TW201100798A - Method for prediction of therapeutic effect of chemotherapy employing expression level of dihydropyrimidine dehydrogenase gene as measure - Google Patents

Method for prediction of therapeutic effect of chemotherapy employing expression level of dihydropyrimidine dehydrogenase gene as measure Download PDF

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TW201100798A TW099116342A TW99116342A TW201100798A TW 201100798 A TW201100798 A TW 201100798A TW 099116342 A TW099116342 A TW 099116342A TW 99116342 A TW99116342 A TW 99116342A TW 201100798 A TW201100798 A TW 201100798A
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201100798 六、發明說明: 【發明所屬之技術領域3 技術領域 本發明係有關於:一種預測對替加氟-吉美嘧啶-奧替拉 西卸複合劑(combination preparation of tegafur,gimeracil and oteracil potassium)及順銘(cisplatin)之併用化學療法之 治療效果的方法;一種用來對患者投藥之抗腫瘤劑,其中 該患者係被預測為對該併用化學療法顯示高延命效果者; 引子對及套組。 背景技術 作為針對進行性胃癌之化學療法,在國内外已有下述 抗腫瘤劑以單劑或併用之形式作臨床應用:5-氟尿嘧咬 (5-fluorouracil ;以下稱為5_FU)、順鉑、愛萊諾迪肯 (irinotecan)、多西紫杉醇(d〇cetaxel)、替加氟-尿α密嚏複合劑 (商品名:UFT®)、替加氟-吉美嘧啶-奥替拉西鉀複合劑(商 品名:TS-1®,以下,將替加氟、吉美嘧啶及奥替拉西鉀以 莫耳比1 : 0_4 : 1所調配出之製劑稱為TS_i。)等。在歐美雖 是以5-FU與順鉑之併用化學療法為標準療法,然而其延命 效果尚非可令人滿意者,而TS-1與順鉑之併用化學療法正 被視為可顯示更高延命效果之併用化學療法而備受期待 (非專利文獻1與非專利文獻2)。 習知技術文獻 非專利文獻 201100798 [非專利文獻 1] Cancer 2007; 109 : 33-40.
[非專利文獻2] J. Clin. Oncol 2006; 24 : 663-667. 【發明内容3 發明概要 發明欲解決之課題 本發明係以提供一種併用化學療法為目的,該併用化 學療法對騎性胃癌患者”,絲包含二脫氫酶 抑制劑但包含5_FU之歐美_療法她下,可產生更高之 治療效果(尤其是延命效果)者。 用以解決課題之手段 經本案發明人就針對$ π 研究的結果,發現在^了-叙化學躲反覆進行 f兄在—氣%'啶脫氫酶(以下, 「DPD」。)之表現量高的 ,㈣马 ^者中,替加氟-吉美嘧啶_奥替拉 西鉀複合劑與順鉑之併甩彳、 、 匕予療法與未包含二氫喷咬脫奇 酶抑制劑但包含5-FU之歐装4 虱击疋脫虱 為標準療法相較下顯示出高延命 效果,而終至完成本發明。 门、ρ ,FTT^ M 再者,雖然二氫嘧啶脫氫酶為 5-FU之分解酶,迄今已知 ,θΤς 、為5_FU之治療效果限制因子, 仁TS-1中換a有—氣°密吩 μ Μ 疋脫氧酶抑制劑之吉美嘧啶,因此 二氫《錢麵料化 < 因此 亦屬已知(例如,int j Ca ⑺療效果限制因子’此事 完全不知可將二氫_;^119,1927]933 (夠)。又, 作指標來預測下述患者層=之=物(―八’酶)量用 氫酶抑制劑但包含5_FU:卩〃歐美未包含—氫°密咬脫 氟-吉美射·奥替拉:標準療法相較下,採用替加 合劑與順鉑之併用化學療法會 201100798 顯示出更高延命效果之患者層。 即,本發明提供如下所述之預測替加氟-吉美嘧啶-奥替 拉西鉀複合劑與順鉑之併用化學療法之治療效果的方法、 抗腫瘤劑、引子對及套組。 第1項 一種預測替加氟-吉美嘧啶-奥替拉西鉀複合劑與順鉑 之併用化學療法對於胃癌患者之治療效果的方法,包含下 述步驟(1)〜(2): ^ (1)測定步驟:測定從患者採取之可能含有癌細胞的活 體試料中所含二氫嘧啶脫氳酶基因之表現量者; (2)預測步驟:當以上述步驟(1)所得到之表現量較已預 先設定之對應截點更高時,即預測患者選擇該併用化學療 法會顯示充分治療效果的可能性高。 第2項 如第1項之方法,其中替加氟-吉美嘧啶-奥替拉西鉀複 合劑之各有效成分的莫耳比為替吉奥:吉美嘧啶:奥替拉 〇 西钟=1 : 0.4 : 1 〇 第3項 一種由替加氟-吉美嘧啶-奥替拉西鉀複合劑與順鉑所 構成之抗腫瘤劑,其特徵在於:對癌症患者實施併用化學 療法,且該癌症患者係依據第1或2項之方法而被預測為選 擇該併用化學療法會顯示充分治療效果之可能性高者。 第4項 一種胃癌的治療方法,其特徵在於:對癌症患者實施 201100798 併用化學療法,且該癌症患者係依據第丨或2項之方法而被 預測為選擇該併用化學療法會顯示充分治療效果之可能性 高者。 種由替加氟-吉美。密。定_奥替拉西鉀複合劑與順鉑所 構成之抗腫瘤劑的用途,係用以對癌症患者實施併用化學 療法者’其巾癌症患者魏據第丨或2項之方法而被預測為 认擇。亥併用化學療法會顯示充分治療效果之可能性高者。 第6項 一種引子對,係用以測定二氫嘧啶脫氫酶之表現量 者,且包含:序列編號!之順向引子及序列編號2之反向引 子’或序列編號7之順向引子及序列編號8之反向引子。 第7項 如第6項之引子對,其係用於預測化學療法的治療效果 者’且該化學療法包含替加氟_吉美•.舆替拉西钟複合 劑。 如第7項之引子對,其係用於預測替加氟-吉美t定-奥 替拉西鉀複合劑與軸的併用化學療法對於胃癌患者之治 療效果者。 ㈣包含替加^美㈣.奥錄續複合 Μ之化學躲·仪療絲的,包⑼㈣定二氮嘴 咬脫氣酶表現量之引子對;且,㈣子對係由序列編如之 201100798 順向引子與序列編號2之反向引子所構成,或是由序列編號 7之順向引子與序列編號8之反向引子所構成。 第10項 如第9項之套組,其係用以預測替加氟-吉美嘧啶_奥替 拉西鉀複合劑與順舶的併用化學療法對於胃癌患者之治療 效果者。 第11項
如第10項之套組,其進-步含有序列編號3或序列編號 9之探針。 本發明之預測方法可選出有效的化學療法,該化學療 法與未包含二氫啊脫氫酶抑制㈣包含別之歐美標準 療法相下具有較H較果(尤料延命絲)。即可確 實地提供-種對胃癌患者顯示出高治療 效果)之併用化學料 ’、(/、疋“ 4不必要的化學療法,因此 在醫療經濟上甚有利的。 【實施冷式】 用以實施發明之形陣、 本發明之預測方法係基於患者之 之表現量,預踯出還摆杜 虱ώ疋脫虱_基因 與順銘之併用化氟,吉美批奥替拉西卸複合劑 效果)之可能性^患者會顯示充分治療絲(尤其是延命 於本發明中,「替加& 、, 順鈾之併用化t α 4定·奥替拉西鉀複合劑與 '、」W味著.併用替加氟-吉美嘧啶-奥替 201100798 拉西鉀複合劑與順鉑兩種抗腫瘤劑進行投藥之化學療法。 又,將前述複合劑與順鉑併用投藥時,可將複合劑與順鉑 同時投藥,亦可以一定間隔投藥。 於本發明中,「選擇併用化學療法會具有充分治療效 果」意味著:顯示出較歐美等地所使用之標準療法(例如, 5-FU與順鉑之併用化學療法)更優異之治療效果。至於是否 顯示出此種高治療效果,可由二氫嘧啶脫氫酶基因之表現 量是否在截點以上來判斷,若二氫嘧啶脫氫酶基因之表現 量在截點以上,則判斷選擇併用化學療法會具有充分的治 療效果。 本發明之治療效果可就延命效果或腫瘤縮小效果予以 判斷,但宜就延命效果作判斷。延命效果可以生存期間之 中位數(期間愈長延命效果愈高)、1年生存率與2年生存率 (比例愈大延命效果愈高)及危害(Hazard,在某瞬間之死亡 率)作評價。 本發明之有效成分替加氟(一般名,化學名:5-氟-1-(2-四氫呋喃)-2,4-(1Η,3Η)-嘧啶二酮)為習知化合物,且為一種 會在活體内受到活化而釋出5 - F U (具抗腫瘤活性之主要成 分)之藥劑。替加氟係可以習知方法(例如日本特開昭 49-10510號之方法)來製造。 本發明之有效成分吉美嘧啶(一般名,化學名:2,4-二 經。-氯吼'1定)亦為習知化合物,雖然其本身完全不具抗腫瘤 活性,但由於可抑制5-FU在生物體内被代謝而失去活性, 因此可使抗腫瘤效果增強。 201100798 本發明之有效成分奥替拉西鉀(一般名,化學名: 1,2,3,4-四赵-2,4-二雜氧_1,3,5_三„秦_6_叛酸鉀)亦為習知化 合物,雖然其本身不具抗腫瘤活性,然其主要分布於消化 管並抑制5-FU在忒部位之活性化,藉此可抑制消化管障礙。 本發明之有效成分順鉑(一般名,化學名:(sp_4_幻二 胺二氯鉑)為習知白金錯合物,已知其係藉由〇1^八合成抑制 作用來達成抗腫瘤效果。又,順鉑可藉由習知方法來製造, 0 更可使用Briplatin (Bnstol-Myers社製)等的市售醫藥品。 在本發明中所投藥之替加氟、吉美嘧啶及奥替拉西鉀 的比例若在可達成個別之配合目的的範圍内則無特別限 制,例如,可與日本專利第2614164號公報所載習知複合劑 在相同範圍内,即:相對於以耳替加氟,可令吉美射為 〇·卜5莫耳左右,且以0.24.5莫耳左右為佳;可令奥替拉西 冑為G.1〜5莫耳左右,且以〇.2〜2莫耳左右為佳。莫耳比特別 以替吉奥:吉美嘧啶··奥替拉西鉀=1 : 〇4 ·· i為宜。 〇 纟本發明巾所投藥之職的比例若在可達成抗腫瘤效 果之範圍内則無特別限制,例如,以i日量計,相對於以 耳替加氟’可令順!自為0 Q1〜5 G莫耳左右,且則1〜2 〇莫耳 左右為佳,特別以0.2〜1.5莫耳左右為佳。 本發明之各有效成分的投藥量可依用法、患者年齡、 性別、病期、有無轉移、治療史以及有無其他抗腫瘤劑等 的條件作適宜選擇,但宜以下述範圍的量為基準:替加氣 的量為0.1〜lOOmg/kg/日左右,而以〇2〜4〇mg/kg/日左右為 佳,以0.5〜20mg/kg/日左右為更佳;吉美嘧啶的量為 201100798 0.02〜30mg/kg/日左右,而以0.05〜12mg/kg/日左右為佳,以 0.1~6mg/kg/日左右為更佳;奥替拉西鉀的量為 0.1〜100mg/kg/日左右,而以0.2~40mg/kg/日左右為佳,以 0.5〜20mg/kg/日左右為更佳;順銘的量為0.08〜200mg/kg/日 左右,而以0.15〜8〇111呂/1^/日左右為佳,以0.4〜4〇111邑/1<^/日 左右為更佳。又,各有效成分於1曰中可作1次或分成多次 投藥。再者,各有效成分可同時或間隔投藥,其投藥順序 並無特別限制。 在本發明中,替加氟、吉美嘧啶、奥替拉西鉀係經製 劑化成單一劑型而以複合劑的型態來提供。又,在本發明 中,順銘可為僅將其製劑化而成之單劑,亦可為與替加氟、 吉美嘧啶、奥替拉西鉀合併而製劑化成單一劑型之複合 劑。以各自製劑化成單一劑型之單劑為佳。 只要各有效成分會被併用投藥,本發明之製劑可區分 為上述各製劑來個別地製造、包裝及流通者,亦可將上述 製劑之全部或一部份採適合併用投藥之單一包裝(套組製 劑)的形式予以製造、包裝、流通。 本發明之製劑的投藥形態並無特別限制,具體而言可 例示如:口服劑(錠劑、膜衣錠劑、粉劑、顆粒劑、膠囊及 液劑等)、注射劑、栓劑、貼附劑及軟膏等。在將本發明之 各有效成分製劑化為多數劑型時,該等製劑可各為不同的 投藥形態,亦可為相同的投藥形態。例如,替加氟-吉美嘧 啶-奥替拉西鉀複合劑宜為口服劑,而含有順鉑之製劑宜為 注射劑。 10 201100798 本發明之製劑係使用藥理學上容許之載劑,且在各別 之投藥形態中以一般習知的製劑化方法來製造。此種載劑 為廣泛使用於一般藥劑之各種載劑,可例示如賦形劑、結 合劑、崩解劑、潤滑劑、稀釋劑、助解輔劑、懸浮劑、等 張劑' pH調整劑、緩衝劑、安定劑、著色劑、調味劑 (corrigent)、氣味改善劑(odor improving agent)等。 就賦形劑而言’可舉例如:乳糖、蔗糖、氯化鈉、葡 萄糖、麥芽糖、甘露糖醇、赤藻糖醇、木糖醇、麥芽糖醇、 肌醇、糊精、山梨糖醇、白蛋白、尿素、澱粉、碳酸鈣、 高嶺土、結晶纖維素、矽酸、曱基纖維素、甘油、海藻酸 鈉、阿拉伯膠及該等之混合物等。 就潤滑劑而言,可舉例如:純化滑石、硬脂酸鹽、硼 砂、聚乙二醇及該等之混合物等。 就結合劑而言,可舉例如:單糖漿、葡萄糖液、澱粉 液、明膠溶液、聚乙烯醇、聚乙烯醚、聚乙烯吡咯烷酮、 羧甲基纖維素、蟲膠、甲基纖維素、乙基纖維素、水、乙 醇、磷酸鉀及該等之混合物等。 就崩解劑而言,可舉例如:乾燥澱粉、海藻酸鈉、洋 菜粉、褐藻澱粉(Laminaran)末、碳酸氫納、碳酸約、聚氧 乙烯山梨醇酐脂肪酸酯類、月桂硫酸鈉、硬脂酸單甘油酯、 澱粉、乳糖及該等之混合物等。 就稀釋劑而言,可舉例如:水、乙基醇、聚乙二醇 (macrogol)、丙二醇、乙氧化異硬脂醇、聚氧化異硬脂醇、 聚氧乙烯山梨醇酐脂肪酸酯類及該等之混合物等。 201100798 就安定劑而言,可舉例如:焦亞硫酸鈉、乙二胺四乙 酸、硫代乙醇酸、硫代乳酸及該等之混合物等。 就等張劑而言,可舉例如:氣化鈉、硼酸、葡萄糖、 甘油及該等之混合物等。 就pH調整劑及緩衝劑而言,可舉例如:擰檬酸鈉、擰 檬酸、乙酸鈉、磷酸鈉及該等之混合物等。 就無痛化劑而言,可舉例如:鹽酸普羅卡因(procaine)、 鹽酸利多卡因(Lidocain)及該等之混合物等。 就著色劑而言,可列舉如:氧化鈦、氧化鐵等。 就調味劑、氣味改善劑而言,可舉例如:白糖、橙皮、 檸檬酸、酒石酸等。 就溶解輔劑而言,可舉例如:聚乙二醇、D-甘露糖醇 等。 就懸浮劑而言,可舉例如:硬脂酸三乙醇胺、月桂硫 酸鈉、氯化苯二甲烴銨(Benzalkonium Chloride)等。 本發明之投藥排程(dosing schedule)可依患者的年齡、 性別、病期、有無轉移、治療史等條件作適當選擇,例如, 本發明之併用化學療法宜在4個星期内將替加氟、吉美嘧啶 及奥替拉西鉀連續投藥21曰,並在其最初投藥曰(第1天)投 藥順鉑,將此作為一循環,進行1次或多數次。 本發明預測方法之對象患者係患有胃癌之患者,但亦 可為患有原病灶為胃癌且已轉移到胃以外之臟器或組織之 胃癌患者。 在本發明中,對象胃癌患者的組織型可為未分化型 12 201100798 (diffuse型)亦可為分化型(n〇n_diffuse型),惟,以已有報土 ㈣· J. Ca而 2004; 112: 967_973 )指出二氣^定脫氣= 因之表現量較高的未分化型(diffu_)更為適宜。 土
作為可用於本發明之二氫錢脫氣酶基因表現量 定過程中的活體試料,只要是可能含有癌細胞之試料則無 特別限定,可例不如體液(血液、尿等)、組織、其抽出物及 所採取之組織的培養物等H體試料的採取方法可因 應活體試料的種類或癌種之方法作適當選擇。來自活體士式 料之DNA、RNA及蛋白質之調t可藉由―般習知方法來進 行。就組織而言,雖可特別舉胃為例,惟當已從胃轉移到 其他臟器或腹膜等時,所轉移之部位將成為對象組織。 二氫嘧啶脫氫酶係在尿嘧啶與胸嘧啶之分解途徨的初 期P自·^又發生作用之速率限制酶(rate enzyme),亦已 知為5-FU之分解酶。此外,人類的二氫嘧啶脫氫酶基因之 驗基序列及胺基酸序列已是習知(j Bi〇丨Chem. 269 (37): 23192-6 (1994)) ° 本發明之預測方法係以二氫嘧啶脫氫酶基因的表現量 為指標,但其表現量可為mRNA的表現量,亦可為蛋白質 的表現量。在此,可使用會與二氫嘧啶脫氫酶基因作專一 性雜父之探針或引子,並按北方點墨法(northern blotting)、 定量或半定量PCR法(例如RT-PCR法、即時(real-time)PCR 法)及原位雜交(in situ hybridization)法等習知基因表現量 測定法來測定mRNA的表現量。前述表現量係以經常表現 一定範圍之量的蛋白質/基因(例如·_ β肌動蛋白等的家務基 13 201100798 因(housekeeping gene)或其表現蛋白質)作為基準,依據比 例可估算其值。 又,使用可專一性辨識二氫嘧啶脫氫酶之抗體,並依 據酵素免疫測定法、放射性免疫測定法、螢光免疫測定法、 ELISA法、西方點墨法及免疫組織化學染色法等習知免疫 學測定法,藉此即可測定蛋白質之表現量。 可用於北方點墨法、原位雜交法等基因表現量測定法 之探針係依一般習知之探針設計法而設計成下述聚核苷酸 (polynucleotide):可與二氫嘧啶脫氫酶基因之鹼基序列内的 至少15個鹼基長至全部鹼基長(宜2〇個鹼基長至全部鹼基 長’更宜30個鹼基長至全部鹼基長)之連續鹼基序列進行專 一性雜交,且具有上述之各鹼基長度。
可用於RT-PCR法及即時PCR法等的定量或半定量pcR 法之引子及探針的設計可進行如下。 本發明之引子及探針係依一般習知之引子及探針的机 計方法,設計成下述聚核苷酸:可與二氫嘧啶脫氫酶基因 的鹼基序列内之至少10個鹼基長至全部鹼基長(宜1〇至1〇〇 個鹼基長,較宜10至50個鹼基長,更宜10至35個鹼基吾)的 連續鹼基序列進行專一性雜交,並具有上述之各驗義長 度。例如,用以檢測二氫嘴σ定脫氫酶基因之表現產物的弓丨 子(即PCR之順向引子及反向引子)可由二氫嘧啶脫氣酶義 因中的外顯子(exon)區來設計及合成出。在二氫,咬脫氣㊣ 基因之各外顯子區中,順向引子及反向引子中之_者係式 於上游側之外顯子區的驗基序列來设叶(順向引子),另〜 者 14 201100798 則基於其下游側之外顯子區的鹼基序列來設計(反向引 子)。例如,當二氫嘧啶脫氫酶基因之引子係基於外顯子1〜3 來設計時,在基於外顯子1區的序列來設計順向引子的情況 下,反向引子便是基於其下游側之外顯子2或外顯子3區的 序列來設計。反向引子係設計成與二氫嘧啶脫氫酶之 mRNA序列互補。又,作為該引子,雖可使用包含各外顯 子區之二氫n密咬脫氫酶之mRNA的驗基序列之全部及其一
部分序列,但仍宜慮及PCR之擴增效率,從各外顯子區來 設計引子。更具體來說,用以檢測二氫β密TJ定脫氫酶基因之 表現產物的順向引子以序列編號1或7所示引子為佳,反向 引子則以序列編號2或8所示引子為佳。從不測定基因體上 之DNA而僅測定mRNA的觀點來看,順向引子尤以序列編 號7所示引子為宜,反向引子則以序列編號8所示引子尤佳。 作為用以檢測二氫㈣脫氫酶基因之表現產物的探 針’只要S可使用上述好並·PCR反應且可與欲擴增 之二氫做脫氫酶基®的各單職^錄交者即可,無特別 限制。只要是具有會與二氫射脫氫酶基因之全部外顯子 的鹼基序贼者是其1份之序财,或是能在嚴苛 條件下雜交者即可。更具體而言,用以檢測二氫做脫氮 酶基因之表現錄之探針轉列職如所轉針為佳; 則 從不測疋基因It上之DNA而僅測定湖八的觀點來看, 以序列編號9所示弓丨子尤佳。 此外’該探針只要能與 雜交即可’無完全互補的必 二氫嘧啶脫氫酶基因作專一性 要。就该聚核苷醆而言,宜為 15 201100798 二氫嘧啶脫氫酶基因之鹼基序列中連續至少15個鹼某r 的驗基序觸構成者;或者是,與其互補之聚料 下,鹼基序列中有70%以上同一性(宜8〇%以上,較宜9〇= 以上,更宜95%以上,而尤宜98%以上)的聚核苷酸。〇 另外’在本發明中「專-性雜交」係指:在嚴苛雜交 條件下,會形成具專一性之雜交體,而不會形成非專〜人 之雜交體。嚴苛雜交條件可依一般習知方法, 基於形成雜 交體之核酸的融解溫度(Tm)等來決定。就可維持雜交狀皞 之具體洗淨條件而言,一般可舉例如r〗x§Sc,〇 37°C」左右的條件,嚴格來說則可列舉如「〇 5xssc 0,1%SDS,42 °C」左右的條件,更嚴格則可列舉如 「0.1XSSC,0.1%SDS ’ 65t:」左右的條件。 又,由於人類的二氫嘧啶脫氫酶基因之鹼基序列已是 習知,因此該探針或引子係可基於其鹼基序列,依一般習 知合成方法(例如市售之核苷酸合成機)來製作。又,亦可將 其鹼基序列作為模板並利用PCR法來調製。 又’為使二氫嘧啶脫氫酶基因可易於檢測出,該探針 或引子亦可以一般慣用的放射性物質、螢光物質、化學發 光物質或酵素予以標記。 本發明之抗體只要是可專一性辨識二氫嘧啶脫氫酶即 可’無特別限制,可為單株抗體及多株抗體中之任一者, 亦可為Fab片段或F(ab,)2片段等的抗體片段。又,該抗體可 依一般習知方法製造(例如:Current protocols in Molecular Biology edit. Ausubel et al. (1987), Publish. John Wiley and 16 201100798
Sons. Section 11.12-11.13)。 在預測是否應M加氟美射_奥替拉 與賴之㈣化學療法實絲療的步驟巾,在與預=定 的各戴點峰下,二氫純量料時,= 測對患者選擇該併用化學 則預 化予療柄顯# m療效果之可 月t*性面。 Ο ❹ 二=Γ會因測定對象及測定方法的種類等諸 夕本’因此有必判應條件作縣 點會因測㈣象(患者人數、年齡、性別、體重、健絲ΐ 及疾病狀態)、測定方法(是否以基因或蛋白f之任 : 物作為測定對象)、測定條件(例如,測定基因表: (mRNA)過程中之料、探針序列、標記_,表 Π:抗體種類及感度等)以及統計手法等而有所ί 動,因此本發明廣泛包含使用到可依上述條件變動之= 截點的發明’而不限定於特定值。在此,可從已預先敎 之-致錢脫氫酶基因表現量,依各㈣計料手法求得 截點值。舉例來說’可列舉如下述數值:祕_始併用 群或已接文5-FU_自併用化學療法的患者體内,二氯射 脫氫酶基因表現量之平均值或是中位數;則順轉用群 對於5-FU/軸個群的危害咐瞬間之狀率的比)成為 最小時之值,TS-1/順鉑併用群與5_FU/順鉑併用群的2年生 存率之差编最大時之值’ TS_1/輸併麟對於5_FU/順鈕 併用群的危害比在某數值)_:<下(例如,危害比在07以下 (TS-!/順翻併用群與5-FU/順麵併用群相較下死亡率減低 17 201100798 30%以上));在5_FU/順鉑併用群與TS-1/順鉑併用群的生存 期間之對數等級檢定(log-rank test)中,P值成為最小時之值 及P值成為一定標準以下之值(例如,p值成為未滿〇1之值或 P值成為未滿〇.〇5之值)。 結果,就本併用化學療法中之二氫嘧啶脫氫酶基因表 現量的截點(相對於β肌動蛋白的比)而言,舉例來說,在即 時PCR法中,以〇 35χ1〇-3〜4.33χ1〇-3為佳,且以 0.83><103〜2.23\1〇-3較佳。又’在進行使用序列編號1至6所 示引子及探針的即時PCR法時,以〇.83xl〇·3〜2_33><10_3為 佳,且0.96Χ10·3〜ι·49χ10_3較佳,以1.49χ1(Τ3尤佳。在進行 使用序列編號7至12所示引子及探針的即時PCR法時,以 〇·35χ10-3〜4.33Χ10·3為佳,〇.35xl(T3〜1·86χ10_3較佳,而以 1.06χ1(Γ3〜1.8以1〇_3尤佳。對應該等截點之二氫嘧啶脫氫酶 基因表現量為低值的例數比率在使用序列編號丨至6所示弓丨 子及探針時為8.1%至39.4% ’在使用序列編號7至12所示弓丨 子及探針時則為25.0%至92.9%,亦可基於該等比率來求得 截點。 本發明之用以測定二氫嘧啶脫氫酶表現量的引子對含 有序列編號1的順向引子與序列編號2的反向引子,或是序 列編號7的順向引子與序列編號8的反向引子。從不剛定基 因體上之DNA而僅測定mRNA的觀點來看,以包含序列編 號7的順向引子與序列編號8的反向引子者為佳。又,本發 明的用以測定二氫嘧啶脫氫酶表現量之套組含有上述引子 對且宜進一步含有序列編號3或9之探針者,從不測定基因 18 201100798 體上之DNA而僅測定mRNA的觀點來看,以包含序列編號9 之探針者尤佳。 本發明之用以測定二氫嘧啶脫氫酶表現量的引子對及 套組可正確測定二氫嘧啶脫氫酶之表現量,且可用於預測 含有5-FU系抗腫瘤劑之化學療法的治療效果。含有5-FU系 抗腫瘤劑之化學療法僅需為含有5-FU或其衍生物者即可而 無特別限制,但舉例來說,可例示如含有5-FU、替加氟-尿°密咬複合劑、替加氟-吉美α密α定-奥替拉西钟複合劑之化學 療法,且,其中以含有替加氟-吉美嘧啶-奥替拉西鉀複合劑 之化學療法為佳,而以替加氟-吉美嘧啶-奥替拉西鉀複合劑 與順鉑之併用化學療法尤佳。會成為進行治療效果預測之 對象癌症腫瘤雖無特別限定,但以胃癌、結腸/直腸癌、頭 頸部癌、肺癌、乳癌、胰臟癌及膽道癌為宜,且以胃癌尤 佳。 [實施例] 以下,基於實施例更詳細地說明本發明,然而本發明 非受該等實施例所限定者。 [實施例1 ]二氫嘧啶脫氫酶之基因表現量測定 在以高加索人之未治療進行性胃癌患者為對象的 TS-1 /順始併用療法與5 -FU/順鉑併用療法之臨床試驗中,實 施生物標記(biomarker)研究(二氫°密咬脫氫酶之基因表現量 測定)。 TS-1/順鉑併用療法係將替加氟換算量為25mg/m2(每 體表面積)的TS-1在連續21日絕食期間作1日2次經口投藥 19 201100798 並在其後7日停藥。順鉑則在TS-1投藥開始日(Day丨)之TS_ i 首次投藥後’耗費1〜3小時以75mg/m2作靜脈内投藥。將斗 週(28曰)為一期的此種投藥排程視為1個循環,重複作最多6 個循環之投藥。 5-FU/順鉑併用療法係將5-FU以1000mg/m2/24小時作 連續5日靜脈内投藥並於其後的23日停藥。順鉑係在5-FU投 藥開始曰(Day 1)且5-FU投藥前,耗費1〜3小時以l〇〇mg/m2 作靜脈内投藥。將4週(28日)為一期的此種投藥排程視為i 循環,重複作最多6個循環之投藥。 生存期間係以隨機化之日為起算日,至死亡曰為止的 期間。關於在解析時間點無法取得死亡確認或是仍生存之 患者,則以最新的觀察日為限。 自藥劑投藥以前所取得之手術檢體或生物檢體的腫瘤 組織之經甲醛固定的石蠟包埋切片中抽提出總mRNA(total mRNA),利用Taqman®即時PCR法,以相對於β肌動蛋白之 比來定量出二氫嘧啶脫氫酶之基因表現量。又,將下述序 列編號1至3所示引子及探針用作測定二氫嘧啶脫氳酶之基 因表現量的引子及探針。此外,β肌動蛋白基因表現量的測 定則使用以下序列編號4至6所示引子及探針。 [表1] 基因名 順向引子 反向引子 Taqman MGB 探針 二氫嘧啶脫氫 酶 TCTGGCTACCA GGCTATACAGT ΤΤ(序列編號1) CAGCCTGTACAA GTGTCGGTTAT(序 列編號2) AAACCCACCTG CCC AC(序列編號 3) β肌動蛋白 AAGGCCAACCG CGAGAAG(序歹 ij 編號4) ATAGCAACGTACA TGGCTGGG(序列編 號5) ACCCAGATCAT GTTT(序列編號6) 20 201100798 除上述表1所記載之引子及探針以外,亦可以習知二氫 σ密咬脫氫酶之基因序列的開放式閱讀架構(open reading frame)為基礎,來設計各種順向引子、反向引子及探針。雖 然一旦變更引子、探針序列及標記種類等,截點可能多少 有所變化,但對於本發明之效果(可預測選擇替加氟-吉美嘧 啶-奥替拉西鉀複合劑與順鉑併用化學療法是否會顯示充 分治療效果)並無實質上的影響。 [實施例2]截點的算出 利用下述統計解析手法,從實施例1中所測定之各患者 二氫嘧啶脫氫酶之基因表現量求出截點。 (1) 算出TS-1 /順鉑併用群對於5-FU/順鉑併用群之的危 害比為最小時之截點,結果為1.49χ10·3。 (2) 算出TS-1/順鉑併用群與5-FU/順鉑併用群的2年生 存率之差最大時之截點,結果為0·96χ10_3。 (3) 算出TS-1 /順鉑併用群對於5-FU/順鉑併用群之的危 害比為0.7以下之截點,結果為0·83χ1(Τ3〜2.23χ1(Γ3。 另,截點表示二氫嘧啶脫氫酶之基因表現量相對於泠 肌動蛋白之比。 [實施例3]以二氫嘧啶脫氫酶作為指標而選出之患者的併用 療法治療效果 使用實施例2所算出之截點值,算出二氫嘧啶脫氫酶之 高表現群的危害比與2年生存率。將結果表示在表2至表5。 21 201100798 [表2] 截點值· 〇·96^^年生存差為最大) 對象 [表4] 截點值· 1.49x10 3(危險因素比為最小) --—_____ / TS-1/順鉑彳 5-FU/順鉑彳 病例數 危害比 2年生存率 (%) 例數比例 51 0.66 13.7 89.9 38 - 0.0 對象 [表5]載點值 TS-1/順鉑 5-FU/順鉑併用群
2·23χΐ〇_3(危險因素比為〇 7以下之上限) 對象 病例數 TS-1/順鉑併用群 33 5-FU/順鉑併用群~~ 27 危害比 _2年生存率 ----1 . (%) (%) 0.69 11.8 -^^~~~ - 0.0 — 60.6 截點值:0.83=0^危害比為〇7以下之下限) 對象 病例數 危害比 2年生存革1 (%) TS-1/順鉑併用群 52 0.68 13.4 5-FU/順鉑併用群 ----1 39 - 0.0 91.9 就腫瘤組織中二氫嘴唆脫氣酶之基因表現量高的患者 而言’TS-1/職併用療法對於5挪順崎用療法之危害比 為0_65至G.69,明顯甚低*顯示出高延命效果。 [實施例4 ]二氫♦定脫氫酶之基因表現量測定 身代實把例1中所使用之引子及探針’使用下述序列編 號7至12之引子及探針,以與實施例丨同樣的手法測定大致 為同-檢體的二氫㈣脫氫酶之基因表現量’。此外,在 22 201100798 序列編號7至12所示引子及探針係藉由將序列設定在剪接 (splicing)部位,而設計成不測定基因體上之DNA而僅測定 mRNA。 [表6] 基因名 順向引子 反而引子 Taqman MGB 探針 二氫嘧啶脫氫 酶 TTCAGTTTCTCC ATAGTGGTGCT T(序列編號7) CACAGTGAAATC CTGATTCTGAATG f序列編號8) TCCTCCAGGTAT GCAGTG(序列編 號9) F肌動蛋白 CCTCGCCTTTG CCGATC(序列編 號10) CGAGCGCGGCGA TAJCA(序列編號11) CGCCAGCTCAC CATG(序列編號 12) [實施例5]截點之算出 依下述統計解析手法,從實施例4中所測定之各患者的 一虱鳴咬脫氮酶之基因表現量求出截點。 (1) 算出TS-1/順鉑併用群對於5_FU/順鉑併用群之危害 比為0_7以下之截點,結果為〇 35χ1〇-3〜4 33χ1〇·3。 (2) 算出5-FU/順鉑併用群與Ts_"順鉑併用群的生存期 〇 間之對數等級檢定的P值未滿0·05之截點,結果為 1·〇6χΐ〇-3〜1.86x10-3。 此外,截點表示二氫嘧啶脫氫酶之基因表現量相對於 万肌動蛋白之比。 、以—氫嘧咬脫氫酶為指標而選出之患者的併用療 法治療效果 *使用只知例5所算出之截點值,算出二氫哺d定脫氯酶之 门表現群的危害比與2年生存率。將結果表示於表7至表9。 23 201100798 [表7] 截點值:0·35χ1(Τ3(危害比為0·7以下之下限) 對象 病例數 危害比 2年生存率 (%) 例數比例 (%) TS-1/順鉑併用群 43 0.70 12.1 90.5 5-FU/順鉑併用群 33 - 0.0 [表8] 截點值:1.06xl(T3(對數等級檢定中Ρ值未滿0.05之下限) 對象 病例數 危害比 2年生存率 (%) 例數比例 (%) TS-1/順鉑併用群 24 0.45 17.6 47.6 5-FU/順鉑併用群 16 - 0.0 [表9] 截點值:1.86xl0_3(對數等級檢定中Ρ值未滿0.05之上限) 對象 病例數 危害比 2年生存率 (%) 例數比例 (%) TS-1/順鉑併用群 13 0.39 17.9 25.0 5-FU/順鉑併用群 8 - 0.0 就腫瘤組織中二氫嘧啶脫氫酶之基因表現量高的患者 而言,TS-1/順鉑併用療法對於5-FU/順鉑併用療法之的危害 比為0.39至0.70,明顯甚低而顯示出高延命效果。 諸如上述,藉由以二氫°密°定脫氫酶基因之表現量為指 標來選擇胃癌患者,已判明TS-1/順鉑併用療法與不包含二 氫嘧啶脫氳酶抑制劑之5 -FU/順鉑併用療法相較下可期待 較高之延命效果。 I:圖式簡單說明3 (無) 【主要元件符號說明】 (無) 24 201100798 序列表 <110>大鵬藥品工業股份有限公司 <120>以二氫嘧咬脫氫酶基因之表現量為指標之化學療法的治療效 果預測方法
<130> 201030/TW ❹ <150〉JP 2009-124241 <151> 2009-5-22 <160〉 12 <170〉Patentln 版本 3.4 〇 <210〉 1 <211> 24 <212> DNA <213> 人工的 <220> <223> 順向引子 201100798 <400〉1 tctggctacc aggctataca gttt <210> 2 <211> 23 <212〉DNA <213>人工的 <220〉 <223>反向引子 <400〉2
Cagcctgtac aagtgtcggt tat <210〉3 <211> 16 <212> DNA <213>人工的 <220 <223> 鐵克曼 MGB 探針(Taqman MGB Probe) 201100798 <400> 3 aaacccacct gcccac <210〉4 <211> 18 <212> DNA <213〉人工的 o <220> <223>順向引子 <400> 4 aaggccaacc gcgagaag 〇 <210 5 <211> 21 <212> DNA <213〉人工的 <220> <223>反向引子 201100798 <400> 5 atagcaacgt acatggctgg g 21 <210> 6 <211> 15 <212> DNA <213〉人工的 <220> <223> 鐵克曼 MGB 探針(Taqman MGB Probe) <400〉 6 acccagatca tgttt 15 <210> 7 <211> 24 <212> DNA <213>人工的 <220> <223>順向引子 4 201100798 <400〉7 ttcagtttct ccatagtggt gctt 24 <210> 8 <211> 25 <212> DNA <213>反向引子 ❹ <400〉8 cacagtgaaa tcctgattct gaatg 25 <210> 9 <211> 18 <212> DNA <213〉人工的 <220> <223〉鐵克曼 MGB 探針(TaqmanMGB Probe) <400〉 9 18 tcctccaggt atgcagtg 5 201100798 <210〉 10 <211> 17 <212> DNA <213〉人工的 <220> <223>順向引子 <400〉 10 cctcgccttt gccgatc 17 <210> 11 <211> 17 <212〉DNA <213〉人工的 <220〉 <223>反向引子 <400〉 11 cgagcgcggcgatatca 6 201100798
<210> 12 <211〉 15 <212> DNA <213〉鐵克曼 MGB 探針(Taqman MGB Probe) <400> 12 cgccagctca ccatg

Claims (1)

  1. 201100798 七、申請專利範圍: 1. 一種預測替加氟-吉美嘧啶-奥替拉西钾複合劑 (combination preparation of tegafur, gimeracil and oteracil potassium)與順鉑(Cisplatin)之併用化學療法對 於胃癌患者之治療效果的方法,包含下述步驟(1)〜(2): (1) 測定步驟.測定從患者採取之可能含有癌細胞的活 體试料中所含^ —氫哺α定脫氫酶(dihydropyrimidine dehydrogenase)基因的表現量; (2) 預測步驟:當以上述步驟(1)所得之表現量較已預先 設定之對應截點更高時,即預測患者選擇該併用化學 療法會顯示充分治療效果的可能性高。 2. 如申請專利範圍第1項之方法’其中替加氟_吉美α密咬_ 奥替拉西钟衩合劑之各有效成分的莫耳比為替吉奧·士 美嘧啶:奥替拉西鉀=1 ·· 0.4 ·· 1。 3. 一種由替加IL-吉美♦定-奥替拉西!曱複合劑與順翻所構 成之抗腫瘤劑,其特徵在於:對癌症患者實施併用化學 療法,且該癌症患者係依據如申請專利範圍第丨或2項之 方法而被預測為選擇該併用化學療法會顯示充分治療 效果之可能性高者。 4 · -種胃癌的治療方法,其特徵在於:對癌症患者實_ 用化學療法’且該癌症患者係依據如申請專利範圍第i 或2項之方法而被預測為對選擇該併用化學療法會顯示 充分治療效果之可能性高者。 5. -種由替加氟-吉美痛嘴-奥替拉西鉀複合劑與順翻所構 201100798 成之抗Μ瘤劍的用途,係用以對癌症患者實施併用化學 療法者,其中癌症患者係依據如申請專利範圍第1或2 項之方法而被預測為選擇該併用化學療法會顯示充分 治療效果之玎能性高者。 6_ —種引子對,徭用以測定二氫嘧啶脫氳酶之表現量者’ 包含:序列編號1之順向引子與序列編號2之反向引子; 或序列編號7之順向引子與序列編號8之反向引子。 Ο 7_如申請專利範園第6項之引子對,其係用於預測對於化 學療法的治療效果者’且該化學療法包含替加氟-吉美 哺唆-奥替拉西鉀複合劑。 8·如申請專利範園第7項之引子對,其係用於預測替加氟_ , 吉美嘧啶-奥替拉西鉀複合劑與順鉑的併用化學療法對 , 於胃癌患者之治療效果者。 9· ~~種用以對於包含替加氟-吉美σ密咬-奥替拉西鋅複合劑 之化學療法預測治療效果的套組,包含用以測定二氫喷 Ο 咬脫氫酶表現量之引子對,且該引子對係由序列編號1 之順向引子與序列編號2之反向引子所構成,或是由序 列編號7之順向引子與序列編號8之反向引子所構成。 1〇·如申請專利範圍第9項之套組,其係用以預測替加氟_吉 美嘧啶-奥替拉西鉀複合劑與順鉑之併用化學療法對於 胃癌患者之治療效果者。 1L如申请專利範圍第10項之套組,其係進一步含有序列編 號3或序列編號9之探針。 201100798 四、指定代表圖: (一) 本案指定代表圖為:(無) (二) 本代表圖之元件符號簡單說明: (無) 五、本案若有化學式時,請揭示最能顯示發明特徵的化學式: (無) 2
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