RU2795897C1 - Способ прогнозирования риска развития рака молочной железы у женщин с использованием молекулярно-генетических данных - Google Patents

Способ прогнозирования риска развития рака молочной железы у женщин с использованием молекулярно-генетических данных Download PDF

Info

Publication number
RU2795897C1
RU2795897C1 RU2022126931A RU2022126931A RU2795897C1 RU 2795897 C1 RU2795897 C1 RU 2795897C1 RU 2022126931 A RU2022126931 A RU 2022126931A RU 2022126931 A RU2022126931 A RU 2022126931A RU 2795897 C1 RU2795897 C1 RU 2795897C1
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
breast cancer
women
risk
mmp
gene
Prior art date
Application number
RU2022126931A
Other languages
English (en)
Inventor
Михаил Иванович Чурносов
Надежда Витальевна Павлова
Анна Владимировна Елыкова
Мария Михайловна Чурносова
Original Assignee
Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Белгородский государственный национальный исследовательский университет" (НИУ "БелГУ")
Filing date
Publication date
Application filed by Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Белгородский государственный национальный исследовательский университет" (НИУ "БелГУ") filed Critical Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Белгородский государственный национальный исследовательский университет" (НИУ "БелГУ")
Application granted granted Critical
Publication of RU2795897C1 publication Critical patent/RU2795897C1/ru

Links

Images

Abstract

Изобретение относится к области медицины, в частности к клинической онкологии, медицинской генетике, молекулярной диагностике, и может быть использовано для прогнозирования риска развития рака молочной железы у женщин с использованием молекулярно-генетических данных. Предложен способ прогнозирования риска развития рака молочной железы у женщин. Выделяют ДНК из периферической венозной крови, производят анализ генетических маркеров гена ММР-9, прогнозируют высокий риск развития рака молочной железы у женщин с использованием молекулярно-генетических данных при выявлении гаплотипа CTAAC полиморфных локусов rs3918242-rs3918249-rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9 (ОR=3,55, р=0,002). Изобретение позволяет оценить риск развития рака молочной железы у женщин русской национальности, уроженок Центрально–Черноземного региона РФ на основе данных о полиморфных локусах rs3918242-rs3918249-rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9. 5 ил., 4 пр.

Description

Изобретение относится к области медицины, в частности к клинической онкологии, медицинской генетике, молекулярной диагностике, и может быть использовано для прогнозирования риска развития рака молочной железы у женщин с использованием молекулярно-генетических данных.
Рак молочной железы (РМЖ) это опухоль молочной железы злокачественного характера, имеющая эпителиальное происхождение [Gradishar W.J., Anderson B.O., Blair S.L. et al. Breast cancer version 3.2014. J Natl Compr Canc Netw 2014;12(4):542–590]. Согласно данным мировой статистики (материалы Международного агентства по изучению рака) в настоящее время ежегодно среди населения мира выявляется более 2 миллионов новых случаев РМЖ. Среди всех случаев рака (ежегодно в мире регистрируется 19,3 млн новых случаев онкопатологии) РМЖ является наиболее частым (11,7%) [Ferlay J., Colombet M., Soerjomataram I., Parkin D.M.,
Figure 00000001
, Znaor A., Bray F. Cancer statistics for the year 2020: An overview. Int. J. Cancer. 2021;149:778–789. doi: 10.1002/ijc.33588]. Среди женского населения удельный вес РМЖ среди всех онкозаболеваний составляет 24,5% [Sung H., Ferlay J., Siegel R.L., Laversanne M., Soerjomataram I., Jemal A., Bray F. Global cancer statistics 2020: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries. CA Cancer J. Clin. 2021;71:209–249. doi: 10.3322/caac.21660]. По данным Росстата в 2020 году в Российской Федерации количество женщин, у которых был впервые в жизни установлен диагноз РМЖ, составило 65,0 тысяч человек, а показатель заболеваемости был равен 82,8 на 100000 человек [Здравоохранение в России. 2021: Стат. сб./Росстат. - М., З-46 2021. – 171 с.]. Обращает на себя внимание имеющаяся тенденция к росту заболеваемости РМЖ в РФ: стандартизованный показатель заболеваемости на 100000 населения (мировой стандарт) за последние десять лет вырос с 42,83 в 2008 г. до 51,63 в 2018 г., параметр среднегодового темпа прироста заболеваемости составил 1,97%, а показатель прироста заболеваемости за данный временной период - 22,15% [5. Каприн А.Д., Старинский В.В., Петрова Г.В. Злокачественные новообразования в России в 2018 году. М., 2019. 250 с. [Kaprin A.D., Starinskij V.V., Petrova G.V. Malignant neoplasms in Russia in 2018. Moscow: 2019. 250 p. (in Russian)].
Несмотря на активное исследование генетических основ РМЖ, которое активно проводится многочисленными научными коллективами, в течение последних десятилетий, значительная часть генетических детерминант, вовлеченных в возникновение заболевания, до настоящего времени остается неизвестной, что диктует необходимость продолжения генетико-эпидемиологических исследований РМЖ.
Среди «потенциальных» генов-кандидатов РМЖ активно изучаются гены матриксных металлопротеиназ (ММР) [Dofara SG, Chang SL, Diorio C. Gene Polymorphisms and Circulating Levels of MMP-2 and MMP-9: A Review of Their Role in Breast Cancer Risk. Anticancer Res. 2020;40(7):3619-3631. doi:10.21873/anticanres.14351]. Связь продуктов экспрессии этих генов (одноименные белки) с заболеванием в настоящее время не вызывает сомнений. За счет своей коллагеназной активности, способности расщеплять проапоптотические факторы, мобилизовывать/активировать проангиогенные факторы (факторы роста), подавлять выработку ингибиторов ангиогенеза (ангиостатин, эндостатин) ММР обеспечивают деградацию компонентов стромальной соединительной ткани и базальной мембраны ММР, что имеет «ключевое» значение в процессах ангиогенеза, инвазии и метастазирования опухоли [Radisky ES, Radisky DC. Matrix metalloproteinases as breast cancer drivers and therapeutic targets. Front Biosci (Landmark Ed). 2015;20(7):1144-1163. Published 2015 Jun 1. doi:10.2741/4364]. Повышенная экспрессия ММР (ММР1, ММР2, ММР9, др.) в очаге поражения индуцирует рост опухолевой ткани, инициирует ее инвазию и метастазирование [Baker EA, Stephenson TJ, Reed MW, Brown NJ. Expression of proteinases and inhibitors in human breast cancer progression and survival. Mol Pathol. 2002 Oct;55(5):300-4. doi: 10.1136/mp.55.5.300.]. Имеются убедительные данные о связи ММР с выживаемостью больных РМЖ [Radisky ES, Radisky DC. Matrix metalloproteinases as breast cancer drivers and therapeutic targets. Front Biosci (Landmark Ed). 2015;20(7):1144-1163. Published 2015 Jun 1. doi:10.2741/4364].
В мировой литературе представлено достаточно большое количество генетико-эпидемиологических исследований, более 50, посвященных изучению роли функционально значимого полиморфизма генов ММР в формировании РМЖ в различных этно-территориальных группах народонаселения. Однако, несмотря на это, полученные в результате проведенных исследований результаты, нередко неоднозначны, а для отдельных полиморфных локусов – противоречивы.
Одной из важных задач современной онкологии является изучение причин и механизмов развития рака молочной железы, среди которых значимую роль играют генетические факторы.
В Российской Федерации исследования вовлеченности гена ММР-9 в формирование предрасположенности к РМЖ у женщин единичны и фрагментарны, а данные о роли генетических вариантов rs3918242-rs3918249-rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9 в развитии РМЖ отсутствуют.
Для оценки сложившейся патентной ситуации был выполнен поиск по охранным документам за период с 1990 по 2022 гг. Анализ документов производился по направлению: способ прогнозирования риска развития рака молочной железы на основе молекулярно-генетических данных в зависимости от полиморфных маркеров гена ММР-9. Источники информации: сайты Федерального института промышленной собственности http://fips.ru.
В изученной научно-медицинской и доступной патентной литературе авторами не было обнаружено способа прогнозирования риска развития РМЖ на основе данных о полиморфных локусах rs3918242-rs3918249-rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9.
Известен способ прогнозирования прогрессирования рака молочной железы по патенту RU №2741232 (опубл. 22.01.2022), включающий определение в периферической крови промежуточного метаболита витамина D 25(OH)D. При значении его содержания в сыворотке крови ≤ 18,9 нг/мл прогнозируют прогрессирование заболевания. Способ обеспечивает повышение точности прогнозирования прогрессирования рака молочной железы за счет определения промежуточного метаболита витамина D 25(OH)D в венозной крови, проявляющееся в снижении показателя промежуточного метаболита витамина D 25(OH)D, предшествующем прогрессированию заболевания. Недостатком этого способа является трудоемкость выполнения и, кроме того, не учитывается роль генетических полиморфизмов.
Известен способ прогнозирования рака молочной железы по патенту RU №2336822 (опубл. 27.08.2008), включающий исследование крови пациента. Дополнительно при обследовании определяют показатели: возраст, социальный статус, сопутствующие заболевания, количество моноцитов крови, скорость оседания эритроцитов (СОЭ), общий билирубин крови, креатинин крови, удельный вес мочи, реакцию мочи. Затем определяют прогностический коэффициент (ПК) для каждого показателя. В системе возраст при маркере до 20 лет устанавливают ПК равным (0), при маркере 20-29 лет - равным (-10), при маркере 30-39 лет - равным (-7), при маркере 40-49 лет - равным (+4), при маркере 50-59 лет - равным (+3), при маркере 60-69 лет - равным (+2), при маркере 70-79 лет - равным (+4), при маркере 80 и более лет - равным (-3). В системе социальный статус при маркере рабочие устанавливают ПК равным (+4), при маркере служащие - равным (-1), при маркере учащиеся - равным (0), при маркере безработные - равным (-12), при маркере пенсионеры и инвалиды труда (ИТР) - равным (+1). В системе сопутствующие заболевания при маркере заболевания желудочно-кишечного тракта (ЖКТ) устанавливают ПК равным (-10), при маркере заболевания сердечно-сосудистой системы - равным (+2), при маркере заболевания эндокринной системы - равным (+1,5), при маркере заболевания дыхательной системы - равным (0), при маркере заболевания опорно-двигательного аппарата - равным (0), при маркере заболевания мочеполовой системы - равным (-13), при маркере сочетание сопутствующий заболеваний - равным (-1), при маркере отсутствие сопутствующих заболеваний - равным (+2). В системе моноциты крови при маркере нет устанавливают ПК равным (0), при маркере 1-3% - равным (-2,5), при маркере 4-6% - равным (+2), при маркере 7-10% - равным (+2,5), при маркере более 10% - равным (0). В системе скорость оседания эритроцитов при маркере - 1-10 мм/ч устанавливают ПК равным (-1), при маркере 11-20 мм/ч - равным (-3), при маркере 21-30 мм/ч - равным (+7), при маркере 31-40 мм/ч - равным (0), при маркере более 40 мм/ч - равным (0). В системе общий билирубин при маркере менее 8,8 мкмоль/л устанавливают ПК равным (0), при маркере 8,8-17 мкмоль/л - равным (-1), при маркере более 17 мкмоль/л - равным (+5,5). В системе креатинин при маркере менее 0,07 ммоль/л устанавливают ПК равным (+11), при маркере 0,07-0,17 - равным (-3), при маркере более 0,17 мкмоль/л - равным (0). В системе удельный вес мочи при маркере менее 1008 устанавливают ПК равным (0), при маркере 1008-1026 - равным (+2), при маркере более 1026 - равным (+6). В системе реакция мочи при маркере кислая, устанавливают ПК равным (+3), при маркере нейтральная - равным (-3), при маркере щелочная - равным (-12). При сумме ПК от (-54,5) до (-21,5) прогнозируют низкую вероятность рака молочной железы, при сумме от (+11) до (+44,5) прогнозируют высокую вероятность рака молочной железы. Однако прогнозирование таким способом рака молочной железы сопряжено с профилактическими осмотрами, при этом диспансеризация лиц из групп повышенного риска должна проводиться длительное время вплоть до возраста 55 лет.
Известен способ прогнозирования рецидива рака молочной железы по патенту RU №2263319 (опубл. 27.10.2005), включающий биохимическое исследование биологической жидкости пациента, отличающийся тем, что у менопаузальных женщин после комплексного лечения рака молочной железы в динамике определяют концентрацию эстриола, эстрона и эстрадиола в моче, вычисляют соотношение эстриола к эстрону и эстрадиолу и при значении его 1,68±0,23 констатируют отсутствие рецидива, а при его снижении до значений 0,74±0,12 у пациенток, проживающих без рецидива менее 1 года, до 0,65±0,13 у пациенток, проживших без рецидива от 2 до 6 лет, и до 0,50±0,10 у пациенток, проживших без рецидива от 6 до 10 лет, констатируют развитие рецидива. Недостатком данного способа является высокая стоимость анализа, что особенно важно при его многократном повторении в ходе наблюдения за больными после комплексного лечения.
Известен патент RU №2522501 (опубл. 20.07.2014), в котором описан способ прогнозирования наследственной предрасположенности к раку молочной железы. Сущность способа заключается в том, что проводят амплификацию коротких фрагментов гена BLM протяженностью до 200 п.о., с последующим высокоразрешающим плавлением, включающим оптимизированный для гена BLM этап формирования гетеродуплексов: быстрый нагрев до 95°С и медленное снижение температуры до 50°С; выбирают один фрагмент с аберрантным профилем плавления для секвенирования, секвенируют выбранный фрагмент и при выявлении мутации гена BLM прогнозируют наследственную предрасположенность к раку молочной железы. Недостатком этого способа является его трудоемкость, он не учитывает роль генетических полиморфизмов.
Известен способ прогнозирования генерализации рака молочной железы по патенту RU №2204836 (опубл. 20.05.2003). В данном способе проводят диагностическое наблюдение больных раком молочной железы. Определяют тромбоцитарную активность МАО-Б в плазме крови, что обеспечивает доклиническое выявление генерализации рака молочной железы. При снижении тромбоцитарной активности МАО-Б в 4-6 раз по отношению к норме прогнозируют генерализацию процесса. Недостатком предлагаемого способа является использование в качестве маркера только одного показателя - тромбоцитарной активности МАО-Б в плазме крови, применение способа в отношении уже больных раком молочной железы, преимущественная информативность предлагаемого показателя тромбоцитарной активности МАО-Б в период генерализации процесса при наличии отдаленных метастазов, что делает невозможным применение способа в ранней диагностике рака молочной железы.
Известен патент RU №2631940 (опубл 28.09.2017), в котором описан способ прогнозирования рака молочной железы. Сущность способа заключается в том, что определяют факторы риска: ношение тугого бюстгальтера (Б), возраст (В), перенесенные воспалительные заболевания молочной железы (ЗМЖ), перенесенные заболевания щитовидной железы (ЗЩЖ), индекс массы тела (ИМТ), частое употребление жирной, жареной и копченой пищи (Калл), некормление ребенка грудью (НКГ), кормление ребенка грудью год и более (КГ≥1 год), позднее наступление менструации (ПНМ), длительное проживание в военных городках (ПВО), перенесенные травмы молочной железы (ТМЖ). Отсутствие каждого из указанных факторов оценивают как «0 баллов», а наличие - «1 балл». Показатели ПНМ, В, ИМТ оценивают количественно. Рассчитывают прогностический коэффициент ПК по заявленной формуле. Если значение ПК меньше 0,2197, то прогнозируют низкий риск, а если ПК от 0,2197 и более - высокий риск рака молочной железы. Недостатком способа является сложность расчетов и не учитываются генетические факторы.
Прогнозирование риска рака молочной железы на основе естественных исследований // Зиннатуллина Г.Ф., Бермишева М.А., Кононова В.А., Фарахтдинова А.Р., Хуснутдинова Э.К. // Креативная хирургия и онкология. 2009. №2. URL: https://cyberleninka.ru/article/n/prognozirovanie-vozniknoveniya-riska-raka-molochnoy-zhelezy-na-osnove-geneticheskih-issledovaniy (дата обращения: 24.07.2022), характеризуется проведением анализа распространенности двух вариантов гена NBN (c.657del5 и p.R215W) у больных раком молочной железы в Республике Башкортостан и Ханты-Мансийском автономном округе. Недостатком данного исследования является применение только для коренных жителей Республики Башкортостан и Ханты-Мансийского автономного округа.
Задачей настоящего исследования является расширение арсенала методов диагностики, а именно создание способа прогнозирования риска развития РМЖ у женщин на основе данных о полиморфных локусах rs3918242-rs3918249-rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9.
Технический результат использования изобретения – получение критериев оценки риска развития рака молочной железы у женщин русской национальности, уроженок Центрально – Черноземного региона РФ, на основе данных о полиморфных локусах rs3918242-rs3918249-rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9, включающий:
- выделение ДНК из периферической венозной крови;
- анализ полиморфных локусов rs3918242-rs3918249-rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9;
- прогнозирование высокого риска развития рака молочной железы у женщин при выявлении гаплотипа CTAAC полиморфных локусов rs3918242-rs3918249-rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9.
Новизна и изобретательский уровень заключаются в том, что из уровня техники не известна возможность прогноза развития рака молочной железы у пациенток на основе данных о гаплотипе CTAAC полиморфных локусов rs3918242-rs3918249-rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9.
Способ осуществляют следующим образом:
Выделение геномной ДНК из периферической крови осуществляют методом фенольно-хлороформной экстракции (Miller, S. A. A simple salting out procedure for extracting DNA from human nucleated cells / S. A. Miller, D. D. Dykes, H. F. Polesky // Nucleic. Acids. Res. – 1988. – Vol. 16, № 3. – P. 1215) в два этапа. На первом этапе к 4 мл крови с ЭДТА добавляют 25 мл лизирующего буфера, содержащего 320 мМ сахарозы, 1% тритон Х-100, 5 мМ MgCl2, 10 мМ трис-HCl (pH=7,6). Полученную смесь перемешивают и центрифугируют при 4ºС, 4000 об/мин в течение 20 минут. После центрифугирования надосадочную жидкость сливают, к осадку добавляют 4 мл раствора, содержащего 25 мМ ЭДТА (рН=8,0) и 75 мМ NaCl, ресуспензируют. Затем прибавляют 0,4 мл 10% SDS, 35 мкл протеиназы К (10 мг/мл) и инкубируют образец при 37°С в течение 16 часов.
На втором этапе из полученного лизата последовательно проводят экстракцию ДНК равными объемами фенола, фенол-хлороформа (1:1) и хлороформа с центрифугированием при 4000 об/мин в течение 10 минут. После каждого центрифугирования производят отбор водной фазы. ДНК осаждают из раствора двумя объемами охлажденного 96% этанола. После лиофилизации полученную ДНК растворяют в бидистиллированной, деионизованной воде и хранят при -20°С.
Анализ полиморфных маркеров rs3918242-rs3918249-rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9 осуществлялся методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) на термоциклере CFX-96 Real-Time System (Bio-Rad) c использованием стандартных олигонуклеотидных праймеров и зондов (синтезированы в ООО «Тест - Ген» (Ульяновск)).
Амплификация геномной ДНК производилась в реакционной смеси, суммарным объемом 10 мкл, включающей смесь для ПЦР ММР-9 – 4 мкл, Taq-полимеразу - 2 мкл, исследуемый образец (~30 нг ДНК/мкл) - 1 мкл, деионизированная вода – 3 мкл.
Генотипирование исследуемых образцов осуществлялось с использованием программного обеспечения «CFX-Manager™» методом дискриминации аллелей по величинам относительных единиц флуоресценции (ОЕФ) (фиг. 1, фиг. 2, фиг. 3, фиг. 4, фиг. 5).
Изобретение характеризуется фигурами:
Фиг. 1 - Дискриминации аллелей методом детекции TaqMan зондов по данным величин ОЕФ (относительные единицы флуоресценции) каждого зонда на амплификаторе CFX96 c детектирующей системой в режиме реального времени полиморфизма rs3918242 ММР-9 (
Figure 00000002
- TT,
Figure 00000003
- CC,
Figure 00000004
- CT, ■ - отриц. контр.).
Фиг. 2 - Дискриминации аллелей методом детекции TaqMan зондов по данным величин ОЕФ (относительные единицы флуоресценции) каждого зонда на амплификаторе CFX96 c детектирующей системой в режиме реального времени полиморфизма rs3918249 ММР-9 (
Figure 00000002
- TT,
Figure 00000003
- CC,
Figure 00000004
- TC, ■ - отриц. контр.).
Фиг. 3 - Дискриминации аллелей методом детекции TaqMan зондов по данным величин ОЕФ (относительные единицы флуоресценции) каждого зонда на амплификаторе CFX96 c детектирующей системой в режиме реального времени полиморфизма rs17576 ММР-9 (
Figure 00000002
- AA,
Figure 00000003
- GG,
Figure 00000004
- AG, ■ - отриц. контр.).
Фиг. 4 - Дискриминации аллелей методом детекции TaqMan зондов по данным величин ОЕФ (относительные единицы флуоресценции) каждого зонда на амплификаторе CFX96 c детектирующей системой в режиме реального времени полиморфизма rs3787268 ММР-9 (
Figure 00000002
- AA,
Figure 00000003
- GG,
Figure 00000004
- GA, ■ - отриц. контр.).
Фиг. 5 - Дискриминации аллелей методом детекции TaqMan зондов по данным величин ОЕФ (относительные единицы флуоресценции) каждого зонда на амплификаторе CFX96 c детектирующей системой в режиме реального времени полиморфизма rs2250889 ММР-9 (
Figure 00000005
- CC,
Figure 00000006
- GG,
Figure 00000007
-CG, ■ - отриц. контр.).
Определение частот гаплотипов и анализ ассоциаций гаплотипов с развитием РМЖ у женщин проводилось с помощью логистического регрессионного анализа в программе PLINK (версия 1.07) [Ponomarenko, I.V., Polonikov, A.V., Churnosov, M.I. Association of ESR2 RS4986938 polymorphism with the development of endometrial hyperplasia (2019) Akusherstvo i Ginekologiya (Russian Federation), 2019 (4), pp. 66-72]. При необходимости в исследование включали ковариаты (возраст, индекс массы тела). После проведения пермутационного теста (выполнялось 1000 пермутаций) за статистически значимый уровень принимали ррerm<0,05.
Возможность использования предложенного способа для оценки прогнозирования риска развития РМЖ у женщин c использованием молекулярно-генетических данных подтверждает анализ результатов наблюдений 1104 пациенток, из них 358 больные с раком молочной железы и 746 женщин контрольной группы. Средний возраст больных составил 54,74±12,73 лет (варьировал от 25 до 84 лет). Возрастные характеристики больных и контроля были сопоставимы. В выборки для исследования включались (критерии включения): 1) пациентки русской национальности, являющиеся уроженками Центрального Черноземья РФ, не имеющие родства между собой и проживающие в Белгородской области (Чурносов М.И., Сорокина И.Н., Балановская Е.В. Генофонд населения Белгородской области. Динамика индекса эндогамии в районных популяциях // Генетика. 2008. Т. 44. № 8. С. 1117-1125), добровольно согласившиеся на проведение исследования; 2) в группу больных включались пациентки только после установления диагноза заболевания РМЖ, подтвержденного с помощью клинических и лабораторно-инструментальных (в т.ч. морфологических) методов обследования.
Обследование больных РМЖ проводилось на базе поликлинического и химиотерапевтического отделений Белгородского областного онкологического диспансера; формирование контрольной группы (без клинико-анамнестических признаков РМЖ) проводилось на базе перинатального центра БОКБ Святителя Иоасафа в ходе профилактических осмотров.
Все больные РМЖ и женщины контрольной группы подписали информированное согласие на участие в исследовании, проведение исследования было согласовано с этическим комитетом медицинского института НИУ «БелГУ».
Типирование молекулярно-генетических маркеров осуществлялось на кафедре медико-биологических дисциплин медицинского института НИУ «БелГУ».
При расчете частот гаплотипов и анализе их ассоциаций у пациенток установлена связь с формированием РМЖ гаплотипа CTAAC полиморфных локусов rs3918242-rs3918249-rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9. Гаплотип CTAAC полиморфных локусов rs3918242-rs3918249-rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9 является фактором риска развития РМЖ у женщин с использованием молекулярно-генетических данных (ОR=3,55, р=0,002).
В качестве примеров конкретного применения разработанного способа приведено обследование русских женщин, уроженок Центрально-Черноземного региона РФ и не являющихся родственницами между собой: проведено генетическое исследование по полиморфным локусам rs3918242-rs3918249-rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9.
У пациентки Л. была взята венозная кровь, при генотипировании ДНК-маркеров был выявлен гаплотип СTAGG полиморфных локусов rs3918242-rs3918249-rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9, что позволило отнести пациентку в группу женщин с низким риском развития РМЖ у женщин с использованием молекулярно-генетических данных. При дальнейшем наблюдение диагноз рака молочной железы у пациентки Л. не подтвердился.
У пациентки Ш. была взята венозная кровь, при генотипировании ДНК-маркеров был выявлен гаплотип CTAAC полиморфных локусов rs3918242-rs3918249-rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9, что позволило отнести женщину в группу пациенток с повышенным риском развития РМЖ с использованием молекулярно-генетических данных. Дальнейшее наблюдение подтвердило диагноз рака молочной железы у пациентки Ш.
У пациентки В. была взята венозная кровь, при генотипировании ДНК-маркеров был выявлен гаплотип ТТААG полиморфных локусов rs3918242-rs3918249-rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9, что позволило отнести пациентку в группу больных с пониженным риском развития РМЖ с использованием молекулярно-генетических данных. Дальнейшее наблюдение не подтвердило диагноз рака молочной железы у пациентки.
У пациентки С. была взята венозная кровь, при генотипировании ДНК-маркеров был выявлен гаплотип CTAAC полиморфных локусов rs3918242-rs3918249-rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9, что позволило отнести пациентку в группу индувидуумов с повышенным риском развития РМЖ. При дальнейшем наблюдении диагноз рака молочной железы у пациентки С. подтвердился.
Применение данного способа позволит на доклиническом этапе формировать среди пациенток группы риска и своевременно реализовывать в этих группах необходимые лечебно-профилактические мероприятия по предупреждению развития РМЖ у женщин с использованием молекулярно-генетических данных.

Claims (1)

  1. Способ прогнозирования риска развития рака молочной железы у женщин с использованием молекулярно-генетических данных, включающий выделение ДНК из периферической венозной крови, анализ генетических маркеров гена ММР-9, отличающийся тем, что высокий риск развития рака молочной железы у женщин с использованием молекулярно-генетических данных прогнозирует выявление гаплотипа CTAAC полиморфных локусов rs3918242-rs3918249-rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9.
RU2022126931A 2022-10-17 Способ прогнозирования риска развития рака молочной железы у женщин с использованием молекулярно-генетических данных RU2795897C1 (ru)

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2795897C1 true RU2795897C1 (ru) 2023-05-15

Family

ID=

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2815932C1 (ru) * 2023-11-16 2024-03-25 Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Белгородский государственный национальный исследовательский университет" (НИУ "БелГУ") Способ прогнозирования риска развития рака молочной железы у женщин на основе данных о межлокусных взаимодействиях

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2522501C1 (ru) * 2012-10-17 2014-07-20 Федеральное государственное бюджетное учреждение "Научно-исследовательский институт онкологии имени Н.Н. Петрова" Министерства здравоохранения Российской Федерации Способ прогнозирования наследственной предрасположенности к раку молочной железы

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2522501C1 (ru) * 2012-10-17 2014-07-20 Федеральное государственное бюджетное учреждение "Научно-исследовательский институт онкологии имени Н.Н. Петрова" Министерства здравоохранения Российской Федерации Способ прогнозирования наследственной предрасположенности к раку молочной железы

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
VICTOR ALVES DE OLIVEIRA et al., Association between matrix metalloproteinase-9 gene polymorphism and breast cancer in Brazilian women, Clinics (Sao Paulo). 2020; 75: e1762, Published online 2020 Oct 21. WIECZOREK E, et al., Genetic polymorphism of matrix metalloproteinases in breast cancer; Neoplasma, 2012;59(3):237-47, аbstract. ЗИННАТУЛЛИНА Г.Ф. и др., Прогнозирование возникновения риска рака молочной железы на основе генетических исследований, Креативная хирургия и онкология. 2009, N 2, с. 61-62. *

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2815932C1 (ru) * 2023-11-16 2024-03-25 Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Белгородский государственный национальный исследовательский университет" (НИУ "БелГУ") Способ прогнозирования риска развития рака молочной железы у женщин на основе данных о межлокусных взаимодействиях

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US9902998B2 (en) Non-invasive diagnostic method for diagnosing bladder cancer
Elmore et al. Identification of a genetic variant associated with abdominal aortic aneurysms on chromosome 3p12. 3 by genome wide association
US20120009581A1 (en) Gene Expression Profiling for Predicting the Survivability of Prostate Cancer Subjects
US20080207723A1 (en) Methods for Detecting and Monitoring COX-2 RNA in Plasma and Serum
US20240076743A1 (en) Method for Predicting and Treating Clinically Significant Prostate Cancer
CN101985651A (zh) 胃肠肿瘤诊断和预示的新分子标记
US10087489B2 (en) Biomarkers and uses thereof in prognosis and treatment strategies for right-side colon cancer disease and left-side colon cancer disease
Lu et al. Association between the functional polymorphism in the matrix metalloproteinase-7 promoter and susceptibility to adult astrocytoma
RU2624480C1 (ru) Способ прогнозирования риска развития эссенциальной гипертензии на основе комбинаций генов матриксных металлопротеиназ
RU2795897C1 (ru) Способ прогнозирования риска развития рака молочной железы у женщин с использованием молекулярно-генетических данных
RU2642939C1 (ru) Способ прогнозирования риска развития преэклампсии
RU2795720C1 (ru) Способ прогнозирования риска развития люминального подтипа рака молочной железы
RU2798666C1 (ru) Способ прогнозирования низкого риска развития рака молочной железы у женщин с высокопенетратными мутациями в генах BRCA1 и CHEK2
RU2795726C1 (ru) Способ прогнозирования риска развития рака молочной железы у женщин без ожирения
RU2795100C1 (ru) Способ прогнозирования повышенного риска развития рака молочной железы 1-2 стадий у женщин на основе полиморфизма гена матриксной металлопротеиназы 9
RU2795244C1 (ru) Способ прогнозирования риска развития рака молочной железы у женщин с ожирением
RU2811257C1 (ru) Способ прогнозирования риска развития тройного негативного подтипа рака молочной железы
RU2828523C1 (ru) Способ прогнозирования риска развития люминального подтипа рака молочной железы у женщин
RU2646448C1 (ru) Способ прогнозирования риска развития преэклампсии на основе комбинаций генов матриксных металлопротеиназ
RU2823459C1 (ru) Способ прогнозирования риска развития 3 степени злокачественности опухолевых клеток при раке молочной железы
RU2828525C1 (ru) Способ прогнозирования риска развития рака молочной железы у женщин без ожирения по результатам генетического тестирования
WO2015115544A1 (ja) 大腸がんの転移又は再発リスクの評価方法
US20160304961A1 (en) Method for predicting the response to chemotherapy treatment in patients suffering from colorectal cancer
RU2809798C1 (ru) Способ прогнозирования риска развития артериальной гипертензии у женщин с использованием молекулярно-генетических данных
RU2646455C1 (ru) Способ прогнозирования риска развития преэклампсии у женщин в зависимости от наследственной отягощенности