TW202114683A - 抗癌組合療法 - Google Patents
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Abstract
本發明說明一種抗癌療法,其包括使用各自如本文所描述之SOS1抑制劑以及MEK抑制劑。
Description
本發明說明一種抗癌療法,其包含使用各自如本文所描述之SOS1抑制劑以及MEK抑制劑。
包括V-Ki-ras2 Kirsten大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(KRAS)、神經母細胞瘤RAS病毒致癌基因同源物(NRAS)及Harvey鼠類肉瘤病毒致癌基因(HRAS)及其任何突變體之RAS家族蛋白質為以GTP結合或GDP結合狀態存在於細胞中之小GTP酶(McCormick等人, J. Mol. Med. (Berl)., 2016, 94(3):253-8;Nimnual等人, Sci. STKE., 2002, 2002(145):pe36)。RAS家族蛋白質具有微弱的固有GTP酶活性及較慢的核苷酸交換速率(Hunter等人, Mol. Cancer Res., 2015, 13(9):1325-35)。GTP酶活化蛋白質(GAP) (諸如NF1)之結合增加RAS家族蛋白質之GTP酶活性。鳥嘌呤核苷酸交換因子(GEF) (諸如非七激酶子1 (Son of Sevenless 1;SOS1))之結合促進自RAS家族蛋白質釋放GDP,使得能夠進行GTP結合(Chardin等人, Science, 1993, 260(5112):1338-43)。當在GTP結合狀態中時,RAS家族蛋白質為活性的且接合包括C-RAF及磷酸肌醇3-激酶(PI3K)之效應蛋白以促進RAF/促分裂原或胞外信號調節激酶(MEK/ERK)路徑、PI3K/AKT/哺乳動物雷帕黴素目標(mTOR)路徑及RalGDS (Ral鳥嘌呤核苷酸解離刺激因子)路徑(McCormick等人, J. Mol. Med. (Berl)., 2016, 94(3):253-8;Rodriguez-Viciana等人, Cancer Cell. 2005, 7(3):205-6)。此等路徑影響不同細胞過程,諸如增殖、存活、代謝、運動、血管生成、免疫及生長(Young等人, Adv. Cancer Res., 2009, 102:1-17;Rodriguez-Viciana等人, Cancer Cell. 2005, 7(3):205-6)。
RAS家族蛋白質中之癌症相關突變抑制其固有及GAP誘導之GTP酶活性,從而導致GTP結合/活性RAS家族蛋白質之群體數增加(McCormick等人, Expert Opin. Ther. Targets., 2015, 19(4):451-4;Hunter等人, Mol. Cancer Res., 2015, 13(9):1325-35)。此繼而導致RAS家族蛋白質之效應路徑(例如,MEK/ERK、PI3K/AKT/mTOR、RalGDS路徑)下游之持續活化。在包括肺癌、結腸直腸癌及胰臟癌之各種人類癌症中發現KRAS突變(例如,胺基酸G12、G13、Q61、A146) (Cox等人, Nat. Rev. Drug Discov., 2014, 13(11):828-51)。亦在各種人類癌症類型中發現HRAS (例如,胺基酸G12、G13、Q61)及NRAS (例如,胺基酸G12、G13、Q61、A146)中之突變,但與KRAS突變相比,通常頻率較低(Cox等人, Nat. Rev. Drug Discov., 2014, 13(11):828-51)。RAS家族蛋白質中之改變(例如,突變、過度表現、基因擴增)亦已描述為針對諸如EGFR抗體西妥昔單抗(cetuximab)及帕尼單抗(panitumumab) (Leto等人, J. Mol. Med. (Berl). 2014年7月;92(7):709-22)及EGFR酪胺酸激酶抑制劑奧希替尼(osimertinib)/AZD9291 (Ortiz-Cuaran等人, Clin. Cancer Res., 2016, 22(19):4837-47;Eberlein等人, Cancer Res., 2015, 75(12):2489-500)之癌症藥物的耐藥性機制。
非七激酶子1 (SOS1)為最初鑑別之果蠅蛋白質非七激酶子之人類同源物(Pierre等人, Biochem. Pharmacol., 2011, 82(9):1049-56;Chardin等人, Cytogenet. Cell. Genet., 1994, 66(1):68-9)。SOS1蛋白質由1333個胺基酸(150 kDa)組成。SOS1為具有兩個串聯N端組蛋白結構域(HD),接著Dbl同源結構域(DH)、普列克底物蛋白(Pleckstrin)同源結構域(PH)、螺旋連接子(HL)、RAS交換基序(REM)、CDC25同源結構域及C端富脯胺酸結構域(PR)之多結構域蛋白質。SOS1具有RAS家族蛋白質之兩個結合位點;結合GDP結合之RAS家族蛋白質以促進鳥嘌呤核苷酸交換之催化位點及結合GTP結合之RAS家族蛋白質之立體異位位點,其導致SOS1之催化GEF功能的進一步提高(Freedman等人, Proc. Natl. Acad. Sci. U S A., 2006, 103(45):16692-7;Pierre等人, Biochem. Pharmacol., 2011, 82(9):1049-56)。公開資料指示SOS1在癌症中之突變KRAS活化及致癌信號傳導中之重要參與(Jeng等人, Nat. Commun., 2012, 3:1168)。消耗SOS1含量降低攜帶KRAS突變之腫瘤細胞之增殖速率及存活,而在KRAS野生型細胞株中未觀察到效果。缺失SOS1之效果不可藉由引入催化位點突變型SOS1來修復,表明SOS1 GEF活性在KRAS突變癌細胞中之必需作用。
SOS1經由除RAS家族蛋白質中之突變以外之機制與癌症中之RAS家族蛋白質信號傳導的活化密切相關。SOS1與接附蛋白Grb2相互作用且所得SOS1/Grb2複合物與活化/磷酸化受體酪胺酸激酶(例如,EGFR、ErbB2、ErbB3、ErbB4、PDGFR-A/B、FGFR1/2/3、IGF1R、INSR、ALK、ROS、TrkA、TrkB、TrkC、RET、c-MET、VEGFR1/2/3、AXL)結合(Pierre等人, Biochem. Pharmacol., 2011, 82(9):1049-56)。SOS1亦補充至其他磷酸化細胞表面受體,諸如T細胞受體(TCR)、B細胞受體(BCR)及單核球群落刺激因子受體(Salojin等人, J. Biol. Chem. 2000, 275(8):5966-75)。此SOS1定位於接近RAS家族蛋白質之質膜,使得SOS1能夠促進RAS家族蛋白質活化。RAS家族蛋白質之SOS1活化亦可藉由SOS1/Grb2與通常發現於慢性骨髓性白血病中之BCR-ABL致癌蛋白之相互作用介導(Kardinal等人, 2001, Blood, 98:1773-81;Sini等人, Nat. Cell Biol., 2004, 6(3):268-74)。
此外,SOS1中之變化已涉及癌症。SOS1突變已在胚胎橫紋肌肉瘤、塞特利氏細胞睪丸腫瘤(Sertoli cell testis tumors)、皮膚粒細胞腫瘤(Denayer等人, Genes Chromosomes Cancer, 2010, 49(3):242-52)及肺腺癌(Cancer Genome Atlas Research Network., Nature. 2014, 511(7511):543-50)中發現。同時,SOS1之過度表現已在膀胱癌(Watanabe等人, IUBMB Life., 2000, 49(4):317-20)及前列腺癌(Timofeeva等人, Int. J. Oncol., 2009, 35(4):751-60)中描述。除癌症以外,遺傳性SOS1突變涉及RAS蛋白家族病變(RASopathies)之發病機制,該等RAS蛋白家族病變如(例如)努南症候群(Noonan syndrome;NS)、心臟-面部-皮膚症候群(CFC)及1型遺傳性齒齦纖維瘤病(Pierre等人, Biochem. Pharmacol., 2011, 82(9):1049-56)。
SOS1亦為用於活化GTP酶Ras相關C3肉毒桿菌毒素受質1 (Ras-related C3 botulinum toxin substrate 1;RAC1)之GEF (Innocenti等人, J. Cell Biol., 2002, 156(1):125-36)。RAC1,如RAS家族蛋白質,涉及多種人類癌症及其他疾病之發病機制(Bid等人, Mol. Cancer Ther. 2013, 12(10):1925-34)。
非七激酶子2 (SOS2) (一種哺乳動物細胞中之SOS1同源物)亦充當用於活化RAS家族蛋白質之GEF (Pierre等人, Biochem. Pharmacol., 2011, 82(9): 1049-56;Buday等人, Biochim. Biophys. Acta., 2008, 1786(2):178-87)。來自小鼠基因剔除模型之公開資料表明SOS1及SOS2在成年小鼠中之穩態中的冗餘作用。雖然小鼠中生殖系基因剔除SOS1導致在中期胚胎妊娠期間之致死性(Qian等人, EMBO J., 2000, 19(4):642-54),但系統條件性SOS1基因剔除成年小鼠可存活(Baltanás等人, Mol. Cell. Biol., 2013, 33(22):4562-78)。SOS2基因靶向並不在小鼠中產生任何明顯表型(Esteban等人, Mol. Cell. Biol., 2000, 20(17):6410-3)。相比之下,SOS1及SOS2雙重基因剔除導致在成年小鼠之快速致死性(Baltanás等人, Mol. Cell. Biol., 2013, 33(22):4562-78)。此等公開資料表明,選擇性靶向個別SOS同功異型物(例如,選擇性SOS1靶向)可為充分耐受的以達成在SOS1/RAS家族蛋白質驅動癌症(或其他SOS1/RAS家族蛋白質病變)與正常細胞及組織之間的治療指數。
預期選擇性藥理學抑制SOS1之催化位點與RAS家族蛋白質之結合將預防SOS1介導之RAS家族蛋白質活化成GTP結合形式。因此,預期此類SOS1抑制劑將抑制RAS家族蛋白質下游之細胞中之信號傳導(例如,ERK磷酸化)。在與RAS家族蛋白質依賴性相關之癌細胞(例如,KRAS突變癌細胞株)中,預期SOS1抑制劑將遞送抗癌功效(例如,抑制增殖、存活、癌轉移等)。對抑制細胞中之SOS1:RAS家族蛋白質結合(奈莫耳水準之IC50
值)及ERK磷酸化(奈莫耳水準之IC50
值)之高效能為SOS1抑制劑所需的特徵。
促分裂原活化蛋白激酶激酶(MEK)作為致癌目標且MEK抑制劑作為治療癌症之選擇為長期已知的,參見例如Cheng等人,Molecules 2017
,22
, 1551中之綜述及其中所引用之期刊文章。
藉由使用與其他化合物之組合療法(特定言之在腫瘤學中)及/或改良劑量排程可改良治療劑之功效。即使已提出組合若干治療劑之概念,且儘管各種組合療法正處於研究中且處於臨床試驗中,但仍存在對用於治療癌症疾病(例如,實體腫瘤)之新穎及有效治療性概念之需求,其展示優於標準療法之優點,諸如(例如)較佳治療結果、有益效果、優良功效及/或經改良耐受性,諸如(例如)減少組合治療之副作用。特定言之,需要為患有如(例如)胰臟癌、肺癌(例如NSCLC)、結腸直腸癌或膽管癌之癌症的患者提供額外治療選擇。
因此,本發明之目的為提供組合治療/組合治療方法,其與當前所使用及/或先前技術中已知之治療/治療方法相比提供某些優點。此等優點可包括活體內功效(例如,經改良臨床反應、反應之延長、反應速率之增加、反應之持續時間、疾病穩定速率、穩定之持續時間、疾病進展之時間、無進展存活期(PFS)及/或總存活期(OS)、稍晚出現之耐藥性及類似者)、安全及良好耐受之投藥及降低的不良事件之頻率及嚴重程度。
在此上下文中,本申請案之發明人出人意料地發現,與單獨使用SOS1抑制劑或MEK抑制劑相比,使用SOS1與RAS家族蛋白質之間相互作用的特異性抑制劑(在本文中稱作「SOS1抑制劑」)以及特異性促分裂原活化蛋白激酶激酶(MEK)抑制劑具有改良臨床結果之潛力。
因此,本發明係關於用於治療及/或預防如本文所描述之致癌或過度增生性疾病(特定言之癌症)的方法,該方法包含組合投與各自如本文所描述之SOS1抑制劑及MEK抑制劑,以及係關於醫學用途、係關於使用、係關於包含此類治療劑之醫藥組合物或組合及套組。
此外,本發明係關於抗癌療法,其包含組合使用各自如本文所描述之SOS1抑制劑及MEK抑制劑。
對於致癌性質之疾病的治療,已提出大量抗癌劑(包括目標特異性及非目標特異性抗癌劑),其可用作單一療法或用作涉及超過一種藥劑之組合療法(例如,雙重或三重組合療法)及/或其可與放射療法(例如,輻照治療)、放射免疫療法及/或手術組合。
本發明之目的為提供用於治療或控制各種惡性疾病的具有本文所描述之治療劑之組合療法(例如,基於組合中涉及之活性組分的協同、互補、相互作用或改良效果)。
( 醫學 ) 用途 - 治療方法 - 組合 - 組合物 - 套組
因此,在一個態樣中,本發明係關於一種治療及/或預防如本文所描述之致癌或過度增生性疾病(特定言之癌症)的方法,其包含向有需要之患者投與各自如本文所描述的治療有效量之SOS1抑制劑及治療有效量之MEK抑制劑。
此類組合治療可以物質之非固定(例如,自由)組合形式或以固定組合(包括成套套組)形式給出。
在另一態樣中,本發明係關於一種各自如本文所描述之SOS1抑制劑及MEK抑制劑的組合,特定言之用於治療及/或預防如本文所描述之致癌或過度增生性疾病(特定言之癌症)的方法中,該方法包含向有需要之患者投與治療有效量之組合。
在另一態樣中,本發明係關於一種如本文所描述之SOS1抑制劑,其用於治療及/或預防如本文所描述之致癌或過度增生性疾病(特定言之癌症)的方法中,該方法包含向有需要之患者投與SOS1抑制劑以及如本文所描述之MEK抑制劑。
在另一態樣中,本發明係關於一種如本文所描述之MEK抑制劑,其用於治療及/或預防如本文所描述之致癌或過度增生性疾病(特定言之癌症)的方法中,該方法包含向有需要之患者投與MEK抑制劑以及如本文所描述之SOS1抑制劑。
在另一態樣中,本發明係關於一種套組,其包含
● 第一醫藥組合物或劑型,其包含如本文所描述之SOS1抑制劑及視情況一或多種醫藥學上可接受之載劑、賦形劑及/或媒劑,及
● 第二醫藥組合物或劑型,其包含如本文所描述之MEK抑制劑及視情況一或多種醫藥學上可接受之載劑、賦形劑及/或媒劑。
在另一態樣中,本發明係關於前述套組,其進一步包含
● 包含印刷說明書之包裝插頁,其指示同時、並行、依序、連續、交替或分開用於治療及/或預防有需要之患者之如本文所描述之致癌或過度增生性疾病(特定言之癌症)。
在另一態樣中,本發明係關於前述套組,其用於治療及/或預防如本文所描述之致癌或過度增生性疾病(特定言之癌症)的方法中。
在另一態樣中,本發明係關於一種醫藥組合物,其包含
● 如本文所描述之SOS1抑制劑,
● 如本文所描述之MEK抑制劑,及
● 視情況一或多種醫藥學上可接受之載劑、賦形劑及/或媒劑。
在另一態樣中,本發明係關於如本文所描述之SOS1抑制劑之用途,其用於製備用於治療及/或預防如本文所描述之致癌或過度增生性疾病(特定言之癌症)的方法中之醫藥組合物,其中SOS1抑制劑將與如本文所描述之MEK抑制劑組合使用。
在另一態樣中,本發明係關於如本文所描述之MEK抑制劑之用途,其用於製備用於治療及/或預防如本文所描述之致癌或過度增生性疾病(特定言之癌症)的方法中之醫藥組合物,其中MEK抑制劑將與如本文所描述之SOS1抑制劑組合使用。
在另一態樣中,本發明係關於各自如本文所描述之SOS1抑制劑及MEK抑制劑之用途,其用於製備用於治療及/或預防如本文所描述之致癌或過度增生性疾病(特定言之癌症)的方法中之醫藥組合物。
在另一態樣中,本發明係關於各自如本文所描述之根據本發明之組合、醫藥組合物或套組,其包含各自如本文所描述之SOS1抑制劑及MEK抑制劑、由各自如本文所描述之SOS1抑制劑及MEK抑制劑組成或基本上由各自如本文所描述之SOS1抑制劑及MEK抑制劑組成,其用於治療及/或預防如本文所描述之致癌或過度增生性疾病(特定言之癌症)的方法中。
SOS1 抑制劑
較佳地,本發明及其所有實施例(包括治療方法、(醫學)用途、組合、組合物等)內之SOS1抑制劑係選自由以下組成之群:如PCT申請案第PCT/EP2018/086197號(WO 2019/122129)中所揭示之實例化合物I-1
至I-179
或其鹽,其揭示內容以全文引用的方式併入本文中,且亦揭示於本文中[A0]
。
如本文所使用之術語「SOS1抑制劑」亦包括上文以互變異構體、醫藥學上可接受之鹽、水合物或溶劑合物(包括醫藥學上可接受之鹽的水合物或溶劑合物)形式列出之SOS1抑制劑。其亦包括呈其所有固體形式(較佳結晶形式)及呈其醫藥學上可接受之鹽、水合物及溶劑合物(包括醫藥學上可接受之鹽的水合物及溶劑合物)之所有結晶形式的SOS1抑制劑。
上文列出之所有SOS1抑制劑揭示於PCT申請案第PCT/EP2018/086197號(WO 2019/122129)中,其揭示內容以全文引用的方式併入本文中,且在本文中具有各別合成及特性。
在一個實施例中,SOS1抑制劑為表A中之化合物I-1
或其醫藥學上可接受之鹽[A2]
。
在另一實施例中,SOS1抑制劑為表A中之化合物I -2
或其醫藥學上可接受之鹽[A3]
。
在另一實施例中,SOS1抑制劑為表A中之化合物I -3
或其醫藥學上可接受之鹽[A4]
。
在另一實施例中,SOS1抑制劑為表A中之化合物I -21
或其醫藥學上可接受之鹽[A5]
。
在另一實施例中,SOS1抑制劑為表A中之化合物I -52
或其醫藥學上可接受之鹽[A6]
。
在另一實施例中,SOS1抑制劑為表A中之化合物I -53
或其醫藥學上可接受之鹽[A7]
。
在另一實施例中,SOS1抑制劑為表A中之化合物I -54
或其醫藥學上可接受之鹽[A8]
。
在另一實施例中,SOS1抑制劑為表A中之化合物I -55
或其醫藥學上可接受之鹽[A9]
。
在另一實施例中,SOS1抑制劑為表A中之化合物I -58
或其醫藥學上可接受之鹽[A10]
。
在另一實施例中,SOS1抑制劑為表A中之化合物I -77
或其醫藥學上可接受之鹽[A11]
。
在另一實施例中,SOS1抑制劑為表A中之化合物I -82
或其醫藥學上可接受之鹽[A12]
。
在另一實施例中,SOS1抑制劑為表A中之化合物I -97
或其醫藥學上可接受之鹽[A13]
。
在另一實施例中,SOS1抑制劑為表A中之化合物I -98
或其醫藥學上可接受之鹽[A14]
。
在另一實施例中,SOS1抑制劑為表A中之化合物I -99
或其醫藥學上可接受之鹽[A15]
。
在另一實施例中,SOS1抑制劑為表A中之化合物I -102
或其醫藥學上可接受之鹽[A16]
。
在另一實施例中,SOS1抑制劑為表A中之化合物I -103
或其醫藥學上可接受之鹽[A17]
。
就SOS1抑制劑之性質而言,所有實施例[A1]
至[A17]
均為實施例[A0]
之較佳實施例。
MEK 抑制劑
較佳地,本發明及其所有實施例(包括治療方法、(醫學)用途、組合、組合物等)內之MEK抑制劑係選自由以下組成之群:如揭示於WO 2013/136249中之實例化合物1至79或其鹽及WO 2013/136254中之實例化合物1至21或其鹽,WO 2013/136249及WO 2013/136254之揭示內容以全文引用的方式併入本文中,且亦揭示於本文中(表B)[B0]
:表 B
如本文所使用之術語「MEK抑制劑」亦包括上文以互變異構體、醫藥學上可接受之鹽、水合物或溶劑合物(包括醫藥學上可接受之鹽的水合物或溶劑合物)形式列出之MEK抑制劑。其亦包括呈其所有固體形式(較佳結晶形式)及呈其醫藥學上可接受之鹽、水合物及溶劑合物(包括醫藥學上可接受之鹽的水合物及溶劑合物)之所有結晶形式的MEK抑制劑。
上文列出之所有MEK抑制劑揭示於WO 2013/136249及WO 2013/136254中,具有各別合成及特性。
更佳地,本發明及其所有實施例(包括治療方法、(醫學)用途、組合、組合物等)內之MEK抑制劑係選自由以下特定MEK1抑制劑或其鹽(表B)組成之群[B1]
:1-2、1-5、1-9、1-16、1-29、1-35、1-37、1-57、1-77、1-78、2-1、2-8、2-11、2-12、2-14、2-15、2-17。
甚至更佳地,本發明及其所有實施例(包括治療方法、(醫學)用途、組合、組合物等)內之MEK抑制劑係選自由以下特定MEK1抑制劑或其鹽(表B)組成之群[B2]
:1-2、1-5、1-9、1-35。
在一個實施例中,MEK抑制劑為表B中之化合物1-2
或其醫藥學上可接受之鹽[B3]
。
在另一實施例中,MEK抑制劑為表B中之化合物1 -5
或其醫藥學上可接受之鹽[B4]
。
在另一實施例中,MEK抑制劑為表B中之化合物1-9
或其醫藥學上可接受之鹽[B5]
。
在另一實施例中,MEK1抑制劑為表B中之化合物1 -16
或其醫藥學上可接受之鹽[B6]
。
在另一實施例中,MEK抑制劑為表B中之化合物1 -29
或其醫藥學上可接受之鹽[B7]
。
在另一實施例中,MEK抑制劑為表B中之化合物1 -35
或其醫藥學上可接受之鹽[B8]
。
在另一實施例中,MEK抑制劑為表B中之化合物1 -37
或其醫藥學上可接受之鹽[B9]
。
在另一實施例中,MEK抑制劑為表B中之化合物1 -57
或其醫藥學上可接受之鹽[B10]
。
在另一實施例中,MEK抑制劑為表B中之化合物1 -77
或其醫藥學上可接受之鹽[B11]
。
在另一實施例中,MEK抑制劑為表B中之化合物1 -78
或其醫藥學上可接受之鹽[B12]
。
在另一實施例中,MEK抑制劑為表B中之化合物2 -1
或其醫藥學上可接受之鹽[B13]
。
在另一實施例中,MEK抑制劑為表B中之化合物2 -8
或其醫藥學上可接受之鹽[B14]
。
在另一實施例中,MEK抑制劑為表B中之化合物2 -11
或其醫藥學上可接受之鹽[B15]
。
在另一實施例中,MEK抑制劑為表B中之化合物2 -12
或其醫藥學上可接受之鹽[B16]
。
在另一實施例中,MEK抑制劑為表B中之化合物2 -14
或其醫藥學上可接受之鹽[B17]
。
在另一實施例中,MEK抑制劑為表B中之化合物2 -15
或其醫藥學上可接受之鹽[B18]
。
在另一實施例中,MEK抑制劑為表B中之化合物2-17
或其醫藥學上可接受之鹽[B19]
。
就MEK抑制劑之性質而言,所有實施例[B1]
至[B19]
均為實施例[B0]
之較佳實施例。
實施例[A0]
至[A17]
(就SOS抑制劑之性質而言)與實施例[B0]
至[B19]
(就MEK抑制劑之性質而言)之組合且產生特定雙重組合或雙重組合組,其應視為具體揭示的且為本發明及其所有組合、組合物、套組、方法、用途及供使用化合物之實施例。
為了在療法中使用,SOS1抑制劑及MEK抑制劑單獨地或聯合地包括於適合於有助於向動物或人類投藥之醫藥組合物中。
用於單獨地或聯合地投與SOS1抑制劑及MEK抑制劑之典型醫藥組合物包括例如錠劑、膠囊、栓劑、溶液(例如,注射(皮下、靜脈內、肌肉內)及輸注用溶液)、酏劑、乳液或可分散散劑。醫藥活性化合物之含量可在整體組合物之0.1至90 wt%,較佳40至60 wt%之範圍內,例如呈足以實現所需劑量範圍之量。視需要,單一劑量可一天給予若干次以遞送所需總日劑量。
典型錠劑可例如藉由將活性物質與已知賦形劑混合(視情況與其組合)來獲得,例如惰性稀釋劑,諸如碳酸鈣、磷酸鈣、纖維素或乳糖;崩解劑,諸如玉米澱粉或褐藻酸或克羅斯波維登(crospovidon);黏合劑,諸如澱粉或明膠;潤滑劑,諸如硬脂酸鎂或滑石及/或延遲釋放用藥劑,諸如羧甲基纖維素、鄰苯二甲酸乙酸纖維素或聚乙酸乙烯酯。錠劑可藉由常用製程,諸如(例如)藉由直接壓製或輥壓製備。錠劑亦可包含若干層。
因此,包衣錠劑可藉由用通常用於錠劑包衣之物質(例如可力酮(collidone)或蟲膠(shellac)、阿拉伯膠(gum arabic)、滑石、二氧化鈦或糖)包覆類似於錠劑所產生之核心來製備。為達成延遲釋放或防止不相容性,核心亦可由多個層組成。類似地,錠劑包衣可由多個層組成以可能使用上文針對錠劑所提及之賦形劑達成延遲釋放。
含有活性物質之糖漿或酏劑可另外含有甜味劑,諸如糖精、賽克拉美(cyclamate)、丙三醇或糖;及風味增強劑,例如調味劑,諸如香草精或橙子萃取物。其亦可含有懸浮佐劑或增稠劑,諸如羧甲基纖維素鈉;濕潤劑,諸如(例如)脂肪醇與環氧乙烷之縮合產物;或防腐劑,諸如對羥基苯甲酸酯。
注射及輸注用溶液以常用方式製備,例如添加等張劑、諸如對羥基苯甲酸酯之防腐劑或諸如乙二胺四乙酸之鹼金屬鹽的穩定劑,視情況使用乳化劑及/或分散劑,同時若水用作稀釋劑,則例如有機溶劑可視情況用作溶劑化劑或溶解助劑,且轉移至注射小瓶或安瓿或輸注瓶中。
含有活性物質之膠囊可例如藉由將活性物質與諸如乳糖或山梨糖醇之惰性載劑混合且將其填充至明膠膠囊中來製備。
典型栓劑可例如藉由將活性物質與出於此目的而提供之載劑(諸如中性脂肪或聚乙二醇或其衍生物)混合來製造。
可使用之賦形劑包括例如水;醫藥學上可接受之有機溶劑,諸如石蠟(例如,石油餾分)、植物油(例如,花生油或芝麻油)、單官能或多官能醇(例如,乙醇或丙三醇);載劑,諸如(例如)天然礦物粉末(例如,高嶺土、黏土、滑石、白堊)、合成礦物粉末(例如,高度分散矽酸及矽酸鹽)、糖(例如,蔗糖、乳糖及葡萄糖)、乳化劑(例如,木質素、廢亞硫酸液體、甲基纖維素、澱粉及聚乙烯吡咯啶酮)及潤滑劑(例如,硬脂酸鎂、滑石、硬脂酸及月桂基硫酸鈉)。
本發明及其所有實施例之SOS1抑制劑及MEK抑制劑係藉由常用方法,較佳藉由經口或非經腸途徑,最佳藉由經口途徑投與。對於經口投藥,錠劑可含有除上述載劑之外的添加劑,諸如檸檬酸鈉、碳酸鈣及磷酸二鈣,以及諸如澱粉(較佳馬鈴薯澱粉)、明膠及類似者之各種添加劑。此外,諸如硬脂酸鎂、月桂基硫酸鈉及滑石之潤滑劑可同時用於制錠過程。在水性懸浮液之情況下,活性物質可與除上文所提及之賦形劑以外之各種風味增強劑或著色劑組合。
對於非經腸使用,可使用活性物質與適合液體載劑之溶液。
SOS1抑制劑(特定言之表A中之SOS1抑制劑)的經口使用之劑量為每劑1 mg至2000 mg (例如,每劑10 mg至1000 mg;在一更佳實施例中每劑200 mg至600 mg;最佳每劑400 mg至500 mg)。在一個實施例中,單一劑量包含50 mg之SOS1抑制劑。在另一實施例中,單一劑量包含100 mg之SOS1抑制劑。在另一實施例中,單一劑量包含200 mg之SOS1抑制劑。在另一實施例中,單一劑量包含400 mg之SOS1抑制劑。在另一實施例中,單一劑量包含800 mg之SOS1抑制劑。在另一實施例中,單一劑量包含1600 mg之SOS1抑制劑。在另一實施例中,單一劑量包含2000 mg之SOS1抑制劑。所有給出之量係指SOS1抑制劑之游離鹼且若使用醫藥學上可接受之鹽或其他固體形式,則可按比例增加。
在一個實施例中,SOS1抑制劑(特定言之表A中之SOS1抑制劑)係每天一次(q.d.)給藥。
靜脈內使用之劑量為每小時1 mg至1000 mg、較佳每小時5至500 mg。
然而,根據體重、投藥途徑、對藥物之個體反應、其調配物之性質及藥物投與歷經之時間或間隔,有時必須偏離指定量。因此,在一些情況下,使用小於上文給出之最小劑量可為足夠的,而在其他情況下可超過上限。當投與較大量時,建議將其分成一天內分佈的多個較小劑量。
組合療法
在本發明內,應理解根據本發明使用之組合、組合物、套組、方法、用途或化合物可設想同時、並行、依序、連續、交替或分開投與活性成分或組分。將瞭解如本文所描述之SOS1抑制劑及MEK抑制劑兩者可依賴性地或獨立地經調配投與,諸如(例如) SOS1抑制劑及MEK抑制劑可作為同一醫藥組合物/劑型之一部分或較佳地以單獨的醫藥組合物/劑型形式投與。
在此上下文中,在本發明之含義內之「組合(combination/combined)」包括(但不限於)由混合或組合超過一種活性成分產生之產物且包括固定及非固定(例如,自由)組合(包括套組)及使用,諸如(例如)組分或成分之同時、並行、依序、連續、交替或單獨使用。術語「固定組合」意謂活性成分皆以單一實體或劑量形式向患者同時投與。術語「非固定組合」意謂活性成分在無特定時間限制之情況下,皆以單獨實體之形式同時、並行或依序向患者投與,其中此類投藥在患者體內提供治療有效量之兩種化合物。
SOS1抑制劑及MEK抑制劑之投藥可藉由共投與活性組分或成分,諸如(例如)藉由將其以單一或以兩種或多於兩種單獨調配物或劑型同時或並行投與來進行。替代地,SOS1抑制劑及MEK之投藥可藉由依序或交替,諸如(例如)以兩種或多於兩種單獨調配物或劑型投與活性組分或成分進行。
舉例而言,同時投藥包括基本上同一時間投藥。此形式之投藥亦可稱作「伴隨」投藥。並行投藥包括在同一通用時段(例如在同一天但不一定在同一時間)內投與活性劑。交替投藥包括在一時段期間(例如在幾天或一週之療程內)投與一種藥劑,隨後在後續時段期間(例如在幾天或一週之療程內)投與另一藥劑,且接著重複模式持續一或多個週期。依序或連續投藥包括使用一或多個劑量在第一時段期間(例如在幾天或一週之療程內)投與一種藥劑,隨後使用一或多個劑量在第二及/或另外時段期間(例如在幾天或一週之療程內)投與另一藥劑。亦可採用重疊排程,其包括在治療期內之不同天數投與活性劑,不必根據常規順序。亦可採用此等通用準則之變化形式,例如根據所使用之藥劑及個體之病況。
本發明之組合之元素可藉由技術人員慣用之方法(無論依賴性地抑或獨立地)投與,例如藉由經口、經腸、非經腸(例如,肌肉內、腹膜內、靜脈內、經皮或皮下注射或植入)、經鼻、經陰道、經直腸或局部投藥途徑,且可以含有適合於各投藥途徑之習知無毒性醫藥學上可接受之載劑、賦形劑及/或媒劑的適合劑量單位調配物形式單獨或一起調配。
因此,在本發明之一個態樣中,本發明提供一種治療及/或預防如本文所描述之致癌或過度增生性疾病(特定言之癌症)的方法,其包含向有需要之患者投與治療有效量之SOS1抑制劑及治療有效量之MEK抑制劑,其中SOS1抑制劑係與MEK抑制劑同時、並行、依序、連續、交替或分開投與。
在另一態樣中,本發明提供一種如本文所描述之SOS1抑制劑,其用於治療及/或預防如本文所描述之致癌或過度增生性疾病(特定言之癌症)的方法中,該方法包含將SOS1抑制劑與如本文所描述之MEK抑制劑組合投與,其中SOS1抑制劑係與MEK抑制劑同時、並行、依序、連續、交替或分開投與。
在另一態樣中,本發明提供一種如本文所描述之MEK抑制劑,其用於治療及/或預防如本文所描述之致癌或過度增生性疾病(特定言之癌症)的方法中,該方法包含將MEK抑制劑與如本文所描述之SOS1抑制劑組合投與,其中MEK抑制劑係與SOS1抑制劑同時、並行、依序、連續、交替或分開投與。
在另一態樣中,本發明提供如本文所描述之SOS1抑制劑之用途,其用於製備用於治療及/或預防如本文所描述之致癌或過度增生性疾病(特定言之癌症)的方法中之醫藥組合物,其中SOS1抑制劑將與如本文所描述之MEK抑制劑組合使用,且其中SOS1抑制劑將與MEK抑制劑同時、並行、依序、連續、交替或分開投與。
在另一態樣中,本發明提供一種套組,其包含
● 第一醫藥組合物或劑型,其包含SOS1抑制劑及視情況一或多種醫藥學上可接受之載劑、賦形劑及/或媒劑,及
● 第二醫藥組合物或劑型,其包含MEK抑制劑及視情況一或多種醫藥學上可接受之載劑、賦形劑及/或媒劑,
其用於治療及/或預防如本文所描述之致癌或過度增生性疾病(特定言之癌症)的方法中,其中第一醫藥組合物或劑型將與第二醫藥組合物或劑型同時、並行、依序、連續、交替或分開投與。
在本發明之另一實施例中,根據本發明(包括所有實施例)使用之組合、套組、用途、方法及化合物的組分(亦即,組合搭配物)係同時投與。
在本發明之另一實施例中,根據本發明(包括所有實施例)使用之組合、套組、用途、方法及化合物之組分(亦即,組合搭配物)係並行投與。
在本發明之另一實施例中,根據本發明(包括所有實施例)使用之組合、套組、用途、方法及化合物之組分(亦即,組合搭配物)係依序投與。
在本發明之另一實施例中,根據本發明(包括所有實施例)使用之組合、套組、用途、方法及化合物之組分(亦即,組合搭配物)係連續投與。
在本發明之另一實施例中,根據本發明(包括所有實施例)使用之組合、套組、用途、方法及化合物之組分(亦即,組合搭配物)係交替投與。
在本發明之另一實施例中,根據本發明(包括所有實施例)使用之組合、套組、用途、方法及化合物之組分(亦即,組合搭配物)係分開投與。
本發明之組合可以治療有效之單一或分次日劑量投與。組合之活性組分可以在單一療法中治療有效之此類劑量或以低於或高於單一療法中使用之劑量的此類劑量投與,但在組合時產生所需(聯合)治療有效量。
根據本發明(包括所有實施例)使用之包括各自如本文所描述之SOS1抑制劑及MEK抑制劑的組合、組合物、套組、(醫學)用途、方法及化合物可視情況包括一或多種額外治療劑。
致癌或過度增生性疾病 / 癌症
根據本發明(包括所有實施例)使用之組合、組合物、套組、用途、方法及化合物適用於治療及/或預防致癌及過度增生性病症。
在某些實施例中,過度增生性病症為癌症。
癌症以兩種方法分類:根據其中癌症起源之組織類型(組織學類型)及根據原發部位或癌症首先發展之體內部位。最常見之癌症發展部位包括皮膚、肺、乳房、前列腺、結腸及直腸、子宮頸及子宮以及血液室。
根據本發明(包括所有實施例)使用之組合、組合物、套組、用途、方法及化合物可適用於治療多種致癌及過度增生性病症,特定言之癌症,其包括例如(但不限於)以下:
● 頭頸部之癌症/腫瘤/癌瘤:例如鼻腔、鼻竇、鼻咽、口腔(包括唇、齒齦、牙槽脊、磨牙後三角、口底、舌、硬齶、頰黏膜)、口咽(包括舌根、扁桃體、扁桃體弓(tonsillar pilar)、軟齶、扁桃體窩、咽壁)、中耳、喉(包括上聲門、聲門、下聲門、聲帶)、喉咽、唾液腺(包括小唾液腺)之腫瘤/癌瘤/癌症;
● 肺之癌症/腫瘤/癌瘤:例如非小細胞肺癌(NSCLC) (鱗狀細胞癌、梭狀細胞癌瘤、腺癌、大細胞癌、透明細胞癌瘤、支氣管肺泡)、小細胞肺癌(SCLC) (燕麥細胞癌、中等細胞癌、組合燕麥細胞癌);
● 縱隔之贅瘤:例如神經性腫瘤(包括神經纖維瘤、神經鞘瘤、惡性神經鞘瘤、神經肉瘤、神經節母細胞瘤、神經節細胞瘤、神經母細胞瘤、嗜鉻細胞瘤、副神經節瘤)、生殖細胞腫瘤(包括精原細胞瘤、畸胎瘤、非精原細胞瘤)、胸腺腫瘤(包括胸腺瘤、胸腺脂肪瘤、胸腺癌、胸腺類癌)、間葉性腫瘤(包括纖維瘤、纖維肉瘤、脂肪瘤、脂肪肉瘤、黏液瘤、間皮瘤、平滑肌瘤、平滑肌肉瘤、橫紋肌肉瘤、黃色肉芽腫、間葉瘤、血管瘤、血管內皮瘤、血管外皮瘤、淋巴管瘤、淋巴周邊細胞瘤、淋巴管肌瘤);
● 胃腸(GI)道之癌症/腫瘤/癌瘤:例如以下之腫瘤/癌瘤/癌症:食道、胃(胃癌)、胰臟、肝及膽道(包括肝細胞癌(HCC),例如兒童HCC、纖維板層HCC、組合HCC、梭狀細胞HCC、透明細胞HCC、巨細胞HCC、癌肉瘤HCC、硬化性HCC;肝母細胞瘤;膽管癌;膽管細胞癌瘤;肝囊腺癌;血管肉瘤、血管內皮瘤、平滑肌肉瘤、惡性神經鞘瘤、纖維肉瘤、克拉斯金瘤(Klatskin tumor))、膽囊、肝外膽管、小腸(包括十二指腸、空腸、回腸)、大腸(包括盲腸、結腸、直腸、肛門;結腸直腸癌、胃腸道基質瘤(GIST))、泌尿生殖系統(包括腎臟,例如腎盂、腎細胞癌(RCC)、腎母細胞瘤(威耳姆士瘤(Wilms´ tumor))、腎上腺樣瘤、格拉維茨瘤(Grawitz tumor);輸尿管;膀胱,例如臍尿管癌、尿道上皮癌;尿道,例如遠端、球膜、前列腺;前列腺(雄激素依賴性、雄激素非依賴性、去勢抗性、激素非依賴性、激素難治性)、陰莖);
● 睪丸之癌症/腫瘤/癌瘤:例如精原細胞瘤、非精原細胞瘤,
● 婦科癌症/腫瘤/癌瘤:例如卵巢、輸卵管、腹膜、子宮頸、外陰、陰道、子宮體(包括子宮內膜、底部)之腫瘤/癌瘤/癌症;
● 乳房之癌症/腫瘤/癌瘤:例如乳癌(浸潤性乳腺管癌、膠樣癌、小葉侵襲性癌、導管癌、腺囊癌、乳頭狀癌瘤、髓質癌、黏液癌)、激素受體陽性乳癌(雌激素受體陽性乳癌、孕酮受體陽性乳癌)、Her2陽性乳癌、三陰性乳癌、佩吉特氏乳房病(Paget´s disease of the breast);
● 內分泌系統之癌症/腫瘤/癌瘤:例如以下內分泌腺之腫瘤/癌瘤/癌症:甲狀腺(甲狀腺癌瘤/腫瘤;乳頭狀癌、濾泡性癌、退行性癌、髓質癌)、甲狀旁腺(甲狀旁腺癌瘤/腫瘤)、腎上腺皮層(腎上腺皮層癌瘤/腫瘤)、腦下腺(包括促乳素瘤、顱咽管瘤)、胸腺、腎上腺、松果體腺、頸動脈體、胰島細胞瘤、副神經節、胰臟內分泌腫瘤(PET;非功能性PET、胰多肽瘤(PPoma)、胃泌素瘤、胰島素瘤、血管活性腸肽瘤(VIPoma)、升糖素瘤、生長抑制素瘤、生長激素釋放因子瘤(GRFoma)、促腎上腺皮質激素瘤(ACTHoma))、類癌;
● 軟組織之肉瘤:例如纖維肉瘤、纖維組織細胞瘤、脂肪肉瘤、平滑肌肉瘤、橫紋肌肉瘤、血管肉瘤、淋巴管肉瘤、卡堡氏肉瘤(Kaposi´s sarcoma)、血管球腫瘤、血管外皮瘤、滑膜肉瘤、腱鞘巨細胞瘤、胸膜及腹膜孤立性纖維腫瘤、瀰漫性間皮瘤、惡性周邊神經外鞘瘤(MPNST)、顆粒細胞瘤、透明細胞肉瘤、黑素細胞神經鞘瘤、神經叢肉瘤(plexosarcoma)、神經母細胞瘤、神經節母細胞瘤、神經上皮瘤、骨外尤文氏肉瘤(extraskeletal Ewing´s sarcoma)、副神經節瘤、骨外軟骨肉瘤、骨外骨肉瘤、間葉瘤、軟組織肺泡狀肉瘤、上皮樣肉瘤、腎外橫紋肌樣瘤、促結締組織增生小細胞瘤;
● 骨骼之肉瘤:例如骨髓瘤、網狀細胞肉瘤、軟骨肉瘤(包括中心細胞軟骨肉瘤、周邊細胞軟骨肉瘤、透明細胞軟骨肉瘤、間葉軟骨肉瘤)、骨肉瘤(包括骨旁骨肉瘤、骨膜骨肉瘤、高惡性表面骨肉瘤、小細胞骨肉瘤、放射線誘發之骨肉瘤、佩吉特氏肉瘤(Paget´s sarcoma))、尤文氏瘤(Ewing´s tumor)、惡性巨細胞瘤、釉質瘤、(纖維)組織細胞瘤、纖維肉瘤、脊索瘤、小圓形細胞肉瘤、血管內皮瘤、血管外皮瘤、骨軟骨瘤、骨樣骨瘤、骨母細胞瘤、嗜酸性肉芽腫、軟骨母細胞瘤;
● 間皮瘤:例如胸膜間皮瘤、腹膜間皮瘤;
● 皮膚之癌症:例如基底細胞癌、鱗狀細胞癌、默克爾氏細胞癌瘤(Merkel´s cell carcinoma)、黑素瘤(包括皮膚黑素瘤、淺表擴散性黑素瘤、惡性雀斑樣痣黑素瘤、肢端雀斑痣性黑素瘤、結節狀黑素瘤、眼內黑素瘤)、光化性角化症、眼瞼癌;
● 中樞神經系統及大腦之贅瘤:例如星形細胞瘤(大腦星形細胞瘤、小腦星形細胞瘤、瀰漫性星形細胞瘤、肌原纖維性星形細胞瘤、退行性星形細胞瘤、毛細胞型星形細胞瘤、原生質星形細胞瘤、大圓形細胞性星形細胞瘤)、神經膠母細胞瘤、神經膠質瘤、寡突神經膠質細胞瘤、寡突星形細胞瘤、室管膜瘤、室管膜母細胞瘤、脈絡叢腫瘤、神經管胚細胞瘤、脊膜瘤、神經鞘瘤、血管母細胞瘤、血管瘤、血管外皮細胞瘤、神經瘤、神經節細胞瘤、神經母細胞瘤、視網膜胚細胞瘤、神經瘤(例如,聽覺神經瘤)、脊髓腫瘤;
● 淋巴瘤及白血病:例如B細胞非霍奇金氏淋巴瘤(B-cell non-Hodgkin lymphomas;NHL) (包括小淋巴球性淋巴瘤(SLL)、淋巴漿細胞樣淋巴瘤(LPL)、套細胞淋巴瘤(MCL)、濾泡性淋巴瘤(FL)、瀰漫性大細胞淋巴瘤(DLCL)、伯基特氏淋巴瘤(Burkitt´s lymphoma;BL))、T細胞非霍奇金氏淋巴瘤(包括退行性大細胞淋巴瘤(ALCL)、成人T細胞白血病/淋巴瘤(ATLL)、皮膚T細胞淋巴瘤(CTCL)、周邊T細胞淋巴瘤(PTCL))、淋巴母細胞T細胞淋巴瘤(T-LBL)、成人T細胞淋巴瘤、淋巴母細胞B細胞淋巴瘤(B-LBL)、免疫細胞瘤、慢性B細胞淋巴球性白血病(B-CLL)、慢性T細胞淋巴球性白血病(T-CLL)、B細胞小淋巴球性淋巴瘤(B-SLL)、皮膚T細胞淋巴瘤(CTLC)、原發性中樞神經系統淋巴瘤(PCNSL)、免疫母細胞瘤、霍奇金氏病(Hodgkin´s disease;HD) (包括結節性淋巴細胞優勢HD (NLPHD)、結節性硬化HD (NSHD)、混合細胞性HD (MCHD)、富含淋巴細胞典型HD、淋巴細胞耗竭HD (LDHD))、大顆粒淋巴細胞白血病(LGL)、慢性骨髓性白血病(CML)、急性骨髓性/骨髓白血病(AML)、急性淋巴/淋巴母細胞白血病(ALL)、急性前髓細胞性白血病(APL)、慢性淋巴球性/淋巴白血病(CLL)、前淋巴球性白血病(PLL)、毛細胞白血病、慢性骨髓性/骨髓白血病(CML)、骨髓瘤、漿細胞瘤、多發性骨髓瘤(MM)、漿細胞瘤、骨髓發育不良症候群(MDS)、慢性骨髓單核細胞性白血病(CMML);
● 原發部位未知之癌症(CUP)。
藉由其體內之特定位置/起源表徵之上文提及之所有癌症/腫瘤/癌瘤意謂包括原發性腫瘤及自其衍生之轉移性腫瘤兩者。
上文提及之所有癌症/腫瘤/癌瘤可藉由其組織病理學分類而進一步區分:
上皮癌症,例如鱗狀細胞癌(SCC) (原位癌,表面侵襲性癌瘤、疣狀癌、假性肉瘤、退行性癌瘤、移行細胞癌瘤、淋巴上皮癌)、腺癌(AC) (良好分化的腺癌、黏液腺癌、乳頭狀腺癌、多形性巨細胞腺癌、乳腺管腺癌、小細胞腺癌、印戒細胞腺癌、梭狀細胞腺癌、透明細胞腺癌、燕麥細胞腺癌、膠樣腺癌、腺鱗腺癌、黏液表皮樣腺癌、腺樣囊性腺癌)、黏液囊腺癌、腺泡細胞癌瘤、大細胞癌、小細胞癌瘤、神經內分泌腫瘤(小細胞癌瘤、副神經節瘤、類癌);嗜酸性細胞癌瘤;
非上皮癌症,例如肉瘤(纖維肉瘤、軟骨肉瘤、橫紋肌肉瘤、平滑肌肉瘤、血管肉瘤、巨細胞肉瘤、淋巴肉瘤、纖維組織細胞瘤、脂肪肉瘤、血管肉瘤、淋巴管肉瘤、神經纖維肉瘤)、淋巴瘤、黑素瘤、生殖細胞腫瘤、血液學贅瘤、混合性及未分化性癌瘤。
在本發明之另一實施例中,根據本發明(包括所有實施例)使用之組合、組合物、套組、用途、方法及化合物用於治療非小細胞肺癌(NSCLC) (包括例如局部晚期或轉移性NSCLC (IIIB/IV期)、NSCLC腺癌、鱗狀組織學NSCLC、非鱗狀組織學NSCLC)。
在本發明之另一實施例中,根據本發明(包括所有實施例)使用之組合、組合物、套組、用途、方法及化合物用於治療非小細胞肺癌(NSCLC),特定言之NSCLC腺癌。
在本發明之另一實施例中,根據本發明(包括所有實施例)使用之組合、組合物、套組、用途、方法及化合物用於治療結腸直腸癌。
在本發明之另一實施例中,根據本發明(包括所有實施例)使用之組合、組合物、套組、用途、方法及化合物用於治療胰臟癌。
在本發明之另一實施例中,根據本發明(包括所有實施例)使用之組合、組合物、套組、用途、方法及化合物用於治療膽管癌。
在本發明之另一實施例中,根據本發明(包括所有實施例)使用之組合、組合物、套組、用途、方法及化合物用於治療選自由以下組成之群的疾病:胰臟癌、肺癌、結腸直腸癌、膽管癌、多發性骨髓瘤、黑素瘤、子宮癌、子宮內膜癌、甲狀腺癌、急性骨髓白血病、膀胱癌、尿道上皮癌、胃癌、子宮頸癌、頭頸部鱗狀細胞癌、瀰漫性大B細胞淋巴瘤、食道癌、慢性淋巴球性白血病、肝細胞癌、乳癌、卵巢癌、前列腺癌、神經膠母細胞瘤、腎癌及肉瘤。
在本發明之另一實施例中,根據本發明(包括所有實施例)使用之組合、組合物、套組、用途、方法及化合物用於治療較佳選自由以下組成之群的RAS蛋白家族病變:1型神經纖維瘤(NF1)、努南症候群(NS)、努南症候群伴多發性雀斑(NSML) (亦稱為LEOPARD症候群)、毛細血管畸形-動靜脈畸形症候群(CM-AVM)、科斯特洛症候群(Costello Syndrome;CS)、心臟-面部-皮膚症候群(CFC)、利吉斯症候群(Legius Syndrome) (亦稱為NF1樣症候群)及遺傳性齒齦纖維瘤病。
在本發明之另一實施例中,根據本發明(包括所有實施例)使用之組合、組合物、套組、用途、方法及化合物用於治療經定義為展現以下分子特徵中之一或多者的疾病/病況:1. KRAS 變異:
a. KRAS擴增(wt
或突變);
b. KRAS過度表現(wt
或突變);
c. KRAS突變:
i. G12突變(例如G12C、G12V、G12S、G12A、G12V、G12R、G12F、G12D);
ii. G13突變(例如G13C、G13D、G13R、G13V、G13S、G13A)
iii. T35突變(例如T35I);
iv. I36突變(例如I36L、I36M);
v. E49突變(例如E49K);
vi. Q61突變(例如Q61H、Q61R、Q61P、Q61E、Q61K、Q61L、Q61K);
vii. K117突變(例如K117N);
viii. A146突變(例如A146T、A146V);2. NRAS 變異:
a. NRAS擴增(wt
或突變);
b. NRAS過度表現(wt
或突變);
c. NRAS突變:
i. G12突變(例如G12A、G12V、G12D、G12C、G12S、G12R);
ii. G13突變(例如G13V、G13D、G13R、G13S、G13C、G13A);
iii. Q61突變(例如Q61K、Q61L、Q61H、Q61P、Q61R);
iv. A146突變(例如A146T、A146V);3. HRAS 變異:
a. HRAS擴增(wt
或突變);
b. HRAS過度表現(wt
或突變);
c. HRAS突變;
i. G12突變(例如G12C、G12V、G12S、G12A、G12V、G12R、G12F、G12D);
ii. G13突變(例如G13C、G13D、G13R、G13V、G13S、G13A);
iii. Q61突變(例如Q61K、Q61L、Q61H、Q61P、Q61R);4. EGFR 變異:
a. EGFR擴增(wt
或突變);
b. EGFR過度表現(wt
或突變);
c. EGFR突變
i. 例如外顯子20插入、外顯子19缺失(Del19)、G719X (例如G719A、G719C、G719S)、T790M、C797S、T854A、L858R、L861Q或其任何組合;5. ErbB2 (Her2) 變異:
a. ErbB2擴增;
b. ErbB2過度表現;
c. ErbB2突變
i. 例如R678、G309、L755、D769、D769、V777、P780、V842、R896、c.2264_2278del (L755_T759del)、c.2339_2340ins (G778_P780dup)、S310;6. c-MET 變異:
a. c-MET擴增;
b. c-MET過度表現;
c. c-MET突變
i. 例如E168、N375、Q648、A887、E908、T1010、V1088、H1112、R1166、R1188、Y1248、Y1253、M1268、D1304、A1357、P1382;7. AXL 變異 :
a. AXL擴增;
b. AXL過度表現;8. BCR-ABL 變異:
a. 涉及ABL基因之染色體重排;9. ALK 變異:
a. ALK擴增;
b. ALK過度表現;
c. ALK突變
i. 例如1151Tins、L1152R、C1156Y、F1174L、L1196M、L1198F、G1202R、S1206Y、G1269A;
d. 涉及ALK基因之染色體重排;10. FGFR1 變異:
a. FGFR1擴增;
b. FGFR1過度表現;11. FGFR2 變異:
a. FGFR2擴增;
b. FGFR2過度表現;12. FGFR3 變異:
a. FGFR3擴增;
b. FGFR3過度表現;
c. 涉及FGFR3基因之染色體重排;13. NTRK1 變異:
a. 涉及NTRK1基因之染色體重排;14. NF1 變異:
a. NF1突變;
b. NF1功能缺失突變
c. NF1缺失15. RET 變異:
a. RET擴增;
b. RET過度表現;
c. 涉及RET基因之染色體重排16. ROS1 變異:
a. ROS1擴增;
b. ROS1過度表現;
c. ROS1突變
i. 例如G2032R、D2033N、L2155S;
d. 涉及ROS1基因之染色體重排;17. SOS1 變異
a. SOS1擴增;
b. SOS1過度表現;
c. SOS1突變;18. RAC1 變異
a. RAC1擴增;
b. RAC1過度表現;
c. RAC1突變;19. MDM2 變異
a. MDM2擴增
b. MDM2過度表現
c. MDM2擴增結合功能性p53
d. MDM2擴增結合野生型p5320. RAS 野生型
a. KRAS野生型
b. HRAS野生型
c. NRAS野生型21. 除 V600E 外之 B-Raf 突變
較佳地,根據本發明(包括所有實施例)使用之組合、組合物、套組、用途、方法及化合物用於治療經定義為展現KRAS突變之疾病/病況/癌症。
尤佳,根據本發明(包括所有實施例)使用之組合、組合物、套組、用途、方法及化合物用於治療以下:
● 攜帶有選自由以下組成之群的KRAS突變之肺腺癌:G12C、G12V、G12D及G12R;
● 攜帶有選自由以下組成之群的KRAS突變之結腸直腸腺癌:G12D、G12V、G12C、G12R及G13D;及
● 攜帶有選自由以下組成之群的KRAS突變之胰臟腺癌:G12D、G12V、G12R、G12C及Q61H。
根據本發明之組合療法之治療適用性可包括患者之第一線、第二線、第三線或其他線治療。癌症可為轉移性、反覆性、復發性、對一或多種抗癌治療具有耐藥性或難治性。因此,患者可為尚未接受治療的,或可接受過一或多種前述抗癌療法,該等抗癌療法並未完全治癒疾病。
對一或多種抗癌劑(例如,組合之單一組分或標準化學治療劑)具有復發性及/或具有耐藥性之患者亦適用於根據本發明之組合治療,例如用於第二或第三線治療週期(視情況與一或多種其他抗癌劑進一步組合),例如作為附加組合或作為替代治療。
因此,本發明之一些揭示之組合療法有效於治療其癌症已復發,或其癌症已變得耐藥或多藥耐藥性的,或其癌症用一或多種抗癌劑(例如,組合之單一組分或標準化學治療劑)之一種、兩種或更多種單一療法或組合療法線治療失敗的個體。
當抗癌藥物在治療患有癌症之個體中不再有效時,例如儘管投與增加劑量之抗癌藥物,但最初對抗癌藥物起反應之癌症可復發且變得對抗癌藥物具有耐藥性。對兩種或更多種抗癌藥已產生耐藥性之癌症稱為多藥耐藥性的。
因此,在本發明之一些組合治療方法中,若患者對最初或先前投與之一或多種藥劑具有耐藥性或產生耐藥性,則開始第二次或第三次投與的根據本發明之組合治療。患者可僅接受用各藥劑之單一治療療程或用一種、兩種或更多種藥劑之多個療程。
在某些情況下,根據本發明之組合療法因此可包括初始或附加組合、替代或維持治療。
本發明之範疇不受本文所描述之特定實施例限制。除本文所描述之彼等修改以外,本發明之各種修改對於熟習此項技術者而言可自本發明變得顯而易見。此類修改意欲屬於隨附申請專利範圍之範疇內。
定義
未在本文中特定定義之術語應被賦予熟習此項技術者依據本發明及上下文將對其賦予之含義。然而,如本說明書中所使用,除非相反說明,否則以下術語具有指示之含義且遵守以下慣例:
前綴Cx-y
(其中x
及y
各自表示正整數(x
<y
))之使用指示以直接關聯指定及提及之鏈或環結構或鏈及環結構作為整體之組合可由最大值y
及最小值x
個碳原子組成。
含有一或多個雜原子之基團(例如,雜芳基、雜芳基烷基、雜環基、雜環基烷基)中成員數之指示係關於所有環成員之總原子數或所有環及碳鏈成員之總數。
由碳鏈及碳環結構之組合組成之基團(例如,環烷基烷基、芳基烷基)中碳原子數之指示係關於所有碳環及碳鏈成員之總碳原子數。顯然,環結構具有至少三個成員。
一般而言,對於包含兩個或多於兩個亞基之基團(例如,雜芳基烷基、雜環基烷基、環烷基烷基、芳基烷基),最後命名之亞基為基團連接點,例如取代基芳基-C1-6
烷基意謂芳基結合至C1-6
烷基,後者結合至核或取代基所連接之基團。
在如HO、H2
N、(O)S、(O)2
S、NC(氰基)、HOOC、F3
C或類似者之基團中,熟習此項技術者可自基團自身之游離價數看到分子之基團連接點。
烷基
表示單價飽和烴鏈,其可以直鏈(未分支)及分支鏈形式兩者存在。若烷基
經取代,則取代可藉由在各情況下單取代或多取代彼此獨立地在所有載氫碳原子上進行。
術語「C1-5
烷基」包括例如H3
C-、H3
C-CH2
-、H3
C-CH2
-CH2
-、H3
C-CH(CH3
)-、H3
C-CH2
-CH2
-CH2
-、H3
C-CH2
-CH(CH3
)-、H3
C-CH(CH3
)-CH2
-、H3
C-C(CH3
)2
-、H3
C-CH2
-CH2
-CH2
-CH2
-、H3
C-CH2
-CH2
-CH(CH3
)-、H3
C-CH2
-CH(CH3
)-CH2
-、H3
C-CH(CH3
)-CH2
-CH2
-、H3
C-CH2
-C(CH3
)2
-、H3
C-C(CH3
)2
-CH2
-、H3
C-CH(CH3
)-CH(CH3
)-及H3
C-CH2
-CH(CH2
CH3
)-。
烷基
之其他實例為甲基(Me;-CH3
)、乙基(Et;-CH2
CH3
)、1-丙基(正丙基;n
-Pr;-CH2
CH2
CH3
)、2-丙基(i
-Pr;異丙基;-CH(CH3
)2
)、1-丁基(正丁基;n
-Bu;-CH2
CH2
CH2
CH3
)、2-甲基-1-丙基(異丁基;i
-Bu;-CH2
CH(CH3
)2
)、2-丁基(第二丁基;sec
-Bu;-CH(CH3
)CH2
CH3
)、2-甲基-2-丙基(第三丁基;t
-Bu;-C(CH3
)3
)、1-戊基(正戊基;-CH2
CH2
CH2
CH2
CH3
)、2-戊基(-CH(CH3
)CH2
CH2
CH3
)、3-戊基(-CH(CH2
CH3
)2
)、3-甲基-1-丁基(異戊基;-CH2
CH2
CH(CH3
)2
)、2-甲基-2-丁基(-C(CH3
)2
CH2
CH3
)、3-甲基-2-丁基(-CH(CH3
)CH(CH3
)2
)、2,2-二甲基-1-丙基(新戊基;-CH2
C(CH3
)3
)、2-甲基-1-丁基(-CH2
CH(CH3
)CH2
CH3
)、1-己基(正己基;-CH2
CH2
CH2
CH2
CH2
CH3
)、2-己基(-CH(CH3
)CH2
CH2
CH2
CH3
)、3-己基(-CH(CH2
CH3
)(CH2
CH2
CH3
))、2-甲基-2-戊基(-C(CH3
)2
CH2
CH2
CH3
)、3-甲基-2-戊基(-CH(CH3
)CH(CH3
)CH2
CH3
)、4-甲基-2-戊基(-CH(CH3
)CH2
CH(CH3
)2
)、3-甲基-3-戊基(-C(CH3
)(CH2
CH3
)2
)、2-甲基-3-戊基(-CH(CH2
CH3
)CH(CH3
)2
)、2,3-二甲基-2-丁基(-C(CH3
)2
CH(CH3
)2
)、3,3-二甲基-2-丁基(-CH(CH3
)C(CH3
)3
)、2,3-二甲基-1-丁基(-CH2
CH(CH3
)CH(CH3
)CH3
)、2,2-二甲基-1-丁基(-CH2
C(CH3
)2
CH2
CH3
)、3,3-二甲基-1-丁基(-CH2
CH2
C(CH3
)3
)、2-甲基-1-戊基(-CH2
CH(CH3
)CH2
CH2
CH3
)、3-甲基-1-戊基(-CH2
CH2
CH(CH3
)CH2
CH3
)、1-庚基(正庚基)、2-甲基-1-己基、3-甲基-1-己基、2,2-二甲基-1-戊基、2,3-二甲基-1-戊基、2,4-二甲基-1-戊基、3,3-二甲基-1-戊基、2,2,3-三甲基-1-丁基、3-乙基-1-戊基、1-辛基(正辛基)、1-壬基(正壬基);1-癸基(正癸基)等。
無任何其他定義之術語丙基、丁基、戊基、己基、庚基、辛基、壬基、癸基等意謂具有對應碳原子數目之飽和烴基,其中包括所有異構體形式。
若烷基
為另一(組合)基團(諸如(例如) Cx-y 烷基
胺基或Cx-y 烷基
氧基)之一部分,則上文關於烷基
之定義亦適用。
術語伸烷基
亦可衍生自烷基
。與烷基
不同,伸烷基
為二價且需要兩個結合搭配物。形式上,藉由移除烷基
中之氫原子產生第二價數。對應基團為例如-CH3
及-CH2
-、-CH2
CH3
及-CH2
CH2
-或>CHCH3
等。
術語「C1-4
伸烷基」包括例如-(CH2
)-、-(CH2
-CH2
)-、-(CH(CH3
))-、-(CH2
-CH2
-CH2
)-、-(C(CH3
)2
)-、-(CH(CH2
CH3
))-、-(CH(CH3
)-CH2
)-、-(CH2
-CH(CH3
))-、-(CH2
-CH2
-CH2
-CH2
)-、-(CH2
-CH2
-CH(CH3
))-、-(CH(CH3
)-CH2
-CH2
)-、-(CH2
-CH(CH3
)-CH2
)-、-(CH2
-C(CH3
)2
)-、-(C(CH3
)2
-CH2
)-、-(CH(CH3
)-CH(CH3
))-、-(CH2
-CH(CH2
CH3
))-、-(CH(CH2
CH3
)-CH2
)-、-(CH(CH2
CH2
CH3
))-、-(CH(CH(CH3
))2
)-及-C(CH3
)(CH2
CH3
)-。
伸烷基
之其他實例為亞甲基、伸乙基、伸丙基、1-甲基伸乙基、伸丁基、1-甲基伸丙基、1,1-二甲基伸乙基、1,2-二甲基伸乙基、伸戊基、1,1-二甲基伸丙基、2,2-二甲基伸丙基、1,2-二甲基伸丙基、1,3-二甲基伸丙基、伸己基等。
無任何其他定義之通用術語伸丙基、伸丁基、伸戊基、伸己基等意謂所有具有對應碳原子數目之可設想異構體形式,亦即伸丙基包括1-甲基伸乙基,且伸丁基包括1-甲基伸丙基、2-甲基伸丙基、1,1-二甲基伸乙基及1,2-二甲基伸乙基。
若伸烷基
為另一(組合)基團之一部分(諸如(例如)在HO-Cx-y 伸烷基
胺基或H2
N-Cx-y 伸烷基
氧基中),則上文關於伸烷基
之定義亦適用。
不同於烷基
,烯基
由至少兩個碳原子組成,其中至少兩個相鄰碳原子藉由C-C雙鍵接合在一起且碳原子僅可為一個C-C雙鍵之一部分。若在如上文所定義之具有至少兩個碳原子之烷基
中,形式上移除相鄰碳原子上的兩個氫原子且使游離價數飽和以形成第二鍵,則形成對應烯基
。
烯基
之實例為乙烯基(vinyl/ethenyl)、丙-1-烯基、烯丙基(丙-2-烯基)、異丙烯基、丁-1-烯基、丁-2-烯基、丁-3-烯基、2-甲基-丙-2-烯基、2-甲基-丙-1-烯基、1-甲基-丙-2-烯基、1-甲基-丙-1-烯基、1-亞甲基丙基、戊-1-烯基、戊-2-烯基、戊-3-烯基、戊-4-烯基、3-甲基-丁-3-烯基、3-甲基-丁-2-烯基、3-甲基-丁-1-烯基、己-1-烯基、己-2-烯基、己-3-烯基、己-4-烯基、己-5-烯基、2,3-二甲基-丁-3-烯基、2,3-二甲基-丁-2-烯基、2-亞甲基-3-甲基丁基、2,3-二甲基-丁-1-烯基、己-1,3-二烯基、己-1,4-二烯基、五-1,4-二烯基、五-1,3-二烯基、丁-1,3-二烯基、2,3-二甲基丁-1,3-二烯等。
無任何其他定義之通用術語丙烯基、丁烯基、戊烯基、己烯基、丁二烯基、戊二烯基、己二烯基、庚二烯基、辛二烯基、壬二烯基、癸二烯基等意謂所有具有對應碳原子數目之可設想異構體形式,亦即丙烯基包括丙-1-烯基及丙-2-烯基,丁烯基包括丁-1-烯基、丁-2-烯基、丁-3-烯基、1-甲基-丙-1-烯基、1-甲基-丙-2-烯基等。
烯基
可視情況相對於雙鍵以順式或反式或E
或Z
定向存在。
若烯基
為另一(組合)基團之一部分(諸如(例如)在Cx-y 烯基
胺基或Cx-y 烯基
氧基中),上文關於烯基
之定義亦適用。
不同於伸烷基
,伸烯基
由至少兩個碳原子組成,其中至少兩個相鄰碳原子藉由C-C雙鍵接合在一起且碳原子僅可為一個C-C雙鍵之一部分。若在如上文所定義之具有至少兩個碳原子之伸烷基
中,形式上移除相鄰碳原子處之兩個氫原子且使游離價數飽和以形成第二鍵,則形成對應伸烯基
。
伸烯基
之實例為伸乙烯基、伸丙烯基、1-甲基伸乙烯基、伸丁烯基、1-甲基伸丙烯基、1,1-二甲基伸乙烯基、1,2-二甲基伸乙烯基、伸戊烯基、1,1-二甲基伸丙烯基、2,2-二甲基伸丙烯基、1,2-二甲基伸丙烯基、1,3-二甲基伸丙烯基、伸己烯基等。
無任何定義之通用術語伸丙烯基、伸丁烯基、伸戊烯基、伸己烯基等意謂所有具有對應碳原子數目之可設想異構體形式,亦即伸丙烯基包括1-甲基伸乙烯基,且伸丁烯基包括1-甲基伸丙烯基、2-甲基伸丙烯基、1,1-二甲基伸乙烯基及1,2-二甲基伸乙烯基。
伸烯基
可視情況相對於雙鍵以順式或反式或E
或Z
定向存在。
若伸烯基
為另一(組合)基團之一部分(如例如在HO-Cx-y 伸烯基
胺基或H2
N-Cx-y 伸烯基
氧基中),上文關於伸烯基
之定義亦適用。
不同於烷基
,炔基
由至少兩個碳原子組成,其中至少兩個相鄰碳原子藉由C-C參鍵接合在一起。若在如上文所定義之具有至少兩個碳原子之烷基
中,在各情況下形式上移除相鄰碳原子處之兩個氫原子且使游離價數飽和以形成另兩個鍵,則形成對應炔基
。
炔基
之實例為乙炔基、丙-1-炔基、丙-2-炔基、丁-1-炔基、丁-2-炔基、丁-3-炔基、1-甲基-丙-2-炔基、戊-1-炔基、戊-2-炔基、戊-3-炔基、戊-4-炔基、3-甲基-丁-1-炔基、己-1-炔基、己-2-炔基、己-3-炔基、己-4-炔基、己-5-炔基等。
無任何其他定義之通用術語丙炔基、丁炔基、戊炔基、己炔基、庚炔基、辛炔基、壬炔基、癸炔基等意謂所有具有對應碳原子數目之可設想異構體形式,亦即丙炔基包括丙-1-炔基及丙-2-炔基,丁炔基包括丁-1-炔基、丁-2-炔基、丁-3-炔基、1-甲基-丙-1-炔基、1-甲基-丙-2-炔基等。
若烴鏈攜帶至少一個雙鍵以及至少一個參鍵兩者,則藉由定義使其屬於炔基
亞基。
若炔基
為另一(組合)基團之一部分(如例如在Cx-y 炔基
胺基或Cx-y 炔基
氧基中),則上文關於炔基
之定義亦適用。
不同於伸烷基
,伸炔基
由至少兩個碳原子組成,其中至少兩個相鄰碳原子藉由C-C參鍵接合在一起。若在如上文所定義之具有至少兩個碳原子之伸烷基
中,在各情況下形式上移除相鄰碳原子處之兩個氫原子且使游離價數飽和以形成另兩個鍵,則形成對應伸炔基
。
伸炔基
之實例為伸乙炔基、伸丙炔基、1-甲基伸乙炔基、伸丁炔基、1-甲基伸丙炔基、1,1-二甲基伸乙炔基、1,2-二甲基伸乙炔基、伸戊炔基、1,1-二甲基伸丙炔基、2,2-二甲基伸丙炔基、1,2-二甲基伸丙炔基、1,3-二甲基伸丙炔基、伸己炔基等。
無任何其他定義之通用術語伸丙炔基、伸丁炔基、伸戊炔基、伸己炔基等意謂所有具有對應碳原子數目之可設想異構體形式,亦即伸丙炔基包括1-甲基伸乙炔基,且伸丁炔基包括1-甲基伸丙炔基、2-甲基伸丙炔基、1,1-二甲基伸乙炔基及1,2-二甲基伸乙炔基。
若伸炔基
為另一(組合)基團之一部分(如例如在HO-Cx-y 伸炔基
胺基或H2
N-Cx-y 伸炔基
氧基中),則上文關於伸炔基
之定義亦適用。
雜原子
意謂氧、氮及硫原子。
鹵烷基 ( 鹵烯基、鹵炔基 )
藉由烴鏈之一或多個氫原子彼此獨立地經可相同或不同的鹵素原子置換而衍生自先前定義之烷基 ( 烯基、炔基 )
。若鹵烷基 ( 鹵烯基、鹵炔基 )
進一步經取代,則取代可在各情況下以單取代或多取代形式彼此獨立地在所有載氫碳原子上進行。
鹵烷基 ( 鹵烯基、鹵炔基 )
之實例為-CF3
、-CHF2
、-CH2
F、-CF2
CF3
、-CHFCF3
、-CH2
CF3
、-CF2
CH3
、-CHFCH3
、-CF2
CF2
CF3
、-CF2
CH2
CH3
、-CF=CF2
、-CCl=CH2
、-CBr=CH2
、-C≡C-CF3
、-CHFCH2
CH3
、-CHFCH2
CF3
等。
自先前定義之鹵烷基 ( 鹵烯基、鹵炔基 )
亦衍生術語鹵伸烷基 ( 鹵伸烯基、鹵伸炔基 )
。不同於鹵烷基 ( 鹵烯基、鹵炔基 )
,鹵伸烷基 ( 鹵伸烯基、鹵伸炔基 )
為二價且需要兩個結合搭配物。形式上,藉由自鹵烷基 ( 鹵烯基、鹵炔基 )
移除氫原子而形成第二價數。
對應基團為例如-CH2
F及-CHF-、-CHFCH2
F及-CHFCHF-或>CFCH2
F等。
若對應含鹵素基團為另一(組合)基團之一部分,則上文定義亦適用。
鹵素
係關於氟、氯、溴及/或碘原子。
環烷基
由亞基單環烴環
、雙環烴環
及螺烴環
組成。系統為飽和的。在雙環烴環中,兩個環接合在一起使得其共同具有至少兩個碳原子。在螺烴環中,一個碳原子(螺原子)同時屬於兩個環。
若環烷基
經取代,則取代可在各情況下以單取代或多取代形式彼此獨立地在所有載氫碳原子上進行。環烷基
自身可作為取代基經由環系統之每個適合的位置鍵聯至分子。
環烷基
之實例為環丙基、環丁基、環戊基、環己基、環庚基、雙環[2.2.0]己基、雙環[3.2.0]庚基、雙環[3.2.1]辛基、雙環[2.2.2]辛基、雙環[4.3.0]壬基(八氫茚基)、雙環[4.4.0]癸基(十氫萘基)、雙環[2.2.1]庚基(降𦯉基)、雙環[4.1.0]庚基(降蒈烷基)、雙環[3.1.1]庚基(蒎基)、螺[2.5]辛基、螺[3.3]庚基等。
若環烷基
為另一(組合)基團之一部分(如例如在Cx-y 環烷基
胺基、Cx-y 環烷基
氧基或Cx-y 環烷基
烷基中),則上文關於環烷基
之定義亦適用。
若環烷基
之游離價數為飽和的,則獲得脂環基
。
若伸環烷基
為另一(組合)基團之一部分(如例如在HO-Cx-y 伸環烷基
胺基或H2
N-Cx-y 伸環烷基
氧基中),則上文關於伸環烷基
之定義亦適用。
環烯基
亦由亞基單環烴環
、雙環烴環
及螺烴環
組成。然而,系統為不飽和的,亦即存在至少一個C-C雙鍵,但不存在芳族系統。若在如上文所定義之環烷基
中,形式上移除相鄰環碳原子處之兩個氫原子且使游離價數飽和以形成第二鍵,則獲得對應環烯基
。
若環烯基
經取代,則取代可在各情況下以單取代或多取代形式彼此獨立地在所有載氫碳原子上進行。環烯基
自身可作為取代基經由環系統之每個適合的位置鍵聯至分子。
環烯基
之實例為環丙-1-烯基、環丙-2-烯基、環丁-1-烯基、環丁-2-烯基、環戊-1-烯基、環戊-2-烯基、環戊-3-烯基、環己-1-烯基、環己-2-烯基、環己-3-烯基、環庚-1-烯基、環庚-2-烯基、環庚-3-烯基、環庚-4-烯基、環丁-1,3-二烯基、環戊-1,4-二烯基、環戊-1,3-二烯基、環戊-2,4-二烯基、環己-1,3-二烯基、環己-1,5-二烯基、環己-2,4-二烯基、環己-1,4-二烯基、環己-2,5-二烯基、雙環[2.2.1]庚-2,5-二烯基(降𦯉-2,5-二烯基)、雙環[2.2.1]庚-2-烯基(降𦯉烯基)、螺[4,5]癸-2-烯基等。
當環烯基
為另一(組合)基團之一部分(如例如在Cx-y 環烯基
胺基、Cx-y 環烯基
氧基或Cx-y 環烯基
烷基中)時,上文關於環烯基
之定義亦適用。
若環烯基
之游離價數為飽和的,則獲得不飽和脂環基
。
若伸環烯基
為另一(組合)基團之一部分(如例如在HO-Cx-y 伸環烯基
胺基或H2
N-Cx-y 伸環烯基
氧基中),則上文關於伸環烯基
之定義亦適用。
芳基
表示具有至少一個芳族碳環之單環、雙環或三環碳環。較佳地,其表示具有六個碳原子之單環基團(苯基)或具有九或十個碳原子之雙環基團(兩個六員環或一個具有五員環之六員環),其中第二環亦可為芳族或,然而亦可為部分飽和的。
若芳基
經取代,則取代可在各情況下以單取代或多取代形式彼此獨立地在所有載氫碳原子上進行。芳基
自身可作為取代基經由環系統之每個適合的位置鍵聯至分子。
芳基
之實例為苯基、萘基、茚滿基(2,3-二氫茚基)、茚基、蒽基、菲基、四氫萘基(1,2,3,4-四氫萘基、萘滿基)、二氫萘基(1,2-二氫萘基)、茀基等。最佳為苯基。
若芳基
為另一(組合)基團之一部分(如例如在芳基
胺基、芳基
氧基或芳基
烷基中),則上文芳基
之定義亦適用。
若芳基
之游離價數為飽和的,則獲得芳族基
。
術語伸芳基
亦可衍生自先前定義之芳基
。不同於芳基
,伸芳基
為二價且需要兩個結合搭配物。形式上,藉由自芳基
移除氫原子形成第二價數。對應基團為例如:
苯基及(鄰伸苯基、間伸苯基、對伸苯基),
萘基及等。
若伸芳基
為另一(組合)基團之一部分(如例如在HO-伸芳基
胺基或H2
N-伸芳基
氧基中),則上文關於伸芳基
之定義亦適用。
雜環基
表示環系統,其藉由烴環中之一或多個基團-CH2
-彼此獨立地經基團-O-、-S-或-NH-置換或藉由一或多個基團=CH-經基團=N-置換而衍生自先前定義之環烷基
、環烯基
及芳基
,其中總共可存在不超過五個雜原子,至少一個碳原子必須在兩個氧原子之間及在兩個硫原子之間或在氧與硫原子之間存在且環整體必須具有化學穩定性。雜原子可視情況存在於所有可能之氧化階段(硫à亞碸-SO-、碸-SO2
-;氮à N-氧化物)中。在雜環基
中,不
存在雜芳環,亦即無雜原子為芳族系統之一部分。
衍生自環烷基
、環烯基
及芳基
之直接結果為雜環基
由亞基單環雜環
、雙環雜環
、三環雜環
及螺雜環
組成,其可以飽和或不飽和形式存在。
不飽和意謂所討論之環系統中存在至少一個雙鍵,但不形成雜芳族系統。在雙環雜環中,兩個環鍵聯在一起使得其共同具有至少兩個(雜)原子。在螺雜環中,一個碳原子(螺原子)同時屬於兩個環。
若雜環基
經取代,則取代可在各情況下以單取代或多取代形式彼此獨立地在所有載氫碳原子及/或氮原子上進行。雜環基
自身可作為取代基經由環系統之每個適合的位置鍵聯至分子。雜環基
上之取代基不對雜環基
之成員數進行計數。
雜環基
之實例為四氫呋喃基、吡咯啶基、吡咯啉基、咪唑啶基、噻唑啶基、咪唑啉基、吡唑啶基、吡唑啉基、哌啶基、哌嗪基、環氧乙基、氮丙啶基、氮雜環丁烷基、1,4-二氧雜環己烷基、氮雜環庚烷基、二氮雜環庚烷基、嗎啉基、硫代嗎啉基、高嗎啉基、高哌啶基、高哌嗪基、高硫嗎啉基、硫代嗎啉基-S
-氧化物、硫代嗎啉基-S,S
-二氧化物、1,3-二氧戊環基、四氫哌喃基、四氫硫代哌喃基、[1,4]-氧氮雜環庚烷基、四氫噻吩基、高硫嗎啉基-S,S
-二氧化物、噁唑啶酮基、二氫吡唑基、二氫吡咯基、二氫吡嗪基、二氫吡啶基、二氫-嘧啶基、二氫呋喃基、二氫哌喃基、四氫噻吩基-S
-氧化物、四氫噻吩基-S,S
-二氧化物、高硫嗎啉基-S
-氧化物、2,3-二氫氮唉、2H-
吡咯基、4H-
哌喃基、1,4-二氫吡啶基、8-氮雜-雙環[3.2.1]辛基、8-氮雜-雙環[5.1.0]辛基、2-氧雜-5-氮雜雙環[2.2.1]庚基、8-氧雜-3-氮雜-雙環[3.2.1]辛基、3,8-二氮雜-雙環[3.2.1]辛基、2,5-二氮雜-雙環[2.2.1]庚基、1-氮雜-雙環[2.2.2]辛基、3,8-二氮雜-雙環[3.2.1]辛基、3,9-二氮雜-雙環[4.2.1]壬基、2,6-二氮雜-雙環[3.2.2]壬基、1,4-二氧雜-螺[4.5]癸基、1-氧雜-3,8-二氮雜-螺[4.5]癸基、2,6-二氮雜-螺[3.3]庚基、2,7-二氮雜-螺[4.4]壬基、2,6-二氮雜-螺[3.4]辛基、3,9-二氮雜-螺[5.5]十一基、2.8-二氮雜-螺[4,5]癸基等。
較佳地,雜環基為4至8員單環且具有一或兩個獨立地選自氧、氮及硫之雜原子。
較佳之雜環基為:哌嗪基、哌啶基、嗎啉基、吡咯啶基、氮雜環丁烷基、四氫哌喃基、四氫呋喃基。
若雜環基
為另一(組合)基團之一部分(如例如在雜環基
胺基、雜環基
氧基或雜環基
烷基中),則上文雜環基
之定義亦適用。
若雜環基
之游離價數為飽和的,則獲得雜環基
。
術語伸雜環基
亦衍生自先前定義之雜環基
。不同於雜環基
,伸雜環基
為二價且需要兩個結合搭配物。形式上,藉由自雜環基
移除氫原子而獲得第二價數。對應基團為例如:
哌啶基及,
2,3-二氫-1H
-吡咯基及等。
若伸雜環基
為另一(組合)基團之一部分(如例如在HO-伸雜環基
胺基或H2
N-伸雜環基
氧基中),則上文伸雜環基
之定義亦適用。
雜芳基
表示具有至少一個雜芳環之單環雜芳環或多環,其相較於對應芳基
或環烷基 ( 環烯基 )
含有一或多個彼此獨立地選自氮、硫及氧之相同或不同雜原子而非一或多個碳原子,其中所得基團必須為化學穩定的。雜芳基
存在之前提條件為雜原子及雜芳族系統。
若雜芳基
經取代,則取代可在各情況下以單取代或多取代形式彼此獨立地在所有載氫碳原子及/或氮原子上進行。雜芳基
自身可作為取代基經由環系統之每個適合的位置(碳及氮兩者)鍵聯至分子。雜芳基
上之取代基不對雜芳基
之成員數進行計數。
雜芳基
之實例為呋喃基、噻吩基、吡咯基、噁唑基、噻唑基、異噁唑基、異噻唑基、吡唑基、咪唑基、三唑基、四唑基、噁二唑基、噻二唑基、吡啶基、嘧啶基、噠嗪基、吡嗪基、三嗪基、吡啶基-N
-氧化物、吡咯基-N
-氧化物、嘧啶基-N
-氧化物、噠嗪基-N
-氧化物、吡嗪基-N
-氧化物、咪唑基-N
-氧化物、異噁唑基-N
-氧化物、噁唑基-N
-氧化物、噻唑基-N
-氧化物、噁二唑基-N
-氧化物、噻二唑基-N
-氧化物、三唑基-N
-氧化物、四唑基-N
-氧化物、吲哚基、異吲哚基、苯并呋喃基、苯并噻吩基、苯并噁唑基、苯并噻唑基、苯并異噁唑基、苯并異噻唑基、苯并咪唑基、吲唑基、異喹啉基、喹啉基、喹喏啉基、㖕啉基、酞嗪基、喹唑啉基、苯并三嗪基、吲哚嗪基、噁唑并吡啶基、咪唑并吡啶基、㖠啶基、苯并噁唑基、吡啶并吡啶基、嘧啶并吡啶基、嘌呤基、喋啶基、苯并噻唑基、咪唑并吡啶基、咪唑并噻唑基、喹啉基-N
-氧化物、吲哚基-N
-氧化物、異喹啉基-N
-氧化物、喹唑啉基-N
-氧化物、喹喏啉基-N
-氧化物、酞嗪基-N
-氧化物、吲哚嗪基-N
-氧化物、吲唑基-N
-氧化物、苯并噻唑基-N
-氧化物、苯并咪唑基-N
-氧化物等。
較佳地,雜芳基為5-6員單環或9-10員雙環,各具有1至4個獨立地選自氧、氮及硫之雜原子。
若雜芳基
為另一(組合)基團之一部分(如例如在雜芳基
胺基、雜芳基
氧基或雜芳基
烷基中),則上文雜芳基
之定義亦適用。
若雜芳基
之游離價數為飽和的,則獲得雜芳族基團
。
若伸雜芳基
為另一(組合)基團之一部分(如例如在HO-伸雜芳基
胺基或H2
N-伸雜芳基
氧基中),則上文伸雜芳基
之定義亦適用。
經取代
意謂直接結合至考慮中之原子之氫原子經另一原子或另一原子團(取代基
)置換。視起始條件(氫原子數目)而定,單取代或多取代可在一個原子上進行。僅在待取代之取代基及原子之准許價數彼此對應且取代產生穩定化合物(亦即,例如藉由重排、環化或抵消不自發轉化之化合物)時,用特定取代基取代才為可能的。
二價取代基(諸如=S、=NR、=NOR、=NNRR、=NN(R)C(O)NRR、=N2
或類似者)可僅為碳原子上之取代基,而二價取代基=O及=NR亦可為硫上之取代基。一般而言,取代可藉由二價取代基僅在環系統上進行且需要用兩個偕位氫原子(亦即,結合至取代前飽和之同一碳原子的氫原子)置換。因此,僅在環系統之基團-CH2
-或硫原子(僅=O基團或=NR基團,可能一或兩個=O基團或例如一個=O基團及一個=NR基團,各基團置換自由電子對)處,才可能藉由二價取代基取代。
立體化學 / 溶劑合物 / 水合物 :
除非特定指示,否則在整篇說明書及隨附申請專利範圍中,給定化學式或名稱將涵蓋互變異構體及所有立體、光學及幾何異構體(例如,對映異構體、非對映異構體、E/Z
異構體等)及其外消旋體,以及不同比例之個別對映異構體之混合物、非對映異構體之混合物、或存在此類異構體及對映異構體之任一前述形式之混合物、以及其鹽(包括其醫藥學上可接受之鹽)及其溶劑合物(諸如水合物),包括游離化合物之溶劑合物及水合物或化合物之鹽的溶劑合物及水合物。
一般而言,可根據熟習此項技術者已知之合成原理來獲得實質上純的立體異構體,例如藉由分離對應混合物,藉由使用立體化學純起始材料及/或藉由立體選擇性合成。此項技術中已知如何製備光學活性形式,諸如藉由外消旋形式之解析或藉由合成(例如,自光學活性起始材料開始及/或藉由使用對掌性試劑)。
本發明之對映異構性純化合物或中間物可經由不對稱合成,例如藉由製備及後續分離可藉由已知方法分離(例如,藉由層析分離或結晶)的適當非對映異構化合物或中間物,及/或藉由使用對掌性試劑(諸如對掌性起始材料、對掌性催化劑或對掌性助劑)來製備。
此外,熟習此項技術者已知如何自對應外消旋混合物製備對映異構性純化合物,諸如藉由在對掌性固定相上層析分離對應外消旋混合物,或藉由使用適當解析劑來解析外消旋混合物,例如藉助於外消旋化合物與光學活性酸或鹼形成非對映異構鹽,隨後解析鹽及自鹽釋放所需化合物,或藉由進行對應外消旋化合物與光學活性對掌性輔助試劑之衍生化,隨後分離非對映異構體及移除對掌性輔助基團,或藉由動力學解析外消旋體(例如,藉由酶解析);藉由在適合條件下自同形異向晶體之聚結物進行對映體選擇性結晶,或藉由在光學活性對掌性助劑之存在下自適合溶劑進行(部分)結晶。
鹽 :
片語「醫藥學上可接受
」在本文中用於係指在合理醫學判斷之範疇內,適用於與人類及動物之組織接觸而無過度毒性、刺激、過敏反應或其他問題或併發症,且與合理益處/風險比相稱的彼等化合物、物質、組合物及/或劑型。
如本文所使用,「醫藥學上可接受之鹽
」係指所揭示化合物之衍生物,其中母體化合物藉由製造其酸式或鹼式鹽而改質。醫藥學上可接受之鹽的實例包括(但不限於)鹼性殘基(諸如胺)之無機酸鹽或有機酸鹽;酸性殘基(諸如羧酸)之鹼金屬鹽或有機鹽;及其類似鹽。
舉例而言,此類鹽包括來自以下之鹽:苯磺酸、苯甲酸、檸檬酸、乙磺酸、反丁烯二酸、龍膽酸(gentisic acid)、氫溴酸、氫氯酸、順丁烯二酸、蘋果酸、丙二酸、杏仁酸、甲磺酸、4-甲基-苯磺酸、磷酸、水楊酸、丁二酸、硫酸及酒石酸。
可與來自氨、L-精胺酸、鈣、2,2'-亞胺基雙乙醇、L-離胺酸、鎂、N
-甲基-D-葡糖胺、鉀、鈉及參(羥甲基)-胺基甲烷之陽離子形成其他醫藥學上可接受之鹽。
本發明之醫藥學上可接受之鹽可藉由習知化學方法由含有鹼性或酸性部分之母體化合物合成。一般而言,此類鹽可藉由使此等化合物之游離酸或游離鹼形式與足夠量之適當鹼或酸在水或有機稀釋劑(如乙醚、乙酸乙酯、乙醇、異丙醇或乙腈或其混合物)中反應來製備。
除上文所提及之彼等外,例如適用於純化或分離本發明之化合物的其他酸之鹽(例如,三氟乙酸鹽)亦構成本發明之一部分。
出於本發明之目的,治療有效量
意謂能夠消除疾病症狀或預防或緩解此等症狀或延長所治療患者之存活期的物質之量。
RAS 家族蛋白質
意謂包括V-Ki-ras2 Kirsten大鼠肉瘤病毒癌基因同源物(KRAS)、神經母細胞瘤RAS病毒癌基因同源物(NRAS)及Harvey鼠類肉瘤病毒癌基因(HRAS)及其任何突變體。
待用於根據本發明(包括所有實施例)使用之組合、組合物、套組、用途、方法及化合物中之所有SOS1抑制劑均屬於以下化合物(I)
之種類:,
其中R1
為Ra1
;Ra1
係選自由以下組成之群:C1-6
烷基、C1-6
鹵烷基、C2-6
烯基、C2-6
炔基、C3-10
環烷基、C4-10
環烯基、3-10員雜環基、C6-10
芳基及5-10員雜芳基,其中C1-6
烷基、C1-6
鹵烷基、C2-6
烯基、C2-6
炔基、C3-10
環烷基、C4-10
環烯基、3-10員雜環基、C6-10
芳基及5-10員雜芳基全部視情況經一或多個相同或不同Rb1
及/或Rc1
取代;
各Rb1
係獨立地選自由以下組成之群:-ORc1
、-NRc1
Rc1
、鹵素、-CN、-C(O)Rc1
、-C(O)ORc1
、-C(O)NRc1
Rc1
、-S(O)2
Rc1
、-S(O)2
NRc1
Rc1
、-NHC(O)Rc1
、-N(C1-4
烷基)C(O)Rc1
、-NHC(O)ORc1
及-N(C1-4
烷基)C(O)ORc1
;
各Rc1
係獨立地選自由以下組成之群:氫、C1-6
烷基、C1-6
鹵烷基、C2-6
烯基、C2-6
炔基、C3-10
環烷基、C4-10
環烯基、3-10員雜環基、C6-10
芳基及5-10員雜芳基,其中C1-6
烷基、C1-6
鹵烷基、C2-6
烯基、C2-6
炔基、C3-10
環烷基、C4-10
環烯基、3-10員雜環基、C6-10
芳基及5-10員雜芳基全部視情況經一或多個相同或不同Rd1
及/或Re1
取代;
各Rd1
係獨立地選自由以下組成之群:-ORe1
、-NRe1
Re1
、鹵素、-CN、-C(O)Re1
、-C(O)ORe1
、-C(O)NRe1
Re1
、-S(O)2
Re1
、-S(O)2
NRe1
Re1
、-NHC(O)Re1
、-N(C1-4
烷基)C(O)Re1
、-NHC(O)ORe1
及-N(C1-4
烷基)C(O)ORe1
;
各Re1
係獨立地選自由以下組成之群:氫、C1-6
烷基、C1-6
鹵烷基、C2-6
烯基、C2-6
炔基、C3-10
環烷基、C4-10
環烯基、3-10員雜環基、C6-10
芳基及5-10員雜芳基;R2
係選自由以下組成之群:氫、C1-4
烷基、C3-6
環烷基、3-6員雜環基及鹵素;R3
係選自由以下組成之群:氫、C1-4
烷基及C1-4
鹵烷基;
環系統A
係選自由以下組成之群:C6-10
芳基、5-10員雜芳基及9-10員雙環雜環基;p
表示1、2或3;
各R4
係獨立地選自由以下組成之群:C1-4
烷基、C2-4
烯基、C2-4
炔基、C1-4
鹵烷基、羥基-C1-4
烷基、羥基-C1-4
鹵烷基、C3-6
環烷基、3-6員雜環基、羥基-C3-6
環烷基、經3-6員雜環基取代之C1-4
鹵烷基,經羥基、鹵素、-NH2
、-SO2
-C1-4
烷基及二價取代基=O取代之3-6員雜環基,而=O可僅為非芳族環中之取代基;
或其鹽。
待用於根據本發明(包括所有實施例)使用之組合、組合物、套組、用途、方法及化合物中之所有SOS1抑制劑可如下合成:縮寫之清單
Ac | 乙醯基 |
ACN | 乙腈 |
amphos | 雙(二第三丁基(4-二甲胺基苯基)膦) |
aq. | 水,水溶液 |
ATP | 腺苷三磷酸 |
Bn | 苯甲基 |
Boc | 第三丁氧基羰基 |
Bu | 丁基 |
c | 濃度 |
Cbz | 羧基苯甲基 |
CH2 Cl2 | 二氯甲烷 |
d | 天 |
dba | 二亞苄基丙酮 |
TLC | 薄層層析 |
DAST | 二乙胺基三氟化硫 |
Davephos | 2-二甲胺基-2'-二環己基胺基膦基聯苯 |
DBA | 二亞苄基丙酮 |
DBU | 1,8-二氮雜雙環(5.4.0)十一-7-烯 |
DCE | 二氯乙烷 |
DCM | 二氯甲烷 |
DEA | 二乙胺 |
DEAD | 偶氮二甲酸二乙酯 |
DIPEA | N -乙基-N,N-二異丙胺(Hünig´s鹼) |
DMAP | 4-N,N -二甲胺基吡啶 |
DME | 1,2-二甲氧基乙烷 |
DMF | N,N -二甲基甲醯胺 |
DMSO | 二甲亞碸 |
DPPA | 二苯基磷醯基疊氮化物 |
dppf | 1.1´-雙(二苯基膦基)二茂鐵 |
EDTA | 乙二胺四乙酸 |
EGTA | 乙二醇四乙酸 |
eq | 當量 |
equiv. | 當量 |
ESI | 電噴離子化法 |
Et | 乙基 |
Et2 O | 乙醚 |
EtOAc | 乙酸乙酯 |
EtOH | 乙醇 |
h | 小時 |
HATU | 六氟磷酸O-(7-氮雜苯并三唑-1-基)-N,N,N',N' -四甲基- |
HPLC | 高效液相層析 |
IBX | 2-二氧碘基苯甲酸 |
i | 異 |
conc. | 濃縮 |
LC | 液相層析 |
LiHMDS | 雙(三甲基矽烷基)醯胺鋰 |
sln. | 溶液 |
Me | 甲基 |
MeOH | 甲醇 |
min | 分鐘 |
MPLC | 中壓液相層析 |
MS | 質譜法 |
MTBE | 甲基第三丁基醚 |
NBS | N -溴-丁二醯亞胺 |
NIS | N -碘-丁二醯亞胺 |
NMM | N -甲基嗎啉 |
NMP | N -甲基吡咯啶酮 |
NP | 正相 |
n.a. | 不可用 |
PBS | 磷酸鹽緩衝鹽水 |
Ph | 苯基 |
Pr | 丙基 |
PTSA | 對甲苯磺酸 |
Py | 吡啶 |
rac | 外消旋 |
red. | 還原 |
Rf (Rf ) | 滯留因子 |
RP | 逆相 |
RRLC | 迅速解析液相層析 |
rt | 環境溫度 |
SFC | 超臨界流體層析 |
SN | 親核取代 |
TBAF | 氟化四丁銨 |
TBDMS | 第三丁基二甲基矽烷基 |
TBME | 第三丁基甲醚 |
TBTU | 四氟硼酸O-(苯并三唑-1-基)-N,N,N',N'-四甲基- |
tBu | 第三丁基 |
TEA | 三乙胺 |
temp. | 溫度 |
tert | 第三 |
Tf | 三氟甲磺酸酯 |
TFA | 三氟乙酸 |
THF | 四氫呋喃 |
TMS | 三甲基矽烷基 |
tRet. | 滯留時間(HPLC) |
TRIS | 參(羥甲基)-胺基甲烷 |
TsOH | 對甲苯磺酸 |
UPLC | 超高效液相層析 |
UV | 紫外線 |
wt | 重量 |
製備 SOS1 抑制劑 綜述
除非另外陳述,否則使用化學實驗室中常用之方法在商業上可獲得設備中進行所有反應。對空氣及/或水分敏感之起始材料經儲存在保護性氣體下,且與此對應的反應及操作在保護性氣體(氮氣或氬氣)下進行。
微波反應
在由Biotage製造之引發器/反應器中或在由CEM製造之Explorer中或在由Anton Paar製造之Synthos 3000或Monowave 3000中,在密封容器(較佳2、5或20 mL)中較佳地在攪拌下進行。
層析
薄層層析在由Merck製造之玻璃(具有螢光指示劑F-254)上之現成矽膠60 TLC板上進行。
SOS1抑制劑之製備型高壓層析 (RP HPLC)
在具有由Waters製造之管柱(名稱:SunFire™ Prep C18, OBD™ 10 µm, 50 × 150 mm或SunFire™ Prep C18 OBD™ 5 µm, 30 × 50 mm或XBridge™ Prep C18, OBD™ 10 µm, 50 × 150 mm或XBridge™ Prep C18, OBD™ 5 µm, 30 × 150 mm或XBridge™ Prep C18, OBD™ 5 µm, 30 × 50 mm)及由YMC製造之管柱(名稱:Actus-Triart Prep C18, 5 µm, 30 × 50 mm)的Agilent或Gilson系統上進行。
使用不同梯度的H2
O/乙腈溶離化合物,而對於Agilent系統,將5%酸性改質劑(20 mL HCOOH至1 L H2
O/乙腈(1/1))添加至水中(酸性條件)。對於Gilson系統,向水中添加0.1% HCOOH。
對於Agilent系統在鹼性條件下之層析,亦使用H2
O/乙腈梯度,而藉由添加5%鹼性改質劑(50 g NH4
HCO3
+ 50 mL NH3
(25%於H2
O中)用H2
O補足至1 L)使水呈鹼性。對於Gilson系統,如下使水呈鹼性:5 mL NH4
HCO3
溶液(158 g於1L H2
O中)及2 mL NH3
(28%於H2
O中)用H2
O補充至1 L。
中間物及SOS1抑制劑之超臨界流體層析 (SFC)
在具有以下管柱之JASCO SFC系統上進行:Chiralcel OJ (250 × 20 mm, 5 µm)、Chiralpak AD (250 × 20 mm, 5 µm)、Chiralpak AS (250 × 20 mm, 5 µm)、Chiralpak IC (250 × 20 mm, 5 µm)、Chiralpak IA (250 × 20 mm, 5 µm)、Chiralcel OJ (250 × 20 mm, 5 µm)、Chiralcel OD (250 × 20 mm, 5 µm)、Phenomenex Lux C2 (250 × 20 mm, 5 µm)。
中間物及最終化合物之分析型 HPLC ( 反應控制 )
使用由Waters製造之管柱(名稱:XBridgeTM
C18, 2.5 µm, 2.1 × 20 mm或XBridgeTM
C18, 2.5 µm, 2.1 × 30 mm或Aquity UPLC BEH C18, 1.7 µM, 2.1 × 50mm)及YMC (名稱:Triart C18, 3.0 µm, 2.0 × 30 mm)及Phenomenex製造之管柱(名稱:Luna C18, 5.0 µm, 2.0 × 30 mm)進行。在各情況下分析設備亦配備有質量偵測器。
HPLC- 質譜 /UV- 光譜法
使用HPLC-MS設備(具有質量偵測器之高效液相層析)產生表徵SOS1抑制劑之滯留時間/MS-ESI+
。注射峰值處溶離之化合物得到滯留時間tRet.
= 0.00。
HPLC- 方法 ( 製備型 ) 製備型 HPLC1
HPLC: 333及334泵
管柱: Waters X-Bridge C18 OBD,10 µm,30 × 100 mm,零件號186003930
溶劑: A:10 mM NH4
HCO3
/H2
O;B:乙腈(HPLC級)
偵測: UV/Vis-155
流量: 50 mL/min
梯度: 0.00 - 1.50 min:1.5 % B
1.50 - 7.50 min:變化
7.50 - 9.00 min:100 % B 製備型 HPLC2
HPLC: 333及334泵
管柱: Waters Sunfire C18 OBD,10 µm,30 × 100 mm,零件號186003971
溶劑: A:H2
O + 0.2% HCOOH;B:乙腈(HPLC級) + 0.2% HCOOH
偵測: UV/Vis-155
流量: 50 mL/min
梯度: 0.00 - 1.50 min:1.5 % B
1.50 - 7.50 min:變化
7.50 - 9.00 min:100 % B HPLC- 方法 ( 分析型 ) LCMSBAS1
HPLC: Agilent 1100系列
MS: Agilent LC/MSD SL
管柱: Phenomenex Mercury Gemini C18,3 µm,2 × 20 mm,零件號00M-4439-B0-CE
溶劑: A:5 mM NH4
HCO3
/20 mM NH3
/H2
O;B:乙腈(HPLC級)
偵測: MS: 正及負模式
質量範圍: 120 - 900 m/z
流量: 1.00 mL/min
管柱溫度: 40℃
梯度: 0.00 - 2.50 min:5 % B à 95 % B
2.50 - 2.80 min:95 % B
2.81 - 3.10 min:95 % B à 5 % B VAB
HPLC: Agilent 1100/1200 系列
MS: Agilent LC/MSD SL
管柱: Waters X-Bridge BEH C18,2.5 µm,2.1 × 30 mm XP
溶劑: A:5 mM NH4
HCO3
/19 mM NH3
/H2
O;B:乙腈(HPLC級)
偵測: MS:正及負模式
質量範圍: 100 - 1200 m/z
流量: 1.40 mL/min
管柱溫度: 45℃
梯度: 0.00 - 1.00 min:5 % B à 100 % B
1.00 - 1.37 min:100 % B
1.37 - 1.40 min:100 % B à 5 % B RND-FA-3.5
HPLC: Agilent Infinity-1290系列
MS: Agilent SQD-6150 (API-ES +/- 3000 V)
MSD信號設置: 掃描正100-1000,掃描負100-1000
管柱: Aquity BEH C18,2.1 × 50 mm,1.7 µm
溶離劑: A:0.1%甲酸/水;B:0.1%甲酸/乙腈
偵測信號: UV 215 nm (頻寬4,參考關閉)
光譜: 範圍:200-400 nm;步長:2 nm
峰寬: > 0.025 min (0.5 S)
注射: 0.5 µL注射,在沖洗口用針清洗
流速: 0.8 mL/min
管柱溫度: 45℃
梯度: 0.0 - 0.2 min:2 % B
0.2 - 1.5 min:2 % B à 98 % B
1.5 - 2.6 min:98 % B
2.6 - 2.61 min:98 % B à2 % B
2.61 - 3.2 min:2 % B GVK_LCMS_18
HPLC: Agilent Infinity-1290系列
MS: Agilent SQD -6130 (API-ES + 3500 V/ -3000 V)
MSD信號設置: 掃描正100-1200,掃描負100-1200
管柱: Aquity BEH C18,2.1 × 50mm,1.7µm
溶離劑 A:0.1%甲酸/乙腈;B:0.1%甲酸/水
偵測信號: UV 215/254 nm (頻寬4,參考關閉)
光譜: 範圍:200-400 nm;步長:2 nm
峰寬: > 0.025 min (0.5 S)
注射: 0.5 µL注射,在沖洗口用針清洗。
流速: 0.8 mL/min
管柱溫度: 60℃
梯度: 0.0 - 0.4 min:97 % B
0.4 - 2.2 min:97 % B à 2 % B
2.2 - 2.6 min:2 % B
2.6 - 2.61 min:2 % B à 97 % B
2.61 - 3.0 min:97 % B GVK_LCMS_02
UPLC: Waters UPLC
MS: Micromass Triple四極桿(ESI)
毛細管電壓: 3500
錐孔電壓: 25至50V
溶解氣體: 600 L/h
溶解溫度: 350℃
MSD信號設置: 掃描正100-1000,掃描負100-1000
管柱: Aquity BEH C18,2.1 × 50 mm,1.7 µm
溶離劑: A:0.1%甲酸/水;B:0.1%甲酸/乙腈
偵測信號: UV-二極體陣列
光譜: 範圍:200-400 nm;解析度:1.2 nm
取樣速率: 10點/秒
注射: 0.5 µL注射,用針清洗
流速: 0.4 mL/min
管柱溫度: 35℃
梯度: 0.0 - 0.5 min:5 % B
0.5 - 2.0 min:50 % B
2.0 - 3.5 min:100 % B
3.5 - 5.0 min:100 % B à 5 % B
5.0 - 5.50 min:5 % B GVK_LCMS_31
HPLC: Agilent Infinity-1290 系列
MS: Agilent-6130四極LCMS (ESI/APCI,多模式+ 3500 V/ - 3000 V)
充電電壓: 2000
打碎器: 50至70
電暈電壓: 4 µ安培
溶解溫度: 300℃
溶解氣體: 600 L/h
MSD信號設置: 掃描正100-1200,掃描負100-1200
管柱: Aquity BEH C18,2.1 × 50 mm,1.7 µm
溶離劑: A:0.1%甲酸/乙腈;B:0.1%甲酸/水
偵測信號: UV 215 nm (頻寬4,參考關閉);UV 254 nm (頻寬4,參考關閉)
光譜: 範圍:200-400 nm;步長:2 nm
峰寬: > 0.025 min (0.5 S)
注射: 0.5 µL注射,在沖洗口用針清洗
流速: 0.8 mL/min
管柱溫度: 50℃
梯度: 0.0 - 0.2 min:2 % A
0.2 - 2.3 min:98 % A
2.3 - 3.4 min:98 % A à 2 % A
3.4 - 3.41 min:2 % A
3.41 - 3.5 min:2 % A GVK_LCMS_34
HPLC: Agilent Infinity-1290系列
MS: Agilent-6130四極LCMS (APCI-ES + 3500 V/ - 3500 V)
錐孔電壓: 25 至50 V
溶解氣體: 600 L/h
溶解溫度: 350℃
MSD信號設置: 掃描正100-1000,掃描負100-1000
管柱: Aquity BEH C18,2.1 × 50 mm,1.7 µm
溶離劑: A:0.1%甲酸/水;B:0.1%甲酸/乙腈
偵測信號: UV 215 nm (頻寬4,參考關閉);UV 254 nm (頻寬16,參考關閉)
光譜: 範圍:190-400 nm;步長:2 nm
峰寬: > 0.05 min (0.5 S)
注射: 0.5 µL注射,在沖洗口用針清洗
流速: 0.8 mL/ min
管柱溫度: 60℃
梯度: 0.0 - 0.4 min:2 % B
0.4 - 2.2 min:2 % B à 98 % B
2.2 - 2.6 min:98 % B
2.6 - 2.61 min:98 % B à 2 % B
2.61 - 3.0 min:2 % B GVK_LCMS_35
UPLC: Waters Acquity UPLC H類系統
MS: Waters SQ Detector 2 (ESI);
毛細管電壓: 3.50 kV
錐孔電壓: 50 V
溶解氣體: 750 L/h
溶解溫度: 350℃
MSD信號設置: 掃描正100-1200,掃描負100-1200
管柱: Aquity BEH C18,2.1 × 50 mm,1.7 µm
溶離劑: A:0.05%甲酸/乙腈;B:0.05%甲酸/水
偵測信號: UV-二極體陣列
光譜: 範圍:200-400 nm;解析度:1.2 nm
取樣速率: 10點/秒
注射: 0.5 µL注射,注射前清洗15秒及注射後清洗20秒
流速: 0.6 mL/min
管柱溫度: 35℃
梯度: 0.0 - 0.3 min:97 % B
0.3 - 2.2 min:97 % B à 2 % B
2.2 - 3.30 min:2 % B
3.30 - 4.50 min:2 % B à 97 % B
4.51 - 5.50 min:97 % B GVK_LCMS_21
LC: Agilent Infinity 1290系列
MS: Agilent 6130 Quadruple lcms(SQ)
MSD信號設置: 掃描正/負80-1200
管柱: Aquity BEH C18,2.1 × 50 mm,1.7 µm
溶離劑: A:水+ 0.1%甲酸;B:乙腈(HPLC級) + 0.1%甲酸
偵測信號: UV 215/254 nm (頻寬4,參考關閉)
光譜: 範圍:200-400 nm;步長:2.0 nm
峰寬: > 0.01 min (0.2 s)
注射: 0.5 µL標準注射
流量: 0.8 mL/min
管柱溫度: 60℃
梯度: 0.0 - 0.2 min:3 % B
0.2 - 1.5 min:3% B à 95 % B
1.5 - 2.5 min:95 % B
2.5 - 2.6min:95% B à 3 % B
2.6 - 3.2 min:3 % B GVK_LCMS_22
HPLC: Agilent Infinity-1290 系列
MS: Agilent SQD-6150 (API-ES +/- 3000 V)
MSD信號設置: 掃描正100-1000,掃描負100-1000
管柱: Aquity BEH C18,2.1 × 50 mm,1.7 µm
溶離劑: A:0.1%甲酸/水;B:0.1%甲酸/乙腈
偵測信號: UV 215 nm (頻寬4,參考關閉)
光譜: 範圍:200-400 nm;步長:2 nm
峰寬: > 0.025 min (0.5 S)
注射: 0.5 µL注射,在沖洗口用針清洗
流速: 0.8 mL/min
管柱溫度: 45℃
梯度: 0.0 - 0.2 min:2 % B
0.2 - 1.5 min:2 % B à 98 % B
1.5 - 2.6 min:98 % B
2.6 - 2.61 min:98 % B à2 % B
2.61 - 3.2 min:2 % B D_LC_SSTD
HPLC: Agilent 1100/1200 (二元泵1)
管柱: (Waters) XBridge BEH C18,30 × 3.0 mm;2.5 µm
溶離劑: A:0.2%甲酸/水;B:乙腈
偵測信號: UV 254 nm (頻寬4,參考550 nm,頻寬100)
光譜: 範圍:190-400 nm;步長:2 nm
峰寬: > 0.01 min
注射: 1.0 µL
流速: 2.30 mL/min
管柱溫度: 50℃
梯度: 0.1 - 1.4 min:97 % A à 100% B
1.4 - 1.6 min:100 % B
1.6 - 1.8 min:100 % B à 97 % A D_LC_BSTD
HPLC: Agilent 1100/1200 (二元泵1)
管柱: (Waters) XBridge BEH C18,30 × 3.0 mm;2.5 µm
溶離劑: A:0.2%氨(25%)/水;B:乙腈
偵測信號: UV 254 nm (頻寬4,參考550 nm,頻寬100)
光譜: 範圍:190-400 nm;步長:2 nm
峰寬: > 0.01 min
注射: 1.0 µL
流速: 2.00 mL/min
管柱溫度: 50℃
梯度: 0.1 - 1.4 min:97 % A à 100 % B
1.4 - 1.6 min:100 % B
1.6 - 1.8 min:100 % B à 97 % A GVK_LCMS_19
RRLC: Agilent RRLC
MS: Agilent SQD
毛細管電壓: 3.50 kV
錐孔電壓: 25至50 V
溶解氣體: 600 L/h
溶解溫度: 350℃
管柱: XBridge C18,4.6 × 75 mm,3.5 µm
溶離劑: A:10 mM乙酸銨;B:乙腈
流速: 2.0 mL/min
管柱溫度: 35℃
梯度: [以min計之時間/B%]:0/10,0.2/10,2.5/75,3.0/100,4.8/100,5.0/10 GVK_LCMS_41
UPLC: Waters Acquity-UPLC
MS: SQ Detector-2
毛細管電壓: 3.50 kV
錐孔電壓: 50 V
溶解氣體: 750 L/h
溶解溫度: 350℃
管柱: AQUITY UPLC BEH C18 1.7 µm,2.1 × 50 mm
溶離劑: A:0.07%於乙腈中;B:0.07%甲酸/水
流速: 0.6 mL/min
管柱溫度: 35℃
梯度: [以min計之時間/B%]:0/97,0.3/97,2.2/2,3.3/2,4.5/2,4.51/97
SOS1抑制劑及中間物藉由下文描述之合成方法製備,其中通式之取代基具有上文給出之含義。在未描述起始化合物之製備之情況下,其為商業上可獲得的或其合成描述於先前技術中或其可類似於已知先前技術化合物或本文所描述之方法製備,亦即合成此等化合物在有機化學工作者之技能內。文獻中所描述之物質可根據公開合成方法製備。
縮醛A-2
可經由對應醛A-1
之縮醛化製備。
A-7
可經由不同途徑製備:
一種方法開始用經取代或未經取代之丙二酸酯對A-2
進行親核芳族取代以得到中間物A-3
(引入R2
)。中間物A -3
之脫羧基反應產生A-4
,其在親核芳族取代中用建構嵌段B-5
(參見下文)轉化。所得酯A-5
進行皂化及隨後在單一步驟中用建構嵌段C-1
進行醯胺化(引入R1
)得到中間物A -7
。
在替代方法中,化合物A-2
用經取代或未經取代之丙二酸酯轉化(引入R2
)且接著單一步驟中用建構嵌段B-5
處理(參見下文)以得到化合物A-5
。所得酯A-5 進行
皂化及隨後用建構嵌段C-1
進行醯胺化(引入R1
)得到中間物A -7
。
另一途徑開始用經取代或未經取代之丙二酸酯對A-2
進行親核芳族取代(引入R2
),隨後在單一步驟中用建構嵌段B-5
進行親核芳族取代(參見下文)以得到化合物A-6
。A-6
直接轉化成A-7
可藉由二酯A-6
進行皂化,原位脫羧基反應及隨後在單一步驟中用建構嵌段C-1
進行醯胺化(引入R1
)來達成。
最終化合物(I)
可藉由縮醛A-7
之去保護及環化來製備。化合物(I)
可在流程1中未描繪之視情況選用之步驟(尤其在R1
及R2
中)中進一步衍生以獲得其他/額外化合物(I)
。
以β-側氧基二酯E-1
為起始材料,對應α,β-二側氧基酯E-3
可經由獲得之中間物E-2
與DMF-縮醛反應來製備。用胺C-1
進行環閉合產生羥基吡啶環E-4
。在將羥基轉移至對應磺酸鹽(例如,甲苯磺酸鹽、三氟甲磺酸鹽等,E-5
)之後,鈀催化與醯胺之交叉偶合得到吡啶醯胺E-6
,其允許第二環閉合以獲得所需雙環吡啶并嘧啶-二酮架構(E-7
)。因此獲得之E-7
可經活化(用例如六氯環三磷氮烯、SOCl2
、POCl3
或類似者)以與建構嵌段B-5
反應來達成最終化合物(I)
(其亦可在額外步驟中衍生)。
(雜)芳基乙胺系統B-5
可由(雜)芳基溴化物B-1
來製備,其經由金屬催化之交叉偶合轉化成對應乙醯基(雜)芳基B-2
。形成對掌性亞磺醯胺B-3
之後進行立體選擇性還原以得到B-4
。最後亞磺醯胺之裂解得到所需對掌性(雜)芳基乙胺B-5
。
替代地,乙醯基(雜)芳基B-2
可對映選擇性地還原成對應醇B-6
,其接著轉化成疊氮化物B-7
且可繼而經氫化以獲得對掌性建構嵌段B-5
。
向A-1a
(150.00 g,785.28 mmol,1.0當量)於苯(1500 mL)中之經攪拌溶液中添加乙二醇(48.69 g,785.28 mmol,1.0當量)及催化量之對甲苯磺酸(13.51 g,78.53 mmol,0.1當量)。將反應混合物回流直至觀察到起始材料之完全轉化。在減壓下蒸發溶劑,將殘餘物用DCM稀釋且用碳酸氫鈉水溶液洗滌。合併有機層,乾燥(Na2
SO4
)且在減壓下濃縮。藉由急驟管柱層析(溶離劑:10%乙酸乙酯/己烷)進一步純化得到所需產物A-2a
。
以下中間物A-2
(表1)可以類似的方式以不同嘧啶A-1
為起始物質而獲得。必要時,粗產物A-2
藉由層析純化。表 1 :
# | 結構 | tret [min] | [M+H]+ | HPLC 方法 |
A-2a | 1.719 | 235 | GVK_LCMS_22 | |
A-2b | n.a. | n.a. | - |
將A-2a
(80.00 g,340.33 mmol,1.0當量)溶解於DMSO (400 mL)中且用碳酸銫(220.53 g,680.66 mmol,2.0當量)及丙二酸二甲酯(49.42 g,374.36 mmol,1.1當量)處理。將所得混合物加熱至80℃持續10 h。在起始材料完全轉化之後,將反應混合物用乙酸乙酯稀釋且倒入冰冷水中。用乙酸乙酯萃取水層。合併有機層且用0.1 N甲酸之水溶液洗滌。將有機層乾燥(Na2
SO4
)且在減壓下濃縮。藉由急驟管柱層析(溶離劑:30%乙酸乙酯/己烷)進一步純化得到所需產物A-3a
。
以下中間物A-3
(表2)可以類似的方式以不同嘧啶A-2
為起始物質而獲得。必要時,粗產物A-3
藉由層析純化。表 2 :
# | 結構 | tret [min] | [M+H]+ | HPLC 方法 |
A-3a | 2.133 | 331 | GVK_LCMS_34 | |
A-3b | 1.537 | 317 | GVK_LCMS_34 |
A-3c 合成之實驗程序
將2-氟-丙二酸二甲酯(72.30 g,481.99 mmol,1.1當量)於無水DMF (300 mL)中之經攪拌溶液冷卻至5℃且用氫化鈉(20.16 g,876.35 mmol,2.0當量)分批處理。在室溫下攪拌10分鐘之後,添加溶解於DMF (50 mL)中之A-2a
(103.00 g,438.17 mmol,1.0當量)且將所得混合物再攪拌2 h。在完全轉化之後,將反應混合物倒入冰冷水中且用乙酸乙酯萃取水層。合併有機層,乾燥(Na2
SO4
)且在減壓下濃縮。藉由急驟管柱層析(溶離劑:15%乙酸乙酯/己烷)進一步純化得到所需產物A-3c
(HPLC方法:GVK_LCMS_31;tret
= 1.756 min;[M+H]+
= 350)。
將A-3a
(40.00 g,120.95 mmol,1.0當量)於DMSO (120 mL)中之經攪拌溶液用氯化鋰(20.32 g,483.79 mmol,4.0當量)處理且加熱至120℃持續2 h。在起始材料完全轉化之後,將所得反應混合物用乙醚稀釋且倒入冰冷水中。用乙醚萃取水層,合併有機層,乾燥(Na2
SO4
)且在減壓下濃縮。藉由鹼性逆相層析(溶離劑:20%乙腈/水)及正相(18%乙酸乙酯/己烷)進一步純化得到所需產物A-4a
。
以下中間物A-4
(表3)可以類似的方式以不同嘧啶A-3
為起始物質而獲得。必要時,粗產物A-4
藉由層析純化。表 3 :
# | 結構 | tret [min] | [M+H]+ | HPLC 方法 |
A-4a | 1.67 | 273.0 | RND-FA-3.5 | |
A-4b | 1.55 | 258.9 | RND-FA-3.5 | |
A-4c | 1.76 | 291.0 | RND-FA-3.5 |
將A-4a
(3135 mg,11.50 mmol,1.5當量)及B-5a
(1450 mg,7.67 mmol,1.0當量)溶解於無水DMSO (10 mL)中且添加DIPEA (2670 µL,15.33 mmol,2.0當量)。將反應混合物在80℃下攪拌6 h直至實現B-5a
之完全轉化。過濾反應混合物且濾液藉由鹼性逆相層析(梯度溶離:25%至65%乙腈/水)純化以得到所需產物A-5a
。
A- 5v 合成之實驗程序
將A-2b
(500 mg,2.262 mmol,1.0當量)於無水DMSO (4.0 mL)中之溶液用2-氟-丙二酸二甲酯(281 µL,2.262 mmol,1.0當量)及碳酸鈉(360 mg,3.393 mmol,1.5當量)處理。將所得混合物在室溫下攪拌4 d直至觀察到起始材料之完全轉化。添加三乙胺(627 µL,4.524 mmol,2.0當量)及B-5a
(642 mg,3.393 mmol,1.5當量)且將反應混合物在80℃下再攪拌16 h。在完全轉化之後,用NaHCO3
水溶液淬滅反應物且用DCM萃取水層。合併有機層,乾燥(Na2
SO4
)且在減壓下濃縮。藉由鹼性逆相層析(梯度溶離:15%至85%乙腈/水)進一步純化得到所需產物A-5v
(HPLC方法:VAB,tret
= 0.945 min;[M+H] +
= 430.3)。
中間物 A-6 之合成 A- 6a 合成之實驗程序
將A-2a
(50 mg,0.213 mmol,1.0當量)溶解於DMSO (0.5 mL)中且用2-氟-丙二酸二甲酯(27 µL,0.221 mmol,1.0當量)及碳酸鉀(58.8 mg,0.425 mmol,2.0當量)處理。將所得混合物在100℃下攪拌5 min直至觀察到起始材料之完全轉化。添加三乙胺(89 µL,0.639 mmol,3.0當量)及B-5a
(60.2 mg,0.318 mmol,1.5當量)且將反應混合物在60℃下再攪拌3 h。過濾反應混合物且濾液藉由鹼性逆相層析(梯度溶離:35%至75%乙腈/水)純化以得到所需產物A-6a
。
以下中間物A-6
(表5)可以類似的方式以不同嘧啶A-5
為起始物質而獲得。必要時將粗產物A-6
藉由層析純化。表 5 :
# | 結構 | tret [min] | [M+H]+ | HPLC 方法 |
A-6a | 1.109 | 530.2 | VAB | |
A-6b | 1.087 | 572.2 | VAB |
將A-5a
(200.0 mg,0.470 mmol,1.0當量)溶解於DMSO (2 mL)及ACN (1 mL)中。添加氫氧化鈉水溶液(20%,313 µL,1.881 mmol,4當量)且將所得混合物攪拌30 min直至觀察到起始材料之完全轉化。添加三乙胺(130 µL,0.933 mmol,2.0當量)、1-甲基-環丙胺鹽酸鹽(62.8 mg,0.583 mmol,1.3當量)及HATU (266.3 mg,0.700 mmol,1.5當量)且將所得混合物攪拌20 min直至觀察到完全轉化。添加水且用DCM稀釋混合物。用DCM萃取水層,將有機層合併且用硫酸鎂乾燥。所得粗產物A-7a
可不進一步純化即用於下一步驟中。
A-7dp 合成之實驗程序
將A-6a
(16.0 mg,0.032 mmol,1.0當量)溶解於DMSO (1.5 mL)中。添加氫氧化鈉水溶液(20%,16 µL,0.096 mmol,3.0當量)且將所得混合物攪拌30 min直至觀察到起始材料之完全轉化。添加三乙胺(8.5 µL,0.061 mmol,2.0當量)、1-氟甲基-環丙胺鹽酸鹽(4.8 mg,0.038 mmol,1.3當量)及HATU (17.3 mg,0.045 mmol,1.5當量)且將所得混合物攪拌20 min直至觀察到完全轉化。添加水且用DCM稀釋混合物。用DCM萃取水層,將有機層合併且用硫酸鎂乾燥。所得粗產物A-7dp
可不進一步純化即用於下一步驟中。
在0℃下,向D-1a
(20.00 g,172.24 mmol,1.0當量)於DCM (200 mL)中之經攪拌溶液中添加EDCI (49.35 g,258.37 mmol,1.5當量)、三乙胺(26.14 g,258.37 mmol,1.5當量)、DMAP (0.21 g,1.72 mmol,0.01 當量)及N
,O-
二甲基羥胺鹽酸鹽(25.20 g,258.37 mmol,1.5當量)。使反應混合物升溫至室溫且攪拌16 h。在起始材料完全轉化之後,將1N HCl添加至反應混合物中。用EtOAc萃取水層,將合併之有機層用NaHCO3
飽和水溶液洗滌,經Na2
SO4
乾燥且在減壓下濃縮。粗產物藉由急驟管柱層析(5%乙酸乙酯/己烷)純化得到所需產物D-2a
。
以下中間物D-2
(表8)可以類似的方式以不同酸D-1
為起始物質而獲得。必要時,粗產物D-2
藉由層析純化。表 8 :
# | 結構 | tret [min] | [M+H]+ | HPLC 方法 |
D-2a | 1.034 | 160 | GVK_LCMS_18 | |
D-2b | 1.045 | 160 | GVK_LCMS_18 | |
D-2c | 1.059 | 160 | GVK_LCMS_18 |
D-3a 合成之實驗程序
在-15℃下,向D-2a
(150 mg,0.942 mmol,1.0當量)於THF (5 mL)中之經攪拌溶液中緩慢添加3-溴苯基溴化鎂(0.5 N,2.26 mL,1.130 mmol,1.2當量)。使反應混合物升溫至室溫且攪拌3 h。在起始材料完全轉化之後,添加水。用EtOAc萃取水層,合併有機層,經Na2
SO4
乾燥且在減壓下濃縮。粗產物藉由急驟管柱層析(溶離劑:10%乙酸乙酯/己烷)純化,得到所需產物D-3a
。
D-3b 合成之實驗程序
將1,3-二溴-2-氟-苯(15.95 g,62.82 mmol,1.0當量)於無水THF (100 mL)中之經攪拌溶液冷卻至-78℃。逐滴添加正丁基鋰(1.6 N,47.1 mL,75.36 mmol,1.2當量)且將所得混合物在-78℃下攪拌30 min。緩慢添加溶解於THF (40 mL)中之D-2b
(10.00 g,62.82 mmol,1.0當量)。在完全轉化之後,添加氯化銨飽和水溶液。用EtOAc萃取水層,合併有機層,經Na2
SO4
乾燥且在減壓下濃縮。粗產物藉由矽膠層析(梯度溶離:10%至20%乙酸乙酯/石油醚)純化,得到所需產物D-3b
。
以下中間物D-3
(表9)可依類似的方式,以不同醯胺D-2
為起始物質製得。必要時,粗產物D-3
藉由層析純化。表 9 :
# | 結構 | tret [min] | [M+H]+ | HPLC 方法 |
D-3a | n.a. | n.a. | - | |
D-3b | 1.762 | 273 | GVK_LCMS_34 | |
D-3c | 1.756 | 273 | GVK_LCMS_34 |
B-1a 合成之實驗程序
在0℃下,向D-3d
(150 g,738.89 mmol,1.0當量)於DCM (1.5 L)中之經攪拌溶液中緩慢添加三氟化二乙基胺基硫(178.64 g,1108.33 mmol,1.5當量)。使反應混合物升溫至室溫且攪拌16 h。在起始材料完全轉化之後,添加冰水。用EtOAc萃取水層,合併有機層,經Na2
SO4
乾燥且在減壓下濃縮。粗產物B-1a
不進一步純化即用於下一步驟中。
以下中間物B-1
(表10)可以類似的方式以不同溴苯D-3
為起始物質而獲得。必要時,粗產物B-1
藉由層析純化。表 10 :
# | 結構 | tret [min] | [M+H]+ | HPLC 方法 |
B-1a | n.a. | n.a. | - | |
B-1b | 1.66 | n.a. | GVK_LCMS_34 | |
B-1c | 1.974 | 278 | GVK_LCMS_31 | |
B-1d | n.a. | n.a. | - | |
B-1e | n.a. | n.a. | - |
D-5a 合成之實驗程序
在室溫下,向溴二氟乙酸乙酯(126.50 g,623 mmol,2.5當量)於DMSO (225 mL)中之經攪拌溶液中添加銅粉(39.26 g,623 mmol,2.5當量)。在1 h之後,添加B-1f
(75.00 g,249.26 mmol,1.0當量)且將所得混合物加熱至70℃且再攪拌3 h。在起始材料完全轉化之後,添加冰水及EtOAc。藉由過濾移除不溶物且用EtOAc萃取水層。合併有機層,經Na2
SO4
乾燥且在減壓下濃縮。粗產物藉由管柱層析(梯度溶離:0%至10%乙酸乙酯/石油醚)純化得到所需產物D-4a
。
B-1g 合成之實驗程序
在0℃下,向D-4a
(100.00 g,336.62 mmol,1.0當量)於無水甲苯(1 L)中之經攪拌溶液中緩慢添加甲基溴化鎂(1 N,1.34 L,1340 mmol,4.0當量)。在室溫下將所得混合物攪拌1 h。在起始材料完全轉化之後,添加氯化銨飽和水溶液且用EtOAc萃取水層。合併有機層,經Na2
SO4
乾燥且在減壓下濃縮。粗產物藉由層析(25%乙酸乙酯/己烷)純化得到所需產物B-1g
。
D-5a 合成之實驗程序
將B-1h
(480.00 g,2274 mmol,1.0當量)及乙烷-1,2-二硫醇(213.78 g,2274 mmol,1.0當量)溶解於甲苯(5 L)中,在室溫下添加TsOH (78.24 g,454.9 mmol,0.2當量)且將所得混合物加熱至回流持續24 h。在起始材料完全轉化之後,添加10% NaOH水溶液且用EtOAc萃取水層。合併有機層,用水及鹽水洗滌,經Na2
SO4
乾燥且在減壓下濃縮。粗產物藉由層析(梯度溶離:0%至10%乙酸乙酯/石油醚)純化得到所需產物D-5a
。
B-1i 合成之實驗程序
在-70℃下,向1,3-二溴-5,5-二甲基咪唑啶-2,4-二酮(793.8 g,2785 mmol,4.0當量)於DCM (1.5 L)中之經攪拌溶液中添加HF-吡啶(70%,800 mL,30800 mmol,44當量)。向此混合物中逐滴添加溶解於DCM (0.5 L)中之D-5a
(200.00 g,696.28 mmol,1.0當量)。將溫度保持低於-60℃持續4 h且接著將所得混合物在室溫下再攪拌16 h。在起始材料完全轉化之後,添加2 N NaOH水溶液及30% NaHSO3
水溶液。將有機層用水及鹽水洗滌,經Na2
SO4
乾燥且在減壓下濃縮。粗產物藉由矽膠管柱層析(梯度溶離:0%至3%乙酸乙酯/石油醚)純化得到所需產物B-1i
。
B-1j 合成之實驗程序
在0℃下,將B-1i
(140.00 g,448.79 mmol,1.0當量)溶解於DCM (1.5 L)中且添加DBU (102.32 g,673.19 mmol,1.5當量)。在室溫下將所得混合物攪拌6 h。在起始材料完全轉化之後,將混合物用DCM稀釋,用0.5 N HCl水溶液、水及鹽水洗滌,經Na2
SO4
乾燥且在減壓下濃縮。粗產物藉由層析(梯度溶離:0%至10%乙酸乙酯/石油醚)純化得到所需產物B-1j
。
B-1k 合成之實驗程序
在0℃下,向B-1j
(130.00 g,562.68 mmol,1.0當量)及2-硝基苯磺醯氯(124.35 g,562.68 mmol,1.0當量)於乙腈(1.3 L)中之經攪拌溶液中緩慢添加K3
PO4
(23.86 g,112.54 mmol,0.2當量)及水合肼(56.27 g,1125.36 mmol,2.0當量)。將所得混合物在室溫下攪拌24 h。在起始材料完全轉化之後,添加水且用EtOAc萃取水層。合併有機層,用水及鹽水洗滌,經Na2
SO4
乾燥且在減壓下濃縮。粗產物藉由矽膠管柱層析(梯度溶離:0%至5%乙酸乙酯/石油醚)純化得到所需產物B-1k
。
將B-1a
(125.0 g,555.54 mmol,1.0當量)溶解於無水1,4-二噁烷(1.2 L)中。添加三乙胺(140.27 mL,1388.85 mmol,2.5 當量)及三丁基(1-乙氧基乙烯基)錫(240.66 g,666.65 mmol,1.2當量)且將所得溶液用氬氣吹掃15 min。添加雙(三苯基膦)氯化鈀(II) (3.90 g,5.6 mmol,0.01當量)且將反應混合物在高壓釜中加熱至100℃持續16 h。在起始材料完全轉化之後,將反應混合物冷卻至室溫且用1 N HCl處理且再攪拌16 h。用EtOAc萃取水層,將合併之有機層經Na2
SO4
乾燥,過濾且將溶劑在減壓下移除。粗產物B-2a
不進一步純化即用於下一步驟中。
以下中間物B-2
(表11)可以類似的方式以不同溴苯B-1
為起始物質而獲得。必要時,粗產物B-2
藉由層析純化。表 11 :
# | 結構 | tret [min] | [M+H]+ | HPLC 方法 |
B-2a | n.a. | n.a. | - | |
B-2b | 1.665 | 185 | GVK_LCMS_18 | |
B-2c | 2.023 | 241 | GVK_LCMS_31 | |
B-2d | n.a. | n.a. | - | |
B-2e | n.a. | n.a. | - | |
B-2f | 1.95 | 247 | GVK_LCMS_35 | |
B-2g | 2.04 | 197 | GVK_LCMS_31 | |
B-2h | 1.699 | 185 | GVK_LCMS_18 |
D-6a 合成之實驗程序
在室溫下,向B-2i
(80.00 g,368.60 mmol,1.0當量)於THF (800 mL)中之經攪拌溶液中添加TMS-乙炔(54.31 g,552.94 mmol,1.5當量)、三乙胺(111.69 g,1105.84 mmol,3.0當量)、CuI (4.034 g,36.86 mmol,0.1當量)及Pd(PPh3
)2
Cl2
(25.88 g,36.87 mmol,0.1當量)。所得混合物加熱至回流持續16 h。在起始材料完全轉化之後,添加冰水及EtOAc且用EtOAc萃取水層。合併有機層,經Na2
SO4
乾燥且在減壓下濃縮。粗產物藉由急驟管柱層析(梯度溶離:0%至10%乙酸乙酯/己烷)純化得到所需產物D-6a
。
B-2j 合成之實驗程序
在室溫下,向D-6a
(60.00 g,256.04 mmol,1.0當量)於DCM (1.2 L)及甲醇(1.2 L)中之經攪拌溶液中添加碳酸鉀(353.87 g,2560.38 mmol,10.0當量)。將所得混合物攪拌2 h。在起始材料完全轉化之後,添加冰水且用DCM萃取水層。合併有機層,經Na2
SO4
乾燥且在減壓下濃縮。粗產物藉由急驟管柱層析(梯度溶離:20%乙酸乙酯/己烷)純化得到所需產物B-2j
。
B-2k 合成之實驗程序
將B-2j
(98.00 g,604.34 mmol,1.0當量)溶解於鐵氟龍燒瓶(teflon flask)中之1,1,1,3,3,3-六氟丙醇(500 mL)中。添加HF-吡啶(70%,250 mL,9625 mmol,16當量)且密封燒瓶。將所得混合物在室溫下攪拌3 d。在起始材料完全轉化之後,添加冰水及EtOAc且用EtOAc萃取水層。合併有機層,用NaHCO3
飽和水溶液及鹽水洗滌,經Na2
SO4
乾燥且在減壓下濃縮。粗產物藉由急驟管柱層析(梯度溶離:0%至20%乙酸乙酯/己烷)純化得到所需產物B-2k
。
D-8a 合成之實驗程序
在-78℃下,向D-7a
(120.00 g,479.98 mmol,1.0當量)於THF (1.2 L)中之經攪拌溶液中逐滴添加甲基溴化鎂(1 N,720 mL,720.00 mmol,1.5當量)。將所得混合物在同一溫度下攪拌3 h。在起始材料完全轉化之後,添加氯化銨飽和水溶液且用EtOAc萃取水層。合併有機層,經Na2
SO4
乾燥且在減壓下濃縮。 粗產物藉由矽膠層析(梯度溶離:0%至10%乙酸乙酯/石油醚)純化得到所需產物D-8a
。
B-2l 合成之實驗程序
在室溫下,向D-8a
(24.00 g,90.21 mmol,1.0當量)於乙腈(240 mL)中之經攪拌溶液中添加高釕酸四丙銨(3.166 g,9.01 mmol,0.1當量)及4-甲基嗎啉N
-氧化物(15.83 g,135.30 mmol,1.5當量)。將所得混合物在同一溫度下攪拌4 h。在起始材料完全轉化之後,藉由過濾移除不溶物且在減壓下濃縮濾液。粗產物藉由矽膠層析(梯度溶離:0%至5%乙酸乙酯/石油醚)純化得到所需產物B-2l
。
D-9a 合成之實驗程序
在室溫下,向B-2l
(22.00 g,83.32 mmol,1.0當量)於DMSO (220 mL)中之經攪拌溶液中添加溴二氟乙酸乙酯(50.74 g,249.95 mmol,3.0當量)及銅粉(15.75 g,250.00 mmol,3.0當量)。將所得混合物加熱至80℃且攪拌16 h。在起始材料完全轉化之後,添加冰水及乙醚。藉由過濾移除不溶物且用乙醚萃取水層。合併有機層,經Na2
SO4
乾燥且在減壓下濃縮。粗產物藉由層析(梯度溶離:0%至3%乙酸乙酯/石油醚)純化得到所需產物D-9a
。
B-2m 合成之實驗程序
在氬氣氛圍下,將D-10a
(20.00 g,121.98 mmol,1.0當量)及2,2,2-三氟乙基碘(51.23 g,243.95 mmol,2.0當量)添加至參(二亞苄基丙酮)-二鈀(7.819 g,8.54 mmol,0.1當量)、氧雜蒽膦(7.05 g,12.20 mmol,0.1當量)及碳酸銫(118.93 g,365.94 mmol,3.0當量)於THF (200 mL)中之攪拌懸浮液中。將所得混合物攪拌一分鐘且接著在密封管中加熱至80℃持續12 h。在起始材料完全轉化之後,添加冰水及EtOAc且用EtOAc萃取水層。合併有機層,經Na2
SO4
乾燥且在減壓下濃縮。將粗產物藉由急驟管柱層析純化得到所需產物B-2m
。
將B-2a
(170.00 g,903.53 mmol;1.0當量)溶解於THF (1.7 L)中。在室溫下添加(R)
-(+)-2-甲基-2-丙烷亞磺醯胺(164.13 g;1355.33 mmol;1.5當量)及四乙氧基鈦(618.03 g,2710.66 mmol;3.0當量)且將所得反應混合物加熱至80℃持續16 h。在起始材料完全轉化之後,添加冰水及EtOAc且用EtOAc萃取水層。合併有機層,經Na2
SO4
乾燥且在減壓下濃縮。粗產物B-3a
不進一步純化即用於下一步驟中。
將B-3a
(170.00 g,583.53 mmol;1.0當量)之溶液溶解於THF (1.7 L)中且冷卻至0℃。添加硼氫化鈉(21.59 g;583.51 mmol;1.0當量)且將所得反應混合物在室溫下攪拌6 h。在起始材料完全轉化之後,添加冰水及EtOAc且用EtOAc萃取水層。合併有機層,經Na2
SO4
乾燥且在減壓下濃縮。粗產物藉由層析(梯度溶離:33%乙酸乙酯/石油醚)純化得到所需產物B-4a
。
B-4n 合成之實驗程序
將D-11a
(26.00 g,71.55 mmol;1.0當量)之溶液溶解於THF (260 mL)及水(5 mL)中,冷卻至-78℃。添加硼氫化鈉(8.156 g;214.63 mmol;3.0當量)且使所得反應混合物升溫至室溫且攪拌4 h。在起始材料完全轉化之後,添加冰水及EtOAc且用EtOAc萃取水層。合併有機層,經Na2
SO4
乾燥且在減壓下濃縮。粗產物藉由逆相層析純化得到所需產物B-4n
。
B-4o 合成之實驗程序
在室溫下,向B-4n
(5.00 g,15.46 mmol,1.0當量)於THF (50 mL)中之經攪拌溶液中添加碳酸銫(15.12 g,46.38 mmol,3.0當量)及18-冠醚-6 (2.04 g,7.73 mmol,0.5當量)。將所得混合物加熱至80℃持續16 h。在起始材料完全轉化之後,添加水及EtOAc且用EtOAc萃取水層。合併有機層,經Na2
SO4
乾燥且在減壓下濃縮。粗產物藉由急驟管柱層析(80% EtOAc/己烷)及逆相層析純化以得到所需產物B-4o
。
B-4p 合成之實驗程序
在室溫下,向B-4n
(1.00 g,3.09 mmol,1.0當量)於THF (10 mL)中之經攪拌溶液中添加第三丁醇鉀(0.52 g,4.64 mmol,1.5當量)及18-冠醚-6 (2.04 g,7.73 mmol,0.5當量)。使所得混合物升溫至80℃持續16 h。在起始材料完全轉化之後,添加水及EtOAc且用EtOAc萃取水層。合併有機層,經Na2
SO4
乾燥且在減壓下濃縮。粗產物藉由HPLC純化以得到所需產物B-4p
。
將苯乙酮B-2n
(5.00 g,24.3 mmol,1.0當量)溶解於甲苯(15 mL)及2-甲基四氫呋喃(5.0 mL)中。添加第三戊醇化鈉(281 µL,50%於甲苯中,1.21 mmol,5 mol%)且用Ar氛圍吹掃反應混合物。將(R
)-RUCY-Xyl-BINAP (58.0 mg,49.0 µmol,0.2 mol%)添加至反應混合物中。將反應混合物充入氫氣氛圍(3巴)且在室溫下攪拌19 h直至實現B-2n
之完全轉化。將反應物用EtOAc (50 mL)稀釋且用水(1 × 50 mL)、HCl水溶液(1 × 10 mL,1.0 M)及水(1 × 50 mL)洗滌。有機層經Na2
SO4
乾燥、過濾且在真空中濃縮以得到所需產物。
以下中間物B-6
(表14)可以類似方式以不同苯乙酮B-2
為起始物質而獲得。必要時,粗產物藉由層析純化。表 14 :
# | 結構 | tret [min] | m/z | HPLC 方法 |
B-6a | 1.283 | [M+H]+ : 191.1 | D_LC_SSTD | |
B-6b | 1.254 | [M]+ : 204.2 | D_LC_SSTD | |
B-6c | 1.281 | [M]+ : 208.2 | D_LC_SSTD | |
B-6d | 1.095 | [M-H]- : 203.1 | D_LC_SSTD |
將B-4a
(13.20 g,45.00 mmol;1.0當量)於1,4-二噁烷(100 mL)中之溶液冷卻至0℃且用含4 N HCl之1,4-二噁烷(50.00 mL,200.00 mmol,4.4當量)處理。將反應混合物攪拌3 h。在起始材料完全轉化之後,將反應混合物在減壓下濃縮,過濾沈澱物且用乙醚洗滌以獲得呈HCl鹽之所需產物B-5a
。
B-5k ( 替代物 ) 合成之實驗程序
將醇B-6a
(2.00 g,9.61 mmol,1.0當量)溶解於無水甲苯(20 mL)中。隨後添加二氮雜雙環十一烯(1.73 mL,11.5 mmol,1.2當量)及二苯基膦酸疊氮化物(2.28 mL,10.6 mmol,1.1當量)。將反應混合物在40℃下攪拌18 h直至實現B-6a
之完全轉化。將反應混合物冷卻至室溫且用Na2
CO3
水溶液(2 × 10 mL)洗滌有機層。由此獲得之疊氮化物B-7a
不經分離而直接在下一步驟中轉化。
將Pd/C (200 mg,10% w/w,10% Pd)添加至有機層中。將反應混合物充入H2
氛圍(10巴)且攪拌24 h直至實現B-7a
之完全轉化。過濾反應物且在真空中移除揮發物。將殘餘物溶解於甲基第三丁基醚(30 mL)中且用含HCl之二噁烷(4.8 mL,4 M)處理。將白色沈澱物過濾,用甲基第三丁基醚(20 mL)洗滌且在真空中進一步乾燥以得到所需產物B-5k
。必要時,粗產物藉由層析純化。
以下中間物B-5
(表16)可以類似方式以不同醇B-6
至疊氮化物B-7
為起始物質而獲得。表 16 :
# | 結構 | tret [min] | [M+H]+ | HPLC 方法 |
B-7a | n.a. | n.a. | n.a. | |
B-7b | n.a. | n.a. | n.a. | |
B-7c | n.a. | n.a. | n.a. | |
B-7d | n.a. | n.a. | n.a. | |
B-5k | 1.290 | 190.0 | D_LC_BSTD | |
B-5i | 1.294 | 204.0 | D_LC_BSTD | |
B-5l | 1.311 | 208.0 | D_LC_BSTD | |
B-5m | 0.829 | 204.2 | D_LC_SSTD |
在0℃下,向D-12a
(6.50 g,35.093 mmol,1.0當量)於DCM (100 mL)中之經攪拌溶液中逐滴添加三氟化二乙基胺基硫(8.48 g,52.67 mmol,1.5當量)。使反應混合物緩慢升溫至室溫且攪拌16 h。在起始材料完全轉化之後,添加NaHCO3
飽和水溶液。用DCM萃取水層,合併有機層,經Na2
SO4
乾燥且在減壓下濃縮。粗產物藉由矽膠層析(梯度溶離:0%至12%乙酸乙酯/石油醚)純化得到所需產物D-13a
。
C-1a 合成之實驗程序
在0℃下,向D-13a
(2.40 g,11.582 mmol,1.0當量)於1,4-二噁烷(5.0 mL)中之經攪拌溶液中添加含4 N HCl之1,4-二噁烷(10 mL,40.00 mmol,3.5當量)。使反應混合物升溫至室溫且攪拌16 h。在起始材料完全轉化之後,將反應混合物在減壓下濃縮。將正戊烷添加至粗產物。將固體材料過濾且用正戊烷洗滌以得到呈HCl鹽之所需產物C-1a
。
D-15a 合成之實驗程序:
將胺基酸D-14a
(2.00 g,19.7 mmol,1.0當量)及鄰苯二甲酸酐(2.92 g,19.7 mmol,1.0當量)懸浮於乙酸(20 mL)中。將反應混合物設定為回流且將獲得之溶液在此溫度下攪拌3 h。將反應混合物冷卻至0℃,同時產物D-15a
結晶。添加水(20 mL)且將反應混合物在此溫度下攪拌1 h。將沈澱物過濾,用水洗滌且在真空中進一步乾燥以得到所需產物。必要時,粗產物藉由層析進一步純化(tret
= 1.03 min;[M-H]+
= 230.0;HPLC方法D_LC_SSTD)。
D-16a 合成之實驗程序:
將酸D-15a
(2.00 g,8.6 mmol,1.0當量)懸浮於甲苯(10 mL)及N,N
-二甲基甲醯胺(0.1 mL)中。在室溫下添加亞硫醯氯(1.08 g,9.1 mmol,1.05當量),接著將反應混合物設定為回流且將獲得之溶液在此溫度下攪拌3 h直至實現D-15a
之完全轉化(用苯甲胺淬滅)。將反應混合物冷卻至室溫,同時產物D-16a
結晶。添加庚烷(10 mL)且將反應混合物進一步冷卻至5℃且在此溫度下攪拌1 h。將沈澱物過濾,用水洗滌且在真空中進一步乾燥以得到所需產物。必要時,粗產物藉由層析進一步純化(tret
= 1.27 min;[M+H]+
= 246/247/248;HPLC方法D_LC_SSTD在用苯甲胺淬滅之後作為苯甲醯胺;1
H NMR (400 MHz, CDCl3
) δ ppm 1.70-1.85 (m, 2H), 2.10-2.31 (m, 2 H), 7.64-8.11 (m, 4 H))。
D-17a 合成之實驗程序:
將醯基氯化物D-16a
(2.00 g,8.0 mmol,1.0當量)及10% Pd/C (無水,100 mg,5% w/w)懸浮於四氫呋喃(12 mL)及2,6-二甲基吡啶(1.03 g,9.6 mmol,1.2當量)中。將反應混合物在3巴及30℃下氫化。在20 h之後,添加額外催化劑(25 mg)且再繼續氫化24 h。此後,過濾反應混合物且蒸發濾液。將殘餘物分配在甲苯與NaHCO3
水溶液之間。將有機相分離且再次用NaHCO3
溶液且最後用檸檬酸溶液洗滌。將有機層乾燥(Na2
SO4
)且在減壓下濃縮。必要時,粗產物藉由層析進一步純化(tret
= 1.26 min;[M+H]+
= 216;HPLC方法D_LC_BSTD)。
D-18a 合成之實驗程序:
在室溫下,將醛D-17a
(2.00 g,9.3 mmol,1.0當量)溶解於二氯甲烷(12 mL)中且緩慢添加雙(2-甲氧基乙基)胺基三氟化硫(9.90 g,22.3 mmol,2.4當量)之50%甲苯溶液。在攪拌兩天之後,將反應混合物用NaHCO3
水溶液且用額外二氯甲烷(15 mL)謹慎地處理。將有機層乾燥(Na2
SO4
)且在減壓下濃縮。必要時,粗產物D-18a
藉由層析進一步純化或結晶(tret
= 1.24 min;[M+H]+
= 238;HPLC方法D_LC_SSTD)。
(待用於轉化D-17a
之潛在替代性氟化劑為例如四氟硼酸(二乙胺基)二氟鋶及四氟化硫)。
C-1a 合成之實驗程序:
將醯亞胺D-18a
(15.0 g,63.2 mmol,1.0當量)懸浮於N-(2-羥乙基)乙二胺(45 mL)中且將混合物加熱至80℃。在在此溫度下2 h之後,將反應混合物冷卻至40℃且添加甲醇(30 mL)。將混合物再次加熱至80℃且將產物C-1a
在60-70℃及大氣壓力下餾出為甲醇溶液。添加甲醇且將蒸餾步驟重複兩次。產物C-1a
可以甲醇溶液形式直接在下一步驟中(1
H NMR (400 MHz, DMSO-d6
)δ
(ppm) = 0.44-0.81 (m, 4 H), 5.64 (t, J = 57.1 Hz, 1 H)。δ
(ppm) = 3.18 (d, 3H), 4.08 (q, 1H)處之甲醇質子未報導)。D-20a 合成之實驗程序 :
向D-19a
(5.00 g,58.08 mmol,1.0當量)於DCM (50 mL)中之經攪拌溶液中添加(S
)-(-)-1-苯乙胺(6.21 g,58.08 mmol,1.0當量)及硫酸鎂(13.94 g,116.16 mmol,2.0當量)。將反應混合物在室溫下攪拌16 h。在起始材料完全轉化之後,藉由過濾移除不溶物且在減壓下濃縮濾液。粗產物D-20a
不進一步純化即用於下一步驟中。
D-21a 及 D-21b 合成之實驗程序
在0℃下,向D-20a
(8.00 g,42.27 mmol,1.0當量)於乙腈(80 mL)及DMF (8 mL)中之經攪拌溶液中添加氟化氫鉀(2.64 g,33.85 mmol,0.8當量)及三氟乙酸(5.30 g,46.49 mmol,1.1當量)。將反應混合物攪拌10 min,接著添加三甲基-三氟甲基-矽烷(9.02 g,63.43 mmol,1.5當量)且使所得混合物升溫至室溫且再攪拌16 h。在起始材料完全轉化之後,添加水及乙酸乙酯,用乙酸乙酯萃取水層且將合併之有機層用鹽水洗滌且經Na2
SO4
乾燥且在減壓下濃縮。粗產物藉由SFC純化得到所需產物D-21a
及D-21b
。
C-1b 合成之實驗程序:
將D-21a
(2.00 g,7.714 mmol,1.0當量)溶解於含3 N HCl之甲醇(6.00 mL,18.00 mmol,2.3當量)中且在室溫下攪拌5 min。將溶劑在減壓下移除且將所得固體材料溶解於甲醇(20 mL)中。添加鈀氧化鋁(10 wt%,200.00 mg,0.188 mmol,0.025當量)且將所得混合物在室溫下攪拌16 h。在完全轉化之後,藉由過濾移除不溶物且在減壓下濃縮濾液。將乙醚添加至粗產物中。將固體材料過濾且用乙醚洗滌以得到呈HCl鹽之所需產物C-1b
。
以下胺C-1
(表17)可以類似的方式以不同中間物D-21
為起始物質而獲得。必要時,粗產物C-1
藉由層析純化且分離為HCl鹽。表 17 :
# | 結構 | tret [min] | [M+H]+ | HPLC 方法 |
C-1b | n.a. | n.a. | - | |
C-1c | n.a. | n.a. | - |
D-23a 合成之實驗程序:
向D-22a
(330 mg,1.293 mmol,1.0當量)於THF (1.0 mL)中之經攪拌溶液中添加三乙胺(99%,544 µL,3.875 mmol,3.0當量)及TBTU (518.8 g,1.616 mmol,1.3當量)。將反應混合物在室溫下攪拌15 min,接著添加二甲胺鹽酸鹽(110.7 mg,1.358 mmol,1.1當量)。將所得混合物再攪拌2 h。在起始材料完全轉化之後,添加水及DCM且用DCM萃取水層。合併有機層,經MgSO4
乾燥且在減壓下濃縮。粗產物D-23a
不進一步純化即用於下一步驟中。
以下醯胺D-23
(表18)可以類似的方式以不同酸D-22
為起始物質而獲得。必要時,粗產物D-23
藉由層析純化。表 18 :
# | 結構 | tret [min] | [M+H]+ | HPLC 方法 |
D-23a | 0.816 | 283 | VAB | |
D-23b | 0.853 | 297 | VAB |
C-1d 合成之實驗程序:
將D-23a
(360 mg,1.275 mmol,1.0當量)溶解於DCM (5.0 mL)中且用含4 N HCl之1,4-二噁烷(2.55 mL,10.200 mmol,8.0當量)處理。將反應混合物攪拌18 h。在起始材料完全轉化之後,將溶劑在減壓下部分移除。將固體材料過濾且乾燥以得到呈HCl鹽之所需產物C-1d
。
以下醯胺C-1
(表19)可以類似的方式以不同中間物D-23
為起始物質而獲得。必要時,粗產物C-1
藉由層析純化且分離為HCl鹽。表 19 :
# | 結構 | tret [min] | [M+H]+ | HPLC 方法 |
C-1d | n.a. | n.a. | - | |
C-1e | n.a. | n.a. | - |
中間物 E-3 之合成 E-3a 合成之實驗程序:
在0℃下,將3-側氧基戊二酸二甲酯E-1a
(10.0 g,57.4 mmol,1.0當量)與N,N
-二甲基甲醯胺二甲基縮醛(7.60 mL,57.4 mmol,1.0當量)合併於2-甲基四氫呋喃(75 mL)中。在0-4℃下攪拌3 h之後,使反應混合物升溫至室溫且緩慢添加鹽酸水溶液(4 N,26 mL) (中間物E-2a
未分離)。在室溫下攪拌3 h之後,將有機層分離,用水且接著鹽水洗滌且在減壓下濃縮。必要時,粗產物E-3a
藉由蒸餾或層析進一步純化(tret
= 0.99/1.04 min;[M+H]+
= 203;HPLC方法D_LC_SSTD)。
中間物 E-4 之合成 E-4a 合成之實驗程序 :
在室溫下,將2-甲醯基-3-側氧基戊二酸二甲酯E-3a
(4.34 g,21.5 mmol,1.15當量)及胺C-1a
(2.00 g 18.7 mmol,1.0當量於14.5 mL甲醇中)之甲醇溶液併入至甲醇(5.5 mL)中。在此溫度下攪拌隔夜之後,添加NaOMe (3.8 mL,21.5 mmol,1.15當量,30%w/w於甲醇中),再用甲醇(2 mL)沖洗。在室溫下攪拌2 h之後,緩慢添加水(24 mL),隨後添加濃鹽酸(4.7 mL)。將沈澱物過濾,用水洗滌且在真空中進一步乾燥以得到所需產物。必要時,粗產物藉由層析純化(tret
= 1.06 min;[M-H]+
= 258;HPLC方法D_LC_SSTD)。
中間物 E-5 之合成 E-5a 合成之實驗程序 :
將4-羥基吡啶酮E-4a
(2.00 g,7.7 mmol,1.0當量)懸浮於乙腈(16 mL)中。在室溫下添加三乙胺(1.61 mL,11.6 mmol,1.5當量),隨後為逐份添加對甲苯磺醯氯(1.47 g,7.7 mmol,1.0當量),用乙腈(4 mL)沖洗。將反應混合物在室溫下攪拌2 h直至實現完全轉化,接著在旋轉蒸發儀中濃縮且用水(20 mL)處理。在室溫下攪拌1 h之後,將沈澱物過濾,用水洗滌且在真空中進一步乾燥以得到所需產物。必要時,粗產物藉由層析純化(tret
= 1.34 min;[M-H]+
= 414;HPLC方法D_LC_SSTD)。
中間物 E-6 之合成 E-6a 合成之實驗程序 :
將甲苯磺酸鹽E-5a
(4.00 g,9.78 mmol,1.0當量)、乙醯胺(686 mg,11.6 mmol,1.0當量)、K3
PO4
(2.26 g,10.6 mmol,1.1當量)、鈀(π-苯烯丙基)氯化物二聚體(75.2 mg,145 µmol,1.5 mol%)及氧雜蒽膦(168 mg,290 µmol,3.0 mol%)懸浮於二噁烷(20 mL)中。將反應混合物用Ar氛圍吹掃且在回流下攪拌2 h直至實現完全轉化。在50℃下,添加濃HCl (36%,83 µL,968 mmol,0.1當量)及水(40 mL)。將反應物進一步冷卻且在室溫下攪拌2 h。將沈澱物過濾,用水洗滌且在真空中進一步乾燥以得到所需產物。必要時,粗產物E-6a
藉由層析純化(tret
= 1.123 min;[M+H]+
= 301.0;HPLC方法D_LC_SSTD)。
中間物 E-7 之合成 E-7a 合成之實驗程序 :
將乙醯胺E-6a
(2.50 g,8.33 mmol,1.0當量)懸浮於甲醇NH3
(7 M,20 mL)中且在室溫下攪拌5天直至實現E-6a
之完全轉化。在真空中移除溶劑且將固體殘餘物溶解於甲醇(10 mL)中。將NaOH水溶液(1 M,10 mL)添加至反應混合物中且將反應物在50℃下攪拌20 min。過濾反應混合物,將殘餘固體用甲醇(5 mL)洗滌且使用HCl水溶液(1 M,大約10 mL)中和濾液。將沈澱物過濾,用水及乙腈洗滌且在真空中進一步乾燥以得到所需產物。必要時,粗產物E-7a
藉由層析純化(tret
= 0.885 min;[M+H]+
= 268.0;HPLC方法D_LC_SSTD)。
根據本發明之化合物 (I) 之合成 I-1 合成之實驗程序
將A-7a
(272.0 mg,0.586 mmol,1.0當量)溶解於2-丙醇(0.5 mL)中。添加5 N HCl水溶液(586 µL,2.928 mmol,5.0當量)且將所得混合物在50℃下攪拌1小時直至觀察到起始材料之完全轉化。將反應混合物用氨水鹼化,過濾且濾液藉由鹼性逆相層析(梯度溶離:20%至60%乙腈/水)純化以得到所需產物。
I-97 合成之實驗程序
將E-7a
(1.00 g,3.74 mmol,1.0當量)懸浮於MeCN (20 mL)中。添加K3
PO4
(2.00 g,9.42 mmol,2.5當量)及六氯環三磷氮烯(1.30 g,3.74 mmol,1.0當量)且將反應混合物在室溫下攪拌1 h。添加苯乙胺鹽酸鹽B-5k
(930 mg,4.12 mmol,1.1當量)且將反應混合物進一步攪拌1 h。添加NH3
水溶液(25%,2.0 mL)及在1 h之後添加飽和K2
CO3
溶液(20 mL)。將二相反應混合物在室溫下攪拌16 h且在真空中濃縮有機層。必要時,粗產物I-97
藉由層析純化。
I-104 及 I-105 合成之實驗程序
將A-7ct
(90 mg,0.196 mmol,1.0當量)溶解於2-丙醇(0.5 mL)中。添加2 N HCl水溶液(500 µL,1.000 mmol,5.1當量)且將所得混合物在50℃下攪拌3 h直至觀察到起始材料之完全轉化。將反應混合物用氨水鹼化,過濾且濾液藉由鹼性逆相層析(梯度溶離:15%至85%乙腈/水)純化以得到所需產物。
I-110 合成之實驗程序
將A-7ak
(56.0 mg,0.120 mmol,1.0當量)溶解於2-丙醇(0.5 mL)中。添加2 N HCl水溶液(500 µL,1.000 mmol,8.3當量)且將所得混合物在50℃下攪拌1 h直至觀察到起始材料之完全轉化。添加2 M NaOH水溶液(500 µL,1.000 mmol,8.3當量)且將所得混合物在室溫下再攪拌一小時直至觀察到中間物之完全轉化。過濾反應混合物且濾液藉由鹼性逆相層析(梯度溶離:30%至70%乙腈/水)純化以得到所需產物。
I-131 合成之實驗程序
將I-1
(179.0 mg,0.445 mmol,1.0當量)溶解於乙腈(1.5 mL)中。逐滴添加NBS (80.8 mg,0.454 mmol,1.0當量)於乙腈(0.5 mL)中之溶液且將所得混合物在室溫下攪拌1 h直至觀察到起始材料之完全轉化。將反應混合物用DCM稀釋且用水洗滌。合併有機層,乾燥(MgSO4
)且在減壓下濃縮以得到所需產物I-131
。
I-155 合成之實驗程序
將I-131
(23.0 mg,0.048 mmol,1.0當量)溶解於二噁烷(0.75 mL)及水(0.25 mL)中。添加碳酸銫(90%,26.0 mg,0.072 mmol,1.5當量)、雙[(二苯基膦基)二茂鐵]二氯化鈀(II) (與DCM之錯合物) (3.9 mg,0.005 mmol,0.1當量)及三甲基硼氧雜環己烷(99%,7.5 µL,0.054 mmol,1.1當量)。用氬氣沖洗燒瓶且將反應混合物在100℃下攪拌16 h直至觀察到起始材料之完全轉化。將反應混合物用DCM稀釋且用NaHCO3
水溶液洗滌。合併有機層,乾燥(MgSO4
)且在減壓下濃縮。藉由鹼性逆相層析(梯度溶離:25%至85%乙腈/水)純化得到所需產物。
I-179 合成之實驗程序
將I-137
(50.0 mg,0.107 mmol,1.0當量)溶解於二噁烷(0.8 mL)及水(0.2 mL)中。添加碳酸鉀(90%,33.0 mg,0.214 mmol,2.0當量)、雙[(二苯基膦基)二茂鐵]二氯化鈀(II) (與DCM之錯合物) (9.0 mg,0.011 mmol,0.1當量)及環丙基硼酸(14.0 mg,0.161 mmol,1.5當量)。用氬氣沖洗燒瓶且將反應混合物在100℃下攪拌4 h直至觀察到起始材料之完全轉化。將反應混合物用DCM稀釋且用NaHCO3
水溶液洗滌。合併有機層,乾燥(MgSO4
)且在減壓下濃縮。藉由鹼性逆相層析(梯度溶離:25%至85%乙腈/水)純化得到所需產物(HPLC方法:LCMSBAS1,tret.
= 1.27 min;[M+H]+
= 429;IC50
= 11 nM)。
以下實例描述根據本發明之化合物的生物活性,但本發明不限於此等實例。
式(I)
化合物之特徵在於其在治療領域中之許多可能應用。
KRAS::SOS1 AlphaScreen 結合分析
此分析可用於檢驗化合物抑制SOS1與KRAS G12D之間的蛋白質-蛋白質相互作用之效能。此表明化合物之分子作用模式。低IC50
值指示在此分析設置中SOS1抑制劑之高效能:
試劑:
● 自製GST標記之SOS1 (564_1049_GST_TEV_ECO)
● GST-TEV-SOS1 (564-1049)購自Viva Biotech Ltd.
● 6xHis-Tev-K-RasG12D(1-169)Avi購自Xtal BioStructures, Inc. (批次號X129-110)
● GDP (Sigma目錄號G7127)
● AlphaLISA麩胱甘肽受體珠粒(PerkinElmer,目錄號AL109)
● AlphaScreen抗生蛋白鏈菌素(Streptavidin)供體珠粒(PerkinElmer目錄號6760002)
● 分析盤:Proxiplate-384 PLUS,白色(PerkinElmer,目錄號6008289)
分析緩衝液:
● 1 × PBS
● 0.1% BSA
● 100 µM EDTA或無EDTA (在無EDTA之情況下量測表中之IC50
,除非其用星號標記)
● 0.05 % Tween 20
KRAS::SOS1 GDP混合物:
將10 nM (最終分析濃度) KRAS G12D、10 µM (最終分析濃度) GDP及5 nM (最終分析濃度) GST-SOS1在使用之前混合於分析緩衝液中且保存在室溫下。
珠粒混合物:
將AlphaLISA麩胱甘肽受體珠粒及AlphaScreen抗生蛋白鏈菌素供體珠粒各自在使用之前以10 µg/mL之濃度(最終分析濃度)混合於分析緩衝液中且保存在室溫下。
分析方案:
將化合物稀釋至100 µM之最終起始濃度且一式兩份地測試。使用具有Labcyte Echo 550或555聲學分配器之Access Labcyte工作台產生分析備用盤(ARP)。對於起始濃度為100 µM之化合物,以11種濃度一式兩份地藉由連續1:5稀釋每孔轉移150 nL之化合物溶液。
分析係在低於100勒克司之黑暗房間中使用全自動機器系統進行。將10 µL之KRAS::SOS1 GDP混合物添加至管柱1-24中達至150 nL之化合物溶液(分析中之最終稀釋度為1:100,最終DMSO濃度為1%)。
在30分鐘培育時間之後,將5 µL之珠粒混合物添加至管柱1-23中。將盤在室溫下保存於黑暗培育箱中。在又60分鐘培育之後,使用PerkinElmer之AlphaScreen規格使用PerkinElmer Envision HTS多標記讀取器來量測信號。各盤含有以下對照:
● 稀釋之DMSO + KRAS::SOS1 GDP混合物+珠粒混合物
● 稀釋之DMSO + KRAS::SOS1 GDP混合物
結果計算:
使用4參數對數模型計算及分析IC50
值。
本文所揭示之實例化合物表含有使用上文分析測定之IC50
值。
細胞增殖分析
細胞增殖分析用於檢驗化合物在活體外抑制癌細胞株之SOS1介導之增殖、生長及細胞凋亡的效能。此表明化合物之分子作用模式。低IC50
值指示在此分析設置中SOS1抑制劑之高效能。特定言之,觀察到SOS1抑制劑對KRAS突變人類癌細胞株之增殖顯示有效抑制作用且對BRAF V600E突變癌細胞株或非成癮KRAS野生型人類癌細胞株無抑制作用。此證實SOS1抑制劑之分子作用模式為選擇性地靶向依賴於RAS家族蛋白質功能之癌細胞。
細胞增殖分析係在三維(3D)非錨定依賴性軟瓊脂條件下用以下人類細胞株進行:
NCI-H358:具有KRAS G12C突變之人類非小細胞肺癌(NSCLC);
PC-9:具有野生型KRAS及EGFR del 19突變之人類非小細胞肺癌(NSCLC);
NCI-H1792:具有KRAS G12C突變之人類非小細胞肺癌(NSCLC);
SW900:具有KRAS G12V突變之人類非小細胞肺癌(NSCLC);
A-549:具有KRAS G12S突變之人類非小細胞肺癌(NSCLC);
NCI-H2122:具有KRAS G12C突變之人類非小細胞肺癌(NSCLC);
NCI-H520:具有野生型KRAS之人類非小細胞肺癌(NSCLC);MIA PaCa-2:具有KRAS G12C突變之人類胰臟癌細胞(PAC);
DLD-1:具有KRAS G13D突變之人類結腸癌;
A-375:具有除BRAFV600E突變以外之野生型KRAS之人類黑素瘤癌症,其用作在用SOS1抑制劑處理後無反應之細胞株;
除PC-9以外之所有細胞株可購自美國菌種保存中心(American Type Culture Collection;ATCC)。PC-9可購自歐洲鑑認細胞培養物保存中心(European Collection of Authenticated Cell Cultures;ECACC)。
所使用之材料 :
來自Corning之96孔超低結合盤(CLS2474-24EA);
來自Gibco之4%瓊脂糖凝膠1 × 液體40 mL (18300-012);
RPMI-1640培養基(ATCC®
30-2001™);
Leibovitz's L-15 (Gibco,目錄號11415);
F-12K (ATCC,目錄號30-2004);
DMEM (Lonza BE12-604F);來自HyClone之胎牛血清(FBS) (SH30071.03);
來自Invitrogen之阿爾瑪藍(Alamar Blue) (DAL1100CSTM1)
細胞培養 :
使用RPMI培養基使NCI-H358細胞(ATCC HTB-182)、DLD-1細胞(ATCC CCL-221)、NCI-H520細胞(ATCC HTB-182)、PC-9細胞(ECACC 90071810)、NCI-H1792細胞(ATCC CRL-5895)及NCI-H2122細胞(ATCC CRL-5985)在細胞培養燒瓶(175 cm2
)中生長。SW900細胞(ATCC HTB-59)在Leibovitz's L-15培養基中生長,A-549細胞(ATCC CCL-185)在F12K培養基中生長,MIA PaCa-2細胞(ATCC CRL-1420)及A-375 (ATCC-CRL-1619)在DMEM培養基中生長。所有列出之細胞株的細胞培養基補充有10% FBS。將培養物在潮濕氛圍中在37℃及5% CO2
下培育,培養基更換或轉種一週進行2-3次。SW900細胞在不添加CO2
之情況下培養。
分析條件:
分析設置由以下構成:
● 由包括1.2%瓊脂糖之90 µL培養基組成之底層
● 由包括0.3%瓊脂糖之60 µL培養基組成之細胞層
● 由包括測試化合物(不含瓊脂糖)之30 µL培養基組成之頂層
對於底層之製備,將4%瓊脂糖(微波加熱)與培養基(包括除SW900以外之所有細胞株之2% FBS,對於SW900,10% FCS用於實現細胞生長)混合以在培養基中最終稀釋1.2%瓊脂糖。各孔填充有90 µL之底層懸浮液且冷卻至室溫1 h。對於細胞層,將細胞胰蛋白酶化,計數且接種於包括0.3%瓊脂糖之60 µL培養基(2% FBS) (每孔1500個細胞)中。冷卻至室溫1 h後,將盤在潮濕氛圍中在37℃及5% CO2
下培育隔夜。次日,一式三份添加化合物(30 µL連續稀釋液)。測試化合物之濃度範圍最小在10微莫耳與0.13奈莫耳之間。將化合物(原液:10 mM於100% DMSO中)稀釋於培養基中。將細胞在潮濕氛圍中在37℃及5% CO2
下培育14天。
偵測:
每孔添加20微升/孔之阿爾瑪藍懸浮液且在培育箱中培育4-24小時。使用螢光讀取器(2030 VICTOR X5,Perkin Elmer)測定螢光強度。激發波長為544/15 nm,發射為590 nm。在單一療法中,資料藉由使用具有可變希爾斜率(hill slope)之S形曲線分析程式(GraphPAD Prism)進行迭代計算來擬合以確定IC50
值。
ERK 磷酸化分析
ERK磷酸化分析用於檢驗化合物在活體外抑制KRAS突變人類癌細胞株中SOS1介導之信號轉導之效能。此藉由干擾RAS家族蛋白質信號轉導級聯表明化合物之分子作用模式。低IC50
值指示在此分析設置中SOS1抑制劑之高效能。觀察到SOS1抑制劑顯示對KRAS突變人類癌細胞株中ERK磷酸化之抑制作用,因此證實SOS1抑制劑對RAS家族蛋白質信號轉導之分子作用模式。
使用以下人類細胞株進行ERK磷酸化分析:
DLD-1 (ATCC CCL-221):具有KRAS G13D突變之人類結腸癌;所使用之材料 :
RPMI-1640培養基(ATCC® 30-2001™)
來自HyClone之胎牛血清(FBS) (SH30071.03)
來自Thermo Fischer Scientific之非必需胺基酸(11140035)
來自Thermo Fischer Scientific之丙酮酸鹽(11360039)
來自Thermo Fischer Scientific之格魯塔瑪(Glutamax) (35050061)
來自Greiner Bio-One之384盤(781182)
來自PerkinElmer Inc.之Proxiplate™ 384 (6008280)
AlphaLISA SureFire Ultra p-ERK1/2 (Thr202/Tyr204)分析套組(ALSU-PERK-A500)
來自Sigma之EGF (E4127)
受體混合物:來自PerkinElmer之蛋白A受體珠粒(6760137M)
供體混合物:來自PerkinElmer之AlphaScreen抗生蛋白鏈菌素塗覆之供體珠粒(6760002)
曲美替尼(Trametinib)
來自Sigma Aldrich之星形孢菌素(Staurosporine) (S6942)分析設置 :
DLD-1細胞(ATCC CCL-221)以每孔50,000個細胞接種於Greiner TC 384盤中之/60 µL具有10% FBS、非必需胺基酸、丙酮酸鹽及格魯塔瑪之RPMI中。將細胞在室溫下培育1 h且接著在潮濕氛圍中在37℃及5% CO2
下之培育箱中培育隔夜。接著使用Labcyte Echo 550裝置添加60 nL化合物溶液(10 mM DMSO儲備溶液)。在前述培育箱中培育1 h之後,添加3 µL表皮生長因子(EGF,最終濃度50 ng/mL)。10分鐘後,移除培養基,且藉由添加20 µL來自添加有蛋白酶抑制劑、100 nM曲美替尼+ 100 nM星形孢菌素之AlphaLISA SureFire Ultra pERK1/2 (Thr202/Tyr204)分析套組的1.6倍裂解緩衝液來裂解細胞。在室溫下振盪培育20分鐘之後,將6 µL之各裂解物樣品轉移至384孔Proxiplate中且用AlphaLISA SureFire Ultra pERK1/2 (Thr202/Tyr204)分析套組分析pERK (Thr202/Tyr204)。在柔和光線下添加3 µL受體混合物及3 µL供體混合物且在暗處在室溫下培育2 h,隨後在Perkin Elmer Envision盤讀取器上使用Proxiplate之384 AlphaScreen設置量測信號。資料藉由用可變希爾斜率之迭代計算來擬合。使用預設擬合曲線擬合S形曲線斜率以確定IC50
值。
表25展示用所揭示分析獲得的根據本發明之一系列化合物(I)
的資料。表 25 :
# | pERK [nM] |
I-21 | 113 |
I-23 | 111 |
I-37 | 61 |
I-38 | 33 |
I-39 | 62 |
I-45 | 47 |
I-49 | 81 |
I-52 | 96 |
I-53 | 74 |
I-57 | 63 |
I-58 | 89 |
I-59 | 113 |
I-61 | 95 |
I-73 | 88 |
I-87 | 100 |
I-97 | 81 |
I-101 | 79 |
I-102 | 67 |
I-103 | 70 |
I-104 | 87 |
I-106 | 113 |
I-108 | 77 |
I-119 | 70 |
I-121 | 93 |
I-123 | 118 |
I-124 | 85 |
I-126 | 51 |
I-130 | 38 |
I-156 | 57 |
I-157 | 104 |
I-171 | 93 |
I-176 | 120 |
I-177 | 91 |
代謝 ( 微粒體 ) 穩定性分析:
在37℃下用收集之肝臟微粒體(小鼠(MLM)、大鼠(RLM)或人類(HLM))來分析測試化合物之代謝降解性。每時間點74 µL之最終培育體積含有TRIS緩衝液(pH 7.5;0.1 M)、氯化鎂(6.5 mM)、微粒體蛋白質(對於小鼠/大鼠為0.5 mg/mL,對於人類檢體為1 mg/mL)及最終濃度為1 µM之測試化合物。在37℃下短暫預培育一定時間段之後,藉由添加8 µL還原形式之β-菸醯胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADPH,10 mM)來引發反應,且藉由在不同時間點之後將等分試樣轉移至溶劑中來終止反應。另外,在不含NADPH之培育物中監測不依賴NADPH之降解性,在最後時間點藉由添加乙腈來終止。藉由離心(1811 g,5 min)來集結經淬滅之培育物。藉由LC-MS/MS分析上清液之等分試樣中的母體化合物量。
活體外固有清除率(CLint,in vitro
)係根據測試藥物在微粒體培育期間消失之時程來計算。各曲線圖擬合至一級消除速率常數,如C
(t
) =C 0
*exp(−ke
*t
),其中C
(t
)及C 0
為在培育時間t
及在預培育時之未改變之測試藥物的濃度,且ke
為未改變之藥物的消失速率常數。隨後,將CLint,in vitro
(μL min−1
·蛋白質量)值轉換成全身之CLint,in vitro
(mL min−1
·kg−1
)。使用生理參數將CLint,in vitro
數據按比例擴大。為了更佳的跨物種比較,以個別物種中之肝臟血流量百分比[%QH]代表所預測之清除率。一般而言,化合物需要在跨物種之間具有高穩定性(對應於低%QH)。
表26展示所選定之根據本發明化合物(I)
採用所揭示分析法得到之代謝穩定性數據。表 26 :
# | MLM [%QH] | RLM [%QH] | HLM [%QH] |
I-3 | 51 | <23 | <24 |
I-4 | 46 | <23 | <24 |
I-10 | 41 | 40 | <24 |
I-13 | <24 | 52 | <24 |
I-14 | 26 | 56 | 27 |
I-25 | <24 | <23 | <24 |
I-27 | 88 | <23 | <24 |
I-47 | <24 | 29 | 24 |
I-50 | <24 | <23 | <24 |
I-51 | <24 | 49 | <24 |
I-54 | 55 | <23 | <24 |
I-69 | <24 | 40 | <24 |
I-71 | <24 | <23 | <24 |
I-78 | <24 | <23 | <24 |
I-80 | 50 | <23 | <24 |
I-81 | 64 | <23 | <24 |
I-83 | <24 | 42 | <24 |
I-84 | <24 | 29 | <24 |
I-85 | 55 | <23 | 24 |
I-86 | 33 | <23 | <24 |
I-88 | <24 | <23 | 24 |
I-90 | <24 | <23 | <24 |
I-96 | 30 | <23 | <24 |
I-97 | <24 | <23 | <24 |
I-98 | <24 | <23 | <24 |
I-101 | 59 | <23 | 36 |
I-128 | <24 | <23 | 29 |
I-161 | 44 | <23 | 31 |
I-165 | 54 | <23 | <24 |
I-166 | 48 | 38 | 24 |
I-169 | 64 | 44 | <24 |
I-170 | 51 | 37 | <24 |
I-172 | 53 | <23 | <24 |
CYP3A4 分析 (TDI 3A4) 之時間依賴性抑制 :
在咪達唑侖(midazolam) (15 µM)作為受質之情況下,在人類肝臟微粒體(0.02 mg/mL)中分析針對CYP3A4之時間依賴性抑制。將測試化合物在NADPH存在下與濃度為25 µM之人類肝臟微粒體(0.2 mg/mL)預培育0 min及30 min。在預培育之後,將培育物1:10稀釋且添加受質咪達唑侖進行主培育(15 min)。用乙腈淬滅主培育且經由LC/MS-MS對羥基-咪達唑侖之形成進行定量。30 min預培育形成之羥基-咪達唑侖相對於0 min預培育形成之羥基-咪達唑侖用作讀數。小於100%之值意謂與0 min預培育相比,30 min預培育時受質咪達唑侖之代謝程度較低。一般而言,30 min預培育時之低效果為所需的(對應於接近100%之值)。
表27展示用所揭示分析獲得的根據本發明之一系列化合物(I)之資料。表 27 :
# | TDI 3A4 [%] |
I-20 | 93 |
I-22 | 87 |
I-25 | 90 |
I-49 | 92 |
I-50 | 82 |
I-53 | 84 |
I-54 | 84 |
I-57 | 87 |
I-75 | 86 |
I-80 | 86 |
I-81 | 85 |
I-87 | 81 |
I-89 | 83 |
I-98 | 85 |
I-123 | 87 |
I-125 | 93 |
I-126 | 88 |
I-127 | 97 |
I-128 | 98 |
I-163 | 82 |
I-166 | 87 |
I-169 | 84 |
I-170 | 82 |
I-173 | 84 |
脫靶傾向之判定
存在某些認為與活體內不良藥物反應密切相關的目標(44),如出版物Reducing safety-related drug attrition: the use of in vitro pharmacological profiling
, Nature Review Drug Discovery 11, 909-922 (2012年12月)中所提及。此論文係若干大型製藥公司安全藥理學小組之間的合作成果,其目的在於建立活體外藥理學分析之核心小組。Eurofins Cerep (France)商業地提供關於其SafetyScreen44TM
小組對初步安全評定中之理論第一步的量測(包含此等脫靶)。可根據此小組對根據本發明之化合物(I)
進行分析以研究脫靶傾向。
Claims (17)
- 如請求項1之用途,其中該藥劑係與該MEK抑制劑同時、並行、依序、連續、交替或分開投與。
- 如請求項1及2中任一項之用途,其中該待治療及/或預防之致癌或過度增生性疾病係選自: 選自由以下組成之群的癌症:胰臟癌、肺癌、結腸直腸癌、膽管癌、多發性骨髓瘤、黑素瘤、子宮癌、子宮內膜癌、甲狀腺癌、急性骨髓白血病、膀胱癌、尿道上皮癌、胃癌、子宮頸癌、頭頸部鱗狀細胞癌、瀰漫性大B細胞淋巴瘤、食道癌、慢性淋巴球性白血病、肝細胞癌、乳癌、卵巢癌、前列腺癌、神經膠母細胞瘤、腎癌及肉瘤;及 較佳選自由以下組成之群的RAS蛋白家族病變(RASopathy):1型神經纖維瘤(NF1)、努南症候群(Noonan Syndrome;NS)、努南症候群伴多發性雀斑(NSML) (亦稱為LEOPARD症候群)、毛細血管畸形-動靜脈畸形症候群(CM-AVM)、科斯特洛症候群(Costello Syndrome;CS)、心臟-面部-皮膚症候群(CFC)、利吉斯症候群(Legius Syndrome) (亦稱為NF1樣症候群)及遺傳性牙齦纖維瘤。
- 如請求項1至2中任一項之用途,其中該待治療及/或預防之致癌或過度增生性疾病係選自肺癌,較佳係非小細胞肺癌(NSCLC),特定言之NSCLC腺癌、結腸直腸癌、胰臟癌及膽管癌。
- 如請求項1至2中任一項之用途,其中該待治療及/或預防之癌症攜帶有KRAS突變。
- 一種醫藥組合物,其包含: 如請求項1中所定義之SOS1抑制劑或其醫藥學上可接受之鹽, 如請求項1中所定義之MEK抑制劑或其醫藥學上可接受之鹽, 及視情況一或多種醫藥學上可接受之載劑、賦形劑及/或媒劑。
- 如請求項6之醫藥組合物,其用於治療及/或預防致癌或過度增生性疾病,特定言之癌症。
- 如請求項7之醫藥組合物,其中該待治療及/或預防之致癌或過度增生性疾病係選自: 選自由以下組成之群的癌症:胰臟癌、肺癌、結腸直腸癌、膽管癌、多發性骨髓瘤、黑素瘤、子宮癌、子宮內膜癌、甲狀腺癌、急性骨髓白血病、膀胱癌、尿道上皮癌、胃癌、子宮頸癌、頭頸部鱗狀細胞癌、瀰漫性大B細胞淋巴瘤、食道癌、慢性淋巴球性白血病、肝細胞癌、乳癌、卵巢癌、前列腺癌、神經膠母細胞瘤、腎癌及肉瘤;及 較佳選自由以下組成之群的RAS蛋白家族病變:1型神經纖維瘤(NF1)、努南症候群(NS)、努南症候群伴多發性雀斑(NSML) (亦稱為LEOPARD症候群)、毛細血管畸形-動靜脈畸形症候群(CM-AVM)、科斯特洛症候群(CS)、心臟-面部-皮膚症候群(CFC)、利吉斯症候群(亦稱為NF1樣症候群)及遺傳性牙齦纖維瘤。
- 如請求項7及8中任一項之醫藥組合物,其中該待治療及/或預防之致癌或過度增生性疾病係選自肺癌,較佳係非小細胞肺癌(NSCLC),特定言之NSCLC腺癌、結腸直腸癌、胰臟癌及膽管癌。
- 如請求項7及8中任一項使用之醫藥組合物,其中該待治療及/或預防之癌症攜帶有KRAS突變。
- 一種套組,其包含: 第一醫藥組合物或劑型,其包含如請求項1中所定義之SOS1抑制劑及視情況一或多種醫藥學上可接受之載劑、賦形劑及/或媒劑, 第二醫藥組合物或劑型,其包含如請求項1中所定義之MEK抑制劑及視情況一或多種醫藥學上可接受之載劑、賦形劑及/或媒劑。
- 如請求項11之套組,其用於治療及/或預防致癌或過度增生性疾病,特定言之癌症。
- 如請求項12使用之套組,其中該第一醫藥組合物或劑型係與該第二醫藥組合物或劑型同時、並行、依序、連續、交替或分開投與。
- 如請求項8之套組,其進一步包括 包含印刷說明書之包裝插頁,其指示同時、並行、依序、連續、交替或分開用於治療及/或預防有需要之患者之致癌或過度增生性疾病,特定言之癌症。
- 如請求項12及13中任一項之套組,其中該待治療及/或預防之致癌或過度增生性疾病係選自: 選自由以下組成之群的癌症:胰臟癌、肺癌、結腸直腸癌、膽管癌、多發性骨髓瘤、黑素瘤、子宮癌、子宮內膜癌、甲狀腺癌、急性骨髓白血病、膀胱癌、尿道上皮癌、胃癌、子宮頸癌、頭頸部鱗狀細胞癌、瀰漫性大B細胞淋巴瘤、食道癌、慢性淋巴球性白血病、肝細胞癌、乳癌、卵巢癌、前列腺癌、神經膠母細胞瘤、腎癌及肉瘤;及 較佳選自由以下組成之群的RAS蛋白家族病變:1型神經纖維瘤(NF1)、努南症候群(NS)、努南症候群伴多發性雀斑(NSML) (亦稱為LEOPARD症候群)、毛細血管畸形-動靜脈畸形症候群(CM-AVM)、科斯特洛症候群(CS)、心臟-面部-皮膚症候群(CFC)、利吉斯症候群(亦稱為NF1樣症候群)及遺傳性牙齦纖維瘤。
- 如請求項12及13中任一項之套組,其中該待治療及/或預防之致癌或過度增生性疾病係選自肺癌,較佳係非小細胞肺癌(NSCLC),特定言之NSCLC腺癌、結腸直腸癌、胰臟癌及膽管癌。
- 如請求項12及13中任一項之套組,其中該待治療及/或預防之癌症攜帶有KRAS突變。
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