TW201903149A

TW201903149A - 抑制apcs之表現的核酸

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Publication number: TW201903149A
Application number: TW107118805A
Authority: TW
Inventors: 有山博之; 村上拓也; 今枝隆; 宮澤達也
Original assignee: 日商協和醱酵麒麟有限公司
Priority date: 2017-05-31
Filing date: 2018-05-31
Publication date: 2019-01-16
Also published as: KR20200014320A; EP3633037A1; JPWO2018221649A1; CN110832078A; WO2018221649A1; AU2018277476A1; US20200190514A1; US11466272B2; EP3633037A4; CA3065149A1

Abstract

本發明提供一種抑制APCS基因之表現的雙鏈核酸，其係包含正義鏈核酸及反義鏈核酸且包含至少11個鹼基對之雙鏈區域者，且於上述反義鏈核酸中之至少17個核苷酸且至多30個核苷酸之鏈長之寡核苷酸鏈中，與包含序列編號1288～1930之任一者所表示之鹼基序列之標靶APCS mRNA序列互補。

Description

抑制APCS之表現的核酸

本發明係關於一種抑制APCS(amyloid P component, serum，血清澱粉樣蛋白P成分)之表現的核酸或包含該核酸之醫藥組合物。

APCS(別名亦稱為Serum amyloid P、SAP或者Pentraxin-2)具有由223個胺基酸構成之糖蛋白質之五聚物結構。APCS係於肝臟中產生之蛋白質，於血液中以30～50 μg/mL之相對較高之濃度存在。又，已知APCS具有鈣依存性地鍵結於所有種類之澱粉樣蛋白纖維之生物化學特性，於具有澱粉樣蛋白之患者之澱粉樣蛋白中亦包含20,000 mg之大量之APCS(非專利文獻1)。由於APCS存在於所有澱粉樣蛋白相關疾病患者之澱粉樣蛋白中，故而被用作澱粉樣蛋白相關疾病患者之診斷標記物(非專利文獻2)。

澱粉樣蛋白相關疾病係已知為澱粉樣蛋白纖維之異常不溶性蛋白質纖維沈積於組織而引起器官障礙之疾病。藉由APCS對被蛋白酶分解或被免疫細胞吞噬之耐受性而可使APCS所鍵結之澱粉樣蛋白穩定化變得明確，又，根據使用動物模型之研究以及臨床研究強烈提示藉由抑制APCS對澱粉樣蛋白之鍵結，可減輕澱粉樣蛋白沈積於器官及其所伴隨之組織障礙(非專利文獻3、4)。雖可期待可藉由特異地抑制APCS之表現而預防或治療澱粉樣蛋白相關疾病，但迄今為止尚未報告有特異地抑制APCS之表現之藥品。

作為抑制基因之表現本身之方法，例如已知有利用RNA(Ribonucleic Acid，核糖核酸)干擾(亦稱為RNA interference、RNAi)之方法等。具體而言，發現藉由導入具有與設為標靶之基因相同之序列之雙鏈RNA，可特異地抑制該標靶基因之表現，而被命名為短干擾RNA(siRNA)(專利文獻1)。又，作為RNA干擾以外之抑制基因之表現之方法，已知有反義法(專利文獻2)。

雖揭示有將人之APCS mRNA(Messenger RNA，信使核糖核酸)作為標靶之siRNA序列之一部分，但尚不知該siRNA序列抑制人之APCS之表現(專利文獻3、4)。 [先前技術文獻] [專利文獻]

[專利文獻1]國際公開第2001/75164號 [專利文獻2]國際公開第98/56905號 [專利文獻3]國際公開第2005/116204號 [專利文獻4]國際公開第2008/043561號

[非專利文獻1]Amyloid, 4:4, 274-295 (1997) [非專利文獻2]N Engl J Med. 1990; 323: 508-13 [非專利文獻3]Nature 468: 93-97.(2010) [非專利文獻4]N. Engl. J. Med. 373: 1106-14.(2015)

[發明所欲解決之問題]

本發明之目的在於提供一種可抑制APCS之表現的核酸。 [解決問題之技術手段]

本發明係關於以下之(1)～(13)。 (1)一種抑制APCS基因之表現的雙鏈核酸，其係包含正義鏈核酸及反義鏈核酸且包含至少11個鹼基對之雙鏈區域者，且於上述反義鏈核酸中之至少17個核苷酸且至多30個核苷酸之鏈長之寡核苷酸鏈中，與包含序列編號1288～1930之任一者所表示之鹼基序列之標靶APCS mRNA序列互補。 (2)如(1)之雙鏈核酸，其中上述雙鏈區域為11～27個鹼基對，且上述反義鏈核酸之自5'末端起第2號核苷酸與上述標靶APCS mRNA序列之自3'末端起第2號核苷酸互補。 (3)如(1)或(2)之雙鏈核酸，其中上述正義鏈核酸之3'末端及上述反義鏈核酸之5'末端、及/或上述正義鏈核酸之5'末端及上述反義鏈核酸之3'末端形成平滑末端。 (4)如(1)至(3)中任一項之雙鏈核酸，其中上述正義鏈核酸具有21個核苷酸之鏈長，且上述反義鏈核酸具有21個核苷酸之鏈長。 (5)如(4)之雙鏈核酸，其包含19個鹼基對之雙鏈區域，且該雙鏈區域內之40～65%之核苷酸為2'-O-甲基修飾核苷酸。 (6)如(1)至(5)中任一項之雙鏈核酸，其中上述反義鏈核酸包含序列編號645～1287及1975～2018之任一者所表示之鹼基序列。 (7)如(1)至(6)中任一項之雙鏈核酸，其中上述正義鏈核酸包含序列編號2～644及1931～1974之任一者所表示之鹼基序列。 (8)如(1)至(7)中任一項之雙鏈核酸，其中上述正義鏈核酸包含序列編號2～644及1931～1974之任一者所表示之鹼基序列，與之對應，上述反義鏈核酸包含序列編號645～1287及1975～2018之任一者所表示之鹼基序列。 (9)如(1)至(8)中任一項之雙鏈核酸，其包含配位基。 (10)一種單鏈核酸，其僅包含如(1)至(9)中任一項之雙鏈核酸之反義鏈核酸。 (11)一種醫藥組合物，其包含如(1)至(10)中任一項之核酸。 (12)一種治療以包含APCS之澱粉樣蛋白纖維為媒介之障礙之方法，其包括將治療上有效量之如(1)至(10)中任一項之核酸或如(11)之醫藥組合物投予至需要此種治療之人之步驟。 (13)如(12)之方法，其中上述障礙係澱粉樣蛋白相關疾病。 [發明之效果]

根據本發明，可提供一種能夠抑制APCS之表現的核酸。

於本發明中，設為核酸之標靶之APCS mRNA係具有與作為Genbank Accession No.NM_001639.3而登錄之序列編號1同源且序列編號1中之T改稱為U之鹼基序列之APCS之全長mRNA。於將mRNA之互補DNA(Deoxyribonucleic acid，脫氧核糖核酸)定義為第一鏈cDNA(complementary DNA，互補脫氧核糖核酸)、將由此製成雙鏈時所合成之DNA定義為第二鏈cDNA之情形時，序列編號1表示APCS第二鏈cDNA之鹼基序列。此處，APCS mRNA之鹼基序列與APCS第二鏈cDNA之鹼基序列處於同源之關係。

1.本發明之核酸於本發明中，將包含相對於APCS mRNA序列互補之鹼基序列之核酸稱為反義鏈核酸，將包含相對於反義鏈核酸之鹼基序列互補之鹼基序列之核酸稱為正義鏈核酸。於本說明書中，於稱為「本發明之核酸」之情形時，只要未特別說明，則係以包含反義鏈核酸或正義鏈核酸之單鏈核酸、以及反義鏈核酸及正義鏈核酸形成對之雙鏈核酸之含義使用。

作為本發明之核酸，只要為核苷酸或具有與該核苷酸同等功能之分子聚合而成之分子，則可為任何分子，例如可列舉：作為核糖核苷酸之聚合物之RNA、作為脫氧核糖核苷酸之聚合物之DNA、作為核糖核苷酸與脫氧核糖核苷酸之聚合物之嵌合核酸、以及該等核酸(RNA、DNA、及嵌合核酸)之至少一個核苷酸被具有與該核苷酸同等功能之分子置換之核苷酸聚合物。RNA中之尿嘧啶(U)於DNA中單一化地改稱為胸腺嘧啶(T)。

作為具有與核苷酸同等功能之分子，例如可列舉對核苷酸實施有修飾之核苷酸衍生物等。藉由使用核苷酸衍生物，雖並無特別限定，但例如與RNA或DNA相比，具有可使核酸酶耐受性提高或者穩定化、可提高與互補鏈核酸之親和性、可提高細胞透過性、及/或可見化等優勢。

作為核苷酸衍生物，例如可列舉糖部修飾核苷酸、磷酸二酯鍵修飾核苷酸、鹼基修飾核苷酸、以及糖部、磷酸二酯鍵、及鹼基之2個以上被同時修飾之核苷酸等。

作為糖部修飾核苷酸，只要為針對核苷酸之糖之化學結構之一部分或全部，以任意之取代基修飾或取代而成者或者以任意之原子取代而成者，則可為任何糖部修飾核苷酸，可較佳地使用2'-修飾核苷酸。

作為2'-修飾核苷酸，例如可列舉核糖之2'-OH基被選自由OR、R、R'OR、SH、SR、NH₂ 、NHR、NR₂ 、N₃ 、CN、F、Cl、Br、及I所組成之群(R為烷基或芳基，較佳為碳數1～6之烷基，R'為伸烷基，較佳為碳數1～6之伸烷基，NR₂ 之2個R可相同，亦可不同)中之取代基取代而成之2'-修飾核苷酸。作為2'-修飾核苷酸，可較佳地使用核糖之2'-OH基被F或甲氧基取代而成之2'-修飾核苷酸(亦分別稱為2'-F修飾核苷酸或2'-O-甲基修飾核苷酸)。作為2'-修飾核苷酸，亦可列舉核糖之2'-OH基被選自由2-(甲氧基)乙氧基、3-胺基丙氧基、2-[(N,N-二甲胺基)氧基]乙氧基、3-(N,N-二甲胺基)丙氧基、2-[2-(N,N-二甲胺基)乙氧基]乙氧基、2-(甲基胺基)-2-氧代乙氧基、2-(N-甲基胺甲醯基)乙氧基、及2-氰基乙氧基所組成之群中之取代基取代而成之2'-修飾核苷酸等。

作為糖部修飾核苷酸，可列舉藉由於糖部導入交聯結構而具有2個環狀結構之交聯結構型人工核酸(Bridged Nucleic Acid)(BNA)，具體而言，可列舉：2'位之氧原子與4'位之碳原子經由亞甲基交聯而成之鎖人工核酸(Locked Nucleic Acid)(LNA)[Tetrahedron Letters, 38, 8735, (1997)及Tetrahedron, 54, 3607, (1998)]、乙烯交聯結構型人工核酸(Ethylene bridged nucleic acid)(ENA)[Nucleic Acid Research, 32, e175 (2004)]、限制性乙基(cEt)[The Journal of Organic Chemistry 75, 1569 (2010)]、醯胺基交聯結構型人工核酸(AmNA)[Chem Bio Chem 13, 2513 (2012)]、及2'-O,4'-c-螺環伸丙基交聯結構型人工核酸(scpBNA)[Chem. Commun., 51, 9737 (2015)]等。作為糖部修飾核苷酸，亦可列舉：肽核酸(PNA)[Acc. Chem. Res., 32, 624 (1999)]、氧-肽核酸(OPNA)[J. Am. Chem. Soc., 123, 4653 (2001)]、及肽核糖核酸(PRNA)[J. Am. Chem. Soc., 122, 6900 (2000)]等。

作為磷酸二酯鍵修飾核苷酸，只要為針對核苷酸之磷酸二酯鍵之化學結構之一部分或全部，以任意之取代基修飾或取代而成者或者以任意之原子取代而成者，則可為任何磷酸二酯鍵修飾核苷酸。作為磷酸二酯鍵修飾核苷酸，例如可列舉：磷酸二酯鍵被取代為硫代磷酸酯鍵之核苷酸、磷酸二酯鍵被取代為二硫代磷酸酯鍵之核苷酸、磷酸二酯鍵被取代為磷酸烷基酯鍵之核苷酸、及磷酸二酯鍵被取代為胺基磷酸酯鍵之核苷酸等。

作為鹼基修飾核苷酸，只要為針對核苷酸之鹼基之化學結構之一部分或全部，以任意之取代基修飾或取代而成者或者以任意之原子取代而成者，則可為任何鹼基修飾核苷酸。作為鹼基修飾核苷酸，例如可列舉：鹼基內之氧原子被硫原子取代而成之核苷酸、鹼基內之氫原子被碳數1～6之烷基、鹵素等取代而成者、甲基被氫、羥甲基、碳數2～6之烷基等取代而成者、胺基被碳數1～6之烷基、碳數1～6之烷醯基、側氧基、羥基等取代而成者。再者，將5-甲基胞嘧啶(5-mC)代替胞嘧啶(C)用作鹼基修飾核苷酸亦為本發明之較佳之形態之一。

作為進一步之核苷酸衍生物，可列舉將配位基、膽固醇、脂肪酸、生育酚、類視黃素等脂質類、N-乙醯半乳胺糖(GalNAc)、半乳糖(Gal)、甘露糖(Man)等糖類、完整抗體、Fab、scFv、VHH等片段抗體、低密度脂蛋白質(LDL)、人血清白蛋白等蛋白質、RGD、NGR、R9、CPP等肽類、啡、啡啶、蒽醌、葉酸等低分子、合成聚胺基酸等合成聚合物、核酸適體、吖啶、螢光素、若丹明、香豆素等色素、Cy3系列、Alexa系列(註冊商標)、Black Hole Quencher等螢光團等其他化學物質直接或經由連接基附加於核苷酸或上述核苷酸衍生物而成者。具體而言，可列舉聚胺附加核苷酸衍生物、膽固醇附加核苷酸衍生物、類固醇附加核苷酸衍生物、GalNAc附加核苷酸衍生物、膽汁酸附加核苷酸衍生物、脂肪酸附加核苷酸衍生物、維生素附加核苷酸衍生物、Cy5附加核苷酸衍生物、Cy3附加核苷酸衍生物、6-FAM附加核苷酸衍生物及生物素附加核苷酸衍生物等，可較佳地列舉GalNAc附加核苷酸衍生物。該等可於固相上之伸長反應時，藉由使可於固相上反應之修飾劑反應，而對5'末端及/或3'末端、及/或序列內部實施修飾。又，亦可藉由預先合成導入有胺基、巰基、疊氮基或三鍵等官能基之核酸及進行純化，並使修飾劑作用於其等而獲得。核苷酸衍生物亦可與核酸內之其他核苷酸或核苷酸衍生物形成伸烷基結構、肽結構、核苷酸結構、醚結構、及酯結構、以及將該等之至少2個組合而成之結構等交聯結構。

本發明之核酸亦包含核酸之分子中之一部分或全部原子被質量數不同之原子(同位素)取代而成者。

於本說明書中，所謂「互補」，意指可於2個鹼基間進行鹼基配對之關係，例如係指如腺嘌呤與胸腺嘧啶或尿嘧啶之關係、及鳥嘌呤與胞嘧啶之關係般經由平緩之氫鍵，就雙鏈區域整體而言取得雙螺旋結構者。於腺嘌呤與胸腺嘧啶或尿嘧啶之關係、及鳥嘌呤與胞嘧啶之關係中，於A、T(U)、G、C之各鹼基為其中一者或兩者經修飾之鹼基之情形時，當可於2個鹼基間經由平緩之氫鍵進行鹼基配對時，該等鹼基彼此之關係亦可稱為互補。

於本說明書中，所謂「互補」，不僅意指2個核苷酸序列完全互補之情形，亦意指於該2個核苷酸序列間可具有0～30%、較佳為0～20%、更佳為0～10%之失配鹼基，例如相對於APCS mRNA序列互補之反義鏈核酸包含與該mRNA之部分鹼基序列完全互補之鹼基序列或包含於完全互補之鹼基序列中可包含1個或複數個鹼基之置換之鹼基序列。反義鏈核酸相對於標靶基因之標靶序列可具有1～8個、較佳為1～6個、更佳為1～4個、進而較佳為1～3個、尤佳為1～2個、尤其更佳為1個失配鹼基。具體而言，於反義鏈核酸為21個核苷酸之鏈長(21鹼基長)之情形時，相對於標靶基因之標靶核苷酸序列可具有1～6個、較佳為1～5個、更佳為1～4個、進而較佳為1～3個、尤佳為1～2個、尤其更佳為1個失配鹼基，該失配之位置可為各個反義鏈中之核苷酸序列之5'末端或3'末端。於本說明書中，所謂「互補」，包含於一核苷酸序列與另一核苷酸序列完全互補之鹼基序列中1個或複數個鹼基附加及/或缺失之序列之情形。例如，本發明中之反義鏈核酸可藉由相對於APCS mRNA序列完全互補之鹼基序列中之鹼基之附加，而於標靶APCS mRNA序列中具有1個或2個突出鹼基。於本發明中，於反義鏈核酸或正義鏈核酸中可具有1個或2個突出鹼基。

於本發明中，所謂「突出鹼基」，係指未與另一核苷酸序列形成互補鹼基對之鹼基。

作為本發明之反義鏈核酸，使用包含相對於標靶APCS mRNA序列完全互補之鹼基序列之核酸，亦可使用該核酸中之1～3個鹼基、較佳為1～2個鹼基、更佳為1個鹼基缺失、置換或附加而成者。

作為抑制APCS之表現的核酸，可較佳地使用作為包含相對於標靶APCS mRNA序列互補之鹼基序列之核酸(反義鏈核酸)之單鏈核酸或包括包含相對於標靶APCS mRNA序列互補之鹼基序列之核酸(反義鏈核酸)及包含相對於該核酸之鹼基序列互補之鹼基序列之核酸(正義鏈核酸)的雙鏈核酸。於本發明中，可藉由反義鏈核酸抑制APCS基因之表現。

本發明之雙鏈核酸係一種抑制APCS基因之表現的雙鏈核酸，其係包含正義鏈核酸及反義鏈核酸且包含至少11個鹼基對之雙鏈區域者，且於該反義鏈核酸中之至少17個核苷酸且至多30個核苷酸之鏈長之寡核苷酸鏈中，與包含序列編號1288～1930之任一者所表示之鹼基序列之標靶APCS mRNA序列互補。序列編號1288～1930之任一者所表示之鹼基序列記載於表1。於本發明之雙鏈核酸中，正義鏈核酸及反義鏈核酸可由任一核苷酸或核苷酸衍生物構成。

作為本發明之雙鏈核酸中之反義鏈核酸，使用包含相對於標靶APCS mRNA序列互補之鹼基序列之核苷酸鏈。標靶APCS mRNA序列與序列編號1同源，包含序列編號1中之T改稱為U之APCS mRNA之鹼基序列中由序列編號1288～1930之任一者所表示之鹼基序列。較佳為標靶APCS mRNA序列與序列編號1同源，係序列編號1中之T改稱為U之APCS mRNA之鹼基序列中由序列編號1288～1930之任一者所表示之鹼基序列。構成本發明之雙鏈核酸中之反義鏈核酸之核苷酸中之至少17個核苷酸且至多30個核苷酸之鏈長之寡核苷酸鏈與標靶APCS mRNA序列互補。於本發明中，於構成反義鏈核酸之核苷酸中之較佳為11～27個核苷酸、更佳為15～25個核苷酸、進而較佳為15～23個核苷酸、尤佳為17～21個核苷酸、尤其更佳為17～19個核苷酸、尤其進而較佳為19個核苷酸之鏈長之寡核苷酸鏈中，與標靶APCS mRNA序列互補。

於本發明中，反義鏈核酸與正義鏈核酸包含至少11個鹼基對之雙鏈區域，雙鏈區域通常為11～30個核苷酸、較佳為11～27個鹼基對，更佳為15～25個鹼基對，進而較佳為15～23個鹼基對，尤佳為17～21個鹼基對，尤其更佳為17～19個鹼基對，尤其進而較佳為19鹼基對。

於本發明中，較佳為相對於雙鏈區域內之核苷酸包含2'-修飾核苷酸，且可包含於任一部位。又，作為較佳之2'-修飾核苷酸之含量，相對於核苷酸之總量(100%)，可為10～20%，亦可為20～40%，亦可為40～65%。作為包含2'-修飾核苷酸之雙鏈核酸，具體而言，例如可列舉包含選自由表3所記載之正義鏈/反義鏈所組成之群中之1對正義鏈/反義鏈之序列之雙鏈核酸。於本發明中，相對於正義鏈核酸之核苷酸，作為較佳之2'-修飾核苷酸之含量，可為20～40%，亦可為40～60%，亦可為60%～100%。於本發明中，相對於反義鏈核酸之核苷酸，作為較佳之2'-修飾核苷酸之含量，可為0～40%，亦可為10～20%，亦可為20～40%。

構成雙鏈核酸之單鏈之反義鏈核酸及正義鏈核酸分別通常包含17～30個鹼基，較佳為包含17～27個鹼基，更佳為包含17～25個鹼基，進而較佳為包含17～25個鹼基，尤佳為包含19～25個鹼基。反義鏈核酸與正義鏈核酸之鹼基長可相同亦可不同。

於本發明中，反義鏈核酸較佳為包含序列編號645～1287及1975～2018之任一者所表示之鹼基序列，正義鏈核酸較佳為包含序列編號2～644及1931～1974之任一者所表示之鹼基序列。於本發明中，反義鏈核酸更佳為具有序列編號645～1287及1975～2018之任一者所表示之鹼基序列之核苷酸鏈，正義鏈核酸更佳為具有序列編號2～644及1931～1974之任一者所表示之鹼基序列之核苷酸鏈。本發明之雙鏈核酸較佳為正義鏈核酸包含序列編號2～644及1931～1974之任一者所表示之鹼基序列，與之對應，反義鏈核酸包含序列編號645～1287及1975～2018之任一者所表示之鹼基序列。於本說明書中，所謂與之對應，意指於表1或表3中作為雙鏈核酸編號而記載之橫一行之欄中之正義鏈核酸與反義鏈核酸之組合，與序列編號n(n＝2～644)對應之序列編號成為n＋643。若具體地例示並進行說明，則與序列編號2對應之序列編號為645。本發明之雙鏈核酸更佳為正義鏈核酸係具有序列編號2～644及1931～1974之任一者所表示之鹼基序列之核苷酸鏈，與之對應，反義鏈核酸係具有序列編號645～1287及1975～2018之任一者所表示之鹼基序列之核苷酸鏈。

於本發明之雙鏈核酸中，於繼雙鏈區域之後之3'末端側或5'末端側具有未形成雙鏈之追加之核苷酸或核苷酸衍生物之情形時，將該未形成雙鏈之核苷酸或核苷酸衍生物稱為突出部(overhang)。於具有突出部之情形時，構成突出部之核苷酸可為核糖核苷酸、脫氧核糖核苷酸或該等之衍生物。

作為具有突出部之雙鏈核酸，使用於正義鏈核酸及反義鏈核酸之至少一核酸之3'末端或5'末端具有通常包含1～6個鹼基、較佳為1～3個鹼基之突出部者，可更佳地使用具有包含2個鹼基之突出部者，例如可列舉具有包含dTdT(dT表示胸苷)或UU之突出部者。可僅於反義鏈核酸、僅於正義鏈核酸、及於反義鏈核酸與正義鏈核酸之兩者具有突出部。又，於僅於反義鏈核酸具有突出部之情形、僅於正義鏈核酸具有突出部之情形、及於反義鏈核酸與正義鏈核酸之兩者具有突出部之情形之任一情形時，均可於核酸之3'末端及/或5'末端具有突出部。

本發明中所使用之反義鏈核酸較佳為於包含與正義鏈核酸之雙鏈區域及繼該雙鏈區域之後之突出部之包含至少17個核苷酸且至多30個核苷酸之寡核苷酸鏈中，與包含序列編號1288～1930之任一者所表示之鹼基序列之標靶APCS mRNA序列充分地互補。作為本發明之雙鏈核酸，例如亦可使用藉由Dicer等核糖核酸酶之作用生成上述雙鏈核酸之核酸分子(WO2005/089287)或不具有3'末端或5'末端之突出部而形成平滑末端之雙鏈核酸、僅正義鏈核酸突出之雙鏈核酸(US2012/0040459)等。於本發明中，所謂「平滑末端」，係指於雙鏈核酸之末端不具有突出部。作為平滑末端，例如有於正義鏈核酸之3'末端及反義鏈核酸之5'末端之兩者、及/或正義鏈核酸之5'末端及反義鏈核酸之3'末端之兩者不具有突出部之雙鏈核酸。

於本發明中，較佳為正義鏈核酸之3'末端及反義鏈核酸之5'末端、及/或正義鏈核酸之5'末端及反義鏈核酸之3'末端形成平滑末端。尤其更佳為正義鏈核酸之3'末端及反義鏈核酸之5'末端、或正義鏈核酸之5'末端及反義鏈核酸之3'末端形成平滑末端。於正義鏈核酸之3'末端及反義鏈核酸之5'末端、及/或正義鏈核酸之5'末端及反義鏈核酸之3'末端形成平滑末端之情形時，較佳為正義鏈核酸具有21個核苷酸之鏈長，且反義鏈核酸具有23個核苷酸之鏈長。

於本發明中，亦較佳為於反義鏈核酸與正義鏈核酸之兩者具有突出部之雙鏈核酸。較佳為正義鏈核酸之3'末端及反義鏈核酸之3'末端或正義鏈核酸之5'末端及反義鏈核酸之5'末端具有突出部。於在反義鏈核酸與正義鏈核酸之兩者具有突出部之情形時，較佳為正義鏈核酸具有21個核苷酸之鏈長，且反義鏈核酸具有21個核苷酸之鏈長。

於本發明中，亦更佳為正義鏈核酸之3'末端及5'末端之兩者或上述反義鏈核酸之3'末端及5'末端之兩者具有突出部。

較佳為本發明之反義鏈核酸之自5'末端起第2號核苷酸與標靶APCS mRNA序列之自3'末端起第2號核糖核苷酸完全互補，更佳為反義鏈核酸之自5'末端起第2～7號核糖核苷酸分別與標靶APCS mRNA序列之自3'末端起第2～7號核糖核苷酸完全互補，進而較佳為反義鏈核酸之自5'末端起第2～11號核糖核苷酸分別與標靶APCS mRNA序列之自3'末端起第2～11號核糖核苷酸完全互補。較佳為本發明中之反義鏈核酸之自5'末端起第11號核苷酸與標靶APCS mRNA序列之自3'末端起第11號核糖核苷酸完全互補，更佳為反義鏈核酸之自5'末端起第9～13號核糖核苷酸分別與標靶APCS mRNA序列之自3'末端起第9～13號核糖核苷酸完全互補，進而較佳為反義鏈核酸之自5'末端起第7～15號核糖核苷酸分別與標靶APCS mRNA序列之自3'末端起第7～15號核糖核苷酸完全互補。

作為製造本發明之核酸之方法，並無特別限定，可列舉使用公知之化學合成之方法或酶轉錄法等。作為使用公知之化學合成之方法，可列舉亞磷醯胺法、硫代磷酸酯法、磷酸三酯法、及CEM(Ca²⁺ enrichment medium，Ca²⁺ 富集培養)法[Nucleic Acid Research, 35, 3287 (2007)]等，例如可藉由ABI3900高產量核酸合成機(Applied Biosystems公司製造)合成本發明之核酸。於合成結束之後，進行自固相之脫離、保護基之脫保護、及目標物之純化等。較理想為藉由純化獲得純度90%以上、較佳為95%以上之核酸。於雙鏈核酸之情形時，將合成及純化之正義鏈核酸及反義鏈核酸以適當之比率、例如相對於反義鏈核酸1當量而正義鏈核酸為0.1～10當量、較佳為0.5～2當量、更佳為0.9～1.1當量、進而較佳為等莫耳量進行混合後，通常對混合而成者進行退火，亦可省略退火步驟而直接使用混合而成者。關於退火，只要為可形成雙鏈核酸之條件，則可於任何條件下進行，通常係藉由將反義鏈核酸及正義鏈核酸以大致等莫耳量進行混合後，於94℃左右下加熱5分鐘左右後，緩冷至室溫而進行。作為酶轉錄法，可列舉藉由將具有目標鹼基序列之質體或DNA作為模板並使用噬菌體RNA聚合酶、例如T7、T3或SP6RNA聚合酶之轉錄之方法。

本發明之核酸可使用轉染用之載體、較佳為陽離子性脂質體等陽離子性載體導入至細胞內。又，亦可藉由磷酸鈣法、電穿孔法或顯微注射法等直接導入至細胞內。

本發明之核酸亦可包含配位基。本發明之核酸可於5'末端及/或3'末端及/或於序列內部經1個或複數個配位基或螢光團修飾，亦將經配位基或螢光團修飾後之核酸稱為複合核酸。於固相上之擴展反應時，可藉由使可於固相上反應之修飾劑反應，而對5'末端及/或3'末端、及/或序列內部實施修飾。又，亦可藉由預先合成導入有胺基、巰基、疊氮基或三鍵等官能基之核酸及進行純化，並使修飾化劑作用於該等官能基而獲得複合核酸。作為配位基，只要為與活體分子具有親和性之分子即可，例如可列舉膽固醇、脂肪酸、生育酚、及類視黃素等脂質類、N-乙醯半乳胺糖(GalNAc)、半乳糖(Gal)、及甘露糖(Man)等糖類、完整抗體、scFV、Fab、及VHH等片段抗體、低密度脂蛋白質(LDL)及人血清白蛋白等蛋白質、RGD、NGR、R9、及CPP等肽類、葉酸等低分子、合成聚胺基酸等合成聚合物、以及核酸適體等，亦可將該等組合使用。作為螢光團，可列舉Cy3系列、Alexa(註冊商標)系列、及Black Hole Quencher(註冊商標)等。作為對本發明之核酸附加配位基之方法，例如於固相上之擴張反應時，可藉由使可於固相上反應之修飾劑反應，而對5'末端、3'末端及/或序列內部實施修飾，但並不限定於此。又，亦可藉由預先合成導入有胺基、巰基、疊氮基或三鍵等官能基之核酸及進行純化，並使修飾劑作用於其等而獲得。

亦可使用如導入至細胞內並使該等表現之載體代替本發明之核酸。具體而言，將編碼本發明之核酸之序列插入至表現載體內之啟動子下游而構建表現載體，並導入至細胞中，藉此使該核酸等表現。作為表現載體，可列舉pcDNA6.2-GW/miR(Invitrogen公司製造)、pSilencer 4.1-CMV(Ambion公司製造)、pSINsi-hH1 DNA(Takara Bio公司製造)、pSINsi-hU6 DNA(Takara Bio公司製造)、及pENTR/U6(Invitrogen公司製造)等。由於在細胞內本發明之核酸表現，因此使用該載體包含於本發明之核酸之技術範圍內。

亦可使用將編碼本發明之核酸之序列插入至病毒載體內之啟動子下游，並將該載體導入至包裝細胞中而生產之重組病毒載體。作為病毒載體，可列舉反轉錄病毒載體、慢病毒載體、腺病毒載體、及腺相關病毒載體等。

2.具有APCS之表現抑制活性之核酸本發明中之反義鏈核酸及正義鏈核酸例如可基於以基因庫登錄號No.NM_001639.3登錄之人APCS之全長mRNA之APCS第二鏈cDNA之鹼基序列(序列編號1)進行設計。再者，藉由將人之APCS之全長mRNA之cDNA之鹼基序列與人以外之生物種之APCS之全長mRNA之cDNA之鹼基序列進行比較，亦可設計於人以外之生物種中抑制APCS mRNA之表現之反義鏈核酸及正義鏈核酸。

作為具有APCS之表現抑制活性之核酸，可列舉如下雙鏈核酸，其包括包含相對於APCS mRNA序列互補之鹼基序列之本發明之反義鏈核酸及包含相對於該反義鏈核酸之鹼基序列互補之鹼基序列之本發明之正義鏈核酸，且具有APCS之表現抑制活性。

藉由將本發明之雙鏈核酸導入至細胞，可抑制APCS之表現。例如本發明之雙鏈核酸可於以數pM～數nM之濃度導入至細胞後培養24小時以上、例如48小時之階段抑制APCS之mRNA之表現。

本發明之雙鏈核酸之APCS之mRNA之表現抑制活性之評價可藉由使用陽離子性脂質體等將該核酸等轉染至人細胞株等並培養固定時間後，對該人細胞株中之APCS之mRNA之表現量進行定量而進行。

本發明之雙鏈核酸之APCS mRNA之表現抑制活性之評價可藉由使用陽離子性脂質體等將該核酸等轉染至人細胞株等並培養固定時間後，對該人細胞株中之APCS之mRNA之表現量進行定量而進行。

作為具有APCS之表現抑制活性之核酸，除上述雙鏈核酸以外，亦可列舉包含相對於APCS mRNA之一部分鹼基序列互補之鹼基序列且抑制APCS之表現之單鏈核酸。該單鏈核酸通常包含8～30個鹼基，較佳為包含12～30個鹼基，更佳為包含12～20個鹼基。又，作為該單鏈核酸，例如可列舉作為本發明之雙鏈核酸中之反義鏈核酸之單鏈核酸。

作為單鏈核酸之本發明中之反義鏈核酸亦可藉由導入至細胞中而抑制APCS之表現。例如本發明之單鏈核酸可於以數pM～數μM之濃度導入至細胞後培養24小時以上、例如48小時之階段抑制APCS之mRNA之表現。

本發明之反義鏈核酸之APCS之mRNA之表現抑制活性之評價可藉由使用陽離子性脂質體等將該核酸等轉染至人細胞株等並培養固定時間後，對該人細胞株中之APCS之mRNA之表現量進行定量而進行。

3.本發明之醫藥組合物本發明亦關於一種含有本發明之雙鏈核酸及單鏈核酸等核酸作為有效成分之醫藥組合物。本發明之醫藥組合物可用作澱粉樣蛋白相關疾病之治療劑或預防劑。又，於本發明中，亦提供一種治療以包含APCS之澱粉樣蛋白纖維為媒介之障礙之方法。於該治療方法中，可藉由將本發明之核酸或本發明之醫藥組合物投予至需要此種治療之人，而治療以包含APCS之澱粉樣蛋白纖維為媒介之障礙。作為以包含APCS之澱粉樣蛋白纖維為媒介之障礙，例如可列舉澱粉樣蛋白相關疾病。本發明之雙鏈核酸亦可單獨用於治療方法，如以下所示，可藉由作為本發明之醫藥組合物中之有效成分投予至人而發揮藥效。

本發明之醫藥組合物可進而包含對於使本發明之核酸轉移至細胞內有效之載體。作為對於使核酸轉移至細胞內有效之載體，例如可列舉陽離子性載體。作為陽離子性載體，可列舉陽離子性脂質體及陽離子性聚合物等。又，作為對於使核酸轉移至細胞內有效之載體，亦可使用利用病毒包膜之載體。作為陽離子性聚合物，例如可列舉JetSI(Qbiogene公司)及Jet-PEI(聚伸乙基亞胺；Qbiogene公司)等。作為利用病毒包膜之載體，例如可列舉GenomeOne(HVJ-E脂質體；石原產業公司)等。

包含本發明之核酸與上述載體之醫藥組合物可藉由業者已知之方法製備。例如，可將適當濃度之載體分散液與核酸溶液進行混合而製備本發明之醫藥組合物。於使用陽離子性載體之情形時，由於核酸通常於水溶液中帶負電荷，故而藉由利用常規方法於水溶液中進行混合，可容易地製備本發明之醫藥組合物。作為用於製備醫藥組合物之水性溶劑，可列舉注射用水、注射用蒸餾水、生理食鹽水等電解質液、以及葡萄糖液及麥芽糖液等糖液等。又，製備本發明之醫藥組合物時之pH值及溫度等條件可由業者適當選擇。醫藥組合物亦可視需要使用超音波分散裝置或高壓乳化裝置等進行分散處理而製成均勻之組合物。由於最適合製備包含本發明之核酸與載體之醫藥組合物之方法及條件依存於所使用之載體，故而並不侷限於上述方法，業者可選擇最適合所使用之載體之方法。

又，作為本發明之醫藥組合物，例如亦可較佳地使用將核酸與引導粒子作為構成成分之複合粒子及由複合粒子及視需要被覆該複合粒子之脂質膜構成之組合物。作為引導粒子，例如可列舉脂質集合體、脂質體、乳膠粒子、高分子、金屬膠體、及微粒子製劑等，較佳為使用脂質體，更佳為使用陽離子性脂質體。本發明中之引導粒子可將使脂質集合體、脂質體、乳膠粒子、高分子、金屬膠體、及微粒子製劑等中之2種以上組合而成之複合體作為構成成分，亦可將使脂質集合體、脂質體、乳膠粒子、高分子、金屬膠體、及/或微粒子製劑等與其他化合物(例如糖、脂質、及無機化合物等)組合而成之複合體作為構成成分。作為被覆該複合粒子之脂質膜，例如可列舉將非陽離子性脂質、阻止粒子之凝集之脂質、及陽離子性脂質等作為構成成分者。本發明之醫藥組合物例如可依據國際公開第2006/080118號等所記載之方法製備。

本發明之醫藥組合物中所包含之核酸與載體之調配比通常宜為相對於核酸1質量份，載體為1～200重量份。該調配比相對於核酸1質量份，較佳為載體為2.5～100質量份，更佳為載體為7～25質量份。

構成本發明之醫藥組合物之粒子之大小較佳為平均粒徑為約10 nm～300 nm，更佳為為約30 nm～200 nm，進而較佳為為約50 nm～150 nm。

於本發明之醫藥組合物中，除上述載體以外，亦可包含醫藥上可容許之載體或稀釋劑等。醫藥上可容許之載體或稀釋劑等係本質上為化學惰性及無毒之化合物(包含作為組合物之情形)，不會對本發明之醫藥組合物之生物學活性造成影響。作為醫藥上可容許之載體或稀釋劑，例如有鹽溶液、糖溶液、甘油溶液、及乙醇等，但並不限定於該等。

本發明之醫藥組合物包含對於疾病之治療或預防有效之量之核酸，且係以可適當投予至患者之形態提供。本發明之醫藥組合物之製劑形態例如可為注射劑、滴眼劑、及吸入用等之液劑以及例如軟膏及洗液劑等外用劑等。

於液劑之情形時，作為本發明之醫藥組合物中之有效成分之本發明之核酸之濃度範圍通常為0.001～25%(w/v)，較佳為0.1～10%(w/v)，更佳為0.5～5%(w/v)。本發明之醫藥組合物亦可含有適當量之醫藥上容許之任意之添加劑、例如乳化輔助劑、穩定劑、等張劑、及/或pH值調整劑等。醫藥上容許之任意之添加劑可於該複合體之分散前或分散後以適當之步驟添加。液劑之pH值通常調整為約5.0～約8.5，較佳為約6.0～約8.0。液劑較佳為進行使用膜濾器等之過濾滅菌等滅菌處理。

本發明之醫藥組合物亦可製備成冷凍乾燥製劑。冷凍乾燥製劑可藉由對核酸與載體進行分散處理後進行冷凍乾燥處理而製備。冷凍乾燥處理可藉由常規方法進行。例如，可將上述分散處理後之複合體溶液於無菌狀態下將特定量分注至小玻璃瓶中，於約-40～-20℃之條件下進行約2小時左右之預乾燥，於約0～10℃下並於減壓下進行一次乾燥，繼而，於約15～25℃下並於減壓下進行二次乾燥而進行冷凍乾燥。並且，例如可藉由對小玻璃瓶內部進行氮氣置換並栓緊而獲得本發明之醫藥組合物之冷凍乾燥製劑。

冷凍乾燥製劑可藉由添加任意適當之溶液進行再溶解而使用。作為此種溶液，例如可列舉注射用水、生理食鹽水等電解質液、葡萄糖液、及其他普通輸液等。所使用之溶液之液量視用途等而有所不同，並無特別限制，較佳為冷凍乾燥前之液量之0.5～2倍量或500 mL以下。

本發明之醫藥組合物例如可靜脈內投予、動脈內投予、經口投予、組織內投予、經皮投予、經黏膜投予、或經直腸投予至包含人之動物中，較佳為藉由符合患者之症狀之適當之方法進行投予。尤其可較佳地使用靜脈內投予、經皮投予、及經黏膜投予。又，亦可進行癌內局部投予等局部投予。作為適合該等投予方法之劑型，例如可列舉各種注射劑、經口劑、點滴劑、吸收劑、滴眼劑、軟膏劑、洗液劑、及栓劑等。

本發明之醫藥組合物之用量較理想為考慮藥物、劑型、年齡、及體重等患者之狀態、投予路徑、以及疾病之性質與程度等後決定，通常以核酸之質量計，針對成人，每天通常為0.1 mg～10 g/天，較佳為1 mg～500 mg/天。視情形亦存在上述量以下之量亦足夠，以及反之需要上述量以上之用量之情況。又，可1天投予1次～數次，亦可間隔1天～數天進行投予。 [實施例]

以下，藉由實施例對本發明進行說明。但是，本發明並不限定於該等實施例。

實施例1 雙鏈核酸之合成依賴Sigma-Aldrich公司，合成包含序列編號2～644所示之核糖核苷酸之正義鏈核酸、包含序列編號645～1287所示之核糖核苷酸之反義鏈核酸、及使其等退火而成之雙鏈核酸(序列編號n(n＝2～644)所示之正義鏈核酸與序列編號[n＋643]所示之反義鏈核酸形成對)。

實施例2 APCS mRNA之減弱活性之測定向384孔之培養盤中添加利用Opti-MEM I減血清培養基(Thermo Fisher Scientific公司製造，目錄編號31985070)對實施例1中合成之雙鏈核酸與RNAiMax轉染試劑(Thermo Fisher Scientific公司製造，目錄編號13778150)進行稀釋而成之siRNA/RNAiMax混合液20 μL。將作為源自人卵巢癌之細胞株之RMG-I細胞(JCRB細胞組，JCRB0172)以成為10,000細胞/40 μL/孔之方式分別播種至384孔之培養盤中，並於37℃、5% CO₂ 條件下培養24小時。培養基使用包含10%胎牛血清(Thermo Fisher Scientific公司製造，目錄編號10091-148)之Ham's F-12營養混合培養基(Thermo Fisher Scientific公司製造，目錄編號11765-047)。雙鏈核酸之最終濃度設為成為1 nM。其後，利用不含鈣鎂之DPBS(Dulbecco's Phosphate-Buffered Saline，杜氏磷酸鹽緩衝液)(Thermo Fisher Scientific公司製造，目錄編號14190-144)將細胞洗淨，自各培養盤中使用TaqMan(註冊商標) Fast Cells-to-CT(商標)套組(Thermo Fisher Scientific公司製造，目錄編號4399003)並利用以下之方法合成cDNA。逐次添加10 μL將裂解液(套組內容物)與脫氧核糖核酸酶I(套組內容物)以100：1進行混合而成之溶液，並混合5分鐘。逐次添加1 μL之終止液(套組內容物)，並混合2分鐘而製成RNA萃取液。將5 μL之2×RT(reverse transcription，反轉錄)緩衝液(套組內容物)、0.5 μL之20×RT酶混合物(套組內容物)、2.5 μL之無核酸酶水、2 μL之RNA萃取液進行混合，使其以37℃ 60分鐘、95℃ 5分鐘進行反應，而合成cDNA。將該cDNA 2 μL添加至MicroAmp(註冊商標) EnduraPlate(商標)附帶條形碼之光學384孔透明反應板(Optical 384-Well Clear Reaction Plates with Barcode)(Thermo Fisher Scientific公司製造，目錄編號4483285)中，進而添加5 μL之TaqMan(註冊商標)快速通用PCR主混合物(Thermo Fisher Scientific公司製造，目錄編號4352042)、2.5 μL之蒸餾水(超純)(Thermo Fisher Scientific公司製造，目錄編號10977015)、0.25 μL之人APCS探針、0.25 μL之人ACTB探針。使用QuantStudio(商標)7 Flex進行人APCS基因及人ACTB(β肌動蛋白)基因之即時PCR(Real-time polymerase chain reaction，即時聚合酶鏈鎖反應)。ACTB係構成性表現基因，作為內部對照進行測定，並修正APCS基因表現量。將未添加siRNA而僅利用轉染試劑對RMG-I細胞進行處理時之APCS mRNA量設為1.0，算出導入各siRNA時之APCS mRNA相對表現量值。將本實驗進行2次，將APCS mRNA相對表現量值之最小值示於表1。表1為便於說明而如以下所示般分割表示。

[表1-1]

[表1-2]

[表1-3]

[表1-4]

[表1-5]

[表1-6]

[表1-7]

[表1-8]

[表1-9]

[表1-10]

[表1-11]

[表1-12]

[表1-13]

[表1-14]

[表1-15]

[表1-16]

再者，將APCS第二鏈cDNA之總長之鹼基序列示於表2。

[表2]

實施例3 經化學修飾之雙鏈核酸之減弱活性依賴Genedesign公司，合成包含序列編號1931～1974所示之核糖核苷酸之正義鏈核酸、包含序列編號1975～2018所示之核糖核苷酸之反義鏈核酸、及使其等退火而成之雙鏈核酸(序列編號n(n＝1931～1974)所示之正義鏈與序列編號[n＋44]所示之反義鏈形成對)。合成之雙鏈核酸之最終濃度設為成為1 nM或0.1 nM，將該雙鏈核酸導入至RMG-1細胞中並培養24小時，除此以外，進行與實施例2相同之操作，算出APCS mRNA相對表現量。將本實驗進行4次，將APCS mRNA相對表現量值之中央值示於表3。於表3中，N(M)表示2'-O-甲基-RNA，N(F)表示2'-F-RNA。此處，N表示A、C、G或U。表3為便於說明而如下所示般分割表示。

[表3-1]

[表3-2]

本申請案以於日本申請之日本專利特願2017-108502(申請日：2017年5月31日)為基礎並於本文中提及，藉此其內容全部包含於本說明書中。

藉由本發明，提供一種具有APCS之表現抑制活性的核酸及將該核酸作為有效成分之醫藥組合物等。本發明之核酸及醫藥組合物抑制APCS之表現，可用作澱粉樣蛋白相關疾病之治療劑或預防劑。 [序列表非關鍵文字]

序列編號1 表示APCS第二鏈cDNA之總長之鹼基序列。序列編號2～644 表示正義鏈核酸之鹼基序列。序列編號645～1287 表示反義鏈核酸之鹼基序列。序列編號1288～1930 表示標靶APCS mRNA序列之鹼基序列。序列編號1931～1974 表示正義鏈核酸之鹼基序列。序列編號1975～2018 表示反義鏈核酸之鹼基序列。 [序列表] 基於國際受理專利合作條約之國際申請K1635AJP00 抑制APCS之表現的核酸 JP18020941 20180531----00190392751801120762正常20180531133139201805101415546770_P1AP101__K1_19.app

Claims

一種抑制APCS基因之表現的雙鏈核酸，其係包含正義鏈核酸及反義鏈核酸且包含至少11個鹼基對之雙鏈區域者，且於上述反義鏈核酸中之至少17個核苷酸且至多30個核苷酸之鏈長之寡核苷酸鏈中，與包含序列編號1288～1930之任一者所表示之鹼基序列之標靶APCS mRNA序列互補。
如請求項1之雙鏈核酸，其中上述雙鏈區域為11～27個鹼基對，且上述反義鏈核酸之自5'末端起第2號核苷酸與上述標靶APCS mRNA序列之自3'末端起第2號脫氧核糖核苷酸互補。
如請求項1或2之雙鏈核酸，其中上述正義鏈核酸之3'末端及上述反義鏈核酸之5'末端、及/或上述正義鏈核酸之5'末端及上述反義鏈核酸之3'末端形成平滑末端。
如請求項1至3中任一項之雙鏈核酸，其中上述正義鏈核酸具有21個核苷酸之鏈長，且上述反義鏈核酸具有21個核苷酸之鏈長。
如請求項4之雙鏈核酸，其包含19個鹼基對之雙鏈區域，且該雙鏈區域內之40～65%之核苷酸為2'-O-甲基修飾核苷酸。
如請求項1至5中任一項之雙鏈核酸，其中上述反義鏈核酸包含序列編號645～1287及1975～2018之任一者所表示之鹼基序列。
如請求項1至6中任一項之雙鏈核酸，其中上述正義鏈核酸包含序列編號2～644及1931～1974之任一者所表示之鹼基序列。
如請求項1至7中任一項之雙鏈核酸，其中上述正義鏈核酸包含序列編號2～644及1931～1974之任一者所表示之鹼基序列，與之對應，上述反義鏈核酸包含序列編號645～1287及1975～2018之任一者所表示之鹼基序列。
如請求項1至8中任一項之雙鏈核酸，其包含配位基。
一種單鏈核酸，其僅包含如請求項1至9中任一項之雙鏈核酸之反義鏈核酸。
一種醫藥組合物，其包含如請求項1至10中任一項之核酸。
一種治療以包含APCS之澱粉樣蛋白纖維為媒介之障礙之方法，其包括將治療上有效量之如請求項1至10中任一項之核酸或如請求項11之醫藥組合物投予至需要此種治療之人之步驟。
如請求項12之方法，其中上述障礙係澱粉樣蛋白相關疾病。