TW201709907A - 位置專一性之具有ksp抑制劑之均質結合物 - Google Patents
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Abstract
本發明係關於紡錘體驅動蛋白抑制劑之位置專一性之均質結合劑藥物結合物,該等結合物之活性代謝物,製備該等結合物之方法,該等結合物用於治療及/或預防疾病之用途,及該等結合物用於製備用以治療及/或預防疾病、特別是過度增殖及/或血管生成病症(例如癌症)之藥劑之用途。該等治療可作為單一療法實施或與其他藥劑或其他治療措施組合實施。
Description
本發明係關於紡錘體驅動蛋白抑制劑之位置專一性之均質結合劑藥物結合物,關於該等結合物之活性代謝物,關於製備該等結合物之方法,關於該等結合物用於治療及/或預防疾病之用途,及關於該等結合物用於製備用以治療及/或預防疾病、特別地過度增殖及/或血管生成病症(例如癌症疾病)之藥劑之用途。該等治療可作為單一療法實施或與其他藥劑或其他治療措施組合實施。
癌症疾病係最多樣組織之不受控細胞生長之結果。在許多情形下,新細胞滲透至現有組織中(侵襲性生長),或其轉移至遠端器官中。癌症疾病在最多樣器官中發生且通常具有疾病之組織專一性過程。因此,術語癌症作為通用術語闡述各種器官、組織及細胞類型之一大組所定義疾病。
可藉由手術及放射療法措施去除早期階段之腫瘤。轉移腫瘤通常僅可藉由化學治療劑來姑息性治療。本文之目的係達成改良生活品質及延長生命之最佳組合。
已知結合劑蛋白與一或多種活性化合物分子之結合物,特別地其呈抗體藥物結合物(ADC)形式,其中針對腫瘤相關性抗原之內在化抗體係經由連接體共價連接至細胞毒性劑。在將ADC引入腫瘤細胞中
及後續結合物解離之後,細胞毒性劑本身或由其形成之細胞毒性代謝物在腫瘤細胞內釋放且可在其中直接及選擇性地顯露其作用。以此方式,與習用化學療法相比,以顯著更窄之範圍含有對正常組織之損害[例如參見J.M.Lambert,Curr.Opin.Pharmacol.5,543-549(2005);A.M.Wu及P.D.Senter,Nat.Biotechnol. 23,1137-1146(2005);P.D.Senter,Curr.Opin.Chem.Biol. 13,235-244(2009);L.Ducry及B.Stump,Bioconjugate Chem. 21,5-13(2010)]。因此,WO2012/171020闡述其中複數個毒性基團(toxophor)分子經由聚合連接體連接至抗體之ADC。作為可能毒性基團,WO2012/171020尤其提及物質SB 743921、SB 715992(伊斯平斯(Ispinesib))、MK-0371、AZD8477、AZ3146及ARRY-520。
最後提及之物質係紡錘體驅動蛋白抑制劑。紡錘體驅動蛋白(KSP,亦稱為Eg5、HsEg5、KNSL1或KIF11)係驅動蛋白樣馬達蛋白(motorprotein),其對於兩極有絲分裂紡錘體起作用而言係必需的。KSP之抑制導致有絲分裂受阻,且在相對長期內導致細胞凋亡(Tao等人,Cancer Cell 2005年7月8日(1),39-59)。在發現第一細胞滲透性KSP抑制劑莫那匹爾(Monastrol)後,KSP抑制劑已將其自身確立為一類新穎化學治療劑(Mayer等人,Science 286:971-974,1999),且其係大量專利申請案(例如WO2006/044825;WO2006/002236;WO2005/051922;WO2006/060737;WO03/060064;WO03/040979及WO03/049527)之標的。然而,由於KSP僅在有絲分裂階段期間在相對短之時間段期間顯露其作用,故KSP抑制劑在該等初始階段期間必須以足夠高之濃度存在。
抗體結合方法通常包括離胺酸或半胱胺酸分別與經活化酯或馬來醯亞胺官能基之化學反應。然而,該等反應在位置專一性及化學計量學方面難以控制,此產生異質產物(Wang等人,Protein Sci. 14,
2436-2446(2005);Hamblett等人,Clin.Cancer Res. 10,7063-7070(2004);Sun等人,Bioconjug.Chem. 16,1282-1290(2005);Willner等人,Bioconjug.Chem. 4,521-527(1993))。因此,異質ADC可含有未結合且超負載之抗體。未結合之抗體與載藥物質競爭用於抗原結合,此可減少ADC治療劑之活性。另一方面,抗體高度修改可導致抗體聚集,增加毒性,降低穩定性並縮短循環中ADC之半衰期(Sochaj等人,Biotechnology Advances,33,775-784(2015))。已報導ADC物質之異質性可影響其藥物動力學(PK)、活體內性能及安全性特性(Jackson等人,PLoS One 9,e83865(2014);Junutula等人,Nat.Biotechnol. 26,925-932(2008);Strop等人,Chem.Biol. 20,161-167(2013);Boswell等人,Bioconjugate Chem. 22,1994-2004(2011))。另外,ADC生產中批次間之一致性具有挑戰性且要求較強制造能力。因此,法規要求對於新穎ADC之批准將來可能有所改變。
其中已知數量之連接體-藥物一致結合至所定義位置之位置專一性結合係克服該等挑戰之一種方式。異質性得到最小化且ADC性質更易預測,且批次間生產一致結合物。藥物-對-抗體比率(DAR)可經精確控制且可經調整以適應各種連接體-藥物。在針對位置專一性結合之文獻中闡述了各種方法(Agarwal等人,Bioconjug.Chem. 26,176-192(2015);Cal等人,Angew.Chem.Int.Ed.Engl. 53,10585-10587(2014);Behrens等人,MAbs 6,46-53(2014);Panowski等人,MAbs 6,34-45(2014))。特別地,用於位置專一性結合之方法包括使用(例如)轉麩醯胺酸酶(TGase)、甘胺醯基轉移酶或甲醯基甘胺酸生成酶之酶性方法(Sochaj等人,Biotechnology Advances,33,775-784 2015)。
在WO2014/198817中(抗TWEAKR抗體)及在WO2015/189143中(無糖基化抗TWEAKR抗體)闡述可用於抗體藥物結合物(ADC)中之抗體。
此外,在WO2015/096982中闡述具有紡錘體驅動蛋白(KSP)之抗體藥物結合物(ADC)。尤其地,本申請案闡述具有TWEAKR抗體之ADC。
本發明提供紡錘體驅動蛋白抑制劑之新穎位置專一性之均質結合劑結合物,其中紡錘體驅動蛋白抑制劑結合至結合劑之麩醯胺酸側鏈且沒有隨機偶合之結合劑藥物結合物之所述缺點。
更具體而言,本發明提供紡錘體驅動蛋白抑制劑之新穎位置專一性之均質結合劑結合物,其中紡錘體驅動蛋白抑制劑係使用轉麩醯胺酸酶(TGase)結合至結合劑之麩醯胺酸側鏈且沒有隨機偶合之結合劑藥物結合物之所述缺點。
鑒於此背景,本發明之目標係提供在相對低之濃度下投與後顯露細胞凋亡作用且因此可有益於癌症療法之物質。
為達成此目標,本發明提供結合劑或其衍生物與一或多種活性化合物分子之位置專一性之均質結合物,該活性化合物分子係一或多個紡錘體驅動蛋白抑制劑(KSP抑制劑)或其前藥,其係經由連接體L連接至結合劑。結合劑較佳為結合劑蛋白或肽,尤佳人類、人類化或嵌合單株抗體或其抗原結合片段,特別地抗TWEAKR抗體或其抗原結合片段或抗EGFR抗體或其抗原結合片段。尤佳者係專一性結合至TWEAKR(SEQ ID NO:169)之位置47胺基酸D(D47)之抗TWEAKR抗體,特別地抗TWEAKR抗體TPP-2090或抗Her2抗體曲妥珠單抗(trastuzumab)。若結合劑係抗體,則其優先在恆定區中包含受體麩醯胺酸。該等受體麩醯胺酸可藉由適宜位置突變成麩醯胺酸(例如突變N297Q,Kabat EU編號)或藉由去糖基化或無糖基化抗體之生成(例如藉由由PNGase F引起之酶性去糖基化或藉由N297X之突變(Kabat EU編號))引入。在去糖基化或無糖基化抗體之後一情形下,麩醯胺酸
Q295(Kabat EU編號)變成受體麩醯胺酸。極佳者係包含突變N297A或N297Q(Kabat EU編號)之抗體。因此一般而言,本文所闡述之抗體亦包括該等抗體藉由由PNGase F引起之去糖基化或藉由重鏈之N297(抗體之Kabat編號系統,參見Kabat等人,Sequences of Proteins of Immulological Interest,第5版公共衛生署,國立衛生研究院,Bethesda,MD.(1991))突變成任一胺基酸而生成之無糖基化變體。此外,本文所闡述之抗體亦包括所闡述抗體經改造以含有一或多個受體麩醯胺酸殘基用於轉麩醯胺酸酶(TGase)催化之反應之變體。
此連接之一種方式係文獻闡述之使用轉麩醯胺酸酶處理結合劑之位置專一性結合之方法。包括細菌轉麩醯胺酸酶(BTG)(EC 2.3.2.13)之轉麩醯胺酸酶(TGase)係催化在麩醯胺酸之γ-羰基醯胺基團與離胺酸之一級胺之間形成共價鍵之酶。由於一些TGase亦接受除離胺酸以外之受質作為胺供體,故其一直用於在適宜受體麩醯胺酸殘基處修改蛋白質(包括抗體)(Jeger等人,Angewandte Chemie Int.Ed.Engl 49,9995-9997(2010);Josten等人,J.Immunol.Methods 240,47-54(2000);Mindt等人,Bioconjugate Chem. 19,271-278(2008);Dennler等人,在Antibody Drug Conjuagtes(Ducry,L.編輯),第205頁至第215頁,Humana Press.(2013))。一方面,使用轉麩醯胺酸酶用於將藥物偶合至所承載之遺傳上人造之麩醯胺酸標籤為藉由遺傳改造引入之轉麩醯胺酸酶受體麩醯胺酸之抗體(Strop等人,Chem.Biol. 20,161-167(2013))。另一方面,據報導位於重鏈恆定域中之保守麩醯胺酸Q295(IgG之Kabat編號系統)在無糖基化IgG1之主鏈內係細菌轉麩醯胺酸酶(EC 2.3.2.13)之唯一γ-羰基醯胺供體,而在IgG1之主鏈中不存在受體麩醯胺酸在重鏈之位置N297(kabat編號)處經糖基化(Jeger等人,Angewandte Chemie Int.Ed.Engl 49,9995-9997(2010))。總之,可使用細菌轉麩醯胺酸酶使連接體/藥物之胺基團結合至抗體之受體麩
醯胺酸殘基。該等受體麩醯胺酸可藉由突變或藉由生成無糖基化抗體而改造抗體來引入。該等無糖基化抗體可藉由使用N-糖苷酶F(PNGaseF)進行去糖基化或藉由重鏈之糖基化位置之N297(Kabat編號)突變成任一其他胺基酸來生成。該等無糖基化抗體之酶性結合係針對具有突變N297D、N297Q(Jeger等人,Angewandte Chemie Int.Ed.Engl 49,9995-9997(2010))或N297S(參見專利申請案WO2013092998A1及WO2013092983A2)之無糖基化抗體變體來闡述。使用該等無糖基化抗體之轉麩醯胺酸酶之酶性結合通常提供具有2之DAR之ADC,其中兩個重鏈均在位置Q295(Kabat編號)處位置專一性地經官能化。抗體之突變N297Q提供1個額外位置用於在每一重鏈處結合,從而產生(例如)具有4之DAR之ADCS,其中兩個重鏈均在位置Q295及Q297(Kabat編號)處位置專一性地經官能化。具有突變Q295N及N297Q之抗體變體在位置Q297處提供一個受體麩醯胺酸殘基(Simone Jeger,Site specific conjugation of tumour targeting antibodies using transglutaminase,ETH Zurich之論文(2009))。在闡述經由轉麩醯胺酸酶之無糖基化抗體之位置專一性結合之文獻中存在若干實例(例如Dennler等人,Bioconjugate Chemistry 19,569-578(2014);Lhospice等人,Molecular Pharmaceutics 12,1863-1871(2015))。使用轉麩醯胺酸酶催化之無糖基化抗體結合之策略概述於圖8中。
本發明者已發現以位置專一性之均質方式使結合劑連接至KSP抑制劑以便達成上文所提及目標之方式。此外,其證實轉麩醯胺酸酶可有效催化與具有突變N297A(Kabat編號)之無糖基化抗體變體之結合。
本發明提供結合劑或其衍生物與一或多種活性化合物分子之位置專一性之均質結合物,該活性化合物分子係紡錘體驅動蛋白抑制劑(KSP抑制劑),其係經由連接體L連接至結合劑,且該連接體L結合至
結合劑之專一位置,較佳結合劑之麩醯胺酸側鏈。
更具體而言,本發明提供結合劑或其衍生物與一或多種活性化合物分子之位置專一性之均質結合物,該活性化合物分子為紡錘體驅動蛋白抑制劑(KSP抑制劑),其係經由連接體L連接至結合劑,且該連接體L係使用轉麩醯胺酸酶(TGase)結合至結合劑之麩醯胺酸側鏈。
本發明之結合物可由以下通式表示:
其中BINDER表示結合劑,較佳抗體,L表示連接體,KSP表示KSP抑制劑,m表示1至5之數值,較佳1,且n表示2至10,較佳2至4,且亦較佳2或4。此處,m係每一連接體KSP抑制劑之數值且n係每一BINDER KSP抑制劑/連接體結合物之數值。因此,存於結合物中之所有KSP之總和係m及n之乘積。結合劑較佳為結合劑肽或蛋白質質,例如抗體。若結合劑係抗體,則其優先在恆定區中包含受體麩醯胺酸。該等受體麩醯胺酸可藉由適宜位置突變成麩醯胺酸(例如突變N297Q,Kabat EU編號)或藉由去糖基化或無糖基化抗體之生成(例如藉由由PNGase F引起之酶性去糖基化或藉由N297X之突變(Kabat EU編號))引入。在去糖基化或無糖基化抗體之後一情形下,麩醯胺酸Q295(Kabat EU編號)變成受體麩醯胺酸。極佳者係包含突變N297A或N297Q(Kabat EU編號)之抗體。此外,連接體連接至結合劑肽或蛋白質或其衍生物之麩醯胺酸殘基。尤佳者係結合至抗體之麩醯胺酸殘基。
根據本發明,紡錘體驅動蛋白抑制劑可具有以下子結構I(sub):
I(sub)
其中#a表示至分子剩餘部分之鍵;R1a 表示-H、-MOD或-(CH2)0-3Z,其中-MOD 表示為如下文所定義,其中Z表示 -H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2、-(CH2CH2O)0-3-(CH2)0-3Z‘(例如-(CH2)0-3Z‘)或-CH(CH2W)Z‘,其中Y3 表示H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2、-COOH、-NH-C(=O)-CH2-CH2-CH(NH2)COOH或-(C=O-NH-CHY4)1-3COOH,其中W 表示-H或-OH,其中Y4 表示視情況經-NHC(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基;R2a 表示-H、-C(=O)-CHY4-NHY5或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基;R4a 表示H、-C(=O)-CHY4-NHY5或-(CH2)0-3Z,
其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;其中Y4 表示視情況經-NHC(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或R4a 表示基團R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-或細胞自溶酶可裂解基團或基團R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-,其中R21 表示C1-10-烷基-、C5-10-芳基-或C6-10-芳烷基-、C5-10-雜烷基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基-、C5-10-雜環烷基-、雜芳基-、雜芳基-烷基-、C1-10-烷氧基-、C6-10-芳基氧基-或C6-10-芳烷氧基-、C5-10-雜烷氧基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基氧基-、C5-10-雜環烷氧基,其可經以下基團取代一或多次:-NH2、-NH-烷基、-N(烷基)2、-NH-C(=O)-烷基、-N(烷基)-C(=O)-烷基、-SO3H、-SO2NH2、-SO2-N(烷基)2、-COOH、-C(=O)-NH2、-C(=O)-N(烷基)2或-OH;或其表示-H或基團-(O)x-(CH2CH2O)y-R22,其中x 係0或1,其中v 係1至10之數值,其中R22 表示-H、-烷基(較佳C1-12-烷基)、-CH2-COOH、-CH2-CH2-COOH或-CH2-CH2-NH2;其中P2 係選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、
Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His;其中P3 係選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His或相應N-烷基胺基酸中之一者,較佳N-甲基胺基酸;或R2a及R4a 一起表示(且形成吡咯啶環)-CH2-CHR10-或-CHR10-CH2-,其中R10 表示-H、鹵素(較佳-F或-Cl)、-NH2、-COOH、-SO3H、-SH C1-4-烷基、鹵基-C1-4-烷基、C1-4-烷氧基、羥基取代之C1-4-烷基、-C(=O)-O-(C1-4-烷基)或-OH。
根據本發明,紡錘體驅動蛋白抑制劑可藉由在R1a、R2a、R4a或R10之氫原子經取代經由連接體連接至結合劑。
連接至此結合劑之該KSP抑制劑(或該等KSP抑制劑,由於通常一種以上KSP抑制劑連接至結合劑)較佳係下式(Ia)之化合物:
其中R1a 表示-H、-MOD或-(CH2)0-3Z,其中-MOD 表示為如下文所定義,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(O)-NY1Y2
或-C(O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2、-(CH2CH2O)0-3-(CH2)0-3Z‘(例如-(CH2)0-3Z‘)或-CH(CH2W)Z‘,Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2、-COOH、-NH-C(=O)-CH2-CH2-CH(NH2)COOH或-(C(=O)-NH-CHY4)1-3COOH,其中W 表示-H或-OH,其中Y4 表示視情況經-NHC(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基;R2a 表示-H、-MOD、-C(=O)-CHY4-NHY5或-(CH2)0-3Z,其中-MOD 表示為如下文所定義,其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基;R4a 表示-H、-C(=O)-CHY4-NHY5或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;
其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,且其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或R4a 表示基團R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-或R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2COOH)-C(=O)-或式R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-之細胞自溶酶可裂解基團,其中R21 表示C1-10-烷基-、C5-10-芳基-或C6-10-芳烷基-、C5-10-雜烷基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基-、C5-10-雜環烷基-、雜芳基-、雜芳基-烷基-、C1-10-烷氧基-、C6-10-芳基氧基-或C6-10-芳烷氧基-、C5-10-雜烷氧基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基氧基-、C5-10-雜環烷氧基(其可經以下基團取代一或多次:-NH2、-NH-烷基、-N(烷基)2、-NH-C(=O)-烷基、-N(烷基)-C(=O)-烷基、-SO3H、-S(=O)2NH2、-S(=O)2-N(烷基)2、-COOH、-C(=O)-NH2、-C(=O)-N(烷基)2或-OH)、-H或基團-(O)x-(CH2CH2O)y-R22,其中x 為0或1且其中v 係1至20之數值,其中R22 表示-H、-烷基(較佳C1-12-烷基)、-CH2-COOH、-CH2-CH2-COOH或-CH2-CH2-NH2;其中P2 係選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His;其中P3 係選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His或相應N-烷基胺基酸中之一者,
較佳N-甲基胺基酸;或R2a及R4a 一起表示(且形成吡咯啶環)-CH2-CHR10-或-CHR10-CH2-,其中R10 表示-H、鹵素(較佳-F或-Cl)、-NH2、-COOH、-SO3H、-SH、C1-4-烷基、鹵基-C1-4-烷基、C1-4-烷氧基、羥基取代之C1-4-烷基、-C(=O)-O-(C1-4-烷基)或-OH;R3a 表示-MOD或視情況經取代之烷基、環烷基、芳基、雜芳基、雜烷基或雜環烷基,較佳C1-10-烷基、C6-10-芳基或C6-10-芳烷基、C5-10-雜烷基、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基或C5-10-雜環烷基,其可經以下各項取代:1至3個-OH基團、1至3個鹵素原子、1至3個鹵化烷基(各自具有1至3個鹵素原子)、1至3個O-烷基、1至3個-SH基團、1至3個-S-烷基、1至3個-O-C(=O)-烷基、1至3個-O-C(=O)-NH-烷基、1至3個-NH-C(=O)-烷基、1至3個-NH-C(=O)-NH-烷基、1至3個-S(=O)n-烷基、1至3個-S(=O)2-NH-烷基、1至3個-NH-烷基、1至3個-N(烷基)2基團、1至3個-NH2基團或1至3個-(CH2)0-3Z基團,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中-MOD 表示為如下文所定義,其中n 為0、1或2,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H、-(CH2)0-2-CH(NHC(=O)-CH3)Z‘、-(CH2)0-3-CH(NH2)Z‘或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH R8a 表示C1-10-烷基或-(CH2)0-2-(HZ2),其中HZ2 表示具有最多兩個選自由N、O及S組成之群之雜原
子之4員至7員雜環;HZ 表示單環或二環雜環,其可經一或多個選自由以下各項組成之群之取代基取代:鹵素、可視情況經鹵素取代之C1-10-烷基、C6-10-芳基及C6-10-芳烷基;-MOD 如上文所定義表示-(NR10)n-(G1)o-G2-G3,其中R10 表示-H;鹵素或C1-C3-烷基;
其中G1 表示-NHC(=O)-、-C(=O)-NH-或
(其中,若G1表示-NHC(=O)-或,則R10不表示NH2);n 係0或1;o 係0或1;G2 表示直鏈及/或具支鏈烴基團,其具有1至10個碳原子且其可由以下基團中之一或多者間雜一次或超過一次:-O-、-S-、-S(=O)-、-S(=O)2-、-NRy-、-NRyC(=O)-、-C(=O)-NRy-、-NRyNRy-、-S(=O)2-NRyNRy-、-C(=O)-NRyNRy-、-C(=O)-、-CRx=N-O-,且其中包括任何側鏈之烴基團可經以下各項取代:-NHC(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、-NH-CNNH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸,其中Ry 表示H、苯基、C1-C10-烷基、C2-C10-烯基或C2-C10-炔基,其每一者均可經以下各項取代:-NHC(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、NH-CNNH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸,其中Rx 表示-H、C1-C3-烷基或苯基,其中G3 表示-H或-COOH,其中-MOD 較佳具有至少一個基團-COOH;且其中紡錘體驅動蛋白抑制劑藉由在R1a、R2a、R3a、R4a、R8a或R10之氫原子之取代或視情況經由HZ之取代基中之一者、特別地經由
R1a、R2a、R3a、R4a或R10連接至連接體,及其鹽、溶劑合物、溶劑合物之鹽及差向異構物。
上文所顯示式中之KSP-L-較佳具有下式(IIa):
其中X1表示N,X2表示N且X3表示C;或X1表示N,X2表示C且X3表示N;或X1表示CH或CF,X2表示C且X3表示N;或X1表示NH,X2表示C且X3表示C;或X1表示CH,X2表示N且X3表示C(其中較佳地X1表示CH,X2表示C且X3表示N);R1 表示H、-L-#1、-MOD或-(CH2)0-3Z,其中-L-#1 表示連接體且#1表示至結合劑或其衍生物之鍵。
其中-MOD 表示為如下文所定義,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2、-(CH2CH2O)0-3-(CH2)0-3Z‘(例
如-(CH2)0-3Z‘)或-CH(CH2W)Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-NH2、-SO3H、-COOH、-NH-C(=O)-CH2-CH2-CH(NH2)COOH或-(C(=O)-NH-CHY4)1-3COOH,其中W 表示-H或-OH,其中Y4 表未視情況經-NHC(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基;R2 表示-L-#1、H、-MOD、-C(=O)-CHY4-NHY5或-(CH2)0-3Z,其中-L-#1 表示連接體且#1表示至結合劑或其衍生物之鍵,其中-MOD 表示為如下文所定義,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,且其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;其中Y4 表示視情況經-NHC(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基;R4 表示-L-#1、-H、-C(=O)-CHY4-NHY5或-(CH2)0-3Z,其中-L-#1 表示連接體且#1表示至結合劑或其衍生物之鍵,其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;
其中Y4 表示視情況經-NHC(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,且其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或R4 表示基團R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-或R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2COOH)-C(=O)-或細胞自溶酶可裂解基團R21-(C=O)(0-1)-(P3)(1-2)-P2-,其中R21 表示H、C1-10-烷基-、C5-10-芳基-或C6-10-芳烷基-、C5-10-雜烷基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基-、C5-10-雜環烷基-、雜芳基-、雜芳基-烷基-、C1-10-烷氧基-、C6-10-芳基氧基-或C6-10-芳烷氧基-、C5-10-雜烷氧基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基氧基-、C5-10-雜環烷氧基(其可經以下基團取代一或多次:-NH2、-NH-烷基、-N(烷基)2、-NH-C(=O)-烷基、N(烷基)-C(=O)-烷基、-SO3H、-SO2NH2、-S(=O)2-N(烷基)2、-COOH、-C(=O)-NH2、-C(=O)-N(烷基)2或-OH)、-H或基團-(O)x-(CH2CH2O)y-R22,其中x 為0或1且其中v 係1至20之數值,其中R22 表示-H、-烷基(較佳C1-12-烷基)、-CH2-COOH、-CH2-CH2-COOH或-CH2-CH2-NH2;其中P2 係選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His;其中P3 係獨立地選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His或相應N-烷基胺基酸中之一
者,較佳N-甲基胺基酸;在存在超過一個胺基酸P3之情形下,P3可具有相同或不同之胺基酸,如上文所定義;或R2及R4 一起(且形成吡咯啶環)表示-CH2-CHR10-或-CHR10-CH2-,其中R10 表示L-#1、-H、-NH2、-SO3H、-COOH、-SH或-OH,且其中該吡咯啶環中二級胺基之氫原子可由R21-C(=O)-P3(0-2)-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-SIG-替代;其中L-#1 表示連接體且#1表示至結合劑或其衍生物之鍵,其中P2 係選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His;其中P3 係獨立地選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His或相應N-烷基胺基酸中之一者,較佳N-甲基胺基酸;其中-SIG 係自消性(self-immolative)基團,在-C(=O)-SIG鍵裂解時提供游離二級胺;A 表示-C(=O)-、-S(=O)-、-S(=O)2-、-S(=O)2-NH-或-C(=N-NH2)-;R3 表示-L-#1、-MOD或視情況經取代之烷基、環烷基、芳基、雜芳基、雜烷基、雜環烷基,較佳-L-#1或C1-10-烷基、C6-10-芳基或C6-10-芳烷基、C5-10-雜烷基、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基或C5-10-雜環烷基,其可經以下各項取代:1至3個-OH基團、1至3個鹵素原子、1至3個鹵化烷基(各自具有1至3個鹵素原子)、1至3個-O-烷基、1至3個-SH基團、1至3個-S-烷基、1至3個-O-C(=O)-烷基、1至3個-O-C(=O)-NH-烷基、1至3個-NH-C(=O)-烷基、1至3個-NH-C(=O)-NH-烷基、1至3個
-S(=O)n-烷基、1至3個-S(=O)2-NH-烷基、1至3個-NH-烷基、1至3個-N(烷基)2基團、1至3個-NH2基團或1至3個-(CH2)0-3Z基團,其中-L-#1 表示連接體且#1表示至結合劑或其衍生物之鍵,其中-MOD 表示為如下文所定義,其中n 表示0、1或2,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘且其中Y3 表示-H、-(CH2)0-3-CH(NHC(=O)-CH3)Z‘、-(CH2)0-3-CH(NH2)Z‘或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH R5 表示-L-#1、-H、-NH2、-NO2、鹵素(特別地-F、-Cl、-Br)、-CN、-CF3、-OCF3、-CH2F、-CH2F、-SH或-(CH2)0-3Z,其中-L-#1, 表示連接體且#1表示至結合劑或其衍生物之鍵,其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、鹵素、-NHY3、-C(O)-NY1Y2或-C(O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;R6及R7 彼此獨立地表示-H、氰基、(視情況經氟化)C1-10-烷基、(視情況經氟化)C2-10-烯基、(視情況經氟化)C2-10-炔基、羥基、-NO2、-NH2、-COOH或鹵素(特別地-F、-Cl、-Br),R8 表示(視情況經氟化)C1-10-烷基、(視情況經氟化)C2-10-烯基、(視情況經氟化)C2-10-炔基、(視情況經氟化)C4-10-環烷基或-(CH2)0-2-(HZ2),其中HZ2 表示具有最多兩個選自由N、O及S組成之群之雜原
子之4員至7員雜環,其中該等基團中之每一者均可經-OH、-COOH或-NH2或-L-#1取代;其中-L-#1 表示連接體且#1表示至結合劑或其衍生物之鍵,且其中-MOD如上文所定義表示-(NR10)n-(G1)o-G2-G3,其中R10 表示H或C1-C3-烷基;
其中G1 表示-NH-C(=O)-、-C(=O)-NH-或
(其中,若G1表示-NHC(=O)-或,則R10不表示-NH2);其中n 係0或1;其中o 係0或1;其中G2 表示直鏈及/或具支鏈烴基團,其具有1至10個碳原子且其可由以下基團中之一或多者間雜一次或超過一次:-O-、-S-、-S(=O)-、-S(=O)2-、-NRy-、-NRyC(=O)-、-C(=O)-NRy-、-NRyNRy-、-S(=O)2-NRyNRy-、-C(=O)-NRyNRy-、-C(=O)-、-CRx=N-O-,且其中包括任何側鏈之烴鏈均可經以下各項取代:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、NH-CNNH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸,其中Ry 表示-H、苯基、C1-C10-烷基、C2-C10-烯基或C2-C10-炔基,其每一者均可經以下各項取代:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、NH-CNNH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸,其中Rx 表示-H、C1-C3-烷基或苯基,其中G3 表示-H或-COOH,且其中-MOD 較佳具有至少一個-COOH基團;及其鹽、溶劑合物、溶劑合物之鹽及差向異構物。
本發明之結合物可具有化學不穩定之連接體、酶性不穩定之連接體或穩定連接體。尤佳者係穩定連接體及可由豆莢蛋白或細胞自溶
酶裂解之連接體。
本發明此外提供製備本發明之位置專一性之均質結合物之製程,亦及用於製備之前體及中間體。
本發明結合物之製備通常包含以下步驟:(i)製備連接體前體,該前體視情況攜載保護基團且具有能夠偶合至結合劑之反應性基團;(ii)使連接體前體結合至低分子量KSP抑制劑(較佳具有尤佳式(Ia)且特別地式(IIa)之子結構I(sub)之KSP抑制劑,其中在該等式中尚無至連接體之鍵)之視情況攜載保護基團之衍生物,獲得視情況攜載保護基團之反應性KSP抑制劑/連接體結合物;(iii)去除存於KSP抑制劑/連接體結合物中之任何保護基團,及(iv)較佳使用轉麩醯胺酸酶使結合劑位置專一性結合至KSP抑制劑/連接體結合物,得到本發明之結合劑/KSP抑制劑位置專一性之均質結合物。
亦可在構築視情況經保護之KSP抑制劑/連接體前體結合物之後連接反應性基團。
如上文所闡釋,可藉由使連接體在子結構I(sub)中之R1a、R2a、R4a或R10處、在式(Ia)中之R1a、R2a、R3a、R4a、R8a或R10或在式(IIa)中之R1、R2、R3、R4、R5、R8或R10取代氫原子而使連接體前體結合至低分子量KSP抑制劑。在結合前之合成步驟中,所存在之任一官能基亦可以保護形式存在。在結合步驟之前,藉由肽化學之已知方法去除該等保護基團。可藉由各種途徑以化學方式發生結合,如實例中之方案2至6中以實例性方式所顯示。特別地,視情況可修改低分子量KSP抑制劑以結合至連接體,例如藉由引入保護基團或脫離基以促進取代。
特別地,本發明提供結合至結合劑之低分子量KSP抑制劑。該等
結合劑結合物具有以下通式(IIIa):
其中X1表示N,X2表示N且X3表示C;或X1表示N,X2表示C且X3表示N;或X1表示CH或CF,X2表示C且X3表示N;或X1表示NH,X2表示C且X3表示C;或X1表示CH,X2表示N且X3表示C(其中較佳地X1表示CH,X2表示C且X3表示N);R1 表示-H、-L-BINDER、-MOD或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、-NHY3、-OY3、-SY3、鹵素、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2、-(CH2CH2O)0-3-(CH2)0-3Z‘(例如-(CH2)0-3Z‘)或-CH(CH2W)Z‘,且其中Y3 表示H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-NH2、-SO3H、-COOH、-NH-C(=O)-CH2-CH2-CH(NH2)COOH或-(C(=O)-NH-CHY4)1-3COOH,其中W 表示-H或-OH,其中Y4 表示視情況經-NH-(C=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基;R2 表示-L-BINDER、H、-MOD、-C(=O)-CHY4-NHY5或-
(CH2)0-3Z,或R2及R4 一起(且形成吡咯啶環)表示-CH2-CHR10-或-CHR10-CH2-,其中R10 表示L-#1、-H、-NH2、-SO3H、-COOH、-SH或-OH;其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;其中Y4 表示經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基視情況,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基;R4 表示-L-BINDER、-H、-C(O)-CHY4-NHY5或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或
R4 表示基團R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-或R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2COOH)-C(=O)-或細胞自溶酶可裂解基團或式R21-(C=O)(0-1)-(P3)(1-2)-P2-,其中R21 表示-H、C1-10-烷基-、C5-10-芳基-或C6-10-芳烷基-、C5-10-雜烷基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基-、C5-10-雜環烷基-、雜芳基-、雜芳基-烷基-、C1-10-烷氧基-、C6-l0-芳基氧基-或C6-10-芳烷氧基-、C5-10-雜烷氧基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基氧基-、C5-10-雜環烷氧基,其可經以下基團取代一或多次:-NH2、-NH-烷基、-N(烷基)2、-NH-C(=O)-烷基、-N(烷基)-C(=O)-烷基、-SO3H、-SO2NH2、-S(=O)2-N(烷基)2、-COOH、-C(=O)-NH2、-C(=O)-N(烷基)2或-OH或係-H或基團-Ox-(CH2CH2O)y-R22,其中x 係0或1,其中v 係1至20之數值,且其中R22 表示-H、-烷基(較佳C1-12-烷基)、-CH2-COOH、-CH2-CH2-COOH或-CH2-CH2-NH2;其中P2 係選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His;其中P3 係獨立地選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His或相應N-烷基胺基酸中之一者,較佳N-甲基胺基酸;或R2及R4 一起(且形成吡咯啶環)表示-CH2-CHR10-或-CHR10-CH2-,其中R10 表示L-#1、-H、-NH2、-SO3H、-COOH、-SH、鹵素、C1-4烷基、C1-4鹵烷基、C1-4烷氧基、羥基取代之C1-4烷基、
COO(C1-4烷基)或-OH;且其中該吡咯啶環中之二級胺基之氫原子可由R21-C(=O)-P3(0-2)-P2-NH-CH(CH2C(=O)NH2)-C(=O)-SIG-替代;其中P2 係選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His;其中P3 係獨立地選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His或相應N-烷基胺基酸中之一者,較佳N-甲基胺基酸;其中-SIG 係自消性基團,在-C(=O)-SIG鍵裂解時提供游離二級胺;A 表示-C(=O)-、-S(=O)-、-S(=O)2-、-S(=O)2-NH-或-C(=N-NH2)-;R3 表示-L-BINDER、-MOD或視情況經取代之烷基、環烷基、芳基、雜芳基、雜烷基、雜環烷基,較佳-L-BINDER或C1-10-烷基、C6-10-芳基或C6-10-芳烷基、C5-10-雜烷基、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基或C5-10-雜環烷基,其可經以下各項取代:1至3個-OH基團、1至3個鹵素原子、1至3個鹵化烷基(各自具有1至3個鹵素原子)、1至3個-O-烷基、1至3個-SH基團、1至3個-S-烷基、1至3個-O-C(=O)-烷基、1至3個-O-C(=O)-NH-烷基、1至3個-NH-C(=O)-烷基、1至3個-NH-C(=O)-NH-烷基、1至3個-S(=O)n-烷基、1至3個-S(=O)2-NH-烷基、1至3個-NH-烷基、1至3個-N(烷基)2基團、1至3個-NH2基團或1至3個-(CH2)0-3Z基團,其中n 為0、1或2,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,
其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H、-(CH2)0-3-CH(NH-C(=O)-CH3)Z‘、-(CH2)0-3-CH(NH2)Z‘或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH其中「烷基」 較佳表示C1-10-烷基);R5 表示-L-BINDER、-H、-NH2、-NO2、鹵素(特別地F、Cl、Br)、-CN、-CF3、-OCF3、-CH2F、-CH2F、-SH或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、鹵素、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;R8 表示C1-10-烷基、氟-C1-10-烷基、C2-10-烯基、氟-C2-10-烯基、C2-10-炔基、氟-C2-10-炔基、C4-10-環烷基、氟-C4-10-環烷基或-(CH2)0-2-(HZ2),其中HZ2 表示具有最多兩個選自由N、O及S組成之群之雜原子之4員至7員雜環(較佳氧雜環丁烷),其中該等基團中之每一者均可經-OH、-COOH或-NH2或-L-BINDER取代;其中L 表示連接體且BINDER 表示結合劑或其衍生物,其中該結合劑可視情況連接至複數種活性化合物分子,其中R1、R2、R3R4、R5、R8及R10中之一個代表表示-L-結合劑;R6及R7 彼此獨立地表示-H、氰基、C1-10-烷基、氟-C1-10-烷基、C2-10-烯基、氟-C2-10-烯基、C2-10-炔基、氟-C2-10-炔基、羥基、-NO2、-NH2、-COOH或鹵素(特別地-F、-Cl、-Br),-MOD 表示-(NR10)n-(G1)o-G2-G3,
其中R10 表示-H或C1-C3-烷基;
其中G1 表示-NH-C(=O)-、-C(=O)-NH-或(其中,
若G1表示-NH-C(=O)-或,則R10不表示NH2);其中n 係0或1;其中o 係0或1;且其中G2 表示直鏈及/或具支鏈烴基團,其具有1至10個碳原子且其可由以下基團中之一或多者間雜一次或超過一次:-O-、-S-、-S(=O)-、-S(=O)2-、-NRy-、-NRyC(=O)-、-C(=O)-NRy-、-NRyNRy-、-S(=O)2-NRyNRy-、-C(=O)-NRyNRy-,其中Ry 表示-H、苯基、C1-C10-烷基、C2-C10-烯基或C2-C10-炔基,其每一者均可經以下各項取代:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、NH-CN-NH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸,或表示-C(=O)-、-CRx=N-O-其中Rx 表示-H、C1-C3-烷基或苯基,其中包括任何側鏈之烴鏈均可經以下各項取代:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、NH-CN-NH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸,其中G3 表示-H或-COOH,且其中-MOD 較佳具有至少一個基團-COOH;及其鹽、溶劑合物、溶劑合物之鹽及差向異構物。
圖1:各物種之TWEAKR富半胱胺酸域(胺基酸34至68)之比對。(數值顯示全長構築體(包括信號序列;SEQ ID NO:169)中之胺基酸位置)。
圖2:A-TWEAKR(SEQ ID NO:169)之結構之示意圖。該圖顯示
細胞外域(胺基酸28至80)(SEQ ID NO:168)(包括富半胱胺酸域(36-67))、跨膜域TM(81-101)及細胞內域(102-129)。TPP-2202係完整胞外域(28-80),其融合至hIgG1之Fc域。TPP-2203係具有N-末端及C-末端截短之細胞外域(34-68),其融合至hIgG1之Fc域。二硫橋Cys36-Cys49、Cys52-Cys67及Cys55-Cys64係由黑色條指示。TPP-2203在N-末端及C-末端所含之胺基酸分別較未經修改之富半胱胺酸域多兩個及一個,以確保適當摺疊。TPP-1984係具有C-末端截短之細胞外域(28至68),其融合至HIS6標籤。所有三種構築體皆顯示相當的至本發明抗體及PDL-192(TPP-1104)之結合。P4A8(TPP-1324)僅結合至全長細胞外域(TPP-2202)。
B-細胞外域之胺基酸序列:已公開胺基酸64對於TWEAK配體結合而言係必需的;且胺基酸47對於本發明抗體之結合而言係必需的,如在本文中所確定。
圖3:TWEAKR胞外域與抗體及參考抗體之相互作用。其顯示利用TWEAKR-Fc融合蛋白塗層(TPP-2202,1μg/ml)及利用0.08μg/ml(空心條)及0.03μ/ml(實心條)生物素化IgG作為可溶性結合配體之ELISA之結果。使用鏈黴抗生物素蛋白-HRP(streptavidin-HRP)及Amplex Red受質實施檢測。Y係「ELISA信號強度[Rfu]」;X係「經測試抗體構築體」;a係「TPP-2090」;b係「TPP-2084」;c係「PDL-192(TPP-1104)」;d係「P4A8(TPP-1324)」;e係「P3G5(TPP-2195)」;f係「136.1(TPP-2194)」;h係「ITEM1」;i係「ITEM4」;j係小鼠同型對照;k係人類同型對照。所有經檢驗抗體在80ng/ml之濃度下皆顯示飽和結合。
圖4:TWEAKR之富半胱胺酸域與本發明抗體及參考抗體之相互作用。其顯示利用TWEAKR(34-68)-Fc融合蛋白塗層(TPP-2203,1μg/ml)及0.08μg/ml(空心條)及0.3μ/ml(實心條)生物素化IgG作為可
溶性結合配體之ELISA之結果。使用鏈黴抗生物素蛋白-HRP及Amplex Red受質實施檢測。X係「測試抗體構築體」;a係「TPP-2090」;b係「TPP-2084」;c係「PDL-192(TPP-1104)」;d係「P4A8(TPP-1324)」;e係「P3G5(TPP-2195)」;f係「136.1(TPP-2194)」;h係「ITEM1」;i係「ITEM4」;j係小鼠同型對照;k係人類同型對照。所有經檢驗抗體在80ng/ml之濃度下皆顯示飽和結合。
圖5:TWEAKR(28至68)與本發明抗體及參考抗體之相互作用。其顯示利用TWEAKR(28至68)-HIS塗層(TTP-1984,1μg/ml)及0.08μg/ml(空心條)及0.3μ/ml(實心條)生物素化IgG作為可溶性結合配體之ELISA之結果。使用鏈黴抗生物素蛋白-HRP及Amplex Red受質實施檢測。X係「測試抗體構築體」;a係「TPP-2090」;b係「TPP-2084」;c係「PDL-192(TPP-1104)」;d係「P4A8(TPP-1324)」;e係「P3G5(TPP-2195)」;f係「136.1(TPP-2194)」;h係「ITEM1」;i係「ITEM4」;j係小鼠同型對照;k係人類同型對照。所有經檢驗抗體在80ng/ml之濃度下皆顯示飽和結合。
圖6:A-富半胱胺酸域之丙胺酸掃描。針對PDL-192(TPP-1104)(X)-及TPP-2090(Y)-結合分析TWEAKR(34-68)-Fc之突變蛋白。S37A、R38A、S40A、W42A、S43A、D45A、D47A、K48A、D51A、S54A、R56A、R58A、P59A、H60A、S61A、D62A、F63A及L65A突變蛋白表現於HEK293細胞中(黑色菱形)。塗覆PFL192(TPP-1104)及TPP-2090(1μg/ml)並添加HEK293發酵液之8倍稀釋之上清液用於TWEAKR蛋白結合。X係「PDL-192(TTP-1104)相互作用之ELISA強度[Rfu]」,Y係「TPP-2090相互作用之ELISA強度[Rfu]」。TPP-2090(Y)顯示於D74A-TWEAKR突變蛋白而言降低之結合(閉合盒),且PDL-192(TPP-1104)(X)顯示至R56A降低之結合(點狀盒)。
B-Y係「正規化為野生型結合信號[%]之結合(%)」,1係「TPP-2090」;2係「PDL-192(TPP-1104)」;3係「P4A8(TPP-1324)」。以250ng/ml添加TWEAKR變體(1μg/ml),經由抗HIS HRP進行檢測。與野生型構築體相比,TTP-2090顯示小於5%結合。
圖7:如由Pellegrini等人(FEBS 280:1818-1829)公開之TWEAKR胞外域之NMR結構。TWEAK結合取決於L46(Pellegrini等人),TTP-2090結合取決於D47且PDL-192結合至R56。PDL-192在TWEAK配體結合位置之對面結合,TPP-2090直接結合至TWEAK配體位置。
圖8:概述使用轉麩醯胺酸酶催化之無糖基化抗體結合之策略。
本發明提供結合劑或其衍生物與一或多種活性化合物分子之位置專一性之均質結合物,該活性化合物分子為紡錘體驅動蛋白抑制劑(KSP抑制劑),其係經由連接體L連接至結合劑,且該連接體L結合至結合劑之專一位置,較佳結合劑之麩醯胺酸側鏈。
更具體而言,本發明提供結合劑或其衍生物與一或多種活性化合物分子之位置專一性之均質結合物,該活性化合物分子為紡錘體驅動蛋白抑制劑(KSP抑制劑),其係經由連接體L連接至結合劑,且該連接體L係使用轉麩醯胺酸酶(TGase)結合至結合劑之麩醯胺酸側鏈。
本發明之結合物可由以下通式表示:
其中BINDER表示結合劑,較佳抗體,L表示連接體,KSP表示KSP抑制劑,m表示1至5之數值,較佳1,且n表示2至10,較佳2至4,且亦較佳2或4。此處,m係每一連接體KSP抑制劑之數值,且n係每一BINDER KSP抑制劑/連接體結合物之數值。因此,存於結合物中之所
有KSP之總和係m及n之乘積。KSP-L較佳具有上文所顯示之式(IIa)。結合劑較佳為結合劑肽或蛋白質,例如抗體。若結合劑係抗體,則其優先在恆定區中包含受體麩醯胺酸。該等受體麩醯胺酸可藉由適宜位置突變成麩醯胺酸(例如突變N297Q,Kabat EU編號)或藉由生成去糖基化或無糖基化抗體(例如藉由由PNGase F引起之酶性去糖基化或藉由N297X之突變(Kabat EU編號))引入。在去糖基化或無糖基化抗體之後一情形下,麩醯胺酸Q295(Kabat EU編號)變成受體麩醯胺酸。極佳者係包含突變N297A或N297Q(Kabat EU編號)之抗體。此外,連接體連接至結合劑肽或蛋白質或其衍生物之麩醯胺酸殘基。尤佳者係結合至抗體之麩醯胺酸殘基。
下文闡述根據本發明可使用之結合劑、根據本發明可使用之KSP抑制劑及根據本發明可使用之連接體,該等可組合使用而無任何限制。特別地,在每一情形下表示為較佳或尤佳之結合劑可與在每一情形下表示為較佳或尤佳之KSP抑制劑組合、視情況與在每一情形下表示為較佳或尤佳之連接體組合使用。
自(例如)WO2006/044825、WO2006/002236、WO2005/051922、WO2006/060737、WO03/060064、WO03/040979及WO03/049527已知低分子量KSP抑制劑。
通常,KSP抑制劑具有以下子結構I(sub):
其中
#a表示至分子剩餘部分之鍵;R1a 表示-H或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、鹵素、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2、-(CH2CH2O)0-3-(CH2)0-3Z‘(例如-(CH2)0-3Z‘)或-CH(CH2W)Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2、-COOH、-NH-C(=O)-CH2-CH2-CH(NH2)COOH或-(C(=O)-NH-CHY4)1-3COOH,其中W 表示-H或-OH,其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基;R2a 表示-H、-C(=O)-CHY4-NHY5或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基;R4a 表示-H、-C(O)-CHY4-NHY5或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,
其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或R4a 表示基團R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-或細胞自溶酶可裂解基團或式R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-,其中R21 表示-H、C1-10-烷基-、C5-10-芳基-或C6-10-芳烷基-、C5-10-雜烷基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基-、C5-10-雜環烷基-、雜芳基-、雜芳基-烷基-、C1-10-烷氧基-、C6-10-芳基氧基-或C6-10-芳烷氧基-、C5-10-雜烷氧基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基氧基-、C5-10-雜環烷氧基,其可經以下基團取代一或多次:-NH2、-NH-烷基、-N(烷基)2、NH-C(=O)-烷基、N(烷基)-C(=O)烷基、-SO3H、-SO2NH2、-S(=O)2-N(烷基)2、-COOH、-C(=O)-NH2,-C(=O)-N(烷基)2或-OH;或其表示-H或基團-Ox-(CH2CH2O)y-R22,其中x 係0或1,其中v 係1至20之數值,其中R22 表示-H、-烷基(較佳C1-12-烷基)、-CH2-COOH、-CH2-CH2-COOH或-CH2-CH2-NH2;其中P2 係選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His;其中P3 係選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、
Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His或相應N-烷基胺基酸中之一者,較佳N-甲基胺基酸;或R2a及R4a 一起表示(且形成吡咯啶環)-CH2-CHR10-或-CHR10-CH2-,其中R10表示-H、鹵素(較佳-F或-Cl)、-NH2、-COOH、-SO3H、-SH、C1-4-烷基、鹵基-C1-4-烷基、C1-4-烷氧基、羥基取代之C1-4-烷基、-C(=O)-O-(C1-4-烷基)或-OH。
尤其通常遇到以下子結構II(sub)
其中#a、R1a、R2a及R4a具有與在I(Sub)中相同之含義且R12a及R13a表示-H或R12a及R13a 一起(且形成六氫吡啶環)表示-CH2-CHR10-或-CHR10-CH2-,其中R10 表示-H、-NH2、-COOH、-SO3H、-SH或-OH;其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2CH2O)0-3-(CH2)0-3Z‘(例如-(CH2)0-3Z‘),其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2、-COOH或-(C=O)-NH-CHY4)1-3COOH,
其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基。
特別地,多種KSP抑制劑均具有其中R1a、R2a、R4a、R12a及R13a表示H之子結構II(sub)。
根據本發明,可使用具有子結構I(sub)或子結構H(sub)之KSP抑制劑。根據本發明可使用之KSP抑制劑亦包括(例如)伊斯平斯(Cytokinetics/GSK)、MK-0731(Merck)、AZD4877(AstraZeneca)、ARRY-520(Array BioPharma)及ARQ 621(ArQule)。
根據本發明較佳之KSP抑制劑具有以下基本結構:
其中R1a 表示-H、-MOD或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2、-(CH2CH2O)0-3-(CH2)0-3Z‘(例如-(CH2)0-3Z‘)或-CH(CH2W)Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2、-COOH、-NH-C(=O)-CH2-CH2-CH(NH2)COOH或-(C(=O)-NH-CHY4)1-3COOH,其中W 表示-H或-OH,
其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基;R2a 表示-H、-MOD、-C(=O)-CHY4-NHY5或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基;R4a 表示-H、-C(=O)-CHY4-NHY5或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,其中Y5 表示H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或R4a 表示基團R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2-(C=O)-NH2)-C(=O)-或R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2COOH)-C(=O)-或細胞自溶酶可裂解基團或式R21-(C=O)(0-1)-(P3)(1-2)-P2-,
其中R21 表示-H、C1-10-烷基-、C5-10-芳基-或C6-10-芳烷基-、C5-10-雜烷基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基-、C5-10-雜環烷基-、雜芳基-、雜芳基-烷基-、C1-10-烷氧基-、C6-10-芳基氧基-或C6-10-芳烷氧基-、C5-10-雜烷氧基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基氧基-、C5-10-雜環烷氧基,其可經以下基團取代一或多次:-NH2、-NH-烷基、-N(烷基)2、-NH-C(=O)-烷基、-N(烷基)-C(=O)-烷基、-SO3H、-SO2NH2、-S(=O)2-N(烷基)2、-COOH、-C(=O)-NH2、-C(=O)-N(烷基)2或-OH;或表示-H或基團-Ox-(CH2CH2O)y-R22,其中x 係0或1其中v 係1至20之數值,其中R22 表示-H、-烷基(較佳C1-12-烷基)、-CH2-COOH、-CH2-CH2-COOH或-CH2-CH2-NH2;其中P2 係選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His;其中P3 係選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His或相應N-烷基胺基酸中之一者,較佳N-甲基胺基酸;或R2a及R4a 一起表示(且形成吡咯啶環)-CH2-CHR10-或-CHR10-CH2-,其中R10 表示H、鹵素(較佳F)、-NH2、-COOH、-SO3H、-SH或-OH,且其中該吡咯啶環中之二級胺基之氫原子可由R21-C(=O)-P3(0-2)-P2-NH-CH(CH2C(=O)NH2)-C(=O)-SIG-替代;其中P2 係選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、
Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His;其中P3 係選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His或相應N-烷基胺基酸中之一者,較佳N-甲基胺基酸;其中-SIG 係自消性基團,在C(=O)-SIG鍵裂解時提供游離二級胺;R3a 表示-MOD或視情況經取代之烷基、環烷基、芳基、雜芳基、雜烷基或雜環烷基,較佳C1-10-烷基、C6-10-芳基或C6-10-芳烷基、C5-10-雜烷基、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基或C5-10-雜環烷基,其可經以下各項取代:1至3個-OH基團、1至3個鹵素原子、1至3個鹵化烷基(各自具有1至3個鹵素原子)、1至3個O-烷基、1至3個-SH基團、1至3個-S-烷基、1至3個-O-C(=O)-烷基、1至3個-O-C(=O)-NH-烷基、1至3個-NH-C(=O)-烷基、1至3個-NH-C(=O)-NH-烷基、1至3個-S(=O)n-烷基、1至3個-S(=O)2-NH-烷基、1至3個-NH-烷基、1至3個-N(烷基)2基團、1至3個-NH2基團或1至3個-(CH2)0-3Z基團,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中-MOD 表示為如下文所定義,其中n 為0、1或2,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H、-(CH2)0-3-CH(NHC(=O)-CH3)Z‘、-(CH2)0-3-CH(NH2)Z‘或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH R8a 表示C1-10-烷基;
HZ 表示單環或二環雜環,其可經一或多個選自由以下各項組成之群之取代基取代:鹵素、可視情況經鹵素取代之C1-10-烷基、C6-10-芳基及C6-10-芳烷基;-MOD 如上文所定義表示-(NR10)n-(G1)o-G2-G3,其中R10 表示-H;鹵素或C1-C3-烷基;
其中G1 表示-NH-C(=O)-、-C(=O)-NH-或
(其中,若G1表示-NHC(=O)-或,則R10不表示NH2);其中n 係0或1;其中o 係0或1;其中G2 表示直鏈及/或具支鏈烴基團,其具有1至10個碳原子且其可由以下基團中之一或多者間雜一次或超過一次:-O-、-S-、-S(=O)-、-S(=O)2-、-NRy-、-NRyC(=O)-、-C(=O)-NRy-、-NRyNRy-、-S(=O)2-NRyNRy-、-C(=O)-NRyNRy-、-C(=O)-、-CRx=N-O-,且其中包括任何側鏈之烴基團可經以下各項取代:-NHC(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、-NH-CNNH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸,其中Ry 表示H、苯基、C1-C10-烷基、C2-C10-烯基或C2-C10-炔基,其每一者均可經以下各項取代:-NHC(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、NH-CNNH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸,其中Rx 表示-H、C1-C3-烷基或苯基,其中G3 表示-H或-COOH,其中-MOD 較佳具有至少一個基團-COOH;及其鹽、溶劑合物、溶劑合物之鹽及差向異構物。
根據本發明,此一紡錘體驅動蛋白抑制劑可藉由在R1a、R2a、R3a、R4a、R8a或R10之氫原子經取代或視情況經由HZ之取代基中之一者、特別地經由R1a、R2a、R3a、R4a或R10連接至連接體。
式(Ia)之取代基較佳具有以下含義,其中該等較佳含義較佳彼此組合:R1a 較佳表示H或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2、-(CH2CH2O)0-3-(CH2)0-3Z‘(例如-(CH2)0-3Z‘)或-CH(CH2W)Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2、-COOH、-NH-C(=O)-CH2-CH2-CH(NH2)COOH或-(C(=O)-NH-CHY4)1-3COOH,其中W 表示-H或-OH,其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基;R2a及R4a彼此獨立地較佳表示-H、-L-#1、-C(=O)-CHY4-NHY5或-(CH2)0-3Z或R2a及R4a一起(且形成吡咯啶環)表示-CH2-CHR10-或-CHR10-CH2-,其中R10 表示-H、-SO3H、-NH2、-COOH、-SH或-OH,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH,其中Y4 彼此獨立地表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,其中Y5 表示H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基。
或者,R4a可為R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-或R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2COOH)-C(=O)-或式R21-(C=O)(0-1)-(P3)(1-2)-P2-之細胞自溶酶可裂解基團。在另一替代中,吡咯啶環上-NH之氫原子由R21-C(=O)-P3-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-SIG-替代。
據信基團R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-、R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2COOH)-C(=O)-或R21-C(=O)-P3-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-SIG-可在活體內由酶豆莢蛋白裂解。在下文中,因此,該等基團將稱作「豆莢蛋白可裂解基團」。豆莢蛋白可裂解基團具有式-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-或-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2COOH)-C(=O)-。在本發明之結合物中,此基團較佳具有式R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)#,亦即豆莢蛋白可裂解基團在一端具有基團R21,且在另一端(-#)其結合至式Ia中之胺基相應位置R4a。
-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-(即天冬醯胺)及-NH-CH(CH2COOH)-C(=O)-(即天冬胺酸)存於天然L-構形中。豆莢蛋白可裂解基團除天冬醯胺以外含有1至3種其他胺基酸(-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-;-P3-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-;-(P3)(2)-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-),因此,其係二肽、三肽或四肽或其衍生物(二肽:-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-;三肽:-P3-P2-NH-CH(CH2C(=O)NH2)-C(=O)-;四肽:-(P3)2-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-)。在豆莢蛋白可裂解基團含有天冬胺酸之情形下同樣適用。
P2係選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、
Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His,較佳選自Ala、Gly、Val、Leu、Ile、Pro、Ser、Thr、瓜胺酸及Asn。P2通常存於天然L-構形中。尤佳者係L-Ala。
P3係獨立地選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸或其相應N-烷基-胺基酸,較佳N-甲基-胺基酸。P3較佳選自His、Pro、Ala、Val、Leu、Ile、Gly、Ser、瓜胺酸及Gln。P3通常存於天然L-構形vor中。尤佳者係L-Ala。
尤佳豆莢蛋白可裂解基團係-L-Ala-L-Ala-L-Asn-(例如R21-L-Ala-L-Ala-L-Asn-#)。
R21 較佳表示-H、C1-5-烷基、C5-10-芳烷基、C1-5-烷氧基、C6-10-芳基氧基、C5-10-雜烷基-、C5-10-雜環烷基-、雜芳基-、雜芳基-烷基-、C5-10-雜烷氧基-或C5-10-雜環烷氧基,其每一者均可經-COOH、-C(=O)-O烷基、-C(=O)-O-NH2、-NH2或-N(烷基)2)取代一或多次;或表示基團-Ox-(CH2CH2O)y-R22,其中x 係0或1其中v 係1至10之數值,且其中R22 表示-H、-烷基(較佳C1-12-烷基)、-CH2-COOH、-CH2-CH2-COOH或-CH2-CH2-NH2。
「烷基」在此處意指具有多至20個碳原子之烷基,較佳C1-12-烷基。
細胞自溶酶可裂解基團具有式-(C=O)(0-1)-(P3)(1-2)-P2-。在本發明之結合物中,此基團較佳具有式R21-(C=O)(0-1)-(P3)(1-2)-P2-#,亦即細胞自溶酶可裂解基團在一端具有基團R21,且在另一端(-#)其結合至式Ia中之胺基相應位置R4a。此處,R21、P2及P3具有與在豆莢蛋白可裂解基團中相同之含義。尤佳細胞自溶酶可裂解基團係其中P2係選自丙
胺酸、離胺酸及瓜胺酸者,且P3係選自纈胺酸、丙胺酸及苯丙胺酸,特別地具有式R21-(C=O)(0-1)-P3-P2-者。
R3 較佳表示視情況經取代之烷基、芳基、雜芳基、雜烷基、雜環烷基、-L-#1、-MOD或C1-10-烷基、C6-10-芳基或C6-10-芳烷基、C5-10-雜烷基、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基或C5-10-雜環烷基,其可經以下各項取代:1至3個-OH基團、1至3個鹵素原子、1至3個鹵化烷基(各自具有1至3個鹵素原子)、1至3個O-烷基、1至3個-SH基團、1至3個-S-烷基、1至3個-O-C(O)-烷基、1至3個-O-C(=O)-NH-烷基、1至3個-NH-C(=O)-烷基、1至3個-NH-C(=O)-NH-烷基、1至3個-S(=O)n-烷基、1至3個-S(=O)2-NH-烷基、1至3個-NH-烷基、1至3個-N(烷基)2基團、1至3個-NH2基團或1至3個-(CH2)0-3Z基團,其中n 為0、1或2,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2彼此獨立地表示-H、-NH2或-(-CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H、-(CH2)0-3-CH(NH-C(=O)-CH3)Z‘、-(CH2)0-3-CH(NH2)Z‘或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH,其中「烷基」較佳表示C1-10-烷基。
R8a 較佳表示C1-10-烷基。
HZ 較佳表示單環或二環雜環,其可經一或多個選自由以下各項組成之群之取代基取代:鹵素、可視情況經鹵素取代之C1-10-烷基、C6-10-芳基及C6-10-芳烷基。
C1-10-烷基在本發明之上下文中(即在上文式中亦及在下文式中)表示具有1至10個碳原子之直鏈或具支鏈烷基。可提及為較佳之實例係:甲基、乙基、正丙基、異丙基、正丁基、異丁基、1-甲基丙基及
第三丁基。
C6-10-芳基-在本發明之上下文中表示單環或二環芳香族同素環,例如苯基及萘基。
C6-10-芳烷基在本發明之上下文中表示單環芳香族同素環,例如連接C1-C4-烷基之苯基。實例性C6-10-芳烷基係苄基。
C5-10-雜芳基在本發明之上下文中表示具有總共6至10個環原子之單環或二環芳香族雜環,其中該(等)環含有一或兩個來自由N、O、S、SO及SO2組成之群之環雜原子且其係經由環碳原子或視情況環氮原子連接。可提及之實例係吡啶基、呋喃基、嘧啶基、咪唑基、噻吩基、噻吩基、異噁唑基、異噻唑基、1,2,3-噁二唑基、呋呫基、1,2,3-三唑基、1,2,4-三唑基、噠嗪基、吡咯基、三嗪基、吲哚基、喹啉基、喹唑啉基、1,3-苯并二氧雜環戊烯、異吲哚基、吲唑基、1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶基、苯并三唑基、異喹啉基、啉基、呔嗪基、喋啶基、萘啶基、苯并咪唑啉基、苯并噻唑啉基、苯并噁唑啉基、3,4-亞甲基二氧基苯基及苯并[6]呋喃基。
單環或二環雜環在本發明中表示具有總共5至10個環碳原子之單環或二環雜環,其中該(等)環含有一至三個由N、O、S、SO及SO2組成之群之環雜原子且其係經由環碳原子或視情況環氮原子連接。可提及之實例係六氫吡啶基、吡咯啉基、嗎啉基、3,4-亞甲基二氧基苯基及四氫呋喃基。
鹵素原子在本發明中表示F、Cl、Br或I。
如本文所用,術語「雜烷基」係指含有一或多個雜原子(亦即除碳以外之元素,包括(但不限於)氧、硫、氮、磷)代替一或多個碳原子之直鏈或具支鏈烷基。
每當基團經闡述為「經取代」時,該基團係經所指示取代基中之一或多者取代。若不指示取代基,則意味著所指示之「經取代」基
團可經一或多個各別地且獨立地選自以下之基團取代:烷基、烯基、炔基、環烷基、環烯基、環炔基、雜烷基、芳基、雜芳基、雜脂環基、芳烷基、雜芳烷基、(雜脂環基)烷基、羥基、烷氧基、芳基氧基、醯基、巰基、烷硫基、芳硫基、氰基、鹵素、硫羰基、胺甲醯基、硫胺甲醯基、醯胺基、磺醯胺基、磺醯胺基、羧基、異氰酸基、氰硫基、異硫氰基、硝基、矽基、硫基(sulfenyl)、亞磺醯基、磺醯基、鹵烷基、鹵烷氧基、三鹵甲烷磺醯基、三鹵甲烷磺醯胺基、胺基、單取代之胺基及二取代之胺基,及其經保護衍生物。
若未指定取代基之數目(例如鹵烷基),則可存在一或多個取代基。舉例而言,「鹵烷基」可包括一或多個相同或不同之鹵素。作為另一實例,「C~-C~烷氧基苯基」可包括一或多個含有1個、2個或3個原子之相同或不同烷氧基。
藉由在子結構I(sub)或子結構II(sub)中之R1a、R2a、R4a或R10或式(Ia)中HZ之R1a、R2a、R3a、R4a、R8a或R10之氫原子之取代,可以熟習此項技術者已知之方式將式(Ia)化合物連接至連接體。尤佳地,氫原子之取代發生在R1a、R2a、R3a、R4a或在由R2a及R4a形成之吡咯啶環。此結合可藉由各種途徑以化學方式進行,如在實例中之方案2至6中以實例性方式所示。特別地,視情況可修改低分子量KSP抑制劑以結合至連接體,例如藉由引入保護基團或脫離基以促進取代(使得在反應中該脫離基(且非氫原子)經連接體取代)。然後可使以此方式獲得之KSP抑制劑-連接體分子(其中連接體具有反應性基團用於偶合至結合劑)與結合劑反應,以得到本發明之結合劑結合物。在實驗部分中,藉由一些實例以實例性方式闡釋此程序。
對於R1a較佳者係-H、-COOH、-C(=O)-NHNH2、-(CH2)1-3NH2、-C(=O)-NZ“(CH2)1-3-NH2及-C(=O)-NZ“CH2COOH,其中Z“表示-H或-NH2。
對於R2a及R4a較佳者係H或R2a及R4a一起(且形成吡咯啶環)表示-CH2-CHR10-或-CHR10-CH2-,其中R10表示-H。
對於R3a較佳者係C1-10-烷基-,其可經以下各項取代:-OH、-O-烷基、-SH、-S-烷基、-O-C(=O)-烷基、-O-C(=O)-NH-烷基、-NH-C(=O)-烷基、-NH-C(=O)-NH-烷基、-S(=O)n-烷基、-S(=O)2-NH-烷基、-NH-烷基、-N(烷基)2或-NH2,其中烷基較佳係C1-3-烷基且n為0、1或2。
對於R8a較佳者係具支鏈C1-5-烷基,較佳甲基、乙基、正丙基、異丙基、正丁基、異丁基、1-甲基丙基及第三丁基。
對於HZ較佳者係單環或二環雜環,其可經一或多個選自由以下各項組成之群之取代基取代:鹵素、可視情況經鹵素取代之C1-10-烷基、C6-10-芳基及C6-10-芳烷基。
尤佳地,HZ係經取代之吡咯、吡唑、咪唑、喹唑啉或二氫喹唑啉,其係在鄰位(就關於R1a等之取代基而言)經視情況經取代之苄基取代。此外,經取代之吡咯、吡唑、咪唑或喹唑啉較佳可經側氧基(在二氫喹唑啉之情形下)或經1或2個鹵素原子取代之苯基取代。尤佳地,HZ係經取代之吡咯。
較佳使用之KSP抑制劑係伊斯平斯。另一較佳KSP抑制劑係Arry-520。
具有結構KSP-L-之其他尤佳化合物具有下文式(IIa)或(II):式(IIa):
其中X1表示N,X2表示N且X3表示C;或X1表示N,X2表示C且X3表示N;或X1表示CH或CF,X2表示C且X3表示N;或X1表示NH,X2表示C且X3表示C;或X1表示CH或CF,X2表示N且X2表示C;(其中較佳地X1表示CH,X2表示C且X3表示N);R1 表示-H、-L-#1、-MOD或-(CH2)0-3Z,其中-L-#1 表示連接體且#1表示至結合劑或其衍生物之鍵。
其中-MOD 表示為如下文所定義,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2、-(CH2CH2O)0-3-(CH2)0-3Z‘(例如-(CH2)0-3Z‘)或-CH(CH2W)Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-NH2、-SO3H、-COOH、-NH-C(=O)-CH2-CH2-CH(NH2)COOH或-(C(=O)-NH-CHY4)1-3COOH,其中W 表示-H或-OH,
其中Y4 表示視情況經-NHC(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基;R2 表示-H、-L-#1、-MOD、-C(=O)-CHY4-NHY5或-(CH2)0-3Z,其中-L-#1 表示連接體且#1表示至結合劑或其衍生物之鍵,其中-MOD 表示為如下文所定義,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,且其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;其中Y4 表示視情況經-NHC(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基;R4 表示-H、-L-#1、-C(=O)-CHY4-NHY5或-(CH2)0-3Z,其中-L-#1 表示連接體且#1表示至結合劑或其衍生物之鍵,其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘滿其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;其中Y4 表示視情況經-NHC(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,且其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或
R4 表示基團R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-或R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2COOH)-C(=O)-或細胞自溶酶可裂解基團R21-(C=O)(0-1)-(P3)(1-2)-P2-,其中R21 表示H、C1-10-烷基-、C5-10-芳基-或C6-10-芳烷基-、C5-10-雜烷基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基-、C5-10-雜環烷基-、雜芳基-、雜芳基-烷基-、C1-10-烷氧基-、C6-10-芳基氧基-或C6-10-芳烷氧基-、C5-10-雜烷氧基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基氧基-、C5-10-雜環烷氧基(其可經以下基團取代一或多次:-NH2、-NH-烷基、-N(烷基)2、-NH-C(=O)-烷基、N(烷基)-C(=O)-烷基、-SO3H、-SO2NH2、-S(O)2-N(烷基)2、-COOH、-C(=O)-NH2、-C(=O)-N(烷基)2或-OH)、-H或基團-(O)x-(CH2CH2O)y-R22,其中x 為0或1且其中v 係1至20之數值,其中R22 表示-H、-烷基(較佳C1-12-烷基)、-CH2-COOH、-CH2-CH2-COOH或-CH2-CH2-NH2;其中P2 係選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His;其中P3 係獨立地選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His或相應N-烷基胺基酸中之一者,較佳N-甲基胺基酸;在存在超過一個胺基酸P3之情形下,P3可具有相同或不同之胺基酸,如上文所定義;或R2及R4 一起(且形成吡咯啶環)表示-CH2-CHR10-或-CHR10-CH2-,其中R10 表示-H、鹵素(較佳-F)、-NH2、-SO3H、-COOH、-
SH或-OH,且其中該吡咯啶環中之二級胺基之氫原子可經R21-C(=O)-P3(0-2)-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-SIG-替代;其中L-#1 表示連接體且#1表示至結合劑或其衍生物之鍵,其中P2 係選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His;其中P3 係獨立地選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His或相應N-烷基胺基酸中之一者,較佳N-甲基胺基酸;在存在超過一個胺基酸P3之情形下,P3可具有相同或不同之胺基酸,如上文所定義;其中-SIG 係自消性基團,在-C(=O)-SIG鍵裂解時提供游離二級胺;A 表示-C(=O)-、-S(=O)-、-S(=O)2-、-S(=O)2-NH-或-C(=N-NH2)-;R3 表示-L-#1、-MOD或視情況經取代之烷基、環烷基、芳基、雜芳基、雜烷基、雜環烷基,較佳C1-10-烷基、C6-10-芳基或C6-10-芳烷基、C5-10-雜烷基、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基或C5-10-雜環烷基,其可經以下各項取代:1至3個-OH基團、1至3個鹵素原子、1至3個鹵化烷基(各自具有1至3個鹵素原子)、1至3個O-烷基、1至3個-SH基團、1至3個-S-烷基、1至3個-O-C(=O)-烷基、1至3個-O-C(=O)-NH-烷基、1至3個-NH-C(=O)-烷基、1至3個-NH-C(=O)-NH-烷基、1至3個-S(=O)n-烷基、1至3個-S(=O)2-NH-烷基、1至3個-NH-烷基、1至3個-N(烷基)2基團、1至3個-NH((CH2CH2O)1-20H)基團、1至3個-NH2基團或1至3個-(CH2)0-3Z基團,其中-L-#1 表示連接體且#1表示至結合劑或其衍生物之鍵,
其中-MOD 表示為如下文所定義,其中n 表示0、1或2,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘且其中Y3 表示-H、-(CH2)0-3-CH(NHC(=O)-CH3)Z‘、-(CH2)0-3-CH(NH2)Z‘或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH R5 表示-L-#1、H、-MOD、-NH2、-NO2、鹵素(特別地-F、-Cl、-Br)、-CN、-CF3、-OCF3、-CH2F、-CH2F、-SH或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、鹵素、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;R6及R7 彼此獨立地表示-H、氰基、C1-10-烷基、氟-C1-10-烷基、C2-10-烯基、氟-C2-10-烯基、C2-10-炔基、氟-C2-10-炔基、羥基、-NO2、-NH2、-COOH或鹵素(特別地-F、-Cl、-Br),R8 表示C1-10-烷基、氟-C1-10-烷基、C2-10-烯基、氟-C2-10-烯基、C2-10-炔基、氟-C2-10-炔基、C4-10-環烷基、氟-C4-10-環烷基、或-(CH2)0-2-(HZ2),其中HZ2 表示具有最多兩個選自由N、O及S組成之群之雜原子之4員至7員雜環,其中該等基團中之每一者均可經-OH、-COOH或-NH2或-L-#1取代;其中-L-#1 表示連接體且#1表示至結合劑或其衍生物之鍵,其中取代基R1、R2、R3、R4、R5、R8及R10中之一者表示(或在R8
之情形下含有)-L-#1,R9 表示-H、-F、-CH3、-CF3、-CH2F或-CHF2;-MOD 如上文所定義表示-(NR10)n-(G1)o-G2-G3,其中R10 表示-H或C1-C3-烷基;
其中G1 表示-NH-C(=O)-、-C(=O)-NH-或
(其中,若G1表示-NH-C(=O)-或,則R10不表示-NH2);其中n 係0或1;其中o 係0或1;其中G2 表示直鏈及/或具支鏈烴基團,其具有1至10個碳原子且其可由以下基團中之一或多者間雜一次或超過一次:-O-、-S-、-S(=O)-、-S(=O)2-、-NRy-、-NRyC(=O)-、-C(=O)-NRy-、-NRyNRy-、-s(=O)2-NRyNRy-、-C(=O)-NRyNRy-、-C(=O)-、-CRx=N-O-,且其中包括任何側鏈之烴鏈均可經以下各項取代:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、NH-CNNH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸,其中Ry 表示-H、苯基、C1-C10-烷基、C2-C10-烯基或C2-C10-炔基,其每一者均可經以下各項取代:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、NH-CN-NH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸,其中Rx 表示-H、C1-C3-烷基或苯基,其中G3 表示-H或-COOH,且其中-MOD 較佳具有至少一個-COOH基團;及其鹽、溶劑合物、溶劑合物之鹽及差向異構物。
式(II):
其中X1表示N,X2表示N且X3表示C;或X1表示N,X2表示C且X3表示N;或X1表示CH或CF,X2表示C且X3表示N;或X1表示NH,X2表示C且X3表示C;或X1表示CH,X2表示N且X3表示C R1表示 -H、-MOD、-L-#1或-(CH2)0-3Z,其中-L-#1 表示連接體且#1表示至結合劑或其衍生物之鍵。
其中-MOD 表示為如下文所定義,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2、-(CH2CH2O)0-3-(CH2)0-3Z‘(例如-(CH2)0-3Z‘)或-CH(CH2W)Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-NH2、-SO3H、-COOH、-NH-C(=O)-CH2-CH2-CH(NH2)COOH或-(C(=O)-NH-CHY4)1-3COOH,其中W 表示-H或-OH,其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基;
R2 表示-L-#1、H、-MOD、-C(=O)-CHY4-NHY5或-(CH2)0-3Z,其中-L-#1 表示連接體且#1表示至結合劑或其衍生物之鍵,其中-MOD 表示為如下文所定義,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,且其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;其中Y4 表示視情況經-NHC(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基;R4 表示-L-#1、-H、-C(=O)-CHY4-NHY5或-(CH2)0-3Z,其中-L-#1 表示連接體且#1表示至結合劑或其衍生物之鍵,其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,且其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或R4 表示基團R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-或R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2COOH)-C(=O)-或
細胞自溶酶可裂解基團R21-(C=O)(0-1)-(P3)(1-2)-P2-,其中R21 表示H、C1-10-烷基-、C5-10-芳基-或C6-10-芳烷基-、C5-10-雜烷基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基-、C5-10-雜環烷基-、雜芳基-、雜芳基-烷基-、C1-10-烷氧基-、C6-10-芳基氧基-或C6-10-芳烷氧基-、C5-10-雜烷氧基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基氧基-、C5-10-雜環烷氧基,其可經以下基團取代一或多次:-NH2、-NH-烷基、-N(烷基)2、-NH-C(=O)-烷基、N(烷基)-C(=O)-烷基、-SO3H、-S(=O)2NH2、-S(=O)2-N(烷基)2、-COOH、-C(=O)-NH2、-C(=O)-N(烷基)2或-OH,或表示-H或基團-(O)x-(CH2CH2O)y-R22,其中x 為0或1且其中v 係1至20之數值,其中R22 表示-H、-烷基(較佳C1-12-烷基)、-CH2-COOH、-CH2-CH2-COOH或-CH2-CH2-NH2;其中P2 係選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His;其中P3 係獨立地選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His或相應N-烷基胺基酸中之一者,較佳N-甲基胺基酸;在存在超過一個胺基酸P3之情形下,P3可具有相同或不同之胺基酸,如上文所定義;或R2及R4 一起(且形成吡咯啶環)表示-CH2-CHR10-或-CHR10-CH2-,其中R10 表示-H、鹵素(較佳-F或-Cl)、-NH2、-SO3H、-COOH、-SH、C1-4-烷基、C1-4-鹵烷基、C1-4-烷氧基、羥基取代之C1-4-烷
基、-C(=O)-O-(C1-4-烷基)或-OH,且其中該吡咯啶環中之二級胺基之氫原子可經R21-C(=O)-P3(0-2)-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-SIG-替代;其中L-#1 表示連接體且#1表示至結合劑或其衍生物之鍵,其中P2 係選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His;其中P3 係獨立地選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His或相應N-烷基胺基酸中之一者,較佳N-甲基胺基酸;其中-SIG 係自消性基團,在-C(=O)-SIG鍵裂解時提供游離二級胺;A 表示-C(=O)-、-S(=O)-、-S(=O)2-、-S(=O)2-NH-或-C(=N-NH2)-;R3 表示-L-#1、-MOD或視情況經取代之烷基、環烷基、芳基、雜芳基、雜烷基、雜環烷基,較佳-L-#1或C1-10-烷基、C6-10-芳基或C6-10-芳烷基、C5-10-雜烷基、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基或C5-10-雜環烷基,其可經以下各項取代:1至3個-OH基團、1至3個鹵素原子、1至3個鹵化烷基(各自具有1至3個鹵素原子)、1至3個-O-烷基、1至3個-SH基團、1至3個-S-烷基、1至3個-O-C(=O)-烷基、1至3個-O-C(=O)-NH-烷基、1至3個-NH-C(=O)-烷基、1至3個-NH-C(=O)-NH-烷基、1至3個-S(=O)n-烷基、1至3個-S(=O)2-NH-烷基、1至3個-NH-烷基、1至3個-N(烷基)2基團、1至3個-NH2基團或1至3個-(CH2)0-3Z基團,其中-L-#1 表示連接體且#1表示至結合劑或其衍生物之鍵,其中-MOD 表示為如下文所定義,
其中n 表示0、1或2,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘且其中Y3 表示-H、-(CH2)0-3-CH(NHC(=O)-CH3)Z‘、-(CH2)0-3-CH(NH2)Z‘或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;R5 表示-H、-NH2、-NO2、鹵素(特別地-F、-Cl、-Br)、-SH或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、鹵素、-NHY3、-C(O)-NY1Y2或-C(O)-OY3,其中Y1及Y2彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;R6及R7 彼此獨立地表示-H、氰基、C1-10-烷基、氟-C1-10-烷基、C2-10-烯基、氟-C2-10-烯基、C2-10-炔基、氟-C2-10-炔基、羥基或鹵素(特別地-F、-Cl、-Br),R8 表示C1-10-烷基、氟-C1-10-烷基、C4-10-環烷基、氟-C4-10-環烷基或視情況經取代之氧雜環丁烷;且R9 表示-H、-F、-CH3、-CF3、-CH2F或-CHF2;及其鹽、溶劑合物、溶劑合物之鹽及差向異構物。
藉由以熟習此項技術者習知之方式在R1、R2、R3、R4、R5或R8或在藉由R2及R4形成之吡咯啶環(R10)取代氫原子,其中取代基R1、R2、R3、R4、R5、R8及R10中之任一者皆不表示-L-#1之式(IIa)或(II)之化合物可連接至連接體。此得到式(IIa)或(II)之結合物,其中取代基R1、R2、R3、R4、R5、R8或R10中之一者表示-L-#1,L表示連接體且#1表
示至結合劑或其衍生物之鍵。若根據式(IIa)或(II)之KSP抑制劑與結合劑結合,則取代基R1、R2、R3、R4、R5、R8或R10中之一者因此表示-L-#1,其中L表示連接體且#1表示至結合劑或其衍生物之鍵。亦即,在結合物之情形下,取代基R1、R2、R3、R4、R5、R8及R10中之一者表示-L-#1,其中-L-#1連接至結合劑,例如抗體。尤佳地,取代基R1及R3中之一者表示-L-#1。在此實施例中,R4較佳表示-H、R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-或R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2COOH)-C(=O)-,如上文所定義。在另一較佳實施例中,取代基R4表示-L-#1,其中連接體可在結合至R4之氮原子處裂解使得藉由裂解生成一級胺基(對應於R4=-H)。下文闡述相應可裂解基團。
若R1不為-H,則結合至R1之碳原子係立體中心,其可存於L及/或D構形中,較佳於L構形中。
若R2不為-H,則結合至R2之碳原子係立體中心,其可存於L及/或D構形中。
結合劑較佳係人類、人類化或嵌合單株抗體或其抗原結合片段,特別地抗TWEAKR抗體或其抗原結合片段或抗EGFR抗體或其抗原結合片段。尤佳者係專一性結合至TWEAKR(SEQ ID NO:169)之位置47胺基酸D(D47)之抗TWEAKR抗體,特別地抗TWEAKR抗體TPP-2090或抗Her2抗體曲妥珠單抗。所有所述抗體皆包括該等抗體藉由由PNGase F引起之去糖基化或藉由重鏈之N297(Kabat編號)突變成任一胺基酸而生成之無糖基化變體。
尤佳者係式(IIa)或(II)之化合物,其中取代基R1、R2、R3、R4、R5及R10中之一者表示-L-#1且其中X1表示N,X2表示N且X3表示C;X1表示CH或CF,X2表示C且X3表示N;
X1表示NH,X2表示C且X3表示C;或X1表示CH,X2表示N且X3表示C,特別地如下者:其中X1表示N,X2表示N且X3表示C;或X1表示CH,X2表示C且X3表示N。尤佳者係其中X1表示CH,X2表示C且X3表示N之化合物。
對於A,較佳者係-C(=O)-。
對於R1較佳者係-L-#1、-H、-COOH、-C(=O)-NHNH2、-(CH2)1-3NH2、-C(=O)-NZ“(CH2)1-3NH2及-C(=O)-NZ“CH2COOH,其中Z“表示-H或-NH2。
R2及R4表示-H或R2表示-H且R4表示R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-或R2及R4一起(且形成吡咯啶環)表示-CH2-CHR10-或-CHR10-CH2-,其中R10表示-H或-L-#1。
對於R3較佳者係-L-#1或C1-10-烷基-,其可視情況經以下各項取代:-OH、-O-烷基、-SH、-S-烷基、-O-C(=O)-烷基、-O-C(=O)-NH-烷基、-NH-C(=O)-烷基、-NH-C(=O)-NH-烷基、-S(O)n-烷基、-S(=O)2-NH-烷基、-NH-烷基、-N(烷基)2或-NH2;其中烷基較佳係C1-3-烷基且n係0、1或2。
對於R5較佳者係-L-#1、-H或-F。
對於R6及R7較佳者係彼此獨立地為-H、(視情況經氟化)C1-3-烷基、(視情況經氟化)C2-4-烯基、(視情況經氟化)C2-4-炔基、羥基或鹵素,對於R8較佳者係具支鏈C1-5-烷基,特別地式-C(CH3)2-(CH2)0-2-Ry之基團,其中Ry表示-H、-OH、-COOH、-NH2或-L-#1。尤佳者係式-C(CH3)2-(CH2)-Ry之基團,其中Ry表示-H或-L-#1。
對於R9較佳者係-H或-F。
尤佳者係式(IIa)或(II)化合物,其中取代基R1、R2、R3、R4、
R5、R8及R10中之任一者皆不表示-L-#1或其中之一者表示-L-#1,且其中X1表示N,X2表示N且X3表示C;X1表示CH或CF,X2表示C且X3表示N;X1表示NH,X2表示C且X3表示C;或X1表示CH,X2表示N且X3表示C A表示-C(=O)-;R1表示-H、-COOH、-C(=O)-NHNH2、-(CH2)1-3NH2、-C(=O)-NZ“(CH2)1-3-NH2及-C(=O)-NZ“CH2COOH,其中Z“表示-H或-NH2;R2及R4表示-H或R2表示-H且R4表示R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-(其中P2及P3具有與上文所定義相同之含義),或R2及R4一起(且形成吡咯啶環)表示-CH2-CHR10-或-CHR10-CH2-,其中R10表示H或-L-#1;R3表示可經鹵素(特別地F)或視情況經氟化C1-3-烷基單取代或多取代之苯基,或表示視情況經氟化C1-10-烷基,其可視情況經以下各項取代:-OY4、-SY4、-O-C(=O)-Y4、-O-C(=O)-NH-Y4、-NH-C(=O)-Y4、-NH-C(=O)-NH-Y4、-S(=O)n-Y4(其中n表示0、1或2)、-S(=O)2-NH-Y4、-NH-Y4或-N(Y4)2,其中Y4表示-H、苯基(視情況經鹵素(特別地F)或視情況經氟化C1-3-烷基單取代或多取代)或烷基(其中該烷基可經以下各項取代:-OH、-COOH及/或-NHC(=O)-C1-3-烷基且其中烷基較佳表示C1-3-烷基);其中尤佳地R3可經以下各項取代:-OH、-O-烷基、-SH、-S-烷基、-O-C(=O)-烷基、-O-C(=O)-NH-烷基、-NH-C(=O)-烷基、-NH-C(=O)-NH-烷基、-S(=O)n-烷基(其中n表示0、1或2)、-S(=O)2-NH-烷基、-NH-烷基、-N(烷基)2或-NH2(其中烷基較佳意指C1-3-烷基)R5表示-H或-F;
R6及R7彼此獨立地表示-H、(視情況經氟化)C1-3-烷基、(視情況經氟化)C2-4-烯基、(視情況經氟化)C2-4-炔基、羥基或鹵素;R8表示具支鏈C1-5-烷基;且R9表示-H或-F。
此外,在以下情形(單獨或組合)時較佳:●R1表示-L-#1、-COOH或-H,●R2及R4彼此獨立地表示-L-#1或-H;或R2表示-H且R4表示R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-(其中P2及P3具有與上文所定義相同之含義)或R2及R4一起(且形成吡咯啶環)表示-CH2-CHR10-或-CHR10-CH2-,其中R10表示-H或-L-#1,●A表示-C(=O)-,●R3表示-(CH2)OH、-CH(CH3)OH、-CH2-S-CH2CH(COOH)NH-C(=O)-CH3、-CH(CH3)OCH3、可經1至3個鹵素原子、1至3個胺基或1至3個烷基(其可視情況經鹵化)取代之苯基,或表示-L-#1,●R5表示-L-#1或-H,●R6及R7彼此獨立地表示-H、C1-3-烷基或鹵素;特別地,R6及R7表示-F;●R8表示C1-4-烷基(較佳第三丁基);及/或●R9表示-H,●其中取代基R1、R2、R3、R4、R5及R10中之一者表示-L-#1。
另外,根據本發明,在以下情形時較佳:●R1表示-L-#1、-COOH或-H,●R2及R4彼此獨立地表示-L-#1或-H或R2表示-H且R4表示R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-(其中P2及P3具有與上文所定義相同之含義)或R2及R4一起(且形成吡咯啶環)表示-
CH2-CHR10-或-CHR10-CH2-,其中R10表示-H或-L-#1,●A表示-C(=O)-,●R3表示-(CH2)OH、-CH(CH3)OH、-CH2-S-CH2CH(COOH)NH-C(=O)-CH3、-CH(CH3)OCH3、可經1至3個鹵素原子、1至3個胺基或1至3個烷基(其可視情況經鹵化)取代之苯基,或表示-L-#1,●R5表示-L-#1或-H,●R6及R7彼此獨立地表示-H、C1-3-烷基或鹵素;特別地,R6及R7表示-F;●R8表示C1-4-烷基(較佳第三丁基);且●R9表示-H,●其中取代基R1、R2、R3、R4、R5及R10中之一者表示-L-#1。
其他尤佳化合物具有下文式(IIIa)或(III):
其中X1表示N,X2表示N且X3表示C;或X1表示N,X2表示C且X3表示N;或X1表示CH或CF,X2表示C且X3表示N;或X1表示NH,X2表示C且X3表示C;或X1表示CH,X2表示N且X3表示C
(其中較佳地X1表示CH,X2表示C且X3表示N);R1 表示-H、-L-BINDER、-MOD或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、-NHY3、-OY3、-SY3、鹵素、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2、-(CH2CH2O)0-3-(CH2)0-3Z‘(例如-(CH2)0-3Z‘)或-CH(CH2W)Z‘,且其中Y3 表示H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-NH2、-SO3H、-COOH、-NH-C(=O)-CH2-CH2-CH(NH2)COOH或-(C(=O)-NH-CHY4)1-3COOH,其中W 表示-H或-OH,其中Y4 表示視情況經-NH-(C=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基;R2 表示-L-BINDER、-H、-MOD、-C(=O)-CHY4-NHY5或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;其中Y4 表示經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基視情況,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基;R4 表示-L-BINDER、-H、-C(O)-CHY4-NHY5或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(O)-OY3,
其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或R4 表示基團R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-,其中R21 表示-H、C1-10-烷基-、C5-10-芳基-或C6-10-芳烷基-、C5-10-雜烷基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基-、C5-10-雜環烷基-、雜芳基-、雜芳基-烷基-、C1-10-烷氧基-、C6-10-芳基氧基-或C6-10-芳烷氧基-、C5-10-雜烷氧基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基氧基-、C5-10-雜環烷氧基,其可經以下基團取代一或多次:-NH2、-NH-烷基、-N(烷基)2、-NH-C(=O)-烷基、-N(烷基)-C(=O)-烷基、-SO3H、-SO2NH2、-S(=O)2-N(烷基)2、-COOH、-C(=O)-NH2、-C(=O)-N(烷基)2或-OH或係-H或基團-Ox-(CH2CH2O)y-R22,其中x 係0或1,其中v 係1至20之數值,且其中R22 表示-H、-烷基(較佳C1-12-烷基)、-CH2-COOH、-CH2-CH2-COOH或-CH2-CH2-NH2;其中P2 係選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His;其中P3 係獨立地選自以下各項之胺基酸:Gly、Pro、Ala、
Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His或相應N-烷基胺基酸中之一者,較佳N-甲基胺基酸;或R2及R4 一起(且形成吡咯啶環)表示-CH2-CHR10-或-CHR10-CH2-,其中R10 表示-L-BINDER、-H、-NH2、-SO3H、-COOH、-SH或-OH;A 表示-C(=O)-、-S(=O)-、-S(=O)2-、-S(=O)2-NH-或-C(=N-NH2)-;R3 表示-L-BINDER、-MOD或視情況經取代之烷基、環烷基、芳基、雜芳基、雜烷基、雜環烷基,較佳-L-BINDER或C1-10-烷基、C6-10-芳基或C6-10-芳烷基、C5-10-雜烷基、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基或C5-10-雜環烷基,其可經以下各項取代:1至3個-OH基團、1至3個鹵素原子、1至3個鹵化烷基(各自具有1至3個鹵素原子)、1至3個-O-烷基、1至3個-SH基團、1至3個-S-烷基、1至3個-O-C(=O)-烷基、1至3個-O-C(=O)-NH-烷基、1至3個-NH-C(=O)-烷基、1至3個-NH-C(=O)-NH-烷基、1至3個-S(=O)n-烷基、1至3個-S(=O)2-NH-烷基、1至3個-NH-烷基、1至3個-N(烷基)2基團、1至3個-NH2基團或1至3個-(CH2)0-3Z基團,其中n 為0、1或2,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H、-(CH2)0-3-CH(NH-C(=O)-CH3)Z‘、-(CH2)0-3-CH(NH2)Z‘或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH
其中「烷基」 較佳表示C1-10-烷基);R5 表示-L-BINDER、-H、-NH2、-NO2、鹵素(特別地F、Cl、Br)、-CN、-CF3、-OCF3、-CH2F、-CH2F、-SH或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、鹵素、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;R6及R7 彼此獨立地表示-H、氰基、C1-10-烷基、氟-C1-10-烷基、C2-10-烯基、氟-C2-10-烯基、C2-10-炔基、氟-C2-10-炔基、羥基、-NO2、-NH2、-COOH或鹵素(特別地-F、-Cl、-Br),R8 表示C1-10-烷基、氟-C1-10-烷基、C2-10-烯基、氟-C2-10-烯基、C2-10-炔基、氟-C2-10-炔基、C4-10-環烷基、氟-C4-10-環烷基或-(CH2)0-2-(HZ2),其中HZ2 表示具有最多兩個選自由N、O及S組成之群之雜原子之4員至7員雜環(較佳氧雜環丁烷),其中該等基團中之每一者均可經-OH、-COOH或-NH2或-L-BINDER取代;R9 表示-H、-F、-CH3、-CF3、-CH2F或-CHF2;L 表示連接體,BINDER 表示結合劑或其衍生物,其中該結合劑可視情況連接至複數種活性化合物分子,其中R1、R2、R3、R4、R5及R8中之一個代表表示-L-結合劑;-MOD 表示-(NR10)n-(G1)o-G2-H,其中其中R10 表示-H或C1-C3-烷基;
其中G1 表示-NHC(=O)-、-C(=O)-NH-或(其中,
若G1表示-NH-C(=O)-或,則R10不表示NH2);其中n 係0或1;其中o 為0或1;且其中G2 表示直鏈及/或具支鏈烴基團,其具有1至10個碳原子且其可由以下基團中之一或多者間雜一次或超過一次:-O-、-S-、-S(=O)-、-S(=O)2-、-NRy-、-NRyC(=O)-、-C(=O)-NRy-、-NRyNRy-、-S(=O)2-NRyNRy-、-C(=O)-NRyNRy-,其中Ry 表示-H、苯基、C1-C10-烷基、C2-C10-烯基或C2-C10-炔基,其每一者均可經以下各項取代:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、NH-CN-NH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸,或表示-C(=O)-、-CRx=N-O-其中Rx 表示-H、C1-C3-烷基或苯基,其中包括任何側鏈之烴鏈均可經以下各項取代:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、NH-CN-NH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸,且其中-MOD較佳具有至少一個基團-COOH;及其鹽、溶劑合物及溶劑合物之鹽。
在式(IIIa)之KSP抑制劑之結合劑結合物之情形下,R1、R2、R3、R4、R5、R8及R10中之最多一個代表(替代上文所給條件中之一者)可表示-L-BINDER,其中L表示連接體且BINDER表示結合劑或其衍生物,其中該結合劑可視情況連接至複數種活性化合物分子。
式(III):
其中X1表示N,X2表示N且X3表示C或X1表示CH,X2表示C且X3表示N或X1表示NH,X2表示C且X3表示C或X1表示CH,X2表示N且X3表示C;R1 表示-H、-L-BINDER或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、-NHY3、-OY3、-SY3、鹵素、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2、-(CH2CH2O)0-3-(CH2)0-3Z‘(例如-(CH2)0-3Z‘)或-CH(CH2W)Z‘,且其中Y3 表示H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-NH2、-SO3H、-COOH、-NH-C(=O)-CH2-CH2-CH(NH2)COOH或-(C(=O)-NH-CHY4)1-3COOH,其中W 表示-H或-OH,其中Y4 表示視情況經-NH-(C=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基;R2及R4 彼此獨立地表示-L-BINDER、-H、-C(O)-CHY4-NHY5或-(CH2)0-3Z,或R2及R4 一起(且形成吡咯啶環)表示-CH2-CHR10-或-CHR10-
CH2-,其中R10 表示L-#1、-H、-NH2、-SO3H、-COOH、-SH或-OH;其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基;A 表示-C(=O)-、-S(=O)-、-S(=O)2-、-S(=O)2-NH-或-C(=N-NH2)-;R3 表示-L-BINDER或視情況經取代之烷基、環烷基、芳基、雜芳基、雜烷基、雜環烷基,較佳-L-BINDER或C1-10-烷基、C6-10-芳基或C6-10-芳烷基、C5-10-雜烷基、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基或C5-10-雜環烷基,其可經以下各項取代:1至3個-OH基團、1至3個鹵素原子、1至3個鹵化烷基(各自具有1至3個鹵素原子)、1至3個-O-烷基、1至3個-SH基團、1至3個-S-烷基、1至3個-O-C(=O)-烷基、1至3個-O-C(=O)-NH-烷基、1至3個-NH-C(=O)-烷基、1至3個-NH-C(=O)-NH-烷基、1至3個-S(=O)n-烷基、1至3個-S(=O)2-NH-烷基、1至3個-NH-烷基、1至3個-N(烷基)2基團、1至3個-NH2基團或1至3個-(CH2)0-3Z基團,其中n 為0、1或2,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(O)-OY3,
其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H、-(CH2)0-3-CH(NH-C(=O)-CH3)Z‘、-(CH2)0-3-CH(NH2)Z‘或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH其中「烷基」 較佳表示C1-10-烷基);R5 表示-L-BINDER、-H、-NH2、-NO2、鹵素(特別地F、Cl、Br)、-CN、-CF3、-OCF3、-CH2F、-CH2F、-SH或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、鹵素、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;R6及R7 彼此獨立地表示-H、氰基、C1-10-烷基、氟-C1-10-烷基、C2-10-烯基、氟-C2-10-烯基、C2-10-炔基、氟-C2-10-炔基、羥基或鹵素(特別地-F、-Cl、-Br),R8 表示C1-10-烷基、氟-C1-10-烷基、C4-10-環烷基、氟-C4-10-環烷基或視情況經取代之氧雜環丁烷;R9 表示-H、-F、-CH3、-CF3、-CH2F或-CHF2;-L 表示連接體且-BINDER 表示結合劑或其衍生物,其中該結合劑可視情況連接至複數種活性化合物分子,其中R1、R2、R3、R4、R5、R8及R10中之一個代表表示-L-結合劑;及其鹽、溶劑合物及溶劑合物之鹽。
此外,根據本發明較佳者係以下KSP抑制劑之結合物:式(IIIb):
其中X1、X2、X3具有與在式(IIIa)或(III)中相同之含義(其中較佳X1表示-CH-,X2表示-C-且X3表示-N-)、R1、R2、R4、R5、R6、R7、R8及R9具有與在式(IIIa)或(III)中相同之含義,A表示-C(=O)-、B表示單鍵、-O-CH2-或-CH2-O-且R20表示-NH2、-F、-CF3或-CH3且n表示0、1或2。
其中X1、X2、X3具有與在式(IIIa)或(III)中相同之含義(其中較佳X1表示-CH-,X2表示-C-且X3表示-N-);A、R1、R3、R6、R7、R8及R9具有與在式(IIIa)或(III)中相同之含義,A較佳表示-C(=O)-且R3表示-CH2OH、-CH2OCH3、-CH(CH3)OH或-CH(CH3)OCH3。
式(IIId):
其中X1、X2、X3具有與在式(IIIa)或(III)中相同之含義(其中較佳X1表示-CH-,X2表示-C-且X3表示-N-);A、R3、R6、R7、R8及R9具有與在式(IIIa)或(III)中相同之含義,其中A較佳表示-C(=O)-且R3表示-CH2-Sx-(CH2)0-4-CHY5-COOH,其中x係0或1且Y5表示-H或-NHY6,其中Y6表示-H或-C(=O)-CH3。
其中X1表示-CH-,X2表示-C-且X3表示-N-;A、R3、R4、R6、R7、R8及R9具有與在式(IIIa)或(III)中相同之含義且R1表示-L-BINDER。
此外,當在式(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IIIc)、(IIId)及(IIIe)之化合物中以下情形(單獨或組合)時較佳:●Z表示Cl或Br;●R1表示-(CH2)0-3Z,其中Z表示-C(=O)-NY1Y2,其中Y2表示-
(CH2CH2O)0-3-(CH2)0-3Z‘且Y1表示-H、-NH2或-(CH2CH2O)0-3-(CH2)0-3Z‘;●Y1表示-H,Y2表示-(CH2CH2O)3-CH2CH2Z‘且Z‘表示-COOH;●Y1表示-H,Y2表示-CH2CH2Z‘且Z‘表示-(C(=O)-NHCHY4)2COOH;●Y1表示-H,Y2表示-CH2CH2Z‘,Z‘表示-(C(=O)-NHCHY4)2COOH且Y4基團中之一者表示異丙基及其他-(CH2)3-NH-C(=O)-NH2;●Y1表示H,Y2表示-CH2CH2Z‘,Z‘表示-(C(=O)-NHCHY4)2COOH且Y4基團中之一者表示-CH3及其他-(CH2)3-NH-C(=O)-NH2;●Y4表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基;●至少一個Y4代表係選自由異丙基及-CH3組成之群;●Y1表示-H,Y2表示-CH2CH2Z‘,Z‘表示-C(=O)-NHCHY4COOH且Y4表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基;●Y4表示胺基苄基;●R2表示-(CH2)0-3Z且Z表示-SY3;●R4表示-C(=O)-CHY4-NHY5且Y5表示-H;●R4表示-C(=O)-CHY4-NHY5且Y5表示-C(=O)-CHY6-NH2;●R4表示R21-L-Ala-L-Ala-L-Asn-#;●Y4表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基。
此外,在式(IIa)或(IIIa)中之R1、R2或R3表示-MOD時,特別地在R4表示-L-#1或-L-BINDER時(特別地在-L係在-N-R4或-N-L-#1或-L-BINDER處直接裂解使得R4或L由-H替代之可裂解連接體時)較佳。
尤佳地,R3表示-MOD且R1或R4表示-L-#1或-L-BINDER,其中-MOD表示-(NR10)n-(G1)o-G2-H,其中R10 表示-H或C1-C3-烷基;
其中G1 表示-NH-C(=O)-、-C(=O)-NH-或(其中,
若G1表示-NH-C(=O)-或,則R10不表示NH2);其中n 係0或1;其中o 為0或1;且其中G2 表示直鏈及/或具支鏈烴基團,其具有1至10個碳原子且其可由以下基團中之一或多者間雜一次或超過一次:-O-、-S-、-S(=O)-、-S(=O)2-、-NRy-、-NRyC(=O)-、-C(=O)-NRy-、-NRyNRy-、-S(=O)2-NRyNRy-、-C(=O)-NRyNRy-,其中Ry 表示-H、苯基、C1-C10-烷基、C2-C10-烯基或C2-C10-炔基,其每一者均可經以下各項取代:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、NH-CN-NH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸,或表示-C(=O)-、-CRx=N-O-其中Rx 表示-H、C1-C3-烷基或苯基,其中包括任何側鏈之烴鏈均可經以下各項取代:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、-NH-CN-NH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸,且其中-MOD 較佳具有至少一個基團-COOH。
尤佳地,基團-MOD具有(較佳末端)-COOH基團,例如在甜菜鹼基團中。較佳地,基團-MOD具有式-CH2-Sx-(CH2)0-4-CHY5-COOH,其中x係0或1,且Y5表示-H或-NHY6,其中Y6表示-H或-C(=O)-CH3。
其他尤佳化合物具有下式(IV):
其中X1 表示N,X2表示C且X3表示N;R1 表示-H、-L-BINDER或-(CH2)0-3Z‘其中Z 表示-H、-NHY3、-OY3、-SY3、鹵素、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2、-(CH2CH2O)0-3-(CH2)0-3Z‘或-CH(CH2W)Z‘,其中Y3 表示H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-NH2、-SO3H、-COOH、-NH-C(=O)-CH2-CH2-CH(NH2)COOH或-(C(=O)-NH-CHY4)1-3COOH,其中W 表示-H或-OH,其中Y4 表示視情況經-NH-(C=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基;R2及R4 彼此獨立地表示-L-BINDER、-H、-C(=O)-CHY4-NHY5或-(CH2)0-3Z,或R2及R4 一起(且形成吡咯啶環)表示-CH2-CHR10-或-CHR10-CH2-,其中R10 表示L-#1、-H、-NH2、-SO3H、-COOH、-SH或-OH;
其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基;A 表示-C(=O)-、-S(=O)-、-S(=O)2-、-S(=O)2-NH-或-C(=N-NH2)-;R3 表示-L-BINDER或視情況經取代之烷基、環烷基、芳基、雜芳基、雜烷基、雜環烷基或-CH2-Sx-(CH2)0-4-CHY5-COOH,其中x 係0或1,其中Y5 表示-H或-NHY6,其中Y6 表示-H或-C(=O)-CH3,較佳-L-BINDER或C1-10-烷基、C6-10-芳基或C6-10-芳烷基、C5-10-雜烷基、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基或C5-10-雜環烷基,其可經以下各項取代:1至3個-OH基團、1至3個鹵素原子、1至3個鹵化烷基(各自具有1至3個鹵素原子)、1至3個-O-烷基、1至3個-SH基團、1至3個-S-烷基、1至3個-O-C(=O)-烷基、1至3個-O-C(=O)-NH-烷基、1至3個-NH-C(=O)-烷基、1至3個-NH-C(=O)-NH-烷基、1至3個-S(=O)n-烷基、1至3個-S(=O)2-NH-烷基、1至3個-NH-烷基、1至3個-N(烷基)2基團、1至3個-NH2基團或1至3個-(CH2)0-3Z基團,其中n 為0、1或2,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-
NY1Y2或-C(O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H、-(CH2)0-3-CH(NH-C(=O)-CH3)Z‘、-(CH2)0-3-CH(NH2)Z‘或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH其中「烷基」 較佳表示C1-10-烷基);R5 表示-L-BINDER、-H、-NH2、-NO2、鹵素(特別地F、Cl、Br)、-SH或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、鹵素、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;其中L 表示連接體,BINDER 表示結合劑或其衍生物,其中該結合劑可視情況連接至複數種活性化合物分子;R6及R7 彼此獨立地表示-H、氰基、C1-10-烷基、氟-C1-10-烷基、C2-10-烯基、氟-C2-10-烯基、C2-10-炔基、氟-C2-10-炔基、羥基或鹵素(特別地-F、-Cl、-Br);R8 表示C1-10-烷基、氟-C1-10-烷基、C4-10-環烷基、氟-C4-10-環烷基或視情況經取代之氧雜環丁烷;R9 表示-H、-F、-CH3、-CF3、-CH2F或-CHF2;及其鹽、溶劑合物、溶劑合物之鹽及差向異構物;前提係R1、R2及R4不同時表示-H。
此外,在式(IIa)、(II)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IIIc)、(IIId)、(IIIe)或(IV)中以下情形(單獨或組合)時較佳:
●Z表示Cl或Br;●R1表示-(CH2)0-3Z,其中Z表示-C(=O)-NY1Y2,其中Y2表示-(CH2CH2O)0-3-(CH2)0-3Z‘且Y1表示H、NH2或-(CH2CH2O)0-3-(CH2)0-3Z‘;●Y1表示-H,Y2表示-(CH2CH2O)3-CH2CH2Z‘且Z‘表示-COOH;●Y1表示-H,Y2表示-CH2CH2Z‘且Z‘表示-(C(=O)-NHCHY4)2COOH;●Y1表示-H,Y2表示-CH2CH2Z‘,Z‘表示-(C(=O)-NHCHY4)2COOH且一個Y4代表表示異丙基且其他表示-(CH2)3-NH-C(=O)-NH2;●Y1表示-H,Y2表示-CH2CH2Z‘,Z‘表示-(C(=O)-NHCHY4)2COOH且一個Y4代表表示-CH3且其他表示-(CH2)3-NH-C(=O)-NH2;●Y4表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基;●至少一個Y4代表係選自由異丙基及-CH3組成之群;●Y1表示-H,Y2表示-CH2CH2Z‘,Z‘表示-C(=O)-NHCHY4COOH且Y4表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基;●Y4表示胺基苄基;●R2表示-(CH2)0-3Z且Z表示-SY3;●R4表示-C(=O)-CHY4-NHY5且Y5表示-H;●R4表示-C(=O)-CHY4-NHY5且Y5表示-C(=O)-CHY6-NH2;●R4表示R21-L-Ala-L-Ala-L-Asn-#;●Y4表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基。
此外較佳者係式(IIa)、(II)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IIIc)、
(IIId)、(IIIe)或(IV)之化合物其中X1表示N,X2表示N且X3表示C;或X1表示N,X2表示C且X3表示N;或X1表示CH或CF,X2表示C且X3表示N;或X1表示NH,X2表示C且X3表示C;或X1表示CH或CF,X2表示N且X3表示C;(其中較佳地X1表示CH,X2表示C且X3表示N);R1 表示H、-L-#1或-L-BINDER、-MOD或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、-NHY3、-OY3、-SY3、鹵素、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2、-(CH2CH2O)0-3-(CH2)0-3Z‘(例如-(CH2)0-3Z‘)或-CH(CH2W)Z‘,其中Y3 表示H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-NH2、-SO3H、-COOH、-NH-C(=O)-CH2-CH2-CH(NH2)COOH或-(C(=O)-NH-CHY4)1-3COOH,其中W 表示-H或-OH,其中Y4 表示視情況經-NH-(C=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基;R2 表示-H、-C(=O)-CHY4-NHY5或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈
C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基;R4 表示-H或R21-L-Ala-L-Ala-L-Asn-;其中R21 表示-H、C1-10-烷基-、C5-10-芳基-或C6-10-芳烷基-、C5-10-雜烷基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基-、C5-10-雜環烷基-、雜芳基-、雜芳基-烷基-、C1-10-烷氧基-、C6-10-芳基氧基-或C6-10-芳烷氧基-、C5-10-雜烷氧基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基氧基-、C5-10-雜環烷氧基,其可經以下基團取代一或多次:-NH2、-NH-烷基、-N(烷基)2、-NH-C(=O)-烷基、-N(烷基)-C(=O)-烷基、-SO3H、-SO2NH2、-S(=O)2-N(烷基)2、-COOH、-C(=O)-NH2、-C(=O)-N(烷基)2或-OH或係-H或基團-Ox-(CH2CH2O)y-R22,其中x 係0或1,其中v 係1至20之數值,且其中R22 表示-H、-烷基(較佳C1-12-烷基)、-CH2-COOH、-CH2-CH2-COOH或-CH2-CH2-NH2;A 表示-C(=O)-、-S(=O)-、-S(=O)2-、-S(=O)2-NH-或-C(=N-NH2)-;R3 表示-L-#1或-L-BINDER、-MOD或視情況經取代之烷基、環烷基、芳基、雜芳基、雜烷基、雜環烷基,較佳-L-BINDER或C1-10-烷基、C6-10-芳基或C6-10-芳烷基、C5-10-雜烷基、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基或C5-10-雜環烷基,其可經以下各項取代:1至3個-OH基團、1至3個鹵素原子、1至3個鹵化烷基(各自具有1至3個鹵素原子)、1至3個-O-烷基、1至3個-SH基團、1至3個-S-烷基、1至3個-O-C(=O)-烷基、1至3個-O-C(=O)-NH-烷基、1至3個-NH-C(=O)-烷基、1至3個-NH-C(=O)-NH-烷基、1至3個-S(=O)n-烷基、1至3個-S(=O)2-NH-烷基、1至3個-
NH-烷基、1至3個-N(烷基)2基團、1至3個-NH2基團或1至3個-(CH2)0-3Z基團,其中n 為0、1或2,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H、-(CH2)0-3-CH(NH-C(=O)-CH3)Z‘、-(CH2)0-3-CH(NH2)Z‘或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH其中「烷基」 較佳表示C1-10-烷基);R5 表示-H、-MOD、-NH2、-NO2、鹵素(特別地F、Cl、Br)、-CN、-CF3、-OCF3、-CH2F、-CH2F、-SH或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、鹵素、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;R6及R7 彼此獨立地表示-H、氰基、C1-10-烷基、氟-C1-10-烷基、C2-10-烯基、氟-C2-10-烯基、C2-10-炔基、氟-C2-10-炔基、羥基、-NO2、-NH2、-COOH或鹵素(特別地-F、-Cl、-Br),R8 表示C1-10-烷基、氟-C1-10-烷基、C2-10-烯基、氟-C2-10-烯基、C2-10-炔基、氟-C2-10-炔基、C4-10-環烷基或氟-C4-10-環烷基,其中取代基R1及R3中之一者表示-L-#1或-L-BINDER,L 表示連接體,#1 表示至結合劑或其衍生物之鍵,BINDER 表示結合劑,
R9 表示-H、-F、-CH3、-CF3、-CH2F或-CHF2;-MOD 表示-(NR10)n-(G1)o-G2-G3,其中R10 表示-H或C1-C3-烷基;
其中G1 表示-NH-C(=O)-、-C(=O)-NH-或(其中,
若G1表示-NH-C(=O)-或,則R10不表示-NH2);其中n 係0或1;其中o 為0或1;且其中G2 表示直鏈及/或具支鏈烴基團,其具有1至10個碳原子且其可由以下基團中之一或多者間雜一次或超過一次:-O-、-S-、-S(=O)-、-S(=O)2-、-NRy-、-NRyC(=O)-、-C(=O)-NRy-、-NRyNRy-、-S(=O)2-NRyNRy-、-C(=O)-NRyNRy-,其中Ry 表示-H、苯基、C1-C10-烷基、C2-C10-烯基或C2-C10-炔基,其每一者均可經以下各項取代:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、NH-CN-NH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸,或表示-C(=O)-、-CRx=N-O-其中Rx 表示-H、C1-C3-烷基或苯基,其中包括任何側鏈之烴鏈均可經以下各項取代:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、-NH-CN-NH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸,其中G3 表示-H或-COOH,且其中-MOD 較佳具有至少一個基團-COOH;及其鹽、溶劑合物、溶劑合物之鹽及差向異構物。此外較佳者係式(IIa)、(II)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IIIc)、(IIId)、(IIIe)或(IV)之化合物,其中X1表示N,X2表示N且X3表示C;或
X1表示N,X2表示C且X3表示N;或X1表示CH或CF,X2表示C且X3表示N;或X1表示NH,X2表示C且X3表示C;或X1表示CH或CF,X2表示N且X3表示C;(其中較佳地X1表示CH,X2表示C且X3表示N);R1 表示-H、-L-#1或-L-BINDER、-MOD或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、-NHY3、-OY3、-SY3、鹵素、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2、-(CH2CH2O)0-3-(CH2)0-3Z‘(例如-(CH2)0-3Z‘)或-CH(CH2W)Z‘,且其中Y3 表示H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-NH2、-SO3H、-COOH、-NH-C(=O)-CH2-CH2-CH(NH2)COOH或-(C(=O)-NH-CHY4)1-3COOH,其中W 表示-H或-OH,其中Y4 表示視情況經-NH-(C=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基;R2 表示-H、-C(=O)-CHY4-NHY5或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基;
R4 表示-H或R21-L-Ala-L-Ala-L-Asn-;其中R21 表示-H、C1-10-烷基-、C5-10-芳基-或C6-10-芳烷基-、C5-10-雜烷基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基-、C5-10-雜環烷基-、雜芳基-、雜芳基-烷基-、C1-10-烷氧基-、C6-10-芳基氧基-或C6-10-芳烷氧基-、C5-10-雜烷氧基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基氧基-、C5-10-雜環烷氧基,其可經以下基團取代一或多次:-NH2、-NH-烷基、-N(烷基)2、-NH-C(=O)-烷基、-N(烷基)-C(=O)-烷基、-SO3H、-SO2NH2、-S(=O)2-N(烷基)2、-COOH、-C(=O)-NH2、-C(=O)-N(烷基)2或-OH或係-H或基團-Ox-(CH2CH2O)y-R22,其中x 係0或1,其中v 係1至20之數值,且其中R22 表示-H、-烷基(較佳C1-12-烷基)、-CH2-COOH、-CH2-CH2-COOH或-CH2-CH2-NH2;A 表示-C(=O)-、-S(=O)-、-S(=O)2-、-S(=O)2-NH-或-C(=N-NH2)-;R3 表示-L-#1或-L-BINDER、-MOD或視情況經取代之烷基、環烷基、芳基、雜芳基、雜烷基、雜環烷基,較佳C1-10-烷基、C6-10-芳基或C6-10-芳烷基、C5-10-雜烷基、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基或C5-10-雜環烷基,其可經以下各項取代:1至3個-OH基團、1至3個鹵素原子、1至3個鹵化烷基(各自具有1至3個鹵素原子)、1至3個-O-烷基、1至3個-SH基團、1至3個-S-烷基、1至3個-O-C(=O)-烷基、1至3個-O-C(=O)-NH-烷基、1至3個-NH-C(=O)-烷基、1至3個-NH-C(=O)-NH-烷基、1至3個-S(=O)n-烷基、1至3個-S(=O)2-NH-烷基、1至3個-NH-烷基、1至3個-N(烷基)2基團、1至3個-NH2基團或1至3個-(CH2)0-3Z基團,其中n 為0、1或2,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-
NY1Y2或-C(O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H、-(CH2)0-3-CH(NH-C(=O)-CH3)Z‘、-(CH2)0-3-CH(NH2)Z‘或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH其中「烷基」 較佳表示C1-10-烷基);R5 表示-MOD、-H、-NH2、-NO2、鹵素(特別地F、Cl、Br)、-CN、-CF3、-OCF3、-CH2F、-CH2F、-SH或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、鹵素、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;R6及R7 彼此獨立地表示-H或鹵素(特別地-F、-Cl、-Br),R8 表示C1-10-烷基或氟-C1-10-烷基,其中取代基R1及R3中之一者表示-L-#1或-L-BINDER,L 表示連接體,#1 表示至結合劑或其衍生物之鍵,BINDER 表示結合劑,R9 表示-H、-F、-CH3、-CF3、-CH2F或-CHF2;-MOD 表示-CH2-Sx-(CH2)0-4-CHY5-COOH,其中x 係0或1,其中Y5 表示H或NHY6,其中Y6 表示H或-C(=O)-CH3,及其鹽、溶劑合物、溶劑合物之鹽及差向異構物。
根據本發明尤佳者係式V、VI及VII之以下化合物之結合物,其
中R1、R2、R3、R4及R5具有上文所提及之含義(如針對(例如)式(IIa)或(IIIa)所提及):
尤佳者係式V、VI、VII之化合物,其中R1及R5表示-H或-L-#1;R2及R4彼此獨立地表示-L-#1或-H或R2及R4一起(且形成吡咯啶環)表示-CH2-CHR10-或-CHR10-CH2-,R10表示-H或-L-#1;且R3表示-CH2OH、-CH(CH3)OH或-L-#1,其中取代基R1、R2、R3、R4、R5及R10中之一者表示-L-#1。尤佳者係相應的式VI化合物。
本發明之較佳抗體藥物結合物(ADC)係具有下式VIII者:
其中m係0至2之數值;n為0或1;X表示-C(=O)-NH2或-COOH;La表示自消性連接體;Lc表示連接體。
A1係衍生自以下各項中之一者之殘基:胺基酸Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His;A2係衍生自以下各項中之一者之殘基:胺基酸Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His或相應N-烷基-胺基酸中之一者,較佳N-甲基-胺基酸(當存在超過一種P3時,P3可具有不同含義)D1係式II或IIa之KSP(亦即無連接體L);R表示Z1-(C=O)q-,其中q係0或1且Z1 表示C1-10-烷基-、C5-10-芳基-或C6-10-芳烷基-、C5-10-雜烷基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基-、C5-10-雜環烷基-、雜芳基-、雜芳基-烷基-、C5-10-雜芳基-烷氧基-、C1-10-烷氧基-、C6-10-芳基氧基-或C6-10-芳烷
氧基-、C5-10-雜烷氧基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基氧基-、C5-10-雜環烷氧基,其可經以下基團取代一或多次:-NH2、-NH-烷基、-N(烷基)2、-NH-C(=O)-烷基、-N(烷基)-C(=O)-烷基、-SO3H、-S(=O)2-NH2、-S(=O)2-N(烷基)2、-COOH、-C(=O)-NH2、-C(=O)-N(烷基)2、-OH、-H或基團-Ox-(CH2CH2O)y-R1,其中x 係0或1,其中v 係1至20之數值,其中R1 表示-H、-烷基(較佳C1-12-烷基)、-CH2-COOH、-CH2-CH2-COOH或-CH2-CH2-NH2,AB 表示抗體,s 係1至20、較佳2至8、尤佳2至4之數值,例如4。
本發明之較佳抗體前藥結合物(APDC)係具有下式IX者:
其中m係0、1或2;n係0或1;X表示-C(=O)-NH2或-COOH;La表示自消性連接體;Lb表示連接體。
A1係衍生自以下各項中之一者之殘基:胺基酸Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、
Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His;A2係衍生自以下各項中之一者之殘基:胺基酸Gly、Pro、Ala、Val、Nva、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Trp、Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Asp、Glu、Lys、Arg、瓜胺酸及His或相應N-烷基-胺基酸中之一者,較佳N-甲基-胺基酸(在存在超過一種P3時,P3可具有不同含義)D1係式II或IIa之KSP(亦即無連接體L);R表示Z1-(C=O)q-,其中q係0或1且Z1 表示C1-10-烷基-、C5-10-芳基-或C6-10-芳烷基-、C5-10-雜烷基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基-、C5-10-雜環烷基-、雜芳基-、雜芳基-烷基-、C5-10-雜芳基-烷氧基-、C1-10-烷氧基-、C6-10-芳基氧基-或C6-10-芳烷氧基-、C5-10-雜烷氧基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基氧基-、C5-10-雜環烷氧基,其可經以下基團取代一或多次:-NH2、-NH-烷基、-N(烷基)2、-NH-C(=O)-烷基、-N(烷基)-C(=O)-烷基、-SO3H、-S(=O)2-NH2、-S(=O)2-N(烷基)2、-COOH、-C(=O)-NH2、-C(=O)-N(烷基)2或-OH、-H或基團-Ox-(CH2CH2O)y-R1,其中x 係O或1,其中v 係1至20之數值,其中R1 表示-H、-烷基(較佳C1-12-烷基)、-CH2-COOH、-CH2-CH2-COOH或-CH2-CH2-NH2,AB 表示抗體,s 係1至20、較佳2至8、尤佳2至4之數值,例如4。
文獻揭示以位置專一性之均質方式使有機分子共價偶合(結合)至結合劑(例如抗體)之各種選項(例如參見(Sochaj等人,Biotechnology Advances,正在評論中之文章(2015),Panowski等人,MAbs 6,34-45(2014))。根據本發明較佳者係使用轉麩醯胺酸酶使KSP抑制劑經由抗體之受體麩醯胺酸殘基結合至抗體。該等受體麩醯胺酸可藉由突變或藉由生成無糖基化抗體而改造抗體來引入。抗體中該受體麩醯胺酸殘基之數量較佳為2或4。為進行偶合,使用連接體。可將連接體歸類為在活體內裂解之連接體群組及在活體內穩定之連接體群組(參見L.Ducry及B.Stump,Bioconjugate Chem. 21,5-13(2010))。可在活體內裂解之連接體具有可在活體內裂解之基團,其中,繼而可在可在活體內以化學方式裂解之基團與可在活體內以酶方式裂解之基團之間加以區分。「可在活體內以化學方式裂解」及「可在活體內以酶方式裂解」意味著連接體或基團在循環中係穩定的且其僅在靶標細胞處或在靶標細胞中因其中在化學上或在酶上不同之環境(較低pH;升高之麩胱甘肽濃度;存在溶酶體酶,例如豆莢蛋白、細胞自溶酶或胞漿素或醣苷酶(例如,ß-葡萄糖醛酸苷酶))而裂解,由此此釋放低分子量KSP抑制劑或其衍生物。可在活體內以化學方式裂解之基團特別地係二硫化物、腙、縮醛及胺縮醛;可在活體內以酶方式裂解之基團特別地係2-8-寡肽基團,尤其二肽基團或醣苷。肽裂解位置揭示於Bioconjugate Chem. 2002, 13,855-869及Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters 8(1998)3341-3346亦及Bioconjugate Chem. 1998, 9,618-626中。該等包括(例如)纈胺酸-丙胺酸、纈胺酸-離胺酸、纈胺酸-瓜胺酸、丙胺酸-離胺酸及苯丙胺酸-離胺酸(視情況具有其他醯胺基團)。
在活體內穩定之連接體可藉由高穩定性(在24小時後在血漿中之代謝物少於5%)加以區分且其沒有上文所提及之可在活體內以化學方式或以酶方式裂解之基團。
連接體-L-較佳具有下文基本結構(i)至(iv)中之一者:
(i)-(C=O)m-SG1-L1-L2-
(ii)-(C=O)m-L1-SG-L1-L2-
(iii)-(C=O)m-L1-L2-
(iv)-(C=O)m-L1-SG-L2
其中m係0或1;SG係可在活體內(以化學方式或以酶方式)裂解之基團(特別地二硫化物、腙、縮醛及胺縮醛;或2至8個寡肽基團,其可由細胞自溶酶或胞漿素裂解),SG1係寡肽基團或較佳二肽基團,L1彼此獨立地表示活體內穩定之有機基團,且L2表示至結合劑之偶合基團。
特別地當結合劑係抗體時,根據本發明尤佳者係基礎連接體結構(iii)。經由代謝,投與具有基礎連接體結構(iii)之本發明結合物及使用轉麩醯胺酸酶使連接體偶合至結合劑蛋白或肽之麩醯胺酸殘基產生下式之麩醯胺酸衍生物:
其中L1在每一情形下均連接至低分子量KSP抑制劑,例如式(I)、(IIa)、(II)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IIIc)、(IIId)、(IIIe)或(IV)至(IX)中之任一者之化合物。
根據本發明,L1較佳由下式表示#1-(NR10)n-(G1)o-G3-#2
其中R10表示-H、-NH2或C1-C3-烷基;
G1表示-NH-C(=O)-、-C-(=O)-NH-或;(若G1表示-
NH-C(=O)-或,則R10較佳不為-NH2)。n為0或1;
o係0或1;且G3表示鍵或視情況經取代之直鏈或具支鏈烴鏈,該烴鏈具有來自伸芳基及/或直鏈及/或具支鏈及/或環狀伸烷基之1至100個碳原子且其可由以下基團中之一或多者間雜一次或超過一次:-O-、-S-、-S(=O)-、-S(=O)2-、-NRy-、-NRy-C(=O)-、-C(NH)NRy-、-C(=O)-NRy-、-NRyNRy-、-S(=O)2-NRyNRy-、-C(=O)-NRyNRy-(其中Ry表示-H、苯基、C1-C10-烷基、C2-C10-烯基或C2-C10-炔基,其每一者均可經以下各項取代:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、-NH-CNNH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸)、-C(=O)-、-CRx=N-O-(其中Rx表示-H、C1-C3-烷基或苯基)及/或具有至多4個選自組成由N、O及S、-S(=O)-或-S(=O)2-之群之雜原子之3員至10員芳香族或非芳香族雜環(較佳
或),其中包括任何側鏈之烴鏈可經以下各項取代:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、-NH-CNNH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸。
G3表示鍵或視情況經取代之直鏈或具支鏈烴鏈,該烴鏈具有來自伸芳基及/或直鏈及/或具支鏈及/或環狀伸烷基之1至100個碳原子且其可由以下基團中之一或多者間雜一次或超過一次:-O-、-S-、-S(=O)-、-S(=O)2-、-NH-、-C(=O)-、-NH-C(=O)-、-C(=O)-NH-、-NMe-、-NHNH-、-S(=O)2-NHNH-、-C(=O)-NHNH-及具有最多4個選自由N、O及S或-S(=O)-組成之群之雜原子之5員至10員芳香族或非芳
香族雜環(較佳或),其中側鏈(若存在)可由以下取代:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、-NH-CNNH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸。
G3表示鍵或視情況經取代之直鏈或具支鏈烴鏈,該烴鏈具有來自伸芳基及/或直鏈及/或具支鏈及/或環狀伸烷基之1至100個碳原子且其可由以下基團中之一或多者間雜一次或超過一次:-O-、-S-、-S(=O)-、-S(=O)2-、-NH-、-C(=O)-、-NH-C(=O)-、-C(=O)-NH-、-NMe-、-NHNH-、-S(=O)2-NHNH-、-C(=O)-NHNH-、-CRx=N-O-(其中Rx表示H、C1-C3-烷基或苯基)及具有最多4個選自由N、O及S、-S(=O)-或-S(=O)2-組成之群之雜原子之3員至10員(例如5員至10員)芳
香族或非芳香族雜環(較佳或),其中包括側鏈(若存在)之烴鏈可經以下各項取代:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、-NH-CN-NH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸。
G3中之其他間雜基團較佳為
其中Rx表示H、C1-C3-烷基或苯基。
此處,#1係至KSP抑制劑之鍵且#2係至至結合劑之偶合基團(例如L2)之鍵。
伸芳基及/或直鏈及/或具支鏈及/或環狀伸烷基之直鏈或具支鏈烴鏈通常包含具有所述各別碳原子數之α,ω-二價烷基。可提及為較佳之實例係:亞甲基、乙烷-1,2-二基(1,2-伸乙基)、丙烷-1,3-二基(1,3-伸
丙基)、丁烷-1,4-二基(1,4-伸丁基)、戊烷-1,5-二基(1,5-伸戊基)、己烷-1,6-二基(1,6-伸己基)、庚烷-1,7-二基(1,7-伸己基)、辛烷-1,8-二基(1,8-伸辛基)、壬烷-1,9-二基(1,9-伸壬基)、癸烷-1,10-二基(1,10-伸癸基)。然而,烴鏈中之伸烷基亦可具支鏈,亦即上文所提及之直鏈伸烷基之一或多個氫原子可視情況經C1-10-烷基取代,由此形成側鏈。烴鏈可此外含有環狀伸烷基(環烷烴二基),例如1,4-環己烷二基或1,3-環戊烷二基。該等環狀基團可為不飽和的。特別地,烴基團中可存在芳香族基團(伸芳基)(例如伸苯基)。轉而,亦在環狀伸烷基及伸芳基中,一或多個氫原子可視情況經C1-10-烷基取代。以此方式,形成視情況具支鏈之烴鏈。此烴鏈具有總共0至100個碳原子,較佳1至50個、尤佳2至25個碳原子。
側鏈(若存在)可經以下各項取代:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、-NH-CN-NH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸。
烴鏈可由以下基團中之一或多者間雜一次或超過一次:-O-、-S-、-S(=O)-、-S(=O)2-、-NH-、-C(=O)-、-NH-C(=O)-、-C(=O)-NH-、-NMe-、-NHNH-、-S(O)2-NHNH-、-C(=O)-NHNH-及具有最多4個選自由N、O及S、-S(=O)-或-S(O)2-組成之群之雜原子之5員至10員芳香族
或非芳香族雜環(較佳或)。
G3中之其他間雜基團較佳為
根據本發明,L2較佳由下式表示:#1-(NH)p-(C=O)q-G4-NH-#2或#1-(NH)p-(C=O)q-G4-O-NH-#2其中p係0或1;q係0或1;且
G4表示視情況經取代之烷基或雜烷基鏈,視情況其中該鏈之任一碳經以下各項取代:烷氧基、羥基、烷基羰基氧基、-S-烷基、硫醇、-C(=O)-S-烷基、-C(=O)-NH-烷基、-NH-C(=O)-烷基、胺、-C(=O)-NH2其中#1表示至基團L1之連接點,#2表示至結合劑之麩醯胺酸殘基之連接點,較佳地,L2係以下基團中之一者:
其中Ry係-H、-C(=O)-NH-烷基、-NH-C(=O)-烷基、-C(=O)-NH2、-NH2,其中#1表示至基團L1之連接點,#2表示至結合劑之麩醯胺酸殘基之連接點。
較佳Ry係-H或-NH-C(=O)-Me。
較佳地,連接體對應於下式:§-(C=O)m-L1-L2-§§
其中m係0或1;§表示至活性化合物分子之鍵且§§表示至結合劑肽或蛋白質之鍵,且L1及L2具有上文所給出之含義。
在式(I)或(II)之結合物中上文所提及之連接體尤佳,其中連接體係藉由在R1或R3取代氫原子或與可裂解連接體SG1在R4處組合而偶
合,亦即R1表示-L-#1或R3表示-L-#1或R4表示-SG1-L-#1,其中#1表示至結合劑之鍵。
上文式§-(C=O)m-L1-L2-§§中之較佳基團L1係下文中之彼等,其中r在每一情形下彼此獨立地表示0至20、較佳0至15、尤佳1至20、尤佳2至10之數值:
具有相應連接體之結合物之實例具有以下結構,其中X1、X2、X3、Ry及L1具有上文所給含義,AK表示結合劑,較佳結合至麩醯胺酸側鏈之抗體,且n係2至10,較佳2至4且亦較佳2或4。且尤佳地,AK係人類、人類化或嵌合單株抗體或其抗原結合片段,特別地抗TWEAKR抗體或其抗原結合片段或抗EGFR抗體或其抗原結合片段。若結合劑係抗體,則其優先在恆定區中包含受體麩醯胺酸。該等受體麩醯胺酸可藉由適宜位置突變成麩醯胺酸(例如突變N297Q,Kabat EU編號)或藉由生成去糖基化或無糖基化抗體(例如藉由由PNGase F引起之酶性去糖基化或藉由N297X之突變(Kabat EU編號))引入。在去糖基化或無糖基化抗體之後一情形下,麩醯胺酸Q295(Kabat EU編號)變成受體麩醯胺酸。極佳者係包含突變N297A或N297Q(Kabat EU編號)之抗體。尤佳者係專一結合至TWEAKR(SEQ ID NO:169)之位置47胺基酸D(D47)之抗TWEAKR抗體,特別地抗TWEAKR抗體TPP-2090或抗Her2抗體。所有所述抗體皆包括該等抗體藉由由PNGase F引起之去糖基化或藉由重鏈之N297(Kabat編號)突變成任一胺基酸而生成之無糖基化變體。
根據本發明此外較佳者係基本結構(i)、(ii)或(iv),其中SG1或SG表示可由細胞自溶酶裂解之基團且L1及L2具有上文所給含義。尤佳者係以下基團:
●-NH-Val-Ala-CONH-(由此在丙胺酸之C-末端醯胺處裂解醯胺鍵)
●-NH-Val-Lys-CONH-(在離胺酸之C-末端醯胺處裂解醯胺鍵)
●-NH-Val-Cit-CONH-(在瓜胺酸之C-末端醯胺處裂解醯胺鍵)
●-NH-Phe-Lys-CONH(在離胺酸之C-末端醯胺處裂解醯胺鍵)
●-NH-Ala-Lys-CONH-(在離胺酸之C-末端醯胺處裂解醯胺
鍵)
●-NH-Ala-Cit-CONH-(在瓜胺酸之C-末端醯胺處裂解醯胺鍵)SG1或SG尤佳係
其中X表示-H或可視情況經以下取代之C1-10-烷基:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、NH2、-NH-CNNH2或磺酸。
下表給出連接體部分-SG1-L1-或-L1-SG-L1-之實例,其中SG1及SG係可由細胞自溶酶裂解之基團。L1基團係在盒中突出顯示。然而,該等基團L1可經針對上文式§-(C=O)m-L1-L2-§§所給基團L1中之一者替代。
具有基本結構(i)之結合物之實例具有以下結構,其中X1、X2、X3、R1及Ry具有上文所給含義,AK表示結合劑,較佳結合至麩醯胺酸側鏈之抗體,且n係2至10,較佳2至4且亦較佳2或4。尤佳地,AK係抗TWEAKR抗體,特別地專一結合至TWEAKR(SEQ ID NO:169)之位置47胺基酸D(D47)之抗TWEAKR抗體,特別地抗TWEAKR抗體TPP-2090。所有所述抗體皆包括該等抗體藉由由PNGase F引起之去糖基化或藉由重鏈之N297(Kabat編號)突變成任一胺基酸而生成之無糖基化變體。
本發明之結合物係藉由初始提供具有連接體之低分子量KSP抑制劑來製備。然後,使用轉麩醯胺酸酶使以此方式獲得之中間體與結合劑(較佳抗體)反應。
較佳地,為位置專一性之偶合至麩醯胺酸側鏈,使用轉麩醯胺酸酶使下文化合物中之一者與含有受體麩醯胺酸之結合劑(例如抗體)反應。
其中X1、X2、X3、SG、L1、R1及Ry具有與上文所闡述相同之含義。在上文所提及之式中,代替游離胺基(-NH2),可存在基團R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2-C(=O)-NH2)-C(=O)-NH-(其中R21、P2及P3具有與上文關於(例如)式(IIa)所定義相同之含義)。
若結合劑係抗體,則其優先在恆定區中包含受體麩醯胺酸。該等受體麩醯胺酸可藉由適宜位置突變成麩醯胺酸(例如突變N297Q,Kabat EU編號)或藉由生成去糖基化或無糖基化抗體(例如藉由由PNGase F引起之酶性去糖基化或藉由N297X之突變(Kabat EU編號))引入。在去糖基化或無糖基化抗體之後一情形下,麩醯胺酸Q295(Kabat EU編號)變成受體麩醯胺酸。極佳者係包含突變N297A或N297Q(Kabat EU編號)之抗體。
該化合物可以(例如)其三氟乙酸鹽之形式使用。為與結合劑(例
如,抗體)反應,相對於結合劑,該化合物較佳以2倍至100倍莫耳過量、更佳10倍至100倍莫耳過量、甚至更佳50倍至100倍莫耳過量使用。
為使中間體偶合至麩醯胺酸側鏈,可如下闡釋反應:
可使其他中間體及其他抗體相應地反應。
根據本發明,此得到以下結合物:
在上文各式中,X1、X2、X3及R1具有與在式(II)中相同之含義,SG、Ry及L1具有與上文所闡述相同之含義。AK係偶合至麩醯胺酸側
鏈之抗體。且尤佳地,AK1係抗TWEAKR抗體,特別地專一性結合至TWEAKR(SEQ ID NO:169)之位置47胺基酸D(D47)之抗體,特別地抗TWEAKR抗體TPP-2090。所有所述抗體皆包括該等抗體藉由由PNGase F引起之去糖基化或藉由重鏈之N297(Kabat編號)突變成任一胺基酸而生成之無糖基化變體。
尤佳者係以下結合物,其中AK3a、AK3b、AK3d、AK3e表示結合劑,較佳抗體,且n表示2至10,較佳2至4,且亦較佳2或4。較佳抗體係下文在部分Binders中所闡述之彼等,特別地抗體TPP-2090-HC-N297A(特別地作為AK3a)、抗體TPP-2090-HC-N297Q(特別地作為AK3b)、曲妥珠單抗(TPP-7510)(等於曲妥珠單抗-HC-N297A)(特別地作為AK3d)及曲妥珠單抗(TPP-7511)(等於曲妥珠單抗-HC-N297Q)(特別地作為AK3e)。
烷基
烷基表示通常具有1至10個碳原子、較佳1至6個碳原子(C1-C6-烷基)、更佳1至4個碳原子(C1-C4-烷基)且尤佳1至3個碳原子(C1-C3-烷基)之直鏈或具支鏈飽和單價烴基團。
可提及為較佳之實例係:
甲基-、乙基-、丙基-、丁基-、戊基-、己基-、異丙基-、異丁基-、第二丁基-、第三丁基-、異戊基-、2-甲基丁基-、1-甲基丁基-、1-乙基丙基-、1,2-二甲基丙基-、新戊基-、1,1-二甲基丙基-、4-甲基戊基-、3-甲基戊基-、2-甲基戊基-、1-甲基戊基-、2-乙基丁基-、1-乙基丁基-、3,3-二甲基丁基-、2,2-二甲基丁基-、1,1-二甲基丁基-、2,3-二甲基丁基-、1,3-二甲基丁基-、1,2-二甲基丁基-。
尤佳者係甲基、乙基、丙基、異丙基或第三丁基。
雜烷基
雜烷基表示如上文在「烷基」下定義之烷基且間雜有-O-、-S-、-NH-、-S(=O)-、-S(=O)2-、-S(=O)2-NH-。
環烷基
環烷基表示通常具有3至10個碳原子(C3-C10-環烷基),較佳3至8個碳原子(C3-C8-環烷基)及尤佳3至7個碳原子(C3-C7-環烷基)之單環飽和單價烴基團。
可提及為較佳之單環環烷基之實例係:環丙基、環丁基、環戊基、環己基及環庚基;尤佳者係環丙基、環戊基或環己基。
芳烷基
芳基-C1-C6-烷基-應理解為意指由視情況經取代之芳基及C1-C6-烷基構成且經由C1-C6-烷基鍵結至分子之剩餘部分之基團。此處,烷基具有上文在烷基下所給出之含義。
可提及之實例包括苄基、苯基乙基、苯丙基、苯基戊基,其中苄基較佳。
烷氧基
烷氧基表示式-O-烷基之直鏈或具支鏈飽和烷基醚基團,其通常
具有1至6個碳原子(C1-C6烷氧基)、較佳1至4個碳原子(C1-C4烷氧基)且尤佳1至3個碳原子(C1-C3烷氧基)。
可提及為較佳之實例係:甲氧基、乙氧基、正丙氧基、異丙氧基、第三丁氧基、正戊氧基及正己氧基。
芳烷氧基
芳烷氧基應理解為意指由視情況經取代之芳基及C1-C6-烷氧基構成且經由C1-C6-烷氧基鍵結至分子之剩餘部分之基團。此處,烷氧基具有上文所定義之含義。
可提及之實例包括苄基氧基、苯基乙基氧基、苯丙基氧基、苯基戊基氧基,其中苄基氧基較佳。
烷氧基烷基
烷氧基烷基表示經烷氧基取代之烷基,例如C1-C6-烷氧基-C1-C6-烷基-或C1-C3-烷氧基-C1-C3-烷基-。
此處,C1-C6-烷氧基-C1-C6-烷基-意指烷氧基烷基係經由烷基部分連接至分子之剩餘部分。
雜原子
雜原子應理解為意指氧、氮或硫原子。
芳基
芳基表示由碳原子組成之單價單環或二環芳香族環系統。實例係萘基-及苯基-;較佳者係苯基-或苯基。
雜芳基
雜芳基表示具有1個、2個、3個或4個可相同或不同之雜原子之單價單環或二環芳香族環系統。該等雜原子可為氮原子、氧原子或硫原子。結合化合價可在任一芳香族碳原子處或在氮原子處。
根據本發明單環雜芳基具有5個或6個環原子。
較佳者係具有一或兩個雜原子之雜芳基。此處,尤佳者係一或兩個氮原子。
具有5個環原子之雜芳基包括(例如)以下環:噻吩基、噻唑基、呋喃基、吡咯基、噁唑基、咪唑基、吡唑基、異噁唑基、異噻唑基、噁二唑基、三唑基、四唑基及噻二唑基。
具有6個環原子之雜芳基包括(例如)以下環:吡啶基、嗒嗪基、嘧啶基、吡嗪基及三嗪基。
根據本發明二環雜芳基具有9個或10個環原子。
具有9個環原子之雜芳基包括(例如)以下環:酞基、硫酞基、吲哚基、異吲哚基、吲唑基、苯并噻唑基、苯并呋喃基、苯并噻吩基、苯并咪唑基、苯并噁唑基、吖基、吲嗪基、嘌呤基、吲哚啉基。
具有10個環原子之雜芳基包括(例如)以下環:異喹啉基、喹啉基、喹嗪基、喹唑啉基、喹喏啉基、啉基、呔嗪基、1,7-萘啶基及1,8-萘啶基、喋啶基、烷基。
雜芳基進一步具有部分飽和二環芳基及部分飽和二環雜芳基之含義。
部分飽和二環芳基及部分飽和二環雜芳基
部分飽和之二環芳基或雜芳基表示由苯基或單環5員或6員雜芳基組成之二環基團,該二環基團在每一情形下均經由兩個直接毗鄰之環原子縮合成可視情況含有一或兩個可相同或不同之雜原子且具有4至7個環原子之脂肪族環狀基團。該等雜原子可為氮原子、氧原子或硫原子。
部分飽和之二環芳基包括(例如)以下基團:四氫萘基、2,3-二氫-1,4-苯并二氧雜環己烯基-、2,3-二氫-1-苯并呋喃基-及1,3-苯并二氧雜環戊烯基-。
部分飽和之二環雜芳基包括(例如)以下基團:5,6,7,8-四氫喹啉基-及5,6,7,8-四氫異喹啉基-。
雜環烷基
雜環烷基代表單環雜環基、雜螺環烷基及橋接雜環烷基。
單環雜環基
單環雜環基意指具有1個、2個或3個可相同或不同之雜原子之非芳香族單環環系統。該等雜原子可為氮原子、氧原子或硫原子。
根據本發明單環雜環基環可具有3至8個、較佳4至7個、尤佳5個或6個環原子。
例如且較佳地,對於具有3個環原子之單環雜環基可提及以下基團:氮丙啶基-。
例如且較佳地,對於具有4個環原子之單環雜環基可提及以下基團:氮雜環丁基-、氧雜環丁基-。
例如且較佳地,對於具有5個環原子之單環雜環基可提及以下基團:吡咯啶基-、咪唑啶基-、吡唑啶基-、吡咯啉基-、二氧戊環基-及四氫呋喃基-。
例如且較佳地,對於具有6個環原子之單環雜環基可提及以下基團:六氫吡啶基-、六氫吡嗪基-、嗎啉基-、二噁烷基-、四氫吡喃基-及硫嗎啉基-。
例如且較佳地,對於具有7個環原子之單環雜環基可提及以下基團:氮雜環庚烷基-、氧雜環庚烷基-、1,3-二氮雜環庚烷基-、1,4-二
氮雜環庚烷基-。
例如且較佳地,對於具有8個環原子之單環雜環基可提及以下基團:氧雜環辛烷基-、氮雜環辛烷基-。
在單環雜環基中,尤佳者係具有至多兩個由O、N及S組成之群之雜原子之4員至7員飽和雜環基。
尤佳者係嗎啉基-、六氫吡啶基-及吡咯啶基-。
螺環烷基及雜螺環烷基
C5-C12-螺環烷基或其中1個、2個、3個或4個碳原子由如上文所定義之雜原子(呈任一組合)替代之C5-C12-雜螺環烷基應理解為意指兩個共用公用原子之飽和環系統之稠合體。實例係螺[2.2]戊基、螺[2.3]己基、氮雜螺[2.3]己基、螺[3.3]庚基、氮雜螺[3.3]庚基、氧氮雜螺[3.3]庚基、硫氮雜螺[3.3]庚基、氧雜螺[3.3]庚基、氧氮雜螺[3.5]壬基、氧氮雜螺[3.4]辛基、氧氮雜螺[5.5]十一烷基、二氮雜螺[3.3]庚基、硫氮雜螺[3.3]庚基、硫氮雜螺[3.4]辛基、氮雜螺[5.5]癸基及其他同源螺[3.4]、螺[4.4]、螺[5.5]、螺[6.6]、螺[2.4]、螺[2.5]、螺[2.6]、螺[3.5]、螺[3.6]、螺[4.5]、螺[4.6]及螺[5.6]系統(包括由根據定義之雜原子修改之變體)。較佳者係C6-C10-雜螺環烷基-,例如且尤佳地2-氮雜螺[3.3]庚基-、1-硫雜-6-氮雜螺[3.3]庚基-、2-硫雜-6-氮雜螺[3.3]庚基-、2-氧雜-6-氮雜螺[3.3]庚基-、2,6-二氮雜螺[3.3]庚基-、2-氧雜-6-氮雜螺[3.4]辛基-、2-氧雜-6-氮雜螺[3.5]壬基-、2-氧雜-7-氮雜螺[3.5]壬基-、8-氮雜螺[4.5]癸基-、2,8-二氮雜螺[4.5]癸基-、3-氧雜-1,8-二氮雜螺[4.5]癸基-。
雙環烷基及雜雙環烷基
C6-C12-雙環烷基或其中1個、2個、3個或4個碳原子由如上文所定義之雜原子(呈任一組合)替代之C6-C12-雜雙環烷基應理解為意指兩
個共用兩個直接毗鄰原子之飽和環系統之稠合體。實例係衍生自以下之基團:雙環[2.2.0]己基-、雙環[3.3.0]辛基-、雙環[4.4.0]癸基-、雙環[5.4.0]十一烷基-、雙環[3.2.0]庚基-、雙環[4.2.0]辛基-、雙環[5.2.0]壬基-、雙環[6.2.0]癸基-、雙環[4.3.0]壬基-、雙環[5.3.0]癸基-、雙環[6.3.0]十一烷基-及雙環[5.4.0]十一烷基-(包括經雜原子修改之變體,例如氮雜雙環[3.3.0]辛基-、氮雜雙環[4.3.0]壬基-、二氮雜雙環[4.3.0]壬基-、氧氮雜雙環[4.3.0]壬基-、硫氮雜雙環[4.3.0]壬基-或氮雜雙環[4.4.0]癸基-)及根據定義之其他可能組合。較佳者係C6-C10-雜二環烷基-,例如且尤佳地全氫環戊[c]吡咯基-、全氫呋喃并[3,2-c]吡啶基-、全氫吡咯并[1,2-a]吡嗪基-、全氫吡咯并[3,4-c]吡咯基-。
C6-C12-二環烷基-之較佳實例係全氫萘基-(十氫萘基-)、全氫苯并輪烯基-、全氫薁基-、全氫二氫茚基-、全氫戊搭烯基-。
橋接環烷基及橋接雜環烷基
橋接C6-C12環系統(例如橋接C6-C12-環烷基或橋接C6-C12-雜環烷基)應理解為意指至少兩個共用兩個彼此不直接毗鄰之原子之飽和環之稠合體。此可得到橋接碳環(橋接環烷基-)或其中1個、2個、3個或4個碳原子由如上文所定義之雜原子(呈任一組合)替代之橋接雜環(橋接雜環烷基-)。實例係雙環[2.2.1]庚基-、氮雜雙環[2.2.1]庚基-、氧氮雜雙環[2.2.1]庚基-、硫氮雜雙環[2.2.1]庚基-、二氮雜雙環[2.2.1]庚基-、雙環[2.2.2]辛基-、氮雜雙環[2.2.2]辛基-、二氮雜雙環[2.2.2]辛基-、氧氮雜雙環[2.2.2]辛基-、硫氮雜雙環[2.2.2]辛基-、雙環[3.2.1]辛基-、氮雜雙環[3.2.1]辛基-、二氮雜雙環[3.2.1]辛基-、氧氮雜雙環[3.2.1]辛基-、硫氮雜雙環[3.2.1]辛基-、雙環[3.3.1]壬基-、氮雜雙環[3.3.1]壬基-、二氮雜雙環[3.3.1]壬基-、氧氮雜雙環[3.3.1]壬基-、硫氮雜雙環[3.3.1]壬基-、雙環[4.2.1]壬基-、氮雜雙環[4.2.1]壬基-、二氮雜雙環[4.2.1]壬基-、氧氮雜雙環[4.2.1]壬基-、硫氮雜雙環[4.2.1]壬
基-、雙環[3.3.2]癸基-、氮雜雙環[3.3.2]癸基-、二氮雜雙環[3.3.2]癸基-、氧氮雜雙環[3.3.2]癸基-、硫氮雜雙環[3.3.2]癸基-或氮雜雙環[4.2.2]癸基-及根據定義之其他可能組合。較佳者係橋接C6-C10-雜環烷基-,例如且尤佳地2-氮雜二環[2.2.1]庚基-、2,5-二氮雜二環[2.2.1]庚基-、2-氧雜-5-氮雜二環[2.2.1]庚基-、8-氮雜二環[3.2.1]辛基-、8-氧雜-3-氮雜二環[3.2.1]辛基-、3,9-二氮雜二環[4.2.1]壬基-。
鹵化烷基
鹵化烷基表示具有至少一個鹵素取代基之烷基。
鹵基-C1-C6-烷基係具有1至6個碳原子及至少一個鹵素取代基之烷基。若存在複數個鹵素取代基,則該等亦可能彼此不同。較佳者係氟-C1-C6-烷基、氟-C1-C4-烷基及氟-C1-C3-烷基。可提及為同樣較佳之實例係:三氟甲基、2,2,2-三氟乙基、五氟乙基、4,4,5,5,5-五氟戊基或3,3,4,4,5,5,5-七氟戊基。
較佳者係全氟化烷基,例如三氟甲基或五氟乙基。
術語「轉麩醯胺酸酶」可與「TGase」或「TG」交換使用,其係指能夠藉助在結合肽之麩醯胺酸之γ-甲醯胺基團與離胺酸或結構相關之一級胺(例如胺基戊基)(例如結合肽之離胺酸)之ε-胺基間發生醯基轉移反應而使蛋白質交聯從而得到8-(y-麩胺醯基)離胺酸異肽鍵之酶。TGase尤其包括細菌轉麩醯胺酸酶(BTG),例如具有EC參考EC2.3.2.13之酶(蛋白-麩醯胺酸-y-麩胺醯基轉移酶)。
術語「受體麩醯胺酸」在指抗體之胺基酸殘基時意指在適宜條件下可由TGase識別且可藉由TGase藉助在麩醯胺酸與離胺酸或結構相關之一級胺(例如胺基戊基)間之反應發生交聯之麩醯胺酸殘基。視情況,受體麩醯胺酸係表面暴露之麩醯胺酸。
「胺基酸修飾」或「突變」在本文中意指在多肽序列中胺基酸之取代、插入及/或缺失。本文中之較佳胺基酸修飾係取代。本文中之「胺基酸取代」或「取代」意指胺基酸在蛋白序列中之給定位置經另一胺基酸替代。舉例而言,取代Y50W係指親代多肽之變體,其中位置50之酪胺酸經色胺酸替代。多肽之「變體」係指具有與參考多肽(通常天然或「親代」多肽)基本上相同之胺基酸序列之多肽。多肽變體可在天然胺基酸序列內在某些位置處具有一或多個胺基酸取代、缺失及/或插入。
術語「位置專一性之結合物」係指結合劑(較佳抗體)及部分(較佳連接體-藥物-部分)之結合物,其中該結合劑係在結合劑之一或多個經定義位置(較佳麩醯胺酸殘基)處經官能化。包括細菌轉麩醯胺酸酶(BTG)(EC 2.3.2.13)之轉麩醯胺酸酶(TGase)在識別麩醯胺酸蛋白受質中展現嚴格專一性且可催化「位置專一性之結合」。
術語「均質結合物」或「均質ADC」係指位置專一性結合物之組合物,其中至少60、70、80或90%之結合劑每一結合劑具有相同數量之經結合部分。在抗體之情形下,每一抗體之經結合部分之數量可為偶數,優先2或4。
在最廣泛意義上,術語「結合劑」應理解為意指結合至存於擬藉由結合劑/活性化合物結合物定址之某一靶標細胞群體處之靶標分子之分子。術語結合劑在其最廣泛意義上應理解為(例如)凝集蛋白、能夠結合至某些糖鏈之蛋白質及磷脂結合蛋白且亦包含該等蛋白質。該等結合劑包括(例如)高分子量蛋白(結合蛋白)、多肽或肽(結合肽)、非肽分子或物質(例如由Keefe AD.等人,Nat.Rev.Drug Discov.2010;9:537-550綜述之適配體(US5,270,163))或維生素)及所有其他細胞結合分子或物質。結合蛋白係(例如)包括無糖基化變體之抗體,
及抗體片段或抗體模擬物,例如,親和體、纖連蛋白、抗轉運蛋白、DARPin、高親和力多聚物、奈米抗體(nanobody)(由Gebauer M.等人,Curr.Opinion in Chem.Biol.2009;13:245-255;Nuttall S.D.等人,Curr.Opinion in Pharmacology 2008;8:608-617綜述)。結合肽係(例如)配體/受體對之配體,例如,配體/受體對VEGF/KDR之VEGF,例如配體/受體對運鐵蛋白/運鐵蛋白受體或細胞介素/細胞介素受體之運鐵蛋白,例如配體/受體對TNFα/TNFα受體之TNFα。
「結合劑」包含可藉由轉麩醯胺酸酶(TGase)(包括細菌轉麩醯胺酸酶(BTG)(EC 2.3.2.13))官能化之受體麩醯胺酸殘基。此受體麩醯胺酸係天然的而無結合劑之任何改變或已生成的。受體麩醯胺酸可經由以下生成:在適宜位置處插入麩醯胺酸殘基(例如經由融合至包含受體麩醯胺酸之標籤)、適宜位置突變成麩醯胺酸殘基、胺基酸殘基之突變(其中該突變具有先前未經TGase識別之天然麩醯胺酸殘基變成受體麩醯胺酸之效應)或改變轉譯後修飾(例如糖基化)(其中該改變具有先前未經TGase識別之天然麩醯胺酸殘基變成受體麩醯胺酸之效應)。若結合劑係抗體,則其優先在恆定區中包含受體麩醯胺酸。該等受體麩醯胺酸可藉由適宜位置突變成麩醯胺酸(例如突變N297Q,Kabat EU編號)或藉由生成去糖基化或無糖基化抗體(例如藉由由PNGase F引起之酶性去糖基化或藉由N297X之突變(Kabat EU編號))引入。在去糖基化或無糖基化抗體之後一情形下,麩醯胺酸Q295(Kabat EU編號)變成受體麩醯胺酸。極佳者係包含突變N297A或N297Q(Kabat EU編號)之抗體。
術語「無糖基抗體」或「無糖基化抗體」或「去糖基化抗體」在本文中用於定義包含在Fc區CH2域中缺乏連接至保守N連接位置之聚醣之Fc區的抗體或抗體衍生物。無糖基抗體可藉由(例如)N297(使用Kabat EU編號)之重鏈糖基化位置之突變或藉由在缺乏糖基化之表
現系統中表現抗體來製備。抗體之酶去糖基化之方法在業內眾所周知(例如Winkelhake & Nicolson(1976),J Biol Chem.251(4):1074-80)。可藉由(例如)使用(例如)PNGase F進行酶去糖基化來製備去糖基化抗體。在本發明之一個實施例中,可藉由在原核宿主中表現抗體來製備無糖基抗體。適宜之原核宿主包括(但不限於)大腸桿菌(E.coli)、枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)、鼠傷寒沙氏桿菌(Salmonella typhimurium)及假單胞菌屬(Pseudomonas)、鏈黴菌屬(Streptomyces)及葡萄球菌屬(Staphylococcus)屬內之各物種。在本發明之另一實施例中,可使用哺乳動物表現系統連同糖基化抑制劑衣黴素(tunicamycin)一起達成無糖基抗體(Nose & WigZell(1983),Proc Natl Acad Sci USA,80(21):6632-6)。亦即該修飾係防止在該抗體之Fc部分之CH2域之保守N連接位置處糖基化。
該文獻亦揭示使有機分子均質位置專一性的共價偶合(結合)至抗體之各種選項。根據本發明較佳者係毒性基團經由抗體之兩個或四個受體麩醯胺酸殘基結合至抗體。
「靶標分子」在其最廣泛意義上應理解為意指存於靶標細胞群體中且可為蛋白質(例如生長因子之受體)或非肽分子(例如糖或磷脂)之分子。其較佳係受體或抗原。
術語「細胞外」靶標分子闡述位於細胞外部且連接至細胞之靶標分子或位於細胞外部之靶標分子之一部分,亦即結合劑可在完整細胞上結合至其細胞外靶標分子。細胞外靶標分子可錨定於細胞膜中或為細胞膜之組份。熟習此項技術者知曉鑑別細胞外靶標分子之方法。對於蛋白質,此可藉由確定跨膜域及膜中蛋白質之定向來達成。該等數據通常存放於蛋白資料庫(例如SwissProt)中。
術語「癌症靶標分子」闡述在一或多種癌細胞物種上之存在較在相同組織類型之非癌細胞上更豐富之靶標分子。較佳地,與相同組
織類型之非癌細胞相比癌症靶標分子選擇性地存於一或多種癌細胞物種上,其中選擇性闡述與相同組織類型之非癌細胞相比在癌細胞上富集至少兩倍(「選擇性癌症靶標分子」)。使用癌症靶標分子容許使用本發明之結合物選擇性治療癌細胞。
結合劑可經由鍵連接至連接體。結合劑之連接可經由麩醯胺酸側鏈之羰基官能基。較佳地,該等麩醯胺酸殘基作為受質由細菌轉麩醯胺酸酶識別。本發明之麩醯胺酸殘基可存於天然結合劑中或藉由分子生物學之方法(例如藉由由PNGaseF引起之抗體去糖基化或藉由引入突變)引入。根據本發明,結合劑連接至毒性基團對結合劑關於靶標分子之結合活性僅具有較少效應。在較佳實施例中,該連接對結合劑關於靶標分子之結合親和力及專一性並無效應。
根據本發明,術語「抗體」在其最廣泛意義上應理解為免疫球蛋白分子且包含該等免疫球蛋白分子,例如完整或經修飾單株抗體、無糖基化抗體、多株抗體或多專一性抗體(例如雙專一性抗體)。免疫球蛋白分子較佳包含具有通常由二硫橋連接之四個多肽鏈、兩個重鏈(H鏈)及兩個輕鏈(L鏈)之分子。每一重鏈包含重鏈之可變域(縮寫為VH)及重鏈之恆定域。重鏈之恆定域可包含(例如)三個域CH1、CH2及CH3。每一輕鏈包含可變域(縮寫為VL)及恆定域。輕鏈之恆定域包含域(縮寫為CL)。可將VH及VL域進一步分成具有超變異性之區(亦稱作互補決定區(縮寫為CDR))及具有低序列變異性之區(框架區,縮寫為FR)。通常,每一VH及VL區均由三個CDR及至多四個FR構成。例如自胺基末端至羧基末端為以下順序:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4。可自任一適宜物種(例如兔、駱馬、駱駝、小鼠或大鼠)獲得抗體。在一個實施例中,抗體係人源性或鼠源性抗體。抗體可為(例如)人類、人類化或嵌合抗體。
術語「單株」抗體係指自基本上均質之抗體類群獲得之抗體,
亦即該類群之個別抗體係相同的,除其中可能存在少量天然突變以外。單株抗體以高專一性識別單一抗原結合位置。術語單株抗體並未提及特定製備製程。
術語「完整」抗體係指包含抗原結合域及輕鏈及重鏈之恆定域之抗體。恆定域可為具有多個經修飾胺基酸位置之天然域或其變體且亦可無糖基化。
術語「經修飾完整」抗體係指經由其胺基末端或羧基末端藉助共價鍵(例如肽鍵)與並非源於抗體之另一多肽或蛋白質融合之完整抗體。此外,抗體可經修飾使得在所定義位置處引入反應性半胱胺酸以有利於偶合至毒性基團(參見Junutula等人Nat Biotechnol.2008年8月;26(8):925-32)。
術語「人類」抗體係指可自人類獲得或為合成之人類抗體之抗體。「合成之」人類抗體係可部分地或完全地基於人類抗體序列之分析自合成序列在電腦上獲得之抗體。可藉由(例如)自人源之抗體序列庫分離之核酸編碼人類抗體。此一抗體之實例可參見Söderlind等人,Nature Biotech.2000,18:853-856。該等「人類」及「合成之」抗體亦包括藉由由PNGase F引起之去糖基化或藉由重鏈之N297(Kabat編號)突變成任一胺基酸生成之無糖基化變體。
術語「人類化」或「嵌合」抗體闡述由序列之非人類及人類部分組成之抗體。在該等抗體中,人類免疫球蛋白(受體)之一部分序列由非人類免疫球蛋白(供體)之序列部分替代。在許多情形下,供體係鼠類免疫球蛋白。在人類化抗體之情形下,受體之CDR之胺基酸由供體之胺基酸替代。有時,框架之胺基酸亦由供體之相應胺基酸替代。在一些情形下,人類化抗體含有既不存於受體中亦不存於供體中之胺基酸,該等胺基酸係在抗體之最佳化期間引入。在嵌合抗體之情形下,供體免疫球蛋白之可變域與人類抗體之恆定區融合。該等「人類
化」及「嵌合」抗體亦包括藉由由PNGase F引起之去糖基化或藉由重鏈之N297(Kabat編號)突變成任一胺基酸而生成之無糖基化變體。
如本文所用術語互補決定區(CDR)係指可變抗體域為結合至抗原所需要之彼等胺基酸。通常,每一可變區具有三個CDR區,稱作CDR1、CDR2及CDR3。每一CDR區均可包括根據Kabat之定義之胺基酸及/或根據Chotia定義之超變環之胺基酸。根據Kabat之定義包含(例如)可變輕鏈之約胺基酸位置24至34(CDR1)、50至56(CDR2)及89至97(CDR3)及可變重鏈之31至35(CDR1)、50至65(CDR2)及95至102(CDR3)之區(Kabat等人,Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版公共衛生署,國立衛生研究院,Bethesda,MD.(1991))。根據Chotia之定義包含(例如)可變輕鏈之約胺基酸位置26至32(CDR1)、50至52(CDR2)及91至96(CDR3)及可變重鏈之26至32(CDR1)、53至55(CDR2)及96至101(CDR3)之區(Chothia及Lesk;J Mol Biol 196:901-917(1987))。在一些情形下,CDR可包含來自根據Kabat及Chotia定義之CDR區之胺基酸。
端視重鏈中恆定域之胺基酸序列,可將抗體歸類為不同類別。存在五種主要類別之完整抗體:IgA、IgD、IgE、IgG及IgM,且可將該等中之若干分成其他子類別。(同型),例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1及IgA2。對應於不同類別之重鏈之恆定域稱作[α/α]、[δ/δ]、[ε/ε]、[γ/γ]及[my/μ]。已知抗體之三維結構及亞單位結構。
術語抗體/免疫球蛋白之「功能片段」或「抗原結合性抗體片段」定義為仍包含抗體/免疫球蛋白之抗原結合域之抗體/免疫球蛋白之片段(例如IgG之可變域)。抗體之「抗原結合域」通常包含抗體之一或多個超變區,例如CDR、CDR2及/或CDR3區。然而,抗體之「框架」或「骨架」區亦可在抗體結合至抗原期間起作用。框架區形成CDR之骨架。較佳地,抗原結合域包含可變輕鏈之至少胺基酸4至
103及可變重鏈之胺基酸5至109,更佳可變輕鏈之胺基酸3至107及可變重鏈之4至111,尤佳完整可變輕鏈及重鏈,亦即VL之胺基酸1至109及VH之1至113(根據WO97/08320編號)。
本發明之「功能片段」或「抗原結合性抗體片段」非決定性地涵蓋Fab、Fab’、F(ab’)2及Fv片段、雙價抗體、單域抗體(DAb)、線性抗體、抗體之個別鏈(單鏈Fv,縮寫成scFv);及多專一性抗體,例如雙專一性及三專一性抗體,例如,其係自抗體片段形成,C.A.K Borrebaeck編者(1995)Antibody Engineering(Breakthroughs in Molecular Biology),Oxford University Press;R.Kontermann及S.Duebel編者(2001)Antibody Engineering(Springer Laboratory Manual),Springer Verlag。除「多專一性」或「多功能」抗體以外之抗體係具有相同結合位置者。多專一性抗體可對於抗原之不同表位具有專一性或可對於超過一種抗原之表位具有專一性(例如參見WO 93/17715;WO 92/08802;WO 91/00360;WO 92/05793;Tutt,等人,1991,J.Immunol.147:6069;美國專利第4,474,893號;第4,714,681號;第4,925,648號;第5,573,920號;第5,601,819號;或Kostelny等人,1992,J.Immunol.148:15471553)。F(ab’)2或Fab分子可經構築使得在Ch1域與CL域之間發生之分子間二硫化物相互作用之數量可有所降低亦或完全防止。
「表位」係指能夠專一性結合至免疫球蛋白或T細胞受體之蛋白決定子。表位決定子通常由分子之化學活性表面基團(例如胺基酸或糖側鏈或其組合)組成,且通常具有專一性3維結構性質亦及專一性電荷性質。
「功能片段」或「抗原結合性抗體片段」可經由其胺基末端或羧基末端藉助共價鍵(例如肽鍵聯)與並非源於抗體之另一多肽或蛋白融合。此外,可藉由在所定義位置引入反應性半胱胺酸修飾抗體及抗
原結合片段,以便有利於偶合至毒性基團(參見Junutula等人Nat Biotechnol.2008年8月;26(8):925-32)。
可藉由熟習此項技術者習知之方法製備多株抗體。可藉由熟習此項技術者習知之方法製備單株抗體(Köhler及Milstein,Nature,256,495-497,1975)。可藉由熟習此項技術者習知之方法製備人類及人類化單株抗體(Olsson等人,Meth Enzymol.92,3-16或Cabilly等人US 4,816,567或Boss等人US 4,816,397)。
熟習此項技術者知曉製備人類抗體及其片段之多種方法,例如,藉助轉基因小鼠(N Lonberg及D Huszar,Int Rev Immunol.1995;13(1):65-93)或噬菌體展示技術(Clackson等人,Nature.1991年8月15日;352(6336):624-8)。可自由(例如)自大量健康志願者編譯之多種抗體之胺基酸序列組成之重組抗體庫獲得本發明抗體。亦可藉助已知之重組DNA技術產生抗體。抗體之核酸序列可藉由常規測序獲得或可自公開訪問之資料庫獲得。
「經分離」抗體或結合劑已經純化以去除細胞之其他組份。細胞中可干擾診斷或治療用途之污染組份係(例如)細胞之酶、激素或其他肽組份或非肽組份。較佳抗體或結合劑係關於該抗體或結合劑已純化至超過95重量%之程度(例如藉由勞裡法(Lowry method)、UV-Vis光譜或藉由SDS毛細管凝膠電泳測定)者。此外,抗體已純化至此一程度使得可確定胺基末端或內部胺基酸序列之至少15種胺基酸,或已純化至均質性,該均質性係藉由SDS-PAGE在還原或非還原條件下確定(檢測可藉助考馬斯藍(Coomassie Blue)染色或較佳藉由銀著色確定)。然而,抗體通常係藉由一或多個純化步驟來製備。
術語「專一性結合」或「專一性地結合」係指抗體或結合劑結合至預定抗原/靶標分子。抗體或結合劑之專一性結合通常闡述具有至少10-7M之親和力之抗體或結合劑(作為Kd值;亦即較佳具有小於 10 -7 M之Kd值者),其中該抗體或結合劑對於預定抗原/靶標分子之親和力較對於不為預定抗原/靶標分子之非專一性抗原/靶標分子(例如牛血清白蛋白或酪蛋白)或密切相關之抗原/靶標分子之親和力高至少兩倍。抗體較佳具有至少10-7M(作為Kd值;換言之較佳具有小於10-7M之Kd值者)、較佳至少10-8M、更佳在10-9M至10-11M之範圍內之親和力。可藉助(例如)表面電漿共振光譜測定Kd值。
本發明之抗體-藥物結合物同樣展現在該等範圍內之親和力。親和力較佳基本上不受藥物結合之影響(一般而言,親和力降低小於一個數量級,換言之,例如,最多10-8M至10-7M)。
根據本發明使用之抗體較佳亦因高選擇性而著稱。當本發明抗體對靶標蛋白展現之親和力較對獨立的其他抗原(例如人類血清白蛋白)好至少2倍、較佳5倍或更佳10倍(可藉助(例如)表面電漿共振光譜測定親和力)時,存在高選擇性。
此外,使用之本發明抗體較佳具有交叉反應性。為能夠有利於且更好的解釋臨床前研究(例如毒物學或活性研究(例如在異種移植小鼠中)),若根據本發明使用之抗體不僅結合人類靶標蛋白且亦結合研究所用物種中之物質靶標蛋白,則其係有利的。在一個實施例中,根據本發明使用之抗體除人類靶標蛋白以外對至少一個其他物種之靶標蛋白具有交叉反應性。對於毒物學及活性研究,較佳使用齧齒類動物、狗及非人類靈長類動物之家族之物種。較佳齧齒類動物物種係小鼠及大鼠。較佳非人類靈長類動物係恒河猴、黑猩猩及長尾獼猴。
在一個實施例中,根據本發明使用之抗體除人類靶標蛋白以外對選自由小鼠、大鼠及長尾獼猴(食蟹猴(Macaca fascicularis))之物種組成之群之至少一種其他物種之靶標蛋白具有交叉反應性。尤佳者係除人類靶標蛋白以外對小鼠靶標蛋白具有至少交叉反應性之根據本發明使用之抗體。較佳者係對該等其他非人類物種之靶標蛋白之親和力
與對人類靶標蛋白之親和力相差不超過50倍、更特別地相差不超過10倍之交叉反應性抗體。
結合劑(例如抗體或其抗原結合片段)所針對之靶標分子較佳係癌症靶標分子。術語「癌症靶標分子」闡述在一或多種癌細胞物種上之存在較在相同組織類型之非癌細胞上更豐富之靶標分子。較佳地,與相同組織類型之非癌細胞相比癌症靶標分子選擇性地存於一或多種癌細胞物種上,其中選擇性闡述與相同組織類型之非癌細胞相比在癌細胞上富集至少兩倍(「選擇性癌症靶標分子」)。使用癌症靶標分子容許使用本發明結合物選擇性治療癌細胞。
專一性抵抗抗原(例如癌細胞抗原)之抗體可由熟習此項技術者藉助其熟悉之方法(例如重組表現)製備或可在商業上獲取(例如來自Merck KGaA,Germany)。癌症療法中已知市售抗體之實例係爾必得舒®(Erbitux®)(西妥昔單抗(cetuximab),Merck KGaA)、癌思停®(Avastin®)(貝伐珠單抗(bevacizumab),Roche)及賀癌平®(Herceptin®)(曲妥珠單抗,Genentech)。曲妥珠單抗係IgG1kappa類型之重組人類化單株抗體,其在基於細胞之分析(Kd=5nM)中以高親和力結合人類表皮生長受體之細胞外域。該抗體係在CHO細胞中以重組方式產生。所有該等抗體皆亦可作為該等抗體藉由由PNGase F引起之去糖基化或藉由重鏈之N297(Kabat編號)突變成任一胺基酸而生成之無糖基化變體來製備。
在較佳實施例中,靶標分子係選擇性癌症靶標分子。
在尤佳實施例中,靶標分子係蛋白質。
在一個實施例中,靶標分子係細胞外靶標分子。在較佳實施例中,細胞外靶標分子係蛋白質。
癌症靶標分子已為熟習此項技術者習知。該等之實例列示於下
文中。
癌症靶標分子之實例係:
(1)EGF受體(NCBI參照序列NP_005219.2),SEQ ID NO:213(1210胺基酸):
>gi|29725609|ref|NP_005219.2| EGFR受體前體[智人(Homo sapiens)]
細胞外域係由下劃線標記。
(2)間皮素(SwissProt參考Q13421-3),SEQ ID NO:214(622胺基酸):
>sp|Q13421-3|間皮素之MSLN_HUMAN同種型2 OS=智人GN=MSLN
其中間皮素係由胺基酸296至598編碼。胺基酸37至286係針對巨
核細胞促進因子編碼。間皮素經由GPI錨定物錨定於細胞膜中且位於細胞外。
(3)碳酸酐酶IX(SwissProt參考Q16790),SEQ ID NO:215(459胺基酸):
>sp|Q16790|CAH9_人類碳酸酐酶9 OS=智人GN=CA9 PE=1 SV=2
細胞外域係由下劃線標記。
(4)C4.4a(NCBI參照序列NP_055215.2;同義詞LYPD3),SEQ ID NO:216(346胺基酸):
>gi|93004088|ref|NP_055215.2|含有ly6/PLAUR域之蛋白質3-前體[智人]
成熟細胞外域係由下劃線標記。
(5)CD52(NCBI參照序列NP_001794.2),SEQ ID NO:217
>gi|68342030|ref|NP_001794.2|坎帕斯-1(CAMPATH-1)抗原-前體[智人]MKRFLFLLLTISLLVMVQIQTGLSGQNDTSQTSSPSASSNISGGIFLFFVANAIIHLFCFS
(6)Her2(NCBI參照序列NP_004439.2),SEQ ID NO:218
>gi|54792096|ref|NP_004439.2|受體酪胺酸-蛋白激酶erbB-2同種型a[智人]
(7)CD20(NCBI參照序列NP_068769.2),SEQ ID NO:219
>gi|23110987|ref|NP_068769.2| B-淋巴球抗原CD20[智人]
(8)淋巴球活化抗原CD30(SwissProt ID P28908),SEQ ID NO:220
>gi|68348711|ref|NP_001234.2|腫瘤壞死因子受體超家族成員8同種型1-前體[智人]
(9)淋巴球黏著分子CD22(SwissProt ID P20273),SEQ ID NO:221
>gi|157168355|ref|NP_001762.2| B細胞受體CD22同種型1-前體[智人]
(10)骨髓細胞表面抗原CD33(SwissProt ID P20138),SEQ ID NO:222
>gi|130979981|ref|NP_001763.3|骨髓細胞表面抗原CD33同種型1-前體[智人]
(11)跨膜糖蛋白NMB(SwissProt ID Q14956),SEQ ID NO:223
>gi|52694752|ref|NP_001005340.1|跨膜糖蛋白NMB同種型a-前體[智人]
(12)黏著分子CD56(SwissProt ID P13591),SEQ ID NO:224
>gi|94420689|ref|NP_000606.3|神經細胞黏著分子1同種型1[智人]
(13)表面分子CD70(SwissProt ID P32970),SEQ ID NO:225
>gi|4507605|ref|NP_001243.1| CD70抗原[智人]
(14)表面分子CD74(SwissProt ID P04233),SEQ ID NO:226
>gi|10835071|ref|NP_004346.1| HLA II類組織相容性抗原γ鏈同種型b[智人]
(15)B-淋巴球抗原CD19(SwissProt ID P15391),SEQ ID NO:227
>gi|296010921|ref|NP_001171569.1| B-淋巴球抗原CD19同種型1-前體[智人]
(16)表面蛋白黏蛋白-1(SwissProt ID P15941),SEQ ID NO:228
>gi|65301117|ref|NP_002447.4|黏蛋白-1同種型1-前體[智人]
(17)表面蛋白CD138(SwissProt ID P18827),SEQ ID NO:229
>gi|29568086|ref|NP_002988.3|多配體聚醣-1-前體[智人]
(18)整聯蛋白αV(基因庫登錄號:NP_002201.1),SEQ ID NO:230
>gi|4504763|ref|NP_002201.1|整聯蛋白α-V同種型1-前體[智人]
(19)畸形癌衍生性生長因子1蛋白TDGF1(基因庫登錄號:NP_003203.1),SEQ ID NO:231
>gi|4507425|ref|NP_003203.1|畸形癌衍生性生長因子1同種型1-前體[智人]
(20)前列腺-專一性膜抗原PSMA(Swiss Prot ID:Q04609),SEQ ID NO:232
>gi|4758398|ref|NP_004467.1|麩胺酸鹽羧肽酶2同種型1[智人]
(21)酪胺酸蛋白激酶EPHA2(Swiss Prot ID:P29317),SEQ ID NO:233
>gi|32967311|ref|NP_004422.2|肝配蛋白類型-A受體2-前體[智人]
(22)表面蛋白SLC44A4(基因庫登錄號:NP_001171515),SEQ ID NO:234
>gi|295849282|ref|NP_001171515.1|膽鹼運輸蛋白樣蛋白4同種型2[智人]
(23)表面蛋白BMPR1B(SwissProt:O00238)
(24)運輸蛋白SLC7A5(SwissProt:Q01650)
(25)上皮前列腺抗原STEAP1(SwissProt:Q9UHE8)
(26)卵巢癌抗原MUC16(SwissProt:Q8WXI7)
(27)運輸蛋白SLC34A2(SwissProt:O95436)
(28)表面蛋白SEMA5b(SwissProt:Q9P283)
(29)表面蛋白LYPD1(SwissProt:Q8N2G4)
(30)內皮素受體類型B EDNRB(SwissProt:P24530)
(31)環指蛋白RNF43(SwissProt:Q68DV7)
(32)前列腺癌相關性蛋白STEAP2(SwissProt:Q8NFT2)
(33)陽離子通道TRPM4(SwissProt:Q8TD43)
(34)補體受體CD21(SwissProt:P20023)
(35)B細胞抗原受體複合體相關性蛋白CD79b(SwissProt:P40259)
(36)細胞黏著抗原CEACAM6(SwissProt:P40199)
(37)二肽酶DPEP1(SwissProt:P16444)
(38)介白素受體IL20Rα(SwissProt:Q9UHF4)
(39)蛋白多醣BCAN(SwissProt:Q96GW7)
(40)肝配蛋白受體EPHB2(SwissProt:P29323)
(41)前列腺幹細胞相關性蛋白PSCA(基因庫登錄號:NP_005663.2)
(42)表面蛋白LHFPL3(SwissProt:Q86UP9)
(43)受體蛋白TNFRSF13C(SwissProt:Q96RJ3)
(44)B細胞抗原受體複合體相關性蛋白CD79a(SwissProt:P11912)
(45)受體蛋白CXCR5(SwissProt:P32302)
(46)離子通道P2X5(SwissProt:Q93086)
(47)淋巴球抗原CD180(SwissProt:Q99467)
(48)受體蛋白FCRL1(SwissProt:Q96LA6)
(49)受體蛋白FCRL5(SwissProt:Q96RD9)
(50)MHC II類分子Ia抗原HLA-DOB(基因庫登錄號:
NP_002111.1)
(51)T細胞蛋白VTCN1(SwissProt:Q7Z7D3)
(52)TWEAKR(SEQ ID NO:169(蛋白);SEQ ID NO:170(DNA)。
(53)淋巴球抗原CD37(Swiss Prot:P11049)
(54)FGF受體2;FGFR2(基因ID:2263;基因名稱(official symbol):FGFR2)。FGFR2受體存於不同剪接變體(α,β,IIIb,IIIc)中。所有剪接變體皆可充當靶標分子。
(55)跨膜糖蛋白B7H3(CD276;基因ID:80381)。
(56)B細胞受體BAFFR(CD268;基因ID:115650)
(57)受體蛋白ROR 1(基因ID:4919)
(58)表面受體IL3RA(CD123;基因ID:3561)
(59)CXC趨化介素受體CXCR5(CD185;基因ID 643)
(60)受體蛋白合胞素(基因ID 30816)
在本發明之較佳標的物中,癌症靶標分子係選自由癌症靶標分子(1)至(60)、特別地(1)、(6)及(52)組成之群。
在本發明之另一尤佳標的物中,結合劑結合至選自由癌症靶標分子(1)至(60)、特別地(1)、(6)及(52)組成之群之細胞外癌症靶標分子。
在本發明之另一尤佳標的物中,結合劑專一結合至選自由癌症靶標分子(1)至(60)、特別地(1)、(6)及(52)組成之群之細胞外癌症靶標分子。在較佳實施例中,結合劑在結合至其在靶標細胞上之細胞外靶標分子後,由於結合而由靶標細胞內在化。此使得結合劑/活性化合物結合物(其可為免疫結合物或ADC)由靶標細胞吸收。然後較佳在細胞內、優先藉由溶酶體處理結合劑。
在一個實施例中,結合劑係結合蛋白。在較佳實施例中,結合
劑係抗體、無糖基化抗體、抗原結合性抗體片段、多專一性抗體或抗體模擬物。
較佳抗體模擬物係親和體、纖連蛋白、抗轉運蛋白、DARPin、高親和力多聚物或奈米抗體。較佳多專一性抗體係雙專一性及三專一性抗體。
在較佳實施例中,結合劑係抗體或抗原結合性抗體片段,更佳經分離抗體或經分離抗原結合性抗體片段。
較佳抗原結合性抗體片段係Fab、Fab’、F(ab’)2及Fv片段、雙價抗體、DAb、線性抗體及scFv。尤佳者係Fab、雙價抗體及scFv。
在尤佳實施例中,結合劑係抗體。尤佳者係單株抗體或其抗原結合性抗體片段。進一步尤佳者係人類、人類化或嵌合抗體或其抗原結合性抗體片段。
熟習此項技術者可使用已知之製程(例如,化學合成或重組表現)製備結合癌症靶標分子之抗體或抗原結合性抗體片段。用於癌症靶標分子之結合劑可在商業上獲得或可由熟習此項技術者使用已知之製程(例如,化學合成或重組表現)來製備。製備抗體或抗原結合性抗體片段之其他製程闡述於WO 2007/070538(參見第22頁「Antibodies」)中。熟習此項技術者已知諸如噬菌體展示庫(例如Morphosys HuCAL Gold)等過程可如何進行編譯及用於發現抗體或抗原結合性抗體片段(參見WO 2007/070538,以下第24頁及第70頁上之AK實例1、第72頁上之AK實例2)。使用B細胞之DNA庫製備抗體之其他製程闡述於(例如)第26頁(WO 2007/070538)中。人類化抗體之製程闡述於WO2007070538之第30頁至第32頁且詳細闡述於Queen等人,Pros.Natl.Acad.Sci.USA 86:10029-10033,1989或於WO 90/0786中。此外,熟習此項技術者已知一般而言蛋白質及特別地抗體之重組表現之製程(例如參見Berger及Kimrnel(Guide to Molecular Cloning
Techniques,Methods in Enzymology,第152卷,Academic Press,Inc.);Sambrook等人,(Molecular Cloning:A Laboratory Manual,(第二版,Cold Spring Harbor Laboratory Press;Cold Spring Harbor,N.Y.;1989)第1卷至第3卷);Current Protocols in Molecular Biology,(F.M.Ausabel等人[編輯],Current Protocols,Green Publishing Associates,Inc./John Wiley & Sons,Inc.);Harlow等人(Monoclonal Antibodies:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory Press(1988,Paul[編輯]);Fundamental Immunology,(Lippincott Williams & Wilkins(1998));及Harlow等人(Using Antibodies:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory Press(1998))。熟習此項技術者已知為蛋白質/抗體之表現所必需之相應載體、啟動子及信號肽。一般製程亦闡述於WO 2007/070538之第41頁至第45頁中。製備IgG1抗體之製程闡述於(例如)WO 2007/070538之以下第74頁之實例6中。容許在結合至抗原後確定抗體之內在化之製程已為熟習此項技術者習知且闡述於(例如)WO 2007/070538之第80頁中。熟習此項技術者能夠使用闡述於WO 2007/070538中之製程,該製程一直用於以與製備具有不同靶標分子專一性之抗體類似之方式製備碳酸酐酶IX(Mn)抗體。
抗EGFR抗體
結合癌症靶標分子EGFR之抗體之實例係西妥昔單抗(INN號7906)、帕尼單抗(panitumumab)(INN號8499)及尼妥珠單抗(nimotuzumab)(INN號8545)。西妥昔單抗(藥物庫登錄號DB00002)係嵌合抗EGFR1抗體,其係在SP2/0小鼠骨髓瘤細胞中產生且由ImClone Systems Inc/Merck KgaA/Bristol-Myers Squibb Co出售。西妥昔單抗適用於治療具有野生型K-Ras基因之表現EGFR之轉移性結腸直腸癌。其具有10-10M之親和力。
序列:
西妥昔單抗輕鏈(κ),SEQ ID NO:235:
西妥昔單抗重鏈,SEQ ID NO:236:
帕尼單抗(INN號8499)(藥物庫登錄號DB01269)係重組單株人類IgG2抗體,其專一性結合至人類EGF受體1且由Abgenix/Amgen出售。帕尼單抗源於轉基因小鼠(XenoMouse)之免疫。該等小鼠能夠產生人類免疫球蛋白(輕鏈及重鏈)。選擇產生抵抗EGFR之抗體之專一性B細胞純系,且此純系係利用CHO細胞(中國倉鼠卵巢細胞(Chinese hamster ovary cell))永生。現在使用該等細胞產生100%人類抗體。帕尼單抗適用於治療表現EGFR之轉移性結腸直腸癌,該結腸直腸癌對利用氟嘧啶、奧沙利鉑(oxaliplatin)及伊立替康(irinotecan)之化學治療
性治療具有抗性。其具有10-11M之親和力。
序列:
帕尼單抗輕鏈(κ),SEQ ID NO:237:
帕尼單抗重鏈,SEQ ID NO:238:
尼妥珠單抗(INN號8545)(EP 00586002,EP 00712863)係人類化單株IgG1抗體,其專一結合至人類EGF受體1且由YM BioScienecs Inc.(Mississauga Canada)出售。其係在非分泌型NSO細胞(哺乳動物細胞系)中產生。尼妥珠單抗經批准用於治療頭頸腫瘤、高度惡性星細胞瘤及多形性神經膠母細胞瘤(並非在EU及US中)及胰臟癌(Orphan drug,EMA)。其具有10-8M之親和力。
尼妥珠單抗輕鏈,SEQ ID NO:239:
尼妥珠單抗重鏈,SEQ ID NO:240:
EGFR抗體之其他實施例係如下:
●紮魯木單抗(Zalutumumab)/2F8/HuMax-EGFr,來自Genmab A/S(WO 02/100348,WO 2004/056847,INN號8605)
●奈昔木單抗(Necitumumab)/11F8,ImClone/IMC-11F8,來自ImClone Systems Inc.[Eli Lilly & Co](WO 2005/090407(EP 01735348-A1,US 2007/0264253-A1,US 7,598,350,WO 2005/090407-A1),INN號9083)
●馬妥珠單抗(Matuzumab)/抗EGFR MAb,Merck KGaA/抗EGFR MAb,Takeda/EMD 72000/EMD-6200/EMD-72000及EMD-55900/MAb 425/單株抗體425,來自Merck KGaA/Takeda(WO
92/15683,INN號8103(馬妥珠單抗))
●RG-7160/GA-201/GA201/R-7160/R7160/RG7160/RO-4858696/RO-5083945/RO4858696/RO5083945,來自Glycart Biotechnology AG(Roche Holding AG)(WO 2010/112413-A1,WO 2010/115554)
●GT-MAB 5.2-GEX/CetuGEX,來自Glycotope GmbH(WO 2008/028686-A2(EP 01900750-A1,EP 01911766-A1,EP 02073842-A2,US 2010/0028947-A1)
●ISU-101,來自Isu Abxis Inc(ISU Chemical Co Ltd)/Scancell(WO 2008/004834-A1)
●ABT-806/mAb-806/ch-806/抗EGFR單株抗體806,來自路德維格癌症研究所(Ludwig Institute for CancerResearch)/Abbott/Life Science Pharmaceuticals(WO 02/092771、WO 2005/081854及WO 2009/023265)
●SYM-004(由兩種嵌合IgG1抗體(992及1024)組成),來自Symphogen A/S(WO 2010/022736-A2)
●MR1-1/MR1-1KDEL,來自IVAX Corp(Teva Pharmaceutical Industries Ltd)(Duke University),(專利:WO2001/062931-A2)
●抵抗缺失突變體之抗體EGFRvIII,來自Amgen/Abgenix(WO 2005/010151,US 7,628,986)
●SC-100,來自Scancell Ltd(WO 01/088138-A1)
●MDX-447/EMD 82633/BAB-447/H 447/MAb,EGFR,Medarex/Merck KgaA,來自Bristol-Myers Squibb(US)/Merck KGaA(DE)/Takeda(JP),(WO 91/05871,WO 92/15683)
●抗EGFR-Mab,來自Xencor(WO 2005/056606)
●DXL-1218/抗EGFR單株抗體(癌症),InNexus,來自InNexus Biotechnology Inc,Pharmaprojects PH048638
在較佳實施例中,抗EGFR抗體係選自由以下各項組成之群:西妥昔單抗、帕尼單抗、尼妥珠單抗、紮魯木單抗、奈昔木單抗、馬妥珠單抗、RG-716、GT-MAB 5.2-GEX、ISU-101、ABT-806、SYM-004、MR1-1、SC-100、MDX-447及DXL-1218。
在尤佳實施例中,抗EGFR抗體係選自由以下各項組成之群:西妥昔單抗、帕尼單抗、尼妥珠單抗、紮魯木單抗、奈昔木單抗及馬妥珠單抗。
熟習此項技術者已知可用於藉助序列變異自上文所提及抗體之CDR區製備其他抗體之製程,該等其他抗體對靶標分子具有類似或更好之親和力及/或專一性。此外,熟習此項技術者已知可用於藉助序列變異自上文所提及抗體之CDR區製備其他抗體之製程,該等其他抗體經無糖基化及/或改造以含有一或多個受體麩醯胺酸殘基用於轉麩醯胺酸酶(TGase)催化之反應。
在另一實施例中,抗EGFR抗體或抗原結合性抗體片段係選自由以下各項組成之群:
包含以下抗體中之一者之輕鏈之三個CDR區及重鏈之三個CDR區之抗體或抗原結合性抗體片段:西妥昔單抗、帕尼單抗、尼妥珠單抗、紮魯木單抗、奈昔木單抗、馬妥珠單抗、RG-716、GT-MAB 5.2-GEX、ISU-101、ABT-806、SYM-004、MR1-1、SC-100、MDX-447及DXL-1218。
在另一實施例中,抗EGFR抗體或抗原結合性抗體片段係選自由以下各項組成之群:
包含以下抗體中之一者之輕鏈之三個CDR區及重鏈之三個CDR區之抗體或抗原結合性抗體片段:西妥昔單抗、帕尼單抗、尼妥珠單
抗、紮魯木單抗、奈昔木單抗、馬妥珠單抗。該等抗體及其抗原結合片段係以引用方式併入本文中,且其可用於本發明之上下文中。
抗碳酸酐酶IX抗體
結合癌症靶標分子碳酸酐酶IX之抗體之實例闡述於WO 2007/070538-A2(例如技術方案1至16)中。
在較佳實施例中,抗碳酸酐酶IX抗體或抗原結合性抗體片段係選自由以下各項組成之群:抗碳酸酐酶IX抗體或抗原結合性抗體片段3ee9(WO 2007/070538-A2中之技術方案4(a))、3ef2(WO2007/070538-A2中之技術方案4(b))、1e4(WO 2007/070538-A2中之技術方案4(c))、3a4(WO 2007/070538-A2中之技術方案4(d))、3ab4(WO 2007/070538-A2中之技術方案4(e))、3ah10(WO 2007/070538-A2中之技術方案4(f))、3bb2(WO 2007/070538-A2中之技術方案4(g))、1aa1(WO 2007/070538-A2中之技術方案4(h))、5a6(WO 2007/070538-A2中之技術方案4(i))及5aa3(WO 2007/070538-A2中之技術方案4(j))。
抗C4.4a抗體:
根據本發明,可使用C4.4a抗體。
C4.4a抗體及抗原結合片段之實例闡述於WO 2012/143499 A2中。WO 2012/143499 A2之所有抗體皆特此以引用方式併入本發明之說明中,且其可用於本發明。抗體之序列係於WO 2012/143499 A2之表1中給出,其中每一列均顯示第1行中所列示抗體之可變輕鏈或可變重鏈之各別CDR胺基酸序列。
在一個實施例中,抗C4.4a抗體或其抗原結合性抗體片段在結合至表現C4.4a之細胞後由該細胞內在化。
在另一實施例中,抗C4.4a抗體或抗原結合性抗體片段包含WO 2012/143499 A2之表1或WO 2012/143499 A2之表2中所列示抗體之至
少一個、兩個或三個CDR胺基酸序列。該等抗體之較佳實施例同樣列示於WO 2012/143499 A2中且以引用方式併入本文中。
抗HER2抗體:
結合至癌症靶標分子Her2之抗體之實例係曲妥珠單抗(Genentech)。曲妥珠單抗係尤其用於治療乳癌之人類化抗體。
除曲妥珠單抗(INN 7637,CAS號:RN:180288-69-1)及帕妥珠單抗(CAS號:380610-27-5)以外,結合至HER2之抗體之其他實例係揭示於WO 2009/123894-A2、WO 200/8140603-A2中或於WO 2011/044368-A2中之抗體。抗HER2結合物之實例係曲妥珠單抗-艾坦辛(trastuzumab-emtansine)(INN號9295)。該等抗體及其抗原結合片段係以引用方式併入本文中,且其可用於本發明之上下文中。
抗CD20抗體:
結合至癌症靶標分子CD20之抗體之實例係利妥昔單抗(rituximab)(Genentech)。利妥昔單抗(CAS號:174722-31-7)係用於治療非霍奇金氏淋巴瘤(non-Hodgkin lymphoma)之嵌合抗體。該等抗體及其抗原結合片段係以引用方式併入本文中且其可用於本發明之上下文中。
抗CD52抗體:
結合至癌症靶標分子CD52之抗體之實例係阿倫單抗(alemtuzumab)(Genzyme)。阿倫單抗(CAS號:216503-57-0)係用於治療慢性淋巴球性白血病之人類化抗體。該等抗體及其抗原結合片段係以引用方式併入本文中且其可用於本發明之上下文中。
抗間皮素抗體:
抗間皮素抗體之實例闡述於(例如)WO 2009/068204中。WO 2009/068204中所闡述之所有抗體皆以引用方式併入本說明中,使得該等抗體可用於本文所揭示之本發明之上下文中。
根據本發明使用之抗間皮素抗體較佳對於結合至間皮素之不變體而言亦係顯著的。不變體結合之特徵在於(例如)根據本發明使用之抗體結合至無法由另一細胞外蛋白遮罩之間皮素表位。此另一細胞外蛋白係(例如)蛋白質卵巢癌抗原125(CA125)。優先使用之抗體之特徵在於其結合至未由CA125阻斷之間皮素。
抗CD30抗體:
結合癌症靶標分子CD30且可用於治療癌症(例如霍奇金氏淋巴瘤)之抗體之實例係貝倫妥單抗(brentuximab)、伊妥木單抗(iratumumab)及揭示於WO 2008/092117、WO 2008/036688或WO 2006/089232中之抗體。抗CD30結合物之實例係貝倫妥單抗維多汀(brentuximab vedotin)(INN號9144)。該等抗體及其抗原結合片段係以引用方式併入本文中且其可用於本發明之上下文中。
抗CD22抗體
結合癌症靶標分子CD22且可用於治療癌症(例如淋巴瘤)之抗體之實例係伊珠單抗(inotuzumab)及依帕珠單抗(epratuzumab)。抗CD22結合物之實例係伊珠單抗奧佐米星(ozagamycin)(INN號8574)或抗CD22-MMAE及抗CD22-MC-MMAE(CAS RN:分別139504-50-0及474645-27-7)。該等抗體及其抗原結合片段係以引用方式併入本文中且其可用於本發明之上下文中。
抗CD33抗體
結合癌症靶標分子CD33且可用於治療癌症(例如白血病)之抗體之實例係吉妥珠單抗(gemtuzumab)及林妥珠單抗(lintuzumab)(INN 7580)。抗CD33結合物之實例係吉妥珠單抗-奧佐米星。該等抗體及其抗原結合片段係以引用方式併入本文中且其可用於本發明之上下文中。
抗NMB抗體
結合癌症靶標分子NMB且可用於治療癌症(例如黑色素瘤或乳癌)
之抗體之實例係格萊木單抗(glembatumumab)(INN 9199)。抗NMB結合物之實例係格萊木單抗維多汀(CAS RN:474645-27-7)。該等抗體及其抗原結合片段係以引用方式併入本文中且其可用於本發明之上下文中。
抗CD56抗體
結合癌症靶標分子CD56且可用於治療癌症(例如多發性骨髓瘤、小細胞肺癌、MCC或卵巢癌)之抗體之實例係洛伏珠單抗(lorvotuzumab)。抗CD56結合物之實例係洛伏珠單抗莫登素(lorvotuzumab mertansine)(CAS RN:139504-50-0)。該等抗體及其抗原結合片段係以引用方式併入本文中且其可用於本發明之上下文中。
抗CD70抗體
結合癌症靶標分子CD70且可用於治療癌症(例如非霍奇金氏淋巴瘤或腎細胞癌)之抗體之實例揭示於WO 2007/038637-A2及WO 2008/070593-A2中。抗CD70結合物之實例係SGN-75(CD70 MMAF)。該等抗體及其抗原結合片段係以引用方式併入本文中且其可用於本發明之上下文中。
抗CD74抗體
結合癌症靶標分子CD74且可用於治療癌症(例如多發性骨髓瘤)之抗體之實例係米拉珠單抗(milatuzumab)。抗CD74結合物之實例係米拉珠單抗-多柔比星(milatuzumab-doxorubicin)(CAS RN:23214-92-8)。該等抗體及其抗原結合片段係以引用方式併入本文中且其可用於本發明之上下文中。
抗CD19抗體
結合癌症靶標分子CD19且可用於治療癌症(例如非霍奇金氏淋巴瘤)之抗體之實例揭示於WO 2008/031056-A2中。抗CD19結合物(SAR3419)之其他抗體及實例揭示於WO 2008/047242-A2中。該等抗
體及其抗原結合片段係以引用方式併入本文中且其可用於本發明之上下文中。
抗黏蛋白抗體
結合癌症靶標分子黏蛋白-1且可用於治療癌症(例如非霍奇金氏淋巴瘤)之抗體之實例係伏妥珠單抗(clivatuzumab)及揭示於WO 2003/106495-A2、WO 2008/028686-A2中之抗體。抗黏蛋白結合物之實例揭示於WO 2005/009369-A2中。該等抗體及其抗原結合片段係以引用方式併入本文中且其可用於本發明之上下文中。
抗CD138抗體
結合癌症靶標分子CD138及其結合物s且可用於治療癌症(例如多發性骨髓瘤)之抗體之實例揭示於WO 2009/080829-A1、WO 2009/080830-A1中。該等抗體及其抗原結合片段係以引用方式併入本文中且其可用於本發明之上下文中。
抗整聯蛋白-αV抗體
結合癌症靶標分子整聯蛋白αV且可用於治療癌症(例如黑色素瘤、肉瘤或癌)之抗體之實例係英妥木單抗(intetumumab)(CAS RN:725735-28-4)、阿昔單抗(abciximab)(CAS RN:143653-53-6)、埃達珠單抗(etaracizumab)(CAS RN:892553-42-3)及揭示於US 7,465,449、EP 719859-A1、WO 2002/012501-A1及WO2006/062779-A2中之抗體。抗整聯蛋白αV結合物之實例係英妥木單抗-DM4及揭示於WO 2007/024536-A2中之其他ADC。該等抗體及其抗原結合片段係以引用方式併入本文中且其可用於本發明之上下文中。
抗TDGF1抗體
結合癌症靶標分子TDGF1且可用於治療癌症之抗體之實例係揭示於WO 02/077033-A1、US 7,318,924、WO 2003/083041-A2及WO 2002/088170-A2中之抗體。抗TDGF1結合物之實例揭示於WO
2002/088170-A2中。該等抗體及其抗原結合片段係以引用方式併入本文中且其可用於本發明之上下文中。
抗PSMA抗體
結合癌症靶標分子PSMA且可用於治療癌症(例如前列腺癌)之抗體之實例係揭示於WO 97/35616-A1、WO 99/47554-A1、WO 01/009192-A1及WO2003/034903中之抗體。抗PSMA結合物之實例揭示於WO 2009/026274-A1及WO 2007/002222中。該等抗體及其抗原結合片段係以引用方式併入本文中且其可用於本發明之上下文中。
抗EPHA2抗體
結合癌症靶標分子EPHA2且可用於製備結合物及用於治療癌症之抗體之實例揭示於WO 2004/091375-A2中。該等抗體及其抗原結合片段係以引用方式併入本文中且其可用於本發明之上下文中。
抗SLC44A4抗體
結合癌症靶標分子SLC44A4且可用於製備結合物及用於治療癌症(例如胰臟或前列腺癌)之抗體之實例揭示於WO2009/033094-A2及US2009/0175796-A1中。該等抗體及其抗原結合片段係以引用方式併入本文中且其可用於本發明之上下文中。
抗HLA-DOB抗體
結合至癌症靶標分子HLA-DOB之抗體之實例係抗體Lym-1(CAS RN:301344-99-0),其可用於治療癌症,例如非霍奇金氏淋巴瘤。抗HLA-DOB結合物之實例揭示於(例如)WO 2005/081711-A2中。該等抗體及其抗原結合片段係以引用方式併入本文中且其可用於本發明之上下文中。
抗VTCN1抗體
結合癌症靶標分子VTCN1且可用於製備結合物及用於治療癌症(例如卵巢癌、胰臟、肺或乳癌)之抗體之實例揭示於WO
2006/074418-A2中。該等抗體及其抗原結合片段係以引用方式併入本文中且其可用於本發明之上下文中。
抗FGFR2抗體
根據本發明,可使用抗FGFR2抗體。
抗FGFR2抗體及抗原結合片段之實例闡述於WO2013076186中。WO2013076186之所有抗體皆特此以引用方式併入本發明之說明中,且其可用於本發明中。抗體之序列顯示於WO2013076186之表9及表10中。較佳者係衍生自稱作M048-D01及M047-D08之抗體之抗體、抗原結合片段及該等抗體之變體。較佳抗FGFR2結合至FGFR2之已知之各種剪接變體。
在一個實施例中,抗FGFR2抗體或其抗原結合性抗體片段在結合至表現FGFR2之細胞後由該細胞內在化。
在另一實施例中,抗FGFR2抗體或抗原結合性抗體片段包含WO2013076186之表9或表10中所列示之抗體之至少一個、兩個或三個CDR胺基酸序列。該等抗體之較佳實施例同樣列示於WO2013076186中且以引用方式併入本文中。
抗TWEAKR抗體
在較佳實施例中,當在本發明製程中使用抗TWEAKR抗體或其抗原結合片段時,此抗體或片段係選自下文所闡述之彼等。另外,結合至TWEAKR之抗體已為熟習此項技術者習知,例如參見WO 2015/189143(A1)、WO 2014/198817(A1)、WO2009/020933(A2)或WO2009140177(A2)。另外,在本發明製程中使用所述抗TWEAKR抗體藉由由PNGase F引起之去糖基化或藉由重鏈之N297(Kabat編號)突變成任一胺基酸而生成之無糖基化變體。此外,該等抗體之變體經改造以含有一或多個受體麩醯胺酸殘基用於轉麩醯胺酸酶(TGase)催化之反應。
本發明特別地係關於具有抗體或其抗原結合性抗體片段或其變體之結合物,該等結合物引起TWEAKR(SEQ ID NO:169(蛋白);SEQ ID NO:170(DNA))之強活化,從而在過表現TWEAKR之各種癌細胞中強誘導細胞凋亡。
TWEAKR關於誘導細胞凋亡及抑制已闡述抗TWEAKR抗體(例如PDL-192)增殖之激動活性有所受限且無法達到內源性配體TWEAK之效能。此激動活性缺乏係基於降低之親和力,乃因該等抗體在TWEAKR處結合,且與內源性配體TWEAK相比親和力在類似範圍內(Michaelson JS等人,MAbs.2011年7月至8月;3(4):362-75;Culp PA等人,Clin Cancer Res.2010年1月15日;16(2):497-508),且甚至具有更高結合親和力之抗體未必展現更有效之信號傳導活性(Culp PA,等人,Clin Cancer Res.2010年1月15日;16(2):497-508)。另外,已顯示已闡述抗體之抗腫瘤活性取決於Fc效應物功能,且已顯示ADCC在小鼠模型中對於活體內效能起重要作用。
抗TWEAKR抗體之生成
使用完整人類抗體噬菌體庫(Hoet RM等人,Nat Biotechnol 2005;23(3):344-8)來分離本發明之TWEAKR專一性之人類單株抗體,藉由蛋白淘選(Hoogenboom H.R.,Nat Biotechnol 2005;23(3):1105-16)使用人類及小鼠TWEAKR之二聚體Fc融合之細胞外域作為固定化靶標。鑑別11種不同之Fab噬菌體,且將相應抗體選殖至哺乳動物EgG表現載體,其提供可溶性FAb中缺少之CH2-CH3域。在鑑別較佳抗體後,該等抗體係以全長IgG表現。藉由在各別抗體之重鏈中引入突變N297A或N297Q生成所述抗體之無糖基化變體。例如,在哺乳動物細胞中瞬時表現構築體,如Tom等人,在Micheal R.Dyson及Yves Durocher,Scion Publishing Ltd,2007編之Methods Express:Expression Systems第12章所闡述(參見AK-實例1)。該等抗體藉由蛋白質-A層析
純化且進一步藉由使用ELISA及BIAcore分析其至可溶性單體TWEAKR之結合親和力表徵,如在AK-實例2中所闡述。為測定抗TWEAKR抗體之細胞結合特徵,在多種細胞系(HT29、HS68、HS578)上藉由流式細胞測量術測試結合。實施NFκB報導基因分析來檢驗經鑑別之所有11種抗體(人類IgG1)之激動活性。針對其他活性及親和力成熟選擇具有最高活體外活性之抗體(TPP-883)(詳情參見AK-實例1)。檢測到具有改良激動活性之單一取代變體:CDR-H3之G102T。最後,基於與最好單一取代變體G102T相比增加之親和力選出7種變體。將其相應DNA選殖至哺乳動物IgG表現載體中並在上文所提及之NF-κB報導基因分析中檢驗功能活性。最後,將所獲得序列與人類生殖細胞系序列相比較,且修改對親和力及效能無任何顯著效應之偏差。藉由抗體庫篩選及藉由親和力及/或活性成熟獲得以下抗體:「TPP-2090」、「TPP-2149」、「TPP-2093」、「TPP-2148」、「TPP-2084」、「TPP-2077」、「TPP-1538」、「TPP-883」、「TPP-1854」、「TPP-1853」、「TPP-1857」及「TPP-1858」。
此外,可藉由業內已知之方法,例如抗體噬菌體顯示篩選(參見例如Hoet RM等人,Nat Biotechnol 2005;23(3):344-8)、充分確立之雜交瘤技術(參見例如Köhler及Milstein Nature.1975年8月7日;256(5517):495-7)或小鼠之免疫、尤其hMAb小鼠(例如VelocImmune小鼠®)之免疫,獲得本發明之抗體。
抗TWEAKR抗體之特定實施例
本發明之一個實施例係提供在一或多種TWEAKR表現細胞系中均顯示半胱天冬酶3/7之強誘導之抗體或其抗原結合性抗體片段或其變體(亦參見WO 2015/189143 A1及WO 2014/198817 A1)。在較佳實施例中,一或多種TWEAKR表現細胞系存於由WiDr、A253、NCI-H322、HT29及786-O組成之群中。可藉由業內已知之常規方法量測
「半胱天冬酶3/7之誘導」,包括本文所闡述之彼等。在一個實施例中,根據本發明使用利用半胱天冬酶3/7溶液(Promega,編號G8093)之活性測定及在VICTOR V(Perkin Elmer)上讀取發光來確定「半胱天冬酶3/7之誘導」。在培育時間結束時,測定半胱天冬酶3/7活性且與未經處理細胞相比測定半胱天冬酶3/7之誘導係數。當誘導係數大於1.2、較佳大於1.5、甚至更佳大於1.8、甚至更佳大於2.1、甚至更佳大於2.5時,據說抗體顯示半胱天冬酶3/7之「強誘導」。與已闡述激動性抗體[例如PDL-192(TPP-1104)、P4A8(TPP-1324)、136.1(TPP-2194)]相比且亦與300ng/ml重組人類TWEAK相比,所提供之抗TWEAKR抗體在HT29細胞中引起半胱天冬酶3/7之更強誘導。亦在WiDr、A253、NIC-H322及786-O細胞中觀察到在癌細胞中誘導半胱天冬酶3/7之此強活性,其中在大多數實驗中,與參考抗體[PDL-192(TPP-1104),P4A8(TPP-1324)]及與300ng/ml TWEAK相比,所檢驗之本發明抗體誘導更高之變化係數。本發明之一些抗體僅以中等親和力(>10nM)結合至TWEAKR,該親和力明顯小於內源性配體TWEAK之親和力,且亦小於其他已知之激動性抗體。此性質提供其他可能優點,例如,可更深入的滲透至腫瘤中。
就此而言,本發明之一個實施例係提供在新穎表位處專一性結合至TWEAKR之抗體或其抗原結合性抗體片段,其特徵在於選擇性結合至TWEAKR(SEQ ID NO:169;亦參見圖1)之位置47天冬胺酸鹽(D)(D47)。對於抗體相互作用針對某些TWEAKR胺基酸鑑別之依賴性與針對該等抗體測定之激動活性相關。天然配體TWEAK顯示TWEAKR之有效活化且端視TWEAKR之富半胱胺酸域中之白胺酸46而結合(Pellegrini等人,FEBS 280:1818-1829)。P4A8展現極低激動活性且至少部分地與TWEAKR之富半胱胺酸域外部之域相互作用。PDL-192展現中等激動活性且端視R56結合至富半胱胺酸域,但在TWEAK配體位
置對面結合。本發明之抗體(例如TPP-2090)端視D47而結合,且TWEAK端視L46而結合。因此,TWEAK結合至類似但不同之結合位置(圖7)。因此,展現強激動活性之本發明抗體結合至於抗體而言與極高激動活性相關之新穎表位(D47依賴性)。
認為TWEAKR(SEQ ID NO:169)之位置47之胺基酸(D47)對於本發明抗體之結合至關重要,此意味著當藉由將此殘基修飾成丙胺酸而使抗體之ELISA信號損失超過20%、另一選擇為超過30%、另一選擇為超過40%、另一選擇為超過50%、另一選擇為超過60%、另一選擇為超過70%、另一選擇為超過80%、另一選擇為超過90%、另一選擇為100%時,該抗體專一結合至TWEAKR(SEQ ID NO:169)之位置47之D(D47)如AK-實例2及圖6中所闡述。或者,當與TPP-2203相比對於TPP-2614使抗體損失其ELISA信號之超過20%、另一選擇為超過30%、另一選擇為超過40%、另一選擇為超過50%、另一選擇為超過60%、另一選擇為超過70%、另一選擇為超過80%、另一選擇為超過90%、另一選擇為100%時,該抗體專一地結合至TWEAKR(SEQ ID NO:169)之位置47之D(D47)。較佳地,當與TPP-2203相比抗體所損失之其關於TPP-2614之ELISA信號超過80%時,抗體專一地結合至TWEAKR(SEQ ID NO:169)之位置47之D(D47)。
在本申請案中,參考以下較佳之本發明抗體,如下表中所顯示:「TPP-2090」、「TPP-2149」、「TPP-2093」、「TPP-2148」、「TPP-2084」、「TPP-2077」、「TPP-1538」、「TPP-883」、「TPP-1854」、「TPP-1853」、「TPP-1857」、「TPP-1858」。
表:抗體之蛋白序列:
TPP-2090係:包含對應於SEQ ID NO:2之重鏈之區及對應於SEQ ID NO:1之輕鏈之區之抗體。
TPP-2658係:包含對應於SEQ ID NO:241之重鏈之區及對應於SEQ ID NO:1之輕鏈之區之抗體。
TPP-5442係:包含對應於SEQ ID NO:242之重鏈之區及對應於SEQ ID NO:1之輕鏈之區之抗體。
TPP-8825係:包含對應於SEQ ID NO:243之重鏈之區及對應於SEQ ID NO:1之輕鏈之區之抗體。
TPP-2149係:包含對應於SEQ ID NO:12之重鏈之區及對應於SEQ ID NO:11之輕鏈之區之抗體。
TPP-2093係:包含對應於SEQ ID NO:22之重鏈之區及對應於SEQ ID NO:21之輕鏈之區之抗體。
TPP-2148係:包含對應於SEQ ID NO:32之重鏈之區及對應於SEQ ID NO:31之輕鏈之區之抗體。
TPP-2084係:包含對應於SEQ ID NO:42之重鏈之區及對應於SEQ ID NO:41之輕鏈之區之抗體。
TPP-2077係:包含對應於SEQ ID NO:52之重鏈之區及對應於SEQ ID NO:51之輕鏈之區之抗體。
TPP-1538係:包含對應於SEQ ID NO:62之重鏈之區及對應於SEQ ID NO:61之輕鏈之區之抗體。
TPP-883係:包含對應於SEQ ID NO:72之重鏈之區及對應於SEQ ID NO:71之輕鏈之區之抗體。
TPP-1854係:包含對應於SEQ ID NO:82之重鏈之區及對應於SEQ ID NO:81之輕鏈之區之抗體。
TPP-1853係:包含對應於SEQ ID NO:92之重鏈之區及對應於
SEQ ID NO:91之輕鏈之區之抗體。
TPP-1857係:包含對應於SEQ ID NO:102之重鏈之區及對應於SEQ ID NO:101之輕鏈之區之抗體。
TPP-1858係:包含對應於SEQ ID NO:112之重鏈之區及對應於SEQ ID NO:111之輕鏈之區之抗體。
TPP-2090係:包含對應於SEQ ID NO:10之重鏈之可變區及對應於SEQ ID NO:9之輕鏈之可變區之抗體。
TPP-2149係:包含對應於SEQ ID NO:20之重鏈之可變區及對應於SEQ ID NO:19之輕鏈之可變區之抗體。
TPP-2093係:包含對應於SEQ ID NO:30之重鏈之可變區及對應於SEQ ID NO:29之輕鏈之可變區之抗體。
TPP-2148係:包含對應於SEQ ID NO:40之重鏈之可變區及對應於SEQ ID NO:39之輕鏈之可變區之抗體。
TPP-2084係:包含對應於SEQ ID NO:50之重鏈之可變區及對應於SEQ ID NO:49之輕鏈之可變區之抗體。
TPP-2077係:包含對應於SEQ ID NO:60之重鏈之可變區及對應於SEQ ID NO:59之輕鏈之可變區之抗體。
TPP-1538係:包含對應於SEQ ID NO:70之重鏈之可變區及對應於SEQ ID NO:69之輕鏈之可變區之抗體。
TPP-883係:包含對應於SEQ ID NO:80之重鏈之可變區及對應於SEQ ID NO:79之輕鏈之可變區之抗體。
TPP-1854係:包含對應於SEQ ID NO:90之重鏈之可變區及對應於SEQ ID NO:89之輕鏈之可變區之抗體。
TPP-1853係:包含對應於SEQ ID NO:100之重鏈之可變區及對應於SEQ ID NO:99之輕鏈之可變區之抗體。
TPP-1857係:包含對應於SEQ ID NO:110之重鏈之可變區及對應
於SEQ ID NO:109之輕鏈之可變區之抗體。
TPP-1858係:包含對應於SEQ ID NO:120之重鏈之可變區及對應於SEQ ID NO:119之輕鏈之可變區之抗體。
抗TWEAKR抗體之較佳實施例係下文中之彼等:
1.抗TWEAKR抗體、無糖基化變體或其抗原結合片段,其專一結合至TWEAKR(SEQ ID NO:169)之位置47之D(D47)。
2.如實施例1之抗體或其抗原結合片段,其中該抗體係激動性抗體。
3.如實施例1或2之抗體或其抗原結合片段,其包含:可變重鏈,其包含:(a)由包含式PYPMX之胺基酸序列(SEQ ID NO:171)編碼之重鏈之CDR1,其中X係I或M;(b)由包含式YISPSGGXTHYADSVKG之胺基酸序列(SEQ ID NO:172)編碼之重鏈之CDR2,其中X係S或K;及(c)由包含式GGDTYFDYFDY之胺基酸序列(SEQ ID NO:173)編碼之重鏈之CDR3;及可變輕鏈,其包含:(a)由包含式RASQSISXYLN之胺基酸序列(SEQ ID NO:174)編碼之輕鏈之CDR1,其中X係G或S;(b)由包含式XASSLQS之胺基酸序列(SEQ ID NO:175)編碼之輕鏈之CDR2,其中X係Q、A或N;及(c)由包含式QQSYXXPXIT之胺基酸序列(SEQ ID NO:176)編碼之輕鏈之CDR3,其中位置5之X係T或S,位置6之X係T或S且位置8之X係G或F。
4.如前述實施例中任一者之抗體或其抗原結合片段,其包含:a.可變重鏈,其包含如SEQ ID NO:6中所顯示之重鏈之可變CDR1序列、如SEQ ID NO:7中所顯示之重鏈之可變CDR2序列,及如SEQ ID NO:8中所顯示之重鏈之可變CDR3序列,亦及可變輕鏈,其包含SEQ ID NO:3中所顯示之輕鏈之可變CDR1序
列、SEQ ID NO:4中所顯示之輕鏈可變CDR2序列及SEQ ID NO:5中所顯示之輕鏈之可變CDR3序列或b.可變重鏈,其包含如SEQ ID NO:16中所顯示之重鏈之可變CDR1序列、如SEQ ID NO:17中所顯示之重鏈之可變CDR2序列、如SEQ ID NO:18中所顯示之重鏈之可變CDR3序列,亦及可變輕鏈,其包含SEQ ID NO:13中所顯示之輕鏈之可變CDR1序列、SEQ ID NO:14中所顯示之輕鏈可變CDR2序列及SEQ ID NO:15中所顯示之輕鏈之可變CDR3序列或c.可變重鏈,其包含如SEQ ID NO:26中所顯示之重鏈之可變CDR1序列、如SEQ ID NO:27中所顯示之重鏈之可變CDR2序列、如SEQ ID NO:28中所顯示之重鏈之可變CDR3序列,亦及可變輕鏈,其包含SEQ ID NO:23中所顯示之輕鏈之可變CDR1序列、SEQ ID NO:24中所顯示之輕鏈可變CDR2序列及SEQ ID NO:25中所顯示之輕鏈之可變CDR3序列或d.可變重鏈,其包含如SEQ ID NO:36中所顯示之重鏈之可變CDR1序列、如SEQ ID NO:37中所顯示之重鏈之可變CDR2序列、如SEQ ID NO:38中所顯示之重鏈之可變CDR3序列,亦及可變輕鏈,其包含SEQ ID NO:33中所顯示之輕鏈之可變CDR1序列、SEQ ID NO:34中所顯示之輕鏈可變CDR2序列及SEQ ID NO:35中所顯示之輕鏈之可變CDR3序列或e.可變重鏈,其包含如SEQ ID NO:46中所顯示之重鏈之可變CDR1序列、如SEQ ID NO:47中所顯示之重鏈之可變CDR2序列、如SEQ ID NO:48中所顯示之重鏈之可變CDR3序列,亦及可變輕鏈,其包含SEQ ID NO:43中所顯示之輕鏈之可變CDR1序列、序列SEQ ID NO:44中所顯示之輕鏈可變CDR2及SEQ ID NO:45中所顯示之輕鏈之可變CDR3序列或
f.可變重鏈,其包含如SEQ ID NO:56中所顯示之重鏈之可變CDR1序列、如SEQ ID NO:57中所顯示之重鏈之可變CDR2序列、如SEQ ID NO:58中所顯示之重鏈之可變CDR3序列,亦及可變輕鏈,其包含SEQ ID NO:53中所顯示之輕鏈之可變CDR1序列、SEQ ID NO:54中所顯示之輕鏈可變CDR2序列及SEQ ID NO:55中所顯示之輕鏈之可變CDR3序列或g.可變重鏈,其包含如SEQ ID NO:66中所顯示之重鏈之可變CDR1序列、如SEQ ID NO:67中所顯示之重鏈之可變CDR2序列、如SEQ ID NO:68中所顯示之重鏈之可變CDR3序列,亦及可變輕鏈,其包含SEQ ID NO:63中所顯示之輕鏈之可變CDR1序列、SEQ ID NO:64中所顯示之輕鏈可變CDR2序列及SEQ ID NO:65中所顯示之輕鏈之可變CDR3序列或h.可變重鏈,其包含如SEQ ID NO:76中所顯示之重鏈之可變CDR1序列、如SEQ ID NO:77中所顯示之重鏈之可變CDR2序列、如SEQ ID NO:78中所顯示之重鏈之可變CDR3序列,亦及可變輕鏈,其包含SEQ ID NO:73中所顯示之輕鏈之可變CDR1序列、SEQ ID NO:74中所顯示之輕鏈可變CDR2序列及SEQ ID NO:75中所顯示之輕鏈之可變CDR3序列或i.可變重鏈,其包含如SEQ ID NO:86中所顯示之重鏈之可變CDR1序列、如SEQ ID NO:87中所顯示之重鏈之可變CDR2序列、如SEQ ID NO:88中所顯示之重鏈之可變CDR3序列,亦及可變輕鏈,其包含中所顯示之輕鏈之可變CDR1序列SEQ ID NO:83、中所顯示之輕鏈可變CDR2序列SEQ ID NO:84及中所顯示之輕鏈之可變CDR3序列SEQ ID NO:85或j.可變重鏈,其包含如SEQ ID NO:96中所顯示之重鏈之可變CDR1序列、如SEQ ID NO:97中所顯示之重鏈之可變CDR2序列、如
SEQ ID NO:98中所顯示之重鏈之可變CDR3序列,亦及可變輕鏈,其包含SEQ ID NO:93中所顯示之輕鏈之可變CDR1序列、SEQ ID NO:94中所顯示之輕鏈可變CDR2序列及SEQ ID NO:95中所顯示之輕鏈之可變CDR3序列或k.可變重鏈,其包含如SEQ ID NO:106中所顯示之重鏈之可變CDR1序列、如SEQ ID NO:107中所顯示之重鏈之可變CDR2序列、如SEQ ID NO:108中所顯示之重鏈之可變CDR3序列,亦及可變輕鏈,其包含SEQ ID NO:103中所顯示之輕鏈之可變CDR1序列、SEQ ID NO:104中所顯示之輕鏈可變CDR2序列及SEQ ID NO:105中所顯示之輕鏈之可變CDR3序列或l.可變重鏈,其包含如SEQ ID NO:116中所顯示之重鏈之可變CDR1序列、如SEQ ID NO:117中所顯示之重鏈之可變CDR2序列、如SEQ ID NO:118中所顯示之重鏈之可變CDR3序列,亦及可變輕鏈,其包含SEQ ID NO:113中所顯示之輕鏈之可變CDR1序列、SEQ ID NO:114中所顯示之輕鏈可變CDR2序列及SEQ ID NO:115中所顯示之輕鏈之可變CDR3序列。
5.如前述實施例中任一者之抗體或其抗原結合片段,其包含:a.如SEQ ID NO:10中所顯示之重鏈之可變序列亦及如SEQ ID NO:9中所顯示之輕鏈之可變序列或b.如SEQ ID NO:20中所顯示之重鏈之可變序列亦及如SEQ ID NO:19中所顯示之輕鏈之可變序列或c.如SEQ ID NO:30中所顯示之重鏈之可變序列亦及如SEQ ID NO:29中所顯示之輕鏈之可變序列或d.如SEQ ID NO:40中所顯示之重鏈之可變序列亦及如SEQ ID NO:39中所顯示之輕鏈之可變序列或e.如SEQ ID NO:50中所顯示之重鏈之可變序列亦及如SEQ ID
NO:49中所顯示之輕鏈之可變序列或f.如SEQ ID NO:60中所顯示之重鏈之可變序列亦及如SEQ ID NO:59中所顯示之輕鏈之可變序列或g.如SEQ ID NO:70中所顯示之重鏈之可變序列亦及如SEQ ID NO:69中所顯示之輕鏈之可變序列或h.如SEQ ID NO:80中所顯示之重鏈之可變序列亦及如SEQ ID NO:79中所顯示之輕鏈之可變序列或i.如SEQ ID NO:90中所顯示之重鏈之可變序列亦及如SEQ ID NO:89中所顯示之輕鏈之可變序列或j.如SEQ ID NO:100中所顯示之重鏈之可變序列亦及如SEQ ID NO:99中所顯示之輕鏈之可變序列或k.如SEQ ID NO:110中所顯示之重鏈之可變序列亦及如SEQ ID NO:109中所顯示之輕鏈之可變序列或l.如SEQ ID NO:120中所顯示之重鏈之可變序列亦及如SEQ ID NO:119中所顯示之輕鏈之可變序列。
6.如前述實施例中任一者之抗體,其係IgG抗體。
7.如前述實施例中任一者之抗體,其包含:a.如SEQ ID NO:2中所顯示之重鏈之序列亦及如SEQ ID NO:1中所顯示之輕鏈之序列或b.如SEQ ID NO:12中所顯示之重鏈之序列亦及如SEQ ID NO:11中所顯示之輕鏈之序列或c.如SEQ ID NO:22中所顯示之重鏈之序列亦及如SEQ ID NO:21中所顯示之輕鏈之序列或d.如SEQ ID NO:32中所顯示之重鏈之序列亦及如SEQ ID NO:31中所顯示之輕鏈之序列或e.如SEQ ID NO:42中所顯示之重鏈之序列亦及如SEQ ID NO:41
中所顯示之輕鏈之序列或f.如SEQ ID NO:52中所顯示之重鏈之序列亦及如SEQ ID NO:51中所顯示之輕鏈之序列或g.如SEQ ID NO:62中所顯示之重鏈之序列亦及如SEQ ID NO:61中所顯示之輕鏈之序列或h.如SEQ ID NO:72中所顯示之重鏈之序列亦及如SEQ ID NO:71中所顯示之輕鏈之序列或i.如SEQ ID NO:82中所顯示之重鏈之序列亦及如SEQ ID NO:81中所顯示之輕鏈之序列或j.如SEQ ID NO:92中所顯示之重鏈之序列亦及如SEQ ID NO:91中所顯示之輕鏈之序列或k.如SEQ ID NO:102中所顯示之重鏈之序列亦及如SEQ ID NO:101中所顯示之輕鏈之序列或l.如SEQ ID NO:112中所顯示之重鏈之序列亦及如SEQ ID NO:111中所顯示之輕鏈之序列。
8.如前述實施例中任一者之抗原結合片段或如前述實施例中任一者之抗體之抗原結合片段,其係scFv、Fab、Fab’片段或F(ab’)2片段。
9.如前述實施例中任一者之抗體或抗原結合片段,其係單株抗體或其抗原結合片段。
10.如前述實施例中任一者之抗體或抗原結合片段,其係人類、人類化或嵌合抗體或抗原結合片段。
尤佳者係抗TWEAKR抗體TPP-2090。
本發明之實施例係提供適於紡錘體驅動蛋白抑制劑之轉麩醯胺酸酶(TGase)介導之結合之抗體。
當抗體係非糖基化形式時,人類同型之野生型全長IgG抗體在重
鏈之殘基295(Kabat EU編號)處具有在TGase存在下可接近且具有反應性之保守受體麩醯胺酸,以自抗體及適宜化合物形成結合物。此一「無糖基抗體」或「無糖基化抗體」或「去糖基化抗體」包含在Fc區之CH2域中缺乏連接至保守N連接位置之聚醣之Fc區。
可藉由(例如)在缺乏糖基化之表現系統中表現抗體而生成無糖基抗體。可藉由在原核宿主中表現抗體來製備無糖基抗體。適宜之原核宿主包括(但不限於)大腸桿菌、枯草芽孢桿菌、鼠傷寒沙氏桿菌及假單胞菌屬、鏈黴菌屬及葡萄球菌屬屬內之各物種。在本發明之另一實施例中,可使用哺乳動物表現系統連同糖基化抑制劑衣黴素一起達成無糖基抗體(Nose & Wigzell(1983),Proc Natl Acad Sci USA,80(21):6632-6)。亦即該修飾係防止在該抗體之Fc部分之CH2域之保守N連接位置處糖基化。在本發明之另一實施例中,在Fc區抗體之CH2域中連接至保守N連接位置之聚醣經去除,此意味著該抗體經去糖基化。抗體之酶去糖基化之方法已為業內熟知(例如Winkelhake & Nicolson(1976),J Biol Chem.251(4):1074-80)。可藉由(例如)使用(例如)PNGase F進行酶去糖基化來製備去糖基化抗體。
在本發明之另一實施例中,藉由N297重鏈糖基化位置之突變(使用Kabat EU編號)製備無糖基化抗體。該等經改造無糖基化抗體之酶結合係針對具有突變N297D、N297Q(Jeger等人,Angewandte Chemie Int.Ed.Engl 49,9995-9997(2010))或N297S(參見專利申請案WO2013092998A1及WO2013092983A2)之無糖基化抗體變體來闡述。此外本發明顯示轉麩醯胺酸酶可有效催化與具有突變N297A(Kabat EU編號)之無糖基化抗體變體之結合。
可藉由改造抗體產生在TGase存在下具有反應性之其他或替代位置。本發明化合物包括麩醯胺酸改造之抗體,其中野生型或親代抗體之一或多個胺基酸經麩醯胺酸胺基酸替代(取代)或其中麩醯胺酸殘基
視情況連同其他胺基酸殘基一起(例如包含受體麩醯胺酸殘基之標籤)經引入或添加至野生型或親代中。
若抗體包含一個以上經改造鏈,則使得麩醯胺酸可接近TGase之單一位置突變可產生一個以上可結合之經改造麩醯胺酸殘基。舉例而言,單一位置突變將由於IgG抗體之二聚體性質而在IgG中產生兩個經改造麩醯胺酸殘基。
抗體中在TGase存在下在適宜條件下具有反應性之麩醯胺酸胺基酸殘基可位於重鏈中,通常於恆定域中。在一個實施例中,胺基酸位置297(Kabat EU編號)之天冬醯胺經不同於麩醯胺酸之殘基替代。較佳者係N297D、N297Q、N297S或N297A,極佳者係N297A。抗體將具有帶有N297X取代之恆定區。因此,在殘基295(Kabat EU編號)處具有N297X取代及麩醯胺酸之抗體將具有一個受體麩醯胺酸且因此,每一重鏈具有一個結合位置。因此,完整IgG形式每一抗體將具有兩個結合物。
抗體中在TGase存在下在適宜條件下具有反應性之麩醯胺酸胺基酸殘基可位於重鏈中,通常於恆定域中。在一個實施例中,胺基酸位置297(Kabat EU編號)之天冬醯胺經麩醯胺酸殘基取代。抗體將具有帶有N297Q取代之恆定區。因此,在殘基295(Kabat EU編號)處具有N297Q取代及麩醯胺酸之抗體將具有兩個受體麩醯胺酸,且因此每一重鏈具有兩個結合位置。因此,完整IgG形式每一抗體將具有四個結合物。
抗體中在TGase存在下在適宜條件下具有反應性之麩醯胺酸胺基酸殘基可位於重鏈中,通常於恆定域中。在一個實施例中,胺基酸位置297(Kabat EU編號)之天冬醯胺經麩醯胺酸殘基取代且在位置295(Kabat EU編號)處麩醯胺酸經替代。抗體將具有帶有N297Q及Q295X取代之恆定區。較佳為Q295N取代。因此,在殘基295(EU編號)處
具有N297Q取代且無麩醯胺酸之抗體將具有一個受體麩醯胺酸,且因此每一重鏈具有一個結合位置。因此,完整IgG形式每一抗體將具有兩個結合物。
適於轉麩醯胺酸酶(TGase)介導之結合之較佳抗體包含:
i. N297X取代,其中X係除天冬醯胺以外之任一胺基酸;甚至更佳者係N297D、N297Q、N297S或N297A,極佳者係N297A及N297Q。
ii. N297Q取代及Q295X取代,其中X係除麩醯胺酸以外之任一胺基酸,較佳者係Q295N。
因此,製備結合抗體之有利方法將涉及提供缺乏N297連接糖基化之抗體作為起始材料(該N連接糖基化干擾TGase偶合)。
本發明亦涵蓋本發明化合物之所有適宜同位素變體。本發明化合物之同位素變體在本文中應理解為意指本發明化合物內之至少一個原子更換為具有相同原子數但具有與通常或主要天然存在之原子質量不同之原子質量之另一原子的化合物。可納入本發明化合物中之同位素之實例係以下之同位素:氫、碳、氮、氧、磷、硫、氟、氯、溴及碘,例如2H(氘)、3H(氚)、13C、14C、15N、17O、18O、32P、33P、33S、34S、35S、36S、18F、36Cl、82Br、123I、124I、129I及131I。本發明化合物之特定同位素變體、尤其已納入一或多種放射性同位素者可有益地(例如)用於檢驗作用機制或身體中之活性化合物分佈;因相對易於製備及檢測,尤其經3H或14C同位素標記之化合物適用於此目的。另外,納入同位素(例如氘)可因化合物之較大代謝穩定性而得到特定治療益處,例如延長身體中之半衰期或降低所需活性劑量;在一些情形下,本發明化合物之該等修飾可由此亦構成本發明之較佳實施例。可藉由熟習此項技術者已知之製程來製備本發明化合物之同位素變體,
例如藉由下文所闡述之方法及工作實例中闡述之程序,藉由使用各別試劑及/或起始化合物之相應同位素修飾。
在本發明之上下文中,較佳鹽係本發明化合物之生理上可接受之鹽。亦涵蓋本身不適用於醫藥應用但可用於(例如)分離或純化本發明化合物之鹽。
本發明化合物之生理上可接受之鹽包括礦物酸、羧酸及磺酸之酸加成鹽,例如以下酸之鹽:鹽酸、氫溴酸、硫酸、磷酸、甲磺酸、乙磺酸、苯磺酸、甲苯磺酸、萘二磺酸、乙酸、三氟乙酸、丙酸、乳酸、酒石酸、蘋果酸、檸檬酸、富馬酸、馬來酸及苯甲酸。
本發明化合物之生理上可接受之鹽亦包括習用鹼之鹽,例如且較佳地鹼金屬鹽(例如鈉鹽及鉀鹽)、鹼土金屬鹽(例如鈣鹽及鎂鹽);及衍生自具有1至16個C原子之氨或有機胺之銨鹽,例如且較佳地乙胺、二乙胺、三乙胺、乙基二異丙基胺、單乙醇胺、二乙醇胺、三乙醇胺、二環己基胺、二甲基胺基乙醇、普魯卡因(procaine)、二苄基胺、N-甲基六氫吡啶、N-甲基嗎啉、精胺酸、離胺酸及1,2-乙二胺。
溶劑合物在本發明上下文中闡述為藉由與溶劑分子配位形成呈固態或液態之複合物之彼等形式之本發明化合物。水合物係與水發生配位之具體溶劑合物形式。在本發明之上下文中,較佳溶劑合物係水合物。
另外,本發明亦涵蓋本發明化合物之前藥。術語「前藥」在本文中表示本身可具有生物活性或無活性但在其在體內之滯留時間期間轉化(例如藉由代謝或水解方式)為本發明化合物之化合物。
以下實施例尤佳:
實施例A:
下式之ADC(或APDC)
其中KSP-L-係式(II)、(IIa)、(IIIb)、(IIIc)、(IIId)、(IIIe)、(IV)至(IX)中之任一者或下式(IIf)之化合物,結合劑係包含受體麩醯胺酸殘基之抗TWEAKR抗體(尤佳專一結合至TWEAKR(SEQ ID NO:169)之位置47胺基酸D(D47)之抗TWEAKR抗體或其變體,尤其抗TWEAKR抗體TPP-2090)、該等抗體藉由由PNGase F引起之去糖基化或藉由重鏈之N297(Kabat編號)突變成任一胺基酸而生成之無糖基化變體,及所述抗體經改造以含有為細菌轉麩醯胺酸酶之受質之溶劑可及麩醯胺酸殘基之變體,且n係2或4
其中X1表示N,X2表示N且X3表示C;X1表示CH,X2表示C且X3表示N;X1表示NH,X2表示C且X3表示C;或X1表示CH,X2表示N且X3表示C;A表示C(=O);R1表示-L-#1、-H、-COOH、-C(=O)-NHNH2、-(CH2)1-3NH2、-
C(=O)-NZ“(CH2)1-3NH2及-C(=O)-NZ“CH2COOH,其中Z“表示-H或-NH2;R2及R4表示-H或-L-#1或R2表示-H且R4表示R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-(其中P2及Pe具有與上文所定義相同之含義,例如如關於式(IIa)所顯示),或R2及R4一起(且形成吡咯啶環)表示-CH2-CHR10-或-CHR10-CH2-,其中R10表示-H或-L-#1;R3表示-L-#1或C1-10-烷基-,其可視情況經以下各項取代:-OH、-O-烷基、-SH、-S-烷基、-O-C(O)-烷基、-O-C(=O)-NH-烷基、-NH-C(=O)-烷基、-NH-C(=O)-NH-烷基、-S(=O)n-烷基、-S(=O)2-NH-烷基、-NH-烷基、-N(烷基)2或-NH2(其中烷基較佳係C1-3-烷基);R5表示-L-#1、H或F;R6及R7彼此獨立地表示-H、C1-10-烷基、氟-C1-10-烷基、C2-10-烯基、氟-C2-10-烯基、C2-10-炔基、氟-C2-10-炔基、羥基或鹵素(特別地-F、-Cl、-Br),R8表示具支鏈C1-5-烷基,其可經-L-#1取代;且R9表示H或F,其中取代基R1、R2、R3、R4、R5、R8及R10中之一者表示-L-#1,且-L-表示連接體且#1表示至抗體之鍵,及ADC之鹽、溶劑合物及溶劑合物之鹽。
連接體較佳係連接體§-(C=O)m-L1-L2-§§
其中m係0或1;§表示至KSP之鍵且§§表示至抗體之鍵,且
L2表示:#1-(NH)p-(C=O)q-G4-NH-#2或#1-(NH)p-(C=O)q-G4-O-NH-#2
其中p係0或1;q係0或1;且G4表示視情況經取代之烷基或雜烷基鏈,視情況其中該鏈之任一碳經以下各項取代:烷氧基、羥基、烷基羰基氧基、-S-烷基、硫醇、-C(=O)-S-烷基、-C(=O)-NH-烷基、-NH-C(=O)-烷基、胺、-C(=O)-NH2其中#1表示至基團L1之連接點,#2表示至結合劑之麩醯胺酸殘基之連接點,且L1係由下式表示#1-(NR10)n-(G1)o-G3-#2
其中R10表示-H、-NH2或C1-C3-烷基;
G1表示-NH-C(=O)-或;n為0或1;o係0或1;且G3表示鍵或視情況經取代之直鏈或具支鏈烴鏈,該烴鏈具有來自伸芳基及/或直鏈及/或具支鏈及/或環狀伸烷基之1至100個碳原子,且其可由以下基團中之一或多者間雜一次或超過一次:-O-、-S-、-S(=O)-、-S(=O)2、-NH-、-C(=O)-、-NH-C(=O)-、-C(=O)-NH-、-NMe-、-NHNH-、-S(=O)2-NHNH-、-C(=O)-NHNH-及具有最多4個選自由N、O及S或-S(=O)-組成之群之雜原子之3員至10員芳香族或非芳
香族雜環(較佳或),其中側鏈(若存在)可經以下各項取代:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、-NH-CNNH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸。
此處,#1係至KSP抑制劑之鍵且#2係至至結合劑之偶合基團(例如L2)之鍵。
實施例B:
下式之ADC
其中KSP-L-係式(II)、(IIa)、(IIIb)、(IIIc)、(IIId)、(IIIe)、(IIf)、(IV)至(IX)中之任一者或下式(IIg)之化合物,結合劑係包含受體麩醯胺酸殘基之抗體且n係2或4:
其中X1表示N,X2表示N且X3表示C;X1表示CH,X2表示C且X3表示N;X1表示NH,X2表示C且X3表示C;或X1表示CH,X2表示N且X3表示C;
A表示-C(=O)-;R1表示-L-#1、-H、-COOH、-C(=O)-NHNH2、-(CH2)1-3NH2、-C(=O)-NZ“(CH2)1-3NH2及-C(=O)-NZ“CH2COOH,其中Z“表示-H或-NH2;R2及R4表示-H或-L-#1或R2表示-H且R4表示R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-(其中P2及Pe具有與上文所定義相同之含義,例如如關於式(IIa)所顯示),或R2及R4一起(且形成吡咯啶環)表示-CH2-CHR10-或-CHR10-CH2-,其中R10表示-H或-L-#1;R3表示-L-#1或C1-10-烷基-,其可視情況經以下各項取代:-OH、-O-烷基、-SH、-S-烷基、-O-C(=O)-烷基、-O-C(=O)-NH-烷基、-NH-C(=O)-烷基、-NH-C(=O)-NH-烷基、-S(=O)n-烷基、-S(=O)2-NH-烷基、-NH-烷基、-N(烷基)2或-NH2(其中烷基較佳係C1-3-烷基);R5表示-L-#1、H或F;R6及R7彼此獨立地表示-H、C1-10-烷基、氟-C1-10-烷基、C2-10-烯基、氟-C2-10-烯基、C2-10-炔基、氟-C2-10-炔基、羥基或鹵素(特別地-F、-Cl、-Br),R8表示具支鏈C1-5-烷基;且R9表示H或F,其中取代基R1、R2、R3、R4、R5及R10中之一者表示-L-#1,且-L-表示連接體且#1表示至抗體之鍵,其中-L-係由下式表示§-(C=O)m-L1-L2-§§
其中m係0或1;§表示至KSP之鍵且§§表示至抗體之鍵,且
L2表示:
#1-(NH)p-(C=O)q-G4-NH-#2或#1-(NH)p-(C=O)q-G4-O-NH-#2其中p係0或1;q係0或1;且G4表示視情況經取代之烷基或雜烷基鏈,視情況其中該鏈之任一碳經以下各項取代:烷氧基、羥基、烷基羰基氧基、-S-烷基、硫醇、-C(=O)-S-烷基、-C(=O)-NH-烷基、-NH-C(=O)-烷基、胺、-C(=O)-NH2其中#1表示至基團L1之連接點,#2表示至結合劑之麩醯胺酸殘基之連接點,且L1係由下式表示#1-(NR10)n-(G1)o-G3-#2
其中R10表示-H、-NH2或C1-C3-烷基;G1表示-NH-C(=O)-或;n為0或1;o係0或1;且G3表示鍵或視情況經取代之直鏈或具支鏈烴鏈,該烴鏈具有來自伸芳基及/或直鏈及/或具支鏈及/或環狀伸烷基之1至100個碳原子且其可由以下基團中之一或多者間雜一次或超過一次:-O-、-S-、-S(=O)-、-S(=O)2、-NH-、-C(=O)-、-NH-C(=O)-、-C(=O)-NH-、-NMe-、-NHNH-、-S(=O)2-NHNH-、-C(=O)-NHNH-及具有最多4個選自由N、O及S或-S(=O)-組成之群之雜原子之3員至10員芳香族或非芳
香族雜環(較佳或),其中側鏈(若存在)可經以下各項取代:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、-NH-CNNH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸。
#1係至KSP抑制劑之鍵且#2係至至抗體之偶合基團(例如L2)之鍵,及ADC之鹽、溶劑合物及溶劑合物之鹽,
實施例C:
下式之ADC
其中KSP-L-係具有以下子結構I(sub)之化合物,結合劑係包含受體麩醯胺酸殘基之抗TWEAKR抗體(尤佳曲妥珠單抗或專一結合至TWEAKR(SEQ ID NO:169)之位置47胺基酸D(D47)之抗TWEAKR抗體,尤其抗TWEAK R抗體TPP-2090)、抗H ER2抗體或抗EGRF抗體(較佳尼妥珠單抗)、該等抗體藉由由PNGase F引起之去糖基化或藉由重鏈之N297(Kabat編號)突變成任一胺基酸而生成之無糖基化變體,及所述抗體經改造以含有一或多個受體麩醯胺酸殘基用於轉麩醯胺酸酶(TGase)催化之反應之變體,且n係2或4:
其中#a表示至分子剩餘部分之鍵;R1a 表示-L-#1、-H或-(CH2)0-3Z,其中Z表示-H、鹵素、-
NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-NH2、-SO3H、-COOH,其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基;R2a及R4a彼此獨立地表示-L-#1、H、-C(=O)-CHY4-NHY5或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y4 表示視情況經-NHC(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或R2a表示 -H且R4a表示 R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-其中P2及P3具有與上文所定義相同之含義,例如如關於式(IIa)所顯示,其中R21 表示H、C1-10-烷基-、C5-10-芳基-或C6-10-芳烷基-、C5-10-雜烷基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基-、C5-10-雜環烷基-、雜芳基-、雜芳基-烷基-、C1-10-烷氧基-、C6-10-芳基氧基-或C6-10-芳烷氧基-、C5-10-雜烷氧基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基氧基-、C5-10-雜環烷氧基,其可經以下基團取代一或多次:-NH2、-NH-烷基、-N(烷基)2、-NH-C(=O)-烷基、N(烷基)-C(=O)-烷基、-SO3H、-S(=O)2NH2、-S(=O)2-N(烷
基)2、-COOH、-C(=O)-NH2、-C(=O)-N(烷基)2或-OH,或表示-H或基團-(O)x-(CH2CH2O)y-R22,其中x 為0或1且其中v 係1至20之數值,其中R22 表示-H、-烷基(較佳C1-12-烷基)、-CH2-COOH、-CH2-CH2-COOH或-CH2-CH2-NH2;或R2a及R4a 一起(且形成吡咯啶環)表示-CH2-CHR10-或-CHR10-CH2-,其中R10 表示-H、-L-#1、-NH2、-SO3H、-COOH、-SH、-SO3H或-OH,其中取代基R1a、R2a、R4a或R10中之一者表示-L-#1,-L-表示連接體且#1表示至抗體之鍵,其中-L-係由下式表示§-(C=O)m-L1-L2-§§
其中m係0或1;§表示至KSP之鍵且§§表示至抗體之鍵,且L2表示 #1-(NH)p-(C=O)q-G4-NH-#2或#1-(NH)p-(C=O)q-G4-O-NH-#2其中p係0或1;q係0或1;且G4表示視情況經取代之烷基或雜烷基鏈,視情況其中該鏈之任一碳經以下各項取代:烷氧基、羥基、烷基羰基氧基、-S-烷基、硫
醇、-C(=O)-S-烷基、-C(=O)-NH-烷基、-NH-C(=O)-烷基、胺、-C(=O)-NH2其中#1表示至基團L1之連接點,#2表示至結合劑之麩醯胺酸殘基之連接點,且L1係由下式表示#1-(NR10)n-(G1)o-G3-#2其中R10表示-H、-NH2或C1-C3-烷基;
G1表示-NH-C(=O)-或;n為0或1;o係0或1;且G3表示鍵或視情況經取代之直鏈或具支鏈烴鏈,該烴鏈具有來自伸芳基及/或直鏈及/或具支鏈及/或環狀伸烷基之1至100個碳原子且其可由以下基團中之一或多者間雜一次或超過一次:-O-、-S-、-S(=O)-、-S(=O)2、-NH-、-C(=O)-、-NH-C(=O)-、-C(=O)-NH-、-NMe-、-NHNH-、-S(=O)2-NHNH-、-C(=O)-NHNH-及具有最多4個選自由N、O及S或-S(=O)-組成之群之雜原子之3員至10員芳香族或非芳
香族雜環(較佳或),其中側鏈(若存在)可經以下各項取代:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、-NH-CN-NH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸。
此處,#1係至KSP抑制劑之鍵且#2係至至結合劑之偶合基團(例如L2)之鍵。
及ADC之鹽、溶劑合物及溶劑合物之鹽。
實施例D:
下式之ADC
其中KSP-L-係式(II)、(IIa)、(IIIb)、(IIIc)、(IIId)、(IIe)、(IIf)、(IIg)、(III)至(IX)中之任一者或下式(IIh)之化合物,結合劑係包含受體麩醯胺酸殘基之抗體且n係2或4之數值:
其中X1表示N,X2表示N且X3表示C;X1表示CH,X2表示C且X3表示N;X1表示NH,X2表示C且X3表示C;或X1表示CH,X2表示N且X3表示C;A 表示-C(=O)-;R1 表示-L-#1;R2及R4 表示-H,或R2 表示-H且R4 表示R21-C(=O)-P3(0-2)-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-
其中P2及P3具有如上文所定義相同之含義,例如如關於式(IIa)所顯示,或R2及R4 一起(且形成吡咯啶環)表示-CH2-CHR10-或-CHR10-CH2-,其中R10表示H;R3 表示C1-10-烷基,其可經以下各項取代:1至3個-OH基團、1至3個-O-烷基、1至3個-SH基團、1至3個-S-烷基、1至3個-O-C(=O)-烷基、1至3個-O-C(=O)-NH-烷基、1至3個-NH-C(=O)-烷基、1至3個-NH-C(=O)-NH-烷基、1至3個-S(=O)n-烷基、1至3個-S(=O)2-NH-烷基、1至3個-NH-烷基、1至3個-N(烷基)2基團或1至3個-NH2基團,其中烷基較佳係C1-3-烷基或-MOD其中-MOD表示-(NR10)n-(G1)o-G2-H,其中R10 表示-H或C1-C3-烷基;
其中G1 表示-NH-C(=O)-、-C(=O)-NH-或(其中,
若G1表示-NH-C(=O)-或,則R10不表示NH2);其中n 係0或1;其中o 為0或1;且其中G2 表示直鏈及/或具支鏈烴基團,其具有1至10個碳原子且其可由以下基團中之一或多者間雜一次或超過一次:-O-、-S-、-S(=O)-、-S(=O)2-、-NRy-、-NRyC(=O)-、-C(=O)-NRy-、-NRyNRy-、-S(=O)2-NRyNRy-、-C(=O)-NRyNRy-,其中Ry 表示-H、苯基、C1-C10-烷基、C2-C10-烯基或C2-C10-炔基,其每一者均可經以下各項取代:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、NH-CN-NH2、磺醯胺、
碸、亞碸或磺酸,或表示-C(=O)-、-CRx=N-O-其中Rx 表示-H、C1-C3-烷基或苯基,其中包括任何側鏈之烴鏈均可經以下各項取代:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、NH-CN-NH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸,其中-MOD 較佳具有至少一個基團-COOH;R5 表示H或F;R6及R7 彼此獨立地表示-H、C1-3-烷基、氟-C1-3-烷基、C2-4-烯基、氟-C2-4-烯基、C2-4-炔基、氟-C2-4-炔基、羥基或鹵素(特別地-F、-Cl、-Br),R8 表示具支鏈C1-5-烷基;且R9 表示H或F,其中-L-表示連接體且#1表示至抗體之鍵,其中-L-係由下式表示§-(C=O)m-L1-L2-§§
其中m係0或1;§表示至KSP之鍵且§§表示至抗體之鍵,且L2表示:#1-(NH)p-(C=O)q-G4-NH-#2或#1-(NH)p-(C=O)q-G4-O-NH-#2
其中p係0或1;q係0或1;且G4表示視情況經取代之烷基或雜烷基鏈,視情況其中該鏈之任一碳經以下各項取代:烷氧基、羥基、烷基羰基氧基、-S-烷基、硫
醇、-C(=O)-S-烷基、-C(=O)-NH-烷基、-NH-C(=O)-烷基、胺、-C(=O)-NH2其中#1表示至基團L1之連接點,#2表示至結合劑之麩醯胺酸殘基之連接點,且L1係由下式表示#1-(NR10)n-(G1)o-G3-#2
其中R10表示-H、-NH2或C1-C3-烷基;
G1表示-NH-C(=O)-或;n為0或1;o係0或1;且G3表示鍵或視情況經取代之直鏈或具支鏈烴鏈,該鏈具有來自伸芳基及/或直鏈及/或具支鏈及/或環狀伸烷基且之1至100個碳原子其可由以下基團中之一或多者間雜一次或超過一次:-O-、-S-、-S(=O)-、-S(=O)2、-NH-、-C(=O)-、-NH-C(=O)-、-C(=O)-NH-、-NMe-、-NHNH-、-S(=O)2-NHNH-、-C(=O)-NHNH-及具有最多4個選自由N、O及S或-S(=O)-組成之群之雜原子之3員至10員芳香族或非芳香族雜環
(較佳或),其中其中包括側鏈(若存在)之烴鏈可經以下各項取代:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、-NH-CNNH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸。
其中#1係至KSP抑制劑之鍵且#2係至至抗體之偶合基團(例如L2)之鍵,及該ADC之鹽、溶劑合物、溶劑合物之鹽及差向異構物。
實施例E:
下式之位置專一性且均質之ADC
其中KSP-L-係式(II)、(IIa)、(IIIb)、(IIIc)、(IIId)、(IIe)、(IIf)、(IIg)或(III)至(IX)中之任一者或式(IIh)之化合物及該ADC之鹽、溶劑合物及溶劑合物之鹽。
本發明之一個實施例係結合劑或其衍生物與一或多種活性化合物分子之結合物,該活性化合物分子為紡錘體驅動蛋白抑制劑,經由連接體L連接至結合劑,其中該連接體L連接至結合劑之麩醯胺酸側鏈,其中1至5個紡錘體驅動蛋白抑制劑係連接至連接體L,其中該紡錘體驅動蛋白抑制劑具有以下式(IIa):
其中X1表示N,X2表示N且X3表示C;或X1表示N,X2表示C且X3表示N;或X1表示CH或CF,X2表示C且X3表示N;或X1表示NH,X2表示C且X3表示C;或X1表示CH,X2表示N且X3表示C(其中較佳地X1表示CH,X2表示C且X3表示N);R1表示 -H、-MOD、-L-#1或-(CH2)0-3Z,
其中-L-#1 表示連接體且#1表示至結合劑或其衍生物之鍵。
其中-MOD 表示為如下文所定義,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2、-(CH2CH2O)0-3-(CH2)0-3Z‘(例如-(CH2)0-3Z‘)或-CH(CH2W)Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-NH2、-SO3H、-COOH、-NH-C(=O)-CH2-CH2-CH(NH2)COOH或-(C(=O)-NH-CHY4)1-3COOH,其中W 表示-H或-OH,其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基;R2 表示-L-#1、H、-MOD、-C(=O)-CHY4-NHY5或-(CH2)0-3Z,其中-L-#1 表示連接體且#1表示至結合劑或其衍生物之鍵,其中-MOD 表示為如下文所定義,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,且其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;其中Y4 表示視情況經-NHC(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基;R4 表示-L-#1、-H、-C(=O)-CHY4-NHY5或-(CH2)0-3Z,其中-L-#1 表示連接體且#1表示至結合劑或其衍生物之鍵,
其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,且其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或R2及R4 一起(且形成吡咯啶環)表示-CH2-CHR10-或-CHR10-CH2-,其中R10 表示L-#1、-H、-NH2、-SO3H、-COOH、-SH或-OH,A 表示-C(=O)-、-S(=O)-、-S(=O)2-、-S(=O)2-NH-或-C(=N-NH2)-;R3 表示-L-#1、-MOD或視情況經取代之烷基、環烷基、芳基、雜芳基、雜烷基、雜環烷基,較佳-L-#1或C1-10-烷基、C6-10-芳基或C6-10-芳烷基、C5-10-雜烷基、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基或C5-10-雜環烷基,其可經以下各項取代:1至3個-OH基團、1至3個鹵素原子、1至3個鹵化烷基(各自具有1至3個鹵素原子)、1至3個-O-烷基、1至3個-SH基團、1至3個-S-烷基、1至3個-O-C(=O)-烷基、1至3個-O-C(=O)-NH-烷基、1至3個-NH-C(=O)-烷基、1至3個-NH-C(=O)-NH-烷基、1至3個-S(=O)n-烷基、1至3個-S(=O)2-NH-烷基、1至3個-NH-烷基、1至3個-N(烷基)2基團、1至3個-NH2基團或1至3個-(CH2)0-3Z基團,其中-L-#1 表示連接體且#1表示至結合劑或其衍生物之鍵,
其中n 表示0、1或2,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘且其中Y3 表示-H、-(CH2)0-3-CH(NHC(=O)-CH3)Z‘、-(CH2)0-3-CH(NH2)Z‘或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;R5 表示-H、-NH2、-NO2、鹵素(特別地-F、-Cl、-Br)、-SH或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、鹵素、-NHY3、-C(O)-NY1Y2或-C(O)-OY3,其中Y1及Y2彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOHR6及R7 彼此獨立地表示-H、氰基、C1-10-烷基、氟-C1-10-烷基、C2-10-烯基、氟-C2-10-烯基、C2-10-炔基、氟-C2-10-炔基、羥基、-NO2、-NH2、-COOH或鹵素(特別地-F、-Cl、-Br),R8 表示C1-10-烷基、氟-C1-10-烷基、C2-10-烯基、氟-C2-10-烯基、C2-10-炔基、氟-C2-10-炔基、C4-10-環烷基、氟-C4-10-環烷基或-(CH2)0-2-(HZ2),其中HZ2 表示具有最多兩個選自由N、O及S組成之群之雜原子之之4員至7員雜環(較佳氧雜環丁烷),其中該等基團中之每一者均可經-OH、-COOH、-NH2或-L-#1取代;其中取代基R1、R2、R3、R4、R5、R8及R10中之一者表示-L-#1或其中之任一者皆不表示-L-#1或(在R8之情形下)含有-L-#1,其中L表示連接體且
其中#1表示至結合劑或其衍生物之鍵,其中-MOD表示-(NR10)n-(G1)o-G2-H,其中R10 表示-H或C1-C3-烷基;
其中G1 表示-NH-C(=O)-、-C(=O)-NH-或(其中,
若G1表示-NH-C(=O)-或,則R10不表示NH2);其中n 係0或1;其中o 為0或1;且其中G2 表示直鏈及/或具支鏈烴基團,其具有1至10個碳原子且其可由以下基團中之一或多者間雜一次或超過一次:-O-、-S-、-S(=O)-、-S(=O)2-、-NRy-、-NRyC(=O)-、-C(=O)-NRy-、-NRyNRy-、-S(=O)2-NRyNRy-、-C(=O)-NRyNRy-,其中Ry 表示-H、苯基、C1-C10-烷基、C2-C10-烯基或C2-C10-炔基,其每一者均可經以下各項取代:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、NH-CN-NH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸,或表示-C(=O)-、-CRx=N-O-其中Rx 表示-H、C1-C3-烷基或苯基,其中包括任何側鏈之烴鏈均可經以下各項取代:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、NH-CN-NH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸,其中G3 表示-H或-COOH,且其中-MOD 較佳具有至少一個基團-COOH;及其鹽、溶劑合物、溶劑合物之鹽及差向異構物。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中X1表示CH,X2表示C且X3表示N。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中取代基R1表
示-L-#1。
本發明之另一實施例係結合劑或其衍生物與活性化合物分子之結合物,該活性化合物分子為紡錘體驅動蛋白抑制劑,經由連接體L連接至該結合劑,其中該連接體L連接至該結合劑之麩醯胺酸側鏈,其中該紡錘體驅動蛋白抑制劑具有以下子結構:
其中#a表示至分子剩餘部分之鍵;R1a 表示H或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2、-(CH2CH2O)0-3-(CH2)0-3Z‘(例如-(CH2)0-3Z‘)或-CH(CH2W)Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-NH2、-SO3H、-COOH、-NH-C(=O)-CH2-CH2-CH(NH2)COOH或-(C(=O)-NH-CHY4)1-3COOH,其中W 表示-H或-OH,其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基;R2a及R4a彼此獨立地表示-H、-C(=O)-CHY4-NHY5或-(CH2)0-3Z,或R2及R4 一起(且形成吡咯啶環)表示-CH2-CHR10-或-CHR10-CH2-,其中R10 表示-H、-NH2、-SO3H、-COOH、-SH或-OH;
其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基;其中紡錘體驅動蛋白抑制劑係藉由在R1a、R2a、R4a或在由R2a及R4a形成之吡咯啶環取代氫原子而連接至連接體,及其鹽、溶劑合物、溶劑合物之鹽及差向異構物。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中紡錘體驅動蛋白抑制劑係由通式(I)表示:
其中R1a 表示-H或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、-NHY3、-OY3、-SY3、鹵素、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2彼此獨立地表示-H、-NH2、-(CH2CH2O)0-3-(CH2)0-3Z‘或-CH(CH2W)Z‘,且
其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-NH2、-SO3H、-COOH、-NH-C(=O)-CH2-CH2-CH(NH2)COOH或-(C(=O)-NH-CHY4)1-3COOH,其中W 表示-H或-OH,其中Y4 表示視情況經-NH-(C=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基;R2a及R4a 彼此獨立地表示-H、-C(=O)-CHY4-NHY5或-(CH2)0-3Z,或R2a及R4a一起(且形成吡咯啶環)表示-CH2-CHR10-或-CHR10-CH2-,其中R10 表示-H、-NH2、-SO3H、-COOH、-SH或-OH;其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基;R3a 表示視情況經取代之烷基、環烷基、芳基、雜芳基、雜烷基、雜環烷基,較佳-L-BINDER或C1-10-烷基、C6-10-芳基或C6-10-芳烷基、C5-10-雜烷基、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基或C5-10-雜環烷基,其可經以下各項取代:1至3個-OH基團、1至3個鹵素原子、1至3個鹵化烷基(各自具有1至3個鹵素原子)、1至3個-O-烷基、1至3個-SH基團、1至3個-S-烷基、1至3個-O-C(=O)-烷基、1至3個-O-C(=O)-NH-烷基、1至3個-NH-C(=O)-烷基、1至3個-NH-C(=O)-NH-烷基、1至3個-S(=O)n-烷
基、1至3個-S(=O)2-NH-烷基、1至3個-NH-烷基、1至3個-N(烷基)2基團、1至3個-NH2基團或1至3個-(CH2)0-3Z基團,其中n 為0、1或2,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(O)-OY3,其中Y1及Y2彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H、-(CH2)0-3-CH(NH-C(=O)-CH3)Z‘、-(CH2)0-3-CH(NH2)Z‘或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH其中「烷基」較佳表示C1-10-烷基);R8a 表示C1-10-烷基;HZ 表示單環或二環雜環,其可經一或多個選自由以下各項組成之群之取代基取代:鹵素、可視情況經鹵素取代之C1-10-烷基、C6-10-芳基及C6-10-芳烷基;其中該紡錘體驅動蛋白抑制劑係藉由在R1a、R2a、R3a、R4a、R8a或在由R2a及R4a形成之吡咯啶環取代氫原子而連接至連接體,及其鹽、溶劑合物及溶劑合物之鹽。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中連接體L係連接至結合劑之麩醯胺酸側鏈,其中1至5個紡錘體驅動蛋白抑制劑連接至連接體L,其中活性化合物分子連接體係由通式(II)表示:
其中X1表示N,X2表示N且X3表示C;或X1表示N,X2表示C且X3表示N;或X1表示CH,X2表示C且X3表示N;或X1表示NH,X2表示C且X3表示C;或X1表示CH,X2表示N且X3表示C R1表示 -H、-L-#1或-(CH2)0-3Z,其中-L-#1 表示連接體且#1表示至結合劑或其衍生物之鍵。
其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2、-(CH2CH2O)0-3-(CH2)0-3Z‘(例如-(CH2)0-3Z‘)或-CH(CH2W)Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-NH2、-SO3H、-COOH、-NH-C(=O)-CH2-CH2-CH(NH2)COOH或-(C(=O)-NH-CHY4)1-3COOH,其中W 表示-H或-OH,其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基;R2及R4 彼此獨立地表示-L-#1、-H、-C(=O)-CHY4-NHY5或-
(CH2)0-3Z,其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,且其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或R2 表示-H且R4 表示基團R21-(C=O)(0-1)-(P3)(0-2)-P2-NH-CH(CH2C(=O)-NH2)-C(=O)-其中R21 表示H、C1-10-烷基-、C5-10-芳基-或C6-10-芳烷基-、C5-10-雜烷基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基-、C5-10-雜環烷基-、雜芳基-、雜芳基-烷基-、C1-10-烷氧基-、C6-10-芳基氧基-或C6-10-芳烷氧基-、C5-10-雜烷氧基-、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基氧基-、C5-10-雜環烷氧基,其可經以下基團取代一或多次:-NH2、-NH-烷基、-N(烷基)2、-NH-C(=O)-烷基、N(烷基)-C(=O)-烷基、-SO3H、-S(=O)2NH2、-S(=O)2-N(烷基)2、-COOH、-C(=O)-NH2、-C(=O)-N(烷基)2或-OH,或表示-H或基團-(O)x-(CH2CH2O)y-R22,其中x 為0或1且其中v 係1至20之數值,其中R22 表示-H、-烷基(較佳C1-12-烷基)、-CH2-COOH、-CH2-CH2-COOH或-CH2-CH2-NH2;其中P2及P3具有與上文所定義相同之含義,例如如關於式(IIa)所顯示,或R2及R4 一起(且形成吡咯啶環)表示-CH2-CHR10-或-CHR10-CH2-,
其中R10 表示L-#1、-H、-NH2、-SO3H、-COOH、-SH或-OH,其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、鹵素、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;A 表示-C(=O)-、-S(=O)-、-S(=O)2-、-S(=O)2-NH-或-C(=N-NH2)-;R3 表示-L-#1或視情況經取代之烷基、芳基、雜芳基或雜環烷基,較佳-L-#1或C1-10-烷基、C6-10-芳基、C6-10-芳烷基、C5-10-雜烷基、C1-10-烷基-O-C6-10-芳基或C5-10-雜環烷基,其可經以下各項取代:1至3個-OH基團、1至3個鹵素原子、1至3個鹵化烷基(各自具有1至3個鹵素原子)、1至3個-O-烷基、1至3個-SH基團、1至3個-S-烷基、1至3個-O-C(=O)-烷基、1至3個-O-C(=O)-NH-烷基、1至3個-NH-C(=O)-烷基、1至3個-NH-C(=O)-NH-烷基、1至3個-S(=O)n-烷基、1至3個-S(=O)2-NH-烷基、1至3個-NH-烷基、1至3個-N(烷基)2基團、1至3個-NH2基團或1至3個-(CH2)0-3Z基團,其中-L-#1 表示連接體且#1表示至結合劑或其衍生物之鍵,其中n 表示0、1或2,其中Z 表示-H、鹵素、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘且其中Y3 表示-H、-(CH2)0-3-CH(NHC(=O)-CH3)Z‘、-(CH2)0-3-CH(NH2)Z‘或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;
R5 表示-L-#1、-H、-F、-NH2、-NO2、鹵素(特別地-F、-Cl、-Br)、-SH或-(CH2)0-3Z,其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、鹵素、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2彼此獨立地表示-H、-NH2或-(CH2)0-3Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-SO3H、-NH2或-COOH;其中取代基R1、R2、R3、R4及R5中之一者表示-L-#1,L表示連接體且#1表示至結合劑或其衍生物之鍵,R6及R7 彼此獨立地表示-H、氰基、C1-10-烷基、氟-C1-10-烷基、C2-10-烯基、氟-C2-10-烯基、C2-10-炔基、氟-C2-10-炔基、羥基或鹵素(特別地-F、-Cl、-Br),R8 表示C1-10-烷基、氟-C1-10-烷基、C4-10-環烷基、氟-C4-10-環烷基或視情況經取代之氧雜環丁烷;且R9 表示-H、-F、-CH3、-CF3、-CH2F或-CHF2;及其鹽、溶劑合物、溶劑合物之鹽及差向異構物。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,R1表示 -H、-L-#1或-(CH2)0-3Z,其中-L-#1 表示連接體且#1表示至結合劑或其衍生物之鍵。
其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3,其中Y1及Y2 彼此獨立地表示-H、-NH2、-(CH2CH2O)0-3-(CH2)0-3Z‘或-CH(CH2W)Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-NH2、-COOH、-NH-C(=O)-CH2-CH2-CH(NH2)COOH或-(C(=O)-NH-CHY4)1-3COOH,
其中W 表示-H或-OH,其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基;R2及R4 彼此獨立地表示-L-#1、-H或-C(=O)-CHY4-NHY5,或R2及R4 一起(且形成吡咯啶環)表示-CH2-CHR10-,其中R10表示-H、-L-#1、-NH2、-COOH、-SH、-OH或-SO3H,其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,且其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基,A -C(=O)-R3 表示-(CH2)OH或-L-#1,且R5 表示-L-#1或-H,其中取代基R1、R2、R3、R4及R5中之一者表示-L-#1,及其鹽、溶劑合物、溶劑合物之鹽及差向異構物。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中R6及R7彼此獨立地表示-H、C1-3-烷基或鹵素。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中R8表示C1-4-烷基(較佳第三丁基)。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中R9表示-H。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中R6及R7表示-F。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中結合劑或其衍生物係結合劑肽或蛋白質或結合劑肽或蛋白質之衍生物。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中該結合物具有每一結合劑2個結合位置。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中該結合物具有每一結合劑4個結合位置。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中結合劑肽或蛋白質表示抗體或包含可由轉麩醯胺酸酶識別之受體麩醯胺酸側鏈之結合劑肽或蛋白質衍生物。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其係由轉麩醯胺酸酶介導之結合產生。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其係使用起源於茂源鏈黴菌(Streptomyces Mobaraensis)之轉麩醯胺酸酶產生。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中結合劑結合至癌症靶標分子。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中結合劑結合至細胞外靶標分子。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中結合劑在結合至細胞外靶標分子後係由表現靶標分子之細胞進行內在化並在細胞內(較佳藉由溶酶體)處理。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中結合劑肽或蛋白質係人類、人類化或嵌合單株抗體或其抗原結合片段。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中結合劑肽或蛋白質係在其重鏈處、視情況在CH2域內具有受體麩醯胺酸殘基之抗體。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中結合劑肽或蛋白質係在其重鏈處在位置295(KABAT編號系統)處具有受體麩醯胺酸殘基之抗體。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中結合劑肽或蛋白質係包含N297X取代(其中X係除天冬醯胺以外之任一胺基酸)、甚至更佳者係N297D、N297Q、N297S或N297A、極佳者係N297A及N297Q之抗體。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中結合劑肽或蛋白質係包含N297Q取代及Q295X取代(其中X係除麩醯胺酸以外之任一胺基酸)、較佳者係Q295N之抗體。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中結合劑肽或蛋白質係實質上缺乏N連接糖基化且在殘基297處包含天冬醯胺之抗體。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中結合劑肽或蛋白質係在宿主細胞中產生之抗體,該細胞產生在胺基酸殘基N297處缺乏N連接糖基化之抗體。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中結合劑肽或蛋白質係抗HER2抗體、抗EGFR抗體、抗TWEAKR抗體或其抗原結合性片段。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中抗TWEAKR抗體專一結合至TWEAKR(SEQ ID NO:169)之位置47胺基酸D(D47),較佳抗TWEAKR抗體TPP2090及其無糖基化變體。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中抗TWEAKR抗體專一結合至TWEAKR(SEQ ID NO:169)之位置47胺基酸D(D47),較佳抗TWEAKR抗體TPP-2090-HC-N297A或TPP-2090-HC-N297Q。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中連接體L連接至結合劑之麩醯胺酸側鏈,其中1至5個紡錘體驅動蛋白抑制劑連接至連接體L,其中連接體L具有下文基本結構(i)至(iv)中之一者:
(i)-(C=O)m-SG1-L1-L2-
(ii)-(C=O)m-L1-SG-L1-L2-
(iii)-(C=O)m-L1-L2-
(iv)-(C=O)m-L1-SG-L2
其中m係0或1,SG及SG1係活體內可裂解基團,L1彼此獨立地表示在活體內不可裂解之有機基團,且L2表示至結合劑之偶合基團。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中連接體L連接至結合劑之麩醯胺酸側鏈,其中1至5個紡錘體驅動蛋白抑制劑連接至連接體L,其中在活體內可裂解之基團SG係2-8寡肽基團,較佳二肽基團或二硫化物、腙、縮醛或胺縮醛,且SG1係2-8寡肽基團,較佳二肽基團。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中連接體連接至麩醯胺酸側鏈且具有下式:§-(C=O)m-L1-L2-§§
其中m係0或1;§表示至活性化合物分子之鍵且§§表示至結合劑肽或蛋白質之鍵,且L1表示-(NR10)n-(G1)o-G3-,其中R10表示-H、-H2或C1-C3-烷基;
G1 表示-NH-C(=O)-或;n係0或1;o為0或1;且G3 表示鍵或視情況經取代之直鏈或具支鏈烴鏈,該烴鏈具有來自伸芳基及/或直鏈及/或具支鏈及/或環狀伸烷基之1至100個碳原子
且其可由以下基團中之一或多者間雜一次或超過一次:-O-、-S-、-S(=O)-、-S(=O)2、-NH-、-C(=O)-、-NH-C(=O)-、-C(=O)-NH-、-NMe-、-NHNH-、-S(=O)2-NHNH-、-C(=O)-NHNH-及具有最多4個選自由N、O及S或-S(=O)-組成之群之雜原子之3員至10員芳香族或非芳
香族雜環(較佳或),其中包括側鏈(若存在)之該烴鏈可經以下各項取代:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、-NH-CN-NH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸。
或表示以下基團中之一者:
其中Rx表示-H、C1-C3-烷基或苯基。
L2 表示#1-(NH)p-(C=O)q-G4-NH-#2或#1-(NH)p-(C=O)q-G4-O-NH-#2其中p係0或1;q為0或1;且G4表示視情況經取代之烷基或雜烷基鏈,視情況其中該鏈之任一碳經以下各項取代:烷氧基、羥基、烷基羰基氧基、-S-烷基、硫醇、-C(=O)-S-烷基、-C(=O)-NH-烷基、-NH-C(=O)-烷基、胺、-C(=O)-NH2其中#1表示至基團L1之連接點,#2表示至結合劑之麩醯胺酸殘基之連接點,
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中烴鏈間雜有以下基團中之一者:
其中X表示-H或可視情況經以下取代之C1-10-烷基:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、-NH-CN-NH2、碸、亞碸或磺酸。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中L2係以下基團中之一者:L2係
其中Ry係-H、-C(=O)-NH-烷基、-NH-C(=O)-烷基、-C(=O)-NH2或-NH2。
其中#1表示至基團L1之連接點,#2表示至結合劑之麩醯胺酸殘基之連接點。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中Ry係H或NHCOMe
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中R1或R4表示-L-#1。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中抗
TWEAKR抗體係激動性抗體。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其包含:可變重鏈,其包含:a.由包含式PYPMX之胺基酸序列(SEQ ID NO:171)編碼之重鏈之CDR1,其中X係I或M;b.由包含式YISPSGGXTHYADSVKG之胺基酸序列(SEQ ID NO:172)編碼之重鏈之CDR2,其中X係S或K;及c.由包含式GGDTYFDYFDY之胺基酸序列(SEQ ID NO:173)編碼之重鏈之CDR3;及可變輕鏈,其包含:d.由包含式RASQSISXYLN之胺基酸序列(SEQ ID NO:174)編碼之輕鏈之CDR1,其中X係G或S;e.由包含式XASSLQS之胺基酸序列(SEQ ID NO:175)編碼之輕鏈之CDR2,其中X係Q、A或N;及f.由包含式QQSYXXPXIT之胺基酸序列(SEQ ID NO:176)編碼之輕鏈之CDR3,其中位置5之X係T或S,位置6處之X係T或S且位置8處之X係G或F。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其包含:a.如SEQ ID NO:10中所顯示之重鏈之可變序列亦及如SEQ ID NO:9中所顯示之輕鏈之可變序列,或b.如SEQ ID NO:20中所顯示之重鏈之可變序列亦及如SEQ ID NO:19中所顯示之輕鏈之可變序列,或c.如SEQ ID NO:30中所顯示之重鏈之可變序列亦及如SEQ ID NO:29中所顯示之輕鏈之可變序列,或d.如SEQ ID NO:40中所顯示之重鏈之可變序列亦及如SEQ ID NO:39中所顯示之輕鏈之可變序列,或
e.如SEQ ID NO:50中所顯示之重鏈之可變序列亦及如SEQ ID NO:49中所顯示之輕鏈之可變序列,或f.如SEQ ID NO:60中所顯示之重鏈之可變序列亦及如SEQ ID NO:59中所顯示之輕鏈之可變序列,或g.如SEQ ID NO:70中所顯示之重鏈之可變序列亦及如SEQ ID NO:69中所顯示之輕鏈之可變序列,或h.如SEQ ID NO:80中所顯示之重鏈之可變序列亦及如SEQ ID NO:79中所顯示之輕鏈之可變序列,或i.如SEQ ID NO:90中所顯示之重鏈之可變序列亦及如SEQ ID NO:89中所顯示之輕鏈之可變序列,或j.如SEQ ID NO:100中所顯示之重鏈之可變序列亦及如SEQ ID NO:99中所顯示之輕鏈之可變序列,或k.如SEQ ID NO:110中所顯示之重鏈之可變序列亦及如SEQ ID NO:109中所顯示之輕鏈之可變序列,或l.如SEQ ID NO:120中所顯示之重鏈之可變序列亦及如SEQ ID NO:119中所顯示之輕鏈之可變序列。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中抗體係IgG抗體。
本發明之另一實施例係製備如上文所定義之結合物之製程,其中下式中之一者之化合物較佳呈其三氟乙酸鹽形式,其係使用轉麩醯胺酸酶結合至結合劑肽或蛋白質之殘基,其中該化合物較佳以相對於結合劑肽或蛋白質2倍至100倍莫耳過量使用:
其中X1、X2、X3、SG、L1、R1具有與上文例如在式(IIa)中相同之含義,且Ry係-H、-C(=O)-NH-烷基、-NH-C(=O)-烷基、-C(=O)-NH2或-NH2。
其中X1、X2、X3、SG、L1、R1及Rx具有與上文所定義相同之含義。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物,其中結合劑肽或蛋白質表示抗體或下式之結合劑肽或蛋白質衍生物
本發明之另一實施例係醫藥組合物,其包含如上文所定義之結合物或如上文所定義之化合物與惰性無毒之醫藥上適宜之輔助物組合。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物或如上文所定義之化合物,其用於用以治療及/或預防疾病之方法中。
本發明之另一實施例係如上文所定義之結合物或如上文所定義之化合物,其用於用以治療過度增殖及/或血管生成病症之方法中。
本發明之另一實施例係使用有效量之至少一種如上文所定義之結合物或如上文所定義之化合物治療及/或預防人類及動物之過度增殖及/或血管生成病症之方法。
尤佳實施例係以下式中之一者之結合物,其中Ak3a、Ak3b、AD3d、Ak3e表示結合劑,較佳抗體,且n表示2至10,較佳2至4,且亦較佳2或4:
可使用本發明化合物用於治療高增殖性疾病(包括特別地癌症及腫瘤疾病之群)。在本發明之上下文中,該等疾病應理解為尤其意指(但不限於)以下疾病:乳癌及乳房腫瘤(乳癌包括管狀及小葉形式,亦原位)、呼吸道之腫瘤(小細胞及非小細胞癌、支氣管癌)、腦腫瘤(例
如腦幹之腫瘤及下丘腦之腫瘤、星細胞瘤、室管膜瘤、神經膠母細胞瘤、神經膠質瘤、髓母細胞瘤、腦脊髓膜瘤及神經外胚層瘤及松果體瘤)、消化器官之腫瘤(食道癌、胃癌、膽囊癌、小腸癌、大腸癌、直腸癌及肛門癌)、肝腫瘤(尤其肝細胞癌、膽道癌及混合型肝細胞膽道癌)、頭頸區之腫瘤(吼腫瘤、下嚥部腫瘤、鼻咽腫瘤、口咽腫瘤、唇部腫瘤及口腔癌、口腔黑色素瘤)、皮膚腫瘤(基底細胞瘤、棘肌細胞瘤(spinalioma)、鱗狀細胞癌、卡波西氏肉瘤(Kaposi's sarcoma)、惡性黑色素瘤、非黑色素瘤性皮膚癌、默克爾細胞皮膚癌(Merkel cell skin cancer)、肥胖細胞腫瘤)、軟組織之腫瘤(尤其軟組織肉瘤、骨肉瘤、惡性纖維性組織細胞瘤、軟骨肉瘤、纖維肉瘤、血管肉瘤、平滑肌肉瘤、脂肪肉瘤、淋巴肉瘤及橫紋肌肉瘤)、眼部腫瘤(尤其眼內黑色素瘤及視網膜母細胞瘤)、內分泌腺及外分泌腺之腫瘤(例如甲狀腺及副甲狀腺腫瘤、胰臟及唾液腺癌、腺癌)、尿路腫瘤(腫瘤膀胱腫瘤、陰莖腫瘤、腎腫瘤、腎骨盆腫瘤及輸尿管腫瘤)及生殖器官腫瘤(女性子宮內膜癌、子宮頸癌、卵巢癌、陰道癌、外陰癌及子宮癌及男性前列腺癌及睪丸癌)。該等亦包括呈實體形式及作為循環細胞之血液、淋巴系統及脊髓之增殖性血液疾病,例如白血病、淋巴瘤及骨髓增殖性疾病,例如急性骨髓樣、急性淋巴母細胞性、慢性淋巴球性、慢性骨髓性及毛細胞白血病及AIDS相關性淋巴瘤、霍奇金氏淋巴瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、皮膚T細胞淋巴瘤、伯基特氏淋巴瘤(Burkitt's lymphoma)及中樞神經系統之淋巴瘤。
人類中之該等經充分描述疾病亦可以相當之病因學在其他哺乳動物中發生且同樣可在其中利用本發明化合物進行治療。
利用本發明化合物治療上文所提及之癌症疾病包含治療實體腫瘤及治療其轉移形式或循環形式。
在本發明之上下文中,術語「治療(treatment或treat)」係以習用
意義使用且意指照料、照護及看護患者且旨在對抗、減輕、減弱或緩和疾病或健康異常,並改良由此疾病損害之生活條件,如在(例如)癌症之事件中。
本發明因此進一步提供本發明化合物用於治療及/或預防病症、特別地上文所提及病症之用途。
本發明進一步提供本發明化合物用於產生用以治療及/或預防病症、特別地上文所提及病症之藥劑的用途。
本發明進一步提供本發明化合物在用於治療及/或預防病症、特別地上文所提及病症之方法中的用途。
本發明進一步提供使用有效量之至少一種本發明化合物治療及/或預防病症、特別地上文所提及病症之方法。
本發明化合物可單獨使用或若需要與一或多種其他藥理學上具有活性之物質組合使用,前提係此組合不會導致不合意且不可接受之副作用。因此本發明此外提供含有本發明化合物中之至少一者及一或多種其他活性化合物之藥劑,特別地其用於治療及/或預防上文所提及病症。
舉例而言,本發明化合物可與已知之抗高增殖性、細胞生長抑制性或細胞毒性物質組合用於治療癌症疾病。適宜組合活性化合物之實例包括:131I-chTNT、阿巴瑞克(abarelix)、阿比特龍(abiraterone)、阿柔比星(aclarubicin)、阿多-曲妥珠單抗艾坦辛(ado-trastuzumab emtansine)、阿法替尼(afatinib)、阿柏西普(aflibercept)、阿地介白素(aldesleukin)、阿倫單抗、阿侖磷酸(Alendronic acid)、阿利維甲酸(alitretinoin)、六甲蜜胺(altretamine)、阿米福汀(amifostine)、胺魯米特(aminoglutethimide)、己基胺基乙醯丙酸(Hexyl aminolevulinate)、胺柔比星(amrubicin)、安吖啶(amsacrine)、阿那曲唑(anastrozole)、安
西司亭(ancestim)、茴香腦二硫雜環戊烯硫酮、血管收縮肽II、抗凝血酶III、阿瑞匹坦(aprepitant)、阿西莫單抗(arcitumomab)、阿格拉賓(arglabin)、三氧化二砷、天冬醯胺酶、阿西替尼(axitinib)、阿紮胞苷(azacitidine)、巴利昔單抗(basiliximab)、貝洛替康(belotecan)、苯達莫司汀(bendamustine)、貝林司他(belinostat)、貝伐珠單抗、貝沙羅汀(bexarotene)、比卡魯胺(bicalutamide)、比生群(bisantrene)、博來黴素(bleomycin)、硼替佐米(bortezomib)、布舍瑞林(buserelin)、伯舒替尼(bosutinib)、貝倫妥單抗維多汀(brentuximab vedotin)、白消安(busulfan)、卡巴他賽(cabazitaxel)、卡博替尼(cabozantinib)、亞葉酸鈣(calcium folinate)、左亞葉酸鈣(calcium levofolinate)、卡培他濱(capecitabine)、卡羅單抗(capromab)、卡鉑(carboplatin)、卡非佐米(carfilzomib)、卡莫氟(carmofur)、卡莫司汀(carmustine)、卡妥索單抗(catumaxomab)、塞來昔布(celecoxib)、西莫白介素(celmoleukin)、色瑞替尼(ceritinib)、西妥昔單抗(cetuximab)、氮芥苯丁酸(chlorambucil)、氯地孕酮(chlormadinone)、甲川氯(chlormethine)、西多福韋(cidofovir)、西那卡塞特(cinacalcet)、順鉑(cisplatin)、克拉屈濱(cladribine)、氯膦酸(clodronic acid)、氯法拉濱(clofarabine)、庫盤昔布(copanlisib)、克立他酶(crisantaspase)、環磷醯胺(cyclophosphamide)、環丙孕酮(cyproterone)、阿糖胞苷(cytarabine)、達卡巴嗪(dacarbazine)、放線菌素(dactinomycin)、阿法達貝泊汀(darbepoetin alfa)、達拉菲尼(dabrafenib)、達沙替尼(dasatinib)、道諾黴素(daunorubicin)、地西他濱(decitabine)、地加瑞克(degarelix)、地尼白介素2(denileukin diftitox)、地諾單抗(denosumab)、地普奧肽(depreotide)、地洛瑞林(deslorelin)、右雷佐生(dexrazoxane)、二溴螺氯銨(dibrospidium chloride)、環氧乳醇(dianhydrogalactitol)、雙氯芬酸(diclofenac)、歐洲紫杉醇(docetaxel)、多拉司瓊(dolasetron)、去氧
氟尿苷(doxifluridine)、多柔比星(doxorubicin)、多柔比星+雌酮(estrone)、屈大麻酚(dronabinol)、依庫珠單抗(eculizumab)、依決洛單抗(edrecolomab)、依利醋胺(elliptinium acetate)、艾曲波帕(eltrombopag)、內皮抑素、依諾他濱(enocitabine)、恩雜魯胺(enzalutamide)、泛艾黴素(epirubicin)、環硫雄醇(epitiostanol)、阿法依伯汀(epoetin alfa)、依伯汀β、依伯汀ζ、依他鉑(eptaplatin)、埃雷布林(eribulin)、厄洛替尼(erlotinib)、埃索美拉唑(esomeprazole)、雌二醇、雌氮芥、依託泊苷(etoposide)、依維莫司(everolimus)、依西美坦(exemestane)、法曲唑(fadrozole)、芬太尼(fentanyl)、非格司亭(filgrastim)、氟甲睪酮(fluoxymesterone)、氟尿苷、氟達拉濱(fludarabine)、氟尿嘧啶、氟他胺(flutamide)、亞葉酸、福美坦(formestane)、福沙吡坦(fosaprepitant)、福莫司汀(fotemustine)、氟維司群(fulvestrant)、氟甲睾酮(gadobutrol)、釓特醇(gadoteridol)、釓特酸葡甲胺(gadoteric acid meglumine)、釓弗塞胺(gadoversetamide)、釓塞酸(gadoxetic acid)、硝酸鎵、加尼瑞克(ganirelix)、吉非替尼(gefitinib)、吉西他濱(gemcitabine)、吉妥珠單抗、穀卡匹酶(Glucarpidase)、格魯西姆(glutoxim)、GM-CSF、戈舍瑞林(goserelin)、格拉司瓊(granisetron)、顆粒球群落刺激因子、二鹽酸組織胺、組胺瑞林(histrelin)、羥基脲、I-125晶粒、蘭索拉唑(lansoprazole)、伊班膦酸(ibandronic acid)、替伊莫單抗(ibritumomab tiuxetan)、依魯替尼(ibrutinib)、伊達比星(idarubicin)、異環磷醯胺(ifosfamide)、伊馬替尼(imatinib)、咪喹莫特(imiquimod)、英丙舒凡(improsulfan)、吲地司瓊(indisetron)、吲地司瓊(incadronic acid)、巨大戟醇甲基丁烯酸酯(ingenol mebutate)、干擾素α、干擾素β、干擾素γ、碘比醇(iobitridol)、碘苄胍(iobenguane)(123I)、碘美普爾(iomeprol)、伊匹單抗(ipilimumab)、伊立替康(irinotecan)、伊曲康唑
(Itraconazole)、伊沙匹隆(ixabepilone)、蘭瑞肽(lanreotide)、拉帕替尼(lapatinib)、Iaso膽鹼、雷利竇邁(lenalidomide)、來格司亭(lenograstim)、香菇多醣(lentinan)、來曲唑(letrozole)、亮丙瑞林(leuprorelin)、左旋咪唑(levamisole)、左炔諾孕酮(levonorgestrel)、左甲狀腺素鈉、利舒脲(lisuride)、洛鉑(lobaplatin)、洛莫司汀(lomustine)、氯尼達明(lonidamine)、馬索羅酚(masoprocol)、甲羥助孕酮、甲地孕酮、美拉腫醇(melarsoprol)、美法侖(melphalan)、美雄烷(mepitiostane)、巰嘌呤、美司鈉(mesna)、美沙酮(methadone)、胺甲喋呤(methotrexate)、甲氧沙林(methoxsalen)、甲基胺基乙醯丙酸酯、甲基普賴蘇濃(methylprednisolone)、甲基睪固酮、甲酪胺酸(metirosine)、米伐木肽(mifamurtide)、米替福新(miltefosine)、米鉑(miriplatin)、二溴甘露醇(mitobronitol)、米托胍腙(mitoguazone)、二溴衛矛醇(mitolactol)、絲裂黴素(mitomycin)、米托坦(mitotane)、米托蒽醌(mitoxantrone)、莫格利珠單抗(mogamulizumab)、莫拉司亭(molgramostim)、莫哌達醇(mopidamol)、鹽酸嗎啡(morphine hydrochloride)、硫酸嗎啡、大麻隆(nabilone)、那必西莫斯(nabiximols)、那法瑞林(nafarelin)、那若松(naloxone)+戊唑辛(pentazocine)、那曲酮(naltrexone)、那托司亭(nartograstim)、奈達鉑(nedaplatin)、奈拉濱(nelarabine)、奈立膦酸(neridronic acid)、尼沃魯單抗(nivolumab)、噴曲肽(pentetreotide)、尼羅替尼(nilotinib)、尼魯米特(nilutamide)、尼莫拉唑(nimorazole)、尼妥珠單抗、尼莫司汀(nimustine)、硝胺丙吖啶(nitracrine)、尼沃魯單抗、奧妥珠單抗(obinutuzumab)、奧曲肽(octreotide)、奧法木單抗(ofatumumab)、高三尖杉酯鹼(omacetaxine mepesuccinate)、奧美拉唑(omeprazole)、昂丹司瓊(ondansetron)、奧普瑞白介素(oprelvekin)、奧古蛋白(orgotein)、奧羅莫德(orilotimod)、奧沙利鉑(oxaliplatin)、羥考酮(oxycodone)、
羥甲烯龍(oxymetholone)、奧佐米星(ozogamicine)、p53基因療法、太平洋紫杉醇(paclitaxel)、帕利夫明(palifermin)、鈀-103晶粒、帕洛諾司瓊(palonosetron)、帕米磷酸(pamidronic acid)、帕尼單抗(panitumumab)、泮托拉唑(pantoprazole)、帕唑帕尼(pazopanib)、培門冬酶(pegaspargase)、PEG-依伯汀β(甲氧基PEG-依伯汀β)、派姆單抗(pembrolizumab)、聚乙二醇非格司亭(pegfilgrastim)、聚乙二醇干擾素α-2b、培美曲塞(pemetrexed)、戊唑辛(pentazocine)、噴司他汀(pentostatin)、培洛黴素(peplomycin)、全氟正丁烷、培磷醯胺(perfosfamide)、帕妥珠單抗、溶鏈菌製劑(picibanil)、毛果芸香鹼(pilocarpine)、吡柔比星(pirarubicin)、匹杉瓊(pixantrone)、普樂沙福(plerixafor)、普卡黴素(plicamycin)、聚胺葡醣(poliglusam)、聚磷酸雌二醇、聚乙烯基吡咯啶酮+玻尿酸鈉、多醣-K、泊馬度胺(pomalidomide)、普納替尼(ponatinib)、卟吩姆鈉(porfimer sodium)、普拉曲沙(pralatrexate)、潑尼莫司汀(prednimustine)、普賴松(prednisone)、丙卡巴肼(procarbazine)、丙考達唑(procodazole)、普萘洛爾(propranolol)、喹高利特(quinagolide)、雷貝拉唑(rabeprazole)、拉妥木單抗(racotumomab)、氯化鐳-223、拉多替尼(radotinib)、雷洛昔芬(raloxifene)、雷替曲塞(raltitrexed)、雷莫司瓊(ramosetron)、雷莫蘆單抗(ramucirumab)、雷莫司汀(ranimustine)、拉布立酶(rasburicase)、雷佐生(razoxane)、雷法替尼(refametinib)、瑞格菲尼(regorafenib)、利塞膦酸(risedronic acid)、依替膦酸錸-186(rhenium-186 etidronate)、利妥昔單抗、羅米地辛(romidepsin)、羅米司亭(romiplostim)、羅莫肽(romurtide)、洛尼西利布(roniciclib)、來昔決南釤(153sm)(samarium(153sm)lexidronam)、沙格司亭(sargramostim)、沙妥莫單抗(satumomab)、胰泌素、西普魯塞-T(sipuleucel-T)、西左非蘭(sizofiran)、索布佐生(sohuzoxane)、甘胺雙唑鈉(sodium
glycididazole)、索拉菲尼(sorafenib)、司坦唑醇(stanozolol)、鏈脲黴素(streptozocin)、舒尼替尼(sunitinib)、他拉泊芬(talaporfin)、他米巴羅汀(tamibarotene)、他莫昔芬(tamoxifen)、他噴他多(tapentadol)、他索那敏(tasonermin)、替西白介素(teceleukin)、鍀(99mTc)巰諾莫單抗(technetium(99mTc)nofetumomab merpentan)、99mTc-HYNIC-[Tyr3]-奧曲肽(99mTc-HYNIC-[Tyr3]-octreotide)、替加氟(tegafur)、替加氟+吉美嘧啶(gimeracil)+奧替拉西(oteracil)、替莫泊芬(temoporfin)、替莫唑胺(temozolomide)、替西羅莫司(temsirolimus)、替尼泊苷(teniposide)、睪固酮、替曲膦(tetrofosmin)、沙利竇邁(thalidomide)、噻替派(thiotepa)、胸腺法新(thymalfasin)、促甲狀腺素α、硫鳥嘌呤、托珠單抗(tocilizumab)、托泊替康(topotecan)、托瑞米芬(toremifene)、托西莫單抗(tositumomab)、曲貝替定(trabectedin)、曲馬朵(tramadol)、曲妥珠單抗、曲妥珠單抗艾坦辛、曲奧舒凡(treosulfan)、維甲酸、曲氟尿苷(trifluridine)+替比拉西(tipiracil)、曲洛司坦(trilostane)、曲普瑞林(triptorelin)、曲美替尼(trametinib)、曲磷胺(trofosfamide)、促血小板生成素、色胺酸、烏苯美司(ubenimex)、瓦拉替尼(valatinib)、戊柔比星(valrubicin)、凡德他尼(vandetanib)、伐普肽(vapreotide)、威羅菲尼(vemurafenib)、長春鹼(vinblastine)、長春新鹼(vincristine)、長春地辛(vindesine)、長春氟寧(vinflunine)、長春瑞濱(vinorelbine)、維莫德吉(vismodegib)、伏立諾他(vorinostat)、伏氯唑(vorozole)、釔-90玻璃微粒球、淨司他丁(zinostatin)、淨司他丁斯酯(zinostatin stimalamer)、唑來膦酸(zoledronic acid)、佐柔比星(zorubicin)。
另外,本發明化合物可與(例如)結合劑組合,該等結合劑例如可結合至以下靶標:OX-40、CD137/4-1BB、DR3、IDO1/IDO2、LAG-3、CD40。
另外,本發明化合物亦可與放射療法及/或手術干預組合使用。
通常,可使用本發明化合物與其他細胞生長抑制或細胞毒性活性劑之組合追求以下目的:●與使用個別活性化合物之治療相比,在減緩腫瘤生長、減小其大小或甚至完全消除其方面具有改良效能;●可能使用以低於在單一療法情形下之劑量使用之化學治療劑;●可能與個別投與相比達成更具耐受性療法且具有較少副作用;●可能治療較寬範圍之腫瘤疾病;●達成對療法之較高反應率;●與當前標準療法相比患者具有較長存活時間。
另外,本發明化合物亦可與放射療法及/或手術干預組合使用。
本發明進一步提供包含至少一種本發明化合物(通常)以及一或多種惰性、無毒、醫藥上適宜之賦形劑之藥劑及其用於上述目的之用途。
本發明化合物可全身及/或局部起作用。出於此目的,其可以適宜方式投與,例如以非經腸方式、可能以吸入方式或作為植入物或支架。
可以適用於該等投與途徑之投與形式投與本發明化合物。
非經腸投與可繞開吸收步驟(例如靜脈內、動脈內、經心臟內、脊柱內或腰內)或包括吸收(例如肌內、皮下、經皮內、經皮或腹膜腔內)。適於非經腸投與之投與形式包括呈溶液、懸浮液、乳液或凍乾物形式之注射及輸注用製劑。較佳者係非經腸投與,尤其靜脈內投與。
一般而言,已發現在非經腸投與之情形下投與約0.001mg/kg體
重至1mg/kg體重、較佳約0.01mg/kg體重至0.5mg/kg體重之量有利於達成有效結果。
然而,可能必須(若適當)偏離所述量,具體而言隨體重、投與途徑、對活性化合物之個別反應、製劑性質及投與時間或間隔而變化。因此,在一些情形下,小於上文所提及之最小量可能係足夠的,而在其他情形下,必須超過所提及之上限。在投與較大量之情形下,可適當的將其分成若干個別劑量並全天投與。
以下實例闡釋本發明。本發明並非限於該等實例。
除非另外陳述,否則以下測試及實例中之百分比係重量百分比;份數係重量份數。溶劑比、稀釋比及液/液溶液之濃度數據在每一情形下均係基於體積。
合成途徑:
針對工作實例之示範,以下方案顯示導致工作實例之實例性合成途徑:
其中n係2或4。
方案2
a.HATU,DIPEA,DMF,rt;b.CAN,緩衝液pH8,rt;c.HCl 4M,二噁烷,rt
方案3:麩醯胺酸連接ADC之合成
其中n係2或4。
[a):例如溴化苄基,Cs2CO3,DMF,RT;b)例如Pd(dppf)2Cl2,DMF,Na2CO3,85℃;c)例如LiAlH4,THF,0℃;MnO2,DCM,RT;d)例如Ti(iOPr)4,THF,RT;e)例如tBuLi,THF,-78℃;MeOH,NH4Cl;f)例如HCl/1,4-二噁烷]
方案5
a.HATU,DIPEA,DMF,rt;b)Pd/C 10%,MeOH;c)HATU,DIPEA,DMF,rt,d)Pd/C 10%,MeOH
方案6
[a):例如三乙醯氧基硼氫化鈉,乙酸,DCM,RT;b)例如乙醯氧基乙醯氯,NEt3,DCM,RT;c)例如LiOH,THF/水,RT;d)例如H2,Pd-C,EtOH,RT;e)例如Teoc-OSu,NEt3,二噁烷,RT;f)例如Fmoc-Cl,二異丙基乙胺,二噁烷/水2:1,RT]
方案7:
[a)HATU,DMF,二異丙基乙胺,RT;b)TFA,DCM,RT;c)HATU,DMF,二異丙基乙胺,RT;d)氯化鋅,三氟乙醇,50℃;e)H2,Pd/C,THF/水,RT]
方案8
[a)HATU,DMF,二異丙基乙胺,RT;b)H2,Pd/C,THF/水,RT;c)氯化鋅,三氟乙醇,50℃]
其中n係2或4。
方案10
[a)三乙醯氧基硼氫化鈉,乙酸,DCM,RT;b)乙醯氧基乙醯氯,三乙胺,DCM,RT;c)L-半胱胺酸,NaHCO3,DBU,異丙醇/水,RT;d)Boc-6-胺基己酸,HATU,DMF,二異丙基乙胺,RT;e)氯化鋅,三氟乙醇,50℃,EDTA.]
A. 實例
縮寫及首字母縮略詞:
胺基酸縮寫
Ala=丙胺酸
Arg=精胺酸
Asn=天冬醯胺
Asp=天冬胺酸
Cys=半胱胺酸
Glu=麩胺酸
Gln=麩醯胺酸
Gly=甘胺酸
His=組胺酸
Ile=異白胺酸
Leu=白胺酸
Lys=離胺酸
Met=甲硫胺酸
Nva=正纈胺酸
Phe=苯丙胺酸
Pro=脯胺酸
Ser=絲胺酸
Thr=蘇胺酸
Trp=色胺酸
Tyr=酪胺酸
Val=纈胺酸
在本發明之上下文中,若在反應之闡述中未給出溫度,則應總假定為室溫。
HPLC及LC-MS方法:
方法1(LC-MS):
儀器:Waters ACQUITY SQD UPLC系統;管柱:Waters Acquity UPLC HSS T3 1.8μ 50×1mm;移動相A:1 l水+0.25ml 99%濃度甲酸;移動相B:1 l乙腈+0.25ml 99%濃度甲酸;梯度:0.0min 90% A→1.2min 5% A→2.0min 5% A烘箱:50℃;流速:0.40ml/min;UV檢測:208-400nm。
方法2(LC-MS):
MS儀器類型:Waters Synapt G2S;UPLC儀器類型:Waters Acquity I-CLASS;管柱:Waters,BEH300,2.1×150mm,C18 1.7μm;移動相A:1 l水+0.01%甲酸;移動相B:1 l乙腈+0.01%甲酸;梯度:0.0min 2% B→1.5min 2% B→8.5min 95% B→10.0min 95% B;烘箱:50℃;流速:0.50ml/min;UV檢測:220nm
方法3(LC-MS):
MS儀器:Waters(Micromass)QM;HPLC儀器:Agilent 1100 series;管柱:Agilent ZORBAX Extend-C18 3.0×50mm 3.5微米;移動相A:1 l水+0.01mol碳酸銨,移動相B:1 l乙腈;梯度:0.0min 98% A→0.2min 98% A→3.0min 5% A→4.5min 5% A;烘箱:40℃;流速:1.75ml/min;UV檢測:210nm
方法4(LC-MS):
MS儀器類型:Waters Synapt G2S;UPLC儀器類型:Waters Acquity I-CLASS;管柱:Waters,HSST3,2.1×50mm,C18 1.8μm;移動相A:1 l水+0.01%甲酸;移動相B:1 l乙腈+0.01%甲酸;梯
度:0.0min 10% B→0.3min 10% B→1.7min 95% B→2.5min 95% B;烘箱:50℃;流速:1.20ml/min;UV檢測:210nm
方法5(LC-MS):
儀器:Waters ACQUITY SQD UPLC系統;管柱:Waters Acquity UPLC HSS T3 1.8μ 50×1mm;移動相A:1 l水+0.25ml 99%濃度甲酸;移動相B:1 l乙腈+0.25ml 99%濃度甲酸;梯度:0.0min 95% A→6.0min 5% A→7.5min 5% A烘箱:50℃;流速:0.35ml/min;UV檢測:210-400nm。
方法6(LC-MS):
儀器:Micromass Quattro Premier with Waters UPLC Acquity;管柱:Thermo Hypersil GOLD 1.9μ 50×1mm;移動相A:1 l水+0.5ml of 50%濃度甲酸;移動相B:1 l乙腈+0.5ml of 50%濃度甲酸;梯度:0.0min 97% A→0.5min 97% A→3.2min 5% A→4.0min 5% A;烘箱:50℃;流速:0.3ml/min;UV檢測:210nm。
方法7(LC-MS):
儀器:Agilent MS Quad 6150;HPLC:Agilent 1290;管柱:Waters Acquity UPLC HSS T3 1.8μ 50×2.1mm;移動相A:1 l水+0.25ml 99%濃度甲酸;移動相B:1 l乙腈+0.25ml 99%濃度甲酸;梯度:0.0min 90% A→0.3min 90% A→1.7min 5% A→3.0min 5% A;烘箱:50℃;流速:1.20ml/min;UV檢測:205-305nm。
方法8(LC-MS):
MS儀器類型:Waters Synapt G2S;UPLC儀器類型:Waters Acquity I-CLASS;管柱:Waters,HSST3,2.1×50mm,C18 1.8μm;移動相A:1 l水+0.01%甲酸;移動相B:1 l乙腈+0.01%甲酸;梯度:0.0min 2% B→2.0min 2% B→13.0min 90% B→15.0min
90% B;烘箱:50℃;流速:1.20ml/min;UV檢測:210nm
方法9:針對實例181-191之LC-MS-Prep純化方法(方法LIND-LC-MS-Prep)
MS儀器:Waters;HPLC儀器:Waters(管柱Waters X-Bridge C18,19mm×50mm,5μm,移動相A:水+0.05%氨,移動相B:乙腈(ULC)with梯度;流速:40ml/min;UV檢測:DAD;210-400nm)。
或:
MS儀器:Waters;HPLC儀器:Waters(管柱Phenomenex Luna 5μ C18(2)100A,AXIA Tech.50×21.2mm,移動相A:水+0.05%甲酸,移動相B:具有梯度之乙腈(ULC);流速:40ml/min;UV檢測:DAD;210-400nm)。
方法10:針對實例181-191之LC-MS分析方法(LIND_SQD_SB_AQ)
MS儀器:Waters SQD;HPLC儀器:Waters UPLC;管柱:Zorbax SB-Aq(Agilent),50mm×2.1mm,1.8μm;移動相A:水+0.025%甲酸,移動相B:乙腈(ULC)+0.025%甲酸;梯度:0.0min 98%A-0.9min 25%A-1.0min 5%A-1.4min 5%A-1.41min 98%A-1.5min 98%A;烘箱:40℃;流速:0.600ml/min;UV檢測:DAD;210nm。
方法11(HPLC):
儀器:HP1100系列
管柱:Merck Chromolith SpeedROD RP-18e,50-4.6mm,目錄號1.51450.0001,前置管柱Chromolith Guard Cartridge Kit,RP-18e,5-4.6mm,目錄號1.51470.0001
梯度:流速5ml/min注入體積5μL
溶劑A:HClO4(70%濃度)水溶液(4ml/l)溶劑B:乙腈開始20% B 0.50min 20% B 3.00min 90% B 3.50min 90% B 3.51min 20% B 4.00min 20% B管柱溫度:40℃
波長:210nm
其製備在下文未明確闡述之所有反應物或試劑皆商購自普遍可獲取之來源。對於製備同樣在下文未闡述且不可自市面獲得或獲自非普遍可獲取來源之所有其他反應物或試劑,參考闡述其製備之所出版文獻。
方法12(LC-MS):
儀器MS:Thermo Scientific FT-MS;儀器UHPLC+:Thermo Scientific UltiMate 3000;Säule:Waters,HSST3,2.1×75mm,C18 1.8μm;溶析液A:1 l水+0.01%甲酸;溶析液B:1 l乙腈+0.01%甲酸;梯度:0.0min 10% B→2.5min 95% B→3.5min 95% B;烘箱:50℃;流速:0.90ml/min;UV檢測:210nm/最佳積分路徑210-300nm
方法13:(LC-MS):
儀器MS:Waters(Micromass)Quattro Micro;儀器Waters UPLC Acquity;Säule:Waters BEH C18 1.7μ 50×2.1mm;溶析液A:1 l水+0.01mol甲酸銨,溶析液B:1 l乙腈;梯度:0.0min 95% A→0.1min 95% A→2.0min 15% A→2.5min 15% A→2.51min 10% A→
3.0min 10% A;烘箱:40℃;流速:0.5ml/min;UV檢測:210nm
起始材料及中間體:
中間體C1
三氟乙酸-(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-咪唑-2-基]-2,2-二甲基丙-1-胺(1:1)
該標題化合物係如WO2006/002326中所闡述來製備。
中間體C2
(2S)-4-({(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-咪唑-2-基]-2,2-二甲基丙基}胺基)-2-[(第三丁氧基羰基)胺基]丁酸第三丁基酯
將4.22g(14.5mmol)N-(第三丁氧基羰基)-L-高絲胺酸第三丁基酯溶解於180ml二氯甲烷中,且然後添加3.5ml吡啶及9.2g(21.7mmol)1,1,1-三乙醯氧基-1λ5,2-苯碘醯-3(1H)-酮。將反應在RT下攪拌1h且然後用500ml二氯甲烷稀釋,且用10%濃度硫代硫酸鈉溶液萃取兩次且然後兩次用5%濃度檸檬酸及兩次用10%濃度碳酸氫鈉溶液進行接續萃取。將有機相分開,經硫酸鎂乾燥且然後在減壓下乾燥。將殘
餘物吸收於乙醚中,並添加HCl(於乙醚中之溶液)。過濾出沈澱物且然後濃縮濾液並自乙腈/水凍乾。此得到3.7g(93%)(2S)-2-[(第三丁氧基羰基)胺基]-4-側氧基丁酸第三丁基酯,其未經進一步純化即用於下一步驟。(Rf:0.5(DCM/甲醇95/5)。
將3.5g(9.85mmol)中間體C1溶解於160ml DCM中,且添加3.13g(14.77mmol)三乙醯氧基硼氫化鈉及0.7ml乙酸。在RT下攪拌5min後,添加3.23g(11.85mmol)(2S)-2-[(第三丁氧基羰基)胺基]-4-側氧基丁酸第三丁基酯並將反應在RT下攪拌另一30min。然後在減壓下蒸發溶劑並將殘餘物吸收於乙腈/水中。過濾出沈澱物固體並乾燥,得到5.46g(84%)標題化合物。
HPLC(方法11):Rt=2.5min;
LC-MS(方法1):Rt=1.13min;MS(ESIpos):m/z=613(M+H)+。
中間體C3
(2S)-4-[(乙醯氧基乙醯基){(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-咪唑-2-基]-2,2-二甲基丙基}胺基]-2-[(第三丁氧基羰基)胺基]丁酸
將5.46g(8.24mmol)中間體C2溶解於160ml DCM中,且然後添加4.8ml三乙胺及2.2ml(20.6mmol)乙醯氧基乙醯氯。將反應物在RT下攪拌過夜且然後在減壓下濃縮。將殘餘物吸收於乙酸乙酯中並用飽
和碳酸氫鈉溶液萃取三次且然後用飽和氯化鈉溶液萃取。將有機相經硫酸鈉乾燥且然後濃縮。藉由在Biotage/Isolera(SNAP 340g)上使用移動相環己烷/乙酸乙酯2:1進行管柱層析來純化殘餘物。此得到4.57g(75%)醯化中間體。
LC-MS(方法1):Rt=1.49min;MS(ESIpos):m/z=713(M+H)+。
將1g(1.36mmol)此中間體溶解於20ml DCM中,並添加20ml TFA。在RT下攪拌5h後,濃縮混合物並用正戊烷將殘餘物研磨兩次。在每一情形下,倒掉正戊烷並在高真空下乾燥剩餘固體。此得到1.1g(2S)-4-[(乙醯氧基乙醯基){(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-咪唑-2-基]-2,2-二甲基丙基}胺基]-2-胺基丁酸/三氟乙酸(1:1)。LC-MS(方法1):Rt=0.93min;MS(ESIpos):m/z=557(M+H)+。
將0.91g(1.57mmol)此中間體溶解於70ml DCM中,並添加3.43g(15.7mmol)二碳酸二第三丁基酯及4.1ml N,N-二異丙基乙胺。在RT下攪拌30min後,用DCM稀釋反應物並用5%濃度檸檬酸萃取。將有機相經硫酸鈉乾燥並濃縮。用正戊烷將殘餘物研磨兩次且在每一情形下倒掉正戊烷。自乙腈/水1:1凍乾所剩固體,得到1.11g標題化合物。
HPLC(方法11):Rt=2.55min;
LC-MS(方法1):Rt=1.3min;MS(ESIpos):m/z=657(M+H)+。
中間體C4
(2S)-2-胺基-4-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-咪唑-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]丁酸/三氟乙酸(1:1)
將5.46g(8.24mmol)中間體C2溶解於160ml DCM中,並添加4.8ml三乙胺及2.2ml(20.6mmol)乙醯氧基乙醯氯。將反應物在RT下攪拌過夜且然後在減壓下濃縮。將殘餘物吸收於乙酸乙酯中並用飽和碳酸氫鈉溶液萃取三次且然後用飽和氯化鈉溶液萃取。將有機相經硫酸鈉乾燥且然後濃縮。藉由在Biotage/Isolera(SNAP 340g)上使用移動相環己烷/乙酸乙酯2:1進行管柱層析來純化殘餘物。此得到4.57g(75%)醯化中間體。
LC-MS(方法1):Rt=1.49min;MS(ESIpos):m/z=713(M+H)+。
將1.5g(2.035mmol)此中間體吸收於50ml乙醇中,且添加5.8ml 40%濃度甲胺水溶液。將反應物在50℃下攪拌4h且然後濃縮。將殘餘物吸收於DCM中並用水洗滌兩次。將有機相經硫酸鎂乾燥且然後濃縮。
在高真空下乾燥殘餘物。此得到1.235mg此中間體,其未經進一步純化進一步反應。
將1.235mg(1.5mmol)此中間體溶解於15ml DCM中,且添加15ml TFA。在RT下攪拌4h後,濃縮混合物。藉由製備型HPLC純化殘餘物。濃縮適當流份且自乙腈凍乾殘餘物。此得到1.04g(quant)標題化合物。
HPLC(方法11):Rt=1.9min;
LC-MS(方法1):Rt=0.89min;MS(ESIpos):m/z=515(M+H)+。
中間體C5
(2S)-4-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-咪唑-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]-2-[(第三丁氧基羰基)胺基]丁酸
將0.9g(1.24mmol)中間體C4溶解於60ml DCM中,且添加2.7g(12.5mmol)二碳酸二第三丁基酯及3.3ml N,N-二異丙基乙胺。在RT下攪拌45min後,濃縮反應物並將殘餘物吸收於乙醚中,且添加正戊烷直至混合物開始變渾濁為止。使反應冷卻至0℃且然後倒出。再一次,將正戊烷添加至殘餘物中並倒出混合物。自乙腈/水1:1凍乾所剩固體,得到0.95g(quant)標題化合物。
HPLC(方法11):Rt=2.5min;LC-MS(方法1):Rt=1.27min;MS(ESIpos):m/z=615(M+H)+。
中間體C52
(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙-1-胺
初始將10.00g(49.01mmol)4-溴-1H-吡咯-2-甲酸甲酯裝填於100.0ml DMF中,且添加20.76g(63.72mmol)碳酸銫及9.22g(53.91mmol)溴化苄基。在RT下將反應混合物攪拌過夜。將反應混合物分配於水與乙酸乙酯之間並用乙酸乙酯萃取水相。將合併之有機相經硫酸鎂乾燥且在減壓下蒸發溶劑。利用90.0g 4-溴-1H-吡咯-2-甲酸甲酯重複該反應。
藉由製備型RP-HPLC(管柱:Daiso 300×100;10μ,流速:250ml/min,MeCN/水)純化兩個合併之反應物。在減壓下蒸發溶劑並在高真空下乾燥殘餘物。此得到125.15g(理論之87%)化合物1-苄基-4-溴-1H-吡咯-2-甲酸甲酯。
LC-MS(方法1):Rt=1.18min;MS(ESIpos):m/z=295[M+H]+。
在氬下,初始將4.80g(16.32mmol)1-苄基-4-溴-1H-吡咯-2-甲酸甲酯裝填於DMF中,且添加3.61g(22.85mmol)(2,5-二氟苯基)酸、19.20ml飽和碳酸鈉溶液及1.33g(1.63mmol)[1,1'-雙(二苯基膦基)二茂鐵]-二氯鈀(II):二氯甲烷。將反應混合物於85℃下攪拌過夜。經由矽藻土(Celite)過濾反應混合物並用乙酸乙酯洗滌濾餅。用水萃取有機相且然後用飽和NaCl溶液洗滌。將有機相經硫酸鎂乾燥並在減壓下蒸發溶劑。在矽膠(移動相:環己烷/乙酸乙酯100:3)上純化殘餘物。在減壓下蒸發溶劑並在高真空下乾燥殘餘物。此得到3.60g(理論之67%)化合物1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-甲酸甲酯。
LC-MS(方法7):Rt=1.59min;MS(ESIpos):m/z=328[M+H]+。
初始將3.60g(11.00mmol)1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-甲酸甲酯裝填於90.0ml THF中,且在0℃下添加1.04g(27.50mmol)氫化鋰鋁(2.4M於THF中)。將反應混合物在0℃下攪拌30分鐘。在0℃下添加飽和酒石酸鉀鈉溶液,且將乙酸乙酯添加至反應混合物中。用飽和酒石酸鉀鈉溶液將有機相萃取三次。用飽和NaCl溶液將有機相洗滌一次並經硫酸鎂乾燥。在減壓下蒸發溶劑並將殘餘物溶解於30.0ml二氯甲烷中。添加3.38g(32.99mmol)氧化錳(IV)並將混合物在RT下攪拌48h。添加另外2.20g(21.47mmol)氧化錳(IV)並將混合物在RT下攪拌過夜。經由矽藻土過濾反應混合物並用二氯甲烷洗滌濾餅。在減壓下蒸發溶劑且殘餘物2.80g(1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-甲醛)未經進一步純化即用於合成之下一步驟中。
LC-MS(方法7):Rt=1.48min;MS(ESIpos):m/z=298[M+H]+。
初始將28.21g(94.88mmol)1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-甲醛連同23.00g(189.77mmol)(R)-2-甲基丙烷-2-亞磺醯胺一起裝填於403.0ml無水THF中,且添加7.42g(237.21mmol)異丙醇鈦(IV)並將混合物在RT下攪拌過夜。添加500.0ml飽和NaCl溶液及1000.0ml乙酸乙酯,並將混合物在RT下攪拌1h。藉助矽藻土過濾混合物並用飽和NaCl溶液將濾液洗滌兩次。將有機相經硫酸鎂乾燥,在減壓下蒸發溶劑並使用Biotage Isolera(矽膠,管柱1500+340g SNAP,流速200ml/min,乙酸乙酯/環己烷1:10)純化殘餘物。
LC-MS(方法7):Rt=1.63min;MS(ESIpos):m/z=401[M+H]+。
初始在氬下將25.00g(62.42mmol)(R)-N-{(E/Z)-[1-苄基-4-(2,5-
二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]亞甲基}-2-甲基丙烷-2-亞磺醯胺裝填於無水THF中並冷卻至-78℃。然後在-78℃下添加12.00g(187.27mmol)第三丁基鋰(於戊烷中之1.7M溶液)並將混合物在此溫度下攪拌3h。在-78℃下,然後連續添加71.4ml甲醇及214.3ml飽和氯化銨溶液,並使反應混合物升溫至RT並在RT下攪拌1h。用乙酸乙酯稀釋混合物並用水洗滌。將有機相經硫酸鎂乾燥並在減壓下蒸發溶劑。殘餘物(R)-N-{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}-2-甲基丙烷-2-亞磺醯胺未經進一步純化即用於合成之下一步驟中。
LC-MS(方法6):Rt=2.97min;MS(ESIpos):m/z=459[M+H]+。
初始將28.00g(61.05mmol)(R)-N-{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}-2-甲基丙烷-2-亞磺醯胺裝填於186.7ml 1,4-二噁烷中,且然後添加45.8ml HCl於1,4-二噁烷中之溶液(4.0M)。將所得反應混合物於RT下攪拌2h,且在減壓下蒸發溶劑。藉由製備型RP-HPLC(管柱:(管柱:Kinetix 100×30;流速:60ml/min,MeCN/水)純化殘餘物。在減壓下蒸發乙腈並將二氯甲烷添加至水性殘餘物中。用碳酸氫鈉溶液洗滌有機相並經硫酸鎂乾燥。在減壓下蒸發溶劑並在高真空下乾燥殘餘物。此得到16.2g(理論之75%)標題化合物。
LC-MS(方法6):Rt=2.10min;MS(ESIpos):m/z=338[M-NH2]+,709[2M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ[ppm]=0.87(s,9H),1.53(s,2H),3.59(s,1H),5.24(d,2H),6.56(s,1H),6.94(m,1H),7.10(d,2H),7.20(m,1H),7.26(m,2H),7.34(m,2H),7.46(m,1H)。
中間體C53
(2S)-4-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙
基}(乙醇醯基)胺基]-2-{[(9H-茀-9-基甲氧基)羰基]胺基}丁酸
首先,類似於C2利用(2S)-2-{[(苄基氧基)羰基]胺基}-4-側氧基丁酸苄基酯以還原方式烷基化中間體C52。然後用乙酸2-氯-2-側氧基乙酯醯化二級胺基且然後用於甲醇中之2M氫氧化鋰溶液水解兩個酯基團。將以此方式獲得之中間體溶解於乙醇中,添加碳載鈀(10%)並將混合物在標準壓力下在RT下利用氫氫化1h。將經去保護化合物吸收於二噁烷/水2:1中且在最後步驟中在N,N-二異丙基乙胺存在下使用氯碳酸9H-茀-9-基酯甲酯引入Fmoc保護基團。
LC-MS(方法1):Rt=1.37min;MS(ESIpos):m/z=734(M-H)-。
中間體C58
(2S)-4-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]-2-({[2-(三甲基矽基)乙氧基]羰基}胺基)丁酸
首先,類似於中間體C2用(2S)-2-{[(苄基氧基)羰基]胺基}-4-側氧基丁酸苄基酯以還原方式烷基化中間體C52。首先,類似於C2用(2S)-2-{[(苄基氧基)羰基]胺基}-4-側氧基丁酸苄基酯以還原方式烷基化中間體C52。然後如針對中間體C27所闡述用乙酸2-氯-2-側氧基乙酯醯化二級胺基,且然後用於甲醇中之2M氫氧化鋰溶液水解兩個酯基團。將以此方式獲得之中間體溶解於乙醇中,添加碳載鈀(10%)並在RT下在標準壓力下用氫將混合物氫化1h。
將500mg(0.886mmol)此完全去保護之中間體吸收於60ml二噁烷中,且添加253mg(0.975mmol)1-({[2-(三甲基矽基)乙氧基]羰基}氧基)吡咯啶-2,5-二酮及198μl三乙胺。在RT下攪拌24h後,濃縮反應物並藉由製備型HPLC純化殘餘物。合併適當流份,在減壓下濃縮並在高真空下乾燥,得到312mg(理論之50%)標題化合物。
LC-MS(方法5):Rt=4.61min;MS(ESIpos):m/z=658(M+H)-。
中間體C61
N-[(2S)-4-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]-2-({[2-(三甲基矽基)乙氧基]羰基}胺基)丁醯基]-β-丙胺酸
該標題化合物係藉由使60mg(0.091mmol)中間體C58與β-丙胺酸甲酯偶合、隨後利用2M氫氧化鋰溶液進行酯裂解來製備。經2個步驟此得到67mg(理論之61%)標題化合物。
LC-MS(方法1):Rt=1.29min;MS(ESIpos):m/z=729(M+H)+。
中間體C69
11-{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}-2,2-二甲基-6,12-二側氧基-5-氧雜-14-硫雜-7,11-二氮雜-2-矽雜十七烷-17-酸
初始將117.0mg(0.19mmol){3-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(氯乙醯基)胺基]丙基}胺基甲酸2-
(三甲基矽基)乙基酯(中間體C70)及21.6mg(0.20mmol)3-硫基丙酸裝填於3.0ml甲醇中,添加89.5mg(0.65mmol)碳酸鉀並將混合物在50℃下攪拌4h。用乙酸乙酯稀釋反應混合物並用水及飽和NaCl溶液洗滌有機相。將有機相經硫酸鎂乾燥,在減壓下蒸發溶劑並在高真空下乾燥殘餘物。該殘餘物未經進一步純化即用於合成之下一步驟中。此得到106.1mg(理論之73%)標題化合物。
LC-MS(方法1):Rt=1.42min;MS(ESIneg):m/z=700(M-H)-。
中間體C70
{3-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(氯乙醯基)胺基]丙基}胺基甲酸(2-(三甲基矽基)乙基酯
初始將990.0mg(2.79mmol)(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙-1-胺(中間體C52)裝填於15.0ml二氯甲烷中,且添加828.8mg(3.91mmol)三乙醯氧基硼氫化鈉及129.9mg(3.21mmol)乙酸,並將混合物在RT下攪拌5min。將698.1mg(3.21mmol)(3-側氧基丙基)胺基甲酸2-(三甲基矽基)乙基酯(中間體L15)溶解於所添加之15.0ml二氯甲烷中,並將反應混合物在RT下攪拌過夜。用乙酸乙酯稀釋反應混合物並在每一情形下用飽和碳酸鈉溶液及飽和NaCl溶液將有機相洗滌兩次。將有機相經硫酸鎂乾燥並在減壓下蒸發溶劑。使用矽膠(移動相:二氯甲烷/甲醇100:2)純化殘餘物。在
減壓下蒸發溶劑並在高真空下乾燥殘餘物。此得到1.25g(理論之73%)化合物[3-({(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}胺基)丙基]胺基甲酸2-(三甲基矽基)乙基酯。
LC-MS(方法1):Rt=1.09min;MS(ESIpos):m/z=556(M+H)+。
初始將908.1mg(1.63mmol)2-(三甲基矽基)乙基[3-({(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}胺基)丙基]胺基甲酸酯及545.6mg(5.39mmol)三乙胺裝填於10.0ml二氯甲烷中,且使混合物冷卻至0℃。在此溫度下,添加590.5mg(5.23mmol)氯乙醯氯並將混合物在RT下攪拌過夜。用乙酸乙酯稀釋反應混合物並在每一情形下用飽和碳酸氫鈉溶液及飽和氯化銨溶液將有機相洗滌三次。用飽和NaCl溶液洗滌有機相並將其經硫酸鎂乾燥。藉由製備型RP-HPLC(管柱:Reprosil 250×30;10μ,流速:50ml/min,MeCN/水,0.1% TFA)純化殘餘物。在減壓下蒸發溶劑並在高真空下乾燥殘餘物。此得到673.8mg(理論之65%)標題化合物。
LC-MS(方法1):Rt=1.53min;MS(ESIneg):m/z=676(M+HCOO-)-。
中間體C71
S-(11-{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}-2,2-二甲基-6,12-二側氧基-5-氧雜-7,11-二氮雜-2-矽雜十三烷-13-基)-L-半胱胺酸/三氟乙酸(1:1)
將536.6mg(4.43mmol)L-半胱胺酸連同531.5mg(6.33mmol)碳酸氫鈉一起懸浮於2.5ml水中。將400.0mg(0.63mmol){3-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(氯乙醯基)胺基]丙基}胺基甲酸2-(三甲基矽基)乙基酯(中間體C70)溶解於25.0ml異丙醇中並添加1.16g(7.59mmol)1,8-二氮雜二環[5.4.0]十一-7-烯。將反應混合物在50℃下攪拌1.5h。將乙酸乙酯添加至反應混合物中並用飽和碳酸氫鈉溶液反覆洗滌有機相且用飽和NaCl溶液洗滌一次。將有機相經硫酸鎂乾燥,在減壓下蒸發溶劑並在高真空下乾燥殘餘物。藉由製備型RP-HPLC(管柱:Reprosil 250×30;10μ,流速:50ml/min,MeCN/水,0.1% TFA)純化殘餘物。在減壓下蒸發溶劑並在高真空下乾燥殘餘物。此得到449.5mg(理論之86%)標題化合物。
LC-MS(方法1):Rt=1.20min;MS(ESIpos):m/z=717(M+H)+。
中間體C74
3-胺基-N-[(2S)-4-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]-2-({[2-(三甲基矽基)乙氧基]羰基}胺基)丁醯基]-D-丙胺酸2-(三甲基矽基)乙基酯三氟乙酸鹽(1:1)
將75mg(0.114mmol)中間體C58溶解於12.5ml DMF中在65mg(0.11mmol)HATU及79μL N,N-二異丙基乙胺存在下並使其與78mg(0.171mmol)中間體L6偶合。在經由製備型HPLC純化後,將殘餘物溶解於20mL乙醇中並在室溫下在大氣壓下在10% Pd/C存在下氫化1h。在過濾觸媒後,在減壓下蒸發溶劑。經製備型HPLC純化殘餘物並凍乾,以得到63mg(64%經2個步驟)標題化合物。
LC-MS(方法1):Rt=1.16min;MS(EIpos):m/z=844[M+H]+。
中間體C75
(2S)-4-[(乙醯氧基乙醯基){(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}胺基]-2-({[2-(三甲基矽基)乙氧基]羰基}胺基)丁酸甲酯
向4.3g(12.2mmol)中間體C52於525mL DCM中之溶液中添加3.63g(17.12mmol)三乙醯氧基硼氫化鈉及8.4mL乙酸。在將混合物在室溫下攪拌5min後,添加3.23g(11.85mmol)(2S)-4-側氧基-2-({[2-(三甲基矽基)乙氧基]羰基}胺基)丁酸甲基酯(使用古典方法自(3S)-3-胺基-4-甲氧基-4-側氧基丁酸製備)於175mL DCM中之溶液,並將反應混合物在室溫下攪拌45min。用DCM稀釋粗製混合物並用100ml飽和碳酸氫鈉溶液洗滌兩次且然後用鹽水洗滌。將有機層經硫酸鎂乾燥並蒸發。在製備型HPLC上純化殘餘物,以得到4.6g(61%)(2S)-4-({(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}胺基)-2-({[2-(三甲基矽基)乙氧基]羰基}胺基)丁酸甲酯。
LC-MS(方法12):Rt=1.97min;MS(ESIpos):m/z=614.32(M+H)+。
向200mg(0.33mmol)(2S)-4-({(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}胺基)-2-({[2-(三甲基矽基)乙氧基]羰基}胺基)丁酸甲酯於10mL DCM中之溶液中添加105μL三乙胺及77μL(0.717mmol)乙醯氧基乙醯氯。將反應混合物在室溫下攪拌過夜,用乙酸乙酯稀釋並用飽和碳酸氫鈉溶液洗滌兩次且然後用鹽水洗滌。
將有機層經硫酸鎂乾燥並蒸發,以得到213mg(75%)標題化合物。
LC-MS(方法1):Rt=1.46min;MS(ESIpos):m/z=714(M+H)+。
中間體C88
(3R)-3-[({(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}胺基)甲基]吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯三氟乙酸鹽(1:1)(立體異構物之混合物)
向2.04g(5.75mmol)(3R)-3-[({(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}胺基)甲基]吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯三氟乙酸鹽(1:1)(中間體C52)於51ml二氯甲烷中之溶液中添加1.71g(8.05mmol)三乙醯氧基硼氫化鈉及0.40g(6.61mmol)乙酸並將反應混合物在室溫下攪拌5min。然後添加1.32g(6.61mmol)3-甲醯基吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯於20ml二氯甲烷中之溶液並將混合物在室溫下攪拌過夜。然後添加乙酸乙酯並用飽和碳酸鈉溶液及鹽水洗滌有機相。將有機相經硫酸鎂乾燥,在減壓下蒸發溶劑並在高真空下乾燥殘餘物。該殘餘物未經進一步純化即用於合成之下一步驟中。此得到1.86g(理論之50%)標題化合物。
LC-MS(方法1):Rt=0.99min;MS(ESIpos):m/z=538(M+H-CF3CO2H)+。
中間體C89
(3R)-3-{[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(氯乙醯基)胺基]甲基}吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯
利用4Å分子篩向2.89g(4.19mmol,80%純度)(3R)-3-[({(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}胺基)甲基]吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯(中間體C88)於42ml二氯甲烷中之溶液中添加1.36g(13.42mmol)三乙胺及2.13g(18.87mmol)氯乙醯氯。將反應混合物在室溫下攪拌5h且然後蒸發溶劑。在製備型HPLC上純化殘餘物,以得到標題化合物之449mg(17% d.Th.)異構物1及442mg(17% d.Th)異構物2。
異構物1 LC-MS(方法1):Rt=2.74min;MS(ESIpos):m/z=614(M+H)+。
異構物2 LC-MS(方法1):Rt=2.78min;MS(ESIpos):m/z=614(M+H)+。
中間體C90
S-[2-({(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}{[(3R)-1-(第三丁氧基羰基)吡咯啶-3-基]甲基}胺基)-2-側氧基乙基]-L-半胱胺酸(異構物1)
向493mg(4.07mmol)L-半胱胺酸於2.3mL水中之溶液中添加489mg(5.82mmol)碳酸氫鈉,隨後357mg(0.58mmol)(3R)-3-{[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(氯乙醯基)胺基]甲基}吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯(中間體C89,異構物1)於23.0mL異丙醇及1.06g(6.98mmol)1,8-二氮雜二環(5.4.0)十一-7-烯中之溶液。將反應混合物於50℃下攪拌3h。然後添加乙酸乙酯並用飽和碳酸鈉溶液及鹽水洗滌有機相。將有機相經硫酸鎂乾燥,在減壓下蒸發溶劑並在高真空下乾燥殘餘物。該殘餘物未經進一步純化即用於合成之下一步驟中。此得到255mg(理論之62%)標題化合物。
LC-MS(方法1):Rt=1.09min;MS(ESIpos):m/z=699(M+H)+。
中間體C95
3-{[2-({(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙
基}{[(3R)-1-(第三丁氧基羰基)吡咯啶-3-基]甲基}胺基)-2-側氧基乙基]硫基}丙酸(異構物1)
向384.0mg(0.62mmol)(3R)-3-{[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(氯乙醯基)胺基]甲基}吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯(中間體C89,異構物1)及73.0mg(0.69mmol)3-硫基丙酸於14ml甲醇及一滴水中之混合物中添加302.5mg(2.19mmol)碳酸鉀。將反應混合物在50℃下攪拌2.5h。然後添加乙酸乙酯且然後用水及鹽水洗滌有機相,經硫酸鎂乾燥並在減壓下蒸發。在高真空下乾燥殘餘物且未經進一步純化即用於合成之下一步驟中。此獲得358.0mg(理論之84%)標題化合物。
LC-MS(方法1):Rt=1.33min;MS(ESIpos):m/z=684(M+H)+。
中間體C101
N-(3-胺基丙基)-N-{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}-2-羥基乙醯胺
初始將150.0mg(0.42mmol)(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙-1-胺(中間體C52)裝填於2.0ml二氯甲烷中,且添加29.2mg(0.49mmol)HOAc及125.6mg(0.59mmol)三乙醯氧基硼氫化鈉並將混合物在RT下攪拌5min。添加98.9mg(0.49mmol)3-(1,3-二側氧基-1,3-二氫-2H-異吲哚-2-基)丙醛。在RT下將反應混合物攪拌過夜。然後用乙酸乙酯稀釋反應混合物並用飽和碳酸鈉溶液將有機相洗滌兩次且用飽和NaCl溶液洗滌一次。在經硫酸鎂乾燥後,在減壓下蒸發溶劑並使用矽膠(移動相:二氯甲烷/甲醇100:1)純化殘餘物。在減壓下蒸發溶劑並在高真空下乾燥殘餘物。此得到188.6mg(74%)化合物2-[3-({(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}胺基)丙基]-1H-異吲哚-1,3(2H)-二酮。
LC-MS(方法1):Rt=1.00min;MS(ESIpos):m/z=541[M+H]+。
初始將171.2mg(0.32mmol)2-[3-({(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}胺基)丙基]-1H-異吲哚-1,3(2H)-二酮裝填於5.0ml二氯甲烷中,且添加73.6mg(0.73mmol)三乙胺。在0℃下添加94.9mg(0.70mmol)乙醯氧基乙醯氯,並將反應混合物在RT下攪拌過夜。用乙酸乙酯稀釋反應混合物並用飽和碳酸氫鈉溶液將有機相洗滌兩次且用飽和NaCl溶液洗滌一次。在經硫酸鎂乾燥後,在減壓下蒸發溶劑並使用Biotage Isolera(矽膠,管柱10g SNAP,流速12
ml/min,乙酸乙酯/環己烷1:3)純化殘餘物。在減壓下蒸發溶劑並在高真空下乾燥殘餘物。此得到159.0mg(77%)化合物乙酸2-({(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}[3-(1,3-二側氧基-1,3-二氫-2H-異吲哚-2-基)丙基]胺基)-2-側氧基乙酯。
LC-MS(方法1):Rt=1.35min;MS(ESIpos):m/z=642[M+H]+。
初始將147.2mg(0.23mmol)乙酸2-({(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}[3-(1,3-二側氧基-1,3-二氫-2H-異吲哚-2-基)丙基]胺基)-2-側氧基乙酯裝填於4.0ml乙醇中,並添加356.2mg(4.59mmol)甲胺(40%水溶液)。將反應混合物於50℃下攪拌過夜。在減壓下蒸發溶劑,且將殘餘物與甲苯一起共蒸餾三次。使用矽膠(移動相:二氯甲烷/甲醇10:1)純化殘餘物。在減壓下蒸發溶劑並在高真空下乾燥殘餘物。此得到67.4mg(63%)標題化合物。
LC-MS(方法1):Rt=0.91min;MS(ESIpos):m/z=470[M+H]+。
中間體C102
{(2S)-4-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-咪唑-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]-1-[(2-{[(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙醯基]胺基}乙基)胺基]-1-側氧基丁-2-基}胺基甲酸第三丁基酯
將20.0mg(32.54μmol)(2S)-4-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-咪唑-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]-2-[(第三丁氧基羰基)胺基]丁酸(中間體C5)、10.1mg(32.54μmol)N-(2-胺基乙基)-2-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙醯胺三氟乙酸鹽(1:1)(中間體L1)及18.6mg(48.81μmol)HATU溶解於2.5ml DMF中。添加16.8mg(23μl,130.15μmol)N,N-二異丙基乙胺並將混合物在室溫下攪拌1h。經由製備型HPLC(溶析液:乙腈/水+0.1% TFA,梯度35:65→95:5)直接純化混合物,隨後冷凍乾燥,以得到15mg(58%)靶標化合物。
LC-MS(方法1):Rt=1.23min;MS(EIpos):m/z=794[M+H]+。
中間體C103
[(2S)-4-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-咪唑-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]-1-({2-[({3-[(2,2-二甲基-4,12-二側氧基-3,15,18,21,24-五氧雜-5,11-二氮雜二十六烷-26-基)硫基]-2,5-二側氧基吡咯啶-1-基}乙醯基)胺基]乙基}胺基)-1-側氧基丁-2-基]胺基甲酸第三丁基酯
將15mg(18.90μmol){(2S)-4-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-咪唑-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]-1-[(2-{[(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙醯基]胺基}乙基)胺基]-1-側氧基丁-2-基}胺基甲酸第三丁基酯(中間體C102)溶解於500μl乙腈中。將溶解於275μl磷酸鹽緩衝鹽水(pH=7)中之12.3mg(26.45μmol)(7-側氧基-21-硫基-10,13,16,19-四氧雜-6-氮雜二十一烷-1-基)胺基甲酸第三丁基酯(中間體L2)添加至混合物中。藉由添加數滴1N氫氧化鈉溶液將溶液之pH調節至pH=8。在室溫下將混合物攪拌30min。經由製備型HPLC(溶析液:乙腈/水+0.1% TFA,梯度35:65→95:5)純化混合物隨後冷凍乾燥,以得到20mg(84%)靶標化合物。
LC-MS(方法1):Rt=1.26min;MS(EIpos):m/z=1261[M+H]+。
中間體C104
(2S)-4-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]-2-{[(苄基氧基)羰基]胺基}丁酸
類似於中間體C2用苄基-(2S)-2-{[(苄基氧基)羰基]胺基}-4-側氧基丁酸以還原方式烷基化酯中間體C52。隨後,用乙酸2-氯-2-側氧基乙酯醯化二級胺基。在最後步驟中,使用於甲醇中之2M氫氧化鋰溶液裂解兩個酯基團。
LC-MS(方法1):Rt=1.31min;MS(ESIpos):m/z=646(M-H)-。
中間體C105
N-{(2S)-2-胺基-4-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]丁醯基}-β-丙胺酸苄基酯三氟乙酸鹽(1:1)
在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下使200mg中間體C58與於DMF中之β-丙胺酸苄基酯偶合,且隨後在加熱40min至50℃下使用4當量於2,2,2三氟乙醇中之氯化鋅裂解Teoc-保護基團。在添加4當量
EDTA之後,藉由HPLC純化產物。
LC-MS(方法12):Rt=1.7min;MS(ESIpos):m/z=675(M+H)+。
中間體C106
N-[2-({(2S)-2-胺基-4-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]丁醯基}胺基)乙基]-N2-{[2-(三甲基矽基)乙氧基]羰基}-L-麩胺酸2-(三甲基矽基)乙基酯
使151mg(0.23mmol)中間體C104與128mg(0.234mmol)中間體L9在DMF中在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下偶合。隨後,藉由在10%鈀/活性木炭上在正常壓力下氫化來裂解Z-保護基團。
產率:理論之30%,經2個步驟
LC-MS(方法1):Rt=1.14min;MS(ESIpos):m/z=929(M+H)+。
中間體C108
N6-(N-{(2S)-2-胺基-4-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]丁醯基}-β-丙胺醯基)-N2-{[2-(三甲基矽基)乙氧基]羰基}-L-離胺酸2-(三甲基矽基)乙基酯
使103mg(0.16mmol)中間體C104與110mg(0.175mmol)N6-β-丙胺醯基-N2-{[2-(三甲基矽基)乙氧基]羰基}-L-離胺酸2-(三甲基矽基)乙基酯(中間體L11)在DMF中在EDC、HOBT及N,N-二異丙基乙胺存在下偶合。隨後,藉由在正常壓力下在10%鈀/活性木炭上在DCM-甲醇1:1中氫化來裂解Z-保護基團。獲得標題化合物,產量為113mg(75%,經2個步驟)。
LC-MS(方法1):Rt=1.17min;MS(ESIpos):m/z=957(M+H)+。
中間體C109
N-{(2S)-2-胺基-4-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]丁醯基}-β-丙胺醯基-L-麩胺酸二苄基酯
藉由以下獲得標題化合物:使中間體C61與L-麩胺酸二苄基酯在DMF中在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下偶合,及隨後在加熱1h至50℃下在三氟乙醇中使用10當量於2,2,2三氟乙醇中之氯化鋅去除Teoc保護基團。
LC-MS(方法1):Rt=1.09min;MS(ESIpos):m/z=894(M+H)+。
中間體C110
N2-乙醯基-N-[2-({(2S)-2-胺基-4-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]丁醯基}胺基)乙基]-N6-(第三丁氧基羰基)-L-離胺醯胺
該標題化合物係藉由以下獲得:使中間體C104與中間體L13在DMF中在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下偶合,及隨後藉由在正常壓力下在10%鈀/活性木炭上在DCM-甲醇1:1中氫化來去除Z保護。
LC-MS(方法1):Rt=0.96min;MS(ESIpos):m/z=826(M+H)+。
中間體C111
(3R,4R)-3-[({(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}胺基)甲基]-4-氟吡咯啶-1-甲酸2-(三甲基矽基)乙基酯三氟乙酸鹽(1:1)
利用4Å分子篩向(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙-1-胺(108mg,304μmol)(中間體C52)於56.0ml DCM中之溶液中添加三乙醯氧基硼氫化鈉(90.2mg,426μmol)。將混合物在RT下攪拌15min且然後添加(3R,4S)-3-氟-4-甲醯基吡咯啶-1-甲酸2-(三甲基矽基)乙基酯(97.3mg,98%純度,365μmol)(參考:WO 2014/151030A1)。將反應混合物在RT下攪拌3.5h且然後用DCM稀釋。用飽和碳酸氫鈉及水洗滌有機層。然後將有機層經硫酸鈉乾燥並蒸發。藉由製備型RP-HPLC純化殘餘物,以得到1.39g(理論之24%)標題化合物。
LC-MS(方法1):Rt=1.15min;MS(ESIpos):m/z=600(M+H)+。
中間體C112
(3R,4R)-3-{[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(氯乙醯基)胺基]甲基}-4-氟吡咯啶-1-甲酸2-(三甲基矽基)乙基酯
利用4Å分子篩向692.8mg(0.88mmol)(3R,4R)-3-[({(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}胺基)甲基]-4-氟吡咯啶-1-甲酸2-(三甲基矽基)乙基酯三氟乙酸鹽(1:1)(中間體C111)於8.7ml DCM中之溶液中添加295.0mg(2.91mmol)三乙胺及418.9mg(3.71mmol)氯乙醯氯。將反應混合物於RT下攪拌2.5h且然後用DCM稀釋。用飽和碳酸氫鈉及飽和氯化銨洗滌有機層。然後將有機層經硫酸鈉乾燥並蒸發。在8.7ml DCM中稀釋殘餘物並添加4Å分子篩、295.0mg(2.91mmol)三乙胺及418.9mg(3.71mmol)氯乙醯氯。將反應混合物於RT下攪拌3h且然後用DCM稀釋。用飽和碳酸氫鈉及飽和氯化銨洗滌有機層。然後將有機層乾燥經硫酸鈉並蒸發,以得到691mg(74%理論之)標題化合物,其未經進一步純化即用於下一步驟中。
LC-MS(方法1):Rt=1.78min;MS(ESIpos):m/z=676(M+H)+。
中間體C113
S-[2-({(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}{[(3R,4R)-4-氟-1-{[2-(三甲基矽基)乙氧基]羰基}吡咯啶-3-基]甲基}胺基)-2-側氧基乙基]-L-半胱胺酸
向203.6mg(1.68mmol)L-半胱胺酸及201.7mg(2.40mmol)碳酸氫鈉於0.95mL水中之懸浮液中添加170.0mg(0.24mmol)(3R,4R)-3-{[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(氯乙醯基)胺基]甲基}-4-氟吡咯啶-1-甲酸2-(三甲基矽基)乙基酯(中間體C112)於9.5mL異丙醇中之溶液及438.5mg(2.40mmol)1,8-二氮雜二環(5.4.0)十一-7-烯。將反應混合物在50℃下攪拌3h。然後用乙酸乙酯稀釋反應混合物並用飽和碳酸氫鈉及鹽水洗滌有機層。然後將有機層經硫酸鈉乾燥並蒸發溶劑,以得到152mg(83%理論之)標題化合物,其未經進一步純化即用於下一步驟中。
LC-MS(方法1):Rt=1.26min;MS(ESIpos):m/z=762(M+H)+。
中間體L1
三氟乙酸/N-(2-胺基乙基)-2-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙醯胺(1:1)
該標題化合物係藉由肽化學之古典方法自市售(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙酸及(2-胺基乙基)胺基甲酸第三丁基酯開始來製備。
HPLC(方法11):Rt=0.19min;LC-MS(方法1):Rt=0.17min;MS(ESIpos):m/z=198(M+H)+。
中間體L2
(7-側氧基-21-硫基-10,13,16,19-四氧雜-6-氮雜二十一烷-1-基)胺基甲酸第三丁基酯
將356mg(1.757mmol)(5-胺基戊基)胺基甲酸第三丁基酯、496mg(1.757mmol)1-硫基-3,6,9,12-四氧雜十五烷-15-酸及801mg(2.108mmol)HATU溶解於5.95ml DMF中。利用冰浴冷卻反應混合物並添加681mg(920μl,5.272mmol)N,N-二異丙基乙胺。將混合物在室溫下攪拌4h且在冰箱中在4℃下儲存過夜。經由製備型HPLC(溶析液:乙腈/水+0.1% TFA,梯度20:80→80:20)直接純化混合物,隨後冷凍乾燥,以得到255mg(29%)靶標化合物。
LC-MS(方法1):Rt=0.87min;MS(EIpos):m/z=467[M+H]+。
中間體L3
N2-乙醯基-N6-[(苄基氧基)羰基]-L-離胺酸
此中間體係藉由使氯甲酸苄基酯與N2-乙醯基-L-離胺酸反應獲得。
LC-MS(方法1):Rt=0.71min;MS(ESIpos):m/z=323(M+H)+。
中間體L4
N2-乙醯基-N6-{[2-(三甲基矽基)乙氧基]羰基}-L-離胺酸
此中間體係藉由使1-({[2-(三甲基矽基)乙氧基]羰基}氧基)吡咯啶-2,5-二酮與N2-乙醯基-L-離胺酸反應獲得。
LC-MS(方法1):Rt=0.87min;MS(ESIpos):m/z=333(M+H)+。
中間體L5
{(5S)-5-乙醯胺基-6-[(2-胺基乙基)胺基]-6-側氧基己基}胺基甲酸9H-茀-9-基甲基酯三氟乙酸鹽(1:1)
此中間體係藉由使市售N2-乙醯基-N6-[(9H-茀-9-基甲氧基)羰基]-L-離胺酸與(2-胺基乙基)胺基甲酸第三丁基酯反應且隨後利用三氟乙酸去除Boc基團獲得。
LC-MS(方法13):Rt=0.87min;MS(ESIpos):m/z=453(M+H)+。
中間體L6
3-{[(苄基氧基)羰基]胺基}-D-丙胺酸2-(三甲基矽基)乙基酯三氟乙酸鹽(1:1)
該標題化合物係使用古典肽化學方法自3-{[(苄基氧基)羰基]胺基}-N-(第三丁氧基羰基)-D-丙胺酸開始來製備。使用EDC/DMAP利用2-(三甲基矽基)乙醇進行酯化,隨後藉由TFA對Boc基團實施去保護,得到405mg(58%,經2個步驟)標題化合物。
LC-MS(方法1):Rt=0.75min;MS(ESIpos):m/z=339(M+H)+。
中間體L7
N2-乙醯基-N6-[(苄基氧基)羰基]-L-離胺醯基-L-丙胺醯基-L-丙胺醯基-
L-天冬醯胺
以使N-[(苄基氧基)羰基]-L-丙胺醯基-L-丙胺酸及L-天冬醯胺第三丁基酯於DMF中在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下偶合開始且隨後去除Z-保護基團藉由在甲醇中利用活性木炭載10%鈀氫化,合成標題化合物。然後在DMF中在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下且在最後步驟中使所獲得中間體與中間體L3偶合,利用於DCM中之三氟乙酸裂解第三丁基酯基團。
LC-MS(方法1):Rt=0.59min;MS(ESIpos):m/z=579(M+H)+。
中間體L8
N2-乙醯基-N6-{[2-(三甲基矽基)乙氧基]羰基}-L-離胺醯基-L-丙胺醯基-L-丙胺醯基-L-天冬醯胺
以使N-[(苄基氧基)羰基]-L-丙胺醯基-L-丙胺酸及L-天冬醯胺第三丁基酯在DMF中在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下偶合開始,且隨後藉由在正常壓力下在甲醇中在10%鈀/活性木炭上氫化來去除Z-保護基團,合成標題化合物。然後使所獲得中間體與中間體L4在DMF中在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下偶合,且隨後在攪拌1h下在於
DCM中之7.5%三氟乙酸中去除兩個保護基團。在最後步驟中,在N,N-二異丙基乙胺存在下在DMF中使用1-({[2-(三甲基矽基)乙氧基]羰基}氧基)吡咯啶-2,5-二酮再次保護胺基。
LC-MS(方法1):Rt=0.71min;MS(ESIpos):m/z=589(M+H)+。
中間體L9
2,2-二甲基丙酸--N-(2-胺基乙基)-N2-{[2-(三甲基矽基)乙氧基]羰基}-L-麩胺酸2-(三甲基矽基)乙酯(1:1)
首先,使(4S)-5-第三丁氧基-4-[(第三丁氧基羰基)胺基]-5-側氧基戊酸與(2-胺基乙基)胺基甲酸苄基酯在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下偶合。隨後,使用三氟乙酸裂解Boc基團及第三丁基酯基團。然後,首先藉由與三甲基矽基)乙氧基]羰基}氧基)吡咯啶-2,5-二酮在DMF/水中在N,N-二異丙基乙胺存在下反應再次保護胺基且然後使用EDC/DMAP在DCM中利用2-(三甲基矽基)乙醇酯化羧基。在最後步驟中,藉由在正常壓力下在10%鈀/活性木炭上氫化來去除Z保護基團且獲得該標題化合物並藉由HPLC純化。
LC-MS(方法1):Rt=0.82min;MS(ESIpos):m/z=434(M+H)+。
中間體L10
N-[(苄基氧基)羰基]-L-丙胺醯基-L-丙胺醯基-L-天冬醯胺第三丁基酯
該標題化合物係藉由以下獲得:使N-[(苄基氧基)羰基]-L-丙胺醯基-L-丙胺酸與L-天冬醯胺第三丁基酯在DMF中在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下偶合且隨後藉由於DCM中之三氟乙酸去除第三丁基酯基團。
LC-MS(方法1):Rt=0.5min;MS(ESIpos):m/z=409(M+H)+。
中間體L11
N6-β-丙胺醯基-N2-{[2-(三甲基矽基)乙氧基]羰基}-L-離胺酸2-(三甲基矽基)乙酯
該標題化合物係如下來合成:利用肽化學之古典方法以使N-(第三丁氧基羰基)-β-丙胺酸與2-(三甲基矽基)乙基N2-[(苄基氧基)羰基]-L-離胺酸酯在HATU及N,N-二異丙基乙胺下偶合開始,藉由在正常壓力下在10%鈀/活性木炭上氫化來去除Z保護基團,利用1-({[2-(三甲基矽基)乙氧基]羰基}氧基)吡咯啶-2,5-二酮引入三甲基矽基-乙基氧基羰基(Teoc)-保護基團,且最後藉由在三氟乙酸於二氯甲烷中之7.5%溶液中攪拌45分鐘適度去除Boc保護基團。
LC-MS(方法1):Rt=0.83min;MS(ESIpos):m/z=462(M+H)。
中間體L12
(2S)-5-({(5S)-5-乙醯胺基-6-[(2-胺基乙基)胺基]-6-側氧基己基}胺基)-2-{[(苄基氧基)羰基]胺基}-5-側氧基戊酸苄基酯三氟乙酸鹽(1:1)
該標題化合物係如下來合成:利用肽化學之古典方法以使(2-胺基乙基)胺基甲酸第三丁基酯與中間體L3在HATU及N,N-二異丙基乙胺下偶合開始,藉由在正常壓力下在DCM/甲醇1:1中在10%鈀/活性木炭上氫化來去除Z-保護基團,使所獲得中間體與(4S)-5-(苄基氧基)-4-{[(苄基氧基)羰基]胺基}-5-側氧基戊酸在HATU及N,N-二異丙基乙胺下偶合,且最後藉由在三氟乙酸於二氯甲烷中之25%溶液中攪拌1h去除Boc保護基團。
LC-MS(方法1):Rt=0.66min;MS(ESIpos):m/z=584(M+H)+。
中間體L13
(2S)-5-({(5S)-5-乙醯胺基-6-[(2-胺基乙基)胺基]-6-側氧基己基}胺基)-2-{[(苄基氧基)羰基]胺基}-5-側氧基戊酸苄基酯三氟乙酸鹽(1:1)
該標題化合物係如下來合成:利用肽化學之古典方法以使N2-乙醯基-N6-(第三丁氧基羰基)-L-離胺酸與(2-胺基乙基)胺基甲酸苄基酯鹽酸鹽(1:1)在HATU及N,N-二異丙基乙胺下偶合開始,且隨後藉由在正常壓力下在DCM/甲醇1:1中在10%鈀/活性木炭上氫化來去除Z保護基團。
LC-MS(方法1):Rt=0.43min;MS(ESIpos):m/z=331(M+H)+。
中間體L14
N-(吡啶-4-基乙醯基)-L-丙胺醯基-L-丙胺醯基-L-天冬醯胺三氟乙酸鹽(1:1)
該標題化合物係如下來合成:應用肽化學之古典方法以使吡啶-4-基乙酸鹽酸鹽(1:1)與市售L-丙胺醯基-L-丙胺酸第三丁基酯鹽酸鹽(1:1)在HATU及N,N-二異丙基乙胺下偶合開始,且隨後利用於DCM中之三氟乙酸去除第三丁基酯。使所獲得中間體與L-天冬醯胺第三丁基酯在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下偶合且最後利用於DCM中之三氟乙酸裂解第三丁基酯。
LC-MS(方法1):Rt=0.15min;MS(ESIpos):m/z=394(M+H)+。
中間體L15
(3-側氧基丙基)胺基甲酸2-(三甲基矽基)乙基酯
將434.4mg(5.78mmol)3-胺基-1-丙醇及1.50g(5.78mmol)2,5-二側氧基吡咯啶-1-甲酸2-(三甲基矽基)乙基酯溶解於10.0ml二氯甲烷中,添加585.3mg(5.78mmol)三乙胺並將混合物在RT下攪拌過夜。用二氯甲烷稀釋反應混合物並用水及飽和碳酸氫鈉溶液洗滌有機相且然後經硫酸鎂乾燥。在減壓下蒸發溶劑。在高真空下乾燥殘餘物2-(三甲基矽基)乙基(3-羥基丙基)胺基甲酸酯(996.4mg,理論之79%)且其未經進一步純化即用於合成之下一步驟中。
初始將807.0mg(3.68mmol)(3-羥基丙基)胺基甲酸2-(三甲基矽基)乙基酯裝填於15.0ml氯仿及15.0ml 0.05N碳酸鉀/0.05N碳酸氫鈉溶液(1:1)中。然後添加102.2mg(0.37mmol)四-正丁基氯化銨、736.9mg(5.52mmol)N-氯琥珀醯亞胺及57.5mg(0.37mmol)TEMPO並將反應混合物在RT下劇烈攪拌過夜。用二氯甲烷稀釋反應混合物並用水及飽和NaCl溶液洗滌有機相。將有機相經硫酸鎂乾燥並在減壓下蒸發溶劑。在高真空下乾燥殘餘物且其未經進一步純化即用於合成之下一步驟中(890.3mg)。
中間體L16
2,2-二甲基-4,11-二側氧基-3,15,18,21,24-五氧雜-5,12-二氮雜二十七烷-27-酸
該標題化合物係藉由以下獲得:使1-胺基-3,6,9,12-四氧雜十五烷-15-酸甲酯與6-[(第三丁氧基羰基)胺基]己酸在DMF中在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下偶合,且隨後在室溫下在THF:水(1:1)中使用5當量氫氧化鋰將酯基團皂化1h。
LC-MS(方法12):Rt=1.25min;MS(ESIpos):m/z=479[M+H]+
中間體L17
3-{[N2-乙醯基-N6-(第三丁氧基羰基)-L-離胺醯基]胺基}-D-丙胺酸2-(三甲基矽基)乙基酯
該標題化合物係藉由以下獲得:使3-胺基-N-[(苄基氧基)羰基]-D-丙胺酸及2,5-二側氧基吡咯啶-1-基N2-乙醯基-N6-(第三丁氧基羰基)-L-離胺酸酯在DMF中在N,N-二異丙基乙胺存在下偶合,隨後使羧酸基團與2-(三甲基矽基)乙醇在乙腈中在吡啶及1,3-二環己基碳二亞胺存在下偶合,且隨後藉由在室溫下在甲醇中在10% Pd/C存在下氫化2h對苄基氧基羰基實施去保護。
LC-MS(方法1):Rt=0.70min;MS(ESIpos):m/z=475(M+H)+。
中間體L81
{2-[(2-胺基乙基)磺醯基]乙基}胺基甲酸苄基酯三氟乙酶鹽(1:1)
使250mg(1.11mmol)2,2'-磺醯基二乙胺與92.3mg(0.37mmol)1-{[(苄基氧基)羰基]氧基}吡咯啶-2,5-二酮在N,N-二異丙基乙胺存在下在DMF中偶合。在HPLC純化後,獲得70mg(47% d.Th.)標題化合物。
LC-MS(方法12):Rt=0.64min;MS(ESIpos):m/z=257.11(M+H)+。
中間體L108
N2-乙醯基-N-(2-胺基乙基)-N6-(第三丁氧基羰基)-L-離胺醯胺
該標題化合物係藉由以下獲得:使N2-乙醯基-N6-(第三丁氧基羰基)-L-離胺酸及(2-胺基乙基)胺基甲酸苄基酯鹽酸鹽(1:1)在DMF中在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下偶合,且隨後藉由在室溫下在二氯甲烷/甲醇1:1中在10% Pd/C存在下氫化1h對苄基氧基羰基實施去保護。
LC-MS(方法1):Rt=0.43min;MS(ESIpos):m/z=331(M+H)+。
中間體F1
1-{[1-(2-{[2-({(2S)-2-胺基-4-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-咪唑-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]丁醯基}胺基)乙基]胺基}-2-側氧基乙基)-2,5-二側氧基吡咯啶-3-基]硫基}-N-(5-胺基戊基)-3,6,9,12-四氧雜十五烷-15-醯胺二鹽酸鹽
將19mg(15.07μmol)[(2S)-4-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-咪唑-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]-1-({2-[({3-[(2,2-二甲基-4,12-二側氧基-3,15,18,21,24-五氧雜-5,11-二氮雜二十六烷-26-基)硫基]-2,5-二側氧基吡咯啶-1-基}乙醯基)胺基]乙基}胺基)-1-側氧基丁-2-基]胺基甲酸第三丁基酯(中間體C103)溶解於300μl DCM中。添加113μl於二噁烷中之4M氯化氫溶液並將混合物在室溫下攪拌1h。添加另外100μl於二噁烷中之4M氯化氫溶液並將混合物再攪拌1h。
蒸發溶劑並藉由冷凍乾燥自乙腈及水之混合物固體化殘餘物,以得到11mg(64%)靶標化合物。
LC-MS(方法4):Rt=5.86min;MS(EIpos):m/z=1060[M+H]+。
中間體F2
N2-乙醯基-L-離胺醯基-L-纈胺醯基-N-{(1S)-3-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]-1-羧基丙基}-L-丙胺醯胺三氟乙酸鹽(1:1)
該標題化合物係使用肽合成中熟知之古典方法自(2S)-4-[(乙醯氧基乙醯基){(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}胺基]-2-({[2-(三甲基矽基)乙氧基]羰基}胺基)丁酸甲酯(中間體C75)開始來製備。首先,在加熱2h至50℃下在三氟乙醇中使用6當量於2,2,2三氟乙醇中之氯化鋅裂解Teoc基團。隨後,使去保護之中間體與N-[(苄基氧基)羰基]-L-纈胺醯基-L-丙胺酸在DMF中在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下反應。在下一步驟中,藉由在正常壓力下在10%鈀/活性木炭上氫化來去除Z保護基團。使所獲得中間體與中間體L3在DMF中在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下反應。隨後,利用2M氫氧化鋰水溶液/THF 2:1進行酯裂解,且最後藉由在正常壓力下在10%鈀/活性木炭上氫化來去除Z保護基團,得到標題化合物。
LC-MS(方法1):Rt=0.9min;MS(ESIpos):m/z=854(M+H)+。
中間體F3
N2-乙醯基-L-離胺醯基-L-纈胺醯基-N-{3-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]丙基}-L-丙胺醯胺三氟乙酸鹽(1:1)
該標題化合物係使用肽合成中熟知之古典方法自N-(3-胺基丙基)-N-{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}-2-羥基乙醯胺(中間體C101)開始藉由在DMF中在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下與苄基氧基)羰基]-L-纈胺醯基-L-丙胺酸偶合來合成。在下一步驟中,藉由在正常壓力下在10%鈀/活性木炭上氫化來去除Z保護基團。使所獲得中間體與中間體L3在DMF中在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下反應。最後,藉由在正常壓力下在10%鈀/活性木炭上氫化,獲得標題化合物。
LC-MS(方法1):Rt=0.90min;MS(ESIpos):m/z=810(M+H)+。
中間體F4
3-[(N2-乙醯基-L-離胺醯基)胺基]-N-{(2S)-2-胺基-4-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]丁醯基}-D-丙胺酸三氟乙酸鹽(1:1)
將25mg(0.026mmol)中間體C74溶解於3.75mL DMF中並使其與13mg(0.031mmol)市售N2-乙醯基-N6-[(9H-茀-9-基甲氧基)羰基]-L-離胺酸在12mg(0.031mmol)HATU及3當量N,N二異丙基乙胺存在下偶合。在第二步驟中,利用100當量於5ml DMF中之DABCO裂解Fmoc保護基團。最後,在加熱2h至50℃下在三氟乙醇中利用6當量氯化鋅裂解Teoc保護基團。在HPLC純化後,獲得4.5mg(20%)標題化合物。
LC-MS(方法1):Rt=0.76min;MS(ESIpos):m/z=770(M+H)+。
中間體F5
N2-乙醯基-N-[2-({(2S)-2-胺基-4-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]丁醯基}胺基)乙基]-L-離胺醯胺三氟乙酸鹽(1:1)
該標題化合物係藉由以下獲得:使(2S)-4-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]-2-{[(9H-茀-9-基甲氧基)羰基]胺基}丁酸(中間體C53)與中間體L5偶合且隨後利用100當量於DMF中之DABCO去除Fmoc保護基團。
LC-MS(方法12):Rt=1.11min;MS(EIpos):m/z=724.40[M+H]+。
中間體F6
3-({15-[(N2-乙醯基-L-離胺醯基)胺基]-4,7,10,13-四氧雜十五烷-1-醯基}胺基)-N-{(2S)-2-胺基-4-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]丁醯基}-D-丙胺酸三氟乙酸鹽(1:1)
在初始步驟中,使中間體C74與市售{15-[(2,5-二側氧基吡咯啶-
1-基)氧基]-15-側氧基-3,6,9,12-四氧雜十五-1-基}胺基甲酸9H-茀-9-基甲基酯在DMF中在N,N二異丙基乙胺存在下偶合。隨後,利用100當量於DMF中之DABCO裂解Fmoc保護基團並使所獲得中間體與L4在1.1當量HATU及3當量N,N二異丙基乙胺存在下在DMF中偶合。最後,在加熱1h至50℃下在三氟乙醇中利用12當量氯化鋅裂解Teoc保護基團及三甲基矽基乙基酯。在HPLC純化後,獲得2.3mg標題化合物。
LC-MS(方法1):Rt=0.72min;MS(EIpos):m/z=1017[M+H]+。
中間體F7
N2-乙醯基-L-離胺醯基-L-丙胺醯基-L-丙胺醯基-N1-{(2S)-4-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]-1-[(2-羧基乙基)胺基]-1-側氧基丁-2-基}-L-天冬醯胺
該標題化合物係藉由以下獲得:使中間體C105與中間體L7在DMF中在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下偶合,且隨後同時藉由在DCM-甲醇1:1中利用活性木炭載10%鈀氫化來去除Z保護基團及苄基
酯並實施HPLC純化。
LC-MS(方法1):Rt=0.82min;MS(ESIpos):m/z=1011(M+H)+。
中間體F8
N2-乙醯基-L-離胺醯基-L-丙胺醯基-L-丙胺醯基-N1-[(2S)-4-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]-1-{[2-(L-γ-麩胺醯基胺基)乙基]胺基}-1-側氧基丁-2-基]-L-天冬醯胺三氟乙酸鹽(1:1)
該標題化合物係藉由以下獲得:使中間體C106與中間體L8在DMF中在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下偶合,且隨後在加熱6h至50℃下使用10當量於2,2,2三氟乙醇中之氯化鋅同時去除所有保護基團。在添加6當量EDTA之後,藉由HPLC純化產物。
LC-MS(方法1):Rt=0.72min;MS(ESIpos):m/z=1111(M+H)+。
中間體F9
N2-乙醯基-L-離胺醯基-L-丙胺醯基-L-丙胺醯基-N1-{(2S)-1-[(3-{[(5S)-5-胺基-5-羧基戊基]胺基}-3-側氧基丙基)胺基]-4-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]-1-側氧基丁-2-基}-L-天冬醯胺三氟乙酸鹽(1:1)
該標題化合物係藉由以下獲得:使中間體C108與中間體L10在DMF中在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下偶合,隨後藉由在正常壓力下在DCM/甲醇1:1中在10%鈀/活性木炭上氫化來去除Z保護基團,然後與中間體L4在DMF中在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下偶合,且最後在加熱2h至50℃下使用12當量於2,2,2三氟乙醇中之氯化鋅同時去除所有保護基團。在添加12當量EDTA之後,藉由HPLC純化產物。
LC-MS(方法12):Rt=11.7min;MS(ESIneg):m/z=1137(M-H)-。
中間體F10
N2-乙醯基-L-離胺醯基-L-丙胺醯基-L-丙胺醯基-N1-{(2S)-4-[{(1R)-1-
[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]-1-[(3-{[(1S)-1,3-二羧基丙基]胺基}-3-側氧基丙基)胺基]-1-側氧基丁-2-基}-L-天冬醯胺三氟乙酸鹽(1:1)
該標題化合物係藉由以下獲得:使中間體C109與中間體L8在DMF中在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下偶合,隨後藉由在正常壓力下在甲醇中在10%鈀/活性木炭上氫化來去除苄基酯保護基團,且最後在加熱6h至50℃下使用6當量於2,2,2三氟乙醇中之氯化鋅去除Teoc保護基團。在添加6當量EDTA之後,藉由HPLC純化產物。
LC-MS(方法12):Rt=1.31min;MS(ESIpos):m/z=1140(M+H)+。
中間體F11
N2-乙醯基-L-離胺醯基-S-{2-[(3-胺基丙基){(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}胺基]-2-側氧基乙基}-L-半胱胺酸三氟乙酸鹽(1:2)
向S-(11-{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}-2,2-二甲基-6,12-二側氧基-5-氧雜-7,11-二氮雜-2-矽雜十三烷-13-基)-L-半胱胺酸三氟乙酸鹽(1:1)(20.0mg,24.1μmol)(中間體C71)及N2-乙醯基-N6-(第三丁氧基羰基)-L-離胺酸(9.02mg,31.3μmol)於乙腈(2.0ml)中之溶液中添加N,N-二異丙基乙胺(34μl,190μmol)及2,4,6-三丙基-1,3,5,2,4,6-三氧雜三磷雜環己烷2,4,6-三氧化物(19μl,50%純度,31μmol)。將混合物在室溫下攪拌過夜並藉由製備型RP-HPLC(管柱:Reprosil 250x30;10μ,流速:50ml/min,MeCN/水,0.1% TFA)純化。在減壓下蒸發溶劑並在高真空下乾燥殘餘物。此得到5.2mg(理論之22%)N2-乙醯基-N6-(第三丁氧基羰基)-L-離胺醯基-S-(11-{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}-2,2-二甲基-6,12-二側氧基-5-氧雜-7,11-二氮雜-2-矽雜十三烷-13-基)-L-半胱胺酸。產物含有約15%之其差向異構物。
向N2-乙醯基-N6-(第三丁氧基羰基)-L-離胺醯基-S-(11-{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}-2,2-二甲基-6,12-二側氧基-5-氧雜-7,11-二氮雜-2-矽雜十三烷-13-基)-L-半胱胺酸(61.6mg,62.4μmol)於2,2,2-三氟乙醇(6.0ml)中之溶液中添加氯化鋅(51.0mg,374μmol)並將混合物在50℃下攪拌1h。然後添加氯化鋅(51.0mg,374μmol)並將混合物在50℃下攪拌1h。將混合物與EDTA
(218mg,748μmol)一起攪拌5min並藉由製備型RP-HPLC(管柱:Reprosil 250×30;10μ,流速:50ml/min,MeCN/水,0.1% TFA)純化。在減壓下蒸發溶劑並凍乾殘餘物。此獲得41.6mg(理論之69%)標題化合物。
LC-MS(方法12):Rt=1.32min;MS(ESIneg):m/z=741[M-H]-
中間體F12
N-(6-胺基己醯基)-S-[2-({(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}{[(3S,4R)-4-氟吡咯啶-3-基]甲基}胺基)-2-側氧基乙基]-L-半胱胺酸三氟乙酸鹽(1:1)
向6-[(第三丁氧基羰基)胺基]己酸(29.2mg,126μmol)於1.4ml DMF中之溶液中添加N,N-二異丙基乙胺(21μl,120μmol)及HATU(46.2mg,122μmol)。將反應混合物在RT下攪拌10min且然後添加S-[2-({(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}{[(3R,4R)-4-氟-1-{[2-(三甲基矽基)乙氧基]羰基}吡咯啶-3-基]甲基}胺基)-2-側氧基乙基]-L-半胱胺酸(37.0mg,48.6μmol)(中間體C107)於1.4ml DMF中之溶液。然後將反應混合物於RT下攪拌過夜。然後添加水及DCM並分離有機相,用水進一步洗滌,經硫酸鎂乾燥
並蒸發,以得到49.7mg(理論之85%)S-[2-({(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}{[(3R,4R)-4-氟-1-{[2-(三甲基矽基)乙氧基]羰基}吡咯啶-3-基]甲基}胺基)-2-側氧基乙基]-N-{6-[(第三丁氧基羰基)胺基]己醯基}-L-半胱胺酸,其未經進一步純化即用於下一步驟中。
LC-MS(方法1):Rt=1.47min;MS(ESIpos):m/z=974[M+H]+
向S-[2-({(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}{[(3R,4R)-4-氟-1-{[2-(三甲基矽基)乙氧基]羰基}吡咯啶-3-基]甲基}胺基)-2-側氧基乙基]-N-{6-[(第三丁氧基羰基)胺基]己醯基}-L-半胱胺酸(49.7mg,81%純度,41.4μmol)於3.5ml三氟乙醇中之溶液中添加(45.2mg,332μmol)並將反應混合物在50℃下攪拌2h。然後添加EDTA(96.9mg,332μmol)並將所得混合物在RT下攪拌15min。然後添加乙酸乙酯並用水及鹽水洗滌有機相,經硫酸鎂乾燥並蒸發。藉由製備型RP-HPLC(MeCN/水,0.1% TFA)純化殘餘物,以得到4.5mg(理論之13%)標題化合物。
LC-MS(方法1):Rt=0.79min;MS(ESIpos):m/z=730[M+H]+
中間體F13
N-(吡啶-4-基乙醯基)-L-丙胺醯基-L-丙胺醯基-N1-{(2S)-1-({2-[(N2-乙醯基-L-離胺醯基)胺基]乙基}胺基)-4-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]-1-側氧基丁-2-基}-L-天冬醯胺三氟乙酸鹽(1:1)
該標題化合物係藉由以下獲得:使中間體C110與中間體L14在DMF中在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下偶合,且隨後在加熱0.5h至50℃下使用6當量於2,2,2三氟乙醇中之氯化鋅去除Boc基團。在添加6當量EDTA之後,藉由HPLC純化產物。
LC-MS(方法1):Rt=0.76min;MS(ESIpos):m/z=1101(M+H)+。
中間體F14
N2-乙醯基-N-(2-{[2-({(2S)-2-胺基-4-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]丁醯基}胺基)乙基]磺醯基}乙基)-L-離胺醯胺三氟乙酸鹽(1:2)
初始,使中間體L81與中間體C58在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下偶合。隨後,藉由在正常壓力下在DCM/甲醇1:1中在10%鈀/活性木炭上氫化來去除Z保護基團。使所獲得中間體與中間體L4在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下偶合。
最後在加熱2h至50℃下使用6當量於2,2,2三氟乙醇中之氯化鋅裂解Teoc保護基團。在添加6當量EDTA之後,藉由HPLC純化產物。
LC-MS(方法12):Rt=0.7min;MS(ESIpos):m/z=818(M+H)。
中間體F15
N2-乙醯基-N-{2-[(3-{[2-({(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}[吡咯啶-3-基甲基]胺基)-2-側氧基乙基]硫基}丙醯基)胺基]乙基}-L-離胺醯胺三氟乙酸鹽(1:2)(異構物1)
該標題化合物係藉由以下獲得:使中間體C95與中間體L108在DMF中在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下偶合,且隨後在加熱1h至50℃下使用6當量於2,2,2三氟乙醇中之氯化鋅去除Boc基團。在添加6當量EDTA之後,藉由HPLC純化產物。
LC-MS(方法1):Rt=0.74min;MS(ESIpos):m/z=796(M+H)+。
中間體F16
N-(15-胺基-4,7,10,13-四氧雜十五烷-1-醯基)-S-[2-({(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}[吡咯啶-3-基甲基]胺基)-2-側氧基乙基]半胱胺酸三氟乙酸鹽(1:2)(異構物1)
該標題化合物係藉由以下獲得:使中間體C90與2,2-二甲基-4-側氧基-3,8,11,14,17-五氧雜-5-氮雜二十烷-20-酸在DMF中在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下偶合,且隨後在加熱3h至50℃下使用6當量於2,2,2三氟乙醇中之氯化鋅去除Boc基團。在添加6當量EDTA之後,藉由HPLC純化產物。
LC-MS(方法1):Rt=0.80min;MS(ESIpos):m/z=846(M+H)+。
中間體F17
N-(22-胺基-17-側氧基-4,7,10,13-四氧雜-16-氮雜二十二烷-1-醯基)-S-{2-[(3-胺基丙基){(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}胺基]-2-側氧基乙基}-L-半胱胺酸三氟乙酸鹽(1:2)
該標題化合物係藉由以下獲得:使中間體C71與中間體L16在DMF中在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下偶合,且隨後在加熱1h至50℃下使用6當量於2,2,2三氟乙醇中之氯化鋅去除保護基團。在添加6當量EDTA之後,藉由HPLC純化產物。
LC-MS(方法1):Rt=0.78min;MS(ESIpos):m/z=933(M+H)+。
中間體F18
3-[(N2-乙醯基-L-離胺醯基)胺基]-N-[3-({2-[(3-胺基丙基){(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}胺基]-2-側氧基乙基}硫基)丙醯基]-D-丙胺酸三氟乙酸鹽(1:2)
該標題化合物係藉由以下獲得:使中間體C69與中間體L17在DMF中在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下偶合,且隨後在加熱1h至50℃下使用6當量於2,2,2三氟乙醇中之氯化鋅去除保護基團。在添加6當量EDTA之後,藉由HPLC純化產物。
LC-MS(方法1):Rt=0.76min;MS(ESIpos):m/z=814(M+H)+。
中間體F19
N2-乙醯基-N-(2-{[3-({2-[(3-胺基丙基){(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}胺基]-2-側氧基乙基}硫基)丙醯基]胺基}乙基)-L-離胺醯胺三氟乙酸鹽(1:2)
該標題化合物係藉由以下獲得:使中間體C69與中間體L108在DMF中在HATU及N,N-二異丙基乙胺存在下偶合,且隨後在加熱1h至50℃下使用6當量於2,2,2三氟乙醇中之氯化鋅去除保護基團。在添加6當量EDTA之後,藉由HPLC純化產物。
LC-MS(方法1):Rt=0.79min;MS(ESIpos):m/z=770(M+H)+。
B:抗體/活性化合物結合物(ADC)之製備
B-1. 生成抗TWEAKR抗體之一般製程
藉由(例如)針對重組人類TWEAKR SEQ ID NO:138及鼠類TWEAKR SEQ ID NO:137篩選噬菌體展示庫而生成抗TWEAKR抗體。特別地,抗體TPP-2090係重要實例。將以此方式獲得之抗體之格式重新定成人類IgG1格式。藉由在TPP-2090之重鏈中引入突變N297A(免疫球蛋白之Kabat編號系統)而生成無糖基化變體TPP-2090-HC-N297A。藉由在TPP-2090之重鏈中引入突變N297Q(免疫球蛋白之Kabat編號系統)而生成無糖基化變體TPP-2090-HC-N297Q。本文所闡述之工作實例使用該兩種抗體(亦參見WO 2015/189143 A1及WO 2014/198817 A1)。另外,熟習此項技術者已知結合至TWEAKR之抗
體,例如參見WO2009/020933(A2)或WO2009140177(A2)。
SEQ ID NO:138(多肽):
SEQ ID NO:137(多肽):
B-2. 在哺乳動物細胞中表現抗TWEAKR抗體之一般製程
在瞬時哺乳動物細胞培養物中產生抗體(例如TPP-2090及無糖基化變體TPP-2090-HC-N297A、TPP-2090-HC-N297Q、曲妥珠單抗-HC-N297A(等於TPP-7510)、曲妥珠單抗-HC-N297Q(等於TPP-7511)),如由Tom等人,第12章在由Micheal R.Dyson及Yves Durocher編輯之
Methods Express:Expression Systems,Scion Publishing Ltd,2007中所闡述(參見AK-實例1)。
B-3. 自細胞上清液純化抗體之一般製程
自細胞培養上清液獲得抗體(例如TPP-2090及無糖基化變體TPP-2090-HC-N297A、TPP-2090-HC-N297Q、曲妥珠單抗-HC-N297A(等於TPP-7510)、曲妥珠單抗-HC-N297Q(等於TPP-7511))。藉由對細胞進行離心使細胞上清液澄清。然後藉由在MabSelect Sure(GE Healthcare)層析管柱上進行親和層析來純化細胞上清液。為此,在DPBS pH 7.4(Sigma/Aldrich)中使管柱平衡,施加細胞上清液並用約10管柱體積DPBS pH 7.4+500mM氯化鈉洗滌管柱。在50mM乙酸鈉pH 3.5+500mM氯化鈉中溶析抗體且然後藉由在Superdex 200管柱(GE Healthcare)上在DPBS(pH 7.4)中進行凝膠過濾層析來進一步純化。
藉由標準層析方法(蛋白質A,製備型SEC)自商用產品純化市售抗體西妥昔單抗(商標名爾必得舒(Erbitux))。
藉由標準層析方法(蛋白質A,製備型SEC)自商用產品純化市售抗體曲妥珠單抗(商標名賀癌平(Herceptin))。
曲妥珠單抗-HC-N297A(等於TPP-7510)包含由SEQ ID NO:244表示之重鏈。輕鏈與曲妥珠單抗中之一者相同。
曲妥珠單抗-HC-N297Q(等於TPP-7511)包含由SEQ ID NO:245表示之重鏈。輕鏈與曲妥珠單抗中之一者相同。
自商用產品(商標名CIMAher),藉由標準層析方法(蛋白質A,製備型SEC)自商用產品純化抗體尼妥珠單抗。
自商用產品(商標名維必施(Vectibix)),藉由標準層析方法(蛋白質A,製備型SEC)自商用產品純化抗體帕尼單抗。
B-4. 偶合至麩醯胺酸之一般製程
在以下實例中用來達成2之最大DAR之用於轉麩醯胺酸酶偶合之一般程序A:
對於ADC工作實例之反應,使用以下抗體(以下術語抗體-HC-N297Z意指在抗體之兩個重鏈中藉由胺基酸Z替代N297(kabat編號)之抗體,術語TPP-XXXX-HC-Q295N-HC-N297Q意指具有TPP-XXXX且在抗體之兩個重鏈中藉由胺基酸N替代胺基酸Q295(kabat編號)且在抗體之兩個重鏈中藉由胺基酸Q(Kabat編號)替代胺基酸N297(kabat編號)之抗體。抗體之名稱可以名稱(例如曲妥珠單抗)或以TPP-XXXX(具有TPP號XXXX之抗體)聲明:
AK3a:TPP-2090-HC-N297A(等於抗TWEAKR抗體TPP-2658)
AK3c:TPP-2090-HC-Q295N-HC-N297Q(等於抗TWEAKR抗體TPP-8825)
AK3d:曲妥珠單抗-HC-N297A(等於TPP-7510)
向5mg各別抗體之無醣變體(HC-N297A或HC-Q295N-HC-N297Q)於DPBS(pH 7.4)中之溶液(濃度約5mg/mL至15mg/mL)中添加20μL(6當量)各別前體中間體F之溶液(10mM於DMSO中)。在37℃下培育5min後,添加50μL(1.25U)重組微生物(細菌)轉麩醯胺酸酶之水溶液(產品編號T001,來自Zedira GmbH,Darmstadt,Germany)(25U/mL)。將反應混合物在37℃下培育24小時且隨後用DPBS(pH 7.4)稀釋至2.5mL之體積。藉由在經DPBS緩衝液(pH 7.4)平衡之PD 10管柱(Sephadex® G-25,GE Healthcare)上進行凝膠過濾來純化ADC溶液,該緩衝液亦用於溶析。隨後,使用Amicon Ultracel-30K離心裝置(Millipore)濃縮ADC溶液並再稀釋至約2.5mL之體積。最後添加於12.5μL DPBS中之0.00625μmol b-轉麩醯胺酸酶阻斷劑Zedira C100。對於所獲得之ADC溶液,如在個別實例中所給出測定蛋白質濃度。利用第B5章中所闡述之方法測定藥物負荷。如實例中所指明來表徵
ADC批料。
在以下實例中用來達成4之最大DAR之用於轉麩醯胺酸酶偶合之一般程序B:
對於ADC工作實例之反應,使用以下抗體(如上文所使用之以下術語):
AK3b:TPP-2090-HC-N297Q(等於抗TWEAKR抗體TPP-5442)
AK3e:曲妥珠單抗-HC-N297Q(等於TPP-7511)
向5mg各別抗體之無醣變體(HC-N297Q)於DPBS(pH 7.4)中之溶液(濃度約5mg/mL至15mg/mL)中添加16當量至24當量各別前體中間體F之溶液(10mM於DMSO中)。在37℃下培育5min後,添加400μL(10U)重組微生物(細菌)轉麩醯胺酸酶之水溶液(產品編號T001,來自Zedira GmbH,Darmstadt,Germany)(25U/mL)。將反應混合物在37℃下培育24小時且隨後用DPBS(pH 7.4)稀釋至2.5mL之體積。藉由在經DPBS緩衝液(pH 7.4)平衡之PD 10管柱(Sephadex® G-25,GE Healthcare)上進行凝膠過濾來純化ADC溶液,該緩衝液亦用於溶析。隨後,使用Amicon Ultracel-30K離心裝置(Millipore)濃縮ADC溶液並再稀釋至約2.5mL之體積。最後添加於200μL DPBS中之0.1μmol b-轉麩醯胺酸酶阻斷劑Zedira C100。對於所獲得之ADC溶液,如個別實例中所給出測定蛋白質濃度。利用第B7章中所闡述之方法測定藥物負荷。如實例中所指明表徵ADC批料。
在以下實例中較大規模用來達成2之最大DAR之用於轉麩醯胺酸酶偶合之一般程序C:
向30mg各別抗體之無醣變體(HC-N297A或HC-Q295N-HC-N297Q)於DPBS(pH 7.4)中之溶液(濃度約5mg/mL至15mg/mL)中添加6當量各別前體中間體F之溶液(10mM於DMSO中)。在37℃下培育5min後,添加200μL(7.5U)重組微生物(細菌)轉麩醯胺酸酶之水溶液
(產品編號T001,來自Zedira GmbH,Darmstadt,Germany)(25U/mL)。將反應混合物在37℃下培育24小時。藉由在Superdex 200管柱(GE Healthcare)上在DPBS(pH 7.4)中進行凝膠過濾層析來純化ADC以自ADC去除小分子及轉麩醯胺酸酶,且最後使用Amicon Ultracel-30K離心裝置(Millipore)濃縮至介於5mg/mL至25mg/mL之間之最終濃度。然後無菌過濾溶液。
測定ADC溶液之各別蛋白濃度,如工作實例中所述。利用第B5章中所闡述之方法測定藥物負荷。如實例中所指明表徵ADC批料。
在以下實例中較大規模用來達成4之最大DAR之用於轉麩醯胺酸酶偶合之一般程序D:
向30mg各別抗體之無醣變體(HC-N297Q)於DPBS(pH 7.4)中之溶液(濃度約5mg/mL至15mg/mL)中添加16當量至24當量各別前體中間體F之溶液(10mM於DMSO中)。在37℃下培育5min後,添加2400μL(60U)重組微生物(細菌)轉麩醯胺酸酶之水溶液(產品編號T001,來自Zedira GmbH,Darmstadt,Germany)(25U/mL)。將反應混合物在37℃下培育24小時。藉由在Superdex 200管柱(GE Healthcare)上在DPBS(pH 7.4)中進行凝膠過濾層析來純化ADC以自ADC去除小分子及轉麩醯胺酸酶,且最後使用Amicon Ultracel-30K離心裝置(Millipore)濃縮至介於5mg/mL至25mg/mL之間之最終濃度。然後無菌過濾溶液。
測定ADC溶液之各別蛋白濃度,如工作實例中所述。利用第B5章中所闡述之方法測定藥物負荷。如實例中所指明表徵ADC批料。
B-5. 抗體、毒性基團負荷之測定及結合位置之測定
關於在去糖基化及/或變性之後除分子量測定以外之蛋白質鑑別,實施胰蛋白酶消化,從而在變性、還原及衍生之後,經由所發現之胰蛋白酶肽證實蛋白質之身份。此外此方法可用於藉由檢測所結合
胰蛋白酶肽來鑑別偶合位置。
如下測定工作實例中所闡述結合物之所獲得PBS緩衝液溶液之毒性基團負荷:
藉由質譜法測定個別結合物物質之分子量來測定麩醯胺酸連接ADC之毒性基團負荷。此處,酸化試樣且在短C4管柱(GromSil 300 Butyl-1 ST,5μm,5mm×500μm)上進行HPLC分離/脫鹽之後,藉由質譜使用ESI-MicroTofQ系統(Bruker Daltonik)進行分析。添加TIC(總離子層析)中信號上之所有光譜且基於MaxEnt去捲積計算不同結合物物質之分子量。然後自毒性基團數量加權之偶合物質之總和除以每一物質之單獨加權之積分結果之總和來計算DAR(=藥物/抗體比率)。
另外,基於物質分佈,將下表中實例5A之四種不同製備相比較,可實例性驗證bTG偶合方法之均質性(對於DAR2,D2之百分比大於85%)。
利用其他bTG偶合之毒性基團-連接體構築體可得到相當均質之分佈。此可在下表中在四種不同ADC化合物下得到實例性驗證。
基於抗體內之N297Q取代,在DAR4之結果下基於bTG之偶合係可能的。此ADC之均質性(D4之百分比大於70%)及於不同抗體上之可轉移性在下表中在三種不同ADC化合物下得到實例性驗證。
或者,藉由經還原及變性ADC之反相層析測定麩醯胺酸連接結合物之毒性基團負荷。將鹽酸胍(GuHCl)(28.6mg)及DL-二硫蘇糖醇(DTT)溶液(500mM,3μl)添加至ADC溶液(1mg/ml,50μl)中。將混合物在55℃下培育1小時並藉由HPLC進行分析。
在Agilent 1260 HPLC系統上且在220nm下檢測實施HPLC分析。以1.2ml/min之流速以及以下梯度使用Polymer Laboratories PLRP-S聚合反相管柱(目錄號PL1912-3802)(2.1×150mm,8μm粒徑,1000Å):0min,31%B;1min,31%B;14min,38%B;16min,95%B。移動相A由0.05%三氟乙酸(TFA)水溶液組成,移動相B由於乙腈中之0.05%三氟乙酸組成。
藉由與未結合抗體之輕鏈(L0)及重鏈(H0)之滯留時間相比較指派經檢測峰。將僅在結合試樣中檢測到之峰指派至具有一或兩個毒性基團之重鏈(H1,H2)。
自藉由以HC負荷及LC負荷之總和之兩倍積分測定之峰面積計算具有毒性基團之抗體之平均負荷,而HC負荷為所有重鏈(HC)峰之毒
性基團數量加權積分結果之總和除以HC峰之單獨加權積分結果之總和,而LC負荷為輕鏈(LC)峰之毒性基團數量加權積分結果之總和除以所有LC峰之單獨加權積分結果之總和。
B-6. 檢查ADC之抗原結合
在發生偶合後檢查結合劑結合至靶標分子之能力。熟習此項技術者熟悉可用於此目的之多種方法;例如,可使用ELISA技術或表面電漿共振分析(BIAcoreTM量測)檢查結合物之親和力。熟習此項技術者可使用常規方法量測結合物濃度,例如對於抗體結合物藉由蛋白質測定。(亦參見Doronina等人;Nature Biotechnol.2003;21:778-784及Polson等人,Blood 2007;1102:616-623)。
以下實例係遵循用於轉麩醯胺酸酶偶合之一般程序C來合成(參見第B-4章):
實例1A
此處,將2250μL DPBS(pH 7.4)、200μL中間體F1溶液(10mM於DMSO中)及50μL重組微生物(細菌)轉麩醯胺酸酶溶液(產品編號T001,來自Zedira GmbH,Darmstadt,Germany)(100U/mL)添加至2500μL抗體TPP-2090-HC-N297A溶液(2mg/mL)中。將反應混合物在37℃下培育24小時。藉由在Superdex 200管柱(GE Healthcare)上在
DPBS(pH 7.4)中進行凝膠過濾層析來純化ADC以自ADC去除小分子及轉麩醯胺酸酶,且最後使用Amicon Ultracel-30K離心裝置(Millipore)濃縮。
蛋白質濃度:1.65mg/ml
藥物/mAb比率:1.9
實例1A4
此處,將450μL DPBS(pH 7.4)、40μL中間體F1溶液(10mM於DMSO中)及10μL重組微生物(細菌)轉麩醯胺酸酶溶液(產品編號T001,來自Zedira GmbH,Darmstadt,Germany)(100U/mL)添加至500μL抗體TPP-2090-HC-N297Q溶液(2mg/mL)中。將反應混合物在37℃下培育24小時且之後未經進一步純化即直接分析藥物抗體比率。
反應混合物中之蛋白質濃度:1mg/ml
藥物/mAb比率:3.5
實例2A
將50μL DPBS(pH 7.4)、40μL中間體F2溶液(10mM於DMSO中)及10μL重組微生物(細菌)轉麩醯胺酸酶溶液(產品編號T001,來自Zedira GmbH,Darmstadt,Germany)(100U/mL)添加至500μL抗體TPP-2090-HC-N297A溶液(2mg/mL)中。將反應混合物在37℃下培育24小時。藉由在Superdex 200管柱(GE Healthcare)上在DPBS(pH 7.4)中進行凝膠過濾層析來純化ADC以自ADC去除小分子及轉麩醯胺酸酶,且最後使用Amicon Ultracel-30K離心裝置(Millipore)濃縮。
蛋白質濃度:1.26mg/ml
藥物/mAb比率:1.6
實例3A
此處,將450μL DPBS(pH 7.4)、40μL中間體F3溶液(10mM於DMSO中)及10μL重組微生物(細菌)轉麩醯胺酸酶溶液(產品編號
T001,來自Zedira GmbH,Darmstadt,Germany)(100U/mL)添加至500μL抗體TPP-2090-HC-N297A溶液(2mg/mL)中。將反應混合物在37℃下培育24小時。藉由在Superdex 200管柱(GE Healthcare)上在DPBS(pH 7.4)中進行凝膠過濾層析來純化ADC以自ADC去除小分子及轉麩醯胺酸酶,且最後使用Amicon Ultracel-30K離心裝置(Millipore)濃縮。
蛋白質濃度:1.06mg/ml
藥物/mAb比率:2.0
實例4A
此處,將900μL DPBS(pH 7.4)、80μL中間體F4溶液(10mM於DMSO中)及20μL重組微生物(細菌)轉麩醯胺酸酶溶液(產品編號T001,來自Zedira GmbH,Darmstadt,Germany)(100U/mL)添加至1000μL抗體TPP-2090-HC-N297A溶液(2mg/mL)中。將反應混合物在37℃下培育24小時。藉由在Superdex 200管柱(GE Healthcare)上在DPBS(pH 7.4)中進行凝膠過濾層析來純化ADC以自ADC去除小分子及轉麩醯胺酸酶,且最後使用Amicon Ultracel-30K離心裝置(Millipore)濃縮。
蛋白質濃度:2.18mg/ml
藥物/mAb比率:1.7
實例5A
此處,將900μL DPBS(pH 7.4)、80μL中間體F5溶液(10mM於DMSO中)及20μL重組微生物(細菌)轉麩醯胺酸酶溶液(產品編號T001,來自Zedira GmbH,Darmstadt,Germany)(100U/mL)添加至1000μL抗體TPP-2090-HC-N297A溶液(2mg/mL)中。將反應混合物在37℃下培育24小時。藉由在Superdex 200管柱(GE Healthcare)上在DPBS(pH 7.4)中進行凝膠過濾層析來純化ADC以自ADC去除小分子及轉麩醯胺酸酶,且最後使用Amicon Ultracel-30K離心裝置(Millipore)濃縮。
蛋白質濃度:2.24mg/ml
藥物/mAb比率:1.9
實例6A
此處,將900μL DPBS(pH 7.4)、80μL中間體F6溶液(10mM於DMSO中)及20μL重組微生物(細菌)轉麩醯胺酸酶溶液(產品編號T001,來自Zedira GmbH,Darmstadt,Germany)(100U/mL)添加至1000μL抗體TPP-2090-HC-N297A溶液(2/mg/mL)中。將反應混合物在37℃下培育24小時且之後未經進一步純化即直接分析藥物抗體比率。
反應混合物中之蛋白質濃度:2.22mg/ml
藥物/mAb比率:2.0
以下實例係遵循用於轉麩醯胺酸酶偶合之一般程序A或B在5mg規模上及遵循程序C或D在較大規模上來合成(參見第B-4章):
實例2A
前體:F2,一般程序A,抗TWEAKR抗體TPP-2658(等於TPP-2090-HC-N297A)
蛋白質濃度:1.66mg/ml
藥物/mAb比率:1.7
實例3A
前體:F3,一般程序A,抗TWEAKR抗體TPP-2658(等於TPP-2090-HC-N297A)
蛋白質濃度:1.71mg/ml
藥物/mAb比率:1.8
實例4A
前體:F4,一般程序A,抗TWEAKR抗體TPP-2658(等於TPP-2090-HC-N297A)
蛋白質濃度:1.71mg/ml
藥物/mAb比率:1.8
實例4A4
前體:F4,一般程序B,抗TWEAKR抗體TPP-5442(等於TPP-2090-HC-N297Q)
蛋白質濃度:1.49mg/ml
藥物/mAb比率:3.4
實例5A
前體:F5,一般程序A,抗TWEAKR抗體TPP-2658(等於TPP-2090-HC-N297A)
蛋白質濃度:1.35mg/ml
藥物/mAb比率:2.0
此ADC之偶合亦係在30mg規模上遵循第B4章中之一般程序C來實施:
蛋白質濃度:11.2mg/ml
藥物/mAb比率:2.0
實例5A4
前體:F5,一般程序B,抗TWEAKR抗體TPP-5442(等於TPP-2090-HC-N297Q)
蛋白質濃度:0.83mg/ml
藥物/mAb比率:3.6
此ADC之偶合亦係在30mg規模上遵循第B4章中之一般程序D來實施:
蛋白質濃度:10.0mg/ml
藥物/mAb比率:3.8
實例5E
前體:F5,一般程序A,曲妥珠單抗-HC-N297A(等於TPP-7510)
蛋白質濃度:2.44mg/ml
藥物/mAb比率:1.6
實例5E4
前體:F5,一般程序B,曲妥珠單抗-HC-N297Q(等於TPP-7511)
蛋白質濃度:2.85mg/ml
藥物/mAb比率:3.6
實例6A
前體:F6,一般程序A,抗TWEAKR抗體TPP-2658(等於TPP-2090-HC-N297A)
蛋白質濃度:1.63mg/ml
藥物/mAb比率:1.8
此ADC之偶合亦係在30mg規模上遵循第B4章中之一般程序C來實施:
蛋白質濃度:13.2mg/ml
藥物/mAb比率:1.9
實例6A4
前體:F6,一般程序B,抗TWEAKR抗體TPP-5442(等於TPP-2090-HC-N297Q)
蛋白質濃度:1.63mg/ml
藥物/mAb比率:4.1
此ADC之偶合亦係在30mg規模上遵循第B4章中之一般程序D來
實施:
蛋白質濃度:11.8mg/ml
藥物/mAb比率:3.7
實例7A
前體:F7,一般程序A,抗TWEAKR抗體TPP-2658(等於TPP-2090-HC-N297A)
蛋白質濃度:1.66mg/ml
藥物/mAb比率:1.9
實例8A
前體:F8,一般程序A,抗TWEAKR抗體TPP-2658(等於TPP-2090-HC-N297A)
蛋白質濃度:1.68mg/ml
藥物/mAb比率:1.9
實例9A
前體:F9,一般程序A,抗TWEAKR抗體TPP-2658(等於TPP-2090-HC-N297A)
蛋白質濃度:1.8mg/ml
藥物/mAb比率:2.0
實例10A
前體:F10,一般程序A,抗TWEAKR抗體TPP-2658(等於TPP-2090-HC-N297A)
蛋白質濃度:1.73mg/ml
藥物/mAb比率:1.8
實例10A4
前體:F10,一般程序B,抗TWEAKR抗體TPP-5442(等於TPP-2090-HC-N297Q)
蛋白質濃度:1.76mg/ml
藥物/mAb比率:3.9
實例10E4
前體:F10,一般程序B,曲妥珠單抗-HC-N297Q(等於TPP-7511)
蛋白質濃度:1.56mg/ml
藥物/mAb比率:3.9
實例11A
前體:F11,一般程序A,抗TWEAKR抗體TPP-2658(等於TPP-2090-HC-N297A)
蛋白質濃度:1.82mg/ml
藥物/mAb比率:1.9
實例11A4
前體:F11,一般程序B,抗TWEAKR抗體TPP-5442(等於TPP-2090-HC-N297Q)
蛋白質濃度:1.1mg/ml
藥物/mAb比率:3.6
實例11E4
前體:F11,一般程序B,曲妥珠單抗-HC-N297Q(等於TPP-7511)。
蛋白質濃度:1.75mg/ml
藥物/mAb比率:3.8
實例12A
前體:F12,一般程序A,抗TWEAKR抗體TPP-2658(等於TPP-2090-HC-N297A)
蛋白質濃度:1.77mg/ml
藥物/mAb比率:1.8
實例13A
前體:F13,一般程序A,抗TWEAKR抗體TPP-2658(等於TPP-
2090-HC-N297A)
蛋白質濃度:2.11mg/ml
藥物/mAb比率:1.8
此ADC之偶合亦係在30mg規模上遵循第B4章中之一般程序C來實施:
蛋白質濃度:11.88mg/ml
藥物/mAb比率:2.0
實例13A4
前體:F13,一般程序D,抗TWEAKR抗體TPP-5442(等於TPP-2090-HC-N297Q)
此ADC之偶合係在30mg規模上遵循第B4章中之一般程序C來實施:
蛋白質濃度:12.0mg/ml
藥物/mAb比率:3.8
實例14A
前體:F14,一般程序A,抗TWEAKR抗體TPP-2658(等於TPP-2090-HC-N297A)
蛋白質濃度:1.58mg/ml
藥物/mAb比率:1.7
實例15A4
前體:F15,一般程序B,抗TWEAKR抗體TPP-5442(等於TPP-2090-HC-N297Q)
蛋白質濃度:1.05mg/ml
藥物/mAb比率:3.6
實例16A4
前體:F16,一般程序B,抗TWEAKR抗體TPP-5442(等於TPP-2090-HC-N297Q)
蛋白質濃度:1.78mg/ml
藥物/mAb比率:3.8
實例16E4
前體:F16,一般程序B,曲妥珠單抗-HC-N297Q(等於TPP-7511)
蛋白質濃度:1.82mg/ml
藥物/mAb比率:3.8
實例17A4
前體:F17,一般程序B,抗TWEAKR抗體TPP-5442(等於TPP-
2090-HC-N297Q)
蛋白質濃度:1.71mg/ml
藥物/mAb比率:3.8
實例17E4
前體:F17,一般程序B,曲妥珠單抗-HC-N297Q(等於TPP-7511)
蛋白質濃度:1.90mg/ml
藥物/mAb比率:3.8
實例18A4
前體:F18,一般程序B,抗TWEAKR抗體TPP-5442(等於TPP-2090-HC-N297Q)
蛋白質濃度:1.07mg/ml
藥物/mAb比率:3.7
實例19A4
前體:F19,一般程序B,抗TWEAKR抗體TPP-5442(等於TPP-2090-HC-N297Q)
蛋白質濃度:0.92mg/ml
藥物/mAb比率:3.3
代謝物實例M100
N6-L-γ-麩胺醯基-N2-乙醯基-N-[2-({(2S)-2-胺基-4-[{(1R)-1-[1-苄基-4-(2,5-二氟苯基)-1H-吡咯-2-基]-2,2-二甲基丙基}(乙醇醯基)胺基]丁醯基}胺基)乙基]-L-離胺醯胺三氟乙酸鹽(1:1)
首先,使中間體C58與中間體L12在DMF中在HATU及N,N-二異
丙基乙胺存在下偶合;隨後,使用4當量於2,2,2三氟乙醇中之氯化鋅在加熱2h至50℃下裂解Teoc保護基團,且在添加4當量EDTA之後,藉由HPLC純化產物。最後,藉由在正常壓力下在甲醇中在10%鈀/活性木炭上進行氫化來裂解Z保護基團及苄基酯。
LC-MS(方法1):Rt=0.74min;MS(ESIpos):m/z=855(M+H)+。
C:生物效能之評價
在下文所闡述之分析中可顯示本發明化合物之生物活性:
C-1a 測定ADC抵抗TWEAKR之細胞毒性效應
利用各種細胞系分析抗TWEAKR-ADC之細胞毒性效應:
NCI-H292:人類黏液性表皮樣肺癌細胞,ATCC-CRL-1848,標準培養基:RPMI 1640(Biochrom;編號FG1215,穩定麩醯胺酸)+10% FCS(Biochrom;#S0415),TWEAKR陽性,EGFR陽性。
SK-HEP-1:人類肝癌細胞,ATCC號HTB-52,標準培養基:具有厄氏鹽(Earle's salt)+Glutamax I(Invitrogen 41090)+10%熱去活化之FCS(Fa.gibco,編號10500-064)之MEM;EGFR陽性,TWEAKR陽性。
LoVo:人類結腸直腸癌細胞,ATCC號CCL-229,標準培養基:凱恩氏(Kaighn's)+L-麩胺醯胺(Invitrogen 21127)+10%熱去活化之FCS(Fa.gibco,編號10500-064),TWEAKR陽性
BxPC3:人類胰臟癌細胞,ATCC-CRL-1687,標準培養基:RPMI 1640(Biochrom;#FG1215,穩定麩醯胺酸)+10% FCS(Biochrom;#S0415),TWEAKR陽性。
KPL4:人類乳房癌細胞,標準培養基:RPMI 1640+GlutaMAX I+10% FBS,細胞庫,Bayer Pharma AG(在2012年7月19日在DSMZ檢查及證實一致性),Berlin,ERBB2陽性。
藉由標準方法培養細胞,如在美國標準菌種庫(American Tissue Type Collection,ATCC)針對各別細胞系所指示。
MTT分析
藉由以下實施測試:利用Accutase於PBS中之溶液(Biochrom AG #L2143)分離細胞,糰粒化,再懸浮於培養基中,計數並將細胞接種至具有白色底部之96孔培養板中(Costar編號3610,LoVo:1000個細胞/孔,SK-HEP-1:1200個細胞/孔,NCI H292:1500個細胞/孔,總體積為100μL)。然後在培育箱中在37℃及5%二氧化碳下培育細胞。48h後,將抗體藥物結合物在10μL培養基中以10-5M至10-13M之濃度添加至細胞中(一式三份)並在培育箱中在37℃及5%二氧化碳下培育。96h後,使用MTT分析(ATCC,Manassas,Virginia,USA,目錄號30-1010K)量測增殖。在所選培育時間結束時,添加MTT試劑並與細胞一起培育4h,隨後藉由添加清潔劑將細胞溶解過夜。在570nm(Infinite M1000 pro,Fa.Tecan)下檢測所形成之染料。基於測得數據,自DRC(劑量反應曲線)測定IC50值。將未經測試物質處理但在其他方面經相同處理之細胞之增殖定義為100%值。源於所選實例之數據概述於表1中。
紡錘體驅動蛋白KSP/Eg5之抑制之C-1b測定
在RT下在15mM PIPES(pH 6.8)(5mM MgCl2及10mM DTT,來自
Sigma)中將人類紡錘體驅動蛋白KSP/Eg5(來自tebu-bio/Cytoskeleton Inc,編號027EG01-XL)之馬達域在10nM之濃度下與50μg/ml紫杉醇-(來自Sigma編號T7191-5MG)穩定之微管(牛或豬,來自tebu-bio/Cytoskeleton Inc)一起培育5min。將剛剛製備之混合物等分至384孔MTP中。然後添加在1.0×10-6M至1.0×10-13M之濃度下之欲檢驗之抑制劑及ATP(最終濃度500μM,來自Sigma)。在RT下培育2h。藉由使用孔雀綠(來自Biomol)檢測所形成之無機磷酸鹽來檢測ATPase活性。在添加試劑後,將分析物在RT下培育50分鐘,之後在620nm之波長下檢測吸收。使用莫那匹爾(Fa.Sigma,M8515-1mg)及伊斯平斯(來自Adooq A10486)作為陽性對照。劑量活性曲線之個別數據係一式八份測定值。IC50值係三個獨立實驗之平均值。100%對照係未經抑制劑處理之試樣。
在以下表2中,概述源於所闡述分析之代表性實例之IC50值及相應細胞毒性數據(MTT分析):
C-2內在化分析
內在化係能夠在表現抗原之癌細胞中經由抗體藥物結合物(ADC)專一且有效的提供細胞毒性酬載之關鍵過程。此過程係經由專一性TWEAKR抗體及同型對照抗體之螢光標記來監測。首先,使螢光染料結合至抗體之離胺酸。結合係在pH 8.3下使用兩倍莫耳過量之CypHer 5E單NHS酯(批次357392,GE Healthcare)來實施。在偶合後,使用凝膠層析(Zeba Spin脫鹽管柱,40K,Fa.Thermo Scientific,編號87768;
溶析緩衝液:達爾伯克氏PBS,Fa.Sima-Aldrich,編號D8537)純化反應混合物,以去除過量染料並調節pH。然後濃縮蛋白質溶液(VIVASPIN 500,來自Sartorius stedim biotec)。藉由分光光度分析(NanoDrop)測定抗體之染料負荷且隨後計算(D:P=A染料ε蛋白:(A280-0.16A染料)ε染料)。在此處檢驗之TWEAKR抗體及同型對照之染料負荷具有相當順序。在細胞結合分析中,證實結合並未使得抗體之親和力發生變化。
使用經標記抗體進行內在化分析。在開始處理前,將細胞(2×104/孔)在96孔MTP(快速,黑色,透明底部,編號4308776,來自Applied Biosystems)中接種於100μL培養基中。在37℃/5%CO2下培育18h後,更換培養基且以不同濃度(10μg/mL、5μg/mL、2.5μg/mL、1μg/mL、0.1μg/mL)添加經標記抗TWEAKR抗體。將相同處理方案施加至經標記之同型對照(陰性對照)。所選培育時間為0h、0.25h、0.5h、1h、1.5h、2h、3h、6h及24h。使用InCellanalyser 1000(來自GE Healthcare)實施螢光量測。此後經由量測參數顆粒計數/細胞及總顆粒濃度/細胞進行動力學評估。
在結合至TWEAKR後,檢驗TWEAKR抗體之內在化能力。出於此目的,選擇具有不同TWEAKR表現程度之細胞。利用TWEAKR抗體觀察靶標介導之專一性內在化,而同型對照未顯示內在化。
相同地處理市售抗體(西妥昔單抗、尼妥珠單抗、賀癌平)且如上文所闡述使用各別表現靶標之細胞實施內在化。對於所有抗體,可觀察到靶標依賴性內在化,而同型對照未顯示內在化。
C-3 用於測定細胞滲透性之活體外測試
可在通量分析中使用Caco-2細胞藉助活體外測試研究物質之細胞滲透性[M.D.Troutman及D.R.Thakker,Pharm.Res.20(8),1210-1224(2003)]。出於此目的,在24孔濾板上將細胞培養15天至16天。為測定
滲透,在頂端(A)或在基底(B)將各別工作實例在HEPES緩衝液中施加至細胞並培育2小時。0小時後及2小時後,自順式隔室及反式隔室取出試樣。藉由HPLC(Agilent 1200,Böblingen,Germany)使用反相管柱分離試樣。經由Turbo Ion Spray Interface將HPLC系統耦合至三重四極桿質譜儀API 4000(Applied Biosystems Applera,Darmstadt,Germany)。基於Papp值評估滲透性,該Papp值係使用由Schwab等人[D.Schwab等人,J.Med.Chem.46,1716-1725(2003)]公開之公式來計算。當Papp(B-A)對Papp(A-B)之比率(流出比)>2或<0.5時,將物質分類為主動運輸。
對於在細胞內釋放之毒性基團至關重要的是自B至A之滲透性[Papp(B-A)]及Papp(B-A)對Papp(A-B)之比率(流出比):此滲透性愈低,物質穿過Caco-2細胞之單層之主動及被動運輸過程愈慢。若另外流出比不指示任何主動運輸,則物質在細胞內釋放後可在細胞中停留較長時間。因此,亦有較多時間與生物化學靶標發生相互作用(在此情形下:紡錘體驅動蛋白KSP/Eg5)。
C-4 用於測定針對P-糖蛋白(P-gp)之受質性質之活體外測試
許多腫瘤細胞表現用於藥物之運輸蛋白,且此通常伴隨發展抵抗細胞抑制劑之抗性。因此,例如不為該等運輸蛋白(例如P-糖蛋白(P-gp)或BCRP)之受質之物質可展現改良之活性譜。
使用過表現P-gp之LLC-PK1細胞(L-MDR1細胞)藉助通量分析測定針對P-gp(ABCB1)之物質之受質性質[A.H.Schinkel等人,J.Clin.Invest.96,1698-1705(1995)]。出於此目的,將LLC-PK1細胞或L
MDR1細胞在96孔濾板上培養3天至4天。為測定滲透,在頂端(A)或在基底(B)將各別測試物質單獨或在抑制劑(例如伊維菌素(ivermectin)或維拉帕米(verapamil))存在下在HEPES緩衝液中施加至細胞並培育2小時。0小時後及2小時後,自順式隔室及反式隔室取出試樣。藉由HPLC使用反相管柱分離試樣。經由Turbo Ion Spray Interface將HPLC系統耦合至三重四極桿質譜儀API 3000(Applied Biosystems Applera,Darmstadt,Germany)。基於Papp值評估滲透性,該Papp值係使用由Schwab等人[D.Schwab等人,J.Med.Chem.46,1716-1725(2003)]之公式來計算。當Papp(B-A)對Papp(A-B)之流出比>2時,將物質分類為P=gp受質。
作為評估P-gp受質性質之其他準則,可比較L-MDR1及LLC-PK1細胞中之流出比或在抑制劑存在或不存在下之流出比。若該等值相差超過2倍,則所述物質為P-gp受質。
C-5 藥物動力學
C5a:在活體外內在化之後鑑別ADC代謝物
方法之說明:
實施利用免疫結合物之內在化研究來分析在細胞內形成之代謝物。為此,將人類肺腫瘤細胞NCI H292(3×105/孔)接種於6孔板中並培育過夜(37℃,5% CO2)。用10μg/ml欲檢驗之ADC處理細胞。在37℃及5% CO2下實施內在化。在各個時間點(0h、4h、24h、48h、72h),取出細胞試樣用於進一步分析。首先,收穫上清液(約5ml),且在離心(2min,RT,1000rpm Heraeus Variofuge 3.0R)後,在-80℃下儲存。用PBS洗滌細胞並利用Accutase分離,並測定細胞數。在另一洗滌之後,用100μl溶解緩衝液(哺乳動物細胞溶解套組(Sigma MCL1)處理所定義數量之細胞(2×105)並在連續振盪(Thermomixer,15min,4℃,650rpm)下在Protein LoBind管(eppendorf目錄號0030
108.116)中培育。在培育後,對溶解產物進行離心(10min,4℃,12000g,eppendorf 5415R)並收穫上清液。在-80℃下儲存所獲得上清液。然後如下分析所有試樣。
在利用甲醇或乙腈沈澱蛋白質後藉由耦合至三重四極桿質譜儀(MS)之高效液相層析(HPLC)量測培養上清液或細胞溶解產物中之化合物。
為後處理50μl培養上清液/細胞溶解產物,添加150μl沈澱試劑(通常乙腈)並將混合物振盪10秒。沈澱試劑含有適宜濃度(通常在20ng/ml至100ng/ml之範圍內)之內標準品(ISTD)。在16000g下離心3分鐘後,將上清液轉移至自動進樣器小瓶中,利用500μl適於移動相之緩衝液補足並再次振盪。
然後使用來自AB SCIEX Deutschland GmbH之HPLC耦合之三重四極桿質譜儀API6500量測兩個基質試樣。
為進行校正,將0.5μg/l至2000μg/l之濃度添加至血漿試樣中。檢測限(LOQ)為約2μg/l。線性範圍自2μg/l延伸至1000μg/l。
為校正腫瘤試樣,將0.5μg/l至200μg/l之濃度添加至未處理腫瘤之上清液中。檢測限為4μg/l。線性範圍自4μg/l延伸至200μg/l。
用於測試有效性之品質對照含有5μg/l及50μg/l。
C5b:在活體內鑑別ADC代謝物
在i.v.投與3mg/kg至30mg/kg不同ADC後,可量測ADC及所出現任何代謝物之血漿及腫瘤濃度,且可計算藥物動力學參數,例如清除率(CL)、曲線下面積(AUC)及半衰期(t1/2)。
用於量化所出現之任何代謝物之分析
在利用甲醇或乙腈沈澱蛋白質後藉由耦合至三重四極桿質譜儀(MS)之高效液相層析(HPLC)量測血漿及腫瘤中之化合物。
為後處理50μl血漿,添加250μl沈澱試劑(通常乙腈)並將混合物
振盪10秒。沈澱試劑含有適宜濃度(通常在20ng/ml至100ng/ml之範圍內)之內標準品(ISTD)。在16000g下離心3分鐘後,將上清液轉移至自動進樣器小瓶中,利用500μl適於移動相之緩衝液補足並再次振盪。
在後處理腫瘤期間,利用一定量之萃取緩衝液將後者處理3次。萃取緩衝液含有50ml組織蛋白萃取試劑(Pierce,Rockford,IL)、兩團完全蛋白酶抑制劑混合劑(Complete-Protease-Inhibitor-Cocktail)(Roche Diagnostics GmbH,Mannheim,Germany)及最終濃度為1mM之苯基甲基磺醯氟(Sigma,St.Louis,MO)。在Tissuelyser II(Qiagen)中經20分鐘以最大衝程數將試樣均質兩次。將50μl均質物轉移至自動進樣器小瓶中並用150μl甲醇(包括ISTD)補足。在16000g下離心3分鐘後,用180μl適於移動相之緩衝液補充10μl上清液並再次振盪。然後使腫瘤試樣準備好進行量測。
然後使用來自AB SCIEX Deutschland GmbH之HPLC耦合之三重四極桿質譜儀API6500量測兩個基質試樣。
為進行校正,將0.5μg/l至2000μg/l之濃度添加至血漿試樣中。檢測限(LOQ)為約2μg/l。線性範圍自2μg/l延伸至1000μg/l。
為校正腫瘤試樣,將0.5μg/l至2000μg/l之濃度添加至未處理腫瘤之上清液中。檢測限為5μg/l。線性範圍自5μg/l延伸至200μg/l。
用於測試有效性之品質對照含有5μg/l及50μg/l,在血漿中另外500μg/l。
用於量化所用抗體之分析
使用配體結合分析(ELISA)作為在血漿試樣及腫瘤溶解產物中之總IgG濃度來測定ADC之抗體部分。此處,使用三明治(sandwich)ELISA格式。此ELISA已經量化及驗證用於在血漿及腫瘤試樣中測定。用抗人類山羊IgG Fc抗體塗覆ELISA板。在與試樣一起培育後,
洗滌各板並與猴抗人類IgG(H+L)抗體及辣根過氧化物酶(HRP)之檢測結合物一起培育。在另一洗滌步驟之後,將HRP受質添加至OPD中並經由490nm下之吸收監測色彩顯影。使用4參數方程式擬合具有已知IgG濃度之標準試樣。在量化下限(LLOQ)及量化上限(ULOQ)內,藉由內插測定未知濃度。
C-6 活體內活性測試
例如使用異種移植物模型測試本發明結合物之活性。熟習此項技術者熟悉在業內測試本發明化合物之活性之方法(例如參見WO 2005/081711;Polson等人,Cancer Res.2009年3月15日;69(6):2358-64)。為此,將表現結合劑之靶標分子之腫瘤細胞系植入齧齒類動物(例如小鼠)中。然後將本發明結合物、同型對照結合物、對照抗體或等滲鹽水投與植入動物。投與進行一次或超過一次。在若干天之培育時間後,藉由比較結合物處理之動物及對照組測定腫瘤之大小。結合物處理之動物展示更小腫瘤大小。
小鼠中實驗腫瘤之生長抑制/消退
將表現針對抗體藥物結合物之抗原之人類腫瘤細胞以皮下方式接種至免疫阻抑小鼠(例如NMRi裸鼠或SCID小鼠)之脅腹中。自細胞培養物分離100萬至1000萬個細胞,離心並再懸浮於培養基或培養基/基質膠中。在小鼠之皮膚下方注射細胞懸浮液。
在數天內,腫瘤生長。在確立腫瘤之腫瘤大小為約40mm2之後開始處理。為檢驗對較大腫瘤之效應,可僅在50mm2至100mm2之腫瘤大小下開始處理。
經由至小鼠尾靜脈中之靜脈內途徑實施ADC之治療。以5ml/kg之體積投與ADC。
治療方案取決於抗體之藥物動力學。作為標準,每四天連續治療三次。為進行快速評價,可採用利用單一治療之方案。然而,亦可
繼續治療,或可在稍後時間展開三個治療日之另一循環。
作為標準,每一治療組使用8隻動物。除投與活性物質之群組以外,一個群組係作為對照組根據相同方案僅利用緩衝液來治療。
在實驗期間,通常使用測徑器在兩個維度(長度/寬度)量測腫瘤面積。腫瘤面積係作為長度×寬度來測定。將治療組之平均腫瘤面積對對照組之比率闡述為T/C面積。
當治療結束後,實驗之所有群組皆在同一時間終止,可去除腫瘤並稱重。治療組之平均腫瘤重量對對照組之比率闡述為T/C重量。
D. 醫藥組合物之工作實例
可如下將本發明化合物轉化為醫藥調配物:
i.v.溶液:
將本發明化合物以低於飽和溶解度之濃度溶解於生理上可接受之溶劑(例如等滲鹽水溶液、D-PBS或在檸檬酸鹽緩衝液中具有甘胺酸及氯化鈉且添加聚山梨醇酯80之調配物)中。使該溶液經受無菌過濾並將其分配至無菌及無熱原之注射器皿中。
i.v.溶液:
可將本發明化合物轉化成所提及之投與形式。此可以本身已知之方式藉由與惰性、無毒、醫藥上適宜之賦形劑(例如緩衝液物質、穩定劑、增溶劑、防腐劑)「混合」或「溶解」於該等賦形劑中來實現。可存在例如以下物質:胺基酸(甘胺酸、組胺酸、甲硫胺酸、精胺酸、離胺酸、白胺酸、異白胺酸、蘇胺酸、麩胺酸、苯丙胺酸及其他)、糖及相關化合物(葡萄糖、蔗糖(saccharose)、甘露醇、海藻醣、蔗糖(sucrose)、甘露醣、乳糖、山梨醇)、甘油、鈉鹽、鉀、銨鹽及鈣鹽(例如氯化鈉、氯化鉀或磷酸氫二鈉及許多其他)、乙酸鹽/乙酸緩衝液系統、磷酸鹽緩衝液系統、檸檬酸及檸檬酸鹽緩衝液系統、緩血酸胺(TRIS及TRIS鹽)、聚山梨醇酯(例如聚山梨醇酯80及聚山梨醇酯
20)、泊洛沙姆(Poloxamer)(例如泊洛沙姆188及泊洛沙姆171)、聚乙二醇(PEG衍生物,例如3350)、Triton X-100、EDTA鹽、麩胱甘肽、白蛋白(例如人類)、尿素、苄醇、苯酚、氯甲酚、間甲酚、氯化苄烷銨及許多其他。
凍乾用於隨後轉化為i.v.、s.c.或i.m.溶液:
另一選擇為,可將本發明化合物轉化為穩定凍乾產物(可能借助於上文所提及賦形劑)且在投與之前,利用適宜溶劑(例如注射級水、等滲鹽水溶液)進行重構並投與。
除非本文詳細闡述,否則所有實例皆係使用熟習此項技術者已知之標準方法來實施。以下實例之分子生物學之常規方法可如標準實驗室手冊(例如Sambrook等人,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,第2版;Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Sping Harbor,N.Y.,1989)中所述來實施。
AK實例1:使用抗體庫製備抗體
使用完整人類噬菌體展示庫(Hoet RM等人,Nat Biotechnol 2005;23(3):344-8)藉由蛋白淘選(Hoogenboom H.R.、Nat Biotechnol 2005;23(3):1105-16)分離本發明之TWEAKR-專一性人類單株抗體,其中將人類及鼠類TWEAKR之二聚體Fc融合之細胞外域固定為靶標。
根據製造商之說明使用約2倍莫耳過量之生物素-LC-NHS(Pierce;目錄號21347)生物素化抗原並使用Zeba脫鹽管柱(Pierce;目錄號89889)脫鹽。在4℃下利用200nM生物素化抗原將洗滌磁珠
(DynaBeads)培育過夜並在4℃下利用阻斷緩衝液(具有3% BSA、0.05% Tween-20之PBS)阻斷1h。將經阻斷Fab噬菌體庫添加至經阻斷TWEAKR珠粒(DynaBeads鏈黴抗生物素蛋白-M280-Invitrogen 112-06D)中並在室溫下培育30min。在嚴格洗滌(利用阻斷緩衝液3次且利用具有0.05% Tween-20之PBS(150mM NaCl;8mM Na2HPO4;1.5mM KH2PO4;調節至pH=7.4-7.6)9次)後,將專一性結合至生物素化TWEAKR珠粒(DynaBeads鏈黴抗生物素蛋白-M280-Invitrogen 112-06D)之Fab噬菌體再懸浮於PBS中,且為進行擴增,其直接用於感染大腸桿菌菌株TG1。在第二輪選擇中,使用兩種鼠類TWEAKR(200nM)針對交叉反應性結合劑進行選擇,且在第三輪選擇中,降低人類TWEAKR之濃度(100nM)以增加針對高親和力結合劑之選擇壓力。
鑑別11種不同的Fab噬菌體並將相應抗體選殖至哺乳動物IgG表現載體中,此提供不存於可溶性Fab中之所缺少CH2-CH3域。在哺乳動物細胞中瞬時表現所得IgG,如在Tom等人,第12章在由Micheal R.Dyson及Yves Durocher編輯之Methods Express:Expression Systems,Scion Publishing Ltd,2007中所闡述。簡言之,將基於CMV啟動子之表現質體轉染至HEK293-6E細胞中並在費氏瓶(Fernbach bottle)或波動包中培育。在37℃下在F17培養基(Invitrogen)中表現5至6天。在轉染後24h添加1%超低IgG FCS(Invitrogen)及0.5mM丙戊酸(Sigma)作為補充物。藉由蛋白-A層析純化抗體且使用ELISA及BIAcore分析藉由其至可溶性單體TWEAKR之結合親和力進行進一步表徵,如AK-實例2中所闡述。
為測定抗TWEAKR抗體之細胞結合特徵,藉由流式細胞術檢驗至多種細胞系(HT29、HS68、HS578)之結合。將細胞懸浮於抗體(5μg/ml)於FACS緩衝液中之稀釋液中並在冰上培育1h。然後添加另一抗體(PE山羊-抗人類IgG,Dianova編號109-115-098)。在冰上培育1h後,藉由流式細胞術使用FACS陣列(BD Biosciences)分析細胞。
實施NF-κB報導基因基因分析來評價經鑑別之所有11抗體之激動活性(人類IgG1)。根據製造商之說明使用293fectin利用NF-κB報導基因構築體(BioCat,目錄號LR-0051-PA)瞬時轉染HEK293細胞。在37℃、5% CO2下將經轉染細胞接種至白色聚離胺酸塗覆之384孔板(BD)中之F17培養基(無血清;Invitrogen)中。第二天,利用各種濃度之純化抗體將細胞刺激6h,且然後使用標準方法實施螢光素酶分析。
經由抗TWEAKR抗體(CypHer 5E單NHS酯;GE Healthcare)之螢光標記監測內在化。在處理前,將HT29細胞(2×104/孔)接種於96孔MTP板(厚的,黑色,透明底部,編號4308776,Applied Biosystems)中之100μl培養基中。在37℃/5%CO2下培育18h後,更換培養基且以不同濃度(10μg/ml、5μg/ml、2.5μg/ml、1μg/ml、0.1μg/ml)添加經標記抗TWEAKR抗體。所選培育時間為0h、0.25h、0.5h、1h、1.5h、2h、3h、6h及24h。在InCell分析儀1000(GE Healthcare)中實施螢光量測。
針對其他活性及親和力成熟選擇具有最高活體外活性之抗體(TPP-883)。
TPP-883
SEQ ID NO.71
SEQ ID NO.72
TPP-883之輕鏈(SEQ ID NO.71)及重鏈(SEQ ID NO.72)之胺基酸序列;重鏈及輕鏈之CDR加以下劃線。
在第一輪突變收集中實施成熟,隨後重組彼等胺基酸修飾,從而最大限度的增加親和力及活性。為收集突變NNK(N=AGCT,K=G或T),藉由定點誘變使用合成寡核苷酸(包括NNK密碼子多樣化)(連續胺基酸命名法)在以下個別胺基酸位置處實施隨機化:在CDR-L1中S35、S36、Y37及N39;在CDR-L2中A51、S53、S54、Q56及S57;在CDR-L3中S92、Y93、S94、S95、G97及I98;在CDR-H1中P31、Y32、P33、M34及M35;在CDR-H2中Y50、S52、P53、S54、G56、K57及H59;在CDR-H3中G99、G100、D101、G102、Y103、F104、D105及Y106。將所有個別NNK飽和誘變庫之DNA選殖至哺乳動物IgG表現載體中用於活性成熟或至噬菌粒載體中用於親和力成熟。藉由噬菌體淘選實施親和力成熟。在4℃下將洗滌磁珠(DynaBeads)與10
nM、1nM、100pM或10pM生物素化抗原一起培育過夜並在4℃下利用阻斷緩衝液(具有3% BSA、0.05% Tween-20之PBS)阻斷1h。與理論庫複雜度相比將經阻斷Fab噬菌體庫以10000倍、1000倍或100倍過量添加至經阻斷TWEAKR-DynaBeads中並在室溫下培育30min。那意味著總共遵循12種策略(4個抗原濃度×3個Fab噬菌體效價)。在嚴格洗滌(利用阻斷緩衝液3次且利用具有0.05% Tween-20之PBS 9次)後,將專一性結合至生物素化TWEAKR DynaBeads(DynaBeads鏈黴抗生物素蛋白-M280-Invitrogen 112-06D)之Fab噬菌體再懸浮於PBS中,且為進行擴增,其直接用於感染大腸桿菌菌株TG1。在第二輪選擇中,降低人類TWEAKR-Fc之濃度(1nM、100pM、10pM及1pM),且對於所有12種策略均使用相同Fab噬菌體效價(4.4×1011)。對於可溶性Fab之表現,利用MluI消化噬菌粒載體以在噬菌體上去除為Fab展示所需要之基因-III膜錨定序列,且重新連接載體。使12種選擇庫中之每一者之96種變體作為可溶性Fab表現且以ELISA格式進行檢驗。為此,抗原塗覆2.5nM生物素化TWEAKR-Fc,且使用抗c-Myc抗體(Abcam ab62928)證明可溶性Fab之結合。證明7種單一取代變體(連續胺基酸命名法)至TWEAKR-Fc(Seq ID No 138)之結合均有所改良:CDR-L1之S36G、CDR-L2之A51Q及S57K、CDR-L3之S94T及G97F、CDR-H1之M35I及CDR-H3之G102T。對於活性成熟,利用NF-κB報導基因(BioCat,目錄號LR-0051-PA)轉染HEK293細胞。將經轉染細胞接種於白色聚離胺酸塗覆之384孔板(BD)中之F17培養基(無血清;Invitrogen)中,並在哺乳動物細胞中瞬時表現NNK多樣化位置抗體(人類IgG1)庫之個別變體。第二天,利用所表現之個別NNK抗體變體將NF-κB報導基因細胞刺激6h,且然後使用標準方法實施螢光素酶分析。檢測到1種具有改良之激動活性之單一取代變體:CDR-H3之G102T。亦藉由親和力成熟獲得此變體,且在彼處其亦顯示親和力之
最高增強。在藉由親和力及活性篩選收集突變之後,將所有7種有利之個別取代(庫複雜度:128種變體)重組成重組庫。為此,合成寡核苷酸以在每一所選位置處引入所選突變或相應野生型胺基酸。使用接續幾輪重疊延伸PCR建立庫。將最終PCR產物連接至細菌可溶性Fab表現載體中,並隨機選擇528種變體(獲得約4倍過量之試樣)以利用可溶性Fab進行平衡ELISA篩選,如上文所闡述。最後,基於與最佳單一取代變體G102T相比有所增加之親和力選出7種變體。將該等之相應DNA選殖至哺乳動物IgG表現載體中並在上文所提及之NF-κB報導基因細胞分析中檢驗功能活性。最後,將所獲得序列與人類生殖細胞系序列相比較,且修改對親和力及效能無任何顯著效應之偏差。藉由抗體庫篩選及藉由親和力及/或活性成熟獲得具有下文序列之抗體:
TPP-2090
SEQ ID NO.1:
SEQ ID NO.2:
TPP-2090之輕鏈(SEQ ID NO.1)及重鏈(SEQ ID NO.2)之胺基酸序列;
重鏈及輕鏈之CDR均加以下劃線。基於TPP-2090之序列,藉由定點誘變生成無糖基化抗體TPP-2090-HC-N297A(在重鏈N297A(Kabat,EU編號)中包含突變)及TPP-2090-HC-N-297Q(在重鏈N297Q(Kabat,EU編號)中包含突變):
TPP-2090-HC-N297A
輕鏈:
重鏈:
TPP-2090-HC-N297Q
輕鏈:
重鏈:
TPP-2149
SEQ ID NO.11
SEQ ID NO.12
TPP-2149之輕鏈(SEQ ID NO.11)及重鏈(SEQ ID NO.12)之胺基酸序列鏈;重鏈及輕鏈之CDR均加以下劃線。
TPP-2093
SEQ ID NO.21
SEQ ID NO.22
TPP-2093之輕鏈(SEQ ID NO.21)及重鏈(SEQ ID NO.22)之胺基酸序列;重鏈及輕鏈之CDR均加以下劃線。
TPP-2148
SEQ ID NO.31
SEQ ID NO.32
TPP-2148之輕鏈(SEQ ID NO.31)及重鏈(SEQ ID NO.32)之胺基酸
序列;重鏈及輕鏈之CDR均加以下劃線。
TPP-2084
SEQ ID NO.41
SEQ ID NO.42
TPP-2084之輕鏈(SEQ ID NO.41)及重鏈(SEQ ID NO.42)之胺基酸序列;重鏈及輕鏈之CDR均加以下劃線。
TPP-2077
SEQ ID NO.51
SEQ ID NO.52
TPP-2077之輕鏈(SEQ ID NO.51)及重鏈(SEQ ID NO.52)之胺基酸序列;重鏈及輕鏈之CDR均加以下劃線。
TPP-1538
SEQ ID NO.61
SEQ ID NO.62
TPP-1538之輕鏈(SEQ ID NO.61)及重鏈(SEQ ID NO.62)之胺基酸序列;重鏈及輕鏈之CDR均加以下劃線。
TPP-1854
SEQ ID NO.81
SEQ ID NO.82
TPP-1854之輕鏈(SEQ ID NO.81)及重鏈(SEQ ID NO.82)之胺基酸序列;重鏈及輕鏈之CDR均加以下劃線。
TPP-1853
SEQ ID NO.91
SEQ ID NO.92
TPP-1853之輕鏈(SEQ ID NO.91)及重鏈(SEQ ID NO.92)之胺基酸序列;重鏈及輕鏈之CDR均加以下劃線。
TPP-1857
SEQ ID NO.101
SEQ ID NO.102
TPP-1857之輕鏈(SEQ ID NO.101)及重鏈(SEQ ID NO.102)之胺基酸序列;重鏈及輕鏈之CDR均加以下劃線。
TPP-1858
SEQ ID NO.111
SEQ ID NO.112
TPP-1858之輕鏈(SEQ ID NO.111)及重鏈(SEQ ID NO.112)之胺基酸序列;重鏈及輕鏈之CDR均加以下劃線。
實例2:抗體之生物化學特徵
藉由Biacore分析測定結合親和力:
藉由在Biacore T100儀器(GE Healthcare Biacore,Inc.)上使用表面電漿共振分析來檢驗抗TWEAKR抗體之結合親和力。使用間接捕獲試劑抗人類IgG(Fc)將抗體固定於CM5感測器晶片上。如製造商所闡述使用「人類抗體捕獲套組」(BR-1008-39,GE Healthcare Biacore,Inc.)之試劑。以10μg/ml之濃度以10μl/min將抗TWEAKR抗體注射10sec。
將各個濃度(200nM、100nM、50nM、25nM、12.5nM、6.25nM、3.12nM、1.56nM)之於HEPES-EP緩衝液(GE Healthcare Biacore,Inc.)中之經純化重組人類TWEAKR蛋白(TPP-2305,SEQ ID NO:168)在經固定抗TWEAKR抗體上以60μl/min之流速注射3分鐘,解離時間為5分鐘。在依次進行在線參考細胞校正、緩衝液試樣扣除後生成感測圖。基於締合常數(kon)與解離常數(koff)之比率來計算解離常
數(KD),該等常數係藉由使用一階1:1結合模型擬合感測圖獲得。
經確定本發明抗體以中等親和力(KD 10-200nM)結合TWEAKR,而一些比較抗體(例如PDL-192(TPP-1104)、136.1(TPP-2194)、18.3.3(TPP-2193)、P4A8(TPP-1324)、P3G5(TPP-2195)、P2D3(TPP-2196)、ITEM-1、ITEM-4)顯示高親和力結合(0.7-3.7nM)。抗體PDL-192、136.1、18.3.3、P4A8、P3G5及P2D3之可變域之序列係獲自專利文獻WO2009/020933及WO2009/140177,且添加編碼人類IgG1及鼠類IgG2之恆定區之序列,產生全長IgG PDL-192(TPP-1104)、136.1(TPP-2194)、18.3.3(TPP-2193)、P4A8(TPP-1324)、
P3G5(TPP-2195)、P2D3(TPP-2196)。在此研究中量測之親和力之範圍與所公開之數據充分一致:對於PDL-192,18.3.3及136.1,已公開5.5nM、0.2nM及0.7nM之KD值(WO2009/020933);對於P4A8 2.6nM(WO2009/140177)。為進行比較:天然配體TWEAK以0.8nM至2.4nM之KD值結合TWEAKR(Immunity.2001年11月;15(5):837-46;Biochem J.2006年7月15日;397(2):297-304;Arterioscler Thromb Vasc Biol.2003年4月1日;23(4):594-600)。
因此,可表明本發明抗體(TPP-883、TPP-1538、TPP-2077、TPP-2084、TPP-2148、TPP-2093、TPP-2149及TPP-2090)以中等親和力(KD 10-200nM)結合TWEAKR。
使用TWEAKR胞外域之N末端及C末端截短之變體表徵TPP-2090之結合表位:
不同物種之TWEAKR(胺基酸34-68)之富半胱胺酸域之比對(圖1-比對)顯示其在所有6種經分析物種中充分保守。PDL-192端視R56而結合(WO2009/020933:圖2B)且因此並不結合至大鼠、豬及小鼠TWEAKR。TPP-2090端視保守胺基酸D47而結合,且因此結合至所顯示之所有物種。
在表徵上文所提及抗體之結合表位之第一方法中,生成TWEAKR胞外域之N末端及C末端截短之突變體且檢驗其結合各種抗TWEAKR抗體之能力。在N末端缺失胺基酸28至33且在C末端缺失胺基酸69至80,使得在Cys36至Cys49、Cys52至Cys67及Cys55至Cys64之間具有二硫橋之富半胱胺酸域保持完整(比較圖2)。兩種構築體(完全胞外域28-80,包括N末端及C末端及經截短胞外域34-68)分別作為Fc融合蛋白TPP-2202及TPP-2203來表現及純化。
為分析結合,塗覆1μg/ml相應二聚體TWEAKR Fc構築體,且使用0.3μg/ml及0.08μg/ml生物素化IgG作為可溶性結合配體。使用鏈黴
抗生物素蛋白-HRP及Amplex Red受質實施檢測。根據製造商之說明使用約2倍莫耳過量之生物素-LC-NHS(Pierce;目錄號21347)生物素化IgG且使用Zeba脫鹽管柱(Pierce;目錄號89889)脫鹽。在可溶性配體所使用之所有濃度下,本發明抗體皆展現至兩種構築體之飽和結合,而抗體P4A8(TPP-1324)、P3G5(TPP-2195)及Item-4僅顯示至全長胞外域之飽和結合,但至N末端及C末端截短構築體之結合有所減弱(圖3及圖4)。此顯示本發明抗體之結合表位位於胺基酸34至68之間之富半胱胺酸域中。為分析P4A8(TPP-1324)及P3G5(TPP-2195)之結合是否要求TWEAKR胞外域之N末端或C末端,生成具有胺基酸69至80之C末端缺失之單體胞外域。P4A8(TPP-1324)及P3G5(TPP-2195)至C末端經截短TWEAKR胞外域之結合同樣有所減弱,而本發明抗體顯示飽和結合(圖5)。
因此,富半胱胺酸域中TPP-2090、TPP-2084、PDL-192(TPP-
1104)及136.1(TPP-2194)之結合表位及P4A8(TPP-1324)及P3G5(TPP-2195)之結合表位至少部分地位於富半胱胺酸域之外部。
TWEAKR-Fc突變蛋白對抗體親和力之效應
為更詳細的檢驗本發明抗體之結合特徵,研究據表明對於已知激動性抗體(WO2009/140177)之活性具有相關性之TWEAKR之某些突變蛋白。為此,具有以下個別胺基酸取代之全長胞外域(胺基酸28-80)係作為Fc融合蛋白來表現及純化:T33Q;S40R;W42A;M50A;R56P;H60K;L65Q。
為獲得劑量反應數據,以低濃度(62ng/ml)將不同TWEAKR-Fc突變蛋白塗覆至384孔Maxisorb ELISA板上,且使用生物素化IgG之連續2倍稀釋物(以100nM之濃度開始)作為可溶性結合配體。使用鏈黴抗生物素蛋白-HRP及Amplex Red實施檢測。所檢驗之IgG為本發明之TPP-2090及TPP-2084、WO2009/020933之PDL-192、136.1及18.3.3、WO2009/140177之P4A8及P3G5及Nakayama等人[Biochem Biophys Res Com 306:819-825]之ITEM-1及ITEM-4。
根據製造商之說明使用約2倍莫耳過量之生物素-LC-NHS(Pierce;目錄號21347)生物素化IgG並使用Zeba脫鹽管柱(Pierce;目錄號89889)脫鹽。擬合劑量反應數據並測定IC50。為闡釋結果,生成表格;「-「標記超過50nM之IC50,「+」標記在1pM至150pM範圍內之IC50。
如已公開,ITEM-4顯示至H60K突變蛋白[WO2009/140177:圖23F]之結合有所減弱且PDL-192顯示至R56P突變蛋白[WO2009/020933:圖22B]之結合有所減弱。與所公開數據相比,ITEM-1顯示至R56P之結合有所減弱,且所有抗體皆顯示至W42A[WO2009/140177:圖23E、圖23F]之結合有所減弱。該等差異可藉由所選方法來解釋。
與ITEM-1、ITEM-4、PDL-192、136.1及18.3.3相比,本發明之抗體獨立於除W42A以外之所有取代來結合。
富半胱胺酸域之丙胺酸掃描:
實施富半胱胺酸域(胺基酸34-68)之丙胺酸掃描以便定位本發明抗體之結合位置。圖6顯示TWEAKR之全長胞外域之N末端及C末端經截短之變體並未減弱本發明抗體之結合。因此,結合表位位於富半胱胺酸域中。將以下取代引入TWEAKR(34-68)Fc構築體中:S37A、R38A、S40A、S41A、W42A、S43A、D45A、D47A、K48A、D51A、S54A、R56A、R58A、P59A、H60A、S61A、D62A、F63A及L65A。
該等TWEAKR(34-68)Fc突變蛋白表現於HEK293細胞中。為獲得劑量反應數據,以1μg/ml之濃度將IgG塗覆至384孔Maxisorp ELISA板上,且使用包含TWEAKR突變蛋白之上清液之連續2倍稀釋液作為可溶性結合配體。使用抗HIS-HRP及Amplex Red實施檢測。所檢驗IgG為本發明之TPP-2090、WO2009/020933之PDL-192及WO2009/140177之P4A8。
為評價TWEAKR突變蛋白對於至各種IgG之結合之相關性,製備某一突變蛋白濃度下之相關墨點。舉例而言,圖6顯示對於TWEAKR表現肉汁之稀釋8倍之上清液之相關墨點,其中PDL-192(TPP-1104)在X軸上且TPP-2090在Y軸上。該墨點顯示TPP-2090之結合因取代D47A
而有所減弱,且PDL-192(TPP-1104)之結合因取代R56A而有所減弱。證實構築體皆未結合至P4A8(TPP-1324),此與上文所獲得之結果一致(圖6)。因此,P4A8表位至少部分地位於富半胱胺酸域之外部。對於抗體相互作用針對某些TWEAKR胺基酸鑑別之依賴性與針對該等抗體測定之激動活性相關。天然配體TWEAK顯示TWEAKR之有效活化且端視TWEAKR之富半胱胺酸域中之白胺酸46而結合(Pellegrini等人,FEBS 280:1818-1829)。P4A8展現極低激動活性且至少部分地與TWEAKR之富半胱胺酸域外部之域發生相互作用。PDL-192展現中等激動活性且端視R56結合至富半胱胺酸域,但在TWEAK配體位置對面結合。TPP-2090及TWEAK結合分別取決於D47及L46,且其因此結合至類似結合位置(圖7)。
可推斷本發明抗體(例如TPP-2090)以端視D47之方式結合至TWEAKR。
針對某些TWEAKR胺基酸對抗體相互作用鑑別之依賴性與針對該等抗體測定之激動活性相關。天然配體TWEAK顯示TWEAKR之有效活化且端視TWEAKR之富半胱胺酸域中之白胺酸46而結合(Pellegrini等人,FEBS 280:1818-1829)。P4A8展現極低激動活性且至少部分地與TWEAKR之富半胱胺酸域外部之域發生相互作用。PDL-192展現中等激動活性且端視R56結合至富半胱胺酸域,但在TWEAK配體位置之對面結合。本發明抗體(實例TPP-2090)結合以端視D47之方式結合,且TWEAK以端視L46之方式結合,且結合至類似但不同之結合位點(圖7)。因此,展現強激動活性之本發明抗體結合至於抗體而言與極高激動活性相關之新穎表位(D47依賴性)。有趣的是應注意Michaelson等人(參見第369頁,左欄,Michaelson JS等人,MAbs.2011年7月至8月;3(4):362-75中)針對由該等人檢驗之所有激動性抗體皆具有弱於天然配體TWEAK之激動活性之事實作出解釋。其推斷降
低之效能可隨抗體與TWEAKR之二聚體結合相互作用而變化,其中TWEAK可能進入三聚體相互作用中。因此令人驚奇的結果係本發明抗體儘管與TWEAKR具有二聚體相互作用,但其具有甚至更高之激動活性。此令人驚奇之活性與本發明抗體之專一性結合性質、亦即至TWEAKR之D47之專一性結合相關。
<110> 德商拜耳製藥公司
<120> 位置專一性之具有KSP抑制劑之均質結合物
<130> BHC 15 1 042 FC
<160> 245
<170> BiSSAP 1.3
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 抗體組份
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<211> 449
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 抗體組份
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<211> 214
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 抗體組份
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 抗體組份
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 抗體組份
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<212> PRT
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<220>
<223> 抗體組份
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<220>
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<220>
<223> 抗體組份
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<220>
<223> 抗體組份
<400> 244
<210> 245
<211> 449
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 抗體組份
<400> 245
Claims (49)
- 一種結合劑(binder)或其衍生物與一或多種活性化合物分子之結合物(conjugate),該活性化合物分子為紡錘體驅動蛋白抑制劑,經由連接體L連接至該結合劑,其中該連接體L連接至該結合劑之麩醯胺酸側鏈,其中1至5個紡錘體驅動蛋白抑制劑連接至該連接體L,其中連接至該連接體L之紡錘體驅動蛋白抑制劑具有以下式(IIa):
- 如請求項1之結合物,其中X1表示CH,X2表示C且X3表示N。
- 如請求項1或2之結合物,其中該取代基R1或取代基R3表示-L-#1。
- 一種結合劑或其衍生物與活性化合物分子之結合物,該活性化合物分子為紡錘體驅動蛋白抑制劑,經由連接體L連接至該結合劑,其中該連接體L連接至該結合劑之麩醯胺酸側鏈,其中該紡錘體驅動蛋白抑制劑具有以下子結構:
- 如請求項4之結合物,其中該紡錘體驅動蛋白抑制劑係由通式(Ia)表示:
- 如前述請求項中任一或多項之結合物,其中該連接體L係連接至該結合劑之麩醯胺酸側鏈,其中1至5個紡錘體驅動蛋白抑制劑連接至該連接體L,其中該活性化合物分子連接體係由通式(II)表示:
- 如請求項6之結合物,R1表示 -H、-L-#1或-(CH2)0-3Z,其中-L-#1 表示該連接體且#1表示至該結合劑或其衍生物之鍵,其中Z 表示-H、-OY3、-SY3、-NHY3、-C(=O)-NY1Y2或-C(=O)-OY3, 其中Y1及Y2彼此獨立地表示-H、-NH2、-(CH2CH2O)0-3-(CH2)0-3Z‘或-CH(CH2W)Z‘,其中Y3 表示-H或-(CH2)0-3Z‘,其中Z‘ 表示-H、-NH2、-COOH、-NH-C(=O)-CH2-CH2-CH(NH2)COOH或-(C(=O)-NH-CHY4)1-3COOH,其中W 表示-H或-OH,其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基;R2及R4 彼此獨立地表示-L-#1、-H或-C(=O)-CHY4-NHY5,其中-L-#1 表示該連接體且#1表示至該結合劑或其衍生物之鍵,其中Y4 表示視情況經-NH-C(=O)-NH2取代之直鏈或具支鏈C1-6-烷基,或表示視情況經-NH2取代之芳基或苄基,其中Y5 表示-H或-C(=O)-CHY6-NH2,其中Y6 表示直鏈或具支鏈C1-6-烷基;或R2及R4 一起(形成吡咯啶環)表示-CH2-CHR10-,其中R10 表示-L-#1、-H、-NH2、-SO3H、-COOH、-SH或-OH,其中L-#1 表示該連接體且#1表示至該結合劑或其衍生物之鍵,A 表示-C(=O);R3 表示-(CH2)OH或-L-#1,其中-L-#1 表示該連接體且#1表示至該結合劑或其衍 生物之鍵,R5 表示-L-#1或-H,其中-L-#1 表示該連接體且#1表示至該結合劑或其衍生物之鍵,其中該等取代基R1、R2、R3、R4及R5中之一者表示-L-#1,及其鹽、溶劑合物、溶劑合物之鹽,及差向異構物。
- 如請求項6之結合物,其中R6及R7彼此獨立地表示H、C1-3-烷基或鹵素。
- 如請求項6之結合物,其中R8表示C1-4-烷基(較佳第三丁基)。
- 如請求項6之結合物,其中R9表示H。
- 如請求項6之結合物,其中R6及R7表示F。
- 如前述請求項中任一或多項之結合物,其中該結合劑或其衍生物係結合劑肽或蛋白質或結合劑肽或蛋白質之衍生物。
- 如前述請求項中任一或多項之結合物,其中該結合物於每一結合劑具有2個結合位置(conjugation sites)。
- 如前述請求項中任一或多項之結合物,其中該結合物於每一結合劑具有4個結合位置。
- 如請求項12至14中任一或多項之結合物,其中該結合劑肽或蛋白質表示抗體或該結合劑肽或蛋白質之衍生物,其包含可由轉麩醯胺酸酶識別之受體麩醯胺酸側鏈。
- 如請求項12至15中任一或多項之結合物,其係由轉麩醯胺酸酶介導之結合產生。
- 如請求項12至16中任一或多項之結合物,其係使用源於茂源鏈黴菌(Streptomyces Mobaraensis)之轉麩醯胺酸酶產生。
- 如前述請求項中任一或多項之結合物,其中該結合劑結合至癌症靶標分子。
- 如請求項18之結合物,其中該結合劑結合至細胞外靶標分子。
- 如請求項19之結合物,其中該結合劑在結合至該細胞外靶標分子後由表現該靶標分子之細胞內在化並在細胞內(較佳藉由溶酶體)處理。
- 如請求項12至20中任一或多項之結合物,其中該結合劑肽或蛋白質係人類、人類化或嵌合單株抗體或其抗原結合片段。
- 如前述請求項中任一或多項之結合物,其中該結合劑肽或蛋白質係在重鏈中、視情況在CH2域內具有受體麩醯胺酸殘基之抗體。
- 如請求項22之結合物,其中該結合劑肽或蛋白質係在重鏈中位置295(KABAT編號系統)具有受體麩醯胺酸殘基之抗體。
- 如請求項22之結合物,其中該結合劑肽或蛋白質係包含N297X取代之抗體,其中X係除天冬醯胺酸以外之任一胺基酸;甚至更佳者係N297D、N297Q、N297S或N297A,極佳者係N297A及N297Q。
- 如請求項22之結合物,其中該結合劑肽或蛋白質係包含N297Q取代及Q295X取代之抗體,其中X係除麩醯胺酸以外之任一胺基酸,較佳者係Q295N。
- 如前述請求項中任一或多項之結合物,其中該結合劑肽或蛋白質係包含天冬醯胺酸在殘基297而實質上缺乏N連接糖基化之抗體。
- 如請求項26之結合物,其中該結合劑肽或蛋白質係在產生缺乏N-連接糖基化在胺基酸殘基N297之抗體之宿主細胞中產生之抗體。
- 如前述請求項中任一或多項之結合物,其中該結合劑肽或蛋白質係抗HER2抗體、抗EGFR抗體、抗TWEAKR抗體或其抗原-結 合片段。
- 如請求項28之結合物,其中該抗TWEAKR抗體專一性結合至TWEAKR(SEQ ID NO:169)之位置47胺基酸D(D47),較佳抗TWEAKR抗體為TPP2090及其無糖基化變體。
- 如請求項28及29之結合物,其中該抗TWEAKR抗體專一性結合至TWEAKR(SEQ ID NO:169)之位置47胺基酸D(D47),較佳抗TWEAKR抗體為TPP-2090-HC-N297A或TPP-2090-HC-N297Q。
- 如前述請求項中任一或多項之結合物,其中該連接體L連接至該結合劑之麩醯胺酸側鏈,其中1至5個紡錘體驅動蛋白抑制劑連接至該連接體L,其中該連接體L具有以下基本結構(i)至(iv)中之一者:(i)-(C=O)m-SG1-L1-L2- (ii)-(C=O)m-L1-SG-L1-L2- (iii)-(C=O)m-L1-L2- (iv)-(C=O)m-L1-SG-L2其中m係0或1,SG及SG1係活體內可裂解基團,L1彼此獨立地表示在活體內不可裂解之有機基團,且L2表示至該結合劑之偶合基團。
- 如請求項31之結合物,其中該連接體L連接至該結合劑之麩醯胺酸側鏈,其中1至5個紡錘體驅動蛋白抑制劑連接至該連接體L,其中該活體內可裂解基團SG係2至8個寡肽基團,較佳二肽基團,或二硫化物、腙、縮醛或胺縮醛(aminal),且SG1係2至8個寡肽基團,較佳二肽基團。
- 如請求項31之結合物,其中該連接體連接至麩醯胺酸側鏈且具有下式:§-(C=O)m-L1-L2-§§ 其中m係0或1;§表示至該活性化合物分子之鍵且§§表示至該結合劑肽或蛋白質之鍵,且L1表示-(NR10)n-(G1)o-G3-,其中R10表示-H、-NH2或C1-C3-烷基; G1表示-NH-C(=O)-或;n為0或1;o係0或1;且G3表示鍵或視情況經取代之直鏈或具支鏈烴鏈,該烴鏈具有來自伸芳基及/或直鏈及/或具支鏈及/或環狀伸烷基之1至100個碳原子且其可由以下基團中之一或多者間雜一次或超過一次:-O-、-S-、-S(=O)-、-S(=O)2-、-NH-、-C(=O)-、-NMe-、-NHNH-、-S(=O)2-NHNH-、-NH-C(=O)-、-C(=O)-NH-、-C(=O)-NHNH-及具有多至4個選自由-N-、-O-及-S-、-S(=O)-或-S(=O)2-組成之群之 雜原子之5員至10員芳香族或非芳香族雜環(較佳或 ),其中該等側鏈若存在,則可經以下取代:-NH-C(=O)-NH2、-COOH、-OH、-NH2、-NH-CN-NH2、磺醯胺、碸、亞碸或磺酸,或表示以下基團中之一者:
- 如請求項33之結合物,其中該烴鏈間雜有以下基團中之一者:
- 如請求項31至34中任一或多項之結合物,其中L2係以下基團中之一者: L2係
- 如請求項35之結合物,其中Ry係-H或-NH-C(=O)-CH3。
- 如請求項35或36之結合物,其中R1或R4表示-L-#1。
- 如前述請求項中任一或多項之結合物,其中該抗TWEAKR抗體係激動性(agonistic)抗體。
- 如前述請求項中任一或多項之結合物,其中該結合劑肽或蛋白質係包含以下之抗體:可變重鏈,其包含:a.由包含式PYPMX之胺基酸序列(SEQ ID NO:171)編碼之重鏈之CDR1,其中X係I或M;b.由包含式YISPSGGXTHYADSVKG之胺基酸序列(SEQ ID NO:172)編碼之重鏈之CDR2,其中X係S或K;及c.由包含式GGDTYFDYFDY之胺基酸序列(SEQ ID NO:173)編碼之重鏈之CDR3;及可變輕鏈,其包含:d.由包含式RASQSISXYLN之胺基酸序列(SEQ ID NO:174)編碼之輕鏈之CDR1,其中X係G或S; e.由包含式XASSLQS之胺基酸序列(SEQ ID NO:175)編碼之輕鏈之CDR2,其中X係Q、A或N;及f.由包含式QQSYXXPXIT之胺基酸序列(SEQ ID NO:176)編碼之輕鏈之CDR3,其中位置5之X係T或S,位置6之X係T或S且位置8之X係G或F。
- 如前述請求項中任一或多項之結合物,其中該結合劑肽或蛋白質係包含以下之抗體:a.如SEQ ID NO:10中所示之重鏈之可變序列及如SEQ ID NO:9中所示之輕鏈之可變序列,或b.如SEQ ID NO:20中所示之重鏈之可變序列及如SEQ ID NO:19中所示之輕鏈之可變序列,或c.如SEQ ID NO:30中所示之重鏈之可變序列及如SEQ ID NO:29中所示之輕鏈之可變序列,或d.如SEQ ID NO:40中所示之重鏈之可變序列及如SEQ ID NO:39中所示之輕鏈之可變序列,或e.如SEQ ID NO:50中所示之重鏈之可變序列及如SEQ ID NO:49中所示之輕鏈之可變序列,或f.如SEQ ID NO:60中所示之重鏈之可變序列及如SEQ ID NO:59中所示之輕鏈之可變序列,或g.如SEQ ID NO:70中所示之重鏈之可變序列及如SEQ ID NO:69中所示之輕鏈之可變序列,或h.如SEQ ID NO:80中所示之重鏈之可變序列及如SEQ ID NO:79中所示之輕鏈之可變序列,或i.如SEQ ID NO:90中所顯示之重鏈之可變序列及如SEQ ID NO:89中所示之輕鏈之可變序列,或j.如SEQ ID NO:100中所示之重鏈之可變序列及如SEQ ID NO:99中所示之輕鏈之可變序列,或k.如SEQ ID NO:110中所示之重鏈之可變序列及如SEQ ID NO:109中所示之輕鏈之可變序列,或l.如SEQ ID NO:120中所示之重鏈之可變序列及如SEQ ID NO:119中所示之輕鏈之可變序列。
- 如前述請求項中任一或多項之結合物,其中該抗體係IgG抗體。
- 一種製備如前述請求項中任一或多項之結合物之方法,其中下式中之一之化合物(較佳呈其三氟乙酸鹽形式)係使用轉麩醯胺酸酶結合至結合劑肽或蛋白質之殘基,其中相對於該結合劑肽或蛋白質,該化合物較佳以2倍至100倍莫耳過量使用:
- 一種具有下式中之一之化合物,
- 一種具有以下式中之一之結合物,其中Ak3a、Ak3b、AD3d、Ak3e表示結合劑、較佳為抗體,且n表示2至10,較佳2至4,且亦較佳2或4:
- 如請求項1至44中任一或多項之結合物,其中該結合劑肽或蛋白質表示抗體或下式之結合劑肽或蛋白質衍生物
- 一種醫藥組合物,其包含如請求項1至43之結合物或如請求項44或45之化合物與惰性無毒之醫藥上適宜之輔助物組合。
- 如請求項1至43中任一或多項之結合物或如請求項44或45之化合物,其用於用以治療及/或預防疾病之方法中。
- 如請求項1至43中任一或多項之結合物或如請求項44或45之化合物,其用於用以治療過度增殖及/或血管生成病症之方法中。
- 一種至少一種如請求項1至43中任一項之結合物或如請求項44或45之化合物之用途,其用於製造用以治療及/或預防人類及動物之過度增殖及/或血管生成病症之藥劑。
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