TW202134278A - 用於治療腫瘤之ｅｐｈａ３導向ｃａｒ－ｔ細胞 - Google Patents
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Abstract
本發明提供靶向人類EphA3之嵌合抗原受體(chimeric antigen receptor；CAR)及結合至人類EphA3且結合至人類突變體表皮生長因子受體變異體III( epidermal growth factor receptor variant III；EGFRvIII)之雙重靶向CAR。本發明亦關於包含所提供的CAR或雙重靶向CAR之CAR-T細胞。本發明提供藉由投與該等CAR來治療實體腫瘤癌症之方法。
Description
本發明係關於靶向人類EphA3且結合至其之嵌合抗原受體(CAR)及關於結合至人類EphA3且結合至人類突變體表皮生長因子受體變異體III (EGFRvIII)之雙重靶向CAR。本發明亦關於包含靶向人類EphA3 且結合至其之CAR之CAR-T細胞及關於包含結合至人類EphA3且結合至人類EGFRvIII之雙重靶向CAR之CAR-T細胞。本發明進一步關於用於治療實體腫瘤癌症之方法，該等方法包含對有此需要的個體投與醫藥組合物，該醫藥組合物包含包含靶向人類EphA3且結合至其之CAR之CAR-T細胞或包含結合至人類EphA3且結合至人類EGFRvIII之雙重靶向CAR之CAR-T細胞。
嵌合抗原受體T細胞(CART)療法之功效在實體腫瘤中仍然有限。考慮到表面受體表現及免疫抑制基質微環境之異質性，需要靶向並破壞腫瘤新生血管系統(neovasculature)及腫瘤基質之策略來幫助克服實體腫瘤(包括多形性神經膠質母細胞瘤(GBM))中之CART抑制。Eph受體為受體酪胺酸激酶之最大家族及在發育及體內平衡期間對細胞黏附、遷移及軸突導引不可缺。EphA3為受體酪胺酸激酶，其在成年組織中表現較弱但在GBM及其他實體腫瘤中的腫瘤新生血管系統及腫瘤基質細胞中高度表現。EphA3在多達40%的GBM樣品中過度表現且在其他實體腫瘤(包括胰臟腫瘤、前列腺腫瘤、乳腫瘤、結腸腫瘤、黑色素瘤、骨髓瘤、膀胱腫瘤、腎腫瘤及肝腫瘤、肺癌(例如小細胞肺癌(SCLC)或非小細胞肺癌(NSCLC)))之腫瘤基質及腫瘤血管系統中過度表現。
手術移除實體GBM腫瘤，替莫唑胺(temozolomide)化療及放療可使約7%的患者延長存活期長達五年。GBM之當前療法為非治癒性。有鑑於針對GBM及其他實體腫瘤之手術及當前藥物及療法的不足，迫切需要改良之組合物及治療有效方法來治療實體腫瘤癌症，來降低患有或曾經患有實體腫瘤癌症的患者之實體腫瘤癌症復發率或防止實體腫瘤癌症復發發生。本發明提供導向EphA3之CART細胞以用於靶向實體腫瘤(包括GBM、胰臟腫瘤、前列腺腫瘤、乳腫瘤、結腸腫瘤、黑色素瘤、骨髓瘤、肺腫瘤、膀胱腫瘤、腎腫瘤及肝腫瘤)中之腫瘤新生血管系統及腫瘤基質細胞。
在一個態樣中，本發明提供結合至人類Eph受體A3 (EphA3)之嵌合抗原受體(CAR)，該CAR包含包含抗人類EphA3單株抗體依法妥珠單抗(ifabotuzumab)之單鏈可變片段(scFv)之胞外抗人類EphA3結合域，其中該人類EphA3 scFv包含包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列之重鏈免疫球蛋白可變區(VH
)及包含SEQ ID NO: 2之胺基酸序列之輕鏈免疫球蛋白可變區(VL
)。
在另一個態樣中，本發明提供結合至人類EphA3之CAR構築體，其包含：(a)結合至人類EphA3之單株抗體依法妥珠單抗之單鏈可變片段(scFv)，該scFv包含包含SEQ ID NO: 1之胺基酸序列之重鏈免疫球蛋白可變區(VH
)及包含SEQ ID NO: 2之胺基酸序列之輕鏈免疫球蛋白可變區(VL
)；其中該VH
及VL
藉由包含SEQ ID NO:4之胺基酸序列之連接肽連接；(b)鉸鏈區，其包含包含SEQ ID NO: 5之胺基酸序列之CD8鉸鏈區或包含SEQ ID NO: 6之胺基酸序列之CD28鉸鏈區；(c)跨膜域，及(d)包含共刺激域及活化域之胞內信號域。
在一個態樣中，本發明提供一種用於產生人類EphA3靶向CAR T細胞之方法，該方法包括用本文所提供的EphA3 CAR表現盒轉導T細胞。
在另一個態樣中，本發明提供用於治療實體腫瘤癌症之方法，該等方法包含對有此需要的個體投與包含本文所提供的人類EphA3靶向CAR-T細胞之醫藥組合物。
在一個態樣中，本發明提供結合至人類EphA3且結合至人類突變體表皮生長因子受體變異體III (EGFRvIII)之雙重靶向CAR-T細胞，該CAR-T細胞包含：結合至人類Eph受體A3 (EphA3)之第一CAR構築體，該CAR包含包含抗EphA3單株抗體依法妥珠單抗之人類EphA3單鏈可變片段(scFv)之胞外抗人類EphA3結合域，其中該人類EphA3 scFv包含包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列之重鏈免疫球蛋白可變區(VH
)及包含SEQ ID NO: 2之胺基酸序列之輕鏈免疫球蛋白可變區(VL
)，其中結合至人類EphA3之單株抗體依法妥珠單抗之該scFv串聯融合至鉸鏈區、跨膜域；及包含共刺激域及活化域之胞內信號域；及包含人類化抗EGFRvIII結合域之結合至人類突變體表皮生長因子受體變異體III (EGFRvIII)之第二CAR構築體，其中該人類化抗EGFRvIII結合域包含：(a)重鏈免疫球蛋白可變區，其包含：(I)包含胺基酸序列DYYIH (SEQ ID NO: 31)之CDR1；(ii)包含胺基酸序列RIDPENDETKYGPIFQG (SEQ ID NO: 32)之CDR2；及(iii)包含胺基酸序列RGGVY (SEQ ID NO: 33)之CDR3；及(b)輕鏈免疫球蛋白可變區，其包含：(I)包含胺基酸序列KSSQSLLDSDGKTYLN (SEQ ID NO: 34)之CDR1；(ii)包含序列LVSKLDS (SEQ ID NO: 35)之CDR2；及(iii)包含胺基酸序列WQGTHFPGT (SEQ ID NO: 36)之CDR3。
在另一個態樣中，本發明提供一種用於產生結合至人類EphA3及人類EGFRvIII之雙重靶向CAR-T細胞，該方法包括：(a)用包含CAR之EphA3靶向CAR表現盒轉導T細胞以產生人類EphA3靶向CAR T細胞，該CAR結合至人類EphA3且藉由分離的SEQ ID NO:16、SEQ ID NO: 17、SEQ ID NO: 18或SEQ ID NO: 19之核酸序列編碼；及(b)用包含結合至人類EGFRvIII之人類EGFRvIII靶向CAR之表現盒轉導產生於步驟(a)中之人類EphA3靶向CAR T細胞且該人類EGFRvIII靶向CAR係藉由SEQ ID NO:42之核酸序列編碼：
以產生人類EphA3靶向及人類EGFRvIII靶向CAR T細胞，其中該人類EphA3靶向及人類EGFRvIII靶向CAR T細胞在其細胞表面上表現人類EphA3靶向CAR及人類EGFRvIII靶向CAR。
在另外態樣中，本發明提供包含本文所提供的結合至人類EphA3且結合至人類突變體EGFRvIII之雙重靶向CAR-T細胞及醫藥上可接受之載劑之醫藥組合物。
在另外態樣中，本發明提供包含結合至人類EphA3之CAR-T細胞之醫藥組合物及包含結合至人類突變體EGFRvIII之CAR-T細胞之醫藥組合物，其中各醫藥組合物係一起(同時)或依序投與給有此需要的個體。
在其他態樣中，本發明提供結合至人類Eph受體A3 (EphA3)之嵌合抗原受體(CAR)構築體，該CAR包含包含抗EphA3單株抗體之人類EphA3單鏈可變片段(scFv)之胞外抗人類EphA3結合域，其中該人類EphA3 scFv包含VH
區之包含GGYYEDFDS (SEQ ID NO: 44)之CDR3及VL
區之包含GQYANYPYT (SEQ ID NO: 45)之CDR3。
在另一個態樣中，本發明提供結合至人類Eph受體A3 (EphA3)之CAR構築體，該CAR構築體包含胞外抗人類EphA3結合域，該胞外抗人類EphA3結合域包含：VH
區，其包含胺基酸序列
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTGYWMNWVRQAPGQGLEWMGDIYPGSGNTNYDEKFQGRVTMTRDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYYCARGGYYEDFDSWGQGTTVTVSS (SEQ ID NO: 46)及
VL
區，其包含胺基酸序列
DIQMTQSPSFLSASVGDRVTITCRASQGIISYLAWYQQKPEKAPKRLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYCGQYANYPYTFGQGTKLEIK (SEQ ID NO: 47)。
在一個態樣中，本發明提供結合至人類Eph受體A3 (EphA3)之CAR構築體，其中該CAR構築體包含胞外抗人類EphA3結合域，該胞外抗人類EphA3結合域包含：具有序列SYWIN (SEQ ID NO: 48)之VH
區CDR1、具有序列DIYPGSGNTNYDEKFKR (SEQ ID NO: 49)之VH
區CDR2、具有序列SGYYEDFDS (SEQ ID NO: 50)之VH
區CDR3及具有序列RASQEISGYLG (SEQ ID NO: 51)之VL
區CDR1、具有序列AASTLDS (SEQ ID NO: 52)之VL
區CDR2及具有序列VQYANYPYT (SEQ ID NO: 53)之VL
區CDR3。
自以下詳細描述、實例及圖式當可明瞭本發明之其他特徵及優點。然而，應明瞭，由於熟習此項技術者自此詳細描述當可明瞭本發明之精神及範疇內之各種變化及修改，因此，在指示本發明之某些實施例時，詳細描述及特定實例僅以例示方式給出。
相關申請案之交叉參考
本申請案主張2019年11月8日申請之美國臨時申請案第62/933,354號之優先權，該案係以引用之方式併入本文中。
可藉由參考構成本發明之一部分之以下詳細描述更容易地明瞭本發明。應明瞭，本發明不限於本文描述及/或顯示之特定方法、產品、條件或參數，及本文所用的術語係出於僅舉例而言描述特定實施例之目的而不意欲限制所主張的本發明。
GBM為最具侵略性之成年腦癌。其特徵係高度浸潤性及異質性細胞。儘管手術移除GBM腫瘤，但大多數GBM患者仍在原始腫瘤部位附近或腦遠處位置發展出複發性腫瘤。
研究已暗指神經膠質母細胞瘤(GBM)中受體酪胺酸激酶Eph受體A3 (EphA3)之過度表現。亦已顯示EphA3在多種血液癌症及實體腫瘤中升高。據報導，EphA3在GBM中具有致癌功能。特定言之，已發現EphA3主要表現於膠質瘤幹細胞(GSC)上，同時其以低程度表現於正常腦組織中。
本發明係關於藉由投與結合至腫瘤新生血管系統及腫瘤基質細胞上之人類EphA3之嵌合抗原受體來治療過度表現EphA3之GBM及其他實體腫瘤。
除非本文另有定義，否則與本申請案搭配使用的科學術語及技術術語應具有一般技術者通常所理解的含義。此外，除非上下文另外要求，否則單數術語應包括複數及複數術語應包括單數。
如以上及本發明通篇所採用，除非另有指示，否則以下術語及縮寫應理解為具有以下含義。
在本發明中，單數形式「一」、「一個」及「該」包括複數個指示物，及除非上下文清楚地另作指示，否則提及特定數值時包括至少該特定值。因此，例如，提及「化合物」係提及熟習此項技術者已知的此類化合物及其等效物中之一者或多者，以此類推。如本文所用，術語「複數」係指超過一個。當表示值之範圍時，另一個實施例包括自一個特定值及/或至另一特定值。類似地，當藉由使用先行詞「約」來將值表示為近似值時，應瞭解，特定值形成另一實施例。所有範圍均係包含性且可組合。
如本文所用，術語「組分」、「組合物」、「化合物之組合物」、「化合物」、「藥物(drug)」、「藥理活性劑」、「活性劑」、「治療性」、「療法」、「治療」或「藥劑(medicament)」在本文中可互換使用以指一種或多種化合物或物質之組合物，其在投與給個體(人類或動物)時藉由局部及/或全身作用誘導所需的藥理學及/或生理作用。
如本文所用，術語「治療」或「療法」(以及其不同形式)包括預防性(preventative) (例如預防性(prophylactic))、治癒性或姑息性治療。如本文所用，術語「治療」包括減輕或減少病狀、疾病或病症之至少一種不良或負面作用或症狀。
術語「個體(subject)」、「個體(individual)」及「患者」在本文中可互換使用，且係指動物(例如人類)，向其提供利用根據本發明之醫藥組合物之治療(包括預防性治療)。如本文所用術語「個體」係指人類及非人類動物。術語「非人類動物」及「非人類哺乳動物」在本文中可互換使用且包括所有脊椎動物，例如哺乳動物，諸如非人類靈長類動物(尤其是高等靈長類動物)、綿羊、狗、囓齒動物(例如，小鼠或大鼠)、天竺鼠、山羊、豬、貓、兔、牛、馬及非哺乳動物(諸如爬行動物、兩棲動物、雞及火雞)。
在一個態樣中，本發明提供結合至人類Eph受體A3 (EphA3)之嵌合抗原受體(CAR)，該CAR包含包含抗人類EphA3單株抗體依法妥珠單抗之單鏈可變片段(scFv)之胞外抗人類EphA3結合域，其中該人類EphA3 scFv包含包含SEQ ID NO: 1之胺基酸序列之重鏈免疫球蛋白可變區(VH
)及包含SEQ ID NO: 2之胺基酸序列之輕鏈免疫球蛋白可變區(VL
)。在一個實施例中，VH
及VL
藉由連接肽連接。在另一個實施例中，連接肽包含SEQ ID NO: 4之胺基酸序列。在一個實施例中，胞外抗人類EphA3結合域藉由鉸鏈區連接至跨膜域。在一些實施例中，鉸鏈區包含CD8鉸鏈區或CD28鉸鏈區。在另一個實施例中，CD8鉸鏈區包含SEQ ID NO: 5之胺基酸序列。在一些實施例中，CD28鉸鏈區包含SEQ ID NO: 6之胺基酸序列。在一個實施例中，當鉸鏈區包含CD8鉸鏈區時，跨膜域包含CD8跨膜域。在另一個實施例中，當鉸鏈區包含CD28鉸鏈區時，跨膜域包含CD28跨膜域。在一個實施例中，CD8跨膜域包含SEQ ID NO: 7之胺基酸序列。在另一個實施例中，CD28跨膜域包含SEQ ID NO: 8之胺基酸序列。在本文提供的CAR之一個實施例中，CAR進一步包含前導序列。在一些實施例中，前導序列包含SEQ ID NO: 3之胺基酸序列。在一個實施例中，CAR進一步包含胞內信號域。在另一個實施例中，胞內信號域包含共刺激域及活化域。在所提供的CAR之一些實施例中，共刺激域包含4-1BB共刺激域或CD28共刺激域。在另一個實施例中，活化域為CD3 ζ (CD3z或CD3ζ)活化域。在一個實施例中，4-1BB共刺激域包含SEQ ID NO: 9之胺基酸序列。在一個特定實施例中，CD28共刺激域包含SEQ ID NO: 10之胺基酸序列。在另一個實施例中，CD3z活化域包含SEQ ID NO: 11之胺基酸序列。
在另一個態樣中，本發明提供結合至人類EphA3之CAR構築體，其包含：(a) 結合至人類EphA3之單株抗體依法妥珠單抗之單鏈可變片段(scFv)，該scFv包含包含SEQ ID NO: 1之胺基酸序列之重鏈免疫球蛋白可變區(VH
)及包含SEQ ID NO: 2之胺基酸序列之輕鏈免疫球蛋白可變區(VL
)；其中該VH
及VL
係藉由包含SEQ ID NO: 4之胺基酸序列之連接肽連接；(b) 鉸鏈區，其包含包含SEQ ID NO: 5之胺基酸序列之CD8鉸鏈區或包含SEQ ID NO: 6之胺基酸序列之CD28鉸鏈區；(c)跨膜域，及(d)包含共刺激域及活化域之胞內信號域。
在結合至人類EphA3之CAR構築體之一個實施例中，鉸鏈區包含CD8鉸鏈區，CD8鉸鏈區包含SEQ ID NO: 5之胺基酸序列。在另一個實施例中，其中當鉸鏈區包含CD28鉸鏈區時，CD28鉸鏈區包含SEQ ID NO: 6之胺基酸序列。在一些實施例中，CAR構築體進一步包含包含SEQ ID NO: 7之胺基酸序列之CD8跨膜域。在一個實施例中，CAR構築體進一步包含包含SEQ ID NO: 8之胺基酸序列之CD28跨膜域。在一個特定實施例中，共刺激域包含4-1BB共刺激域或CD28共刺激域。在另一個實施例中，活化域為CD3z活化域。在一些實施例中，4-1BB共刺激域包含SEQ ID NO: 9之胺基酸序列。在一個實施例中，CD28共刺激域包含SEQ ID NO: 10之胺基酸序列。在一些實施例中，CD3z活化域包含SEQ ID NO: 11之胺基酸序列。在一個特定實施例中，結合至人類EphA3之單株抗體依法妥珠單抗之scFv、鉸鏈區、跨膜域及胞內信號域串聯融合。
在一個實施例中，如本文所述，在啟動子之控制下將包含第二代CAR之人類EphA3靶向CAR表現盒選殖於慢病毒主鏈中。在如技術方案32之人類EphA3靶向CAR表現盒之另一個實施例中，啟動子為人類延伸因子-1α (EF-1α)。在一個實施例中，EF1α啟動子具有(SEQ ID NO:54)之核酸：
在人類EphA3靶向CAR表現盒之一些實施例中，慢病毒主鏈為第三代慢病毒主鏈。在一個實施例中，人類EphA3靶向CAR T細胞包含本文所提供的EphA3靶向CAR表現盒，其中該CAR-T細胞在其細胞表面上表現CAR，如本文所述。在另一個實施例中，EphA3靶向CAR T細胞為自體EphA3靶向CAR T細胞。
在一個實施例中，本文提供包含如本文所述的人類EphA3靶向CAR-T細胞及醫藥上可接受之載劑之醫藥組合物。在醫藥組合物之一些實施例中，人類EphA3靶向CAR-T細胞係自體。
在一個實施例中，本文提供一種用於產生人類EphA3靶向CAR T細胞之方法，該方法包括用如本文所述的EphA3 CAR表現盒轉導T細胞。
在另一個實施例中，本文提供一種用於治療實體腫瘤癌症之方法，該方法包括對有此需要的個體投與本文所述的醫藥組合物。在一個特定實施例中，實體腫瘤癌症為腦癌。在一個特定實施例中，腦癌為多形性神經膠質母細胞瘤(GBM)。在一個實施例中，實體腫瘤癌症為結腸癌、腎癌、膀胱癌、乳癌、肝癌、胰臟癌、前列腺腫瘤、黑色素瘤、骨髓瘤或肺癌(例如小細胞肺癌(SCLC)或非小細胞肺癌(NSCLC))。在另一個實施例中，實體腫瘤癌症在腫瘤細胞、腫瘤相關血管系統及/或腫瘤基質之表面上表現EphA3。在一個實施例中，腫瘤基質細胞包含骨髓衍生之抑制細胞。在一個實施例中，腫瘤細胞包含腫瘤幹細胞。在特定實施例中，腫瘤相關血管系統包含新生血管系統。
在一個實施例中，該方法進一步包含投與人類GM-CSF (hGM-CSF)拮抗劑，該拮抗劑選自由抗人類GM-CSF抗體、抗hGM-CSF抗體片段、可溶性hGM-CSF受體α、抗hGM-CSF受體(GM-CSFr)抗體及抗hGM-CSFr抗體片段組成之群。在一個特定實施例中，抗人類GM-CSF抗體為hGM-CSF中和抗體朗齊魯單抗(lenzilumab)。在一個特定實施例中，抗人類GM-CSF抗體為奈米路單抗(Namilumab)、奧替利單抗(Otilimab)、吉斯魯單抗(Gimsilumab)及TJM2 (TJ003234)。在另一個實施例中，GM-CSF拮抗劑為抗GM-CSF受體抗體嗎里木單抗(Mavrilimumab)。
根據本發明投與的抗人類GM-CSF抗體可包含如美國專利第8,168,183號及第9,017,674號之圖1中所顯示的VH
區VH#1、VH#2、VH#3、VH#4或VH#5中之任一者，該等專利各者之全文係以引用之方式併入本文中。在一個特定實施例中，抗人類GM-CSF抗體包含如美國專利第8,168,183號及第9,017,674號之圖1中所顯示的VH#5及VLK#2，該等專利各者之全文係以引用之方式併入本文中。
在一些實施例中，本發明之抗人類GM-CSF抗體可包含如圖1中所顯示的VL
區VK#1、VK#2、VK#3或VK#4中之任一者。在一些實施例中，抗人類GM-CSF抗體具有如美國專利第8,168,183號及第9,017,674號之圖1中所顯示的VH
區VH#1、VH#2、VH#3、VH#4或VH#5，該等專利各者之全文係以引用之方式併入本文中；及如圖1中所顯示，如於例如美國專利第8,168,183號及第9,017,674號中所描述之VL
區VK#1、VK#2、VK#3或VK#4，該等專利各者之全文係以引用之方式併入本文中。
在一個實施例中，投與朗齊魯單抗會降低實體腫瘤復發率或防止實體腫瘤復發發生。在另一個實施例中，投與朗齊魯單抗會預防或降低個體中之免疫療法相關毒性之發生率。在一些實施例中，免疫療法相關毒性為EphA3靶向CAR-T細胞相關毒性。在一個實施例中，EphA3靶向CAR-T細胞相關毒性為細胞介素釋放症候群、神經毒性及/或神經發炎。在另一個實施例中，該方法進一步包含投與GM-CSF沉默EphA3靶向CAR-T細胞或基因敲除(GM-CSFk/o
) EphA3靶向CAR-T細胞，其中投與GM-CSF沉默EphA3靶向CAR-T細胞或GM-CSFk/o
EphA3靶向CAR-T細胞會預防或降低個體中免疫療法相關毒性之發生率。在一個實施例中，投與GM-CSF沉默EphA3靶向CAR-T細胞或GM-CSFk/o
EphA3靶向CAR-T細胞會降低實體腫瘤復發率或防止實體腫瘤復發發生。在另一個實施例中，該方法進一步包含投與至少一種免疫檢查點抑制劑，該免疫檢查點抑制劑選自由抗程式化細胞死亡-1 (PD-1)抗體、抗程式化死亡配位體1 (PD-L1)抗體及抗細胞毒性T淋巴細胞相關蛋白4 (CTLA-4)抗體組成之群。在一個實施例中，該方法進一步包含投與至少一種免疫檢查點抑制劑，該免疫檢查點抑制劑選自由抗程式化細胞死亡-1 (PD-1)抗體、抗程式化死亡配位體1 (PD-L1)抗體及抗細胞毒性T淋巴細胞相關蛋白4 (CTLA-4)抗體組成之群。
在一個特定實施例中，抗程式化細胞死亡1抗體為派立珠單抗(Pembrolizumab)。在另一個實施例中，抗程式化死亡配位體抗體為阿維單抗(avelumab)。在另一個實施例中，抗細胞毒性T淋巴細胞相關蛋白4 (CTLA-4)抗體為易普利單抗(Ipilimumab)。
在另一個實施例中，本發明提供一種用於降低有此需要的個體中之實體腫瘤癌症復發率或防止實體腫瘤復發發生之方法，該方法包括對個體投與如本文所述的醫藥組合物。在一個實施例中，實體腫瘤癌症為腦癌。在另一個實施例中，腦癌為多形性神經膠質母細胞瘤(GBM)。在一個實施例中，實體腫瘤癌症為結腸癌、腎癌、膀胱癌、乳癌、肝癌、胰臟癌、前列腺癌、黑色素瘤、骨髓瘤、肺癌(包括非小細胞肺癌(NSCLC)或小細胞肺癌(SCLC))。在另一個實施例中，實體腫瘤癌症在腫瘤細胞、腫瘤相關血管系統及/或腫瘤基質之表面上表現EphA3。在一個實施例中，腫瘤基質細胞包含骨髓衍生之抑制細胞。在一個實施例中，腫瘤細胞包含腫瘤幹細胞。在另一個實施例中，腫瘤相關血管系統包含新生血管系統。在又另一個實施例中，該方法進一步包含投與人類GM-CSF (hGM-CSF)拮抗劑，該拮抗劑選自由抗人類GM-CSF抗體、抗hGM-CSF抗體片段、可溶性hGM-CSF受體α、抗hGM-CSF受體(GM-CSFr)抗體及抗hGM-CSFr抗體片段組成之群。在一個實施例中，抗人類GM-CSF抗體為hGM-CSF中和抗體朗齊魯單抗。在一個特定實施例中，抗人類GM-CSF抗體為奈米路單抗、奧替利單抗、吉斯魯單抗及TJM2 (TJ003234)。在另一個實施例中，GM-CSF拮抗劑為抗GM-CSF受體抗體嗎里木單抗。在另一個實施例中，投與朗齊魯單抗會降低實體腫瘤復發率或防止實體腫瘤復發發生。在一些實施例中，投與朗齊魯單抗會預防或降低個體中免疫療法相關毒性之發生率。在一個實施例中，免疫療法相關毒性為EphA3靶向CAR-T細胞相關毒性。在另一個實施例中，EphA3靶向CAR-T細胞相關毒性為細胞介素釋放症候群、神經毒性及/或神經發炎。在一個實施例中，該方法進一步包含投與GM-CSF沉默EphA3靶向CAR-T細胞或基因敲除(GM-CSFk/o
) EphA3靶向CAR-T細胞，其中投與GM-CSF沉默EphA3靶向CAR-T細胞或GM-CSFk/o
EphA3靶向CAR-T細胞會預防或降低個體中免疫療法相關毒性之發生率。在一個實施例中，該方法進一步包含投與至少一種免疫檢查點抑制劑，該免疫檢查點抑制劑選自由抗程式化細胞死亡-1 (PD-1)抗體、抗程式化死亡配位體1 (PD-L1)抗體及抗細胞毒性T淋巴細胞相關蛋白4 (CTLA-4)抗體組成之群。在一個特定實施例中，抗程式化細胞死亡1抗體為派立珠單抗。在另一個實施例中，抗程式化死亡配位體抗體為阿維單抗。在另一個實施例中，抗細胞毒性T淋巴細胞相關蛋白4 (CTLA-4)抗體為易普利單抗。
在一個態樣中，本發明提供結合至人類EphA3且結合至人類突變體表皮生長因子受體變異體III (EGFRvIII)之雙重靶向CAR-T細胞，該CAR-T細胞包含：
結合至人類Eph受體A3 (EphA3)之第一CAR構築體，該CAR包含包含抗EphA3單株抗體依法妥珠單抗之人類EphA3單鏈可變片段(scFv)之胞外抗人類EphA3結合域，其中該人類EphA3 scFv包含包含SEQ ID NO: 1之胺基酸序列之重鏈免疫球蛋白可變區(VH
)及包含SEQ ID NO: 2之胺基酸序列之輕鏈免疫球蛋白可變區(VL
)，
其中結合至人類EphA3之單株抗體依法妥珠單抗之該scFv串聯融合至鉸鏈區、跨膜域；包含共刺激域及活化域之胞內信號域；
及
包含人類化抗EGFRvIII結合域之結合至人類突變體表皮生長因子受體變異體III (EGFRvIII)之第二CAR構築體，其中該人類化抗EGFRvIII結合域包含：
(a)重鏈免疫球蛋白可變區，其包含：
(i)包含胺基酸序列DYYIH (SEQ ID NO: 31)之CDR1；
(ii)包含胺基酸序列RIDPENDETKYGPIFQG (SEQ ID NO: 32)之CDR2；及
(iii)包含胺基酸序列RGGVY (SEQ ID NO: 33)之CDR3；及
(b)輕鏈免疫球蛋白可變區，其包含：
(i)包含胺基酸序列KSSQSLLDSDGKTYLN (SEQ ID NO: 34)之CDR1；
(ii)包含序列LVSKLDS (SEQ ID NO: 35)之CDR2；及
(iii)包含胺基酸序列WQGTHFPGT (SEQ ID NO: 36)之CDR3。
在雙重靶向CAR-T細胞之一個實施例中，人類化抗EGFRvIII結合域為單株抗體純系3C10之人類化單鏈可變片段(scFv)，該人類化scFV具有胺基酸序列：
。
在另一個實施例中，第二CAR進一步包含：
(c) 跨膜域，其包含胺基酸序列IYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYC (SEQ ID NO: 38)；
(d) 鉸鏈區，其包含胺基酸序列TTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACD (SEQ ID NO: 39)；
(e) 包含共刺激域及初級信號域之胞內信號域，其中該共刺激域包含包含SEQ ID NO: 9之胺基酸序列之4-1BB共刺激域。
在雙重靶向CAR-T細胞之另一個實施例中，初級信號域包含具有以下胺基酸序列之CD3 ζ域：
RVKFSRSADAPAYKQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQE (SEQ ID NO: 40)。
在另一個實施例中，初級信號域包含胺基酸序列NCBI參考序列NM_000734.3：
RVKFSRSADAPAYKQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQELYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR (SEQ ID NO: 41)。
在另一個實施例中，醫藥組合物包含本文所提供的結合至人類EphA3且結合至人類突變體EGFRvIII之雙重靶向CAR-T細胞及醫藥上可接受之載劑。
在另一個態樣中，本發明提供一種用於產生結合至人類EphA3及人類EGFRvIII之雙重靶向CAR-T細胞之方法，該方法包括：(a) 用包含CAR之EphA3靶向CAR表現盒轉導T細胞以產生人類EphA3靶向CAR T細胞，該CAR結合至人類EphA3且藉由分離的SEQ ID NO: 16、SEQ ID NO: 17、SEQ ID NO: 18或SEQ ID NO: 19之核酸序列編碼；及(b)用包含結合至人類EGFRvIII之人類EGFRvIII靶向CAR之表現盒轉導產生於步驟(a)中之人類EphA3靶向CAR T細胞且該人類EGFRvIII靶向CAR係藉由SEQ ID NO: 42之胺基酸序列編碼：
以產生人類EphA3靶向且人類EGFRvIII靶向CAR T細胞，其中該人類EphA3靶向且人類EGFRvIII靶向CAR T細胞在其細胞表面上表現人類EphA3靶向CAR及人類EGFRvIII靶向CAR。
在該方法之一個實施例中，經編碼之人類EGFRvIII靶向CAR包含SEQ ID NO: 43之胺基酸序列：
在另一個實施例中，提供一種用於治療實體腫瘤癌症之方法，該方法包括對有此需要的個體投與如本文所述的醫藥組合物。
在一個特定實施例中，實體腫瘤癌症為腦癌。在一個特定實施例中，腦癌為多形性神經膠質母細胞瘤(GBM)。在一個實施例中，實體腫瘤癌症為結腸癌、腎癌、膀胱癌、乳癌、肝癌、胰臟癌、前列腺腫瘤、黑色素瘤、骨髓瘤或肺癌(例如非小細胞肺癌(NSCLC)或小細胞肺癌(SCLC))。在另一個實施例中，實體腫瘤癌症在腫瘤細胞、腫瘤相關血管系統及/或腫瘤基質之表面上表現EphA3。在一個實施例中，腫瘤基質細胞包含骨髓衍生之抑制細胞。在一個實施例中，腫瘤細胞包含腫瘤幹細胞。在特定實施例中，腫瘤相關血管系統包含新生血管系統。
在一個實施例中，該方法進一步包含投與人類GM-CSF (hGM-CSF)拮抗劑，該拮抗劑選自由抗人類GM-CSF抗體、抗hGM-CSF抗體片段、可溶性hGM-CSF受體α、抗hGM-CSF受體(GM-CSFr)抗體及抗hGM-CSFr抗體片段組成之群。在一個特定實施例中，抗人類GM-CSF抗體為hGM-CSF中和抗體朗齊魯單抗。在一個特定實施例中，抗人類GM-CSF抗體為奈米路單抗、奧替利單抗、吉斯魯單抗及TJM2 (TJ003234)。在另一個實施例中，GM-CSF拮抗劑為抗GM-CSF受體抗體嗎里木單抗。在一個實施例中，投與朗齊魯單抗會降低實體腫瘤復發率或防止實體腫瘤復發發生。在另一個實施例中，投與朗齊魯單抗會預防或降低個體中免疫療法相關毒性之發生率。在一些實施例中，免疫療法相關毒性為EphA3靶向CAR-T細胞相關毒性。在一個實施例中，EphA3靶向CAR-T細胞相關毒性為細胞介素釋放症候群、神經毒性及/或神經發炎。在另一個實施例中，該方法進一步包含投與GM-CSF沉默EphA3靶向CAR-T細胞或基因敲除(GM-CSFk/o
) EphA3靶向CAR-T細胞，其中投與GM-CSF沉默EphA3靶向CAR-T細胞或GM-CSFk/o
EphA3靶向CAR-T細胞會預防或降低個體中免疫療法相關毒性之發生率。在一個實施例中，投與GM-CSF沉默EphA3靶向CAR-T細胞或GM-CSFk/o
EphA3靶向CAR-T細胞會降低實體腫瘤復發率或防止實體腫瘤復發發生。在另一個實施例中，該方法進一步包含投與至少一種免疫檢查點抑制劑，該免疫檢查點抑制劑選自由抗程式化細胞死亡-1 (PD-1)抗體、抗程式化死亡配位體1 (PD-L1)抗體及抗細胞毒性T淋巴細胞相關蛋白4 (CTLA-4)抗體組成之群。在一個實施例中，該方法進一步包含投與至少一種免疫檢查點抑制劑，該免疫檢查點抑制劑選自由抗程式化細胞死亡-1 (PD-1)抗體、抗程式化死亡配位體1 (PD-L1)抗體及抗細胞毒性T淋巴細胞相關蛋白4 (CTLA-4)抗體組成之群。在一個特定實施例中，抗程式化細胞死亡-1抗體為派立珠單抗。在另一個實施例中，抗程式化死亡配位體抗體為阿維單抗。在另一個實施例中，抗細胞毒性T淋巴細胞相關蛋白4 (CTLA-4)抗體為易普利單抗。
在另一個實施例中，免疫療法相關毒性為EphA3靶向CAR-T細胞相關毒性及/或人類EGFRvIII靶向CAR-T細胞相關毒性。在一個實施例中，EphA3靶向CAR-T細胞相關毒性及/或人類EGFRvIII靶向CAR-T細胞相關毒性為細胞介素釋放症候群、神經毒性及/或神經發炎。
在一個實施例中，結合至人類Eph受體A3 (EphA3)之CAR包含胺基酸序列：
在另一個實施例中，結合至人類Eph受體A3 (EphA3)之CAR包含胺基酸序列：
在一個實施例中，結合至人類Eph受體A3 (EphA3)之CAR包含胺基酸序列：
在一個實施例中，結合至人類Eph受體A3 (EphA3)之CAR包含胺基酸序列：
在另一個態樣中，本發明提供結合至人類Eph受體A3 (EphA3)之嵌合抗原受體(CAR)構築體，該CAR包含包含抗EphA3單株抗體之人類EphA3單鏈可變片段(scFv)之胞外抗人類EphA3結合域，其中該人類EphA3 scFv包含VH
區之包含GGYYEDFDS (SEQ ID NO: 44)之CDR3及VL
區之包含GQYANYPYT (SEQ ID NO: 45)之CDR3。
在一個態樣中，本發明提供結合至人類Eph受體A3 (EphA3)之嵌合抗原受體(CAR)構築體，該CAR構築體包含胞外抗人類EphA3結合域，其包含：
VH
區，其包含胺基酸序列
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTGYWMNWVRQAPGQGLEWMGDIYPGSGNTNYDEKFQGRVTMTRDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYYCARGG YYEDFDSWGQGTTVTVSS (SEQ ID NO: 46)及
VL
區，其包含胺基酸序列
DIQMTQSPSFLSASVGDRVTITCRASQGIISYLAWYQQKPEKAPKRLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYCGQYANYPYTFGQGTKLEIK (SEQ ID NO: 47)。
在另一個態樣中，本發明提供結合至人類Eph受體A3 (EphA3)之嵌合抗原受體(CAR)構築體，該CAR構築體包含胞外抗人類EphA3結合域，其包含：
具有序列SYWIN (SEQ ID NO: 48)之VH
區CDR1、具有序列DIYPGSGNTNYDEKFKR (SEQ ID NO: 49)之VH
區CDR2、具有序列SGYYEDFDS (SEQ ID NO: 50)之VH
區CDR3及
具有序列RASQEISGYLG (SEQ ID NO: 51)之VL
區CDR1、具有序列AASTLDS (SEQ ID NO: 52)之VL
區CDR2及具有序列VQYANYPYT (SEQ ID NO: 53)之VL
區CDR3。
在本文所提供的包含以上所述的EphA3靶向CAR構築體之人類EphA3靶向CAR T細胞之一個實施例中，CAR-T細胞在其細胞表面上表現CAR。在人類EphA3靶向CAR T細胞之另一個實施例中，人類EphA3靶向CAR T細胞為自體EphA3靶向CAR T細胞。在另一個實施例中，醫藥組合物包含本文所提供的人類EphA3靶向CAR-T細胞及醫藥上可接受之載劑。
在一個實施例中，本文提供一種用於治療實體腫瘤癌症之方法，該方法包括對有此需要的個體投與本文所述的醫藥組合物中任一者。醫藥組合物
本文描述包含本發明之化合物或治療劑及一或多種醫藥上可接受之載劑之醫藥組合物及其投與方法。「醫藥上可接受之載劑」包括在所採用的劑量及濃度下對暴露於其之細胞或哺乳動物無毒之任何賦形劑。該醫藥組合物可包括一或多種治療劑。在一個實施例中，醫藥組合物包含治療劑，其為本文描述於實例1、2A、2B及3至5中之包含EphA-3 CART構築體之EphA3 CART細胞。在特定實施例中，治療劑包含EphA3 CART細胞，該EphA3 CART細胞包含EphA-3 CART構築體EphA3 CAR K082 (H2L-BBz)、EphA3 CAR K083 (H2L-28z)、EphA3 CAR K084 (L2H-28z)或EphA3 CAR K085 (L2H BBz)及其組合中之任一者。在一個實施例中，EphA3 CART細胞包含EphA-3 CART構築體，該EphA-3 CART構築體包含EphA3 scFv重鏈，該EphA3 scFv重鏈包含SEQ ID NO: 21之核酸序列及SEQ ID NO: 23之核酸序列。
在一個特定實施例中，醫藥組合物包含治療劑，其中該治療劑包含EphA3 CART細胞，該EphA3 CART細胞包含EphA-3 CART構築體，該EphA-3 CART構築體包含EphA3 scFv重鏈胺基酸序列
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTGYWMNWVRQAPGQGLEWMGDIYPGSGNTNYDEKFQGRVTMTRDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYYCARGGYYEDFDSWGQGTTVTVSS (SEQ ID NO: 1)及EphA3 scFv輕鏈胺基酸序列
DIQMTQSPSFLSASVGDRVTITCRASQGIISYLAWYQQKPEK
APKRLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATY
YCGQYANYPYTFGQGTKLEIK (SEQ ID NO: 2)。
在一個特定實施例中，醫藥組合物包含治療劑，其為包含SEQ ID NO: 55之核酸序列之EphA-3 CART構築體，其中該核酸序列包含CD8前導、抗人類EphA3單株抗體依法妥珠單抗之單鏈可變片段(scFv) (Ifab scFv)及CD8鉸鏈。
在一些實施例中，醫藥組合物包含作為治療劑的EphA3 CART細胞，該EphA3 CART細胞包含使用抗EphA3單株抗體之人類EphA3單鏈可變片段(scFv)結合至人類Eph受體A3 (EphA3)之嵌合抗原受體(CAR)構築體，其中該人類EphA3 scFv包含VH
區之包含GGYYEDFDS (SEQ ID NO: 44)之CDR3及VL
區之包含GQYANYPYT (SEQ ID NO: 45)之CDR3。
在某些實施例中，醫藥組合物包含作為治療劑的EphA3 CART細胞，該EphA3 CART細胞包含結合至人類Eph受體A3 (EphA3)之嵌合抗原受體(CAR)構築體，其中該CAR構築體包含胞外抗人類EphA3結合域，該胞外抗人類EphA3結合域包含：
VH
區，其包含胺基酸序列：
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTGYWMNWVRQAPGQGLEWMGDIYPGSGNTNYDEKFQGRVTMTRDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYYCARGGYYEDFDSWGQGTTVTVSS (SEQ ID NO: 46)及
VL
區，其包含胺基酸序列：
DIQMTQSPSFLSASVGDRVTITCRASQGIISYLAWYQQKPEKAPKRLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYCGQYANYPYTFGQGTKLEIK (SEQ ID NO: 47)。
在一個實施例中，醫藥組合物包含作為治療劑的EphA3 CART細胞，該EphA3 CART細胞包含結合至人類Eph受體A3 (EphA3)之嵌合抗原受體(CAR)構築體，胞外抗人類EphA3結合域包含具有序列SYWIN (SEQ ID NO: 48)之VH
區CDR1、具有序列DIYPGSGNTNYDEKFKR (SEQ ID NO: 49)之VH
區CDR2、具有序列SGYYEDFDS (SEQ ID NO: 50)之VH
區CDR3及具有序列RASQEISGYLG (SEQ ID NO: 51)之VL
區CDR1、具有序列AASTLDS (SEQ ID NO: 52)之VL
區CDR2及具有序列VQYANYPYT (SEQ ID NO: 53)之VL
區CDR3。
在一個實施例中，治療劑包含EGFRViii CART (3C10-41BBz)，該EGFRViii CART包含SEQ ID NO: 42之核酸序列。
因此，如本文所用，「醫藥上可接受之載劑」意在包括與醫藥投與相容之任何及所有溶劑、分散介質、塗料、抗細菌劑及抗真菌劑、等滲劑及吸收延緩劑及類似物。適宜載劑描述於最新版Remington's Pharmaceutical Sciences (此領域中之標準參考文本)中，該案係以引用之方式併入本文中。此類載劑或稀釋劑之實例包括(但不限於)水、鹽水、指溶液(finger's solutions)、右旋糖溶液及5%人類血清白蛋白。亦可使用脂質體及非水性媒劑，諸如不揮發性油。此類介質及試劑用於醫藥活性物質之用途係此項技術中熟知的。除非任何習知介質或試劑與活性化合物不相容，否則考慮將其用於組合物中。亦可將補充活性化合物併入組合物中。
在一個實施例中，含有本文所述的一種或多種治療劑之醫藥組合物在一個實施例中可藉由熟習此項技術者已知的任何方法(諸如(但不限於)經口、非經腸、經鼻、經黏膜、皮下、經皮、肌肉內、靜脈內、動脈內、真皮內、腹膜內、心室內、顱內或陰道內)投與給個體。
載劑可為如以上所述的彼等習知使用者中之任一者，且僅受化學物理考量(諸如溶解性及缺乏與本發明之化合物之反應性)及投與途徑限制。載劑之選擇將藉由用於投與醫藥組合物之特定方法來確定。適宜載劑之一些實例包括乳糖、葡萄糖、右旋糖、蔗糖、山梨糖醇、甘露醇、澱粉、阿拉伯膠(gum acacia)、磷酸鈣、藻酸鹽、黃蓍膠、明膠、矽酸鈣、微晶纖維素、聚乙烯吡咯啶酮、纖維素、水及甲基纖維素。該等調配物可另外包括潤滑劑，諸如滑石、硬脂酸鎂及礦物油；潤濕劑、表面活性劑、乳化劑及懸浮劑；防腐劑，諸如羥基苯甲酸甲酯及羥基苯甲酸丙酯；甜味劑；矯味劑、著色劑、緩衝劑(例如乙酸鹽、檸檬酸鹽或磷酸鹽)、崩解劑、潤濕劑、抗細菌劑、抗氧化劑(例如抗壞血酸或亞硫酸氫鈉)、螯合劑(例如乙二胺四乙酸)及用於調整張力之試劑(諸如氯化鈉)。其他醫藥載劑可為無菌液體，諸如水及油，包括石油、動物、植物或合成來源之其等油，諸如花生油、大豆油、礦物油、芝麻油及類似物、聚乙二醇、甘油、丙二醇或其他合成溶劑。在一個實施例中，當醫藥組合物經靜脈內或瘤內投與時，水(較佳係抑菌水)為載劑。鹽水溶液及右旋糖水溶液及甘油溶液亦可用作液體載劑，特別是用於可注射溶液。
適於注射使用之醫藥組合物可包括無菌水溶液(水溶性時)或分散液及用於即時製備無菌注射溶液或分散液之無菌粉末。對於靜脈內投與，適宜載劑包括(但不限於)生理鹽水、抑菌水、Cremophor EL.TM. (BASF，Parsippany, N.J.)或磷酸鹽緩衝鹽水(PBS)。該組合物應為無菌且應為流體，程度為容易可注射性存在。其在製造及儲存條件下應係穩定且應加以保藏以防微生物(諸如細菌及真菌)之污染作用。載劑可為溶劑或分散介質，其含有例如水、乙醇、多元醇(例如甘油、丙二醇及液體聚乙二醇及類似物)及其適宜混合物。可例如藉由使用塗料(諸如卵磷脂)，就分散液而言藉由維持所需粒度及藉由使用表面活性劑來維持適當流動性。可藉由各種抗細菌劑及抗真菌劑，例如對羥基苯甲酸酯、氯丁醇、苯酚、抗壞血酸、硫柳汞(thimerosal)及類似物來防止微生物之作用。在許多情況下，較佳在組合物中包括等滲劑，例如糖、多元醇(諸如甘露醇、山梨糖醇)或氯化鈉。藉由在組合物中包括延遲吸收之試劑，例如單硬脂酸鋁及明膠，可達成可注射組合物之延長吸收。
無菌注射溶液可藉由將所需量的活性化合物視需要與以上所列舉的成分中之一者或組合併入適宜溶劑中，接著過濾滅菌來製備。一般而言，藉由將活性化合物併入無菌載劑中來製備分散液，該無菌載劑含有基礎分散液介質及所需的選自彼等以上所列舉者之其他成分。就用於製備無菌注射溶液之無菌粉末而言，製備方法為自其先前的無菌過濾溶液產生活性成分加上任何另外所需成分之粉末之真空乾燥及冷凍乾燥。
如本文所述的組合物及調配物可單獨投與或與其他生物活性劑一起投與。投與可係全身或局部，例如透過門靜脈遞送至肝臟。此外，可宜藉由任何適宜途徑(包括腦室內及鞘內注射)將組合物投與至中樞神經系統中。可藉由連接至儲槽(例如Ommaya儲槽)之腦室內導管來促進腦室內注射。肺部投與亦可藉由使用吸入器或噴霧器，且利用霧化劑之調配物進行使用。亦可理想地局部投與治療劑至需要治療的區域；此可藉由例如(但非限制性地)手術期間局部輸注，局部施覆，藉由注射，藉助導管，藉助栓劑，或藉助植入物來達成。
此外，「醫藥上可接受」係指在合理醫學判斷範圍內適於與人類及動物之組織接觸而無過度毒性、刺激性、過敏反應或其他問題併發症符合合理效益/風險比之其等化合物、材料、組合物及/或劑型。術語「醫藥上可接受」亦包括由聯邦或州政府監管機構批准或列於美國藥典或用於動物，且更特別是人類之其他公認藥典中之其等載劑。有效劑量
用於治療病狀或疾病之本發明醫藥組合物之有效劑量取決於許多不同因素(包括投與方式，靶部位，患者之生理狀態，患者是人類還是動物，所投與的其他藥物，及治療是預防性還是治療性)而變化。通常，患者為人類，但亦可治療非人類哺乳動物，包括轉殖基因哺乳動物。可使用熟習此項技術者已知的慣常方法來滴定治療劑量以最佳化安全性及功效。因此，本發明之醫藥組合物可包括「治療有效量」。「治療有效量」係指在必需的劑量及時間段下可有效達成所需治療結果之量。分子或治療劑之治療有效量可根據因素(諸如個體之疾病狀態、年齡、性別及體重、及分子引起個體所需反應之能力)而變化。治療有效量亦為其中該分子之任何毒性或有害作用勝過治療有益作用之量。
此外，熟練技術者將明瞭，術語「治療有效量」可包涵足以顯示有意義的患者益處，亦即治療、治癒、預防或改善相關醫學病狀，或提高此類病狀之治療率、治癒率、預防率或改善率之醫藥組合物或方法之各活性組分之總量。當應用於單獨投與的個別活性成分時，該術語係指單獨的成分。當應用於組合時，該術語係指導致治療作用之活性成分之組合量，無論是以組合、連續或同時投與。
將可有效治療特定病症或病狀(包括繼發於眼高壓之視網膜發炎及神經元死亡)之本發明化合物之量亦將取決於病症或病狀之性質，且可藉由標準臨床技術來確定。另外，可視需要採用活體外分析以幫助鑑定最佳劑量範圍。意欲用於調配物中之精確劑量亦將取決於投與途徑，及疾病或病症之嚴重性，且應根據從業者判斷及各患者情況來決定。在一個實施例中，包含如本文所述的EphA-3 CART構築體或其組合之EphA3 CART細胞之劑量將在約0.01至約1000 mg/kg體重之範圍內。在另一個實施例中，劑量將在約0.1 mg/kg至約100 mg/kg之範圍內。在另一個實施例中，劑量將在約1 mg/kg至約10 mg/kg之範圍內。在一個實施例中，劑量為約10 mg/kg。在另一個實施例中，劑量為10 mg/kg。
本發明之化合物或組合物或治療劑，包括包含如本文所述的EphA-3 CART構築體或其組合之EphA3 CART細胞，可僅投與一次，或其可投與多次。對於多次劑量，該組合物可例如每天三次、每天兩次、每天一次、每兩天一次、每週兩次、每週一次、每兩週一次或每月一次投與。
在一個實施例中，劑量係投與一次。在一個實施例中，根據本發明之CAR-T細胞係在用環磷醯胺(CY)及氟達拉濱(Fludarabine) (FLU)之淋巴細胞耗盡化學療法後投與一次。在一個實施例中，劑量在1 x 104
個細胞/kg至2 x 106
個細胞/kg之間且為一次。此外，有效劑量可自活體外或動物模型測試生物分析或系統得出的劑量反應曲線推斷出。
在一個實施例中，包含人類EphA3靶向CAR-T細胞之醫藥組合物係與兩種或更多種醫藥組合物組合投與，其中各醫藥組合物包含抗原靶向CAR T細胞，該抗原靶向CAR T細胞包含抗原靶向CAR，其中藉由CAR所靶向之該抗原係選自由CAIX、CD133、CEA、c-MET、EGFR、EGFRvIII、EpCam、EphA2、ErB2/Her2、FAP、葉酸受體α (FR-a)、GD2、GPC3、IL-13Ra2、L1-CAM、間皮素、MUC1、PD-L1、PSCA、PSMA、ROR1、VEGFR-2及HER2組成之群，或其中各醫藥組合物包含選自由CART19、CART22、CART123、CART33、CART-CLL1、CART BCMA、CART38、CART138及CS1-CART組成之群之液體癌症CART。
在一個實施例中，包含人類EphA3靶向CAR-T細胞之醫藥組合物係與兩種或更多種醫藥組合物組合投與，其中各醫藥組合物包含抗原靶向CAR T細胞，該抗原靶向CAR T細胞包含抗原靶向CAR，其中所靶向的抗原係選自由CAIX、CD133、CEA、c-MET、EGFR、EGFRvIII、EpCam、EphA2、ErB2/Her2、FAP、葉酸受體α (FR-a)、GD2、GPC3、IL-13Ra2、L1-CAM、間皮素、MUC1、PD-L1、PSCA、PSMA、ROR1、VEGFR-2及HER2組成之群，或其中各醫藥組合物包含選自由CART19、CART22、CART123、CART33、CART-CLL1、CART BCMA、CART38、CART138及CS1-CART組成之群之液體癌症CART。
在又另一個實施例中，包含人類EphA3靶向CAR-T細胞之醫藥組合物係與兩種或更多種醫藥組合物組合投與，其中各醫藥組合物包含抗原靶向CAR T細胞，該抗原靶向CAR T細胞包含抗原靶向CAR，其中所靶向的抗原係選自由CAIX、CD133、CEA、c-MET、EGFR、EGFRvIII、EpCam、EphA2、ErB2/Her2、FAP、葉酸受體α (FR-a)、GD2、GPC3、IL-13Ra2、L1-CAM、間皮素、MUC1、PD-L1、PSCA、PSMA、ROR1、VEGFR-2及HER2組成之群，或其中各醫藥組合物包含選自由CART19、CART22、CART123、CART33、CART-CLL1、CART BCMA、CART38、CART138及CS1-CART組成之群之液體癌症CART。在本文所提供的方法之各種實施例中，將包含人類EphA3靶向CAR-T細胞之醫藥組合物與兩種或更多種醫藥組合物一起或依序投與。在一個實施例中，投與包含人類EphA3靶向CAR-T細胞之醫藥組合物及兩種或更多種醫藥組合物改善該個體之客觀反應率。在另一個實施例中，投與包含人類EphA3靶向CAR-T細胞之醫藥組合物及兩種或更多種醫藥組合物改善個體之無疾病進展存活期。在又另一個實施例中，投與包含人類EphA3靶向CAR-T細胞之醫藥組合物及兩種或更多種醫藥組合物改善個體之總存活期。在如本文所述的結合至人類EphA3且結合至人類突變體EGFRvIII之雙重靶向CAR-T細胞之一個實施例中，雙重靶向CAR-T細胞為自體EphA3靶向CAR T細胞。在一個實施例中，本文所提供的醫藥組合物包含如本文提供及描述的結合至人類EphA3且結合至人類突變體EGFRvIII之雙重靶向CAR-T細胞及醫藥上可接受之載劑。在本文所提供及描述的用於治療實體腫瘤癌症之方法之另一個實施例中，該方法包括對有此需要的個體投與本文所提供的醫藥組合物中之任一者。
引述於本說明書中之所有專利及參考文獻之全文均以引用之方式併入本文中。
呈現以下實例以便更充分地說明本發明之某些實施例。然而，該等實例決不應解釋為限制本發明之寬廣範疇。實例 實例 1 建構結合至 EphA3 且結合至 EGFRViii 之 CAR
吾人使用前導序列、EphA3 scFv重鏈、連接子序列、EphA3 scFv輕鏈、鉸鏈區、跨膜(TM)域、包含4-1BB共刺激域或CD28共刺激域及CD3 ζ活化域之胞內信號域之以下核酸序列，建構靶向EphA3之四個嵌合抗原受體(CAR)。如美國專利9,394,368中所述，吾人建構靶向EGFRViii之CAR，該專利之全文係以引用之方式併入本文中。使用以下核酸序列(SEQ ID NO:42)，其編碼SEQ ID NO: 43之EGFRViii。
CD8 前導：
ATGGCCTTACCAGTGACCGCCTTGCTCCTGCCGCTGGCCTTGCTGCTCCACGCCGCCAGGCCG (SEQ ID NO: 20)
EphA3 scFv 重鏈：
CAGGTGCAGCTGGTGCAGTCTGGGGCTGAGGTGAAGAAGCCTGGGGCCTCAGTGAAGGTTTCCTGCAAGGCTTCTGGATACACCTTCACAGGCTACTGGATGAATTGGGTGCGCCAGGCCCCCGGGCAAGGCCTGGAGTGGATGGGGGACATCTACCCGGGCAGTGGTAACACAAACTACGATGAGAAGTTCCAGGGTAGAGTCACGATGACCAGGGACACGTCCATCAGCACAGCCTACATGGAGCTGAGCAGGCTGAGATCTGACGACACAGCCGTGTACTACTGCGCAAGAGGTGGATATTATGAAGATTTTGATAGCTGGGGCCAAGGTACCACTGTGACCGTGAGCTCC (SEQ ID NO: 21)
連接子
GGTGGAGGTGGTTCGGGAGGTGGAGGTAGCGGAGGTGGTGGATCT (SEQ ID NO: 22)
EphA3 scFv 輕鏈
GACATCCAGATGACCCAGTCTCCATCCTTCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCCGGGCCAGTCAGGGCATTATCAGTTATTTAGCCTGGTATCAGCAAAAACCAGAGAAAGCCCCTAAGCGCCTGATCTATGCTGCATCCAGTTTGCAAAGTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGCGGCAGTGGATCTGGGACAGAATTCACTCTCACAATCAGCAGCCTGCAGCCTGAAGATTTTGCAACTTACTACTGCGGGCAGTATGCCAATTATCCGTACACCTTTGGCCAAGGTACGAAACTGGAAATTAAA (SEQ ID NO: 23)
CD8 鉸鏈
ACCACTACCCCTGCACCGCGACCACCAACACCGGCGCCCACCATTGCGTCGCAGCCTCTGTCCCTGCGCCCAGAAGCATGCCGTCCAGCAGCAGGTGGTGCAGTTCATACTCGTGGTCTGGATTTCGCCTGTGAT (SEQ ID NO: 24)
CD8 TM
ATCTACATCTGGGCGCCCTTGGCCGGGACTTGTGGGGTCCTTCTCCTGTCACTGGTTATCACCCTTTACTGC (SEQ ID NO: 25)
41BB
AAACGGGGCAGAAAGAAACTCCTGTATATATTCAAACAACCATTTATGAGACCAGTACAAACTACTCAAGAGGAAGATGGCTGTAGCTGCCGATTTCCAGAAGAAGAAGAAGGAGGATGTGAACTG (SEQ ID NO: 26)
CD28 鉸鏈
CTCGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCGGATCCCAAA (SEQ ID NO: 27)
CD28 TM
TTTTGGGTGCTGGTGGTGGTTGGTGGAGTCCTGGCTTGCTATAGCTTGCTAGTAACAGTGGCCTTTATTATTTTCTGGGTG (SEQ ID NO: 28)
CD28
AGGAGTAAGAGGAGCAGGCTCCTGCACAGTGACTACATGAACATGACTCCCCGCCGCCCCGGGCCCACCCGCAAGCATTACCAGCCCTATGCCCCACCACGCGACTTCGCAGCCTATCGCTCC (SEQ ID NO: 29)
CD3z
AGAGTGAAGTTCAGCAGGAGCGCAGACGCCCCCGCGTACAAGCAGGGCCAGAACCAGCTCTATAACGAGCTCAATCTAGGACGAAGAGAGGAGTACGATGTTTTGGACAAGAGACGTGGCCGGGACCCTGAGATGGGGGGAAAGCCGAGAAGGAAGAACCCTCAGGAAGGCCTGTACAATGAACTGCAGAAAGATAAGATGGCGGAGGCCTACAGTGAGATTGGGATGAAAGGCGAGCGCCGGAGGGGCAAGGGGCACGATGGCCTTTACCAGGGTCTCAGTACAGCCACCAAGGACACCTACGACGCCCTTCACATGCAGGCCCTGCCCCCTCGC (SEQ ID NO: 30)
以上所提供的分離的核酸序列編碼本文所述的CAR之以下胺基酸序列：
CD8 前導胺基酸序列
MALPVTALLLPLALLLHAARP (SEQ ID NO: 3)
EphA3 scFv 重鏈胺基酸序列
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTGYWMNWVRQAPGQGLEWMGDIYPGSGNTNYDEKFQGRVTMTRDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYYCARGGYYEDFDSWGQGTTVTVSS (SEQ ID NO: 1)
連接子胺基酸序列
GGGGSGGGGSGGGGS (SEQ ID NO: 4)
EphA3 scFv 輕鏈胺基酸序列
DIQMTQSPSFLSASVGDRVTITCRASQGIISYLAWYQQKPEKAPKRLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYCGQYANYPYTFGQGTKLEIK (SEQ ID NO: 2)
CD8 鉸鏈胺基酸序列
TTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACD (SEQ ID NO: 5)
CD8 TM 胺基酸序列
IYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYC (SEQ ID NO: 7)
41BB 胺基酸序列
KRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCEL (SEQ ID NO: 9)
CD28 鉸鏈胺基酸序列
LEPKSCDKTHTCPPCPDPK (SEQ ID NO: 6)
CD28 TM 胺基酸序列
FWVLVVVGGVLACYSLLVTVAFIIFWV (SEQ ID NO: 8)
CD28 胺基酸序列
RSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRS (SEQ ID NO: 10)
CD3z 胺基酸序列
RVKFSRSADAPAYKQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR (SEQ ID NO: 11)
以下分離的核酸序列編碼本文所述的EphA3靶向CAR：
EphA3 CAR K082 (H2L-BBz)
EphA3 CAR K083 (H2L-28z)
EphA3 CAR K084 (L2H-28z)
EphA3 CAR K085 (L2H BBz)
以上所述的核酸序列編碼包含以下胺基酸序列之嵌合CAR：
EphA3 CAR K082 (H2L-BBz)
胺基酸序列
EphA3 CAR K083 (H2L-28z)
胺基酸序列
EphA3 CAR K084 (L2H-28z)
胺基酸序列
EphA3 CAR K085 (L2H BBz)
胺基酸序列
建構結合至人類EphA3且結合至人類突變體表皮生長因子受體變異體III (EGFRvIII)之CAR。
吾人使用以下核酸序列建構結合至人類突變體表皮生長因子受體變異體III (EGFRvIII)之嵌合抗原受體，其中該胞內信號域包含4-1BB共刺激域：
EGFRViii CART (3C10-41BBz)
結合至人類突變體表皮生長因子受體變異體III (EGFRvIII)之經編碼之嵌合抗原受體(CAR)包含以下胺基酸序列：
EGFRViii CART (3C10-41BBz)
胺基酸序列
實例
實例
2A
方法
吾人在第三代慢病毒主鏈中開發第二代CD28共刺激CAR構築體，以使用依法妥珠單抗(導向EphA3之單株抗體)之單鏈可變片段生成EphA3 CART細胞。在此等實驗中使用患者衍生之GBM異種移植細胞株。EphA3 CART構築體經設計且然後使用以下DNA序列，使用市售蛋白質合成供應商從頭合成，正分別如三個另外EphA-3 CART構築體：
EphA3 CAR K082 (H2L-BBz)
EPHA3 CAR K083 (H2L-28z)
EPHA3 CAR K084 (L2H-28z)
EPHA3 CAR K085 (L2H BBz)
於隨後在EF-1α啟動子控制下將EphA3 CAR構築體選殖於第三代慢病毒中。單鏈可變區片段為由Humanigen生產的專有序列。EphA3構築體具有第二代CD28共刺激域及CD3ζ刺激。
吾人使用293T細胞以70至90%匯合度進行慢病毒產生，在允許在室溫下培養轉染試劑(包括15 µg EphaA3慢病毒質體、18 µg gag/pol/tat/rev包裝載體、7 µg VSV-G包膜載體、111 µL預複合試劑、129 µL轉染試劑及9.0 mL轉染培養基)30分鐘後，然後加入293T細胞。然後在37℃，5% CO2
下培養經轉染之細胞。然後，吾人收穫細胞培養基上清液且藉由超離心以112,700 xg
濃縮2小時。
經由陰性選擇磁珠套組自來自血球分離術期間收集的去識別化正常供體血錐之周邊血液單核細胞(PBMC)分離人類T細胞。然後用CD3/CD28磁珠以3:1磁珠:T細胞比刺激經分離的T細胞且培養24小時。
吾人以3.0之感染倍率(MOI)用收穫的病毒轉導經刺激之T細胞。然後藉由在37℃，5% CO2
下培養來擴增CAR-T細胞，在慢病毒轉導後的第3天及第5天時計數並餵養且保持在1 x 106
/mL之CAR-T細胞濃度。轉導後六天，藉由流動式細胞測量術評估CAR之細胞表面表現。用利用杜貝卡氏磷酸鹽緩衝鹽水(Dulbecco's phosphate-buffered saline)、2%胎牛血清及1%疊氮化鈉製備的流動緩衝液洗滌來自培養物之100,000個T細胞且於隨後用抗CAR抗體(使用山羊抗小鼠)染色並洗滌兩次。細胞用活/死染色劑及CD3單株抗體染色。洗滌細胞且再懸浮於流動緩衝液中及於隨後藉由流動式細胞測量術分析以確定轉導效率。針對殺死分析，將具有變化之靶抗原表現(藉由RNA-seq分析)的患者衍生之GBM異種移植細胞株(來自Jann Sarkaria之實驗室之贈物)與效應T細胞以指定比培養24小時。藉由在Xenogen IVIS-200 Spectrum相機上進行生物發光成像來計算殺死率，作為殘留活細胞之量度。在成像之前，每100 μl樣品體積用1 μl D-螢光素(30 μg/mL)處理樣品10分鐘。
結果：
吾人藉由流動式細胞測量術證實供體T細胞之表面上之EphA3靶向CAR (稱為CAR K084 (或「K84」) (L2H-28z) (SEQ ID NO: 18))之CAR-T細胞產生(圖 1A 至 1B
)。顯示CAR構築體之圖譜(圖 1C
)。EphA3導向CART細胞展現針對具有可變轉錄組EphA3表現之EphA3+ GBM細胞株之特異性且強效之抗腫瘤活性，這指示其在患有GBM之患者中之較寬廣適用性(圖 2B 、 3A
)。在24小時培養期內之殺死在低效應子:標靶比下顯著：針對具有25.05% EphA3表現之細胞株，在1.25:1下，52.5%殺死，及針對具有19.28%表現之細胞株，在1.25:1下，37.1%殺死，及在5:1比下，90%殺死。相反地，當與UTD對照共同培養時，存在顯著降低的腫瘤細胞之殺死，或生長。當暴露於較高比率之效應子(CAR-T細胞)與標靶(腫瘤細胞)比時，藉由當與來自相同供體血球分離術錐之未轉導(UTD)相比時減少之生物發光——表現螢光素酶之活腫瘤細胞之代用品，來證實細胞殺死。當與具有6.95% EphA3表現之細胞株共同培養時，不存在殺死之顯著差異(圖 4A
)。實例 2B
方法：
吾人在第三代慢病毒主鏈中開發第二代CD28共刺激CAR構築體，以使用依法妥珠單抗(導向EphA3之單株抗體)之單鏈可變片段生成EphA3 CART細胞。在此等實驗中使用患者衍生之GBM異種移植細胞株。EphA-3 CART構築體經設計且然後使用以下包含CD8前導、抗人類EphA3單株抗體依法妥珠單抗之單鏈可變片段(scFv) (Ifab scFv)及CD8鉸鏈之DNA序列，使用市售蛋白質合成供應商從頭合成：
於隨後在EF-1α啟動子控制下將EphA-3 CAR構築體選殖於第三代慢病毒中。單鏈可變區片段為由Humanigen生產的專有序列。EphA-3構築體具有第二代CD28共刺激域及CD3ζ刺激。
吾人使用293T細胞以70至90%匯合度進行慢病毒產生，在允許在室溫下培養轉染試劑(包括15 µg Epha-3慢病毒質體、18 µg gag/pol/tat/rev包裝載體、7 µg VSV-G包膜載體、111 µL預複合試劑、129 µL轉染試劑及9.0 mL轉染培養基) 30分鐘後，然後加入293T細胞。然後在37℃，5% CO2
下培養經轉染之細胞。然後，吾人收穫細胞培養基上清液且藉由超離心以112,700 xg
濃縮2小時。
經由陰性選擇磁珠套組自來自血球分離術期間收集的去識別化正常供體血錐之周邊血液單核細胞(PBMC)分離人類T細胞。然後用CD3/CD28磁珠以3:1磁珠:T細胞比刺激經分離的T細胞且培養24小時。
吾人以3.0之感染倍率(MOI)用收穫的病毒轉導經刺激之T細胞。然後藉由在37℃，5% CO2
下培養來擴增CAR-T細胞，在慢病毒轉導後的第3天及第5天時計數並餵養且保持在1 x 106
/mL之CAR-T細胞濃度。轉導後六天，藉由流動式細胞測量術評估CAR之細胞表面表現。用利用杜貝卡氏磷酸鹽緩衝鹽水、2%胎牛血清及1%疊氮化鈉製備的流動緩衝液洗滌來自培養物之100,000個T細胞且於隨後用抗CAR抗體(使用山羊抗小鼠)染色並洗滌兩次。細胞用活/死染色劑及CD3單株抗體染色。洗滌細胞且再懸浮於流動緩衝液中及於隨後藉由流動式細胞測量術分析以確定轉導效率。針對殺死分析，將具有變化之靶抗原表現(藉由RNA-seq分析)的患者衍生之GBM異種移植細胞株(來自Jann Sarkaria之實驗室之贈物)與效應T細胞以指定比培養24小時。藉由在Xenogen IVIS-200 Spectrum相機上進行生物發光成像來計算殺死率，作為殘留活細胞之量度。在成像之前，每100 μl樣品體積用1 μl D-螢光素(30 μg/mL)處理樣品10分鐘。
結果：
吾人藉由流動式細胞測量術證實供體T細胞之表面上之Epha-3靶向CAR (稱為K84)之CAR-T細胞產生(圖1)。顯示CAR構築體之圖譜(圖1)。EphA3導向CART細胞展現針對具有可變轉錄組EphA3表現之EphA3+ GBM細胞株之特異性且強效之抗腫瘤活性，這指示其在患有GBM之患者中之較寬廣適用性(圖2)。在24小時培養期內之殺死在低效應子:標靶比下顯著：針對具有25.05% EphA3表現之細胞株，在1.25:1下，52.5%殺死，及針對具有19.28%表現之細胞株，在1.25:1下，37.1%殺死，及在5:1比下，90%殺死。相反地，當與UTD對照共同培養時，存在顯著降低之腫瘤細胞之殺死，或生長。當暴露於較高比率之效應子(CAR-T細胞)與標靶(腫瘤細胞)比時，藉由當與來自相同供體血球分離術錐之未轉導(UTD)相比時減少之生物發光——表現螢光素酶之活腫瘤細胞之代用品，來證實細胞殺死。當與細胞株共同培養時，不存在殺死之顯著差異。圖25顯示與未轉導之T細胞(左側)相比，在經轉導之T細胞上之EphA3 CAR表現(右側)；構築體圖譜顯示在底部。圖26A至26C顯示24小時培養時相對於GBM 76、GBM 6及GBM 39之EphA3 CAR生物發光殺死分析。圖27A至27B顯示，雙重EPHA3/EGFRvIII靶向CART細胞展現針對患者衍生之GBM之強效抗腫瘤殺死。在圖28中，組合之EGFRvIII及EphA3 CAR證實在暴露於靶抗原時增加之增殖。
結論：吾人首次證實，利用CART細胞靶向EphA3係可行，特異性，且有效的，並且代表靶向GBM之新穎治療策略。實例 3 生成 結合至人類 EphA3 之 CAR 及包含 該 CAR 之 CART 細胞
慢病毒主鏈中之CAR構築體如實例 1
中所述經設計且合成，以使用抗EphA3單株抗體之人類EphA3單鏈可變片段(scFv)，來生成包含結合至人類Eph受體A3 (EphA3)之嵌合抗原受體(CAR)構築體之EphA3 CART細胞，其中該人類EphA3 scFv包含包含GGYYEDFDS (SEQ ID NO:44)之VH
區之CDR3及包含GQYANYPYT (SEQ ID NO:45)之VL
區之CDR3。實例 4 生成 結合至人類 EphA3 之 CAR 及包含 該 CAR 之 CART 細胞
慢病毒主鏈中之CAR構築體如實例 1
中所述經設計且合成，以使用胞外抗人類EphA3結合域，生成包含結合至人類Eph受體A3 (EphA3)之嵌合抗原受體(CAR)構築體之EphA3 CART細胞，該胞外抗人類EphA3結合域包含以下：
VH
區，其包含胺基酸序列：
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTGYWMNWVRQAPGQGLEWMGDIYPGSGNTNYDEKFQGRVTMTRDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYYCARGGYYEDFDSWGQGTTVTVSS (SEQ ID NO: 46)及
VL
區，其包含胺基酸序列：
DIQMTQSPSFLSASVGDRVTITCRASQGIISYLAWYQQKPEKAPKRLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYCGQYANYPYTFGQGTKLEIK (SEQ ID NO: 47)。實例 5 生成 結合至人類 EphA3 之 CAR 及包含 該 CAR 之 CART 細胞
慢病毒主鏈中之CAR構築體如實例 1
中所述經設計且合成，以使用胞外抗人類EphA3結合域，生成包含結合至人類Eph受體A3 (EphA3)之嵌合抗原受體(CAR)構築體之EphA3 CART細胞，該胞外抗人類EphA3結合域包含以下：
具有序列SYWIN (SEQ ID NO: 48)之VH
區CDR1、具有序列DIYPGSGNTNYDEKFKR (SEQ ID NO: 49)之VH
區CDR2、具有序列SGYYEDFDS (SEQ ID NO: 50)之VH
區CDR3及
具有序列RASQEISGYLG (SEQ ID NO: 51)之VL
區CDR1、具有序列AASTLDS (SEQ ID NO: 52)之VL
區CDR2及具有序列VQYANYPYT (SEQ ID NO: 53)之VL
區CDR3。實例 6 組合療法
用如本文所述的人類EphA3靶向CAR T細胞及至少一種免疫檢查點抑制劑(諸如抗CTLA-4抗體及/或抗PD-1抗體)治療患有在腫瘤細胞表面上或在腫瘤相關細胞之表面上表現EphA3之腫瘤之個體以增強人類EphA3靶向CAR T細胞之抗腫瘤活性。人類EphA3靶向CAR T細胞及抗CTLA-4抗體及/或抗PD-1抗體以任何順序依序投與。CART細胞(108
至109
) 每2至3天給藥一次持續16至20天。抗CTLA-4抗體及/或抗PD-1抗體每月給藥一次。
在腫瘤細胞表面或腫瘤相關細胞之表面上表現EphA3之腫瘤可在3個月內尺寸減小＞50%。投與此組合療法12個月(4個週期)後，可能無法藉由成像技術(諸如放射圖、CT掃描、MRI、PET掃描及/或超音波)檢測到該個體之腫瘤。實例 7 組合療法
用如本文所述的人類EphA3靶向CAR T細胞及至少一種免疫檢查點抑制劑(諸如抗CTLA-4抗體及/或抗PD-1抗體)治療患有在腫瘤細胞表面上或在腫瘤相關細胞之表面上表現EphA3之腫瘤之個體以增強人類EphA3靶向CAR T細胞之抗腫瘤活性。人類EphA3靶向CAR T細胞及抗CTLA-4抗體及/或抗PD-1抗體以任何順序依序投與。若由於毒性問題需要分次給藥，則將CART細胞之劑量分為在第0天與第5天或第7天之間的兩個單獨劑量。抗CTLA-4抗體及/或抗PD-1抗體係Q3週給藥。實例 8 EphA3 靶向 CAR T 細胞及免疫檢查點抑制劑組合療法
在接受CAR-T療法之實體腫瘤患者中，在CAR-T細胞在血液中持續存在超過6週之其等患者中，已觀測到更佳臨床結果。此表明，CAR-T細胞之臨床功效取決於其持久性。CAR-T細胞之抑制或耗盡可導致減低之擴增及持久性且因此降低效應。此可由PD-1/PD-L1信號傳導引起，該信號傳導減弱抗原結合後的T細胞活性。PD-1可在活體內CART細胞上上調，從而導致功效損失。其他人已證實，可藉由CTLA-4及PD-1二者共同抑制信號之上調來抑制腫瘤浸潤T細胞之活性。由抗體阻斷CTLA-4及/或PD-1可增強抗腫瘤活性。
依法妥珠單抗為結合至人類及小鼠EphA3受體之人類工程改造(humaneered)單株抗體。使用依法妥珠單抗之單鏈可變區片段，在第三代慢病毒載體主鏈中建構第二代CD28共刺激且CD3ζ刺激之抗EphA3 CAR-T構築體(如本申請案中所述)。
人類小細胞肺癌細胞株NCI-H446在其細胞表面上表現EphA3，如藉由流動式細胞測量術研究使用結合至Alexa Fluor 647染料之小鼠抗EphA3抗體IIIA4所證實(圖 23A 至 23C
)。
將NCI-H446細胞於燒瓶內的完全DMEM培養基中培養直至其覆蓋底部的70%。然後用0.25%胰蛋白酶消化細胞且傳代擴增。最後，收穫癌細胞，且然後將1 x 106
個細胞皮下注射於免疫缺陷型NSG小鼠之左前背中。監測小鼠且評定皮下(sc)腫瘤生長。當測定腫瘤為約100 mm2
時，開始給藥。小鼠靜脈內接受1至1.5 x 106
個CART細胞(經轉導且表現抗EphA3 TCR或未轉導)。一組小鼠在第0天且然後每三天亦接受抗PD1單株抗體(10 mg/kg) IP。另一組接受每三天給藥之抗CTLA4抗體(10 mg/kg)。給藥持續25天或直至小鼠由於腫瘤達到1500 mm2
而終止。藉由測量腫瘤大小及總存活期來評定EphA3-CART單獨及與抗PD1及/或抗CTLA4之組合之抗腫瘤效應。
熟習此項技術者應明瞭，可在不脫離本發明之寬廣發明概念下對上述實施例作出改變。因此，應明瞭，本發明不限於所揭示的特定實施例，而是意欲涵蓋如藉由隨附申請專利範圍所定義的本發明之精神及範疇內之修改。
以下附圖構成本說明書之一部分且經包括在內以進一步證實本發明之某些態樣，本發明之發明可藉由參考此等附圖中之一者或多者以及本文呈現的特定實施例之詳細描述更好地明瞭。專利或申請文檔含有至少一個彩色附圖。將由專利局(Office)在請求及支付必要費用後提供該專利或專利申請公開案之具有彩色附圖之複本。
圖 1A 至 1C
顯示藉由流動式細胞測量術之供體T細胞之表面上Epha-3靶向CAR (稱為K84)之CAR-T細胞產生(圖 1A 至 1B
)及EphA-3靶向CAR構築體(稱為K84)之圖譜 (圖 1C) 。
圖 2A 至 2B
顯示與來自相同供體血球分離術錐之未轉導(UTD)細胞相比，在24小時TdT殺死分析中EphA-3靶向CAR (稱為K84)之GBM6殺死。GBM6 EphA-3表現為19.28%。與UTD相比，CAR 84證實在24小時內顯著殺死GBM6。
圖 3A 至 3B
顯示在24小時殺死分析中，EphA-3靶向CAR (稱為K84)對GBM PDX細胞株76 (「GBM 76」)之殺死。GBM 76 Epha-3表現為25.05% RNA表現。與UTD相比，CAR 84證實在24小時內顯著殺死GBM 76。
圖 4A 至 4B
顯示在24小時殺死分析中，EphA-3靶向CAR (稱為K84)對GBM PDX細胞株39 (「GBM 39」)之殺死。當與具有6.95% EphA3表現之細胞株共同培養時，在殺死上沒有顯著差異(圖 4A
)。
圖 5A 至 5D
顯示藉由流動式細胞測量術之供體T細胞之表面上EGFRviii靶向CAR (稱為K96或K096)之CAR-T細胞產生(圖 5A 至 5C
)及EGFRviii靶向CAR構築體(稱為K96)之圖譜(圖 5D)
。
圖 6A 至 6B
顯示在24小時TdT殺死分析中，EGFRviii靶向CAR (稱為K96)對GBM PDX細胞株39 (「GBM 39」)之殺死。與UTD相比，CAR K96證實在24小時內顯著殺死GBM 39 (來自低效應子:標靶比1.25:1)。
圖 7A 至 7B
顯示在48小時TdT殺死分析中，EGFRviii靶向CAR (稱為K96)對GBM PDX細胞株39 (「GBM 39」)之殺死。與UTD相比，CAR K96證實在48小時內顯著殺死GBM 39(來自低效應子:標靶比0.625:1)。
圖 8A 至 8C
顯示針對GBM 39 (圖 8A
)、GBM 76 (圖 8B
)及GBM 22 (圖 8C
)，與UTD相比，在5天培養中K96 EGFRviii靶向CAR-T細胞(EGFRviii CART)相對於經放射細胞株之增殖分析。
圖 9A 至 9B
顯示在48小時TdT殺死分析中，Epha-3靶向CAR (稱為K84)對GBM PDX細胞株39 (「GBM 39」)之殺死。GBM 39 EphA-3表現為6.95% RNA表現。
圖 10A 至 10B
顯示在48小時TdT殺死分析中，EGFRviii靶向CAR (稱為K96)對GBM PDX細胞株39 (「GBM 39」)之殺死。與UTD相比，CAR K96證實在48小時內顯著殺死GBM 39 (來自低效應子:標靶比0.625:1)。
圖 11
顯示與UTD相比，K84 (包含經選殖於慢病毒中之EphA3靶向CAR)、K96 (包含經選殖於慢病毒中之EGFRviii靶向CAR)、「二者」 = 「K84 + K96」 (亦即，將CAR T細胞暴露於一種慢病毒且與其一起培養(例如K84)，且然後與暴露於其他慢病毒且與其一起培養之CAR T細胞(例如K96)混合)及「組合型CAR T細胞」(其暴露於兩種慢病毒且與其一起培養，K84及K96)在24小時內對GBM 76之殺死。在該GBM細胞株中存在EGFRviii表現且Epha-3 RNA表現為25.05%。術語「二者」=「K84 + K96」及「組合型CAR T細胞」(亦稱為「combi」)在本文中通篇使用，如針對圖 11
所述。
圖 12
顯示與UTD相比，K84、K96、「K84 + K96二者」及「組合型CAR T細胞」在72小時內對GBM 76之殺死(在TdT分析中)。GBM 76 EphA3表現為25.02%。
圖 13
顯示與UTD相比，K84、K96、「K84 + K96二者」及「組合型CAR T細胞」在72小時內對GBM 76之殺死 (在TdT分析中)。GBM 76 EphA3表現為25.02%。
圖 14
顯示與UTD相比，K84、K96、「K84 + K96二者」及「組合型CAR T細胞」在72小時內對GBM 108之殺死。與UTD相比，GBM 76 EphA3表現為25.02%。在該GBM細胞株中存在EGFRviii表現。
圖 15A 至 15B
顯示與UTD相比，K84、K96、「K84 + K96二者」及「組合型CAR T細胞」在7天培養期內對GBM 76之殺死。GBM 76 EphA3表現為25.02% RNA表現。
圖 16A 至 16B
顯示與UTD相比，K84、K96、「K84 + K96二者」及「組合型CAR T細胞」在7天培養期內對GBM 108之殺死。該GBM細胞株顯示EphA3表現為1.52% RNA表現且存在EGFRviii表現。
圖 17
顯示與UTD相比，CAR T細胞：K84、K96、「K84 + K96二者」及「組合型CAR T細胞」在5天培養期內之GBM 6殺死分析。GBM 6 EphA3顯示按RNA序列19.28%表現；該GBM確實具有(表現) EGFR及EGFRviii。
圖 18
顯示與UTD相比，CAR T細胞：K96及「組合型CAR T細胞」在5天培養期內對GBM 6之重複殺死分析。沒有用K84或K84 + K96二者進行殺死分析。
圖 19
顯示與UTD相比，K96 (EGFRviii靶向CAR-T細胞)及「組合型CAR T細胞」針對GBM 6細胞株之增殖分析。
圖 20
顯示與UTD相比，K96 (EGFRviii靶向CAR-T細胞)及「組合型CAR T細胞」針對GBM 150細胞株之增殖分析。GBM 150不應具有任何EGFRviii表現，但其確實具有三個EGFR複本(染色體7)。GBM 150具有按RNA序列96.33% EphA3表現。
圖 21
顯示與UTD相比，K84、K96、「K84 + K96二者」及「組合型CAR T細胞」在20天培養期內對GBM 6之殺死分析。
圖 22
顯示與UTD相比，K96及「組合型CAR T細胞」在20天培養期內對GBM 6之殺死分析。進行單向ANOVA，比較UTD與K96及UTD與組合(p值係針對於兩個測試)。
圖 23A 至 23C
顯示IIIA4抗體對NCI-H446細胞株(人類SCLC)之結合。
圖 24
顯示根據Hartman等人，EMBO Mol Med. 2017年9月；9(9):1183-1197改編的正在進行的試驗或非活性試驗中之針對實體腫瘤之CAR-T細胞。
將本文所述的人類EphA3靶向CAR-T細胞作為佐劑或與圖24中針對實體腫瘤之包含CAR-T細胞之兩種或更多種醫藥組合物組合投與(經由包含人類EphA3靶向CAR-T細胞之醫藥組合物)。
圖 25
顯示與未轉導T細胞(左側)相比，經轉導之T細胞(右側)上之EphA3 CAR表現。構築體圖譜(底部)。
圖 26A 至 26C
顯示在24小時培養期時相對於GBM 76、GBM 6及GBM 39之EphA3 CAR生物發光殺死分析。
圖 27A 至 27B
顯示雙重EphA3/EGFRvIII靶向CART細胞展現針對於患者衍生之GBM之強效抗腫瘤殺死。
圖 28
顯示組合型EGFRvIII及EphA3 CAR證實當暴露於靶抗原時增加之增殖。
Claims (132)
- 一種結合至人類Eph受體A3 (EphA3)之嵌合抗原受體(chimeric antigen receptor；CAR)，該CAR包含包含抗人類EphA3單株抗體之單鏈可變片段(single chain variable fragment；scFv)之胞外抗人類EphA3結合域，其中該人類EphA3 scFv包含包含SEQ ID NO: 1之胺基酸序列之重鏈免疫球蛋白可變區(VH )及包含SEQ ID NO: 2之胺基酸序列之輕鏈免疫球蛋白可變區(VL )。
- 如請求項1之CAR，其中該VH 及VL 係藉由連接肽連接。
- 如請求項2之CAR，其中該連接肽包含SEQ ID NO:4之胺基酸序列。
- 如請求項1之CAR，其中該胞外抗人類EphA3結合域係藉由鉸鏈區連接至跨膜域。
- 如請求項4之CAR，其中該鉸鏈區包含CD8鉸鏈區或CD28鉸鏈區。
- 如請求項5之CAR，其中該CD8鉸鏈區包含SEQ ID NO: 5之胺基酸序列。
- 如請求項5之CAR，其中該CD28鉸鏈區包含SEQ ID NO: 6之胺基酸序列。
- 如請求項5之CAR，其中當該鉸鏈區包含CD8鉸鏈區時，該跨膜域包含CD8跨膜域。
- 如請求項5之CAR，其中當該鉸鏈區包含CD28鉸鏈區時，該跨膜域包含CD28跨膜域。
- 如請求項8之CAR，其中該CD8跨膜域包含SEQ ID NO: 7之胺基酸序列。
- 如請求項9之CAR，其中該CD28跨膜域包含SEQ ID NO: 8之胺基酸序列。
- 如請求項1之CAR，其進一步包含前導序列。
- 如請求項12之CAR，其中該前導序列包含SEQ ID NO: 3之胺基酸序列。
- 如請求項1之CAR，其進一步包含胞內信號域。
- 如請求項14之CAR，其中該胞內信號域包含共刺激域及活化域。
- 如請求項15之CAR，其中該共刺激域包含4-1BB共刺激域或CD28共刺激域。
- 如請求項15之CAR，其中該活化域為CD3 ζ (CD3z或CD3ζ)活化域。
- 如請求項16之CAR，其中該4-1BB共刺激域包含SEQ ID NO: 9之胺基酸序列。
- 如請求項16之CAR，其中該CD28共刺激域包含SEQ ID NO: 10之胺基酸序列。
- 如請求項17之CAR，其中該CD3z活化域包含SEQ ID NO: 11之胺基酸序列。
- 一種結合至人類EphA3之CAR構築體，其包含： (a) 結合至人類EphA3之單株抗體之單鏈可變片段(scFv)，該scFv包含包含SEQ ID NO: 1之胺基酸序列之重鏈免疫球蛋白可變區(VH )及包含SEQ ID NO: 2之胺基酸序列之輕鏈免疫球蛋白可變區(VL )；其中該VH 及VL 係藉由包含SEQ ID NO: 4之胺基酸序列之連接肽連接； (b) 鉸鏈區，其包含包含SEQ ID NO: 5之胺基酸序列之CD8鉸鏈區或包含SEQ ID NO: 6之胺基酸序列之CD28鉸鏈區。 (c) 跨膜域，及 (d) 包含共刺激域及活化域之胞內信號域。
- 如請求項21之CAR構築體，其中該鉸鏈區包含CD8鉸鏈區，該CD8鉸鏈區包含SEQ ID NO: 5之胺基酸序列。
- 如請求項21之CAR構築體，其中當該鉸鏈區包含CD28鉸鏈區時，該CD28鉸鏈區包含SEQ ID NO: 6之胺基酸序列。
- 如請求項22之CAR構築體，其進一步包含包含SEQ ID NO: 7之胺基酸序列之CD8跨膜域。
- 如請求項23之CAR構築體，其進一步包含包含SEQ ID NO: 8之胺基酸序列之CD28跨膜域。
- 如請求項21之CAR構築體，其中該共刺激域包含4-1BB共刺激域或CD28共刺激域。
- 如請求項21之CAR，其中該活化域為CD3z活化域。
- 如請求項26之CAR構築體，其中該4-1BB共刺激域包含SEQ ID NO: 9之胺基酸序列。
- 如請求項26之CAR構築體，其中該CD28共刺激域包含SEQ ID NO: 10之胺基酸序列。
- 如請求項27之CAR構築體，其中該CD3z活化域包含SEQ ID NO: 11之胺基酸序列。
- 如請求項21之CAR構築體，其中結合至人類EphA3之單株抗體之該scFv、該鉸鏈區、該跨膜域及該胞內信號域係以串聯融合。
- 一種包含第二代如請求項1之CAR之人類EphA3靶向CAR表現盒，其在啟動子之控制下選殖於慢病毒主鏈中。
- 如請求項32之人類EphA3靶向CAR表現盒，其中該啟動子為人類延長因子-1α (elongation factor-1 alpha；EF-1α)。
- 如請求項32之人類EphA3靶向CAR表現盒，其中該慢病毒主鏈為第三代慢病毒主鏈。
- 一種包含如請求項32之EphA3靶向CAR表現盒之人類EphA3靶向CAR T細胞，其中該CAR-T細胞在其細胞表面上表現CAR。
- 如請求項35之人類EphA3靶向CAR T細胞，其中該EphA3靶向CAR T細胞為自體EphA3靶向CAR T細胞。
- 一種醫藥組合物，其包含如請求項35或36中任一項之人類EphA3靶向CAR-T細胞及醫藥上可接受之載劑。
- 一種用於產生人類EphA3靶向CAR T細胞之方法，該方法包括用如請求項32之EphA3 CAR表現盒轉導T細胞。
- 一種用於治療實體腫瘤癌症之方法，該方法包括對有此需要的個體投與如請求項37之醫藥組合物。
- 如請求項39之方法，其中該實體腫瘤癌症為腦癌。
- 如請求項40之方法，其中該腦癌為多形性神經膠質母細胞瘤(glioblastoma multiforme；GBM)。
- 如請求項39之方法，其中該實體腫瘤癌症為結腸癌、肺癌、腎癌、膀胱癌、乳癌、肝癌、胰臟癌、前列腺癌、黑色素瘤、骨髓瘤，其中該肺癌為非小細胞肺癌(non-small cell lung cancer；NSCLC)或小細胞肺癌(small cell lung cancer；SCLC)。
- 如請求項39之方法，其中該實體腫瘤癌症在腫瘤細胞、腫瘤相關血管系統及/或腫瘤基質細胞之表面上表現EphA3。
- 如請求項43之方法，其中該腫瘤基質細胞包含骨髓衍生之抑制細胞。
- 如請求項43之方法，其中該等腫瘤細胞包含腫瘤幹細胞。
- 如請求項43之方法，其中該腫瘤相關血管系統包含新生血管系統。
- 如請求項39之方法，該方法進一步包含投與人類GM-CSF (hGM-CSF)拮抗劑，該拮抗劑選自由抗人類GM-CSF抗體、抗hGM-CSF抗體片段、可溶性hGM-CSF受體α、抗hGM-CSF受體(GM-CSFr)抗體及抗hGM-CSFr抗體片段組成之群。
- 如請求項47之方法，其中該抗人類GM-CSF抗體為hGM-CSF中和抗體朗齊魯單抗(lenzilumab)。
- 如請求項47之方法，其中該抗人類GM-CSF抗體為奈米路單抗(Namilumab)、奧替利單抗(Otilimab)、吉斯魯單抗(Gimsilumab)、TJM2 (TJ003234)或嗎里木單抗(Mavrilimumab)。
- 如請求項48之方法，其中投與朗齊魯單抗降低實體腫瘤復發率或防止實體腫瘤復發發生。
- 如請求項48之方法，其中投與朗齊魯單抗預防或降低該個體中之免疫療法相關毒性之發生率。
- 如請求項51之方法，其中該免疫療法相關毒性為EphA3靶向CAR-T細胞相關毒性。
- 如請求項52之方法，其中該EphA3靶向CAR-T細胞相關毒性為細胞介素釋放症候群、神經毒性及/或神經發炎。
- 如請求項39之方法，該方法進一步包含投與GM-CSF沉默EphA3靶向CAR-T細胞或基因敲除(GM-CSFk/o ) EphA3靶向CAR-T細胞，其中投與GM-CSF沉默EphA3靶向CAR-T細胞或GM-CSFk/o EphA3靶向CAR-T細胞會預防或降低該個體中之免疫療法相關毒性之發生率。
- 如請求項39之方法，其中投與該等GM-CSF沉默EphA3靶向CAR-T細胞或GM-CSFk/o EphA3靶向CAR-T細胞會降低實體腫瘤復發率或防止實體腫瘤復發發生。
- 如請求項39之方法，該方法進一步包含投與至少一種免疫檢查點抑制劑，該免疫檢查點抑制劑選自由抗程式化細胞死亡-1 (PD-1)抗體、抗程式化死亡配位體1 (PD-L1)抗體及抗細胞毒性T淋巴細胞相關蛋白4 (CTLA-4)抗體組成之群。
- 如請求項55之方法，其中該抗程式化細胞死亡-1 (PD-1)抗體為派立珠單抗(Pembrolizumab)，該抗程式化死亡配位體抗體(PD-L1)為阿維單抗(avelumab)，及該抗毒性T淋巴細胞相關蛋白4 (CTLA-4)抗體為易普利單抗(Ipilimumab)。
- 如請求項53之方法，該方法進一步包含投與至少一種免疫檢查點抑制劑，該免疫檢查點抑制劑選自由抗程式化細胞死亡-1 (PD-1)抗體、抗程式化死亡配位體1 (PD-L1)抗體及抗細胞毒性T淋巴細胞相關蛋白4 (CTLA-4)抗體組成之群。
- 如請求項58之方法，其中該抗程式化細胞死亡-1 (PD-1)抗體為派立珠單抗，該抗程式化死亡配位體抗體(PD-L1)為阿維單抗，及該抗細胞毒性T淋巴細胞相關蛋白4 (CTLA-4)抗體為易普利單抗。
- 一種用於降低有此需要的個體中實體腫瘤癌症之復發率或防止實體腫瘤復發發生之方法，該方法包括對該個體投與如請求項37之醫藥組合物。
- 如請求項60之方法，其中該實體腫瘤癌症為腦癌。
- 如請求項61之方法，其中該腦癌為多形性神經膠質母細胞瘤(GBM)。
- 如請求項60之方法，其中該實體腫瘤癌症為結腸癌、肺癌、腎癌、膀胱癌、乳癌、肝癌、胰臟癌、前列腺腫瘤、黑色素瘤、骨髓瘤，其中該肺癌為NSCLC或SCLC。
- 如請求項60之方法，其中該實體腫瘤癌症在腫瘤細胞、腫瘤相關血管系統及/或腫瘤基質之表面上表現EphA3。
- 如請求項64之方法，其中該等腫瘤基質細胞包含骨髓衍生之抑制細胞。
- 如請求項64之方法，其中該等腫瘤細胞包含腫瘤幹細胞。
- 如請求項64之方法，其中該腫瘤相關血管系統包含新生血管系統。
- 如請求項60之方法，該方法進一步包含投與人類GM-CSF (hGM-CSF)拮抗劑，該拮抗劑選自由抗人類GM-CSF抗體、抗hGM-CSF抗體片段、可溶性hGM-CSF受體α、抗hGM-CSF受體(GM-CSFr)抗體及抗hGM-CSFr抗體片段組成之群。
- 如請求項68之方法，其中該抗人類GM-CSF抗體為hGM-CSF中和抗體朗齊魯單抗。
- 如請求項68之方法，其中該抗人類GM-CSF抗體為奈米路單抗、奧替利單抗、吉斯魯單抗、TJM2 (TJ003234)或嗎里木單抗。
- 如請求項69之方法，其中投與朗齊魯單抗會降低實體腫瘤復發率或防止實體腫瘤復發發生。
- 如請求項69之方法，其中投與朗齊魯單抗會預防或降低該個體中之免疫療法相關毒性之發生率。
- 如請求項72之方法，其中該免疫療法相關毒性為EphA3靶向CAR-T細胞相關毒性。
- 如請求項73之方法，其中該EphA3靶向CAR-T細胞相關毒性為細胞介素釋放症候群、神經毒性及/或神經發炎。
- 如請求項60之方法，該方法進一步包含投與GM-CSF沉默EphA3靶向CAR-T細胞或基因敲除(GM-CSFk/o ) EphA3靶向CAR-T細胞，其中投與GM-CSF沉默EphA3靶向CAR-T細胞或GM-CSFk/o EphA3靶向CAR-T細胞會預防或降低該個體中之與免疫療法相關之發生率。
- 如請求項60之方法，該方法進一步包含投與至少一種免疫檢查點抑制劑，該免疫檢查點抑制劑選自由抗程式化細胞死亡-1 (PD-1)抗體、抗程式化死亡配位體1 (PD-L1)抗體及抗細胞毒性T淋巴細胞相關蛋白4 (CTLA-4)抗體組成之群。
- 如請求項76之方法，其中該抗程式化細胞死亡-1 (PD-1)抗體為派立珠單抗，該抗程式化死亡配位體抗體(PD-L1)為阿維單抗，及該抗細胞毒性T淋巴細胞相關蛋白4 (CTLA-4)抗體為易普利單抗。
- 一種結合至人類EphA3且結合至人類突變體表皮生長因子受體變異體III (EGFRvIII)之雙重靶向CAR-T細胞，該CAR-T細胞包含： 結合至人類Eph受體A3 (EphA3)之第一CAR構築體，該CAR包含包含抗EphA3單株抗體之人類EphA3單鏈可變片段(scFv)之胞外抗人類EphA3結合域，其中該人類EphA3 scFv包含包含SEQ ID NO: 1之胺基酸序列之重鏈免疫球蛋白可變區(VH )及包含SEQ ID NO: 2之胺基酸序列之輕鏈免疫球蛋白可變區(VL )， 其中結合至人類EphA3之該單株抗體之該scFv以串聯方式融合至鉸鏈區、跨膜域；及包含共刺激域及活化域之胞內信號域； 及 包含人類化抗EGFRvIII結合域之結合至人類突變體表皮生長因子受體變異體III (EGFRvIII)之第二CAR構築體，其中該人類化抗EGFRvIII結合域包含： (a)重鏈免疫球蛋白可變區，其包含： (i) 包含胺基酸序列DYYIH (SEQ ID NO: 31)之CDR1； (ii) 包含胺基酸序列RIDPENDETKYGPIFQG (SEQ ID NO: 32)之CDR2；及 (iii) 包含胺基酸序列RGGVY (SEQ ID NO: 33)之CDR3；及 (b)輕鏈免疫球蛋白可變區，其包含： (i) 包含胺基酸序列KSSQSLLDSDGKTYLN (SEQ ID NO: 34)之CDR1； (ii)包含序列LVSKLDS (SEQ ID NO: 35)之CDR2；及 (iii)包含胺基酸序列WQGTHFPGT (SEQ ID NO: 36)之CDR3。
- 如請求項78之雙重靶向CAR-T細胞，其中該人類化抗EGFRvIII結合域為單株抗體純系3C10之人類化單鏈可變片段(scFv)，該人類化scFV具有胺基酸序列：。
- 如請求項78之雙重靶向CAR-T細胞，其中該第二CAR進一步包含： (c)包含胺基酸序列IYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYC (SEQ ID NO: 38)之跨膜域； (d)包含胺基酸序列TTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACD (SEQ ID NO: 39)之鉸鏈區； (e)包含共刺激域及初級信號域之胞內信號域，其中該共刺激域包含包含SEQ ID NO: 9之胺基酸序列之4-1BB共刺激域。
- 如請求項80之雙重靶向CAR-T細胞，其中該初級信號域包含具有以下胺基酸序列之CD3 ζ域： RVKFSRSADAPAYKQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQE (SEQ ID NO: 40)。
- 如請求項80之雙重靶向CAR-T細胞，其中該初級信號域包含胺基酸序列NCBI參考序列NM_000734.3： RVKFSRSADAPAYKQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQELYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR (SEQ ID NO: 41)。
- 一種醫藥組合物，其包含如請求項78之結合至人類EphA3且結合至人類突變體EGFRvIII之雙重靶向CAR-T細胞及醫藥上可接受之載劑。
- 一種用於產生結合至人類EphA3及人類EGFRvIII之雙重靶向CAR-T細胞之方法，該方法包括： (a)用EphA3靶向CAR表現盒轉導T細胞以產生人類EphA3靶向CAR T細胞，該表現盒包含結合至人類EphA3且藉由分離的SEQ ID NO: 16、SEQ ID NO: 17、SEQ ID NO: 18或SEQ ID NO: 19之核酸序列編碼之CAR；及 (b)用表現盒轉導產生於步驟(a)中的人類EphA3靶向CAR T細胞以產生人類EphA3靶向CAR T細胞及人類EGFRvIII靶向CAR T細胞，該表現盒包含結合至人類EGFRvIII之人類EGFRvIII靶向CAR且該人類EGFRvIII靶向CAR藉由以下SEQ ID NO: 42之核酸序列編碼：
其中該人類EphA3靶向CAR T細胞及人類EGFRvIII靶向CAR T細胞在其細胞表面上表現該人類EphA3靶向CAR及該人類EGFRvIII靶向CAR。
- 如請求項84之方法，其中該經編碼之人類EGFRvIII靶向CAR包含SEQ ID NO:43之胺基酸序列：
- 一種用於治療實體腫瘤癌症之方法，該方法包括對有此需要的個體投與如請求項83之醫藥組合物。
- 如請求項86之方法，其中該實體腫瘤癌症為腦癌。
- 如請求項87之方法，其中該腦癌為多形性神經膠質母細胞瘤(GBM)。
- 如請求項86之方法，其中該實體腫瘤癌症為結腸癌、肺癌、腎癌、膀胱癌、乳癌、肝癌、胰臟癌、前列腺腫瘤、黑色素瘤，其中該肺癌為NSCLC或SCLC。
- 如請求項86之方法，其中該實體腫瘤癌症在腫瘤細胞、腫瘤相關血管系統及/或腫瘤基質之表面上表現人類EphA3及/或人類EGFRvIII。
- 如請求項90之方法，其中該等腫瘤基質細胞包含骨髓衍生之抑制細胞。
- 如請求項90之方法，其中該等腫瘤細胞包含腫瘤幹細胞。
- 如請求項90之方法，其中該腫瘤相關血管系統包含新生血管系統。
- 如請求項86之方法，該方法進一步包含投與人類GM-CSF (hGM-CSF)拮抗劑，該拮抗劑選自由抗人類GM-CSF抗體、抗hGM-CSF抗體片段、可溶性hGM-CSF受體α、抗hGM-CSF受體(GM-CSFr)抗體及抗hGM-CSFr抗體片段組成之群。
- 如請求項94之方法，其中該抗人類GM-CSF抗體為hGM-CSF中和抗體朗齊魯單抗。
- 如請求項94之方法，其中該抗人類GM-CSF抗體為奈米路單抗、奧替利單抗、吉斯魯單抗、TJM2 (TJ003234)或嗎里木單抗。
- 如請求項95之方法，其中投與朗齊魯單抗會降低實體腫瘤復發率或防止實體腫瘤復發發生。
- 如請求項95之方法，其中投與朗齊魯單抗會預防或降低該個體中之免疫療法相關毒性之發生率。
- 如請求項98之方法，其中該免疫療法相關毒性為EphA3靶向CAR-T細胞相關毒性及/或人類EGFRvIII靶向CAR-T細胞相關毒性。
- 如請求項99之方法，其中該EphA3靶向CAR-T細胞相關毒性及/或人類EGFRvIII靶向CAR-T細胞相關毒性為細胞介素釋放症候群、神經毒性及/或神經發炎。
- 如請求項86之方法，該方法進一步包含投與GM-CSF沉默EphA3靶向或基因敲除(GM-CSFk/o ) EphA3靶向CAR-T細胞，或投與具有GM-CSF沉默或基因敲除(GM-CSFk/o )之結合至人類EphA3且結合至人類突變體EGFRvIII之雙重EphA3靶向且人類突變體EGFRvIII靶向CAR-T細胞， 其中投與GM-CSF沉默EphA3靶向CAR-T細胞或EphA3靶向GM-CSFk/o CAR-T細胞會預防或降低該個體中之與免疫療法相關之發生率。
- 如請求項86之方法，該方法進一步包含投與至少一種免疫檢查點抑制劑，該免疫檢查點抑制劑選自由抗程式化細胞死亡-1 (PD-1)抗體、抗程式化死亡配位體1 (PD-L1)抗體及抗細胞毒性T淋巴細胞相關蛋白4 (CTLA-4)抗體組成之群。
- 如請求項102之方法，其中該抗程式化細胞死亡-1 (PD-1)抗體為派立珠單抗，該抗程式化死亡配位體抗體(PD-L1)為阿維單抗，及該抗細胞毒性T淋巴細胞相關蛋白4 (CTLA-4)抗體為易普利單抗。
- 如請求項1之CAR，其包含胺基酸序列：
- 如請求項1之CAR，其包含胺基酸序列：
- 如請求項1之CAR，其包含胺基酸序列：
- 如請求項1之CAR，其包含胺基酸序列：
- 一種結合至人類Eph受體A3 (EphA3)之嵌合抗原受體(CAR)構築體，該CAR包含包含抗EphA3單株抗體之人類EphA3單鏈可變片段(scFv)之胞外抗人類EphA3結合域，其中該人類EphA3 scFv包含包含GGYYEDFDS (SEQ ID NO: 44)之VH 區之CDR3及包含GQYANYPYT (SEQ ID NO: 45)之VL 區之CDR3。
- 一種結合至人類Eph受體A3 (EphA3)之CAR構築體，該CAR構築體包含胞外抗人類EphA3結合域，該胞外抗人類EphA3結合域包含： VH 區，其包含胺基酸序列 QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTGYWMNWVRQAPGQGLEWMGDIYPGSGNTNYDEKFQGRVTMTRDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYYCARGGYYEDFDSWGQGTTVTVSS (SEQ ID NO: 46)及 VL 區，其包含胺基酸序列 DIQMTQSPSFLSASVGDRVTITCRASQGIISYLAWYQQKPEKAPKRLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYCGQYANYPYTFGQGTKLEIK (SEQ ID NO: 47)。
- 一種結合至人類Eph受體A3 (EphA3)之CAR構築體，該CAR構築體包含胞外抗人類EphA3結合域，該胞外抗人類EphA3結合域包含： 具有序列SYWIN (SEQ ID NO: 48)之VH 區CDR1、具有序列DIYPGSGNTNYDEKFKR (SEQ ID NO: 49)之VH 區CDR2、具有序列SGYYEDFDS (SEQ ID NO: 50)之VH 區CDR3及 具有序列RASQEISGYLG (SEQ ID NO: 51)之VL 區CDR1、具有序列AASTLDS (SEQ ID NO: 52)之VL 區CDR2及具有序列VQYANYPYT (SEQ ID NO: 53)之VL 區CDR3。
- 如請求項108之包含EphA3靶向CAR構築體之人類EphA3靶向CAR T細胞，其中該CAR-T細胞在其細胞表面上表現該CAR。
- 如請求項109之包含EphA3靶向CAR構築體之人類EphA3靶向CAR T細胞，其中該CAR-T細胞在其細胞表面上表現該CAR。
- 如請求項110之包含EphA3靶向CAR構築體之人類EphA3靶向CAR T細胞，其中該CAR-T細胞在其細胞表面上表現該CAR。
- 如請求項111之人類EphA3靶向CAR T細胞，其為自體EphA3靶向CAR T細胞。
- 如請求項112之人類EphA3靶向CAR T細胞，其為自體EphA3靶向CAR T細胞。
- 如請求項113之人類EphA3靶向CAR T細胞，其為自體EphA3靶向CAR T細胞。
- 一種醫藥組合物，其包含如請求項111或請求項114之人類EphA3靶向CAR-T細胞及醫藥上可接受之載劑。
- 一種醫藥組合物，其包含如請求項112或請求項115之人類EphA3靶向CAR-T細胞及醫藥上可接受之載劑。
- 一種醫藥組合物，其包含如請求項113或請求項116之人類EphA3靶向CAR-T細胞及醫藥上可接受之載劑。
- 一種用於治療實體腫瘤癌症之方法，該方法包括對有此需要的個體投與如請求項117之醫藥組合物。
- 一種用於治療實體腫瘤癌症之方法，該方法包括對有此需要的個體投與如請求項118之醫藥組合物。
- 一種用於治療實體腫瘤癌症之方法，該方法包括對有此需要的個體投與如請求項119之醫藥組合物。
- 如請求項120之方法，其中該包含人類EphA3靶向CAR-T細胞之醫藥組合物係作為佐劑投與或係與兩種或更多種醫藥組合物組合投與，其中各醫藥組合物包含抗原靶向CAR T細胞，該抗原靶向CAR T細胞包含抗原靶向CAR，其中藉由該CAR所靶向之該抗原係選自由CAIX、CD133、CEA、c-MET、EGFR、EGFRvIII、EpCam、EphA2、ErB2/Her2、FAP、葉酸受體α (FR-a)、GD2、GPC3、IL-13Ra2、L1-CAM、間皮素、MUC1、PD-L1、PSCA、PSMA、ROR1、VEGFR-2及HER2組成之群，或 其中各醫藥組合物包含選自由CART19、CART22、CART123、CART33、CART-CLL1、CART BCMA、CART38、CART138及CS1-CART組成之群之液體癌症CART。
- 如請求項121之方法，其中該包含人類EphA3靶向CAR-T細胞之醫藥組合物係作為佐劑投與或係與兩種或更多種醫藥組合物組合投與，其中各醫藥組合物包含抗原靶向CAR T細胞，該抗原靶向CAR T細胞包含抗原靶向CAR，其中所靶向的該抗原係選自由CAIX、CD133、CEA、c-MET、EGFR、EGFRvIII、EpCam、EphA2、ErB2/Her2、FAP、葉酸受體α (FR-a)、GD2、GPC3、IL-13Ra2、L1-CAM、間皮素、MUC1、PD-L1、PSCA、PSMA、ROR1、VEGFR-2及HER2組成之群，或 其中各醫藥組合物包含選自由CART19、CART22、CART123、CART33、CART-CLL1、CART BCMA、CART38、CART138及CS1-CART組成之群之液體癌症CART。
- 如請求項122之方法，其中該包含人類EphA3靶向CAR-T細胞之醫藥組合物係作為佐劑投與或係與兩種或更多種醫藥組合物組合投與，其中各醫藥組合物包含抗原靶向CAR T細胞，該抗原靶向CAR T細胞包含抗原靶向CAR，其中所靶向的該抗原係選自由CAIX、CD133、CEA、c-MET、EGFR、EGFRvIII、EpCam、EphA2、ErB2/Her2、FAP、葉酸受體α (FR-a)、GD2、GPC3、IL-13Ra2、L1-CAM、間皮素、MUC1、PD-L1、PSCA、PSMA、ROR1、VEGFR-2及HER2組成之群，或 其中各醫藥組合物包含選自由CART19、CART22、CART123、CART33、CART-CLL1、CART BCMA、CART38、CART138及CS1-CART組成之群之液體癌症CART。
- 如請求項123至125中任一項之方法，其中該包含人類EphA3靶向CAR-T細胞之醫藥組合物係與兩種或更多種醫藥組合物一起或依序投與。
- 如請求項126之方法，其中投與該包含人類EphA3靶向CAR-T細胞之醫藥組合物及該兩種或更多種醫藥組合物會改善該個體之客觀反應率。
- 如請求項126之方法，其中投與該包含人類EphA3靶向CAR-T細胞之醫藥組合物及該兩種或更多種醫藥組合物會改善該個體之無疾病進展存活期。
- 如請求項126之方法，其中投與該包含人類EphA3靶向CAR-T細胞之醫藥組合物及該兩種或更多種醫藥組合物會改善該個體之總存活期。
- 如請求項78之結合至人類EphA3且結合至人類突變體EGFRvIII之雙重靶向CAR-T細胞，其中該雙重靶向CAR-T細胞為自體EphA3靶向CAR T細胞。
- 一種醫藥組合物，其包含如請求項130之結合至人類EphA3且結合至人類突變體EGFRvIII之雙重靶向CAR-T細胞及醫藥上可接受之載劑。
- 一種用於治療實體腫瘤癌症之方法，該方法包括對有此需要的個體投與如請求項131之醫藥組合物。
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