TH13832U - A standard DNA calibration kit for estimating the size of DNA samples. - Google Patents

A standard DNA calibration kit for estimating the size of DNA samples.

Info

Publication number
TH13832U
TH13832U TH1303000761U TH1303000761U TH13832U TH 13832 U TH13832 U TH 13832U TH 1303000761 U TH1303000761 U TH 1303000761U TH 1303000761 U TH1303000761 U TH 1303000761U TH 13832 U TH13832 U TH 13832U
Authority
TH
Thailand
Prior art keywords
dna
base sequence
size
base
kit
Prior art date
Application number
TH1303000761U
Other languages
Thai (th)
Other versions
TH13832C3 (en
TH13832Y (en
TH13832A3 (en
Inventor
กระแจะจันทร์ นพธีรพงษ์
ศรีวาณิชรักษ์ นางกาญจนา
ผสมทรัพย์ นายเอกวัฒน์
โพธิ์เงินนาค พญพสุพร
Original Assignee
มหาวิทยาลัยมหิดล
Filing date
Publication date
Application filed by มหาวิทยาลัยมหิดล filed Critical มหาวิทยาลัยมหิดล
Publication of TH13832C3 publication Critical patent/TH13832C3/en
Publication of TH13832U publication Critical patent/TH13832U/en
Publication of TH13832Y publication Critical patent/TH13832Y/en
Publication of TH13832A3 publication Critical patent/TH13832A3/en

Links

Abstract

DC60 (10/07/56) ชุดเทียบวัดดีเอ็นเอมาตรฐานนี้เป็นชุดของสายดีเอ็นเอจำนวน 10 ขนาด คือ 100,200,300,400,500,600,700,800,900 และ 1000 คู่เบส (base pairs:bp) ผลิตขึ้นโดยอาศัยการเพิ่มจำนวนสายดีเอ็นเอขนาดต่างๆ ด้วยปฏิกิริยาลูกโซ่ polymerase chain reaction (PCR) จากพลาสมิดดีเอ็นเอ (plasmid DNA) ที่ทราบลำดับ เบสแล้ว เมื่อนำผลผลิตจาก PCR ไปแยกในแผ่นวุ้นโดยใช้กระแสไฟฟ้า (Gel electrophoresis) จะปรากฏแถบเป็นขั้นบันได 10 แถบ เรียงขนาดจากใหญ่ไปเล็ก และ จะใช้เป็นตัวอ้างอิงเพื่อประมาณขนาดของดีเอ็นเอที่ต้องการศึกษาที่อยู่ในแผ่นวุ้น เดียวกัน มีวัตถุประสงค์เพื่อใช้เป็นชุดเทียบวัดดีเอ็นเอมาตรฐานสำหรับใช้ประมาณค่า ขนาดของดีเอ็นเอในตัวอย่างที่ต้องการศึกษา 1.ชุดเทียบวัดเอมาตรฐานนี้เป็นชุดของสายดีเอ็นเอจำนวน 10 ขนาด คือ 100,200,300,400,500,600,700,800,900 และ 1000 คู่เบส(Base Pairs:bp) ผลิตขึ้นโดยอาศัยการเพิ่มจำนวนสายดีเอ็นเอขนาดต่างๆ ด้วยปฏิกิริยาลูกโซ่ Polymerase Chain Reaction(PCR)จากพลาสมิดดีเอ็นเอ(Plasmid DNA)ที่ราบลำดับ เบาแล้ว เมื่อนำ ผลผลิตจาก PCR ไปแยกในแผ่นวุ้นโดยใช้กระแสไฟฟ้า(Gel electroporseis) จะปรากฏแถบเป็นขั้นบันได 10 แถบ เรียงขนาดจากใหญ่ไปเล็ก และ จะใช้เป็นตัวอ้างอิงเพื่อประมาณขนาดของดีเอ็นเอที่ต้องการศึกษาที่อยู่ในแผ่นวุ้น เดียวกัน มีวัตถุประสงค์เพื่อใช้เป็นชุดเทียบวัดดีเอ็นดีมาตรฐานสำหรับใช้ประมาณค่า ขนาดของดีเอ็นในตัวอย่างที่ต้องการศึกษาDC60 (10/07/56) This standard DNA calibration kit contains 10 DNA strand sizes: 100, 200, 300, 400, 500, 600, 700, 800, 900, and 1000 base pairs (bp). These are produced by amplifying DNA strands of different sizes using polymerase chain reaction (PCR) from a plasmid DNA with a known base pair sequence. When the PCR product is separated on a gel plate using gel electrophoresis, a ladder-like pattern of 10 bands appears, arranged from largest to smallest. This band is used as a reference to estimate the size of the DNA being studied in the same gel plate. Its purpose is to serve as a standard DNA calibration kit for estimating the size of DNA in samples under study. 1. This standard DNA calibration kit contains 10 different DNA strand sizes: 100, 200, 300, 400, 500, 600, 700, 800, 900, and 1000 base pairs (bp). These are produced by amplifying DNA strands of different sizes using Polymerase Chain Reaction (PCR) from pre-sequenced plasmid DNA. When the PCR product is separated on a gel plate using gel electroporation, a ladder-like pattern of 10 bands appears, arranged from largest to smallest. This band serves as a reference to estimate the size of the DNA being studied in the same gel plate. Its purpose is to provide a standard DNA calibration kit for estimating the DNA size of the sample under study.

Claims (2)

แก้ไข 08/03/2560Updated 08/03/2017 1. ชุดเทียบวัดดีเอ็นเอมาตรฐานสำหรับประมาณค่าขนาดของดีเอ็นเอตัวอย่าง เป็นชุดของสาย ดีเอ็นเอจำนวน 10 ขนาด คือ 100, 200, 300, 400, 500, 600, 700, 800, 900 และ 1000 คู่เบส (base pairs : bp) ผลิตขึ้นโดยอาศัยการเพิ่มจำนวนสายดีเอ็นเอขนาดต่างๆด้วยปฏิกิริยาลูกโซ่พอลิเมอเรส (polymerase chain reaction : PCR) จากพลาสมิดดีเอ็นเอ (plasmid DNA) ที่ทราบลำดับเบสแล้ว เมื่อนำผลผลิตพีซีอาร์ (PCR) ไปแยกในแผ่นวุ้นโดยใช้กระแสไฟฟ้า (Gel electrophoresis) จะปรากฏแถบเป็นขั้นบันได 10 แถบ เรียงขนาดจากใหญ่ไปเล็ก และจะใช้เป็นตัวอ้างอิงเพื่อประมาณขนาดของดีเอ็นเอที่ต้องการศึกษาที่อยู่ใน แผ่นวุ้นเดียวกัน ที่ซึ่งมีลักษณะพิเศษ คือ ลำดับเบสของไพรเมอร์ ที่ใช้ผลิตชุดเทียบวัดขนาดดีเอ็นเอ คือ Forward primer ที่มีลำดับเบส 5’-CACATGCAGCTCCCGGAGACG-3’ 100reverse ที่มีลำดับเบส 5’-CCCGACACCCGCCAACAC-3’ 200reverse ที่มีลำดับเบส 5’-CTGATGCGGTATTTTCTCCTTA-3’ 300reverse ที่มีลำดับเบส 5’-CCTTGCAGCACATCCCCCTT-3’ 400reverse ที่มีลำดับเบส 5’-GGTCGACTCTAGAGGATC-3’ 500reverse ที่มีลำดับเบส 5’-TTATGCTTCCGGCTCGTAT-3’ 600reverse ที่มีลำดับเบส 5’-TGCAGCTGGCACGACAGGT-3’ 700reverse ที่มีลำดับเบส 5’-CCGCAGCCGAACGACCGAGCG-3’ 800reverse ที่มีลำดับเบส 5’-TGGCCTTTTGCTGGCCTT-3’ 900reverse ที่มีลำดับเบส 5’-GGGTTTCGCCACCTCTGACT-3’ 1000reverse ที่มีลำดับเบส 5’-GAGAAAGGCGGACAGGTATC-3’ --------------------- แก้ไข 30/03/2559 1.ชุดเทียบวัดเอมาตรฐานสำหรับประมาณค่าขนาดของเอ็นเอตัวอย่าง เป็นชุด ของสายดีเอ็นเอจำนวน 10 ขนาด คือ 100,200,300,400,500,600,700,800, 900 เเละ 1000 คู่เบส(Base Pairs:bp)ผลิตขึ้นโดยอาศัยการเพิ่มจำนวนสายดีเอ็นเอขนาด ต่างๆ ด้วยปฏิกิริยาลูกโซ่ Polymerase Chain Reaction(PCR)จากพลาสมิดดีเอ็นเอ(Plasmid DNA) ที่ทราบลำดับเบสเเล้ว เมื่อนำ ผลผลิตจาก PCR ไปเเยกในเเผ่นวุ้นโดยใช้ กระเเสไฟฟ้า(Gel elecrotrophoresis)จะปรากฏเเถบเป็นชั้นบันได 10 เเถบ เรียงขนาดจาก ใหญ่ไปเล็ก เเละจขะใช้เป็นตัวอ้างเพื่อประมาณขนาดของดีเอ็นเอที่ต้องการศึกษาที่อยู่ใน เเผ่นวุ้นเดียวกัน ที่ซึ่งมีลักษณะพิเศษ คือ ลำดับเบสของ Primers ที่ใช้ผลิตชุดเทียบวัดขนาดดีเอ็น เอ คือ Forward Primer ที่มีลำดับเบส 5-CACATGCAGCTCCCGGAGACG-3 100reversr ที่มีลำดับเบส 5-CACATGCAGCTCCCGGAGACG-3 200reversr ที่มีลำดับเบส 5-CTGATGCGGGTATTTTCTCCTTA-3 300reversr ที่มีลำดับเบส 5-CTGATGCGGGTATTTTCTCCTTA-3 400reversr ที่มีลำดับเบส 5-GGTCGACTAGAGGATC-3 500reversr ที่มีลำดับเบส 5-TIATGCTTCCGGCTCGTAT-3 600reversr ที่มีลำดับเบส 5-TGCAGCTGGcACGACAGGT-3 700reversr ที่มีลำดับเบส 5-CC GCAGCCGAACCGAGCG-3 800reversr ที่มีลำดับเบส 5-TGGCCTTTTGGCCTT-3 900reversr ที่มีลำดับเบส 5-GGGTTTCGCCACCTGACT-3 1000reversr ที่มีลำดับเบส 5-GAGAAAGGCGACAGGTATC-31. A standard DNA calibration kit for estimating the size of DNA samples consists of 10 DNA strand sizes: 100, 200, 300, 400, 500, 600, 700, 800, 900, and 1000 base pairs (bp). These are produced by amplifying DNA strands of different sizes using polymerase chain reaction (PCR) from plasmid DNA with known base pairs. When the PCR product is separated on a gel plate using gel electrophoresis, a ladder-like pattern of 10 bands appears, arranged from largest to smallest. This is used as a reference to estimate the size of the DNA being studied on the same gel plate. A special feature is the primer sequence used to produce the DNA calibration kit: a forward primer with the base pair sequence 5’-CACATGCAGCTCCCGGAGACG-3’ 100 and a reverse primer with the base pair sequence... 5’-CCCGACACCCGCCAACAC-3’ 200reverse with base sequence 5’-CTGATGCGGTATTTTCTCCTTA-3’ 300reverse with base sequence 5’-CCTTGCAGCACATCCCCCTT-3’ 400reverse with base sequence 5’-GGTCGACTCTAGAGGATC-3’ 500reverse with base sequence 5’-TTATGCTTCCGGCTCGTAT-3’ 600reverse with base sequence 5’-TGCAGCTGGCACGACAGGT-3’ 700reverse with base sequence 5’-CCGCAGCCGAACGACCGAGCG-3’ 800reverse with base sequence 5’-TGGCCTTTTGCTGGCCTT-3’ 900reverse with base sequence 5’-GGGTTTCGCCACCTCTGACT-3’ 1000reverse with base sequence 5’-GAGAAAGGCGGACAGGTATC-3’ --------------------- Updated 30/03/2016 1. A standard reference set for estimating the size of DNA samples consists of 10 DNA strand sizes: 100, 200, 300, 400, 500, 600, 700, 800, 900, and 1000 base pairs (bp). These are produced by amplifying DNA strands of different sizes using Polymerase Chain Reaction (PCR) from plasmid DNA with known base sequences. When the PCR product is separated on a gel plate using electrophoresis, a ladder-like structure of 10 bands will appear, arranged in order from largest to smallest. This will be used as a reference to estimate the size of the DNA to be studied in the same gel plate. A unique feature is the base sequence of the primers used to manufacture the DNA calibration kits: Forward Primers with the base sequence 5-CACATGCAGCTCCCGGAGACG-3 100reversr, 5-CACATGCAGCTCCCGGAGACG-3 200reversr, 5-CTGATGCGGGTATTTTCTCCTTA-3 300reversr, 5-CTGATGCGGGTATTTTCTCCTTA-3 400reversr, 5-GGTCGACTAGAGGATC-3 500reversr, 5-TIATGCTTCCGGCTCGTAT-3 600reversr, 5-TGCAGCTGGcACGACAGGT-3 700reversr, and 5-CC GCAGCCGAACCGAGCG-3 800reversr. 5-TGGCCTTTTGGCCTT-3 900reversr with base sequence 5-GGGTTTCGCCACCTGACT-3 1000reversr with base sequence 5-GAGAAAGGCGACAGGTATC-3 2. กรรมวิธีเตรียมชุดเทียบวัดดีเอ็นเอมาตรฐานสำหรับประมาณค่าขนาดของดีเอ็นเอ ตัวอย่าง ตามข้อถือสิทธิที่ 1 ซึ่งมีขั้นตอนหลัก 3 ขั้นตอน คือ 1. การเตรียมสารและวัสดุ อุปกรณ์ 2. กรรมวิธีการประดิษฐ์ชุดเทียบวัดขนาดดีเอ็นเอ และ 3. การทดสอบคุณภาพ ชุดเทียบวัดขนาดดีเอ็นเอ ------------------------------------------------------ 1.ชุดเทียบวัดเอมาตรฐานสำหรับประมาณค่าขนาดของเอ็นเอตัวอย่าง เป็นชุด ของสายดีเอ็นเอจำนวน 10 ขนาด คือ 100,200,300,400,500,600,700,800, 900 เเละ 1000 คู่เบส(Base Pairs:bp)ผลิตขึ้นโดยอาศัยการเพิ่มจำนวนสายดีเอ็นเอ ขนาดต่างๆ ด้วยปฏิกิริยาลูกโซ่ Polymerase Chain Reaction(PCR)จากพลาสมิดดีเอ็นเอ (Plasmid DNA)ที่ราบลำดับเบาเเล้ว เมื่อนำ ผลผลิตจาก PCR ไปเเยกในเเผ่นวุ้น โดยใช้กระเเสไฟฟ้า(Gel elecrotrophoresis)จะปรากฏเเถบเป็นชั้นบันได 10 เเถบ เรียง ขนาดจากใหญ่ไปเล็ก เเละจขะใช้เป็นตัวอ้างเพื่อประมาณขนาดของดีเอ็นเอที่ต้องการ ศึกษาที่อยู่ในเเผ่นวุ้นเดียว มีขั้นตอนหลัก 3 ขั้นตอน คือ 1.การเตรียมสารเเละวัสดุ อุปกรณ์ 2.กรรมวิธีการประดิษฐ์ชุดเทียบวัดขนาดดีเอ็นเอ เเละ 3.การทดสอบคุณภาพ ชุดเทียบวัดขนาดดีเอ็นเอ ที่ซึ่งมีลักษณะพิเศษ คือ ลำดับเบสของ Primers ที่ใช้ผลิตชุดเทียบวัดขนาดสี เอ็นเอ คือ Forward Primer ที่มีลำดับเบส 5-CACATGCAGCTCCCGGAGACG-3 100reversr ที่มีลำดับเบส 5-CACATGCAGCTCCCGGAGACG-3 200reversr ที่มีลำดับเบส 5-CTGATGCGGGTATTTTCTCCTTA-3 300reversr ที่มีลำดับเบส 5-CTGATGCGGGTATTTTCTCCTTA-3 400reversr ที่มีลำดับเบส 5-GGTCGACTAGAGGATC-3 500reversr ที่มีลำดับเบส 5-TIATGCTTCCGGCTCGTAT-3 600reversr ที่มีลำดับเบส 5-TGCAGCTGGcACGACAGGT-3 700reversr ที่มีลำดับเบส 5-CC GCAGCCGAACCGAGCG-3 800reversr ที่มีลำดับเบส 5-TGGCCTTTTGGCCTT-3 900reversr ที่มีลำดับเบส 5-GGGTTTCGCCACCTGACT-3 1000reversr ที่มีลำดับเบส 5-GAGAAAGGCGACAGGTATC-32. The method for preparing a standard DNA size estimation kit for estimating the size of DNA samples, according to claim 1, consists of three main steps: 1. Preparation of substances and materials; 2. The method for fabricating the DNA size estimation kit; and 3. Quality testing of the DNA size estimation kit. ------------------------------------------------------ 1. The standard DNA size estimation kit for estimating the size of DNA samples consists of 10 DNA strand sizes: 100, 200, 300, 400, 500, 600, 700, 800, 900, and 1000 base pairs (bp). These are produced by amplifying DNA strands of different sizes using Polymerase Chain Reaction (PCR) from light-synthetized plasmid DNA. When the PCR product is separated on a gel plate using electrophoresis, a ladder-like structure of 10 bands appears, arranged in order from largest to smallest. This will be used as a reference to estimate the size of the DNA to be studied in a single agar plate. There are three main steps: 1. Preparation of substances, materials, and equipment; 2. The process of fabricating the DNA size measurement kit; and 3. Testing the quality of the DNA size measurement kit. A special feature of the kit is the base sequence of the primers used: Forward Primers with the base sequence 5-CACATGCAGCTCCCGGAGACG-3 100reversr, 5-CACATGCAGCTCCCGGAGACG-3 200reversr, 5-CTGATGCGGGTATTTTCTCCTTA-3 300reversr, 5-CTGATGCGGGTATTTTCTCCTTA-3 400reversr, and 5-GGTCGACTAGAGGATC-3 500reversr. 5-TIATGCTTCCGGCTCGTAT-3 600reversr with base sequence 5-TGCAGCTGGcACGACAGGT-3 700reversr with base sequence 5-CC GCAGCCGAACCGAGCG-3 800reversr with base sequence 5-TGGCCTTTTGGCCTT-3 900reversr with base sequence 5-GGGTTTCGCCACCTGACT-3 1000reversr with base sequence 5-GAGAAAGGCGACAGGTATC-3
TH1303000761U 2013-07-10 A standard DNA calibration kit for estimating the size of a sample DNA. TH13832A3 (en)

Publications (4)

Publication Number Publication Date
TH13832C3 TH13832C3 (en) 2018-05-10
TH13832U true TH13832U (en) 2018-05-10
TH13832Y TH13832Y (en) 2018-05-10
TH13832A3 TH13832A3 (en) 2018-05-10

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
WO2016033251A3 (en) Compositions and methods for targeted nucleic acid sequence enrichment and high efficiency library generation
WO2014190138A3 (en) Measures of short telomere abundance
EA201692157A1 (en) SYNTHESIS OF TWO-CELLULAR NUCLEIC ACIDS
EP4249604A3 (en) Compositions and methods of rna analysis
MX2016011377A (en) Method for diagnosing colorectal cancer from a human feces sample by quantitive pcr, primers and kit.
WO2014116729A3 (en) Haplotying of hla loci with ultra-deep shotgun sequencing
EP4461812A3 (en) Method for preparing a next generation sequencing (ngs) library from a ribonucleic acid (rna) sample and compositions for practicing the same
WO2017044993A3 (en) Nucleic acid analysis by joining barcoded polynucleotide probes
EP4300099A3 (en) Measurement of protein expression using reagents with barcoded oligonucleotide sequences
WO2015081229A3 (en) Selective amplification of nucleic acid sequences
EP4219746A3 (en) Analysis of chromatin using a nicking enzyme
GB201205769D0 (en) Methods for preparing samples for nucleic acid amplification
WO2015114469A3 (en) Covered sequence conversion dna and detection methods
HK1245346A1 (en) High-throughput sequencing of polynucleotides
SG10201806000YA (en) Primer set for pcr for bacterial dna amplification, kit for detection and/or identification of bacterial species, and, method of detection and/or identification of bacterial species
EP4461824A3 (en) Detection kit or device and detection method for biliary tract cancer
WO2016027162A3 (en) Methods and compositions for nucleic acid detection
WO2013166444A3 (en) Biomarker analysis using scodaphoresis
WO2015112948A3 (en) Methods for determining a nucleotide sequence
AU2013252445A8 (en) Assays, methods and apparatus for assessing RNA disruption
WO2016014240A3 (en) Compositions and methods for the detection and analysis of mycobacterium tuberculosis
WO2017218737A3 (en) Methods of small-rna transcriptome sequencing and applications thereof
WO2015200833A3 (en) COMPOSITIONS AND METHODS FOR DETECTING HUMAN PEGIVIRUS 2 (HPgV-2)
TH13832Y (en) A standard DNA calibration kit for estimating the size of DNA samples.
MX2016015531A (en) Assay for oral inflammation.