TW202246279A - 吡𠯤硫聯苯基類化合物及其應用 - Google Patents

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付志飛
羅妙榮
帥斌
張楊
李秋
健 黎
曙輝 陳
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大陸商南京明德新藥研發有限公司
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Abstract

一種吡𠯤硫聯苯基類化合物及其應用,具體公開了式(Ⅱ)化合物或其藥學上可接受的鹽。

Description

吡𠯤硫聯苯基類化合物及其應用
本發明涉及吡𠯤硫聯苯基類化合物及其應用,具體涉及式(Ⅱ)化合物或其藥學上可接受的鹽。
本申請主張如下優先權: CN202110412812.7,申請日:2021年04月16日; CN202110590591.2,申請日:2021年05月28日; PCT/CN2021/119985,申請日:2021年9月23日; CN202210170047.7,申請日:2022年2月23日。
酪胺酸激酶的磷酸化作用與酪胺酸磷酸酶的去磷酸化作用足生物體內普遍存在的信號轉導機制,它們共同調節細胞內蛋白質的酪胺酸磷酸化水平。Shp2(SH2 domain-containing protein-tyrosine phosphatase-2)就是起去磷酸化作用的一種非跨膜型蛋白酪胺酸磷酸酶,是蛋白酪胺酸磷酸酶(PTP)家族的重要成員之一,其分子由 PTPN11 基因編碼,既可以通過磷酸酶的催化活性來正向調控下游信號轉導通路,也可以作為磷酸酶非依賴性的接頭蛋白發揮正向調控作用,在特定的條件下亦可發揮負向調控作用,從而廣泛參與細胞的分化、遷移等生物學功能的調控及相關的信號轉導過程。 PTPN11 突變被認為是青少年粒單細胞白血病(JMML)的高危因素,同時,因其在不同類型白血病中均存在著 Shp2 的異常活化和突變而被認為是白血病的原癌基因;在前列腺癌、乳腺癌、胰腺癌、胃癌和神經膠質瘤中,Shp2也被報道呈過度活化狀態;在肺癌中 Shp2 作為癌基因通過調控多種機制促進腫瘤的發生、發展。但在肝癌發生過程中,Shp2卻在特定環境的影響下發揮抑癌基因的作用。總之,作為重要的節點分子,Shp2在腫瘤發生、發展的過程中發揮著重要的調控作用,是潛在的治療靶點。
本發明提供了式(Ⅱ)化合物或其藥學上可接受的鹽,
Figure 02_image001
, 其中, 結構單元
Figure 02_image004
Figure 02_image006
Figure 02_image008
; E 1為O或CH 2; T 1為N或CH; R 1
Figure 02_image010
Figure 02_image012
; R 11、R 13和R 14分別獨立地為C 1-3烷基; R 12為H或C 1-3烷基; R 2為F、Cl、Br或I; R 3為C 1-3烷基,所述C 1-3烷基任選被1、2或3個R a取代; R 4為H、F、Cl、Br、I或C 1-3烷基,所述C 1-3烷基任選被1、2或3個R b取代; R a和R b分別獨立地為F、Cl、Br、I、OH或NH 2; n為0、1、2或3; m為1、2或3; 當n為0時,結構單元
Figure 02_image006
Figure 02_image014
,結構單元
Figure 02_image008
Figure 02_image017
; 當n為1、2或3時,結構單元
Figure 02_image006
為結構單元
Figure 02_image019
,結構單元
Figure 02_image008
Figure 02_image021
本發明提供了式(Ⅰ)化合物或其藥學上可接受的鹽,
Figure 02_image023
, 其中, 結構單元
Figure 02_image025
Figure 02_image027
Figure 02_image029
; R 1
Figure 02_image010
Figure 02_image012
; R 11、R 13和R 14分別獨立地為C 1-3烷基; R 12為H或C 1-3烷基; R 2為F、Cl、Br或I; R 3為C 1-3烷基,所述C 1-3烷基任選被1、2或3個R a取代; R 4為H、F、Cl、Br、I或C 1-3烷基,所述C 1-3烷基任選被1、2或3個R b取代; R a和R b分別獨立地為F、Cl、Br、I、OH或NH 2; m為1、2或3。
本發明的一些方案中,上述R 1
Figure 02_image031
Figure 02_image033
Figure 02_image035
,其他變量如本發明任意技術方案所定義。
本發明的一些方案中,上述R 11、R 13和R 14分別獨立地為CH 3,其他變量如本發明任意技術方案所定義。
本發明的一些方案中,上述R 12為H或CH 3,其他變量如本發明任意技術方案所定義。
本發明的一些方案中,上述R 3為CH 3,其他變量如本發明任意技術方案所定義。
本發明的一些方案中,上述R 4為F、Cl、Br或I,其他變量如本發明任意技術方案所定義。
本發明的一些方案中,上述結構單元
Figure 02_image004
Figure 02_image037
Figure 02_image039
Figure 02_image041
Figure 02_image043
,其他變量如本發明任意技術方案所定義。
本發明的一些方案中,上述結構單元
Figure 02_image004
Figure 02_image037
Figure 02_image041
Figure 02_image048
,其他變量如本發明任意技術方案所定義。
本發明的一些方案中,上述結構單元
Figure 02_image004
Figure 02_image050
Figure 02_image052
Figure 02_image054
Figure 02_image056
Figure 02_image058
Figure 02_image060
Figure 02_image062
Figure 02_image064
,其他變量如本發明任意技術方案所定義。
本發明的一些方案中,上述結構單元
Figure 02_image004
Figure 02_image050
Figure 02_image052
Figure 02_image054
Figure 02_image056
Figure 02_image058
Figure 02_image060
Figure 02_image062
,其他變量如本發明任意技術方案所定義。
本發明還有一些方案是由上述各變量任意組合而來。
本發明的一些方案中,上述化合物具有式(Ⅱ-1)的結構
Figure 02_image066
, 其中, R 11、R 12、R 2、n、E 1和結構單元
Figure 02_image068
如本發明任意技術方案所定義。
本發明的一些方案中,上述化合物具有式(Ⅰ-1)或(Ⅰ-2)的結構
Figure 02_image070
Figure 02_image072
, 其中, R 11、R 12、R 13、R 14、R 2和結構單元
Figure 02_image074
如本發明任意技術方案所定義。
本發明的一些方案中,上述化合物具有式(Ⅰ-1A)、(Ⅰ-1B)、(Ⅰ-2A)、(Ⅱ-1A)或(Ⅱ-1B)的結構
Figure 02_image076
Figure 02_image078
Figure 02_image080
Figure 02_image082
Figure 02_image084
, 其中, n、m、E 1、T 1、R 11、R 12、R 13、R 14、R 2、R 3和R 4如本發明任意技術方案所定義。
本發明的一些方案中,上述化合物具有式(Ⅰ-1A-1)、(Ⅰ-2A-1)、(Ⅱ-1A-1)或(Ⅱ-1B-1)的結構
Figure 02_image086
Figure 02_image088
Figure 02_image090
Figure 02_image092
, 其中, m、n、E 1、T 1、R 11、R 12、R 13、R 14、R 2、R 3和R 4如本發明任意技術方案所定義。
本發明還提供了下列化合物或其藥學上可接受的鹽,
Figure 02_image094
Figure 02_image096
Figure 02_image098
Figure 02_image100
Figure 02_image102
Figure 02_image104
Figure 02_image106
Figure 02_image108
Figure 02_image110
Figure 02_image112
本發明的一些方案中,上述化合物為
Figure 02_image114
Figure 02_image116
Figure 02_image118
Figure 02_image120
Figure 02_image122
Figure 02_image124
Figure 02_image126
Figure 02_image128
Figure 02_image130
Figure 02_image132
Figure 02_image134
Figure 02_image136
Figure 02_image138
Figure 02_image140
Figure 02_image142
Figure 02_image144
Figure 02_image146
Figure 02_image148
Figure 02_image150
Figure 02_image152
Figure 02_image154
Figure 02_image156
在本發明的一個技術方案中,本發明上述化合物為:
Figure 02_image158
Figure 02_image160
Figure 02_image162
在本發明的一個技術方案中,本發明上述化合物為化合物004,
Figure 02_image164
。 004
本發明的一個技術方案中,本發明化合物為化合物004的立體異構體、或所述立體異構體的甲酸鹽,所述立體異構體、或其甲酸鹽經手性超臨界流體色譜分析後保留時間為3.1-3.5min,優選3.2-3.4min,更優選約3.3 min;所述手性超臨界流體色譜分析的條件為:色譜柱: Chiralpak AS-3(100 mm*4.6 mm,3μm);流動相:二氧化碳;[0.05% 三乙胺,乙醇%]:40%-40%。
本發明的一個技術方案中,本發明上述化合物為化合物004的另一立體異構體,所述立體異構體經手性超臨界流體色譜分析後保留時間為4.3-4.7min,優選4.4-4.6min,更優選約4.5 min;所述手性超臨界流體色譜分析的條件為:色譜柱: Chiralpak AS-3(100 mm*4.6 mm,3μm);流動相:二氧化碳;[0.05% 三乙胺,乙醇%]:40%-40%。
在本發明的一個技術方案中,本發明上述化合物為
Figure 02_image166
在本發明的一個技術方案中,本發明化合物為化合物005的立體異構體;所述立體異構體經手性超臨界流體色譜分析後保留時間為4.8-5.2min,優選4.9-5.1min,更優選約5.0min;所述手性超臨界流體色譜分析的條件為:色譜柱:DAICEL CHIRALPAK AS(250mm*30mm,10μm); 流動相: [0.1%氨水-乙醇];乙醇%: 48%-78%, 7min。
本發明的一個技術方案中,本發明化合物為化合物005的另一立體異構體;所述立體異構體經手性超臨界流體色譜分析後保留時間為5.6-6.0min,優選5.7-5.9min,更優選約5.8min;所述手性超臨界流體色譜分析的條件為:色譜柱:DAICEL CHIRALPAK AS(250mm*30mm,10μm); 流動相: [0.1%氨水-乙醇];乙醇%: 48%-78%, 7min。
本發明的一個技術方案中,本發明化合物為
Figure 02_image168
。 006
在發明的一個技術方案中,上述化合物為化合物006的立體異構體,所述立體異構體經手性超臨界流體色譜分離後保留時間為4.9-5.3min,優選5.0-5.2min,更優選約5.1 min;所述手性超臨界流體色譜分離的條件為:色譜柱:DAICEL CHIRALPAK AS(250mm*30 mm,10 μm); 流動相: [0.1%氨水-甲醇]; 甲醇%: 40%-40%。
在發明的一個技術方案中,上述化合物為化合物006的另一立體異構體,所述立體異構體經手性超臨界流體色譜分離後保留時間為6.6-7.0min,優選6.7-6.9min,更優選約6.8 min;所述手性超臨界流體色譜分離的條件為:色譜柱:DAICEL CHIRALPAK AS(250mm*30 mm,10 μm); 流動相: [0.1%氨水-甲醇]; 甲醇%: 40%-40%。
在本發明的一個技術方案中,本發明化合物為
Figure 02_image170
在本發明的一個技術方案中,本發明化合物為化合物007的立體異構體;所述立體異構體經手性超臨界流體色譜分離後保留時間為6.6-7.0min,優選6.7-6.9min,更優選約6.8min;所述手性超臨界流體色譜分離的條件為色譜柱:DAICEL CHIRALPAK AS(250mm*30mm,10μm);流動相: [0.1%氨水-乙醇];乙醇%: 48%-78%, 10min。
在本發明的一個技術方案中,本發明化合物為化合物007的另一立體異構體;所述立體異構體經手性超臨界流體色譜分離後保留時間為7.1-7.5min,優選7.2-7.4min,更優選約7.4 min;所述手性超臨界流體色譜分離的條件為色譜柱:DAICEL CHIRALPAK AS(250mm*30mm,10μm);流動相: [0.1%氨水-乙醇];乙醇%: 48%-78%, 10min。
在本發明的一個技術方案中,本發明化合物為
Figure 02_image172
在本發明的一個技術方案中,本發明化合物為化合物008的立體異構體;所述立體異構體經手性超臨界流體色譜分離後保留時間為2.7-3.1min,優選2.8-3.0min,更優選約2.9 min;所述手性超臨界流體色譜分離的條件為:色譜柱:DAICEL CHIRALPAK AS(250mm*30mm,10μm); 流動相: [0.1%氨水-乙醇];乙醇%: 45%-45%。
在本發明的一個技術方案中,本發明化合物為化合物008的另一立體異構體;所述立體異構體經手性超臨界流體色譜分離後保留時間為3.6-4.0min,優選3.7-3.9min,更優選約3.9 min;所述手性超臨界流體色譜分離的條件為:色譜柱:DAICEL CHIRALPAK AS(250mm*30mm,10μm); 流動相: [0.1%氨水-乙醇];乙醇%: 45%-45%。
在本發明的一個技術方案中,本發明化合物為
Figure 02_image174
在本發明的一個技術方案中,本發明化合物為化合物010的立體異構體;所述立體異構體經手性超臨界流體色譜分離後保留時間為2.3-2.7min,優選2.4-2.6min,更優選約2.6min;所述手性超臨界流體色譜分離的條件為:DAICEL CHIRALPAK AS(250mm*30mm,10μm); 流動相: [0.1%氨水-乙醇];乙醇%: 40%-40%。
在本發明的一個技術方案中,本發明化合物為化合物010的另一立體異構體;所述立體異構體經手性超臨界流體色譜分離後保留時間為3.2-3.6min,優選3.3-3.5min,更優選約3.4min;所述手性超臨界流體色譜分離的條件為:DAICEL CHIRALPAK AS(250mm*30mm,10μm); 流動相: [0.1%氨水-乙醇];乙醇%: 40%-40%。
本發明第二方面還提供一種藥物組合物,其包含上述任意技術方案所限定的化合物或其藥學上可接受的鹽和藥學上可接受的載體。
本發明還提供一種在需要的受試者中治療與SHP2相關的疾病的方法,包括向受試者提供有效劑量的上述任意技術方案所限定的化合物或其藥學上可接受的鹽或藥物組合物。
本發明還提供了上述化合物、其異構體或其藥學上可接受的鹽或藥物組合物在製備治療與SHP2相關疾病的藥物中的應用。
技術效果
本發明化合物對蛋白酪胺酸磷酸酶SHP2展現出較好的抑制活性,將會在SHP2異常腫瘤患者中具有優異的治療效果。
定義與說明
除非另有說明,本文所用的下列術語和短語旨在具有下列含義。一個特定的術語或短語在沒有特別定義的情況下不應該被認為是不確定的或不清楚的,而應該按照普通的含義去理解。當本文中出現商品名時,意在指代其對應的商品或其活性成分。
這裡所採用的術語“藥學上可接受的”,是針對那些化合物、材料、組合物和/或劑型而言,它們在可靠的醫學判斷的範圍之內,適用於與人類和動物的組織接觸使用,而沒有過多的毒性、刺激性、過敏性反應或其它問題或併發症,與合理的利益/風險比相稱。
術語“藥學上可接受的鹽”是指本發明化合物的鹽,由本發明發現的具有特定取代基的化合物與相對無毒的酸或鹼製備。當本發明的化合物中含有相對酸性的功能團時,可以通過在純的溶液或合適的惰性溶劑中用足夠量的鹼與這類化合物接觸的方式獲得鹼加成鹽。藥學上可接受的鹼加成鹽包括鈉、鉀、鈣、銨、有機胺或鎂鹽或類似的鹽。當本發明的化合物中含有相對鹼性的官能團時,可以通過在純的溶液或合適的惰性溶劑中用足夠量的酸與這類化合物接觸的方式獲得酸加成鹽。藥學上可接受的酸加成鹽的實例包括無機酸鹽,所述無機酸包括例如鹽酸、氫溴酸、硝酸、碳酸,碳酸氫根,磷酸、磷酸一氫根、磷酸二氫根 、硫酸、硫酸氫根、氫碘酸、亞磷酸等;以及有機酸鹽,所述有機酸包括如乙酸、丙酸、異丁酸、馬來酸、丙二酸、苯甲酸、琥珀酸、辛二酸、反丁烯二酸、乳酸、扁桃酸、鄰苯二甲酸、苯磺酸、對甲苯磺酸、檸檬酸、酒石酸和甲磺酸等類似的酸;還包括胺基酸(如精胺酸等)的鹽,以及如葡糖醛酸等有機酸的鹽。本發明的某些特定的化合物含有鹼性和酸性的官能團,從而可以被轉換成任一鹼或酸加成鹽。
本發明的藥學上可接受的鹽可由含有酸根或鹼基的母體化合物通過常規化學方法合成。一般情況下,這樣的鹽的製備方法是:在水或有機溶劑或兩者的混合物中,經由游離酸或鹼形式的這些化合物與化學計量的適當的鹼或酸反應來製備。
本發明的化合物可以存在特定的幾何或立體異構體形式。本發明設想所有的這類化合物,包括順式和反式異構體、(-)- 和 (+)-對映體、(R)- 和 (S)-對映體、非對映異構體、(D)-異構體、(L)-異構體,及其外消旋混合物和其他混合物,例如對映異構體或非對映體富集的混合物,所有這些混合物都屬於本發明的範圍之內。烷基等取代基中可存在另外的不對稱碳原子。所有這些異構體以及它們的混合物,均包括在本發明的範圍之內。
除非另有說明,術語“對映異構體”或者“旋光異構體”是指互為鏡像關係的立體異構體。
除非另有說明,術語“順反異構體”或者“幾何異構體”系由因雙鍵或者成環碳原子單鍵不能自由旋轉而引起。
除非另有說明,術語“非對映異構體”是指分子具有兩個或多個手性中心,並且分子間為非鏡像的關係的立體異構體。
除非另有說明,“(+)”表示右旋,“(-) ”表示左旋,“(±)”表示外消旋。
除非另有說明,用楔形實線鍵(
Figure 02_image176
)和楔形虛線鍵(
Figure 02_image178
)表示一個立體中心的絕對構型,用直形實線鍵(
Figure 02_image180
)和直形虛線鍵(
Figure 02_image182
)表示立體中心的相對構型,用波浪線(
Figure 02_image184
)表示楔形實線鍵(
Figure 02_image176
)或楔形虛線鍵(
Figure 02_image178
),或用波浪線(
Figure 02_image184
)表示直形實線鍵(
Figure 02_image180
)和直形虛線鍵(
Figure 02_image182
)。
除非另有說明,術語“互變異構體”或“互變異構體形式”是指在室溫下,不同官能團異構體處於動態平衡,並能很快的相互轉化。若互變異構體是可能的 (如在溶液中),則可以達到互變異構體的化學平衡。例如,質子互變異構體 (proton tautomer) (也稱質子轉移互變異構體 (prototropic tautomer)) 包括通過質子遷移來進行的互相轉化,如酮-烯醇異構化和亞胺-烯胺異構化。價鍵異構體 (valence tautomer) 包括一些成鍵電子的重組來進行的相互轉化。其中酮-烯醇互變異構化的具體實例是戊烷-2,4-二酮與4-羥基戊-3-烯-2-酮兩個互變異構體之間的互變。
除非另有說明,帶“*”或“#”的原子為手性原子或手性中心,以(R)或(S)單一對映體形式或富含一種對映體形式存在;例如,
Figure 02_image186
表示的為
Figure 02_image188
Figure 02_image190
除非另有說明,術語“富含一種異構體”、“異構體富集”、“富含一種對映體”或者“對映體富集”指其中一種異構體或對映體的含量小於100%,並且,該異構體或對映體的含量大於等於60%,或者大於等於70%,或者大於等於80%,或者大於等於90%,或者大於等於95%,或者大於等於96%,或者大於等於97%,或者大於等於98%,或者大於等於99%,或者大於等於99.5%,或者大於等於99.6%,或者大於等於99.7%,或者大於等於99.8%,或者大於等於99.9%。
除非另有說明,術語“異構體過量”或“對映體過量”指兩種異構體或兩種對映體相對百分數之間的差值。例如,其中一種異構體或對映體的含量為90%,另一種異構體或對映體的含量為10%,則異構體或對映體過量(ee值)為80%。
可以通過的手性合成或手性試劑或者其他常規技術製備光學活性的(R)-和(S)-異構體以及D和L異構體。如果想得到本發明某化合物的一種對映體,可以通過不對稱合成或者具有手性助劑的衍生作用來製備,其中將所得非對映體混合物分離,並且輔助基團裂開以提供純的所需對映異構體。 或者,當分子中含有鹼性官能團(如氨基)或酸性官能團(如羧基)時,與適當的光學活性的酸或鹼形成非對映異構體的鹽,然後通過本領域所公知的常規方法進行非對映異構體拆分,然後回收得到純的對映體。此外,對映異構體和非對映異構體的分離通常是通過使用色譜法完成的,所述色譜法採用手性固定相,並任選地與化學衍生法相結合(例如由胺生成氨基甲酸鹽)。
本發明的化合物可以在一個或多個構成該化合物的原子上包含非天然比例的原子同位素。例如,可用放射性同位素標記化合物,比如氚( 3H),碘-125( 125I)或C-14( 14C)。又例如,可用重氫取代氫形成氘代藥物,氘與碳構成的鍵比普通氫與碳構成的鍵更堅固,相比於未氘化藥物,氘代藥物有降低毒副作用、增加藥物穩定性、增強療效、延長藥物生物半衰期等優勢。本發明的化合物的所有同位素組成的變換,無論放射性與否,都包括在本發明的範圍之內。
術語“任選”或“任選地”指的是隨後描述的事件或狀況可能但不是必需出現的,並且該描述包括其中所述事件或狀況發生的情況以及所述事件或狀況不發生的情況。
術語“被取代的”是指特定原子上的任意一個或多個氫原子被取代基取代,取代基可以包括重氫和氫的變體,只要特定原子的價態是正常的並且取代後的化合物是穩定的。當取代基為氧(即=O)時,意味著兩個氫原子被取代。氧取代不會發生在芳香基上。
術語“任選被取代的”是指可以被取代,也可以不被取代,除非另有規定,取代基的種類和數目在化學上可以實現的基礎上可以是任意的。
當任何變量(例如R)在化合物的組成或結構中出現一次以上時,其在每一種情況下的定義都是獨立的。因此,例如,如果一個基團被0-2個R所取代,則所述基團可以任選地至多被兩個R所取代,並且每種情況下的R都有獨立的選項。此外,取代基和/或其變體的組合只有在這樣的組合會產生穩定的化合物的情況下才是被允許的。
當其中一個變量選自單鍵時,表示其連接的兩個基團直接相連,比如A-L-Z中L代表單鍵時表示該結構實際上是A-Z。
當一個取代基為空缺時,表示該取代基是不存在的,比如A-X中X為空缺時表示該結構實際上是A。當所列舉的取代基中沒有指明其通過哪一個原子連接到被取代的基團上時,這種取代基可以通過其任何原子相鍵合,例如,吡啶基作為取代基可以通過吡啶環上任意一個碳原子連接到被取代的基團上。
當所列舉的連接基團沒有指明其連接方向,其連接方向是任意的,例如,
Figure 02_image192
中連接基團L為-M-W-,此時-M-W-既可以按與從左往右的讀取順序相同的方向連接環A和環B構成
Figure 02_image194
,也可以按照與從左往右的讀取順序相反的方向連接環A和環B構成
Figure 02_image196
。所述連接基團、取代基和/或其變體的組合只有在這樣的組合會產生穩定的化合物的情況下才是被允許的。
除非另有規定,當某一基團具有一個或多個可連接位點時,該基團的任意一個或多個位點可以通過化學鍵與其他基團相連。當該化學鍵的連接方式是不定位的,且可連接位點存在H原子時,則連接化學鍵時,該位點的H原子的個數會隨所連接化學鍵的個數而對應減少變成相應價數的基團。所述位點與其他基團連接的化學鍵可以用直形實線鍵(
Figure 02_image198
)、直形虛線鍵(
Figure 02_image200
)、或波浪線(
Figure 02_image202
)表示。例如-OCH 3中的直形實線鍵表示通過該基團中的氧原子與其他基團相連;
Figure 02_image204
中的直形虛線鍵表示通過該基團中的氮原子的兩端與其他基團相連;
Figure 02_image206
中的波浪線表示通過該苯基基團中的1和2位碳原子與其他基團相連;
Figure 02_image208
表示該哌啶基上的任意可連接位點可以通過1個化學鍵與其他基團相連,至少包括
Figure 02_image210
Figure 02_image212
Figure 02_image214
Figure 02_image216
這4種連接方式,即使-N-上畫出了H原子,但是
Figure 02_image208
仍包括
Figure 02_image210
這種連接方式的基團,只是在連接1個化學鍵時,該位點的的H會對應減少1個變成相應的一價哌啶基。
除非另有規定,術語“C 1-3烷基”用於表示直鏈或支鏈的由1至3個碳原子組成的飽和碳氫基團。所述C 1-3烷基包括C 1-2和C 2-3烷基等;其可以是一價(如甲基)、二價(如亞甲基)或者多價(如次甲基)。C 1-3烷基的實例包括但不限於甲基 (Me)、乙基 (Et)、丙基 (包括n-丙基和異丙基) 等。
除非另有規定,C n-n+m或C n-C n+m包括n至n+m個碳的任何一種具體情況,例如C 1-12包括C 1、C 2、C 3、C 4、C 5、C 6、C 7、C 8、C 9、C 10、C 11、和C 12,也包括n至n+m中的任何一個範圍,例如C 1-12包括C 1-3、C 1-6、C 1-9、C 3-6、C 3-9、C 3-12、C 6-9、C 6-12、和C 9-12等;同理,n元至n+m元表示環上原子數為n至n+m個,例如3-12元環包括3元環、4元環、5元環、6元環、7元環、8元環、9元環、10元環、11元環、和12元環,也包括n至n+m中的任何一個範圍,例如3-12元環包括3-6元環、3-9元環、5-6元環、5-7元環、6-7元環、6-8元環、和6-10元環等。
術語“離去基團”是指可以被另一種官能團或原子通過取代反應(例如親核取代反應)所取代的官能團或原子。例如,代表性的離去基團包括三氟甲磺酸酯;氯、溴、碘;磺酸酯基,如甲磺酸酯、甲苯磺酸酯、對溴苯磺酸酯、對甲苯磺酸酯等;醯氧基,如乙醯氧基、三氟乙醯氧基等等。
術語“保護基”包括但不限於“氨基保護基”、“羥基保護基”或“巰基保護基”。術語“氨基保護基”是指適合用於阻止氨基氮位上副反應的保護基團。代表性的氨基保護基包括但不限於:甲醯基;醯基,例如鏈烷醯基(如乙醯基、三氯乙醯基或三氟乙醯基);烷氧基羰基,如第三丁氧基羰基(Boc);芳基甲氧羰基,如苄氧羰基(Cbz)和9-芴甲氧羰基(Fmoc);芳基甲基,如苄基(Bn)、三苯甲基(Tr)、1,1-二-(4'-甲氧基苯基)甲基;甲矽烷基,如三甲基甲矽烷基(TMS)和第三丁基二甲基甲矽烷基(TBS)等等。術語“羥基保護基”是指適合用於阻止羥基副反應的保護基。代表性羥基保護基包括但不限於:烷基,如甲基、乙基和第三丁基;醯基,例如鏈烷醯基(如乙醯基);芳基甲基,如苄基(Bn),對甲氧基苄基(PMB)、9-芴基甲基(Fm)和二苯基甲基(二苯甲基,DPM);甲矽烷基,如三甲基甲矽烷基(TMS)和第三丁基二甲基甲矽烷基(TBS)等等。
除非另有說明,超臨界流體色譜的條件,例如,超臨界流體色譜(色譜柱:DAICEL CHIRALPAK AS(250mm*30mm,10μm); 流動相: [0.1%氨水-乙醇];乙醇%: 48%-78%, 7min,其中7min表示的是乙醇濃度從48%增加到78%所需要的時間。
本發明的化合物可以通過本發明所屬技術領域具通常知識者所熟知的多種合成方法來製備,包括下面列舉的具體實施方式、其與其他化學合成方法的結合所形成的實施方式以及本發明所屬技術領域上具通常知識者所熟知的等同替換方式,優選的實施方式包括但不限於本發明的實施例。
本發明的化合物可以通過本發明所屬技術領域具通常知識者所熟知的常規方法來確認結構,如果本發明涉及化合物的絕對構型,則該絕對構型可以通過本領域常規技術手段予以確證。例如單晶X射線衍射法(SXRD),把培養出的單晶用Bruker D8 venture衍射儀收集衍射強度數據,光源為CuKα輻射,掃描方式:φ/  掃描,收集相關數據後,進一步採用直接法(Shelxs97)解析晶體結構,便可以確證絕對構型。
本發明所使用的溶劑可經市售獲得。本發明採用下述縮略詞:aq代表水;eq代表當量、等量; NaCNBH 3代表氰基硼氫化鈉;r.t.代表室溫;mp代表熔點;DCM代表二氯甲烷;MeOH代表甲醇;SFC代表超臨界流體色譜;MMS表示肝固有清除率。
化合物依據本領域常規命名原則或者使用ChemDraw®軟體命名,市售化合物採用供應商目錄名稱。
下面經過實施例對本發明進行詳細描述,但並不意味著對本發明任何不利限制。本文已經詳細地描述了本發明,其中也公開了其具體實施例方式,對本發明所屬技術領域具通常知識者而言,在不脫離本發明精神和範圍的情況下針對本發明具體實施方式進行各種變化和改進將是顯而易見的,仍然屬於本發明的保護範圍。
實施例1
Figure 02_image158
Figure 02_image219
步驟1:化合物001-2的合成: 將化合物001-1 (5 g, 24.22 mmol, 1 eq) 溶解到乙腈 (50 mL),加入二碘甲烷(9.73 g, 36.33 mmol, 2.93 mL, 1.5 eq),0℃緩慢加入亞硝酸第三丁脂 (3.75 g, 36.33 mmol, 4.32 mL, 1.5 eq),混合物升溫至20℃攪拌,然後升溫至80℃攪拌1小時。將反應液在 43℃減壓濃縮。將濃縮物溶解在80 mL石油醚中,過濾,最後用無水硫酸鈉乾燥有機相,過濾,濾液減壓濃縮。柱層析:粗品經柱層析(石油醚)分離,得化合物001-2。
步驟2:化合物001-3的合成: 在氮氣的保護下,將化合物001-2 (5 g, 15.76 mmol, 1 eq) 和二甲基氧膦(1.23 g, 15.76 mmol, 1 eq) 溶解到二氧六環(50 mL),一次加入三(二亞苄基丙酮)二鈀 (721.38 mg, 787.78 μmol, 0.05 eq), 4,5-雙二苯基膦-9,9-二甲基氧雜蒽(455.82 mg, 787.78 μmol, 0.05 eq),N,N-二異丙基乙胺 (5.09 g, 39.39 mmol, 6.86 mL,2.5 eq),然後升溫至60℃攪拌16小時。將反應液冷卻到20℃,並且在43℃減壓濃縮。將濃縮物溶解在30 mL水和50 mL乙酸乙酯中,萃取分層,同時水相用乙酸乙酯(30 mL,30 mL,30 mL)萃取三次。合併有機相,用飽和氯化鈉溶液(30 mL)洗滌一次,最後用無水硫酸鈉乾燥有機相,過濾,濾液減壓濃縮。用高效液相色譜(色譜柱: Phenomenex Genimi NX C18150*40mm*5μm;流動相: [水(0.225%甲酸)-乙腈];乙腈%: 22%-32%,10min)分離純化,得化合物001-3。MS (ESI) m/z: 269.0[M+H] +
步驟3:化合物001-4的合成: 在氮氣的保護下,將化合物001-3 (2.3 g, 8.60mmol, 1eq) 和化合物001-3A (2.25 g, 10.32 mmol, 1.2 eq)溶解到二氧六環(25 mL),一次加入N,N-二異丙基乙胺 (3.33 g, 25.80 mmol, 4.49 mL, 3eq),三(二亞苄基丙酮)二鈀 (787.38 mg, 859.86 μmol, 0.1 eq),4,5-雙二苯基膦-9,9-二甲基氧雜蒽(497.53mg, 859.86 μmol, 0.1 eq),然後升溫至110℃攪拌5小時。將反應液冷卻到20℃,並且在43℃減壓濃縮。將濃縮物溶解在50mL水和50mL乙酸乙酯中,萃取分層,同時水相用乙酸乙酯( 50mL,30mL,30mL)萃取三次。合併有機相,用飽和氯化鈉溶液(30mL)洗滌一次,最後用無水硫酸鈉乾燥有機相,過濾,濾液減壓濃縮。粗品經柱層析(0 - 10%甲醇在二氯甲烷中)分離。得到化合物001-4。MS (ESI) m/z:405.2[M+H] +
步驟4:化合物001-5的合成: 將化合物001-4 (0.5 g,1.23 mmol, 1 eq)溶解到四氫呋喃 (5 mL),-78℃一次加入(滴加)溶於四氫呋喃(5 mL)的第三丁醇鉀 (1 M, 1.85 mL, 1.5 eq),混合物在-78℃攪拌1小時。將反應液直接旋乾得到粗品。得到的粗品,無需進一步純化,直接用於下一步反應。得到化合物001-5。MS (ESI) m/z: 221.0[M+H] +
步驟5:化合物001-6的合成: 在氮氣保護下,將化合物001-5(270 mg, 1.22 mmol, 1 eq) 和化合物001-5A(382.59 mg, 1.84 mmol, 1.5 eq)溶解到二氧六環 (3 mL),一次加入三(二亞苄基丙酮)二鈀(112.05 mg, 122.36 μmol, 0.1eq) ,4,5-雙二苯基膦-9,9-二甲基氧雜蒽(70.80 mg, 122.36 μmol, 0.1 eq),N,N-二異丙基乙胺 (474.43 mg,3.67 mmol, 639.40 μL, 3 eq),然後升溫至110℃攪拌5小時。將反應液冷卻到20℃,並且在43℃減壓濃縮。將濃縮物溶解在30mL水和30mL乙酸乙酯中,萃取分層,同時水相用乙酸乙酯(30mL,30mL,30mL)萃取三次。合併有機相,用飽和氯化鈉溶液(30mL)洗滌一次,最後用無水硫酸鈉乾燥有機相,過濾,濾液減壓濃縮。粗品經柱層析(0 - 10%甲醇在二氯甲烷中)(TLC檢測DCM:MeOH = 10: 1)分離。得到化合物001-6。MS (ESI) m/z: 347.9[M+H] +
步驟6:化合物001-7的合成: 將化合物001-6 (40mg, 114.88 μmol, 1 eq)和化合物001-6A (47.29 mg, 172.32 μmol, 1.5 eq)溶解到二甲基乙醯胺 (2 mL) 和水 (2 mL) 的混合溶劑中,一次加入碳酸鉀(79.39 mg, 574.40μmol, 5 eq),然後升溫至100℃攪拌16小時。將反應液直接旋乾得到粗品。得到化合物001-7,直接用於下一步反應。MS (ESI) m/z: 586.3[M+H] +
步驟7:化合物001的合成: 將化合物001-7 (45mg, 76.77 μmol, 1 eq) 溶解到鹽酸/二氧六環(4 M, 479.83 μL, 25 eq),混合物在20℃攪拌1小時。將反應液直接旋乾得到粗品。用高效液相色譜(色譜柱: Phenomenex Gemini-NX C18 75*30mm*3μm;流動相:[水(0.225%甲酸)-乙腈];乙腈%: 0%-30%,7min)分離純化,得到化合物001的甲酸鹽。MS (ESI) m/z: 482.1[M+H] +1H NMR (400 MHz, CD 3OD) δ ppm 1.32 - 1.35 (m, 3 H), 1.71 (br d, J = 12.80 Hz, 1 H), 1.80 - 1.90 (m, 3 H), 1.95 (s, 3 H), 1.99 (s, 3 H), 3.09 - 3.25 (m, 2 H), 3.41 (br d, J = 4.02 Hz, 1 H), 3.87 (d, J = 9.29 Hz, 1 H), 4.00 (d, J = 9.03 Hz, 1 H), 4.18 - 4.38 (m, 3 H), 6.95 (d, J = 7.53 Hz, 1 H), 7.36 (m, 1 H), 7.62 (s, 1 H), 7.75 (m, 1 H)。
實施例2
Figure 02_image160
Figure 02_image221
步驟1:化合物002-1的合成: 在氮氣的保護下,將化合物001-1 (200 mg, 968.68 μmol, 1eq) 溶解到乙腈 (5mL),一次加入二碘甲烷 (73.00 mg, 774.94 μmol, 69.52μL, 0.8eq),升溫至60℃,緩慢加入亞硝酸第三丁酯 (149.83 mg, 1.45 mmol, 172.82 μL, 1.5eq),然後升溫至80℃攪拌1 小時。將反應液在43℃減壓濃縮。將濃縮物溶解在80 mL 石油醚中,過濾,最後用無水硫酸鈉乾燥有機相,過濾,濾液減壓濃縮。柱層析:粗品經柱層析(石油醚= 100%)分離。得到化合物002-1。 1H NMR (400 MHz,CDCl 3) δ ppm 7.33 (dd, J=7.15, 2.13 Hz, 1 H), 6.95 - 7.05 (m, 2 H), 2.40 (s, 3 H)。
步驟2:化合物002-2的合成: 將化合物002-1 (2.8 g, 11.79 mmol, 1eq) 溶解到甲醇(40 mL),一次加入乙酸胺 (1.82 g, 23.57 mmol, 2eq) ,醋酸碘苯 (9.49 g, 29.47 mmol, 2.5eq) ,混合物在20℃攪拌 1 小時。將反應液直接旋乾得到粗品。粗品經柱層析(0 - 10%甲醇在二氯甲烷中)分離得到化合物002-2。MS (ESI) m/z: 269.7[M+H] +
步驟3:化合物002-3的合成: 在氮氣的保護下,將化合物002-2 (1 g, 3.72 mmol, 1 eq)和化合物001-3A (894.37 mg, 4.10 mmol, 1.1eq) 溶解到二氧六環 (10 mL),一次加入二異丙基乙胺 (1.44 g, 11.17 mmol, 1.95 mL, 3 eq),三(二亞苄基丙酮)二鈀(340.98 mg, 372.36μmol, 0.1eq),4,5-雙二苯基膦-9,9-二甲基氧雜蒽(215.45 mg, 372.36 umol, 0.1eq),然後升溫至110℃攪拌5小時。將反應液冷卻到20℃,並且在43℃減壓濃縮。將濃縮物溶解在50mL水和50mL乙酸乙酯中,萃取分層,同時水相用乙酸乙酯(50 mL,30 mL,30 mL)萃取三次。合併有機相,用飽和氯化鈉溶液(30 mL)洗滌一次,最後用無水硫酸鈉乾燥有機相,過濾,濾液減壓濃縮。柱層析:粗品經柱層析(0 - 10%甲醇在二氯甲烷中)分離。得到化合物002-3。MS (ESI) m/z: 406.1[M+H] +
步驟4:化合物002-4的合成: 在氮氣的保護下,將化合物002-4 (100 mg, 246.30 μmol, 1 eq) 溶解到四氫呋喃(1.23 mL),-78℃一次加入第三丁醇鉀 (1 M, 1.23 mL, eq) ,混合物在-78℃攪拌1 小時。將反應液直接旋乾得到粗品。得到的粗品,無需進一步純化,直接用於下一步反應。得到化合物002-4。MS (ESI) m/z: 221.9[M+H]+。
步驟5:化合物002-5的合成: 在氮氣的保護下,將化合物002-4(50 mg, 225.50 μmol, 1eq)和化合物001-5A (70.51 mg, 338.25 μmol, 1.5eq) 溶解到 二氧六環(3 mL) ,一次加入二異丙基乙胺(87.43 mg, 676.51 μmol, 117.84 μL, 3eq) , 三(二亞苄基丙酮)二鈀 (20.65mg, 22.55 μmol, 0.1eq) , 4,5-雙二苯基膦-9,9-二甲基氧雜蒽(13.05 mg, 22.55 μmol, 0.1eq),然後升溫至110℃攪拌5小時。將反應液冷卻到20℃,並且在43℃減壓濃縮。將濃縮物溶解在30mL水和30 mL乙酸乙酯中,萃取分層,同時水相用乙酸乙酯(30 mL×3)萃取三次。合併有機相,用飽和氯化鈉溶液(30 mL)洗滌一次,最後用無水硫酸鈉乾燥有機相,過濾,濾液減壓濃縮。粗品經柱層析(0 - 10%甲醇在二氯甲烷中)分離。得到化合物002-5。MS (ESI) m/z: 348.9[M+H]+。
步驟6:化合物002-6的合成: 在氮氣的保護下,將化合物002-5 (50 mg, 143.16 μmol, 1eq) 和化合物001-6A (39.29 mg, 143.16 μmol, 1eq) 溶解到二甲基乙醯胺 (2 mL),水 (2 mL),一次加入碳酸鉀 (59.36 mg, 429.48 μmol, 3eq),然後升溫至100℃攪拌16小時。將反應液直接旋乾得到化合物002-6。MS (ESI) m/z: 587.1[M+H]+。
步驟7:化合物002的合成: 將化合物002-6 (50 mg, 85.15 μmol, 1eq)溶解到鹽酸/甲醇(4 M, 532.17 μL, 25eq),混合物在20℃攪拌1 小時。將反應液直接旋乾得到粗品。用高效液相色譜(色譜柱: Phenomenex Gemini-NX C18 75*30mm*3μm; 流動相: [水(0.225%甲酸)-乙腈];乙腈%: 0%-30%,7min)分離純化。得到化合物002的甲酸鹽。將002的甲酸鹽加入到乙酸乙酯(30 mL)中,飽和碳酸氫鈉溶液洗,無水硫酸鈉乾燥,過濾,濾液旋乾可得化合物002。MS (ESI) m/z: 483.1[M+H] +1H NMR (400 MHz, CD 3OD) δ ppm 7.96 (d, J = 7.75 Hz, 1 H), 7.63 (s, 1 H), 7.37 (t, J = 8.00 Hz, 1 H), 6.97 (d, J = 8.50 Hz, 1 H), 4.63 (br s, 2 H), 4.20 - 4.37 (m, 4 H), 3.99 (m, 1 H), 3.87 (m, 1 H), 3.36 (s, 3 H), 3.10 - 3.24 (m, 1 H), 1.77 - 1.91 (m, 3 H), 1.70 (m, 1 H), 1.32 (m, 3 H)。
實施例3
Figure 02_image162
Figure 02_image223
步驟1:化合物003-1的合成: 在氮氣的保護下,將化合物002-2 (1.9 g, 7.07 mmol, 1eq) 溶解到N,N-二甲基甲醯胺(20 mL),0℃一次加入氫化鈉 (424.45 mg, 10.61 mmol, 60% 純度, 1.5eq),混合物在0℃攪拌 10min,然後加入碘甲烷 (2.01 g, 14.15 mmol, 880.86 μL, 2 eq) 升溫至25℃攪拌小時。將反應液逐滴滴入10 mL冰水中,50mL乙酸乙酯稀釋,分液,水相乙酸乙酯洗(50mL),合併有機相,無水硫酸鈉乾燥,過濾,濾液減壓旋去溶劑。粗品經柱層析(石油醚:乙酸乙酯= 0- 50%)分離,得到化合物003-1。MS (ESI) m/z: 283.9[M+H] +
步驟2:化合物003-2的合成: 在氮氣的保護下,將化合物003-1 (1.5 g, 5.31mmol, 1 eq) 和化合物001-3A (1.27 g, 5.84 mmol, 1.1 eq) 溶解到而二氧六環 (20 mL),一次加入二異丙基乙胺(2.06 g, 15.92 mmol, 2.77 mL, 3 eq),三(二亞苄基丙酮)二鈀(486.08 mg,530.81 μmol, 0.1 eq),4,5-雙二苯基膦-9,9-二甲基氧雜蒽(307.14 mg, 530.81 μmol, 0.1 eq),然後升溫至110℃攪拌5小時。將反應液冷卻到20℃,並且在43℃減壓濃縮。將濃縮物溶解在50mL水和50mL乙酸乙酯中,萃取分層,同時水相用乙酸乙酯(50mL,30mL,30mL)萃取三次。合併有機相,用飽和氯化鈉溶液(30mL)洗滌一次,最後用無水硫酸鈉乾燥有機相,過濾,濾液減壓濃縮。柱層析:粗品經柱層析(0 - 10%甲醇在二氯甲烷中)分離。得到化合物003-2。MS (ESI) m/z: 420.0[M+H] +
步驟3:化合物003-3的合成: 在氮氣的保護下,將化合物003-2 (100 mg, 238.08 μmol, 1 eq) 溶解到四氫呋喃 (1 mL),-78℃一次加入第三丁醇鉀 (1 M, 1.19 mL, 5 eq),混合物在-78℃攪拌1小時。將反應液直接旋乾得到得到化合物003-3。MS (ESI) m/z: 235.9[M+H]+。
步驟4:化合物003-4的合成: 在氮氣的保護下,將化合物003-3 (56 mg, 237.54 μmol, 1eq) 和化合物001-5A (74.27 mg, 356.30 μmol, 1.5 eq) 溶解到二氧六環 (3 mL),一次加入二異丙基乙胺 (92.10 mg, 712.61 μmol, 124.12 uL, 3 eq) , 三(二亞苄基丙酮)二鈀(21.75 mg,23.75 μmol, 0.1 eq) , 4,5-雙二苯基膦-9,9-二甲基氧雜蒽(13.74 mg, 23.75 μmol, 0.1 eq),然後升溫至110℃攪拌5 小時。將反應液冷卻到20℃,並且在43℃減壓濃縮。將濃縮物溶解在30mL水和30mL乙酸乙酯中,萃取分層,同時水相用乙酸乙酯(30mL×3)萃取三次。合併有機相,用飽和氯化鈉溶液(30mL)洗滌一次,最後用無水硫酸鈉乾燥有機相,過濾,濾液減壓濃縮。粗品經柱層析(0 - 10%甲醇在二氯甲烷中)分離得到化合物003-4。MS (ESI) m/z: 362.9[M+H] +
步驟5:化合物003-5的合成: 在氮氣的保護下,將化合物003-4 (85 mg, 233.98 μmol, 1 eq) 和化合物001-6A (77.05 mg, 280.77 μmol, 1.2 eq) 溶解到二甲基乙醯胺 (2 mL) , 水 (2 mL),一次加入碳酸鉀 (97.01 mg, 701.93 μmol, 3 eq) ,然後升溫至100℃攪拌16小時。將反應液直接旋乾得到粗品。得到化合物003-5。MS (ESI) m/z: 601.1[M+H] +
步驟6:化合物003的合成: 將化合物003-5 (50 mg, 83.16 μmol, 1 eq)溶解到氯化氫/甲醇(4 M, 20.79 μL, 1 eq),混合物在20℃攪拌1 小時。將反應液直接旋乾得到粗品。送高效液相色譜(Phenomenex Gemini-NX C18 75*30mm*3μm;流動相:[水(0.225%甲酸)-乙腈];乙腈%: 5%-35%,7min)分離純化得到化合物003的甲酸鹽。將003的甲酸鹽加入到乙酸乙酯(30 mL)中,飽和碳酸氫鈉溶液洗,無水硫酸鈉乾燥,過濾,濾液旋乾可得化合物003。MS (ESI) m/z: 497.0[M+H ]+1H NMR (400 MHz, CD 3OD) δ ppm 7.92 (dd, J = 7.91, 1.38 Hz, 1 H), 7.63 (s, 1 H), 7.40 (t, J = 7.91 Hz, 1 H), 7.00 (dd, J = 8.03, 1.51 Hz, 1 H), 4.25 - 4.38 (m, 3 H), 4.02 (d, J = 9.29 Hz, 1 H), 3.90 (d, J = 9.29 Hz, 1 H), 3.44 (d, J = 4.27 Hz, 1 H), 3.36 (s, 3 H), 3.07 - 3.24 (m, 2 H), 2.57 (s, 3 H), 1.79 - 1.90 (m, 3 H), 1.68 - 1.76 (m, 1 H), 1.35 (s, 3 H)。
實施例4
Figure 02_image225
Figure 02_image227
Figure 02_image229
Figure 02_image231
步驟1:化合物004-2的合成: 在氮氣的保護下,將化合物004-1(5.0 g, 19.43 mmol, 1 eq)溶解於無水四氫呋喃中 (60 mL)中,氮氣置換三次後降溫至-78 ℃。向反應混合物中緩慢滴加二異丙基氨基鋰(2.0 M, 10.69 mL, 1.1 eq)的四氫呋喃溶液後混合物在-78℃下攪拌1小時,之後往體系中緩慢滴加化合物004-2A的四氫呋喃溶液並在-78℃下反應30分鐘,然後將反應體系緩慢升溫至-25℃反應15小時。反應結束後用100 mL飽和氯化銨溶液淬滅,乙酸乙酯萃取三次(50 mL×3),合併有機相,無水硫酸鈉乾燥,過濾,旋蒸除去溶劑。柱層析:粗品經柱層析(石油醚:乙酸乙酯= 0- 10%)分離得到化合物004-2。MS(ESI)m/z: 388.2 [M+Na] +
步驟2:化合物004-3的合成: 在氮氣的保護下,將化合物004-2 (6.91 g, 18.91 mmol, 1 eq)溶於二氧六環(80 mL) 和甲醇(32 mL)中,再加入氫氧化鈉水溶液(6 M, 16 mL, 5.08 eq)後,升溫至100 ℃回流反應15小時。反應結束後冷卻至室溫,減壓除去有機溶劑後用稀鹽酸(1.0 M)調節pH為3-4,過濾,濾餅用水洗滌,洗滌後的濾餅重新溶解於乙酸乙酯中,無水硫酸鈉乾燥後旋乾得化合物004-3,MS (ESI) m/z: 360.1 [M+Na] +
步驟3:化合物004-4的合成: 在氮氣的保護下,將化合物004-4(6.10 g, 18.08 mmol, 1 eq)和多聚磷酸(40 mL,1.0 eq)加入單口瓶中,120℃下反應1小時。反應結束後冷卻至室溫,將反應混合物倒入冰水中淬滅,冰浴下緩慢用氫氧化鈉水溶液(6 M)調節pH至9。乙酸乙酯萃取三次(50 mL×3),合併有機相,無水硫酸鈉乾燥,過濾,旋蒸除去溶劑後將粗品溶於二氯甲烷(100 mL)中。加入二碳酸二第三丁酯(6.12 g, 28.05 mmol, 6.44 mL, 3.0 eq)和三乙胺(5.68 g, 56.10 mmol, 7.81 mL, 6.0 eq)後反應混合物在25℃下反應2小時。反應結束後加水,分液,水相用乙酸乙酯萃取(50 mL×3),合併有機相,無水硫酸鈉乾燥,過濾,旋蒸除去溶劑得化合物004-4。MS (ESI)m/z: 342.1 [M+Na] +
步驟4:化合物004-5的合成: 在氮氣的保護下,將化合物004-4(2 g, 6.26 mmol, 1eq)和化合物004-5A (2.28 g, 18.79 mol, 3.0 eq) 加入單口瓶中,隨後加入鈦酸四乙酯(5 mL)100℃回流反應18小時。反應結束後冷卻至室溫,將混合物倒入冰水中淬滅,加入乙酸乙酯(50 mL)後攪拌1小時,分液,水相用乙酸乙酯萃取(50 mL×3)。合併有機相,無水硫酸鈉乾燥,過濾,旋蒸除去溶劑。柱層析:粗品經柱層析(石油醚:乙酸乙酯= 0- 20%)分離,得到化合物004-5。MS(ESI)m/z: 445.1 [M+Na] +
步驟5:化合物004-6的合成: 在氮氣的保護下,將化合物004-5(2.54g, 6.01 mmol, 1 eq)溶於四氫呋喃(25 mL)中,降溫至-20℃後加入硼氫化鈉(455 mg, 12.02 mmol, 2.0 eq)。反應體系逐漸恢復至25℃反應12小時。反應結束後,冰浴下加水淬滅反應,乙酸乙酯萃取(50 mL×3)後合併有機相,無水硫酸鈉乾燥,過濾,旋蒸除去溶劑得到化合物004-6。MS(ESI) m/z: 447.1 [M+Na] +
步驟6:化合物004-7的合成: 將化合物004-6(34 mg, 80 μmol, 1 eq)溶於二氯甲烷(5 mL)中,加入三氟乙酸(91.2 mg, 800 umol, 59.23 μL, 10 eq)。反應混合物在25℃下反應2小時後加入碳酸鉀中和反應體系至中性,旋乾溶劑得化合物004-7。MS(ESI)m/z: 325.1 [M+H] +
步驟7:化合物004-8的合成: 將化合物004-7(25.9 mg, 80 μmol, 1 eq)和化合物002-5(27.6 mg, 80 μmol, 1 eq)溶於N,N-二甲基乙醯胺(4 mL)和水(4 mL)中,加入碳酸鉀(57.38 mg, 415 μmol, 5 eq)後100℃下反應48小時。反應結束後冷卻至室溫,加入水(10 mL)後用乙酸乙酯萃取(10 mL×3),合併有機相,無水硫酸鈉乾燥,過濾,旋蒸除去溶劑。柱層析:粗品經柱層析(二氯甲烷:甲醇= 0- 10%)分離,得到化合物004-8。MS(ESI)m/z: 637.1 [M+H] +
步驟8:化合物004的合成: 將化合物004-8(23 mg, 36.1 μmol, 1 eq)溶於甲醇(2 mL)中,加入鹽酸甲醇溶液(4 M, 530 μL, 58.5 eq)。反應混合物在25℃下反應1小時後直接旋乾溶劑得粗品,粗品送製備高效液相色譜(色譜柱:Phenomenex Gemini-NX C18 75*30mm*3μm;流動相: [水(0.225%甲酸)-乙腈];乙腈%: 48%-78%,7min)分離得到化合物004的甲酸鹽。將004的甲酸鹽加入到乙酸乙酯(30 mL)中,飽和碳酸氫鈉溶液洗,無水硫酸鈉乾燥,過濾,濾液旋幹可得化合物004。MS(ESI) m/z: 533.2 [M+H] +1H NMR (400 MHz,CDCl 3) δ ppm 7.95 (dd, J = 7.78, 1.25 Hz, 1 H), 7.68 (s, 1 H), 7.28 (m, 2 H), 7.04 (dd, J = 7.91, 1.38 Hz, 1 H), 6.91 – 6.96 (m, 2 H), 4.88 (s, 2 H), 4.21 (m, 2 H), 3.98 (s, 1H), 3.34 (s, 3 H), 3.17 – 3.27 (m, 2 H), 3.05 - 3.14 (d, J = 15.56 Hz, 1 H), 2.75 (d, J=15.56 Hz, 1 H), 1.30 - 1.34 (m, 2 H)。
步驟9:化合物004-8A和004-8B的合成: 將化合物004-8送手性超臨界流體色譜進行分離(色譜柱: Chiralpak AS-3(100 mm*4.6 mm,3μm);流動相: 二氧化碳; [0.05% 三乙胺,乙醇%]: 40%-40%),分離得到兩個異構體,異構體1為004-8A(保留時間2.557 min)。MS(ESI)m/z: 637.1 [M+H] +。異構體2為004-8B(保留時間3.028 min),MS(ESI)m/z: 637.1 [M+H] +
步驟10:化合物004A的合成: 將化合物004-8A(23 mg, 36.1 μmol, 1 eq)溶於甲醇(2 mL)中,加入鹽酸甲醇溶液(4 M, 530 μL, 58.5 eq)。反應混合物在25℃下反應1小時後直接旋乾溶劑得粗品,粗品送高效液相色譜(色譜柱:Welch Xtimate C18 150*25mm*5μm;流動相: [水(0.225%甲酸)-乙腈];乙腈%: 10%-40%,7min)分離得到化合物004A的甲酸鹽。MS(ESI) m/z: 533.2 [M+H] +1H NMR (400 MHz,CD 3OD) δ ppm 7.95(dd, J=7.78, 1.25 Hz, 1 H), 7.64 (s, 1 H), 7.50 dd, J = 8.28, 5.27 Hz, 1 H), 7.38 (t, J=7.91, 1 H), 7.15 – 7.02 (m, 2 H), 6.99 (dd, J = 8.03, 1.51 Hz, 1H), 4.45 – 4.25 (m, 3 H), 3.36 (s, 3H), 3.32 – 3.22 (m, 2 H ), 3.20 – 3.10 ( m, 2 H ), 2.00 - 1.50 (m, 4 H )。 1H NMR (400 MHz,CDCl 3) δ ppm 7.95(dd, J=7.78, 1.25 Hz, 1 H), 7.68 (s, 1 H), 7.28 (m, 2 H), 7.04 (dd, J=7.91, 1.38 Hz, 1 H), 6.91 – 6.96 (m, 2 H), 4.88 (s, 2 H), 4.21 (m, 2 H), 3.98 (s, 1H), 3.34 (s, 3 H ), 3.17 – 3.27 m, 2 H ), 3.05 - 3.14 (d, J=15.56 Hz, 1 H ), 2.75 (d, J=15.56 Hz, 1 H ), 1.30 - 1.34 (m, 2 H )。 004A的甲酸鹽送手性超臨界流體色譜進行分析:(色譜柱: Chiralpak AS-3(100 mm*4.6 mm,3μm);流動相: 二氧化碳; [0.05% 三乙胺,乙醇%]: 40%-40%)保留時間為3.327 min。
步驟11:化合物004B的合成: 將化合物004-8B(23 mg, 36.1 μmol, 1 eq)溶於甲醇(2 mL)中,加入鹽酸甲醇溶液(4 M, 530 μL, 58.5 eq)。反應混合物在25℃下反應1小時後直接旋乾溶劑得粗品,粗品送高效液相色譜(色譜柱:Welch Xtimate C18 150*25mm*5μm;流動相: [水(0.225%甲酸)-乙腈];乙腈%: 10%-70%,7min)分離得到化合物004B的甲酸鹽。MS (ESI)m/z: 533.2 [M+H] +1H NMR (400 MHz,CD 3OD) δ ppm 7.95 (dd, J = 7.78, 1.25 Hz, 1 H ), 7.64 (s, 1 H ), 7.54 (dd, J = 8.53, 5.02 Hz, 1 H ), 7.38 (t, J = 7.91, 1 H ), 7.18 – 7.05 (m, 2 H ), 6.99 (dd, J = 8.03, 1.25 Hz, 1H), 4.45 – 4.25 (m, 3 H ), 3.36 (s, 3 H ), 3.32 – 3.22 (m, 2H ), 3.22 – 3.15 (m, 2 H ), 2.00 – 1.50 (m, 4 H )。 1H NMR (400 MHz,CDCl 3) δ ppm 7.95 (dd, J = 7.78, 1.25 Hz, 1 H ), 7.68 (s, 1 H ), 7.28 (m, 2 H ), 7.04 (dd, J = 7.91, 1.38 Hz, 1 H ), 6.91 – 6.96 (m, 2 H ), 4.88 (s, 2 H ), 4.21 (m, 2 H ), 3.98 (s, 1H ), 3.34 (s, 3 H ), 3.17 – 3.27 (m, 2 H ), 3.05 - 3.14 (d, J = 15.56 Hz, 1 H ), 2.75 (m, 1 H ), 1.30 - 1.34 (m, 2 H )。 004B的甲酸鹽送手性超臨界流體色譜進行分析:(色譜柱: Chiralpak AS-3(100 mm*4.6 mm,3μm);流動相: 二氧化碳; [0.05% 三乙胺,乙醇%]: 40%-40%)保留時間為4.498 min。
實施例5
Figure 02_image166
Figure 02_image234
Figure 02_image236
步驟1:化合物005-2的合成: 將化合物005-1(500 mg, 1.17 mmol, 1 eq)溶於二氯甲烷(5 mL)中,加入三氟乙酸(3.0 mL)。反應混合物在25℃下反應2小時後加入碳酸鉀中和反應體系至中性,旋乾溶劑得化合物005-2。MS(ESI)m/z: 327.1 [M+H] +
步驟2:化合物005-3的合成: 將化合物005-2(380 mg,1.16 mmol, 1 eq)和化合物002-5(405 mg,1.16 mmol, 1 eq)溶於N,N-二甲基乙醯胺(10 mL)和水(10 mL)中,加入碳酸鉀(995 mg, 5.8 mmol, 5 eq)後100℃下反應48小時。反應結束後冷卻至室溫,加入水(10 mL)後用乙酸乙酯萃取(10 mL×3),合併有機相,無水硫酸鈉乾燥,過濾,旋蒸除去溶劑。柱層析:粗品經柱層析(二氯甲烷:甲醇= 0- 10%)分離,得到化合物005-3。MS (ESI) m/z: 639.1 [M+H] +
步驟3:化合物005的合成: 將化合物005-3(250 mg, 391 μmol, 1 eq)溶於甲醇(10 mL)中,加入鹽酸甲醇溶液(4 M, 2.5 mL, 58.5 eq)。反應混合物在25℃下反應1小時後直接旋乾溶劑得粗品,粗品送超臨界流體色譜(色譜柱:DAICEL CHIRALPAK AS(250mm*30mm,10μm); 流動相: [0.1%氨水-乙醇];乙醇%: 48%-78%, 7min。分離得到化合物005A (5.032 min) 和化合物005B (5.823 min)。化合物005A:MS (ESI ) m/z: 535.1 [M+H] +1H NMR (400 MHz, CD 3OD ) δ ppm 7.94 (dd, J = 7.78, 1.25 Hz, 1 H ), 7.65 (s, 1 H ) 7.38 – 7.34 (m, 2 H ), 7.00 – 6.97 (m, 1 H ), 6.91 – 6.55 (m, 2 H ), 4.48 – 4.40 (m, 1 H ), 4.37 – 4.26 (m, 1 H ), 4.09 (s, 1 H ), 3.45 – 3.37 (m, 2 H ), 3.35 (s, 3 H ), 1. 96 – 1.93 (m, 2 H ), 1. 85 – 1.82 (m, 2 H )。化合物005B:MS (ESI ) m/z: 535.1 [M+H] +1H NMR (400 MHz, CD 3OD ) δ ppm 7.94 (dd, J = 7.78, 1.25 Hz, 1 H ), 7.65 (s, 1 H ), 7.38 – 7.34 (m, 2 H ), 7.00 – 6.97 (m, 1 H ), 6.91 – 6.66 – 6.55 (m, 2 H ), 4.48 – 4.40 (m, 1 H ), 4.37 – 4.26 (m, 1 H ), 4.09 (s, 1 H ), 3.45 – 3.37 (m, 2 H ), 3.35 (s, 3 H ), 1. 96 – 1.93 (m, 2 H ), 1. 85 – 1.82 (m, 2 H )。
實施例6
Figure 02_image238
Figure 02_image240
Figure 02_image242
步驟1:化合物006-3的合成: 將化合物006-1(7.13 g, 33.93 mmol,1 eq)溶於四氫呋喃(160 mL)中,待溫度降低至-78℃下加入雙異丙基氨基鋰(2 M, 22.06 mL, 1.3 eq) ,反應體系在-78℃下反應1小時,加入006-2 (10 g, 37.32 mmol, 1.1 eq),體系在-78℃下再反應1小時,而後在攪拌下緩慢升溫至25℃。反應結束後用25 mL飽和氯化銨溶液淬滅,乙酸乙酯萃取三次(150 mL×3),合併有機相,無水硫酸鈉乾燥,過濾,旋蒸除去溶劑。柱層析:粗品經柱層析(石油醚:乙酸乙酯= 0- 10%)分離得到化合物006-3。MS (ESI) m/z: 296.8 [M+H] +。 步驟2:化合物006-4的合成: 在氮氣的保護下,將化合物006-3 (12.00 g, 30.21 mmol, 1 eq)溶於N-N二甲基乙醯胺(100 mL) 和水(10 mL)的混合溶液中,加入二氯雙[二第三丁基-(4-二甲基氨基苯基)膦]鈀(2.14 g, 3.02 mmol, 2.14 mL, 0.1 eq)  和三乙胺 (12.23 g, 120.82 mmol, 16.82 mL, 4 eq),體系抽換氮氣三次,升溫至130℃反應5小時。將反應液冷卻至室溫,加入水150ml,用乙酸乙酯萃取(200 mL×3),合併有機相,減壓濃縮至濃縮液體積為150 mL左右,水洗4次,飽和食鹽水洗滌2次,無水硫酸鈉乾燥,減壓濃縮得粗產物。粗品經柱層析(30%~35%乙酸乙酯在石油醚中)分離得到化合物006-4,MS(ESI)m/z: 263.9[M+H] +
步驟3:化合物006-5的合成: 將化合物006-4 (8.83 g, 27.65 mmol, 1 eq) 溶於鈦酸四乙酯(85ml)中,加入化合物004-5A(10.05 g, 82.94 mmol, 3 eq),體系抽換氮氣三次,而後升溫至130℃反應3小時。反應結束後,將反應液冷卻至室溫,將反應液加入至冰水中,攪拌40分鐘,將上清液加入分液漏斗中,再加入乙酸乙酯萃取(200 mL×3),合併有機相,用飽和食鹽水洗滌,無水硫酸鈉乾燥,減壓濃縮得粗產物。粗產物經柱層析(25%~35%乙酸乙酯在石油醚中)分離得到化合物006-5。MS(ESI)m/z: 322.9 [M- tBu] +
步驟4:化合物006-6的合成: 將化合物006-5 (7.34 g, 17.37 mmol, 1 eq)溶於四氫呋喃中(70ml),降溫至0℃,攪拌下加入硼氫化鈉 (1.31 g, 34.74 mmol, 2 eq),反應體系逐漸恢復至25℃下反應16小時。向反應液中加入150 mL水淬滅未反應完的NaBH 4,乙酸乙酯萃取(200 mL×3),合併有機相用無水硫酸鈉乾燥,減壓濃縮的粗產物。粗產物經SFC純化得到化合物006-6。MS (ESI) m/z: 325.0 [M- tBu] +
步驟5:化合物006-7的合成: 將化合物006-6(1.10 g, 2.59 mmol, 1 eq)溶於二氯甲烷(10 mL)中,加入三氟乙酸 (3.84 g, 33.68 mmol, 2.49 mL, 13 eq),混合液在25℃下反應50min。反應結束後,減壓濃縮除掉部分三氟乙酸,再向濃縮液中加入30ml水,加入3g碳酸鉀除掉多餘三氟乙酸,乙酸乙酯萃取(50 mL×3),有機相合併後用無水硫酸鈉乾燥,過濾,旋蒸除去溶劑得到化合物006-7。MS(ESI) m/z: 325.1 [M+H] +
步驟6:化合物006-8的合成: 將化合物006-7(380 mg,1.16 mmol, 1 eq)和化合物002-5(405 mg,1.16 mmol, 1 eq)溶於N,N-二甲基乙醯胺(10 mL)和水(10 mL)中,加入碳酸鉀(995 mg, 5.8 mmol, 5 eq)後100℃下反應48小時。反應結束後冷卻至室溫,加入水(50 mL)後用乙酸乙酯萃取(50 mL×3),合併有機相並用飽和食鹽水洗滌(50 mL×3),有機相用無水硫酸鈉乾燥,過濾,旋蒸除去溶劑。柱層析:粗品經柱層析(二氯甲烷:甲醇= 0- 10%)分離,得到化合物006-8。MS(ESI)m/z: 637.2 [M+H] +
步驟7:化合物006的合成: 將化合物006-8(308 mg, 483 μmol, 1 eq)溶於甲醇(10 mL)中,加入鹽酸甲醇溶液(4 M, 2.5 mL, 58.5 eq)。反應混合物在25℃下反應1小時後直接旋乾溶劑得006粗品,粗品送手性超臨界流體色譜(色譜柱:DAICEL CHIRALPAK AS(250mm*30 mm,10 μm); 流動相: [0.1%氨水-甲醇]; 甲醇%: 40%-40%。分離得到化合物006A (5.115 min) 和化合物006B (6.812 min)。化合物006A:MS (ESI ) m/z: 533.1 [M+H] +1H NMR (400 MHz, CD 3OD ) δ ppm 7.94 (d, J = 7.78 Hz, 1 H ), 7.65 (s, 1 H ), 7.37 (t, J = 7.91 Hz, 1 H ), 7.24 (dd, J = 7.91, 5.14 Hz, 1 H ), 7.19 – 7.10 (m, 1 H ), 7.00 – 6.93 (m, 2 H ), 4.39 – 4.25 (m, 2 H ), 3.98 (s, 1 H ), 3.35 (s, 3 H ), 3.30 - 3.10 (m, 3 H ), 2.79 (d, J = 15.31 Hz, 1 H ), 1. 90 – 1.70 (m, 2 H), 1.64 – 1.59 (m, 1H), 1.45 – 1.35 (m, 1H)。化合物006B:MS (ESI ) m/z: 533.1 [M+H] +。δ ppm 7.94 (d, J = 7.78 Hz, 1 H ), 7.65 (s, 1 H ), 7.37 (t, J = 7.91 Hz, 1 H ), 7.24 (dd, J = 7.91, 5.14 Hz, 1 H ), 7.19 – 7.10 (m, 1 H ), 7.00 – 6.93 (m, 2 H ), 4.39 – 4.25 (m, 2 H ), 3.98 (s, 1 H ), 3.35 (s, 3 H ), 3.30 - 3.10 (m, 3 H ), 2.79 (d, J = 15.31 Hz, 1 H ), 1. 90 – 1.70 (m, 2 H), 1.64 – 1.59 (m, 1H), 1.45 – 1.35 (m, 1H)。
實施例7
Figure 02_image170
Figure 02_image245
Figure 02_image247
步驟1:化合物007-2的合成: 將化合物007-1(500 mg, 1.23 mmol, 1 eq)溶於二氯甲烷(5 mL)中,加入三氟乙酸(3.0 mL)。反應混合物在25℃下反應2小時後加入碳酸鉀中和反應體系至中性,旋乾溶劑得化合物007-2。MS(ESI)m/z: 306.1 [M+H] +
步驟2:化合物007-3的合成: 將化合物007-2(366 mg,1.19 mmol, 1 eq)和化合物002-5(420 mg, 1.20 mmol, 1 eq)溶於N,N-二甲基乙醯胺(10 mL)和水(10 mL)中,加入碳酸鉀(832 mg, 5.8 mmol, 5 eq)後100℃下反應48小時。反應結束後冷卻至室溫,加入水(10 mL)後用乙酸乙酯萃取(10 mL×3),合併有機相,無水硫酸鈉乾燥,過濾,旋蒸除去溶劑。柱層析:粗品經柱層析(二氯甲烷:甲醇= 0- 10%)分離,得到化合物007-3。MS(ESI)m/z: 621.1 [M+H] +
步驟3:化合物007的合成: 將化合物007-3(238 mg, 391 μmol, 1 eq)溶於甲醇(10 mL)中,加入鹽酸甲醇溶液(4 M, 2.5 mL, 58.5 eq)。反應混合物在25℃下反應1小時後直接旋乾溶劑得粗品,粗品送超臨界流體色譜(色譜柱:DAICEL CHIRALPAK AS(250mm*30mm,10μm); 流動相: [0.1%氨水-乙醇];乙醇%: 48%-78%, 10min。分離得到化合物007A (6.802 min)和化合物007B(7.384 min)。化合物007A :MS (ESI ) m/z: 516.1 [M+H] +。化合物007A :MS (ESI ) m/z: 516.1 [M+H] +1H NMR (400 MHz, CD 3OD ) δ ppm 8.35 (d, J = 5.14 Hz, 1 H ) 7.95 (dd, J = 7.91 Hz, 1.38, 1 H ), 7.84 (d, J = 7.53 Hz, 2 H ), 7.63 (s, 1 H ), 7.37 (t , J = 7.91 Hz, 1H ), 7.28 (dd , J = 7.40, 5.14 Hz, 1 H ), 7.00 (dd , J = 7.91, 1.38 Hz, 1 H ), 4.37 – 4.26 (m, 2 H ), 4.04 (s, 1 H ), 3.35 (s, 3 H ), 3.20 – 3.30 (m, 3 H ), 2.97 – 2.82 (m, 1 H ), 1.95 – 1.75 (m, 2 H ), 1.70 – 1.60 (m, 1 H ), 1.45 – 1.40 (m, 1 H )。化合物007B:MS (ESI ) m/z: 516.1 [M+H] +1H NMR (400 MHz, CD 3OD ) δ ppm 8.35 (d, J = 5.14 Hz, 1 H ), 7.95 (dd, J = 7.91 Hz, 1.38, 1 H ), 7.84 (d, J = 7.53 Hz, 2 H ), 7.63 (s, 1 H ), 7.37 (t , J = 7.91 Hz, 1H ), 7.28 (dd , J = 7.40, 5.14 Hz, 1 H ), 7.00 (dd , J = 7.91, 1.38 Hz, 1 H ), 4.37 – 4.26 (m, 2 H ), 4.04 (s, 1 H ), 3.35 (s, 3 H ), 3.20 – 3.30 (m, 3 H ), 2.97 – 2.82 (m, 1 H ), 1.95 – 1.75 (m, 2 H ), 1.70 – 1.60 (m, 1 H ), 1.45 – 1.40 (m, 1 H )。
實施例8
Figure 02_image172
Figure 02_image250
Figure 02_image252
步驟1:化合物008-2的合成: 將化合物006-1(19 g, 70.92 mmol, 1.1 eq)溶於四氫呋喃(160 mL)中,待溫度降低至-78℃下加入雙異丙基氨基鋰(2 M, 38.6 mL, 1.2 eq),反應體系在-78℃下反應1小時,加入008-1 (13.6 g, 64.50 mmol, 1.0 eq),體系在-78℃下再反應1小時,而後在攪拌下緩慢升溫至25℃。反應結束後用250 mL飽和氯化銨溶液淬滅,乙酸乙酯萃取三次(150 mL×3),合併有機相,無水硫酸鈉乾燥,過濾,旋蒸除去溶劑。柱層析:粗品經柱層析(石油醚:乙酸乙酯= 0- 10% )分離得到化合物008-2。MS (ESI) m/z: 297.9 [M- tBu] +
步驟2:化合物008-3的合成: 在氮氣的保護下,將化合物008-2 (12.00 g, 30.21 mmol, 1 eq)溶於N-N二甲基乙醯胺(100 mL)和水(10 mL)的混合溶液中,加入二氯雙[二第三丁基-(4-二甲基氨基苯基)膦]鈀(2.14 g, 3.02 mmol, 2.14 mL, 0.1 eq)和三乙胺 (12.23 g, 120.82 mmol, 16.82 mL, 4 eq),體系抽換氮氣三次,升溫至130℃反應5小時。將反應液冷卻至室溫,加入水150ml,用乙酸乙酯萃取(200 mL×3),合併有機相,減壓濃縮至濃縮液體積為150ml左右,飽和食鹽水洗滌(200 mL×6),無水硫酸鈉乾燥,減壓濃縮得粗產物。粗品經柱層析(30%~35%乙酸乙酯在石油醚中)分離得到008-3,MS(ESI)m/z: 264.1 [M- tBu] +
步驟3:化合物008-4的合成: 將008-3 (18 g, 56.36 mmol, 1 eq)溶於鈦酸四乙酯(180 mL)中,加入004-5A(20.49 g, 169.08 mmol, 3 eq),體系抽換氮氣三次,而後升溫至130℃反應3小時。反應結束後,將反應液冷卻至室溫,將反應液加入至冰水中,攪拌40分鐘,將上清液加入分液漏斗中,再加入乙酸乙酯萃取(200 mL×3),合併有機相,用飽和食鹽水洗滌,無水硫酸鈉乾燥,減壓濃縮得粗產物。粗產物經柱層析(25%~35%乙酸乙酯在石油醚中)分離得到化合物008-4。MS(ESI)m/z: 323.2 [M-Boc] +
步驟4:化合物008-5的合成: 將008-4 (18 g, 42.60 mmol, 1 eq)溶於四氫呋喃中(70 mL),降溫至0℃,攪拌下加入硼氫化鈉 (3.22 g, 85.20 mmol, 2 eq),反應體系逐漸恢復至25℃下反應16小時。向反應液中加入150 mL水淬滅未反應完的NaBH 4,乙酸乙酯萃取(200 mL×3),合併有機相用無水硫酸鈉乾燥,減壓濃縮的粗產物。粗產物經SFC純化(色譜柱:DAICEL CHIRALPAK AD (250mm*50mm,10μm); 流動相: [0.1%氨水-乙醇];乙醇%: 25%-25%。分離得到化合物008-5。MS (ESI) m/z: 325.2 [M-Boc] +
步驟5:化合物008-6的合成: 將008-5(800 mg, 1.88 mmol, 1 eq)溶於二氯甲烷(10mL)中,加入三氟乙酸 (3.84 g, 33.68 mmol, 2.49 mL, 13 eq),混合液在25℃下反應50分鐘。反應結束後,減壓濃縮除掉部分三氟乙酸,再向濃縮液中加入30ml水,加入3g碳酸鉀除掉多餘三氟乙酸,乙酸乙酯萃取(50 mL×3),有機相合併後用無水硫酸鈉乾燥,過濾,旋蒸除去溶劑得到化合物008-6。MS(ESI) m/z: 325.2 [M+H] +
步驟6:化合物008-7的合成: 將化合物008-6(570 mg,1.76 mmol, 1 eq)和化合物002-5(767 mg, 2.20 mmol, 1.2 eq)溶於N,N-二甲基乙醯胺(10 mL)和水(10 mL)中,加入碳酸鉀(607 mg, 4.39 mmol, 2.5 eq)後100℃下反應48小時。反應結束後冷卻至室溫,加入水(50 mL)後用乙酸乙酯萃取(50 mL×3),合併有機相並用飽和食鹽水洗滌(50 mL×3),有機相用無水硫酸鈉乾燥,過濾,旋蒸除去溶劑得到化合物008-7。MS (ESI) m/z: 637.2 [M+H] +
步驟7:化合物008的合成: 將化合物008-7(1.04 g, 1.63 mmol, 1 eq)溶於甲醇(10 mL)中,加入鹽酸甲醇溶液(4 M, 2.5 mL, 58.5 eq)。反應混合物在25℃下反應1小時後直接旋乾溶劑得008粗品,粗品送超臨界流體色譜(色譜柱:DAICEL CHIRALPAK AS(250mm*30mm,10μm); 流動相: [0.1%氨水-乙醇];乙醇%: 45%-45%。分離得到化合物008A (2.921 min)和化合物008B (3.872 min)。化合物008A:MS (ESI ) m/z: 533.1 [M+H]+。 1H NMR (400 MHz, CD 3OD ) δ ppm 7.94 (dd, J = 7.91, 1.38 Hz, 1 H ), 7.63 (s, 1 H ), 7.38 (t, J = 7.91 Hz, 1 H ), 7.30 – 7.20 (m, 2 H ), 7.00 – 6.95 (m, 2 H ), 4.35 – 4.28 (m, 2 H ), 4.03 (s, 1 H ), 3.36 (s, 3 H ), 3.32 – 3.25 (m, 2 H ), 3.21 (d, J = 16.06 Hz, 1 H ), 2.85 (d, J = 16.06 Hz, 1 H ), 1. 92 – 1.77 (m, 2 H ), 1. 65 – 1.60 (m, 1 H ), 1. 50 – 1.43 (m, 1 H )。化合物008B:MS (ESI ) m/z: 533.1 [M+H] +1H NMR (400 MHz, DMSO-d6 ) δ ppm 7.84 (dd, J = 7.91, 1.38 Hz, 1 H ), 7.63 (s, 1 H ), 7.42 (t, J = 7.91 Hz, 1 H ), 7.30 – 7.20 (m, 2 H ), 6.99 (t, J = 8.53 Hz, 1 H ), 6.86 (dd, J = 8.53, 1.51 Hz, 1H), 4.25 – 4.18 (m, 2 H ), 3.89 (s, 1 H ), 3.36 (s, 3 H ), 3.32 – 3.15 (m, 2 H ), 3.10 (d, J = 16.06 Hz, 1 H ), 2.65 (d, J = 16.06 Hz, 1 H ), 1. 80 – 1.65 (m, 2 H ), 1. 60 – 1.50 (m, 1 H ), 1. 20 – 1.05 (m, 1 H )。
實施例9
Figure 02_image254
Figure 02_image256
Figure 02_image258
步驟1:化合物009-3的合成: 0℃下將第三丁醇鉀 (17.43 g, 155.36 mmol, 3.5 eq)溶於乙二醇二甲醚(500 mL)中,抽換氮氣三次後在0℃下緩慢滴加009-2 (13.00 g, 66.58 mmol, 1.5 eq)的乙二醇二甲醚(500 mL)溶液。控制溫度不能高於5℃。混合物在0℃下攪拌反應1 小時後在0℃下加入異丙醇 (3.73 g, 62.14 mmol, 4.76 mL, 1.4 eq),混合物繼續攪拌反應30 分鐘。再加入009-1 (10 g, 44.39 mmol, 1 eq)的DME (500 mL) 溶液。混合物在0℃下攪拌反應1 小時後恢復至25℃繼續攪拌反應12小時。反應結束後用200 mL飽和氯化銨溶液淬滅,乙酸乙酯萃取(500 mL*3),有機相合併後用無水硫酸鈉乾燥,旋乾。粗品通過快速柱層析純化,(石油醚:乙酸乙酯 = 20:1-10:1) 得到化合物009-3。
步驟2:化合物009-5的合成: 將化合物009-3(6.3 g, 26.66 mmol, 1 eq)溶於四氫呋喃(250 mL)中,待溫度降低至-78℃下加入雙異丙基氨基鋰(2 M, 22.06 mL, 1.3 eq) ,反應體系在-78℃下反應1小時,加入009-4 (7.50 g, 27.99 mmol, 1.05 eq)的四氫呋喃溶液50 mL,體系在-78℃下再反應1小時,而後在攪拌下緩慢升溫至25℃。反應結束後用250 mL飽和氯化銨溶液淬滅,乙酸乙酯萃取三次(450 mL×3),合併有機相,無水硫酸鈉乾燥,過濾,旋蒸除去溶劑。粗品經柱層析(石油醚:乙酸乙酯= 10- 20%)分離得到化合物009-5。MS (ESI) m/z: 369.0 [M- tBu] +
步驟3:化合物009-6的合成: 在氮氣的保護下,將化合物009-5(5.1 g, 12.05 mmol, 1 eq)溶於N-N二甲基乙醯胺(200 mL) 和水(20 mL)的混合溶液中,加入二氯雙[二第三丁基-(4-二甲基氨基苯基)膦]鈀(0.85 g, 1.2 mmol, 0.1 eq) 和三乙胺 (4.88 g, 48.19 mmol, 6.71 mL, 4 eq),體系抽換氮氣三次,升溫至130℃反應5小時。將反應液冷卻至室溫,加入水150ml,用乙酸乙酯萃取(200 mL×3),合併有機相,減壓濃縮至濃縮液體積為150ml左右,飽和食鹽水洗滌(200 mL×6),無水硫酸鈉乾燥,減壓濃縮得粗產物。粗品經柱層析(30%~35%乙酸乙酯在石油醚中)分離得到009-6,MS(ESI)m/z: 290.1 [M- tBu] +
步驟4:化合物009-7的合成: 將009-6 (4.2 g, 12.16 mmol, 1 eq)溶於鈦酸四乙酯(100 mL)中,加入004-5A(4.42 g, 36.48 mmol, 3 eq) ,體系抽換氮氣三次,而後升溫至130℃反應3小時。反應結束後,將反應液冷卻至室溫,將反應液加入至冰水中,攪拌40分鐘,將上清液加入分液漏斗中,再加入乙酸乙酯萃取(200 mL×3),合併有機相,用飽和食鹽水洗滌,無水硫酸鈉乾燥,減壓濃縮得粗產物。粗產物經 柱層析(10%~20%乙酸乙酯在石油醚中)分離得到化合物009-7。MS(ESI)m/z: 449.1 [M+H] +
步驟5:化合物009-8的合成: 將009-7 (4.5 g, 10.03 mmol, 1 eq)溶於四氫呋喃中(70 mL),降溫至0℃,攪拌下加入硼氫化鈉 (379.51 mg, 10.03 mmol, 1 eq),反應體系逐漸恢復至25℃下反應4小時。向反應液中加入150 mL水淬滅未反應完的NaBH 4,乙酸乙酯萃取(200 mL×3),合併有機相用無水硫酸鈉乾燥,減壓濃縮的粗產物。粗產物經高效液相色譜純化(色譜柱:Phenomenex Genimi NX C18 (150mm*40mm,5μm); 流動相: [水(0.225%甲酸)-乙腈];乙腈%: 42%-72%),分離得到化合物009-8A和化合物009-8B。MS (ESI) m/z: 451.1 [M+H] +
步驟6:化合物009-9A的合成: 將009-8A(0.4 g, 0.89 mmol, 1 eq)溶於二氯甲烷(10mL)中,加入三氟乙酸 (3.84 g, 33.68 mmol, 2.49 mL, 13 eq),混合液在25℃下反應50分鐘。反應結束後,減壓濃縮除掉部分三氟乙酸,再向濃縮液中加入30ml水,加入3g碳酸鉀除掉多餘三氟乙酸,乙酸乙酯萃取(50 mL×3),有機相合併後用無水硫酸鈉乾燥,過濾,旋蒸除去溶劑得到化合物009-9A。MS(ESI) m/z: 351.1 [M+H] +
步驟7:化合物009-10A的合成: 將化合物009-9A(300 mg, 0.860 mmol, 1 eq)和化合物002-5(300 mg, 0.860 mmol, 1 eq)溶於N,N-二甲基乙醯胺(10 mL)和水(10 mL)中,加入碳酸鉀(0.591 mg, 4.3 mmol, 5 eq)後100℃下反應48小時。反應結束後冷卻至室溫,加入水(50 mL)後用乙酸乙酯萃取(50 mL×3),合併有機相並用飽和食鹽水洗滌(50 mL×3),有機相用無水硫酸鈉乾燥,過濾,旋蒸除去溶劑。柱層析:粗品經柱層析(二氯甲烷:甲醇= 0- 10%)分離,得到化合物009-10A。MS(ESI)m/z: 351.1 [M+H] +
步驟8:化合物009A的合成: 將化合物009-10A(40 mg, 60.3 μmol, 1 eq)溶於甲醇(5 mL)中,加入鹽酸甲醇溶液(4 M, 2.5 mL, 58.5 eq)。反應混合物在25℃下反應1小時後直接旋乾溶劑得009A粗品,粗品經製備高效液相色譜(色譜柱:Phenomenex Gemini-NX C18 (75mm*30mm,3μm); 流動相: [水(0.225%甲酸)-乙腈];乙腈%: 5%-35%),7 min。分離得到化合物009A的甲酸鹽:MS (ESI ) m/z: 560.0 [M+H] +1H NMR (400 MHz, CD 3OD ) δ ppm 7.98 – 7.86 (m, 1 H ), 7. 51 (s, 1 H ), 7.48 – 7.34 (m, 2 H ), 7.00 – 6.97 (m, 1 H ), 6.91 – 6.55 (m, 2 H ), 4.71 – 4.65 (m, 1 H ), 4.61 (s, 2 H ), 4.35 (s, 1 H ), 3.37 (s, 3 H ), 3.10 – 3.02 (m, 1 H ), 2.44 – 2.34 (m, 1 H ), 2.27 – 2.15 (m, 2 H ), 2.12 – 2.01 (m, 3 H ), 1.91 – 1.83 (m, 1 H ), 1.64 – 1.57 (m, 1 H )。
步驟9:化合物009-9B的合成: 將009-8B(0.4 g, 0.89 mmol, 1 eq)溶於二氯甲烷(10mL)中,加入三氟乙酸 (3.84 g, 33.68 mmol, 2.49 mL, 13 eq),混合液在25℃下反應50分鐘。反應結束後,減壓濃縮除掉部分三氟乙酸,再向濃縮液中加入30ml水,加入3g碳酸鉀除掉多餘三氟乙酸,乙酸乙酯萃取(50 mL×3),有機相合併後用無水硫酸鈉乾燥,過濾,旋蒸除去溶劑得到化合物009-9B。MS(ESI) m/z: 351.1 [M+H] +
步驟10:化合物009-10B的合成: 將化合物009-9B(300 mg, 0.860 mmol, 1 eq)和化合物002-5(300 mg, 0.860 mmol, 1 eq)溶於N,N-二甲基乙醯胺(10 mL)和水(10 mL)中,加入碳酸鉀(0.591 mg, 4.3 mmol, 5 eq)後100℃下反應48小時。反應結束後冷卻至室溫,加入水(50 mL)後用乙酸乙酯萃取(50 mL×3),合併有機相並用飽和食鹽水洗滌(50 mL×3),有機相用無水硫酸鈉乾燥,過濾,旋蒸除去溶劑。柱層析:粗品經柱層析(二氯甲烷:甲醇= 0- 10%)分離,得到化合物009-10B。MS(ESI)m/z: 351.1 [M+H] +
步驟11:化合物009B的合成: 將化合物009-10B(20 mg, 60.3 μmol, 1 eq)溶於甲醇(5 mL)中,加入鹽酸甲醇溶液(4 M, 2.5 mL, 58.5 eq)。反應混合物在25℃下反應1小時後直接旋乾溶劑得009B粗品,粗品經製備高效液相色譜(色譜柱:Phenomenex Gemini-NX C18 (75mm*30mm, 3μm); 流動相: [水(0.225%甲酸)-乙腈];乙腈%: 5%-35%),7 min。分離得到化合物009B的甲酸鹽,MS (ESI ) m/z: 5,60.0 [M+H] +1H NMR (400 MHz, CD 3OD ) δ ppm 7.98 – 7.86 (m, 1 H ), 7. 51 (s, 1 H ), 7.48 – 7.34 (m, 2 H ), 7.00 – 6.97 (m, 1 H ), 6.91 – 6.55 (m, 2 H ), 4.71 – 4.65 (m, 1 H ), 4.61 (s, 2 H ), 4.35 (s, 1 H ), 3.37 (s, 3 H ), 3.10 – 3.02 (m, 1 H ), 2.44 – 2.34 (m, 1 H ), 2.27 – 2.15 (m, 2 H ), 2.12 – 2.01 (m, 3 H ), 1.91 – 1.83 (m, 1 H ), 1.64 – 1.57 (m, 1 H )。
實施例10
Figure 02_image174
Figure 02_image261
Figure 02_image263
步驟1:化合物010-2的合成: 將化合物010-1(8.5 g, 41.06 mmol, 1 eq)溶於三氯甲烷(100 mL)中,加入N-溴代丁二醯亞胺(7.31 g, 41.06 mmol, 1 eq),過氧化苯甲醯(596.75 mg, 2.46 mmol, 0.06 eq),體系抽換氮氣三次,而後緩慢升溫至80℃反應5hr。反應結束後將反應液冷卻至室溫,過濾,濾液中加水200 mL,乙酸乙酯萃取(100mL×3),合併有機相,用飽和食鹽水(200 mL×1)洗滌後有機相用無水硫酸鈉乾燥,過濾,旋蒸除去溶劑。粗品經快速柱層析(3%~5%乙酸乙酯在石油醚中)分離得到化合物010-2。
步驟2:化合物010-3的合成: 將化合物006-1(4.35 g, 20.67 mmol, 1 eq)溶於四氫呋喃(120 mL)中,體系抽換氮氣三次,待溫度降低至-78℃下加入雙異丙基氨基鋰 (2 M, 12.40 mL, 1.2 eq),反應體系在-78℃下反應1小時,加入010-2 (6.5 g, 22.73 mmol, 1.1 eq)的四氫呋喃溶液(30mL)。體系在-78℃下再反應1小時,而後在攪拌下緩慢升溫至25℃繼續反應10小時。反應結束後用100 mL飽和氯化銨溶液淬滅,乙酸乙酯萃取三次(100 mL×3),合併有機相,無水硫酸鈉乾燥,過濾,旋蒸除去溶劑。柱層析:粗品經柱層析(10%~15%乙酸乙酯在石油醚中 )分離得到化合物010-3。MS (ESI) m/z=358.9 [M- tBu] +
步驟3:化合物010-4的合成: 將化合物010-3 (4.41 g, 10.62 mmol, 1 eq)溶於N-N二甲基乙醯胺(40 mL)和水(4 mL)的混合溶液中,加入二氯雙[二第三丁基-(4-二甲基氨基苯基)膦]鈀(751.94 mg, 1.06 mmol, 751.94 μL, 0.1 eq)  和三乙胺 (4.30 g, 42.48 mmol, 5.91 mL, 4 eq),體系抽換氮氣三次,升溫至130℃反應5小時。反應結束後,將反應液冷卻至室溫,加入水150ml,用乙酸乙酯萃取(200 mL×3),合併有機相,減壓濃縮至濃縮液體積為150 mL左右,飽和食鹽水洗滌 (200 mL×6),無水硫酸鈉乾燥,減壓濃縮得粗產物。粗品經柱層析(15%~25%乙酸乙酯在石油醚中)分離得到化合物010-4,MS(ESI)m/z:= 282.1 [M- tBu] +
步驟4:化合物010-5的合成: 將化合物010-4 (2.35 g, 6.97 mmol, 1 eq)溶於鈦酸四乙酯(30 mL)中,加入004-5A (2.53 g, 20.90 mmol, 3 eq),體系抽換氮氣三次,而後升溫至130℃反應3小時。反應結束後,將反應液冷卻至室溫,將反應液加入冰水中,攪拌40分鐘,將上清液加入分液漏斗中,再加入乙酸乙酯萃取(100 mL×3),合併有機相,用飽和食鹽水洗滌,無水硫酸鈉乾燥,減壓濃縮得粗產物。粗產物經 柱層析(25%~35%乙酸乙酯在石油醚中)分離得到化合物010-5。MS(ESI)m/z: 341.1 [M-Boc] +
步驟5:化合物010-6的合成: 將化合物010-5 (2.68 g, 6.08 mmol, 1 eq) 溶於四氫呋喃中(30 mL),降溫至0℃,攪拌下加入硼氫化鈉 (460.30 mg, 12.17 mmol, 2 eq),反應體系逐漸恢復至25℃下反應16小時。向反應液中加入100 mL水淬滅未反應完的NaBH 4,乙酸乙酯萃取(100 mL×3),合併有機相並用無水硫酸鈉乾燥,減壓濃縮得粗產物。粗產物經柱層析(45%~55%乙酸乙酯在石油醚中),分離得到化合物010-6。MS (ESI) m/z: 343.1 [M-Boc] +
步驟6:化合物010-7的合成: 將化合物010-6(435.50 mg, 984.04 μmol, 1 eq)溶於二氯甲烷(5 mL)中,加入三氟乙酸 (1.57 g, 13.78 mmol, 1.02 mL, 14 eq),混合液在25℃下反應50分鐘。反應結束後,減壓濃縮除掉部分三氟乙酸,再向濃縮液中加入30 mL水,加入3g碳酸鉀除掉多餘三氟乙酸,乙酸乙酯萃取(50 mL×3),有機相合併後用無水硫酸鈉乾燥,過濾,旋蒸除去溶劑得到化合物010-7。MS(ESI) m/z: 343.1 [M+H] +
步驟7:化合物010-8的合成: 將化合物001-7(330.00 mg, 963.66 μmol, 1 eq)和化合物002-5(403.88 mg, 1.16 mmol, 1.2 eq)溶於N,N-二甲基乙醯胺(7 mL)和水(7 mL)中,加入碳酸鉀(399.55 mg, 2.89 mmol, 3 eq)後80℃下反應16小時。反應結束後冷卻至室溫,加入水(50 mL)後用乙酸乙酯萃取(50 mL×3),合併有機相並用飽和食鹽水洗滌(50 mL×6),有機相用無水硫酸鈉乾燥,過濾,旋蒸除去溶劑得到粗產物。粗產物經柱層析(4%~8%二氯甲烷在甲醇中),分離得到化合物010-8。MS (ESI) m/z: 655.2 [M+H] +
步驟8:化合物010的合成: 將化合物010-8(160 mg, 244.18 μmol, 1 eq)溶於甲醇(2 mL)中,加入鹽酸甲醇溶液(4 M, 1.86 mL, 30.43 eq)。反應混合物在25℃下反應1小時後直接旋乾溶劑得010粗品,粗品送超臨界流體色譜(色譜柱: DAICEL CHIRALPAK AS(250mm*30mm,10μm); 流動相: [0.1%氨水-乙醇];乙醇%: 40%-40%。分離得到化合物010A (保留時間:2.561 min) 和化合物010B (保留時間:3.389 min)。化合物010A:MS(ESI)m/z: 551.0 [M+H] +1H NMR(400 MHz, CD 3OD)δ ppm 7.94 (dd, J=7.91, 1.38 Hz, 1 H), 7.61 (s, 1 H), 7.35 (t, J=7.91 Hz, 1 H), 7.30 – 7.23 (m, 1 H), 7.18 – 7.10 (m, 1 H), 7.00 – 6.95 (m, 1H), 4.35 – 4.28 (m, 2 H), 3.94 (s, 1 H), 3.36 (s, 3 H), 3.30 – 3.11 (m, 3 H), 2.82 – 2.75 (m, 1 H), 1.90– 1.71 (m, 2 H), 1. 64 – 1.55 (m, 1 H), 1. 45 – 1.37 (m, 1 H)。化合物010B:MS(ESI)m/z: 551.0 [M+H] +1H NMR(400 MHz, CD 3OD)δ ppm 7.94 (dd, J=7.91, 1.38 Hz, 1 H), 7.61 (s, 1 H), 7.35 (t, J=7.91 Hz, 1 H), 7.30 – 7.23 (m, 1 H), 7.18 – 7.10 (m, 1 H), 7.00 – 6.95 (m, 1H), 4.35 – 4.28 (m, 2 H), 3.94 (s, 1 H), 3.36 (s, 3 H), 3.30 – 3.11 (m, 3 H), 2.82 – 2.75 (m, 1 H), 1.9 – 1.71 (m, 2 H), 1. 64 – 1.55 (m, 1 H), 1. 45 – 1.37 (m, 1 H)。
生物測試
實驗例1:體外評價 反應緩衝液: 60 mM 羥乙基哌𠯤乙硫磺酸(HEPES)(pH 7.4),1 mM 乙二胺四乙酸 (EDTA),75 mM KCl,75 mM NaCl,0.01%Brij-35,5 mM 二硫蘇糖醇 (DTT) 和10%DMSO(最終)。 酶:PTPN11 / SHP2-FL(RBC生產,沒有CAS號) 重組人PTPN11全長(Genbank登錄號#NM_002834; aa 2-597, 同種型1(規範))在大腸桿菌中表達,具有N-端StrepII-TEV,C-端組胺酸的標籤。Mw = 71.93 kDa。 活化肽:H2N-LN(pY)IDLDLV(dPEG8)LST(pY)ASINFQK-amide(基於出版物) 基質:DiFMUP [6,8-二氟-7-羥基-4-甲基香豆素] 測定中的最終濃度: 0.35 μM活化肽 100 μM DiFMUP (6,8-二氟-4-甲基傘形酮磷酸酯)
步驟: 1.在新製備的反應緩衝液中製備指定的酶/肽和基質; 2.將酶/肽溶液加入到反應孔中; 3.通過聲學技術將化合物在100%DMSO中提供到酶溶液中(Echo550;納升範圍),在室溫下孵育30分鐘; 4.將基質溶液加入到反應孔中以引發反應; 5.監測酶活性(Ex/Em 355/460),作為室溫下螢光基質螢光信號增加60分鐘的時程測量; 6.數據分析:取時間過程測量的線性部分的斜率×(信號/分鐘),並計算相對於DMSO對照的%酶活性;減去酶基礎活性(無肽)的背景斜率。
本發明化合物體外篩選試驗結果如標1所示。 表1.本發明化合物體外篩選試驗結果
化合物編號 PTPN11/SHP2-FL (IC 50nM)
化合物001的甲酸鹽 21.8
化合物002的甲酸鹽 12.6
化合物003的甲酸鹽 72.4
化合物004的甲酸鹽 2.84
化合物004A的甲酸鹽 3.21
化合物004B的甲酸鹽 2.61
化合物005A 5.35
化合物005B 3.66
化合物006A 2.95
化合物006B 2.22
化合物008A 2.78
化合物008B 2.43
化合物010A 6.01
化合物010B 5.81
結論:本發明化合物對PTPN11/SHP2-FL有一定的抑制活性。
實驗例2:化合物H358細胞活性評價
實驗目的: 本實驗旨在驗證本發明化合物對KRAS G12C突變的NCI-H358人非小細胞肺癌細胞增殖抑制效果。
實驗材料: 細胞株NCI-H358(購自普諾賽)、RPMI1640培養基,盤尼西林/鏈黴素抗生素購自維森特,胎牛血清購自Biosera。CellTiter-Glo(細胞活率化學發光檢測試劑)試劑購自Promega。
實驗方法: 將NCI-H358細胞種於白色96孔板中,80μL細胞懸液每孔,其中包含4000個NCI-H358細胞。細胞板置於二氧化碳培養箱中過夜培養。將待測化合物用排槍進5倍稀釋至第9個濃度,即從2000 μM稀釋至5.12nM,設置雙複孔實驗。向中間板中加入78 μL培養基,再按照對應位置,轉移2 μL每孔的梯度稀釋化合物至中間板,混勻後轉移20μL每孔到細胞板中。轉移到細胞板中的化合物濃度範圍是10μM至0.026nM。細胞板置於二氧化碳培養箱中培養5天。另準備一塊細胞板,在加藥當天讀取信號值作為最大值(下面方程式中Max值)參與數據分析。向此細胞板每孔加入25 μL細胞活率化學發光檢測試劑,室溫孵育10分鐘使發光信號穩定。加入化合物的細胞板結束孵育後,採用多標記分析儀讀數。
數據分析: 利用方程式(Sample-Min)/(Max-Min)*100%將原始數據換算成抑制率,IC50的值即可通過四參數進行曲線擬合得出(GraphPad Prism中"log(inhibitor) vs. response -- Variable slope" 模式得出)。 本發明化合物H358細胞活性篩選試驗結果如表2所示。 表2. 本發明化合物體外篩選試驗結果
化合物編號 H358 (IC 50nM)
化合物004A的甲酸鹽 56.5
化合物004B的甲酸鹽 19.2
化合物006A 30
化合物006B 18
化合物010A 11.9
化合物010B 7.9
結論:本發明化合物對H358細胞的抑制活性良好。
實驗例3:化合物藥代動力學評價
實驗目的:測試化合物在CD-1小鼠體內藥代動力學
實驗材料:CD-1小鼠 (雄性, 32-33g)
實驗操作: 以標準方案測試化合物靜脈注射及口服給藥後的齧齒類動物藥代特徵,實驗中候選化合物配成澄清溶液,給予小鼠單次靜脈注射及口服給藥。靜注及口服溶媒為一定比例的羥丙基β環糊精水溶液或生理鹽水溶液。收集24小時內的全血樣品,3000g離心15分鐘,分離上清得血漿樣品,加入4倍體積含內標的乙腈溶液沉澱蛋白,離心取上清液加入等倍體積的水再離心取上清進樣,以LC-MS/MS 分析方法定量分析血藥濃度,並計算藥代參數,如達峰濃度,達峰時間,清除率,半衰期,藥時曲線下面積,生物利用度等。
本發明化合物藥代動力學測試結果如表3所示。 表3 藥代動力學測試結果
供試品(各實施例所制得的化合物) 清除率 (mL/min/kg) (IV @ 2 mpk) 半衰期 T 1/2(h) (PO @ 10 mpk) C max(nM) T max(h) 藥時曲線下面積 AUC (nM.hr) (PO @ 10 mpk) 生物利用度 F (%)
化合物004A的甲酸鹽 32.8 4.65 1310 1.0 6557 72.1
化合物004B的甲酸鹽 15.3 3.26 1955 1.0 7857 38.7
化合物006A 29.6 3.65 1707 1.0 7065 68.3
化合物006B 15.0 2.42 2057 1.0 9176 43.8
結論:本發明化合物可以顯著提高小鼠藥代動力學單項或部分指標。
實驗例4:人肝微粒體CYP抑制實驗 研究項目的目的是採用CYP同功酶的5合1探針基質來評價供試品對人肝微粒體細胞色素P450同功酶(CYP1A2、CYP2C9、CYP2C19、CYP2D6和CYP3A4)的抑制性。 混合人肝微粒體(HLM)購自Corning Inc. (Steuben, New York, USA)或者XenoTech, LLC. (Lenexa, KS, USA)或者其他的供應商,使用前都儲存在低於-70℃條件下。 將稀釋好的系列濃度的供試品工作液加入到含有人肝微粒體、探針基質和循環體系的輔助因子的孵育體系中,不含供試品而含有溶劑的對照作為酶活性對照(100%)。探針基質生成的代謝產物在樣品中的濃度採用液相色譜-串聯質譜(LC-MS/MS)方法進行測定。使用SigmaPlot (V.11)對供試品平均百分比活性對濃度作非線性回歸分析。通過三參數或四參數反曲對數方程來計算IC 50值。
測試結果如表4所示: 表4
測試化合物 CYP1A2, 2C9, 2C19, 2D6, 3A4 (IC 50, µM)
化合物004A的甲酸鹽 >50, >50, >50, >50, >50
化合物004B的甲酸鹽 >50, > 50, >50, >50, >50
化合物006A >50, 38.8, >50, 43.3, >50
化合物006B >50, >50, >50, 24.6, >50
結論:本發明化合物對五個CYP同功酶抑制程度均較弱。
實驗例5:hERG 鉀離子通道的抑制試驗 1. 實驗目的: 用全自動膜片鉗的方法檢測待測實施例1對hERG鉀離子通道的影響。 2. 實驗方法 2.1. 細胞培養 實驗所用的穩定表達hERG 鉀離子通道的細胞來自於Aviva Biosciences 的CHO-hERE,CHO-hERG 培養於5% CO 2,37℃的環境下。CHO hERG 培養液見表5。 表5 CHO hERG 培養液
Reagent Supplier Catalog Number Volume (mL)
F12 Hams Invitrogen 31765-092 500
FBS Invitrogen 10099-141 50
G418/Geneticin Invitrogen 10131-027 1
Hygromycin B Invitrogen 10687-010 1
2.2. 細胞的前期準備 準備用於實驗的CHO-hERG細胞至少培養兩天以上,且細胞密度達到75%以上。實驗開始之前,用TrypLE消化細胞,然後用細胞外液重懸收集細胞。 2.3. 細胞內外液的配製 細胞外液需每個月配製一次。細胞內液須分裝凍存在-20℃。細胞內外液成分見表6。 表6細胞內外液成分
組成成分 細胞外液(mM) 細胞內液(mM)
NaCl 145 -
KCl 4 120
KOH - 31.25
CaCl 2 2 5.374
MgCl 2 1 1.75
Glucose 10 -
Na 2ATP - 4
HEPES 10 10
EGTA - 10
pH 7.4 with NaOH 7.2 with KOH
滲透壓 295mOsm 285mOsm
2.4. 化合物的配製 將待測化合物和陽性對照Amitriptyline 用 DMSO 溶解成一定濃度的儲備液,然後按照不同的梯度稀釋,最後按一定的比例加入細胞外液中,稀釋成待測濃度。在實驗開始前用肉眼檢查看有無沉澱。最後,待測溶液和陽性對照Amitriptyline 中,DMSO 的濃度最高不能超過0.3%。 2.5. 電壓刺激方案 保持鉗制電位在-80 mv,首先是給予-50 mv的電壓刺激,持續80 ms以記錄細胞漏電流值,隨後去極化至+20 mv,維持4800 ms,打開hERG的通道,然後複極化至-50 mv 維持5000 ms,引出hERG 尾電流並記錄,最後,電壓恢復至鉗制電位-80 mv,維持3100 ms。以上電壓刺激,每15000 ms重複一次。 2.6. QPatch HTX全細胞膜片鉗記錄 hERG QPatch HTX實驗是在室溫下進行的。在QPatch Assay Software 5.2(Sophion Bioscience)的軟體上建立全細胞方案,電壓刺激方案和化合物檢測方案。 首先進行30次重複設定電壓刺激,該區段為後續分析的基線區域,隨後加入5 µL細胞外液,重複三次。依次加入各個化合物的作用濃度,仍舊以5 µL加入體積重複三次。每一測試濃度孵育細胞至少不低於5mins。整個記錄過程中,各項指標需達到數據分析接收標準,若未達到該標準,則該細胞不計入分析範圍,化合物將重新進行測試,以上記錄過程由均由Qpatch分析軟體自動化操作。每一化合物測試濃度依次為0.24 µM、1.20 µM、6.00 µM、30.00 µM,每一濃度至少重複兩個細胞。 2.7. 數據分析 在每一個完整電流記錄中,基於峰值電流在陰性對照中所占的百分比,可以計算出每一化合物作用濃度的抑制百分比。利用標準希式方程擬合得到量效關係曲線,具體方程如下: I (C)= I b+(I fr-I b)*c n/(IC 50 n+c n) C為化合物測試濃度,n 為斜率 曲線擬合和抑制率計算均由Qpatch 分析軟體分析完成,若最低濃度下抑制率超過半數抑制或最高濃度下抑制率未達到半數抑制,則該化合物相應的IC 50低於最低濃度或IC 50值大於最高濃度。 2.8. 測試結果 實施例化合物 hERG IC50值結果見表7。 表7 實施例化合物 hERG IC 50值結果
供試樣品 hERG IC 50(nM)
化合物004A的甲酸鹽 8.20
化合物004B的甲酸鹽 9.82
化合物006A 10.3
化合物006B 14.0
結論:本發明化合物對hERG抑制不明顯。
實驗例6:體外微粒體穩定性實驗 6.1、實驗材料: 6.1.1  肝微粒體 人和動物微粒體購買於Corning 或 Xenotech,儲存於-80℃ 冰箱。 6.1.2 還原型煙醯胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADPH),供應商:Chem-impex international,貨號:00616 6.1.3 對照化合物:睾酮,雙氯芬酸,普羅帕酮 6.2實驗步驟 6.2.1 工作液的配製 儲備液:10mM DMSO 溶液 工作濃度配製:100%乙腈稀釋到100μM(有機相含量:99%ACN,1%DMSO) 6.2.2  實驗步驟 準備2塊96孔孵育板,分別命名為T60孵育板和NCF60孵育板。 在T60孵育板和NCF60孵育板上分別加入445μL微粒體工作液(肝微粒體蛋白濃度為0.56 mg/mL),然後將上述孵育板放置於37℃水浴鍋中預孵育大約10分鐘。 預孵育結束後,在T60孵育板和NCF60孵育板上分別加入5 μL供試品或對照化合物工作液,混勻。在NCF60孵育板上每孔添加50 μL磷酸鉀鹽緩衝液啟動反應;在T0終止板中加入180 μL的終止液(含200 ng/mL tolbutamide和200 ng/mL labetalol的乙腈溶液)和6 uL的NADPH再生體系工作液,從T60孵育板中取出54 μL樣品至T0終止板(T0樣品產生)。在T60孵育板上每孔添加44 μL NADPH再生體系工作液啟動反應。在Blank板中只添加54 μL微粒體工作液、6 uL的NADPH再生體系工作液和180 μL的終止液。因此,在供試品或對照化合物的樣品中,化合物、睾酮、雙氯芬酸和普羅帕酮的反應終濃度為1 μM,肝微粒體的濃度為0.5 mg/mL,DMSO和乙腈在反應體系中的終濃度分別為0.01%(v/v)和0.99%(v/v)。 孵育適當時間(如5、15、30、45和60分鐘)後,分別在每個終止板的樣品孔中加入180 μL的終止液(含200 ng/mL tolbutamide和200 ng/mL labetalol的乙腈溶液),之後從T60孵育板中取出60 μL樣品以終止反應。 所有樣品板搖勻並在3220 ×g離心20分鐘,然後每孔取80 μL上清液稀釋到240 μL純水中用於液相色譜串聯質譜分析。 本發明化合物 MMS 結果如表8所示。 表8 本發明化合物 MMS 結果
供試樣品 MMS(mL/min/kg), H, M
化合物004A的甲酸鹽 19.7, 67.9
化合物004B的甲酸鹽 33.0, 61.1
化合物006A 31.2, 100.8
化合物006B 47.9, 57.3
雖然本發明已以實施例揭露如上,然其並非用以限定本發明,本發明所屬技術領域中具有通常知識者,在不脫離本發明之精神和範圍內,當可作些許之更動與潤飾,因此本發明之保護範圍當視後附之申請專利範圍所界定者為準。

Claims (22)

  1. 一種式(Ⅱ)化合物或其藥學上可接受的鹽,
    Figure 03_image001
    , 其中, 結構單元
    Figure 03_image004
    Figure 03_image006
    Figure 03_image008
    ; E 1為O或CH 2; T 1為N或CH; R 1
    Figure 03_image010
    Figure 03_image012
    ; R 11、R 13和R 14分別獨立地為C 1-3烷基; R 12為H或C 1-3烷基; R 2為F、Cl、Br或I; R 3為C 1-3烷基,所述C 1-3烷基任選被1、2或3個R a取代; R 4為H、F、Cl、Br、I或C 1-3烷基,所述C 1-3烷基任選被1、2或3個R b取代; R a和R b分別獨立地為F、Cl、Br、I、OH或NH 2; n為0、1、2或3; m為1、2或3; 當n為0時,結構單元
    Figure 03_image006
    Figure 03_image014
    ,結構單元
    Figure 03_image008
    Figure 03_image017
    ; 當n為1、2或3時,結構單元
    Figure 03_image006
    為結構單元
    Figure 03_image019
    ,結構單元
    Figure 03_image008
    Figure 03_image021
  2. 根據請求項1所述的化合物或其藥學上可接受的鹽,其中,R 11、R 13和R 14分別獨立地為CH 3
  3. 根據請求項1所述的化合物或其藥學上可接受的鹽,其中,R 12為H或CH 3
  4. 根據請求項1~3任意一項所述的化合物或其藥學上可接受的鹽,其中,R 1
    Figure 03_image031
    Figure 03_image033
    Figure 03_image035
  5. 根據請求項1所述的化合物或其藥學上可接受的鹽,其中,R 3為CH 3
  6. 根據請求項1所述的化合物或其藥學上可接受的鹽,其中,R 4為F、Cl、Br或I。
  7. 根據請求項1所述的化合物或其藥學上可接受的鹽,其中,結構單元
    Figure 03_image004
    Figure 03_image037
    Figure 03_image039
    Figure 03_image041
    Figure 03_image043
  8. 根據請求項7所述的化合物或其藥學上可接受的鹽,其中,結構單元
    Figure 03_image004
    Figure 03_image037
    Figure 03_image041
    Figure 03_image048
  9. 根據請求項8所述的化合物或其藥學上可接受的鹽,其中,結構單元
    Figure 03_image004
    Figure 03_image050
    Figure 03_image052
    Figure 03_image054
    Figure 03_image056
    Figure 03_image058
    Figure 03_image060
    Figure 03_image062
    Figure 03_image064
  10. 根據請求項1所述的化合物或其藥學上可接受的鹽,其化合物具有式(Ⅱ-1)的結構
    Figure 03_image066
    , 其中, R 11、R 12、R 2、n、E 1和結構單元
    Figure 03_image068
    如請求項1所定義。
  11. 根據請求項1所述的化合物或其藥學上可接受的鹽,其化合物具有式(Ⅱ-1A)或(Ⅱ-1B)的結構,
    Figure 03_image082
    Figure 03_image084
    , 其中,n、m、T 1、R 11、R 12、R 2和R 4如請求項1-10所定義。
  12. 根據請求項1所述的化合物或其藥學上可接受的鹽,其化合物具有式(Ⅰ-1A)、(Ⅰ-1B)或(Ⅰ-2A)的結構,
    Figure 03_image076
    Figure 03_image078
    Figure 03_image080
    , 其中,n、R 11、R 12、R 13、R 14、R 2、R 3和R 4如請求項1-10所定義。
  13. 根據請求項11-12所述的化合物或其藥學上可接受的鹽,其化合物具有式(Ⅰ-1A-1)、(Ⅰ-2A-1)、(Ⅱ-1A-1)或(Ⅱ-1B-1)的結構
    Figure 03_image086
    Figure 03_image088
    Figure 03_image090
    Figure 03_image092
    , 其中,m、n、E 1、T 1、R 11、R 12、R 13、R 14、R 2、R 3和R 4如請求項11-12所定義。
  14. 一種下列化合物或其藥學上可接受的鹽,
    Figure 03_image284
    Figure 03_image096
    Figure 03_image098
    Figure 03_image288
    Figure 03_image102
    Figure 03_image104
    Figure 03_image106
    Figure 03_image108
    Figure 03_image110
    Figure 03_image112
  15. 根據請求項14所述的化合物或其藥學上可接受的鹽,其化合物為
    Figure 03_image114
    Figure 03_image116
    Figure 03_image118
    Figure 03_image120
    Figure 03_image122
    Figure 03_image124
    Figure 03_image126
    Figure 03_image128
    Figure 03_image130
    Figure 03_image132
    Figure 03_image134
    Figure 03_image136
    Figure 03_image138
    Figure 03_image140
    Figure 03_image142
    Figure 03_image144
    Figure 03_image146
    Figure 03_image148
    Figure 03_image150
    Figure 03_image152
    Figure 03_image154
    Figure 03_image156
  16. 一種下式化合物的立體異構體、或所述立體異構體的藥學上可接受的鹽,
    Figure 03_image164
    , 其中,所述立體異構體經手性超臨界流體色譜分析後保留時間為3.1-3.5min,優選3.2-3.4min,更優選3.3min;所述手性超臨界流體色譜分析的條件為:色譜柱: Chiralpak AS-3(100 mm*4.6 mm,3μm);流動相:二氧化碳;[0.05% 三乙胺,乙醇%]:40%-40%。
  17. 一種下式化合物的立體異構體、或所述立體異構體的藥學上可接受的鹽,
    Figure 03_image164
    , 其中,所述化合物經手性超臨界流體色譜分析後保留時間為4.3-4.7min,優選4.4-4.6min,更優選4.5 min;所述手性超臨界流體色譜分析的條件為:色譜柱: Chiralpak AS-3(100 mm*4.6 mm,3μm);流動相:二氧化碳;[0.05% 三乙胺,乙醇%]:40%-40%。
  18. 一種下式化合物的立體異構體,或所述異構體的藥學上可接受的鹽,
    Figure 03_image306
    , 其中,所述化合物經手性超臨界流體色譜分離後保留時間為4.9-5.3min,優選5.0-5.2min,更優選5.1min;所述手性超臨界流體色譜分離的條件為:色譜柱:DAICEL CHIRALPAK AS(250mm*30 mm,10 μm); 流動相: [0.1%氨水-甲醇]; 甲醇%: 40%-40%。
  19. 一種下式化合物的立體異構體、或所述立體異構體的藥學上可接受的鹽,
    Figure 03_image308
    , 其中,所述化合物經手性超臨界流體色譜分離後保留時間為6.6-7.0min,優選6.7-6.9min,更優選6.8min;所述手性超臨界流體色譜分離的條件為:色譜柱:DAICEL CHIRALPAK AS(250mm*30 mm,10 μm); 流動相: [0.1%氨水-甲醇]; 甲醇%: 40%-40%。
  20. 一種藥物組合物,其包含請求項1-19任意一項所述的化合物或其藥學上可接受的鹽和藥學上可接受的載體。
  21. 一種根據請求項1~19任意一項所述化合物或其藥學上可接受的鹽或根據請求項20所述的藥物組合物在製備治療與SHP2相關的疾病的藥物中的應用。
  22. 根據請求項21所述的應用,其中所述SHP2相關的疾病為實體瘤。
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