TW201903409A - 最近的瘧疾感染的血清學分析 - Google Patents

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克里斯多夫 約翰 德雷克利
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Abstract

在一些實施方案中，用於檢測近期瘧疾感染的免疫測定裝置包括：鄰近綴合墊的第一端定位的樣品墊，其中所述樣品墊或綴合墊的第一端包括能夠結合抗-ETRAMP5抗體的檢測絡合物；其中所述綴合墊的第二端包括浸漬有包含ETRAMP5蛋白片段的構建體蛋白的一個或多個區域。在一些實施方案中，用於抗-ETRAMP5抗體的檢測絡合物包括與抗-IgG抗體絡合的捕集顆粒。在一些實施方案中，用於抗-ETRAMP5抗體的檢測絡合物包括與包括ETRAMP5蛋白片段的絡合分子絡合的檢測顆粒。

Description

最近的瘧疾感染的血清學分析
本發明係有關一種用於檢測近期瘧疾感染的免疫測定裝置。
由於在過去的某些時間遭受瘧疾的個體中持續存在瘧疾蛋白的抗體，使得在全球瘧疾流行區域中通過血清學測定，諸如免疫測定檢測瘧疾更加複雜。生活在瘧疾流行區域的人們在他們的生活中經常感染多次，可能在同一季節或同一年中具有多種不同的感染事件。瘧疾的許多生物學標記具有以下局限性：由於感染個體中的持續免疫反應，在活性感染結束後的一定時間內，它們將繼續在血清學測定中提供陽性結果。根據瘧疾感染的生物標誌物，測定結果可持續陽性數月至數年。在瘧疾流行的地區，許多個體在其壽命中感染多次並可能在同一年或同一季節中感染多次。在活性瘧疾感染結束後，對於從此類個體採集的體液(諸如血液)的血清學測定可在一些測定中示出持久性陽性結果並持續數月至數年。參見，Helb等人於2015年7約27日線上公佈的Novel Serologic Biomarkers Provide Accurate Estimates of Recent Plasmodium Falciparum Exposure for Individuals and Communities, PNAS doi 10.1073，其以引用方式併入。
在先申請的所有主題均在此類主題與本文不矛盾的程度上通過引用方式併入本文。
在一些實施方案中，用於檢測近期瘧疾感染的免疫測定裝置包括：鄰近綴合墊的第一端定位的樣品墊，其中綴合墊的第一端或樣品墊包括能夠結合抗-ETRAMP5抗體的檢測絡合物；其中所述綴合墊的第二端包括浸漬有包含ETRAMP5蛋白片段的構建體蛋白的一個或多個區域。在一些實施方案中，用於抗-ETRAMP5抗體的檢測絡合物包括與抗-IgG抗體絡合的捕集顆粒。在一些實施方案中，用於抗-ETRAMP5抗體的檢測絡合物包括與包括ETRAMP5蛋白片段的絡合分子絡合的檢測顆粒。
在一些實施方案中，用於檢測近期瘧疾感染的免疫測定裝置包括：鄰近綴合墊的第一端定位的樣品墊，其中綴合墊的第一端或樣品墊包括能夠結合抗-ETRAMP5抗體的第一檢測絡合物和能夠結合瘧疾免疫應答抗原的第二檢測絡合物；其中所述綴合墊的第二端包括第一區域和第二區域，所述第一區域包括與包括ETRAMP5蛋白片段的絡合分子絡合的第一捕集顆粒，所述第二區域包括與包括瘧疾免疫應答蛋白的一個或多個片段的絡合分子絡合的第二捕集顆粒。
前述概述僅是示例性的並不旨在以任何方式進行限制。除了上述示例性方面、實施方案和特徵之外，其它方面、實施方案和特徵將結合圖式和以下具體實施方式變得明白清楚。
在以下具體實施方式中，參考了形成其一部分的圖式。在圖式中，除非上下文另有規定，否則相似的符號通常標識相似的元件。具體實施方式、圖式和申請專利範圍中所述的示例性實施方案並不意指限制。可使用其它實施方案，並且可以進行其它改變，但不脫離在此呈現的主題的精神或範圍。
為了檢測近期感染並向瘧疾發病率的流行病學研究報告醫學診斷和/或提供資料，如本文所述的免疫測定檢測對近期瘧疾感染具有特異性的生物標記。更具體地講，如本文所述的免疫測定檢測瘧疾早期轉錄膜蛋白5的人抗體(如本文所使用的“ETRAMP5”)。ETRAMP5在間日瘧原蟲(Plasmodium vivax)早期感染期間由瘧原蟲表達，並且近期感染的人對該蛋白產生抗體。一般來講，ETRAMP5蛋白的抗體在感染後數月時間段內僅可在人體內檢測到。因此檢測與ETRAMP5蛋白的部分反應的抗體的免疫測定具體地指示相對近期的感染。
在一些實施方案中，預期免疫測定將僅對來自已感染瘧疾不到一年的時間內的個體的樣品產生陽性結果。在一些實施方案中，預期免疫測定將僅對來自已感染瘧疾不到六個月的時間段內的個體的樣品產生陽性結果。在一些實施方案中，預期免疫測定將僅對來自已感染瘧疾不到三個月的時間段內的個體的樣品產生陽性結果。具體免疫測定實施方案自感染的時間段取決於以下因素，其包括：在測定的可視化線處的構建體蛋白濃度、測定中使用的樣品體積、所選的ETRAMP5蛋白的片段和測定的緩衝液條件。一些實施方案利用多個ETRAMP5蛋白片段以提高測試的準確度。一些實施方案將ETRAMP5蛋白片段與其它蛋白片段組合使用。
用於檢測近期瘧疾感染的裝置可以包括免疫測定裝置，諸如側流測定(LFA)裝置。裝置通常是單次使用和一次性的，以便使臨床人員交叉污染和/或感染的風險最小化。瘧疾的血清學測定經常使用血液作為樣本，理想地體積大約為幾滴以最小化患者干預。例如，可刺破小指獲得血液，並直接置於測定中。優選地，免疫測定需要最少的臨床或實驗室人員處理並且在少於一個小時內遞送結果。
在一些實施方案中，被構造成檢測近期瘧原蟲感染的免疫測定裝置包括：鄰近結合點的第一端定位的樣品墊，其中樣品墊或綴合墊的第一端包含能夠結合抗-ETRAMP5抗體的檢測絡合物；其中所述綴合墊的第二端包括浸漬有包括ETRAMP5蛋白片段的構建體蛋白的一個或多個區域。在使用期間，人抗體將檢測絡合物與來自陽性樣品的抗-ETRAMP5抗體和包含ETRAMP5蛋白片段的構建體蛋白同時結合，從而在綴合墊上在包括ETRAMP5蛋白片段的構建體蛋白的位置處產生陽性訊號。在一些實施方案中，抗-ETRAMP5抗體的檢測絡合物包括與抗-IgG抗體絡合的捕集顆粒。在一些實施方案中，抗-ETRAMP5抗體的檢測絡合物包括與包括ETRAMP5蛋白片段的絡合物分子絡合的檢測顆粒。
根據實施方案，包括ETRAMP5蛋白片段的構建體蛋白可包括對應於ETRAMP5 DNA序列的外顯子1的蛋白和/或對應於外顯子1的亞基的蛋白。在一些實施方案中，包括ETRAMP5蛋白片段的構建體蛋白可包括對應於ETRAMP5基因組DNA序列的外顯子1的蛋白或其片段和用作標籤分子的蛋白。例如，包括ETRAMP5蛋白片段的構建體蛋白可包括對應於ETRAMP5基因組DNA序列的外顯子1的蛋白或其片段和來自日本血吸蟲(Schistosoma japonicum)的谷胱甘肽S-轉移酶(GST)蛋白。例如，包括ETRAMP5蛋白片段的構建體蛋白可包括對應於ETRAMP5基因組DNA序列外顯子1的蛋白或其片段和人谷胱甘肽S-轉移酶(GST)蛋白。例如，包括ETRAMP5蛋白片段的構建體蛋白可包括對應於ETRAMP5基因組DNA序列的外顯子1的蛋白或其片段和至少六個組氨酸分子(諸如六個組氨酸分子、七個組氨酸分子、八個組氨酸分子、九個組氨酸分子、十個組氨酸分子等)的鏈。例如，包括ETRAMP5蛋白片段的構建體蛋白可包括對應於ETRAMP5基因組DNA序列的外顯子1的蛋白或其片段和包括碳水化合物結合分子2(CBM2)蛋白的一部分的蛋白。在一些實施方案中，包括ETRAMP5蛋白片段的構建體蛋白自大腸桿菌純化。在一些實施方案中，包括ETRAMP5蛋白片段的構建體蛋白自哺乳動物細胞純化。
一些實施方案包括與包括ETRAMP5蛋白片段的絡合分子絡合的第一捕集顆粒，和與包括非ETRAMP5瘧疾免疫應答抗原的絡合分子絡合的第二捕集顆粒。所述捕集顆粒可位於測定的不同區域中。例如，綴合墊可在第一區域中用第一捕集顆粒浸漬並且在遠離第一區域的第二區域中用第二捕集顆粒浸漬。在一些實施方案中，與包括ETRAMP5蛋白片段的絡合分子絡合的第一捕集顆粒包括一系列附接的一個或多個ETRAMP蛋白片段的蛋白構建體。例如，取決於實施方案，非ETRAMP5瘧疾免疫應答抗原可包括以下中的至少一種：碳水化合物結合模組家族2(CBM2)、配子體輸出蛋白(GEXP)、裂殖子表面蛋白1(MSP1)、裂殖子表面蛋白2(MSP2)、富谷氨酸蛋白(GLURP)、環子孢子蛋白(CSP)、和/或網織紅細胞結合蛋白(Rh5)。非ETRAMP5瘧疾免疫應答抗原可包括這些蛋白中的一種或多種的片段。例如，MSP2抗原可包括MSP2.CH150.0和/或MSP2.Dd2.KT蛋白片段。
圖1示出了將依賴於生物素的系統與其中用於抗ETRAMP5抗體的檢測絡合物包括與抗-IgG抗體絡合的檢測顆粒的系統進行比較的免疫測定反應的示意圖。在該圖中，大圓代表用於在免疫測定中可視化的檢測分子，諸如金顆粒、乳膠珠或類似顆粒。檢測分子可塗覆有抗-IgG抗體，但出於解釋說明的目的，其作為單個Y形抗-IG抗體示出。右側的圖示圖片示出了固接於代表性IgG抗體的代表性檢測顆粒。在一個裝置中，檢測顆粒可塗覆有多種抗IgG抗體。固接到檢測顆粒的IgG抗體與目標抗體(針對瘧原蟲早期感染蛋白諸如ETRAMP5的人抗體)絡合。該圖片的下部示出了在浸漬有包括ETRAMP5蛋白片段的構建體蛋白的區域中，在圖片下部中作為彎曲表面示出的綴合墊的第二端，如以較小的圓所示的(Etramp5.1)。構建體蛋白包括來自DNA序列的外顯子1的ETRAMP5蛋白片段。來自樣品的目標抗體與塗覆有抗-IgG抗體的檢測分子和包含來自DNA序列的外顯子1的至少一個ETRAMP5蛋白片段的構建體蛋白兩者形成絡合物。
圖2示出了比較依賴於生物素的系統與其中用於抗-ETRAMP5抗體的檢測絡合物包括與一種或多種ETRAMP5蛋白片段絡合的檢測顆粒的系統的免疫測定反應的示意性比較結果。在該圖中，大圈代表檢測分子，諸如用於免疫測定中可視化的金顆粒、乳膠珠或類似顆粒。檢測分子可塗覆有ETRAMP5蛋白片段，具體地講由外顯子1編碼的蛋白或其片段。出於說明的目的，ETRAMP5塗層被示為單個小片段，圖示中較小的黑圈（“Etramp5.1”）。右側的圖示圖片示出了固接到代表性ETRAMP5蛋白片段塗層的代表性檢測顆粒。在裝置中，檢測顆粒將塗覆有多個ETRAMP5蛋白片段。固接到檢測顆粒上的ETRAMP5蛋白片段與靶抗體(針對瘧原蟲早期感染蛋白ETRAMP5的人抗體)絡合。圖片的下部描繪了在用包含ETRAMP5蛋白片段的構建體蛋白浸漬的區域中，圖片的下部示出在浸漬有包含ETRAMP5蛋白片段的構建體蛋白的區域(作為較小的黑圈示出)中的綴合墊的第二端，其在所述圖片下部處作為曲面示出。構建體蛋白包括來自DNA序列的外顯子1的ETRAMP5蛋白片段。來自樣品的靶抗體與塗覆有ETRAMP5蛋白片段的檢測分子和包含來自DNA序列外顯子1的至少一個ETRAMP5片段的構建體蛋白兩者均形成絡合物。來自樣品的靶抗體同時結合至塗覆有ETRAMP5蛋白片段的檢測分子和包含至少一個ETRAMP5片段的構建體蛋白兩者，從而在存在此類抗體時，在陽性結果區域產生可檢測的絡合物。在一些實施方案中，陽性結果對觀察者的眼睛可見，而在其它實施方案中其可使用讀取裝置來檢測。
圖3示出了免疫測定裝置，諸如側流測定裝置300的代表性外部視圖。免疫測定裝置，諸如側流測定裝置旨在是單次使用的、低成本的和一次性的。側流測定裝置300以俯視圖示出。側流測定裝置300包括任選的覆蓋件320，其例如具有保持內部元件的相對位置並防止它們污染的尺寸、形狀和位置的塑膠覆蓋件。在使用時，覆蓋件320還用於防止潛在感染性人血清學樣品(諸如血液或尿液)從側流測定裝置300的內部洩漏。側流測定裝置300包括鄰近所述裝置的第一端的加樣孔310。所述加樣孔310具有允許樣品流體(例如，血滴)添加到裝置的內部的尺寸、形狀和位置。在一些實施方案中，加樣孔310具有允許測定緩衝液或洗滌流體添加到裝置內部的尺寸、形狀和位置。
側流測定裝置300還包括可視化區域330。所述可視化區域330對應於裝置內部的檢測區域。在一些實施方案中，可視化區域330包括對應於相鄰內部膜上的適當位置的覆蓋件320中的孔。可對可視化區域330添加透明塑膠覆蓋件以在裝置中形成窗口。
圖4示出了如圖3所示的側流測定裝置300的剖視圖。圖4的視圖對應於裝置的長軸，其從圖中的點A到點B。側流測定裝置300包括基本上圍繞裝置300的外部的覆蓋件320。側流測定裝置300包括鄰近所述裝置300的第一端的加樣孔310。樣品墊400鄰近加樣孔310定位。樣品墊400由能吸收樣品的材料製成。在一些實施方案中，樣品墊400包括從血液或尿液過濾樣品的部分(例如較大顆粒)的結構。樣品墊400被定位並構造成在鄰近加樣孔310的第一側處接收樣品，並且允許樣品在鄰近綴合墊410的第二側處離開樣品墊400。一些實施方案包括樣品墊，所述樣品墊包括多個子部分，諸如多個層或區域。一些實施方案包括定位成與樣本墊對齊的附加組件，諸如過濾器或選擇性膜。例如，選擇性滲透膜可鄰近樣品墊定位於樣品墊和綴合墊410之間。
綴合墊410沿側流測定裝置300的長度定位，其中第一端鄰近樣品墊310定位，並且第二端鄰近廢物墊420定位。在一些實施方案中，能夠結合抗-ETRAMP5抗體的檢測絡合物定位於樣品墊內。在一些實施方案中，能夠結合抗-ETRAMP5抗體的檢測絡合物定位於綴合墊內在鄰近樣品墊的位置處。附加特徵結構，諸如鹽、測定陽性對照組分、測定陰性對照組分和/或流量控制元件可包含於綴合墊中。儘管圖4中所示的綴合墊作為單個單元示出，但在一些實施方案中，綴合墊可由多個子部分組成，諸如由不同材料製成的層或區域。
廢物墊420鄰近綴合墊的第二端定位。在所示實施方案中，廢物墊420鄰近綴合墊的第二端的下表面定位，處於允許過量流體向下流入廢物墊中的位置。廢物墊具有將過量流體保留在所述裝置內以最小化由流體洩漏導致交叉污染或感染蔓延的可能性的尺寸、形狀和材料。儘管廢料墊在本文中視為單個單元，但在一些實施方案中，其由相同或不同材料的多個層或區域形成。
在一些實施方案中，綴合墊的第二端的一個或多個區域包括浸漬有構建體蛋白的一個或多個區域，所述構建體蛋白包括來自在人宿主的早期感染期間表達的瘧原蟲蛋白的片段。例如，構建體蛋白可包括作為構建體蛋白表達的AMA1、GLURP、MSP1.19、Rh2030、EBA181、EBE175、Etramp4Ag2 MSP2、HSP40、GexP、Hyp2、SBP1、SEA、H101和hSG6蛋白的一個或多個片段。
在一些實施方案中，用於檢測近期瘧疾感染的免疫測定裝置包括：鄰近綴合墊的第一端定位的樣品墊，其中樣品墊或綴合墊的第一端包括能夠結合人抗-ETRAMP5抗體的第一檢測絡合物和能夠結合瘧疾免疫應答抗原的第二檢測絡合物；其中所述綴合墊的第二端包括第一區域和第二區域，所述第一區域包括與包含ETRAMP5蛋白片段的絡合分子絡合的第一捕集顆粒，所述第二區域包括與包含瘧疾免疫應答蛋白的一個或多個片段的絡合分子絡合的第二捕集顆粒。綴合墊的第一區域和第二區域可作為所述墊的不同區域，例如作為橫跨所述墊的寬度的不同線或帶定位。根據實施方方案，測定的陽性結果可包括檢測綴合墊的第一區域和第二區域兩者中的反應(例如顏色變化)。一些實施方案還包括陽性對照測試線，其中陽性結果由綴合墊的第一區域和第二區域以及陽性對照測試線指示，其全部均示出陽性結果，例如顏色變化。
第一或第二檢測絡合物可包括與抗-IgG抗體絡合的捕集顆粒。在一些實施方案中，第一或第二檢測絡合物可包括與抗-IgG抗體絡合的捕集顆粒。在一些實施方案中，僅第一或第二檢測絡合物中的一種將包括與抗-IgG抗體絡合的捕集顆粒。一些實施方案包括與包含ETRAMP5蛋白片段的絡合分子絡合的捕集顆粒。例如，包括ETRAMP5蛋白片段的絡合分子可包括彼此串聯連接的多個ETRAMP5蛋白片段。ETRAMP5蛋白片段可對應於全分子的相同部分，例如串聯連接的ETRAMP5的經表達外顯子1的多個拷貝。ETRAMP5蛋白片段可對應於(例如串聯連接的)全分子的兩個或更多個不同部分。
在一些實施方案中，能夠結合瘧疾免疫應答抗原的第二檢測絡合物包括下列中的至少一種：碳水化合物結合模組家族2(CBM2)、配子體輸出蛋白(GEXP)、裂殖子表面蛋白1(MSP1)、裂殖子表面蛋白2(MSP2)、富谷氨酸蛋白(GLURP)、環子孢子蛋白(CSP)、和/或網織紅細胞結合蛋白(Rh5)。蛋白可以為全瘧疾免疫應答抗原蛋白的片段或部分，例如MSP2可包括MSP2的MSP2.CH150.0和/或MSP2.Dd2.KT片段中的一個或多個。存在與包含瘧疾免疫應答蛋白的一個或多個片段的絡合分子絡合的第二捕集顆粒，其將對應於來自第二檢測絡合物的免疫應答抗原。例如，其中瘧疾免疫應答抗原包括碳水化合物結合模組家族2(CBM2)蛋白或其片段，與絡合分子絡合的第二捕集顆粒包括碳水化合物結合模組家族2(CBM2)蛋白。
一些實施方案包括第三檢測絡合物，並且綴合墊的第三部分包含對應於第三檢測絡合物的捕集顆粒。例如，第三檢測絡合物可包括來自上文提供的列表的瘧疾免疫應答抗原，並且綴合墊的第三部分包括與包含瘧疾免疫應答蛋白的一個或多個片段的絡合分子絡合的捕集顆粒。
在一些實施方案中，用於近期瘧疾感染的免疫測定裝置包括：鄰近綴合墊的第一端定位的樣品墊，其中樣品墊或綴合墊的第一端包含能夠結合人抗-ETRAMP5抗體的第一檢測絡合物和能夠結合瘧疾免疫應答抗原的第二檢測絡合物；以及分析膜，所述分析膜與所述綴合墊的第二端接觸，所述分析膜包括第一區域和第二區域，所述第一區域包含與包含ETRAMP5蛋白片段的絡合分子絡合的第一捕集顆粒，所述第二區域包含與包含瘧疾免疫應答蛋白的一個或多個片段的絡合分子絡合的第二捕集顆粒。
分析膜可具有用於免疫測定，具體地講用於側流測定的類型。用於實施方案中的分析膜可基於以下因素來選擇：諸如成本、耐久性、穩定性、通過膜的流速和附接到檢測絡合物的能力。
圖5示出了側流測定形式的免疫測定的示意圖。為了內部的更好可視化，側流測定的外部殼體已從示意圖中移除。最頂端的圖示出了使用前的側流測定，其中樣品墊在綴合墊左側和末端的頂部上。綴合墊浸漬有至少一種檢測絡合物。在所示示例中，檢測顆粒由與針對瘧疾免疫應答抗原的抗體(例如ETRAMP5)絡合的金顆粒形成。綴合墊定位成與樣品墊直接接觸，其中綴合墊的第一端(圖5的視圖中的左側)定位在樣品墊的邊緣下方。分析膜鄰近綴合墊的第二端定位並與所述第二端接觸。分析膜包括至少一個測試區以及控制區。測試區具有與包含瘧疾抗原蛋白的絡合分子絡合的第一捕集顆粒的附接顆粒。例如，至少一個測試區包括附接於分析膜上的ETRAMP5蛋白片段。單獨的第一捕集顆粒可以橫跨分析膜的寬度的線(如圖5所示)形式或者作為以其它形式相對於分析膜定位的點、圓、線，或其它圖案來定位。分析膜包括對照區，所述對照區包括附接在分析膜上的對照分子的抗體。對照分子的單個抗體可以橫跨分析膜的寬度的線(如圖5所示)的形式或者作為以其它形式相對於分析膜定位的點、圓、線，或其它圖案定位。在一些實施方案中，對照區和至少一個測試區相交，例如形成“X”或與交叉線類似的符號。吸收墊(有時被稱為廢物墊)從綴合墊遠離分析膜的遠端定位。
圖5中自頂部的第二示意圖示出例如來自血液樣本的血漿沉積在樣品墊的頂部表面上。一些實施方案包括定位於樣品墊頂部上的附加過濾層，所述過濾層在流體樣品進入樣品墊之前從樣品中移除紅細胞和細胞碎片顆粒。如果血漿樣品來自近期感染瘧疾的人，則樣品將包含對應於感染寄生蟲的瘧原蟲的抗體。圖5將這些抗體顯示為血漿中的Y形分子。
圖5的中部示意圖示出在血漿樣品整合到樣品墊中後，血漿內的抗體(包括瘧疾抗原的可能抗體)隨流體流從樣品墊移動到綴合墊中。在綴合墊中，樣品中存在的任何抗體可與綴合墊中的任何檢測絡合物結合。這種抗體-檢測絡合物相互作用和潛在結合取決於相關抗體和檢測絡合物的存在。例如，瘧疾蛋白ETRAMP5的抗體可與包含含有抗體表位的ETRAMP5蛋白片段的檢測絡合物相互作用並結合。如果血漿樣品中不存在對應於檢測顆粒的抗體，則在該情況下將不發生與檢測絡合物的特異性結合。圖示示出了提供血液樣品的患者具有檢測顆粒的抗體的情況。
圖5的兩個較低部分示出了陽性(表示為+)和陰性(表示為-)結果的基礎。陽性結果為上圖，即圖5中從底部起的第二個，並且陰性結果是圖示的最下部分。在提供血液樣品的人在其血液中具有識別並結合檢測絡合物上的蛋白的抗體(例如相應的抗體)的情況下。然後較大的絡合物將通過流體流動從綴合墊移動到分析膜中。如果較大檢測絡合物中的抗體識別並結合附接在測試區域中的蛋白，則檢測絡合物將在該區域中成簇並在分析膜中形成可見的顏色變化。也存在於綴合墊中的對照檢測顆粒也通過流體流動移動到分析膜中並且結合附接在分析膜的對照區域中的分子。對照檢測顆粒在對照區域形成可見的顏色變化。在陽性測定中，測試區域和對照區域兩者均具有結合的檢測顆粒並且在分析膜上形成兩條線。在陰性測定中，僅對照檢測絡合物結合並形成單條線。對於這兩種結果，過量檢測絡合物隨著流體流移動到所示測定的最右側處的吸收墊中。
在一些實施方案中，免疫測定包括兩個或更多個測試區域和相應類型的檢測顆粒，所述檢測顆粒具有將與近期感染的多個血液指標結合的分子。例如，免疫測定可能包括測試區域和識別ETRAMP5以及非ETRAMP5瘧疾免疫應答抗原的相應類型的檢測顆粒。例如，非-ETRAMP5瘧疾免疫應答抗原可包括下列中的一種：碳水化合物結合模組家族2(CBM2)、配子體輸出蛋白(GEXP)、裂殖子表面蛋白1(MSP1)、裂殖子表面蛋白2(MSP2)、富谷氨酸蛋白(GLURP)、環子孢子蛋白(CSP)、和/或網織紅細胞結合蛋白(Rh5)。對於包括兩個或更多測試區域的免疫測定，在所有測試線改變顏色(即檢測到所有瘧疾感染指示目標)以及對照線改變顏色時，可評為陽性結果。任何少於所有改變顏色的區域均可被評為陰性結果。添加第二個測試線，或者在一些示例中，添加第三個測試線將增加測定的特異性。這可在臨床上用於複雜的臨床情況，諸如在生活在瘧疾流行地區的人群中存在的。
實施例
實施例1：Etramp 5 ag1 變體的分子和生物化學工程
早期測試示出非特異性結合水準，從而可能導致假陽性結果，從而希望其最小化。Etramp 5 ag1蛋白的多聚化無標籤型式將消除潛在的非特異性結合，並由於由抗原的多聚化導致表位元顯示增加而潛在增加血清學訊號。目的是通過免疫測定(包括側流測定)減少或消除非特異性結合以及改善血清學訊號。
設計並表達了六個構建體。所述構建體包括使用pET/His標籤表達體系的三個變體和使用pGEX/GST標籤表達體系的三個變體。除了內源性質粒衍生的純化標籤之外，每個構建體還被工程化以包含：
1.BirA生物素連接位元點，其已經工程化以鄰近Etramp 5 ag1序列定位，從而允許經表達的蛋白通過生物素連接反應進行連接並允許抗原的多聚化發生。
2.cTPR[X]接頭序列(共有三角形四肽重複序列，其中X是指重複序列數)。使用包含三個(cTPR3)或十二個(cTPR12)重複序列的接頭序列。目的是提供純化標籤(具體地講GST變體)和BirA標籤之間的距離，使得生物素連接反應不受空間位阻阻礙而進行。關注的是作為構建體的較大組成部分的GST潛在地阻止連接酶訪問標籤。
3.最後，還將HRV 3C蛋白酶位元點工程化到構建體中以位於接頭和BirA位點之間。如果需要，這將允許在Etramp 5 ag1蛋白的成功的生物素介導的連接之後，接頭序列和純化標籤被切除。
接頭旨在提供GST和BirA標籤之間的“空間”，從而允許連接酶訪問標籤。
表達構建體：
圖6示出Etramp 5 ag1 His-標記的變體的示意性總結，其突出了工程化組分相對於Etramp 5 ag1序列的位置。灰色區域突出了cTPR3(短)或cTPR12(長)接頭序列。斜體序列表示HRV 3C蛋白酶位點(對於GST-Bir-E5Ag1構建體而言不需要)。粗體區域突出BirA生物素連接位點。帶底線的區域突出了Etramp 5 ag1序列。
圖6行A
His-Bir-E5Ag1
限制性位點-
CATATGGLNDIFEAQKIEWHEQLDMGSVHNNNSVVGNSSSHSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSASSSSSSSSPASSSSSPSSTSDDSKNASLDKIDEELQKKKKNEKL
終止密碼子-TAA
限制性位點-GGATCC
圖6行B
His-cTPR3-HRV-Bir-E5Ag1
限制性位點-CATATG
KLSGGGGSGGGGSGGGGSAEAWYNLGNAYYKQGDYQKAIEYYQKALELDPNNAEAWYNLGNAYYKQGDYQKAIEYYQKALELDPNNAEAWYNLGNAYYKQGDYQKAIEDYQKALELDPNNLQRSAGGGGSGGGGSGGGGASLEVLFQGP
GLNDIFEAQKIEWHEQLDMGSVHNNNSVVGNSSSHSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSASSSSSSSSPASSSSSPSSTSDDSKNASLDKIDEELQKKKKNEKL
終止密碼子-TAA
限制性位點-GGATCC
圖6行C
His-cTPR12-HRV-Bir-E5Ag1
限制性位點-CATATG
KLSGGGGSGGGGSGGGGSAEAWYNLGNAYYKQGDYQKAIEYYQKALELDPNNAEAWYNLGNAYYKQGDYQKAIEYYQKALELDPNNAEAWYNLGNAYYKQGDYQKAIEDYQKALELDPNNLQAEAWKNLGNAYYKQGDYQKAIEYYQKALELDPNNASAWYNLGNAYYKQGDYQKAIEYYQKALELDPNNAKAWYRRGNAYYKQGDYQKAIEDYQKALELDPNNRSAEAWYNLGNAYYKQGDYQKAIEYYQKALELDPNNAEAWYNLGNAYYKQGDYQKAIEYYQKALELDPNNAEAWYNLGNAYYKQGDYQKAIEDYQKALELDPNNLQAEAWKNLGNAYYKQGDYQKAIEYYQKALELDPNNASAWYNLGNAYYKQGDYQKAIEYYQKALELDPNNAKAWYRRGNAYYKQGDYQKAIEDYQKALELDPNNRSAGGGGSGGGGSGGGGASLEVLFQGP
GLNDIFEAQKIEWHEQLDMGSVHNNNSVVGNSSSHSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSASSSSSSSSPASSSSSPSSTSDDSKNASLDKIDEELQKKKKNEKL
終止密碼子-TAA
限制性位點-GGATCC
圖7示出了對Etramp 5 ag1 GST標記的變體的概述，突出了與Etramp 5 ag1序列相關的工程化組分的位置。灰色區域突出了cTPR12接頭序列。斜體序列表示HRV 3C蛋白酶位點(對於GST-Bir-E5Ag1構建體而言不需要)。粗體區域突出了BirA生物素連接位點。帶底線的區域突出了Etramp 5 ag1序列。
圖7行A
GST-Bir-E5Ag1
Restriction site-GAATTC
GLNDIFEAQKIEWHE QLDMGSVHNNNSVVGNSSSHSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSASSSSSSSSPASSSSSPSSTSDDSKNASLDKIDEELQKKKKNEKL
終止密碼子-TAA
限制性位點-GAATTC
圖7行B
GST-cTPR3-HRV-Bir-E5Ag1
限制性位點-GAATTC
KLSGGGGSGGGGSGGGGSAEAWYNLGNAYYKQGDYQKAIEYYQKALELDPNNAEAWYNLGNAYYKQGDYQKAIEYYQKALELDPNNAEAWYNLGNAYYKQGDYQKAIEDYQKALELDPNNLQRSAGGGGSGGGGSGGGGASLEVLFQGP GLNDIFEAQKIEWHEQLDMGSVHNNNSVVGNSSSHSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSASSSSSSSSPASSSSSPSSTSDDSKNASLDKIDEELQKKKKNEKL
終止密碼子-TAA
限制性位點-GTCGAC
圖7行C
GST-cTPR12-HRV-Bir-E5Ag1
限制性位點-GAATTC
KLSGGGGSGGGGSGGGGSAEAWYNLGNAYYKQGDYQKAIEYYQKALELDPNNAEAWYNLGNAYYKQGDYQKAIEYYQKALELDPNNAEAWYNLGNAYYKQGDYQKAIEDYQKALELDPNNLQAEAWKNLGNAYYKQGDYQKAIEYYQKALELDPNNASAWYNLGNAYYKQGDYQKAIEYYQKALELDPNNAKAWYRRGNAYYKQGDYQKAIEDYQKALELDPNNRSAEAWYNLGNAYYKQGDYQKAIEYYQKALELDPNNAEAWYNLGNAYYKQGDYQKAIEYYQKALELDPNNAEAWYNLGNAYYKQGDYQKAIEDYQKALELDPNNLQAEAWKNLGNAYYKQGDYQKAIEYYQKALELDPNNASAWYNLGNAYYKQGDYQKAIEYYQKALELDPNNAKAWYRRGNAYYKQGDYQKAIEDYQKALELDPNNRSAGGGGSGGGGSGGGGASLEVLFQGP GLNDIFEAQKIEWHEQLDMGSVHNNNSVVGNSSSHSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSASSSSSSSSPASSSSSPSSTSDDSKNASLDKIDEELQKKKKNEKL
終止密碼子-TAA
限制性位點-GTCGAC
實施例2：人群中的瘧疾抗原測試結果
圖8示出了在非洲有地方流行性瘧疾的三個測試位點處從15歲以下的多個個體採集的血清瘧疾測定結果的匯總。用Luminex測定測試每個血清樣品中的每種瘧原蟲抗原(參見Helbet等人，Novel Serologic Biomarkers Provide Accurate Estimates of Recent Plasmodium Falciparum Exposure for Individuals and Communities, PNAS doi 10.1073，2015年7月27日線上公佈，其以引用方式併入本文)。每個樣品還通過顯微鏡測試瘧原蟲的存在。當樣品通過顯微鏡對瘧原蟲呈陽性並且對於該抗原測試為陽性時，將每種抗原評定為陽性。X表示在測試為瘧疾陽性的個體中特定抗原相對於其它抗原得分高。
圖9示出了在非洲具有地方流行性瘧疾的測試位點測試的來自所有年齡的多個個體的血清瘧疾測定結果的匯總。測試方案如上文和Helb中所述，出處同上，其以引用方式併入本文。
雖然本文已經公開了各個方面和實施方案，但是其它方面和實施方案對於本領域技術人員而言將是顯而易見的。本文所公開的各個方面和實施方案是出於說明的目的並且不旨在是限制性的，真正的範圍和精神由以下申請專利範圍指示。
300‧‧‧側流測定裝置
310‧‧‧加樣孔
320‧‧‧覆蓋件
330‧‧‧視覺化區域
400‧‧‧樣品墊
410‧‧‧綴合墊
420‧‧‧廢物墊
圖1為免疫測定的示意圖；
圖2為另一免疫測定的示意圖；
圖3為側流實施方案中的免疫測定的俯視示意圖；
圖4為側流實施方案中另一免疫測定的橫向側視示意圖；
圖5為免疫測定的示意圖；
圖6為一組蛋白構建體的示意圖；
圖7為一組蛋白構建體的示意圖；
圖8示出來自群體的瘧疾抗原測試結果；及
圖9示出來自群體的瘧疾抗原測試結果。

Claims (42)

  1. 一種用於近期瘧疾感染的免疫測定裝置，其包括： 鄰近一綴合墊的一第一端定位的一樣品墊，其中所述樣品墊或所述綴合墊的所述第一端包括能夠結合一抗-ETRAMP5抗體的檢測絡合物； 其中所述綴合墊的第二端包括浸漬有一包含ETRAMP5蛋白片段的構建體蛋白的一個或多個區域。
  2. 根據請求項1所述的免疫測定裝置，其中所述抗-ETRAMP5抗體的檢測絡合物包含： 與抗-ETRAMP5抗體絡合的捕集顆粒。
  3. 根據請求項1所述的免疫測定裝置，其中所述抗-ETRAMP5抗體的所述檢測絡合物包含： 與一包括ETRAMP5蛋白片段的絡合分子絡合的捕集顆粒。
  4. 根據請求項3所述的免疫測定裝置，其中所述抗-ETRAMP5抗體的檢測絡合物包含： 與包括彼此串聯連接的多個ETRAMP5蛋白片段的絡合分子絡合的捕集顆粒。
  5. 根據請求項1所述的免疫測定裝置，其中所述抗-ETRAMP5抗體的檢測絡合物包括： 人抗-ETRAMP5抗體的檢測絡合物。
  6. 根據請求項1所述的免疫測定裝置，其中所述抗-ETRAMP5抗體的檢測絡合物包含： 一與包括ETRAMP5蛋白片段的絡合分子絡合的第一捕集顆粒；和 與包括一非ETRAMP5瘧疾免疫應答抗原的絡合分子絡合的第二捕集顆粒。
  7. 根據請求項6所述的免疫測定裝置，其中所述非ETRAMP5瘧疾免疫應答抗原包括下列中的至少一種：碳水化合物結合模組家族2、配子體輸出蛋白、裂殖子表面蛋白1、裂殖子表面蛋白2、富谷氨酸蛋白、環子孢子蛋白、和/或網織紅細胞結合蛋白。
  8. 根據請求項6所述的免疫測定裝置，其中所述包括ETRAMP5蛋白片段的絡合分子包括一系列ETRAMP5蛋白片段。
  9. 根據請求項1所述的免疫測定裝置，其中所述包括ETRAMP5蛋白片段的構建體蛋白包括： 對應於所述ETRAMP5 DNA序列的外顯子1的蛋白。
  10. 根據請求項1所述的免疫測定裝置，其中所述包括ETRAMP5蛋白片段的構建體蛋白包括： 對應於所述ETRAMP5基因組DNA序列的外顯子1的蛋白和來自日本血吸蟲的谷胱甘肽S-轉移酶蛋白。
  11. 根據請求項1所述的免疫測定裝置，其中所述包括ETRAMP5蛋白片段的構建體蛋白包括： 對應於所述ETRAMP5基因組DNA序列的外顯子1的蛋白和人谷胱甘肽S-轉移酶蛋白。
  12. 根據請求項1所述的免疫測定裝置，其中所述包括ETRAMP5蛋白片段的構建體蛋白包括： 對應於所述ETRAMP5基因組DNA序列的外顯子1的蛋白和至少六個組氨酸分子。
  13. 根據請求項1所述的免疫測定裝置，其中所述包括ETRAMP5蛋白片段的構建體蛋白包括： 對應於所述ETRAMP5基因組DNA序列的外顯子1的蛋白和用作標籤分子的標籤蛋白。
  14. 根據請求項1所述的免疫測定裝置，其中所述包括ETRAMP5蛋白片段的構建體蛋白包括： 對應於所述ETRAMP5基因組DNA序列的外顯子1的蛋白和包括碳水化合物結合分子2(CBM2)蛋白的一部分的蛋白。
  15. 根據請求項1所述的免疫測定裝置，其中所述包含ETRAMP5蛋白片段的構建體蛋白從大腸桿菌純化。
  16. 根據請求項1的免疫測定裝置，其中所述包含ETRAMP5蛋白片段的構建體蛋白從哺乳動物細胞純化。
  17. 一種用於近期瘧疾感染的免疫測定裝置，其包括： 鄰近一綴合墊的第一端定位的一樣品墊，其中所述樣品墊或所述綴合墊的第一端包括能夠結合人抗-ETRAMP5抗體的一第一檢測絡合物和能夠結合至一瘧疾免疫應答抗原的一第二檢測絡合物； 其中所述綴合墊的第二端包括一第一區域和一第二區域，所述第一區域包括一與包括ETRAMP5蛋白片段的絡合分子絡合的第一捕集顆粒，所述第二區域包括與包括所述瘧疾免疫應答蛋白的一個或多個片段的絡合分子絡合的第二捕集顆粒。
  18. 根據請求項17所述的免疫測定裝置，其中所述第一或第二檢測絡合物包含： 與抗-IgG抗體絡合的捕集顆粒。
  19. 根據請求項17所述的免疫測定裝置，其中所述第一絡合物包含： 與包括ETRAMP5蛋白片段的絡合分子絡合的捕集顆粒。
  20. 根據請求項17所述的免疫測定裝置，其中所述第二絡合物包含下列中的至少一種：碳水化合物結合模組家族2、配子體輸出蛋白、裂殖子表面蛋白1、裂殖子表面蛋白2、富谷氨酸蛋白、環子孢子蛋白、和/或網織紅細胞結合蛋白。
  21. 根據請求項17所述的免疫測定裝置，其中所述與包括ETRAMP5蛋白片段的絡合分子絡合的第一捕集顆粒包含： 對應於所述ETRAMP5 DNA序列的外顯子1的蛋白。
  22. 根據請求項17所述的免疫測定裝置，其中所述與包括ETRAMP5蛋白片段的絡合分子絡合的第一捕集顆粒包含： 對應於所述ETRAMP5基因組DNA序列的外顯子1的蛋白和來自日本血吸蟲的谷胱甘肽S-轉移酶蛋白。
  23. 根據請求項17所述的免疫測定裝置，其中所述與包括ETRAMP5蛋白片段的絡合分子絡合的第一捕集顆粒包含： 對應於所述ETRAMP5基因組DNA序列的外顯子1的蛋白和人谷胱甘肽S-轉移酶蛋白。
  24. 根據請求項17所述的免疫測定裝置，其中所述與包括ETRAMP5蛋白片段的絡合分子絡合的第一捕集顆粒包含： 對應於所述ETRAMP5基因組DNA序列的外顯子1的蛋白和至少六個組氨酸分子。
  25. 根據請求項17所述的免疫測定裝置，其中所述與包括ETRAMP5蛋白片段的絡合分子絡合的第一捕集顆粒包含： 對應於所述ETRAMP5基因組DNA序列的外顯子1的蛋白和用作標籤分子的標籤蛋白。
  26. 根據請求項17所述的免疫測定裝置，其中所述與包括ETRAMP5蛋白片段的絡合分子絡合的第一捕集顆粒包括對應於所述ETRAMP5基因組DNA序列的外顯子1的蛋白，所述與包括瘧疾免疫應答蛋白的一個或多個片段的絡合分子絡合的第二捕集顆粒包括碳水化合物結合分子2(CBM2)蛋白的片段。
  27. 根據請求項17所述的免疫測定裝置，其中所述與包括瘧疾免疫應答蛋白的一個或多個片段的絡合分子絡合的第二捕集顆粒包括下列中的一種或多種：碳水化合物結合模組家族2、配子體輸出蛋白、裂殖子表面蛋白1、裂殖子表面蛋白2、富谷氨酸蛋白、環子孢子蛋白、和/或網織紅細胞結合蛋白蛋白片段。
  28. 根據請求項17所述的免疫測定裝置，其中所述ETRAMP5蛋白片段和/或所述瘧疾免疫應答蛋白的一個或多個片段中的至少一種從大腸桿菌純化。
  29. 根據請求項17所述的免疫測定裝置，其中所述ETRAMP5蛋白片段和/或所述瘧疾免疫應答蛋白的一個或多個片段中的至少一種從哺乳動物細胞純化。
  30. 一種用於近期瘧疾感染的免疫測定裝置，其包括： 鄰近一綴合墊的一第一端定位的一樣品墊，其中所述樣品墊或所述綴合墊的所述第一端包括能夠結合人抗-ETRAMP5抗體的一第一檢測絡合物和能夠結合至一瘧疾免疫應答抗原的一第二檢測絡合物；以及 與所述綴合墊的第二端接觸的分析膜，所述分析膜包括一第一區域和一第二區域，所述第一區域包括一與包括ETRAMP5蛋白片段的絡合分子絡合的第一捕集顆粒，所述第二區域包括與一包括所述瘧疾免疫應答蛋白的一個或多個片段的絡合分子絡合的第二捕集顆粒。
  31. 根據請求項30所述的免疫測定裝置，其中所述第一或第二檢測絡合物包含： 與抗-IgG抗體絡合的捕集顆粒。
  32. 根據請求項30所述的免疫測定裝置，其中所述第一檢測絡合物包含： 與包括ETRAMP5蛋白片段的絡合分子絡合的捕集顆粒。
  33. 根據請求項30所述的免疫測定裝置，其中所述第二檢測絡合物包含下列中的至少一種：碳水化合物結合模組家族2、配子體輸出蛋白、裂殖子表面蛋白1、裂殖子表面蛋白2、富谷氨酸蛋白、環子孢子蛋白、和/或網織紅細胞結合蛋白。
  34. 根據請求項30所述的免疫測定裝置，其中所述與包括ETRAMP5蛋白片段的絡合分子絡合的第一捕集顆粒包含： 對應於所述ETRAMP5 DNA序列的外顯子1的蛋白。
  35. 根據請求項30所述的免疫測定裝置，其中所述與包括ETRAMP5蛋白片段的絡合分子絡合的第一捕集顆粒包含： 對應於所述ETRAMP5基因組DNA序列的外顯子1的蛋白和來自日本血吸蟲的谷胱甘肽S-轉移酶蛋白。
  36. 根據請求項30所述的免疫測定裝置，其中所述與包括ETRAMP5蛋白片段的絡合分子絡合的第一捕集顆粒包含： 對應於所述ETRAMP5基因組DNA序列的外顯子1的蛋白和人谷胱甘肽S-轉移酶蛋白。
  37. 根據請求項30所述的免疫測定裝置，其中所述與包括ETRAMP5蛋白片段的絡合分子絡合的第一捕集顆粒包含： 對應於所述ETRAMP5基因組DNA序列的外顯子1的蛋白和至少六個組氨酸分子。
  38. 根據請求項30所述的免疫測定裝置，其中所述與包括ETRAMP5蛋白片段的絡合分子絡合的第一捕集顆粒包含： 對應於所述ETRAMP5基因組DNA序列的外顯子1的蛋白和用作標籤分子的標籤蛋白。
  39. 根據請求項30所述的免疫測定裝置，其中所述與包括ETRAMP5蛋白片段的絡合分子絡合的第一捕集顆粒包括對應於所述ETRAMP5基因組DNA序列的外顯子1的蛋白，所述與包括瘧疾免疫應答蛋白的一個或多個片段的絡合分子絡合的第二捕集顆粒包括碳水化合物結合分子2(CBM2)蛋白的片段。
  40. 根據請求項30所述的免疫測定裝置，其中所述與包括瘧疾免疫應答蛋白的一個或多個片段的絡合分子絡合的第二捕集顆粒包含下列中的至少一種：碳水化合物結合模組家族2、配子體輸出蛋白、裂殖子表面蛋白1、裂殖子表面蛋白2、富谷氨酸蛋白、環子孢子蛋白、和/或網織紅細胞結合蛋白蛋白片段。
  41. 根據請求項30的免疫測定裝置，其中所述ETRAMP5蛋白片段和/或所述瘧疾免疫應答蛋白的一個或多個片段中的至少一種從大腸桿菌純化。
  42. 根據請求項30的免疫測定裝置，其中所述ETRAMP5蛋白片段和/或所述瘧疾免疫應答蛋白的一個或多個片段中的至少一種從哺乳動物細胞純化。
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