TW202120559A - 一種分離的結合抗原ａｘｌ的蛋白及其用途 - Google Patents

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Abstract

本申請提供一種分離的抗原結合蛋白，其包含胺基酸序列如SEQ ID NO：1或SEQ ID NO：46所示的VH中的至少一個CDR；且包含胺基酸序列如SEQ ID NO：2所示的VL中的至少一個CDR。本申請還提供包含所述分離的抗原結合蛋白的免疫綴合物、編碼所述分離的抗原結合蛋白的核酸、包含所述分離的抗原結合蛋白的載體、包含所述核酸或所述載體的細胞、製備所述分離的抗原結合蛋白的方法以及所述分離的抗原結合蛋白的用途。

Description

一種分離的結合抗原AXL的蛋白及其用途
本申請涉及生物醫藥領域，具體的涉及一種分離的結合抗原AXL的蛋白及其用途。
AXL(受體酪胺酸激酶)是激酶的Tyro-3家族的成員，其可藉由配體Gas6(與抗凝血因數蛋白S同源的70-kDa蛋白)的結合來啟動。AXL啟動導致藉由PI-3-激酶/Akt(Franke等人，Oncogene 22：8983-8998，2003)和其他主要途徑如Ras/Erk和β-聯蛋白/TCF(Goruppi等人，Mol.Cell Biol.21：902-915，2001)的信號轉導。
在腫瘤細胞中，AXL在調節細胞的侵襲和遷移中發揮重要作用。AXL的過度表達不僅與預後不良相關，也與乳房、結腸、食管癌、肝細胞、胃、神經膠質瘤、肺、黑色素瘤、骨肉瘤、卵巢、前列腺、橫紋肌肉瘤、腎、甲狀腺和子宮內膜癌中所報告的各種人癌症的侵襲增加相關(Linger R.M.Adv.Cancer Res.2008,100,35-83以及Verma A.Mol.Cancer Ther.(2011).10,1763-1773)。
鑒於AXL的治療潛能，需要製備特異性結合AXL蛋白的抗體。
一方面，本申請提供一種分離的抗原結合蛋白，其包含胺基酸序列SEQ ID NO：1或SEQ ID NO：46所示的VH中的至少一個CDR；且包含胺基酸序列SEQ ID NO：2所示的VL中的至少一個CDR。
在某些實施方式中，該分離的抗原結合蛋白具有下述性質中的一種或多種：
1)能夠以1×10-7M或更低的KD與AXL蛋白相結合；
2)能夠特異性識別在細胞表面表達的AXL蛋白；
3)結合在細胞表面表達的AXL蛋白後能夠介導內化。
在某些實施方式中，該AXL蛋白包括人AXL蛋白。
在某些實施方式中，該人AXL蛋白包含SEQ ID NO：39所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該AXL蛋白包含細胞外結構域。
在某些實施方式中，該細胞外結構域包含SEQ ID NO：40所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該細胞包括腫瘤細胞。
在某些實施方式中，該腫瘤包括AXL陽性腫瘤。
在某些實施方式中，該腫瘤選自下組：肺癌、皮膚癌、腎癌、胰腺癌、血液腫瘤、乳腺癌、卵巢癌、淋巴瘤和骨髓瘤。
在某些實施方式中，該腫瘤選自下組：非小細胞肺癌、皮膚鱗癌、腎透明細胞腺癌、胰腺癌、紅白血病、急性T細胞白血病、乳腺癌、卵巢癌、淋巴瘤和骨髓瘤。
在某些實施方式中，該細胞包括人的細胞。
在某些實施方式中，該細胞選自下組：人非小細胞肺癌A549細胞、人皮膚鱗癌A431細胞、腎透明細胞腺癌786-O細胞、人胰腺癌MIA PaCa- 2細胞、紅白血病K562細胞、急性T細胞白血病Jurkat細胞、人乳腺癌MCF-7細胞、人乳腺癌MDA-MB-231細胞、人乳腺癌MDA-MB-468細胞、人乳腺癌SKBR3細胞、人卵巢癌SKOV3細胞、淋巴瘤U-937細胞、淋巴瘤Raji細胞、人骨髓瘤U266細胞和人多發性骨髓瘤RPMI8226細胞。
在某些實施方式中，該VH包含HCDR1、HCDR2和HCDR3。
在某些實施方式中，該HCDR1包含SEQ ID NO：25所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該HCDR2包含SEQ ID NO：26、44和45中任一項所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該HCDR3包含SEQ ID NO：27所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該VL包含LCDR1、LCDR2和LCDR3。
在某些實施方式中，該LCDR1包含SEQ ID NO：28所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該LCDR2包含SEQ ID NO：29所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該LCDR3包含SEQ ID NO：30所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該VH包含框架區H-FR1，H-FR2，H-FR3，和H-FR4。
在某些實施方式中，該H-FR1的C末端與該HCDR1的N末端直接或間接相連，且該H-FR1包含SEQ ID NO：7所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該H-FR1包含SEQ ID NO：11、15中任一項所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該H-FR2位於該HCDR1與該HCDR2之間，且該H-FR2包含SEQ ID NO：8所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該H-FR2包含SEQ ID NO：12所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該H-FR3位於該HCDR2與該HCDR3之間，且該H-FR3包含SEQ ID NO：9所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該H-FR3包含SEQ ID NO：13所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該H-FR4的N末端與該HCDR3的C末端相連，且該H-FR4包含SEQ ID NO：10所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該H-FR4包含SEQ ID NO：14所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該VH包含SEQ ID NO：3、5、42和43中任一項所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該VL包含框架區L-FR1，L-FR2，L-FR3，和L-FR4。
在某些實施方式中，該L-FR1的C末端與該LCDR1的N末端直接或間接相連，且該L-FR1包含SEQ ID NO：16所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該L-FR1包含SEQ ID NO：20和24中任一項所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該L-FR2位於該LCDR1與該LCDR2之間，且該L-FR2包含SEQ ID NO：17所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該L-FR2包含SEQ ID NO：21所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該L-FR3位於該LCDR2與該LCDR3之間，且該L-FR3包含SEQ ID NO：18所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該L-FR3包含SEQ ID NO：22所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該L-FR4的N末端與該LCDR3的C末端相連，且該L-FR4包含SEQ ID NO：19所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該L-FR4包含SEQ ID NO：23所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該VL包含SEQ ID NO：4和6中任一項所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該分離的抗原結合蛋白包含抗體重鏈恆定區，且該抗體重鏈恆定區源自人IgG重鏈恆定區。
在某些實施方式中，該抗體重鏈恆定區源自人IgG1重鏈恆定區或人IgG4重鏈恆定區。
在某些實施方式中，該抗體重鏈恆定區包含SEQ ID NO：33和41中任一項所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該分離的抗原結合蛋白包含抗體輕鏈恆定區，且該抗體輕鏈恆定區包含人Igκ恆定區。
在某些實施方式中，該抗體輕鏈恆定區包含SEQ ID NO：34所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該分離的抗原結合蛋白包含抗體重鏈，且該抗體重鏈包含SEQ ID NO：35和37中任一項所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該分離的抗原結合蛋白包含抗體輕鏈，且該抗體輕鏈包含SEQ ID NO：36和38中任一項所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中，該分離的抗原結合蛋白包括抗體或其抗原結合片段。
在某些實施方式中，該抗體選自下組：單株抗體、單鏈抗體、嵌合抗體、多特異性抗體、人源化抗體和全人源抗體。
在某些實施方式中，該抗原結合片段選自下組：Fab、Fab’、F(ab)2、Fv、F(ab’)2、scFv、di-scFv和dAb片段。
另一方面，本申請提供一種免疫綴合物，其包含該分離的抗原結合蛋白。
在某些實施方式中，該免疫綴合物還包含選自下組的至少一種其他試劑：化療劑、放射性元素、細胞生長抑制劑和細胞毒性劑。
在某些實施方式中，該分離的抗原結合蛋白與該其他試劑藉由連接分子相連。
在某些實施方式中，該分離的抗原結合蛋白及該其他試劑分別與該連接分子共價相連。
在某些實施方式中，該其他試劑包括美登素或其衍生物。
在某些實施方式中，該美登素衍生物包括美登素衍生物DM1。
另一方面，本申請提供分離的一種或多種核酸分子，其編碼該分離的抗原結合蛋白。
另一方面，本申請提供載體，其包含該核酸分子。
另一方面，本申請提供細胞，其包含該核酸分子或該載體。
另一方面，本申請提供一種醫藥組成物，其包含該分離的抗原結合蛋白、該免疫綴合物、該核酸分子、該載體和/或該細胞，以及視需要地藥學上可接受的佐劑。
另一方面，本申請提供製備該分離的抗原結合蛋白的方法，該方法包括在使得該分離的抗原結合蛋白表達的條件下，培養該細胞。
另一方面，本申請提供該分離的抗原結合蛋白、該免疫綴合物、所述的核酸分子、該載體、該細胞和/或該醫藥組成物在製備藥物中的用途，該藥物用於預防、緩解和/或治療腫瘤。
在某些實施方式中，該腫瘤包括AXL陽性腫瘤。
在某些實施方式中，該腫瘤選自下組：肺癌、皮膚癌、腎癌、胰腺癌、血液腫瘤、乳腺癌、卵巢癌、淋巴瘤和骨髓瘤。
在某些實施方式中，該腫瘤選自下組：非小細胞肺癌、皮膚鱗癌、腎透明細胞腺癌、胰腺癌、紅白血病、急性T細胞白血病、乳腺癌、卵巢癌、淋巴瘤和骨髓瘤。
另一方面，本申請提供該分離的抗原結合蛋白在製備診斷劑中的用途，該診斷劑用於診斷與AXL蛋白的表達相關的疾病或病況。
另一方面，本申請提供診斷受試者中與AXL蛋白的表達相關的疾病或病況的方法，該方法包括：使源自該受試者的樣品與該分離的抗原結合蛋白接觸，以及判斷該樣品中能夠特異性結合該分離的抗原結合蛋白的物質的存在和/或含量。
另一方面，本申請提供檢測樣品中AXL的方法，該方法包括施用該分離的抗原結合蛋白。
本領域技術人員能夠從下文的詳細描述中容易地洞察到本申請的其它方面和優勢。下文的詳細描述中僅顯示和描述了本申請的示例性實施方式。如本領域技術人員將認識到的，本申請的內容使得本領域技術人員能夠對所公開的具體實施方式進行改動而不脫離本申請所涉及發明的精神和範圍。相應地，本申請的圖式和說明書中的描述僅僅是示例性的，而非為限制性的。
本申請所涉及的發明的具體特徵如所附申請專利範圍所顯示。藉由參考下文中詳細描述的示例性實施方式和圖式能夠更好地理解本申請所涉及發明的特點和優勢。對圖式簡要說明書如下：
圖1顯示該分離的抗原結合蛋白結合抗原的能力。
圖2顯示該抗原結合蛋白6G12M11與不同靶抗原的結合情況。
圖3顯示該抗原結合蛋白6G12M21與不同靶抗原的結合情況。
圖4顯示該抗原結合蛋白6G12M31與不同靶抗原的結合情況。
圖5顯示該抗原結合蛋白6G12M41與不同靶抗原的結合情況。
圖6顯示該分離的抗原結合蛋白6G12M11、6G12M21與A549細胞表面的抗原的結合情況。
圖7顯示該分離的抗原結合蛋白6G12M11、6G12M21與MDA-MB-231細胞表面的抗原的結合情況。
圖8顯示該分離的抗原結合蛋白6G12M11、6G12M21與786-O細胞表面的抗原的結合情況。
圖9顯示該分離的抗原結合蛋白6G12M21、6G12M31、6G12M41與MDA-MB-231細胞表面的抗原的結合情況。
圖10顯示該分離的抗原結合蛋白6G12M21、6G12M31、6G12M41與786-O細胞表面的抗原的結合情況。
圖11顯示該分離的抗原結合蛋白6G12M11、6G12M21在A549細胞上的內化效率。
圖12顯示該分離的抗原結合蛋白6G12M11、6G12M21在MDA-MB-231細胞上的內化效率。
圖13顯示該分離的抗原結合蛋白6G12M11、6G12M21在786-O細胞上的內化效率。
圖14顯示該分離的抗原結合蛋白6G12M21、6G12M31、6G12M41在MDA-MB-231細胞上的內化效率。
圖15顯示該分離的抗原結合蛋白6G12M21、6G12M31、6G12M41在786-O細胞上的內化效率。
圖16顯示該免疫綴合物對MDA-MB-231的抑制曲線。
圖17顯示該免疫綴合物給藥後腫瘤(人乳腺癌MDA-MB-231)體積變化趨勢圖。
圖18顯示該免疫綴合物給藥後小鼠體重變化趨勢圖。
以下由特定的具體實施例說明本申請發明的實施方式，熟悉此技術的人士可由本說明書所公開的內容容易地瞭解本申請發明的其他優點及效果。
以下對本申請做進一步描述：在本發明中，除非另有說明，否則本文中使用的科學和技術名詞具有本領域技術人員所通常理解的含義。並且，本文中所用的蛋白質和核酸化學、分子生物學、細胞和組織培養、微生物學、免疫學相關術語和實驗室操作步驟均為相應領域內廣泛使用的術語和常規步驟。同時，為了更好地理解本發明，下面提供相關術語的定義和解釋。
在本申請中，術語“分離的”通常指從天然狀態下經人工手段獲得的。如果自然界中出現某一種“分離”的物質或成分，那麼可能是其所處的天然環境發生了改變，或從天然環境下分離出該物質，或二者情況均有發生。例如， 某一活體動物體內天然存在某種未被分離的多聚核苷酸或多肽，而從這種天然狀態下分離出來的高純度的相同的多聚核苷酸或多肽即稱之為分離的。術語“分離的”不排除混有人工或合成的物質，也不排除存在不影響物質活性的其它不純物質。
在本申請中，術語“分離的抗原結合蛋白”通常指從天然狀態下經人工手段獲得的具有抗原結合能力的蛋白。該“分離的抗原結合蛋白”可以包含結合抗原的部分和視需要地，允許抗原結合部分採用促進該抗原結合部分結合抗原的構象的支架或構架部分。抗原結合蛋白可以包含例如抗體來源的蛋白支架或具有移植的CDR或CDR衍生物的備選蛋白支架或人工支架。此類支架包括，但不限於包含被引入例如以穩定抗原結合蛋白的三維結構的突變的抗體來源的支架以及包含例如生物相容性聚合物的完全合成的支架。參見例如Korndorfer等，2003,Proteins：Structure,Function,andBioinformatics,53(1)：121-129(2003)；Roque等，Biotechnol.Prog.20：639-654(2004)。此外，肽抗體模擬物("PAMs")以及利用纖連蛋白組分基於抗體模擬物的支架可以用作支架。
在本申請中，術語“KD”(同樣地，“KD”或“KD”)通常指“親和常數”或“平衡解離常數”，並指在滴定測量中在平衡時、或者藉由將解離速率常數(kd)除以結合速率常數(ka)所獲得的值。使用結合速率常數(ka)、解離速率常數(kd)和平衡解離常數(KD)表示結合蛋白(例如本申請該的分離的抗原結合蛋白)對抗原(例如AXL蛋白)的結合親和力。確定結合和解離速率常數的方法為本領域熟知。使用基於螢光的技術提供了高靈敏度以及在生理緩衝液中在平衡時檢查樣品的能力。例如，可以藉由Octet測定該KD值，也可以使用其他實驗途徑和儀器例如BIAcore(生物分子相互作用分析)測定(例如，可以從BIAcoreInternationalAB，aGEHealthcarecompany，Uppsala，瑞典獲得的儀器)。另外，也可以使用可以從SapidyneInstruments(Boise，Idaho)獲得的KinExA (動態排阻測定(KineticExclusionAssay))測定該KD值，或者使用表面等離子共振儀(SPR)測定該KD值。
在本申請中，術語“EC50”或“EC50”，又叫半最大效應濃度，通常是指引起50%最大效應的抗體濃度。
在本申請中，術語“AXL蛋白”通常是指axl基因所編碼的蛋白質受體酪胺酸激酶。AXL(Ark、UFO、Tyro-7)是激酶的Tyro-3家族的成員，其可藉由配體Gas6(與抗凝血因數蛋白S同源的70-kDa蛋白)的結合來啟動。在一些癌症(例如，肺癌、腎癌或乳腺癌)的細胞中，可能存在著AXL蛋白的過表達。人AXL蛋白是894個胺基酸的蛋白質，其胺基酸序列可以如SEQ ID NO：39所示；其中第1-26位元胺基酸殘基為信號肽；第27-451位為AXL蛋白的細胞外結構域(其胺基酸序列如SEQ ID NO：40所示)。
在本申請中，術語“細胞外結構域”通常是指位於細胞外的多肽或蛋白結構域。例如，該細胞外結構域可以為AXL蛋白的細胞外結構域，其胺基酸序列可如SEQ ID NO：40所示。AXL蛋白的細胞外結構域可以具有接近細胞黏附分子所需的結構。該AXL蛋白的細胞外結構域可以為兩個免疫球蛋白樣結構域的組成物，能夠結合Gas6配體(Sasaki T等人，EMBO J.(2006).25,80-87)。
在本申請中，術語“特異性結合”或“特異性的”通常指可測量的和可再現的相互作用，比如靶標和抗體之間的結合，可在分子(包括生物分子)的異質群體存在的情況可決定靶標的存在。例如，特異性結合靶標(其可以為表位)的抗體是以比它結合其它靶標更大的親和性、親合力、更容易、和/或以更大的持續時間結合該靶標的抗體。在一個實施方案中，抗體結合無關靶標的程度小於抗體對靶標的結合的約10%，如例如藉由放射免疫分析(RIA)測量的。例如，在本申請中，該分離的抗原結合蛋白能夠以<1x10-7M或更低的解離常數(KD)與AXL蛋白相結合。在某些實施方案中，抗體特異性結合蛋白質上的表位，該表位在不 同種屬的蛋白質中是保守的。在另一個實施方案中，特異性結合可以包括但不要求排他性地結合。
在本申請中，術語“內化”通常是指抗體或其抗原結合片段或多肽與細胞表面的受體特異性結合，形成受體-抗體複合物，然後借助該受體介導的胞吞作用進入到細胞內的過程。此時這樣的抗體或其抗原結合片段(如Fab片段)可以成為內化抗體。該內化抗體可以作為定向運載藥物、酶或DNA的載體。在某些情形下，該內化可抑制腫瘤細胞的增殖。例如，該內化抗體可用於偶聯抗腫瘤的化療劑、放射性元素、細胞生長抑制劑和細胞毒性劑，並作為腫瘤生物治療的候選分子。
在本申請中，術語“腫瘤”通常指由異常細胞生長形成的贅生物或實體病變。在本申請中，腫瘤可以是實體瘤或血液瘤。例如，在本申請中，腫瘤可以是AXL陽性的腫瘤，其中該AXL陽性的腫瘤可以選自下組：肺癌、皮膚癌、腎癌、胰腺癌、血液腫瘤、乳腺癌、卵巢癌、淋巴瘤和骨髓瘤。在某些實施方式中，該AXL陽性的腫瘤可以選自下組：非小細胞肺癌、皮膚鱗癌、腎透明細胞腺癌、胰腺癌、紅白血病、急性T細胞白血病、乳腺癌、卵巢癌、淋巴瘤和骨髓瘤。
在本申請中，術語“可變結構域”通常指抗體重鏈或輕鏈的胺基末端結構域。重鏈和輕鏈的可變結構域可以分別稱為“VH”和“VL”(或者分別稱為“VH”和“VL”)。這些結構域通常是抗體的變化最大的部分(相對於相同類型的其它抗體)，且包含抗原結合位點。
在本申請中，術語“可變”通常指在抗體之間可變結構域的某些區段在序列上存在很大差異的事實。V結構域介導抗原結合並決定特定抗體對其特定抗原的特異性。然而，可變性並非在整個可變結構域範圍內均勻分佈。相 反，它集中在輕鏈和重鏈可變結構域中稱為高變區(CDR或HVR)的三個區段中。可變結構域的更高度保守的部分稱為框架區(FR)。天然重鏈和輕鏈的可變結構域各自包含四個FR區，大多數採用β-折疊構型，藉由三個CDR連接，其形成環形連接，並且在一些情況下形成β-折疊結構的一部分。每條鏈中的CDR藉由FR區緊密靠近地保持在一起，並且來自另一條鏈的CDR一同促進抗體的抗原結合位點的形成(參見Kabat et al,Sequences of Immunological Interest,Fifth Edition,National Institute of Health,Bethesda,Md.(1991))。恆定結構域不直接參與抗體與抗原的結合，但顯示出各種效應子功能，例如抗體參與抗體依賴性細胞毒性。
在本申請中，術語“抗體”通常指免疫球蛋白或其片段或其衍生物，涵蓋包括抗原結合位點的任何多肽，無論其是在體外還是體內產生的。該術語包括但不限於多株的、單株的、單特異性的、多特異性的、非特異性的、人源化的、單鏈的、嵌合的、合成的、重組的、雜化的、突變的和移植的抗體。除非另外被術語“完整的”修飾，如在“完整的抗體”中，為了本發明的目的，術語“抗體”也包括抗體片段，比如Fab、F(ab')2、Fv、scFv、Fd、dAb和保持抗原結合功能(例如，特異性結合AXL)的其它抗體片段。通常，這樣的片段應當包括抗原結合結構域。基本的4鏈抗體單元是由兩個相同的輕(L)鏈和兩個相同的重(H)鏈組成的異四聚體糖蛋白。IgM抗體由5個基本的異四聚體單元與另外一個稱為J鏈的多肽組成，且含有10個抗原結合位點，而IgA抗體包括2-5個可以與J鏈相結合聚合形成多價組合的基本4鏈單元。就IgG而言，4鏈單元一般為約150,000道爾頓。每個L鏈藉由一個共價二硫鍵與H鏈連接，而兩個H鏈藉由一個或多個取決於H鏈同種型的二硫鍵相互連接。每個H和L鏈還具有規則間隔的鏈內二硫化橋鍵。每個H鏈在N末端具有可變結構域(VH)，對於α和γ鏈各自繼之以三個恆定結構域(CH)、對於μ和ε同種型繼之以四個CH結構域。每個 L鏈在N末端具有可變結構域(VL)，在其另一端具有恆定結構域。VL與VH對應，且CL與重鏈的第一恆定結構域(CH1)相對應。特定的胺基酸殘基被認為在輕鏈和重鏈可變結構域之間形成介面。VH和VL配對一起形成單個抗原結合位點。對於不同類別抗體的結構和性質，參見例如Basic and Clinical Immunology,8th Edition,Daniel P.Sties,Abba I.Terr and Tristram G.Parsolw(eds),Appleton & Lange,Norwalk,Conn.,1994，第71頁和第6章。來自任何脊椎動物物種的L鏈可以基於其恆定結構域的胺基酸序列被分為兩種明顯不同的類型中的一種，稱為κ和λ。取決於其重鏈(CH)恆定結構域的胺基酸序列，可以將免疫球蛋白分為不同的類別或同種型。存在五類免疫球蛋白：IgA、IgD、IgE、IgG和IgM，具有分別被命名為α、δ、ε、γ和μ的重鏈。基於CH序列和功能方面的相對小的差異，將γ和α類進一步分成亞類，例如，人表達下述亞類：IgG1、IgG2A、IgG2B、IgG3、IgG4、IgA1和IgK1。
在本申請中，術語“CDR”通常指抗體可變結構域的區域，其序列是高度可變的和/或形成結構定義環。通常，抗體包括六個CDR；在VH中三個(HCDR1、HCDR2、HCDR3)，和在VL中三個(LCDR1、LCDR2、LCDR3)。在天然抗體中，HCDR3和LCDR3顯示該六個CDR的大多數多樣性，並且特別地HCDR3被認為在賦予抗體的精細特異性方面起獨特作用。參見，例如Xu et al,Immunity 13：37-45(2000)；Johnson and Wu,in Methods in Molecular Biology 248：1-25(Lo,ed.,Human Press,Totowa,N.J.,2003)。實際上，僅由重鏈組成的天然存在的駱駝抗體在缺乏輕鏈的情況功能正常且穩定。參見，例如，Hamers-Casterman et al.,Nature 363：446-448(1993)；Sheriff et al,Nature Struct.Biol.3：733-736(1996)。
在本申請中，術語“FR”通常指抗體可變結構域的更高度保守的部分，其被稱為框架區。通常，天然重鏈和輕鏈的可變結構域各自包含四個FR區，即在VH中四個(H-FR1，H-FR2，H-FR3，和H-FR4)，和在VL中四個(L-FR1，L-FR2，L-FR3，和L-FR4)。例如，該分離的抗原結合蛋白的VL可以包括框架區L-FR1，L-FR2，L-FR3，和L-FR4。該分離的抗原結合蛋白的VH可以包括框架區H-FR1，H-FR2，H-FR3，和H-FR4。
在本申請中，術語“抗原結合片段”通常指具有特異結合抗原(例如，AXL蛋白)能力的一個或多個片段。在本申請中，該抗原結合片段可以包括Fab，Fab’，F(ab)2、Fv片段、F(ab’)2，scFv，di-scFv和/或dAb。
在本申請中，術語“單株抗體”或“單抗”或“單株抗體組成”通常是指單一分子組成的抗體分子製品。單株抗體組成呈現出對於特定表位的單一結合特異性和親和力。
在本申請中，術語“單鏈抗體”通常是指包含抗體重鏈可變區和輕鏈可變區的分子。例如，該單鏈抗體可以由抗體重鏈可變區和輕鏈可變區藉由連接分子(linker)(例如，連接肽)連接而成。
在本申請中，術語“人源抗體”通常是指可變區框架和CDR區得自人種系免疫球蛋白序列的抗體。此外，如果抗體包含恆定區，其也得自人種系免疫球蛋白序列。本申請的人源抗體可以包含不由人種系免疫球蛋白序列編碼的胺基酸殘基，例如藉由體外隨機突變或點突變或藉由體內體細胞突變而導入的突變。然而，術語“人源抗體”不包括在人框架序列中插入得自其他哺乳動物物種的CDR序列的抗體。
在本申請中，術語“鼠源抗體”通常是指可變區框架和CDR區得自小鼠種系免疫球蛋白序列的抗體。此外，如果抗體包含恆定區，其也得自小 鼠種系免疫球蛋白序列。本申請的鼠源抗體可以包含不由小鼠種系免疫球蛋白序列編碼的胺基酸殘基，例如藉由體外隨機突變或點突變或藉由體內體細胞突變而導入的突變。然而，術語“鼠源抗體”不包括在小鼠框架序列中插入得自其他哺乳動物物種的CDR序列的抗體。
在本申請中，術語“嵌合抗體”通常是指藉由組合非人源遺傳物質與人源遺傳物質而得來的抗體。或者更籠統地說，嵌合抗體是指組合有一個物種的遺傳物質與另一物種遺傳物質的抗體。
在本申請中，術語“多特異性抗體”通常是指可以同時識別兩個或兩個以上抗原或者表位的抗體分子。該多特異性抗體可以藉由化學偶聯法、雜交-雜交瘤法、基因工程抗體製備法等方法在真核表達系統或者在原核表達系統中獲得。
在本申請中，術語“人源化抗體”通常是指來源於非人物種但其蛋白序列已經被修改以增加其與人天然生成抗體的相似度的抗體。
在本申請中，術語“全人源抗體”通常是指全人抗體，即抗體的恆定區和可變區均來源於人。該全人源抗體可以藉由噬菌體抗體庫技術、轉基因小鼠製備人源性抗體、核糖體展示技術、EBV轉化B細胞選殖技術、單個B細胞選殖等技術來實現。
在本申請中，術語“識別抗原的抗體”以及“對抗原特異的抗體”在本文中與術語“特異結合抗原的抗體”交替使用。
在本申請中，術語“直接相連”與術語“間接相連”相對，術語“直接相連”通常是指直接連接。例如，該直接相連可以為物質間沒有間隔子而直接相連的情況。該間隔子可以是連接子。例如，該連接子可以為肽連接子。術語“間接相連”通常是指物質間不直接相連的情況。例如，該間接相連可以為藉 由間隔子而連接的情況。例如，在該分離的抗原結合蛋白中，該L-FR1的C末端與該LCDR1的N末端可以直接或間接相連。
在本申請中，術語“免疫綴合物”通常是指該其他試劑(例如，化療劑、放射性元素、細胞生長抑制劑和細胞毒性劑)與該分離的抗原結合蛋白綴合(例如，藉由連接分子共價相連)而形成的綴合物，該綴合物可以藉由該分離的抗原結合蛋白與靶細胞上的抗原的特異性結合，將該其他試劑遞送至靶細胞(例如，腫瘤細胞)。然後該免疫綴合物經該內化，最終進入靶細胞內部(例如，進入溶酶體等泡囊體)，此時該免疫綴合物中的連接分子可以裂解，釋放該其他試劑從而發揮其細胞毒性效應。此外，該抗原也可以由該靶細胞分泌，並位於該靶細胞外的間隙。
在本申請中，術語“化療劑”通常是指可以抑制腫瘤和/或腫瘤細胞增殖的化療用試劑。該化療劑可以選自以下組：有絲分裂抑制劑、激酶抑制劑、烷基化試劑、抗代謝藥、嵌入抗生素、生長因數抑制劑、細胞週期抑制劑、酶、拓撲異構酶抑制劑、組蛋白脫乙醯基酶抑制劑、抗存活劑、生物學應答調節劑、抗激素例如抗雄激素和抗血管生成劑。例如，該化療劑可以選自以下組：卡培他濱、柔紅黴素、道諾黴素、放線菌素D、多柔比星、表柔比星、伊達比星、依索比星、博來黴素、馬磷醯胺、異環磷醯胺、阿糖胞苷、雙氯乙基亞硝脲、白消安、絲裂黴素C、放線菌素D、普卡黴素、潑尼松、羥孕酮、睾酮、他莫昔芬、達卡巴嗪、丙卡巴肼、六甲蜜胺、五甲蜜胺、米托蒽醌、安吖啶、苯丁酸氮芥、甲基環己基亞硝基脲、氮芥、美法侖、環磷醯胺、6-巰嘌呤、6-硫鳥嘌呤、阿糖胞苷(CA)、5-氮雜胞苷、羥基脲、去氧助間型黴素、4-羥基過氧環磷醯胺、5-氟尿嘧啶(5-FU)、5-氟去氧尿苷(5-FUdR)、甲胺喋呤(MTX)、秋水仙鹼、泰素(taxol)、長春新鹼、長春鹼、依託泊苷、三甲曲沙、替尼泊苷和/或己烯雌酚(DES)。
在本申請中，術語“放射性元素”通常是指可以抑制腫瘤和/或腫瘤細胞增殖的放療用元素。該放射性元素可以選自以下組：3H、14C、15N、35S、90Y、99Tc、111In、125I和/或131I。
在本申請中，術語“細胞生長抑制劑”通常是指藉由抑制促進腫瘤細胞生長和複製的生長因數從而抑制腫瘤的試劑。生長因數與在細胞表面的受體結合後啟動了細胞內的信號通路，複雜的通路可能促使細胞失控生長，從而導致細胞過度的分裂並發展為腫瘤。該細胞生長抑制劑能夠抑制這些生長因數的作用。該細胞生長抑制劑可以選自以下組：血管生成抑制因數、脫乙醯化酶(HDAC)抑制因數、Hedgehog信號通路阻滯劑、mTOR抑制劑、p53/mdm2抑制劑、PARP抑制劑、蛋白酶體抑制劑和/或酪胺酸激酶抑制劑。
在本申請中，術語“細胞毒性劑”通常是指藉由對作用的細胞產生毒素，抑制腫瘤和/或腫瘤細胞增殖的試劑。該細胞毒性劑可以選自以下組：烷化劑，如白消安、六甲蜜胺、噻替派、環磷醯胺、氮芥、烏拉莫司汀、美法侖、苯丁酸氮芥、卡莫司汀、鏈脲黴素、達卡巴嗪、替莫唑胺、異環磷醯胺等；抗腫瘤劑，如絲裂黴素C等；抗代謝物，如甲胺蝶呤、咪唑硫嘌呤、巰基嘌呤、氟達拉濱、5-氟尿嘧啶等；含鉑的抗癌劑，如順鉑、卡鉑等；蒽環黴素，如柔紅黴素、阿黴素、表柔比星、伊達比星、米托蒽醌等；植物生物鹼和萜類化合物，如長春新鹼、長春鹼、長春瑞濱、長春地辛、鬼臼毒素、多西他賽等；拓撲異構酶抑制劑，如伊立替康、安吖啶、托泊替康、依託泊苷、替尼泊苷等；抗體類，如利妥昔單抗、曲妥珠單抗、貝伐珠單抗、厄洛替尼、更生黴素等；非那雄胺；芳香化酶抑制劑；他莫昔芬；戈舍瑞林；紫杉醇和/或甲磺酸伊馬替尼。該細胞毒性劑可以藉由口服、注射等方式施用。
在本申請中，術語“連接分子”通常是指連接或聯接兩個分子的功能分子。例如，該連接分子可以連接一個分子和另一個分子(例如，一個分子為 蛋白質分子，另一個分子也為蛋白質分子，或者可以為小分子藥物)。該連接分子可以用於該免疫綴合物的構建中。在該免疫綴合物中，該連接分子可以具備兩個功能特徵：1、具有循環系統穩定性，在該免疫綴合物到達靶細胞前在循環系統中不能發生裂解釋放該其他試劑，避免產生毒性作用；2、在進入靶細胞過後，該連接分子需要快速有效地斷裂，使該其他試劑有效釋放發揮應有的藥理活性。該連接分子可以由極性或非極性胺基酸組成。該連接分子也可以為包含雜原子(如氮原子、硫原子等)的碳鏈。該連接分子的長度可以為2至100個原子，例如為2至50個原子之間，也可以為3、5、10、15、20、25、30、35、40、45或50個原子；又例如，該連接子的長度可以為20至26個(20、21、22、23、24、25或26個)原子。該連接分子可以包括選自以下組的取代基取代：氫原子、烷基、烯基、炔基、胺基、烷基胺基、二烷基胺基、三烷基胺基、羥基、烷氧基、鹵素、芳基、雜環、芳香族雜環、氰基、醯胺、胺基甲醯基、羧酸、酯、硫醚、烷基硫醚、巰基和脲基。此外，該連接分子可以選自以下組：pH敏感連接分子、蛋白酶可切割連接分子、核酸酶敏感連接分子、脂肪酶敏感連接分子、糖苷酶連接分子、缺氧連接分子、光切割連接分子、熱不穩定連接分子和超聲敏感連接分子。
在本申請中，術語“共價”通常是指共價鍵，即兩個或多個原子存在共用電子對，達到電子飽和的狀態從而形成比較穩定的化學結構。共價鍵的形成是相鄰兩個原子之間自旋方向相反的電子相互配對，此時原子軌道相互重疊，兩核間的電子雲密度相對地增大，從而增加對兩核的引力。共價鍵可以具備飽和性與方向性。共價鍵可以分為非極性共價鍵、極性共價鍵和配價鍵。只含有共價鍵的化合物可稱為共價化合物。
在本申請中，術語“美登素”通常是指從美登木屬植物分離得到(參見美國專利US3896111)的化合物，其屬於一種抗有絲分裂細胞毒素，結構式為：
Figure 109141730-A0101-12-0020-1
該美登素的CAS號為35846-53-8。美登素可以對各種腫瘤，如L-1210、P-388白血病、S-180、W-256、路易士肺癌和體外鼻咽癌均有顯著療效。該美登素衍生物可以包括具有美登素的環結構且其環上具有一個或一個以上取代基修飾的化合物，例如美登素衍生物DM1、DM4。
在本申請中，術語“美登素衍生物DM1”通常是指具備以下結構式的化合物：
Figure 109141730-A0101-12-0020-2
CAS號為139504-50-0。該美登素衍生物DM1可以為一種抗有絲分裂細胞毒素。
在本申請中，術語“與AXL蛋白的表達相關的疾病或病況”通常是指與AXL蛋白的表達相關，或者AXL蛋白的表達上調會導致的疾病或病 況。例如，與AXL蛋白的表達相關的疾病或病況可以為肺癌、皮膚癌、腎癌、胰腺癌、血液腫瘤、乳腺癌、卵巢癌、淋巴瘤和/或骨髓瘤。
在本申請中，術語“分離的核酸分子”通常指任何長度的分離形式的核苷酸，去氧核糖核苷酸或核糖核苷酸，或從其天然環境分離的或人工合成的類似物。
在本申請中，術語“載體”通常指可將編碼某蛋白的多聚核苷酸插入其中並使蛋白獲得表達的一種核酸運載工具。載體可藉由轉化、轉導或轉染宿主細胞，使其攜帶的遺傳物質元件在宿主細胞內表達得以表達。舉例來說，載體包括：質粒；噬菌粒；柯斯質粒；人工染色體如酵母人工染色體(YAC)、細菌人工染色體(BAC)或P1來源的人工染色體(PAC)；噬菌體如λ噬菌體或M13噬菌體及動物病毒等。用作載體的動物病毒種類有逆轉錄酶病毒(包括慢病毒)、腺病毒、腺相關病毒、皰疹病毒(如單純皰疹病毒)、痘病毒、杆狀病毒、乳頭瘤病毒、乳頭多瘤空泡病毒(如SV40)。一種載體可能含有多種控制表達的元件，包括啟動子序列、轉錄起始序列、增強子序列、選擇元件及報告基因。另外，載體還可含有複製起始位點。載體還有可能包括有協助其進入細胞的成分，如病毒顆粒、脂質體或蛋白外殼，但不僅僅只有這些物質。
在本申請中，術語“細胞”通常指可以是或已經是受試者質粒或載體的接受者的單個細胞、細胞系或細胞培養物，其包括本發明的核酸分子或本發明的載體。細胞可以包括單個細胞的後代。由於天然、偶然或有意的突變，後代可以不一定與原始母細胞完全相同(在總DNA互補體的形態上或在基因組上)。細胞可包括用本申請該的載體在體外轉染的細胞。細胞可以是細菌細胞(例如，大腸桿菌)、酵母細胞或其它真核細胞，例如COS細胞、中國倉鼠卵巢(CHO)細胞、CHO-K1細胞、LNCAP細胞、HeLa細胞、HEK293細胞、 COS-1細胞、NS0細胞、人非小細胞肺癌A549細胞、人皮膚鱗癌A431細胞、腎透明細胞腺癌786-O細胞、人胰腺癌MIA PaCa-2細胞、紅白血病K562細胞、急性T細胞白血病Jurkat細胞、人乳腺癌MCF-7細胞、人乳腺癌MDA-MB-231細胞、人乳腺癌MDA-MB-468細胞、人乳腺癌SKBR3細胞、人卵巢癌SKOV3細胞、淋巴瘤U-937細胞、淋巴瘤Raji細胞、人骨髓瘤U266細胞或人多發性骨髓瘤RPMI8226細胞。在某些實施方案中，細胞為哺乳動物細胞。在某些實施方案中，哺乳動物細胞為HEK293細胞。
在本申請中，術語“醫藥組成物”通常指涉及適合施用于患者、較佳人患者的組成物。例如，該醫藥組成物，其可以包含該分離的抗原結合蛋白、該免疫綴合物、該核酸分子、該載體和/或該細胞，以及視需要地藥學上可接受的佐劑。此外，該醫藥組成物還可以包含一種或多種(藥學上有效的)載劑、穩定劑、賦形劑、稀釋劑、增溶劑、表面活性劑、乳化劑和/或防腐劑的合適的製劑。組成物的可接受成分在所用劑量和濃度下較佳地對接受者無毒。本發明的醫藥組成物包括但不限於液體、冷凍和凍幹組成物。
在本申請中，術語“藥學上可接受的佐劑”通常指與醫藥給藥相容的任何和所有的溶劑、分散介質、包衣、等滲劑和吸收延遲劑等，通常安全、無毒，且既不是生物學上也非其它方面不合需要的。
在本申請中，術語“受試者”通常指人類或非人類動物，包括但不限於貓、狗、馬、豬、奶牛、羊、兔、小鼠、大鼠或猴。
在本申請中，術語“包含”通常是指包括明確指定的特徵，但不排除其他要素。
在本申請中，術語“約”通常是指在指定數值以上或以下0.5%-10%的範圍內變動，例如在指定數值以上或以下0.5%、1%、1.5%、2%、 2.5%、3%、3.5%、4%、4.5%、5%、5.5%、6%、6.5%、7%、7.5%、8%、8.5%、9%、9.5%、或10%的範圍內變動。
分離的抗原結合蛋白
一方面本申請提供了一種分離的抗原結合蛋白，其包含胺基酸序列如SEQ ID NO：1或SEQ ID NO：46所示的VH中的至少一個CDR；且包含胺基酸序列如SEQ ID NO：2所示的VL中的至少一個CDR。
Figure 109141730-A0101-12-0023-7
Figure 109141730-A0101-12-0023-6
Figure 109141730-A0101-12-0023-5
(SEQ ID NO：1)，其中， X1可以是K或V，X2可以是S或A，X3可以是T或S，X4可以是F、Y、D或S，X5可以是F或S，X6可以是N或Q，X7可以是K或G，X8可以是T或S，X9可以是S或T。
Figure 109141730-A0101-12-0023-8
Figure 109141730-A0101-12-0023-9
Figure 109141730-A0101-12-0023-10
(SEQ ID NO：46)，其中，X1可以是D或者G。
Figure 109141730-A0101-12-0023-56
Figure 109141730-A0101-12-0023-57
(SEQ ID NO：2)，其中，X1可以是E或D，X2可以是L或I，X3可以是F或S，X4可以是N或V，X5可以是A或S，X6可以是T或Q，X7可以是L或 Q，X8可以是S或G，X9可以是R或K，X10可以是A或G，X11可以是L或I。
該分離的抗原結合蛋白的VH可以藉由在6G12抗體VH(SEQ ID NO：31)中的一個或多個位置處的胺基酸突變獲得，具體而言，可以藉由6G12抗體VH的框架區(FR)中的一個或多個位置處的胺基酸突變來獲得該分離的抗原結合蛋白，也可以藉由6G12抗體VH的可變區(CDR)中的一個或多個位置處的胺基酸突變來獲得該分離的抗原結合蛋白。例如，在6G12抗體VH中，從N端到C端，第5位的K可以突變成V，第23位的S可以突變成A，第25位的T可以突變成S，第27位的F可以突變成Y、D或S，第41位的F可以突變成S，第44位的N可以突變成Q，第45位的K可以突變成G，第88位的T可以突變成S，第114位的S可以突變成T。
例如，在6G12抗體VH中，從N端到C端，第5位的K可以突變成V，第23位的S可以突變成A，第25位的T可以突變成S，第27位的F可以突變成Y、D或S，第41位的F可以突變成S，第44位的N可以突變成Q，第45位的K可以突變成G，第61位的N可以突變成D或G，第88位的T可以突變成S，第114位的S可以突變成T。
該分離的抗原結合蛋白的VL可以藉由在6G12抗體VL(SEQ ID NO：32)中的一個或多個位置處的胺基酸突變獲得，具體而言，可以藉由6G12抗體VL的框架區(FR)中的一個或多個位置處的胺基酸突變來獲得該分離的抗原結合蛋白。
例如，在6G12抗體VL中，從N端到C端，第1位的E可以突變成D，第2位的L可以突變成I，第9位的F可以突變成S，第11位的N可以突變成V，第12位的A可以突變成S，第17位的T可以突變成Q，第42位 的L可以突變成Q，第69位的S可以突變成G，第79位的R可以突變成K，第105位的A可以突變成G，第111位的L可以突變成I。
該分離的抗原結合蛋白的性質
在本申請中，該分離的抗原結合蛋白可以具有下述性質中的一種或多種：
1)能夠以1×10-7M或更低的KD與AXL蛋白相結合；
2)能夠特異性識別在細胞表面表達的AXL蛋白；
3)結合在細胞表面表達的AXL蛋白後能夠介導內化。
在本申請中，該分離的抗原結合蛋白能夠以1×10-7M或更低的KD與AXL蛋白相結合。例如，該分離的抗原結合蛋白結合源自人的AXL蛋白的KD值可以為
Figure 109141730-A0101-12-0025-97
1×10-7M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-98
9×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-99
8×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-100
7×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-162
6×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-102
5×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-104
4×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-105
3×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-106
2×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-107
1.5×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-108
1.2×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-109
1.15×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-111
1.1×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-112
1.05×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-116
1×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-115
5×10-9M或
Figure 109141730-A0101-12-0025-117
1×10-9M。又例如，該分離的抗原結合蛋白結合源自鼠的AXL蛋白的KD值可以為
Figure 109141730-A0101-12-0025-118
1×10-7M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-119
9×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-120
8×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-122
7×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-124
6×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-125
5×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-127
4×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-128
3×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-129
2×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-131
1.5×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-132
1.2×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-133
1.15×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-134
1.1×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-135
1.05×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-136
1×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-137
5×10-9M或
Figure 109141730-A0101-12-0025-138
1×10-9M。又例如，該分離的抗原結合蛋白結合源自猴的AXL蛋白的KD值可以為
Figure 109141730-A0101-12-0025-159
1×10-7M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-140
9×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-141
8×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-142
7×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-144
6×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-145
5×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-147
4×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-148
3×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-149
2×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-151
1.5×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-152
1.2×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-153
1.15×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-154
1.1×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-160
1.05×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-156
1×10-8M、
Figure 109141730-A0101-12-0025-157
5×10-9M或
Figure 109141730-A0101-12-0025-158
1×10-9M。
在本申請中，該KD值還可以藉由ELISA、競爭ELISA或BIACORE或KINEXA進行測定。
在本申請中，該競爭性結合的能力可以藉由測定該分離的抗原結合蛋白的抗體-抗原相互作用的解離平衡常數來衡量。檢測該解離平衡常數的 方法可以選自以下組：酶聯免疫吸附法、表面等離振子共振(SRP)法、電位滴定法、分光光度法、細管電泳法、螢光法和薄層色譜pH法。例如，該分離的抗原結合蛋白可以經SRP法(例如，使用生物大分子相互作用儀)檢測。
在本申請中，該分離的抗原結合蛋白能夠特異性結合細胞表面表達的AXL蛋白。該特異性結合可以藉由FACS測定。例如，可以藉由FACS測定中的EC50來反映本申請該分離的抗原結合蛋白特異性結合細胞表面的AXL蛋白的情況，例如，EC50越低說明特異性結合越好。例如，該分離的抗原結合蛋白在FACS測定中結合非小細胞肺癌A549細胞表面的AXL蛋白的EC50值可以為0.01μg/ml~0.10μg/ml、0.01μg/ml~0.15μg/ml、0.01μg/ml~0.20μg/ml、0.01μg/ml~0.25μg/ml、0.01μg/ml~0.30μg/ml、0.01μg/ml~0.35μg/ml、0.01μg/ml~0.40μg/ml、0.01μg/ml~0.45μg/ml、0.01μg/ml~0.50μg/ml、0.01μg/ml~0.55μg/ml、0.01μg/ml~0.60μg/ml、0.01μg/ml~0.65μg/ml、0.01μg/ml~0.70μg/ml、0.01μg/ml~0.75μg/ml或0.01μg/ml~0.80μg/ml。又例如，該分離的抗原結合蛋白在FACS測定中結合人乳腺癌MDA-MB-231細胞表面的AXL蛋白的EC50值可以為0.01μg/ml~0.10μg/ml、0.01μg/ml~0.15μg/ml、0.01μg/ml~0.20μg/ml、0.01μg/ml~0.25μg/ml、0.01μg/ml~0.30μg/ml、0.01μg/ml~0.35μg/ml、0.01μg/ml~0.40μg/ml、0.01μg/ml~0.45μg/ml、0.01μg/ml~0.50μg/ml、0.01μg/ml~0.55μg/ml、0.01μg/ml~0.60μg/ml、0.01μg/ml~0.65μg/ml、0.01μg/ml~0.70μg/ml、0.01μg/ml~0.75μg/ml或0.01μg/ml~0.80μg/ml。又例如，該分離的抗原結合蛋白在FACS測定中結合腎透明細胞腺癌786-O細胞表面的AXL蛋白的EC50值可以為0.01μg/ml~0.10μg/ml、0.01μg/ml~0.15μg/ml、0.01μg/ml~0.20μg/ml、0.01μg/ml~0.25μg/ml、0.01μg/ml~0.30μg/ml、0.01μg/ml~0.35μg/ml、0.01μg/ml~0.40μg/ml、0.01μg/ml~0.45μg/ml、 0.01μg/ml~0.50μg/ml、0.01μg/ml~0.55μg/ml、0.01μg/ml~0.60μg/ml、0.01μg/ml~0.65μg/ml、0.01μg/ml~0.70μg/ml、0.01μg/ml~0.75μg/ml或0.01μg/ml~0.80μg/ml。
在本申請中，該分離的抗原結合蛋白可以結合在細胞表面表達的AXL蛋白後能夠介導內化。例如，該內化可以包括以下的步驟：當該分離的抗原結合蛋白可以結合到細胞(例如腫瘤細胞)的質膜上，或者，可以回應於細胞微環境(例如腫瘤細胞微環境)中的蛋白水解活性後在細胞內釋放。從而，該分離的抗原結合蛋白可以被細胞膜吞沒，並吸入該細胞中。在某些實施方式中，該免疫綴合物中的該分離的抗原結合蛋白，和/或與之綴合的該其他試劑，也可以在該分離的抗原結合蛋白結合到細胞的質膜上後，被細胞膜吞沒，並吸入該細胞中。
在本申請中，該AXL蛋白可以為人AXL蛋白(NP_068713)；也可以為食蟹猴AXL蛋白(Genbank登錄號HB387229.1)。例如，該AXL蛋白可以為人AXL蛋白，其胺基酸序列如SEQ ID NO：39所示。
該AXL蛋白可以包括AXL蛋白的變體。例如，該變體可以為：1)在該AXL蛋白的胺基酸序列中經過取代、缺失或添加一個或多個胺基酸的蛋白質或多肽；和2)與該AXL蛋白具有至少約85%(例如，具有至少約85%、約90%、約91%、約92%、約93%、約94%、約95%、約96%、約97%、約98%、約99%或更高的)序列同源性的蛋白質或多肽。
該AXL蛋白還可以包括AXL蛋白的片段。例如，該AXL蛋白可以為人AXL蛋白的細胞外結構域，其胺基酸序列如SEQ ID NO：40所示。
在本申請中，該細胞可以包括腫瘤細胞。例如，該腫瘤可以為AXL陽性腫瘤。例如，該腫瘤可以選自下組：肺癌、皮膚癌、腎癌、胰腺癌、血液腫瘤、乳腺癌、卵巢癌、淋巴瘤和骨髓瘤。又例如，該腫瘤選自下組：非 小細胞肺癌、皮膚鱗癌、腎透明細胞腺癌、胰腺癌、紅白血病、急性T細胞白血病、乳腺癌、卵巢癌、淋巴瘤和骨髓瘤。
在本申請中，該細胞可以包括人的細胞。例如，該細胞可以包括選自下組的細胞：人非小細胞肺癌A549細胞、人皮膚鱗癌A431細胞、腎透明細胞腺癌786-O細胞、人胰腺癌MIA PaCa-2細胞、紅白血病K562細胞、急性T細胞白血病Jurkat細胞、人乳腺癌MCF-7細胞、人乳腺癌MDA-MB-231細胞、人乳腺癌MDA-MB-468細胞、人乳腺癌SKBR3細胞、人卵巢癌SKOV3細胞、淋巴瘤U-937細胞、淋巴瘤Raji細胞、人骨髓瘤U266細胞和人多發性骨髓瘤RPMI8226細胞。
該分離的抗原結合蛋白的種類
在本申請中，該分離的抗原結合蛋白可以包括抗體或其抗原結合片段。例如，本申請該的分離的抗原結合蛋白可以包括但不限於重組抗體、單株抗體、人抗體、鼠源抗體、人源化抗體、嵌合抗體、雙特異性抗體、單鏈抗體、雙抗體、三抗體、四抗體、Fv片段、scFv片段、Fab片段、Fab'片段、F(ab')2片段和駱駝化單結構域抗體。
在本申請中，該抗體可以為人源化抗體。換句話說，本申請該的分離的抗原結合蛋白，其可以為免疫特異性結合至相關抗原(例如人類AXL)且包含基本上具有人類抗體的胺基酸序列的框架(FR)區及基本上具有非人類抗體的胺基酸序列的互補決定區(CDR)的抗體或其變異體、衍生物、類似物或片段。此處的“基本上”在CDR的情況下是指CDR的胺基酸序列與非人類抗體CDR的胺基酸序列至少80%、較佳至少85%、至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一。該人源化抗體基本上可以包含所有至少一個且通常兩個可變域(Fab、Fab′、F(ab′)2、FabC、Fv)，其中所有或基本上所有 CDR區對應於非人類免疫球蛋白(即抗體)的CDR區且所有或基本上所有框架區為具有人類免疫球蛋白共有序列的框架區。較佳地，人源化抗體還包含至少一部分免疫球蛋白恆定區(例如，Fc)，通常為人類免疫球蛋白的恆定區。在一些實施例中，人源化抗體含有輕鏈以及重鏈的至少可變域。抗體還可包括重鏈的CH1、鉸鏈、CH2、CH3及CH4區。在一些實施例中，人源化抗體僅含人源化輕鏈。在一些實施例中，人源化抗體僅含人源化重鏈。在特定實施例中，人源化抗體僅含輕鏈和/或人源化重鏈的人源化可變域。
在本申請中，該抗原結合片段可以包括Fab，Fab’，F(ab)2、Fv片段、F(ab’)2，scFv，di-scFv和/或dAb。
CDR
抗體的CDR又稱互補決定區，是可變區的一部分。該區域的胺基酸殘基與抗原或抗原表位接觸。抗體CDR可以藉由多種編碼系統來確定，如CCG、Kabat、Chothia、IMGT、綜合考慮Kabat/Chothia等。這些編碼系統為領域內已知，具體可參見http：//www.bioinf.org.uk/abs/index.html#kabatnum。本領域技術人員可以根據抗體的序列和結構，用不同的編碼系統確定出CDR區。使用不同的編碼系統，CDR區可能存在差別。本申請該的分離的抗原結合蛋白的CDR可以使用Kabat確定出來。
在本申請中，該分離的抗原結合蛋白的該VH可以包含HCDR1、HCDR2和HCDR3。
在本申請中，該HCDR1可以包含SEQ ID NO：25所示的胺基酸序列。
在本申請中，該HCDR2可以包含SEQ ID NO：26、44和45所示的胺基酸序列。
在本申請中，該HCDR3可以包含SEQ ID NO：27所示的胺基酸序列。
例如，該分離的抗原結合蛋白的HCDR1可包含SEQ ID NO：25所示的胺基酸序列，HCDR2可包含SEQ ID NO：26所示的胺基酸序列，HCDR3可包含SEQ ID NO：27所示的胺基酸序列。
例如，該分離的抗原結合蛋白的HCDR1可包含SEQ ID NO：25所示的胺基酸序列，HCDR2可包含SEQ ID NO：44所示的胺基酸序列，HCDR3可包含SEQ ID NO：27所示的胺基酸序列。
該分離的抗原結合蛋白的HCDR1可包含SEQ ID NO：25所示的胺基酸序列，HCDR2可包含SEQ ID NO：45所示的胺基酸序列，HCDR3可包含SEQ ID NO：27所示的胺基酸序列。
在本申請中，該LCDR1可以包含SEQ ID NO：28所示的胺基酸序列。
在本申請中，該LCDR2可以包含SEQ ID NO：29所示的胺基酸序列。
在本申請中，該LCDR3可以包含SEQ ID NO：30所示的胺基酸序列。
例如，該分離的抗原結合蛋白的LCDR1可包含SEQ ID NO：28所示的胺基酸序列，LCDR2可包含SEQ ID NO：29所示的胺基酸序列，LCDR3可包含SEQ ID NO：30所示的胺基酸序列。
又例如，該分離的抗原結合蛋白的HCDR1可包含SEQ ID NO：25所示的胺基酸序列，HCDR2可包含SEQ ID NO：26所示的胺基酸序列，HCDR3可包含SEQ ID NO：27所示的胺基酸序列，且LCDR1可包含SEQ ID NO：28所示的胺基酸序列，LCDR2可包含SEQ ID NO：29所示的胺基酸序列，LCDR3可包含SEQ ID NO：30所示的胺基酸序列。
又例如，該分離的抗原結合蛋白的HCDR1可包含SEQ ID NO：25所示的胺基酸序列，HCDR2可包含SEQ ID NO：44所示的胺基酸序列，HCDR3可包含SEQ ID NO：27所示的胺基酸序列，且LCDR1可包含SEQ ID NO：28所示的胺基酸序列，LCDR2可包含SEQ ID NO：29所示的胺基酸序列，LCDR3可包含SEQ ID NO：30所示的胺基酸序列。
又例如，該分離的抗原結合蛋白的HCDR1可包含SEQ ID NO：25所示的胺基酸序列，HCDR2可包含SEQ ID NO：45所示的胺基酸序列，HCDR3可包含SEQ ID NO：27所示的胺基酸序列，且LCDR1可包含SEQ ID NO：28所示的胺基酸序列，LCDR2可包含SEQ ID NO：29所示的胺基酸序列，LCDR3可包含SEQ ID NO：30所示的胺基酸序列。
FR
在本申請中，該分離的抗原結合蛋白的該VH可以包含框架區H-FR1，H-FR2，H-FR3，和H-FR4。
在本申請中，該H-FR1的C末端可以與該HCDR1的N末端直接或間接相連，且該H-FR1可以包含SEQ ID NO：7所示的胺基酸序列。
QVQL X1 QSGPGLVKPSQSLSLTC X2 V X3 G X4 SIS(SEQ ID NO：7)，其中，X1可以是K或V，X2可以是S或A，X3可以是T或S，X4可以是F、Y、D或S。
例如，在本申請中，該H-FR1可以包含SEQ ID NO：11和15中任一項所示的胺基酸序列。
在本申請中，該H-FR2可以位於該HCDR1與該HCDR2之間，且該H-FR2可以包含SEQ ID NO：8所示的胺基酸序列。
WIRQ X1 PG X2 X3 LEWMG(SEQ ID NO：8)，其中，X1可以是F或S，X2可以是N或Q，X3可以是K或G。
例如，在本申請中，該H-FR2可以包含SEQ ID NO：12所示的胺基酸序列。
在本申請中，該H-FR3可以位於該HCDR2與該HCDR3之間，且該H-FR3可以包含SEQ ID NO：9所示的胺基酸序列。
RISITRDTSKNQFFLKLNSVT X1 EDTATYYCAR(SEQ ID NO：9)，其中，X1可以是T或S。
例如，在本申請中，該H-FR3可以包含SEQ ID NO：13所示的胺基酸序列。
在本申請中，該H-FR4的N末端可以與該HCDR3的C末端相連，且該H-FR4可以包含SEQ ID NO：10所示的胺基酸序列。
WGQGT X1 VTVSS(SEQ ID NO：10)，其中，X1可以是S或T。
例如，在本申請中，該H-FR4可以包含SEQ ID NO：14所示的胺基酸序列。
又例如，該分離的抗原結合蛋白的H-FR1可包含SEQ ID NO：11所示的胺基酸序列，H-FR2可包含SEQ ID NO：12所示的胺基酸序列，H-FR3可包含SEQ ID NO：13所示的胺基酸序列，H-FR4可包含SEQ ID NO：14所示的胺基酸序列。
再例如，該分離的抗原結合蛋白的H-FR1可包含SEQ ID NO：15所示的胺基酸序列，H-FR2可包含SEQ ID NO：12所示的胺基酸序列，H-FR3 可包含SEQ ID NO：13所示的胺基酸序列，H-FR4可包含SEQ ID NO：14所示的胺基酸序列。
在本申請中，該分離的抗原結合蛋白的VL可以包含框架區L-FR1，L-FR2，L-FR3，和L-FR4。
在本申請中，該L-FR1的C末端可以與該LCDR1的N末端直接或間接相連，且該L-FR1可以包含SEQ ID NO：16所示的胺基酸序列。
X1 X2 VMTQSP X3 S X4 X5 VTLG X6 SASISC(SEQ ID NO：16)，其中，X1可以是E或D，X2可以是L或I，X3可以是F或S，X4可以是N或V，X5可以是A或S，X6可以是T或Q。
例如，在本申請中，該L-FR1可以包含SEQ ID NO：20和24中任一項所示的胺基酸序列。
在本申請中，該L-FR2可以位於該LCDR1與該LCDR2之間，且該L-FR2可以包含SEQ ID NO：17所示的胺基酸序列。
WY X1 QKPGQSPQLLIY(SEQ ID NO：17)，其中，X1可以是L或Q。
例如，在本申請中，該L-FR2可以包含SEQ ID NO：21所示的胺基酸序列。
在本申請中，該L-FR3可以位於該LCDR2與該LCDR3之間，且該L-FR3可以包含SEQ ID NO：18所示的胺基酸序列。
GVPDRFS X1 SGSGTDFTL X2 ISRVEAEDVGVYYC(SEQ ID NO：18)，其中，X1可以是S或G，X2可以是R或K。
例如，在本申請中，該L-FR3可以包含SEQ ID NO：22所示的胺基酸序列。
在本申請中，該L-FR4的N末端可以與該LCDR3的C末端相連，且該L-FR4可以包含SEQ ID NO：19所示的胺基酸序列。
FG X1 GTKLE X2 K(SEQ ID NO：19)，其中，X1可以是A或G，X2可以是L或I。
例如，在本申請中，該L-FR4可以包含SEQ ID NO：23所示的胺基酸序列。
又例如，該分離的抗原結合蛋白的L-FR1可包含SEQ ID NO：20所示的胺基酸序列，L-FR2可包含SEQ ID NO：21所示的胺基酸序列，L-FR3可包含SEQ ID NO：22所示的胺基酸序列，L-FR4可包含SEQ ID NO：23所示的胺基酸序列。
又例如，該分離的抗原結合蛋白的L-FR1可包含SEQ ID NO：24所示的胺基酸序列，L-FR2可包含SEQ ID NO：21所示的胺基酸序列，L-FR3可包含SEQ ID NO：22所示的胺基酸序列，L-FR4可包含SEQ ID NO：23所示的胺基酸序列。
再例如，例如，該分離的抗原結合蛋白的H-FR1可包含SEQ ID NO：11所示的胺基酸序列，H-FR2可包含SEQ ID NO：12所示的胺基酸序列，H-FR3可包含SEQ ID NO：13所示的胺基酸序列，H-FR4可包含SEQ ID NO：14所示的胺基酸序列，且L-FR1可包含SEQ ID NO：20所示的胺基酸序列，L-FR2可包含SEQ ID NO：21所示的胺基酸序列，L-FR3可包含SEQ ID NO：22所示的胺基酸序列，L-FR4可包含SEQ ID NO：23所示的胺基酸序列。
再例如，例如，該分離的抗原結合蛋白的H-FR1可包含SEQ ID NO：15所示的胺基酸序列，H-FR2可包含SEQ ID NO：12所示的胺基酸序列，H-FR3可包含SEQ ID NO：13所示的胺基酸序列，H-FR4可包含SEQ ID NO：14所示的胺基酸序列，且L-FR1可包含SEQ ID NO：24所示的胺基酸序列，L- FR2可包含SEQ ID NO：21所示的胺基酸序列，L-FR3可包含SEQ ID NO：22所示的胺基酸序列，L-FR4可包含SEQ ID NO：23所示的胺基酸序列。
VH和VL
該分離的抗原結合蛋白可包含抗體輕鏈可變區VH和抗體重鏈可變區VL。
在本申請中，該VH可包含SEQ ID NO：3、5、42和43中任一項所示的胺基酸序列。
在本申請中，該VL可包含SEQ ID NO：4、6中任一項所示的胺基酸序列。
例如，該VH可包含SEQ ID NO：3所示的胺基酸序列，該VL可包含SEQ ID NO：4所示的胺基酸序列。
又例如，該VH可包含SEQ ID NO：5所示的胺基酸序列，該VL可包含SEQ ID NO：6所示的胺基酸序列。
又例如，該VH可包含SEQ ID NO：42所示的胺基酸序列，該VL可包含SEQ ID NO：6所示的胺基酸序列。
又例如，該VH可包含SEQ ID NO：43所示的胺基酸序列，該VL可包含SEQ ID NO：6所示的胺基酸序列。
恆定區、重鏈和輕鏈
在本申請中，該分離的抗原結合蛋白可以包括抗體重鏈恆定區，且該抗體重鏈恆定區可以源自人IgG重鏈恆定區。
在某些實施方式中，該分離的抗原結合蛋白可以包括抗體重鏈恆定區，且該抗體重鏈恆定區可以源自人IgG1重鏈恆定區。在另一些實施方 式中，該分離的抗原結合蛋白可以包括抗體重鏈恆定區，且該抗體重鏈恆定區可以源自人IgG4重鏈恆定區。
例如，該抗體重鏈恆定區可以包含SEQ ID NO：33、41中任一項所示的胺基酸序列。
在本申請中，該分離的抗原結合蛋白可以包括抗體輕鏈恆定區，且該抗體輕鏈恆定區可以包括人Igκ恆定區。例如，該抗體輕鏈恆定區可以包含SEQ ID NO：34所示的胺基酸序列。
在本申請中，該分離的抗原結合蛋白可以包含抗體重鏈HC，且該HC可以包含SEQ ID NO：35、37中任一項所示的胺基酸序列。
在本申請中，該分離的抗原結合蛋白可以包含抗體輕鏈LC，且該LC可以包含SEQ ID NO：36、38中任一項所示的胺基酸序列。
該分離的抗原結合蛋白可以包含抗體重鏈和抗體輕鏈。
例如，該重鏈可包含SEQ ID NO：35所示的胺基酸序列，該輕鏈可包含SEQ ID NO：36所示的胺基酸序列。
例如，該重鏈可包含SEQ ID NO：37所示的胺基酸序列，該輕鏈可包含SEQ ID NO：38所示的胺基酸序列。
在本申請中，該分離的抗原結合蛋白的重鏈可包含SEQ ID NO：35所示的胺基酸序列，且輕鏈可包含SEQ ID NO：36所示的胺基酸序列。其中，該分離的抗原結合蛋白的HCDR1可包含SEQ ID NO：25所示的胺基酸序列，HCDR2可包含SEQ ID NO：26所示的胺基酸序列，HCDR3可包含SEQ ID NO：27所示的胺基酸序列，且LCDR1可包含SEQ ID NO：28所示的胺基酸序列，LCDR2可包含SEQ ID NO：29所示的胺基酸序列，LCDR3可包含SEQ ID NO：30所示的胺基酸序列。此外，該分離的抗原結合蛋白的H-FR1可包含SEQ ID NO：11所示的胺基酸序列，H-FR2可包含SEQ ID NO：12所示的胺基 酸序列，H-FR3可包含SEQ ID NO：13所示的胺基酸序列，H-FR4可包含SEQ ID NO：14所示的胺基酸序列，且L-FR1可包含SEQ ID NO：20所示的胺基酸序列，L-FR2可包含SEQ ID NO：21所示的胺基酸序列，L-FR3可包含SEQ ID NO：22所示的胺基酸序列，L-FR4可包含SEQ ID NO：23所示的胺基酸序列。此外，該VH可包含SEQ ID NO：3所示的胺基酸序列，且該VL可包含SEQ ID NO：4所示的胺基酸序列。例如，該分離的抗原結合蛋白可以為6G12M11抗體。
在本申請中，該分離的抗原結合蛋白的重鏈可包含SEQ ID NO：37所示的胺基酸序列，且輕鏈可包含SEQ ID NO：38所示的胺基酸序列。其中，該分離的抗原結合蛋白的HCDR1可包含SEQ ID NO：25所示的胺基酸序列，HCDR2可包含SEQ ID NO：26所示的胺基酸序列，HCDR3可包含SEQ ID NO：27所示的胺基酸序列，且LCDR1可包含SEQ ID NO：28所示的胺基酸序列，LCDR2可包含SEQ ID NO：29所示的胺基酸序列，LCDR3可包含SEQ ID NO：30所示的胺基酸序列。此外，該分離的抗原結合蛋白的H-FR1可包含SEQ ID NO：15所示的胺基酸序列，H-FR2可包含SEQ ID NO：12所示的胺基酸序列，H-FR3可包含SEQ ID NO：13所示的胺基酸序列，H-FR4可包含SEQ ID NO：14所示的胺基酸序列，且L-FR1可包含SEQ ID NO：24所示的胺基酸序列，L-FR2可包含SEQ ID NO：21所示的胺基酸序列，L-FR3可包含SEQ ID NO：22所示的胺基酸序列，L-FR4可包含SEQ ID NO：23所示的胺基酸序列。此外，該VH可包含SEQ ID NO：5所示的胺基酸序列，且該VL可包含SEQ ID NO：6所示的胺基酸序列。例如，該分離的抗原結合蛋白可以為6G12M21抗體。
在本申請中，該分離的抗原結合蛋白的HCDR1可包含SEQ ID NO：25所示的胺基酸序列，HCDR2可包含SEQ ID NO：44所示的胺基酸序 列，HCDR3可包含SEQ ID NO：27所示的胺基酸序列，且LCDR1可包含SEQ ID NO：28所示的胺基酸序列，LCDR2可包含SEQ ID NO：29所示的胺基酸序列，LCDR3可包含SEQ ID NO：30所示的胺基酸序列。此外，該分離的抗原結合蛋白的H-FR1可包含SEQ ID NO：15所示的胺基酸序列，H-FR2可包含SEQ ID NO：12所示的胺基酸序列，H-FR3可包含SEQ ID NO：13所示的胺基酸序列，H-FR4可包含SEQ ID NO：14所示的胺基酸序列，且L-FR1可包含SEQ ID NO：24所示的胺基酸序列，L-FR2可包含SEQ ID NO：21所示的胺基酸序列，L-FR3可包含SEQ ID NO：22所示的胺基酸序列，L-FR4可包含SEQ ID NO：23所示的胺基酸序列。此外，該VH可包含SEQ ID NO：42所示的胺基酸序列，且該VL可包含SEQ ID NO：6所示的胺基酸序列。例如，該分離的抗原結合蛋白可以為6G12M31抗體。
在本申請中，該分離的抗原結合蛋白的HCDR1可包含SEQ ID NO：25所示的胺基酸序列，HCDR2可包含SEQ ID NO：45所示的胺基酸序列，HCDR3可包含SEQ ID NO：27所示的胺基酸序列，且LCDR1可包含SEQ ID NO：28所示的胺基酸序列，LCDR2可包含SEQ ID NO：29所示的胺基酸序列，LCDR3可包含SEQ ID NO：30所示的胺基酸序列。此外，該分離的抗原結合蛋白的H-FR1可包含SEQ ID NO：15所示的胺基酸序列，H-FR2可包含SEQ ID NO：12所示的胺基酸序列，H-FR3可包含SEQ ID NO：13所示的胺基酸序列，H-FR4可包含SEQ ID NO：14所示的胺基酸序列，且L-FR1可包含SEQ ID NO：24所示的胺基酸序列，L-FR2可包含SEQ ID NO：21所示的胺基酸序列，L-FR3可包含SEQ ID NO：22所示的胺基酸序列，L-FR4可包含SEQ ID NO：23所示的胺基酸序列。此外，該VH可包含SEQ ID NO：43所示的胺基酸序列，且該VL可包含SEQ ID NO：6所示的胺基酸序列。例如，該分離的抗原結合蛋白可以為6G12M41抗體。
此外，需要說明的是，該分離的抗原結合蛋白可以包含與6G12M11、6G12M21、6G12M31和6G12M41抗體存在一個或多個保守序列修飾的重鏈和/或輕鏈序列。所謂“保守序列修飾”是指不會顯著影響或改變抗體結合特性的胺基酸修飾。這樣的保守修飾包括胺基酸替換、添加和刪除。可以藉由領域內已知的標準技術，例如點突變和PCR介導的突變，將修飾引入本申請該分離的抗原結合蛋白中。保守胺基酸替換是胺基酸殘基用具有相似側鏈的胺基酸殘基進行替換。具有相似側鏈的胺基酸殘基組在領域內已知。這些胺基酸殘基組包括具有鹼性側鏈(例如，賴胺酸、精胺酸、組胺酸)、酸性側鏈(例如，天冬胺酸、谷胺酸)、不帶電極性側鏈(例如，甘胺酸、天冬醯胺、穀胺醯胺、絲胺酸、蘇胺酸、酪胺酸、半胱胺酸、色胺酸)、非極性側鏈(例如，丙胺酸、纈胺酸、亮胺酸、異亮胺酸、脯胺酸、苯丙胺酸、甲硫胺酸)、β-支鏈側鏈(例如，蘇胺酸、纈胺酸、異亮胺酸)和芳香族側鏈(例如，酪胺酸、苯丙胺酸、色胺酸、組胺酸)的胺基酸。在某些實施方式中，該分離的抗原結合蛋白的CDR區中的一個或多個胺基酸殘基可以用同側鏈組的其他胺基酸殘基替換。本領域內的技術人員知道，一些保守序列修改不會使抗原結合性消失，具體可以參見，例如，Brummell et al.,(1993)Biochem 32：1180-8；de Wildt et al.,(1997)Prot.Eng.10：835-41；Komissarov et al.,(1997)J.Biol.Chem.272：26864-26870；Hall et al.,(1992)J.Immunol.149：1605-12；Kelley and O'Connell(1993)Biochem.32：6862-35；Adib-Conquy et al.,(1998)Int.Immunol.10：341-6 and Beers et al.,(2000)Clin.Can.Res.6：2835-43。
在本申請中涉及的蛋白質、多肽和/或胺基酸序列，還應理解為至少包含以下的範圍：與該蛋白質或多肽具備相同或類似功能的變體或同源物。
在本申請中，該變體可以為，在該蛋白質和/或該多肽(例如，本申請該分離的抗原結合蛋白)的胺基酸序列中經過取代、缺失或添加一個或 多個胺基酸的蛋白質或多肽。例如，該變體可包含已經藉由至少1個，例如1-30個、1-20個或1-10個，又例如1個、2個、3個、4個或5個胺基酸取代、缺失和/或插入而具有胺基酸改變的蛋白質或多肽。該功能性變體可基本上保持改變(例如取代、缺失或添加)之前的該蛋白質或該多肽的生物學特性。例如，該功能性變體可保持改變之前的該蛋白質或該多肽的至少60%，70%，80%，90%，或100%的生物學活性(例如特異性結合AXL蛋白的能力)。
在本申請中，該同源物可以為，與該蛋白質和/或該多肽(例如，本申請該抗體或其抗原結合片段)的胺基酸序列具有至少約80%(例如，具有至少約85%、約90%、約91%、約92%、約93%、約94%、約95%、約96%、約97%、約98%、約99%或更高的)序列同源性的蛋白質或多肽。
在本申請中，該同源性通常是指兩個或多個序列之間的相似性或關聯的程度。可以藉由以下方式計算“序列同源性百分比”：將兩條待比對的序列在比較窗中進行比較，確定兩條序列中存在相同核酸鹼基(例如，A、T、C、G、I)或相同胺基酸殘基(例如，Ala、Pro、Ser、Thr、Gly、Val、Leu、Ile、Phe、Tyr、Trp、Lys、Arg、His、Asp、Glu、Asn、Gln、Cys和Met)的位置的數目以得到匹配位置的數目，將匹配位置的數目除以比較窗中的總位置數(即，窗大小)，並且將結果乘以100，以產生序列同源性百分比。為了確定序列同源性百分數而進行的比對，可以按本領域已知的多種方式實現，例如，使用可公開獲得的電腦軟體如BLAST、BLAST-2、ALIGN或Megalign(DNASTAR)軟體。本領域技術人員可以確定用於比對序列的適宜參數，包括為實現正在比較的全長序列範圍內或目標序列區域內最大比對所需要的任何演算法。該同源性也可以藉由以下的方法測定：FASTA和BLAST。對FASTA演算法的描述可以參見W．R．Pearson和D．J．Lipman的“用於生物學序列比較的改進的工具”，美國國家科學院院刊(Proc．Natl．Acad． Sci．)，85：2444-2448，1988；和D．J．Lipman和W．R．Pearson的“快速靈敏的蛋白質相似性搜索”，Science，227：1435-1441，1989。對BLAST演算法的描述可參見S．Altschul、W．Gish、W．Miller、E．W．Myers和D．Lipman的“一種基本的局部對比(alignment)搜索工具”，分子生物學雜誌，215：403-410，1990。
免疫綴合物、核酸分子、載體、細胞和醫藥組成物
免疫綴合物
另一方面，本申請提供了一種免疫綴合物，其包含該分離的抗原結合蛋白。
例如，該免疫綴合物可以包含選自下組的至少一種其他試劑：化療劑、放射性元素、細胞生長抑制劑和細胞毒性劑。在某些實施方式中，該免疫綴合物中該分離的抗原結合蛋白與該至少一種其他試劑可以藉由連接分子相連。例如，該免疫綴合物中該分離的抗原結合蛋白及該至少一種其他試劑可以分別與該連接分子共價相連。
在本申請中，該其他試劑可以包括美登素(maytansine)或其衍生物。例如，該美登素衍生物可以包括美登素衍生物DM1。
核酸分子
另一方面，本申請還提供了分離的一種或多種核酸分子，其可以編碼該分離的抗原結合蛋白。該分離的一種或多種核酸分子可以為任何長度的分離形式的核苷酸，去氧核糖核苷酸或核糖核苷酸，或從其天然環境分離的或人工合成的類似物，但可以編碼該分離的抗原結合蛋白。
載體
另一方面，本申請還提供了載體，其可以包含該核酸分子。該載體可藉由轉化、轉導或轉染宿主細胞，使其攜帶的遺傳物質元件在宿主細胞內表達得以表達。例如，載體可以包括：質粒；噬菌粒；柯斯質粒；人工染色體如酵母人工染色體(YAC)、細菌人工染色體(BAC)或P1來源的人工染色體(PAC)；噬菌體如λ噬菌體或M13噬菌體及動物病毒等。用作載體的動物病毒種類有逆轉錄酶病毒(包括慢病毒)、腺病毒、腺相關病毒、皰疹病毒(如單純皰疹病毒)、痘病毒、杆狀病毒、乳頭瘤病毒、乳頭多瘤空泡病毒(如SV40)。又例如，該載體可以含有多種控制表達的元件，包括啟動子序列、轉錄起始序列、增強子序列、選擇元件及報告基因。另外，該載體還可以含有複製起始位點。此外，該載體還可以包括有協助其進入細胞的成分，如病毒顆粒、脂質體或蛋白外殼，但不僅僅只有這些物質。
細胞
另一方面，本申請還提供了細胞，其可以包含該核酸分子或該載體。該細胞可以包括單個細胞的後代。由於天然、偶然或有意的突變，後代可以不一定與原始母細胞完全相同(在總DNA互補體的形態上或在基因組上)。在某些實施方式中，該細胞還可以包括用本發明的載體在體外轉染的細胞。在某些實施方式中，該細胞可以是細菌細胞(例如，大腸桿菌)、酵母細胞或其它真核細胞，例如COS細胞、中國倉鼠卵巢(CHO)細胞、CHO-K1細胞、LNCAP細胞、HeLa細胞、HEK293細胞、COS-1細胞、NS0細胞、骨髓瘤細胞、人非小細胞肺癌A549細胞、人皮膚鱗癌A431細胞、腎透明細胞腺癌786-O細胞、人胰腺癌MIA PaCa-2細胞、紅白血病K562細胞、急性T細胞白血病Jurkat細胞、人乳腺癌MCF-7細胞、人乳腺癌MDA-MB-231細胞、人乳腺癌MDA-MB-468細胞、人乳腺癌SKBR3細胞、人卵巢癌SKOV3細胞、淋巴瘤U-937細胞、淋巴瘤Raji細胞、人骨髓瘤U266細胞或人多發性骨髓瘤 RPMI8226細胞。在某些實施方案中，該細胞可以為哺乳動物細胞。在某些實施方案中，該哺乳動物細胞可以為HEK293細胞。
醫藥組成物
另一方面，本申請還提供了醫藥組成物，其可以包含該分離的抗原結合蛋白、該免疫綴合物、該核酸分子、該載體和/或該細胞，以及視需要地藥學上可接受的佐劑。
在某些實施方案中，該醫藥組成物還可以包含一種或多種(藥學上有效的)載劑、穩定劑、賦形劑、稀釋劑、增溶劑、表面活性劑、乳化劑和/或防腐劑的合適的製劑。組成物的可接受成分在所用劑量和濃度下較佳地對接受者無毒。本發明的醫藥組成物包括但不限於液體、冷凍和凍幹組成物。
在某些實施方案中，該藥學上可接受的佐劑可以包括與藥物給藥相容的任何和所有的溶劑、分散介質、包衣、等滲劑和吸收延遲劑，通常安全、無毒，且既不是生物學上也非其它方面不合需要的。
在某些實施方案中，該醫藥組成物可以包含腸胃外、經皮、腔內、動脈內、鞘內和/或鼻內施用或直接注射到組織中。例如，該醫藥組成物可以藉由輸注或注射施用于患者或者受試者。在某些實施方案中，該醫藥組成物的施用可以藉由不同的方式進行，例如靜脈內、腹膜內、皮下、肌肉內、局部或真皮內施用。在某些實施方案中，該醫藥組成物可以不間斷施用。該不間斷(或連續)施用可以藉由患者佩戴的小泵系統來實現，以測量流入患者體內的治療劑，如WO2015/036583所述。
該醫藥組成物的給藥方案可以是施用快速灌注劑，可以隨時間推移施用多個分劑量，或者劑量可以隨治療情況的危急程度成比例降低或提高。在某些實施方式中，治療方案可以是每週施用一次、兩週一次、三週一次、四週一次、一個月一次、3個月一次、或3-6個月一次。在某些實施方式 中，給藥方案包括靜脈內施用，1mg/kg體重或3mg/kg體重，抗體以下述給藥時間表中的一個進行給藥：(i)每四週給藥六次，然後每三個月一次；(ii)每三週一次；(iii)3mg/kg體重一次，之後1mg/kg體重每三週一次。在某些實施方式中，劑量調整成實現約1-1000μg/ml的血藥濃度，例如可以為約25-300μg/ml。
製備方法和用途
製備方法
另一方面，本申請還提供了製備該分離的抗原結合蛋白的方法，該方法可以包括在使得該分離的抗原結合蛋白表達的條件下，培養該細胞。
用途
另一方面，本申請還提供了該分離的抗原結合蛋白、該免疫綴合物、該核酸分子、該載體、該細胞和/或該醫藥組成物在製備藥物中的用途，該藥物用於預防、緩解和/或治療腫瘤。
另一方面，本申請還提供了預防、緩解或治療腫瘤的方法，該方法可以包括向有需要的受試者施用該分離的抗原結合蛋白、該免疫綴合物、該核酸分子、該載體、該細胞和/或該醫藥組成物。在本申請中，該施用可以藉由不同的方式進行，例如靜脈內、瘤內、腹膜內、皮下、肌肉內、局部或真皮內施用。
另一方面，該分離的抗原結合蛋白、該免疫綴合物、該核酸分子、該載體、該細胞和/或該醫藥組成物，其可以用於預防、緩解或治療腫瘤。
在本申請中，該腫瘤可以是實體瘤或血液瘤。
在本申請中，該腫瘤可以包括AXL陽性的腫瘤。例如，該AXL陽性的腫瘤可以選自：肺癌、皮膚癌、腎癌、胰腺癌、血液腫瘤、乳腺癌、卵巢癌、淋巴瘤和骨髓瘤。又例如，該AXL陽性的腫瘤可以選自：非小細胞肺癌、 皮膚鱗癌、腎透明細胞腺癌、胰腺癌、紅白血病、急性T細胞白血病、乳腺癌、卵巢癌、淋巴瘤和骨髓瘤。
在本申請中，該受試者可以包括人類和非人類動物。例如，該受試者可以包括但不限於貓、狗、馬、豬、奶牛、羊、兔、小鼠、大鼠或猴。
在本申請中，該分離的抗原結合蛋白可以與一種或多種其他抗體一起施用，以便有效抑制受試者中的腫瘤生長。在某些實施方式中，可以向受試者施用該分離的抗原結合蛋白以及一種或多種其他抗體，例如LAG-3抗體、PD-1抗體和/或CTLA-4抗體。
在本申請中，該分離的抗原結合蛋白可以與化療劑一起施用，該化療劑可以是細胞毒性劑，例如，SN-38、表阿黴素、奧沙利鉑、和/或5-FU。
另一方面，本申請提供了根據該分離的抗原結合蛋白，其用於診斷與AXL蛋白的表達相關的疾病或病況。
另一方面，本申請提供了根據該抗體或其抗原結合片段用於製備診斷劑的用途，其中該診斷劑用於診斷與AXL蛋白的表達相關的疾病或病況。
在本申請中，該診斷劑可以單獨使用或者可以與儀器、器具、設備或系統組合使用。在疾病的預防、診斷、治療監測、預後觀察、健康狀態評價以及遺傳性疾病的預測過程中，可以使用該診斷劑對人體樣本(例如，各種體液、細胞、組織樣本等)進行體外檢測。該診斷劑可以選自以下組：試劑、試劑盒、校準品和質控品。
該體外檢測的方法可以選自以下組：Western Blot、ELISA和免疫組化法。例如，該試劑可以包括能夠測量該AXL蛋白表達量的試劑。例如，該試劑可以選自以下組：用以實施Western Blot的試劑、用以實施ELISA的試劑和用以實施免疫組化法的試劑。
另一方面，本申請提供了一種診斷受試者中與AXL蛋白的表達相關的疾病或病況的方法，該方法包括：使源自該受試者的樣品與該分離的抗原結合蛋白接觸，以及判斷該樣品中能夠特異性結合該分離的抗原結合蛋白的物質的存在和/或含量。
另一方面，本申請提供了一種檢測樣品中AXL的方法，該方法包括施用該分離的抗原結合蛋白。在本申請中，該施用可以藉由不同的方式進行，例如靜脈內、瘤內、腹膜內、皮下、肌肉內、局部或真皮內施用。
在本申請中，該與AXL蛋白的表達相關的疾病或病況可以選自以下組：肺癌、皮膚癌、腎癌、胰腺癌、血液腫瘤、乳腺癌、卵巢癌、淋巴瘤和骨髓瘤，或者，可以選自以下組：非小細胞肺癌、皮膚鱗癌、腎透明細胞腺癌、胰腺癌、紅白血病、急性T細胞白血病、乳腺癌、卵巢癌、淋巴瘤和骨髓瘤。
此外，本申請還可以包括以下的實施方式：
分離的抗原結合蛋白，其包含胺基酸序列SEQ ID NO：1或SEQ ID NO：46所示的VH中的至少一個CDR；且包含胺基酸序列SEQ ID NO：2所示的VL中的至少一個CDR。
根據實施方式1所述的分離的抗原結合蛋白，其具有下述性質中的一種或多種：
1)能夠以1×10-7M或更低的KD與AXL蛋白相結合；
2)能夠特異性識別在細胞表面表達的AXL蛋白；
3)結合在細胞表面表達的AXL蛋白後能夠介導內化。
根據實施方式2所述的分離的抗原結合蛋白，該AXL蛋白包括人AXL蛋白。
根據實施方式3所述的分離的抗原結合蛋白，該人AXL蛋白包含SEQ ID NO：39所示的胺基酸序列。
根據實施方式2-4中任一項所述的分離的抗原結合蛋白，該AXL蛋白包含細胞外結構域。
根據實施方式5所述的分離的抗原結合蛋白，該細胞外結構域包含SEQ ID NO：40所示的胺基酸序列。
根據實施方式2所述的分離的抗原結合蛋白，該細胞包括腫瘤細胞。
根據實施方式7所述的分離的抗原結合蛋白，該腫瘤包括AXL陽性腫瘤。
根據實施方式8所述的分離的抗原結合蛋白，該腫瘤選自下組：肺癌、皮膚癌、腎癌、胰腺癌、血液腫瘤、乳腺癌、卵巢癌、淋巴瘤和骨髓瘤。
根據實施方式9所述的分離的抗原結合蛋白，該腫瘤選自下組：非小細胞肺癌、皮膚鱗癌、腎透明細胞腺癌、胰腺癌、紅白血病、急性T細胞白血病、乳腺癌、卵巢癌、淋巴瘤和骨髓瘤。
根據實施方式2所述的分離的抗原結合蛋白，該細胞包括人的細胞。
根據實施方式7或11所述的分離的抗原結合蛋白，該細胞選自下組：人非小細胞肺癌A549細胞、人皮膚鱗癌A431細胞、腎透明細胞腺癌786-O細胞、人胰腺癌MIA PaCa-2細胞、紅白血病K562細胞、急性T細胞白血病Jurkat細胞、人乳腺癌MCF-7細胞、人乳腺癌MDA-MB-231細胞、人乳腺癌MDA-MB-468細胞、人乳腺癌SKBR3細胞、人卵巢癌SKOV3細胞、淋巴瘤U-937細胞、淋巴瘤Raji細胞、人骨髓瘤U266細胞和人多發性骨髓瘤RPMI8226細胞。
根據實施方式1所述的分離的抗原結合蛋白，該VH包含HCDR1、HCDR2和HCDR3。
根據實施方式13所述的分離的抗原結合蛋白，該HCDR1包含SEQ ID NO：25所示的胺基酸序列。
根據實施方式13所述的分離的抗原結合蛋白，該HCDR2包含SEQ ID NO：26、44和45中任一項所示的胺基酸序列。
根據實施方式13所述的分離的抗原結合蛋白，該HCDR3包含SEQ ID NO：27所示的胺基酸序列。
根據實施方式1所述的分離的抗原結合蛋白，該VL包含LCDR1、LCDR2和LCDR3。
根據實施方式17所述的分離的抗原結合蛋白，該LCDR1包含SEQ ID NO：28所示的胺基酸序列。
根據實施方式17所述的分離的抗原結合蛋白，該LCDR2包含SEQ ID NO：29所示的胺基酸序列。
根據實施方式17所述的分離的抗原結合蛋白，該LCDR3包含SEQ ID NO：30所示的胺基酸序列。
根據實施方式1或13所述的分離的抗原結合蛋白，該VH包含框架區H-FR1，H-FR2，H-FR3，和H-FR4。
根據實施方式21所述的分離的抗原結合蛋白，該H-FR1的C末端與該HCDR1的N末端直接或間接相連，且該H-FR1包含SEQ ID NO：7所示的胺基酸序列。
根據實施方式22所述的分離的抗原結合蛋白，該H-FR1包含SEQ ID NO：11和15中任一項所示的胺基酸序列。
根據實施方式21所述的分離的抗原結合蛋白，該H-FR2位於該HCDR1與該HCDR2之間，且該H-FR2包含SEQ ID NO：8所示的胺基酸序列。
根據實施方式24所述的分離的抗原結合蛋白，該H-FR2包含SEQ ID NO：12所示的胺基酸序列。
根據實施方式21所述的分離的抗原結合蛋白，該H-FR3位於該HCDR2與該HCDR3之間，且該H-FR3包含SEQ ID NO：9所示的胺基酸序列。
根據實施方式26所述的分離的抗原結合蛋白，該H-FR3包含SEQ ID NO：13所示的胺基酸序列。
根據實施方式21所述的分離的抗原結合蛋白，該H-FR4的N末端與該HCDR3的C末端相連，且該H-FR4包含SEQ ID NO：10所示的胺基酸序列。
根據實施方式28所述的分離的抗原結合蛋白，該H-FR4包含SEQ ID NO：14所示的胺基酸序列。
根據實施方式1、13-16和22-29中任一項所述的分離的抗原結合蛋白，該VH包含SEQ ID NO：3、5、42和43中任一項所示的胺基酸序列。
根據實施方式1或17所述的分離的抗原結合蛋白，該VL包含框架區L-FR1，L-FR2，L-FR3，和L-FR4。
根據實施方式31所述的分離的抗原結合蛋白，該L-FR1的C末端與該LCDR1的N末端直接或間接相連，且該L-FR1包含SEQ ID NO：16所示的胺基酸序列。
根據實施方式32所述的分離的抗原結合蛋白，該L-FR1包含SEQ ID NO：20和24中任一項所示的胺基酸序列。
根據實施方式31所述的分離的抗原結合蛋白，該L-FR2位於該LCDR1與該LCDR2之間，且該L-FR2包含SEQ ID NO：17所示的胺基酸序列。
根據實施方式34所述的分離的抗原結合蛋白，該L-FR2包含SEQ ID NO：21所示的胺基酸序列。
根據實施方式31所述的分離的抗原結合蛋白，該L-FR3位於該LCDR2與該LCDR3之間，且該L-FR3包含SEQ ID NO：18所示的胺基酸序列。
根據實施方式36所述的分離的抗原結合蛋白，該L-FR3包含SEQ ID NO：22所示的胺基酸序列。
根據實施方式31所述的分離的抗原結合蛋白，該L-FR4的N末端與該LCDR3的C末端相連，且該L-FR4包含SEQ ID NO：19所示的胺基酸序列。
根據實施方式38所述的分離的抗原結合蛋白，該L-FR4包含SEQ ID NO：23所示的胺基酸序列。
根據實施方式1、17-20和32-39中任一項所述的分離的抗原結合蛋白，該VL包含SEQ ID NO：4、6中任一項所示的胺基酸序列。
根據實施方式1-4、6-11、13-20、22-29和32-39中任一項所述的分離的抗原結合蛋白，其包含抗體重鏈恆定區，且該抗體重鏈恆定區源自人IgG重鏈恆定區。
根據實施方式41所述的分離的抗原結合蛋白，該抗體重鏈恆定區源自人IgG1重鏈恆定區或人IgG4重鏈恆定區。
根據實施方式42所述的分離的抗原結合蛋白，該抗體重鏈恆定區包含SEQ ID NO：33、41中任一項所示的胺基酸序列。
根據實施方式1-4、6-11、13-20、22-29、32-39和42-43中任一項所述的分離的抗原結合蛋白，其包含抗體輕鏈恆定區，且該抗體輕鏈恆定區包含人Igκ恆定區。
根據實施方式44所述的分離的抗原結合蛋白，該抗體輕鏈恆定區包含SEQ ID NO：34所示的胺基酸序列。
根據實施方式1-4、6-11、13-20、22-29、32-39、42-43和45中任一項所述的分離的抗原結合蛋白，其包含抗體重鏈，且該抗體重鏈包含SEQ ID NO：35和37中任一項所示的胺基酸序列。
根據實施方式1-4、6-11、13-20、22-29、32-39、42-43和45中任一項所述的分離的抗原結合蛋白，其包含抗體輕鏈，且該抗體輕鏈包含SEQ ID NO：36和38中任一項所示的胺基酸序列。
根據實施方式1-4、6-11、13-20、22-29、32-39、42-43和45中任一項所述的分離的抗原結合蛋白，其包括抗體或其抗原結合片段。
根據實施方式48所述的分離的抗原結合蛋白，該抗體選自下組：單株抗體、單鏈抗體、嵌合抗體、多特異性抗體、人源化抗體和全人源抗體。
根據實施方式48所述的分離的抗原結合蛋白，該抗原結合片段選自下組：Fab、Fab’、F(ab)2、Fv、F(ab’)2、scFv、di-scFv和dAb片段。
免疫綴合物，其包含實施方式1-50中任一項所述的分離的抗原結合蛋白。
根據實施方式51所述的免疫綴合物，其還包含選自下組的至少一種其他試劑：化療劑、放射性元素、細胞生長抑制劑和細胞毒性劑。
根據實施方式52所述的免疫綴合物，該分離的抗原結合蛋白與該其他試劑藉由連接分子相連。
根據實施方式53所述的免疫綴合物，該分離的抗原結合蛋白及該其他試劑分別與該連接分子共價相連。
根據實施方式52-54中任一項所述的免疫綴合物，該其他試劑包括美登素或其衍生物。
根據實施方式55所述的免疫綴合物，該美登素衍生物包括美登素衍生物DM1。
分離的一種或多種核酸分子，其編碼實施方式1-50中任一項所述的分離的抗原結合蛋白。
載體，其包含實施方式57所述的核酸分子。
細胞，其包含實施方式57所述的核酸分子或實施方式58所述的載體。
醫藥組成物，其包含實施方式1-50中任一項所述的分離的抗原結合蛋白、實施方式51-56中任一項所述的免疫綴合物、實施方式57所述的核酸分子、實施方式58所述的載體和/或實施方式59所述的細胞，以及視需要地藥學上可接受的佐劑。
製備實施方式1-50中任一項所述的分離的抗原結合蛋白的方法，該方法包括在使得實施方式1-50中任一項所述的分離的抗原結合蛋白表達的條件下，培養實施方式59所述的細胞。
實施方式1-50中任一項所述的分離的抗原結合蛋白、實施方式51-56中任一項所述的免疫綴合物、實施方式57所述的核酸分子、實施方式58所述的載體、實施方式59所述的細胞和/或實施方式60所述的醫藥組成物在製備藥物中的用途，該藥物用於預防、緩解和/或治療腫瘤。
根據實施方式62所述的用途，該腫瘤包括AXL陽性腫瘤。
根據實施方式63所述的用途，該腫瘤選自下組：肺癌、皮膚癌、腎癌、胰腺癌、血液腫瘤、乳腺癌、卵巢癌、淋巴瘤和骨髓瘤。
根據實施方式64所述的用途，該腫瘤選自下組：非小細胞肺癌、皮膚鱗癌、腎透明細胞腺癌、胰腺癌、紅白血病、急性T細胞白血病、乳腺癌、卵巢癌、淋巴瘤和骨髓瘤。
實施方式1-50中任一項所述的分離的抗原結合蛋白在製備診斷劑中的用途，該診斷劑用於診斷與AXL蛋白的表達相關的疾病或病況。
診斷受試者中與AXL蛋白的表達相關的疾病或病況的方法，該方法包括：使源自該受試者的樣品與實施方式1-50中任一項所述的分離的抗原結合蛋白接觸，以及判斷該樣品中能夠特異性結合該分離的抗原結合蛋白的物質的存在和/或含量。
檢測樣品中AXL的方法，該方法包括施用實施方式1-50中任一項所述的分離的抗原結合蛋白。
不欲被任何理論所限，下文中的實施例僅僅是為了闡釋本申請的蛋白質分子、製備方法和用途等，而不用於限制本申請發明的範圍。實施例不包括對傳統方法的詳細描述，如那些用於構建載體和質粒的方法，將編碼蛋白的基因插入到這樣的載體和質粒的方法或將質粒引入宿主細胞的方法。這樣的方法對於本領域中具有普通技術的人員是眾所周知的，並且在許多出版物中都有所描述，包括Sambrook,J.,Fritsch,E．F．and Maniais，T．(1989)Molecular Cloning：A Laboratory Manual，2nd edition，Cold spring Harbor Laboratory Press。
實施例
實施例1. 抗體識別靶抗原
將靶抗原AXL-His(北京義翹神州科技有限公司)包被ELISA板條，1μg/ml，4℃過夜；PBST洗滌後，加入10%的胎牛血清，37℃封閉1小時；加入不同濃度的6G12M11、6G12M21、6G12M31和6G12M41抗體，37℃反應1小時；PBST洗滌後，加入辣根過氧化物酶標記的羊抗小鼠二抗(Goat Anti-mouse IgG HRP，Abcam)，37℃反應30分鐘；PBST重複洗板5遍，在吸水紙上儘量拍乾殘留液滴；每孔加入100μl TMB(eBioscience)，室溫(20±5℃)避光放置1.5min；每孔加入100μl 2N H2SO4終止液終止受質反應，酶標儀450nm處讀取OD值，分析抗體與靶抗原AXL結合能力。其中，6G12M11抗體的重鏈 胺基酸序列如SEQ ID NO：35所示，輕鏈胺基酸序列如SEQ ID NO：36所示；6G12M21抗體的重鏈胺基酸序列如SEQ ID NO：37所示，輕鏈胺基酸序列如SEQ ID NO：38所示，6G12M31抗體的VH如SEQ ID NO：42所示，VL如SEQ ID NO：6所示；6G12M41抗體的VH如SEQ ID NO：43所示，VL如SEQ ID NO：6所示。
試驗結果如圖1A和圖1B所示，可以看出，6G12M11和6G12M21抗體均能特異性識別靶抗原AXL；該識別活性呈顯著的劑量依賴性，6G12M11的EC50值為27.03ng/mL，6G12M21的EC50值為25.29ng/mL，6G12M31的EC50值為21.11ng/mL，6G12M41的EC50值為17.56ng/mL。
實施例2. 抗體親和力測定
本實驗運用表面等離子共振技術檢測AXL-His與6G12M11、6G12M21、6G12M31和6G12M41抗體的親和力。試驗儀器採用的是BIACOR生物大分子相互作用儀(GE Healthcare，T-200)。首先採用抗體捕獲法將6G12M11、6G12M21、6G12M31和6G12M41抗體固定於晶片表面上，二者濃度定為0.5μg/mL，以流速10μL/min進樣60秒；將配製好的AXL-His(北京義翹神州生物技術有限公司，6×His標籤，分子量為47.5Kda)為流動相，使用5個濃度梯度(8、4、2、1、0.5μg/mL)分別流經晶片表面，進行相互作用測定；AXL-His以30μL/min流速結合120s，解離1800s。抗原抗體親和力的結果如表1所示，可以看出，本申請該的分離的抗原結合蛋白能夠以1×10-7M或更低的KD與AXL蛋白相結合。
表1. 抗體的親和力測定結果
Figure 109141730-A0101-12-0055-11
實施例3. 抗體特異性識別靶抗原
AXL、TRYO3、MER同屬於TYRO3受體酪胺酸激酶亞家族，為驗證6G12M11、6G12M21、6G12M31和6G12M41抗體的識別特異性，利用ELISA法檢測抗體與AXL同家族其它成員的結合能力。
將TYRO3-Fc(ACRO Biosystems)、MER-His(ACRO Biosystems)以及AXL-His(北京義翹神州科技有限公司)分別包被ELISA板條，1μg/ml，4℃過夜；PBST洗滌後，加入10%的胎牛血清，37℃封閉1小時；加入6G12M11、6G12M21、6G12M31和6G12M41抗體，37℃反應1小時；PBST洗滌後，加入辣根過氧化物酶標記的羊抗人IgG Fab二抗(Goat Anti-Human IgG(Fab')2(HRP)，Abcam)，室溫反應30分鐘；PBST重複洗板5遍，在吸水紙上儘量拍乾殘留液滴；每孔加入100μl TMB(eBioscience，#85-00-420)，室溫(20±5℃)避光放置1.5分鐘；每孔加入100μl 2N H2SO4終止液終止受質反應，酶標儀450nm處讀取OD值，分析抗體與蛋白結合能力。
結果如圖2-5所示，可以看出，6G12M11、6G12M21、6G12M31和6G12M41抗體能特異性識別靶抗原AXL，但與AXL同家族的其它蛋白TYRO3、MER均不結合。
實施例4. 抗體特異性識別細胞表面抗原
利用流式分析技術檢測人非小細胞肺癌A549細胞、人乳腺癌MDA-MB-231細胞和腎透明細胞腺癌786-O細胞表面的AXL與6G12M11、6G12M21、6G12M31和6G12M41抗體的結合。收集對數生長期細胞，調整細胞密度到5×106個/mL，冰上預冷。含2%FBS預冷的生理鹽水稀釋6G12M11、6G12M21、6G12M31和6G12M41抗體至20μg/ml。取100μl細胞，加入等體積前述稀釋抗體，4℃避光反應30min。結束後，用含2%FBS預冷的生理鹽水洗兩次(6000rpm，45s)。用含2% FBS預冷的生理鹽水按1：5稀釋二抗PE Mouse Anti-Human IgG(BD Pharmingen)，取100μL重懸細胞，4℃避光反應30min。反應結束後，用含2% FBS預冷的生理鹽水洗兩次(6000rpm，45s)。用400μl 1%多聚甲醛重懸細胞。流式細胞儀(BD Calibur)分析抗體與細胞表面抗原的結合能力。
結果如圖6、圖7和圖8所示，可以看出，6G12M11和6G12M21抗體能特異且劑量依賴性識別人非小細胞肺癌A549細胞、人乳腺癌MDA-MB-231細胞和腎透明細胞腺癌786-O細胞表面的AXL，6G12M11和6G12M21抗體識別能力相似。其中，6G12M11和6G12M21抗體，與A549細胞結合的EC50值分別為0.46μg/mL、0.78μg/mL；與MDA-MB-231細胞結合 的EC50值分別為0.59μg/mL、0.39μg/mL；與786-O細胞結合的EC50值分別為0.43μg/mL、0.31μg/mL。
結果如圖9和圖10所示。結果顯示，6G12M21、6G12M31和6G12M41抗體能特異且劑量依賴性識別人乳腺癌MDA-MB-231細胞和腎透明細胞腺癌786-O細胞表面的AXL，6G12M21、6G12M31和6G12M41抗體識別能力相似。其中與MDA-MB-231細胞結合的EC50值6G12M21為0.64μg/mL，6G12M31為0.60μg/mL，6G12M41為0.54μg/mL。與786-O細胞結合的EC50值6G12M21為0.40μg/mL，6G12M31為0.53μg/mL，6G12M41為0.47μg/mL。
實施例5. 抗體的內化活性
利用流式分析技術檢測6G12M11、6G12M21、6G12M31和6G12M41抗體在人非小細胞肺癌A549細胞、人乳腺癌MDA-MB-231細胞、腎透明細胞腺癌786-O細胞上的內化效率。收集對數生長期細胞，調整細胞密度到5×106個/mL，冰上預冷。含2%FBS預冷的生理鹽水稀釋6G12M11、6G12M21、6G12M31和6G12M41抗體至不同濃度。取100μl細胞，加入等體積前述稀釋抗體，4℃孵育30分鐘。結束後，用含2%FBS預冷的生理鹽水洗滌細胞三次。將細胞繼續放置於4℃或37℃培養2小時後洗滌細胞兩次。用含2% FBS預冷的生理鹽水按1：5稀釋二抗PE Mouse Anti-Human IgG(BD Pharmingen)，取100μL重懸細胞，4℃避光反應30分鐘。反應結束後，洗滌細胞三次。用400μl 1%多聚甲醛重懸細胞。流式細胞儀(BD Calibur)分析抗 體在不同溫度下培養細胞表面的螢光強度，並按照以下公式計算出抗體的內化效率。
內化效率=(4℃表面總MFI-37℃表面總MFI)/4℃表面總MFI×100%。
結果如圖11、圖12和圖13所示，可以看出，6G12M11和6G12M21抗體在人非小細胞肺癌A549細胞、人乳腺癌MDA-MB-231細胞、腎透明細胞腺癌786-O細胞上均可以有效的內化，內化效率相似，說明6G12M11和6G12M21抗體具備良好的內化活性。
如圖14和圖15所示，可以看出，6G12M21、6G12M31和6G12M41抗體在人乳腺癌MDA-MB-231細胞、腎透明細胞腺癌786-O細胞上均可以有效的內化，內化效率相似。可見6G12M21、6G12M31和6G12M41抗體具備良好的內化活性。
實施例6. 免疫綴合物抑制腫瘤細胞的增殖
利用小分子linker及MMAF構建免疫綴合物6G12M41-ADC作為ADC的示例分子，評價基於6G12M41的免疫綴合物的生物學活性，分析6G12M41抗體構建抗體小分子偶聯藥物(ADC)等免疫綴合物的潛力。
在96孔培養板中接種一定數量的對數生長期細胞(人乳腺癌MDA-MB-231細胞)，貼壁生長24小時後，加入不同濃度的藥物作用72小時。藥物作用結束後，將CCK-8(Dojindo，日本同仁化學研究所)以每孔10μl加至培養板，37℃、5%二氧化碳培養箱中培養3-5小時。酶標儀450nm波長下測定OD值，並且根據以下的公式計算細胞生長抑制率：
抑制率=(OD值對照孔-OD值給藥孔)/OD值對照孔×100%
根據各濃度抑制率，再計算半數抑制濃度IC50。
結果如圖16所示。結果顯示，6G12M41抗體偶聯MMAF(6G12M41-ADC)後對乳腺癌MDA-MB-231顯示出顯著的增殖抑制作用，IC50為8.298nM。
實施例7. 免疫綴合物體內抑制腫瘤活性
以免疫綴合物6G12M41-ADC為例，進行體內抑制腫瘤活性分析。
藉由B-NDG小鼠皮下接種MDA-MB-231乳腺癌細胞，建立皮下乳腺癌動物模型，評價6G12M41-ADC的體內抑制腫瘤活性。選擇雌性、8週齡B-NDG小鼠(百奧賽圖江蘇基因生物技術有限公司)，MDA-MB-231細胞培養在含有10%滅活胎牛血清的GIBCO Leibovitz's L-15培養基中。收集指數生長期的MDA-MB-231細胞，以1×107個/0.1mL濃度，0.1mL/隻體積接種於B-NDG小鼠的右側皮下。接種後，待腫瘤平均體積92mm3時，根據腫瘤大小隨機分為4組，每組6隻，分別為G1 PBS、G2 6G12M41(10mg/kg)、G3 6G12M41-ADC(10mg/kg)和G4 6G12M41-ADC(5mg/kg)，腹腔注射給藥，每週給藥1次，連續給藥2次；在分組給藥第25天結束實驗。給藥期間和觀察期間每週測量兩次小鼠體重和腫瘤體積，並記錄測量值。實驗結束時，動物安樂死，剖取小鼠腫瘤稱重。根據相對腫瘤抑制率(TGI)進行療效評價，根據動物體重變化和死亡情況進行安全性評價。TGITV(%)=[1-(Ti-T0)/(Vi-V0)]×100%(Ti：治療組在給藥第i天的腫瘤體積均值，T0：治療組在給藥第0 天的腫瘤體積均值；Vi：溶劑對照組在給藥第i天的腫瘤體積均值，V0：溶劑對照組在給藥第0天的腫瘤體積均值)。
結果如圖17和圖18所示，在實驗過程中，給藥組實驗動物在給藥期間活動和進食狀態良好，體重均有一定程度的上升，表明實驗動物對受試品耐受性較好。在分組給藥第25天，PBS對照組平均腫瘤體積為668±45mm3，G2-G4各給藥組平均腫瘤體積分別為458±14mm3、311±26mm3和395±14mm3，TGITV分別為36.5%、62.0%和47.5%。
各受試品對MDA-MB-231細胞皮下移植瘤生長均產生了顯著的抑制作用，且在發揮藥效的同時未對動物產生明顯的毒副作用，安全性良好。此外，受試品6G12M41-ADC的抑瘤作用具有濃度依賴性。
前述詳細說明是以解釋和舉例的方式提供的，並非要限制所附申請專利範圍。目前本申請所列舉的實施方式的多種變化對本領域普通技術人員來說是顯而易見的，且保留在所附的申請專利範圍和其等同方案的範圍內
<110> 尚健單抗(北京)生物技術有限公司(SUMGEN MAB(BEIJING)BIOTECH CO.,LTD.) 杭州尚健生物技術有限公司(HANGZHOU SUMGEN BIOTECH CO.,LTD.)
<120> 一種分離的結合抗原AXL的蛋白及其用途
<130> 0070-PA-022TW
<160> 46
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 119
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> VH通式
<220>
<221> X
<222> (5)..(5)
<223> X可以是K或V
<220>
<221> X
<222> (23)..(23)
<223> X可以是S或A
<220>
<221> X
<222> (25)..(25)
<223> X可以是T或S
<220>
<221> X
<222> (27)..(27)
<223> X可以是F、Y、D或S
<220>
<221> X
<222> (41)..(41)
<223> X可以是F或S
<220>
<221> X
<222> (44)..(44)
<223> X可以是N或Q
<220>
<221> X
<222> (45)..(45)
<223> X可以是K或G
<220>
<221> X
<222> (88)..(88)
<223> X可以是T或S
<220>
<221> X
<222> (114)..(114)
<223> X可以是S或T
<400> 1
Figure 109141730-A0101-12-0062-12
<210> 2
<211> 112
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> VL通式
<220>
<221> X
<222> (1)..(1)
<223> X可以是E或D
<220>
<221> X
<222> (2)..(2)
<223> X可以是L或I
<220>
<221> X
<222> (9)..(9)
<223> X可以是F或S
<220>
<221> X
<222> (11)..(11)
<223> X可以是N或V
<220>
<221> X
<222> (12)..(12)
<223> X可以是A或S
<220>
<221> X
<222> (17)..(17)
<223> X可以是T或Q
<220>
<221> X
<222> (42)..(42)
<223> X可以是L或Q
<220>
<221> X
<222> (69)..(69)
<223> X可以是S或G
<220>
<221> X
<222> (79)..(79)
<223> X可以是R或K
<220>
<221> X
<222> (105)..(105)
<223> X可以是A或G
<220>
<221> X
<222> (111)..(111)
<223> X可以是L或I
<400> 2
Figure 109141730-A0101-12-0063-13
<210> 3
<211> 119
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M11的VH
<400> 3
Figure 109141730-A0101-12-0064-14
<210> 4
<211> 112
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M11的VL
<400> 4
Figure 109141730-A0101-12-0064-15
Figure 109141730-A0101-12-0065-16
<210> 5
<211> 119
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M21的VH
<400> 5
Figure 109141730-A0101-12-0065-17
<210> 6
<211> 112
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M21/6G12M31/6G12M41的VL
<400> 6
Figure 109141730-A0101-12-0065-18
Figure 109141730-A0101-12-0066-20
<210> 7
<211> 30
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> H-FR1通式
<220>
<221> X
<222> (5)..(5)
<223> X可以是K或V
<220>
<221> X
<222> (23)..(23)
<223> X可以是S或A
<220>
<221> X
<222> (25)..(25)
<223> X可以是T或S
<220>
<221> X
<222> (27)..(27)
<223> X可以是F、Y、D或S
<400> 7
Figure 109141730-A0101-12-0066-19
<210> 8
<211> 14
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> H-FR2通式
<220>
<221> X
<222> (5)..(5)
<223> X可以是F或S
<220>
<221> X
<222> (8)..(8)
<223> X可以是N或Q
<220>
<221> X
<222> (9)..(9)
<223> X可以是K或G
<400> 8
Figure 109141730-A0101-12-0067-21
<210> 9
<2 11> 32
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> H-FR3通式
<220>
<221> X
<222> (22)..(22)
<223> X可以是T或S
<400> 9
Figure 109141730-A0101-12-0067-22
<210> 10
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> H-FR4通式
<220>
<221> X
<222> (6)..(6)
<223> X可以是S或T
<400> 10
Figure 109141730-A0101-12-0067-23
<210> 11
<211> 30
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M11的H-FR1
<400> 11
Figure 109141730-A0101-12-0068-27
<210> 12
<211> 14
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M11/6G12M121/6G12M31/6G12M41的H-FR2
<400> 12
Figure 109141730-A0101-12-0068-163
<210> 13
<211> 32
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M11/6G12M21/6G12M31/6G12M41的H-FR3
<400> 13
Figure 109141730-A0101-12-0068-26
<210> 14
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M11/6G12M21/6G12M31/6G12M41的H-FR4
<400> 14
Figure 109141730-A0101-12-0068-25
<210> 15
<211> 30
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M21/6G12M31/6G12M41的H-FR1
<400> 15
Figure 109141730-A0101-12-0068-24
Figure 109141730-A0101-12-0069-28
<210> 16
<211> 23
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> L-FR1通式
<220>
<221> X
<222> (1)..(1)
<223> X可以是E或D
<220>
<221> X
<222> (2)..(2)
<223> X可以是L或I
<220>
<221> X
<222> (9)..(9)
<223> X可以是F或S
<220>
<221> X
<222> (11)..(11)
<223> X可以是N或V
<220>
<221> X
<222> (12)..(12)
<223> X可以是A或S
<220>
<221> X
<222> (17)..(17)
<223> X可以是T或Q
<400> 16
Figure 109141730-A0101-12-0069-29
<210> 17
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> L-FR2通式
<220>
<221> X
<222> (3)..(3)
<223> X可以是L或Q
<400> 17
Figure 109141730-A0101-12-0070-32
<210> 18
<211> 32
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> L-FR3通式
<220>
<221> X
<222> (8)..(8)
<223> X可以是S或G
<220>
<221> X
<222> (18)..(18)
<223> X可以是R或K
<400> 18
Figure 109141730-A0101-12-0070-31
<210> 19
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> L-FR4通式
<220>
<221> X
<222> (3)..(3)
<223> X可以是A或G
<220>
<221> X
<222> (9)..(9)
<223> X可以是L或I
<400> 19
Figure 109141730-A0101-12-0070-30
<210> 20
<211> 23
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M11的L-FR1
<400> 20
Figure 109141730-A0101-12-0071-33
<210> 21
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M11/6G12M21/6G12M31/6G12M41的L-FR2
<400> 21
Figure 109141730-A0101-12-0071-34
<210> 22
<211> 32
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M11/6G12M21/6G12M31/6G12M41的L-FR3
<400> 22
Figure 109141730-A0101-12-0071-35
<210> 23
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M11/6G12M21/6G12M31/6G12M41的L-FR4
<400> 23
Figure 109141730-A0101-12-0071-37
<210> 24
<211> 23
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M21/6G12M31/6G12M41的L-FR1
<400> 24
Figure 109141730-A0101-12-0071-36
Figure 109141730-A0101-12-0072-58
<210> 25
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M11/6G12M21/6G12/6G12M31/6G12M41的HCDR1
<400> 25
Figure 109141730-A0101-12-0072-59
<210> 26
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M11/6G12M21/6G12的HCDR2
<400> 26
Figure 109141730-A0101-12-0072-60
<210> 27
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M11/6G12M21/6G12/6G12M31/6G12M41的HCDR3
<400> 27
Figure 109141730-A0101-12-0072-61
<210> 28
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M11/6G12M21/6G12/6G12M31/6G12M41的LCDR1
<400> 28
Figure 109141730-A0101-12-0072-62
<210> 29
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M11/6G12M21/6G12/6G12M31/6G12M41的LCDR2
<400> 29
Figure 109141730-A0101-12-0073-63
<210> 30
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M11/6G12M21/6G12/6G12M31/6G12M41的LCDR3
<400> 30
Figure 109141730-A0101-12-0073-64
<210> 31
<211> 119
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12的VH
<400> 31
Figure 109141730-A0101-12-0073-65
<210> 32
<211> 112
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12的VL
<400> 32
Figure 109141730-A0101-12-0074-66
<210> 33
<211> 330
<212> PRT
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 33
Figure 109141730-A0101-12-0074-67
Figure 109141730-A0101-12-0075-68
<210> 34
<211> 107
<212> PRT
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 34
Figure 109141730-A0101-12-0075-69
Figure 109141730-A0101-12-0076-70
<210> 35
<211> 449
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M11的重鏈
<400> 35
Figure 109141730-A0101-12-0076-71
Figure 109141730-A0101-12-0077-72
Figure 109141730-A0101-12-0078-73
<210> 36
<211> 219
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M11的輕鏈
<400> 36
Figure 109141730-A0101-12-0078-74
Figure 109141730-A0101-12-0079-75
<210> 37
<211> 449
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M21的重鏈
<400> 37
Figure 109141730-A0101-12-0079-76
Figure 109141730-A0101-12-0080-77
<210> 38
<211> 219
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M21的輕鏈
<400> 38
Figure 109141730-A0101-12-0081-78
<210> 39
<211> 894
<212> PRT
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 39
Figure 109141730-A0101-12-0082-79
Figure 109141730-A0101-12-0083-80
Figure 109141730-A0101-12-0084-81
Figure 109141730-A0101-12-0085-82
<210> 40
<211> 425
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人AXL蛋白的細胞外結構域
<400> 40
Figure 109141730-A0101-12-0085-83
Figure 109141730-A0101-12-0086-84
Figure 109141730-A0101-12-0087-85
<210> 41
<211> 229
<212> PRT
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 41
Figure 109141730-A0101-12-0087-86
Figure 109141730-A0101-12-0088-87
<210> 42
<211> 119
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M31的VH
<400> 42
Figure 109141730-A0101-12-0088-88
<210> 43
<211> 119
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M41的VH
<400> 43
Figure 109141730-A0101-12-0088-89
Figure 109141730-A0101-12-0089-90
<210> 44
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M31的HCDR2
<400> 44
Figure 109141730-A0101-12-0089-92
<210> 45
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M41的HCDR2
<400> 45
Figure 109141730-A0101-12-0089-91
<210> 46
<211> 119
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 6G12M31的VH；6G12M41的VH
<220>
<221> misc_feature
<222> (61)..(61)
<223> X可以為D或G
<400> 46
Figure 109141730-A0101-12-0089-93
Figure 109141730-A0101-12-0090-94

Claims (68)

  1. 一種分離的抗原結合蛋白，其包含胺基酸序列SEQ ID NO：1或SEQ ID NO：46所示的VH中的至少一個CDR；且包含胺基酸序列SEQ ID NO：2所示的VL中的至少一個CDR。
  2. 如請求項1所述的分離的抗原結合蛋白，其具有下述性質中的一種或多種：
    1)能夠以1×10-7M或更低的KD與AXL蛋白相結合；
    2)能夠特異性識別在細胞表面表達的AXL蛋白；
    3)結合在細胞表面表達的AXL蛋白後能夠介導內化。
  3. 如請求項2所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該AXL蛋白包括人AXL蛋白。
  4. 如請求項3所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該人AXL蛋白包含SEQ ID NO：39所示的胺基酸序列。
  5. 如請求項2至4中任一項所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該AXL蛋白包含細胞外結構域。
  6. 如請求項5所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該細胞外結構域包含SEQ ID NO：40所示的胺基酸序列。
  7. 如請求項2所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該細胞包括腫瘤細胞。
  8. 如請求項7所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該腫瘤包括AXL陽性腫瘤。
  9. 如請求項8所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該腫瘤選自下組：肺癌、皮膚癌、腎癌、胰腺癌、血液腫瘤、乳腺癌、卵巢癌、淋巴瘤和骨髓瘤。
  10. 如請求項9所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該腫瘤選自下組：非小細胞肺癌、皮膚鱗癌、腎透明細胞腺癌、胰腺癌、紅白血病、急性T細胞白血病、乳腺癌、卵巢癌、淋巴瘤和骨髓瘤。
  11. 如請求項2所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該細胞包括人的細胞。
  12. 如請求項7或11所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該細胞選自下組：人非小細胞肺癌A549細胞、人皮膚鱗癌A431細胞、腎透明細胞腺癌786-O細胞、人胰腺癌MIA PaCa-2細胞、紅白血病K562細胞、急性T細胞白血病Jurkat細胞、人乳腺癌MCF-7細胞、人乳腺癌MDA-MB-231細胞、人乳腺癌MDA-MB-468細胞、人乳腺癌SKBR3細胞、人卵巢癌SKOV3細胞、淋巴瘤U-937細胞、淋巴瘤Raji細胞、人骨髓瘤U266細胞和人多發性骨髓瘤RPMI8226細胞。
  13. 如請求項1所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該VH包含HCDR1、HCDR2和HCDR3。
  14. 如請求項13所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該HCDR1包含SEQ ID NO：25所示的胺基酸序列。
  15. 如請求項13所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該HCDR2包含SEQ ID NO：26、44和45中任一項所示的胺基酸序列。
  16. 如請求項13所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該HCDR3包 含SEQ ID NO：27所示的胺基酸序列。
  17. 如請求項1所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該VL包含LCDR1、LCDR2和LCDR3。
  18. 如請求項17所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該LCDR1包含SEQ ID NO：28所示的胺基酸序列。
  19. 如請求項17所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該LCDR2包含SEQ ID NO：29所示的胺基酸序列。
  20. 如請求項17所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該LCDR3包含SEQ ID NO：30所示的胺基酸序列。
  21. 如請求項1或13所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該VH包含框架區H-FR1，H-FR2，H-FR3，和H-FR4。
  22. 如請求項21所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該H-FR1的C末端與該HCDR1的N末端直接或間接相連，且所述H-FR1包含SEQ ID NO：7所示的胺基酸序列。
  23. 如請求項22所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該H-FR1包含SEQ ID NO：11和15中任一項所示的胺基酸序列。
  24. 如請求項21所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該H-FR2位於該HCDR1與該HCDR2之間，且該H-FR2包含SEQ ID NO：8所示的胺基酸序列。
  25. 如請求項24所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該H-FR2包含SEQ ID NO：12所示的胺基酸序列。
  26. 如請求項21所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該H-FR3位 於該HCDR2與該HCDR3之間，且該H-FR3包含SEQ ID NO：9所示的胺基酸序列。
  27. 如請求項26所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該H-FR3包含SEQ ID NO：13所示的胺基酸序列。
  28. 如請求項21所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該H-FR4的N末端與該HCDR3的C末端相連，且該H-FR4包含SEQ ID NO：10所示的胺基酸序列。
  29. 如請求項28所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該H-FR4包含SEQ ID NO：14所示的胺基酸序列。
  30. 如請求項1、13至16和22至29中任一項所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該VH包含SEQ ID NO：3、5、42和43中任一項所示的胺基酸序列。
  31. 如請求項1或17所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該VL包含框架區L-FR1，L-FR2，L-FR3，和L-FR4。
  32. 如請求項31所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該L-FR1的C末端與該LCDR1的N末端直接或間接相連，且該L-FR1包含SEQ ID NO：16所示的胺基酸序列。
  33. 如請求項32所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該L-FR1包含SEQ ID NO：20和24中任一項所示的胺基酸序列。
  34. 如請求項31所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該L-FR2位於該LCDR1與該LCDR2之間，且該L-FR2包含SEQ ID NO：17所示的胺基酸序列。
  35. 如請求項34所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該L-FR2包含SEQ ID NO：21所示的胺基酸序列。
  36. 如請求項31所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該L-FR3位於該LCDR2與該LCDR3之間，且該L-FR3包含SEQ ID NO：18所示的胺基酸序列。
  37. 如請求項36所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該L-FR3包含SEQ ID NO：22所示的胺基酸序列。
  38. 如請求項31所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該L-FR4的N末端與該LCDR3的C末端相連，且該L-FR4包含SEQ ID NO：19所示的胺基酸序列。
  39. 如請求項38所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該L-FR4包含SEQ ID NO：23所示的胺基酸序列。
  40. 如請求項1、17至20和32至39中任一項所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該VL包含SEQ ID NO：4和6中任一項所示的胺基酸序列。
  41. 如請求項1至4、6至11、13至20、22至29和32至39中任一項所述的分離的抗原結合蛋白，其包含抗體重鏈恆定區，且該抗體重鏈恆定區源自人IgG重鏈恆定區。
  42. 如請求項41所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該抗體重鏈恆定區源自人IgG1重鏈恆定區或人IgG4重鏈恆定區。
  43. 如請求項42所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該抗體重鏈恆定區包含SEQ ID NO：33和41中任一項所示的胺基酸序列。
  44. 如請求項1至4、6至11、13至20、22至29、32至39和42 至43中任一項所述的分離的抗原結合蛋白，其包含抗體輕鏈恆定區，且該抗體輕鏈恆定區包含人Igκ恆定區。
  45. 如請求項44所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該抗體輕鏈恆定區包含SEQ ID NO：34所示的胺基酸序列。
  46. 如請求項1至4、6至11、13至20、22至29、32至39、42至43和45中任一項所述的分離的抗原結合蛋白，其包含抗體重鏈，且該抗體重鏈包含SEQ ID NO：35和37中任一項所示的胺基酸序列。
  47. 如請求項1至4、6至11、13至20、22至29、32至39、42至43和45中任一項所述的分離的抗原結合蛋白，其包含抗體輕鏈，且該抗體輕鏈包含SEQ ID NO：36和38中任一項所示的胺基酸序列。
  48. 如請求項1至4、6至11、13至20、22至29、32至39、42至43和45中任一項所述的分離的抗原結合蛋白，其包括抗體或其抗原結合片段。
  49. 如請求項48所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該抗體選自下組：單株抗體、單鏈抗體、嵌合抗體、多特異性抗體、人源化抗體和全人源抗體。
  50. 如請求項48所述的分離的抗原結合蛋白，其中，該抗原結合片段選自下組：Fab、Fab’、F(ab)2、Fv、F(ab’)2、scFv、di-scFv和dAb片段。
  51. 一種免疫綴合物，其包含如請求項1至50中任一項所述的分離的抗原結合蛋白。
  52. 如請求項51所述的免疫綴合物，其還包含選自下組的至少一種其他試劑：化療劑、放射性元素、細胞生長抑制劑和細胞毒性劑。
  53. 如請求項52所述的免疫綴合物，該分離的抗原結合蛋白與該 其他試劑藉由連接分子相連。
  54. 如請求項53所述的免疫綴合物，該分離的抗原結合蛋白及該其他試劑分別與所述連接分子共價相連。
  55. 如請求項52至54中任一項所述的免疫綴合物，其中，該其他試劑包括美登素或其衍生物。
  56. 如請求項55所述的免疫綴合物，其中，該美登素衍生物包括美登素衍生物DM1。
  57. 一種分離的核酸分子，其編碼如請求項1至50中任一項所述的分離的抗原結合蛋白。
  58. 一種載體，其包含如請求項57所述的核酸分子。
  59. 一種細胞，其包含如請求項57所述的核酸分子或如請求項58所述的載體。
  60. 一種醫藥組成物，其包含如請求項1至50中任一項所述的分離的抗原結合蛋白、如請求項51至56中任一項所述的免疫綴合物、如請求項57所述的核酸分子、如請求項58所述的載體和/或如請求項59所述的細胞，以及視需要地藥學上可接受的佐劑。
  61. 一種製備如請求項1至50中任一項所述的分離的抗原結合蛋白的方法，該方法包括在使得如請求項1至50中任一項所述的分離的抗原結合蛋白表達的條件下，培養如請求項59所述的細胞。
  62. 一種請求項1至50中任一項所述的分離的抗原結合蛋白、如請求項51至56中任一項所述的免疫綴合物、如請求項57所述的核酸分子、如請求項58所述的載體、如請求項59所述的細胞和/或如請求項60所述的醫藥組 成物在製備藥物中的用途，該藥物用於預防、緩解和/或治療腫瘤。
  63. 如請求項62所述的用途，其中，該腫瘤包括AXL陽性腫瘤。
  64. 如請求項63所述的用途，其中，該腫瘤選自下組：肺癌、皮膚癌、腎癌、胰腺癌、血液腫瘤、乳腺癌、卵巢癌、淋巴瘤和骨髓瘤。
  65. 如請求項64所述的用途，其中，該腫瘤選自下組：非小細胞肺癌、皮膚鱗癌、腎透明細胞腺癌、胰腺癌、紅白血病、急性T細胞白血病、乳腺癌、卵巢癌、淋巴瘤和骨髓瘤。
  66. 一種如請求項1至50中任一項所述的分離的抗原結合蛋白在製備診斷劑中的用途，該診斷劑用於診斷與AXL蛋白的表達相關的疾病或病況。
  67. 一種診斷受試者中與AXL蛋白的表達相關的疾病或病況的方法，該方法包括：使源自所述受試者的樣品與如請求項1至50中任一項所述的分離的抗原結合蛋白接觸，以及判斷所述樣品中能夠特異性結合所述分離的抗原結合蛋白的物質的存在和/或含量。
  68. 一種檢測樣品中AXL的方法，該方法包括施用如請求項1至50中任一項所述的分離的抗原結合蛋白。
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CN110642952B (zh) * 2014-08-14 2021-05-25 上海生物制品研究所有限责任公司 抗her3抗体、其制法及其应用
EP3229836B1 (en) * 2014-12-09 2019-11-13 Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale (INSERM) Human monoclonal antibodies against axl
EP3297662A4 (en) * 2015-05-18 2019-03-13 Agensys, Inc. ANTIBODY BINDING TO AXL PROTEINS
EP3458482A4 (en) * 2016-05-20 2020-01-15 Agency for Science, Technology and Research ANTI-AXL TYROSINE KINASEPEPTOR ANTIBODIES AND USES THEREOF
BR112020005011A2 (pt) * 2017-09-13 2020-09-15 National Research Council Of Canada anticorpos específicos de axl e usos dos mesmos
CN110483639A (zh) * 2018-05-15 2019-11-22 复旦大学 靶向axl的抗体及抗体-药物偶联物及其制备方法和用途
CN110540592B (zh) * 2018-05-29 2022-08-09 杭州尚健生物技术有限公司 结合axl蛋白的抗体及其应用
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