TW202322799A - 冠狀病毒非結構性蛋白3降解化合物 - Google Patents

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Abstract

本發明提供用於治療感染冠狀病毒,包括但不限於SARS-CoV-2之宿主,包括人類的有利化合物。

Description

冠狀病毒非結構性蛋白3降解化合物
本發明提供降解冠狀病毒非結構蛋白3 (NSP3),例如SARS-CoV-2 NSP3之有利化合物,用於治療有需要之宿主之冠狀病毒。
2019年底,中國武漢的一些患者出現類似於2002-2003年SARS-CoV-1爆發的症狀。2020年初,該病毒被鑑定為一種新型冠狀病毒,且隨後被命名為嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒-2 (SARS-CoV-2),且由此產生的疾病被命名為2019年冠狀病毒病(COVID-19)。SARS-CoV-2迅速傳播至世界各地,且在2020年3月11日,世界衛生組織(WHO)宣佈COVID-19為全球大流行病。
SARS-CoV-2可引起多種症狀,其範圍介於輕微的感冒樣症狀至嚴重的住院、通氣及甚至死亡。病毒可對肺、心臟及腦造成長期損害。迄今為止,COVID-19已奪去超過六百萬人的生命,而住院的患者數量則多得多。SARS-CoV-2的高毒力、潛在的致命或永久性症狀以及缺乏有效的治療方法使世界基礎設施面臨巨大壓力。大流行現已持續近三年,且新變異株繼續發展且迅速傳播。
冠狀病毒為具有單股、正義RNA基因體之包膜病毒。SARS-CoV-2之基因體係世界上已知最大的RNA病毒之一,且包括大約30千鹼基。SARS-CoV-2係一種冠狀病毒(CoV),其屬於巢病毒目、冠狀病毒科、冠狀病毒亞科。相關冠狀病毒包括:嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒(SARS-CoV)、蝙蝠SARS樣冠狀病毒WIV1 (Bat SL-CoV-WIVl)、α冠狀病毒229E (HCoV-229E)、紐黑文冠狀病毒NL63 (HCoV-NL63)、β冠狀病毒OC43 (HCoV-OC43)、冠狀病毒HKIJ I (HCoV-HKU l)及中東呼吸道症候群冠狀病毒(MERS-CoV)。與SARS-CoV與MERS-CoV相比,SARS-CoV-2展現更快的人際傳播速度(Huang等人, Lancet 2020, 395, 497),使其特別危險且難以遏制。冠狀病毒通常為地方性的,跨越動物-人類物種障壁(Lau等人, PNAS 2005, 102, 14040-5;Rest等人, Infect Genet Evol. 2003, 3, 219-25)。跨物種障壁跳躍係導致諸如SARS CoV及中東呼吸症候群CoV (MERS)之CoV表現為毒性人類病毒的原因(Schoeman及Fielding,Virology 2019, 16, 69)。基因體定序已揭示SARS-CoV-2在全基因體層面上與蝙蝠冠狀病毒具有大約96%一致性(Zhou等人 Nature 2020, 579, 270),且因此最可能源於蝙蝠。
SARS-CoV-2經由內吞作用或藉由結合至血管收縮素轉化酶2 (ACE2)受體與細胞膜融合而進入細胞。病毒包膜表面上之棘醣蛋白接著結合至ACE2受體。人類跨膜蛋白酶絲胺酸2裂解且活化棘蛋白(Luan等人Biochem. Biophys. Res. Commun. 2020: 527, 165;Hoffman, M.等人Cell, 2020, 181, 271;Yang等人Int. J. Biol. Sci. 2020, 16, 1724)。一旦進入宿主細胞,SARS-CoV-2便會快速複製及傳播。
Dana-Farber Cancer Institute, Inc.申請了一份公佈為WO 2022/081827之專利申請案,其描述使用蛋白質降解劑治療包括SARS-CoV-2在內的病毒性病症。Kymera Therapeutics, Inc.亦在公佈為WO 2021/231778之專利申請案中描述用於治療SARS-CoV-2之降解劑。
University of Illinois及University of Arizona在題為「Design of SARS-CoV-2 PLpro Inhibitors for COVID-19 Antiviral Therapy Leveraging Binding Cooperativity」 J. Med. Chem., COVID-19特刊, 2021年10月19日之論文中公佈了新NSP3抑制劑。此等抑制劑及一些含有此等抑制劑之蛋白質降解化合物描述於WO 2022/169891中,該案主張2021年2月8日申請之USSN 63/146,871的優先權。
C4 Therapeutics, Inc.申請的描述能夠結合至E3泛素連接酶及目標蛋白以進行降解之化合物的專利申請案包括:WO 2022/032026,標題為「Advantageous Therapies For Disorders Mediated By Ikaros or Aiolos」;WO 2022/081925,標題為「Tricyclic Ligands for Degradation of IKZF2 or IKZF4」;WO 2022/081927,標題為「Tricyclic Compounds to Degrade Neosubstrates for Medical Use」;WO 2022/081928,標題為「Tricyclic Heterobifunctional Compounds for Degradation of Targeted Proteins」;WO 2021/255212,標題為「BRAF Degraders」;WO 2021/255213,標題為「Heterobifunctional Compounds as Degraders of BRAF」;WO 2021/178920,標題為「Compounds for Targeted Degradation of BRD9」;WO 2021/127561,標題為「Isoindolinone And Indazole Compounds For The Degradation Of EGFR」;WO 2021/086785,標題為「Bifunctional Compounds」;WO 2021/083949,標題為「Bifunctional Compounds for the Treatment of Cancer」;WO 2020/210630,標題為「Tricyclic Degraders of Ikaros and Aiolos」;WO 2020/181232,標題為「Heterocyclic Compounds for Medical Treatment」;WO 2020/132561,標題為「Targeted Protein Degradation」;WO 2019/236483,標題為「Spirocyclic Compounds」;WO 2020/051235,標題為「Compounds for the degradation of BRD9 or MTH1」;WO 2019/191112,標題為「Cereblon binders for the Degradation of Ikaros」;WO 2019/204354,標題為「Spirocyclic Compounds」;WO 2019/099868,標題為「Degraders and Degrons for Targeted Protein Degradation」;WO 2018/237026,標題為「N/O-Linked Degrons and Degronimers for Protein Degradation」;WO 2017/197051,標題為「Amine-Linked C3-Glutarimide Degronimers for Target Protein Degradation」;WO 2017/197055,標題為「Heterocyclic Degronimers for Target Protein Degradation」;WO 2017/197036,標題為「Spirocyclic Degronimers for Target Protein Degradation」;WO 2017/197046,標題為「C3-Carbon Linked Glutarimide Degronimers for Target Protein Degradation」;及WO 2017/197056,標題為「Bromodomain Targeting Degronimers for Target Protein Degradation」。
描述蛋白質降解化合物之其他專利申請案包括: WO 2015/160845;WO 2016/105518;WO 2016/118666;WO 2016/149668;WO 2016/197032;WO 2016/197114;WO 2017/007612;WO 2017/011371;WO 2017/011590;WO 2017/030814;WO 2017/046036;WO 2017/176708;WO 2017/176957;WO 2017/180417;WO 2018/053354;WO 2018/071606;WO 2018/102067;WO 2018/102725;WO 2018/118598;WO 2018/119357;WO 2018/119441;WO 2018/119448;WO 2018/140809;WO2018/144649;WO 2018/119448;WO 2018/226542;WO 2019/023553;WO 2019/195201;WO2019/199816;WO 2019/099926;WO 2019/195609;WO 2020/041331;WO 2020/051564;WO 2020/023851;WO2020/200291;及WO2021/011634。
鑒於冠狀病毒之嚴重及潛在的大流行影響,為其治療提供新治療劑係一個重要的醫療保健目標。
本發明提供引起冠狀病毒非結構蛋白3 (NSP3),例如SARS-CoV-2 NSP3之降解的化合物及其組合物、用途及製造。藉由降解NSP3,本發明化合物可以有效量投與以治療冠狀病毒,例如SARS-CoV-2 (亦稱為COVID19)之患者。另外,本發明化合物展現抗病毒活性。
已發現NSP3係一種經由靶向蛋白質降解來治療冠狀病毒之有用蛋白質靶標。NSP3係冠狀病毒複製之關鍵組分。其由不同的域構成,該等域之組織因屬而異。儘管結構複雜,但NSP3複合物之八個域在各種CoV之間係保守的:泛素樣域1 (Ubl1)、富含Glu之酸性域(亦稱為「高變區」)、宏域(亦稱為「X域」)、泛素樣域2 (Ubl2)、番木瓜蛋白酶樣蛋白酶(PLpro)、NSP3胞外域(3Ecto,亦稱為「鋅指域」),以及未知功能之域Y1及CoV-Y。Neuman, Antiviral Research, 135, 97-107, 2016。
NSP3對病毒存活至關重要,顯示病毒中可放大NSP3降解作用之影響的多種功能或骨架作用之證據,NSP3之靶向域與可影響選擇性概況之人類旁系同源物不同,且有結構證據表明配體發現之保守功能性或表面暴露結合位點。Báez-Santos YM等人, Antiviral Research, 2015, 115, 21-38;O'Donoghue SI等人, Mol Syst Biol., 2021, 17(9);Lei J等人, Antiviral Research, 2018, 149, 58-74;及Shan H等人, Cell Chem Biol., 2021, 28(6), 855-865。
已為NSP3之PLpro域開發出配體。此域包括一種半胱胺酸蛋白酶,其藉由處理病毒多蛋白來介導病毒複製,此外其亦為複製酶轉錄酶複合物(RTC)形成過程中必需的蛋白酶。PLpro亦充當去泛素化酶及去ISG化酶,藉由經由去泛素化(DUB)干擾IRF3/NF-kB活化及IFN抗病毒信號傳導而作為宿主免疫反應之主要拮抗劑。特定言之,PLpro裂解異肽鍵,其將泛素(Ub)及泛素樣蛋白(UbL),諸如干擾素刺激之基因產物15 (ISG15)接合至宿主蛋白之離胺酸側鏈,Barretto等人Journal of Virology, 79(24), 15189-98, 2005。NSP3配體之非限制性實例包括Shen等人「Potent, Novel SARS-CoV-2 PLpro Inhibitors Block Viral Replication in Monkey and Human Cell Cultures」 preprint doi.org/10.1101/2021.02.13.431008中所述之彼等。額外NSP3配體描述於Santos等人, J. Med. Chem., 2014, 57, 2393-2412中。
已發現,含有經由連接部分連接至NSP3靶向配體之所選E3連接酶配體之化合物可降解NSP3且停止病毒複製。藉由降解NSP3而非僅對其進行抑制,本發明化合物可催化作用於NSP3,且因此與單獨使用NSP3抑制劑治療相比,在治療SARS-CoV-2 (COVID19)方面提供優勢。另外,由於NSP3之PLpro域在整個冠狀病毒中部分保守,因此藉由靶向PLpro降解NSP3可為SARS-CoV-2變異株、其他冠狀病毒或尚未發現之未來冠狀病毒提供強有力的治療。
在某些實施例中,本發明化合物用於治療冠狀病毒變異株,例如選自α、β、γ、δ、ε、η、ι、κ、μ、o及ζ之SARS-CoV-2變異株。SARS-CoV-2 α變異株之非限制性實例包括B.1.1.7及Q.1-Q.8。SARS-CoV-2 β變異株之非限制性實例包括B.1.351、B.1.351.2及B.1.351.3。SARS-CoV-2 γ變異株之非限制性實例包括P.1、P.1.1及P.1.2。SARS-CoV-2 δ變異株之非限制性實例包括B.1.617.2及AY.1。SARS-CoV-2 ε變異株之非限制性實例包括B.1.427及B.1.429。SARS-CoV-2 η變異株之非限制性實例包括B.1.525。SARS-CoV-2 ι變異株之非限制性實例包括B.1.526。SARS-CoV-2 κ變異株之非限制性實例包括B.1.617.1。SARS-CoV-2 μ變異株之非限制性實例包括B.1.621及B.1.621.1。SARS-CoV-2 ζ變異株之非限制性實例包括P.2。SARS-CoV2 o變異株之非限制性實例包括B.1.1.529及子系變異株BA.1、BA.2、BA.2.12.1、BA.2.75、BA.3、BA.4及BA.5。
在某些實施例中,本發明化合物用於治療除SARS-CoV-2以外之冠狀病毒。冠狀病毒之額外實例包括:嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒(SARS-CoV)、蝙蝠SARS樣冠狀病毒WIV1 (Bat SL-CoV-WIVl)、α冠狀病毒229E (HCoV-229E)、紐黑文冠狀病毒NL63 (HCoV-NL63)、β冠狀病毒OC43 (HCoV-OC43)、冠狀病毒HKIJ I (HCoV-HKU l)及中東呼吸道症候群冠狀病毒(MERS-CoV)。
在某些實施例中,本發明化合物用於治療尚未發現或尚未感染可觀人數之新型冠狀病毒。
本發明化合物包括NSP3靶向配體、雜環部分及連接其之連接子。更特定言之,提供一種式A化合物:
Figure 02_image003
(A); 或其醫藥學上可接受之鹽、 N-氧化物、同位素類似物或前藥,視情況在醫藥學上可接受之載劑中以形成組合物; 其中: 雜環部分選自:
Figure 02_image005
Figure 02_image007
Q為CH 2、NR 2、O或S; X 3、X 4、X 5及X 6獨立地選自N、CH及CR 5,其中X 3、X 4、X 5及X 6中之一者為連接至連接子之碳原子; R 1、R 3、R 4及R 6獨立地選自氫、烷基、烯基、炔基及鹵素; 或R 3及R 4與其所結合之碳一起形成3、4、5或6員螺碳環;包含1或2個選自N、O及S之雜原子的4、5或6員螺雜環;或側氧基; 或R 1與R 6組合在一起以形成1或2-碳橋;例如
Figure 02_image009
Figure 02_image011
; 或R 1與R 3組合在一起以形成3-6員稠環;例如
Figure 02_image013
Figure 02_image015
; 各R 2選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、芳基、雜芳基、雜環及-C(O)R 9,其各自視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 10之取代基取代; 各R 5獨立地選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、鹵素、芳基、雜芳基、雜環、氰基、硝基、-NR 7R 8、-OR 7、-SR 7、-C(O)R 9、-C(S)R 9、-S(O)R 9、-S(O) 2R 9、-OC(O)R 9、-OC(S)R 9、-OS(O)R 9、-OS(O) 2R 9、-SC(O)R 9、-OS(O) 2R 9、-NR 7C(O)R 9、-NR 7C(S)R 9、-NR 7S(O)R 9、-NR 7S(O) 2R 9、-P(O)(R 9) 2、-SP(O)(R 9) 2、-NR 7P(O)(R 9) 2及-OP(O)(R 9) 2;除了氫、鹵素、氰基及硝基之外的各者視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 10之取代基取代; R 16選自:
Figure 02_image017
Figure 02_image019
及R 12,其各自視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代; R 17選自:
Figure 02_image021
Figure 02_image023
,其各自視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代; R 18選自:
Figure 02_image025
Figure 02_image023
,其各自經由C-N鍵連接至氮雜戊二醯亞胺部分且各R 18視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代;例如
Figure 02_image028
,但不包括
Figure 02_image030
; 環為視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代且經一個R 12取代基取代之稠合芳基或雜芳基; 螺環為視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代且經一個R 12取代基取代之環烷基、環烯或雜環基; R 12為與連接子之連接點; R 7及R 8在各情況下獨立地選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、芳基、雜芳基、雜環及C(O)R 14,除了氫之外的各者視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 10之取代基取代; 各R 9獨立地選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、芳基、雜芳基、雜環、-NR 7R 8、-OR 7及-SR 7,其各自視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 10之取代基取代; 各R 10獨立地選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、鹵素、芳基、雜芳基、雜環、氰基、硝基、-NR 11R 13、-OR 11、-SR 11、-C(O)R 14、-C(S)R 14、-S(O)R 14、-S(O) 2R 14、-OC(O)R 14、-OC(S)R 14、-OS(O)R 14、-OS(O) 2R 14、-NR 11C(O)R 14、-NR 11C(S)R 14、-NR 11S(O)R 14、-NR 11S(O) 2R 14、-P(O)(R 14) 2、-NR 11P(O)(R 14) 2及-OP(O)(R 14) 2;除了氫、鹵素、氰基及硝基之外的各者視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 15之取代基取代; R 11及R 13在各情況下獨立地選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、芳基、雜芳基、雜環、-C(O)R 14、-C(S)R 14、-S(O)R 14、-S(O) 2R 14及-P(O)(R 14) 2;其各自視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 15之取代基取代; 各R 14獨立地選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、芳基、雜芳基、雜環、胺基、羥基、烷氧基、-N(H)(烷基)及-N(烷基) 2,除了氫之外的各者視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 15之取代基取代; 各R 15獨立地選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、鹵素、芳基、雜芳基、雜環、氰基、硝基、胺基、羥基、烷氧基、-N(H)(烷基)及-N(烷基) 2; 連接子為二價化學基團; NSP3靶向配體選自:
Figure 02_image032
Figure 02_image034
; y為0或1; 稠環為視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代之稠合芳基、雜芳基、環烷基或雜環基; X 16選自
Figure 02_image036
Figure 02_image038
Figure 02_image040
及鍵; X 17選自CR 33R 34、C(O)、C(S)、S(O)及S(O) 2; X 18選自CR 30、CH及N; 各x獨立地為0、1、2、3或4; X 8、X 9、X 10、X 11、X 12、X 13、X 14及X 15獨立地選自N、CH及CR 28; 或X 8、X 9、X 10、X 11、X 12、X 13、X 14及X 15獨立地選自N、CH及CR 28,其中X 8、X 9、X 10、X 11、X 12、X 13、X 14及X 15中不超過三者為N; 在某些實施例中,X 8、X 9、X 10、X 11、X 12、X 13、X 14及X 15中不超過兩者為N; 在某些實施例中,X 8、X 9、X 10、X 11、X 12、X 13、X 14及X 15中僅一者為N; R 27選自
Figure 02_image042
Figure 02_image044
,其各自視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 29之取代基取代; 各R 28、R 29及R 30獨立地選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、鹵素、芳基、雜芳基、雜環、氰基、硝基、-NR 7R 8、-OR 7、-SR 7、-C(O)R 9、-C(S)R 9、-S(O)R 9、-S(O) 2R 9、-OC(O)R 9、-OC(S)R 9、-OS(O)R 9、-OS(O) 2R 9、-SC(O)R 9、-OS(O) 2R 9、-NR 7C(O)R 9、-NR 7C(S)R 9、-NR 7S(O)R 9、-NR 7S(O) 2R 9、-P(O)(R 9) 2、-SP(O)(R 9) 2、-NR 7P(O)(R 9) 2及-OP(O)(R 9) 2;除了氫、鹵素、氰基及硝基之外的各者視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 10之取代基取代; 各R 31、R 32、R 33及R 34獨立地選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、鹵素、芳基、雜芳基、雜環、氰基、硝基、-C(O)R 9、-C(S)R 9、-S(O)R 9、-S(O) 2R 9、-OC(O)R 9、-OC(S)R 9、-OS(O)R 9、-OS(O) 2R 9、-SC(O)R 9、-OS(O) 2R 9、-NR 7C(O)R 9、-NR 7C(S)R 9、-NR 7S(O)R 9、-NR 7S(O) 2R 9、-P(O)(R 9) 2、-SP(O)(R 9) 2、-NR 7P(O)(R 9) 2及-OP(O)(R 9) 2;除了氫、鹵素、氰基及硝基之外的各者視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 10之取代基取代; 在某些實施例中,連接子選自
Figure 02_image046
; 其中: X 1及X 2在各次出現時獨立地選自鍵、雜環、NR 2、C(R 2) 2、O、C(O)及S; R 20、R 21、R 22、R 23及R 24在各次出現時獨立地選自由二價部分組成之群,該等二價部分選自鍵結烷基、-C(O)-、-C(O)O-、-OC(O)-、-SO 2-、-S(O)-、-C(S)-、-C(O)NR 2-、-NR 2C(O)-、-O-、-S-、-NR 2-、-C(R 40R 40)-、-P(O)(OR 26)O-、-P(O)(OR 26)-、雙環、烯、炔、鹵烷基、烷氧基、芳基、雜環、脂族基、雜脂族基、雜芳基、乳酸、乙醇酸及碳環;其各自視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 40之取代基取代; R 26在各次出現時獨立地選自由以下組成之群:氫、烷基、芳烷基、雜芳烷基、烯烴、炔烴、芳基、雜芳基、雜環、脂族基及雜脂族基;且 R 40在各次出現時獨立地選自由以下組成之群:氫、烷基、烯烴、炔烴、氟、溴、氯、羥基、烷氧基、疊氮化物、胺基、氰基、-NH(脂族基,包括烷基)、-N(脂族基,包括烷基) 2、-NHSO 2(脂族基,包括烷基)、-N(脂族基,包括烷基)SO 2烷基、-NHSO 2(芳基、雜芳基或雜環)、-N(烷基)SO 2(芳基、雜芳基或雜環)、-NHSO 2烯基、-N(烷基)SO 2烯基、-NHSO 2炔基、-N(烷基)SO 2炔基、鹵烷基、脂族基、雜脂族基、芳基、雜芳基、雜環及環烷基。
在某些實施例中,NSP3靶向配體選自:
Figure 02_image048
Figure 02_image050
Figure 02_image052
在某些實施例中,NSP3靶向配體選自:
Figure 02_image054
在某些態樣中,提供式B化合物:
Figure 02_image056
(B); 或其醫藥學上可接受之鹽、 N-氧化物、同位素類似物或前藥,視情況在醫藥學上可接受之載劑中以形成組合物; 其中: 雜環部分 B
Figure 02_image058
; NSP3靶向配體 B選自:
Figure 02_image060
在某些實施例中,NSP3靶向配體 B選自:
Figure 02_image062
在某些態樣中,提供式C或式D化合物:
Figure 02_image064
Figure 02_image066
(D); 或其醫藥學上可接受之鹽、 N-氧化物、同位素類似物或前藥,視情況在醫藥學上可接受之載劑中以形成組合物; 其中: NSP3靶向配體 C選自:
Figure 02_image068
Figure 02_image070
在某些實施例中,本發明化合物提供優於例如SARS CoV-2之冠狀病毒之傳統抗病毒治療的多種優點。舉例而言,本發明之NSP3降解化合物可a)在某些情況下克服耐藥性;b)藉由破壞蛋白質來延長藥物作用之動力學,因此即使在化合物已被代謝後亦需要重新合成蛋白質;c)同時針對蛋白質之所有功能而非特定的催化活性或結合事件;d)需要較小劑量;e)需要較低給藥頻率;f)需要較短給藥期;g)引起較少副作用;及/或h)由於本發明化合物可能起催化作用,因此與傳統抗病毒劑相比具有增加的效力。
在一個態樣中,本發明化合物包括以中等效力(K d< 1 μM)可逆、非共價結合之NSP3靶向配體。
選擇本文所述之式內之變數以使得所得化合物足夠穩定,例如足夠穩定以在環境條件下維持至少兩個、三個、四個或五個月之存放期。一般熟習此項技術者十分瞭解化學部分之穩定性且可避免在適當條件下不穩定或反應性過高的彼等化學部分。此外,所有R基團,無論具有或不具有視情況存在之取代基,均應以不包括冗餘之方式解釋(亦即,如此項技術中已知,經烷基取代之烷基係冗餘的;然而,舉例而言,經烷氧基取代之烷氧基並非冗餘的且經芳基取代之芳基亦非冗餘的)。
本發明化合物或其醫藥學上可接受之鹽及/或其醫藥學上可接受之組合物可用於治療冠狀病毒,例如SARS CoV-2。因此,在一些實施例中,提供一種用SARS CoV-2治療宿主之方法,其包括向有需要之患者(通常人類)投與有效量之本發明化合物或其醫藥學上可接受之鹽(視情況在醫藥學上可接受之組合物中)。
在某些實施例中,本發明化合物具有其量高於同位素之天然豐度(亦即增濃)的原子之至少一個所需同位素取代。在一個實施例中,本發明化合物包括氘或多個氘原子。
本發明化合物可向患者提供重要臨床益處,尤其用於快速治療SARS CoV-2感染。
本申請案之其他特徵及優勢將自以下實施方式及申請專利範圍顯而易見。
本發明因此至少包括以下特徵: (a)       本發明化合物或其醫藥學上可接受之鹽、同位素衍生物(包括氘化衍生物)或前藥; (b)       本發明化合物或其醫藥學上可接受之鹽、同位素衍生物(包括氘化衍生物)或前藥,其用於治療冠狀病毒; (c)       一種治療冠狀病毒之方法,其包含向有需要之患者投與有效量之本發明化合物或其醫藥學上可接受之鹽、同位素衍生物(包括氘化衍生物)或前藥; (d)       本發明化合物以有效量治療冠狀病毒患者,通常人類之用途; (e)       本發明化合物以有效量製造用於治療冠狀病毒患者,通常人類之藥劑之用途; (f)       一種醫藥組合物,其包含有效宿主治療量之本發明化合物或其醫藥學上可接受之鹽、同位素衍生物或前藥及醫藥學上可接受之載劑; (g)       作為對映異構體或非對映異構體(相關)之混合物,包括作為外消旋體之本發明化合物; (h)       本發明化合物,其呈對映異構性或非對映異構性(相關)增濃形式,包括經分離之對映異構體或非對映異構體(亦即,大於85、90、95、97或99%純);以及 (i)        一種製備含有有效量之本發明化合物之治療產品的方法。
相關申請案之交叉參考
本申請案主張2021年10月6日申請之美國臨時申請案63/253,038及2022年7月25日申請之美國臨時申請案63/392,062之權益,各申請案之全部內容出於所有目的而以引用之方式併入。 I. 定義
使用標準命名法描述化合物。除非另外定義,否則本文所使用之所有技術及科學術語均具有與本發明所屬領域中之技術人員通常所理解之含義相同的含義。
除非上下文特別排除,否則本文所描述之任一式中之化合物可呈外消旋體、對映異構體、對映異構體混合物、非對映異構體、非對映異構體混合物、互變異構體、N-氧化物、異構體形式;諸如旋轉異構體,如同各自經特定描述。
術語「一(a/an)」不表示數量之限制,而是表示存在所提項中之至少一者。術語「或」意謂「及/或」。除非本文另外指明,否則數值範圍之敍述僅意欲充當個別提及屬於該範圍內之各獨立值之速記方法,且各獨立值併入本說明書中,如同其在本文中個別敍述一般。所有範圍之端點均包括於該範圍內且可獨立地組合。除非本文另外指示或另外與上下文明顯矛盾,否則本文所述之所有方法均可以任何適合之順序進行。除非另有主張,否則實例或例示性語言(例如「諸如」)的使用僅旨在更好地說明本發明且對本發明之範疇不構成限制。
本發明包括本發明化合物,該化合物具有原子之至少一個所需同位素取代,其量高於同位素之天然豐度,亦即經增濃。同位素為具有相同原子數、但具有不同質量數,亦即,質子數目相同,但中子數目不同的原子。
可併入本發明之化合物中的同位素之實例分別包括氫、碳、氮、氧、磷、氟、氯及碘之同位素,諸如 2H、 3H、 11C、 13C、 14C、 15N、 17O、 18O、 18F、 31P、 32P、 35S、 36CI及 125I。在一個非限制性實施例中,經同位素標記之化合物可用於代謝研究(使用例如 14C);反應動力學研究(使用例如 2H或 3H);偵測或成像技術,諸如正電子發射斷層攝影術(PET)或單光子發射電腦斷層攝影術(SPECT),包括藥物或受質組織分佈分析;或適用於患者之放射性治療。特定言之,經 18F標記之化合物可尤其為PET或SPECT研究所需要的。本發明之經同位素標記之化合物及其前藥一般可藉由進行下文所描述之流程中或實例及製備中所揭示之程序藉由用易於得到之經同位素標記之試劑取代未經同位素標記之試劑來製備。在某些實施例中,同位素取代發生於選自以下之一或多個變數上:雜環部分、連接子、NSP3靶向配體、環、稠環、螺環、Q、X 1、X 2、X 3、X 4、X 5、X 6、X 8、X 9、X 10、X 11、X 12、X 13、X 14、X 15、X 16、X 17、X 18、R 1、R 2、R 3、R 4、R 5、R 6、R 7、R 8、R 9、R 10、R 11、R 12、R 13、R 14、R 15、R 16、R 17、R 18、R 20、R 21、R 22、R 23、R 24、R 26、R 27、R 28、R 29、R 30、R 31、R 32、R 33、R 34、R 36及R 40
同位素取代,例如氘取代可為部分的或完全的。部分氘取代意謂至少一個氫經氘取代。在某些實施例中,同位素在任何所關注位置增濃90%、95%或99%或更多。在一個非限制性實施例中,氘在所需位置處增濃90%、95%或99%。
在一個非限制性實施例中,氫原子對氘原子之取代可提供於任何本發明化合物中。在一個非限制性實施例中,氫原子取代氘原子發生在選自本文所描述之R或變數、連接子及NSP3靶向配體中之任一者的一或多個基團內。舉例而言,當基團中之任一者經由取代而為或含有例如甲基、乙基或甲氧基時,烷基殘基可經氘化(在非限制性實施例中,CDH 2、CD 2H、CD 3、CH 2CD 3、CD 2CD 3、CHDCH 2D、CH 2CD 3、CHDCHD 2、OCDH 2、OCD 2H或OCD 3等)。在某些其他實施例中,當兩個取代基組合以形成環時,未經取代之碳可經氘化。
本發明化合物可與溶劑(包括水)一起形成溶劑合物。因此,在一個實施例中,本發明包括化合物之溶劑化形式。術語「溶劑合物」係指本發明之化合物(包括其鹽)與一或多個溶劑分子之分子複合物。溶劑之非限制性實例為水、乙醇、異丙醇、二甲亞碸、丙酮及其他常見有機溶劑。術語「水合物」係指包含本發明之化合物及水的分子複合物。根據本發明之醫藥學上可接受之溶劑合物包括其中溶劑可經同位素取代之彼等溶劑合物,例如D 2O、d 6-丙酮、d 6-DMSO (二甲亞碸)。溶劑合物可呈液體或固體形式。
不在兩個字母或符號之間的短劃線(「-」)用於指示取代基之連接點。舉例而言,-(C=O)NH 2係經由羰基(C=O)之碳連接。
「烷基」為分支鏈或直鏈飽和脂族烴基。在一個非限制性實施例中,烷基含有1至約12個碳原子、更大體而言1至約6個碳原子或1至約4個碳原子。在一個非限制性實施例中,烷基含有1至約8個碳原子。在某些實施例中,烷基為C 1-C 2、C 1-C 3、C 1-C 4、C 1-C 5或C 1-C 6。如本文所用的特定範圍指示具有作為獨立種類描述之範圍內之各成員的烷基。舉例而言,如本文所用之術語C 1-C 6烷基指示具有1、2、3、4、5或6個碳原子之直鏈或分支鏈烷基且欲意謂其中之各者描述為獨立物質且因此各子集視為單獨揭示。舉例而言,如本文所使用,術語C 1-C 4烷基指示具有1、2、3或4個碳原子的直鏈或支鏈烷基且旨在意謂此等中之各者以獨立種類描述。烷基之實例包括但不限於甲基、乙基、正丙基、異丙基、正丁基、異丁基、二級丁基、三級丁基、正戊基、異戊基、三級戊基、新戊基、正己基、2-甲基戊烷、3-甲基戊烷、2,2-二甲基丁烷、及2,3-二甲基丁烷。在一替代性實施例中,烷基視情況經取代。術語「烷基」亦涵蓋環烷基或碳環基團。舉例而言,除非明確地由上下文排除,否則當使用包括「alk」,接著「環烷基」或「碳環」之術語時,可被視為該定義之部分。例如且不限於,除非上下文明確地排除,否則術語烷基、烷氧基、鹵烷基等可全部視為包括烷基之環狀形式。
在一個實施例中,「烷基」為C 1-C 10烷基、C 1-C 9烷基、C 1-C 8烷基、C 1-C 7烷基、C 1-C 6烷基、C 1-C 5烷基、C 1-C 4烷基、C 1-C 3烷基或C 1-C 2烷基。
在一個實施例中,「烷基」具有一個碳。
在一個實施例中,「烷基」具有兩個碳。
在一個實施例中,「烷基」具有三個碳。
在一個實施例中,「烷基」具有四個碳。
在一個實施例中,「烷基」具有五個碳。
在一個實施例中,「烷基」具有六個碳。
「烷基」之非限制性實例包括:甲基、乙基、丙基、丁基、戊基及己基。
「烷基」之另外的非限制性實例包括:異丙基、異丁基、異戊基及異己基。
「烷基」之額外非限制性實例包括:二級丁基、二級戊基及二級己基。
「烷基」之額外非限制性實例包括:三級丁基、三級戊基及三級己基。
「烷基」之額外非限制性實例包括:新戊基、3-戊基及活性戊基。
在替代實施例中,「烷基」「視情況」經1、2、3或4個取代基「取代」。
在一個實施例中,「環烷基」為C 3-C 8環烷基、C 3-C 7環烷基、C 3-C 6環烷基、C 3-C 5環烷基、C 3-C 4環烷基、C 4-C 8環烷基、C 5-C 8環烷基或C 6-C 8環烷基。
在一個實施例中,「環烷基」具有三個碳。
在一個實施例中,「環烷基」具有四個碳。
在一個實施例中,「環烷基」具有五個碳。
在一個實施例中,「環烷基」具有六個碳。
在一個實施例中,「環烷基」具有七個碳。
在一個實施例中,「環烷基」具有八個碳。
在一個實施例中,「環烷基」具有九個碳。
在一個實施例中,「環烷基」具有十個碳。
「環烷基」之非限制性實例包括:環丙基、環丁基、環戊基、環己基、環庚基、環辛基及環癸基。
「環烷基」之額外非限制性實例包括二氫-茚及四氫化萘,其中用於每一基團之附著點在環烷基環上。
例如,
Figure 02_image072
為「環烷基」。
然而,
Figure 02_image074
為「芳基」。
在替代實施例中,「環烷基」「視情況」經1、2、3或4個取代基「取代」。
「烯基」為具有一或多個可在沿著鏈之穩定點處出現之碳-碳雙鍵的直鏈或分支鏈脂族烴基。如本文所用之指定範圍指示具有範圍內之各成員的烯基經描述為獨立物種,如上文針對烷基部分所描述。烯基之實例包括但不限於乙烯基、丙烯基、烯丙基、丙烯基、丁烯基及4-甲基丁烯基。術語「烯基」亦體現「順式」及「反式」烯基幾何形狀,或替代地「E」及「Z」烯基幾何形狀。在一替代實施例中,烯基視情況經取代。術語「烯基」亦涵蓋一或多個具有至少一個不飽和點的環烷基。在替代實施例中,「烯基」「視情況經1、2、3或4個取代基取代」。
「炔基」為具有一或多個可在沿著鏈之任何穩定點處出現之碳-碳參鍵的分支鏈或直鏈脂族烴基。如本文所用之指定範圍指示具有範圍內之各成員的炔基經描述為獨立物種,如上文針對烷基部分所描述。炔基之實例包括但不限於乙炔基、丙炔基、1-丁炔基、2-丁炔基、3-丁炔基、1-戊炔基、2-戊炔基、3-戊炔基、4-戊炔基、1-己炔基、2-己炔基、3-己炔基、4-己炔基及5-己炔基。在一替代實施例中,炔基視情況經取代。術語「炔基」亦涵蓋一或多個具有至少一個參鍵的環烷基。在替代實施例中,「炔基」「視情況」經1、2、3或4個取代基「取代」。
「伸烷基」為二價飽和烴。伸烷基例如可為1、2、3、4、5、6、7至8個碳原子部分、1至6個碳原子或所指示之數目之碳原子,例如C 1-C 2伸烷基、C 1-C 3伸烷基、C 1-C 4伸烷基、C 1-C 5伸烷基或C 1-C 6伸烷基。
「伸烯基」為具有至少一個碳碳雙鍵的二價烴。伸烯基例如可為2至8個碳部分、2至6個碳部分或指定數目個碳原子,例如C 2-C 4伸烯基。
「伸炔基」為具有至少一個碳碳參鍵的二價烴。伸炔基例如可為2至8個碳部分、2至6個碳部分或指定數目個碳原子,例如C 2-C 4伸炔基。
「鹵基」及「鹵素」獨立地係指氟、氯、溴或碘。
「鹵烷基」為經1個或更多個上述鹵基原子(至多最大可允許數目之鹵素原子)取代之分支鏈或直鏈烷基。鹵烷基之實例包括但不限於氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、氯甲基、二氯甲基、三氯甲基、五氟乙基、七氟丙基、二氟氯甲基、二氯氟甲基、二氟乙基、二氟丙基、二氯乙基及二氯丙基。「全鹵烷基」意謂具有全部氫原子由鹵素原子替代之烷基。實例包括但不限於三氟甲基及五氟乙基。
在一個實施例中,「鹵烷基」為C 1-C 10鹵烷基、C 1-C 9鹵烷基、C 1-C 8鹵烷基、C 1-C 7鹵烷基、C 1-C 6鹵烷基、C 1-C 5鹵烷基、C 1-C 4鹵烷基、C 1-C 3鹵烷基及C 1-C 2鹵烷基。
在一個實施例中,「鹵烷基」具有一個碳。
在一個實施例中,「鹵烷基」具有一個碳及一個鹵素。
在一個實施例中,「鹵烷基」具有一個碳及兩個鹵素。
在一個實施例中,「鹵烷基」具有一個碳及三個鹵素。
在一個實施例中,「鹵烷基」具有兩個碳。
在一個實施例中,「鹵烷基」具有三個碳。
在一個實施例中,「鹵烷基」具有四個碳。
在一個實施例中,「鹵烷基」具有五個碳。
在一個實施例中,「鹵烷基」具有六個碳。
「鹵烷基」之非限制性實例包括:
Figure 02_image076
「鹵烷基」之額外非限制性實例包括:
Figure 02_image078
Figure 02_image080
「鹵烷基」之額外非限制性實例包括:
Figure 02_image082
「鹵烷基」之額外非限制性實例包括:
Figure 02_image084
「鏈」指示所有其他鏈(長或短或兩者)可被視為與其側接的直鏈。在兩個或更多個鏈可同等地被視為主鏈的情況下,「鏈」係指產生分子之最簡單表示的鏈。
「鹵烷氧基」指示經由氧橋(醇基團中之氧)連接的如本文所描述之鹵烷基。
「雜環烷基」為經如本文所述之雜環基團取代的如本文所述之烷基。
「芳基烷基」為經如本文所述之芳基取代的如本文所述之烷基。
「芳基烷基」之非限制性實例包括:
Figure 02_image086
在一個實施例中,「芳基烷基」為
Figure 02_image088
在一個實施例中,「芳烷基」係指經芳基取代之2碳烷基。
「芳基烷基」之非限制性實例包括:
Figure 02_image090
在一個實施例中,「芳基烷基」指經芳基取代之3碳烷基。
「雜芳基烷基」為經如本文所述之雜芳基取代的如本文所述之烷基。
如本文所用,「芳基」係指芳環系統中提供有6-14個環碳原子及0個雜原子之單環或多環(例如,雙環或三環) 4n+2芳環系統(例如在環狀陣列中共用6、10或14個π電子)之基團(「C 6-14芳基」)。在一些實施例中,芳基具有6個環碳原子(「C 6芳基」;例如,苯基)。在一些實施例中,芳基具有10個環碳原子(「C 10芳基」;例如萘基,諸如1-萘基及2-萘基)。在一些實施例中,芳基具有14個環碳原子(「C 14芳基」;例如,蒽基)。「芳基」亦包括其中如上文所定義之芳基環與一或多個碳環基或雜環基稠合之環系統,其中連接子或連接點在芳基環上,且在此類情況下,碳原子數繼續指示芳基環系統中之碳原子數。一或多個稠合碳環基或雜環基可為視情況含有1、2或3個獨立地選自氮、氧、磷、硫、矽及硼之雜原子以形成例如3,4-亞甲基二氧基苯基的4員至7員或5員至7員飽和或部分不飽和碳環基或雜環基。在一個非限制性實施例中,芳基為側接的。側接環之實例為經苯基取代之苯基。在替代性實施例中,芳基視情況如上文所描述經取代。在某些實施例中,芳基為未經取代之C 6-14芳基。在某些實施例中,芳基為經取代之C 6-14芳基。芳基可視情況經一或多個官能基取代,該等官能基包括但不限於鹵基、羥基、硝基、胺基、氰基、鹵烷基、芳基、雜芳基及雜環。
在一個實施例中,「芳基」為6碳芳族基團(苯基)。
在一個實施例中,「芳基」為10碳芳族基團(萘基)。
在一個實施例中,「芳基」為與雜環稠合之6碳芳族基團,其中連接點為芳基環。「芳基」之非限制性實例包括吲哚啉、四氫喹啉、四氫異喹啉及二氫苯并呋喃,其中各基團之附接點在芳環上。
例如,
Figure 02_image092
為「芳基」。
然而,
Figure 02_image094
為「雜環」基團。
在一個實施例中,「芳基」為與環烷基稠合之6碳芳族基團,其中連接點為芳基環。「芳基」之非限制性實例包括二氫-茚及四氫化萘,其中用於各基團之附著點在芳環上。
例如,
Figure 02_image096
為「芳基」。
然而,
Figure 02_image098
為「環烷基」。
在一替代實施例中,「芳基」「視情況」經1、2、3或4個取代基「取代」。
術語「雜環基」、「雜環(heterocycle/heterocyclo」包括含飽和及部分飽和含雜原子之環自由基,其中雜原子可選自氮、硫及氧。此術語不應與在本發明中且單獨定義之大寫術語「雜環部分」混淆。雜環包含單環3員、4員、5員、6員、7員、8員、9員或10員環,以及5員、6員、7員、8員、9員、10員、11員、12員、13員、14員、15員或16員雙環系統(其可包括橋連及螺稠合雙環系統)。其不包括含有-O-O-、-O-S-或-S-S-部分之環。該「雜環」基團可視情況例如經1、2、3、4或更多個取代基取代,該等取代基包括但不限於羥基、Boc、鹵基、鹵烷基、氰基、烷基、芳烷基、側氧基、烷氧基及胺基。飽和雜環基之實例包括含有1、2、3或4個氮原子之飽和3員、4員、5員或6員雜單環基團[例如吡咯啶基、咪唑啶基、哌啶基、吡咯啉基、哌𠯤基];含有1或2個氧原子及1、2或3個氮原子之飽和3員、4員、5員或6員雜單環基團[例如嗎啉基];含有1或2個硫原子及1、2或3個氮原子之飽和3員、4員、5員或6員雜單環基團[例如噻唑啶基]。部分飽和雜環基團之實例包括但不限於二氫噻吩基、二氫哌喃基、二氫呋喃基及二氫噻唑基。部分飽和及飽和雜環基團之實例包括但不限於吡咯啶基、咪唑啶基、哌啶基、吡咯啉基、吡唑啶基、哌𠯤基、嗎啉基、四氫哌喃基、噻唑啶基、二氫噻吩基、2,3-二氫-苯并[l,4]氧雜環己烷基、吲哚啉基、異吲哚啉基、二氫苯并噻吩基、二氫苯并呋喃基、異𠳭烷基、𠳭烷基、1,2-二氫喹啉基、1,2,3,4-四氫-異喹啉基、1,2,3,4-四氫-喹啉基、2,3,4,4a,9,9a-六氫-lH-3-氮雜-茀基、5,6,7-三氫-l,2,4-三唑并[3,4-a]異喹啉基、3,4-二氫-2H-苯并[l,4]㗁 𠯤基、苯并[l,4]二氧雜環己烷基、2,3-二氫-lH-lλ'-苯并[d]異噻唑-6-基、二氫哌喃基、二氫呋喃基、異喹啉-1(2H)-酮基、苯并[d]㗁唑-2(3H)-酮基、1,3-二氫-2H-苯并[d]咪唑2-酮基、苯并[d]噻唑-2(3H)-酮基、1,2-二氫-3 H-吡唑-3-酮基、2(1 H)-吡啶酮基、2-哌𠯤酮基、吲哚啉基及二氫噻唑基。
術語「雜環基」、「雜環(heterocycle/heterocyclo)」基團亦包括其中雜環基團與芳基或雜芳基稠合/縮合之部分:諸如含有1、2、3、4或5個氮原子之不飽和縮合雜環基團,例如吲哚啉、異吲哚啉、含有1或2個氧原子及1、2或3個氮原子之不飽和縮合雜環基團、含有1或2個硫原子及1、2或3個氮原子之不飽和縮合雜環基團,及含有1或2個氧或硫原子之飽和、部分不飽和及不飽和縮合雜環基團。
在一個實施例中,「雜環」係指具有一個氮及3、4、5、6、7或8個碳原子之環狀環。
在一個實施例中,「雜環」指具有一個氮及一個氧及3、4、5、6、7或8個碳原子之環狀環。
在一個實施例中,「雜環」係指具有兩個氮及3、4、5、6、7或8個碳原子之環狀環。
在一個實施例中,「雜環」係指具有一個氧及3、4、5、6、7或8個碳原子之環狀環。
在一個實施例中,「雜環」係指具有一個硫及3、4、5、6、7或8個碳原子之環狀環。
「雜環」之非限制性實例包括氮丙啶、環氧乙烷、環硫乙烷、氮雜環丁烷、1,3-二氮雜環丁烷、氧雜環丁烷及硫雜環丁烷。
「雜環」之額外非限制性實例包括吡咯啶、3-吡咯啉、2-吡咯啉、吡唑啶及咪唑啶。
「雜環」之額外非限制性實例包括四氫呋喃、1,3-二氧雜環戊烷、四氫噻吩、1,2-氧硫雜環戊烷及1,3-氧硫雜環戊烷。
「雜環」之額外非限制性實例包括哌啶、哌𠯤、四氫哌喃、1,4-二㗁烷、噻烷、1,3-二噻烷、1,4-二噻烷、𠰌啉及硫代𠰌啉。
「雜環」之額外非限制性實例包括吲哚啉、四氫喹啉、四氫異喹啉及二氫苯并呋喃,其中各基團之連接點位於雜環上。
例如,
Figure 02_image100
為「雜環」基團。
然而,
Figure 02_image102
為「芳基」。
「雜環」之非限制性實例亦包括:
Figure 02_image104
「雜環」之額外非限制性實例包括:
Figure 02_image106
「雜環」之額外非限制性實例包括:
Figure 02_image108
「雜環」之非限制性實例亦包括:
Figure 02_image110
「雜環」之非限制性實例亦包括:
Figure 02_image112
「雜環」之額外非限制性實例包括:
Figure 02_image114
「雜環」之額外非限制性實例包括:
Figure 02_image116
在替代實施例中,「雜環」「視情況」經1、2、3或4個取代基「取代」。
術語「雜芳基」表示單環或多環(例如,雙環或三環) 4n+2芳族環系統(例如,具有6、10或14個在環狀陣列中共用之π電子)及1、2、3、4、5或6個獨立地選自O、N及S之雜原子,其中環氮及硫原子視情況經氧化,且氮原子視情況經四級銨化。實例包括但不限於含有1、2、3或4個氮原子之不飽和5員至6員雜單環基,諸如吡咯基、咪唑基、吡唑基、2-吡啶基、3-吡啶基、4-吡啶基、嘧啶基、吡𠯤基、嗒𠯤基、三唑基[例如,4 H-1,2,4-三唑基、1 H-1,2,3-三唑基、2 H-1,2,3-三唑基];含有氧原子之不飽和5員或6員雜單環基團,例如哌喃基、2-呋喃基、3-呋喃基等;含有硫原子之不飽和5員或6員雜單環基團,例如2-噻吩基、3-噻吩基等;含有1至2個氧原子及1至3個氮原子之不飽和5員或6員雜單環基團,例如㗁唑基、異㗁唑基、㗁二唑基[例如1,2,4-㗁二唑基、1,3,4-㗁二唑基、1,2,5-㗁二唑基];含有1至2個硫原子及1至3個氮原子之不飽和5員或6員雜單環基團,例如噻唑基、噻二唑基[例如1,2,4-噻二唑基、1,3,4-噻二唑基、1 2,5-噻二唑基]。額外實例包括8員、9員或10員雜芳基雙環基團,諸如吲唑基、吲哚基、咪唑并[1,5-a]吡啶基、苯并咪唑基、4(3 H)-喹唑啉基、喹啉基、異喹啉基、異吲哚基、噻吩并噻吩基、吲
Figure 111138051-A0304-1
基、苯并呋喃基、異苯并呋喃基、苯并噻吩基、異苯并噻吩基、苯并㗁唑基、苯并噻唑基、嘌呤基、香豆素基、㖕啉基及三唑并吡啶基。
在一個實施例中,「雜芳基」為含有1、2、3或4個氮原子之5員芳族基。
5員「雜芳基」之非限制性實例包括吡咯、呋喃、噻吩、吡唑、咪唑、三唑、四唑、異㗁唑、㗁唑、㗁二唑、㗁三唑、異噻唑、噻唑、噻二唑及噻三唑。
5員「雜芳基」之額外非限制性實例包括:
Figure 02_image118
Figure 02_image120
Figure 02_image122
在一個實施例中,「雜芳基」為含有1、2或3個氮原子之6員芳族基團(亦即,吡啶基、嗒𠯤基、三𠯤基、嘧啶基及吡𠯤基)。
具有1或2個氮原子之6員「雜芳基」之非限制性實例包括:
Figure 02_image124
Figure 02_image126
在一個實施例中,「雜芳基」為含有1或2個選自氮、氧及硫之原子的9員雙環芳族基團。
雙環「雜芳基」之非限制性實例包括吲哚、苯并呋喃、異吲哚、吲唑、苯并咪唑、氮雜吲哚、氮雜吲唑、嘌呤、異苯并呋喃、苯并噻吩、苯并異㗁唑、苯并異噻唑、苯并㗁唑及苯并噻唑。
雙環「雜芳基」之額外非限制性實例包括:
Figure 02_image128
雙環「雜芳基」之額外非限制性實例包括:
Figure 02_image130
雙環「雜芳基」之額外非限制性實例包括:
Figure 02_image132
在一個實施例中,「雜芳基」為含有選自氮、氧及硫之1或2個原子之10員雙環芳族基。
雙環「雜芳基」之非限制性實例包括喹啉、異喹啉、喹喏啉、呔𠯤、喹唑啉、㖕啉及㖠啶。
雙環「雜芳基」之額外非限制性實例包括:
Figure 02_image134
在一替代實施例中,「雜芳基」「視情況」經1、2、3或4個取代基「取代」。
術語「雙環」係指其中兩個環稠合在一起且各環獨立地選自碳環、雜環、芳基及雜芳基之環系統。雙環基團之非限制性實例包括:
Figure 02_image136
Figure 02_image138
當術語「雙環」用於二價殘基,諸如連接子之上下文中時,連接點可位於單獨環上或相同環上。在某些實施例中,兩個連接點位於相同環上。在某些實施例中,兩個連接點位於不同環上。二價雙環基團之非限制性實例包括:
Figure 02_image140
在一替代實施例中,「雙環」「視情況」經1、2、3或4個取代基「取代」。
術語「視情況經取代」表示本文中之基團經包括但不限於以下之部分取代:C 1-C 10烷基、C 2-C 10烯基、C 2-C 10炔基、C 3-C 12環烷基、C 3-C 12環烯基、C 1-C 12雜環烷基、C 3-C 12雜環烯基、C 1-C 10烷氧基、芳基、芳基氧基、雜芳基、雜芳基氧基、胺基、C 1-C 10烷基胺基、C 1-C 10二烷基胺基、芳基胺基、二芳基胺基、C 1-C 10烷基磺胺基、芳基磺胺基、C 1-C 10烷基亞胺基、芳基亞胺基、C 1-C 10烷基磺亞胺基、芳基磺亞胺基、羥基、鹵基、硫基、C 1-C 10烷基硫基、芳基硫基、C 1-C 10烷基磺醯基、芳基磺醯基、醯基胺基、胺基醯基、胺基硫醯基、甲脒基、胍、脲基、氰基、硝基、疊氮基、醯基、硫醯基、醯氧基、羧基及羧酸酯。
在一個替代實施例中,若指示形成穩定分子且符合本發明之所需目的,則任何適合之基團可存在於「經取代之」或「視情況經取代之」位置上,且包括但不限於例如鹵素(其可獨立地為F、Cl、Br或I);氰基;羥基;硝基;疊氮基;烷醯基(諸如C 2-C 6烷醯基);甲醯胺;烷基、環烷基、烯基、炔基、烷氧基、芳氧基,諸如苯氧基;硫烷基,包括具有一或多個硫醚鍵之彼等;烷基亞磺醯基;烷基磺醯基,包括具有一或多個磺醯基鍵之彼等;胺基烷基,包括具有超過一個N原子之基團;芳基(例如苯基、聯苯基、萘基或其類似基團,各環經取代或未經取代);具有例如1至3個獨立或稠環及6至約14或18個環碳原子之芳基烷基,苯甲基為例示性芳基烷基;例如具有1至3個獨立或稠環之芳基烷氧基,苯甲氧基為例示性芳基烷氧基;或具有1至3個具有一或多個N、O或S原子之獨立或稠環之飽和或部分不飽和雜環,或具有1至3個具有一或多個N、O或S原子之獨立或稠環之雜芳基,例如香豆素基、喹啉基、異喹啉基、喹唑啉基、吡啶基、吡𠯤基、嘧啶基、呋喃基、吡咯基、噻吩基、噻唑基、三𠯤基、㗁唑基、異㗁唑基、咪唑基、吲哚基、苯并呋喃基、苯并噻唑基、四氫呋喃基、四氫哌喃基、哌啶基、嗎啉基、哌𠯤基及吡咯啶基。此類基團可進一步經取代,例如經羥基、烷基、烷氧基、鹵素及胺基取代。
在某些實施例中,「視情況經取代」包括一或多個獨立地選自以下之取代基:鹵素、羥基、胺基、氰基、-CHO、-COOH、-CONH 2、烷基(包括C 1-C 6烷基)、烯基(包括C 2-C 6烯基)、炔基(包括C 2-C 6炔基)、-C 1-C 6烷氧基、烷醯基(包括C 2-C 6烷醯基)、C 1-C 6烷基酯、(單-及二-C 1-C 6烷基胺基)C 0-C 2烷基、鹵基烷基(包括C 1-C 6鹵基烷基)、羥基C 1-C 6烷基、酯、胺基甲酸酯、脲、磺醯胺、-C 1-C 6烷基(雜環)、C 1-C 6烷基(雜芳基)、-C 1-C 6烷基(C 3-C 7環烷基)、O-C 1-C 6烷基(C 3-C 7環烷基)、B(OH) 2、磷酸酯、膦酸酯及鹵基烷氧基(包括C 1-C 6鹵基烷氧基)。
在一些實施例中,「經取代」或「視情況經取代」上所存在的適合基團為二價基團,包括但不限於側氧基(=O)、=S、=CH 2等。「經取代」或「視情況經取代」位置上的適合基團可為單價、二價或三價的,使得其形成穩定分子且滿足本發明之所需目的。
在一個實施例中,可經1、2、3或4個取代基取代的本文所描述之基團經一個取代基取代。
在一個實施例中,可經1、2、3或4個取代基取代的本文所描述之基團經兩個取代基取代。
在一個實施例中,可經1、2、3或4個取代基取代的本文所描述之基團經三個取代基取代。
在一個實施例中,可經1、2、3或4個取代基取代的本文所描述之基團經四個取代基取代。
「脂族」係指飽和或不飽和、直鏈、分支鏈或環烴。脂族在本文中意欲包括但不限於烷基、烯基、炔基、環烷基、環烯基及環炔基部分,且因此併入有此等定義中之各者。在一實施例中,「脂族」用於指示具有1至20個碳原子之彼等脂族基團。脂族鏈可為例如單不飽和、雙不飽和、三不飽和或多不飽和的,或為炔基。不飽和脂族基可呈順式或反式組態形式。在一個實施例中,脂族基含有1至約12個碳原子,更大體而言,1至約6個碳原子或1至約4個碳原子。在一個實施例中,脂族基含有1至約8個碳原子。在某些實施例中,脂族基為C 1-C 2、C 1-C 3、C 1-C 4、C 1-C 5或C 1-C 6。如本文中所使用之指定範圍指示具有描述為非依賴性物種之範圍之各成員的脂族基。舉例而言,如本文中所使用之術語C 1-C 6脂族指示具有1、2、3、4、5或6個碳原子之直鏈或分支鏈烷基、烯基或炔基且意欲意謂此等中之各者描述為非依賴性物種。舉例而言,如本文中所使用之術語C 1-C 4脂族指示具有1、2、3或4個碳原子之直鏈或分支鏈烷基、烯基或炔基,且意欲意謂此等中之每一者描述為非依賴性物種。在一實施例中,脂族基團經一或多個引起穩定部分形成之官能基取代。
術語「雜脂族」係指在鏈中含有至少一個雜原子(例如胺、羰基、羧基、側氧基、硫基、磷酸、膦酸酯、氮、磷、矽或硼原子)而非碳原子之脂族部分。在一個實施例中,唯一雜原子為氮。在一個實施例中,唯一雜原子為氧。在一個實施例中,唯一雜原子為硫。「雜脂族」在本文中意欲包括但不限於雜烷基、雜烯基、雜炔基、雜環烷基、雜環烯基及雜環炔基部分。在一個實施例中,「雜脂族」用於指示具有1-20個碳原子之雜脂族基(環狀、非環狀、經取代、未經取代、分支鏈或非分支鏈)。在一個實施例中,雜脂族基團視情況以引起穩定部分形成之方式進行取代。雜脂族部分之非限制性實例為聚乙二醇、聚伸烷二醇、醯胺、聚醯胺、聚丙交酯(polylactide)、聚乙交酯、硫醚、醚、烷基-雜環-烷基、-O-烷基-O-烷基、烷基-O-鹵烷基等。
「劑型」意謂活性劑之投藥單元。劑型之實例包括錠劑、膠囊、注射液、懸浮液、液體、乳液、植入物、粒子、球粒、乳膏、軟膏、栓劑、可吸入形式、經皮形式、經頰、舌下、局部、凝膠、黏膜及其類似形式。「劑型」亦可包括植入物,例如眼植入物。
如本文所使用,「有效量」意謂提供治療或預防益處之量。
如本文所用,術語「調節」意謂與不存在治療或化合物之患者中之反應水準相比及/或與其他相同但未治療之患者中之反應水準相比,調節患者中之反應水準之可偵測增加或降低。該術語涵蓋擾動及/或影響天然信號或反應,由此介導患者、較佳人類中之有益治療反應。
「非經腸」投與醫藥組合物包括例如皮下(s.c.)、靜脈內(i.v.)、肌肉內(i.m.)、胸骨內注射或輸注技術。
如本文所使用,術語「肽」、「多肽」及「蛋白質」可互換使用,且係指由藉由肽鍵共價連接之胺基酸殘基構成之化合物。蛋白質或肽必須含有至少兩個胺基酸,且存在於蛋白質或肽序列內之胺基酸之最大數目通常與自然界中所發現之胺基酸數目相當。多肽包括任何包含藉由肽鍵彼此接合之兩個或大於兩個胺基酸的肽或蛋白質。如本文所使用,該術語係指短鏈(其在此項技術中通常亦稱為例如肽、寡肽及寡聚物)及長鏈(其在此項技術中一般稱為蛋白質,其存在多種類型)。「多肽」尤其包括例如生物活性片段、實質上同源多肽、寡肽、均二聚體、雜二聚體、多肽變異株、經修飾之多肽、衍生物、類似物、融合蛋白。多肽包括天然肽、重組肽、合成肽或其組合。
如本文所使用之術語「治療」疾病意謂降低患者經歷之疾病或病症之至少一種病徵或症狀的頻率或嚴重程度(亦即,緩解性治療)或減小疾病或病症之原因或影響(亦即,疾病調節治療)。
在整個本發明中,本發明之各種態樣可以範圍格式呈現。應理解,範圍型式中之描述僅為了方便起見,且不應視為對本發明之範疇的限制。範圍之描述應視為已特定揭示所有可能的子範圍以及彼範圍內之個別數值。舉例而言,對諸如1至6之範圍的描述應被視為已特定揭示子範圍,諸如1至3、1至4、1至5、2至4、2至6、3至6等,以及彼範圍內之個別數值,例如1、2、2.7、3、4、5、5.3及6。不管範圍之廣度如何,此均適用。
如本文所用,「抗病毒活性」係指化合物在本領域用於評估抗病毒活性之各種分析,例如細胞病變效應(CPE)分析、噬菌斑減少分析、VSV-假型中和分析及qPCR分析中展現的抗病毒活性。在一個態樣中,本發明化合物之抗病毒活性係使用CPE分析來量測,且特定言之,抗SARS-CoV-2之抗病毒活性係使用量測A549 +ACE2細胞之保護的CPE分析來確定,該等細胞為在經SARS-CoV-2病毒株(諸如SARS-CoV2,USA/WA-1/2020病毒株)感染後,經工程化以組成型表現人類血管收縮素轉化酶-2 (ACE2)之肺上皮細胞。CPE分析之非限制性實例包括Yan等人「Simple Ripid In Vitro Screening Method for SARS-CoV2 Anti-Virals That Identifies Potential Cytomorbidity-Associated False Positives」, Virology Journal, 2021, 18, 123, doi.org/10.1186/s12985-021-01587-z中所述之分析。
如本文中所使用,「醫藥組合物」為包含至少一種活性劑及至少一種其他物質(諸如載劑)之組合物。「醫藥組合」為至少兩種活性劑之組合,其可合併為單一劑型或以單獨的劑型與活性劑一起用於治療本文所描述之任何病症的說明書一起提供。
如本文中所使用,「醫藥學上可接受之鹽」為所揭示之化合物之衍生物,其中親本化合物藉由製備其無機及有機、無毒、酸或鹼加成鹽來改質。本發明化合物之鹽可藉由習知化學方法自含有鹼性或酸性部分之親本化合物合成。通常,該等鹽可藉由使此等化合物之游離酸形式與化學計算量之適當鹼(諸如Na、Ca、Mg或K之氫氧化物、碳酸鹽、碳酸氫鹽或其類似物)反應,或藉由使此等化合物之游離鹼形式與化學計算量之適當酸反應來製備。該等反應通常在水中或有機溶劑中,或在兩者之混合物中進行。一般而言,在可行之情況下,非水性介質(如乙醚、乙酸乙酯、乙醇、異丙醇或乙腈)為典型的。本發明化合物之鹽進一步包括化合物及化合物鹽之溶劑合物。
醫藥學上可接受之鹽的實例包括但不限於鹼性殘基(諸如胺)之礦物鹽或有機酸鹽;酸性殘基(諸如羧酸)之鹼鹽或有機鹽;及其類似物。醫藥學上可接受之鹽包括母體化合物與例如無毒無機酸或有機酸形成之習知無毒鹽及四級銨鹽。舉例而言,習知的無毒酸式鹽包括自無機酸(諸如鹽酸、氫溴酸、硫酸、胺磺酸、磷酸、硝酸及其類似酸)衍生的鹽;及由有機酸(諸如乙酸、丙酸、丁二酸、乙醇酸、硬脂酸、乳酸、蘋果酸、酒石酸、檸檬酸、抗壞血酸、雙羥萘酸、順丁烯二酸、羥基順丁烯二酸、苯乙酸、麩胺酸、苯甲酸、水楊酸、甲磺酸、乙磺酸、苯磺酸、對胺基苯磺酸、2-乙醯氧基苯甲酸、反丁烯二酸、甲苯磺酸、甲烷磺酸、乙烷二磺酸、草酸、羥乙基磺酸、HOOC-(CH 2) n-COOH,其中n為0-4,及其類似酸)製備的鹽,或使用產生相同相對離子的不同酸。其他適合鹽之清單可見於例如 Remington's Pharmaceutical Sciences,第17版, Mack Publishing Company, Easton, Pa.,第1418頁(1985)中。
本發明之醫藥組合物/組合中所應用的術語「載劑」係指藉以提供活性化合物之稀釋劑、賦形劑或媒劑。
「醫藥學上可接受之載劑」意謂適用於製備醫藥組合物/組合的載劑或賦形劑,其大體而言安全、無毒性且對於投與宿主(通常為人類)而言既無生物學不當、亦無其他不當。在一個實施例中,使用獸醫學用途可接受的賦形劑。
「患者」或「個體」為需要治療或預防如本文所特定描述之病症中之任一者的人類或非人類動物,例如藉由可根據本發明降解之天然(野生型)或經修飾(非野生型)蛋白質調節,從而產生治療效果。如本文中進一步描述,字詞「患者」或「個體」通常係指人類患者或個體,除非自上下文或措辭瞭解本發明意欲包括非人類動物。通常,患者為人類。在替代實施例中,患者或個體為需要此類療法且對其有反應之非人類動物。
本發明之醫藥組合物或組合之「治療有效量」意謂在向患者(通常為人類患者)投與時可有效提供諸如改善疾病症狀或減輕或減弱疾病自身之治療益處的量。
「前藥」係母體分子之一種型式,其在活體內,例如在哺乳動物或人類中代謝或化學轉化為母體分子。前藥之非限制性實例包括酯、醯胺(例如分離自一級或二級胺)、碳酸酯、胺基甲酸酯、磷酸酯、縮酮、亞胺、㗁唑啶及噻唑啶。前藥可經設計以在pH變化(例如在胃或腸中)或酶(例如酯酶或醯胺酶)作用時釋放母體分子。舉例而言,當母體分子為以下者時:
Figure 02_image142
前藥之非限制性實例可包括
Figure 02_image144
除非另外定義,否則本文中所使用之所有技術及科學術語均具有與本申請案所屬的領域之一般熟習此項技術者通常所理解的相同的含義。在本說明書中,除非上下文另外明確規定,否則單數形式亦包括複數。儘管與本文中所描述之方法及材料類似或等效的方法及材料可用於實踐或測試本申請案,但在下文描述適合的方法及材料。所有公開案、專利申請案、專利及本文所提及之其他參考文獻均以引用之方式併入。不承認本文所引用之參考文獻為所主張之申請案的先前技術。在衝突之情況下,以本說明書(包括其特定定義)為主。另外,材料、方法及實例僅為說明性的且並不意欲為限制性的。 II. NSP3 靶向配體
用於本發明之降解劑中之NSP3靶向配體的非限制性實例包括:
Figure 02_image146
Figure 02_image148
Figure 02_image150
Figure 02_image152
在某些實施例中,NSP3靶向配體選自:
Figure 02_image154
在某些實施例中,NSP3靶向配體選自:
Figure 02_image156
Figure 02_image158
Figure 02_image160
在某些實施例中,NSP3靶向配體選自:
Figure 02_image162
Figure 02_image164
Figure 02_image166
在某些實施例中,NSP3靶向配體選自:
Figure 02_image168
Figure 02_image170
Figure 02_image172
在某些實施例中,NSP3靶向配體選自:
Figure 02_image174
Figure 02_image176
Figure 02_image178
在某些實施例中,NSP3靶向配體選自:
Figure 02_image180
Figure 02_image182
Figure 02_image184
在某些實施例中,NSP3靶向配體選自:
Figure 02_image186
Figure 02_image188
Figure 02_image190
在某些實施例中,NSP3靶向配體選自:
Figure 02_image192
Figure 02_image194
Figure 02_image196
在某些實施例中,NSP3靶向配體選自:
Figure 02_image198
Figure 02_image200
Figure 02_image202
Figure 02_image204
在某些實施例中,NSP3靶向配體選自:
Figure 02_image206
Figure 02_image208
Figure 02_image210
Figure 02_image212
在某些實施例中,NSP3靶向配體選自:
Figure 02_image214
Figure 02_image216
Figure 02_image218
在某些實施例中,NSP3靶向配體選自
Figure 02_image220
Figure 02_image222
Figure 02_image224
Figure 02_image226
Figure 02_image228
Figure 02_image230
Figure 02_image232
Figure 02_image234
Figure 02_image236
Figure 02_image238
Figure 02_image240
Figure 02_image242
Figure 02_image244
Figure 02_image246
Figure 02_image248
Figure 02_image250
.
Figure 02_image252
Figure 02_image254
III. 本發明之實施例 R 1 R 2 R 3 R 4 R 5 之實施例
在某些實施例中,R 1為氫。
在某些實施例中,R 1為烷基。
在某些實施例中,R 1為烯基。
在某些實施例中,R 1為炔基。
在某些實施例中,R 1為鹵素。在某些實施例中,R 1為鹵素,其中該鹵素為F。在某些實施例中,R 1為鹵素,其中該鹵素為Cl。在某些實施例中,R 1為鹵素,其中該鹵素為Br。在某些實施例中,R 1為鹵素,其中該鹵素為I。
在某些實施例中,R 2為氫。在某些實施例中,R 2為氫,其中該氫經1、2、3或4個獨立地選自R 10之取代基取代。
在某些實施例中,R 2為烷基。在某些實施例中,R 2為烷基,其中該烷基經1、2、3或4個獨立地選自R 10之取代基取代。
在某些實施例中,R 2為鹵烷基。在某些實施例中,R 2為鹵烷基,其中該鹵烷基經1、2、3或4個獨立地選自R 10之取代基取代。   在某些實施例中,R 2為烯基。在某些實施例中,R 2為烯基,其中該烯基經1、2、3或4個獨立地選自R 10之取代基取代。
在某些實施例中,R 2為炔基。在某些實施例中,R 2為炔基,其中該炔基經1、2、3或4個獨立地選自R 10之取代基取代。
在某些實施例中,R 2為芳基。在某些實施例中,R 2為芳基,其中該芳基經1、2、3或4個獨立地選自R 10之取代基取代。
在某些實施例中,R 2為雜芳基。在某些實施例中,R 2為雜芳基,其中該雜芳基經1、2、3或4個獨立地選自R 10之取代基取代。
在某些實施例中,R 2為雜環。在某些實施例中,R 2為雜環,其中該雜環經1、2、3或4個獨立地選自R 10之取代基取代。
在某些實施例中,R 2為C(O)R 9。在某些實施例中,R 2為C(O)R 9,其中該C(O)R 9經1、2、3或4個獨立地選自R 10之取代基取代。
在某些實施例中,R 3為氫。
在某些實施例中,R 3為烷基。
在某些實施例中,R 3為烯基。
在某些實施例中,R 3為炔基。
在某些實施例中,R 3為鹵素。在某些實施例中,R 3為鹵素,其中該鹵素為F。在某些實施例中,R 3為鹵素,其中該鹵素為Cl。在某些實施例中,R 3為鹵素,其中該鹵素為Br。在某些實施例中,R 3為鹵素,其中該鹵素為I。
在某些實施例中,R 4為氫。
在某些實施例中,R 4為烷基。
在某些實施例中,R 4為烯基。
在某些實施例中,R 4為炔基。
在某些實施例中,R 4為鹵素。在某些實施例中,R 4為鹵素,其中該鹵素為F。在某些實施例中,R 4為鹵素,其中該鹵素為Cl。在某些實施例中,R 4為鹵素,其中該鹵素為Br。在某些實施例中,R 4為鹵素,其中該鹵素為I。
在某些實施例中,R 3及R 4與其所結合之碳一起形成3員、4員、5員或6員螺碳環。在某些實施例中,R 3及R 4與其所結合之碳一起形成3員螺碳環。在某些實施例中,R 3及R 4與其所結合之碳一起形成4員螺碳環。在某些實施例中,R 3及R 4與其所結合之碳一起形成5員螺碳環。在某些實施例中,R 3及R 4與其所結合之碳一起形成6員螺碳環。
在某些實施例中,R 3及R 4與其所結合之碳一起形成4員、5員或6員螺雜環,該螺雜環包含1或2個選自N、O及S之雜原子,或側氧基。
在某些實施例中,R 3及R 4與其所結合之碳一起形成4員螺雜環,該螺雜環包含1或2個選自N、O及S之雜原子,或側氧基。
在某些實施例中,R 3及R 4與其所結合之碳一起形成5員螺雜環,該螺雜環包含1或2個選自N、O及S之雜原子,或側氧基。
在某些實施例中,R 3及R 4與其所結合之碳一起形成6員螺雜環,該螺雜環包含1或2個選自N、O及S之雜原子,或側氧基。
在某些實施例中,R 5為烷基。
在某些實施例中,R 5為鹵烷基。
在某些實施例中,R 5為烯基。
在某些實施例中,R 5為炔基。
在某些實施例中,R 5為鹵素。在某些實施例中,R 5為鹵素,其中該鹵素為F。在某些實施例中,R 5為鹵素,其中該鹵素為Cl。在某些實施例中,R 5為鹵素,其中該鹵素為Br。在某些實施例中,R 5為鹵素,其中該鹵素為I。
在某些實施例中,R 5為雜芳基。在某些實施例中,R 5為芳基。在某些實施例中,R 5為雜環。
在某些實施例中,R 5為氰基。
在某些實施例中,R 5為-NR 7R 8。在某些實施例中,R 5為-NR 7C(O)R 9。在某些實施例中,R 5為-NR 7C(S)R 9。在某些實施例中,R 5為-NR 7C(O)R 9。在某些實施例中,R 5為-NR 7S(O) 2R 9
在某些實施例中,R 5為-OR 7-
在某些實施例中,R 5為-SR 7。在某些實施例中,R 5為-S(O) 2R 9
在某些實施例中,R 5為-C(O)R 9
在某些實施例中,至少一個R 5為側氧基。
在某些實施例中,一個R 5為側氧基。
在某些實施例中,兩個R 5 '為側氧基。 R 15 R 16 之實施例
R 15及R 16之非限制性實例包括:
Figure 02_image256
Figure 02_image258
Figure 02_image260
Figure 02_image262
在某些實施例中,本發明之化合物具有下式:
Figure 02_image264
Figure 02_image266
Figure 02_image268
Figure 02_image270
; 或其醫藥學上可接受之鹽。
在某些實施例中,本發明之化合物具有下式:
Figure 02_image272
在某些實施例中,本發明之化合物具有下式:
Figure 02_image274
Figure 02_image276
在某些實施例中,本發明之化合物具有下式:
Figure 02_image278
Figure 02_image280
在某些實施例中,本發明之化合物具有下式:
Figure 02_image282
Figure 02_image284
在某些實施例中,本發明之化合物具有下式:
Figure 02_image286
Figure 02_image288
在某些實施例中,本發明之化合物具有下式:
Figure 02_image290
在某些實施例中,本發明之化合物具有下式:
Figure 02_image292
在某些實施例中,本發明之化合物具有下式:
Figure 02_image294
Figure 02_image296
在某些實施例中,本發明之化合物具有下式:
Figure 02_image298
Figure 02_image300
在某些實施例中,本發明之化合物具有下式:
Figure 02_image302
Figure 02_image304
在某些實施例中,本發明之化合物具有下式:
Figure 02_image306
在某些實施例中,本發明之化合物具有下式:
Figure 02_image308
Figure 02_image310
在某些實施例中,本發明之化合物具有下式:
Figure 02_image312
Figure 02_image314
在某些實施例中,本發明之化合物具有下式:
Figure 02_image316
在某些實施例中,本發明之化合物具有下式:
Figure 02_image318
在某些實施例中,本發明之化合物具有下式:
Figure 02_image320
Figure 02_image322
在某些實施例中,本發明之化合物具有下式:
Figure 02_image324
Figure 02_image326
在某些實施例中,本發明之化合物具有下式:
Figure 02_image328
Figure 02_image330
在某些實施例中,本發明之化合物選自:
Figure 02_image332
在某些實施例中,本發明之化合物選自:
Figure 02_image334
在某些實施例中,本發明之化合物選自:
Figure 02_image336
在某些實施例中,本發明之化合物選自:
Figure 02_image338
Figure 02_image340
在某些實施例中,本發明之化合物選自:
Figure 02_image342
Figure 02_image344
在以上實施例及整個說明書中,z為0、1、2、3或4。
在某些實施例中,本發明之化合物選自:
Figure 02_image346
Figure 02_image348
R 16 R 17 R 18 R 27 R 28 之實施例
在某些實施例中,R 16
Figure 02_image350
,其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5的取代基取代。
在某些實施例中,R 16
Figure 02_image352
,其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5的取代基取代。
在某些實施例中,R 16
Figure 02_image354
,其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5的取代基取代。
在某些實施例中,R 16
Figure 02_image356
,其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5的取代基取代。
在某些實施例中,R 16為R 12
在某些實施例中,R 16
Figure 02_image358
,其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5的取代基取代。
在某些實施例中,R 17
Figure 02_image360
,其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5的取代基取代。
在某些實施例中,R 17
Figure 02_image352
,其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5的取代基取代。
在某些實施例中,R 17
Figure 02_image363
,其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5的取代基取代。
在某些實施例中,R 17
Figure 02_image365
,其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5的取代基取代。
在某些實施例中,R 17
Figure 02_image367
,其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5的取代基取代。
在某些實施例中,R 18
Figure 02_image369
,其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5的取代基取代。
在某些實施例中,R 18
Figure 02_image352
,其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5的取代基取代。
在某些實施例中,R 18
Figure 02_image372
,其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5的取代基取代。
在某些實施例中,R 18
Figure 02_image374
,其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5的取代基取代。
在某些實施例中,R 18
Figure 02_image376
,其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5的取代基取代。
在某些實施例中,R 27
Figure 02_image378
,其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 29的取代基取代。
在某些實施例中,R 27
Figure 02_image380
,其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 29的取代基取代。
在某些實施例中,R 27
Figure 02_image382
,其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 29的取代基取代。
在某些實施例中,R 27
Figure 02_image384
,其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 29的取代基取代。
在某些實施例中,R 28
Figure 02_image386
,其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 30的取代基取代。
在某些實施例中,R 28
Figure 02_image380
,其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 30的取代基取代。
在某些實施例中,
Figure 02_image389
選自
Figure 02_image391
,其中各Y獨立地選自N、CH或CR 5,其中Y之0、1、2、3或4個(如上下文所允許)實例經選擇為N且經選擇以產生熟習此項技術者熟知且形成醫藥學上可接受之化合物的穩定環。
在某些實施例中,
Figure 02_image393
選自
Figure 02_image395
,其中各Y獨立地選自N、CH或CR 5,其中Y之0、1、2、3或4個(如上下文所允許)實例經選擇為N且經選擇以產生熟習此項技術者熟知且形成醫藥學上可接受之化合物的穩定環。
當存在於本發明化合物中時,
Figure 02_image397
之實例包括以下:
Figure 02_image399
Figure 02_image401
Figure 02_image403
之額外實例包括以下:
Figure 02_image405
Figure 02_image407
Figure 02_image409
之額外實例包括以下:
Figure 02_image411
Figure 02_image413
Figure 02_image415
之額外實例包括以下:
Figure 02_image417
Figure 02_image419
Figure 02_image421
Figure 02_image423
之額外實例包括以下:
Figure 02_image425
Figure 02_image427
Figure 02_image429
Figure 02_image431
Figure 02_image433
之額外實例包括以下:
Figure 02_image435
Figure 02_image437
Figure 02_image439
Figure 02_image441
Figure 02_image443
之額外實例包括以下:
Figure 02_image445
Figure 02_image447
Figure 02_image449
在某些實施例中,
Figure 02_image451
選自
Figure 02_image453
當存在於本發明化合物中時,
Figure 02_image455
之實例包括:
Figure 02_image457
Figure 02_image459
Figure 02_image461
之額外實例包括:
Figure 02_image463
Figure 02_image465
Figure 02_image467
之額外實例包括:
Figure 02_image469
Figure 02_image471
Figure 02_image473
之額外實例包括:
Figure 02_image475
Figure 02_image477
Figure 02_image479
之額外實例包括:
Figure 02_image481
Figure 02_image483
Figure 02_image485
當存在於本發明化合物中時,
Figure 02_image487
之實例包括:
Figure 02_image489
Figure 02_image491
Figure 02_image493
Figure 02_image495
之額外實例包括:
Figure 02_image497
Figure 02_image499
Figure 02_image501
Figure 02_image503
之額外實例包括:
Figure 02_image505
Figure 02_image507
Figure 02_image509
Figure 02_image511
之額外實例包括:
Figure 02_image513
Figure 02_image515
Figure 02_image517
之額外實例包括:
Figure 02_image519
Figure 02_image521
Figure 02_image523
額外實施例:1.      在某些態樣中,提供一種式A化合物:
Figure 02_image525
(A); 或其醫藥學上可接受之鹽、 N-氧化物、同位素類似物或前藥,視情況在醫藥學上可接受之載劑中以形成組合物; 其中: 雜環部分選自:
Figure 02_image527
; Q為CH 2、NR 2、O或S; X 3、X 4、X 5及X 6獨立地選自N、CH及CR 5,其中X 3、X 4、X 5及X 6中之一者為連接至連接子之碳原子; R 1、R 3、R 4及R 6獨立地選自氫、烷基、烯基、炔基及鹵素; 或R 3及R 4與其所結合之碳一起形成3、4、5或6員螺碳環;包含1或2個選自N、O及S之雜原子的4、5或6員螺雜環;或側氧基; 或R 1與R 6組合在一起以形成1或2-碳橋;例如
Figure 02_image529
Figure 02_image531
; 或R 1與R 3組合在一起以形成3-6員稠環;例如
Figure 02_image533
Figure 02_image535
; 各R 2選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、芳基、雜芳基、雜環及-C(O)R 9,其各自視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 10之取代基取代; 各R 5獨立地選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、鹵素、芳基、雜芳基、雜環、氰基、硝基、-NR 7R 8、-OR 7、-SR 7、-C(O)R 9、-C(S)R 9、-S(O)R 9、-S(O) 2R 9、-OC(O)R 9、-OC(S)R 9、-OS(O)R 9、-OS(O) 2R 9、-SC(O)R 9、-OS(O) 2R 9、-NR 7C(O)R 9、-NR 7C(S)R 9、-NR 7S(O)R 9、-NR 7S(O) 2R 9、-P(O)(R 9) 2、-SP(O)(R 9) 2、-NR 7P(O)(R 9) 2及-OP(O)(R 9) 2;除了氫、鹵素、氰基及硝基之外的各者視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 10之取代基取代; R 16選自:
Figure 02_image537
Figure 02_image539
及R 12,其各自視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代; R 17選自:
Figure 02_image541
Figure 02_image543
,其各自視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代; R 18選自:
Figure 02_image541
Figure 02_image546
,其各自經由C-N鍵連接至氮雜戊二醯亞胺部分且各R 18視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代;例如
Figure 02_image548
,但不包括
Figure 02_image550
; 環為視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代且經1個R 12取代基取代之稠合芳基或雜芳基; 螺環為視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代且經1個R 12取代基取代之環烷基、環烯或雜環基; R 12為與連接子之連接點; R 7及R 8在各情況下獨立地選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、芳基、雜芳基、雜環及C(O)R 14,除了氫之外的各者視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 10之取代基取代; 各R 9獨立地選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、芳基、雜芳基、雜環、-NR 7R 8、-OR 7及-SR 7,其各自視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 10之取代基取代; 各R 10獨立地選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、鹵素、芳基、雜芳基、雜環、氰基、硝基、-NR 11R 13、-OR 11、-SR 11、-C(O)R 14、-C(S)R 14、-S(O)R 14、-S(O) 2R 14、-OC(O)R 14、-OC(S)R 14、-OS(O)R 14、-OS(O) 2R 14、-NR 11C(O)R 14、-NR 11C(S)R 14、-NR 11S(O)R 14、-NR 11S(O) 2R 14、-P(O)(R 14) 2、-NR 11P(O)(R 14) 2及-OP(O)(R 14) 2;除了氫、鹵素、氰基及硝基之外的各者視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 15之取代基取代; R 11及R 13在各情況下獨立地選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、芳基、雜芳基、雜環、-C(O)R 14、-C(S)R 14、-S(O)R 14、-S(O) 2R 14及-P(O)(R 14) 2;其各自視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 15之取代基取代; 各R 14獨立地選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、芳基、雜芳基、雜環、胺基、羥基、烷氧基、-N(H)(烷基)及-N(烷基) 2,除了氫之外的各者視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 15之取代基取代; 各R 15獨立地選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、鹵素、芳基、雜芳基、雜環、氰基、硝基、胺基、羥基、烷氧基、-N(H)(烷基)及-N(烷基) 2; 連接子為二價化學基團; NSP3靶向配體選自:
Figure 02_image552
Figure 02_image554
; y為0或1; 稠環為視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代之稠合芳基、雜芳基、環烷基或雜環基; X 16選自
Figure 02_image556
Figure 02_image558
Figure 02_image560
及鍵; X 17選自CR 33R 34、C(O)、C(S)、S(O)及S(O) 2; 各x獨立地為0、1、2、3或4; X 8、X 9、X 10、X 11、X 12、X 13、X 14及X 15獨立地選自N、CH及CR 28; R 27選自
Figure 02_image562
Figure 02_image564
,其各自視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 29之取代基取代; 各R 28、R 29及R 30獨立地選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、鹵素、芳基、雜芳基、雜環、氰基、硝基、-NR 7R 8、-OR 7、-SR 7、-C(O)R 9、-C(S)R 9、-S(O)R 9、-S(O) 2R 9、-OC(O)R 9、-OC(S)R 9、-OS(O)R 9、-OS(O) 2R 9、-SC(O)R 9、-OS(O) 2R 9、-NR 7C(O)R 9、-NR 7C(S)R 9、-NR 7S(O)R 9、-NR 7S(O) 2R 9、-P(O)(R 9) 2、-SP(O)(R 9) 2、-NR 7P(O)(R 9) 2及-OP(O)(R 9) 2;除了氫、鹵素、氰基及硝基之外的各者視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 10之取代基取代; 各R 31、R 32、R 33及R 34獨立地選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、鹵素、芳基、雜芳基、雜環、氰基、硝基、-C(O)R 9、-C(S)R 9、-S(O)R 9、-S(O) 2R 9、-OC(O)R 9、-OC(S)R 9、-OS(O)R 9、-OS(O) 2R 9、-SC(O)R 9、-OS(O) 2R 9、-NR 7C(O)R 9、-NR 7C(S)R 9、-NR 7S(O)R 9、-NR 7S(O) 2R 9、-P(O)(R 9) 2、-SP(O)(R 9) 2、-NR 7P(O)(R 9) 2及-OP(O)(R 9) 2;除了氫、鹵素、氰基及硝基之外的各者視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 10之取代基取代。 2.      如實施例1之化合物,其中連接子係選自
Figure 02_image566
; 其中: X 1及X 2在各次出現時獨立地選自鍵、雜環、NR 2、C(R 2) 2、O、C(O)及S; R 20、R 21、R 22、R 23及R 24在各次出現時獨立地選自由二價部分組成之群,該等二價部分選自鍵結烷基、-C(O)-、-C(O)O-、-OC(O)-、-SO 2-、-S(O)-、-C(S)-、-C(O)NR 2-、-NR 2C(O)-、-O-、-S-、-NR 2-、-C(R 40R 40)-、-P(O)(OR 26)O-、-P(O)(OR 26)-、雙環、烯、炔、鹵烷基、烷氧基、芳基、雜環、脂族基、雜脂族基、雜芳基、乳酸、乙醇酸及碳環;其各自視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 40之取代基取代; R26在各次出現時獨立地選自由以下組成之群:氫、烷基、芳烷基、雜芳烷基、烯烴、炔烴、芳基、雜芳基、雜環、脂族基及雜脂族基;且 R 40在各次出現時獨立地選自由以下組成之群:氫、烷基、烯烴、炔烴、氟、溴、氯、羥基、烷氧基、疊氮化物、胺基、氰基、-NH(脂族基,包括烷基)、-N(脂族基,包括烷基) 2、-NHSO 2(脂族基,包括烷基)、-N(脂族基,包括烷基)SO 2烷基、-NHSO 2(芳基、雜芳基或雜環)、-N(烷基)SO 2(芳基、雜芳基或雜環)、-NHSO 2烯基、-N(烷基)SO 2烯基、-NHSO 2炔基、-N(烷基)SO 2炔基、鹵烷基、脂族基、雜脂族基、芳基、雜芳基、雜環及環烷基。 3.      如實施例2之化合物,其中連接子選自:
Figure 02_image568
。 4.      如實施例2之化合物,其中連接子選自:
Figure 02_image570
。 5.      如實施例2之化合物,其中連接子選自:
Figure 02_image572
。 6.      如實施例1-5中任一項之化合物,其中雜環部分為
Figure 02_image574
。 7.      如實施例6之化合物,其中Q為NH。 8.      如實施例6之化合物,其中Q為NCH 3。 9.      如實施例6之化合物,其中Q為CH 2。 10.   如實施例1-5中任一項之化合物,其中雜環部分為
Figure 02_image576
。 11.   如實施例1-5中任一項之化合物,其中雜環部分為
Figure 02_image578
。 12.   如實施例1-11中任一項之化合物,其中R 16
Figure 02_image580
, 其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代。 13.   如實施例1-11中任一項之化合物,其中R 16
Figure 02_image582
, 其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代。 14.   如實施例1-11中任一項之化合物,其中R 16
Figure 02_image584
, 其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代。 15.   如實施例1-11中任一項之化合物,其中R 16
Figure 02_image586
, 其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代。 16.   如實施例1-11中任一項之化合物,其中R 16
Figure 02_image588
, 其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代。 17.   如實施例1-11中任一項之化合物,其中R 16為R 12。 18.   如實施例1-5中任一項之化合物,其中雜環部分為
Figure 02_image590
。 19.   如實施例18之化合物,其中R 17
Figure 02_image592
, 其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代。 20.   如實施例18之化合物,其中R 17
Figure 02_image582
, 其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代。 21.   如實施例18之化合物,其中R 17
Figure 02_image595
, 其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代。 22.   如實施例18之化合物,其中R 17
Figure 02_image597
, 其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代。 23.   如實施例18之化合物,其中R 17
Figure 02_image599
, 其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代。 24.   如實施例18之化合物,其中R 17為R 12。 25.   如實施例1-5中任一項之化合物,其中雜環部分為
Figure 02_image601
。 26.   如實施例25之化合物,其中R 18
Figure 02_image603
, 其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代。 27.   如實施例25之化合物,其中R 18
Figure 02_image582
, 其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代。 28.   如實施例1-5中任一項之化合物,其中雜環部分為
Figure 02_image606
。 29.   如實施例28之化合物,其中環為苯基。 30.   如實施例1-5中任一項之化合物,其中雜環部分為
Figure 02_image608
。 31.   如實施例1-5中任一項之化合物,其中雜環部分為
Figure 02_image610
。 32.   如實施例1-5中任一項之化合物,其中雜環部分為
Figure 02_image612
。 33.   如實施例1-5中任一項之化合物,其中雜環部分為
Figure 02_image614
。 34.   如實施例1-5中任一項之化合物,其中雜環部分為
Figure 02_image616
。 35.   如實施例31-34中任一項之化合物,其中X 6為CR 12。 36.   如實施例31-34中任一項之化合物,其中X 5為CR 12。 37.   如實施例31-34中任一項之化合物,其中X 4為CR 12。 38.   如實施例31-34中任一項之化合物,其中X 3為CR 12。 39.   如實施例31-34或36-38中任一項之化合物,其中X 6為CH。 40.   如實施例31-34或36-38中任一項之化合物,其中X 6為CR 5。 41.   如實施例31-34或36-38中任一項之化合物,其中X 6為N。 42.   如實施例31-35或37-41中任一項之化合物,其中X 5為CH。 43.   如實施例31-35或37-41中任一項之化合物,其中X 5為CR 5。 44.   如實施例31-35或37-41中任一項之化合物,其中X 5為N。 45.   如實施例31-36或38-44中任一項之化合物,其中X 4為CH。 46.   如實施例31-36或38-44中任一項之化合物,其中X 4為CR 5。 47.   如實施例31-36或38-44中任一項之化合物,其中X 4為N。 48.   如實施例31-37或39-47中任一項之化合物,其中X 3為CH。 49.   如實施例31-37或39-47中任一項之化合物,其中X 3為CR 5。 50.   如實施例31-37或39-47中任一項之化合物,其中X 3為N。 51.   如實施例1-5中任一項之化合物,其中雜環為
Figure 02_image618
。 52.   如實施例1-51中任一項之化合物,其中R 3為氫。 53.   如實施例1-52中任一項之化合物,其中R 4為氫。 54.   如實施例1-53中任一項之化合物,其中R 6為氫。 55.   如實施例1-54中任一項之化合物,其中連接子具有下式:
Figure 02_image620
。 56.   如實施例55之化合物,其中X 1為鍵。 57.   如實施例55之化合物,其中X 1為雜環。 58.   如實施例55之化合物,其中X 1為NR 2。 59.   如實施例55之化合物,其中X 1為C(O)。 60.   如實施例55-59中任一項之化合物,其中X 2為鍵。 61.   如實施例55-59中任一項之化合物,其中X 2為雜環。 62.   如實施例55-59中任一項之化合物,其中X 2為NR 2。 63.   如實施例55-59中任一項之化合物,其中X 2為C(O)。 64.   如實施例55-63中任一項之化合物,其中R 20為鍵。 65.   如實施例55-63中任一項之化合物,其中R 20為CH 2。 66.   如實施例55-63中任一項之化合物,其中R 20為雜環。 67.   如實施例55-63中任一項之化合物,其中R 20為芳基。 68.   如實施例55-63中任一項之化合物,其中R 20為苯基。 69.   如實施例55-63中任一項之化合物,其中R 20為雙環。 70.   如實施例55-69中任一項之化合物,其中R 21為鍵。 71.   如實施例55-69中任一項之化合物,其中R 21為CH 2。 72.   如實施例55-69中任一項之化合物,其中R 21為雜環。 73.   如實施例55-69中任一項之化合物,其中R 21為芳基。 74.   如實施例55-69中任一項之化合物,其中R 21為苯基。 75.   如實施例55-69中任一項之化合物,其中R 21為雙環。 76.   如實施例1-54中任一項之化合物,其中連接子具有下式:
Figure 02_image622
。 77.   如實施例55-76中任一項之化合物,其中R 22為鍵。 78.   如實施例55-76中任一項之化合物,其中R 22為CH 2。 79.   如實施例55-76中任一項之化合物,其中R 22為雜環。 80.   如實施例55-76中任一項之化合物,其中R 22為芳基。 81.   如實施例55-76中任一項之化合物,其中R 22為苯基。 82.   如實施例55-76中任一項之化合物,其中R 22為雙環。 83.   如實施例1-54中任一項之化合物,其中連接子具有下式:
Figure 02_image624
。 84.   如實施例55-83中任一項之化合物,其中R 23為鍵。 85.   如實施例55-83中任一項之化合物,其中R 23為CH 2。 86.   如實施例55-83中任一項之化合物,其中R 23為雜環。 87.   如實施例55-83中任一項之化合物,其中R 23為芳基。 88.   如實施例55-83中任一項之化合物,其中R 23為苯基。 89.   如實施例55-83中任一項之化合物,其中R 23為雙環。 90.   如實施例1-54中任一項之化合物,其中連接子具有下式:
Figure 02_image626
。 91.   如實施例55-90中任一項之化合物,其中R 24為鍵。 92.   如實施例55-90中任一項之化合物,其中R 24為CH 2。 93.   如實施例55-90中任一項之化合物,其中R 24為雜環。 94.   如實施例55-90中任一項之化合物,其中R 24為芳基。 95.   如實施例55-90中任一項之化合物,其中R 24為苯基。 96.   如實施例55-90中任一項之化合物,其中R 24為雙環。 97.   如實施例55-90中任一項之化合物,其中R 24為C(O)。 98.   如實施例1-97中任一項之化合物,其中該NSP3靶向配體選自:
Figure 02_image628
。 99.   如實施例1-97中任一項之化合物,其中該NSP3靶向配體選自:
Figure 02_image630
。 100. 如實施例1-97中任一項之化合物,其中NSP3靶向配體選自:
Figure 02_image632
。 101. 如實施例1-97中任一項之化合物,其中該NSP3靶向配體選自:
Figure 02_image634
。 102. 如實施例1-97中任一項之化合物,其中該NSP3靶向配體選自:
Figure 02_image636
。 103. 如實施例1-97中任一項之化合物,其中該NSP3靶向配體選自:
Figure 02_image638
。 104. 如實施例1-97中任一項之化合物,其中該NSP3靶向配體選自:
Figure 02_image640
。 105. 如實施例1-97中任一項之化合物,其中該NSP3靶向配體選自:
Figure 02_image642
。 106. 如實施例103-105中任一項之化合物,其中X 18為CH。 107. 如實施例103-105中任一項之化合物,其中X 18為N。 108. 如實施例1-107中任一項之化合物,其中X 16
Figure 02_image644
。 109. 如實施例1-105中任一項之化合物,其中X 16
Figure 02_image646
Figure 02_image648
。 110. 如實施例1-105中任一項之化合物,其中X 16
Figure 02_image650
Figure 02_image652
。 111. 如實施例1-105中任一項之化合物,其中X 16為鍵。 112. 在某些實施例中,提供來自表1之化合物。 113. 在某些實施例中,提供如實施例1-113中任一項之化合物,其具有小於1 µM之抗病毒活性EC50。 114. 在某些實施例中,提供一種醫藥組合物,其包含有效量之如實施例1-114中任一項之化合物及醫藥學上可接受之賦形劑。 115. 在某些實施例中,提供一種治療冠狀病毒之方法,其包含投與有效量之如實施例1-114中任一項之化合物或如實施例115之醫藥組合物。 116. 如實施例116之方法,其中該冠狀病毒為SARS-CoV-2。 117. 如實施例117之方法,其中該冠狀病毒為SARS-CoV-2變異株。 118. 如實施例118之方法,其中該SARS-CoV-2變異株為α變異株。 119. 如實施例118之方法,其中該SARS-CoV-2變異株為β變異株。 120. 如實施例118之方法,其中該SARS-CoV-2變異株為γ變異株。 121. 如實施例118之方法,其中該SARS-CoV-2變異株為δ變異株。 122. 如實施例118之方法,其中該SARS, CoV-2變異株為o變異株。 123. 如實施例123之方法,其中該o變異株選自BA.2、BA.2.12.1、BA.2.75、BA.3、BA.4或BA.5。 IV. 本發明之例示性化合物
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image654
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image656
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image658
Figure 02_image660
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image662
Figure 02_image664
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image666
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image668
Figure 02_image670
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image672
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image674
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image676
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image678
Figure 02_image680
Figure 02_image682
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image684
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image686
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image688
Figure 02_image690
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image692
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image694
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image696
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image698
Figure 02_image700
Figure 02_image702
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image704
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image706
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image708
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image710
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image712
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image714
Figure 02_image716
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image718
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image720
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image722
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image724
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image726
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image728
在某些實施例中,雜環部分選自:
Figure 02_image730
Figure 02_image734
雜環部分的非限制性實例包括:
Figure 02_image736
Figure 02_image738
Figure 02_image740
Figure 02_image742
Figure 02_image744
雜環部分的非限制性實例包括:
Figure 02_image746
Figure 02_image748
Figure 02_image750
Figure 02_image752
Figure 02_image754
Figure 02_image756
Figure 02_image758
在替代實施例中,雜環部分選自
Figure 02_image760
; 其中稠環A、稠環B及稠環C獨立地選自稠合芳基、雜芳基、環烷基及雜環,其各自視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5的取代基取代。
在替代實施例中,雜環部分選自
Figure 02_image762
Figure 02_image764
在某些實施例中,稠環A為吡咯。
在某些實施例中,稠環A為咪唑。
在某些實施例中,稠環A為吡唑。
在某些實施例中,稠環A為吡咯啶。
在某些實施例中,稠環A為吡咯啶酮。
在某些實施例中,稠環B為苯基。
在某些實施例中,稠環B為吡啶。
在某些實施例中,稠環C為苯基。
在某些實施例中,稠環C為吡啶。
在某些實施例中,雜環部分或雜環部分 B選自
Figure 02_image766
Figure 02_image768
在某些實施例中,雜環部分 B選自
Figure 02_image770
Figure 02_image772
在某些實施例中,本發明之化合物選自:
Figure 02_image774
Figure 02_image776
Figure 02_image778
Figure 02_image780
Figure 02_image782
Figure 02_image784
Figure 02_image786
Figure 02_image788
Figure 02_image790
IV. 連接子
連接子包括於本發明化合物中,諸如描述於式A中。連接子為將雜環部分共價連接至所選NSP3靶向配體之鍵或化學穩定二價基團。
在某些實施例中,連接子可為將雜環部分連接至NSP3靶向配體之任何化學穩定基團。在一些實施例中,連接子具有2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20個或更多個碳原子之鏈,其中一或多個碳原子可經諸如O、N、S或P之雜原子置換,只要所得分子作為醫藥學上可接受之劑型之部分具有至少兩個月、三個月、六個月或一年的穩定存放期或本身為醫藥學上可接受的。在某些實施例中,鏈具有2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個鏈中之連續原子。舉例而言,鏈可包括1個或多個乙二醇單元,且在一些實施例中,可具有至少2、3、4、5、6、7、8、9或10個或更多個連續、部分連續或不連續乙二醇連接子。在某些實施例中,鏈具有至少1、2、3、4、5、6、7或8個分支,其可獨立地為烷基、雜烷基、芳基、雜芳基、烯基或炔基取代基,在一個實施例中,各分支具有10、8、6、4、3、2或1個碳。
在其他實施例中,連接子可包括以下中之一或多者或由以下中之一或多者組成:乙二醇、丙二醇、乳酸及/或乙醇酸。大體而言,丙二醇添加疏水性,而丙二醇添加親水性。乳酸片段往往會具有比乙醇酸片段更長之半衰期。嵌段及無規則乳酸-共-乙醇酸部分以及乙二醇及丙二醇在此項技術中已知為醫藥學上可接受的且可經修飾或經配置以獲得所需半衰期及親水性。在某些態樣中,此等單元可視需要與其他部分(諸如脂族基,包括烷基、雜脂族基、芳基、雜芳基、雜環基、環烷基等)側接或穿插,以達成適當藥物特性。
在某些實施例中,本發明化合物具有一或多個出口載體,其適當地定向NSP3靶向配體及/或E3連接酶配體(雜環部分)以改良化合物之特性,例如增加結合效力或三元複合物形成。舉例而言,在某些實施例中,X 16為NSP3靶向配體之出口載體。在某些實施例中,本發明化合物具有超過一個出口載體。在某些實施例中,X 1或X 2為E3連接酶配體之出口載體。出口載體可與其射出之蛋白質相互作用及/或可以適當角度導引分子之連接子部分及靶向配體部分以允許形成包含NSP3蛋白質、本發明化合物及塞勒布隆之三元複合物。
在某些態樣中,連接子係選自
Figure 02_image792
其中所有變數係如上文所定義。
在某些實施例中,連接子包括
Figure 02_image794
在某些實施例中,連接子包括
Figure 02_image796
Figure 02_image798
在某些實施例中,連接子包括
Figure 02_image800
Figure 02_image802
在某些實施例中,連接子包括
Figure 02_image804
在某些實施例中,連接子包括
Figure 02_image806
在某些實施例中,連接子包括
Figure 02_image808
在某些實施例中,連接子包括
Figure 02_image810
在某些實施例中,連接子包括
Figure 02_image812
在某些實施例中,連接子包括
Figure 02_image814
在某些實施例中,連接子包括
Figure 02_image816
在某些實施例中,連接子包括
Figure 02_image818
在某些實施例中,連接子包括
Figure 02_image820
在某些實施例中,連接子包括
Figure 02_image822
以下為可用於本發明中之連接子之非限制性實例。基於此詳細描述,熟習此項技術者將理解如何使用將實現本發明之目標之連接子的全部範圍。
作為某些非限制性實例,連接子包括:
Figure 02_image824
Figure 02_image826
Figure 02_image828
在另一實施例中,連接子選自:
Figure 02_image830
在一個實施例中,X 1連接至NSP3靶向配體。在另一實施例中,X 2連接至NSP3靶向配體。
R 20、R 21、R 22、R 23及R 24之部分之非限制性實例包括:
Figure 02_image832
Figure 02_image834
Figure 02_image836
R 20、R 21、R 22、R 23及R 24之部分之額外非限制性實例包括:
Figure 02_image838
Figure 02_image840
R 20、R 21、R 22、R 23及R 24之部分之額外非限制性實例包括:
Figure 02_image842
Figure 02_image844
Figure 02_image846
在額外實施例中,連接子部分為具有至少1個、至少2個、至少3個、至少4個、至少5個、至少6個、至少7個、至少8個、至少9個、至少10個乙二醇單元的視情況經取代之(聚)乙二醇,或穿插有視情況經取代之O、N、S、P或Si原子的視情況經取代之烷基。在某些實施例中,連接子側接、取代或穿插有芳基、苯基、苯甲基、烷基、伸烷基或雜環基。在某些實施例中,連接子可為不對稱或對稱的。在一些實施例中,連接子為經取代或未經取代之聚乙二醇基團,其大小範圍為約1個至約12個乙二醇單元、在1個與約10個乙二醇單元之間、在約2個與約6個乙二醇單元之間、在約2個與5個乙二醇單元之間、在約2個與4個乙二醇單元之間。在本文所描述之化合物的實施例中之任一者中,連接子可為如本文中所描述之任何適合部分。
在額外實施例中,連接子選自: -NR 61(CH 2) n1-(低碳數烷基)-,-NR 61(CH 2) n1-(低碳數烷氧基)-, -NR 61(CH 2) n1-(低碳數烷氧基)-OCH 2-,-NR 61(CH 2) n1-(低碳數烷氧基)-(低碳數烷基)-OCH 2-, -NR 61(CH 2) n1-(環烷基)-(低碳數烷基)-OCH 2-,-NR 61(CH 2) n1-(雜環烷基)-, -NR 61(CH 2CH 2O) n1-(低碳數烷基)-O-CH 2-,-NR 61(CH 2CH 2O) n1-(雜環烷基)-O-CH 2-, -NR 61(CH 2CH 2O) n1-芳基-O-CH 2-,-NR 61(CH 2CH 2O) n1-(雜芳基)-O-CH 2-, -NR 61(CH 2CH 2O) n1-(環烷基)-O-(雜芳基)-O-CH 2-, -NR 61(CH 2CH 2O) n1-(環烷基)-O-芳基-O-CH 2-, -NR 61(CH 2CH 2O) n1-(低碳數烷基)-NH-芳基-O- CH 2-, -NR 61(CH 2CH 2O) n1-(低碳數烷基)-O-芳基-CH 2, -NR 61(CH 2CH 2O) n1-環烷基-O-芳基-,- NR 61(CH 2CH 2O) n1-環烷基-O-雜芳基-, -NR 61(CH 2CH 2) n1-(環烷基)-O-(雜環)-CH 2, -NR 61(CH 2CH 2) n1-(雜環)-(雜環)-CH 2及-NR 61-(雜環)-CH 2; 其中n1為0、1、2、3、4、5、6、7、8、9或10;且 R 61為H、甲基或乙基。
在額外實施例中,連接子選自: -N(R 61)-(CH 2) m1-O(CH 2) n2-O(CH 2) o1-O(CH 2) p1-O(CH 2) q1-O(CH 2) r1-OCH 2-, -O-(CH 2) m1-O(CH 2) n2-O(CH 2) o1-O(CH 2) p1-O(CH 2) q1-O(CH 2) r1-OCH 2-, -O-(CH 2) m1-O(CH 2) n2-O(CH 2) o1-O(CH 2) p1-O(CH 2) q1-O(CH 2) r1-O-; -N(R 61)-(CH 2) m1-O(CH 2) n2-O(CH 2) o1-O(CH 2) p1-O(CH 2) q1-O(CH 2) r1-O-; -(CH 2) m1-O(CH 2) n2-O(CH 2) o1-O(CH 2) p1-O(CH 2) q1-O(CH 2) r1-O-; -(CH 2) m1-O(CH 2) n2-O(CH 2) o1-O(CH 2) p1-O(CH 2) q1-O(CH 2) r1-OCH 2-; -O(CH 2) m1O(CH 2) n2O(CH 2) p1O(CH 2) q1OCH 2-; -O(CH 2) m1O(CH 2) n2O(CH 2) p1O(CH 2) q1OCH 2-;其中 m1、n2、o1、p1、q1及r1獨立地為1、2、3、4或5;且 R 61為H、甲基或乙基。
在額外實施例中,連接子選自:
Figure 02_image848
Figure 02_image850
; m1、n2、o1、p1、q2及r1獨立地為1、2、3、4或5。
在額外實施例中,連接子選自:
Figure 02_image852
Figure 02_image854
Figure 02_image856
在額外實施例中,連接子選自:
Figure 02_image858
Figure 02_image860
Figure 02_image862
在額外實施例中,連接子選自:
Figure 02_image864
Figure 02_image866
Figure 02_image868
Figure 02_image870
Figure 02_image872
Figure 02_image874
Figure 02_image876
Figure 02_image878
; 其中R 71為-O-、-NH、N烷基、雜脂族基、脂族基或-NMe。
在額外實施例中,連接子選自:
Figure 02_image880
Figure 02_image882
在額外實施例中,連接子選自:
Figure 02_image884
Figure 02_image886
Figure 02_image888
Figure 02_image890
Figure 02_image892
Figure 02_image894
在額外實施例中,連接子選自:
Figure 02_image896
Figure 02_image898
在額外實施例中,連接子選自:
Figure 02_image900
在額外實施例中,連接子選自:
Figure 02_image902
Figure 02_image904
Figure 02_image906
在額外實施例中,連接子選自:
Figure 02_image908
Figure 02_image910
Figure 02_image912
在額外實施例中,連接子選自:
Figure 02_image914
在某些實施例中,連接子選自:
Figure 02_image916
Figure 02_image918
在某些實施例中,連接子選自:
Figure 02_image920
Figure 02_image922
Figure 02_image924
在以上結構中,
Figure 02_image926
表示
Figure 02_image928
在某些實施例中,連接子可為4至24個碳原子直鏈,其中直鏈中之一或多個碳原子可經氧、氮、醯胺、氟化碳等置換或取代,諸如以下:
Figure 02_image930
Figure 02_image932
Figure 02_image934
Figure 02_image936
在某些實施例中,連接子可為非線性鏈,且可為或包括脂族或芳族或雜芳族環狀部分。
在某些實施例中,連接子可包括連續、部分連續或非連續乙二醇單元基團,其大小範圍為約1個與約12個乙二醇單元、在1個與約10個乙二醇單元之間、在約2個與約6個乙二醇單元之間、在約2個與5個乙二醇單元之間、在約2個與4個乙二醇單元之間,例如1、2、3、4、6、6、7、8、9、10、11或12個乙二醇單元。
在某些實施例中,連接子可具有1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14或15個氟取代基。在另一實施例中,連接子係全氟化的。在另一實施例中,連接子為部分或完全氟化之聚醚。氟化連接子部分之非限制性實例包括:
Figure 02_image938
Figure 02_image940
Figure 02_image942
R 20、R 21、R 22、R 23及R 24之部分之非限制性實例包括:
Figure 02_image944
Figure 02_image946
Figure 02_image948
R 20、R 21、R 22、R 23及R 24之部分之額外非限制性實例包括:
Figure 02_image950
Figure 02_image952
R 20、R 21、R 22、R 23及R 24之部分之額外非限制性實例包括:
Figure 02_image954
在某些實施例中,長度可視需要或如發現有必要而調節以用於所需應用。 V. 治療方法
本發明化合物,諸如式A化合物可以有效量用於治療有需要之宿主,包括人類,視情況在醫藥學上可接受之載劑中以治療本文所述之冠狀病毒。
在某些實施例中,該方法包含投與有效量的本文所述之化合物,視情況包括醫藥學上可接受之賦形劑、載劑、佐劑,亦即醫藥學上可接受之組合物,視情況與另一生物活性劑或藥劑之組合組合。
在某些實施例中,本發明化合物用於治療SARS-CoV-2變異株。在某些實施例中,本發明化合物用於治療SARS-CoV-2 α變異株。在某些實施例中,本發明化合物用於治療SARS-CoV-2 β變異株。在某些實施例中,本發明化合物用於治療SARS-CoV-2 γ變異株。在某些實施例中,本發明化合物用於治療SARS-CoV-2 δ變異株。在某些實施例中,本發明化合物用於治療SARS-C-V-2 o變異株。
在某些實施例中,本發明化合物用於治療冠狀病毒變異株,例如選自α、β、γ、δ、ε、η、ι、κ、μ、o及ζ之SARS-CoV-2變異株。SARS-CoV-2 α變異株之非限制性實例包括B.1.1.7及Q.1-Q.8。SARS-CoV-2 β變異株之非限制性實例包括B.1.351、B.1.351.2及B.1.351.3。SARS-CoV-2 γ變異株之非限制性實例包括P.1、P.1.1及P.1.2。SARS-CoV-2 δ變異株之非限制性實例包括B.1.617.2及AY.1。SARS-CoV-2 ε變異株之非限制性實例包括B.1.427及B.1.429。SARS-CoV-2 η變異株之非限制性實例包括B.1.525。SARS-CoV-2 ι變異株之非限制性實例包括B.1.526。SARS-CoV-2 κ變異株之非限制性實例包括B.1.617.1。SARS-CoV-2 μ變異株之非限制性實例包括B.1.621及B.1.621.1。SARS-CoV-2 ζ變異株之非限制性實例包括P.2。SARS-CoV2 o變異株之非限制性實例包括B.1.1.529及子系變異株BA.1、BA.2、BA.2.12.1、BA.2.75、BA.3、BA.4及BA.5。
在某些實施例中,本發明化合物用於治療除SARS-CoV-2以外之冠狀病毒。冠狀病毒之額外實例包括:嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒(SARS-CoV)、蝙蝠SARS樣冠狀病毒WIV1 (Bat SL-CoV-WIVl)、α冠狀病毒229E (HCoV-229E)、紐黑文冠狀病毒NL63 (HCoV-NL63)、β冠狀病毒OC43 (HCoV-OC43)、冠狀病毒HKIJ I (HCoV-HKU l)及中東呼吸道症候群冠狀病毒(MERS-CoV)。
在某些實施例中,本發明化合物用於治療尚未發現或尚未感染可觀人數之新型冠狀病毒。 VI. 醫藥組合物
所選本發明化合物可以純化學物質形式投與,但通常以醫藥組合物形式投與,該醫藥組合物包括用於需要此類針對本文所述之病症中之任一者的治療之宿主(通常為人類)的有效量。因此,本發明提供包含有效量之化合物或其醫藥學上可接受之鹽連同至少一種醫藥學上可接受之載劑一起的醫藥組合物以用於本文所述之任何用途。醫藥組合物可含有作為唯一活性劑之化合物或鹽,或在一替代實施例中含有化合物及至少一種額外活性劑。
在某些實施例中,醫藥組合物的劑型在單位劑型中含有約0.001 mg至約1000 mg、約0.01 mg至約800 mg、約1 mg至約800 mg、或約200 mg至約600 mg活性化合物,且視情況含有約0.1 mg至約2000 mg、約10 mg至約1000 mg、約100 mg至約800 mg、或約200 mg至約600 mg額外活性劑。實例為具有至少約或不超過0.001、0.005、0.010、0.10、1、5、10、25、50、100、200、250、300、400、500、600、700或750 mg活性化合物或其鹽之劑型。
本文所揭示之化合物可以含有習知醫藥學上可接受之載劑的劑量單位調配物形式經口、局部、全身性、非經腸、藉由吸入或噴霧、舌下、經由植入(包括眼部植入)、經皮、經由頰內投與、經直腸、呈眼用溶液形式、注射(包括靜脈內、主動脈內、顱內、真皮下、腹膜內、皮下、經鼻、舌下或經直腸)或藉由其他方式投與。
醫藥組合物可調配為任何醫藥學上適用之形式,例如調配為固體劑型、液體、氣溶膠、乳膏、凝膠、丸劑、注射或輸注溶液、膠囊、錠劑、糖漿、經皮貼片、皮下貼片、乾粉、吸入調配物、醫學裝置、栓劑、頰內或舌下調配物、非經腸調配物或眼用溶液。一些劑型(諸如錠劑及膠囊)細分成含有適當數量之活性組分(例如達成所需目的之有效量)的適當尺寸化單位劑量。
載劑包括賦形劑及稀釋劑且應具有足夠高的純度及足夠低的毒性,以使其適用於以有效量投與至所治療之患者。載劑可呈惰性或其本身可具有醫藥效益。結合化合物採用的載劑之量足以根據單位劑量之化合物投與提供實用量之物質。
載劑類別包括但不限於黏合劑、緩衝劑、著色劑、稀釋劑、崩解劑、乳化劑、調味劑、滑動劑、潤滑劑、保存劑、穩定劑、界面活性劑、製錠劑及濕潤劑。一些載劑可列入超過一種類別中,例如植物油可在一些調配物中用作潤滑劑且可在其他調配物中用作稀釋劑。例示性醫藥學上可接受之載劑包括糖、澱粉、纖維素、粉末狀黃蓍、麥芽、明膠;滑石及植物油。視情況存選用之活性劑可包括在醫藥組合物中,該等活性劑並未實質上干擾本發明之化合物之活性。
醫藥組合物/組合可經調配以用於經口投與。此等組合物可含有達成所需結果的任何量之活性化合物,例如介於0.1與99重量% (wt.%)之間的化合物且通常至少約5 wt.%的化合物。一些實施例含有約25 wt.%至約50 wt.%或約5 wt.%至約75 wt.%的化合物。
在某些實施例中,LNP含有陽離子或可電離限制。實例包括但不限於:美國專利公開案第20060083780號及第20060240554號;美國專利第5,208,036號;第5,264,618號;第5,279,833號;第5,283,185號;第5,753,613號;及第5,785,992號;及PCT公開案第WO 96/10390號,該等專利之揭示內容出於所有目的各自以全文引用之方式併入本文中。
適用於直腸投與之調配物有時以單位劑量栓劑呈遞。此等物可藉由使活性化合物與一或多種習知固體載劑(例如可可脂)摻合,且隨後使所得混合物成形來製備。
適用於局部施用至皮膚之調配物較佳呈軟膏、乳膏、洗劑、膏劑、凝膠、噴霧劑、氣溶膠或油之形式。可使用的載劑包括石油膠、羊毛脂、聚乙二醇、醇、經皮增強劑,及其兩者或更多者之組合。
適用於經皮投與之醫藥組合物可以離散貼片形式呈遞,該等貼片經調適可與受者之表皮保持長時間之緊密接觸。適用於經皮投與之調配物亦可藉由離子導入療法遞送(參見例如 Pharmaceutical Research 3 (6):318 (1986))且有時呈活性化合物之視情況選用之緩衝水溶液形式。在一個實施例中,提供用於遞送藥物跨越生物學組織(尤其皮膚)或遞送藥物至生物學組織中的微針貼片或裝置。微針貼片或裝置允許藥物以臨床上相關的速率遞送跨越皮膚或其他組織障壁或至皮膚或其他組織障壁中,而對組織的損傷、疼痛或刺激最小或無。
適用於投與肺的調配物可藉由廣泛範圍之被動式呼吸驅動及主動式電驅動單劑量/多劑量乾粉吸入器(DPI)來進行遞送。呼吸遞送最常用之裝置包括噴霧器、定劑量吸入器及乾粉吸入器。有若干類型的噴霧器可利用,包括噴射噴霧器、超音波噴霧器及振動式網狀噴霧器。選擇適合的肺遞送裝置視參數而定,諸如藥物及其調配物之性質、作用位點及肺病理生理學。 VII. 通用合成
本文所述之化合物可藉由熟習此項技術者已知之方法來製備。在一個非限制性實例中,所揭示之化合物可使用以下流程製備。
為方便起見,具有立體中心之本發明化合物可在不具有立體化學之情況下繪製。熟習此項技術者將認識到,純對映異構體及非對映異構體可藉由此項技術中已知之方法製備。獲得光學活性材料之方法之實例至少包括以下: i)           晶體之物理分離-將個別對映異構體之宏觀晶體人工分離之技術。若獨立對映異構體之晶體存在,亦即,物質為聚結物且晶體在視覺上明顯,則可使用這種技術; ii)          同時結晶-個別對映異構體分別自外消旋體之溶液結晶的技術,僅在對映異構體為固態聚結物時才可能; iii)        酶促解析-藉助於對映異構體與酶之反應速率不同而部分或完全分離外消旋體的技術; iv)         酶促不對稱合成-合成之至少一個步驟使用酶促反應來獲得所需對映異構物之鏡像異構性純或增濃合成前驅體之合成技術; v)          化學不對稱合成-在於產物中產生不對稱性(亦即對掌性)之條件下自非對掌性前驅體合成所需對映異構體的合成技術,其可藉由對掌性催化劑或對掌性助劑達成; vi)         非對映異構體分離-使外消旋化合物與將個別對映異構體轉化為非對映異構體之對映異構性純的試劑(對掌性助劑)反應的技術。隨後所得非對映異構體藉由層析或結晶藉助於其現在更明顯之結構差異分離且稍後移除對掌性助劑,獲得所需對映異構體; vii)       第一及第二級不對稱轉化-如下技術,其中來自外消旋體之非對映異構體快速平衡以優先溶解來自所需對映異構體之非對映異構體,其中來自所需對映異構體之非對映異構體優先結晶干擾平衡以使得最終大體上所有物質均轉化為來自所需對映異構體之結晶非對映異構體。接著自非對映異構體釋放所需對映異構體; viii)      動力學解析-此技術指藉助於對映異構體與對掌性非外消旋試劑或催化劑在動力學條件下不相等之反應速率達成外消旋體之部分或完全解析(或部分解析化合物之進一步解析); ix)         自非外消旋前驅體進行對映異構特異性合成-自非對掌性起始物質獲得所要對映異構體且其中立體化學完整性在合成過程中不會或僅最低限度地受損的合成技術; x)          對掌性液相層析-外消旋體之對映異構體藉助於其與固定相之不同相互作用(包括經由對掌性HPLC)以液體行動相分離之技術。固定相可由對掌性物質製得或行動相可含有另一對掌性物質以引起不同相互作用; xi)         對掌性氣相層析-外消旋體揮發且對映異構體藉助於其在氣體移動相中與含有固定非外消旋對掌性吸附劑相之管柱之不同相互作用分離的技術; xii)       用對掌性溶劑萃取-藉助於一種對映異構體優先溶解於特定對掌性溶劑中來分離對映異構體的技術; xiii)      跨越對掌性膜轉運-使外消旋體與薄膜障壁接觸的技術。障壁可分離兩種可混溶流體,一種含有外消旋體,且動力(諸如濃度或壓力差)引起跨越膜障壁之優先轉運。分離係根據膜非外消旋對掌性性質而進行,該性質僅允許外消旋體之一種對映異構體穿過。 xiv)      模擬移動床層析用於一個實施例中。多種對掌性固定相為市售的。 本發明之代表性化合物的合成 合成 CRBN 結合劑 實例 1 合成 3-[3- 甲基 -2- 側氧基 -5-(4- 哌啶基 ) 苯并咪唑 -1- ] 哌啶 -2,6- 二酮鹽酸鹽及 2-[4-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ]-1- 哌啶基 ] 乙酸鹽酸鹽
Figure 02_image956
Figure 02_image958
步驟 -1
向氫化鈉(於油分散液中)於礦物油(53.51 g,2.33 mol)中之60%分散液中添加THF (2300 mL)且將懸浮液冷卻至5-10℃。在5-10℃下經20分鐘添加2,6-二苯甲氧基吡啶-3-胺( 1,230 g,750.76 mmol)於THF (1400 mL)中之溶液,觀測到放熱性。維持該溫度30分鐘。在5-10℃下經20分鐘向此溶液中添加含4-溴-1-氟-2-硝基苯( 2,247.75 g,1.13 mol,138.41 mL)之THF (1600 mL)。使溶液升溫至室溫且攪拌16小時。在低於10℃下用含10%水之THF (5 V)淬滅反應物質,觀測到放熱性。在低於15℃下添加飽和NaCl溶液(10 V)且升溫至室溫。分離各層,且在真空下濃縮有機層。取出水層且用DCM (15 V)萃取。有機層經合併且用水(5 V)洗滌且在45℃下在真空中完全濃縮。將粗物質在45℃下饋入DCM (2.5 V)中且維持15分鐘直至溶解,在45℃下添加石油醚(10 V)且在45℃下維持1小時。將混合物冷卻至環境溫度且維持30分鐘。將固體過濾且用石油醚(2×3 V)洗滌,得到2,6-二苯甲氧基-N-(4-溴-2-硝基-苯基)吡啶-3-胺( 3,400 g,686 mmol,91%產率)。LC-MS (ES +): m/z506.32 [M + H] +步驟 -2
將2,6-二苯甲氧基-N-(4-溴-2-硝基-苯基)吡啶-3-胺( 3,50 g,98.75 mmol)於乙腈(450 mL)及水(50 mL)中之溶液冷卻至0-5℃,且經60分鐘逐份添加硼氫化鈉(7.47 g,197.49 mmol),在此期間維持室溫4小時。在0-5℃下添加硼氫化鈉(7.47 g,197.49 mmol)且維持該溫度2小時。接著用10% NH 4Cl溶液(5 V)淬滅反應物。添加水(5 V),接著添加DCM (10 V),且在室溫下攪拌混合物15分鐘。用DCM (10 V)萃取水層,且用水(10 V)洗滌合併之有機層且在40℃下在真空中完全濃縮。石油醚用於汽提殘餘物(3 V),接著將10% EtOAc/石油醚(5 V)饋入粗殘餘物中且加熱至45℃。將溫度維持在45℃下30分鐘,冷卻至室溫且維持30分鐘。產物經過濾且用石油醚(3 V)洗滌,得到4-溴-N1-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)苯-1,2-二胺( 4,34 g,69.73 mmol,71%產率)。LC-MS (ES +): m/z476.33 [M + H] +步驟 -3
在25-35℃下向4-溴-N1-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)苯-1,2-二胺( 4,200 g,419.85 mmol)於DMF (800 mL)中之攪拌溶液中添加1,1'-羰基二咪唑(177.00 g,1.09 mol),觀測到放熱性。監測初始溫度25℃,且在15分鐘時記錄最終溫度35℃。在室溫下攪拌反應物14小時。在室溫下將反應物饋入水(420 mL)中。形成沈澱且攪拌混合物3小時。過濾固體且用水及石油醚(2×35 ml)洗滌。將產物在50℃下真空乾燥7小時,得到6-溴-3-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-1H-苯并咪唑-2-酮( 5,200 g,391.43 mmol,93%產率)。LC-MS (ES +): m/z502.1 [M + H] +步驟 -4
在0-28℃下向6-溴-3-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-1H-苯并咪唑-2-酮( 5,108 g,214.99 mmol)於DMF (1000 mL)中之攪拌溶液中逐份添加氫化鈉(60%分散液於礦物油中) (14.83 g,644.96 mmol)。將反應混合物攪拌1小時,接著經半小時逐滴添加碘甲烷(儲存於銅上) (31.16 g,214.99 mmol,13.37 mL)。用冰冷水稀釋反應混合物,且獲得所得固體,過濾,且真空乾燥。固體用乙酸乙酯萃取,接著用鹽水洗滌,經硫酸鈉乾燥,且濃縮至乾燥。粗化合物用戊烷洗滌,得到呈淡棕色固體狀之5-溴-1-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-3-甲基-苯并咪唑-2-酮( 6,95 g,183.81 mmol,86%產率)。LC-MS (ES +): m/z516.14 [M + H] +步驟 -5
向5-溴-1-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-3-甲基-苯并咪唑-2-酮( 6,20 g,38.73 mmol)於1,4-二㗁烷(160 mL)及水(40 mL)中之溶液中添加碳酸鈉(12.32 g,116.19 mmol)及4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊烷-2-基)-3,6-二氫-2H-吡啶-1-甲酸三級丁酯( 7,15.57 g,50.35 mmol)。反應物用氮氣吹掃20分鐘,接著饋入肆(三苯基膦)鈀(0) (2.24 g,1.94 mmol)且加熱至90-100℃後維持5小時。將反應物冷卻至室溫且經由矽藻土床過濾且用EtOAc洗滌。在45℃下在真空中完全蒸餾濾液。將粗產物溶解於EtOAc (15 V)中且用水(10 V)分離。有機層用水(5 V)、鹽水(5 V)洗滌,接著經無水Na 2SO 4乾燥。將有機層在45℃下真空濃縮且藉由管柱層析(100-200目矽膠,0-30%乙酸乙酯/石油醚)純化,得到4-[1-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-3,6-二氫-2H-吡啶-1-甲酸三級丁酯( 8,21 g,33.06 mmol,85%產率)。LC-MS (ES +): m/z619.41 [M + H] +步驟 -6
向4-[1-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-3,6-二氫-2H-吡啶-1-甲酸三級丁酯( 8,40 g,64.65 mmol)於甲醇(1600 mL)中之溶液中添加10%鈀/碳,487型,乾式(12.00 g,112.76 mmol)及鎳(12.00 g,204.45 mmol)。將反應物在60-65℃下在氫氣氛圍(10 kg)下加熱16小時。接著將反應混合物冷卻至室溫,過濾且用DCM及MeOH洗滌。將濾液取出且在45℃下在真空中完全蒸餾。向粗殘餘物中添加IPA (3 V)且在60℃下加熱15分鐘。添加石油醚(3 V),且將混合物冷卻至室溫且進一步攪拌1小時。將固體過濾且用石油醚洗滌,得到4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 9,21 g,44 mmol,69%產率)。LC-MS (ES -): m/z441.18 [M - H] -步驟 -7
在26℃下向4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 9,1.6 g,3.62 mmol)於DCM (30 mL)中之攪拌溶液中添加含4 M氯化氫之1,4-二㗁烷,99% (16.00 mL)。將所得反應混合物在26℃下攪拌3小時。在反應完成後,將反應混合物真空濃縮,用MTBE (50 mL)洗滌且濃縮,得到呈灰白色固體狀之3-[3-甲基-2-側氧基-5-(4-哌啶基)苯并咪唑-1-基]哌啶-2,6-二酮鹽酸鹽( 10,1.37 g,3.24 mmol,87%產率)。LC-MS (ES +): m/z343.2 [M + H] +步驟 -8
在26℃下向3-[3-甲基-2-側氧基-5-(4-哌啶基)苯并咪唑-1-基]哌啶-2,6-二酮鹽酸鹽( 10,1 g,2.64 mmol)於DMF (10 mL)中之攪拌溶液中添加2-溴乙酸三級丁酯( 11,617.83 mg,3.17 mmol,464.53 μL)且攪拌10分鐘,隨後添加N,N-二異丙基乙胺(2.73 g,21.12 mmol,3.68 mL)。在26℃下攪拌所得反應混合物1.5小時。在反應完成後,將反應混合物倒入冰冷水(20 mL)中且用乙酸乙酯(2×50 mL)萃取,經無水硫酸鈉乾燥,過濾且真空濃縮,得到呈灰白色固體狀之2-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]乙酸三級丁酯( 12,1.1 g,2.40 mmol,91%產率)。LC-MS (ES +): m/z457.4 [M + H] +步驟 -9
在26℃下向2-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]乙酸三級丁酯( 12,1.0 g,2.19 mmol)於DCM (34.00 mL)中之攪拌溶液中添加含4 M氯化氫之1,4-二㗁烷,99% (40.00 mL)。在26℃下攪拌所得反應混合物20小時。在反應完成後,真空濃縮反應混合物,得到呈灰白色固體狀之2-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]乙酸鹽酸鹽( 13,1 g,1.65 mmol,75%產率)。LC-MS (ES +): m/z401.2 [M + H] +實例 2 合成 6-[4-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ]-1- 哌啶基 ]-6- 側氧基 - 己酸鹽酸鹽
Figure 02_image960
步驟 -1
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有3-[3-甲基-2-側氧基-5-(4-哌啶基)苯并咪唑-1-基]哌啶-2,6-二酮( 1,1500 mg,4.38 mmol)及6-三級丁氧基-6-側氧基-己酸( 2,1.07 g,5.26 mmol)於無水DMF (20 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加 N,N-二異丙基乙胺(2.83 g,21.90 mmol,3.82 mL)及HATU (2.50 g,6.57 mmol)。在環境溫度下攪拌內含物4小時。反應完成後,將反應混合物用水淬滅且用乙酸乙酯(2×50 ml)萃取。將有機層合併且用鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且在減壓下濃縮,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,8% MeOH/DCM)純化,得到呈糖漿液體狀之6-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-6-側氧基-己酸三級丁酯( 3,2.1 g,3.75 mmol,86%產率)。LC-MS (ES +): m/z527.4 [M + H] +步驟 -2
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有6-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-6-側氧基-己酸三級丁酯( 3,1.5 g,2.68 mmol)於無水DCM (10 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加4.0 M氯化氫於1,4-二㗁烷(5.0 mL)中之溶液。在環境溫度下攪拌內含物12小時。完成後,在減壓下濃縮反應混合物以產生粗產物,其用10%乙酸乙酯/石油醚濕磨,得到呈白色固體狀之6-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-6-側氧基-己酸鹽酸鹽( 4,1.2 g,2.22 mmol,83%產率)。LC-MS (ES +): m/z471.2 [M + H] +
以下CRBN結合劑( 實例 3-5)基本上遵循如上文 實例 2中所述之方法,使用步驟-1中之對應中間物製備。
實例編號 步驟-1 中之中間物 CRBN 結合劑 LC-MS (ESI): m/z
3
Figure 02_image962
Figure 02_image964
485.2 [M + H] +
4
Figure 02_image966
Figure 02_image968
497.3 [M - H] -
5
Figure 02_image970
Figure 02_image972
527.2 [M + H] +
實例 6 合成 3-[6- -3- 甲基 -2- 側氧基 -5-(4- 哌啶基 ) 苯并咪唑 -1- ] 哌啶 -2,6- 二酮鹽酸鹽
Figure 02_image974
步驟 1
在環境溫度下向含有5-溴-1-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-6-氟-3-甲基-苯并咪唑-2-酮( 1,250 mg,0.463 mmol)於1,4-二㗁烷(2.5 mL)及水(0.3 mL)中之充分攪拌溶液的20 mL玻璃小瓶中添加4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊烷-2-基)-3,6-二氫-2H-吡啶-1-甲酸三級丁酯( 2,214.82 mg,0.694 mmol)及碳酸鈉(98.18 mg,0.926 mmol)。將氮氣吹掃通過反應混合物10分鐘。隨後,添加Pd(dppf)Cl 2·DCM (37.82 mg,0.0463 mmol)且在90℃下繼續攪拌16小時。使反應混合物穿過矽藻土墊且在減壓下濃縮濾液,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,35% EtOAc/石油醚)純化,得到呈無色固體狀之4-[1-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-6-氟-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-3,6-二氫-2H-吡啶-1-甲酸三級丁酯( 3,350 mg,0.423 mmol,91%產率)。LC-MS (ES +): m/z637.2 [M + H] +步驟 2
在環境溫度下向含有4-[1-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-6-氟-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-3,6-二氫-2H-吡啶-1-甲酸三級丁酯( 3,350 mg,0.423 mmol)於無水1,4-二㗁烷(2 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加氫氧化鈀/碳,20重量% 50%水(326.93 mg,0.465 mmol)。在氫氣氛圍下在此溫度下攪拌反應混合物16小時。反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且用1:1 THF:DMF之混合物(200 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮濾液,得到呈灰色固體狀之4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-6-氟-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 4,200 mg,0.402 mmol,95%產率)。LC-MS (ES +): m/z405.0 [M - 異丁烯+ H] +步驟 3
在0℃下向含有4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-6-氟-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 4,200.32 mg,0.402 mmol)於無水DCM (1.5 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加含4M HCl之1,4-二㗁烷(1.21 mL)。在環境溫度下攪拌反應物2小時。反應完成後,自反應混合物移除溶劑,得到粗物質,使其與甲苯(10 mL)共沸,且用MTBE (8 mL)洗滌,得到呈灰白色固體狀之3-[6-氟-3-甲基-2-側氧基-5-(4-哌啶基)苯并咪唑-1-基]哌啶-2,6-二酮鹽酸鹽( 5, 150 mg,0.349 mmol,87%產率)。LC-MS (ES +): m/z361.2 [M + H] +實例 7 合成 1- 甲基 -3-[3- 甲基 -2- 側氧基 -5-(4- 哌啶基 ) 苯并咪唑 -1- ] 哌啶 -2,6- 二酮及 2-[4-[3- 甲基 -1-(1- 甲基 -2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ]-1- 哌啶基 ] 乙酸
Figure 02_image976
步驟 -1
在室溫下向含有4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-1-甲酸三級丁酯鹽酸鹽( 1,300 mg,620.08 μmol)於無水DMF (5.02 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加無水碳酸鉀(342.81 mg,2.48 mmol)及碘甲烷(264.04 mg,1.86 mmol,115.81 μL)。在50℃下攪拌反應混合物7小時。反應完成後,在真空中蒸發溶劑,且逐滴添加水且進行音波處理。藉由過濾收集固體沈澱,且在真空中乾燥,獲得呈灰白色固體狀之4-[3-甲基-1-(1-甲基-2,6-二側氧基-3-哌啶基)-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 2,250 mg,546.62 μmol,88%產率)。LC-MS (ES +): m/z401.2 [M - tBu + H] +步驟 -2
向含有4-[3-甲基-1-(1-甲基-2,6-二側氧基-3-哌啶基)-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 2,200 mg,433.70 μmol)於無水DCM (2.5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加含4.0 M鹽酸之1,4-二㗁烷(2.71 mL),且在室溫下攪拌所得溶液3小時。接著將反應混合物在減壓下濃縮且用MTBE濕磨,得到呈灰白色固體狀之1-甲基-3-[3-甲基-2-側氧基-5-(4-哌啶基)苯并咪唑-1-基]哌啶-2,6-二酮鹽酸鹽( 3,160 mg,407.25 μmol,94%產率)。LC-MS (ES +): m/z357.3 [M + H] +步驟 -3
在0℃下在氮氣氛圍下向含有1-甲基-3-[3-甲基-2-側氧基-5-(4-哌啶基)苯并咪唑-1-基]哌啶-2,6-二酮鹽酸鹽( 3,160 mg,403.18 μmol)於無水DMF (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL圓底燒瓶中添加 N,N-二異丙基乙胺(114.64 mg,886.99 μmol,154.50 μL)及溴乙酸三級丁酯( 4,94.37 mg,483.81 μmol,70.95 μL)。在室溫下攪拌反應物3小時。反應完成後,將反應混合物倒入冰水(10 mL)中且用EtOAc (2×10 mL)萃取。合併之有機層經硫酸鈉乾燥且在真空中濃縮,得到呈白色固體狀之2-[4-[3-甲基-1-(1-甲基-2,6-二側氧基-3-哌啶基)-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]乙酸三級丁酯( 5,160 mg,299.22 μmol,74%產率)。LC-MS (ES +): m/z471.3 [M + H] +步驟 -4
在氮氣氛圍下向含有2-[4-[3-甲基-1-(1-甲基-2,6-二側氧基-3-哌啶基)-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]乙酸三級丁酯( 5,160 mg,299.22 μmol)於DCM (5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加氯化氫(4 M溶液於1,4-二㗁烷中,5 mL, 20 mmol),且在室溫下攪拌所得溶液4小時。接著將反應混合物在減壓下濃縮且用MTBE濕磨,得到呈淡黃色固體狀之2-[4-[3-甲基-1-(1-甲基-2,6-二側氧基-3-哌啶基)-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]乙酸鹽酸鹽( 6,160 mg,273.22 μmol,91%產率)。LC-MS (ES +): m/z415.4 [M + H] +實例 8 合成 4-[1-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ]-4- 哌啶基 ] 丁醛鹽酸鹽
Figure 02_image978
步驟 -1
在-78℃下向含有4-甲基吡啶( 1,3.0 g,32.21 mmol,3.13 mL)於無水THF (40 mL)中之溶液的500 mL雙頸圓底燒瓶中添加n-BuLi (14.82 mL;2.5 M於己烷中),且攪拌所得混合物30分鐘。隨後,逐滴添加含3-溴-1,1-二甲氧基-丙烷( 2,6.49 g,35.44 mmol,4.77 mL)之無水THF (20 mL)且在-50℃至-30℃下繼續攪拌1小時。反應完成後,將反應混合物用飽和氯化銨溶液淬滅且用EtOAc (2×300 mL)萃取。合併之有機相用鹽水(50 mL)洗滌,乾燥(Na 2SO 4),過濾且在減壓下濃縮濾液。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,0-100% EtOAc/石油醚)純化粗殘餘物,得到呈淡黃色液體狀之4-(4,4-二甲氧基丁基)吡啶( 3,3.6 g,17.74 mmol,55%產率)。LC-MS (ES +): m/z196.2 [M + H] +步驟 -2
在環境溫度下向含有4-(4,4-二甲氧基丁基)吡啶( 3,3.6 g,17.88 mmol)於無水MeOH (60 mL)及AcOH (0.2 mL)中之充分攪拌溶液的250 mL單頸圓底燒瓶中添加氫氧化鈀/碳,20重量% 50%水(3.84 g,5.46 mmol)。在此溫度下在氫氣氛圍(約1 atm)下攪拌所得混合物16小時。在起始物質完全耗盡之後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且用MeOH (150 mL)洗滌矽藻土墊。在減壓下濃縮合併之濾液,得到呈無色液體狀之4-(4,4-二甲氧基丁基)哌啶( 4,3.5 g,17.37 mmol,97%產率)。LC-MS (ES +): m/z202.2 [M + H] +步驟 -3
向含有4-(4,4-二甲氧基丁基)哌啶( 4,795.26 mg,3.91 mmol)及5-溴-1-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-3-甲基-苯并咪唑-2-酮( 5,1.7 g,3.26 mmol)於無水1-4-二㗁烷(30 mL)中之充分攪拌溶液的250 mL密封管中添加碳酸銫(2.65 g,8.15 mmol),且將反應混合物用氮氣吹掃5分鐘。隨後,添加RuPhos (152.08 mg,0.326 mmol)及RuPhos-Pd-G3 (272.59 mg,0.326 mmol)且將反應混合物在110℃下加熱16小時。完成後,將反應混合物冷卻至環境溫度,經由矽藻土墊過濾,且用EtOAc (100 mL)洗滌矽藻土床且在減壓下濃縮合併之濾液,獲得粗殘餘物,藉由管柱層析(60-120目;50 g矽膠,0-80% EtOAc/石油醚)純化,得到呈棕色膠狀之1-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-5-[4-(4,4-二甲氧基丁基)-1-哌啶基]-3-甲基-苯并咪唑-2-酮( 6,1.1 g,1.64 mmol,50%產率)。LC-MS (ES +): m/z637.2 [M + H] +步驟 -4
在環境溫度下向含有1-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-5-[4-(4,4-二甲氧基丁基)-1-哌啶基]-3-甲基-苯并咪唑-2-酮( 6,1.1 g,1.64 mmol)於無水1,4-二㗁烷(35 mL)中之充分攪拌溶液的250 mL單頸圓底燒瓶中添加氫氧化鈀/碳,20重量% 50%水(2.09 g,2.98 mmol)。在此溫度下在氫氣氛圍(約1 atm)下攪拌所得混合物16小時。在起始物質耗盡後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且用1,4-二㗁烷(200 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮濾液且獲得之粗產物用甲基三級丁基醚(20 mL)洗滌,得到呈灰白色固體狀之3-[5-[4-(4,4-二甲氧基丁基)-1-哌啶基]-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-1-基]哌啶-2,6-二酮( 7,550 mg,1.03 mmol,62%產率)。LC-MS (ES +): m/z459.2 [M + H] +步驟 -5
在0℃下向含有3-[5-[4-(4,4-二甲氧基丁基)-1-哌啶基]-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-1-基]哌啶-2,6-二酮( 7,140 mg,0.262 mmol)於無水DCM (2.81 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加含4M HCl之1,4-二㗁烷(1.31 mL)。將所得混合物在環境溫度下攪拌2小時。反應完成後,濃縮混合物,獲得粗物質,其用MTBE (10 mL)濕磨,得到呈灰白色固體狀之4-[1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-4-哌啶基]丁醛鹽酸鹽( 8,120 mg,0.189 mmol,72%產率)。LC-MS (ES +): m/z413.2 [M + H] +實例 9 5-[1-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ]-4- 哌啶基 ] 戊醛鹽酸鹽
Figure 02_image980
基本上遵循4-[1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-4-哌啶基]丁醛鹽酸鹽之合成來製備此化合物。LC-MS (ES +): m/z427.4 [M + H] +實例 10 合成 5-[1-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-6- -3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ]-4- 哌啶基 ] 戊醛鹽酸鹽
Figure 02_image982
Figure 02_image984
步驟 -1
在-78℃下向含有4-甲基吡啶( 1;4 g,42.95 mmol,4.18 mL)於無水THF (60 mL)中之溶液的500 mL雙頸圓底燒瓶中添加n-BuLi (19.76 mL;2.5 M/己烷)且攪拌所得混合物35分鐘。隨後,逐滴添加含4-溴丁氧基-三級丁基-二甲基-矽烷( 2,12.05 g,45.1 mmol)之無水THF (20 mL),且在-78℃下繼續攪拌2小時。反應物用飽和氯化銨溶液淬滅且用EtOAc (2×400 mL)萃取混合物。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥且過濾。在減壓下濃縮濾液,得到粗殘餘物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,10-14% EtOAc/石油醚)純化,得到呈黃色液體狀之三級丁基-二甲基-[5-(4-吡啶基)戊氧基]矽烷( 3,11.5 g,36.93 mmol,86%產率)。LC-MS (ES +): m/z280.2 [M + H] +步驟 -2
在環境溫度下向含有三級丁基-二甲基-[5-(4-吡啶基)戊氧基]矽烷( 3,5 g,15.92 mmol)於無水MeOH (120 mL)中之充分攪拌溶液的500 mL單頸圓底燒瓶中添加氫氧化鈀/碳,20重量% 50%水(4 g,5.70 mmol)及乙酸(956.13 mg,15.92 mmol,0.911 mL)。將反應混合物在此溫度下在氫氣(氣囊約1 atm壓力)下攪拌16小時。反應完成後,反應混合物經由矽藻土床過濾且用MeOH (500 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下蒸發合併之濾液,得到呈黃色液體狀之三級丁基-二甲基-[5-(4-哌啶基)戊氧基]矽烷( 4,4.5 g,15.60 mmol,97%產率)。LC-MS (ES +): m/z286.2 [M + H] +步驟 -3
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有三級丁基-二甲基-[5-(4-哌啶基)戊氧基]矽烷( 4,4.5 g,15.60 mmol)於THF (80 mL)中之充分攪拌溶液的500 mL單頸圓底燒瓶中添加飽和NaHCO 3溶液(2.62 g,31.20 mmol)且攪拌10分鐘。在0℃下逐滴添加含50%氯甲酸苯甲酯之甲苯(3.19 g,18.72 mmol)且在環境溫度下攪拌所得混合物3小時。完成後,將反應混合物用水(150 mL)稀釋且用EtOAc (3×100 mL)萃取。合併之有機層用鹽水(30 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥且在減壓下濃縮,以獲得粗化合物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)純化,用10-15% EtOAc/石油醚溶離所需化合物,得到呈無色液體狀之4-[5-[三級丁基(二甲基)矽基]氧基戊基]哌啶-1-甲酸苯甲酯( 5;6.8 g,13.92 mmol,89%產率)。LC-MS (ES +): m/z420.2 [M + H] +步驟 -4
在0℃下向含有4-[5-[三級丁基(二甲基)矽基]氧基戊基]哌啶-1-甲酸苯甲酯( 5,6.8 g,13.92 mmol)於無水THF (60 mL)中之充分攪拌溶液的250 mL單頸圓底燒瓶中添加TBAF (27.85 mL;1M/THF)且在環境溫度下繼續攪拌3小時。完成後,將反應混合物用水(300 mL)稀釋且用EtOAc (2×400 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且在減壓下濃縮濾液,得到粗物質,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,40% EtOAc石油醚)純化,得到呈黃色液體狀之4-(5-羥戊基)哌啶-1-甲酸苯甲酯( 6,4.1 g,13.37 mmol,96%產率)。LC-MS (ES +): m/z306.2 [M + H] +步驟 -5
在0℃下在氮氣氛圍下向含有4-(5-羥戊基)哌啶-1-甲酸苯甲酯( 6,2 g,6.48 mmol)於無水DCM (20 mL)中之充分攪拌溶液的10 mL單頸圓底燒瓶中添加氯鉻酸吡啶(2.10 g,9.72 mmol)及矽藻土(4 g)之混合物。在環境溫度下攪拌反應混合物2小時。完成後,反應混合物經由矽藻土墊過濾,且用1:1 EtOAc/石油醚(200 mL)洗滌矽藻土床,且濃縮合併之濾液,得到呈棕色膠狀之4-(5-側氧基戊基)哌啶-1-甲酸苯甲酯( 7,1.9 g,6.2 mmol,96%產率)。LC-MS (ES +): m/z304.2 [M + H] +步驟 -6
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有4-(5-側氧基戊基)哌啶-1-甲酸苯甲酯( 7,1.9 g,6.2 mmol)於無水MeOH (20 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加4-甲基苯磺酸;水合物(235.85 mg,1.24 mmol)及原甲酸三甲酯(3.29 g,31.00 mmol,3.40 mL)。在70℃下攪拌反應混合物2小時。完成後,將反應混合物倒入水(50 mL)中且攪拌5分鐘。用EtOAc (2×300 mL)萃取水相。合併之有機相用鹽水(70 mL)洗滌,乾燥(無水Na 2SO 4),過濾且在減壓下蒸發濾液,得到呈淡黃色液體狀之4-(5,5-二甲氧基戊基)哌啶-1-甲酸苯甲酯( 8,2 g,4.6 mmol,74%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ). δ7.40-7.32 (m, 5H), 5.06 (s, 1H), 4.33-4.30 (m, 1H), 4.03-3.97 (m, 2H), 3.20 (s, 6H), 2.76 (s, 2H), 1.78-1.67 (m, 2H), 1.52-1.47 (m, 2H), 1.39-1.38 (m, 2H), 1.27-1.25 (m, 6H)及1.20-1.18 (m, 2H)。 步驟 -7
在環境溫度下向含有4-(5,5-二甲氧基戊基)哌啶-1-甲酸苯甲酯( 8,2.0 g,4.58 mmol)於無水MeOH (40 mL)中之充分攪拌溶液的250 mL單頸圓底燒瓶中添加氫氧化鈀/碳,20重量% 50%水(2.0 g,2.85 mmol)。將所得混合物在環境溫度下在氫氣氛圍(約1 atm)下攪拌16小時。完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且用MeOH (100 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮合併之濾液,得到呈無色膠狀之4-(5,5-二甲氧基戊基)哌啶( 9,950 mg,4.39 mmol,96%產率)。LC-MS (ES +): m/z216.2 [M + H] +步驟 -8
向含有5-溴-1-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-6-氟-3-甲基-苯并咪唑-2-酮( 10,920 mg,1.34 mmol)及4-(5,5-二甲氧基戊基)哌啶( 9,438.13 mg,2.01 mmol)於無水1,4-二㗁烷(30 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL密封管中添加碳酸銫(1.09 g,3.36 mmol),且將反應混合物用氮氣吹掃5分鐘。隨後,添加Pd-PEPPSI-Ihept (26.13 mg,0.026 mmol)且在110℃下加熱反應混合物16小時。完成後,將反應混合物冷卻至環境溫度,經由矽藻土墊過濾且用EtOAc (200 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮合併之濾液,得到粗物質,其藉由急驟矽膠(230-400目)管柱層析純化,用30%-40% EtOAc/石油醚溶離,得到呈棕色膠狀之1-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-5-[4-(5,5-二甲氧基戊基)-1-哌啶基]-6-氟-3-甲基-苯并咪唑-2-酮( 11,400 mg,0.520 mmol,39%產率)。UPLC-MS (ES +): m/z669.8 [M + H] +步驟 -9
在環境溫度下向含有1-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-5-[4-(5,5-二甲氧基戊基)-1-哌啶基]-6-氟-3-甲基-苯并咪唑-2-酮( 11,400 mg,0.520 mmol)於無水1,4-二㗁烷(20 mL)中之充分攪拌溶液的250 mL單頸圓底燒瓶中添加氫氧化鈀/碳,20重量% 50%水(900 mg,1.28 mmol)。在此溫度下在氫氣(約1 atm)下攪拌所得混合物16小時。完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且用1,4-二㗁烷(200 mL)洗滌矽藻土床,且在減壓下濃縮合併之濾液。所得粗物質用MTBE (20 mL)洗滌且藉由逆相C18管柱層析(0.1%碳酸氫銨/水:ACN)進一步純化,得到呈灰白色固體狀之3-[5-[4-(5,5-二甲氧基戊基)-1-哌啶基]-6-氟-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-1-基]哌啶-2,6-二酮( 12,60 mg,0.111 mmol,21%產率)。LC-MS (ES +): m/z491.4 [M + H] +步驟 -10
在0℃下向含有3-[5-[4-(5,5-二甲氧基戊基)-1-哌啶基]-6-氟-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-1-基]哌啶-2,6-二酮( 12,50 mg,0.093 mmol)於無水DCM (1 mL)中之充分攪拌溶液的10 mL單頸圓底燒瓶中添加含4 N HCl之1,4-二㗁烷(2 mL)。將所得混合物在環境溫度下攪拌2小時。完成後,在減壓下濃縮反應混合物,且由此獲得之粗物質用MTBE (20 mL)洗滌,得到呈白色固體狀之5-[1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-6-氟-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-4-哌啶基]戊醛鹽酸鹽( 13;50 mg,0.069 mmol,74%產率)。LC-MS (ES +): m/z445.3 [M + H] +實例 11 合成 1-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ] 哌啶 -4- 甲酸
Figure 02_image986
步驟 -1
在0℃下經10分鐘向含有2,4-二氟-1-硝基-苯( 1,10 g,62.86 mmol,6.90 mL)之充分攪拌溶液的250 mL圓底燒瓶中逐滴添加40%甲胺/水(14.64 g,188.57 mmol)。在室溫下在0℃下攪拌所得混合物1小時。過濾所觀測到的黃色沈澱物,用水(400 mL)洗滌且減壓乾燥,得到呈黃色固體狀之5-氟- N-甲基-2-硝基-苯胺( 2,8.5 g,47.36 mmol,75%產率)。LCMS (ES +): m/z171.0 [M+H] +步驟 -2
在室溫下向含有5-氟- N-甲基-2-硝基-苯胺( 2,8.5 g,46.96 mmol)於DMF (250 mL)中之充分攪拌溶液的500 mL單頸圓底燒瓶中添加 N,N-二異丙基乙胺(30.35 g,234.81 mmol,40.90 mL),接著添加哌啶-4-甲酸三級丁酯( 3,9.37 g,42.26 mmol,HCl鹽),且將所得混合物在90℃下攪拌16小時。反應完成後,在真空下移除揮發物且用水(900 mL)淬滅混合物。用EtOAc (3×900 mL)萃取水層,且合併之有機層經無水Na 2SO 4乾燥,且過濾。在減壓下濃縮濾液且藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,20% EtOAc/石油醚)純化粗產物,得到呈黃色固體狀之1-[3-(甲胺基)-4-硝基-苯基]哌啶-4-甲酸三級丁酯( 4,6.5 g,18.01 mmol,38%產率)。LCMS (ES +): m/z336.2 [M+H] +步驟 -3
向1-[3-(甲胺基)-4-硝基-苯基]哌啶-4-甲酸三級丁酯( 4,8 g,22.16 mmol)於THF (200 mL)中之攪拌溶液中添加10%鈀/碳(9.43 g,8.86 mmol)。在室溫下在H 2氛圍下攪拌反應混合物16小時。在起始物質耗盡後,反應混合物經由矽藻土墊過濾,其用THF:二㗁烷(300 mL)洗滌。蒸發濾液,得到呈棕色固體狀之1-[4-胺基-3-(甲胺基)苯基]哌啶-4-甲酸三級丁酯( 5,6.5 g,19.85 mmol,90%產率)。LCMS (ES +): m/z306.2 [M+H] +步驟 -4
在室溫下在氮氣氛圍下向含有1-[4-胺基-3-(甲胺基)苯基]哌啶-4-甲酸三級丁酯( 5,6.5 g,19.85 mmol)於THF (400 mL)中之攪拌溶液的1 L單頸圓底燒瓶中添加二(咪唑-1-基)甲酮( 6,6.44 g,39.71 mmol)。在室溫下攪拌反應混合物16小時。反應完成後,將反應混合物用水(200 mL)稀釋且用乙酸乙酯(3×400 mL)萃取。合併之有機層經硫酸鈉乾燥,過濾且在減壓下濃縮,且藉由管柱層析(60-120目矽膠,1-3%甲醇/DCM)純化粗產物,得到呈灰白色固體狀之1-(3-甲基-2-側氧基-1H-苯并咪唑-5-基)哌啶-4-甲酸三級丁酯( 7,5.5 g,16.35 mmol,82%產率)。LCMS (ES +): m/z332.2 [M+H] +步驟 -5
在0℃下向含有1-(3-甲基-2-側氧基-1H-苯并咪唑-5-基)哌啶-4-甲酸三級丁酯( 7,2.5 g,7.39 mmol)於無水THF (100 mL)中之充分攪拌溶液的500 mL三頸圓底燒瓶中添加氫化鈉(60%分散液於礦物油中,4.14 g,103.50 mmol)。在0℃下攪拌所得混合物0.5小時。接著在0℃下緩慢添加含3-溴哌啶-2,6-二酮( 8,8.52 g,44.36 mmol)之無水THF (60 mL),且在70℃下攪拌反應物16小時。反應完成後,在0℃下用NH 4Cl飽和溶液淬滅反應混合物且用EtOAc (3×75 mL)萃取水層。合併之有機層經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮,得到粗產物,其用乙腈(100 mL)洗滌,得到呈白色固體狀之1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸三級丁酯( 9,1.82 g,4.00 mmol,54%產率)。LCMS (ES +): m/z443.2 [M+H] +步驟 -6
在室溫下向含有1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸三級丁酯( 9, 500 mg,1.10 mmol)於無水DCM (5 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加含4 M HCl之二㗁烷(274.40 μL)。在室溫下攪拌所得混合物1小時。自反應混合物移除溶劑且將所得粗物質與甲苯(7 mL)共蒸餾且用MTBE (20 mL)洗滌,得到呈白色固體狀之1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸( 10,450 mg,1.05 mmol,95%產率,HCl鹽)。LCMS (ES +): m/z387.2 [M+H] +實例 12 合成 1-[3- 甲基 -1-(1- 甲基 -2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ] 哌啶 -4- 甲酸
Figure 02_image988
步驟 -1
在室溫下向含有1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸三級丁酯( 1,250 mg,536.71 μmol)於無水DMF (5 mL)中之充分攪拌溶液的50mL單頸圓底燒瓶中添加K 2CO 3(222.46 mg,1.61 mmol)及碘甲烷(228.54 mg,1.61 mmol)。在室溫下攪拌反應混合物5小時。反應完成後,在真空中移除溶劑,且藉由逆相管柱層析(C18管柱,溶劑系統A:0.1% FA/水及B:CAN)純化所得粗產物,得到呈灰白色固體狀之1-[3-甲基-1-(1-甲基-2,6-二側氧基-3-哌啶基)-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸三級丁酯( 2,100 mg,198.98 μmol,37%產率,甲酸鹽)。LC-MS (ES +): m/z457.2 [M + H] +步驟 -2
在0℃下向含有1-[3-甲基-1-(1-甲基-2,6-二側氧基-3-哌啶基)-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸三級丁酯( 2,100 mg,219.04 μmol)於無水DCM (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加含4 M HCl之二㗁烷(1.10 mL)。在室溫下攪拌所得反應混合物2小時。反應完成後,真空濃縮反應混合物且粗產物用MTBE (2 mL)洗滌且乾燥,得到1-[3-甲基-1-(1-甲基-2,6-二側氧基-3-哌啶基)-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸(90 mg,185.40 μmol,85%產率,HCl鹽)。LC-MS (ES +): m/z401.2 [M+ H] +實例 13 合成 1 -[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-3- 乙基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ] 哌啶 -4- 甲酸鹽酸鹽
Figure 02_image990
Figure 02_image992
步驟 -1
在0℃下向含有6-溴-3-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-1H-苯并咪唑-2-酮( 1,1 g,1.79 mmol)於無水DMF (15 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加氫化鈉(137.29 mg,3.58 mmol,60%分散液於礦物油中)。在環境溫度下攪拌反應混合物20分鐘,隨後在0℃下添加碘乙烷(558.84 mg,3.58 mmol,0.288 mL)。接著在環境溫度下攪拌反應物2小時。反應完成後,將反應混合物用飽和氯化銨(10 mL)淬滅且用EtOAc (2×150 mL)萃取。合併之有機相用水繼之以鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥且過濾。在減壓下濃縮濾液,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,25-27% EtOAc/石油醚)純化,得到呈棕色液體狀之5-溴-1-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-3-乙基-苯并咪唑-2-酮( 2,1 g,1.78 mmol,93%產率)。LC-MS (ES +): m/z532.0 [M+ H] +步驟 -2
向含有5-溴-1-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-3-乙基-苯并咪唑-2-酮 (2,720 mg,1.28 mmol)及哌啶-4-甲酸三級丁酯( 3, 565.83 mg,2.55 mmol)於無水1,4-二㗁烷(6 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL密封管中添加碳酸銫(1.25 g,3.83 mmol),且將反應混合物用N 2脫氣10分鐘。隨後,添加RuPhos-Pd-G3 (106.85 mg,0.127 mmol)且將所得混合物再用N 2脫氣5分鐘。在110℃下攪拌反應混合物16小時。反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且用EtOAc (150 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮合併之濾液,得到粗產物,其藉由閃蒸塔(230-400目矽膠,40% EtOAc/石油醚)純化,得到呈棕色膠狀之1-[1-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-3-乙基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸三級丁酯( 4,700 mg,1.09 mmol,85%產率)。LC-MS (ES +): m/z635.2 [M+ H] +步驟 -3
在環境溫度下向含有1-[1-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-3-乙基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸三級丁酯( 4,600 mg,0.935 mmol)於無水1,4-二㗁烷(6 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加氫氧化鈀/碳,20重量% 50%水(1.18 mg,1.68 mmol)。在氫氣氛圍下在此溫度下攪拌反應混合物16小時。反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且用EtOAc (150 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮經合併之濾液,得到呈無色膠狀之1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-乙基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸三級丁酯( 5,420 mg,0.811 mmol,86%產率)。LC-MS (ES +): m/z457.4 [M+ H] +步驟 -4
在0℃下向含有1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-乙基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸三級丁酯( 5,500 mg,0.964 mmol)於無水DCM (5 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加含4M HCl之1,4-二㗁烷(2.41 mL)。在環境溫度下攪拌反應混合物2小時。接著在減壓下濃縮反應混合物,得到粗物質,其用MTBE (10 mL)洗滌,得到呈灰白色固體狀之1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-乙基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸鹽酸鹽( 6,400 mg,0.858 mmol,89%產率)。LC-MS (ES +): m/z401.2 [M+ H] +實例 14 合成 3-(6- -3- 甲基 -2- 側氧基 -5- 𠯤 -1- - 苯并咪唑 -1- ) 哌啶 -2,6- 二酮鹽酸鹽
Figure 02_image994
步驟 -1
在室溫下向含有1,2,4-三氟-5-硝基-苯( 1,3.5 g,19.76 mmol,2.27 mL)於無水DMF (35 mL)中之充分攪拌溶液的250 mL單頸圓底燒瓶中添加K 2CO 3(2.55 g,19.76 mmol)且攪拌5分鐘。接著,在0℃下添加含哌𠯤-1-甲酸三級丁酯( 2,3.68 g,19.76 mmol)之無水DMF (15 mL)且在室溫下繼續攪拌3小時。混合物經由矽藻土墊過濾且在減壓下濃縮,得到粗化合物。向此粗化合物中添加MTBE及石油醚之1:1混合物(50 mL)以獲得固體,其經過濾且在減壓下乾燥,得到呈黃色固體狀之4-(2,5-二氟-4-硝基-苯基)哌𠯤-1-甲酸酯( 3, 4 g,11.53 mmol,58%產率)。 LC-MS (ES +): m/z244.1 [M - Boc + H] +步驟 -2
在室溫下向含有4-(2,5-二氟-4-硝基-苯基)哌𠯤-1-甲酸三級丁酯 (3,4 g,11.53 mmol)於1,4-二㗁烷(30 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL密封管中添加甲胺鹽酸鹽(1.17 g,17.30 mmol)及 N,N-二異丙基乙胺(4.47 g,34.60 mmol,6.03 mL)。在90℃下加熱反應混合物18小時。反應混合物經由矽藻土墊過濾且用EtOAc (250 mL)洗滌。將濾液用水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。在減壓下濃縮,得到呈淡黃色固體狀之4-[2-氟-5-(甲胺基)-4-硝基-苯基]哌𠯤-1-甲酸三級丁酯( 4,3.5 g,9.75 mmol,85%產率)。 LC-MS (ES +): m/z299.2 [M - tBu + H] + 步驟 -3
在室溫下向含有4-[2-氟-5-(甲胺基)-4-硝基-苯基]哌𠯤-1-甲酸三級丁酯( 4,3.5 g,9.68 mmol)於THF (100 mL)、甲醇(70 mL)及水(30 mL)中之充分攪拌溶液的250 mL單頸圓底燒瓶中添加鋅粉(325目高級材料,3.16 g,48.39 mmol)及氯化銨(2.59 g,48.39 mmol,1.69 mL)。在80℃下加熱反應混合物4小時。此後,混合物經由矽藻土墊過濾且用EtOAc (250 mL)洗滌。將濾液用水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥。在減壓下濃縮,得到呈紅棕色膠狀之4-[4-胺基-2-氟-5-(甲胺基)苯基]哌𠯤-1-甲酸三級丁酯( 5,2.8 g,7.46 mmol,77%產率)。LC-MS (ES +): m/z325.2 [M + H] +步驟 -4
在室溫下向含有4-[4-胺基-2-氟-5-(甲胺基)苯基]哌𠯤-1-甲酸三級丁酯( 5,2.8 g,7.42 mmol)於THF (30 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加1,1'-羰基二咪唑(3.21 g,22.27 mmol)。在室溫下攪拌反應混合物16小時。隨後,蒸發溶劑,且將殘餘物分配於水與DCM之間。分離有機層,且用DCM (2×200 mL)萃取水層。將合併之有機層用水洗滌且經硫酸鈉乾燥,得到粗物質,其藉由矽膠急驟管柱層析(230-400目矽膠;50-60% EtOAc/石油醚)純化,得到呈淡黃色固體狀之4-(6-氟-3-甲基-2-側氧基-1H-苯并咪唑-5-基)哌𠯤-1-甲酸三級丁酯( 6,1.5 g,4.08 mmol,55%產率)。LC-MS (ES +): m/z351.2 [M + H] +步驟 -5
在0℃下以5分鐘時間間隔分三份向含有4-(6-氟-3-甲基-2-側氧基-1H-苯并咪唑-5-基)哌𠯤-1-甲酸三級丁酯( 6,500 mg,1.36 mmol)於THF (30 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加氫化鈉(60%分散液於礦物油中,727.21 mg,18.98 mmol),且在室溫下攪拌1小時。在0℃下逐滴添加3-溴哌啶-2,6-二酮( 7,1.56 g,8.13 mmol)於THF (10 mL)中之溶液。將混合物在65℃下加熱16小時且接著在0℃下用飽和氯化銨溶液淬滅。用EtOAc (2×200 mL)萃取水溶液。合併之有機層經Na 2SO 4乾燥且接著濃縮,得到粗化合物,其藉由逆相管柱層析[管柱:Silicycle C18-100 g;移動相A:0.1%甲酸/水及移動相B:乙腈]純化,得到呈淡黃色膠狀之4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-6-氟-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌𠯤-1-甲酸三級丁酯( 8,450 mg,744.19 μmol,55%產率)。LC-MS (ES +): m/z462.2 [M + H] +步驟 -6
在室溫下在氮氣氛圍下向含有4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-6-氟-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌𠯤-1-甲酸三級丁酯( 8,450 mg,955.61 μmol)於DCM (7 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加氯化氫(4.0 M於1,4-二㗁烷中,4.78 mL)。在室溫下攪拌所得混合物3小時。隨後,在減壓下濃縮混合物,得到呈淡黃色膠狀之3-(6-氟-3-甲基-2-側氧基-5-哌𠯤-1-基-苯并咪唑-1-基)哌啶-2,6-二酮鹽酸鹽( 9,400 mg,818.04 μmol,86%產率)。LC-MS (ES +): m/z362.2 [M + H] +實例 15 合成 3-[3- 甲基 -5-[3-( 甲胺基 ) 丙基 ]-2- 側氧基 - 苯并咪唑 -1- ] 哌啶 -2,6- 二酮鹽酸鹽
Figure 02_image996
步驟 -1
向含有3-(5-溴-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-1-基)哌啶-2,6-二酮( 1,200 mg,0.591 mmol)及 N-甲基- N-丙-2-炔基-胺基甲酸三級丁酯( 2,400.34 mg,1.18 mmol)於無水乙腈(5 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL密封管中添加碳酸銫(481.76 mg,1.48 mmol),且藉由吹掃氮氣將反應混合物脫氣5分鐘。隨後,添加XPhos (28.16 mg,0.059 mmol)及XPhos-Pd-G3 (25.03 mg,0.029 mmol)且在90℃下加熱所得混合物16小時。反應完成後,反應混合物經由矽藻土墊過濾且矽藻土床用EtOAc (2×50 mL)洗滌且在減壓下濃縮合併之濾液。所得粗物質藉由逆相管柱層析[Redisef-RF C18管柱,移動相:0.1%甲酸/水:MeCN]純化,得到呈灰白色固體狀之 N-[3-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]丙-2-炔基]- N-甲基-胺基甲酸三級丁酯( 3,45 mg,0.103 mmol,18%產率)。LC-MS (ES +): m/z371.2 [M -異丁烯+ H] +步驟 -2
在環境溫度下向含有 N-[3-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]丙-2-炔基]- N-甲基-胺基甲酸三級丁酯( 3,45 mg,0.102 mmol)於無水1.4-二㗁烷(1 mL)及DMF (0.5 mL)之混合物中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加氫氧化鈀/碳,20重量% 50%水(35.93 mg,0.051 mmol)。在此溫度下在氫氣氛圍(約1 atm)下攪拌反應混合物16小時。反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且用1:1 THF:DMF之混合物(50 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮濾液,得到呈灰白色固體狀之 N-[3-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]丙基]- N-甲基-胺基甲酸三級丁酯( 4,35 mg,0.081 mmol,79%產率)。LC-MS (ES +): m/z375.0 [M -異丁烯+ H] +步驟 -3
在0℃下向含有 N-[3-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]丙基]- N-甲基-胺基甲酸三級丁酯( 4,35.35 mg,0.081 mmol)於DCM (0.5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加含4 M HCl之1,4-二㗁烷(0.203 mL)。在添加完成後,將所得混合物在環境溫度下攪拌2小時。反應完成後,自反應混合物移除過量溶劑,得到粗物質,使其與甲苯共沸且用MTBE (5 mL)洗滌,得到呈灰白色固體狀之3-[3-甲基-5-[3-(甲胺基)丙基]-2-側氧基-苯并咪唑-1-基]哌啶-2,6-二酮鹽酸鹽( 5,25 mg,0.067 mmol,83%產率)。LC-MS (ES +): m/z331.2 [M + H] +實例 16 合成 6-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -4- ] 己醛
Figure 02_image998
化合物4-溴-1-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-3-甲基-苯并咪唑-2-酮遵循WO2021127586 A1之第200-201頁上所述之方法製備。 步驟 -1
向含有4-溴-1-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-3-甲基-苯并咪唑-2-酮( 1,0.5 g,0.803 mmol)於無水乙腈(5 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL密封管中添加己-5-炔-1-醇( 2,157.75 mg,1.61 mmol,0.179 mL)及三乙胺(243.97 mg,2.41 mmol,0.336 mL)。用氮氣吹掃反應混合物5分鐘,隨後添加碘化銅(15.31 mg,0.08 mmol)及二氯鈀;三苯基膦(56.41 mg,0.08 mmol)。將所得反應混合物再次用氮氣吹掃2分鐘,且接著在90℃下攪拌10小時。完成後,反應混合物用水(30 mL)稀釋且用EtOAc (3×50 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥且過濾。濃縮濾液,得到粗產物,其藉由管柱層析(60-120目矽膠,50-60% EtOAc/石油醚)純化,得到呈淺棕色膠質液體狀之1-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-4-(6-羥基己-1-炔基)-3-甲基-苯并咪唑-2-酮( 3,0.42 g,0.66 mmol,80%產率)。LC-MS (ES +): m/z534.0 [M + H] +步驟 -2
向含有1-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-4-(6-羥基己-1-炔基)-3-甲基-苯并咪唑-2-酮( 3,0.42 g,0.643 mmol)於1,4-二㗁烷(10 mL)中之攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加10%鈀/碳(0.6 g,5.64 mmol)。反應混合物用氫氣鼓泡10分鐘且接著在氫氣氛圍(1 atm)下在環境溫度下攪拌16小時。完成後,用氮氣吹掃反應混合物,且藉由經矽藻土墊過濾來移除催化劑,且用1:1 THF/1,4-二㗁烷(100 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮濾液,得到呈淺棕色膠狀之3-[4-(6-羥己基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-1-基]哌啶-2,6-二酮( 4,0.24 g,0.605 mmol,94%產率)。LC-MS (ES +): m/z360.2 [M + H] +步驟 -3
在0℃下在氮氣氛圍下向含有3-[4-(6-羥己基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-1-基]哌啶-2,6-二酮( 4,0.24 g,0.66 mmol)於無水DCM (10 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加乙酸(1,1-二乙醯氧基-3-側氧基-1,2-苯并碘氧雜環戊-1-基)酯(513.93 mg,1.21 mmol)。在環境溫度下攪拌反應混合物12小時。完成後,將反應混合物用硫代硫酸鈉溶液(2 g於15 mL水中)及碳酸氫鈉溶液(2 g於15 mL水中)淬滅,且將反應混合物在環境溫度下攪拌20分鐘,且接著用DCM (3×20 mL)萃取。合併之有機相用水(20 mL)、鹽水(20 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且過濾。在減壓下濃縮濾液,得到呈無色液體狀之6-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-4-基]己醛( 5,0.22 g,0.460 mmol,75%產率)。LC-MS (ES +): m/z358.0 [M + H] +實例 17 合成 (3R)-3- 甲基 -3-[3- 甲基 -2- 側氧基 -5-(4- 哌啶基 ) 苯并咪唑 -1- ] 哌啶 -2,6- 二酮鹽酸鹽
Figure 02_image1000
步驟 -1
向含有5-溴-3-甲基-1H-苯并咪唑-2-酮( 1,2 g,8.81 mmol)及2-溴丙腈( 2,1.18 g,8.81 mmol)於二甲基甲醯胺(25 mL)中之充分攪拌溶液的20 mL (2×1g)小瓶中添加碳酸銫(5.74 g,17.62 mmol),且將反應混合物加熱至85℃後維持2小時。反應混合物用DCM (5 mL)稀釋且倒入水中。合併之有機層用鹽水溶液(10 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥,過濾且真空濃縮,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(100-200目矽膠,15%-60%乙酸乙酯/石油醚)純化,得到呈白色固體狀之2-(5-溴-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-1-基)丙腈( 3,1.6 g,5.70 mmol,65%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ 7.53 (d, J = 1.6 Hz, 1H), 7.35-7.30 (m, 2H), 5.82 (q, J = 7.2 Hz, 1H), 3.34 (s, 3H), 1.71 (d, J = 7.2 Hz, 3H) ppm。 步驟 -2
在250 mL單頸圓底燒瓶中,將2-(5-溴-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-1-基)丙腈( 3,1 g,3.57 mmol)於四氫呋喃(40 mL)中之充分攪拌溶液冷卻至-78℃。逐滴添加二異丙基胺基鋰溶液(2 M,8.92 mL)且在-78℃下攪拌所得混合物1小時,接著在-78℃下添加3-溴丙酸甲酯( 4,894.26 mg,5.35 mmol),且攪拌3小時。將反應混合物在-78℃下用飽和氯化銨溶液(30 mL)淬滅且接著升溫至室溫且用乙酸乙酯(2×40 ml)萃取。合併之有機層經無水硫酸鈉乾燥且過濾。在減壓下濃縮濾液,得到呈黃色液體狀之4-(5-溴-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-1-基)-4-氰基-戊酸甲酯( 5,1.4 g,2.77 mmol,78%產率)。LC-MS (ES +): m/z366.2 [M + H] +步驟 -3
在室溫下向含有4-(5-溴-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-1-基)-4-氰基-戊酸甲酯( 5,4 g,10.92 mmol)於THF (40 mL)及水(20 mL)中之攪拌溶液的250 ml單頸圓底燒瓶中添加單水合氫氧化鋰(2.29 g,54.61 mmol),且在室溫下攪拌所得反應混合物3小時。反應完成後,添加30 ml水且用乙酸乙酯(2×40 ml)萃取反應混合物。接著將水層用1 N HCl溶液酸化,且用乙酸乙酯(2×40 ml)萃取。合併之有機層經無水硫酸鈉乾燥,過濾且在減壓下濃縮,得到呈無色膠質液體狀之4-(5-溴-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-1-基)-4-氰基-戊酸( 6,2.8 g,4.18 mmol,38%產率)。LC-MS (ES +): m/z354.0 [M + H] +步驟 -4
在室溫下向含有4-(5-溴-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-1-基)-4-氰基-戊酸( 6,3.0 g,8.52 mmol)之充分攪拌溶液的40 mL螺旋蓋中添加乙酸(15.74 g,262.03 mmol,15 mL)、硫酸(835.48 mg,8.52 mmol,456.54 μL)。在90℃下攪拌所得反應混合物3小時。將反應混合物冷卻至室溫且在減壓下濃縮。接著將100 ml水添加至所獲得之殘餘物中,且將沈澱物過濾且乾燥,得到粗產物,其藉由逆相管柱層析[管柱:X select C18 (250*19) mm,5微米,移動相:A:0.1% HCOOH/水,B:乙腈]純化,得到呈灰白色固體狀之3-(5-溴-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-1-基)-3-甲基-哌啶-2,6-二酮( 7,2.1 g,5.52 mmol,65%產率)。LC-MS (ES +): m/z352.0 [M + H] +步驟 -5
向含有3-(5-溴-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-1-基)-3-甲基-哌啶-2,6-二酮( 7,1.5 g,3.94 mmol)於THF (15 mL)及水(1 mL)中之充分攪拌溶液的40 ml螺旋蓋小瓶中添加4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊烷-2-基)-3,6-二氫-2H-吡啶-1-甲酸三級丁酯( 8,1.34 g,4.34 mmol)、K 3PO 4(1.51 g,7.10 mmol)且將反應混合物用N 2脫氣約5分鐘,隨後在室溫下在氮氣氛圍下添加XPhos-Pd-G2 (232.71 mg,295.77 μmol)。在80℃下攪拌所得反應混合物2小時。接著將反應混合物冷卻至室溫,添加水(30 ml),且用乙酸乙酯(2×40 ml)萃取混合物。合併之有機層經無水硫酸鈉乾燥,過濾且在減壓下濃縮。所獲得之粗產物藉由急驟管柱層析(70%乙酸乙酯/石油醚)純化,得到呈灰白色固體狀之4-[3-甲基-1-(3-甲基-2,6-二側氧基-3-哌啶基)-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-3,6-二氫-2H-吡啶-1-甲酸三級丁酯( 9,1.55 g,3.21 mmol,82%產率)。LC-MS (ES +): m/z399.2 [M - 異丁烯+ H] +步驟 -6
向烘箱乾燥的250 mL單頸圓底燒瓶中裝入含4-[3-甲基-1-(3-甲基-2,6-二側氧基-3-哌啶基)-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-3,6-二氫-2H-吡啶-1-甲酸三級丁酯( 9,1.8 g,3.73 mmol)之二㗁烷(40 mL)。將內含物用N 2脫氣,接著添加氫氧化鈀/碳,20重量% 50%水(883.14 mg,6.29 mmol)。在室溫下在氫氣氛圍(1 kg壓力)下攪拌所得混合物16小時。完成後,反應混合物經由矽藻土墊過濾且矽藻土床用含50% 1,4-二㗁烷之乙酸乙酯(500 mL)洗滌。在減壓下濃縮濾液,得到4-[3-甲基-1-(3-甲基-2,6-二側氧基-3-哌啶基)-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 10,1.75 g,3.66 mmol,98%產率)。LC-MS (ES +): m/z401.6 [M - 異丁烯+ H] +步驟 -7
遵循以下方法藉由對掌性SFC分離4-[3-甲基-1-(3-甲基-2,6-二側氧基-3-哌啶基)-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 10,500  mg,1.05 mmol)之對映異構體:YMC Cellulose-SA,流動速率:5 mL/分鐘,共溶劑:40%,共溶劑名稱:IPA,注射體積:7μL,溫度:35℃,出口壓力:100巴。在減壓下濃縮RT=2.10 min處之早期溶離峰,得到呈灰白色固體狀之4-[3-甲基-2-側氧基-1-[(3R)-3-甲基-2,6-二側氧基-3-哌啶基]苯并咪唑-5-基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 11,220 mg,0.481 mmol,46%產率)。注意:組態經任意指定。LC-MS (ES +): m/z401.2 [M - 異丁烯+ H] +. [a] 22.9= 17.0 (c 0.6, ACN)。 步驟 -8
在0℃下向含有4-[3-甲基-2-側氧基-1-[(3R)-3-甲基-2,6-二側氧基-3-哌啶基]苯并咪唑-5-基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 11,101.01 mg,0.219 mmol)於無水DCM (3 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加含4 N HCl之1,4-二㗁烷(0.547 mL)。在環境溫度下攪拌所得溶液1小時。接著在減壓下蒸發揮發物,得到呈灰白色固體狀之( R)-3-甲基-3-(3-甲基-2-側氧基-5-(哌啶-4-基)-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-1-基)哌啶-2,6-二酮鹽酸鹽( 12,80 mg,0.201 mmol,91%產率)。LC-MS (ES +): m/z357.2 [M + H] +實例 18 合成 1-(3-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-2- 側氧基 -2,3- 二氫苯并 [d] 㗁唑 -6- ) 哌啶 -4- 甲酸
Figure 02_image1002
步驟 -1
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有5-氟-2-硝基-苯酚( 1,2 g,12.73 mmol)及哌啶-4-甲酸三級丁酯鹽酸鹽( 2,3.39 g,15.28 mmol)於無水DMSO (15 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL密封管中添加4-甲基嗎啉(5.15 g,50.92 mmol,5.6 mL)。在100℃下攪拌所得反應混合物16小時。藉由UPLC-MS監測反應物質之進展。在起始物質耗盡後,用冷水稀釋反應混合物,且將沈澱物過濾且乾燥,得到呈黃色固體狀之1-(3-羥基-4-硝基-苯基)哌啶-4-甲酸三級丁酯( 3,4.1 g,12.46 mmol,98%產率)。LC-MS (ES +): m/z323.0 [M + H] +步驟 -2
在環境溫度下向含有1-(3-羥基-4-硝基-苯基)哌啶-4-甲酸三級丁酯( 3,4.2 g,12.77 mmol)於無水1,4-二㗁烷(50 mL)中之充分攪拌溶液的250 mL單頸圓底燒瓶中添加氫氧化鈀/碳,20重量% 50%水(4.48 g,6.38 mmol)。在此溫度下在氫氣氛圍(約1 atm)下攪拌所得混合物16小時。藉由UPLC監測反應。在起始物質耗盡後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且在減壓下濃縮濾液,得到呈粉色固體狀之1-(4-胺基-3-羥基-苯基)哌啶-4-甲酸三級丁酯( 4,3.8 g,11.57 mmol,91%產率)。LC-MS (ES +): m/z293.2 [M + H] +步驟 -3
在25℃下在惰性氛圍下向含有1-(4-胺基-3-羥基-苯基)哌啶-4-甲酸三級丁酯( 4,3.8 g,11.57 mmol)於無水THF (40 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加羰基二咪唑(2.81 g,17.35 mmol)。在添加完成後,在相同溫度下攪拌反應混合物16小時,此時TLC指示起始物質完全耗盡。在減壓下濃縮反應混合物,得到粗殘餘物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,0-100% EtOAc/石油醚)純化,得到呈粉色固體狀之1-(2-側氧基-3H-1,3-苯并㗁唑-6-基)哌啶-4-甲酸三級丁酯( 5,2.6 g,8 mmol,69%產率)。LC-MS (ES +): m/z319.0 [M + H] +步驟 -4
在0℃下在氮氣氛圍下向含有1-(2-側氧基-3H-1,3-苯并㗁唑-6-基)哌啶-4-甲酸三級丁酯( 5,2.5 g,7.70 mmol)於無水THF (15 mL)中之充分攪拌溶液的500 mL三頸圓底燒瓶中逐份添加氫化鈉(4.31 g,107.74 mmol,60%分散液於礦物油中)。在環境溫度下攪拌反應混合物1小時。隨後,在0℃下將含3-溴哌啶-2,6-二酮( 6,8.87 g,46.17 mmol)之無水THF(15 mL)添加至反應混合物中且將反應混合物加熱至65℃後維持16小時。反應完成後,將反應混合物冷卻至0℃且用逐滴的飽和氯化銨溶液(60 mL)淬滅過量試劑且用EtOAc (3×200 mL)萃取水相。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且在減壓下濃縮濾液,得到粗固體,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)純化,得到呈淺藍色固體狀之1-[3-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-2-側氧基-1,3-苯并㗁唑-6-基]哌啶-4-甲酸三級丁酯( 7,1.5 g,3.49 mmol,45%產率)。LC-MS (ES +): m/z430.4 [M + H] +步驟 -5
在0℃下向含有1-[3-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-2-側氧基-1,3-苯并㗁唑-6-基]哌啶-4-甲酸三級丁酯( 7,1.5 g,3.49 mmol)於無水DCM (20 mL)中之溶液的250 mL單頸圓底燒瓶中添加含4 M HCl之二㗁烷(8.73 mL)。在環境溫度下攪拌反應混合物16小時且藉由LCMS監測反應進程。在減壓下濃縮反應混合物,得到粗產物,其用MTBE洗滌,得到呈藍色固體狀之1-[3-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-2-側氧基-1,3-苯并㗁唑-6-基]哌啶-4-甲酸鹽酸鹽( 8,1.4 g,3.38 mmol,97%產率)。LC-MS (ES +): m/z374.2 [M + H] +實例 19 合成 6-(3-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-2- 側氧基 -2,3- 二氫苯并 [d] 㗁唑 -7- ) 己醛
Figure 02_image1004
步驟 -1
在環境溫度下向含有2-胺基-6-溴-苯酚( 1,3 g,15.96 mmol)於無水THF (60 mL)中之充分攪拌溶液的250 mL單頸圓底燒瓶中添加1,1'-羰基二咪唑(7.76 g,47.87 mmol)。將所得混合物在80℃下攪拌2小時且藉由UPLC監測。反應完成後,在減壓下自反應混合物移除THF。反應粗物質用EtOAc (200 mL)稀釋且有機層用1.5N HCl水溶液(2×75 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且過濾。在減壓下濃縮濾液,得到呈棕色固體狀之7-溴-3H-1,3-苯并㗁唑-2-酮( 2, 3.1 g,14.47 mmol,91%產率)。LC-MS (ES -): m/z213.8 [M - H] -步驟 -2
在0℃下向含有7-溴-3H-1,3-苯并㗁唑-2-酮( 2,3.1 g,14.48 mmol)於無水THF (100 mL)中之充分攪拌溶液的500 mL三頸圓底燒瓶中添加氫化鈉(3.33 g,86.91 mmol;60%分散液於礦物油中)。將所得混合物在0℃下攪拌0.5小時。接著,在0℃下緩慢添加含3-溴哌啶-2,6-二酮( 3,8.34 g,43.45 mmol)之無水THF (30 mL)且在60℃下繼續攪拌16小時。反應完成後,在0℃下用飽和NH 4Cl溶液淬滅反應混合物。水相用EtOAc (3×75 mL)萃取且合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥,且過濾。在減壓下濃縮濾液,得到粗殘餘物,其用乙酸再結晶,得到呈白色固體狀之3-(7-溴-2-側氧基-1,3-苯并㗁唑-3-基)哌啶-2,6-二酮( 4,1.7 g,5.21 mmol,36%產率)。LC-MS (ES -): m/z324.8 [M - H] -步驟 -3
在環境溫度下向含有3-(7-溴-2-側氧基-1,3-苯并㗁唑-3-基)哌啶-2,6-二酮( 4,0.5 g,1.53 mmol)及己-5-炔-1-醇( 5,450.86 mg,4.59 mmol,0.512 mL)於無水乙腈(7 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL密封管中添加TEA (619.81 mg,6.13 mmol,0.853 mL)。反應混合物用氮氣吹掃10分鐘。隨後,添加碘化銅(I) (43.75 mg,0.229 mmol)及二氯雙(三苯基膦)鈀(II) (107.48 mg,0.153 mmol)且在90℃下繼續攪拌16小時,且藉由UPLC監測反應進程。反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊且在減壓下濃縮濾液,得到粗殘餘物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,90-95% EtOAc/石油醚)純化,得到呈灰白色固體狀之3-[7-(6-羥基己-1-炔基)-2-側氧基-1,3-苯并㗁唑-3-基]哌啶-2,6-二酮( 6,0.35 g,0.899 mmol,59%產率)。LC-MS (ES +): m/z343.3 [M + H] +步驟 -4
在環境溫度下向含有3-[7-(6-羥基己-1-炔基)-2-側氧基-1,3-苯并㗁唑-3-基]哌啶-2,6-二酮( 6,0.35 g,0.899 mmol)於無水1,4-二㗁烷(4 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加氫氧化鈀/碳,20重量% 50%水(315.87 mg,0.449 mmol)。在環境溫度下在氫氣氛圍(1 atm)下攪拌所得反應混合物6小時。在經UPLC指示反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且用THF (100 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮合併之濾液,得到呈灰白色固體狀之3-[7-(6-羥己基)-2-側氧基-1,3-苯并㗁唑-3-基]哌啶-2,6-二酮( 7,0.3 g,0.743 mmol,83%產率)。LC-MS (ES +): m/z347.0 [M + H] +步驟 -5
在0℃下向含有3-[7-(6-羥己基)-2-側氧基-1,3-苯并㗁唑-3-基]哌啶-2,6-二酮( 7 0.3 g,0.743 mmol)於無水DMF (4 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加戴斯-馬丁高碘烷(472.73 mg,1.11 mmol)。將所得混合物在環境溫度下攪拌2小時。在經UPLC指示反應完成後,用飽和硫代硫酸鈉水溶液(5 mL)及飽和碳酸氫鈉水溶液(5 mL)淬滅反應混合物。水層用DCM (3×40 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥且過濾。在減壓下濃縮濾液,得到呈灰白色固體狀之6-[3-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-2-側氧基-1,3-苯并㗁唑-7-基]己醛( 8, 0.24 g,0.411 mmol,55%產率)。LC-MS (ES +): m/z367.0 [M + Na] +實例 20 合成 6-[4-[[[2-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-1,3- 二側氧基 - 異吲哚啉 -4- ] 胺基 ] 甲基 ] 三唑 -1- ] 己酸
Figure 02_image1006
遵循WO2017197056 A1之第357頁上所述之方法製備化合物2-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-4-(丙-2-炔基胺基)異吲哚啉-1,3-二酮( 1)。
在室溫下向2-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-4-(丙-2-炔基胺基)異吲哚啉-1,3-二酮( 1,5 g,16.06 mmol)及6-疊氮基己酸(2.52 g,16.06 mmol)於水(25 mL)及THF (100 mL)中之攪拌溶液中添加(+)-L-抗壞血酸鈉(3.18 g,16.06 mmol)及五水合硫酸銅(4.01 g,16.06 mmol)且攪拌2小時。反應完成後,向反應混合物中添加水且用乙酸乙酯萃取混合物。合併之有機層經硫酸鈉乾燥,且在減壓下濃縮。藉由逆相管柱層析(C18管柱,10mM乙酸銨/水及乙腈作為溶離劑)純化粗產物,得到呈黃色固體狀之6-[4-[[[2-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-1,3-二側氧基-異吲哚啉-4-基]胺基]甲基]三唑-1-基]己酸( 3,4.15 g,8.55 mmol,53.21%產率)。LC -MS (ES +): m/z469.29 [M + H] +實例 21 3-[1- 甲基 -6-(4- 哌啶基 ) 吲唑 -3- ] 哌啶 -2,6- 二酮
Figure 02_image1008
化合物3-[1-甲基-6-(4-哌啶基)吲唑-3-基]哌啶-2,6-二酮遵循WO2021127586 A1之第197-200頁上所述之方法製備。 實例 22 合成 ( R)-3- 甲基 -3-(1- 甲基 -6-( 哌啶 -4- )-1H- 吲唑 -3- ) 哌啶 -2,6- 二酮
Figure 02_image1010
Figure 02_image1012
步驟 -1
在環境溫度下向含有6-溴-1H-吲唑-3-甲酸甲酯( 1,25 g,98.01 mmol)於無水MeCN (710.34 mL)中之充分攪拌溶液的1000 mL三頸圓底燒瓶中添加99%無水碳酸鉀(135.46 g,980.13 mmol)及碘甲烷(69.56 g,490.07 mmol,30.51 mL)。在此溫度下攪拌所得混合物3小時,且藉由UPLC監測反應進程。接著使反應混合物穿過矽藻土墊,且在減壓下濃縮濾液,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,35-40% EtOAc/石油醚)純化,得到呈灰白色固體狀之6-溴-1-甲基-吲唑-3-甲酸甲酯( 2,13.45 g,49.47 mmol,50 %產率)及呈淡黃色固體狀之6-溴-2-甲基-3,3a-二氫吲唑-3-甲酸甲酯( 3,5.5 g,19.66 mmol,20%產率)。 2:LCMS (ES+): m/z 271.0 [M+H] +3:LCMS (ES+): m/z 271.0 [M+H] +步驟 -2
在0℃下向含有6-溴-1-甲基-吲唑-3-甲酸酯( 2,13.14 g,48.31 mmol)於THF (119.48 mL)中之充分攪拌溶液的2000 mL三頸圓底燒瓶中添加DIBAL-H (1.2 M, 80.52 mL)。將反應物在環境溫度下攪拌3小時且藉由TLC及UPLC監測。反應完成後,將反應混合物冷卻至0℃,用飽和氯化銨溶液(200 mL)淬滅且用乙酸乙酯(3×200 mL)萃取。有機相用水(150 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥,過濾且在減壓下濃縮,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(矽膠,230-400目,35-40%乙酸乙酯/石油醚)純化,得到呈灰白色固體狀之(6-溴-1-甲基-吲唑-3-基)甲醇( 4,8.6 g,35.57 mmol,74%產率)。LC-MS (ES +): m/z241.0 [M + H] +步驟 -3
在0℃下向含有(6-溴-1-甲基-吲唑-3-基)甲醇( 4,20 g,82.96 mmol)於二氯甲烷(150 mL)中之充分攪拌溶液的500 mL單頸圓底燒瓶中添加亞硫醯氯(29.61 g,248.88 mmol,18.05 mL)。在室溫下攪拌反應混合物2小時。藉由TLC及UPLC監測反應。反應完成後,在減壓下濃縮反應混合物,得到呈灰白色固體狀之6-溴-3-(氯甲基)-1-甲基-吲唑( 5,20.5 g,74.77 mmol,90%產率)。UPLC-MS (ES +): m/z261.1 [M + H] +步驟 -4
在環境溫度下向具有含6-溴-3-(氯甲基)-1-甲基-吲唑( 5,8.5 g,21.69 mmol)之DMF (50 mL)的250 mL圓底燒瓶中添加氰化鈉(2.13 g,43.39 mmol)。在60℃下攪拌所得反應混合物16小時。藉由TLC及UPLC監測反應進程。反應完成後,將反應混合物冷卻至室溫且倒入水(150 mL)中且用乙酸乙酯(3×150 mL)萃取。合併之有機層用鹽水(100 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥,過濾且在減壓下濃縮,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,30-40% 乙酸乙酯/石油醚)純化,得到呈灰白色固體狀之2-(6-溴-1-甲基-吲唑-3-基)乙腈( 6,5.2 g,20.71 mmol,95%產率)。LC-MS (ES +): m/z251.6 [M + H] +步驟 -5
在-78℃下經10分鐘向含有2-(6-溴-1-甲基-吲唑-3-基)乙腈( 6,1.8 g,7.13 mmol)於四氫呋喃(100.00 mL)中之充分攪拌溶液的250 mL單頸圓底燒瓶中添加雙(三甲基矽基)胺基鉀(1 M,7.13 mL)。在-78℃下攪拌所得反應混合物1小時。接著在-78℃下逐滴添加碘甲烷(1.01 g,7.13 mmol,443.58 μL)。將所得反應混合物在-78℃下攪拌20分鐘,且藉由TLC及UPLC監測反應進程。接著將反應混合物用飽和氯化銨溶液(30 mL)淬滅且用乙酸乙酯(2×200 mL)萃取。有機層用水(2×150 mL)、10%氯化鈉溶液(50 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥,過濾且在減壓下濃縮,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,35-40%乙酸乙酯/石油醚)純化,得到2-(6-溴-1-甲基-吲唑-3-基)丙腈( 7,480 mg,1.49 mmol,21%產率,灰白色固體)及2-(6-溴-1-甲基-吲唑-3-基)-2-甲基-丙腈( 8,100 MG, 265.15 μmol,4%產率)。 7:UPLC-MS (ES +): m/z264.0 [M + H] +8:UPLC-MS (ES +): m/z278.1 [M + H] +步驟 -6
在0℃下向含有2-(6-溴-1-甲基-吲唑-3-基)丙腈( 7,2.5 g,8.73 mmol)於二㗁烷(36.51 mL)中之充分攪拌溶液的250 mL單頸圓底燒瓶中添加丙烯酸甲酯(1.50 g,17.45 mmol,1.57 mL)、苯甲基三甲基氫氧化銨,40重量% (1.82 g,4.36 mmol,1.92 mL)。在室溫下攪拌所得反應混合物2小時。接著將反應混合物在0℃下用飽和氯化銨溶液(20 mL)淬滅且用乙酸乙酯(2×30 mL)萃取。合併之有機層用鹽水(20 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥,過濾且在減壓下濃縮,得到呈黃色油狀之4-(6-溴-1-甲基-吲唑-3-基)-4-氰基-戊酸甲酯( 9,2.8 g,7.08 mmol,81%產率)。LC-MS (ES +): m/z350.0 [M + H] +步驟 -7
在室溫下向含有4-(6-溴-1-甲基-吲唑-3-基)-4-氰基-戊酸甲酯( 9,2.4 g,3.77 mmol)之充分攪拌溶液的20 mL壓力小瓶中添加乙酸(11.32 g,188.46 mmol,10.79 mL)及硫酸(369.68 mg,3.77 mmol,202.01 μL)。在110℃下攪拌反應混合物3小時,同時藉由UPLC及TLC監測。反應完成後,將反應混合物冷卻至室溫,在減壓下濃縮,得到殘餘物,其用乙酸乙酯(50 mL)進行稀釋。有機物接著用水(20 mL)、鹽水(20 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥,過濾且在減壓下濃縮,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,45-55%乙酸乙酯/石油醚)純化,得到3-(6-溴-1-甲基-吲唑-3-基)-3-甲基-哌啶-2,6-二酮( 10,1.10 g,3.12 mmol,83%產率)。LC-MS (ES +): m/z337.0 [M + H] +步驟 -8
在環境溫度下向含有3-(6-溴-1-甲基-吲唑-3-基)-3-甲基-哌啶-2,6-二酮( 10,0.6 g,1.78 mmol)於無水DMF (10.02 mL)中之充分攪拌溶液的20 mL玻璃小瓶中添加4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊烷-2-基)-3,6-二氫-2H-吡啶-1-甲酸三級丁酯( 11,827.78 mg,2.68 mmol)及氟化銫(542.20 mg,3.57 mmol)。反應混合物用氮氣吹掃10分鐘。隨後,添加Pd(dppf)Cl 2·DCM (291.50 mg,0.356 mmol)且在90℃下繼續攪拌2小時。如TLC所示反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且用EtOAc (350 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮濾液,得到粗物質,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,40-50% EtOAc/石油醚)純化,得到呈棕色固體狀之4-[1-甲基-3-(3-甲基-2,6-二側氧基-3-哌啶基)吲唑-6-基]-3,6-二氫-2H-吡啶-1-甲酸三級丁酯( 12,850 mg,1.71 mmol,96%產率)。LC -MS (ES +): m/z439.3 [M + H] +步驟 -9
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有4-[1-甲基-3-(3-甲基-2,6-二側氧基-3-哌啶基)吲唑-6-基]-3,6-二氫-2H-吡啶-1-甲酸三級丁酯( 12,850 mg,1.71 mmol)於無水1,4-二㗁烷(10 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加氫氧化鈀/碳,20重量% 50%水(1.20 g,1.71 mmol)。將所得混合物在環境溫度下在氫氣氛圍下攪拌16小時。藉由TLC/UPLC監測反應進程。在起始物質完全耗盡之後,經由矽藻土墊過濾反應混合物,且用1,4-二㗁烷(100 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮合併之濾液,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,40-50% EtOAc/石油醚)純化,得到呈白色固體狀之4-[1-甲基-3-(3-甲基-2,6-二側氧基-3-哌啶基)吲唑-6-基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 13,570 mg,1.29 mmol,76%產率)。LC -MS (ES +): m/z385.2 [M -異丁烯+ H] +步驟 -10
藉由對掌性SFC分離對映異構體,方法細節:管柱名稱:Lux A1,共溶劑:40%及共溶劑名稱:IPA;出口壓力:100巴;溫度:35℃。在分離之後,在減壓下濃縮RT=2.30分鐘之第一溶離份(任意指定為 R-異構體),得到呈灰白色膠狀之( R)-4-(1-甲基-3-(3-甲基-2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1H-吲唑-6-基)哌啶-1-甲酸三級丁酯( 14,200 mg,0.444 mmol,35%產率) (對掌性純度=100%)。 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6). δ10.85 (s, 1H), 7.72 (d, J= 11.2 Hz, 1H), 7.47 (s, 1H), 7.04 (d, J= 11.20 Hz, 1H), 4.12 (d, J= 11.6 Hz, 2H), 3.96-3.94 (m, 3H), 2.82-2.74 (m, 3H), 2.43-2.28 (m, 2H), 2.15-2.11 (m, 1H), 1.81 (d , J= 14.8 Hz, 2H), 1.64-1.54 (m, 5H)及1.43 (s, 9H)。LC -MS (ES +): m/z441.2 [M + H] +步驟 -11
在0℃下向含有( R)-4-(1-甲基-3-(3-甲基-2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1H-吲唑-6-基)哌啶-1-甲酸三級丁酯( 14,85 mg,0.192 mmol)於無水DCM (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加含4M HCl之1,4-二㗁烷(0.48 mL)。將所得混合物在環境溫度下攪拌1小時。反應完成後,在減壓下濃縮反應混合物,得到粗產物,其用MTBE (2 mL)洗滌且乾燥,得到呈白色固體狀之( R)-3-甲基-3-(1-甲基-6-(哌啶-4-基)-1H-吲唑-3-基)哌啶-2,6-二酮鹽酸鹽( 15,73 mg,0.190 mmol,99%產率)。LC -MS (ES +): m/z341.2 [M + H] +實例 23 合成 1-(3-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-1- 甲基 -1H- 吲唑 -6- ) 哌啶 -4- 甲酸
Figure 02_image1014
步驟 -1
在環境溫度下在氮氣下向含有哌啶-4-甲酸三級丁酯鹽酸鹽( 2,779.87 mg,3.52 mmol)於1,4二㗁烷(8 mL)中之充分攪拌溶液的40 ml玻璃小瓶中添加6-溴-3-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-1-甲基-吲唑( 1,800 mg,1.60 mmol)。用N 2使反應混合物脫氣5分鐘,接著在相同溫度下添加碳酸銫(1.30 g,4.00 mmol)。再脫氣5分鐘後,添加RuPhos (89.53 mg,0.191 mmol)及RuPhos-Pd-G3 (66.86 mg,0.079 mmol)且在100℃下攪拌反應混合物16小時。藉由TLC/LCMS監測反應進程。16小時後,經由矽藻土墊過濾反應混合物,且用EtOAc (2×50 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮合併之有機相,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,15% EtOAc/石油醚)純化,得到呈棕色液體狀之1-[3-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-1-甲基-吲唑-6-基]哌啶-4-甲酸三級丁酯( 3,360 mg,0.577 mmol,36%產率)。LC -MS (ES +): m/z605.3 [M + H] +步驟 -2
在環境溫度下向含有1-[3-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-1-甲基-吲唑-6-基]哌啶-4-甲酸三級丁酯( 3,370 mg,0.593 mmol)於無水1,4-二㗁烷(3 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加氫氧化鈀/碳,20重量% 50%水(666.79 mg,0.949 mmol)。在氫氣氛圍下在環境溫度下攪拌反應混合物16小時。在經UPLC指示起始物質耗盡之後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且用1,4-二㗁烷(150 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮合併之濾液,得到呈灰白色固體狀之1-[3-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-1-甲基-吲唑-6-基]哌啶-4-甲酸三級丁酯( 4,280 mg,0.590 mmol,97%產率)。LC -MS (ES +): m/z427.6 [M + H] +步驟 -3
在0℃下向含有1-[3-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-1-甲基-吲唑-6-基]哌啶-4-甲酸三級丁酯( 4,370 mg,0.780 mmol)於無水DCM (4 mL)中之充分攪拌溶液的50 ml單頸圓底燒瓶中添加含4M HCl之1,4-二㗁烷(1.95 mL)。在環境溫度下攪拌反應混合物2小時。藉由LCMS監測反應進程。反應完成後,在減壓下濃縮反應混合物,得到粗殘餘物,其用MTBE洗滌,得到呈灰白色固體狀之1-[3-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-1-甲基-吲唑-6-基]哌啶-4-甲酸鹽酸鹽( 5,330 mg,0.705 mmol,90%產率)。LC -MS (ES +): m/z371.3 [M + H] +實例 24 合成 ( R)-1-(1- 甲基 -3-(3- 甲基 -2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-1H- 吲唑 -6- ) 哌啶 -4- 甲酸鹽酸鹽
Figure 02_image1016
步驟 -1
在環境溫度下向含有3-(6-溴-1-甲基-吲唑-3-基)-3-甲基-哌啶-2,6-二酮( 1,380 mg,1.13 mmol)及哌啶-4-甲酸三級丁酯鹽酸鹽( 2,418.82 mg,1.89 mmol)於無水1,4-二㗁烷(8 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL密封管中添加碳酸銫(920.71 mg,2.83 mmol)。反應混合物用氮氣吹掃10分鐘。隨後,添加Pd‐PEPPSI‐IHeptCl (109.96 mg,0.113 mmol)且在100℃下繼續攪拌16小時,同時藉由UPLC監測反應進程。使反應混合物穿過矽藻土墊且在減壓下濃縮濾液,得到粗殘餘物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,40% EtOAc/石油醚)純化,得到呈淡黃色固體狀之1-[1-甲基-3-(3-甲基-2,6-二側氧基-3-哌啶基)吲唑-6-基]哌啶-4-甲酸三級丁酯( 3,400 mg,0.792 mmol,70%產率)。LC-MS (ES +): m/z441.2 [M + H] +步驟 -2
對映異構體( 3)係藉由對掌性SFC分離,方法細節:管柱名稱:Chiral Pak AS-H,共溶劑:40%及共溶劑名稱:IPA;出口壓力:100巴;注射體積:0.007 ml,溫度:35℃。在分離之後,在減壓下濃縮具有RT=1.61 min之早期溶離峰(任意指定為 R-異構體),以得到呈灰白色膠狀之( R)-1-(1-甲基-3-(3-甲基-2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1H-吲唑-6-基)哌啶-4-甲酸三級丁酯( 4,150 mg,0.311 mmol,38%產率) (對掌性純度=100%)。LC-MS (ES +): m/z441.2 [M + H] +步驟 -3
在0℃下向含有( R)-1-(1-甲基-3-(3-甲基-2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1H-吲唑-6-基)哌啶-4-甲酸三級丁酯( 4,150 mg,0.323 mmol)於無水DCM (4 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(0.808 mL)。在環境溫度下攪拌所得溶液16小時。在經UPLC-MS指示反應完成後,在減壓下蒸發揮發物,得到呈灰白色固體狀之( R)-1-(1-甲基-3-(3-甲基-2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1H-吲唑-6-基)哌啶-4-甲酸鹽酸鹽( 5,130 mg,0.282 mmol,87%產率)。LC-MS (ES +): m/z385.2 [M + H] +實例 25 3-[3- -4-(4- 哌啶基 ) 苯胺基 ] 哌啶 -2,6- 二酮鹽酸鹽
Figure 02_image1018
化合物3-[3-氟-4-(4-哌啶基)苯胺基]哌啶-2,6-二酮鹽酸鹽遵循WO2021127561 A1之第353-355頁上所述之方法製備。 實例 26 合成 4-[4-[4-[(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 ) 胺基 ] 苯基 ] 𠯤 -1- ]-4- 側氧基 - 丁酸
Figure 02_image1020
化合物3-(4-哌𠯤-1-基苯胺基)哌啶-2,6-二酮鹽酸鹽遵循WO2018237026 A1之第268頁上所述之方法製備。 步驟 -1
在25℃下向3-(4-哌𠯤-1-基苯胺基)哌啶-2,6-二酮( 1,800 mg,2.46 mmol,HCl 鹽)於DMF (5 mL)中之溶液中添加DIPEA (3.18 g,24.63 mmol,4.29 mL)、4-三級丁氧基-4-側氧基-丁酸( 2,514.85 mg,2.96 mmol)及HATU (1.40 g,3.69 mmol)。在25℃下攪拌反應混合物4小時。反應完成後,將反應混合物倒入水(50 mL)中且用乙酸乙酯(2×100 mL)萃取。將合併之有機層用水(3×50 mL)、鹽水(50 mL)洗滌,經無水硫酸鈉乾燥,且在真空中濃縮,得到呈深灰色固體狀之4-[4-[4-[(2,6-二側氧基-3-哌啶基)胺基]苯基]哌𠯤-1-基]-4-側氧基-丁酸三級丁酯( 3,900 mg,1.65 mmol,66.95%產率)。LCMS (ES +): m/z445.2 [M+H] +步驟 -2
在0℃下向含有4-[4-[4-[(2,6-二側氧基-3-哌啶基)胺基]苯基]哌𠯤-1-基]-4-側氧基-丁酸三級丁酯( 3,700 mg,1.57 mmol)於DCM (3 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加TFA (5.92 g,51.92 mmol,4 mL),且將反應混合物在環境溫度下攪拌5小時。在經UPLC指示反應完成後,在減壓下濃縮反應混合物,且用MTBE (2×5 ml)洗滌殘餘物,得到呈綠色固體狀之4-[4-[4-[(2,6-二側氧基-3-哌啶基)胺基]苯基]哌𠯤-1-基]-4-側氧基-丁酸( 4,500 mg,993.05 µmol,63.06%產率,TFA鹽)。LCMS (ES +): m/z388.8 [M+H] +實例 27 合成 1-(4-((2,6- 二側氧基哌啶 -3- ) 氧基 ) 苯基 ) 哌啶 -4- 甲酸
Figure 02_image1022
步驟 -1
在環境溫度下向含有1-苯甲氧基-4-溴-苯( 1,2 g,7.60 mmol)哌啶-4-甲酸三級丁酯鹽酸鹽( 2,3.37 g,15.20 mmol)於1,4-二㗁烷(30 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL密封管中添加碳酸銫(6.19 g,19.00 mmol)。將氮氣吹掃通過反應混合物10分鐘。隨後,添加RuPhos (532.03 mg,1.14 mmol)及RuPhos-Pd-G3 (635.71 mg,0.760 mmol)且在110℃下攪拌16小時。在經UPLC指示反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且用EtOAc (100 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮合併之濾液,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,10% EtOAc/石油醚)純化,得到呈灰白色固體狀之1-(4-苯甲氧基苯基)哌啶-4-甲酸三級丁酯( 3,1.6 g,4.14 mmol,54%產率)。LC-MS (ES +): m/z368.2 [M + H] +步驟 -2
在環境溫度下向含有1-(4-苯甲氧基苯基)哌啶-4-甲酸三級丁酯( 3,1.6 g,4.14 mmol)於1:1無水MeOH/EtOAc (20 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加氫氧化鈀/碳,20重量% 50%水(1.00 g,1.43 mmol)。在此溫度下在氫氣氛圍(約1 atm)下攪拌所得混合物16小時,且藉由UPLC監測反應進程。使反應混合物穿過矽藻土墊,且用EtOAc (100 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮合併之濾液,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,25% EtOAc/石油醚)純化,得到呈灰白色固體狀之1-(4-羥苯基)哌啶-4-甲酸三級丁酯( 4,1 g,3.32 mmol,80%產率)。LC-MS (ES +): m/z278.2 [M + H] +步驟 -3
在0℃下在氮氣氛圍下向含有1-(4-羥苯基)哌啶-4-甲酸三級丁酯( 4,1 g,3.32 mmol)於無水DMF (10 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加氫化鈉(190.64 mg,4.98 mmol,60%分散液於礦物油中),且在0℃下攪拌所得混合物15分鐘。隨後,在0℃下添加含3-溴哌啶-2,6-二酮( 5,1.27 g,6.63 mmol)之無水DMF (10 mL),且在環境溫度下攪拌所得混合物16小時。藉由UPLC監測反應。用冷水淬滅反應混合物且用EtOAc (3×50 mL)萃取水層。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥且過濾。在減壓下濃縮濾液,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,60% EtOAc/石油醚)純化,得到呈灰白色固體狀之1-[4-[(2,6-二側氧基-3-哌啶基)氧基]苯基]哌啶-4-甲酸三級丁酯( 6,0.6 g,1.37 mmol,41%產率)。LC-MS (ES +): m/z389.5 [M + H] +步驟 -4
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有1-[4-[(2,6-二側氧基-3-哌啶基)氧基]苯基]哌啶-4-甲酸三級丁酯( 6,0.6 g,1.37 mmol)於無水DCM (5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(6 mL)。在此溫度下攪拌所得混合物6小時,且藉由UPLC監測反應。反應完成後,自反應混合物移除溶劑,得到粗化合物,將其與甲苯(7 mL)共蒸發,得到呈白色固體狀之1-[4-[(2,6-二側氧基-3-哌啶基)氧基]苯基]哌啶-4-甲酸( 7,0.55 g,1.06 mmol,77%產率)。LC-MS (ES +): m/z333.2 [M + H] +實例 28 合成 1-[1- 甲基 -6-(4- 哌啶基 ) 吲唑 -3- ] 六氫嘧啶 -2,4- 二酮鹽酸鹽
Figure 02_image1024
步驟 -1
在室溫下向4-溴-2-氟苯甲腈( 1,25 g,125.00 mmol)於乙醇(500 mL)中之攪拌溶液中添加甲基肼( 2,85%水溶液) (51.83 g,1.12 mol)。在125℃下在高壓釜中加熱反應混合物7小時。將反應混合物冷卻至室溫且倒入冰冷水(2000 ml)中且攪拌30分鐘。濾出固化物質,用水洗滌,且充分乾燥,得到呈灰白色固體狀之6-溴-1-甲基-1H-吲唑-3-胺( 3,25 g,105.05 mmol,84%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ) δ 7.63 (s, 2H), 7.02 (d, J =8.0 Hz,1H), 5.54 (s, 2H), 3.71 (s, 3H). LC-MS (ES +): m/z226.0 [M + H] +步驟 -2
在室溫下向6-溴-1-甲基-吲唑-3-胺( 3,50 g,221.17 mmol)於鹽酸(2 M, 500.00 mL, 1 mol)中之攪拌溶液中添加四丁基溴化銨(7.13 g,22.12 mmol)。將反應混合物加熱至55℃且在此溫度下逐滴添加丙烯酸( 4,23.91 g,331.75 mmol,22.77 mL)。將反應物加熱至100℃後維持12小時。反應完成後,將反應混合物冷卻至室溫且用冰冷水(1000 ml)稀釋。在快速攪拌下用2 M碳酸氫鈉溶液(1000 ml)將其中和至pH 6.5-7。濾出固體沈澱物,用過量冰冷水洗滌且乾燥,得到呈灰白色固體狀之3-[(6-溴-1-甲基-吲唑-3-基)胺基]丙酸( 5,54 g,163.30 mmol,74%產率)。LC-MS (ES +): m/z298.28 [M + H] +步驟 -3
向3-[(6-溴-1-甲基-吲唑-3-基)胺基]丙酸( 5,160 g,536.67 mmol)於乙酸(1.07 kg,17.76 mol,1.02 L)中之攪拌溶液中添加氰酸鈉(46.67 g,717.88 mmol)。在100℃下加熱反應混合物12小時。完成後,將反應物冷卻至室溫,經由布赫納漏斗過濾,且用水(2×500 mL)洗滌濾餅。將收集之固體乾燥,得到呈灰白色固體狀之1-(6-溴-1-甲基-吲唑-3-基)六氫嘧啶-2,4-二酮( 6,175 g,527.69 mmol,98%產率)。LC-MS (ES +): m/z323.27 [M + H] +步驟 -4
在室溫下向1-(6-溴-1-甲基-吲唑-3-基)六氫嘧啶-2,4-二酮( 6,15 g,46.42 mmol)及4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊烷-2-基)-3,6-二氫-2H-吡啶-1-甲酸三級丁酯( 7,18.66 g,60.34 mmol)於1,4-二㗁烷(150 mL)及水(30 mL)中之溶液中添加無水乙酸鈉(11.42 g,139.26 mmol)。反應混合物用氬氣脫氣10分鐘且添加1,1'-雙(二苯基膦基)二茂鐵]二氯化鈀(II) (3.40 g,4.64 mmol)。反應混合物用氬氣再脫氣5分鐘,隨後將其在90℃下攪拌16小時。隨後,在真空中濃縮反應混合物,得到粗產物,其藉由管柱層析(矽膠230-400目,70%乙酸乙酯/石油醚)純化,得到呈棕色固體狀之4-[3-(2,4-二側氧基六氫嘧啶-1-基)-1-甲基-吲唑-6-基]-3,6-二氫-2H-吡啶-1-甲酸三級丁酯( 8,18 g,34.69 mmol,75%產率)。LC-MS (ES +): m/z426.44 [M + H] +步驟 -5
將具有催化量冰乙酸(508.09 mg,8.46 mmol,484.36 μL)之4-[3-(2,4-二側氧基六氫嘧啶-1-基)-1-甲基-吲唑-6-基]-3,6-二氫-2H-吡啶-1-甲酸三級丁酯( 8,3.6g,8.46 mmol)於乙醇(30 ml)及DCM (10 ml)中之溶液添加至帕爾震盪器氫化器中。在惰性氛圍下將10重量%鈀/碳(3.08 g,25.38 mmol)添加至此混合物中,且在室溫下在氫氣氛圍下攪拌所得反應物16小時。完成後,反應物經由矽藻土床過濾且用10% MeOH/DCM洗滌。在減壓下濃縮濾液,得到4-[3-(2,4-二側氧基六氫嘧啶-1-基)-1-甲基-吲唑-6-基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 9,3.6 g,8.17 mmol,97%產率)。LC-MS (ES +): m/z428.45 [M + H] +步驟 -6
在室溫下向含有4-[3-(2,4-二側氧基六氫嘧啶-1-基)-1-甲基-吲唑-6-基]哌啶-1-甲酸三級丁酯(500 mg,1.15 mmol)於無水1,4-二㗁烷(6 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加4.0 M氯化氫於1,4-二㗁烷(2.87 mL,11.5 mmol)中之溶液。在室溫下攪拌反應混合物16小時。反應完成後,在真空中蒸發揮發物,得到呈淺黃色固體狀之1-[1-甲基-6-(4-哌啶基)吲唑-3-基]六氫嘧啶-2,4-二酮鹽酸鹽(400 mg,1.08 mmol,95%產率)。LC-MS (ES +): m/z328.2 [M + H] +實例 29 合成 4-(4-(3-(2,4- 二側氧基四氫嘧啶 -1(2H)- )-1- 甲基 -1H- 吲唑 -6- ) 哌啶 -1- )-4- 側氧基丁酸
Figure 02_image1026
步驟 -1
將1-[1-甲基-6-(4-哌啶基)吲唑-3-基]六氫嘧啶-2,4-二酮鹽酸鹽(6 g,16.5 mmol,1當量)溶解於DMF (120 mL)中。將4-(三級丁氧基)-4-側氧基丁酸(3.16 g,18.1 mmol,1.1當量)添加至反應混合物中。將反應混合物冷卻至0℃。將 N,N-二異丙基乙胺(7.17 mL, 5.32 g,41.25 mmol,2.5當量)及HATU (9.4 g,24.8 mmol,1.5當量)添加至反應混合物中且攪拌16小時,同時升溫至室溫。反應混合物用碳酸氫鈉稀釋且用乙酸乙酯萃取兩次。有機層經硫酸鈉乾燥,過濾且在減壓下蒸發,得到4-(4-(3-(2,4-二側氧基四氫嘧啶-1(2H)-基)-1-甲基-1H-吲唑-6-基)哌啶-1-基)-4-側氧基丁酸三級丁酯(10 g,定量產率)。LC-MS (ES +): m/z484.1 [M + H] +步驟 -2
在環境溫度下攪拌,將來自前一步驟之粗4-(4-(3-(2,4-二側氧基四氫嘧啶-1(2H)-基)-1-甲基-1H-吲唑-6-基)哌啶-1-基)-4-側氧基丁酸三級丁酯(10 g)溶解於二氯甲烷(100 mL)中。添加氯化氫(4M溶液於1,4-二㗁烷中,41.2 mL,165 mmol,10當量),且將反應混合物在環境溫度下攪拌16小時。蒸發揮發物且藉由逆相層析純化粗產物,得到4-(4-(3-(2,4-二側氧基四氫嘧啶-1(2H)-基)-1-甲基-1H-吲唑-6-基)哌啶-1-基)-4-側氧基丁酸(5.1 g,11.9 mmol,72%產率,經2個步驟)。LC-MS (ES +): m/z428.1 [M + H] +實例 30 7-(4-(3-(2,4- 二側氧基四氫嘧啶 -1(2H)- )-1- 甲基 -1H- 吲唑 -6- ) 哌啶 -1- )-7- 側氧基庚酸
Figure 02_image1028
遵循4-(4-(3-(2,4-二側氧基四氫嘧啶-1(2H)-基)-1-甲基-1H-吲唑-6-基)哌啶-1-基)-4-側氧基丁酸之合成中所述之方法,使用4-(三級丁氧基)-4-側氧基庚酸作為步驟-1中之建構嵌段來合成化合物7-(4-(3-(2,4-二側氧基四氫嘧啶-1(2H)-基)-1-甲基-1H-吲唑-6-基)哌啶-1-基)-7-側氧基庚酸。LC-MS (ES +): m/z470.1 [M + H] +實例 31 合成 1-(5- -1- 甲基 -6-( 哌啶 -4- )-1H- 吲唑 -3- ) 二氫嘧啶 -2,4(1H,3H)- 二酮
Figure 02_image1030
化合物1-(6-溴-5-氟-1-甲基-吲唑-3-基)六氫嘧啶-2,4-二酮遵循WO2022032026 A1之第200-201頁上所述之方法製備。 步驟 -1
在環境溫度下向含有1-(6-溴-5-氟-1-甲基-吲唑-3-基)六氫嘧啶-2,4-二酮( 1,250 mg,0.710 mmol)及4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊烷-2-基)-3,6-二氫-2H-吡啶-1-甲酸三級丁酯( 2,329.71 mg,1.07 mmol)於無水DMF (2.5 mL)中之充分攪拌溶液的20 mL玻璃小瓶中添加氟化銫(215.96 mg,1.42 mmol)。用氮氣吹掃反應混合物5分鐘。隨後,添加Pd(dppf)Cl 2.DCM (116.10 mg,0.142 mmol)且在90℃下繼續攪拌16小時,且藉由UPLC監測反應。反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且用EtOAc (200 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮合併之濾液,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,95% EtOAc/石油醚)純化,得到呈灰色固體狀之4-[3-(2,4-二側氧基六氫嘧啶-1-基)-5-氟-1-甲基-吲唑-6-基]-3,6-二氫-2H-吡啶-1-甲酸三級丁酯( 3,300 mg,0.629 mmol,89%產率)。LC-MS (ES +): m/z444.2 [M + H] +步驟 -2
在環境溫度下向含有4-[3-(2,4-二側氧基六氫嘧啶-1-基)-5-氟-1-甲基-吲唑-6-基]-3,6-二氫-2H-吡啶-1-甲酸三級丁酯( 3,250 mg,0.524 mmol)於無水1,4-二㗁烷(5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加氫氧化鈀/碳,20%重量(294.85 mg,0.419 mmol)。在此溫度下在氫氣氛圍(約1 atm)下攪拌反應混合物16小時。在經UPLC指示反應完成時,使反應混合物穿過矽藻土墊,且用1:1 THF:DMF之混合物(250 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮合併之濾液,得到呈灰色固體狀之4-[3-(2,4-二側氧基六氫嘧啶-1-基)-5-氟-1-甲基-吲唑-6-基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 4,200 mg,0.412 mmol,79%產率)。LC-MS (ES +): m/z390.2 [M + H] +步驟 -3
在0℃下向含有4-[3-(2,4-二側氧基六氫嘧啶-1-基)-5-氟-1-甲基-吲唑-6-基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 4,200 mg,0.412 mmol)於無水DCM (2 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加含4M HCl之1,4-二㗁烷(1.24 mL)。添加後,在環境溫度下在氮氣氛圍下攪拌內含物2小時,且藉由UPLC監測。反應完成後,自反應混合物移除溶劑,得到殘餘物,使其與甲苯共沸。所獲得之粗產物用MTBE (10 mL)洗滌,得到呈灰白色固體狀之1-[5-氟-1-甲基-6-(4-哌啶基)吲唑-3-基]六氫嘧啶-2,4-二酮鹽酸鹽( 5,150 mg,0.381 mmol,93%產率)。LC-MS (ES +): m/z346.2 [M + H] +實例 32 合成 1-(3-(2,4- 二側氧基四氫嘧啶 -1(2H)- )-1- 甲基 -1H- 吲唑 -6- ) 哌啶 -4- 甲酸
Figure 02_image1032
化合物1-(6-溴-1-甲基-吲唑-3-基)六氫嘧啶-2,4-二酮遵循WO2020132561 A1之第328-329頁上所述之方法製備。 步驟 -1
在環境溫度下向含有1-(6-溴-1-甲基-吲唑-3-基)六氫嘧啶-2,4-二酮( 1,500 mg,1.55 mmol)於1,4-二㗁烷(10 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL密封管中添加哌啶-4-甲酸三級丁酯鹽酸鹽( 2,514.61 mg,2.32 mmol)及碳酸銫(1.26 g,3.87 mmol)。用氮氣吹掃反應混合物5分鐘,隨後添加Pd‐PEPPSI‐IHeptCl (75.21 mg,0.077 mmol)且在110℃下攪拌所得混合物16小時,同時藉由UPLC-MS監測。反應完成後,將反應混合物冷卻至環境溫度且經矽藻土墊過濾,且用EtOAc (200 mL)洗滌矽藻土床。蒸發濾液,得到粗物質,其藉由逆相管柱層析(C18管柱,移動相A:0.1%甲酸/水;B:乙腈)純化,得到呈棕色固體狀之1-[3-(2,4-二側氧基六氫嘧啶-1-基)-1-甲基-吲唑-6-基]哌啶-4-甲酸三級丁酯( 3,280 mg,0.437 mmol,28%產率)。LC-MS (ES +): m/z428.2 [M + H] +步驟 -2
在0℃下在氮氣氛圍下向含有1-[3-(2,4-二側氧基六氫嘧啶-1-基)-1-甲基-吲唑-6-基]哌啶-4-甲酸三級丁酯( 3,280 mg,0.484 mmol)於無水DCM (5 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加含4 M HCl之1,4-二㗁烷(1.21 mL)。在環境溫度下攪拌所得溶液16小時且藉由UPLC-MS監測反應進程。接著在真空中蒸發溶劑,得到粗物質,其用MTBE (10 mL)洗滌,得到呈黃色固體狀之1-[3-(2,4-二側氧基六氫嘧啶-1-基)-1-甲基-吲唑-6-基]哌啶-4-甲酸鹽酸鹽( 4,150 mg,0.328 mmol,68%產率)。LC-MS (ES +): m/z372.0 [M + H] +實例 33 合成 6-(3-(2,4- 二側氧基四氫嘧啶 -1(2H)- )-1- 甲基 -1H- 吲唑 -7- ) 己醛
Figure 02_image1034
步驟 -1
將3-溴-2-氟-苯甲腈( 1,25 g,125.00 mmol)於乙醇(125.14 mL)中之溶液在25℃下攪拌10分鐘,接著在室溫下逐滴添加甲基肼( 2,74.86 g,1.62 mol,74.86 mL, 85%水溶液)。在90℃下攪拌反應混合物16小時。完成後,在真空中蒸發反應混合物。向所得粗物質中添加水且過濾形成之沈澱物且乾燥,得到呈灰白色固體狀之7-溴-1-甲基-吲唑-3-胺( 3,24 g,68.99 mmol,55%產率)。LCMS (ES +): m/z226.96 [M + H] +步驟 -2
在室溫下向7-溴-1-甲基-吲唑-3-胺( 3,1 g,4.42 mmol)於2 M HCl (2 M, 10.00 mL)中之溶液中添加四丁基溴化銨(142.59 mg,442.34 μmol)。使反應混合物升溫至55℃且在相同溫度下逐滴添加丙烯酸( 4,382.51 mg,5.31 mmol,363.95 μL)且在90℃下攪拌16小時。完成後,藉由NaHCO 3(2 M,100 mL)中和反應混合物。沈澱物經過濾且用水(100 mL)洗滌,得到呈灰白色固體狀之3-[(7-溴-1-甲基-吲唑-3-基)胺基]丙酸( 5,0.62 g,1.81 mmol,41%產率)。LCMS (ES +): m/z299.01 [M + H] +步驟 -3
在室溫下向化合物3-[(7-溴-1-甲基-吲唑-3-基)胺基]丙酸( 5,18 g,60.38 mmol)於AcOH (150 mL)中之溶液中添加氰酸鈉(7.85 g,120.75 mmol,4.15 mL),且在65℃下攪拌混合物16小時。接著在65℃下添加4 M HCl (180.00 mL)且在65℃下攪拌4小時。反應完成後,將反應混合物冷卻至室溫且用飽和NaHCO 3(180-200 mL)中和。接著過濾反應混合物,用水(100 mL)洗滌濾餅且乾燥,得到呈淡棕色固體狀之1-(7-溴-1-甲基-吲唑-3-基)六氫嘧啶-2,4-二酮( 6,15 g,41.60 mmol,69%產率)。LCMS (ES +): m/z323.44 [M + H] +步驟 -4
在環境溫度下向含有1-(7-溴-1-甲基-吲唑-3-基)六氫嘧啶-2,4-二酮( 6,600 mg,1.84 mmol)及己-5-炔-1-醇( 7,360.81 mg,3.68 mmol,0.41 mL)於無水乙腈(12 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL密封管中添加三乙胺(744.02 mg,7.35 mmol,1.02 mL)。反應混合物用N 2脫氣5分鐘。隨後,添加Pd(PPh 3) 2Cl 2(129.02 mg,0.183 mmol)及CuI (17.50 mg,0.091 mmol)且在90℃下攪拌反應混合物16小時。藉由UPLC-MS監測反應進程。此後,反應混合物經由矽藻土墊過濾且用乙腈(100 mL)洗滌矽藻土床且在減壓下蒸發濾液,得到殘餘物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,5-10% MeOH/DCM)純化,得到呈黃色固體狀之1-[7-(6-羥基己-1-炔基)-1-甲基-吲唑-3-基]六氫嘧啶-2,4-二酮( 8,400 mg,1.07 mmol,58% 產率)。LCMS (ES +): m/z341.2 [M + H] +步驟 -5
在環境溫度下向25 mL單頸圓底燒瓶中添加1-[7-(6-羥基己-1-炔基)-1-甲基-吲唑-3-基]六氫嘧啶-2,4-二酮( 8,400 mg,1.07 mmol)於無水1,4-二㗁烷(8 mL)中之充分攪拌溶液,且將混合物用N 2脫氣5分鐘。隨後,添加氫氧化鈀/碳,20重量% (377.11 mg,0.537 mmol)且在環境溫度下在氫氣氛圍(約1 atm)下攪拌所得反應混合物16小時。此後,反應混合物經由矽藻土墊過濾且用1,4-二㗁烷(100 mL)洗滌矽藻土床。合併之濾液經乾燥(無水Na 2SO 4),過濾且在減壓下濃縮,得到呈棕色固體狀之1-[7-(6-羥己基)-1-甲基-吲唑-3-基]六氫嘧啶-2,4-二酮( 9,200 mg,0.573 mmol,53%產率)。LCMS (ES +): m/z345.2 [M + H] +步驟 -6
在0℃下在氮氣氛圍下向含有1-[7-(6-羥己基)-1-甲基-吲唑-3-基]六氫嘧啶-2,4-二酮( 9,150 mg,0.430 mmol)於無水DMF (3 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加戴斯-馬丁高碘烷(273.85 mg,0.645 mmol)。在環境溫度下攪拌反應混合物2小時。經由多孔玻璃注射器過濾反應混合物,用DCM (50 mL)洗滌玻璃料。濾液用飽和硫代硫酸鈉溶液(15 mL)繼之以鹽水(15 mL)洗滌,且經無水Na 2SO 4乾燥,且過濾。在減壓下蒸發濾液,得到呈黃色膠狀之6-[3-(2,4-二側氧基六氫嘧啶-1-基)-1-甲基-吲唑-7-基]己醛( 10,140 mg,0.318 mmol,74%產率)。LCMS (ES +): m/z345.2 [M + H] +實例 34 合成 5-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-2- 側氧基 -1,2- 二氫苯并 [cd] 吲哚 -5- ) 戊醛
Figure 02_image1036
步驟 -1
在環境溫度下向含有5-溴-1-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)苯并[cd]吲哚-2-酮( 1,2 g,3.72 mmol)及戊-4-炔-1-醇( 2,626.09 mg,7.44 mmol,0.69 mL)於無水乙腈(30 mL)中之溶液的100 mL減壓閥密封管中添加TEA (1.13 g,11.16 mmol,1.56 mL)。在用氮氣吹掃反應混合物5分鐘之後,在環境溫度下添加碘化銅(I) (141.76 mg,0.744 mmol)及雙(三苯膦)二氯化鈀(313.46 mg,0.446 mmol)。將反應混合物在90℃下攪拌16小時。藉由UPLC及TLC監測反應進程。接著將反應混合物經由矽藻土墊過濾,且在減壓下濃縮濾液以得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(240-400目矽膠,70% EtOAc/石油醚)純化,得到呈棕色膠狀之1-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-5-(5-羥基戊-1-炔基)苯并[cd]吲哚-2-酮( 3,2 g,3.51 mmol,94%產率)。LC-MS (ES +): m/z541.0 [M + H] +步驟 -2
在環境溫度下向含有1-1-(2,6-二苯甲氧基-3-吡啶基)-5-(5-羥基戊-1-炔基)苯并[cd]吲哚-2-酮( 3,1 g,1.76 mmol)於無水1,4-二㗁烷(6 mL)及DMF (4 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加氫氧化鈀/碳,20重量% 50%水(1.23 mg,1.76 mmol)。接著用氫氣吹掃反應混合物,且在氫氣氛圍下在環境溫度下攪拌16小時。藉由UPLC監測反應進程。反應混合物經由矽藻土墊過濾且用含30% DMF之1,4-二㗁烷溶液洗滌矽藻土床。接著,在減壓下濃縮濾液。將所獲得之粗產物溶解於無水DMF (4 mL)中且在環境溫度下添加1,4-二㗁烷(6 mL)及氫氧化鈀/碳,20重量% 50%水(616.96 mg,0.878 mmol,20%純度)。接著在氫氣氛圍下在此溫度下攪拌反應混合物16小時。16小時後,經由矽藻土床過濾反應混合物,且用含30% DMF之1,4-二㗁烷溶液洗滌矽藻土床。隨後,在減壓下濃縮濾液,得到粗物質。藉由逆相管柱層析(C-18,0.1%甲酸/水及乙腈)純化粗物質,且凍乾純溶離份,得到呈綠色固體狀之3-[5-(5-羥戊基)-2-側氧基-苯并[cd]吲哚-1-基]哌啶-2,6-二酮( 4,100 mg,0.27 mmol,15%產率)。LC-MS (ES +): m/z367.0 [M + H] +步驟 -3
在環境溫度下向含有3-[5-(5-羥戊基)-2-側氧基-苯并[cd]吲哚-1-基]哌啶-2,6-二酮( 4,100 mg,0.27 mmol)於DMF (1 mL)中之溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加戴斯-馬丁高碘烷(171.90 mg,0.405 mmol)。將反應混合物在環境溫度下攪拌3小時。藉由UPLC監測反應進程。在經UPLC指示反應完成後,反應混合物用硫代硫酸鈉水溶液(10 mL)淬滅,且接著用EtOAc (2×50 mL)萃取。合併之有機相用鹽水(50 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且過濾。在減壓下濃縮濾液,得到呈棕色膠狀之5-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-2-側氧基-苯并[cd]吲哚-5-基]戊醛( 5,80 mg,0.175 mmol,65%產率)。LC-MS (ES +): m/z365.2 [M + H] +實例 35 合成 (3R)-3-[5-(4- 哌啶基 ) 吲哚啉 -1- ] 哌啶 -2,6- 二酮及 (3S)-3-[5-(4- 哌啶基 ) 吲哚啉 -1- ] 哌啶 -2,6- 二酮
Figure 02_image1038
步驟 -1
在室溫下在氮氣氛圍下向4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊烷-2-基)-3,6-二氫-2 H-吡啶-1-甲酸三級丁酯( 2,15.61 g,50.49 mmol)於1,4-二㗁烷(60 mL)及水(40 mL)中之攪拌溶液中添加5-溴吲哚啉( 1,10.00 g,50.49 mmol)及碳酸鈉(14.23 g,151.47 mmol)。反應混合物藉由用氮氣鼓泡5分鐘而脫氣,且接著在室溫下將[1,1'-雙(二苯基膦基)二茂鐵]二氯化鈀(II)與二氯甲烷之複合物(2.06 g,2.52 mmol)添加至反應混合物中。將反應混合物再次脫氣5分鐘且在85℃下攪拌8小時。在經TLC指示反應完成後,將反應物質倒入冰水(20 mL)中。用乙酸乙酯(50 mL)萃取水層。有機層經無水硫酸鈉乾燥,過濾,且在減壓下濃縮,獲得粗物質。粗物質藉由急驟矽膠管柱層析使用0-100%乙酸乙酯/己烷作為溶離劑來純化,得到呈灰白色固體狀之4-吲哚啉-5-基-3,6-二氫-2 H-吡啶-1-甲酸三級丁酯( 3,9.8 g,32.62 mmol,64.61%產率)。LCMS (ES +): m/z301.4 [M + H] +步驟 -2
在室溫下在氮氣氛圍下向4-吲哚啉-5-基-3,6-二氫-2 H-吡啶-1-甲酸三級丁酯( 3,8 g,26.63 mmol)於1,4-二㗁烷(100 mL)中之攪拌溶液中添加鈀,10%/碳(4 g,26.63 mmol)。在室溫下在氫氣壓力(氣囊壓力)下攪拌反應混合物16小時。反應完成後,將反應混合物用MeOH (200 mL)稀釋,經由矽藻土床過濾,且在減壓下濃縮所得濾液,獲得粗物質。粗物質藉由管柱層析(矽膠,230-400目),使用0-100%乙酸乙酯/石油醚作為溶離劑來純化,得到呈黃色固體狀之4-吲哚啉-5-基哌啶-1-甲酸三級丁酯( 4,4.8 g,14.26 mmol,53.55%產率)。LCMS (ES +): m/z247.2 [M - tBu + H] +步驟 -3
在室溫下在氮氣氛圍下向4-吲哚啉-5-基-3,6-二氫-2 H-吡啶-1-甲酸三級丁酯( 4,5 g,16.64 mmol)於DMF (50 mL)中之攪拌溶液中添加碳酸氫鈉(4.19 g,49.93 mmol)及3-溴哌啶-2,6-二酮( 5,4.79 g,24.97 mmol)。在100℃下攪拌反應混合物16小時。反應完成後,將反應混合物在減壓下濃縮,溶解於DCM (50 mL)中且用水(2×50 mL)洗滌。有機層經無水硫酸鈉乾燥,過濾,且在減壓下濃縮,獲得粗物質。粗物質藉由管柱層析(矽膠,100-200目),使用0-100%乙酸乙酯/石油醚作為溶離劑來純化,得到呈棕色固體狀之4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)吲哚啉-5-基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 6,2.3 g,5.10 mmol,30.64%產率)。LCMS (ES +): m/z414.4 [M + H] +步驟 -4
藉由對掌性SFC純化化合物4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)吲哚啉-5-基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 6,1 g,2.20 mmol),以分離『R』及『S』異構體[管柱:I Cellulose J,流動速率:4 mL/min,溶離:80:20 (CO 2:共溶劑),共溶劑:含0.2 %甲酸之乙腈/異丙醇]。
將早期溶離峰(任意指定為 R) 4-[1-[(3R)-2,6-二側氧基-3-哌啶基]吲哚啉-5-基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 7,420 mg,998.43 μmol,45.37%產率,95.44%對映體純度)分離為淺藍色固體。LCMS (ES +): m/z358.2 [M - tBu + H] +. 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ 10.76 (brs, 1H), 6.90 (s, 1H), 6.80 (dd, J= 1.20, 8.00 Hz, 1H), 6.40 (d, J= 8.00 Hz, 1H), 4.58 (dd, J= 4.80, 12.80 Hz, 1H), 4.12-4.01 (m, 2H), 3.83-3.73 (m, 1H), 3.44-3.38 (m, 1H), 3.31-3.22 (m, 1H), 2.96-2.68 (m, 5H), 2.62-2.53 (m, 1H), 2.25-2.11 (m, 1H), 1.93-1.85 (m, 1H), 1.72-1.66 (m, 2H), 1.47-1.35 (m, 11H)。
將晚期溶離峰(任意指定為 S) 4-[1-[(3S)-2,6-二側氧基-3-哌啶基]吲哚啉-5-基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 8,210 mg,462.65 μmol,21.02%產率,93.36%對映體純度)分離為棕色固體。LCMS (ES +): m/z358.2 [M - tBu + H] +. 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ 10.75 (brs, 1H), 6.90 (s, 1H), 6.80 (d, J= 9.20 Hz, 1H), 6.40 (d, J= 8.00 Hz, 1H), 4.58 (dd, J= 4.80, 13.20 Hz, 1H), 4.11-4.02 (m, 2H), 3.43-3.22 (m, 3H), 2.94-2.70 (m, 5H), 2.61-2.53 (m, 1H), 2.24-2.12 (m, 1H), 1.95-1.86 (m, 1H), 1.74-1.65 (m, 2H), 1.46-1.34 (m, 11H)。 步驟 -5
在0℃下向含有4-[1-[(3R)-2,6-二側氧基-3-哌啶基]吲哚啉-5-基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 7,90 mg,215.21 μmol)於無水DCM (1.01 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加含4M HCl之1,4-二㗁烷(1.08 mL)。在室溫下攪拌反應物2小時。反應完成後,在真空中移除溶劑且使所得粗產物與甲苯共沸,且用MTBE洗滌,得到呈粉色固體狀之(3R)-3-[5-(4-哌啶基)吲哚啉-1-基]哌啶-2,6-二酮( 9,80 mg,212.66 μmol,98.81%產率,HCl鹽)。LCMS (ES +): m/z314.0 [M + H] + 步驟 -6
在0℃下向含有4-[1-[(3S)-2,6-二側氧基-3-哌啶基]吲哚啉-5-基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 8,80 mg,189.60 μmol)於DCM (0.8 mL)中之溶液的25 ml圓底燒瓶中添加含4 M氯化氫之1,4-二㗁烷(529.06 μL)。接著在室溫下攪拌反應混合物1小時。反應完成後,在減壓下濃縮反應混合物,得到呈棕色固體狀之(3S)-3-[5-(4-哌啶基)吲哚啉-1-基]哌啶-2,6-二酮( 10,65 mg,185.79 μmol,97.99%產率,HCl鹽)。UPLC-MS (ES +): m/z314.5 [M + H] + 實例 36 合成 炔中間物
Figure 02_image1040
步驟 -1
向含有4-乙炔基哌啶鹽酸鹽( 1,2 g,13.05 mmol)及4-甲醯基哌啶-1-甲酸三級丁酯( 2,3.34 g,15.66 mmol)於MeOH (20 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加無水乙酸鈉(2.14 g,26.09 mmol)及乙酸(7.83 g,130.47 mmol,7.47 mL),且將反應混合物在環境溫度下攪拌1小時。隨後,一次性添加MP-CNBH 3(2 mmol\g) (6.5 g,13.05 mmol)且繼續在環境溫度下再攪拌16小時。藉由TLC監測反應。在減壓下蒸發溶劑且用水稀釋所得粗物質。水相用NaHCO 3水溶液鹼化且用DCM (2×150 mL)萃取,得到呈棕色固體狀之4-[(4-乙炔基-1-哌啶基)甲基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 3,4.3 g,13 mmol,99%產率)。LC-MS (ES +): m/z307.2. [M + H] +步驟 -2
在0℃下向含有4-[(4-乙炔基-1-哌啶基)甲基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 3,5.0 g,15.12 mmol)於無水DCM (20 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加含4M HCl之1,4-二㗁烷(37.8 mL)。將所得混合物在環境溫度下攪拌1小時。反應完成後,減壓移除過量溶劑,得到粗物質,其用MTBE (20 mL)洗滌且乾燥,得到呈白色固體狀之4-乙炔基-1-(4-哌啶基甲基)哌啶鹽酸鹽( 4,3.73 g,15.06 mmol,99%產率)。LC-MS (ES +): m/z207.2 [M + H] +
Figure 02_image1042
步驟 -1
在-78℃下向含有乙二醯氯(5.44 g,42.87 mmol,3.74 mL)於無水DCM (50 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中逐滴添加DMSO (6.70 g,85.73 mmol,6.08 mL)。在-78℃下攪拌所得混合物1小時。此後,在-78℃下添加含4-氟-4-(羥甲基)哌啶-1-甲酸三級丁酯( 1,5 g,21.43 mmol)之無水DCM (50 mL)且繼續在-78℃下攪拌2小時。接著在-78℃下將所得酸用三乙胺(10.84 g,107.17 mmol,14.94 mL)淬滅且將混合物緩慢升溫至環境溫度且攪拌30分鐘。藉由TLC監測反應進程。向此反應混合物中添加冷水(100 mL)且水層用DCM (2×50 mL)萃取。合併之有機相用1.5 N HCl水溶液(50 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且在減壓下濃縮濾液。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用40% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化粗產物,得到呈無色糖漿液體狀之4-氟-4-甲醯基-哌啶-1-甲酸三級丁酯( 2,3.4 g,13.88 mmol,65%產率)。GC-MS (ES +): m/z231.1 [M + H] +步驟 -2
向含有4-乙炔基哌啶鹽酸鹽( 3,2.03 g,13.86 mmol)及4-氟-4-甲醯基-哌啶-1-甲酸三級丁酯( 2,3.40 g,13.86 mmol)於MeOH (50 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加無水乙酸鈉(3.41 g,41.59 mmol)及乙酸(8.33 g,138.64 mmol,7.94 mL),且將反應混合物在環境溫度下攪拌1小時。隨後,一次性添加MP-CNBH 3(6.80 g,13.6 mmol;2 mmol\g)且繼續在環境溫度下再攪拌16小時。經TLC指示反應完成後,真空蒸發過量溶劑且添加水且攪拌混合物15分鐘。水相用NaHCO 3水溶液鹼化且用DCM (2×150 mL)萃取。合併之濾液經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且在減壓下濃縮濾液,得到呈無色液體狀之4-[(4-乙炔基-1-哌啶基)甲基]-4-氟-哌啶-1-甲酸三級丁酯( 4,3.5 g,7.20 mmol,52%產率)。LC-MS (ES +): m/z325.2 [M + H] +步驟 -3
在環境溫度下向含有4-[(4-乙炔基-1-哌啶基)甲基]-4-氟-哌啶-1-甲酸三級丁酯( 4,3.5 g,7.20 mmol)於無水二氯甲烷(30 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(3.60 mL)。在環境溫度下攪拌所得混合物2小時且藉由UPLC監測。反應完成後,自反應混合物移除溶劑,得到粗產物,其用MTBE繼之以二氯甲烷(50 mL)洗滌,得到呈灰白色固體狀之4-乙炔基-1-[(4-氟-4-哌啶基)甲基]哌啶鹽酸鹽( 5,1.8 g,6.83 mmol,95%產率)。LC-MS (ES +): m/z225.0 [M + H] +
Figure 02_image1044
步驟 -1
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有4-乙炔基哌啶-1-甲酸三級丁酯( 1,3.8 g,18.16 mmol)於無水DCM (30 mL)中之充分攪拌溶液的250 mL單頸圓底燒瓶中添加含4M HCl之1,4-二㗁烷(45.39 mL)且將所得混合物在環境溫度下攪拌1小時。經TLC指示反應完成後,在減壓下濃縮反應混合物以得到粗物質,其用MTBE濕磨,得到呈灰白色固體狀之4-乙炔基哌啶鹽酸鹽( 2,2.6 g,17.68 mmol,97%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ9.07 (s, 2H), 3.14-2.97 (m, 3H), 2.95-2.90 (m, 2H), 2.75-2.69 (m, 1H), 1.98-1.92 (m, 2H)及1.76-1.70 (m, 2H)。 步驟 -2
向含有4-乙炔基哌啶鹽酸鹽( 2,3 g,27.21 mmol)於EtOH (30 mL)中之充分攪拌溶液的20 mL玻璃小瓶中添加1-氧雜-6-氮雜螺[2.5]辛烷-6-甲酸三級丁酯( 3,5.8 g,27.21 mmol),且將反應混合物在70℃下攪拌16小時。經TLC指示反應完成後,將反應混合物用冰水淬滅,用EtOAc (3×150 mL)萃取水層。合併之有機相用水、鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且過濾。在減壓下濃縮濾液,得到呈無色液體狀之4-[(4-乙炔基-1-哌啶基)甲基]-4-羥基-哌啶-1-甲酸三級丁酯( 4,9 g,20.10 mmol,74%產率)。LC-MS (ES +): m/z323.2 [M + H] +步驟 -3
在0℃下向含有4-[(4-乙炔基-1-哌啶基)甲基]-4-羥基-哌啶-1-甲酸三級丁酯( 4,8 g,14.89 mmol)於無水DCM (20 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加含4M HCl之1,4-二㗁烷(18.6 mL)。添加完成後,將所得混合物在環境溫度下攪拌2小時。經UPLC指示反應完成後,自反應混合物移除溶劑,得到粗產物,將其與甲苯一起共蒸發且接著用MTBE洗滌,得到呈灰白色固體狀之4-[(4-乙炔基-1-哌啶基)甲基]哌啶-4-醇鹽酸鹽( 5,3.9 g,14.62 mmol,98%產率)。LC-MS (ES +): m/z223.2 [M + H] +
Figure 02_image1046
步驟 -1
在-78℃下在氮氣氛圍下向含有乙二醯氯(1.06 g,8.32 mmol,0.726 mL)於無水DCM (20 mL)中之充分攪拌溶液的250 mL單頸圓底燒瓶中逐滴添加DMSO (1.30 g,16.65 mmol,1.18 mL)。在-78℃下攪拌所得混合物1小時。隨後,在-78℃下添加含4-氰基-4-(羥甲基)哌啶-1-甲酸三級丁酯( 1,1.00 g,4.16 mmol)之無水DCM (20 mL)且繼續在-78℃下攪拌4小時。此後,在-78℃下將反應物用三乙胺(2.11 g,20.81 mmol,2.90 mL)淬滅且將混合物緩慢升溫至環境溫度且攪拌30分鐘,且藉由TLC監測。向反應混合物中添加冷水(100 mL)且用DCM (2×50 mL)萃取水相。合併之有機相用1.5N HCl水溶液(50 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且過濾。在減壓下濃縮濾液,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用40% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化,得到呈無色糖漿液體狀之4-氰基-4-甲醯基-哌啶-1-甲酸三級丁酯( 2,600 mg,2.06 mmol,49%產率)。GC-MS (ES +): m/z238.1 [M] +步驟 -2
在環境溫度下向含有4-乙炔基哌啶( 3,230.69 mg,2.10 mmol)及4-氰基-4-甲醯基-哌啶-1-甲酸三級丁酯( 2,733.50 mg,2.52 mmol)於THF (15 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加乙酸(1.26 g,20.98 mmol,1.20 mL)、無水乙酸鈉(430.32 mg,5.25 mmol)及異丙醇鈦(IV) (1.19 g,4.20 mmol,1.25 mL)。在70℃下攪拌所得混合物1小時。隨後,在環境溫度下添加MP-CNBH 3(1.00 g,1.89 mmol)且在70℃下繼續攪拌16小時。藉由UPLC監測反應進程。使反應混合物穿過燒結漏斗且在減壓下濃縮濾液,得到殘餘物,其用NaHCO 3水溶液中和且用EtOAc (3×20 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥且過濾。在減壓下濃縮濾液,得到呈黃色液體狀之4-氰基-4-[(4-乙炔基-1-哌啶基)甲基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 4,200 mg,0.601 mmol,29%產率)。LC-MS (ES +): m/z332.4 [M + H] +步驟 -3
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有4-氰基-4-[(4-乙炔基-1-哌啶基)甲基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 4,200 mg,0.601 mmol)於無水DCM (4 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加含4 N HCl之1,4-二㗁烷(1.50 mL)。添加完成後,在環境溫度下攪拌所得混合物16小時。經UPLC指示反應完成後,在減壓下自反應混合物移除過量溶劑,得到粗產物,其用MTBE (20 mL)洗滌,得到呈灰白色固體狀之4-[(4-乙炔基-1-哌啶基)甲基]哌啶-4-甲腈鹽酸鹽( 5,120 mg,0.448 mmol,74%產率)。LC-MS (ES +): m/z232.2 [M + H] +
Figure 02_image1048
步驟 -1
在0℃下向含有4-乙炔基哌啶-1-甲酸三級丁酯( 1,7 g,33.45 mmol)於無水DCM (50 mL)中之溶液的500 ml圓底燒瓶中添加4.0 M氯化氫於二㗁烷(83.62 mL)中之溶液。在室溫下攪拌反應混合物三小時。經LCMS指示反應完成後,在減壓下濃縮反應混合物,得到粗產物,其用MTBE洗滌,得到呈淺黃色固體狀之4-乙炔基哌啶鹽酸鹽( 2,4.9 g,33.31 mmol,99%產率)。LC-MS (ES +): m/z110.2 [M + H] +步驟 -2
向含有4-乙炔基哌啶( 2,700 mg,6.35 mmol)於DMF (7.02 mL)中之充分攪拌溶液的20 mL螺旋蓋小瓶中添加三乙胺(1.61 g,15.87 mmol,2.21 mL)及5-溴戊酸乙酯( 3,1.99 g,9.52 mmol),且將所得懸浮液在70℃下加熱3小時。隨後,將反應混合物倒入水中且用DCM (2×100 mL)萃取。合併之有機層經硫酸鈉乾燥且在減壓下濃縮,得到呈深色膠狀之5-(4-乙炔基-1-哌啶基)戊酸乙酯( 4,1 g,3.79 mmol,60%產率)。LC-MS (ES +): m/z238.2 [M + H] +步驟 -3
程序與步驟-2一致且獲得呈棕色固體狀之6-(4-乙炔基-1-哌啶基)己酸乙酯。LC-MS (ES +): m/z252.2 [M + H] +
Figure 02_image1050
步驟 -1
在10℃下在氮氣氛圍下向含有7-氧雜-3-氮雜雙環[4.1.0]庚烷-3-甲酸三級丁酯( 1,3.0 g,15.06 mmol)於無水DMSO (30 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加炔化鋰,乙二胺複合物( 2,2.71 g,30.11 mmol)。在環境溫度下攪拌所得混合物16小時。經LCMS確認反應完成後,將反應混合物用水(20 mL)稀釋且用EtOAc (2×100 mL)萃取。用鹽水洗滌合併之有機相且在減壓下蒸發,得到粗物質,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用0-50% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化,得到呈無色液體狀之4-乙炔基-3-羥基哌啶-1-甲酸三級丁酯( 3,2.2 g,8.52 mmol,57%產率)。LC-MS (ES +): m/z170.0 [M - 異丁烯+ H] +步驟 -2
在0℃下在氮氣氛圍下向含有4-乙炔基-3-羥基-哌啶-1-甲酸三級丁酯( 3,500 mg,1.93 mmol)於無水DCM (15 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加DAST (622.48 mg,0.51 mmol,0.51 mL)。在環境溫度下攪拌所得混合物4小時。經LCMS確認反應完成後,將反應混合物用NaHCO 3(30 mL)稀釋且用DCM (2×200 mL)萃取。合併之有機相用鹽水洗滌且在減壓下蒸發,得到粗物質,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用0-20% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化,得到呈黃色液體狀之4-乙炔基-3-氟-哌啶-1-甲酸三級丁酯( 4,200 mg,0.862 mmol,45%產率)。LC-MS (ES +): m/z172.2 [M - 異丁烯+ H] +步驟 -3
在0℃下向含有4-乙炔基-3-氟-哌啶-1-甲酸三級丁酯( 4,200 mg,0.862 mmol)於無水DCM (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加含4 N HCl之1,4-二㗁烷(2.16 mL),且在環境溫度下攪拌所得混合物2小時。經UPLC確認反應完成後,減壓移除過量溶劑,得到粗殘餘物,其用MTBE (2×10 mL)洗滌,得到呈灰白色固體狀之4-乙炔基-3-氟-哌啶鹽酸鹽( 5,140 mg,0.788 mmol,91%產率)。LCMS (ES +): m/z128.2 [M + H] +
Figure 02_image1052
步驟 -1
在環境溫度下向含有4-乙炔基-4-氟-哌啶-1-甲酸三級丁酯( 1,500 mg,2.20 mmol)於無水DCM (4 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(2.20 mL)。在環境溫度下攪拌所得混合物2小時。藉由UPLC監測反應。反應完成後,自反應混合物移除過量溶劑,得到粗產物,其用MTBE (10 mL)洗滌,得到呈灰白色固體狀之4-乙炔基-4-氟-哌啶鹽酸鹽( 2,350 mg,2.10 mmol,95%產率)。LCMS (ES +): m/z128.2 [M + H] +步驟 -2
向含有4-乙炔基-4-氟-哌啶鹽酸鹽( 2,350 mg,2.10 mmol)及4-甲醯基哌啶-1-甲酸三級丁酯( 3,536.51 mg,2.52 mmol)於MeOH (10 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加無水乙酸鈉(343.92 g,4.19 mmol)及乙酸(1.26 g,20.96 mmol,1.20 mL),且將所得反應混合物在環境溫度下攪拌1小時。此後,一次性添加MP-CNBH 3(1.2 g,2.10 mmol;2 mmol\g)且繼續在環境溫度下再攪拌16小時。藉由TLC監測反應。在減壓下蒸發過量溶劑且用水稀釋由此獲得之粗物質。水層用NaHCO 3水溶液鹼化且用DCM (2×150 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥,且在減壓下濃縮,得到呈無色液體狀之4-[(4-乙炔基-4-氟-1-哌啶基)甲基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 4,650 mg,1.54 mmol,73%產率)。LCMS (ES +): m/z325.2 [M + H] +步驟 -3
在室溫下向含有4-[(4-乙炔基-4-氟-1-哌啶基)甲基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 4,650 mg,1.54 mmol)於無水DCM (5 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加含4 M HCl之二㗁烷(112.50 mg,3.09 mmol)。在室溫下攪拌內含物2小時。藉由UPLC監測反應。反應完成後,自反應混合物移除溶劑,得到粗產物,其用MTBE (10 mL)洗滌,得到呈灰白色固體狀之4-乙炔基-4-氟-1-(4-哌啶基甲基)哌啶鹽酸鹽( 5,400 mg,1.45 mmol,93.74%產率)。LCMS (ES +): m/z225.2 [M + H] +
Figure 02_image1054
步驟 -1
向含有4-(羥甲基)環己酮( 1,2 g,15.60 mmol)於無水DCM (30 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加咪唑(2.12 g,31.21 mmol),且將所得混合物冷卻至0℃,接著添加三級丁基-氯-二甲基-矽烷(4.70 g,31.21 mmol,5.81 mL)。在環境溫度下攪拌反應混合物2小時。藉由TLC監測反應進程。反應完成後,將反應混合物用水(20 mL)稀釋且用EtOAc (3×50 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥,且在減壓下濃縮,得到粗殘餘物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用10-20% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化,得到呈無色液體狀之4-(((三級丁基二甲基矽基)氧基)甲基)環己-1-酮( 2,2.1 g,8.66 mmol,55%產率)。 1H NMR (400 MHz, CDCl 3): δ3.54 (d, J= 6.4 Hz, 2H), 2.50-2.35 (m, 4H), 2.13-2.10 (m, 2H), 1.98-1.91 (m, 1H), 1.50-1.43 (m, 2H), 0.94-0.92 (m, 9H)及0.07-0.05 (m, 6H)。 步驟 -2
在0℃下在氮氣氛圍下向含有5-(溴三苯基-l5-膦醯基)戊酸( 3,5.21 g,11.76 mmol)於無水THF (60 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL雙頸圓底燒瓶中逐滴添加1 M雙(三甲基矽基)胺基鋰於THF (23.51 mL)中之溶液。將反應混合物在環境溫度下攪拌1小時且接著在0℃下逐滴添加含4-[[三級丁基(二甲基)矽基]氧基甲基]環己酮(950 mg,3.92 mmol)之無水THF (10 mL)。在環境溫度下攪拌反應混合物16小時。藉由TLC及LCMS監測反應進程。反應完成後,將反應混合物在0℃下用飽和氯化銨溶液(50 mL)淬滅且用EtOAc (3×100 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥,且在減壓下濃縮,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(60-120目矽膠)用10-15% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化,得到呈無色膠質液體狀之5-(4-(((三級丁基二甲基矽基)氧基)甲基)亞環己基)戊酸( 4,0.88 g,2.69 mmol,69%產率)。LC-MS (ES +): m/z327.0 [M + H] +步驟 -3
在0℃下在氮氣氛圍下向含有5-(4-(((三級丁基二甲基矽基)氧基)甲基)亞環己基)戊酸( 4,0.8 g,2.45 mmol)於MeOH (20 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL雙頸圓底燒瓶中逐滴添加2M (重氮基甲基)三甲基矽烷/己烷( 5,12.25 mL)。在環境溫度下攪拌反應混合物3小時。藉由TLC及LCMS監測反應進程。反應完成後,在減壓下濃縮反應混合物,且殘餘物用水(20 mL)稀釋且用EtOAc (3×50 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(60-120目矽膠)用15-20% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化,得到呈無色液體狀之5-(4-(((三級丁基二甲基矽基)氧基)甲基)亞環己基)戊酸甲酯( 6,0.6 g,1.76 mmol,72%產率)。LC-MS (ES +): m/z341.2 [M + H] +步驟 -4
向含有5-(4-(((三級丁基二甲基矽基)氧基)甲基)亞環己基)戊酸甲酯( 6,0.6 g,1.76 mmol)於1,4-二㗁烷(10 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加鈀,10%/碳(625.93 mg,0.528 mmol),且藉由鼓泡氫氣將所得混合物吹掃10分鐘。接著在氫氣氛圍(約1 atm)下在環境溫度下攪拌混合物4小時。藉由TLC及UPLC監測反應進程。反應完成後,用氮氣吹掃反應混合物,且藉由經矽藻土墊過濾來移除催化劑,且用MeOH (100 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮濾液,得到呈無色液體狀之5-(4-(((三級丁基二甲基矽基)氧基)甲基)環己基)戊酸甲酯( 7,0.5 g,1.46 mmol,83%產率)。 1H NMR (400 MHz, CDCl 3): δ3.68 (s, 3H), 3.49-3.48 (m, 1H) 3.40 (d, J= 6.4 Hz, 1H), 2.35-2.30 (m, 2H), 1.83-1.72 (m, 3H), 1.65-1.53 (m, 3H), 1.48-1.28 (m, 6H), 1.22-1.15 (m, 3H), 0.94-0.90 (m, 10H)及0.05 (s, 6H)。 步驟 -5
在0℃下在氮氣氛圍下向含有5-(4-(((三級丁基二甲基矽基)氧基)甲基)環己基)戊酸甲酯( 7,0.5 g,1.46 mmol)於THF (10 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL雙頸圓底燒瓶中逐滴添加含1M TBAF之THF (4.38 mL)。在環境溫度下攪拌反應混合物2小時。藉由TLC及LCMS監測反應進程。反應完成後,將反應混合物在0℃下用飽和氯化銨溶液(20 mL)淬滅且用EtOAc (3×30 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮,得到粗物質,其藉由急驟管柱層析(60-120目矽膠)用20-30% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化,得到呈無色液體狀之5-(4-(羥甲基)環己基)戊酸甲酯( 8,0.3 g,1.31 mmol,90%產率)。 1H NMR (400 MHz, CDCl 3): δ3.69 (s, 3H), 3.47 (d, J= 6.4 Hz, 1H), 2.34 (t, J= 7.2 Hz, 2H), 1.80 (d, J= 0.8 Hz, 2H), 1.68-1.56 (m, 2H), 1.55-1.40 (m, 2H), 1.38-1.18 (m, 7H)及0.98-0.80 (m, 5H)。 步驟 -6
在0℃下在氮氣氛圍下向含有5-(4-(羥甲基)環己基)戊酸甲酯( 8,0.29 g,1.27 mmol)於無水DCM (10 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加乙酸(1,1-二乙醯氧基-3-側氧基-1,2-苯并碘氧雜環戊-1-基)酯(1.08 g,2.54 mmol)。在環境溫度下攪拌反應混合物2小時。藉由TLC及LCMS監測反應進程。反應完成後,將反應混合物用硫代硫酸鈉溶液(2 g於15 mL中)及碳酸氫鈉溶液(2 g於15 mL中)淬滅,且在環境溫度下攪拌反應混合物20分鐘。用DCM (3×20 mL)萃取水相,且將有機相用水(20 mL)、鹽水(20 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮,得到呈無色液體狀之5-(4-甲醯基環己基)戊酸甲酯( 9,0.28 g,1.06 mmol,83%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ9.55 (s, 1H), 3.58 (s, 3H), 2.31 (t, J= 6 Hz, 2H), 2.15-2.12 (m, 1H), 1.95-1.92 (m, 1H), 1.85-1.82 (m, 1H), 1.80-1.69 (m, 2H), 1.50 (t, J= 7.2 Hz, 3H), 1.35-1.22 (m, 3H), 1.20-1.09 (m, 3H)及0.90 (m, 2H)。 步驟 -7
向含有5-(4-甲醯基環己基)戊酸甲酯( 9,0.28 g,1.06 mmol)於MeOH (5 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加99%無水碳酸鉀(291.65 mg,2.11 mmol)。將反應混合物冷卻至0℃,隨後在氮氣氛圍下添加(1-重氮基-2-側氧基丙基)膦酸二甲酯( 10,405.40 mg,2.11 mmol,0.506 mL)。將所得混合物在環境溫度下攪拌1小時。經LCMS指示反應完成後,將反應混合物在減壓下濃縮,用水(20 mL)稀釋,且接著用EtOAc (3×30 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥,且在減壓下濃縮,得到粗殘餘物,其藉由急驟管柱層析(60-120目矽膠)用5-15% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化,得到呈無色液體狀之5-(4-乙炔基環己基)戊酸甲酯( 11,0.13 g,0.555 mmol,53%產率)。 1H NMR (400 MHz, CDCl 3). δ3.69 (s, 3H), 2.32 (t, J= 4 Hz, 2H), 2.20-2.12 (m, 1H), 2.05 (s, 1H), 2.00 (d, J= 16 Hz, 1H), 1.73 (d, J= 12 Hz, 1H), 1.65-1.55 (m, 2H), 1.40-1.25 (m, 6H), 1.21-1.18 (m, 3H)及0.89 (m, 2H)。 實例 37 合成 N-[(3- 氟苯基 ) 甲基 ]-1-[1-[4-[2-(4- 哌啶基 ) 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ] 哌啶 -4- 甲醯胺鹽酸鹽
Figure 02_image1056
Figure 02_image1058
步驟 -1
在環境溫度下向含有1-(4-溴-1-萘基)乙酮( 1, 5.0 g,19.07 mmol)於純無水異丙醇鈦(IV) (50.31 mL)之混合物中之充分攪拌溶液的250 mL圓底燒瓶中添加哌啶-4-甲酸甲酯( 2,4.10 g,28.60 mmol,3.86 mL)。在80℃下攪拌反應混合物6小時。將反應混合物冷卻至0℃且向反應混合物中添加硼氫化鈉(3.60 g,95.14 mmol)。在30℃下攪拌反應混合物3小時。反應完成後,將反應混合物冷卻至0℃,用水稀釋,且過濾固體沈澱物。用乙酸乙酯(2×150 mL)萃取濾液。合併之有機層用鹽水(100 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且過濾。在減壓下濃縮濾液,得到粗殘餘物,其藉由急驟管柱層析(60-120目矽膠)用0-100%乙酸乙酯/石油醚作為溶離劑來純化,得到呈無色濃稠液體狀之1-[1-(4-溴-1-萘基)乙基]哌啶-4-甲酸異丙酯( 3,3.5 g,8.14 mmol,43%產率)。LC-MS (ES +): m/z404.2 [M + H] +步驟 -2
在室溫下向含有1-[1-(4-溴-1-萘基)乙基]哌啶-4-甲酸異丙酯( 3,5 g,12.37 mmol)、4-乙炔基哌啶-1-甲酸三級丁酯( 4,3.36 g,16.08 mmol)於無水乙腈(60 mL)中之充分攪拌溶液的250 mL密封管中添加碳酸銫(10.07 g,30.91 mmol)。將反應混合物用氮氣吹掃10分鐘,隨後添加XPhos (589.50 mg,1.24 mmol)及XPhos-Pd-G3 (524.00 mg,618.29 μmol)。在90℃下攪拌反應物5小時。反應完成後,經由矽藻土墊過濾反應混合物,用乙酸乙酯(500 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮濾液以產生粗化合物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,40%乙酸乙酯/石油醚)純化,得到呈淺棕色膠質固體狀之4-[2-[4-[1-(4-異丙氧基羰基-1-哌啶基)乙基]-1-萘基]乙炔基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 5,4 g,7.36 mmol,60%產率)。LC-MS(ES +): m/z533.2 [M + H] +步驟 -3
在環境溫度下向含有4-[2-[4-[1-(4-異丙氧基羰基-1-哌啶基)乙基]-1-萘基]乙炔基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 5,4.08 g,7.51 mmol)於甲醇(40 mL)及THF (40 mL)及水(20 mL)中之攪拌溶液的250 mL單頸圓底燒瓶中添加98%單水合氫氧化鋰(3.15 g,75.09 mmol),且攪拌所得混合物3小時。反應完成後,真空蒸發揮發物,得到粗產物,用10%檸檬酸溶液將其酸化至pH=4且用10% MeOH/DCM (2×400 mL)萃取。合併之有機層經Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮,得到呈棕色固體狀之1-[1-[4-[2-(1-三級丁氧羰基-4-哌啶基)乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲酸( 6,3.67 g,7.41 mmol,99%產率)。LC-MS (ES +): m/z491.2 [M + H] +步驟 -4
在室溫下在氮氣氛圍下向含有1-[1-[4-[2-(1-三級丁氧羰基-4-哌啶基)乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲酸( 6,4 g,7.51 mmol)及(3-氟苯基)甲胺( 7,940.19 mg,7.51 mmol,857.05 μL)於無水DMF (40 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL圓底燒瓶中添加N,N-二異丙基乙胺(4.85 g,37.56 mmol,6.54 mL)。5分鐘後,添加HATU (4.28 g,11.27 mmol),且在室溫下攪拌所得混合物3小時。反應完成後,將反應混合物用水(100 mL)淬滅,用乙酸乙酯(3×150 mL)萃取,經硫酸鈉乾燥且在減壓下濃縮,得到粗產物,其藉由管柱層析(100 g矽膠管柱,0-100%乙酸乙酯/石油醚)純化,得到呈棕色固體狀之4-[2-[4-[1-[4-[(3-氟苯基)甲基胺甲醯基]-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 8,3.5 g,5.57 mmol,74%產率)。LC-MS (ES +): m/z598.2 [M + H] +步驟 -5
在0℃下向含有4-[2-[4-[1-[4-[(3-氟苯基)甲基胺甲醯基]-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 8,3.5 g,5.56 mmol)於無水DCM (5 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加含4 M氯化氫之1,4-二㗁烷(5.56 mmol)。在室溫下攪拌內含物2小時。反應完成後,移除溶劑,得到粗化合物,其用甲苯溶解,蒸發至乾燥且用MTBE洗滌,得到呈棕色固體狀之N-[(3-氟苯基)甲基]-1-[1-[4-[2-(4-哌啶基)乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲醯胺鹽酸鹽( 9,3 g,5.21 mmol,94% 產率)。LC-MS (ES +): m/z498.2 [M + H] +實例 38 合成 N-[(3- 氟苯基 ) 甲基 ]-1-[(1 R)-1-[4-[2-(4- 哌啶基 ) 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ] 哌啶 -4- 甲醯胺鹽酸鹽
Figure 02_image1060
步驟 -1
使用以下方法對化合物4-[2-[4-[1-[4-[(3-氟苯基)甲基胺甲醯基]-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 1,300 mg)進行對掌性純化以分離對映異構體:儀器:PIC 100;管柱:Lux cellulose 2 (250×30) mm,5 μm;移動相:CO 2:0.5%異丙胺/異丙醇(70:30);總流量:70 g/min;背壓:100巴;波長:220 nm;循環時間:10分鐘;溫度:35℃。
任意指定為 R-異構體之早期溶離份(RT=3.6 min,光學純度100%)在減壓下濃縮,得到呈灰白色固體狀之4-[2-[4-[(1 R)-1-[4-[(3-氟苯基)甲基胺甲醯基]-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 2,130 mg,217.04 μmol,43%產率)。LC-MS (ES +): m/z598.2 [M + H] +。[α] 22D +5.40º (c 1.0, CH 3OH)。
任意指定為 S-異構體之晚期溶離份(RT 4.28 min,光學純度99.35%)在減壓下濃縮,得到呈灰白色固體狀之4-[2-[4-[(1 S)-1-[4-[(3-氟苯基)甲基胺甲醯基]-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 3, 130 mg,217.26 μmol,43%產率)。LC-MS (ES +): m/z598.2 [M + H] +。[α] 22D -5.40º (c 1.0, CH 3OH) 步驟 -2
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有4-[2-[4-[(1 R)-1-[4-[(3-氟苯基)甲基胺甲醯基]-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]哌啶-1-甲酸三級丁酯鹽酸鹽( 2,130.41 mg,203.56 μmol)於無水DCM (0.6 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加4.0 M氯化氫於二㗁烷(1.0 mL)中之溶液。2小時後,在減壓下濃縮反應混合物,得到粗產物,其用10% EtOAc/石油醚濕磨,得到呈白色固體狀之N-[(3-氟苯基)甲基]-1-[1 R)-1-[4-[2-(4-哌啶基)乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲醯胺鹽酸鹽( 4,116 mg,201.98 μmol,99%產率)。LC-MS (ES +): m/z498.2 [M + H] +實例 39 合成 1-[1-[4-[2-[1-[2-[4-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ]-1- 哌啶基 ] 乙醯基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ]-N-[(3- 氟苯基 ) 甲基 ] 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 1)
Figure 02_image1062
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有2-(4-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-1-基)乙酸( 2,82.3 mg,0.201 mmol)於無水DMF (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (121.98 mg,0.943 mmol,0.164 mL)及HATU (143.54 mg,0.377mol),接著添加 N-(3-氟苯甲基)-1-(1-(4-(哌啶-4-基乙炔基)萘-1-基)乙基)哌啶-4-甲醯胺( 1,100.82 mg,0.188 mmol)。將所得混合物在環境溫度下攪拌1小時。藉由UPLC監測反應進程。在減壓下移除過量溶劑,得到粗殘餘物,其藉由逆相管柱層析(RediSep-RF Gold C18管柱,移動相:10 mm NH 4HCO 3/水:MeCN)純化,得到呈灰白色固體狀之1-(1-(4-((1-(2-(4-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-1-基)乙醯基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)- N-(3-氟苯甲基)哌啶-4-甲醯胺(化合物 1,55 mg,0.062 mmol,33%產率)。
LC-MS (ES +): m/z880.3 [M + H] +1H-NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ 11.11 (s, 1H), 8.50-8.48 (m, 1H), 8.33-8.27 (m, 2H), 7.64-7.52 (m, 4H), 7.37-7.31 (m, 1H), 7.08-6.99 (m, 5H), 6.92 (d, J= 8.40 Hz, 1H), 5.37-5.29 (m, 1H), 4.25 (d, J= 6.00 Hz, 2H), 4.21-4.12 (m, 1H), 3.48-3.87 (m, 2H), 3.51-3.40 (m, 1H), 3.29 (s, 3H), 3.26-3.21 (m, 3H), 3.16-2.85 (m, 5H), 2.81-2.61 (m, 3H), 2.18-1.96 (m, 9H), 1.82-1.50 (m, 10H), 1.39 (d, J= 6.40 Hz, 3H)。 實例 40 合成 1-[1-[4-[2-[1-[4-[4-[3-(2,4- 二側氧基六氫嘧啶 -1- )-1- 甲基 - 吲唑 -6- ]-1- 哌啶基 ]-4- 側氧基 - 丁醯基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ]-N-[(3- 氟苯基 ) 甲基 ] 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 2)
Figure 02_image1064
基本上遵循 化合物 1之合成,使用對應中間物製備 化合物 2
LC-MS (ES +): m/z907.7 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ) δ 10.54 (s, 1H), 9.37 (s, 1H), 8.67 - 8.22 (m, 3H), 7.87 - 7.80 (m, 2H), 7.78 - 7.61 (m, 2H), 7.56 (d, J= 8.5 Hz, 1H), 7.45 (s, 1H), 7.34 (td, J= 8.0, 6.1 Hz, 1H), 7.12 - 6.93 (m, 4H), 5.42 (t, J= 6.9 Hz, 1H), 4.57 (d, J= 12.7 Hz, 1H), 4.27 (d, J= 6.0 Hz, 2H), 4.08 (d, J= 13.3 Hz, 1H), 3.96 (s, 3H), 3.90 (t, J= 6.7 Hz, 2H), 3.42 (dd, J= 13.0, 8.6 Hz, 1H), 3.34 - 3.20 (m, 1H), 3.20 - 2.79 (m, 5H), 2.75 (t, J= 6.7 Hz, 2H), 2.70 - 2.52 (m, 5H), 2.46 - 2.36 (m, 1H), 2.16 - 1.35 (m, 9H)。 實例 41 1-[1-[4-[2-[1-[7-[4-[3-(2,4- 二側氧基六氫嘧啶 -1- )-1- 甲基 - 吲唑 -6- ]-1- 哌啶基 ]-7- 側氧基 - 庚醯基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ]-N-[(3- 氟苯基 ) 甲基 ] 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 3)
Figure 02_image1066
基本上遵循 化合物 1之合成,使用對應中間物製備 化合物 3
LC-MS (ES +): m/z949.7 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ) δ 10.54 (s, 1H), 9.38 - 9.30 (m, 1H), 8.53 - 8.33 (m, 3H), 7.90 - 7.78 (m, 2H), 7.78 - 7.68 (m, 2H), 7.55 (d, J= 8.5 Hz, 1H), 7.44 (s, 1H), 7.34 (td, J= 7.9, 6.1 Hz, 1H), 7.03 (ttd, J= 9.9, 5.0, 2.4 Hz, 4H), 5.42 (d, J= 7.0 Hz, 1H), 4.59 (d, J= 12.8 Hz, 1H), 4.27 (d, J= 6.0 Hz, 2H), 4.06 - 3.98 (m, 1H), 3.96 (s, 3H), 3.93 (s, 2H), 3.90 (t, J= 6.7 Hz, 2H), 3.76 (d, J= 13.7 Hz, 1H), 3.23 (s, 1H), 3.12 (td, J= 9.6, 5.0 Hz, 2H), 3.11 - 3.00 (m, 1H), 2.95 - 2.79 (m, 2H), 2.74 (t, J= 6.7 Hz, 2H), 2.66 - 2.55 (m, 1H), 2.35 (td, J= 7.4, 2.1 Hz, 4H), 2.08 - 1.99 (m, 1H), 2.03 - 1.81 (m, 4H), 1.79 (s, 1H), 1.72 (d, J= 6.6 Hz, 3H), 1.69 (s, 1H), 1.61 (s, 2H), 1.65 - 1.46 (m, 5H), 1.39 - 1.29 (m, 2H), 1.23 (s, 1H)。 實例 42 N-[(3- 氟苯基 ) 甲基 ]-1-[1-[4-[2-[1-[2-[4-[3- 甲基 -1-(1- 甲基 -2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ]-1- 哌啶基 ] 乙醯基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ] 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 4)
Figure 02_image1068
基本上遵循 化合物 1之合成,使用對應中間物製備 化合物 4
LC-MS (ES +): m/z895.2 [M + H] +1H-NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ 8.53-8.49 (m, 1H), 8.49 (s, 1H), 8.33-8.27 (m, 2H), 7.63 (d, J= 7.20 Hz, 1H), 7.57-7.53 (m, 3H), 7.37-7.32 (m, 1H), 7.09-7.00 (m, 5H), 6.91 (d, J= 8.80 Hz, 1H), 5.41 (dd, J= 5.20, 12.60 Hz, 1H), 4.25 (d, J= 5.60 Hz, 2H), 4.21-4.15 (m, 1H), 4.01-3.91 (m, 2H), 3.55-3.45 (m, 3H), 3.31 (s, 3H), 3.30-3.10 (m, 4H), 3.04 (s, 3H), 2.99-2.96 (m, 2H), 2.79-2.76 (m, 2H), 2.20-1.90 (m, 8H), 1.89-1.51 (m, 11H), 1.39 (d, J= 6.40 Hz, 3H)。 實例 43 1-[1-[4-[2-[1-[6-[4-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ]-1- 哌啶基 ]-6- 側氧基 - 己醯基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ]-N-[(3- 氟苯基 ) 甲基 ] 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 5)
Figure 02_image1070
基本上遵循 化合物 1之合成,使用對應中間物製備 化合物 5
LC-MS (ES +): m/z950.2 [M + H] +1H-NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ 11.09 (s, 1H), 8.50 (d, J= 7.60 Hz, 1H), 8.33-8.27 (m, 2H), 7.63-7.57 (m, 3H), 7.53 (d, J= 7.60 Hz, 1H), 7.37-7.31 (m, 1H), 7.11 (s, 1H), 7.06-6.99 (m, 4H), 6.91 (d, J= 7.60 Hz, 1H), 5.34 (dd, J= 5.20, 12.80, Hz, 1H), 4.58 (d, J= 12.6 Hz, 1H), 4.25 (d, J= 6.00 Hz, 2H), 4.20-4.15 (m, 1H), 4.08-3.91 (m, 2H), 3.82-3.70 (m, 1H), 3.16-3.00 (m, 2H), 2.80-2.70 (m, 2H), 2.42-2.29 (m, 5H), 2.25-2.10 (m, 2H), 2.10-1.98 (m, 6H), 1.90-1.40 (m, 17H), 1.38 (d, J= 6.40 Hz, 3H)。 實例 44 1-[1-[4-[2-[1-[7-[4-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ]-1- 哌啶基 ]-7- 側氧基 - 庚醯基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ]-N-[(3- 氟苯基 ) 甲基 ] 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 6)
Figure 02_image1072
基本上遵循 化合物 1之合成,使用對應中間物製備 化合物 6
LC-MS (ES +): m/z964.2 [M + H] +1H-NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ 11.09 (s, 1H), 8.50 (d, J= 8.40 Hz, 1H), 8.32-8.27 (m, 2H), 7.64-7.57 (m, 3H), 7.53 (d, J= 7.60 Hz, 1H), 7.37-7.31 (m, 1H), 7.10 (s, 1H), 7.06-7.00 (m, 4H), 6.99-6.90 (m, 1H), 5.35-5.32 (m, 1H), 4.61-4.52 (m, 1H), 4.25 (d, J= 6.00 Hz, 2H), 4.19-4.12 (m, 1H), 4.03-3.88 (m, 2H), 3.80-3.71 (m, 1H), 3.29-3.19 (m, 1H), 3.15-3.00 (m, 3H), 2.95-2.62 (m, 4H), 2.42-2.30 (m, 5H), 2.21-2.11 (m, 1H), 2.05-1.86 (m, 5H), 1.82-1.66 (m, 4H), 1.65-1.51 (m, 11H), 1.39-1.31 (m, 5H)。 實例 45 1-[1-[4-[2-[1-[8-[4-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ]-1- 哌啶基 ]-8- 側氧基 - 辛醯基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ]-N-[(3- 氟苯基 ) 甲基 ] 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 7)
Figure 02_image1074
基本上遵循 化合物 1之合成,使用對應中間物製備 化合物 7
LC-MS (ES +): m/z978.2 [M + H] +1H-NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ 11.10 (s, 1H), 8.34 (brs, 1H), 8.28 (d, J= 6.80 Hz, 1H), 7.63-7.56 (m, 4H), 7.37-7.31 (m, 1H), 7.10 (s, 1H), 7.07-6.99 (m, 4H), 6.90 (d, J= 8.00 Hz, 1H), 5.34 (dd, J= 5.60, 12.60 Hz, 1H), 4.57 (d, J= 11.60 Hz, 1H), 4.25 (d, J= 6.00 Hz, 2H), 4.20-4.10 (m, 1H), 4.01-3.93 (m, 2H), 3.77-3.74 (m, 1H), 3.11-3.05 (m, 3H), 2.90-2.60 (m, 5H), 2.40-2.28 (m, 5H), 2.23-1.88 (m, 7H), 1.85-1.25 (m, 22H)。 實例 46 N-[(3- 氟苯基 ) 甲基 ]-1-[(1 R)-1-[4-[2-[1-[7-[4-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ]-1- 哌啶基 ]-7- 側氧基 - 庚醯基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ] 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 8)
Figure 02_image1076
基本上遵循 化合物 1之合成,使用對應中間物製備 化合物 8
LC-MS (ES +): m/z964.4 [M + H] +1H-NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ 11.09 (s, 1H), 8.50 (d, J= 8.40 Hz, 1H), 8.33-8.27 (m, 2H), 7.63-7.57 (m, 3H), 7.53 (d, J= 7.60 Hz, 1H), 7.37-7.31 (m, 1H), 7.11 (s, 1H), 7.06-6.99 (m, 4H), 6.91 (d, J= 7.60 Hz, 1H), 5.39-5.31 (m, 1H), 4.13-4.52 (m, 1H), 4.25 (d, J= 6.00 Hz, 2H), 4.21-4.13 (m, 1H), 4.04-3.91 (m, 2H), 3.83-3.73 (m, 1H), 3.25-3.01 (m, 4H), 2.95-2.83 (m, 1H), 2.81-2.60 (m, 5H), 2.36-2.33 (m, 4H), 2.19-1.88 (m, 7H), 1.78-1.71 (m, 4H), 1.62-1.50 (m, 10H), 1.38 (d, J= 6.40 Hz, 3H), 1.35-1.33 (m, 2H)。 實例 47 1-(1-(4-((1-(4-(4-(4-((2,6- 二側氧基哌啶 -3- ) 胺基 ) 苯基 ) 𠯤 -1- )-4- 側氧基丁醯基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )- N-(3- 氟苯甲基 ) 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 9)
Figure 02_image1078
基本上遵循 化合物 1之合成,使用對應中間物製備 化合物 9
LC-MS (ES +): m/z868.5 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): Δ10.76 (s, 1H), 8.50 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.32-8.27 (m, 2H), 7.64-7.52 (m, 4H), 7.37-7.31 (m, 1H), 7.08-6.98 (m, 3H), 6.79 (d, J= 8.8 Hz, 2H), 6.63 (d, J= 8.8 Hz, 2H), 5.44 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 4.26-4.16 (m, 4H), 3.97-3.90 (m, 1H), 3.84-3.77 (m, 1H), 3.65-3.55 (m, 4H), 3.39-3.35 (m, 1H), 3.31-3.22 (m, 1H), 3.12-3.02 (m, 2H), 2.98-2.85 (m, 4H), 2.82-2.65 (m, 2H), 2.63-2.55 (m, 5H), 2.21-1.98 (m, 5H), 1.96-1.81 (m, 2H), 1.78-1.67 (m, 2H), 1.65-1.51 (m, 4H)及1.39 (d, J= 6.4 Hz, 3H)。 實例 48 1-(1-(4-((1-(6-(4-(((2-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-1,3- 二側氧基異吲哚啉 -4- ) 胺基 ) 甲基 )-1H-1,2,3- 三唑 -1- ) 己醯基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )- N-(3- 氟苯甲基 ) 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 10)
Figure 02_image1080
基本上遵循 化合物 1之合成,使用對應中間物製備 化合物 10
LC-MS (ES +): m/z948.5 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.12 (s, 1H), 8.50 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 8.32-8.26 (m, 2H), 8.03 (s, 1H), 7.63-7.52 (m, 5H), 7.37-7.31 (m, 1H), 7.16 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 7.09-6.99 (m, 5H), 5.06 (dd, J= 13, 5.6 Hz, 1H), 4.59 (d, J= 6 Hz, 2H), 4.32 (t, J= 6.8 Hz, 2H), 4.25 (d, J= 6 Hz, 2H), 4.21-4.15 (m, 1H), 3.95-3.91 (m, 1H), 3.77-3.69 (m, 1H), 3.28-3.19 (m, 2H), 3.15-3.01 (m, 2H), 2.95-2.76 (m, 2H), 2.69-2.55 (m, 2H), 2.35-2.26 (m, 2H), 2.20-2.10 (m, 1H), 2.07-1.90 (m, 5H), 1.85-1.76 (m, 2H), 1.75-1.65 (m, 2H), 1.62-1.49 (m, 6H), 1.39 (d, J= 6.4 Hz, 3H)及1.28-1.21 (m, 2H)。 實例 49 合成 N-[(3- 氟苯基 ) 甲基 ]-1-[(1R)-1-[4-[2-[1-[6-[4-[3- 甲基 -2- 側氧基 -1-[(3R)-2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 ] 苯并咪唑 -5- ]-1- 哌啶基 ]-6- 側氧基 - 己醯基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ] 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 11) N-[(3- 氟苯基 ) 甲基 ]-1-[(1R)-1-[4-[2-[1-[6-[4-[3- 甲基 -2- 側氧基 -1-[(3S)-2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 ] 苯并咪唑 -5- ]-1- 哌啶基 ]-6- 側氧基 - 己醯基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ] 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 12)
Figure 02_image1082
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有N-[(3-氟苯基)甲基]-1-[(1 R)-1-[4-[2-(4-哌啶基)乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲醯胺鹽酸鹽( 1,120.00 mg,208.95 μmol)及6-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-6-側氧基-己酸鹽酸鹽( 2,104.59 mg,193.92 μmol)於無水DMF (0.5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加N,N-二異丙基乙胺(135.02 mg,1.04 mmol,181.97 μL)及HATU (95.34 mg,250.74 μmol)。4小時後,在減壓下濃縮反應混合物,得到粗產物,其藉由逆相製備型HPLC [管柱:Xbridge C8 (20 X 150) mm;移動相:A:0.1%碳酸氫銨/水及移動相B:乙腈]純化,得到呈白色固體狀之N-[(3-氟苯基)甲基]-1-[(1 R)-1-[4-[2-[1-[6-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-6-側氧基-己醯基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲醯胺(65 mg,66.05 μmol,32% 產率)。
LC-MS (ES +): m/z950.2 [M + H] +
接著藉由對掌性SFC,遵循以下方法分離非對映異構體:
儀器:PIC 175;管柱:R,R Whelk (250×30) mm,5μm;移動相:CO 2:0.1%異丙胺/{[異丙醇:乙腈] (1:1)} (50:50);總流量:90 g/min;背壓:120巴;波長:210 nm;溫度:35℃。
在0℃下收集早期溶離份(RT 23.17 min),用三氟乙酸酸化,在減壓下濃縮且藉由製備型HPLC [管柱:X Bridge C18 (150 Xv19 mm) 5μm;移動相A:0.1%甲酸/水及移動相B:乙腈]進一步純化,得到立體化學經任意指定之呈白色固體狀之N-[(3-氟苯基)甲基]-1-[(1R)-1-[4-[2-[1-[6-[4-[3-甲基-2-側氧基-1-[(3R)-2,6-二側氧基-3-哌啶基]苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-6-側氧基-己醯基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲醯胺甲酸酯( 化合物 11,10.5 mg,10.47 μmol,25%產率,100%光學純度)。
LC-MS (ES +): m/z950.2 [M + H ] +1H-NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ 11.08 (s, 1H), 8.49-8.46 (m, 1H), 8.38-8.29 (m, 1H), 7.89-7.82 (m, 1H), 7.70-7.68 (m, 1H), 7.61-7.54 (m, 2H), 7.40-7.28 (m, 1H), 7.10 (s, 1H), 7.06-7.00 (m, 4H), 6.91 (d, J = 8.80 Hz, 1H), 5.34 (dd, J= 5.60, 12.60 Hz, 1H), 4.57 (d, J= 12.0 Hz, 1H), 4.30-4.20 (m, 2H), 4.10-3.90 (m, 3H), 3.85-3.71 (m, 1H), 3.30-3.17 (m, 2H), 3.15-2.99 (m, 4H), 2.90-2.65 (m, 5H), 2.38-2.33 (m, 5H), 2.10-1.89 (m, 5H), 1.86-1.38 (m, 17H)。
在0℃下收集晚期溶離份(RT 27.55 min),用三氟乙酸酸化,在減壓下濃縮且藉由製備型HPLC [管柱:Sunfire C18 (150 X 19 mm) 5μm;移動相A:0.1%甲酸/水及移動相B:乙腈]進一步純化,得到立體化學經任意指定之呈白色固體狀之N-[(3-氟苯基)甲基]-1-[(1R)-1-[4-[2-[1-[6-[4-[3-甲基-2-側氧基-1-[(3S)-2,6-二側氧基-3-哌啶基]苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-6-側氧基-己醯基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲醯胺甲酸酯(化合物 12, 10.5 mg,10.48 μmol,25%產率,100%光學純度)。
LC-MS (ES +): m/z950.2 [M + H ] +1H-NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ 11.08 (s, 1H), 8.51-8.37 (m, 3H), 7.88-7.82 (m, 2H), 7.75-7.73 (m, 1H), 7.38-7.32 (m, 1H), 7.10 (s, 1H), 7.07-7.00 (m, 4H), 6.91 (d, J= 8.80 Hz, 1H), 5.34 (dd, J= 5.20, 12.80 Hz, 1H), 4.58 (d, J= 12.0 Hz, 1H), 4.27 (d, J= 6.00 Hz, 2H), 4.15-3.90 (m, 3H), 3.85-3.75 (m, 1H), 3.30-3.20 (m, 2H), 3.20-3.00 (m, 4H), 2.95-2.60 (m, 5H), 2.38-2.33 (m, 5H), 2.02-1.92 (m, 5H), 1.88-1.33 (m, 17H)。 實例 50 合成 N-[(3- 氟苯基 ) 甲基 ]-1-[(1R)-1-[4-[2-[1-[2-[4-[3- 甲基 -2- 側氧基 -1-[(3S)-2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 ] 苯并咪唑 -5- ]-1- 哌啶基 ] 乙醯基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ] 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 13)
Figure 02_image1084
步驟 -1
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有N-[(3-氟苯基)甲基]-1-[(1R)-1-[4-[2-(4-哌啶基)乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲醯胺( 1,150 mg,294.58 μmol)及2-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]乙酸( 2,118.43 mg,294.58 μmol)於無水DMF (1 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加N,N-二異丙基乙胺(38.07 mg,294.58 μmol,51.31 μL)及HATU (112.01 mg,294.58 μmol),且將內含物在此溫度下攪拌4小時。反應完成後,在減壓下濃縮反應混合物,得到粗產物,其藉由逆相製備型HPLC (管柱:Xbridge C-18 20x150m,移動相:A:0.1%碳酸氫銨/水,B:乙腈]純化且凍乾,得到呈白色固體狀之N-[(3-氟苯基)甲基]-1-[(1R)-1-[4-[2-[1-[2-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]乙醯基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲醯胺(80 mg,88.18 μmol,30%產率),任意指定為(1 R)。LC-MS (ES +): m/z950.0 [M + H] +
藉由對掌性SFC純化N-[(3-氟苯基)甲基]-1-[(1R)-1-[4-[2-[1-[2-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]乙醯基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲醯胺之非對映異構混合物(80 mg,88.84 μmol)。
對掌性SFC方法:儀器:PIC 175;管柱:R,R Whelk (250*30) mm,5μm
移動相:CO 2:{0.1% IPAm/IPA:乙腈(1:1)} (50:50);總流量:90 g/min;背壓:120巴;波長:210 nm;循環時間:24.0min
在0℃下收集早期溶離異構體(RT=10.0 min),藉由使用三氟乙酸(1.5 ml)酸化,在35℃下在減壓下濃縮,且藉由逆相製備型HPLC (管柱:Sunfire C18 (150 X 19 mm) 5μm;移動相:A:0.1%甲酸/水,B:乙腈]進一步純化且凍乾,得到N-[(3-氟苯基)甲基]-1-[(1R)-1-[4-[2-[1-[2-[4-[3-甲基-2-側氧基-1-[(3R)-2,6-二側氧基-3-哌啶基]苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]乙醯基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲醯胺甲酸酯( 3,14 mg,15.09 μmol,17%產率),立體化學任意指定為(1 R,3 R)。LC-MS (ES +): m/z880.4 [M + H] +1H-NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ 11.11 (s, 1H), 9.48-9.43 (m, 2H), 8.53-8.45 (m, 2H), 8.38 (dd, J= 3.20, 6.40 Hz, 1H), 7.88-7.82 (m, 2H), 7.76-7.74 (m, 2H), 7.38-7.33 (m, 1H), 7.16-7.09 (m, 6H), 5.45-5.35 (m, 2H), 4.50-4.38 (m, 2H), 4.28 (d, J= 6.00 Hz, 2H), 4.05-3.93 (m, 2H), 3.71-3.59 (m, 3H), 3.22-3.11 (m, 4H), 3.06-2.83 (m, 5H), 2.76-2.62 (m, 2H), 2.13-1.92 (m, 10H), 1.83-1.68 (m, 7H)。
在0℃下收集晚期溶離異構體(RT=11.53 min),藉由使用三氟乙酸(1.5 ml)酸化,在35℃下在減壓下濃縮,且藉由逆相製備型HPLC (管柱:Sunfire C18 (150 X 19 mm) 5μm;移動相:A:0.1%甲酸/水,B:乙腈]進一步純化且凍乾,得到N-[(3-氟苯基)甲基]-1-[(1R)-1-[4-[2-[1-[2-[4-[3-甲基-2-側氧基-1-[(3S)-2,6-二側氧基-3-哌啶基]苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]乙醯基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲醯胺甲酸酯(化合物 13, 13 mg,14.00 μmol,16%產率),立體化學任意指定為(1 R,3 S)。LC-MS (ES +): m/z880.3 [M + H] +1H-NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ 11.10 (s, 1H), 9.46-9.37 (m, 2H), 8.52-8.45 (m, 2H), 8.38 (dd, J= 3.20, 6.40 Hz, 1H), 7.88-7.82 (m, 2H), 7.76-7.74 (m, 2H), 7.38-7.33 (m, 1H), 7.10-6.96 (m, 5H), 5.39-5.35 (m, 2H), 4.39 (d, J= 4.00 Hz, 2H), 4.28 (d, J= 6.00 Hz, 2H), 4.11-3.93 (m, 2H), 3.71-3.55 (m, 3H), 3.22-3.01 (m, 5H), 3.00-2.83 (m, 3H), 2.76-2.62 (m, 3H), 2.22-1.92 (m, 10H), 1.83-1.68 (m, 7H)。 實例 51 合成 1-[1-[4-[2-[1-[4-[1-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ]-4- 哌啶基 ] 丁基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ]- N-[(3- 氟苯基 ) 甲基 ] 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 14)
Figure 02_image1086
在環境溫度下向含有4-[1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-4-哌啶基]丁醛鹽酸鹽( 2,200 mg,0.343  mmol)及 N-[(3-氟苯基)甲基]-1-[1-[4-[2-(4-哌啶基)乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲醯胺鹽酸鹽( 1,236.40 mg,0.411 mmol)於無水DMSO (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加乙酸鈉(112.55 mg,1.37 mmol)及乙酸(411.98 mg,6.86 mmol,392.73 μL)。隨後,在環境溫度下添加MP-氰基硼氫化物,2 mmol/g (257mg,0.514 mmol)。將所得混合物在環境溫度下攪拌16小時。藉由UPLC監測反應進程。反應完成後,過濾反應混合物,且在減壓下蒸發濾液。藉由逆相HPLC (Redisep-RF Gold C18-100g管柱,移動相A:含10 mm NH 4HCO 3之MQ-水/水及移動相B:乙腈)純化所獲得之粗物質,得到呈灰白色固體狀之1-[1-[4-[2-[1-[4-[1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-4-哌啶基]丁基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]- N-[(3-氟苯基)甲基]哌啶-4-甲醯胺(化合物 14,73 mg,0.078 mmol,22%產率)。LC-MS (ES +): m/z894.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.06 (s, 1H), 8.50 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.32-8.29 (m, 2H), 7.63-7.51 (m, 4H), 7.37-7.31 (m, 1H), 7.06-6.99 (m, 3H), 6.92 (d, J= 8.8 Hz, 1H), 6.82 (d, J= 2 Hz, 1H), 6.64-6.61 (m, 1H), 5.32-5.25 (m, 1H), 4.25 (d, J= 6 Hz, 2H), 4.19-4.13 (m, 1H), 3.59-3.56 (m, 2H), 3.30 (s, 3H), 3.08 (m, 1H), 2.92-2.65 (m, 6H), 2.60 (m, 3H), 2.35-2.12 (m, 3H), 2.06-1.90 (m, 5H), 1.77-1.71 (m, 6H), 1.59-1.45 (m, 6H)及1.44-1.24 (m, 10H)。 實例 52 合成 1-[1-[4-[2-[1-[5-[4-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ]-1- 哌啶基 ]-5- 側氧基 - 戊基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ]-N-[(3- 氟苯基 ) 甲基 ] 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 15)
Figure 02_image1088
Figure 02_image1090
步驟 -1
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有N-[(3-氟苯基)甲基]-1-[1-[4-[2-(4-哌啶基)乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲醯胺鹽酸鹽( 1,50.00 mg,92.85 μmol)於無水DMF (148.24 μL)中之充分溶液的10 mL單頸圓底燒瓶中添加三乙胺(46.98 mg,464.23 μmol,64.71 μL)及5-溴戊酸三級丁酯( 2,66.05 mg,278.54 μmol)。將所得混合物在室溫下攪拌16小時。此後,減壓蒸發溶劑,得到殘餘物,將其用MTBE (10 mL)進行濕磨。所得固體經過濾且真空乾燥,得到呈棕色固體狀之5-[4-[2-[4-[1-[4-[(3-氟苯基)甲基胺甲醯基]-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]-1-哌啶基]戊酸三級丁酯( 3,55 mg,65.01 μmol,70%產率)。LC-MS(ES +): m/z598.6 [M - tBu + H] +步驟 -2
在0℃下在氮氣氛圍下向含有5-[4-[2-[4-[1-[4-[(3-氟苯基)甲基胺甲醯基]-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]-1-哌啶基]戊酸三級丁酯( 3,55 mg,76.83 μmol)於無水DCM (0.5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加氯化氫(4.0M於二㗁烷中,576.25 μL)。將所得混合物在環境溫度下攪拌16小時。此後,將反應混合物在減壓下濃縮且用MTBE (10 mL)濕磨,得到固體,其經過濾及乾燥,得到呈淺棕色固體狀之5-[4-[2-[4-[1-[4-[(3-氟苯基)甲基胺甲醯基]-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]-1-哌啶基]戊酸鹽酸鹽( 4,50 mg,76.63 μmol,99%產率)。LC-MS(ES +): m/z598.6 [M + H] +步驟 -3
在室溫下在氮氣氛圍下向含有5-[4-[2-[4-[1-[4-[(3-氟苯基)甲基胺甲醯基]-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]-1-哌啶基]戊酸鹽酸鹽( 4,50 mg,76.63 μmol)及3-[3-甲基-2-側氧基-5-(4-哌啶基)苯并咪唑-1-基]哌啶-2,6-二酮鹽酸鹽(29.03 mg,76.63 μmol)於無水DMF (0.5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加N,N-二異丙基乙胺(59.42 mg,459.78 μmol,80.08 μL)及HATU (43.71 mg,114.94 μmol)。將所得混合物在室溫下攪拌3小時。此後,蒸發溶劑以得到殘餘物,其藉由逆相管柱層析[管柱:RediSep C18-30 g;移動相A:0.1%碳酸氫銨/水及移動相B:乙腈]純化,得到呈灰白色固體狀之1-[1-[4-[2-[1-[5-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-5-側氧基-戊基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]-N-[(3-氟苯基)甲基]哌啶-4-甲醯胺(化合物 15,34 mg,35.30 μmol,46%產率)。LC-MS(ES +): m/z922.2 [M + H] +1H-NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ 11.09 (s, 1H), 8.50 (d, J= 8.40 Hz, 1H), 8.33-8.28 (m, 2H), 7.62-7.56 (m, 3H), 7.51 (d, J= 7.60 Hz, 1H), 7.11 (s, 1H), 7.09-7.01 (m, 4H), 6.92 (d, J= 8.00 Hz, 1H), 5.36 (dd, J= 5.60, 12.60 Hz, 1H), 4.58 (d, J= 12.0 Hz, 1H), 4.25 (d, J= 6.00 Hz, 2H), 4.10-4.12 (m, 1H), 3.16-3.00 (m, 2H), 2.95-2.60 (m, 5H), 2.40-2.25 (m, 4H), 2.23-2.00 (m, 3H), 2.10-1.00 (m, 6H), 1.89-1.43 (m, 17H), 1.39 (d, J= 6.80 Hz, 3H)。 實例 53 N-[(3- 氟苯基 ) 甲基 ]-1-[(1 R)-1-[4-[2-[1-[5-[4-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ]-1- 哌啶基 ]-5- 側氧基 - 戊基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ] 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 16)
Figure 02_image1092
基本上遵循 化合物 15之合成,使用對應中間物製備 化合物 16
LC-MS(ES -): m/z920.2 [M - H] -1H-NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ 11.07 (s, 1H), 8.49 (d, J= 9.20 Hz, 1H), 8.31-8.28 (m, 2H), 7.61-7.56 (m, 3H), 7.52 (d, J= 7.60 Hz, 1H), 7.37-7.31 (m, 1H), 7.10 (s, 1H), 7.06-6.99 (m, 4H), 6.92 (dd, J= 1.20, 8.00 Hz, 1H), 5.32 (dd, J= 5.30, 13.20 Hz, 1H), 4.61-4.52 (m, 1H), 4.25 (d, J= 6.00 Hz, 2H), 4.19-4.14 (m, 1H), 4.06-3.99 (m, 1H), 3.20-3.01 (m, 2H), 2.95-2.60 (m, 5H), 2.41-2.30 (m, 5H), 2.29-2.11 (m, 3H), 2.11-1.90 (m, 6H), 1.88-1.68 (m, 6H), 1.67-1.46 (m, 10H), 1.39 (d, J= 6.40 Hz, 3H)。 實例 54 1-[1-[4-[2-[1-[5-[4-[3-(2,4- 二側氧基六氫嘧啶 -1- )-1- 甲基 - 吲唑 -6- ]-1- 哌啶基 ]-5- 側氧基 - 戊基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ]-N-[(3- 氟苯基 ) 甲基 ] 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 17)
Figure 02_image1094
基本上遵循 化合物 15之合成,使用對應中間物製備 化合物 17
LC-MS(ES +): m/z907.4 [M + H] +1H-NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ 10.54 (s, 1H), 8.50-8.48 (m, 1H), 8.32-8.27 (m, 2H), 7.61-7.55 (m, 4H), 7.51 (d, J= 7.60 Hz, 1H), 7.45 (s, 1H), 7.37-7.31 (m, 1H), 7.05-6.99 (m, 4H), 4.64-4.58 (m, 1H), 4.25 (d, J= 6.00 Hz, 2H), 4.20-4.13 (m, 1H), 4.10-4.02 (m, 1H), 3.96 (s, 3H), 3.90 (t, J= 6.40 Hz, 2H), 3.20-3.10 (m, 1H), 3.09-3.01 (m, 1H), 2.99-2.89 (m, 1H), 2.85-2.60 (m, 6H), 2.40-2.31 (m, 4H), 2.29-2.10 (m, 3H), 2.07-1.80 (m, 6H), 1.78-1.45 (m, 13H), 1.38 (d, J= 6.40 Hz, 3H)。 實例 55 1-[1-[4-[2-[1-[5-[4-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-6- -3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ] 𠯤 -1- ]-5- 側氧基 - 戊基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ]-N-[(3- 氟苯基 ) 甲基 ] 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 18)
Figure 02_image1096
基本上遵循 化合物 15之合成,使用對應中間物製備 化合物 18
LC-MS(ES -): m/z940.2 [M - H] -1H-NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.07 (s, 1H), 8.49 (d, J= 8.80 Hz, 1H), 8.31-8.28 (m, 2H), 7.62-7.51 (m, 5H), 7.37-7.31 (m, 1H), 7.17 (d, J= 12.00 Hz, 1H), 7.05-6.95 (m, 5H), 5.38-5.28 (m, 1H), 4.25 (d, J= 6.00 Hz, 2H), 4.19-4.11 (m, 2H), 3.63-3.62 (m, 4H), 3.31 (s, 3H), 3.06-2.85 (m, 4H), 2.32-2.69 (m, 6H), 2.41-2.31 (m, 4H), 2.22-2.11 (m, 3H), 2.02-1.95 (m, 4H), 1.73-1.71 (m, 3H), 1.59-1.50 (m, 8H), 1.39 (d, J= 6.80 Hz, 3H)。 實例 56 1-[1-[4-[2-[1-[5-[4-[3-(2,4- 二側氧基六氫嘧啶 -1- )-5- -1- 甲基 - 吲唑 -6- ]-1- 哌啶基 ]-5- 側氧基 - 戊基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ]-N-[(3- 氟苯基 ) 甲基 ] 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 19)
Figure 02_image1098
基本上遵循 化合物 15之合成,使用對應中間物製備 化合物 19
LC-MS(ES +): m/z926.3 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ10.57 (s, 1H), 8.50 (d, J= 9.2 Hz, 1H), 8.33-8.27 (m, 2H), 7.62-7.57 (m, 4H), 7.52 (d, J= 7.60 Hz, 1H), 7.40-7.31 (m, 2H), 7.07-6.99 (m, 3H), 4.66-4.58 (m, 1H), 4.25 (d, J= 6 Hz, 2H), 4.19-4.15 (m, 1H), 4.08-4.01 (m, 1H), 3.99 (s, 3H), 3.90 (t, J= 6.8 Hz, 2H), 3.23-3.12 (m, 3H), 3.09-3.02 (m, 1H), 2.95-2.82 (m, 3H), 2.79-2.66 (m, 4H), 2.42-2.33 (m, 3H), 2.22-2.11 (m, 2H), 2.05-1.95 (m, 4H), 1.92-1.65 (m, 7H), 1.63-1.56 (m, 8H)及1.39 (d, J= 6.8 Hz, 3H)。 實例 57 1-[1-[4-[2-[1-[5-[4-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-6- -3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ]-1- 哌啶基 ]-5- 側氧基 - 戊基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ]-N-[(3- 氟苯基 ) 甲基 ] 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 20)
Figure 02_image1100
基本上遵循 化合物 15之合成,使用對應中間物製備 化合物 20
LC-MS(ES +): m/z941.2 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.10 (s, 1H), 8.50 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 8.34-8.27 (m, 2H), 7.63-7.53 (m, 4H), 7.37-7.31 (m, 1H), 7.16-7.11 (m, 2H), 7.07-6.99 (m, 3H), 5.36-5.32 (m, 1H), 4.61-4.58 (m, 1H), 4.25 (d, J= 6 Hz, 2H), 4.23-4.15 (m, 1H), 4.05-3.98 (m, 1H), 3.18-3.00 (m, 5H), 2.95-2.50 (m, 11H), 2.42-2.39 (m, 2H), 2.38-2.35 (m, 2H), 2.22-1.95 (m, 6H), 1.85-1.50 (m, 14H)及1.39 (d, J= 6.4 Hz, 3H)。 實例 58 N-[(3- 氟苯基 ) 甲基 ]-1-[1-[4-[2-[1-[5-[4-[3- 甲基 -1-(1- 甲基 -2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ]-1- 哌啶基 ]-5- 側氧基 - 戊基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ] 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 21)
Figure 02_image1102
基本上遵循 化合物 15之合成,使用對應中間物製備 化合物 21
LC-MS(ES +): m/z937.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ8.49 (d, J= 9.2 Hz, 1H), 8.32-8.27 (m, 2H), 7.59-7.56 (m, 3H), 7.51 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 7.37-7.31 (m, 1H), 7.11 (s, 1H), 7.06-6.9 (m, 5H), 5.41 (dd, J= 12.8, 5.2 Hz, 1H), 4.61-4.53 (m, 1H), 4.25 (d, J= 6 Hz, 2H), 4.20-4.13 (m, 1H), 4.08-4.00 (m, 1H), 3.15-2.90 (m, 6H), 2.81-2.63 (m, 7H), 2.60 (m, 1H), 2.40-2.30 (m, 5H), 2.25-2.10 (m, 3H), 2.10-1.90 (m, 6H), 2.00-1.66 (m, 6H), 1.65-1.46 (m, 9H)及1.39 (d, J= 6.8 Hz, 3H)。 實例 59 1-[1-[4-[2-[1-[6-[4-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ]-1- 哌啶基 ]-6- 側氧基 - 己基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ]-N-[(3- 氟苯基 ) 甲基 ] 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 22)
Figure 02_image1104
基本上遵循 化合物 15之合成製備 化合物 22,除了在步驟-1中使用6-溴己酸三級丁酯及在步驟-3中使用對應CRBN結合劑。
LC-MS(ES +): m/z936.4 [M + H] +1H-NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.10 (s, 1H), 8.50 (d, J = 8.00 Hz, 1H), 8.33-8.28 (m, 2H), 7.63-7.56 (m, 3H), 7.52 (d, J = 7.60 Hz, 1H), 7.37-7.31 (m, 1H), 7.11 (s, 1H), 7.06-6.98 (m, 5H), 5.33 (dd, J = 5.20, 12.80 Hz, 1H), 4.56 4.56 (d, J = 12.6 Hz, 1H), 4.25 (d, J = 6.00 Hz, 2H), 4.20-4.12 (m, 1H), 4.07-4.02 (m, 1H), 3.23-3.00 (m, 2H), 2.95-2.58 (m, 8H), 2.40-2.25 (m, 4H), 2.24-2.10 (m, 3H), 2.10-1.90 (m, 5H), 1.84-1.67 (m, 5H), 1.65-1.42 (m, 10H), 1.32 (s, 3H), 1.30-1.22 (m, 2H)。 實例 60 合成 1-(1-(4-((1-(2-(4-(4-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -1- 羰基 )-1H- 吡唑 -1- ) 乙基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )- N-(3- 氟苯甲基 ) 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 23)
Figure 02_image1106
步驟 -1
在環境溫度下向含有 N-[(3-氟苯基)甲基]-1-[1-[4-[2-(4-哌啶基)乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲醯胺鹽酸鹽( 1,250 mg,0.430 mmol)、1-(2-側氧基)吡唑-4-甲酸乙酯三氟乙酸酯( 2,350 mg,0.957 mmol)於無水MeOH (5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加無水乙酸鈉(105.98 mg,1.29 mmol)及乙酸(1.31 g,21.84 mmol,1.25 mL)。將所得混合物在環境溫度下攪拌2小時。此後,添加MP-CNBH 3(430.62 mg,0.861 mmol;2 mmol\g)且繼續攪拌16小時。藉由UPLC監測反應。使反應混合物穿過燒結漏斗,且用MeOH (50 mL)洗滌漏斗上之固體,且在減壓下濃縮合併之濾液,得到粗物質。此反應粗物質藉由急驟矽膠(230-400目)管柱用9% MeOH/DCM純化,得到呈棕色糖漿液體狀之1-[2-[4-[2-[4-[1-[4-[(3-氟苯基)甲基胺甲醯基]-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]-1-哌啶基]乙基]吡唑-4-甲酸乙酯( 3,0.2 g,0.280 mmol,65%產率)。LC-MS(ES +): m/z664.3 [M + H] +步驟 -2
在環境溫度下向含有1-[2-[4-[2-[4-[1-[4-[(3-氟苯基)甲基胺甲醯基]-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]-1-哌啶基]乙基]吡唑-4-甲酸乙酯( 3,0.2 g,0.280 mmol)於1:1 THF/MeOH (4 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加含單水合氫氧化鋰(117.82 mg,2.81 mmol)之水(2 mL)。在環境溫度下攪拌所得溶液5小時。藉由UPLC監測反應。自反應混合物移除溶劑,得到粗物質。藉由逆相[Redisef-C18管柱,移動相:NH 4HCO 3/水及B:乙腈純化粗物質,得到呈灰白色固體狀之1-[2-[4-[2-[4-[1-[4-[(3-氟苯基)甲基胺甲醯基]-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]-1-哌啶基]乙基]吡唑-4-甲酸( 4,120 mg,0.183 mmol,65%產率)。LC-MS(ES +): m/z637.4 [M + H] +步驟 -3
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有1-[2-[4-[2-[4-[1-[4-[(3-氟苯基)甲基胺甲醯基]-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]-1-哌啶基]乙基]吡唑-4-甲酸( 4;65 mg,0.099 mmol)於無水DMF (1.5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (64.09 mg,0.495 mmol,0.086 mL)及HATU (75.42 mg,0.198 mmol),接著添加3-[3-甲基-2-側氧基-5-(4-哌啶基)苯并咪唑-1-基]哌啶-2,6-二酮鹽酸鹽( 5,45.09 mg,0.119 mmol)。將所得混合物在環境溫度下攪拌2小時。藉由UPLC監測反應進程。在減壓下移除過量溶劑,得到粗殘餘物。藉由逆相管柱層析(Redisef-C18管柱,移動相A:10 mm NH 4HCO 3/水及B:MeCN)純化粗物質,得到呈灰白色固體狀之1-[1-[4-[2-[1-[2-[4-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-1-羰基]吡唑-1-基]乙基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]- N-[(3-氟苯基)甲基]哌啶-4-甲醯胺(化合物 23,60 mg,0.060 mmol,61%產率)。LC-MS (ES +): m/z962.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.08 (s, 1H), 8.50-8.48 (m, 1H), 8.32-8.26 (m, 2H), 8.11 (s, 1H), 7.69 (s, 1H), 7.60-7.49 (m, 4H), 7.37-7.31 (m, 1H), 7.12 (s, 1H), 7.06-6.98 (m, 4H), 6.90 (dd, J= 8.4, 1.2 Hz, 1H), 5.36-5.31 (m, 1H), 4.51-4.35 (bs, 2H), 4.27-4.24 (m, 4H), 4.18-4.12 (m, 1H), 3.06-2.99 (m, 2H), 2.91-2.50 (m, 11H), 2.35-2.25 (m, 2H), 2.18-2.11 (m, 2H), 2.06-1.92 (m, 6H), 1.85-1.82 (m, 2H), 1.70-1.53 (m, 9H)及1.38 (d, J= 6.4 Hz, 3H)。 實例 61 合成 1-(1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 ) 哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )- N-(3- 氟苯甲基 ) 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 24)
Figure 02_image1108
步驟 -1
在環境溫度下向含有 N-[(3-氟苯基)甲基]-1-[1-[4-[2-(4-哌啶基)乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲醯胺鹽酸鹽( 1,0.2 g,0.333 mmol)及4-甲醯基哌啶-1-甲酸三級丁酯( 2,142.15 mg,0.666 mmol)於無水MeOH (3 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加無水乙酸鈉(27.34 mg,0.333 mmol)及乙酸(2.10 g,34.94 mmol,2.00 mL)。獎所得混合物在環境溫度下攪拌2小時。隨後,添加MP-CNBH 3(0.33 g;2 mmol/g)且繼續攪拌16小時。藉由UPLC監測反應。使反應混合物穿過燒結漏斗,且用MeOH (25 mL)洗滌漏斗上之固體,且在減壓下濃縮合併之濾液,得到粗殘餘物。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用10% MeOH/DCM作為溶離劑來純化此反應粗物質,得到呈無色膠狀之4-[[4-[2-[4-[1-[4-[(3-氟苯基)甲基胺甲醯基]-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]-1-哌啶基]甲基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 3,0.21 g,0.290 mmol,87%產率)。LC-MS (ES +): m/z695.2 [M + H] +步驟 -2
在0℃下向含有4-[[4-[2-[4-[1-[4-[(3-氟苯基)甲基胺甲醯基]-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]-1-哌啶基]甲基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 3,0.21 g,0.290 mmol)於無水二氯甲烷(2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(2 mL),且在環境溫度下攪拌所得混合物2小時。藉由UPLC監測反應進程。在減壓下移除過量溶劑,得到粗殘餘物,其用MTBE (30 mL)洗滌且乾燥,得到呈灰白色固體狀之 N-[(3-氟苯基)甲基]-1-[1-[4-[2-[1-(4-哌啶基甲基)-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲醯胺鹽酸鹽( 4,180 mg,0.283 mmol,98%產率)。LC-MS(ES +): m/z596.2 [M + H] +步驟 -3
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸甲酸酯( 5,70 mg,0.161 mmol)於無水DMF (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (83.69 mg,0.647 mmol,0.112 mL)及HATU (92.33 mg,0.242 mmol),接著添加 N-[(3-氟苯基)甲基]-1-[1-[4-[2-[1-(4-哌啶基甲基)-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲醯胺鹽酸鹽( 4,103.22 mg,0.161 mmol)。將所得混合物在環境溫度下攪拌2小時。藉由UPLC監測反應進程。在減壓下移除過量溶劑,得到粗殘餘物,其藉由逆相管柱層析(Redisef-C18管柱,移動相A:10 mm NH 4HCO 3/水及B:乙腈)純化,得到呈灰白色固體狀之1-[1-[4-[2-[1-[[1-[1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-羰基]-4-哌啶基]甲基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]- N-[(3-氟苯基)甲基]哌啶-4-甲醯胺( 化合物 24,35 mg,0.035 mmol,22%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.06 (s, 1H), 8.50 (d, J= 8.8 Hz, 1H), 8.32-8.29 (m, 2H), 7.64-7.57 (m, 3H), 7.53 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 7.37-7.31 (m, 1H), 7.06-6.99 (m, 3H), 6.94 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 6.84 (d, J= 2.4 Hz, 1H), 6.65-6.63 (m, 1H), 5.35-5.25 (m, 1H), 4.44-4.36 (m, 1H), 4.25 (d, J= 6 Hz, 2H), 4.21-4.13 (m, 1H), 4.03-3.95 (m, 1H), 3.64-3.57 (m, 2H), 3.11-2.98 (m, 2H), 2.90-2.50 (m, 14H), 2.22-2.16 (m, 5H), 2.03-1.95 (m, 5H), 1.81-1.71 (m, 10H), 1.59-1.53 (m, 3H), 1.39 (d, J= 6.4 Hz, 3H)及1.09-0.85 (m, 2H)。LC-MS (ES +): m/z963.4 [M + H] +實例 62 合成 4-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ] 哌啶 -1- 甲酸 3-[4-[2-[4-[1-[4-[(3- 氟苯基 ) 甲基胺甲醯基 ]-1- 哌啶基 ] 乙基 ]-1- 萘基 ] 乙炔基 ]-1- 哌啶基 ] 丙酯 ( 化合物 25)
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步驟 -1
在環境溫度下向含有 N-[(3-氟苯基)甲基]-1-[1-[4-[2-(4-哌啶基)乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲醯胺鹽酸鹽 (1,350 mg,0.609 mmol)於無水DMF (7 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加無水碳酸鉀(168.45 mg,1.22 mmol)及碘化鉀(101.17 mg,0.609 mmol),接著添加3-溴丙氧基-三級丁基-二甲基-矽烷( 2;185.21 mg,0.731 mmol)。在90℃下攪拌反應混合物3小時,此時經UPLC監測,反應完成。在減壓下濃縮反應混合物以移除過量溶劑,且由此獲得之粗物質用水(100 mL)稀釋且用EtOAc (2×200 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠;50g SNAP)用5-8% MeOH/DCM作為溶離劑來純化,得到呈淡黃色固體狀之1-[1-[4-[2-[1-[3-[三級丁基(二甲基)矽基]氧基丙基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]- N-[(3-氟苯基)甲基]哌啶-4-甲醯胺( 3,250 mg,0.354 mmol,58%產率)。LC-MS (ES +): m/z670.4 [M + H] +步驟 -2
在環境溫度下向含有1-[1-[4-[2-[1-[3-[ tert-丁基(二甲基)矽基]氧基丙基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]- N-[(3-氟苯基)甲基]哌啶-4-甲醯胺( 3,250 mg,0.354.49 mmol)於無水THF (5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加含1M TBAF之THF (0.7 mL, 0.789 mmol)且攪拌所得混合物1小時。在經UPLC指示反應完成後,將反應混合物用水(150 mL)稀釋且用EtOAc (2×100 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮,得到呈淡黃色膠質液體狀之 N-[(3-氟苯基)甲基]-1-[1-[4-[2-[1-(3-羥丙基)-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲醯胺( 4,150 mg,0.263 mmol,74%產率)。LC-MS (ES +): m/z556.2 [M + H] +步驟 -3
在0℃下向含有 N-[(3-氟苯基)甲基]-1-[1-[4-[2-[1-(3-羥丙基)-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲醯胺( 4,150 mg,0.264 mmol)於無水THF (4 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加氯甲酸4-硝基苯酯(79.97 mg,0.396 mmol)及TEA (133.83 mg,1.32 mmol,0.2 mL)。在環境溫度下攪拌反應混合物2小時。此後,在環境溫度下向反應混合物中添加3-[3-甲基-2-側氧基-5-(4-哌啶基)苯并咪唑-1-基]哌啶-2,6-二酮鹽酸鹽( 5,110.24 mg,0.290 mmol)於無水THF (2 mL)及TEA (133.83 mg,1.32 mmol,0.2 mL)中之溶液。在相同溫度下攪拌所得混合物16小時。藉由UPLC監測反應。反應完成後,過濾反應混合物,且在減壓下濃縮濾液。粗產物藉由逆相HPLC (Redisep-RF Gold C18-100 g管柱,移動相A:含10 mM NH 4HCO 3之MQ-水/水及移動相B:乙腈)純化,得到呈灰白色固體狀之4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-1-甲酸3-[4-[2-[4-[1-[4-[(3-氟苯基)甲基胺甲醯基]-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]-1-哌啶基]丙酯(化合物 25, 93 mg,0.092 mmol,35%產率)。LC-MS (ES +): m/z925.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.08 (s, 1H), 8.50 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 8.32-8.29 (m, 2H), 7.63-7.51 (m, 4H), 7.37-7.31 (m, 1H), 7.11 (s, 1H), 7.06-7.00 (m, 4H), 6.95 (m, 1H), 5.40-5.28 (m, 1H), 4.28 (d, J= 6 Hz, 2H), 4.17 (m, 3H), 4.01 (m, 2H), 3.45 (m, 1H), 3.21-3.13 (m, 1H), 3.07-2.98 (m, 1H), 2.92-2.67 (m, 8H), 2.58 (m, 1H), 2.45-2.32 (m, 2H), 2.29-2.11 (m, 3H), 2.05-1.95 (m, 5H), 1.79-1.71 (m, 7H), 1.60-1.53 (m, 6H), 1.39-1.38 (m, 3H)及0.95 (m, 1H)。 實例 63 合成 1-(1-(4-(5-(6-(4-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -1- )- N- 甲基 -6- 側氧基己醯胺基 ) 戊基 ) -1- ) 乙基 )- N-(3- 氟苯甲基 ) 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 26)
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步驟 -1
在0℃下向含有氫化鈉(253.74 mg,3.81 mmol;60%分散液於礦物油中)於DMF (5 mL)中之充分攪拌懸浮液的100 mL雙頸圓底燒瓶中添加 N-戊-4-炔基胺基甲酸三級丁酯( 1,500 mg,2.54 mmol)於無水DMF (3 mL)中之溶液,且將所得混合物在環境溫度下攪拌1小時。添加碘甲烷(360.18 mg,2.54 mmol,0.157 mL)且將混合物在環境溫度下攪拌16小時。藉由TLC監測反應。隨後,將反應混合物用飽和NH 4Cl (10 mL)淬滅且用EtOAc (3×15 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,120 g)用20% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化所獲得之殘餘物,得到呈棕色液體狀之 N-甲基- N-戊-4-炔基-胺基甲酸三級丁酯( 2,260 mg,1.25 mmol,49%產率)。 1H NMR (400 MHz, CDCl 3). δ3.35 (S, 3H), 2.9-2.8 (m, 3H), 2.25-2.20 (m, 1H), 2.00-1.95 (m, 1H), 1.80-1.70 (m, 2H)及1.43 (s, 9H)。 步驟 -2
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有1-[1-(4-溴-1-萘基)乙基]哌啶-4-甲酸( 3,1.3 g,3.59 mmol)於無水DMF (15 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (2.32 g,17.95 mmol,3.13 mL)及HATU (1.64 g,4.31 mmol),接著添加(3-氟苯基)甲胺( 4,673.63 mg,5.38 mmol,0.61 mL)。在此溫度下攪拌所得混合物2小時。藉由TLC監測反應進程。反應完成後,將反應混合物倒入水(25 mL)中且用DCM (2×50 mL)萃取。有機相經合併且用鹽水(25 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮,得到粗殘餘物。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,120 g)用0-15% MeOH/DCM作為溶離劑來純化粗殘餘物,得到呈棕色固體狀之1-[1-(4-溴-1-萘基)乙基]- N-[(3-氟苯基)甲基]哌啶-4-甲醯胺( 5,1 g,2.11 mmol,59%產率)。LC-MS (ES +): m/z471.0 [M + H] +步驟 -2
在環境溫度下向含有1-[1-(4-溴-1-萘基)乙基]- N-[(3-氟苯基)甲基]哌啶-4-甲醯胺( 5,250 mg,0.527 mmol)及 N-甲基- N-戊-4-炔基-胺基甲酸三級丁酯( 2,109.49 mg,0.527 mmol)於無水乙腈(8 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL密封管中添加碳酸銫(429.50 mg,1.32 mmol),且藉由用氮氣鼓泡10分鐘使所得混合物脫氣。隨後,添加XPhos (25.14 mg,0.052 mmol)及XPhos-Pd-G3 (22.32 mg,0.026 mmol),且將所得混合物再用N 2脫氣5分鐘。在90℃下攪拌反應混合物4小時。藉由UPLC監測反應進程。反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且用EtOAc (150 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮濾液,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,50 g)用0-10% MeOH/DCM作為溶離劑來純化,得到呈淡黃色固體狀之 N-[5-[4-[1-[4-[(3-氟苯基)甲基胺甲醯基]-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]戊-4-炔基]- N-甲基-胺基甲酸三級丁酯( 6,115 mg,0.184 mmol,35%產率)。LC-MS (ES +): m/z586.2 [M + H] +步驟 -4
在環境溫度下向含有 N-[5-[4-[1-[4-[(3-氟苯基)甲基胺甲醯基]-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]戊-4-炔基]- N-甲基-胺基甲酸三級丁酯( 6,90 mg,0.144 mmol)於無水EtOAc (2.5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加鈀/碳,10重量% (40 mg,0.033 mmol)。所得混合物在環境溫度下在氫氣氛圍下攪拌1小時。藉由UPLC監測反應。反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且用EtOAc (50 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮濾液,得到呈棕色液體狀之 N-[5-[4-[1-[4-[(3-氟苯基)甲基胺甲醯基]-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]戊基]- N-甲基-胺基甲酸三級丁酯( 7,40 mg,0.033 mmol,97%產率)。LC-MS (ES +): m/z590.2 [M + H] +步驟 -5
在0℃下向含有 N-[5-[4-[1-[4-[(3-氟苯基)甲基胺甲醯基]-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]戊基]- N-甲基-胺基甲酸三級丁酯( 7,115 mg,0.183 mmol)於無水DCM (2.5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(8 mmol,2 mL),且將所得混合物在環境溫度下攪拌1小時。在經UPLC指示反應完成後,在減壓下移除過量溶劑,得到粗殘餘物,其用MTBE (10 mL)洗滌且乾燥,得到呈黃色固體狀之 N-[(3-氟苯基)甲基]-1-[1-[4-[5-(甲胺基)戊基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲醯胺鹽酸鹽( 8,120 mg,0.159 mmol,87%產率)。LC-MS (ES +): m/z490.2 [M + H] +步驟 -6
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有 N-[(3-氟苯基)甲基]-1-[1-[4-[5-(甲胺基)戊基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲醯胺鹽酸鹽( 8,120 mg,0.182 mmol)於無水DMF (3 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (70.75 mg,0.547 mmol,0.095 mL)及HATU (76.32 mg,0.20 mmol),接著添加6-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-6-側氧基-己酸( 9,93.32 mg,0.182 mmol)。將所得混合物在環境溫度下攪拌2小時。藉由UPLC監測反應進程。在減壓下濃縮反應混合物,得到粗產物,其藉由逆相HPLC (RediSep-RF Gold C18管柱,移動相A:10 mm NH 4HCO 3/水,B:乙腈)純化,得到呈灰白色固體狀之1-[1-[4-[5-[[6-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-6-側氧基-己醯基]-甲基-胺基]戊基]-1-萘基]乙基]- N-[(3-氟苯基)甲基]哌啶-4-甲醯胺( 化合物 26,24 mg,0.024 mmol,14%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.09 (s, 1H), 8.51-8.47 (m, 1H), 8.30 (t, J= 6 Hz, 1H), 8.09-8.06 (m, 1H), 7.54-7.49 (m, 2H), 7.44 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.36-7.29 (m, 2H), 7.10 (s, 1H), 7.05-7.01 (m, 4H), 6.95-6.92 (m, 1H), 5.36 (dd, J= 12.6, 5.2 Hz,  1H), 4.60-4.51 (m, 1H), 4.25 (d, J= 6 Hz, 2H), 4.16-4.08 (m, 1H), 4.05-3.95 (m, 1H), 3.35 (s, 3H), 3.27 (t, J= 7.6 Hz, 2H), 3.15-2.98 (m, 4H), 2.93 (s, 3H), 2.85 (m, 1H), 2.80-2.50 (m, 7H), 2.40-2.25 (m, 6H), 2.20-2.10 (m, 2H), 2.06-1.96 (m, 3H), 1.80-1.47 (m, 11H)及1.45-1.30 (m, 5H). LC-MS (ES +): m/z942.4 [M + H] +實例 64 合成 N-[(3- 氟苯基 ) 甲基 ]-1-[1-[5-[2-(4- 哌啶基 ) 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ] 哌啶 -4- 甲醯胺
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步驟 -1
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有5-溴萘-1-甲酸( 1,8 g,31.86 mmol)於無水DMF (200 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加N,N-二甲基吡啶-4-胺(11.68 g,95.59 mmol)及3-(乙基亞胺基亞甲基胺基)-N,N-二甲基-丙-1-胺鹽酸鹽(12.22 g,63.73 mmol),接著添加N-甲氧基甲胺鹽酸鹽( 2,12.43 g,127.45 mmol)。在環境溫度下攪拌內含物16小時。反應完成後,將反應混合物倒入水(500 mL)中且用EtOAc (2×500 mL)萃取。合併之有機層用鹽水(300 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且過濾。在減壓下濃縮濾液,得到粗產物,其藉由管柱層析(100 g矽膠,0-100% EtOAc/石油醚)純化,得到呈黏稠無色液體狀之5-溴-N-甲氧基-N-甲基-萘-1-甲醯胺( 3,9 g,26.35 mmol,83%產率)。LC-MS (ES +): m/z 295.9 [M + H] +步驟 -2
在0℃下向含有5-溴-N-甲氧基-N-甲基-萘-1-甲醯胺( 3,8.5 g,24.88 mmol)於無水THF (100 mL)中之充分攪拌溶液的500 mL 3頸圓底燒瓶中添加無水氯化鈰(III) (9.20 g,37.32 mmol)。將所得反應混合物在室溫下攪拌1小時,隨後將其冷卻至0℃且逐滴添加甲基溴化鎂於THF (149.28 mL,149.28 mmol)中之1 M溶液。在室溫下攪拌所得溶液12小時。反應完成後,在0℃下用飽和NH 4Cl溶液(200 mL)緩慢淬滅反應混合物。反應混合物經由矽藻土墊過濾,且濾餅用EtOAc洗滌且用EtOAc (2×500 mL)萃取。合併之有機層用鹽水(150 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且過濾。在減壓下濃縮濾液,得到粗產物,其藉由管柱層析(100 g,矽膠,0-100% EtOAc/石油醚)純化,得到呈黏稠無色液體狀之1-(5-溴萘-1-基)乙-1-酮( 4,6.5 g,24.74 mmol,99%產率)。LCMS (ES -): m/z 249.2 [M - H] -步驟 -3
在100 mL密封管中,在環境溫度下將1-(5-溴萘-1-基)乙-1-酮( 4,6 g,22.84 mmol)、哌啶-4-甲酸甲酯( 5,4.91 g,34.26 mmol,4.63 mL)及無水異丙醇鈦(IV) (60 mL)混合。在80℃下攪拌反應混合物6小時。將反應混合物冷卻至0℃且添加硼氫化鈉(2.59 g,68.52 mmol,2.42 mL)。接著將其在30℃下攪拌3小時。反應完成後,使反應混合物冷卻至0℃且用EtOAc稀釋,且依次用飽和碳酸氫鈉溶液洗滌。過濾固體沈澱且用EtOAc (2×150 mL)萃取濾液。合併之有機相用鹽水(100 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且在減壓下濃縮,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,用10%三乙胺/石油醚、0-100% EtOAc/石油醚中和)純化,得到呈無色黏稠液體狀之1-[1-(5-溴-1-萘基)乙基]哌啶-4-甲酸異丙酯( 6,7 g,14.97 mmol,66%產率)。LC-MS (ES +): m/z 405.9 [M+ H] +步驟 -4
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有1-[1-(5-溴-1-萘基)乙基]哌啶-4-甲酸異丙酯( 6,1 g,2.13 mmol)及4-乙炔基哌啶-1-甲酸三級丁酯( 7,578.67 mg,2.77 mmol)於無水乙腈(10 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL密封管中添加碳酸銫(2.08 g,6.38 mmol)。所得混合物用氮氣脫氣10分鐘。隨後,添加XPhos-Pd-G3 (90.02 mg,106.35 µmol)及二環己基-[2-(2,4,6-三異丙基苯基)苯基]膦(101.39 mg,212.69 µmol),且將所得混合物用氮氣再脫氣5分鐘,隨後在90℃下加熱4小時。在起始物質耗盡後,接著將反應混合物冷卻至環境溫度且倒入水(100 mL)及EtOAc (100 mL)中。其接著經由矽藻土墊過濾,且濾餅用EtOAc (50 mL)洗滌且用EtOAc (2×150 mL)萃取。合併之有機層用鹽水(150 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且過濾。在減壓下濃縮濾液,得到粗產物,其藉由Biotage® Isolera (含0-100%乙酸乙酯/石油醚之230-400目矽膠)純化,得到呈黏稠灰白色固體狀之4-[2-[5-[1-(4-異丙氧基羰基-1-哌啶基)乙基]-1-萘基]乙炔基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 8,1 g,1.76 mmol,83%產率)。LC-MS (ES +): m/z 533.4 [M + H] +步驟 -5
在0℃下向4-[2-[5-[1-(4-異丙氧基羰基-1-哌啶基)乙基]-1-萘基]乙炔基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 8,1 g,1.76 mmol)於1:1:1 THF (10 mL):甲醇(10 mL):水(10 mL)之混合物中之充分攪拌溶液中添加單水合氫氧化鋰(740.47 mg,17.65 mmol)。在30℃下攪拌反應混合物12小時。同時藉由TLC監測反應進程。反應完成後,將反應混合物在真空中濃縮,用水(50 mL)稀釋,且用MTBE (2×150 ml)萃取。水相用檸檬酸溶液(pH 4)酸化且用EtOAc (2×250 mL)萃取。在減壓下濃縮有機層,得到呈灰白色固體狀之1-[1-[5-[2-(1-三級丁氧羰基-4-哌啶基)乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲酸( 9,900 mg,1.74 mmol,99%產率)。LC-MS (ES +): m/z 491.1 [M + H] +步驟 -6
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有1-[1-[5-[2-(1-三級丁氧羰基-4-哌啶基)乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲酸( 9,900 mg,1.74 mmol)於無水DMF (10 mL)中之充分攪拌溶液的10 mL單頸圓底燒瓶中添加N,N-二異丙基乙胺(1.13 g,8.71 mmol,1.52 mL)及HATU (993.91 mg,2.61 mmol),接著添加(3-氟苯基)甲胺( 10,327.12 mg,2.61 mmol,297.38 µL)。在環境溫度下攪拌內含物2小時。反應完成後,將反應混合物倒入水(50 mL)中且用EtOAc (2×250 mL)萃取。合併之有機層用鹽水(50 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且過濾。在減壓下濃縮濾液,得到粗產物,其藉由Biotage® Isolera(230-400目矽膠,0-100%乙酸乙酯/石油醚)純化。藉由逆相層析(Biotage C18 120 g SNAP,移動相:移動相A:0.1%碳酸氫銨/水;移動相B:乙腈;流動速率:15 mL/min)進一步純化產物,得到呈灰白色固體狀之4-[2-[5-[1-[4-[(3-氟苯基)甲基胺甲醯基]-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 11,400 mg,668.56 µmol,38%產率)。LC-MS (ES +): m/z598.3 [M + H] +步驟 -7
在0℃下向含有4-[2-[5-[1-[4-[(3-氟苯基)甲基胺甲醯基]-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 11,390 mg,651.85 µmol)於DCM (4 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加含4 M氯化氫之1,4-二㗁烷,99% (21.9 mL, 87.69 mmol)。在環境溫度下攪拌反應混合物2小時。反應完成後,在減壓下濃縮反應混合物,得到殘餘物,其用MTBE (2×200 mL)及乙腈(50 ml)洗滌且乾燥,得到呈白色固體狀之N-[(3-氟苯基)甲基]-1-[1-[5-[2-(4-哌啶基)乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲醯胺二鹽酸鹽( 12,370 mg,639.66 µmol,98%產率)。LCMS (ES +): m/z498.3 [M + H] +實例 65 合成 1-[1-[5-[2-[1-[4-[4-[4-[(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 ) 胺基 ] 苯基 ] 𠯤 -1- ]-4- 側氧基 - 丁醯基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ]-N-[(3- 氟苯基 ) 甲基 ] 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 27)
Figure 02_image1122
向N-[(3-氟苯基)甲基]-1-[1-[5-[2-(4-哌啶基)乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲醯胺( 1,30 mg,52.58 µmol,HCl鹽)及4-[4-[4-[(2,6-二側氧基-3-哌啶基)胺基]苯基]哌𠯤-1-基]-4-側氧基-丁酸( 2,20.42 mg,52.58 µmol,TFA鹽)於DMF (1.5 mL)中之溶液中添加DIPEA (33.98 mg,45.79 µL)及HATU (39.98 mg,105.1 µmol),且將反應混合物在室溫下攪拌2小時。反應完成後,用冰水(5 ml)稀釋反應混合物,且沈澱物經過濾且溶解於20% MeOH/二氯甲烷中。溶液經Na 2SO 4乾燥且真空濃縮,得到粗產物,其藉由製備型HPLC純化,得到1-[1-[5-[2-[1-[4-[4-[4-[(2,6-二側氧基-3-哌啶基)胺基]苯基]哌𠯤-1-基]-4-側氧基-丁醯基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]-N-[(3-氟苯基)甲基]哌啶-4-甲醯胺(化合物 27, 5 mg,5.65 µmol,10.74%產率)。LC-MS (ES +): m/z868.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ10.78 (bs, 1H), 8.50 (d, J= 8.8 Hz, 1H), 8.30 (t, J= 6 Hz, 1H), 8.19 (dd, J= 7, 2.4 Hz, 1H), 7.65 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.60-7.58 (m, 2H), 7.49 (t, J= 7.2 Hz, 1H), 7.52-7.48 (m, 1H), 7.35-7.31 (m, 1H), 7.06-6.99 (m, 3H), 6.79 (d, J= 9.2 Hz, 1H), 6.63 (d, J= 8.8 Hz, 1H), 5.44 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 4.25 (d, J= 6 Hz, 3H), 4.21-4.17 (m, 1H), 3.92 (m, 1H), 3.80 (m, 1H), 3.61-3.58 (m, 5H), 3.33 (m, 4H), 3.11 (m, 1H), 3.05 (m, 1H), 2.95-2.87 (m, 4H), 2.75 (m, 1H), 2.70 (m, 1H), 2.67 (s, 3H), 2.50 (m, 4H), 2.15 (m, 2H), 2.05 (m, 3H), 1.68-1.50 (m, 4H)及1.40 (d, J= 6.8 Hz, 3H)。 實例 66 1-[1-[5-[2-[1-[6-[4-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ]-1- 哌啶基 ]-6- 側氧基 - 己醯基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ]-N-[(3- 氟苯基 ) 甲基 ] 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 28)
Figure 02_image1124
基本上遵循 化合物 27之合成製備 化合物 28
LC-MS (ES +): m/z950.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.08 (s, 1H), 8.49 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.35-8.26 (m, 1H), 8.19 (d, J= 6.4 Hz, 1H), 7.68-7.55 (m, 3H), 7.52-7.46 (m, 1H), 7.37-7.31 (m, 1H), 7.10-6.99 (m, 5H), 6.91 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 5.34 (dd, J= 12.8, 5.2 Hz, 1H), 4.57 (d, J= 12.8 Hz, 1H), 4.30-4.15 (m, 3H), 4.05-3.93 (m, 2H), 3.82-3.75 (m, 1H), 3.48-3.35 (m, 2H), 3.33 (s, 3H), 3.32-3.22 (m, 2H), 3.15-3.01 (m, 3H), 2.95-2.54 (m, 5H), 2.41-2.31 (m, 4H), 2.20-1.90 (m, 5H), 1.81-1.45 (m, 14H), 1.42-1.35 (m, 3H)。 實例 67 1-[1-[5-[2-[1-[5-[4-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ]-1- 哌啶基 ]-5- 側氧基 - 戊基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ]-N-[(3- 氟苯基 ) 甲基 ] 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 29)
Figure 02_image1126
步驟 -1
在室溫下向含有N-[(3-氟苯基)甲基]-1-[1-[5-[2-(4-哌啶基)乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲醯胺( 1,160 mg,289.36 μmol)及5-溴戊酸三級丁酯( 2,343.09 mg,1.45 mmol)於DMF (2 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL圓底燒瓶中添加三乙胺(146.40 mg,1.45 mmol,201.66 μL)。攪拌反應物16小時且在減壓下濃縮以獲得粗物質,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠;EtOAc/石油醚)純化,得到呈黃色膠狀之5-[4-[2-[5-[1-[4-[(3-氟苯基)甲基胺甲醯基]-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]-1-哌啶基]戊酸三級丁酯( 3,140 mg,209.83 μmol,73%產率)。LC-MS (ES +): m/z654.4 [M + H] +步驟 -2
在0℃下在氮氣氛圍下向含有5-[4-[2-[5-[1-[4-[(3-氟苯基)甲基胺甲醯基]-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]-1-哌啶基]戊酸三級丁酯( 3,140 mg,209.83 μmol)於DCM (2 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL圓底燒瓶中逐滴添加氯化氫溶液(4.0 M於二㗁烷中,2 mL)。在室溫下攪拌1小時之後,在減壓下濃縮反應混合物,得到殘餘物,其用MTBE洗滌且乾燥,得到呈黃色固體狀之5-[4-[2-[5-[1-[4-[(3-氟苯基)甲基胺甲醯基]-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]-1-哌啶基]戊酸鹽酸鹽( 4,140 mg,192.05 μmol,92%產率)。LC-MS (ES +): m/z598.3 [M + H] +步驟 -3
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有5-[4-[2-[5-[1-[4-[(3-氟苯基)甲基胺甲醯基]-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]-1-哌啶基]戊酸鹽酸鹽( 4,165 mg,249.76 μmol)及3-[3-甲基-2-側氧基-5-(4-哌啶基)苯并咪唑-1-基]哌啶-2,6-二酮鹽酸鹽( 5,94.62 mg,249.76 μmol)於無水DMF (4 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加N,N-二異丙基乙胺(161.39 mg,1.25 mmol,217.51 μL)及HATU (113.96 mg,299.71 μmol)。1小時後,在減壓下濃縮反應混合物,得到粗物質,其藉由逆相製備型HPLC [管柱:X-BRIDGE C8 (150 X 19) mm,5 µm;移動相A:10 mM碳酸氫銨/水及移動相B:乙腈]純化,得到呈白色固體狀之1-[1-[5-[2-[1-[5-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-5-側氧基-戊基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]-N-[(3-氟苯基)甲基]哌啶-4-甲醯胺( 化合物 29,72 mg,76.95 μmol,29%產率)。LC-MS (ES +): m/z922.3 [M + H] +1H-NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ 11.08 (s, 1H), 8.48 (d, J= 8.40 Hz, 1H), 8.30 (t, J= 6.00 Hz, 1H), 8.19 (d, J= 8.00 Hz, 1H), 7.61-7.54 (m, 3H), 7.50-7.46 (m, 1H), 7.37-7.31 (m, 1H), 7.10 (s, 1H), 7.06-6.99 (m, 4H), 6.93-6.90 (m, 1H), 5.35-5.30 (m, 1H), 4.61-4.53 (m, 1H), 4.25 (d, J= 6.00 Hz, 2H), 4.21-4.13 (m, 1H), 4.06-3.99 (m, 1H), 3.16-2.98 (m, 2H), 2.91-2.65 (m, 5H), 2.63-2.57 (m, 2H), 2.39-2.32 (m, 5H), 2.26-2.11 (m, 3H), 2.08-1.95 (m, 5H), 1.80-1.70 (m, 6H), 1.61-1.49 (m, 10H), 1.40 (d, J= 6.40 Hz, 3H)。 實例 68 合成 ( R)-2- 甲基 - N-(1-(4-((1-( 哌啶 -4- 基甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 苯甲醯胺
Figure 02_image1128
步驟 -1
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有2-甲基苯甲酸( 1,510 mg,3.75 mmol)於無水DMF (10 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (2.42 g,18.73 mmol,3.26 mL)及HATU (2.14 g,5.62 mmol),接著添加( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙-1-胺鹽酸鹽( 2,985.93 mg,3.37 mmol)。將所得混合物在環境溫度下攪拌4小時。藉由UPLC監測反應進程。接著在減壓下濃縮反應混合物。所獲得之粗殘餘物用冰冷水(20 mL)稀釋,且將固體沈澱物過濾,用水(15 mL)洗滌,且在真空中乾燥,得到呈灰白色固體狀之( R)- N-(1-(4-溴萘-1-基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺( 3,1.3 g,3.06 mmol,82%產率)。LC-MS (ES +): m/z368.0 [M + H] +步驟 -2
向含有( R)- N-(1-(4-溴萘-1-基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺( 3,0.15 g,0.353 mmol)及4-乙炔基-1-(4-哌啶基甲基)哌啶鹽酸鹽( 4,74.28 mg,0.300 mmol)於無水ACN (3 mL)及THF (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL密封管中添加碳酸銫(115.13 mg,0.353 mmol),且將反應混合物用N 2脫氣5分鐘。隨後,添加XPhos-Pd-G3 (59.82 mg,0.070 mmol)及XPhos (33.69 mg,0.070 mmol)且在90℃下加熱所得混合物3小時。使反應混合物穿過矽藻土墊,且洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮合併之濾液且藉由逆相(C18管柱,移動相:10 mm NH 4HCO 3/水: MeCN)純化粗產物,得到呈黃色膠狀之( R)-2-甲基- N-(1-(4-((1-(哌啶-4-基甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)苯甲醯胺( 5,60 mg,0.110 mmol,31%產率)。LC-MS (ES +): m/z494.2 [M + H] +實例 69 合成 2- 甲基 - N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(3- 甲基 -1-(1- 甲基 -2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 ) 哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 苯甲醯胺 ( 化合物 30)
Figure 02_image1130
在環境溫度下向含有1-[3-甲基-1-(1-甲基-2,6-二側氧基-3-哌啶基)-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸鹽酸鹽 (2,30 mg,0.064 mmol)及( R)-2-甲基- N-(1-(4-((1-(哌啶-4-基甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)苯甲醯胺( 1,53.00 mg,0.097 mmol)於無水DMF (1 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加HATU (37.02 mg,0.097 mmol)及DIPEA (41.94 mg,0.324 mmol,0.056 mL)。在環境溫度下攪拌所得混合物3小時。經UPLC指示反應完成後,在減壓下自反應混合物移除過量溶劑且藉由逆相製備型HPLC (X-Select C18 (150 x 19) mm;5微米管柱;移動相:A:0.1%甲酸/MQ-水;B:乙腈;流動速率:15 mL/分鐘)純化所獲得之粗物質,得到呈灰白色固體狀之2-甲基- N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(3-甲基-1-(1-甲基-2,6-二側氧基哌啶-3-基)-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)苯甲醯胺甲酸酯(化合物 30,23 mg,0.024 mmol,38%產率)。LC-MS (ES +): m/z876.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ8.93 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 8.33-8.31 (m, 2H), 7.69-7.67 (m, 3H), 7.60 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 7.33 (d, J= 1.6 Hz, 2H), 7.26-7.23 (m, 2H), 6.95 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 6.84 (d, J= 2 Hz, 1H), 6.63 (dd, J= 8.8, 2 Hz, 1H), 5.93-5.89 (m, 1H), 5.39-5.34 (m, 1H), 4.42-4.38 (m, 1H), 4.03-3.98 (m, 1H), 3.64-3.61 (m, 3H), 3.32 (s, 3H), 3.21 (m, 2H), 3.03-2.99 (m, 6H), 2.98-2.95 (m, 1H), 2.80-2.67 (m, 4H), 2.50 (m, 4H), 2.29 (m,1H), 2.28 (s, 3H), 2.12-2.08 (m, 3H), 2.02-1.99 (m, 3H), 1.79-1.71 (m, 7H)及1.57 (d, J= 7.2 Hz, 3H)。 實例 70 合成 N -(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 ) 哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 31)
Figure 02_image1132
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸鹽酸鹽( 2,100 mg,0.222 mmol)於無水DMF (3 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (143.65 mg,1.11 mmol,0.19 mL)、HATU (126.78 mg,0.333 mmol)及( R)-2-甲基- N-(1-(4-((1-(哌啶-4-基甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)苯甲醯胺( 1,110 mg,0.201 mmol)。在此溫度下攪拌所得混合物1小時。藉由UPLC監測反應進程。反應完成後,在減壓下移除過量溶劑且藉由逆相管柱層析(RediSep-RF Gold C18管柱,移動相:10 mm HCOOH/水:MeCN)純化所獲得之粗物質,得到呈灰白色固體狀之 N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺甲酸酯( 化合物 31,77 mg,0.084 mmol,38%產率)。LC-MS (ES +): m/z862.3 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.08 (s, 1H), 8.93 (d , J= 7.6 Hz, 1H), 8.32-8.31 (m, 2H), 7.69-7.66 (m, 3H), 7.59 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 7.34-7.31 (m, 2H), 7.25-7.23 (m, 2H), 6.94 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 6.84 (d, J= 1.6 Hz, 1H), 6.64 (dd, J= 8.6, 2 Hz, 1H), 5.92-5.89 (m, 1H), 5.35-5.29 (m, 1H), 4.43-4.40 (m, 1H), 4.03-3.97 (m, 1H), 3.63-3.60 (m, 3H), 3.31 (s, 3H), 3.05-2.91 (m, 3H), 2.90-2.85 (m, 1H), 2.72-2.66 (m, 4H), 2.66-2.50 (m, 7H), 2.28 (s, 3H), 2.14-2.06 (m, 2H), 2.00-1.97 (m, 2H), 1.89-1.75 (m, 3H), 1.72-1.65 (m, 4H), 1.56 (d, J= 6.8 Hz, 3H)及1.12-0.83 (m, 2H)。 實例 71 合成 2- 甲基 - N-(( 1R)-1-(4-((1-(5-(4-(3- 甲基 -1-(1- 甲基 -2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -1- )-5- 側氧基戊基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 苯甲醯胺 ( 化合物 32)
Figure 02_image1134
Figure 02_image1136
步驟 -1
在環境溫度下向含有( R)- N-(1-(4-溴萘-1-基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺( 1,250 mg,0.583 mmol)於無水ACN (6 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL密封管中添加5-(4-乙炔基-1-哌啶基)戊酸乙酯( 2,307.91 mg,1.17 mmol)及碳酸銫(570.66 mg,1.75 mmol)。所得反應混合物用N 2脫氣5分鐘。隨後,在環境溫度下添加XPhos-Pd-G3 (24.70 mg,0.029 mmol)及XPhos (27.80 mg,0.058 mmol)。混合物用N 2再脫氣5分鐘且在90℃下攪拌4小時。經UPLC指示反應完成後,經由矽藻土墊過濾反應混合物,且用EtOAc (200 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮濾液且藉由急驟管柱(230-400目矽膠,50 g)用0-15% MeOH/DCM作為溶離劑來純化所得殘餘物,得到呈淡黃色膠狀之( R)-5-(4-((4-(1-(2-甲基苯甲醯胺基)乙基)萘-1-基)乙炔基)哌啶-1-基)戊酸乙酯( 3,200 mg,0.353 mmol,60%產率)。LC-MS (ES +): m/z525.2 [M + H] +步驟 -2
在環境溫度下向含有( R)-5-(4-((4-(1-(2-甲基苯甲醯胺基)乙基)萘-1-基)乙炔基)哌啶-1-基)戊酸乙酯( 3,200 mg,0.350 mmol)於MeOH (2 mL)、THF (2 mL)及水(1 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加單水合氫氧化鋰(147.15 mg,3.51 mmol),且攪拌所得混合物4小時。經TLC指示反應完成後,在減壓下移除反應混合物中之揮發物,且所獲得之殘餘物用水(50 mL)稀釋且用MTBE (100 mL)萃取。水相用10%檸檬酸溶液酸化至pH=4且用10% MeOH/DCM (2×150 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥且在真空中濃縮,得到呈淡黃色固體狀之( R)-5-(4-((4-(1-(2-甲基苯甲醯胺基)乙基)萘-1-基)乙炔基)哌啶-1-基)戊酸( 4,150 mg,0.300 mmol,86%產率)。UPLC-MS (ES +): m/z497.2 [M + H] +步驟 -3
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有( R)-5-(4-((4-(1-(2-甲基苯甲醯胺基)乙基)萘-1-基)乙炔基)哌啶-1-基)戊酸( 4,150 mg,0.295 mmol)及1-甲基-3-[3-甲基-2-側氧基-5-(4-哌啶基)苯并咪唑-1-基]哌啶-2,6-二酮鹽酸鹽( 5,117.46 mg,0.295 mmol)於無水DMF (5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (191.27 mg,1.48 mmol,0.258 mL)及HATU (168.82 mg,0.443  mmol)。在此溫度下攪拌所得混合物4小時。經UPLC指示反應完成後,自反應混合物移除溶劑且藉由逆相製備型HPLC (X-Select C18 (150 ×19) mm;5微米管柱,移動相:A:0.1%甲酸/MQ-水;B:乙腈;流動速率:15 mL/分鐘)純化所獲得之粗物質,得到呈灰白色固體狀之2-甲基- N-(( 1R)-1-(4-((1-(5-(4-(3-甲基-1-(1-甲基-2,6-二側氧基哌啶-3-基)-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-1-基)-5-側氧基戊基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)苯甲醯胺甲酸酯( 化合物 32,66 mg,0.072 mmol,24%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ8.93 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 8.33-8.30 (m, 2H), 7.69-7.61 (m, 3H), 7.60 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 7.35-7.31 (m, 2H), 7.31-7.23 (m, 2H), 7.10 (s, 1H), 7.03 (d, J= 8 Hz, 1H), 6.89 (d, J= 0.8 Hz, 1H), 5.91 (m, 1H), 5.43-5.42 (m, 1H),  4.63-4.50 (m, 1H), 4.13- 3.98 (m, 1H), 3.30-3.20 (m, 4H), 3.11-3.03 (m, 3H), 3.02 (s, 3H), 2.99-2.95 (m, 2H), 2.80-2.75 (m, 3H), 2.68-2.67 (m, 1H), 2.56-2.51 (m, 4H), 2.40 (m, 3H), 2.34 (s, 3H), 2.33 (m, 1H), 2.08-2.01 (m, 3H), 1.63-1.59 (m, 3H), 1.57-1.55 (m, 4H)及1.54 (d, J= 7.2 Hz, 3H)。LC-MS (ES +): m/z835.4 [M + H] +實例 72 合成 N -(( 1R)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -1- )-5- 側氧基戊基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 33)
Figure 02_image1138
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有( R)-5-(4-((4-(1-(2-甲基苯甲醯胺基)乙基)萘-1-基)乙炔基)哌啶-1-基)戊酸( 1,70 mg,0.124 mmol)於無水DMF (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (80.15 mg,0.620 mmol)、HATU (70.74 mg,0.186 mmol)、3-[3-甲基-2-側氧基-5-(4-哌啶基)苯并咪唑-1-基]哌啶-2,6-二酮( 2,(93.98 mg,0.248 mmol)。在此溫度下攪拌所得混合物1小時。經UPLC指示反應完成後,在減壓下移除過量溶劑,且藉由逆相管柱層析(C18管柱,移動相:10 mm NH 4HCO 3/水:MeCN)純化所獲得之粗物質,得到呈灰白色固體狀之 N-(( 1R)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-1-基)-5-側氧基戊基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺(化合物 33,55 mg,0.065 mmol,53%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.08 (s, 1H), 8.90 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 8.33-8.29 (m, 2H), 7.67-7.64 (m, 3H), 7.58 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 7.34-7.30 (m, 2H), 7.25-7.23 (m, 2H), 7.10 (d, J= 1.2 Hz, 1H), 7.02 (d, J= 8 Hz, 1H), 6.93-6.89 (m, 1H), 5.95-5.85 (m, 1H), 5.35-5.31 (m, 1H), 4.65-4.53 (m, 1H), 4.09-3.98 (m, 1H), 3.17-3.09 (m, 1H), 2.90-2.74 (m, 6H), 2.72-2.59 (m, 3H), 2.5 (m, 5H), 2.39-2.33 (m, 3H), 2.28 (s, 3H), 2.00-1.98 (m, 3H), 1.80-1.76 (m, 4H)及1.58-1.50 (m, 9H)。LC-MS (ES +): m/z821.4 [M + H] +實例 73 合成 5-[4-[2-[4-[1-[4-( 咪唑并 [1,5-a] 吡啶 -6- 基甲基胺甲醯基 )-1- 哌啶基 ] 乙基 ]-1- 萘基 ] 乙炔基 ]-1- 哌啶基 ] 戊酸
Figure 02_image1140
Figure 02_image1142
步驟 -1
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有N-Boc-胺基甲基三氟硼酸鉀( 2,1.5 g,7.61 mmol)及6-溴咪唑并[1,5-a]吡啶( 1,1.5 g,7.61 mmol)於1,4-二㗁烷(70 mL)及水(7 mL)中之充分攪拌溶液的250 mL密封管中添加碳酸銫(7.44 g,22.84 mmol)。所得混合物藉由使氮氣鼓泡至反應混合物中5分鐘而脫氣。隨後,添加Pd(OAc) 2(341.84 mg,1.52 mmol)及CataCXium (272.96 mg,0.761 mmol)且所得混合物用N 2再脫氣5分鐘且將反應混合物加熱至120℃後維持16小時。藉由UPLC監測反應進程。反應完成後,使反應混合物冷卻至環境溫度,用EtOAc (150 mL)稀釋且經由矽藻土墊過濾,且用EtOAc (350 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮濾液,得到粗殘餘物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用10% MeOH/DCM作為溶離劑來純化,得到呈棕色固體狀之 N-(咪唑并[1,5-a]吡啶-6-基甲基)胺基甲酸三級丁酯( 3,700 mg,2.73 mmol,36%產率)。LC-MS (ES +): m/z248.2 [M + H] +步驟 -2
在環境溫度下向含有 N-(咪唑并[1,5-a]吡啶-6-基甲基)胺基甲酸三級丁酯( 3,700 mg,2.72 mmol)於無水DCM (7 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加含4 N HCl之1,4-二㗁烷(54.35 mmol,2.48 mL)。將所得混合物在環境溫度下攪拌2小時。經UPLC指示反應完成後,自反應混合物移除溶劑。所獲得之粗物質與甲苯(15 mL)共蒸餾,得到呈灰白色固體狀之咪唑并[1,5-a]吡啶-6-基甲胺鹽酸鹽( 4,500 mg,2.55 mmol,94%產率)。LC-MS (ES +): m/z148.1 [M + H] +步驟 -3
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有1-[1-[4-[2-(1-三級丁氧羰基-4-哌啶基)乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲酸( 5,300 mg,0.599 mmol)於無水DMF (7 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (387.22 mg,3.00 mmol,0.52 mL)及HATU ((341.77 mg,0.898 mmol)。向燒瓶中添加( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙-1-胺鹽酸鹽( 4,248.97 mg,1.20 mmol)。將所得混合物在環境溫度下攪拌3小時。經UPLC確定反應完成後,在真空中蒸發反應混合物,得到粗殘餘物。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用5% MeOH/DCM作為溶離劑來純化粗殘餘物,得到呈棕色黏性固體狀之4-[2-[4-[1-[4-(咪唑并[1,5-a]吡啶-6-基甲基胺甲醯基)-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 6,300 mg,0.423 mmol,71%產率)。LC-MS (ES +): m/z620.4 [M + H] +步驟 -4
在0℃下向含有4-[2-[4-[1-[4-(咪唑并[1,5-a]吡啶-6-基甲基胺甲醯基)-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 6,300 mg,0.421 mmol)於DCM (7 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加含4 N HCl之1,4二㗁烷(8.42 mmol,2.11 mL)。在環境溫度下攪拌所得混合物2小時。經UPLC確認反應完成後,濃縮反應混合物,得到粗產物,其用MTBE (15 mL)濕磨,得到呈灰白色固體狀之 N-(咪唑并[1,5-a]吡啶-6-基甲基)-1-[1-[4-[2-(4-哌啶基)乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲醯胺鹽酸鹽( 7,220 mg,0.350 mmol,83%產率)。LC-MS (ES +): m/z520.2 [M + H] +步驟 -5
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有 N-(咪唑并[1,5-a]吡啶-6-基甲基)-1-[1-[4-[2-(4-哌啶基)乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲醯胺鹽酸鹽( 7,188.49 mg,1.86 mmol)於無水DMF (5 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL圓底燒瓶中添加三乙胺(188.49 mg,1.86 mmol,0.259 mL)及5-溴戊酸甲酯( 8,176.68 mg,0.745 mmol)。在70℃下攪拌所得混合物4小時。此後,將反應混合物倒入冰冷水(20 mL)中且用EtOAc (3×100 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且在減壓下濃縮濾液,得到呈黃色膠狀之5-[4-[2-[4-[1-[4-(咪唑并[1,5-a]吡啶-6-基甲基胺甲醯基)-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]-1-哌啶基]戊酸三級丁酯( 9,180 mg,0.247 mmol,66%產率)。LC-MS (ES +): m/z677.2 [M + H] +步驟 -6
在0℃下向含有5-[4-[2-[4-[1-[4-(咪唑并[1,5-a]吡啶-6-基甲基胺甲醯基)-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]-1-哌啶基]戊酸三級丁酯( 9,180 mg,0.239 mmol)於DCM (5 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加4 N HCl/1,4二㗁烷(4.79 mmol,0.218 mL)。在環境溫度下攪拌所得混合物2小時。經TLC指示反應完成後,真空濃縮反應混合物,且將所獲得之粗產物用MTBE(15 mL)濕磨,得到呈黃色固體狀之5-[4-[2-[4-[1-[4-(咪唑并[1,5-a]吡啶-6-基甲基胺甲醯基)-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]-1-哌啶基]戊酸鹽酸鹽( 10,150 mg,0.205 mmol,86%產率)。LC-MS (ES +): m/z621.2 [M + H] +實例 74 合成 1-(1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -1- )-5- 側氧基戊基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )- N-( 咪唑并 [1,5-a] 吡啶 -6- 基甲基 ) 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 34)
Figure 02_image1144
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有5-[4-[2-[4-[1-[4-(咪唑并[1,5-a]吡啶-6-基甲基胺甲醯基)-1-哌啶基]乙基]-1-萘基]乙炔基]-1-哌啶基]戊酸鹽酸鹽( 1,150 mg,0.203 mmol)於無水DMF (4 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (131.45 mg,1.02 mmol,0.177 mL)及HATU (116.02 mg,0.305 mmol),接著添加3-[3-甲基-2-側氧基-5-(4-哌啶基)苯并咪唑-1-基]哌啶-2,6-二酮鹽酸鹽( 2,77.85 mg,0.203 mmol)。將所得混合物在環境溫度下攪拌2小時。藉由UPLC監測反應進程。在減壓下移除過量溶劑,得到粗殘餘物。藉由逆相(Redisef-C18管柱,移動相A:10 mm NH 4HCO 3/水及B:乙腈)純化粗物質,得到呈灰白色固體狀之1-[1-[4-[2-[1-[5-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-5-側氧基-戊基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]- N-(咪唑并[1,5-a]吡啶-6-基甲基)哌啶-4-甲醯胺( 化合物 34,55 mg,0.056 mmol,28%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.09 (s, 1H), 8.49 (d, J= 8.8 Hz, 1H), 8.34 (s, 1H), 8.30-8.23 (m, 2H), 8.12 (d, J= 0.8 Hz, 1H), 7.61-7.55 (m, 3H), 7.52-7.48 (m, 2H), 7.30 (s, 1H), 7.10 (s, 1H), 7.02 (d, J= 8 Hz, 1H), 6.92 (dd, J= 8.4, 1.2 Hz, 1H), 6.64 (dd, J= 9.4, 1.6 Hz, 1H), 5.40-5.22 (m, 1H), 4.62-4.53 (m, 1H), 4.17-4.14 (m, 3H), 4.08-3.99 (m, 1H), 3.15-3.02 (m, 2H), 2.92-2.50 (m, 9H), 2.39-2.33 (m, 5H), 2.32-2.11 (m, 2H), 2.02-1.95 (m, 6H), 1.82-1.66 (m, 6H), 1.63-1.49 (m, 10H)及1.38 (d, J= 6.8 Hz, 3H)。LC-MS (ES +): m/z944.4 [M + H] +實例 75 合成 1-(1-(4-((1-(7-(4-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -1- )-7- 側氧基庚醯基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )- N-( 咪唑并 [1,5-a] 吡啶 -6- 基甲基 ) 哌啶 -4- 甲醯胺 ( 化合物 35)
Figure 02_image1146
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有7-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-7-側氧基-庚酸鹽酸鹽( 2,160 mg,0.276 mmol)於無水DMF (3 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (178.60 mg,1.38 mmol,0.24 mL)、HATU (157.64 mg,0.414 mmol)及 N-(咪唑并[1,5-a]吡啶-6-基甲基)-1-[1-[4-[2-(4-哌啶基)乙炔基]-1-萘基]乙基]哌啶-4-甲醯胺鹽酸鹽( 1,192.14 mg,0.276 mmol)。在此溫度下攪拌所得混合物2小時。經UPLC指示反應完成後,在減壓下移除過量溶劑,且藉由逆相管柱層析(Redisef-C18管柱,移動相A:10 mm HCOOH/水及B:乙腈)純化所獲得之殘餘物,得到呈灰白色固體狀之1-[1-[4-[2-[1-[7-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-7-側氧基-庚醯基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]- N-(咪唑并[1,5-a]吡啶-6-基甲基)哌啶-4-甲醯胺甲酸酯(化合物 35, 57 mg,0.054 mmol,20%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.10 (s, 1H), 8.46-8.42 (m, 2H), 8.34-8.27 (m, 2H), 8.14 (s, 1H), 7.90-7.45 (m, 5H), 7.31 (s, 1H), 7.11 (s, 1H), 7.01 (d, J= 8 Hz, 1H), 6.91 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 6.64 (d, J= 9.2 Hz, 1H), 5.38-5.31 (m, 1H), 4.61-4.55 (m, 1H), 4.19-4.13 (m, 3H), 4.02-3.91 (m, 3H), 3.81-3.73 (m, 2H), 3.31-3.20 (m, 2H), 3.15-3.01 (m, 4H), 2.95-2.71 (m, 5H), 2.65-2.50 (m, 2H), 2.37-2.33 (m, 3H), 2.03-1.88 (m, 6H), 1.85-1.50 (m, 15H)及1.37-1.29 (m, 4H)。LC-MS (ES +): m/z986.2 [M + H] +實例 76 合成 ( R)-(4- 甲基 -3-((1-(4-( 哌啶 -4- 基乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 胺甲醯基 ) 苯基 ) 胺基甲酸三級丁酯、 ( R)-(3-((1-(4-((1-((4- 羥基哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 胺甲醯基 )-4- 甲基苯基 ) 胺基甲酸三級丁酯及 ( R)-(4- 甲基 -3-((1-(4-((1-( 哌啶 -4- 基甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 胺甲醯基 ) 苯基 ) 胺基甲酸三級丁酯
Figure 02_image1148
Figure 02_image1150
步驟 -1
在環境溫度下向含有1-(4-溴-1-萘基)乙酮( 1,40 g,160.58 mmol)於無水THF (800 mL)中之充分攪拌溶液的2000 mL三頸圓底燒瓶中添加( S)-2-甲基丙烷-2-亞磺醯胺( 2,29.19 g,240.86 mmol)及乙醇鈦(109.89 g,481.7 mmol,101 mL)。在70℃下攪拌反應混合物16小時。經TLC指示反應完成後,用水(1200 mL)淬滅反應混合物。藉由穿過矽藻土墊濾出固體且用EtOAc (900 mL)洗滌矽藻土床。用EtOAc (3×1000 mL)萃取濾液且合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥,且在減壓下濃縮,得到粗殘餘物,其藉由管柱層析(60-120目矽膠)用20% EtOAc/石油醚作為溶離劑來行純化,得到呈淡黃色液體狀之( S, E)- N-(1-(4-溴萘-1-基)亞乙基)-2-甲基丙烷-2-亞磺醯胺( 3,33 g,88.3 mmol,55%產率)。LC-MS (ES +): m/z354.1 [M + H] +步驟 -2
在-78℃下在氮氣氛圍下向含有( S, E)- N-(1-(4-溴萘-1-基)亞乙基)-2-甲基丙烷-2-亞磺醯胺( 3,17 g,45.5 mmol)於無水THF (500 mL)中之充分攪拌溶液的3000 mL三頸圓底燒瓶中逐滴添加含1 M三-二級丁基硼氫化鋰(L-Selectride)之THF (136.49 mL)。將所得反應混合物在-78℃下攪拌5小時。經UPLC指示反應完成後,將反應混合物在0℃下用飽和氯化銨溶液(1000 mL)逐滴淬滅,接著用冰水(500 mL)淬滅,且在0℃下攪拌混合物0.5小時。接著用EtOAc (3×1000 mL)萃取水相,且合併之有機相經Na 2SO 4乾燥,且在減壓下濃縮。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用80-100% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化粗殘餘物,得到呈淡黃色液體狀之( S)- N-(( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙基)-2-甲基丙烷-2-亞磺醯胺( 4,12 g,29.1 mmol,64%產率)。LC-MS (ES +): m/z354.1 [M + H] +步驟 -3
在5℃下在氮氣氛圍下向含有( S)- N-(( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙基)-2-甲基丙烷-2-亞磺醯胺( 4,25.97 g,62.97 mmol)於無水DCM (20 mL)中之充分攪拌溶液的500 mL單頸圓底燒瓶中添加含4 M HCl之1,4-二㗁烷(236 mL)。在環境溫度下攪拌反應混合物10小時。經TLC指示反應完成後,在減壓下移除過量溶劑。所獲得之粗物質用MTBE (100 mL)洗滌,經由濾紙過濾且在45℃下在真空中濃縮濾液0.5小時,得到呈灰白色固體狀之( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙-1-胺鹽酸鹽( 5,15.5 g,53.1 mmol,84%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ8.76 (s, 3H), 8.23-8.29 (m, 2H), 8.02 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 7.70-7.71 (m, 3H), 5.32-5.34 (m, 1H)及1.61 (d, J= 6.8 Hz, 3H)。 步驟 -4
在0℃下向含有5-胺基-2-甲基-苯甲酸( 6,10 g,66.15 mmol)、1M NaOH溶液(1M, 66.15 mL)於1,4-二㗁烷(70 mL)及水(70 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL三頸圓底燒瓶中添加碳酸三級丁氧基羰基三級丁酯(15.16 g,69.46 mmol,15.94 mL)。將所得反應混合物在環境溫度下攪拌1小時。此後,在0℃下使用10%檸檬酸溶液將反應混合物酸化至pH約4。固體沈澱物經過濾,用水(50 mL)洗滌且在真空中乾燥,得到呈白色固體狀之5-(三級丁氧基羰基胺基)-2-甲基-苯甲酸( 7,10 g,38.76 mmol,59%產率)。LC-MS (ES -): m/z250.2 [M - H] -步驟 -5
在環境溫度下在氮氣氛圍下向5-(三級丁氧基羰基胺基)-2-甲基-苯甲酸( 7,4 g,15.50 mmol)於無水DMF (50 mL)中之攪拌溶液中添加HATU (7.07 g,18.61 mmol)及DIPEA (5.01 g,38.76 mmol,6.75 mL)。攪拌所得反應混合物5分鐘,接著添加( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙-1-胺鹽酸鹽( 5,3.62 g,12.4 mmol)。在環境溫度下攪拌反應混合物3小時。經TLC指示反應完成後,將反應混合物用水(100 mL)稀釋且用EtOAc (3×200 mL)萃取。合併之有機相用冷水(3×30 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮。藉由管柱層析(230-400目矽膠)純化粗物質,得到呈灰白色固體狀之( R)-(3-((1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基甲酸三級丁酯( 8,5.5 g,9.6 mmol,62%產率)。LC-MS (ES +): m/z427.0 [M - 異丁烯+ H] +步驟 -6
向含有( R)-(3-((1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基甲酸三級丁酯( 8,1.0 g,1.74 mmol)及4-乙炔基哌啶鹽酸鹽( 9,687.67 mg,4.34 mmol)於1:1無水乙腈/THF (20 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL密封管中添加碳酸銫(3.40 g,10.4 mmol),且將反應混合物用N 2脫氣5分鐘。隨後,添加XPhos (165.68 mg,0.347 mmol)及XPhos-Pd-G3 (294.17 mg,0.347 mmol),且將所得混合物用N 2脫氣5分鐘。在90℃下攪拌反應混合物4小時,同時藉由UPLC-MS監測反應進程。此後,反應混合物經由矽藻土墊過濾且用DCM洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮合併之濾液,得到粗殘餘物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,100 g)用0-20% MeOH/DCM作為溶離劑來純化,得到呈灰白色固體狀之( R)-(4-甲基-3-((1-(4-(哌啶-4-基乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基甲酸三級丁酯( 10,400 mg,0.742 mmol,43%產率)。LC-MS (ES +): m/z512.4 [M + H] +步驟 -7
向含有( R)-(3-((1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基甲酸三級丁酯( 8,1250 mg,0.382 mmol)及4-[(4-乙炔基-1-哌啶基)甲基]哌啶-4-醇鹽酸鹽( 11,198.20 mg,0.765 mmol)於無水乙腈(5 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL密封管中添加碳酸銫(748.16 mg,2.30 mmol),且將反應混合物用N 2脫氣10分鐘。隨後,添加XPhos (36.49 mg,0.076 mmol)及XPhos-Pd-G3 (32.39 mg,0.038 mmol),且所得混合物用N 2再脫氣5分鐘。接著在90℃下攪拌反應混合物5小時。藉由UPLC-MS監測反應進程。此後,經由矽藻土墊過濾反應混合物且用DCM 10% MeOH/DCM (200 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮濾液,得到粗物質,其藉由逆相管柱層析(管柱:RediSep C18 (100 g SNAP),移動相:A:0.1%甲酸/水,B:MeCN)純化。在減壓下濃縮具有所需產物之溶離份以移除乙腈且接著用10%碳酸氫鈉溶液(100 mL)、鹽水(50 mL)稀釋且用EtOAc (3×200 mL)萃取。有機相經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮,得到呈淡黃色固體狀之( R)-(3-((1-(4-((1-((4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基甲酸三級丁酯( 12,170 mg,0.226 mmol,70%產率)。UPLC-MS (ES +): m/z625.5 [M + H] +步驟 -8
向含有( R)-(3-((1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基甲酸三級丁酯( 8,350 mg,0.535 mmol)及4-乙炔基-1-(4-哌啶基甲基)哌啶鹽酸鹽 (13,332.14 mg,1.37 mmol)於無水乙腈(5 mL)及THF (2 mL)之混合物中之充分攪拌溶液的50 mL密封管中添加碳酸銫(436.43 mg,1.34 mmol),且將所得混合物藉由鼓泡N 2脫氣10分鐘。隨後,添加XPhos (25.54 mg,0.053 mmol)及XPhos-Pd-G3 (22.68 mg,0.026 mmol),且將所得混合物再用N 2脫氣5分鐘。在90℃下攪拌反應混合物3小時且藉由UPLC-MS監測反應物質之進程。反應完成後,使反應混合物冷卻至環境溫度,經由矽藻土墊過濾且用10% MeOH/DCM (200 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮濾液且藉由逆相管柱層析(管柱:RediSep C18 (100 g SNAP),移動相:A:0.1%甲酸/水及B:乙腈)純化粗產物。在減壓下濃縮具有所需產物之溶離份以移除乙腈且接著用10%碳酸氫鈉溶液(100 mL)、鹽水(50 mL)稀釋且用EtOAc (2×200 mL)萃取。有機相經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮,得到呈淡黃色固體狀之( R)-(4-甲基-3-((1-(4-((1-(哌啶-4-基甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基甲酸三級丁酯( 14,300 mg,0.379 mmol,70%產率)。LC-MS (ES +): m/z609.4 [M + H] +
使用在上文 實例 76中( R)-(4-甲基-3-((1-(4-(哌啶-4-基乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基甲酸三級丁酯之合成中所述的方法,用步驟-6中之對應炔中間物製備以下靶向配體( 實例 77-79)。
實例編號 步驟 -6 中之 炔中間物 TL 配體 MS
77
Figure 02_image1152
Figure 02_image1154
LC-MS (ES +): m/z627.8 [M + H] +
78
Figure 02_image1156
Figure 02_image1158
LC-MS (ES +): m/z634.4 [M + H] +
79
Figure 02_image1160
Figure 02_image1162
LC-MS (ES +): m/z627.6 [M + H] +
實例 79 合成 N -[4- 甲基 -3-[1-[4-[2-(4- 哌啶基 ) 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基胺甲醯基 ] 苯基 ] 胺基甲酸三級丁酯
Figure 02_image1164
步驟 -1
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有1-(4-溴-1-萘基)乙胺( 1,320mg,1.19 mmol)於無水DMF (3 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (461.29 mg,3.57 mmol,0.621 mL)及HATU (542.86 mg,1.43 mmol),接著添加5-(三級丁氧基羰基胺基)-2-甲基-苯甲酸( 2,456.15 mg,1.78 mmol)。在此溫度下攪拌所得混合物3小時。經UPLC確認反應完成後,在減壓下濃縮反應混合物,且藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠;50 g)用40%-50% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化所得粗物質,得到呈黃色固體狀之 N-[3-[1-(4-溴-1-萘基)乙基胺甲醯基]-4-甲基-苯基]胺基甲酸三級丁酯( 3,310 mg,0.493 mmol,42%產率)。LC-MS (ES +): m/z485.0 [M + H] +步驟 -2
在環境溫度下向含有 N-[3-[1-(4-溴-1-萘基)乙基胺甲醯基]-4-甲基-苯基]胺基甲酸三級丁酯( 3,290 mg,0.461 mmol)及4-乙炔基哌啶鹽酸鹽( 4,89.70 mg,0.554 mmol)於無水乙腈(4 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL密封管中添加碳酸銫(376.27 mg,1.15 mmol),且藉由鼓泡氮氣使所得混合物脫氣5分鐘。隨後,添加XPhos (22.02 mg,0.046 mmol)及XPhos-Pd-G3 (19.55 mg,0.023 mmol),且將所得混合物用氮氣再脫氣5分鐘。在90℃下攪拌反應混合物4小時。藉由UPLC監測反應進程。反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且用EtOAc (50 mL)洗滌矽藻土墊。在減壓下濃縮合併之濾液且藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠;50 g)用0-15% MeOH/DCM作為溶離劑來純化粗產物,得到呈黃色固體狀之 N-[4-甲基-3-[1-[4-[2-(4-哌啶基)乙炔基]-1-萘基]乙基胺甲醯基]苯基]胺基甲酸三級丁酯( 5,80 mg,0.128 mmol,28%產率)。LC-MS (ES +): m/z512.2 [M + H] +實例 80 合成 ( R)-5- 胺基 - N-(1-(4-((1-(6-(3-(2,4- 二側氧基四氫嘧啶 -1(2H)- )-1- 甲基 -1H- 吲唑 -7- ) 己基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 36)
Figure 02_image1166
步驟 -1
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有6-[3-(2,4-二側氧基六氫嘧啶-1-基)-1-甲基-吲唑-7-基]己醛( 2,150 mg,0.341 mmol)於DMSO (2.5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加( R)-(4-甲基-3-((1-(4-(哌啶-4-基乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基甲酸三級丁酯( 1,147.23 mg,0.273 mmol)、無水乙酸鈉(140.16 mg,1.71 mmol)、乙酸(205.21 mg,3.42 mmol,0.195 mL)及MP-CNBH 3(2 mmol/1 g) (300 mg,0.601 mmol)。在此溫度下攪拌所得混合物16小時。經LCMS指示反應完成後,反應混合物經過濾且用THF (20 mL)洗滌且在減壓下濃縮。藉由逆相管柱層析(移動相A:10 mm ABC/水及移動相B:乙腈)純化所獲得之殘餘物,得到呈淺棕色固體狀之( R)-(3-((1-(4-((1-(6-(3-(2,4-二側氧基四氫嘧啶-1(2H)-基)-1-甲基-1H-吲唑-7-基)己基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基甲酸三級丁酯( 3,80 mg,0.086 mmol,25%產率)。LC-MS (ES +): m/z838.4 [M + H] +步驟 -2
在0℃下在氮氣氛圍下向含有( R)-(3-((1-(4-((1-(6-(3-(2,4-二側氧基四氫嘧啶-1(2H)-基)-1-甲基-1H-吲唑-7-基)己基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基甲酸三級丁酯( 3,80 mg,0.086 mmol)於無水DCM (1 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加含4M HCl之1,4-二㗁烷(126.32 mg,3.46 mmol,0.157 mL),且將所得溶液在環境溫度下攪拌2小時。經LCMS指示反應完成後,在減壓下移除過量溶劑以得到殘餘物,其用MTBE濕磨以得到粗殘餘物。藉由逆相製備型HPLC [管柱:X SELECT C18 150×19 mm) 5μm;移動相A:10 mM甲酸/水及移動相B:乙腈]對粗物質進行純化,且將具有化合物之級分凍乾,得到呈米色固體狀之( R)-5-胺基- N-(1-(4-((1-(6-(3-(2,4-二側氧基四氫嘧啶-1(2H)-基)-1-甲基-1H-吲唑-7-基)己基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺甲酸酯( 化合物 36,66 mg,0.081 mmol,94%產率)。LC-MS (ES +): m/z738.3 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ10.54 (s, 1H), 8.76 (d, J = 8 Hz, 1H), 8.33-8.28 (m, 2H), 7.67-7.62 (m, 3H), 7.57 (d, J = 7.6 Hz, 1H), 7.47-7.44 (m, 1H), 7.16 (d, J = 6.4 Hz, 1H), 7.10-7.01 (m, 1H), 6.84 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 6.55-6.49 (m, 2H), 5.95-5.85 (m, 1H), 4.98 (brs, 2H), 4.19 (s, 3H), 3.88 (t, J = 6.8 Hz, 2H), 3.05 (t, J = 8 Hz, 2H), 2.84-2.70 (m, 4H), 2.35-2.26 (m, 3H), 2.24-2.15 (m, 2H), 2.08 (s, 3H), 2.00-1.90 (m, 1H), 1.75-1.65 (m, 4H), 1.54 (d, J = 6.8 Hz, 3H), 1.54 (d, J= 6.8 Hz, 3H)及1.49-1.35 (m, 4H)。 實例 81 合成 5- 胺基 - N-(( 1R)-1-(4-((1-(6-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -4- ) 己基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 37)
Figure 02_image1168
步驟 -1
向含有( R)-(4-甲基-3-((1-(4-(哌啶-4-基乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基甲酸三級丁酯( 1,0.14 g,0.212 mmol)及6-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-4-基]己醛( 2,190.18 mg,0.425 mmol)於無水DMSO (5 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加乙酸(153.38 mg,2.55 mmol,0.146 mL),且將反應混合物在環境溫度下攪拌1小時。隨後,添加MP-CNBH 3(0.3 g; 2.0 mmol/g),且將懸浮液在環境溫度下攪拌16小時。藉由TLC及UPLC監測反應進程。反應完成後,用普通濾紙過濾反應混合物,且在減壓下濃縮濾液。藉由逆相管柱層析(C18管柱,溶劑系統A:0.1%甲酸/水及B:MeCN)純化所獲得之粗物質,且將具有所需產物之級分凍乾,得到呈灰白色固體狀之(3-((( 1R)-1-(4-((1-(6-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-4-基)己基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基甲酸三級丁酯(3;0.035 g,0.031 mmol,15%產率)。LC-MS (ES +): m/z853.4 [M + H] +步驟 -2
在5℃下在氮氣氛圍下向含有(3-((( 1R)-1-(4-((1-(6-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-4-基)己基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基甲酸三級丁酯( 3,30 mg,0.027 mmol)於無水DCM (3 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(0.3 mL)。在環境溫度下攪拌反應混合物3小時。藉由TLC及LCMS監測反應進程。完成後,在減壓下濃縮反應混合物。藉由逆相管柱層析(0.1%甲酸/水:MeCN)來純化所獲得之粗產物,得到呈灰白色固體狀之5-胺基- N-(( 1R)-1-(4-((1-(6-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-4-基)己基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺甲酸酯( 化合物 37,6 mg,0.007 mmol,27%產率)。LC-MS (ES +): m/z753.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.09 (s, 1H), 8.76 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.75-8.28 (m, 2H), 7.67-7.62 (m, 3H), 7.57 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 6.97-6.93 (m, 2H), 6.89-6.84 (m, 2H), 6.55-6.50 (m, 2H), 5.88 (quin, J= 7.2 Hz, 1H), 5.39 (dd, J= 5.2,12.4 Hz, 1H), 4.98 (brs, 2H), 3.56 (s, 3H), 2.92-2.85 (m, 3H), 2.85-2.80 (m, 1H), 2.78-2.71 (m, 3H), 2.65-2.55 (m, 2H), 2.25-2.21 (m, 2H), 2.09 (s, 3H), 2.05-1.91 (m, 3H), 1.80-1.68 (m, 2H), 1.65-1.57 (m, 2H), 1.53 (d, J= 6.8 Hz, 3H), 1.50-1.39 (m, 4H), 1.37-1.35 (m, 3H)。 實例 82 5- 胺基 - N-(( 1R)-1-(4-((1-(5-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-2- 側氧基 -1,2- 二氫苯并 [cd] 吲哚 -5- ) 戊基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 38)
Figure 02_image1170
基本上遵循 化合物 36之合成,使用對應中間物製備 化合物 38
LC-MS (ES +): m/z760.3 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO -d 6 ): δ11.13 (s, 1H), 8.77 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.33-8.28 (m, 2H), 8.02 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.78 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 7.66-7.57 (m, 4H), 7.57-7.52 (m, 2H), 7.15 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 6.84 (d, J= 8 Hz, 1H), 6.60-6.40 (m, 2H), 5.95-5.75 (m, 1H), 5.44 (dd, J= 12.8,  Hz, 1H), 4.99 (brs, 2H), 3.18-3.16 (m, 3H), 3.19-2.90 (m, 1H), 2.90-2.70 (m, 4H), 2.20-2.01 (m, 5H), 2.00-1.89 (m, 3H), 1.89-1.62 (m, 5H), 1.65-1.49 (m, 6H)及1.50-1.30 (m, 2H)。 實例 83 5- 胺基 - N-(( 1R)-1-(4-((1-(6-(3-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-2- 側氧基 -2,3- 二氫苯并 [d] 㗁唑 -7- ) 己基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 39)
Figure 02_image1172
基本上遵循 化合物 36之合成,使用對應中間物製備 化合物 39
LC-MS (ES +): m/z740.2 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.26 (s, 1H), 8.76 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.32-8.28 (m, 2H), 7.68-7.63 (m, 3H), 7.57 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 7.16-7.12 (m, 2H), 7.03 (dd, J= 7.4, 0.8 Hz, 1H), 6.84 (d , J= 8 Hz, 1H), 6.54-6.50 (m, 2H), 5.90-5.86 (m, 1H), 5.38-5.33 (m, 1H), 5.19-4.62 (bs, 2H), 2.94-2.82 (m, 2H), 2.85-2.64 (m, 6H), 2.50-2.32 (m, 2H), 2.31-2.18 (m, 3H), 2.15 (s, 3H), 1.97-1.95 (m, 2H), 1.90-1.83 (m, 2H), 1.74-1.72 (m, 2H), 1.54 (d, J= 7.2 Hz, 3H), 1.47-1.44 (m, 2H)及1.35-1.24 (m, 4H)。 實例 84 合成 5- 胺基 - N-(1-(4-((1-(6-(4-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -1- )-6- 側氧基己醯基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 40)
Figure 02_image1174
步驟 -1
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有 N-[4-甲基-3-[1-[4-[2-(4-哌啶基)乙炔基]-1-萘基]乙基胺甲醯基]苯基]胺基甲酸三級丁酯( 1,80 mg,0.128 mmol)於無水DMF (1.5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (49.71 mg,0.384 mmol,0.067 mL))及HATU (58.50 mg,0.153 mmol),接著添加6-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-6-側氧基-己酸( 2,77.01 mg,0.153 mmol)。將所得混合物在環境溫度下攪拌1小時。藉由UPLC監測反應進程。在減壓下濃縮反應混合物,得到粗殘餘物,其藉由逆相HPLC (RediSep-RF Gold C18管柱,移動相A:10 mm甲酸/水,及B:乙腈)純化,得到呈灰白色固體狀之 N-[3-[1-[4-[2-[1-[6-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-6-側氧基-己醯基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基胺甲醯基]-4-甲基-苯基]胺基甲酸三級丁酯甲酸酯( 3,45 mg,0.041 mmol,32%產率)。LC-MS (ES +): m/z964.2 [M + H] +步驟 -2
在0℃下向含有 N-[3-[1-[4-[2-[1-[6-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-6-側氧基-己醯基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基胺甲醯基]-4-甲基-苯基]胺基甲酸三級丁酯甲酸酯( 3,45 mg,0.041 mmol)於無水DCM (1 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(22.99 mmol,5.75 mL),且將所得混合物在環境溫度下攪拌1小時。藉由UPLC監測反應進程。反應完成後,在減壓下移除過量溶劑,得到粗產物,其藉由逆相HPLC (RediSep-RF Gold C18管柱,移動相A:10 mm NH 4HCO 3/水,B:乙腈)純化,得到呈灰白色固體狀之5-胺基- N-[1-[4-[2-[1-[6-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-6-側氧基-己醯基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]-2-甲基-苯甲醯胺( 化合物 40,16.2 mg,0.018 mmol,45%產率)。LC-MS (ES +): m/z864.3 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.10 (s, 1H), 8.76 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.32-8.29 (m, 2H), 7.68-7.63 (m, 3H), 7.57 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.11 (s, 1H), 7.01 (d, J= 8 Hz, 1H), 6.91 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 6.84 (d, J= 8 Hz, 1H), 6.55-6.50 (m, 2H), 5.90-5.86 (m, 1H), 5.36-5.32 (m, 1H), 4.98 (s, 2H), 4.61-4.55 (m, 1H), 4.06-3.92 (m, 2H), 3.82-3.74 (m, 1H), 3.33 (s, 3H), 3.30-3.29 (m, 1H), 3.10-3.07 (m, 2H), 2.92-2.60 (m, 5H), 2.42-2.32 (m, 3H), 2.10 (s, 3H), 2.03-1.89 (m, 3H), 1.85-1.53 (m, 15H)。 實例 85 合成 5- 胺基 - N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(3-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-1- 甲基 -1H- 吲唑 -6- ) 哌啶 -4- 羰基 )-4- 羥基哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 41)
Figure 02_image1176
步驟 -1
在環境溫度下向含有1-[3-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-1-甲基-吲唑-6-基]哌啶-4-甲酸鹽酸鹽( 2,72.60 mg,0.155 mmol)於無水DMF (1.5 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加HATU (88.54 mg,0.232 mmol)、DIPEA (100.32 mg,0.776 mmol,0.135 mL)及( R)-(3-((1-(4-((1-((4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基甲酸三級丁酯( 1,100 mg,0.155 mmol)。在此溫度下攪拌反應混合物2小時。經UPLC指示反應完成後,將反應混合物用水(50 mL)稀釋, EtOAc (3×100 mL) 萃取。合併之有機相經無水 Na 2SO 4 乾燥且在減壓下濃縮。藉由逆相管柱層析 ( 10 mM 碳酸氫銨溶液 / 乙腈 ) 純化所獲得之粗殘餘物,得到呈灰白色固體狀之 (3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(3-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-1- 甲基 -1H- 吲唑 -6- ) 哌啶 -4- 羰基 )-4- 羥基哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 胺甲醯基 )-4- 甲基苯基 ) 胺基甲酸 三級丁 (3 60 mg 0.057 mmol 37% 產率 ) LC-MS (ES +): m/z977.3 [M + H] +步驟 -2
在0℃下向含有(3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(3-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1-甲基-1H-吲唑-6-基)哌啶-4-羰基)-4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基甲酸三級丁酯( 3,60 mg,0.057 mmol)於無水DCM (1 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加含4N HCl之1,4二㗁烷(0.142 mL)。將所得反應混合物在環境溫度下攪拌1小時。反應完成後,在減壓下濃縮反應混合物,得到粗產物,其用MTBE (2 mL)洗滌,且在真空中乾燥。藉由逆相管柱層析(X Select C18 (150×19 mm) 5微米,移動相0.1%甲酸/水:乙腈)純化粗固體,得到呈白色固體狀之5-胺基- N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(3-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1-甲基-1H-吲唑-6-基)哌啶-4-羰基)-4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺甲酸酯( 化合物 41,27 mg,0.028 mmol,50%產率)。LC-MS (ES +): m/z877.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ10.86 (s, 1H), 8.77 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.34-8.29 (m, 2H), 7.68-7.63 (m, 3H), 7.57 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 7.49 (d, J= 8.8 Hz, 1H), 6.91 (dd, J= 9, 1.2 Hz, 1H), 6.85-6.84 (m, 2H), 6.55-6.50 (m, 2H), 5.93-5.81 (m, 1H), 4.99 (br s, 2H), 4.27-4.24 (m, 2H), 4.11-4.01 (m, 1H), 3.89 (s, 3H), 3.86-3.70 (m, 3H), 3.10-2.70 (m, 7H), 2.65-2.55 (m, 2H), 2.41-2.23 (m, 4H), 2.21-2.11 (m, 2H), 2.10-2.02 (m, 1H), 2.08 (s, 3H), 2.00-1.90 (m, 2H), 1.85-1.68 (m, 6H), 1.54 (d, J= 6.8 Hz, 3H), 1.52 (m, 2H)及1.43-1.33 (m, 2H)。 實例 86 合成 5- 胺基 - N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 乙基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 )-4- 羥基哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 42)
Figure 02_image1178
步驟 -1
向含有( R)-(3-((1-(4-((1-((4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基甲酸三級丁酯( 1,85 mg,0.11 mmol)及1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-乙基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸鹽酸鹽( 2,51.94 mg,0.110 mmol)於無水DMF (2 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加HATU (63.06 mg,0.165 mmol)及DIPEA (71.45 mg,0.552 mmol,0.096 mL),且將反應混合物在環境溫度下攪拌2小時。反應完成後,用冰水淬滅反應混合物。固體沈澱物經過濾,用水洗滌且在真空中乾燥,得到呈棕色固體狀之(3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-乙基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)-4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基甲酸三級丁酯( 3,100 mg,0.058 mmol,53%產率)。LC-MS (ES +): m/z1008.4 [M + H] +步驟 -2
在-78℃下向含有(3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-乙基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)-4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基甲酸三級丁酯( 3,100 mg,0.058 mmol)於無水DCM (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(0.147 mL)。在環境溫度下攪拌所得混合物2小時且藉由UPLC監測。反應完成後,自反應混合物移除過量溶劑且藉由逆相製備型HPLC (XBridge C18 (150×19 mm),5微米,0.1% ABC/水:MeCN)純化粗產物,得到呈灰白色固體狀之5-胺基- N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-乙基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)-4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺( 化合物 42,19 mg,0.020 mmol,35%產率)。LC-MS (ES +): m/z908.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.06 (s, 1H), 8.76 (d, J = 8 Hz, 1H), 8.34-8.28 (m, 2H), 7.68-7.63 (m, 3H), 7.57 (d, J = 7.6 Hz, 1H), 6.93 (d, J = 8.8 Hz, 1H), 6.88-6.83 (m, 2H), 6.63 (dd, J = 8.8, 2 Hz, 1H), 6.55-6.50 (m, 2H), 5.95-5.85 (m, 1H), 5.40-5.25 (m, 1H), 4.98 (bs, 2H), 4.56 (m, 1H), 4.25 (s, 1H), 4.10-4.01 (m, 1H), 3.86-3.85 (m, 2H), 3.79-3.69 (m, 1H), 3.63-3.60 (m, 2H), 3.51-3.49 (m, 2H), 3.43-3.41 (m, 2H), 3.00-2.80 (m, 4H), 2.79-2.60 (m, 4H), 2.46 (m, 2H), 2.34-2.33 (m, 1H), 2.30 (s, 2H), 2.09 (m, 3H), 2.01-1.90 (m, 3H), 1.76-1.71 (m, 6H), 1.54 (d, J = 6.8 Hz, 3H), 1.52 (m, 2H)及1.24-1.18 (m, 3H)。 實例 87 合成 5- 胺基 - N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 )-4- 羥基哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 43)
Figure 02_image1180
步驟 -1
向含有( R)-(3-((1-(4-((1-((4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基甲酸三級丁酯( 1,170 mg,0.269 mmol)及1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸鹽酸鹽( 2,121.17 mg,0.269 mmol)於無水DMF (4 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加HATU (153.63 mg,0.404 mmol)及DIPEA (174.07 mg,1.35 mmol,0.235 mL),且在環境溫度下攪拌所得混合物2小時。在反應完成後,在減壓下蒸發過量溶劑且添加冰冷水(50 mL)。固體沈澱物經過濾,用水(5 mL)洗滌且在真空中乾燥,得到呈灰白色固體狀之(3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)-4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基甲酸三級丁酯( 3,130 mg,0.118 mmol,44%產率)。LC-MS (ES +): m/z994.5 [M + H] +步驟 -2
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有(3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)-4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基甲酸三級丁酯( 3,130 mg,0.117 mmol)於無水DCM (3 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(0.294 mL)。在此溫度下攪拌所得混合物2小時。在反應完成後,移除溶劑且藉由逆相製備型HPLC (X-Select C18 (150×19)mm) 5微米管柱;移動相:A:0.1%甲酸/MQ-水;B:乙腈;流動速率:15 mL/分鐘)純化粗產物,得到呈灰白色固體狀之5-胺基- N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)-4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺甲酸酯( 化合物 43,45 mg,0.0 47 mmol,40%產率)。LC-MS (ES +): m/z894.2 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.07 (s, 1H), 8.76 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.29-8.32 (m, 2H), 7.68-7.63 (m, 3H), 7.57 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 6.93 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 6.85 (d, J= 8 Hz, 2H), 6.65-6.62 (m, 1H), 6.55-6.52 (m, 2H), 5.89-5.86 (m, 1H), 5.29-5.26 (m, 1H), 5.01-4.98 (bs, 2H),  4.08-4.05 (m, 1H), 3.75-3.72 (m, 2H), 3.63-3.60 (m, 3H), 3.30 (s, 3H), 2.98-2.86 (m, 5H), 2.80-2.60 (m, 7H), 2.45 (m, 2H), 2.38 (m, 2H), 2.08 (s, 3H), 2.00-1.95 (m, 3H), 1.79-1.71 (m, 6H), 1.54 (d, J= 7.2 Hz, 3H)及1.50-1.40 (m, 2H)。 實例 88 合成 5- 胺基 - N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 ) 哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 44)
Figure 02_image1182
步驟 -1
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸( 2,150 mg,0.349 mmol)於無水DMF (5 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加HATU (159.41 mg,0.441 mmol)、DIPEA (112.89 mg,0.873 mmol,0.152 mL)及( R)-(4-甲基-3-((1-(4-((1-(哌啶-4-基甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基甲酸三級丁酯( 1,276.24 mg,0.349 mmol)。在此溫度下攪拌所得混合物3小時。經UPLC指示反應完成後,在減壓下蒸發過量溶劑,且向燒瓶中添加冰冷水。固體沈澱物經過濾,用水(10 mL)洗滌且真空乾燥,得到呈棕色固體狀之(3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基甲酸三級丁酯( 3,250 mg,0.130 mmol,37%產率)。LC-MS (ES +): m/z978.6 [M + H] +步驟 -2
在0℃下向含有(3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基甲酸三級丁酯( 3,250 mg,0.130 mmol)於無水DCM (4 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加三氟乙酸(29.75 mg,0.260 mmol,0.020 mL)。將所得混合物在環境溫度下攪拌1小時。經TLC指示反應完成後,在減壓下自反應混合物移除過量溶劑,得到粗物質。藉由逆相製備型HPLC (X-Select C18 (150×19) mm) 5微米管柱,移動相:A:0.1%甲酸/MQ-水;B:乙腈;流動速率:15 mL/分鐘)純化此反應粗物質,得到呈白色固體狀之5-胺基- N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺甲酸酯( 化合物 44,45 mg,0.047 mmol,36%產率)。LC-MS (ES +): m/z877.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.10 (s, 1H), 9.34-9.26 (bs, 2H), 8.89 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 8.34-8.29 (m, 2H), 7.77-7.67 (m, 3H), 7.61-7.58 (m, 1H), 7.25-6.99 (m, 3H), 6.89-6.80 (m, 3H), 5.92-5.89 (m, 1H), 5.42-5.28 (m, 1H), 4.48-4.36 (m, 1H), 4.08-3.96 (m, 2H), 3.84-3.62 (m, 2H), 3.39-3.35 (m, 4H), 3.18-3.12 (m, 7H), 2.96-2.86 (m, 3H), 2.68-2.57 (m, 2H), 2.34-2.28 (m, 1H), 2.15-2.05 (m, 9H), 2.02-1.83 (m, 6H), 1.55 (d, J= 6.8 Hz, 3H)及1.38-1.00 (m, 2H)。 實例 89 5- 胺基 - N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 乙基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 )-4- 氟哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 45)
Figure 02_image1184
基本上遵循 化合物 41之合成,使用對應中間物製備 化合物 45
LC-MS (ES +): m/z909.0 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.07 (s, 1H), 8.77 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.34-8.29 (m, 2H), 7.58-7.63 (m, 4H), 6.95-6.83 (m, 3H), 6.65-6.62 (m, 1H), 6.55-6.50 (m, 2H), 5.90-5.86 (m, 1H), 5.30-5.26 (m, 1H), 4.99 (s, 2H), 4.25-4.10 (m, 1H), 3.87-3.83 (m, 3H), 3.63-3.60 (m, 2H), 2.93-2.51 (m, 10H), 2.39 (m, 3H), 2.08 (s, 3H), 2.01-1.95 (m, 4H), 1.75-1.73 (m, 10H), 1.54 (d, J= 6.8 Hz, 3H)及1.24-1.19 (m, 4H)。 實例 90 5- 胺基 - N-(( 1R)-1-(4-((1-((4- 氰基 -1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 ) 哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 46)
Figure 02_image1186
基本上遵循 化合物 41之合成,使用對應中間物製備 化合物 46
LC-MS (ES +): m/z903.2 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.01 (bs,1H), 8.76 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.34-8.28 (m, 2H), 7.69-7.64 (m, 3H), 7.57 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 6.94 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 6.86-6.84 (m, 2H), 6.64 (d, J= 2 Hz, 1H), 6.53-6.50 (m, 2H), 5.88 (m, 1H), 5.30-5.27 (m, 1H), 4.98 (brs, 2H), 4.52-4.48 (m, 1H), 4.10-3.98 (m, 1H), 3.62 (d, J= 12 Hz, 2H), 3.33 (s, 3H), 3.31-3.10 (m, 1H), 2.93-2.50 (m, 13H), 2.08 (s, 3H), 2.01-1.95 (m, 6H), 1.77-1.73 (m, 6H), 1.55 (d, J= 6.8 Hz, 3H)及1.50-1.25 (m, 2H)。 實例 91 5- 胺基 - N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(3-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-2- 側氧基 -2,3- 二氫苯并 [d] 㗁唑 -6- ) 哌啶 -4- 羰基 )-4- 氟哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 47)
Figure 02_image1188
基本上遵循 化合物 41之合成,使用對應中間物製備 化合物 47
LC-MS (ES +): m/z882.3 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.19 (s, 1H), 9.41 (bs, 2H), 8.82 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 8.34-8.31 (m, 2H), 7.69-7.66 (m, 3H), 7.59 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.10-7.08 (m, 2H), 6.91 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 6.80 (dd, J=  8.8, 2 Hz, 1H), 6.64-6.61 (m, 2H), 5.89 (m, 1H), 5.30 (dd, J= 5.2, 13.2 Hz, 1H), 4.30-4.25 (m, 1H), 3.97-3.94 (m, 1H), 3.66-3.63 (m, 2H), 3.33-3.16 (m, 4H), 3.25 -3.00 (m, 2H), 2.94-2.90 (m, 3H), 2.83-2.72 (m, 3H), 2.69-2.63 (m, 2H), 2.34-2.23 (m, 2H), 2.16-2.03 (m, 8H), 1.85-1.62 (m, 7H)及1.55 (d, J= 6.8 Hz, 3H)。 實例 92 5- 胺基 - N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 )-4- 氟哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 48)
Figure 02_image1190
基本上遵循 化合物 41之合成,使用對應中間物製備 化合物 48
LC-MS (ES +): m/z895.3 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.06 (s, 1H), 8.77 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 8.32-8.31 (m, 2H), 7.68-7.66 (m, 3H), 7.57 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 6.94 (d, J= 8.8 Hz, 1H), 6.85 (d, J= 7.6 Hz, 2H), 6.65 (d, J= 8 Hz, 1H), 6.57-6.52 (m, 2H), 5.88 (m, 1H), 5.32-5.28 (m, 1H), 5.07 (bs, 2H), 4.26-4.20 (m, 2H), 4.18-3.87 (m, 2H), 3.65-3.61 (m, 4H), 3.31 (s, 3H), 2.98-2.52 (m, 9H), 2.49-2.39 (m, 4H), 2.08 (s, 3H), 2.00-1.97 (m, 4H), 1.78-1.62 (m, 7H)及1.54 (d, J= 6.8 Hz, 3H)。 實例 93 5- 胺基 - N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(3-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-2- 側氧基 -2,3- 二氫苯并 [d] 㗁唑 -6- ) 哌啶 -4- 羰基 )-4- 羥基哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 49)
Figure 02_image1192
基本上遵循 化合物 41之合成,使用對應中間物製備 化合物 49
LC-MS (ES +): m/z880.3 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.19 (s, 1H), 8.77 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.34-8.28 (m, 2H), 7.68-7.63 (m, 3H), 7.57 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.09-7.06 (m, 2H), 6.84 (d, J= 8 Hz, 1H), 6.78 (dd, J= 8.8, 2 Hz, 1H), 6.55-6.50 (m, 2H), 5.88 (m, 1H), 5.30 (dd, J= 13, 5.6 Hz, 1H), 4.98 (brs, 2H), 4.32-4.15 (m, 1H), 4.09-4.01 (m, 1H), 3.71-3.62 (m, 3H), 2.97-2.85 (m, 3H), 2.77-2.66 (m, 6H), 2.50-2.42 (m, 4H), 2.34-2.29 (m, 2H), 2.14-2.08 (m, 4H), 1.95-1.92 (m, 2H), 1.78-1.69 (m, 6H)及1.55-1.40 (m, 7H)。 實例 94 5- 胺基 - N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(4-((2,6- 二側氧基哌啶 -3- ) 氧基 ) 苯基 ) 哌啶 -4- 羰基 )-4- 氟哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 50)
Figure 02_image1194
基本上遵循 化合物 41之合成,使用對應中間物製備 化合物 50
LC-MS (ES +): m/z841.3 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ10.88 (s, 1H), 8.76 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.34-8.29 (m, 2H), 7.69-7.63 (m, 3H), 7.57 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 6.92-6.84 (m, 5H), 6.55-6.50 (m, 2H), 5.89-5.81 (m, 1H), 5.02-4.98 (m, 3H), 4.18-4.11 (m, 1H), 3.84-3.79 (m, 1H), 3.57-3.54 (m, 2H), 3.30 (m, 2H), 2.82-2.68 (m, 5H), 2.67-2.50 (m, 6H), 2.39-2.33 (m, 2H), 2.18-2.05 (m, 2H), 2.10-2.06 (s, 3H), 1.99-1.91 (m, 3H), 1.78-1.70 (m, 7H), 1.54 (d, J= 6.8 Hz, 3H)及1.50 (m, 1H)。 實例 95 ( R)-5- 胺基 - N-(1-(4-((1-((1-(1-(3-(2,4- 二側氧基四氫嘧啶 -1(2H)- )-1- 甲基 -1H- 吲唑 -6- ) 哌啶 -4- 羰基 )-4- 氟哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 51)
Figure 02_image1196
基本上遵循 化合物 41之合成,使用對應中間物製備 化合物 51
LC-MS (ES +): m/z880.3 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ10.51 (s, 1H), 8.76 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.38-8.28 (m, 2H), 7.70-7.61 (m, 3H), 7.57 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.45 (d, J= 9.2 Hz, 1H), 6.88-6.80 (m, 2H), 6.92 (dd, J= 9.2, 1.6 Hz, 1H), 6.89-6.80 (m, 2H), 5.88 (m, 1H), 4.98 (bs, 2H), 4.20-4.10 (m, 1H), 3.92-3.80 (m, 8H), 3.48-3.25 (m, 2H), 3.01-2.78 (m, 8H), 2.74 (t, J= 6.8 Hz, 2H), 2.60-2.57 (m, 1H), 2.50 (m, 2H), 2.46-2.35 (m, 2H), 2.09 (s, 3H), 2.01-1.88 (m, 3H), 1.80-1.67 (m, 6H)及1.54 (d, J= 7.2 Hz, 3H)。 實例 96 ( R)-5- 胺基 - N-(1-(4-((1-((1-(1-(3-(2,4- 二側氧基四氫嘧啶 -1(2H)- )-1- 甲基 -1H- 吲唑 -6- ) 哌啶 -4- 羰基 )-4- 羥基哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 52)
Figure 02_image1198
基本上遵循 化合物 41之合成,使用對應中間物製備 化合物 52
LC-MS (ES +): m/z879.2 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ10.59 (s, 1H), 8.76 (d, J= 10.8 Hz, 1H), 8.28 (m, 2H), 7.67-7.64 (m, 3H), 7.58-7.56 (m, 1H), 7.44 (d, J= 12 Hz, 1H), 6.93-6.83 (m, 3H), 6.55-6.49 (m, 2H), 5.91-5.86 (m, 1H), 4.97 (bs, 2H), 4.08-4.05 (m, 1H), 3.97-3.65 (m, 3H), 3.2.87-2.84 (m, 7H), 2.74-2.72 (m, 3H), 2.50 (m, 2H), 2.35-2.27 (m, 4H), 2.09 (m, 1H), 2.08 (s, 3H), 1.94 (m, 3H), 1.78-1.72 (m, 7H)及1.65-1.25 (m, 8H)。 實例 97 5- 胺基 -2- 甲基 - N-(( R)-1-(4-((1-((1-(1-(1- 甲基 -3-(( R)-3- 甲基 -2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-1H- 吲唑 -6- ) 哌啶 -4- 羰基 ) 哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 苯甲醯胺 ( 化合物 53)
Figure 02_image1200
基本上遵循 化合物 41之合成,使用對應中間物製備 化合物 53
LC-MS (ES +): m/z876.2 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ10.83 (s, 1H), 8.78 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.79-8.77 (m, 2H), 7.68-7.56 (m, 5H), 6.92 (d, J= 1.6 Hz, 1H), 6.86-6.83 (m, 2H), 6.49-6.48 (m, 2H), 5.89-5.85 (m, 1H), 5.10-4.91 (m, 2H), 4.41-4.38 (m, 1H), 4.03 (m, 1H), 3.92 (s, 3H), 3.87-3.80 (m, 2H), 3.40 (m, 3H), 3.07-3.04 (m, 1H), 2.84-2.67 (m, 6H), 2.50 (m, 2H), 2.45-2.40 (m, 2H), 2.39-2.33 (m, 2H), 2.14 (m, 1H), 2.12 (s, 3H), 2.10-2.01 (m, 2H), 1.99-1.98 (m, 4H), 1.81-1.76 (m, 4H), 1.61 (s, 3H), 1.54 (d, J= 5.2 Hz, 3H)及1.03-1.01 (m, 2H)。 實例 98 5- 胺基 - N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 ) 哌啶 -4- ) 甲基 )-4- 氟哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 54)
Figure 02_image1202
基本上遵循 化合物 44之合成,使用對應中間物製備 化合物 54
LC-MS (ES +): m/z895.2 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.08 (s, 1H), 9.25 (bs, 2H), 8.89 - 8.84 (m, 1H), 8.42 - 8.21 (m, 2H), 7.76 - 7.57 (m, 4H), 7.02 - 6.84 (m, 3H), 6.74 - 6.53 (m, 3H), 5.96 - 5.84 (m, 1H), 5.36 - 5.26 (m, 1H), 4.49 - 4.39 (m, 1H), 4.10 - 4.00 (m, 1H), 3.67 - 3.56 (m, 4H), 3.45 (m, 2H), 3.31 (s, 3H), 3.23 - 3.00 (m, 5H), 2.99-2.70 (m, 3H), 2.66 - 2.57 (m, 4H), 2.50 (m, 2H), 2.10 - 2.09 (s, 3H), 2.06 (m, 1H), 2.03 - 1.92 (m, 1H), 1.87 - 1.67 (m, 6H), 1.53 (d, J= 6.8 Hz, 3H)及1.14 - 1.05 (m, 2H)。 實例 99 合成 ( R)-3-((4- 甲基 -3-((1-(4-((1-( 哌啶 -4- 基甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 胺甲醯基 ) 苯基 ) 胺基 ) 氮雜環丁烷 -1- 羧酸三級丁酯、 ( R )-3-((3-((1-(4-((1-((4- 氟哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 胺甲醯基 )-4- 甲基苯基 ) 胺基 ) 氮雜環丁烷 -1- 羧酸三級丁酯、 ( R)-3-((4- 甲基 -3-((1-(4-( 哌啶 -4- 基乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 胺甲醯基 ) 苯基 ) 胺基 ) 氮雜環丁烷 -1- 羧酸三級丁酯及 3-((3-(((1R)-1-(4-((3- 氟哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 胺甲醯基 )-4- 甲基苯基 ) 胺基 ) 氮雜環丁烷 -1- 羧酸三級丁酯
Figure 02_image1204
Figure 02_image1206
步驟 -1
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有5-胺基-2-甲基-苯甲酸( 1,10 g,66.15 mmol)於MeOH (150 mL)中之充分攪拌溶液的500 mL單頸圓底燒瓶中添加3-側氧基氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 2,16.99 g,99.23 mmol)、無水乙酸鈉(16.28 g,198.46 mmol)及乙酸(1.99 g,33.08 mmol,1.89 mL)。在此溫度下在氮氣氛圍下攪拌反應混合物8小時,接著添加MP-氰基硼氫化物(26.46 g,52.92 mmol),且攪拌所得懸浮液12小時。經TLC及LCMS確認反應完成後,過濾反應混合物且在減壓下濃縮濾液。所得粗物質用水(100 mL)稀釋且用EtOAc (3×150 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮。藉由逆相HPLC[Redi Sep-RF C18管柱,30 g;CV26.4 mL-35 mL/分鐘]移動相:0.1%甲酸/水:MeCN]純化粗產物,得到呈灰白色固體狀之5-[(1-三級丁氧基羰基氮雜環丁烷-3-基)胺基]-2-甲基-苯甲酸( 3,8 g,24.94 mmol,38%產率)。LC-MS (ES +): m/z251.0 [M - 異丁烯+ H] +步驟 -2
在環境溫度下向含有5-[(1-三級丁氧基羰基氮雜環丁烷-3-基)胺基]-2-甲基-苯甲酸( 3,1.2 g,3.72 mmol)於無水DMF (10 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加HATU (2.12 g,5.58 mmol)、DIPEA (2.40 g,18.61 mmol,3.24 mL)及( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙-1-胺( 4,863.62 mg,3.35 mmol)。在此溫度下攪拌反應混合物4小時。經TLC指示反應完成後,將反應混合物用水(25 mL)稀釋且用EtOAc (3×100 mL)萃取。合併之有機相經乾燥(Na 2SO 4),過濾且在減壓下濃縮濾液,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用38% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化,得到呈黃色膠狀之( R)-3-((3-((1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 5,1.8 g,2.98 mmol,80%產率)。LC-MS (ES +): m/z482.3 [M - 異丁烯+ H] +步驟 -3
向含有( R)-3-((3-((1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 5,1 g,1.67 mmol)及4-乙炔基-1-(4-哌啶基甲基)哌啶鹽酸鹽( 6,819.78 mg,3.34 mmol)於無水ACN (20 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL密封管中添加碳酸銫(1.63 g,5.01 mmol),且將反應混合物用N 2脫氣5分鐘。隨後,添加XPhos-Pd-G3 (70.74 mg,0.0835 mmol)及XPhos (79.68 mg,0.167 mmol),且在90℃下加熱所得混合物3小時。使反應混合物穿過矽藻土墊,且用EtOAc (50 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮合併之濾液,得到粗殘餘物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用10% MeOH/DCM作為溶離劑來純化,得到呈黃色膠狀之( R)-3-((4-甲基-3-((1-(4-((1-(哌啶-4-基甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 7,650 mg,0.812 mmol,49%產率)。LC-MS (ES +): m/z664.4 [M + H] +步驟 -4
在環境溫度下向含有( R)-(3-((1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基甲酸三級丁酯( 5,300 mg,0.467 mmol)及4-乙炔基-1-[(4-氟-4-哌啶基)甲基]哌啶鹽酸鹽( 8,246.55 mg,0.935 mmol)於無水乙腈(5 mL)及THF (1 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL密封管中添加碳酸銫(381.20 mg,1.17 mmol)。將氮氣吹掃通過反應混合物10分鐘。隨後,添加XPhos (44.62 mg,0.093 mmol)及XPhos-Pd-G3 (79.23 mg,0.093 mmol)且在90℃下繼續攪拌3小時。藉由UPLC監測反應。反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且在減壓下濃縮濾液。所獲得之粗物質藉由逆相HPLC (RediSep-RF Gold C18管柱,移動相A:甲酸/水及B:乙腈)純化,得到呈棕色黏性固體狀之( R)-3-((3-((1-(4-((1-((4-氟哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 9,150 mg,0.153 mmol,33%產率)。LC-MS (ES +): m/z682.4 [M + H] +步驟 -5
向含有( R)-3-((3-((1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 5,300.00 mg,0.467 mmol)及4-乙炔基哌啶鹽酸鹽( 10,89.49 mg,0.608 mmol)於無水乙腈(20 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL密封管中添加碳酸銫(381.20 mg,1.17 mmol),且藉由吹掃氮氣將反應混合物脫氣5分鐘。隨後,添加XPhos-Pd-G3 (19.81 mg,0.023 mmol)及XPhos (22.31 mg,0.046 mmol),且在90℃下加熱所得混合物4小時。在反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊且用EtOAc (50 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮濾液,得到殘餘物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用10% MeOH/DCM作為溶離劑來純化,得到呈棕色膠質固體狀之( R)-3-((4-甲基-3-((1-(4-(哌啶-4-基乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 11,180 mg,0.303 mmol,65%產率)。LC-MS (ES +): m/z567.2 [M + H] +步驟 -6
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有( R)-3-((3-((1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 5,300 mg,0.506 mmol)及4-乙炔基-3-氟-哌啶鹽酸鹽( 12,117.22 mg,0.659 mmol)於無水乙腈(8 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL密封管中添加碳酸銫(412.97 mg,0.001 mmol)。所得混合物藉由使氮氣鼓泡至反應混合物中5分鐘而脫氣。隨後,添加XPhos-Pd-G3 (21.46 mg,0.025 mmol)及二環己基-[2-(2,4,6-三異丙基苯基)苯基]膦(24.17 mg,0.05 mmol)且藉由將氮氣鼓泡至反應混合物中5分鐘進一步使所得混合物脫氣。接著將反應混合物加熱至90℃後維持4小時,且藉由UPLC監測反應進程。反應完成後,使反應混合物冷卻至環境溫度,用EtOAc (20 mL)稀釋且經由矽藻土墊過濾,且用EtOAc (100 mL)洗滌矽藻土床。將水(20 mL)添加至濾液中且用EtOAc (2×150 mL)萃取水相。合併之有機層用鹽水(50 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用0-10% MeOH/DCM作為溶離劑來純化所獲得之粗物質,得到呈棕色固體狀之3-((3-((( 1R)-1-(4-((3-氟哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 13,250 mg,0.379 mmol,75%產率)。LC-MS (ES +): m/z585.2 [M + H] +
使用在上文 實例 99中( R)-3-((4-甲基-3-((1-(4-((1-(哌啶-4-基甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯之合成中所述的方法,用步驟-3中之對應炔中間物製備以下靶向配體( 實例 100-101)。
實例編號 步驟-3 中之 炔中間物 TL 配體 MS
100
Figure 02_image1208
Figure 02_image1210
LC-MS (ES +): m/z680.4 [M + H] +
101
Figure 02_image1212
Figure 02_image1214
LC-MS (ES +): m/z689.4 [M + H] +
實例 102 合成 3-[4- 甲基 -3-[1-[4-[2-[1-(4- 哌啶基甲基 )-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基胺甲醯基 ] 苯胺基 ] 氮雜環丁烷 -1- 羧酸三級丁酯
Figure 02_image1216
步驟 -1
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有1-(4-溴-1-萘基)乙酮( 1,5 g,20.07 mmol)於MeOH (150 mL)中之充分攪拌溶液的500 mL單頸圓底燒瓶中添加乙酸銨(15.47 g,200.72 mmol)及氰基硼氫化鈉(1.89 g,30.11 mmol)。在75℃下攪拌反應混合物7小時。藉由UPLC及TLC監測反應進程,且反應完成後,在0℃下使用三氟乙酸將反應混合物酸化至pH約2且在減壓下濃縮。將水(200 mL)添加至所獲得之殘餘物中且用EtOAc (3×150 mL)萃取水相。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥且真空濃縮,得到粗物質,其藉由管柱層析(230-400目矽膠)用15% MeOH/DCM作為溶離劑來純化,得到呈灰白色固體狀之1-(4-溴-1-萘基)乙胺( 2,4.2 g,16.44 mmol,83%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ8.57 (s, 2H), 8.28-8.30 (m, 2H), 8.04 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 7.76-7.78 (m, 2H), 7.64 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 5.32-5.33 (m, 1H)及1.61 (d, J= 6.8 Hz, 3H)。 步驟 -2
在環境溫度下在氮氣氛圍下向1-(4-溴-1-萘基)乙胺( 2,2 g,7.48 mmol)於無水DMF (20 mL)中之充分攪拌溶液中添加5-[(1-三級丁氧基羰基氮雜環丁烷-3-基)胺基]-2-甲基-苯甲酸( 3,3.09 g,8.98 mmol)、HATU (4.27 g,11.22 mmol)及DIPEA (2.90 g,22.44 mmol,3.91 mL)。將所得反應混合物在環境溫度下攪拌3小時。經UPLC指示反應完成後,在減壓下蒸發溶劑,且藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用40% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化粗產物,得到呈黃色固體狀之3-[3-[1-(4-溴-1-萘基)乙基胺甲醯基]-4-甲基-苯胺基]氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 4,1.5 g,1.83 mmol,24%產率)。LC-MS (ES +): m/z484.2 [M + H] +步驟 -3
在環境溫度下向含有3-[3-[1-(4-溴-1-萘基)乙基胺甲醯基]-4-甲基-苯胺基]氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 4,200 mg,0.241 mmol)於無水乙腈(5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL密封管中添加4-乙炔基-1-(4-哌啶基甲基)哌啶鹽酸鹽( 5,148.02 mg,0.603 mmol)及Cs 2CO 3(235.98 mg,0.724 mmol)。所得反應混合物藉由鼓泡氮氣脫氣5分鐘。隨後,在環境溫度下添加XPhos-Pd-G3 (10.22 mg,0.012 mmol)及XPhos (11.51 mg,0.024 mmol)。反應混合物用N 2再脫氣5分鐘,且接著在90℃下攪拌3小時。此後,將反應混合物冷卻至環境溫度且經由矽藻土墊過濾且用EtOAc (200 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下蒸發濾液,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用10% MeOH/DCM作為溶離劑來純化,得到呈淡黃色膠狀之3-[4-甲基-3-[1-[4-[2-[1-(4-哌啶基甲基)-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基胺甲醯基]苯胺基]氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 6,130 mg,0.189 mmol,79%產率)。LC-MS (ES +): m/z664.4 [M + H] +
使用上文 實例 102中所述之方法,用步驟-3中之對應炔中間物製備以下靶向配體( 實例 103)。
實例編號 步驟-3 中之 炔中間物 TL 配體 MS
103
Figure 02_image1218
Figure 02_image1220
LC-MS (ES +): m/z567.2 [M + H] +
實例 104 合成 ( S)-5-(4-((4-(1-(5-((1-( 三級丁氧基羰基 ) 氮雜環丁烷 -3- ) 胺基 )-2- 甲基苯甲醯胺基 ) 乙基 ) -1- ) 乙炔基 ) 哌啶 -1- ) 戊酸
Figure 02_image1222
Figure 02_image1224
步驟 -1
遵循以下方法對化合物1-(4-溴-1-萘基)乙酮( 1,2 g,7.63 mmol)進行分離以分離非對映異構體:YMC Cellulose-C,流動速率:4 mL/min,共溶劑:40%,共溶劑名稱:IPA,注射體積:2μL,溫度:35℃,出口壓力:100巴。在減壓下濃縮RT=2.59分鐘處之早期溶離峰,得到呈灰白色固體狀之( S)-1-(4-溴萘-1-基)乙-1-胺( 2,550 mg,2.09 mmol,27%產率)。[α] D 22.4= -36.4 (c, 0.5 g/100 mL)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ8.57 (s, 2H), 8.28-8.30 (m, 2H), 8.04 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 7.76-7.78 (m, 2H), 7.64 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 5.32-5.33 (m, 1H)及1.61 (d, J= 6.80 Hz, 3H)。注意:組態經任意指定。 步驟 -2
在環境溫度下在氮氣氛圍下向( S)-1-(4-溴萘-1-基)乙-1-胺( 2,650.00 mg,2.47 mmol)於無水DMF (10 mL)中之充分攪拌溶液中添加5-[(1-三級丁氧基羰基氮雜環丁烷-3-基)胺基]-2-甲基-苯甲酸( 3,1.03 g,2.96 mmol)、HATU (1.41 g,3.70 mmol)及DIPEA (1.60 g,12.34 mmol,2.15 mL)。在環境溫度下攪拌反應混合物3小時。經UPLC指示反應完成後,在減壓下移除過量溶劑。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用40% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化粗產物,得到呈黃色固體狀之( S)-3-((3-((1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 4,500 mg,0.846 mmol,34%產率)。LC-MS (ES +): m/z484.0 [M - 異丁烯+ H] +步驟 -3
在環境溫度下向含有( S)-3-((3-((1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 4,500.00 mg,0.844 mmol)於無水乙腈(10 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL密封管中添加5-(4-乙炔基哌啶-1-基)戊酸乙酯( 5,385.09 mg,1.69 mmol)及Cs 2CO 3(825.93 mg,2.53 mmol)。將所得反應混合物用N 2脫氣5分鐘,隨後在環境溫度下添加XPhos-Pd-G3 (35.76 mg,0.042 mmol)及XPhos (40.24 mg,0.084 mmol)。使混合物再脫氣5分鐘且密封試管。在90℃下攪拌反應混合物3小時。藉由UPLC/TLC監測反應進程。其後,將反應混合物冷卻至環境溫度且經由矽藻土墊過濾且用EtOAc (200 mL)洗滌矽藻土床。在真空中濃縮濾液且接著藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用10% MeOH/DCM作為溶離劑來純化,得到呈黃色固體狀之( S)-3-((3-((1-(4-((1-(5-乙氧基-5-側氧基戊基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 6,430 mg,0.564 mmol,67%產率)。LC-MS (ES +): m/z681.4 [M + H] +步驟 -4
在環境溫度下向含有( S)-3-((3-((1-(4-((1-(5-乙氧基-5-側氧基戊基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 6,430.00 mg,0.568 mmol)於1:1 THF/MeOH (8 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加含單水合氫氧化鋰(190.80 mg,4.55 mmol)之水(2 mL)。將所得混合物在此溫度下攪拌4小時。藉由UPLC監測反應進程。此後,反應混合物用水(25 mL)稀釋且用MTBE (20 mL)萃取。水相用10%檸檬酸溶液酸化至pH=4,且接著用10% MeOH/DCM (3×150 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮,得到呈黃色固體狀之( S)-5-(4-((4-(1-(5-((1-(三級丁氧基羰基)氮雜環丁烷-3-基)胺基)-2-甲基苯甲醯胺基)乙基)萘-1-基)乙炔基)哌啶-1-基)戊酸( 7,310 mg,0.444 mmol,78%產率)。LC-MS (ES +): m/z667.4 [M + H] +
使用上文 實例 104中所述之方法,用步驟-3中之對應溴化物中間物製備以下靶向配體( 實例 105-106)。
實例編號 步驟-3 中之 溴化物中間物 TL 結構 MS
105
Figure 02_image1226
Figure 02_image1228
LC-MS (ES +): m/z667.2 [M + H] +
106
Figure 02_image1230
Figure 02_image1232
LC-MS (ES +): m/z667.4 [M + H] +
實例 107 合成 ( R)-3-((3-((1-(4- 溴萘 -1- ) 乙基 ) 胺甲醯基 )-4- 甲基苯基 ) 胺甲醯基 ) 氮雜環丁烷 -1- 羧酸三級丁酯
Figure 02_image1234
步驟 -1
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有5-胺基-2-甲基-苯甲酸甲酯( 1,500 mg,3.03 mmol)及1-三級丁氧基羰基氮雜環丁烷-3-甲酸( 2,609.06 mg,3.03 mmol)於DMF (8 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (1.96 g,15.13 mmol,2.64 mL)及1-丙基膦酸酐溶液,50重量%於EtOAc中(3.85 g,6.05 mmol),且在環境溫度下攪拌所得混合物4小時。經UPLC指示反應完成後,將反應混合物用水(20 mL)稀釋且用EtOAc (3×150 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且在減壓下濃縮濾液,得到粗物質,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用35-40% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化,得到呈淡黃色固體狀之3-[(3-甲氧羰基-4-甲基-苯基)胺甲醯基]氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 3,600 mg,1.71 mmol,56%產率)。LC-MS (ES -): m/z347.0 [M - H] -步驟 -2
在環境溫度下向含有3-[(3-甲氧羰基-4-甲基-苯基)胺甲醯基]氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 3,600 mg,1.70 mmol)於1:1  THF/MeOH (4 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加含LiOH.H 2O (408.31 mg,17.05 mmol)之水(2 mL)。將所得混合物在環境溫度下攪拌16小時。經UPLC指示反應完成後,在減壓下自反應混合物移除過量溶劑,且將殘餘物溶解於檸檬酸水溶液(50 mL)中。水相用EtOAc (2×100 mL)萃取且合併之有機層經無水Na 2SO 4乾燥,且在減壓下濃縮,得到呈淡黃色固體狀之5-[(1-三級丁氧基羰基氮雜環丁烷-3-羰基)胺基]-2-甲基-苯甲酸( 4,500 mg,1.49 mmol,87%產率)。LC-MS (ES -): m/z333.2 [M - H] -步驟 -3
在環境溫度下向含有5-[(1-三級丁氧基羰基氮雜環丁烷-3-羰基)胺基]-2-甲基-苯甲酸( 4,350 mg,1.04 mmol)於無水DMF (5 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (401.79 mg,3.11 mmol)及HATU (591.04 mg,1.55 mmol),接著添加( 1R)-1-(4-溴-1-萘基)乙胺鹽酸鹽( 5,303.06 mg,1.04 mmol)。將所得混合物在環境溫度下攪拌3小時。經UPLC指示反應完成後,在真空下蒸發揮發物,得到粗殘餘物,將其用水(100 mL)稀釋且用EtOAc (2×200 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥,且在減壓下濃縮,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用50-60% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化,得到呈淡黃色固體狀之( R)-3-((3-((1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺甲醯基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 6,300 mg,0.459 mmol,44%產率)。LC-MS (ES +): m/z468.0 [M -CO 2 tBu + H] +實例 108 合成 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )-2- 甲基 - N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(3- 甲基 -1-(1- 甲基 -2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 ) 哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 苯甲醯胺 ( 化合物 55)
Figure 02_image1236
步驟 -1
在環境溫度下向含有( R)-3-((4-甲基-3-((1-(4-((1-(哌啶-4-基甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 1,120 mg,0.157 mmol)及1-[3-甲基-1-(1-甲基-2,6-二側氧基-3-哌啶基)-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸鹽酸鹽( 2,70.83 mg,0.157.26 mmol)於無水DMF (5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (203.24 mg,1.57 mmol,0.273 mL)及HATU (89.69 mg,0.235 mmol)。將反應混合物在環境溫度下攪拌2小時。經UPLC監測反應完成後,添加冰水,形成之固體經過濾且用水洗滌且在減壓下乾燥,得到呈淡黃色固體狀之3-((4-甲基-3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(3-甲基-1-(1-甲基-2,6-二側氧基哌啶-3-基)-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 3,150 mg,0.106 mmol,68%產率)。LC-MS (ES +): m/z1047.4 [M + H] +步驟 -2
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有3-((4-甲基-3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(3-甲基-1-(1-甲基-2,6-二側氧基哌啶-3-基)-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 3,150 mg,0.114 mmol)於無水DCM (5 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(0.573 mL)。將所得混合物在環境溫度下攪拌2小時。藉由UPLC-MS監測反應進程。在減壓下蒸發揮發物,得到粗產物,其藉由逆相管柱層析(管柱:X Select C18 (250×19) mm,5微米;移動相A:0.1%甲酸;B:MeCN)純化,得到呈灰白色固體狀之5-(氮雜環丁烷-3-基胺基)-2-甲基- N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(3-甲基-1-(1-甲基-2,6-二側氧基哌啶-3-基)-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)苯甲醯胺甲酸酯( 化合物 55,61 mg,0.058 mmol,51%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ8.83 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.34-8.23 (m, 2H), 7.69-7.64 (m, 3H), 7.57 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.08-6.93 (m, 2H), 6.84 (s, 1H), 6.62 (dd, J= 8.8, 2 Hz, 1H), 6.49-6.47 (m, 2H), 6.30 (d, J= 6.4 Hz, 1H), 5.90-5.87 (m, 1H), 5.36 (dd, J= 13, 5.2 Hz, 1H), 4.39-4.28 (m, 2H), 4.20-4.10 (m, 2H), 4.05-3.90 (m, 1H), 3.71-3.60 (m, 5H), 3.31 (s, 3H), 3.03 (s, 3H), 3.01 (m, 2H), 2.89-2.60 (m, 9H), 2.30-2.06 (m, 4H), 2.11 (s, 3H), 2.04-1.90 (m, 3H), 1.88-1.62 (m, 9H), 1.54 (d, J = 6.4 Hz, 3H)及1.10-0.85 (m, 2H). LC-MS (ES +): m/z947.0 [M + H] +實例 109 合成 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )- N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 )-4- 氟哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 56)
Figure 02_image1238
步驟 -1
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有( R)-3-((3-((1-(4-((1-((4-氟哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 1,150 mg,0.153 mmol)於無水DMF (3 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (139.73 mg,1.08 mmol,0.18 mL)及HATU (164.43 mg,0.432 mmol),接著添加1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸( 2,110 mg,0.216 mmol)。將所得混合物在環境溫度下攪拌2小時。藉由UPLC監測反應進程。在減壓下移除過量溶劑,得到粗殘餘物,且用冰冷水(20 mL)稀釋後者,且過濾沈澱出的固體。用水(10 mL)洗滌過濾器上之固體且在真空中乾燥,得到呈灰白色固體狀之3-((3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)-4-氟哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 3,230 mg,0.124 mmol,58%產率)。LC-MS (ES +): m/z1050.6 [M + H] +步驟 -2
在0℃下向含有3-((3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)-4-氟哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 3;230 mg,0.124 mmol)於無水DCM (4 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加三氟乙酸(71.16 mg,0.624 mmol,0.048 mL),且在環境溫度下攪拌所得混合物0.5小時。藉由UPLC監測反應進程。在減壓下移除過量溶劑,得到粗產物,其藉由逆相管柱層析(C18管柱,移動相:10 mm HCOOH/水:MeCN)純化,得到呈灰白色固體狀之5-(氮雜環丁烷-3-基胺基)- N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)-4-氟哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺甲酸酯(化合物 56,60 mg,0.058 mmol,47%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.08 (s, 1H), 8.84 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 8.38-8.29 (m, 2H), 7.73-7.67 (m, 3H), 7.58 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 7.00-6.95 (m, 2H), 6.86 (bs, 1H), 6.66 (bs, 1H), 6.50 (d, J= 6 Hz, 2H), 6.34 (bs, 1H), 5.92-5.87 (m, 1H), 5.33-5.29 (m, 1H), 4.35-4.25 (m, 4H), 3.81-3.74 (m, 2H), 3.65-3.62 (m, 5H), 3.53-3.41 (m, 2H), 3.32 (s, 3H), 3.20 (m, 2H), 2.93-2.73 (m, 7H), 2.50 (m, 3H), 2.33-2.12 (m, 2H), 2.11 (s, 3H), 2.10-1.98 (m, 5H), 1.71-1.63 (m, 6H)及1.56 (d, J= 7.2 Hz, 3H). LC-MS (ES +): m/z950.4 [M + H] +實例 110 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 ) -N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 )-4- 羥基哌啶 -4 ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺二 - 三氟乙酸酯 ( 化合物 57)
Figure 02_image1240
基本上遵循 化合物 55之合成,使用對應中間物製備 化合物 57
LC-MS (ES +): m/z948.2 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.15 (s, 1H), 8.85-8.75 (m, 2H), 8.33-8.29 (m, 2H), 7.59-7.69 (m, 4H), 7.00-6.97 (m, 3H), 6.50 (d, J= 6 Hz, 2H), 5.90-5.87 (m, 1H), 5.44-5.31 (m, 2H), 4.42-4.38 (m, 1H), 4.37-4.25 (m, 2H), 4.23-4.10 (m, 1H), 3.80-3.74 (m, 8H), 3.45-3.40 (m, 6H), 3.30-3.15 (m, 3H), 3.06-3.04 (m, 2H), 2.90-2.80 (m, 3H), 2.58-2.50 (3H), 2.34-2.23 (m, 3H), 2.11 (s, 3H), 2.09-2.06 (m, 2H), 2.03-1.90 (m, 1H), 1.87-1.65 (m, 5H)及1.56-1.55 (m, 5H)。 實例 111 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )- N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 ) 哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 58)
Figure 02_image1242
基本上遵循 化合物 56之合成,使用對應中間物製備 化合物 58
LC-MS (ES +): m/z932.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.10 (s, 1H), 8.85-8.84 (m, 2H), 8.31 (m, 2H), 7.72-7.53 (m, 4H), 7.17-7.10 (m, 2H), 7.00-6.97 (m, 2H), 6.55-6.47 (m, 2H), 5.90-5.87 (m, 1H), 5.36-5.33 (m, 1H), 4.40-4.38 (m, 2H), 4.36-4.35 (m, 2H), 4.01-3.90 (m, 1H), 3.83-3.80 (m, 3H), 3.73-3.60 (m, 4H), 3.46 (s, 3H), 3.35-3.11 (m, 8H), 2.94-2.92 (m, 2H), 2.68-2.65 (m, 3H), 2.36-2.32 (m, 1H), 2.20-2.10 (m, 8H), 1.90-1.80 (m, 6H), 1.56-1.55 (d, J= 7.2 Hz, 3H)及1.24 (m, 2H)。 實例 112 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )- N-(1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 ) 哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 59)
Figure 02_image1244
基本上遵循 化合物 56之合成,使用對應中間物製備 化合物 59
LC-MS (ES +): m/z932.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.12 (bs, 1H), 8.82 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.34-8.29 (m, 3H), 7.68-7.64 (m, 2H), 7.57 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 6.97-6.84 (m, 2H), 6.84 (m, 1H),  6.64 (m, 1H), 6.46 (m, 2H), 6.27 (d, J= 6.8 Hz, 1H), 5.90-5.87 (m, 1H), 5.29 (dd, J= 12.8, 5.6 Hz, 1H), 4.45-4.35 (m, 1H), 4.33-4.25 (m, 1H), 4.20-4.11 (m, 1H), 4.05-3.95 (m, 2H), 3.62-3.58 (m, 4H), 3.50 (m, 2H), 3.31 (s, 3H), 3.05-2.90 (m, 2H), 2.85-2.65 (m, 4H), 2.65-2.50 (m, 4H), 2.30-2.13 (m, 5H), 2.11 (s, 3H), 2.05-1.90 (m, 3H), 1.88-1.62 (m, 8H), 1.55 (d, J= 6.8 Hz, 3H)及1.10-0.82 (m, 2H)。 實例 113 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )- N-(( 1R)-1-(4-((1-((4- 氰基 -1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 ) 哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 60)
Figure 02_image1246
基本上遵循 化合物 55之合成,使用對應中間物製備 化合物 60
LC-MS (ES +): m/z957.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.17 (s, 1H), 8.82 (d, J = 8 Hz, 1H), 8.33-8.27 (m, 1H), 7.69-7.64 (m, 4H), 7.56 (d, J = 7.6 Hz, 1H), 6.95 (d, J = 1.6 Hz, 2H), 6.83 (s, 1H), 6.63 (d, J = 2 Hz, 1H), 6.46-6.44 (m, 2H), 6.15 (d, J = 6.8 Hz, 1H), 5.89-5.85 (m, 1H), 5.30-5.25 (m, 1H), 4.43 (m, 1H), 4.23-4.22 (m, 1H), 4.20-4.07 (m, 1H), 3.90-3.86 (m, 2H), 3.30 (s, 3H), 3.18-3.12 (m, 2H), 2.69-2.60 (m, 12H), 2.10 (s, 3H), 1.97-1.88 (m, 7H), 1.76-1.72 (m, 7H), 1.76-1.72 (m, 6H)及1.39-1.35 (m, 2H)。 實例 114 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )-2- 甲基 - N-(( R)-1-(4-((1-((1-(1-(1- 甲基 -3-(( R)-3- 甲基 -2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-1H- 吲唑 -6- ) 哌啶 -4- 羰基 ) 哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 苯甲醯胺 ( 化合物 61)
Figure 02_image1248
基本上遵循 化合物 56之合成,使用對應中間物製備 化合物 61
LC-MS (ES +): m/z930.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ10.98 (s, 1H), 8.35-8.26 (m, 3H), 7.68-7.56 (m, 5H), 6.96 (d, J= 8.8 Hz, 1H), 6.90 (d, J= 9.2 Hz, 1H), 6.83 (s, 1H), 6.48-6.46 (m, 2H), 6.25 (d, J= 6.4 Hz, 1H), 5.90-5.87 (m, 1H), 4.41 (m, 1H), 4.30 (m, 1H), 4.12-3.96 (m, 3H), 3.85 (s, 3H), 3.80-3.72 (m, 2H), 3.69-3.58 (m, 3H), 3.10-2.97 (m, 3H), 2.90-2.78 (m, 4H), 2.35 (m, 2H), 2.30-2.21 (m, 6H), 2.15 (m, 5H), 2.01 (s, 3H), 1.85-1.72 (m, 9H), 1.61 (s, 3H)及1.55 (d, J= 6.80 Hz, 3H)。 實例 115 合成 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )- N-(( 1R)-1-(4-((1-(4-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- ) 丁基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 62)
Figure 02_image1250
步驟 -1
向含有4-[1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-4-哌啶基]丁醛鹽酸鹽( 2,120 mg,0.188 mmol)及( R)-3-((4-甲基-3-((1-(4-(哌啶-4-基乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 1,123.83 mg,0.207 mmol)於無水DMSO (3 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加無水乙酸鈉(77.40 mg,0.943 mmol)及乙酸(113.32 mg,1.89 mmol,0.1 mL),且將所得混合物在環境溫度下攪拌1小時。隨後,一次性添加MP-CNBH 3(2mmol\g) (147 mg,0.283 mmol)且在環境溫度下繼續攪拌另外16小時。經LC-MS指示反應完成後,過濾反應混合物,且在減壓下蒸發濾液。藉由逆相管柱層析(RediSep-RF Gold C18管柱,移動相:10 mm HCOOH/水:MeCN)來純化所獲得之粗產物,得到呈無色液體狀之3-((3-((( 1R)-1-(4-((1-(4-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-基)丁基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯甲酸酯( 3,90 mg,0.085 mmol,45%產率)。LC-MS (ES +): m/z936.6 [M + H] +步驟 -2
在0℃下向含有3-((3-((( 1R)-1-(4-((1-(4-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-基)丁基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯甲酸酯( 3,90.00 mg,0.085 mmol)於無水DCM (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(1.3 mL,0.786 mmol),且在環境溫度下攪拌所得混合物2小時。藉由UPLC監測反應進程。在減壓下移除過量溶劑且藉由逆相管柱層析(RediSep-RF Gold C18管柱,移動相:10 mm HCOOH/水:MeCN)純化所獲得之粗物質,得到呈灰白色固體狀之5-(氮雜環丁烷-3-基胺基)- N-(( 1R)-1-(4-((1-(4-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-基)丁基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺甲酸酯(化合物 62,63 mg,0.067 mmol,79%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ10.95 (s, 1H), 8.82 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.34-8.28 (m, 3H), 7.69-7.64 (m, 3H), 7.57 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 6.97-6.91 (m, 2H), 6.82 (d, J= 2 Hz, 1H), 6.63 (d, J= 2 Hz, 1H), 6.47-6.46 (m, 2H), 6.26 (d, J= 6.8 Hz, 1H), 5.90-5.87 (m, 1H), 4.28-4.26 (m, 1H), 4.02 (t, J= 2 Hz, 2H), 3.62-3.58 (m, 4H), 3.30 (s, 3H), 2.90-2.50 (m, 7H), 2.34-2.33 (m, 3H), 2.31-2.21 (m, 2H), 2.11 (s, 3H), 2.00-1.97 (m, 3H), 1.77-1.72 (m, 4H), 1.56-1.54 (d, J= 6.8 Hz, 3H), 1.45-1.44 (m, 2H)及1.25-1.29 (m, 8H)。LC-MS (ES +): m/z864.4 [M + H] +實例 116 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )- N-[1-[4-[2-[1-[5-[1-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-6- -3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ]-4- 哌啶基 ] 戊基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ]-2- 甲基 - 苯甲醯胺 ( 化合物 63)
Figure 02_image1252
基本上遵循 化合物 62之合成,使用對應中間物製備 化合物 63
LC-MS (ES +): m/z895.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.07 (s, 1H), 8.80 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.34-8.29 (m, 2H), 7.68-7.56 (m, 4H), 7.12 (d, J= 12 Hz, 1H), 6.96-6.92 (m, 2H), 6.47-6.45 (m, 2H), 6.23 (d, J= 6.8 Hz, 1H), 5.90-5.87 (m, 1H), 5.35-5.25 (m, 1H), 4.35 (m, 1H), 4.02 (m, 1H), 3.61-3.57 (m, 3H), 3.32 (s, 3H), 2.95-2.70 (m, 5H), 2.65 (m, 2H), 2.50 (m, 4H), 2.30 (m, 2H), 2.20 (m, 2H), (2.11 (s, 3H), 2.01-1.91 (m, 3H), 1.80-1.65 (m, 4H), 1.55 (d, J= 7.20 Hz, 3H), 1.49-1.41 (m, 2H)及1.40-1.22 (m, 9H)。 實例 117 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )- N-[1-[4-[2-[1-[4-[1-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ]-4- 哌啶基 ] 丁基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ]-2- 甲基 - 苯甲醯胺 ( 化合物 64)
Figure 02_image1254
基本上遵循 化合物 62之合成,使用對應中間物製備 化合物 64
LC-MS (ES +): m/z863.3 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.14 (s, 1H), 8.81 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.35-8.27 (m, 2H), 7.68-7.64 (m, 3H), 7.58-7.56 (m, 1H), 6.98-6.91 (m, 2H), 6.82 (d, J= 2 Hz, 1H), 6.63 (dd, J= 8.4, 2 Hz, 1H), 6.49-6.47 (m, 2H), 6.32 (d, J= 4 Hz, 1H), 5.95-5.85 (m, 1H), 5.40-5.20 (m, 1H), 4.35 (m, 1H), 4.10 (m, 2H), 3.69-3.64 (m, 3H), 3.59-3.56 (m, 3H), 2.98-2.80 (m, 3H), 2.73-2.68 (m, 2H), 2.58 (m, 3H), 2.34-2.32 (m, 2H), 2.30-2.12 (m, 2H), 2.04 (s, 3H), 1.99-1.96 (m, 3H), 1.77-1.72 (m, 4H), 1.55 (d, J= 7.20 Hz, 3H), 1.49 (m, 2H)及1.40-1.15 (m, 9H)。 實例 118 3-( 羧基甲氧基 )-4- -5-[3-[[(4S)-1-[[3-[[4-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-2- 側氧基 - 苯并 [cd] 吲哚 -6- ]-3,3- 二氟 - 哌啶 -1- 羰基 ] 胺基 ] 苯基 ] 甲基磺醯基 ]-2,2- 二甲基 -4- 哌啶基 ] 胺基 ] 苯基 ] 噻吩 -2- 甲酸 ( 化合物 65)
Figure 02_image1256
Figure 02_image1258
步驟 -1
在室溫下在氮氣氛圍下向含有5-[4-[2-[4-[1-[[5-[(1-三級丁氧基羰基氮雜環丁烷-3-基)胺基]-2-甲基-苯甲醯基]胺基]乙基]-1-萘基]乙炔基]-1-哌啶基]戊酸 (1,150 mg,157.46 μmol)及3-[3-甲基-2-側氧基-5-(4-哌啶基)苯并咪唑-1-基]哌啶-2,6-二酮鹽酸鹽( 2,60.87 mg,157.46 μmol)於無水DMF (5 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加N,N-二異丙基乙胺(101.75 mg,787.29 μmol,137.13 μL)及HATU (89.81 mg,236.19 μmol)。將所得混合物在室溫下攪拌4小時。隨後,真空濃縮混合物,得到粗物質,其藉由逆相管柱層析[管柱:SiliaSep C18 60 g;移動相A:0.1%甲酸/水及移動相B:乙腈]純化,得到呈灰白色固體狀之3-[3-[1-[4-[2-[1-[5-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-5-側氧基-戊基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基胺甲醯基]-4-甲基-苯胺基]氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯甲酸酯( 3,80 mg,71.96 μmol,46%產率)。LC-MS (ES +): m/z991.4 [M + H] +步驟 -2
在室溫下在氮氣氛圍下向含有3-[3-[1-[4-[2-[1-[5-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-5-側氧基-戊基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基胺甲醯基]-4-甲基-苯胺基]氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯甲酸酯( 3,90 mg,80.69 μmol)於無水DCM (2.96 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加氯化氫溶液(4.0 M於1,4-二㗁烷中,403.47 μL, 1.61 mmol)。2小時後,在減壓下濃縮溶液,得到粗物質,其藉由逆相製備型HPLC [管柱:X Select C18 (250 X 19) mm,5 µm;移動相A:10 mM碳酸氫銨/水及移動相B:乙腈]純化,得到呈灰白色固體狀之5-(氮雜環丁烷-3-基胺基)-N-[1-[4-[2-[1-[5-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-5-側氧基-戊基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]-2-甲基-苯甲醯胺 ( 化合物 65, 23 mg,24.08 μmol,30%產率)。LC-MS (ES -): m/z889.2 [M - H] -1H-NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.11 (brs, 1H), 8.80 (d, J= 8.00 Hz, 1H), 8.33-8.27 (m, 1H), 7.66-7.63 (m, 3H), 7.56 (d, J= 7.60 Hz, 1H), 7.22 (s, 1H), 7.01 (d, J= 8.00 Hz, 1H), 6.93-6.91 (m, 2H), 6.45-6.40 (m, 2H), 6.06 (d, J= 6.80 Hz, 1H), 5.91-5.84 (m, 1H), 5.36-5.32 (m, 1H), 4.61-4.52 (m, 1H), 4.21-4.11 (m, 1H), 4.07-3.98 (m, 1H), 3.71-3.68 (m, 1H), 3.14-3.08 (m, 2H), 2.89-2.62 (m, 6H), 2.35-2.30 (m, 6H), 2.26-2.14 (m, 3H), 2.10 (s, 3H), 2.00-1.90 (m, 4H), 1.83-1.63 (m, 5H), 1.60-1.49 (m, 11H)。 實例 119 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )-N-[1-[4-[2-[1-[5-[4-[3-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-1- 甲基 - 吲唑 -6- ]-1- 哌啶基 ]-5- 側氧基 - 戊基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ]-2- 甲基 - 苯甲醯胺 ( 化合物 66)
Figure 02_image1260
基本上遵循 化合物 65之合成製備 化合物 66,除了在步驟-2中使用TFA及DCM進行Boc-去保護。
LC-MS (ES +): m/z876.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ10.88 (s, 1H), 8.84-8.28 (m, 2H), 8.32-8.29 (m, 2H), 7.69-7.57 (m, 5H), 7.43 (s, 1H), 7.04 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 6.98 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 6.50-6.49 (m, 2H), 6.33-6.32 (m, 1H), 5.88 (quin, J= 7.2 Hz, 1H), 4.61-4.58 (m, 1H), 4.35-4.31 (m, 2H), 4.25 (m, 2H), 4.03-3.98 (m, 1H), 3.97 (s, 3H), 3.85-3.71 (m, 2H), 3.50 (m, 4H), 3.30 (s, 3H), 3.17-3.03 (m, 4H), 2.97-2.91 (m, 1H), 2.68-2.64 (m, 2H), 2.50-2.40 (m, 2H), 2.37-2.30 (m, 2H), 2.19-2.17 (m, 2H), 2.16 (s, 3H), 1.90-1.83 (m, 2H), 1.71-1.68 (m, 3H)及1.56-1.54 (m, 6H)。 實例 120 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )-N-[1-[4-[2-[1-[5-[4-[3-(2,4- 二側氧基六氫嘧啶 -1- )-5- -1- 甲基 - 吲唑 -6- ]-1- 哌啶基 ]-5- 側氧基 - 戊基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ]-2- 甲基 - 苯甲醯胺 ( 化合物 67)
Figure 02_image1262
基本上遵循 化合物 65之合成,使用對應中間物製備 化合物 67
LC-MS (ES +): m/z894.2 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ10.80 (s, 1H), 8.81 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.33-8.27 (m, 2H), 7.66-7.56 (m, 5H), 7.39 (d, J= 11.2 Hz, 1H), 6.95 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 6.47 (s, 2H), 6.35-6.25 (m, 1H), 5.90-5.86 (m, 1H), 4.64 (m, 1H), 4.32-4.22 (m, 1H), 4.10-4.00 (m, 3H), -3.98 (s, 3H), 3.89 (t, J= 6.4 Hz, 3H), 3.60 (m, 3H), 3.21-3.13 (m, 3H), 2.80-2.71 (m, 4H), 2.40-2.33 (m, 3H), 2.27-2.19 (m, 2H), 2.11 (s, 3H), 2.00-1.90 (m, 2H), 1.90-1.82 (m, 2H), 1.76-1.69 (m, 4H)及1.63-1.50 (m, 8H)。 實例 121 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )-N-[1-[4-[2-[1-[5-[4-[1-[(3S)-2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 ] 吲哚啉 -5- ]-1- 哌啶基 ]-5- 側氧基 - 戊基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ]-2- 甲基 - 苯甲醯胺 ( 化合物 68)
Figure 02_image1264
基本上遵循 化合物 65之合成,使用對應中間物製備 化合物 68
LC-MS (ES +): m/z862.3 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ10.90 (s, 1H), 8.81 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.34-8.28 (m, 3H), 7.67-7.63 (m, 3H), 7.57 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 6.95 (d, J= 9.2 Hz, 1H), 6.89 (s, 1H), 6.80 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 6.47-6.45 (m, 2H), 6.39 (d, J= 8 Hz, 1H), 6.23 (d, J= 6.8 Hz, 1H), 5.93-5.85 (m, 1H), 4.61-4.49 (m, 2H), 4.35 (m, 1H), 4.0 (m, 3H), 3.58 (m, 2H), 3.29 (m, 2H), 3.13-3.02 (m, 2H), 2.93-2.87 (m, 2H), 2.85-2.65 (m, 5H), 2.59 (m, 4H), 2.41-2.29 (m, 5H), 2.25-2.12 (m, 3H), 2.1 (s, 3H), 2.05-1.85 (m, 3H), 1.80-1.67 (m, 4H), 1.55 (d, J= 7.6 Hz, 3H)及1.52-1.45 (m, 2H)。 實例 122 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )-N-[1-[4-[2-[1-[5-[4-[1-[(3R)-2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 ] 吲哚啉 -5- ]-1- 哌啶基 ]-5- 側氧基 - 戊基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ]-2- 甲基 - 苯甲醯胺 ( 化合物 69)
Figure 02_image1266
基本上遵循 化合物 65之合成,使用對應中間物製備 化合物 69
LC-MS (ES +): m/z862.3 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ10.8 (bs,1H), 8.83 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.29-8.32 (m, 3H), 7.67-7.64 (m, 3H), 7.57 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 6.96 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 6.89 (s, 1H), 6.80 (d, J= 8 Hz, 1H), 6.47 (bs, 2H), 6.38 (d, J= 8 Hz, 2H), 5.90-5.85 (m, 1H), 4.55 (m, 2H), 4.36-4.25 (m, 1H), 4.18-4.03 (m, 2H), 4.01-3.92 (m, 2H), 3.30-3.20 (m, 2H), 3.10-3.02 (m, 2H), 2.92-2.70 (m, 5H), 2.60-2.57 (m, 2H), 2.41-2.30 (m, 5H), 2.21-2.18 (m, 3H), 2.11 (s, 3H), 2.01-1.85 (m, 3H), 1.79-1.65 (m, 4H), 1.60-1.42 (m, 9H)及0.85 (m, 1H)。 實例 123 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )-N-[1-[4-[2-[1-[5-[4-[4-[(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 ) 胺基 ]-2- - 苯基 ]-1- 哌啶基 ]-5- 側氧基 - 戊基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ]-2- 甲基 - 苯甲醯胺 ( 化合物 70)
Figure 02_image1268
基本上遵循 化合物 65之合成製備 化合物 70,除了在步驟-2中使用TFA及DCM進行Boc-去保護。
LC-MS (ES +): m/z855.2 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ10.81 (s, 1H), 8.85 (d, J= 2.8 Hz, 1H), 8.73 (brs, 1H), 8.34-8.268 (m, 2H), 7.77-7.62 (m, 3H), 7.60 (m, 1H), 7.00-6.94 (m, 2H), 6.51-6.44 (m, 4H), 5.92-5.85 (m, 1H), 6.10-5.95 (m, 1H), 5.90 (m, 1H), 4.59-4.50 (m, 1H), 4.37-4.24 (m, 4H), 3.99-3.90 (m, 2H), 3.82-3.73 (m, 3H), 3.48-3.41 (m, 3H), 3.25-3.00 (m, 5H), 3.00-2.84 (m, 1H), 2.69-2.60 (m, 2H), 2.35-2.25 (m, 2H), 2.15-2.02 (m, 6H), 1.98-1.82 (m, 3H), 1.81-1.65 (m, 4H), 1.62-1.50 (m, 4H), 1.30-1.11 (m, 2H)。 實例 124 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )-N-[1-[4-[2-[1-[5-[4-[3-(2,4- 二側氧基六氫嘧啶 -1- )-1- 甲基 - 吲唑 -6- ]-1- 哌啶基 ]-5- 側氧基 - 戊基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ]-2- 甲基 - 苯甲醯胺 ( 化合物 71)
Figure 02_image1270
基本上遵循 化合物 65之合成,使用對應中間物製備 化合物 71
LC-MS (ES -): m/z874.2 [M - H] -1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ10.54 (s, 1H), 8.80 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.32-8.27 (m, 2H), 7.65 (m, 3H), 7.55-7.54 (m, 2H), 7.49 (s, 1H), 7.04 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 6.93 (d, J= 8 Hz, 1H), 6.43 (m, 2H), 6.08 (d, J= 6.4 Hz, 1H), 5.89-5.85 (m, 1H), 4.61-4.58 (m, 1H), 4.20 (m, 1H), 4.06-4.03 (m, 1H), 3.91 (s, 3H), 3.88 (m, 2H), 3.78-3.76 (m, 3H), 3.17-3.11 (m, 2H), 2.95 (m, 2H), 2.92 (m, 1H), 2.89 (m, 4H), 2.68-2.65 (m, 2H), 2.39-2.36 (m, 2H), 2.33-2.30 (m, 2H), 2.21 (m, 2H), 2.10 (s, 3H), 1.95 (m, 2H), 1.85 (m, 2H), 1.80-1.65 (m, 3H)及1.60-1.49 (m, 7H)。 實例 125 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )- N-((1 R)-1-(4-((1-(5-((3-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 丙基 )( 甲基 ) 胺基 )-5- 側氧基戊基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 72)
Figure 02_image1272
基本上遵循 化合物 65之合成,使用對應中間物製備 化合物 72
LC-MS (ES +): m/z880.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.09 (s, 1H), 8.82 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.33-8.27 (m, 3H), 7.67-7.63 (m, 3H), 7.56 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 6.92-7.02 (m, 4H), 6.47 (d, J= 6.8 Hz, 2H), 6.29 (d, J= 6.8 Hz, 1H), 5.90-5.86 (m, 1H), 4.35-4.25 (m, 1H), 4.12-4.07 (m, 2H), 3.68-3.64 (m, 2H), 3.33 (s, 3H), 2.95 (s, 2H), 2.92-2.83 (m, 2H), 2.80 (s, 2H), 2.75-2.69 (m, 4H), 2.69-2.60 (m, 2H), 2.59-2.55 (m, 2H), 2.38-2.20 (m, 6H), 2.11 (s, 3H), 1.98-1.93 (m, 3H), 1.90-1.80 (m, 1H), 1.76-1.72 (m, 3H), 1.55 (d, J= 6.80 Hz, 3H), 1.50-1.42 (m, 4H)。 實例 126 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )-2- 甲基 - N-(( R)-1-(4-((1-(5-(4-(1- 甲基 -3-(( R)-3- 甲基 -2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-1H- 吲唑 -6- ) 哌啶 -1- )-5- 側氧基戊基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 苯甲醯胺 ( 化合物 73)
Figure 02_image1274
基本上遵循 化合物 65之合成製備 化合物 73,除了在步驟-2中使用TFA及DCM進行Boc-去保護。
LC-MS (ES +): m/z889.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ10.86 (s, 1H), 8.85 (d, J= 2.4 Hz, 1H), 8.33-8.28 (m, 2H), 7.77-7.67 (m, 4H), 7.58 (dd, J= 7.4, 3.2 Hz, 1H), 7.45 (d, J= 5.6 Hz, 1H), 7.06-6.97 (m, 2H), 6.50 (s, 2H), 6.32 (s, 1H), 5.90-5.87 (m, 1H), 4.68-4.55 (m, 1H), 4.35 (m, 1H), 4.25 (m, 2H), 4.4.05 (m, 1H), 3.95 (d, J= 4.4 Hz, 3H), 3.80-3.62 (m, 2H), 3.50 (s, 3H), 3.24-2.90 (m, 7H), 2.65 - 2.30 (m, 4H), 2.20-2.05 (m, 6H), 2.01-1.79 (m, 4H), 1.78-1.45 (m, 12H)及1.28-1.23 (m, 2H)。 實例 127 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )- N-(( 1S)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -1- )-5- 側氧基戊基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 74)
Figure 02_image1276
基本上遵循 化合物 65之合成,使用對應中間物製備 化合物 74
LC-MS (ES +): m/z892.2 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.11 (bs, 1H), 8.80 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.33-8.27 (m, 2H), 7.66-7.63 (m, 3H), 7.56 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 7.22 (s, 1H), 7.01 (d, J= 8 Hz, 1H), 6.93-6.91 (m, 2H), 6.45-6.40 (m, 2H), 6.25 (m, 1H), 5.91-5.84 (m, 1H), 5.36-5.32 (m, 1H), 4.61-4.52 (m, 1H), 4.21-4.11 (m, 1H), 4.07-3.98 (m, 2H), 3.71-3.68 (m, 4H), 3.32 (s, 3H), 3.14-3.08 (m, 2H), 2.89-2.50 (m, 6H), 2.35-2.30 (m, 4H), 2.26-2.14 (m, 2H), 2.10 (s, 3H), 2.00-1.90 (m, 3H), 1.83-1.63 (m, 5H)及1.60-1.49 (m, 9H)。 實例 128 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )-2- 甲基 - N-(( R)-1-(4-((1-(5-(4-(3- 甲基 -1-(( R)-3- 甲基 -2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -1- )-5- 側氧基戊基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 苯甲醯胺 ( 化合物 75)
Figure 02_image1278
基本上遵循 化合物 65之合成,使用對應中間物製備 化合物 75
LC-MS (ES +): m/z905.2 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ10.97 (s, 1H), 8.40-8.28 (m, 2H), 7.78-7.70 (m, 3H), 7.64-7.50 (m, 1H). 7.34-7.30 (m,1H), 7.27-7.24 (m, 1H), 7.11-7.09 (m, 1H), 7.00-6.90 (m, 2H), 6.51-6.42 (m, 2H), 6.34 (bs, 1H), 5.91-5.87 (m, 1H), 4.60 (m, 1H), 4.40 (m, 1H), 4.31(m, 2H), 4.15 (m, 1H), 4.10-3.92 (m, 2H), 3.70-3.60 (m, 3H), 3.28 (s, 3H), 3.25-2.91 (m, 6H), 2.90-2.68 (m, 3H), 2.65 (m, 1H), 2.50 (m, 2H), 2.34-2.30 (m, 2H), 2.11-1.91 (m, 10H), 1.82-1.70 (m, 5H)及1.68-1.51 (m, 6H)。 實例 129 合成 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )- N-(( 1R)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -1- )-5- 側氧基戊基 )-3- 氟哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 76)
Figure 02_image1280
步驟 -1
在環境溫度下向含有3-((3-((( 1R)-1-(4-((3-氟哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 1,250.00 mg,0.376 mmol)於無水DMF (2 mL)中之充分攪拌溶液的20 mL螺旋蓋玻璃小瓶中添加5-溴戊酸乙酯( 2,94.40 mg,0.451 mmol)及DIPEA (243.14 mg,1.88 mmol,0.328 mL)。在80℃下攪拌混合物2小時。經UPLC監測反應完成後,在減壓下移除反應混合物中之揮發物。反應混合物用水(30 mL)稀釋,用DCM (3×520 mL)萃取。合併之有機相經乾燥(無水Na 2SO 4),過濾且在減壓下濃縮濾液,得到呈棕色液體狀之3-((3-((( 1R)-1-(4-((1-(5-乙氧基-5-側氧基戊基)-3-氟哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 3,300 mg,0.349 mmol,93%產率)。LC-MS (ES +): m/z713.2 [M + H] +步驟 -2
在環境溫度下向含有3-((3-((( 1R)-1-(4-((1-(5-乙氧基-5-側氧基戊基)-3-氟哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 3,300.00 mg,0.353 mmol)於MeOH (2 mL)、THF (2 mL)及水(1 mL)之混合物中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加單水合氫氧化鋰(74.17 mg,1.77 mmol),且攪拌所得混合物2小時。經TLC指示反應完成後,在真空中蒸發反應混合物中之揮發物,且所獲得之殘餘物用水(50 mL)稀釋且用MTBE (100 mL)萃取。水相用10%檸檬酸溶液酸化至pH=4且用10% MeOH/DCM (2×150 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥,在減壓下濃縮,得到呈灰白色固體狀之5-(4-((4-(( R)-1-(5-((1-(三級丁氧基羰基)氮雜環丁烷-3-基)胺基)-2-甲基苯甲醯胺基)乙基)萘-1-基)乙炔基)-3-氟哌啶-1-基)戊酸( 4,180 mg,0.229 mmol,64%產率)。LC-MS (ES +): m/z685.2 [M + H] +步驟 -3
向含有5-(4-((4-(( R)-1-(5-((1-(三級丁氧基羰基)氮雜環丁烷-3-基)胺基)-2-甲基苯甲醯胺基)乙基)萘-1-基)乙炔基)-3-氟哌啶-1-基)戊酸( 4,180.00 mg,0.228 mmol)於無水DMF (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (147.77 mg,1.14 mmol,0.199 mL)及HATU (130.42 mg,0.343 mmol)。隨後在環境溫度下在氮氣氛圍下向燒瓶中添加化合物3-[3-甲基-2-側氧基-5-(4-哌啶基)苯并咪唑-1-基]哌啶-2,6-二酮鹽酸鹽( 5,105.42 mg,0.275 mmol)。在環境溫度下攪拌所得混合物4小時。經UPLC指示反應完成後,在減壓下蒸發過量溶劑且添加冰冷水。所得固體沈澱物經過濾,用水(5 mL)洗滌且在真空中乾燥,得到呈灰白色固體狀之3-((3-((( 1R)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-1-基)-5-側氧基戊基)-3-氟哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 6,150 mg,0.092 mmol,40%產率)。LC-MS (ES +): m/z1010.4 [M + H] +步驟 -4
在0℃下向含有3-((3-((( 1R)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-1-基)-5-側氧基戊基)-3-氟哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 6,150 mg,0.092 mmol)於無水DCM (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(0.461 mL)。在環境溫度下攪拌所得反應混合物2小時。經UPLC監測反應完成後,減壓蒸發過量溶劑。藉由逆相製備型HPLC [X-Select C18 (150×19) mm 5微米管柱]移動相:A:0.1%甲酸/MQ-水;B:乙腈;流動速率:15 mL/分鐘來純化所獲得之粗產物,且將具有所需產物之級分凍乾,得到呈灰白色固體狀之5-(氮雜環丁烷-3-基胺基)- N-(( 1R)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-1-基)-5-側氧基戊基)-3-氟哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺甲酸酯( 化合物 76,30 mg,0.031 mmol,34%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.09 (s, 1H), 8.83 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 8.33-8.32 (m, 2H), 7.60-7.59 (m, 4H), 7.10 (s, 1H), 7.02-7.00 (m, 2H), 6.99-6.90 (m, 1H), 6.51-6.47 (m, 2H), 6.33 (d, J =6.4 Hz, 1H), 5.89 (m, 1H), 5.34 (dd, J =12.6, 5.6 Hz, 1H), 4.62-4.59 (m, 2H), 4.34 (m, 1H), 4.24 (m, 2H), 4.05-3.95 (m, 1H), 3.77 (m, 2H), 3.20-3.4 (m, 2H), 2.80-2.67 (m, 3H), 2.62-2.56 (m, 2H), 2.50 (m, 9H), 2.50-2.46 (m, 3H), 2.32 (m, 2H), 2.12 (s, 3H), 2.02-1.90 (m, 1H), 1.80-1.76 (m, 3H)及1.55 (d, J= 6.8 Hz, 3H), 1.52 (m, 6H)。LC-MS (ES +): m/z909.4 [M + H] +實例 130 合成 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )- N-(( 1R)-1-(4-((4-(5-(4-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -1- )-5- 側氧基戊基 ) 環己基 ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 77)
Figure 02_image1282
Figure 02_image1284
步驟 -1
向含有( R)-3-((3-((1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 1,0.2 g,0.337 mmol)於乙腈(5 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL密封管中添加5-(4-乙炔基環己基)戊酸甲酯( 2,112.53 mg,0.506 mmol)及碳酸銫(329.83 mg,1.01 mmol)。將反應混合物用氮氣吹掃5分鐘,隨後添加XPhos (16.09 mg,0.033 mmol)及XPhos-Pd-G3 (28.56 mg,0.033 mmol),且將混合物用氮氣再吹掃2分鐘且在90℃下攪拌2小時。經UPLC及TLC指示反應完成後,反應混合物用水(20 mL)稀釋且用EtOAc (3×30 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥,且在減壓下濃縮,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用40-45% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化,得到呈淡黃色固體狀之( R)-3-((3-((1-(4-((4-(5-甲氧基-5-側氧基戊基)環己基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 3,0.18 g,0.235 mmol,70%產率)。LC-MS (ES -): m/z678.5 [M - H] -步驟 -2
在環境溫度下向含有( R)-3-((3-((1-(4-((4-(5-甲氧基-5-側氧基戊基)環己基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 3,0.18 g,0.235 mmol)於3:2:1 THF /MeOH/水(6 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加氫氧化鋰;水合物(49.35 mg,1.18 mmol)。在此溫度下攪拌反應混合物2小時。經UPLC指示反應完成後,在減壓下濃縮反應混合物。將殘餘物溶解於水(10 mL)中且冷卻至0℃,接著用5%檸檬酸溶液(4 mL)酸化至pH約3。固體沈澱物經過濾,用水(30 mL)、石油醚(30 mL)洗滌,且接著在減壓下在50℃下乾燥1小時,得到呈灰白色固體狀之( R)-5-(4-((4-(1-(5-((1-(三級丁氧基羰基)氮雜環丁烷-3-基)胺基)-2-甲基苯甲醯胺基)乙基)萘-1-基)乙炔基)環己基)戊酸( 4,0.13 g,0.168 mmol,72%產率)。LC-MS (ES -): m/z664.2 [M - H] -步驟 -3
向含有3-(3-甲基-2-側氧基-5-(哌啶-4-基)-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-1-基)哌啶-2,6-二酮鹽酸鹽( 5,87.09 mg,0.211 mmol)於無水DMF (3 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (20.16 mg,0.156 mmol,0.027 mL)及HATU (59.30 mg,0.156 mmol),接著添加( R)-5-(4-((4-(1-(5-((1-(三級丁氧基羰基)氮雜環丁烷-3-基)胺基)-2-甲基苯甲醯胺基)乙基)萘-1-基)乙炔基)環己基)戊酸( 4,0.12 g,0.156 mmol)。在環境溫度下攪拌反應混合物2小時。經LCMS指示反應完成後,將反應混合物用水(20 mL)稀釋且用EtOAc (3×30 mL)萃取。合併之有機相用冷水(3×20 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在真空中濃縮,得到呈灰白色固體狀之3-((3-((( 1R)-1-(4-((4-(5-(4-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-1-基)-5-側氧基戊基)環己基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 6,0.15 g,0.121 mmol,77%產率)。LC-MS (ES +): m/z990.6 [M + H] +步驟 -4
在5℃下在氮氣氛圍下向含有3-((3-(((1 R)-1-(4-((4-(5-(4-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-1-基)-5-側氧基戊基)環己基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 6,0.14 g,0.112 mmol)於無水DCM (5 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(1.20 mL)。在環境溫度下攪拌反應混合物2小時。藉由TLC及LCMS監測反應進程。反應完成後,在減壓下濃縮反應混合物且所獲得之粗物質藉由逆相HPLC (Redisep-RF C18-120 g管柱,移動相A:0.1%甲酸/水及B:乙腈)純化,得到呈灰白色固體狀之5-(氮雜環丁烷-3-基胺基)- N-((1 R)-1-(4-((4-(5-(4-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-1-基)-5-側氧基戊基)環己基)乙炔基)萘-1-基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺甲酸酯( 化合物 77,0.055 g,0.058 mmol,51%產率)。LC-MS (ES +): m/z890.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.08 (s, 1H), 8.79 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.27-8.34 (m, 2H), 7.61-7.66 (m, 3H), 7.55-7.58 (m, 1H), 7.11 (s, 1H), 7.02 (d, J= 8 Hz, 1H), 6.91-6.94 (m, 2H), 6.44-6.46 (m, 2H), 6.16 (d, J= 6.4 Hz, 1H), 5.88 (m, 1H), 5.34 (dd, J=12.6, 5.6 Hz, 1H), 4.60 (d, J= 8 Hz, 1H), 4.27-4.18 (m, 1H), 4.10 (m, 1H), 3.87 (t, J= 7.2 Hz, 2H), 3.50 (t, J= 7.6 Hz, 2H), 3.35 (s, 3H), 3.12 (m, 1H), 2.85-2.75 (m, 3H), 2.63-2.59 (m, 2H), 2.34 (m, 2H), 2.11 (m, 5H), 2.05-1.99 (m, 1H), 1.80 (m, 4H), 1.62-1.42 (m, 10H), 1.40-1.16 (m, 6H)及1.05-0.95 (m, 2H)。 實例 131 N -(3-((( 1R)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -1- )-5- 側氧基戊基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 胺甲醯基 )-4- 甲基苯基 ) 氮雜環丁烷 -3- 甲醯胺 ( 化合物 78)
Figure 02_image1286
基本上遵循 化合物 77之合成,使用步驟-1中之( R)-3-((3-((1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺甲醯基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯及5-(4-乙炔基-1-哌啶基)戊酸乙酯製備 化合物 78
LC-MS (ES +): m/z919.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.01 (bs, 1H), 10.16 (s, 1H), 8.92 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.33-8.30 (m, 2H), 7.68-7.66 (m, 3H), 7.58-7.56 (m, 2H), 7.52 (s, 1H), 7.19 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 7.10 (s, 1H), 7.02 (d, J= 8 Hz, 1H), 6.92 (d, J= 8 Hz, 1H), 5.94-5.90 (m, 1H), 5.36-5.32 (m, 1H), 4.60 (m, 1H), 4.09-4.00 (m, 5H), 3.73 (m, 1H), 3.14-3.11 (m, 1H), 2.93-2.90 (m, 4H), 2.86-2.84 (m, 1H), 2.68-2.63 (m, 5H), 2.50 (m, 3H), 2.48-2.40 (m, 4H), 2.38 (s, 3H), 2.24-2.21 (m, 4H), 1.81-1.63 (m, 4H)及1.56-1.49 (m, 9H)。 實例 132 合成 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )- N-[1-[4-[2-[1-[6-[4-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ]-1- 哌啶基 ]-6- 側氧基 - 己基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ]-2- 甲基 - 苯甲醯胺 ( 化合物 79)
Figure 02_image1288
Figure 02_image1290
步驟 -1
在環境溫度下向含有3-[3-[1-(4-溴-1-萘基)乙基胺甲醯基]-4-甲基-苯胺基]氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 1,300 mg,0.408 mmol)於無水乙腈(7 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL密封管中添加6-(4-乙炔基-1-哌啶基)己酸乙酯( 2,484.20 mg,1.02 mmol)及碳酸銫(399.17 mg,1.23 mmol)。將氮氣吹掃通過反應混合物10分鐘。隨後,添加XPhos (19.45 mg,0.040 mmol)及XPhos-Pd-G3 (34.57 mg,0.040 mmol),且在90℃下攪拌混合物4小時。藉由UPLC/TLC監測反應。反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且用EtOAc (2×50 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮濾液且藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠;50 g)用0-100% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化粗產物,得到呈淺棕色固體狀之3-[3-[1-[4-[2-[1-(6-乙氧基-6-側氧基-己基)-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基胺甲醯基]-4-甲基-苯胺基]氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 3,155 mg,0.139 mmol), 34%產率)。UPLC-MS (ES +): m/z710.7 [M + H] +步驟 -2
在環境溫度下向含有3-[3-[1-[4-[2-[1-(6-乙氧基-6-側氧基-己基)-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基胺甲醯基]-4-甲基-苯胺基]氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 3,180 mg,187.64 mmol)於1:1 THF/MeOH (2.5 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加含單水合氫氧化鋰(62.99 mg,1.50 mmol)之水(1.5 mL)。在此溫度下攪拌所得混合物3小時。經UPLC指示反應完成後,將反應混合物用水(15 mL)稀釋,且用MTBE (15 mL)萃取。水相用10%檸檬酸溶液酸化至pH=4,且接著用10% MeOH/DCM (3×70 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮,得到呈淡黃色固體狀之6-[4-[2-[4-[1-[[5-[(1-三級丁氧基羰基氮雜環丁烷-3-基)胺基]-2-甲基-苯甲醯基]胺基]乙基]-1-萘基]乙炔基]-1-哌啶基]己酸( 4,150 mg,0.155 mmol,83%產率)。LC-MS (ES +): m/z681.6 [M + H] +步驟 -3
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有6-[4-[2-[4-[1-[[5-[(1-三級丁氧基羰基氮雜環丁烷-3-基)胺基]-2-甲基-苯甲醯基]胺基]乙基]-1-萘基]乙炔基]-1-哌啶基]己酸( 4,150 mg,0.155 mmol)及3-[3-甲基-2-側氧基-5-(4-哌啶基)苯并咪唑-1-基]哌啶-2,6-二酮鹽酸鹽( 5,59.05 mg,0.155 mmol)於無水DMF (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (100.73 mg,779.38 μmol,135.75 μL)及HATU (88.90 mg,0.233 mmol)。在此溫度下攪拌所得混合物2小時。經UPLC指示反應完成後,在減壓下移除過量溶劑。向所獲得之殘餘物中添加冰冷水(10 mL)且過濾所形成之固體,用水(10 mL)洗滌且在真空中乾燥,得到呈淡黃色固體狀之3-[3-[1-[4-[2-[1-[6-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-6-側氧基-己基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基胺甲醯基]-4-甲基-苯胺基]氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 6,120 mg,0.085 mmol,55%產率)。UPLC-MS (ES +): m/z1005.8 [M + H] +步驟 -4
在0℃溫度下在氮氣氛圍下向含有3-[3-[1-[4-[2-[1-[6-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-6-側氧基-己基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基胺甲醯基]-4-甲基-苯胺基]氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 6,120 mg,0.085 mmol)於無水DCM (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加三氟乙酸(392.01 mg,3.44 mmol,264.87 μL)。將所得混合物在環境溫度下攪拌1小時。反應完成後,在減壓下蒸發過量溶劑且藉由逆相製備型HPLC (管柱:X SELECT C18 (150×19) mm,5 μm;移動相A:含10 mm NH 4HCO 3之MQ-水/水及移動相B:乙腈)純化,得到呈灰白色固體狀之5-(氮雜環丁烷-3-基胺基)- N-[1-[4-[2-[1-[6-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-6-側氧基-己基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]-2-甲基-苯甲醯胺( 化合物 79,31 mg,0.032 mmol,38%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.08 (bs, 1H), 8.77 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 8.34-8.28 (m, 2H), 7.67-7.63 (m, 3H), 7.57 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 7.10 (s, 1H), 7.02 (d, J= 8 Hz, 1H), 6.91 (d, J= 8.4 Hz, 2H), 6.46-6.42 (m, 2H), 6.02 (d, J= 6.4 Hz, 1H), 5.88 (t, J= 6.8 Hz, 1H), 5.34 (dd , J= 12.2, 5.6 Hz, 1H), 4.66 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 4.16-4.14 (m, 1H), 4.05-3.97 (m, 1H), 3.66 (m, 1H), 3.13-3.07 (m, 2H), 2.95-2.60 (m, 10H), 2.37-2.27 (m, 6H), 2.20-2.18 (m, 5H), 2.01-1.95 (m, 5H), 1.83-1.71 (m, 6H), 1.58-1.46 (m, 6H)及1.35-1.32 (m, 3H)。LC-MS (ES +): m/z905.2 [M + H] +實例 133 合成 ( 3S, 4S)-3- -4-((3-((( R)-1-(4-((1-((4- 羥基哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 胺甲醯基 )-4- 甲基苯基 ) 胺基 ) 吡咯啶 -1- 甲酸三級丁酯
Figure 02_image1292
步驟 -1
在環境溫度下向含有5-溴-2-甲基-苯甲酸甲酯( 1,560.78 mg,2.45 mmol)及( 3S, 4S)-3-胺基-4-氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 2,500 mg,2.45 mmol)於無水1,4-二㗁烷(10 mL)中之充分攪拌溶液的20 mL密封管中添加碳酸銫(1.99 g,6.12 mmol)。將氮氣吹掃通過反應混合物10分鐘。隨後,添加XPhos (233.41 mg,0.489 mmol)及參(二苯亞甲基丙酮)二鈀(0) (448.35 mg,0.489 mmol)且在100℃下繼續攪拌16小時。經UPLC確認反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且用DCM洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮合併之濾液,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用25% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化,得到呈黃色膠狀之( 3S, 4S)-3-氟-4-((3-(甲氧羰基)-4-甲基苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,850 mg,2.3 mmol,93%產率)。LC-MS (ES +): m/z297.2 [M - 異丁烯+ H] +步驟 -2
在0℃下向( 3S, 4S)-3-氟-4-((3-(甲氧羰基)-4-甲基苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,850 mg,2.27 mmol)於THF (6.98 mL)、水(2 mL)及MeOH (2 mL)之混合物中之攪拌溶液中添加98%單水合氫氧化鋰(951.45 mg,22.7 mmol)。將反應混合物在氮氣氛圍下在環境溫度下攪拌16小時。藉由TLC監測反應進程。此後,反應混合物用水(25 mL)稀釋且用MTBE (20 mL)萃取。水相用10%檸檬酸溶液酸化直至pH=4,且用EtOAc (3×80 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且在減壓下濃縮濾液,得到呈白色固體狀之5-((( 3S, 4S)-1-(三級丁氧基羰基)-4-氟吡咯啶-3-基)胺基)-2-甲基苯甲酸( 4,650 mg,1.90 mmol,84%產率)。LC-MS (ES -): m/z337.1 [M - H] -步驟 -3
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有5-((( 3S, 4S)-1-(三級丁氧基羰基)-4-氟吡咯啶-3-基)胺基)-2-甲基苯甲酸( 4,650 mg,1.88 mmol)及( 1R)-1-(4-溴-1-萘基)乙胺鹽酸鹽( 5,490.5 mg,1.69 mmol)於DMF (7 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (2.43 g,18.8 mmol,3.3 mL)及HATU (1.07 g,2.8 mmol),且在環境溫度下攪拌所得混合物4小時。經UPLC確認反應完成後,將反應混合物用水(100 mL)稀釋且用EtOAc (2×200 mL)萃取水相。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用40%-50% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化粗產物,得到呈淡黃色固體狀之( 3S, 4S)-3-((3-((( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-4-氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 6,650 mg,1.04 mmol,55%產率)。LC-MS (ES +): m/z514.1 [M - 異丁烯+ H] +步驟 -4
向含有( 3S, 4S)-3-((3-((( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-4-氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 6,0.06 g,0.096 mmol)於1:1 乙腈/THF (4.8 mL)中之充分攪拌溶液的8 mL玻璃小瓶中添加碳酸銫(187.9 mg,0.576 mmol)及4-[(4-乙炔基-1-哌啶基)甲基]哌啶-4-醇鹽酸鹽( 7,75.38 mg,0.288 mmol)。將反應混合物用氮氣吹掃5分鐘,隨後添加XPhos (9.17 mg,0.0192 mmol)及XPhos-Pd-G3 (16.27 mg,0.0192 mmol)。將反應混合物用氮氣吹掃2分鐘且在90℃下在微波中攪拌1.5小時。藉由TLC及UPLC監測反應進程。反應完成後,將反應混合物用水(20 mL)稀釋且用EtOAc (3×30 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮,得到粗產物,其藉由逆相管柱層析(管柱:RediSep C18 (100 g SNAP),移動相:A:0.1%甲酸/水,B:乙腈)純化。在減壓下濃縮溶離份以移除乙腈且接著用10%碳酸氫鈉溶液(100 mL)及鹽水(50 mL)稀釋且接著用EtOAc (3×200 mL)萃取。合併之有機相經Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮,得到呈淡黃色固體之( 3S, 4S)-3-氟-4-((3-((( R)-1-(4-((1-((4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 8,0.033 g,0.0436 mmol,45%產率)。LC-MS (ES +): m/z712.4 [M + H] +
使用上文 實例 133中所述之方法,用步驟-4中之對應炔中間物製備以下靶向配體( 實例 134-135)。
實例編號 步驟-4 中之 炔中間物 TL 配體 MS
134
Figure 02_image1294
Figure 02_image1296
LC-MS (ES +): m/z696.4 [M + H] +
135
Figure 02_image1298
Figure 02_image1300
LC-MS (ES +): m/z714.2 [M + H] +
實例 136 合成 ( 3R, 4S)-3- -4-((3-((( R)-1-(4-((1-((4- 羥基哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 胺甲醯基 )-4- 甲基苯基 ) 胺基 ) 吡咯啶 -1- 甲酸三級丁酯
Figure 02_image1302
Figure 02_image1304
步驟 -1
向含有5-溴-2-甲基-苯甲酸甲酯( 1,400 mg,1.75 mmol)及( 3S, 4R)-3-胺基-4-氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 2,427.97 mg,2.1 mmol)於無水1,4-二㗁烷(5 mL)中之充分攪拌溶液的20 mL玻璃小瓶中添加碳酸銫(1.42 g,4.37 mmol),且將所得混合物用N 2脫氣10分鐘。隨後,添加XPhos (166.49 mg,0.349 mmol)及參(二苯亞甲基丙酮)二鈀(0) (319.80 mg,0.349 mmol)且將所得混合物用N 2再脫氣5分鐘。在100℃下攪拌反應混合物16小時。經TLC指示反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且用EtOAc (150 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮濾液,得到粗物質,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用25% EtAOc/石油醚作為溶離劑來純化,得到呈黃色固體狀之( 3R, 4S)-3-氟-4-((3-(甲氧羰基)-4-甲基苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,450 mg,1.2 mmol,69%產率)。LC-MS (ES +): m/z297.1 [M - 異丁烯+ H] +步驟 -2
在環境溫度下向含有( 3R, 4S)-3-氟-4-((3-(甲氧羰基)-4-甲基苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,450 mg,1.2 mmol)於1:1 THF/MeOH (4 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加含單水合氫氧化鋰(503.71 mg,12 mmol)之水(2 mL)。將所得混合物在此溫度下攪拌16小時。經UPLC指示反應完成後,在減壓下自反應混合物移除過量溶劑,且將殘餘物溶解於檸檬酸水溶液(50 mL)中。水層用15% MeOH/DCM (2×100 mL)萃取且合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥,且在減壓下濃縮,得到呈棕色液體狀之5-((( 3S, 4R)-1-(三級丁氧基羰基)-4-氟吡咯啶-3-基)胺基)-2-甲基苯甲酸( 4,400 mg,1.13 mmol,95%產率)。LC-MS (ES +): m/z283.0 [M - 異丁烯+ H] +步驟 -3
向含有5-((( 3S, 4R)-1-(三級丁氧基羰基)-4-氟吡咯啶-3-基)胺基)-2-甲基苯甲酸( 4,450 mg,1.28 mmol)、( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙-1-胺鹽酸鹽( 5,369.59 mg,1.28 mmol)於無水DMF (5 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL圓底燒瓶中添加HATU (728.16 mg,1.92 mmol)及DIPEA (825.02 mg,6.38 mmol,1.11 mL),且在環境溫度下攪拌所得混合物4小時。經TLC指示反應完成後,用冰水淬滅反應混合物,且用EtOAc (2×200 mL)萃取水相。合併之有機相用水繼之以鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥,且在減壓下濃縮。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用50% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化粗產物,得到呈無色液體狀之( 3S, 4R)-3-((3-((( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-4-氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 6,680 mg,1.11 mmol,87%產率)。LC-MS (ES +): m/z514.2 [M - 異丁烯+ H] +步驟 -4
在環境溫度下向含有( 3S, 4R)-3-((3-((( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-4-氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 6,200 mg,0.326 mmol)及4-[(4-乙炔基-1-哌啶基)甲基]哌啶-4-醇鹽酸鹽( 7,260.95 mg,0.978 mmol)於無水ACN (2 mL)及DMF (3 mL)中之充分攪拌溶液的15 mL密封管中添加碳酸銫(265.57 mg,0.815 mmol)。將氮氣吹掃通過反應混合物10分鐘。隨後,添加XPhos (31.09 mg,0.065 mmol)及XPhos-Pd-G3 (41.40 mg,0.049 mmol)且在90℃下繼續攪拌4小時。經LCMS確認反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且用15% MeOH/DCM (100 mL)洗滌矽藻土床。在真空中移除過量溶劑且藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用25% MeOH/DCM作為溶離劑來純化粗產物,得到呈棕色固體狀之( 3R, 4S)-3-氟-4-((3-((( R)-1-(4-((1-((4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 8,95 mg,0.13 mmol,40%產率)。LC-MS (ES +): m/z712.2 [M + H] +步驟 -5
向含有( 3S, 4R)-3-((3-((( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-4-氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 9,238.89 mg,0.906 mmol)於1:1無水MeCN/THF (5 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL密封管中添加碳酸銫(246.24 mg,0.775 mmol),且將反應混合物用N 2脫氣10分鐘。隨後,添加XPhos (14.41 mg,0.030 mmol)及XPhos-Pd-G3 (12.79 mg,0.015 mmol),且將所得混合物用氮氣再脫氣5分鐘。在90℃下攪拌反應混合物4小時。藉由UPLC監測反應進程。反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且用EtOAc (200 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮濾液且藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用0-15% MeOH/DCM作為溶離劑來純化所獲得之粗物質,得到呈淡黃色固體狀之( 3R, 4S)-3-氟-4-((3-((( R)-1-(4-((1-((4-氟哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 10,150 mg,0.178 mmol,59%產率)。LC-MS (ES +): m/z714.4 [M + H] +步驟 -6
向含有( 3S, 4R)-3-((3-((( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-4-氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 6,250 mg,0.377 mmol)及4-乙炔基-1-(4-哌啶基甲基)哌啶鹽酸鹽( 11,119.34 mg,0.481 mmol)於無水乙腈(5 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL密封管中添加碳酸銫(307.80 mg,0.944 mmol),且藉由吹掃氮氣將反應混合物脫氣5分鐘。隨後,添加XPhos-Pd-G3 (15.99 mg,0.018 mmol)及XPhos (18.01 mg,0.037 mmol),且在90℃下加熱所得混合物5小時。在反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊且用EtOAc (50 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮濾液且藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用15% MeOH/DCM作為溶離劑來純化所獲得之粗物質,得到呈黃色固體狀之( 3R, 4S)-3-氟-4-((4-甲基-3-((( R)-1-(4-((1-(哌啶-4-基甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 12,200 mg,0.283 mmol,75%產率)。LC-MS (ES +): m/z696.4 [M + H] +實例 137 合成 N -(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 )-4- 羥基哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-5-(((3S,4S)-4- 氟吡咯啶 -3- ) 胺基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 80)
Figure 02_image1306
步驟 -1
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸鹽酸鹽( 2,70.72 mg,0.157 mmol)於無水DMF (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (84.68 mg,0.655 mmol,0.114 mL)及HATU (59.79 mg,0.157 mmol)。隨後,添加( 3S, 4S)-3-氟-4-((3-((( R)-1-(4-((1-((4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 1,0.1 g,0.131 mmol)。在環境溫度下攪拌反應混合物2小時。藉由TLC及LCMS監測反應進程。反應完成後,在減壓下濃縮反應混合物以移除DMF,用冷水(10 mL)稀釋。固體沈澱物經過濾,用冷水(10 mL)洗滌,在真空中乾燥10分鐘,且用石油醚(10 mL)洗滌,且在真空中在50℃下乾燥0.5小時,得到呈灰白色固體狀之( 3S, 4S)-3-((3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)-4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-4-氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,0.09 g,0.052 mmol,39%產率)。LC-MS (ES +): m/z1080.7 [M + H] +步驟 -2
在5℃下在氮氣氛圍下向含有( 3S, 4S)-3-((3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)-4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-4-氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,0.1 g,0.057 mmol)於無水DCM (3 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(1 mL)。在環境溫度下攪拌反應混合物2小時。藉由TLC及LCMS監測反應進程。反應完成後,在減壓下濃縮反應混合物,得到粗產物,其藉由製備型HPLC (0.1%甲酸/水:MeCN)純化,得到呈灰白色固體狀之 N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)-4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)-5-((( 3S, 4S)-4-氟吡咯啶-3-基)胺基)-2-甲基苯甲醯胺甲酸酯( 化合物 80,22 mg,0.02 mmol,35%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.06 (s, 1H), 8.83 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.33-8.28 (m, 2H), 7.68-7.56 (m, 4H), 6.99-6.92 (m, 2H), 6.84 (s, 1H), 6.65-6.64 (m, 3H), 5.92-5.85 (m, 1H), 5.71 (d, J= 5.6 Hz, 1H), 5.32-5.25 (m, 1H), 4.85 (d, 2J H-F= 80 Hz, 1H), 4.05 (m, 1H), 3.85-3.68 (m, 2H), 3.63 (m, 3H), 3.33 (m, 6H), 3.35-2.91 (m, 4H), 2.92-2.82 (m, 3H), 2.80-2.65 (m, 7H), 2.40-2.35 (m, 2H), 2.28 (s, 2H), 2.12 (s, 3H), 2.00-1.90 (m, 2H), 1.80-1.69 (m, 6H), 1.55 (d, J= 6.8 Hz, 3H)及1.65-1.41 (m, 4H)。LC-MS (ES +): m/z980.0 [M + H] +實例 138 N-((1R )-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 ) 哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-5-((( 3S, 4S)-4- 氟吡咯啶 -3- ) 胺基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 81)
Figure 02_image1308
基本上遵循 化合物 80之合成,使用對應中間物製備 化合物 81
LC-MS (ES +): m/z964.3 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.10 (s, 1H), 8.90-8.80 (m, 1H), 8.35-8.20 (m, 2H), 7.75-7.50 (m, 5H), 7.01-6.90 (m, 1H), 6.60 (s, 2H), 6.08 (s, 1H), 5.91-5.80 (m, 2H), 5.45-5.32 (m, 1H), 5.17 (d, 2 J H-F = 50 Hz, 1H), 4.44-4.30 (m, 1H), 4.35-4.20 (m, 1H), 4.05-3.90 (m, 1H), 3.70-3.55 (m, 4H), 3.50 (m, 3H), 3.30 (s, 3H), 3.06-2.88 (m, 8H), 2.50 (m, 4H), 2.32-2.22 (m, 4H), 2.20 (s, 3H), 2.09-1.90 (m, 5H), 1.90-1.75 (m, 4H), 1.55 (d, J= 6.8 Hz, 3H), (1.30-1.05 (m, 4H)。 實例 139 N -(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 )-4- 氟哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-5-(((3 S,4 S)-4- 氟吡咯啶 -3- ) 胺基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 82)
Figure 02_image1310
基本上遵循 化合物 80之合成,使用對應中間物製備 化合物 82
LC-MS (ES +): m/z982.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.07 (s, 1H), 8.84 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 8.34-8.29 (m, 2H), 7.67-7.57 (m, 4H), 6.99-6.93 (m, 2H), 6.84 (s, 1H), 6.65-6.57 (m, 3H), 5.91-5.88 (m, 1H), 5.72-5.71 (m, 1H), 5.30 (dd, J= 5.6, 13 Hz, 1H), 5.00-4.98 (m, 1H), 4.16-4.13 (m, 1H), 3.82-3.76 (m, 2H), 3.64-3.61 (m, 2H), 3.13-2.78 (m, 9H), 2.50 (m, 2H), 2.12 (s, 3H), 2.08 (m, 2H), 2.00-1.84 (m, 9H), 1.73-1.63 (m, 10H), 1.54 (d, J= 6.8 Hz, 3H)及1.53-1.42 (m, 4H)。 實例 140 合成 N -(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 )-4- 羥基哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-5-((( 3S, 4R)-4- 氟吡咯啶 -3- ) 胺基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 83)
Figure 02_image1312
步驟 -1
向含有( 3R, 4S)-3-氟-4-((3-((( R)-1-(4-((1-((4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 1,95 mg,0.129 mmol)及1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸鹽酸鹽( 2,63.38 mg,0.142 mmol)於無水DMF (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加HATU (73.83 mg,0.194 mmol)及DIPEA (83.65 mg,0.647 mmol,0.112 mL),且將反應混合物在環境溫度下攪拌2小時。反應完成後,用冷水淬滅反應物,且將固體沈澱物過濾,用水洗滌且在減壓下乾燥,得到呈棕色固體狀之( 3S, 4R)-3-((3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)-4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-4-氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,108 mg,0.073 mmol,57%產率)。LC-MS (ES +): m/z1080.6 [M + H] +步驟 -2
在0℃下向含有( 3S, 4R)-3-((3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)-4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-4-氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,108 mg,0.073 mmol)於無水DCM (0.8 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(0.185 mL)。將所得混合物在環境溫度下攪拌1小時。經UPLC指示反應完成後,自反應混合物移除過量溶劑以得到粗產物,其藉由逆相製備型HPLC (X SELECT C18 (250×19 mm) 5微米;0.1%甲酸/水:MeCN)純化,得到呈灰白色固體狀之 N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)-4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)-5-((( 3S, 4R)-4-氟吡咯啶-3-基)胺基)-2-甲基苯甲醯胺甲酸酯 ( 化合物 83,16 mg,0.015 mmol,21%產率)。LC-MS (ES +): m/z981.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.08 (s, 1H), δ 8.81 (d, J = 8 Hz, 1H), 8.29-8.32 (m, 2H), 7.68-7.63 (m, 3H), 7.57 (d, J = 7.6 Hz, 1H), 6.96-6.92 (m, 2H), 6.84 (d, J = 2 Hz, 1H), 6.67-6.62 (m, 3H), 5.88 (m, 1H), 5.69 (m, 1H), 5.32-5.23 (m, 1H), 4.85 (d, 2J H-F= 80 Hz, 1H), 4.10-3.90 (m, 2H), 3.75-3.60 (m, 3H), 3.30 (m, 3H), 3.20-3.10 (m, 3H), 3.05-2.81 (m, 5H), 2.80-2.67 (m, 7H), 2.67-2.59 (m, 2H), 2.42 (m, 2H), 2.34-2.30 (m, 2H), 2.10-2.09 (m, 3H), 1.97-1.93 (m, 3H), 1.75-1.71 (m, 6H), 1.55 (d, J= 6.8 Hz, 3H)及1.65-1.41 (m, 4H)。 實例 141 合成 N -(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 )-4- 氟哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-5-((( 3S, 4R)-4- 氟吡咯啶 -3- ) 胺基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 84)
Figure 02_image1314
步驟 -1
向含有( 3R, 4S)-3-氟-4-((3-((( R)-1-(4-((1-((4-氟哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 1,100 mg,0.119 mmol)及1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸鹽酸鹽( 2,50.86 mg,0.119 mmol)於DMF (2.5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加HATU (67.91 mg,0.178 mmol)及DIPEA (76.94 mg,0.595 mmol,0.103 mL),且將反應混合物在環境溫度下攪拌2小時。經UPLC指示反應完成後,在減壓下蒸發過量溶劑。添加冰冷水且所形成之固體沈澱物經過濾,用水(5 mL)洗滌且在真空中乾燥,得到呈灰白色固體狀之( 3S, 4R)-3-((3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)-4-氟哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-4-氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,100 mg,0.073 mmol,61%產率)。LC-MS (ES +): m/z1084.4 [M + H] +步驟 -2
在-78℃下向含有( 3S, 4R)-3-((3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)-4-氟哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-4-氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,100 mg,0.073 mmol)於無水DCM (1.5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(182.48 μL)。將所得混合物在環境溫度下攪拌2小時。經UPLC指示反應完成後,在減壓下自反應混合物移除過量溶劑,且藉由逆相製備型HPLC (X-Select C18 (150×19) mm 5微米管柱],移動相:A:0.1%甲酸/MQ-水;B:乙腈,流動速率:15 mL/分鐘)純化粗產物,得到呈灰白色固體狀之 N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)-4-氟哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)-5-(((3S,4R)-4-氟吡咯啶-3-基)胺基)-2-甲基苯甲醯胺甲酸酯( 化合物 84,18 mg,0.017 mmol,24%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.1 (s, 1H), 8.83 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 8.29-8.33 (m, 2H), 7.69-7.64 (m, 3H), 7.58 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 6.97-6.93 (m, 2H), 6.84 (d, J= 2.4 Hz, 1H), 6.69-6.63 (m, 3H), 5.88-5.80 (m, 2H), 5.31-5.20 (m, 1H), 5.20-5.10 (m, 1H),  4.20-4.01 (m, 2H), 3.90-3.80 (m, 1H), 3.64-3.61 (m, 2H), 3.30 (s, 3H), 2.90-2.75 (m, 7H), 2.73-2.65 (m, 3H), 2.60-2.55 (m, 2H), 2.50 (m, 2H), 2.45-2.33 (m, 4H), 2.11 (s, 3H), 2.08 (m, 1H), 1.99-1.95 (m, 4H), 1.80 (m, 2H), 1.75-1.73 (m, 6H), 1.56 (m, 2H)及1.55 (d, J= 6.8 Hz, 3H)。LC-MS (ES +): m/z983.4 [M + H] +實例 142 合成 N -(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 ) 哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-5-((( 3S, 4R)-4- 氟吡咯啶 -3- ) 胺基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 85)
Figure 02_image1316
步驟 -1
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有( 3R, 4S)-3-氟-4-((4-甲基-3-((( R)-1-(4-((1-(哌啶-4-基甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 1,100 mg,0.143 mmol)於無水DMF (2.5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (92.86 mg,0.718 mmol,0.12 mL)及HATU (81.96 mg,0.215 mmol)及1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸鹽酸鹽( 2,60.76 mg,0.143 mmol)。將所得混合物在此溫度下攪拌2小時。藉由UPLC監測反應進程。在減壓下濃縮反應混合物,得到殘餘物,其用冰冷水(20 mL)稀釋且固體沈澱物經過濾,用水(10 mL)洗滌且在真空中乾燥,得到呈灰白色固體狀之( 3S, 4R)-3-((3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-4-氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,125 mg,0.078 mmol,55%產率)。LC-MS (ES +): m/z1065.4 [M + H] +步驟 -2
在-78℃下向含有( 3S, 4R)-3-((3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-4-氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,125 mg,0.078 mmol)於無水DCM (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(1.3 mL,0.786 mmol),且在環境溫度下攪拌所得混合物2小時。藉由UPLC監測反應進程。反應完成後,在減壓下移除過量溶劑且藉由逆相管柱層析(C18管柱,移動相:10 mm TFA/水:MeCN)純化所獲得之粗物質,得到呈灰白色固體狀之 N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)-5-(((3S,4R)-4-氟吡咯啶-3-基)胺基)-2-甲基苯甲醯胺二-三氟乙酸酯( 化合物 85,30 mg,0.025 mmol,32%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.10 (s, 1H), 8.85 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.33-8.28 (m, 2H), 7.76-7.58 (m, 4H), 7.13-7.07 (m, 2H), 6.99 (d, J= 9.2 Hz, 1H), 6.90 (s, 1H), 6.70 (d, J= 6.4 Hz, 2H), 5.92-5.88 (m, 1H), 5.36-5.32 (m, 1H), 5.22 (d, 2J H-F= 56 Hz, 1H), 4.41-4.20 (m, 2H), 4.04-4.02 (m, 1H), 3.62-3.56 (m, 4H), 3.40 (m, 6H), 3.34 (s, 3H), 3.20-3.00 (m, 7H), 2.94-2.86 (m, 2H), 2.71-2.65 (m, 2H), 2.50 (m, 1H), 2.34-2.31 (m, 2H), 2.20-2.28 (m, 6H), 2.09-2.00 (m, 2H), 1.83 (m, 6H), 1.55 (d, J= 6.8 Hz, 3H)及1.20-1.00 (m, 2H)。LC-MS (ES +): m/z964.0 [M + H] +實例 143 合成 N -(( 1R)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -1- )-5- 側氧基戊基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-5-(( (3S,4R)-4- 氟吡咯啶 -3- ) 胺基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 86)
Figure 02_image1318
步驟 -1
向含有( 3S,4S)-3-((3-((( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-4-氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 1,180 mg,0.205 mmol)及5-(4-乙炔基-1-哌啶基)戊酸乙酯( 2,17 mg,0.512 mmol)於無水乙腈(6 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL密封管中添加碳酸銫(200.46 mg,0.615 mmol),且將所得混合物用鼓泡氮氣脫氣10分鐘。隨後,添加XPhos (9.78 mg,0.020 mmol)及XPhos-Pd-G3 (8.68 mg,0.010 mmol),且將所得混合物用氮氣脫氣5分鐘。在90℃下攪拌反應混合物4小時。藉由UPLC監測反應進程。反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且用EtOAc (200 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮合併濾液,且藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,50 g)用0-15% MeOH/DCM作為溶離劑來純化所獲得之粗殘餘物,得到呈淡黃色固體狀之( 3S,4S)-3-((3-((( R)-1-(4-((1-(5-乙氧基-5-側氧基戊基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-4-氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,165 mg,0.200 mmol,98%產率)。LC-MS (ES +): m/z727.4 [M + H] +步驟 -2
在環境溫度下向含有( 3S,4S)-3-((3-(((R)-1-(4-((1-(5-乙氧基-5-側氧基戊基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-4-氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,185 mg,0.232 mmol)於THF (3.5 mL)及MeOH (1.5 mL)之混合物中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加含單水合氫氧化鋰(48.71 mg,1.16 mmol)之水(1.5 mL)。在環境溫度下攪拌所得混合物16小時。藉由UPLC監測反應。在減壓下自反應混合物移除過量溶劑且將粗產物溶解於10%檸檬酸水溶液中。水相用15% MeOH/DCM (3×100 mL)萃取且有機相經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮。藉由逆相管柱層析(C18,RediSep Gold (100 g SNAP),移動相A:0.1%甲酸/MQ-水;B:乙腈;流動速率:15 mL/分鐘)純化粗殘餘物,得到呈灰白色固體狀之5-(4-((4-(( R)-1-(5-((( 3S,4S)-1-(三級丁氧基羰基)-4-氟吡咯啶-3-基)胺基)-2-甲基苯甲醯胺基)乙基)萘-1-基)乙炔基)哌啶-1-基)戊酸甲酸酯( 4,160 mg,0.228  mmol,98%產率)。LC-MS (ES +): m/z699.4 [M + H] +步驟 -3
向含有5-(4-((4-(( R)-1-(5-((( 3S,4S)-1- (三級丁氧基羰基)-4-氟吡咯啶-3-基)胺基)-2-甲基苯甲醯胺基)乙基)萘-1-基)乙炔基)哌啶-1-基)戊酸甲酸酯( 4,160 mg,0.228 mmol)及3-[3-甲基-2-側氧基-5-(4-哌啶基)苯并咪唑-1-基]哌啶-2,6-二酮鹽酸鹽( 5,78.39 mg,0.171 mmol )於無水DMF (2.5 mL)中之充分攪拌溶液的8 mL玻璃小瓶中添加HATU (130.58 mg,0.343 mmol)及DIPEA (295.89 mg,2.29 mmol,0.399 mL),且將混合物在環境溫度下在氮氣氛圍下攪拌2小時。藉由UPLC監測反應進程。反應完成後,在減壓下移除過量溶劑,且用冰冷水(10 mL)濕磨所獲得之粗產物。固體沈澱物經過濾,用水(10 mL)洗滌且在真空中乾燥,得到呈灰白色固體狀之( 3S,4S)-3-((3-((( 1R)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-1-基)-5-側氧基戊基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-4-氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 6,65 mg,0.062 mmol,26%產率)。LC-MS (ES +): m/z1024.4 [M + H] +步驟 -4
在0℃下向含有( 3S, 4S)-3-((3-((( 1R)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-1-基)-5-側氧基戊基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-4-氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 6,55 mg,0.052 mmol)於無水DCM (2.5 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(0.261 mL)。在環境溫度下攪拌所得混合物2小時且藉由UPLC監測。反應完成後,移除過量溶劑且用MTBE (7 mL)洗滌粗殘餘物。將所得固體溶解於水中且凍乾,得到呈灰白色固體狀之 N-(( 1R)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-1-基)-5-側氧基戊基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)-5-((( 3S,4S)-4-氟吡咯啶-3-基)胺基)-2-甲基苯甲醯胺甲酸酯 ( 化合物 86,38 mg,0.036 mmol,70%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.10 (s, 1H), 8.89 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 8.33-8.30 (m, 2H), 7.74-7.67 (m, 3H), 7.60 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 7.12 (s, 1H), 7.03 (d, J= 8 Hz, 2H), 6.93 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 6.64-6.62 (m, 2H), 6.10-6.04 (m, 1H), 5.93-5.85 (m, 1H), 5.3653.0 (m, 1H), 5.19 (d, 2 J H-F = 75 Hz, 1H), 4.61-4.52 (m, 1H), 4.25-4.16 (m, 1H), 4.09-4.02 (m, 1H), 3.80-3.70 (m, 2H), 3.60-3.48 (m, 4H), 3.52-3.50 (m, 1H), 3.20-2.80 (m, 9H), 2.50-2.45 (m, 4H), 2.30-2.18 (m, 2H), 2.14 (s, 3H), 2.10-1.95 (m, 4H), 1.90-1.70 (m, 5H), 1.68-1.45 (m, 8H)。LC-MS (ES +): m/z924.4 [M + H] +實例 144 N -(( 1R)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -1- )-5- 側氧基戊基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-5-((( 3S,4R)-4- 氟吡咯啶 -3- ) 胺基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 87)
Figure 02_image1320
基本上遵循 化合物 86之合成,使用對應中間物製備 化合物 871H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.03 (s, 1H), 8.81 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 8.29-8.32 (m, 2H), 7.66-7.63 (m, 3H), 7.57 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 7.10 (d, J= 1.2 Hz, 1H), 7.01 (d, J= 8 Hz, 1H), 6.96-6.90 (m, 2H), 6.68-6.66 (m, 2H), 5.88-5.86 (m, 1H), 5.79-5.69 (m, 1H), 5.33-5.30 (m, 1H), 5.17 (d, 2 J H-F = 96 Hz,1H), 4.61-4.52 (m, 1H), 4.03-4.00 (m, 2H), 3.32 (s, 6H), 3.30-3.05 (m, 3H), 2.90-2.70 (m, 6H), 2.70-2.60 (m, 2H), 2.50-2.27 (m, 7H), 2.10 (s, 3H), 2.00-1.97 (m, 3H), 1.80-1.73 (m, 4H), 1.56-1.49 (m, 8H). LC-MS (ES +): m/z924.4 [M + H] +實例 145 合成 ( R)-3,3- 二氟 -4-((4- 甲基 -3-((( R)-1-(4-((1-( 哌啶 -4- 基甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 胺甲醯基 ) 苯基 ) 胺基 ) 吡咯啶 -1- 甲酸三級丁酯、 ( S)-3,3- 二氟 -4-((4- 甲基 -3-((( R)-1-(4-((1-( 哌啶 -4- 基甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 胺甲醯基 ) 苯基 ) 胺基 ) 吡咯啶 -1- 甲酸三級丁酯及 ( S)-3,3- 二氟 -4-((3-((( R)-1-(4-((1-((4- 羥基哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 胺甲醯基 )-4- 甲基苯基 ) 胺基 ) 吡咯啶 -1- 甲酸三級丁酯
Figure 02_image1322
Figure 02_image1324
步驟 -1
在室溫下向含有5-溴-2-甲基-苯甲酸甲酯( 1,2 g,8.73 mmol)、4-胺基-3,3-二氟-吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 2,1.94 g,8.73 mmol)於無水1,4-二㗁烷(20 mL)中之充分攪拌溶液的40 mL小瓶中添加碳酸銫(7.11 g,21.83 mmol)。將混合物用氮氣吹掃10分鐘,隨後添加X-Phos (416.20 mg,873.09 μmol)及Pd 2(dba) 3(799.51 mg,873.09 μmol)。在110℃下攪拌反應物6小時。反應完成後,將反應混合物經由矽藻土墊過濾,且在減壓下濃縮濾液。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,15% EtOAc/石油醚)純化粗產物,得到呈淡棕色固體狀之3,3-二氟-4-(3-甲氧羰基-4-甲基-苯胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,2.2 g,5.58 mmol,63.95%產率)。UPLC (ES +): m/z315.2 [M+H- tbu] +步驟 -2
在室溫下向含有3,3-二氟-4-(3-甲氧羰基-4-甲基-苯胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,2.2 g,5.58 mmol)於無水THF (20 mL)及甲醇(20 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加含單水合氫氧化鋰(3.98 g,94.79 mmol)之水(20 mL)。在室溫下攪拌內含物16小時。反應完成後,移除溶劑且用10%檸檬酸水溶液酸化所得粗物質。水層用EtOAc (3×75 mL)萃取且合併之有機層經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且在減壓下濃縮,得到呈灰白色固體狀之5-[(1-三級丁氧基羰基-4,4-二氟-吡咯啶-3-基)胺基]-2-甲基-苯甲酸( 4,1.9 g,5.17 mmol,92.63%產率)。UPLC (ES -): m/z355.3 [M-H] -步驟 -3
在室溫下向含有5-[(1-三級丁氧基羰基-4,4-二氟-吡咯啶-3-基)胺基]-2-甲基-苯甲酸( 4,1 g,2.72 mmol)、(1R)-1-(4-溴-1-萘基)乙胺( 5,866.77 mg,2.99 mmol,HCl鹽)於無水DMF (15 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加HATU (1.55 g,4.08 mmol)及DIPEA (1.76 g,13.61 mmol,2.37 mL)。在室溫下攪拌內含物3小時。反應完成後,用水淬滅反應混合物且用EtOAc (3×40 mL)萃取水層。合併之有機層經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且在減壓下濃縮,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,30% EtOAc/石油醚)純化,得到呈白色固體狀之3,3-二氟-4-[4-甲基-3-[[(1R)-1-(4-溴-1-萘基)乙基]胺甲醯基]苯胺基]吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 6,1.4 g,2.28 mmol,83.90%產率)。UPLC (ES +): m/z532.3 [M- tbu+H] +步驟 -4
化合物3,3-二氟-4-[4-甲基-3-[[(1R)-1-(4-溴-1-萘基)乙基]胺甲醯基]苯胺基]吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 6,1.4 g,2.28 mmol)係藉由對掌性SFC分離,得到呈灰白色固體狀之(4R)-3,3-二氟-4-[4-甲基-3-[[(1R)-1-(4-溴-1-萘基)乙基]胺甲醯基]苯胺基]吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 7,任意指定為 R-異構體之早期溶離峰,0.55 g,887.88 μmol,38.88%產率,95%純度)及(4S)-3,3-二氟-4-[4-甲基-3-[[(1R)-1-(4-溴-1-萘基)乙基]胺甲醯基]苯胺基]吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 8,任意指定為 S-異構體之晚期溶離峰,0.53 g,882.61 μmol,38.65%產率,98%純度)。
7:UPLC (ES +): m/z590.2 [M+H] +。SOR [α] D 25 =-29.33 [0.3濃度,THF]
8:UPLC (ES +): m/z590.2 [M+H] +。SOR [α] D 25 =-46.00 [0.3濃度,THF]
SFC方法:樣品製備:將1.40 g 6溶解於10 mL MeCN中;儀器:PIC 100;管柱:YMC Cellulose C (250*30) mm,5μm;移動相:CO 2:IPA (60:40)%;總流量:70 g/min;背壓:100巴;波長:220 nm;循環時間:6 min;注射體積:500 µL 步驟 -5
向含有( R)-4-((3-((( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 7,250 mg,0.395 mmol)及4-乙炔基-1-(4-哌啶基甲基)哌啶鹽酸鹽( 9,192.59 mg,0.790 mmol)於無水乙腈(6 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL密封管中添加碳酸銫(321.81 mg,0.987 mmol),且將所得混合物用N 2脫氣5分鐘。隨後,添加XPhos (18.83 mg,0.039 mol)及XPhos-Pd-G3 (33.44 mg,0.039 mmol)且在90℃下加熱所得混合物3小時。經TLC指示反應完成後,經由矽藻土墊過濾所得混合物且用EtOAc (50 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮濾液且藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用20% MeOH/DCM作為溶離劑來純化所獲得之粗物質,得到呈棕色固體狀之( R)-3,3-二氟-4-((4-甲基-3-((( R)-1-(4-((1-(哌啶-4-基甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 10,195 mg,0.261 mmol,66%產率)。LC-MS (ES +): m/z714.3 [M + H] +步驟 -6
在室溫下向含有(4 S)-3,3-二氟-4-[4-甲基-3-[[(1 R)-1-(4-溴-1-萘基)乙基]胺甲醯基]苯胺基]吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 8,260 mg,384.38 μmol)、4-乙炔基-1-(4-哌啶基甲基)哌啶鹽酸鹽( 9,187.38 mg,768.76 μmol)於無水乙腈(6 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL密封管中添加碳酸銫(313.09 mg,960.95 μmol)。將氮氣吹掃通過反應混合物10分鐘。接著添加XPhos (18.32 mg,38.44 μmol)及XPhos-Pd-G3 (32.54 mg,38.44 μmol)且將反應物在90℃下攪拌4小時且藉由UPLC監測。使反應混合物穿過矽藻土床,在減壓下濃縮濾液,得到粗化合物。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,30% MeOH/DCM)純化此反應粗物質,得到呈灰白色固體狀之(4 S)-3,3-二氟-4-[4-甲基-3-[[(1 R)-1-[4-[2-[1-(4-哌啶基甲基)-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]胺甲醯基]苯胺基]吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 11,200 mg,265.84 μmol,69%產率)。LC-MS (ES +): m/z714.3 [M + H] +步驟 -7
在環境溫度下向含有( S)-4-((3-((( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 8,200 mg,0.336 mmol)及4-[(4-乙炔基-1-哌啶基)甲基]哌啶-4-醇鹽酸鹽( 12,359.06 mg,1.35 mmol)於無水ACN (2.5 mL)、THF (2.5 mL)及DMF (1 mL)中之充分攪拌溶液的15 mL密封管中添加碳酸銫(274.06 mg,0.841 mmol)。將氮氣吹掃通過反應混合物10分鐘。隨後,添加XPhos (16.04 mg,0.033 mmol)及XPhos-Pd-G3 (28.48 mg,0.033 mmol)且將混合物在90℃下攪拌4小時。經UPLC指示反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且用10% MeOH/DCM (100 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮濾液且藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用28% MeOH/DCM作為溶離劑來純化所獲得之粗物質,得到呈黃色固體狀之( S)-3,3-二氟-4-((3-((( R)-1-(4-((1-((4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 13,140 mg,0.183 mmol,55%產率)。LC-MS (ES +): m/z730.4 [M + H] +
使用 實例 145中關於( R)-3,3-二氟-4-((4-甲基-3-((( R)-1-(4-((1-(哌啶-4-基甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯之合成所述之方法,用步驟-5中之對應中間物製備靶向配體( 實例 147 148)。
使用 實例 145中關於( S)-3,3-二氟-4-((4-甲基-3-((( R)-1-(4-((1-(哌啶-4-基甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯之合成所述之方法,用步驟-6中之對應中間物製備靶向配體( 實例 146 146)。
實例編號 步驟-5 步驟-6 中之中間物 TL 結構 MS
146
Figure 02_image1326
  
Figure 02_image1328
LC-MS (ES +): m/z739.4 [M + H] +
147
Figure 02_image1330
Figure 02_image1332
LC-MS (ES +): m/z740.4 [M + H] +
148
Figure 02_image1334
  
Figure 02_image1336
LC-MS (ES +): m/z732.2 [M + H] +
149
Figure 02_image1338
  
Figure 02_image1340
LC-MS (ES +): m/z732.2 [M + H] +
實例 150 合成 ( R)-4-((3-((( R)-1-(4-((1-(5- 乙氧基 -5- 側氧基戊基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 胺甲醯基 )-4- 甲基苯基 ) 胺基 )-3,3- 二氟吡咯啶 -1- 甲酸三級丁酯及 ( S)-4-((3-((( R)-1-(4-((1-(5- 乙氧基 -5- 側氧基戊基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 胺甲醯基 )-4- 甲基苯基 ) 胺基 )-3,3- 二氟吡咯啶 -1- 甲酸三級丁酯
Figure 02_image1342
步驟 -1
在環境溫度下向含有4-((3-((( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 1,0.5 g,0.781 mmol)及5-(4-乙炔基-1-哌啶基)戊酸乙酯( 2,383.98 mg,1.56 mmol)於無水乙腈(15 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL密封管中添加碳酸銫(254.68 mg,0.781 mmol)。將氮氣吹掃通過反應混合物10分鐘。隨後,添加XPhos (37.26 mg,0.078 mmol)及XPhos-Pd-G3 (66.16 mg,0.078 mmol)且在90℃下繼續攪拌3小時。經UPLC指示反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且在減壓下濃縮濾液。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠,7% MeOH/DCM)純化所獲得之粗物質且藉由逆相管柱層析(Redisef-RF C18管柱,移動相A:10 mm NH 4HCO 3/水及B:乙腈]再純化,得到呈灰白色固體狀之4-((3-((( R)-1-(4-((1-(5-乙氧基-5-側氧基戊基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,260 mg,0.353 mmol)。 步驟 -2
遵循以下方法對化合物4-((3-((( R)-1-(4-((1-(5-乙氧基-5-側氧基戊基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,260 mg,0.353 mmol)進行對掌性SFC分離,以分離非對映異構體:YMC Cellulose-SB,流動速率:5 mL/min,共溶劑:40%,共溶劑名稱:0.5%異丙胺/IPA,注射體積:15μL,溫度:35℃,出口壓力:100巴。
在減壓下濃縮RT=2.72分鐘處之早期溶離峰,得到呈灰白色固體狀之( R)-4-((3-((( R)-1-(4-((1-(5-乙氧基-5-側氧基戊基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 4,120 mg,153.04 mmol,20%產率)。UPLC-MS (ES +): m/z746.1 [M + H] +。[α] 25= - 24.8 (c 0.25, THF)。
在減壓下濃縮RT=4.73分鐘處之晚期溶離峰,得到呈灰白色固體狀之( S)-4-((3-((( R)-1-(4-((1-(5-乙氧基-5-側氧基戊基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 5,125 mg,0.156 mmol,21%產率)。UPLC-MS (ES +): m/z746.1 [M + H] +。[α] 25= - 42.56 (c 0.25, THF)。 注意:組態經任意指定。 實例 151 合成 1-(2-(4-((4-(( R)-1-(5-((( S)-1-( 三級丁氧基羰基 )-4,4- 二氟吡咯啶 -3- ) 胺基 )-2- 甲基苯甲醯胺基 ) 乙基 ) -1- ) 乙炔基 ) 哌啶 -1- ) 乙基 )-1H- 吡唑 -4- 甲酸
Figure 02_image1344
步驟 -1
在環境溫度下向含有1H-吡唑-4-甲酸乙酯( 1,1 g,7.14 mmol)及2-溴-1,1-二乙氧基-乙烷( 2,2.11 g,10.70 mmol)於無水乙腈(10 mL)中之充分攪拌溶液的40 mL玻璃小瓶中添加碳酸銫(4.65 g,14.27 mmol)。將所得混合物在90℃下攪拌8小時。經UPLC指示反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且在減壓下濃縮濾液。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用30% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化粗殘餘物,得到呈無色液體狀之1-(2,2-二乙氧基乙基)吡唑-4-甲酸乙酯( 3,1.5 g,4.68 mmol,66%產率)。LC-MS (ES +): m/z257.1 [M + H] +步驟 -2
在環境溫度下向含有1-(2,2-二乙氧基乙基)吡唑-4-甲酸乙酯( 3,0.3 g,0.936 mmol)於無水DCM (5 mL)中之充分攪拌溶液的10 mL單頸圓底燒瓶中添加TFA (1.80 g,15.81 mmol,1.22 mL)。在環境溫度下攪拌所得混合物16小時且藉由UPLC監測。接著自反應混合物移除過量溶劑且使所獲得之粗產物與甲苯(20 mL)共沸,得到呈無色糖漿液體狀之1-(2-側氧基)吡唑-4-甲酸乙酯三氟乙酸酯( 4,0.32 g,0.745 mmol,80%產率)。LC-MS (ES +): m/z181.1 [M + H] +步驟 -3
在環境溫度下向含有( S)-4-((3-((( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 5,270 mg,0.449 mmol)及4-乙炔基哌啶鹽酸鹽( 6,49.58 mg,0.337 mmol)於無水乙腈(5 mL)及THF (2 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL密封管中添加碳酸銫(366.25 mg,1.12 mmol)。將氮氣吹掃通過反應混合物10分鐘。隨後,添加XPhos (42.87 mg,0.089 mmol)及XPhos-Pd-G3 (76.12 mg,0.089 mmol)且在90℃下繼續攪拌3小時。經UPLC確認反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且在減壓下濃縮濾液。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用30% MeOH/DCM作為溶離劑來純化粗殘餘物,得到呈灰白色固體狀之( S)-3,3-二氟-4-((4-甲基-3-((( R)-1-(4-(哌啶-4-基乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 7,0.2 g,0.304 mmol,68%產率)。LC-MS (ES +): m/z617.5 [M + H] +。注意:組態經任意指定。 步驟 -4
在環境溫度下向含有( S)-3,3-二氟-4-((4-甲基-3-((( R)-1-(4-(哌啶-4-基乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 7,0.2 g,0.304 mmol)、1-(2-側氧基)吡唑-4-甲酸酯三氟乙酸乙酯( 4,0.32 g,1.21 mmol)於無水MeOH (6 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加無水乙酸鈉(125.03 mg,1.52 mmol)及乙酸(1.05 g,17.47 mmol,1 mL)。將所得混合物在環境溫度下攪拌2小時。隨後,添加MP-CNBH 3(0.4 g,0.8 mmol;2mmol\g)且繼續攪拌16小時。經UPLC確認反應完成後,使反應混合物穿過燒結漏斗,且在減壓下濃縮濾液。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用9% MeOH/DCM作為溶離劑來純化粗物質,得到呈灰白色固體狀之1-(2-(4-((4-(( R)-1-(5-((( S)-1-(三級丁氧基羰基)-4,4-二氟吡咯啶-3-基)胺基)-2-甲基苯甲醯胺基)乙基)萘-1-基)乙炔基)哌啶-1-基)乙基)-1H-吡唑-4-甲酸乙酯( 8,0.3 g,0.256 mmol,84%產率)。LC-MS (ES +): m/z783.6 [M + H] +步驟 -5
在環境溫度下向含有1-(2-(4-((4-(( R)-1-(5-(((S)-1-(三級丁氧基羰基)-4,4-二氟吡咯啶-3-基)胺基)-2-甲基苯甲醯胺基)乙基)萘-1-基)乙炔基)哌啶-1-基)乙基)-1H-吡唑-4-甲酸乙酯( 8,0.3 g,0.256 mmol)於1:1 THF/MeOH (4 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加含單水合氫氧化鋰(107.73 mg,2.57 mmol)之水(2 mL)。在環境溫度下攪拌所得混合物4小時。經UPLC確認反應完成後,自反應混合物移除溶劑且藉由逆相管柱層析(RediSep-RF Gold C18管柱,移動相A:甲酸/水及B:乙腈)純化粗產物,得到呈灰白色固體狀之1-(2-(4-((4-(( R)-1-(5-((( S)-1-(三級丁氧基羰基)-4,4-二氟吡咯啶-3-基)胺基)-2-甲基苯甲醯胺基)乙基)萘-1-基)乙炔基)哌啶-1-基)乙基)-1H-吡唑-4-甲酸甲酸酯( 9,0.19 g,0.232 mmol,90%產率)。LC-MS (ES +): m/z755.4 [M + H] +實例 152 2- 甲基 -5-[[(3S)-4,4- 二氟吡咯啶 -3- ] 胺基 ]-N-[(1R)-1-[4-[2-[1-[[1-[1-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ] 哌啶 -4- 羰基 ]-4- 哌啶基 ] 甲基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ] 苯甲醯胺 ( 化合物 88)
Figure 02_image1346
步驟 -1
在室溫下向含有1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸鹽酸鹽( 2,120 mg,236.96 μmol)、(4S)-3,3-二氟-4-[4-甲基-3-[[(1R)-1-[4-[2-[1-(4-哌啶基甲基)-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]胺甲醯基]苯胺基]吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 1,196.10 mg,260.65 μmol)於無水DMF (2.84 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加HATU (135.15 mg,355.44 μmol)及DIPEA (153.13 mg,1.18 mmol,206.37 μL)。在室溫下攪拌內含物1小時。經UPLC指示反應完成後,用水淬滅反應混合物且灰白色沈澱物經過濾且在減壓下乾燥,得到呈灰白色固體狀之(4S)-3,3-二氟-4-[4-甲基-3-[[(1R)-1-[4-[2-[1-[[1-[1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-羰基]-4-哌啶基]甲基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]胺甲醯基]苯胺基]吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,200 mg,133.05 μmol,56%產率)。UPLC-MS (ES+): m/z1082.7 [M + H] +步驟 -2
在-78℃下向含有(4S)-3,3-二氟-4-[4-甲基-3-[[(1R)-1-[4-[2-[1-[[1-[1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-羰基]-4-哌啶基]甲基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]胺甲醯基]苯胺基]吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,200 mg,133.05 μmol)於無水DCM (4 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加含4 M HCl之1,4-二㗁烷(2 mL)。接著在室溫下攪拌內含物0.5小時。經UPLC指示反應完成後,自反應混合物移除溶劑且藉由逆相製備型HPLC [X-Select C18 (150×19) mm,5微米管柱,移動相:0.1% FA/水:MeCN]來純化粗產物,得到呈白色固體狀之2-甲基-5-[[(3S)-4,4-二氟吡咯啶-3-基]胺基]-N-[(1R)-1-[4-[2-[1-[[1-[1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-羰基]-4-哌啶基]甲基]-4-哌啶基]乙炔基]-1-萘基]乙基]苯甲醯胺甲酸酯( 化合物 88,80 mg,74.94 μmol,56.32%產率)。LCMS (ES +): m/z982.3 [M + H] +1H-NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.06 (s, 1H), 8.81 (d, J= 8.00 Hz, 1H), 8.34-8.29 (m, 2H), 7.67-7.56 (m, 4H), 6.95-6.93 (m, 2H), 6.84 (s, 1H), 6.65-6.60 (m, 4H), 5.90-5.80 (m, 2H), 5.29 (s, 1H), 4.45-4.38 (m, 1H), 3.98-3.94 (m, 2H), 3.63-3.60 (m, 2H), 3.04-2.99 (m, 2H), 2.96-2.90 (m, 2H), 2.86-2.66 (m, 5H), 2.33-2.26 (m, 3H), 2.10 (s, 3H), 1.98-1.81 (m, 3H), 1.78-1.72 (m, 10H), 1.54 (d, J= 8.00 Hz, 3H), 1.08-0.81 (m, 2H)。 實例 153 5-[[(3S)-4,4- 二氟吡咯啶 -3- ] 胺基 ]-2- 甲基 -N-[(1R)-1-[4-[2-[1-[[1-[1-[3- 甲基 -1-(1- 甲基 -2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ] 哌啶 -4- 羰基 ]-4- 哌啶基 ] 甲基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ] 苯甲醯胺 ( 化合物 89)
Figure 02_image1348
步驟 -1
向含有( S)-3,3-二氟-4-((4-甲基-3-((( R)-1-(4-((1-(哌啶-4-基甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 1,95 mg,0.119  mmol)及1-[3-甲基-1-(1-甲基-2,6-二側氧基-3-哌啶基)-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸鹽酸鹽( 2,53.26 mg,0.119 mmol)於無水DMF (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加HATU (68.14 mg,0.179 mmol)及DIPEA (77.20 mg,0.559 mmol,0.104 mL),且將所得反應混合物在環境溫度下攪拌2小時。經TLC指示反應混合物完成後,添加冷水(50 mL)且固體沈澱物經過濾,用水洗滌且在真空中乾燥,得到呈棕色固體狀之( 4S)-3,3-二氟-4-((4-甲基-3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(3-甲基-1-(1-甲基-2,6-二側氧基哌啶-3-基)-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,150 mg,0.097 mmol,81%產率)。LCMS (ES +): m/z1096.4 [M + H] +步驟 -2
在0℃下向含有( 4S)-3,3-二氟-4-((4-甲基-3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(3-甲基-1-(1-甲基-2,6-二側氧基哌啶-3-基)-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,150 mg,0.097 mmol)於無水DCM (3 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(0.242 mL)。在環境溫度下攪拌所得混合物2小時。經UPLC確認反應完成後,在減壓下自反應混合物移除過量溶劑,且藉由逆相製備型HPLC (X SELECT C18 (250×19 mm) 5微米;移動相A;0.1% FA/水:MeCN)純化所得粗產物,得到呈淡黃色固體狀之5-((( S)-4,4-二氟吡咯啶-3-基)胺基)-2-甲基- N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(3-甲基-1-(1-甲基-2,6-二側氧基哌啶-3-基)-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)苯甲醯胺甲酸酯( 化合物 89,31 mg,0.028 mmol,29%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ8.83 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.33-8.29 (m, 2H), 7.69-7.64 (m, 3H), 7.56 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 6.94 (d, J= 8.4 Hz, 2H), 6.84 (d, J= 2 Hz, 1H), 6.66-6.59 (m, 3H), 5.90-5.82 (m, 2H), 5.38-5.34 (m, 1H), 4.45-4.35 (m, 1H), 4.05-3.90 (m, 2H), 3.67-3.55 (m, 2H), 3.30 (s, 3H), 3.20 (m, 4H), 3.05 (s, 3H), 3.00-2.90 (m, 4H), 2.80-2.60 (m, 7H), 2.50 (m, 2H), 2.30 (m, 4H), 2.10 (s, 3H), 2.02-1.98 (m, 3H), 1.90-1.62 (m, 8H), 1.54 (d, J= 6.8 Hz, 3H)及1.17-0.79 (m, 2H)。LCMS (ES +): m/z997.4 [M + H] +實例 154 5-((( S)-4,4- 二氟吡咯啶 -3- ) 胺基 )- N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 )-4- 羥基哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 90)
Figure 02_image1350
步驟 -1
向含有(S)-3,3-二氟-4-((3-((( R)-1-(4-((1-((4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 1,140 mg,0.182 mmol)及1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸鹽酸鹽( 2,77.05 mg,0.182 mmol)於無水DMF (2.5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加HATU (103.93 mg,0.273 mmol)及DIPEA (117.75 mg,0.911 mmol,0.158 mL),且將反應混合物在環境溫度下攪拌2小時。反應完成後,用水淬滅反應混合物,且固體沈澱物經過濾,用水洗滌且在真空中乾燥,得到呈灰白色固體狀之( 4S)-4-((3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)-4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,130 mg,0.104 mmol,57%產率)。LC-MS (ES +): m/z1099.4 [M + H] +步驟 -2
在0℃下向含有( 4S)-4-((3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)-4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,130 mg,0.104 mmol)於無水DCM (2 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(0.260 mL)。將所得混合物在環境溫度下攪拌2小時。經TLC/UPLC指示反應完成後,自反應混合物移除過量溶劑且藉由逆相製備型HPLC (X SELECT C18 (250×19 mm) 5微米,0.1%甲酸/水:MeCN)純化所獲得之粗物質,得到呈灰白色固體狀之5-((( S)-4,4-二氟吡咯啶-3-基)胺基) -N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)-4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺甲酸酯( 化合物 90,23 mg,0.0207 mmol,20%產率)。LC-MS (ES +): m/z998.9 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO d 6 ): δ11.07 (s, 1H), 8.83 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.33-8.29 (m, 2H), 7.69-7.65 (m, 3H), 7.57 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 6.96-6.93 (m, 2H), 6.83 (d, J= 2 Hz, 1H), 6.66-6.61 (m, 3H), 5.90-5.88 (m, 2H), 5.29-5.26 (m, 1H), 4.09-4.07 (m, 3H), 3.78-3.75 (m, 1H), 3.63-3.60 (m, 3H), 3.30 (s, 3H), 3.17-3.10 (m, 3H), 3.05-2.84 (m, 5H), 2.80-2.60 (m, 10H),   2.50 (m, 2H), 2.10 (s, 3H), 2.07 (m, 1H), 2.05-1.8 (m, 3H), 1.71-1.68 (m, 4H), 1.54 (d, J= 6.8 Hz, 3H), 1.52 (m, 2H)及1.49-1.40 (m, 2H)。 實例 155 合成 5-((( R)-4,4- 二氟吡咯啶 -3- ) 胺基 )- N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 ) 哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 91)
Figure 02_image1352
步驟 -1
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸( 2,120 mg,0.236 mmol)於無水DMF (3 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (153.13 mg,1.18 mmol,0.2 mL)及HATU (135.15 mg,0.355 mmol),接著添加( R)-3,3-二氟-4-((4-甲基-3-((( R)-1-(4-((1-(哌啶-4-基甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯鹽酸鹽( 1,194.75 mg,0.260 mmol)。將所得混合物在環境溫度下攪拌1小時。藉由UPLC監測反應進程。在減壓下濃縮反應混合物,得到粗殘餘物,且用冰冷水(20 mL)稀釋後者,且過濾沈澱出的固體。用水(10 mL)洗滌過濾器上之固體,在真空中乾燥,得到呈灰白色固體狀之( 4R)-4-((3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,210 mg,0.153 mmol,65%產率)。LC-MS (ES +): m/z1082.7 [M + H] +步驟 -2
在-78℃下向含有( 4R)-4-((3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,210 mg,0.153 mmol)於無水DCM (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(2 mL,8 mmol),且在環境溫度下攪拌所得混合物0.5小時。經UPLC指示反應完成後,在減壓下移除過量溶劑且藉由逆相管柱層析(RediSep-RF Gold C18管柱,移動相:10 mm HCOOH/水:MeCN)純化所獲得之粗物質,得到呈灰白色固體狀之5-((( R)-4,4-二氟吡咯啶-3-基)胺基)-N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺甲酸酯( 化合物 91,60 mg,0.057 mmol,37%產率)。LC-MS (ES +): m/z982.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.06 (s, 1H), 8.82 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.34-8.29 (m, 2H), 7.67-7.58 (m, 4H), 6.96-6.93 (m, 2H), 6.84 (s, 1H), 6.66-6.60 (m, 3H), 5.91-5.79 (m, 2H), 5.35-5.28 (m, 1H), 4.45-4.38 (m, 1H), 3.98-3.94 (m, 2H), 3.63-3.60 (m, 3H), 3.30 (m, 2H), 3.03-2.90 (m, 2H), 2.85-2.50 (m, 11H), 2.34-2.22 (m, 4H), 2.12 (s, 3H), 2.00-1.98 (m, 4H), 1.77-1.72 (m, 11H), 1.54 (d, J= 8 Hz, 3H)及1.08-0.81 (m, 2H)。 實例 156 合成 2- 甲基 -5-[[(3R)-4,4- 二氟吡咯啶 -3- ] 胺基 ]-N-[(1R)-1-[4-[2-[1-[[1-[1-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ] 哌啶 -4- 羰基 ]-4- -4- 哌啶基 ] 甲基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ] 苯甲醯胺 ( 化合物 92)
Figure 02_image1354
基本上遵循 化合物 88之合成,使用對應中間物製備 化合物 92
LC-MS (ES +): m/z1001.2 [M + H] +1H-NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.07 (s, 1H), 8.84 (d, J= 8.00 Hz, 1H), 8.30-8.32 (m, 2H), 8.14 (s, 1H), 7.62-7.65 (m, 4H), 6.98-6.93 (m, 2H), 6.84 (d, J= 2.00 Hz, 1H), 6.63-6.65 (m, 3H), 5.90-5.87 (m, 2H), 5.29-5.26 (m, 1H), 4.16-4.13 (m, 2H), 3.90-3.80 (m, 1H), 3.63-3.60 (m, 2H), 3.31 (s, 3H), 3.26-3.19 (m, 2H), 2.92-2.82 (m, 6H), 2.80-2.70 (m, 3H), 2.70-2.60 (m, 2H), 2.50-2.42 (m, 2H), 2.13 (s, 3H), 2.01-1.95 (m, 3H), 1.77-1.72 (m, 6H), 1.54 (d, J= 6.80 Hz, 3H)。 實例 157 2- 甲基 -5-[[(3S)-4,4- 二氟吡咯啶 -3- ] 胺基 ]-N-[(1R)-1-[4-[2-[1-[[1-[1-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ] 哌啶 -4- 羰基 ]-4- -4- 哌啶基 ] 甲基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ] 苯甲醯胺 ( 化合物 93)
Figure 02_image1356
基本上遵循 化合物 88之合成,使用對應中間物製備 化合物 93
LC-MS (ES +): m/z1000.1 [M + H] +1H-NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.07 (s, 1H), 8.84 (d, J= 8.00 Hz, 1H), 8.30-8.32 (m, 2H), 8.14 (s, 1H), 7.62-7.65 (m, 4H), 6.98-6.93 (m, 2H), 6.84 (d, J= 2.00 Hz, 1H), 6.63-6.65 (m, 3H), 5.90-5.87 (m, 2H), 5.29-5.26 (m, 1H), 4.16-4.13 (m, 2H), 3.90-3.80 (m, 1H), 3.63-3.60 (m, 2H), 3.31 (s, 3H), 3.26-3.19 (m, 2H), 2.92-2.82 (m, 6H), 2.80-2.70 (m, 3H), 2.70-2.60 (m, 2H), 2.50-2.42 (m, 2H), 2.13 (s, 3H), 2.01-1.95 (m, 3H), 1.77-1.72 (m, 6H), 1.54 (d, J= 6.80 Hz, 3H)。 實例 158 5-[[(3S)-4,4- 二氟吡咯啶 -3- ] 胺基 ]-2- 甲基 -N-[(1R)-1-[4-[2-[1-[[1-[1-[1- 甲基 -3-[(3R)-3- 甲基 -2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 ] 吲唑 -6- ] 哌啶 -4- 羰基 ]-4- 哌啶基 ] 甲基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ] 苯甲醯胺 ( 化合物 94)
Figure 02_image1358
基本上遵循 化合物 88之合成,使用對應中間物製備 化合物 94
LC-MS (ES +): m/z981.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ10.82 (s, 1H), 8.82 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 8.34-8.28 (m, 2H), 7.67-7.55 (m, 5H),6.95-6.89 (m, 2H), 6.83 (s, 1H), 6.66 (s,1H), 6.65-6.59 (m, 1H), 5.90-5.80 (m, 2H), 4.41-4.38 (m, 1H), 4.02-3.90 (m, 2H), 3.87 (s, 3H), 3.83-3.80 (m, 2H), 3.38-3.20 (m, 2H), 3.04-2.93 (m, 3H), 2.93-2.70 (m, 4H), 2.68-2.66 (m, 4H), 2.50 (m, 2H), 2.42-2.41 (m, 1H), 2.30 - 2.14 (m, 4H), 2.13 (s, 3H), 2.08-1.95 (m, 2H), 1.77-1.70 (m, 10H), 1.61 (s, 3H), 1.54 (d, J= 6.8 Hz, 3H)及0.92 (m, 2H)。 實例 159 N -(( 1R)-1-(4-((1-((4- 氰基 -1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 ) 哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-5-((( S)-4,4- 二氟吡咯啶 -3- ) 胺基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 95)
Figure 02_image1360
基本上遵循 化合物 88之合成,使用對應中間物製備 化合物 951H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.07 (s, 1H), 8.82 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.34-8.29 (m, 2H), 7.69-7.63 (m, 3H), 7.57 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 6.95-6.93 (m, 2H), 6.84 (d, J= 1.6 Hz, 1H), 6.63-6.59 (m, 3H), 5.90-5.80 (m, 2H), 5.32-5.21 (m, 1H), 4.57-4.48 (m, 1H), 4.11-4.08 (m, 1H), 3.95-3.89 (m, 1H), 3.72-3.60 (m, 2H), 3.51-3.49 (m, 2H), 3.38-3.18 (m, 4H), 2.97-2.90 (m, 3H), 2.85-2.79 (m, 3H), 2.78-2.69 (m, 7H), 2.69-2.66 (m, 3H), 2.10 (s, 3H), 2.08-1.96 (m, 6H), 1.77-1.73 (m, 6H), 1.54 (d, J= 6.8 Hz, 3H)及1.39-1.24 (m, 2H)。 LCMS: ES+ (M+H) 1007.4實例 160 5-((( S)-4,4- 二氟吡咯啶 -3- ) 胺基 )- N-(( 1R)-1-(4-((1-(2-(4-(4-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -1- 羰基 )-1H- 吡唑 -1- ) 乙基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 96)
Figure 02_image1362
基本上遵循 化合物 88之合成,使用對應中間物製備 化合物 96
LC-MS (ES +): m/z979.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.09 (s, 1H), 8.82 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.31-8.28 (m, 2H), 8.12 (s, 1H), 7.70 (s, 1H), 7.65-7.60 (m, 3H), 7.55 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 7.11 (s, 1H), 7.00-6.88 (m, 3H), 6.66-6.62 (m, 2H), 5.97-5.79 (m, 2H), 5.35-5.31 (m, 1H), 4.51-4.38 (m, 2H), 4.28-4.25 (t, J= 6.4 Hz, 2H), 3.93-3.89 (m, 1H), 3.31 (s, 3H), 3.26-3.23 (m, 2H), 3.02-2.92 (m, 2H), 2.81-2.79 (m, 3H), 2.76-2.69 (m, 4H), 2.68-2.50 (m, 5H), 2.38-2.28 (m, 2H), 2.10 (s, 3H), 2.00-1.93 (m, 3H), 1.84-1.82 (m, 2H), 1.73-1.66 (m, 4H)及1.54 (d, J= 6.8 Hz, 3H)。 實例 161 N -(( 1R)-1-(4-((1-((4- 氰基 -1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 ) 哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-5-((( R)-4,4- 二氟吡咯啶 -3- ) 胺基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 97)
Figure 02_image1364
基本上遵循 化合物 88之合成,使用對應中間物製備 化合物 97
LC-MS (ES +): m/z1030.2 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6): δ11.07 (s, 1H), 8.83 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 8.34-8.30 (m, 2H), 7.69-7.66 (m, 4H), 6.94 (dd, J= 8.2, 4.4 Hz, 2H), 6.85-6.84 (m, 1H), 6.60-6.66 (m, 3H), 5.91-5.87 (m, 1H), 5.85-5.75 (m, 1H), 5.34-5.29 (m, 1H), 4.48-4.44 (m, 1H), 4.11-4.08 (m, 1H), 3.97-3.90 (m, 1H), 3.62 -3.5(m, 2H), 3.64-3.61 (m, 3H), 3.20-3.10 (m, 3H), 2.74-2.66 (m, 5H), 2.75-2.65 (m, 5H), 2.62-2.49 (m, 5H), 2.12 (s, 3H), 2.10 (m, 1H), 2.19-2.09 (m, 5H), 1.82-1.69 (m, 7H), 1.54 (d, J= 6.8 Hz, 3H)及1.45-1.35 (m, 2H)。 實例 162 合成 5-((( S)-4,4- 二氟吡咯啶 -3- ) 胺基 )- N-(( 1R)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6- 二側氧基 哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -1- )-5- 側氧基戊基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 98)
Figure 02_image1366
步驟 -1
在環境溫度下向含有( S)-4-((3-((( R)-1-(4-((1-(5-乙氧基-5-側氧基戊基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 1,125 mg,0.156 mmol)於THF (1.5 mL)及MeOH (1.5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加含單水合氫氧化鋰(65.49 mg,1.56 mmol)之水(1.5 mL)。將所得混合物在此溫度下攪拌3小時。經UPLC指示反應完成後,自反應混合物移除溶劑。將粗產物溶解於10%檸檬酸水溶液中且用10% MeOH/DCM (3×50 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥在減壓下濃縮,得到呈灰白色固體狀之5-(4-((4-(( S)-1-(5-((( R)-1-(三級丁氧基羰基)-4,4-二氟吡咯啶-3-基)胺基)-2-甲基苯甲醯胺基)乙基)萘-1-基)乙炔基)哌啶-1-基)戊酸( 2,115 mg,0.139  mmol,89%產率)。UPLC-MS (ES +): m/z717.6 [M + H] +步驟 -2
在環境溫度下向含有5-(4-((4-(( S)-1-(5-((( R)-1-(三級丁氧基羰基)-4,4-二氟吡咯啶-3-基)胺基)-2-甲基苯甲醯胺基)乙基)萘-1-基)乙炔基)哌啶-1-基)戊酸( 2,115 mg,0.209 mmol)及3-[3-甲基-2-側氧基-5-(4-哌啶基)苯并咪唑-1-基]哌啶-2,6-二酮鹽酸鹽( 3,106.07 mg,0.279 mmol)於無水DMF (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加HATU (105 mg,0.279 mmol)及DIPEA (88.28 mg,0.695 mmol,0.118 mL)。在環境溫度下攪拌所得混合物2小時。經UPLC指示反應完成後,在減壓下濃縮反應混合物。殘餘物用冰冷水(10 mL)稀釋且固體沈澱物經過濾,用水(10 mL)洗滌且在真空中乾燥,得到呈灰白色固體狀之( 4S)-4-((3-((( 1R)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-1-基)-5-側氧基戊基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 4,140 mg,0.102 mmol,73%產率)。UPLC-MS (ES +): m/z1041.6 [M + H] +步驟 -3
在0℃下向含有( 4S)-4-((3-((( 1R)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-1-基)-5-側氧基戊基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 4,140 mg,0.102 mmol)於無水DCM (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(1 mL)。將所得混合物在環境溫度下攪拌1小時。經UPLC確認反應完成後,移除溶劑且藉由逆相製備型HPLC (X-SELECT C18 (250×19) mm,5微米;移動相:0.1%甲酸/MQ-水;B:乙腈,流動速率:15 mL/分鐘)純化粗產物,得到呈灰白色固體狀之5-((( S)-4,4-二氟吡咯啶-3-基)胺基)- N-((1R)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-1-基)-5-側氧基戊基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺甲酸 ( 化合物 98,45 mg,0.045 mmol,45%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.08 (s, 1H), 8.81 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.33-8.28 (m, 2H), 7.65-7.55 (m, 4H), 7.10 (s, 1H), 7.01 (d, J= 8 Hz, 1H), 6.95-6.91 (m, 2H), 6.66-6.60 (m, 2H), 5.88-5.81 (m, 1H), 5.79-5.75 (m, 1H), 5.34-5.29 (m, 1H), 4.61-4.54 (m, 1H), 4.01-3.93 (m, 1H), 3.95-3.83 (m, 2H), 3.10 (m, 2H), 3.08-2.90 (m, 4H), 2.87-2.71 (m, 7H), 2.52-2.50 (m, 2H), 2.37-2.33 (m, 5H), 2.23-2.18 (m, 2H), 2.10 (s, 3H), 1.99-1.96 (m, 3H), 1.80-1.63 (m, 5H)及1.60-1.50 (m, 8H)。LC-MS (ES +): m/z941.2 [M + H] +實例 163 5-((( R)-4,4- 二氟吡咯啶 -3- ) 胺基 )- N-((1R)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -1- )-5- 側氧基戊基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 99)
Figure 02_image1368
基本上遵循 化合物 98之合成,使用對應中間物製備 化合物 99
LC-MS (ES +): m/z941.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.09 (s, 1H), 8.82 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.33-8.28 (m, 2H), 7.66-7.57 (m, 4H), 7.11 (s, 1H), 7.02 (d, J= 8Hz, 1H), 6.96-6.91 (m, 2H), 6.66-6.62 (m, 1H), 6.61-6.55 (m, 1H), 5.91-5.87 (m, 1H), 5.81-5.79 (m, 1H), 5.36-5.31 (m, 1H), 4.61-4.53 (m, 1H), 4.05-4.01 (m, 1H), 3.97-3.89 (m, 1H), 3.14-3.11 (m, 2H), 3.08-2.90 (m, 2H), 2.85-2.71 (m, 4H), 2.68-2.59 (m, 4H), 2.52-2.50 (m, 2H), 2.37-2.34 (m, 5H), 2.28-2.21 (m, 2H), 2.12 (s, 3H), 2.00-1.96 (m, 4H), 1.80-1.73 (m, 4H), 1.63-1.55 (m, 1H), 1.54-1.49 (m, 9H)。 實例 164 合成 ( S)-3,3- 二氟 -4-((4- 甲基 -3-((( R)-1-(4-((4-( 哌啶 -4- 基氧基 ) 環己基 ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 胺甲醯基 ) 苯基 ) 胺基 ) 吡咯啶 -1- 甲酸三級丁酯
Figure 02_image1370
Figure 02_image1372
步驟 -1
在0℃下在氮氣氛圍下向含有4-羥基環己烷甲酸甲酯( 1,4 g,25.29 mmol)、吡啶-4-醇( 2,2.40 g,25.29 mmol)及三苯膦(7.96 g,30.34 mmol)於無水THF (40 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加偶氮二甲酸二異丙酯(6.65 g,32.87 mmol,6.47 mL)。將所得混合物在55℃下攪拌48小時,且藉由UPLC監測反應進程。在減壓下自反應混合物移除過量溶劑且添加1:1 EtOAc\石油醚(20 mL)且攪拌所得混合物16小時。過濾此反應混合物,且在減壓下濃縮濾液,得到粗產物,其藉由逆相HPLC (RediSep-RF Gold C18管柱,移動相A:甲酸/水及B:乙腈)純化,得到呈糖漿液體狀之4-(4-吡啶基氧基)環己烷甲酸甲酯甲酸酯( 3,3 g,10.56 mmol,42%產率)。LC-MS (ES +): m/z236.2 [M + H] +步驟 -2
在環境溫度下向含有4-(4-吡啶基氧基)環己烷甲酸甲酯甲酸酯( 3,2.7 g,9.50 mmol)於無水MeOH (30 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加乙酸(3.15 g,52.40 mmol,3 mL)及氫氧化鈀/碳,20重量% 50%水(4 g,5.70 mmol)。將所得混合物在環境溫度下在氫氣氛圍(約1 atm)下攪拌24小時。經UPLC確認反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊且在減壓下濃縮濾液,得到呈無色糖漿液體狀之4-(4-哌啶基氧基)環己烷甲酸甲酯( 4,2.3 g,8.95 mmol,94%產率)。LC-MS (ES +): m/z242.2 [M + H] +步驟 -3
在0℃下向含有4-(4-哌啶基氧基)環己烷甲酸甲酯( 4,2.3 g,8.96 mmol)於無水DCM (30 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加TEA (4.53 g,44.79 mmol,6.24 mL)、DMAP (218.90 mg,1.79 mmol)及Boc-酸酐(3.91 g,17.92 mmol)。將所得混合物在環境溫度下攪拌2小時。經UPLC確認反應完成後,用DCM (150 mL)稀釋反應混合物。將有機相用1.5N HCl (2×20 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥,且在減壓下濃縮。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用20-30% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化粗殘餘物,得到呈無色糖漿液體狀之4-(4-甲氧羰基環己氧基)哌啶-1-甲酸三級丁酯( 5,2.5 g,7.25 mmol,81%產率)。LC-MS (ES +): m/z242.2 [M - COO tBu + H] +步驟 -4
在-78℃下在氮氣氛圍下向含有4-(4-甲氧羰基環己氧基)哌啶-1-甲酸三級丁酯( 5,2.5 g,7.25 mmol)於無水DCM (30 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中逐滴添加1M二異丁基氫化鋁/四氫呋喃(18.12 mL)。在環境溫度下攪拌所得混合物2小時且藉由UPLC監測。將反應混合物在0℃下用鹽水(20 mL)淬滅且攪拌2小時。使反應混合物穿過矽藻土墊,且用DCM (2×20 mL)萃取水相。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且在減壓下濃縮濾液。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用50-70% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化粗殘餘物,得到呈無色糖漿液體狀之4-[4-(羥甲基)環己氧基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 6,1.8 g,5.69 mmol,78%產率)。LC-MS (ES +): m/z214.2 [M - COO tBu + H] +步驟 -5
在0℃下向含有4-[4-(羥甲基)環己氧基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 6,1.9 g,6.00 mmol)於無水DCM (15 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加戴斯-馬丁高碘烷(3.82 g,9.00 mmol)。將所得混合物在環境溫度下在氮氣氛圍下攪拌2小時。經UPLC確認反應完成後,用飽和硫代硫酸鈉水溶液(5 mL)及飽和碳酸氫鈉水溶液(5 mL)淬滅反應物。水層用DCM (3×40 mL)萃取且合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且在減壓下濃縮濾液。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用35-45% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化粗殘餘物,得到呈無色糖漿液體狀之4-(4-甲醯基環己氧基)哌啶-1-甲酸三級丁酯( 7,1.4 g,4.14 mmol,69%產率)。LC-MS (ES +): m/z212.2 [M - COO tBu + H] +步驟 -6
在環境溫度下向含有4-(4-甲醯基環己氧基)哌啶-1-甲酸三級丁酯( 7,1.3 g,3.84 mmol)於無水MeOH (20 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加99%無水碳酸鉀(1.06 g,7.68 mmol)。將所得混合物在環境溫度下攪拌15分鐘。隨後,在0℃下添加(1-二氮雜-2-側氧基丙基)膦酸二甲酯( 8,1.48 g,7.68 mmol)且在環境溫度下攪拌混合物2小時。經UPLC確認反應完成後,用飽和NH 4Cl水溶液淬滅反應物。水相用EtOAc (3×20 mL)萃取且合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且在減壓下濃縮濾液。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用15-20% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化粗殘餘物,得到呈無色糖漿液體狀之4-(4-乙炔基環己氧基)哌啶-1-甲酸三級丁酯( 9,0.9 g,2.92 mmol,76%產率)。LC-MS (ES +): m/z208.2 [M - Boc + H] +步驟 -7
在環境溫度下向含有4-(4-乙炔基環己氧基)哌啶-1-甲酸三級丁酯( 9,0.9 g,2.92 mmol)於無水DCM (10 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(5 mL)。將所得混合物在此溫度下攪拌2小時。經UPLC確認反應完成後,自反應混合物移除過量溶劑。將粗殘餘物與甲苯(15 mL)一起共蒸餾,得到呈白色固體狀之4-(4-乙炔基環己氧基)哌啶鹽酸鹽( 10,0.65 g,2.67 mmol,91%產率)。LC-MS (ES +): m/z208.2 [M + H] +步驟 -8
在環境溫度下向含有( S)-4-((3-((( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 11,0.2 g,0.333 mmol)及4-(4-乙炔基環己氧基)哌啶鹽酸鹽( 10,0.2 g,0.812 mmol)於1:1無水乙腈/THF (5 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL密封管中添加碳酸銫(0.35 g,1.07 mmol)。將氮氣吹掃通過反應混合物10分鐘。隨後,添加XPhos (23.82 mg,0.049 mmol)及XPhos-Pd-G3 (42.29 mg,0.049 mol)且在90℃下繼續攪拌3小時。藉由UPLC監測反應混合物。使反應混合物穿過矽藻土墊,且在減壓下濃縮濾液。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用50-70% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化粗殘餘物,得到呈白色固體狀之( S)-3,3-二氟-4-((4-甲基-3-((( R)-1-(4-((4-(哌啶-4-基氧基)環己基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 12,200 mg,0.271 mmol,81%產率)。LC-MS (ES +): m/z716.0 [M + H] +實例 165 合成 5-((( S)-4,4- 二氟吡咯啶 -3- ) 胺基 )- N-(( 1R)-1-(4-((( 1s, 4S)-4-((1-(1-(1- (2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 ) 哌啶 -4- ) 氧基 ) 環己基 ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 100) 5-((( S)-4,4- 二氟吡咯啶 -3- ) 胺基 )- N-(( 1R)-1-(4-((( 1r, 4R)-4-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 ) 哌啶 -4- ) 氧基 ) 環己基 ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 101)
Figure 02_image1374
步驟 -1
在環境溫度下向含有( S)-3,3-二氟-4-((4-甲基-3-((( R)-1-(4-((4-(哌啶-4-基氧基)環己基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 1,200 mg,0.271 mmol)及1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-甲酸鹽酸鹽( 2,122.08 mg,0.271 mmol)於無水DMF (3 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加HATU (154.78 mg,0.407 mmol)及DIPEA (140.29 mg,1.09 mmol,0.189 mL)。在此溫度下攪拌所得混合物1小時。經UPLC指示反應完成後,用水稀釋反應混合物,且形成之灰白色固體沈澱物經過濾且在真空中乾燥,得到呈灰白色固體狀之( 4S)-4-((3-((( 1R)-1-(4-((4-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)氧基)環己基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3;250 mg,0.216 mmol,80%產率)。LC-MS (ES +): m/z1083.6 [M + H] +步驟 -2
在-78℃下向含有( 4S)-4-((3-((( 1R)-1-(4-((4-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)氧基)環己基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,250 mg,0.216 mmol)於無水DCM (3 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加4M HCl/1,4-二㗁烷(2 mL)。添加完成後,將所得混合物在環境溫度下攪拌0.5小時。經UPLC指示反應完成後,在減壓下自反應混合物移除過量溶劑,得到粗殘餘物。藉由逆相製備型HPLC (X-Select C18 (150×19) mm,5微米管柱;移動相A:0.1%甲酸/水及B:MeCN)純化粗殘餘物,得到呈白色固體狀之5-((( S)-4,4-二氟吡咯啶-3-基)胺基)- N-(( 1R)-1-(4-((( 1s, 4S)-4-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)氧基)環己基)乙炔基)萘-1-基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺甲酸酯( 化合物 100,早期溶離峰,73 mg,0.070 mmol,33%產率)及5-(((S)-4,4-二氟吡咯啶-3-基)胺基)- N-(( 1R)-1-(4-((( 1r, 4R)-4-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)氧基)環己基)乙炔基)萘-1-基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺甲酸酯( 化合物 101,晚期溶離峰,30 mg,0.029 mmol,13%產率)。 化合物 100 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.07 (s, 1H), 8.81 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.31-8.28 (m, 2H), 7.68-7.61 (m, 3H), 7.56 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 6.94 (d, J= 8.8 Hz, 2H), 6.84 (d, J= 2 Hz, 1H), 6.66-6.59 (m, 3H), 5.90-5.86 (m, 1H), 5.85-5.80 (m, 1H), 5.33-5.28 (m, 1H), 3.95-3.91 (m, 2H), 3.85-3.73 (m, 1H), 3.71-3.68 (m, 1H), 3.64-3.61 (m, 2H), 3.52-3.52 (m, 2H), 3.31 (s, 3H), 3.07-2.87 (m, 5H), 2.76-2.64 (m, 6H), 2.10-2.00 (m, 5H), 1.99-1.97 (m, 3H), 1.87-1.81 (m, 2H), 1.79-1.68 (m, 6H), 1.60-1.53 (m, 5H)及1.40-1.32 (m, 4H)。LC-MS (ES +): m/z983.4 [M + H] +化合物 101 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.07 (s, 1H), 8.82 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.34-8.29 (m, 2H), 7.68-7.64 (m, 3H), 7.57 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 6.95-6.92 (m, 2H), 6.84 (d, J= 2 Hz, 1H), 6.66-6.59 (m, 3H), 5.91-5.87 (m, 1H), 5.83-5.79 (m, 1H), 5.32-5.23 (m, 1H), 3.94-3.90 (m, 2H), 3.83-3.75 (m, 1H), 3.71-3.65 (m, 1H), 3.63-3.57 (m, 3H), 3.39-3.37 (m, 1H), 3.31-3.24 (m, 6H), 3.07-3.00 (m, 1H), 2.98-2.89 (m, 3H), 2.75-2.63 (m, 5H), 2.10 (s, 3H), 2.00-1.97 (m, 1H), 1.90-1.88 (m, 3H), 1.74-1.71 (m, 11H), 1.55 (d, J= 6.8 Hz, 3H)及1.49-1.38 (m, 2H)及1.33-1.27 (m, 1H)。LC-MS (ES +): m/z983.4 [M + H] +。 注意:組態經任意指定。 實例 166 合成 ( 3R)-3-((3-((1-(4- 溴萘 -1- ) 乙基 ) 胺甲醯基 )-4- 甲基苯基 ) 胺基 ) 吡咯啶 -1- 甲酸三級丁酯
Figure 02_image1376
步驟 -1
在環境溫度下向含有5-溴-2-甲基-苯甲酸甲酯( 1,400 mg,1.75 mmol)及( R)-3-胺基吡咯啶-1-甲酸三級丁酯(813.07 mg,4.37 mmol)於無水1,4-二㗁烷(7 mL)中之充分攪拌溶液的20 mL密封管中添加碳酸銫( 2,1.42 g,4.37 mmol)。將氮氣吹掃通過反應混合物10分鐘。隨後,添加XPhos (166.49 mg,0.349 mmol)及參(二苯亞甲基丙酮)二鈀(0) (319.80 mg,349.24 mmol)且在100℃下繼續攪拌16小時。藉由UPLC監測反應。使反應混合物穿過矽藻土墊,且用EtOAc (300 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮合併之濾液,得到粗殘餘物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用70-75% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化,得到呈黃色膠狀之( R)-3-((3-(甲氧羰基)-4-甲基苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,600 mg,1.71 mmol,97%產率)。LC-MS (ES +): m/z279.2 [M - 異丁烯+ H] +步驟 -2
在環境溫度下向含有( R)-3-((3-(甲氧羰基)-4-甲基苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,600 mg,1.71 mmol)於1:1  THF/MeOH (4 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加含LiOH.H 2O (430.52 mg,10.26 mmol)之水(2 mL)。將所得混合物在環境溫度下攪拌3小時。經UPLC指示反應完成後,在減壓下自反應混合物移除過量溶劑,且將粗物質溶解於檸檬酸水溶液(50 mL)中。用10% MeOH/DCM (2×200 mL)萃取水相,且合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮,得到呈淡黃色固體狀之( R)-5-((1-(三級丁氧基羰基)吡咯啶-3-基)胺基)-2-甲基苯甲酸( 4,520 mg,1.52 mmol,88%產率)。LC-MS (ES -): m/z319.0 [M - H] -步驟 -3
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有( R)-5-((1-(三級丁氧基羰基)吡咯啶-3-基)胺基)-2-甲基苯甲酸( 4,520 mg,1.52 mmol)及1-(4-溴萘-1-基)乙-1-胺( 5,426.38 mg,1.67 mmol)於無水DMF (3 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (980.65 mg,7.59 mmol,1.32 mL)及HATU (692.43 mg,1.82 mmol),且在環境溫度下攪拌所得混合物4小時。藉由UPLC-MS監測反應進程。反應完成後,在減壓下自反應混合物移除溶劑。藉由逆相HPLC (RediSep C18 (100 g SNAP)管柱,移動相:A:0.1%甲酸/水及B:乙腈)純化所獲得之粗物質且在減壓下濃縮具有所需產物之溶離份,得到呈淡黃色固體狀之( 3R)-3-((3-((1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯甲酸酯( 6,300 mg,0.554 mmol,36%產率)。LC-MS (ES +): m/z496.0 [M - 異丁烯+ H] +
使用上文 實例 166中所述之方法,用步驟-1中之對應胺中間物製備以下靶向配體( 實例 167)。
實例編號 步驟-1 中之 胺中間物 靶向配體 MS
167
Figure 02_image1378
Figure 02_image1380
LC-MS (ES +): m/z496.0 [M - 異丁烯+ H] +。   
實例 168 合成 ( 3S,4R)-3-((3-((( R)-1-(4- 溴萘 -1- ) 乙基 ) 胺甲醯基 )-4- 甲基苯基 ) 胺基 )-4- 羥基吡咯啶 -1- 甲酸三級丁酯
Figure 02_image1382
步驟 -1
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有5-溴-2-甲基-苯甲酸甲酯( 1,900 mg,3.93 mmol)及( 3S,4R)-3-胺基-4-羥基吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 2,794.63 mg,3.93 mmol)於無水1,4-二㗁烷(15 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL密封管中添加碳酸銫(3.20 g,9.82 mmol),且藉由將氮氣鼓泡至反應混合物中使所得混合物脫氣5分鐘。隨後,添加XPhos (374.60 mg,785.79 μmol)及參(二苯亞甲基丙酮)二鈀(0) (719.56 mg,785.79 μmol),且所得混合物用N 2再脫氣5分鐘且將反應混合物加熱至90℃後維持16小時。藉由UPLC監測反應進程。反應完成後,將反應混合物冷卻至環境溫度。反應混合物用10%檸檬酸酸化,且水相用EtOAc (2×150 mL)萃取。合併有機相用鹽水(100 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥,過濾且在減壓下濃縮濾液。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用0-100% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化粗殘餘物,得到呈灰白色固體狀之( 3R,4S)-3-羥基-4-((3-(甲氧羰基)-4-甲基苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,310 mg,0.659 mmol,17%產率)。LC-MS (ES +): m/z295.0 [M + H] +步驟 -2
在0℃下向含有( 3R,4S)-3-羥基-4-((3-(甲氧羰基)-4-甲基苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,310 mg,0.663 mmol)於1:1:1 THF/MeOH/H 2O (5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加單水合氫氧化鋰(417.65 mg,9.95 mmol)。在環境溫度下攪拌反應混合物12小時。藉由UPLC監測反應進程。反應完成後,在減壓下濃縮反應混合物,且所得粗物質用水(50 mL)稀釋且用MTBE (2×150 mL)萃取。水相用檸檬酸溶液(pH=3-4)酸化且用EtOAc (2×250 mL)萃取。在減壓下濃縮經合併之有機相,得到呈棕色液體狀之5-((( 3S,4R)-1-(三級丁氧基羰基)-4-羥基吡咯啶-3-基)胺基)-2-甲基苯甲酸( 4,315 mg,0.655 mmol,99%產率)。LC-MS (ES +): m/z281.2 [M - 異丁烯+ H] +步驟 -3
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有5-((( 3S,4R)-1-(三級丁氧基羰基)-4-羥基吡咯啶-3-基)胺基)-2-甲基苯甲酸( 4,315 mg,0.655 mmol)於無水DMF (3 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (423.60 mg,3.28 mmol,0.57 mL)及HATU (315 mg,0.655 mmol)。向燒瓶中添加( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙-1-胺( 5,195.69 mg,0.655 mmol)。在環境溫度下攪拌所得混合物4小時。經UPLC確認反應完成後,用冰水(5 mL)稀釋反應混合物,且用EtOAc (2×100 mL)萃取水相。合併之有機相用水繼之以鹽水洗滌且經無水Na 2SO 4乾燥且真空濃縮。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用0-60% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化粗殘餘物,得到呈棕色黏性固體狀之( 3S,4R)-3-((3-((( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-4-羥基吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 6,310 mg,0.404 mmol,62%產率)。LC-MS (ES +): m/z512.3 [M + H] +
使用上文 實例 168中所述之方法,用步驟-1中之對應胺中間物製備以下靶向配體( 實例 169-171)。
實例編號 步驟-1 中之 胺中間物 靶向配體 MS
169
Figure 02_image1384
Figure 02_image1386
UPLC-MS (ES +): m/z512.2 [M - 異丁烯+ H] +
170
Figure 02_image1388
Figure 02_image1390
LC-MS (ES +): m/z466.0 [M - 異丁烯+ H] +
171
Figure 02_image1392
Figure 02_image1394
LC-MS (ES +): m/z466.0 [M - 異丁烯+ H] +
實例 172 合成 4-[3-[1-(4- -1- 萘基 ) 乙基胺甲醯基 ]-4- 甲基 - 苯胺基 ] 哌啶 -1- 甲酸三級丁酯
Figure 02_image1396
步驟 -1
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有5-胺基-2-甲基-苯甲酸( 1,0.6 g,3.97 mmol)及1,2-二氯乙烷(5 mL)於MeOH (5 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加4-側氧基哌啶-1-甲酸三級丁酯( 2,1.19 g,5.95 mmol)、無水乙酸鈉(976.84 mg,11.91 mmol)及乙酸(2.10 g,34.94 mmol,2 mL)。在環境溫度下在氮氣氛圍下攪拌所得混合物2小時,接著添加MP-氰基硼氫化物(2 g,4 mmol),及攪拌所得懸浮液16小時。經TLC及LCMS指示反應完成後,過濾反應混合物且在減壓下且濃縮濾液,得到呈灰白色固體狀之5-[(1-三級丁氧基羰基-4-哌啶基)胺基]-2-甲基-苯甲酸( 3,1.3 g,3.07 mmol,77%產率)。LC-MS (ES +): m/z279.4 [M - 異丁烯+ H] +步驟 -2
在環境溫度下向含有5-[(1-三級丁氧基羰基-4-哌啶基)胺基]-2-甲基-苯甲酸( 3,1.2 g,3.72 mmol)於無水DMF (10 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加HATU (898.25 mg,2.36 mmol)及DIPEA  (1.53 g,11.81 mmol,2.06 mL),接著添加1-(4-溴萘-1-基)乙-1-胺( 4,500 mg,1.18 mmol)。在環境溫度下攪拌反應混合物2小時。經TLC指示反應完成後,反應混合物用水(150 mL)稀釋且用EtOAc (3×250 mL)萃取。合併之有機相經乾燥(Na 2SO 4),過濾且在減壓下濃縮濾液以得到粗產物,其藉由逆相HPLC (管柱:RediSep Rf Gold C18(100 g SNAP),移動相:A:10 mm NH 4HCO 3/MQ-水,B:乙腈)純化,得到呈黃色固體狀之4-[3-[1-(4-溴-1-萘基)乙基胺甲醯基]-4-甲基-苯胺基]哌啶-1-甲酸三級丁酯( 5,300 mg,0.511 mmol,43%產率)。LC-MS (ES +): m/z468.0 [M - CO 2 tBu + H] +
使用上文 實例 172中所述之方法,用步驟-1中之對應酮中間物製備以下靶向配體( 實例 173)。
實例編號 步驟-1 中之 酮中間物 靶向配體 MS
173
Figure 02_image1398
Figure 02_image1400
LC-MS (ES +): m/z578.2 [M + H] +
實例 174 合成 7-((3-((( R)-1-(4- 溴萘 -1- ) 乙基 ) 胺甲醯基 )-4- 甲基苯基 ) 胺基 )-3- 氧雜 -9- 氮雜雙環 [3.3.1] 壬烷 -9- 甲酸三級丁酯
Figure 02_image1402
步驟 -1
在環境溫度下向含有7-側氧基-3-氧雜-9-氮雜雙環[3.3.1]壬烷-9-甲酸三級丁酯( 1,600 mg,2.49 mmol)及5-胺基-2-甲基-苯甲酸( 2,375.90 mg,2.49 mmol)於無水MeOH (10 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加乙酸鈉(611.95 mg,7.46 mmol,0.4 mL)及AcOH (1.49 g,24.87 mmol,1.42 mL)。攪拌反應混合物2小時。隨後,添加MP-CNBH 3(2.5 g,4.97 mmol)且將所得混合物攪拌至環境溫度後維持16小時。經TLC指示反應完成後,經由矽藻土墊過濾反應混合物且用EtOAc (40 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮合併之濾液,得到粗殘餘物,其藉由逆相管柱層析(C-18,0.1%甲酸/水及乙腈)純化,得到呈白色固體狀之5-[(9-三級丁氧基羰基-3-氧雜-9-氮雜雙環[3.3.1]壬-7-基)胺基]-2-甲基-苯甲酸( 3, 365 mg,0.921 mmol,37%產率)。LC-MS (ES +): m/z377.2 [M + H] +步驟 -2
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有5-[(9-三級丁氧基羰基-3-氧雜-9-氮雜雙環[3.3.1]壬-7-基)胺基]-2-甲基-苯甲酸( 3,365 mg,0.911 mmol)及( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙-1-胺( 4,263.85 mg,0.911 mmol)於無水DMF (3 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加HATU (519.82 mg,1.37 mmol),接著添加DIPEA (353.38 mg,2.73 mmol,0.47 mL)。將所得混合物在環境溫度下攪拌2小時。藉由UPLC監測反應混合物之進程。反應完成後,將反應混合物用水(10 mL)稀釋且用EtOAc (3×20 mL)萃取。合併之有機相用鹽水洗滌且在減壓下蒸發以得到粗殘餘物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用0-100% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化,得到呈灰白色固體狀之 7-((3-((( R)-1-(4- 溴萘 -1- ) 乙基 ) 胺甲醯基 )-4- 甲基苯基 ) 胺基 )-3- 氧雜 -9- 氮雜雙環 [3.3.1] 壬烷 -9- 甲酸 三級丁 ( 5,490 mg,0.764 mmol,84%產率)。LC-MS (ES +): m/z608.2 [M + H] +實例 175 合成 5-((3- 氧雜 -9- 氮雜雙環 [3.3.1] -7- ) 胺基 )- N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 )-4- 羥基哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 102)
Figure 02_image1404
步驟 -1
在環境溫度下向含有7-((3-((( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3-氧雜-9-氮雜雙環[3.3.1]壬烷-9-甲酸三級丁酯( 1,200 mg,0.289 mmol)及4-[(4-乙炔基-1-哌啶基)甲基]哌啶-4-醇( 2,154.31 mg,0.578 mmol)於無水乙腈(2 mL)中之溶液的20 mL玻璃小瓶中添加碳酸銫(235.57 mg,0.723.mmol)。用N 2吹掃反應混合物,隨後在環境溫度下在氮氣氛圍下添加X Phos (13.79 mg,0.0228 mmol)及XPhos-Pd-G3 (24.48 mg,0.028 mmol)。將反應混合物在90℃下攪拌3小時。經UPLC確認反應完成後,經由矽藻土墊過濾反應混合物,且用乙腈洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮合併之濾液且藉由逆相製備型HPLC (X-SELECT,C18),5微米;移動相:A;10 mm NH 4HCO 3/MQ-水;B:乙腈;流動速率:15 mL/分鐘)來純化所獲得之粗產物,得到呈淡黃色固體狀之7-((3-((( R)-1-(4-((1-((4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3-氧雜-9-氮雜雙環[3.3.1]壬烷-9-甲酸三級丁酯( 3,90 mg,0.097 mmol,34%產率)。UPLC-MS (ES +): m/z750.5 [M + H] +步驟 -2
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸鹽酸鹽( 4,50.74 mg,0.120 mmol)及7-((3-((( R)-1-(4-((1-((4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3-氧雜-9-氮雜雙環[3.3.1]壬烷-9-甲酸三級丁酯( 3,90 mg,0.120 mmol)於無水DMF (1 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加HATU (68.44 mg,0.180 mmol)及DIPEA (77.55 mg,0.660 mmol,0.104 mL)。在此溫度下攪拌所得混合物1小時。經UPLC指示反應完成後,在減壓下移除過量溶劑以得到粗殘餘物,其用冰冷水(10 mL)稀釋。藉由過濾收集固體沈澱物,用水(15 mL)洗滌且在真空中乾燥,得到呈淡黃色固體狀之7-((3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)-4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3-氧雜-9-氮雜雙環[3.3.1]壬烷-9-甲酸三級丁酯鹽酸鹽( 5,100 mg,0.070 mmol,59%產率)。UPLC-MS (ES +): m/z1116.7 [M + H] +步驟 -3
在0℃下向含有7-((3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)-4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3-氧雜-9-氮雜雙環[3.3.1]壬烷-9-甲酸三級丁酯鹽酸鹽( 5,100 mg,0.089 mmol)於無水DCM (1 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加4M HCl/1,4-二㗁烷(0.200 mL)。將所得反應混合物在環境溫度下攪拌1小時。經UPLC指示反應完成後,真空濃縮反應混合物。藉由逆相製備型HPLC (X-SELECT,C18,5微米;移動相:A:0.1% 甲酸/MQ-水;B:乙腈;流動速率:15 mL/分鐘)純化粗產物,得到呈灰白色固體狀之5-((3-氧雜-9-氮雜雙環[3.3.1]壬-7-基)胺基)- N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)-4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺甲酸酯( 化合物 102,13.5 mg,0.012 mmol,13%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.07 (s, 1H), 8.81-8.77 (m, 1H), 8.34-8.28 (m, 2H), 7.68-7.62 (m, 3H), 7.57 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 6.95-6.90 (m, 2H), 6.84-6.84 (m, 1H), 6.64 (dd, J= 8.4, 2 Hz, 1H), 6.56-6.53 (m, 2H), 5.95-5.81 (m, 1H), 5.80-5.75 (m, 1H), 5.33-5.25 (m, 1H), 4.47-4.12 (bs, 1H), 4.10-4.02 (m, 1H), 3.80-3.65 (m, 2H), 3.64-3.55 (m, 6H), 3.30 (m, 4H), 3.04-2.92 (m, 3H), 2.90-2.81 (m, 3H), 2.79-2.65 (m, 3H), 2.63-2.55 (m, 2H), 2.50 (m, 2H), 2.43-2.35 (m, 2H), 2.30 (m, 2H), 2.20-2.16 (m, 2H), 2.10 (s, 3H), 2.00-1.90 (m, 3H), 1.8-1.62 (m, 6H)及1.6-1.33 (m, 9H)。LC-MS (ES +): m/z1018.4 [M + H] +實例 176 合成 5-((3- 氧雜 -9- 氮雜雙環 [3.3.1] -7- ) 胺基 )- N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 ) 哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 103)
Figure 02_image1406
步驟 -1
在環境溫度下向含有7-((3-((( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3-氧雜-9-氮雜雙環[3.3.1]壬烷-9-甲酸三級丁酯( 1,240 mg,0.370 mmol)及4-乙炔基-1-(4-哌啶基甲基)哌啶鹽酸鹽( 2,183.68 mg,741.42 mmol)於無水乙腈(5 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL密封管中添加碳酸銫(301.96 mg,926.77 mmol)。反應混合物用N 2吹掃10分鐘,隨後在環境溫度下在氮氣氛圍下添加X-Phos (17.67 mg,0.037 mmol)及XPhos-Pd-G3 (31.38 mg,0.037 mmol)。在90℃下攪拌反應混合物3小時。經UPLC指示反應完成後,反應混合物經由矽藻土墊過濾,且用10% MeOH/DCM (200 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮合併之濾液且藉由逆相管柱層析(管柱:RediSep-RF Gold C18(100 g SNAP),移動相:A:0.1%甲酸/水,B:MeCN)純化所獲得之粗殘餘物。在減壓下濃縮具有所需產物之溶離份以移除乙腈且接著用10%碳酸氫鈉溶液(100 mL)、鹽水(50 mL)稀釋且接著用EtOAc (3×200 mL)萃取。有機相經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮,得到呈淡黃色固體狀之7-((4-甲基-3-(((R)-1-(4-((1-(哌啶-4-基甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)-3-氧雜-9-氮雜雙環[3.3.1]壬烷-9-甲酸三級丁酯( 3,170 mg,0.207 mmol,56%產率)。UPLC-MS (ES +): m/z734.7 [M + H] +步驟 -2
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有7-((4-甲基-3-((( R)-1-(4-((1-(哌啶-4-基甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)-3-氧雜-9-氮雜雙環[3.3.1]壬烷-9-甲酸三級丁酯( 3,70 mg,0.094 mmol)及1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸鹽酸鹽( 4,48.10 mg,0.094 mmol)於無水DMF (1.5 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加HATU (53.85 mg,0.141 mmol)及DIPEA (61.01 mg,0.447 mmol,0.082 mL)。所得混合物在環境溫度下攪拌1小時。藉由UPLC監測反應進程。其後,在減壓下蒸發溶劑且添加冰冷水以沈澱經過濾之固體。所得固體用水(10 mL)洗滌且在真空中乾燥,得到呈淡黃色固體狀之7-((3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3-氧雜-9-氮雜雙環[3.3.1]壬烷-9-甲酸三級丁酯( 5,100 mg,0.075 mmol,80%產率)。UPLC-MS (ES +): m/z1102.7 [M + H] +步驟 -3
在0℃下在氮氣氛圍下向含有7-((3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3-氧雜-9-氮雜雙環[3.3.1]壬烷-9-甲酸三級丁酯( 5,100 mg,0.074 mmol)於無水DCM (2 mL)中之溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(0.186 mL)。在環境溫度下攪拌反應混合物1小時。經UPLC指示反應完成後,在減壓下濃縮反應混合物,且藉由逆相製備型HPLC (X-Select C18 (150×19) mm;5微米管柱;移動相:A:0.1%甲酸/MQ-水;B:乙腈;流動速率:15 mL/分鐘)純化所獲得之粗殘餘物,得到呈灰白色固體狀之5-((3-氧雜-9-氮雜雙環[3.3.1]壬-7-基)胺基)- N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺二甲酸酯( 化合物 103,30 mg,0.022 mmol,36%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.06 (s, 1H), 8.78 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.35 - 8.25 (m, 2H), 7.69 - 7.61 (m, 4H), 7.59 - 7.54 (m, 1H), 6.96 - 6.89 (m, 2H), 6.67 - 6.60 (m, 1H), 6.55 - 6.49 (m, 2H), 5.91 - 5.83 (m, 1H), 5.80 (d, J= 10.5 Hz, 1H), 5.29 (dd, J= 12.8, 5.2 Hz, 1H),4.40 (d, J= 12 Hz, 1H), 4.03 - 3.96 (m, 1H), 3.80-3.50 (m, 9H), 3.08 - 2.99 (m, 1H), 2.91 - 2.85 (m, 5H), 2.78 - 2.50 (m, 7H), 2.11 - 2.07 (m, 10H), 2.03 - 1.93 (m, 4H), 1.88 - 1.67 (m, 9H)及1.58 - 1.47 (m, 5H)及1.10-0.85 (m, 2H)。LC-MS (ES +): m/z1002.4 [M + H] +實例 177 合成 5-((3- 氧雜 -9- 氮雜雙環 [3.3.1] -7- ) 胺基 )- N-(( 1R)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6- 二側氧基 哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -1- )-5- 側氧基戊基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 104)
Figure 02_image1408
步驟 -1
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有7-((3-((( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3-氧雜-9-氮雜雙環[3.3.1]壬烷-9-甲酸三級丁酯( 1,240 mg,0.374 mmol)及5-(4-乙炔基-1-哌啶基)戊酸乙酯( 2,185.25 mg,0.749 mmol)於無水乙腈(5 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL密封管中添加碳酸銫(305.17 mg,0.936 mmol),且藉由將氮氣鼓泡至反應混合物中使所得混合物脫氣5分鐘。隨後,添加XPhos-Pd-G3 (31.71 mg,0.037 mmol)及二環己基-[2-(2,4,6-三異丙基苯基)苯基]膦(17.86 mg,0.037 mmol),且將所得混合物進一步用N 2脫氣5分鐘。在90℃下攪拌反應混合物3小時。經UPLC指示反應完成後,經由矽藻土墊過濾反應混合物,且在減壓下濃縮濾液。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用0-5% MeOH/DCM作為溶離劑來純化粗殘餘物,得到呈棕色固體狀之7-((3-((( R)-1-(4-((1-(5-乙氧基-5-側氧基戊基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3-氧雜-9-氮雜雙環[3.3.1]壬烷-9-甲酸三級丁酯( 3,190 mg,0.208 mmol,56%產率)。LC-MS (ES +): m/z765.2 [M + H] +步驟 -2
在0℃下向含有7-((3-((( R)-1-(4-((1-(5-乙氧基-5-側氧基戊基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3-氧雜-9-氮雜雙環[3.3.1]壬烷-9-甲酸三級丁酯( 3,190 mg,0.208 mmol)於1:1:1 THF/MeOH/H 2O (5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加單水合氫氧化鋰(87.55 mg,2.09 mmol)。在環境溫度下攪拌反應混合物1小時。經UPLC指示反應完成後,在減壓下濃縮反應混合物,且將殘餘物用水(5 mL)稀釋,且用MTBE (2×10 mL)萃取。水相用檸檬酸溶液(pH=3-4)酸化,且用10% MeOH/DCM (3×25 mL)萃取。在減壓下濃縮合併之有機相。藉由逆相管柱層析(C18管柱,移動相:10 mm HCOOH/水:MeCN)純化所獲得之粗產物,得到呈黃色固體狀之5-(4-((4-(( 1R)-1-(5-((9-(三級丁氧基羰基)-3-氧雜-9-氮雜雙環[3.3.1]壬-7-基)胺基)-2-甲基苯甲醯胺基)乙基)萘-1-基)乙炔基)哌啶-1-基)戊酸甲酸酯( 4,100 mg,0.126 mmol,61%產率)。LC-MS (ES +): m/z737.4 [M + H] +步驟 -3
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有5-(4-((4-(( 1R)-1-(5-((9-(三級丁氧基羰基)-3-氧雜-9-氮雜雙環[3.3.1]壬-7-基)胺基)-2-甲基苯甲醯胺基)乙基)萘-1-基)乙炔基)哌啶-1-基)戊酸甲酸酯( 4,100 mg,0.134 mmol)於無水DMF (1 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (52.09 mg,0.403 mmol,0.070 mL)及HATU (76.62 mg,0.201 mmol),接著添加3-[3-甲基-2-側氧基-5-(4-哌啶基)苯并咪唑-1-基]哌啶-2,6-二酮鹽酸鹽( 5,56.55 mg,0.147 mmol)。在此溫度下攪拌所得混合物2小時。經UPLC確認反應完成後,在減壓下濃縮反應混合物,得到殘餘物,其用冰冷水(20 mL)進行稀釋。在過濾器上收集固體沈澱物,且將固體用水(10 mL)洗滌,在真空中乾燥,得到呈灰白色固體狀之7-((3-((( 1R)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-1-基)-5-側氧基戊基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3-氧雜-9-氮雜雙環[3.3.1]壬烷-9-甲酸三級丁酯( 6,100 mg,84.80 mmol,63%產率)。LC-MS (ES +): m/z1062.4 [M + H] +步驟 -4
在0℃下向含有7-((3-((( 1R)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-1-基)-5-側氧基戊基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3-氧雜-9-氮雜雙環[3.3.1]壬烷-9-甲酸三級丁酯( 6,100 mg,0.084 mmol)於無水DCM (1.5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(1.5 mL, 1.7 mmol),且將所得混合物在環境溫度下攪拌1小時。經UPLC確認反應完成後,在減壓下移除過量溶劑且藉由逆相管柱層析(RediSep-RF Gold C18管柱,移動相:10 mm HCOOH/水:MeCN)純化粗產物,得到呈灰白色固體狀之5-((3-氧雜-9-氮雜雙環[3.3.1]壬-7-基)胺基)- N-(( 1R)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-1-基)-5-側氧基戊基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺二甲酸酯( 化合物 104,42 mg,0.0.039 mmol,47%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.08 (br s, 1H), 8.77 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.38 - 8.25 (m, 2H), 7.68 - 7.60 (m, 3H), 7.60 - 7.54 (m, 1H), 7.10 (s, 1H), 7.01 (d, J= 8.1 Hz, 1H), 6.97 - 6.87 (m, 2H), 6.57 - 6.49 (m, 2H), 5.92 - 5.76 (m, 2H), 5.33 (dd, J= 12.6, 5.3 Hz, 1H),  4.58 (d, J= 12.4 Hz, 1H), 4.03 (d, J= 13 Hz, 1H), 3.69 - 3.65 (m, 2H), 3.61 - 3.56 (m, 2H), 3.36 (s, 3H), 3.16 - 3.06 (m, 2H), 2.90 (m, 2H), 2.78 - 2.65 (m, 6H), 2.50 (m, 1H), 2.40 - 2.29 (m, 4H), 2.27 - 2.14 (m, 3H), 2.10 (s, 3H), 2.02 - 1.94 (m, 4H), 1.86 - 1.66 (m, 5H)及1.64 - 1.45 (m, 12H)。LC-MS (ES +): m/z962.4 [M + H] +實例 178 N -(( 1R)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -1- )-5- 側氧基戊基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-5-(((3 S,4 R)-4- 羥基吡咯啶 -3- ) 胺基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 105)
Figure 02_image1410
基本上遵循 化合物 104之合成,使用對應中間物製備 化合物 105
LC-MS (ES +): m/z921.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.09 (s, 1H), 8.80 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 8.29-8.32 (m, 2H), 7.58-7.63 (m, 4H), 7.10 (d, J= 1.2 Hz, 1H), 7.01 (d, J= 8 Hz, 1H), 6.95-6.91 (m, 2H), 6.66-6.63 (m, 2H), 5.91-5.80 (m, 1H), 5.48-5.30 (m, 2H), 4.61-4.50 (m, 1H), 4.22 (s, 1H), 4.17-3.85 (m, 3H), 3.32 (s, 3H), 3.15-3.05 (m, 4H), 2.95-2.70 (m, 8H), 2.60-2.58 (m, 3H), 2.41-2.30 (m, 4H), 2.98-2.20 (m, 2H), 2.11 (s, 3H), 1.99-1.95 (m, 3H), 1.76-1.72 (m, 4H)及1.56-1.49 (m, 8H)。 實例 179 N -(( 1R)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -1- )-5- 側氧基戊基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-5-((( 3S, 4S)-4- 羥基吡咯啶 -3- ) 胺基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 106)
Figure 02_image1412
基本上遵循 化合物 104之合成,使用對應中間物製備 化合物 106
LC-MS (ES +): m/z921.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.09 (s, 1H), 8.85-8.83 (m, 1H), 8.34-8.28 (m, 2H), 7.76-7.66 (m, 3H), 7.60-7.57 (m, 1H), 7.10-7.09 (m, 1H), 7.04-6.99 (m, 2H), 6.93-6.90 (m, 1H), 6.62-6.60 (m, 2H), 5.91-5.82 (m, 3H), 5.36-5.33 (m, 1H), 4.61-4.51 (m, 1H), 4.20 (s, 1H), 3.99-3.92 (m, 1H), 3.81-3.75 (m, 1H), 3.58-3.36 (m, 3H), 3.20-3.18 (m, 6H), 3.13-3.02 (m, 2H), 3.00-2.71 (m, 3H), 2.68-2.60 (m, 4H), 2.50-2.49 (m, 6H), 2.34-2.29 (m, 1H), 2.11 (s, 3H), 2.10 (m, 1H),  2.01-1.92 (m, 2H), 1.81-1.70 (m, 2H), 1.69-1.61 (m, 2H)及1.60-1.54 (m, 7H)。 實例 180 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )-2- 甲基 - N-(( R)-1-(4-((1-(5-(4-(3- 甲基 -1-(( R)-3- 甲基 -2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -1- )-5- 側氧基戊基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 苯甲醯胺 ( 化合物 107)
Figure 02_image1414
基本上遵循 化合物 104之合成,使用對應中間物製備 化合物 107
LC-MS (ES +): m/z920.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.10 (s, 1H), 8.87-8.84 (m, 1H), 8.34-8.28 (m, 2H), 7.79-7.67 (m, 3H), 7.61-7.59 (m, 1H), 7.12-7.11 (m, 1H), 7.09 (m, 1H), 7.04-6.91 (m, 3H), 6.61 (d, J= 8 Hz, 2H), 5.93-5.85 (m, 1H), 5.38 (dd, J= 12.8, 5.2 Hz, 1H), 4.60-4.51 (m, 1H), 4.05-3.97 (m, 1H), 3.40-3.25 (m, 5H), 3.23-2.90 (m, 8H), 2.85-2.70 (m, 3H), 3.60 (m, 3H), 2.49-2.38 (m, 3H), 2.35-2.19 (m, 2H), 2.15 (m, 5H), 2.10-1.90 (m, 4H), 1.8 1-1.70 (m, 5H), 1.65-1.41 (m, 8H)及1.30-1.20 (m, 1H)。 實例 181 N -(( 1R)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -1- )-5- 側氧基戊基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基 -5-((( S)- 哌啶 -3- ) 胺基 ) 苯甲醯胺 ( 化合物 108)
Figure 02_image1416
基本上遵循 化合物 104之合成,使用對應中間物製備 化合物 108
LC-MS (ES +): m/z920.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.09 (s, 1H), 8.82 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.33-8.28 (m, 2H), 7.66-7.63 (m, 3H), 7.57 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 7.10 (d, J= 0.8 Hz, 1H), 7.01 (d, J= 8 Hz, 1H), 6.94-6.91 (m, 2H), 6.57 (d, J= 8.4 Hz, 2H), 5.95-5.85 (m, 1H), 5.34 (s, 1H), 5.39-5.31 (m, 1H), 4.61 (m, 1H), 4.05 (m, 1H), 3.32 (s, 3H), 3.27-3.19 (m, 2H), 3.16-3.02 (m, 3H), 3.00-2.51 (m, 10H), 2.50 (m, 1H), 2.40-2.30 (m, 4H), 2.30-2.20 (m, 2H), 2.10 (s, 3H), 2.03-1.90 (m, 4H), 1.85-1.70 (m, 5H)及1.69-1.45 (m, 10H)。 實例 182 N -[1-[4-[2-[1-[5-[4-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ]-1- 哌啶基 ]-5- 側氧基 - 戊基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ]-2- 甲基 -5-(4- 哌啶基胺基 ) 苯甲醯胺 ( 化合物 109)
Figure 02_image1418
基本上遵循 化合物 104之合成製備 化合物 109,除了在步驟-1中使用5-(4-乙炔基-1-哌啶基)戊酸甲酯。
LC-MS (ES +): m/z919.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.08 (bs, 1H), 8.79 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.33-8.28 (m, 2H), 7.67-7.62 (m, 3H), 7.56 (d, J= 7.6 Hz 1H), 7.11 (s, 1H), 7.01 (d, J= 8 Hz, 1H), 6.92 (d, J= 8.8 Hz, 2H), 6.56-6.55 (m, 2H), 5.96-5.86 (m, 1H), 5.61-5.55 (m, 1H), 5.39-5.31 (m, 1H), 4.60 (m, 1H), 4.07 (m, 1H), 3.33 (s, 3H), 3.25-3.11 (m, 4H), 2.95-2.51 (m, 12H), 2.40-2.30 (m, 5H), 2.29-2.15 (m, 2H), 2.09 (s, 3H), 2.00-1.94 (m, 5H), 1.80-1.72 (m, 5H)及1.55-1.42 (m, 8H)。 實例 183 N -(1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -1- )-5- 側氧基戊基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基 -5-((( R)- 吡咯啶 -3- ) 胺基 ) 苯甲醯胺 ( 化合物 110)
Figure 02_image1420
基本上遵循 化合物 104之合成製備 化合物 110,除了在步驟-1中使用5-(4-乙炔基-1-哌啶基)戊酸甲酯。
LC-MS (ES +): m/z906.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.14 (s, 1H), 8.82 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.32-8.28 (m, 2H), 7.65-7.63 (m, 3H), 7.57 (d, J= 8 Hz, 1H), 7.11 (s, 1H), 7.01 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 6.96-0.91 (m, 2H), 6.54 (t, J= 6.8 Hz, 2H), 5.92-5.87 (m, 2H), 5.38-5.31 (m, 1H), 4.58 (d, J= 8 Hz, 1H), 4.15-3.98 (m, 3H), 3.33 (s, 3H), 3.30 (m, 2H), 3.16-3.08 (m, 2H), 2.87-2.74 (m, 7H), 2.68-2.67 (m, 1H), 2.59-2.53 (m, 1H), 2.37-2.31 (m, 5H), 2.22-2.19 (m, 2H), 2.12-2.11 (m, 4H), 1.99-1.96 (m, 3H), 1.75-1.72 (m, 6H)及1.56-1.49 (m, 7H)。 實例 184 N -(1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -1- )-5- 側氧基戊基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基 -5-((( S)- 吡咯啶 -3- ) 胺基 ) 苯甲醯胺 ( 化合物 111)
Figure 02_image1422
基本上遵循 化合物 104之合成製備 化合物 111,除了在步驟-1中使用5-(4-乙炔基-1-哌啶基)戊酸甲酯。
LC-MS (ES +): m/z905.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.08 (s, 1H), 8.81 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 8.33-8.28 (m, 2H), 7.66-7.63 (m, 3H), 7.56 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 7.11 (s, 1H), 7.01 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 6.96-6.91 (m, 2H), 6.55-6.53 (m, 2H), 5.90-5.87 (m, 1H), 5.83-5.81 (m, 1H), 5.34 (dd, J= 12.8, 5.2 Hz, 1H), 4.58 (m, 1H), 4.04-4.01 (m, 1H), 4.00-3.90 (m, 1H), 3.12 (m, 5H), 2.91-2.75 (m, 5H), 2.61-2.51 (m, 3H), 2.48-2.32 (m, 4H), 2.30-2.19 (m, 2H), 2.13-2.02 (m, 5H), 2.01-1.92 (m, 4H), 1.86-1.61 (m, 6H)及1.52-1.48 (m, 10H)。 實例 185 5-(2- 氮雜螺 [3.3] -6- 基胺基 )- N-[1-[4-[2-[1-[5-[4-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ]-1- 哌啶基 ]-5- 側氧基 - 戊基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-1- 萘基 ] 乙基 ]-2- 甲基 - 苯甲醯胺 ( 化合物 112)
Figure 02_image1424
基本上遵循 化合物 104之合成製備 化合物 112,除了在步驟-1中使用5-(4-乙炔基-1-哌啶基)戊酸甲酯。
LC-MS (ES +): m/z931.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.08 (bs, 1H), 8.79 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.33-8.28 (m, 2H), 7.66-7.63 (m, 3H), 7.56 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.11 (s, 1H), 7.03-7.01 (m, 1H), 6.93-6.90 (m, 2H), 6.43-6.42 (m, 2H), 5.89-5.86 (m, 1H), 5.79 (d, J= 6 Hz, 1H), 5.39-5.31 (m, 1H), 4.59 (m, 1H), 4.11-4.01 (m, 1H), 3.94 (bs, 2H), 3.83 (bs, 2H), 3.66-3.40 (m, 2H), 3.33 (s, 3H), 3.14-3.08 (m, 2H), 2.83-2.62 (m, 7H), 2.59-2.53 (m, 4H), 2.50 (m, 1H), 2.39-2.31 (m, 2H), 2.25-2.15 (m, 2H), 2.09 (s, 3H), 2.00-1.96 (m, 5H), 1.80-1.72 (m, 5H)及1.55-1.49 (m, 7H)。 實例 186 合成 N -(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 ) 哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-5-((( 3S, 4R)-4- 羥基吡咯啶 -3- ) 胺基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 113)
Figure 02_image1426
步驟 -1
在環境溫度下向含有 (3S, 4R)-3-((3-((( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-4-羥基吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 1,150 mg,0.195 mmol)及4-乙炔基-1-(4-哌啶基甲基)哌啶鹽酸鹽( 2,145.12 mg,0.585 mmol)於無水乙腈(3 mL)及THF (2.5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL密封管中添加碳酸銫(159.04 mg,0.488 mmol)。所得反應混合物藉由鼓泡氮氣脫氣10分鐘。隨後,添加XPhos (18.62 mg,0.039 mmol)及XPhos-Pd-G3 (24.79 mg,0.029 mmol)且在90℃下繼續攪拌4小時。經UPLC指示反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且用15% MeOH/DCM (150 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮合併之濾液且藉由逆相製備型HPLC (Red-Sep Gold C18管柱,移動相A:10 mm NH 4HCO 3/MQ-水;B:乙腈)純化所獲得之殘餘物,得到呈灰白色固體狀之( 3R, 4S)-3-羥基-4-((4-甲基-3-((( R)-1-(4-((1-(哌啶-4-基甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,55 mg,0.061 mmol,31%產率)。LC-MS (ES +): m/z694.4 [M + H] +步驟 -2
在環境溫度下向含有( 3R, 4S)-3-羥基-4-((4-甲基-3-((( R)-1-(4-((1-(哌啶-4-基甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,55 mg,0.061 mmol)及1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸鹽酸鹽( 4,30.97 mg,0.073 mmol)於無水DMF (1.5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加HATU (34.81 mg,0.091 mmol)及DIPEA (39.44 mg,0.305 mmol,0.053 mL)。在環境溫度下攪拌反應混合物2小時。經TLC指示反應混合物完成後,在減壓下濃縮過量溶劑。向所獲得之殘餘物中添加冰冷水(10 mL)且過濾固體沈澱物,用水(15 mL)洗滌且在真空中乾燥,得到呈淡黃色固體狀之( 3S, 4R)-3-((3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-4-羥基吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 5,70 mg,0.030 mmol,49%產率)。UPLC-MS (ES +): m/z1069.4 [M + H] +步驟 -3
在0℃下向含有( 3S, 4R)-3-((3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-4-羥基吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 5,70 mg,0.030 mmol)於無水DCM (1.55 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(0.076 mL)。將所得混合物在環境溫度下攪拌2小時。經UPLC指示反應完成後,自反應混合物移除過量溶劑。藉由逆相製備型HPLC (X-SELECT,C18管柱,5微米;移動相:A:0.1% FA/MQ-水;B:乙腈;流動速率:15 mL/分鐘)純化粗產物,得到呈灰白色固體狀之 N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)-5-((( 3S, 4R)-4-羥基吡咯啶-3-基)胺基)-2-甲基苯甲醯胺甲酸酯( 化合物 113,14 mg,0.013 mmol,44%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.09 (s, 1H), 8.80 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 8.34-8.28 (m, 2H), 7.69-7.64 (m, 3H), 7.58 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 6.94 (dd, J= 8.8, 2.4 Hz, 2H), 6.84 (d, J= 2 Hz, 1H), 6.65-6.63 (m, 3H), 5.88 (m, 1H), 5.40 (m, 1H), 5.30 (m, 1H), 4.45-4.36 (m, 1H), 4.20 (m, 1H), 4.00-3.85 (m, 3H), 3.63-3.60 (m, 3H), 3.10-3.04 (m, 3H), 2.96-2.76 (m, 6H), 2.65-2.60 (m, 7H), 2.50 (m, 1H), 2.25-2.19 (m, 4H), 2.17 (s, 3H), 2.00-1.96 (m, 3H), 1.81-1.71 (m, 10H), 1.55 (d, J= 6.8 Hz, 3H)及1.05-0.85 (m, 2H)。LC-MS (ES +): m/z963.4 [M + H] +實例 187 N-((1R )-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 ) 哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-5-((( 3S, 4S)-4- 羥基吡咯啶 -3- ) 胺基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 116)
Figure 02_image1428
基本上遵循 化合物 115之合成,使用對應中間物製備 化合物 116
LC-MS (ES +): m/z963.4 [M + H] +1H-NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.07 (s, 1H), 8.80 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.33-8.28 (m, 2H), 7.77-7.56 (m, 4H), 6.95-6.93 (m, 2H), 6.84 (d, J= 2 Hz, 1H), 6.65-6.56 (m, 3H), 5.90-5.86 (m, 1H), 5.63 (d, J= 8 Hz, 1H), 5.40-5.30 (m, 1H), 4.88-4.87 (m, 1H), 4.42-4.40 (d, J= 6.8 Hz, 1H), 4.12-4.10 (d, J= 6.8 Hz, 1H), 3.90 (s, 1H), 3.72-3.60 (m, 2H), 3.42 (m, 1H), 3.28 (s, 3H), 3.26-3.20 (m, 2H), 3.10-3.19 (m, 1H), 3.09-3.01 (m, 1H), 2.98-2.90 (m, 3H), 2.89-2.80 (m, 4H), 2.60 (m, 2H), 2.50-2.4 (m, 4H), 2.30-2.22 (m, 3H), 2.15 (s, 3H), 2.08 (m, 3H), 1.85-1.68 (m, 9H), 1.54 (d, J= 6.8 Hz, 3H)及1.12-0.90 (m, 2H)。 實例 188 合成 (R)-3-((4- 甲基 -3-((1-(4-((1-( 哌啶 -4- 基甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 )-3-( 噻吩 -2- ) 苯基 ) 乙基 ) 胺甲醯基 ) 苯基 ) 胺基 ) 氮雜環丁烷 -1- 羧酸三級丁酯
Figure 02_image1430
步驟 -1
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有4-溴-3-碘-苯甲酸( 1,20 g,61.18 mmol)及2-噻吩基
Figure 111138051-A0304-2
酸( 2,10.18 g,79.53 mmol)於1,4-二㗁烷(200 mL)及水(30 mL)之混合物中之充分攪拌溶液的500 mL單頸圓底燒瓶中添加碳酸鉀(16.91 g,122.36 mmol),且藉由將氮氣鼓泡至反應混合物中使所得混合物脫氣10分鐘。隨後,添加肆(三苯基膦)鈀(0) (2.12 g,1.84 mmol),且將所得混合物用N 2再脫氣5分鐘,且將反應混合物加熱至100℃後維持2小時。藉由UPLC監測反應進程。反應完成後,將反應混合物冷卻至環境溫度且經矽藻土墊過濾,用EtOAc (200 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮合併之濾液,且殘餘物用水(50 mL)稀釋且用EtOAc (50 mL)洗滌。水相用1.5N HCl水溶液酸化,且所形成之白色沈澱物經過濾且在減壓下乾燥,得到呈灰白色固體狀之4-溴-3-(2-噻吩基)苯甲酸( 3,17 g,46.23 mmol,76%產率)。LC-MS (ES -): m/z283.1 [M - H] -步驟 -2
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有4-溴-3-(2-噻吩基)苯甲酸( 3,17 g,46.23 mmol)於無水DMF (170 mL)中之充分攪拌溶液的500 mL單頸圓底燒瓶中添加DMAP (16.94 g,138.69 mmol)及3-(乙基亞胺基亞甲基胺基)- N, N-二甲基-丙-1-胺鹽酸鹽(17.73 g,92.46 mmol),接著添加 N-甲氧基甲胺鹽酸鹽( 4,18.04 g,184.93 mmol)。將所得混合物在環境溫度下攪拌3小時。藉由UPLC監測反應進程。在起始物質完全耗盡後,將反應混合物用水(700 mL)稀釋且用EtOAc (3×300 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮,得到呈黏稠無色液體狀之4-溴- N-甲氧基- N-甲基-3-(2-噻吩基)苯甲醯胺( 5,16 g,36.79 mmol,67%產率)。LC-MS (ES +): m/z328.0 [M + H] +步驟 -3
在0℃下在氮氣氛圍下向含有4-溴- N-甲氧基- N-甲基-3-(2-噻吩基)苯甲醯胺( 5,16 g,36.79 mmol)於無水THF (150 mL)中之充分攪拌溶液的500 mL三頸圓底燒瓶中添加無水三氯化鈰(18.13 g,73.57 mmol)。將所得微溶性反應物在環境溫度下攪拌1小時。將所得溶液冷卻至0℃且將2 M於THF中之溴化甲基鎂(55.18 mL)逐滴添加至燒瓶中。添加後,將所得溶液在環境溫度下攪拌3小時,同時藉由UPLC監測反應進程。在起始物質完全耗盡後,在0℃下用NH 4Cl飽和溶液(500 mL)緩慢淬滅反應物且經由矽藻土墊過濾混合物。將過濾器上之固體溶解於水(100 mL)中且用EtOAc (2×500 mL)萃取。有機相經合併且用鹽水(150 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮。藉由管柱層析(230-44目矽膠;100 g)用0-10% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化粗殘餘物,得到呈棕色糖漿液體狀之1-[4-溴-3-(2-噻吩基)苯基]乙酮( 6,12 g,34.14 mmol,93%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ8.04-8.02 (m, 1H), 7.94 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 7.86-7.83 (m, 1H), 7.75 (d, J= 5.2 Hz, 1H), 7.45-7.42 (m, 1H), 7.22 (t, J= 4.8 Hz, 1H)及2.62 (s, 3H)。 步驟 -4
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有1-[4-溴-3-(2-噻吩基)苯基]乙酮( 6,10.5 g,29.88 mmol)於無水THF (60 mL)中之充分攪拌溶液的500 mL單頸圓底燒瓶中添加( R)-2-甲基丙烷-2-亞磺醯胺( 7,4.35 g,35.85 mmol)及乙醇鈦(13.63 g,59.75 mmol,12.53 mL)。在80℃下攪拌反應混合物7小時。藉由UPLC監測反應進程。反應完成後,將反應混合物冷卻至0℃且用水(300 mL)稀釋,穿過矽藻土床且用EtOAc (300 mL)洗滌,且用EtOAc (3×150 mL)萃取水相。有機相經合併且用鹽水(100 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥,且在減壓下濃縮,得到粗殘餘物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用0-40% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化,得到呈黃色糖漿液體狀之( R,E)- N-(1-(4-溴-3-(噻吩-2-基)苯基)亞乙基)-2-甲基丙烷-2-亞磺醯胺( 8,12 g,23.63 mmol,79%產率)。LC-MS (ES +): m/z384.0 [M + H] +步驟 -5
在0℃下在氮氣氛圍下向含有( R,E)- N-(1-(4-溴-3-(噻吩-2-基)苯基)亞乙基)-2-甲基丙烷-2-亞磺醯胺( 8,12 g,23.63 mmol)於無水THF (98 mL)及水(2 mL)中之充分攪拌溶液的500 mL單頸圓底燒瓶中添加硼氫化鈉(2.68 g,70.90 mmol)。使反應混合物在環境溫度下攪拌1小時。藉由UPLC監測反應進程。反應完成後,將反應混合物冷卻至0℃,用冰冷水(30 mL)稀釋,接著在環境溫度下攪拌1小時。水層用EtOAc (3×50 mL)萃取,且有機相經合併且用鹽水(100 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用0-100% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化粗產物,得到呈無色糖漿液體狀之( R)- N-(( R)-1-(4-溴-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)-2-甲基丙烷-2-亞磺醯胺( 9 10 g,20.71 mmol,88%產率)。LC-MS (ES +): m/z386.1 [M + H] +步驟 -6
在0℃下向含有( R)- N-(( R)-1-(4-溴-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)-2-甲基丙烷-2-亞磺醯胺( 9,10 g,20.71 mmol)於無水DCM (50 mL)中之充分攪拌溶液的250 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(4 M,25 mL),且在環境溫度下攪拌所得混合物2小時。藉由UPLC監測反應混合物之進程。反應完成後,在減壓下移除過量溶劑且所獲得之粗物質用MTBE (2×50 mL)洗滌,得到呈灰白色固體狀之( R)-1-(4-溴-3-(噻吩-2-基)苯基)乙-1-胺鹽酸鹽( 10,6 g,16.19 mmol,78%產率)。LC-MS (ES +): m/z265.0 [M + H] +步驟 -7
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有( R)-1-(4-溴-3-(噻吩-2-基)苯基)乙-1-胺鹽酸鹽( 10,4 g,10.80 mmol)於無水DMF (60 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (5.58 g,43.18  mmol,7.52 mL)及HATU (6.16 g,16.19 mmol),接著添加5-[(1-三級丁氧基羰基氮雜環丁烷-3-基)胺基]-2-甲基-苯甲酸( 11,4.09 g,11.87 mmol)。將所得混合物在環境溫度下攪拌2小時。藉由UPLC監測反應進程。反應完成後,在減壓下濃縮反應混合物。將殘餘物溶解於冰冷水(20 mL)中且用EtOAc (3×30 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用0-100% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化,得到呈灰白色固體狀之( R)-3-((3-((1-(4-溴-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 12,2.6 g,2.99 mmol,28%產率)。LC-MS (ES +): m/z472.0 [M + H] +步驟 -8
向含有( R)-3-((3-((1-(4-溴-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 12,0.2 g,0.210 mmol)及4-乙炔基-1-(4-哌啶基甲基)哌啶鹽酸鹽( 13,130.27 mg,0.525 mmol)於無水乙腈(5 mL)中之充分攪拌溶液的20毫升玻璃小瓶中添加碳酸銫(205.59 mg,0.630 mmol),且藉由N 2吹掃將反應混合物脫氣5分鐘。隨後,添加XPhos-Pd-G3 (8.90 mg,0.010 mmol)及XPhos (10.03 mg,0.021 mmol),且在90℃下加熱所得混合物4小時。在反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土床墊且用EtOAc (150 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮濾液且藉由逆相管柱層析(C18管柱,移動相:10 mm HCOOH/水:MeCN)純化粗殘餘物,得到呈灰白色固體狀之( R)-3-((4-甲基-3-((1-(4-((1-(哌啶-4-基甲基)哌啶-4-基)乙炔基)-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 14,0.1 g,0.112 mmol,53%產率)。LC-MS (ES +): m/z696.4 [M + H] +
使用上文 實例 188中所述之方法,用步驟-8中之對應炔中間物製備以下靶向配體( 實例 189)。
實例編號 步驟 -8 中之 炔中間物 靶向配體 MS
189
Figure 02_image1432
Figure 02_image1434
LC-MS (ES +): m/z599.2 [M + H] +
實例 190 合成 ( S)-3,3- 二氟 -4-((4- 甲基 -3-((( R)-1-(4-((1-( 哌啶 -4- 基甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 )-3-( 噻吩 -2- ) 苯基 ) 乙基 ) 胺甲醯基 ) 苯基 ) 胺基 ) 吡咯啶 -1- 甲酸三級丁酯及 ( R)-3,3- 二氟 -4-((4- 甲基 -3-((( R)-1-(4-((1-( 哌啶 -4- 基甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 )-3-( 噻吩 -2- ) 苯基 ) 乙基 ) 胺甲醯基 ) 苯基 ) 胺基 ) 吡咯啶 -1- 甲酸三級丁酯
Figure 02_image1436
Figure 02_image1438
步驟 -1
在環境溫度下向含有5-溴-2-甲基-苯甲酸甲酯( 1,3 g,13.1 mmol)及4-胺基-3,3-二氟-吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 2,2.9 g,13.1 mmol)於無水1,4-二㗁烷(20 mL)中之溶液的(3×20 mL)玻璃小瓶中添加碳酸銫(10.6 g,32.7 mmol),且吹掃氮氣五分鐘。隨後,在環境溫度下在氮氣氛圍下添加XPhos (624.33 mg,1.31 mmol)及Pd 2(dba) 3(1.05 g,1.31 mmol)。在100℃下攪拌反應混合物6小時。反應完成後,反應混合物經由矽藻土墊過濾且用DCM洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮濾液且藉由急驟管柱層析(240-400目矽膠)用10% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化粗殘餘物,得到呈黃色膠狀之3,3-二氟-4-((3-(甲氧羰基)-4-甲基苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,3.5 g,8.69 mmol,66%產率)。LC-MS (ES +): m/z315.0 [M - 異丁烯+ H] +步驟 -2
在環境溫度下向含有3,3-二氟-4-((3-(甲氧羰基)-4-甲基苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,3.5 g,8.69 mmol)於1:1:1無水MeOH/THF/H 2O (75 mL)中之溶液的250 mL單頸圓底燒瓶中添加98%單水合氫氧化鋰(5.84 g,139.10 mmol)。在此溫度下攪拌反應混合物16小時。經UPLC指示反應完成後,減壓移除過量溶劑,且所獲得之粗物質用10%檸檬酸溶液溶解,且用EtOAc (2×50 mL)萃取。合併之有機相經Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮,得到呈黃色固體狀之5-((1-(三級丁氧基羰基)-4,4-二氟吡咯啶-3-基)胺基)-2-甲基苯甲酸( 4,3.3 g,8.6 mmol,99%產率)。LC-MS (ES +): m/z301.0 [M - 異丁烯+ H] +步驟 -3
向含有5-((1-(三級丁氧基羰基)-4,4-二氟吡咯啶-3-基)胺基)-2-甲基苯甲酸( 4,1 g,2.64 mmol)、( R)-1-(4-溴-3-(噻吩-2-基)苯基)乙-1-胺鹽酸鹽( 5,1.05 g,2.90 mmol)於無水DMF (10 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加HATU (1.50 g,3.96 mmol)及DIPEA (1.70 g,13.19 mmol,2.30 mL),且在環境溫度下攪拌所得混合物4小時。經TLC指示反應完成後,反應物用冰水淬滅,且用EtOAc (2×200 mL)萃取。合併之有機相用水、鹽水洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用50% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化粗產物,得到呈灰白色固體狀之4-((3-((( R)-1-(4-溴-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 6,1.25 g,1.64 mmol,62%產率)。LC-MS (ES +): m/z564.0 [M - 異丁烯+ H] +步驟 -4
遵循以下方法對化合物4-((3-((( R)-1-(4-溴-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 6,1.25 g,1.65 mmol)進行對掌性SFC純化,以分離非對映異構體:YMC Cellulose-SJ,流動速率:4 mL/分鐘,共溶劑:30%,共溶劑:MeOH,注射體積:300 μL,溫度:35℃,出口壓力:100巴。
在減壓下濃縮RT=2.14分鐘處之早期溶離峰,得到呈灰白色固體狀之( R)-4-((3-((( R)-1-(4-溴-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 7,470 mg,0.757 mmol,46%產率)。LC-MS (ES +): m/z564.0 [M - 異丁烯+ H] +。[α] 21.7= 3.6 (c 0.5, MeOH)。
在減壓下濃縮RT=3.21分鐘處之晚期溶離峰,得到呈灰白色固體狀之( S)-4-((3-((( R)-1-(4-溴-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 8,495 mg,0.797 mmol,48%產率)。LC-MS (ES +): m/z564.0 [M - 異丁烯+ H] +。[α] 21.6= - 8.0 (c 0.5, MeOH)。
注意:組態經任意指定。 步驟 -5
在環境溫度下向含有( S)-4-((3-((( R)-1-(4-溴-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 8,170 mg,0.271 mmol)及4-乙炔基-1-(4-哌啶基甲基)哌啶鹽酸鹽( 9,201.57 mg,0.813 mmol)於無水乙腈(5 mL)中之充分攪拌溶液的10 mL密封管中添加碳酸銫(220.92 mg,0.678 mmol)。將氮氣吹掃通過反應混合物10分鐘。隨後,添加XPhos (25.86 mg,0.0542 mmol)及XPhos-Pd-G3 (34.44 mg,0.0406 mmol)且在90℃下繼續攪拌4小時。經UPLC指示反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且用15% MeOH/DCM洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮濾液且藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用25% MeOH/DCM作為溶離劑來純化所獲得之粗物質,得到呈黃色固體狀之( S)-3,3-二氟-4-((4-甲基-3-((( R)-1-(4-((1-(哌啶-4-基甲基)哌啶-4-基)乙炔基)-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 10,100 mg,0.118 mmol,44%產率)。LC-MS (ES +): m/z746.4 [M + H] +步驟 -6
程序與步驟-5相同。獲得呈黃色固體狀之化合物( R)-3,3-二氟-4-((4-甲基-3-((( R)-1-(4-((1-(哌啶-4-基甲基)哌啶-4-基)乙炔基)-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯 11。LC-MS (ES +): m/z746.2 [M + H] +實例 191 合成 1-[4- -3-(2- 噻吩基 ) 苯基 ] 乙胺
Figure 02_image1440
步驟 -1
向含有4-溴-3-碘-苯甲酸( 1,7 g,21.41 mmol)於甲苯(80 mL)及水(8 mL)中之攪拌溶液的密封管中添加磷酸三鉀(13.64 g,64.24 mmol)及2-噻吩基
Figure 111138051-A0304-2
酸( 2,5.48 g,42.82 mmol)。將反應混合物用氮氣吹掃5分鐘,隨後添加環戊基(二苯基)膦;二氯甲烷;二氯化鈀;鐵(174.86 mg,214.12 μmol)。將反應混合物用N 2再吹掃兩分鐘,且接著在115℃下攪拌16小時。藉由TLC及UPLC監測反應進程。反應完成後,反應混合物用水(100 mL)稀釋,使用1.5 N HCl溶液酸化至pH約1且用乙酸乙酯(3×200 mL)萃取。合併之有機層經硫酸鈉乾燥且在真空中濃縮,得到粗產物,其藉由管柱層析(60-120目矽膠)用40%-50%乙酸乙酯/石油醚作為溶離劑來純化,得到呈灰白色固體狀之4-溴-3-(2-噻吩基)苯甲酸( 3,5.6 g,15.69 mmol,73%產率)。UPLC-MS (ES -): m/z281.0 [M - H] -步驟 -2
在室溫下在氮氣氛圍下向4-溴-3-(2-噻吩基)苯甲酸( 3,5.6 g,15.69 mmol)於DMF (70 mL)中之攪拌溶液中添加N,N-二甲基吡啶-4-胺(1.92 g,15.69 mmol)及3-(乙基亞胺基亞甲基胺基)-N,N-二甲基-丙-1-胺鹽酸鹽(6.02 g,31.39 mmol)。在攪拌5分鐘之後,添加N-甲氧基甲胺鹽酸鹽( 4,6.12 g,62.78 mmol),且在室溫下攪拌反應混合物4小時。藉由TLC及LCMS監測反應進程。反應完成後,將反應混合物用水(100 mL)稀釋且用乙酸乙酯(3×150 mL)萃取。將有機層用冷水(3×70 mL)洗滌,經硫酸鈉乾燥且在真空中濃縮,得到粗產物,其藉由管柱層析(60-120目矽膠)用30-40%乙酸乙酯/石油醚作為溶離劑來純化,得到呈無色膠狀之4-溴-N-甲氧基-N-甲基-3-(2-噻吩基)苯甲醯胺( 5,5.2 g,12.82 mmol,82%產率)。UPLC-MS (ES +): m/z326.1 [M + H] +步驟 -3
在0℃下向4-溴-N-甲氧基-N-甲基-3-(2-噻吩基)苯甲醯胺( 5,6.47 g,15.94 mmol)於無水THF (70 mL)中之攪拌溶液中添加無水三氯鈰(5.89 g,23.91 mmol)。在室溫下在氮氣氛圍下攪拌反應混合物1小時,隨後在0℃下逐滴添加含2 M甲基溴化鎂之THF (23.91 mL)。在室溫下攪拌所得混合物3小時。藉由TLC監測反應進程。反應完成後,將反應混合物在0℃下用飽和氯化銨溶液(50 mL)緩慢淬滅且用乙酸乙酯(3×70 mL)萃取。合併之有機層經硫酸鈉乾燥且濃縮,得到粗產物,其藉由管柱層析(60-120目矽膠)用5-10%乙酸乙酯/石油醚作為溶離劑來純化,得到呈淺黃色膠狀之1-[4-溴-3-(2-噻吩基)苯基]乙酮( 6,4 g,12.41 mmol,78%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ8.02 (m, 1H), 7.95-7.91 (m, 1H), 7.86-7.82 (m, 1H), 7.75 (d, J= 7.2 Hz, 1H), 7.43 (m, 1H), 7.23-7.20 (m, 1H)及2.51 (s, 3H)。 步驟 -4
向1-[4-溴-3-(2-噻吩基)苯基]乙酮( 6,3 g,10.67 mmol)於甲醇(40 mL)中之攪拌溶液中添加乙酸銨(8.22 g,106.70 mmol)及氰基硼氫化鈉(804.59 mg,12.80 mmol)。在75℃下在氮氣氛圍下攪拌反應混合物6小時。藉由TLC及UPLC監測反應進程。反應完成後,在0℃下使用三氟乙酸將反應混合物酸化至pH約2,且接著在減壓下濃縮。殘餘物用水(30 mL)稀釋且用乙酸乙酯(3×50 mL)萃取。合併之有機層經硫酸鈉乾燥且濃縮,得到粗產物,其藉由管柱層析(60-120目矽膠)用5-10%甲醇/DCM作為溶離劑來純化,得到呈灰白色固體狀之1-[4-溴-3-(2-噻吩基)苯基]乙胺( 7,1.8 g,6.38 mmol,60%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ8.31 (brs, 2H), 7.85 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 7.74-7.66 (m, 2H), 7.45-7.38 (m, 2H), 7.21 (dd, J= 5.2, 3.6 Hz, 1H), 4.47-4.42 (m, 1H)及1.51 (d, J= 6.8 Hz, 3H) 實例 192 合成 3-((4- 甲基 -3-((1-(4-( 哌啶 -4- 基乙炔基 )-3-( 噻吩 -2- ) 苯基 ) 乙基 ) 胺甲醯基 ) 苯基 ) 胺基 ) 氮雜環丁烷 -1- 羧酸三級丁酯
Figure 02_image1442
步驟 -1
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有1-[4-溴-3-(2-噻吩基)苯基]乙胺( 1,245.75 mg,0.870 mmol)於無水DMF (5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (675.29 mg,5.23 mmol,0.910 mL)及HATU (397.35 mg,1.05 mmol),接著添加5-[(1-三級丁氧基羰基氮雜環丁烷-3-基)胺基]-2-甲基-苯甲酸( 2,300 mg,0.870 mmol)。將所得混合物在環境溫度下攪拌16小時。藉由UPLC監測反應進程。反應完成後,在減壓下移除過量溶劑且藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用50% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化粗產物,得到呈棕色固體狀之3-[3-[1-[4-溴-3-(2-噻吩基)苯基]乙基胺甲醯基]-4-甲基-苯胺基]氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 3,260 mg,0.364 mmol,42%產率)。LC-MS (ES +): m/z516.3 [M - 異丁烯+ H] +步驟 -2
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有3-[3-[1-[4-溴-3-(2-噻吩基)苯基]乙基胺甲醯基]-4-甲基-苯胺基]氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 3,44.77 mg,0.369 mmol)及4-乙炔基哌啶( 4,44.77 mg,0.369 mmol)於無水乙腈(2 mL)中之充分攪拌溶液的20 mL小瓶中添加碳酸銫(300.67 mg,0.922 mmol),且藉由將氮氣鼓泡至反應混合物中使所得混合物脫氣5分鐘。隨後,添加XPhos-Pd-G3 (15.62 mg,0.018 mmol)及二環己基-[2-(2,4,6-三異丙基苯基)苯基]膦(17.60 mg,0.036 mmol),且將所得混合物進一步用N 2再脫氣5分鐘,隨後將反應混合物加熱至90℃後維持4小時。經UPLC確認反應完成後,將反應混合物冷卻至環境溫度,用EtOAc (50 mL)及水(50 mL)稀釋,且在環境溫度下攪拌。經由矽藻土墊過濾反應混合物,且用EtOAc (100 mL)洗滌矽藻土床。用EtOAc (2×50 mL)萃取濾液且將有機相用鹽水(10 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥,且在減壓下濃縮,得到呈棕色固體狀之3-[4-甲基-3-[1-[4-[2-(4-哌啶基)乙炔基]-3-(2-噻吩基)苯基]乙基胺甲醯基]苯胺基]氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 5,300 mg,0.330 mmol,90%產率)。LC-MS (ES +): m/z599.8 [M - 異丁烯+ H] +
使用上文 實例 192中所述之方法,用步驟-1中之對應酸中間物製備以下靶向配體( 實例 193)。
實例編號 步驟 -1 中之 酸中間物 靶向配體 MS
193
Figure 02_image1444
Figure 02_image1446
LC-MS (ES +): m/z544.7 [M + H] +
實例 194 合成 5-((( S)-4,4- 二氟吡咯啶 -3- ) 胺基 )- N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 ) 哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 )-3-( 噻吩 -2- ) 苯基 ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 115)
Figure 02_image1448
步驟 -1
向含有( S)-3,3-二氟-4-((4-甲基-3-((( R)-1-(4-((1-(哌啶-4-基甲基)哌啶-4-基)乙炔基)-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 1,100 mg,0.118 mmol)及1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸( 2,51.25 mg,0.129 mmol)於無水DMF (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加HATU (67.39 mg,0.177 mmol)及DIPEA (76.35 mg,0.590 mmol,0.103 mL),且將反應混合物在環境溫度下攪拌2小時。反應完成後,用水淬滅反應混合物且固體沈澱物經過濾,用水洗滌且在真空中乾燥,得到呈黃色固體狀之( 4S)-4-((3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,135 mg,0.084 mmol,72%產率)。LC-MS (ES +): m/z1115.4 [M + H] +步驟 -2
在0℃下向含有( 4S)-4-((3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,135 mg,0.084 mmol)於無水DCM (2 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加4M HCl/1,4-二㗁烷(0.212 mL)。將所得混合物在環境溫度下攪拌1小時。經UPLC確認反應完成後,在減壓下移除過量溶劑且藉由逆相製備型HPLC (X SELECT C18 (250×19 mm) 5微米;0.1%甲酸/水:MeCN)純化所獲得之粗物質,得到呈灰白色固體狀之5-((( S)-4,4-二氟吡咯啶-3-基)胺基)- N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺甲酸酯( 化合物 115,23 mg,0.021 mmol,25%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.06 (s, 1H), 8.68 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 7.64-7.61 (m, 3H), 7.45 (d, J = 8 Hz, 1H), 7.31 (dd, J= 8.4, 1.6 Hz, 1H), 7.17-7.15 (m, 1H), 6.96-6.93 (m, 2H), 6.84 (d, J = 2.4 Hz, 1H), 6.66-6.61 (m, 3H), 5.82-5.80 (m, 1H), 5.32-5.28 (m, 1H), 5.13-5.09 (m, 1H), 4.45-4.35 (m, 1H), 4.01-3.96 (m, 2H), 3.63-3.60 (m, 2H), 3.30-3.20 (m, 4H), 3.10-2.88 (m, 3H), 2.75-2.60 (m, 9H), 2.50 (m, 2H), 2.13-2.11 (m, 6H), 2.05-1.95 (m, 1H), 1.87-1.84 (m, 2H), 1.76-1.61 (m, 11H), 1.43 (d, J = 7.2 Hz, 3H)及1.09-0.80 (m, 2H). LC-MS (ES +): m/z1015.4 [M + H] +實例 195 5-((( R)-4,4- 二氟吡咯啶 -3- ) 胺基 )- N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 ) 哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 )-3-( 噻吩 -2- ) 苯基 ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 116)
Figure 02_image1450
基本上遵循 化合物 115之合成,使用對應中間物製備 化合物 116
LC-MS (ES +): m/z1015.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.08 (s, 1H), 8.70 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.14 (s, 1H), 7.64-7.61 (m, 3H), 7.46 (d, J= 8 Hz, 1H), 7.32 (dd, J= 8, 1.6 Hz, 1H), 7.18-7.16 (m, 1H), 6.97-6.93 (m, 2H), 6.84 (d, J= 2 Hz, 1H), 6.65-6.61 (m, 3H), 5.83-5.81 (m, 1H), 5.30-5.26 (m, 1H), 5.11-5.09 (m, 1H), 4.45-4.35 (m, 1H), 4.01-3.95 (m, 2H), 3.63-3.60 (m, 2H), 3.30 (s, 3H), 3.29-3.20 (m, 2H), 3.05-2.85 (m, 3H), 2.90 (m, 1H), 2.80-2.64 (m, 9H), 2.60-2.56 (m, 1H), 2.34-2.33 (m, 3H), 2.12 (s, 3H), 2.00-1.86 (m, 3H), 1.82-1.62 (m, 9H), 1.42 (d, J= 6.8 Hz, 3H), 1.45-0.99 (m, 1H)及0.93-0.83 (m, 1H)。 實例 196 合成 5- 胺基 -N-[1-[4-[2-[1-[4-[4-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ]-1- 哌啶基 ]-4- 側氧基 - 丁基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-3-(2- 噻吩基 ) 苯基 ] 乙基 ]-2- 甲基 - 苯甲醯胺 ( 化合物 117)
Figure 02_image1452
步驟 -1
在室溫下向含有N-[4-甲基-3-[1-[4-[2-(4-哌啶基)乙炔基]-3-(2-噻吩基)苯基]乙基胺甲醯基]苯基]胺基甲酸三級丁酯( 1,200 mg,283.24 μmol)於無水DMF (4 mL)中之充分攪拌溶液的20 mL螺旋蓋小瓶中添加99%無水碳酸鉀(117.43 mg,849.71 μmol)及4-溴丁酸甲酯( 2,102.55 mg,566.47 μmol)。在80℃下攪拌反應混合物3小時。隨後,將反應混合物用水(10 mL)稀釋且用乙酸乙酯(2×100 mL)萃取。合併之有機層經無水硫酸鈉乾燥,過濾且在減壓下濃縮,得到粗物質,其藉由Biotage® Isolera (230-400目矽膠)純化,用5%-MeOH/DCM溶離所需化合物,得到呈黃色膠質固體狀之4-[4-[2-[4-[1-[[5-(三級丁氧基羰基胺基)-2-甲基-苯甲醯基]胺基]乙基]-2-(2-噻吩基)苯基]乙炔基]-1-哌啶基]丁酸甲酯(3,150 mg,196.17 μmol,69%產率)。LC-MS (ES +): m/z644.2 [M + H] +步驟 -2
在環境溫度下向含有4-[4-[2-[4-[1-[[5-(三級丁氧基羰基胺基)-2-甲基-苯甲醯基]胺基]乙基]-2-(2-噻吩基)苯基]乙炔基]-1-哌啶基]丁酸甲酯( 3,150 mg,195.70 μmol)於THF (2 mL)、甲醇(2 mL)及水(1 mL)中之攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加98%單水合氫氧化鋰(41.06 mg,978.51 μmol),且攪拌所得混合物2小時。此後,蒸發來自反應混合物之溶劑且殘餘物用水(30 mL)稀釋且用MTBE (20 mL)萃取。水相用10%檸檬酸溶液酸化至pH=4且用10% MeOH-DCM (2×50 mL)萃取。合併之有機層經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮,得到呈灰白色膠質固體狀之4-[4-[2-[4-[1-[[5-(三級丁氧基羰基胺基)-2-甲基-苯甲醯基]胺基]乙基]-2-(2-噻吩基)苯基]乙炔基]-1-哌啶基]丁酸( 4,100 mg,146.08 μmol,75%產率)。LC-MS (ES +): m/z630.2 [M + H] +步驟 -3
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有4-[4-[2-[4-[1-[[5-(三級丁氧基羰基胺基)-2-甲基-苯甲醯基]胺基]乙基]-2-(2-噻吩基)苯基]乙炔基]-1-哌啶基]丁酸( 4,100 mg,146.08 μmol)於無水DMF (3 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加N,N-二異丙基乙胺(18.88 mg,146.08 μmol,25.44 μL)、HATU (55.54 mg,146.08 μmol)及3-[3-甲基-2-側氧基-5-(4-哌啶基)苯并咪唑-1-基]哌啶-2,6-二酮( 5,50.02 mg,146.08 μmol)。將所得混合物在室溫下攪拌4小時。此後,在減壓下蒸發溶劑且添加冰冷水。固體沈澱經洗滌且乾燥,得到呈灰白色固體狀之N-[3-[1-[4-[2-[1-[4-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-4-側氧基-丁基]-4-哌啶基]乙炔基]-3-(2-噻吩基)苯基]乙基胺甲醯基]-4-甲基-苯基]胺基甲酸三級丁酯( 6,120 mg,61.12 μmol,42%產率)。LC-MS (ES +): m/z954.2 [M + H] +步驟 -4
在0℃下向含有N-[3-[1-[4-[2-[1-[4-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-4-側氧基-丁基]-4-哌啶基]乙炔基]-3-(2-噻吩基)苯基]乙基胺甲醯基]-4-甲基-苯基]胺基甲酸三級丁酯( 6,120 mg,61.62 μmol)於無水DCM (2 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加4 M氯化氫/1,4-二㗁烷,99% (308.12 μL, 1.23 mmol)。在室溫下攪拌所得反應混合物2小時。此後,蒸發溶劑以得到粗物質,其藉由逆相HPLC (管柱:100 g Redisep C18管柱;移動相A:0.1%甲酸/水及移動相B:乙腈],化合物以40%甲酸:CH 3CN溶離)純化,得到呈白色固體狀之5-胺基-N-[1-[4-[2-[1-[4-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-4-側氧基-丁基]-4-哌啶基]乙炔基]-3-(2-噻吩基)苯基]乙基]-2-甲基-苯甲醯胺甲酸酯( 化合物 117,50 mg,54.47 μmol,88%產率)。LC-MS (ES +): m/z854.2 [M + H] +1H-NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.11 (s, 1H), 9.43-9.36 (m, 1H), 8.66 (d, J= 8.00 Hz, 1H), 7.67-7.56 (m, 3H), 7.48 (d, J= 8.00 Hz, 1H), 7.37-7.32 (m, 1H), 7.21-7.17 (m, 1H), 7.10 (s, 1H), 7.03 (d, J= 8.00 Hz, 1H), 6.97-6.87 (m, 2H), 6.58-6.55 (m, 2H), 5.36-5.32 (m, 1H), 5.13-5.09 (m, 1H), 4.60-4.57 (m, 1H), 4.02-3.97 (m, 1H), 3.54-3.45 (m, 2H), 3.18-2.83 (m, 11H), 2.71-2.60 (m, 4H), 2.20-2.17 (m, 1H), 2.09 (s, 3H), 2.02-1.80 (m, 8H), 1.67-1.48 (m, 2H), 1.43 (d, J= 6.80 Hz, 3H)。 實例 197 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )-N-[1-[4-[2-[1-[5-[4-[1-(2,6- 二側氧基 -3- 哌啶基 )-3- 甲基 -2- 側氧基 - 苯并咪唑 -5- ]-1- 哌啶基 ]-5- 側氧基 - 戊基 ]-4- 哌啶基 ] 乙炔基 ]-3-(2- 噻吩基 ) 苯基 ] 乙基 ]-2- 甲基 - 苯甲醯胺 ( 化合物 118)
Figure 02_image1454
基本上遵循 化合物 117之合成製備 化合物 118,除了在步驟-1中使用3-[4-甲基-3-[1-[4-[2-(4-哌啶基)乙炔基]-3-(2-噻吩基)苯基]乙基胺甲醯基]苯胺基]氮雜環丁烷-1-羧酸酯(1當量)及5-溴戊酸甲酯(2當量)。
LC-MS (ES +): m/z925.2 [M + H] +1H-NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ10.99 (bs, 1H), 8.70 (d, J= 8.40 Hz, 1H), 8.31 (s, 1H), 7.63-7.62 (m, 3H), 7.46 (d, J= 8.00 Hz, 1H), 7.30 (dd, J= 1.60, 8.00 Hz, 1H), 7.16 (dd, J= 4.00, 4.80 Hz, 1H), 7.10 (s, 1H), 7.03-6.91 (m, 3H), 6.49-6.47 (m, 2H), 6.29 (d, J= 7.20 Hz, 1H), 5.38-5.31 (m, 1H), 5.14-5.07 (m, 1H), 4.61-4.55 (m, 1H), 4.32-4.23 (m, 1H), 4.05-3.98 (m, 3H), 3.62-3.58 (m, 1H), 3.37 (s, 3H), 3.14-3.04 (m, 2H), 2.93-2.72 (m, 2H), 2.71-2.54 (m, 6H), 2.37-2.26 (m, 5H), 2.15-2.07 (m, 5H), 2.01-1.93 (m, 1H), 1.86-1.70 (m, 4H), 1.65-1.46 (m, 8H), 1.43 (d, J= 6.80 Hz, 3H)。 實例 198 合成 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )- N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 ) 哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 )-3-( 噻吩 -2- ) 苯基 ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 119)
Figure 02_image1456
步驟 -1
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有( R)-3-((4-甲基-3-((1-(4-((1-(哌啶-4-基甲基)哌啶-4-基)乙炔基)-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 1,100 mg,0.114 mmol)於無水DMF (1.5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (74.28 mg,0.574 mmol,0.1 mL)及HATU (65.56 mg,0.172 mmol),接著添加1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-甲酸( 2,52.32 mg,0.114 mmol)。將所得混合物在環境溫度下攪拌4小時。經UPLC指示反應完成後,減壓移除過量溶劑,且用冰冷水(20 mL)稀釋所獲得之殘餘物。所形成之固體沈澱物經過濾,用水(10 mL)洗滌且在真空中乾燥,得到呈灰白色固體狀之3-((3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 3,120 mg,0.090 mmol,78%產率)。LC-MS (ES +): m/z1064.6 [M + H] +步驟 -2
在-78℃下向含有3-((3-((( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 3,120 mg,0.090 mmol)於無水DCM (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加三氟乙酸(51.42 mg,0.450 mmol,0.034 mL),且將所得混合物在環境溫度下攪拌1小時。經UPLC指示反應完成後,在減壓下移除過量溶劑以得到粗殘餘物,其藉由逆相管柱層析(RediSep-RF Gold C18管柱,移動相:10 mm HCOOH/水:MeCN)純化,得到呈灰白色固體狀之5-(氮雜環丁烷-3-基胺基)-N-(( 1R)-1-(4-((1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺甲酸酯( 化合物 119,15 mg,0.014 mmol,16%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.12 (bs, 1H), 8.69 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 8.29 (s, 1H), 7.65-7.62 (m, 2H), 7.47 (d, J= 8 Hz, 1H), 7.31 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 7.18 (dd , J= 5, 4 Hz, 1H), 6.97-6.93 (m, 2H), 6.84 (s, 1H), 6.64 (d, J= 6.8 Hz, 1H), 6.49-6.47 (m, 2H), 6.21 (d, J= 6.8 Hz, 1H), 5.30 (dd , J= 13, 5.6 Hz, 1H), 5.13-5.09 (m, 1H), 4.43-4.35 (m, 1H), 4.30-4.19 (m, 1H), 4.12-3.85 (m, 3H), 3.68-3.55 (m, 3H), 3.30 (s, 3H;與溶劑合併), 3.10-2.80 (m, 2H), 2.66-2.50 (m, 14H), 2.12-1.85 (m, 6H), 2.00 (m, 1H), 1.85-1.61 (m, 9H), 1.43 (d, J= 7.2 Hz, 3H)及1.02-0.87 (m, 2H)。LC-MS (ES +): m/z964.2 [M + H] +實例 199 合成 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )- N-(( 1R)-1-(4-((1-(5-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- ) 戊基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 )-3-( 噻吩 -2- ) 苯基 ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 120)
Figure 02_image1458
步驟 -1
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有5-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-基)戊醛( 2,110 mg,0.227 mmol)及( R)-3-((4-甲基-3-((1-(4-(哌啶-4-基乙炔基)-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 1,121.44 mg,0.192 mmol)於DMSO (2 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中。隨後,添加無水乙酸鈉(93.09 mg,1.13 mmol)及乙酸(136.29 mg,2.27 mmol,0.129 mL)。在此溫度下攪拌混合物4小時,向燒瓶中添加MP-CNBH 3(190 mg,0.381 mmol;2 mmol/g)。反應完成後,反應混合物經過濾且在減壓下濃縮,得到粗產物,其藉由逆相管柱層析(純化方法:管柱:Redisef-RF C18 120 g,移動相A:0.1%甲酸/水及B:乙腈)純化,得到呈棕色膠質液體狀之3-((3-((( 1R)-1-(4-((1-(5-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-基)戊基)哌啶-4-基)乙炔基)-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 3,90 mg,0.080 mmol,35%產率)。LC-MS (ES +): m/z1009.4 [M + H] +步驟 -2
在0℃下向含有3-((3-((( 1R)-1-(4-((1-(5-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-基)戊基)哌啶-4-基)乙炔基)-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 3,90 mg,0.080 mmol)於無水DCM (1 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(0.020 mL)。添加完成後,在環境溫度下攪拌內含物2小時。藉由UPLC監測反應。反應完成後,自反應混合物移除過量溶劑以得到粗殘餘物,其藉由逆相製備型HPLC (管柱:X Select C18(250×19) mm,5微米;移動相A:0.1%甲酸/水及B:乙腈)純化,得到呈白色固體狀之5-(氮雜環丁烷-3-基胺基)- N-(( 1R)-1-(4-((1-(5-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-基)戊基)哌啶-4-基)乙炔基)-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺甲酸酯( 化合物 120, 15.5 mg,0.015 mmol,19%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.15 (s, 1H), 8.71 (d, J= 10.4 Hz, 1H), 7.64-7.61 (m, 3H), 7.48 (d, J= 5.6 Hz, 1H), 7.31 (d , J= 6.8 Hz, 1H), 7.19-7.16 (m, 1H), 6.98-6.91 (m, 2H), 6.82 (d, J= 2 Hz, 1H), 6.64 (d, J= 2.4 Hz, 1H), 6.51-6.49 (m, 2H),6.30-6.25 (m, 1H), 5.29 (dd , J= 12.8, 5.2 Hz, 1H), 5.13-5.09 (m, 1H), 4.32-4.25 (m, 1H), 4.03-3.91 (m, 2H), 3.62-3.35 (m, 3H), 3.30 (s, 3H), 2.93-2.85 (m, 1H), 2.67-2.61 (m, 7H), 2.34-2.25 (m, 3H), 2.16-2.05 (m, 5H), 2.01-1.98 (m, 2H), 1.90-1.84 (m, 2H), 1.76-1.70 (m, 2H), 1.63-1.55 (m, 2H), 1.49-1.38 (m, 5H)及1.38-1.19 (m, 9H)。LC-MS (ES +): m/z909.4 [M + H] +實例 200 合成 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )- N-(1-(4-((1-(6-(4-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -1- )-6- 側氧基己醯基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 )-3-( 噻吩 -2- ) 苯基 ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 121)
Figure 02_image1460
步驟 -1
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有6-(4-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-1-基)-6-側氧基己酸( 2,56.37 mg,0.110 mmol)於無水DMF (3 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (71.23 mg,0.551 mmol,0.095 mL)及HATU (50.29 mg,0.132 mmol),接著添加3-[4-甲基-3-[1-[4-[2-(4-哌啶基)乙炔基]-3-(2-噻吩基)苯基]乙基胺甲醯基]苯胺基]氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯鹽酸鹽( 1,100 mg,0.110 mmol)。將所得混合物在環境溫度下攪拌3小時。藉由UPLC監測反應進程。在減壓下濃縮反應混合物,得到粗殘餘物,且用冰冷水(20 mL)稀釋後者,且過濾沈澱出的固體。過濾器上之固體用水(10 mL)洗滌,且在真空中乾燥,得到呈棕色固體狀之3-[3-[1-[4-[2-[1-[6-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-6-側氧基-己醯基]-4-哌啶基]乙炔基]-3-(2-噻吩基)苯基]乙基胺甲醯基]-4-甲基-苯胺基]氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 3,80 mg,0.030 mmol,28%產率)。LC-MS (ES +): m/z1051.7 [M + H] +步驟 -2
在0℃下向含有3-[3-[1-[4-[2-[1-[6-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-6-側氧基-己醯基]-4-哌啶基]乙炔基]-3-(2-噻吩基)苯基]乙基胺甲醯基]-4-甲基-苯胺基]氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 3,80 mg,0.030 mmol)於無水DCM (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(0.152 mmol,0.038 mL),且將所得混合物在環境溫度下攪拌1小時。藉由UPLC監測反應進程。接著在減壓下移除過量溶劑且藉由逆相HPLC (RediSep-RF Gold C18管柱,移動相A:10 mm NH 4HCO 3/水,B:乙腈)純化所獲得之粗物質,得到呈灰白色固體狀之5-(氮雜環丁烷-3-基胺基)- N-[1-[4-[2-[1-[6-[4-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]-1-哌啶基]-6-側氧基-己醯基]-4-哌啶基]乙炔基]-3-(2-噻吩基)苯基]乙基]-2-甲基-苯甲醯胺( 化合物 121,16 mg,0.015 mmol,50%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.08 (s, 1H), 8.68 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 7.64-7.59 (m, 3H), 7.48 (d, J= 8 Hz, 1H), 7.32 (d, J= 6.8 Hz, 1H), 7.16 (dd, J= 5, 3.6, 5 Hz, 1H), 7.11 (s, 1H), 7.01 (d, J= 8 Hz, 1H), 6.96-6.91 (m, 2H), 6.47-6.47 (m, 2H), 6.17 (d, J= 6.8 Hz, 1H), 5.34-5.31 (m, 1H), 5.17-5.10 (m, 1H), 4.60-4.52 (m, 1H), 4.30-4.20 (m, 1H), 4.08-3.98 (m, 1H), 3.95-3.79 (m, 3H), 3.70-3.62 (m, 2H), 3.55-3.45 (m, 2H), 3.28-3.05 (m, 2H), 3.00-2.85 (m, 2H), 2.85-2.71 (m, 2H), 2.65 (m, 1H), 2.35 (m, 2H), 2.11 (s, 3H), 2.02-1.93 (m, 2H), 1.90-1.69 (m, 5H), 1.70-1.40 (m, 12H), 1.30-1.10 (m, 4H)。LC-MS (ES +): m/z952.2 [M + H] +實例 201 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )- N-(1-(4-((1-(2-(4-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -1- ) 乙醯基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 )-3-( 噻吩 -2- ) 苯基 ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 122)
Figure 02_image1462
基本上遵循 化合物 121之合成,使用對應中間物製備 化合物 122
LC-MS (ES +): m/z883.2 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.09 (s, 1H), 8.68 (d, J= 8 Hz, 1H), 7.62-7.57 (m, 3H), 7.50-7.48 (d, J= 8 Hz, 1H), 7.32 (d, J= 6.8 Hz, 1H), 7.15-7.13 (m, 1H), 7.07 (s, 1H), 7.0-7.02 (d, J= 8 Hz, 1H), 6.93-6.90 (m, 2H), 6.47-6.43 (m, 2H), 6.17 (d, J= 6.80 Hz, 1H), 5.34-5.31 (m, 1H), 5.13-5.10 (m, 1H), 4.26-4.20 (m, 1H), 3.90-3.80 (m, 4H), 3.50-3.35 (m, 4H), 3.31 (s, 3H), 3.23-3.12 (m, 4H), 2.99-2.90 (m, 4H), 2.68-2.63 (m, 2H), 2.14-2.11 (m, 4H), 2.01-1.90 (m, 2H), 1.88-1.60 (m, 7H), 1.52-1.46 (m, 1H), 1.43 (d, J= 6.8 Hz, 3H)。 實例 202 合成 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )- N-(( 1S)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -1- )-5- 側氧基戊基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 )-3-( 噻吩 -2- ) 苯基 ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 123)
Figure 02_image1464
步驟 -1
在環境溫度下向含有3-[3-[1-[4-溴-3-(2-噻吩基)苯基]乙基胺甲醯基]-4-甲基-苯胺基]氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 1,700 mg,0.797 mmol)及5-(4-乙炔基-1-哌啶基)戊酸乙酯( 2,259.28 mg,0.797 mmol)於無水乙腈(5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL密封管中添加碳酸銫(649.60 mg,1.99 mmol),且藉由鼓泡氮氣使所得混合物脫氣5分鐘。隨後,添加XPhos (38.02 mg,0.079 mmol)及XPhos-Pd-G3 (33.75 mg,0.039 mmol),且將所得混合物用氮氣再脫氣5分鐘。在90℃下攪拌反應混合物4小時。藉由UPLC監測反應進程。反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊,且用EtOAc (50 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮濾液且藉由逆相管柱層析(RediSep-RF Gold C18管柱,移動相A:10 mm HCOOH/水,B:MeCN)純化所獲得之粗物質,得到呈灰白色固體狀之3-[3-[1-[4-[2-[1-(5-乙氧基-5-側氧基-戊基)-4-哌啶基]乙炔基]-3-(2-噻吩基)苯基]乙基胺甲醯基]-4-甲基-苯胺基]氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯甲酸酯( 3,270 mg,0.342 mmol,43%產率)。LC-MS (ES +): m/z727.6 [M + H] +步驟 -2
遵循以下方法對化合物3-[3-[1-[4-[2-[1-(5-乙氧基-5-側氧基-戊基)-4-哌啶基]乙炔基]-3-(2-噻吩基)苯基]乙基胺甲醯基]-4-甲基-苯胺基]氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯甲酸酯( 3,270 mg,0.349 mmol)進行對掌性SFC分離,以分離非對映異構體:YMC Cellulose-SZ,流動速率:4 mL/分鐘,共溶劑:50%,共溶劑:0.1%異丙胺/IPA,溫度:35℃,出口壓力:100巴。在減壓下濃縮RT=2.6分鐘處之晚期溶離峰,得到呈灰白色固體狀之( S)-3-((3-((1-(4-((1-(5-乙氧基-5-側氧基戊基)哌啶-4-基)乙炔基)-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 4,100 mg,0.131 mmol,38%產率,99.7%對掌性純度)。LC-MS (ES +): m/z727.3 [M + H] +步驟 -3
在環境溫度下向含有( S)-3-((3-((1-(4-((1-(5-乙氧基-5-側氧基戊基)哌啶-4-基)乙炔基)-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 4,100 mg,0.131 mmol)於1:1 THF/MeOH (4 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加含單水合氫氧化鋰(11.01 mg,0.262 mmol)之水(1 mL)。將所得混合物在此溫度下攪拌2小時。經UPLC指示反應完成後,自反應混合物移除溶劑。粗產物用1.5 N HCl酸化且用10% MeOH/DCM (2×25 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮,得到呈黃色固體狀之( S)-5-(4-((4-(1-(5-((1-(三級丁氧基羰基)氮雜環丁烷-3-基)胺基)-2-甲基苯甲醯胺基)乙基)-2-(噻吩-2-基)苯基)乙炔基)哌啶-1-基)戊酸鹽酸鹽( 5,100 mg,0.125 mmol,96%產率)。LC-MS (ES +): m/z699.2 [M + H] +步驟 -4
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有( S)-5-(4-((4-(1-(5-((1-(三級丁氧基羰基)氮雜環丁烷-3-基)胺基)-2-甲基苯甲醯胺基)乙基)-2-(噻吩-2-基)苯基)乙炔基)哌啶-1-基)戊酸鹽酸鹽( 5,100 mg,0.125 mmol)於無水DMF (3 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (48.51 mg,0.375 mmol,0.065 mL)、HATU (57.08 mg,0.150 mmol)及3-[3-甲基-2-側氧基-5-(4-哌啶基)苯并咪唑-1-基]哌啶-2,6-二酮三氟乙酸酯( 6,57.51 mg,0.125 mmol)。將所得混合物在環境溫度下攪拌2小時。經UPLC指示反應完成後,在減壓下濃縮反應混合物,且向所獲得之粗殘餘物中添加冰水(10 mL)。固體沈澱物經過濾,用水(10 mL)洗滌且在真空中乾燥,得到呈灰白色固體狀之3-((3-((( 1S)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-1-基)-5-側氧基戊基)哌啶-4-基)乙炔基)-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 7,140 mg,0.088 mmol,71%產率)。LC-MS (ES -): m/z1022.4 [M - H] -步驟 -5
在0℃下向含有3-((3-((( 1S)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-1-基)-5-側氧基戊基)哌啶-4-基)乙炔基)-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 7,140 mg,0.088 mmol)於無水DCM (3 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加TFA (101.45 mg,0.889 mmol,0.068 mL),且將所得混合物在環境溫度下攪拌1小時。經UPLC指示反應完成後,在減壓下移除過量溶劑且粗產物藉由逆相HPLC (RediSep-RF Gold C18管柱,移動相A:10 mm TFA/水及B:MeCN)純化,得到呈灰白色固體狀之5-(氮雜環丁烷-3-基胺基)- N-(( 1S)-1-(4-((1-(5-(4-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-1-基)-5-側氧基戊基)哌啶-4-基)乙炔基)-3-(噻吩-2-基)苯基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺二-三氟乙酸酯( 化合物 123,60 mg,0.051 mmol,58%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.10 (s, 1H), 9.30 (bs, 1H), 8.72 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 7.67-7.56 (m, 3H), 7.49 (d, J= 8 Hz, 1H), 7.37-7.32 (m, 1H), 7.19-7.15 (m, 1H), 7.10 (s, 1H), 7.19-7.00 (m, 2H), 6.95-6.90 (m, 1H), 6.52-6.49 (m, 2H), 5.38-5.31 (m, 1H), 5.15-5.08 (m, 1H), 4.63-4.55 (m, 1H), 4.38-4.20 (m, 3H), 4.03-3.95 (m, 1H), 3.90-3.75 (m, 3H), 3.33 (s, 3H), 3.25-3.05 (m, 4H), 3.00-2.75 (m, 7H), 2.7-2.6 (m, 2H), 2.50 (m, 1H), 2.44-2.41 (m, 2H), 2.20-2.15 (m, 1H), 2.12 (s, 3H), 2.05-1.9 (m, 3H), 1.90-1.76 (m, 3H), 1.721-1.51 (m, 6H), 1.43 (d, J= 7.20 Hz, 3H)。LC-MS (ES +): m/z923.4 [M + H] +實例 203 合成 (3-((( R)-1-(4-((( 3R, 4S)-3- -1-( 哌啶 -4- 基甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 胺甲醯基 )-4- 甲基苯基 ) 胺基甲酸三級丁酯
Figure 02_image1466
步驟 -1
在10℃下在氮氣氛圍下向含有7-氧雜-3-氮雜雙環[4.1.0]庚烷-3-甲酸三級丁酯( 1,3.0 g,15.06 mmol)於無水DMSO (30 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加炔化鋰(2.71 g,30.11 mmol)。將所得混合物在環境溫度下攪拌16小時。其後,反應混合物用水(20 mL)稀釋且用EtOAc (2×100 mL)萃取。有機相經合併,經無水Na 2SO 4乾燥,且在減壓下濃縮,得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用50% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化,得到呈無色液體狀之( 3S, 4S)-4-乙炔基-3-羥基哌啶-1-甲酸三級丁酯( 2,2.2 g,8.52 mmol,57%產率)。LC-MS (ES +): m/z170.0 [M - 異丁烯+ H] +步驟 -2
在0℃下在氮氣氛圍下向含有( 3S, 4S)-4-乙炔基-3-羥基哌啶-1-甲酸三級丁酯( 2,1.00 g,3.86 mmol)於無水DCM (10 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加 N-乙基- N-(三氟-硫基)乙胺,DAST (2.49 g,15.45 mmol,2.04 mL),且在環境溫度下攪拌所得混合物4小時。經TLC指示反應完成後,在0℃下用飽和NaHCO 3(30 mL)淬滅反應物且用DCM (2×200 mL)萃取水相。合併之有機相用鹽水(20 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用15% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化粗物質,得到呈黃色液體狀之( 3R, 4S)-4-乙炔基-3-氟哌啶-1-甲酸三級丁酯( 3,680 mg,2.33 mmol,60%產率)。LC-MS (ES +): m/z128.2 [M - COO tBu + H] +步驟 -3
在0℃下向含有( 3R, 4S)-4-乙炔基-3-氟哌啶-1-甲酸三級丁酯( 3,650 mg,2.52 mmol)於無水DCM (5 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(3.15 mL)。將所得混合物在環境溫度下攪拌2小時。藉由UPLC監測反應進程。其後,在減壓下蒸發過量溶劑且用MTBE (10 mL)洗滌所獲得之殘餘物,得到呈白色固體狀之( 3R, 4S)-4-乙炔基-3-氟哌啶鹽酸鹽( 4,400 mg,2.42 mmol,96%產率)。LC-MS (ES +): m/z128.2 [M + H] +步驟 -4
向含有( 3R, 4S)-4-乙炔基-3-氟哌啶( 4,300 mg,1.71 mmol)及4-甲醯基哌啶-1-甲酸三級丁酯( 5,436.40 mg,2.05 mmol)於MeOH (10 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加無水乙酸鈉(279.75 mg,3.41 mmol)及乙酸(1.02 g,17.05 mmol,0.976 mL),且將反應混合物在環境溫度下攪拌1小時。隨後,一次性添加MP-CNBH 3(600 mg,1.23 mmol;2 mmol/g)且在環境溫度下再繼續攪拌16小時。經UPLC確認反應完成後,減壓蒸發過量溶劑。接著將水添加至殘餘物中且所得水相用NaHCO 3水溶液鹼化且用DCM (2×150 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥,且真空濃縮,得到呈紅色膠狀之4-((( 3R, 4S)-4-乙炔基-3-氟哌啶-1-基)甲基)哌啶-1-甲酸三級丁酯( 6,500 mg,1.22 mmol,71%產率)。LC-MS (ES +): m/z325.2 [M + H] +步驟 -5
在0℃下向含有4-((( 3R, 4S)-4-乙炔基-3-氟哌啶-1-基)甲基)哌啶-1-甲酸三級丁酯( 6,500 mg,1.22 mmol)於無水DCM (5 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷,99% (0.304 mL)。將所得反應混合物在環境溫度下攪拌2小時。經TLC指示反應完成後,在真空中濃縮反應混合物以得到粗產物,其用MTBE洗滌且乾燥,得到呈白色固體狀之( 3R, 4S)-4-乙炔基-3-氟-1-(哌啶-4-基甲基)哌啶鹽酸鹽( 7,310 mg,1.19 mmol,98%產率)。LC-MS (ES +): m/z225.2 [M + H] +步驟 -6
向含有( 3R, 4S)-4-乙炔基-3-氟-1-(哌啶-4-基甲基)哌啶鹽酸鹽( 7,206.19 mg,0.790 mmol)及( R)-(3-((1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基甲酸三級丁酯( 8,350 mg,0.608 mmol)於無水乙腈(25 mL)及THF (5 mL)之混合物中之充分攪拌溶液的50 mL密封管中添加碳酸銫(1.19 g,3.65 mmol),且將所得混合物藉由鼓泡N 2脫氣10分鐘。其後,添加XPhos (57.92 mg,0.121 mmol)及XPhos-Pd-G3 (102.96 mg,0.121 mmol)且將所得混合物用N 2再脫氣3分鐘。在90℃下攪拌反應混合物4小時。藉由UPLC-MS監測反應物質之進程。反應完成後,將反應混合物經由矽藻土墊及矽藻土床過濾且用EtOAc (200 mL)洗滌。在減壓下濃縮合併之濾液,得到粗產物,其藉由逆相管柱層析(RediSep-Rf Gold C18管柱-100 g,移動相:A:0.1%甲酸/水,B:乙腈)純化。在減壓下濃縮具有所需產物之溶離份以移除乙腈且接著用10%碳酸氫鈉溶液(100 mL)及鹽水(25 mL)稀釋且接著用EtOAc (2×100 mL)萃取。有機相經無水Na 2SO 4乾燥,且在減壓下濃縮,得到呈淡黃色固體狀之(3-((( R)-1-(4-((( 3R, 4S)-3-氟-1-(哌啶-4-基甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基甲酸三級丁酯( 9,210 mg,0.331 mmol,54%產率)。LC-MS (ES +): m/z627.2 [M + H] +實例 204 合成 ( S)-3,3- 二氟 -4-((3-((( R)-1-(4-((( 3R, 4S)-3- -1-((4- 氟哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 胺甲醯基 )-4- 甲基苯基 ) 胺基 ) 吡咯啶 -1- 甲酸三級丁酯
Figure 02_image1468
步驟 -1
向含有( 3R, 4S)-4-乙炔基-3-氟哌啶鹽酸鹽( 1,200 mg,1.21 mmol)及4-氟-4-甲醯基-哌啶-1-甲酸三級丁酯( 2,363.81 mg,1.57 mmol)於MeOH (5 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加無水乙酸鈉(297.81 mg,3.63 mmol)及乙酸(436.02 mg,7.26 mmol,0.415 mL),且將所得混合物在環境溫度下攪拌1小時。隨後,一次性添加MP-CNBH 3(2 mmol\1 g) (901 mg,1.82 mmol)且在環境溫度下再繼續攪拌16小時。經LCMS確認反應完成後,將反應混合物經由棉塞過濾且在減壓下蒸發過量溶劑。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)純化所得粗物質,所需化合物以20% EtOAc/石油醚溶離,得到呈無色液體狀之4-((( 3R, 4S)-4-乙炔基-3-氟哌啶-1-基)甲基)-4-氟哌啶-1-甲酸三級丁酯( 3,250 mg,0.546 mmol,45%產率)。LC-MS (ES +): m/z343.2 [M + H] +步驟 -2
在0℃下向含有4-((( 3R, 4S)-4-乙炔基-3-氟哌啶-1-基)甲基)-4-氟哌啶-1-甲酸三級丁酯( 3,250 mg,0.547 mmol)於無水DCM (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加4M HCl/1,4-二㗁烷,99% (1.37 mL)。在環境溫度下攪拌所得混合物2小時。經UPLC指示反應完成後,移除過量溶劑,且用MTBE濕磨粗物質,得到呈灰白色固體狀之( 3R, 4S)-4-乙炔基-3-氟-1-((4-氟哌啶-4-基)甲基)哌啶鹽酸鹽( 4,150 mg,0.511 mmol,93%產率)。LC-MS (ES +): m/z243.2 [M + H] +步驟 -3
向含有( S)-4-((3-((( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 5,100 mg,0.168 mmol)及( 3R, 4S)-4-乙炔基-3-氟-1-((4-氟哌啶-4-基)甲基)哌啶鹽酸鹽( 4,52.11 mg,0.185 mmol)於無水乙腈(2 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL密封管中添加碳酸銫(137.03 mg,0.420 mmol),且將反應混合物用N 2脫氣5分鐘。隨後,添加XPhos (8.02 mg,0.0168 mmol)及XPhos-Pd-G3 (7.12 mg,0.0084 mmol)且在90℃下加熱所得混合物4小時。經TLC指示反應完成後,經由矽藻土墊過濾反應混合物且用EtOAc (50 mL)洗滌矽藻土床。在減壓下濃縮濾液。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用20% MeOH/DCM作為溶離劑來純化粗殘餘物,得到呈棕色固體狀之( S)-3,3-二氟-4-((3-((( R)-1-(4-((( 3R, 4S)-3-氟-1-((4-氟哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 6,140 mg,0.100 mmol,60%產率)。LC-MS (ES +): m/z750.4 [M + H] +實例 205 合成 ( R)-3,3- 二氟 -4-((3-((( R)-1-(4-((( 3R, 4S)-3- -1-( 哌啶 -4- 基甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 胺甲醯基 )-4- 甲基苯基 ) 胺基 ) 吡咯啶 -1- 甲酸三級丁酯
Figure 02_image1470
步驟 -1 、步驟 -2 及步驟 -3
程序與 實例 204中之步驟-1至步驟-3的程序相同。得到呈棕色固體狀之化合物( R)-3,3-二氟-4-((3-((( R)-1-(4-((( 3R,4S)-3-氟-1-(哌啶-4-基甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯。LC-MS (ES +): m/z732.4 [M + H] +
使用上文 實例 205中所述之方法,用步驟-3中之對應溴化物中間物製備以下靶向配體( 實例 206)。
實例編號 步驟-3 中之 溴化物中間物 靶向配體 MS
206
Figure 02_image1472
Figure 02_image1474
LC-MS (ES +): m/z732.4 [M + H] +
實例 207 合成 ( S)-3,3- 二氟 -4-((3-((( R)-1-(4-(((3 R,4 S)-3- -1-((4- 羥基哌啶 -4- ) 甲基 ) 哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 ) 胺甲醯基 )-4- 甲基苯基 ) 胺基 ) 吡咯啶 -1- 甲酸三級丁酯
Figure 02_image1476
步驟 -1
向含有(3 R,4 S)-4-乙炔基-3-氟哌啶鹽酸鹽( 1,200 mg,1.21 mmol)於EtOH (2 mL)中之充分攪拌溶液的20 mL玻璃小瓶中添加1-氧雜-6-氮雜螺[2.5]辛烷-6-甲酸三級丁酯( 2,258.09 mg,1.21 mmol)且在70℃下攪拌所得混合物16小時。藉由TLC監測反應物質之進程。反應完成後,用冰水稀釋反應混合物且用EtOAc (3×150 mL)萃取水相。合併之有機相用水(25 mL)、鹽水(25 mL)洗滌,經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用15% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化粗產物,得到呈無色液體狀之4-(((3 R,4 S)-4-乙炔基-3-氟哌啶-1-基)甲基)-4-羥基哌啶-1-甲酸三級丁酯( 3,280 mg,0.797 mmol,66%產率)。LC-MS (ES +): m/z341.2 [M + H] +步驟 -2
在0℃下向含有4-(((3 R,4 S)-4-乙炔基-3-氟哌啶-1-基)甲基)-4-羥基哌啶-1-甲酸三級丁酯( 3,300 mg,0.854 mmol)於無水DCM (3 mL)中之充分攪拌溶液的50 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(1.07 mL),且在25℃下攪拌反應混合物1小時。經TLC指示反應完成後,在減壓下移除過量溶劑。用MTBE洗滌所獲得之粗物質,得到呈黃色固體狀之4-(((3 R,4 S)-4-乙炔基-3-氟哌啶-1-基)甲基)哌啶-4-醇鹽酸鹽( 4,230 mg,0.822 mmol,96%產率)。LC-MS (ES +): m/z241.2 [M + H] +步驟 -3
在環境溫度下向含有( S)-4-((3-((( R)-1-(4-溴萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 5,140 mg,0.235 mmol)及4-((( 3R, 4S)-4-乙炔基-3-氟哌啶-1-基)甲基)哌啶-4-醇鹽酸鹽( 4,131.69 mg,0.471 mmol)於無水乙腈(15 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL密封管中添加碳酸銫(191.84 mg,0.589 mmol)。將氮氣吹掃通過反應混合物10分鐘。隨後,添加XPhos (11.23 mg,0.023 mmol)及XPhos-Pd-G3 (19.94 mg,0.023 mmol)且在90℃下繼續攪拌4小時。藉由LCMS監測反應。使反應混合物穿過矽藻土床,且用EtOAc (50 mL)洗滌該矽藻土床。在真空中濃縮濾液以得到粗產物,其藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用25% MeOH/DCM作為溶離劑來純化,得到呈棕色固體狀之( S)-3,3-二氟-4-((3-((( R)-1-(4-(((3 R,4 S)-3-氟-1-((4-羥基哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 6,55 mg,0.068 mmol,29%產率)。LC-MS (ES +): m/z748.5 [M + H] +實例 208 合成 5-((( S)-4,4- 二氟吡咯啶 -3- ) 胺基 )- N-(( 1R)-1-(4-((( 3R, 4S)-1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-2- 側氧基 -1,2- 二氫 -3l2- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 )-4- 氟哌啶 -4- ) 甲基 )-3- 氟哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 124)
Figure 02_image1478
步驟 -1
在環境溫度下在氮氣氛圍下向含有1-[1-(2,6-二側氧基-3-哌啶基)-3-甲基-2-側氧基-苯并咪唑-5-基]哌啶-4-甲酸鹽酸鹽( 2,50 mg,0.112 mmol)於無水DMF (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加DIPEA (72.59 mg,0.561 mmol,0.098 mL)、HATU (64.07 mg,0.168 mmol)及( S)-3,3-二氟-4-((3-((( R)-1-(4-((( 3R, 4S)-3-氟-1-((4-氟哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 1,140.39 mg,0.101 mmol)。將所得混合物在此溫度下攪拌4小時。經UPLC指示反應完成後,在減壓下蒸發過量溶劑,且添加冰冷水以沈澱固體,將該固體過濾,用水(5 mL)洗滌且在真空中乾燥,得到呈灰白色固體狀之( 4S)-4-((3-((( 1R)-1-(4-((( 3R, 4S)-1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)-4-氟哌啶-4-基)甲基)-3-氟哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,100 mg,0.036 mmol,32%產率)。LC-MS (ES +): m/z1118.7 [M + H] +步驟 -2
在0℃下向含有( 4S)-4-((3-((( 1R)-1-(4-((( 3R, 4S)-1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)-4-氟哌啶-4-基)甲基)-3-氟哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)-3,3-二氟吡咯啶-1-甲酸三級丁酯( 3,100 mg,0.036 mmol)於無水DCM (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加4N HCl/1,4-二㗁烷(0.091 mL)。將所得反應混合物在環境溫度下攪拌2小時。經UPLC指示反應完成後,在減壓下蒸發過量溶劑,得到粗產物,其藉由逆相管柱層析(C18管柱,60 g,移動相:0.1%甲酸/水:MeCN)純化,得到呈白色固體狀之5-((( S)-4,4-二氟吡咯啶-3-基)胺基)- N-(( 1R)-1-(4-((( 3R, 4S)-1-((1-(1-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-2-側氧基-1,2-二氫-3l2-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-4-羰基)-4-氟哌啶-4-基)甲基)-3-氟哌啶-4-基)乙炔基)萘-1-基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺甲酸酯( 化合物 124,0.011 mmol,31%產率)。LC-MS (ES +): m/z1018.2 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.07 (s, 1H), 8.83 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.34-8.30 (m, 2H), 7.69-7.66 (m, 3H), 7.58 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 6.96-6.93 (m, 2H), 6.84 (d, J= 1.6 Hz, 1H), 6.66-6.60 (m, 3H), 5.91-5.86 (m, 2H), 5.29 (dd, J =13, 5.6 Hz, 1H), 4.81-4.51 (m, 1H), 4.15 (d, J= 14.4 Hz, 1H), 4.10-3.91 (m, 1H), 3.90-3.81 (m, 1H), 3.62 (d, J= 11.6 Hz, 2H), 3.45-3.42 (m, 2H), 3.40-3.33 (m, 3H),   3.10 (m, 2H), 3.01-2.97 (m, 3H), 2.82-2.72 (m, 3H), 2.50 (m, 10H),  2.20-2.10 (m, 1H), 2.01 (s, 3H), 2.00-1.85 (m, 2H), 1.81-1.73 (m, 6H), 1.56 (m, 2H)及1.55 (d, J= 6.8 Hz, 3H)。 實例 209 5- 胺基 - N-(( 1R)-1-(4-((( 3R, 4S)-1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 ) 哌啶 -4- ) 甲基 )-3- 氟哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 125)
Figure 02_image1480
基本上遵循 化合物 124之合成,使用對應中間物製備 化合物 125
LC-MS (ES +): m/z895.3 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.07 (s, 1H), 8.78 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 8.34-8.30 (m, 2H), 7.69-7.64 (m, 3H), 7.59 (d, J= 3.6 Hz, 1H), 6.96-6.93 (m, 1H), 6.85 (d, J= 7.6 Hz, 2H), 6.64 (d, J= 9.2 Hz, 1H), 6.55-6.51 (m, 2H), 5.92-5.81 (m, 1H), 5.30-5.27 (m, 1H), 5.00 (bs, 2H), 4.80-4.61 (m, 1H), 4.40 (d, J= 12.8 Hz, 1H), 4.00 (d, J= 11.2 Hz, 1H), 3.62 (d, J= 11.6 Hz, 2H), 3.36 (s ,3H), 3.35-3.32 (m, 1H), 3.15-2.95 (m, 3H), 2.91-2.86 (m, 1H), 2.85-2.62 (m, 7H), 2.61-2.35 (m, 2H), 2.30-2.10 (m, 3H), 2.09 (s, 3H), 2.05-1.90 (m, 1H), 1.89-1.60 (m, 7H)及1.54 (d, J= 6.8 Hz, 3H)及1.10 -0.80 (m, 2H)。 實例 210 5-((( R)-4,4- 二氟吡咯啶 -3- ) 胺基 )- N-(( 1R)-1-(4-((( 3R, 4S)-1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 ) 哌啶 -4- ) 甲基 )-3- 氟哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 126)
Figure 02_image1482
基本上遵循 化合物 124之合成,使用對應中間物製備 化合物 126
LC-MS (ES +): m/z1000.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.07 (s, 1H), 8.84 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.34-8.32 (m, 2H), 7.68-7.58 (m, 4H), 6.96-6.93 (m, 2H), 6.84 (d, J= 2 Hz, 1H), 6.66-6.60 (m, 3H), 5.90 (quin, J= 8 Hz, 1H ), 5.89-5.80 (m, 1H), 5.39-5.31 (m, 1H), 4.70-4.60 (m, 1H), 4.52-4.42 (m, 1H), 4.10-3.90 (m, 2H), 3.62 (d, J= 12 Hz, 2H), 3.43-3.40 (m, 2H), 3.38-3.33 (m, 3H), 3.27-3.26 (m, 1H), 3.03-2.95 (m, 6H), 2.68-2.61 (m, 5H), 2.59-2.53 (m, 2H), 2.34-2.34 (m, 3H), 2.25 (m, 1H), 2.12 (s, 3H), 2.05-1.98 (m, 2H), 1.77-1.71 (m, 8H), 1.55-1.53 (d, J= 6.8 Hz, 3H)及1.10-0.80 (m, 2H)。 實例 211 5-((( S)-4,4- 二氟吡咯啶 -3- ) 胺基 )- N-(( 1R)-1-(4-((( 3R, 4S)-1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 ) 哌啶 -4- ) 甲基 )-3- 氟哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 127)
Figure 02_image1484
基本上遵循 化合物 124之合成,使用對應中間物製備 化合物 127
LC-MS (ES +): m/z1000.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.06 (s, 1H), 8.82 (d, J= 10.8 Hz, 1H), 8.42-8.29 (m, 2H), 7.68-7.65 (m, 3H), 7.59-7.56 (m, 1H), 6.94 (d, J= 10.8 Hz, 2H), 6.84 (d, J= 2.8 Hz, 1H), 6.65-6.58 (m, 3H), 5.91-5.86 (m, 2H), 5.38-5.14 (m, 1H),  4.68 (d, 2J H-F= 57 Hz, 1H ),4.45-4.35 (m, 1H), 4.05-3.85 (m, 2H), 3.63-3.59 (m, 2H), 3.30 (s, 3H), 3.25-3.15 (m, 2H), 3.07-2.93 (m, 6H), 2.72-2.64 (m, 4H), 2.50 (m, 5H), 2.28-2.13 (m, 3H), 2.12 (s, 3H), 2.00-1.98 (m, 2H), 1.77-1.71 (m, 8H), 1.71-1.53 (m, 3H)及1.10-0.08 (m, 2H)。 實例 212 5-((( S)-4,4- 二氟吡咯啶 -3- ) 胺基 )- N-(( 1R)-1-(4-((( 3R, 4S)-1-((1-(1-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -4- 羰基 )-4- 羥基哌啶 -4- ) 甲基 )-3- 氟哌啶 -4- ) 乙炔基 ) -1- ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 128)
Figure 02_image1486
基本上遵循 化合物 124之合成,使用對應中間物製備 化合物 128
LC-MS (ES +): m/z1016.4 [M + H] +1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.07 (s, 1H), 8.83 (d, J= 8 Hz, 1H), 8.34-8.30 (m, 2H), 7.69-7.64 (m, 3H), 7.58 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 6.94 (dd, J= 8.6, 2.8 Hz, 2H), 6.84-6.84 (m, 1H), 6.72-6.59 (m, 3H), 5.91-5.80 (m, 2H), 5.31-5.22 (m, 1H), 4.67 ( 2J HF= 52 Hz, 1H), 4.34 (s, 1H), 4.11-4.00 (m, 1H), 3.98-3.87 (m, 1H), 3.77-3.66 (m, 1H), 3.64-3.56 (m, 2H), 3.52 (m, 4H), 3.31 (s, 3H), 3.05-2.80 (m, 5H), 2.72-2.65 (m, 3H), 2.62-2.5 (m, 6H), 32.45-2.30 (m, 2H), 2.10 (m, 1H), 2.09 (s, 3H), 2.00-1.91 (m, 2H), 1.83-1.62 (m, 5H)及1.60-1.32 (m, 6H)。 實例 213 合成 3-((3-((( R)-1-(3-(5-((( S)-3- 胺基吡咯啶 -1- ) 甲基 ) 噻吩 -2- ) 苯基 ) 乙基 ) 胺甲醯基 )-4- 甲基苯基 ) 胺基 ) 氮雜環丁烷 -1- 羧酸三級丁酯
Figure 02_image1488
步驟 -1
在環境溫度下向含有5-[(1-三級丁氧基羰基氮雜環丁烷-3-基)胺基]-2-甲基-苯甲酸( 1,0.7 g,2.18 mmol)及( R)-1-(3-溴苯基)乙-1-胺( 2,436.63 mg,2.18 mmol)於無水DMF (10 mL)中之充分攪拌溶液的100 mL單頸圓底燒瓶中添加HATU (1.24 g,3.27 mmol)及DIPEA (846.15 mg,6.55 mmol,1.14 mL)。在環境溫度下攪拌所得混合物3小時。藉由UPLC監測反應。反應完成後,將反應混合物用水淬滅且用EtOAc (3×40 mL)萃取。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用50% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化所獲得之殘餘物,得到呈灰白色固體狀之( R)-3-((3-((1-(3-溴苯基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 3,0.9 g,1.81 mmol,83%產率)。LC-MS (ES +): m/z432.2 [M - 異丁烯+ H] +. 步驟 -2
在環境溫度下向含有( R)-3-((3-((1-(3-溴苯基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 3,0.9 g,1.81 mmol)及5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊烷-2-基)噻吩-2-甲醛( 4,644.98 mg,2.71 mmol)於無水1,4-二㗁烷(8 mL)及水(2 mL)中之充分攪拌溶液的20 mL玻璃小瓶中添加碳酸鈉(478.50 mg,4.51 mmol)。將氮氣吹掃通過反應混合物10分鐘。接著添加PdCl 2(dppf). DCM複合物(147.46 mg,0.180 mmol),且將反應混合物在90℃下攪拌6小時且藉由UPLC監測。反應完成後,使反應混合物穿過矽藻土墊且在減壓下濃縮濾液。藉由急驟管柱層析(230-400目矽膠)用55% EtOAc/石油醚作為溶離劑來純化所獲得之粗產物,得到呈淡黃色固體狀之( R)-3-((3-((1-(3-(5-甲醯基噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 5,0.6 g,1.10 mmol,61%產率)。LC-MS (ES +): m/z520.3 [M + H] +步驟 -3
在環境溫度下向含有( R)-3-((3-((1-(3-(5-甲醯基噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 5,6.2 g,10.74 mmol)及( S)-2,2,2-三氟- N-(吡咯啶-3-基)乙醯胺鹽酸鹽( 6,2.82 g,12.89 mmol)於無水MeOH (100 mL)中之充分溶液的500 mL單頸圓底燒瓶中添加無水乙酸鈉(3.52 g,42.95 mmol)及乙酸(12.25 g,204.02 mmol,11.68 mL)。在環境溫度下攪拌反應混合物1小時。接著在環境溫度下添加MP-CNBH 3(16 g,32.21 mmol;2 mmol/g)且在環境溫度下攪拌反應混合物16小時。經UPLC指示反應完成後,經由矽藻土墊過濾反應混合物,且在減壓下濃縮濾液。將水(500 mL)添加至殘餘物中且用EtOAc (2×300 mL)萃取水相。合併之有機相經無水Na 2SO 4乾燥且在減壓下濃縮,得到呈黃色固體狀之3-((4-甲基-3-((( R)-1-(3-(5-((( S)-3-(2,2,2-三氟乙醯胺基)吡咯啶-1-基)甲基)噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 7,7 g,7.66 mmol,71%產率)。LC-MS (ES +): m/z686.2 [M + H] +步驟 -4
在環境溫度下向含有3-((4-甲基-3-((( R)-1-(3-(5-((( S)-3-(2,2,2-三氟乙醯胺基)吡咯啶-1-基)甲基)噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 7,7 g,7.55 mmol)於THF (50 mL)及水(15 mL)中之充分溶液的250 mL單頸圓底燒瓶中添加單水合氫氧化鋰(3.17 g,75.53 mmol)。在此溫度下攪拌反應混合物16小時。經UPLC指示反應完成後,在減壓下濃縮反應混合物,且藉由逆相管柱層析(RediSep-Rf Gold C18管柱,移動相A:0.1%碳酸氫銨/水,及B=乙腈)純化粗化合物。將具有所需產物之溶離份凍乾,得到呈灰白色固體狀之3-((3-((( R)-1-(3-(5-((( S)-3-胺基吡咯啶-1-基)甲基)噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 8,1.5 g,2.31 mmol,31%產率)。LC-MS (ES +): m/z590.4 [M + H] +實例 214 合成 5-( 氮雜環丁烷 -3- 基胺基 )- N-(( 1R)-1-(3-(5-((( 3S)-3-(10-(4-(1-(2,6- 二側氧基哌啶 -3- )-3- 甲基 -2- 側氧基 -2,3- 二氫 -1H- 苯并 [d] 咪唑 -5- ) 哌啶 -1- )-10- 側氧基癸醯胺基 ) 吡咯啶 -1- ) 甲基 ) 噻吩 -2- ) 苯基 ) 乙基 )-2- 甲基苯甲醯胺 ( 化合物 129)
Figure 02_image1490
步驟 -1
在環境溫度下向含有10-(4-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-1-基)-10-側氧基癸酸鹽酸鹽( 2,60 mg,0.106 mmol)、3-((3-((( R)-1-(3-(5-(((S)-3-胺基吡咯啶-1-基)甲基)噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯甲酸酯( 1,60 mg,0.092 mmol)於無水DMF (2 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加HATU (60.77 mg,0.159 mmol)及DIPEA (55.09 mg,0.426 mmol,0.074 mL)。在環境溫度下攪拌所得混合物2小時。藉由UPLC監測反應。接著在攪拌的同時用水稀釋反應混合物且形成灰白色固體。在過濾器上收集固體沈澱物且在真空中乾燥,得到呈灰白色固體狀之3-((3-((( 1R)-1-(3-(5-((( 3S)-3-(10-(4-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-1-基)-10-側氧基癸醯胺基)吡咯啶-1-基)甲基)噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 3;90 mg,0.058 mmol,55%產率)。LC-MS (ES +): m/z1098.5 [M + H] +步驟 -2
在-78℃下向含有3-((3-((( 1R)-1-(3-(5-((( 3S)-3-(10-(4-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-1-基)-10-側氧基癸醯胺基)吡咯啶-1-基)甲基)噻吩-2-基)苯基)乙基)胺甲醯基)-4-甲基苯基)胺基)氮雜環丁烷-1-羧酸三級丁酯( 3,90 mg,0.058 mmol)於無水DCM (1 mL)中之充分攪拌溶液的25 mL單頸圓底燒瓶中添加4M HCl/1,4-二㗁烷(0.7 mL)。將所得混合物在環境溫度下攪拌0.5小時。經UPLC指示反應完成後,自反應混合物移除溶劑,且藉由逆相製備型HPLC (X-Select C18 (150×19) mm, 5微米管柱;移動相A:0.1%甲酸/水:B:乙腈)純化所獲得之粗物質,得到呈白色固體狀之5-(氮雜環丁烷-3-基胺基)- N-(( 1R)-1-(3-(5-((( 3S)-3-(10-(4-(1-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-3-甲基-2-側氧基-2,3-二氫-1H-苯并[d]咪唑-5-基)哌啶-1-基)-10-側氧基癸醯胺基)吡咯啶-1-基)甲基)噻吩-2-基)苯基)乙基)-2-甲基苯甲醯胺甲酸酯( 化合物 129, 37 mg,0.034 mmol,60%產率)。 1H NMR (400 MHz, DMSO- d 6 ): δ11.08 (s, 1H), 8.66 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 8.35 (s, 1H), 7.93 (d, J= 6.8 Hz, 1H), 7.62 (s, 1H), 7.49 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 7.38-7.29 (m, 3H), 7.10 (d, J= 1.20 Hz, 1H), 7.01 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 6.96-6.90 (m, 3H), 6.48-6.46 (m, 2H), 6.21 (d, J= 6.8 Hz, 1H), 5.39-5.31 (m, 1H), 5.13-5.09 (m, 1H), 4.61-4.51 (m, 1H), 4.31-4.28 (m, 1H), 4.19-4.11 (m, 1H), 3.94-3.92 (m, 3H), 3.77-3.77 (m, 2H), 3.55-3.51 (m, 2H), 3.33 (s, 3H), 3.28-3.23 (m, 2H), 3.13-3.05 (m, 1H), 2.95-2.83 (m, 1H), 2.77-2.75 (m, 3H), 2.69-2.60 (m, 3H), 2.36-2.30 (m, 4H), 2.12 (s, 3H), 2.04-2.00 (m, 3H), 1.83-1.71 (m, 2H), 1.62-1.52 (m, 2H), 1.49-1.42 (m, 8H)及1.29-1.13 (m, 8H)。LC-MS (ES +): m/z998.4 [M + H] +實例 215 產生穩定表現 NSP3 Ubl-2_PLpro-HA-HiBiT 239T 細胞株
對於由本文所述之雙功能降解劑介導之目標蛋白降解的定量細胞降解,將HA及HiBiT附接至來自嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒2 (SARS-CoV-2)之ORF1a聚合蛋白之胺基酸1564-1878的人類密碼子最佳化基因序列的C末端,且表現NSP3 UBL2_PLpro-HA-HiBiT之293T (ATCC®,CRL-3216)細胞株係在內部產生。NSP3 UBL2_PLpro-HA-HiBiT之表現用預期分子量之HA抗體得到證實。
使用CRISPR/Cas9編輯之CRBN -/-293T細胞株以類似方式產生NSP3 UBL2_PLpro-HA-HiBiT 293T CRBN -/-細胞株。 材料
如本文所述地在內部產生NSP3 UBL2_PLpro-HA-HiBiT 293T株。親本293T細胞株以及NSP3 UBL2_PLpro-HA-HiBiT 293T CRBN +/+及CRBN -/-細胞株在以下培養基中常規培養:含有10%血清(Thermo Fisher,10437036)之DMEM (Thermo Fisher,11965092),且不超過20個繼代。對於分析,將NSP3 UBL2_PLpro-HA-HiBiT細胞接種在含有10%血清(Thermo Fisher,10437036)之無酚紅DMEM (Thermo Fisher,21063045或替代無酚紅DMEM)中進行處理。在Corning® 384孔低凸緣黑色平底聚苯乙烯TC處理的微孔盤(Corning,3571)中進行分析。在Nano-Glo ®HiBiT溶解分析系統(Promega, N3050)中溶解細胞。 實例 216 NSP3 UBL2_PLpro-HA-HiBiT 降解分析 ( 細胞 )
將測試化合物自10 mM之最高濃度以10點、半對數滴定一式兩份添加至384孔盤中,且儲存於-20℃下直至使用。簡言之,在化合物處理當天,將細胞以每孔2,500個細胞之密度接種至含有測試化合物之384孔盤中,其體積使得測試化合物之最高劑量為10 mM。另外,陰性對照細胞僅用媒劑處理。在分析之持續時間(6或24小時)內,將盤在37℃與5% CO 2下培育。在所需培育時間後,藉由添加Nano-Glo ®HiBiT溶解分析系統(根據製造建議製備且以1:1,v/v之比率添加至細胞)來溶解細胞。微量盤在300-600rpm下在軌道盤振盪器上攪拌10分鐘且在室溫下再培育60分鐘。在EnVision ®多標記讀取器(PerkinElmer, Santa Clara, Calif., USA)上獲取發光。
在化合物存在下量測之發光反應的定量係以高信號/無降解對照(未經處理之細胞+溶解偵測試劑)及低信號/完全降解對照(未經處理之細胞,無溶解偵測試劑)標準化。用4參數邏輯擬合分析資料以產生S形劑量-反應曲線。DC 50為總細胞NSP3 UBL2_PLpro-HA-HiBiT 中恰好50%已降解之化合物濃度。各化合物之E max或最大作用表示化合物處理之後細胞中殘留之殘餘蛋白質的量。IP或拐點表示S形曲線改變符號時之化合物濃度。此分析之結果顯示於表1、圖1及圖4中。
當分析之持續時間為6小時時,化合物27之ΔEmax [CRBN null- CRBN WT]為18%且化合物5之ΔEmax [CRBN null- CRBN WT]為25%。
當分析之持續時間為24小時時,化合物27之ΔEmax [CRBN null- CRBN WT]為12%且化合物5之ΔEmax [CRBN null- CRBN WT]為16%。 本發明之代表性化合物 1
293T.234 NSP3_PLpro 上之HiBiT- 降解 ,6.0 小時
化合物編號 DC 50[nM] IP [nM] Emax (%)
1 NA +++ ++
2 NA +++ +++
3 + +++ +++
4 NA + ++
5 NA +++ ++
6 + +++ +++
7 NA +++ +++
8 +++ +++ ++++
9 NA + ++
10 NA +++ ++
11 NA +++ ++
12 NA +++ ++
13 NA +++ ++
14 NA +++ +++
15 + +++ +++
16 +++ +++ ++++
17 NA +++ +++
18 NA +++ +++
19 +++ +++ ++++
20 NA NA NA
21 NA + +
22 NA +++ +++
23 +++ +++ ++++
24 +++ +++ ++++
25 NA +++ ++
26 NA +++ ++
27 NA + ++
28 NA + ++
29 NA +++ ++
30 NA +++ ++
31 +++ +++ ++++
32 NA +++ +
33 NA +++ ++
34 +++ +++ ++++
35 +++ +++ ++++
36 +++ +++ ++++
37 +++ +++ ++++
38 +++ +++ ++++
39 +++ +++ ++++
40 NA + ++
41 +++ +++ ++++
42 +++ +++ ++++
43 +++ +++ ++++
44 +++ +++ ++++
45 +++ +++ ++++
46 +++ +++ ++++
47 +++ +++ ++++
48 +++ +++ ++++
49 +++ +++ ++++
50 ++ +++ ++++
51 +++ +++ ++++
52 +++ +++ ++++
53 +++ +++ ++++
54 +++ +++ ++++
55 + +++ +++
56 +++ +++ ++++
57 +++ +++ ++++
58 +++ +++ ++++
59 +++ +++ ++++
60 +++ +++ ++++
61 +++ +++ ++++
62 +++ +++ ++++
63 + +++ ++++
64 +++ +++ ++++
65 +++ +++ ++++
66 +++ +++ ++++
67 +++ +++ ++++
68 ++ +++ ++++
69 ++ ++ ++++
70 ++ ++ ++++
71 +++ +++ ++++
72 +++ +++ ++++
73 +++ +++ ++++
74 +++ +++ ++++
75 +++ +++ ++++
76 +++ +++ ++++
77 +++ +++ ++++
78 ++ +++ ++++
79 ++ +++ ++++
80 +++ +++ ++++
81 +++ +++ ++++
82 +++ +++ ++++
83 +++ +++ ++++
84 +++ +++ ++++
85 +++ +++ ++++
86 +++ +++ ++++
87 +++ +++ ++++
88 +++ +++ ++++
89 NA ++ +++
90 +++ +++ ++++
91 +++ +++ ++++
92 +++ +++ ++++
93 +++ +++ ++++
94 +++ +++ ++++
95 +++ +++ ++++
96 +++ +++ ++++
97 +++ +++ ++++
98 +++ +++ ++++
99 +++ +++ ++++
100 NA +++ ++
101 +++ +++ ++++
102 +++ +++ ++++
103 +++ +++ ++++
104 +++ +++ ++++
105 +++ +++ ++++
106 +++ +++ ++++
107 +++ +++ ++++
108 +++ +++ ++++
109 +++ +++ ++++
110 +++ +++ ++++
111 +++ +++ ++++
112 +++ +++ ++++
113 +++ +++ ++++
114 +++ +++ ++++
115 +++ +++ ++++
116 +++ +++ ++++
117 NA + ++
118 NA +++ ++
119 +++ +++ ++++
120 +++ +++ ++++
121 NA + ++
122 NA + ++
123 NA +++ +++
124 +++ +++ ++++
125 +++ +++ ++++
126 +++ +++ ++++
127 +++ +++ ++++
128 +++ +++ ++++
129 NA +++ +++
如上表1中所使用,對於DC 50值,+++ = DC 50< 500 nM,++ = 500 nM ≤ DC 50< 10,000 nM,+ = DC 50≥ 10,000 nM,且NA= Emax > 50%。對於拐點(IP)值,+++ = IP < 500 nM,++ = 500 nM ≤ IP < 10,000 nM,且+ = IP ≥10,000 nM。對於Emax值,++++ = Emax < 45%,+++ = 45% ≤ Emax < 60%,++ = 60% ≤ Emax < 95%,且+ = Emax ≥ 95%。 實例 217 CRBN+ CRBN- 細胞活力分析
293T親本及NSP3 UBL2_PLpro-HA-HiBiT 293T CRBN +/+及CRBN -/-細胞活力係基於使用CellTiter-Glo® 2.0發光分析套組(Promega,其發信號指示代謝活性細胞之存在)對ATP進行定量而確定的。簡言之,將測試化合物以20 μΜ之最高濃度在10點、半對數滴定下一式兩份地添加至384孔盤中。在含有10% FBS之DMEM培養基中以每孔2,500個細胞之細胞密度將細胞接種至384孔盤中。在不存在測試化合物之情況下處理之細胞為陰性對照,標準化為100%生存率,且在不存在CellTiter-Glo® 2.0之情況下處理之細胞為陽性對照,標準化為0%生存率。在37℃與5% CO 2下培育細胞6或24小時。接著將CellTiter-Glo試劑添加至細胞中且在EnVision ®多標記讀取器(PerkinElmer,Santa Clara,CA,USA)上獲得發光。此分析之結果展示於圖2A及圖2B中。 實例 218 三元複合物形成分析
使用AlphaLISA ®(PerkinElmer)分析表徵NSP3 PLpro、化合物與CRBN之間的三元複合物形成。在此研究中,CRBN上之His (6x)標籤用Ni供體珠粒標記,且生物素化NSP3 PLpro用鏈黴抗生物素蛋白接受體珠粒標記。經由來自珠粒之化學發光信號的變化監測三元複合物形成。在不存在三元複合物之情況下,供體與接受體珠粒之間的平均距離太大而無法引發信號。由測試化合物促進之複合物形成使珠粒非常接近,從而產生α-信號。為了將發光信號轉換為三元複合物之莫耳濃度,吾人使用分別位於孔23及24中之陰性及陽性對照樣品產生的信號。在N末端及C末端分別經組胺酸及生物素標籤修飾之麥芽糖結合蛋白(MBP)用作陽性對照。此構築體能夠結合供體及接受體珠粒兩者,且產生每個濃度單位之最大可能信號,該信號用於標準化來自化合物處理樣品之信號。此分析之結果展示於圖3中。 實例 219 雄性 ICR-C1 小鼠中之藥物動力學 (PK)
在單次劑量IV (1 mg/kg)及PO (10 mg/kg)投與後,在雄性ICR-CD1小鼠中確定兩種本發明化合物,亦即實例156中所述之化合物92及實例157中之化合物93在血漿中之藥物動力學(PK)概況。此研究在非GLP條件下進行,且除非另外說明,否則所有分析試劑均為標準實驗室試劑級。
化合物92及化合物93各自在20% PEG 400、20%磺丁基醚-b-環糊精(SBECD,Captisol ®, CyDex Pharmaceuticals, Inc., San Diego, CA)及60%水中調配。各化合物之IV及PO調配物描述於下表2中。 2
化合物92 化合物93
   IV調配物 PO調配物    IV調配物 PO調配物
化合物 1.168 mg 2.424 mg 化合物 1.103 mg 2.562 mg
PEG 400 1045.5 mL 433.9 mL PEG 400 1000.8 mL 464.9 mL
20% SBECD 1045.5 mL 433.9 mL 20% SBECD 1000.8 mL 464.9 mL
3136.4 mL 1301.8 mL 3002.3 mL 1394.7 mL
濃度 0.2 mg/mL 1.00 mg/mL 濃度 0.2 mg/mL 1.00 mg/mL
pH 4.3 4.8 pH 4.4 4.7
添加PEG 400後,將各調配物在間歇攪拌下保持超音波處理二十分鐘。調配物在給藥當天新鮮製備且在室溫下儲存直至使用。
在藥物投與之前對所有動物稱重,且所用動物之標準體重為30公克。對於各測試之化合物,將動物分為兩組,靜脈內(IV)組及經口(PO)組,各組各含有3隻動物。藉由靜脈內注射將IV劑量投與至尾部靜脈中,且經由經口管飼投與PO劑量。IV組之給藥體積為5 mL/kg體重且PO組之給藥體積為10 mL/kg體重。IV組及PO組之給藥濃度分別為0.2 mg/mL及1.00 mg/mL。在研究期間動物處於禁食狀態。
對於兩種測試化合物,對於IV給藥組,在給藥前(0.00小時)及0.033、0.33、1、2、4、6、8及24小時時間點處自隱靜脈採集血液(連續取樣)用於血漿分離,且對於PO給藥組,在給藥前(0.00小時)及0.25、0.50、1、2、4、6、8及24小時時間點自隱靜脈採集全血(連續取樣)用於血漿分離。所用抗凝劑溶液為6% (v/v)檸檬酸鈉(200 mM,pH 4.79)。
對於樣品製備,5 µl血漿樣品用150 µl含內標(VERAPAMIL 50 ng/mL)之乙腈沈澱。將樣品以1000 rpm渦旋且以4000 rpm離心10分鐘。將120 µl上清液轉移至96孔盤且使用LC-MS/MS進行分析。對於樣品稀釋,用18 µl空白血漿稀釋2 µl樣品。渦旋後,自樣品中等分出5 µl,且繼續進行常規處理程序。處理時對IV-0.033小時樣品應用10X稀釋因子。
藉由Shimadzu NexeraX2 (Shimadzu Corp., Kyoto, Japan)高壓液相層析(HPLC)系統分析樣品,接著用SCIEX TripleQuad™4500 (AB Sciex LLC, Framingham, MA)進行串聯質譜分析(MS/MS)。在Kinetex ®(Phenomenex, Inc., Torrance, CA) 5 µm C18 100Å, 100*2.1mm管柱上解析樣品。
對於化合物92,0.1%甲酸/Milli-Q ®水(EMD Millipore, Burlington, MA)用作水性(A)移動相且0.1%甲酸/乙腈用作有機(B)移動相。流動速率設定為0.8 mL/min。注射體積為8 µl,管柱烘箱為40℃且自動進樣器溫度為8℃。LC梯度程式包括0.5分鐘時90% A之初始條件,在1分鐘時切換至60% A,在1.5分鐘時切換至5%且保持直至2.5分鐘,隨後在2.7分鐘時返回至90% A之初始條件,在90% A處保持直至3.5分鐘。
對於化合物93,0.1%甲酸/Milli-Q ®水(EMD Millipore, Burlington, MA)用作水性(A)移動相且0.1%甲酸/甲醇用作有機(B)移動相。流動速率設定為0.8 mL/min。注射體積為8 µl,管柱烘箱為40℃且自動進樣器溫度為8℃。LC梯度程式包括0.01分鐘時90% A之初始條件,在1分鐘時切換至50% A,在1.5分鐘時切換至5%且保持至2.5分鐘,隨後在2.7分鐘時返回至90% A之初始條件,在90% A處保持直至3.5分鐘。
使用正電噴霧電離(ESI)方法以藉由質譜分析偵測分析物及內標。化合物92之MRM條件為Q1 m/z 501.047、Q3 m/z 373.200、去簇電位(DP) 86 V、碰撞能量(CE) 21 eV及碰撞室射出電位(CXP) 6。化合物93之MRM條件為Q1 m/z 501.082、Q3 m/z 373.2、DP 81 V及CE 21 eV,及碰撞室射出電位(CXP) 6。對於兩種化合物,內標MEM條件為Q1 m/z 455.10、Q3 m/z 165.10、去簇電位(DP) 80 V、碰撞能量(CE) 44 eV及碰撞室射出電位(CXP) 8。測試化合物及內標之其他MS/MS條件包括碰撞氣體(CAD) 10、氣簾(CUR) 40、離子噴霧電壓(V) 5500、溫度(TEM) 550、GS1 55、GS2 50及EP 10。
藉由非室模型用Phoenix軟體8.1版計算個別動物之藥物動力學參數,如AUC last、T 1/2、T max、C 0、Vdss、Cl、C max及%F。化合物92在雄性ICR-CD1小鼠中之此PK研究的結果展示於下表3-6及圖5中,且化合物93之結果展示於下表7-10及圖6中。 3
在雄性ICR-CD1小鼠中以1 mg/kg IV給藥化合物92之後的血漿濃度時間概況
時間(h) 在1mpk IV 下之血漿濃度(ng/mL) 平均值(ng/mL) SD
Ma0907 Ma0908 Ma0909
0.00 BQL BQL BQL NC NA
0.033 906.30 1194.63 740.57 947.17 229.77
0.33 180.22 193.70 170.52 181.48 11.64
1.00 122.59 132.76 102.18 119.18 15.57
2.00 103.41 96.03 70.83 90.09 17.08
4.00 54.04 69.50 40.11 54.55 14.70
8.00 23.36 25.32 12.75 20.48 6.76
24.00 BQL 5.29 BQL NC NA
BQL-低於定量極限;NC-未計算;NA-不適用 4
在雄性ICR-CD1小鼠中以10 mg/kg PO給藥化合物92之後的血漿濃度時間概況
時間(h) 在10mpk PO 下之血漿濃度(ng/mL) 平均值(ng/mL) SD
Ma0910 Ma0911 Ma0912
0.00 BQL BQL BQL NC NA
0.25 170.42 165.65 113.75 149.94 31.43
0.50 293.17 328.95 236.88 286.33 46.41
1.00 318.81 401.28 282.81 334.30 60.74
2.00 307.04 247.54 189.04 247.87 59.00
4.00 237.66 243.06 169.15 216.62 41.20
8.00 112.68 116.21 67.71 98.87 27.04
24.00 24.25 30.94 15.99 23.73 7.49
BQL-低於定量極限;NC-未計算;NA-不適用 5
在雄性ICR-CD1小鼠中以1 mg/kg IV給藥化合物92之後的計算藥物動力學參數
1 mg/kg IV
C 0 (ng/mL) T ½ (h) Vdss (L/kg) Cl (ml/min/kg) AUC 最終 (h*ng/mL)
平均值 1139.51 2.78 4.91 22.59 723.46
SD 299.04 0.33 0.4 6.45 229.48
6
在雄性ICR-CD1小鼠中以10 mg/kg PO給藥化合物92之後的計算藥物動力學參數
10 mg/kg PO
C max (ng/mL) T ½ (h) T max (h) AUC 最終 (h*ng/mL) %F
平均值 334.3 6.6 1 2421.81 33.48
SD 60.74 0.46 0 545.75 7.54
7
在雄性ICR-CD1小鼠中以1 mg/kg IV給藥化合物93之後的血漿濃度時間概況
時間(h) 在1mpk IV 下之血漿濃度(ng/mL) 平均值(ng/mL) SD
Ma0883 Ma0884 Ma0885
0.00 BQL 1.17* BQL NC NA
0.033 3015.81 1315.72 927.54 1753.02 1110.70
0.33 290.46 227.58 276.39 264.81 33.00
1.00 188.92 167.53 171.40 175.95 11.40
2.00 147.35 161.10 134.02 147.49 13.54
4.00 69.31 67.16 64.50 66.99 2.41
8.00 29.73 34.30 33.17 32.40 2.38
24.00 6.74 8.57 7.69 7.67 0.92
BQL-低於定量極限;NC-未計算;NA-不適用 *-觀察到的給藥前樣品濃度可能係由於污染 8
在雄性ICR-CD1小鼠中以10 mg/kg PO給藥化合物93之後的血漿濃度時間概況
時間(h) 在10mpk PO 下之血漿濃度(ng/mL) 平均值(ng/mL) SD
Ma0886 Ma0887 Ma0888
0.00 BQL BQL BQL NC NA
0.25 183.10 250.00 252.06 228.39 39.23
0.50 401.09 348.84 417.18 389.04 35.73
1.00 707.35 335.64 450.69 497.89 190.30
2.00 399.32 218.50 448.63 355.48 121.17
4.00 185.11 182.30 210.03 192.48 15.26
8.00 69.29 34.5 38.4 47.40 19.06
24.00 9.55 4.62 5.79 6.65 2.58
BQL-低於定量極限;NC-未計算;NA-不適用 9
在雄性ICR-CD1小鼠中以1 mg/kg IV給藥化合物93之後的計算藥物動力學參數
1 mg/kg IV
C 0 (ng/mL) T ½ (h) Vd ss (L/kg) Cl (ml/min/kg) AUC 最終 (h*ng/mL)
平均值 2190.47 6.72 4.8 12.47 1270.3
SD 1514.41 0.37 1.2 1.21 142.18
10
在雄性ICR-CD1小鼠中以10 mg/kg PO給藥化合物93之後的計算藥物動力學參數
10 mg/kg PO
C max (ng/mL) T ½ (h) T max (h) AUC 最終 (h*ng/mL) %F
平均值 502.29 4.44 0.83 2018.63 15.89
SD 184.74 0.41 0.29 444.39 3.50
化合物92在小鼠中顯示出中等肝血流清除率(Qh=25%),且穩態分佈體積比小鼠體內總水量高大約7倍,向小鼠IV投與1 mg/kg之後的消除半衰期為2.78小時。化合物92在以10 mg/kg向小鼠經口投與後顯示出快速經口吸收(Tmax:1小時),經口生物可用性為33.48%。
化合物93在小鼠中顯示出低肝血流清除率(Qh=13.9%),且穩態分佈體積比小鼠體內總水量高大約6.9倍,向小鼠IV投與1 mg/kg之後的消除半衰期為6.72小時。觀測到C0之一些變化(約3.7倍變化)。化合物93在以10 mg/kg向小鼠經口投與後顯示出快速經口吸收(Tmax:0.5-1小時),經口生物可用性為15.89%。 實例 220 化合物 92 及化合物 93 之溶解度
使用標準程序測定化合物92及化合物93之動力學溶解度。此分析之結果顯示在pH 6.5下,化合物92之溶解度為6.98 µM且化合物93之溶解度為3.14 µM。 實例 221 細胞病變效應 (CPE) 保護分析
A549-ACE2細胞(獲自tenOever Lab之Dr. Benjamin tenOever及同事) (Blanco-Melo D, Nilsson-Payant BE, Liu WC, Uhl S, Hoagland D, Møller R, Jordan TX, Oishi K, Panis M, Sachs D, Wang TT, Schwartz RE, Lim JK, Albrecht RA, tenOever BR. Imbalanced Host Response to SARS-CoV-2 Drives Development of COVID-19. Cell. 2020年5月28日;181(5):1036-1045.e9. doi: 10.1016/j.cell.2020.04.026. 電子版2020年5月15日. PMID: 32416070; PMCID: PMC7227586)在182 cm 2燒瓶(GenClone25-211)中之培養基中生長,該培養基由補充有10% FBS (經熱處理之FBS 100-106 BenchMark TM胎牛血清)、1%青黴素-鏈黴素(15-140-122 Fisher Scientific)及1% NEAA (非必需胺基酸,11-140-050 Fisher Scientific)之DMEM培養基(Fischer 11995073)構成。在感染前二十四小時,細胞以10,000個細胞/孔之密度接種於96孔培養盤(GenClone 25-109)中之100 μL培養基中。
藥物稀釋係在與培養基相同,但僅添加2%而非10% FBS之感染培養基中進行。自細胞中移除培養基且用藥物稀釋液替代,且在感染前培育2小時。藉由以1:1000稀釋10 μM初始濃度之10mM藥物儲備溶液且以1:4稀釋比進行後續連續稀釋來進行藥物稀釋。總共進行七次稀釋,各藥物一式三份。各盤之最後一列無任何藥物濃度,且充當實驗之陰性及陽性感染對照。
在2小時藥物培育後,細胞被0.5 MOI (感染倍率)之SARS-CoV-2華盛頓菌株[新型冠狀病毒[(nCoV)/Washington/1/2020]感染,該菌株由N. Thornburg (CDC)經由新興病毒及蟲媒病毒世界參考中心(新興病毒及蟲媒病毒世界參考中心https://www.utmb.edu/wrceva, Galveston, TX)提供。
使用上文所述之感染培養基培養病毒。最終列中之一半無藥物孔用0.5 MOI之SARS-CoV-2感染且充當陽性對照。另一半孔用無病毒感染培養基模擬感染且充當陰性對照。將細胞與病毒一起培育至少72小時以使得在陽性對照孔中觀測到細胞病變效應(CPE)。此時,移除感染培養基且將100 μl福馬林溶液(10%福馬林,Fisher 23305510)添加至各孔中以固定細胞且使病毒不活化。將細胞在室溫下與福馬林溶液一起培育至少15分鐘以確保病毒不活化。接著移除福馬林培養基,且添加0.25%結晶紫溶液(0.25% w/v結晶紫,Sigma C0775,在20% EtOH中)。將細胞在結晶紫溶液中染色15-30分鐘,其後在平緩流動的自來水下洗掉結晶紫。接著使盤在工作台上未覆蓋地乾燥至少24小時,隨後藉由盤讀取器進行分析。
在Infinite ®200 Pro TECAN盤讀取器(Tecan Trading AG, Männedorf, Switzerland)上使用以下設定分析無蓋的乾燥盤:
Corning 96平底透明聚苯乙烯
模式 吸光度
每孔多次讀取(圓(實心)) 3×3
每孔多次讀取(邊界) 750
波長 595
頻寬 9
閃爍次數 15
安定時間 0
收集到的各孔之吸光度資料被組織在一個EXCEL檔案(Microsoft Corporation, Redmond, WA, USA)中,其中其經配置以與盤之96孔格式相匹配。對資料進行以下分析。 1. 將對應於陽性對照之孔的吸光度值取平均值。接著自對應盤(各藥物稀釋處理以及陰性對照孔)之所有其他吸光度值中減去此平均值。接著藉由找到該孔與陰性對照孔平均值之間的比率切乘以100來計算各藥物稀釋孔中之細胞存活百分比。以下公式概述該方法。
Figure 02_image1492
2. 接著將藥物稀釋系列之細胞存活%輸入至Graph Pad Prism 9.3.1 (GraphPad by Dotmatics, San Diego, CA, USA)中且使用該程式之XY: Log-劑量相對於反應(非線性回歸)分析函數計算劑量反應曲線及EC 50值。
在此細胞病變效應(CPE)保護分析中測試下表11中之化合物以評估針對SARS-CoV-2之活體外抗病毒活性。 11
化合物編號 針對SARS-CoV-2 之活體外抗病毒活性(CPE 保護分析)
1 A
30 B
31 B
32 B
33 B
37 B
41 B
42 B
43 B
43 B
44 B
45 C
46 C
55 B
56 B
58 C
62 B
72 C
74 C
76 C
80 A
83 A
84 B
85 A
88 A
89 A
90 B
91 B
92 C
93 C
95 C
100 C
101 C
102 A
103 A
104 B
113 B
114 C
115 B
119 B
124 C
125 C
126 C
127 C
129 C
如上表11中所使用,A = EC 50< 1 µM,B = 1 µM ≤ EC 50< 10 µM,且C = EC 50≥ 10 µM。
本說明書中所引用之所有公開案及專利申請案以引用的方式併入本文中,就如同各個別公開案或專利申請案特定地且個別地指示以引用的方式併入一般。
儘管已出於清楚理解之目的藉由說明及實例相當詳細地描述前述發明,但根據本發明之教示,一般熟習此項技術者將顯而易知,可在不背離如本發明之申請專利範圍中所定義之本發明之精神或範疇的情況下對其進行某些改變或修改。
1為展示塞勒布隆陽性及塞勒布隆陰性HEK293細胞株中NSP3之降解的線圖。細胞與改變濃度之化合物5一起培育。將HEK293細胞培育6小時。x軸為以奈米莫耳濃度量測之濃度且y軸為反應%。實驗程序提供於實例216中。 2A 及圖 2B為展示在塞勒布隆陽性及塞勒布隆陰性HEK293細胞株中在化合物5存在下之細胞存活率的線圖。細胞與改變濃度之化合物5一起培育。將HEK293細胞培育6或24小時。x軸為以奈米莫耳濃度量測之濃度且y軸為反應%。實驗程序提供於實例217中。 3為展示NSP3在與塞勒布隆及化合物5之三元複合物中之比例的線圖。細胞與改變濃度之化合物5一起培育。x軸為以奈米莫耳濃度量測之濃度且y軸為形成之三元複合物之分率。實驗程序提供於實例218中。 4為展示NSP3 UBL2_PLpro-HA HiBiT 293T細胞株中化合物24對NSP3之降解的線圖。細胞與改變濃度之化合物24一起培育6小時及24小時。x軸為以微莫耳濃度量測之濃度且y軸為反應% (Emax)。實驗程序提供於實例216中。 5為展示在向雄性ICR-CD1小鼠IV (1 mg/kg)及PO (10 mg/kg)投與之後,化合物92之平均血漿濃度相對於時間(小時)概況的線圖。實驗程序及相關結果提供於實例219中。 6為展示在向雄性ICR-CD1小鼠IV (1 mg/kg)及PO (10 mg/kg)投與之後,化合物93之平均血漿濃度相對於時間(小時)概況的線圖。實驗程序及相關結果提供於實例219中。 7描繪本發明之式A。
Figure 111138051-A0101-11-0001-1

Claims (125)

  1. 一種下式之化合物,
    Figure 03_image1494
    ; 或其醫藥學上可接受之鹽; 其中: 雜環部分選自:
    Figure 03_image1496
    ; 雜環部分 B
    Figure 03_image1498
    ; Q為CH 2、NR 2、O或S; X 3、X 4、X 5及X 6獨立地選自N、CH及CR 5,其中X 3、X 4、X 5及X 6中之一者為連接至連接子之碳原子; R 1、R 3、R 4及R 6獨立地選自氫、烷基、烯基、炔基及鹵素; 或R 3及R 4與其所結合之碳一起形成3、4、5或6員螺碳環;包含1或2個選自N、O及S之雜原子的4、5或6員螺雜環;或側氧基; 或R 1與R 6組合在一起以形成1或2-碳橋; 或R 1與R 3組合在一起以形成3-6員稠環; 各R 2選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、芳基、雜芳基、雜環及-C(O)R 9,其各自視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 10之取代基取代; 各R 5獨立地選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、鹵素、芳基、雜芳基、雜環、氰基、硝基、-NR 7R 8、-OR 7、-SR 7、-C(O)R 9、-C(S)R 9、-S(O)R 9、-S(O) 2R 9、-OC(O)R 9、-OC(S)R 9、-OS(O)R 9、-OS(O) 2R 9、-SC(O)R 9、-OS(O) 2R 9、-NR 7C(O)R 9、-NR 7C(S)R 9、-NR 7S(O)R 9、-NR 7S(O) 2R 9、-P(O)(R 9) 2、-SP(O)(R 9) 2、-NR 7P(O)(R 9) 2及-OP(O)(R 9) 2;除了氫、鹵素、氰基及硝基之外的各者視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 10之取代基取代; R 16選自:
    Figure 03_image1500
    Figure 03_image1502
    及R 12,其各自視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代; R 17選自:
    Figure 03_image1504
    Figure 03_image1502
    ,其各自視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代; R 18選自:
    Figure 03_image1507
    Figure 03_image1509
    ,其各自經由C-N鍵連接至氮雜戊二醯亞胺部分且各R 18視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代; 環為視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代且經1個R 12取代基取代之稠合芳基或雜芳基; 螺環為視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代且經1個R 12取代基取代之環烷基、環烯或雜環基; R 12為與連接子之連接點; R 7及R 8在各情況下獨立地選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、芳基、雜芳基、雜環及C(O)R 14,除了氫之外的各者視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 10之取代基取代; 各R 9獨立地選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、芳基、雜芳基、雜環、-NR 7R 8、-OR 7及-SR 7,其各自視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 10之取代基取代; 各R 10獨立地選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、鹵素、芳基、雜芳基、雜環、氰基、硝基、-NR 11R 13、-OR 11、-SR 11、-C(O)R 14、-C(S)R 14、-S(O)R 14、-S(O) 2R 14、-OC(O)R 14、-OC(S)R 14、-OS(O)R 14、-OS(O) 2R 14、-NR 11C(O)R 14、-NR 11C(S)R 14、-NR 11S(O)R 14、-NR 11S(O) 2R 14、-P(O)(R 14) 2、-NR 11P(O)(R 14) 2及-OP(O)(R 14) 2;除了氫、鹵素、氰基及硝基之外的各者視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 15之取代基取代; R 11及R 13在各情況下獨立地選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、芳基、雜芳基、雜環、-C(O)R 14、-C(S)R 14、-S(O)R 14、-S(O) 2R 14及-P(O)(R 14) 2;其各自視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 15之取代基取代; 各R 14獨立地選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、芳基、雜芳基、雜環、胺基、羥基、烷氧基、-N(H)(烷基)及-N(烷基) 2,除了氫之外的各者視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 15之取代基取代; 各R 15獨立地選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、鹵素、芳基、雜芳基、雜環、氰基、硝基、胺基、羥基、烷氧基、-N(H)(烷基)及-N(烷基) 2; 連接子為二價化學基團; NSP3靶向配體選自:
    Figure 03_image1511
    Figure 03_image1513
    ; NSP3靶向配體 B選自:
    Figure 03_image1515
    ; NSP3靶向配體 C選自:
    Figure 03_image1517
    Figure 03_image1519
    ; y為0或1; 稠環為視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代之稠合芳基、雜芳基、環烷基或雜環基; X 16選自
    Figure 03_image1521
    Figure 03_image1523
    Figure 03_image1525
    及鍵; X 17選自CR 33R 34、C(O)、C(S)、S(O)及S(O) 2; 各x獨立地為0、1、2、3或4; X 8、X 9、X 10、X 11、X 12、X 13、X 14及X 15獨立地選自N、CH及CR 28; R 27選自
    Figure 03_image1527
    Figure 03_image1529
    ,其各自視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 29之取代基取代; 各R 28、R 29及R 30獨立地選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、鹵素、芳基、雜芳基、雜環、氰基、硝基、-NR 7R 8、-OR 7、-SR 7、-C(O)R 9、-C(S)R 9、-S(O)R 9、-S(O) 2R 9、-OC(O)R 9、-OC(S)R 9、-OS(O)R 9、-OS(O) 2R 9、-SC(O)R 9、-OS(O) 2R 9、-NR 7C(O)R 9、-NR 7C(S)R 9、-NR 7S(O)R 9、-NR 7S(O) 2R 9、-P(O)(R 9) 2、-SP(O)(R 9) 2、-NR 7P(O)(R 9) 2及-OP(O)(R 9) 2;除了氫、鹵素、氰基及硝基之外的各者視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 10之取代基取代;且 各R 31、R 32、R 33及R 34獨立地選自氫、烷基、鹵烷基、烯基、炔基、鹵素、芳基、雜芳基、雜環、氰基、硝基、-C(O)R 9、-C(S)R 9、-S(O)R 9、-S(O) 2R 9、-OC(O)R 9、-OC(S)R 9、-OS(O)R 9、-OS(O) 2R 9、-SC(O)R 9、-OS(O) 2R 9、-NR 7C(O)R 9、-NR 7C(S)R 9、-NR 7S(O)R 9、-NR 7S(O) 2R 9、-P(O)(R 9) 2、-SP(O)(R 9) 2、-NR 7P(O)(R 9) 2及-OP(O)(R 9) 2;除了氫、鹵素、氰基及硝基之外的各者視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 10之取代基取代。
  2. 如請求項1之化合物,其中連接子選自
    Figure 03_image1531
    ; 其中: X 1及X 2在各次出現時獨立地選自鍵、雜環、NR 2、C(R 2) 2、O、C(O)及S; R 20、R 21、R 22、R 23及R 24在各次出現時獨立地選自由二價部分組成之群,該等二價部分選自鍵結烷基、-C(O)-、-C(O)O-、-OC(O)-、-SO 2-、-S(O)-、-C(S)-、-C(O)NR 2-、-NR 2C(O)-、-O-、-S-、-NR 2-、-C(R 40R 40)-、-P(O)(OR 26)O-、-P(O)(OR 26)-、雙環、烯、炔、鹵烷基、烷氧基、芳基、雜環、脂族基、雜脂族基、雜芳基、乳酸、乙醇酸及碳環;其各自視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 40之取代基取代; R 26在各次出現時獨立地選自由以下組成之群:氫、烷基、芳烷基、雜芳烷基、烯烴、炔烴、芳基、雜芳基、雜環、脂族基及雜脂族基;且 R 40在各次出現時獨立地選自由以下組成之群:氫、烷基、烯烴、炔、氟、溴、氯、羥基、烷氧基、疊氮化物、胺基、氰基、-NH(烷基)、-N(烷基) 2、-NHSO 2(烷基)、-N(烷基)SO 2烷基、-NHSO 2(芳基、雜芳基或雜環)、-N(烷基)SO 2(芳基、雜芳基或雜環)、-NHSO 2烯基、-N(烷基)SO 2烯基、-NHSO 2炔基、- N(烷基)SO 2炔基、鹵烷基、脂族基、雜脂族基、芳基、雜芳基、雜環及環烷基。
  3. 如請求項2之化合物,其中連接子選自
    Figure 03_image1533
  4. 如請求項2之化合物,其中連接子選自
    Figure 03_image1535
  5. 如請求項2之化合物,其中X 8、X 9、X 10、X 11、X 12、X 13、X 14及X 15中不超過三者為N。
  6. 如請求項2之化合物,其中該化合物具有下式:
    Figure 03_image1537
    (A); 或其醫藥學上可接受之鹽。
  7. 如請求項2之化合物,其中該化合物具有下式:
    Figure 03_image1539
    (B); 或其醫藥學上可接受之鹽。
  8. 如請求項2之化合物,其中雜環部分或雜環部分 B
    Figure 03_image1541
  9. 如請求項8之化合物,其中Q為NH。
  10. 如請求項8之化合物,其中Q為NCH 3
  11. 如請求項8之化合物,其中Q為CH 2
  12. 如請求項2之化合物,其中雜環部分或雜環部分 B
    Figure 03_image1543
  13. 如請求項2之化合物,其中雜環部分或雜環部分 B
    Figure 03_image1545
  14. 如請求項12之化合物,其中R 16
    Figure 03_image1547
    , 其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代。
  15. 如請求項12之化合物,其中R 16
    Figure 03_image1549
    , 其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代。
  16. 如請求項12之化合物,其中R 16
    Figure 03_image1551
    , 其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代。
  17. 如請求項12之化合物,其中R 16
    Figure 03_image1553
    , 其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代。
  18. 如請求項12之化合物,其中R 16
    Figure 03_image1555
    , 其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代。
  19. 如請求項12之化合物,其中R 16為R 12
  20. 如請求項2之化合物,其中雜環部分或雜環部分 B
    Figure 03_image1557
  21. 如請求項20之化合物,其中R 17
    Figure 03_image1559
    , 其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代。
  22. 如請求項20之化合物,其中R 17
    Figure 03_image1549
    , 其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代。
  23. 如請求項20之化合物,其中R 17
    Figure 03_image1562
    , 其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代。
  24. 如請求項20之化合物,其中R 17
    Figure 03_image1564
    , 其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代。
  25. 如請求項20之化合物,其中R 17
    Figure 03_image1566
    , 其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代。
  26. 如請求項20之化合物,其中R 17為R 12
  27. 如請求項2之化合物,其中雜環部分或雜環部分 B
    Figure 03_image1568
  28. 如請求項27之化合物,其中R 18
    Figure 03_image1570
    , 其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代。
  29. 如請求項27之化合物,其中R 18
    Figure 03_image1549
    , 其視情況經1、2、3或4個獨立地選自R 5之取代基取代。
  30. 如請求項2之化合物,其中雜環部分或雜環部分 B
    Figure 03_image1573
  31. 如請求項30之化合物,其中環為苯基。
  32. 如請求項31之化合物,其中R 2為氫。
  33. 如請求項31之化合物,其中R 2為甲基。
  34. 如請求項2之化合物,其中雜環部分或雜環部分 B
    Figure 03_image1575
  35. 如請求項2之化合物,其中雜環部分或雜環部分 B
    Figure 03_image1577
  36. 如請求項2之化合物,其中雜環部分或雜環部分 B
    Figure 03_image1579
  37. 如請求項36之化合物,其中X 6為與連接子之連接點。
  38. 如請求項36之化合物,其中X 5為與連接子之連接點。
  39. 如請求項36之化合物,其中X 4為與連接子之連接點。
  40. 如請求項36之化合物,其中X 3為與連接子之連接點。
  41. 如請求項36之化合物,其中X 6為CH。
  42. 如請求項36之化合物,其中X 6為CR 5
  43. 如請求項36之化合物,其中X 6為N。
  44. 如請求項36之化合物,其中X 5為CH。
  45. 如請求項36之化合物,其中X 5為CR 5
  46. 如請求項36之化合物,其中X 5為N。
  47. 如請求項36之化合物,其中X 4為CH。
  48. 如請求項36之化合物,其中X 4為CR 5
  49. 如請求項36之化合物,其中X 4為N。
  50. 如請求項36之化合物,其中X 3為CH。
  51. 如請求項36之化合物,其中X 3為CR 5
  52. 如請求項36之化合物,其中X 3為N。
  53. 如請求項2之化合物,其中雜環部分或雜環部分 B
    Figure 03_image1581
  54. 如請求項2之化合物,其中該化合物具有下式:
    Figure 03_image1583
    (C); 或其醫藥學上可接受之鹽。
  55. 如請求項2之化合物,其中該化合物具有下式:
    Figure 03_image1585
    (D); 或其醫藥學上可接受之鹽。
  56. 如請求項1至55中任一項之化合物,其中R 3為氫。
  57. 如請求項56之化合物,其中R 4為氫。
  58. 如請求項56之化合物,其中R 6為氫。
  59. 如請求項2至55中任一項之化合物,其中連接子具有下式:
    Figure 03_image1587
    Figure 03_image1589
  60. 如請求項59之化合物,其中X 1為鍵。
  61. 如請求項59之化合物,其中X 1為雜環。
  62. 如請求項59之化合物,其中X 1為NR 2
  63. 如請求項59之化合物,其中X 1為C(O)。
  64. 如請求項59之化合物,其中X 2為鍵。
  65. 如請求項59之化合物,其中X 2為雜環。
  66. 如請求項59之化合物,其中X 2為NR 2
  67. 如請求項59之化合物,其中X 2為C(O)。
  68. 如請求項59之化合物,其中R 20為鍵。
  69. 如請求項59之化合物,其中R 20為CH 2
  70. 如請求項59之化合物,其中R 20為雜環。
  71. 如請求項59之化合物,其中R 20為芳基。
  72. 如請求項59之化合物,其中R 20為苯基。
  73. 如請求項59之化合物,其中R 20為雙環。
  74. 如請求項59之化合物,其中R 21為鍵。
  75. 如請求項59之化合物,其中R 21為CH 2
  76. 如請求項59之化合物,其中R 21為雜環。
  77. 如請求項59之化合物,其中R 21為芳基。
  78. 如請求項59之化合物,其中R 21為苯基。
  79. 如請求項59之化合物,其中R 21為雙環。
  80. 如請求項2至55中任一項之化合物,其中連接子具有下式:
    Figure 03_image1591
  81. 如請求項80之化合物,其中R 22為CH 2
  82. 如請求項80之化合物,其中R 22為雜環。
  83. 如請求項80之化合物,其中R 22為芳基。
  84. 如請求項80之化合物,其中R 22為苯基。
  85. 如請求項80之化合物,其中R 22為雙環。
  86. 如請求項2至55中任一項之化合物,其中連接子具有下式:
    Figure 03_image1593
  87. 如請求項86之化合物,其中R 23為CH 2
  88. 如請求項86之化合物,其中R 23為雜環。
  89. 如請求項86之化合物,其中R 23為芳基。
  90. 如請求項86之化合物,其中R 23為苯基。
  91. 如請求項86之化合物,其中R 23為雙環。
  92. 如請求項2至55中任一項之化合物,其中連接子具有下式:
    Figure 03_image1595
  93. 如請求項92之化合物,其中R 24為鍵。
  94. 如請求項92之化合物,其中R 24為CH 2
  95. 如請求項92之化合物,其中R 24為雜環。
  96. 如請求項92之化合物,其中R 24為芳基。
  97. 如請求項92之化合物,其中R 24為苯基。
  98. 如請求項92之化合物,其中R 24為雙環。
  99. 如請求項92之化合物,其中R 24為C(O)。
  100. 如請求項1至55中任一項之化合物,其中該NSP3靶向配體或NSP3靶向配體 C選自:
    Figure 03_image1597
  101. 如請求項1至55中任一項之化合物,其中該NSP3靶向配體或NSP3靶向配體 C選自:
    Figure 03_image1599
  102. 如請求項1至55中任一項之化合物,其中該NSP3靶向配體、NSP3靶向配體 B或NSP3靶向配體 C選自:
    Figure 03_image1601
  103. 如請求項1至55中任一項之化合物,其中該NSP3靶向配體、NSP3靶向配體 B或NSP3靶向配體 C選自:
    Figure 03_image1603
  104. 如請求項1至55中任一項之化合物,其中該NSP3靶向配體、NSP3靶向配體 B或NSP3靶向配體 C選自:
    Figure 03_image1605
  105. 如請求項1至55中任一項之化合物,其中該NSP3靶向配體、NSP3靶向配體 B或NSP3靶向配體 C選自:
    Figure 03_image1607
  106. 如請求項1至55中任一項之化合物,其中該NSP3靶向配體選自:
    Figure 03_image1609
  107. 如請求項1至55中任一項之化合物,其中該NSP3靶向配體或NSP3靶向配體 C選自:
    Figure 03_image1611
  108. 如請求項106之化合物,其中X 18為CH。
  109. 如請求項106之化合物,其中X 18為N。
  110. 如請求項1至55中任一項之化合物,其中X 16
    Figure 03_image1613
  111. 如請求項1至55中任一項之化合物,其中X 16
    Figure 03_image1615
    Figure 03_image1617
  112. 如請求項1至55中任一項之化合物,其中X 16
    Figure 03_image1619
    Figure 03_image1621
  113. 如請求項1至55中任一項之化合物,其中X 16為鍵。
  114. 一種選自表1之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。
  115. 一種化合物,其選自由以下組成之群:
    Figure 03_image1623
    Figure 03_image1625
    Figure 03_image1627
    Figure 03_image1629
    Figure 03_image1631
    Figure 03_image1633
    ; 或其醫藥學上可接受之鹽。
  116. 一種醫藥組合物,其包含有效量之如請求項1至115中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽及醫藥學上可接受之賦形劑。
  117. 一種如請求項1至115中任一項之化合物或其醫藥學上可接受之鹽或其醫藥組合物之用途,其用於製造供治療冠狀病毒用之藥劑。
  118. 如請求項117之用途,其中該冠狀病毒為SARS-CoV-2。
  119. 如請求項118之用途,其中該冠狀病毒為SARS-CoV-2變異株。
  120. 如請求項119之用途,其中該SARS-CoV-2變異株為α變異株。
  121. 如請求項119之用途,其中該SARS-CoV-2變異株為β變異株。
  122. 如請求項119之用途,其中該SARS-CoV-2變異株為γ變異株。
  123. 如請求項119之用途,其中該SARS-CoV-2變異株為δ變異株。
  124. 如請求項119之用途,其中該SARS-CoV-2變異株為o變異株。
  125. 如請求項124之用途,其中該o變異株選自BA.2、BA.2.12.1、BA.2.75、BA.3、BA.4及BA.5。
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