TW202102222A - 白斑病之生物標記物 - Google Patents

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貝絲 羅恩貝格
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Abstract

提供與個體對JAK抑制劑之反應性有關或預測個體對JAK抑制劑之反應性的生物標記物。本文所述之生物標記物、組合物及方法可用於為患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之個體選擇適當治療模式。

Description

白斑病之生物標記物
本發明一般關於生物標記物及白斑病。
當產生黑色素之細胞死亡或功能停止,引起皮膚色素呈斑片狀脫失時,發生白斑病。非節段型白斑病涉及全身皮膚呈斑片狀脫色。脫色通常出現在面部、頸部及頭皮以及體孔周圍。亦常在往往經歷摩擦、撞擊或其他外傷之區域,諸如手及手臂中見到色素脫失。節段型白斑病引起較小斑片狀脫色皮膚,出現在身體一側中,面積有限。
已研發出Janus激酶(JAK)抑制劑作為治療白斑病之藥劑。然而,就任何治療劑而論,JAK抑制劑在患有白斑病之所有個體中可能並非同等有效的。需要鑑定可自用JAK抑制劑治療獲得最大益處之患有白斑病之彼等個體以及鑑定對用JAK抑制劑治療展現治療反應之彼等個體的方式。
本申請案至少部分地係基於對可鑑定已經歷對JAK抑制劑之治療反應之個體的生物標記物及預測白斑病個體對JAK抑制劑之反應性之生物標記物的鑑定。在治療過程中某些蛋白質之水準之變化確定為對JAK抑制劑之反應性之有用標誌。此外,在治療之前某些蛋白質之基線水準及某些基因之基線表現水準確定為對JAK抑制劑之反應性之有用預測因子。因此,本文所述之生物標記物及組合物可用於例如鑑定患有、疑似患有或處於顯現白斑病之風險下的可得益於或已得益於用JAK抑制劑治療之患者或患者子集、對其進行分層及/或選擇。此外,本文所述之方法可用於例如為罹患、疑似患有或處於顯現白斑病之風險下之個體選擇適當治療模式(例如JAK抑制劑)。
本發明之特徵在於一種治療患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體的方法,該方法藉由:量測在投與JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之第一生物樣品中之CXCL9及/或CXCL10的濃度;向該人類個體投與該JAK抑制劑;及量測在投與該JAK抑制劑之後自該人類個體獲得之第二生物樣品中之CXCL9及/或CXCL10的與該第一生物樣品相比降低的濃度。在一些實施例中,JAK抑制劑之投與繼續進行。
在一些實施例中,該方法需要:量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之該第一生物樣品中之CXCL9的濃度;向該人類個體投與該JAK抑制劑;及量測在投與該JAK抑制劑之後自該人類個體獲得之該第二生物樣品中之CXCL9的與該第一生物樣品相比降低的濃度。在一些實施例中,JAK抑制劑之投與繼續進行。
在一些實施例中,與第一生物樣品相比,第二生物樣品中之CXCL9之濃度降低至少5%。
在一些實施例中,與第一生物樣品相比,第二生物樣品中之CXCL9之濃度降低至少10%。
在一些實施例中,與第一生物樣品相比,第二生物樣品中之CXCL9之濃度降低至少15%。
在一些實施例中,該方法需要:量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之該第一生物樣品中之CXCL10的濃度;向該人類個體投與該JAK抑制劑;及量測在投與該JAK抑制劑之後自該人類個體獲得之該第二生物樣品中之CXCL10的與該第一生物樣品相比降低的濃度。在一些實施例中,JAK抑制劑之投與繼續進行。
在一些實施例中,與第一生物樣品相比,第二生物樣品中之CXCL10之濃度降低至少5%。
在一些實施例中,與第一生物樣品相比,第二生物樣品中之CXCL10之濃度降低至少10%。
在一些實施例中,與第一生物樣品相比,第二生物樣品中之CXCL10之濃度降低至少15%。
在一些實施例中,該方法需要:量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之該第一生物樣品中之CXCL9及CXCL10的濃度;向該人類個體投與該JAK抑制劑;及量測在投與該JAK抑制劑之後自該人類個體獲得之該第二生物樣品中之CXCL9及CXCL10的與該第一生物樣品相比降低的濃度。在一些實施例中,JAK抑制劑之投與繼續進行。
在一些實施例中,與第一生物樣品相比,第二生物樣品中之CXCL9及CXCL10之濃度各降低至少5%。
在一些實施例中,與第一生物樣品相比,第二生物樣品中之CXCL9及CXCL10之濃度各降低至少10%。
在一些實施例中,與第一生物樣品相比,第二生物樣品中之CXCL9及CXCL10之濃度各降低至少15%。
在一些實施例中,向人類個體投與JAK抑制劑,一週至少一次,歷經例如至少12週之時段(例如至少3個月、至少4個月、至少5個月、至少6個月、至少7個月、至少8個月、至少9個月、至少10個月、至少11個月或至少12個月)。
在一些實施例中,向人類個體投與JAK抑制劑,一天至少一次,歷經例如至少12週之時段(例如至少3個月、至少4個月、至少5個月、至少6個月、至少7個月、至少8個月、至少9個月、至少10個月、至少11個月或至少12個月)。
在一些實施例中,向人類個體投與JAK抑制劑,每天至少兩次,歷經例如至少12週之時段(例如至少3個月、至少4個月、至少5個月、至少6個月、至少7個月、至少8個月、至少9個月、至少10個月、至少11個月或至少12個月)。
在一些實施例中,其中JAK抑制劑係局部投與人類個體。
在一些實施例中,在第一次投與JAK抑制劑之後至少12週自人類個體獲得第二生物樣品。
在一些實施例中,在第一次投與JAK抑制劑之後至少24週自人類個體獲得第二生物樣品。
在一些實施例中,第二治療劑係與JAK抑制劑組合投與人類個體。
在另一態樣中,本發明之特徵在於一種鑑定患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體對JAK抑制劑之治療反應(例如在明顯皮膚改善前)的方法,該方法藉由:量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之第一生物樣品中之CXCL9及/或CXCL10的濃度;及量測在投與該JAK抑制劑之後自該個體獲得之第二生物樣品中之CXCL9及/或CXCL10的濃度,其中第二生物樣品中之CXCL9及/或CXCL10之濃度與第一生物樣品相比降低指示該人類個體已經歷對JAK抑制劑之治療反應(例如在明顯皮膚改善之前)。
在一些實施例中,與第一生物樣品相比,第二生物樣品中之CXCL9之濃度降低至少5%。在一些實施例中,與第一生物樣品相比,第二生物樣品中之CXCL10之濃度降低至少5%。在一些實施例中,與第一生物樣品相比,第二生物樣品中之CXCL9及CXCL10之濃度各降低至少5%。
在一些實施例中,與第一生物樣品相比,第二生物樣品中之CXCL9之濃度降低至少10%。在一些實施例中,與第一生物樣品相比,第二生物樣品中之CXCL10之濃度降低至少10%。在一些實施例中,與第一生物樣品相比,第二生物樣品中之CXCL9及CXCL10之濃度各降低至少10%。
在一些實施例中,與第一生物樣品相比,第二生物樣品中之CXCL9之濃度降低至少15%。在一些實施例中,與第一生物樣品相比,第二生物樣品中之CXCL10之濃度降低至少15%。在一些實施例中,與第一生物樣品相比,第二生物樣品中之CXCL9及CXCL10之濃度各降低至少15%。
在另一態樣中,本發明之特徵在於一種治療患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體的方法,該方法藉由:量測在投與JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之第一生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種蛋白質)的濃度:FAP、RET、CNTN5、FUCA1、ITGAV、ITGB5、THBS4、CD207、GDF-8、CDH6、MRC2、ICOSLG、TNXB、EDIL3、OSMR、GPC1、MIC-A/B、TGFR-2、LRRN1、TLR3、KIM1、ROBO2、CD70、CLMP、N-CDase、FCRL5、CTSV、SCARF2、PLXDC1、PRTG、ERBB4、MAGED1、CEACAM1、TSHB、PTK7、TGFR-2、ADAM 22、CTSC、DLK-1、USP8、SCARF2、TNFRSF13B、MB、TMPRSS5、NUDT5、MMP-3、MAEA、NEMO、IFN-γ、IL18、AKT1S1、CASP-8、PPP1R2、ST2、VSIG4、SCGB3A2、HDGF、ICA1、IL13、PEBP1、PARK7、MAP4K5、FLI1、MMP-10、CCL24、TIMP4、MBL2、REG4及CPA2;向該人類個體投與該JAK抑制劑;及量測在投與該JAK抑制劑之後自該人類個體獲得之第二生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種蛋白質)的與該第一生物樣品相比降低的濃度:FAP、RET、CNTN5、FUCA1、ITGAV、ITGB5、THBS4、CD207、GDF-8、CDH6、MRC2、ICOSLG、TNXB、EDIL3、OSMR、GPC1、MIC-A/B、TGFR-2、LRRN1、TLR3、KIM1、ROBO2、CD70、CLMP、N-CDase、FCRL5、CTSV、SCARF2、PLXDC1、PRTG、ERBB4、MAGED1、CEACAM1、TSHB、PTK7、TGFR-2、ADAM 22、CTSC、DLK-1、USP8、SCARF2、TNFRSF13B、MB及TMPRSS5,及/或至少一種選自由以下組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種蛋白質)的與該第一生物樣品相比增加的濃度:NUDT5、MMP-3、MAEA、NEMO、IFN-γ、IL18、AKT1S1、CASP-8、PPP1R2、ST2、VSIG4、SCGB3A2、HDGF、ICA1、IL13、PEBP1、PARK7、MAP4K5、FLI1、MMP-10、CCL24、TIMP4、MBL2、REG4及CPA2。在一些實施例中,JAK抑制劑之投與繼續進行。
在一些實施例中,該方法需要量測在投與JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之第一生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種或6種蛋白質)的濃度:FAP、RET、CNTN5、NUDT5、MMP-3及MAEA;向該人類個體投與該JAK抑制劑;及量測在投與該JAK抑制劑之後自該人類個體獲得之第二生物樣品中的至少一種選自由FAP、RET及CNTN5組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種或3種蛋白質)的與該第一生物樣品相比降低的濃度,及/或至少一種選自由NUDT5、MMP-3及MAEA組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種或3種蛋白質)的與該第一生物樣品相比增加的濃度。在一些實施例中,JAK抑制劑之投與繼續進行。
在一些實施例中,該方法需要量測在投與JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之第一生物樣品中的至少一種選自由FAP、RET、NUDT5及MMP-3組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種或4種蛋白質)的濃度;向該人類個體投與該JAK抑制劑;及量測在投與該JAK抑制劑之後自該人類個體獲得之第二生物樣品中的至少一種選自由FAP及RET組成之群之蛋白質(例如至少1種或2種蛋白質)的與該第一生物樣品相比降低的濃度,及/或至少一種選自由NUDT5及MMP-3組成之群之蛋白質(例如至少1種或2種蛋白質)的與該第一生物樣品相比增加的濃度。在一些實施例中,JAK抑制劑之投與繼續進行。
在另一態樣中,本發明之特徵在於一種鑑定患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體對JAK抑制劑之治療反應(例如在明顯皮膚改善前)的方法,該方法藉由:量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之第一生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種蛋白質)的濃度:FAP、RET、CNTN5、FUCA1、ITGAV、ITGB5、THBS4、CD207、GDF-8、CDH6、MRC2、ICOSLG、TNXB、EDIL3、OSMR、GPC1、MIC-A/B、TGFR-2、LRRN1、TLR3、KIM1、ROBO2、CD70、CLMP、N-CDase、FCRL5、CTSV、SCARF2、PLXDC1、PRTG、ERBB4、MAGED1、CEACAM1、TSHB、PTK7、TGFR-2、ADAM 22、CTSC、DLK-1、USP8、SCARF2、TNFRSF13B、MB、TMPRSS5、NUDT5、MMP-3、MAEA、NEMO、IFN-γ、IL18、AKT1S1、CASP-8、PPP1R2、ST2、VSIG4、SCGB3A2、HDGF、ICA1、IL13、PEBP1、PARK7、MAP4K5、FLI1、MMP-10、CCL24、TIMP4、MBL2、REG4及CPA2;及量測在投與該JAK抑制劑之後自該個體獲得之第二生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種蛋白質)的濃度:FAP、RET、CNTN5、FUCA1、ITGAV、ITGB5、THBS4、CD207、GDF-8、CDH6、MRC2、ICOSLG、TNXB、EDIL3、OSMR、GPC1、MIC-A/B、TGFR-2、LRRN1、TLR3、KIM1、ROBO2、CD70、CLMP、N-CDase、FCRL5、CTSV、SCARF2、PLXDC1、PRTG、ERBB4、MAGED1、CEACAM1、TSHB、PTK7、TGFR-2、ADAM 22、CTSC、DLK-1、USP8、SCARF2、TNFRSF13B、MB、TMPRSS5、NUDT5、MMP-3、MAEA、NEMO、IFN-γ、IL18、AKT1S1、CASP-8、PPP1R2、ST2、VSIG4、SCGB3A2、HDGF、ICA1、IL13、PEBP1、PARK7、MAP4K5、FLI1、MMP-10、CCL24、TIMP4、MBL2、REG4及CPA2,其中第二生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種蛋白質)的濃度與第一生物樣品相比降低:FAP、RET、CNTN5、FUCA1、ITGAV、ITGB5、THBS4、CD207、GDF-8、CDH6、MRC2、ICOSLG、TNXB、EDIL3、OSMR、GPC1、MIC-A/B、TGFR-2、LRRN1、TLR3、KIM1、ROBO2、CD70、CLMP、N-CDase、FCRL5、CTSV、SCARF2、PLXDC1、PRTG、ERBB4、MAGED1、CEACAM1、TSHB、PTK7、TGFR-2、ADAM 22、CTSC、DLK-1、USP8、SCARF2、TNFRSF13B、MB及TMPRSS5,及/或該第二生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種蛋白質)的濃度與該第一生物樣品相比增加:NUDT5、MMP-3、MAEA、NEMO、IFN-γ、IL18、AKT1S1、CASP-8、PPP1R2、ST2、VSIG4、SCGB3A2、HDGF、ICA1、IL13、PEBP1、PARK7、MAP4K5、FLI1、MMP-10、CCL24、TIMP4、MBL2、REG4及CPA2,指示該人類個體已經歷對JAK抑制劑之治療反應(例如在明顯皮膚改善之前)。
在一些實施例中,該方法需要量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之第一生物樣品中的至少一種選自由FAP、RET、CNTN5、NUDT5、MMP-3及MAEA組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種或6種蛋白質)的濃度;及量測在投與該JAK抑制劑之後自該個體獲得之第二生物樣品中的至少一種選自由FAP、RET、CNTN5、NUDT5、MMP-3及MAEA組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種或6種蛋白質)的濃度,其中第二生物樣品中的至少一種選自由FAP、RET及CNTN5組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種或3種蛋白質)的濃度與第一生物樣品相比降低,及/或該第二生物樣品中的至少一種選自由NUDT5、MMP-3及MAEA組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種或3種蛋白質)的濃度與該第一生物樣品相比增加,指示該人類個體已經歷對JAK抑制劑之治療反應(例如在明顯皮膚改善之前)。
在一些實施例中,該方法需要量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之第一生物樣品中的至少一種選自由FAP、RET、NUDT5及MMP-3組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種或4種蛋白質)的濃度;及量測在投與該JAK抑制劑之後自該個體獲得之第二生物樣品中的至少一種選自由FAP、RET、NUDT5及MMP-3組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種或4種蛋白質)的濃度,其中第二生物樣品中的至少一種選自由FAP及RET組成之群之蛋白質(例如至少1種或2種蛋白質)的濃度與第一生物樣品相比降低,及/或該第二生物樣品中的至少一種選自由NUDT5及MMP-3組成之群之蛋白質(例如至少1種或2種蛋白質)的濃度與該第一生物樣品相比增加,指示該人類個體已經歷對JAK抑制劑之治療反應(例如在明顯皮膚改善之前)。
在另一態樣中,本發明之特徵在於一種治療患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體的方法,該方法藉由:量測在投與JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之第一生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種蛋白質)的濃度:DDR1、NTRK2、CES2、SCARA5、GDF-8、BOC、PAEP、ARTN、CDNF、TMPRSS5、FLRT2、ROBO2、SIGLEC10、PRTG、SCARF2、CDH3、GFR-α-1、TSHB、CD200R1、RGMB、KYNU、HS3ST3B1、CHRDL2、CNTN1、VSIG4、ARHGAP1、B4GAT1、STX8、CRELD2、ARSA、BCAM、SCARF1、CA13、DAG1、LAIR1、GUSB、PMVK、PEAR1、GP1BA、TACC3、PARK7、ARHGEF12、SEMA7A、ESAM、FKBP5、ARHGAP1、SCAMP3、ABL1、EGF、TACC3、FKBP5、BID、PRDX5、STX8、CD63、SCARF1、PTPN1、CLEC1B、ARSB、FKBP1B、YES1、SRC、TNFSF14、PLXNB3、LRMP、CD164、DAG1、PVALB、NAA10、TRIM5、ARHGEF12、HGF、CA13、SNAP23、SORT1、GP6、CTSS、PPIB、CRKL、MAP2K6、MANF、PMVK、ABHD14B、GUSB、FATC1、MAD1L1、EDAR、CEACAM8、GLB1、ST3GAL1、ARSA、ADAM 8、CD40、IFI30、ECE1、AXIN1、WFDC2、TBCB、CXCL13、ST1A1、KIF1BP、DPP7、VEGFA、CETN2、TGF-α、CD84、SNAP29、CASP-8、S100A11、GSTP1、CRADD、PRKAB1、HGF、STK4、RNASE3、SERPINB6、OSM、MK、FADD、CLEC11A、CD69、LOX-1、ITGA6、CLEC5A、BCAM、FES、TXNDC5、LAT2、CXCL11、PARP-1、APBB1IP、GZMB及CRNN;向該人類個體投與該JAK抑制劑;及量測在投與該JAK抑制劑之後自該人類個體獲得之第二生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種蛋白質)的與該第一生物樣品相比降低的濃度:DDR1、NTRK2、CES2、SCARA5、GDF-8、BOC、PAEP、ARTN、CDNF、TMPRSS5、FLRT2、ROBO2、SIGLEC10、PRTG、SCARF2、CDH3、GFR-α-1、TSHB、CD200R1、RGMB、KYNU、HS3ST3B1、CHRDL2及CNTN1,及/或至少一種選自由以下組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種蛋白質)的與該第一生物樣品相比增加的濃度:VSIG4、ARHGAP1、B4GAT1、STX8、CRELD2、ARSA、BCAM、SCARF1、CA13、DAG1、LAIR1、GUSB、PMVK、PEAR1、GP1BA、TACC3、PARK7、ARHGEF12、SEMA7A、ESAM、FKBP5、ARHGAP1、SCAMP3、ABL1、EGF、TACC3、FKBP5、BID、PRDX5、STX8、CD63、SCARF1、PTPN1、CLEC1B、ARSB、FKBP1B、YES1、SRC、TNFSF14、PLXNB3、LRMP、CD164、DAG1、PVALB、NAA10、TRIM5、ARHGEF12、HGF、CA13、SNAP23、SORT1、GP6、CTSS、PPIB、CRKL、MAP2K6、MANF、PMVK、ABHD14B、GUSB、FATC1、MAD1L1、EDAR、CEACAM8、GLB1、ST3GAL1、ARSA、ADAM 8、CD40、IFI30、ECE1、AXIN1、WFDC2、TBCB、CXCL13、ST1A1、KIF1BP、DPP7、VEGFA、CETN2、TGF-α、CD84、SNAP29、CASP-8、S100A11、GSTP1、CRADD、PRKAB1、HGF、STK4、RNASE3、SERPINB6、OSM、MK、FADD、CLEC11A、CD69、LOX-1、ITGA6、CLEC5A、BCAM、FES、TXNDC5、LAT2、CXCL11、PARP-1、APBB1IP、GZMB及CRNN。
在一些實施例中,該方法需要量測在投與JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之第一生物樣品中的至少一種選自由DDR1、NTRK2、CES2、VSIG4、ARHGAP1及B4GAT1組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種或6種蛋白質)的濃度;向該人類個體投與該JAK抑制劑;及量測在投與該JAK抑制劑之後自該人類個體獲得之第二生物樣品中的至少一種選自由DDR1、NTRK2及CES2組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種或3種蛋白質)的與該第一生物樣品相比降低的濃度,及/或至少一種選自由VSIG4、ARHGAP1及B4GAT1組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種或3種蛋白質)的與該第一生物樣品相比增加的濃度。
在一些實施例中,該方法需要量測在投與JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之第一生物樣品中的至少一種選自由DDR1、NTRK2、VSIG4及ARHGAP1組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種或4種蛋白質)的濃度;向該人類個體投與該JAK抑制劑;及量測在投與該JAK抑制劑之後自該人類個體獲得之第二生物樣品中的至少一種選自由DDR1及NTRK2組成之群之蛋白質(例如至少1種或2種蛋白質)的與該第一生物樣品相比降低的濃度,及/或至少一種選自由VSIG4及ARHGAP1組成之群之蛋白質(例如至少1種或2種蛋白質)的與該第一生物樣品相比增加的濃度。
在另一態樣中,本發明之特徵在於一種鑑定患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體對JAK抑制劑之治療反應的方法,該方法藉由:量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之第一生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種蛋白質)的濃度:DDR1、NTRK2、CES2、SCARA5、GDF-8、BOC、PAEP、ARTN、CDNF、TMPRSS5、FLRT2、ROBO2、SIGLEC10、PRTG、SCARF2、CDH3、GFR-α-1、TSHB、CD200R1、RGMB、KYNU、HS3ST3B1、CHRDL2、CNTN1、VSIG4、ARHGAP1、B4GAT1、STX8、CRELD2、ARSA、BCAM、SCARF1、CA13、DAG1、LAIR1、GUSB、PMVK、PEAR1、GP1BA、TACC3、PARK7、ARHGEF12、SEMA7A、ESAM、FKBP5、ARHGAP1、SCAMP3、ABL1、EGF、TACC3、FKBP5、BID、PRDX5、STX8、CD63、SCARF1、PTPN1、CLEC1B、ARSB、FKBP1B、YES1、SRC、TNFSF14、PLXNB3、LRMP、CD164、DAG1、PVALB、NAA10、TRIM5、ARHGEF12、HGF、CA13、SNAP23、SORT1、GP6、CTSS、PPIB、CRKL、MAP2K6、MANF、PMVK、ABHD14B、GUSB、FATC1、MAD1L1、EDAR、CEACAM8、GLB1、ST3GAL1、ARSA、ADAM 8、CD40、IFI30、ECE1、AXIN1、WFDC2、TBCB、CXCL13、ST1A1、KIF1BP、DPP7、VEGFA、CETN2、TGF-α、CD84、SNAP29、CASP-8、S100A11、GSTP1、CRADD、PRKAB1、HGF、STK4、RNASE3、SERPINB6、OSM、MK、FADD、CLEC11A、CD69、LOX-1、ITGA6、CLEC5A、BCAM、FES、TXNDC5、LAT2、CXCL11、PARP-1、APBB1IP、GZMB及CRNN;及量測在投與該JAK抑制劑之後自該個體獲得之第二生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種蛋白質)的濃度:DDR1、NTRK2、CES2、SCARA5、GDF-8、BOC、PAEP、ARTN、CDNF、TMPRSS5、FLRT2、ROBO2、SIGLEC10、PRTG、SCARF2、CDH3、GFR-α-1、TSHB、CD200R1、RGMB、KYNU、HS3ST3B1、CHRDL2、CNTN1、VSIG4、ARHGAP1、B4GAT1、STX8、CRELD2、ARSA、BCAM、SCARF1、CA13、DAG1、LAIR1、GUSB、PMVK、PEAR1、GP1BA、TACC3、PARK7、ARHGEF12、SEMA7A、ESAM、FKBP5、ARHGAP1、SCAMP3、ABL1、EGF、TACC3、FKBP5、BID、PRDX5、STX8、CD63、SCARF1、PTPN1、CLEC1B、ARSB、FKBP1B、YES1、SRC、TNFSF14、PLXNB3、LRMP、CD164、DAG1、PVALB、NAA10、TRIM5、ARHGEF12、HGF、CA13、SNAP23、SORT1、GP6、CTSS、PPIB、CRKL、MAP2K6、MANF、PMVK、ABHD14B、GUSB、FATC1、MAD1L1、EDAR、CEACAM8、GLB1、ST3GAL1、ARSA、ADAM 8、CD40、IFI30、ECE1、AXIN1、WFDC2、TBCB、CXCL13、ST1A1、KIF1BP、DPP7、VEGFA、CETN2、TGF-α、CD84、SNAP29、CASP-8、S100A11、GSTP1、CRADD、PRKAB1、HGF、STK4、RNASE3、SERPINB6、OSM、MK、FADD、CLEC11A、CD69、LOX-1、ITGA6、CLEC5A、BCAM、FES、TXNDC5、LAT2、CXCL11、PARP-1、APBB1IP、GZMB及CRNN,其中第二生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種蛋白質)的濃度與第一生物樣品相比降低:DDR1、NTRK2、CES2、SCARA5、GDF-8、BOC、PAEP、ARTN、CDNF、TMPRSS5、FLRT2、ROBO2、SIGLEC10、PRTG、SCARF2、CDH3、GFR-α-1、TSHB、CD200R1、RGMB、KYNU、HS3ST3B1、CHRDL2及CNTN1,及/或該第二生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種蛋白質)的濃度與該第一生物樣品相比增加:VSIG4、ARHGAP1、B4GAT1、STX8、CRELD2、ARSA、BCAM、SCARF1、CA13、DAG1、LAIR1、GUSB、PMVK、PEAR1、GP1BA、TACC3、PARK7、ARHGEF12、SEMA7A、ESAM、FKBP5、ARHGAP1、SCAMP3、ABL1、EGF、TACC3、FKBP5、BID、PRDX5、STX8、CD63、SCARF1、PTPN1、CLEC1B、ARSB、FKBP1B、YES1、SRC、TNFSF14、PLXNB3、LRMP、CD164、DAG1、PVALB、NAA10、TRIM5、ARHGEF12、HGF、CA13、SNAP23、SORT1、GP6、CTSS、PPIB、CRKL、MAP2K6、MANF、PMVK、ABHD14B、GUSB、FATC1、MAD1L1、EDAR、CEACAM8、GLB1、ST3GAL1、ARSA、ADAM 8、CD40、IFI30、ECE1、AXIN1、WFDC2、TBCB、CXCL13、ST1A1、KIF1BP、DPP7、VEGFA、CETN2、TGF-α、CD84、SNAP29、CASP-8、S100A11、GSTP1、CRADD、PRKAB1、HGF、STK4、RNASE3、SERPINB6、OSM、MK、FADD、CLEC11A、CD69、LOX-1、ITGA6、CLEC5A、BCAM、FES、TXNDC5、LAT2、CXCL11、PARP-1、APBB1IP、GZMB及CRNN,指示該人類個體尚未經歷對該JAK抑制劑之治療反應。
在一些實施例中,該方法需要量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之第一生物樣品中的至少一種選自由DDR1、NTRK2、CES2、VSIG4、ARHGAP1及B4GAT1組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種或6種蛋白質)的濃度;及量測在投與該JAK抑制劑之後自該個體獲得之第二生物樣品中的至少一種選自由DDR1、NTRK2、CES2、VSIG4、ARHGAP1及B4GAT1組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種或6種蛋白質)的濃度,其中第二生物樣品中的至少一種選自由DDR1、NTRK2及CES2組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種或3種蛋白質)的濃度與第一生物樣品相比降低,及/或該第二生物樣品中的至少一種選自由VSIG4、ARHGAP1及B4GAT1組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種或3種蛋白質)的濃度與該第一生物樣品相比增加指示該人類個體尚未經歷對該JAK抑制劑之治療反應。
在一些實施例中,該方法需要量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之第一生物樣品中的至少一種選自由DDR1、NTRK2、VSIG4及ARHGAP1組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種或4種蛋白質)的濃度;及量測在投與該JAK抑制劑之後自該個體獲得之第二生物樣品中的至少一種選自由DDR1、NTRK2、VSIG4及ARHGAP1組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種或4種蛋白質)的濃度,其中第二生物樣品中的至少一種選自由DDR1及NTRK2組成之群之蛋白質(例如至少1種或2種蛋白質)的濃度與第一生物樣品相比降低,及/或該第二生物樣品中的至少一種選自由VSIG4及ARHGAP1組成之群之蛋白質(例如至少1種或2種蛋白質)的濃度與該第一生物樣品相比增加指示該人類個體尚未經歷對該JAK抑制劑之治療反應。
在另一態樣中,本發明之特徵在於一種治療患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體的方法,該方法包括向該人類個體投與JAK抑制劑,其中先前已確定該人類個體中:(i)自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種蛋白質)的基線濃度低於對照組:SCF、CPA2、P4HB、SPARCL1、ST2、SCF、CNDP1、TRAIL、KIRREL2、EGFR、ISLR2、PPP3R1、FCGR3B、MMP-3、IL-18BP、Flt3L、PPY、LTA4H、ITGB2、PTN、GPNMB、SIRPB1、PLTP、PSP-D、COMP、PAMR1、VASN、F11、IL10、CA3、CXCL10、Notch 3、NCAM1、PROC、CLEC14A、IL-12B、IL10、CD40及IFN-γ,及/或(ii)自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由SERPINA12、GHRL、PREB、IL-20RA及PON2組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種或5種蛋白質)的基線濃度高於對照組。
在一些實施例中,該方法需要向該人類個體投與JAK抑制劑,其中先前已確定該人類個體中:(i)自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由SCF、CPA2及P4HB組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種或3種蛋白質)的基線濃度低於對照組,及/或(ii)自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由SERPINA12、GHRL及PREB組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種或3種蛋白質)的基線濃度高於對照組。
在一些實施例中,該方法需要向該人類個體投與JAK抑制劑,其中先前已確定該人類個體中:自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由IL-20RA及PON2組成之群之蛋白質(例如至少1種或2種蛋白質)的基線濃度高於對照組。
在另一態樣中,本發明之特徵在於一種治療患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體的方法,該方法藉由:量測自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種蛋白質)的與對照組相比降低的濃度:SCF、CPA2、P4HB、SPARCL1、ST2、SCF、CNDP1、TRAIL、KIRREL2、EGFR、ISLR2、PPP3R1、FCGR3B、MMP-3、IL-18BP、Flt3L、PPY、LTA4H、ITGB2、PTN、GPNMB、SIRPB1、PLTP、PSP-D、COMP、PAMR1、VASN、F11、IL10、CA3、CXCL10、Notch 3、NCAM1、PROC、CLEC14A、IL-12B、IL10、CD40及IFN-γ,及/或至少一種選自由SERPINA12、GHRL、PREB、IL-20RA及PON2組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、5種或5種蛋白質)的與對照組相比增加的濃度;及向該人類個體投與JAK抑制劑。
在一些實施例中,該方法需要量測自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由SCF、CPA2及P4HB組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種或3種蛋白質)的與對照組相比降低的濃度,及/或至少一種選自由SERPINA12、GHRL及PREB組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種或3種蛋白質)的與對照組相比增加的濃度;及向該人類個體投與JAK抑制劑。
在一些實施例中,該方法需要量測自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由IL-20RA及PON2組成之群之蛋白質(例如至少1種或2種蛋白質)的與對照組相比增加的濃度;及向該人類個體投與JAK抑制劑。
在另一態樣中,本發明之特徵在於一種預測患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體對JAK抑制劑之反應的方法,該方法藉由:量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種蛋白質)的濃度:SCF、CPA2、P4HB、SPARCL1、ST2、SCF、CNDP1、TRAIL、KIRREL2、EGFR、ISLR2、PPP3R1、FCGR3B、MMP-3、IL-18BP、Flt3L、PPY、LTA4H、ITGB2、PTN、GPNMB、SIRPB1、PLTP、PSP-D、COMP、PAMR1、VASN、F11、IL10、CA3、CXCL10、Notch 3、NCAM1、PROC、CLEC14A、IL-12B、IL10、CD40、IFN-γ、SERPINA12、GHRL、PREB、IL-20RA及PON2,其中以下中之至少一種(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種)的濃度與對照組相比降低:SCF、CPA2、P4HB、SPARCL1、ST2、SCF、CNDP1、TRAIL、KIRREL2、EGFR、ISLR2、PPP3R1、FCGR3B、MMP-3、IL-18BP、Flt3L、PPY、LTA4H、ITGB2、PTN、GPNMB、SIRPB1、PLTP、PSP-D、COMP、PAMR1、VASN、F11、IL10、CA3、CXCL10、Notch 3、NCAM1、PROC、CLEC14A、IL-12B、IL10、CD40及IFN-γ,及/或SERPINA12、GHRL、PREB、IL-20RA或PON2中之至少一種(例如至少1種、2種、3種、4種或5種)的濃度與對照組相比增加,預示該個體將對該JAK抑制劑作出反應。
在一些實施例中,該方法需要量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由SCF、CPA2、P4HB、SERPINA12、GHRL及PREB組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種或6種蛋白質)的濃度,其中SCF、CPA2或P4HB中之至少一種(例如至少1種、2種或3種)的濃度與對照組相比降低,及/或SERPINA12、GHRL或PREB中之至少一種(例如至少1種、2種或3種)的濃度與對照組相比增加,預示該個體將對該JAK抑制劑作出反應。
在一些實施例中,該方法需要量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由IL-20RA及PON2組成之群之蛋白質(例如至少1種或2種蛋白質)的濃度,其中IL-20RA及PON2中之至少一種(例如至少1種或2種)的濃度與對照組相比增加預示該個體將對該JAK抑制劑作出反應。
在另一態樣中,本發明之特徵在於一種預測患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體對JAK抑制劑之反應的方法,該方法藉由:量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種蛋白質)的濃度:EPHA10、GH2、PARP-1、GLRX、ARSB、SCAMP3、t-PA、LDL受體、DLK-1、SELE、EPHB4、GFRA2、PLC、LTBR、PAMR1、TACSTD2、FS、ICAM-2、AXL、PRSS8、SPINK5、AMN、NOMO1、PAI及CPM,其中EPHA10、GH2、PARP-1、GLRX、ARSB及SCAMP3中之至少一種(例如至少1種、2種、3種、4種、5種或6種)的濃度與對照組相比降低,及/或t-PA、LDL受體、DLK-1、SELE、EPHB4、GFRA2、PLC、LTBR、PAMR1、TACSTD2、FS、ICAM-2、AXL、PRSS8、SPINK5、AMN、NOMO1、PAI及CPM中之至少一種(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種)的濃度與對照組相比增加,預示該個體不會對該JAK抑制劑作出反應。
在一些實施例中,該方法需要量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由EPHA10、GH2、PARP-1、t-PA、LDL受體、DLK-1及SELE組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種或6種蛋白質)的濃度,其中EPHA10、GH2或PARP-1中之至少一種(例如至少1種、2種或3種)的濃度與對照組相比降低,及/或t-PA、LDL受體或DLK-1中之至少一種(例如至少1種、2種或3種)的濃度與對照組相比增加,預示該個體不會對該JAK抑制劑作出反應。
本發明之特徵亦在於一種量測樣品中之蛋白質之量的方法,該方法藉由:提供自患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體獲得的生物樣品;及量測生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種蛋白質)的濃度:FAP、RET、CNTN5、FUCA1、ITGAV、ITGB5、THBS4、CD207、GDF-8、CDH6、MRC2、ICOSLG、TNXB、EDIL3、OSMR、GPC1、MIC-A/B、TGFR-2、LRRN1、TLR3、KIM1、ROBO2、CD70、CLMP、N-CDase、FCRL5、CTSV、SCARF2、PLXDC1、PRTG、ERBB4、MAGED1、CEACAM1、TSHB、PTK7、TGFR-2、ADAM 22、CTSC、DLK-1、USP8、SCARF2、TNFRSF13B、MB、TMPRSS5、NUDT5、MMP-3、MAEA、NEMO、IFN-γ、IL18、AKT1S1、CASP-8、PPP1R2、ST2、VSIG4、SCGB3A2、HDGF、ICA1、IL13、PEBP1、PARK7、MAP4K5、FLI1、MMP-10、CCL24、TIMP4、MBL2、REG4及CPA2。在本文所述之方法的一些實施例中,量測至多50種、40種、30種、20種、15種、10種或5種蛋白質之濃度。
本發明之特徵亦在於一種量測樣品中之蛋白質之量的方法,該方法藉由:提供自患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體獲得的生物樣品;及量測生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種蛋白質)的濃度:DDR1、NTRK2、CES2、SCARA5、GDF-8、BOC、PAEP、ARTN、CDNF、TMPRSS5、FLRT2、ROBO2、SIGLEC10、PRTG、SCARF2、CDH3、GFR-α-1、TSHB、CD200R1、RGMB、KYNU、HS3ST3B1、CHRDL2、CNTN1、VSIG4、ARHGAP1、B4GAT1、STX8、CRELD2、ARSA、BCAM、SCARF1、CA13、DAG1、LAIR1、GUSB、PMVK、PEAR1、GP1BA、TACC3、PARK7、ARHGEF12、SEMA7A、ESAM、FKBP5、ARHGAP1、SCAMP3、ABL1、EGF、TACC3、FKBP5、BID、PRDX5、STX8、CD63、SCARF1、PTPN1、CLEC1B、ARSB、FKBP1B、YES1、SRC、TNFSF14、PLXNB3、LRMP、CD164、DAG1、PVALB、NAA10、TRIM5、ARHGEF12、HGF、CA13、SNAP23、SORT1、GP6、CTSS、PPIB、CRKL、MAP2K6、MANF、PMVK、ABHD14B、GUSB、FATC1、MAD1L1、EDAR、CEACAM8、GLB1、ST3GAL1、ARSA、ADAM 8、CD40、IFI30、ECE1、AXIN1、WFDC2、TBCB、CXCL13、ST1A1、KIF1BP、DPP7、VEGFA、CETN2、TGF-α、CD84、SNAP29、CASP-8、S100A11、GSTP1、CRADD、PRKAB1、HGF、STK4、RNASE3、SERPINB6、OSM、MK、FADD、CLEC11A、CD69、LOX-1、ITGA6、CLEC5A、BCAM、FES、TXNDC5、LAT2、CXCL11、PARP-1、APBB1IP、GZMB及CRNN。在本文所述之方法的一些實施例中,量測至多50種、40種、30種、20種、15種、10種或5種蛋白質之濃度。
本發明之特徵亦在於一種量測樣品中之蛋白質之量的方法,該方法藉由:提供自患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體獲得的生物樣品;及量測生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種蛋白質)的濃度:SCF、CPA2、P4HB、SPARCL1、ST2、SCF、CNDP1、TRAIL、KIRREL2、EGFR、ISLR2、PPP3R1、FCGR3B、MMP-3、IL-18BP、Flt3L、PPY、LTA4H、ITGB2、PTN、GPNMB、SIRPB1、PLTP、PSP-D、COMP、PAMR1、VASN、F11、IL10、CA3、CXCL10、Notch 3、NCAM1、PROC、CLEC14A、IL-12B、IL10、CD40、IFN-γ、SERPINA12、GHRL、PREB、IL-20RA及PON2。在本文所述之方法的一些實施例中,量測至多50種、40種、30種、20種、15種、10種或5種蛋白質之濃度。
本發明之特徵亦在於一種量測樣品中之蛋白質之量的方法,該方法藉由:提供自患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體獲得的生物樣品;及量測生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種蛋白質)的濃度:EPHA10、GH2、PARP-1、GLRX、ARSB、SCAMP3、t-PA、LDL受體、DLK-1、SELE、EPHB4、GFRA2、PLC、LTBR、PAMR1、TACSTD2、FS、ICAM-2、AXL、PRSS8、SPINK5、AMN、NOMO1、PAI及CPM。在本文所述之方法的一些實施例中,量測至多50種、40種、30種、20種、15種、10種或5種蛋白質之濃度。
在另一態樣中,本發明之特徵在於一種治療患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體的方法,該方法包括向該人類個體投與JAK抑制劑,其中先前已確定該人類個體中:(i)自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之基因(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種基因)的基線表現水準低於對照組:SLFN12、DLEU1、EDARADD、SH3BGR、IGFN1、APOBEC3G、TRPM2、RNF148、HMMR、SKA1、AHRR、LDHAL6A、SHCBP1、GBP3、RFC4、CTF1、RAB3IL1、GINS1、CD5、PRKG1、SRSF12、FAXC、PDIA5、TGIF2、EED、GORAB、NPAS3、AVPR1A、C9orf64、C1orf74、ACAN、RNF180、BCL2L12、XK、IQCG及ZNF43,及/或(ii)自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之基因(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種基因)的基線表現水準高於對照組:OVCH2、ANKRD2、KCNJ1、TAS1R3、PPIAL4G、ZSCAN1、CACNA1F、IL17B、C1QL1、OR10A4、TAF1L、STK16、RFNG、CSAG1、PRR21、NHSL2、ZNF787、ZNRF1、PALD1、ZNF444、FAM219A、TMEM208、NMRK1、ARID3B、MPLKIP、CAB39L、ALKBH3、PLCE1、C12orf29、LSAMP、SMIM5、UQCC2、FAM96B、GID4、AKAP10、HMGCL及C11orf49。
本發明之特徵亦在於一種治療患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體的方法,該方法包括:量測自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之基因(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種基因)的與對照組相比降低的表現水準:SLFN12、DLEU1、EDARADD、SH3BGR、IGFN1、APOBEC3G、TRPM2、RNF148、HMMR、SKA1、AHRR、LDHAL6A、SHCBP1、GBP3、RFC4、CTF1、RAB3IL1、GINS1、CD5、PRKG1、SRSF12、FAXC、PDIA5、TGIF2、EED、GORAB、NPAS3、AVPR1A、C9orf64、C1orf74、ACAN、RNF180、BCL2L12、XK、IQCG及ZNF43,及/或至少一種選自由以下組成之群之基因(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種基因)的與對照組相比增加的表現水準:OVCH2、ANKRD2、KCNJ1、TAS1R3、PPIAL4G、ZSCAN1、CACNA1F、IL17B、C1QL1、OR10A4、TAF1L、STK16、RFNG、CSAG1、PRR21、NHSL2、ZNF787、ZNRF1、PALD1、ZNF444、FAM219A、TMEM208、NMRK1、ARID3B、MPLKIP、CAB39L、ALKBH3、PLCE1、C12orf29、LSAMP、SMIM5、UQCC2、FAM96B、GID4、AKAP10、HMGCL及C11orf49;及向該人類個體投與JAK抑制劑。
本發明之特徵亦在於一種預測患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體對JAK抑制劑之反應的方法,該方法包括:量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之基因(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種基因)的表現水準:OVCH2、ANKRD2、KCNJ1、TAS1R3、PPIAL4G、ZSCAN1、CACNA1F、IL17B、C1QL1、OR10A4、TAF1L、STK16、RFNG、CSAG1、PRR21、NHSL2、ZNF787、ZNRF1、PALD1、ZNF444、FAM219A、TMEM208、NMRK1、ARID3B、MPLKIP、CAB39L、ALKBH3、PLCE1、C12orf29、LSAMP、SMIM5、UQCC2、FAM96B、GID4、AKAP10、HMGCL、C11orf49、SLFN12、DLEU1、EDARADD、SH3BGR、IGFN1、APOBEC3G、TRPM2、RNF148、HMMR、SKA1、AHRR、LDHAL6A、SHCBP1、GBP3、RFC4、CTF1、RAB3IL1、GINS1、CD5、PRKG1、SRSF12、FAXC、PDIA5、TGIF2、EED、GORAB、NPAS3、AVPR1A、C9orf64、C1orf74、ACAN、RNF180、BCL2L12、XK、IQCG及ZNF43,其中SLFN12、DLEU1、EDARADD、SH3BGR、IGFN1、APOBEC3G、TRPM2、RNF148、HMMR、SKA1、AHRR、LDHAL6A、SHCBP1、GBP3、RFC4、CTF1、RAB3IL1、GINS1、CD5、PRKG1、SRSF12、FAXC、PDIA5、TGIF2、EED、GORAB、NPAS3、AVPR1A、C9orf64、C1orf74、ACAN、RNF180、BCL2L12、XK、IQCG及ZNF43中之至少一者的表現水準與對照組相比降低,及/或OVCH2、ANKRD2、KCNJ1、TAS1R3、PPIAL4G、ZSCAN1、CACNA1F、IL17B、C1QL1、OR10A4、TAF1L、STK16、RFNG、CSAG1、PRR21、NHSL2、ZNF787、ZNRF1、PALD1、ZNF444、FAM219A、TMEM208、NMRK1、ARID3B、MPLKIP、CAB39L、ALKBH3、PLCE1、C12orf29、LSAMP、SMIM5、UQCC2、FAM96B、GID4、AKAP10、HMGCL及C11orf49中之至少一者的表現水準與對照組相比增加,預示該個體將對該JAK抑制劑作出反應。
本發明之特徵亦在於一種預測患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體對JAK抑制劑之反應的方法,該方法包括:量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之基因(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種基因)的表現水準:OVCH2、ANKRD2、KCNJ1、TAS1R3、PPIAL4G、ZSCAN1、CACNA1F、IL17B、C1QL1、OR10A4、TAF1L、STK16、RFNG、CSAG1、PRR21、NHSL2、ZNF787、ZNRF1、PALD1、ZNF444、FAM219A、TMEM208、NMRK1、ARID3B、MPLKIP、CAB39L、ALKBH3、PLCE1、C12orf29、LSAMP、SMIM5、UQCC2、FAM96B、GID4、AKAP10、HMGCL、C11orf49、SLFN12、DLEU1、EDARADD、SH3BGR、IGFN1、APOBEC3G、TRPM2、RNF148、HMMR、SKA1、AHRR、LDHAL6A、SHCBP1、GBP3、RFC4、CTF1、RAB3IL1、GINS1、CD5、PRKG1、SRSF12、FAXC、PDIA5、TGIF2、EED、GORAB、NPAS3、AVPR1A、C9orf64、C1orf74、ACAN、RNF180、BCL2L12、XK、IQCG及ZNF43,其中OVCH2、ANKRD2、KCNJ1、TAS1R3、PPIAL4G、ZSCAN1、CACNA1F、IL17B、C1QL1、OR10A4、TAF1L、STK16、RFNG、CSAG1、PRR21、NHSL2、ZNF787、ZNRF1、PALD1、ZNF444、FAM219A、TMEM208、NMRK1、ARID3B、MPLKIP、CAB39L、ALKBH3、PLCE1、C12orf29、LSAMP、SMIM5、UQCC2、FAM96B、GID4、AKAP10、HMGCL及C11orf49中之至少一者的表現水準與對照組相比降低,及/或SLFN12、DLEU1、EDARADD、SH3BGR、IGFN1、APOBEC3G、TRPM2、RNF148、HMMR、SKA1、AHRR、LDHAL6A、SHCBP1、GBP3、RFC4、CTF1、RAB3IL1、GINS1、CD5、PRKG1、SRSF12、FAXC、PDIA5、TGIF2、EED、GORAB、NPAS3、AVPR1A、C9orf64、C1orf74、ACAN、RNF180、BCL2L12、XK、IQCG及ZNF43中之至少一者的表現水準與對照組相比增加,預示該個體不會對該JAK抑制劑作出反應。
在另一態樣中,本發明之特徵在於一種治療患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體的方法,該方法包括向該人類個體投與JAK抑制劑,其中先前已確定該人類個體中:(i)自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由STK16、RFNG、ZNRF1、ARID3B、WSB2、JAK1、IL1RL2、PALD1、S100A1、BCL2L12、FAM219A及TSHZ1組成之群之基因(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種或12種基因)的基線表現水準低於對照組,及/或(ii)自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由PPIAL4G、CD5、IFI6、CCR4、CNTF、CD28及RAB3IL1組成之群之基因的基線表現水準(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種或7種基因)高於對照組。
本發明之特徵亦在於一種治療患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體的方法,該方法包括:量測自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之基因(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種或12種基因)的與對照組相比降低的表現水準:STK16、RFNG、ZNRF1、ARID3B、WSB2、JAK1、IL1RL2、PALD1、S100A1、BCL2L12、FAM219A及TSHZ1,及/或至少一種選自由以下組成之群之基因(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種或7種基因)的與對照組相比增加的表現水準:PPIAL4G、CD5、IFI6、CCR4、CNTF、CD28及RAB3IL1;及向該人類個體投與JAK抑制劑。
本發明之特徵亦在於一種預測患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體對JAK抑制劑之反應的方法,該方法包括:量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之基因(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種或19基因)的表現水準:PPIAL4G、CD5、IFI6、CCR4、CNTF、CD28、RAB3IL1、STK16、RFNG、ZNRF1、ARID3B、WSB2、JAK1、IL1RL2、PALD1、S100A1、BCL2L12、FAM219A及TSHZ1,其中STK16、RFNG、ZNRF1、ARID3B、WSB2、JAK1、IL1RL2、PALD1、S100A1、BCL2L12、FAM219A及TSHZ1中之至少一者的表現水準與對照組相比降低,及/或PPIAL4G、CD5、IFI6、CCR4、CNTF、CD28及RAB3IL1中之至少一者的表現水準與對照組相比增加預示該個體將對該JAK抑制劑作出反應。
本發明之特徵亦在於一種預測患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體對JAK抑制劑之反應的方法,該方法包括:量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之基因(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種或19種基因)的表現水準:PPIAL4G、CD5、IFI6、CCR4、CNTF、CD28、RAB3IL1、STK16、RFNG、ZNRF1、ARID3B、WSB2、JAK1、IL1RL2、PALD1、S100A1、BCL2L12、FAM219A及TSHZ1,其中PPIAL4G、CD5、IFI6、CCR4、CNTF、CD28及RAB3IL1中之至少一者的表現水準與對照組相比降低,及/或STK16、RFNG、ZNRF1、ARID3B、WSB2、JAK1、IL1RL2、PALD1、S100A1、BCL2L12、FAM219A及TSHZ1中之至少一者的表現水準與對照組相比增加,預示該個體不會對該JAK抑制劑作出反應。
在本文所述之方法的一些實施例中,生物樣品為血液、血清、血漿、尿液、脊髓液、唾液、淚液或汗液。在一些實施例中,生物樣品為血液、血清或血漿。
在本文所述之方法的一些實施例中,蛋白質之濃度藉由免疫學方法(例如選自由酶聯免疫吸附分析法、酶免疫分析法、放射免疫分析法、化學發光免疫分析法、電化學發光免疫分析法、乳膠濁度免疫分析法、乳膠光度免疫分析法、免疫層析分析法及西方墨點法(western blotting)組成之群)來量測。
在本文所述之方法的一些實施例中,藉由質譜法量測蛋白質之濃度。
在本文所述之方法的一些實施例中,藉由RNA定序或定量PCR量測基因之表現水準。
在本文所述之方法的一些實施例中,JAK抑制劑為魯索替尼(ruxolitinib)。在一些實施例中,魯索替尼係以包含至少0.15%魯索替尼之乳膏形式局部投與人類個體,一天至少一次。在一些實施例中,魯索替尼係以包含至少0.15%魯索替尼之乳膏形式局部投與人類個體,每天至少兩次。在一些實施例中,魯索替尼係以包含至少0.5%魯索替尼之乳膏形式局部投與人類個體,一天至少一次。在一些實施例中,魯索替尼係以包含至少0.5%魯索替尼之乳膏形式局部投與人類個體,每天至少兩次。在一些實施例中,魯索替尼係以包含至少1.5%魯索替尼之乳膏形式局部投與人類個體,一天至少一次。在一些實施例中,魯索替尼係以包含至少1.5%魯索替尼之乳膏形式局部投與人類個體,每天至少兩次。
在本文所述之方法的一些實施例中,JAK抑制劑為伊他替尼(itacitinib)、4-[3-(氰基甲基)-3-(3',5'-二甲基-1H,1'H-4,4'-聯吡唑-1-基)氮雜環丁烷-1-基]-2,5-二氟-N-[(1S)-2,2,2-三氟-1-甲基乙基]苯甲醯胺或其醫藥學上可接受之鹽,或者((2R,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥基乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)乙腈或其醫藥學上可接受之鹽。
術語蛋白質之「基線濃度」係指在開始用JAK抑制劑治療之前個體中之蛋白質的濃度。
術語基因之「基線表現水準」係指在開始用JAK抑制劑治療之前個體中之基因的表現水準。
術語「降低的濃度」意謂所分析之蛋白質之濃度低於對照組中或先前樣品中之該蛋白質的濃度。舉例而言,所分析之蛋白質的濃度可比對照組中之該蛋白質之濃度低至少1.5、2、3、4、5、6、7、8、9、10、20、25、50、75或100倍,或低至少10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、200%、300%、400%、500%、600%、700%、800%、900%、1,000%、1,500%、2,000%、2,500%、3,000%、3,500%、4,000%、4,500%或5,000%。
術語「降低的表現水準」意謂所分析之基因的表現水準低於對照組中之該基因的表現水準。舉例而言,所分析之基因的表現水準可比對照組中之該基因之表現水準低至少1.5、2、3、4、5、6、7、8、9、10、20、25、50、75或100倍,或低至少10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、200%、300%、400%、500%、600%、700%、800%、900%、1,000%、1,500%、2,000%、2,500%、3,000%、3,500%、4,000%、4,500%或5,000%。
術語「增加的濃度」意謂所分析之蛋白質之濃度高於對照組中或先前樣品中之該蛋白質的濃度。舉例而言,所分析之蛋白質的濃度可比對照組中之該蛋白質之濃度高至少1.5、2、3、4、5、6、7、8、9、10、20、25、50、75或100倍,或高至少10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、200%、300%、400%、500%、600%、700%、800%、900%、1,000%、1,500%、2,000%、2,500%、3,000%、3,500%、4,000%、4,500%或5,000%。
術語「增加的表現水準」意謂所分析之基因的表現水準高於對照組中之該基因的表現水準。舉例而言,所分析之基因的表現水準可比對照組中之該基因之表現水準高至少1.5、2、3、4、5、6、7、8、9、10、20、25、50、75或100倍,或高至少10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、200%、300%、400%、500%、600%、700%、800%、900%、1,000%、1,500%、2,000%、2,500%、3,000%、3,500%、4,000%、4,500%或5,000%。
術語「對療法作出反應」意謂投與療法之個體對所提供之JAK抑制劑療法顯示陽性反應。
除非另外定義,否則本文中使用之所有技術及科學術語均具有與本發明所屬領域之一般技術人員通常所瞭解之含義相同的含義。雖然與本文所述之方法及材料類似或同等的任何方法及材料可用於實踐或測試本發明,但下文描述例示性方法及材料。本文中提到之所有公開案、專利申請案、專利及其他參考文獻均以引用之方式整體併入本文中。萬一發生矛盾,本申請案,包括定義,將為準。材料、方法及實例僅僅是例示性的,並且不意欲限制。
本發明之其他特徵及優點將自以下詳細描述及申請專利範圍中顯而易見。
相關申請案之交叉引用
本申請案主張2019年3月19日申請之美國臨時申請案第62/820,647號及2019年8月29日申請之美國臨時申請案第62/893,532號的優先權。前述申請案每一者之內容以引用之方式整體併入本文中。
本發明提供用JAK抑制劑治療患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體的方法及組合物。本發明提供鑑定患有白斑病之已經歷對JAK抑制劑之治療反應(例如在明顯皮膚改善之前)的彼等個體的藥效學生物標記物(例如蛋白質表現水準)。本發明亦提供鑑定投與JAK抑制劑可能有效的患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之彼等個體的預測性生物標記物(例如蛋白質表現水準)。 鑑定對JAK抑制劑之治療反應性的方法
如實例1中所述,用JAK抑制劑治療患有白斑病之個體引起循環之CXCL9及CXCL10水準下降。因此,在治療過程中CXCL9及CXCL10水準之變化可用於鑑定患有白斑病之個體對JAK抑制劑之治療反應性(例如改善疾病評分及/或疾病消退)。在用JAK抑制劑治療之後自個體獲得之生物樣品(例如血漿或血清)中之CXCL9及/或CXCL10蛋白質的濃度與在用JAK抑制劑治療之前自個體獲得之生物樣品中的基線CXCL9及/或CXCL10表現水準相比降低指示個體已經歷對JAK抑制劑之治療反應(例如在明顯皮膚改善之前)。
如實例2-4中所述,蛋白質組學概況分析鑑定出在對用JAK抑制劑治療作出反應之個體中表現水準在治療過程中變化且因此可用於鑑定患有白斑病之個體對JAK抑制劑之治療反應性(例如疾病評分改善及/或疾病消退)的許多蛋白質。此外,鑑定出在對用JAK抑制劑治療未作出反應之個體中表現水準在治療過程中變化且因此可用於鑑定患有白斑病之個體對JAK抑制劑無治療反應性(例如疾病評分未改善及/或缺乏疾病消退)的許多蛋白質。
在用JAK抑制劑治療之後自個體獲得之生物樣品(例如血漿或血清)中的以下中之一或多種(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種)的蛋白質濃度與在用JAK抑制劑治療之前自個體獲得之生物樣品中的基線表現水準相比降低指示個體已經歷對JAK抑制劑之治療反應(例如在明顯皮膚改善之前):FAP、RET、CNTN5、FUCA1、ITGAV、ITGB5、THBS4、CD207、GDF-8、CDH6、MRC2、ICOSLG、TNXB、EDIL3、OSMR、GPC1、MIC-A/B、TGFR-2、LRRN1、TLR3、KIM1、ROBO2、CD70、CLMP、N-CDase、FCRL5、CTSV、SCARF2、PLXDC1、PRTG、ERBB4、MAGED1、CEACAM1、TSHB、PTK7、TGFR-2、ADAM 22、CTSC、DLK-1、USP8、SCARF2、TNFRSF13B、MB或TMPRSS5。
在用JAK抑制劑治療之後自個體獲得之生物樣品(例如血漿或血清)中的以下中之一或多種(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種)的蛋白質濃度與在用JAK抑制劑治療之前自個體獲得之生物樣品中的基線表現水準相比增加指示個體已經歷對JAK抑制劑之治療反應(例如在明顯皮膚改善之前):NUDT5、MMP-3、MAEA、NEMO、IFN-γ、IL18、AKT1S1、CASP-8、PPP1R2、ST2、VSIG4、SCGB3A2、HDGF、ICA1、IL13、PEBP1、PARK7、MAP4K5、FLI1、MMP-10、CCL24、TIMP4、MBL2、REG4或CPA2。
在用JAK抑制劑治療之後自個體獲得之生物樣品(例如血漿或血清)中的以下中之一或多種(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種)的蛋白質濃度與在用JAK抑制劑治療之前自個體獲得之生物樣品中的基線表現水準相比降低:FAP、RET、CNTN5、FUCA1、ITGAV、ITGB5、THBS4、CD207、GDF-8、CDH6、MRC2、ICOSLG、TNXB、EDIL3、OSMR、GPC1、MIC-A/B、TGFR-2、LRRN1、TLR3、KIM1、ROBO2、CD70、CLMP、N-CDase、FCRL5、CTSV、SCARF2、PLXDC1、PRTG、ERBB4、MAGED1、CEACAM1、TSHB、PTK7、TGFR-2、ADAM 22、CTSC、DLK-1、USP8、SCARF2、TNFRSF13B、MB或TMPRSS5,聯合在用JAK抑制劑治療之後自個體獲得之生物樣品(例如血漿或血清)中的以下中之一或多種(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種)的蛋白質濃度與在用JAK抑制劑治療之前自個體獲得之生物樣品中的基線表現水準相比增加:NUDT5、MMP-3、MAEA、NEMO、IFN-γ、IL18、AKT1S1、CASP-8、PPP1R2、ST2、VSIG4、SCGB3A2、HDGF、ICA1、IL13、PEBP1、PARK7、MAP4K5、FLI1、MMP-10、CCL24、TIMP4、MBL2、REG4或CPA2,指示個體已經歷對JAK抑制劑之治療反應(例如在明顯皮膚改善之前)。
在用JAK抑制劑治療之後自個體獲得之生物樣品(例如血漿或血清)中的以下中之一或多種(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種)的蛋白質濃度與在用JAK抑制劑治療之前自個體獲得之生物樣品中的基線表現水準相比降低指示個體尚未經歷對JAK抑制劑之治療反應:DDR1、NTRK2、CES2、SCARA5、GDF-8、BOC、PAEP、ARTN、CDNF、TMPRSS5、FLRT2、ROBO2、SIGLEC10、PRTG、SCARF2、CDH3、GFR-α-1、TSHB、CD200R1、RGMB、KYNU、HS3ST3B1、CHRDL2或CNTN1。
在用JAK抑制劑治療之後自個體獲得之生物樣品(例如血漿或血清)中的以下中之一或多種(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種)的蛋白質濃度與在用JAK抑制劑治療之前自個體獲得之生物樣品中的基線表現水準相比增加指示個體尚未經歷對JAK抑制劑之治療反應:VSIG4、ARHGAP1、B4GAT1、STX8、CRELD2、ARSA、BCAM、SCARF1、CA13、DAG1、LAIR1、GUSB、PMVK、PEAR1、GP1BA、TACC3、PARK7、ARHGEF12、SEMA7A、ESAM、FKBP5、ARHGAP1、SCAMP3、ABL1、EGF、TACC3、FKBP5、BID、PRDX5、STX8、CD63、SCARF1、PTPN1、CLEC1B、ARSB、FKBP1B、YES1、SRC、TNFSF14、PLXNB3、LRMP、CD164、DAG1、PVALB、NAA10、TRIM5、ARHGEF12、HGF、CA13、SNAP23、SORT1、GP6、CTSS、PPIB、CRKL、MAP2K6、MANF、PMVK、ABHD14B、GUSB、FATC1、MAD1L1、EDAR、CEACAM8、GLB1、ST3GAL1、ARSA、ADAM 8、CD40、IFI30、ECE1、AXIN1、WFDC2、TBCB、CXCL13、ST1A1、KIF1BP、DPP7、VEGFA、CETN2、TGF-α、CD84、SNAP29、CASP-8、S100A11、GSTP1、CRADD、PRKAB1、HGF、STK4、RNASE3、SERPINB6、OSM、MK、FADD、CLEC11A、CD69、LOX-1、ITGA6、CLEC5A、BCAM、FES、TXNDC5、LAT2、CXCL11、PARP-1、APBB1IP、GZMB或CRNN。
在用JAK抑制劑治療之後自個體獲得之生物樣品(例如血漿或血清)中的以下中之一或多種(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種)的蛋白質濃度與在用JAK抑制劑治療之前自個體獲得之生物樣品中的基線表現水準相比降低:DDR1、NTRK2、CES2、SCARA5、GDF-8、BOC、PAEP、ARTN、CDNF、TMPRSS5、FLRT2、ROBO2、SIGLEC10、PRTG、SCARF2、CDH3、GFR-α-1、TSHB、CD200R1、RGMB、KYNU、HS3ST3B1、CHRDL2或CNTN1,聯合在用JAK抑制劑治療之後自個體獲得之生物樣品(例如血漿或血清)中的以下中之一或多種(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種或20種)的蛋白質濃度與在用JAK抑制劑治療之前自個體獲得之生物樣品中的基線表現水準相比增加:VSIG4、ARHGAP1、B4GAT1、STX8、CRELD2、ARSA、BCAM、SCARF1、CA13、DAG1、LAIR1、GUSB、PMVK、PEAR1、GP1BA、TACC3、PARK7、ARHGEF12、SEMA7A、ESAM、FKBP5、ARHGAP1、SCAMP3、ABL1、EGF、TACC3、FKBP5、BID、PRDX5、STX8、CD63、SCARF1、PTPN1、CLEC1B、ARSB、FKBP1B、YES1、SRC、TNFSF14、PLXNB3、LRMP、CD164、DAG1、PVALB、NAA10、TRIM5、ARHGEF12、HGF、CA13、SNAP23、SORT1、GP6、CTSS、PPIB、CRKL、MAP2K6、MANF、PMVK、ABHD14B、GUSB、FATC1、MAD1L1、EDAR、CEACAM8、GLB1、ST3GAL1、ARSA、ADAM 8、CD40、IFI30、ECE1、AXIN1、WFDC2、TBCB、CXCL13、ST1A1、KIF1BP、DPP7、VEGFA、CETN2、TGF-α、CD84、SNAP29、CASP-8、S100A11、GSTP1、CRADD、PRKAB1、HGF、STK4、RNASE3、SERPINB6、OSM、MK、FADD、CLEC11A、CD69、LOX-1、ITGA6、CLEC5A、BCAM、FES、TXNDC5、LAT2、CXCL11、PARP-1、APBB1IP、GZMB或CRNN,指示個體尚未經歷對JAK抑制劑之治療反應。
在一些實施例中,白斑病為非節段型白斑病。在其他實施例中,白斑病為節段型白斑病。 預測對JAK抑制劑之治療反應性的方法
已在實例中鑑定出基線表現水準可用於預測患有白斑病之個體對JAK抑制劑之治療反應性(例如疾病評分之改善及/或疾病消退)的幾種蛋白質。此外,已鑑定出基線表現水準可用於預測患有白斑病之個體對JAK抑制劑無反應性(例如疾病評分無改善及/或疾病缺乏消退)的幾種蛋白質。
以下中之一或多種(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種或14種)的基線蛋白質濃度(例如血漿或血清中)與對照組相比降低指示/預示患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之個體將對JAK抑制劑作出反應:SCF、CPA2、P4HB、SPARCL1、ST2、SCF、CNDP1、TRAIL、KIRREL2、EGFR、ISLR2、PPP3R1、FCGR3B、MMP-3、IL-18BP、Flt3L、PPY、LTA4H、ITGB2、PTN、GPNMB、SIRPB1、PLTP、PSP-D、COMP、PAMR1、VASN、F11、IL10、CA3、CXCL10、Notch 3、NCAM1、PROC、CLEC14A、IL-12B、IL10、CD40或IFN-γ。舉例而言,在用JAK抑制劑治療之前自個體獲得之生物樣品中的SPARCL1蛋白質之濃度低(與對照組相比)預測個體將對JAK抑制劑作出反應。
SERPINA12、GHRL、PREB、IL-20RA或PON2中之一或多種(例如至少1種、2種或3種)的基線蛋白質濃度(例如血漿或血清中)與對照組相比增加指示/預示患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之個體將對JAK抑制劑作出反應。舉例而言,在用JAK抑制劑治療之前自個體獲得之生物樣品中的SERPINA12蛋白質之濃度增加(與對照組相比)預示個體將對JAK抑制劑作出反應。
以下中之一或多種(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種或14種)的基線蛋白質濃度(例如血漿或血清中)與對照組相比降低:SCF、CPA2、P4HB、SPARCL1、ST2、SCF、CNDP1、TRAIL、KIRREL2、EGFR、ISLR2、PPP3R1、FCGR3B、MMP-3、IL-18BP、Flt3L、PPY、LTA4H、ITGB2、PTN、GPNMB、SIRPB1、PLTP、PSP-D、COMP、PAMR1、VASN、F11、IL10、CA3、CXCL10、Notch 3、NCAM1、PROC、CLEC14A、IL-12B、IL10、CD40或IFN-γ,聯合SERPINA12、GHRL、PREB、IL-20RA或PON2中之一或多種(例如至少1種、2種或3種)的基線蛋白質濃度與對照組相比增加指示/預示患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之個體將對JAK抑制劑作出反應。舉例而言,在用JAK抑制劑治療之前自個體獲得之生物樣品中的SPARCL1蛋白質之濃度低(與對照組相比)及SERPINA12蛋白質之濃度增加(與對照組相比)預示個體將對JAK抑制劑作出反應。
EPHA10、GH2、PARP-1、GLRX、ARSB或SCAMP3中之一或多種(例如至少1種、2種、3種、4種、5種或6種)的基線蛋白質濃度(例如血漿或血清中)與對照組相比降低指示/預示患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之個體不會對JAK抑制劑作出反應。舉例而言,在用JAK抑制劑治療之前自個體獲得之生物樣品中的EPHA10蛋白質之濃度低(與對照組相比)預測個示不會對JAK抑制劑作出反應。
以下中之一或多種(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種或14種)的基線蛋白質濃度(例如血漿或血清中)與對照組相比增加指示/預示患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之個體不會對JAK抑制劑作出反應:t-PA、LDL受體、DLK-1、SELE、EPHB4、GFRA2、PLC、LTBR、PAMR1、TACSTD2、FS、ICAM-2、AXL、PRSS8、SPINK5、AMN、NOMO1、PAI或CPM。舉例而言,在用JAK抑制劑治療之前自個體獲得之生物樣品中的EPHB4蛋白質之濃度增加(與對照組相比)預示個體不會對JAK抑制劑作出反應。
EPHA10、GH2、PARP-1、GLRX、ARSB或SCAMP3中之一或多種(例如至少1種、2種、3種、4種、5種或6種)的基線蛋白質濃度(例如血漿或血清中)與對照組相比降低,聯合以下中之一或多種(例如至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種、12種、13種或14種)的基線蛋白質濃度(例如血漿或血清中)與對照組相比增加:t-PA、LDL受體、DLK-1、SELE、EPHB4、GFRA2、PLC、LTBR、PAMR1、TACSTD2、FS、ICAM-2、AXL、PRSS8、SPINK5、AMN、NOMO1、PAI或CPM,指示/預示患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之個體不會對JAK抑制劑作出反應。舉例而言,在用JAK抑制劑治療之前自個體獲得之生物樣品中的EPHA10蛋白質之濃度低(與對照組相比)及EPHB4蛋白質之濃度增加(與對照組相比)預示個體不會對JAK抑制劑作出反應。
在一些實施例中,白斑病為非節段型白斑病。在其他實施例中,白斑病為節段型白斑病。 對照
如上所述,本發明之方法可包括量測來自患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之個體之生物樣品中的一或多種蛋白質之濃度,其中與對照組相比一或多種蛋白質之濃度預測個體對JAK抑制劑之反應。在某些實施例中,當來自患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之個體之生物樣品中的本文所述之蛋白質之濃度低於對照時,鑑定個體為可能對JAK抑制劑作出反應。在其他實施例中,當來自患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之個體之生物樣品中的本文所述之蛋白質之濃度高於對照時,鑑定個體為可能對JAK抑制劑作出反應。在這裡,術語「對照」包括自已知不對JAK抑制劑作出反應之個體獲得之樣品(來自相同組織類型)。術語「對照」亦包括過去自已知不對JAK抑制劑作出反應之個體獲得且用作將來與自將預測治療反應性之個體取得之測試樣品比較的參考的樣品(來自相同組織類型)。具體細胞類型或組織中之具體蛋白質的「對照」表現水準/濃度可藉由分析尚未對用JAK抑制劑治療作出反應的相同物種之一或多個(例如2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、15個、20個、25個、30個、35個或40個或更多個)個體中之蛋白質表現來預先確立。此預先確立之參考值(其可為自尚未對療法作出反應之多名個體取得的平均或中位表現水準/濃度)可在與測試樣品之比較中用於蛋白質之「對照」濃度/表現。在此類比較中,若所分析之蛋白質之表現水準低於或高於預先確立之參考,則預測個體對JAK抑制劑作出反應。
可替代地,具體細胞類型或組織中之具體蛋白質的「對照」濃度可藉由分析已對用JAK抑制劑治療作出反應之一或多名個體中之蛋白質表現來預先確立。接著此預先確立之參考值(其可為自已對療法作出反應之多名個體取得的平均或中位表現水準)可在與測試樣品之比較中用作蛋白質之「對照」濃度/表現。在此類比較中,若所分析之蛋白質之濃度與預先確立之參考相同或比得上預先確立之參考(例如至少85%但小於100%),則預測個體對JAK抑制劑作出反應。
在某些實施例中,「對照」為預先確立之截止值。截止值通常為超過或低於均視為預測個體對所關注療法之反應性的蛋白質濃度。因此,根據本文所述之方法及組合物,對照蛋白質濃度確定為截止值,超過或低於其均預測對JAK抑制劑之反應性。經確定用於本文所述之方法的截止值可與例如濃度之公開範圍相比,但可針對所用方法及患者群體而個體化。
在一些實施例中,所分析之蛋白質之濃度與對照組中該蛋白質之濃度相比降低。舉例而言,所分析之蛋白質的濃度可比對照組中之該蛋白質之濃度低至少1.5、2、3、4、5、6、7、8、9、10、20、25、50、75或100倍,或低至少10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、200%、300%、400%、500%、600%、700%、800%、900%、1,000%、1,500%、2,000%、2,500%、3,000%、3,500%、4,000%、4,500%或5,000%。
在一些實施例中,所分析之蛋白質之濃度與對照組中該蛋白質之濃度相比增加。舉例而言,所分析之蛋白質的濃度可比對照組中之該蛋白質之濃度高至少1.5、2、3、4、5、6、7、8、9、10、20、25、50、75或100倍,或高至少10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、200%、300%、400%、500%、600%、700%、800%、900%、1,000%、1,500%、2,000%、2,500%、3,000%、3,500%、4,000%、4,500%或5,000%。 生物樣品
適用於本文所述之方法的生物樣品包括含有所關注之蛋白質的任何生物流體、細胞、組織或其碎片。生物樣品可為例如自人類個體獲得之試樣或可源自於此類個體。舉例而言,生物樣品可為生物流體,諸如血液、血清、血漿、尿液、脊髓液、唾液、淚液或汗液,或吸收至基底(例如玻璃、聚合物或紙)上之此類樣品。
生物樣品可自患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體獲得。在某些實施例中,個體患有非節段型白斑病。在一些實施例中,個體患有節段型白斑病。
本領域之技術人員熟知用於獲得及/或儲存樣品的維持樣品中分子(例如蛋白質)之活性或完整性的方法。舉例而言,生物樣品可進一步與一或多種維持樣品中之分子或將變化減至最少的額外試劑接觸,該等試劑諸如緩衝劑及/或抑制劑,包括核酸酶、蛋白酶及磷酸酶抑制劑中之一或多種。 確定生物標記物之表現水準/濃度
基因產物之表現水準(量)可藉由偵測及/或量測基因之蛋白質表現水準來確定。
在一個實施例中,基因表現可藉由偵測及/或量測由該基因編碼之蛋白質之表現或水準來確定。確定蛋白質表現/濃度之方法為此項技術中所熟知。一般使用之方法包括使用對所關注之目標蛋白具有特異性之抗體。舉例而言,確定蛋白質表現之方法包括(但不限於)西方墨點法或墨點雜交分析(dot blot analysis)、免疫組織化學(例如定量免疫組織化學)、免疫細胞化學、酶聯免疫吸附分析法(ELISA)、酶聯免疫吸附斑點(ELISPOT;Coligan, J. E.等人編輯 (1995) Current Protocols in Immunology. Wiley, New York)、放射免疫分析法、化學發光免疫分析法、電化學發光免疫分析法、乳膠濁度免疫分析法、乳膠光度免疫分析法、免疫層析分析法及抗體陣列分析法(參見例如美國公開案第20030013208號及2004171068,該等揭示內容各以引用之方式併入本文中)。
在一個實例中,基因之蛋白質表現之存在或量可使用西方墨點技術測定。舉例而言,溶解產物可自生物樣品製備,或生物樣品本身可與Laemmli緩衝液接觸且經受十二烷基硫酸鈉聚丙烯醯胺凝膠電泳(SDS-PAGE)。SDS-PAGE解析之蛋白質按大小分開,接著可轉移至濾膜(例如硝化纖維素)且使用對所關注蛋白質具有特異性之可偵測標記之抗體經受免疫墨點技術。結合之可偵測標記之抗體的存在或量指示生物樣品中蛋白質之存在或量。
在另一個實例中,免疫分析法可用於偵測及/或量測基因之蛋白質表現。如上,出於偵測之目的,免疫分析法可用載有偵測部分(例如螢光劑或酶)之抗體進行。來自生物樣品之蛋白質可直接結合於固相基質(例如多孔分析盤、硝化纖維素、瓊脂糖、瓊脂糖凝膠、編碼粒子或磁性珠粒),或其可結合於特定結合對(例如生物素或抗生蛋白鏈菌素)之第一成員,該特定結合對在固相基質結合於特定結合對之第二成員(例如抗生蛋白鏈菌素或生物素)後附接於固相基質。與固相基質之此類附接允許在與偵測抗體接觸之前純化蛋白質,使其不含生物樣品之其他干擾或不相干之組分,且亦允許隨後洗滌未結合之抗體。這裡如上,結合之可偵測標記之抗體的存在或量指示生物樣品中之蛋白質之存在或量。
對於抗體形式無特定限制,且本發明包括多株抗體以及單株抗體。亦包括藉由用蛋白質或其片段免疫接種之動物(諸如兔)獲得之抗血清,以及所有類別之多株及單株抗體、人類抗體及藉由基因重組產生之人類化抗體。對由一或多種生物標記物編碼之蛋白質具有特異性之抗體或抗體片段藉由諸如噬菌體展示之活體外方法產生。此外,抗體可為抗體片段或經修飾之抗體,只要其結合於由本發明之生物標記物編碼之蛋白質即可。舉例而言,可考慮Fab、F(ab')2、H鏈Fv及L鏈Fv由連接子適當連接之Fv單鏈Fv (scFv) (Huston等人,Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 85:5879-5883, (1988))作為抗體片段。
抗體可結合於各種分子,諸如螢光物質、放射性物質及發光物質。已建立將此類部分附接於抗體之方法且為所屬領域中習知的(參見例如US 5,057,313及5,156,840)。
分析抗體之抗原結合活性之方法的實例包括例如量測吸光度、酶聯免疫吸附分析法(ELISA)、酶免疫分析法(EIA)、放射免疫分析法(RIA)及/或免疫螢光。舉例而言,當使用ELISA時,由本發明之生物標記物編碼之蛋白質添加至包覆有本發明之抗體的培養盤,接著添加抗體樣品,例如抗體產生之細胞之培養上清液,或經純化之抗體。接著添加藉由鹼性磷酸酶及此類酶標記之識別初級抗體之二級抗體,將盤培育及洗滌,且在添加諸如對硝基苯基磷酸酯之酶受質之後量測吸光度以評估抗原結合活性。作為蛋白質,可使用蛋白質片段,例如包含C端之片段或包含N端之片段。為評估本發明抗體之活性,可使用BIAcore (GE Healthcare)。
藉由使用此等方法,使抗體與假定含有所關注蛋白質之樣品接觸,且藉由偵測或分析在以上提及之抗體與蛋白質之間形成之免疫複合物來偵測或分析由本發明之生物標記物編碼的蛋白質。
基於質譜法之定量分析法,例如但不限於基於多反應監測(MRM)之方法聯合穩定同位素標記之內標,可作為定量量測蛋白質之免疫分析的替代方法。此等方法不需要使用抗體(參見例如Addona等人,Nat. Biotechnol., 27:633-641, 2009;Kuzyk等人,Mol. Cell Proteomics , 8:1860-1877, 2009;Paulovich等人,Proteomics Clin. Appl. , 2:1386-1402, 2008)。此外,MRM提供優良多工能力,允許同時平行定量許多蛋白質。此等方法之基礎理論已為大家所公認,且廣泛用於小分子之藥物代謝及藥物動力學分析。
在一些實施例中,可評定及/或量測兩種蛋白質、三種蛋白質、四種蛋白質、五種蛋白質、六種蛋白質、七種蛋白質、八種蛋白質、九種蛋白質、10種蛋白質、11種蛋白質、12種蛋白質、13種蛋白質或14種蛋白質,或至少兩種蛋白質、至少三種蛋白質、至少四種蛋白質、至少五種蛋白質、至少六種蛋白質、至少七種蛋白質、至少八種蛋白質、至少九種蛋白質、至少10種蛋白質、至少11種蛋白質、至少12種蛋白質、至少13種蛋白質、至少14種蛋白質、至少15種蛋白質、至少16種蛋白質、至少17種蛋白質、至少18種蛋白質、至少19種蛋白質、或至少20種蛋白質。 JAK抑制劑
在一些實施例中,JAK抑制劑為抑制JAK1、JAK2、JAK3及/或TYK2之化合物。在一些實施例中,相比於JAK3及TYK2,JAK抑制劑對JAK1及JAK2具選擇性。在一些實施例中,相比於JAK2、JAK3及TYK2,JAK抑制劑對JAK1具選擇性。舉例而言,相比於JAK2、JAK3及TYK2中之一或多種,本文所述之一些化合物或其醫藥學上可接受之鹽優先抑制JAK1。在一些實施例中,相比於JAK2,化合物或鹽優先抑制JAK1 (例如JAK2/JAK1 IC50 比率>1)。在一些實施例中,化合物或鹽對JAK1之選擇性為對JAK2之選擇性的約10倍。在一些實施例中,如藉由在1 mM ATP下量測IC50 所計算,化合物或鹽對JAK1之選擇性為對JAK2之選擇性的約3倍、約5倍、約10倍、約15倍或約20倍。
在一些實施例中,JAK抑制劑為3-環戊基-3-[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]丙腈。
在一些實施例中,JAK抑制劑為(3R)-3-環戊基-3-[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]丙腈(魯索替尼;亦稱INCB018424)。
3-環戊基-3-[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]丙腈及魯索替尼可藉由2006年12月12日申請之US 7,598,257 (實例67)(其以引用之方式整體併入本文中)中所述之程序製成。
在一些實施例中,JAK抑制劑為(3R)-3-環戊基-3-[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]丙腈磷酸鹽。
在一些實施例中,JAK抑制劑為巴瑞替尼(barcitinib)、托法替尼(tofacitinib)、奧拉替尼(oclacitinib)、非戈替尼(filgotinib)、甘多替尼(gandotinib)、來他替尼(lestaurtinib)、莫莫替尼(momelotinib)、巴克瑞替尼(bacritinib)、PF-04965842、烏帕替尼(upadacitinib)、培非替尼(peficitinib)、非德替尼(fedratinib)、葫蘆素I (cucurbitacin I)、ATI-501 (Aclaris)、ATI-502 (Aclaris)、JTE052 (Leo Pharma及Japan Tobacco)或CHZ868。
在一些實施例中,JAK抑制劑可為同位素標記之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。「同位素」或「放射性標記」之化合物為其中一或多個原子經原子質量或質量數不同於在自然界中通常發現(亦即天然存在)之原子質量或質量數之原子置換或取代的本發明化合物。可併入本發明化合物中之合適放射性核素包括但不限於2 H (氘亦寫成D)、3 H (氚亦寫成T)、11 C、13 C、14 C、13 N、15 N、15 O、17 O、18 O、18 F、35 S、36 Cl、82 Br、75 Br、76 Br、77 Br、123 I、124 I、125 I及131 I。舉例而言,本發明之化合物中之一或多個氫原子可經氘原子置換(例如式(I)之C1-6 烷基之一或多個氫原子可視情況經氘原子取代,諸如-CD3 取代-CH3 )。
本文所述之化合物之一或多個組成原子可經天然或非天然豐度之原子同位素置換或取代。在一些實施例中,化合物包括至少一個氘原子。在一些實施例中,化合物包括兩個或更多個氘原子。在一些實施例中,化合物包括1-2個、1-3個、1-4個、1-5個或1-6個氘原子。在一些實施例中,化合物中之所有氫原子可經氘原子置換或取代。
用於將同位素包括於有機化合物中之合成方法為本領域中已知(Deuterium Labeling in Organic Chemistry, Alan F. Thomas (New York, N.Y., Appleton-Century-Crofts, 1971;The Renaissance of H/D Exchange, Jens Atzrodt, Volker Derdau, Thorsten Fey and Jochen Zimmermann, Angew. Chem. Int. Ed. 2007, 7744-7765;The Organic Chemistry of Isotopic Labelling, James R. Hanson, Royal Society of Chemistry, 2011)。同位素標記之化合物可用於各種研究,諸如NMR波譜學、代謝實驗及/或分析法。
經諸如氘之重同位素取代可提供由更大代謝穩定性產生的某些治療優點,例如活體內半衰期延長或劑量需求降低,由此在一些情況下可為較佳。(參見例如A. Kerekes等人 J. Med. Chem. 2011, 54, 201-210;R. Xu等人 J. Label Compd. Radiopharm. 2015, 58, 308-312)。詳言之,在一或多個代謝位點處之取代可提供一或多個治療優點。
因此,在一些實施例中,JAK抑制劑為其中化合物中之一或多個氫原子經氘原子置換之化合物,或其醫藥學上可接受之鹽。
在一些實施例中,JAK抑制劑為其中一或多個氫原子經氘原子置換之魯索替尼,或其醫藥學上可接受之鹽。在一些實施例中,JAK抑制劑為美國專利9,249,149 (其以引用之方式整體併入本文中)中之任一化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在一些實施例中,JAK抑制劑為CTP-543或其醫藥學上可接受之鹽。在一些實施例中,化合物為式I化合物:
Figure 02_image001
或其醫藥學上可接受之鹽,其中: R1 係選自H及D; 各R2 係獨立地選自H及D,條件為附接至共同碳之各R2 相同; 各R3 係獨立地選自H及D,條件為附接至共同碳之各R3 相同; R4 係選自H及D; 各R5 相同且係選自H及D;且 R6 、R7 及R8 各獨立地選自H及D;條件為當R1 為H,各R2 及各R3 為H,R4 為H,且R6 、R7 及R8 各為H時,各R5 為D。
在一些實施例中,JAK抑制劑為選自下表中之以下化合物100-130 (其中R6 、R7 及R8 各為H)之式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽。在一些實施例中,JAK抑制劑為選自下表中之以下化合物200-231 (其中R6 、R7 及R8 各為D)之式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽。
Figure 02_image002
Figure 02_image004
Figure 02_image006
在一些實施例中,JAK抑制劑為其中一或多個氫原子經氘原子置換之巴瑞克替尼,或其醫藥學上可接受之鹽。在一些實施例中,JAK抑制劑為美國專利9,540,367 (其以引用之方式整體併入本文中)中之任一化合物或其醫藥學上可接受之鹽。
在一些實施例中,JAK抑制劑為表A之化合物或其醫藥學上可接受之鹽。表A中之化合物為選擇性JAK1抑制劑(相比於JAK2、JAK3及TYK2,具選擇性)。 表A:JAK抑制劑之實例
化合物編號 製備 名稱 結構
1 US 2011/ 0224190 (實例1) {1-{1-[3-氟-2-(三氟甲基)異菸鹼醯基]哌啶-4-基}-3-[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]氮雜環丁烷-3-基}乙腈(伊他替尼;亦稱INCB039110)
Figure 02_image008
2 US 2011/ 0224190 (實例154) 4-{3-(氰基甲基)-3-[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]氮雜環丁烷-1-基}-N-[4-氟-2-(三氟甲基)苯基]哌啶-1-甲醯胺
Figure 02_image010
3 US 2011/ 0224190 (實例85) [3-[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]-1-(1-{[2-(三氟甲基)嘧啶-4-基]羰基}哌啶-4-基)氮雜環丁烷-3-基]乙腈
Figure 02_image012
4 US 2014/0343030 (實例7) 4-[3-(氰基甲基)-3-(3’,5’-二甲基-1H,1’H-4,4’-聯吡唑-1-基)氮雜環丁烷-1-基]-2,5-二氟-N-[(1S)-2,2,2-三氟-1-甲基乙基]苯甲醯胺
Figure 02_image014
5 US 2014/0121198 (實例20) ((2R,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥基乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)乙腈
Figure 02_image016
6 US 2010/ 0298334 (實例2) 3-[1-(6-氯吡啶-2-基)吡咯啶-3-基]-3-[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]丙腈
Figure 02_image018
7 US 2010/ 0298334 (實例13c) 3-(1-[1,3]噁唑并[5,4-b]吡啶-2-基吡咯啶-3-基)-3-[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]丙腈
Figure 02_image020
8 US 2011/ 0059951 (實例12) 4-[(4-{3-氰基-2-[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]丙基}哌嗪-1-基)羰基]-3-氟苯甲腈
Figure 02_image022
9 US 2011/ 0059951 (實例13) 4-[(4-{3-氰基-2-[3-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡咯-1-基]丙基}哌嗪-1-基)羰基]-3-氟苯甲腈
Figure 02_image024
10 US 2012/ 0149681 (實例7b) [反式-1-[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]-3-(4-{[2-(三氟甲基)嘧啶-4-基]羰基}哌嗪-1-基)環丁基]乙腈
Figure 02_image026
11 US 2012/ 0149681 (實例157) {反式-3-(4-{[4-[(3-羥基氮雜環丁烷-1-基)甲基]-6-(三氟甲基)吡啶-2-基]氧基}哌啶-1-基)-1-[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]環丁基}乙腈
Figure 02_image028
12 US 2012/ 0149681 (實例161) {反式-3-(4-{[4-{[(2S)-2-(羥基甲基)吡咯啶-1-基]甲基}-6-(三氟甲基)吡啶-2-基]氧基}哌啶-1-基)-1-[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]環丁基}乙腈
Figure 02_image030
13 US 2012/ 0149681 (實例162) {反式-3-(4-{[4-{[(2R)-2-(羥基甲基)吡咯啶-1-基]甲基}-6-(三氟甲基)吡啶-2-基]氧基}哌啶-1-基)-1-[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]環丁基}乙腈
Figure 02_image032
14 US 2012/ 0149682 (實例20) 4-(4-{3-[(二甲基胺基)甲基]-5-氟苯氧基}哌啶-1-基)-3-[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]丁腈
Figure 02_image034
15 US 2013/ 0018034 (實例18) 5-{3-(氰基甲基)-3-[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]氮雜環丁烷-1-基}-N-異丙基吡嗪-2-甲醯胺
Figure 02_image036
16 US 2013/ 0018034 (實例28) 4-{3-(氰基甲基)-3-[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]氮雜環丁烷-1-基}-2,5-二氟-N-[(1S)-2,2,2-三氟-1-甲基乙基]苯甲醯胺
Figure 02_image038
17 US 2013/ 0018034 (實例34) 5-{3-(氰基甲基)-3-[4-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]氮雜環丁烷-1-基}-N-異丙基吡嗪-2-甲醯胺
Figure 02_image040
18 US 2013/ 0045963 (實例45) {1-(順式-4-{[6-(2-羥基乙基)-2-(三氟甲基)嘧啶-4-基]氧基}環己基)-3-[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]氮雜環丁烷-3-基}乙腈
Figure 02_image042
19 US 2013/ 0045963 (實例65) {1-(順式-4-{[4-[(乙基胺基)甲基]-6-(三氟甲基)吡啶-2-基]氧基}環己基)-3-[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]氮雜環丁烷-3-基}乙腈
Figure 02_image044
20 US 2013/ 0045963 (實例69) {1-(順式-4-{[4-(1-羥基-1-甲基乙基)-6-(三氟甲基)吡啶-2-基]氧基}環己基)-3-[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]氮雜環丁烷-3-基}乙腈
Figure 02_image046
21 US 2013/ 0045963 (實例95) {1-(順式-4-{[4-{[(3R)-3-羥基吡咯啶-1-基]甲基}-6-(三氟甲基)吡啶-2-基]氧基}環己基)-3-[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]氮雜環丁烷-3-基}乙腈
Figure 02_image048
22 US 2013/ 0045963 (實例95) {1-(順式-4-{[4-{[(3S)-3-羥基吡咯啶-1-基]甲基}-6-(三氟甲基)吡啶-2-基]氧基}環己基)-3-[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]氮雜環丁烷-3-基}乙腈
Figure 02_image050
23 US 2014/ 0005166 (實例1) {反式-3-(4-{[4-({[(1S)-2-羥基-1-甲基乙基]胺基}甲基)-6-(三氟甲基)吡啶-2-基]氧基}哌啶-1-基)-1-[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]環丁基}乙腈
Figure 02_image052
24 US 2014/ 0005166 (實例14) {反式-3-(4-{[4-({[(2R)-2-羥基丙基]胺基}甲基)-6-(三氟甲基)吡啶-2-基]氧基}哌啶-1-基)-1-[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]環丁基}乙腈
Figure 02_image054
25 US 2014/ 0005166 (實例15) {反式-3-(4-{[4-({[(2S)-2-羥基丙基]胺基}甲基)-6-(三氟甲基)吡啶-2-基]氧基}哌啶-1-基)-1-[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]環丁基}乙腈
Figure 02_image056
26 US 2014/ 0005166 (實例20) {反式-3-(4-{[4-(2-羥基乙基)-6-(三氟甲基)吡啶-2-基]氧基}哌啶-1-基)-1-[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]環丁基}乙腈
Figure 02_image058
在一些實施例中,JAK抑制劑為{1-{1-[3-氟-2-(三氟甲基)異菸鹼醯基]哌啶-4-基}-3[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]氮雜環丁烷-3-基}乙腈或其醫藥學上可接受之鹽。
在一些實施例中,JAK抑制劑為{1-{1-[3-氟-2-(三氟甲基)異菸鹼醯基]哌啶-4-基}-3[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]氮雜環丁烷-3-基}乙腈己二酸鹽。
{1-{1-[3-氟-2-(三氟甲基)異菸鹼醯基]哌啶-4-基}-3[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]氮雜環丁烷-3-基}乙腈及其己二酸鹽之合成及製備可見於例如2011年3月9日申請之美國專利公開案第2011/0224190號、2012年9月6日申請之美國專利公開案第2013/0060026號及2014年3月5日申請之美國專利公開案第2014/0256941號中,各公開案以引用之方式整體併入本文中。
在一些實施例中,JAK抑制劑為4-[3-(氰基甲基)-3-(3’,5’-二甲基-1H,1’H-4,4’-聯吡唑-1-基)氮雜環丁烷-1-基]-2,5-二氟-N-[(1S)-2,2,2-三氟-1-甲基乙基]苯甲醯胺或其醫藥學上可接受之鹽。
在一些實施例中,JAK抑制劑為4-[3-(氰基甲基)-3-(3’,5’-二甲基-1H,1’H-4,4’-聯吡唑-1-基)氮雜環丁烷-1-基]-2,5-二氟-N-[(1S)-2,2,2-三氟-1-甲基乙基]苯甲醯胺磷酸鹽。
4-[3-(氰基甲基)-3-(3’,5’-二甲基-1H,1’H-4,4’-聯吡唑-1-基)氮雜環丁烷-1-基]-2,5-二氟-N-[(1S)-2,2,2-三氟-1-甲基乙基]苯甲醯胺及其磷酸鹽之合成及製備可見於例如2014年5月16日申請之美國專利公開案第US 2014/0343030號,該公開案以引用之方式整體併入本文中。
在一些實施例中,JAK抑制劑為((2R,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥基乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)乙腈或其醫藥學上可接受之鹽。
在一些實施例中,JAK抑制劑為((2R,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥基乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)乙腈單水合物。
((2R,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥基乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)乙腈之合成及其無水形式及單水合物形式之表徵描述於2013年10月31日申請之美國專利公開案第2014/0121198號及2015年4月29日申請之美國專利公開案第2015/0344497號中,各公開案以引用之方式整體併入本文中。
在一些實施例中,表A之化合物藉由以下中所述之合成程序製備:2011年3月9日申請之美國專利公開案第2011/0224190號、2014年5月16日申請之美國專利公開案第2014/0343030號、2013年10月31日申請之美國專利公開案第2014/0121198號、2010年5月21日申請之美國專利公開案第2010/0298334號、2010年8月31日申請之美國專利公開案第2011/0059951號、2011年11月18日申請之美國專利公開案第2012/0149681號、2011年11月18日申請之美國專利公開案第2012/0149682號、2012年6月19日申請之美國專利公開案第2013/0018034號、2012年8月17日申請之美國專利公開案第2013/0045963號及2013年5月17日申請之美國專利公開案第2014/0005166號,各公開案以引用之方式整體併入本文中。
在一些實施例中,JAK抑制劑係選自以下中之化合物或其醫藥學上可接受之鹽:2011年3月9日申請之美國專利公開案第2011/0224190號、2014年5月16日申請之美國專利公開案第2014/0343030號、2013年10月31日申請之美國專利公開案第2014/0121198號、2010年5月21日申請之美國專利公開案第2010/0298334號、2010年8月31日申請之美國專利公開案第2011/0059951號、2011年11月18日申請之美國專利公開案第2012/0149681號、2011年11月18日申請之美國專利公開案第2012/0149682號、2012年6月19日申請之美國專利公開案第2013/0018034號、2012年8月17日申請之美國專利公開案第2013/0045963號及2013年5月17日申請之美國專利公開案第2014/0005166號,各公開案以引用之方式整體併入本文中。 治療方法
本文揭示之方法能夠評定患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之個體是否正對JAK抑制劑作出反應或可能對JAK抑制劑作出反應(例如如疾病嚴重度降低及/或疾病症狀緩解/消退所證明,疾病可能更大程度改善。可向患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之可能對JAK抑制劑作出反應的個體投與JAK抑制劑(例如魯索替尼)。相反地,可向患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之不太可能對JAK抑制劑(例如魯索替尼)作出反應的個體投與適合於治療白斑病之額外療法。
本發明之方法亦能夠將患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之個體分層,分成更可能受益於包含JAK抑制劑之治療的個體組及不太可能受益於包含JAK抑制劑之治療的個體組。自大量正在考慮用JAK抑制劑治療之白斑病個體選擇此類個體的能力有益於向個體投與有效治療。
在一個實施例中,有待用JAK抑制劑(例如魯索替尼)治療之個體患有、疑似患有或可能顯現白斑病。在某些實施例中,有待用JAK抑制劑(例如魯索替尼)治療之個體患有、疑似患有或可能顯現非節段型白斑病。在其他實施例中,有待用JAK抑制劑(例如魯索替尼)治療之個體患有、疑似患有或可能顯現節段型白斑病。
若患有白斑病之個體更可能對JAK抑制劑作出反應,則可向個體投與有效量之JAK抑制劑(例如魯索替尼)。可適當地藉由保健醫師考慮例如患者之特徵(年齡、性別、體重、種族等)、疾病之進展及先前藥物暴露來確定JAK抑制劑之有效量。若個體不太能夠對JAK抑制劑作出反應,則可視情況向個體投與不包含JAK抑制劑之療法。
該等方法亦可施加於處於顯現白斑病之風險下之個體。
在基於個體更可能還是不太可能對JAK抑制劑作出反應對個體進行分層或選擇之後,開業醫生(例如醫生)可向個體投與適當治療模式。投與JAK抑制劑之方法為所屬領域中所熟知。
若先前已向患有白斑病且預測對JAK抑制劑作出反應之個體投與一或多種非JAK抑制劑療法,則JAK抑制劑可替換或加強先前或當前投與之療法。舉例而言,在用JAK抑制劑治療之後,可停止或減少,例如以較低水準投與該一或多種非JAK抑制劑療法。可維持先前療法之投與,同時投與JAK抑制劑。在一些實施例中,可維持先前療法,直至JAK抑制劑之水準達到足夠提供治療作用之水準。
根據本文所述之方法用JAK抑制劑(例如魯索替尼)治療之個體可聯合一或多種有效治療白斑病之額外組合物治療。可用於此類組合治療中之組合物之實例包括皮質類固醇(例如甲基潑尼松龍(methylprednisolone)或潑尼松(prednisone))、鈣調神經蛋白(alcineurin)抑制劑、維生素D類似物、假過氧化氫酶、脫色劑、他克莫司(tacrolimus)、吡美莫司(pimecrolimus)、氧化補骨脂素(oxsoralen)、補骨脂素、凱林(khellin)。
以下為本發明實施之實例。不應將其視為以任何方式限制本發明之範疇。實例 實例1:用魯索替尼治療之患有白斑病之個體中的人類血清CXCL9、CXCL10及IFN-γ水準
研究個體經臨床診斷患有白斑病,其中使用手掌(或手紋)法(手掌加5個手指),面部脫色區域佔總體表面積之至少0.5%,且受影響之非面部區域佔總體表面積之至少3%。
在134名白斑病個體之血清中評估在基線(在治療之前)以及在用以下五種方案中之一者局部治療之後12及24週的CXCL9、CXCL10及IFN-γ之水準:魯索替尼乳膏0.15% QD (每天一次)、魯索替尼乳膏0.5% QD (每天一次)、魯索替尼乳膏1.5% QD (每天一次)、魯索替尼乳膏1.5% BID (每天兩次)及媒劑BID (每天兩次)。各種治療中之「%」係指魯索替尼佔乳膏總重量之百分比。
將血清自每名個體收集於8.5 mL血清分離管(SST)中。在收集之後立即將SST顛倒5次以使凝血活化劑與血液混合。使血液在豎直位置在室溫下凝固30分鐘。接著對於擺動頭裝置,在室溫(大約25℃)下將SST在1100與1300×g之間離心10分鐘,或對於固定角度裝置,離心15分鐘。自SST收集血清,接著冷凍等分試樣,且儲存在-70℃下,直至測試。
在每名個體之血清中,使用Simple Plex濾筒套組(目錄號SPCKC-PS-002038;Protein Simple-Biotechne, San Jose, CA)根據製造商之準則量測CXCL9、CXCL10及IFN-γ蛋白質濃度。樣品一式兩份測試且表示為各個體之重複測試之平均值。使用Graph Pad Prism (San Diego, CA)進行統計分析。數據呈現為平均值±標準誤差。媒劑與每個處理組之間的統計差異使用曼恩-惠特尼檢驗(Mann-Whitney test)來評估。具體而言,計算研究之各處理組內之個別個體的CXCL9、CXCL10及IFN-γ之基線水準,且與經媒劑處理之個體相比,求得統計學差異。計算各個體之CXCL9、CXCL10及IFN-γ水準自基線之變化百分比且接著求各組之平均值。藉由使用非參數曼恩-惠特尼檢驗比較各處理組與媒劑,來確定自基線之變化百分比的統計學差異。
在此研究中測試之134名個體的基線CXCL9濃度在151.7至13,016 pg/mL之範圍內,中位濃度為479.3 pg/mL。在處理組之間未觀察到基線CXCL9濃度之統計學顯著差異。
各處理組之CXCL9水準自基線至第24週之平均變化百分比展示於圖1中。大部分個體之CXCL9水準在各處理組之既定範圍內;然而,媒劑(n = 1)、0.15% QD (n=1)、0.5% QD (n=1)、1.5% QD及1.5% BID (n = 1)組中存在離群值。儘管存在此等離群值,但與媒劑相比,魯索替尼乳膏1.5% BID塗覆24週顯著(p < 0.05)降低循環中之CXCL9水準(圖1)。移除離群值未引起所觀察到之顯著性的任何變化。另外,當比較CXCL9水準之變化的方向性時,看到在基線與第24週之間17/24 (71%)魯索替尼乳膏1.5% QD及24/30 (80%)魯索替尼乳膏1.5% BID中循環CXCL9水準降低。作為比較,僅僅13/26 (50%)經媒劑處理之個體、15/26 (58%)經魯索替尼乳膏0.15% QD處理之個體及10/28 (36%)經魯索替尼乳膏0.5% QD處理之個體以類似方式移動。
在此研究中測試之134名個體的基線CXCL10濃度在56.5至507.3 pg/mL之範圍內,中位濃度為145.6 pg/mL。在處理組之間未觀察到基線CXCL10濃度之統計學顯著差異。
各處理組之CXCL10水準自基線至第24週之平均變化百分比展示於圖2中。大部分個體之CXCL10水準在各處理組之既定範圍內;然而,魯索替尼乳膏1.5% QD (n = 2)組中存在離群值。儘管存在此等離群值,但與媒劑相比,魯索替尼乳膏1.5% QD或BID塗覆24週顯著(p < 0.05)降低循環中之CXCL10水準(圖2)。移除離群值未引起所觀察到之顯著性的任何變化。另外,當比較CXCL10水準之變化的方向性時,看到在基線與第24週之間20/24 (83%)魯索替尼乳膏1.5% QD及23/30 (77%)魯索替尼乳膏1.5% BID處理組中循環CXCL10水準降低。作為比較,僅僅13/26 (50%)經媒劑處理之個體、15/26 (58%)經魯索替尼乳膏0.15% QD處理之個體及15/28 (54%)經魯索替尼乳膏0.5% QD處理之個體以類似方式移動。
自基線至第24週血清CXCL9及CXCL10水準之變化描繪於表B中,反映在絕對值及變化百分比上。 B :自基線至第 24 週血清 CXCL9 CXCL10 水準之變化
CXCL9 基線 24
治療臂 絕對值 平均值pg/mL ± SEM 最小值 (pg/mL) 最大值 (pg/mL) 絕對值 平均值pg/mL ± SEM 最小值 (pg/mL) 最大值 (pg/mL) 自基線之變化% 平均值± SEM
媒劑 633.7 ± 78.3 183.9 2034.7 655.8 ± 80.9 157.9 2093.9 6.12 ± 6.4
0.15% QD 708.6 ± 210.7 249.2 5890.4 469.2 ± 33.4 160.9 904.6 -5.80 ± 6.7
0.5% QD 1009.7 ± 449.1 214.6 13016.0 760.5 ± 209.3 158.1 6070.5 12.44 ± 10.3
1.5% QD 519.8 ± 84.1 151.7 2334.3 422.2 ± 44.0 125.3 1073.8 -4.26 ± 10.6
1.5% BID 767.0 ± 144.6 247.7 4616.8 655.4 ± 137.1 148.5 3443.9 -18.17 ± 5.8
CXCL10 基線 24
治療臂 絕對值 平均值pg/mL ± SEM 最小值 (pg/mL) 最大值 (pg/mL) 絕對值 平均值pg/mL ± SEM 最小值 (pg/mL) 最大值 (pg/mL) 自基線之變化% 平均值± SEM
媒劑 177.6 ± 15.1 80.9 408.2 177.4 ± 15.4 56.6 380.2 0.39 ± 3.6
0.15% QD 152.0 ± 11.8 78.9 323.0 135.8 ± 9.1 56.2 232.3 -5.64 ± 5.2
0.5% QD 181.3 ± 18.0 79.0 507.3 162.4 ± 12.7 80.3 381.8 -2.53 ± 5.6
1.5% QD 149.4 ± 16.5 73.1 405.6 119.6 ± 15.7 49.5 446.1 -15.49 ± 6.7
1.5% BID 177.0 ± 12.7 56.5 361.3 138.3 ± 13.9 54.0 340.7 -19.74 ± 6.6
137名個體中之16名的基線IFN-γ濃度超過偵測下限。該16名個體之基線水準在1.14至5.07 pg/mL範圍內,中位濃度為1.78 pg/mL。在處理組之間未觀察到基線IFN-γ濃度之統計學顯著差異。各處理組之IFN-γ水準自基線至第12週及第24週之平均變化百分比展示於表C中。未觀察到各組之間IFN-γ之變化百分比的顯著差異。 C :自基線至第 12 週及第 24 週血清 IFN-γ 水準之平均變化百分比
處理組 個體數目 自基線至第 12 週血清 IFN-γ 水準之變化 % a 自基線至第 24 週血清 IFN-γ 水準之變化 % a
媒劑 3 -44.8 ± 22.8 -35.2 ± 14.5
0.15% QD 3 6.8 ± 17.4 -8.6 ± 7.2
0.5% QD 2 -58.3 ± 41.7 -44.9 ± 55.1
1.5% QD 3 -23.3 ± 31.7 -49.9 ± 17.9
1.5% BID 5 -20.5 ± 20.5 -10.7 ± 26.8
a 資料呈現為平均值±標準誤差 實例2:在用魯索替尼治療之白斑病患者中顯著調節之蛋白質的鑑定
自加入實例1中所述之研究的個體收集血清樣品。一旦收集,即使用OLINK™對血清樣品進行廣泛蛋白質組學概況分析,OLINK™允許分析超過1000種蛋白質。基於用局部魯索替尼之處理組,將樣品分成各組。血清之廣泛蛋白質組學分析可鑑定各組內自基線至第12週及/或第24週顯著調節之蛋白質。參見表1A至7B。下調蛋白質為表現隨時間減少之蛋白質,而上調蛋白質為表現隨時間增加之蛋白質。展示各蛋白質之表現變化倍數,其為處理後之蛋白質表現水準(第12週或第24週)與處理前之表現水準(基線)的比率。值超過1指示自基線增加,而值小於1指示自基線減少。 1A :媒劑中第 12 週顯著調節之蛋白質
處理 分析 p值 變化倍數
12 週顯著下調之蛋白質
媒劑BID 12 GLB1 0.026 0.82
媒劑BID 12 CD63 0.007 0.87
媒劑BID 12 SERPINA12 0.044 0.87
媒劑BID 12 WISP-1 0.010 0.89
媒劑BID 12 CTSV 0.011 0.90
媒劑BID 12 SERPINA5 0.038 0.92
媒劑BID 12 ITGAV 0.026 0.92
媒劑BID 12 CRIM1 0.041 0.93
媒劑BID 12 HSD11B1 0.033 0.93
媒劑BID 12 FGF-BP1 0.020 0.93
媒劑BID 12 DPP10 0.049 0.94
媒劑BID 12 LEPR 0.022 0.95
媒劑BID 12 Siglec-9 0.041 0.96
12 週顯著上調之蛋白質
媒劑BID 12 TNFSF13B 0.024 1.05
媒劑BID 12 RAGE 0.041 1.06
媒劑BID 12 CDHR5 0.050 1.06
媒劑BID 12 Gal-9 0.014 1.07
媒劑BID 12 AMN 0.034 1.07
媒劑BID 12 PDGFC 0.019 1.07
媒劑BID 12 TRAIL 0.034 1.09
媒劑BID 12 MAX 0.011 1.09
媒劑BID 12 FAM19A5 0.024 1.09
媒劑BID 12 CST6 0.004 1.10
媒劑BID 12 IL18 0.035 1.10
媒劑BID 12 TYMP 0.050 1.11
媒劑BID 12 CDSN 0.013 1.13
媒劑BID 12 MMP-10 0.029 1.14
媒劑BID 12 CALCA 0.020 1.16
媒劑BID 12 MB 0.045 1.19
1B :第 24 週媒劑中顯著調節之蛋白質
TRT01A 分析 wk24probt Wk24FC
24 週顯著下調之蛋白質
媒劑BID 24 TANK 0.005 0.74
媒劑BID 24 LAG3 0.025 0.93
媒劑BID 24 LEPR 0.011 0.94
24 週顯著上調之蛋白質
媒劑BID 24 MAX 0.021 1.05
媒劑BID 24 CSF-1 0.024 1.05
媒劑BID 24 TRAIL 0.013 1.06
媒劑BID 24 TNFRSF9 0.026 1.06
媒劑BID 24 CD5 0.024 1.06
媒劑BID 24 FSTL3 0.042 1.06
媒劑BID 24 MRC2 0.021 1.06
媒劑BID 24 TNFSF13B 0.018 1.06
媒劑BID 24 PILRB 0.049 1.06
媒劑BID 24 OPG 0.042 1.07
媒劑BID 24 CD163 0.035 1.07
媒劑BID 24 LRP11 0.048 1.07
媒劑BID 24 CRHBP 0.045 1.07
媒劑BID 24 LAIR1 0.016 1.07
媒劑BID 24 VEGFA 0.027 1.07
媒劑BID 24 SIGLEC10 0.004 1.07
媒劑BID 24 TNF-R1 0.024 1.08
媒劑BID 24 PTN 0.046 1.08
媒劑BID 24 IGSF3 0.020 1.08
媒劑BID 24 MFGE8 0.010 1.08
媒劑BID 24 MATN2 0.005 1.08
媒劑BID 24 CCL25 0.039 1.09
媒劑BID 24 TXNDC5 0.020 1.09
媒劑BID 24 CST6 0.029 1.09
媒劑BID 24 CLSTN2 0.020 1.09
媒劑BID 24 NECTIN2 0.009 1.10
媒劑BID 24 SCGB3A2 0.020 1.10
媒劑BID 24 IL18 0.016 1.10
媒劑BID 24 SEZ6L2 0.008 1.10
媒劑BID 24 FAM19A5 0.036 1.11
媒劑BID 24 MESDC2 0.044 1.11
媒劑BID 24 SUMF2 0.014 1.11
媒劑BID 24 IL10 0.013 1.12
媒劑BID 24 PPP1R2 0.045 1.12
媒劑BID 24 DAPP1 0.033 1.12
媒劑BID 24 DDAH1 0.025 1.12
媒劑BID 24 CDSN 0.016 1.13
媒劑BID 24 FLI1 0.031 1.13
媒劑BID 24 REG4 0.026 1.14
媒劑BID 24 DDC 0.006 1.15
媒劑BID 24 PARK7 0.040 1.15
媒劑BID 24 ICA1 0.024 1.17
媒劑BID 24 LEP 0.006 1.17
媒劑BID 24 ERBB2IP 0.047 1.18
媒劑BID 24 BCR 0.008 1.19
媒劑BID 24 INPPL1 0.016 1.20
媒劑BID 24 AGR2 0.046 1.21
媒劑BID 24 PEBP1 0.030 1.21
媒劑BID 24 MAP4K5 0.037 1.23
媒劑BID 24 Ep-CAM 0.031 1.27
媒劑BID 24 SIRT2 0.029 1.29
媒劑BID 24 GCG 0.017 1.34
媒劑BID 24 TSHB 0.031 1.42
2A :第 12 0.15% 魯索替尼 QD 中顯著調節之蛋白質
處理 分析 p值 變化倍數
12 週顯著下調之蛋白質
INCB018424 0.15% QD 12 BANK1 0.010 0.61
INCB018424 0.15% QD 12 AXIN1 0.005 0.68
INCB018424 0.15% QD 12 EREG 0.046 0.69
INCB018424 0.15% QD 12 ST1A1 0.034 0.70
INCB018424 0.15% QD 12 FATC1 0.022 0.72
INCB018424 0.15% QD 12 INPPL1 0.019 0.75
INCB018424 0.15% QD 12 NEMO 0.047 0.76
INCB018424 0.15% QD 12 TANK 0.035 0.77
INCB018424 0.15% QD 12 CDKN1A 0.043 0.79
INCB018424 0.15% QD 12 PPP1R9B 0.015 0.79
INCB018424 0.15% QD 12 ZBTB16 0.037 0.80
INCB018424 0.15% QD 12 TXLNA 0.030 0.81
INCB018424 0.15% QD 12 MGMT 0.022 0.82
INCB018424 0.15% QD 12 BCR 0.044 0.83
INCB018424 0.15% QD 12 GRAP2 0.036 0.83
INCB018424 0.15% QD 12 WWP2 0.030 0.85
INCB018424 0.15% QD 12 G-CSF 0.030 0.85
INCB018424 0.15% QD 12 ANXA10 0.037 0.85
INCB018424 0.15% QD 12 STX6 0.011 0.86
INCB018424 0.15% QD 12 CRX 0.044 0.86
INCB018424 0.15% QD 12 IL-20 0.012 0.88
INCB018424 0.15% QD 12 WASF1 0.016 0.89
INCB018424 0.15% QD 12 NTF4 0.037 0.90
INCB018424 0.15% QD 12 IL13 0.022 0.90
INCB018424 0.15% QD 12 NCR1 0.025 0.91
INCB018424 0.15% QD 12 IL-10RA 0.014 0.91
INCB018424 0.15% QD 12 HTRA2 0.023 0.91
INCB018424 0.15% QD 12 CTRC 0.028 0.92
INCB018424 0.15% QD 12 DDAH1 0.035 0.93
INCB018424 0.15% QD 12 PLXNB2 0.016 0.94
INCB018424 0.15% QD 12 IL1RL2 0.034 0.94
INCB018424 0.15% QD 12 CLEC4G 0.040 0.94
INCB018424 0.15% QD 12 IL-17D 0.013 0.94
INCB018424 0.15% QD 12 CFC1 0.041 0.95
INCB018424 0.15% QD 12 FKBP7 0.049 0.95
INCB018424 0.15% QD 12 COL18A1 0.036 0.95
INCB018424 0.15% QD 12 CCL14 0.040 0.95
INCB018424 0.15% QD 12 LILRB1 0.029 0.95
INCB018424 0.15% QD 12 OSMR 0.044 0.96
INCB018424 0.15% QD 12 AMBP 0.049 0.97
12 週顯著上調之蛋白質
INCB018424 0.15% QD 12 Gal-1 0.037 1.05
INCB018424 0.15% QD 12 CLSPN 0.047 1.06
INCB018424 0.15% QD 12 CPE 0.049 1.06
INCB018424 0.15% QD 12 PVRL4 0.018 1.06
INCB018424 0.15% QD 12 ACP6 0.049 1.06
INCB018424 0.15% QD 12 FR-α 0.031 1.06
INCB018424 0.15% QD 12 hK11 0.008 1.07
INCB018424 0.15% QD 12 ITGB5 0.017 1.08
INCB018424 0.15% QD 12 FURIN 0.031 1.08
INCB018424 0.15% QD 12 hK8 0.014 1.09
INCB018424 0.15% QD 12 CLSTN2 0.023 1.10
INCB018424 0.15% QD 12 hK14 0.011 1.10
INCB018424 0.15% QD 12 CXL17 0.020 1.11
INCB018424 0.15% QD 12 TFPI-2 0.019 1.11
INCB018424 0.15% QD 12 TNFRSF12A 0.019 1.13
INCB018424 0.15% QD 12 MYOC 0.028 1.13
INCB018424 0.15% QD 12 ESM-1 0.008 1.13
2B :第 24 0.15% 魯索替尼 QD 中顯著調節之蛋白質
處理 分析 p值 變化倍數
24 週顯著下調之蛋白質
INCB018424 0.15% QD 24 PPY 0.033 0.71
INCB018424 0.15% QD 24 TANK 0.043 0.76
INCB018424 0.15% QD 24 ANXA10 0.029 0.82
INCB018424 0.15% QD 24 PRTFDC1 0.021 0.90
INCB018424 0.15% QD 24 CDH17 0.021 0.91
INCB018424 0.15% QD 24 FKBP7 0.031 0.92
INCB018424 0.15% QD 24 STXBP3 0.044 0.93
INCB018424 0.15% QD 24 CFC1 0.016 0.93
INCB018424 0.15% QD 24 SMOC1 0.045 0.94
INCB018424 0.15% QD 24 PRDX3 0.037 0.95
24 週顯著上調之蛋白質
INCB018424 0.15% QD 24 ACP6 0.037 1.06
INCB018424 0.15% QD 24 PRSS8 0.030 1.06
INCB018424 0.15% QD 24 CDCP1 0.032 1.08
INCB018424 0.15% QD 24 CSTB 0.025 1.08
INCB018424 0.15% QD 24 SH2D1A 0.028 1.09
INCB018424 0.15% QD 24 FGF-BP1 0.005 1.10
INCB018424 0.15% QD 24 TFPI-2 0.026 1.10
INCB018424 0.15% QD 24 HNMT 0.008 1.11
INCB018424 0.15% QD 24 MSLN 0.015 1.12
INCB018424 0.15% QD 24 SERPINA9 0.020 1.12
INCB018424 0.15% QD 24 t-PA 0.033 1.13
INCB018424 0.15% QD 24 FABP4 0.028 1.13
INCB018424 0.15% QD 24 PTN 0.018 1.14
INCB018424 0.15% QD 24 CGA 0.045 1.19
INCB018424 0.15% QD 24 MAGED1 0.014 1.24
INCB018424 0.15% QD 24 IGFBP-1 0.047 1.34
INCB018424 0.15% QD 24 FGF-21 0.032 1.42
INCB018424 0.15% QD 24 FGF-21 0.024 1.44
3A :第 12 0.5% 魯索替尼 QD 中顯著調節之蛋白質
處理 分析 p值 變化倍數
12 週顯著下調之蛋白質
INCB018424 0.5% QD 12 CA2 0.043 0.78
INCB018424 0.5% QD 12 GLO1 0.016 0.82
INCB018424 0.5% QD 12 CASP-8 0.010 0.84
INCB018424 0.5% QD 12 AARSD1 0.041 0.85
INCB018424 0.5% QD 12 ATG4A 0.041 0.85
INCB018424 0.5% QD 12 MMP12 0.017 0.85
INCB018424 0.5% QD 12 TRANCE 0.038 0.87
INCB018424 0.5% QD 12 FGF-23 0.019 0.88
INCB018424 0.5% QD 12 DFFA 0.040 0.88
INCB018424 0.5% QD 12 KLRD1 0.003 0.88
INCB018424 0.5% QD 12 BACH1 0.029 0.89
INCB018424 0.5% QD 12 BLVRB 0.028 0.89
INCB018424 0.5% QD 12 IL2-RA 0.003 0.89
INCB018424 0.5% QD 12 PAPPA 0.023 0.89
INCB018424 0.5% QD 12 IL16 0.036 0.90
INCB018424 0.5% QD 12 XCL1 0.020 0.90
INCB018424 0.5% QD 12 DRAXIN 0.035 0.90
INCB018424 0.5% QD 12 DCTN2 0.023 0.90
INCB018424 0.5% QD 12 MAEA 0.008 0.90
INCB018424 0.5% QD 12 FCRL6 <<0.00011 0.91
INCB018424 0.5% QD 12 FES 0.045 0.91
INCB018424 0.5% QD 12 NCR1 0.016 0.91
INCB018424 0.5% QD 12 FASLG 0.011 0.91
INCB018424 0.5% QD 12 IL-18BP 0.046 0.92
INCB018424 0.5% QD 12 NFKBIE 0.014 0.92
INCB018424 0.5% QD 12 ZBTB17 0.050 0.92
INCB018424 0.5% QD 12 SRPK2 0.033 0.93
INCB018424 0.5% QD 12 IGFBP-2 0.037 0.93
INCB018424 0.5% QD 12 GRN 0.028 0.93
INCB018424 0.5% QD 12 TNFSF13B 0.038 0.93
INCB018424 0.5% QD 12 BOC 0.050 0.95
12 週顯著上調之蛋白質
INCB018424 0.5% QD 12 IL15 0.023 1.05
INCB018424 0.5% QD 12 VAMP5 0.027 1.06
INCB018424 0.5% QD 12 PRSS8 0.015 1.06
INCB018424 0.5% QD 12 PCOLCE 0.028 1.07
INCB018424 0.5% QD 12 CD300LG 0.038 1.07
INCB018424 0.5% QD 12 SMOC1 0.027 1.08
INCB018424 0.5% QD 12 CTSF 0.049 1.09
INCB018424 0.5% QD 12 PCSK9 0.040 1.09
INCB018424 0.5% QD 12 LPL 0.041 1.10
INCB018424 0.5% QD 12 RSPO3 0.023 1.10
INCB018424 0.5% QD 12 SUMF2 0.031 1.10
INCB018424 0.5% QD 12 NT-3 0.006 1.11
INCB018424 0.5% QD 12 CST6 0.010 1.12
INCB018424 0.5% QD 12 PTN 0.005 1.13
INCB018424 0.5% QD 12 SERPINA9 0.002 1.13
INCB018424 0.5% QD 12 IL6 0.025 1.14
INCB018424 0.5% QD 12 CHI3L1 0.045 1.15
INCB018424 0.5% QD 12 SFRP1 0.003 1.23
INCB018424 0.5% QD 12 CES1 0.021 1.27
3B :第 24 0.5% 魯索替尼 QD 中顯著調節之蛋白質
處理 分析 p值 變化倍數
24 週顯著下調之蛋白質
INCB018424 0.5% QD 24 BMP-6 0.009 0.80
INCB018424 0.5% QD 24 GHRL 0.024 0.80
INCB018424 0.5% QD 24 TNFRSF6B 0.007 0.81
INCB018424 0.5% QD 24 DAPP1 0.006 0.82
INCB018424 0.5% QD 24 BCL2L11 0.003 0.83
INCB018424 0.5% QD 24 SPINT2 0.021 0.84
INCB018424 0.5% QD 24 CRH 0.027 0.87
INCB018424 0.5% QD 24 DRAXIN 0.026 0.88
INCB018424 0.5% QD 24 OPN 0.004 0.89
INCB018424 0.5% QD 24 RASA1 0.013 0.89
INCB018424 0.5% QD 24 MMP-3 0.044 0.90
INCB018424 0.5% QD 24 CLSTN2 0.017 0.90
INCB018424 0.5% QD 24 CD8A 0.047 0.91
INCB018424 0.5% QD 24 PDGFC 0.011 0.91
INCB018424 0.5% QD 24 IL2-RA 0.017 0.92
INCB018424 0.5% QD 24 NCR1 0.015 0.92
INCB018424 0.5% QD 24 FLI1 0.046 0.93
INCB018424 0.5% QD 24 FCRL6 0.042 0.93
INCB018424 0.5% QD 24 BOC 0.035 0.94
INCB018424 0.5% QD 24 LYPD1 0.031 0.94
24 週顯著上調之蛋白質
INCB018424 0.5% QD 24 QPCT 0.027 1.04
INCB018424 0.5% QD 24 ITGAV 0.033 1.04
INCB018424 0.5% QD 24 DPEP1 0.039 1.05
INCB018424 0.5% QD 24 FGFR2 0.040 1.05
INCB018424 0.5% QD 24 NCAM1 0.050 1.05
INCB018424 0.5% QD 24 ERBB4 0.037 1.06
INCB018424 0.5% QD 24 IGF1R 0.045 1.06
INCB018424 0.5% QD 24 DPP4 0.026 1.06
INCB018424 0.5% QD 24 TRAIL-R2 0.030 1.06
INCB018424 0.5% QD 24 PAM 0.016 1.06
INCB018424 0.5% QD 24 PEAR1 0.046 1.07
INCB018424 0.5% QD 24 ITGB5 0.015 1.07
INCB018424 0.5% QD 24 SIRPB1 0.034 1.07
INCB018424 0.5% QD 24 CCL16 0.033 1.07
INCB018424 0.5% QD 24 ASGR1 0.038 1.07
INCB018424 0.5% QD 24 CR2 0.042 1.07
INCB018424 0.5% QD 24 CCL14 0.016 1.07
INCB018424 0.5% QD 24 ICOSLG 0.044 1.07
INCB018424 0.5% QD 24 TNFRSF19 0.042 1.08
INCB018424 0.5% QD 24 Gal-4 0.042 1.08
INCB018424 0.5% QD 24 PLC 0.024 1.08
INCB018424 0.5% QD 24 CRTAC1 0.015 1.09
INCB018424 0.5% QD 24 RELT 0.032 1.09
INCB018424 0.5% QD 24 RNF31 0.038 1.09
INCB018424 0.5% QD 24 CD59 0.035 1.09
INCB018424 0.5% QD 24 VEGFA 0.046 1.10
INCB018424 0.5% QD 24 CTSF 0.037 1.10
INCB018424 0.5% QD 24 FCGR3B 0.008 1.10
INCB018424 0.5% QD 24 IGFBP6 0.013 1.10
INCB018424 0.5% QD 24 TGFBI 0.018 1.10
INCB018424 0.5% QD 24 MMP7 0.001 1.11
INCB018424 0.5% QD 24 CD300LG 0.029 1.11
INCB018424 0.5% QD 24 COCH 0.037 1.11
INCB018424 0.5% QD 24 SCGB1A1 0.005 1.12
INCB018424 0.5% QD 24 SCGB3A2 0.018 1.12
INCB018424 0.5% QD 24 SCGB3A1 0.001 1.12
INCB018424 0.5% QD 24 EPHA10 0.037 1.12
INCB018424 0.5% QD 24 TFPI-2 0.041 1.13
INCB018424 0.5% QD 24 ECE1 0.014 1.13
INCB018424 0.5% QD 24 MUC-16 0.031 1.14
INCB018424 0.5% QD 24 SERPINA5 <<0.00011 1.16
INCB018424 0.5% QD 24 PTN 0.043 1.16
INCB018424 0.5% QD 24 TP53 0.029 1.17
INCB018424 0.5% QD 24 CHI3L1 0.022 1.17
INCB018424 0.5% QD 24 ITGAM 0.014 1.17
INCB018424 0.5% QD 24 NRP2 0.035 1.20
INCB018424 0.5% QD 24 SNCG 0.006 1.21
INCB018424 0.5% QD 24 LEP 0.040 1.24
INCB018424 0.5% QD 24 FGF-21 0.003 1.31
INCB018424 0.5% QD 24 FGF-21 0.004 1.33
INCB018424 0.5% QD 24 FGF-21 0.002 1.40
4A :第 12 1.5% 魯索替尼 QD 中顯著調節之蛋白質
處理 分析 p值 變化倍數
12 週顯著下調之蛋白質
INCB018424 1.5% QD 12 CCL19 <.0001 0.73
INCB018424 1.5% QD 12 NCR1 <.0001 0.79
INCB018424 1.5% QD 12 LAIR-2 <.0001 0.79
INCB018424 1.5% QD 12 FASLG <.0001 0.83
INCB018424 1.5% QD 12 TNFRSF9 <.0001 0.84
INCB018424 1.5% QD 12 CRTAM <.0001 0.85
INCB018424 1.5% QD 12 CD6 <.0001 0.86
INCB018424 1.5% QD 12 DEFB4A 0.032 0.72
INCB018424 1.5% QD 12 IGFBP-1 0.028 0.74
INCB018424 1.5% QD 12 CXCL10 <<0.00011 0.74
INCB018424 1.5% QD 12 GZMH 0.001 0.80
INCB018424 1.5% QD 12 FS 0.011 0.80
INCB018424 1.5% QD 12 KIR2DL3 0.025 0.81
INCB018424 1.5% QD 12 GZMB 0.005 0.82
INCB018424 1.5% QD 12 IFNL1 0.001 0.82
INCB018424 1.5% QD 12 DRAXIN 0.018 0.83
INCB018424 1.5% QD 12 SH2D1A 0.007 0.84
INCB018424 1.5% QD 12 IL-12B <0.0001 0.84
INCB018424 1.5% QD 12 CXCL11 0.041 0.85
INCB018424 1.5% QD 12 KLRD1 <0.0001 0.85
INCB018424 1.5% QD 12 CD160 <0.0001 0.85
INCB018424 1.5% QD 12 GZMA <0.0001 0.86
INCB018424 1.5% QD 12 FCRL6 0.001 0.86
INCB018424 1.5% QD 12 MCP-4 0.027 0.86
INCB018424 1.5% QD 12 IL12 0.001 0.87
INCB018424 1.5% QD 12 XCL1 0.011 0.87
INCB018424 1.5% QD 12 ANGPTL4 0.027 0.87
INCB018424 1.5% QD 12 CCL21 0.001 0.87
INCB018424 1.5% QD 12 IL6 0.026 0.87
INCB018424 1.5% QD 12 MMP12 0.003 0.87
INCB018424 1.5% QD 12 TYMP 0.005 0.87
INCB018424 1.5% QD 12 CD5 <0.0001 0.88
INCB018424 1.5% QD 12 CCL18 0.018 0.88
INCB018424 1.5% QD 12 ITGB2 <0.0001 0.88
INCB018424 1.5% QD 12 TNFB 0.008 0.89
INCB018424 1.5% QD 12 CD8A 0.018 0.89
INCB018424 1.5% QD 12 ARTN 0.015 0.89
INCB018424 1.5% QD 12 SIGLEC1 0.004 0.90
INCB018424 1.5% QD 12 IL-15RA 0.034 0.90
INCB018424 1.5% QD 12 CD163 <0.0001 0.90
INCB018424 1.5% QD 12 SLAMF1 0.049 0.90
INCB018424 1.5% QD 12 RETN 0.006 0.90
INCB018424 1.5% QD 12 TNFSF13B 0.005 0.91
INCB018424 1.5% QD 12 CLEC6A 0.036 0.91
INCB018424 1.5% QD 12 PAPPA 0.036 0.91
INCB018424 1.5% QD 12 CLEC10A 0.002 0.91
INCB018424 1.5% QD 12 SELE 0.017 0.92
INCB018424 1.5% QD 12 ADAM 8 0.012 0.92
INCB018424 1.5% QD 12 GDF-15 0.025 0.92
INCB018424 1.5% QD 12 IL-1RT1 0.007 0.92
INCB018424 1.5% QD 12 CD244 0.015 0.92
INCB018424 1.5% QD 12 CLM-1 0.009 0.93
INCB018424 1.5% QD 12 DSC2 0.006 0.93
INCB018424 1.5% QD 12 FOLR2 0.001 0.93
INCB018424 1.5% QD 12 TNF-R2 0.019 0.93
INCB018424 1.5% QD 12 LIF-R 0.014 0.93
INCB018424 1.5% QD 12 IL12RB1 0.017 0.93
INCB018424 1.5% QD 12 CDH3 0.032 0.93
INCB018424 1.5% QD 12 CLEC4G 0.020 0.93
INCB018424 1.5% QD 12 CD79B 0.037 0.93
INCB018424 1.5% QD 12 IL-18BP 0.028 0.93
INCB018424 1.5% QD 12 GM-CSF-R-α 0.026 0.94
INCB018424 1.5% QD 12 CD1C 0.005 0.94
INCB018424 1.5% QD 12 ST2 0.034 0.94
INCB018424 1.5% QD 12 MSR1 0.015 0.94
INCB018424 1.5% QD 12 PDCD1 0.022 0.94
INCB018424 1.5% QD 12 CSF-1 0.046 0.94
INCB018424 1.5% QD 12 FcRL2 0.016 0.94
INCB018424 1.5% QD 12 LY9 0.032 0.95
INCB018424 1.5% QD 12 CD27 0.026 0.95
INCB018424 1.5% QD 12 CD48 0.024 0.95
INCB018424 1.5% QD 12 CD200R1 0.013 0.95
INCB018424 1.5% QD 12 hOSCAR 0.030 0.96
12 週顯著上調之蛋白質
INCB018424 1.5% QD 12 CD300LG <.0001 1.10
INCB018424 1.5% QD 12 hK11 <.0001 1.11
INCB018424 1.5% QD 12 IL15 <.0001 1.12
INCB018424 1.5% QD 12 KLK10 <.0001 1.12
INCB018424 1.5% QD 12 FGF-BP1 <.0001 1.23
INCB018424 1.5% QD 12 MYOC <.0001 1.29
INCB018424 1.5% QD 12 GPNMB 0.035 1.04
INCB018424 1.5% QD 12 CAMKK1 0.028 1.04
INCB018424 1.5% QD 12 ITGB1 0.012 1.04
INCB018424 1.5% QD 12 PDGFRB 0.013 1.04
INCB018424 1.5% QD 12 TYRO3 0.030 1.04
INCB018424 1.5% QD 12 B4GAT1 0.035 1.05
INCB018424 1.5% QD 12 CLEC4A 0.017 1.05
INCB018424 1.5% QD 12 GFRA2 0.026 1.05
INCB018424 1.5% QD 12 ENTPD6 0.021 1.05
INCB018424 1.5% QD 12 SPON2 0.005 1.05
INCB018424 1.5% QD 12 TCL1B 0.048 1.05
INCB018424 1.5% QD 12 GALNT2 0.042 1.06
INCB018424 1.5% QD 12 CRISP2 0.042 1.06
INCB018424 1.5% QD 12 CA14 0.034 1.06
INCB018424 1.5% QD 12 IGF2R 0.038 1.06
INCB018424 1.5% QD 12 MRC2 0.015 1.06
INCB018424 1.5% QD 12 CD200 0.025 1.06
INCB018424 1.5% QD 12 LRRN1 0.023 1.06
INCB018424 1.5% QD 12 TCN2 0.034 1.06
INCB018424 1.5% QD 12 DPP4 0.010 1.06
INCB018424 1.5% QD 12 ESAM 0.031 1.07
INCB018424 1.5% QD 12 SCGB3A1 0.039 1.07
INCB018424 1.5% QD 12 AOC3 0.016 1.07
INCB018424 1.5% QD 12 BCAM 0.003 1.07
INCB018424 1.5% QD 12 WFIKKN2 0.003 1.07
INCB018424 1.5% QD 12 IGSF3 0.029 1.07
INCB018424 1.5% QD 12 ENTPD6 0.012 1.07
INCB018424 1.5% QD 12 SMAD1 0.043 1.07
INCB018424 1.5% QD 12 SAA4 0.027 1.07
INCB018424 1.5% QD 12 ANG-1 0.027 1.07
INCB018424 1.5% QD 12 SEZ6L2 0.024 1.07
INCB018424 1.5% QD 12 APOM 0.005 1.07
INCB018424 1.5% QD 12 IGFBPL1 0.016 1.07
INCB018424 1.5% QD 12 ITGB5 0.006 1.07
INCB018424 1.5% QD 12 CPXM1 0.004 1.07
INCB018424 1.5% QD 12 METRNL 0.002 1.07
INCB018424 1.5% QD 12 ENAH 0.020 1.08
INCB018424 1.5% QD 12 LRP11 0.017 1.08
INCB018424 1.5% QD 12 SOD2 0.020 1.08
INCB018424 1.5% QD 12 DCBLD2 0.049 1.08
INCB018424 1.5% QD 12 VEGFA 0.040 1.08
INCB018424 1.5% QD 12 MFAP5 0.045 1.08
INCB018424 1.5% QD 12 MCFD2 0.020 1.08
INCB018424 1.5% QD 12 RAGE 0.003 1.08
INCB018424 1.5% QD 12 KLK6 0.033 1.08
INCB018424 1.5% QD 12 SPINK5 0.002 1.08
INCB018424 1.5% QD 12 NCAM1 0.003 1.08
INCB018424 1.5% QD 12 FR-α 0.008 1.08
INCB018424 1.5% QD 12 CLUL1 0.006 1.08
INCB018424 1.5% QD 12 CXCL16 0.011 1.08
INCB018424 1.5% QD 12 TACSTD2 <0.0001 1.08
INCB018424 1.5% QD 12 ENTPD2 0.035 1.09
INCB018424 1.5% QD 12 VEGFC 0.005 1.09
INCB018424 1.5% QD 12 CNTN2 0.022 1.09
INCB018424 1.5% QD 12 PAI 0.050 1.09
INCB018424 1.5% QD 12 GPC1 0.005 1.09
INCB018424 1.5% QD 12 Flt3L 0.027 1.09
INCB018424 1.5% QD 12 DKK3 0.002 1.09
INCB018424 1.5% QD 12 VEGFD 0.007 1.09
INCB018424 1.5% QD 12 hK14 0.011 1.09
INCB018424 1.5% QD 12 APP 0.018 1.09
INCB018424 1.5% QD 12 ISLR2 0.030 1.09
INCB018424 1.5% QD 12 PVRL4 0.002 1.10
INCB018424 1.5% QD 12 DDC 0.039 1.10
INCB018424 1.5% QD 12 SCGB3A2 <0.0001 1.10
INCB018424 1.5% QD 12 CLMP 0.006 1.10
INCB018424 1.5% QD 12 REG4 0.030 1.10
INCB018424 1.5% QD 12 KAZALD1 0.003 1.10
INCB018424 1.5% QD 12 DPP7 0.042 1.10
INCB018424 1.5% QD 12 ANGPTL7 0.001 1.10
INCB018424 1.5% QD 12 CD46 0.043 1.10
INCB018424 1.5% QD 12 TIMP1 0.001 1.11
INCB018424 1.5% QD 12 COCH 0.015 1.11
INCB018424 1.5% QD 12 ROR1 0.004 1.11
INCB018424 1.5% QD 12 FAM3B 0.020 1.11
INCB018424 1.5% QD 12 IL7R 0.042 1.11
INCB018424 1.5% QD 12 CXCL5 0.048 1.11
INCB018424 1.5% QD 12 PROC <0.0001 1.11
INCB018424 1.5% QD 12 IGFBP6 0.001 1.11
INCB018424 1.5% QD 12 CYR61 0.021 1.11
INCB018424 1.5% QD 12 PAM <0.0001 1.11
INCB018424 1.5% QD 12 MSLN <0.0001 1.11
INCB018424 1.5% QD 12 SYND1 0.038 1.11
INCB018424 1.5% QD 12 CCL11 0.017 1.12
INCB018424 1.5% QD 12 CA6 0.006 1.12
INCB018424 1.5% QD 12 KLK13 0.012 1.12
INCB018424 1.5% QD 12 CLSTN2 0.047 1.12
INCB018424 1.5% QD 12 MMP-3 0.022 1.12
INCB018424 1.5% QD 12 COMP 0.006 1.12
INCB018424 1.5% QD 12 DPP6 0.017 1.12
INCB018424 1.5% QD 12 MMP-1 0.001 1.12
INCB018424 1.5% QD 12 ST6GAL1 0.002 1.12
INCB018424 1.5% QD 12 SOST 0.002 1.12
INCB018424 1.5% QD 12 ANGPTL3 0.001 1.12
INCB018424 1.5% QD 12 CST6 0.038 1.13
INCB018424 1.5% QD 12 DSG4 <0.0001 1.13
INCB018424 1.5% QD 12 CXCL1 0.013 1.13
INCB018424 1.5% QD 12 FAM3C 0.007 1.13
INCB018424 1.5% QD 12 NID1 0.011 1.13
INCB018424 1.5% QD 12 PLTP 0.003 1.13
INCB018424 1.5% QD 12 CPE 0.007 1.13
INCB018424 1.5% QD 12 MOG 0.001 1.14
INCB018424 1.5% QD 12 CA4 0.010 1.14
INCB018424 1.5% QD 12 SERPINA9 0.003 1.15
INCB018424 1.5% QD 12 LEP 0.025 1.15
INCB018424 1.5% QD 12 CRTAC1 <0.0001 1.15
INCB018424 1.5% QD 12 F11 0.029 1.17
INCB018424 1.5% QD 12 APLP1 0.040 1.17
INCB018424 1.5% QD 12 hK8 <0.0001 1.18
INCB018424 1.5% QD 12 MAP4K5 0.049 1.20
INCB018424 1.5% QD 12 CES2 0.047 1.23
INCB018424 1.5% QD 12 GAL 0.001 1.24
INCB018424 1.5% QD 12 CEACAM5 0.003 1.25
INCB018424 1.5% QD 12 EPO 0.021 1.25
INCB018424 1.5% QD 12 CCL5 0.010 1.28
INCB018424 1.5% QD 12 OMG 0.010 1.28
4B :第 24 1.5% 魯索替尼 QD 中顯著調節之蛋白質
處理 分析 p值 變化倍數
24 週顯著下調之蛋白質
INCB018424 1.5% QD 24 CXCL10 0.002 0.70
INCB018424 1.5% QD 24 CCL19 <0.0001 0.70
INCB018424 1.5% QD 24 DEFB4A 0.008 0.74
INCB018424 1.5% QD 24 CXCL11 0.005 0.76
INCB018424 1.5% QD 24 DRAXIN 0.011 0.76
INCB018424 1.5% QD 24 XCL1 0.016 0.76
INCB018424 1.5% QD 24 LAIR-2 <.0001 0.76
INCB018424 1.5% QD 24 GZMH 0.002 0.77
INCB018424 1.5% QD 24 TRANCE 0.013 0.78
INCB018424 1.5% QD 24 CD8A 0.005 0.78
INCB018424 1.5% QD 24 CD160 <.0001 0.78
INCB018424 1.5% QD 24 GZMB 0.013 0.79
INCB018424 1.5% QD 24 TNFRSF6B 0.045 0.79
INCB018424 1.5% QD 24 IL5 0.037 0.79
INCB018424 1.5% QD 24 FASLG <.0001 0.79
INCB018424 1.5% QD 24 TNFRSF9 <0.0001 0.79
INCB018424 1.5% QD 24 CRTAM <.0001 0.80
INCB018424 1.5% QD 24 IL12 <0.0001 0.80
INCB018424 1.5% QD 24 IL-12B <.0001 0.81
INCB018424 1.5% QD 24 KLRD1 0.001 0.81
INCB018424 1.5% QD 24 NCR1 <0.0001 0.81
INCB018424 1.5% QD 24 FCRL6 0.001 0.81
INCB018424 1.5% QD 24 GZMA <0.0001 0.82
INCB018424 1.5% QD 24 IL2-RA 0.001 0.82
INCB018424 1.5% QD 24 CD6 0.001 0.82
INCB018424 1.5% QD 24 MCP-4 0.002 0.83
INCB018424 1.5% QD 24 SH2D1A 0.006 0.83
INCB018424 1.5% QD 24 CRH 0.046 0.84
INCB018424 1.5% QD 24 CD5 <0.0001 0.84
INCB018424 1.5% QD 24 MBL2 0.040 0.84
INCB018424 1.5% QD 24 TNFB 0.001 0.85
INCB018424 1.5% QD 24 IL10 0.027 0.85
INCB018424 1.5% QD 24 CCL18 0.017 0.85
INCB018424 1.5% QD 24 PTH1R 0.029 0.86
INCB018424 1.5% QD 24 IL6 0.044 0.86
INCB018424 1.5% QD 24 MMP12 0.021 0.86
INCB018424 1.5% QD 24 PTX3 0.041 0.87
INCB018424 1.5% QD 24 PAPPA 0.001 0.87
INCB018424 1.5% QD 24 IL10 0.042 0.87
INCB018424 1.5% QD 24 SIGLEC1 0.008 0.87
INCB018424 1.5% QD 24 sFRP-3 0.024 0.88
INCB018424 1.5% QD 24 IL-15RA 0.045 0.88
INCB018424 1.5% QD 24 CCL23 0.030 0.88
INCB018424 1.5% QD 24 ADAM 8 0.001 0.88
INCB018424 1.5% QD 24 SLAMF1 0.018 0.89
INCB018424 1.5% QD 24 TNFRSF4 0.012 0.89
INCB018424 1.5% QD 24 ESM-1 0.028 0.89
INCB018424 1.5% QD 24 CLM-1 0.001 0.89
INCB018424 1.5% QD 24 CDH3 0.002 0.89
INCB018424 1.5% QD 24 CLEC4C 0.004 0.89
INCB018424 1.5% QD 24 CCL21 0.024 0.89
INCB018424 1.5% QD 24 PON2 0.027 0.89
INCB018424 1.5% QD 24 TNC 0.036 0.89
INCB018424 1.5% QD 24 IL12RB1 0.019 0.89
INCB018424 1.5% QD 24 FcRL2 0.004 0.90
INCB018424 1.5% QD 24 CD48 <0.0001 0.90
INCB018424 1.5% QD 24 COL4A3BP 0.010 0.90
INCB018424 1.5% QD 24 CD27 0.001 0.90
INCB018424 1.5% QD 24 CD1C 0.001 0.90
INCB018424 1.5% QD 24 CD79B 0.042 0.90
INCB018424 1.5% QD 24 GM-CSF-R-α 0.014 0.90
INCB018424 1.5% QD 24 PDCD1 0.009 0.91
INCB018424 1.5% QD 24 CD83 0.011 0.91
INCB018424 1.5% QD 24 CLEC10A 0.006 0.91
INCB018424 1.5% QD 24 IL-1RT1 0.026 0.91
INCB018424 1.5% QD 24 CD244 0.012 0.91
INCB018424 1.5% QD 24 LY9 <0.0001 0.91
INCB018424 1.5% QD 24 FCRL1 0.042 0.92
INCB018424 1.5% QD 24 PD-L1 0.022 0.92
INCB018424 1.5% QD 24 IL17RB 0.040 0.92
INCB018424 1.5% QD 24 TNFRSF13B 0.018 0.92
INCB018424 1.5% QD 24 CLEC7A 0.040 0.92
INCB018424 1.5% QD 24 LIF-R 0.031 0.92
INCB018424 1.5% QD 24 SIRT5 0.029 0.93
INCB018424 1.5% QD 24 IFNLR1 0.043 0.93
INCB018424 1.5% QD 24 CD200R1 0.026 0.93
INCB018424 1.5% QD 24 IL-5R-α 0.015 0.93
INCB018424 1.5% QD 24 PDGF-R-α 0.009 0.93
INCB018424 1.5% QD 24 TNF-R2 0.031 0.93
INCB018424 1.5% QD 24 TM 0.021 0.93
INCB018424 1.5% QD 24 WFIKKN1 0.042 0.93
INCB018424 1.5% QD 24 CSF-1 0.024 0.94
INCB018424 1.5% QD 24 EFNA4 0.006 0.94
INCB018424 1.5% QD 24 CLM-6 0.010 0.94
INCB018424 1.5% QD 24 N2DL-2 0.038 0.94
INCB018424 1.5% QD 24 GFR-α-1 0.033 0.95
INCB018424 1.5% QD 24 THBS2 0.011 0.95
INCB018424 1.5% QD 24 LY75 0.044 0.95
INCB018424 1.5% QD 24 NBL1 0.040 0.97
24 週顯著上調之蛋白質
INCB018424 1.5% QD 24 TACSTD2 0.035 1.04
INCB018424 1.5% QD 24 GALNT2 0.034 1.05
INCB018424 1.5% QD 24 EGFR 0.042 1.05
INCB018424 1.5% QD 24 BAMBI 0.040 1.05
INCB018424 1.5% QD 24 AOC3 0.038 1.06
INCB018424 1.5% QD 24 CNDP1 0.047 1.06
INCB018424 1.5% QD 24 ITGB5 0.010 1.06
INCB018424 1.5% QD 24 CLEC4A 0.022 1.07
INCB018424 1.5% QD 24 ST6GAL1 0.025 1.07
INCB018424 1.5% QD 24 MEP1B 0.002 1.07
INCB018424 1.5% QD 24 CNTN1 0.032 1.07
INCB018424 1.5% QD 24 B4GAT1 0.031 1.07
INCB018424 1.5% QD 24 CA4 0.048 1.07
INCB018424 1.5% QD 24 KIT 0.008 1.07
INCB018424 1.5% QD 24 TIMP1 0.028 1.08
INCB018424 1.5% QD 24 DPP4 0.009 1.08
INCB018424 1.5% QD 24 CD300LG 0.016 1.08
INCB018424 1.5% QD 24 Flt3L 0.038 1.08
INCB018424 1.5% QD 24 NCAM1 0.006 1.08
INCB018424 1.5% QD 24 DPP6 0.031 1.08
INCB018424 1.5% QD 24 ADGRG2 0.007 1.08
INCB018424 1.5% QD 24 DKK3 0.028 1.09
INCB018424 1.5% QD 24 SPINK5 0.002 1.09
INCB018424 1.5% QD 24 TF 0.040 1.09
INCB018424 1.5% QD 24 BLM水解酶 0.047 1.09
INCB018424 1.5% QD 24 VEGFD 0.016 1.09
INCB018424 1.5% QD 24 IGF2R 0.006 1.09
INCB018424 1.5% QD 24 ISLR2 0.041 1.09
INCB018424 1.5% QD 24 WFIKKN2 0.019 1.09
INCB018424 1.5% QD 24 KLK6 0.006 1.09
INCB018424 1.5% QD 24 PAI 0.006 1.10
INCB018424 1.5% QD 24 CXCL5 0.021 1.10
INCB018424 1.5% QD 24 PROC 0.003 1.10
INCB018424 1.5% QD 24 CLMP 0.035 1.10
INCB018424 1.5% QD 24 KLK10 0.007 1.10
INCB018424 1.5% QD 24 ITGB1 0.036 1.10
INCB018424 1.5% QD 24 TGFBI 0.004 1.10
INCB018424 1.5% QD 24 MOG 0.024 1.10
INCB018424 1.5% QD 24 PDGF次單元A 0.017 1.11
INCB018424 1.5% QD 24 hK8 0.031 1.11
INCB018424 1.5% QD 24 EDIL3 0.036 1.11
INCB018424 1.5% QD 24 CA6 0.020 1.11
INCB018424 1.5% QD 24 BCAM 0.048 1.11
INCB018424 1.5% QD 24 KLK13 0.023 1.11
INCB018424 1.5% QD 24 COCH 0.010 1.11
INCB018424 1.5% QD 24 CRTAC1 0.023 1.12
INCB018424 1.5% QD 24 MMP-1 0.003 1.12
INCB018424 1.5% QD 24 CA3 0.040 1.12
INCB018424 1.5% QD 24 IGFBP6 <.0001 1.12
INCB018424 1.5% QD 24 MB 0.032 1.13
INCB018424 1.5% QD 24 KYAT1 0.042 1.13
INCB018424 1.5% QD 24 CXCL16 <.0001 1.13
INCB018424 1.5% QD 24 SNCG 0.034 1.13
INCB018424 1.5% QD 24 SPINK1 0.006 1.14
INCB018424 1.5% QD 24 SCGB3A2 0.010 1.14
INCB018424 1.5% QD 24 IL15 <0.0001 1.14
INCB018424 1.5% QD 24 Gal-4 0.018 1.15
INCB018424 1.5% QD 24 DDC 0.009 1.16
INCB018424 1.5% QD 24 MMP-3 0.015 1.16
INCB018424 1.5% QD 24 LGALS7 0.006 1.16
INCB018424 1.5% QD 24 PLIN1 0.018 1.17
INCB018424 1.5% QD 24 TIMP4 0.023 1.17
INCB018424 1.5% QD 24 PCSK9 0.001 1.17
INCB018424 1.5% QD 24 F11 0.018 1.17
INCB018424 1.5% QD 24 FAM3C 0.001 1.18
INCB018424 1.5% QD 24 FGF-BP1 <.0001 1.19
INCB018424 1.5% QD 24 CES2 0.040 1.19
INCB018424 1.5% QD 24 CES1 0.026 1.22
INCB018424 1.5% QD 24 P4HB 0.015 1.22
INCB018424 1.5% QD 24 LEP 0.014 1.23
INCB018424 1.5% QD 24 TMPRSS15 0.025 1.24
INCB018424 1.5% QD 24 Ep-CAM 0.010 1.26
INCB018424 1.5% QD 24 FABP4 0.001 1.28
5A :第 12 1.5% 魯索替尼 BID 中顯著調節之蛋白質
處理 分析 p值 變化倍數
12 週顯著下調之蛋白質
INCB018424 1.5% BID 12 FASLG <.0001 0.78
INCB018424 1.5% BID 12 TRANCE <.0001 0.78
INCB018424 1.5% BID 12 CD160 <.0001 0.79
INCB018424 1.5% BID 12 FCRL6 <.0001 0.79
INCB018424 1.5% BID 12 TNFB <.0001 0.82
INCB018424 1.5% BID 12 TNFRSF9 <.0001 0.84
INCB018424 1.5% BID 12 ITGB2 <.0001 0.85
INCB018424 1.5% BID 12 TIMD4 <.0001 0.86
INCB018424 1.5% BID 12 CD5 <.0001 0.88
INCB018424 1.5% BID 12 RNASE3 0.024 0.73
INCB018424 1.5% BID 12 CCL19 <0.0001 0.75
INCB018424 1.5% BID 12 MCP-4 0.002 0.78
INCB018424 1.5% BID 12 CXCL9 <0.0001 0.78
INCB018424 1.5% BID 12 CCL18 0.002 0.79
INCB018424 1.5% BID 12 CRH 0.007 0.79
INCB018424 1.5% BID 12 KLRD1 <0.0001 0.81
INCB018424 1.5% BID 12 CXCL10 0.044 0.82
INCB018424 1.5% BID 12 LAIR-2 <0.0001 0.83
INCB018424 1.5% BID 12 NCR1 <0.0001 0.84
INCB018424 1.5% BID 12 IL2-RA <0.0001 0.84
INCB018424 1.5% BID 12 IL-12B 0.001 0.85
INCB018424 1.5% BID 12 XCL1 <0.0001 0.85
INCB018424 1.5% BID 12 TCL1B 0.024 0.85
INCB018424 1.5% BID 12 CA5A 0.028 0.86
INCB018424 1.5% BID 12 DRAXIN 0.003 0.86
INCB018424 1.5% BID 12 TNFRSF6B 0.004 0.86
INCB018424 1.5% BID 12 CHIT1 0.013 0.87
INCB018424 1.5% BID 12 TGF-α 0.025 0.87
INCB018424 1.5% BID 12 CD6 <0.0001 0.87
INCB018424 1.5% BID 12 OSM 0.043 0.87
INCB018424 1.5% BID 12 CD1C <0.001 0.87
INCB018424 1.5% BID 12 CRTAM 0.001 0.87
INCB018424 1.5% BID 12 PRTN3 0.021 0.88
INCB018424 1.5% BID 12 MBL2 0.002 0.88
INCB018424 1.5% BID 12 KIR2DL3 0.001 0.88
INCB018424 1.5% BID 12 IL5 0.006 0.88
INCB018424 1.5% BID 12 TNFSF13B <0.0001 0.88
INCB018424 1.5% BID 12 ADAM 8 <0.0001 0.88
INCB018424 1.5% BID 12 GZMB 0.045 0.89
INCB018424 1.5% BID 12 CCL21 0.001 0.89
INCB018424 1.5% BID 12 MMP12 0.041 0.89
INCB018424 1.5% BID 12 PAPPA 0.009 0.89
INCB018424 1.5% BID 12 CLEC4D 0.039 0.89
INCB018424 1.5% BID 12 IFNL1 0.007 0.89
INCB018424 1.5% BID 12 COL1A1 0.001 0.89
INCB018424 1.5% BID 12 CLEC4C 0.026 0.89
INCB018424 1.5% BID 12 LIF 0.020 0.90
INCB018424 1.5% BID 12 IL-2RB 0.033 0.90
INCB018424 1.5% BID 12 NOV 0.005 0.90
INCB018424 1.5% BID 12 IL12 0.030 0.90
INCB018424 1.5% BID 12 TNC 0.044 0.90
INCB018424 1.5% BID 12 VSTM1 0.002 0.91
INCB018424 1.5% BID 12 DSC2 0.002 0.91
INCB018424 1.5% BID 12 WISP-1 0.002 0.91
INCB018424 1.5% BID 12 TNFRSF10C 0.015 0.91
INCB018424 1.5% BID 12 CD163 0.003 0.92
INCB018424 1.5% BID 12 IL3RA 0.010 0.92
INCB018424 1.5% BID 12 PGLYRP1 0.040 0.92
INCB018424 1.5% BID 12 RETN 0.021 0.92
INCB018424 1.5% BID 12 ICAM3 0.001 0.92
INCB018424 1.5% BID 12 ICAM1 0.003 0.92
INCB018424 1.5% BID 12 FCRL5 0.005 0.92
INCB018424 1.5% BID 12 IL-18BP 0.008 0.92
INCB018424 1.5% BID 12 IL-1RT1 0.004 0.92
INCB018424 1.5% BID 12 CLEC7A 0.004 0.92
INCB018424 1.5% BID 12 VCAM1 0.002 0.92
INCB018424 1.5% BID 12 SLAMF8 0.024 0.92
INCB018424 1.5% BID 12 CDON 0.011 0.92
INCB018424 1.5% BID 12 FCER2 0.006 0.93
INCB018424 1.5% BID 12 SELL 0.013 0.93
INCB018424 1.5% BID 12 PON2 0.029 0.93
INCB018424 1.5% BID 12 CD244 0.006 0.93
INCB018424 1.5% BID 12 CD48 0.003 0.93
INCB018424 1.5% BID 12 TNF-R2 0.028 0.94
INCB018424 1.5% BID 12 CD209 0.023 0.94
INCB018424 1.5% BID 12 IL-10RB 0.010 0.94
INCB018424 1.5% BID 12 ARTN 0.028 0.94
INCB018424 1.5% BID 12 LAIR1 0.022 0.94
INCB018424 1.5% BID 12 TNF-R1 0.037 0.94
INCB018424 1.5% BID 12 KIRREL2 0.027 0.94
INCB018424 1.5% BID 12 FCRL1 0.004 0.94
INCB018424 1.5% BID 12 LY9 0.044 0.95
INCB018424 1.5% BID 12 MILR1 0.049 0.95
INCB018424 1.5% BID 12 CD79B 0.015 0.95
INCB018424 1.5% BID 12 CD27 0.034 0.95
INCB018424 1.5% BID 12 hOSCAR 0.006 0.96
INCB018424 1.5% BID 12 HAVCR2 0.017 0.96
INCB018424 1.5% BID 12 KPNA1 0.029 0.96
INCB018424 1.5% BID 12 TGFR-2 0.036 0.96
12 週顯著上調之蛋白質
INCB018424 1.5% BID 12 NTRK3 <.0001 1.10
INCB018424 1.5% BID 12 TF <.0001 1.12
INCB018424 1.5% BID 12 KLK13 <.0001 1.14
INCB018424 1.5% BID 12 FGF-BP1 <.0001 1.27
INCB018424 1.5% BID 12 EPO <.0001 1.59
INCB018424 1.5% BID 12 Gal-1 0.012 1.04
INCB018424 1.5% BID 12 ITGAV 0.035 1.04
INCB018424 1.5% BID 12 ERBB3 0.016 1.04
INCB018424 1.5% BID 12 ITGB1 0.038 1.05
INCB018424 1.5% BID 12 CLEC14A 0.044 1.05
INCB018424 1.5% BID 12 GALNT2 0.027 1.05
INCB018424 1.5% BID 12 ERBB4 0.008 1.05
INCB018424 1.5% BID 12 Nr-CAM 0.005 1.05
INCB018424 1.5% BID 12 CRISP2 0.048 1.05
INCB018424 1.5% BID 12 ENTPD6 0.019 1.05
INCB018424 1.5% BID 12 NTRK2 0.010 1.05
INCB018424 1.5% BID 12 EDA2R 0.028 1.05
INCB018424 1.5% BID 12 LTBP2 0.045 1.05
INCB018424 1.5% BID 12 CD300LG 0.029 1.05
INCB018424 1.5% BID 12 DKKL1 0.007 1.05
INCB018424 1.5% BID 12 CD58 0.004 1.06
INCB018424 1.5% BID 12 Gal-3 0.035 1.06
INCB018424 1.5% BID 12 DPP4 0.022 1.06
INCB018424 1.5% BID 12 AOC3 0.031 1.06
INCB018424 1.5% BID 12 GDNFR-α-3 0.013 1.06
INCB018424 1.5% BID 12 FABP9 0.029 1.06
INCB018424 1.5% BID 12 α-2-MRAP 0.045 1.06
INCB018424 1.5% BID 12 PRELP 0.008 1.06
INCB018424 1.5% BID 12 DPEP1 0.019 1.06
INCB018424 1.5% BID 12 hK11 0.008 1.06
INCB018424 1.5% BID 12 DCBLD2 0.042 1.06
INCB018424 1.5% BID 12 ANGPTL7 0.035 1.06
INCB018424 1.5% BID 12 MMP7 0.025 1.06
INCB018424 1.5% BID 12 SCARB2 0.032 1.06
INCB018424 1.5% BID 12 B4GAT1 0.011 1.06
INCB018424 1.5% BID 12 ITGB5 0.010 1.06
INCB018424 1.5% BID 12 BAMBI 0.047 1.06
INCB018424 1.5% BID 12 SPINK5 0.001 1.06
INCB018424 1.5% BID 12 ACAN 0.010 1.06
INCB018424 1.5% BID 12 TACSTD2 0.002 1.06
INCB018424 1.5% BID 12 DCN 0.002 1.07
INCB018424 1.5% BID 12 PEAR1 0.017 1.07
INCB018424 1.5% BID 12 PODXL2 0.011 1.07
INCB018424 1.5% BID 12 VWC2 0.025 1.07
INCB018424 1.5% BID 12 BLM水解酶 0.008 1.07
INCB018424 1.5% BID 12 CCL25 0.028 1.07
INCB018424 1.5% BID 12 VEGFD 0.029 1.07
INCB018424 1.5% BID 12 FAM3C 0.024 1.07
INCB018424 1.5% BID 12 SCARF2 0.011 1.07
INCB018424 1.5% BID 12 CLUL1 0.009 1.07
INCB018424 1.5% BID 12 EZR 0.008 1.07
INCB018424 1.5% BID 12 OPTC 0.007 1.07
INCB018424 1.5% BID 12 SOD2 0.003 1.07
INCB018424 1.5% BID 12 EPHB6 0.015 1.07
INCB018424 1.5% BID 12 PVR 0.002 1.07
INCB018424 1.5% BID 12 DPP10 0.017 1.07
INCB018424 1.5% BID 12 PRTG 0.002 1.08
INCB018424 1.5% BID 12 TMPRSS5 0.004 1.08
INCB018424 1.5% BID 12 CPE 0.012 1.08
INCB018424 1.5% BID 12 CD70 0.035 1.08
INCB018424 1.5% BID 12 hK8 0.023 1.08
INCB018424 1.5% BID 12 CXCL16 0.004 1.08
INCB018424 1.5% BID 12 THPO 0.026 1.08
INCB018424 1.5% BID 12 KIM1 0.038 1.08
INCB018424 1.5% BID 12 GPC1 0.002 1.08
INCB018424 1.5% BID 12 VEGFD 0.003 1.08
INCB018424 1.5% BID 12 ROBO2 0.003 1.08
INCB018424 1.5% BID 12 DKK3 0.036 1.08
INCB018424 1.5% BID 12 CLEC4A 0.009 1.08
INCB018424 1.5% BID 12 CDNF 0.014 1.09
INCB018424 1.5% BID 12 SPOCK1 0.012 1.09
INCB018424 1.5% BID 12 ST3GAL1 0.022 1.09
INCB018424 1.5% BID 12 CNTN5 0.001 1.09
INCB018424 1.5% BID 12 GCP5 0.032 1.09
INCB018424 1.5% BID 12 GP1BA 0.032 1.09
INCB018424 1.5% BID 12 KLK6 0.018 1.09
INCB018424 1.5% BID 12 hK14 0.011 1.09
INCB018424 1.5% BID 12 RGMB 0.001 1.09
INCB018424 1.5% BID 12 LGALS7 0.025 1.09
INCB018424 1.5% BID 12 RAGE 0.003 1.10
INCB018424 1.5% BID 12 KLK10 0.003 1.10
INCB018424 1.5% BID 12 FUT8 0.041 1.10
INCB018424 1.5% BID 12 FAM3B 0.011 1.10
INCB018424 1.5% BID 12 CXADR 0.038 1.10
INCB018424 1.5% BID 12 CD200 <0.0001 1.10
INCB018424 1.5% BID 12 MATN3 0.013 1.10
INCB018424 1.5% BID 12 SCF 0.001 1.10
INCB018424 1.5% BID 12 SCF <0.0001 1.10
INCB018424 1.5% BID 12 NCAN <0.0001 1.10
INCB018424 1.5% BID 12 GDF-2 0.016 1.10
INCB018424 1.5% BID 12 TFPI-2 0.001 1.10
INCB018424 1.5% BID 12 CAIX 0.037 1.10
INCB018424 1.5% BID 12 WFIKKN2 <0.0001 1.10
INCB018424 1.5% BID 12 RGMA <0.0001 1.10
INCB018424 1.5% BID 12 SFRP1 0.042 1.11
INCB018424 1.5% BID 12 NPTXR 0.001 1.11
INCB018424 1.5% BID 12 PHOSPHO1 0.005 1.11
INCB018424 1.5% BID 12 STX6 0.018 1.11
INCB018424 1.5% BID 12 CA6 0.005 1.11
INCB018424 1.5% BID 12 PON3 0.003 1.11
INCB018424 1.5% BID 12 gal-8 0.003 1.11
INCB018424 1.5% BID 12 NCAM1 <0.0001 1.12
INCB018424 1.5% BID 12 CADM3 0.001 1.12
INCB018424 1.5% BID 12 CX3CL1 0.009 1.12
INCB018424 1.5% BID 12 SCF <0.0001 1.12
INCB018424 1.5% BID 12 PADI2 0.025 1.12
INCB018424 1.5% BID 12 PREB 0.039 1.12
INCB018424 1.5% BID 12 DDC 0.004 1.12
INCB018424 1.5% BID 12 MDGA1 <0.0001 1.13
INCB018424 1.5% BID 12 SCGB1A1 0.004 1.13
INCB018424 1.5% BID 12 IL-17A 0.035 1.13
INCB018424 1.5% BID 12 SCGB3A2 0.037 1.13
INCB018424 1.5% BID 12 NEFL 0.005 1.13
INCB018424 1.5% BID 12 GIF 0.014 1.13
INCB018424 1.5% BID 12 TN-R 0.001 1.13
INCB018424 1.5% BID 12 MOG 0.001 1.14
INCB018424 1.5% BID 12 CCL11 0.008 1.14
INCB018424 1.5% BID 12 ITM2A <0.0001 1.14
INCB018424 1.5% BID 12 PLXNB3 0.016 1.14
INCB018424 1.5% BID 12 CYR61 <0.0001 1.14
INCB018424 1.5% BID 12 SMOC2 <0.0001 1.14
INCB018424 1.5% BID 12 Dkk-4 0.002 1.14
INCB018424 1.5% BID 12 IL15 0.006 1.14
INCB018424 1.5% BID 12 BCAN <0.0001 1.14
INCB018424 1.5% BID 12 MFGE8 0.024 1.14
INCB018424 1.5% BID 12 Flt3L <0.0001 1.15
INCB018424 1.5% BID 12 CEACAM5 0.049 1.16
INCB018424 1.5% BID 12 G-CSF 0.007 1.16
INCB018424 1.5% BID 12 P4HB 0.006 1.16
INCB018424 1.5% BID 12 MMP-3 0.024 1.17
INCB018424 1.5% BID 12 MYOC 0.001 1.19
INCB018424 1.5% BID 12 PLIN1 0.006 1.20
INCB018424 1.5% BID 12 TNFRSF12A 0.001 1.21
INCB018424 1.5% BID 12 GAL 0.002 1.22
INCB018424 1.5% BID 12 APLP1 0.001 1.23
INCB018424 1.5% BID 12 AGR3 0.025 1.23
INCB018424 1.5% BID 12 Ep-CAM 0.005 1.27
INCB018424 1.5% BID 12 TSHB 0.011 1.27
INCB018424 1.5% BID 12 TNNI3 0.019 1.59
5B :第 24 1.5% 魯索替尼 BID 中顯著調節之蛋白質
處理 分析 p值 變化倍數
24 週顯著下調之蛋白質
INCB018424 1.5% BID 24 CXCL10 <0.0001 0.68
INCB018424 1.5% BID 24 CCL19 <0.0001 0.71
INCB018424 1.5% BID 24 CXCL9 <.0001 0.73
INCB018424 1.5% BID 24 TRANCE <.0001 0.74
INCB018424 1.5% BID 24 CCL18 0.001 0.76
INCB018424 1.5% BID 24 IL2-RA <.0001 0.79
INCB018424 1.5% BID 24 FCRL6 <.0001 0.79
INCB018424 1.5% BID 24 TNFB <.0001 0.80
INCB018424 1.5% BID 24 CRH 0.001 0.80
INCB018424 1.5% BID 24 GZMB 0.002 0.80
INCB018424 1.5% BID 24 TNFRSF9 <.0001 0.80
INCB018424 1.5% BID 24 KLRD1 <.0001 0.81
INCB018424 1.5% BID 24 IL-12B <.0001 0.81
INCB018424 1.5% BID 24 FASLG <.0001 0.81
INCB018424 1.5% BID 24 MMP12 0.001 0.81
INCB018424 1.5% BID 24 CD160 <.0001 0.82
INCB018424 1.5% BID 24 XCL1 <.0001 0.82
INCB018424 1.5% BID 24 CXCL11 0.019 0.82
INCB018424 1.5% BID 24 LAIR-2 0.003 0.82
INCB018424 1.5% BID 24 MCP-4 0.010 0.84
INCB018424 1.5% BID 24 NCR1 <0.0001 0.84
INCB018424 1.5% BID 24 IL-2RB 0.003 0.84
INCB018424 1.5% BID 24 DRAXIN 0.008 0.85
INCB018424 1.5% BID 24 IL12 0.001 0.85
INCB018424 1.5% BID 24 TNFRSF6B 0.001 0.85
INCB018424 1.5% BID 24 COL1A1 0.001 0.86
INCB018424 1.5% BID 24 CD8A <0.0001 0.86
INCB018424 1.5% BID 24 KIR2DL3 0.008 0.86
INCB018424 1.5% BID 24 SIGLEC1 <0.0001 0.86
INCB018424 1.5% BID 24 LAP TGF-β-1 0.018 0.86
INCB018424 1.5% BID 24 CHIT1 0.016 0.86
INCB018424 1.5% BID 24 OPN 0.011 0.87
INCB018424 1.5% BID 24 CD6 <.0001 0.87
INCB018424 1.5% BID 24 IFNL1 0.037 0.87
INCB018424 1.5% BID 24 CLEC4C 0.001 0.87
INCB018424 1.5% BID 24 CD5 <.0001 0.88
INCB018424 1.5% BID 24 CRTAM 0.015 0.88
INCB018424 1.5% BID 24 CCL21 0.002 0.88
INCB018424 1.5% BID 24 ITGB2 <.0001 0.88
INCB018424 1.5% BID 24 SLAMF8 0.001 0.88
INCB018424 1.5% BID 24 ADAM 8 0.001 0.88
INCB018424 1.5% BID 24 IL10 0.040 0.88
INCB018424 1.5% BID 24 IL-18BP 0.001 0.89
INCB018424 1.5% BID 24 CLEC7A <.0001 0.89
INCB018424 1.5% BID 24 SLAMF1 0.003 0.90
INCB018424 1.5% BID 24 TNFSF13B 0.003 0.90
INCB018424 1.5% BID 24 LILRB4 0.001 0.90
INCB018424 1.5% BID 24 FCER2 0.001 0.90
INCB018424 1.5% BID 24 CCL23 0.010 0.90
INCB018424 1.5% BID 24 CD1C <0.0001 0.90
INCB018424 1.5% BID 24 TIMD4 0.008 0.91
INCB018424 1.5% BID 24 MBL2 0.011 0.91
INCB018424 1.5% BID 24 TNF-R2 0.001 0.91
INCB018424 1.5% BID 24 IL12RB1 0.006 0.91
INCB018424 1.5% BID 24 CD163 0.010 0.91
INCB018424 1.5% BID 24 MILR1 0.002 0.91
INCB018424 1.5% BID 24 NOV 0.022 0.92
INCB018424 1.5% BID 24 CD48 0.001 0.92
INCB018424 1.5% BID 24 GZMA 0.014 0.92
INCB018424 1.5% BID 24 IL-18R1 0.012 0.92
INCB018424 1.5% BID 24 IL-1RT1 0.010 0.92
INCB018424 1.5% BID 24 TRAIL 0.009 0.92
INCB018424 1.5% BID 24 GM-CSF-R-α 0.015 0.92
INCB018424 1.5% BID 24 CDON 0.006 0.92
INCB018424 1.5% BID 24 PAPPA 0.046 0.92
INCB018424 1.5% BID 24 WISP-1 0.004 0.92
INCB018424 1.5% BID 24 TNFRSF4 0.016 0.93
INCB018424 1.5% BID 24 IFNLR1 0.011 0.93
INCB018424 1.5% BID 24 CD244 0.018 0.93
INCB018424 1.5% BID 24 PGF 0.014 0.93
INCB018424 1.5% BID 24 CLEC4G 0.008 0.93
INCB018424 1.5% BID 24 SELL 0.006 0.93
INCB018424 1.5% BID 24 CSF-1 0.003 0.93
INCB018424 1.5% BID 24 ICAM1 0.022 0.93
INCB018424 1.5% BID 24 VCAM1 0.014 0.94
INCB018424 1.5% BID 24 IL32 0.048 0.94
INCB018424 1.5% BID 24 CD27 0.006 0.94
INCB018424 1.5% BID 24 CD83 0.008 0.94
INCB018424 1.5% BID 24 PON2 0.050 0.94
INCB018424 1.5% BID 24 LY9 0.014 0.94
INCB018424 1.5% BID 24 PILRA 0.004 0.94
INCB018424 1.5% BID 24 DSC2 0.007 0.94
INCB018424 1.5% BID 24 RELT 0.021 0.94
INCB018424 1.5% BID 24 KIRREL2 0.027 0.94
INCB018424 1.5% BID 24 FcRL2 0.037 0.95
INCB018424 1.5% BID 24 ICAM3 0.050 0.95
INCB018424 1.5% BID 24 DLL1 0.012 0.95
INCB018424 1.5% BID 24 Gal-9 0.017 0.95
INCB018424 1.5% BID 24 CLEC10A 0.043 0.95
INCB018424 1.5% BID 24 TRAIL 0.045 0.95
INCB018424 1.5% BID 24 PDCD1 0.035 0.95
INCB018424 1.5% BID 24 CLM-6 0.015 0.95
INCB018424 1.5% BID 24 SIRPB1 0.042 0.95
INCB018424 1.5% BID 24 SIGLEC10 0.018 0.95
INCB018424 1.5% BID 24 SIGLEC6 0.030 0.95
INCB018424 1.5% BID 24 hOSCAR 0.020 0.96
INCB018424 1.5% BID 24 SHPS-1 0.038 0.96
24 週顯著上調之蛋白質
INCB018424 1.5% BID 24 CLEC14A 0.044 1.04
INCB018424 1.5% BID 24 SPINT1 0.040 1.05
INCB018424 1.5% BID 24 TACSTD2 0.026 1.05
INCB018424 1.5% BID 24 ROBO1 0.035 1.05
INCB018424 1.5% BID 24 DCN 0.011 1.05
INCB018424 1.5% BID 24 ITGB1 0.021 1.05
INCB018424 1.5% BID 24 PRELP 0.004 1.05
INCB018424 1.5% BID 24 IGF2R 0.027 1.05
INCB018424 1.5% BID 24 MMP7 0.018 1.05
INCB018424 1.5% BID 24 PVR 0.026 1.05
INCB018424 1.5% BID 24 CDH1 0.049 1.06
INCB018424 1.5% BID 24 RGMA 0.023 1.06
INCB018424 1.5% BID 24 TMPRSS5 0.036 1.06
INCB018424 1.5% BID 24 GDNFR-α-3 0.023 1.06
INCB018424 1.5% BID 24 GPC1 0.039 1.06
INCB018424 1.5% BID 24 LYPD3 0.039 1.06
INCB018424 1.5% BID 24 ITM2A 0.034 1.06
INCB018424 1.5% BID 24 Notch 3 0.041 1.06
INCB018424 1.5% BID 24 ACAN 0.030 1.06
INCB018424 1.5% BID 24 hK11 0.028 1.06
INCB018424 1.5% BID 24 MSMB 0.003 1.07
INCB018424 1.5% BID 24 SCF 0.013 1.07
INCB018424 1.5% BID 24 CNTN1 0.023 1.07
INCB018424 1.5% BID 24 RGMB 0.045 1.07
INCB018424 1.5% BID 24 AOC3 0.016 1.07
INCB018424 1.5% BID 24 PRSS27 0.037 1.07
INCB018424 1.5% BID 24 VEGFD 0.004 1.07
INCB018424 1.5% BID 24 DPP4 0.020 1.07
INCB018424 1.5% BID 24 CLEC4A 0.033 1.07
INCB018424 1.5% BID 24 PEAR1 0.032 1.07
INCB018424 1.5% BID 24 CRISP2 0.030 1.07
INCB018424 1.5% BID 24 CD300LG 0.005 1.07
INCB018424 1.5% BID 24 DKK3 0.027 1.07
INCB018424 1.5% BID 24 SPINK5 0.002 1.07
INCB018424 1.5% BID 24 CNTN5 0.021 1.07
INCB018424 1.5% BID 24 CXCL16 0.018 1.07
INCB018424 1.5% BID 24 B4GAT1 0.004 1.07
INCB018424 1.5% BID 24 PRTG 0.007 1.07
INCB018424 1.5% BID 24 FABP9 0.006 1.07
INCB018424 1.5% BID 24 PAM 0.011 1.07
INCB018424 1.5% BID 24 BLM水解酶 0.012 1.07
INCB018424 1.5% BID 24 RAGE 0.027 1.08
INCB018424 1.5% BID 24 IGFBP6 0.027 1.08
INCB018424 1.5% BID 24 BCAM <.0001 1.08
INCB018424 1.5% BID 24 MFAP5 0.003 1.08
INCB018424 1.5% BID 24 NTRK3 0.006 1.08
INCB018424 1.5% BID 24 TGFBI 0.041 1.08
INCB018424 1.5% BID 24 PON3 0.043 1.08
INCB018424 1.5% BID 24 ISLR2 0.039 1.08
INCB018424 1.5% BID 24 SOST 0.046 1.08
INCB018424 1.5% BID 24 DPP10 0.008 1.08
INCB018424 1.5% BID 24 SCF <0.0001 1.08
INCB018424 1.5% BID 24 CRIM1 0.035 1.08
INCB018424 1.5% BID 24 ITGB5 0.010 1.09
INCB018424 1.5% BID 24 TF 0.014 1.09
INCB018424 1.5% BID 24 CLUL1 0.001 1.09
INCB018424 1.5% BID 24 CTSV 0.020 1.09
INCB018424 1.5% BID 24 KLK10 0.030 1.09
INCB018424 1.5% BID 24 WFIKKN2 0.001 1.09
INCB018424 1.5% BID 24 DPEP1 0.001 1.10
INCB018424 1.5% BID 24 hK8 0.048 1.10
INCB018424 1.5% BID 24 SCF 0.001 1.10
INCB018424 1.5% BID 24 hK14 0.002 1.10
INCB018424 1.5% BID 24 COMP 0.030 1.10
INCB018424 1.5% BID 24 MDGA1 0.004 1.10
INCB018424 1.5% BID 24 GDF-2 0.009 1.10
INCB018424 1.5% BID 24 Gal-4 0.046 1.10
INCB018424 1.5% BID 24 SMOC2 0.026 1.10
INCB018424 1.5% BID 24 SNCG 0.031 1.11
INCB018424 1.5% BID 24 COCH 0.018 1.11
INCB018424 1.5% BID 24 F11 0.006 1.11
INCB018424 1.5% BID 24 NPTXR 0.007 1.11
INCB018424 1.5% BID 24 PHOSPHO1 0.001 1.11
INCB018424 1.5% BID 24 NCAM1 0.002 1.11
INCB018424 1.5% BID 24 TNXB 0.012 1.12
INCB018424 1.5% BID 24 SCGB3A1 0.002 1.12
INCB018424 1.5% BID 24 Flt3L 0.015 1.12
INCB018424 1.5% BID 24 MFGE8 0.048 1.12
INCB018424 1.5% BID 24 IL15 0.009 1.12
INCB018424 1.5% BID 24 CYR61 0.026 1.13
INCB018424 1.5% BID 24 SCGB1A1 0.004 1.13
INCB018424 1.5% BID 24 DDC 0.042 1.13
INCB018424 1.5% BID 24 TN-R <0.0001 1.13
INCB018424 1.5% BID 24 WASF1 0.042 1.13
INCB018424 1.5% BID 24 CPA2 0.034 1.14
INCB018424 1.5% BID 24 CRTAC1 0.001 1.14
INCB018424 1.5% BID 24 P4HB 0.009 1.14
INCB018424 1.5% BID 24 PADI2 0.041 1.14
INCB018424 1.5% BID 24 BAG6 0.016 1.14
INCB018424 1.5% BID 24 PLIN1 0.002 1.15
INCB018424 1.5% BID 24 CA6 <0.0001 1.15
INCB018424 1.5% BID 24 GAL 0.005 1.15
INCB018424 1.5% BID 24 NAAA 0.013 1.15
INCB018424 1.5% BID 24 KLK13 <0.0001 1.16
INCB018424 1.5% BID 24 REG4 0.002 1.16
INCB018424 1.5% BID 24 GIF 0.006 1.17
INCB018424 1.5% BID 24 PTN 0.026 1.17
INCB018424 1.5% BID 24 NID2 0.026 1.17
INCB018424 1.5% BID 24 GSAP 0.014 1.17
INCB018424 1.5% BID 24 TNFRSF12A 0.001 1.19
INCB018424 1.5% BID 24 SCGB3A2 0.007 1.19
INCB018424 1.5% BID 24 Ep-CAM 0.049 1.19
INCB018424 1.5% BID 24 NEFL 0.014 1.19
INCB018424 1.5% BID 24 MYOC <0.0001 1.21
INCB018424 1.5% BID 24 CEACAM5 0.007 1.22
INCB018424 1.5% BID 24 FGF-BP1 <.0001 1.24
INCB018424 1.5% BID 24 EPO 0.003 1.41
6A :第 12 1.5% 魯索替尼 QD 1.5% 魯索替尼 BID 中顯著下調之蛋白質
1.5% QD獨有 1.5% QD與1.5% BID均有 1.5% BID獨有
DEFB4A CD160 TIMD4
IGFBP-1 TNFB RNASE3
GZMH TNFRSF9 CXCL9
FS ITGB2 CRH
SH2D1A CD5 TCL1B
CXCL11 CCL19 CA5A
GZMA MCP-4 TNFRSF6B
ANGPTL4 CCL18 CHIT1
IL6 CXCL10 TGF-α
TYMP LAIR-2 OSM
CD8A IL-12B PRTN3
SIGLEC1 CD6 MBL2
IL-15RA CD1C IL5
SLAMF1 CRTAM CLEC4D
CLEC6A KIR2DL3 COL1A1
CLEC10A ADAM 8 CLEC4C
SELE GZMB LIF
GDF-15 CCL21 IL-2RB
CLM-1 IFNL1 NOV
FOLR2 IL12 TNC
LIF-R DSC2 VSTM1
IL12RB1 CD163 WISP-1
CDH3 RETN TNFRSF10C
GM-CSF-R-α IL-1RT1 IL3RA
ST2 CD244 PGLYRP1
MSR1 CD48 ICAM3
PDCD1 TNF-R2 ICAM1
CSF-1 ARTN FCRL5
FcRL2 LY9 CLEC7A
CD200R1 CD79B VCAM1
      SLAMF8
      CDON
      FCER2
      SELL
      PON2
      CD209
      IL-10RB
      LAIR1
      TNF-R1
      KIRREL2
      FCRL1
      MILR1
      HAVCR2
      KPNA1
      TGFR-2
6B :第 24 週中 1.5% 魯索替尼 QD 1.5% 魯索替尼 BID 顯著下調之蛋白質
1.5% QD獨有 1.5% QD與1.5% BID均有 1.5% BID獨有
DEFB4A CXCL10 CXCL9
GZMH CCL19 IL-2RB
IL5 TRANCE COL1A1
SH2D1A CCL18 KIR2DL3
PTH1R TNFB LAP TGF-β-1
IL6 GZMB CHIT1
PTX3 TNFRSF9 IFNL1
sFRP-3 KLRD1 ITGB2
IL-15RA IL-12B SLAMF8
ESM-1 FASLG IL-18BP
CLM-1 MMP12 TNFSF13B
CDH3 CD160 LILRB4
TNC XCL1 FCER2
COL4A3BP CXCL11 TIMD4
CD79B LAIR-2 CD163
FCRL1 MCP-4 MILR1
PD-L1 IL12 NOV
IL17RB SIGLEC1 IL-18R1
TNFRSF13B CD6 TRAIL
LIF-R CLEC4C CDON
SIRT5 CD5 WISP-1
CD200R1 CRTAM PGF
IL-5R-α CCL21 CLEC4G
PDGF-R-α ADAM 8 SELL
TM IL10 ICAM1
WFIKKN1 CLEC7A VCAM1
EFNA4 SLAMF1 IL32
N2DL-2 CCL23 PILRA
GFR-α-1 CD1C DSC2
THBS2 MBL2 RELT
LY75 TNF-R2 KIRREL2
NBL1 IL12RB1 ICAM3
   CD48 DLL1
   GZMA Gal-9
   IL-1RT1 SIRPB1
   GM-CSF-R-α SIGLEC10
   PAPPA SIGLEC6
   TNFRSF4 hOSCAR
   IFNLR1 SHPS-1
   CD244   
   CSF-1   
   CD27   
   CD83   
   PON2   
   LY9   
   FcRL2   
   CLEC10A   
   PDCD1   
   CLM-6   
7A :第 12 1.5% 魯索替尼 QD 1.5% 魯索替尼 BID 中上調之蛋白質
1.5% QD獨有 1.5% QD與1.5% BID均有 1.5% BID獨有
GPNMB KLK13 NTRK3
CAMKK1 FGF-BP1 TF
PDGFRB EPO ITGAV
TYRO3 ITGB1 ERBB3
GFRA2 GALNT2 CLEC14A
SPON2 CRISP2 ERBB4
TCL1B ENTPD6 Nr-CAM
CA14 DPP4 NTRK2
IGF2R AOC3 EDA2R
MRC2 DCBLD2 LTBP2
LRRN1 ANGPTL7 DKKL1
TCN2 B4GAT1 CD58
ESAM SPINK5 Gal-3
SCGB3A1 TACSTD2 GDNFR-α-3
BCAM VEGFD FABP9
IGSF3 FAM3C α-2-MRAP
SMAD1 CLUL1 PRELP
SAA4 SOD2 DPEP1
ANG-1 CXCL16 MMP7
SEZ6L2 GPC1 SCARB2
APOM DKK3 BAMBI
IGFBPL1 CLEC4A ACAN
CPXM1 KLK6 DCN
METRNL RAGE PEAR1
ENAH KLK10 PODXL2
LRP11 FAM3B VWC2
VEGFA CD200 BLM水解酶
MFAP5 WFIKKN2 CCL25
MCFD2 CA6 SCARF2
ENTPD2 NCAM1 EZR
VEGFC DDC OPTC
CNTN2 SCGB3A2 EPHB6
PAI MOG PVR
APP CCL11 DPP10
ISLR2 CYR61 PRTG
CLMP Flt3L TMPRSS5
REG4 CEACAM5 CD70
KAZALD1 MMP-3 THPO
DPP7 GAL KIM1
CD46 APLP1 ROBO2
TIMP1    CDNF
COCH    SPOCK1
ROR1    ST3GAL1
IL7R    CNTN5
CXCL5    GCP5
PROC    GP1BA
IGFBP6    RGMB
PAM    LGALS7
MSLN    FUT8
SYND1    CXADR
COMP    MATN3
DPP6    SCF
MMP-1    NCAN
ST6GAL1    GDF-2
SOST    CAIX
ANGPTL3    RGMA
DSG4    NPTXR
CXCL1    PHOSPHO1
NID1    STX6
PLTP    PON3
CA4    gal-8
LEP    CADM3
CRTAC1    CX3CL1
F11    PADI2
MAP4K5    PREB
CES2    MDGA1
CCL5    SCGB1A1
OMG    IL-17A
      NEFL
      GIF
      TN-R
      ITM2A
      PLXNB3
      SMOC2
      Dkk-4
      BCAN
      MFGE8
      G-CSF
      P4HB
      PLIN1
      AGR3
      Ep-CAM
      TSHB
      TNNI3
7B :第 24 1.5% 魯索替尼 QD 1.5% 魯索替尼 BID 中上調之蛋白質
1.5% QD獨有 1.5% QD與1.5% BID均有 1.5% BID獨有
GALNT2 TACSTD2 CLEC14A
EGFR ITGB1 SPINT1
BAMBI IGF2R ROBO1
CNDP1 CNTN1 DCN
ST6GAL1 AOC3 PRELP
MEP1B VEGFD PVR
CA4 CLEC4A CDH1
KIT DKK3 RGMA
TIMP1 SPINK5 TMPRSS5
DPP6 CXCL16 GDNFR-α-3
ADGRG2 B4GAT1 GPC1
KLK6 BLM水解酶 LYPD3
PAI BCAM ITM2A
CXCL5 ISLR2 Notch 3
PROC TF ACAN
CLMP KLK10 hK11
MOG WFIKKN2 MSMB
PDGF次單元A hK8 SCF
EDIL3 F11 RGMB
MMP-1 Flt3L PRSS27
CA3 IL15 CRISP2
MB DDC CNTN5
KYAT1 P4HB PRTG
SPINK1 PLIN1 FABP9
MMP-3 CA6 RAGE
LGALS7 KLK13 MFAP5
TIMP4 Ep-CAM NTRK3
PCSK9    PON3
FAM3C    SOST
CES2    DPP10
CES1    CRIM1
TMPRSS15    CLUL1
      CTSV
      hK14
      COMP
      MDGA1
      GDF-2
      SMOC2
      NPTXR
      PHOSPHO1
      TNXB
      MFGE8
      CYR61
      TN-R
      WASF1
      CPA2
      PADI2
      BAG6
      GAL
      NAAA
      REG4
      GIF
      NID2
      GSAP
      TNFRSF12A
      NEFL
      MYOC
      CEACAM5
      EPO
研究用魯索替尼乳膏局部治療對循環中炎性介體表現之作用。針對廣泛蛋白質組學變化,利用基線及第24週樣品來分析來自130名參與者(媒劑n=23,0.15%每天一次[QD] n=26,0.5% QD n=27,1.5% QD n=24,n=1.5%每天兩次[BID] 30)之血清。配對t檢驗確定在p<0.05之截止值下處理組內顯著之變化。使用斯皮爾曼相關性(Spearman's correlation)評定基線生物標記物及面部白斑病面積評分指數(facial Vitiligo Area Scoring Index,F-VASI)。圖3中描繪與基線F-VASI正相關之循環中之蛋白質。圖4中描繪所選炎性介體自基線至第24週之變化倍數(值超過1指示增加,而值小於1指示減少)。總體而言,用魯索替尼乳膏局部治療及相關之皮膚改善符合循環炎性介體之劑量依賴性調節。在媒劑BID處理下所有炎性介體保持穩定或略微增加。在增加劑量之魯索替尼乳膏下炎性介體更顯著地減少。 實例3:面部白斑病面積評分指數之變化百分比與基線處之蛋白質、自基線至第12週之變化倍數及自基線至第24週之變化倍數之間的相關性
研究面部白斑病面積評分指數(VASI)之變化百分比與基線處之蛋白質、自基線至第12週之變化倍數及自基線至第24週之變化倍數之間的相關性。斯皮爾曼相關值>|0.3|及p值<0.05指示中度相關性。針對a)所有患者、b)反應者及c)無反應者,完成相關性。所有相關性計算均排除媒劑群組。呈現與面部VASI之變化百分比中等相關之蛋白質。
下表描述面部VASI之變化百分比與以下各者之關聯:a)基線蛋白質水準;b)自基線至第12週蛋白質表現之變化倍數;及c)自基線至第24週蛋白質表現之變化倍數。相關性之截止值為斯皮爾曼相關性>|0.3|及p<0.05,指示中等顯著相關。 8A :面部 VASI 之變化百分比與基線蛋白質水準之間的關聯
分析 斯皮爾曼相關性 p值
IL-20RA 0.34 <0.00013
PON2 0.34 <0.00013
8B :面部 VASI 之變化百分比與自基線至第 12 週蛋白質表現之變化倍數之間的關聯
分析 斯皮爾曼相關性 p值
DEFA1 -0.30 0.002
DKKL1 -0.35 <0.00012
8C :面部 VASI 之變化百分比與自基線至第 24 週蛋白質表現之變化倍數之間的關聯
分析 斯皮爾曼相關性 p值
GH 0.33 <0.00016
9A :反應者中面部 VASI 之變化百分比與基線蛋白質水準之間的關聯
反應 分析 斯皮爾曼相關性 p值
反應者中與面部 VASI 之變化百分比負相關之基線蛋白質
反應者 SCF -0.35 0.017
反應者 CPA2 -0.34 0.019
反應者 P4HB -0.34 0.019
反應者 SPARCL1 -0.34 0.021
反應者 ST2 -0.34 0.021
反應者 SCF -0.33 0.023
反應者 CNDP1 -0.33 0.024
反應者 TRAIL -0.32 0.027
反應者 KIRREL2 -0.32 0.028
反應者 SCF -0.32 0.029
反應者 EGFR -0.32 0.030
反應者 ISLR2 -0.32 0.030
反應者 PPP3R1 -0.32 0.030
反應者 FCGR3B -0.31 0.031
反應者 MMP-3 -0.31 0.031
反應者 IL-18BP -0.31 0.033
反應者 Flt3L -0.31 0.035
反應者 PPY -0.31 0.036
反應者 LTA4H -0.31 0.036
反應者 ITGB2 -0.30 0.037
反應者 PTN -0.30 0.038
反應者 GPNMB -0.30 0.039
反應者 SIRPB1 -0.30 0.040
反應者 PLTP -0.35 0.017
反應者 PSP-D -0.34 0.019
反應者 COMP -0.34 0.019
反應者 PAMR1 -0.34 0.021
反應者 VASN -0.34 0.021
反應者 F11 -0.33 0.023
反應者 IL10 -0.33 0.024
反應者 CA3 -0.32 0.027
反應者 CXCL10 -0.32 0.028
反應者 Notch 3 -0.32 0.029
反應者 NCAM1 -0.32 0.030
反應者 PROC -0.32 0.030
反應者 CLEC14A -0.32 0.030
反應者 IL-12B -0.31 0.031
反應者 IL10 -0.31 0.031
反應者 CD40 -0.31 0.033
反應者 IFN-γ -0.31 0.035
反應者中與面部 VASI 之變化百分比正相關之基線蛋白質
反應者 SERPINA12 12 0.34 0.019
反應者 GHRL 12 0.34 0.019
反應者 PREB 12 0.31 0.036
9B :無反應者中面部 VASI 之變化百分比與基線蛋白質水準之間的關聯
反應 分析 斯皮爾曼相關性 p值
無反應者中與面部 VASI 之變化百分比負相關之基線蛋白質
無反應者 EPHA10 -0.46 0.001
無反應者 GH2 -0.36 0.005
無反應者 PARP-1 -0.35 0.005
無反應者 GLRX -0.32 0.012
無反應者 ARSB -0.31 0.013
無反應者 SCAMP3 -0.30 0.016
無反應者中與面部 VASI 之變化百分比正相關之基線蛋白質
無反應者 t-PA 0.48 <0.0001
無反應者 LDL受體 0.45 <0.0001
無反應者 DLK-1 0.44 <0.0001
無反應者 SELE 0.40 0.001
無反應者 EPHB4 0.39 0.002
無反應者 GFRA2 0.38 0.002
無反應者 PLC 0.37 0.003
無反應者 LTBR 0.35 0.005
無反應者 PAMR1 0.35 0.006
無反應者 TACSTD2 0.35 0.006
無反應者 FS 0.34 0.006
無反應者 ICAM-2 0.34 0.007
無反應者 AXL 0.34 0.007
無反應者 PRSS8 0.33 0.009
無反應者 SPINK5 0.32 0.010
無反應者 AMN 0.32 0.011
無反應者 NOMO1 0.31 0.014
無反應者 PAI 0.31 0.015
無反應者 CPM 0.30 0.017
10A :反應者中面部 VASI 之變化百分比與自基線至第 12 週或自基線至第 24 週蛋白質水準之變化倍數之間的關聯
反應 分析 斯皮爾曼相關性 p值
反應者中與面部 VASI 之變化百分比負相關之蛋白質變化倍數
反應者 FAP 12 -0.45 0.002
反應者 RET 12 -0.44 0.002
反應者 CNTN5 12 -0.40 0.005
反應者 FUCA1 12 -0.40 0.006
反應者 ITGAV 12 -0.39 0.007
反應者 ITGB5 12 -0.39 0.008
反應者 THBS4 12 -0.38 0.009
反應者 CD207 12 -0.36 0.013
反應者 GDF-8 12 -0.36 0.013
反應者 CDH6 12 -0.36 0.013
反應者 MRC2 12 -0.36 0.015
反應者 ICOSLG 12 -0.36 0.015
反應者 TNXB 12 -0.35 0.017
反應者 EDIL3 12 -0.35 0.018
反應者 OSMR 12 -0.35 0.019
反應者 GPC1 12 -0.34 0.020
反應者 MIC-A/B 12 -0.34 0.021
反應者 TGFR-2 12 -0.34 0.022
反應者 LRRN1 12 -0.34 0.022
反應者 TLR3 12 -0.33 0.024
反應者 KIM1 12 -0.32 0.029
反應者 ROBO2 12 -0.32 0.030
反應者 CD70 12 -0.32 0.032
反應者 CLMP 12 -0.31 0.033
反應者 N-CDase 12 -0.31 0.034
反應者 FCRL5 12 -0.31 0.035
反應者 CTSV 12 -0.31 0.037
反應者 SCARF2 12 -0.31 0.037
反應者 KIM1 12 -0.31 0.038
反應者 PLXDC1 12 -0.31 0.038
反應者 PRTG 12 -0.31 0.039
反應者 ERBB4 12 -0.30 0.040
反應者 MAGED1 12 -0.30 0.040
反應者 CEACAM1 12 -0.30 0.042
反應者 TSHB 24 -0.54 <0.0001
反應者 PTK7 24 -0.46 0.001
反應者 ICOSLG 24 -0.36 0.014
反應者 TGFR-2 24 -0.34 0.023
反應者 RET 24 -0.33 0.027
反應者 ADAM 22 24 -0.32 0.030
反應者 CTSC 24 -0.32 0.031
反應者 DLK-1 24 -0.32 0.032
反應者 USP8 24 -0.32 0.035
反應者 SCARF2 24 -0.31 0.037
反應者 TNFRSF13B 24 -0.31 0.038
反應者 MB 24 -0.31 0.038
反應者 TMPRSS5 24 -0.30 0.044
反應者中與面部 VASI 之變化百分比正相關之蛋白質變化倍數
反應者 NUDT5 12 0.38 0.010
反應者 MMP-3 12 0.37 0.010
反應者 MAEA 12 0.36 0.013
反應者 NEMO 12 0.35 0.019
反應者 IFN-γ 12 0.34 0.020
反應者 IL18 12 0.33 0.024
反應者 AKT1S1 12 0.33 0.025
反應者 CASP-8 12 0.33 0.025
反應者 PPP1R2 12 0.33 0.026
反應者 ST2 12 0.33 0.027
反應者 VSIG4 12 0.32 0.028
反應者 SCGB3A2 12 0.32 0.028
反應者 HDGF 12 0.32 0.029
反應者 ICA1 12 0.32 0.030
反應者 IL13 12 0.32 0.032
反應者 PEBP1 12 0.31 0.033
反應者 PARK7 12 0.31 0.035
反應者 MAP4K5 12 0.31 0.036
反應者 FLI1 12 0.31 0.038
反應者 MMP-3 24 0.45 0.002
反應者 MMP-10 24 0.43 0.003
反應者 ST2 24 0.43 0.003
反應者 CCL24 24 0.42 0.004
反應者 TIMP4 24 0.41 0.006
反應者 MBL2 24 0.35 0.018
反應者 FLI1 24 0.33 0.029
反應者 IL18 24 0.32 0.030
反應者 REG4 24 0.32 0.032
反應者 IFN-γ 24 0.32 0.034
反應者 CPA2 24 0.31 0.037
10B :無反應者中面部 VASI 之變化百分比與自基線至第 12 週或自基線至第 24 週蛋白質水準之變化倍數之間的關聯
反應 分析 斯皮爾曼相關性 p值
無反應者中與面部 VASI 之變化百分比負相關之蛋白質變化倍數
無反應者 DDR1 12 -0.40 0.001
無反應者 NTRK2 12 -0.38 0.003
無反應者 CES2 12 -0.38 0.003
無反應者 SCARA5 12 -0.37 0.003
無反應者 GDF-8 12 -0.35 0.006
無反應者 BOC 12 -0.35 0.007
無反應者 PAEP 12 -0.35 0.007
無反應者 ARTN 12 -0.35 0.007
無反應者 CDNF 12 -0.34 0.008
無反應者 TMPRSS5 12 -0.34 0.008
無反應者 FLRT2 12 -0.34 0.009
無反應者 ROBO2 12 -0.33 0.011
無反應者 SIGLEC10 12 -0.33 0.011
無反應者 PRTG 12 -0.32 0.012
無反應者 SCARF2 12 -0.32 0.014
無反應者 CDH3 12 -0.32 0.014
無反應者 GFR-α-1 12 -0.31 0.015
無反應者 TSHB 12 -0.31 0.015
無反應者 CD200R1 12 -0.31 0.017
無反應者 RGMB 12 -0.31 0.017
無反應者 KYNU 12 -0.30 0.018
無反應者 HS3ST3B1 24 -0.37 0.004
無反應者 CHRDL2 24 -0.33 0.010
無反應者 CNTN1 24 -0.30 0.019
無反應者中與面部 VASI 之變化百分比正相關之蛋白質變化倍數
無反應者 VSIG4 12 0.38 0.002
無反應者 ARHGAP1 12 0.38 0.003
無反應者 B4GAT1 12 0.37 0.003
無反應者 STX8 12 0.37 0.004
無反應者 CRELD2 12 0.37 0.004
無反應者 ARSA 12 0.36 0.004
無反應者 BCAM 12 0.35 0.005
無反應者 SCARF1 12 0.34 0.007
無反應者 CA13 12 0.34 0.009
無反應者 DAG1 12 0.34 0.009
無反應者 LAIR1 12 0.33 0.009
無反應者 GUSB 12 0.33 0.009
無反應者 PMVK 12 0.33 0.009
無反應者 PEAR1 12 0.33 0.010
無反應者 GP1BA 12 0.33 0.011
無反應者 TACC3 12 0.32 0.013
無反應者 PARK7 12 0.31 0.016
無反應者 ARHGEF12 12 0.31 0.017
無反應者 SEMA7A 12 0.30 0.018
無反應者 ESAM 12 0.30 0.019
無反應者 FKBP5 12 0.30 0.020
無反應者 ARHGAP1 24 0.49 <0.0001
無反應者 SCAMP3 24 0.48 <0.0001
無反應者 ABL1 24 0.48 <0.0001
無反應者 EGF 24 0.48 <0.0001
無反應者 TACC3 24 0.47 <0.0001
無反應者 FKBP5 24 0.47 <0.0001
無反應者 BID 24 0.47 <0.0001
無反應者 PRDX5 24 0.47 <0.0001
無反應者 STX8 24 0.46 <0.0001
無反應者 CD63 24 0.46 <0.0001
無反應者 SCARF1 24 0.45 <0.0001
無反應者 PTPN1 24 0.45 <0.0001
無反應者 CLEC1B 24 0.44 <0.0001
無反應者 ARSB 24 0.44 <0.0001
無反應者 FKBP1B 24 0.43 0.001
無反應者 YES1 24 0.43 0.001
無反應者 SRC 24 0.43 0.001
無反應者 TNFSF14 24 0.42 0.001
無反應者 PLXNB3 24 0.42 0.001
無反應者 LRMP 24 0.42 0.001
無反應者 CD164 24 0.42 0.001
無反應者 DAG1 24 0.41 0.001
無反應者 PVALB 24 0.41 0.001
無反應者 NAA10 24 0.41 0.001
無反應者 TRIM5 24 0.41 0.001
無反應者 ARHGEF12 24 0.41 0.001
無反應者 HGF 24 0.40 0.001
無反應者 CA13 24 0.40 0.001
無反應者 SNAP23 24 0.40 0.002
無反應者 SORT1 24 0.40 0.002
無反應者 GP6 24 0.39 0.002
無反應者 CTSS 24 0.39 0.002
無反應者 PPIB 24 0.39 0.002
無反應者 CRKL 24 0.38 0.003
無反應者 MAP2K6 24 0.38 0.003
無反應者 MANF 24 0.38 0.003
無反應者 PMVK 24 0.38 0.003
無反應者 ABHD14B 24 0.38 0.003
無反應者 GUSB 24 0.38 0.003
無反應者 FATC1 24 0.38 0.003
無反應者 MAD1L1 24 0.37 0.003
無反應者 EDAR 24 0.37 0.004
無反應者 CEACAM8 24 0.37 0.004
無反應者 GLB1 24 0.36 0.004
無反應者 ST3GAL1 24 0.36 0.004
無反應者 ARSA 24 0.36 0.005
無反應者 ADAM 8 24 0.36 0.005
無反應者 CD40 24 0.36 0.005
無反應者 IFI30 24 0.36 0.005
無反應者 ECE1 24 0.35 0.006
無反應者 AXIN1 24 0.35 0.006
無反應者 WFDC2 24 0.35 0.006
無反應者 TBCB 24 0.35 0.007
無反應者 CXCL13 24 0.35 0.007
無反應者 ST1A1 24 0.35 0.007
無反應者 KIF1BP 24 0.35 0.007
無反應者 DPP7 24 0.34 0.007
無反應者 VEGFA 24 0.34 0.007
無反應者 CETN2 24 0.34 0.007
無反應者 TGF-α 24 0.34 0.008
無反應者 CD84 24 0.34 0.009
無反應者 SNAP29 24 0.34 0.009
無反應者 CASP-8 24 0.33 0.010
無反應者 S100A11 24 0.33 0.010
無反應者 GSTP1 24 0.33 0.010
無反應者 CRADD 24 0.33 0.010
無反應者 PRKAB1 24 0.33 0.011
無反應者 HGF 24 0.33 0.011
無反應者 STK4 24 0.33 0.011
無反應者 RNASE3 24 0.33 0.011
無反應者 SERPINB6 24 0.32 0.012
無反應者 OSM 24 0.32 0.012
無反應者 MK 24 0.32 0.012
無反應者 FADD 24 0.32 0.013
無反應者 CLEC11A 24 0.32 0.013
無反應者 CD69 24 0.32 0.013
無反應者 LOX-1 24 0.32 0.013
無反應者 ITGA6 24 0.31 0.015
無反應者 CLEC5A 24 0.31 0.015
無反應者 BCAM 24 0.31 0.015
無反應者 FES 24 0.31 0.016
無反應者 TXNDC5 24 0.31 0.016
無反應者 LAT2 24 0.31 0.018
無反應者 CXCL11 24 0.30 0.018
無反應者 PARP-1 24 0.30 0.018
無反應者 APBB1IP 24 0.30 0.018
無反應者 GZMB 24 0.30 0.019
無反應者 CRNN 24 0.30 0.019
實例4:在第12週及第24週在反應者之間及反應者內自基線之蛋白質組學變化
研究在第12週及第24週在反應者之間及反應者內自基線之蛋白質組學變化。進行配對t檢驗且在p<0.05下賦予顯著性。下表展示在反應者與無反應者之間顯著差異之蛋白質組學變化。反應定義為面部VASI > 50%之變化百分比。 11A :在第 12 週在反應者與無反應者 ( 排除媒劑 ) 之間蛋白質組學變化之差異
分析 p值 反應者變化倍數 無反應者變化倍數
WAS 12 0.001 1.26 0.90
TRIM21 12 0.001 1.07 0.92
DDAH1 12 0.002 1.11 0.97
PSIP1 12 0.002 1.18 0.93
IRF9 12 0.002 1.11 0.88
FGF-BP1 12 0.002 1.19 1.06
LGALS7 12 0.002 1.13 0.98
TACSTD2 12 0.002 1.06 1.00
CTSC 12 0.003 1.08 0.93
GDF-15 12 0.003 0.92 1.02
GLB1 12 0.003 1.19 0.88
HDGF 12 0.003 1.13 0.92
AMIGO2 12 0.003 1.05 0.97
GSAP 12 0.004 1.12 0.93
CD1C 12 0.004 0.90 0.98
CCL11 12 0.004 1.12 1.00
SIRT5 12 0.005 0.96 1.04
APBB1IP 12 0.005 1.09 0.91
COL4A3BP 12 0.006 1.04 0.93
LRMP 12 0.006 1.11 0.93
ADAM-TS13 12 0.006 1.03 0.98
DDX58 12 0.007 1.13 0.93
PIK3AP1 12 0.007 1.09 0.87
IL32 12 0.009 1.03 0.95
DKKL1 12 0.009 1.05 0.99
HS6ST1 12 0.010 1.07 0.97
ILKAP 12 0.010 1.17 0.93
PRKRA 12 0.010 1.06 0.95
FES 12 0.011 1.07 0.93
VEGFD 12 0.011 1.08 1.01
CCL23 12 0.011 0.90 1.01
CXCL1 12 0.011 1.12 1.00
ARSB 12 0.012 1.11 0.94
TRIM5 12 0.013 1.13 0.90
SPRY2 12 0.013 1.13 0.92
ENTPD6 12 0.013 1.06 1.00
CRISP2 12 0.013 1.06 0.99
TOP2B 12 0.014 1.15 0.84
CASP-8 12 0.014 1.04 0.88
CCL15 12 0.015 0.96 1.03
CCL27 12 0.015 1.03 0.97
IL15 12 0.016 1.12 1.04
PRDX5 12 0.016 1.13 0.86
SNCG 12 0.016 1.08 0.98
TNFRSF10C 12 0.016 0.91 0.98
DFFA 12 0.017 1.04 0.90
PLXNB3 12 0.017 1.13 0.97
METRNL 12 0.017 1.01 1.06
NPM1 12 0.018 1.14 0.95
PFKM 12 0.019 1.17 0.97
BST2 12 0.019 1.05 0.98
CD160 12 0.020 0.85 0.93
SERPINA5 12 0.020 1.05 0.97
BNP 12 0.021 1.06 0.98
DPP7 12 0.021 1.10 0.98
CXCL1 12 0.021 1.10 1.00
SLITRK2 12 0.021 1.05 0.98
CCL11 12 0.022 1.10 1.00
LRRN1 12 0.022 1.08 1.01
SIGLEC6 12 0.022 1.03 0.97
FHIT 12 0.022 1.05 0.95
CBL 12 0.022 1.06 0.88
PHOSPHO1 12 0.023 1.08 1.00
DCTN2 12 0.025 1.07 0.94
GSTP1 12 0.025 1.06 0.97
DSG3 12 0.025 1.03 0.96
NMNAT1 12 0.026 1.14 0.89
SRP14 12 0.026 1.15 0.90
NAAA 12 0.027 1.06 0.96
DEFA1 12 0.027 1.26 0.96
S100A4 12 0.027 1.08 0.94
Siglec-9 12 0.028 1.02 0.98
ARSA 12 0.028 1.09 0.97
CD46 12 0.030 1.06 0.99
S100A11 12 0.030 1.05 0.96
NPDC1 12 0.031 0.99 1.06
FLI1 12 0.031 1.04 0.94
CD79B 12 0.032 0.95 1.00
IGFBP-2 12 0.033 0.95 1.04
IL5 12 0.033 0.88 1.02
GCP5 12 0.033 1.07 0.98
UMOD 12 0.033 1.04 0.99
SOD2 12 0.034 1.06 1.01
gal-8 12 0.035 1.08 0.98
HCLS1 12 0.035 1.07 0.85
SORT1 12 0.036 1.05 0.98
ATP6V1F 12 0.036 1.06 0.96
XCL1 12 0.036 0.86 0.94
LIF 12 0.036 0.92 1.01
Flt3L 12 0.037 1.12 1.04
ABHD14B 12 0.037 1.06 0.93
PPP1R9B 12 0.037 1.03 0.89
MMP-1 12 0.039 1.11 1.00
APOM 12 0.039 1.05 1.00
SCGB3A1 12 0.039 1.08 1.01
IL-17D 12 0.039 1.04 0.99
HNMT 12 0.039 1.05 0.98
RBKS 12 0.040 1.06 0.94
MAD1L1 12 0.041 1.08 0.97
PODXL2 12 0.041 1.05 1.00
OPN 12 0.042 0.90 0.99
DPEP1 12 0.042 1.06 0.99
FURIN 12 0.044 1.07 0.99
ANXA1 12 0.044 1.12 0.96
NCAM1 12 0.045 1.08 1.02
PADI2 12 0.046 1.09 1.00
GFRA2 12 0.046 1.03 0.99
IL2-RA 12 0.046 0.86 0.95
CEACAM5 12 0.048 1.19 1.03
IRAK1 12 0.048 1.04 0.92
BTC 12 0.049 1.14 0.94
ARHGAP1 12 0.050 1.18 0.82
11B :在第 24 週在反應者與無反應者 ( 排除媒劑 ) 之間蛋白質組學變化之差異
分析 隨訪 p值 反應者變化倍數 無反應者變化倍數
WAS 24 0.001 1.09 0.99
TRIM21 24 0.001 1.05 0.97
DDAH1 24 0.002 1.07 1.01
PSIP1 24 0.002 1.21 0.98
IRF9 24 0.002 1.02 0.93
FGF-BP1 24 0.002 1.18 1.08
LGALS7 24 0.002 1.11 1.04
TACSTD2 24 0.002 1.05 1.00
CTSC 24 0.003 1.06 0.98
GDF-15 24 0.003 0.98 1.06
HDGF 24 0.003 1.13 1.02
GLB1 24 0.003 1.10 0.99
AMIGO2 24 0.003 1.03 1.00
GSAP 24 0.004 1.14 0.95
CD1C 24 0.004 0.90 0.99
CCL11 24 0.004 1.11 0.99
SIRT5 24 0.005 0.98 1.01
APBB1IP 24 0.005 1.11 1.00
COL4A3BP 24 0.006 0.99 0.97
LRMP 24 0.006 1.04 0.99
ADAM-TS13 24 0.006 1.01 1.01
DDX58 24 0.007 1.09 0.98
PIK3AP1 24 0.007 1.16 0.99
IL32 24 0.009 1.01 0.96
DKKL1 24 0.009 1.02 0.99
HS6ST1 24 0.010 1.06 0.99
ILKAP 24 0.010 1.07 0.98
PRKRA 24 0.010 1.06 0.99
FES 24 0.011 1.04 1.00
VEGFD 24 0.011 1.08 1.04
CCL23 24 0.011 0.89 0.99
CXCL1 24 0.011 1.05 1.00
ARSB 24 0.012 1.08 1.01
SPRY2 24 0.013 1.14 0.88
TRIM5 24 0.013 1.12 0.95
ENTPD6 24 0.013 1.03 0.99
CRISP2 24 0.013 1.06 1.00
TOP2B 24 0.014 1.13 0.98
CASP-8 24 0.014 1.08 0.99
CCL15 24 0.015 0.99 1.04
CCL27 24 0.015 1.02 0.99
IL15 24 0.016 1.11 1.04
PRDX5 24 0.016 1.13 0.96
SNCG 24 0.016 1.13 1.06
TNFRSF10C 24 0.016 0.97 1.02
DFFA 24 0.017 1.06 0.98
PLXNB3 24 0.017 1.09 1.01
METRNL 24 0.017 1.02 1.04
NPM1 24 0.018 1.16 1.04
PFKM 24 0.019 1.09 1.03
BST2 24 0.019 1.05 0.99
CD160 24 0.020 0.84 0.95
SERPINA5 24 0.020 1.11 1.03
BNP 24 0.021 1.01 0.99
DPP7 24 0.021 1.07 1.03
CXCL1 24 0.021 1.05 0.99
SLITRK2 24 0.021 1.01 1.01
CCL11 24 0.022 1.11 1.00
LRRN1 24 0.022 1.08 1.01
SIGLEC6 24 0.022 0.99 0.98
FHIT 24 0.022 1.04 1.00
CBL 24 0.022 1.10 0.97
PHOSPHO1 24 0.023 1.07 1.02
DCTN2 24 0.025 1.11 1.01
GSTP1 24 0.025 1.03 0.99
DSG3 24 0.025 0.99 0.99
NMNAT1 24 0.026 1.14 1.05
SRP14 24 0.026 1.15 1.04
NAAA 24 0.027 1.09 1.02
S100A4 24 0.027 1.09 1.04
DEFA1 24 0.027 1.03 0.97
Siglec-9 24 0.028 1.02 1.00
ARSA 24 0.028 1.06 1.02
S100A11 24 0.030 1.07 0.99
CD46 24 0.030 1.06 1.03
NPDC1 24 0.031 1.00 1.07
FLI1 24 0.031 1.05 0.98
CD79B 24 0.032 0.96 0.99
IGFBP-2 24 0.033 0.94 1.04
IL5 24 0.033 0.91 1.03
GCP5 24 0.033 1.03 1.00
UMOD 24 0.033 1.04 1.01
SOD2 24 0.034 1.05 1.02
gal-8 24 0.035 1.07 1.02
HCLS1 24 0.035 1.15 0.95
SORT1 24 0.036 1.02 1.00
ATP6V1F 24 0.036 1.01 1.02
XCL1 24 0.036 0.84 0.93
LIF 24 0.036 0.99 1.02
Flt3L 24 0.037 1.13 1.05
ABHD14B 24 0.037 1.05 1.02
PPP1R9B 24 0.037 1.01 0.96
MMP-1 24 0.039 1.13 1.01
APOM 24 0.039 1.08 0.99
SCGB3A1 24 0.039 1.07 1.08
IL-17D 24 0.039 1.02 0.98
HNMT 24 0.039 1.08 1.01
RBKS 24 0.040 1.11 1.02
MAD1L1 24 0.041 1.03 1.03
PODXL2 24 0.041 1.01 1.00
OPN 24 0.042 0.83 0.97
DPEP1 24 0.042 1.04 1.01
FURIN 24 0.044 1.07 1.00
ANXA1 24 0.044 1.12 1.01
NCAM1 24 0.045 1.09 1.02
PADI2 24 0.046 1.10 0.98
GFRA2 24 0.046 1.01 0.99
IL2-RA 24 0.046 0.83 0.94
CEACAM5 24 0.048 1.25 1.04
IRAK1 24 0.048 1.02 0.99
BTC 24 0.049 1.09 0.97
ARHGAP1 24 0.050 1.15 0.98
實例5:角化細胞中干擾素-γ及腫瘤壞死-α誘導之Janus激酶表現及隨後炎性介體之產生
轉型人類角化細胞(HaCaT)係購自AddexBio (目錄號T0020001)且在補充有10%胎牛血清(Hyclone,目錄號16140-071)及1x青黴素(Penicillin)/鏈黴素(Streptomycin) (Gibco,目錄號15140-122)的優化達爾伯克改良伊格爾培養基(Optimized Dulbecco’s Modified Eagle’s Medium) (AddexBio,目錄號C0003-02)中培養。當細胞達到80-90%匯合時,將其用1x DPBS洗滌,接著藉由與0.25%胰蛋白酶(Gibco,目錄號25200-056)一起在37℃/5% CO2 下培育3-5分鐘,自組織培養燒瓶分離。將細胞培養基添加至經胰蛋白酶處理之細胞,接著將細胞懸浮液轉移至無菌15 mL離心管,在1300 rpm下短暫離心10分鐘。自細胞團塊吸出含有胰蛋白酶之培養基,接著使糰粒再懸浮在10 mL細胞培養基中。使用Countess II自動化細胞計數器計數細胞,且以4×104 個細胞/毫升之濃度接種至經組織培養基處理之24孔盤,且在37℃/5% CO2 下培育48小時。在48小時後,移除培養基且替換為500 uL細胞培養基或重組人類干擾素-γ (R&D Systems,目錄號285-IF-100)與重組人類腫瘤壞死因子α (R&D Systems,目錄號210-TA-020)之組合刺激。用組合細胞介素刺激處理之HaCaT細胞以最終濃度為10 ng/mL、25 ng/mL、50 ng/mL或100 ng/mL之各細胞介素處理。藉由和緩攪動將經處理之盤混合30秒,接著在37℃/5% CO2 下培育24小時。在24小時培育結束時,立即自各盤移除培養基。
使用QuantiGene Plex分析試劑及方案(Affymetrix,目錄號QGP-232-M18042302)自HaCaT細胞分離RNA。將細胞用1x DPBS洗滌,接著藉由與所提供之QuantiGene溶解緩衝液一起在50-55℃下培育30分鐘而溶解。將細胞溶解產物與經設計以特異性地與來自所關注之標靶之mRNA雜交的捕獲珠粒及探針組一起在55℃下培育18-24小時。32個所關注之標靶的小組包括用於將結果正規化之看家基因。培育18-24小時之後,利用分支DNA方法,根據製造商之程序(Affymetrix,目錄號QGP-232-M18042302),擴增信號。在雜交及洗滌步驟之後,在Luminex 200上讀取分析盤且資料可表示為淨中值螢光強度。接著資料相對於看家基因HPRT1之淨中位螢光強度正規化(表12)。 12 :用 TNFα IFNγ 刺激人類角化細胞誘導 JAK/STAT 路徑及促炎性細胞介素
基因 處理 MFIa p
JAK1 媒劑 126.7 ± 6.55 -
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 178.19 ± 3.41 <.0001
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 195.02 ± 3.47 <.0001
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 198.23 ± 2.52 <.0001
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 207.34 ± 3.91 <.0001
JAK2 媒劑 21.7 ± 0.53 -
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 154.13 ± 11.65 <.0001
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 174.07 ± 12.34 <.0001
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 180.71 ± 13.63 <.0001
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 187.94 ± 13.12 <.0001
JAK3 媒劑 0.1 ± 0.02 -
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 0.16 ± 0.05 0.8111
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 0.18 ± 0.05 0.596
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 0.33 ± 0.06 0.0082
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 0.28 ± 0.06 0.0532
TYK2 媒劑 167.84 ± 2.25 -
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 240.49 ± 4.4 <.0001
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 250.15 ± 3.41 <.0001
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 257.24 ± 3.55 <.0001
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 265.37 ± 3.1 <.0001
STAT1 媒劑 484.33 ± 4.52 -
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 3834.09 ± 65.62 <.0001
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 3935.51 ± 66.15 <.0001
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 3943.03 ± 63.05 <.0001
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 4136.09 ± 67.06 <.0001
STAT3 媒劑 606.76 ± 11.51 -
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 1561.14 ± 40.35 <.0001
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 1652.97 ± 39.53 <.0001
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 1666.52 ± 52.15 <.0001
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 1742.81 ± 38.26 <.0001
STAT4 媒劑 2.27 ± 0.12 -
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 3.78 ± 0.22 <.0001
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 3.84 ± 0.23 <.0001
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 3.72 ± 0.25 <.0001
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 3.61 ± 0.28 0.0003
STAT5A 媒劑 1.03 ± 0.1 -
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 26.06 ± 3.1 <.0001
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 28.58 ± 3.23 <.0001
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 31.01 ± 3.37 <.0001
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 29.61 ± 2.91 <.0001
STAT5B 媒劑 37.04 ± 1.85 _   
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 28.06 ± 0.7 0.0002
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 31.37 ± 1.24 0.0288
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 34.89 ± 0.88 0.693
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 41.66 ± 2.17 0.0978
STAT6 媒劑 626.95 ± 22 -
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 1010.38 ± 14.28 <.0001
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 1044.97 ± 12.71 <.0001
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 1039.59 ± 10.5 <.0001
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 1059.01 ± 13.45 <.0001
IL1A 媒劑 156.9 ± 1.89 -
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 1786.44 ± 31.13 <.0001
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 2135.03 ± 66.58 <.0001
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 2256.89 ± 90.79 <.0001
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 2459.6 ± 106.2 <.0001
IL6 媒劑 5.89 ± 0.19 -
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 311.31 ± 38.81 0.0002
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 410.93 ± 52.93 <.0001
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 464.27 ± 61.46 <.0001
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 519.31 ± 68.04 <.0001
AREG 媒劑 400.84 ± 7.25 _   
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 1265.9 ± 28.84 <.0001
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 1336.82 ± 61.28 <.0001
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 1403.44 ± 80.21 <.0001
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 1644.4 ± 105.83 <.0001
CCL17 媒劑 400.84 ± 7.25 _   
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 1265.9 ± 28.84 <.0001
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 1336.82 ± 61.28 <.0001
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 1403.44 ± 80.21 <.0001
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 1644.4 ± 105.83 <.0001
CCL18 媒劑 400.84 ± 7.25 _   
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 1265.9 ± 28.84 <.0001
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 1336.82 ± 61.28 <.0001
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 1403.44 ± 80.21 <.0001
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 1644.4 ± 105.83 <.0001
FLG 媒劑 400.84 ± 7.25 _   
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 1265.9 ± 28.84 <.0001
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 1336.82 ± 61.28 <.0001
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 1403.44 ± 80.21 <.0001
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 1644.4 ± 105.83 <.0001
IL-17A 媒劑 0.15 ± 0.02 _   
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 0.44 ± 0.07 0.0957
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 0.49 ± 0.07 0.0367
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 0.6 ± 0.1 0.0032
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 0.71 ± 0.15 0.0002
IL-1A 媒劑 156.9 ± 1.89 _   
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 1786.44 ± 31.13 <.0001
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 2135.03 ± 66.58 <.0001
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 2256.89 ± 90.79 <.0001
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 2459.6 ± 106.2 <.0001
IL-22 媒劑 0.23 ± 0.03 _   
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 0.41 ± 0.09 0.388
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 0.47 ± 0.09 0.1539
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 0.48 ± 0.11 0.1227
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 0.67 ± 0.09 0.0015
IL-23A 媒劑 12.76 ± 0.37 _   
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 38.09 ± 2.39 <.0001
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 39.07 ± 2.15 <.0001
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 42.28 ± 1.89 <.0001
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 47.07 ± 1.65 <.0001
IL-31 媒劑 0.04 ± 0.01 _   
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 0.22 ± 0.07 0.3665
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 0.11 ± 0.04 0.9472
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 0.32 ± 0.09 0.0847
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 0.86 ± 0.15 <.0001
IL-8 媒劑 74.64 ± 3.13 _   
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 617.68 ± 42.23 <.0001
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 728.81 ± 54.99 <.0001
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 802.14 ± 74.58 <.0001
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 911.16 ± 81.8 <.0001
LOR 媒劑 0.04 ± 0.01 _   
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 0.22 ± 0.07 0.3665
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 0.11 ± 0.04 0.9472
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 0.32 ± 0.09 0.0847
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 0.86 ± 0.15 <.0001
S100A12 媒劑 0.04 ± 0.01 _   
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 0.22 ± 0.07 0.3665
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 0.11 ± 0.04 0.9472
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 0.32 ± 0.09 0.0847
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 0.86 ± 0.15 <.0001
S100A7 媒劑 0.04 ± 0.01 _   
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 0.22 ± 0.07 0.3665
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 0.11 ± 0.04 0.9472
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 0.32 ± 0.09 0.0847
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 0.86 ± 0.15 <.0001
SERPINB3 媒劑 0.04 ± 0.01 _   
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 0.22 ± 0.07 0.3665
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 0.11 ± 0.04 0.9472
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 0.32 ± 0.09 0.0847
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 0.86 ± 0.15 <.0001
SERPINB4 媒劑 0.04 ± 0.01 _   
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 0.22 ± 0.07 0.3665
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 0.11 ± 0.04 0.9472
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 0.32 ± 0.09 0.0847
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 0.86 ± 0.15 <.0001
TNF-α 媒劑 2.18 ± 0.17 _   
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 41.6 ± 4.36 <.0001
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 47.25 ± 4.66 <.0001
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 49.39 ± 5.12 <.0001
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 46.97 ± 3.58 <.0001
VEGFA 媒劑 280 ± 5.86 _   
   10 ng/ml TNFα/IFNγ 777.83 ± 43.18 <.0001
   25 ng/ml TNFα/IFNγ 828.3 ± 42.48 <.0001
   50 ng/ml TNFα/IFNγ 874.08 ± 47.85 <.0001
   100 ng/ml TNFα/IFNγ 941.78 ± 48.85 <.0001
a 資料呈現為平均值±標準誤差(SEM)
偵測培養基中所關注之標靶蛋白且使用ProCarta Multiplex免疫分析試劑及方案(Invitrogen,目錄號EPX450-12171-901)定量。將培養基與抗體結合之珠粒一起培育,該等抗體結合之珠粒經設計以結合於特異性標靶蛋白之抗原決定基且經由珠粒特殊之光譜圖鑑定結合蛋白。將生物素化之偵測抗體及抗生蛋白鏈菌素-PE添加至分析盤以定量標靶蛋白之量,該等生物素化之偵測抗體經設計以結合於同一標靶蛋白之不同抗原決定基。在Luminex 200上讀取分析盤且資料可表示為淨中位螢光強度。根據製造商之程序(Invitrogen,目錄號EPX450-12171-901)製備的抗原標準曲線之淨中位螢光強度值相對於各標準之預期濃度繪圖。自抗原標準曲線推斷各蛋白質之濃度且濃度可表示為pg/mL (表13)。 13 :用 TNFα IFNγ 刺激人類角化細胞誘導促炎性細胞介素產生
蛋白質 處理 pg/mLa p
BDNF 媒劑 4.15 ± 0.08 _   
10ng/ml TNF/IFN 4.15 ± 0.19 >0.9999
25ng/ml TNF/IFN 4.09 ± 0.16 0.9977
50ng/ml TNF/IFN 3.84 ± 0.17 0.4162
100ng/ml TNF/IFN 3.68 ± 0.14 0.1121
EGF 媒劑 0.83 ± 0.13 _   
10ng/ml TNF/IFN 0.9 ± 0.08 0.9983
25ng/ml TNF/IFN 1.44 ± 0.16 0.1401
50ng/ml TNF/IFN 2.55 ± 0.22 <.0001
100ng/ml TNF/IFN 5.49 ± 0.35 <.0001
伊紅趨素 媒劑 2.95 ± 0.33 _   
10ng/ml TNF/IFN 9.46 ± 0.33 <.0001
25ng/ml TNF/IFN 9.67 ± 0.34 <.0001
50ng/ml TNF/IFN 9.49 ± 0.39 <.0001
100ng/ml TNF/IFN 9.83 ± 0.37 <.0001
FGF-2 媒劑 20.84 ± 1.64 _   
10ng/ml TNF/IFN 40.98 ± 3.26 <.0001
25ng/ml TNF/IFN 40.02 ± 3.17 <.0001
50ng/ml TNF/IFN 39.86 ± 3.16 <.0001
100ng/ml TNF/IFN 38.08 ± 2.95 0.0003
GM-CSF 媒劑 25.71 ± 2.38 _   
10ng/ml TNF/IFN 134.07 ± 3.66 <.0001
25ng/ml TNF/IFN 141.84 ± 4.48 <.0001
50ng/ml TNF/IFN 142.45 ± 5.69 <.0001
100ng/ml TNF/IFN 140.49 ± 4.62 <.0001
GROα 媒劑 305.38 ± 40.82 _   
10ng/ml TNF/IFN 688.25 ± 83.68 0.0009
25ng/ml TNF/IFN 698.98 ± 81.47 0.0006
50ng/ml TNF/IFN 610.81 ± 69.54 0.0103
100ng/ml TNF/IFN 548.83 ± 66.13 0.0546
HGF 媒劑 7.57 ± 0.65 _   
10ng/ml TNF/IFN 14.55 ± 1.05 0.0006
25ng/ml TNF/IFN 16.49 ± 1.01 <.0001
50ng/ml TNF/IFN 19.3 ± 1.44 <.0001
100ng/ml TNF/IFN 27.71 ± 1.76 <.0001
IFNα 媒劑 0.21 ± 0.02 _   
10ng/ml TNF/IFN 0.26 ± 0 0.0144
25ng/ml TNF/IFN 0.26 ± 0 0.0144
50ng/ml TNF/IFN 0.26 ± 0 0.0144
100ng/ml TNF/IFN 0.25 ± 0.01 0.1082
IFNγ 媒劑 6.79 ± 0.41 _   
10ng/ml TNF/IFN 15919.19 ± 802.52 <.0001
25ng/ml TNF/IFN 23228.32 ± 780.43 <.0001
50ng/ml TNF/IFN 22666.44 ± 788.93 <.0001
100ng/ml TNF/IFN 19582.48 ± 496.94 <.0001
IL1α 媒劑 0.37 ± 0.05 _   
10ng/ml TNF/IFN 13.22 ± 1.24 <.0001
25ng/ml TNF/IFN 15.12 ± 1.48 <.0001
50ng/ml TNF/IFN 14.74 ± 1.45 <.0001
100ng/ml TNF/IFN 13.64 ± 1.29 <.0001
IL1β 媒劑 0.69 ± 0.09 _   
10ng/ml TNF/IFN 9.79 ± 0.64 <.0001
25ng/ml TNF/IFN 11.45 ± 0.8 <.0001
50ng/ml TNF/IFN 14.14 ± 0.98 <.0001
100ng/ml TNF/IFN 23.46 ± 1.72 <.0001
IL10 媒劑 0.28 ± 0.07 _   
10ng/ml TNF/IFN 0.37 ± 0.03 0.9194
25ng/ml TNF/IFN 0.47 ± 0.04 0.4732
50ng/ml TNF/IFN 0.95 ± 0.06 <.0001
100ng/ml TNF/IFN 2.4 ± 0.2 <.0001
IL12p70 媒劑 0.59 ± 0.04 _   
10ng/ml TNF/IFN 1.07 ± 0.03 <.0001
25ng/ml TNF/IFN 1.18 ± 0.04 <.0001
50ng/ml TNF/IFN 1.37 ± 0.04 <.0001
100ng/ml TNF/IFN 1.55 ± 0.04 <.0001
IL13 媒劑 1.28 ± 0.05 _   
10ng/ml TNF/IFN 1.41 ± 0.19 0.9825
25ng/ml TNF/IFN 2.3 ± 0.23 0.0052
50ng/ml TNF/IFN 2.79 ± 0.3 <.0001
100ng/ml TNF/IFN 2.98 ± 0.23 <.0001
IL15 媒劑 1.39 ± 0 _   
10ng/ml TNF/IFN 1.43 ± 0.14 0.9999
25ng/ml TNF/IFN 1.62 ± 0.18 0.9145
50ng/ml TNF/IFN 1.79 ± 0.35 0.6378
100ng/ml TNF/IFN 3.16 ± 0.39 <.0001
IL17A 媒劑 1.21 ± 0.13 _   
10ng/ml TNF/IFN 2.14 ± 0.15 0.7274
25ng/ml TNF/IFN 3.27 ± 0.34 0.104
50ng/ml TNF/IFN 6.05 ± 0.65 <.0001
100ng/ml TNF/IFN 14.95 ± 1.29 <.0001
IL18 媒劑 4.38 ± 0.69 _   
10ng/ml TNF/IFN 110.9 ± 2.53 <.0001
25ng/ml TNF/IFN 122.55 ± 1.91 <.0001
50ng/ml TNF/IFN 120.77 ± 1.51 <.0001
100ng/ml TNF/IFN 118.99 ± 1.8 <.0001
IL1RA 媒劑 585.47 ± 72.44 _   
10ng/ml TNF/IFN 7383.84 ± 804.86 <.0001
25ng/ml TNF/IFN 7420.07 ± 815.17 <.0001
50ng/ml TNF/IFN 7311.36 ± 802.4 <.0001
100ng/ml TNF/IFN 7548.02 ± 827.05 <.0001
IL2 媒劑 3.54 ± 0.43 _   
10ng/ml TNF/IFN 16.3 ± 1.24 0.0082
25ng/ml TNF/IFN 23.72 ± 1.43 <.0001
50ng/ml TNF/IFN 37.7 ± 2.7 <.0001
100ng/ml TNF/IFN 70.58 ± 5.44 <.0001
IL21 媒劑 2.62 ± 0.18 _   
10ng/ml TNF/IFN 2.88 ± 0 0.0911
25ng/ml TNF/IFN 2.88 ± 0 0.0911
50ng/ml TNF/IFN 2.88 ± 0 0.0911
100ng/ml TNF/IFN 2.88 ± 0 0.0911
IL22 媒劑 8.41 ± 0.71 _   
   10ng/ml TNF/IFN 8.68 ± 0.22 0.9808
   25ng/ml TNF/IFN 8.9 ± 0 0.8618
   50ng/ml TNF/IFN 8.21 ± 0.47 0.994
   100ng/ml TNF/IFN 8.24 ± 0.52 0.997
IL23 媒劑 5.68 ± 0.71 _   
   10ng/ml TNF/IFN 6.64 ± 0.55 0.413
   25ng/ml TNF/IFN 7.07 ± 0.36 0.1265
   50ng/ml TNF/IFN 7.43 ± 0 0.036
   100ng/ml TNF/IFN 7 ± 0.44 0.1598
IL27 媒劑 8.55 ± 1.54 _   
   10ng/ml TNF/IFN 6.61 ± 0.18 0.946
   25ng/ml TNF/IFN 6.59 ± 0.81 0.9441
   50ng/ml TNF/IFN 10.05 ± 2.65 0.9777
   100ng/ml TNF/IFN 19.3 ± 4.41 0.009
IL31 媒劑 2.99 ± 0.4 _   
   10ng/ml TNF/IFN 4.34 ± 0.81 0.2722
   25ng/ml TNF/IFN 4.52 ± 0.56 0.1789
   50ng/ml TNF/IFN 3.55 ± 0.39 0.8899
   100ng/ml TNF/IFN 4.06 ± 0.55 0.4739
IL4 媒劑 5.48 ± 0.44 _   
   10ng/ml TNF/IFN 4.99 ± 0.68 0.9822
   25ng/ml TNF/IFN 6.4 ± 0.7 0.8529
   50ng/ml TNF/IFN 7.24 ± 1 0.3834
   100ng/ml TNF/IFN 8.75 ± 1.18 0.0261
IL5 媒劑 3.72 ± 0 _   
   10ng/ml TNF/IFN 26.46 ± 1.88 <.0001
   25ng/ml TNF/IFN 29.73 ± 1.67 <.0001
   50ng/ml TNF/IFN 33.05 ± 2.37 <.0001
   100ng/ml TNF/IFN 47.28 ± 3.85 <.0001
IL6 媒劑 72.86 ± 9.77 _   
   10ng/ml TNF/IFN 2012.1 ± 337.23 0.0001
   25ng/ml TNF/IFN 2329.01 ± 384.78 <.0001
   50ng/ml TNF/IFN 2208.6 ± 370.81 <.0001
   100ng/ml TNF/IFN 1889.75 ± 298.39 0.0004
IL7 媒劑 2.55 ± 0.19 _   
   10ng/ml TNF/IFN 2.12 ± 0.14 0.1103
   25ng/ml TNF/IFN 2.06 ± 0.1 0.0537
   50ng/ml TNF/IFN 2.03 ± 0.12 0.0378
   100ng/ml TNF/IFN 2.14 ± 0.14 0.137
IL8 媒劑 659.4 ± 97.41 _   
   10ng/ml TNF/IFN 3799.39 ± 339.11 <.0001
   25ng/ml TNF/IFN 3995.6 ± 356.89 <.0001
   50ng/ml TNF/IFN 3698.94 ± 353.51 <.0001
   100ng/ml TNF/IFN 3292.06 ± 314.73 <.0001
IL9 媒劑 6.01 ± 1.19 _   
   10ng/ml TNF/IFN 3.99 ± 0.48 0.2022
   25ng/ml TNF/IFN 3.91 ± 0.4 0.1747
   50ng/ml TNF/IFN 5.08 ± 0.69 0.8074
   100ng/ml TNF/IFN 5.47 ± 0.82 0.9645
IP-10/CXCL10 媒劑 16.61 ± 1.6 _   
   10ng/ml TNF/IFN 3275.51 ± 174.48 <.0001
   25ng/ml TNF/IFN 3243.28 ± 178.41 <.0001
   50ng/ml TNF/IFN 3209.56 ± 211.43 <.0001
   100ng/ml TNF/IFN 2978.45 ± 167.27 <.0001
LIF 媒劑 60.23 ± 7 _   
   10ng/ml TNF/IFN 121.31 ± 11.64 0.0002
   25ng/ml TNF/IFN 120.23 ± 11.48 0.0002
   50ng/ml TNF/IFN 112.18 ± 10.84 0.0017
   100ng/ml TNF/IFN 100.63 ± 8.12 0.0195
MCP1 媒劑 575.07 ± 57.34 _   
   10ng/ml TNF/IFN 99191.31 ± 42809.9 >0.9999
   25ng/ml TNF/IFN 711985.75 ± 650934.52 0.9442
   50ng/ml TNF/IFN 43521.49 ± 10251.23 >0.9999
   100ng/ml TNF/IFN 1906255.02 ± 1861136.23 0.3587
MIP1α 媒劑 7.47 ± 1.13 _   
   10ng/ml TNF/IFN 525.75 ± 87.5 <.0001
   25ng/ml TNF/IFN 546.69 ± 92.35 <.0001
   50ng/ml TNF/IFN 531.55 ± 91.88 <.0001
   100ng/ml TNF/IFN 409.14 ± 60.62 0.0012
MIP1β 媒劑 133.69 ± 15.91 _   
   10ng/ml TNF/IFN 312.85 ± 20.44 <.0001
   25ng/ml TNF/IFN 319.91 ± 20.09 <.0001
   50ng/ml TNF/IFN 305.48 ± 20.78 <.0001
   100ng/ml TNF/IFN 281.82 ± 17.93 <.0001
PDGF-BB 媒劑 3.88 ± 0.47 _   
   10ng/ml TNF/IFN 7.89 ± 0.95 0.0039
   25ng/ml TNF/IFN 8.11 ± 0.99 0.0022
   50ng/ml TNF/IFN 7.52 ± 0.92 0.01
   100ng/ml TNF/IFN 6.52 ± 0.72 0.0902
PIGF-1 媒劑 43.42 ± 4.08 _   
   10ng/ml TNF/IFN 81.42 ± 4.94 <.0001
   25ng/ml TNF/IFN 79.48 ± 4.09 <.0001
   50ng/ml TNF/IFN 73.14 ± 4.31 <.0001
   100ng/ml TNF/IFN 61.36 ± 3.52 0.0127
RANTES 媒劑 11.78 ± 1.41 _   
   10ng/ml TNF/IFN 126.13 ± 5.15 <.0001
   25ng/ml TNF/IFN 127.73 ± 2.8 <.0001
   50ng/ml TNF/IFN 119.95 ± 4.67 <.0001
   100ng/ml TNF/IFN 103.48 ± 7.09 <.0001
SCF 媒劑 1.94 ± 0.06 _   
   10ng/ml TNF/IFN 3.14 ± 0.05 <.0001
   25ng/ml TNF/IFN 3.13 ± 0.05 <.0001
   50ng/ml TNF/IFN 2.95 ± 0.06 <.0001
   100ng/ml TNF/IFN 2.89 ± 0.07 <.0001
SDF-1α 媒劑 1118.99 ± 135.41 _   
   10ng/ml TNF/IFN 3192.57 ± 228.82 <.0001
   25ng/ml TNF/IFN 3205.2 ± 218.97 <.0001
   50ng/ml TNF/IFN 3032.51 ± 212.4 <.0001
   100ng/ml TNF/IFN 2658.04 ± 190.6 <.0001
TNFα 媒劑 2.91 ± 0.61 _   
   10ng/ml TNF/IFN 3939.26 ± 53.96 0.9636
   25ng/ml TNF/IFN 17995.73 ± 1620.77 0.0793
   50ng/ml TNF/IFN 57409.04 ± 12245.5 <.0001
   100ng/ml TNF/IFN 41410 ± 610 <.0001
TNFβ 媒劑 4.34 ± 0.38 _   
   10ng/ml TNF/IFN 4.9 ± 0.45 0.8774
   25ng/ml TNF/IFN 4.55 ± 0.29 0.9964
   50ng/ml TNF/IFN 5.6 ± 0.97 0.3051
   100ng/ml TNF/IFN 4.2 ± 0.38 0.9994
VEGF-A 媒劑 1293.03 ± 126.33 _   
   10ng/ml TNF/IFN 2226.76 ± 233.38 0.0016
   25ng/ml TNF/IFN 2066.69 ± 194.45 0.0113
   50ng/ml TNF/IFN 1829.38 ± 195.87 0.1193
   100ng/ml TNF/IFN 1372.76 ± 118.46 0.9935
VEGF-D 媒劑 7.77 ± 0.61 _   
   10ng/ml TNF/IFN 11.87 ± 0.67 <.0001
   25ng/ml TNF/IFN 12.02 ± 0.45 <.0001
   50ng/ml TNF/IFN 11.83 ± 0.67 <.0001
   100ng/ml TNF/IFN 10.98 ± 0.5 0.0009
bNGF 媒劑 7.59 ± 1.1 _   
   10ng/ml TNF/IFN 11.65 ± 0.89 0.03
   25ng/ml TNF/IFN 10.97 ± 1.04 0.0893
   50ng/ml TNF/IFN 10.01 ± 1.32 0.3156
   100ng/ml TNF/IFN 8.2 ± 0.92 0.9829
a 資料呈現為平均值±標準誤差(SEM)
實例6:Janus激酶抑制劑干擾角化細胞中干擾素-γ及腫瘤壞死-α誘導之炎症
轉型人類角化細胞(HaCaT)係購自AddexBio (目錄號T0020001)且如實例5中所概述來培養。將四種化合物A-D (化合物A:魯索替尼,化合物B:伊他替尼({1-{1-[3-氟-2-(三氟甲基)異菸鹼醯基]哌啶-4-基}-3[4-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡唑-1-基]氮雜環丁烷-3-基}乙腈),化合物C:4-[3-(氰基甲基)-3-(3',5'-二甲基-1H,1'H-4,4'-聯吡唑-1-基)氮雜環丁烷-1-基]-2,5-二氟-N-[(1S)-2,2,2-三氟-1-甲基乙基]苯甲醯胺,化合物D:((2R,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥基乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)乙腈)在DMSO中復原,接著將各化合物用細胞培養基連續稀釋至400 nM、200 nM、100 nM及50 nM濃度。48小時之後,自24孔盤移除細胞培養基且替換為250 uL含有連續稀釋之藥物的培養基,接著在37℃/5% CO2 下培育15分鐘。在藥物培育之後,將250 uL含有重組人類干擾素γ (R&D Systems,目錄號285-IF-100)與重組人類腫瘤壞死因子α (R&D Systems,目錄號210-TA-020)之組合刺激添加至盤中。重組人類干擾素γ及重組人類腫瘤壞死因子α之最終濃度為25 ng/mL各細胞介素。添加至含有藥物之孔的細胞介素刺激使各藥物處理之最終濃度為25 nM、50 nM、100 nM及200 nM。藉由和緩攪動將經處理之盤混合30秒,接著在37℃/5% CO2 下培育24小時。在24小時培育結束時,立即自各盤移除培養基。
使用QuantiGene Plex分析試劑及方案(Affymetrix,目錄號QGP-232-M18042302),根據製造商之指南,自HaCaT細胞分離RNA。將細胞用1x DPBS洗滌,接著藉由與所提供之QuantiGene溶解緩衝液一起在50-55℃下培育30分鐘而溶解。將細胞溶解產物與經設計以特異性地與來自所關注之標靶之mRNA雜交的捕獲珠粒及探針組一起在55℃下培育18-24小時。基因包括用於將結果正規化之看家基因(例如HPRT1及GAPDH)。培育18-24小時之後,利用分支DNA方法,根據製造商之程序(Affymetrix,目錄號QGP-232-M18042302),擴增信號。在雜交及洗滌步驟之後,在Luminex 200上讀取分析盤且資料可表示為淨中位螢光強度。接著資料相對於看家基因HPRT1之淨中位螢光強度正規化(表14)。 14 :在 JAK 抑制劑存在 / 缺乏下用 TNFα IFNγ 刺激之人類角化細胞中標靶基因之正規化表現
         化合物A 化合物B 化合物C 化合物D
基因 刺激 a 藥物濃度 MFI b p c MFI b p c MFI b p c MFI b p c
   - - 280.78 ± 16.51
AREG 25 ng/mL    751.69 ± 31.99¥
- 200 nM 260.77 ± 22.45 0.9518 260.61 ± 14.67 0.9502 242.5 ± 16.14 0.6149 251.8 ± 23.68 0.8192
25 ng/mL 25 nM 760.69 ± 22.09 0.9975 737.85 ± 22.1 0.9832 703.71 ± 20.69 0.5239 725.6 ± 33.78 0.9652
25ng/mL 50 nM 777.53 ± 28.12 0.8906 701.57 ± 12.75 0.3979 719.73 ± 30.82 0.8126 778.42 ± 44.28 0.9621
25ng/mL 100 nM 729.54 ± 20.47 0.933 731.24 ± 25.4 0.9345 669.44 ± 30.13 0.1075 703.3 ± 37.3 0.7655
25ng/mL 200 nM 699.96 ± 26.4 0.4532 730.41 ± 24.58 0.9254 681.68 ± 16.1 0.206 713.33 ± 37.27 0.8774
CCL17 - - 1.24 ± 0.32
25 ng/mL    2.58 ± 0.39
- 200 nM 1.91 ± 0.63 0.6035 1.56 ± 0.38 0.9645 0.99 ± 0.28 0.9885 0.94 ± 0.14 0.9724
25 ng/mL 25 nM 3.2 ± 0.5 0.7354 3.37 ± 0.54 0.487 2.63 ± 0.4 0.9999 3.08 ± 0.64 0.8407
25ng/mL 50 nM 2.5 ± 0.39 0.9999 3.06 ± 0.34 0.8373 2.94 ± 0.35 0.9148 2.71 ± 0.41 0.9987
25ng/mL 100 nM 2.99 ± 0.35 0.9168 2.87 ± 0.33 0.9682 3.06 ± 0.47 0.8012 2.86 ± 0.3 0.9756
25ng/mL 200 nM 3.86 ± 0.64 0.1754 3.13 ± 0.48 0.7611 2.59 ± 0.34 1 2.34 ± 0.4 0.9873
CCL18 - - 1.7 ± 0.53
25 ng/mL    1.86 ± 0.21
- 200 nM 1.17 ± 0.27 0.8529 1.49 ± 0.37 0.997 1.56 ± 0.73 0.9995 0.95 ± 0.19 0.6111
25 ng/mL 25 nM 1.92 ± 0.33 0.9997 2.12 ± 0.32 0.949 2.11 ± 0.28 0.9923 1.89 ± 0.28 0.9999
25ng/mL 50 nM 1.89 ± 0.37 1 2.2 ± 0.35 0.8808 2.13 ± 0.46 0.9891 2.16 ± 0.22 0.8129
25ng/mL 100 nM 1.7 ± 0.37 0.9909 2.01 ± 0.44 0.9932 2.55 ± 0.87 0.775 1.74 ± 0.26 0.9928
25ng/mL 200 nM 1.52 ± 0.37 0.8881 1.68 ± 0.32 0.9872 1.74 ± 0.62 0.9996 1.57 ± 0.3 0.847
FLG - - 258.99 ± 34.78
25 ng/mL    66.67 ± 9.89
- 200 nM 251.29 ± 35.44 0.9999 256.93 ± 36.45 >0.999 211.48 ± 29.55 0.7251 219.44 ± 34.83 0.8406
25 ng/mL 25 nM 100.31 ± 13.92 0.4228 71.57 ± 9.14 0.9882 62.5 ± 8.63 0.9921 71.27 ± 11.09 0.994
25ng/mL 50 nM 119.05 ± 15.88 0.0981 74.31 ± 8.77 0.9434 59.01 ± 8.69 0.9315 78.47 ± 10.63 0.8468
25ng/mL 100 nM 142.19 ± 17.68 0.0083 74.99 ± 8.16 0.925 65.04 ± 9.31 0.9998 69.64 ± 9.33 0.9989
25ng/mL 200 nM 182.45 ± 24.67 <.0001 87.37 ± 10.99 0.3487 68.26 ± 8.04 0.9998 72.06 ± 11.85 0.9891
IL17A - - 0.62 ± 0.14
25 ng/mL    0.73 ± 0.15
- 200 nM 0.47 ± 0.11 0.8112 0.46 ± 0.1 0.7849 0.51 ± 0.1 0.9335 0.43 ± 0.08 0.6608
25 ng/mL 25 nM 0.86 ± 0.17 0.8935 0.88 ± 0.13 0.8705 0.87 ± 0.14 0.8988 1.05 ± 0.18 0.4119
25ng/mL 50 nM 0.73 ± 0.11 1 0.92 ± 0.14 0.7718 1.07 ± 0.16 0.3001 1.06 ± 0.15 0.3772
25ng/mL 100 nM 0.66 ± 0.11 0.9916 0.85 ± 0.15 0.9406 0.89 ± 0.16 0.8425 0.84 ± 0.16 0.9649
25ng/mL 200 nM 0.55 ± 0.12 0.7651 0.91 ± 0.17 0.7898 0.87 ± 0.13 0.8859 0.82 ± 0.13 0.9778
IL1A - - 95.72 ± 5.84
25 ng/mL    1405.01 ± 27.93¥
- 200 nM 85.16 ± 6.5 0.9724 92.67 ± 5.54 0.9999 88.72 ± 5.9 0.9955 84.51 ± 7.04 0.9647
25 ng/mL 25 nM 1115.1 ± 18.96 <.0001 1288.02 ± 20 0.0047 1370.52 ± 35.28 0.8379 1269.66 ± 50.59 0.0744
25ng/mL 50 nM 962.51 ± 23 <.0001 1258.76 ± 23.63 0.0003 1308.7 ± 45.12 0.0933 1336.95 ± 50.97 0.5871
25ng/mL 100 nM 839.16 ± 21.04 <.0001 1162.35 ± 23.34 <.0001 1194.29 ± 12.27 <.0001 1244.96 ± 41.03 0.0264
25ng/mL 200 nM 755.65 ± 16.88 <.0001 1126.94 ± 26.22 <.0001 1151.31 ± 20.01 <.0001 1163.14 ± 26.71 0.0004
IL22 - - 0.66 ± 0.15
25 ng/mL    0.92 ± 0.27
- 200 nM 0.7 ± 0.11 0.9999 0.61 ± 0.13 0.9997 0.71 ± 0.11 0.9996 0.62 ± 0.11 0.9999
25 ng/mL 25 nM 1.07 ± 0.18 0.953 1.21 ± 0.24 0.7351 1.23 ± 0.21 0.729 1.39 ± 0.23 0.4163
25ng/mL 50 nM 1.03 ± 0.14 0.9841 1.15 ± 0.18 0.8649 1.4 ± 0.19 0.3761 1.4 ± 0.21 0.392
25ng/mL 100 nM 0.85 ± 0.18 0.9975 1 ± 0.17 0.9963 1.19 ± 0.2 0.8132 1.24 ± 0.22 0.7256
25ng/mL 200 nM 0.9 ± 0.19 1 1.01 ± 0.19 0.9936 1.14 ± 0.25 0.8924 1.28 ± 0.2 0.628
IL23A - - 12.36 ± 1.2
25 ng/mL    36.02 ± 2.45¥
- 200 nM 10.88 ± 1.35 0.939 11.41 ± 1.43 0.9902 9.42 ± 0.97 0.5247 9.55 ± 1.15 0.5682
25 ng/mL 25 nM 60.64 ± 3.34 0.0006 43.92 ± 1.89 0.1624 42.15 ± 1.61 0.2312 48.01 ± 2.69 0.0213
25ng/mL 50 nM 75.92 ± 4.61 <.0001 45.85 ± 2.3 0.0568 45.16 ± 2.92 0.0339 56.64 ± 3.44 <.0001
25ng/mL 100 nM 89.83 ± 5.03 <.0001 53.05 ± 3.22 0.0003 48.11 ± 1.85 0.0031 51.42 ± 2.55 0.0021
25ng/mL 200 nM 104.5 ± 5.55 <.0001 59.53 ± 3.83 <.0001 51.86 ± 2.95 <.0001 53.83 ± 3.54 0.0003
IL31 - - 0.61 ± 0.16
25 ng/mL    1.08 ± 0.38
- 200 nM 0.65 ± 0.18 >0.999 0.72 ± 0.18 0.997 0.79 ± 0.2 0.977 0.91 ± 0.23 0.8412
25 ng/mL 25 nM 1.19 ± 0.32 0.9975 1.33 ± 0.33 0.9546 1.52 ± 0.37 0.7954 1.99 ± 0.4 0.2952
25ng/mL 50 nM 1.27 ± 0.3 0.9833 1.22 ± 0.29 0.9951 1.59 ± 0.33 0.6922 1.82 ± 0.44 0.4719
25ng/mL 100 nM 1.02 ± 0.31 0.9997 1.04 ± 0.31 0.9999 1.49 ± 0.35 0.8327 1.61 ± 0.35 0.7377
25ng/mL 200 nM 0.95 ± 0.29 0.9948 1.14 ± 0.32 0.9999 1.32 ± 0.34 0.9697 1.51 ± 0.36 0.8459
IL6 - - 5.86 ± 0.38
25 ng/mL    170.83 ± 5.28¥
- 200 nM 4.98 ± 0.28 0.999 4.7 ± 0.32 0.9964 4.97 ± 0.36 0.999 5.15 ± 0.31 0.9997
25 ng/mL 25 nM 93.79 ± 4.03 <.0001 130.24 ± 3.84 <.0001 135.32 ± 3.36 <.0001 132.28 ± 7.41 <.0001
25ng/mL 50 nM 69.7 ± 2.81 <.0001 122.69 ± 4.36 <.0001 128.14 ± 6.83 <.0001 137.61 ± 5.87 0.0006
25ng/mL 100 nM 51.01 ± 1.57 <.0001 111.07 ± 4.74 <.0001 112.13 ± 3.37 <.0001 122.46 ± 5.35 <.0001
25ng/mL 200 nM 40.39 ± 2.19 <.0001 93.03 ± 3.25 <.0001 101.17 ± 2.91 <.0001 119.49 ± 4.42 <.0001
IL8 - - 69.62 ± 3.87   
25 ng/mL    361.15 ± 12.15¥
- 200 nM 57.85 ± 4.65 0.6023 61.71 ± 4.86 0.8713 55.48 ± 3.11 0.4288 58.9 ± 5.89 0.6821
25 ng/mL 25 nM 420.45 ± 10.71 0.0534 381.74 ± 10.25 0.759 387.86 ± 17.53 0.5469 398.64 ± 22.41 0.5547
25ng/mL 50 nM 475.48 ± 17.32 <.0001 376.41 ± 13.16 0.8968 369.89 ± 17.71 0.9832 417.47 ± 21.97 0.2108
25ng/mL 100 nM 559.43 ± 18.52 <.0001 387.33 ± 19.5 0.584 361.05 ± 16.02 1 410.72 ± 29.84 0.3111
25ng/mL 200 nM 650.22 ± 24.17 <.0001 377.69 ± 20.45 0.8684 350.6 ± 11.85 0.967 367.56 ± 17.81 0.9986
JAK1 - - 183.21 ± 7.55
25 ng/mL    213.93 ± 5.55
- 200 nM 177.67 ± 11.84 0.9936 177.97 ± 14.91 0.995 159.13 ± 7.08 0.2871 171.53 ± 9.49 0.8675
25 ng/mL 25 nM 206.18 ± 7.99 0.894 216.23 ± 6.41 0.9993 206.29 ± 6.84 0.7834 200.4 ± 9.84 0.5654
25ng/mL 50 nM 195.48 ± 9.54 0.2925 210.42 ± 10.89 0.9965 194.2 ± 8.24 0.0808 210.52 ± 7.73 0.9942
25ng/mL 100 nM 186.97 ± 7.49 0.0621 205.03 ± 11.49 0.9026 193.28 ± 4.55 0.0631 200.25 ± 8.15 0.5562
25ng/mL 200 nM 180.99 ± 8.58 0.0191 195.97 ± 10.45 0.4597 182.86 ± 4.07 0.0023 190.53 ± 7.68 0.1286
JAK2 - - 25.35 ± 0.95
25 ng/mL    126.63 ± 4.89¥
- 200 nM 25.67 ± 1.03 >0.999 25.21 ± 1.12 >0.999 23.67 ± 0.92 0.9806 25.25 ± 1.04 >0.999
25 ng/mL 25 nM 89.4 ± 2.21 <.0001 109.39 ± 2.8 0.0021 114.94 ± 2.16 0.0419 108.89 ± 3.25 0.0165
25ng/mL 50 nM 69.7 ± 1.78 <.0001 101 ± 2.26 <.0001 107.16 ± 2.86 0.0003 106.83 ± 5.94 0.0063
25ng/mL 100 nM 54.4 ± 1.8 <.0001 94.5 ± 2.65 <.0001 95.51 ± 3.13 <.0001 102.64 ± 3.52 0.0007
25ng/mL 200 nM 40.25 ± 1.3 <.0001 89.16 ± 3.43 <.0001 91.17 ± 2.15 <.0001 92.21 ± 2.9 <.0001
JAK3 - - 0.66 ± 0.14
25 ng/mL    0.52 ± 0.16
- 200 nM 0.71 ± 0.15 0.9996 0.68 ± 0.17 >0.999 0.63 ± 0.1 0.9998 0.53 ± 0.09 0.9429
25 ng/mL 25 nM 0.81 ± 0.15 0.5284 0.84 ± 0.12 0.3247 1.02 ± 0.19 0.1022 0.97 ± 0.18 0.2187
25ng/mL 50 nM 1.01 ± 0.23 0.1284 0.83 ± 0.15 0.3497 0.99 ± 0.16 0.1451 0.99 ± 0.2 0.1854
25ng/mL 100 nM 0.84 ± 0.13 0.4473 0.92 ± 0.13 0.1608 0.99 ± 0.15 0.1449 1.01 ± 0.17 0.1531
25ng/mL 200 nM 0.68 ± 0.13 0.9133 0.79 ± 0.15 0.4876 0.85 ± 0.15 0.425 0.86 ± 0.16 0.4442
LOR - - 27.47 ± 9.25
25 ng/mL    31.02 ± 9.83
- 200 nM 24.61 ± 7.5 0.9994 23.78 ± 7.16 0.998 19.48 ± 9.66 0.9402 12.79 ± 4.84 0.6024
25 ng/mL 25 nM 40.79 ± 15.11 0.9505 43.2 ± 14.11 0.9107 23.22 ± 10.14 0.9976 23 ± 9.47 0.9343
25ng/mL 50 nM 42.06 ± 14.64 0.9258 43.96 ± 15.87 0.892 32.81 ± 17.47 1 28.28 ± 10.86 0.9987
25ng/mL 100 nM 33.46 ± 10.9 0.9997 31.4 ± 10.44 1 65.94 ± 37.89 0.6538 21.29 ± 9.59 0.8792
25ng/mL 200 nM 29.98 ± 11.67 1 38.46 ± 14.1 0.9836 37.49 ± 25.57 0.9988 17 ± 7.28 0.6804
S100A12 - - 1.00 ± 0.31
25 ng/mL    1.13 ± 0.12
- 200 nM 0.81 ± 0.22 0.9379 0.8 ± 0.13 0.9172 0.72 ± 0.18 0.7495 0.61 ± 0.11 0.4876
25 ng/mL 25 nM 1.16 ± 0.18 0.9997 1.21 ± 0.16 0.9829 1.31 ± 0.16 0.9298 1.31 ± 0.18 0.8142
25ng/mL 50 nM 1.11 ± 0.18 1 1.04 ± 0.15 0.983 1.18 ± 0.18 0.9991 1.11 ± 0.18 1
25ng/mL 100 nM 1.02 ± 0.12 0.969 1 ± 0.17 0.942 1.48 ± 0.32 0.5855 1.12 ± 0.15 1
25ng/mL 200 nM 0.98 ± 0.2 0.9219 1.14 ± 0.16 1 1.06 ± 0.2 0.9978 0.91 ± 0.14 0.7081
S100A7 - - 5.2 ± 1.46
25 ng/mL    6.28 ± 1.61
- 200 nM 4.4 ± 1.41 0.9928 4.94 ± 1.59 >0.999 4.38 ± 1.15 0.992 3.69 ± 0.84 0.9024
25 ng/mL 25 nM 6.28 ± 1.42 1 5.45 ± 1.02 0.9847 5.33 ± 1.21 0.948 5.37 ± 1.3 0.9715
25ng/mL 50 nM 6.12 ± 1.82 1 7.08 ± 1.99 0.987 3.62 ± 0.78 0.3469 5.94 ± 1.23 0.9993
25ng/mL 100 nM 4 ± 0.77 0.6092 3.83 ± 1.02 0.6011 4.3 ± 1.17 0.6007 4.6 ± 1.68 0.8016
25ng/mL 200 nM 3.91 ± 1.18 0.5945 5.73 ± 1.59 0.9968 3.95 ± 1.14 0.4638 3.77 ± 0.91 0.5084
SERPINB3 - - 2.66 ± 0.74
25 ng/mL    2.65 ± 0.39
- 200 nM 2.86 ± 0.72 0.9995 2.25 ± 0.49 0.9843 2.31 ± 0.77 0.9925 1.5 ± 0.27 0.5042
25 ng/mL 25 nM 2.53 ± 0.36 0.9984 3.16 ± 0.43 0.7675 2.58 ± 0.41 1 2 ± 0.3 0.4027
25ng/mL 50 nM 2.32 ± 0.44 0.9304 2.3 ± 0.34 0.9228 2.6 ± 0.69 1 2.54 ± 0.33 0.9973
25ng/mL 100 nM 2.23 ± 0.39 0.8555 2.2 ± 0.35 0.8326 3.63 ± 1.32 0.7776 2 ± 0.26 0.4053
25ng/mL 200 nM 1.97 ± 0.32 0.552 2.21 ± 0.44 0.8518 2.14 ± 0.67 0.9734 1.69 ± 0.29 0.1148
SERPINB4 - - 4.45 ± 1.4
25 ng/mL    3.72 ± 0.37
- 200 nM 3.6 ± 0.97 0.9677 3.39 ± 0.89 0.9238 3.37 ± 1.57 0.918 1.84 ± 0.42 0.2699
25 ng/mL 25 nM 3.39 ± 0.81 0.9939 4.23 ± 0.7 0.9325 3.53 ± 0.5 1 2.78 ± 0.31 0.2638
25ng/mL 50 nM 4.07 ± 1.17 0.9925 3.76 ± 0.66 1 4.24 ± 1.6 0.9991 3.2 ± 0.53 0.7515
25ng/mL 100 nM 3.02 ± 0.7 0.9158 2.87 ± 0.48 0.7071 7.56 ± 3.67 0.4349 2.64 ± 0.3 0.1667
25ng/mL 200 nM 2.84 ± 0.5 0.8419 3.19 ± 0.7 0.9217 3.54 ± 1.5 1 2.33 ± 0.38 0.0489
STAT1 - - 538.44 ± 16.19
25 ng/mL    3092.83 ± 221.46¥
- 200 nM 548.21 ± 11.82 >0.999 529.16 ± 21.86 >0.999 522.12 ± 14.19 >0.999 549.79 ± 12.18 >0.999
25 ng/mL 25 nM 2899.48 ± 209.59 0.8799 2861.37 ± 204.56 0.8059 3103.89 ± 185.88 1 3156.82 ± 244.78 0.9981
25ng/mL 50 nM 2896.02 ± 176.39 0.8733 2855.28 ± 166.89 0.7919 3049.62 ± 159.5 0.9993 3009.6 ± 169.64 0.9948
25ng/mL 100 nM 2705.87 ± 184.25 0.406 2783.68 ± 179.19 0.6111 3028.93 ± 125.19 0.9969 2991.9 ± 200.56 0.9892
25ng/mL 200 nM 2468.6 ± 137.34 0.0837 2850.04 ± 177.51 0.7796 2977.26 ± 166.85 0.9717 3154.11 ± 139.56 0.9984
STAT3 - - 751.2 ± 14.97
25 ng/mL    1608.39 ± 70.09¥                     
- 200 nM 746.17 ± 16.73 >0.999 732.19 ± 23.03 0.9952 728.97 ± 20.48 0.9903 750.9 ± 27.68 >0.999
25 ng/mL 25 nM 1434.08 ± 43.26 0.074 1466.73 ± 66.75 0.3206 1557.84 ± 58.15 0.9399 1572.76 ± 65.5 0.988
25ng/mL 50 nM 1301.55 ± 51.7 0.0005 1437.28 ± 60.69 0.1762 1519.61 ± 69.92 0.6963 1543.4 ± 58.65 0.9042
25ng/mL 100 nM 1150.46 ± 52.66 <.0001 1373.34 ± 55.51 0.0352 1457.24 ± 54.48 0.2524 1549.17 ± 89.41 0.9288
25ng/mL 200 nM 1082.84 ± 39.32 <.0001 1400.77 ± 58.44 0.0738 1483.1 ± 51.73 0.4109 1570.19 ± 51.51 0.9845
STAT4 - - 4.52 ± 0.64
25 ng/mL    6.19 ± 0.53
- 200 nM 4.32 ± 0.53 0.999 4.28 ± 0.61 0.9975 4.01 ± 0.45 0.9392 3.75 ± 0.33 0.7552
25 ng/mL 25 nM 6.15 ± 0.47 1 6 ± 0.46 0.9967 5.65 ± 0.44 0.7981 5.4 ± 0.45 0.5462
25ng/mL 50 nM 5.57 ± 0.53 0.7712 6.22 ± 0.42 1 5.41 ± 0.33 0.5294 6.1 ± 0.36 0.9997
25ng/mL 100 nM 5.63 ± 0.39 0.8269 6.21 ± 0.48 1 5.32 ± 0.46 0.4306 5.83 ± 0.34 0.9448
25ng/mL 200 nM 5.25 ± 0.45 0.4653 6.27 ± 0.56 0.9999 5.04 ± 0.36 0.1955 5.42 ± 0.52 0.5691
STAT5A - - 2.17 ± 0.54
25 ng/mL    26.41 ± 2.26¥
- 200 nM 1.99 ± 0.51 >0.999 1.75 ± 0.44 0.9988 1.44 ± 0.41 0.9839 1.12 ± 0.19 0.9305
25 ng/mL 25 nM 19.04 ± 1.94 0.0111 23.69 ± 1.63 0.7471 22.82 ± 1.77 0.452 20.12 ± 1.29 0.0428
25ng/mL 50 nM 16.18 ± 1.66 0.0003 22.32 ± 2.16 0.4225 20.71 ± 1.77 0.1041 22.69 ± 1.71 0.3629
25ng/mL 100 nM 12.94 ± 1.27 <.0001 20.87 ± 2.1 0.1784 18.44 ± 1.85 0.0122 19.54 ± 1.34 0.0233
25ng/mL 200 nM 9.48 ± 0.86 <.0001 19.2 ± 1.94 0.0505 17.64 ± 1.46 0.0051 18.33 ± 1.83 0.0059
STAT5B - - 58.77 ± 4.23
25 ng/mL    41.69 ± 2.3
- 200 nM 57.17 ± 5.38 0.9994 58.85 ± 6.21 >0.999 50.91 ± 4.38 0.6377 54.64 ± 4.79 0.9556
25 ng/mL 25 nM 42.26 ± 2.35 0.9997 40.74 ± 2.3 0.997 40.13 ± 1.97 0.9485 38.56 ± 2.02 0.6509
25ng/mL 50 nM 43.63 ± 3.24 0.9665 42.9 ± 2.44 0.9923 38.42 ± 2.28 0.5958 40.76 ± 1.91 0.9926
25ng/mL 100 nM 41.63 ± 2.76 1 40.75 ± 2.41 0.9971 36.56 ± 1.18 0.2154 40.91 ± 2.17 0.9963
25ng/mL 200 nM 44.1 ± 3.37 0.9356 41 ± 3.46 0.9991 36.34 ± 1.97 0.1863 36.62 ± 1.7 0.2421
STAT6 - - 749.34 ± 20.85
25 ng/mL    1045.99 ± 26.73¥
- 200 nM 777.03 ± 29.31 0.8981 740.11 ± 34.98 0.9991 723.56 ± 20.76 0.9214 762.04 ± 9.44 0.9961
25 ng/mL 25 nM 1043.96 ± 20.37 1 1004.82 ± 23.76 0.5557 1020.89 ± 23.57 0.8238 1042.76 ± 29.23 1
25ng/mL 50 nM 1016.85 ± 25.68 0.8028 990.05 ± 21.06 0.2895 982.62 ± 14.34 0.1296 1046.46 ± 29.12 1
25ng/mL 100 nM 966.76 ± 28.58 0.0739 987.64 ± 15.75 0.2557 943.66 ± 25.99 0.005 985.1 ± 39.79 0.3955
25ng/mL 200 nM 976.22 ± 14.93 0.1487 985.17 ± 29.31 0.224 966.51 ± 12.3 0.0388 1013.25 ± 17.15 0.8453
TNF - - 3.3 ± 1
25 ng/mL    26.79 ± 1.26¥
- 200 nM 2.39 ± 0.5 0.8882 2.58 ± 0.57 0.9528 2.19 ± 0.56 0.7829 1.59 ± 0.22 0.417
25 ng/mL 25 nM 27.95 ± 2.01 0.9797 28.04 ± 1.24 0.9859 24.07 ± 1.43 0.5138 26.07 ± 1.13 0.9962
25ng/mL 50 nM 26.21 ± 2.55 0.9986 28.66 ± 2.58 0.9421 26.51 ± 1.84 0.9998 29.31 ± 2.52 0.7374
25ng/mL 100 nM 24.59 ± 1.6 0.8367 29.5 ± 2.82 0.8206 25.93 ± 1.59 0.9829 27.59 ± 1.64 0.994
25ng/mL 200 nM 24.02 ± 2.04 0.7181 28.31 ± 2.97 0.9717 24.73 ± 1.29 0.733 27.63 ± 2.3 0.9928
TYK2 - - 217.4 ± 8.13
25 ng/mL    296.98 ± 6.92
- 200 nM 220.78 ± 12.01 0.9996 217.28 ± 14.28 >0.999 205.57 ± 10.87 0.8924 217.28 ± 10.09 >0.999
25 ng/mL 25 nM 298.27 ± 10.83 1 292.92 ± 7.99 0.9929 283.97 ± 8.59 0.5015 283.93 ± 8.16 0.7981
25ng/mL 50 nM 287.93 ± 16.28 0.9305 287.31 ± 11.08 0.8603 273.68 ± 7.44 0.076 307.36 ± 14.87 0.8958
25ng/mL 100 nM 260.21 ± 7.05 0.0546 284.15 ± 9.62 0.7043 266 ± 6.82 0.0108 280.63 ± 10.46 0.65
25ng/mL 200 nM 264.75 ± 8.44 0.1204 277.52 ± 8.67 0.3578 263.49 ± 5.05 0.0053 283.28 ± 10.88 0.7707
VEGFA - - 214.26 ± 7.51   
25 ng/mL    614.31 ± 19.03¥
- 200 nM 200.65 ± 9.3 0.8794 211.13 ± 12.18 0.9998 199.88 ± 6.52 0.8548 210.34 ± 9.72 0.9995
25 ng/mL 25 nM 538.79 ± 9.54 0.0006 553.23 ± 11.38 0.0119 570.27 ± 10.88 0.0433 600.98 ± 13.99 0.9438
25ng/mL 50 nM 479.91 ± 16.23 <.0001 545.93 ± 9.71 0.0041 531.53 ± 11.24 <.0001 582.24 ± 17.89 0.4554
25ng/mL 100 nM 415.36 ± 8.5 <.0001 524.82 ± 13.65 0.0001 514.04 ± 7.46 <.0001 572.2 ± 19.67 0.2261
25ng/mL 200 nM 398.41 ± 8.58 <.0001 516.11 ± 14.7 <.0001 492.12 ± 8.32 <.0001 541.01 ± 9.94 0.0098
                                
a   用TNFα (25 ng/mL)及IFNγ (25 ng/mL)刺激b 資料呈現為平均值±標準誤差c 與用單獨TNFα及IFNγ刺激比較有顯著差異¥ 表明與單獨媒劑(無刺激及無藥物濃度) p<0.0001之顯著差異 表明與媒劑p<0.1之顯著差異
偵測培養基中所關注之標靶蛋白且使用ProCarta Multiplex免疫分析試劑及方案(Invitrogen,目錄號EPX450-12171-901)定量。將培養基與抗體結合之珠粒一起培育,該等抗體結合之珠粒經設計以結合於特異性標靶蛋白之抗原決定基且經由珠粒特殊之光譜圖鑑定結合蛋白。將生物素化之偵測抗體及抗生蛋白鏈菌素-PE添加至分析盤以定量標靶蛋白之量,該等生物素化之偵測抗體經設計以結合於同一標靶蛋白之不同抗原決定基。在Luminex 200上讀取分析盤且資料可表示為淨中位螢光強度。根據製造商之程序(Invitrogen,目錄號EPX450-12171-901)製備的抗原標準曲線之淨中位螢光值相對於各標準之預期濃度繪圖。自抗原標準曲線推斷各蛋白質之濃度且濃度可表示為pg/mL (表15)。 15 :在 JAK 抑制劑存在 / 缺乏下用 TNFα IFNγ 刺激之人類角化細胞所產生的炎性介體之濃度
         化合物A 化合物B 化合物C 化合物D
蛋白質 刺激 a 藥物濃度 pg/mLb p c pg/mLb p c pg/mLb p c pg/mLb p c
BDNF       5.91 ± 0.28
25ng/ml    4.11 ± 0.15¥
   200nM 5.59 ± 0.34 0.9116 5.35 ± 0.34 0.5647 5.7 ± 0.31 0.9821 5.66 ± 0.38 0.9648
25ng/ml 25nM 4.13 ± 0.18 >0.999 4.05 ± 0.19 0.9989 4.01 ± 0.19 0.9922 4.08 ± 0.26 >0.999
25ng/ml 50nM 4.16 ± 0.29 0.9996 4.04 ± 0.24 0.9972 4 ± 0.23 0.9887 3.97 ± 0.25 0.9848
25ng/ml 100nM 4.22 ± 0.24 0.9928 4.06 ± 0.26 0.9993 4.24 ± 0.26 0.9819 4.18 ± 0.28 0.9989
25ng/ml 200nM 4.3 ± 0.26 0.9394 4.1 ± 0.24 >0.999 3.97 ± 0.22 0.9709 4.03 ± 0.28 0.9972
                                
bNGF       2.13 ± 0.39
25ng/ml    6.86 ± 0.53¥
   200nM 3.81 ± 0.48 0.1269 3.84 ± 0.71 0.1179 3.73 ± 0.63 0.1582 3.47 ± 0.48 0.2975
25ng/ml 25nM 7.4 ± 0.5 0.9486 7.7 ± 0.55 0.743 7.86 ± 0.56 0.7301 7.44 ± 0.63 0.9268
25ng/ml 50nM 6.73 ± 0.69 0.9998 7.09 ± 0.71 0.9968 6.86 ± 0.6 >0.999 6.17 ± 0.74 0.8786
25ng/ml 100nM 6.54 ± 0.88 0.993 7.04 ± 0.59 0.9987 6.93 ± 1.04 >0.999 7.12 ± 0.8 0.9962
25ng/ml 200nM 7.72 ± 0.76 0.7846 6.52 ± 0.69 0.9855 5.7 ± 0.76 0.6114 6.73 ± 0.61 0.9997
                                
EGF       1.2 ± 0.13
25ng/ml    1.33 ± 0.08
   200nM 0.97 ± 0.18 0.6107 1.06 ± 0.14 0.8987 1.12 ± 0.14 0.9912 1.24 ± 0.09 0.9998
25ng/ml 25nM 1.87 ± 0.17 0.1339 1.76 ± 0.17 0.1475 1.54 ± 0.13 0.7273 1.49 ± 0.14 0.8865
25ng/ml 50nM 1.57 ± 0.24 0.7734 1.67 ± 0.15 0.3115 1.14 ± 0.17 0.7846 1.31 ± 0.19 0.9999
25ng/ml 100nM 1.75 ± 0.22 0.3094 1.56 ± 0.2 0.6457 1.35 ± 0.18 0.9999 1.23 ± 0.16 0.9666
25ng/ml 200nM 1.82 ± 0.16 0.1796 1.52 ± 0.1 0.7548 1.46 ± 0.17 0.9337 1.45 ± 0.17 0.9445
                                
伊紅趨素       2.16 ± 0.08
25ng/ml    9.63 ± 0.17¥
   200nM 2.28 ± 0.07 0.8577 2.22 ± 0.09 0.9939 2.28 ± 0.07 0.853 2.08 ± 0.07 0.9688
25ng/ml 25nM 10.33 ± 0.15 0.0307 10.22 ± 0.15 0.093 10.08 ± 0.15 0.353 9.82 ± 0.2 0.8778
25ng/ml 50nM 10.2 ± 0.26 0.1019 9.92 ± 0.2 0.6424 9.84 ± 0.25 0.8797 9.58 ± 0.21 0.9991
25ng/ml 100nM 10.67 ± 0.11 0.0007 10.09 ± 0.19 0.2456 9.89 ± 0.22 0.7879 10.02 ± 0.19 0.3925
25ng/ml 200nM 11.02 ± 0.17 <.0001 10.05 ± 0.19 0.2976 9.89 ± 0.21 0.7655 9.85 ± 0.17 0.8038
                                
FGF-2       9.44 ± 1.18
25ng/ml    22.39 ± 0.9¥
   200nM 9.44 ± 0.62 >0.999 8.5 ± 0.95 0.9283 8.77 ± 0.79 0.9818 8.19 ± 1.07 0.8096
25ng/ml 25nM 21.29 ± 1.39 0.9364 20.63 ± 1.49 0.802 21.41 ± 1.39 0.9536 22.89 ± 1.39 0.9968
25ng/ml 50nM 20.92 ± 1.66 0.8456 19.94 ± 1.49 0.571 20.77 ± 1.37 0.7882 20.96 ± 1.43 0.8636
25ng/ml 100nM 20.8 ± 1.16 0.8096 20.42 ± 1.5 0.735 20.84 ± 1.31 0.8113 21.77 ± 1.51 0.9924
25ng/ml 200nM 20.13 ± 1.33 0.5458 21.39 ± 1.61 0.9627 20.93 ± 1.37 0.8282 20.96 ± 1.34 0.8551
                                
GM-CSF       7.58 ± 1.05
25ng/ml    122.09 ± 2.57¥
   200nM 11.32 ± 1.46 0.3826 8.69 ± 1.22 0.9865 9.48 ± 1.48 0.8873 8.49 ± 1.84 0.9945
25ng/ml 25nM 136.85 ± 3 0.0058 130.13 ± 2.13 0.2541 130 ± 3.15 0.3521 126.24 ± 3.53 0.8083
25ng/ml 50nM 137.01 ± 3.11 0.0052 128.05 ± 2.9 0.5101 126.18 ± 3.4 0.8392 124.89 ± 3.37 0.9418
25ng/ml 100nM 138.7 ± 3.64 0.0017 133.06 ± 4.24 0.0714 134.94 ± 4.45 0.052 133.19 ± 3.97 0.0881
25ng/ml 200nM 136.87 ± 2.98 0.0045 134.13 ± 3.74 0.0359 132.6 ± 3.95 0.1275 130.42 ± 3.44 0.2505
                                
GRO α       244.73 ± 8.14          _            
25ng/ml    529.34 ± 24.39          <.0001         
   200nM 245.8 ± 12.99 >0.999 228.97 ± 14.45 0.9163 236.87 ± 11.04 0.9955 234.42 ± 14.21 0.985
25ng/ml 25nM 592.61 ± 42.91 0.8763 547.38 ± 31.41 0.989 548.93 ± 27.91 0.987 539.42 ± 38.03 0.9995
25ng/ml 50nM 650.74 ± 57.35 0.4383 544.63 ± 38.3 0.9941 544.74 ± 37.71 0.9947 555.54 ± 44.74 0.9797
25ng/ml 100nM 784.21 ± 70.75 0.018 568.49 ± 35.18 0.8502 575.98 ± 43.22 0.7813 578.28 ± 48.32 0.842
25ng/ml 200nM 879.13 ± 83.38 0.0006 563.61 ± 42.17 0.8918 560.99 ± 43.32 0.925 564.53 ± 52.35 0.9386
                                
HGF       4.37 ± 0.38
25ng/ml    13.82 ± 0.29¥
   200nM 4.54 ± 0.39 0.998 4.44 ± 0.32 >0.999 4.74 ± 0.47 0.9368 3.68 ± 0.39 0.5616
25ng/ml 25nM 14.89 ± 0.34 0.3296 14.15 ± 0.3 0.9692 13.66 ± 0.51 0.9966 13.47 ± 0.45 0.9402
25ng/ml 50nM 15.05 ± 0.56 0.2218 13.65 ± 0.53 0.9972 13.04 ± 0.28 0.5379 13.27 ± 0.45 0.7642
25ng/ml 100nM 15.5 ± 0.43 0.0549 14.41 ± 0.55 0.7955 13.53 ± 0.5 0.9722 13.75 ± 0.4 0.9998
25ng/ml 200nM 15.62 ± 0.61 0.0302 13.5 ± 0.57 0.9669 13.6 ± 0.53 0.9881 13.8 ± 0.48 >0.999
                                
IFN α       0.24 ± 0.03
25ng/ml    0.26 ± 0
   200nM 0.22 ± 0.03 0.983 0.23 ± 0.02 >0.999 0.2 ± 0.03 0.7279 0.22 ± 0.03 0.986
25ng/ml 25nM 0.24 ± 0.02 0.3231 0.24 ± 0.02 0.3231 0.25 ± 0.01 0.3231 0.26 ± 0.01 0.9405
25ng/ml 50nM 0.26 ± 0 >0.999 0.26 ± 0 >0.999 0.26 ± 0 >0.999 0.26 ± 0 >0.999
25ng/ml 100nM 0.26 ± 0 >0.999 0.26 ± 0 >0.999 0.26 ± 0 >0.999 0.26 ± 0 >0.999
25ng/ml 200nM 0.26 ± 0 >0.999 0.26 ± 0 >0.999 0.26 ± 0 >0.999 0.25 ± 0.02 0.4509
                                
IFN γ       4.81 ± 0.71
25ng/ml    25004.72 ± 3327.44¥
   200nM 3.02 ± 0.54 >0.999 3.39 ± 0.69 >0.999 3.81 ± 0.74 >0.999 4.52 ± 0.68 >0.999
25ng/ml 25nM 24518.59 ± 2794.62 0.9999 35023.68 ± 10759.49 0.7134 27765.18 ± 4653.71 0.9432 24180.78 ± 2901.94 0.9996
25ng/ml 50nM 24118.43 ± 3991.24 0.9993 28977.92 ± 7400.61 0.9843 23531.94 ± 2644.35 0.9941 25506.14 ± 3960.86 >0.999
25ng/ml 100nM 27210.77 ± 4144.05 0.9787 29276.66 ± 7697.74 0.9796 23113.79 ± 2086.62 0.985 29392.77 ± 4832.25 0.8463
25ng/ml 200nM 24961.65 ± 3542.59 >0.999 25272.53 ± 3796.83 >0.999 25179.01 ± 3591.71 >0.999 26972.77 ± 4164.13 0.9888
                                
IL1 α       0.29 ± 0.03
25ng/ml    7.82 ± 0.18¥
   200nM 0.31 ± 0.04 >0.999 0.29 ± 0.03 >0.999 0.3 ± 0.05 >0.999 0.26 ± 0.05 0.9989
25ng/ml 25nM 5.93 ± 0.29 <.0001 7.34 ± 0.31 0.7043 7.74 ± 0.36 0.9994 6.8 ± 0.39 0.1498
25ng/ml 50nM 4.9 ± 0.3 <.0001 7.06 ± 0.37 0.3281 7.01 ± 0.39 0.3537 6.76 ± 0.4 0.1249
25ng/ml 100nM 4.12 ± 0.26 <.0001 7 ± 0.41 0.2631 7.27 ± 0.47 0.6747 6.92 ± 0.4 0.2281
                             
25ng/ml 200nM 3.45 ± 0.23 <.0001 6.16 ± 0.35 0.0034 6.45 ± 0.38 0.0358 6.3 ± 0.35 0.0121
                                
IL1 β       0.94 ± 0.1
25ng/ml    8.29 ± 0.44¥
   200nM 0.7 ± 0.13 0.8893 0.98 ± 0.14 >0.999 0.93 ± 0.17 >0.999 0.98 ± 0.12 >0.999
25ng/ml 25nM 9.68 ± 0.61 0.1181 9.53 ± 0.3 0.0812 8.88 ± 0.35 0.7302 8.92 ± 0.42 0.64
25ng/ml 50nM 8.96 ± 0.56 0.6835 8.96 ± 0.43 0.5388 8.72 ± 0.47 0.8871 8.82 ± 0.46 0.7601
25ng/ml 100nM 8.21 ± 0.33 0.9999 8.66 ± 0.41 0.8899 8.55 ± 0.34 0.9788 8.63 ± 0.36 0.9366
25ng/ml 200nM 8.04 ± 0.27 0.9851 8.43 ± 0.29 0.9966 8.71 ± 0.5 0.8878 8.81 ± 0.35 0.759
                                
IL10       0.38 ± 0.08
25ng/ml    0.84 ± 0.08¥
   200nM 0.3 ± 0.08 0.9638 0.32 ± 0.07 0.9855 0.4 ± 0.11 0.9998 0.43 ± 0.11 0.993
25ng/ml 25nM 0.96 ± 0.06 0.5558 0.87 ± 0.06 0.9913 0.75 ± 0.05 0.729 0.76 ± 0.08 0.8444
25ng/ml 50nM 0.95 ± 0.06 0.6701 0.85 ± 0.05 >0.999 0.74 ± 0.06 0.667 0.67 ± 0.07 0.3152
25ng/ml 100nM 0.87 ± 0.06 0.9985 0.88 ± 0.06 0.9871 0.75 ± 0.07 0.7279 0.81 ± 0.07 0.9892
25ng/ml 200nM 0.91 ± 0.06 0.8842 0.84 ± 0.06 >0.999 0.84 ± 0.08 >0.999 0.84 ± 0.08 >0.999
                                
IL12p70       2.34 ± 0.27
25ng/ml    1.75 ± 0.23
   200nM 2.17 ± 0.25 0.9859 1.55 ± 0.29 0.1466 1.52 ± 0.29 0.1263 2.15 ± 0.26 0.9799
25ng/ml 25nM 1.91 ± 0.2 0.9534 2.01 ± 0.21 0.7679 1.97 ± 0.22 0.8905 1.88 ± 0.19 0.9744
25ng/ml 50nM 1.71 ± 0.23 0.9999 1.68 ± 0.21 0.9979 1.72 ± 0.2 >0.999 1.69 ± 0.19 0.9988
25ng/ml 100nM 1.76 ± 0.21 >0.999 1.77 ± 0.18 0.9999 1.75 ± 0.23 >0.999 1.75 ± 0.22 >0.999
25ng/ml 200nM 1.82 ± 0.2 0.9966 1.87 ± 0.16 0.9787 1.79 ± 0.23 0.9997 1.7 ± 0.2 0.9996
                                
IL13       1.2 ± 0.13                     
25ng/ml    2.19 ± 0.42¥                     
   200nM 1.22 ± 0.11 >0.999 1.14 ± 0.13 0.9998 1.08 ± 0.13 0.9929 1.26 ± 0.15 0.9996
25ng/ml 25nM 3.12 ± 0.27 0.1649 2.79 ± 0.33 0.5041 2.93 ± 0.41 0.402 2.67 ± 0.24 0.7568
25ng/ml 50nM 2.46 ± 0.31 0.9449 2.73 ± 0.23 0.5946 2.24 ± 0.28 0.9999 2.21 ± 0.27 >0.999
25ng/ml 100nM 2.16 ± 0.27 >0.999 2.55 ± 0.33 0.8523 2.58 ± 0.36 0.8525 2.98 ± 0.4 0.363
25ng/ml 200nM 2.44 ± 0.35 0.9547 2.52 ± 0.3 0.8751 2.12 ± 0.3 0.9996 2.52 ± 0.42 0.9127
                                
IL15       1.84 ± 0.29
25ng/ml    2.75 ± 0.78
   200nM 1.64 ± 0.22 0.999 2.22 ± 0.42 0.9814 1.98 ± 0.49 0.9999 3.2 ± 0.71 0.2474
25ng/ml 25nM 2.95 ± 0.78 0.9977 3.3 ± 0.93 0.9541 3.97 ± 0.71 0.4062 4.2 ± 0.86 0.5333
25ng/ml 50nM 2.36 ± 0.41 0.9731 2.71 ± 0.65 >0.999 2.29 ± 0.44 0.9517 2.82 ± 0.72 >0.999
25ng/ml 100nM 2.31 ± 0.39 0.9576 2.58 ± 0.68 0.9995 2.42 ± 0.54 0.9859 3.29 ± 0.9 0.972
25ng/ml 200nM 2.88 ± 0.46 0.9994 2.57 ± 0.54 0.9994 2.32 ± 0.44 0.959 3.37 ± 0.8 0.9493
                                
IL17A       1.03 ± 0.09
25ng/ml    3.91 ± 0.36¥
   200nM 1.26 ± 0.22 0.9429 1.2 ± 0.29 0.9838 1.39 ± 0.22 0.7488 1.22 ± 0.2 0.9738
25ng/ml 25nM 4.97 ± 0.36 0.1478 4.6 ± 0.5 0.5215 4.27 ± 0.42 0.9116 3.84 ± 0.3 0.9999
25ng/ml 50nM 4.7 ± 0.5 0.3725 4.09 ± 0.43 0.991 3.48 ± 0.39 0.8568 4.15 ± 0.57 0.986
25ng/ml 100nM 5.05 ± 0.15 0.1065 4.84 ± 0.34 0.2722 3.77 ± 0.42 0.9974 3.57 ± 0.45 0.9569
25ng/ml 200nM 4.91 ± 0.36 0.1703 4.43 ± 0.26 0.729 4 ± 0.34 0.9993 4.04 ± 0.49 0.9984
                                
IL18       6.51 ± 0.55
25ng/ml    155.14 ± 2.91¥
   200nM 7.11 ± 0.21 0.997 6.04 ± 0.5 0.9991 5.89 ± 0.58 0.9968 6.54 ± 0.37 >0.999
25ng/ml 25nM 159.94 ± 3.38 0.7069 162.16 ± 4.98 0.5501 163.63 ± 3.29 0.4124 159.38 ± 4.31 0.8787
25ng/ml 50nM 151.44 ± 4.51 0.851 153.4 ± 3.46 0.994 156.41 ± 4.19 0.9984 156.12 ± 3.47 0.9994
25ng/ml 100nM 151.88 ± 3.38 0.8983 156.06 ± 3.24 0.9995 162.12 ± 5.14 0.5817 156.97 ± 5.2 0.9934
25ng/ml 200nM 150.47 ± 2.29 0.7082 159.36 ± 4.73 0.8617 157.36 ± 4.56 0.9856 155.77 ± 4.15 0.9999
                                
IL1RA       513.38 ± 56.01
25ng/ml    6231.09 ± 271.61¥
   200nM 559.82 ± 69.13 0.999 502.58 ± 57.22 >0.999 488.84 ± 49.85 >0.999 461.31 ± 30.68 0.9982
25ng/ml 25nM 5863.67 ± 328.02 0.8215 5944.59 ± 264.97 0.8905 6175.66 ± 277.7 0.9998 5760.33 ± 367.09 0.7833
25ng/ml 50nM 5640.46 ± 363 0.4817 5840.44 ± 314.35 0.7411 6065 ± 325.72 0.9881 5709.52 ± 391.3 0.7198
25ng/ml 100nM 5417.9 ± 272.66 0.2149 5953.24 ± 309.78 0.9003 6167.55 ± 367.54 0.9997 5879.83 ± 410.09 0.9069
25ng/ml 200nM 5320 ± 306.58 0.1274 5710.44 ± 269.38 0.501 5756.59 ± 328.24 0.6603 5450.17 ± 388.11 0.3705
                                
IL2       2.99 ± 0.33
25ng/ml    29 ± 1.27¥
   200nM 3.57 ± 0.62 0.955 3.32 ± 0.6 0.9961 2.65 ± 0.28 0.9954 2.4 ± 0.09 0.9515
25ng/ml 25nM 35.39 ± 2.01 0.0508 33.62 ± 1.88 0.1037 31.39 ± 1.44 0.578 31.46 ± 1.56 0.6728
25ng/ml 50nM 34.31 ± 2.49 0.1292 31.96 ± 1.47 0.4299 29.87 ± 1.38 0.9779 29.16 ± 2.01 >0.999
25ng/ml 100nM 35.16 ± 1.54 0.0629 31.33 ± 1.43 0.6329 30.51 ± 1.23 0.8659 29.23 ± 1.62 0.9999
25ng/ml 200nM 34.65 ± 1.35 0.0871 31.86 ± 1.25 0.4421 30.68 ± 1.62 0.8062 31.88 ± 1.61 0.5284
                                
IL21       2.88 ± 0
25ng/ml    2.88 ± 0
   200nM 2.63 ± 0.24 0.9101 2.43 ± 0.31 0.5085 2.33 ± 0.29 0.3239 2.5 ± 0.3 0.6612
25ng/ml 25nM 2.55 ± 0.26 0.6216 2.66 ± 0.22 0.9387 2.71 ± 0.18 0.9285 2.71 ± 0.18 0.942
25ng/ml 50nM 2.77 ± 0.11 0.9855 2.45 ± 0.29 0.5954 2.88 ± 0 >0.999 2.13 ± 0.39 0.0587
25ng/ml 100nM 2.33 ± 0.31 0.1873 2.36 ± 0.35 0.4301 2.6 ± 0.28 0.733 2.64 ± 0.24 0.8512
25ng/ml 200nM 2.68 ± 0.18 0.883 2.47 ± 0.28 0.6156 2.45 ± 0.29 0.3546 2.84 ± 0.04 0.9996
                                
IL22          8.9 ± 0
25ng/ml    7.92 ± 0.65
   200nM 7.74 ± 0.8 0.74 8.13 ± 0.77 0.9345 7.16 ± 1.16 0.3838 8.08 ± 0.82 0.9165
25ng/ml 25nM 8.69 ± 0.42 0.7682 8.69 ± 0.42 0.8119 7.15 ± 1.16 0.9285 7.83 ± 0.75 0.9999
25ng/ml 50nM 8.24 ± 0.66 0.9868 8.9 ± 0 0.6582 8.03 ± 0.87 >0.999 8.9 ± 0 0.5913
25ng/ml 100nM 8.9 ± 0 0.596 8.03 ± 0.87 0.9999 7.31 ± 1.07 0.9662 8.21 ± 0.69 0.9909
25ng/ml 200nM 7.48 ± 0.79 0.9547 7.74 ± 0.78 0.9988 8.24 ± 0.53 0.9966 8.39 ± 0.51 0.94
                                
IL23       7.35 ± 0.54
25ng/ml    5.56 ± 0.97
   200nM 6.18 ± 0.76 0.8627 5.8 ± 1.11 0.6828 6.54 ± 1 0.9642 6.43 ± 1.28 0.9407
25ng/ml 25nM 7.43 ± 0 0.0716 7.28 ± 0.16 0.1332 7.43 ± 0 0.0906 7.43 ± 0 0.0117
25ng/ml 50nM 6.82 ± 0.61 0.3244 7.43 ± 0 0.089 7.43 ± 0 0.0906 7.43 ± 0 0.0117
25ng/ml 100nM 6.9 ± 0.53 0.2733 6.44 ± 0.69 0.667 6.7 ± 0.73 0.4485 7.43 ± 0 0.0117
25ng/ml 200nM 7.5 ± 0.06 0.0525 7.41 ± 0.5 0.084 6.95 ± 0.48 0.2634 7.43 ± 0 0.0096
                                
IL27       6.93 ± 0.9
25ng/ml    6.23 ± 0.97
   200nM 8.91 ± 2.62 0.9348 7.57 ± 2.22 0.9996 9.17 ± 2.36 0.8968 11.9 ± 2.31 0.2941
25ng/ml 25nM 6.59 ± 1.92 0.9997 8.03 ± 1.71 0.7164 8.88 ± 1.64 0.3282 7.42 ± 0.9 0.8475
25ng/ml 50nM 7.67 ± 1.39 0.9418 6.95 ± 0.83 0.9844 5.98 ± 1.08 0.9996 5.51 ± 1.25 0.9695
25ng/ml 100nM 7.11 ± 1.17 0.9899 5.36 ± 0.73 0.9686 5.7 ± 1.04 0.993 5.92 ± 0.88 0.9988
25ng/ml 200nM 11.45 ± 2.57 0.1198 8.04 ± 1.65 0.6958 6.59 ± 0.99 0.9982 8.3 ± 1.2 0.4393
                                
IL31       3.67 ± 0
25ng/ml    2.6 ± 0.63
   200nM 3.32 ± 0.35 0.9393 3.01 ± 0.44 0.5865 3.28 ± 0.31 0.9074 3.7 ± 0.06 >0.999
25ng/ml 25nM 3.33 ± 0.36 0.5388 3.6 ± 0.28 0.3255 3.52 ± 0.53 0.559 2.97 ± 0.37 0.9353
25ng/ml 50nM 3.32 ± 0.35 0.5468 3.22 ± 0.38 0.722 3.36 ± 0.27 0.7072 3.43 ± 0.31 0.4939
25ng/ml 100nM 3.19 ± 0.34 0.7047 3.35 ± 0.44 0.5741 2.95 ± 0.38 0.9708 4.14 ± 0.48 0.0632
25ng/ml 200nM 3.2 ± 0.29 0.6722 3.93 ± 0.4 0.1137 3.34 ± 0.69 0.7103 3.05 ± 0.38 0.875
                                
IL4       4.72 ± 0.44
25ng/ml    6.73 ± 1.28
   200nM 3.6 ± 0.51 0.8423 4.61 ± 0.7 >0.999 4.89 ± 1.18 >0.999 5.34 ± 0.89 0.9842
25ng/ml 25nM 8.29 ± 1.89 0.771 6.74 ± 1.65 >0.999 8.31 ± 2.19 0.8432 7.2 ± 1.25 0.9963
25ng/ml 50nM 3.75 ± 0.54 0.2516 5.74 ± 1.1 0.9463 5.24 ± 0.99 0.8657 5.9 ± 1.18 0.968
25ng/ml 100nM 3.94 ± 0.7 0.304 5.78 ± 0.72 0.9522 6.26 ± 1.35 0.9978 5.13 ± 0.78 0.7576
25ng/ml 200nM 6.49 ± 1.1 0.9997 6.42 ± 1.24 0.9992 7.07 ± 0.88 0.9994 8.19 ± 1.39 0.8006
                                
IL5       2.7 ± 0.43
25ng/ml    28.59 ± 1.29¥
   200nM 2.42 ± 0.45 0.9981 2.84 ± 0.38 0.9999 3.04 ± 0.41 0.9956 2.88 ± 0.36 0.9998
25ng/ml 25nM 25.21 ± 1.58 0.4178 27.31 ± 1.32 0.9256 27.03 ± 1.35 0.8768 26.66 ± 1.72 0.8703
25ng/ml 50nM 26.88 ± 2.14 0.8782 25.5 ± 1.65 0.3753 26.49 ± 1.58 0.7237 28.49 ± 1.85 >0.999
25ng/ml 100nM 26.65 ± 1.6 0.8262 26.52 ± 1.54 0.7073 28.64 ± 1.4 >0.999 27.43 ± 2.11 0.9759
25ng/ml 200nM 25.3 ± 1.55 0.4226 25.88 ± 1.37 0.472 27.1 ± 1.76 0.886 25.61 ± 1.98 0.59
                                
IL6       30.57 ± 2.89
25ng/ml    862.33 ± 17.95¥
   200nM 28.79 ± 2.91 0.9999 26.86 ± 2.62 0.997 28.49 ± 2.89 0.9998 28.84 ± 1.89 0.9999
25ng/ml 25nM 594.5 ± 25.17 <.0001 749.64 ± 32.94 0.0158 774.87 ± 31.09 0.1794 743.07 ± 36.3 0.0476
25ng/ml 50nM 446.35 ± 19.73 <.0001 674.21 ± 27.15 <.0001 710.89 ± 36.7 0.006 698.04 ± 29.79 0.0037
25ng/ml 100nM 362.14 ± 18.73 <.0001 643.8 ± 27.14 <.0001 690.4 ± 35.25 0.0016 703.99 ± 42.22 0.0054
25ng/ml 200nM 295.21 ± 15.22 <.0001 568.73 ± 24.74 <.0001 621.79 ± 33.44 <.0001 646.2 ± 32.46 <.0001
                                
IL7       3.22 ± 0.12
25ng/ml    2.26 ± 0.09¥
   200nM 3.29 ± 0.21 0.9973 3.03 ± 0.2 0.8957 3.35 ± 0.18 0.9726 3.44 ± 0.16 0.7986
25ng/ml 25nM 2.1 ± 0.15 0.8024 2.14 ± 0.12 0.9135 2.18 ± 0.15 0.9587 2.16 ± 0.11 0.9291
25ng/ml 50nM 1.96 ± 0.11 0.2854 1.9 ± 0.12 0.1612 2.02 ± 0.07 0.3795 2.14 ± 0.07 0.8446
25ng/ml 100nM 2.05 ± 0.11 0.5818 2.12 ± 0.14 0.8633 2.04 ± 0.11 0.4449 2.15 ± 0.14 0.8923
25ng/ml 200nM 2.18 ± 0.14 0.9803 2.09 ± 0.14 0.7513 1.91 ± 0.11 0.0979 2.14 ± 0.12 0.8584
                                
IL8          271.75 ± 7.98
25ng/ml    2577.97 ± 63.03¥
   200nM 273.06 ± 11.28 >0.999 261.92 ± 12.12 0.9992 269.53 ± 10.35 >0.999 257.62 ± 7.07 0.9957
25ng/ml 25nM 3240.19 ± 156.41 0.5347 2837.03 ± 135.03 0.6768 2879.27 ± 117.07 0.4575 2820.21 ± 159.05 0.7286
25ng/ml 50nM 3611.64 ± 221.79 0.1708 2862.21 ± 240.57 0.6054 2869.74 ± 167.65 0.4857 2907.08 ± 193.16 0.4877
25ng/ml 100nM 4865.79 ± 574.48 0.0003 2980.9 ± 173.36 0.306 3035.52 ± 206.85 0.1337 3061.2 ± 217.26 0.1753
25ng/ml 200nM 5827.91 ± 500.48 <.0001 3023.88 ± 193.36 0.2093 2874.26 ± 169.59 0.4518 2893.51 ± 190.51 0.5041
                                
IL9       3.33 ± 0.37
25ng/ml    3.7 ± 0
   200nM 3.93 ± 0.33 0.5698 3.91 ± 0.48 0.5942 3.65 ± 0.2 0.9404 3.98 ± 0.36 0.4998
25ng/ml 25nM 3.7 ± 0 >0.999 4.55 ± 0.85 0.5554 3.37 ± 0.33 0.7599 3.7 ± 0 >0.999
25ng/ml 50nM 3.27 ± 0.32 0.3649 4.13 ± 0.43 0.9285 3.7 ± 0 >0.999 3.37 ± 0.33 0.8739
25ng/ml 100nM 4.02 ± 0.31 0.6282 4.13 ± 0.43 0.9285 4.16 ± 0.46 0.5047 3.58 ± 0.24 0.9965
25ng/ml 200nM 3.62 ± 0.08 0.9958 3.28 ± 0.35 0.9249 3.66 ± 0.04 0.9999 4.44 ± 0.54 0.2822
                                
IP-10/ CXCL10       20.14 ± 0.36
25ng/ml    3935.46 ± 375.68¥
   200nM 20.39 ± 0.57 >0.999 19.75 ± 0.42 >0.999 19.83 ± 0.4 >0.999 20.23 ± 0.48 >0.999
25ng/ml 25nM 3497.56 ± 194.81 0.6232 4068.98 ± 507.12 0.9982 3999.39 ± 370.53 0.9998 3903.67 ± 366.97 >0.999
25ng/ml 50nM 3599.04 ± 402.58 0.7995 3872.74 ± 295.01 0.9999 3665.2 ± 277.11 0.9431 3998.62 ± 456.34 0.9999
25ng/ml 100nM 3158.24 ± 189.25 0.1574 4050.7 ± 471.31 0.999 3860.41 ± 323.05 0.9995 4100.26 ± 502.48 0.9978
25ng/ml 200nM 2662.18 ± 89.27 0.0059 4071.78 ± 411.22 0.9979 3835.78 ± 304.58 0.9984 4407.56 ± 645.63 0.8945
                                
LIF       23.57 ± 0.93
25ng/ml    63.3 ± 2.1¥
   200nM 24.61 ± 0.9 0.9625 23.25 ± 0.99 0.9998 24.24 ± 1.14 0.9947 22.66 ± 0.82 0.9784
25ng/ml 25nM 74.41 ± 2.51 0.0243 68.82 ± 2.51 0.4762 67.72 ± 2.04 0.6687 65.71 ± 2.6 0.9551
25ng/ml 50nM 74.64 ± 3.23 0.0209 67.89 ± 3.08 0.6301 67.64 ± 3.17 0.6825 66.01 ± 3.21 0.9336
25ng/ml 100nM 80.58 ± 2.89 0.0003 70.3 ± 3.65 0.2723 73.12 ± 3.62 0.0743 70.02 ± 3.89 0.3858
25ng/ml 200nM 86.79 ± 2.87 <.0001 71.92 ± 2.82 0.117 70.66 ± 3.22 0.2261 67.62 ± 3.58 0.7257
                                
MCP1          1288.79 ± 44.4
25ng/ml    15200 ± 0¥
   200nM 1231.38 ± 54.82 0.8558 1125.31 ± 55.12 0.0677 1158.23 ± 47.13 0.1939 1306.83 ± 54.65 0.9989
25ng/ml 25nM 31401.9 ± 12245.69 0.6168 29762.04 ± 13226.23 0.5166 15200 ± 0 >0.999 21968.74 ± 4662.32 0.7846
25ng/ml 50nM 21656.92 ± 6456.92 0.9745 27471.13 ± 12271.13 0.6564 33175.72 ± 17975.72 0.4889 25836.84 ± 10636.84 0.4403
25ng/ml 100nM 32481.08 ± 17281.08 0.564 15200 ± 0 >0.999 26334.64 ± 11134.64 0.8276 15200 ± 0 >0.999
25ng/ml 200nM 20201.73 ± 5001.73 0.989 17302.89 ± 2102.89 0.9991 19811.45 ± 4611.45 0.9903 18512.1 ± 3312.1 0.9759
                                
MIP1 α          3.14 ± 0.24
25ng/ml    105.63 ± 3.74¥
   200nM 3.11 ± 0.28 >0.999 2.63 ± 0.35 0.9995 2.9 ± 0.21 >0.999 2.75 ± 0.26 0.9999
25ng/ml 25nM 82.56 ± 3.1 <.0001 103.81 ± 3.29 0.9925 101.71 ± 3.84 0.931 102.06 ± 4.18 0.9303
25ng/ml 50nM 70.57 ± 3.32 <.0001 100.64 ± 4.66 0.7866 104.54 ± 6.56 0.9994 96.35 ± 3.57 0.3335
25ng/ml 100nM 50.91 ± 1.6 <.0001 91.52 ± 5.05 0.0532 96.4 ± 4.18 0.4229 96.22 ± 3.58 0.3215
25ng/ml 200nM 40.36 ± 0.88 <.0001 83.1 ± 2.77 0.0007 98.72 ± 3.87 0.6469 88.49 ± 5.06 0.016
                                
MIP1 β       122.07 ± 4.05
25ng/ml    313.11 ± 5.46¥
   200nM 116.79 ± 5.02 0.8764 113.94 ± 3.76 0.5849 117.97 ± 3.75 0.9512 113.08 ± 4.82 0.4912
25ng/ml 25nM 328.74 ± 7.75 0.4072 319.77 ± 6.92 0.9203 318.92 ± 6.03 0.9606 313.64 ± 8.9 >0.999
25ng/ml 50nM 335.46 ± 9.56 0.1354 318.84 ± 8.17 0.9516 318.37 ± 9.88 0.9722 316.87 ± 10.18 0.9939
25ng/ml 100nM 348.55 ± 7.71 0.007 323.13 ± 6.82 0.7439 324.42 ± 8.52 0.7136 317.95 ± 8.1 0.9843
25ng/ml 200nM 361.86 ± 6.8 0.0001 318.83 ± 8.71 0.9479 318.74 ± 8.72 0.9617 316.74 ± 9.29 0.9942
                                
PDGF-BB          2.13 ± 0.17
25ng/ml    4.27 ± 0.22¥
   200nM 1.95 ± 0.21 0.936 2.15 ± 0.13 >0.999 2.19 ± 0.17 0.9993 1.93 ± 0.18 0.8993
25ng/ml 25nM 5.15 ± 0.21 0.0234 5.19 ± 0.15 0.002 4.93 ± 0.21 0.1721 4.23 ± 0.18 0.9995
25ng/ml 50nM 5.09 ± 0.22 0.0366 5.28 ± 0.18 0.0007 5.22 ± 0.25 0.0254 4.36 ± 0.18 0.9926
25ng/ml 100nM 5.09 ± 0.22 0.0373 5.4 ± 0.16 0.0001 5.57 ± 0.23 0.0015 4.71 ± 0.23 0.329
25ng/ml 200nM 5.18 ± 0.22 0.0154 5.28 ± 0.15 0.0005 5.52 ± 0.27 0.0017 4.75 ± 0.16 0.2397
                                
PIGF-1          20.75 ± 0.87
25ng/ml    55.66 ± 1.47¥
   200nM 21.21 ± 1.23 0.9989 20.17 ± 1.26 0.9968 21.19 ± 1.05 0.9991 20.55 ± 1.16 >0.999
25ng/ml 25nM 59.03 ± 2.6 0.7932 56.69 ± 2.37 0.9958 58.04 ± 2.17 0.9291 59.56 ± 3.2 0.7867
25ng/ml 50nM 56.18 ± 3.04 0.9997 53.92 ± 2.81 0.9714 55.59 ± 2.74 >0.999 56.72 ± 3.48 0.9975
25ng/ml 100nM 57.5 ± 3.14 0.9689 54.67 ± 3.27 0.9965 58.69 ± 3.37 0.8506 59.49 ± 3.52 0.7971
25ng/ml 200nM 58.88 ± 2.87 0.8058 54.61 ± 2.69 0.9951 55.71 ± 3.28 >0.999 55.63 ± 3.23 >0.999
                                
RANTES          9.56 ± 0.42
25ng/ml    230.17 ± 9.43¥
   200nM 9.51 ± 0.56 >0.999 8.42 ± 0.51 0.9997 8.61 ± 0.52 0.9999 10.17 ± 0.54 >0.999
25ng/ml 25nM 192 ± 12.74 0.0311 203.77 ± 12.55 0.4195 216.88 ± 13.45 0.9096 237.57 ± 17.46 0.9967
25ng/ml 50nM 165.12 ± 11.76 0.0001 198.35 ± 15.1 0.262 201.93 ± 15.44 0.439 237.55 ± 21.78 0.9967
25ng/ml 100nM 136.24 ± 7.8 <.0001 194.21 ± 12.67 0.1736 207.79 ± 17.38 0.6354 241.39 ± 22.79 0.9841
25ng/ml 200nM 111.94 ± 6.48 <.0001 183.18 ± 13.92 0.0416 189.62 ± 13.78 0.1403 238.51 ± 23.12 0.9942
                                
SCF          2.01 ± 0.08
25ng/ml    4.16 ± 0.08¥
   200nM 1.99 ± 0.14 >0.999 1.93 ± 0.13 0.9847 2 ± 0.1 >0.999 1.91 ± 0.15 0.9538
25ng/ml 25nM 4.41 ± 0.13 0.6315 4.33 ± 0.18 0.8691 4.34 ± 0.19 0.9047 4.18 ± 0.24 >0.999
25ng/ml 50nM 4.41 ± 0.22 0.6213 4.16 ± 0.18 >0.999 4.25 ± 0.22 0.9888 4.1 ± 0.21 0.9989
25ng/ml 100nM 4.58 ± 0.16 0.203 4.26 ± 0.17 0.9739 4.59 ± 0.25 0.3051 4.29 ± 0.29 0.9805
25ng/ml 200nM 4.49 ± 0.16 0.3684 4.2 ± 0.17 0.9988 4.23 ± 0.15 0.9962 4.07 ± 0.21 0.9952
                                
SDF-1α       1075.14 ± 36.63
25ng/ml    3307.18 ± 98.57¥
   200nM 1050.43 ± 48.77 0.9981 1003.25 ± 40.97 0.8391 1028.82 ± 43.21 0.9683 990.69 ± 48.87 0.7402
25ng/ml 25nM 3610.22 ± 119.33 0.2517 3430.87 ± 111.52 0.8805 3503.89 ± 90.15 0.6507 3456.41 ± 158.06 0.8874
25ng/ml 50nM 3666.62 ± 135.83 0.1361 3356.32 ± 136.22 0.9953 3471.01 ± 141.19 0.7742 3450.69 ± 158.13 0.9001
25ng/ml 100nM 3794.59 ± 134.61 0.0252 3471.01 ± 111.77 0.7414 3521.98 ± 154.06 0.5807 3563.68 ± 157.35 0.5609
25ng/ml 200nM 3962.77 ± 116.03 0.0013 3481.04 ± 134.24 0.6851 3436.48 ± 134.91 0.8755 3464.97 ± 155.2 0.8577
                                
TNFα          1.49 ± 0.59
25ng/ml    9159.41 ± 1060.96¥
   200nM 2.61 ± 0.65 >0.999 2.4 ± 0.71 >0.999 2.82 ± 0.72 >0.999 2.41 ± 0.7 >0.999
25ng/ml 25nM 10472.77 ± 779.28 0.9989 10574.99 ± 753.02 0.8099 11212.78 ± 1168.53 0.4872 8951.15 ± 870.67 0.9997
25ng/ml 50nM 10873.61 ± 631.64 0.9969 11776.9 ± 1658.47 0.3395 10367.04 ± 1016.28 0.8503 9862.6 ± 1041 0.9662
25ng/ml 100nM 21115.64 ± 10093.98 0.2343 11722.68 ± 1259.67 0.3574 10632.61 ± 795.65 0.7448 10525.46 ± 1077.11 0.7438
25ng/ml 200nM 13938.92 ± 2924.27 0.8755 11233.91 ± 945.2 0.5219 10619.05 ± 1276.72 0.7358 9777.73 ± 966.87 0.9767
                                
TNFβ          4.5 ± 0.48
25ng/ml    4.86 ± 0.09
   200nM 3.53 ± 0.62 0.4426 4.7 ± 0.28 0.9978 4.5 ± 0.5 >0.999 4.42 ± 0.57 >0.999
25ng/ml 25nM 3.85 ± 0.63 0.4631 4.91 ± 0.79 1 5.68 ± 1.4 0.8542 4.62 ± 0.49 0.9848
25ng/ml 50nM 4.6 ± 0.68 0.9896 4.13 ± 0.5 0.7159 5.54 ± 0.56 0.9179 5.03 ± 0.38 0.9959
25ng/ml 100nM 4.31 ± 0.56 0.8742 4 ± 0.51 0.5971 4.6 ± 0.46 0.9976 4.47 ± 0.37 0.915
25ng/ml 200nM 4.48 ± 0.44 0.9598 4.42 ± 0.45 0.9271 3.78 ± 0.57 0.686 4.96 ± 0.56 0.9994
                                
VEGF-A          633.68 ± 16.37
25ng/ml    1322.08 ± 42.07¥
   200nM 610.03 ± 18.16 0.9435 554.18 ± 29.76 0.1114 609.51 ± 15.83 0.9386 598.11 ± 16.67 0.7728
25ng/ml 25nM 1285.27 ± 48.3 0.9508 1249.75 ± 44.89 0.6545 1261.47 ± 37.95 0.8399 1303.84 ± 56.86 0.9983
25ng/ml 50nM 1251.08 ± 47.7 0.6733 1242.76 ± 50.39 0.5813 1268.91 ± 59.05 0.8911 1286.84 ± 61.29 0.9801
25ng/ml 100nM 1270.06 ± 51.71 0.8536 1262.01 ± 46.28 0.7787 1335.99 ± 63.65 0.9992 1346.72 ± 67.56 0.9947
25ng/ml 200nM 1206.81 ± 45.57 0.2491 1232.36 ± 49.33 0.4555 1262.36 ± 57.42 0.836 1256.89 ± 60.57 0.8386
                                
VEGF-D          3.63 ± 0.39
25ng/ml    8.37 ± 0.77¥
   200nM 2.98 ± 0.51 0.9007 3.19 ± 0.57 0.9787 3.63 ± 0.6 >0.999 3.55 ± 0.66 >0.999
25ng/ml 25nM 8.47 ± 0.59 0.9999 9.22 ± 0.87 0.8543 8.6 ± 0.74 0.9982 8.7 ± 0.52 0.9949
25ng/ml 50nM 8.05 ± 0.73 0.9939 9.72 ± 0.75 0.5549 8.44 ± 0.66 >0.999 8.49 ± 0.72 0.9999
25ng/ml 100nM 8.13 ± 0.8 0.9979 8.71 ± 0.65 0.9936 9.25 ± 0.7 0.8045 9.64 ± 0.91 0.6256
25ng/ml 200nM 7.76 ± 0.75 0.9332 9.12 ± 0.78 0.8932 8.82 ± 0.7 0.9752 8.03 ± 0.93 0.9933
                                
a   用TNFα (25 ng/mL)及IFNγ (25 ng/mL)刺激b 資料呈現為平均值±標準誤差c 與用單獨TNFα及IFNγ刺激比較有顯著差異¥ 表明與單獨媒劑(無刺激及無藥物濃度) p<0.01之顯著差異
實例7:鑑定在作為對用魯索替尼乳膏治療之完全反應者之白斑病患者中有區別地表現之基因
使用無創皮膚膠帶,自加入關於魯索替尼乳膏(INCB018424)治療經臨床診斷患有白斑病之個體之研究中的各患有白斑病之個體收集皮膚組織,使用手掌(或手紋)法(手掌加5個手指),面部脫色區域佔總體表面積之至少0.5%,且受影響之非面部區域佔總體表面積之至少3%。所有個體均同意收集皮膚組織,且符合臨床方案中所概述之納入及排除準則。一旦收集,可自無創皮膚膠帶將皮膚組織加工成核糖核酸(RNA),以供進一步分析,且隨後使用RNA定序進行分析。基於對用局部INCB018424治療之臨床反應,將樣品分成兩組。具體而言,基於其在治療第24週之治療反應,將樣品分類為「反應者」或「無反應者」(「F-VASI」係指面部白斑病面積及嚴重度指數)。以0.15%、0.5%或1.5%之劑量強度每天向個體局部塗覆INCB018424一次或兩次。在乳膏調配物中每天兩次塗覆相隔至少10小時。
藉由Beijing Genomics Institute,使用Illumina HiSeq 4000系統對所有生檢樣品進行RNA定序。接著在OmicSoft Array Studio中使用人類基因組B38文庫對資料進行比對及質量控制。產生每百萬個定位讀段之每千鹼基轉錄產物之片段(Fragments Per Kilobase of transcript per Million (FPKM) mapped read) (轉錄產物之相對表現)且用於所有下游分析。使用ANOVA檢驗鑑定在組之間有區別地表現之基因的顯著差異。RNA定序鑑定出在基線處在反應者組與無反應者組之間有區別地表現的基因(原始p值<0.05)。與無反應者相比,反應者中增加三百六十九種基因且減少339種基因(表16)。 16 :與無反應者相比反應者之皮膚生檢中有區別地表現之基因
與無反應者相比反應者中上調 與無反應者相比反應者中下調
基因符號 變化倍數 原始P值 基因符號 變化倍數 原始P值
TBC1D3 68.0367 0.0006    RARRES3 -153.032 0.0012
MT1E 53.8104 0.0182    CXCL10 -62.5312 0.0345
RBPMS2 37.1356 0.0044    ABLIM2 -62.3872 2.79E-07
HIST1H2AK 29.0245 0.038    FMO4 -61.6695 0.0002
ARHGAP19-SLIT1 27.4855 0.003    ZSCAN31 -57.6809 0.0003
DRC3 23.4005 0.0236    FAM153C -45.9711 0.0102
OVCH2 21.9183 0.0201    VCAM1 -43.9304 0.0137
CCDC78 20.8539 0.0031    CDC42EP5 -41.845 0.0002
UGT1A6 19.6003 0.0445    KCNRG -41.3377 0.0023
CCDC105 18.5561 0.0098    PRR5 -40.7814 0.0003
KCNAB3 16.7528 0.019    HIST1H2AB -40.7575 0.0413
ECE2 16.4402 0.0264    GOLGA8Q -38.142 0.0103
ANKRD2 15.9273 0.0213    PRR7 -37.6323 0.0002
ACVR1C 15.3089 0.0301    C10orf128 -37.3554 0.002
B3GNT4 14.755 0.0352    CXCL11 -36.054 0.0286
IYD 14.1814 0.0484    NUDT6 -34.7085 0.0029
TWIST2 13.314 0.0346    CD3E -32.0222 0.0272
DERL3 13.0597 0.0178    LDHD -31.0204 0.0024
KCNJ1 12.9249 0.013    CTAGE15 -30.8756 0.0263
SYT12 12.6703 0.0193    SLFN12 -30.8518 0.0104
GPR61 12.3318 0.0089    GGACT -29.4351 0.0041
KRT71 12.0543 0.0346    APOL3 -28.8838 0.0248
CCDC153 11.7483 0.0213    DLEU1 -27.6186 0.0178
ZNF764 11.7269 0.0293    FAM231D -27.6104 0.0043
TCEB3B 11.6698 0.0124    C1orf233 -27.2263 0.0003
FEZ1 11.6487 0.0325    SPRR3 -26.4914 0.0291
C3orf49 11.6458 0.0428    KCNIP4 -26.065 0.0108
VEPH1 11.5131 0.0442    TBX19 -26.0579 0.002
PDE9A 11.2422 0.0133    HLA-DMA -24.1058 0.0485
GAGE2E 10.6926 0.0309    IL2RB -23.2681 0.0065
POU5F1B 9.2163 0.0141    GPR27 -23.088 0.0068
COL11A1 8.9606 0.0219    IL1RL1 -22.1689 0.0304
HBZ 8.9457 0.0418    AGTRAP -21.8711 0.0407
CCNI2 8.8795 0.0336    EDARADD -21.2019 0.0173
ADAMTS13 8.8091 0.0337    SH3BGR -21.0306 0.0263
CNDP1 8.5325 0.0328    IGFN1 -20.7897 0.0013
CILP 8.2659 0.0326    GOLGA8R -20.0035 0.0361
ZYG11A 7.8521 0.0282    OCEL1 -19.5751 0.0078
GEMIN6 7.5022 0.0424    MLKL -19.533 0.0114
PSD2 7.4261 0.0035    JPH3 -19.5114 0.0044
C10orf62 7.1923 0.0382    APOBEC3G -19.371 0.0498
TAS1R3 7.0305 0.0281    TRPM2 -19.3403 0.0116
TMEM170B 6.8909 0.019    KLHDC7B -19.2599 0.0288
APLN 6.8326 0.0141    GAS2L3 -19.2454 0.0293
ETNPPL 6.094 0.0309    CYP27B1 -19.1669 0.0005
WBSCR17 5.8639 0.0307    LRRC70 -19.1541 0.012
PPIAL4G 5.8596 0.0254    MMP25 -18.8131 0.0152
ZNF77 5.7936 0.035    SYNE4 -18.7815 0.0088
VWA5B2 5.5818 0.0325    KBTBD8 -18.5263 0.0145
SLC2A10 5.3839 0.0367    FAM124A -18.2655 0.0016
PTGER1 5.3803 0.0305    TVP23C-CDRT4 -18.1156 0.0453
NPR3 5.1731 0.0153    CD3G -17.8975 0.032
ZSCAN1 5.0883 0.03    GSTT2B -17.5226 0.01
EFR3B 4.8859 0.0379    CYP4V2 -17.304 0.0292
TFR2 4.7716 0.0294    H3F3C -17.2902 0.0113
FAM13C 4.5878 0.0335    RNF148 -17.2129 0.0324
CLEC4E 4.5778 0.0393    TICAM2 -17.0725 0.0315
GRM3 4.5593 0.0177    KLB -17.041 0.0008
CACNA1F 4.5255 0.046    RGS9 -17.0012 0.0093
IL17B 4.5105 0.0334    BTN3A3 -16.4997 0.0129
METTL20 4.4939 0.0038    MTRNR2L3 -16.4822 0.0099
C1QL1 4.1931 0.0314    HIST4H4 -16.3414 0.016
NID2 4.1828 0.0344    ZNF597 -16.2528 0.0094
FCER2 4.121 0.0427    RCBTB2 -15.9872 0.0413
OR10A4 3.9713 0.0337    HMMR -15.6366 0.0345
CLMN 3.9588 0.024    MYCL -14.709 0.0196
PDGFRL 3.8707 0.0374    C15orf65 -14.6809 0.0435
MRAP2 3.8395 0.0207    RARB -14.6653 0.0069
OR7G1 3.7882 0.0319    KLHDC1 -14.5112 0.0068
LIN52 3.7792 0.0347    TMEM8A -14.3754 0.0124
TAF1L 3.7768 0.0211    SKA1 -14.2437 0.0386
GOLGA6D 3.7667 0.03    SERINC4 -14.1611 0.032
SIRT3 3.5852 0.0104    AHRR -14.1386 0.0113
SEMA4G 3.4866 0.0182    C1QTNF6 -14.0618 0.0401
IFT43 3.3886 0.0406    C4orf27 -13.9415 0.0386
STK16 3.3738 0.0102    FUT2 -13.8461 0.0133
ARMC7 3.3542 0.0291    PAEP -13.7052 0.0318
RFNG 3.3135 0.0482    TDRKH -13.6903 0.0359
CSAG1 3.2459 0.0299    C9orf172 -13.5475 0.0065
HRNR 3.1974 0.0406    AIMP2 -13.4501 0.0049
RAB30 3.1613 0.0366    LZTS1 -13.3286 0.0122
TMEM174 3.1396 0.0293    NEK3 -13.2495 0.0103
CCDC77 3.034 0.0054    ADAM21 -13.0459 0.027
PRR21 3.0038 0.0298    FAM216A -13.0367 0.0188
NHSL2 2.9573 0.0367    PIK3CG -12.9166 0.0341
C1orf123 2.9328 0.0095    SDF2L1 -12.8938 0.0335
ZNF787 2.9154 0.0486    LAIR1 -12.8913 0.0079
RUNX2 2.854 0.0347    ANGPTL3 -12.8408 0.0323
ZNRF1 2.846 0.018    TTYH2 -12.6181 0.0382
ASB1 2.8451 0.0073    BEST1 -12.5347 0.0434
BRINP2 2.8274 0.0325    SELPLG -12.4437 0.0426
PUSL1 2.8167 0.0119    PRKAR2B -12.4218 0.0276
TMEM108 2.7928 0.0414    NKX3-2 -12.41 0.0215
AP3M1 2.759 0.0024    SCO2 -12.3332 0.0427
PALD1 2.738 0.0142    C20orf27 -12.1621 0.0076
BMF 2.7127 0.0084    RGS16 -11.9215 0.0266
UTP23 2.6966 0.0084    COQ6 -11.8346 0.0084
GTF2H3 2.6344 0.0211    TMEM158 -11.8129 0.0111
GLRX5 2.632 0.0211    PCDHB5 -11.6183 0.0119
PEPD 2.6262 0.0246    WNT5A -11.6009 0.0168
DUSP23 2.5657 0.0093    PRR15 -11.4573 0.0264
EVA1B 2.5237 0.0254    ERAP2 -11.3813 0.0071
ZNF444 2.4989 0.0432    LDHAL6A -11.3778 0.0299
FAM219A 2.4931 0.0252    MRPS28 -11.3045 0.022
HAUS4 2.4771 0.0144    PSG1 -11.2907 0.0327
VBP1 2.4476 0.018    GNB5 -11.2064 0.0374
TMEM208 2.4346 0.0459    PILRB -11.1383 0.0126
NMRK1 2.4342 0.0178    SHCBP1 -11.0917 0.0348
ARID3B 2.4294 0.044    MROH7 -11.0736 0.0466
MPLKIP 2.4118 0.0249    GBP3 -11.0394 0.0402
CAB39L 2.3956 0.0034    RFC4 -10.9808 0.0101
ALKBH3 2.3941 0.0014    NHLH1 -10.9216 0.0478
RNF113A 2.3587 0.045    CTF1 -10.7115 0.0433
LAMTOR5 2.3182 0.0433    BIN2 -10.651 0.0464
CHRNB1 2.3101 0.0383    ANKRD13B -10.6479 0.0091
PLCE1 2.304 0.0074    MAP1A -10.6232 0.0292
NDUFB6 2.302 0.0393    PRMT6 -10.6027 0.0239
DDX55 2.2971 0.0036    WSCD2 -10.4554 0.0099
TMEM14A 2.2938 0.008    KCNMB1 -10.2631 0.0151
C12orf29 2.2891 0.0062    PLIN1 -9.9343 0.0335
NUDT9 2.2659 0.0058    ARHGAP15 -9.9233 0.0439
THG1L 2.2594 0.0387    KIF18A -9.8102 0.0353
SERTAD1 2.2401 0.0403    RAD51B -9.7928 0.0259
LSAMP 2.2351 0.0474    DNAJB5 -9.7628 0.0177
CHST15 2.2172 0.0329    LRRC8C -9.7212 0.0448
VARS2 2.2089 0.0391    CUZD1 -9.7111 0.0312
SMIM5 2.2004 0.0331    DISC1 -9.6567 0.031
CUEDC1 2.1963 0.0305    ADCY7 -9.6462 0.0295
ZNF619 2.1826 0.0295    WAS -9.5953 0.0418
FAM89B 2.1601 0.0223    CCBL1 -9.4587 0.028
MRPL14 2.154 0.0372    ZNF286B -9.3988 0.011
RPL36A 2.1513 0.0466    SLA2 -9.3314 0.0432
UQCC2 2.1142 0.0357    PLA2G4C -9.2972 0.0301
ORAOV1 2.1074 0.0264    MAP1LC3C -9.2483 0.0288
FAM96B 2.1 0.0496    DNAH9 -9.0277 0.026
GID4 2.0867 0.0078    MUC1 -9.0163 0.0362
LMLN 2.0845 0.0414    PROX1 -8.9899 0.0084
AKAP10 2.0712 0.0017    SSC4D -8.7828 0.0307
RNF166 2.0613 0.0301    SLC9A4 -8.6475 0.0245
HMGCL 2.0551 0.0228    ARHGEF39 -8.5813 0.0453
C11orf49 2.0425 0.0107    RAB3IL1 -8.5209 0.0338
TSHZ1 2.0399 0.0324    TNFRSF8 -8.4521 0.0311
ERMARD 2.0267 0.0112    GINS1 -8.2901 0.0339
TATDN2 2.0046 0.0258    P3H3 -8.2773 0.0311
GTF2H5 1.9878 0.0448    CD5 -8.1417 0.0371
REXO2 1.9865 0.0162    GPR34 -8.1372 0.0496
PCCA 1.9856 0.035    HHIPL2 -8.1104 0.0338
ZNF780A 1.9837 0.036    NEFH -8.0898 0.0309
ZNF133 1.982 0.0114    PADI3 -8.0437 0.0436
RWDD4 1.9749 0.0011    NUGGC -8.02 0.0304
MAPK3 1.9741 0.0429    SEZ6L2 -8.016 0.0399
CRY2 1.9599 0.0196    ETS1 -8.0143 0.0015
ZNF397 1.9584 0.044    CSF1R -8.0002 0.0498
TMEM68 1.949 0.0442    GPR89B -7.9587 0.0288
HLCS 1.945 0.0079    MRPL24 -7.9498 0.0431
MRPL33 1.9409 0.0019    SLC25A25 -7.8202 0.0167
RAB3B 1.9339 0.05    LRRC37A3 -7.6832 0.0282
CSTF2 1.9291 0.0213    C1orf109 -7.5885 0.0312
SMPD2 1.9171 0.0348    FBXO4 -7.5231 0.0207
DNAJA3 1.9077 0.0256    SGIP1 -7.4578 0.0426
BTF3L4 1.9049 0.0464    PRKG1 -7.455 0.0108
RANBP9 1.9028 0.0221    TMC8 -7.4527 0.0388
MCFD2 1.9021 0.0091    SRSF12 -7.3006 0.0399
CSNK1G3 1.8954 0.0037    GJA3 -7.2952 0.0494
SEPSECS 1.8912 0.0246    LMAN2L -7.2387 0.021
TEX264 1.8749 0.0302    GALNT16 -7.2288 0.0388
AMOTL2 1.8745 0.0254    EN1 -7.2271 0.0387
ASAH1 1.8711 0.0255    FAXC -7.2246 0.0365
PMF1 1.8691 0.0335    MUC4 -7.0712 0.0231
ZNF865 1.8645 0.0376    CUX2 -7.0366 0.0244
RARS2 1.8549 0.0027    NDOR1 -7.0359 0.0256
LYPLA2 1.8525 0.0495    TEX14 -7.0294 0.0352
MRPS10 1.8459 0.0267    PDIA5 -7.0173 0.0134
MOAP1 1.8357 0.0331    FOSL1 -6.9778 0.0278
TFAM 1.8176 0.0399    FBXO2 -6.9416 0.0381
LIPH 1.8045 0.0359    TGIF2 -6.9025 0.0367
RDH11 1.8019 0.0418    EED -6.8688 0.0318
RNF41 1.801 0.0135    WNT4 -6.8002 0.0287
HAUS5 1.8 0.0223    IFT88 -6.6886 0.0348
FBXO8 1.7986 0.0334    GORAB -6.5339 0.0256
SUMF1 1.79 0.0494    ESRRG -6.5206 0.0362
CNNM3 1.7821 0.0452    NPAS3 -6.4759 0.0474
MRPL50 1.7811 0.0038    DNAJC25 -6.4515 0.0255
DCAF17 1.7746 0.0223    CNGB1 -6.4413 0.0364
DCXR 1.7739 0.0098    AVPR1A -6.4102 0.0057
RPS6KB1 1.7721 0.0073    QTRTD1 -6.4086 0.0089
RAB11FIP2 1.7699 0.0432    C9orf64 -6.324 0.0389
SFMBT1 1.7681 0.028    NANOS1 -6.2575 0.0281
MANEA 1.766 0.0307    GTF2H2C -6.2444 0.0113
ZNF266 1.7643 0.0306    ARMC9 -6.2366 0.0254
IKZF5 1.7618 0.004    PLSCR1 -6.1774 0.0038
EIF2AK4 1.7598 0.0298    PHTF1 -6.081 0.0316
CHMP6 1.7493 0.0065    EEF1E1 -6.0239 0.025
ZNF525 1.7492 0.0203    APOLD1 -5.9596 0.024
VPS33A 1.7483 0.0123    ZBTB46 -5.9247 0.0184
MIDN 1.7458 0.0243    SLC22A18 -5.8962 0.0417
CMTM4 1.7449 0.044    SS18L2 -5.7458 0.0484
POLR1B 1.743 0.0122    SLC41A2 -5.7433 0.0427
TRIM11 1.736 0.0453    C3 -5.4761 0.0447
COX7A2 1.7329 0.029    FGFRL1 -5.4726 0.0499
PRPF40B 1.7259 0.0039    DENND1C -5.3414 0.0459
SUPV3L1 1.7245 0.0369    TNFAIP8L1 -5.2489 0.033
CCP110 1.7177 0.0195    CILP2 -5.0874 0.028
PGRMC1 1.7171 0.0285    DUSP28 -4.9879 0.0366
PCDHGB7 1.7097 0.0003    S1PR2 -4.8478 0.0438
PEX26 1.708 0.0374    C1orf74 -4.8217 0.0335
POLR2E 1.6977 0.0057    IMPG2 -4.7994 0.0155
FHL2 1.6965 0.023    ACAN -4.6964 0.0344
MCPH1 1.6935 0.0248    TARSL2 -4.6505 0.0001
RNASEH1 1.6927 0.0101    SARM1 -4.4398 0.0485
TMEM70 1.6875 0.0425    ALPK3 -4.3531 0.007
CNOT7 1.6848 0.0393    SYCP2 -4.3321 0.0427
PPP1R37 1.681 0.0427    ZNF555 -4.2258 0.035
PPP1R14B 1.6793 0.0471    NLRP2 -4.0548 0.0392
MAK16 1.6778 0.0286    ZNF34 -4.0366 0.0336
TANK 1.6768 0.0342    GPRC5A -4.027 0.0387
APLF 1.6766 0.0132    CECR5 -3.8695 0.0009
MAGEF1 1.6717 0.0382    JMJD6 -3.8462 0.0024
RUFY1 1.6712 0.0486    SPATA5L1 -3.8252 0.0241
CDK4 1.6694 0.046    MSRB2 -3.8049 0.0441
SNRK 1.6669 0.0362    ZNF469 -3.6847 0.0105
GLOD4 1.6615 0.0101    SLC35E3 -3.677 0.0032
PHLPP1 1.6594 0.0478    FECH -3.5554 0.0407
DCAF15 1.6546 0.0174    NOP16 -3.4316 0.0125
PSMB3 1.6539 0.0357    PTRHD1 -3.3579 0.0037
ZNF467 1.6474 0.0454    SLC5A6 -3.276 0.0048
PIGV 1.6448 0.0392    SCARB1 -3.1716 0.0072
HCFC2 1.6409 0.0284    MSANTD4 -3.1499 0.0224
C11orf57 1.6332 0.0143    HCN4 -3.0177 0.0496
PCNXL4 1.628 0.0195    RNF180 -2.9924 0.0132
SLC25A44 1.627 0.0327    BCL2L12 -2.9658 0.0487
LRIG3 1.6263 0.0102    MRPL27 -2.8904 0.0058
HSPA4L 1.625 0.0216    XK -2.8026 0.0072
PTK2B 1.6221 0.0409    CYB5R4 -2.7853 0.0352
DNAJC4 1.619 0.0326    VOPP1 -2.7641 0.0074
CCDC117 1.6127 0.0216    PDLIM7 -2.7221 0.0116
CAPG 1.6117 0.0371    PAAF1 -2.7215 0.0266
ARHGEF5 1.6091 0.0483    INTS2 -2.663 0.0081
ENOSF1 1.6084 0.0226    CTGF -2.6517 0.0391
MAST2 1.6068 0.0397    ABCA7 -2.6328 0.048
ST6GALNAC6 1.6038 0.0293    TRUB2 -2.5715 0.034
NFYB 1.6025 0.0409    NAV1 -2.5603 0.0495
TMED7 1.5976 0.01    NPIPB4 -2.5301 0.0001
SLIT3 1.5936 0.0152    IQCG -2.5235 0.0287
GLCCI1 1.5838 0.0275    ZNF124 -2.5084 0.0229
ZNF765 1.5737 0.0229    GRIP1 -2.457 0.0246
BLOC1S1 1.5718 0.0327    NDC1 -2.4318 0.0449
NDFIP2 1.5714 0.0352    HSF4 -2.4304 0.0246
PSME3 1.5708 0.0139    BACE1 -2.4226 0.0322
MED1 1.5663 0.017    EOGT -2.3483 0.0282
FAM60A 1.5652 0.037    NAF1 -2.3137 0.0291
CAMK2D 1.5631 0.0411    BHLHE41 -2.303 0.0448
DVL1 1.5627 0.0346    ESD -2.2919 0.0149
BIRC2 1.5623 0.0269    USP28 -2.2862 0.001
PRPF4 1.5571 0.0306    PLXND1 -2.2778 0.0364
DOCK6 1.556 0.0497    CKS1B -2.2471 0.0149
SPTLC1 1.5552 0.0179    PPT2 -2.2363 0.0313
ACAD11 1.5517 0.0057    KATNAL2 -2.2113 0.0465
H2AFV 1.5491 0.0471    PRKAA1 -2.1788 0.0108
SWAP70 1.5477 0.0129    FTSJ1 -2.1679 0.0383
MTCH1 1.5441 0.0494    RNF2 -2.1655 0.0306
RNF167 1.5393 0.0489    SPRY4 -2.1628 0.0463
CD2BP2 1.5368 0.0199    PDE5A -2.1518 0.042
PHF8 1.5358 0.0185    CARD16 -2.1372 0.0404
SKAP2 1.5355 0.0458    TAF6 -2.1197 0.0401
TSPAN6 1.535 0.0218    FBXL4 -2.1123 0.0008
DCTN4 1.5348 0.0393    EGLN2 -2.0977 0.0151
FBXO42 1.5336 0.0356    SLC39A14 -2.0906 0.0054
TOB2 1.5327 0.0261    ASPSCR1 -2.0848 0.0392
SCAF1 1.5323 0.0107    DENND6A -2.0844 0.0439
KDM6A 1.5295 0.0406    HEXA -2.0705 0.0379
PHF1 1.528 0.0499    DHFR -2.0671 0.0452
RNPC3 1.5275 0.0134    ZNF43 -2.0455 0.0028
UBE2K 1.5234 0.0174    HEATR5A -2.0294 0.0497
ZNF91 1.5229 0.0369    SCFD2 -2.0009 0.0374
FOXO1 1.5207 0.0376    MLH1 -1.9963 0.0116
STX7 1.5195 0.0324    GAA -1.9848 0.0214
CDC27 1.5186 0.0107    FLOT2 -1.9772 0.0249
CGGBP1 1.5159 0.0362    TNPO1 -1.9693 0.023
CASC4 1.5117 0.0265    RNF8 -1.9597 0.0334
FBXO25 1.5103 0.0375    SHMT2 -1.9187 0.0211
CDK16 1.5005 0.0125    TAPT1 -1.9096 0.0401
MAPK7 1.4978 0.0237    FBXO48 -1.9025 0.0471
XPO4 1.4976 0.0197    STARD9 -1.9024 0.0071
MAN2C1 1.4976 0.0354    ARL13B -1.8733 0.0425
MZF1 1.4936 0.0406    CNTN4 -1.8547 0.0318
EDC4 1.4913 0.0272    ZSCAN16 -1.8429 0.0495
RNF34 1.4882 0.0302    CTPS1 -1.8415 0.0071
DCAF4 1.488 0.0472    HNRNPLL -1.8397 0.0417
LRP11 1.4853 0.0407    MRPL30 -1.8365 0.0311
WTAP 1.4772 0.0131    EXOC5 -1.82 0.0067
RBM23 1.4763 0.0487    PDCD7 -1.8129 0.0284
ZNF224 1.47 0.0286    ARHGAP30 -1.8009 0.0447
ATP11A 1.4699 0.0275    MTHFD1 -1.757 0.0318
CLASRP 1.4674 0.0108    RINT1 -1.7568 0.0087
CPSF2 1.4594 0.0498    DNMT3A -1.7456 0.0053
FAM50A 1.4579 0.0154    NAA10 -1.7147 0.034
PHF10 1.4546 0.011    RFX7 -1.7118 0.0084
CDK2 1.454 0.0365    SDCCAG8 -1.7004 0.0196
EFR3A 1.4466 0.0044    TMX3 -1.6894 0.0168
SAR1A 1.4465 0.0258    NUP107 -1.6884 0.0315
BUB3 1.4456 0.0398    DENND1A -1.6801 0.017
ATP5E 1.4441 0.0493    DAXX -1.6753 0.0009
MEA1 1.4435 0.0427    ACBD6 -1.6687 0.0051
TARDBP 1.4379 0.0185    WSB2 -1.6676 0.0268
LZTS2 1.4358 0.0223    KLHL9 -1.6617 0.0083
ATP11B 1.4202 0.038    ABCA2 -1.6526 0.0369
ANKHD1 1.4186 0.0196    CHTF8 -1.6523 0.0105
ANKS1A 1.4176 0.0489    TRIM66 -1.6518 0.0071
CD2AP 1.4174 0.0329    ARNTL -1.6485 0.0297
AGFG1 1.4156 0.0481    PLD2 -1.6456 0.0112
EIF2A 1.4149 0.0096    IL6ST -1.6403 0.0389
METTL7A 1.4107 0.0426    ZNF551 -1.6251 0.0289
HINT1 1.4073 0.0469    LIMA1 -1.6226 0.0124
REXO1 1.4069 0.0184    SYNJ1 -1.6023 0.0393
TBC1D22A 1.4003 0.0409    SRC -1.5899 0.0462
ARHGAP5 1.4002 0.0338    MDM4 -1.5825 0.0135
CCDC174 1.3992 0.035    INTS3 -1.5722 0.0436
SERINC1 1.3973 0.0367    HIVEP1 -1.559 0.0097
SAP18 1.3949 0.0338    DNHD1 -1.5442 0.0493
SEC16A 1.3849 0.0471    MEF2A -1.5306 0.0277
RALBP1 1.3837 0.0264    TMSB10 -1.5295 0.0499
PRPF18 1.3802 0.0334    ARFRP1 -1.5238 0.0468
STK24 1.3751 0.0431    MCC -1.5213 0.009
MPHOSPH10 1.3743 0.0484    POLR3GL -1.5197 0.0308
AVL9 1.3659 0.0376    CABIN1 -1.5105 0.0072
TRIM28 1.356 0.0239    BBS9 -1.4879 0.0404
UBTF 1.3536 0.0324    RAB2B -1.4817 0.0346
PAFAH1B2 1.352 0.024    BRAT1 -1.4566 0.0458
CDC5L 1.3516 0.0171    TM7SF3 -1.4542 0.046
PAF1 1.3435 0.0396    WDR33 -1.4522 0.0167
SLMAP 1.3356 0.003    WDR46 -1.4522 0.0116
IPO8 1.3307 0.0345    PLXNA3 -1.4331 0.0403
CALU 1.3268 0.0306    PAPD4 -1.4057 0.0355
KDM5A 1.3258 0.0157    ATP2B4 -1.3949 0.0275
TRA2A 1.3241 0.003    OXSR1 -1.3411 0.0235
WNK1 1.3218 0.0276    TBC1D8B -1.3347 0.0297
NBAS 1.3148 0.0167    FBRSL1 -1.2975 0.0479
KAT6B 1.3111 0.0182    IMMT -1.2443 0.0452
TAOK3 1.2979 0.0453            
ITGB1 1.2977 0.0489            
PPP1R12A 1.2976 0.0249            
RNF20 1.295 0.0097            
SMC1A 1.2917 0.0156            
ZC3H11A 1.2916 0.0229            
DNAJC8 1.2892 0.02            
RAB22A 1.2886 0.0406            
SPEN 1.2812 0.006            
HNRNPD 1.2737 0.0326            
YWHAZ 1.2704 0.0471            
DNAJC13 1.2687 0.0317            
IFNAR1 1.2677 0.0437            
INO80D 1.2663 0.0096            
TRIP11 1.2661 0.0404            
ARID2 1.2649 0.0377            
DDB1 1.2649 0.0221            
TGOLN2 1.2605 0.0444            
C3orf58 1.2578 0.03            
IARS2 1.2553 0.0436            
PMPCB 1.2502 0.0285            
USP47 1.2426 0.0201            
PHIP 1.2382 0.0118            
IQGAP1 1.2353 0.043            
HNRNPK 1.2227 0.0282            
NUMA1 1.2168 0.021            
VPS36 1.2153 0.0257            
FUBP1 1.1848 0.0447            
ZNF638 1.1446 0.0493            
KMT2C 1.1063 0.0278            
實例8:在治療過程中基因表現之表徵
在基線及第24週自加入實例7之臨床研究之個體收集皮膚組織及對應RNA樣品。表17及表18分別列出在反應者及無反應者中在基線與第24週之間藉由治療而顯著調節(P<0.05)之基因。此等基因代表可能與治療反應相關之生物標記物。 17 :反應者中在基線與第 24 週之間顯著調節之基因
自基線至第24 週增加之表現 自基線至第24 週減少之表現
基因符號 變化倍數 原始P值 基因符號 變化倍數 原始P值
OCEL1 98.7285 0.0205    HIST1H1B -359.79 0.0152
FMO4 90.1456 0.0179    HLA-DPA1 -276.107 0.0071
DPF1 87.0034 0.0042    C3orf14 -217.796 0.0158
TNNC2 63.2953 0.0223    HIST1H3D -200.86 0.0256
TMEM217 54.4275 0.0189    IFI6 -193.193 0.0044
FAM131C 48.5846 0.017    PXMP2 -156.391 0.0107
RSG1 44.7652 0.032    HLA-DQB2 -150.163 0.0201
ADAM21 41.0881 0.0176    IL32 -137.196 0.0231
FANK1 40.7236 0.0416    FUOM -131.679 0.017
PCDHB8 37.0503 0.0472    GKAP1 -119.173 0.0059
CORO7-PAM16 31.3983 0.0399    RANGRF -118.714 0.0139
CORO6 30.762 0.0361    DCTPP1 -115.051 0.0166
FSCN2 23.8405 0.0425    MT1E -93.8553 0.0438
VRTN 23.787 0.029    RGS14 -87.6162 0.0125
ARHGEF39 22.5721 0.0222    GMNN -83.8834 0.0204
CNGA3 21.5758 0.025    THOC3 -77.7502 0.0434
ALPK3 20.8473 0.0354    SNRNP25 -76.015 0.0248
PCDHB5 20.4521 0.0445    PARP8 -75.5333 0.0062
FKBP10 17.8669 0.0426    PLXNC1 -74.1112 0.005
IMPG1 16.6877 0.0428    GPX7 -72.2 0.0167
ISCA2 14.3856 0.0448    HEY1 -72.0076 0.0212
LMAN2L 12.2518 0.0458    TBC1D3 -71.9042 0.016
ETS1 11.5607 0.0096    APOBEC3A -70.5453 0.0174
RYR2 11.5153 0.03    CCDC121 -67.9646 0.0193
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PPP6R2 1.7008 0.0182    MAGED1 -1.3738 0.0231
GTF2F1 1.6812 0.0024    RPS21 -1.3622 0.0291
C1orf198 1.6782 0.03    AARS2 -1.3422 0.0156
C7orf60 1.6728 0.0347    BCL6 -1.2351 0.0254
UBA2 1.671 0.0366    CDK3 -1.0356 0.0343
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VEZT 1.6693 0.0199            
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MFF 1.668 0.0175            
PLEKHF1 1.663 0.0362            
SS18L1 1.6622 0.0051            
AP1G1 1.6422 0.0372            
ZNF384 1.6237 0.001            
TECR 1.6232 0.016            
ESRP2 1.6132 0.0294            
NDUFA10 1.6132 0.0032            
STOML2 1.6124 0.0395            
NIPAL1 1.6016 0.0363            
HM13 1.5968 0.0147            
FUS 1.5949 0.0207            
DUSP22 1.5812 0.0095            
RNPEPL1 1.5778 0.0145            
SMURF1 1.5754 0.0378            
PREP 1.5686 0.003            
RNF14 1.5649 0.0473            
BLZF1 1.5621 0.0443            
DNAJB2 1.5493 0.0241            
FBXO18 1.5407 0.0438            
EIF2AK1 1.5379 0.0193            
C9orf69 1.5376 0.0281            
PIGO 1.5337 0.0334            
VDAC2 1.5215 0.0234            
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WDR46 1.4483 0.0317            
PRDM2 1.4319 0.0069            
C19orf43 1.4275 0.0378            
SLC4A2 1.4219 0.0387            
TTYH3 1.421 0.0163            
PPP4R2 1.4207 0.0192            
RBM19 1.4204 0.0241            
ACSL1 1.405 0.033            
KAT7 1.4016 0.0307            
SPTAN1 1.4 0.0331            
ZNF654 1.3982 0.0419            
KDM6B 1.3947 0.0467            
CDC42SE1 1.3932 0.044            
CABIN1 1.3875 0.0067            
TNFAIP2 1.3847 0.0109            
UBE2Q1 1.382 0.0403            
SON 1.3584 0.0484            
TXNDC16 1.3542 0.0441            
NCOR1 1.3492 0.0045            
FAM102A 1.3319 0.003            
IPP 1.3303 0.008            
NARFL 1.3288 0.0272            
SUGP1 1.3045 0.0112            
KLHL24 1.2912 0.0131            
PLCH2 1.285 0.0126            
NPIPB5 1.2724 0.0315            
NUPR1 1.2695 0.0036            
RBM18 1.2591 0.0292            
ATP2B4 1.2529 0.0208            
AACS 1.2472 0.0375            
COX5A 1.2307 0.0428            
CUL2 1.2095 0.0484            
18 :無反應者中在基線與第 24 週之間顯著調節之基因
自基線至第24 週增加之表現 自基線至第24 週減少之表現
基因符號 變化倍數 原始P值 基因符號 變化倍數 原始P值
MADCAM1 27.6015 0.0007    GMFG -22.3167 0.0097
EVI2A 25.3613 0.0015    IL1RL1 -22.1689 0.0074
S100A5 21.2684 0.0021    NIPSNAP3B -21.7911 0.0031
HIST2H4B 16.2558 0.0112    FMO2 -19.3532 0.0037
BCO1 15.2064 0.0035    LUZP6 -18.3831 0.0373
GPR52 14.5969 0.0262    TICAM2 -17.0725 0.0078
USP17L2 14.3178 0.0038    RNF148 -16.9574 0.0293
THBS4 13.9528 0.0008    ABHD14A -16.9299 0.0072
BIK 13.8984 0.0169    SIGLEC10 -16.0127 0.0072
ZYG11A 11.6203 0.0016    DEFB103B -14.7613 0.0041
RASGRP4 11.6041 0.003    RHOF -14.111 0.0338
CRYGS 11.5803 0.0283    RHCG -13.9626 0.0246
ENTPD8 11.3311 0.0386    CCL20 -13.8396 0.0339
THAP10 11.1195 0.0101    LCE5A -13.4353 0.0063
MEP1B 10.2003 0.0314    C10orf128 -13.3022 0.0129
RAB3A 10.1306 0.0064    IL37 -13.122 0.0158
UBE2Q2L 10.1167 0.0407    CYP27B1 -12.6505 0.0006
MLXIPL 9.975 0.0153    SH3BGR -12.366 0.0197
MAPK12 9.6678 0.013    VNN3 -11.7831 0.0073
WBP2NL 9.3408 0.0155    PRR7 -11.7235 0.0434
MROH7-TTC4 8.9094 0.0279    ADCY2 -11.6259 0.0144
ASIC1 8.8674 0.0041    KBTBD8 -10.5372 0.0222
MYEF2 8.7777 0.027    CD28 -10.3214 0.0352
TSLP 8.6794 0.004    SOX10 -10.3179 0.001
CHRNA7 8.5419 0.006    CD36 -10.1313 0.0169
PSORS1C1 8.2205 0.0498    KRT3 -9.945 0.0064
ANKDD1A 8.1112 0.0214    TRIM36 -9.6633 0.0104
FBXO5 8.0028 0.0386    ARL4D -9.5441 0.0273
BSCL2 7.7117 0.0307    IGFN1 -9.3742 0.0091
AS3MT 7.5298 0.0256    S100A12 -9.2963 0.0413
DERL3 7.4784 0.0187    PROX1 -8.9646 0.0106
UFSP1 7.3488 0.0393    FAM19A5 -8.8138 0.0147
AGBL3 7.2792 0.0181    C19orf80 -8.659 0.0157
AGBL4 7.2768 0.0176    APOBEC3A -8.5652 0.0249
RAB42 7.2584 0.0255    DLEU1 -8.5213 0.0357
YPEL1 7.223 0.0121    PARVG -8.4144 0.0464
TPO 7.1394 0.0135    GSTT2B -8.3303 0.0329
PYROXD2 7.0715 0.0268    SLCO4C1 -8.0891 0.0272
ASPDH 7.0177 0.0177    ENG -7.819 0.0225
UTS2 6.6584 0.0276    RCBTB2 -7.7833 0.0232
GRM3 6.5925 0.0324    GZMB -7.7809 0.0456
MPP3 6.5563 0.0365    OASL -7.7308 0.0217
TSPYL6 6.5459 0.0399    LY6K -7.6642 0.0325
NAGLU 6.5148 0.0428    VMO1 -7.5022 0.0422
ARHGAP19-SLIT1 6.41 0.0434    LZTS1 -7.4675 0.0335
FAM69B 6.234 0.0474    TF -7.3803 0.0431
RNASE2 6.2032 0.0428    AMDHD1 -7.38 0.0478
ACKR3 6.2027 0.0272    SLFN12 -7.303 0.0095
COLGALT2 6.2027 0.0218    PPP1R14A -7.2477 0.0419
UGT1A4 6.1468 0.0348    MYPN -7.1862 0.0238
TEKT2 6.0415 0.024    JAKMIP1 -7.0395 0.0191
TMEM121 6.0361 0.0165    AHRR -6.9435 0.0297
SULT1A1 5.8246 0.0382    LGALS2 -6.8965 0.0396
CYP4A11 5.8074 0.0283    TIGD3 -6.7542 0.0288
PRB3 5.797 0.0347    GPRIN1 -6.7215 0.0187
NPIPA3 5.7805 0.0361    CHKB-CPT1B -6.6251 0.039
STK31 5.757 0.0349    NRN1 -6.6135 0.0139
GRID1 5.75 0.0068    PIK3R5 -6.6118 0.0383
ZNF773 5.729 0.0488    SLAMF7 -6.5562 0.0484
TMEM35 5.6621 0.0182    SRGN -6.5542 0.0169
SYCP2L 5.642 0.026    RNF113B -6.434 0.0392
TMEM143 5.5559 0.0418    TRPV2 -6.4053 0.0239
PDE9A 5.5511 0.0287    KRTAP5-1 -6.2339 0.0342
CNTN2 5.5263 0.022    TRAF5 -6.1305 0.0317
RMDN2 5.505 0.0356    PDE6A -6.0672 0.0328
SV2A 5.3862 0.0348    CD244 -6.0509 0.0421
GPR182 5.3123 0.0107    FAM166B -5.9975 0.038
CCDC74B 5.2571 0.0489    DTYMK -5.9009 0.0255
HPDL 5.2215 0.0128    CXCR2 -5.8694 0.0155
SHC3 5.1772 0.0392    KLHDC1 -5.7732 0.0391
ZNF222 5.1663 0.0455    PLIN1 -5.742 0.029
KCTD14 5.1346 0.0421    KCNJ2 -5.7133 0.0236
C4orf46 5.0848 0.0216    ASPN -5.6593 0.0227
CPLX2 5.0008 0.0333    SUV39H2 -5.5883 0.0335
SYT2 4.9878 0.0383    ROPN1B -5.533 0.0381
MAT1A 4.9268 0.0432    VNN1 -5.4803 0.018
FOXE1 4.8759 0.0339    IFI27 -5.4264 0.0349
INA 4.7583 0.0409    KCNG2 -5.3548 0.0268
ALX1 4.6257 0.0328    LAIR1 -5.3473 0.0371
KBTBD12 4.5979 0.0351    P2RX5 -5.3335 0.039
GINS4 4.5679 0.0456    CHRM4 -5.2948 0.0336
RGS11 4.5219 0.0141    TOR4A -5.2677 0.004
DCDC2B 4.5158 0.0323    HIGD1B -5.2371 0.042
ANKRD53 4.4706 0.0298    RGS2 -5.1484 0.0134
EBLN2 4.4504 0.0266    RNF224 -4.9675 0.0442
COX6B2 4.3655 0.0257    AURKA -4.9118 0.0485
CHRM5 4.3036 0.0389    LGI2 -4.8099 0.0284
TTC34 4.274 0.0394    SLC22A13 -4.7851 0.0416
ADPRM 4.2277 0.0448    MLC1 -4.7144 0.0305
C9orf66 4.2211 0.0339    TLR3 -4.7066 0.0429
MAP1S 4.1703 0.0454    HHEX -4.7002 0.0388
CYP4F11 4.1295 0.0493    C8orf48 -4.6899 0.0382
LY6G5B 4.093 0.0488    TIMM8A -4.5289 0.0318
HEATR4 3.9807 0.0423    TTC25 -4.4167 0.0396
SHISA6 3.9742 0.0442    KRT72 -4.3577 0.0397
TPST1 3.9197 0.0379    KCNMB3 -4.2805 0.0257
KCTD19 3.9047 0.0402    HAPLN4 -4.2381 0.0472
CDHR2 3.8518 0.0391    CCDC69 -4.203 0.0488
ZNF454 3.8193 0.0491    TMBIM4 -4.1761 0.0273
DGKG 3.8179 0.0189    BMP5 -4.1521 0.0233
TRIM45 3.7012 0.0495    GPRC5A -4.1494 0.0183
PCYT1B 3.6534 0.0363    GPD2 -4.1448 0.0444
ZNF696 3.5396 0.0301    ZNF668 -4.1396 0.0428
RNF165 3.536 0.0369    SERPINB3 -4.0734 0.0235
RBM44 3.5063 0.0106    PPP1R16B -4.0259 0.0093
PRICKLE4 3.4544 0.0447    NTSR1 -3.9405 0.0434
PCDHAC1 3.3838 0.0156    PTAFR -3.9092 0.0477
MAST1 3.3258 0.0467    AVPR1A -3.907 0.0044
COL14A1 3.3194 0.0444    STARD8 -3.8533 0.0246
ISY1-RAB43 3.2156 0.0306    C15orf53 -3.6751 0.0462
SPRED3 3.2113 0.004    ADCY7 -3.6529 0.0156
DET1 3.1417 0.0322    PIK3R6 -3.6311 0.0264
CCDC168 3.0629 0.0279    ZIC2 -3.6198 0.0249
FAM9C 2.9715 0.0439    ZNF490 -3.5651 0.0493
PDZD7 2.957 0.024    CLDN14 -3.5193 0.0385
GPR179 2.9457 0.0181    NUDT2 -3.5151 0.0464
NPDC1 2.9016 0.0258    FOXP3 -3.4118 0.0275
KIF12 2.9003 0.0157    APBB1IP -3.3841 0.0244
DCHS1 2.7724 0.0288    EIF3C -3.3247 0.0213
KIF7 2.7666 0.017    ACTR5 -3.2145 0.0319
ZNF799 2.7127 0.0494    RPS6KA5 -3.1343 0.0376
RPS6KL1 2.6129 0.04    C4orf27 -3.1257 0.0253
ZNF717 2.5241 0.0163    FUT2 -3.0804 0.0348
ARMC7 2.4962 0.0019    LCE3E -3.0756 0.0024
ATHL1 2.3694 0.0467    HIST3H2BB -3.0463 0.0407
B3GNT9 2.3402 0.0426    ARC -3.0248 0.0423
GIN1 2.2823 0.0085    SPRR2A -3.0167 0.0345
RNLS 2.2603 0.0203    DOCK11 -2.9427 0.0164
EFEMP2 2.2448 0.0377    KRT78 -2.8669 0.0053
GDF11 2.2028 0.0292    WAS -2.8546 0.0369
VAMP1 2.1104 0.0086    RTL1 -2.852 0.0458
PITPNM2 2.0924 0.044    TCEANC -2.8089 0.011
NUP35 2.0831 0.0019    FAM25A -2.6398 0.0004
CDC25B 2.068 0.0423    G0S2 -2.6281 0.037
XPNPEP3 2.0478 0.0119    CD3G -2.5886 0.0351
ANKRD9 2.0415 0.0129    SPRR2G -2.5758 0.027
NID2 2.0359 0.0405    GPN3 -2.5708 0.0125
TK2 2.0105 0.0346    SEL1L3 -2.5671 0.038
SLC47A1 1.998 0.0381    CSF1R -2.5368 0.0412
FAM20C 1.9903 0.0498    CETN3 -2.4829 0.0161
NSUN4 1.9577 0.0448    STXBP6 -2.468 0.0065
ZDHHC1 1.9446 0.0171    MSRB2 -2.4649 0.0437
EIF3CL 1.9147 0.0137    CD209 -2.4462 0.0496
ACACB 1.9112 0.0473    MRPL39 -2.4296 0.0129
FAM213B 1.8976 0.0267    NCOA7 -2.38 0.0136
GNB1L 1.8789 0.01    C9orf85 -2.3763 0.0349
NME6 1.8707 0.0097    PTPMT1 -2.3581 0.0248
ZNF358 1.8663 0.0053    COX14 -2.3346 0.0071
SOX8 1.8525 0.0332    LCE3D -2.2937 0.0431
C19orf48 1.8457 0.013    SLC43A2 -2.2909 0.0474
RAC3 1.8405 0.0318    SLC20A1 -2.2879 0.0421
SMIM8 1.8085 0.0292    MLF1 -2.26 0.0347
DDX51 1.7997 0.0428    FAM185A -2.2522 0.0245
ZNF785 1.7908 0.0171    MRPL15 -2.2193 0.0185
RRP8 1.7884 0.0409    B3GALT4 -2.2061 0.0213
POLR2H 1.786 0.0151    TBC1D12 -2.183 0.0436
ARHGAP24 1.7854 0.0219    FCHSD1 -2.1791 0.031
ARNT2 1.785 0.0093    DNASE1L2 -2.1662 0.0445
PCDH12 1.7803 0.0248    PNPLA1 -2.156 0.0076
IVD 1.7686 0.0312    ABHD17B -2.1475 0.0047
ZNF484 1.746 0.0095    CARD16 -2.1366 0.0288
MARCH5 1.739 0.0152    IL6R -2.1301 0.0109
TFAM 1.7294 0.0052    HIST1H4B -2.1092 0.014
MRPL14 1.7167 0.0295    PTS -2.0901 0.0276
TSHZ1 1.7159 0.0484    ANAPC13 -2.0894 0.0188
FEM1A 1.7134 0.0187    DCTN5 -2.0889 0.001
R3HCC1 1.7112 0.0105    FAM110C -2.0776 0.0038
C1orf174 1.7009 0.0292    GOLGA8F -2.0534 0.0477
IPMK 1.6975 0.0123    SPRR2E -2.0439 0.0024
ZNF500 1.6929 0.0455    GNA12 -2.0286 0.0443
TUBGCP5 1.6922 0.0484    ZNF584 -2.0169 0.0115
MR1 1.6913 0.0051    GPX3 -2.0139 0.0464
FAM89B 1.681 0.0222    RIPK2 -2.0049 0.0083
TMEM80 1.677 0.0414    LCE6A -1.9922 0.0321
SLC44A3 1.6556 0.0416    RNF180 -1.9829 0.0073
PLTP 1.6543 0.0335    GNB5 -1.9531 0.0465
FASTKD2 1.6536 0.0098    SDR9C7 -1.9516 0.0005
TYK2 1.6521 0.0414    DUSP5 -1.9484 0.0168
CEP89 1.6498 0.0147    ETS1 -1.9476 0.0412
ANAPC4 1.6404 0.0187    PLA2G2F -1.9275 0.0379
TTYH1 1.6205 0.0301    YOD1 -1.9234 0.0003
ZNF574 1.616 0.014    TRAPPC1 -1.9138 0.0339
PARP2 1.6149 0.0364    ZDHHC13 -1.9113 0.0372
NEU1 1.6133 0.0305    MARVELD3 -1.9109 0.0275
STARD3 1.5994 0.046    ZNF16 -1.9062 0.0374
CBX7 1.5991 0.0137    PRELID3B -1.8833 0.0175
CBLC 1.5975 0.0488    TMLHE -1.8685 0.0325
ZNF529 1.5958 0.0115    SLC36A1 -1.8658 0.0376
CADM1 1.5941 0.0097    CCL22 -1.8563 0.0346
ABCB6 1.5753 0.0179    ZFAND2A -1.8553 0.0436
ZC2HC1A 1.5687 0.0397    MAP1LC3A -1.8522 0.0095
MTSS1L 1.5593 0.0181    RHOQ -1.8521 0.0337
LONRF1 1.5555 0.0374    ARNTL -1.8509 0.0325
PAXBP1 1.5555 0.0102    INPP5D -1.8454 0.027
SMO 1.5445 0.0114    SPTBN5 -1.8452 0.0221
THNSL2 1.543 0.0113    PRSS3 -1.8422 0.0492
TULP3 1.5357 0.0378    MPDU1 -1.8281 0.0308
CNGA1 1.524 0.0361    MPST -1.8255 0.0228
PACS2 1.519 0.0117    SMOX -1.8246 0.0122
RAB3IP 1.5134 0.0007    MRPL30 -1.8185 0.0147
TBC1D16 1.5078 0.0113    NOS3 -1.8178 0.0274
ZNF316 1.5078 0.0084    ARNTL2 -1.8116 0.0408
CDK4 1.5049 0.0196    LIMS1 -1.8077 0.0265
CTBP2 1.501 0.0397    BCKDK -1.7907 0.0102
NOL9 1.4991 0.0188    ABHD12B -1.783 0.003
MEX3D 1.4985 0.0228    HIST1H4C -1.7668 0.0292
TC2N 1.4963 0.0044    SLC19A2 -1.7647 0.0356
NEIL1 1.4926 0.0479    RAP1B -1.764 0.0111
TMEM181 1.4892 0.0037    UBL3 -1.7629 0.0069
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PCNXL4 1.4664 0.032    ZNF248 -1.7545 0.0341
TRIM8 1.4615 0.0303    TBC1D23 -1.7528 0.022
DHRS3 1.4609 0.0161    CCDC124 -1.7484 0.0352
RGL2 1.4604 0.0012    RAB23 -1.7364 0.0327
EXOC3 1.4509 0.0025    PAPL -1.7334 0.0094
PER2 1.4369 0.0293    PHLDA2 -1.7326 0.0389
ASPH 1.4367 0.0368    TSSC1 -1.7263 0.0443
HKR1 1.4322 0.0451    POLD3 -1.726 0.0298
ARL10 1.4309 0.0168    MPV17 -1.7246 0.036
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RCN1 1.4224 0.0146    GULP1 -1.7222 0.0476
TNS1 1.4221 0.0436    NCCRP1 -1.7216 0.0013
REV1 1.4168 0.0298    TM2D1 -1.7173 0.0044
BIN3 1.4116 0.0472    MYO1B -1.7131 0.0018
RHOV 1.4116 0.0186    C2orf47 -1.7098 0.0486
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PDCD5 1.3899 0.0011    ESD -1.6832 0.0341
MEX3C 1.3871 0.0381    GADD45A -1.6793 0.015
ADPRHL2 1.3855 0.0444    AIM1 -1.6698 0.038
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PKD1 1.374 0.0367    MRPL27 -1.6542 0.0028
ARID2 1.3706 0.0329    HERC6 -1.6508 5.71E-05
FGD1 1.3669 0.0188    ERN1 -1.6493 0.0114
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MYSM1 1.3578 0.0212    SLC10A6 -1.6437 0.0277
ZNF623 1.3561 0.0106    RBPJ -1.6436 0.029
TOPBP1 1.3549 0.01    LCE2C -1.642 0.0318
CACNB1 1.3537 0.0424    SEMA7A -1.6327 0.0033
BTBD7 1.3428 0.0311    RNGTT -1.632 0.0064
PEX14 1.3404 0.0399    USP2 -1.6284 0.0306
STK35 1.3378 0.0185    CHURC1 -1.6274 0.0014
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PLEKHG5 1.3348 0.0384    BZW1 -1.6243 0.0034
MAN2B2 1.3277 0.026    ABHD5 -1.6219 0.0132
XPO7 1.3258 0.0498    HK2 -1.6217 0.0443
GAS1 1.3212 0.0324    AZGP1 -1.6203 0.0214
SNX17 1.3212 0.0206    CASP7 -1.6192 0.0045
MAST2 1.3045 0.033    SLC5A1 -1.618 0.008
TRAF3IP2 1.2978 0.0286    RAP1GDS1 -1.6172 0.0033
UBE2I 1.2935 0.0322    TVP23B -1.6152 0.0291
IGF1R 1.289 0.0067    MRPS25 -1.615 0.0317
LDB1 1.2829 0.0019    MINPP1 -1.612 0.0296
RIPK4 1.2752 0.0235    CPA4 -1.6102 0.0133
SRRT 1.2673 0.0313    ATG9B -1.6079 0.0419
TOM1L2 1.254 0.0306    CNFN -1.6073 0.02
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SNRNP70 1.2481 0.046    GNPTAB -1.6027 0.039
MBD6 1.246 0.0256    SNRPG -1.596 0.0494
VPS36 1.2454 0.0256    ARHGAP29 -1.5928 0.0322
ZNF207 1.2452 0.0386    USF1 -1.5874 0.0386
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HNRNPD 1.2357 0.0209    NBN -1.583 0.0384
RNMT 1.2177 0.0422    HIST1H1B -1.5817 0.0218
SMAD5 1.2141 0.0237    PIM1 -1.581 0.04
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ATXN7L3 1.201 0.0141    UBE2D3 -1.5735 0.01
SIN3B 1.1983 0.0224    CDC34 -1.5732 0.0273
IRX3 1.1959 0.0451    PCNP -1.568 0.0475
EFS 1.1946 0.0277    SLC35E3 -1.5657 0.0156
PLCH2 1.1917 0.0243    YWHAH -1.5657 0.0098
CIC 1.1774 0.0061    C18orf25 -1.5611 0.0313
CREBBP 1.1736 0.0258    RPRD1B -1.5569 0.0442
ZFP36L2 1.173 0.0168    UBE2J1 -1.5485 0.0292
DOCK7 1.1723 0.0045    MRPL32 -1.5465 0.0406
IQSEC1 1.162 0.048    ECHDC1 -1.5434 0.0362
DDR1 1.1618 0.0261    PDE12 -1.5349 0.0472
SUV420H1 1.1548 0.0457    ZNF649 -1.5338 0.0147
MBD2 1.119 0.0409    DNAJB1 -1.5334 0.0017
            CHIC2 -1.5332 0.0359
            CNST -1.5303 0.0152
            NUP107 -1.5272 0.045
            ZNF720 -1.5207 0.0359
            PLA2G4D -1.5181 0.0315
            STXBP3 -1.518 0.0229
            SSNA1 -1.5168 0.0398
            BAG5 -1.5158 0.0015
            PRKCH -1.5157 0.01
            ARHGAP30 -1.5151 0.0477
            PPP1R18 -1.5143 0.0216
            USP38 -1.5138 0.0377
            SLC31A2 -1.5136 0.0419
            NUB1 -1.5101 0.0086
            SEPT11 -1.5075 0.0388
            SUB1 -1.5053 0.0269
            TIMM21 -1.4994 0.0417
            MRPL49 -1.4981 0.0257
            DENR -1.487 0.0274
            TRABD -1.4869 0.0348
            VMP1 -1.4868 0.0465
            FNDC3A -1.4825 0.0115
            SIL1 -1.4815 0.0127
            MAP1LC3B -1.4758 0.038
            WWC1 -1.4749 0.0404
            POLR3B -1.4745 0.0212
            VSIG10L -1.4732 0.0134
            BLOC1S1 -1.473 0.0469
            SHPK -1.4715 0.0309
            PI4K2A -1.4714 0.0311
            TNIP1 -1.471 0.0008
            ZNF706 -1.4695 0.0366
            CORO1C -1.4673 0.0345
            PLEKHB2 -1.4646 0.0055
            ALDH7A1 -1.4641 0.0251
            TOMM5 -1.4639 0.0399
            ADTRP -1.462 0.0229
            SLC6A14 -1.4614 0.0223
            CSRNP1 -1.4595 0.0091
            FAF2 -1.457 0.0056
            MRPL44 -1.4529 0.0283
            UGCG -1.4494 0.0216
            SYNJ2 -1.4479 0.0404
            PDLIM2 -1.4444 0.006
            AK3 -1.4361 0.0358
            DERL1 -1.4357 0.0305
            TMEM179B -1.4357 0.0194
            SNF8 -1.4332 0.0489
            MGLL -1.4306 0.0327
            GSE1 -1.4247 0.0324
            CIRH1A -1.4201 0.0236
            HEXA -1.417 0.0329
            SYNJ1 -1.4159 0.0369
            ZNF440 -1.4142 0.0323
            PPARD -1.414 0.0131
            HYOU1 -1.4135 0.0046
            ARL13B -1.4122 0.0417
            PLCXD1 -1.4108 0.0348
            CRCT1 -1.4069 0.0325
            PPP1R15B -1.405 0.0255
            TTYH3 -1.4035 0.0153
            GBA -1.4003 0.0395
            ARRDC4 -1.3999 0.0042
            DDX52 -1.3964 0.0404
            CFL1 -1.3955 0.0493
            RABGEF1 -1.3923 0.0238
            ARHGEF10L -1.3921 0.042
            GNPAT -1.3896 0.0473
            NFYA -1.3888 0.0287
            SFT2D2 -1.388 0.0387
            ZNF213 -1.3874 0.0437
            NADK -1.3873 0.0021
            SH3BP5L -1.3827 0.0087
            MXD1 -1.382 0.0308
            DHRS7 -1.3803 0.0389
            RAB24 -1.3771 0.0378
            LNX1 -1.3769 0.0218
            PSD4 -1.373 0.0093
            ATP6V1C2 -1.3717 0.0136
            TMED9 -1.371 0.0377
            PDCD7 -1.3706 0.0474
            H2AFY -1.3699 0.049
            ALAS1 -1.3692 0.032
            NCOA3 -1.3678 0.023
            SDCCAG8 -1.3678 0.0196
            KATNB1 -1.3677 0.0328
            AP5Z1 -1.3664 0.0149
            ADIPOR1 -1.3654 0.0443
            TMPRSS13 -1.3611 0.0285
            SNX9 -1.3605 0.0224
            PPP2CA -1.3592 0.0465
            GPR137B -1.3585 0.0428
            EHD1 -1.3582 0.0131
            DENND2C -1.3558 0.0144
            CHTF8 -1.3535 0.0141
            PLK3 -1.349 0.0139
            CTSB -1.3444 0.0441
            PIEZO1 -1.3433 0.0008
            ERH -1.3384 0.0422
            ITFG1 -1.3382 0.0356
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            PTPN2 -1.3363 0.0424
            FBXW11 -1.3355 0.0431
            ITSN2 -1.3354 0.0054
            MAP2K3 -1.3315 0.0374
            GTPBP2 -1.3304 0.0303
            SBSN -1.3301 0.0467
            LIMA1 -1.3288 0.0293
            EPG5 -1.3268 0.0308
            TWISTNB -1.326 0.028
            EPT1 -1.3252 0.0184
            SPIRE1 -1.324 0.0058
            LAMP2 -1.3221 0.0175
            COPB2 -1.3193 0.0325
            GAS6 -1.3184 0.0451
            LMTK3 -1.3184 0.0421
            BCR -1.3173 0.0251
            TCP11L2 -1.3165 0.0246
            AHCYL1 -1.3145 0.0047
            HMGN2 -1.3145 0.0141
            MYO9B -1.3112 0.0113
            PPP2R2C -1.3073 0.0332
            ARPC5 -1.3065 0.0351
            ATP2C1 -1.3047 0.0206
            TBC1D20 -1.3043 0.0417
            MAPKAPK5 -1.3018 0.0068
            WWTR1 -1.2981 0.0469
            SDE2 -1.2972 0.0283
            NDUFA13 -1.2936 0.0337
            EDEM1 -1.2917 0.0304
            HEATR5B -1.2866 0.0276
            CHMP4C -1.2862 0.0302
            CTTNBP2NL -1.2817 0.0229
            RSF1 -1.2789 0.012
            RPS26 -1.2758 0.0385
            PRMT2 -1.2753 0.0261
            RBM10 -1.2741 0.0361
            TAF7 -1.2737 0.025
            JARID2 -1.2729 0.0219
            PSMD3 -1.2716 0.0312
            COL5A2 -1.2659 0.0478
            ZNF212 -1.2542 0.031
            UBR1 -1.2539 0.0462
            IMMT -1.2534 0.0354
            TBC1D10B -1.2483 0.0209
            FNBP1 -1.2453 0.0353
            STAM2 -1.2398 0.0137
            PCLO -1.2393 0.0119
            TTC19 -1.2369 0.0248
            RAB7A -1.2359 0.0361
            EPS15 -1.235 0.0398
            PICALM -1.2347 0.026
            PELI1 -1.2318 0.0416
            CUL1 -1.2268 0.0027
            ENSA -1.2222 0.0155
            CYFIP1 -1.2184 0.0182
            KDM1B -1.2178 0.0474
            EPS8L1 -1.2091 0.047
            RTFDC1 -1.209 0.0493
            MARVELD2 -1.2083 0.036
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            INPP5D -1.8454 0.027
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            MPDU1 -1.8281 0.0308
            MPST -1.8255 0.0228
            SMOX -1.8246 0.0122
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            LIMS1 -1.8077 0.0265
            BCKDK -1.7907 0.0102
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            EXOC5 -1.7555 0.0241
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            TBC1D23 -1.7528 0.022
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            PAPL -1.7334 0.0094
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            GADD45A -1.6793 0.015
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            ACTR10 -1.6639 0.0274
            AK9 -1.6629 0.0471
            FAM98A -1.6616 0.007
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            AZGP1 -1.6203 0.0214
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            USF1 -1.5874 0.0386
            ZNF330 -1.5849 0.0195
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            HIST1H1B -1.5817 0.0218
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            GSDMA -1.5778 0.0068
            UBE2D3 -1.5735 0.01
            CDC34 -1.5732 0.0273
            PCNP -1.568 0.0475
            SLC35E3 -1.5657 0.0156
            YWHAH -1.5657 0.0098
            C18orf25 -1.5611 0.0313
            RPRD1B -1.5569 0.0442
            UBE2J1 -1.5485 0.0292
            MRPL32 -1.5465 0.0406
            ECHDC1 -1.5434 0.0362
            PDE12 -1.5349 0.0472
            ZNF649 -1.5338 0.0147
            DNAJB1 -1.5334 0.0017
            CHIC2 -1.5332 0.0359
            CNST -1.5303 0.0152
            NUP107 -1.5272 0.045
            ZNF720 -1.5207 0.0359
            PLA2G4D -1.5181 0.0315
            STXBP3 -1.518 0.0229
            SSNA1 -1.5168 0.0398
            BAG5 -1.5158 0.0015
            PRKCH -1.5157 0.01
            ARHGAP30 -1.5151 0.0477
            PPP1R18 -1.5143 0.0216
            USP38 -1.5138 0.0377
            SLC31A2 -1.5136 0.0419
            NUB1 -1.5101 0.0086
            SEPT11 -1.5075 0.0388
            SUB1 -1.5053 0.0269
            TIMM21 -1.4994 0.0417
            MRPL49 -1.4981 0.0257
            DENR -1.487 0.0274
            TRABD -1.4869 0.0348
            VMP1 -1.4868 0.0465
            FNDC3A -1.4825 0.0115
            SIL1 -1.4815 0.0127
            MAP1LC3B -1.4758 0.038
            WWC1 -1.4749 0.0404
            POLR3B -1.4745 0.0212
            VSIG10L -1.4732 0.0134
            BLOC1S1 -1.473 0.0469
            SHPK -1.4715 0.0309
            PI4K2A -1.4714 0.0311
            TNIP1 -1.471 0.0008
            ZNF706 -1.4695 0.0366
            CORO1C -1.4673 0.0345
            PLEKHB2 -1.4646 0.0055
            ALDH7A1 -1.4641 0.0251
            TOMM5 -1.4639 0.0399
            ADTRP -1.462 0.0229
            SLC6A14 -1.4614 0.0223
            CSRNP1 -1.4595 0.0091
            FAF2 -1.457 0.0056
            MRPL44 -1.4529 0.0283
            UGCG -1.4494 0.0216
            SYNJ2 -1.4479 0.0404
            PDLIM2 -1.4444 0.006
            AK3 -1.4361 0.0358
            DERL1 -1.4357 0.0305
            TMEM179B -1.4357 0.0194
            SNF8 -1.4332 0.0489
            MGLL -1.4306 0.0327
            GSE1 -1.4247 0.0324
            CIRH1A -1.4201 0.0236
            HEXA -1.417 0.0329
            SYNJ1 -1.4159 0.0369
            ZNF440 -1.4142 0.0323
            PPARD -1.414 0.0131
            HYOU1 -1.4135 0.0046
            ARL13B -1.4122 0.0417
            PLCXD1 -1.4108 0.0348
            CRCT1 -1.4069 0.0325
            PPP1R15B -1.405 0.0255
            TTYH3 -1.4035 0.0153
            GBA -1.4003 0.0395
            ARRDC4 -1.3999 0.0042
            DDX52 -1.3964 0.0404
            CFL1 -1.3955 0.0493
            RABGEF1 -1.3923 0.0238
            ARHGEF10L -1.3921 0.042
            GNPAT -1.3896 0.0473
            NFYA -1.3888 0.0287
            SFT2D2 -1.388 0.0387
            ZNF213 -1.3874 0.0437
            NADK -1.3873 0.0021
            SH3BP5L -1.3827 0.0087
            MXD1 -1.382 0.0308
            DHRS7 -1.3803 0.0389
            RAB24 -1.3771 0.0378
            LNX1 -1.3769 0.0218
            PSD4 -1.373 0.0093
            ATP6V1C2 -1.3717 0.0136
            TMED9 -1.371 0.0377
            PDCD7 -1.3706 0.0474
            H2AFY -1.3699 0.049
            ALAS1 -1.3692 0.032
            NCOA3 -1.3678 0.023
            SDCCAG8 -1.3678 0.0196
            KATNB1 -1.3677 0.0328
            AP5Z1 -1.3664 0.0149
            ADIPOR1 -1.3654 0.0443
            TMPRSS13 -1.3611 0.0285
            SNX9 -1.3605 0.0224
            PPP2CA -1.3592 0.0465
            GPR137B -1.3585 0.0428
            EHD1 -1.3582 0.0131
            DENND2C -1.3558 0.0144
            CHTF8 -1.3535 0.0141
            PLK3 -1.349 0.0139
            CTSB -1.3444 0.0441
            PIEZO1 -1.3433 0.0008
            ERH -1.3384 0.0422
            ITFG1 -1.3382 0.0356
            RND3 -1.3368 0.0298
            IRF2 -1.3364 0.0324
            PTPN2 -1.3363 0.0424
            FBXW11 -1.3355 0.0431
            ITSN2 -1.3354 0.0054
            MAP2K3 -1.3315 0.0374
            GTPBP2 -1.3304 0.0303
            SBSN -1.3301 0.0467
            LIMA1 -1.3288 0.0293
            EPG5 -1.3268 0.0308
            TWISTNB -1.326 0.028
            EPT1 -1.3252 0.0184
            SPIRE1 -1.324 0.0058
            LAMP2 -1.3221 0.0175
            COPB2 -1.3193 0.0325
            GAS6 -1.3184 0.0451
            LMTK3 -1.3184 0.0421
            BCR -1.3173 0.0251
            TCP11L2 -1.3165 0.0246
            AHCYL1 -1.3145 0.0047
            HMGN2 -1.3145 0.0141
            MYO9B -1.3112 0.0113
            PPP2R2C -1.3073 0.0332
            ARPC5 -1.3065 0.0351
            ATP2C1 -1.3047 0.0206
            TBC1D20 -1.3043 0.0417
            MAPKAPK5 -1.3018 0.0068
            WWTR1 -1.2981 0.0469
            SDE2 -1.2972 0.0283
            NDUFA13 -1.2936 0.0337
            EDEM1 -1.2917 0.0304
            HEATR5B -1.2866 0.0276
            CHMP4C -1.2862 0.0302
            CTTNBP2NL -1.2817 0.0229
            RSF1 -1.2789 0.012
            RPS26 -1.2758 0.0385
            PRMT2 -1.2753 0.0261
            RBM10 -1.2741 0.0361
            TAF7 -1.2737 0.025
            JARID2 -1.2729 0.0219
            PSMD3 -1.2716 0.0312
            COL5A2 -1.2659 0.0478
            ZNF212 -1.2542 0.031
            UBR1 -1.2539 0.0462
            IMMT -1.2534 0.0354
            TBC1D10B -1.2483 0.0209
            FNBP1 -1.2453 0.0353
            STAM2 -1.2398 0.0137
            PCLO -1.2393 0.0119
            TTC19 -1.2369 0.0248
            RAB7A -1.2359 0.0361
            EPS15 -1.235 0.0398
            PICALM -1.2347 0.026
            PELI1 -1.2318 0.0416
            CUL1 -1.2268 0.0027
            ENSA -1.2222 0.0155
            CYFIP1 -1.2184 0.0182
            KDM1B -1.2178 0.0474
            EPS8L1 -1.2091 0.047
            RTFDC1 -1.209 0.0493
            MARVELD2 -1.2083 0.036
            COPA -1.2072 0.0353
            KPNB1 -1.2072 0.0224
            ITGAV -1.2026 0.0359
            PCF11 -1.1978 0.019
            NDUFS1 -1.1881 0.0323
            ITPKC -1.1866 0.0212
            KHSRP -1.1825 0.0257
            PAPD4 -1.1728 0.0378
            DDX18 -1.1521 0.0177
表19列出在整個研究中在反應者中穩定表現且在基線與第24週之間未藉由治療顯著調節的有區別地表現之基因。 19 :在第 1 天與第 24 週之間穩定表現之基因
增加但不顯著之基因 減少但不顯著之基因
基因符號 變化倍數 原始P值 基因符號 變化倍數 原始P值
SERINC4 34.3284 0.0518    ESD -47.3843 0.0643
FAM153C 29.43 0.0795    HIST1H2AK -45.1381 0.0531
ANGPTL3 26.1574 0.1792    DCAF4 -32.5166 0.1119
ADCY7 23.0366 0.2193    MRAP2 -30.5134 0.0571
NUGGC 20.5734 0.0722    SIRT3 -29.7841 0.0816
AGTRAP 20.0111 0.1793    C3orf49 -23.1537 0.0517
FOSL1 17.5836 0.1671    IYD -22.2703 0.1023
BEST1 16.5446 0.1629    TWIST2 -18.1727 0.0595
TBX19 15.0717 0.1436    CSF1R -17.8603 0.2654
RGS16 14.0051 0.0856    ZNF224 -17.0106 0.1338
ESRRG 13.8518 0.0855    CCDC77 -15.6151 0.2115
KCNRG 13.8334 0.1162    MANEA -13.6223 0.1211
KLB 12.4857 0.0761    ZNF619 -13.2749 0.1456
IL2RB 10.8092 0.1694    ZNF764 -13.1932 0.1349
COQ6 10.7709 0.1102    MSRB2 -12.9185 0.1888
CILP2 10.7666 0.086    HLCS -12.7892 0.1489
RARRES3 10.0574 0.1796    TCEB3B -11.6698 0.1256
ZSCAN31 9.9201 0.1378    SLC39A14 -11.5582 0.133
RGS9 9.873 0.2332    PLSCR1 -11.5506 0.1374
FGFRL1 9.8481 0.1008    CCDC78 -11.3228 0.1061
ABLIM2 9.6717 0.2161    VEPH1 -11.2508 0.059
DNAJB5 9.3076 0.312    VARS2 -11.0178 0.1183
PSG1 9.1933 0.195    GAGE2E -10.6926 0.1817
EN1 9.1394 0.184    THG1L -10.688 0.0959
SPRR3 9.12 0.2347    CCDC105 -10.3782 0.2109
PILRB 8.7256 0.0793    ZNF77 -10.3141 0.1357
MRPS28 8.6524 0.1779    KRT71 -10.2566 0.1144
CTAGE15 8.6356 0.2001    FAM13C -10.1912 0.1209
C10orf128 8.4822 0.1446    DRC3 -9.7252 0.2144
ZNF469 8.2243 0.086    RPL36A -9.7145 0.2232
DENND1C 8.0945 0.3416    ERAP2 -9.6026 0.154
NHLH1 7.9637 0.1535    PLD2 -9.2801 0.2707
HLA-DMA 7.9418 0.2251    BHLHE41 -9.1793 0.2438
CD3G 7.7405 0.1815    HBZ -8.9457 0.2065
ZNF597 7.6 0.1519    DERL3 -8.7066 0.152
DUSP28 7.4942 0.2359    LAMTOR5 -8.5578 0.2044
SGIP1 7.0389 0.1875    TMEM14A -8.4019 0.1953
SLC9A4 6.9988 0.3613    KCNAB3 -8.2478 0.1873
MTRNR2L3 6.9949 0.1884    TMEM68 -8.1349 0.2041
WNT5A 6.873 0.2695    ACAD11 -7.9298 0.1781
CNGB1 6.6189 0.1883    APLN -7.9087 0.0998
LAIR1 6.5911 0.1932    PDE9A -7.808 0.1511
GOLGA8R 6.5819 0.4926    NFYB -7.6596 0.2107
FAM231D 6.5529 0.3909    CSNK1G3 -7.4422 0.2146
QTRTD1 6.4476 0.0698    CDC27 -7.3554 0.2263
GGACT 6.3922 0.2153    SUPV3L1 -7.245 0.1424
TDRKH 6.2265 0.302    TMSB10 -6.9475 0.3782
C3 6.1916 0.1921    NPIPB4 -6.9423 0.2675
KCNIP4 6.1543 0.2061    ERMARD -6.8012 0.1415
CYP27B1 6.1044 0.1376    PRPF40B -6.7313 0.236
LRRC37A3 6.0566 0.2476    VBP1 -6.6425 0.2802
HCN4 5.8493 0.1417    DDX55 -6.4281 0.242
PRR15 5.6279 0.1936    NDUFB6 -6.3519 0.2601
SSC4D 5.5912 0.1798    DUSP23 -6.2692 0.2681
PADI3 5.5866 0.1831    FBXO4 -6.2466 0.207
NEFH 5.5755 0.201    PHF1 -6.1423 0.2155
TMEM8A 5.5413 0.5101    STARD9 -6.1174 0.1875
MYCL 5.5065 0.1456    ETNPPL -6.094 0.1817
C1QTNF6 5.461 0.2211    GTF2H3 -6.0361 0.1908
LRRC70 5.4331 0.0932    ECE2 -5.9855 0.1135
S1PR2 5.3442 0.2721    MPHOSPH10 -5.9297 0.3449
CUX2 5.3366 0.1895    UTP23 -5.8203 0.3474
GAS2L3 5.1129 0.3695    PSMB3 -5.7926 0.3734
NDOR1 5.0487 0.3877    LRIG3 -5.7089 0.3642
NOP16 5.024 0.1491    ZNF551 -5.6873 0.147
FUT2 4.8582 0.5052    PHF10 -5.6573 0.3747
SLC25A25 4.738 0.3423    FAM60A -5.5425 0.3226
SCARB1 4.7238 0.187    PPP1R14B -5.5217 0.407
PIK3CG 4.6587 0.1867    BTN3A3 -5.4241 0.2408
FAM216A 4.6515 0.1312    PTGER1 -5.3803 0.1808
PRR5 4.6447 0.2381    CDK2 -5.32 0.3026
RAD51B 4.5065 0.3035    TFAM -5.3111 0.3205
VOPP1 4.4705 0.0567    PGRMC1 -5.2664 0.3723
SERTAD1 4.4197 0.2114    KATNAL2 -5.2088 0.287
C9orf172 4.3974 0.4044    COL11A1 -5.1339 0.2327
GPR27 4.2735 0.2146    IFT43 -5.0331 0.2865
MUC4 4.24 0.1784    SLC2A10 -5.028 0.2656
KBTBD8 4.1801 0.4819    SYCP2 -4.9532 0.2374
ARHGAP30 3.9568 0.1496    AP3M1 -4.7944 0.3675
TRUB2 3.8837 0.1049    CASC4 -4.7642 0.3695
ARNTL 3.8384 0.1    MCPH1 -4.6727 0.3028
C1orf233 3.8091 0.36    EIF2A -4.6478 0.4098
DNAH9 3.6983 0.4376    RUNX2 -4.2513 0.3311
CXCL11 3.6945 0.3739    PHTF1 -4.2207 0.3946
GTF2H2C 3.6605 0.3008    SEPSECS -4.2127 0.3042
ATP11A 3.5782 0.2704    NUP107 -4.2013 0.2705
CUEDC1 3.5752 0.1938    NID2 -4.1828 0.1903
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ANKHD1 1.1809 0.591    PMPCB -1.1787 0.5688
SLC25A44 1.1757 0.6893    PALD1 -1.1739 0.6174
MAPK7 1.1678 0.6886    PAFAH1B2 -1.1689 0.7234
NMRK1 1.1673 0.6635    TAF1L -1.1551 0.919
LDHAL6A 1.145 0.7744    PRPF4 -1.1498 0.6006
SLFN12 1.1371 0.9183    SMC1A -1.1481 0.5563
SMIM5 1.1305 0.765    ZNF638 -1.1466 0.5843
DCXR 1.1294 0.7353    DENND1A -1.1447 0.7931
TRIP11 1.1237 0.2552    SDCCAG8 -1.143 0.7603
SHCBP1 1.1225 0.3253    KDM5A -1.1363 0.3314
IGFN1 1.1199 0.8295    TGOLN2 -1.1327 0.5785
CAB39L 1.1072 0.8469    TAOK3 -1.104 0.6469
SRC 1.1072 0.5551    TRA2A -1.101 0.2225
FOXO1 1.1054 0.6213    ZNF444 -1.1002 0.8229
TANK 1.1047 0.7836    CNTN4 -1.0998 0.7783
ZNF787 1.0984 0.5444    ARID2 -1.0958 0.8084
DLEU1 1.096 0.9565    OXSR1 -1.0947 0.5115
HMMR 1.0897 0.3739    PAPD4 -1.0946 0.7857
EXOC5 1.0815 0.8585    ANKS1A -1.0933 0.5991
AVL9 1.074 0.5527    SAR1A -1.0872 0.7106
TBC1D8B 1.0706 0.8034    DNAJC8 -1.0817 0.709
ATP5E 1.0675 0.8835    FAM50A -1.0776 0.7436
ACBD6 1.0629 0.892    MEF2A -1.0722 0.732
PCNXL4 1.0628 0.7428    SWAP70 -1.0719 0.8245
EDC4 1.0599 0.9017    FBXO25 -1.0697 0.8649
RAB3IL1 1.0581 0.3739    HMGCL -1.0684 0.8143
WDR33 1.0578 0.7285    EDARADD -1.0652 0.3739
TAS1R3 1.0521 0.9485    DCAF15 -1.0498 0.8502
ARID3B 1.0478 0.9345    NBAS -1.0482 0.8536
BRAT1 1.0445 0.9268    OR10A4 -1.0478 0.9812
PRR21 1.0425 0.9631    MZF1 -1.0398 0.9022
FHL2 1.0395 0.9208    COX7A2 -1.0389 0.9275
LRP11 1.0388 0.8197    TMEM208 -1.0371 0.9409
REXO2 1.0385 0.8612    SERINC1 -1.0329 0.8602
EIF2AK4 1.0361 0.9097    C3orf58 -1.0285 0.9443
ATP11B 1.0356 0.8862    CPSF2 -1.0267 0.9367
CDK16 1.0342 0.6506    POLR2E -1.0177 0.9419
MOAP1 1.0256 0.9396    RNF20 -1.0155 0.9624
RFC4 1.0201 0.9903    CSAG1 -1.0119 0.9945
ZNRF1 1.0196 0.9534    C9orf64 -1.0033 0.9978
CHMP6 1.0111 0.9771            
實例9:鑑定預測對用魯索替尼治療之反應性之基因
藉由自實例7及8中之RNA-Seq資料選擇生物標記物來鑑定穩固藥物反應基因組簽名(genomic signature)。具體而言,若在反應者與無反應者中之表現之間存在超過2.0之絕對變化倍數及p<0.05,則自實例7選擇基線基因。對所得基因進行進一步分析以選擇在基線與第24週之間不顯著(絕對變化倍數小於1.5及p>0.05)調節之彼等基因。表20示出符合此準則之基因。 20 :與無反應者相比在反應者之皮膚生檢中有區別地表現且在基線與第 24 週之間未顯著調節之基因
在基線處在反應者中增加 在基線處在無反應者中增加
OVCH2 SLFN12
ANKRD2 DLEU1
KCNJ1 EDARADD
TAS1R3 SH3BGR
PPIAL4G IGFN1
ZSCAN1 APOBEC3G
CACNA1F TRPM2
IL17B RNF148
C1QL1 HMMR
OR10A4 SKA1
TAF1L AHRR
STK16 LDHAL6A
RFNG SHCBP1
CSAG1 GBP3
PRR21 RFC4
NHSL2 CTF1
ZNF787 RAB3IL1
ZNRF1 GINS1
PALD1 CD5
ZNF444 PRKG1
FAM219A SRSF12
TMEM208 FAXC
NMRK1 PDIA5
ARID3B TGIF2
MPLKIP EED
CAB39L GORAB
ALKBH3 NPAS3
PLCE1 AVPR1A
C12orf29 C9orf64
LSAMP C1orf74
SMIM5 ACAN
UQCC2 RNF180
FAM96B BCL2L12
GID4 XK
AKAP10 IQCG
HMGCL ZNF43
C11orf49   
實例10:鑑定在作為對用魯索替尼乳膏治療之反應者之白斑病患者中有區別地表現之基因
使用無創皮膚膠帶,自加入關於魯索替尼乳膏(INCB018424)治療經臨床診斷患有白斑病之個體之研究中的一百二十三名患有白斑病之個體收集皮膚組織,使用手掌(或手紋)法(手掌加5個手指),面部脫色區域佔總體表面積之至少0.5%,且受影響之非面部區域佔總體表面積之至少3%。所有個體均同意收集皮膚組織,且符合臨床方案中所概述之納入及排除準則。一旦收集,可自無創皮膚膠帶將皮膚組織加工成核糖核酸(RNA),以供進一步分析,且隨後使用RNA定序進行分析。基於對用局部INCB018424治療之臨床反應,將樣品分成兩組。具體而言,基於其在治療第24週之治療反應,將樣品分類為「反應者」(可替代地稱為「早期反應者」)或「無反應者」(可替代地稱為「晚期反應者」)(「F-VASI」係指面部白斑病面積及嚴重度指數)。以0.15%、0.5%或1.5%之劑量強度每天向個體局部塗覆INCB018424一次或兩次。在乳膏調配物中每天兩次塗覆相隔至少10小時。
使用Illumina HiSeq 4000系統自實例7及8鑑定一百二十六個基因,且在來自各個體之RNA中進行評估。參見表21。接著在OmicSoft Array Studio中使用人類基因組B38文庫對資料進行比對及質量控制。產生每百萬個定位讀段之每千鹼基轉錄產物之片段(FPKM)(轉錄產物之相對表現)且用於所有下游分析。 21 126 種基因之靶向分析
ACAN CAB39L EGF IL17B NHSL2 S100A1 XK
ACVR1C CACNA1F FAM219A IL17RB NMRK1 SELPLG ZNF43
ADAM21 CCNI2 FAM96B IL23 NPAS3 SerpinF1 ZNF444
ADAMTS13 CCR4 FAXC IL1RL1 OR10A4 SH3BGR ZNF787
AHRR CCR5 GBP3 IL-1RL2 OVCH2 SHCBP1 ZNRF1
AKAP10 CD28 GID4 IL32 PALD1 SKA1 ZSCAN1
ALKBH3 CD3E GINS1 IL36A PCDHB5 SLFN12   
ALPK3 CD5 GORAB IL4I1 PDIA5 SMIM5   
ANKRD2 CNTF GPR61 IQCG PDE9A SOCS5   
APOBEC3G CSAG1 GPR89B KCNJ1 PI3KCG SRSF12   
ARID3B CTF1 HLA-DQB2 KRT16 PLCE1 STK16   
AurKA CXCL9 HMGCL KRT33A PPIAL4G TAF1L   
AVPR1A CXCL10 HMMR LDHAL6A PRKG1 TAS1R3   
BCL2L12 CXCL11 IFI6 LSAMP PRR21 TBC1D3   
BCL7B CXCL8 IFNA MAKPK12 PTPN22 TGIF2   
C11orf49 CXCR4 IFNB MMP25 RAB3IL1 TICAM2   
C12orf29 dkk2 IFNG MMP28 RFC4 TMEM208   
C1orf74 DLEU1 IGFN1 MPLKIP RFNG TNFAIP8L1   
C1QL1 EDARADD IL15 MT1E RNF148 TRPM2   
C9orf64 EED IL17A NLRP1 RNF180 UQCC2   
自進一步分析中剔除在表21中所概述之126個基因中之任一個中無可量測之基因表現的RNA樣品。總共52個基線RNA樣品可用於分析,其中跨越三個治療臂(0.5% QD、1.5% BID、1.5% QD),有27名早期反應者及25名晚期反應者。與無反應者相比,反應者中在基線處增加二十五種基因,且減少11種基因(表22)。 22 :與無反應者相比在反應者之皮膚生檢中有區別地表現之基因
在基線處與無反應者相比在反應者中上調 在基線處與無反應者相比在反應者中下調
基因符號 變化倍數 原始P值 基因符號 變化倍數 原始P值
PPIAL4G 2.946 0.0015    STK16 -16.642 1.19E-06
CD5 2.7957 0.013    RFNG -9.1603 4.34E-05
IFI6 2.2036 0.0803    ZNRF1 -8.1509 0.0002
CCR4 1.7699 0.0093    ARID3B -7.1425 0.0012
CNTF 1.5962 0.0103    WSB2 -5.7202 0.0057
CD28 1.5816 0.0652    JAK1 -4.9886 0.0131
RAB3IL1 1.5178 0.0134    IL1RL2 -3.3798 0.0063
C1QL1 1.4941 0.0808    PALD1 -3.2885 0.0274
VCAM1 1.4707 0.0378    S100A1 -2.5712 0.0829
ACAN 1.4153 0.0471    BCL2L12 -2.2394 0.0716
ETS1 1.4103 0.0668    FAM219A -1.796 0.0975
GPR61 1.4101 0.0566    TSHZ1 -1.6083 0.0705
IFNG 1.3952 0.0597            
KCNJ1 1.3898 0.0674            
PDE9A 1.3878 0.0532            
NPAS3 1.3709 0.0801            
AVPR1A 1.3704 0.0677            
PRKG1 1.3694 0.0653            
CSAG1 1.3646 0.0876            
APOBEC3G 1.3633 0.0676            
LDHAL6A 1.3522 0.0993            
ZSCAN1 1.3521 0.0993            
HMMR 1.3416 0.0991            
IL15 1.3367 0.0739            
SHCBP1 1.3109 0.099            
圖1為描繪在用媒劑對照物或含魯索替尼之組合物處理之後12週及24週CXCL9水準自基線之變化百分比的圖。
圖2為描繪在用媒劑對照物或含魯索替尼之組合物處理之後12週及24週CXCL10水準自基線之變化百分比的圖。
圖3描繪與基線F-VASI正相關之循環中之蛋白質。
圖4描繪藉由處理組引起的所選炎性介體自基線至第24週之變化倍數及配對t檢驗之p值。

Claims (41)

  1. 一種治療患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體的方法,該方法包括: 量測在投與JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之第一生物樣品中之CXCL9、CXCL10、CCL19、IL2-RA、CCL18、IL12、MMP12、GZMB及/或Gal-9的濃度; 向該人類個體投與該JAK抑制劑;及 量測在投與該JAK抑制劑之後自該人類個體獲得之第二生物樣品中之CXCL9、CXCL10、CCL19、IL2-RA、CCL18、IL12、MMP12、GZMB及/或Gal-9的與該第一生物樣品相比降低的濃度。
  2. 如請求項1之方法,該方法包括: 量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之該第一生物樣品中之CXCL9的濃度; 向該人類個體投與該JAK抑制劑;及 量測在投與該JAK抑制劑之後自該人類個體獲得之該第二生物樣品中之CXCL9的與該第一生物樣品相比降低的濃度。
  3. 如請求項1之方法,該方法包括: 量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之該第一生物樣品中之CXCL10的濃度; 向該人類個體投與該JAK抑制劑;及 量測在投與該JAK抑制劑之後自該人類個體獲得之該第二生物樣品中之CXCL10的與該第一生物樣品相比降低的濃度。
  4. 如請求項1之方法,該方法包括: 量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之該第一生物樣品中之CXCL9及CXCL10的濃度; 向該人類個體投與該JAK抑制劑;及 量測在投與該JAK抑制劑之後自該人類個體獲得之該第二生物樣品中之CXCL9及CXCL10的與該第一生物樣品相比降低的濃度。
  5. 如前述請求項中任一項之方法,其中向該人類個體投與該JAK抑制劑,一天至少一次,歷經至少12週之時段。
  6. 如前述請求項中任一項之方法,其中向該人類個體投與該JAK抑制劑,每天至少兩次,歷經至少12週之時段。
  7. 如前述請求項中任一項之方法,其中該JAK抑制劑係局部投與該人類個體。
  8. 如前述請求項中任一項之方法,其中在第一次投與該JAK抑制劑之後至少12週自該人類個體獲得該第二生物樣品。
  9. 如前述請求項中任一項之方法,其中在第一次投與該JAK抑制劑之後至少24週自該人類個體獲得該第二生物樣品。
  10. 如前述請求項中任一項之方法,其中第二治療劑係與該JAK抑制劑組合投與該人類個體。
  11. 一種鑑定患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體對JAK抑制劑之治療反應的方法,該方法包括: 量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之第一生物樣品中之CXCL9、CXCL10、CCL19、IL2-RA、CCL18、IL12、MMP12、GZMB及/或Gal-9的濃度;及 量測在投與該JAK抑制劑之後自該個體獲得之第二生物樣品中之CXCL9、CXCL10、CCL19、IL2-RA、CCL18、IL12、MMP12、GZMB及/或Gal-9的濃度, 其中與該第一生物樣品相比,該第二生物樣品中之CXCL9、CXCL10、CCL19、IL2-RA、CCL18、IL12、MMP12、GZMB及/或Gal-9之降低的濃度指示該人類個體已經歷對該JAK抑制劑之治療反應。
  12. 一種治療患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體的方法,該方法包括: 量測在投與JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之第一生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質的濃度:FAP、RET、CNTN5、FUCA1、ITGAV、ITGB5、THBS4、CD207、GDF-8、CDH6、MRC2、ICOSLG、TNXB、EDIL3、OSMR、GPC1、MIC-A/B、TGFR-2、LRRN1、TLR3、KIM1、ROBO2、CD70、CLMP、N-CDase、FCRL5、CTSV、SCARF2、PLXDC1、PRTG、ERBB4、MAGED1、CEACAM1、TSHB、PTK7、TGFR-2、ADAM 22、CTSC、DLK-1、USP8、SCARF2、TNFRSF13B、MB、TMPRSS5、NUDT5、MMP-3、MAEA、NEMO、IFN-γ、IL18、AKT1S1、CASP-8、PPP1R2、ST2、VSIG4、SCGB3A2、HDGF、ICA1、IL13、PEBP1、PARK7、MAP4K5、FLI1、MMP-10、CCL24、TIMP4、MBL2、REG4及CPA2; 向該人類個體投與該JAK抑制劑;及 量測在投與該JAK抑制劑之後自該人類個體獲得之第二生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質的與該第一生物樣品相比降低的濃度:FAP、RET、CNTN5、FUCA1、ITGAV、ITGB5、THBS4、CD207、GDF-8、CDH6、MRC2、ICOSLG、TNXB、EDIL3、OSMR、GPC1、MIC-A/B、TGFR-2、LRRN1、TLR3、KIM1、ROBO2、CD70、CLMP、N-CDase、FCRL5、CTSV、SCARF2、PLXDC1、PRTG、ERBB4、MAGED1、CEACAM1、TSHB、PTK7、TGFR-2、ADAM 22、CTSC、DLK-1、USP8、SCARF2、TNFRSF13B、MB及TMPRSS5,及/或至少一種選自由以下組成之群之蛋白質的與該第一生物樣品相比增加的濃度:NUDT5、MMP-3、MAEA、NEMO、IFN-γ、IL18、AKT1S1、CASP-8、PPP1R2、ST2、VSIG4、SCGB3A2、HDGF、ICA1、IL13、PEBP1、PARK7、MAP4K5、FLI1、MMP-10、CCL24、TIMP4、MBL2、REG4及CPA2。
  13. 一種鑑定患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體對JAK抑制劑之治療反應的方法,該方法包括: 量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之第一生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質的濃度:FAP、RET、CNTN5、FUCA1、ITGAV、ITGB5、THBS4、CD207、GDF-8、CDH6、MRC2、ICOSLG、TNXB、EDIL3、OSMR、GPC1、MIC-A/B、TGFR-2、LRRN1、TLR3、KIM1、ROBO2、CD70、CLMP、N-CDase、FCRL5、CTSV、SCARF2、PLXDC1、PRTG、ERBB4、MAGED1、CEACAM1、TSHB、PTK7、TGFR-2、ADAM 22、CTSC、DLK-1、USP8、SCARF2、TNFRSF13B、MB、TMPRSS5、NUDT5、MMP-3、MAEA、NEMO、IFN-γ、IL18、AKT1S1、CASP-8、PPP1R2、ST2、VSIG4、SCGB3A2、HDGF、ICA1、IL13、PEBP1、PARK7、MAP4K5、FLI1、MMP-10、CCL24、TIMP4、MBL2、REG4及CPA2;及 量測在投與該JAK抑制劑之後自該個體獲得之第二生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質的濃度:FAP、RET、CNTN5、FUCA1、ITGAV、ITGB5、THBS4、CD207、GDF-8、CDH6、MRC2、ICOSLG、TNXB、EDIL3、OSMR、GPC1、MIC-A/B、TGFR-2、LRRN1、TLR3、KIM1、ROBO2、CD70、CLMP、N-CDase、FCRL5、CTSV、SCARF2、PLXDC1、PRTG、ERBB4、MAGED1、CEACAM1、TSHB、PTK7、TGFR-2、ADAM 22、CTSC、DLK-1、USP8、SCARF2、TNFRSF13B、MB、TMPRSS5、NUDT5、MMP-3、MAEA、NEMO、IFN-γ、IL18、AKT1S1、CASP-8、PPP1R2、ST2、VSIG4、SCGB3A2、HDGF、ICA1、IL13、PEBP1、PARK7、MAP4K5、FLI1、MMP-10、CCL24、TIMP4、MBL2、REG4及CPA2, 其中該第二生物樣品中的至少一種選自由FAP、RET、CNTN5、FUCA1、ITGAV、ITGB5、THBS4、CD207、GDF-8、CDH6、MRC2、ICOSLG、TNXB、EDIL3、OSMR、GPC1、MIC-A/B、TGFR-2、LRRN1、TLR3、KIM1、ROBO2、CD70、CLMP、N-CDase、FCRL5、CTSV、SCARF2、PLXDC1、PRTG、ERBB4、MAGED1、CEACAM1、TSHB、PTK7、TGFR-2、ADAM 22、CTSC、DLK-1、USP8、SCARF2、TNFRSF13B、MB及TMPRSS5組成之群之蛋白質的濃度與該第一生物樣品相比降低,及/或該第二生物樣品中的至少一種選自由NUDT5、MMP-3、MAEA、NEMO、IFN-γ、IL18、AKT1S1、CASP-8、PPP1R2、ST2、VSIG4、SCGB3A2、HDGF、ICA1、IL13、PEBP1、PARK7、MAP4K5、FLI1、MMP-10、CCL24、TIMP4、MBL2、REG4及CPA2組成之群之蛋白質的濃度與該第一生物樣品相比增加,指示該人類個體已經歷對該JAK抑制劑之治療反應。
  14. 一種治療患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體的方法,該方法包括: 量測在投與JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之第一生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質的濃度:DDR1、NTRK2、CES2、SCARA5、GDF-8、BOC、PAEP、ARTN、CDNF、TMPRSS5、FLRT2、ROBO2、SIGLEC10、PRTG、SCARF2、CDH3、GFR-α-1、TSHB、CD200R1、RGMB、KYNU、HS3ST3B1、CHRDL2、CNTN1、VSIG4、ARHGAP1、B4GAT1、STX8、CRELD2、ARSA、BCAM、SCARF1、CA13、DAG1、LAIR1、GUSB、PMVK、PEAR1、GP1BA、TACC3、PARK7、ARHGEF12、SEMA7A、ESAM、FKBP5、ARHGAP1、SCAMP3、ABL1、EGF、TACC3、FKBP5、BID、PRDX5、STX8、CD63、SCARF1、PTPN1、CLEC1B、ARSB、FKBP1B、YES1、SRC、TNFSF14、PLXNB3、LRMP、CD164、DAG1、PVALB、NAA10、TRIM5、ARHGEF12、HGF、CA13、SNAP23、SORT1、GP6、CTSS、PPIB、CRKL、MAP2K6、MANF、PMVK、ABHD14B、GUSB、FATC1、MAD1L1、EDAR、CEACAM8、GLB1、ST3GAL1、ARSA、ADAM 8、CD40、IFI30、ECE1、AXIN1、WFDC2、TBCB、CXCL13、ST1A1、KIF1BP、DPP7、VEGFA、CETN2、TGF-α、CD84、SNAP29、CASP-8、S100A11、GSTP1、CRADD、PRKAB1、HGF、STK4、RNASE3、SERPINB6、OSM、MK、FADD、CLEC11A、CD69、LOX-1、ITGA6、CLEC5A、BCAM、FES、TXNDC5、LAT2、CXCL11、PARP-1、APBB1IP、GZMB及CRNN; 向該人類個體投與該JAK抑制劑;及 量測在投與該JAK抑制劑之後自該人類個體獲得之第二生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質的與該第一生物樣品相比降低的濃度:DDR1、NTRK2、CES2、SCARA5、GDF-8、BOC、PAEP、ARTN、CDNF、TMPRSS5、FLRT2、ROBO2、SIGLEC10、PRTG、SCARF2、CDH3、GFR-α-1、TSHB、CD200R1、RGMB、KYNU、HS3ST3B1、CHRDL2及CNTN1,及/或至少一種選自由以下組成之群之蛋白質的與該第一生物樣品相比增加的濃度:VSIG4、ARHGAP1、B4GAT1、STX8、CRELD2、ARSA、BCAM、SCARF1、CA13、DAG1、LAIR1、GUSB、PMVK、PEAR1、GP1BA、TACC3、PARK7、ARHGEF12、SEMA7A、ESAM、FKBP5、ARHGAP1、SCAMP3、ABL1、EGF、TACC3、FKBP5、BID、PRDX5、STX8、CD63、SCARF1、PTPN1、CLEC1B、ARSB、FKBP1B、YES1、SRC、TNFSF14、PLXNB3、LRMP、CD164、DAG1、PVALB、NAA10、TRIM5、ARHGEF12、HGF、CA13、SNAP23、SORT1、GP6、CTSS、PPIB、CRKL、MAP2K6、MANF、PMVK、ABHD14B、GUSB、FATC1、MAD1L1、EDAR、CEACAM8、GLB1、ST3GAL1、ARSA、ADAM 8、CD40、IFI30、ECE1、AXIN1、WFDC2、TBCB、CXCL13、ST1A1、KIF1BP、DPP7、VEGFA、CETN2、TGF-α、CD84、SNAP29、CASP-8、S100A11、GSTP1、CRADD、PRKAB1、HGF、STK4、RNASE3、SERPINB6、OSM、MK、FADD、CLEC11A、CD69、LOX-1、ITGA6、CLEC5A、BCAM、FES、TXNDC5、LAT2、CXCL11、PARP-1、APBB1IP、GZMB及CRNN。
  15. 一種鑑定患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體對JAK抑制劑之治療反應的方法,該方法包括: 量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之第一生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質的濃度:DDR1、NTRK2、CES2、SCARA5、GDF-8、BOC、PAEP、ARTN、CDNF、TMPRSS5、FLRT2、ROBO2、SIGLEC10、PRTG、SCARF2、CDH3、GFR-α-1、TSHB、CD200R1、RGMB、KYNU、HS3ST3B1、CHRDL2、CNTN1、VSIG4、ARHGAP1、B4GAT1、STX8、CRELD2、ARSA、BCAM、SCARF1、CA13、DAG1、LAIR1、GUSB、PMVK、PEAR1、GP1BA、TACC3、PARK7、ARHGEF12、SEMA7A、ESAM、FKBP5、ARHGAP1、SCAMP3、ABL1、EGF、TACC3、FKBP5、BID、PRDX5、STX8、CD63、SCARF1、PTPN1、CLEC1B、ARSB、FKBP1B、YES1、SRC、TNFSF14、PLXNB3、LRMP、CD164、DAG1、PVALB、NAA10、TRIM5、ARHGEF12、HGF、CA13、SNAP23、SORT1、GP6、CTSS、PPIB、CRKL、MAP2K6、MANF、PMVK、ABHD14B、GUSB、FATC1、MAD1L1、EDAR、CEACAM8、GLB1、ST3GAL1、ARSA、ADAM 8、CD40、IFI30、ECE1、AXIN1、WFDC2、TBCB、CXCL13、ST1A1、KIF1BP、DPP7、VEGFA、CETN2、TGF-α、CD84、SNAP29、CASP-8、S100A11、GSTP1、CRADD、PRKAB1、HGF、STK4、RNASE3、SERPINB6、OSM、MK、FADD、CLEC11A、CD69、LOX-1、ITGA6、CLEC5A、BCAM、FES、TXNDC5、LAT2、CXCL11、PARP-1、APBB1IP、GZMB及CRNN;及 量測在投與該JAK抑制劑之後自該個體獲得之第二生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質的濃度:DDR1、NTRK2、CES2、SCARA5、GDF-8、BOC、PAEP、ARTN、CDNF、TMPRSS5、FLRT2、ROBO2、SIGLEC10、PRTG、SCARF2、CDH3、GFR-α-1、TSHB、CD200R1、RGMB、KYNU、HS3ST3B1、CHRDL2、CNTN1、VSIG4、ARHGAP1、B4GAT1、STX8、CRELD2、ARSA、BCAM、SCARF1、CA13、DAG1、LAIR1、GUSB、PMVK、PEAR1、GP1BA、TACC3、PARK7、ARHGEF12、SEMA7A、ESAM、FKBP5、ARHGAP1、SCAMP3、ABL1、EGF、TACC3、FKBP5、BID、PRDX5、STX8、CD63、SCARF1、PTPN1、CLEC1B、ARSB、FKBP1B、YES1、SRC、TNFSF14、PLXNB3、LRMP、CD164、DAG1、PVALB、NAA10、TRIM5、ARHGEF12、HGF、CA13、SNAP23、SORT1、GP6、CTSS、PPIB、CRKL、MAP2K6、MANF、PMVK、ABHD14B、GUSB、FATC1、MAD1L1、EDAR、CEACAM8、GLB1、ST3GAL1、ARSA、ADAM 8、CD40、IFI30、ECE1、AXIN1、WFDC2、TBCB、CXCL13、ST1A1、KIF1BP、DPP7、VEGFA、CETN2、TGF-α、CD84、SNAP29、CASP-8、S100A11、GSTP1、CRADD、PRKAB1、HGF、STK4、RNASE3、SERPINB6、OSM、MK、FADD、CLEC11A、CD69、LOX-1、ITGA6、CLEC5A、BCAM、FES、TXNDC5、LAT2、CXCL11、PARP-1、APBB1IP、GZMB及CRNN, 其中該第二生物樣品中的至少一種選自由DDR1、NTRK2、CES2、SCARA5、GDF-8、BOC、PAEP、ARTN、CDNF、TMPRSS5、FLRT2、ROBO2、SIGLEC10、PRTG、SCARF2、CDH3、GFR-α-1、TSHB、CD200R1、RGMB、KYNU、HS3ST3B1、CHRDL2及CNTN1組成之群之蛋白質的濃度與該第一生物樣品相比降低,及/或該第二生物樣品中的至少一種選自由VSIG4、ARHGAP1、B4GAT1、STX8、CRELD2、ARSA、BCAM、SCARF1、CA13、DAG1、LAIR1、GUSB、PMVK、PEAR1、GP1BA、TACC3、PARK7、ARHGEF12、SEMA7A、ESAM、FKBP5、ARHGAP1、SCAMP3、ABL1、EGF、TACC3、FKBP5、BID、PRDX5、STX8、CD63、SCARF1、PTPN1、CLEC1B、ARSB、FKBP1B、YES1、SRC、TNFSF14、PLXNB3、LRMP、CD164、DAG1、PVALB、NAA10、TRIM5、ARHGEF12、HGF、CA13、SNAP23、SORT1、GP6、CTSS、PPIB、CRKL、MAP2K6、MANF、PMVK、ABHD14B、GUSB、FATC1、MAD1L1、EDAR、CEACAM8、GLB1、ST3GAL1、ARSA、ADAM 8、CD40、IFI30、ECE1、AXIN1、WFDC2、TBCB、CXCL13、ST1A1、KIF1BP、DPP7、VEGFA、CETN2、TGF-α、CD84、SNAP29、CASP-8、S100A11、GSTP1、CRADD、PRKAB1、HGF、STK4、RNASE3、SERPINB6、OSM、MK、FADD、CLEC11A、CD69、LOX-1、ITGA6、CLEC5A、BCAM、FES、TXNDC5、LAT2、CXCL11、PARP-1、APBB1IP、GZMB及CRNN組成之群之蛋白質的濃度與該第一生物樣品相比增加,指示該人類個體尚未經歷對該JAK抑制劑之治療反應。
  16. 一種治療患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體的方法,該方法包括向該人類個體投與JAK抑制劑,其中先前已確定該人類個體中:(i)自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由SCF、CPA2、P4HB、SPARCL1、ST2、SCF、CNDP1、TRAIL、KIRREL2、EGFR、ISLR2、PPP3R1、FCGR3B、MMP-3、IL-18BP、Flt3L、PPY、LTA4H、ITGB2、PTN、GPNMB、SIRPB1、PLTP、PSP-D、COMP、PAMR1、VASN、F11、IL10、CA3、CXCL10、Notch 3、NCAM1、PROC、CLEC14A、IL-12B、IL10、CD40及IFN-γ組成之群之蛋白質的基線濃度低於對照組;及/或(ii)自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由SERPINA12、GHRL、PREB、IL-20RA及PON2組成之群之蛋白質的基線濃度高於對照組。
  17. 一種治療患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體的方法,該方法包括: 量測自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質的與對照組相比降低的濃度:SCF、CPA2、P4HB、SPARCL1、ST2、SCF、CNDP1、TRAIL、KIRREL2、EGFR、ISLR2、PPP3R1、FCGR3B、MMP-3、IL-18BP、Flt3L、PPY、LTA4H、ITGB2、PTN、GPNMB、SIRPB1、PLTP、PSP-D、COMP、PAMR1、VASN、F11、IL10、CA3、CXCL10、Notch 3、NCAM1、PROC、CLEC14A、IL-12B、IL10、CD40及IFN-γ,及/或至少一種選自由以下組成之群之蛋白質的與對照組相比增加的濃度:SERPINA12、GHRL、PREB、IL-20RA及PON2;及 向該人類個體投與JAK抑制劑。
  18. 一種預測患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體對JAK抑制劑之反應的方法,該方法包括: 量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質的濃度:SCF、CPA2、P4HB、SPARCL1、ST2、SCF、CNDP1、TRAIL、KIRREL2、EGFR、ISLR2、PPP3R1、FCGR3B、MMP-3、IL-18BP、Flt3L、PPY、LTA4H、ITGB2、PTN、GPNMB、SIRPB1、PLTP、PSP-D、COMP、PAMR1、VASN、F11、IL10、CA3、CXCL10、Notch 3、NCAM1、PROC、CLEC14A、IL-12B、IL10、CD40、IFN-γ、SERPINA12、GHRL、PREB、IL-20RA及PON2, 其中SCF、CPA2、P4HB、SPARCL1、ST2、SCF、CNDP1、TRAIL、KIRREL2、EGFR、ISLR2、PPP3R1、FCGR3B、MMP-3、IL-18BP、Flt3L、PPY、LTA4H、ITGB2、PTN、GPNMB、SIRPB1、PLTP、PSP-D、COMP、PAMR1、VASN、F11、IL10、CA3、CXCL10、Notch 3、NCAM1、PROC、CLEC14A、IL-12B、IL10、CD40或IFN-γ中之至少一者的濃度與對照組相比降低,及/或SERPINA12、GHRL、PREB、IL-20RA或PON2中之至少一者的濃度與對照組相比增加預示該個體將對該JAK抑制劑作出反應。
  19. 一種預測患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體對JAK抑制劑之反應的方法,該方法包括: 量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質的濃度:EPHA10、GH2、PARP-1、GLRX、ARSB、SCAMP3、t-PA、LDL受體、DLK-1、SELE、EPHB4、GFRA2、PLC、LTBR、PAMR1、TACSTD2、FS、ICAM-2、AXL、PRSS8、SPINK5、AMN、NOMO1、PAI及CPM, 其中EPHA10、GH2、PARP-1、GLRX、ARSB及SCAMP3中之至少一者的濃度與對照組相比降低,及/或t-PA、LDL受體、DLK-1、SELE、EPHB4、GFRA2、PLC、LTBR、PAMR1、TACSTD2、FS、ICAM-2、AXL、PRSS8、SPINK5、AMN、NOMO1、PAI及CPM中之至少一者的濃度與對照組相比增加預示該個體不會對該JAK抑制劑作出反應。
  20. 如前述請求項中任一項之方法,其中藉由免疫學方法量測該蛋白質之濃度。
  21. 如請求項20之方法,其中該免疫學方法係選自由以下組成之群:酶聯免疫吸附分析法、酶免疫分析法、放射免疫分析法、化學發光免疫分析法、電化學發光免疫分析法、乳膠濁度免疫分析法、乳膠光度免疫分析法、免疫層析分析法及西方墨點法(western blotting)。
  22. 如請求項1至19中任一項之方法,其中藉由質譜法量測該蛋白質之濃度。
  23. 一種治療患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體的方法,該方法包括向該人類個體投與JAK抑制劑,其中先前已確定該人類個體中:(i)自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由SLFN12、DLEU1、EDARADD、SH3BGR、IGFN1、APOBEC3G、TRPM2、RNF148、HMMR、SKA1、AHRR、LDHAL6A、SHCBP1、GBP3、RFC4、CTF1、RAB3IL1、GINS1、CD5、PRKG1、SRSF12、FAXC、PDIA5、TGIF2、EED、GORAB、NPAS3、AVPR1A、C9orf64、C1orf74、ACAN、RNF180、BCL2L12、XK、IQCG及ZNF43組成之群之基因的基線表現水準低於對照組;及/或(ii)自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由OVCH2、ANKRD2、KCNJ1、TAS1R3、PPIAL4G、ZSCAN1、CACNA1F、IL17B、C1QL1、OR10A4、TAF1L、STK16、RFNG、CSAG1、PRR21、NHSL2、ZNF787、ZNRF1、PALD1、ZNF444、FAM219A、TMEM208、NMRK1、ARID3B、MPLKIP、CAB39L、ALKBH3、PLCE1、C12orf29、LSAMP、SMIM5、UQCC2、FAM96B、GID4、AKAP10、HMGCL及C11orf49組成之群之基因的基線表現水準高於對照組。
  24. 一種治療患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體的方法,該方法包括: 量測自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之基因與對照組相比降低的表現水準:SLFN12、DLEU1、EDARADD、SH3BGR、IGFN1、APOBEC3G、TRPM2、RNF148、HMMR、SKA1、AHRR、LDHAL6A、SHCBP1、GBP3、RFC4、CTF1、RAB3IL1、GINS1、CD5、PRKG1、SRSF12、FAXC、PDIA5、TGIF2、EED、GORAB、NPAS3、AVPR1A、C9orf64、C1orf74、ACAN、RNF180、BCL2L12、XK、IQCG及ZNF43,及/或至少一種選自由以下組成之群之基因與對照組相比增加的表現水準:OVCH2、ANKRD2、KCNJ1、TAS1R3、PPIAL4G、ZSCAN1、CACNA1F、IL17B、C1QL1、OR10A4、TAF1L、STK16、RFNG、CSAG1、PRR21、NHSL2、ZNF787、ZNRF1、PALD1、ZNF444、FAM219A、TMEM208、NMRK1、ARID3B、MPLKIP、CAB39L、ALKBH3、PLCE1、C12orf29、LSAMP、SMIM5、UQCC2、FAM96B、GID4、AKAP10、HMGCL及C11orf49;及 向該人類個體投與JAK抑制劑。
  25. 一種預測患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體對JAK抑制劑之反應的方法,該方法包括: 量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之基因的表現水準:OVCH2、ANKRD2、KCNJ1、TAS1R3、PPIAL4G、ZSCAN1、CACNA1F、IL17B、C1QL1、OR10A4、TAF1L、STK16、RFNG、CSAG1、PRR21、NHSL2、ZNF787、ZNRF1、PALD1、ZNF444、FAM219A、TMEM208、NMRK1、ARID3B、MPLKIP、CAB39L、ALKBH3、PLCE1、C12orf29、LSAMP、SMIM5、UQCC2、FAM96B、GID4、AKAP10、HMGCL、C11orf49、SLFN12、DLEU1、EDARADD、SH3BGR、IGFN1、APOBEC3G、TRPM2、RNF148、HMMR、SKA1、AHRR、LDHAL6A、SHCBP1、GBP3、RFC4、CTF1、RAB3IL1、GINS1、CD5、PRKG1、SRSF12、FAXC、PDIA5、TGIF2、EED、GORAB、NPAS3、AVPR1A、C9orf64、C1orf74、ACAN、RNF180、BCL2L12、XK、IQCG及ZNF43, 其中SLFN12、DLEU1、EDARADD、SH3BGR、IGFN1、APOBEC3G、TRPM2、RNF148、HMMR、SKA1、AHRR、LDHAL6A、SHCBP1、GBP3、RFC4、CTF1、RAB3IL1、GINS1、CD5、PRKG1、SRSF12、FAXC、PDIA5、TGIF2、EED、GORAB、NPAS3、AVPR1A、C9orf64、C1orf74、ACAN、RNF180、BCL2L12、XK、IQCG及ZNF43中之至少一者的表現水準與對照組相比降低,及/或OVCH2、ANKRD2、KCNJ1、TAS1R3、PPIAL4G、ZSCAN1、CACNA1F、IL17B、C1QL1、OR10A4、TAF1L、STK16、RFNG、CSAG1、PRR21、NHSL2、ZNF787、ZNRF1、PALD1、ZNF444、FAM219A、TMEM208、NMRK1、ARID3B、MPLKIP、CAB39L、ALKBH3、PLCE1、C12orf29、LSAMP、SMIM5、UQCC2、FAM96B、GID4、AKAP10、HMGCL及C11orf49中之至少一者的表現水準與對照組相比增加預示該個體將對該JAK抑制劑作出反應。
  26. 一種預測患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體對JAK抑制劑之反應的方法,該方法包括: 量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之基因的表現水準:OVCH2、ANKRD2、KCNJ1、TAS1R3、PPIAL4G、ZSCAN1、CACNA1F、IL17B、C1QL1、OR10A4、TAF1L、STK16、RFNG、CSAG1、PRR21、NHSL2、ZNF787、ZNRF1、PALD1、ZNF444、FAM219A、TMEM208、NMRK1、ARID3B、MPLKIP、CAB39L、ALKBH3、PLCE1、C12orf29、LSAMP、SMIM5、UQCC2、FAM96B、GID4、AKAP10、HMGCL、C11orf49、SLFN12、DLEU1、EDARADD、SH3BGR、IGFN1、APOBEC3G、TRPM2、RNF148、HMMR、SKA1、AHRR、LDHAL6A、SHCBP1、GBP3、RFC4、CTF1、RAB3IL1、GINS1、CD5、PRKG1、SRSF12、FAXC、PDIA5、TGIF2、EED、GORAB、NPAS3、AVPR1A、C9orf64、C1orf74、ACAN、RNF180、BCL2L12、XK、IQCG及ZNF43, 其中OVCH2、ANKRD2、KCNJ1、TAS1R3、PPIAL4G、ZSCAN1、CACNA1F、IL17B、C1QL1、OR10A4、TAF1L、STK16、RFNG、CSAG1、PRR21、NHSL2、ZNF787、ZNRF1、PALD1、ZNF444、FAM219A、TMEM208、NMRK1、ARID3B、MPLKIP、CAB39L、ALKBH3、PLCE1、C12orf29、LSAMP、SMIM5、UQCC2、FAM96B、GID4、AKAP10、HMGCL及C11orf49中之至少一者的表現水準與對照組相比降低,及/或SLFN12、DLEU1、EDARADD、SH3BGR、IGFN1、APOBEC3G、TRPM2、RNF148、HMMR、SKA1、AHRR、LDHAL6A、SHCBP1、GBP3、RFC4、CTF1、RAB3IL1、GINS1、CD5、PRKG1、SRSF12、FAXC、PDIA5、TGIF2、EED、GORAB、NPAS3、AVPR1A、C9orf64、C1orf74、ACAN、RNF180、BCL2L12、XK、IQCG及ZNF43中之至少一者的表現水準與對照組相比增加預示該個體不會對該JAK抑制劑作出反應。
  27. 一種治療患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體的方法,該方法包括向該人類個體投與JAK抑制劑,其中先前已確定該人類個體中:(i)自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由STK16、RFNG、ZNRF1、ARID3B、WSB2、JAK1、IL1RL2、PALD1、S100A1、BCL2L12、FAM219A及TSHZ1組成之群之基因的基線表現水準低於對照組,及/或(ii)自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由PPIAL4G、CD5、IFI6、CCR4、CNTF、CD28及RAB3IL1組成之群之基因的基線表現水準高於對照組。
  28. 一種治療患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體的方法,該方法包括: 量測自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之基因與對照組相比降低的表現水準:STK16、RFNG、ZNRF1、ARID3B、WSB2、JAK1、IL1RL2、PALD1、S100A1、BCL2L12、FAM219A及TSHZ1,及/或至少一種選自由以下組成之群之基因與對照組相比增加的表現水準:PPIAL4G、CD5、IFI6、CCR4、CNTF、CD28及RAB3IL1;及 向該人類個體投與JAK抑制劑。
  29. 一種預測患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體對JAK抑制劑之反應的方法,該方法包括: 量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之基因的表現水準:PPIAL4G、CD5、IFI6、CCR4、CNTF、CD28、RAB3IL1、STK16、RFNG、ZNRF1、ARID3B、WSB2、JAK1、IL1RL2、PALD1、S100A1、BCL2L12、FAM219A及TSHZ1, 其中STK16、RFNG、ZNRF1、ARID3B、WSB2、JAK1、IL1RL2、PALD1、S100A1、BCL2L12、FAM219A及TSHZ1中之至少一者的表現水準與對照組相比降低,及/或PPIAL4G、CD5、IFI6、CCR4、CNTF、CD28及RAB3IL1中之至少一者的表現水準與對照組相比增加預示該個體將對該JAK抑制劑作出反應。
  30. 一種預測患有白斑病、疑似患有白斑病或處於顯現白斑病之風險下之人類個體對JAK抑制劑之反應的方法,該方法包括: 量測在投與該JAK抑制劑之前自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之基因的表現水準:PPIAL4G、CD5、IFI6、CCR4、CNTF、CD28、RAB3IL1、STK16、RFNG、ZNRF1、ARID3B、WSB2、JAK1、IL1RL2、PALD1、S100A1、BCL2L12、FAM219A及TSHZ1, 其中PPIAL4G、CD5、IFI6、CCR4、CNTF、CD28及RAB3IL1中之至少一者的表現水準與對照組相比降低,及/或STK16、RFNG、ZNRF1、ARID3B、WSB2、JAK1、IL1RL2、PALD1、S100A1、BCL2L12、FAM219A及TSHZ1中之至少一者的表現水準與對照組相比增加預示該個體不會對該JAK抑制劑作出反應。
  31. 如請求項23至30中任一項之方法,其中藉由RNA定序或定量PCR來量測該至少一種基因之表現水準。
  32. 如前述請求項中任一項之方法,其中該生物樣品為血液、血清、血漿、尿液、脊髓液、唾液、淚液或汗液。
  33. 如前述請求項中任一項之方法,其中該生物樣品為血液、血清或血漿。
  34. 如前述請求項中任一項之方法,其中該JAK抑制劑為魯索替尼(ruxolitinib)。
  35. 如請求項34之方法,其中魯索替尼係以包含至少0.15%魯索替尼之乳膏形式局部投與該人類個體。
  36. 如請求項34之方法,其中魯索替尼係以包含至少1.5%魯索替尼之乳膏形式局部投與該人類個體。
  37. 如請求項1至33中任一項之方法,其中該JAK抑制劑為伊他替尼(itacitinib)、4-[3-(氰基甲基)-3-(3',5'-二甲基-1H,1'H-4,4'-聯吡唑-1-基)氮雜環丁烷-1-基]-2,5-二氟-N-[(1S)-2,2,2-三氟-1-甲基乙基]苯甲醯胺或其醫藥學上可接受之鹽,或者((2R,5S)-5-{2-[(1R)-1-羥基乙基]-1H-咪唑并[4,5-d]噻吩并[3,2-b]吡啶-1-基}四氫-2H-哌喃-2-基)乙腈或其醫藥學上可接受之鹽。
  38. 一種評定患有白斑病之人類個體中之疾病嚴重度的方法,該方法包括: 量測自該人類個體獲得之生物樣品中的至少一種選自由以下組成之群之蛋白質的濃度:FUCA1、GFRA2、LDL受體、AXL、t-PA、IL-1RT1、EPHB4、TR-AP、PTPRF、PON2、DLK-1及IL-20RA, 其中該等蛋白質中之至少一者的濃度與對照組相比增加指示該人類個體中之白斑病嚴重。
  39. 如請求項38之方法,其中量測該等蛋白質中之至少1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種、11種或全部的濃度。
  40. 如請求項38或39中任一項之方法,其中該生物樣品為血液、血清、血漿、尿液、脊髓液、唾液、淚液或汗液。
  41. 如請求項38或39中任一項之方法,其中該生物樣品為血液、血清或血漿。
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