通用術語及定義
本文中未特定地定義之術語應賦予熟習此項技術者依據本發明及上下文將對其賦予之含義。然而,如本說明書中所用,除非相反說明,否則以下術語具有指定之含義且將遵守以下慣例。 術語「一或多種根據本發明之化合物」、「一或多種式(I)化合物」、「一或多種本發明之化合物」及其類似者表示根據本發明之式(I)化合物,包括其互變異構體、立體異構體及其混合物及其鹽(尤其其醫藥學上可接受之鹽)及該等化合物之溶劑合物及水合物,包括該等互變異構體、立體異構體及其鹽之溶劑合物及水合物。 除非特定說明,否則在整篇本說明書及隨附申請專利範圍中,指定化學式或名稱應涵蓋互變異構體及所有立體、光學及幾何異構體(例如對映異構體、非對映異構體、E/Z異構體等)及其外消旋體,以及不同比例之各別對映異構體之混合物、非對映異構體之混合物、或存在此類異構體及對映異構體的任何上述形式之混合物、以及其鹽(包括其醫藥學上可接受之鹽)及其溶劑合物(諸如水合物),包括游離化合物之溶劑合物或化合物之鹽之溶劑合物。 在本發明化合物以化學名稱及化學式形式描述的情況下,若有任何不一致之情況,則應以化學式為準。 可在子式中使用星號來指示連接至如所定義之核心分子之鍵。 如本文所用,關於式(I)化合物之術語「實質上純」係指相對於關於磷原子之其他可能非對映異構體,一種(Rp,Rp)、(Rp,Sp)、(Sp,Rp)或(Sp,Sp)非對映異構體之純度為至少75%。在較佳實施例中,實質上純之通式(I)之化合物的純度為至少85%、至少90%、至少95%、至少97%或至少99%。 如本文所用,術語「保護基」,且除非另外定義,否則指連接於氧、氮或磷原子以防止該原子之進一步反應或用於其他目的之化學官能基。各種保護基為熟習有機合成技術者所已知且描述於例如T.W. Greene及P.G.M. Wuts之「Protective Groups in Organic Synthesis」,第三版,1999中。 術語「醫藥學上可接受」在本文中用於指彼等化合物、物質、組合物及/或劑型,其在合理醫學判斷之範疇內,適用於與人類及動物之組織接觸而無過度毒性、刺激、過敏反應或其他問題或併發症,且與合理益處/風險比率相匹配。 如本文所使用,「醫藥學上可接受之鹽」係指所揭示之化合物的衍生物,其中母體化合物藉由製得其酸鹽或鹼鹽而改性。醫藥學上可接受之鹽之實例包括(但不限於)鹼性殘基(諸如胺)之無機或有機酸鹽;酸性殘基(諸如磷酸二酯或硫代磷酸酯部分)之鹼金屬、銨或有機鹽;及其類似物。 除非另外指明,否則如本文所用,術語「調節(modulated)」或「調節(modulating)」或「調節(modulate(s))」係指用一或多種本發明之化合物,在此情況下表示STING促效劑,來活化STING路徑。 如本文所用,術語「治療(treatment)」及「治療(treating)」涵蓋治療性(亦即治癒性及/或緩解性)及預防性(亦即防治性)治療兩者。 治療性治療係指已罹患呈明顯急性或慢性形式的該等病狀中之一或多者的患者之治療。治療性治療可為對症治療,其為了減輕特定適應症之症狀,或可為病因治療,其為了逆轉或部分逆轉適應症之病狀或阻止或減緩疾病之發展。此外,治療性治療涵蓋歷經一段時間之治療以及長期療法。 預防性治療(「預防」、「防治性治療」)係指在疾病臨床發作之前,對處於罹患該等病狀中之一或多者的風險下之患者的治療以便減小該風險。 術語「治療(treatment)」及「治療(treating)」包括投與一或多種活性化合物以便預防或延遲症狀或併發症之發病,且預防或延遲罹患疾病、病況或病症,及/或以便消除或控制疾病、病況或病症,以及緩解與疾病、病況或病症相關之症狀或併發症。 術語「治療有效量」意謂(i)治療或預防特定疾病或病狀,(ii)減輕、改善或消除特定疾病或病狀之一或多個症狀,或(iii)預防或延遲本文所述之特定疾病或病狀之一或多個症狀之發病的本發明之化合物之量。 當本發明提及需要治療之患者時,其主要地係關於哺乳動物(尤其人類)中之治療。
本發明之化合物
在本發明之一個態樣中,發現式(I)之經修飾CDN
, 其中鹼基
1
及鹼基
2
如上下文所定義,展現與人類STING之有利結合親和力且在攜載不同人類STING對偶基因之細胞中展現有利活性,其可使得在低劑量下可達成藥理學功效。 因此,預期如上文或下文所定義之式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽適用於治療與STING相關或經STING調節之疾病或病狀。 因此,根據本發明之一個態樣,提供式(I)化合物
, 其中鹼基
1
及鹼基
2
如上文或下文所定義,以及其同功異型物、互變異構體、立體異構體、代謝物、前藥、溶劑合物、水合物及鹽,尤其具有無機或有機鹼的其生理學上可接受之鹽。 取代基鹼基
1
及鹼基
2
之一些較佳含義將提供於下文中。此等定義中之任一者及每一者可彼此組合。 根據一個實施例,鹼基
1
係選自由以下組成之群:嘌呤、腺嘌呤、鳥嘌呤、黃嘌呤及次黃嘌呤,其經由其N
9
氮原子連接。 根據另一實施例,鹼基
1
係選自由腺嘌呤及鳥嘌呤組成之群,其經由其N
9
氮原子連接。 根據另一實施例,鹼基
1
為嘌呤,其經由其N
9
氮原子連接。 根據另一實施例,鹼基
1
為腺嘌呤,其經由其N
9
氮原子連接。 根據另一實施例,鹼基
1
為鳥嘌呤,其經由其N
9
氮原子連接。 根據另一實施例,鹼基
1
為黃嘌呤,其經由其N
9
氮原子連接。 根據另一實施例,鹼基
1
為次黃嘌呤,其經由其N
9
氮原子連接。 根據一個實施例,鹼基
2
係選自由以下組成之群:嘌呤、腺嘌呤、鳥嘌呤、黃嘌呤及次黃嘌呤,其經由其N
9
氮原子連接。 根據另一實施例,鹼基
2
係選自由腺嘌呤、鳥嘌呤及次黃嘌呤組成之群,其經由其N
9
氮原子連接。 根據另一實施例,鹼基
2
為嘌呤,其經由其N
9
氮原子連接。 根據另一實施例,鹼基
2
為腺嘌呤,其經由其N
9
氮原子連接。 根據另一實施例,鹼基
2
為鳥嘌呤,其經由其N
9
氮原子連接。 根據另一實施例,鹼基
2
為黃嘌呤,其經由其N
9
氮原子連接。 根據另一實施例,鹼基
2
為次黃嘌呤,其經由其N
9
氮原子連接。 根據另一實施例,式(I)化合物為化合物(I-1)
。 根據另一實施例,式(I)化合物為化合物(I-2)
。 根據另一實施例,式(I)化合物為化合物(I-3)
。 根據另一實施例,式(I)化合物為化合物(I-4)
。 本發明之化合物具有具有Rp或Sp組態之對掌性磷原子。式(I)、式(I-1)、式(I-2)、式(I-3)及式(I-4)化合物之所有立體異構體,呈實質上純形式或呈其混合物形式均由本發明涵蓋。呈實質上純(Rp,Rp)、(Rp,Sp)、(Sp,Rp)或(Sp,Sp)立體異構體形式之通式(I)、式(I-1)、式(I-2)、式(I-3)及式(I-4)化合物為較佳的。
製備
根據本發明之化合物及其中間物可使用熟習此項技術者已知的且描述於有機合成之文獻中的合成方法獲得。較佳地,以與下文較充分解釋的製備方法(尤其如實驗部分中所述)類似地來獲得化合物。在一些情況下,實施反應流程所採用的順序可有所變化。亦可使用熟習此項技術者已知的但未在此詳細描述的此等反應之變化形式。基於研究以下方法,用於製備根據本發明之化合物的一般製程對於熟習此項技術者將顯而易見。起始化合物可商購或可藉由描述於文獻或本文中之方法製備,或可以類似或相似方式製備。在進行反應之前,起始化合物中之任何相應官能基可使用習知保護基加以保護。此等保護基可在反應順序內適合階段中使用熟習此項技術者熟悉之方法來斷裂。 本文所揭示之CDN可如下文中詳細描述或藉由熟習此項技術者已知之其他方法來製備。一般熟習此項技術者將理解,此等方案絕非限制性且可在不背離本發明之精神之情況下進行細節之變化。 CDN可藉由描述於Chem. Rev. 113, 7354-7401 (2013);Org. Lett., 12, 3269-3271 (2010);Tetrahedron 49, 1115-1132 (1993);WO 2017/0247645;WO 2017/027646;WO 2014/189805;WO 2016/096174;WO 2015/185565;WO 2016/145102;或WO 2016/120305及其中所引用之參考文獻中之方法獲得。 根據本發明之另一態樣,式(I)化合物及其鹽可藉由下文中所述之方法來製備。 熟習此項技術者應認識到,式(I)中之兩個硫代磷酸酯部分可各自存在於R組態(R
P
)或S組態(S
P
)中。下文中所述之方法可在合成之不同階段產生至多四個關於磷原子之非對映異構體,其可藉由熟習此項技術者已知之方法,例如藉由層析及/或分步結晶,例如具有適合溶劑系統及管柱之HPLC來分離。在一些情況中,例如當一個硫化步驟以非對映立體選擇性方式進行時,下文中所述之方法在合成之不同階段可優先產生僅兩個非對映異構體,其可藉由熟習此項技術者已知的層析或結晶方法來分離。 如上文所提及,式(I)化合物可藉由熟習此項技術者已知的方法轉化成鹽,尤其轉化成醫藥學上可接受之鹽以用於醫藥用途。 根據本發明之化合物亦宜使用描述於以下實例中之方法獲得,該等方法亦可出於此目的與技術人員自文獻中已知之方法組合。 未在以下製備方法中明確指定的取代基應理解為涵蓋發明內容下的上文所提及的定義。 式(I)化合物
可藉由對式(II-1)或式(II-2)化合物進行脫保護來製備
其中 R
1
表示攜載適合保護基,諸如苯甲醯基之NH,且R
2
表示H (「經保護之腺嘌呤」)或 R
1
表示OH且R
2
表示攜載適合保護基,諸如異丁醯基或
N , N
-二甲基甲脒基之NH (「經保護之鳥嘌呤」)或 R
1
及R
2
兩者表示OH(「黃嘌呤」)或 R
1
表示OH且R
2
表示H (「次黃嘌呤」)或 R
1
及R
2
兩者表示H (「嘌呤」);及 其中 R
3
表示攜載適合保護基,諸如苯甲醯基之NH,且R
4
表示H (「經保護之腺嘌呤」)或 R
3
表示OH且R
4
表示攜載適合保護基,諸如異丁醯基或
N , N
-二甲基甲脒基之NH (「經保護之鳥嘌呤」)或 R
3
及R
4
兩者表示OH(「黃嘌呤」)或 R
3
表示OH且R
4
表示H (「次黃嘌呤」)或 R
3
及R
4
兩者表示H(「嘌呤」)。 例如,將式(II-1)或式(II-2)之化合物溶解於適合混合物,例如甲醇或乙醇中之甲胺或氨水中,且在適合溫度,例如20℃至60℃下攪拌適合時段,例如1至24小時。 式(II-1)化合物可藉由對下式(III-1)化合物進行環化且隨後進行硫化來製備:
, 其中R
1
、R
2
、R
3
及R
4
如上文所定義。 例如,將式(III-1)化合物溶解於適合溶劑,例如吡啶或吡啶與二氯甲烷之混合物中,且用適合偶合劑,例如2-氯-5,5-二甲基-1,3,2-二氧磷雜環己烷2-氧化物(DMOCP)、氯磷酸二苯酯、特戊醯氯或金剛烷醯氯(adamantoyl chloride)處理,且在適合溫度,例如-50℃至20℃下攪拌適合時段,例如0.1至2小時。藉由用適合硫化試劑,例如3H-1,2-苯并二硫醇-3-酮或元素硫處理來淬滅環化反應,且在適合溫度,例如-50℃至20℃下攪拌適合時段,例如0.1至2小時。 以類似方式,式(II-2)化合物可藉由對下式(III-2)化合物進行環化且隨後進行硫化來製備:
其中R
1
、R
2
、R
3
及R
4
如上文所定義。 式(III-1)化合物可藉由使式(IV-1)化合物與式(V-1)化合物來製備:
其中R
1
、R
2
、R
3
及R
4
如上文所定義。 例如,將式(V-1)化合物溶解於適合溶劑,例如乙腈中且用溶解於適合溶劑,例如乙腈中之式(IV-1)化合物之溶液處理,視情況在適合偶合劑,例如四唑、Activator 42
®
(活化劑溶液,含有於乙腈中之5-(3,5-雙(三氟甲基)苯基)-1H-四唑)、二氯乙酸吡錠或三氟乙酸吡錠(或偶合試劑之混合物)存在下,且在適合溫度,例如0℃至20℃下攪拌適合時段,例如0.1至2小時。藉由用適合硫化試劑,例如3-((N,N-二甲基胺基亞甲基)胺基)-3
H
-1,2,4-二噻唑-3-硫酮(DDTT)或苯乙醯基二硫化物(PADS)或3
H
-1,2-苯并二硫醇-3-酮1,1-二氧化物(布凱吉氏試劑(Beaucage's reagent))處理來淬滅偶合反應,且在適合溫度,例如0℃至20℃下攪拌適合時段,例如0.1至2小時。在蒸發溶劑之後,將殘餘物溶解於適合溶劑,例如二氯甲烷與水之混合物中,且用適合試劑,例如二氯乙酸處理,且在適合溫度,例如0℃至20℃下攪拌適合時段,例如0.1至1小時。 式(III-2)化合物可以類似方式藉由使式(IV-2)化合物與式(V-2)化合物偶合來製備:
其中R
1
、R
2
、R
3
及R
4
如上文所定義。 如上文所定義,式(IV-1)化合物可藉由式(V-2)化合物之反應來製備。舉例而言,將市售式(V-2)化合物溶解於適合混合物,例如含水乙腈中,且用三氟乙酸吡錠處理,且在適合溫度,例如0℃至20℃下攪拌適合時段,例如1至30分鐘。隨後添加第三丁胺且將混合物在適合溫度,例如0℃至20℃下攪拌適合時段,例如0.1至1小時。藉由蒸發溶劑分離產物,隨後溶解於適合溶劑,例如含水二氯甲烷中,且用二氯乙酸處理,且在適合溫度,例如0℃至20℃下攪拌適合時段,例如0.1至1小時。 通式I化合物或其合成中間物可藉由利用其不同物理化學特性使用本身已知方法,例如層析及/或分步結晶而拆分成其非對映異構體。 根據本發明之化合物亦宜使用描述於以下實例中之方法獲得,該等方法亦可出於此目的與技術人員自文獻中已知之方法組合。 本發明之醫藥學上可接受之鹽可藉由習知化學方法由含有鹼性部分之母體化合物合成。一般而言,此類鹽可藉由使此等化合物之游離酸形式與足夠量之於於水中或有機稀釋劑,如醚、乙酸乙酯、乙醇、正丙醇、異丙醇、丙酮或乙腈或其混合物中之合適鹼反應來製備。或者,採用「揮發性緩衝液」,諸如三乙基乙酸銨、三乙基甲酸銨、乙酸銨或碳酸氫銨之水溶液的本發明之化合物(游離酸或鹽形式)的逆相層析在凍乾/冷凍乾燥之後產生呈相應三乙基銨或銨鹽形式的本發明化合物。或者,鹽可藉由離子交換,例如藉由用陽離子交換劑處理本發明之化合物(游離酸或鹽形式)之水溶液來製備。
藥理學活性
根據本發明之化合物展現有利的與人類STING之結合親和力。結合親和力可例如藉由基於閃爍近接分析(scintillation proximity assay;SPA)的競爭結合分析測定,如Nat. Chem. Biol. 10, 1043-1048 (2014)中所述。或者,結合親和力可例如藉由等溫滴定熱量測定(isothermal titration calorimetry;ITC)測定,如Molecular Cell 51, 226-235 (2013)中所述。或者,結合親和力可例如藉由表面電漿子共振(SPR)測定,如WO 2016/145102中所述。或者,結合親和力可例如藉由如下文所述之差示掃描螢光測定法(DSF)測定。 根據本發明之化合物展現有利之細胞活性。可在報導細胞株中,例如THP1細胞中量測活體外細胞介素誘導,如下文所述。人類STING存在於至少五種已知變異體(WT、HAQ、REF / 232H、AQ、Q / 293Q)中。為測試不同CDN在人類STING變異體上的活性,可使用編碼不同STING變異體編碼的載體穩定轉導THP1-STING KO細胞。另外,可在人類原生PBMC或人類樹突狀細胞中量測活體外細胞介素誘導。 根據本發明之化合物在例如使用THP1細胞、Calu-3細胞或人類肝細胞的活體外細胞分析中展現有利之穩定性。此外,根據本發明之化合物展現有利之藥物動力學(PK)特性。可在臨床前動物物種(例如小鼠、大鼠、倉鼠、狗、天竺鼠、小型豬、食蟹獼猴、恆河猴)中測定PK特性。化合物之PK特性可例如藉由以下參數描述:平均滯留時間(MRT)、消除半衰期(t
1 / 2
,亦即藥物濃度達至其初始值之一半所需之時間)、分佈體積(V
D
,亦即藥物分佈之表觀體積)、曲線下面積(AUC,亦即單次劑量之後濃度-時間曲線之積分)、清除量(CL,亦即每單位時間清除藥物的血漿之體積),如E. Kerns及L. Di所述(Drug-like properties: concepts, structure design and methods: from ADME to toxicity optimization, Elsevier,第1版,2008)。此外,根據本發明之化合物在例如小鼠MC38、B16、4T1、Colon26、EMT6腫瘤模型中,在瘤內施加之後展現有利之活體內藥理學活性。 與人類STING之有利結合親和力加上有利之細胞活性及/或有利之PK特性之組合可以使達到藥理學功效所需之劑量降低。降低劑量具有對於患者而言引起較少潛在副作用的較低「載藥量」或「藥物負荷」(母藥及其代謝物)之優點,以及對於藥品而言有降低生產成本之優點。其優點在於同樣對人類STING之變異體具有強效活性,因為當投與固定劑量時,其可在具有單核苷酸多形現象之患者中,使誘導所需藥理學反應的可能性達至最大。 本發明之化合物與人類STING之結合可使用以下分析證實:
差示掃描螢光測定法 (DSF)
材料: 384孔薄壁Hard-Shell
®
PCR盤(目錄號HSP3805R,BIO-RAD) 用於PCR盤之Microseal
®
'B'黏著密封件(目錄號MSB-1001,BIO-RAD) 於DMSO中之SYPRO橙色溶液(SIGMA目錄號S5692-500UL),濃度「5000×」 儀器:讀取器:CFX384即時系統(Bio-Rad) 自動移液機:HamiltonStarlet 分析緩衝液:20mM Tris,150mM NaCl pH7.5 靶蛋白:人類STING (hSTING,殘基155-341,具有N-末端His8-標記之野生型序列及TEV-裂解位點,MW:23601.5Da) 蛋白儲備溶液:在分析緩衝液中之c = 309 µM之儲備溶液 測試化合物之最終分析濃度:100 µM,3 µM靶蛋白,「5×」SYPR Orange 分析程序: 1) 在分析緩衝液中製備化合物儲備溶液及其稀釋液。 2) 將5 µl螢光染料儲備溶液(5000× SYPRO Orange)與50 µl靶蛋白(309µM)及945 µl緩衝液混合。 3) 將2 µl此蛋白-染料混合物(25× SYPRO Orange及15 µM蛋白)添加至8 µl化合物溶液中。最終體積為10 µL。 4) 某些孔位置用作陰性對照。 5) 製備盤用於重複量測且以1000 g離心2 min。 6)在量測中,使用160次0.5℃之循環(溫度逐漸上升15秒/循環,15℃至95℃)。 資料分析:在Bio-Rad CFX Manager中處理解離曲線。峰類型設定成「負」。在實例1.1、實例2.1、實例3.1及實例4.1之情況下,將至少兩次Tm量測結果平均化。Tm變化(「熱位移」)展示於表1中。 表1:如藉由差示掃描螢光測定法所測定之hSTING結合
出人意料地發現,與其中LNA部分經核糖部分替代之類似物相比,根據本發明之化合物展現出顯著改良之結合,例如,與WO 2016/145102中之核糖實例5/化合物23(「3'3'-RR-(2'F-G)(A)」)相比,LNA實例1.1、實例2.1、實例3.1及實例4.1展現出顯著較大熱位移,亦即經改良之結合。上述差示掃描螢光測定法(DSF)分析中的根據本發明之化合物的改良結合亦在表面電漿子共振(SPR)分析中得到確認。 本發明化合物之細胞活性可使用以下活體外THP1分析展示:
活體外細胞介素誘導
根據本發明之化合物的細胞介素誘導活性已藉由使用THP1報導細胞株證明。 在THP1細胞中表現的STING蛋白質之活化導致干擾素產生之提高。藉由干擾素調控因子(IRF)-誘導性SEAP (分泌性胚胎鹼性磷酸酶)報導構築體之穩定整合可監測功能性干擾素信號傳遞路徑。使用Invivogen`s QUANTI-Blue™比色酶分析及適合光密度(OD)讀取器,可偵測到且定量SEAP之活性。此技術可用於表徵STING蛋白質之藥理學修飾。 在穩定表現人類STING蛋白質及IRF-誘導性SEAP報導構築體的THP1-Blue ISG細胞中進行SEAP活性之量測。在37度、濕度95%及5% CO
2
之培育箱中在RPMI1640培養基中使用10%胎牛血清、50 µg/ml青黴素(Penicillin)-鏈黴素(Streptomycin)、100 µg/ml吉歐黴素(Zeocin)及100 µg/ml新黴素(Normocin)培養擴增細胞。將分析備用細胞以冷凍儲備液形式儲存。 在分析之準備中,在不含吉歐黴素/新黴素的培養基中將細胞解凍,且分配至具有15000個細胞/15微升每孔之密度的分析盤中。藉由在50%水性DMSO中之8或16點連續稀釋及在培養基中進行的為確保分析中最終DMSO濃度為0.5%的最終稀釋步驟來製備化合物。將5 µL經稀釋之化合物加上5 µL培養基添加至盤中,隨後在37℃下培育24小時。 在分析當天,將每孔75微升之Quanti-Blue試劑添加至盤之全部孔中,且將盤在37℃下再培育30分鐘。在EnVision讀取器(PerkinElmer)上量測620 nm處之OD。 EC
50
值及Hill斜度來自用Megalab軟體(Boehringer Ingelheim)使用在620 nM處之OD的8或16點四參數非線性曲線擬合。參見表2。 表2:THP1-Blue ISG細胞分析中之細胞活性
已在人類STING基因中鑑別出若干單核苷酸多形現象,其可能影響對環二核苷酸之反應。為測定本發明化合物之活性,已生成表現不同人類STING變異體之THP1-Blue ISG報導細胞株。為此,首先使用CRISPR/CAS9系統將內源性人類STING刪除:用靶向STING基因之一體式CRISPR質體(購自Sigma,編碼gRNA且GFP作為成功轉導之報導基因)電穿孔THP1-Blue ISG細胞。隨後,在轉染及擴增24 h後分選出GFP陽性細胞。隨後將細胞分散於半固體甲基纖維素培養基中來使單細胞純系分離。隨後使用Quanti-blue報導分析針對cGAMP反應篩檢純系。之後藉由西方墨點法及STING基因座之定序針對STING損失分析無反應純系。 對於人類STING變體之過度表現,用編碼hSTING之對偶基因變異體(WT、HAQ、R232H、AQ及R293Q)之個別反轉錄病毒質體(MSCV-ires-GFP-Blasti)分別轉導經確認的THP1-Blue ISG hSTING KO純系。針對不同程度之GFP螢光分選轉導細胞,且藉由西方墨點法分析STING對偶基因表現。從親本未經修飾THP1-Blue ISG細胞株中選拔表現程度相當於內源性STING的表現異位STING蛋白質(WT、HAQ、R232H、AQ及R293Q)之群體,且用於判別化合物特徵。出人意料地發現,根據本發明之化合物在以上全部五個變異細胞株中均展現出極具強效之細胞活性,例如實例2.1、實例3.1及實例4.1分別在WT、HAQ、R232H、AQ及R293Q變異細胞株中均展現出≤1 µM EC
50
值,表明不存在顯著變異體差別/選擇性。所觀測到之細胞活性為STING依賴性的,因為未在缺失人類STING之THP1細胞株中觀測到活性。 如下測定本發明化合物之細胞穩定性:將化合物溶解於細胞培養基(補充有10% FCS、1%非必需胺基酸及1%丙酮酸鹽之MEM)中以得到最終濃度10 µM,且與人類肺上皮細胞株Calu-3一起培育(在24孔盤中,60000個細胞/孔)至多24 h。在1 h、6 h、24 h時取得細胞培養上清液之樣本且藉由LC-MS/MS進行定量。
治療方法
在本發明之另一態樣中,發現式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽可適用於治療其中STING之調節具有治療效益之疾病或病狀。此外,本發明之化合物因為其活性而適用作疫苗佐劑。 與STING相關或經STING調節之疾病和病狀涵蓋(但不限於)發炎、過敏性或自體免疫疾病(例如過敏性鼻炎或哮喘)、傳染病或癌症。 自體免疫疾病包括(但不限於):全身性紅斑性狼瘡、牛皮癬、胰島素依賴型糖尿病(IDDM)、皮肌炎及休格連氏症候群(Sjogren's syndrome;SS)。 發炎代表對外傷之血管、細胞及神經反應之群。發炎可表徵為發炎性細胞,諸如單核球、嗜中性白血球及顆粒球向組織內之移動。此通常與降低的內皮障壁功能及組織內之水腫相關。發炎可分為急性或慢性。急性發炎係身體對有害刺激之初始反應且藉由增加血漿及白血球自血液至受傷組織之移動達成。一連串生化事件傳播且促成發炎反應,涉及局部血管系統、免疫系統及受傷組織內之各種細胞。長期發炎,稱為慢性發炎,引起存在於發炎部位之細胞之類型發生進展性變換且特徵在於自發炎過程起同時進行的組織之破壞及癒合。 當發炎作為對感染之免疫反應之部分或作為對外傷之急性反應出現時可能有利且通常係自我限制的。然而,在各種條件下發炎可能有害。此包括對傳染媒介物起反應之過度發炎之產生,其可導致顯著器官損傷及死亡(例如在敗血症之情況中)。而且,慢性發炎通常有害且係多種慢性疾病之根源,對組織造成嚴重且不可逆損傷。在此類情況中,免疫反應通常係針對自身組織(自體免疫),但對外來實體之慢性反應亦可能導致對自身組織之旁路損壞。因此抗炎療法之目標係減弱此發炎、抑制自體免疫(若存在)及允許生理過程或癒合及組織修復進展。 本發明化合物可用於治療身體之任何組織及器官之發炎,包括肌肉骨胳發炎、血管發炎、神經發炎、消化系統發炎、眼部發炎、生殖系統發炎及其他發炎,如下所例示。 肌肉骨胳發炎係指肌肉骨胳系統之任何發炎性病狀,尤其彼等影響骨骼關節之病狀,包括手、腕、肘、肩、頜、脊椎、頸、髖、膝、踝及足之關節,及影響連接肌肉與骨之組織(諸如肌腱)之病狀。可用本發明化合物治療之肌肉骨胳發炎之實例包括:關節炎(包括例如骨關節炎、類風濕性關節炎、牛皮癬性關節炎、僵直性脊椎炎、急性及慢性感染性關節炎、與痛風及偽通風相關的關節炎及青少年特發性關節炎)、肌腱炎、關節膜炎、腱鞘炎、滑囊炎、纖維組織炎(肌肉纖維疼痛)、上髁炎、肌炎及骨炎(包括例如佩吉特氏病(Paget's disease)、恥骨炎及囊性纖維性骨炎)。眼部發炎係指眼睛之任何結構,包括眼瞼之發炎。可用本發明化合物治療之眼部發炎之實例包括:瞼炎、眼瞼鬆弛(blepharochalasis)、結膜炎、淚腺炎、角膜炎、乾眼症(眼睛乾燥)、鞏膜炎、倒睫及葡萄膜炎。可用本發明化合物治療之神經系統之發炎之實例包括:腦炎、格-巴二氏症候群(Guillain-Barre syndrome)、腦膜炎、神經肌強直、發作性睡病、多發性硬化、脊髓炎及精神分裂症。 可用本發明化合物治療之血管結構或淋巴系統之發炎之實例包括:關節硬化、關節炎、靜脈炎、脈管炎及淋巴管炎。 可用本發明化合物治療之消化系統之發炎病狀之實例包括:膽管炎、膽囊炎、腸炎、小腸結腸炎、胃炎、胃腸炎、發炎性腸病(諸如克羅恩氏病(Crohn's disease)及潰瘍性結腸炎)、迴腸炎及直腸炎。 可用本發明化合物治療的生殖系統之發炎病狀之實例包括:子宮頸炎、絨毛膜羊膜炎(chorioamnionitis)、子宮內膜炎、附睾炎、臍炎、卵巢炎、睾丸炎、輸卵管炎、輸卵管卵巢囊腫、尿道炎、陰道炎、外陰炎及外陰疼痛。 藥劑可用於治療具有發炎性部分之自體免疫病狀。此類病狀包括急性散佈性普禿、白塞氏病(Behcet's disease)、卻格司氏病(Chagas' disease)、慢性疲勞症候群、自主神經障礙、腦脊髓炎、僵直性脊椎炎、再生不全性貧血、化膿性汗腺炎、自體免疫肝炎、自體免疫卵巢炎、乳糜瀉、克羅恩氏病、1型糖尿病、巨大細胞動脈炎、古巴士德氏症候群(goodpasture's syndrome)、格雷氏病(Grave's disease)、格-巴二氏症候群、橋本氏病(Hashimoto's disease)、過敏性紫斑(Henoch-Schonlein purpura)、川崎氏病(Kawasaki's disease)、紅斑狼瘡、顯微性結腸炎、顯微性多動脈炎、混合性結締組織病、多發性硬化、重症肌無力、眼陣攣肌陣攣症候群、視神經炎、奧德氏甲狀腺炎(ord's thyroiditis)、天疱瘡、結節性多動脈炎、多肌痛、類風濕性關節炎、萊特爾氏症候群(Reiter's syndrome)、休格連氏症候群、顳動脈炎、韋格納氏肉芽腫病(Wegener's granulomatosis)、溫型自體免疫溶血性貧血、間質性膀胱炎、萊姆病(lyme disease)、硬斑病、牛皮癬、類肉瘤病、硬皮病、潰瘍性結腸炎及白斑病。 藥劑可用於治療具有發炎性部分之T細胞介導的超敏性疾病。此類病狀包括:接觸超敏、接觸性皮炎(包括因毒葛引起之接觸性皮炎)、風疹、皮膚過敏、呼吸過敏(枯草熱、過敏性鼻炎)及麩質敏感性腸病(賽利亞病(Celliac disease))。 其他可用藥劑治療之發炎病狀包括例如闌尾炎、皮炎、皮肌炎、心內膜炎、纖維組織炎、齒齦炎、舌炎、肝炎、化膿性汗腺炎、虹膜炎、喉炎、乳房炎、心肌炎、腎炎、耳炎、胰臟炎、腮腺炎、心包炎、腹膜炎、咽炎、胸膜炎、肺炎、前列腺炎、腎盂腎炎及口炎、移植排斥(涉及諸如腎臟、肝、心臟、肺、胰臟(例如胰島細胞)、骨髓、角膜、小腸之器官、皮膚同種異體移植物、皮膚同種移植物及心臟瓣膜異種移植物、血清病及移植物抗宿主疾病)、急性胰臟炎、慢性胰臟炎、急性呼吸窘迫症候群、塞紮里症候群(Sexary's syndrome)、先天性腎上腺增生、非化膿性甲狀腺炎、與癌症相關的高鈣血症、天疱瘡、大皰性疱疹樣皮炎、嚴重多形性紅斑、剝脫性皮膚炎、脂溢性皮膚炎、季節性或常年性過敏性鼻炎、支氣管哮喘、接觸性皮炎、異位性皮炎、藥物超敏性反應、過敏性結膜炎、角膜炎、眼帶狀疱疹、虹膜炎及虹膜睫體炎、脈絡膜視網膜炎、視神經炎、症狀性類肉瘤病、暴發性或多發性肺結核化學療法、成年人之特發性血小板減少性紫癜、成年人之繼發性血小板減少、獲得性(自體免疫)溶血性貧血、成年人白血病及淋巴瘤、兒童急性白血病、局部腸炎、自體免疫脈管炎、多發性硬化、慢性阻塞性肺病、實體器官移植排斥、敗血症。較佳治療包括移植排斥、類風濕性關節炎、牛皮癬性關節炎、多發性硬化、1型糖尿病、哮喘、發炎性腸病、全身性紅斑狼瘡、牛皮癬、慢性肺病及伴隨傳染性病狀之發炎(例如敗血症)之治療。 在一個態樣中,待使用本發明化合物治療之疾病或病狀為癌症。其中式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽或溶劑合物可具有潛在有益抗腫瘤作用的癌症疾病及病狀之實例包括(但不限於):肺、骨、胰臟、皮膚、頭、頸、子宮、卵巢、胃、結腸、乳房、卵巢、食道、小腸、腸、內分泌系統、甲狀腺、副甲狀腺、腎上腺、尿道、前列腺、陰莖、睾丸、輸尿管、膀胱、腎臟或肝臟之癌症;尿道上皮癌;直腸癌;肛門區癌;輸卵管、子宮內膜、子宮頸、陰道、外陰、腎盂、腎細胞之癌瘤;軟組織肉瘤;黏液瘤;橫紋肌瘤;纖維瘤;脂肪瘤;畸胎瘤;膽管癌;肝胚細胞瘤;血管肉瘤;血管瘤;肝細胞瘤;纖維肉瘤;軟骨肉瘤;骨髓瘤;慢性或急性白血病;淋巴球性淋巴瘤;原發性CNS淋巴瘤;CNS之贅瘤;脊椎軸腫瘤;鱗狀細胞癌;滑膜肉瘤;惡性胸膜間皮瘤;腦幹神經膠質瘤;垂體腺瘤;支氣管腺瘤;軟骨瘤性錯構瘤;間皮瘤(inesothelioma);霍奇金氏病(Hodgkin's Disease)或前述癌症中之一或多者之組合。 可用根據本發明化合物治療之較佳癌症為皮膚、肺、肝臟、結腸、腦、乳房、卵巢、前列腺癌、胰臟、腎臟、胃、頭、頸、皮膚及尿道上皮癌以及淋巴瘤及白血病。新型化合物可用於上文所提及疾病之預防、短期或長期治療,視情況亦與手術、放射線療法或其他「最先進」化合物(諸如細胞生長抑制或細胞毒性物質、細胞增殖抑制劑、抗血管生成物質、類固醇或抗體)組合。 在其作為佐劑之作用中,在某些實施例中,本發明化合物及組合物可在採用疫苗之治療或防治性策略中用作佐劑。因此,本發明之實質上純CDN或其前藥或醫藥學上可接受之鹽可與一或多種經選擇用於刺激對一或多種預定抗原之免疫反應之疫苗一起使用。本發明之實質上純CDN或其前藥或醫藥學上可接受之鹽可與此類疫苗一起提供或除了此類疫苗外額外提供。 疫苗可包含不活化或減毒細菌或病毒,其包含相關抗原、經純化抗原、為表現及/或分泌抗原而以重組方式工程改造之活性病毒或細菌遞送載體、包含負載有抗原或經包含編碼抗原之核酸的組合物轉染之細胞的抗原呈現細胞(APC)載體、脂質抗原遞送媒劑或編碼抗原之裸核酸載體。此清單並不意欲為限制性的。舉例而言,此類疫苗亦可包含表現且分泌GM-CSF、CCL20、CCL3、IL-12p70、FLT-3配位體、細胞介素中之一或多者之不活化腫瘤細胞。 每天可用之通式(I)化合物的劑量範圍通常為每公斤體重0.00001至10 mg,例如每公斤患者體重0.00001至1 mg。各劑量單位可宜含有0.001至1000 mg,例如0.001至100 mg。 當然,實際治療有效量或治療劑量將視熟習此項技術者已知之因素,諸如患者之年齡及體重、投藥途徑及疾病之嚴重程度而定。在任何情況下,化合物或組合物應根據患者之特有病狀以能達成遞送治療有效量之劑量及方式投與。 根據本發明之化合物、組合物,包括與一或多種額外治療劑之任何組合可藉由黏膜(例如口服、舌下、陰道、經鼻、頸椎等)、瘤內、瘤周、經皮、吸入或非經腸(例如皮下、靜脈內、肌肉內、動脈內、皮內、鞘內及硬膜外投藥)途徑投與。在可能的投藥方法中,瘤內、瘤周、皮下或靜脈內投藥係較佳的。 本發明化合物展現出若干優點,諸如與人類STING之有利結合親和力、有利細胞活性,亦即在攜載不同人類STING對偶基因之細胞中,細胞分析中展現有利穩定性。 因此,在另一態樣中,本發明提供新型式(I)化合物,包括其醫藥學上可接受之鹽,其以STING依賴型方式活體外及/或活體內誘導細胞介素產生,且具有供用於療法中,亦即供用作藥劑之適合藥理學及藥物動力學特性。 在另一態樣中,本發明提供新型式(I)化合物,包括其醫藥學上可接受之鹽,其供用於治療與STING相關或經STING調節之疾病或病狀的方法中。 在另一態樣中,本發明提供新型式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽,其用於治療發炎、過敏性或自體免疫疾病,例如過敏性鼻炎或哮喘,用於治療傳染病或癌症,或用於用作疫苗佐劑。 在另一態樣中,本發明提供式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽在製造用於治療STING之調節為有益的的疾病或病狀之藥劑中的用途。 在另一態樣中,本發明提供式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽在製造用於治療發炎、過敏性或自體免疫疾病,例如過敏性鼻炎或哮喘,用於治療傳染病或癌症之藥劑中的用途。 因此,本發明係關於作為藥劑之式(I)化合物。 此外,本發明係關於式(I)化合物在用於在患者中,較佳人類中治療與STING相關或經STING調節之疾病或病狀的方法中之用途。 此外,本發明係關於式(I)化合物在用於治療發炎、過敏性或自體免疫疾病,例如過敏性鼻炎或哮喘,用於治療傳染病或癌症的方法中之用途。 在又一態樣中,本發明係關於一種用於在哺乳動物中治療與STING相關或經STING調節之疾病或病狀的方法,其包括向需要此類治療之患者,較佳人類投與治療有效量的本發明之化合物或醫藥組合物的步驟。 在另一態樣中,本發明提供一種用於在個體中治療與STING相關或經STING調節之疾病或病狀的方法,其包含向個體投與治療有效量之式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽。 在另一態樣中,本發明提供一種在有需要之患者中治療發炎、過敏性或自體免疫疾病,例如過敏性鼻炎或哮喘,治療傳染病或癌症之方法,其包含向患者投與治療有效量之式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽。 在一相關態樣中,本發明係關於在個體中誘導、刺激或輔助免疫反應之方法。此等方法包含向個體投與本發明之實質上純CDN或其前藥或醫藥學上可接受之鹽。 在另一態樣中,本發明提供式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽之用途,其係用於製造用於治療或預防疾病之包含抗原或抗原組合物之免疫原性組合物。 在另一態樣中,本發明提供一種治療或預防疾病之方法,其包含向患有或易患疾病之人類個體投與包含抗原或抗原組合物及式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽的免疫原性組合物。 在另一態樣中,本發明提供用於治療或預防疾病的包含抗原或抗原組合物及式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽的疫苗組合物。 在另一態樣中,本發明提供式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽之用途,其係用於製造用於治療或預防疾病之包含抗原或抗原組合物的疫苗組合物。 在另一態樣中,本發明提供一種治療或預防疾病之方法,其包含向患有或易患疾病之人類個體投與包含抗原或抗原組合物及式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽的疫苗組合物。
醫藥組合物
在本發明之另一態樣中,發現上述化合物之醫藥組合物可經調配而適用於投與治療有效量之該等抑制劑以治療與STING相關或經STING調節之疾病或病狀。 出於本發明之目的,醫藥組合物可藉由多種手段投與,包括以含有醫藥學上可接受之載劑、佐劑及媒劑之調配物形式經腸、非經腸、藉由吸入噴霧、局部或經直腸進行。本發明化合物之瘤內(直接進入腫瘤塊)或瘤周(腫瘤塊周圍)投與可直接活化局部浸潤性DC,直接促進腫瘤細胞之細胞凋亡或使腫瘤細胞對細胞毒素劑敏感。 本發明之醫藥組合物可呈無菌可注射製劑形式,諸如無菌可注射水性或油性懸浮液。此懸浮液可根據已知技術使用上文或下文所提及之彼等適合分散劑或濕潤劑及懸浮劑調配。無菌可注射製劑亦可為在無毒非經腸可接受稀釋劑或溶劑中之無菌可注射溶液或懸浮液,諸如於1,3-丁二醇中之溶液;或製備成凍乾粉末。在可接受之媒劑及溶劑中,可採用的有水、林格氏溶液(Ringer's solution)及等張氯化鈉溶液。此外,無菌不揮發性油可習知地用作溶劑或懸浮介質。出於此目的,可採用任何溫和不揮發性油,包括合成單甘油酯或二甘油酯。此外,諸如油酸之脂肪酸亦可用於製備可注射劑。 適用於在口腔中局部投與之調配物包括在調味基質(通常為蔗糖及阿拉伯膠或黃蓍)中包含活性成分的口含錠;在惰性基質(諸如明膠及甘油或蔗糖及阿拉伯膠)中包含活性成分之片劑;及在適合液體載劑中包含活性成分的漱口劑。 適用於經陰道投與之調配物可呈現為子宮托、棉塞、乳膏、凝膠、糊狀物、發泡體或噴霧劑調配物形式,除了含有活性成分以外,其亦含有諸如此項技術中已知為合適之載劑。 適用於非經腸投與之調配物包括水性及非水性等張無菌注射溶液,其可含有抗氧化劑、緩衝劑、抑菌劑及溶質,其使得調配物與既定接受者之血液等張;及水性及非水性無菌懸浮液,其可包括懸浮劑及增稠劑。可使調配物存於單位劑量或多劑量密封容器(例如安瓿及小瓶)中,且可在經冷凍乾燥(凍乾)條件下儲存,僅需要在即將使用之前添加無菌液體載劑,例如注射用水。可自上述種類之無菌粉末、顆粒及錠劑製備注射溶液及懸浮液。 因此,根據本發明之另一態樣,提供醫藥組合物,其包含一或多種式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽,視情況連同一或多種惰性載劑及/或稀釋劑。 此外,本發明係關於根據本發明之醫藥組合物用於在患者中,較佳人類中治療與STING相關或經STING調節之疾病或病狀的用途。 根據本發明之第二態樣之一個實施例,提供一種供用於治療與STING相關或經STING調節之疾病或病狀之方法中的醫藥組合物,其包含上述化合物中之一或多者或其醫藥學上可接受之鹽,視情況連同一或多種惰性載劑及/或稀釋劑。 根據另一實施例,提供一種包含一或多種式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽的疫苗。 在另一態樣中,本發明提供一種包含式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽的疫苗佐劑。 在另一態樣中,本發明提供一種包含抗原或抗原組合物及式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽的免疫原性組合物。 在另一態樣中,本發明提供一種用於治療或預防疾病的包含抗原或抗原組合物及式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽的免疫原性組合物。 根據另一實施例,提供一種醫藥組合物,其包含一或多種式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽及一或多種額外治療劑,視情況連同一或多種惰性載劑及/或稀釋劑。較佳地,此組合物包含一種式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽及一或多種額外治療劑。
組合療法
本發明化合物可以足以誘導、調節或刺激合適免疫反應之量獨立使用或可與醫藥學上可接受之賦形劑組合使用。免疫反應可包含(但不限於)特異性免疫反應、非特異性免疫反應、特異性及非特異性反應、先天性反應、原初免疫反應、繼承免疫性、二次免疫反應、記憶免疫反應、免疫細胞活化、免疫細胞增殖、免疫細胞分化及細胞介素表現。在某些實施例中,本文所述之化合物及其組合物與一或多種其他組合物結合投與,該一或多種其他組合物包括旨在刺激對一或多種預定抗原之免疫反應的疫苗;佐劑;CTLA-4及PD-1路徑拮抗劑、脂質、脂質體、化學治療劑、免疫調節細胞株等。 本文所述之化合物及其組合物可在其他治療性或防治性組合物或模態之前、之後及/或同時投與。此等包括(但不限於):B7共刺激分子、介白素-2、干擾素-g、GM-CSF、CTLA-4拮抗劑、OX-40/OX-40配位體、CD40/CD40配位體、沙格司亭(sargramostim)、左旋咪唑(levamisol)、痘瘡病毒、卡介苗(Bacille Calmette-Guerin;BCG)、脂質體、礬、弗氏完全或不完全佐劑(Freund's complete or incomplete adjuvant)、解毒內毒素、礦物油、表面活性物質(諸如脂質卵磷脂(lipolecithin))、普洛尼克多元醇(pluronic polyol)、聚陰離子、肽及油或烴乳液。較佳為誘導T細胞免疫反應之載劑,其相對於抗體反應優先刺激細胞溶解T細胞反應,但亦可使用刺激兩種類型之反應的載劑。在試劑為多肽之情況下,可投與多肽本身或編碼多肽之聚核苷酸。載劑可為細胞,諸如抗原呈現細胞(APC)或樹突狀細胞。抗原呈現細胞包括此類如巨噬細胞、樹狀細胞及B細胞之細胞類型。其他專業抗原呈現細胞包括單核細胞、邊緣區庫普弗細胞(marginal zone Kupffer cell)、微神經膠質細胞、蘭格漢氏細胞(Langerhans' cell)、嚙合樹突狀細胞、濾泡樹突狀細胞及T細胞。亦可使用兼性抗原呈現細胞。兼性抗原呈現細胞之實例包括星形膠質細胞、濾泡細胞、內皮細胞及纖維母細胞。載劑可為細菌細胞,其經轉型以表現多肽或遞送聚核苷酸,其之後在經疫苗接種的個體之細胞中表現。可添加佐劑(諸如氫氧化鋁或磷酸鋁)以提高疫苗觸發、增強或延長免疫反應之能力。其他材料,諸如細胞介素、趨化激素及細菌核酸序列,例如CpG、鐸樣受體(TLR) 9促效劑以及TLR 2、TLR 4、TLR 5、TLR 7、TLR 8、TLR9之其他促效劑,包括脂蛋白、LPS、單磷醯基脂質A、脂磷壁酸、咪喹莫特(imiquimod)、雷西莫特(resiquimod)以及視黃酸誘導性基因I (RIG-I)促效劑,諸如聚I:C亦為潛在佐劑,其單獨或與所述組合物組合使用。佐劑之其他代表性實例包括合成佐劑QS-21,其包含自皂皮樹之樹皮純化之均質皂素及短小棒狀桿菌(Corynebacterium parvum) (McCune等人, Cancer, 1979; 43:1619)。 用於與其他治療劑共同投與之方法為此項技術中所熟知(Hardman等人(編) (2001) Goodman and Gilman's The Pharmacological Basis of Therapeutics,第10版,McGraw-Hill, New York, NY;Poole及Peterson (編) (2001) Pharmacotherapeutics for Advanced Practice:A Practical Approach, Lippincott, Williams & Wilkins, Phila., PA;Chabner及Longo (編) (2001) Cancer Chemotherapy and Biotherapy, Lippincott, Williams & Wilkins, Phila., PA)。通常,共同投藥或一起投藥指示用兩種或多於兩種藥劑治療個體,其中該等藥劑可同時或在不同時間投與。舉例而言,此類藥劑可以單獨投與形式遞送至單一個體,單獨投與可在基本上相同時間或不同時間進行,且其可藉由相同投與途徑或不同投與途徑進行。此類藥劑可在同一投藥(例如同一調配物)中遞送至單一個體,以使得其藉由同一投藥途徑得到同時投與。 由於本發明化合物之佐劑特性,其亦可與其他治療模態(包括其他疫苗、佐劑、抗原、抗體及免疫調節劑)組合使用。實例提供於下。
佐劑
除了本文所述之本發明化合物及其組合物之外,本發明之組合物或方法可進一步包含一或多種其他物質,由於其性質,其可用以刺激或以其他方式利用免疫系統對經靶向之腫瘤細胞上存在的癌症抗原作出反應。此類佐劑包括(但不限於)脂質、脂質體、誘導先天性免疫之不活化細菌(例如不活化或減毒單核球增多性李氏菌(Listeria monocytogenes))、經由鐸樣受體(TLR)、(NOD)-樣受體(NLR)介導先天性免疫活化之組合物、視黃酸誘導性基因類(RIG)-I樣受體(RLR)、C型凝集素受體(CLR)及/或病原體相關分子模式(「PAMPS」)。PAMP之實例包括脂蛋白、脂多肽、肽聚糖、酵母聚糖、脂多醣、奈瑟氏球菌外膜蛋白(neisserial porin)、鞭毛蛋白、普洛非林(profillin)、半乳糖神經醯胺、胞壁醯二肽。肽聚糖、脂蛋白及脂磷壁酸為革蘭氏陽性(Gram-positive)細胞壁組分。脂多醣由大部分細菌表現,MPL係其中一個實例。鞭毛蛋白指由病原性及共生細菌分泌之細菌鞭毛之結構組分。半乳糖苷基神經醯胺為自然殺手T (NKT)細胞之活化因子。胞壁醯二肽為所有細菌共有的生物活性肽聚糖主結構。
免疫檢查點抑制劑
本發明之化合物可與免疫檢查點抑制劑,諸如選自由以下組成之群的免疫檢查點抑制劑:CTLA-4路徑拮抗劑、PD-1路徑拮抗劑、Tim-3路徑拮抗劑、Vista路徑拮抗劑、BTLA路徑拮抗劑、LAG-3路徑拮抗劑或TIGIT路徑拮抗劑組合使用。在一些實施例中,免疫檢查點抑制劑係選自由以下組成之群:抗CTLA-4抗體、抗PD-1抗體、抗Tim-3抗體、抗Vista抗體、抗BTLA抗體、抗LAG-3抗體或抗TIGIT抗體。 本發明之化合物可與CTLA-4路徑拮抗劑組合使用。在一些實施例中,組合用於治療實體腫瘤或血液科惡性疾病。認為CTLA-4為後天性免疫反應之重要負調控劑。經活化之T細胞上調CTLA-4,其與CD28相比以較高親和力結合抗原呈現細胞上之CD80及CD86,由此抑制T細胞刺激、IL-2基因表現及T細胞增殖。已在結腸癌瘤、轉移性前列腺癌及轉移性黑素瘤之鼠類模型中觀測到CTLA4阻斷之抗腫瘤作用。在一些實施例中,CTLA-4路徑拮抗劑為選自由曲美單抗(tremelimumab)及伊派利單抗(ipilimumab)組成之群的抗CTLA-4抗體分子。 伊派利單抗(CTLA-4抗體,亦稱為MDX-010,CAS編號477202-00-9)及曲美單抗(IgG2單株抗體,原名替西單抗(ticilimumab),CP-675,206)係結合於人類CTLA4且防止其與CD80及CD86相互作用的人類化單株抗體。可由類似策略靶向之其他負免疫調節劑包括計劃性細胞死亡1 (PD-1)、B及T淋巴細胞弱化子、轉型生長因子β、介白素-10及血管內皮生長因子。 在一些實施例中,本發明化合物可與抗CTLA-4抗體及抗PD-1抗體組合使用。在一個實施例中,組合包括抗PD-1抗體分子,例如如本文中所述,及抗CTLA-4抗體,例如伊派利單抗。可使用之例示性劑量包括約1至10 mg/kg,例如3 mg/kg之抗-PD-1抗體分子之劑量及約3 mg/kg之抗CTLA-4抗體,例如伊派利單抗。 本發明化合物可與PD-1路徑拮抗劑組合使用。在一些實施例中,組合用於治療實體腫瘤或血液科惡性疾病。PD-1為在活化T細胞上表現之後天性免疫反應之另一負調控劑。PD-1結合於B7-H1及B7-DC,且PD-1之接合抑制T細胞活化。抗腫瘤作用已經PD-1路徑阻斷證明。已在文獻中報導抗PD-1抗體分子(例如納武單抗(Nivolumab)(Opdivo™)、派立珠單抗(pembrolizumab)(Keytruda™)及皮立珠單抗(pidilizumab))及AMP-224為可用於本發明中之PD-1路徑阻斷劑之實例。在一些實施例中,PD-1路徑拮抗劑為選自由納武單抗、派立珠單抗或皮立珠單抗組成之群的抗PD-1抗體分子。 在一些實施例中,PD-1路徑拮抗劑為免疫黏附素(例如包含與恆定區(例如免疫球蛋白序列之Fc區)融合之PD-L1或PD-L2之細胞外或PD-1結合部分之免疫黏附素)。在一些實施例中,PD-1抑制劑為AMP-224 (B7-DCIg;Amplimmune;例如WO2010/027827及WO2011/066342中所揭示),其為阻斷PD-1與B7-H1之間的相互相用之PD-L2 Fc融合可溶性受體。 在一些實施例中,PD-1路徑拮抗劑為PD-L1或PD-L2抑制劑。在一些實施例中,PD-L1或PD-L2抑制劑為抗PD-L1抗體或抗PD-L2抗體。在一些實施例中,抗PD-L1抑制劑係選自YW243.55.S70、MPDL3280A、MEDI-4736、MSB-0010718C或MDX-1105。在一些實施例中,PD-L1抑制劑為抗PD-L1抗體MSB0010718C。MSB0010718C (亦稱為A09-246-2;Merck Serono)為單株抗體,其結合於PD-L1。 本發明化合物可與TIM-3路徑拮抗劑組合使用。在一些實施例中,組合用於治療實體腫瘤或血液科惡性疾病。在一些實施例中,TIM-3路徑拮抗劑為抗TIM-3抗體。在一些實施例中,抗TIM-3抗體分子揭示於2015年8月6日公開之題為「Antibody Molecules to TIM-3 and Uses Thereof」之US 2015/0218274中。 本發明化合物可與LAG-3路徑拮抗劑組合使用。在一些實施例中,組合用於治療實體腫瘤或血液科惡性疾病。在一些實施例中,LAG-3路徑拮抗劑為抗LAG-3抗體。在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子揭示於2015年3月13日申請之題為「Antibody Molecules to LAG-3 and Uses Thereof」之US 2015/0259420中。
T 細胞受體促效劑
本發明化合物可與T細胞受體促效劑組合使用,諸如CD28促效劑、OX40促效劑、GITR促效劑、CD137促效劑、CD27促效劑或HVEM促效劑。 本發明化合物可與CD27促效劑組合使用。例示性CD27促效劑包括抗CD27促效抗體,例如PCT公開案第WO 2012/004367號中所述。 本發明化合物可與GITR促效劑組合使用。在一些實施例中,組合用於治療實體腫瘤或血液科惡性疾病。例示性GITR促效劑包括例如GITR融合蛋白及抗GITR抗體(例如二價抗GITR抗體)。
TLR 促效劑
本發明化合物可與鐸樣受體促效劑組合使用。如本文所用,術語「鐸樣受體」(或「TLR」)係指感測微生物產物及/或引發後天性免疫反應的蛋白質之鐸樣受體家族之成員或其片段。在一個實施例中,TLR活化樹突狀細胞(DC)。鐸樣受體(TLR)為模式識別受體之家族,其最初鑑別為識別微生物病原體之先天性免疫系統之感測器。TLR包含含有富含白胺酸之重複之胞外域、跨膜域及胞內TIR (Toll/IL-1R)域之保守性跨膜分子之家族。TLR識別微生物中之不同結構,通常稱為「PAMP」(病原體相關分子模式)。結合於TLR之配位體調用細胞內信號傳遞路徑之級聯,該級聯誘導參與炎症及免疫之因子之產生。 此項技術中已知且在本發明中使用之TLR促效劑包括(但不限於)以下: Pam3Cys,一種TLR-1/2促效劑; CFA,一種TLR-2促效劑; MALP2,一種TLR-2促效劑; Pam2Cys,一種TLR-2促效劑; FSL-1,一種TLR-2促效劑; Hib-OMPC,TLR-2促效劑; 聚肌胞苷酸(聚I:C),一種TLR-3促效劑; 聚腺苷-聚尿苷酸(聚AU),一種TLR-3促效劑; 經聚-L-離胺酸及羧甲基纖維素穩定之聚肌苷酸-聚胞苷酸(Hiltonol
®
),一種TLR-3促效劑; 單磷醯基脂質A (MPL),一種TLR-4促效劑; LPS,一種TLR-4促效劑; 細菌鞭毛蛋白,一種TLR-5促效劑; 唾液酸基-Tn (STn),一種與許多人類癌細胞上之MUC1黏蛋白相關之碳水化合物及一種TLR-4促效劑; 咪喹莫特,一種TLR-7促效劑; 雷西莫特,一種TLR-7/8促效劑; 洛索立賓(loxoribine),一種TLR-7/8促效劑;及 未甲基化CpG二核苷酸(CpG-ODN),一種TLR-9促效劑。 由於其佐劑品質,TLR促效劑較佳與其他疫苗、佐劑及/或免疫調節劑組合使用,且可組合於多種組合中。由此在某些實施例中,如本文所述,結合於STING且誘導STING依賴型TBK1活化之單或二FCDN化合物及表現且分泌一或多種刺激樹突狀細胞誘導、募集及/或成熟的細胞介素之不活化腫瘤細胞可與用於治療目的之一或多種TLR促效劑一起投與。
抗體治療
本發明化合物可與治療性抗體組合使用。在一些實施例中,治療性抗體之作用機制為抗體依賴性細胞介導之細胞毒性(ADCC)。ADCC為細胞介導之免疫防禦機制,藉此免疫系統之效應細胞主動溶解細胞膜表面抗原已由特異性抗體結合之靶細胞。其為抗體作為體液免疫反應之一部分可發揮作用來限制及制約感染之機制中之一者。經典ADCC由自然殺手(NK)細胞介導;巨噬細胞、嗜中性白血球及嗜伊紅血球亦可介導ADCC。ADCC為針對腫瘤之治療性單株抗體(包括曲妥珠單抗(trastuzumab)及利妥昔單抗(rituximab))之重要作用機制。本發明化合物可用於增強ADCC。 以下係可與本發明化合物一起使用之抗體之例示性清單。 莫羅莫那-CD3 (Muromonab-CD3)、英利昔單抗(Infliximab)、阿達木單抗(adalimumab)、奧馬珠單抗(Omalizumab)、達利珠單抗(Daclizumab)、利妥昔單抗、布突默單抗(Ibritumomab)、托西莫單抗(Tositumomab)、西妥昔單抗(Cetuximab)、曲妥珠單抗、阿侖單抗(Alemtuzumab)、Lym-1伊派利單抗、維他欣(Vitaxin)、貝伐單抗(Bevacizumab)及阿昔單抗(Abciximab)。 可與本發明化合物組合使用之其他治療性抗體包括催乳激素受體(PRLR)抑制劑、HER3抑制劑、EGFR2及/或EGFR4抑制劑、M-CSF抑制劑、抗APRIL抗體或抗SIRP或抗CD47抗體。
化學治療劑
在本文所述之方法的其他實施例中,本發明化合物與化學治療劑(例如小分子醫藥化合物)組合使用。因此,方法進一步涉及投與個體有效量之一或多種化學治療劑作為額外治療或組合治療。在某些實施例中,該一或多種化學治療劑係選自由以下組成之群:乙酸阿比特龍(abiraterone acetate)、六甲蜜胺(altretamine)、脫水長春花鹼(anhydrovinblastine)、奧瑞他汀(auristatin)、貝瑟羅汀(bexarotene)、比卡魯胺(bicalutamide)、BMS 184476、2,3,4,5,6-五氟-N-(3-氟-4-甲氧苯基)苯磺醯胺、博萊黴素(bleomycin)、N,N-二甲基-L-纈胺醯基-N-甲基-L-纈胺醯基-L-脯胺醯基-1-L脯胺酸-第三丁基醯胺、惡病質素、西馬多丁(cemadotin)、氯芥苯丁酸(chlorambucil)、環磷醯胺、3',4'-二去氫-4'-脫氧-8'-去甲長春鹼(3',4'-didehydro-4'-deoxy-8'-norvin-caleukoblastine)、多烯紫杉醇(docetaxol)、多西他賽(doxetaxel)、環磷醯胺、卡鉑(carboplatin)、卡莫司汀(carmustine)、順鉑(cisplatin)、克瑞托欣(cryptophycin)、環磷醯胺、阿糖胞苷(cytarabine)、達卡巴嗪(dacarbazine;DTIC)、放線菌素D、道諾黴素(daunorubicin)、地西他濱多拉司他汀(decitabine dolastatin)、小紅莓(doxorubicin) (阿德力黴素(adriamycin))、依託泊苷(etoposide)、5-氟尿嘧啶、非那雄安(finasteride)、氟他胺(flutamide)、羥基尿素(hydroxyurea)及羥基尿素紫杉烷(hydroxyureataxanes)、異環磷醯胺(ifosfamide)、利阿唑(liarozole)、氯尼達明(lonidamine)、洛莫司汀(lomustine;CCNU)、恩雜魯胺(enzalutamide)、雙氯乙基甲胺(氮芥)、美法侖(melphalan)、羥乙基磺酸米伏布林(mivobulin isethionate)、根瘤菌素(rhizoxin)、塞尼氟(sertenef)、鏈脲菌素(streptozocin)、絲裂黴素(mitomycin)、甲胺喋呤(methotrexate)、紫杉烷(taxanes)、尼魯胺(nilutamide)、奧那司酮(onapristone)、太平洋紫杉醇(paclitaxel)、潑尼氮芥(prednimustine)、丙卡巴肼(procarbazine)、RPR109881、磷酸斯穆斯汀(stramustine phosphate)、他莫昔芬(tamoxifen)、他索那明(tasonermin)、紫杉醇(taxol)、維甲酸(tretinoin)、長春鹼(vinblastine)、長春新鹼(vincristine)、硫酸長春地辛(vindesine sulfate)及長春氟寧(vinflunine)。 在本文所述之方法的其他實施例中,本發明化合物與化學治療劑及/或其他用於治療如本文方法中所述之適應症的藥劑組合使用。在一些實施例中,本發明化合物與一或多種選自由以下組成之群的藥劑組合使用:索塔妥林(sotrastaurin)、尼羅替尼(nilotinib)、5-(2,4-二羥基-5-異丙基苯基)-N-乙基-4-(4-((N-嗎啉基)甲基)苯基)異噁唑-3-甲醯胺、達妥昔布(dactolisib)、8-(6-甲氧基-吡啶-3-基)-3-甲基-1-(4-哌嗪-1-基-3-三氟甲基-苯基)-1,3-二氫-咪唑并[4,5-c]喹啉-2-酮、3-(2,6-二氯-3,5-二甲氧基苯基)-1-(6-((4-(4-乙基哌嗪-1-基)苯基)胺基)嘧啶-4-基)-1-甲基脲、布帕昔布(buparlisib)、8-(2,6-二氟-3,5-二甲氧基苯基)-N-(4-((二甲胺基)甲基)-1H-咪唑-2-基)喹喏啉-5-甲醯胺、(S)-N1-(4-甲基-5-(2-(1,1,1-三氟-2-甲基丙-2-基)吡啶-4-基)噻唑-2-基)吡咯啶-1,2-二甲醯胺、(S)-1-(4-氯苯基)-7-異丙氧基-6-甲氧基-2-(4-(甲基-(((1r,4S)-4-(4-甲基-3-側氧基哌嗪-1-基)環己基)甲基)胺基)苯基)-1,2-二氫異喹啉-3(4H)-酮、地拉羅司(deferasirox)、來曲唑(letrozole)、(4S,5R)-3-(2'-胺基-2-(N-嗎啉基)-4'-(三氟甲基)-[4,5'-二嘧啶]-6-基)-4-(羥甲基)-5-甲基噁唑啶-2-酮、(S)-5-(5-氯-1-甲基-2-側氧基-1,2-二氫吡啶-3-基)-6-(4-氯苯基)-2-(2,4-二甲氧基嘧啶-5-基)-1-異丙基-5,6-二氫吡咯并[3,4-d]咪唑-4(1H)-酮、4-((2-(((1R,2R)-2-羥基環己基)胺基)苯并[d]噻唑-6-基)氧基)-N-甲基-2-吡啶甲醯胺、甲磺酸伊馬替尼(imatinib mesylate)、2-氟-N-甲基-4-(7-(喹啉-6-基甲基)咪唑并[1,2-b][1,2,4]三嗪-2-基)苯甲醯胺、盧佐替尼(ruxolitinib)、帕比諾他(panobinostat)、奧卓司他(osilodrostat)、(S)-N-((S)-1-環己基-2-((S)-2-(4-(4-氟苯甲醯基)噻唑-2-基)吡咯啶-1-基)-2-側氧基乙基)-2-(甲胺基)丙醯胺、(S)-N-((S)-1-環己基-2-((S)-2-(4-(4-氟苯甲醯基)噻唑-2-基)吡咯啶-1-基)-2-側氧基乙基)-2-(甲胺基)丙醯胺、磷酸索尼蒂吉伯(sonidegib phosphate)、色瑞替尼(ceritinib)、7-環戊基-N,N-二甲基-2-((5-(哌嗪-1-基)吡啶-2-基)胺基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-甲醯胺、N-(4-((1R,3S,5S)-3-胺基-5-甲基環己基)吡啶-3-基)-6-(2,6-二氟苯基)-5-氟吡啶甲醯胺、2-(2',3-二甲基-[2,4'-二吡啶]-5-基)-N-(5-(吡嗪-2-基)吡啶-2-基)乙醯胺、恩拉菲尼(encorafenib)、7-環戊基-N,N-二甲基-2-((5-((1R,6S)-9-甲基-4-側氧基-3,9-二氮雙環[4.2.1]-壬-3-基)吡啶-2-基)胺基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-甲醯胺、畢尼替尼(binime-tinib)、米哚妥林(midostaurin)、依維莫司(everolimus)、1-甲基-5-((2-(5-(三氟甲基)-1H-咪唑-2-基)吡啶-4-基)氧基)-N-(4-(三氟甲基)苯基)-1H-苯并[d]咪唑2-胺、二天冬胺酸帕瑞肽(pasi-reotide diaspartate)、多韋替尼(dovitinib)、(R,E)-N-(7-氯-1-(1-(4-(二甲胺基)丁-2-烯醯基)氮雜環庚烷-3-基)-1H-苯并[d]咪唑-2-基)-2-甲基異菸鹼醯胺、N6-(2-異丙氧基-5-甲基-4-(1-甲基哌啶-4-基)苯基)-N4-(2-(異丙基磺醯基)-苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4,6-二胺、3-(4-(4-((5-氯-4-((5-甲基-1H-吡唑-3-基)胺基)嘧啶-2-基)胺基)-5-氟-2-甲基苯基)哌啶-1-基)硫雜環丁烷1,1-二氧化物、5-氯-N2-(2-氟-5-甲基-4-(1-(四氫-2H-哌喃-4-基)哌啶-4-基)苯基)-N4-(5-甲基-1H-吡唑-3-基)嘧啶-2,4-二胺、5-氯-N2-(4-(1-乙基哌啶-4-基)-2-氟-5-甲基苯基)-N4-(5-甲基-1H-吡唑-3-基)嘧啶-2,4-二胺、伐司撲達(valspodar)及丁二酸凡塔藍尼(vatalanib succinate)。 在其他實施例中,本發明化合物可與PKC抑制劑、BCR-ABL抑制劑、HSP90抑制劑、PI3K及/或mTOR之抑制劑、FGFR抑制劑、PI3K抑制劑、FGFR抑制劑、PI3K抑制劑、細胞色素P450之抑制劑(例如CYP17抑制劑)、HDM2抑制劑、芳香酶抑制劑、p53及/或p53/Mdm2相互作用之抑制劑或CSF-1R酪胺酸激酶抑制劑組合使用。 適合製劑包括例如錠劑、膠囊、栓劑、溶液(尤其注射用溶液(皮下、靜脈內、肌肉內)及輸注用溶液)、酏劑、乳液或可分散性粉末。醫藥活性化合物的含量應佔整體組合物之0.1至90 wt%,較佳0.5至50 wt%範圍內,亦即呈足以達成下文所指定之劑量範圍之量。必要時,指定之劑量可一日投與若干次。 上述組合搭配物之劑量通常為一般建議最低劑量之1/5至一般建議劑量之1/1。 在又一態樣中,本發明係關於一種用於在患者中治療與STING相關或經STING調節之疾病或病狀的方法,其包括向需要此類治療之患者(較佳為人類)組合投與治療有效量之本發明化合物與治療有效量之上文所述一或多種額外治療劑的步驟。 根據本發明之化合物與其他治療劑組合之用法可同時進行或以錯開的時間進行。 根據本發明之化合物及一或多種額外治療劑可一起存在於一種調配物中或獨立地在兩種相同或不同調配物中,例如作為所謂的分裝部分之套組。 因此,在另一態樣中,本發明提供一種包含式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽及至少一種其他治療劑的組合。 本發明的另一目的在於提供一種醫藥組合物,其包含式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽及至少一種其他治療劑及醫藥學上可接受之賦形劑中之一或多者。 在另一態樣中,本發明提供一種供用於療法中的包含式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽及至少一種其他治療劑之組合。 在另一態樣中,本發明提供一種供用於治療STING之調節為有益的的疾病或病狀的組合,其包含式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽及至少一種其他治療劑。 在另一態樣中,本發明提供一種供用於治療發炎、過敏性及自體免疫疾病、傳染病及癌症之組合,其包含式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽及至少一種其他治療劑。 在另一態樣中,本發明提供一種在患者中治療STING之調節為有益的的疾病或病狀之方法,其包含投與治療有效量之包含式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽及至少一種其他治療劑之組合。 在另一態樣中,本發明提供一種在患者中治療發炎、過敏性或自體免疫疾病、傳染病或癌症之方法,其包含投與治療有效量之包含式(I)化合物或其醫藥學上可接受之鹽及至少一種其他治療劑的組合。 當然,實際醫藥學上之有效量或治療劑量將視熟習此項技術者已知之因素,諸如患者之年齡及體重、投藥途徑及疾病之嚴重性而定。在任何情況下,組合應根據患者之特有病狀以能達成遞送醫藥學上之有效量之劑量及方式投與。 在另一態樣中,本發明係關於一種醫藥組合物,其包含根據本發明之化合物及一或多種上下文所述之額外治療劑,視情況連同一或多種惰性載劑及/或稀釋劑。 本發明之其他特徵及優點將自以下較詳細之實例而變得顯而易見,該等實例以舉例方式說明本發明之原理。
實例及實驗資料
以下實例僅出於說明本發明之目的且並不意欲以任何方式限制本發明之範疇。 在上下文中使用以下縮寫:
一般技術註解
術語「環境溫度」及「室溫」可互換使用且表示約20℃,例如15至25℃之溫度。 一般而言,已獲得根據本發明之化合物的
1
H NMR光譜及/或質譜。除非另外說明,否則所有層析操作均在室溫下進行。在環二核苷酸合成期間,典型地藉由使用不超過35℃之水浴溫度在減壓下旋轉蒸發來進行溶劑之蒸發。此外,在環二核苷酸合成期間,反應典型地在氮氣或氬氣下進行。 與人類STING複合的實例1.1 (與實例1.2相比,與人類STING之結合改良)及實例2.1 (與實例2.2相比,與人類STING之結合改良)之X射線結構表明兩個磷原子均具有Rp組態。由此以類似方式假定實例3.1 (與另一實例3非對映異構體相比,與人類STING之結合改良)及實例4.1 (與實例4.2相比,與人類STING之結合改良)之特徵亦為兩個磷原子處之Rp組態。
A) 分析方法 LC-MS 分析方法: 方法名稱:系統 A
HPLC系統:VWR/Hitachi:L-2130泵;VWR/Hitachi:L-2200自動取樣器;VWR/Hitachi:L-2300管柱烘箱;VWR/Hitachi:L-2450二極體陣列偵測器;Agilent:OpenLab MS系統:Bruker Esquire LC 6000光譜儀 管柱:Kromasil 100-5 C
8
,5 µm,50 mm × 3 mm 流速:0.4 mL/min,35℃,UV偵測範圍:220至300 nm 質譜:使用負離子及正離子ESI記錄於質譜儀上 溶劑: A:乙腈 B:水 C:20 mM NH
4
HCO
3
(pH 5.5)水溶液 梯度: 時間 A% B% C% 0 2 93 5 20 60 35 5 23 95 0 5 24 2 93 5 30 2 93 5 樣本製備:將樣本(2 µL至20 µL)溶解於87.5 µL乙腈及262.5 µL水中,注射體積2 µL至5 µL。
方法名稱: Z011_S03
裝置描述:具有DA及MS檢測器之Agilent 1200 管柱:XBridge C18_3.0 × 30 mm,2.5 μm 管柱生產商:Waters 描述: 梯度/溶劑 % Sol [H
2
O % Sol [乙腈] 流速[mL/min] T [℃] 時間[min] 0.1% NH
4
OH] 0.0 97.0 3.0 2.2 60.0 0.2 97.0 3.0 2.2 60.0 1.2 0.0 100.0 2.2 60.0 1.25 0.0 100.0 3.0 60.0 1.4 0.0 100.0 3.0 60.0
方法名稱: Z017_S04
裝置描述:具有DA及MS檢測器之Agilent 1200 管柱:StableBond C18_3.0 × 3 0 mm,1.8 μm 管柱生產商:Agilent 描述: 梯度/溶劑 % Sol % Sol [乙腈] 流速[mL/min] T [℃] 時間[min] [H
2
O 0.1% TFA] 0.0 97.0 3.0 2.2 60.0 0.2 97.0 3.0 2.2 60.0 1.2 0.0 100.0 2.2 60.0 1.25 0.0 100.0 3.0 60.0 1.4 0.0 100.0 3.0 60.0
方法名稱 : Z018_S04
裝置描述:具有DA及MS檢測器之Agilent 1200 管柱:Sunfire C18_3.0 × 30 mm,2.5 μm 管柱生產商:Waters 描述: 梯度/溶劑 % Sol % Sol [乙腈] 流速[mL/min] T [℃] 時間[min] [H
2
O 0.1% TFA] 0.0 97.0 3.0 2.2 60.0 0.2 97.0 3.0 2.2 60.0 1.2 0.0 100.0 2.2 60.0 1.25 0.0 100.0 3.0 60.0 1.4 0.0 100.0 3.0 60.0
方法名稱: Z035_001
裝置描述:具有DA及MS檢測器之Agilent 1200 管柱:Atlantis T3,4.6 × 50 mm,3 µm 管柱生產商:Waters 描述: 梯度/溶劑 % Sol [H
2
O % Sol [乙腈] 流速[mL/min] T [℃] 時間[min] 0.02 mol/L TEAF] 0.0 98.0 2.0 1.0 25.0 3.0 98.0 2.0 1.0 25.0 12.0 80.0 20.0 1.0 25.0 14.0 0.0 100.0 1.0 25.0 16.0 0.0 100.0 1.0 25.0
分析型 HPLC 組態 : 方法名稱 : 組態 A
(梯度HPLC) VWR/Hitachi:L-2130泵;VWR/Hitachi:L-2200自動取樣器;VWR/Hitachi:L-2350管柱烘箱(設置在30℃);VWR/Hitachi:L-2400可變波長UV/Vis偵測器;EZChrom軟體版本3.3.1 SP1。 YMC*GEL ODS-A 12 nm (10 µm;250 × 4 mm) 通道A= 20 mM TEAF (pH 6.8)水溶液;通道B= 100 %乙腈,20 mM TEAF (pH 6.8)。梯度:0 min 100 % A;30 min 100 % B;40 min 100 % B,30℃;流速:1.0 mL/min;UV 262 nm;
NMR 光譜分析:
核磁共振(NMR)光譜:對於
1
H光譜,化學位移參考DMSO溶劑信號(2.50 ppm),或者,對於在D
2
O中之測量值,參考DSS (4,4-二甲基-4-矽戊烷(silapentane)-1-磺酸)。
31
P NMR光譜藉由對比
1
H/
31
P之絕對頻率間接參考(Bruker BioSpin有限公司,軟體:TopSpin,au程式:xsi)。所有
31
P NMR光譜均用質子去偶記錄。
B) 中間物之合成 中間物 1.1
5'-OH-2'-F-3'-H-膦酸-N
6
-Bz-2'-脫氧腺苷
在室溫下將5'-DMTr-2'-F-3'-CEP-N
6
-Bz-2'-脫氧腺苷(由ChemGenes獲得,0.654g,0.747 mmol)溶解於乙腈(10 mL)及水(0.033 mL,1.50 mmol,2 eq.)中。添加三氟乙酸吡錠(0.173 g,0.896 mmol,1.2 eq.)且在室溫下攪拌反應混合物10分鐘。之後,添加第三丁胺(10 mL,95.7 mmol)且在室溫下攪拌反應混合物30分鐘。減壓蒸發反應混合物,再溶解於無水乙腈(25 mL)中且在減壓下蒸發。將殘餘物溶解於二氯甲烷(25 mL)及水(0.134 mL,7.44 mmol,10 eq.)中。添加於二氯甲烷(25 mL)中之二氯乙酸(0.555 mL,6.73 mmol,9 eq.)且將所得橙色溶液在室溫下攪拌10分鐘。添加吡啶(1.31 mL,13.6 mmol,18 eq.)且在室溫下攪拌反應混合物5分鐘。 反應混合物之LC-MS分析結果確認存在中間物1.1。 LC-MS (系統A): t
Ret
4.22 min;ESI-MS: 438 [M+H]
+
將溶劑減壓蒸發且使殘餘物與無水乙腈(4 × 15 mL)共沸。在最後一次蒸發程序期間,將溶液濃縮為約4 mL最終共沸物。所得中間物1.1之無水溶液立即用於後續反應。
中間物 1.2
線性二聚體5'-OH-LNA-N
6
-Bz-腺苷-(3'→5')-氰基乙基-硫代磷酸酯-2'-F-3'-H-膦酸-N
6
-Bz-2'-脫氧腺苷
使5'-DMTr-3'-CEP-LNA-N
6
-Bz-腺苷(由Exiqon獲得,0.998 g,1.27 mmol,1.7 eq.)與無水乙腈(4 × 15 mL)共沸。在最後一次蒸發程序期間,將溶液濃縮為約4 mL最終共沸物。在室溫下將所得溶液添加至溶解於約4 mL無水乙腈中之中間物1.1 (最大理論量:0.747 mmol)中。在室溫下攪拌反應混合物20 min。添加((
N , N -
二甲胺基-亞甲基)胺基)-
3H
-1,2,4-二噻唑啉-3-硫酮(DDTT) (0.203 g,0.823 mmol,1.1 eq.)且在室溫下攪拌反應混合物30分鐘。將揮發物減壓蒸發且將殘餘物溶解於二氯甲烷(25 mL)及水(0.134 mL,7.44 mmol,10 eq.)中。添加於二氯甲烷(25 mL)中之二氯乙酸(1.11 mL,13.5 mmol,18 eq.)且將橙色溶液在室溫下攪拌20分鐘。添加吡啶(10 mL)且在室溫下攪拌反應混合物5分鐘。 反應混合物之LC-MS分析結果確認存在呈非對映異構體之混合物形式的中間物1.2。 LC-MS (系統A): t
Ret
8.32 min、8.53 min;ESI-MS: 952 [M+H]
+
(對於各非對映異構體)。 將燒瓶塞住,小心地密封且儲存於-70℃下16小時。將混合物減壓蒸發且將殘餘物與無水吡啶(2 × 20 mL)減壓共蒸發。添加另一部分40 mL無水吡啶且將殘餘物減壓濃縮至總體積約20 mL。所得中間物1.2之無水溶液立即用於後續反應。
中間物 1.3
環二聚體LNA-N
6
-Bz-腺苷-(3'→5')-氰基乙基-硫代磷酸酯-2'-F-N
6
-Bz-2'-脫氧腺苷-(3'→5')-硫代磷酸酯
將2-氯-5,5-二甲基-1,3,2-二氧磷雜環己烷2-氧化物(DMOCP) (0.483 g,2.62 mmol,3.5 eq.)添加至於總體積為約20 mL的無水吡啶中之粗中間物1.2 (最大理論量:0.747 mmol)中。在室溫下攪拌所得混合物30分鐘。添加水(0.470 mL,26.1 mmol,35 eq.)及3
H
-1,2-苯并二硫醇-3-酮(0.189 g,1.12 mmol,1.5 eq.)且在室溫下持續攪拌。30分鐘之後,將反應混合物倒入於150 mL水中之碳酸氫鈉之溶液(4.500 g,53.6 mmol)中且在室溫下振盪5分鐘,之後添加乙酸乙酯/甲基-第三丁基醚之混合物(150 mL,1:1)。分離有機相且將水相用乙酸乙酯/甲基-第三丁基醚(2 × 80 mL,1:1)進一步萃取。將合併之有機相用無水硫酸鎂乾燥,隨後減壓蒸發溶劑且與100 mL無水甲苯共蒸發。進一步真空乾燥剩餘殘餘物。藉由製備型急驟層析(160 g矽膠,0%至16.7% MeOH/二氯甲烷之梯度)純化粗產物,得到呈非對映異構體之粗混合物形式的中間物1.3。 LC-MS (系統A): t
Ret
= 9.91 min、10.08 min;ESI-MS: 966 [M+H]
+
(對於各非對映異構體)。
中間物 2.1
5'-OH-3'-H-膦酸-LNA-N
6
-Bz-腺苷
以如針對中間物1.1所述之類似方式以5'-DMTr-3'-CEP-LNA-N
6
-Bz-腺苷(「LNA-A胺基酸酯」,EQ-0063-1000,由Exiqon獲得)為起始物質來製備中間物2.1。粗產物之LC-MS分析結果確認存在中間物2.1。 LC-MS (Z017_S04): t
Ret
= 0.62 min;ESI-MS: 448 [M+H]
+
。
中間物 2.2
線性二聚體5'-OH-2'-F-N
2
-異丁醯基-2'-脫氧鳥苷-(3'→5')-氰基乙基-硫代磷酸酯-3'-H-膦酸-LNA-N
6
-Bz-腺苷
使5'-DMTr-2'-F-3'-CEP-N
2
-異丁醯基-2'-脫氧鳥苷(ABCR AB350793,1.85 g,2.16 mmol,1.3 eq.) 與無水乙腈(2 × 10 mL)共沸。將殘餘物溶解於無水乙腈(10 mL)中且減壓濃縮至約5 mL。添加10片分子篩(3 Å)且在室溫下將所得混合物添加至溶解於約3 mL無水乙腈中之中間物2.1 (最大理論量:1.65 mmol)中。將反應混合物在室溫下攪拌42分鐘。添加((
N , N
-二甲胺基-亞甲基)胺基)-3
H
-1,2,4-二噻唑啉-3-硫酮(DDTT) (381 mg,1.85 mmol,1.1 eq.)且在室溫下攪拌反應混合物30分鐘。將揮發物真空蒸發且將殘餘物溶解於二氯甲烷(20 mL)及水(0.299 mL,16.6 mmol,10 eq.)中。添加於二氯甲烷中之二氯乙酸(6%,20 mL),且將所得橙色溶液在室溫下攪拌10分鐘。之後,添加吡啶(15 mL)且真空蒸發反應混合物。 粗產物之LC-MS分析結果確認存在中間物2.2。 LC-MS (Z011_S03): t
Ret
= 0.60 min;ESI-MS: 934 [M+H]
+ 中間物 2.3
環二聚體2'-F-N
2
-異丁醯基-2'-脫氧鳥苷-(3'→5')-氰基乙基-硫代磷酸酯-LNA-N
6
-Bz-腺苷-(3'→5')-硫代磷酸酯
將粗中間物2.2 (最大理論量:1.65 mmol)溶解於吡啶(36 mL)中且將溶液真空濃縮至約20 mL。添加2-氯-5,5-二甲基-1,3,2-二氧磷雜環己烷2-氧化物(DMOCP) (1134 mg,6.15 mmol,3.7 eq.)且在室溫下攪拌所得混合物15 min。添加水(1.03 mL,57.1 mmol,34 eq.)及3
H
-1,2-苯并二硫醇-3-酮(428 mg,2.54 mmol,1.5 eq.)且在室溫下持續攪拌。5分鐘之後,將反應混合物倒入於140 mL水中之碳酸氫鈉之溶液(4.00 g,47.6 mmol)中且在室溫下攪拌5分鐘,之後添加乙酸乙酯/甲基-第三丁基醚之混合物(140 mL,1:1)。分離有機相且用乙酸乙酯/甲基-第三第三丁基醚(1:1)進一步萃取水相且用二氯甲烷萃取若干次。合併有機相,用無水硫酸鎂乾燥且真空移除揮發物。 將剩餘殘餘物溶解於最小體積之二氯甲烷中且藉由製備型急驟層析(矽膠,DCM/MeOH:梯度100/0 à 70/30)純化。藉由HPLC-MS分析溶離份。合併含產物之溶離份且真空移除溶劑,得到呈非對映異構體之粗混合物形式的中間物2.3。 LC-MS (Z017_S04): t
Ret
= 0.86至0.88 min;ESI-MS: 948 [M+H]
+ 中間物 3.1
線性二聚體5'-OH-LNA-N
2
-dmf-鳥苷-(3'→5')-氰基乙基-硫代磷酸酯-2'-F-3'-H-膦酸-N
6
-Bz-2'-脫氧腺苷
向中間物1.1 (600 mg,1.17 mmol)之溶液中添加Activator 42之溶液(0.1 M於乙腈中,24 mL,2.4 mmol,2.1 eq.)。數分鐘之後,添加5'-DMTr-3'-CEP- LNA-N
2
-dmf-鳥苷-(「LNA-G(dmf)-胺基酸酯」,EQ-0082-1000,由Exiqon獲得,1.69 g,1.98 mmol,1.7 eq.)且在室溫下攪拌混合物45 min。添加苯乙醯基二硫化物(「PADS」,710 mg,2.35 mmol,2.0 eq.)於吡啶(10 mL)中之溶液且在室溫下攪拌混合物30 min。真空蒸發揮發物且使殘餘物與乙腈共沸兩次。將殘餘物溶解於二氯甲烷(14 mL)及水(0.21 mL,11.7 mmol,10 eq.)中。添加於二氯甲烷中之二氯乙酸(6%,1.14 mL),且將所得橙色溶液在室溫下攪拌20分鐘。之後,添加吡啶(8 mL)與甲醇(8 mL)之混合物且真空蒸發反應混合物。將剩餘殘餘物溶解於最小體積之二氯甲烷中且藉由製備型急驟層析(矽膠,DCM/MeOH:梯度95/5 à 0/100)純化。藉由HPLC-MS分析溶離份。合併含產物之溶離份且真空移除溶劑,得到粗中間物3.1。 粗物質之LC-MS分析結果確認存在中間物3.1。 LC-MS (Z017_S04): t
Ret
= 0.71 min;ESI-MS: 919 [M+H]
+ 中間物 3.2
環二聚體LNA-N
2
-dmf-鳥苷-(3'→5')-氰基乙基-硫代磷酸酯-2'-F-N
6
-Bz-2'-脫氧腺苷-(3'→5')-硫代磷酸酯
使粗中間物3.1 (最大理論量:0.109 mmol)與吡啶共沸兩次且溶解於吡啶(4 mL)中。添加特戊醯氯(0.050 mL,0.41 mmol,3.7 eq.)且在室溫下攪拌所得混合物45分鐘。添加元素硫(12 mg,0.38 mmol,3.5 eq.)且在室溫下持續攪拌45 min。真空蒸發揮發物且使殘餘物與甲苯共沸兩次。用乙腈濕磨剩餘殘餘物且加以過濾。減壓濃縮濾液且真空乾燥,得到呈非對映異構體之粗混合物形式的中間物3.2。 物質之LC-MS分析結果確認存在中間物3.2。 LC-MS (Z017_S04): t
Ret
= 0.78 min;ESI-MS: 933 [M+H]
+ 中間物 4.1
線性二聚體5'-OH-2'-F-2'-脫氧肌核苷-(3'→5')-氰基乙基-硫代磷酸酯-3'-H-膦酸-LNA-N
6
-Bz-腺苷
使5'-DMTr-2'-F-3'-CEP-2'-脫氧肌核苷(MFCD22374068,Astatech,2 g,2.59 mmol,1.7 eq.)與無水乙腈(3 × 15 mL)共沸。在最後一次蒸發程序期間,將溶液濃縮為約5 mL最終共沸物。在室溫下將所得溶液添加至溶解於約5 mL無水乙腈中之中間物2.1 (最大理論量:1.53 mmol)中。將反應混合物在室溫下攪拌15分鐘。以如針對中間物1.2所述之類似方式進行製備中間物4.1之進一步操作。 粗物質之LC-MS分析結果確認存在中間物4.1。 LC-MS (系統A): t
Ret
7.67 min;ESI-MS: 849 [M+H] 將燒瓶塞住,小心地密封且儲存於-70℃下16小時。將混合物減壓蒸發且將殘餘物與無水吡啶(2 × 20 mL)減壓共蒸發。添加另外一部分40 mL無水吡啶且將殘餘物減壓濃縮至總體積約20 mL。所得中間物4.1之無水溶液立即用於後續反應。
中間物 4.2
環二聚體2'-F-2'-脫氧肌核苷-(3'→5')-氰基乙基-硫代磷酸酯-LNA-N
6
-Bz-腺苷-(3'→5')-硫代磷酸酯
以如針對中間物1.3所述之類似方式進行中間物4.2之合成。將粗反應混合物倒入碳酸氫鈉(6.7 g,79.8 mmol)於200 mL水中之溶液中且在室溫下振盪5分鐘。在此期間,形成含產物之沈澱物且藉由過濾分離。將乙酸乙酯(200 mL)添加至濾液中且分離有機相。用乙酸乙酯(3 × 200 mL)進一步萃取水相三次。用無水硫酸鎂乾燥合併之有機相,之後減壓蒸發溶劑。添加含初始產物之沈澱物,之後與200 mL無水甲苯最終共蒸發。完成此等操作後,進一步真空乾燥粗物質。藉由製備型急驟層析(160 g矽膠,0%至16.7% MeOH/DCM之梯度)純化,得到呈非對映異構體之混合物形式的粗中間物4.2。 LC-MS (系統A): t
Ret
= 9.14 min、9.28 min;ESI-MS: 863 [M+H]
+
(對於各非對映異構體)。
C) 根據本發明之化合物的合成 實例 1.1 與實例 1.2
環狀(LNA-腺苷-(3'→5')-硫代磷酸酯-2'-F-2'-脫氧腺苷-(3'→5')-硫代磷酸酯)
將甲胺於無水乙醇(150 mL)中之33%溶液添加至粗環二聚體LNA-N
6
-Bz-腺苷-(3'→5')-氰基乙基-硫代磷酸酯-2'-F-N
6
-Bz-2'-脫氧腺苷-(3'→5')-硫代磷酸酯((中間物1.3;0.36 g)中且在室溫下攪拌所得溶液4小時。減壓蒸發所有揮發物且真空乾燥剩餘殘餘物。添加125 mL水且將所得懸浮液置放於室溫下之超音波浴中。15分鐘之後,將此懸浮液倒入100 mL氯仿中且分離有機相。用氯仿(2 × 100 mL)再重複此萃取兩次。用100 mL水萃取合併之有機相且用0.45 µm Rotilabo®-CME針筒過濾器(外徑:33 mm)過濾含合併產物之水相。將產物溶液用水稀釋至245 mL且施加至先前用2 M氯化鈉再生且用水洗滌之Cl
-
形式Q Sepharose™快流陰離子交換管柱(40至165 µm;125 × 35 mm;約120 mL)。用水(2個管柱體積)洗滌管柱,之後用超過16.7個管柱體積的0至1 M梯度之三乙基碳酸氫銨緩衝劑(TEAB,pH 7)水溶液,之後用超過8.3個管柱體積的2 M TEAB (pH 7)之階段梯度(偵測波長254 nm)。用約0.6 M TEAB至約2.0 M TEAB溶離實例1.1及實例1.2。小心地減壓濃縮含產物之溶離份。 藉由重複半製備型逆相HPLC純化實現實例1.1(第二溶離)與實例1.2(第一溶離)之分離。將產物溶液施加至先前用10%乙腈、20 mM三乙基甲酸銨(TEAF,pH 6.8)水溶液平衡之YMC*GEL ODS-A 12 nm管柱(10 µm;250 × 16 mm;約50 mL)。用10%、12%及16%乙腈,20 mM TEAF (pH 6.8)水溶液之階段梯度進行溶離。
實例 1 . 1 ,鈉鹽 ( 「第二溶離非對映異構體」 ) 之製備
藉由製備型逆相中壓液相層析(MPLC)進行實例1.1,TEA鹽之脫鹽。將產物溶液(約50 mL)施加至先前用水平衡之Merck LiChroprep®RP-18管柱(15至25 µm;450 × 25 mm;約220 mL)。用水洗滌管柱以移除過量TEAF緩衝液。之後,使用2% 2-丙醇水溶液溶離經脫鹽之實例1.1。將含產物之溶離份部分地減壓濃縮且隨後施加至先前用2 M氯化鈉再生且用水洗滌之Na
+
形式SP Sepharose™快流陽離子交換管柱(45至165 µm;125 × 35 mm;約120 mL)。將管柱用水洗滌直至不再偵測到UV吸光度(偵測波長254 nm)。將含產物之溶離份小心地減壓蒸發且進一步真空乾燥,得到呈鈉鹽形式之實例1.1。 HPLC (組態A):t
Ret
= 10.51 min;ESI-MS: 705 [M+H]
+ 31
P NMR (162 MHz, D
2
O, 303 K): δ 54.5 (s, 1P), 55.0 (s, 1P) ppm。
實例 1 . 2 , 鈉鹽 ( 「第一溶離非對映異構體」 ) 之製備
實例1.2,TEA鹽之脫鹽及自三乙基銨至鈉之鹽變化以如針對實例1.1,TEA鹽所述之類似方式進行。 HPLC (組態A):t
Ret
= 9.25 min;ESI-MS: 705 [M+H]
+ 31
P NMR (162 MHz, D
2
O, 303 K): δ 54.8 (s, 1P), 55.7 (s, 1P) ppm。
實例 2.1 及實例 2.2
環狀(LNA-腺苷-(3'→5')-硫代磷酸酯-2'-F-2'-脫氧鳥苷-(3'→5')-硫代磷酸酯),鈉鹽
向中間物2.3 (1300 mg,最大理論量:1.37 mmol)中添加甲胺於乙醇(50 mL)中之33%溶液且在室溫下攪拌混合物2 h。真空移除揮發物。用乙腈濕磨殘餘物,過濾,用乙腈洗滌且真空乾燥。藉由製備型HPLC (Atlantis C18;20 mM NH
4
OAc/乙腈= 98/2 à 70/30水溶液)純化殘餘物。合併含產物之溶離份且凍乾。以此方式獲得兩種非對映異構體,藉由製備型HPLC (Bonus;20 mM三乙基甲酸銨/乙腈= 98/2 à 70/30水溶液)進一步純化。合併含純產物之溶離份且凍乾兩次。藉由以下將兩種非對映異構體之三乙基銨鹽分別轉化成相應鈉鹽:將其溶解於1 mL水中,流動通過Bio-Rad Spin管柱(填充有250 mg BT AG 50W-2樹脂100至200目氫型,經3 mL 1M NaOH水溶液調節且之後用水洗滌至中性),用水溶離且凍乾含產物之溶離份。 實例2.1 (「第二溶離非對映異構體」): LC-MS (Z035_001): t
Ret
= 10.73 min;ESI-MS: 721 [M+H]
+
LC-MS (Z018_S04): t
Ret
= 0.60 min;ESI-MS: 721 [M+H]
+ 31
P NMR (162 MHz, D
2
O, 303 K): δ 54.7 (s, 2P) ppm。 實例2.2 (「第一溶離非對映異構體」): LC-MS (Z035_001): t
Ret
= 9.09 min;ESI-MS: 721 [M+H]
+
LC-MS (Z018_S04): t
Ret
= 0.39 min;ESI-MS: 721 [M+H]
+ 31
P NMR (162 MHz, D
2
O, 303 K): δ 54.7 (s, 1P); 55.0 (s, 1P) ppm。
實例 3.1 、實例 3.2 、實例 3.3 及實例 3.4
環狀(LNA-鳥苷-(3'→5')-硫代磷酸酯-2'-F-2'-脫氧腺苷-(3'→5')-硫代磷酸酯),鈉鹽
向中間物3.2 (330 mg,最大理論量:0.35 mmol)中添加甲胺於乙醇(16 mL)中之33%溶液且在室溫下攪拌混合物1 h。真空移除揮發物。用乙腈濕磨殘餘物,過濾,用乙腈洗滌且真空乾燥。藉由製備型HPLC (Atlantis C18;20 mM NH
4
OAc/乙腈水溶液,梯度98/2 à 80/20)純化殘餘物。合併含純產物之溶離份且凍乾。可以此方式分離四種非對映異構體。藉由以下將四種非對映異構體之三乙基銨鹽分別轉化成相應鈉鹽:將其溶解於1 mL水中,流動通過Bio-Rad Spin管柱(填充有250 mg BT AG 50W-2樹脂100至200目氫型,經1M NaOH水溶液調節且之後用水洗滌至中性),用水溶離且凍乾含產物之溶離份。 實例3.1 (「第四溶離非對映異構體」): LC-MS (Z018S04):t
Ret
= 0.60 min;ESI-MS: 721 [M+H]
+
LC-MS (Z035_001):t
Ret
= 11.05 min;ESI-MS: 721 [M+H]
+ 31
P NMR (162 MHz, D
2
O, 303 K): δ 54.4 (s, 1P), 54.7 (s, 1P) ppm。 實例3.2 (「第三溶離非對映異構體」): LC-MS (Z018S04):t
Ret
= 0.42 min;ESI-MS: 721 [M+H]
+
LC-MS (Z035_001):t
Ret
= 9.62 min;ESI-MS: 721 [M+H]
+ 31
P NMR (162 MHz, D
2
O, 303 K): δ 54.4 (s, 2P) ppm。 實例3.3 (「第二溶離非對映異構體」): LC-MS (Z018S04):t
Ret
= 0.26 min;ESI-MS: 721 [M+H]
+
LC-MS (Z035_001):t
Ret
= 8.76 min;ESI-MS: 721 [M+H]
+ 31
P NMR (162 MHz, D
2
O, 303 K): δ 54.8 (s, 1P), 55.9 (s, 1P) ppm。 實例3.4 (「第一溶離非對映異構體」): LC-MS (Z018S04):t
Ret
= 0.16 min;ESI-MS: 721 [M+H]
+
LC-MS (Z035_001):t
Ret
= 8.06 min;ESI-MS: 721 [M+H]
+ 31
P NMR (162 MHz, D
2
O, 303 K): δ 54.8 (s, 1P), 56.0 (s, 1P) ppm。
實例 4.1 及實例 4.2
環狀(LNA-腺苷-(3'→5')-硫代磷酸酯-2'-F-2'-脫氧肌核苷-(3'→5')-硫代磷酸酯),鈉鹽
將甲胺於純乙醇中之250 mL 33%溶液添加至粗中間物4.2 (0.43 g)中且在室溫下攪拌所得溶液5小時。減壓蒸發所有揮發物且進一步真空乾燥殘餘物,得到含有實例4.1及實例4.2之粗混合物。添加250 mL水且將所得懸浮液置放於室溫下之超音波浴中。15分鐘之後,將此懸浮液倒入125 mL氯仿中且分離有機相。用氯仿(2 × 125 mL)再重複此萃取兩次。用150 mL水萃取合併之有機相,且用0.45 µm再生纖維素(RC)濾膜(Sartorius Stedim Biotech,外徑:50 mm)過濾含合併產物之水相以移除顆粒組分。將產物溶液用水稀釋至1100 mL且施加至先前用2 M氯化鈉再生且用水洗滌之Cl
-
形式Q Sepharose™快流陰離子交換管柱(40至165 µm;125 × 35 mm;約120 mL)。用水(2個管柱體積)洗滌管柱,之後用超過16.7個管柱體積的0至1 M梯度之三乙基碳酸氫銨緩衝劑(TEAB,pH 7)水溶液,之後用超過4.2個管柱體積的1 M TEAB (pH 7) (偵測波長254 nm)。用約0.4 M TEAB至約0.8 M TEAB溶離實例4.1與實例4.2。小心地減壓濃縮含產物之溶離份。 藉由製備型逆相中壓液相層析(MPLC)實現實例4.1 (「第二次溶離」)與實例4.2 (第一次溶離)之分離。將產物溶液(約65 mL)施加至先前用100 mM三乙基甲酸銨(TEAF)水溶液平衡之Merck LiChroprep
®
RP-18管柱(15至25 µm;435 × 25 mm;約215 mL)。用2%、3%及4% 2-丙醇,20 mM TEAF (pH 6.8)水溶液之階段梯度進行溶離。小心地減壓濃縮含產物之溶離份。 藉由重複半製備型逆相HPLC純化實現實例4.1與實例4.2之進一步純化。將產物溶液施加至先前用9%至12%乙腈、20 mM TEAF (pH 6.8)水溶液平衡之YMC*GEL ODS-A 12 nm管柱(10 µm;250 × 16 mm;約50 mL)。用9%及12%乙腈,20 mM TEAF (pH 6.8)水溶液(實例4.2)或用12%乙腈,20 mM TEAF (pH 6.8)水溶液(實例4.1)之階段梯度進行溶離。小心地減壓濃縮含產物之溶離份。
實例 4 . 1 ,鈉鹽 ( 「第二溶離非對映異構體」 ) 之製備
藉由製備型逆相中壓液相層析(MPLC)進行實例4.1,TEA鹽之脫鹽。將產物溶液(約15 mL)施加至先前用水平衡之Merck LiChroprep®RP-18管柱(15至25 µm;450 × 25 mm;約220 mL)。用水洗滌管柱以移除過量TEAF緩衝液。之後,使用2% 2-丙醇水溶液溶離經脫鹽之實例2.1。將含產物之溶離份部分地減壓濃縮且隨後施加至先前用2 M氯化鈉再生且用水洗滌之Na
+
形式SP Sepharose™快流陽離子交換管柱(45至165 µm;125 × 35 mm;約120 mL)。將管柱用水洗滌直至不再偵測到UV吸光度(偵測波長254 nm)。將含產物之溶離份小心地減壓蒸發且進一步真空乾燥,得到呈鈉鹽形式之實例4.1。 HPLC (組態A, UV 250 nm):t
Ret
= 10.43 min;ESI-MS: 706 [M+H]
+ 31
P NMR (162 MHz, D
2
O, 303 K): δ 54.4 (s, 1P), 54.9 (s, 1P) ppm。
實例 4 . 2 , 鈉鹽 ( 「第一溶離非對映異構體」 ) 之製備
實例4.2,TEA鹽之脫鹽及自TEA至鈉之鹽變化以如針對實例4.1,TEA鹽所述之類似方式進行。 HPLC (組態A,UV 250 nm):t
Ret
= 9.37 min;ESI-MS: 706 [M+H]
+ 31
P NMR (162 MHz, D
2
O, 303 K): δ 54.4 (s, 1P), 54.9 (s, 1P) ppm。