RU2810751C1 - Тест-система и способ обнаружения специфических фрагментов нуклеиновых кислот 16 патогенов с использованием изотермической реакции амплификации - Google Patents
Тест-система и способ обнаружения специфических фрагментов нуклеиновых кислот 16 патогенов с использованием изотермической реакции амплификации Download PDFInfo
- Publication number
- RU2810751C1 RU2810751C1 RU2023104954A RU2023104954A RU2810751C1 RU 2810751 C1 RU2810751 C1 RU 2810751C1 RU 2023104954 A RU2023104954 A RU 2023104954A RU 2023104954 A RU2023104954 A RU 2023104954A RU 2810751 C1 RU2810751 C1 RU 2810751C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- insdqualifier
- insdseq
- insdfeature
- name
- value
- Prior art date
Links
- 244000052769 pathogen Species 0.000 title claims abstract description 61
- 150000007523 nucleic acids Chemical group 0.000 title claims abstract description 37
- 238000012360 testing method Methods 0.000 title claims abstract description 31
- 238000011901 isothermal amplification Methods 0.000 title claims abstract description 29
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 22
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 title description 17
- 108091027757 Deoxyribozyme Proteins 0.000 claims abstract description 29
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 claims abstract description 24
- 241000709687 Coxsackievirus Species 0.000 claims abstract description 21
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims abstract description 19
- 241000222122 Candida albicans Species 0.000 claims abstract description 18
- 241000606768 Haemophilus influenzae Species 0.000 claims abstract description 18
- 241000701027 Human herpesvirus 6 Species 0.000 claims abstract description 17
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 claims abstract description 16
- 241000186779 Listeria monocytogenes Species 0.000 claims abstract description 16
- 241000193985 Streptococcus agalactiae Species 0.000 claims abstract description 16
- 241000701044 Human gammaherpesvirus 4 Species 0.000 claims abstract description 15
- 241000588650 Neisseria meningitidis Species 0.000 claims abstract description 13
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 claims abstract description 13
- 241000700588 Human alphaherpesvirus 1 Species 0.000 claims abstract description 10
- 241000701074 Human alphaherpesvirus 2 Species 0.000 claims abstract description 10
- 229940095731 candida albicans Drugs 0.000 claims abstract description 9
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N guanine Chemical compound O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 8
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 claims abstract description 6
- 241000191967 Staphylococcus aureus Species 0.000 claims abstract description 6
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 6
- 241000187479 Mycobacterium tuberculosis Species 0.000 claims abstract description 5
- 241000193998 Streptococcus pneumoniae Species 0.000 claims abstract description 5
- 229940047650 haemophilus influenzae Drugs 0.000 claims abstract description 5
- 229940031000 streptococcus pneumoniae Drugs 0.000 claims abstract description 5
- 229940023064 escherichia coli Drugs 0.000 claims abstract description 3
- 229940115931 listeria monocytogenes Drugs 0.000 claims abstract description 3
- 229940030998 streptococcus agalactiae Drugs 0.000 claims abstract description 3
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 claims abstract 4
- 230000003321 amplification Effects 0.000 claims description 53
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 claims description 53
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 35
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 32
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 32
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 claims description 25
- 241000701085 Human alphaherpesvirus 3 Species 0.000 claims description 15
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims description 12
- 201000008827 tuberculosis Diseases 0.000 claims description 10
- 241000588653 Neisseria Species 0.000 claims description 9
- 208000035473 Communicable disease Diseases 0.000 claims description 5
- 201000009906 Meningitis Diseases 0.000 claims description 5
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 231100000676 disease causative agent Toxicity 0.000 claims description 4
- 239000012678 infectious agent Substances 0.000 claims description 3
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 abstract description 7
- 239000012491 analyte Substances 0.000 abstract description 6
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 2
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 abstract description 2
- 208000007514 Herpes zoster Diseases 0.000 abstract 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 abstract 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 abstract 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 abstract 1
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 abstract 1
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 abstract 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract 1
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 273
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 273
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 30
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 27
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 18
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 16
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 16
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 16
- 230000004544 DNA amplification Effects 0.000 description 14
- 241000194017 Streptococcus Species 0.000 description 14
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 14
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 14
- 230000005284 excitation Effects 0.000 description 13
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 12
- 239000006101 laboratory sample Substances 0.000 description 12
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 12
- 210000001175 cerebrospinal fluid Anatomy 0.000 description 9
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 9
- 244000052616 bacterial pathogen Species 0.000 description 7
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 7
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 6
- LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N ethylene glycol Natural products OCCO LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 238000011160 research Methods 0.000 description 6
- 241000186781 Listeria Species 0.000 description 5
- 238000013048 microbiological method Methods 0.000 description 5
- 244000052613 viral pathogen Species 0.000 description 5
- 241000191940 Staphylococcus Species 0.000 description 4
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 4
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 4
- 229920002477 rna polymer Polymers 0.000 description 4
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 3
- 239000005547 deoxyribonucleotide Substances 0.000 description 3
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 3
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 3
- 229910052943 magnesium sulfate Inorganic materials 0.000 description 3
- CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L magnesium sulphate Substances [Mg+2].[O-][S+2]([O-])([O-])[O-] CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 3
- 235000019341 magnesium sulphate Nutrition 0.000 description 3
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 3
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 description 3
- JADVWWSKYZXRGX-UHFFFAOYSA-M thioflavine T Chemical compound [Cl-].C1=CC(N(C)C)=CC=C1C1=[N+](C)C2=CC=C(C)C=C2S1 JADVWWSKYZXRGX-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 2
- 206010019233 Headaches Diseases 0.000 description 2
- TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L Magnesium chloride Chemical compound [Mg+2].[Cl-].[Cl-] TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 208000002193 Pain Diseases 0.000 description 2
- WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M Potassium chloride Chemical compound [Cl-].[K+] WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 241000700584 Simplexvirus Species 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 206010047700 Vomiting Diseases 0.000 description 2
- SXEHKFHPFVVDIR-UHFFFAOYSA-N [4-(4-hydrazinylphenyl)phenyl]hydrazine Chemical compound C1=CC(NN)=CC=C1C1=CC=C(NN)C=C1 SXEHKFHPFVVDIR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000013060 biological fluid Substances 0.000 description 2
- 210000003169 central nervous system Anatomy 0.000 description 2
- 231100000869 headache Toxicity 0.000 description 2
- 238000007726 management method Methods 0.000 description 2
- 210000003205 muscle Anatomy 0.000 description 2
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 2
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 2
- 125000006850 spacer group Chemical group 0.000 description 2
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 2
- ZIBGPFATKBEMQZ-UHFFFAOYSA-N triethylene glycol Chemical compound OCCOCCOCCO ZIBGPFATKBEMQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000008673 vomiting Effects 0.000 description 2
- JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 2-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]ethanesulfonic acid Chemical compound OCC[NH+]1CCN(CCS([O-])(=O)=O)CC1 JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UAIUNKRWKOVEES-UHFFFAOYSA-N 3,3',5,5'-tetramethylbenzidine Chemical compound CC1=C(N)C(C)=CC(C=2C=C(C)C(N)=C(C)C=2)=C1 UAIUNKRWKOVEES-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091093088 Amplicon Proteins 0.000 description 1
- 208000014912 Central Nervous System Infections Diseases 0.000 description 1
- 241000606153 Chlamydia trachomatis Species 0.000 description 1
- 206010011224 Cough Diseases 0.000 description 1
- 201000007336 Cryptococcosis Diseases 0.000 description 1
- 241001522864 Cryptococcus gattii VGI Species 0.000 description 1
- 241000221204 Cryptococcus neoformans Species 0.000 description 1
- 239000003298 DNA probe Substances 0.000 description 1
- 241000194031 Enterococcus faecium Species 0.000 description 1
- 241000193385 Geobacillus stearothermophilus Species 0.000 description 1
- 239000007995 HEPES buffer Substances 0.000 description 1
- 206010020843 Hyperthermia Diseases 0.000 description 1
- 208000027601 Inner ear disease Diseases 0.000 description 1
- 241000588747 Klebsiella pneumoniae Species 0.000 description 1
- 206010024264 Lethargy Diseases 0.000 description 1
- 206010024971 Lower respiratory tract infections Diseases 0.000 description 1
- 241000701076 Macacine alphaherpesvirus 1 Species 0.000 description 1
- 206010028347 Muscle twitching Diseases 0.000 description 1
- 206010052904 Musculoskeletal stiffness Diseases 0.000 description 1
- 241000204051 Mycoplasma genitalium Species 0.000 description 1
- 206010033546 Pallor Diseases 0.000 description 1
- 241000991583 Parechovirus Species 0.000 description 1
- 102000003992 Peroxidases Human genes 0.000 description 1
- 208000037581 Persistent Infection Diseases 0.000 description 1
- 208000035109 Pneumococcal Infections Diseases 0.000 description 1
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 1
- 206010036790 Productive cough Diseases 0.000 description 1
- 241000589517 Pseudomonas aeruginosa Species 0.000 description 1
- 206010037549 Purpura Diseases 0.000 description 1
- 206010037660 Pyrexia Diseases 0.000 description 1
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 206010057190 Respiratory tract infections Diseases 0.000 description 1
- 206010040047 Sepsis Diseases 0.000 description 1
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 1
- 208000001871 Tachycardia Diseases 0.000 description 1
- 229920004890 Triton X-100 Polymers 0.000 description 1
- 239000013504 Triton X-100 Substances 0.000 description 1
- 210000001015 abdomen Anatomy 0.000 description 1
- 230000001154 acute effect Effects 0.000 description 1
- OHDRQQURAXLVGJ-HLVWOLMTSA-N azane;(2e)-3-ethyl-2-[(e)-(3-ethyl-6-sulfo-1,3-benzothiazol-2-ylidene)hydrazinylidene]-1,3-benzothiazole-6-sulfonic acid Chemical compound [NH4+].[NH4+].S/1C2=CC(S([O-])(=O)=O)=CC=C2N(CC)C\1=N/N=C1/SC2=CC(S([O-])(=O)=O)=CC=C2N1CC OHDRQQURAXLVGJ-HLVWOLMTSA-N 0.000 description 1
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 1
- 239000012620 biological material Substances 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 230000036772 blood pressure Effects 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 239000012568 clinical material Substances 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 230000002920 convulsive effect Effects 0.000 description 1
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 208000002173 dizziness Diseases 0.000 description 1
- 241001493065 dsRNA viruses Species 0.000 description 1
- 210000005069 ears Anatomy 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 206010014599 encephalitis Diseases 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 230000027950 fever generation Effects 0.000 description 1
- 238000001917 fluorescence detection Methods 0.000 description 1
- 230000002538 fungal effect Effects 0.000 description 1
- 244000053095 fungal pathogen Species 0.000 description 1
- IIRDTKBZINWQAW-UHFFFAOYSA-N hexaethylene glycol Chemical compound OCCOCCOCCOCCOCCOCCO IIRDTKBZINWQAW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000008214 highly purified water Substances 0.000 description 1
- 230000036031 hyperthermia Effects 0.000 description 1
- 208000027866 inflammatory disease Diseases 0.000 description 1
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 1
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 210000001503 joint Anatomy 0.000 description 1
- 238000009593 lumbar puncture Methods 0.000 description 1
- 229910001629 magnesium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 206010025482 malaise Diseases 0.000 description 1
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 238000011880 melting curve analysis Methods 0.000 description 1
- 238000009629 microbiological culture Methods 0.000 description 1
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 1
- 108040007629 peroxidase activity proteins Proteins 0.000 description 1
- 206010034754 petechiae Diseases 0.000 description 1
- 208000008423 pleurisy Diseases 0.000 description 1
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 1
- 239000001103 potassium chloride Substances 0.000 description 1
- 235000011164 potassium chloride Nutrition 0.000 description 1
- 230000036632 reaction speed Effects 0.000 description 1
- 230000000241 respiratory effect Effects 0.000 description 1
- 230000000405 serological effect Effects 0.000 description 1
- 238000009589 serological test Methods 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 208000024794 sputum Diseases 0.000 description 1
- 210000003802 sputum Anatomy 0.000 description 1
- 230000006794 tachycardia Effects 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 208000027491 vestibular disease Diseases 0.000 description 1
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 1
- 238000012800 visualization Methods 0.000 description 1
Abstract
Изобретение относится к области биотехнологии. Предложена тест-система, содержащая набор реагентов для обнаружения в биологическом образце патогенов Neisseria meningitidis, Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Escherichia coli, Listeria monocytogenes, Streptococcus agalactiae, Candida albicans, Mycobacterium tuberculosis, Streptococcus aureus, Herpes simplex virus type 1/2, Varicella Zoster virus, Cytomegalovirus, Epstein-Barr virus, Human herpesvirus 6, Coxsackievirus В. Тест-система включает наборы олигонуклеотидов для изотермической амплификации специфических последовательностей геномов патогенов и ДНКзимные сенсоры, образующие гуаниновый комплекс Г-4. Тест-система используется в способе обнаружения указанных патогенов в биологическом образце. Изобретение направлено на детекцию продукта, накопленного методом циклической или изотермической ПЦР с использованием праймеров. Последующая визуализация реализуется посредством активации ферментативной активности гуанинового квадруплекса, который собирается при гибридизации ДНКзимных сенсоров с целевой последовательностью нуклеиновой кислоты (аналитом). Изобретение может быть использовано для диагностики инфекций, вызванных одним или несколькими указанными патогенами. 2 н.п. ф-лы, 21 ил., 1 табл., 6 пр.
Description
Область техники, к которой относится изобретение
Настоящее изобретение относится к области биохимии и может быть использовано в молекулярно-генетической диагностике. Предложенный способ обнаружения нуклеиновых кислот патогенов N. meningitidis, S. pneumoniae, Н. influenzae, Е. coli, L. monocytogenes, S. agalactiae, С.albicans, М. tuberculosis, S. aureus, HSV 1/2, Varicella Zoster virus, Cytomegalovirus, Epstein-Barr virus, Human herpesvirus 6, Coxsackievirus В предполагает проведение двух этапов исследования: 1) мультиплексная изотермическая амплификации с использованием петлевых праймеров и 2) последующая синглплексная детекция продуктов амплификации сенсорами на основе ДНКзимов. Данный способ обнаружения позволяет достичь высоких показателей чувствительности и специфичности и сократить время исследования до менее 2 часов, что может быть применено для диагностики инфекций, вызванных вышеперечисленными патогенами, а также для целей научных исследований.
Уровень техники
Обнаружение нуклеиновых кислот является одним из основных методов молекулярно-генетической диагностики инфекций: подход позволяет быстро идентифицировать возбудитель заболевания посредством амплификации специфического фрагмента нуклеиновой кислоты генома патогена-возбудителя, рибонуклеиновой (РНК) или дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК). Скорость проведения исследования имеет особо важное значение для стремительно развивающихся воспалительных заболеваний с высоким уровнем инвалидизации, а мультиплексный подход - для инфекций, вызываемых широким спектром патогенов. Есть группа инфекций, для которых критичными являются оба параметра - и скорость реакции, и мультиплексный подход. Это, к примеру, инфекции центральной нервной системы.
Широкий спектр потенциальных возбудителей нейроинфекций, тяжесть последствий и размытость клинической картины становятся причиной использования большого набора тестов, используемых для выявления патогенов в спинномозговой жидкости (СМЖ). Подобные тестирования требуют наличия лабораторных условий и специально обученного персонала, а также функционирования полноценной клинико-диагностической лаборатории. Существует несколько основных подходов к исследованию СМЖ. Традиционные микробиологические методы, такие как посев, могут быть специфичны, однако они имеют низкую чувствительность, а постановка диагноза в случае их использования занимает несколько дней. Серологические тесты часто применяются в последнее время, однако они не позволяют различить острую форму инфекции от хронической. Молекулярно-генетические тесты, такие как полимеразная цепная реакция, намного удобнее и точнее, чем микробиологические посевы, к тому же могут определять патогены различной природы. Однако одним из недостатков серологических и молекулярно-биологических исследований является необходимость выбора целевых патогенов для проведения исследований, а также соответствующие материальные, временные и трудовые затраты. Все вышеобозначенные проблемы способны решить мультиплексные молекулярно-диагностические тест-системы.
На сегодняшний день к данному уровню техники можно отнести несколько существующих тест-систем.
В качестве ближайшего аналога может быть представлена система компании Biomerieux для мультиплексной детекции патогенов: панель ME (Meningitis/Encephalitis), позволяющая определять одновременно 14 патогенов центральной нервной системы в СМЖ (Е. coli, Н. influenzae, L. monocytogenes, N. meningitidis, S. agalactiae, S. pneumoniae, Cryptococcus neoformans/gattii, Cytomegalovirus, Coxsackievirus B, HSV 1/2, Human herpesvirus 6, Varicella Zoster virus и Parechovirus) по анализу кривых плавления после проведения полимеразной цепной реакции (ПЦР) в реальном времени, панель RP (Respiratory), позволяющая определять одновременно 21 патоген, панель для идентификации 43 возбудителей сепсиса BioFire BCID2 panel. Однако все эти панели предназначены для использования в закрытой тест-системе FilmArray, основанной на проведении полимеразной цепной реакции в режиме реального времени с накапливанием флуоресцентно меченого продукта амплификации. Данный способ детекции предполагает использование дорогостоящих реагентов, что препятствует массовизации метода для диагностики инфекций.
Известны диагностические системы компании «Т2 Biosystems», которые предназначены для прямой детекции ряда бактериальных патогенов (Enterococcus faecium, Е. coli, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus) в различных биологических жидкостях, включая кровь, без предварительного выделения нуклеиновых кислот и их очистки. Реакции лизиса клеточных компонентов биологического материала и бактерий, этап амплификации и детекции ампликонов с помощью патентованной технологии Т2 магнитного резонанса проводятся автоматически в одном картридже в специальном аппарате (https://www.t2biosystems.com/t2direct-diagnostics-eu/t2bacteria-panel-eu/).
Еще одним изобретением для мультиплексной идентификации возбудителей инфекций являются тест-системы с наборами специфических праймеров для диагностики серии «Амплисенс»: «Амплисенс N.meningitidis/H. influenzae/S.pneumoniae-FL» для диагностики нейроинфекций и «Амплисенс
С.trachomatis/ M.genitalium/ Ureaplasma-FRT» для выявления ДНК возбудителей инфекций урогенитального тракта в клиническом материале методом ПЦР с гибридизационно-флуоресцентной детекцией (https://interlabservice.ru/catalog/reagents/?sid=1495&id=6505).
Главными недостатками всех известных систем являются их сложность, высокая стоимость, низкая мобильность по причине необходимости юстировки лазеров прибора при перемещении и длительность проведения анализа. Два последних изобретения, наборы реагентов «Амписенс» и диагностические системы компании «Т2 Biosystems», помимо того, что они также, как и панели Biomerieux, не могут быть использованы в местах предоставления медицинской помощи, нацелены на обнаружение ограниченного количества бактерий-возбудителей инфекционных заболеваний.
Таким образом, в результате поиска способа мультиплексного обнаружения 16 патоген-специфичных последовательностей нуклеиновых кислот не обнаружено.
Технической задачей является создание способа этиологической идентификации нуклеиновых кислот 16 возбудителей различных инфекций в относительно короткий промежуток времени, применение которого не требует использования дорогостоящих реагентов.
Описание иллюстраций
Фигура 1 - Схематическое изображение работы заявляемых петлевых праймеров для реакции изотермической амплификации [Luo G, et al. Stem-loop-primer assisted isothermal amplification enabling high-specific and ultrasensitive nucleic acid detection. Biosens Bioelectron. 2021 Jul 15;184:113239. doi: 10.1016/j.bios.2021.113239].
Фигура 2 - Схематическое изображение работы трехкомпонентной системы ДНКзимных сенсоров [Amanda J.C., et al. DNA antenna tile-associated deoxyribozymes sensor with improved sensitivity. Chembiochem. 2016 Nov 3; 17(21):2038-2041. doi: 10.1002/cbic.201600438].
Фигура 3 - Результаты детекции 16 патогенов при использовании заявляемых сенсоров электрофорез реакции амплификации.
Фигура 4 - Гель-электрофорез продуктов амплификации ДНК Е. coli. Слева направо: 3 технических повторности экспериментальной изотермической амплификации ДНК Е. coli, маркер веса Евроген 50+bp, 3 технических повторности негативного контроля. Агароза 2%, 80 V.
Фигура 5 - Гель-электрофорез продуктов амплификации ДНК S. pneumoniae. Слева направо: 3 технических повторности из экспериментальной пробирки с добавленной ДНК S. pneumoniae, 3 технических повторности негативного контроля. Агароза 2%, 80 V.
Фигура 6 - Гель-электрофорез продуктов амплификации ДНК N. meningitides. Слева направо: 3 технических повторности негативного контроля, 3 технических повторности из экспериментальной пробирки с добавленной ДНК N. meningitidis. Агароза 2%, 80 V.
Фигура 7 - Гель-электрофорез продуктов амплификации ДНК Н. influenzae. Слева направо: 3 технических повторности из экспериментальной пробирки с добавленной ДНК Н. influenzae, 3 технических повторности негативного контроля. Агароза 2%, 80 V.
Фигура 8 - Гель-электрофорез продуктов амплификации ДНК S. agalactiae. Слева направо: 3 технических повторности из экспериментальной пробирки с добавленной ДНК S. agalactiae, 3 технических повторности негативного контроля. Агароза 2%, 80 V
Фигура 9 - Гель-электрофорез продуктов амплификации ДНК L. monocytogenes. Слева направо: 3 технических повторности из экспериментальной пробирки с добавленной ДНК L. monocytogenes, 3 технических повторности негативного контроля. Агароза 2%, 80 V.
Фигура 10 - Гель-электрофорез продуктов амплификации ДНК S. aureus. Слева направо: 3 технических повторности из экспериментальной пробирки с добавленной ДНК S. aureus, 3 технических повторности негативного контроля. Агароза 2%, 80 V.
Фигура 11 - Гель-электрофорез продуктов амплификации М. tuberculosis. Слева направо: 3 технических повторности из экспериментальной пробирки с добавленной ДНК М. tuberculosis, 3 технических повторности негативного контроля. Агароза 2%, 80 V.
Фигура 12 - Гель-электрофорез продуктов амплификации ДНК С.albicans. Слева направо: 3 технических повторности из экспериментальной пробирки с добавленной ДНК С.albicans, 3 технических повторности негативного контроля. Агароза 2%, 80 V.
Фигура 13 - Гель-электрофорез продуктов амплификации ДНК HSV 1. Слева направо: 3 технических повторности из экспериментальной пробирки с добавленной ДНК HSV 1, 3 технических повторности негативного контроля. Агароза 2%, 80 V.
Фигура 14 - Гель-электрофорез продуктов амплификации ДНК HSV 2. Слева направо: 3 технических повторности из экспериментальной пробирки с добавленной ДНК HSV 2, 3 технических повторности негативного контроля. Агароза 2%, 80 V.
Фигура 15 - Гель-электрофорез продуктов амплификации ДНК Varicella Zoster virus. Слева направо: 3 технических повторности из экспериментальной пробирки с добавленной ДНК Varicella Zoster virus, 3 технических повторности негативного контроля. Агароза 2%, 80 V.
Фигура 16 - Гель-электрофорез продуктов амплификации ДНК Epstein-Barr virus. Слева направо: 3 технических повторности из экспериментальной пробирки с добавленной ДНК Epstein-Barr virus, 3 технических повторности негативного контроля. Агароза 2%, 80 V.
Фигура 17 - Гель-электрофорез продуктов амплификации Cytomegalovirus. Слева направо: 3 технических повторности из экспериментальной пробирки с добавленной ДНК Cytomegalovirus, 3 технических повторности негативного контроля. Агароза 2%, 80 V.
Фигура 18 - Гель-электрофорез продуктов амплификации Human herpesvirus 6. Слева направо: 3 технических повторности из экспериментальной пробирки с добавленной ДНК Human herpesvirus 6, 3 технических повторности негативного контроля. Агароза 2%, 80 V.
Фигура 19 - Гель-электрофорез продуктов амплификации Coxsackievirus В. Слева направо: 3 технических повторности из экспериментальной пробирки с добавленной ДНК Coxsackievirus В, 3 технических повторности негативного контроля. Агароза 2%, 80 V.
Фигура 20 - Результаты измерения флуоресцентного сигнала после гибридизации сенсоров к 16 патогенам, определяемым набором реагентов, с продуктом амплификации ДНК микроорганизма Н. influenzae. Идентификация нуклеиновых кислот лабораторного образца бактериального патогена при помощи заявляемого набора реагентов.
Фигура 21 - Результаты измерения флуоресцентного сигнала после гибридизации сенсоров к 16 определяемым набором реагентов патогенам с продуктом амплификации ДНК Human herpesvirus 6. Идентификация нуклеиновых кислот лабораторного образца вирусного патогена при помощи заявляемого набора реагентов.
Раскрытие изобретения
Настоящее техническое решение заключается в создании способа идентификации 16 возбудителей инфекций как бактериальной и вирусной, так и грибковой природы.
Техническим результатом создание тест-системы для определения этиологии инфекционных заболеваний, вызванных патогенами Neisseria meningitidis, Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Escherichia coli, Listeria monocytogenes, Streptococcus agalactiae, Candida albicans, Mycobacterium tuberculosis, Streptococcus aureus, Herpes simplex virus 1/2, Varicella Zoster virus, Cytomegalovirus, Epstein-Barr virus, Human herpesvirus 6, Coxsackievirus B.
Технический результат достигается за счет того, что высокоспецифичные зонды, представленные ДНКзимами, при обнаружении целевой нуклеиновой кислоты возбудителя инфекционного заболевания (аналита) специфически связываются с ее участками и формируют гуаниновый квадруплекс (Г-4), обладающий ферментативной активностью пероксидазы, что позволяет выявлять специфичные фрагменты нуклеиновых кислот патогена посредством колориметрической реакции либо реакции с производством флуоресцентного продукта. В отсутствие аналита ДНКзимные сенсоры находятся преимущественно в диссоциированной форме. При добавлении в раствор аналита сенсоры собираются в комплексную структуру, которая и является ДНКзимом, способным связывать субстрат. Данный метод позволяет использовать различные субстраты и различные способы детектирования результата реакции - как колориметрические, так и световые.
С целью достижения высокой чувствительности и для облегчения потенциальной интеграции реагентов в мобильную тест-систему стадии детекции предшествует стадия изотермической амплификации с использованием петлевых праймеров, SPA (stem-loop-primer assisted amplification).
Суммарное время исследования проверки образца на 16 патогенов составляет около 90 минут.
Заявляемый набор реагентов нацелен на обнаружение последовательностей нуклеиновых кислот патогенов SEQ №1 - SEQ №15, что позволяет идентифицировать следующие патогены: N. meningitidis, S. pneumoniae, Н. influenzae, Е. coli, L. monocytogenes, S. agalactiae, C. albicans, M. tuberculosis, S. aureus, Herpes simplex virus 1/2, Varicella Zoster virus, Cytomegalovirus, Epstein-Barr virus, Human herpesvirus 6, Coxsackievirus В. В случае Coxsackievirus В, который является РНК-вирусом, последовательность представлена комплементарной последовательностью ДНК.
Олигонуклеотиды для изотермической амплификации специфической последовательности патогена представляют собой 15 наборов из четырех праймеров: SEQ №16-SEQ №75.
Г-4 зонды представлены олигонуклеотидами с последовательностями SEQ №76 - SEQ №120, содержащими участки, распознающие одноцепочечные нуклеиновые кислоты возбудителя инфекционного заболевания.
Новизна заявляемого технического решения заключается в том, что для получения информации о наличии нуклеиновой кислоты используется комбинация методов изотермической амплификации и гибридизации с ДНКзимными сенсорами в 15 отдельных пробирках с использованием недорогих реагентов, включая BST-полимеразу. Праймеры и сенсоры системы не различают Herpes simplex virus 1 и 2 типа, однако распознают любой из них. Для реализации каждой из стадий детекции были использованы праймеры для изотермической амплификации SPA, представленные в группе последовательностей SEQ №16 - SEQ №75, и последовательности ДНКзимных сенсоров, представленные в группе последовательностей SEQ №76 - SEQ №120. Данные реакции и реагенты могут быть как объединены в единой разработке для мультиплексной детекции, так и использованы для обнаружения нуклеиновых кислот и идентификации патогенов N. meningitidis, S. pneumoniae, Н. influenzae, Е. coli, L. monocytogenes, S. agalactiae, C. albicans, M. tuberculosis, S. aureus, Herpes simplex virus 1/2, Varicella Zoster virus, Cytomegalovirus, Epstein-Barr virus, Human herpesvirus 6, Coxsackievirus В в отдельных 15 пробирках.
Для обнаружения всех определяемых патогенов, кроме Coxsackievirus В, нужно в пробирке приготовить раствор следующего состава:
- буфер для BST-полимеразы 1х;
- сульфат магния 8 мМ;
- этиленгликоль 0,5%;
- дезоксирибонуклеотиды 1,4 мМ;
- короткие праймеры для соответствующего патогена (F и R из группы последовательностей SEQ№16 - SEQ №75 для поиска и амплификации фрагментов геномов патогенов SEQ №1 - SEQ №15) по 0,4 мкМ;
- петлевые праймеры для соответствующего патогена (LF и LR из группы последовательностей SEQ №16 - SEQ №75) по 1,6 мкМ;
- BST-полимераза 8U;
- нуклеиновые кислоты патогена в количестве, соответствующем 100 геномным эквивалентам (1000 геномным эквивалентам каждого из патогенов в случае мультиплексного образца нуклеиновых кислот);
- вода высокоочищенная до 50 мкл (при необходимости);
- термостабильная ревертаза (для обнаружения Coxsackievirus В).
Необходимо инкубировать полученную смесь при 65°С в течение 60 минут, далее 5 мкл смеси после амплификации добавить в раствор следующего состава:
- 50 мМ HEPES, рН 7,4;
- 70 мМ хлорида калия;
- 160 мМ хлорида натрия;
- 50 мМ хлорида магния;
- 1% ДМСО;
- 0,03% Тритон Х-100;
- соответствующий набор сенсоров в концентрации 1 мкМ каждой части (SEQ №76 - SEQ №120);
- субстрат для ДНКзимов: концентрация зависит от типа субстрата (например, флуорофор тиофлавин Т 0,5 мкМ).
Необходимо инкубировать полученную смесь в течение 5 минут, далее измерить результат окисления субстрата ДНКзимами в пробирке: в случае использования тиофлавина Т измерить флуоресценцию при длине волны возбуждения 450 нм и волны эмиссии 520 нм.
После завершения эксперимента результаты могут быть интерпретированы по наличию цветового или светового сигнала, количественно отражающего активность собранных ДНКзимных комплексов после обнаружения аналита. Такой порядок действий и такая репрезентация делают результат однозначным и позволяют использовать реагенты без ужесточения мер биологической безопасности. Использование одной пробы для обнаружения сразу 16 патогенов экономит время, затрачиваемое на получение результата.
Заявляемое техническое решение рекомендовано к использованию в медицинской клинической практике, эпидемиологии и научных исследованиях, а именно как устройство для мультиплексного обнаружения патоген-специфичных нуклеиновых кислот, что соответствует критерию «промышленная применимость».
Предлагаемое изобретение поясняется фигурами со схематическими изображениями стадий исследования и примерами использования (фигуры 1-21).
Создание тест-системы
Синтетические олигонуклеотиды произведены компаниями ДНК-Синтез, Россия и Евроген, Россия. Сконструированы последовательности гибридизационных ДНК-зондов на основе Г-4 (SEQ №76 - SEQ №120) для детекции одноцепочечной ДНК N meningitidis, S. pneumoniae, Н. influenzae, Е. coli, L. monocytogenes, S. agalactiae, C. albicans, M. tuberculosis, S. aureus, Herpes simplex virus 1/2, Varicella Zoster virus, Cytomegalovirus, Epstein-Barr virus, Human herpesvirus 6, Coxsackievirus В, а также петлевые праймеры для изотермической амплификации (SEQ №16 - SEQ №75).
Для фундаментальной разработки бинарных Г-4 зондов были проанализированы патоген-специфичные консервативные участки геномов N. meningitidis, S. pneumoniae, Н. influenzae, Е. coli, L. monocytogenes, S. agalactiae, C. albicans, M. tuberculosis, S. aureus, Herpes simplex virus 1/2, Varicella Zoster virus, Cytomegalovirus, Epstein-Barr virus, Human herpesvirus 6, Coxsackievirus В и выделены для посадки Г-4 зондов. В качестве спейсера использовали триэтиленгликоль или политимидин. Рабочая концентрация зондов составляет 1 мкМ для каждого компонента сенсорной системы.
Набор праймеров для каждого патогена из группы последовательностей SEQ№16 - SEQ №75 амплифицирует соответствующий фрагмент генома из набора последовательностей SEQ №1 - SEQ №15 в соответствии с протоколом реакции, указанным выше в разделе «Раскрытие изобретения». Чувствительность каждого набора праймеров для одного патогена составляет менее 10 геномных эквивалентов для образцов, содержащих нуклеиновые кислоты одного патогена, и менее 100 геномных эквивалентов для образцов, содержащих нуклеиновые кислоты двух и более патогенов. Каждый набор праймеров расфасован в 15 пробирок, уже содержащих все остальные составляющие реакционной смеси. Далее в такие наборы добавляют образцы выделенной из лабораторного образца нуклеиновой кислоты патогена. После инкубируют пробирки при 65°С в течение 60 минут.
Для визуализации в качестве субстрата нужно использовать флуорофор тиофлавин Т, который в результате связывания с Г-4 комплексом генерирует флуоресцентный сигнал. Для этого переносят по 5 мкл амплификационной смеси в пробирки для гибридизации с соответствующими ДНКзимными сенсорами, содержащими все необходимые для реакции ингредиенты, а через 5 минут замеряют уровень флуоресценции при помощи флуориметра Tecan при длине волны возбуждения 450 нм и длине волны эмиссии 520 нм. Результаты отражает фигура 3.
Полная длительность анализа со всеми манипуляциями исследователя составляет 90 минут.
Примеры использования тест-системы
Пример 1. Использование реагентов для определения лабораторных образцов патогенов
Изотермическая амплификация выделенных из патогенов нуклеиновых кислот -амплификация целевого патоген-специфического фрагмента (SEQ№1 - SEQ №15) нуклеиновых кислот лабораторных образцов культур
Для амплификации нуклеиновых кислот каждого патогена, кроме Coxsackievirus В, необходимо приготовить реакционную смесь следующего состава:
- буфер для BST-полимеразы 1х;
- сульфат магния 2 мМ;
- этиленгликоль 0,5%;
- дезоксирибонуклеотиды 1,4 мМ;
- короткие праймеры (F и R из группы последовательностей SEQ№16 - SEQ №75) по 0,4 мкМ;
- петлевые праймеры (LF и LR из группы последовательностей SEQ№16 - SEQ №75) по 0,8 мкМ;
- BST-полимераза 8U (полимераза, выделенная из Bacillus stearothermophilus);
- выделенная из лабораторной культуры патогена ДНК (в количестве, соответствующем 50 геномным эквивалентам (ГЭ)).
Для вируса Коксаки В необходимо приготовить реакционную смесь следующего состава:
- буфер для BST 1х;
- сульфат магния 2 мМ;
- этиленгликоль 0,5%;
- дезоксирибонуклеотиды 1,4 мМ;
- короткие праймеры (F и R) по 0,4 мкМ;
- петлевые праймеры (LF и LR) по 0,8 мкМ;
- термостабильная ревертаза 3U;
- BST-полимераза 8U;
- РНК 0,7 фг (соответствует около 100 ГЭ).
Реакция амплификации протекает при 65°С в течение 60 минут.
Пример 2. Идентификация неизвестных лабораторных образцов с помощью разработанных реагентов
Образец №1
Проводили изотермическую амплификацию ДНК, выделенной из неизвестного лабораторного образца бактериального патогена с использованием описанного выше протокола без добавления термостабильной ревертазы. Полученную после амплификации смесь без предварительной очистки добавляли к ДНКзимным сенсорам по следующему протоколу:
- в СОХ-буфер добавляли 1 мкМ каждой из части сенсора, 0,5 мкМ тиофлавина, 5 мкл смеси после амплификации,
- все компоненты перемешивали,
- инкубировали в течение 5 минут при комнатной температуре,
- детектировали флуоресцентный сигнал при длине волны возбуждения 450 нм и волны эмиссии 520 нм (фигура 20).
Результат идентификации: Н. influenzae.
Результат идентификации методом ПЦР: Н. influenzae.
Образец №2
Проводили изотермическую амплификацию ДНК, выделенной из неизвестного лабораторного образца инактивированного вирусного патогена с использованием описанного выше протокола без добавления термостабильной ревертазы. Полученную после амплификации смесь без предварительной очистки добавляли к ДНКзимным сенсорам по следующему протоколу:
- в СОХ-буфер добавляли 1 мкМ каждой из части сенсора, 0,5 мкМ тиофлавина, 5 мкл смеси после амплификации,
- все компоненты перемешивали,
- инкубировали в течение 5 минут при комнатной температуре,
- детектировали флуоресцентный сигнал при длине волны возбуждения 450 нм и длине волны эмиссии 520 нм (фигура 21).
Результат идентификации: Human herpesvirus 6.
Результат идентификации методом ПЦР: Human herpesvirus 6.
Образец №3
Проводили изотермическую амплификацию ДНК, выделенной из неизвестного лабораторного образца бактериального патогена с использованием описанного выше протокола без добавления термостабильной ревертазы. Полученную после амплификации смесь без предварительной очистки добавляли к ДНКзимным сенсорам по следующему протоколу:
- в СОХ-буфер добавляли 1 мкМ каждой из части сенсора, 0,5 мкМ тиофлавина, 5 мкл смеси после амплификации,
- все компоненты перемешивали,
- инкубировали в течение 5 минут при комнатной температуре,
- детектировали флуоресцентный сигнал при длине волны возбуждения 450 нм и волны эмиссии 520 нм (фигура 20).
Результат идентификации: S. agalactiae
Результат идентификации методом ПЦР: S. agalactiae.
Образец №4
Проводили изотермическую амплификацию ДНК, выделенной из неизвестного лабораторного образца патогена грибов с использованием описанного выше протокола без добавления термостабильной ревертазы. Полученную после амплификации смесь без предварительной очистки добавляли к ДНКзимным сенсорам по следующему протоколу:
- в СОХ-буфер добавляли 1 мкМ каждой из части сенсора, 0,5 мкМ тиофлавина, 5 мкл смеси после амплификации,
- все компоненты перемешивали,
- инкубировали в течение 5 минут при комнатной температуре,
- детектировали флуоресцентный сигнал при длине волны возбуждения 450 нм и волны эмиссии 520 нм (фигура 20).
Результат идентификации: С.albicans.
Результат идентификации методом ПЦР: С.albicans.
Образец №5
Проводили изотермическую амплификацию ДНК, выделенной из неизвестного лабораторного образца бактериального патогена с использованием описанного выше протокола без добавления термостабильной ревертазы. Полученную после амплификации смесь без предварительной очистки добавляли к ДНКзимным сенсорам по следующему протоколу:
- в СОХ-буфер добавляли 1 мкМ каждой из части сенсора, 0,5 мкМ тиофлавина, 5 мкл смеси после амплификации,
- все компоненты перемешивали,
- инкубировали в течение 5 минут при комнатной температуре,
- детектировали флуоресцентный сигнал при длине волны возбуждения 450 нм и волны эмиссии 520 нм (фигура 20).
Результат идентификации: Е. coli.
Результат идентификации методом ПЦР: Е. coli.
Образец №6
Проводили изотермическую амплификацию ДНК, выделенной из неизвестного лабораторного образца бактериального патогена с использованием описанного выше протокола без добавления термостабильной ревертазы. Полученную после амплификации смесь без предварительной очистки добавляли к ДНКзимным сенсорам по следующему протоколу:
- в СОХ-буфер добавляли 1 мкМ каждой из части сенсора, 0,5 мкМ тиофлавина, 5 мкл смеси после амплификации,
- все компоненты перемешивали,
- инкубировали в течение 5 минут при комнатной температуре,
- детектировали флуоресцентный сигнал при длине волны возбуждения 450 нм и волны эмиссии 520 нм (фигура 20).
Результат идентификации: L. monocytogenes.
Результат идентификации методом ПЦР: L. monocytogenes.
Образец №7
Проводили изотермическую амплификацию ДНК, выделенной из образца культуры клеток, зараженных неизвестным вирусным патогеном с использованием описанного выше протокола без добавления термостабильной ревертазы. Полученную после амплификации смесь без предварительной очистки добавляли к ДНКзимным сенсорам по следующему протоколу:
- в СОХ-буфер добавляли 1 мкМ каждой из части сенсора, 0,5 мкМ тиофлавина, 5 мкл смеси после амплификации,
- все компоненты перемешивали,
- инкубировали в течение 5 минут при комнатной температуре,
- детектировали флуоресцентный сигнал при длине волны возбуждения 450 нм и волны эмиссии 520 нм (фигура 20).
Результат идентификации: Cytomegalovirus
Результат идентификации методом ПЦР: Cytomegalovirus.
Образец №8
Проводили изотермическую амплификацию ДНК, выделенной из образца культуры клеток, зараженных неизвестным вирусным патогеном с использованием описанного выше протокола без добавления термостабильной ревертазы. Полученную после амплификации смесь без предварительной очистки добавляли к ДНКзимным сенсорам по следующему протоколу:
- в СОХ-буфер добавляли 1 мкМ каждой из части сенсора, 0,5 мкМ тиофлавина, 5 мкл смеси после амплификации,
- все компоненты перемешивали,
- инкубировали в течение 5 минут при комнатной температуре,
- детектировали флуоресцентный сигнал при длине волны возбуждения 450 нм и волны эмиссии 520 нм (фигура 20).
Результат идентификации: Epstein-Barr virus.
Результат идентификации методом ПЦР: Epstein-Barr virus.
Образец №9
Проводили изотермическую амплификацию ДНК, выделенной из образца культуры клеток, зараженных неизвестным вирусным патогеном с использованием описанного выше протокола без добавления термостабильной ревертазы. Полученную после амплификации смесь без предварительной очистки добавляли к ДНКзимным сенсорам по следующему протоколу:
- в СОХ-буфер добавляли 1 мкМ каждой из части сенсора, 0,5 мкМ тиофлавина, 5 мкл смеси после амплификации,
- все компоненты перемешивали,
- инкубировали в течение 5 минут при комнатной температуре,
- детектировали флуоресцентный сигнал при длине волны возбуждения 450 нм и волны эмиссии 520 нм (фигура 20).
Результат идентификации: Varicella-zoster virus.
Результат идентификации методом ПЦР: Varicella-zoster virus.
Образец №10
Проводили изотермическую амплификацию ДНК, выделенной из неизвестного лабораторного образца бактериального патогена с использованием описанного выше протокола без добавления термостабильной ревертазы. Полученную после амплификации смесь без предварительной очистки добавляли к ДНКзимным сенсорам по следующему протоколу:
- в СОХ-буфер добавляли 1 мкМ каждой из части сенсора, 0,5 мкМ тиофлавина, 5 мкл смеси после амплификации,
- все компоненты перемешивали,
- инкубировали в течение 5 минут при комнатной температуре,
- детектировали флуоресцентный сигнал при длине волны возбуждения 450 нм и волны эмиссии 520 нм (фигура 20).
Результат идентификации: М. tuberculosis.
Результат идентификации методом ПЦР: М. tuberculosis.
Образец №11
Проводили изотермическую амплификацию РНК, выделенной из образца культуры клеток, зараженных вирусом Коксаки с использованием протокола, описанного выше с добавлением термостабильной ревертазы. Полученную после амплификации смесь без предварительной очистки добавляли к ДНКзимным сенсорам по следующему протоколу:
- в СОХ-буфер добавляли 1 мкМ каждой из части сенсора, 0,5 мкМ тиофлавина, 5 мкл смеси после амплификации,
- все компоненты перемешивали,
- инкубировали в течение 5 минут при комнатной температуре,
- детектировали флуоресцентный сигнал при длине волны возбуждения 450 нм и волны эмиссии 520 нм (фигура 20).
Результат идентификации: Coxsackievirus В.
Результат идентификации методом ПЦР: Coxsackievirus В.
Пример 3: Пациент с респираторной инфекцией и с вестибулярными нарушениями - головокружением, рвотой, шумом и болью в ушах.
Для диагностики нейроинфекции исследовали спинномозговую жидкость при помощи тест-системы. Для этого выделяли нуклеиновые кислоты из 100 мкл спинномозговой жидкости, растворяли в 150 мкл воды и добавляли по 10 мкл полученного раствора в 15 пробирок с праймерами и растворами для амплификации (SEQ №16 - SEQ №75 для поиска и амплификации фрагментов геномов патогенов SEQ№1 - SEQ №15). После амплификации в течение 60 минут по 5 мкл амплификационных смесей добавляли в пробирки, содержащие соответствующие сенсоры (SEQ №76 - SEQ №120) и растворы для детекции. Через 5 минут после добавления замеряли уровень флуоресценции в каждой из 15 пробирок.
Длительность анализа составила 90 минут.
Результат исследования: в пробирке, где происходила гибридизация продукта амплификации с сенсорами для S. pneumoniae, показал флуоресцентный сигнал выше порогового.
Диагноз: пневмококковая инфекция, вызванная S. pneumoniae. Диагноз был подтвержден микробиологическими методами.
Пример 4: Пациент с подозрением на инфекцию центральной нервной системы с симптомами внезапной гипертермии, ознобом, вялостью, головной болью, спутанностью сознания и измененным поведением.
Для диагностики использовали образец спинномозговой жидкости поциента, полученной при помощи спинномозговой пункции в течение часа после госпитализации. Из 100 мкл спинномозговой жидкости выделяли нуклеиновые кислоты, затем растворяли в 150 мкл воды и добавляли по 10 мкл полученного раствора в 15 пробирок с праймерами и раствором для амплификации (SEQ№16 - SEQ №75 для поиска и амплификации фрагментов геномов патогенов SEQ№1 - SEQ№15). После амплификации по 5 мкл амплификационных смесей добавляли в пробирки, содержащие соответствующие сенсоры (SEQ№76 - SEQ №120) и растворы для детекции. Через 5 минут после добавления замеряли уровень флуоресценции в каждой из 15 пробирок.
Длительность анализа составила 90 минут.
Результат исследования: в пробирке, где происходила гибридизация продукта амплификации с сенсорами для идентификации Herpes simplex virus 1/2, показал флуоресцентный сигнал выше порогового.
Диагностическая специфичность зондов и чувствительность детекции аналитов составила 100%.
Диагноз: Herpes simplex virus .
Диагноз был подтвержден методом ПЦР в реальном времени.
Пример 5. Пациент, демонстрирующий отказ от еды и питья, с бледностью кожи, рвотой, болями в мышцах, суставах, животе, судорожными подергиваниями отдельных мышц, головной болью, тахикардией, неустойчивостью артериального давления, ригидностью шеи, петехиями.
Брали спинномозговую жидкость, выделяли нуклеиновые кислоты и растворяли в 150 мкл воды, добавляли по 10 мкл полученного раствора в 15 пробирок с праймерами и растворами для амплификации из примера 1 (SEQ №16 - SEQ №75 для поиска и амплификации фрагментов геномов патогенов SEQ №1 - SEQ №15). После амплификации в течение 60 минут по 5 мкл амплификационных смесей добавляли в пробирки, содержащие соответствующие сенсоры (SEQ №76 - SEQ №120) и растворы для детекции. Через 5 минут после добавления замеряли уровень флуоресценции в каждой из 15 пробирок.
Длительность анализа составила 90 минут.
Результат исследования: в пробирке, где происходила гибридизация продукта амплификации с сенсорами для обнаружения N. meningitidis, показал флуоресцентный сигнал выше порогового.
Диагностическая специфичность зондов и чувствительность детекции аналитов составила 100%.
Диагноз: гнойный менингит, вызванный N. meningitidis.
Диагноз был подтвержден микробиологическими методами.
Пример 6. Пациент с гипертермией, плохим самочувствием, в анамнезе кашель.
При осмотре были выявлены симптомы инфекции нижних дыхательных путей. Был назначен посев мокроты. Далее выделяли нуклеиновые кислоты из чистой культуры и растворяли в 150 мкл воды, добавляли по 10 мкл полученного раствора в 15 пробирок с праймерами и растворами для амплификации из примера 1 (SEQ №16 - SEQ №75 для поиска и амплификации фрагментов геномов патогенов SEQ№1 - SEQ№15). После амплификации в течение 60 минут по 5 мкл амплификационных смесей добавляли в пробирки, содержащие соответствующие сенсоры (SEQ №76 - SEQ №120) и растворы для детекции. Через 5 минут после добавления замеряли уровень флуоресценции в каждой из 15 пробирок.
Длительность анализа составила 90 минут.
Результат исследования: в пробирке, где происходила гибридизация продукта амплификации с сенсорами для обнаружения S. aureus, показал флуоресцентный сигнал выше порогового.
Диагностическая специфичность зондов и чувствительность детекции аналитов составила 100%.
Диагноз: плеврит, вызванный S. aureus.
Диагноз был подтвержден микробиологическими методами.
Данные примеры демонстрируют, что определение этиологии инфекций при помощи ДНКзимных сенсоров показывает достоверные, подтверждаемые микробиологическими методами результаты.
Рабочие характеристики представленного набора реагентов:
1. Для визуализации реакции может быть использован любой субстрат, изменяющий свой цвет или испускающий флуоресцентный сигнал при окислении, в том числе диаминобензидин (ДАБ), 3,3',5,5'-тетраметилбензидин (ТМВ), 2,2-азино-бис (3-этилбензотиазолин-6-сульфокислота) (АБТС) и флуорофоры.
2. В качестве спейсера в ДНКзимных зондах может быть использован полиэтиленгликоль, триэтиленгликоль, гексаэтиленгликоль, политимидин.
3. Рабочая концентрация зондов может составлять 0,1-10 мкМ.
4. Для увеличения чувствительности тест-системы работа сенсоров совмещена с предварительной реакцией накопления аналита в виде изотермической амплификации. Реакция изотермической амплификации протекает при температуре 65°С в течение 60 минут в присутствии специфических петлевых праймеров.
5. Для использования в диагностике перед накоплением образец биологической жидкости с содержащимися в нем патогенами лизируется. Выделенные очищенные нуклеиновые кислоты используются в качестве матрицы для изотермической амплификации.
6. Заявляемый набор реагентов может быть помещен в любой формат тест-системы как для мультиплексной идентификации патогена, так и для синглплексных реакций.
--->
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE ST26SequenceListing PUBLIC "-//WIPO//DTD Sequence Listing
1.3//EN" "ST26SequenceListing_V1_3.dtd">
<ST26SequenceListing dtdVersion="V1_3" fileName="Тест-система и
способ для обнаружения специфических фрагментов нуклеиновых кислот 16
патогенов с использованием изотермической реакции амплификации .xml"
softwareName="WIPO Sequence" softwareVersion="2.2.0"
productionDate="2023-03-02">
<ApplicationIdentification>
<IPOfficeCode>RU</IPOfficeCode>
<ApplicationNumberText>2023125255</ApplicationNumberText>
<FilingDate>2023-03-02</FilingDate>
</ApplicationIdentification>
<ApplicantFileReference>123</ApplicantFileReference>
<EarliestPriorityApplicationIdentification>
<IPOfficeCode>RU</IPOfficeCode>
<ApplicationNumberText>2022123569</ApplicationNumberText>
<FilingDate>2022-03-02</FilingDate>
</EarliestPriorityApplicationIdentification>
<ApplicantName languageCode="ru">Федеральное государственное
бюджетное учреждение "Центр стратегического планировния и
управления медико-биологическими рисками здоровью" Федерального
медико-биологического агентства</ApplicantName>
<ApplicantNameLatin>Federal State Budgetary Institution "Center
for Strategic Planning and Management of Biomedical Health
Risks" of the Federal Medical Biological
Agency</ApplicantNameLatin>
<InventionTitle languageCode="ru">Тест-система и способ для
обнаружения специфических фрагментов нуклеиновых кислот 16 патогенов
с использованием изотермической реакции амплификации
</InventionTitle>
<SequenceTotalQuantity>120</SequenceTotalQuantity>
<SequenceData sequenceIDNumber="1">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>236</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..236</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>genomic DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q2">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Neisseria
meningitidis</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>aacacaagaaatcggtttttcagccagaggcttatcgctttctgaagcc
attggccgtatgggcggtttgcaagatcgccgttctgatgcgcgtggtgtgtttgtgttccgctatacgc
cattggtggaattgccggcagaacgtcaggataaatggattgctcaaggttatggcagtgaggcagagat
tccaacggtatatcgtgtgaatatggctgatgcgcattcgctatttt</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="2">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>203</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..203</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>genomic DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q4">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Streptococcus
pneumoniae</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gctggaagaaaatcgctgacaagtggtactattttgatgtagaaggtgc
catgaagacaggctgggtcaagtacaaggacacttggtactacttagacgctaaagaaggcgccatggta
tcaaatgcctttatccagtcagcggacggaacaggctggtactacctcaaaccagacggaacactggcag
acaagccagagttc</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="3">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>196</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..196</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>genomic DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q6">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>ggtgggttgtgagagactagaactctcgactgacggattaagagtccgc
tactctaccaactgagctaacaacccaactggacaactaaatcagagagtggtgggtcgtgaaggattcg
aaccttcgaccaacggattaaaagtccgctgctctaccgactgagctaacgaccccactgtattaaatgg
atttatg</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="4">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>204</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..204</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>genomic DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q8">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Escherichia coli</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gccatctcctgatgacgcatagtcagcccatcatgaatgttgctgtcga
tgacaggttgttacaaagggagaagggcatggcgagcgtacagctgcaaaatgtaacgaaagcctggggc
gaggtcgtggtatcgaaagatatcaatctcgatatccatgaaggtgaattcgtggtgtttgtcggaccgt
ctggctgcggtaaat</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="5">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>79</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..79</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>genomic DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q10">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Listeria
monocytogenes</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>caaactgaagcaaaggatgcatctgcattccataaagaaaatttaattt
catccatggcaccaccagcatctccgcctg</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="6">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>215</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..215</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>genomic DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q12">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Streptococcus
agalactiae</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>agtcgtgtagaagccttaacagatgtgattgaagcaatcactttttcaa
ctcaacatttaacaaataaggttagtcaagcaaatattgatatgggatttgggataactaagctagttat
tcgcattttagatccatttgcttcagttgattcaattaaagctcaagttaacgatgtaaaggcattagaa
caaaaagttttaacttatcctgattt</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="7">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>106</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..106</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>genomic DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q14">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Candida albicans</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>ctccagggtttgttaccttagactttaatgtcaaaagatcccttgttga
tccagatgatccaactgtcgaatctaaaagatcacctttatttttagatcttgatcc</INSDSeq_seq
uence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="8">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>79</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..79</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>genomic DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q16">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>aaaacagccgctagtcctagtccgagtcgcccgcaaagttcctcgaata
actccgtacccggagcgccaaaccgggtct</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="9">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>232</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..232</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>genomic DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q18">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Staphylococcus
aureus</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gactcagtctttaaagaagatgcaggacgtggttatagaaaagtagttg
cgtcaccactacctcaatctatactagaacaccagttaattcgaactttagcagacggtaaaaatattgt
cattgcatgcggtggtggcggtattccagttataaaaaaagaaaatacctatgaaggtgttgaagcggtt
atagataaagattttgctagtgagaaattagcaacgctgattg</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="10">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>113</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..113</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>genomic DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q20">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>tattacttctcgcacctgctgggggcggcctgcgtgacgttcaaggccc
tgtttggaaataacgccaagatcaccgagagtctgttaaagaggtttattcccgagacgtggca</INSD
Seq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="11">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>89</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..89</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>genomic DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q22">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gactgtgctggagtttgatagtgaattcgagctattaattgcatttatg
accctcgtaaaacagtacgctcccgagtttgccacaggtt</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="12">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>242</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..242</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>genomic DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q24">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>tgaattcgcgcatgatctcttcgaggtcaaaaacgttgctggaacgcag
ctctttctgcgagtaaagttccagtaccctgaagtcggtattttccagcgggtcgatatccagggcgatc
atgctgtcgacggtggagatactgctgaggtcaatcatgcgtttgaagaggtagtccacgtactcgtagg
ccgagttcccggcgatgaagatcttgaggctgggaagctgacattcctcagtg</INSDSeq_sequenc
e>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="13">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>183</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..183</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>genomic DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q26">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>aggaataagcccccagacaggggagtgggcttgtttgtgacttcaccaa
aggtcagggcccaagggggttcgcgttgctaggccaccttctcagtccagcgcgtttacgtaagccagac
agcagccaattgtcagttctagggagggggaccactgcccctggtataaagtggtcctgcagct</INSD
Seq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="14">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>93</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..93</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>genomic DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q28">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>cgagcgctaggttgaggatgatcgaaacgcctacacagaattttatgtt
tgtgacgagcgttattccttcgggtgtgacgtctggtgaaaaaa</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="15">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>80</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..80</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>genomic DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q30">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gtgcgcctgttttataccccctctcccaactgtaacttagaagtaacac
acaccgatcaacagtcagcgtggcacaccag</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="16">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>20</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..20</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q32">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Neisseria
meningitidis</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>aagaaatcggtttttcagcc</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="17">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>19</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..19</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q34">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>tagcgaatgcgcatcagcc</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="18">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>37</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..37</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q36">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Neisseria
meningitidis</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>acaccacgcgcatcagaacgtgaagccattggccgta</INSDSeq_se
quence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="19">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>40</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..40</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q38">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Neisseria
meningitidis</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>tgttccgctatacgccattggtcgttggaatctctgcctc</INSDSeq
_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="20">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>20</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..20</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q40">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Streptococcus
pneumoniae</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>agcccatcatgaatgttgct</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="21">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>18</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..18</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>genomic DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q42">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Streptococcus
pneumoniae</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gaattctggcctgtctgc</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="22">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>48</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..48</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>genomic DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q44">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Streptococcus
pneumoniae</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>tctaagtagtaccaagtgtccttgtggtactatttcaacgaagaaggt<
/INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="23">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>38</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..38</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q46">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Streptococcus
pneumoniae</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gctaaagaaggcgccatggtcgtctggtttgaggtagt</INSDSeq_s
equence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="24">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>21</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..21</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q48">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>ggttgtgagagactagaactc</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="25">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>20</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..20</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q50">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>tccatttaatacagtggggt</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="26">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>42</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..42</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q52">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>agttgtccagttgggttgttagtcgactgacggattaagagt</INSDS
eq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="27">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>40</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..40</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q54">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>aatcagagagtggtgggtcgtgcgttagctcagtcggtag</INSDSeq
_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="28">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>18</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..18</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q56">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Escherichia coli</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gccatctcctgatgacgc</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="29">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>18</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..18</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q58">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>atttaccgcagccagacg</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="30">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>40</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..40</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q60">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Escherichia coli</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>ctggggcgaggtcgtggtattccgacaaacaccacgaatt</INSDSeq
_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="31">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>42</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..42</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q62">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Escherichia coli</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>cattttgcagctgtacgctcgcagcccatcatgaatgttgct</INSDS
eq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="32">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>19</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..19</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q64">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Listeria
monocytogenes</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>ttgcgcaacaaactgaagc</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="33">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>20</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..20</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q66">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Listeria
monocytogenes</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gcttttacgagagcacctgg</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="34">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>46</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..46</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q68">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Listeria
monocytogenes</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>cgtgtttcttttcgattggcgtctttttttcatccatggcaccacc</I
NSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="35">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>51</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..51</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q70">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>ccacggagatgcagtgacaaatgttttggatttcttctttttctccaca
ac</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="36">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>20</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..20</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q72">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Streptococcus
agalactiae</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>agaagccttaacagatgtga</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="37">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>25</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..25</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q74">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Streptococcus
agalactiae</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>caggataagttaaaaccttttgttc</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="38">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>48</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..48</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q76">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Streptococcus
agalactiae</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>cagcttagttatcccaaatcccatagaagcaatcactttttcaactca<
/INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="39">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>47</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..47</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q78">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>attcgcattttagatccatttgcttgcctttacatcgttaacttgag</
INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="40">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>22</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..22</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q80">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Candida albicans</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>tgctccagttaaaagatttcca</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="41">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>22</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..22</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q82">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>atcatttctaccagtatcatcg</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="42">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>53</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..53</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q84">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Candida albicans</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>catctggatcaacaagggatctgaattcgggtttgttaccttagacttg
aatg</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="43">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>53</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..53</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q86">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Candida albicans</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>ccaactgtcgaatctaaaagatcaccgaattcgggaatttgtgtgggat
taag</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="44">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>18</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..18</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q88">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>cccgccagagcaaaacag</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="45">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>19</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..19</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q90">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>cactcgaacgaatcggtct</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="46">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>41</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..41</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q92">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gaggaactttgcgggcgacgaattcccgctagtcctagtcc</INSDSe
q_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="47">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>44</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..44</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q94">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>taacctgcgcgaaccacttgaggaattcacgtcaaggagtcacg</INS
DSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="48">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>22</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..22</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q96">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Staphylococcus
aureus</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gtctttaaagaagatgcaggac</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="49">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>19</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..19</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q98">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gcgttgctaatttctcact</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="50">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>42</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..42</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q100">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Staphylococcus
aureus</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>accgtctgctaaagttcgaattactagttgcgtcaccactac</INSDS
eq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="51">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>40</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..40</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q102">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Staphylococcus
aureus</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>tggtggcggtattccagttaataaccgcttcaacaccttc</INSDSeq
_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="52">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>19</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..19</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q104">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>ttccgctcaacacggacta</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="53">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>19</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..19</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q106">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gccacgtctcgggaataaa</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="54">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>40</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..40</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q108">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gaacgtcacgcaagcgaattcttacttctcgcacctgctg</INSDSeq
_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="55">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>49</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..49</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q110">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gccctgtttggaaataacgcgaattctctttaacagactctcggtgatc
</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="56">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>17</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..17</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q112">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gactgtgctggagtttg</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="57">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>17</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..17</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q114">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>aacctgtggcaaactcg</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="58">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>34</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..34</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q116">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>cctatataatatatagggactgtgctggagtttg</INSDSeq_seque
nce>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="59">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>34</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..34</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q118">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>cctatataatatataggaacctgtggcaaactcg</INSDSeq_seque
nce>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="60">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>19</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..19</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q120">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>ttcgcgcatgatctcttcg</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="61">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>20</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..20</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q122">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gaggaatgtcagcttcccag</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="62">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>46</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..46</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q124">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>atcgacccgctggaaaataccgttttgttgctggaacgcagctctt</I
NSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="63">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>46</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..46</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q126">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>actgctgaggtcaatcatgcgtttttatcttcatcgccgggaactc</I
NSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="64">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>20</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..20</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q128">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>agaggaataagcccccagac</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="65">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>20</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..20</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q130">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>accagaaatagctgcaggac</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="66">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>40</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..40</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q132">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>ctagcaacgcgaacccccttggagtgggcttgtttgtgac</INSDSeq
_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="67">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>41</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..41</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q134">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>ctcagtccagcgcgtttacgtctttataccaggggcagtgg</INSDSe
q_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="68">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>19</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..19</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q136">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>cgctaggttgaggatgatc</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="69">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>22</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..22</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q138">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>ttttttcaccagacgtcacacc</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="70">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>36</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..36</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q140">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>tttatataatatataaacgctaggttgaggatgatc</INSDSeq_seq
uence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="71">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>39</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..39</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q142">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>tttatataatatataaattttttcaccagacgtcacacc</INSDSeq_
sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="72">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>23</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..23</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q144">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gtgcgcctgttttataccccctc</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="73">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>19</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..19</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q146">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>ctggtgtgccacgctgact</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="74">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>40</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..40</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q148">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>tttatataatatataaagtgcgcctgttttataccccctc</INSDSeq
_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="75">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>36</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..36</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q150">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>tttatataatatataaactggtgtgccacgctgact</INSDSeq_seq
uence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="76">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>42</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..42</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q152">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Neisseria
meningitidis</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>tgcccagggaggctagctcgtatagcggaacacaaacacacc</INSDS
eq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="77">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>73</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..73</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q154">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Neisseria
meningitidis</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>agactagcagagaggtgacagtagtcagcttttttgccggcaattccac
caatggacaacgagaggaaacctt</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="78">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>62</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..62</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q156">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Neisseria
meningitidis</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>tgagcaatccatttatcctgacgttctttttttgctgactactgtcacc
tctctgctagtct</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="79">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>48</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..48</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q158">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Streptococcus
pneumoniae</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>tgcccagggaggctagctggtagtccgtcatgaactcttctttagttg<
/INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="80">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>84</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..84</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q160">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Streptococcus
pneumoniae</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>agagtccgttcgctgatgtccgtagcagtattttttctagattgcgtaa
gagttcgatataaaggcacaacgagaggaaacctt</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="81">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>61</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..61</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q162">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Streptococcus
pneumoniae</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gttttcggcaaacctgcttcatctgtttttttactgctacggacatcag
cgaacggactct</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="82">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>47</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..47</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q164">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>tgcccagggaggctagctctgatttagttgtccagttgggttgttag</
INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="83">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>76</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..76</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q166">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>agactagcagagaggttcacagttgacgtaatttttttccttcacgacc
caccactctacaacgagaggaaacctt</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="84">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>59</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..59</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q168">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>agcagcggacttttaatccgttttttttttacgtcaactgtgaacctct
ctgctagtct</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="85">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>39</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..39</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q170">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Escherichia coli</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gggtagggttttttccaggctttcgttacattttgcagc</INSDSeq_
sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="86">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>83</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..83</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q172">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Escherichia coli</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>atgataccgttctcatctttacttctatgtcactacttatatttttttt
tcgataccacgacctcgccttttttggggttggg</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="87">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>98</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..98</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q174">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Escherichia coli</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>catggatatcgagattgatattttttttataactagtgacatagaagta
aagatgagaacgctatcatttttttgtacgctcgccatgcccttctccc</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="88">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>33</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..33</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q176">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Listeria
monocytogenes</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gggtagggaaaaaatctttatggaatgcagatg</INSDSeq_sequen
ce>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="89">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>82</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..82</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q178">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>cgagcagagctagcgatccgttagctagtgacttgagtttctcaaaaaa
ccatggatgaaattaaattaaaaaagggaaggg</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="90">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>88</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..88</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q180">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>ggagatgctggtggtgaaaaaagagaaactcaagtcactagctaacgga
tcgctagctctgctcgaaaaaacatcctttgcttcagtt</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="91">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>47</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..47</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q182">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Streptococcus
agalactiae</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>tgcccagggaggctagctcccaaatcccatatcaatatttgcttgac</
INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="92">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>85</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..85</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q184">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>agactagcagagaggtgacagtagtcagcttttttggatctaaaatgcg
aataactagcttagttatacaacgagaggaaacctt</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="93">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>67</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..67</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q186">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>Streptococcus
agalactiae</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>cttgagctttaattgaatcaactgaagcaaatttttttgctgactactg
tcacctctctgctagtct</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="94">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>33</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..33</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q188">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gggttgggttttttgatcatctggatcaacaag</INSDSeq_sequen
ce>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="95">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>74</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..74</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q190">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>cgatattaatcatcaatctatctatcatccaccttttttatcttttaga
ttcgacagttgttttttgggttggg</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="96">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>82</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..82</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q192">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gatctaaaaataaaggtgttttttggtggatgatagatagattgatgat
taatatcgttttttaagggatcttttgacatta</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="97">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>30</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..30</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q194">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>cagggttgggttttttcgggcgactcggac</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="98">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>64</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..64</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q196">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>caatttatataatcatattttacatattcttttttattcgaggaacttt
gttttttgggttggg</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="99">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>68</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..68</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q198">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>cgggtacggagttttttttgaatatgtaaaatatgattatataaattgt
ttttttaggactagcggct</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="100">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>45</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..45</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q200">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>tgcccagggaggctagctctgctaaagttcgaattaactggtgtt</IN
SDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="101">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>80</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..80</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q202">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>agactagcagagaggtgacagtagtcagcttttttgcatgcaatgacaa
tatttttaccgtcacaacgagaggaaacctt</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="102">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>60</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..60</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q204">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>ttataactggaataccgccaccaccttttttgctgactactgtcacctc
tctgctagtct</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="103">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>36</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..36</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q206">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gggttgggttttttcgttatttccaaacagggaccc</INSDSeq_seq
uence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="104">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>70</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..70</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q208">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>cccaagagtctatatctacttcttctatatctagatttttttctcggtg
atcttggttttttgggttggg</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="105">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>72</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..72</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q210">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>aacctctttaacagactttttttctagatatagaagaagtagatataga
ctctttttttccttgaacgtcac</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="106">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>32</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..32</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q212">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>ccagggttgggttttttaattaatagctcgaa</INSDSeq_sequenc
e>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="107">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>67</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..67</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q214">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>tgagaagaattgagtactctataatagtagttttttagggtcataaatg
cttttttgggttgggacc</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="108">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>73</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..73</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q216">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gagcgtactgttttattttttctactattatagagtactcaattcttct
cattttttttcactatcaaactcc</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="109">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>45</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..45</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q218">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gtcgacagcatgatcgccctggatatcgaccttttttgggtaggg</IN
SDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="110">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>48</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..48</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q220">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gggttgggttttttcgctggaaaataccgacttcagggtactggaact<
/INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="111">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>67</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..67</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q222">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>cccaagagtctatatctacttcttctatatctttttttggtgtgtgtta
cttcttttttgggttggg</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="112">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>42</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..42</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q224">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>tgcccagggaggctagcttttggtgaagtcacaaacaagccc</INSDS
eq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="113">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>73</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..73</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q226">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>tgtctagctgtctctctgctcagacgagcttttttttcccccttgggcc
ctgaccacaacgagaggaaacctt</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="114">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>56</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..56</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q228">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>ggtggcctagcaacgcgaattttttaagctcgtctgagcagagagacag
ctagaca</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="115">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>32</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..32</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q230">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gggttgggttttttcgctcgtcacaaacaccc</INSDSeq_sequenc
e>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="116">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>67</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..67</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q232">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>cccagatatagatgaagaagatatagagatatattttttacccgaagga
ataattttttgggttggg</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="117">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>69</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..69</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q234">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>tcaccagacgtcattttttatatctctatatcttcttcatctatatctt
ttttataaaattctgtgtag</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="118">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>29</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..29</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q236">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>gggttgggtttttttacttctaagtaccc</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="119">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>67</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..67</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q238">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>cccaagagtctatatctacttcttctatatctttttttggtgtgtgtta
cttcttttttgggttggg</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
<SequenceData sequenceIDNumber="120">
<INSDSeq>
<INSDSeq_length>68</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..68</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals>
<INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q240">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>unidentified</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier>
</INSDFeature_quals>
</INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>ctgactgttgatcttttttagatatagaagaagtagatatagactcttt
ttttggagagggggtataa</INSDSeq_sequence>
</INSDSeq>
</SequenceData>
</ST26SequenceListing>
<---
Claims (4)
1. Тест-система, содержащая набор реагентов для обнаружения в биологическом образце патогенов Neisseria meningitidis, Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Escherichia coli, Listeria monocytogenes, Streptococcus agalactiae, Candida albicans, Mycobacterium tuberculosis, Streptococcus aureus, Herpes simplex virus type 1/2, Varicella Zoster virus, Cytomegalovirus, Epstein-Barr virus, Human herpesvirus 6, Coxsackievirus В, включающая:
А) наборы олигонуклеотидов для изотермической амплификации специфических последовательностей геномов патогенов, представленные в группе: SEQ ID NO: 16–19 Neisseria meningitides, SEQ ID NO: 20–23 Streptococcus pneumoniae, SEQ ID NO: 24–27 Haemophilus influenzae, SEQ ID NO: 28–31 Escherichia coli, SEQ ID NO: 32–35 Listeria monocytogenes, SEQ ID NO: 36–39 Streptococcus agalactiae, SEQ ID NO: 40–43 Candida albicans, SEQ ID NO: 44–47 Mycobacterium tuberculosis, SEQ ID NO: 48–51 Streptococcus aureus, SEQ ID NO: 52–55 Herpes simplex virus 1/2, SEQ ID NO: 56–59 Varicella Zoster virus, SEQ ID NO: 60–63 Cytomegalovirus, SEQ ID NO: 64–67 Epstein-Barr virus, SEQ ID NO: 68–71 Human herpesvirus 6, SEQ ID NO: 72–75 Coxsackievirus В и объединенные в 15 наборов по четыре олигонуклеотида в каждом, при этом упомянутые 15 наборов амплифицируют фрагменты геномов патогенов, представленные в группе последовательностей SEQ ID NO: 1–15;
Б) ДНКзимные сенсоры, образующие гуаниновый комплекс Г-4, содержащие участки, распознающие одноцепочечные нуклеиновые кислоты возбудителя инфекционного заболевания в биообразце, представленные в группе SEQ ID NO: 76–78 Neisseria meningitides, SEQ ID NO: 79–81 Streptococcus pneumoniae, SEQ ID NO: 82–84 Haemophilus influenzae, SEQ ID NO: 85–87 Escherichia coli, SEQ ID NO: 88–90 Listeria monocytogenes, SEQ ID NO: 91–93 Streptococcus agalactiae, SEQ ID NO: 94–96 Candida albicans, SEQ ID NO: 97–99 Mycobacterium tuberculosis, SEQ ID NO: 100–102 Streptococcus aureus, SEQ ID NO: 103–105 Herpes simplex virus 1/2, SEQ ID NO: 106–108 Varicella Zoster virus, SEQ ID NO: 109–111 Cytomegalovirus, SEQ ID NO: 112–114 Epstein-Barr virus, SEQ ID NO: 115–117 Human herpesvirus 6, SEQ ID NO: 118–120 Coxsackievirus В.
2. Способ обнаружения в биологическом образце возбудителей инфекций N. meningitidis, S. pneumoniae, Н. influenzae, Е. coli, L. monocytogenes, S. agalactiae, C. albicans, M. tuberculosis, S. aureus, HSV 1/2, Varicella Zoster virus, Cytomegalovirus, Epstein-Barr virus, Human herpesvirus 6, Coxsackievirus B, предусматривающий использование тест-системы по п. 1 путем выделения нуклеиновых кислот из биообразца, растворения нуклеиновых кислот в воде и добавления по 10 мкл полученного раствора в 15 пробирок с праймерами, представленными на участке SEQ ID NO: 16–75, для поиска и амплификации фрагментов геномов патогенов, которым соответствуют нуклеиновые кислоты, представленные на участке SEQ ID NO: 1–15, добавления после амплификации по 5 мкл амплификационных смесей в пробирки, содержащие соответствующие ДНКзимные сенсоры, представленные на участке SEQ ID NO: 76–120, оценки 5 мин спустя уровня флуоресценции в каждой из 15 пробирок.
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2810751C1 true RU2810751C1 (ru) | 2023-12-28 |
Family
ID=
Citations (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2154106C2 (ru) * | 1994-06-24 | 2000-08-10 | Иннодженетикс Н.В. | Одновременное определение, идентификация и дифференциация эубактериальных таксонов с помощью гибридизационного анализа |
| WO2007106407A2 (en) * | 2006-03-10 | 2007-09-20 | Wyeth | Microarray for monitoring gene expression in multiple strains of streptococcus pneumoniae |
| WO2014077417A1 (en) * | 2012-11-16 | 2014-05-22 | Nihon University | Method for detecting neisseria meningitidis using loop-mediated isothermal amplification (lamp) assay |
| CN106566882A (zh) * | 2016-11-02 | 2017-04-19 | 拜奥法尔诊断有限责任公司 | 一种检测脑膜炎和脑炎的装置和方法 |
Patent Citations (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2154106C2 (ru) * | 1994-06-24 | 2000-08-10 | Иннодженетикс Н.В. | Одновременное определение, идентификация и дифференциация эубактериальных таксонов с помощью гибридизационного анализа |
| WO2007106407A2 (en) * | 2006-03-10 | 2007-09-20 | Wyeth | Microarray for monitoring gene expression in multiple strains of streptococcus pneumoniae |
| WO2014077417A1 (en) * | 2012-11-16 | 2014-05-22 | Nihon University | Method for detecting neisseria meningitidis using loop-mediated isothermal amplification (lamp) assay |
| CN106566882A (zh) * | 2016-11-02 | 2017-04-19 | 拜奥法尔诊断有限责任公司 | 一种检测脑膜炎和脑炎的装置和方法 |
Non-Patent Citations (2)
| Title |
|---|
| W. LI et al., Insight into G-quadruplex-hemin DNAzyme/RNAzyme: adjacent adenine as the intramolecular species for remarkable enhancement of enzymatic activity, Nucleic Acids Res., 2016, vol. 44, no. 15, pp. 7373-7384. * |
| ГОРБЕНКО Д.А. и др. Пероксидазоподобные дезоксирибозимы для детекции бактериальных и вирусных патогенов, СОВРЕМЕННЫЕ ДОСТИЖЕНИЯ ХИМИКО-БИОЛОГИЧЕСКИХ НАУК В ПРОФИЛАКТИЧЕСКОЙ И КЛИНИЧЕСКОЙ МЕДИЦИНЕ / Сборник научных трудов Всероссийской научно-практической конференции с международным участием. Том Часть 1. Под редакцией А.В. Силина, Л.Б. Гайковой. Санкт-Петербург, 2020, с.253-259. * |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| US8535888B2 (en) | Compositions and methods for detecting methicillin-resistant S. aureus | |
| ES2605303T3 (es) | Detección cualitativa y cuantitativa de ácidos nucleicos microbianos | |
| US10358675B2 (en) | Oligonucleotides for controlling amplification of nucleic acids | |
| US20140017692A1 (en) | Method and kit for detecting target nucleic acid | |
| CN114381538B (zh) | 用于检测鼻疽诺卡菌的lamp引物组和检测试剂盒 | |
| Choi et al. | Point-of-care COVID-19 testing: colorimetric diagnosis using rapid and ultra-sensitive ramified rolling circle amplification | |
| US20100233717A1 (en) | Methods for detecting toxigenic microbes | |
| US20050244836A1 (en) | Methods and compositions to detect bacteria using multiplex PCR | |
| US20080090224A1 (en) | Nucleic acid detection | |
| US20150031038A1 (en) | Sample preparation methods | |
| TW202219272A (zh) | SARS-CoV-2之偵測 | |
| KR102551477B1 (ko) | 표적 물질의 검출용 키트 및 이를 이용하여 표적 물질을 검출하는 방법 | |
| JP6117775B2 (ja) | スタフィロコッカス・アウレウスの検出のための組成物及び方法 | |
| RU2810751C1 (ru) | Тест-система и способ обнаружения специфических фрагментов нуклеиновых кислот 16 патогенов с использованием изотермической реакции амплификации | |
| US20230031670A1 (en) | Method and kit for detection of polynucleotide | |
| US20170283888A1 (en) | Use of rnase h for the selective amplification of viral dna | |
| Cao et al. | Detection of Haemophilus influenzae by loop-mediated isothermal amplification coupled with nanoparticle-based lateral flow biosensor assay | |
| US20110189665A1 (en) | Methods for detecting drug-resistant microbes | |
| ES2305646T3 (es) | Deteccion de estreptococos del grupo b. | |
| RU2813995C1 (ru) | Набор праймеров для выявления возбудителей бактериальной пневмонии человека методом мультиплексной рекомбиназной полимеразной амплификации | |
| RU2762759C1 (ru) | Способ пробоподготовки образцов изолятов коронавируса SARS-CoV-2 и олигонуклеотидные праймеры для его реализации | |
| US20230374570A1 (en) | Method and system for detecting fungal genes and kit for use with same | |
| US20100092949A1 (en) | Methods for detecting staphylococcus aureus | |
| WO2024003260A1 (en) | Compositions and methods for detecting lymphogranuloma venereum (lgv) serovars of chlamydia trachomatis | |
| Diego et al. | 34 Nucleic Acid Diagnostics |