TH21737U - ชุดไพรเมอร์และกรรมวิธีการตรวจจำแนกเชื้อโทบาโมไวรัสชนิด Pepper mild mottle virus (PMMoV), Tobacco mosaic virus (TMV) และ Tomato mosaic virus (ToMV) ได้พร้อมกันในคราวเดียว - Google Patents

ชุดไพรเมอร์และกรรมวิธีการตรวจจำแนกเชื้อโทบาโมไวรัสชนิด Pepper mild mottle virus (PMMoV), Tobacco mosaic virus (TMV) และ Tomato mosaic virus (ToMV) ได้พร้อมกันในคราวเดียว

Info

Publication number
TH21737U
TH21737U TH2103000508U TH2103000508U TH21737U TH 21737 U TH21737 U TH 21737U TH 2103000508 U TH2103000508 U TH 2103000508U TH 2103000508 U TH2103000508 U TH 2103000508U TH 21737 U TH21737 U TH 21737U
Authority
TH
Thailand
Prior art keywords
mosaic virus
pmmov
tmv
tomv
virus
Prior art date
Application number
TH2103000508U
Other languages
English (en)
Other versions
TH21737Y (th
Inventor
วารินทร์ นางนุชนาถ
ดีโท นางสาวรุ่งนะภา
ชัชวาลการพาณิชย์ นางสาวอรวรรณ
Original Assignee
สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
Filing date
Publication date
Application filed by สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ filed Critical สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
Publication of TH21737U publication Critical patent/TH21737U/th
Publication of TH21737Y publication Critical patent/TH21737Y/th

Links

Abstract

------19/02/2564------(OCR) การประดิษฐ์นี้เกี่ยวข้องกับชุดไพรเมอร์และกรรมวิธีการตรวจจำแนกเชื้อโทบาโมไวรัสชนิด Pepper mild mottle virus (PMMoV), Tobacco mosaic virus (TMV) และ Tomato mosaic virus (ToMV) ได้ พร้อมกันในคราวเดียว เพื่อพัฒนาชุดไพรเมอร์และกรรมวิธีที่เกี่ยวข้องดังกล่าวให้มีความไว ความจำเพาะ เจาะจง สามารถตรวจจำแนกเชื้อดังกล่าวได้อย่างถูกต้องแม่นยำภายในปฏิกิริยาเดียว โดยไพรเมอร์ที่ได้ ออกแบบตามการประดิษฐ์นี้จะมีความจำเพาะเจาะจงต่อเชื้อ PMMoV, TMV และ ToMV และอาศัยปฏิกิริยา มัลติเพล็กซ์ อาร์ที-พีซีอาร์ ในการตรวจจำแนกเชื้อที่พบในพริกและมะเขือเทศได้ โดยจะให้ผลิตภัณฑ์พีซีอาร์ที่ ได้ขนาด 232, 652 หรือ 406 คู่เบส สำหรับการติดเชื้อ PMMoV, TMV และ ToMV ตามลำดับ โดยสามารถ ตรวจพบเชื้อทั้ง 3 ชนิด ได้ในปฏิกิริยาเดียว ซึ่งจะช่วยประหยัดเวลา ค่าใช้จ่าย เมื่อเปรียบเทียบกับการตรวจ ด้วยวิธีอาร์ที-พีซีอาร์ทั่วไป โดยชุดไพรเมอร์และกรรมวิธีตามการประดิษฐ์นี้สามารถนำไปใช้ประโยชน์ใน การศึกษาระบาดวิทยาของเชื้อโทบาโมไวรัสในพริกและมะเขือเทศ การจัดการควบคุมโรค การปรับปรุงพันธุ์ พืช และการศึกษาวิจัยได้อีกด้วย ------------

Claims (7)

------19/02/2564------(OCR)
1. ชุดไพรเมอร์สำหรับตรวจจำแนกเชื้อโทบาโมไวรัสชนิด Pepper mild mottle virus (PMMoV), Tobacco mosaic virus (TMV) และ Tomato mosaic virus (ToMV) มีลำดับนิวคลีโอไทด์ดังนี้ Tob-F (5’-3’): AGTYGTTGATGAGTTCATSGA PMM-R (5’-3’): ATTGATTGGCACTGGAAACTG TM-R (5’-3’): AAGATCCGGTTCCTCTGATc ToM-R (5’-3’): TGACGGTGCTCTGAGGGAA โดยที่ Y เลือกได้จาก T หรือ C ; S เลือกได้จาก G หรือ C
2. กรรมวิธีการตรวจจำแนกเชื้อโทบาโมไวรัสชนิด Pepper mild mottle virus (PMMoV), Tobacco mosaic virus (TMV) และ Tomato mosaic virus (ToMV) ได้พร้อมกันในคราวเดียวโดยใช้ชุดไพรเมอร์ ตามข้อถือสิทธิที่ 1 ที่ซึ่ง ทำได้โดย การนำสารสกัดอาร์เอ็นเอจากตัวอย่างพืชมาทดสอบด้วยการทำปฏิกิริยา มัลติเพล็กซ์ อาร์ที-พีซีอาร์ จากนั้นตรวจสอบผลิตภัณฑ์พีซีอาร์ที่ได้
3. กรรมวิธีการตรวจจำแนกเชื้อโทบาโมไวรัสชนิด Pepper mild mottle virus (PMMoV), Tobacco mosaic virus (TMV) และ Tomato mosaic virus (ToMV) ได้พร้อมกันในคราวเดียวโดยใช้ชุดไพรเมอร์ ตามข้อถือสิทธิที่ 2 ที่ซึ่ง องค์ประกอบสำหรับการทำปฏิกิริยามัลติเพล็กซ์ อาร์ที-พีซีอาร์ ประกอบด้วย ก. บัฟเฟอร์ 1X ข. สารละลายแมกนีเซียมคลอไรด์ ค. ดีออกซีไรโบนิวคลีโอไทด์ไตรฟอสเฟท ง. ฟอร์เวิร์ดไพรเมอร์ Tob-F จ. รีเวิร์สไพรเมอร์ PMM-R, TM-R และToM-R ฉ. เอนไซม์รีเวิร์ส ทรานสคริปเทส และดีเอ็นเอโพลีเมอเรส ช. สารสกัดอาร์เอ็นเอของตัวอย่างพืช ซ. นํ้ากลั่น
4. กรรมวิธีการตรวจจำแนกเชื้อโทบาโมไวรัสชนิด Pepper mild mottle virus (PMMoV), Tobacco mosaic virus (TMV) และ Tomato mosaic virus (ToMV) ได้พร้อมกันในคราวเดียวโดยใช้ชุดไพรเมอร์ ตามข้อถือสิทธิที่ 2 ที่ซึ่ง องค์ประกอบสำหรับการทำปฏิกิริยามัลติเพล็กซ์ อาร์ที-พีซีอาร์ ที่เหมาะสม ประกอบด้วย ก. บัฟเฟอร์ 1X ข. สารละลายแมกนีเซียมคลอไรด์ 2.5 มิลลิโมลาร์ ค. ดีออกซีไรโบนิวคลีโอไทด์ไตรฟอสเฟท ชนิดละ 0.4 มิลลิโมลาร์ ง. ฟอร์เวิร์ดไพรเมอร์ Tob-F ที่ความเข้มข้น 0.6 ไมโครโมลาร์ จ. รีเวิร์สไพรเมอร์ PMM-R, TM-R และToM-R ที่ความเข้มข้น 0.6 ไมโครโมลาร์ ฉ. เอนไซม์รีเวิร์ส ทรานสคริปเทส และดีเอ็นเอโพลีเมอเรส 1 ไมโครลิตร ช. สารสกัดอาร์เอ็นเอของตัวอย่างพืช 100 นาโนกรัม ซ. นํ้ากลั่น
5. กรรมวิธีการตรวจจำแนกเชื้อโทบาโมไวรัสชนิด Pepper mild mottle virus (PMMoV), Tobacco mosaic virus (TMV) และ Tomato mosaic virus (ToMV) ได้พร้อมกันในคราวเดียวโดยใช้ชุดไพรเมอร์ ตามข้อถือสิทธิที่ 2 ถึง 4 ข้อใดข้อหนึ่ง ที่ซึ่ง ตัวอย่างพืช เลือกได้จาก พริก หรือ มะเขือเทศ อย่างใดอย่าง หนึ่งหรือหลายอย่างรวมกัน
6. กรรมวิธีการตรวจจำแนกเชื้อโทบาโมไวรัสชนิด Pepper mild mottle virus (PMMoV), Tobacco mosaic virus (TMV) และ Tomato mosaic virus (ToMV) ได้พร้อมกันในคราวเดียวโดยใช้ชุดไพรเมอร์ ตามข้อถือสิทธิที่ 2 ที่ซึ่ง สภาวะในการทำปฏิกิริยามัลติเพล็กซ์ อาร์ที-พีซีอาร์ มีขั้นตอนดังนี้ ก. ปฏิกิริยารีเวิร์ส ทรานสคริปชั่น (Reverse transcription) ที่อุณหภูมิ 50 องศาเซลเซียส นาน 30 นาที ข. ปฏิกิริยาอินนีเชียล ดีแนทเชอเรชั่น (Initial denaturation) ที่อุณหภูมิ 95 องศาเซลเซียส เป็นเวลา 15 นาที ค. ปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอเรส (Polymerase chain reaction, PCR) ซึ่งประกอบด้วย การบ่มที่อุณหภูมิ 94 องศาเซลเซียส เป็นเวลา 50 วินาที, ที่อุณหภูมิ 58 องศาเซลเซียส เป็นเวลา 50 วินาที และที่ อุณหภูมิ 72 องศาเซลเซียส เป็นเวลา 1 นาที เป็นจำนวน 30 รอบ ง. ปฏิกิริยาต่อสายดีเอ็นเอขั้นสุดท้าย (final extension) ที่อุณหภูมิ 72 องศาเซลเซียส เป็นเวลา 7 นาที
7. กรรมวิธีการตรวจจำแนกเชื้อโทบาโมไวรัสชนิด Pepper mild mottle virus (PMMoV), Tobacco mosaic virus (TMV) และ Tomato mosaic virus (ToMV) ได้พร้อมกันในคราวเดียวโดยใช้ชุดไพรเมอร์ ตามข้อถือสิทธิที่ 2 ที่ซึ่ง การตรวจสอบผลิตภัณฑ์พีซีอาร์ ทำได้โดย วิธีอะกาโรสเจลอิเล็กโทรฟอรีซิส ------------
TH2103000508U 2021-02-19 ชุดไพรเมอร์และกรรมวิธีการตรวจจำแนกเชื้อโทบาโมไวรัสชนิด Pepper mild mottle virus (PMMoV), Tobacco mosaic virus (TMV) และ Tomato mosaic virus (ToMV) ได้พร้อมกันในคราวเดียว TH21737Y (th)

Publications (2)

Publication Number Publication Date
TH21737U true TH21737U (th) 2023-05-30
TH21737Y TH21737Y (th) 2023-05-30

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Zhang et al. Rapid diagnostic detection of plum pox virus in Prunus plants by isothermal AmplifyRP® using reverse transcription-recombinase polymerase amplification
Zhao et al. Reverse transcription-recombinase polymerase amplification combined with lateral flow strip for detection of rice black-streaked dwarf virus in plants
Magome et al. Single-strand conformation polymorphism analysis of apple stem grooving capillovirus sequence variants
Wu et al. Development of reverse transcription thermostable helicase-dependent DNA amplification for the detection of tomato spotted wilt virus
Wacharapluesadee et al. Development of a TaqMan real-time RT-PCR assay for the detection of rabies virus
JP2022081563A (ja) Rnaを検出する方法およびrnaを検出するための試薬
Kim et al. A portable detection assay for apple stem pitting virus using reverse transcription-recombinase polymerase amplification
Chan et al. Differential diagnosis of orf viruses by a single-step PCR
CN105755134A (zh) 一种内切酶介导的实时多交叉置换核酸扩增技术及应用
Alsaheli et al. Development of singleplex and multiplex real-time (Taqman®) RT-PCR assays for the detection of viruses associated with fig mosaic disease
CN106755597B (zh) 一种同步检测4种辣椒病毒的多重pcr方法
Bhat et al. Detection of viruses infecting black pepper by SYBR green-based realtime PCR assay.
JP7633643B2 (ja) サツマイモ病原ウイルス検出用プライマーセット及びサツマイモ病原ウイルスの検出方法
TH21737Y (th) ชุดไพรเมอร์และกรรมวิธีการตรวจจำแนกเชื้อโทบาโมไวรัสชนิด Pepper mild mottle virus (PMMoV), Tobacco mosaic virus (TMV) และ Tomato mosaic virus (ToMV) ได้พร้อมกันในคราวเดียว
Ravindran et al. Molecular sexing of Southeast Asian barn owl, Tyto alba javanica, using blood and feather
KR20170001071A (ko) 배추 감염성 4종 바이러스 복합진단 pcr 프라이머 및 이를 이용한 바이러스 검출방법
Ma et al. Recombinase polymerase amplification assay for sensitive and rapid detection of southern rice black-streaked dwarf virus in plants
Hasiów-Jaroszewska et al. A new method for detection and discrimination of Pepino mosaic virus isolates using high resolution melting analysis of the triple gene block 3
Xu et al. Improving the sensitivity of single-strand conformation polymorphism (SSCP) to study the variability of PLMVd
JP2023128819A (ja) サツマイモ病原体検出用プライマーセット及びサツマイモ病原体の検出方法
Brežná et al. In silico and experimental evaluation of DNA-based detection methods for the ability to discriminate almond from other Prunus spp.
US20100209566A1 (en) Method of separating and distinguishing walnut from pecan nut
WO2016114675A1 (en) Method and kit for identification of nematodes, forest plant pests, by real-time pcr
CN111100948A (zh) 快速检测苹果腐烂病菌的lamp引物及其检测方法和试剂盒
RU2815339C1 (ru) Набор олигонуклеотидов-праймеров, используемых для идентификации вируса болезни Ньюкасла