密碼子優化的FVIIIco6XTEN基因盒證明了更高水平的FVIII表現。此基因盒包含編碼B結構域缺失的人因子VIII（BDDcoFVIII）的密碼子優化的cDNA，所述BDDcoFVIII與FVIII的B結構域中的XTEN 144肽融合。
為了進一步改善標靶特異性並且降低免疫原性，將經由電腦類比抗原性分析用於評價將新表位引入FVIIIco6XTEN蛋白中的風險並且使所述風險最小化。使用開放資源免疫表位資料庫和分析資源（Immune Epitope Database and Analysis Resource，IEDB）和用於確定主要組織相容性複合物II類（MHCII）與嵌合蛋白的結合的推薦的預測方法評價了多種代表性人白細胞抗原（HLA）等位基因（DR、DP、DQ）。對於另外的分析，還使用了用HLA-DR等位基因（代表北美或日本群體）的NetMHCIIpan 3.0方法（參見Lamberth K等人 Sci Transl Med. 2017;9(372):eaag1286）。
半數最大抑制濃度（IC 50）值＜ 50 nM、＜ 500 nM、＜ 5000 nM的肽被認為對MHCII分別具有高親和力（高免疫原性風險）、中親和力和低親和力。將500 nM的IC 50截止值用於評價HLA-DR等位基因。IC 50值＞ 500 nM被認為不具有顯著的免疫原性潛力。
位於嵌合蛋白的FVIII-XTEN連接處的GAP殘基被鑑定為具有免疫原性潛力。申請人將這些GAP殘基鑑定為由對應於XhoI限制性酶切位點（最初為了促進選殖而引入）的核苷酸序列編碼。將編碼GAP殘基的9個核苷酸從FVIII蛋白的編碼序列中缺失。這些核苷酸和轉譯的蛋白質中的相應的GAP殘基的缺失被確認為消除了FVIII-XTEN連接處的免疫原性潛力。
這得到了編碼本文測試的嵌合FVIII蛋白（被稱為“coBDDFVIII6-XTEN-3aa”）的最終FVIII核苷酸序列。編碼coBDDFVIII6-XTEN-3aa的核苷酸序列被揭示為SEQ ID NO: 11。coBDDFVIII6-XTEN-3aa的胺基酸序列被揭示為SEQ ID NO: 12（對於另外的序列資訊，參見 表 1）。 實例 2 ：編碼 coBDDFVIII-XTEN-3aa 的基因表現盒的產生
設計攜帶在肝細胞特異性啟動子的控制下以用於體內表現的coBDDFVIII-XTEN-3aa轉基因的基因表現盒。基因表現盒側接5’和3’長末端重複（LTR）序列，所述序列促進轉移質體序列整合到宿主基因組中。
LTR編碼元件包括與異源人巨細胞病毒（CMV）早期基因啟動子區融合的嵌合5’ LTR（SEQ ID NO: 1）、3’ LTR的U3區中的增強子/啟動子序列的自失活（SIN）缺失體（SEQ ID NO: X_標注為“dU3RU5”）以及允許Tat結合的R區和U5區（SEQ ID NO: 2_RU5區）。
轉移質體維持衣殼化、反轉錄和整合到宿主細胞基因組中所必需的順式作用病毒序列。順式作用病毒序列是包裝信號（Psi，Ψ）、SL123的引子結合位點（PBS）（SEQ ID NO: 3）、莖環4（SL4）（SEQ ID NO: 4）、反轉錄所必需的多嘌呤區（PPT）（SEQ ID NO: 6）、具有供體和受體剪接位點的內含子以及未剪接的全基因組轉錄物的Rev介導的核輸出所必需的Rev回應元件（RRE）（SEQ ID NO: 5）。另外，質體還編碼在3’ UTR處摻入的造血特異性微小RNA miR-142-3pT（SEQ ID NO: 10）的互補序列的四個串聯複本，以防止轉基因在造血譜系抗原呈遞細胞中表現而維持轉基因在非造血細胞中表現（Brown等人Nature 12:585-591 (2006)）。
基因盒包含編碼與XTEN 144肽融合的B結構域缺失的人因子VIII（BDDcoFVIII）的密碼子優化的cDNA，其中將FVIII/XTEN連接處的三個胺基酸殘基（Gly-Ala-Pro）去除以避免潛在的MHCII結合位點（XTEN-3aa）（參見實例1）。此轉基因（稱為coBDDFVIII6-XTEN-3aa）藉由肝臟特異性的經修飾的小鼠甲狀腺素轉運蛋白（mTTR）啟動子（SEQ ID NO: 9）與兩個上游增強子序列（mTTR增強子元件（SEQ ID NO: 8）和合成增強子（SEQ ID NO: 7））調控。
包含編碼coBDDFVIII6-XTEN-3aa的基因表現盒的質體的圖形表示示於 圖 1中。
以下實例測試了在多個動物模型中coBDDFVIII-XTEN-3aa轉基因的體內功能性。 實例 3 ： LV-coBDDFVIII6-XTEN-3aa 處理在 HemA 新生小鼠中的長期劑量反應
為了評估使用慢病毒系統在兒科HemA模型中表現coBDDFVIII6-XTEN-3aa以及產生FVIII活性的功效，向新生（2日齡）HemA小鼠藉由顳靜脈注射投予約1.5 x 10 9、3.0 x 10 9、6 x 10 9或1.3 x 10 10TU/kg LV-coBDDFVIII6-XTEN-3aa。藉由FVIII顯色測定測量循環FVIII活性。藉由人FVIII特異性ELISA測定測量循環FVIII蛋白。
對於投予LV-coBDDFVIII6-XTEN-3aa的所有小鼠，均觀察到呈劑量依賴性方式的持續長期FVIII表現。慢病毒載體處理後，接受LV-coBDDFVIII6-XTEN-3aa的小鼠的FVIII活性水平保持相對穩定直到第25週研究結束（ 圖 2A）。在接受1.3 x 10 10TU/kg LV-coBDDFVIII6-XTEN-3aa劑量的小鼠中觀察到約50%的最高FVIII活性。與FVIII活性資料一致，對於所有慢病毒劑量，循環FVIII蛋白的水平均保持相對穩定直到研究結束（ 圖 2B）。
這些資料證明使用慢病毒系統遞送的coBDDFVIII6-XTEN-3aa可以在新生HemA小鼠中產生治療性FVIII水平。
這些資料支援使用LV-coBDDFVIII6-XTEN-3aa治療兒科HemA患者的潛在的治療益處。 實例 4 ： LV-coBDDFVIII6-XTEN-3aa 處理在 HemA 成年小鼠中的長期劑量反應
為了評估使用慢病毒系統在成年HemA模型中表現coBDDFVIII6-XTEN-3aa以及產生FVIII活性的功效，向成年（16週齡）HemA小鼠藉由顳靜脈注射投予約1.3 x 10 10或3.7 x 10 10TU/kg LV-coBDDFVIII6-XTEN-3aa。藉由FVIII顯色測定測量循環FVIII活性。藉由人FVIII特異性ELISA測定測量循環FVIII蛋白。
對於兩個給藥組，均觀察到呈劑量依賴性方式的持續長期FVIII表現。慢病毒載體處理後，接受LV-coBDDFVIII6-XTEN-3aa的所有小鼠的FVIII活性水平均保持相對穩定直到至少第20週研究結束（ 圖 3）。接受3.7 x 10 10TU/kg LV-coBDDFVIII6-XTEN-3aa的小鼠在研究持續時間內的FVIII活性為正常值的大約50%。接受較低劑量1.3 x 10 10TU/kg LV-coBDDFVIII6-XTEN-3aa的小鼠的FVIII活性為正常值的≥ 5%-7%。
這些資料證明使用慢病毒系統遞送的coBDDFVIII6-XTEN-3aa可以在成年HemA小鼠中產生治療性FVIII水平。
這些資料支援使用LV-coBDDFVIII6-XTEN-3aa治療成年HemA患者的潛在的治療益處。這些資料還表明使用LV-coBDDFVIII6-XTEN-3aa的治療益處可以以相對較低劑量的LV實現。 實例 5 ： LV-coBDDFVIII6-XTEN-3aa 處理在非人靈長類動物中的長期劑量反應
為了評估使用慢病毒系統在非人靈長類動物中表現coBDDFVIII6-XTEN-3aa以及產生FVIII活性的功效，將十隻雄性豬尾獼猴（3.5-4.3 kg體重）經由以1.5 mL/分鐘的輸注速率的靜脈內（IV）輸注用LV-coFVIII-6或LV-coFVIII-6-XTEN（由CD47高/MHC-I 無293T細胞產生）處理。LV-coBDDFVIII6-XTEN-3aa的劑量是1 x 10 9或3 x 10 9TU/kg。為了控制抗人FVIII抗體形成，從LV處理的第-1天至第7天，將動物用每天肌內注射SOLU-MEDROL®（甲基潑尼松龍）以10 mg/kg的劑量處理。LV處理前三十（30）分鐘，還將動物用IV注射右撲爾敏（右氯苯那敏）以4 mg/kg的劑量處理以控制潛在的過敏反應。
在LV處理後第0天、第1天、第3天、第7天、第14天、第21天、第28天、第45天和第60天收集血漿樣品，並且分析所述血漿樣品的人FVIII活性和FVIII抗原水平。藉由FVIII顯色測定測量循環FVIII活性。藉由人FVIII特異性ELISA測定測量循環FVIII蛋白。將每個LV給藥組的FVIII活性水平和FVIII抗原水平跨處理後時間點取平均值。
1 x 10 9和3 x 10 9TU/kg處理組的平均FVIII活性水平分別是正常值的約20%和約75%（ 圖 4A）。1 x 10 9或3 x 10 9TU/kg處理組的平均FVIII抗原水平分別為約31 ng/mL或約140 ng/mL（ 圖 4B）。
這些資料證明LV-coBDDFVIII6-XTEN-3aa可以在非人靈長類動物中產生治療性人FVIII水平。 序列 表 1. 核苷酸和胺基酸序列
SEQ ID NO/ 描述 核苷酸或胺基酸序列
SEQ ID NO.1： 人CMV啟動子區- 5’ LTR TGGCCATTGCATACGTTGTATCCATATCATAATATGTACATTTATATTGGCTCATGTCCAACATTACCGCCATGTTGACATTGATTATTGACTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGAGTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTGATGCGGTTTTGGCAGTACATCAATGGGCGTGGATAGCGGTTTGACTCACGGGGATTTCCAAGTCTCCACCCCATTGACGTCAATGGGAGTTTGTTTTGGCACCAAAATCAACGGGACTTTCCAAAATGTCGTAACAACTCCGCCCCATTGACGCAAATGGGCGGTAGGCGTGTACGGTGGGAGGTCTATATAAGCAGAGCTCGTTTAGTGAACC
SEQ ID NO.2： RU5區 GGGTCTCTCTGGTTAGACCAGATCTGAGCCTGGGAGCTCTCTGGCTAACTAGGGAACCCACTGCTTAAGCCTCAATAAAGCTTGCCTTGAGTGCTTCAAGTAGTGTGTGCCCGTCTGTTGTGTGACTCTGGTAACTAGAGATCCCTCAGACCCTTTTAGTCAGTGTGGAAAATCTCTAGCAG
SEQ ID NO.3： SL123的引子結合位點（PBS） TGGCGCCCGAACAGGGACCTGAAAGCGAAAGGGAAACCAGAGCTCTCTCGACGCAGGACTCGGCTTGCTGAAGCGCGCACGGCAAGAGGCGAGGGGCGGCGACTGGTGAGTACGCCAAAAATTTTGACTAGCGGAGGCTAGAAGGAGAGAG
SEQ ID NO.4： 莖環4（SL4）mgag ATGGGTGCGAGAGCGTCAGTATTAAGCGGGGGAGAATTAGATCGCGATGGGAAAAAATTCGGTTAAGGCCAGGGGGAAAGAAAAAATATAAATTAAAACATATAGTATGGGCAAGCAGGGAGCTAGAACGATTCGCAGTTAATCCTGGCCTGTTAGAAACATCAGAAGGCTGTAGACAAATACTGGGACAGCTACAACCATCCCTTCAGACAGGATCAGAAGAACTTAGATCATTATATAATACAGTAGCAACCCTCTATTGTGTGCATCAAAGGATAGAGATAAAAGACACCAAGGAAGCTTTAGACAAGATAGAGGAAGAGCAAAACAAAAGTAAGACCACCGCACAGCAAGCGGCCGCTGAT
SEQ ID NO.5： REV回應元件（RRE） GGAGCTTTGTTCCTTGGGTTCTTGGGAGCAGCAGGAAGCACTATGGGCGCAGCCTCAATGACGCTGACGGTACAGGCCAGACAATTATTGTCTGGTATAGTGCAGCAGCAGAACAATTTGCTGAGGGCTATTGAGGCGCAACAGCATCTGTTGCAACTCACAGTCTGGGGCATCAAGCAGCTCCAGGCAAGAATCCTGGCTGTGGAAAGATACCTAAAGGATCAACAGCTCCTGGGGATTT
SEQ ID NO.6： 多嘌呤區（PPT） AACTTTTAAAAGAAAAGGGGGGATTGGGGGGTACAGTGCAGGGGAAAGAATAGTAGACATAATAGCAACAGACATACAAACTAAAGAATTACAAAAACAAATTACAAAAATTCAAAATTTTATC
SEQ ID NO.7： 合成增強子 CGCGAGTTAATAATTACCAGCGCGGGCCAAATAAATAATCCGCGAGGGGCAGGTGACGTTTGCCCAGCGCGCGCTGGTAATTATTAACCTCGCGAATATTGATTCGAGGCCGCGATTGCCGCAATCGCGAGGGGCAGGTGACCTTTGCCCAGCGCGCG
SEQ ID NO.8： mTTR增強子 CACTGGGAGGATGTTGAGTAAGATGGAAAACTACTGATGACCCTTGCAGAGACAGAGTATTAGGACATGTTTGAACAGGGGCCGGGCGATCAGCAGGTAG
SEQ ID NO.9: mTTR啟動子 GTCTGTCTGCACATTTCGTAGAGCGAGTGTTCCGATACTCTAATCTCCCTAGGCAAGGTTCATATTTGTGTAGGTTACTTATTCTCCTTTTGTTGACTAAGTCAATAATCAGAATCAGCAGGTTTGGAGTCAGCTTGGCAGGGATCAGCAGCCTGGGTTGGAAGGAGGGGGTATAAAAGCCCCTTCACCAGGAGAAGCCGTC
SEQ ID NO.10： 微小RNA 142-3pT TCCATAAAGTAGGAAACACTACA
SEQ ID NO.11： 編碼coBDDFVIII6-XTEN-3aa的核苷酸序列 ATGCAGATTGAGCTGTCCACTTGTTTCTTCCTGTGCCTCCTGCGCTTCTGTTTCTCCGCCACTCGCCGGTACTACCTTGGAGCCGTGGAGCTTTCATGGGACTACATGCAGAGCGACCTGGGCGAACTCCCCGTGGATGCCAGATTCCCCCCCCGCGTGCCAAAGTCCTTCCCCTTTAACACCTCCGTGGTGTACAAGAAAACCCTCTTTGTCGAGTTCACTGACCACCTGTTCAACATCGCCAAGCCGCGCCCACCTTGGATGGGCCTCCTGGGACCGACCATTCAAGCTGAAGTGTACGACACCGTGGTGATCACCCTGAAGAACATGGCGTCCCACCCCGTGTCCCTGCATGCGGTCGGAGTGTCCTACTGGAAGGCCTCCGAAGGAGCTGAGTACGACGACCAGACTAGCCAGCGGGAAAAGGAGGACGATAAAGTGTTCCCGGGCGGCTCGCATACTTACGTGTGGCAAGTCCTGAAGGAAAACGGACCTATGGCATCCGATCCTCTGTGCCTGACTTACTCCTACCTTTCCCATGTGGACCTCGTGAAGGACCTGAACAGCGGGCTGATTGGTGCACTTCTCGTGTGCCGCGAAGGTTCGCTCGCTAAGGAAAAGACCCAGACCCTCCATAAGTTCATCCTTTTGTTCGCTGTGTTCGATGAAGGAAAGTCATGGCATTCCGAAACTAAGAACTCGCTGATGCAGGACCGGGATGCCGCCTCAGCCCGCGCCTGGCCTAAAATGCATACAGTCAACGGATACGTGAATCGGTCACTGCCCGGGCTCATCGGTTGTCACAGAAAGTCCGTGTACTGGCACGTCATCGGCATGGGCACTACGCCTGAAGTGCACTCCATCTTCCTGGAAGGGCACACCTTCCTCGTGCGCAACCACCGCCAGGCCTCTCTGGAAATCTCCCCGATTACCTTTCTGACCGCCCAGACTCTGCTCATGGACCTGGGGCAGTTCCTTCTCTTCTGCCACATCTCCAGCCATCAGCACGACGGAATGGAGGCCTACGTGAAGGTGGACTCATGCCCGGAAGAACCTCAGTTGCGGATGAAGAACAACGAGGAGGCCGAGGACTATGACGACGATTTGACTGACTCCGAGATGGACGTCGTGCGGTTCGATGACGACAACAGCCCCAGCTTCATCCAGATTCGCAGCGTGGCCAAGAAGCACCCCAAAACCTGGGTGCACTACATCGCGGCCGAGGAAGAAGATTGGGACTACGCCCCGTTGGTGCTGGCACCCGATGACCGGTCGTACAAGTCCCAGTATCTGAACAATGGTCCGCAGCGGATTGGCAGAAAGTACAAGAAAGTGCGGTTCATGGCGTACACTGACGAAACGTTTAAGACCCGGGAGGCCATTCAACATGAGAGCGGCATTCTGGGACCACTGCTGTACGGAGAGGTCGGCGATACCCTGCTCATCATCTTCAAAAACCAGGCCTCCCGGCCTTACAACATCTACCCTCACGGAATCACCGACGTGCGGCCACTCTACTCGCGGCGCCTGCCGAAGGGCGTCAAGCACCTGAAAGACTTCCCTATCCTGCCGGGCGAAATCTTCAAGTATAAGTGGACCGTCACCGTGGAGGACGGGCCCACCAAGAGCGATCCTAGGTGTCTGACTCGGTACTACTCCAGCTTCGTGAACATGGAACGGGACCTGGCATCGGGACTCATTGGACCGCTGCTGATCTGCTACAAAGAGTCGGTGGATCAACGCGGCAACCAGATCATGTCCGACAAGCGCAACGTGATCCTGTTCTCCGTGTTTGATGAAAACAGATCCTGGTACCTCACTGAAAACATCCAGAGGTTCCTCCCAAACCCCGCAGGAGTGCAACTGGAGGACCCTGAGTTTCAGGCCTCGAATATCATGCACTCGATTAACGGTTACGTGTTCGACTCGCTGCAGCTGAGCGTGTGCCTCCATGAAGTCGCTTACTGGTACATTCTGTCCATCGGCGCCCAGACTGACTTCCTGAGCGTGTTCTTTTCCGGTTACACCTTTAAGCACAAGATGGTGTACGAAGATACCCTGACCCTGTTCCCTTTCTCCGGCGAAACGGTGTTCATGTCGATGGAGAACCCGGGTCTGTGGATTCTGGGATGCCACAACAGCGACTTTCGGAACCGCGGAATGACTGCCCTGCTGAAGGTGTCCTCATGCGACAAGAACACCGGAGACTACTACGAGGACTCCTACGAGGATATCTCAGCCTACCTCCTGTCCAAGAACAACGCGATCGAGCCGCGCAGCTTCAGCCAGAACACATCAGAGAGCGCCACCCCTGAAAGTGGTCCCGGGAGCGAGCCAGCCACATCTGGGTCGGAAACGCCAGGCACAAGTGAGTCTGCAACTCCCGAGTCCGGACCTGGCTCCGAGCCTGCCACTAGCGGCTCCGAGACTCCGGGAACTTCCGAGAGCGCTACACCAGAAAGCGGACCCGGAACCAGTACCGAACCTAGCGAGGGCTCTGCTCCGGGCAGCCCAGCCGGCTCTCCTACATCCACGGAGGAGGGCACTTCCGAATCCGCCACCCCGGAGTCAGGGCCAGGATCTGAACCCGCTACCTCAGGCAGTGAGACGCCAGGAACGAGCGAGTCCGCTACACCGGAGAGTGGGCCAGGGAGCCCTGCTGGATCTCCTACGTCCACTGAGGAAGGGTCACCAGCGGGCTCGCCCACCAGCACTGAAGAAGGTGCCTCGAGCCCGCCTGTGCTGAAGAGGCACCAGCGAGAAATTACCCGGACCACCCTCCAATCGGATCAGGAGGAAATCGACTACGACGACACCATCTCGGTGGAAATGAAGAAGGAAGATTTCGATATCTACGACGAGGACGAAAATCAGTCCCCTCGCTCATTCCAAAAGAAAACTAGACACTACTTTATCGCCGCGGTGGAAAGACTGTGGGACTATGGAATGTCATCCAGCCCTCACGTCCTTCGGAACCGGGCCCAGAGCGGATCGGTGCCTCAGTTCAAGAAAGTGGTGTTCCAGGAGTTCACCGACGGCAGCTTCACCCAGCCGCTGTACCGGGGAGAACTGAACGAACACCTGGGCCTGCTCGGTCCCTACATCCGCGCGGAAGTGGAGGATAACATCATGGTGACCTTCCGTAACCAAGCATCCAGACCTTACTCCTTCTATTCCTCCCTGATCTCATACGAGGAGGACCAGCGCCAAGGCGCCGAGCCCCGCAAGAACTTCGTCAAGCCCAACGAGACTAAGACCTACTTCTGGAAGGTCCAACACCATATGGCCCCGACCAAGGATGAGTTTGACTGCAAGGCCTGGGCCTACTTCTCCGACGTGGACCTTGAGAAGGATGTCCATTCCGGCCTGATCGGGCCGCTGCTCGTGTGTCACACCAACACCCTGAACCCAGCGCATGGACGCCAGGTCACCGTCCAGGAGTTTGCTCTGTTCTTCACCATTTTTGACGAAACTAAGTCCTGGTACTTCACCGAGAATATGGAGCGAAACTGTAGAGCGCCCTGCAATATCCAGATGGAAGATCCGACTTTCAAGGAGAACTATAGATTCCACGCCATCAACGGGTACATCATGGATACTCTGCCGGGGCTGGTCATGGCCCAGGATCAGAGGATTCGGTGGTACTTGCTGTCAATGGGATCGAACGAAAACATTCACTCCATTCACTTCTCCGGTCACGTGTTCACTGTGCGCAAGAAGGAGGAGTACAAGATGGCGCTGTACAATCTGTACCCCGGGGTGTTCGAAACTGTGGAGATGCTGCCGTCCAAGGCCGGCATCTGGAGAGTGGAGTGCCTGATCGGAGAGCACCTCCACGCGGGGATGTCCACCCTCTTCCTGGTGTACTCGAATAAGTGCCAGACCCCGCTGGGCATGGCCTCGGGCCACATCAGAGACTTCCAGATCACAGCAAGCGGACAATACGGCCAATGGGCGCCGAAGCTGGCCCGCTTGCACTACTCCGGATCGATCAACGCATGGTCCACCAAGGAACCGTTCTCGTGGATTAAGGTGGACCTCCTGGCCCCTATGATTATCCACGGAATTAAGACCCAGGGCGCCAGGCAGAAGTTCTCCTCCCTGTACATCTCGCAATTCATCATCATGTACAGCCTGGACGGGAAGAAGTGGCAGACTTACAGGGGAAACTCCACCGGCACCCTGATGGTCTTTTTCGGCAACGTGGATTCCTCCGGCATTAAGCACAACATCTTCAACCCACCGATCATAGCCAGATATATTAGGCTCCACCCCACTCACTACTCAATCCGCTCAACTCTTCGGATGGAACTCATGGGGTGCGACCTGAACTCCTGCTCCATGCCGTTGGGGATGGAATCAAAGGCTATTAGCGACGCCCAGATCACCGCGAGCTCCTACTTCACTAACATGTTCGCCACCTGGAGCCCCTCCAAGGCCAGGCTGCACTTGCAGGGACGGTCAAATGCCTGGCGGCCGCAAGTGAACAATCCGAAGGAATGGCTTCAAGTGGATTTCCAAAAGACCATGAAAGTGACCGGAGTCACCACCCAGGGAGTGAAGTCCCTTCTGACCTCGATGTATGTGAAGGAGTTCCTGATTAGCAGCAGCCAGGACGGGCACCAGTGGACCCTGTTCTTCCAAAACGGAAAGGTCAAGGTGTTCCAGGGGAACCAGGACTCGTTCACACCCGTGGTGAACTCCCTGGACCCCCCACTGCTGACGCGGTACTTGAGGATTCATCCTCAGTCCTGGGTCCATCAGATTGCATTGCGAATGGAAGTCCTGGGCTGCGAGGCCCAGGACCTGTACTGA
SEQ ID NO.12： coBDDFVIII6-XTEN-3aa的胺基酸序列 MQIELSTCFFLCLLRFCFSATRRYYLGAVELSWDYMQSDLGELPVDARFPPRVPKSFPFNTSVVYKKTLFVEFTDHLFNIAKPRPPWMGLLGPTIQAEVYDTVVITLKNMASHPVSLHAVGVSYWKASEGAEYDDQTSQREKEDDKVFPGGSHTYVWQVLKENGPMASDPLCLTYSYLSHVDLVKDLNSGLIGALLVCREGSLAKEKTQTLHKFILLFAVFDEGKSWHSETKNSLMQDRDAASARAWPKMHTVNGYVNRSLPGLIGCHRKSVYWHVIGMGTTPEVHSIFLEGHTFLVRNHRQASLEISPITFLTAQTLLMDLGQFLLFCHISSHQHDGMEAYVKVDSCPEEPQLRMKNNEEAEDYDDDLTDSEMDVVRFDDDNSPSFIQIRSVAKKHPKTWVHYIAAEEEDWDYAPLVLAPDDRSYKSQYLNNGPQRIGRKYKKVRFMAYTDETFKTREAIQHESGILGPLLYGEVGDTLLIIFKNQASRPYNIYPHGITDVRPLYSRRLPKGVKHLKDFPILPGEIFKYKWTVTVEDGPTKSDPRCLTRYYSSFVNMERDLASGLIGPLLICYKESVDQRGNQIMSDKRNVILFSVFDENRSWYLTENIQRFLPNPAGVQLEDPEFQASNIMHSINGYVFDSLQLSVCLHEVAYWYILSIGAQTDFLSVFFSGYTFKHKMVYEDTLTLFPFSGETVFMSMENPGLWILGCHNSDFRNRGMTALLKVSSCDKNTGDYYEDSYEDISAYLLSKNNAIEPRSFSQNTSESATPESGPGSEPATSGSETPGTSESATPESGPGSEPATSGSETPGTSESATPESGPGTSTEPSEGSAPGSPAGSPTSTEEGTSESATPESGPGSEPATSGSETPGTSESATPESGPGSPAGSPTSTEEGSPAGSPTSTEEGASSPPVLKRHQREITRTTLQSDQEEIDYDDTISVEMKKEDFDIYDEDENQSPRSFQKKTRHYFIAAVERLWDYGMSSSPHVLRNRAQSGSVPQFKKVVFQEFTDGSFTQPLYRGELNEHLGLLGPYIRAEVEDNIMVTFRNQASRPYSFYSSLISYEEDQRQGAEPRKNFVKPNETKTYFWKVQHHMAPTKDEFDCKAWAYFSDVDLEKDVHSGLIGPLLVCHTNTLNPAHGRQVTVQEFALFFTIFDETKSWYFTENMERNCRAPCNIQMEDPTFKENYRFHAINGYIMDTLPGLVMAQDQRIRWYLLSMGSNENIHSIHFSGHVFTVRKKEEYKMALYNLYPGVFETVEMLPSKAGIWRVECLIGEHLHAGMSTLFLVYSNKCQTPLGMASGHIRDFQITASGQYGQWAPKLARLHYSGSINAWSTKEPFSWIKVDLLAPMIIHGIKTQGARQKFSSLYISQFIIMYSLDGKKWQTYRGNSTGTLMVFFGNVDSSGIKHNIFNPPIIARYIRLHPTHYSIRSTLRMELMGCDLNSCSMPLGMESKAISDAQITASSYFTNMFATWSPSKARLHLQGRSNAWRPQVNNPKEWLQVDFQKTMKVTGVTTQGVKSLLTSMYVKEFLISSSQDGHQWTLFFQNGKVKVFQGNQDSFTPVVNSLDPPLLTRYLRIHPQSWVHQIALRMEVLGCEAQDLY-
SEQ ID NO.13： coBDDFVIII6-XTEN-3aa的信號肽 MQIELSTCFFLCLLRFCFS
SEQ ID NO.14： 編碼coBDDFVIII6-3aa的核苷酸序列 ATGCAGATTGAGCTGTCCACTTGTTTCTTCCTGTGCCTCCTGCGCTTCTGTTTCTCCGCCACTCGCCGGTACTACCTTGGAGCCGTGGAGCTTTCATGGGACTACATGCAGAGCGACCTGGGCGAACTCCCCGTGGATGCCAGATTCCCCCCCCGCGTGCCAAAGTCCTTCCCCTTTAACACCTCCGTGGTGTACAAGAAAACCCTCTTTGTCGAGTTCACTGACCACCTGTTCAACATCGCCAAGCCGCGCCCACCTTGGATGGGCCTCCTGGGACCGACCATTCAAGCTGAAGTGTACGACACCGTGGTGATCACCCTGAAGAACATGGCGTCCCACCCCGTGTCCCTGCATGCGGTCGGAGTGTCCTACTGGAAGGCCTCCGAAGGAGCTGAGTACGACGACCAGACTAGCCAGCGGGAAAAGGAGGACGATAAAGTGTTCCCGGGCGGCTCGCATACTTACGTGTGGCAAGTCCTGAAGGAAAACGGACCTATGGCATCCGATCCTCTGTGCCTGACTTACTCCTACCTTTCCCATGTGGACCTCGTGAAGGACCTGAACAGCGGGCTGATTGGTGCACTTCTCGTGTGCCGCGAAGGTTCGCTCGCTAAGGAAAAGACCCAGACCCTCCATAAGTTCATCCTTTTGTTCGCTGTGTTCGATGAAGGAAAGTCATGGCATTCCGAAACTAAGAACTCGCTGATGCAGGACCGGGATGCCGCCTCAGCCCGCGCCTGGCCTAAAATGCATACAGTCAACGGATACGTGAATCGGTCACTGCCCGGGCTCATCGGTTGTCACAGAAAGTCCGTGTACTGGCACGTCATCGGCATGGGCACTACGCCTGAAGTGCACTCCATCTTCCTGGAAGGGCACACCTTCCTCGTGCGCAACCACCGCCAGGCCTCTCTGGAAATCTCCCCGATTACCTTTCTGACCGCCCAGACTCTGCTCATGGACCTGGGGCAGTTCCTTCTCTTCTGCCACATCTCCAGCCATCAGCACGACGGAATGGAGGCCTACGTGAAGGTGGACTCATGCCCGGAAGAACCTCAGTTGCGGATGAAGAACAACGAGGAGGCCGAGGACTATGACGACGATTTGACTGACTCCGAGATGGACGTCGTGCGGTTCGATGACGACAACAGCCCCAGCTTCATCCAGATTCGCAGCGTGGCCAAGAAGCACCCCAAAACCTGGGTGCACTACATCGCGGCCGAGGAAGAAGATTGGGACTACGCCCCGTTGGTGCTGGCACCCGATGACCGGTCGTACAAGTCCCAGTATCTGAACAATGGTCCGCAGCGGATTGGCAGAAAGTACAAGAAAGTGCGGTTCATGGCGTACACTGACGAAACGTTTAAGACCCGGGAGGCCATTCAACATGAGAGCGGCATTCTGGGACCACTGCTGTACGGAGAGGTCGGCGATACCCTGCTCATCATCTTCAAAAACCAGGCCTCCCGGCCTTACAACATCTACCCTCACGGAATCACCGACGTGCGGCCACTCTACTCGCGGCGCCTGCCGAAGGGCGTCAAGCACCTGAAAGACTTCCCTATCCTGCCGGGCGAAATCTTCAAGTATAAGTGGACCGTCACCGTGGAGGACGGGCCCACCAAGAGCGATCCTAGGTGTCTGACTCGGTACTACTCCAGCTTCGTGAACATGGAACGGGACCTGGCATCGGGACTCATTGGACCGCTGCTGATCTGCTACAAAGAGTCGGTGGATCAACGCGGCAACCAGATCATGTCCGACAAGCGCAACGTGATCCTGTTCTCCGTGTTTGATGAAAACAGATCCTGGTACCTCACTGAAAACATCCAGAGGTTCCTCCCAAACCCCGCAGGAGTGCAACTGGAGGACCCTGAGTTTCAGGCCTCGAATATCATGCACTCGATTAACGGTTACGTGTTCGACTCGCTGCAGCTGAGCGTGTGCCTCCATGAAGTCGCTTACTGGTACATTCTGTCCATCGGCGCCCAGACTGACTTCCTGAGCGTGTTCTTTTCCGGTTACACCTTTAAGCACAAGATGGTGTACGAAGATACCCTGACCCTGTTCCCTTTCTCCGGCGAAACGGTGTTCATGTCGATGGAGAACCCGGGTCTGTGGATTCTGGGATGCCACAACAGCGACTTTCGGAACCGCGGAATGACTGCCCTGCTGAAGGTGTCCTCATGCGACAAGAACACCGGAGACTACTACGAGGACTCCTACGAGGATATCTCAGCCTACCTCCTGTCCAAGAACAACGCGATCGAGCCGCGCAGCTTCAGCCAGAACCCGCCTGTGCTGAAGAGGCACCAGCGAGAAATTACCCGGACCACCCTCCAATCGGATCAGGAGGAAATCGACTACGACGACACCATCTCGGTGGAAATGAAGAAGGAAGATTTCGATATCTACGACGAGGACGAAAATCAGTCCCCTCGCTCATTCCAAAAGAAAACTAGACACTACTTTATCGCCGCGGTGGAAAGACTGTGGGACTATGGAATGTCATCCAGCCCTCACGTCCTTCGGAACCGGGCCCAGAGCGGATCGGTGCCTCAGTTCAAGAAAGTGGTGTTCCAGGAGTTCACCGACGGCAGCTTCACCCAGCCGCTGTACCGGGGAGAACTGAACGAACACCTGGGCCTGCTCGGTCCCTACATCCGCGCGGAAGTGGAGGATAACATCATGGTGACCTTCCGTAACCAAGCATCCAGACCTTACTCCTTCTATTCCTCCCTGATCTCATACGAGGAGGACCAGCGCCAAGGCGCCGAGCCCCGCAAGAACTTCGTCAAGCCCAACGAGACTAAGACCTACTTCTGGAAGGTCCAACACCATATGGCCCCGACCAAGGATGAGTTTGACTGCAAGGCCTGGGCCTACTTCTCCGACGTGGACCTTGAGAAGGATGTCCATTCCGGCCTGATCGGGCCGCTGCTCGTGTGTCACACCAACACCCTGAACCCAGCGCATGGACGCCAGGTCACCGTCCAGGAGTTTGCTCTGTTCTTCACCATTTTTGACGAAACTAAGTCCTGGTACTTCACCGAGAATATGGAGCGAAACTGTAGAGCGCCCTGCAATATCCAGATGGAAGATCCGACTTTCAAGGAGAACTATAGATTCCACGCCATCAACGGGTACATCATGGATACTCTGCCGGGGCTGGTCATGGCCCAGGATCAGAGGATTCGGTGGTACTTGCTGTCAATGGGATCGAACGAAAACATTCACTCCATTCACTTCTCCGGTCACGTGTTCACTGTGCGCAAGAAGGAGGAGTACAAGATGGCGCTGTACAATCTGTACCCCGGGGTGTTCGAAACTGTGGAGATGCTGCCGTCCAAGGCCGGCATCTGGAGAGTGGAGTGCCTGATCGGAGAGCACCTCCACGCGGGGATGTCCACCCTCTTCCTGGTGTACTCGAATAAGTGCCAGACCCCGCTGGGCATGGCCTCGGGCCACATCAGAGACTTCCAGATCACAGCAAGCGGACAATACGGCCAATGGGCGCCGAAGCTGGCCCGCTTGCACTACTCCGGATCGATCAACGCATGGTCCACCAAGGAACCGTTCTCGTGGATTAAGGTGGACCTCCTGGCCCCTATGATTATCCACGGAATTAAGACCCAGGGCGCCAGGCAGAAGTTCTCCTCCCTGTACATCTCGCAATTCATCATCATGTACAGCCTGGACGGGAAGAAGTGGCAGACTTACAGGGGAAACTCCACCGGCACCCTGATGGTCTTTTTCGGCAACGTGGATTCCTCCGGCATTAAGCACAACATCTTCAACCCACCGATCATAGCCAGATATATTAGGCTCCACCCCACTCACTACTCAATCCGCTCAACTCTTCGGATGGAACTCATGGGGTGCGACCTGAACTCCTGCTCCATGCCGTTGGGGATGGAATCAAAGGCTATTAGCGACGCCCAGATCACCGCGAGCTCCTACTTCACTAACATGTTCGCCACCTGGAGCCCCTCCAAGGCCAGGCTGCACTTGCAGGGACGGTCAAATGCCTGGCGGCCGCAAGTGAACAATCCGAAGGAATGGCTTCAAGTGGATTTCCAAAAGACCATGAAAGTGACCGGAGTCACCACCCAGGGAGTGAAGTCCCTTCTGACCTCGATGTATGTGAAGGAGTTCCTGATTAGCAGCAGCCAGGACGGGCACCAGTGGACCCTGTTCTTCCAAAACGGAAAGGTCAAGGTGTTCCAGGGGAACCAGGACTCGTTCACACCCGTGGTGAACTCCCTGGACCCCCCACTGCTGACGCGGTACTTGAGGATTCATCCTCAGTCCTGGGTCCATCAGATTGCATTGCGAATGGAAGTCCTGGGCTGCGAGGCCCAGGACCTGTACTGA
SEQ ID NO.15： 胺基酸 coBDDFVIII-3aa的序列 MQIELSTCFFLCLLRFCFSATRRYYLGAVELSWDYMQSDLGELPVDARFPPRVPKSFPFNTSVVYKKTLFVEFTDHLFNIAKPRPPWMGLLGPTIQAEVYDTVVITLKNMASHPVSLHAVGVSYWKASEGAEYDDQTSQREKEDDKVFPGGSHTYVWQVLKENGPMASDPLCLTYSYLSHVDLVKDLNSGLIGALLVCREGSLAKEKTQTLHKFILLFAVFDEGKSWHSETKNSLMQDRDAASARAWPKMHTVNGYVNRSLPGLIGCHRKSVYWHVIGMGTTPEVHSIFLEGHTFLVRNHRQASLEISPITFLTAQTLLMDLGQFLLFCHISSHQHDGMEAYVKVDSCPEEPQLRMKNNEEAEDYDDDLTDSEMDVVRFDDDNSPSFIQIRSVAKKHPKTWVHYIAAEEEDWDYAPLVLAPDDRSYKSQYLNNGPQRIGRKYKKVRFMAYTDETFKTREAIQHESGILGPLLYGEVGDTLLIIFKNQASRPYNIYPHGITDVRPLYSRRLPKGVKHLKDFPILPGEIFKYKWTVTVEDGPTKSDPRCLTRYYSSFVNMERDLASGLIGPLLICYKESVDQRGNQIMSDKRNVILFSVFDENRSWYLTENIQRFLPNPAGVQLEDPEFQASNIMHSINGYVFDSLQLSVCLHEVAYWYILSIGAQTDFLSVFFSGYTFKHKMVYEDTLTLFPFSGETVFMSMENPGLWILGCHNSDFRNRGMTALLKVSSCDKNTGDYYEDSYEDISAYLLSKNNAIEPRSFSQNPPVLKRHQREITRTTLQSDQEEIDYDDTISVEMKKEDFDIYDEDENQSPRSFQKKTRHYFIAAVERLWDYGMSSSPHVLRNRAQSGSVPQFKKVVFQEFTDGSFTQPLYRGELNEHLGLLGPYIRAEVEDNIMVTFRNQASRPYSFYSSLISYEEDQRQGAEPRKNFVKPNETKTYFWKVQHHMAPTKDEFDCKAWAYFSDVDLEKDVHSGLIGPLLVCHTNTLNPAHGRQVTVQEFALFFTIFDETKSWYFTENMERNCRAPCNIQMEDPTFKENYRFHAINGYIMDTLPGLVMAQDQRIRWYLLSMGSNENIHSIHFSGHVFTVRKKEEYKMALYNLYPGVFETVEMLPSKAGIWRVECLIGEHLHAGMSTLFLVYSNKCQTPLGMASGHIRDFQITASGQYGQWAPKLARLHYSGSINAWSTKEPFSWIKVDLLAPMIIHGIKTQGARQKFSSLYISQFIIMYSLDGKKWQTYRGNSTGTLMVFFGNVDSSGIKHNIFNPPIIARYIRLHPTHYSIRSTLRMELMGCDLNSCSMPLGMESKAISDAQITASSYFTNMFATWSPSKARLHLQGRSNAWRPQVNNPKEWLQVDFQKTMKVTGVTTQGVKSLLTSMYVKEFLISSSQDGHQWTLFFQNGKVKVFQGNQDSFTPVVNSLDPPLLTRYLRIHPQSWVHQIALRMEVLGCEAQDLY-
SEQ ID NO:16 coBDDFVIII6-XTEN-3aa的基因表現盒的核苷酸序列 TGGCCATTGCATACGTTGTATCCATATCATAATATGTACATTTATATTGGCTCATGTCCAACATTACCGCCATGTTGACATTGATTATTGACTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGAGTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTGATGCGGTTTTGGCAGTACATCAATGGGCGTGGATAGCGGTTTGACTCACGGGGATTTCCAAGTCTCCACCCCATTGACGTCAATGGGAGTTTGTTTTGGCACCAAAATCAACGGGACTTTCCAAAATGTCGTAACAACTCCGCCCCATTGACGCAAATGGGCGGTAGGCGTGTACGGTGGGAGGTCTATATAAGCAGAGCTCGTTTAGTGAACCGGGGTCTCTCTGGTTAGACCAGATCTGAGCCTGGGAGCTCTCTGGCTAACTAGGGAACCCACTGCTTAAGCCTCAATAAAGCTTGCCTTGAGTGCTTCAAGTAGTGTGTGCCCGTCTGTTGTGTGACTCTGGTAACTAGAGATCCCTCAGACCCTTTTAGTCAGTGTGGAAAATCTCTAGCAGTGGCGCCCGAACAGGGACCTGAAAGCGAAAGGGAAACCAGAGCTCTCTCGACGCAGGACTCGGCTTGCTGAAGCGCGCACGGCAAGAGGCGAGGGGCGGCGACTGGTGAGTACGCCAAAAATTTTGACTAGCGGAGGCTAGAAGGAGAGAGATGGGTGCGAGAGCGTCAGTATTAAGCGGGGGAGAATTAGATCGCGATGGGAAAAAATTCGGTTAAGGCCAGGGGGAAAGAAAAAATATAAATTAAAACATATAGTATGGGCAAGCAGGGAGCTAGAACGATTCGCAGTTAATCCTGGCCTGTTAGAAACATCAGAAGGCTGTAGACAAATACTGGGACAGCTACAACCATCCCTTCAGACAGGATCAGAAGAACTTAGATCATTATATAATACAGTAGCAACCCTCTATTGTGTGCATCAAAGGATAGAGATAAAAGACACCAAGGAAGCTTTAGACAAGATAGAGGAAGAGCAAAACAAAAGTAAGACCACCGCACAGCAAGCGGCCGCTGATCTTCAGACCTGGAGGAGGAGATATGAGGGACAATTGGAGAAGTGAATTATATAAATATAAAGTAGTAAAAATTGAACCATTAGGAGTAGCACCCACCAAGGCAAAGAGAAGAGTGGTGCAGAGAGAAAAAAGAGCAGTGGGAATAGGAGCTTTGTTCCTTGGGTTCTTGGGAGCAGCAGGAAGCACTATGGGCGCAGCCTCAATGACGCTGACGGTACAGGCCAGACAATTATTGTCTGGTATAGTGCAGCAGCAGAACAATTTGCTGAGGGCTATTGAGGCGCAACAGCATCTGTTGCAACTCACAGTCTGGGGCATCAAGCAGCTCCAGGCAAGAATCCTGGCTGTGGAAAGATACCTAAAGGATCAACAGCTCCTGGGGATTTGGGGTTGCTCTGGAAAACTCATTTGCACCACTGCTGTGCCTTGGAATGCTAGTTGGAGTAATAAATCTCTGGAACAGATTTGGAATCACACGACCTGGATGGAGTGGGACAGAGAAATTAACAATTACACAAGCTTAATACACTCCTTAATTGAAGAATCGCAAAACCAGCAAGAAAAGAATGAACAAGAATTATTGGAATTAGATAAATGGGCAAGTTTGTGGAATTGGTTTAACATAACAAATTGGCTGTGGTATATAAAATTATTCATAATGATAGTAGGAGGCTTGGTAGGTTTAAGAATAGTTTTTGCTGTACTTTCTATAGTGAATAGAGTTAGGCAGGGATATTCACCATTATCGTTTCAGACCCACCTCCCAACCCCGAGGGGACCCGACAGGCCCGAAGGAATAGAAGAAGAAGGTGGAGAGAGAGACAGAGACAGATCCATTCGATTAGTGAACGGATCTCGACGGTATCGGTTAACTTTTAAAAGAAAAGGGGGGATTGGGGGGTACAGTGCAGGGGAAAGAATAGTAGACATAATAGCAACAGACATACAAACTAAAGAATTACAAAAACAAATTACAAAAATTCAAAATTTTATCGATCACGAGACTAGCCTCGAGCACGCGAGTTAATAATTACCAGCGCGGGCCAAATAAATAATCCGCGAGGGGCAGGTGACGTTTGCCCAGCGCGCGCTGGTAATTATTAACCTCGCGAATATTGATTCGAGGCCGCGATTGCCGCAATCGCGAGGGGCAGGTGACCTTTGCCCAGCGCGCGTTCGCCCCGCCCCGGACGGTATCGATAAGCTTAGGAGCTTGGGCTGCAGGTCGAGGGCACTGGGAGGATGTTGAGTAAGATGGAAAACTACTGATGACCCTTGCAGAGACAGAGTATTAGGACATGTTTGAACAGGGGCCGGGCGATCAGCAGGTAGCTCTAGAGGATCCCCGTCTGTCTGCACATTTCGTAGAGCGAGTGTTCCGATACTCTAATCTCCCTAGGCAAGGTTCATATTTGTGTAGGTTACTTATTCTCCTTTTGTTGACTAAGTCAATAATCAGAATCAGCAGGTTTGGAGTCAGCTTGGCAGGGATCAGCAGCCTGGGTTGGAAGGAGGGGGTATAAAAGCCCCTTCACCAGGAGAAGCCGTCACACAGATCCACAAGCTCCTGGCTAGCGCCACCATGCAGATTGAGCTGTCCACTTGTTTCTTCCTGTGCCTCCTGCGCTTCTGTTTCTCCGCCACTCGCCGGTACTACCTTGGAGCCGTGGAGCTTTCATGGGACTACATGCAGAGCGACCTGGGCGAACTCCCCGTGGATGCCAGATTCCCCCCCCGCGTGCCAAAGTCCTTCCCCTTTAACACCTCCGTGGTGTACAAGAAAACCCTCTTTGTCGAGTTCACTGACCACCTGTTCAACATCGCCAAGCCGCGCCCACCTTGGATGGGCCTCCTGGGACCGACCATTCAAGCTGAAGTGTACGACACCGTGGTGATCACCCTGAAGAACATGGCGTCCCACCCCGTGTCCCTGCATGCGGTCGGAGTGTCCTACTGGAAGGCCTCCGAAGGAGCTGAGTACGACGACCAGACTAGCCAGCGGGAAAAGGAGGACGATAAAGTGTTCCCGGGCGGCTCGCATACTTACGTGTGGCAAGTCCTGAAGGAAAACGGACCTATGGCATCCGATCCTCTGTGCCTGACTTACTCCTACCTTTCCCATGTGGACCTCGTGAAGGACCTGAACAGCGGGCTGATTGGTGCACTTCTCGTGTGCCGCGAAGGTTCGCTCGCTAAGGAAAAGACCCAGACCCTCCATAAGTTCATCCTTTTGTTCGCTGTGTTCGATGAAGGAAAGTCATGGCATTCCGAAACTAAGAACTCGCTGATGCAGGACCGGGATGCCGCCTCAGCCCGCGCCTGGCCTAAAATGCATACAGTCAACGGATACGTGAATCGGTCACTGCCCGGGCTCATCGGTTGTCACAGAAAGTCCGTGTACTGGCACGTCATCGGCATGGGCACTACGCCTGAAGTGCACTCCATCTTCCTGGAAGGGCACACCTTCCTCGTGCGCAACCACCGCCAGGCCTCTCTGGAAATCTCCCCGATTACCTTTCTGACCGCCCAGACTCTGCTCATGGACCTGGGGCAGTTCCTTCTCTTCTGCCACATCTCCAGCCATCAGCACGACGGAATGGAGGCCTACGTGAAGGTGGACTCATGCCCGGAAGAACCTCAGTTGCGGATGAAGAACAACGAGGAGGCCGAGGACTATGACGACGATTTGACTGACTCCGAGATGGACGTCGTGCGGTTCGATGACGACAACAGCCCCAGCTTCATCCAGATTCGCAGCGTGGCCAAGAAGCACCCCAAAACCTGGGTGCACTACATCGCGGCCGAGGAAGAAGATTGGGACTACGCCCCGTTGGTGCTGGCACCCGATGACCGGTCGTACAAGTCCCAGTATCTGAACAATGGTCCGCAGCGGATTGGCAGAAAGTACAAGAAAGTGCGGTTCATGGCGTACACTGACGAAACGTTTAAGACCCGGGAGGCCATTCAACATGAGAGCGGCATTCTGGGACCACTGCTGTACGGAGAGGTCGGCGATACCCTGCTCATCATCTTCAAAAACCAGGCCTCCCGGCCTTACAACATCTACCCTCACGGAATCACCGACGTGCGGCCACTCTACTCGCGGCGCCTGCCGAAGGGCGTCAAGCACCTGAAAGACTTCCCTATCCTGCCGGGCGAAATCTTCAAGTATAAGTGGACCGTCACCGTGGAGGACGGGCCCACCAAGAGCGATCCTAGGTGTCTGACTCGGTACTACTCCAGCTTCGTGAACATGGAACGGGACCTGGCATCGGGACTCATTGGACCGCTGCTGATCTGCTACAAAGAGTCGGTGGATCAACGCGGCAACCAGATCATGTCCGACAAGCGCAACGTGATCCTGTTCTCCGTGTTTGATGAAAACAGATCCTGGTACCTCACTGAAAACATCCAGAGGTTCCTCCCAAACCCCGCAGGAGTGCAACTGGAGGACCCTGAGTTTCAGGCCTCGAATATCATGCACTCGATTAACGGTTACGTGTTCGACTCGCTGCAGCTGAGCGTGTGCCTCCATGAAGTCGCTTACTGGTACATTCTGTCCATCGGCGCCCAGACTGACTTCCTGAGCGTGTTCTTTTCCGGTTACACCTTTAAGCACAAGATGGTGTACGAAGATACCCTGACCCTGTTCCCTTTCTCCGGCGAAACGGTGTTCATGTCGATGGAGAACCCGGGTCTGTGGATTCTGGGATGCCACAACAGCGACTTTCGGAACCGCGGAATGACTGCCCTGCTGAAGGTGTCCTCATGCGACAAGAACACCGGAGACTACTACGAGGACTCCTACGAGGATATCTCAGCCTACCTCCTGTCCAAGAACAACGCGATCGAGCCGCGCAGCTTCAGCCAGAACACATCAGAGAGCGCCACCCCTGAAAGTGGTCCCGGGAGCGAGCCAGCCACATCTGGGTCGGAAACGCCAGGCACAAGTGAGTCTGCAACTCCCGAGTCCGGACCTGGCTCCGAGCCTGCCACTAGCGGCTCCGAGACTCCGGGAACTTCCGAGAGCGCTACACCAGAAAGCGGACCCGGAACCAGTACCGAACCTAGCGAGGGCTCTGCTCCGGGCAGCCCAGCCGGCTCTCCTACATCCACGGAGGAGGGCACTTCCGAATCCGCCACCCCGGAGTCAGGGCCAGGATCTGAACCCGCTACCTCAGGCAGTGAGACGCCAGGAACGAGCGAGTCCGCTACACCGGAGAGTGGGCCAGGGAGCCCTGCTGGATCTCCTACGTCCACTGAGGAAGGGTCACCAGCGGGCTCGCCCACCAGCACTGAAGAAGGTGCCTCGAGCCCGCCTGTGCTGAAGAGGCACCAGCGAGAAATTACCCGGACCACCCTCCAATCGGATCAGGAGGAAATCGACTACGACGACACCATCTCGGTGGAAATGAAGAAGGAAGATTTCGATATCTACGACGAGGACGAAAATCAGTCCCCTCGCTCATTCCAAAAGAAAACTAGACACTACTTTATCGCCGCGGTGGAAAGACTGTGGGACTATGGAATGTCATCCAGCCCTCACGTCCTTCGGAACCGGGCCCAGAGCGGATCGGTGCCTCAGTTCAAGAAAGTGGTGTTCCAGGAGTTCACCGACGGCAGCTTCACCCAGCCGCTGTACCGGGGAGAACTGAACGAACACCTGGGCCTGCTCGGTCCCTACATCCGCGCGGAAGTGGAGGATAACATCATGGTGACCTTCCGTAACCAAGCATCCAGACCTTACTCCTTCTATTCCTCCCTGATCTCATACGAGGAGGACCAGCGCCAAGGCGCCGAGCCCCGCAAGAACTTCGTCAAGCCCAACGAGACTAAGACCTACTTCTGGAAGGTCCAACACCATATGGCCCCGACCAAGGATGAGTTTGACTGCAAGGCCTGGGCCTACTTCTCCGACGTGGACCTTGAGAAGGATGTCCATTCCGGCCTGATCGGGCCGCTGCTCGTGTGTCACACCAACACCCTGAACCCAGCGCATGGACGCCAGGTCACCGTCCAGGAGTTTGCTCTGTTCTTCACCATTTTTGACGAAACTAAGTCCTGGTACTTCACCGAGAATATGGAGCGAAACTGTAGAGCGCCCTGCAATATCCAGATGGAAGATCCGACTTTCAAGGAGAACTATAGATTCCACGCCATCAACGGGTACATCATGGATACTCTGCCGGGGCTGGTCATGGCCCAGGATCAGAGGATTCGGTGGTACTTGCTGTCAATGGGATCGAACGAAAACATTCACTCCATTCACTTCTCCGGTCACGTGTTCACTGTGCGCAAGAAGGAGGAGTACAAGATGGCGCTGTACAATCTGTACCCCGGGGTGTTCGAAACTGTGGAGATGCTGCCGTCCAAGGCCGGCATCTGGAGAGTGGAGTGCCTGATCGGAGAGCACCTCCACGCGGGGATGTCCACCCTCTTCCTGGTGTACTCGAATAAGTGCCAGACCCCGCTGGGCATGGCCTCGGGCCACATCAGAGACTTCCAGATCACAGCAAGCGGACAATACGGCCAATGGGCGCCGAAGCTGGCCCGCTTGCACTACTCCGGATCGATCAACGCATGGTCCACCAAGGAACCGTTCTCGTGGATTAAGGTGGACCTCCTGGCCCCTATGATTATCCACGGAATTAAGACCCAGGGCGCCAGGCAGAAGTTCTCCTCCCTGTACATCTCGCAATTCATCATCATGTACAGCCTGGACGGGAAGAAGTGGCAGACTTACAGGGGAAACTCCACCGGCACCCTGATGGTCTTTTTCGGCAACGTGGATTCCTCCGGCATTAAGCACAACATCTTCAACCCACCGATCATAGCCAGATATATTAGGCTCCACCCCACTCACTACTCAATCCGCTCAACTCTTCGGATGGAACTCATGGGGTGCGACCTGAACTCCTGCTCCATGCCGTTGGGGATGGAATCAAAGGCTATTAGCGACGCCCAGATCACCGCGAGCTCCTACTTCACTAACATGTTCGCCACCTGGAGCCCCTCCAAGGCCAGGCTGCACTTGCAGGGACGGTCAAATGCCTGGCGGCCGCAAGTGAACAATCCGAAGGAATGGCTTCAAGTGGATTTCCAAAAGACCATGAAAGTGACCGGAGTCACCACCCAGGGAGTGAAGTCCCTTCTGACCTCGATGTATGTGAAGGAGTTCCTGATTAGCAGCAGCCAGGACGGGCACCAGTGGACCCTGTTCTTCCAAAACGGAAAGGTCAAGGTGTTCCAGGGGAACCAGGACTCGTTCACACCCGTGGTGAACTCCCTGGACCCCCCACTGCTGACGCGGTACTTGAGGATTCATCCTCAGTCCTGGGTCCATCAGATTGCATTGCGAATGGAAGTCCTGGGCTGCGAGGCCCAGGACCTGTACTGA
SEQ ID NO:17 BDD成熟人FVIII的胺基酸序列 ATRRYYLGAVELSWDYMQSDLGELPVDARFPPRVPKSFPFNTSVVYKKTLFVEFTDHLFNIAKPRPPWMGLLGPTIQAEVYDTVVITLKNMASHPVSLHAVGVSYWKASEGAEYDDQTSQREKEDDKVFPGGSHTYVWQVLKENGPMASDPLCLTYSYLSHVDLVKDLNSGLIGALLVCREGSLAKEKTQTLHKFILLFAVFDEGKSWHSETKNSLMQDRDAASARAWPKMHTVNGYVNRSLPGLIGCHRKSVYWHVIGMGTTPEVHSIFLEGHTFLVRNHRQASLEISPITFLTAQTLLMDLGQFLLFCHISSHQHDGMEAYVKVDSCPEEPQLRMKNNEEAEDYDDDLTDSEMDVVRFDDDNSPSFIQIRSVAKKHPKTWVHYIAAEEEDWDYAPLVLAPDDRSYKSQYLNNGPQRIGRKYKKVRFMAYTDETFKTREAIQHESGILGPLLYGEVGDTLLIIFKNQASRPYNIYPHGITDVRPLYSRRLPKGVKHLKDFPILPGEIFKYKWTVTVEDGPTKSDPRCLTRYYSSFVNMERDLASGLIGPLLICYKESVDQRGNQIMSDKRNVILFSVFDENRSWYLTENIQRFLPNPAGVQLEDPEFQASNIMHSINGYVFDSLQLSVCLHEVAYWYILSIGAQTDFLSVFFSGYTFKHKMVYEDTLTLFPFSGETVFMSMENPGLWILGCHNSDFRNRGMTALLKVSSCDKNTGDYYEDSYEDISAYLLSKNNAIEPRSFSQNPPVLKRHQREITRTTLQSDQEEIDYDDTISVEMKKEDFDIYDEDENQSPRSFQKKTRHYFIAAVERLWDYGMSSSPHVLRNRAQSGSVPQFKKVVFQEFTDGSFTQPLYRGELNEHLGLLGPYIRAEVEDNIMVTFRNQASRPYSFYSSLISYEEDQRQGAEPRKNFVKPNETKTYFWKVQHHMAPTKDEFDCKAWAYFSDVDLEKDVHSGLIGPLLVCHTNTLNPAHGRQVTVQEFALFFTIFDETKSWYFTENMERNCRAPCNIQMEDPTFKENYRFHAINGYIMDTLPGLVMAQDQRIRWYLLSMGSNENIHSIHFSGHVFTVRKKEEYKMALYNLYPGVFETVEMLPSKAGIWRVECLIGEHLHAGMSTLFLVYSNKCQTPLGMASGHIRDFQITASGQYGQWAPKLARLHYSGSINAWSTKEPFSWIKVDLLAPMIIHGIKTQGARQKFSSLYISQFIIMYSLDGKKWQTYRGNSTGTLMVFFGNVDSSGIKHNIFNPPIIARYIRLHPTHYSIRSTLRMELMGCDLNSCSMPLGMESKAISDAQITASSYFTNMFATWSPSKARLHLQGRSNAWRPQVNNPKEWLQVDFQKTMKVTGVTTQGVKSLLTSMYVKEFLISSSQDGHQWTLFFQNGKVKVFQGNQDSFTPVVNSLDPPLLTRYLRIHPQSWVHQIALRMEVLGCEAQDLY
SEQ ID NO:18 編碼野生型人FVIII的核酸序列 ATGCAAATAGAGCTCTCCACCTGCTTCTTTCTGTGCCTTTTGCGATTCTGCTTTAGTGCCACCAGAAGATACTACCTGGGTGCAGTGGAACTGTCATGGGACTATATGCAAAGTGATCTCGGTGAGCTGCCTGTGGACGCAAGATTTCCTCCTAGAGTGCCAAAATCTTTTCCATTCAACACCTCAGTCGTGTACAAAAAGACTCTGTTTGTAGAATTCACGGATCACCTTTTCAACATCGCTAAGCCAAGGCCACCCTGGATGGGTCTGCTAGGTCCTACCATCCAGGCTGAGGTTTATGATACAGTGGTCATTACACTTAAGAACATGGCTTCCCATCCTGTCAGTCTTCATGCTGTTGGTGTATCCTACTGGAAAGCTTCTGAGGGAGCTGAATATGATGATCAGACCAGTCAAAGGGAGAAAGAAGATGATAAAGTCTTCCCTGGTGGAAGCCATACATATGTCTGGCAGGTCCTGAAAGAGAATGGTCCAATGGCCTCTGACCCACTGTGCCTTACCTACTCATATCTTTCTCATGTGGACCTGGTAAAAGACTTGAATTCAGGCCTCATTGGAGCCCTACTAGTATGTAGAGAAGGGAGTCTGGCCAAGGAAAAGACACAGACCTTGCACAAATTTATACTACTTTTTGCTGTATTTGATGAAGGGAAAAGTTGGCACTCAGAAACAAAGAACTCCTTGATGCAGGATAGGGATGCTGCATCTGCTCGGGCCTGGCCTAAAATGCACACAGTCAATGGTTATGTAAACAGGTCTCTGCCAGGTCTGATTGGATGCCACAGGAAATCAGTCTATTGGCATGTGATTGGAATGGGCACCACTCCTGAAGTGCACTCAATATTCCTCGAAGGTCACACATTTCTTGTGAGGAACCATCGCCAGGCGTCCTTGGAAATCTCGCCAATAACTTTCCTTACTGCTCAAACACTCTTGATGGACCTTGGACAGTTTCTACTGTTTTGTCATATCTCTTCCCACCAACATGATGGCATGGAAGCTTATGTCAAAGTAGACAGCTGTCCAGAGGAACCCCAACTACGAATGAAAAATAATGAAGAAGCGGAAGACTATGATGATGATCTTACTGATTCTGAAATGGATGTGGTCAGGTTTGATGATGACAACTCTCCTTCCTTTATCCAAATTCGCTCAGTTGCCAAGAAGCATCCTAAAACTTGGGTACATTACATTGCTGCTGAAGAGGAGGACTGGGACTATGCTCCCTTAGTCCTCGCCCCCGATGACAGAAGTTATAAAAGTCAATATTTGAACAATGGCCCTCAGCGGATTGGTAGGAAGTACAAAAAAGTCCGATTTATGGCATACACAGATGAAACCTTTAAGACTCGTGAAGCTATTCAGCATGAATCAGGAATCTTGGGACCTTTACTTTATGGGGAAGTTGGAGACACACTGTTGATTATATTTAAGAATCAAGCAAGCAGACCATATAACATCTACCCTCACGGAATCACTGATGTCCGTCCTTTGTATTCAAGGAGATTACCAAAAGGTGTAAAACATTTGAAGGATTTTCCAATTCTGCCAGGAGAAATATTCAAATATAAATGGACAGTGACTGTAGAAGATGGGCCAACTAAATCAGATCCTCGGTGCCTGACCCGCTATTACTCTAGTTTCGTTAATATGGAGAGAGATCTAGCTTCAGGACTCATTGGCCCTCTCCTCATCTGCTACAAAGAATCTGTAGATCAAAGAGGAAACCAGATAATGTCAGACAAGAGGAATGTCATCCTGTTTTCTGTATTTGATGAGAACCGAAGCTGGTACCTCACAGAGAATATACAACGCTTTCTCCCCAATCCAGCTGGAGTGCAGCTTGAGGATCCAGAGTTCCAAGCCTCCAACATCATGCACAGCATCAATGGCTATGTTTTTGATAGTTTGCAGTTGTCAGTTTGTTTGCATGAGGTGGCATACTGGTACATTCTAAGCATTGGAGCACAGACTGACTTCCTTTCTGTCTTCTTCTCTGGATATACCTTCAAACACAAAATGGTCTATGAAGACACACTCACCCTATTCCCATTCTCAGGAGAAACTGTCTTCATGTCGATGGAAAACCCAGGTCTATGGATTCTGGGGTGCCACAACTCAGACTTTCGGAACAGAGGCATGACCGCCTTACTGAAGGTTTCTAGTTGTGACAAGAACACTGGTGATTATTACGAGGACAGTTATGAAGATATTTCAGCATACTTGCTGAGTAAAAACAATGCCATTGAACCAAGAAGCTTCTCCCAGAATTCAAGACACCCTAGCACTAGGCAAAAGCAATTTAATGCCACCACAATTCCAGAAAATGACATAGAGAAGACTGACCCTTGGTTTGCACACAGAACACCTATGCCTAAAATACAAAATGTCTCCTCTAGTGATTTGTTGATGCTCTTGCGACAGAGTCCTACTCCACATGGGCTATCCTTATCTGATCTCCAAGAAGCCAAATATGAGACTTTTTCTGATGATCCATCACCTGGAGCAATAGACAGTAATAACAGCCTGTCTGAAATGACACACTTCAGGCCACAGCTCCATCACAGTGGGGACATGGTATTTACCCCTGAGTCAGGCCTCCAATTAAGATTAAATGAGAAACTGGGGACAACTGCAGCAACAGAGTTGAAGAAACTTGATTTCAAAGTTTCTAGTACATCAAATAATCTGATTTCAACAATTCCATCAGACAATTTGGCAGCAGGTACTGATAATACAAGTTCCTTAGGACCCCCAAGTATGCCAGTTCATTATGATAGTCAATTAGATACCACTCTATTTGGCAAAAAGTCATCTCCCCTTACTGAGTCTGGTGGACCTCTGAGCTTGAGTGAAGAAAATAATGATTCAAAGTTGTTAGAATCAGGTTTAATGAATAGCCAAGAAAGTTCATGGGGAAAAAATGTATCGTCAACAGAGAGTGGTAGGTTATTTAAAGGGAAAAGAGCTCATGGACCTGCTTTGTTGACTAAAGATAATGCCTTATTCAAAGTTAGCATCTCTTTGTTAAAGACAAACAAAACTTCCAATAATTCAGCAACTAATAGAAAGACTCACATTGATGGCCCATCATTATTAATTGAGAATAGTCCATCAGTCTGGCAAAATATATTAGAAAGTGACACTGAGTTTAAAAAAGTGACACCTTTGATTCATGACAGAATGCTTATGGACAAAAATGCTACAGCTTTGAGGCTAAATCATATGTCAAATAAAACTACTTCATCAAAAAACATGGAAATGGTCCAACAGAAAAAAGAGGGCCCCATTCCACCAGATGCACAAAATCCAGATATGTCGTTCTTTAAGATGCTATTCTTGCCAGAATCAGCAAGGTGGATACAAAGGACTCATGGAAAGAACTCTCTGAACTCTGGGCAAGGCCCCAGTCCAAAGCAATTAGTATCCTTAGGACCAGAAAAATCTGTGGAAGGTCAGAATTTCTTGTCTGAGAAAAACAAAGTGGTAGTAGGAAAGGGTGAATTTACAAAGGACGTAGGACTCAAAGAGATGGTTTTTCCAAGCAGCAGAAACCTATTTCTTACTAACTTGGATAATTTACATGAAAATAATACACACAATCAAGAAAAAAAAATTCAGGAAGAAATAGAAAAGAAGGAAACATTAATCCAAGAGAATGTAGTTTTGCCTCAGATACATACAGTGACTGGCACTAAGAATTTCATGAAGAACCTTTTCTTACTGAGCACTAGGCAAAATGTAGAAGGTTCATATGACGGGGCATATGCTCCAGTACTTCAAGATTTTAGGTCATTAAATGATTCAACAAATAGAACAAAGAAACACACAGCTCATTTCTCAAAAAAAGGGGAGGAAGAAAACTTGGAAGGCTTGGGAAATCAAACCAAGCAAATTGTAGAGAAATATGCATGCACCACAAGGATATCTCCTAATACAAGCCAGCAGAATTTTGTCACGCAACGTAGTAAGAGAGCTTTGAAACAATTCAGACTCCCACTAGAAGAAACAGAACTTGAAAAAAGGATAATTGTGGATGACACCTCAACCCAGTGGTCCAAAAACATGAAACATTTGACCCCGAGCACCCTCACACAGATAGACTACAATGAGAAGGAGAAAGGGGCCATTACTCAGTCTCCCTTATCAGATTGCCTTACGAGGAGTCATAGCATCCCTCAAGCAAATAGATCTCCATTACCCATTGCAAAGGTATCATCATTTCCATCTATTAGACCTATATATCTGACCAGGGTCCTATTCCAAGACAACTCTTCTCATCTTCCAGCAGCATCTTATAGAAAGAAAGATTCTGGGGTCCAAGAAAGCAGTCATTTCTTACAAGGAGCCAAAAAAAATAACCTTTCTTTAGCCATTCTAACCTTGGAGATGACTGGTGATCAAAGAGAGGTTGGCTCCCTGGGGACAAGTGCCACAAATTCAGTCACATACAAGAAAGTTGAGAACACTGTTCTCCCGAAACCAGACTTGCCCAAAACATCTGGCAAAGTTGAATTGCTTCCAAAAGTTCACATTTATCAGAAGGACCTATTCCCTACGGAAACTAGCAATGGGTCTCCTGGCCATCTGGATCTCGTGGAAGGGAGCCTTCTTCAGGGAACAGAGGGAGCGATTAAGTGGAATGAAGCAAACAGACCTGGAAAAGTTCCCTTTCTGAGAGTAGCAACAGAAAGCTCTGCAAAGACTCCCTCCAAGCTATTGGATCCTCTTGCTTGGGATAACCACTATGGTACTCAGATACCAAAAGAAGAGTGGAAATCCCAAGAGAAGTCACCAGAAAAAACAGCTTTTAAGAAAAAGGATACCATTTTGTCCCTGAACGCTTGTGAAAGCAATCATGCAATAGCAGCAATAAATGAGGGACAAAATAAGCCCGAAATAGAAGTCACCTGGGCAAAGCAAGGTAGGACTGAAAGGCTGTGCTCTCAAAACCCACCAGTCTTGAAACGCCATCAACGGGAAATAACTCGTACTACTCTTCAGTCAGATCAAGAGGAAATTGACTATGATGATACCATATCAGTTGAAATGAAGAAGGAAGATTTTGACATTTATGATGAGGATGAAAATCAGAGCCCCCGCAGCTTTCAAAAGAAAACACGACACTATTTTATTGCTGCAGTGGAGAGGCTCTGGGATTATGGGATGAGTAGCTCCCCACATGTTCTAAGAAACAGGGCTCAGAGTGGCAGTGTCCCTCAGTTCAAGAAAGTTGTTTTCCAGGAATTTACTGATGGCTCCTTTACTCAGCCCTTATACCGTGGAGAACTAAATGAACATTTGGGACTCCTGGGGCCATATATAAGAGCAGAAGTTGAAGATAATATCATGGTAACTTTCAGAAATCAGGCCTCTCGTCCCTATTCCTTCTATTCTAGCCTTATTTCTTATGAGGAAGATCAGAGGCAAGGAGCAGAACCTAGAAAAAACTTTGTCAAGCCTAATGAAACCAAAACTTACTTTTGGAAAGTGCAACATCATATGGCACCCACTAAAGATGAGTTTGACTGCAAAGCCTGGGCTTATTTCTCTGATGTTGACCTGGAAAAAGATGTGCACTCAGGCCTGATTGGACCCCTTCTGGTCTGCCACACTAACACACTGAACCCTGCTCATGGGAGACAAGTGACAGTACAGGAATTTGCTCTGTTTTTCACCATCTTTGATGAGACCAAAAGCTGGTACTTCACTGAAAATATGGAAAGAAACTGCAGGGCTCCCTGCAATATCCAGATGGAAGATCCCACTTTTAAAGAGAATTATCGCTTCCATGCAATCAATGGCTACATAATGGATACACTACCTGGCTTAGTAATGGCTCAGGATCAAAGGATTCGATGGTATCTGCTCAGCATGGGCAGCAATGAAAACATCCATTCTATTCATTTCAGTGGACATGTGTTCACTGTACGAAAAAAAGAGGAGTATAAAATGGCACTGTACAATCTCTATCCAGGTGTTTTTGAGACAGTGGAAATGTTACCATCCAAAGCTGGAATTTGGCGGGTGGAATGCCTTATTGGCGAGCATCTACATGCTGGGATGAGCACACTTTTTCTGGTGTACAGCAATAAGTGTCAGACTCCCCTGGGAATGGCTTCTGGACACATTAGAGATTTTCAGATTACAGCTTCAGGACAATATGGACAGTGGGCCCCAAAGCTGGCCAGACTTCATTATTCCGGATCAATCAATGCCTGGAGCACCAAGGAGCCCTTTTCTTGGATCAAGGTGGATCTGTTGGCACCAATGATTATTCACGGCATCAAGACCCAGGGTGCCCGTCAGAAGTTCTCCAGCCTCTACATCTCTCAGTTTATCATCATGTATAGTCTTGATGGGAAGAAGTGGCAGACTTATCGAGGAAATTCCACTGGAACCTTAATGGTCTTCTTTGGCAATGTGGATTCATCTGGGATAAAACACAATATTTTTAACCCTCCAATTATTGCTCGATACATCCGTTTGCACCCAACTCATTATAGCATTCGCAGCACTCTTCGCATGGAGTTGATGGGCTGTGATTTAAATAGTTGCAGCATGCCATTGGGAATGGAGAGTAAAGCAATATCAGATGCACAGATTACTGCTTCATCCTACTTTACCAATATGTTTGCCACCTGGTCTCCTTCAAAAGCTCGACTTCACCTCCAAGGGAGGAGTAATGCCTGGAGACCTCAGGTGAATAATCCAAAAGAGTGGCTGCAAGTGGACTTCCAGAAGACAATGAAAGTCACAGGAGTAACTACTCAGGGAGTAAAATCTCTGCTTACCAGCATGTATGTGAAGGAGTTCCTCATCTCCAGCAGTCAAGATGGCCATCAGTGGACTCTCTTTTTTCAGAATGGCAAAGTAAAGGTTTTTCAGGGAAATCAAGACTCCTTCACACCTGTGGTGAACTCTCTAGACCCACCGTTACTGACTCGCTACCTTCGAATTCACCCCCAGAGTTGGGTGCACCAGATTGCCCTGAGGATGGAGGTTCTGGGCTGCGAGGCACAGGACCTCTAC
SEQ ID NO:19 野生型人成熟FVIII蛋白的胺基酸序列 ATRRYYLGAVELSWDYMQSDLGELPVDARFPPRVPKSFPFNTSVVYKKTLFVEFTDHLFNIAKPRPPWMGLLGPTIQAEVYDTVVITLKNMASHPVSLHAVGVSYWKASEGAEYDDQTSQREKEDDKVFPGGSHTYVWQVLKENGPMASDPLCLTYSYLSHVDLVKDLNSGLIGALLVCREGSLAKEKTQTLHKFILLFAVFDEGKSWHSETKNSLMQDRDAASARAWPKMHTVNGYVNRSLPGLIGCHRKSVYWHVIGMGTTPEVHSIFLEGHTFLVRNHRQASLEISPITFLTAQTLLMDLGQFLLFCHISSHQHDGMEAYVKVDSCPEEPQLRMKNNEEAEDYDDDLTDSEMDVVRFDDDNSPSFIQIRSVAKKHPKTWVHYIAAEEEDWDYAPLVLAPDDRSYKSQYLNNGPQRIGRKYKKVRFMAYTDETFKTREAIQHESGILGPLLYGEVGDTLLIIFKNQASRPYNIYPHGITDVRPLYSRRLPKGVKHLKDFPILPGEIFKYKWTVTVEDGPTKSDPRCLTRYYSSFVNMERDLASGLIGPLLICYKESVDQRGNQIMSDKRNVILFSVFDENRSWYLTENIQRFLPNPAGVQLEDPEFQASNIMHSINGYVFDSLQLSVCLHEVAYWYILSIGAQTDFLSVFFSGYTFKHKMVYEDTLTLFPFSGETVFMSMENPGLWILGCHNSDFRNRGMTALLKVSSCDKNTGDYYEDSYEDISAYLLSKNNAIEPRSFSQNSRHPSTRQKQFNATTIPENDIEKTDPWFAHRTPMPKIQNVSSSDLLMLLRQSPTPHGLSLSDLQEAKYETFSDDPSPGAIDSNNSLSEMTHFRPQLHHSGDMVFTPESGLQLRLNEKLGTTAATELKKLDFKVSSTSNNLISTIPSDNLAAGTDNTSSLGPPSMPVHYDSQLDTTLFGKKSSPLTESGGPLSLSEENNDSKLLESGLMNSQESSWGKNVSSTESGRLFKGKRAHGPALLTKDNALFKVSISLLKTNKTSNNSATNRKTHIDGPSLLIENSPSVWQNILESDTEFKKVTPLIHDRMLMDKNATALRLNHMSNKTTSSKNMEMVQQKKEGPIPPDAQNPDMSFFKMLFLPESARWIQRTHGKNSLNSGQGPSPKQLVSLGPEKSVEGQNFLSEKNKVVVGKGEFTKDVGLKEMVFPSSRNLFLTNLDNLHENNTHNQEKKIQEEIEKKETLIQENVVLPQIHTVTGTKNFMKNLFLLSTRQNVEGSYDGAYAPVLQDFRSLNDSTNRTKKHTAHFSKKGEEENLEGLGNQTKQIVEKYACTTRISPNTSQQNFVTQRSKRALKQFRLPLEETELEKRIIVDDTSTQWSKNMKHLTPSTLTQIDYNEKEKGAITQSPLSDCLTRSHSIPQANRSPLPIAKVSSFPSIRPIYLTRVLFQDNSSHLPAASYRKKDSGVQESSHFLQGAKKNNLSLAILTLEMTGDQREVGSLGTSATNSVTYKKVENTVLPKPDLPKTSGKVELLPKVHIYQKDLFPTETSNGSPGHLDLVEGSLLQGTEGAIKWNEANRPGKVPFLRVATESSAKTPSKLLDPLAWDNHYGTQIPKEEWKSQEKSPEKTAFKKKDTILSLNACESNHAIAAINEGQNKPEIEVTWAKQGRTERLCSQNPPVLKRHQREITRTTLQSDQEEIDYDDTISVEMKKEDFDIYDEDENQSPRSFQKKTRHYFIAAVERLWDYGMSSSPHVLRNRAQSGSVPQFKKVVFQEFTDGSFTQPLYRGELNEHLGLLGPYIRAEVEDNIMVTFRNQASRPYSFYSSLISYEEDQRQGAEPRKNFVKPNETKTYFWKVQHHMAPTKDEFDCKAWAYFSDVDLEKDVHSGLIGPLLVCHTNTLNPAHGRQVTVQEFALFFTIFDETKSWYFTENMERNCRAPCNIQMEDPTFKENYRFHAINGYIMDTLPGLVMAQDQRIRWYLLSMGSNENIHSIHFSGHVFTVRKKEEYKMALYNLYPGVFETVEMLPSKAGIWRVECLIGEHLHAGMSTLFLVYSNKCQTPLGMASGHIRDFQITASGQYGQWAPKLARLHYSGSINAWSTKEPFSWIKVDLLAPMIIHGIKTQGARQKFSSLYISQFIIMYSLDGKKWQTYRGNSTGTLMVFFGNVDSSGIKHNIFNPPIIARYIRLHPTHYSIRSTLRMELMGCDLNSCSMPLGMESKAISDAQITASSYFTNMFATWSPSKARLHLQGRSNAWRPQVNNPKEWLQVDFQKTMKVTGVTTQGVKSLLTSMYVKEFLISSSQDGHQWTLFFQNGKVKVFQGNQDSFTPVVNSLDPPLLTRYLRIHPQSWVHQIALRMEVLGCEAQDLY
無
圖 1是coBDDFVIII6-XTEN-3aa表現質體的圖形表示。
圖 2A- 圖 2B是在大約25週內，如藉由FVIII血漿活性（ 圖 2A）和FVIII血漿抗原水平（ 圖 2B）測量的，在以1.5 x 10 9、3.0 x 10 9、6.0 x 10 9或1.3 x 10 10TU/kg劑量經由顳靜脈注射投予表現coBDDFVIII6-XTEN-3aa的慢病毒的新生（2日齡）HemA小鼠中的峰值循環FVIII水平的圖形表示。
圖 3是在大約25週內，如藉由FVIII血漿活性測量的，在以1.3 x 10 10或3.7 x 10 10TU/kg劑量經由尾靜脈注射投予表現coBDDFVIII6-XTEN-3aa的慢病毒的成年（16週齡）HemA小鼠中的峰值循環FVIII水平的圖形表示。
圖 4A- 圖 4B是在投予3 x 10 9TU/kg或6 x 10 9TU/kg的表現coBDDFVIII6-XTEN-3aa的慢病毒的雄性豬尾獼猴中的人FVIII活性（圖4A）和人FVIII抗原水平（圖4B）的峰值血漿水平的圖形表示。將FVIII血漿活性（ 圖 4A）和FVIII血漿抗原水平（ 圖 4B）表示為跨多個時間點的平均值。
無
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Claims (48)

  1. 一種分離的核酸分子，其包含與SEQ ID NO: 11具有至少85%序列同一性的核苷酸序列，其中所述核苷酸序列編碼具有因子VIII（FVIII）活性的多肽。
  2. 如請求項1所述的分離的核酸分子，其中所述核苷酸序列與SEQ ID NO: 11具有至少90%序列同一性。
  3. 如請求項1所述的分離的核酸分子，其中所述核苷酸序列與SEQ ID NO: 11具有至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%序列同一性。
  4. 一種分離的核酸分子，所述分離的核酸分子包含SEQ ID NO: 11的核苷酸序列，其中所述核苷酸序列編碼具有因子VIII活性的多肽。
  5. 如請求項1-4中任一項所述的分離的核酸分子，其中所述核苷酸序列包含與SEQ ID NO: 11的核苷酸58-4815具有至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的核苷酸序列。
  6. 如請求項1-5中任一項所述的分離的核酸分子，其中所述核苷酸序列包含SEQ ID NO: 11的核苷酸58-4815。
  7. 一種分離的核酸分子，其包含與SEQ ID NO: 14具有至少85%序列同一性的核苷酸序列，其中所述核苷酸序列編碼具有因子VIII（FVIII）活性的多肽。
  8. 如請求項7所述的分離的核酸分子，其中所述核苷酸序列與SEQ ID NO: 14具有至少90%序列同一性。
  9. 如請求項7所述的分離的核酸分子，其中所述核苷酸序列與SEQ ID NO: 14具有至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%序列同一性。
  10. 一種分離的核酸分子，其包含SEQ ID NO: 14的核苷酸序列，其中所述核苷酸序列編碼具有因子VIII活性的多肽。
  11. 一種分離的核酸分子，其包含表現因子VIII多肽的基因盒，其中所述基因盒包含與SEQ ID NO: 16具有至少85%序列同一性的核苷酸序列。
  12. 如請求項11所述的分離的核酸分子，其中所述基因盒包含與SEQ ID NO: 16具有至少90%序列同一性的核苷酸序列。
  13. 如請求項11所述的分離的核酸分子，其中所述基因盒包含與SEQ ID NO: 16具有至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的核苷酸序列。
  14. 一種分離的核酸分子，其包含表現因子VIII多肽的基因盒，其中所述基因盒包含SEQ ID NO: 16的核苷酸序列。
  15. 一種分離的核酸分子，其包含表現因子VIII（FVIII）多肽的基因盒，所述基因盒包含： i)  編碼FVIII蛋白的核苷酸序列，所述核苷酸序列包含與SEQ ID NO: 11或SEQ ID NO: 14具有至少85%序列同一性的核酸序列； ii) 控制所述核苷酸序列的轉錄的啟動子；和 iii) 轉錄終止序列。
  16. 如請求項15所述的分離的核酸分子，其中所述啟動子是肝臟特異性啟動子。
  17. 如請求項15所述的分離的核酸分子，其中所述啟動子是小鼠甲狀腺素轉運蛋白（mTTR）啟動子。
  18. 如請求項15所述的分離的核酸分子，其中所述啟動子是mTTR482啟動子。
  19. 如請求項18所述的分離的核酸分子，其中所述啟動子包含SEQ ID NO: 9的核苷酸序列。
  20. 如請求項15-19中任一項所述的分離的核酸分子，所述分離的核酸分子還包含增強子元件。
  21. 如請求項20所述的分離的核酸分子，其中所述增強子元件是mTTR增強子元件。
  22. 如請求項20或21所述的分離的核酸分子，其中所述mTTR增強子元件包含SEQ ID NO: 8的核苷酸序列。
  23. 如請求項15-22中任一項所述的分離的核酸分子，所述分離的核酸分子還包含合成增強子序列。
  24. 如請求項23所述的分離的核酸分子，其中所述合成增強子序列包含SEQ ID NO: 7的核苷酸序列。
  25. 如請求項15-24中任一項所述的分離的核酸分子，所述分離的核酸分子還包含多嘌呤區（PPT）。
  26. 如請求項25所述的分離的核酸分子，其中所述PPT序列包含SEQ ID NO: 6的核苷酸序列。
  27. 如請求項15-26中任一項所述的分離的核酸分子，所述分離的核酸分子還包含人CMV啟動子區序列。
  28. 如請求項27所述的分離的核酸分子，其中所述CMV啟動子區序列包含SEQ ID NO: 1的核苷酸序列。
  29. 如請求項15-28中任一項所述的分離的核酸分子，所述分離的核酸分子還包含5’長末端重複（LTR）序列。
  30. 如請求項15-29中任一項所述的分離的核酸分子，所述分離的核酸分子還包含3’ LTR序列。
  31. 如請求項15-30中任一項所述的分離的核酸分子，所述分離的核酸分子還包含莖環4序列。
  32. 如請求項31所述的分離的核酸分子，其中所述莖環4序列包含SEQ ID NO: 4的核苷酸序列。
  33. 如請求項15-32中任一項所述的分離的核酸分子，所述分離的核酸分子還包含SL123的引子結合位點。
  34. 如請求項33所述的分離的核酸分子，其中所述SL123的引子結合位點包含SEQ ID NO: 3的核苷酸序列。
  35. 如請求項15-34中任一項所述的分離的核酸分子，所述分離的核酸分子還包含RU5區的引子結合位點。
  36. 如請求項35所述的分離的核酸分子，其中所述RU5區序列包含SEQ ID NO: 2的核苷酸序列。
  37. 一種分離的核酸分子，其包含表現因子VIII（FVIII）多肽的基因盒，其中所述基因盒從5’至3’包含： (a) 5’長末端重複（LTR）序列； (b)       包含SEQ ID NO: 9的核苷酸序列的肝臟特異性的經修飾的小鼠甲狀腺素轉運蛋白(transthyretin)（mTTR）啟動子； (c) 編碼FVIII蛋白的核苷酸序列，所述核苷酸序列包含與SEQ ID NO: 11或SEQ ID NO: 14具有至少85%序列同一性的核酸序列；和 (d)       3’ LTR序列。
  38. 一種載體，其包含如請求項1-37中任一項所述的核酸分子。
  39. 一種宿主細胞，其包含如請求項1-37中任一項所述的核酸分子或如請求項38所述的載體。
  40. 一種多肽，其由如請求項39所述的宿主細胞產生。
  41. 一種產生具有FVIII活性的多肽的方法，其包括：將如請求項39所述的宿主細胞在產生具有FVIII活性的多肽的條件下培養，以及回收所述具有FVIII活性的多肽。
  42. 一種醫藥組合物，其包含如請求項1-37中任一項所述的核酸分子。
  43. 一種醫藥組合物，其包含如請求項38所述的載體和醫藥上可接受的賦形劑。
  44. 一種套組，其包含如請求項1-37中任一項所述的核酸分子和用於向有需要的個體投予所述核酸分子的說明書。
  45. 一種增加個體中的具有FVIII活性的多肽的表現的方法，其包括投予包含與SEQ ID NO: 11、SEQ ID NO: 14或SEQ ID NO: 16具有至少80%序列同一性的核苷酸序列的核酸分子。
  46. 一種治療個體的出血障礙的方法，其包括投予包含與SEQ ID NO: 11、SEQ ID NO: 14或SEQ ID NO: 16具有至少85%序列同一性的核苷酸序列的核酸分子。
  47. 一種治療個體的出血障礙的方法，其包括投予如請求項42或43所述的醫藥組合物。
  48. 如請求項46或47所述的方法，其中所述出血障礙是A型血友病。
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