RU2766662C1 - Способ определения лекарственной чувствительности немелкоклеточного рака легкого in vitro - Google Patents

Способ определения лекарственной чувствительности немелкоклеточного рака легкого in vitro Download PDF

Info

Publication number
RU2766662C1
RU2766662C1 RU2021114312A RU2021114312A RU2766662C1 RU 2766662 C1 RU2766662 C1 RU 2766662C1 RU 2021114312 A RU2021114312 A RU 2021114312A RU 2021114312 A RU2021114312 A RU 2021114312A RU 2766662 C1 RU2766662 C1 RU 2766662C1
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
cytostatic
sections
vitro
expression
wells
Prior art date
Application number
RU2021114312A
Other languages
English (en)
Inventor
Ольга Олеговна Лопушанская
Александр Олегович Иванцов
Светлана Николаевна Алексахина
Дарья Сергеевна Кузнецова
Айгуль Рифовна Венина
Софья Владимировна Баскина
Михаил Александрович Майдин
Артем Валерьевич Косьмин
Евгений Николаевич Слугин
Марк Львович Гельфонд
Никита Евгеньевич Левченко
Олег Юрьевич Мамонтов
Евгений Владимирович Левченко
Евгений Наумович Имянитов
Original Assignee
Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный медицинский исследовательский центр онкологии имени Н.Н. Петрова" Министерства здравоохранения Российской Федерации
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный медицинский исследовательский центр онкологии имени Н.Н. Петрова" Министерства здравоохранения Российской Федерации filed Critical Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный медицинский исследовательский центр онкологии имени Н.Н. Петрова" Министерства здравоохранения Российской Федерации
Priority to RU2021114312A priority Critical patent/RU2766662C1/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2766662C1 publication Critical patent/RU2766662C1/ru

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61BDIAGNOSIS; SURGERY; IDENTIFICATION
    • A61B5/00Measuring for diagnostic purposes; Identification of persons
    • A61B5/0059Measuring for diagnostic purposes; Identification of persons using light, e.g. diagnosis by transillumination, diascopy, fluorescence
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Heart & Thoracic Surgery (AREA)
  • Medical Informatics (AREA)
  • Surgery (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Изобретение относится к медицине и касается способа определения лекарственной чувствительности немелкоклеточного рака легкого in vitro путем культивирования раковых клеток в присутствии цитостатика, где культивируют срезы опухолевой ткани толщиной 300-500 мкм, полученные из первичной опухоли, при этом срезы помещают в 24-луночный планшет, по одному срезу в каждую лунку с питательной средой и цитостатиком, часть лунок оставляют контрольными, где лунки с контролем содержат питательную среду без цитостатика, культивируют в условиях CO2-инкубатора при постоянном перемешивании, по окончании культивирования срезы фиксируют и хранят до выделения кДНК и до определения в них экспрессии РНК-маркеров, при увеличении экспрессии РНК-маркеров в сравнении с контрольным образцом определяют лекарственную чувствительность к исследуемому цитостатику. Изобретение обеспечивает индивидуальный подбор цитостатической лекарственной терапии с использованием срезов опухолевой ткани, правильное и своевременное проведение цитостатической лекарственной терапии. 1 пр.

Description

Изобретение относится к медицине, а именно к онкологии, и может быть использовано для определения лекарственной чувствительности немелкоклеточного рака легкого (НМРЛ) in vitro при выборе лекарственной терапии.
В настоящее время для лекарственного лечения НМРЛ используется несколько схем цитостатической (противоопухолевой) терапии, при этом выбор тех или иных препаратов осуществляется эмпирическим путем - на основании статистической вероятности получения положительного эффекта (Gentzler RD, Johnson ML. Complex decisions for first-line and maintenance treatment of advanced wild-type non-small cell lung cancer. Oncologist. 2015 Mar; 20(3):299-306. doi: 10.1634/theoncologist. 2014 - 0212).
Недостатком является отсутствие индивидуального подбора цитостатической лекарственной терапии.
Техническим результатом изобретения является индивидуальный подбор цитостатической лекарственной терапии на срезах опухолевой ткани, правильное и своевременное проведение цитостатической лекарственной терапии.
Указанный технический результат достигается в способе определения лекарственной чувствительности НМРЛ in vitro путем культивирования раковых клеток в присутствии цитостатика, в котором культивируют срезы опухолевой ткани толщиной 300-500 мкм, полученные из первичной опухоли, при этом срезы помещают в 24-луночный планшет, по 2 среза в каждую лунку с питательной средой и различными цитостатиками, часть лунок оставляют контрольными, культивируют в условиях CO2-инкубатора при постоянном перемешивании в течение 24 часов, по окончании культивирования один срез из пары помещают в формалин для дальнейшего гистологического исследования, второй - фиксируют в реагенте RNAlater и хранят при - 80°С до определения в них экспрессии РНК-маркеров, при увеличении экспрессии РНК-маркеров в сравнении с контрольным образцом определяют лекарственную чувствительность к исследуемому цитостатику.
На данный момент для разработки и усовершенствования противоопухолевой терапии in vitro используются два типа клеточных систем - иммортализованные опухолевые клеточные линии и первичные культуры опухолевых клеток.
Первые, иммортализованные («перевиваемые») клеточные линии - это однородная популяция клеток, которые ведут свое начало от первичной опухоли и обладают способностью непрерывно делиться вне организма в течение неограниченного количества пассажей. Линии НМРЛ с успехом используются для валидации таргетной терапии и для исследования механизмов химиочувствительности и резистентности, поскольку, они способны сохранять в своем геноме клинически значимые мутации, в том числе и в драйверных генах. Однако, иммортализованные клеточные линии представляют собой чистую гомогенную клеточную популяцию, утратившую многие свойства исходной опухоли, и сохранившие в «дистиллированном» виде только некоторые из ее молекулярных и биологических особенностей.
Известны первичные культуры опухолевых клеток, недавно выделенных из организма. Они гетерогенны по природе, полнее и объективнее характеризуют «родительскую» опухоль, по крайней мере, на первых этапах культивация. При пассировании in vitro такие клетки сохраняют морфологию и молекулярно-патогенетические характеристики клеток первичной опухоли, но большая их часть способна к весьма ограниченному росту in vitro (5-25 пассажей), в то время как проведение тестов на лекарственную чувствительность на ранних пассажах весьма затруднительно ввиду малого процента эпителиальных клеток в культуре. Также, процент успешной перевивки опухоли в культуру для рака легкого составляет не более 30%. Причем, представленные 30% выведенных первичных культур получают с помощью специальных условий культивирования и добавочных биоактивных компонентов, в частности, использования комбинации фидерных клеточных слоев и ингибитора Rho-связанной спиральной киназы ROCK, что делает подобную процедуру довольно затратной и трудоемкой по исполнению, а соответственно не совсем оптимальной для рутинного тестирования лекарственной чувствительности.
В качестве альтернативы по отношению к клеточным культурам, нами предложено использовать тканевые экспланты (тканевые срезы; слайсы). Слайсы представляют собой тонкие срезы толщиной 300-500 мкм опухолевой ткани, полученные из первичной опухоли. При культивировании в питательной среде до 7 суток слайсы сохраняют свою структуру без изменения морфологических свойств. Методика их получения проста, не занимает много времени и, может быть применена при большинстве солидных опухолей.
Основным преимуществом оценки лекарственной чувствительности с использованием слайсов представляется возможность сохранения архитектоники ткани, внутренней структуры и индивидуальной вариабельности опухоли.
Методика изготовления тканевых слайсов и их последующего культивирования состоит в следующем.
С помощью вибратома формируют срезы ткани толщиной, например, 400 мкм из первичной опухоли. Затем срезы опухоли помещают в 24-луночный планшет, по 2 среза в каждую лунку. В каждую лунку вносится 1 мл полной питательной среды с различными противоопухолевыми препаратами. Лунки с контролем содержат 1 мл питательной среды без препаратов. Планшет с пластинками культивируют в условиях CO2-инкубатора при постоянном перемешивании в течение 24 часов. После культивирования один срез из пары помещают в формалин для дальнейшего гистологического исследования, второй фиксируют в реагенте для стабилизации РНК в тканях - RNAlater, и хранят при - 80°С до выделения кДНК.
Производят морфологический анализ воздействия препаратов на ткань в сравнении с контрольным образцом, а именно анализ РНК - маркеров связанных с активацией процессов гибели клеток под воздействием препаратов. При увеличении экспрессии РНК-маркеров в сравнении с контрольным образцом определяют лекарственную чувствительность к исследуемому цитостатику.
Способ подтверждается следующим примером.
Для оценки воспроизводимости данного способа уровень экспрессии маркеров - мРНК HEXIM1, HSPA2, ТОВ1 и TSYPL2 был оценен методом ПЦР в режиме реального времени в 173 пластинках, полученных от 21 пациента. Выделенные из пластинок нуклеиновые кислоты перед проведением реакции обратной транскрипции обрабатывали ДНКазой. Для оценки значимости полученных результатов был использован метод 2^-ΔΔCt. Экспрессия кандидатных генов варьировалась в зависимости от исследуемых препаратов.
Больная Г., 65 лет. Диагноз: Периферический рак нижней доли правого легкого cT1bN0M0/pT2aN2M0 IIIA стадия. 16.09.2019 г. выполнена VATS справа, нижняя лобэктомия. По данным послеоперационного гистологического заключения высокодифференцированная аденокарцинома нижней доли правого легкого, преимущественно стелющегося строения, с ацинарным и солидными компонентами. Метастазы в 1 лимфоузле 4R группы, 1-7 группы, 1-8 группы, 1-9 группы, 1-11 группы нижней доли, 2 перибронхиальных лимфоузлах. Учитывая данные заключения, пациентке показано проведение адъювантной химиотерапии.
Из послеоперационного опухолевого материала были получены тканевые срезы, которые впоследствии прошли инкубацию в течение 24 часов с препаратом Цисплатин (30 мкг/ мл) и Гефитиниб (4 мкг/мл). Было обнаружено статистически значимое увеличение экспрессии всех кандидатных маркеров (HEXIM1, HSPA2, ТОВ1 и TSYPL2) при воздействии на тканевые пластинки цисплатина. Данные результаты продемонстрировали, что клетки, находящиеся в тканевой пластинке, реагируют на воздействие химиопрепарата в клеточной среде в соответствии с его механизмом действия (активируется система репарации ДНК).
Пациентке был назначен курс адъювантной химиотерапии по схеме Пеметрексед 500 мг/м2 в/в в 1 день + Цисплатин 75 мг/ м2 в/в в 1 день 21 дневного цикла. По данным контрольной КТ грудной клетки через 2 цикла химиотерапии отмечен частичный регресс.
Способ обеспечивает индивидуальный подбор цитостатической лекарственной терапии с использованием срезов опухолевой ткани, правильное и своевременное проведение цитостатической лекарственной терапии.

Claims (1)

  1. Способ определения лекарственной чувствительности немелкоклеточного рака легкого in vitro путем культивирования раковых клеток в присутствии цитостатика, отличающийся тем, что культивируют срезы опухолевой ткани толщиной 300-500 мкм, полученные из первичной опухоли, при этом срезы помещают в 24-луночный планшет, по одному срезу в каждую лунку с питательной средой и цитостатиком, часть лунок оставляют контрольными, где лунки с контролем содержат 1 мл питательной среды без цитостатика, культивируют в условиях CO2-инкубатора при постоянном перемешивании в течение 24 часов, по окончании культивирования срезы фиксируют в реагенте RNAlater и хранят при - 80°С до выделения кДНК и до определения в них экспрессии РНК-маркеров, выбранных из HEXIM1, HSPA2, ТОВ1 и TSYPL2, при увеличении экспрессии РНК-маркеров в сравнении с контрольным образцом определяют лекарственную чувствительность к исследуемому цитостатику.
RU2021114312A 2021-05-18 2021-05-18 Способ определения лекарственной чувствительности немелкоклеточного рака легкого in vitro RU2766662C1 (ru)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2021114312A RU2766662C1 (ru) 2021-05-18 2021-05-18 Способ определения лекарственной чувствительности немелкоклеточного рака легкого in vitro

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2021114312A RU2766662C1 (ru) 2021-05-18 2021-05-18 Способ определения лекарственной чувствительности немелкоклеточного рака легкого in vitro

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2766662C1 true RU2766662C1 (ru) 2022-03-15

Family

ID=80736629

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2021114312A RU2766662C1 (ru) 2021-05-18 2021-05-18 Способ определения лекарственной чувствительности немелкоклеточного рака легкого in vitro

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2766662C1 (ru)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN118169379A (zh) * 2024-05-14 2024-06-11 北京航空航天大学 肿瘤的药敏检测方法

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2068563C1 (ru) * 1992-04-20 1996-10-27 Людмила Александровна Филиппова Способ оценки индивидуальной химиочувствительности опухолей у больных
WO2013052652A1 (en) * 2011-10-04 2013-04-11 Erard Gilles Methods and systems for identifying and treating anti-progestin sensitive tumors
RU2509808C1 (ru) * 2012-10-30 2014-03-20 Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения Российской академии наук (ИХБФМ СО РАН) СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТИ КЛЕТОК НЕМЕЛКОКЛЕТОЧНОГО РАКА ЛЕГКИХ К ДЕЙСТВИЮ ПРЕПАРАТОВ, РЕАКТИВИРУЮЩИХ БЕЛОК р53
RU2666921C2 (ru) * 2013-06-20 2018-09-13 Тайхо Фармасьютикал Ко., Лтд. СПОСОБ ПРЕДСКАЗАНИЯ ТЕРАПЕВТИЧЕСКОЙ ЭФФЕКТИВНОСТИ ИНГИБИТОРА PI3K/AKT/mTOR НА ОСНОВАНИИ ЭКСПРЕССИИ PHLDA1 ИЛИ PIK3C2B

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2068563C1 (ru) * 1992-04-20 1996-10-27 Людмила Александровна Филиппова Способ оценки индивидуальной химиочувствительности опухолей у больных
WO2013052652A1 (en) * 2011-10-04 2013-04-11 Erard Gilles Methods and systems for identifying and treating anti-progestin sensitive tumors
RU2509808C1 (ru) * 2012-10-30 2014-03-20 Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения Российской академии наук (ИХБФМ СО РАН) СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТИ КЛЕТОК НЕМЕЛКОКЛЕТОЧНОГО РАКА ЛЕГКИХ К ДЕЙСТВИЮ ПРЕПАРАТОВ, РЕАКТИВИРУЮЩИХ БЕЛОК р53
RU2666921C2 (ru) * 2013-06-20 2018-09-13 Тайхо Фармасьютикал Ко., Лтд. СПОСОБ ПРЕДСКАЗАНИЯ ТЕРАПЕВТИЧЕСКОЙ ЭФФЕКТИВНОСТИ ИНГИБИТОРА PI3K/AKT/mTOR НА ОСНОВАНИИ ЭКСПРЕССИИ PHLDA1 ИЛИ PIK3C2B

Non-Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
SHAW G.L., et al., Correlation of in vitro drug sensitivity testing results with response to chemotherapy and survival: comparison of non-small cell lung cancer and small cell lung cancer. J Cell Biochem Suppl. 1996; 24:173-85.doi: 10.1002/jcb.240630513. *
TAHMINEH K., et al., RNA markers enable phenotypic test of antibiotic susceptibility in Neisseria gonorrhoeae after 10 minutes of ciprofloxacin exposure.Sci Rep. 2018 Aug 2; 8 (1): 11606.doi: 10.1038/s41598-018-29707-w. *
WANG X., et al., Association of thymidylate synthase gene 3'-untranslated region polymorphism with sensitivity of non-small cell lung cancer to pemetrexed treatment: TS gene polymorphism and pemetrexed sensitivity in NSCLC.J Biomed Sci. 2013 Jan 25; 20 (1): 5.doi: 10.1186/1423-0127-20-5. *
WANG X., et al., Association of thymidylate synthase gene 3'-untranslated region polymorphism with sensitivity of non-small cell lung cancer to pemetrexed treatment: TS gene polymorphism and pemetrexed sensitivity in NSCLC.J Biomed Sci. 2013 Jan 25; 20 (1): 5.doi: 10.1186/1423-0127-20-5. SHAW G.L., et al., Correlation of in vitro drug sensitivity testing results with response to chemotherapy and survival: comparison of non-small cell lung cancer and small cell lung cancer. J Cell Biochem Suppl. 1996; 24:173-85.doi: 10.1002/jcb.240630513. TAHMINEH K., et al., RNA markers enable phenotypic test of antibiotic susceptibility in Neisseria gonorrhoeae after 10 minutes of ciprofloxacin exposure.Sci Rep. 2018 Aug 2; 8 (1): 11606.doi: 10.1038/s41598-018-29707-w. *

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN118169379A (zh) * 2024-05-14 2024-06-11 北京航空航天大学 肿瘤的药敏检测方法

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Faury et al. Molecular profiling identifies prognostic subgroups of pediatric glioblastoma and shows increased YB-1 expression in tumors
CN105308189B (zh) 响应于抗癌疗法的肿瘤细胞标志物
EP3458604B1 (en) Method for determining sensitivity to a cdk4/6 inhibitor
JP2017061448A5 (ru)
WO2021052286A1 (zh) 新型外泌体释放相关靶点及其在监测和抑制肿瘤中的应用
RU2766662C1 (ru) Способ определения лекарственной чувствительности немелкоклеточного рака легкого in vitro
JP2022543555A (ja) miRNA-193aに関する新たな処置
CN107828888A (zh) 环状RNA circ‑PTPRA的用途
Tsubaki et al. Contributions of MET activation to BCR-ABL1 tyrosine kinase inhibitor resistance in chronic myeloid leukemia cells
Niu et al. MiRNA-221-5p promotes breast cancer progression by regulating E-cadherin expression.
JP6479672B2 (ja) 癌における放射線療法に対する応答をモニタリングするための方法およびキット
CN106999734A (zh) 针对parp抑制剂的应答的预测和靶向c‑met和parp1的组合疗法
Zhang et al. Significance of neoadjuvant chemotherapy (NACT) in limb salvage treatment of osteosarcoma and its effect on GLS1 expression.
CN117298121A (zh) 蒲公英甾醇在幽门螺旋杆菌诱导的胃炎或胃癌中的应用
CN104884097B (zh) 用于耐药性乳腺癌预后和治疗的作为新治疗助剂和生物标志物的miRNA
CN117210527A (zh) 一种基于肿瘤类器官耐药克隆指导临床耐药后治疗系统
US20190249134A1 (en) Cell cultures and use thereof
CN108660211A (zh) 一种与肝细胞癌相关的生物标志物linc01549及其应用
Abed et al. IDE161, a potential first-in-class clinical candidate PARG inhibitor, selectively targets homologous-recombination-deficient and PARP inhibitor resistant breast and ovarian tumors
CN114395622A (zh) 一种利用数字pcr检测循环肿瘤细胞egfr基因突变的方法及其应用
Oleskin et al. Testing neurotransmitters for toxicity with a luminescent biosensor: Implications for microbial endocrinology
RU2818352C1 (ru) Способ оценки резистентности злокачественных новообразований к радиационной терапии и набор тестов для его реализации
CN109554471A (zh) Dhrs2基因及检测dhrs2基因表达的试剂的应用
Beyer et al. Gastroenteropancreatic neuroendocrine carcinoma tumor spheroid drug screen reveals vulnerability to tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 inhibitors
CN114794016B (zh) 一种构建肠道菌群分布紊乱和抗肿瘤免疫能力失调模型的方法