RU2511440C2 - Method of quantitative determination of fixed rabies virus "moskva 3253" - Google Patents
Method of quantitative determination of fixed rabies virus "moskva 3253" Download PDFInfo
- Publication number
- RU2511440C2 RU2511440C2 RU2012139719/10A RU2012139719A RU2511440C2 RU 2511440 C2 RU2511440 C2 RU 2511440C2 RU 2012139719/10 A RU2012139719/10 A RU 2012139719/10A RU 2012139719 A RU2012139719 A RU 2012139719A RU 2511440 C2 RU2511440 C2 RU 2511440C2
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- virus
- rabies
- pcr
- fluorescence
- rabies virus
- Prior art date
Links
Images
Landscapes
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
Description
Изобретение относится к биотехнологии и вирусологии и может быть использовано специалистами, работающими в области производства медицинских иммунобиологических препаратов (МИБП).The invention relates to biotechnology and virology and can be used by specialists working in the field of production of medical immunobiological preparations (MIBP).
Изобретение выполнено в рамках реализации федеральной целевой программы «Национальная система химической и биологической безопасности Российской Федерации (2009-2013 гг.)» и в соответствии с Государственным контрактом №54-Д от 04.06.2012 г.The invention was carried out as part of the implementation of the federal target program “National System of Chemical and Biological Safety of the Russian Federation (2009-2013)” and in accordance with State Contract No. 54-D of 04.06.2012
До настоящего времени бешенство остается одной из самых опасных инфекционных болезней, от которой ежегодно в мире погибает около 50000 человек и 1 млн животных [1]. Неблагоприятная эпидемиологическая ситуация по бешенству, сложившаяся практически во всех регионах Российской Федерации из-за повышения заболеваемости диких и домашних животных, обусловливает резко возросший уровень численности людей, ежегодно обращающихся за антирабической помощью - свыше 450000 человек. Половина из этого числа получает курс антирабического лечения [3], что диктует необходимость интенсификации исследований по совершенствованию качества антирабических препаратов.To date, rabies remains one of the most dangerous infectious diseases, from which annually about 50,000 people and 1 million animals die in the world [1]. The unfavorable epidemiological situation of rabies, which has developed in almost all regions of the Russian Federation due to an increase in the incidence of wild and domestic animals, is responsible for the sharply increased level of the number of people who seek rabies care annually - over 450,000 people. Half of this number receives a course of anti-rabies treatment [3], which necessitates the intensification of research to improve the quality of anti-rabies drugs.
Для постэкспозиционной профилактики бешенства у людей в Российской Федерации применяют концентрированную культуральную антирабическую вакцину в сочетании с антирабическим иммуноглобулином.For post-exposure prophylaxis of rabies in humans in the Russian Federation, a concentrated culture-based rabies vaccine is used in combination with rabies immunoglobulin.
На сегодняшний день гетерологичный антирабический иммуноглобулин можно считать приемлемой и безопасной альтернативой гомологичному препарату, получаемому из иммунной сыворотки крови человека. Использование современных методов очистки иммуноглобулиновых препаратов позволило значительно снизить частоту побочных эффектов до 1-2%, проявляющихся в результате применения антирабического иммуноглобулина животного происхождения [15].To date, heterologous anti-rabies immunoglobulin can be considered an acceptable and safe alternative to a homologous drug obtained from human immune serum. The use of modern methods of purification of immunoglobulin preparations has significantly reduced the frequency of side effects to 1-2%, resulting from the use of rabies immunoglobulin of animal origin [15].
Для иммунизации продуцентов при получении лошадиной гипериммунной сыворотки используют рабический антиген на основе фиксированного вируса бешенства штамма «Москва 3253». При получении антигена необходима стандартизация количественной оценки содержания вируса бешенства «Москва 3253» в материале для иммунизации.To immunize producers upon receipt of equine hyperimmune serum, a rabic antigen based on the fixed rabies virus strain Moscow 3253 is used. Upon receipt of the antigen, standardization of the quantitative assessment of the content of rabies virus "Moscow 3253" in the material for immunization is necessary.
В настоящее время количество вируса в исследуемом материале можно определять различными способами.Currently, the amount of virus in the test material can be determined in various ways.
Известны способы определения количества вируса в исследуемом материале по локальным повреждениям в зараженных культурах клеток и на хорион-аллантоисной оболочке (ХАО) куриных эмбрионов, в которых количество вируса учитывают в бляшкообразующих единицах (БОЕ), оспообразующих единицах (ООЕ). Однако использование методов затруднено в связи с тем, что при высокой концентрации вируса в исследуемом материале избежать слияния бляшек невозможно и соответственно невозможно провести количественную оценку [4]. Метод выполняют с живым вирусом, он трудоемкий и длительный по исполнению (72-96 часов).Known methods for determining the amount of virus in the test material by local damage in infected cell cultures and on the chorion-allantoic membrane (HAO) of chicken embryos, in which the amount of virus is taken into account in plaque forming units (PFU), smallpox units (OOE). However, the use of methods is difficult due to the fact that at a high concentration of the virus in the test material it is impossible to avoid plaque fusion and, accordingly, it is impossible to conduct a quantitative assessment [4]. The method is performed with a live virus; it is laborious and time consuming to execute (72-96 hours).
Известен метод определения титра вируса в единицах 50% инфекционного действия. По этому методу за единицу количества вируса принимается такая его доза, которая способна вызывать инфекционный эффект у 50% зараженных животных. Способ определения титра вируса заключается в заражении животных вирусом с последующим учетом клинических особенностей проявления инфекционного процесса у каждого животного (явления признаков паралича на 4-7 сутки) и определением 50% эффективной дозы. Однако этот метод титрования вирусов довольно трудоемкий, длительный и требует большого количества животных. Недостатками данного метода также является то, что более высокая доза вируса не всегда вызывает и более высокий инфекционный эффект, что связано с индивидуальной чувствительностью каждого вида животного [4].A known method for determining the titer of the virus in units of 50% of the infectious effect. According to this method, a unit dose of the virus is taken to be its dose that can cause an infectious effect in 50% of infected animals. The method for determining the titer of the virus is to infect animals with the virus, followed by the clinical features of the manifestation of the infectious process in each animal (the occurrence of signs of paralysis on days 4-7) and the determination of 50% of the effective dose. However, this method of titration of viruses is rather laborious, time consuming and requires a large number of animals. The disadvantages of this method is that a higher dose of the virus does not always cause a higher infectious effect, which is associated with the individual sensitivity of each animal species [4].
Известен метод, основанный на способности агглютинировать эритроциты определенных видов животных при определенных условиях. Титр таких вирусов выражают в гемагглютинирующих единицах (ГАЕ). Суспензию эритроцитов и вируссодержащий материал в разведениях смешивают в равных объемах, инкубируют при 37°С и учитывают реакцию агглютинации. Однако не все вирусы способны агглютинировать эритроциты, поэтому недостатком данного метода является возможность постановки реакции только с гемагглютинирующими вирусами [4].A known method based on the ability to agglutinate red blood cells of certain animal species under certain conditions. The titer of such viruses is expressed in hemagglutinating units (GAE). The erythrocyte suspension and virus-containing material in dilutions are mixed in equal volumes, incubated at 37 ° C and the agglutination reaction is taken into account. However, not all viruses are able to agglutinate red blood cells; therefore, the disadvantage of this method is the possibility of setting the reaction only with hemagglutinating viruses [4].
Все вышеописанные методы определения содержания вируса бешенства в материале основаны на воздействии живого возбудителя на различные биологические клетки и ткани и не пригодны для количественной оценки инактивированного вируса бешенства.All the above methods for determining the content of rabies virus in the material are based on the action of a living pathogen on various biological cells and tissues and are not suitable for the quantitative assessment of inactivated rabies virus.
Одним из перспективных подходов к количественной оценке вирусов в инактивированном антигеном материале является использование молекулярно-генетических методов.One of the promising approaches to the quantitative assessment of viruses in inactivated antigen material is the use of molecular genetic methods.
При классической ПЦР с электрофоретическим учетом результатов отсутствует возможность количественного определения ДНК/РНК инфекционных агентов в исследуемом материале. Кроме того, наличие стадии электрофореза предъявляет более строгие требования к организации ПЦР-лаборатории и возрастает риск контаминации продуктами ПЦР. При использовании ПЦР с гибридизационно-флуоресцентным учетом результатов в режиме реального времени, возможно количественное определение ДНК/РНК инфекционных агентов в исследуемом материале, с автоматическим регистрированием и интерпретацией полученных результатов. Отсутствие стадии электрофореза позволяет минимизировать число ложноположительных результатов. Поскольку регистрация результатов проводится непосредственно в процессе ПЦР, весь анализ можно выполнять в одной-двух комнатах лаборатории и нет необходимости в отдельном помещении для детекции продуктов реакции [2].In classical PCR with electrophoretic consideration of the results, it is not possible to quantify the DNA / RNA of infectious agents in the test material. In addition, the presence of an electrophoresis stage makes more stringent requirements for the organization of a PCR laboratory and the risk of contamination with PCR products increases. When using PCR with hybridization-fluorescence real-time results, it is possible to quantify the DNA / RNA of infectious agents in the test material, with automatic recording and interpretation of the results. The absence of an electrophoresis stage allows minimizing the number of false positive results. Since the registration of the results is carried out directly in the PCR process, the entire analysis can be performed in one or two rooms of the laboratory and there is no need for a separate room for the detection of reaction products [2].
Данный подход нашел успешное применение для определения концентрации РНК желтой геморрагической лихорадки, человеческого герпес вируса-6 и цитомегаловируса [8, 9]. Доказана эффективность использования ПЦР с электрофоретическим, гибридизационно-флуоресцентным и секвенационным учетом результатов для выявления РНК вируса бешенства в биологическом материале от животных и человека [5, 6, 7, 10, 11, 12, 13, 14]. Во всех работах определение количества вирусных частиц в материале для исследований не проводилось.This approach has been successfully used to determine the concentration of RNA of yellow hemorrhagic fever, human herpes virus-6 and cytomegalovirus [8, 9]. The effectiveness of using PCR with electrophoretic, hybridization-fluorescence, and sequencing results has been proven to detect rabies virus RNA in biological material from animals and humans [5, 6, 7, 10, 11, 12, 13, 14]. In all studies, the determination of the number of viral particles in the research material was not carried out.
Задачей предлагаемого изобретения является создание высокоспецифичного, чувствительного, простого и быстрого в исполнении способа количественного определения фиксированного вируса бешенства штамма «Москва 3253 » с использованием полимеразной цепной реакции в режиме реального времени при производстве антирабического иммуноглобулина.The objective of the invention is the creation of a highly specific, sensitive, simple and quick method for the quantitative determination of fixed rabies virus strain "Moscow 3253" using the polymerase chain reaction in real time in the production of rabies immunoglobulin.
Технический результат изобретения заключается в сокращении времени исполнения, получении количественных характеристик используемого антигена, что способствует стандартизации этапа приготовления рабического антигена при производстве антирабического иммуноглобулина.The technical result of the invention is to reduce the execution time, to obtain quantitative characteristics of the antigen used, which helps to standardize the stage of preparation of the rabid antigen in the production of rabies immunoglobulin.
Технический результат достигается способом, включающим обеззараживание и выделение РНК из вируссодержащего материала, постановку реакции обратной транскрипции и полимеразной цепной реакции с гибридизационно-флуоресцентным учетом результатов в режиме «реального времени» с использованием специфичных праймеров PV5-5'-GTTGGGCACTGAAACTGCTA-3',The technical result is achieved by a method including disinfecting and isolating RNA from a virus-containing material, staging a reverse transcription reaction and polymerase chain reaction with hybridization-fluorescence taking into account the results in real time using specific primers PV5-5'-GTTGGGCACTGAAACTGCTA-3 ',
RV6-5'-GAATCTCCGGGTTCAAGAGT-3'RV6-5'-GAATCTCCGGGTTCAAGAGT-3 '
и зонда RV7-5'-ROX-AATCCTCCTTGAACTCCATGCGACAGA-BHQ2, обеспечивающих амплификацию фрагмента G-L области генома фиксированного вируса бешенства штамма «Москва 3253», отжиг праймеров проводят при температуре 60°С в течение 10 циклов, затем при 56°С в течение 35 циклов, а количественную оценку вируса определяют на основании регистрации сигнала флуоресценции исследуемого образца и сравнения его с сигналом флуоресценции ПЦР-стандартов, содержащих различные количества ДНК-мишени.and probe RV7-5'-ROX-AATCCTCCTTGAACTCCATGCGACAGA-BHQ2, providing amplification of the GL fragment of the genome of the fixed rabies virus strain Moscow 3253, annealing the primers is carried out at a temperature of 60 ° C for 10 cycles, then at 56 ° C for 35 cycles and a quantitative assessment of the virus is determined based on the registration of the fluorescence signal of the test sample and comparing it with the fluorescence signal of PCR standards containing various amounts of the target DNA.
В качестве ДНК-мишени для разработки способа количественного определения фиксированного вируса бешенства штамма «Москва 3253» был выбран фрагмент G-L области вируса бешенства размером 881 н.п. При изучении этой нуклеотидной последовательности установлено, что последовательность G-L области штамма вируса бешенства «Москва 3253» уникальна и имеет отличия от других последовательностей данного участка от 12 нуклеотидов у штамма RV-97 до 152 нуклеотидов для изолята NNV-RAB-H. Результаты анализа представлены в табл.1. Анализ нуклеотидной последовательности проводили с помощью алгоритма AlignX и программы Mega 3.1, а также алгоритма BLAST и генетической базы данных GenBank. При изучении нуклеотидной последовательности данного локуса у штамма вируса бешенства «Москва 3253» установлена ее высокая стабильность во всех пассажах вируса, используемых в производстве антирабического иммуноглобулина. На основании полученных результатов выведена консенсусная последовательность фрагмента G-L области у фиксированного штамма вируса бешенства «Москва 3253». Проведенный анализ гомологии исследуемой области фрагмента G-L области у производных штамма SAD В19, показал идентичность у штаммов после пассажей на куриных эмбрионах и клетках Vero на 99,8% и 99,7%, соответственно, что также подтверждает высокую специфичность указанного фрагмента.As a target DNA for the development of a method for the quantitative determination of the fixed rabies virus of the strain "Moscow 3253", a fragment of the G-L region of the rabies virus of 881 bp was selected. When studying this nucleotide sequence, it was found that the G-L sequence of the rabies virus strain "Moscow 3253" is unique and differs from other sequences of this region from 12 nucleotides in strain RV-97 to 152 nucleotides for the NNV-RAB-H isolate. The results of the analysis are presented in table 1. The analysis of the nucleotide sequence was carried out using the AlignX algorithm and the Mega 3.1 program, as well as the BLAST algorithm and the GenBank genetic database. When studying the nucleotide sequence of this locus in the strain of rabies virus "Moscow 3253" its high stability was established in all passages of the virus used in the production of rabies immunoglobulin. Based on the results obtained, the consensus sequence of the G-L region fragment of the fixed strain of rabies virus “Moscow 3253” was derived. The homology analysis of the studied region of the G-L fragment of the region of derivatives of the SAD B19 strain showed 99.8% and 99.7% identity of the strains after passages on chicken embryos and Vero cells, respectively, which also confirms the high specificity of this fragment.
На основании консенсусной последовательности выбранного участка G-L области с помощью программы Primer Premier- V5 (Premier Bio Soft International), интернет-сайта www.genscript.com и алгоритма BLAST подобранны олигонуклеотидные праймеры RV5 и RV6, обеспечивающие амплификацию фрагмента в пределах 436-585 нуклеотида полной последовательности локуса и зонд формата TaqMan RV7 с флуоресцентными меткой ROX и гасителем BHQ2 в позиции 542-565 нуклеотида полной последовательности локуса, позволяющие учитывать результаты реакции в режиме реального времени:Based on the consensus sequence of the selected region of the GL region using the Primer Premier-V5 program (Premier Bio Soft International), the website www.genscript.com and the BLAST algorithm, the oligonucleotide primers RV5 and RV6 were selected to ensure fragment amplification within 436-585 nucleotides of the complete locus sequences and TaqMan RV7 format probe with a ROX fluorescent label and a BHQ2 quencher at position 542-565 of the nucleotide of the complete locus sequence, allowing real-time reaction results to be taken into account:
RV5-5'-GTTGGGCACTGAAACTGCTA-3',RV5-5'-GTTGGGCACTGAAACTGCTA-3 ',
RV6-5'-GAATCTCCGGGTTCAAGAGT-3'RV6-5'-GAATCTCCGGGTTCAAGAGT-3 '
RV7-5'-ROX-AATCCTCCTTGAACTCCATGCGACAGA-BHQ2,RV7-5'-ROX-AATCCTCCTTGAACTCCATGCGACAGA-BHQ2,
Анализ соответствия выбранных праймеров и зонда по количеству вариабельных нуклеотидов представлен в табл.2. Полученные результаты указывают на высокую специфичность праймеров RV-5, RV-6 и зонда RV-7 по отношению к указанному выше фрагменту последовательности G-L области штамма вируса бешенства «Москва 3253». Для повышения эффективности гидролиза зонда RV7 за счет 5'-экзонуклеазной активности фермента Taq-полимеразы к 5'-концу зонда добавлено три нуклеотида «ААТ», некомплементарных последовательности локуса. Схема расположения праймеров и зондов представлена на фигуре 1.An analysis of the correspondence of the selected primers and probe according to the number of variable nucleotides is presented in Table 2. The results indicate a high specificity of the primers RV-5, RV-6 and probe RV-7 with respect to the above fragment of the G-L sequence of the region of the rabies virus strain "Moscow 3253". To increase the efficiency of hydrolysis of the RV7 probe due to the 5'-exonuclease activity of the Taq polymerase enzyme, three “AAT” nucleotides, non-complementary to the locus sequence, were added to the 5'-end of the probe. The arrangement of primers and probes is presented in figure 1.
Экспериментально установлен оптимальный состав реакционной смеси для выполнения ПЦР с гибридизационно-флуоресцентным учетом результатов. Подобраны оптимальные параметры реакции амплификации с олигонуклеотидными праймерами и зондом. В частности, для постановки ПЦР с гибридизационно-флуоресцентным учетом результатов ПЦР-смесь 1 содержит праймеры RV5 и RV6, зонд RV7, четыре дезоксинуклеотидтрифосфата, азид натрия, воду, свободную от нуклеаз; реакционная ПЦР-смесь 2 содержит 10×Taq буфер с сульфатом аммония, магния хлорид, воду свободную от нуклеаз.The optimal composition of the reaction mixture for performing PCR with hybridization-fluorescence results was established experimentally. The optimal parameters of the amplification reaction with oligonucleotide primers and probe were selected. In particular, to perform PCR with hybridization-fluorescence results, the
Экспериментально подобран режим отжига праймеров и эффективное число циклов амплификации. Отжиг праймеров проводят при температуре 60°С в течение 10 циклов, затем при 56°С в течение 35 циклов. Учет флуоресценции по каналу ROX осуществляют при температуре 56°С путем сравнения с ПЦР-стандартами RV1, RV2, RV3, RV4, содержащих различные количества ДНК-мишени и обеспечивающих проведение количественной ПЦР.The mode of primer annealing and the effective number of amplification cycles were experimentally selected. Annealing of the primers is carried out at a temperature of 60 ° C for 10 cycles, then at 56 ° C for 35 cycles. The fluorescence analysis of the ROX channel is carried out at a temperature of 56 ° C by comparison with the PCR standards RV1, RV2, RV3, RV4, containing various amounts of target DNA and providing quantitative PCR.
Реализация заявляемого способа представлена в примерах.The implementation of the proposed method is presented in the examples.
Пример 1. Количественное определение концентрации вируса бешенства штамма «Москва 3253» в рабическом антигене органо-тканевого происхождения.Example 1. Quantitative determination of the concentration of rabies virus strain "Moscow 3253" in the rabies antigen of organo-tissue origin.
Рабический антиген органо-тканевого происхождения получают из мозговой суспензии кроликов, которым предварительно вводят вирус бешенства штамма «Москва 3253». Для анализа было отобрано 12 проб мозговой суспензии кроликов.Rabic antigen of organ-tissue origin is obtained from the brain suspension of rabbits, which previously introduced rabies virus strain "Moscow 3253". For analysis, 12 rabbit brain suspension samples were taken.
Определение концентрации вируса бешенства выполняли в несколько этапов.Determination of rabies virus concentration was carried out in several stages.
Обеззараженные в соответствии с МУ 1.3.2569-09 пробы рабического антигена органо-тканевого происхождения отбирали по 100 мкл и переносили в 12 микроцентрифужных пробирок объемом 1,5 мл. Дополнительно в отдельную микроцентрифужную пробирку объемом 1,5 мл вносили 100 мкл ТЕ-буфера (ОКБ).Disinfected in accordance with MU 1.3.2569-09 samples of a rabies antigen of organo-tissue origin were taken in 100 μl and transferred into 12 1.5 ml microcentrifuge tubes. Additionally, 100 μl of TE buffer (OKB) was added to a separate 1.5 ml microcentrifuge tube.
Выделение РНК. Для выделения РНК использовали «комплект реагентов для выделения РНК/ДНК из клинического материала «РИБО-сорб», выпускаемый фирмой (ООО «ИнтерЛабСервис», Россия). Комплект реагентов для выделения РНК состоит из лизирующего раствора, раствора для отмывки 1, раствора для отмывки 3, раствора для отмывки 4, сорбента и РНК-буфера. В 12 микроцентрифужных пробирок со 100 мкл обеззараженного рабического антигена органо-тканевого происхождения и 1 пробирку ОКВ добавляли по 450 мкл предварительно прогретого при температуре (62±2)°С в течение 5-10 мин лизирующего раствора и тщательно перемешивали. Оставляли в штативе на 5-8 мин, 3-4 раза перемешивая. Центрифугировали в течение 5 с при 3000-5000 об/мин. Сорбент тщательно ресуспендировали и добавляли по 30 мкл в каждую пробирку. Перемешивали, оставляли в штативе на 1 мин, еще раз перемешивали и оставляли на 5 мин. Центрифугировали пробирки при 10000 об/мин в течение 45 с. Супернатант удаляли, а к осадку добавляли по 400 мкл раствора для отмывки 1. Перемешивали до полного ресуспендирования сорбента, центрифугировали в течение 45 с при 10000 об/мин. После удаления супернатанта добавляли в пробирки по 500 мкл раствора для отмывки 3. Сорбент тщательно ресуспендировали и пробирки центрифугировали в течение 45 с при 10000 об/мин. После удаления супернатанта операцию повторяли еще раз. Затем в пробирки добавляли по 400 мкл раствора для отмывки 4, тщательно ресуспендировали и центрифугировали в течение 45 с при 10000 об/мин. Надосадочную жидкость удаляли и помещали пробирки в термостат при температуре 60°С на 10 мин, при этом крышки оставляли открытыми.RNA isolation. For RNA isolation, we used a “kit of reagents for RNA / DNA isolation from the clinical material“ RIBO-sorb ”manufactured by the company (LLC“ InterLabService ”, Russia). The set of reagents for RNA isolation consists of a lyse solution, a solution for washing 1, a solution for washing 3, a solution for washing 4, a sorbent and an RNA buffer. In 12 microcentrifuge tubes with 100 μl of disinfected rabbit antigen of organo-tissue origin and 1 OKV tube, 450 μl of pre-heated lysing solution was heated at a temperature of (62 ± 2) ° C for 5-10 min and mixed thoroughly. Left in a tripod for 5-8 minutes, stirring 3-4 times. Centrifuged for 5 s at 3000-5000 rpm. The sorbent was carefully resuspended and 30 μl was added to each tube. Stirred, left in a rack for 1 minute, mixed again and left for 5 minutes. Tubes were centrifuged at 10,000 rpm for 45 s. The supernatant was removed, and 400 μl of
После сушки в каждую пробирку добавляли по 50 мкл РНК-буфера, перемешивали и помещали в твердотельный термостат при температуре 60°С на 3 мин. Перемешивали и центрифугировали в течение 1 мин при 13000 об/мин. Надосадочная жидкость содержит очищенную РНК вируса.After drying, 50 μl of RNA buffer was added to each tube, mixed and placed in a solid state thermostat at a temperature of 60 ° С for 3 min. Stirred and centrifuged for 1 min at 13,000 rpm. The supernatant contains purified virus RNA.
Проведение реакции обратной транскрипции.Conducting a reverse transcription reaction.
Для постановки реакции обратной транскрипции использовали комплект реагентов для получения кДНК на матрице РНК «Реверта-L» (ООО «ИнтерЛабСервис», Россия). Комплект реагентов для получения кДНК на матрице РНК содержит RT-G-mix-1, RT-mix-0,125 мл, ревертазу (MMLv) и ДНК-буфер.To set up the reverse transcription reaction, a set of reagents was used to obtain cDNA on the Reverta-L RNA template (InterLabService LLC, Russia). The reagent kit for producing cDNA on an RNA template contains RT-G-mix-1, RT-mix-0.125 ml, revertase (MMLv) and DNA buffer.
Перед началом работы из морозильной камеры извлекали пробирки с RT-mix и RT-G-mix-1 (RT-G-mix-2). После размораживания содержимого пробирок при комнатной температуре тщательно перемешивали и центрифугировали в течение 5 с при 3000-5000 об/мин для осаждения капель со стенок. Для приготовления реакционной смеси в пробирку с RT-mix вносили по 5 мкл RT-G-mix-1 (RT-G-mix-2), тщательно перемешивали, центрифугировали в течение 5 с при 3000-5000 об/мин для осаждения капель со стенок. К полученному раствору добавляли 6 мкл ревертазы MMLv, аккуратно перемешивали и центрифугировали в течение 5 с при 3000-5000 об/мин для осаждения капель со стенок. Отбирали 12 микроцентрифужных пробирок объемом 0,6 мл, соответствующие числу исследуемых проб и ОКБ. В каждую пробирку вносили по 10 мкл полученной реакционной смеси, затем в пробирки добавляли по 10 мкл препарата РНК и 10 мкл ТЕ-буфера в ОКВ. Пробирки инкубировали в амплификаторе или твердотельном термостате в течение 30 мин при температуре 37°С. Во все пробирки добавляли по 20 мкл ДНК-буфера и аккуратно 8-10 раз перемешивают. Полученную кДНК использовали для постановки ПЦР с гибридизационно-флуоресцентным учетом результатов.Before starting work, tubes with RT-mix and RT-G-mix-1 (RT-G-mix-2) were removed from the freezer. After thawing the contents of the tubes at room temperature, they were thoroughly mixed and centrifuged for 5 s at 3000-5000 rpm to precipitate drops from the walls. To prepare the reaction mixture, 5 μl of RT-G-mix-1 (RT-G-mix-2) was added to the RT-mix tube, mixed thoroughly, centrifuged for 5 s at 3000-5000 rpm to precipitate drops the walls. To the resulting solution was added 6 μl of MMLv revertase, gently mixed and centrifuged for 5 s at 3000-5000 rpm to precipitate drops from the walls. 12 microcentrifuge tubes with a volume of 0.6 ml were selected, corresponding to the number of test samples and OKB. 10 μl of the resulting reaction mixture was added to each tube, then 10 μl of the RNA preparation and 10 μl of TE buffer in OKB were added to the tubes. The tubes were incubated in a thermocycler or solid state thermostat for 30 min at a temperature of 37 ° C. 20 μl of DNA buffer was added to all tubes and gently mixed 8-10 times. The obtained cDNA was used for PCR with hybridization-fluorescent results.
Постановка ПЦР.Arrangement of PCR.
Из морозильной камеры извлекали микропробирки объемом 0,2 мл, содержащих ПЦР-смесь-1, ПЦР-смесь-2, ТЕ-буфер, фермент Taq ДНК-полимеразу с активностью 5 ед/мкл, набор ПЦР-стандартов RV1, RV2, RV3 различных концентраций для определения высоких и низких концентраций вируса. Содержимое пробирок полностью размораживали.0.2 ml microtubes containing PCR mixture-1, PCR mixture-2, TE buffer, Taq enzyme DNA polymerase with an activity of 5 units / μl, a set of PCR standards RV1, RV2, RV3 of various concentrations to determine high and low virus concentrations. The contents of the tubes were completely thawed.
ПЦР-смесь-1 в объеме 5 мкл содержит раствор праймеров RV5, RV6 и зонда RV7 в количестве 8 и 4 пМоль, соответственно, 1 мМоль каждого из четырех дНТФ, 0,025% раствор азида натрия и воду свободную от нуклеаз. ПЦР-смесь-1 переносили по 5 мкл в 17 микроцентрифужных пробирок объемом 0,2 мл. В каждую пробирку на поверхность ПЦР-смеси-1 наслаивали расплавленный 20% раствор парафина в минеральном масле.PCR mixture-1 in a volume of 5 μl contains a solution of primers RV5, RV6 and probe RV7 in an amount of 8 and 4 pMol, respectively, 1 mMol of each of the four dNTPs, 0.025% sodium azide solution and nuclease-free water. PCR mix-1 was transferred 5 μl into 17 0.2 ml microcentrifuge tubes. In each tube, a molten 20% solution of paraffin in mineral oil was layered on the surface of the PCR mixture-1.
ПЦР-смесь-2 в объеме 10 мкл, содержащую 2,5×Taq буфер с сульфатом аммония, 6,25 мМоль магния хлорида, фермент Taq ДНК-полимеразу, воду свободную от нуклеаз.PCR mixture-2 in a volume of 10 μl, containing 2.5 × Taq buffer with ammonium sulfate, 6.25 mmol of magnesium chloride, Taq enzyme DNA polymerase, nuclease-free water.
Полученную ПЦР-смесь-2 перемешивали на микроцентирифуге/встряхивателе и переносили по 10 мкл в 17 микропробирок с ПЦР-смесью-1, не повреждая слой парафина.The resulting PCR mixture-2 was mixed on a microcentrifuge / shaker and transferred to 10 μl in 17 microtubes with PCR mixture-1 without damaging the paraffin layer.
В 12 микропробирок вносили по 10 мкл пробы кДНК, в 3 микропробирки вносили по 10 мкл каждого ПЦР-стандарта RV1, RV2, RV3, в 1 микропробирку вносили 10 мкл из ОКВ-пробы, содержащей ТЕ-буфер, исследование которой происходит вместе с анализируемыми образцами, начиная с этапа выделения ДНК. Это позволяет оценить отсутствие контаминации на этапах выделения ДНК и постановки обратной транскрипции. В 1 микропробирку с отрицательным контролем амплификации (К-) вносили 10 мкл ТЕ-буфера. Позволяет оценить отсутствие контаминации на этапе проведения амплификации: контроль чистоты реагентов и отсутствие ошибок оператора.In 12 microtubes, 10 μl of a cDNA sample was added, in 3
Подготовленые микропробирки помещали в термоциклер RotorGene 6000 и проводили ПЦР с гибридизационно-флуоресцентным учетом результатов при режиме отжига праймеров при температуре 60°С в течение 10 циклов, затем при 56°С в течение 35 циклов. Учет флуоресценции по каналу ROX осуществляли при температуре 56°С.The prepared microtubes were placed in a RotorGene 6000 thermal cycler and PCR was carried out with hybridization-fluorescence results taking into account when the primers were annealed at a temperature of 60 ° C for 10 cycles, then at 56 ° C for 35 cycles. Accounting for fluorescence via the ROX channel was carried out at a temperature of 56 ° C.
ПЦР-анализ выполняется с обеззараженным материалом и занимает 3,5-4,0 ч.PCR analysis is performed with disinfected material and takes 3.5-4.0 hours.
Учет результатов.Accounting for results.
Количественную оценку содержания кДНК вируса бешенства в исследуемом материале проводили при наличии отрицательного результата в пробах К- и ОКВ по значению интенсивности флуоресценции сигнала путем сравнения исследуемого образца с ПЦР-стандартами RV1, RV2, RV3, предназначенными для выявления высоких концентраций. Количественную оценку определяли с помощью программного обеспечения термоциклера RotorGene 6000.The rabies virus cDNA content in the test material was quantitatively assessed in the presence of a negative result in K- and OKV samples by the value of the signal fluorescence intensity by comparing the test sample with PCR standards RV1, RV2, RV3, designed to detect high concentrations. Quantification was determined using RotorGene 6000 thermal cycler software.
Концентрация фиксированного вируса бешенства штамма «Москва 3253» в 12 исследуемых пробах мозговой суспензии кроликов составила от 2×109 копий/мл до 2,81×109 копий/мл (фигура 2). Значения коэффициента корреляции составили 0,99708, эффективности реакции - 0,89667.The concentration of fixed rabies virus strain Moscow 3253 in 12 test samples of the brain suspension of rabbits ranged from 2 × 10 9 copies / ml to 2.81 × 10 9 copies / ml (figure 2). The correlation coefficient amounted to 0.99708, the reaction efficiency - 0.89667.
Пример 2. Количественное определение концентрации вируса бешенства штамма «Москва 3253» в рабическом антигене культурального происхождения при стационарном способе выращивания.Example 2. Quantitative determination of the concentration of rabies virus strain "Moscow 3253" in the rabbit antigen of cultural origin with a stationary method of growing.
Для исследования взяты 12 проб рабического антигена, полученного при стационарном способе выращивания Virus fixe на культуре клеток Vero. Этапы обеззараживания антигена культурального происхождения, выделение РНК, реакцию обратной транскрипции и ПЦР проводили аналогично примера 1, только при проведении ПЦР использовали ПЦР-стандарты RV2, RV3, RV4, предназначенных для выявления низких концентраций.For the study, 12 samples of rabies antigen obtained using the stationary method of growing Virus fixe on a Vero cell culture were taken. The stages of disinfection of an antigen of cultural origin, RNA isolation, reverse transcription reaction and PCR were carried out similarly to example 1, only when performing PCR, PCR standards RV2, RV3, RV4 were used, designed to detect low concentrations.
Концентрация фиксированного вируса бешенства штамма «Москва 3253» в исследуемых пробах составила от 4,99×102 копий/мл до 7,59×106 копий/мл (фигура 3). Значения коэффициента корреляции составили 0,99893, эффективности реакции - 0,96566.The concentration of fixed rabies virus strain Moscow 3253 in the studied samples ranged from 4.99 × 10 2 copies / ml to 7.59 × 10 6 copies / ml (figure 3). The correlation coefficient amounted to 0.99893, the reaction efficiency - 0.96566.
Таким образом, заявляемый способ количественного определения фиксированного вируса бешенства штамма «Москва 3253» методом полимеразной цепной реакции с гибридизационно-флуоресцентным учетом результатов в режиме реального времени позволяет определить количественное содержание вируса в рабическом антигене органо-тканевого и культурального происхождения и обеспечивает простоту и безопасность работы. Значительно сокращает время исполнения анализа. Использование данного способа способствует стандартизации этапа приготовления рабического антигена в производстве гетерологичного антирабического иммуноглобулина.Thus, the claimed method for the quantitative determination of the fixed rabies virus of the strain "Moscow 3253" by the method of polymerase chain reaction with hybridization-fluorescence taking into account the results in real time allows you to determine the quantitative content of the virus in the rabid antigen of organo-tissue and cultural origin and ensures simplicity and safety of work. Significantly reduces analysis execution time. The use of this method helps to standardize the stage of preparation of the rabbit antigen in the production of heterologous rabies immunoglobulin.
ЛитератураLiterature
1. Груздев К.Н., Недосеков В.В. Бешенство животных. М.: 2001. 16-24 с.1. Gruzdev K.N., Nedosekov V.V. Rabies animals. M.: 2001.16-24 s.
2. Екимов А.Н., Шипулин Г.А., Бочкарев Е.Г., Рюмин Д.В. Новейшие технологии в генодиагностике: полимеразная цепная реакция в реальном времени (Real-Time PCR). // Вестник последипломного медицинского образования. - 2001. - N 3. - С.7-10.2. Ekimov A.N., Shipulin G.A., Bochkarev E.G., Ryumin D.V. The latest technology in gene diagnostics: real-time polymerase chain reaction (Real-Time PCR). // Bulletin of postgraduate medical education. - 2001. -
3. Онищенко Г.Г. О санитарно-эпидемиологической обстановке в Российской Федерации в 2009 году: Государственный доклад. М.: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора. 2010. 334-336 с.3. Onishchenko G. G. On the sanitary-epidemiological situation in the Russian Federation in 2009: State report. M .: Federal Center for Hygiene and Epidemiology of Rospotrebnadzor. 2010.334-336 p.
4. Троценко Н.И., Белоусова Р.В., Преображенская Э.А. Практикум по ветеринарной вирусологии. М.: 2000. 103-125 с.4. Trotsenko N.I., Belousova R.V., Preobrazhenskaya E.A. Workshop on Veterinary Virology. M .: 2000.103-125 s.
5. Black E.M., Lowings J.P., Smith J. et al. A rapid RT-PCR method to differentials six established genotypes of rabies and rabies-related viruses using TaqMan technology // J. Viral. Methods. - 2002. - Vol.105. - P.25-35; Waheley P.R., Johnson N., Me Elhinney et al. Development of a real-time, TaqMan Reverse Transcription PCR assay for detection and differentiation of Lyssavirus genotypes 1,5, and, 6 // J. Clin. Microbiol. 2005. - Vol.43. - P.2786-2792.5. Black E.M., Lowings J.P., Smith J. et al. A rapid RT-PCR method to differentials six established genotypes of rabies and rabies-related viruses using TaqMan technology // J. Viral. Methods - 2002 .-- Vol.105. - P.25-35; Waheley P. R., Johnson N., Me Elhinney et al. Development of a real-time, TaqMan Reverse Transcription PCR assay for detection and differentiation of Lyssavirus genotypes 1,5, and, 6 // J. Clin. Microbiol. 2005 .-- Vol. 43. - P.2786-2792.
6. Bourhy П., Kissi В., Tordo N. Molecular diversity of the Lyssavirus genus // Virology. - 1993. - Vol.194. - P.70-81.6. Bourhy P., Kissi B., Tordo N. Molecular diversity of the Lyssavirus genus // Virology. - 1993 .-- Vol. 194. - P.70-81.
7. Heaton P.R., Johnsbone P., McElhinney L.M. et al. Heminested PCR assay for detection of six genotypes of rabies and rabies-related viruses // J. Clin. Microbiol. - 1997. - Vol.35. - P.2762-2766; Dantasjunior J.V., Kimura L.M.S., Ferreira M.S.R. et al. Reverse transcription polymerase chain reaction assay for rabies virus detection // Arq. Bras. Med. Vet. Zootec. - 2004. - Vol.56. - P.398-400; Bordignon J., Brazil-dos-Anjos G., Bumo C.R. et al. Detection and characterization of rabies virus in Southern Brazil by PCR amplification and sequencing of the nucleoprotein gene // Arch Virol. - 2005. - Vol.150. - P.695-708; Nagaraj Т., Vasanth J.P., Desai A. et al. Ante mortem diagnosis of human rabies using saliva samples: comparison of real-time and conventional RT-PCR techniques // J. Clin. Virol. - 2006. - Vol.36. - P.17-23; Saengseesom W., Mitmoonpitak C., Kasempimolpom S., Sitprija V. Real-time PCR analysis of dog cerebrospinal fluid and saliva samples for ante-mortem diagnosis of rabies // Southeast Asian J. Trop.Med. Public Health. - 2007. - Vol.38. - P.53-57.7. Heaton P.R., Johnsbone P., McElhinney L.M. et al. Heminested PCR assay for detection of six genotypes of rabies and rabies-related viruses // J. Clin. Microbiol. - 1997. - Vol. 35. - P.2762-2766; Dantasjunior J.V., Kimura L.M.S., Ferreira M.S.R. et al. Reverse transcription polymerase chain reaction assay for rabies virus detection // Arq. Bras. Med. Vet. Zootec. - 2004 .-- Vol.56. - P.398-400; Bordignon J., Brazil-dos-Anjos G., Bumo C.R. et al. Detection and characterization of rabies virus in Southern Brazil by PCR amplification and sequencing of the nucleoprotein gene // Arch Virol. - 2005. - Vol. 150. - P.695-708; Nagaraj T., Vasanth J. P., Desai A. et al. Ante mortem diagnosis of human rabies using saliva samples: comparison of real-time and conventional RT-PCR techniques // J. Clin. Virol. - 2006. - Vol. 36. - P.17-23; Saengseesom W., Mitmoonpitak C., Kasempimolpom S., Sitprija V. Real-time PCR analysis of dog cerebrospinal fluid and saliva samples for ante-mortem diagnosis of rabies // Southeast Asian J. Trop.Med. Public Health. - 2007. - Vol. 38. - P.53-57.
8. Kosinova Е. et al. Real-time PCR for quantitation of bovine viral diarrhea virus RNA using SYBR Green I fluorimetry. Veterinarian medicine, 52, 2007; 6: 259-261 p.8. Kosinova E. et al. Real-time PCR for quantitation of bovine viral diarrhea virus RNA using SYBR Green I fluorimetry. Veterinarian medicine, 52, 2007; 6: 259-261 p.
9. Radonic A., Thuike S. et al. Reference gene selection for quantitative real-time PCR analysis in virus infected cells: SARS corona virus. Yellow fever virus. Human Herpesvirus-6, Cameplox virus and Cytomegalovirus infections. Virology. 2005; 7: Tab2.9. Radonic A., Thuike S. et al. Reference gene selection for quantitative real-time PCR analysis in virus infected cells: SARS corona virus. Yellow fever virus. Human Herpesvirus-6, Cameplox virus and Cytomegalovirus infections. Virology. 2005; 7: Tab2.
10. Sato G. et al. 2005 Sato G., Tanabe H., Shoji Y. et al. Rapid discrimination of rabies viruses isolated from various host species in Brazil by multiplex reverse transcription-polymerase chain reaction // J. Clin. Virol. - 2005. - Vol.33(4). - P.267-273.10. Sato G. et al. 2005 Sato G., Tanabe H., Shoji Y. et al. Rapid discrimination of rabies viruses isolated from various host species in Brazil by multiplex reverse transcription-polymerase chain reaction // J. Clin. Virol. - 2005 .-- Vol.33 (4). - P.267-273.
11. Sato G., Itou Т., Shoji Y. et al. Genetic and phylogenetic analysis of glycoprotein of rabies virus isolated from several species in Brazil // J. Vet. Med. Sci. - 2004. - Vol.66. - P.747-753.11. Sato G., Itou T., Shoji Y. et al. Genetic and phylogenetic analysis of glycoprotein of rabies virus isolated from several species in Brazil // J. Vet. Med. Sci. - 2004 .-- Vol.66. - P.747-753.
12. Tordo N., Kouknetroff A. The rabies virus genome: an overview // J. Vet. Res. - 1993. - Vol.60. - P.263-269.12. Tordo N., Kouknetroff A. The rabies virus genome: an overview // J. Vet. Res. - 1993. - Vol.60. - P.263-269.
13. Tordo N., Poch O., Ermine A. et al. Walking along the rabies genome: is the large G-L intergenic region a remnant gene? // Proc Nati Acad Sci USA. - 1986. - Vol.83. - P.3914-3918; Wunner W.H., Larson J.K., Dietzschold В., Smith C.L. The molecular biology of rabies viruses // Rev. Infect. Dis. - 1988. - Vol.10. - P.1149-1158.13. Tordo N., Poch O., Ermine A. et al. Walking along the rabies genome: is the large G-L intergenic region a remnant gene? // Proc Nati Acad Sci USA. - 1986. - Vol. 83. - P.3914-3918; Wunner W.H., Larson J.K., Dietzschold B., Smith C. L. The molecular biology of rabies viruses // Rev. Infect. Dis. - 1988 .-- Vol.10. - P.1149-1158.
14. Wacharapluesadee S. 2008 Wacharapluesadee S., Sutipauya J., Damrougwatanapokin S. et el. Development of a TaqMan real-time RT-PCR assay for the detection of rabies virus // JJ. Virol. Methods. - 2008. - Vol.151(2). - P.317-320.14. Wacharapluesadee S. 2008 Wacharapluesadee S., Sutipauya J., Damrougwatanapokin S. et el. Development of a TaqMan real-time RT-PCR assay for the detection of rabies virus // JJ. Virol. Methods - 2008 .-- Vol. 151 (2). - P.317-320.
15. WHO Expert Consultation on Rabies 931, Женева, 2004.15. WHO Expert Consultation on Rabies 931, Geneva, 2004.
Claims (1)
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2012139719/10A RU2511440C2 (en) | 2012-09-17 | 2012-09-17 | Method of quantitative determination of fixed rabies virus "moskva 3253" |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2012139719/10A RU2511440C2 (en) | 2012-09-17 | 2012-09-17 | Method of quantitative determination of fixed rabies virus "moskva 3253" |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2012139719A RU2012139719A (en) | 2013-03-20 |
RU2511440C2 true RU2511440C2 (en) | 2014-04-10 |
Family
ID=49123524
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2012139719/10A RU2511440C2 (en) | 2012-09-17 | 2012-09-17 | Method of quantitative determination of fixed rabies virus "moskva 3253" |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
RU (1) | RU2511440C2 (en) |
Cited By (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2575088C1 (en) * | 2014-10-02 | 2016-02-10 | Федеральное бюджетное государственное учреждение "Федеральный Центр токсикологической, радиационной и биологической безопасности" (ФГБУ "ФЦТРБ-ВНИВИ") | Set of synthetic oligonucleotide primers for identification of rna of rabies virus and method of identification of rna of rabies virus by means of synthetic oligonucleotide primers in polymerase chain reaction with reverse transcription (rt-pcr) |
RU2746588C1 (en) * | 2020-11-02 | 2021-04-16 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Федеральный центр охраны здоровья животных" (ФГБУ "ВНИИЗЖ") | Method of indirect determination of the completeness of rabies virus antigen inactivation using reverse-transcriptase polymerase chain reaction followed by electrophoresis of amplicons in agarose gel |
RU2748475C1 (en) * | 2020-11-02 | 2021-05-26 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Федеральный центр охраны здоровья животных" (ФГБУ "ВНИИЗЖ") | Method for spectrometric determination of concentration of rabies virus ribonucleoprotein by estimating the number of viral rna molecules in raw materials for rabies vaccines |
RU2761535C1 (en) * | 2020-11-02 | 2021-12-09 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Федеральный центр охраны здоровья животных" (ФГБУ "ВНИИЗЖ") | Method for indirect determination of the number of infectious doses of rabies virus strain pb -97 in raw materials for attenuated rabies vaccine by reverse transcription and polymerase chain reaction in real time |
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2340673C1 (en) * | 2007-04-10 | 2008-12-10 | Федеральное государственное учреждение науки "Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФГУН ГНЦ ВБ "Вектор" Роспотребнадзора) | Set of oligonucleotide primers for rna identification of rabies virus in samples |
-
2012
- 2012-09-17 RU RU2012139719/10A patent/RU2511440C2/en not_active IP Right Cessation
Patent Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2340673C1 (en) * | 2007-04-10 | 2008-12-10 | Федеральное государственное учреждение науки "Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФГУН ГНЦ ВБ "Вектор" Роспотребнадзора) | Set of oligonucleotide primers for rna identification of rabies virus in samples |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
R.FRANKA et al., Quantification of the effectiveness of laboratory diagnostics of rabies using classical andmolecular-genetic methods, Vet.Med.-Czech, 2004, Vol.7, p.p.259-267. G. J. Hughes et al., Evaluation of a TaqMan PCR Assay To Detect Rabies Virus RNA: Influence of Sequence Variation and Application to Quantification of Viral Loads, JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY, Jan. 2004, Vol. 42, No. 1, p. 299-306. * |
Cited By (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2575088C1 (en) * | 2014-10-02 | 2016-02-10 | Федеральное бюджетное государственное учреждение "Федеральный Центр токсикологической, радиационной и биологической безопасности" (ФГБУ "ФЦТРБ-ВНИВИ") | Set of synthetic oligonucleotide primers for identification of rna of rabies virus and method of identification of rna of rabies virus by means of synthetic oligonucleotide primers in polymerase chain reaction with reverse transcription (rt-pcr) |
RU2746588C1 (en) * | 2020-11-02 | 2021-04-16 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Федеральный центр охраны здоровья животных" (ФГБУ "ВНИИЗЖ") | Method of indirect determination of the completeness of rabies virus antigen inactivation using reverse-transcriptase polymerase chain reaction followed by electrophoresis of amplicons in agarose gel |
RU2748475C1 (en) * | 2020-11-02 | 2021-05-26 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Федеральный центр охраны здоровья животных" (ФГБУ "ВНИИЗЖ") | Method for spectrometric determination of concentration of rabies virus ribonucleoprotein by estimating the number of viral rna molecules in raw materials for rabies vaccines |
RU2761535C1 (en) * | 2020-11-02 | 2021-12-09 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Федеральный центр охраны здоровья животных" (ФГБУ "ВНИИЗЖ") | Method for indirect determination of the number of infectious doses of rabies virus strain pb -97 in raw materials for attenuated rabies vaccine by reverse transcription and polymerase chain reaction in real time |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
RU2012139719A (en) | 2013-03-20 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Belák | Molecular diagnosis of viral diseases, present trends and future aspects: A view from the OIE Collaborating Centre for the Application of Polymerase Chain Reaction Methods for Diagnosis of Viral Diseases in Veterinary Medicine | |
CN108192996B (en) | Multiple RT-RPA primer combination for detecting influenza A virus and parting H1 and H3 and application thereof | |
KR20070103417A (en) | Method for extraction and identification of nucleic acids | |
CN111286559B (en) | Primer, probe and kit for detecting African swine fever virus | |
CA2035471A1 (en) | Techniques for the amplification of nucleic acid | |
RU2511440C2 (en) | Method of quantitative determination of fixed rabies virus "moskva 3253" | |
CN110343784B (en) | Composition and kit for quadruple influenza virus nucleic acid detection based on melting curve | |
RU2385943C2 (en) | Oligonucleotide primers, method and test system for detecting bluetongue virus genome by polymerase chain reaction in electrophoretic detection of amplification products | |
RU2360971C1 (en) | Method and test system to detect dna of african swine fever virus by means of specific oligonucleotide primers in polymerase chain reaction | |
Qiao et al. | Rapid detection of Akabane virus by a novel reverse transcription loop-mediated isothermal amplification assay (RT-LAMP) | |
CN116814857A (en) | Cat parvovirus and kit thereof and fluorescent recombinase polymerase amplification method | |
US11098380B2 (en) | Reagent and method for rapid detection of porcine adenovirus | |
Orlowska et al. | Comparison of real-time PCR and heminested RT-PCR methods in the detection of rabies virus infection in bats and terrestrial animals | |
RU2515916C2 (en) | Test system for detecting rna of schmallenberg virus and method for recognising schmallenberg virus genome | |
Ranjan et al. | Use of nucleic acid recognition methods (m-PCR and RT-LAMP) for the detection of foot-and-mouth disease virus excreted in cow milk | |
Hussin et al. | An Overview of Laboratory Diagnosis of Central Nervous System Viral Infections | |
RU2694499C1 (en) | Test system for detecting coronavirus infection pathogen genome in cattle by means of multiplex polymerase chain reaction with fluorescent detection in real time | |
CN112553357A (en) | Nested PCR (polymerase chain reaction) detection primer group and kit for equine piroplasmosis and application of nested PCR detection primer group and kit | |
KR20120086028A (en) | Differential detection of West nile virus and Japanese encephalitis virus | |
Khalafalla et al. | Polymerase chain reaction (PCR) for rapid diagnosis and differentiation of Parapoxvirus and Orthopoxvirus infections in camels | |
CN111304342A (en) | PCR kit for identifying Brucella strain S2 vaccine strain and wild strains of other species and use method thereof | |
CN111500774A (en) | Epidemic hemorrhagic disease virus and serotype identification RT-PCR kit | |
CN113549709A (en) | Primer pair, probe and kit for detecting SARS-CoV-2 by utilizing nested RPA technology and application thereof | |
RU2731716C1 (en) | Kit for differentiating cattle pestiviruses and method for differentiating cattle pestiviruses | |
RU2511029C2 (en) | RECOMBINANT STRAIN OF Escherichia coli TG1(pRVMoscow3253G-L) FOR OBTAINING SET OF PCR-STANDARDS AND SET OF PCR-STANDARDS FOR DETERMINATION OF CONCENTRATION OF RABIES VIRUS "Moskva 3253" IN RABIES ANTIGEN |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20160918 |